JP5464578B2 - Ssea系新規糖鎖化合物 - Google Patents
Ssea系新規糖鎖化合物 Download PDFInfo
- Publication number
- JP5464578B2 JP5464578B2 JP2009179705A JP2009179705A JP5464578B2 JP 5464578 B2 JP5464578 B2 JP 5464578B2 JP 2009179705 A JP2009179705 A JP 2009179705A JP 2009179705 A JP2009179705 A JP 2009179705A JP 5464578 B2 JP5464578 B2 JP 5464578B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- sugar chain
- structural formula
- chemical structural
- 4glcnacβ1
- protecting group
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 title claims description 66
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 42
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 16
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 15
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 15
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims description 14
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 13
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 13
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 claims description 9
- TXCIAUNLDRJGJZ-BILDWYJOSA-N CMP-N-acetyl-beta-neuraminic acid Chemical compound O1[C@@H]([C@H](O)[C@H](O)CO)[C@H](NC(=O)C)[C@@H](O)C[C@]1(C(O)=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](N2C(N=C(N)C=C2)=O)O1 TXCIAUNLDRJGJZ-BILDWYJOSA-N 0.000 claims description 7
- 229940060155 neuac Drugs 0.000 claims description 6
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 5
- HSCJRCZFDFQWRP-ABVWGUQPSA-N UDP-alpha-D-galactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 HSCJRCZFDFQWRP-ABVWGUQPSA-N 0.000 claims description 3
- HSCJRCZFDFQWRP-UHFFFAOYSA-N Uridindiphosphoglukose Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC1C(O)C(O)C(N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 HSCJRCZFDFQWRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- LFTYTUAZOPRMMI-CFRASDGPSA-N UDP-N-acetyl-alpha-D-glucosamine Chemical compound O1[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)C)[C@H]1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OC[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 LFTYTUAZOPRMMI-CFRASDGPSA-N 0.000 claims description 2
- LFTYTUAZOPRMMI-UHFFFAOYSA-N UNPD164450 Natural products O1C(CO)C(O)C(O)C(NC(=O)C)C1OP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC1C(O)C(O)C(N2C(NC(=O)C=C2)=O)O1 LFTYTUAZOPRMMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- -1 carbohydrate compound Chemical class 0.000 claims 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 claims 1
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 12
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 11
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 11
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 11
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 11
- 238000000034 method Methods 0.000 description 11
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 9
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 9
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 8
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 230000024245 cell differentiation Effects 0.000 description 6
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 5
- 238000011161 development Methods 0.000 description 5
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 5
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229910021380 Manganese Chloride Inorganic materials 0.000 description 4
- GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L Manganese chloride Chemical compound Cl[Mn]Cl GLFNIEUTAYBVOC-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N Palladium on carbon Substances [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 4
- SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N beta-N-Acetyl-D-neuraminic acid Natural products CC(=O)NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO SQVRNKJHWKZAKO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 4
- 239000011565 manganese chloride Substances 0.000 description 4
- 235000002867 manganese chloride Nutrition 0.000 description 4
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 4
- 238000011160 research Methods 0.000 description 4
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 4
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 4
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 4
- 150000004043 trisaccharides Chemical class 0.000 description 4
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 4
- 0 C*C(*(C1)C1[C@@](C12)*1[C@@](C(C1O)O)OC(CO)[C@@]1O[C@](C(C1O[C@](*(C3)C3[C@](C3*)[Rn][C@@](C(C4O)O)OC(CO[C@@]5(*)OC([C@](C)[C@@](C*)O)[C@](*)C(C)C5)[C@@]4O)[C@]3NC(C)=O)O)OC(CO)[C@@]1O)C2O Chemical compound C*C(*(C1)C1[C@@](C12)*1[C@@](C(C1O)O)OC(CO)[C@@]1O[C@](C(C1O[C@](*(C3)C3[C@](C3*)[Rn][C@@](C(C4O)O)OC(CO[C@@]5(*)OC([C@](C)[C@@](C*)O)[C@](*)C(C)C5)[C@@]4O)[C@]3NC(C)=O)O)OC(CO)[C@@]1O)C2O 0.000 description 3
- 102000004856 Lectins Human genes 0.000 description 3
- 108090001090 Lectins Proteins 0.000 description 3
- 230000011712 cell development Effects 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 3
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 3
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 description 3
- 239000002523 lectin Substances 0.000 description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 3
- ZNJHFNUEQDVFCJ-UHFFFAOYSA-M sodium;2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid;hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+].OCCN1CCN(CCS(O)(=O)=O)CC1 ZNJHFNUEQDVFCJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 3
- 125000004172 4-methoxyphenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(OC([H])([H])[H])=C([H])C([H])=C1* 0.000 description 2
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YVECGMZCTULTIS-HSUXUTPPSA-N D-galactal Chemical compound OC[C@H]1OC=C[C@@H](O)[C@H]1O YVECGMZCTULTIS-HSUXUTPPSA-N 0.000 description 2
- 241000991587 Enterovirus C Species 0.000 description 2
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 2
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 2
- 208000007766 Kaposi sarcoma Diseases 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 208000002030 Merkel cell carcinoma Diseases 0.000 description 2
- UDCDOJQOXWCCSD-UHFFFAOYSA-N N,N-dimethyl-N'-p-tolylsulfamide Chemical compound CN(C)S(=O)(=O)NC1=CC=C(C)C=C1 UDCDOJQOXWCCSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010046068 N-Acetyllactosamine Synthase Proteins 0.000 description 2
- SQVRNKJHWKZAKO-LUWBGTNYSA-N N-acetylneuraminic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)CC(O)(C(O)=O)O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-LUWBGTNYSA-N 0.000 description 2
- 206010029266 Neuroendocrine carcinoma of the skin Diseases 0.000 description 2
- 102000003838 Sialyltransferases Human genes 0.000 description 2
- 108090000141 Sialyltransferases Proteins 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- WQDUMFSSJAZKTM-UHFFFAOYSA-N Sodium methoxide Chemical compound [Na+].[O-]C WQDUMFSSJAZKTM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 2
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 2
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 description 2
- AGEZXYOZHKGVCM-UHFFFAOYSA-N benzyl bromide Chemical compound BrCC1=CC=CC=C1 AGEZXYOZHKGVCM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000005574 benzylation reaction Methods 0.000 description 2
- AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M caesium chloride Chemical compound [Cl-].[Cs+] AIYUHDOJVYHVIT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 230000032823 cell division Effects 0.000 description 2
- 238000001311 chemical methods and process Methods 0.000 description 2
- 229940125773 compound 10 Drugs 0.000 description 2
- 229940125898 compound 5 Drugs 0.000 description 2
- 208000017763 cutaneous neuroendocrine carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 2
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 2
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N jdtic Chemical compound C1([C@]2(C)CCN(C[C@@H]2C)C[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]2NCC3=CC(O)=CC=C3C2)=CC=CC(O)=C1 ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 210000000716 merkel cell Anatomy 0.000 description 2
- CERZMXAJYMMUDR-UHFFFAOYSA-N neuraminic acid Natural products NC1C(O)CC(O)(C(O)=O)OC1C(O)C(O)CO CERZMXAJYMMUDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052762 osmium Inorganic materials 0.000 description 2
- SYQBFIAQOQZEGI-UHFFFAOYSA-N osmium atom Chemical compound [Os] SYQBFIAQOQZEGI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 2
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 125000005630 sialyl group Chemical group 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical compound CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FTVLMFQEYACZNP-UHFFFAOYSA-N trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate Chemical compound C[Si](C)(C)OS(=O)(=O)C(F)(F)F FTVLMFQEYACZNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GLGNXYJARSMNGJ-VKTIVEEGSA-N (1s,2s,3r,4r)-3-[[5-chloro-2-[(1-ethyl-6-methoxy-2-oxo-4,5-dihydro-3h-1-benzazepin-7-yl)amino]pyrimidin-4-yl]amino]bicyclo[2.2.1]hept-5-ene-2-carboxamide Chemical compound CCN1C(=O)CCCC2=C(OC)C(NC=3N=C(C(=CN=3)Cl)N[C@H]3[C@H]([C@@]4([H])C[C@@]3(C=C4)[H])C(N)=O)=CC=C21 GLGNXYJARSMNGJ-VKTIVEEGSA-N 0.000 description 1
- SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N (1s,2s,3s,5r)-1-(carboxymethyl)-3,5-bis[(4-phenoxyphenyl)methyl-propylcarbamoyl]cyclopentane-1,2-dicarboxylic acid Chemical compound O=C([C@@H]1[C@@H]([C@](CC(O)=O)([C@H](C(=O)N(CCC)CC=2C=CC(OC=3C=CC=CC=3)=CC=2)C1)C(O)=O)C(O)=O)N(CCC)CC(C=C1)=CC=C1OC1=CC=CC=C1 SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N 0.000 description 1
- GHYOCDFICYLMRF-UTIIJYGPSA-N (2S,3R)-N-[(2S)-3-(cyclopenten-1-yl)-1-[(2R)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxopropan-2-yl]-3-hydroxy-3-(4-methoxyphenyl)-2-[[(2S)-2-[(2-morpholin-4-ylacetyl)amino]propanoyl]amino]propanamide Chemical compound C1(=CCCC1)C[C@@H](C(=O)[C@@]1(OC1)C)NC([C@H]([C@@H](C1=CC=C(C=C1)OC)O)NC([C@H](C)NC(CN1CCOCC1)=O)=O)=O GHYOCDFICYLMRF-UTIIJYGPSA-N 0.000 description 1
- LAQPKDLYOBZWBT-NYLDSJSYSA-N (2s,4s,5r,6r)-5-acetamido-2-{[(2s,3r,4s,5s,6r)-2-{[(2r,3r,4r,5r)-5-acetamido-1,2-dihydroxy-6-oxo-4-{[(2s,3s,4r,5s,6s)-3,4,5-trihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy}hexan-3-yl]oxy}-3,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy}-4-hydroxy-6-[(1r,2r)-1,2,3-trihydrox Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@H]([C@@H](NC(C)=O)C=O)[C@@H]([C@H](O)CO)O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@]2(O[C@H]([C@H](NC(C)=O)[C@@H](O)C2)[C@H](O)[C@H](O)CO)C(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 LAQPKDLYOBZWBT-NYLDSJSYSA-N 0.000 description 1
- QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N (3S)-3-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[5-[(3aS,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-[1-bis(4-chlorophenoxy)phosphorylbutylamino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound CCCC(NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CCCCC1SC[C@@H]2NC(=O)N[C@H]12)C(C)C)P(=O)(Oc1ccc(Cl)cc1)Oc1ccc(Cl)cc1 QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N 0.000 description 1
- UNILWMWFPHPYOR-KXEYIPSPSA-M 1-[6-[2-[3-[3-[3-[2-[2-[3-[[2-[2-[[(2r)-1-[[2-[[(2r)-1-[3-[2-[2-[3-[[2-(2-amino-2-oxoethoxy)acetyl]amino]propoxy]ethoxy]ethoxy]propylamino]-3-hydroxy-1-oxopropan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-[(2r)-2,3-di(hexadecanoyloxy)propyl]sulfanyl-1-oxopropan-2-yl Chemical compound O=C1C(SCCC(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)COCC(=O)N[C@@H](CSC[C@@H](COC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CO)C(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)COCC(N)=O)CC(=O)N1CCNC(=O)CCCCCN\1C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2CC/1=C/C=C/C=C/C1=[N+](CC)C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2C1 UNILWMWFPHPYOR-KXEYIPSPSA-M 0.000 description 1
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003903 2-propenyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])=C([H])[H] 0.000 description 1
- 238000011537 Coomassie blue staining Methods 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 108700023372 Glycosyltransferases Proteins 0.000 description 1
- 102000051366 Glycosyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000001008 Macro domains Human genes 0.000 description 1
- 108050007982 Macro domains Proteins 0.000 description 1
- 241000579048 Merkel cell polyomavirus Species 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Natural products CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N N-acetyl-D-galactosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-KEWYIRBNSA-N 0.000 description 1
- MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N N-acetyl-D-galactosamine Natural products CC(=O)NC(C=O)C(O)C(O)C(O)CO MBLBDJOUHNCFQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N N-acetyl-D-glucosamine Chemical compound CC(=O)N[C@H]1C(O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-RTRLPJTCSA-N 0.000 description 1
- MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N N-acetylglucosamine Natural products CC(=O)N[C@@H](C=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBLBDJOUHNCFQT-LXGUWJNJSA-N 0.000 description 1
- 241000588653 Neisseria Species 0.000 description 1
- 241000588650 Neisseria meningitidis Species 0.000 description 1
- 241001505332 Polyomavirus sp. Species 0.000 description 1
- 208000000453 Skin Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 102000005262 Sulfatase Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 229920004890 Triton X-100 Polymers 0.000 description 1
- 239000013504 Triton X-100 Substances 0.000 description 1
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N azide group Chemical group [N-]=[N+]=[N-] IVRMZWNICZWHMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000649 benzylidene group Chemical group [H]C(=[*])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical group 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000170 cell membrane Anatomy 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 1
- 229940125904 compound 1 Drugs 0.000 description 1
- 229940125797 compound 12 Drugs 0.000 description 1
- 229940126543 compound 14 Drugs 0.000 description 1
- 229940125758 compound 15 Drugs 0.000 description 1
- 229940125782 compound 2 Drugs 0.000 description 1
- 229940126214 compound 3 Drugs 0.000 description 1
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 238000005194 fractionation Methods 0.000 description 1
- 150000002301 glucosamine derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000002339 glycosphingolipids Chemical class 0.000 description 1
- 108700014210 glycosyltransferase activity proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 description 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000006011 modification reaction Methods 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 238000003541 multi-stage reaction Methods 0.000 description 1
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- CUQOHAYJWVTKDE-UHFFFAOYSA-N potassium;butan-1-olate Chemical compound [K+].CCCC[O-] CUQOHAYJWVTKDE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 1
- 230000001172 regenerating effect Effects 0.000 description 1
- SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N sialic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@](O)(C(O)=O)OC1[C@H](O)[C@H](O)CO SQVRNKJHWKZAKO-OQPLDHBCSA-N 0.000 description 1
- 125000005629 sialic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 201000000849 skin cancer Diseases 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 108060007951 sulfatase Proteins 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L sulfate group Chemical group S(=O)(=O)([O-])[O-] QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 1
- 230000033772 system development Effects 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
Landscapes
- Saccharide Compounds (AREA)
- Polysaccharides And Polysaccharide Derivatives (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Description
現在、ES細胞やiPS細胞を利用展開した研究が盛んに進められているが、SSEAを抗原マーカーとすることで、これらの分化細胞の状態が検定できる。
また、糖鎖化合物の研究の一手法として、糖鎖の構造を一部変更した非天然型糖鎖化合物を合成し、当該新たな非天然型糖鎖化合物の特性を研究し、天然型糖鎖との比較を行うなども行われている。
糖鎖合成で利用される酵素は、糖と糖を結合させるグリコシル化反応では、各種「糖転移酵素」や「糖加水分解酵素」が利用される。そのほか、糖鎖を構成する糖単位のヒドロキシル基の修飾反応に利用される、例えば硫酸基導入のための硫酸化酵素などの酵素もある。
したがって、酵素反応で非天然体を含む多様な糖鎖を合成することは、必ずしも容易なことではないのが実情である。
天然のSSEA系糖鎖と構造が類似する糖鎖化合物の中には、天然のSSEA系糖鎖の生理的役割や機能、例えば上述の細胞分化に果たす役割を調節することができるものがあることが期待される。
しかしながら、天然の糖鎖化合物に類似する任意の糖鎖化合物を合成することは、上述のとおり、容易なことではない。
そこで、本発明は、天然のSSEA系糖鎖と構造が類似する非天然型の新規な糖鎖化合物を提供することを課題とし、その中から、天然のSSEA系糖鎖の生理的役割や機能を調節することができるものを提供することをさらなる目標とする。
また、本発明は、糖結合物質であるレクチンの新たな分類用試薬として用い得る、新規な糖鎖化合物を提供することをも、目的とする。
本発明は、また、当該新規な非天然型の糖鎖化合物を容易に調製することができる方法を提供することを課題とする。
(1)以下の化学構造式で表される糖鎖化合物。
この化合物は、天然のSSEA系糖鎖化合物の出発物質である三糖体Gb3(図1参照)を用いれば、GlcNAcβ1-3Gb3と表記することができ、Gb3に結合する糖が天然のGb4(図1参照)と相違する四糖体である (以下、これをneoGb4と称する。)。
(2)以下の化学構造式で表される糖鎖化合物。
この化合物は、天然のSSEA系糖鎖化合物の出発物質である三糖体Gb3を用いれば、Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3あるいはLacNAcβ1-3Gb3と表記することができ、Gb3に結合する糖が天然のGb5(SSEA-3とも呼ばれる)(図1参照)と相違する五糖体である (以下、これをneoGb5 あるいはneoSSEA-3 と称する。)。
(3)以下の化学構造式で表される糖鎖化合物。
この化合物は、天然のSSEA系糖鎖化合物の出発物質である三糖体Gb3を用いれば、Siaα2-3Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3 あるいはSiaα2-3LacNAcβ1-3Gb3と表記することができ、Gb3に結合する糖が天然のsialyl Gb5(SSEA-4とも呼ばれる)(図1参照)と相違する六糖体である (以下、これをsialyl-neoGb5 あるいはneoSSEA-4と称する。)。)
(4)以下の化学構造式で表される糖鎖化合物。
この化合物は、天然のSSEA系糖鎖化合物の出発物質である三糖体Gb3を用いれば、Siaα2-6Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3 あるいはSiaα2-6LacNAcβ1-3Gb3と表記することができ、Gb3に結合する糖および末端のシアリル酸(Sia)の結合位置が天然のsialyl Gb5(SSEA-4とも呼ばれる)と相違する六糖体である (以下、これを2,6sialyl-neoGb5 あるいは2,6neoSSEA-4と称する。)。
これらは、いずれも未だ報告されたことのない、新規な非天然型糖鎖化合物である。
(1)Gb3+UDP-GlcNAc(酵素β1,3-GlcNacTを使用)→ GlcNAcβ1-3Gb3
(2)GlcNAcβ1-3Gb3+UDP-Gal(酵素β1,4-GalTを使用)→ Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3
(3)Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3+CMP-NeuAc (CMP-NANA)(酵素α2,3(N)-SiaTを使用)
→ Siaα2-3Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3
(4)Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3+CMP-NeuAc (CMP-NANA)(酵素α2,6-SiaTを使用)
→ Siaα2-6Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3
また、これらの非天然型糖鎖化合物のうち、2,6sialyl-neoGb5については、メルケル細胞ポリオマーウイルス(MCV)との結合活性を有することが確認されている(実施例5参照)。
また、当該非天然型糖鎖化合物のうち、2,6sialyl-neoGb5は、メルケル細胞ポリオマーウイルス(MCV)との結合活性を有するので、当該ウイルスの検出等に利用することができる。
また、本発明の方法により、本発明の新規糖鎖化合物を容易に調製することができる。
また、実施例で用いた具体的な酵素は、以下のとおりである。
β1,3-GlcNacT=β1,3-N-アセチルグルコサミン転移酵素:北海道大学西村研究室で調製したNeisseria由来のもの(J.Org.Chem.2006,71,9609-9621)。
β1,4-GalT=β1,4ガラクトース転移酵素:TOYOBOから市販されているHuman由来のもの(code: BTG-401, EC Number: 2.4.1.22, Glycoconjugate Journal,1995,12,865-878)。
α2,3(N)-SiaT=α2,3シアル酸転移酵素:CalBioChemから市販されているRat由来のもの(cat.No.566218, EC Number: 2.4.99.5, Glycoconjugate Journal,1995,12,755-762)。
α2,6-SiaT=α2,6シアル酸転移酵素:TOYOBOから市販されているHuman由来のもの(code: AST-601, EC Number: 2.4.99.1, Nucleic Acid Research,1990,18,667)。
MCVは2008年皮膚がんの一種であるメルケル細胞がんから発見された新しいポリオーマウイルスであり、メルケル細胞がん、カポシ肉腫などとの関連が知られている。
(1)バキュロウイルスを用いた組換えMCV様粒子の作製
日本人カポシ肉腫患者よりクローン化したMCV遺伝子全長のうちVP1領域遺伝子(1269塩基)をバキュロウイルストランスファーベクターpVL1393へ挿入した。得られたpVLMCVVP1をlinearized baculovirus DNAとともに昆虫細胞Sf9へトランスフェクションし、相同組換えにより組換えバキュロウイルス(AcMCVVP1)を作製した。プラークアッセイにより精製した組換えウイルスからのMCV蛋白の発現をSDS-PAGE電気泳動後のクマシーブルー染色およびウエスタンブロット法で確認した。
AcMCVVP1を昆虫細胞Sf9またはTn5に感染させ1週間培養後の培養上清を10,000xgで1時間遠心し、上清をさらに100,000xgで3時間遠心しMCV様粒子を沈査に回収した。これを4.5 mL培地(EX-CELL)に懸濁した後2.1 gの塩化セシウムを加えた。35,000 rpm、36時間遠心した後、分画操作を行った。浮上密度1.3 g/cm3の分画を回収し、塩化セシウムを除去して精製MCV様粒子(MCV-LP)を得た。
MCV-LPは、本来のウイルス粒子と同様の構造を有しながら、ウイルスゲノムを持たないため増殖性は有していないことから、安全で汎用性の高い構造体である。MCVの診断系開発またワクチン開発への利用が考えられる。
(2)表面プラズモン共鳴(SPR)分析法によるウイルス-糖鎖相互作用の解析
2 mM 1.2-Dimyristoyl-SN-Glycero-3-phosphocholinの0.01M HEPES(pH7.4), 0.15M NaCl緩衝液(HBS-N)に終濃度5%となるよう、Siaα2-6LacNAcβ1-3Gb3などの本願の各糖鎖を有する糖脂質を添加し、超音波破砕法により糖鎖含リポソームを作製した。
バイオセンサーBIAcore2000(GE Healthcare社)のセンサーチップHPAに各糖鎖含リポソームを流速2 uL/分で120 uL流し、さらに5 uLの50 mM NaOH/ HBS-Nを2回、 25 uLのBSA/HBS-Nを1回流して糖鎖含リポソームのセンサーチップへの固定化、及びブロッキングを行った。糖鎖固定化センサーチップに1 ug/uL MCV-LP溶液を20 uL/minで40 uL流した。その後、HBS-Nを2分間流しMCV-LPの糖鎖からの解離を観察した。さらに、50mM NaOHを20uL/分で10uL、BSA 5uL/minを25uL流しリポソーム表面を再生した後、0.5 ug/uL MCV-LPを同様に流した。このように、段階希釈したMCV-LPを順番に流し、糖鎖との結合、解離を解析した。
Siaα2-6LacNAcβ1-3Gb3(2,6 sialyl- neoGb5)は、MCV-LPとの相互作用が認められた(図7参照)。
実施例1〜4においては、酵素反応を用いて本発明の糖鎖化合物を合成したが、以下の手順を用いれば、これらを有機化学的に合成することも可能である。
(1)単糖合成シントンの調製(図8参照)
化合物1(H. Shimizu et. al, Biosci. Biotech. Biochem., 60, 73-76, 1996)の3位ヒドロキシル基をアセチル化し(Ac2O, Py)、グルコサミン誘導体2とする。
また、ガラクタールから4,6ベンジリデン化(C6H5CH(OCH3)2, TsOH)、レブリノイル化(LevOH, DCC)、脱ベンジリデンと引き続きベンジル化(1) HCl; 2)BnBr, Ag2O)、オスミニウム酸化と引き続きアセチル化(1) OsO4, 2) Ac2O, Py)、チオメチル化(TMSSMe, TMSOTf)にてガラクトース糖供与体3が合成されうる。
同じくガラクタールから、3,4,イソプロピリデン化(acetone, TsOH)、レブリノイル化(LevOH, DCC)、脱イソプロピリデンと引き続きベンジル化(1) HCl; 2)BnBr, Ag2O)、オスミニウム酸化と引き続きアセチル化(1) OsO4, 2) Ac2O, Py)、チオメチル化(TMSSMe, TMSOTf)にてガラクトース糖供与体4が合成されうる。
また、シアル酸シントン5はすでに報告のある化合物である。(T. Murase et. Al, Carbohydr. Res., 184, C1-C4, 1988)
(2)Gb3からの本発明の糖鎖化合物群の合成(図9参照)
東京化成から市販されている化合物6にアリル保護基を脱保護(BuOK, then HCl)して化合物7とする。これに化合物2を活性化剤(PeSePhth-TMSOTfなど)存在下でグリコシル化することにより化合物8が得られ、化合物8を脱保護(1) NH2CH2CH2NH2; 2) Ac2O, MeOH; 3) Pd-C, H2)するとneoGb4が得られる。
さらに、化合物8を塩基処理(NaOMe, MeOH)し化合物9とした後、化合物3と活性化剤(PeSePhth-TMSOTfなど)存在下でグリコシル化することにより化合物10が得られ、脱保護(1) NH2CH2CH2NH2; 2) Ac2O, MeOH; 3) Pd-C, H2)するとneoGb5が得られる。
また、化合物10のレブリノイル基を脱保護(NH2NH2, AcOH)し化合物11とした後、化合物5を活性化剤(DMTSTなど)存在下でグリコシル化することにより得られる化合物12を脱保護(1) NH2CH2CH2NH2; 2) Ac2O, MeOH; 3) Pd-C, H2)するとneoSSEA-4が得られる。
さらに、化合物9と化合物4を活性化剤(PeSePhth-TMSOTfなど)存在下でグリコシル化することにより得られる化合物13のレブリノイル基を脱保護(NH2NH2, AcOH)し化合物14とした後、化合物5を活性化剤(DMTSTなど)存在下でグリコシル化することにより得られる化合物15を脱保護(1) NH2CH2CH2NH2; 2) Ac2O, MeOH; 3) Pd-C, H2)すると2,6neoSSEA-4が得られる。
Claims (8)
- 以下の反応式で表される酵素反応により、以下の化学構造式(II)(Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3)で表される糖鎖化合物から以下の化学構造式(III)(Siaα2-3Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3)で表される糖鎖化合物sialyl-neoGb5(neoSSEA-4)を製造する方法。
Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3+CMP-NeuAc (CMP-NANA)(酵素α2,3(N)-SiaTの存在下)→ Siaα2-3Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3
- 以下の反応式で表される酵素反応により、以下の化学構造式(II)(Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3)で表される糖鎖化合物から以下の化学構造式(IV)(Siaα2-6Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3)で表される糖鎖化合物2,6sialyl-neoGb5(2,6neoSSEA-4)を製造する方法。
Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3+CMP-NeuAc (CMP-NANA)(酵素α2,6-SiaTの存在下)→ Siaα2-6Galβ1-4GlcNAcβ1-3Gb3
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2009179705A JP5464578B2 (ja) | 2009-07-31 | 2009-07-31 | Ssea系新規糖鎖化合物 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2009179705A JP5464578B2 (ja) | 2009-07-31 | 2009-07-31 | Ssea系新規糖鎖化合物 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2011032206A JP2011032206A (ja) | 2011-02-17 |
JP5464578B2 true JP5464578B2 (ja) | 2014-04-09 |
Family
ID=43761637
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2009179705A Active JP5464578B2 (ja) | 2009-07-31 | 2009-07-31 | Ssea系新規糖鎖化合物 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP5464578B2 (ja) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
TWI563091B (en) * | 2012-08-20 | 2016-12-21 | Academia Sinica | Large scale enzymatic synthesis of oligosaccharides |
Family Cites Families (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2000086688A (ja) * | 1998-09-04 | 2000-03-28 | Ngk Insulators Ltd | パルボウイルス吸着糖鎖リガンドおよびこれを利用したパルボウイルス除去装置 |
SE520256C2 (sv) * | 2001-10-25 | 2003-06-17 | Lundonia Biotech Ab | Biomolekylkvadratsyramonoamidkopplingsreagensintermediär |
-
2009
- 2009-07-31 JP JP2009179705A patent/JP5464578B2/ja active Active
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP2011032206A (ja) | 2011-02-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Wen et al. | Toward automated enzymatic synthesis of oligosaccharides | |
Gagarinov et al. | Chemoenzymatic approach for the preparation of asymmetric bi-, tri-, and tetra-antennary N-glycans from a common precursor | |
Li et al. | Efficient chemoenzymatic synthesis of an N-glycan isomer library | |
TWI573876B (zh) | 寡醣之大規模酵素合成 | |
Bojarová et al. | Enzymatic glycosylation of multivalent scaffolds | |
Chao et al. | Recent progress in chemo-enzymatic methods for the synthesis of N-glycans | |
Brockhausen | Crossroads between bacterial and mammalian glycosyltransferases | |
Brockhausen et al. | Glycoproteins and their relationship to human disease | |
JP5975577B2 (ja) | シアル酸含有糖鎖の製造方法 | |
Meng et al. | Regioselective chemoenzymatic synthesis of ganglioside disialyl tetrasaccharide epitopes | |
Lu et al. | Redox-controlled site-specific α2–6-sialylation | |
Huang et al. | Sulfo-Fluorous tagging strategy for site-selective enzymatic glycosylation of Para-human milk oligosaccharides | |
Anwar et al. | Sugar nucleotide regeneration system for the synthesis of Bi-and triantennary N-glycans and exploring their activities against siglecs | |
Nilsson | Enzymatic synthesis of complex carbohydrates and their glycosides | |
Tseng et al. | Exploring regioselective fucosylation catalyzed by bacterial glycosyltransferases through substrate promiscuity and acceptor-mediated glycosylation | |
Wu et al. | A Biomimetic Synthetic Strategy Can Provide Keratan Sulfate I and II Oligosaccharides with Diverse Fucosylation and Sulfation Patterns | |
Cao et al. | General consideration on sialic acid chemistry | |
JP5464578B2 (ja) | Ssea系新規糖鎖化合物 | |
JP6718561B2 (ja) | 活性型GcMAFの製造方法 | |
RU2135585C1 (ru) | Способ получения производных лактозамина, производное лактозамина, полученное указанным способом, способ получения соединений levis-x и их производных при использовании указанных производных лактозамина | |
Joziasse et al. | Enzymatic-Synthesis of the α3-Galactosyl-LeX Tetrasaccharide: A Potential Ligand for Selectin-Type Adhesion Molecules | |
JP6156909B2 (ja) | N型糖タンパク質の製造方法 | |
JP4910091B2 (ja) | 4位ハロゲン化ガラクトース含有糖鎖及びその応用 | |
Schwardt et al. | Minireview: bacterial sialyltransferases for carbohydrate synthesis | |
Lim | Synthesis of O-Linked glycopeptides using enzymatic catalysis. |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20120223 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20131105 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20131219 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20140114 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20140115 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 5464578 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
S533 | Written request for registration of change of name |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313533 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |