JP5669081B2 - 生体分子固定化担体および生体分子担体固定化方法 - Google Patents
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Description
[1] 配列番号1に示すアミノ酸配列および配列番号2に示す塩基配列がコードするアミノ酸配列のいずれかを含む膜接着ペプチドを有する生体分子、および/または前記膜接着ペプチドと生体分子とを有する膜接着分子を、リン脂質を含む有機膜で被覆された担体に接着させてなる、生体分子固定化担体。
[2] 前記担体が磁性微粒子、もしくは前記膜接着ペプチドを有する生体分子および/または前記膜接着分子をプローブとするプローブ固定化担体である、[1]に記載の生体分子固定化担体。
[3] 前記生体分子が酵素または糖鎖である、[1]または[2]に記載の生体分子固定化担体。
[4] 前記酵素が糖転移酵素または糖加水分解酵素である、[3]に記載の生体分子固定化担体。
[5] 配列番号1に示すアミノ酸配列および配列番号2に示す塩基配列がコードするアミノ酸配列のいずれかを含む膜接着ペプチドを有する生体分子、および/または前記膜接着ペプチドと生体分子とを有する膜接着分子を、リン脂質を含む有機膜で被覆された磁性微粒子に接着させてなる、生体分子の分離剤。
[6] 担体に生理活性を保持した状態で生体分子を直接または間接に固定化する方法であって、担体に固定するための固定リガンドをリン脂質に修飾するリン脂質修飾ステップと、前記固定リガンドを修飾したリン脂質を用いて担体表面に有機膜を形成して被覆させる担体被覆ステップと、配列番号1に示すアミノ酸配列および配列番号2に示す塩基配列がコードするアミノ酸配列のいずれかを含む膜接着ペプチドを有する生体分子、および/または前記膜接着ペプチドをリンカーとして融合ないし結合した生体分子を前記有機膜に接着させる接着ステップとを有する生体分子担体固定化方法。
(i)配列番号1に示すアミノ酸配列をコードするプライマーを設計してPCR法によりDNA断片を増幅するDNA断片増幅工程、
(ii)生体分子を発現するベクターを構築する生体分子発現ベクター構築工程、
(iii)DNA断片と生体分子発現ベクターとから膜接着分子を発現するベクターを構築する膜接着分子発現ベクター構築工程、
(iv)膜接着分子発現ベクターを導入して発現細胞株を作製する発現細胞株作製工程、
(v)発現細胞株を培養して膜接着分子を回収する膜接着分子回収工程。
以上各工程(i)〜(v)を有している。
(i)坦体にリン脂質を含む有機膜を被覆させて生体膜摸倣坦体を形成する生体膜模倣担体形成工程、
(ii)膜接着ペプチドを有する生体分子および/または前記膜接着ペプチドと生体分子とを有する膜接着分子を作製する固定化生体分子作製工程、
(iii)膜接着ペプチドをリンカーとして用いて中性かつリン脂質存在下において膜接着分子を生体膜摸倣坦体へ固定化する固定化工程。
以上各工程(i)〜(iii)を有している。
ヘリコバクター・ピロリ由来のα−1,3フコース転移酵素は、前記膜接着ペプチドをC末端側に有する。そこで、このフコース転移酵素を生体膜摸倣(有機膜被覆)磁性微粒子へ提示し、得られたフコース転移酵素固定化磁性微粒子の酵素活性を測定した。
ヘリコバクター・ピロリJ99B株由来α−1,3フコース転移酵素を組み換え大腸菌にて発現し、精製した。具体的には、ヘリコバクター・ピロリJ99B株由来フコース転移酵素を発現する組み換え大腸菌(Taylor, D. E. et al. J. Biol. Chem. 2003, 278, 21893-21900)を2倍希釈したYT培地2L中にて、37℃,8時間培養した後、イソプロピルチオガラクトシドを終濃度1mMとなるように添加し、20℃,20時間培養した。培養液を10,000×gにて20分間遠心して菌体を回収した。回収した菌体を1mMのメルカプトエタノールと10%(w/v)のグリセロールとを含む25mMのトリス緩衝液(pH8.0)5mLに懸濁し、冷却下にて超音波破砕装置により菌体の超音波破砕を2分間、5回行った。再び10,000×gにて20分間遠心後、上清を回収して、ニッケルカラム(His Trap FF;Amersham Pharmacia Biotech社)によりアフィニティー精製を行った。フコース転移酵素を含む画分を、25mMのグリシン−水酸化ナトリウム緩衝液(pH10)を用いて透析により置換し、グリシン−水酸化ナトリウム緩衝液(pH10)のアルカリ性条件下にて陰イオン交換カラム(HiTrap Q HP;Amersham Pharmacia Biotech社)に供した後、ゲル濾過カラムクロマトグラフィー(Superdex 200pg;Amersham Pharmacia Biotech社)により精製を行った。得られた精製物を限外濾過にて濃縮し、精製フコース転移酵素を得た。
本実施例1(1)で精製して得られたフコース転移酵素を生体膜模倣磁性微粒子へ提示し、フコース転移酵素固定化磁性微微粒子を作製した。具体的には、直径200nmの銀被覆磁性微粒子(フェライト微粒子;日立マクセル社)1mgを100μLのエタノールにて3回洗浄した後、アルキル鎖末端にチオールを有する80mMのホスファチジルコリンリンカー40μL中にて室温下で16時間反応させ、生体膜模倣磁性微粒子を作製した。これを図1に示す。
[3−1:ラクト−N−ネオテトラオースを用いたフコース転移酵素活性の測定]
つづいて、本実施例1(2)にて得られたフコース転移酵素固定化磁性微粒子の、ヒトミルクオリゴ糖であるラクト−N−ネオテトラオース(LNnT)に対するフコース転移酵素活性を測定した。具体的には、本実施例1(2)にて作製したフコース転移酵素固定化磁性微粒子1mgを、1Mの塩化マンガン0.5μLと、200mMのグアノシン5’−2リン酸−β−L−フコース(GDP−フコース)2.5μLと、40mMのLNnT25μLと、1Mのトリス緩衝液(pH7.5)5μLと、超純水17μLとを含む混合液中において、室温下で60分間反応させた。5,15,30,60分毎に糖質分析装置(HPAEC−PAD;Dionex社)にて分析を行い、フコシル化された5糖を定量することでフコース転移酵素活性を測定した。各々の反応時間が5,15,30,60分時の測定結果を表すクロマトグラフを図3(a)、(b)、(c)、(d)に、これをグラフ化したものを図4に各々示す。
本実施例1(2)にて得られたフコース転移酵素固定化磁性微粒子の、O−結合型糖アミノ酸に対するフコース転移酵素活性を測定した。具体的には、576mU/mLのフコース転移酵素固定化磁性微粒子1mgを、1mgのO−結合型糖アミノ酸(図5中に示すRがHのもの;以下、「1a」という。)またはO−結合型糖アミノ酸(図5中に示すRがCH3のもの;以下、「1b」という。)と、10mMの塩化マンガンと、200mMのGDP−フコース5μLと、1Mのトリス緩衝液(pH7.5)5μLと、超純水40μLとを含む混合液中において、室温下で16時間反応させた。O−結合型糖アミノ酸がフコシル化される反応を図5に示す。この反応溶液をマトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型質量分析計(MALDI−TOF−MS;Bruker社)および逆相高速液体クロマトグラフ(RP−HPLC;HITACHI社)に供し、フコシル化されたO−結合型糖アミノ酸を検出した。
同様に、本実施例1(2)にて作製したフコース転移酵素固定化磁性微粒子の、N−結合型糖アミノ酸に対するフコース転移酵素活性を測定した。具体的には、576mU/mLのフコース転移酵素固定化磁性微粒子1mgを、10mMのN−結合型糖アミノ酸5μLと、1Mの塩化マンガン0.5μLと、200mMのGDP−フコース5μLと、1Mのトリス緩衝液(pH7.5)5μLと、超純水34.5μLとを含む溶液中において、室温で16時間反応させた。N−結合型糖アミノ酸がフコシル化される反応を図8に示し、図8中、1はN−結合型糖アミノ酸を、2はフコシル化されたN−結合型糖アミノ酸を各々示す。前記反応溶液を本実施例1(3)3−2と同様にしてMALDI−TOF−MSに供し、フコシル化されたN−結合型糖アミノ酸(図8中の2)を検出した。そのスペクトルチャートを図9に示す。具体的には、反応前と反応後の測定結果を図9(a)および(b)に示す。
次に、本実施例1(2)にて調製したフコース転移酵素固定化磁性微粒子について、繰り返し使用できるか否かを検討した。具体的には、本実施例1(3)[3−1]の方法と同様に、本実施例1(2)にて作製した576mU/mLの活性を有するフコース転移酵素固定化磁性微粒子1mgを、10mMの塩化マンガンと、10mMのGDP−フコースと、20mMのLNnTとを含む100mMのトリス緩衝液(pH7.5)中、室温下で15分間反応させた。これを5回繰り返し、各々について、糖質分析装置(HPAEC−PAD;Dionex社)を用いてフコシル化された5糖を定量することでフコース転移酵素活性を測定した。1〜3回目は、反応終了後に100mMのトリス緩衝液(pH7.5)100μLで5回洗浄した後に次の活性測定を行った。4回目は、100mMのトリス緩衝液(pH7.5)100μLでの5回洗浄に加えて1Mの塩化ナトリウム100μLで5回洗浄した後に活性測定を行った。5回目は、100mMのトリス緩衝液(pH7.5)100μLで5回洗浄した後4℃に保存し、翌日に活性測定を行った。使用回数1〜5回目の測定結果を示すクロマトグラフを図10(a)〜(e)に、これをグラフ化したものを図11に各々示す。
フコース転移酵素固定化磁性微粒子のフコース転移酵素の遊離実験を行った。具体的には、図12に示すように、本実施例1(2)にて調製した576mU/mLのフコース転移酵素固定化磁性微粒子1mgを、0.4%(w/v)のトライトンX−100を含む100mMのトリス緩衝液(pH7.5)または100mMのグリシン−水酸化ナトリウム緩衝液(pH10)中において、室温下で20分間反応させた。これら各反応溶液についてSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS−PAGE)を行い、Coomasie Brilliant Blue(CBB)染色を行った。その結果を図13(写真)に示す。図13中、Mは分子量マーカーを流したレーン、Iはフコース転移酵素を泳動させたレーン、IIはトライトンX−100を含むトリス緩衝液(pH7.5)にて処理した反応溶液を泳動させたレーン、IIIはグリシン−水酸化ナトリウム緩衝液(pH10)にて処理した反応溶液を泳動させたレーンを各々示す。
96穴プレートの各ウェルをアルキル鎖末端にチオールを有するホスファチジルコリンリンカーで被覆することにより生体膜模倣ウェルを作製し、これに膜接着ペプチドと有機膜(生体膜模倣膜)とを介してフコース転移酵素をウェルに固定化して得られるフコース転移酵素固定化マイクロアレイの酵素活性を測定した。
96穴プレートの各ウェルにアルキル鎖末端にチオールを有する80mMのホスファチジルコリンリンカー100μLを加え、室温下で16時間反応させ、生体膜模倣ウェルを作製した。つづいて、この生体膜模倣ウェルを100mMトリス緩衝液(pH7.5)100μLで5回洗浄後、実施例1(1)と同様の手法により得られた精製フコース転移酵素を100mMトリス緩衝液(pH7.5)にて希釈して調製したフコース転移酵素溶液100μL(734μg)を添加し、4℃にて2時間攪拌した。その後、生体膜模倣ウェルを100mMトリス緩衝液(pH7.5)100μLで5回洗浄し、フコース転移酵素が有する膜接着ペプチドと、有機膜(生体膜模倣膜)とを介して、フコース転移酵素固定化マイクロアレイを作製した。
つづいて、本実施例2(1)にて得られたフコース転移酵素固定化マイクロアレイの、O−結合型4糖アミノ酸に対するフコース転移酵素活性を測定した。具体的には、実施例1(2)にて作製したフコース転移酵素固定化マイクロアレイに、1Mの塩化マンガンを1μLと、200mMのGDP−フコースを5μLと、1mMのO−結合型4糖アミノ酸10μLと、1Mのトリス緩衝液(pH7.5)10μLと、超純水74μLとを混合して、室温下で1時間反応させた。この反応溶液1μLをMALDI−TOF−MS(Bruker社)に供し、実施例1(3)[3−2]と同様に10mg/mLのDHB1μLをマトリックス剤として用い、フコシル化されたO−結合型5糖アミノ酸を検出した。また、コントロールとして、アルキル鎖末端にチオールを有するホスファチジルコリンリンカーで被覆しないフコース転移酵素非特異的吸着ウェルに前記溶液を加えてMALDI−TOF−MSに供した。フコース転移酵素非特異的吸着ウェルを用いた結果を図14(a)に、フコース転移酵素固定化マイクロアレイを用いた結果を図14(b)に各々示す。
膜接着ペプチドの非存在下、生体膜摸倣していない(有機膜を被覆していない)磁性微粒子を用いて生体分子非特異的吸着磁性微粒子を作製し、その活性を測定した。
具体的には、まず、直径が200nmの銀被覆磁性微粒子(日立マクセル社;フェライト微粒子)1mgを100μLのエタノールにて3回洗浄後、アルキル鎖末端にチオールを有するホスファチジルコリンリンカーで被覆せずに、これにVivrio cholerae由来のシアリダーゼ(SIGMA社)を100mMのトリス緩衝液(pH7.5)にて希釈した溶液100μL(74μg)を添加し、4℃にて2時間攪拌した。次いで、100mMのトリス緩衝液(pH7.5)100mLで5回洗浄し、非特異的にシアリダーゼを吸着させたシアリダーゼ非特異的吸着磁性微粒子を得た。
つづいて、本比較例1(1)にて得られたシアリダーゼ非特異的吸着磁性微粒子の、4−メチルウンベリフェリルシアル酸に対するシアリダーゼ活性を測定した。具体的には、本比較例1(1)にて作製したシアリダーゼ非特異的吸着磁性微粒子1mgを、2mMの塩化カルシウムと、20mMの4−メチルウンベリフェリルシアル酸とを含む100mMのトリス緩衝液(pH7.5)中において、室温下で10分間反応させた後、糖質分析装置(HPAEC−PAD;Dionex社)にてこの反応溶液の分析を行い、遊離シアル酸を定量することでシアリダーゼ活性を測定した。活性測定は、各活性測定終了後に100mMのトリス緩衝液(pH7.5)100μLで5回洗浄し、次の活性測定を行うという手順で繰り返し3回行った。その結果を図15に示す。
水溶液中またはミセル溶液中における膜接着ペプチドの立体構造解析を行い、膜接着性を検討した。
実施例3において、膜接着ペプチドの膜接着性が確認されたことから、生体分子としてマルトース結合タンパク融合ガラクトース転移酵素(MBP−GalT)を用い、これに膜接着ペプチドを融合させたMBP−GalTを生体膜模倣磁性微粒子へ提示することにより、MBP−GalT固定化磁性微微粒子をin vitroで作製し、その活性を測定した。
ソルテースA(SrtA)は、図18に示すように、アミノ酸配列LPETG(Leu−Pro−Glu−Thr−Gly)とN末端にアミノ酸配列GGG(Gly−Giy−Gly;トリグリシン)を有するペプチドとを結合させる性質を有する酵素である。この酵素を用いることにより、C末端にアミノ酸配列LPETGを有する生体分子とトリグリシンをN末端に含む膜接着ペプチドとを結合させることができる。つまり、SrtAを用いて、C末端にLPETGを有するMBP−GalTとトリグリシンをN末端に含む膜接着ペプチドとを融合させて、膜接着ペプチド融合MBP−GalTを調製し、これを生体膜摸倣磁性微粒子へ提示することにより、MBP−GalT固定化磁性微粒子を作製することができる。
本実施例4(1)で得られたMBP−GalTとトリグリシンをN末端に含む膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドとをSrtAにより結合させ、得られた膜接着ペプチド融合MBP−GalTを生体膜摸倣磁性微粒子へ提示することにより、MBP−GalT固定化磁性微粒子を作製した。具体的には、まず、本実施例4(1)で得られた4μMのMBP−GalTを100μLと、本実施例4(1)で得られた1mMのトリグリシンをN末端に含む前記42残基のポリペプチド4μLと、1Mのトリス塩酸緩衝液 (pH7.5)10μLと、1Mの塩化カルシウム1μLと、2Mの塩化ナトリウム15μLと、超純水68μLとの混合液に1.8mMのSrtAを2μL加え、37℃で20時間反応させた。この反応液をMicrocon YM−50(ミリポア社)に移し、10,000×gにて1分間遠心することで未反応のトリグリシンをN末端に含む前記42残基のポリペプチドを除き、フィルターに残った50μLの膜接着ペプチド融合MBP−GalTを含む酵素反応液を得た。
コントロールとして、4μMのMBP−GalTを100μLと水100μLとの混合液を、ホスホコリンリンカーで被覆していない(生体膜摸倣していない)銀被覆磁性微粒子に加えて上記と同様の操作をすることにより、MBP−GalTが非特異的に吸着したMBP−GalT非特異的吸着磁性微粒子を作製した。
つづいて、本実施例4(2)にて得られたMBP−GalT固定化磁性微粒子および本実施例4(3)にて得られたMBP−GalT非特異的吸着磁性微粒子の、4−メチルウンベリフェリル−N−アセチルグルコサミン(4MU−GlcNAc)に対するMBP−GalT活性を測定した。具体的には、1Mの塩化マンガン10μLと、25mMのウリジン5’−2リン酸−α−D−ガラクトース(UDP−Gal)25μLと、2.5mMの4MU−GlcNAcを200μLと、1Mのトリス塩酸緩衝液(pH7.5)50μLと、10%(w/v)のトライトンX−100を1μLとを、超純水714μLに混合して基質溶液を調製した。本実施例4(2)および(3)で作製したMBP−GalT固定化磁性微粒子1mgおよびMBP−GalT非特異的吸着磁性微粒子1mgに、この基質溶液を50μLずつ加え、室温で30分反応させた。各々、反応液50μLを超純水450mLに希釈し、RP−HPLCにより分析した。コントロールであるMBP−GalT非特異的吸着磁性微粒子の測定結果を図19(a)に、膜接着ペプチドを介したMBP−GalT固定化磁性微粒子の測定結果を図19(b)に各々示す。
(1)MBP−GalT固定化セファロースレジンのin vitro作製
実施例4で用いたMBP−GalTをシアノブロミド(BrCN)活性化セファロース4Bに固定化することにより、MBP−GalT固定化セファロースレジンをin vitroで作製した(図20)。具体的には、実施例4(1)と同様の手法(Nishiguchi,S.et al.Chem.Commun,2001,1944−1945)により得られた2μMのMBP−GalTを500μLと、0.3mLのBrCN活性化セファロース4B(GEヘルスケアバイオサイエンス社)とを含む100mMのトリス緩衝液(pH8)中において4℃にて16時間反応させた。この反応液をULTRAFREE−MC・0.45μmb・Filter−Unit(ミリポア社)にて1000×gで3分間遠心してMBP−GalT固定化セファロースレジンを得た。
つづいて、本比較例2(1)にて得られたMBP−GalT固定化セファロースレジンの、糖供与体であるUDP−Galに対するMBP−GalT活性を測定した。具体的には、本比較例2(1)にて作製した0.2Uの活性を有するMBP−GalT固定化セファロースレジン0.3mLを、UDP−Galを13mMと、2−アミノピリシル−N−アセチルグルコサミンがポリアクリルアミドポリマーに結合した10mMの受容体とを含む50mMのヘペス(HEPES)緩衝液(pH7.5)中において、37℃で24時間反応させた後、Sephadex G−25(GEヘルスケアバイオサイエンス社)で分画することにより酵素活性測定を行った。この酵素活性測定操作を繰り返し8回行った。その活性測定結果を図21に示す。なお、図21中の収率(%,●)は、受容体であるN−アセチルグルコサミンが結合したポリアクリルアミドポリマーにガラクトースが導入された化合物の割合(変換率)を示す。一方、図21中の相対活性(%,▲)は、初回の酵素活性値を100%として換算した相対値を示す。
糖鎖を有する膜接着ペプチド(糖ペプチド)であるO−結合型糖ペプチド(ムチン型ペプチド)を生体分子として用い、このO−結合型糖ペプチドのC末端に膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドを組み込んだ膜接着ペプチド融合O−結合型糖ペプチドをin vitro法により作製し、これを生体膜模倣磁性微粒子へ提示することでO−結合型糖ペプチド固定化磁性微粒子を作製して、その活性を測定した。
O−結合型糖ペプチド(ムチン型ペプチド)は、Naruchi,K.et al.J.Org.Chem.2006,71,9609−9621に記載の方法により調製し、トリグリシンをN末端に含む膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドは、実施例3と同様の手法により調製し、実施例4(1)と同様の手法によりRP−HPLCにて測定して精製した。
本実施例5(1)で得られたO−結合型糖ペプチド(C末端にSrtA認識配列を含む)とトリグリシンをN末端に含む膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドとをSrtAにより結合させ、得られた膜接着ペプチド融合O−結合型糖ペプチドを生体膜摸倣磁性微粒子へ提示することにより、O−結合型糖ペプチド固定化磁性微粒子を作製した。具体的には、本実施例5(1)で得られた10mMのO−結合型糖ペプチド2.5μLと、本実施例5(1)で得られた10mMのトリグリシンをN末端に含む前記42残基のポリペプチド2.5μLと、1Mのトリス緩衝液(pH7.5)を2.5μLと、100mMの塩化カルシウム2.5μLと、3Mの塩化ナトリウムを2.5μLと、超純水35.5μLとの混合液に1.8mMのSrtAを1μL加え、37℃で20時間反応させた。この反応液をMicrocon YM−10(ミリポア社)に移し、14,000×gにて20分間遠心することでSrtAを除き、濾過してペプチド混合液を得た。この混合液を実施例4(1)と同様の手法によりRP−HPLCにて測定して精製し、膜接着ペプチド融合O−結合型糖ペプチドを得た。この生成工程を図22に示す。
コントロールとして、ホスホコリンリンカーで被覆していない(生体膜摸倣していない)銀被覆磁性微粒子へ膜接着ペプチド融合O−結合型糖ペプチドの提示を行い、O−結合型糖ペプチド固定化銀被覆磁性微粒子の作製を試みた。具体的には、本実施例5(2)で得られた膜接着ペプチド融合O−結合型糖ペプチドに、100μLのエタノールにて3回洗浄した直径が200nmの銀被覆磁性微粒子(日立マクセル社;フェライト微粒子)1mgを加え、4℃にて2時間撹拌した後、溶液を全て除去し、銀被覆磁性微粒子を50mMのトリス緩衝液(pH7.5)100μLで5回洗浄した。
O−結合型糖ペプチド固定化磁性微粒子およびO−結合型糖ペプチド固定化銀被覆磁性微粒子において膜接着ペプチド融合O−結合型糖ペプチドが固定化されているか否かを確認した。具体的には、本実施例5(2)および(3)で作製したO−結合型糖ペプチド固定化磁性微粒子およびO−結合型糖ペプチド固定化銀被覆磁性微粒子を、チップの先で少量とりMALDI−TOF−MS用ターゲットに点着した。これに10mg/mLのDHB1μLを混合し、乾燥させた後、MALDI−TOF−MSにより測定した。その結果を図23に示す。
生体膜模倣磁性微粒子に膜接着ペプチドと有機膜(生体膜模倣膜)とを介して固定化されたO−結合型糖ペプチドを特異的に認識する抗体を用いて、抗体分離剤としての検討を行った。具体的には、実施例5(2)と同様の手法により作製したO−結合型糖ペプチド固定化磁性微粒子と、終濃度1%のウシ胎児血清(Fetal Bovine Serum;FBS)との混合液に、50mMのトリス緩衝液(pH7.5)を含む、ムチン型糖ペプチドMUC1を認識する1次抗体VU−3C6(Exalpha Biologicals社)を1000倍希釈した溶液を100μL加え、室温下で1時間反応させた後、O−結合型糖ペプチド固定化磁性微粒子を0.2MのNaClと0.05%Tweenとを含む100mMトリス緩衝液(pH7.5)100μLで5回洗浄することにより回収し、これに1000倍希釈したHRPコンジュゲート−マウスモノクローナル抗体(Kirkegaard & Perry Laboratories社)を100μL混合して、室温下で1時間さらに反応させた。
実施例6において、O−結合型糖ペプチド固定化担体が抗体分離剤として実用可能であることが示されたことから、O−結合型糖ペプチド固定化マイクロアレイの作製を試みた。
O−結合型糖ペプチド固定化マイクロアレイの基板を調製するため、金被覆したチップを実施例2(1)と同様の手法によりホスホコリンリンカーで被覆した後、スライドガラスに固定化してMTP−Slide−AdaptorII(Bruker社)に嵌め込んだ。点着部位をエタノール5μLと超純水5μLと50mMのトリス緩衝液(pH7.5)5μLとの混合液で5回洗浄することにより、O−結合型糖ペプチド固定化マイクロアレイの基板を作製した。
実施例5(1)と同様の手法により調製した500μMの膜接着ペプチド融合O−結合型糖ペプチド5μLを、本実施例7(1)で作製したO−結合型糖ペプチド固定化マイクロアレイの基板に点着した。5分静置した後、50mMのトリス緩衝液(pH7.5)5μLで5回洗浄した。実施例1(3)[3−2]と同様の手法によりMALDI−TOF−MSを用いて測定した結果、膜接着ペプチド融合O−結合型糖ペプチドの固定化が確認された。O−結合型糖ペプチド固定化マイクロアレイを図25(写真)に、MALDI−TOF−MSにて測定したスペクトルチャートを図26に示す。
生体膜模倣磁性微粒子に固定可能な、膜接着ペプチドを融合させた生体分子のin vivo法による作製を試みた。具体的には、生体分子として、糖鎖末端に存在してシアル酸を加水分解する酵素であるヒト由来シアリダーゼNEU2を用い、このヒト由来シアリダーゼNEU2のC末端に膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドを組み込んだ膜接着ペプチド融合シアリダーゼをin vivo法により作製した。
プライマー;
5‘CAAAGCTTGATCGCCTTTTACAAAACGCT3’(配列番号3)
5‘CTGTGACTGGTGAGTACTCAACCAAGT(配列番号4)
反応条件;
95℃で30秒、55℃で30秒、68℃で1分30秒を1サイクルとして30サイクル
実施例8において、膜接着ペプチドを融合させた生体分子のin vivo法による作製が確認されたことから、生体分子としてMBP−GalTを用い、このMBP−GalTのC末端に膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドを組み込んだ膜接着ペプチド融合MBP−GalTをin vivo法により作製し、これを生体膜模倣磁性微粒子へ提示することでMBP−GalT固定化磁性微粒子を作製して、その活性を測定した。
実施例8で調製した膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドをコードする断片と、MBP−GalTを構築したベクター(Susumu Nishiguchi, Shin-Ichiro Nishimura. Chem. Commun. 2001, 1944-1945)とを、制限酵素NdeIおよびBamHIにより処理し、膜接着ペプチドをC末端に融合したMBP−GalTの発現ベクターを構築した。このベクターを大腸菌JM109株に形質転換し、大腸菌変異株を作製した。2×YT培地4mLにて37℃で一晩培養後、この培養液を200mLの2×YT培地に植え継ぎ、さらに37℃で2時間培養した。培養液にIPTGを終濃度1mMになるよう添加して、20℃で20時間培養した。
本実施例9(1)で得られた膜接着ペプチド融合MBP−Galを生体膜摸倣磁性微粒子へ提示することにより、MBP−GalT固定化磁性微粒子を作製した。具体的には、実施例1(2)と同様の手法により作製した生体膜模倣磁性微粒子に、本実施例9(1)で得られた膜接着ペプチド融合MBP−Gal溶液100μL(160μg)を添加し、4℃で2時間攪拌した後、溶液を全て除去し、この生体膜摸倣磁性微粒子を100mMのトリス緩衝液(pH7.5)100μLで5回洗浄した。これにより、膜接着ペプチドをC末端に有するMBP−GalTを生体膜摸倣磁性微粒子に提示することができ、膜接着ペプチドと有機膜(生体膜模倣膜)とを介してMBP−GalTが磁性微粒子へ固定化されたMBP−GalT固定化磁性微粒子を得た。
つづいて、本実施例9(2)にて得られたMBP−GalT固定化磁性微粒子の、4MU−GlcNAcに対するMBP−GalT活性を測定し、膜接着ペプチドと有機膜(生体膜模倣膜)とを介して磁性微粒子に固定化したMBP−GalTが活性を有しているかを確認した。具体的には、本実施例9(2)で作製したMBP−GalT固定化磁性微粒子に、実施例4(4)と同様の手法により調製した基質溶液を50μL加え、室温で2時間反応させた後、この反応液1μLに10mg/mLのDHB1μLを混合し、その活性を実施例1(3)[3−2]と同様の手法によりMALDI−TOF−MSにより測定した。なお、コントロールとして、磁性微粒子に固定化していない遊離の膜接着ペプチド融合MBP−GalTの活性を同様に測定した。遊離の膜接着ペプチド融合MBP−GalTの測定結果を図27(a)に、MBP−GalT固定化磁性微粒子の測定結果を図27(b)に各々示す。
スレオニンまたはセリン側鎖水酸基にN−アセチルガラクトサミンを転移する酵素であるN−アセチルガラクトサミン転移酵素2(ppGalNAcT2)を生体分子として用い、このppGalNAcT2のC末端に膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドを組み込んだ膜接着ペプチド融合ppGalNAcT2をin vivo法により作製し、これを生体膜模倣磁性微粒子へ提示することでppGalNAcT2固定化磁性微粒子を作製して、その活性を測定した。
小腸由来cDNA(Invitrogen)よりppGalNAcT2をクローニングし、ppGalNAcT2を構築したベクターを得た(Tabak, LA et al. JBC. 2006, 281, 8613-8619)。このベクターと、実施例8で調製した膜接着ペプチドを含む42残基のポリペプチドをコードする断片とを、制限酵素NdeIおよびBamHIにより処理し、膜接着ペプチドをC末端に融合したppGalNAcT2の発現ベクターを構築した。このベクターをメタノール資化性酵母に形質転換し、酵母変異株を作製した。YPAD培地50mLにて37℃で一晩培養後、この培養液を500mLのYPAD培地に植え継ぎ、24時間ごとにメタノール2.5mLを添加することにより計72時間、20℃でさらに培養した。
本実施例10(1)で得られた膜接着ペプチド融合ppGalNAcT2を生体膜摸倣磁性微粒子へ提示することにより、ppGalNAcT2固定化磁性微粒子を作製した。具体的には、実施例1(2)と同様の手法により作製した生体膜模倣磁性微粒子に、本実施例10(1)で得られた膜接着ペプチド融合ppGalNAcT2溶液40μL(60μg)を添加し、4℃で2時間撹拌した後、溶液を全て除去し、この生体膜摸倣磁性微粒子を50mMのトリス塩酸緩衝液(pH7.5)100μLで7回洗浄した。これにより、膜接着ペプチドをC末端に有するppGalNAcT2を磁性微粒子に提示することができ、膜接着ペプチドと有機膜(生体膜模倣膜)とを介してppGalNAcT2が磁性微粒子へ固定化されたppGalNAcT2固定化磁性微粒子を得た。
コントロールとして、ppGalNAcT2を40μL(60μg)と銀被覆磁性微粒子とを混合して上記と同様の操作をすることにより、ppGalNAcT2が非特異的に吸着したppGalNAcT2非特異的吸着磁性微粒子を作製した。
つづいて、本実施例10(2)にて得られたppGalNAcT2固定化磁性微粒子および本実施例10(3)にて得られたppGalNAcT2非特異的吸着磁性微粒子の、MUC5ACムチンに対するppGalNAcT2活性を測定した。具体的には、100mMの塩化マンガンを5μLと、10mMのウリジン5’−2リン酸−α−D−N−アセチルガラクトサミンを10μLと、10mMのMUC5ACムチンペプチド(GTTPSPVPTTSTTSA−NH2)を1.25μLと、1Mのトリス塩酸緩衝液(pH7.5)2.5μLとを、超純水36.25μLに混合して基質溶液を調製した。本実施例10(2)および(3)で作製したppGalNAcT2固定化磁性微粒子1mgおよびppGalNAcT2非特異的吸着磁性微粒子1mgに、この基質溶液を50μLずつ加え、37℃で1時間反応させた。反応液1μLに10mg/mLのDHB1μLを混合し、その活性を実施例1(3)[3−2]と同様の手法によりMALDI−TOF−MSにより測定した。ppGalNAcT2固定化磁性微粒子の測定結果を図28(a)に、コントロールであるppGalNAcT2非特異的吸着磁性微粒子の測定結果を図28(b)に各々示す。
Claims (13)
- 膜接着ペプチドを有する生体分子、および/または膜接着ペプチドと融合ないし結合した生体分子(以下、膜接着生体分子と総称する)を、リン脂質を含む有機膜で被覆された担体に接着させてなる、生体分子固定化担体であって、
前記膜接着ペプチドは、ヘリコバクター・ピロリ由来α1,3/α1,4−フコース転移酵素C末端ポリペプチドからなり、前記膜接着生体分子は、アルカリ性条件下に置いて膜接着ペプチドをランダム構造にして可溶化した物を中性条件下にてα−ヘリックス構造をとって前記リン脂質を含む有機膜に接着させた物である、生体分子固定化担体。 - 前記膜接着ペプチドは、DRLLQNASPLLELSQNTTFKIYRKAYQKSLPLLRTIRRWVKKで示されるアミノ酸配列からなる請求項1に記載の生体分子固定化担体。
- 前記膜接着ペプチドのα−ヘリックス構造をとるアミノ酸配列は、KIYRKAYQKSLPLLRTIRRWVKKで示されるアミノ酸配列である請求項1に記載の生体分子固定化担体。
- 前記生体分子固定化担体は、アルカリ性条件下に置かれると、前記膜接着生体分子が、リン脂質を含む有機膜で被覆された坦体から遊離し、遊離した後に中性かつリン脂質存在下に、リン脂質を含む有機膜で被覆された坦体と共に置かれると、前記担体への接着が可能なものである請求項1に記載の生体分子固定化担体。
- 前記有機膜で被覆される担体が磁性微粒子であり、かつ前記生体分子固定化担体が前記膜接着生体分子をプローブとするプローブ固定化担体である、請求項1〜4のいずれかに記載の生体分子固定化担体。
- 前記生体分子が酵素または糖鎖である、請求項1〜5のいずれかに記載の生体分子固定化担体。
- 前記酵素が糖転移酵素または糖加水分解酵素である、請求項6に記載の生体分子固定化担体。
- 担体に生体分子の生理活性を保持した状態で生体分子を直接または間接に固定化させる方法であって、
(1)膜接着ペプチドを有する生体分子、および/または膜接着ペプチドを融合ないし結合した生体分子(以下、膜接着生体分子と総称する)をアルカリ性条件下に置いて膜接着ペプチドをランダム構造にして可溶化するステップ、但し、前記膜接着ペプチドは、ヘリコバクター・ピロリ由来α1,3/α1,4−フコース転移酵素C末端ポリペプチドからなる、
(2)リガンドを修飾したリン脂質を用い、前記リガンドを介して担体表面にリン脂質を含む有機膜を形成して、有機膜被覆担体を得るステップと、
(3)前記可溶化した膜接着生体分子を前記有機膜被覆担体の有機膜に接着させて生体分子固定化担体を得る接着ステップ、但し、前記接着ステップはpHを中性条件として、α−ヘリックス構造をとる膜接着ペプチドを前記有機膜に接着させる、と
を有する生体分子担体固定化方法。 - 前記膜接着ペプチドは、DRLLQNASPLLELSQNTTFKIYRKAYQKSLPLLRTIRRWVKKで示されるアミノ酸配列からなる請求項8に記載の生体分子固定化方法。
- 前記膜接着ペプチドのα−ヘリックス構造をとるアミノ酸配列は、KIYRKAYQKSLPLLRTIRRWVKKで示されるアミノ酸配列である請求項8に記載の生体分子固定化方法。
- 前記有機膜で被覆される担体が磁性微粒子であり、かつ前記生体分子固定化担体が前記膜接着生体分子をプローブとするプローブ固定化担体である、請求項8〜10のいずれかに記載の生体分子固定化方法。
- 前記生体分子が酵素または糖鎖である、請求項8〜11のいずれかに記載の生体分子固定化方法。
- 前記酵素が糖転移酵素または糖加水分解酵素である、請求項12に記載の生体分子固定化方法。
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Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JPH022938A (ja) * | 1988-06-11 | 1990-01-08 | Shinku Yakin Kk | 磁性微粒子およびその製造方法 |
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---|---|---|---|---|
JPH022938A (ja) * | 1988-06-11 | 1990-01-08 | Shinku Yakin Kk | 磁性微粒子およびその製造方法 |
US5405766A (en) * | 1992-03-26 | 1995-04-11 | Her Majesty The Queen In Right Of Canada, As Represented By The Minister Of National Defence | Immobilization of biologically active protein on a support with a 7-18 carbon spacer and a bifunctional phospholipid |
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Non-Patent Citations (7)
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JPN6009019236; J.Biol.Chem. Vol.278, No.24, 2003, p.21893-21900 * |
JPN6009019238; Biochemistry Vol.42, No.38, 2003, p.11307-11315 * |
JPN6009019239; Mol.Microbiol. Vol.40, No.5, 2001, p.1049-1057 * |
JPN6013046963; Anal.Biochem. Vol.333, 2004, p.216-224 * |
JPN6013046966; Biosensors & Bioelectronics Vol.14, 1999, p.651-662 * |
JPN6013046968; Biosensors & Bioelectronics Vol.13, 1998, p.585-591 * |
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