JP5468388B2 - 大環状多形、そのような多形を含む組成物、ならびにその使用方法および製造方法 - Google Patents
大環状多形、そのような多形を含む組成物、ならびにその使用方法および製造方法 Download PDFInfo
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Description
本願は、それぞれの全開示が参照により本明細書に組み込まれている、2007年7月31日に出願された、米国特許出願第11/831,886号、および2007年1月22日に出願された米国仮特許出願第60/881,950号の利益を主張する。
本発明は、広範囲の抗生物質活性を呈する新規形態の化合物、特にそのような化合物の結晶多形形態および非晶質形態、そのような化合物のそのような結晶多形形態および非晶質形態を含む組成物、その製造方法および使用方法を包含する。本発明の化合物および組成物は、医療および医薬品産業、例えば、それだけに限らないが、大腸炎、例えば、偽膜性大腸炎、抗生物質関連下痢、およびクロストリジウム・ディフィシレ(Clostridium difficile)(「C.difficile」)、クロストリジウム・パーフリンジェンス(Clostridium perfringens)(「C.perfringens」)、ブドウ球菌(Staphylococcus)種、例えばメチシリン耐性ブドウ球菌、バンコマイシン耐性腸球菌を含めた腸球菌(Enterococcus)による感染症を含めた、抗生物質、化学療法、または抗ウイルス療法の使用に関連した疾患または障害の治療または予防において有用である。
抗生物質関連下痢(「AAD」)疾患は、C.ディフィシレ、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌(「MRSA」)を含めた黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)(「S.aureus」)、およびC.パーフリンジェンスの毒素産生菌株によって生じる。AADは、保健医療制度に対する主要な経済的負担を代表し、これは、米国単独における過剰病院費において、控えめにみて1年当たり30〜60億ドルと推定されている。
本発明は、細菌感染症および原虫感染症を治療または予防するのに有用な、マクロライド化合物の新規の結晶形態および非晶質形態を包含する。例示的実施形態では、本発明のマクロライド化合物の新規の結晶形態および非晶質形態は、広範囲の抗生物質活性を示す。こうして、驚いたことに、細菌感染症および原虫感染症、特にグラム陽性およびグラム陰性細菌、とりわけグラム陽性細菌に関連するものを治療または予防することにおいて、広範囲の活性を有する抗生物質として作用する、マクロライド化合物の新規の結晶形態および非晶質形態が同定された。
6.1 一般的な説明
本発明は、様々な量の式Iの化合物を含む化合物の混合物を広く包含する。本発明者らは、式Iの化合物および場合によりチアクミシンの混合物の結晶多形形態および非晶質形態の形成は、結晶化溶媒の選択および結晶化または沈殿の方法および条件に依存することを驚いたことに突き止めた。
用語「抗生物質関連状態」は、抗生物質療法により、腸の微生物叢のバランスが乱れ、C.ディフィシレ、黄色ブドウ球菌およびC.パーフリンジェンスのエンテロトキシン産生菌株などの病原生物が繁殖することが可能になるときに生じる状態を指す。これらの生物は、下痢、偽膜性大腸炎、および大腸炎を引き起こす場合があり、他の症状の中でも、下痢、尿意切迫、腹部痙攣、しぶり、および発熱によって顕在化する。下痢により、重症の場合、脱水症および脱水症に関連する内科的合併症が生じる。
本発明は、様々な量の式Iの化合物を含むチアクミシンの混合物の、式Iの化合物の第1の多形、式Iの化合物の第2の多形、これらの他の多形形態、非晶質形態または混合物を含む組成物を包含する。
18員大環状分子およびその類似体は、発酵によって生成される。チアクミシン生成のための、ダクチロスポランギウム・アウランチアクム亜種ハムデネンシス(hamdenensis)AB 718C−41 NRRL 18085の培養は、滅菌環境において、適切な通気条件および混合下で、1つまたは複数の吸収剤とともに、炭素供給源、無機塩、および他の有機成分を含む培地中で実施される。
例示的実施形態では、式Iの化合物を含有するチアクミシンの混合物を、
(i)栄養培地中で微生物を培養することによって、この栄養培地中で混合物を蓄積するステップと、
(ii)混合物を吸着するための吸着剤を含む栄養培地から混合物を単離するステップと
を含む方法によって調製する。
R−チアクミシンB(主要な最も活性な成分)の構造を、式Iで以下に示す。R−チアクミシンBのX線結晶構造を、メタノール水溶液中で成長させた、無色の平行六面体形結晶(0.08×0.14×0.22mm)として得た。このx線構造により、以下に示した構造が確認される。公式化学名は、3−[[[6−デオキシ−4−O−(3,5−ジクロロ−2−エチル−4,6−ジヒドロキシベンゾイル)−2−O−メチル−β−D−マンノピラノシル]オキシ]−メチル]−12(R)−[[6−デオキシ−5−C−メチル−4−O−(2−メチル−1−オキソプロピル)−β−D−lyxo−ヘキソピラノシル]オキシ]−11(S)−エチル−8(S)−ヒドロキシ−18(S)−(1(R)−ヒドロキシエチル)−9,13,15−トリメチルオキサシクロオクタデカ−3,5,9,13,15−ペンタエン−2−オンである。
R−チアクミシンB(これは、ほとんど完全に(すなわち90%超)R−チアクミシンである)の分析データ。
融点 166〜169℃(イソプロパノールからの白色針状晶)
[α]D 20 −6.9(c2.0、MeOH)
MS m/z(ESI)1079.7(M+Na)+
1H NMR (400MHz, CD3OD) δ 7.21 (d, 1H), 6.59 (dd, 1H), 5.95 (ddd, 1H), 5.83 (br s, 1H), 5.57 (t, 1H), 5.13 (br d, 1H), 5.09 (t, 1H), 5.02 (d, 1H), 4.71 (m, 1H), 4.71 (br s, 1H), 4.64 (br s, 1H), 4.61 (d, 1H), 4.42 (d, 1H), 4.23 (m, 1H), 4.02 (五重線, 1H), 3.92 (dd, 1H), 3.73 (m, 2H), 3.70 (d, 1H), 3.56 (s, 3H), 3.52-3.56 (m, 2H), 2.92 (m, 2H), 2.64-2.76 (m, 3H), 2.59 (七重線, 1H), 2.49 (ddd, 1H), 2.42 (ddd, 1H), 2.01 (dq, 1H), 1.81 (s, 3H), 1.76 (s, 3H), 1.65 (s, 3H), 1.35 (d, 3H), 1.29 (m, 1H), 1.20 (t, 3H), 1.19 (d, 3H), 1.17 (d, 3H), 1.16 (d, 3H), 1.14 (s, 3H), 1.12 (s, 3H), 0.87 (t, 3H);
13C NMR (100MHz, CD3OD) δ 178.4, 169.7, 169.1, 154.6, 153.9, 146.2, 143.7, 141.9, 137.1, 137.0, 136.4, 134.6, 128.5, 126.9, 125.6, 124.6, 114.8, 112.8, 108.8, 102.3, 97.2, 94.3, 82.5, 78.6, 76.9, 75.9, 74.5, 73.5, 73.2, 72.8, 71.6, 70.5, 68.3, 63.9, 62.2, 42.5, 37.3, 35.4, 28.7, 28.3, 26.9, 26.4, 20.3, 19.6, 19.2, 18.7, 18.2, 17.6, 15.5, 14.6, 14.0, 11.4.
本発明の別の例示的実施形態は、チアクミシンの混合物から式Iの化合物の多形を生成するための方法であって、
a)メタノール、水、アセトニトリル、酢酸、またはこれらのイソプロピルアルコール混合物を含む、最小量の溶液中で、約76%から約100%の式Iの化合物を含有するチアクミシンの粗混合物を溶解させるステップと、
b)a)の溶液を室温(例えば、約22℃)で静置しながら3から7日間蒸発させることによって、式Iの化合物の第1の多形を沈殿させるステップと、
c)当技術分野で既知の技法によって、溶液から多形を分離するステップと
を含む方法を含む。
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、粗物質を、1.2kgのBiotage KP−C18−HSシリカカラムを含むBiotage Flash 75Lシステムを使用する逆相クロマトグラフィーによって精製し、70:30:1のMeOH/H2O/AcOHで溶出した。75〜80%の式Iの化合物を含む収集画分を合わせ、最初の体積の3分の1に濃縮することによって、沈殿物を生成させた。この沈殿物を濾過し、水で洗浄する。この固体を高真空下で乾燥させることによって、オフホワイト粉末を得た。HPLC分析により、この粉末は主生成物として約78%の式Iの化合物および副成分としてチアクミシンの混合物を含むことが示された。
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、粗物質を、3.75kgのBiotage KP−C18−HSシリカカラムを含むBiotage Flash 150システムを使用する逆相クロマトグラフィーによって精製し、52:48:1のEtOH/H2O/AcOHで溶出した。約80〜88%の式Iの化合物を含む収集画分を合わせ、最初の体積の3分の1に濃縮することによって、沈殿物を生成させた。この沈殿物を濾過し、水で洗浄した。この固体を高真空下で乾燥させた。HPLC分析により、粉末は主生成物として85.4%の式Iの化合物および副成分としてチアクミシンの混合物を含むことが示された。
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、粗物質を、1.2kgのBiotage KP−C18−HSシリカカラムを含むBiotage Flash 75Lシステムを使用する逆相クロマトグラフィーによって精製し、67:33:4から70:30:1のMeOH/H2O/AcOHで溶出した。90%超の式Iの化合物を含む収集画分を合わせ、3分の1の体積に濃縮した。沈殿物を濾過し、水で洗浄した。この固体を高真空下で乾燥させた。HPLC分析により、粉末は94.0%の式Iの化合物を含むことが示された。
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、粗物質を、1.2kgのBiotage KP−C18−HSシリカカラムを含むBiotage Flash 75Lシステムを使用する逆相クロマトグラフィーによって精製し、52:48:1のEtOH/H2O/AcOHで溶出した。90%超の式Iの化合物を含む収集画分を合わせ、3分の1の体積の水を加え、室温で一晩放置した。沈殿物を濾過し、水で洗浄した。この固体を高真空下で乾燥させた。HPLC分析により、粉末は94.7%の式Iの化合物を含むことが示された。
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、混合物をカラム上で精製し、0.06gのチアクミシンの混合物を、20mLのバイアル中の16mLのメタノールおよび4mLの水中で溶解させた。このバイアルをパラフィルムで覆い、ピンホールを開けた。覆われたバイアルをデシケーター中に置き、室温で10日間貯蔵する。次いでパラフィルムのカバーを取り除き、バイアルをデシケーターに戻す。パラフィルムを取り除いて3から5日後以内に、結晶物質が生成する。この結晶物質をメタノールと水の溶液で洗浄する。式Iの化合物を75.6%で単離した。
イソプロパノールからの多形の調製
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、粗物質を、3.75kgのBiotage KP−C18−HSシリカカラムを含むBiotage Flash 150システムを使用する逆相クロマトグラフィーによって精製し、52:48:1のEtOH/H2O/AcOHで溶出した。80〜88%の式Iの化合物を含む収集画分を合わせ、最初の体積の3分の1に濃縮することによって、沈殿物を生成させた。この沈殿物を濾過し、水で洗浄した。この固体を高真空下で乾燥させた。HPLC分析により、粉末は、85.4%の式Iの化合物を含むことが示された。
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセス、およびカラム精製の後、式Iの化合物の混合物(90%超、15g)を、最小量のメタノール(約20mLから約30mL)中に溶解させ、この溶液をイソプロパノール(約100mL)でトリチュレートすることによって、多形を生成させた。この固体は、濾過によって溶液から分離し、165〜168℃の融点を有する。
アセトニトリルからの多形の調製
上述したように得たチアクミシンの混合物(85.44%の式Iの化合物、1000mg)を、30mLのアセトニトリル中に溶解させた。この溶液を室温で12日間蒸発および静置させることによって、結晶沈殿物を生成させた。この結晶は、濾過によって溶液から分離し、165〜169℃の融点を示す。
本発明の別の例示的実施形態は、式Iの化合物の多形を生成するための方法であって、
a)最小量の酢酸エチル中で、約78%から約100%の式Iの化合物を含有するチアクミシンの粗混合物を溶解させるステップと、
b)この溶液を室温で3から7日間蒸発および静置させることによって、多形を沈殿させるステップと、
c)溶液から多形を分離するステップと
を含む方法を含む。
酢酸エチルからの多形の調製
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、粗物質を、3.75kgのBiotage KP−C18−HSシリカカラムを含むBiotage Flash 150システムを使用する逆相クロマトグラフィーによって精製し、52:48:1のEtOH/H2O/AcOHで溶出した。70〜88%の式Iの化合物を含む収集画分を合わせ、3分の1の体積に濃縮することによって、沈殿物を生成させた。この沈殿物を濾過し、水で洗浄する。この固体を高真空下で乾燥させた。HPLC分析により、粉末は、85.4%の式Iの化合物を含むことが示された。
メタノールおよびイソプロパノールからの多形の調製。
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、様々な量の式Iの化合物の6つの異なるバッチの粗物質を、組合せ物が平均91%の式Iの化合物を有するように合わせた。この組合せ物をメタノール中に溶解させ、回転蒸発によって濃縮した。次いでこの濃縮溶液を、イソプロパノールと混合し、濾過し、真空で乾燥させることによって、156〜160℃の融点を有する白色粉末を生成する。
クロロホルムからの多形Bの調製
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、式Iの化合物を含有するチアクミシンの粗物質を、クロロホルム中に溶解させ、室温での蒸発によって濃縮することによって、156〜160℃の融点を有する固体を生成した。
アセトンからの多形形態の調製
セクション7.1中の実施例に関して説明した発酵プロセスの後、式Iの化合物を含有するチアクミシンの粗物質を、アセトン中に溶解させ、室温での蒸発によって濃縮することによって、156〜160℃の融点を有する固体を生成した。
チアクミシンの非晶質混合物の調製
チアクミシンの非晶質混合物は、カラム精製後に得、いずれのさらなる処理ステップも伴わなかった。あるいは、クロロホルムまたはアセトンをチアクミシンの混合物に加えることができ、この溶媒を蒸発させることによって非晶質生成物を形成する。
8.1.多形の実験データ
式Iの化合物の化合物の第1の多形は、示差走査熱量測定(「DSC」)および粉末X線回折(「XRD」)によって特徴づけられる。
式Iの化合物の第2の多形も、示差走査熱量測定(DSC)および粉末X線回折(XRD)によって特徴づけられる。
Claims (15)
- 174℃から186℃の範囲のDSC吸熱を特徴とする、請求項1に記載の結晶多形。
- 請求項1又は2に記載の結晶多形を含む医薬組成物。
- 前記式Iの多形が、全重量の75%から99.99%で存在する、請求項3に記載の医薬組成物。
- 前記式Iの多形が、全重量の少なくとも85%で存在する、請求項3に記載の医薬組成物。
- 前記式Iの多形が、全重量の少なくとも90%で存在する、請求項3に記載の医薬組成物。
- 前記式Iの多形が、全重量の少なくとも95%で存在する、請求項3に記載の医薬組成物。
- 前記式Iの多形が、全重量の少なくとも99%で存在する、請求項3に記載の医薬組成物。
- 固体剤形である、請求項3〜8のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 医薬として許容可能な担体をさらに含む、請求項3〜9のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 哺乳動物における細菌感染症の治療又は予防に使用するための、請求項3〜10のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 哺乳動物がヒトである、請求項11に記載の医薬組成物。
- 細菌感染症がクロストリジウム・ディフィシレ感染症である、請求項11又は12に記載の医薬組成物。
- 細菌感染症が消化管感染症である、請求項11〜13のいずれか1項に記載の医薬組成物。
- 細菌感染症がクロストリジウム・ディフィシレ関連下痢(CDAD)である、請求項11又は12に記載の医薬組成物。
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