JP5461776B2 - マイコバクテリウムのエレクトロポレーションおよびマイコバクテリア中における抗原類の過剰発現 - Google Patents
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Description
先行技術から、BCGが均質な株ではなく、それどころか、明確な遺伝系統アレイを示すことが示唆されている(Oettingerほか、Tuber Lung Dis.79(4):243−250;1990)。最近になるまで、これらの差異がBCG族メンバーの免疫原性および能力を変化させるのかどうか、明らかではなかった。しかし、本明細書にも述べたように、現在、組み換えBCG(本明細書でrBCGと称する)を誘導するもととなったある特定の株がrBCGの免疫能力において実質的差異を生じることが発見されている。下記の実施例1は、BCG Danish 1331株(本明細書で“BCG1331”と称する)がBCGTiceと比較して優れたワクチンであることを示している。したがって、株rBCG30における抗原85Bの過剰発現は、rBCG30を誘導するもととなった親株BCGTiceの免疫原性を増大させたが、BCG tice株において抗原85Bを過剰発現するrBCG30は、BCG1331の能力を獲得しなかった。したがって、BCGにおける抗原過剰発現から得られた利点は、ワクチン構築プロセスの最初に強力な親BCG株を選択することによって、得ることもできる。この解決法は後知恵から見れば自明であるように思われるが、当技術に明るい者たちもこの埋め合わせ的工夫をしておらず(Horwitzほか、Proc Natl Acad Sci USA 97(25):13853−13858;2000)、これまでは、rBCGワクチン作成前に親BCG株が適切な能力を示すかどうか最初に決めることは一般的でも必須でもなかったことを明らかにしている。このような株類は、BCGおよびTB抗原類または外来性抗原類の過剰発現に非常に適している。
上にも述べたとおり、BCG免疫原性は、変動しないというものではない。さらに、実施例1は、BCG抗原類の免疫原性はBCGを遺伝子修飾することで増強できるが、組み換え変化を行った親BCG株がモルモットチャレンジモデルにおいて能力を欠いているならば、このような修飾が非現実的となることを示している。この規則から推定すれば、BCGの免疫原性をさらに増強する修飾はまた、このような親株類に由来する組み換え株類の免疫原性をさらに増強するであろう。
非抗生物質選択システムの開発
上にも述べたとおり、rBCG株類において防御性抗原類の過剰発現に現在利用されているプラスミド類は、維持のために抗生物質耐性遺伝子類に依存していること、および、これらのプラスミド類が広範囲の微生物宿主に水平移行できるというそれらに固有の能力により、環境生物に対して抗生物質耐性遺伝子類と抗原発現カセット類を伝播するかもしれないという恐れがあるので、受け入れられない。こうした重大な限界を克服するため、本発明は、rBCGのようなマイコバクテリウム宿主株類に発現ベクター類を導入し維持するための新規非抗生物質選択システムおよびワンウェイシャトルシステムを記載する。
上記操作では、M.tbおよびrBCGにおける発現ベクターの維持のための選択システムを新たに作る手法を述べた。しかし、このベクターシステムは、マイコバクテリウム中に導入する前にプラスミド構造の効率的取り扱いを可能とするためには、大腸菌中で複製できなければならない。さらに、プラスミド構築時に利用できる強力な組み換え大腸菌宿主株類の種類を多くしてプラスミド構築を円滑にするために研究者らが大腸菌宿主を使用できるようにするため、発現ベクター中に抗生物質選択マーカー(例 カナマイシン耐性)および広範囲の複製開始点を含ませることが好適である(例 OriE;Halpernほか、Proc Natl Acad Sci,USA 76(12):6137−6141;1979;Mosigほか、New Biol 1(2):171−179;1989)。これらの要素類は、独自の制限酵素エンドヌクレアーゼ消化部位(例 NdeI)に隣接し、標的マイコバクテリウム株類にプラスミドを導入する前に抗生物質耐性マーカーおよびE.coli複製開始点を除去できるようにする。さらに、抗原発現カセットを導入できる独自の制限酵素エンドヌクレアーゼ部位(例 PacI)も含む。
本発明において、ワンウェイシャトルベクター中の発現カセット中に取り込まれ次にrBCGに取り込まれた遺伝子は、M.tb免疫原をコードすることもできる。このM.tb免疫原は、例えば、天然の全長タンパク質、2種以上のM.tb免疫原類またはその模倣物類間でのキメラ融合体、またはMycobacterium tuberculosis由来のM.tb免疫原の断片または断片類であることもできる。
本発明において、マイコバクテリウムが保有するワンウェイシャトルベクター中発現カセットは、免疫原をコードでき、それは、ウイルス、細菌性または寄生病原体由来の外来性免疫原であるか、または、自己免疫抗原または癌抗原のような内因性免疫原のいずれかであるが、自己免疫抗原または癌抗原に限定されることはない。前記免疫原は、例えば、天然型全長タンパク質;外来性免疫原と内因性タンパク質または模倣体とのキメラ融合体;またはウイルス、細菌および寄生病原体から派生する免疫原の断片または断片類であり得る。
rBCGは、免疫原およびアジュバントをコードするように構築でき、rBCGに対する宿主応答を増大させるために用いることができる。これとは別に、rBCGはアジュバントをコードするように構築でき、他のrBCGと混合してパートナーrBCGによってコードされた免疫原類に対する宿主応答を増大させることができる。
rBCGは、免疫原およびサイトカインをコードするように構築でき、これを用いて、rBCGに対する宿主応答を増大させることができる。これとは別に、rBCGは前記サイトカインのみをコードするように構築することもでき、他のrBCGと混合して、パートナーrBCGによってコードされた免疫原類に対する宿主応答を増大させることができる。
方法類
マイコバクテリウム株類の培養
選択したBCG株類を、ミドルブルック(Middlebrook)7H9またはソールトンシンセティック培地(Saulton Synthetic Medium)のような液体培地中で好適には37℃で培養する。前記株類は、静止または攪拌培養物として維持できる。さらに、BCGの増殖率は、オレイン酸(0.06%v/v;Research Diagnostics,Cat.No.01257)およびタイレキサポル(Tyloxapol)(0.05%v/v;Research Diagnostics Cat.No.70400)のような界面活性剤類を添加することで、高めることができる。BCG培養物の純度は、Middlebrook 7H10のような固体培地25−30mlを含む3.5インチのプレート上に、リン酸緩衝生理食塩水(本文でPBSと称する)で系列希釈(例 無希釈から10倍ずつ10−8まで)したBCG培養物アリコットを100μlずつ均等に広げて、評価できる。さらに、前記培養物の純度は、チグリケート培地(Science Lab,カタログ番号#1891)および大豆カシン培地(BD、カタログ番号#211768)のような市販のキット類を用いて、評価できる。
制限酵素エンドヌクレアーゼ(本明細書で、“REs”と表記;New England Biolab,Beverly、MA)、T4 DNAリガーゼ(New England Biolab,Beverly、MA)およびTaqポリメラーゼ(Life Technologies,Gaithersburg,MD)を、製造業者のプロトコールに従って用いる;プラスミドDNAは、小型(Qiagen MiniprepRキット、Santa Clarita,CA)または大型(Qiagen MaxiprepRキット、Santa Clarita,CA)プラスミドDNA精製キットを、製造業者のプロトコール(Qiagen、Santa Clarita,CA)に従い用い、調製する;ヌクレアーゼを含まない分子生物学等級のmilli−Q水、Tris−HCl(pH7.5)、EDTA pH8.0、1M MgCl2、100%(v/v)エタノール、超純粋アガロース、およびアガロースゲル電気泳動緩衝液は、Life Technologies、Gaithersburg、MDから購入する。RE消化、PCRs、DNA連結反応およびアガロースゲル電気泳動は、周知の操作(Sambrookほか、Molecular Cloning:A Laboratory Manual.1,2,3;1989);Strausほか、Proc Natl Acad Sci USA.Mar;87(5)1889−93;1990)に従い行う。下記の章で述べる各組み換えプラスミドのDNA配列を明らかにするためのヌクレオチド配列決定は、Applied Biosystems自動シークエンサーモデル373Aを用いて、従来の自動DNA配列決定法により、実施できた。
先行技術では、マイコバクテリウム株類に改変対立遺伝子類を導入する方法を教示しており、当業者は、このような方法を理解しかつ実行できるであろう(Parishほか、Microbiology 146:1969−1975;2000)。対立遺伝子交換プラスミドを調製するための新しい方法では、合成DNAを用いることを含む。この手法の利点は、調製プラスミドが極めて明らかな調製の経緯を有しており政府規制に沿ってコンプライアンスを有していることであろう。一方これまでに用いられてきた方法は、効果的ではあるが、ラボでの培養記録記載が満足のいくものではなくしたがってコンプライアンスを有しているとはいえないであろう。上記規制へのコンプライアンスは、もしヒトでの使用のために製品のライセンスを米国および欧州政府当局から取得しようとするならば、必須である。
ワクチン処方の戦略は、製造プロセス全てにおいて、最大の生存度と安定性を求めるための研究に基づいて、作成する。これには、マイコバクテリウム菌の培養のために一般的に用いられるさまざまな培地を利用した培養時において、最大菌生存度(生きているか死んでいるか)を調べることが含まれ、培養には、グリセロール、糖類、アミノ酸類、および界面活性剤類または塩類の添加を含む。遠心分離または接線フローろ過により培養細胞を採取した後、凍結または凍結乾燥プロセスにおいて細胞を保護できる安定化培地に再懸濁する。一般的に用いられる安定化剤には、グルタミン酸ナトリウム、またはアミノ酸またはアミノ酸誘導体類、グリセロール、糖類または一般的に使用される塩類が挙げられる。最終処方は、十分に高い生存度の菌体を提供し、それらは、筋肉内、経皮注入、潅流または経口投与により運搬され、維持のための十分な安定性と市販および使用のための適切な保存期間を有しているであろう。
一般的安全性試験
1群6匹のBALB/cマウスを、問題のrBCG株(類)および同族の親株類2×106CFUで腹腔内感染させる。前記動物を全身健康と体重について感染後14日間、モニタリングする。BCGおよびrBCG株類を投与した動物は健康のままであり、観察期間中体重減少を起こすこともなく、あるいは病気の明らかな症状も示さない。
BALB/cマウス15匹を1群とし、これらに静注でそれぞれrBCGおよびBCG親株 2×106CFUを感染させる。感染第1日において、各群のマウス3匹を屠殺し、脾臓、肺および肝臓におけるCFUを分析し、各動物が同等の感染量であるようにする。感染後第4、8、12および16週において、各群のマウス3匹を屠殺し、脾臓、肝臓および肺におけるCFUを得て、親BCG株と比較してrBCG株類のインビボ増殖を評価する。rBCG株類は、親BCGと同等の毒性を示すと考えられる。
各群10匹としてSCID(重症複合免疫不全症)を有する免疫妥協マウスに、静注でそれぞれrBCGおよびBCG親株 2×106cfuを感染させる。感染後第1日において、各群のマウス3匹を屠殺し、脾臓、肝臓および肺におけるcfuを分析し、接種用量を確認する。各群7匹の残りのマウスは、全身状態および体重をモニタリングする。これらのマウスの生存を追跡し、全観察期間において親株感染動物よりもrBCG感染マウスの生存が悪くないときに良好な結果が得られる。
rBCG株類の安全性をまた、親BCGワクチンと比較しモルモットモデルで評価すると、ヒトにおける十分に確立された安全性を有している。最初に、動物の全般健康状態に及ぼすワクチンの効果を検討するが、それには、体重も含める。モルモットは、組み換えおよび親株類を107(ワクチン用量の100倍)cfu筋肉注射で免疫し、6週間、全般健康状態と体重をモニタリングする。この6週間という期間の前に死亡した動物については、死後検査も行う。感染後6週間の期間が終わった時点で、動物は全て屠殺し、総合病理検査を行う。体重減少および異常行動は全くなく、この6週時剖検において全ての臓器は正常のように見える。rBCG−Pfoワクチンについて、全く健康に対する悪影響が見られずしかも親株を接種した動物に比較して正常速度で動物が体重を増やす時、試験成功が示唆される。
rBCG株類の毒性を評価するため、各群12匹のモルモットを、それぞれ、ヒト用rBCG株類、BCG親株または生理食塩水の単回投与量よりも4倍の1回投与量または4分の1の1回投与量で、筋肉内投与によりワクチン接種する。ワクチン後第3日において、動物6匹を屠殺し、これらの動物に及ぼすワクチンの急性効果を評価する。ワクチン後第28日において、残りの動物6匹を屠殺し、動物に及ぼす慢性効果を評価する。両方の時点で各動物の体重を調べ、全般病理状態と注射部位の様子を調べる。血液を採取し、血液検査を行い、内臓および注射部位の組織病理を調べる。
マウス防御研究
1群13匹としたC57Bl/6マウス(雌性、5−6週齢)を、皮下からrBCG、親BCGまたは生理食塩水106cfuで免疫するであろう。別のマウス群は、健常対照として使用する。免疫後8週時点で、マウスに対して、M.tb Erdman株(または、H37Rv Kan耐性株)を総計107CFU含む10mlの単細胞懸濁液から作製したエアゾールとして、このチャレンジ株によりチャレンジするが、この量は、先にも述べたように各動物の肺に100個の生きている菌を伝播する。チャレンジしていない動物とともに、実験動物の生存をモニタリングする。チャレンジ後、体重減少と全般健康状態についても動物をモニタリングする。チャレンジ後第1日において、各群3匹のマウスを屠殺し、肺におけるcfuを調べ、チャレンジ用量を確認し、動物1匹は、脾臓および肺の組織病理検査のために屠殺する。その後、チャレンジ後第5週において、各群の動物9匹を屠殺し、動物の組織病理検査と顕微鏡検査を行う。マウス6匹の肺と脾臓組織を、cfu計測のために評価する(選択サプリメントを有するプレートを用いて、チャレンジ株からワクチン株を識別する)。もしH37Rv−kan耐性株でチャレンジするならば、KanまたはTCHを用いてワクチン株からチャレンジ株を識別する。もしM.tb Erdman株をチャレンジに使用するならば、TCHを用いてチャレンジ株からワクチン株を識別する(BCGは感受性であるが、M.tbは本来耐性である)。
SPFモルモットを、rBCGまたは親BCG株103により筋肉注射で免疫するであろう。免疫後9週で、動物背部の毛を剃り、リン酸緩衝生理食塩水100μl中のPPD10μgを筋肉内注射する。24時間後、硬い硬変部の直径を測定する。rBCG株は、親BCG株類で誘導した硬変と同じかそれよりも大きいDTHを誘発する。
M.tbチャレンジに対してのrBCGワクチン類の有効性を調べるため、各群12匹のモルモット(若い成熟SPFハートレイ(Hartley)、250−300グラム、雄性)を、rBCG、親BCG株または生理食塩水で免疫する。ワクチン類および対照は、106cfuを筋肉注射で投与する。免疫後10週時点で、rBCG免疫動物、BCG免疫動物および偽免疫動物に対して、M.tbを総計107cfu含む10mlの単細胞懸濁液から作製したエアゾールでチャレンジする;この操作では、先にも述べたように各動物の肺に約100個の生きている菌を伝播する(Brodinほか、J Infect Dis.190(1)、2004)。チャレンジ後、ワクチン接種していない未チャレンジの健常群とともに、動物の生存をモニタリングする。チャレンジ後、体重減少と全般健康状態についても動物をモニタリングする。各群から6匹のマウスをチャレンジ後第10週で屠殺し、各群中残りの6匹は、チャレンジ後第70週で屠殺したが、それは、長期評価のためである。両方の時点において、動物の組織病理検査と顕微鏡検査を行うであろう。肺および脾臓組織を、組織病理検査とcfu計測のために評価する(選択サプリメントを有するプレートを用いて、チャレンジ株からワクチン株を識別する)。もしH37Rv−kan耐性株でチャレンジするならば、KanまたはTCHを用いてワクチン株からチャレンジ株を識別する。もしM.tb Erdman株をチャレンジに使用するならば、TCH(BCGは感受性であるが、M.tbは本来耐性である)を用いてチャレンジ株からワクチン株を識別する。チャレンジ後偽免疫動物が最も早く死亡し、一方、rBCG免疫動物がBCG親株免疫動物よりも長く生存すれば、成功が示唆される。
さらに最近になってカニクイザルを用いてM.tbに対するワクチン接種の評価が行われた。ヒトと非ヒト霊長類の進化上の関係とこれらの種における結核の臨床および病理的表れ方が似ていることにより、TBとワクチン効果についての実験的研究にとってこの非ヒト霊長類モデルが魅力的となっている。
本研究では、組み換えBCG単独投与またはrBCG構築物中に過剰発現される配列類を含むワクチンをその後2回追加接種する投与を、さまざまな用量のBCG親株投与と直接比較するであろう。後者は、適当なアジュバント処方に基づく組み換えタンパク質、DNAまたはAd35構築物類のいずれかとして運搬できた。
安全性と毒性試験:
規制ガイドラインにより規制されている前臨床安全性および毒性試験を、上記のような前臨床毒性および安全性試験として行う。これらを調べた後、ヒト安全性試験を行う。これらの研究は、健常クアンティフェロン(Quantiferon)陰性成人で当初行い、その後、小児および新生児に年齢を移行して行う。
マウスおよび霊長類における免疫原性研究では、INFγのような細胞免疫評価のための標準的手法類、ELISPOTおよび/またはフローサイトメトリを短期および長期抗原またはペプチド刺激とともに用いるが、これらに限定されない。同様の方法論は、ヒト応答を評価するために利用する。テトラマー研究を、ヒトワクチン後のCD4およびCD8応答を評価するために用いる。
rBCGは、TBまたは関連トランスジーン類を発現するように工学的に作製した他の疾患に対する単独ワクチンとしても、同様に作用する。本文では、“トランスジーン”は、マイコバクテリウムプロモータに機能的に連結して問題のタンパク質を発現するDNAセグメントである。本文でTBに対するワクチンとしてまたは他の疾患に対する防御のためのトランスジーンを発現するワクチンとして述べたrBCGは、また、アジュバントまたはウイルスまたは細菌ベクター抗原類と混合した組み換えタンパク質類による追加免疫のための免疫系を用意するためにも、非常によく作用する。動物前臨床研究およびヒト前臨床研究の両者において、BCGプライムとその後の組み換えタンパク質/アジュバントまたはベクターブーストを、投与法および用量の観点から最適化する。これらのプライムブースト戦略は、ヒトにおいて免疫を誘発するための最も強力な手段であり、その理由は、特に本発明の態様にあるBCGのプライム能力とその後組み換えタンパク質またはベクターが免疫系のブースター応答を集束させ増強させることにある。
C57Bl/6マウスを用いて、潜伏感染を確立し;低用量感染によって無視可能なM.tb特異的免疫性が誘発された時点およびM.tb特異的免疫性がメモリT細胞で低下され圧倒される別の時点で、治療用ワクチンをマウスに投与するであろう。ワクチン類の治療上の利点は、その後、最終処置用ワクチン投与後2ヶ月および5ヶ月にマウスで、各マウスの肺および脾臓におけるcfuを計数することにより、評価されるであろう。このcfu計数値を、マウス群で標準的統計方法により分析し、その結果を用いて治療的ワクチン接種がマウスにおいて潜伏M.tb感染を有意に低下させるかどうかを分析し;同様の方法論を用いて、必要に応じて他の動物の応答評価のために利用する。
本発明のrBCGによる標的動物の経口ワクチン投与はまた、先に記載した方法類を用いて行うことができる(Millerほか、Can Med Assoc J 121(1):45−54;1979)。経口投与したrBCG量は、対象の種により、また治療しようとしている疾患または状態に応じて、変わるであろう。一般的に、使用した投与量は、生きている菌体約103乃至1011個であり、好適には生きている菌体約105乃至109個であろう。
(実施例)
既存のrBCG30ワクチンで行った研究の例として、モルモットでの大規模研究を行い、その目的は、親BCG Tice株および市販され世界中で広くヒトで使用されているもうひとつのBCGワクチン(SSI−1331)と2種のロットのrBCG30の防御効果を比較することであった。この2種のrBCG30ロットは、ヒトでの用途のために実験室条件で作製されたか(rBCG30−UCLA)またはGMP条件下で製造されたもの(rBCG30−KIT)である。
1)rBCG30(UCLA)およびBCG Danish 1331はより防御性が高い;および
2)BCG(親Tice株)およびrBCG30(KIT)は防御性が低い。
BCG Danish 1331株におけるleuD遺伝子ノックアウトプラスミド構築体:
leuD遺伝子の左側および右側にある1kbの隣接領域を、DNA合成により(DNA2.0、CA)組み立て、両端にpacI部位を有する2kbのDNAセグメントを作製した。PacI制限酵素消化とその後の連結を用いて、上記対立遺伝子交換プラスミド中にこのDNA断片をクローニングし、leuDノックアウトプラスミドを作製した。
leuD遺伝子の不活性化を上記のように行うが、ただし、leuD遺伝子ノックアウト株については、培地にロイシン50μg/mlを添加するであろう。この操作の主要段階のフローチャートを図4に示す。
表現型試験:
得られた株について、増殖にロイシン添加が必要かどうかを試験する。具体的に述べると、菌をロイシン50μg/ml存在下または非存在下において10%OADCおよび0.05%(v/v)タイロキサポル(Tyloxapol)を添加した7H9培地中で培養し、菌増殖を、OD600値を測定することによって、モニタリングする。
構築した株のゲノムDNAを、先に述べたようにして調製する。標的遺伝子の左側および右側両方の1kb隣接領域に相補性のプライマー対をPCR増幅に用い、染色体から約2kbの断片を得る。このPCR産物の配列を決定し、この領域にleuD遺伝子がないことを確認する。
DNA操作:
M.tb抗原類TB10.4(Rv0288)、Ag85B(Rv1886c)およびAg85A(Rv3804c)は、Ag85B+Rv3130から得たプロモータを用いて、この順序でポリシストロンとして発現させる(Florczykほか、同上、2003)。配列KDELを有するペプチドをコードするDNA配列類を、小胞体保持シグナルとして各抗原の末端に置き、各抗原について抗原提示性を向上させる。さらに、5´ループ構造および3´転写終止配列を置き、転写ポリシストロンmRNAの安定性を確保する。最後に、制限酵素PacI配列を用いて両端に隣接させ、発現カセットが容易に発現ベクター中にクローニングされるようにする。発現カセット中の全てのDNAは、遺伝子合成により作製する(Picoscript社、TX)。発現カセットを、PacI部位を利用して発現ベクター中にクローニングする。大腸菌中で増幅させた後、プラスミドをNdeIで消化し、oriEとカナマイシン耐性遺伝子を除去し、その後消化して、ワンウェイシャトルシステムを新たに作製し、それを次に、標準的エレクトロポレーション操作を用いてマイコバクテリウムleuD栄養素要求性変異体に導入する(Parishほか、Microbiology,145:3497−3503;1999)。図3は、非抗生物質発現ベクターの例を概略、図示している。
非抗生物質選択システムの宿主として用いるロイシン栄養素要求性BCG Danish 1331を、10%OADC(オレイン酸−アルブミン−デキストロース−カタラーゼ)、0.05%(v/v)Tyloxapolおよびロイシン50μg/mlを添加した7H9培地中で培養する。エレクトロポレーション後、抗原発現プラスミドを保有する組み換え株類を、ロイシンを含まない7H10プレート(BD Difco)に接種することによって単離する。菌の生存は、プラスミドによるleuD遺伝子の抗原発現に依存性で、それは、細胞中にプラスミドを保持するメカニズムとして次に作用する。生成したそれぞれのコロニーを単離し、上記の7H9培地で培養するが、ただし、ロイシン添加は行わなかった。
各抗原の発現は、ウェスタンブロット分析により検出する。具体的には、培養上清を採取し、先に記載したとおり処理する(Harthほか、Infect Immun 65(6):2321−2328;1997)。その後、発現した抗原をSDS−PAGEゲルで分離し、抗原85A,85Bおよび10.4に対する抗体でブロッティングする。各抗原の発現レベルは、発現プラスミド陰性宿主菌が産生したものと比較して各特異的バンドの強度を定量的に測定することによって、評価する。
エレクトロポレーション用プラスミドおよびマイコバクテリウム調製:
組み換えプラスミドDNAを単離し、制限エンドヌクレアーゼNdeI(New England Biolabs)で消化し、抗生物質選択マーカー(例 カナマイシン耐性)および大腸菌の複製開始点(OriE)を放出させる。その後、消化したプラスミドDNA断片を、T4 DNAリガーゼ(New England Biolabs)を用い製造業者の指示に従い環状にした。生成したプラスミドは、マイコバクテリウムの複製開始点と選択抗原類を含むが抗生物質耐性遺伝子を有さずグラム陰性菌で複製できず、それを、選択したマイコバクテリウムに導入した。エレクトロポレーション用マイコバクテリウムを調製するため、BCG Danish 1331を、10%OADCを添加したMiddlebrook 7H9培地(BD Biosciences)中37℃で対数増殖相になるまで培養した。Tyloxapol(0.05%v/v、Research Diagnostics Cat.No.70400)を用いて菌を分散させた。その後細胞を10%グリセロール+0.05%Tyloxanolで3回、洗浄し、エレクトロポレーション前に培地を除去した。各エレクトロポレーションのため、菌体1.25×108についてプラスミド1.6μgを用いた。エレクトロポレーションは、2.2kV,容量25μFおよび抵抗1.0kΩで行った。エレクトロポレーション後、細胞をすぐに10倍希釈物としてMiddlebrook 7H10寒天(BD Biosciences)プレート上に置き、37℃でインキュベーションした。
組み換え株類は、最初に、フォーワードプライマーGTTAAGCGACTCGGCTATCG(配列番号1)およびリバースプライマーATGCCACCACAAGCACTACA(配列番号2)を用いてPCRによりスクリーニングし、発現プラスミド中においてoriM領域のDNA配列を増幅させる。PCRパラメータは下記のようであった:段階1:95℃で4分間を1サイクル;段階2:95℃で1分間、60℃で1分間、およびその後72℃で1分間を総計30サイクル;段階3:72℃で10分間を1サイクル。段階4:4℃で保存。生成したPCR生成物は、アガロースゲル電気泳動で分析し、細胞中において前記プラスミド類の存在を証明した。
プラスミドの複製領域(oriM)を増幅するために設計したPCRを行い、生成したコロニーについて過剰発現プラスミドを保有しているか、スクリーニングした。この領域は菌染色体に存在していないので、細胞中にこの領域が存在することは、プラスミドが細胞中に導入されたことを強く示唆している。スクリーニングしたrBCGコロニー中、いくつかのコロニーがPCR産物を産生し、その産物は、大きさがプラスミド陽性対照反応のものと類似しており、そのことは、ゲル電気泳動で分析した。対照的に、親BCG菌は図5に示したように、全くPCR産物を産生しなかった。この実験は、このプラスミドがマイコバクテリウム中にうまく取り込まれたことおよびこのプラスミドを保有する菌クローンが、抗生物質選択を用いることなく単離されたことを明らかに証明している。
組み換えマイコバテクリウム株類用従来のプラスミド類は、組み換えDNA実験で用途を有する必須プラスミド要素としての複製領域と選択マーカーを含む(通常、カナマイシン耐性遺伝子のような抗生物質耐性遺伝子または例えばleuDまたはasdのような代謝欠陥を補完する遺伝子(Galanほか、Gene,94:29;1990))。通常は、抗生物質類を用いて組み換えプラスミド類を保有するクローン類を選択する。しかし、これにより、抗生物質耐性遺伝的修飾生物体を実験室内部に限定した以外の用途に使用しようとする場合、抗生物質耐性遺伝子類が意図に反して広がってしまうリスクがでてくる。
Claims (2)
- 問題のタンパク質の遺伝子をコードする外来性ヌクレオチド配列を含む形質転換マイコバクテリウムまたはその子孫であって、前記形質転換マイコバクテリウムがグラム陰性菌で複製できないプラスミドを含むことと、抗生物質耐性を示さないこと、および栄養素要求性であることと、前記外来性ヌクレオチド配列が前記プラスミドの一部であり、前記プラスミドが選択可能なマーカーを欠いており、前記タンパク質が生存に必要なタンパク質であって前記形質転換マイコバクテリウムの菌ゲノムから欠失させたヌクレオチド配列でコードした生存タンパク質に対応するタンパク質であることとを特徴とする形質転換マイコバクテリウムまたはその子孫。
- 前記タンパク質がleuDである請求項1記載の形質転換マイコバクテリウムまたはその子孫。
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