JP5926166B2 - マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 - Google Patents
マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5926166B2 JP5926166B2 JP2012251788A JP2012251788A JP5926166B2 JP 5926166 B2 JP5926166 B2 JP 5926166B2 JP 2012251788 A JP2012251788 A JP 2012251788A JP 2012251788 A JP2012251788 A JP 2012251788A JP 5926166 B2 JP5926166 B2 JP 5926166B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- temperature
- molecule
- channel
- fluorescence
- thermal
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 118
- 238000002844 melting Methods 0.000 title description 58
- 230000008018 melting Effects 0.000 title description 58
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims description 142
- 238000009739 binding Methods 0.000 claims description 56
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 claims description 52
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 51
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 claims description 47
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 claims description 47
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 claims description 47
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 claims description 47
- 239000000975 dye Substances 0.000 claims description 41
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 claims description 25
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 claims description 20
- 238000002866 fluorescence resonance energy transfer Methods 0.000 claims description 19
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 claims description 19
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 claims description 18
- 239000011616 biotin Substances 0.000 claims description 18
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 claims description 10
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 claims description 10
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 claims description 8
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 claims description 8
- 108010087904 neutravidin Proteins 0.000 claims description 7
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical group [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 claims description 5
- 239000001046 green dye Substances 0.000 claims description 4
- 238000009830 intercalation Methods 0.000 claims 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 93
- 230000008859 change Effects 0.000 description 58
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 58
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 47
- 239000000463 material Substances 0.000 description 40
- 239000003269 fluorescent indicator Substances 0.000 description 39
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 39
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 39
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 38
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 38
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 38
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 33
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 31
- 229960002143 fluorescein Drugs 0.000 description 30
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 29
- 238000002875 fluorescence polarization Methods 0.000 description 28
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 27
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 25
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 22
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 22
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 22
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 22
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 20
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 19
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 17
- 238000011880 melting curve analysis Methods 0.000 description 17
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 16
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 16
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 230000006870 function Effects 0.000 description 15
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 15
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 14
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 14
- FWEOQOXTVHGIFQ-UHFFFAOYSA-M 8-anilinonaphthalene-1-sulfonate Chemical compound C=12C(S(=O)(=O)[O-])=CC=CC2=CC=CC=1NC1=CC=CC=C1 FWEOQOXTVHGIFQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 13
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 13
- 230000033001 locomotion Effects 0.000 description 13
- 230000000704 physical effect Effects 0.000 description 13
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 13
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 13
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 13
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 description 12
- -1 antibodies Proteins 0.000 description 12
- 238000002983 circular dichroism Methods 0.000 description 12
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 12
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 12
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 12
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 11
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 11
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 11
- 230000010287 polarization Effects 0.000 description 11
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 10
- 230000005684 electric field Effects 0.000 description 10
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 10
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 10
- 230000008569 process Effects 0.000 description 10
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 description 10
- 125000000430 tryptophan group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12 0.000 description 10
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 9
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 9
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 9
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 9
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 9
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 9
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 9
- 230000004044 response Effects 0.000 description 9
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 9
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 9
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 8
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 8
- 230000006854 communication Effects 0.000 description 8
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 8
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 8
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 7
- 238000000113 differential scanning calorimetry Methods 0.000 description 7
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 7
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 7
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 7
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 7
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 7
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 7
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 6
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 6
- 238000013461 design Methods 0.000 description 6
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 6
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 6
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 6
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 6
- 238000012552 review Methods 0.000 description 6
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 6
- 230000003595 spectral effect Effects 0.000 description 6
- 230000006641 stabilisation Effects 0.000 description 6
- 238000011105 stabilization Methods 0.000 description 6
- ABZLKHKQJHEPAX-UHFFFAOYSA-N tetramethylrhodamine Chemical compound C=12C=CC(N(C)C)=CC2=[O+]C2=CC(N(C)C)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C([O-])=O ABZLKHKQJHEPAX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 6
- 108091093088 Amplicon Proteins 0.000 description 5
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 5
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 5
- 239000003607 modifier Substances 0.000 description 5
- 239000003068 molecular probe Substances 0.000 description 5
- 238000011160 research Methods 0.000 description 5
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 5
- 102000030914 Fatty Acid-Binding Human genes 0.000 description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 4
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229940045799 anthracyclines and related substance Drugs 0.000 description 4
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 4
- 229920001222 biopolymer Polymers 0.000 description 4
- 238000007707 calorimetry Methods 0.000 description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 4
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 4
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 4
- 108091022862 fatty acid binding Proteins 0.000 description 4
- 238000000198 fluorescence anisotropy Methods 0.000 description 4
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 4
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 4
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 4
- 230000001953 sensory effect Effects 0.000 description 4
- 238000005382 thermal cycling Methods 0.000 description 4
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 3
- DMLAVOWQYNRWNQ-UHFFFAOYSA-N azobenzene Chemical compound C1=CC=CC=C1N=NC1=CC=CC=C1 DMLAVOWQYNRWNQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 3
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 3
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 3
- 238000005112 continuous flow technique Methods 0.000 description 3
- 238000002060 fluorescence correlation spectroscopy Methods 0.000 description 3
- 230000005484 gravity Effects 0.000 description 3
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 3
- 230000009149 molecular binding Effects 0.000 description 3
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 3
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 230000006916 protein interaction Effects 0.000 description 3
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 3
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 3
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 3
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 3
- 235000012431 wafers Nutrition 0.000 description 3
- 108010038550 3-dehydroquinate dehydratase Proteins 0.000 description 2
- WCKQPPQRFNHPRJ-UHFFFAOYSA-N 4-[[4-(dimethylamino)phenyl]diazenyl]benzoic acid Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1N=NC1=CC=C(C(O)=O)C=C1 WCKQPPQRFNHPRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 2
- 230000005653 Brownian motion process Effects 0.000 description 2
- 101000925646 Enterobacteria phage T4 Endolysin Proteins 0.000 description 2
- 102000018233 Fibroblast Growth Factor Human genes 0.000 description 2
- 108050007372 Fibroblast Growth Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000003971 Fibroblast Growth Factor 1 Human genes 0.000 description 2
- 108090000386 Fibroblast Growth Factor 1 Proteins 0.000 description 2
- 241000187479 Mycobacterium tuberculosis Species 0.000 description 2
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 2
- 108010039918 Polylysine Proteins 0.000 description 2
- XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N Silicon Chemical compound [Si] XUIMIQQOPSSXEZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 239000003463 adsorbent Substances 0.000 description 2
- 239000002168 alkylating agent Substances 0.000 description 2
- 229940100198 alkylating agent Drugs 0.000 description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 2
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 2
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 2
- 238000005537 brownian motion Methods 0.000 description 2
- 239000004020 conductor Substances 0.000 description 2
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 2
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 2
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001351 cycling effect Effects 0.000 description 2
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 2
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 239000006185 dispersion Substances 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 230000005672 electromagnetic field Effects 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 2
- 230000005281 excited state Effects 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 2
- 229940126864 fibroblast growth factor Drugs 0.000 description 2
- 238000001506 fluorescence spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 2
- 238000013537 high throughput screening Methods 0.000 description 2
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 2
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 2
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 230000002452 interceptive effect Effects 0.000 description 2
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 2
- 238000002334 isothermal calorimetry Methods 0.000 description 2
- VMPHSYLJUKZBJJ-UHFFFAOYSA-N lauric acid triglyceride Natural products CCCCCCCCCCCC(=O)OCC(OC(=O)CCCCCCCCCCC)COC(=O)CCCCCCCCCCC VMPHSYLJUKZBJJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004973 liquid crystal related substance Substances 0.000 description 2
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 2
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 2
- 238000002094 microwave spectroscopy Methods 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 230000004001 molecular interaction Effects 0.000 description 2
- UPBAOYRENQEPJO-UHFFFAOYSA-N n-[5-[[5-[(3-amino-3-iminopropyl)carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]carbamoyl]-1-methylpyrrol-3-yl]-4-formamido-1-methylpyrrole-2-carboxamide Chemical compound CN1C=C(NC=O)C=C1C(=O)NC1=CN(C)C(C(=O)NC2=CN(C)C(C(=O)NCCC(N)=N)=C2)=C1 UPBAOYRENQEPJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 2
- 229920000656 polylysine Polymers 0.000 description 2
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N pyrene Chemical compound C1=CC=C2C=CC3=CC=CC4=CC=C1C2=C43 BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000006862 quantum yield reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000700 radioactive tracer Substances 0.000 description 2
- 229910052705 radium Inorganic materials 0.000 description 2
- HCWPIIXVSYCSAN-UHFFFAOYSA-N radium atom Chemical compound [Ra] HCWPIIXVSYCSAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000011896 sensitive detection Methods 0.000 description 2
- JXOHGGNKMLTUBP-HSUXUTPPSA-N shikimic acid Chemical compound O[C@@H]1CC(C(O)=O)=C[C@@H](O)[C@H]1O JXOHGGNKMLTUBP-HSUXUTPPSA-N 0.000 description 2
- JXOHGGNKMLTUBP-JKUQZMGJSA-N shikimic acid Natural products O[C@@H]1CC(C(O)=O)=C[C@H](O)[C@@H]1O JXOHGGNKMLTUBP-JKUQZMGJSA-N 0.000 description 2
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 108010042747 stallimycin Proteins 0.000 description 2
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 2
- 238000002834 transmittance Methods 0.000 description 2
- BJEVMXQIEZQIHC-UHFFFAOYSA-N 2-iodo-n-(2',4',5',7'-tetrabromo-3',6'-dihydroxy-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-5-yl)acetamide Chemical compound O1C(=O)C2=CC(NC(=O)CI)=CC=C2C21C1=CC(Br)=C(O)C(Br)=C1OC1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C21 BJEVMXQIEZQIHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- COCMHKNAGZHBDZ-UHFFFAOYSA-N 4-carboxy-3-[3-(dimethylamino)-6-dimethylazaniumylidenexanthen-9-yl]benzoate Chemical compound C=12C=CC(=[N+](C)C)C=C2OC2=CC(N(C)C)=CC=C2C=1C1=CC(C([O-])=O)=CC=C1C(O)=O COCMHKNAGZHBDZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SJQRQOKXQKVJGJ-UHFFFAOYSA-N 5-(2-aminoethylamino)naphthalene-1-sulfonic acid Chemical compound C1=CC=C2C(NCCN)=CC=CC2=C1S(O)(=O)=O SJQRQOKXQKVJGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BZTDTCNHAFUJOG-UHFFFAOYSA-N 6-carboxyfluorescein Chemical compound C12=CC=C(O)C=C2OC2=CC(O)=CC=C2C11OC(=O)C2=CC=C(C(=O)O)C=C21 BZTDTCNHAFUJOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWEOQOXTVHGIFQ-UHFFFAOYSA-N 8-anilinonaphthalene-1-sulfonic acid Chemical compound C=12C(S(=O)(=O)O)=CC=CC2=CC=CC=1NC1=CC=CC=C1 FWEOQOXTVHGIFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000023308 Acca Species 0.000 description 1
- 102000004506 Blood Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010017384 Blood Proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 1
- 235000019687 Lamb Nutrition 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 238000010222 PCR analysis Methods 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 229910052771 Terbium Inorganic materials 0.000 description 1
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011481 absorbance measurement Methods 0.000 description 1
- 238000004847 absorption spectroscopy Methods 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 108010004469 allophycocyanin Proteins 0.000 description 1
- 230000003281 allosteric effect Effects 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 238000000149 argon plasma sintering Methods 0.000 description 1
- 238000003149 assay kit Methods 0.000 description 1
- 239000003899 bactericide agent Substances 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 238000012742 biochemical analysis Methods 0.000 description 1
- 125000004057 biotinyl group Chemical group [H]N1C(=O)N([H])[C@]2([H])[C@@]([H])(SC([H])([H])[C@]12[H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 238000009529 body temperature measurement Methods 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 1
- 238000007816 calorimetric assay Methods 0.000 description 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 1
- 230000020411 cell activation Effects 0.000 description 1
- 239000013522 chelant Substances 0.000 description 1
- 239000013611 chromosomal DNA Substances 0.000 description 1
- 239000005515 coenzyme Substances 0.000 description 1
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 1
- 239000000306 component Substances 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 238000013211 curve analysis Methods 0.000 description 1
- 238000013500 data storage Methods 0.000 description 1
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001934 delay Effects 0.000 description 1
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 1
- 238000010894 electron beam technology Methods 0.000 description 1
- 238000000295 emission spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 239000002532 enzyme inhibitor Substances 0.000 description 1
- GWQVMPWSEVRGPY-UHFFFAOYSA-N europium cryptate Chemical compound [Eu+3].N=1C2=CC=CC=1CN(CC=1N=C(C=CC=1)C=1N=C(C3)C=CC=1)CC(N=1)=CC(C(=O)NCCN)=CC=1C(N=1)=CC(C(=O)NCCN)=CC=1CN3CC1=CC=CC2=N1 GWQVMPWSEVRGPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010408 film Substances 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N fluoranthrene Natural products C1=CC(C2=CC=CC=C22)=C3C2=CC=CC3=C1 GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 1
- 238000002795 fluorescence method Methods 0.000 description 1
- 238000000799 fluorescence microscopy Methods 0.000 description 1
- 238000002189 fluorescence spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000005187 foaming Methods 0.000 description 1
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 1
- 239000003574 free electron Substances 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 238000012252 genetic analysis Methods 0.000 description 1
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 1
- 230000005283 ground state Effects 0.000 description 1
- 229960004198 guanidine Drugs 0.000 description 1
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003104 hexanoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000012188 high-throughput screening assay Methods 0.000 description 1
- 230000002706 hydrostatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 239000000138 intercalating agent Substances 0.000 description 1
- PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N iodoacetamide Chemical compound NC(=O)CI PGLTVOMIXTUURA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 238000000111 isothermal titration calorimetry Methods 0.000 description 1
- 150000002540 isothiocyanates Chemical class 0.000 description 1
- 150000002605 large molecules Chemical class 0.000 description 1
- 230000031700 light absorption Effects 0.000 description 1
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 239000000155 melt Substances 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 230000028161 membrane depolarization Effects 0.000 description 1
- QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N mercury Chemical compound [Hg] QSHDDOUJBYECFT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052753 mercury Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000004899 motility Effects 0.000 description 1
- 230000009871 nonspecific binding Effects 0.000 description 1
- 229920001542 oligosaccharide Polymers 0.000 description 1
- 150000002482 oligosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 239000005022 packaging material Substances 0.000 description 1
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 description 1
- 125000001147 pentyl group Chemical group C(CCCC)* 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 1
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 1
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 229920000307 polymer substrate Polymers 0.000 description 1
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 1
- 239000010453 quartz Substances 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000006903 response to temperature Effects 0.000 description 1
- 239000004065 semiconductor Substances 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N silicon dioxide Inorganic materials O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 1
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 239000013526 supercooled liquid Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- GZCRRIHWUXGPOV-UHFFFAOYSA-N terbium atom Chemical compound [Tb] GZCRRIHWUXGPOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JGVWCANSWKRBCS-UHFFFAOYSA-N tetramethylrhodamine thiocyanate Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(N(C)C)=CC2=[O+]C2=CC(N(C)C)=CC=C2C=1C1=CC=C(SC#N)C=C1C(O)=O JGVWCANSWKRBCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010409 thin film Substances 0.000 description 1
- 238000004448 titration Methods 0.000 description 1
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 1
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010937 tungsten Substances 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052724 xenon Inorganic materials 0.000 description 1
- FHNFHKCVQCLJFQ-UHFFFAOYSA-N xenon atom Chemical compound [Xe] FHNFHKCVQCLJFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N25/00—Investigating or analyzing materials by the use of thermal means
- G01N25/02—Investigating or analyzing materials by the use of thermal means by investigating changes of state or changes of phase; by investigating sintering
- G01N25/04—Investigating or analyzing materials by the use of thermal means by investigating changes of state or changes of phase; by investigating sintering of melting point; of freezing point; of softening point
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/502715—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by interfacing components, e.g. fluidic, electrical, optical or mechanical interfaces
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L3/00—Containers or dishes for laboratory use, e.g. laboratory glassware; Droppers
- B01L3/50—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes
- B01L3/502—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures
- B01L3/5027—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip
- B01L3/50273—Containers for the purpose of retaining a material to be analysed, e.g. test tubes with fluid transport, e.g. in multi-compartment structures by integrated microfluidic structures, i.e. dimensions of channels and chambers are such that surface tension forces are important, e.g. lab-on-a-chip characterised by the means or forces applied to move the fluids
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L7/00—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices
- B01L7/52—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
- B01L7/525—Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples with physical movement of samples between temperature zones
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6862—Ligase chain reaction [LCR]
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
- G01N21/25—Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
- G01N21/31—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry
- G01N21/33—Investigating relative effect of material at wavelengths characteristic of specific elements or molecules, e.g. atomic absorption spectrometry using ultraviolet light
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/62—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
- G01N21/63—Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light optically excited
- G01N21/64—Fluorescence; Phosphorescence
- G01N21/6428—Measuring fluorescence of fluorescent products of reactions or of fluorochrome labelled reactive substances, e.g. measuring quenching effects, using measuring "optrodes"
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2200/00—Solutions for specific problems relating to chemical or physical laboratory apparatus
- B01L2200/10—Integrating sample preparation and analysis in single entity, e.g. lab-on-a-chip concept
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/06—Auxiliary integrated devices, integrated components
- B01L2300/0627—Sensor or part of a sensor is integrated
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/08—Geometry, shape and general structure
- B01L2300/0809—Geometry, shape and general structure rectangular shaped
- B01L2300/0816—Cards, e.g. flat sample carriers usually with flow in two horizontal directions
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/14—Means for pressure control
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/18—Means for temperature control
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2300/00—Additional constructional details
- B01L2300/18—Means for temperature control
- B01L2300/1833—Means for temperature control using electrical currents in the sample itself
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
- B01L2400/0403—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific forces
- B01L2400/0409—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific forces centrifugal forces
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
- B01L2400/0403—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific forces
- B01L2400/0415—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific forces electrical forces, e.g. electrokinetic
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01L—CHEMICAL OR PHYSICAL LABORATORY APPARATUS FOR GENERAL USE
- B01L2400/00—Moving or stopping fluids
- B01L2400/04—Moving fluids with specific forces or mechanical means
- B01L2400/0475—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure
- B01L2400/0487—Moving fluids with specific forces or mechanical means specific mechanical means and fluid pressure fluid pressure, pneumatics
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10T—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
- Y10T436/00—Chemistry: analytical and immunological testing
- Y10T436/14—Heterocyclic carbon compound [i.e., O, S, N, Se, Te, as only ring hetero atom]
- Y10T436/142222—Hetero-O [e.g., ascorbic acid, etc.]
- Y10T436/143333—Saccharide [e.g., DNA, etc.]
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Clinical Laboratory Science (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Dispersion Chemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Pathology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Optics & Photonics (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
- Automatic Analysis And Handling Materials Therefor (AREA)
- Sampling And Sample Adjustment (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
- Physical Or Chemical Processes And Apparatus (AREA)
- Investigating Or Analyzing Materials Using Thermal Means (AREA)
Description
温度変化に応答した標的分子(1つまたは複数)の伸展、解離、もしくは変性は、多くの応用例において、例えば、指定の条件下で特定のタンパク質の安定性を判定する際、または、核酸を同定する際、核酸中のSNPを検出する際などにおいて有用であり得る。標的分子の分子変性、解離、または伸展の測定は、熱的性質曲線を構築するために使用される。他の応用例では、基礎的な熱的性質曲線の変化を使用して、例えば、特定の配位子もしくは他の分子が標的分子に結合するかを試験することができる。例えば、特定の配位子の特定の受容体への結合は、熱的性質曲線によって調査することができる。例えば、Gonzalez, M. et al., (1997) "Interaction of Biotin with Streptavidin" J Biol Chem, 272(17): 11288-11294を参照のこと。それに加えて、熱的性質曲線を用いて、特定のオリゴヌクレオチドの互いへのハイブリダイゼーションを実証することができる。例えば、Clegg, R. et al. (1994) "Observing the helical geometry of double-stranded DNA in solution by fluorescence resonance energy transfer." Proc Natl Acad Sci USA 90(7):2994-2998を参照のこと。
熱的性質曲線は、温度変化による分子の配座の変化に基づく。上述したように、分子、例えばタンパク質および核酸は、一連の温度にわたって伸展、解離、または変性を示す。温度に応じて決まる、所与の標的分子の伸展などの測定により、その分子の熱的性質曲線が生成される。例えば配位子(例えば、核酸またはタンパク質など)の標的分子への結合は、分子の安定化に、ひいてはその熱的性質曲線の変化に結び付き得る。例えば、Gonzalez, M. et al., (1997) "Interaction of Biotin with Streptavidin" J Biol Chem, 272(17):11288-11294、Schellman, J. (1975) Biopolymers, 14:999-1018、Barcelo, F. et al., (1990) "A scanning calorimetric study of natural DNA and antitumoral anthracycline antibiotic-DNA complexes." Chem Biol Interactions, 74(3):315-324、Schellman, J. (1976) Biopolymers, 15:999-1000、ならびに、Brandts, J. et al. (1990) "Study of strong to ultratight protein interactions using differential scanning calorimetry" Biochem 29:6927-2940を参照のこと。
図3は、単に例示として、配位子結合による熱的性質曲線のシフトを示す模擬図を提供する。この図は、温度に応じて決まる検出可能な性質(例えば、余分な熱容量)をプロットする。十分に説明されるように、変性を示すため、他の変化、例えば、指標色素または分子の蛍光、固有の蛍光などが任意に追跡される。
3’ GTAGG TTCCT CATCG ACACA GTAGT CCGGG CGGCG 5’(フルオレセイン)
5’ CATCC AAGGA GTAGC TGTGT CATCA GGCCC GCCGC 3’(TAMRA)
熱的性質曲線を構築する際、分子の変性/伸展を判定するため、問題の分子の物理的性質が測定されなければならない。この物理的性質の変化は変化する温度に応じて決まるものとして測定され、分子の配座の変化に比例/相関する。例えば、熱量分析、すなわち熱容量の変化を測定して、分子の温度誘発性の変性を示すことができる。例えば、Weber, P. et al., (1994) "Structure-based design of Synthetic Azobenzene Ligands for Streptavidin" J Am Chem Soc 16:2717-2724を参照のこと。分子の折畳み/配座の変化を示すために測定することができる追加の物理的性質としては、例えば、蛍光もしくは発光の存在、蛍光もしくは発光の変化、または蛍光もしくは発光の偏光の変化など、様々なスペクトル現象が挙げられる。これらの性質は、一連の温度にわたって測定し、マイクロ流体素子内の検査における標的分子(1つまたは複数)の伸展/変性の変化に相関させることができる。
本発明の一実施形態は、熱量測定を使用して、標的分子が温度の変化に晒されたときの熱力学的パラメータの変化を測定する。例えば、示差走査熱量測定(DSC)は、任意に、分子の相対的安定性を測定するのに使用される。本発明においてDSCを使用して、標的分子を含有するサンプルはマイクロ流体素子内の一連の温度にわたって加熱される。加熱プロセスの間のある時点において、標的分子は、熱を吸収あるいは放出する、物理的または化学的変化(例えば、変性)を起こす。次に、そのプロセスの間の熱変化(1つまたは複数)が、プロセス全体についての総熱量またはエンタルピーの変化(ΔH)を表す曲線の下の面積で、温度に応じて決まるものとしてプロットされる。当業者であれば、結果として得られるプロットを使用して、例えば、熱容量変化(ΔCp)、Tm(すなわち、変性または伸展反応が半分だけ完了する中間点温度)などを決定することができる。例えば、Gonzalez, M. et al., (1997) "Interaction of Biotin with Streptavidin", J Biol Chem, 272(17): 11288-11294を参照のこと。
本発明の別の実施形態は、印加電流の測定を使用して、温度に応じて決まる標的分子の変性/伸展を追跡する。ジュール加熱は「クランプ」モードで適用することができる。特定の温度(1つまたは複数)を維持するのに必要な電流の量は、検査中の分子(すなわち、個々にかつ組合せで)が素子内の温度を通して循環されるときに測定される。
本発明の別の実施形態は、分光法を使用して、標的分子が温度の変化に晒されたときの標的分子の変性/伸展を追跡するために、蛍光または光の変化を測定する。例えば蛍光による分光測定法は、分子の熱誘発性の変性/伸展を検出する有用な方法である。分子の変性(例えば、固有の蛍光、多数の蛍光指標色素もしくは分子、蛍光偏光、蛍光共鳴放射移動など)を検出する、蛍光が関与する多くの異なる方法が利用可能であり、本発明の任意の実施形態である。これらの方法は、標的分子の内部蛍光性、または外部蛍光、すなわち分析に関与する追加の指標分子の蛍光のどちらかを利用することができる。
標的分子の変性/伸展の度合い(標的分子がアミノ酸ベースの場合)を測定する任意の方法は、例えば、トリプトファン残基の固有の蛍光を監視することによるものである。他の芳香族アミノ酸残基は、トリプトファンに加えて、固有の蛍光を示し、本発明において任意に利用される。標的分子が温度の上昇による伸展を起こすと、タンパク質構造の内部に事前に埋めた様々なトリプトファンまたは他の分子を、分子(1つまたは複数)を取り囲む溶媒に暴露させることができる。例えばトリプトファン残基の暴露のこの変化は、標的分子の蛍光における対応する変化に結び付く。放射の量子収量は、標的分子のシーケンスおよび配座に応じて減少あるいは増加する。標的分子が伸展する際、通常は分子の固有の放射においてレッド・シフトがあり、それも、任意に配座の変化を検出するのに使用することができる。例えば、Ropson, I. et al. (1997) "Fluorescence spectral changes during the folding of intestinal fatty acid binding protein" Biochem, 36(38):8594-8601を参照のこと。この方法から観察される固有の蛍光の変化は、温度に応じて決まるものとして測定され、熱的性質曲線を構築するのに使用される。上述したように、試験分子(1つまたは複数)の標的分子への結合は、熱的性質曲線をシフトさせ、結合の事象を判定し定量化/定性化するのに使用される。
標的分子の変性/伸展の度合いを測定する別の方法は、標的分子および目的の任意の試験分子とともにマイクロ流体素子に添加された、指標色素または分子の蛍光を監視することによるものである。「蛍光指標色素」または「蛍光指標分子」は、標的分子が伸展もしくは変性したら、あるいは例えば変性によって標的分子の配座が変化する前に標的分子に結合することができ、かつ、例えば指定の波長の光によって励起された後、蛍光エネルギーまたは光を放射する、蛍光分子または化合物(すなわち、蛍光体)を指す。「蛍光指標色素」および「蛍光指標分子」はすべての蛍光体を含む。
本発明の他の実施形態は蛍光偏光を利用する。蛍光偏光(FP)は、目的の分子間のハイブリダイゼーション形成を検出する有用な方法を提供する。この方法は、特に、核酸間のハイブリダイゼーション検出、例えば、一塩基多型(SNP)の監視に適用可能である。
本発明のさらに別の任意の実施形態は、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を使用して、温度に応じて決まる標的分子の配座の変化(および、標的分子と結合することができる試験分子との相互作用)を追跡する。FRETは、ドナー発光体から受容体発光体へのエネルギーの距離依存性の移動に依存する。受容体発光体が励起されたドナー発光体に近接している場合、ドナー発光体の励起は受容体発光体に移動させることができる。これは、ドナー発光体の強度のそれに付随する減少と、受容体発光体の発光強度の増加とを引き起こす。励起移動の効率は、とりわけ2つの発光体間の距離に依存するので、この技術は、配座の変化を検出するときに生じるような、非常に小さな距離を測定するのに使用することができる。この技術は、結合反応、タンパク質間の相互作用、例えば、抗体に結合する目的のタンパク質、ならびに2つの標識付けられた分子の近接度を変更する他の生物学的事象の測定に特に適している。多くの適切な相互作用的な標識が知られている。例えば、蛍光性ラベル、色素、酵素性ラベル、および抗体ラベルはすべて適切である。相互作用的な蛍光性標識の対の例としては、テルビウム・キレートとTRITC(テトラローダミン・イソチオシアネート)、ユーロピウム・クリプテートとアロフィコシアニン、DABCYLとEDANS、および当業者には知られている他の多くのもの(例えば、カルボキシフルオレセイン、ヨードアセトアミドフルオレセイン、およびフルオレセイン・イソチオシアネートなどのドナー蛍光体と、ヨードアセトアミドエオシン、およびテトラメチルローダミンなどの受容体蛍光体)が挙げられる。同様に、2つの熱量測定標識(calorimetric labels)は、第3の色を生じる組合せをもたらし、例えば、青色発光が黄色発光に近接していると緑色発光が観察される。蛍光性の対に関しては、互いを消光することが知られている多数の発光体がある。蛍光消光は、一般的には蛍光発光スペクトルを変えることなく、蛍光量子収率を低減する二分子から成るプロセスである。消光は、一時的な励起状態相互作用(動的消光)によって、あるいは、例えば非蛍光性の基底状態の種を形成することによって得ることができる。自己消光は、ある発光体が別の発光体によって消光されることであり、高濃度、標識付けの密度、または標識の近接が生じたときに起こる傾向がある。FRETは、ある発光体の発光がそれに近接している(発光の観察可能な変化が起こるのに十分な近さで)別の発光体の励起に結合される、距離依存性の励起状態相互作用である。いくつかの励起発光体は相互作用して、変更された発光スペクトルを示す励起状態のダイマー(例えば、ピレンsn−2アシル鎖を有するリン脂質類似体)であるエキシマーを形成する。例えば、Haugland (1996) Handbook of Fluorescent Probes and Research Chemicals Published by Molecular Probes, Inc., Eugene, OR. e.g., at chapter 13、ならびに、Selvin, P. (2000) "The renaissance of fluorescence resonance energy transfer" Nat Struct Biol 7(9):730-734を参照のこと。
本発明の他の任意の実施形態は、温度に応じて決まる標的分子/試験分子の配座変化に続いて、分子ビーコンを使用する。分子ビーコンは、特定の核酸の存在を報告するのに使用することができるプローブ(すなわち、本発明における試験分子)である。それらは、検定されている核酸ハイブリッドを隔離することが望ましくないか、あるいは不可能である状況において特に有用である。
本発明の別の任意の実施形態は、円二色性(CD)を使用して、温度に応じて決まる標的分子/試験分子の配座の変化を追う。CDは、右円偏光光と左円偏光光との間の分子によって吸光度の差を測定する、一種の光吸収分光法である。CDは、ポリペプチドおよびタンパク質の構造に対する感度が非常に高い。CDの適用および技術の概説については、例えば、Woody, R. (1985) "Circular Dichroism of Peptides" in The Peptides 7:14-114, Academic Press、ならびに、Johnson, W. (1990) "Protein Secondary Structure and Circular Dichroism: A Practical Guide" Proteins 7:205-214を参照のこと。分子融解曲線を構築するため、本発明は、任意に、CDを使用して、温度の変化によって引き起こされる標的分子と試験分子の配座の変化を追う。
本発明の任意の実施形態は、誘電性の測定を使用して、分子の配座の変化(例えば配位子・受容体の結合の場合のように、例えば、分子間の相互作用によって生じるもの)を検出および/または追跡することを含む。
本発明の任意の実施形態は、UV吸光度の測定を使用して、核酸分子の変性を検出および/または追跡し、かつ/または核酸の総量を定量化することを含む。一本鎖核酸分子のUV吸光度の値は、二本鎖核酸分子の吸光度の値よりも大きいので、UVは、変性の程度を測定するのに使用することができる。
配座の変化の実際の検出および熱的性質曲線の構築に加えて、本発明のマイクロ流体素子は、多数の任意の変形実施形態、例えば、流体運搬、温度制御、蛍光検出、および加熱も含む。
本発明の実施形態は、温度制御を使用して、融解曲線検定のため、分子の融解または変性を実現する。本発明による総合システムは、温度を制御して、例えば熱循環反応(例えば、PCR、LCR)における反応パラメータを制御し、または試薬の性質を制御することもできる。一般に、かつ本発明の実施形態では、様々な加熱方法を使用して、小型化された流体システム内の温度制御をもたらすことができる。そのような加熱方法としては、ジュール加熱および非ジュール加熱の両方が挙げられる。非ジュール加熱法は、マイクロ流体素子の内部にあって、すなわちマイクロ流体素子の構造に統合するか、または外部にあって、すなわち、マイクロ流体素子とは別個であるが、マイクロ流体システムの一部であることができる。非ジュール加熱は、光子線、流体を通しての伝導性または対流性の加熱および冷却(例えば、液体を素子内のチャネルに流すか、または素子の1つもしくは複数の外面を気体もしくは液体と接触させる)、レーザー、電磁界、電子線、熱電加熱器、炉、抵抗性薄膜、抵抗加熱コイル、ペルチエ加熱器、ならびに熱電加熱器または冷却器によって実施することができる。それらの非ジュール加熱法の多くは、伝導によってマイクロ流体素子と熱エネルギーをやり取りする、マイクロ流体素子の外面と熱接触している熱伝導性材料のブロックである、熱ブロックと併せて使用することができる。熱伝導性材料のブロックは、ブロック内の温度変化によってマイクロ流体チャネル内の温度変化が生じるという点で、マイクロ流体素子の内部にあるマイクロ流体チャネルと「熱接触」している。熱ブロックの温度は、上記に列挙した非ジュール加熱法の1つまたは複数を使用して操作することができる。例えば、熱ブロックの温度は、熱ブロックと熱接触している抵抗性加熱器を流れる電流を制御することによって、またはペルチエ素子を流れる電流を制御することによって操作することができる。マイクロ流体素子と相互作用するシステム内の、またはマイクロ流体素子自体の中のコントローラを使用して、対象の温度を調節することができる。これらの実施例は非限定的であり、他の多数のエネルギー源を利用して、マイクロ流体素子内の流体温度を上げることができる。
様々な制御器具類は、任意に、例えば、圧力に基づく、もしくは動電学的制御によって、本発明の素子内の流動物質および/または物質の運搬および方向を制御するため、上述のマイクロ流体素子と併せて利用される。
一般に、マイクロ流体素子内の検出システムは、例えば、光センサ、温度センサ、圧力センサ、pHセンサ、導電率センサなどを含む。これらのタイプのセンサはそれぞれ、本明細書に記載のマイクロ流体システムに容易に組み込まれる。これらのシステムでは、そのような検出器は、マイクロ流体素子、または素子の1つもしくは複数のマイクロチャネル、マイクロチャンバ、または導管の中に、あるいはそれらに隣接して置かれるので、検出器は、素子、チャネル、またはチャンバと感覚的に連通している。特定の要素または領域に「近接する」という語句は、本明細書で使用されるとき、一般に、検出器が対象とする、マイクロ流体素子、マイクロ流体素子の一部、またはマイクロ流体素子の一部の内容物の性質を、検出器が検出することができるような検出器の位置を指す。例えば、マイクロスケールのチャネルと感覚的に連通しているpHセンサは、そのチャネル内に配置された流体のpHを判定することができる。同様に、マイクロ流体素子の本体と感覚的に連通している温度センサは、素子自体の温度を判定することができる。
上述したように、流体方向システムおよび/または検出システムのどちらかもしくは両方は、プログラムされたもしくはユーザ入力の命令に従ってそれらの機器の動作を命令し、それらの機器からデータおよび情報を受け取り、かつ、この情報を解釈し、操作し、ユーザに報告するように機能する、適切にプログラムされたプロセッサまたはコンピュータに連結される。そのため、コンピュータは、一般的に、これらの機器の一方または両方(例えば、必要に応じて、アナログ・デジタルもしくはデジタル・アナログ変換器を含む)に適切に連結される。
図1のパネルA、B、およびC、ならびに図2は、本明細書の方法を実行するのに任意に使用される、統合システムの実施例に関する追加の詳細を提供する。本発明による統合システムは、機器200とインターフェース接続された、カートリッジまたはカセットなどの交換可能な構成要素である、マイクロ流体素子100を含む。図1および2に示されるマイクロ流体素子は、主要チャネル104が中に配置された本体構造102を含む。サンプルまたは成分の混合物は、任意に、例えば、レザーバ114(もしくはシステム内の別の地点)において真空を印加することにより、または適切な圧力勾配を適用することにより、ピペッター120からレザーバ114に向かって流される。したがって、ピペッターは流体流路における最も上流の地点を表し、レザーバ114は流体流路における最も下流の地点を表す。あるいは、真空は、例えばレザーバ108および112において、またはピペッター・チャネル120を介して印加される。本明細書に記載されるような、緩衝液、基質溶液、酵素溶液、試験分子、蛍光指標色素もしくは分子などの添加物質は、任意に、ウェル、例えば108または112から、主要チャネル104内へと流される。これらのウェルからの流れは、任意に、流体圧力を調整することにより、または記載されるような動電学的アプローチにより(あるいはそれらの両方により)行われる。流体が、例えばレザーバ108から、主要チャネル104に添加されると、流量が増加する。流量は、任意に、流体の一部を主要チャネル104から流れ低減チャネル106または110内へと流すことによって低減される。図1に示されるチャネルの配置は、本発明にて使用するのに適切かつ利用可能である多数のうち、1つの可能な配置に過ぎない。追加の代替例は、例えば、本明細書に記載のマイクロ流体エレメント、例えば流れ低減チャネルを、本明細書にて参照される特許および特許出願に記載されている他のマイクロ流体素子と組み合わせることによって考案することができる。
本発明は、本発明の結合検定を実施するキットも提供する。具体的には、これらのキットは、一般的に、本発明の検定を行うマイクロ流体素子、システム、モジュール、およびワークステーションを含む。キットは、任意に、ロボット要素(例えば、追跡ロボット、ロボット電機子など)、プレート処理素子、流体処理素子、およびコンピュータ(例えば、入力装置、モニタ、CPUなどを含む)などを含むがそれらに限定されない、本発明の多重モジュール・ワークステーションの組立ておよび/または作業用の追加の構成要素を含有する。
1つもしくは複数の焦点を当てた細胞または粒子を含む生化学系に対する、複数の試験化合物それぞれの効果を試験するため、少なくとも第1の基質を含み、第1のチャネルおよび第1のチャネルと交差する第2のチャネルを有し、チャネルの少なくとも1つが、0.1〜500μmの範囲の少なくとも1つの断面積を有する、マイクロ流体システムを使用すること。
生化学系が前記チャネルの1つを実質的に継続的に貫流して、例えば、複数の試験化合物の連続的な試験を行う、本明細書に記載されるようなマイクロ流体システムを使用すること。
マイクロチャネル内の反応を調整するため、本明細書に記載されるようなマイクロ流体素子を使用すること。
チャネル内の流れを調整または達成するため、本明細書に記載されるようなマイクロ流体素子内への動電学的注入を使用すること。
例えば素子のチャネル内の物質の流れを調整、集束、または達成するため、本明細書に記載されるようなマイクロ流体素子内の、灯芯、動電学的注入、および圧力に基づく流れエレメントの組合せを使用すること。
本明細書に記載のマイクロ流体システムまたは気質のいずれか1つを利用する検定。
Claims (12)
- Tmが既知である分子を含む流体をチャネルに貫流させることと、
前記チャネル内の温度と相関する熱ブロックの温度を変化させることと、
前記熱ブロックの温度に応じて決まる前記分子の検出可能な性質の値を測定することによって、前記分子の熱的性質曲線を生成することと、
前記分子のTmに対応する前記熱的性質曲線の地点における前記検出可能な性質および前記熱ブロックの温度を決定することと
任意の時間の前記チャネルの温度を、熱ブロックの温度と、チャネル内の前記分子の既知のTmと熱ブロックの温度の間の温度補正に基づいて、決定することと
を含む、マイクロ流体素子のチャネル内の基準温度に対応する物理的パラメータの値、すなわち前記熱ブロックの温度を決定する、方法であって、前記熱ブロックは前記チャネル外でチャネルと熱接触している、前記方法。 - Tmが既知である前記分子が既知のシーケンスを有する核酸である、請求項1に記載の方法。
- 前記核酸がDNAである、請求項2に記載の方法。
- 前記流体が、前記チャネルに適用される圧力差によって前記チャネルを貫流するように誘導される、請求項1に記載の方法。
- 前記検出可能な性質が蛍光を含む、請求項1に記載の方法。
- 前記蛍光がFRETまたは分子ビーコンによって発生する、請求項5の方法。
- 前記蛍光が蛍光色素によって発生し、前記蛍光色素によって発生する蛍光の量が、Tmが既知である前記分子の熱変性の程度を示す、請求項5に記載の方法。
- 前記蛍光色素が挿入色素である、請求項7に記載の方法。
- 前記蛍光色素が臭化エチジウムである、請求項7に記載の方法。
- 前記蛍光色素が副溝結合色素である、請求項7に記載の方法。
- 前記蛍光色素がサイバー(登録商標)・グリーン色素である、請求項10に記載の方法。
- 前記分子が、ビオチン、ビオチン−4−フルオレセイン、フルオレセイン−ビオチン、アビジン、ストレプトアビジン、およびニュートラアビジンの群から選択される、請求項1に記載の方法。
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US11/352,452 | 2006-02-09 | ||
US11/352,452 US8900811B2 (en) | 2000-11-16 | 2006-02-09 | Method and apparatus for generating thermal melting curves in a microfluidic device |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008554429A Division JP5517456B2 (ja) | 2006-02-09 | 2007-02-09 | マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2013051969A JP2013051969A (ja) | 2013-03-21 |
JP5926166B2 true JP5926166B2 (ja) | 2016-05-25 |
Family
ID=38324009
Family Applications (4)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008554429A Active JP5517456B2 (ja) | 2006-02-09 | 2007-02-09 | マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 |
JP2012251788A Active JP5926166B2 (ja) | 2006-02-09 | 2012-11-16 | マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 |
JP2013271633A Active JP6063374B2 (ja) | 2006-02-09 | 2013-12-27 | マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 |
JP2016182726A Pending JP2016208994A (ja) | 2006-02-09 | 2016-09-20 | マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2008554429A Active JP5517456B2 (ja) | 2006-02-09 | 2007-02-09 | マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 |
Family Applications After (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2013271633A Active JP6063374B2 (ja) | 2006-02-09 | 2013-12-27 | マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 |
JP2016182726A Pending JP2016208994A (ja) | 2006-02-09 | 2016-09-20 | マイクロ流体素子内の熱融解曲線を生成する方法および装置 |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (5) | US8900811B2 (ja) |
EP (2) | EP1987163A2 (ja) |
JP (4) | JP5517456B2 (ja) |
CN (2) | CN101426933A (ja) |
WO (1) | WO2007092643A2 (ja) |
Families Citing this family (140)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6048734A (en) | 1995-09-15 | 2000-04-11 | The Regents Of The University Of Michigan | Thermal microvalves in a fluid flow method |
US8900811B2 (en) * | 2000-11-16 | 2014-12-02 | Caliper Life Sciences, Inc. | Method and apparatus for generating thermal melting curves in a microfluidic device |
US6692700B2 (en) | 2001-02-14 | 2004-02-17 | Handylab, Inc. | Heat-reduction methods and systems related to microfluidic devices |
US7323140B2 (en) | 2001-03-28 | 2008-01-29 | Handylab, Inc. | Moving microdroplets in a microfluidic device |
US7829025B2 (en) * | 2001-03-28 | 2010-11-09 | Venture Lending & Leasing Iv, Inc. | Systems and methods for thermal actuation of microfluidic devices |
WO2004094986A2 (en) * | 2003-04-16 | 2004-11-04 | Handylab, Inc. | System and method for electrochemical detection of biological compounds |
EP3718635A1 (en) | 2003-07-31 | 2020-10-07 | Handylab, Inc. | Processing particle-containing samples |
US8852862B2 (en) | 2004-05-03 | 2014-10-07 | Handylab, Inc. | Method for processing polynucleotide-containing samples |
CA3198754A1 (en) | 2004-05-03 | 2005-11-17 | Handylab, Inc. | A microfluidic device and methods for processing polynucleotide-containing samples |
US11806718B2 (en) | 2006-03-24 | 2023-11-07 | Handylab, Inc. | Fluorescence detector for microfluidic diagnostic system |
US10900066B2 (en) | 2006-03-24 | 2021-01-26 | Handylab, Inc. | Microfluidic system for amplifying and detecting polynucleotides in parallel |
ES2587007T3 (es) | 2006-03-24 | 2016-10-20 | Handylab, Inc. | Sistema integrado para procesar muestras microfluídicas, y métodos de uso del mismo |
US7998708B2 (en) * | 2006-03-24 | 2011-08-16 | Handylab, Inc. | Microfluidic system for amplifying and detecting polynucleotides in parallel |
US8088616B2 (en) | 2006-03-24 | 2012-01-03 | Handylab, Inc. | Heater unit for microfluidic diagnostic system |
US8883490B2 (en) | 2006-03-24 | 2014-11-11 | Handylab, Inc. | Fluorescence detector for microfluidic diagnostic system |
US8778637B2 (en) * | 2006-03-28 | 2014-07-15 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Method and apparatus for applying continuous flow and uniform temperature to generate thermal melting curves in a microfluidic device |
US8637436B2 (en) | 2006-08-24 | 2014-01-28 | California Institute Of Technology | Integrated semiconductor bioarray |
US11001881B2 (en) | 2006-08-24 | 2021-05-11 | California Institute Of Technology | Methods for detecting analytes |
EP2489745B1 (en) | 2006-06-05 | 2017-01-11 | California Institute Of Technology | Real time micro arrays |
US7629124B2 (en) * | 2006-06-30 | 2009-12-08 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Real-time PCR in micro-channels |
US11525156B2 (en) | 2006-07-28 | 2022-12-13 | California Institute Of Technology | Multiplex Q-PCR arrays |
WO2008014485A2 (en) | 2006-07-28 | 2008-01-31 | California Institute Of Technology | Multiplex q-pcr arrays |
US11560588B2 (en) | 2006-08-24 | 2023-01-24 | California Institute Of Technology | Multiplex Q-PCR arrays |
US8709787B2 (en) | 2006-11-14 | 2014-04-29 | Handylab, Inc. | Microfluidic cartridge and method of using same |
CN101583724A (zh) * | 2006-11-29 | 2009-11-18 | 佳能美国生命科学公司 | 用于数字多重pcr测定的装置和方法 |
US9114398B2 (en) | 2006-11-29 | 2015-08-25 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Device and method for digital multiplex PCR assays |
EP2100254A2 (en) | 2006-11-30 | 2009-09-16 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Systems and methods for monitoring the amplification and dissociation behavior of dna molecules |
WO2008091568A2 (en) * | 2007-01-23 | 2008-07-31 | Dtherapeutics, Llc | Applications of scaling laws of tree structures |
US9591994B2 (en) | 2007-01-23 | 2017-03-14 | Dtherapeutics, Llc | Systems and methods to obtain a myocardial mass index indicative of an at-risk myocardial region |
JP2010530057A (ja) * | 2007-03-30 | 2010-09-02 | 富士フイルム株式会社 | 温調方法 |
US20100108514A1 (en) * | 2007-03-30 | 2010-05-06 | Fujifilm Coporation | Method of controlling temperature |
US20100098584A1 (en) * | 2007-03-30 | 2010-04-22 | Fujifilm Corporation | Clinical analysis apparatus |
EP3222733B1 (en) | 2007-07-13 | 2021-04-07 | Handylab, Inc. | Polynucleotide capture materials, and methods of using same |
US20090136385A1 (en) * | 2007-07-13 | 2009-05-28 | Handylab, Inc. | Reagent Tube |
US9618139B2 (en) | 2007-07-13 | 2017-04-11 | Handylab, Inc. | Integrated heater and magnetic separator |
US8287820B2 (en) | 2007-07-13 | 2012-10-16 | Handylab, Inc. | Automated pipetting apparatus having a combined liquid pump and pipette head system |
US8133671B2 (en) | 2007-07-13 | 2012-03-13 | Handylab, Inc. | Integrated apparatus for performing nucleic acid extraction and diagnostic testing on multiple biological samples |
US8182763B2 (en) | 2007-07-13 | 2012-05-22 | Handylab, Inc. | Rack for sample tubes and reagent holders |
US9186677B2 (en) | 2007-07-13 | 2015-11-17 | Handylab, Inc. | Integrated apparatus for performing nucleic acid extraction and diagnostic testing on multiple biological samples |
USD621060S1 (en) | 2008-07-14 | 2010-08-03 | Handylab, Inc. | Microfluidic cartridge |
US8105783B2 (en) | 2007-07-13 | 2012-01-31 | Handylab, Inc. | Microfluidic cartridge |
US8380457B2 (en) | 2007-08-29 | 2013-02-19 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Microfluidic devices with integrated resistive heater electrodes including systems and methods for controlling and measuring the temperatures of such heater electrodes |
JP5085444B2 (ja) * | 2007-09-19 | 2012-11-28 | 株式会社日立製作所 | 微小試料加熱プローブ、および微小試料加熱プローブを用いた分析装置 |
US8180572B2 (en) * | 2007-10-25 | 2012-05-15 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | High-resolution melting analysis |
US8538733B2 (en) * | 2008-01-25 | 2013-09-17 | Life Technologies Corporation | Methods for the analysis of dissociation melt curve data |
EP2247710A4 (en) * | 2008-03-03 | 2016-04-20 | Heatflow Technologies Inc | THERMAL FLOW POLYMERASE CHAIN REACTION SYSTEMS AND METHOD |
CN102143695A (zh) | 2008-06-13 | 2011-08-03 | 耐克国际有限公司 | 具有传感器系统的鞋 |
US9549585B2 (en) | 2008-06-13 | 2017-01-24 | Nike, Inc. | Footwear having sensor system |
US10070680B2 (en) | 2008-06-13 | 2018-09-11 | Nike, Inc. | Footwear having sensor system |
US9393566B2 (en) * | 2008-06-23 | 2016-07-19 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | System and method for temperature referencing for melt curve data collection |
USD618820S1 (en) | 2008-07-11 | 2010-06-29 | Handylab, Inc. | Reagent holder |
US20100009351A1 (en) * | 2008-07-11 | 2010-01-14 | Handylab, Inc. | Polynucleotide Capture Materials, and Method of Using Same |
USD787087S1 (en) | 2008-07-14 | 2017-05-16 | Handylab, Inc. | Housing |
CA2733186A1 (en) * | 2008-08-08 | 2010-02-11 | Smiths Detection Inc. | Detection algorithm for pcr assay |
US7943320B2 (en) * | 2008-12-30 | 2011-05-17 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Unsymmetrical cyanine dyes for high resolution nucleic acid melting analysis |
US10066977B2 (en) * | 2009-01-26 | 2018-09-04 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Microfluidic flow monitoring |
US9404152B2 (en) | 2009-01-26 | 2016-08-02 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Microfluidic flow monitoring |
US9542526B2 (en) * | 2009-03-10 | 2017-01-10 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Method and system for temperature correction in thermal melt analysis |
WO2010120800A1 (en) * | 2009-04-13 | 2010-10-21 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | A rapid method of pattern recognition, machine learning, and automated genotype classification through correlation analysis of dynamic signals |
EP2437887B1 (en) | 2009-06-04 | 2016-05-11 | Lockheed Martin Corporation | Multiple-sample microfluidic chip for dna analysis |
GB0910759D0 (en) * | 2009-06-22 | 2009-08-05 | Ucl Business Plc | Microfluidic device |
JP5832998B2 (ja) * | 2009-06-29 | 2015-12-16 | キヤノン ユー.エス. ライフ サイエンシズ, インコーポレイテッドCanon U.S. Life Sciences, Inc. | 熱制御のためのマイクロ流体システム及び方法 |
WO2011031234A1 (en) * | 2009-09-08 | 2011-03-17 | Agency For Science, Technology And Research | Method and system for thermal melt analysis |
FR2950358B1 (fr) * | 2009-09-18 | 2015-09-11 | Biomerieux Sa | Dispositif d'amplification d'acides nucleiques simplifie et son procede de mise en oeuvre |
US9102979B2 (en) * | 2010-02-23 | 2015-08-11 | Rheonix, Inc. | Self-contained biological assay apparatus, methods, and applications |
US9963739B2 (en) | 2010-05-21 | 2018-05-08 | Hewlett-Packard Development Company, L.P. | Polymerase chain reaction systems |
EP2571696B1 (en) | 2010-05-21 | 2019-08-07 | Hewlett-Packard Development Company, L.P. | Fluid ejection device with circulation pump |
US9395050B2 (en) | 2010-05-21 | 2016-07-19 | Hewlett-Packard Development Company, L.P. | Microfluidic systems and networks |
US10132303B2 (en) | 2010-05-21 | 2018-11-20 | Hewlett-Packard Development Company, L.P. | Generating fluid flow in a fluidic network |
WO2011146069A1 (en) | 2010-05-21 | 2011-11-24 | Hewlett-Packard Development Company, L.P. | Fluid ejection device including recirculation system |
WO2011153385A2 (en) * | 2010-06-02 | 2011-12-08 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Methods and systems for sequential determination of genetic mutations and/or variants |
WO2012006148A2 (en) | 2010-06-29 | 2012-01-12 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | System and method for genotype analysis and enhanced monte carlo simulation method to estimate misclassification rate in automated genotyping |
CA2808118C (en) | 2010-07-22 | 2016-04-19 | Kieran Curran | Composite liquid cells |
US11022573B2 (en) | 2010-08-31 | 2021-06-01 | Canon U.S.A., Inc. | Positive controls |
EP2611541A4 (en) * | 2010-08-31 | 2016-11-02 | Canon Us Life Sciences Inc | METHOD, DEVICES AND SYSTEMS FOR MIXING FLUIDS AND CHIP INTERFACE THEREFOR |
US9114399B2 (en) | 2010-08-31 | 2015-08-25 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | System and method for serial processing of multiple nucleic acid assays |
EP2612120B1 (en) | 2010-08-31 | 2019-04-10 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Thermal calibration |
EP2612123B1 (en) * | 2010-08-31 | 2016-08-10 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Compound calibrator for thermal sensors |
WO2012051529A1 (en) | 2010-10-15 | 2012-04-19 | Lockheed Martin Corporation | Micro fluidic optic design |
WO2012064956A1 (en) | 2010-11-10 | 2012-05-18 | Nike International Ltd. | Systems and methods for time-based athletic activity measurement and display |
JP5813787B2 (ja) | 2011-02-17 | 2015-11-17 | ナイキ イノベイト シーブイ | ワークアウトセッション中のユーザーパフォーマンス指標の追跡 |
KR101618841B1 (ko) | 2011-02-17 | 2016-05-10 | 나이키 이노베이트 씨.브이. | 센서 시스템을 가지는 신발류 |
JP5841616B2 (ja) | 2011-02-17 | 2016-01-13 | ナイキ イノベイト セー. フェー. | センサーシステムを有する履物 |
EP3159697B1 (en) | 2011-04-15 | 2019-12-25 | Becton, Dickinson and Company | Scanning real-time microfluidic thermo-cycler |
WO2013101295A2 (en) * | 2011-05-17 | 2013-07-04 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Systems and methods using external heater systems in microfluidic devices |
US9207690B2 (en) | 2011-09-23 | 2015-12-08 | Analogic Corporation | Thermal cycling |
ES2825905T3 (es) | 2011-09-30 | 2021-05-17 | Becton Dickinson Co | Tira reactiva unificada |
USD692162S1 (en) | 2011-09-30 | 2013-10-22 | Becton, Dickinson And Company | Single piece reagent holder |
AU2012322674B9 (en) * | 2011-10-14 | 2015-10-01 | Becton, Dickinson And Company | Square wave thermal cycling |
EP2773892B1 (en) | 2011-11-04 | 2020-10-07 | Handylab, Inc. | Polynucleotide sample preparation device |
US9447458B2 (en) | 2011-11-16 | 2016-09-20 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Detection of neighboring variants |
BR112014018995B1 (pt) | 2012-02-03 | 2021-01-19 | Becton, Dickson And Company | sistemas para executar ensaio automatizado |
US11071344B2 (en) | 2012-02-22 | 2021-07-27 | Nike, Inc. | Motorized shoe with gesture control |
US9322054B2 (en) | 2012-02-22 | 2016-04-26 | Lockheed Martin Corporation | Microfluidic cartridge |
US11684111B2 (en) | 2012-02-22 | 2023-06-27 | Nike, Inc. | Motorized shoe with gesture control |
US20130213144A1 (en) | 2012-02-22 | 2013-08-22 | Nike, Inc. | Footwear Having Sensor System |
US20130213147A1 (en) | 2012-02-22 | 2013-08-22 | Nike, Inc. | Footwear Having Sensor System |
US20150174043A1 (en) * | 2012-06-21 | 2015-06-25 | L'oreal | Water-releasing cosmetic composition |
JP2014030373A (ja) * | 2012-08-02 | 2014-02-20 | Canon Inc | ホモ接合体とヘテロ接合体の判別方法 |
US9850549B2 (en) * | 2012-10-09 | 2017-12-26 | University Of Utah Research Foundation | Monitoring temperature with fluorescence |
AU2013350823B2 (en) | 2012-11-27 | 2017-11-16 | Gencell Biosystems Ltd. | Handling liquid samples |
US9743861B2 (en) | 2013-02-01 | 2017-08-29 | Nike, Inc. | System and method for analyzing athletic activity |
US10926133B2 (en) | 2013-02-01 | 2021-02-23 | Nike, Inc. | System and method for analyzing athletic activity |
US11006690B2 (en) | 2013-02-01 | 2021-05-18 | Nike, Inc. | System and method for analyzing athletic activity |
US10197519B2 (en) | 2013-03-15 | 2019-02-05 | H2Scan Corporation | Gas sensing systems and methods |
US9279734B2 (en) | 2013-03-15 | 2016-03-08 | Nike, Inc. | System and method for analyzing athletic activity |
JP6055922B2 (ja) * | 2013-08-08 | 2016-12-27 | パナソニック株式会社 | マイクロ流体デバイス |
US11066696B2 (en) * | 2013-08-30 | 2021-07-20 | University Of Utah Research Foundation | Quantum method for fluorescence background removal in DNA melting analysis |
CN106029885A (zh) * | 2014-02-10 | 2016-10-12 | 基因细胞生物系统有限公司 | 复合液体池(clc)介导的核酸文库制备装置及其使用方法 |
CA2949984C (en) | 2014-05-27 | 2021-10-19 | Illumina, Inc. | Systems and methods for biochemical analysis including a base instrument and a removable cartridge |
CN106662595B (zh) | 2014-06-30 | 2019-10-15 | 普和希控股公司 | 试样分析用基板、试样分析装置、试样分析系统及从含磁性颗粒的液体中去除液体的方法 |
JP6588908B2 (ja) | 2014-06-30 | 2019-10-09 | Phcホールディングス株式会社 | 試料分析用基板、試料分析装置、試料分析システムおよび試料分析システム用プログラム |
JP6548645B2 (ja) | 2014-06-30 | 2019-07-24 | Phcホールディングス株式会社 | 試料分析用基板および試料分析装置 |
JP6588910B2 (ja) | 2014-06-30 | 2019-10-09 | Phcホールディングス株式会社 | 試料分析用基板、試料分析装置、試料分析システムおよび試料分析システム用プログラム |
DE102014221734A1 (de) * | 2014-10-24 | 2016-04-28 | Fraunhofer-Gesellschaft zur Förderung der angewandten Forschung e.V. | Messvorrichtung und System zur Schmelzkurvenanalyse eines DNA Microarrays, sowie Verwendung eines Fluoreszenzdetektorarrays zur Analyse |
US10539583B2 (en) | 2014-12-12 | 2020-01-21 | Phc Holdings Corporation | Substrate for sample analysis, sample analysis device, sample analysis system, and program for sample analysis system |
CN107209766B (zh) * | 2014-12-15 | 2021-04-06 | 卢米尼克斯股份有限公司 | 详细试验协议规范 |
US9708647B2 (en) * | 2015-03-23 | 2017-07-18 | Insilixa, Inc. | Multiplexed analysis of nucleic acid hybridization thermodynamics using integrated arrays |
WO2017015468A1 (en) * | 2015-07-21 | 2017-01-26 | The University Of Florida Research Foundation, Inc. | Microfluidic trap |
US10028353B2 (en) * | 2015-08-29 | 2018-07-17 | Taizhou Heystar Electronic Technology Co., Ltd | LED lamp string having selectable light emitting mode |
US9499861B1 (en) | 2015-09-10 | 2016-11-22 | Insilixa, Inc. | Methods and systems for multiplex quantitative nucleic acid amplification |
WO2017059049A1 (en) * | 2015-09-29 | 2017-04-06 | Life Technologies Corporation | Systems and methods for performing digital pcr |
CN105330419A (zh) * | 2015-11-12 | 2016-02-17 | 成都九十度工业产品设计有限公司 | 一种缓释微量元素螯合剂的智能制备方法 |
WO2017155858A1 (en) | 2016-03-07 | 2017-09-14 | Insilixa, Inc. | Nucleic acid sequence identification using solid-phase cyclic single base extension |
EP3491116B1 (en) * | 2016-07-29 | 2022-09-21 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | High speed nucleic acid melting analysis |
US10409227B2 (en) * | 2016-08-03 | 2019-09-10 | Texas Instruments Incorporated | Temperature gradient in microfabricated sensor cavity |
US20180088049A1 (en) * | 2016-09-26 | 2018-03-29 | Azure Biosystems, Inc. | Methods and devices for photometric analysis |
EP3541314A4 (en) * | 2016-11-16 | 2020-06-17 | University of Washington | SYSTEMS AND METHODS FOR CYCLIC FLUORESCENCE IMAGING |
EP3357578B1 (en) | 2017-02-06 | 2021-01-06 | Sharp Life Science (EU) Limited | Temperature control system for microfluidic device |
WO2019178121A1 (en) * | 2018-03-12 | 2019-09-19 | The Penn State Research Foundation | Method and apparatus for temperature gradient microfluidics |
GB201812192D0 (en) | 2018-07-26 | 2018-09-12 | Ttp Plc | Variable temperature reactor, heater and control circuit for the same |
DE102018213587A1 (de) * | 2018-08-13 | 2020-02-13 | Robert Bosch Gmbh | Verfahren zum Bestimmen einer Spezifität einer Echtzeit-Polymerase-Kettenreaktion mit einer Schmelzkurvenanalyse |
US11298701B2 (en) | 2018-11-26 | 2022-04-12 | King Instrumentation Technologies | Microtiter plate mixing control system |
CN109698097A (zh) * | 2018-12-29 | 2019-04-30 | 宁波市鄞州顺和自动化设备有限公司 | 一种继电器透气孔热熔密封自动机 |
KR102009505B1 (ko) * | 2019-01-17 | 2019-08-12 | 주식회사 엘지화학 | 유전자 증폭 모듈 |
EP3937780A4 (en) | 2019-03-14 | 2022-12-07 | InSilixa, Inc. | METHODS AND SYSTEMS FOR TIMED FLUORESCENCE-BASED DETECTION |
US11235325B2 (en) | 2019-11-11 | 2022-02-01 | Sharp Life Science (Eu) Limited | Microfluidic system including remote heat spreader |
CN111495452B (zh) * | 2020-05-12 | 2023-07-21 | 河北工业大学 | 一种微型可控温度梯度装置 |
CN113967487B (zh) * | 2021-10-11 | 2022-12-02 | 华中科技大学 | 一种喷嘴、液滴光热操控系统及其应用 |
WO2024091598A1 (en) * | 2022-10-26 | 2024-05-02 | Esbiolab, Llc | 3-dimensional robotic sequencing device |
Family Cites Families (51)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5277566A (en) | 1988-10-19 | 1994-01-11 | Hoechst Aktiengesellschaft | Extrusion impregnating device |
ATE125605T1 (de) | 1990-08-31 | 1995-08-15 | Westonbridge Int Ltd | Ventil mit positionsdetektor und damit versehener mikropumpe. |
DE4234086A1 (de) | 1992-02-05 | 1993-08-12 | Diagen Inst Molekularbio | Verfahren zur bestimmung von in vitro amplifizierten nukleinsaeuresequenzen |
US5498392A (en) | 1992-05-01 | 1996-03-12 | Trustees Of The University Of Pennsylvania | Mesoscale polynucleotide amplification device and method |
US5637469A (en) | 1992-05-01 | 1997-06-10 | Trustees Of The University Of Pennsylvania | Methods and apparatus for the detection of an analyte utilizing mesoscale flow systems |
DE4220077A1 (de) | 1992-06-19 | 1993-12-23 | Bosch Gmbh Robert | Mikropumpe |
US5639423A (en) | 1992-08-31 | 1997-06-17 | The Regents Of The University Of Calfornia | Microfabricated reactor |
JP3368011B2 (ja) | 1993-10-04 | 2003-01-20 | キヤノン株式会社 | 核酸検出法 |
US5600690A (en) | 1994-02-02 | 1997-02-04 | Mpr Associates, Inc. | Method and apparatus for repairing boiling water reactor shrouds utilizing tie-rods and braces |
US6001229A (en) | 1994-08-01 | 1999-12-14 | Lockheed Martin Energy Systems, Inc. | Apparatus and method for performing microfluidic manipulations for chemical analysis |
EP0711840B1 (en) | 1994-11-09 | 2002-06-19 | Hitachi, Ltd. | DNA analyzing method and device therefor |
US5856174A (en) | 1995-06-29 | 1999-01-05 | Affymetrix, Inc. | Integrated nucleic acid diagnostic device |
MX9701596A (es) | 1995-06-30 | 1997-05-31 | Incyte Pharma Inc | Un homologo de quinasa de proteina activada por mitogeno humana. |
US6132580A (en) | 1995-09-28 | 2000-10-17 | The Regents Of The University Of California | Miniature reaction chamber and devices incorporating same |
US20110251084A1 (en) * | 1996-04-02 | 2011-10-13 | Colin Brenan | System for the Detection of a Biological Pathogen and Use Thereof |
US6399023B1 (en) | 1996-04-16 | 2002-06-04 | Caliper Technologies Corp. | Analytical system and method |
US5942443A (en) | 1996-06-28 | 1999-08-24 | Caliper Technologies Corporation | High throughput screening assay systems in microscale fluidic devices |
US5885470A (en) | 1997-04-14 | 1999-03-23 | Caliper Technologies Corporation | Controlled fluid transport in microfabricated polymeric substrates |
ATE295427T1 (de) | 1996-06-04 | 2005-05-15 | Univ Utah Res Found | Überwachung der hybridisierung während pcr |
US5800690A (en) | 1996-07-03 | 1998-09-01 | Caliper Technologies Corporation | Variable control of electroosmotic and/or electrophoretic forces within a fluid-containing structure via electrical forces |
WO1998045481A1 (en) | 1997-04-04 | 1998-10-15 | Caliper Technologies Corporation | Closed-loop biochemical analyzers |
US6391622B1 (en) * | 1997-04-04 | 2002-05-21 | Caliper Technologies Corp. | Closed-loop biochemical analyzers |
US6235471B1 (en) | 1997-04-04 | 2001-05-22 | Caliper Technologies Corp. | Closed-loop biochemical analyzers |
JP4171075B2 (ja) | 1997-04-25 | 2008-10-22 | カリパー・ライフ・サイエンシズ・インコーポレーテッド | 改良されたチャネル幾何学的形状を組み込む微小流体装置 |
NZ500648A (en) | 1997-04-28 | 2001-08-31 | Ecoflex Au Pty Ltd | Retaining wall system comprised of tyres and reinforcing grid of linked strips of conveyor belt or tyres |
CA2300203A1 (en) * | 1997-09-02 | 1999-03-11 | Caliper Technologies Corporation | Microfluidic system with electrofluidic and electrothermal controls |
US5965410A (en) | 1997-09-02 | 1999-10-12 | Caliper Technologies Corp. | Electrical current for controlling fluid parameters in microchannels |
US6395480B1 (en) | 1999-02-01 | 2002-05-28 | Signature Bioscience, Inc. | Computer program and database structure for detecting molecular binding events |
JP2002502028A (ja) | 1998-02-02 | 2002-01-22 | シグネチャー バイオサイエンス,インコーポレイティド | 分子結合現象を検出するための方法及び装置 |
US6140054A (en) | 1998-09-30 | 2000-10-31 | University Of Utah Research Foundation | Multiplex genotyping using fluorescent hybridization probes |
US6416642B1 (en) | 1999-01-21 | 2002-07-09 | Caliper Technologies Corp. | Method and apparatus for continuous liquid flow in microscale channels using pressure injection, wicking, and electrokinetic injection |
US20020019059A1 (en) | 1999-01-28 | 2002-02-14 | Calvin Y.H. Chow | Devices, systems and methods for time domain multiplexing of reagents |
US6303343B1 (en) | 1999-04-06 | 2001-10-16 | Caliper Technologies Corp. | Inefficient fast PCR |
US6506609B1 (en) | 1999-05-17 | 2003-01-14 | Caliper Technologies Corp. | Focusing of microparticles in microfluidic systems |
EP1203096B1 (en) * | 1999-07-28 | 2008-12-31 | Merck Serono Biodevelopment | Continuous flow micro device in which local temperature cycles act on a flowing sample |
US6977145B2 (en) | 1999-07-28 | 2005-12-20 | Serono Genetics Institute S.A. | Method for carrying out a biochemical protocol in continuous flow in a microreactor |
US6472156B1 (en) | 1999-08-30 | 2002-10-29 | The University Of Utah | Homogeneous multiplex hybridization analysis by color and Tm |
US20020119442A1 (en) | 1999-11-12 | 2002-08-29 | Dunlop Charles L.M. | Approaches to identify genetic traits |
EP1238673A4 (en) | 1999-12-14 | 2005-03-09 | Asahi Kasei Pharma Corp | GRANULES OF SULFATE OF COLISTINE |
US6358387B1 (en) * | 2000-03-27 | 2002-03-19 | Caliper Technologies Corporation | Ultra high throughput microfluidic analytical systems and methods |
EP1317569B1 (en) | 2000-09-14 | 2009-11-18 | Caliper Life Sciences, Inc. | Microfluidic devices and methods for performing temperature mediated reactions |
US8900811B2 (en) * | 2000-11-16 | 2014-12-02 | Caliper Life Sciences, Inc. | Method and apparatus for generating thermal melting curves in a microfluidic device |
US20050202470A1 (en) | 2000-11-16 | 2005-09-15 | Caliper Life Sciences, Inc. | Binding assays using molecular melt curves |
EP1384022A4 (en) * | 2001-04-06 | 2004-08-04 | California Inst Of Techn | AMPLIFICATION OF NUCLEIC ACID USING MICROFLUIDIC DEVICES |
US20020197630A1 (en) | 2001-04-12 | 2002-12-26 | Knapp Michael R. | Systems and methods for high throughput genetic analysis |
WO2003037514A2 (en) * | 2001-10-30 | 2003-05-08 | The Texas A & M University System | Method and apparatus for temperature gradient microfluidics |
US7785776B2 (en) | 2002-05-13 | 2010-08-31 | Idaho Technology, Inc. | Genotyping by amplicon melting curve analysis |
US20050042639A1 (en) | 2002-12-20 | 2005-02-24 | Caliper Life Sciences, Inc. | Single molecule amplification and detection of DNA length |
AU2003209572A1 (en) | 2003-03-08 | 2004-09-28 | Ecole Polytechnique Federale De Lausanne (Epfl) | Magnetic bead manipulation and transport device |
US7629124B2 (en) * | 2006-06-30 | 2009-12-08 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Real-time PCR in micro-channels |
US9114398B2 (en) * | 2006-11-29 | 2015-08-25 | Canon U.S. Life Sciences, Inc. | Device and method for digital multiplex PCR assays |
-
2006
- 2006-02-09 US US11/352,452 patent/US8900811B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2007
- 2007-02-09 JP JP2008554429A patent/JP5517456B2/ja active Active
- 2007-02-09 CN CNA2007800127617A patent/CN101426933A/zh active Pending
- 2007-02-09 EP EP07763208A patent/EP1987163A2/en not_active Ceased
- 2007-02-09 CN CN201511020147.8A patent/CN105586403A/zh active Pending
- 2007-02-09 EP EP11159467.7A patent/EP2402460B1/en active Active
- 2007-02-09 WO PCT/US2007/003802 patent/WO2007092643A2/en active Application Filing
-
2012
- 2012-04-11 US US13/444,502 patent/US9376718B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2012-11-16 JP JP2012251788A patent/JP5926166B2/ja active Active
-
2013
- 2013-03-15 US US13/840,994 patent/US9983155B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2013-12-27 JP JP2013271633A patent/JP6063374B2/ja active Active
-
2016
- 2016-06-27 US US15/194,367 patent/US11162910B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2016-09-20 JP JP2016182726A patent/JP2016208994A/ja active Pending
-
2018
- 2018-05-25 US US15/990,369 patent/US10871460B2/en not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
US8900811B2 (en) | 2014-12-02 |
JP5517456B2 (ja) | 2014-06-11 |
CN101426933A (zh) | 2009-05-06 |
US9983155B2 (en) | 2018-05-29 |
US10871460B2 (en) | 2020-12-22 |
JP2009525759A (ja) | 2009-07-16 |
JP2013051969A (ja) | 2013-03-21 |
EP1987163A2 (en) | 2008-11-05 |
US20180321170A1 (en) | 2018-11-08 |
JP2016208994A (ja) | 2016-12-15 |
US20140093879A1 (en) | 2014-04-03 |
US20160377562A1 (en) | 2016-12-29 |
CN105586403A (zh) | 2016-05-18 |
US20070026421A1 (en) | 2007-02-01 |
US9376718B2 (en) | 2016-06-28 |
WO2007092643A3 (en) | 2007-10-25 |
WO2007092643A2 (en) | 2007-08-16 |
EP2402460A1 (en) | 2012-01-04 |
JP2014079252A (ja) | 2014-05-08 |
US11162910B2 (en) | 2021-11-02 |
JP6063374B2 (ja) | 2017-01-18 |
EP2402460B1 (en) | 2019-05-08 |
US20120288865A1 (en) | 2012-11-15 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US10871460B2 (en) | Method and apparatus for generating thermal melting curves in a microfluidic device | |
US20050202470A1 (en) | Binding assays using molecular melt curves | |
US9580744B2 (en) | Method and apparatus for applying continuous flow and uniform temperature to generate thermal melting curves in a microfluidic device | |
US10343167B2 (en) | Integrated microfluidic system, method and kit for performing assays | |
JP5547071B2 (ja) | 関連付け多パラメーター単一細胞測定および残留する生物学的材料の回収のための方法および装置 | |
US9683994B2 (en) | High throughput mobility shift | |
JP5627886B2 (ja) | 生物学的な高速解析および高速識別のための、pcrを使用しない試料調製および検出システム | |
US20080124726A1 (en) | Biochemical analysis of partitioned cells |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20140515 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20140815 |
|
A602 | Written permission of extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602 Effective date: 20140820 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20141114 |
|
A02 | Decision of refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A02 Effective date: 20150324 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20150724 |
|
A911 | Transfer to examiner for re-examination before appeal (zenchi) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911 Effective date: 20150804 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20150901 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20151201 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20160226 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20160324 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20160421 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5926166 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |