JP5409658B2 - 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用 - Google Patents

静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用 Download PDF

Info

Publication number
JP5409658B2
JP5409658B2 JP2010550884A JP2010550884A JP5409658B2 JP 5409658 B2 JP5409658 B2 JP 5409658B2 JP 2010550884 A JP2010550884 A JP 2010550884A JP 2010550884 A JP2010550884 A JP 2010550884A JP 5409658 B2 JP5409658 B2 JP 5409658B2
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
snp
nucleic acid
snps
allele
seq
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
JP2010550884A
Other languages
English (en)
Other versions
JP2011517935A5 (ja
JP2011517935A (ja
Inventor
ランス バレー，
ジェームス デブリン，
フリッツ アール． ロセンダール，
ピーター エイチ． レイツマ，
イレーナ ディー． ベゼマー，
Original Assignee
セレラ コーポレーション
レイデン ユニバーシティ メディカル センター （エルユーエムシー） アクティング オン ビハーフ オブ アカデミック ホスピタル レイデン （エーゼットエル）
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by セレラ コーポレーション, レイデン ユニバーシティ メディカル センター （エルユーエムシー） アクティング オン ビハーフ オブ アカデミック ホスピタル レイデン （エーゼットエル） filed Critical セレラ コーポレーション
Publication of JP2011517935A publication Critical patent/JP2011517935A/ja
Publication of JP2011517935A5 publication Critical patent/JP2011517935A5/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP5409658B2 publication Critical patent/JP5409658B2/ja
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/335—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin
    • A61K31/35—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having six-membered rings with one oxygen as the only ring hetero atom
    • A61K31/352—Heterocyclic compounds having oxygen as the only ring hetero atom, e.g. fungichromin having six-membered rings with one oxygen as the only ring hetero atom condensed with carbocyclic rings, e.g. methantheline 
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/4353—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom ortho- or peri-condensed with heterocyclic ring systems
    • A61K31/4365—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom ortho- or peri-condensed with heterocyclic ring systems the heterocyclic ring system having sulfur as a ring hetero atom, e.g. ticlopidine
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/44—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof
    • A61K31/4427—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems
    • A61K31/4439—Non condensed pyridines; Hydrogenated derivatives thereof containing further heterocyclic ring systems containing a five-membered ring with nitrogen as a ring hetero atom, e.g. omeprazole
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33—Heterocyclic compounds
    • A61K31/395—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/435—Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with one nitrogen as the only ring hetero atom
    • A61K31/47—Quinolines; Isoquinolines
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/60—Salicylic acid; Derivatives thereof
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/715—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/715—Polysaccharides, i.e. having more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic linkages; Derivatives thereof, e.g. ethers, esters
    • A61K31/726—Glycosaminoglycans, i.e. mucopolysaccharides
    • A61K31/727—Heparin; Heparan
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00—Drugs for disorders of the respiratory system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
    • A61P7/02—Antithrombotic agents; Anticoagulants; Platelet aggregation inhibitors
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00—Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/10—Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N35/00—Automatic analysis not limited to methods or materials provided for in any single one of groups G01N1/00 - G01N33/00; Handling materials therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/118—Prognosis of disease development
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/158—Expression markers
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/172—Haplotypes

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Vascular Medicine (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Description

本発明は、血栓症の診断および療法の分野にある。特に、本発明は、ヒトゲノム中の特異的な一塩基多型（ＳＮＰ）、ならびに静脈血栓症（ＶＴ）および関連する病態とのそれらの関連性に関する。正常な個体と比較した、患者集団における対立遺伝子頻度の差異に基づいて、本明細書において開示される天然に存在するＳＮＰは、診断試薬の設計および治療剤の開発ならびに疾患関連性および連鎖解析のための標的として使用され得る。特に、本発明のＳＮＰは、静脈血栓症を発症する危険性が増加または減少している個体を同定するため、疾患を早期に検出するため、静脈血栓症の予防および／または処置のために臨床的に重要な情報を提供するため、治療剤をスクリーニングし、選択するため、ならびに患者の治療剤に対する応答を予測するために有用である。本明細書において開示されるＳＮＰはまた、ヒト識別への適用にも有用である。これらの多型およびそれらのコード産物の存在を検出するための方法、アッセイ、キットおよび試薬が提供される。
静脈血栓症（ＶＴ）
血餅の発症は、血栓症として公知である。静脈血栓症（ＶＴ）は、静脈における血餅の形成である。ＶＴはまた、静脈血栓塞栓症（ＶＴＥ）と呼ばれ得る。ＶＴの２００，０００例を超える新しい症例が、毎年生じている。これらのうち、患者の３０パーセントは、３日以内に死亡し、５人のうち１人は、肺塞栓症（ＰＥ）により突然死する（Ｓｅｍｉｎａｒｓ ｉｎ Ｔｈｒｏｍｂｏｓｉｓ ａｎｄ Ｈｅｍｏｓｔａｓｉｓ、２００２年、２８巻、補足２）（Ｓｔｅｉｎら、Ｃｈｅｓｔ ２００２年；１２２巻（３号）：９６０〜９６２頁は、ＰＥについてさらに記載する）。白人およびアフリカ系アメリカ人は、ラテン系アメリカ人、アジア人、またはポリネシア人よりも有意に高度な発生率を有する（Ｗｈｉｔｅ， Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ １０７巻（２３号 補足１）：Ｉ４〜８頁 レビュー、２００３年）。
いくつかの条件が、静脈または動脈において血餅を発症する傾向の増加に至り得（Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｈｅｍｏｐｈｉｌｉａ Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ、ＨｅｍＡｗａｒｅ ｎｅｗｓｌｅｔｔｅｒ、６巻（５号）、２００１年）、そのような条件は、遺伝し得る（遺伝的）または獲得され得る。獲得される条件の例は、手術および外傷、長期の固定、癌、骨髄増殖性疾患、年齢、ホルモン療法、さらに妊娠などであり、これらのすべては、血栓症をもたらし得る（Ｓｅｌｉｇｓｏｈｎら、Ｎｅｗ Ｅｎｇ Ｊ Ｍｅｄ ３４４巻（１６号）：１２２２〜１２３１頁、２００１年およびＨｅｉｔら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ ２００１年；８６巻（１号）：４５２〜４６３頁）。家族および双子についての研究は、遺伝の（遺伝子の）原因が、ＤＶＴの危険性の約６０％を占めることを示す（Ｓｏｕｔｏら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ２０００年；６７巻（６号）：１４５２〜１４５９頁；Ｌａｒｓｅｎら、Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ ２００３年；１４巻（３号）：３２８〜３３２頁）。遺伝の原因は、第Ｖ因子遺伝子（第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎ（ＦＶＬ）改変体）、プロトロンビン遺伝子（第ＩＩ因子）、およびメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ遺伝子（ＭＴＨＦＲ）などの、いくつかの異なる凝固因子、抗凝固因子、または血栓溶解因子のうちのいずれかにおける多型を含む。他の、おそらく遺伝の原因は、第ＶＩＩＩ因子、第ＩＸ因子、もしくは第ＸＩ因子またはフィブリノーゲンの遺伝子の発現レベルにおける増加である（Ｓｅｌｉｇｓｏｈｎら、Ｎｅｗ Ｅｎｇ Ｊ Ｍｅｄ ３４４巻（１６号）：１２２２〜１２３１頁、２００１年）。天然抗凝固物質アンチトロンビン、プロテインＣ、およびプロテインＳの欠乏は、ＤＶＴについての強い危険因子となるが、これらの欠乏を引き起こす改変体はまれであり、すべてのＤＶＴのわずか約１％しか説明しない（Ｒｏｓｅｎｄａａｌら、Ｌａｎｃｅｔ １９９９年；３５３巻（９１５９号）：１１６７〜１１７３頁）。第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎ（ＦＶＬ）遺伝子改変体およびプロトロンビンＧ２０２１０Ａ遺伝子改変体は、一貫して、ＤＶＴと関連することが分かってきたが（Ｂｅｒｔｉｎａら、Ｎａｔｕｒｅ １９９４年；３６９巻（６４７５号）：６４〜６７頁およびＰｏｏｒｔら、Ｂｌｏｏｄ １９９６年；８８巻（１０号）：３６９８〜３７０３頁）、なお、ＤＶＴの事象のほんの一部分について説明するにすぎない（Ｒｏｓｅｎｄａａｌ， Ｌａｎｃｅｔ １９９９年；３５３巻（９１５９号）：１１６７〜１１７３頁；Ｂｅｒｔｉｎａら、Ｎａｔｕｒｅ １９９４年；３６９巻（６４７５号）：６４〜６７頁；Ｐｏｏｒｔら、Ｂｌｏｏｄ １９９６年；８８巻（１０号）：３６９８〜３７０３頁）。血液凝固因子（例えばＶＩＩＩ、ＩＸ、Ｘ、およびＸＩ）の血漿濃度の上昇もまた、ＤＶＴについての重要な危険因子であることが示された（それぞれ、Ｋｙｒｌｅら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ． ２０００年；３４３巻：４５７〜４６２頁；ｖａｎ Ｈｙｌｃｋａｍａ Ｖｌｉｅｇら、Ｂｌｏｏｄ． ２０００年；９５巻：３６７８〜３６８２頁；ｄｅ Ｖｉｓｓｅｒら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． ２００１年；８５巻：１０１１〜１０１７頁；およびＭｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ． ２０００年；３４２巻：６９６〜７０１頁）。
症候性のＶＴを有する患者の約３分の１は、肺塞栓症（ＰＥ）を発症するのに対して、３分の２は、深部静脈血栓症（ＤＶＴ）を発症する（Ｗｈｉｔｅ， Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ １０７巻（２３号 補足 １）：Ｉ４〜８頁 レビュー、２００３年）。ＤＶＴは、深部静脈における、通常大腿、脚、または骨盤における急性ＶＴであり、それは、入院患者に対して合併症として発生し得るが、その他に健康な人々にも影響し得る、重篤で、潜在的に致命的な障害である（Ｌｅｎｓｉｎｇら、Ｌａｎｃｅｔ ３５３巻：４７９〜４８５頁、１９９９年）。ＶＴにおける大きな血餅は、血液循環に干渉し、正常な血流を妨害し得る。いくつかの場合において、血餅は剥がれ、脳、心臓、またはＰＥと同様に肺などの遠位の主要な器官に移動し、致死をもたらし得る。ＶＴの第１のエピソードを有する患者が、抗凝固剤を用いて処置されることを示唆する証拠がある（Ｋｅａｒｏｎら、Ｎｅｗ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ３４０巻：９０１〜９０７頁、１９９９年）。
ＶＴは、エピソード性の再発を伴う慢性疾患であり、患者の約３０％は、ＶＴの第１の発生の後の１０年以内に再発を起こす（Ｈｅｉｔら、Ａｒｃｈ Ｉｎｔｅｒｎ Ｍｅｄ． ２０００年；１６０巻：７６１〜７６８頁；Ｈｅｉｔら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ ２００１年；８６巻（１号）：４５２〜４６３頁；およびＳｃｈｕｌｍａｎら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． ２００６年；４巻：７３２〜７４２頁）。ＶＴの再発は、本明細書において再発性ＶＴと呼ばれ得る。再発の危険は、偶発的な事象から時間と共に変化し、最初の６〜１２か月以内が最も高い。抗凝固は、再発を予防するのに有効であるが、一度、偶発的な事象のための一次療法が停止されたら、抗凝固の期間は、再発の危険性に影響しない（Ｓｃｈｕｌｍａｎら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． ２００６年；４巻：７３２〜７４２頁およびｖａｎ Ｄｏｎｇｅｎら、Ａｒｃｈ Ｉｎｔｅｒｎ Ｍｅｄ． ２００３年；１６３巻：１２８５〜１２９３頁）。再発の独立予測因子は、男性（ＭｃＲａｅら、Ｌａｎｃｅｔ． ２００６年；３６８巻：３７１〜３７８頁）、患者年齢およびボディマス指数の増加、脚の不全麻痺を伴う神経疾患、ならびに活性な癌を含む（Ｃｕｓｈｍａｎら、Ａｍ Ｊ Ｍｅｄ． ２００４年；１１７巻：１９〜２５頁；Ｈｅｉｔら、Ａｒｃｈ Ｉｎｔｅｒｎ Ｍｅｄ． ２０００年；１６０巻：７６１〜７６８頁；Ｓｃｈｕｌｍａｎら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． ２００６年；４巻：７３２〜７４２頁；およびＢａｇｌｉｎら、Ｌａｎｃｅｔ． ２００３年；３６２巻：５２３〜５２６頁）。追加の予測因子は、「特発性」静脈血栓症（Ｂａｇｌｉｎら、Ｌａｎｃｅｔ． ２００３年；３６２巻：５２３〜５２６頁）、ループス性抗凝固因子または抗リン脂質抗体（Ｋｅａｒｏｎら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ． １９９９年；３４０巻：９０１〜９０７頁およびＳｃｈｕｌｍａｎら、Ａｍ Ｊ Ｍｅｄ． １９９８年；１０４巻：３３２〜３３８頁）、アンチトロンビン、プロテインＣ、またはプロテインＳの欠乏（ｖａｎ ｄｅｎ Ｂｅｌｔら、Ａｒｃｈ Ｉｎｔｅｒｎ Ｍｅｄ． １９９７年；１５７巻：２２７〜２３２頁）、およびおそらく持続的に増加する血漿フィブリンＤ−二量体（Ｐａｌａｒｅｔｉら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ． ２００６年；３５５巻：１７８０〜１７８９頁）ならびに残存静脈血栓症（Ｐｒａｎｄｏｎｉら、Ａｎｎ Ｉｎｔｅｒｎ Ｍｅｄ． ２００２年；１３７巻：９５５〜９６０頁）を含む。
ＶＴおよび癌は、同時発生的なものとなり得る。１９６６年からＯｌｍｓｔｅｄ Ｃｏｕｎｔｙ、Ｍｉｎｎｅｓｏｔａの集団について前向き収集された臨床データによれば、一般住民における、ＤＶＴまたはＰＥの第１のエピソードの毎年の発生率は、１００，０００人のうち１１７人である。癌のみでは、血栓症の４．１倍の危険性と関連したのに対して、化学療法は、６．５倍、危険性を増加させた。これらの推定値を組み合わせると、２００人の癌患者における１人の癌患者におけるＶＴのおよその毎年の発生をもたらす（Ｌｅｅら、Ｃｉｒｃｕｌａｔｉｏｎ． ２００３年；１０７巻：Ｉ−１７〜Ｉ−２１頁）。手術、ホルモン療法、化学療法、および中心静脈カテーテルの長期使用などの外的因子は、癌関連性の前血栓状態を増加させる。手術後の血栓症は、非腫瘍性患者と比較して、癌を有する患者においてより頻繁に生じる（Ｒａｒｈら、Ｂｌｏｏｄ ｃｏａｇｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ ｆｉｂｒｉｎｏｌｙｓｉｓ １９９２年；３巻：４５１頁）。
したがって、特に、従来の危険因子に基づいて疾患の発症に対する素因を有すると認識されていない個体のための、ＶＴに対する素因を予測する新規な遺伝子マーカーが緊急に必要である。そのような遺伝子マーカーは、既存の危険因子およびバイオマーカーを使用することによって現在評価することができる集団と比較して、はるかに多くの集団におけるＶＴのスクリーニングを可能にし得る。遺伝子検査の利用可能性は、例えば、危険性が高い個体に提供されることとなる、急性静脈血栓症の事象のための適切な予防的処置を可能にし得る（そのような予防的処置は、例えば、抗凝固剤を含んでもよい）。さらに、ＶＴと関連する遺伝子マーカーの発見は、治療的介入または予防的処置のための新規な標的を提供し得る。
（ＳＮＰ）
全ての生体のゲノムは、それらの継続的な進化の過程で、自然発生性の突然変異を起こし、前駆遺伝子配列の改変形態を生じる（Ｇｕｓｅｌｌａ，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．５５，８３１−８５４（１９８６））。改変形態は、前駆形態に対して、進化上の利益もしくは不利益を与え得るか、または中立的である。いくつかの例において、改変形態は、その種に進化上の利益を与え、最終的に、その種の多くかまたはほとんどのメンバーのＤＮＡに組み込まれ、効率的にその前駆形態になる。さらに、改変形態の効果は、環境に依存して、有益でもあり有害でもある。例えば、ヘテロ接合性の鎌形赤血球突然変異はマラリアに対する耐性を与えるが、ホモ接合性の鎌形赤血球突然変異は通常は致死性である。多くの場合、前駆形態および改変形態の両方が生き残り、種の集団内で共存する。遺伝子配列の複数の形態の共存は、ＳＮＰを含む遺伝的多型をもたらす。
ヒトのゲノムにおける全遺伝子多型のおよそ９０％は、ＳＮＰである。ＳＮＰは、異なる対立遺伝子または代替的ヌクレオチドが集団内に存在するＤＮＡ中の一塩基の配置である。ＳＮＰ位置（本明細書において、交換可能に、ＳＮＰ、ＳＮＰ部位、ＳＮＰ座、ＳＮＰマーカーまたはマーカーと呼ばれる）には、通常、対立遺伝子の高度に保存された配列（例えば、集団のメンバーの１／１００もしくは１／１０００未満で異なる配列）が先行するか、または対立遺伝子の高度に保存された配列が後に続く。個体は、各ＳＮＰ位置における対立遺伝子に関して、ホモ接合性またはヘテロ接合性であり得る。ＳＮＰは、いくつかの例において、「ｃＳＮＰ」と呼ばれ、そのＳＮＰを含むヌクレオチド配列がアミノ酸をコードする配列であることを表し得る。
ＳＮＰは、多型部位における一ヌクレオチドの他への置換から生じ得る。置換は、転移または塩基転換であり得る。転移は、一プリンヌクレオチドの、他のプリンヌクレオチドによる置換、または一ピリミジンの他のピリミジンによる置換である。塩基転換は、ピリミジンによるプリンの置換またはその逆である。ＳＮＰはまた、「ｉｎｄｅｌ」（Ｗｅｂｅｒら、「Ｈｕｍａｎ ｄｉａｌｌｅｌｉｃ ｉｎｓｅｒｔｉｏｎ／ｄｅｌｅｔｉｏｎ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ」，Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ２００２ Ｏｃｔ；７１（４）：８５４−６２）と呼ばれる一塩基が挿入または欠失した改変体であり得る。
同義的コドン変化またはサイレント突然変異／ＳＮＰ（「ＳＮＰ」、「多型」、「突然変異」、「突然変異体」、「改変」、および「改変体」のような用語は、本明細書において、交換可能に使用される）は、遺伝暗号の縮重に起因する、アミノ酸の変化をもたらさないものである。一アミノ酸をコードするコドンを異なるアミノ酸をコードするコドンに変化させる置換（すなわち、非同義的コドン変化）は、ミスセンス変異と呼ばれる。ナンセンス変異は、非同義的コドン変化の一つの型を生じる。その中では、終止コドンが形成され、それによってポリペプチド鎖の早期終止および短縮型タンパク質を生じる。リードスルー突然変異は、停止コドンの破壊を引き起こし、それよって延長されたポリペプチド産物をもたらす、別の型の非同義的コドン変化である。ＳＮＰは、二対立遺伝子性（ｂｉ−ａｌｌｅｌｉｃ）、三対立遺伝子性（ｔｒｉ−ａｌｌｅｌｉｃ）、または四対立遺伝子性（ｔｅｔｒａ−ａｌｌｅｌｉｃ）であり得るが、大部分のＳＮＰは、二対立遺伝子性であり、したがって、多くの場合、二対立遺伝子マーカーまたはジアレリック（ｄｉ−ａｌｌｅｌｉｃ）マーカーと呼ばれる。
本明細書中で使用される場合、ＳＮＰおよびＳＮＰ遺伝子型への言及は、個別のＳＮＰおよび／またはハプロタイプを含み、これらは、一般的に互いに遺伝するＳＮＰの群である。ハプロタイプは、個別のＳＮＰと比較して、疾患または他の表現型効果とより強い相関を有し得、したがって、いくつかの場合、診断精度の上昇を提供し得る（Ｓｔｅｐｈｅｎｓら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２９３，４８９−４９３，２００１年７月２０日）。
原因（Ｃａｕｓａｔｉｖｅ）ＳＮＰは、遺伝子発現または遺伝子産物の発現、構造、および／または機能における変化を生じるＳＮＰであり、したがって、最も可能性のある臨床表現型として予測される。このような分類の一つとしては、ポリペプチド産物をコードする遺伝子領域に含まれるＳＮＰ（すなわち、ｃＳＮＰ）が挙げられる。これらのＳＮＰは、ポリペプチド産物のアミノ酸配列の変化をもたらし得（すなわち、非同義的コドン変化）、そして欠損型または他の改変型タンパク質の発現を生じる。さらに、ナンセンス変異の場合、ＳＮＰは、ポリペプチド産物の早期終結を生じ得る。このような変異体産物は、病的状態（例えば、遺伝病）を生じ得る。コード配列中のＳＮＰが遺伝病を引き起こす遺伝子の例としては、鎌形赤血球貧血および嚢胞性線維症が挙げられる。
原因ＳＮＰは、必ずしもコード領域に生じる必要はない；原因ＳＮＰは、例えば、最終的に核酸にコードされたタンパク質の発現、構造および／または活性に影響し得るあらゆる遺伝子領域に起こり得る。このような遺伝子領域としては、例えば、転写に関与する領域（例えば、転写因子結合ドメインにおけるＳＮＰ、プロモーター領域におけるＳＮＰ）、転写物のプロセシングに関する部位に関与する領域（例えば、不完全なスプライシングを引き起こし得るイントロン−エクソン境界におけるＳＮＰ、または、ｍＲＮＡプロセシングシグナル配列（例えば、ポリアデニル化シグナル領域）におけるＳＮＰ）、が挙げられる。いくつかのＳＮＰは、原因ＳＮＰではないが、やはり疾患を引き起こす配列に密接に関連し、したがって、疾患を引き起こす配列に分けられる。この状況において、ＳＮＰの存在は、疾患の存在、疾患の素因、または疾患発症の危険性の増加と関連する。これらのＳＮＰはまた、原因ＳＮＰでなくとも、やはり診断、疾患の素因のスクリーニング、および他の用途に有用である。
ＳＮＰと特定の障害との関連性の研究は、目的の障害（例えば、ＶＴ）を有する個体由来の生物学的サンプル中のＳＮＰ対立遺伝子の存在または頻度の決定、およびその情報と、好ましくは同様の年齢および人種のコントロール（すなわち、障害を有さない個体；コントロールは、「健康」個体、「正常」個体ともいわれる）との比較に関係する。患者およびコントロールの適切な選択は、ＳＮＰの関連性の研究の成功に重要である。したがって、十分特徴付けられた表現型を有する個体のプールが、非常に望ましい。
ＳＮＰは、疾患組織サンプルまたは疾患個体から得られた任意の生物サンプルにおいてスクリーニングされ得、コントロールサンプルと比較され得、特定の病的状態（例えば、ＶＴに関連する病態）の発生の増加（または減少）について選択され得る。一旦統計学的に有意な関連が、一以上のＳＮＰと目的の病的状態（または他の表現型）との間に確立された場合、このＳＮＰ周辺の領域は、必要に応じて十分にスクリーニングされて、この病的状態または表現型に影響する原因遺伝子座／配列（例えば、原因となるＳＮＰ／突然変異、遺伝子、調節領域など）を同定し得る。関連性の研究は、一般的な集団内で行われ得、罹患家系中の関係する個体において行われる研究（連鎖研究）に限定されない。
臨床試験は、医薬品による処置に応答する患者が、多くの場合、異種性であることを示した。医薬品の設計および治療を改善することへの必要性が引き続いて存在する。これに関して、ＳＮＰは、特定の医薬品による治療に最も適した患者を同定するために使用され得る（これは、多くの場合、薬理ゲノム科学と称される）。同様に、ＳＮＰは、患者が毒性の副作用を発現する可能性の増加、または患者がその処置に応答しない可能性に起因して、特定の処置から患者を除外するために使用され得る。薬理ゲノム科学はまた、薬学的研究に使用されて、薬物の開発および選択のプロセスを支援し得る。（Ｌｉｎｄｅｒら（１９９７），Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，４３，２５４；Ｍａｒｓｈａｌｌ（１９９７），Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１５，１２４９；Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｐａｔｅｎｔ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ＷＯ ９７／４０４６２，Ｓｐｅｃｔｒａ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ；およびＳｃｈａｆｅｒら（１９９８），Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１６，３）。
本発明は、ＶＴと関連する新規なＳＮＰ、そのようなＳＮＰの固有の組合せ、およびＳＮＰのハプロタイプの同定に関する。本明細書において開示される多型は、ＶＴの診断および処置における使用のための診断試薬の設計および治療剤の開発のための標的として直接有用である。
本発明は、例えば以下の項目を提供する。
（項目１）
ヒトにおいて静脈血栓症（ＶＴ）の危険性が変化しているかどうかを決定する方法であって、前記ヒト由来の核酸を、配列番号６０２〜１５８７のヌクレオチド配列のうちのいずれか１つの１０１位によって表される多型からなる群から選択される多型またはその相補体の有無について試験する工程を包含し、前記多型が、ＶＴの危険性の変化を示す方法。
（項目２）
前記ＶＴが、深部静脈血栓症（ＤＶＴ）である、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記多型が、表５〜９および１１〜３０の少なくとも１つに提供される多型からなる群から選択される、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記危険性の変化が、危険性の増加である、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記危険性の変化が、危険性の減少である、項目１に記載の方法。
（項目６）
前記核酸が、前記ヒト由来の生物学的サンプルからの核酸抽出物である、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記生物学的サンプルが、血液、唾液または頬の細胞である、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記試験工程の前に、前記生物学的サンプルからの前記核酸抽出物を調製する工程をさらに包含する、項目６に記載の方法。
（項目９）
前記調製工程の前に、前記生物学的サンプルを前記ヒトから得る工程をさらに包含する、項目８に記載の方法。
（項目１０）
前記試験工程が、核酸増幅を含む、項目１に記載の方法。
（項目１１）
前記核酸増幅が、ポリメラーゼ連鎖反応によって実施される、項目１０に記載の方法。
（項目１２）
前記多型の有無をＶＴの危険性の変化と相関させる工程をさらに包含する、項目１に記載の方法。
（項目１３）
前記相関工程が、コンピューターソフトウェアによって実施される、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記試験が、配列決定、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチド連結アッセイ、サイズ解析、一本鎖高次構造多型分析、または変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）を使用して実施される、項目１に記載の方法。
（項目１５）
前記試験が、対立遺伝子に特異的な方法を使用して実施される、項目１のいずれか１つに記載の方法。
（項目１６）
前記対立遺伝子に特異的な方法が、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、または対立遺伝子特異的増幅である、項目１５に記載の方法。
（項目１７）
表３に提供される対立遺伝子特異的プライマーを使用して実施される、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
自動化された方法である、項目１に記載の方法。
（項目１９）
前記ＶＴが、再発性ＶＴである、項目１に記載の方法。
（項目２０）
前記多型が、表２４に提供される多型からなる群から選択される、項目１９に記載の方法。
（項目２１）
前記ＶＴが、肺塞栓症（ＰＥ）を含む、項目１に記載の方法。
（項目２２）
前記多型が、表２５に提供される多型からなる群から選択される、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記ヒトが、癌を有する、項目１に記載の方法。
（項目２４）
前記多型が、表２６に提供される多型からなる群から選択される、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
ヒトにおいて静脈血栓症（ＶＴ）の危険性を低下させるための方法であって、有効量の治療剤を前記ヒトに投与する工程を包含し、前記ヒトが、配列番号６０２〜１５８７のヌクレオチド配列のうちのいずれか１つの１０１位によって表される多型からなる群から選択される多型またはその相補体の有無に起因して、ＶＴの危険性が増加していると同定されている方法。
（項目２６）
前記ヒト由来の核酸を、前記多型の有無について試験する工程を包含する、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
前記治療剤が、抗凝固剤を含む、項目２５に記載の方法。
（項目２８）
前記抗凝固剤が、ワルファリン（クマジン）、アセノクマロール、フェンプロクモン、およびフェニンジオンなどのクマリン（ビタミンＫアンタゴニスト）；ヘパリンおよび低分子量ヘパリンなどの誘導体物質；フォンダパリヌクス、イドラパリナックス、および第Ｘａ因子の他の合成五糖阻害剤などの第Ｘａ因子阻害剤；ならびにアルガトロバン、レピルジン、ビバリルジン、およびダビガトランなどのトロンビン阻害剤からなる群から選択される、項目２７に記載の方法。
（項目２９）
前記治療剤が、抗血小板薬を含む、項目２５に記載の方法。
（項目３０）
前記抗血小板薬が、アスピリンなどのシクロオキシゲナーゼ阻害剤ならびにクロピドグレル（Ｐｌａｖｉｘ）およびプラスグレル（Ｅｆｆｉｅｎｔ）などのＡＤＰレセプター阻害剤からなる群から選択される、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
静脈血栓症（ＶＴ）の危険性が増加しているヒトを同定する方法であって、前記ヒト由来の核酸サンプルを、第二の多型との連鎖不均衡である第一の多型の有無について試験する工程を包含し、前記第二の多型が、配列番号６０２〜１５８７のヌクレオチド配列のうちのいずれか１つの１０１位によって表される多型からなる群から選択される多型またはその相補体であり、前記第一の多型が、前記ＶＴの危険性が増加しているヒトを同定する方法。
（項目３２）
前記連鎖不均衡が、ｒ ２ ＝１である、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記第一の多型が、表４に記載される多型からなる群から選択される、項目３１に記載の方法。
（項目３４）
前記第一の多型の有無をＶＴの危険性の増加と相関させる工程をさらに包含する、項目３１に記載の方法。
（項目３５）
前記相関工程が、コンピューターソフトウェアによって実施される、項目３４に記載の方法。
（項目３６）
ａ）治療剤の臨床試験への採用のために前記ヒトを選択する工程、および
ｂ）臨床試験内の群に前記ヒトを割り当てる工程
の少なくとも１つをさらに包含する、項目１に記載の方法。
（項目３７）
前記治療剤が、抗凝固剤または抗血小板薬である、項目３６に記載の方法。
（項目３８）
ヒトにおいて静脈血栓症（ＶＴ）の危険性が変化しているかどうかを決定するためのキットであって、少なくとも１つの容器および前記容器中に保管される少なくとも１つのポリヌクレオチド検出試薬を含み、前記ヌクレオチド検出試薬が、配列番号６０２〜１５８７のヌクレオチド配列のうちのいずれか１つの１０１位によって表される多型からなる群から選択される多型またはその相補体の有無を検出することができるキット。
（項目３９）
前記ポリヌクレオチド検出試薬が、前記多型の存在下では前記核酸に選択的にハイブリダイズし、前記多型の非存在下では前記核酸にハイブリダイズしない、項目３８に記載のキット。

ＶＴと関連するＳＮＰの同定に基づいて、本発明はまた、これらの改変体を検出する方法、ならびにこのタスクを達成するために必要な検出試薬の設計および調製も提供する。本発明は、例えば、ＶＴに関与する遺伝子配列における新規なＳＮＰ、これらのＳＮＰを含む単離された核酸分子（例えばＤＮＡ分子およびＲＮＡ分子を含む）、そのようなＳＮＰを含む核酸分子によってコードされた改変型タンパク質、コードされた改変型タンパク質に対する抗体、新規のＳＮＰ情報を含むコンピューターベースのデータ記憶システム、試験サンプル中のこれらのＳＮＰを検出する方法、本明細書において開示される１つ以上のＳＮＰ部位の１つ以上の特定のヌクレオチド（対立遺伝子）の有無または１つ以上のコードされた改変体産物（例えば改変型ｍＲＮＡ転写物もしくは改変型タンパク質）の検出に基づいて、ＶＴを発症する危険性が変化している（すなわち増加もしくは減少している）個体を同定するための方法、多かれ少なかれ、処置に応答する可能性がある個体（または多かれ少なかれ、処置に由来する望ましくない副作用を経験する可能性がある個体など）を同定するための方法、改変型の遺伝子／タンパク質と関連する障害の処置において有用な化合物、これらの方法によって同定される化合物についてスクリーニングするための方法、改変型の遺伝子／タンパク質によって媒介される障害を処置する方法、ヒト識別に本発明の新規なＳＮＰを使用する方法などを特に提供する。
表１〜２において、本発明は、本発明のＳＮＰを含む、遺伝子情報、転写物配列（配列番号１〜１２５）、コードされたアミノ酸配列（配列番号１２６〜２５０）、ゲノム配列（配列番号４０４〜６０１）、転写物ベースのコンテクスト配列（配列番号２５１〜４０３）およびゲノムベースのコンテクスト配列（配列番号６０２〜１５８７）の同定に対する基準を提供し、そして観察された対立遺伝子、対立遺伝子頻度、対立遺伝子が観察された集団／民族群、ＳＮＰの型および対応する機能的効果についての情報、ならびに、ｃＳＮＰに関して、コードされたポリペプチド産物についての情報を含む大規模ＳＮＰ情報を提供する。実際の転写物配列（配列番号１〜１２５）、アミノ酸配列（配列番号１２６〜２５０）、ゲノム配列（配列番号４０４〜６０１）、転写物ベースのＳＮＰコンテクスト配列（配列番号２５１〜４０３）、ならびにゲノムベースのＳＮＰコンテクスト配列（配列番号６０２〜１５８７および配列番号２５５７〜２５８０）は、プライマー配列（配列番号１５８８〜２５５６）と共に、配列表に提供される。
本発明の一実施形態において、出願人らは、ＶＴを発症する危険性が変化している個体を同定するための方法を教示し、この方法は、前記個体の核酸中、配列番号１〜１２５、配列番号１２６〜２５０、配列番号２５１〜４０３、および配列番号４０４〜６０１のヌクレオチド配列のいずれか１つにおける一塩基多型（ＳＮＰ）または配列番号１〜１２５、配列番号１２６〜２５０、配列番号２５１〜４０３、および配列番号４０４〜６０１のヌクレオチド配列のいずれか１つで連鎖不均衡（ＬＤ）にあるＳＮＰを検出する工程を包含し、ＳＮＰは、それぞれ表１および表２において特定される通りであり、ＳＮＰの存在は、前記個体におけるＶＴの危険性の変化と相関する。本発明の特定の実施形態において、ヒトゲノム中の天然に存在するＳＮＰが、単離された核酸分子として提供される。これらのＳＮＰは、ＶＴと関連し、それらは、ＶＴおよび関連する病態の診断および／または処置において様々に使用することができる。代替の実施形態において、本発明の核酸は、ＳＮＰを含む核酸鋳型の増幅によって生成される増幅されたポリヌクレオチドである。別の実施形態において、本発明は、本明細書において開示されたＳＮＰを含む核酸分子によってコードされた改変型タンパク質を提供する。
本発明のなお別の実施形態において、ＳＮＰを、その天然に存在する隣接（ｆｌａｎｋｉｎｇ）ヌクレオチド配列（これは例えば、ＤＮＡもしくはｍＲＮＡのいずれかであり得る）と関連させて検出する試薬が提供される。特に、このような試薬は、例えば、目的とするＳＮＰの特異的検出に有用なハイブリダイゼーションプローブまたは増幅用プライマーの形態であり得る。代替の実施形態において、タンパク質検出試薬は、本明細書において開示されるＳＮＰを含む核酸分子によってコードされる改変型タンパク質を検出するために使用され得る。タンパク質検出試薬の好ましい実施形態は、抗体または抗原応答性抗体フラグメントである。
また、本発明の種々の実施形態はまた、ＳＮＰ検出試薬を含むキット、および本明細書において開示されるＳＮＰを、検出試薬を利用することによって検出するための方法も提供する。特定の実施形態において、本発明は、ＶＴを発症する危険性が増加または減少している個体を、本明細書において開示される１つ以上のＳＮＰ対立遺伝子の有無の検出によって同定するための方法を提供する。別の実施形態において、本明細書において開示される１つ以上のＳＮＰ対立遺伝子の有無を検出することによるＶＴの診断のための方法が提供される。
本発明の核酸分子は、発現ベクター（例えば、宿主細胞において改変型タンパク質を産生するためのもの）に挿入され得る。したがって、本発明はまた、ＳＮＰを含む核酸分子を含むベクター、このベクターを含む遺伝的に操作された宿主細胞、およびこのような宿主細胞を用いて組み換え改変タンパク質を発現させる方法を提供する。別の特定の実施形態において、宿主細胞、ＳＮＰを含む核酸分子、および／または改変型タンパク質は、ＶＴの処置に有用な治療剤または薬学的化合物をスクリーニングおよび同定するための方法において、標的として使用され得る。
本発明の一局面は、ヒト被験体においてＶＴを処置または予防するための方法である。ここで、このヒト被験体は、表１〜２に同定されたＳＮＰ、遺伝子、転写物、および／またはコードされたタンパク質を有する。本方法は、このヒト被験体に、疾患の影響を相殺する（例えば、この表１〜２に同定された遺伝子、転写物、および／またはコードされたタンパク質の活性を阻害（または刺激）することによって相殺する）治療的有効量または予防的有効量の一種以上の薬物を投与する工程を包含する。
本発明のある実施形態は、本明細書において開示されるＳＮＰの有無に起因して、ＶＴの危険性が増加していると同定されたヒトにおいてＶＴ（最初のＶＴまたは再発性ＶＴ）の危険性を低下させるための方法を提供し、この方法は、ＶＴの危険性を低下させるために、有効量の治療剤をヒトに投与する工程を包含する。ある実施形態において、この方法は、ＳＮＰの有無について前記ヒト由来の核酸を試験する工程を含む。ある実施形態において、治療剤は、抗凝固剤および抗血小板薬の少なくとも１つである。
本発明のある実施形態は、本明細書において開示されるＳＮＰの有無に基づいて、ＶＴ（これは最初のＶＴまたは再発性ＶＴであり得る）に対するそれらの危険性を低下させるために、ヒトに治療剤を投与するべきかどうかを決定するための方法を提供する。ある実施形態において、治療剤は、抗凝固剤および抗血小板薬の少なくとも１つである。
抗凝固剤の例は、ワルファリン（クマジン）、アセノクマロール、フェンプロクモン、およびフェニンジオンなどのクマリン（ビタミンＫアンタゴニスト）；ヘパリンおよび低分子量ヘパリンなどの誘導体物質；フォンダパリヌクス、イドラパリナックス（Ｉｄｒａｐａｒｉｎｕｘ）、および第Ｘａ因子の他の合成五糖阻害剤などの第Ｘａ因子阻害剤；ならびにアルガトロバン、レピルジン、ビバリルジン、およびダビガトランなどのトロンビン阻害剤を含むが、これらに限定されない。抗血小板薬の例は、アスピリンなどのシクロオキシゲナーゼ阻害剤ならびにクロピドグレル（Ｐｌａｖｉｘ）およびプラスグレル（Ｅｆｆｉｅｎｔ）などのアデノシン二リン酸（ＡＤＰ）レセプター阻害剤を含むが、これらに限定されない。
本発明のある実施形態は、治療剤の臨床試験を実施するための方法であって、ヒトが、本明細書において開示されるＳＮＰの有無に基づいて、臨床試験への採用のために選択され、かつ／または臨床試験内の特定の群（例えば試験の「アーム」もしくは「コホート」）に割り当てられる方法を提供する。ある実施形態において、治療剤は、抗凝固剤および抗血小板薬の少なくとも１つである。
本発明の別の局面は、ヒト被験体におけるＶＴを治療的にまたは予防的に処置するのに有用な作用物質を同定するための方法であり、前記ヒト被験体は、表１〜２において同定されるＳＮＰ、遺伝子、転写物、および／またはコードされるタンパク質を持ち、この方法は、遺伝子、転写物、またはコードされるタンパク質および候補作用物質の間の結合複合体の形成を可能にするのに適した条件下で、遺伝子、転写物、またはコードされるタンパク質を候補作用物質と接触させる工程ならびに結合複合体の形成を検出する工程を包含し、複合体の存在によって、前記作用物質が同定される。
本発明の別の局面は、ヒト被験体におけるＶＴを処置するための方法であり、この方法は、
（ｉ）前記ヒト被験体が、表１〜２において同定されるＳＮＰ、遺伝子、転写物、および／またはコードされるタンパク質を持つことを決定する工程、ならびに
（ｉｉ）抗凝固物質または抗血小板薬などの、疾患の影響を抑制する、治療的または予防的有効量の１つ以上の作用物質を前記被験体に投与する工程
を含む。
本発明の多くの他の用途および利点は、本明細書における好ましい実施形態の詳細な説明を概説することによって当業者に明らかとなる。考察の明確さのためにのみ、本発明は、非限定的な実施例として以下の節に記載される。
ＥＦＳ−ＷＥＢを介して電子的に提出されたテキスト（ＡＳＣＩＩ）ファイルの説明
以下の３つのテキスト（ＡＳＣＩＩ）ファイルは、本出願の一部としてＥＦＳ−Ｗｅｂを介して電子的に提出される。
１）ファイルＳＥＱＬＩＳＴ＿ＣＤ００００２３．ｔｘｔは、配列表を提供する。配列表は、本発明の１つ以上のＳＮＰを含む、それぞれのＶＴ関連性遺伝子またはゲノム領域（遺伝子間ＳＮＰに対する）についての、表１において言及される転写配列（配列番号１〜１２５）およびタンパク質配列（配列番号１２６〜２５０）ならびに表２において言及されるゲノム配列（配列番号４０４〜６０１）を提供する。配列表において、表１において言及される転写物ベースのコンテクスト配列（配列番号２５１〜４０３）および表２において言及されるゲノムベースのコンテクスト配列（配列番号６０２〜１５８７）の両方を含むそれぞれのＳＮＰの側面に位置するコンテクスト配列もまた提供される。さらに、配列表は、表３（配列番号１５８８〜２５５６）からのプライマー配列を提供し、これは、ＶＴとのこれらのＳＮＰの関連性を確認するための関連性研究の過程の間に、表５〜１３において開示されるＳＮＰをアッセイするために実験室において合成され、使用されたオリゴヌクレオチドである。コンテクスト配列は一般に、各ＳＮＰを囲む総数２００ｂｐのコンテクスト配列について、各ＳＮＰの上流（５’）の１００ｂｐおよび下流（３’）の１００ｂｐを提供し、コンテクスト配列の中央にＳＮＰがある。配列表はまた、配列番号２５５７〜２５８０を提供し、これは、表８および表１７において示されるあるＳＮＰについての例示的なゲノムコンテクスト配列である。
ファイルＳＥＱＬＩＳＴ＿ＣＤ００００２３．ｔｘｔのサイズは、２４，３２７ＫＢであり、これは２００９年３月１２日に作成された。
２）ファイルＴＡＢＬＥ１＿ＣＤ００００２３．ｔｘｔは、表１を提供する。ファイルＴａｂｌｅ１＿ＣＤ００００２３．ｔｘｔのサイズは、１７５ＫＢであり、これは、２００９年３月１１日に作成された。
３）ファイルＴＡＢＬＥ２＿ＣＤ００００２３．ｔｘｔは、表２を提供する。ファイルＴａｂｌｅ２＿ＣＤ００００２３．ｔｘｔのサイズは、７３９ＫＢであり、これは、２００９年３月１１日に作成された。
これらの３ファイルは、米国特許法施行規則 １．７７（ｂ）（４）に従って、参照によってこれによって組み込まれる。
表１および表２の説明
表１および表２（共に、ＥＦＳ−Ｗｅｂを介して電子的に提出されたＡＳＣＩＩテキストファイルである）は、本発明のＳＮＰおよび関連する遺伝子／転写物／タンパク質の情報を開示する。各遺伝子について、表１は、遺伝子、転写物、およびタンパク質の情報、それに続く転写配列およびタンパク質配列の識別子（配列番号）、次いで、転写コンテクスト配列を含む、その遺伝子／転写物において見つけられるそれぞれのＳＮＰに関するＳＮＰ情報を含むヘッダーを提供する。表２における各遺伝子について、遺伝子およびゲノムの情報、それに続くゲノム配列識別子（配列番号）、次いで、ゲノムコンテクスト配列を含む、その遺伝子において見つけられるそれぞれのＳＮＰに関するＳＮＰ情報を含むヘッダーが提供される。
ＳＮＰマーカーが、表１および表２の両方において含まれ得ることに留意されたい。表１は、それらの転写配列およびコードされたタンパク質配列に対するＳＮＰを示すのに対して、表２は、それらのゲノム配列に対するＳＮＰを示す。いくつかの場合において、表２はまた、最後の遺伝子配列の後に、１つ以上の遺伝子間領域のゲノム配列ならびにこれらの遺伝子間領域内に位置する任意のＳＮＰについてのＳＮＰコンテクスト配列および他のＳＮＰ情報を含み得る。さらに、表１または２において、「関連する照会ＳＮＰ」は、所与の検出力値に従ってその照会ＳＮＰとＬＤにあることが決定されるＳＮＰに続いて挙げられ得る。ＳＮＰは、それらのＣｅｌｅｒａ ｈＣＶ（または、いくつかの場合においてｈＤＶ）識別番号に基づくすべての表の間で、それらの対応する配列番号に基づく配列表に対して容易に相互参照することができる。
遺伝子／転写物／タンパク質の情報は、以下を含む：
−遺伝子番号（１〜ｎ、ここでｎ＝表の遺伝子の総数）
−遺伝子についてのＣｅｌｅｒａ ｈＣＧおよびＵＩＤ内部識別番号
−転写物についてのＣｅｌｅｒａ ｈＣＴおよびＵＩＤ内部識別番号（表１のみ）
−転写物についての公開Ｇｅｎｂａｎｋ登録番号（例えばＲｅｆＳｅｑ ＮＭ番号）（表１のみ）
−ｈＣＴ転写物によってコードされるタンパク質についてのＣｅｌｅｒａ ｈＣＰおよびＵＩＤ内部識別番号（表１のみ）
−タンパク質についての公開Ｇｅｎｂａｎｋ受入番号（例えばＲｅｆＳｅｑ ＮＰ番号）（表１のみ）
−当該分野で公知の遺伝子記号
−当該分野で公知の遺伝子／タンパク質の名前
−Ｃｅｌｅｒａゲノム軸位置（開始ヌクレオチド位置〜停止ヌクレオチド位置を示す）
−遺伝子が位置する染色体の染色体番号
−各遺伝子の医学的重要性に関するさらなる情報を得るためのＯＶＴＭ（Ｏｎｌｉｎｅ Ｍｅｎｄｅｌｉａｎ Ｉｎｈｅｒｉｔａｎｃｅ ｉｎ Ｍａｎ；Ｊｏｈｎｓ Ｈｏｐｋｉｎｓ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ／ＮＣＢＩ）公開参照番号
−ＯＶＴＥＭエントリにおける代替の遺伝子／タンパク質の（１つ以上の）名前および／または（１つ以上の）記号
代替的スプライス形態の存在に起因して、複数の転写物／タンパク質のエントリが、表１における単一の遺伝子エントリに対して提供され得る、すなわち、単一の遺伝子番号に対して、複数のエントリが、それらの転写物／タンパク質の情報および配列において異なるシリーズで提供され得ることに留意されたい。
遺伝子／転写物／タンパク質の情報に続いて、その遺伝子内の各ＳＮＰについての転写コンテクスト配列（表１）またはゲノムコンテクスト配列（表２）がある。
最後の遺伝子配列の後、表２は、遺伝子間の領域のさらなる遺伝子配列（そのような場合、これらの配列は、「遺伝子間領域」として同定され、数値の識別番号を与えられる）ならびにＳＮＰコンテクスト配列および各遺伝子間領域内に存在する任意のＳＮＰ（そして、このようなＳＮＰは、ＳＮＰ型に関して「ＩＮＴＥＲＧＥＮＩＣ」として同定される）についての他のＳＮＰ情報を含み得る。
転写物、タンパク質、および転写物ベースのＳＮＰコンテクスト配列はすべて、配列表において提供されることに留意されたい。転写物ベースのＳＮＰコンテクスト配列は、表１およびさらに配列表の両方において提供される。ゲノムＳＮＰコンテクスト配列およびゲノムベースのＳＮＰコンテクスト配列は、配列表において提供される。ゲノムベースのＳＮＰコンテクスト配列は、表２および配列表の両方において提供される。配列番号は、転写物ベースのコンテクスト配列（配列番号２５１〜４０３）について表１において示され、配列番号は、ゲノムベースのコンテクスト配列（配列番号６０２〜１５８７）について表２において示される。
ＳＮＰ情報は、以下を含む：
−ＳＮＰ位置の上流（５’）の１００ｂｐおよびＳＮＰ位置の下流（３’）の１００ｂｐを含む、そのＩＵＢコードによって表されるＳＮＰを有する、コンテクスト配列（表１における転写配列、表２におけるゲノム配列から得られる）（表１における転写物ベースのＳＮＰコンテクスト配列は、配列番号２５１〜４０３として配列表において提供され、表２におけるゲノムベースのＳＮＰコンテクスト配列は、配列番号６０２〜１５８７として配列表において提供される）。
−ＳＮＰに対するＣｅｌｅｒａ ｈＣＶ内部識別番号（いくつかの場合において、「ｈＤＶ」番号が、「ｈＣＶ」番号の代わりに示される）。
−ＳＮＰについての対応する公的な識別番号、ＲＳ番号。
−ＳＮＰ位置（所与の転写配列（表１）または所与のゲノム配列（表２）内のＳＮＰ位置）。
−「関連する照会ＳＮＰ」は、挙げられたＳＮＰが、の所与の検出力値でＬＤにある照会ＳＮＰとしてのものである。
−ＳＮＰ源（これは、内部配列決定プロジェクトおよび／または公開データベースに依存する以下の５個のコードの一つ以上の任意の組合せを含み得、ＳＮＰは、以下に見出された：「Ａｐｐｌｅｒａ」＝３９の個体の遺伝子および調節領域の再配列決定の間に見出されたＳＮＰ、「Ｃｅｌｅｒａ」＝ショットガン配列決定およびＣｅｌｅｒａヒトゲノム配列のアセンブリの間に見出されたＳＮＰ、「Ｃｅｌｅｒａ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ」＝疾患を有する個体由来の核酸サンプルの配列決定の間に見出されたＳＮＰ、「ｄｂＳＮＰ」＝ｄｂＳＮＰ公開データベースに見出されたＳＮＰ、「ＨＧＢＡＳＥ」＝ＨＧＢＡＳＥ公開データベースに見出されたＳＮＰ、「ＨＧＭＤ」＝Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｍｕｔａｔｉｏｎ Ｄａｔａｂａｓｅ（ＨＧＭＤ）公開データベースに見出されたＳＮＰ、「ＨａｐＭａｐ」＝Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔ公開データベースにおいて観察されるＳＮＰ、「ＣＳＮＰ」＝コードＳＮＰＳ（ｃＳＮＰ）のＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ、ＣＡ）の内部データベースにおいて観察されるＳＮＰ）
（以下に留意すること：複数の「Ａｐｐｌｅｒａ」源の単一ＳＮＰへのエントリーは、同一のＳＮＰが、複数の重複する増幅産物によって網羅されたこと、およびこれらの増幅産物のそれぞれの再配列決定結果（例えば、観察された対立遺伝子の数）が提供されることを示唆する）。
表１および／または表２において提供される以下のＳＮＰについて、ＳＮＰ源は、以下の３つのカテゴリーのうちの１つに属する：１）ＳＮＰ源が、「Ａｐｐｌｅｒａ」のみに限られるＳＮＰ、２）ＳＮＰ源が、「Ｃｅｌｅｒａ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ」のみに限られるＳＮＰ、ならびに３）ＳＮＰ源が、「Ａｐｐｌｅｒａ」および「Ｃｅｌｅｒａ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ」の両方のみであるＳＮＰ（表２に、ｈＣＶ識別番号、およびＳＮＰゲノムコンテクスト配列の配列番号を示す）：ｈＣＶ２２２７５２９９（配列番号４８２）、ｈＣＶ２５６１５８２２（配列番号６３９）、ｈＣＶ２５６５１１０９（配列番号８４０）、ｈＣＶ２５９５１６７８（配列番号１０１３）、およびｈＣＶ２５６１５８２２（配列番号１３７５）。これらのＳＮＰは、公開データベース（ｄｂＳＮＰ、ＨＧＢＡＳＥ、およびＨＧＭＤ）のうちのいずれにおいても観察されたことはなく、また、ショットガン配列決定およびＣｅｌｅｒａヒトゲノム配列のアセンブリの間にも観察されなかった（すなわち、「Ｃｅｌｅｒａ」ＳＮＰ源）。
−［集団１（第一の対立遺伝子の数｜第二の対立遺伝子の数）集団２（第一の対立遺伝子の数｜第二の対立遺伝子の数）総数（第一の対立遺伝子の総数｜第二の対立遺伝子の総数）］の形式における集団／対立遺伝子／対立遺伝子数の情報。この分野における情報は、集団／特定のＳＮＰ対立遺伝子が観察された人種群（「ｃａｕ」＝白人、「ｈｉｓ」＝ラテン系アメリカ人、「ｃｈｎ」＝中国人、および「ａｆｒ」＝アフリカ系アメリカ人、「ｊｐｎ」＝日本人、「ｉｎｄ」＝インド人、「ｍｅｘ」＝メキシコ人、「ａｉｎ」＝アメリカインディアン、「ｃｒａ」＝Ｃｅｌｅｒａドナー、「ｎｏ＿ｐｏｐ」＝集団の情報が利用可能ではない）、同定されたＳＮＰ対立遺伝子、および観察された対立遺伝子数（各集団群内および総対立遺伝子数の内で）を含む、ここで以下が適用される；利用可能な［対立遺伝子の領域における「−」は、挿入／欠失（「ｉｎｄｅｌ」）多型の欠失対立遺伝子を表し、（この場合対応する挿入対立遺伝子は、一つ以上のヌクレオチドから構成され得るが、「｜」の反対側の対立遺伝子の領域に示される）；数領域における「−」は、対立遺伝子数情報が利用可能ではないことを示唆する］。公開ｄｂＳＮＰデータベースからの特定のＳＮＰについて、集団／人種の情報を、以下に示す（この集団の情報は、ｄｂＳＮＰにおいて公開されている）：「ＨＩＳＰ１」＝自称ラテン系アメリカ人の遺伝形質の２３人由来のヒト個体ＤＮＡ（匿名扱いのサンプル）；「ＰＡＣ１」＝自称環太平洋地域遺伝形質の２４人由来のヒト個体ＤＮＡ（匿名扱いのサンプル）；「ＣＡＵＣ１」＝自称白人遺伝形質の３１人のヒト個体ＤＮＡ（匿名扱いのサンプル）；「ＡＦＲ１」＝自称アフリカ人／アフリカ系アメリカ人遺伝形質の２４人由来のヒト個体ＤＮＡ（匿名扱いのサンプル）；「Ｐ１」＝自称遺伝形質の１０２人由来のヒト個体ＤＮＡ（匿名扱いのサンプル）；「ＰＡ１３０２９９５１５」；「ＳＣ＿１２＿Ａ」＝Ｃｏｒｉｅｌｌｅ ｃｅｌｌ ｒｅｐｏｓｉｔｏｒｉｅｓからのアジア人由来のＳＡＮＧＥＲ １２ ＤＮＡ、これらは、男性６人および女性６人である；「ＳＣ＿１２＿Ｃ」＝ＣＥＰＨ／ＵＴＡＨ ｌｉｂｒａｒｙ由来のＣｏｒｉｅｌｌｅ ｃｅｌｌ ｒｅｐｏｓｉｔｏｒｉｅｓからの白人由来のＳＡＮＧＥＲ １２ ＤＮＡ。男性６人および女性６人；「ＳＣ＿１２＿ＡＡ」＝Ｃｏｒｉｅｌｌｅ ｃｅｌｌ ｒｅｐｏｓｉｔｏｒｉｅｓからのアフリカ系アメリカ人由来のＳＡＮＧＥＲ １２ ＤＮＡ、これらは、男性６人および女性６人である；「ＳＣ＿９５＿Ｃ」＝ＣＥＰＨ／ＵＴＡＨ ｌｉｂｒａｒｙ由来のＣｏｒｉｅｌｌｅ ｃｅｌｌ ｒｅｐｏｓｉｔｏｒｉｅｓからの白人由来のＳＡＮＧＥＲ ９５ ＤＮＡ；ならびに「ＳＣ＿１２＿ＣＡ」＝ＣＥＰＨ／ＵＴＡＨ ｌｉｂｒａｒｙに由来するＣｏｒｉｅｌｌｅ ｃｅｌｌ ｒｅｐｏｓｉｔｏｒｉｅｓからの白人−１２ ＤＮＡ。
以下に留意すること：「Ａｐｐｌｅｒａ」ＳＮＰ源のＳＮＰに関しては、３９人の個体（２０人の白人および１９人のアフリカ系アメリカ人）の遺伝子／調節領域を再配列決定し、そして、各ＳＮＰの位置は、各個体の二つの染色体によって表される（男性のＸ染色体およびＹ染色体上のＳＮＰを除く、これらについては、各ＳＮＰの染色体に対する位置は、一つの染色体によって代表される）ので、７８本以下の染色体を、各ＳＮＰ位置に関して遺伝子型特定した。従って、アフリカ系アメリカ人（「ａｆｒ」）の対立遺伝子の数の合計は、３８以下であり、白人の対立遺伝子の数の合計（「ｃａｕ」）は、４０以下であり、全ての対立遺伝子の数の合計は、７８以下である。
（以下に留意すること：セミコロンは、それぞれの示されたＳＮＰ源に対応する集団／対立遺伝子／数情報を分ける；すなわち、四つのＳＮＰ源（例えば、「Ｃｅｌｅｒａ」、「ｄｂＳＮＰ」、「ＨＧＢＡＳＥ」および「ＨＧＭＤ」）が示される場合、集団／対立遺伝子／数情報は、セミコロンによって分けられる４つの群に提供され、ＳＮＰ源の一覧と同じ順序で、列挙され、順序に基づくそれぞれのＳＮＰ源に対応する各集団／対立遺伝子／数情報群を伴なう；従って、この例において、第一の集団／対立遺伝子／数情報群は、第一の列挙したＳＮＰ源（Ｃｅｌｅｒａ）に相当し、セミコロンによって分けられる第三の集団／対立遺伝子／数情報群は、第三の列挙したＳＮＰ源（ＨＧＢＡＳＥ）に対応する；任意の特定のＳＮＰ源に対する集団／対立遺伝子／数情報が利用可能ではない場合、一対のセミコロンが、ＳＮＰ源のリストと集団／対立遺伝子／数情報の対応するリストとの間の対応を維持するために、なおプレースホルダー（ｐｌａｃｅ−ｈｏｌｄｅｒ）として挿入される）。
−ＳＮＰ型（例えば、遺伝子／転写産物における位置および／または予測される機能効果）［「ＶＴＥＳ−ＳＥＮＳＥ ＭＵＴＡＴＩＯＮ」＝ＳＮＰは、コードされたアミノ酸に変化を引き起こす（すなわち、コードＳＮＰと同義語ではない）；「ＳＩＬＥＮＴ ＭＵＴＡＴＩＯＮ」＝ＳＮＰは、コードされたアミノ酸に変化を引き起こさない（すなわち、コードＳＮＰの同義語）；「ＳＴＯＰ ＣＯＤＯＮ ＭＵＴＡＴＩＯＮ」＝ＳＮＰは、終止コドンに位置する；「ＮＯＮＳＥＮＳＥ ＭＵＴＡＴＩＯＮ」＝ＳＮＰは、終止コドンを作製するかまたは破壊する；「ＵＴＲ ５」＝ＳＮＰは、転写産物の５’ＵＴＲに位置する；「ＵＴＲ３」＝ＳＮＰは、転写産物の３’ＵＴＲに位置する；「ＰＵＴＡＴＩＶＥ ＵＴＲ ５」＝ＳＮＰは、推定５’ＵＴＲに位置する；「ＰＵＴＡＴＩＶＥ ＵＴＲ ３’’＝ＳＮＰは、推定３’ＵＴＲに位置する；「ＤＯＮＯＲ ＳＰＬＩＣＥ ＳＩＴＥ」＝ＳＮＰは、ドナースプライシング部位（５’イントロン境界）に位置する；「ＡＣＣＥＰＴＯＲ ＳＰＬＩＣＥ ＳＩＴＥ」＝ＳＮＰは、レセプタースプライシング部位（３’イントロン境界）に位置する；「ＣＯＤＩＮＧ ＲＥＧＩＯＮ」＝ＳＮＰは、転写産物のタンパク質コード領域に位置する；「ＥＸＯＮ」＝ＳＮＰは、エクソンに位置する；「ＩＮＴＲＯＮ」＝ＳＮＰは、イントロンに位置する；「ｈｍＣＳ」＝ＳＮＰは、ヒト−マウス保存セグメントに位置する；「ＴＦＢＳ」＝ＳＮＰは、転写因子結合部位に位置する；「ＵＮＫＮＯＷＮ」＝ＳＮＰ型は、定義されない；「ＩＮＴＥＲＧＥＮＩＣ」＝ＳＮＰは、遺伝子間である、すなわち、任意の遺伝子境界の外側である］。
−タンパク質コード情報（表１のみ）、関連する場合、［タンパク質配列番号、アミノ酸位置（アミノ酸−１、コドン１）（アミノ酸−２、コドン２）］の形式におけるタンパク質コード情報。この分野における情報としては、コードタンパク質配列の配列番号、ＳＮＰを含むコドンによってコードされる配列番号によって同定されるタンパク質内のアミノ酸残基の位置、代替的なＳＮＰ対立遺伝子によってコードされるアミノ酸（一文字アミノ酸コードによって表される）（終止コドンの場合には、一文字アミノ酸コードに対して、「Ｘ」が使用される）、およびアミノ酸残基をコードする代替的なＳＮＰヌクレオチドを含む代替的なコドン（従って、例えば、ミスセンス変異型ＳＮＰに関しては、少なくとも二つの異なるアミノ酸および少なくとも二つの異なるコドンが、一般に示される；サイレント変異型ＳＮＰに関しては、一つのアミノ酸および少なくとも二つの異なるコドンが一般に示されるなど）が挙げられる。ＳＮＰがタンパク質コード領域の外側（例えば、ＵＴＲ領域）に位置する例において、「Ｎｏｎｅ」は、タンパク質配列番号の後に示される。
表３の説明
表３は、ＶＴとこれらのＳＮＰの関連性を確認するための関連性研究の過程の間に、表５〜１３において開示されるＳＮＰをアッセイするために実験室において合成され、使用されたオリゴヌクレオチドの配列（配列番号１５８８〜２５５６）を提供する。これらのプライマーを使用して実施された実験は、以下の実施例１において詳細に説明される。
表３は、以下を提供する。
−「Ｍａｒｋｅｒ」と表示した列は、それぞれのＳＮＰマーカーについてのＣｅｌｅｒａ識別子ｈＣＶ番号を挙げる。
−「Ａｌｌｅｌｅｓ」と表示した列は、対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドによって標的とされる、ｈＣＶ識別番号によって同定されるＳＮＰ部位における２つの代替の対立遺伝子を指定する。
−それぞれの配列番号を有する対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドは、次の２つの列「Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａ」（対立遺伝子特異的プライマー）および「Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｂ」（対立遺伝子特異的プライマー）において示される。これらの２つのプライマーは、それぞれのＳＮＰマーカーについてのＤＮＡサンプルを遺伝子型解析するためのそれぞれのＰＣＲアッセイにおける共通プライマーと併せて使用された。対立遺伝子は、表３中、同じ対立遺伝子が表１〜２において示されているのとは異なる方向に基づいて示されている場合がある（すなわち、逆相補体）ことに留意されたい。
−それぞれの配列番号を有する共通オリゴヌクレオチドは、列「Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｃ（共通プライマー）」において示される。それぞれの共通プライマーは、それぞれのＳＮＰマーカーについてのＤＮＡサンプルを遺伝子型解析するための２つの対立遺伝子特異的プライマーと併せて使用された。
すべての配列は、５’から３’方向で示される。
表４の説明
表４は、照会ＳＮＰに関連するまたは由来するサンプルＬＤ ＳＮＰのリストを提供する。これらのＬＤ ＳＮＰは、それらが、照会ＳＮＰを有するＬＤ中にあることに基づいて、疾患関連性についてのマーカーとしても役立ち得る、ＳＮＰのグループの例として提供される。ｒ２値およびｒ２閾値の計算を含めた、そのようなＬＤ ＳＮＰを選択する判断基準およびプロセスが、以下の実施例１０に記載される。
表４中、「Ｉｎｔｅｒｒｏｇａｔｅｄ ＳＮＰ」と表示した列は、その固有の識別因子である、ｈＣＶ番号によって同定される各マーカーを示す。「Ｉｎｔｅｒｒｏｇａｔｅｄ ｒｓ」と表示した列は、対応するｈＣＶ番号についての公知の識別子ｒｓ番号を示す。「ＬＤ ＳＮＰ」と表示した列は、それらの対応する照会ＳＮＰに由来するＬＤ ＳＮＰのｈＣＶ番号を示す。「ＬＤ ＳＮＰ ｒｓ」と表示した列は、対応するｈＣＶ番号についての公知のｒｓ番号を示す。「Ｐｏｗｅｒ（Ｔ）」と表示した列は、ｒ２閾値が設定される検出力のレベルを示す。例えば、ＬＤ ＳＮＰが、疾患表現型と５１％超の確率で関連し得るマーカーとして分類されるためには、検出力が０．５１に設定される場合、それから計算された閾値ｒ２の値は、ＬＤ ＳＮＰが照会ＳＮＰを参照して有さなければならない最小ｒ２である。「Ｔｈｒｅｓｈｏｌｄ ｒ２」と表示した列は、ＬＤ ＳＮＰが、ＬＤ ＳＮＰとして適格であるために、照会ＳＮＰを参照して満たさなければならないｒ２の最小値を示す。「ｒ２」と表示した列は、ＬＤ ＳＮＰが関係する照会ＳＮＰを参照した、ＬＤ ＳＮＰの実際のｒ２値を示す。
他の表の説明
表３〜４、２０〜２３、および２５〜２７は、本明細書の実施例の節に続いて（請求項の前に）提供される。表１〜２は、別のＡＳＣＩＩテキストファイルとして提供される。表１〜４は、上記に記載される。表５〜１９、２４、および２８〜２９は、下記の本明細書の実施例の節内に提供され、そこに記載される。したがって、この部は、表２０〜２３および２５〜２７を記載する。
表２０は、ＭＥＧＡ−１およびＬＥＴＳの両方において試験され、これらのサンプルセットの両方においてＤＶＴと関連した１４９のＳＮＰについての、ＤＶＴとの、調整しなかった付加的な遺伝子型の関連性を提供する（少なくとも１つのモデルにおいて、ＭＥＧＡ−１においてｐ値カットオフ＜＝０．０５およびＬＥＴＳにおいてｐ値カットオフ＜＝０．１）。
表２１は、ＭＥＧＡ−１サンプルセットにおいてまだ試験されていない、ＬＥＴＳにおけるＤＶＴとの９２のＳＮＰの、調整しなかった関連性を提供する（ｐ＜＝０．０５）。
表２２は、ＬＥＴＳサンプルセットにおいてまだ試験されていない、ＭＥＧＡ−１におけるＤＶＴとの９のＳＮＰの調整しなかった関連性を提供する（ｐ＜＝０．０５）。
表２３は、３つのサンプルセットＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２において試験された４１のＳＮＰについての、ＤＶＴとの年齢および性別について調整した関連性を提供する。
表２０〜２３に関して下記の実施例５を参照されたい。
表２５は、組み合わせたＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２における５２のＳＮＰについての、孤立性の肺塞栓症（ＰＥ）との年齢および性別について調整した関連性を提供する（ｐ値カットオフ＜＝０．０５）。下記の実施例７を参照されたい。
表２６は、組み合わせたＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２における３１のＳＮＰについての、癌関連ＤＶＴとの年齢および性別について調整した関連性を提供する（ｐ値カットオフ＜＝０．０５）。表２６において提供されるＳＮＰは、癌もＤＶＴも有していない個体（対照）と比較して、癌（任意の型の）およびＤＶＴの両方を有するＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２の研究における個体（症例）と比較した場合に、ｐ値カットオフ＜＝０．０５を有した。下記の実施例８を参照されたい。
表２７は、ＬＥＴＳにおける１２３のＳＮＰについてのＤＶＴとの付加的な関連性を提供する（ＬＥＴＳにおけるｐ値カットオフ＜＝０．１）。Ｈａｐｍａｐからの連鎖不均衡データもまた、それぞれのＳＮＰについて提供される。表２７におけるＳＮＰは、以下の標的遺伝子およびＳＮＰの辺りのファインマッピング／連鎖不均衡分析に基づくものである（表２７において示される）：遺伝子ＡＫＴ３（ＳＮＰ ｈＣＶ２３３１４８）、遺伝子ＳＥＲＰＩＮＣ１（ＳＮＰ ｈＣＶ１６１８０１７０）、遺伝子ＲＧＳ７（ＳＮＰ ｈＣＶ９１６１０７）、遺伝子ＮＲ１Ｉ２（ＳＮＰ ｈＣＶ２６３８４１）、遺伝子ＦＧＧ（ＳＮＰ ｈＣＶ１１５０３４６９）、遺伝子ＣＹＰ４Ｖ２（ＳＮＰ ｈＣＶ２５９９０１３１）、遺伝子ＧＰ６（ＳＮＰ ｈＣＶ８７１７８７３）、および遺伝子Ｆ９（ＳＮＰ ｈＣＶ５９６３３１）。下記の実施例９を参照されたい。
表の全体にわたって、以下の略語を使用し得る：「ｃｎｔ」＝数、「ｆｒｑ」＝頻度、「ｄｏｍ」＝優性、「ｒｅｃ」＝劣性、「ｇｅｎ」＝遺伝子型、「ａｄｄ」＝付加、「ａｎｎｏｔ」＝注釈（説明）、「ｇｅｎｏｔ」＝遺伝子型、および「Ｃｏｎｔｒｏｌ ＲＡＦ」＝対照における危険対立遺伝子の頻度。
表全体を通して、「ＨＲ」または「ＨＲＲ」は、ハザード比を指し、「ＯＲ」は、オッズ比を指し、「９０％ ＣＩ」または「９５％ ＣＩ」などの用語は（それぞれ）、ハザード比またはオッズ比についての９０％信頼区間または９５％信頼区間を指し、「ＯＲ９５ｌ」および「ＯＲ９５ｕ」などの用語は（それぞれ）、オッズ比についての９５％信頼区間の下限および上限を指す（「ＣＩ」／「ｃｏｎｆｉｄｅｎｃｅ ｉｎｔｅｒｖａｌ」および「ＣＬ」／「ｃｏｎｆｉｄｅｎｃｅ ｌｉｍｉｔ」は、本明細書においては交換可能に使用し得る）。１超であるハザード比（「ＨＲ」もしくは「ＨＲＲ」）またはオッズ比（ＯＲ）は、所与の対立遺伝子（またはハプロタイプもしくはディプロタイプなどの対立遺伝子の組合せ）が危険対立遺伝子（これは、感受性対立遺伝子とも呼ばれ得る）であることを示し、一方、１未満であるハザード比またはオッズ比は、所与の対立遺伝子が非危険対立遺伝子（これは、保護対立遺伝子とも呼ばれ得る）であることを示す。所与の危険対立遺伝子について、ＳＮＰ位置における他方の代替の対立遺伝子（これは、例えば、表１〜２に提供される情報から得ることができる）は、非危険対立遺伝子とみなされ得る。所与の非危険対立遺伝子について、ＳＮＰ位置における他方の代替の対立遺伝子は、危険対立遺伝子とみなされ得る。
したがって、疾患の危険性（例えば、ＶＴ）に関しては、あるＳＮＰ位置における特定の対立遺伝子についての危険性推定値（オッズ比またはハザード比）が１超である場合、これは、そのＳＮＰ位置において他方の対立遺伝子を有する個体よりも、この特定の対立遺伝子を有する個体の疾患の危険性が高まっていることを示す。対照的に、特定の対立遺伝子についての危険性推定値（オッズ比またはハザード比）が１未満である場合、これは、そのＳＮＰ位置において他方の対立遺伝子を有する個体と比較して、この特定の対立遺伝子を有する個体の疾患の危険性が低下していることを示す。
図１は、ＤＶＴと関連するＳＮＰを同定するために使用されるアプローチのフローチャートを示す図である。左側について、「ＩＮ」ボックスは、それぞれのステージにおいて遺伝子型解析したＳＮＰの数を示す。右側について、「ＯＵＴ」ボックスは、それぞれのステージにおいてＤＶＴと関連するＳＮＰの数を示す（Ｐ＜．０５）。ステージ４においてＭＥＧＡ−２ ＤＮＡを保存するために、ＳＮＰは、多重オリゴライゲーションアッセイを使用して、遺伝子型解析され、１８のステージ３のＳＮＰのうちの９のみについてのアッセイが、本研究の時に多重フォーマットにおいて利用可能であった。 図２は、女性および男性におけるＤＶＴとの第ＩＸ因子Ｍａｌｍｏのメタ分析を示す図である。
本発明は、本明細書において開示されるＳＮＰを検出するための、ＶＴと関連するＳＮＰ、ＳＮＰを含む核酸分子、方法および試薬、検出試薬の開発のためのこれらのＳＮＰの使用、ならびにそのような試薬を活用するアッセイまたはキットを提供する。本明細書において開示されるＶＴ関連性のＳＮＰは、ヒトにおいて、ＶＴおよび関連する病態に対する素因を、診断、スクリーニングおよび評価するために有用である。さらに、そのようなＳＮＰおよびそれらのコード産物は、治療剤を開発するための有用な標的である。
多数のＳＮＰが、３９の個体のＤＮＡを再配列決定することにより同定され、それらは、表１〜２では、「Ａｐｐｌｅｒａ」ＳＮＰ源として示されている。白人およびアフリカ系アメリカ人の人種群のそれぞれにおいて観察されたそれらの対立遺伝子頻度が提供される。本明細書中に含まれるさらなるＳＮＰは、ヒトゲノムのショットガン配列決定およびアセンブリの間に既に同定されており、それらは、表１〜２では「Ｃｅｌｅｒａ」ＳＮＰ源として示されている。さらに、表１〜２において提供される情報、特に３９の個体から得た対立遺伝子頻度情報および各遺伝子／転写物内の各ＳＮＰの正確な位置の同定は、ハプロタイプ（すなわち同時に遺伝するＳＮＰの群）を容易に推測することを可能にする。本発明は、ＳＮＰハプロタイプおよび個別のＳＮＰを包含する。
したがって、本発明は、ＶＴと関連する個別のＳＮＰを提供し、ＶＴと関連する遺伝子領域中のＳＮＰの組合せおよびハプロタイプ、ＳＮＰを含む多型／改変型の転写物配列（配列番号１〜１２５）およびゲノム配列（配列番号４０４〜６０１）、コードされたアミノ酸配列（配列番号１２６〜２５０）、ならびに転写物ベースのＳＮＰコンテクスト配列（配列番号２５１〜４０３）およびゲノムベースのＳＮＰコンテクスト配列（配列番号６０２〜１５８７）の両方（転写物配列、タンパク質配列、および転写物ベースのＳＮＰコンテクスト配列は、表１および配列表に提供され、ゲノム配列およびゲノムベースのＳＮＰコンテクスト配列は、表２および配列表に提供される）、試験サンプル中のこれらの多型を検出する方法、ＶＴを有するまたは発症する個体の危険性を決定する方法、ＶＴなどの、改変型の遺伝子／タンパク質と関連する障害を処置するのに有用な化合物をスクリーニングする方法、これらのスクリーニング方法によって同定される化合物、開示されたＳＮＰを使用して、処置ストラテジーを選択する方法、改変型の遺伝子／タンパク質と関連する障害を処置する方法（すなわち治療方法）、個体が、特定の処置に対して応答するかどうかを決定する方法、ならびにヒト識別のために本発明のＳＮＰを使用するための方法も提供する。
本発明は、ＶＴと関連する新規なＳＮＰおよび当該分野において以前から公知であったが、ＶＴと関連することが以前は公知ではなかったＳＮＰを提供する。したがって、本発明は、本明細書において開示される新規なＳＮＰに基づく新規な組成物および方法を提供し、また、ＶＴに関する方法において、公知であるが、以前は関連していなかったＳＮＰを使用するための新規な方法をも提供する（例えばＶＴを診断するためなど）。表１〜２において、公知のＳＮＰは、それらが観察された公開データベースに基づいて同定され、これは、１つ以上の以下のＳＮＰ型として示される：「ｄｂＳＮＰ」＝ｄｂＳＮＰにおいて観察されたＳＮＰ、「ＨＧＢＡＳＥ」＝ＨＧＢＡＳＥにおいて観察されたＳＮＰ、および「ＨＧＭＤ」＝Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅ Ｍｕｔａｔｉｏｎ Ｄａｔａｂａｓｅ（ＨＧＭＤ）において観察されたＳＮＰ。ＳＮＰ源が、「Ａｐｐｌｅｒａ」のみに限られる新規なＳＮＰ、すなわち、いかなる公開データベースにおいても観察されず、またＣｅｌｅｒａヒトゲノム配列（すなわち「Ｃｅｌｅｒａ」ＳＮＰ源）のショットガン配列決定およびアセンブリの間にも観察されなかったものもまた、表において示される。
本発明の特定のＳＮＰ対立遺伝子は、ＶＴを発症する危険性の増加、またはＶＴを発症する危険性の減少のいずれかと関連し得る。ＶＴを発症する危険性の減少と関連するＳＮＰ対立遺伝子は、「保護」対立遺伝子と称され得、そしてＶＴを発症する危険性の増加と関連するＳＮＰ対立遺伝子は、「感受性」対立遺伝子、「危険」対立遺伝子、または「危険因子」と称され得る。従って、特定のＳＮＰ（またはそれらにコードされる産物）は、個体が、ＶＴを発症する危険性が増加したことを示すＳＮＰ対立遺伝子（すなわち、感受性対立遺伝子）を保有するか否かを決定するためにアッセイされ得るのに対して、他のＳＮＰ（またはそれらにコードされる産物）は、個体が、ＶＴを発症する危険性が減少したことを示すＳＮＰ対立遺伝子（すなわち、保護対立遺伝子）を保有するか否かを決定するためにアッセイされ得る。同様に、本発明の特定のＳＮＰ対立遺伝子は、特定の処置または治療化合物に対する応答の可能性の増加もしくは減少、または特定の処置または治療化合物由来の毒作用を受ける可能性の増加または減少のいずれかと関連し得る。用語「変化した」は、本明細書中では、これらの二つの可能性（例えば、危険性／可能性の増加または減少）のいずれかを含むように使用され得る。
当業者は、核酸分子が二本鎖分子であり得、一本鎖上の特定の部位に対する参照はまた、相補鎖上の対応する部位を参照するということを容易に認識する。ＳＮＰ位置、ＳＮＰ対立遺伝子またはヌクレオチド配列の規定において、核酸分子の一本鎖上の特定の部位におけるアデニン、チミン（ウリジン）、シトシン、グアニンに対する参照はまた、核酸分子の相補鎖上の対応する部位におけるチミン（ウリジン）、アデニン、グアニンまたはシトシン（それぞれ）を規定する。従って、参照は、特定のＳＮＰ位置、ＳＮＰ対立遺伝子またはヌクレオチド配列を参照するために、どちらかの鎖上でなされ得る。プローブおよびプライマーは、どちらかの鎖にハイブリダイズするように設計され得、そして、本明細書中に開示されるＳＮＰ遺伝子型特定方法は、一般にどちらかの鎖を標的し得る。本明細書を通して、ＳＮＰ位置を同定する工程において、参照は、便宜のために、一般に、タンパク質コード鎖に対してなされる。
本発明の改変ペプチド、改変ポリペプチドまたは改変タンパク質に対する参照は、当該分野で公知のペプチド／ポリペプチド／タンパク質の対応するアミノ酸配列とは異なる少なくとも一つのアミノ酸残基を含むペプチド、ポリペプチド、タンパク質またはこれらのフラグメントを含む（当該分野で公知のタンパク質は、相互変換可能に、「野生型」タンパク質、「参照」タンパク質または「正常」タンパク質と称され得る）。このような改変ペプチド／ポリペプチド／タンパク質は、本発明により開示されるＳＮＰ位置をコードするタンパク質での非同義的ヌクレオチド置換（すなわち、ミスセンス変異）により引き起こされるコドン変化から生じ得る。本発明の改変ペプチド／ポリペプチド／タンパク質はまた、ナンセンス変異（すなわち、早すぎる終止コドンを作製するＳＮＰ、終止コドンをなくすことによるリードスルー変異を作製するＳＮＰ）から、または他にタンパク質の構造、機能／活性、もしくは発現を変える、本発明により開示される任意のＳＮＰ（例えば、プロモーターまたはエンハンサーなどの調節領域におけるＳＮＰまたは代替的なスプライシング、または不完全なスプライシングを生じるＳＮＰ（例えば、イントロン内のＳＮＰもしくはエキソン／イントロン境界でのＳＮＰ））に起因して生じ得る。本明細書中で使用される場合、用語「ポリペプチド」、「ペプチド」、および「タンパク質」は相互変換可能に使用される。
本明細書中で使用される場合、「対立遺伝子」は、あるＳＮＰ位置におけるヌクレオチド（ＳＮＰの本来の定義に従って、少なくとも２つの代替のヌクレオチドが、集団内において、このＳＮＰ位置において存在する）を指してもよく、またはＳＮＰ位置を含むコドンによってコードされるアミノ酸残基（集団内において、このＳＮＰ位置において存在する代替のヌクレオチドが、異なるアミノ酸残基をコードする代替のコドンを形成する）を指してもよい。また、「対立遺伝子」は、本明細書においては、「改変体」とも呼ばれ得る。また、特定のＳＮＰを含むコドンによってコードされるアミノ酸残基は単に、ＳＮＰによってコードされるとも呼び得る。
本明細書においては、「によって表される（ａｓ ｒｅｐｒｅｎｔｅｄ ｂｙ）」、「によって示される（ａｓ ｓｈｏｗｎ ｂｙ）」、「によって記号で表される（ａｓ ｓｙｍｂｏｌｉｚｅｄ ｂｙ）」、または「によって指定される（ａｓ ｄｅｓｉｇｎａｔｅｄ ｂｙ）」などの句を使用して、「配列番号Ｘまたはその相補体の１０１位によって表される多型」の文脈においてなど、配列（例えば、ＳＮＰを囲むポリヌクレオチドコンテクスト配列）内のＳＮＰを指し得る。典型的には、ＳＮＰを指す場合には、ＳＮＰを囲む配列が記述され得るが、しかしこの配列には、特異的なＳＮＰ位置自体を越える構造的な制約としての意味はない。むしろ、配列には、単にＳＮＰを指す一手段として記述される（この例では、「配列番号Ｘまたはその相補体」は、配列番号Ｘの１０１位に位置するＳＮＰを指すために記述されるが、配列番号Ｘまたはその相補体には、特異的なＳＮＰ位置自体を越える構造的な制約としての意味はない）。ＳＮＰは、単一のヌクレオチドの位置における改変であり、したがって、通常、このＳＮＰを固有に同定しかつ指すために、特定のＳＮＰ位置を囲むコンテクスト配列（例えば、この例では、配列番号Ｘ）を指す。あるいは、公開の「ｒｓ」識別番号または内部の「ｈＣＶ」識別番号、例えば、各ＳＮＰについて本明細書において（例えば、表１〜２中に）提供されているものなどの固有の識別番号によって、ＳＮＰを指すこともできる。
（例えば、個体の核酸中の１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰの有無に基づく）疾患についての個体の危険性に関しては、「割り当てる（ａｓｓｉｇｎｉｎｇ）」または「指定する（ｄｅｓｉｇｎａｔｉｎｇ）」などの用語は、本明細書においては個体の疾患の危険性を特徴付けるために使用し得る。
本明細書において使用される場合、（予防的または治療的な薬物処置に関する）「利益」という用語は、同じ遺伝子型について、薬物による治療または予防が意図される疾患（例えば、ＶＴ）の危険性を、その薬物による処置を投与することによって、その薬物による処置を投与しない（またはその薬物による治療の代わりにプラセボを投与する）場合のその疾患の危険性と比較して、低下させることを達成することと定義される。「利益」という用語は、本明細書においては「陽性に応答する（ｒｅｓｐｏｎｄ ｐｏｓｉｔｉｖｅｌｙ）」または「陽性に応答する（ｐｏｓｉｔｉｖｅｌｙ ｒｅｓｐｏｎｄ）」などの用語と交換可能に使用され得る。
本明細書において使用される場合、「薬物」および「治療剤」は、交換可能に使用され、それらとして、これらに限定されないが、小分子化合物、生物学的製剤（例えば、抗体、タンパク質、タンパク質フラグメント、融合タンパク質、糖タンパク質など）、核酸薬剤（例えば、アンチセンス、ＲＮＡｉ／ｓｉＲＮＡ、およびマイクロＲＮＡ分子など）、ワクチンなどを挙げることができ、これらは、疾患（例えば、ＶＴ）の治療的処置および／または予防的処置のために使用し得る。
本明細書において記載される種々の方法、例えば、多型の有無をＶＴの危険性の変化（例えば、増加もしくは減少）があること（または危険性がないこと）と相関させる方法は、自動化された方法、例えば、本明細書において記載される方法のうちのいずれかを実施するためにプログラムされたコンピューター（または生物医学装置、実験室の測定器などの他の機器／装置、もしくはコンピュータープロセッサを有する他の機器／装置）を使用することによって実施され得る。例えば、コンピューターソフトウェア（これは、本明細書においてはコンピュータープログラムと交換可能に呼ばれ得る）が、個体中の多型の有無を、個体についてのＶＴの危険性の変化（例えば、増加もしくは減少）があること（または危険性がないこと）と相関させる工程を実施し得る。また、コンピューターソフトウェアは、個体中の多型の有無を、治療剤または他の型の処置に対する、個体の予測される応答と相関させる工程も実施し得る。したがって、本発明の特定の実施形態は、本明細書において記載される方法のうちのいずれかを実施するためにプログラムされたコンピューター（または他の機器／装置）を提供する。
報告、プログラムされたコンピューター、ビジネス方法、およびシステム
試験結果（例えば、１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰのアッセイに基づいた個体のＶＴの危険性もしくは個体の予測される薬物応答性、および／または１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰにおける個体の対立遺伝子（１つ以上）／遺伝子型など）、ならびに／あるいは試験に関する任意の他の情報が、本明細書においては「報告」と呼ばれ得る。有形の報告が、試験プロセスの一部として場合によっては作成され得る（これは、本明細書においては、「報告（ｒｅｐｏｒｔｉｎｇ）」、または報告の「提供（ｐｒｏｖｉｄｉｎｇ）」、報告の「作成（ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ）」もしくは報告の「作成（ｇｅｎｅｒａｔｉｎｇ）」と交換可能に呼ばれ得る）。
有形の報告の例として、これらに限定されないが、紙面による報告（例として、コンピューターが作成した試験結果のプリントアウト）、あるいはコンピューター可読媒体（例として、ＣＤ、ＵＳＢフラッシュドライブもしくは他の取り外し可能な記憶装置、コンピューターハードドライブ、またはコンピューターネットワークサーバーなど）上に記憶させた同等のフォーマットもしくは報告を挙げることができる。報告、特に、コンピューター可読媒体上に記憶させたものは、データベースの一部であり得、これは、インターネットを介して場合によりアクセス可能であり得る（例として、コンピューターネットワークサーバー上に記憶させた患者記録または遺伝情報のデータベース、これは、セキュリティー機能を有する「安全なデータベース」であり得、セキュリティー機能は、例えば、患者および患者の医療従事者のみが報告を見ることを可能にし、かつ他の無許可の個体が報告を見ることを阻止するなど、報告へのアクセスを制限する。有形の報告を作成することに加え、またはそれに代わって、報告はまた、コンピュータースクリーン（または別の電子的な装置もしくは機器のディスプレイ）上にも表示され得る。
例えば、報告は、個体のＶＴの危険性を含んでもよく、あるいは個体が１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰにおいて保有する対立遺伝子（１つ以上）／遺伝子型のみを含んでもよく、これらは、ＳＮＰにおいて対立遺伝子（１つ以上）／遺伝子型を有する有意性に関する情報に場合により結び付けられ得る（例えば、ネットワークサーバーなどのコンピューター可読媒体上の報告は、ＳＮＰにおいて特定の対立遺伝子／遺伝子型を有する個体について、危険性の増加または減少などの医学的／生物学的な関連事項を記載する、１つ以上の学術刊行物またはウェブサイトへの（１つ以上の）ハイパーリンクを含み得る）。したがって、例えば、報告は、対立遺伝子／遺伝子型の情報もさらにまた場合により含めた、疾患の危険性もしくは他の医学的／生物学的な有意性（例えば、薬物応答性など）を含んでもよく、または報告は、疾患の危険性もしくは他の医学的／生物学的な有意性を含まずに、対立遺伝子／遺伝子型の情報のみを含んでもよい（したがって、報告を見る個体が、対立遺伝子／遺伝子型の情報を使用して、関連する疾患の危険性または他の医学的／生物学的な有意性を、報告自体以外の源、例えば、報告にハイパーリンクによってなど、場合により結び付けられ得る医療従事者、刊行物、ウェブサイトなどから決定し得る）。
さらに、報告を、試験された個体、医療従事者（例えば、医師、看護師、臨床検査技師、遺伝カウンセラーなど）、医療組織、臨床検査室、および／または報告を見るもしくは所有することを意図する任意の他の関係者もしくは要求者に対してなど、「発信（ｔｒａｎｓｍｉｔｔｉｎｇ）」また「交信（ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｎｇ）」することもできる（これらの用語は、本明細書においては交換可能に使用され得る）。「発信」または「交信」の行為は、報告のフォーマットに基づいた当該分野で公知の任意の手段であってよい。さらに、報告の「発信」または「交信」は、報告を、「届けること（ｄｅｌｉｖｅｒｉｎｇ）（「ｐｕｓｈｉｎｇ」）こと」および／または「読み出すこと（ｒｅｔｒｉｅｖｉｎｇ）（「ｐｕｌｌｉｎｇ」）」も含み得る。例えば、報告は、種々の手段によって発信／交信され得、それらとして、（紙のフォーマットとしての報告など）関係者の間での物理的な移動、例えば、ある関係者から別の関係者へ物理的に届けること、あるいは電子的なまたは信号の形態の発信（例えば、電子メールによるもしくはインターネット上で、ファックスによる、かつ／または当該分野で公知の任意の有線もしくは無線の通信方法による）、例えば、コンピューターネットワークサーバー上に記憶させたデータベースから読み出すことなどが挙げられる。
特定の例示的な実施形態において、本発明は、本明細書において記載される方法を実施するためにプログラムされたコンピューター（または生物医学装置、実験室の測定器などの他の機器／装置）を提供する。例えば、特定の実施形態においては、本発明は、１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰの身元（例えば、あるＳＮＰにおける対立遺伝子（１つ以上）または遺伝子型）を受け取り（すなわち、入力）、（１種以上の）ＳＮＰの身元に基づいて、疾患の危険性（例えば、個体のＶＴの危険性）または他の結果（例えば、疾患の診断もしくは予後診断、応答性など）を提供する（すなわち、出力）ためにプログラムされたコンピューターを提供する。そのような出力（例えば、疾患の危険性、疾患の診断または予後診断、薬物応答性などの交信）は、例えば、コンピューター可読媒体上の報告の形態であっても、紙の形態として印刷しても、かつ／またはコンピュータースクリーンもしくは他のディスプレイの上に表示してもよい。
種々の例示的な実施形態において、本発明は、ビジネスを行う方法もさらに提供する（ビジネスを行う方法に関しては、本明細書においては「個体」および「顧客」という用語は交換可能に使用される）。例えば、ビジネスを行う例示的な方法は、１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰをアッセイする工程、ならびに例えば、（（１種以上の）ＳＮＰにおいてどの対立遺伝子（１つ以上）／遺伝子型が存在するかに基づいた）顧客のＶＴの危険性を含み、かつ／または疾患の危険性もしくは他の生物学的／医学的な有意性に関する情報（例えば、学術刊行物、ウェブサイトなど）に、ハイパーリンクの手段によってなど、場合により結び付けられ得る、アッセイされた（１種以上の）ＳＮＰにおける対立遺伝子（１つ以上）／遺伝子型を含む報告を提供する工程（報告は、例えば、インターネットアクセス可能であるコンピューターネットワークサーバーまたは他のコンピューター可読媒体の上に提供され得、顧客がそれらの報告にアクセスすることを可能にし、かつ他の無許可の個体が報告を見ることを阻止する安全なデータベース中に、報告は含まれ得る）、さらに場合により、報告を発信する工程を包含し得る。顧客（または例えば、顧客の医師など、顧客と関連がある別の関係者）が、例えば、試験を、インターネットを介してオンラインで（または電話、通信販売により、直販店／店においてなど）要求／注文（例えば、購入）することができ、顧客から生物学的サンプル（例えば、頬の細胞を収集するための頬の拭き取り検体）を収集するために、キットを、顧客（または例えば、顧客の医師など、顧客のための別の関係者）に送る／届ける（またはその他の方法で提供する）ことができ、顧客（または顧客の生物学的サンプルを収集する関係者）は、顧客の生物学的サンプルをアッセイのために（例えば、検査室、または検査室と関連がある関係者、例えば、顧客のサンプルを検査室のために受け入れる関係者、検査室が制御下にある関係者（例えば、検査室は、アッセイを、例えば、関係者の要求によってもしくは関係者との契約下で実施する）、および／あるいは試験のための顧客の支払いのうちの少なくとも一部を受け取る関係者に）提出することができる。報告（例えば、アッセイの結果、これらとして、例えば、アッセイした（１種以上の）ＳＮＰにおける顧客の疾患の危険性および／または対立遺伝子（１つ以上）／遺伝子型が挙げられる）は、例えば、（１種以上の）ＳＮＰをアッセイする検査室または検査室と関連がある関係者（例えば、アッセイのための顧客の支払いのうちの少なくとも一部を受け取る関係者、またはアッセイの実施を検査室に要求するもしくはアッセイの実施のために検査室と契約している関係者）、あるいは検査室と関連がある（例えば、検査室によって雇用されている、または検査室とコンサルティングもしくは契約の同意を有する）かまたは検査室と関連がある関係者と関連がある医師または他の医療従事者によって顧客に提供され得る。あるいは、報告は、報告を顧客に場合により提供する第三者（例えば、医師、遺伝カウンセラー、病院など）に提供され得る。さらなる実施形態においては、顧客は、他の個体（例えば、個体の親または顧客）を、１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰについてアッセイし、場合によりアッセイの結果の報告を入手する目的で、試験を要求／注文（例えば、購入）する医師もしくは他の医療従事者または病院、検査室、医療保険組織もしくは他の医療組織であり得る。
ビジネスを行う特定の例示的な方法においては、顧客から生物学的サンプル（例えば、頬の細胞を収集するための頬の拭き取り検体）を収集するためのキットが、（例えば、販売のために）例として、直販店（例えば、ドラッグストア、薬局、総合小売店、または任意の他の望ましい直販店）において、インターネットを介してオンラインで、通信販売によりなどで提供され、それによって、顧客は、キットを入手（例えば、購入）し、顧客自身の生物学的サンプルを収集し、（顧客のＶＴの危険性を決定するためになど）サンプルを１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰについてアッセイし、場合により（例えば、顧客の（１つ以上の）ＳＮＰ遺伝子型に基づいた顧客の疾患の危険性の）報告を顧客に提供するかまたは場合により（例えば、顧客の（１つ以上の）ＳＮＰ遺伝子型に基づいた顧客の疾患の危険性の）報告を顧客に提供する別の関係者（例えば、医師、遺伝カウンセラー、病院など）にアッセイの結果を提供する検査室に、顧客のサンプルを提出する（例えば、送る／郵送により届ける）ことができる。
本発明の特定のさらなる実施形態は、個体のＤＶＴの危険性を、または個体がＤＶＴの危険性の低下において薬物処置（もしくは他の療法）から利益を得るかどうかを決定するためのシステムを提供する。特定の例示的なシステムは、個体（または個体の医療従事者）が、そのような個体のＶＴの危険性（または薬物応答など）の決定を要求し、この決定が、個体由来のサンプルを試験することによって実施され、次いで、この決定の結果が、要求者に提供され返す統合された「ループ」を含む。例えば、特定のシステムにおいては、サンプル（例えば、血液または頬の細胞）が、試験のために個体から得られ（サンプルは、個体によって、または例えば、医療従事者によって入手され得る）、サンプルは、試験する（例えば、１種以上の本明細書において開示されるＳＮＰの遺伝子型を決定する）ために検査室（または他の施設）に提出され、次いで、試験結果が患者に送られ（これは場合により、最初に、医療従事者などの仲介人に送ることができ、次いで、その人が、結果を個体に提供するかまたは別途伝えるか、そして／または結果に基づいて行動する）、それによって、個体のＤＶＴの危険性（または薬物応答など）を決定するための統合されたループのシステムが形成される。結果が（例えば、試験施設、医療従事者および／または個体の間で）発信されるシステムの部分は、電子的なまたは信号による発信によって（例えば、電子メールもしくはインターネットを介してなど、コンピューターにより、場合により安全なデータベースであり得るウェブサイトもしくはコンピューターネットワークサーバーに結果を提供することにより、電話もしくはファックスにより、または当該分野で公知の任意の他の有線もしくは無線の発信方法により）実施され得る。場合によっては、システムは、統合されたループの一部として、危険性低下の構成要素（すなわち疾病管理システム）をさらに含むことができる（疾病管理システムの例について、米国特許第６，７７０，０２９号、「Ｄｉｓｅａｓｅ ｍａｎａｇｅｍｅｎｔ ｓｙｓｔｅｍ ａｎｄ ｍｅｔｈｏｄ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ」を参照されたい）。例えば、試験の結果は、予防的療法レジメンを実行すること（例えば、ＤＶＴ危険性を低下させるための抗凝固および／もしくは抗血小板薬などの薬剤レジメンの投与）、個体の食事を改変すること、運動を増加させること、ストレスを低下させること、ならびに／または疾患危険性を低下させる目標を伴う、個体における他の生理的改変もしくは行動改変を実行することなどによって、試験された個体において疾患の危険性を低下させるために使用することができる。ＤＶＴ危険性を低下させるために、これは、心血管健康状態を改善するための、当技術分野において使用される任意の手段を含んでもよい。したがって、例示的な実施形態において、個体および／または彼らの医療従事者が試験を要求し、試験結果を受け取り、かつ（場合によっては）疾病管理の構成要素を実行することなどによって、個体の疾患危険性を低下させるために試験結果に基づいて行動するという点で、システムは、個体および／または彼らの医療従事者によって制御される。
（単離された核酸分子ならびにＳＮＰ検出試薬およびキット）
表１および表２は、ＶＴと関連する本発明の各ＳＮＰについての種々の情報を提供し、コードされる遺伝子産物（核酸配列中に、ＩＵＢコードによって示されるＳＮＰを有する）の転写産物配列（配列番号１〜１２５）、ゲノム配列（配列番号４０４〜６０１）およびタンパク質配列（配列番号１２６〜２５０）を含む。さらに、表１および表２は、ＳＮＰコンテクスト配列を含み、この配列は、一般に、各ＳＮＰの位置の上流（５’）に１００ヌクレオチド＋下流（３’）に１００ヌクレオチド（配列番号２５１〜４０３は、表１に開示される転写産物ベースのＳＮＰコンテクスト配列に対応し、配列番号６０２〜１５８７は、表２に開示されるゲノムベースのコンテクスト配列に対応する）、各ＳＮＰ位置における代替的なヌクレオチド（対立遺伝子）、および例えば、ＳＮＰ型（コード部位、ミスセンス部位、スプライシング部位、ＵＴＲなど）、ＳＮＰが見出されたヒト集団、見出された対立遺伝子頻度、コードされるタンパク質についての情報などに関連する改変体についてのさらなる情報を含む。
（単離された核酸分子）
本発明は、表１および／または表２に開示された一つ以上のＳＮＰを含む単離された核酸分子を提供する。表１〜２の少なくとも一つに開示された一つ以上のＳＮＰを含む単離された核酸分子は、本文を通して相互変換可能に、「ＳＮＰ含有核酸分子」と言われ得る。単離された核酸分子は、必要に応じて全長改変タンパク質またはそれらのフラグメントをコードし得る。本発明の単離された核酸分子はまた、プローブおよびプライマー（「ＳＮＰ検出試薬」と題された以下の節により詳細に記載される）を含み、これらは、開示されたＳＮＰ、および単離された全長遺伝子、転写産物、ｃＤＮＡ分子、およびこれらのフラグメントをアッセイするために使用され得、これらは、例えば、コードされたタンパク質を発現する目的で使用され得る。
本明細書中で使用される場合、「単離された核酸分子」は、一般に、本発明のＳＮＰを含む核酸分子、またはこのような分子（例えば、相補的配列を有する核酸）にハイブリダイズする核酸分子を含み、そして、核酸分子の天然供給源に存在するほとんどの他の核酸から分離される。さらに、「単離された」核酸分子（例えば、本発明のＳＮＰを含むｃＤＮＡ分子）は、他の細胞物質、または組換え技術によって産生される場合、培養培地、または化学合成される場合、化学的前駆物質もしくは他の化学物質を、実質的に含み得ない。核酸分子は、他のコード配列または調節配列に融合され得、それでもなお、「単離された」と考えられ得る。非ヒトトランスジェニック動物に存在する核酸分子は、動物には、天然には存在しないが、やはり「単離された」と考えられる。例えば、ベクター中に含まれる組換えＤＮＡ分子は、「単離された」と考えられる。「単離された」ＤＮＡ分子のさらなる例としては、異種宿主細胞内で維持される組換えＤＮＡ分子、および溶液中の（部分的に、または実質的に）精製されたＤＮＡ分子が挙げられる。単離されたＲＮＡ分子はとしては、本発明の単離されたＳＮＰ含有ＤＮＡ分子のインビボＲＮＡ転写産物またはインビトロＲＮＡ転写産物が挙げられる。本発明に従う単離された核酸分子としては、さらに、合成により生成されたこのような分子が挙げられる。
一般に、単離されたＳＮＰ含有核酸分子は、本発明によって開示される一以上のＳＮＰ位置を含み、それらのＳＮＰ位置の両側の隣接ヌクレオチド配列を有する。隣接配列は、上記ＳＮＰ部位と天然で結合しているヌクレオチド残基および／または非相同ヌクレオチド配列を含み得る。好ましくは、上記隣接配列は、特に上記ＳＮＰ含有核酸分子が、タンパク質またはタンパク質フラグメントを産生するために使用される場合、ＳＮＰ位置の両側の約５００ヌクレオチド、約３００ヌクレオチド、約１００ヌクレオチド、約６０ヌクレオチド、約５０ヌクレオチド、約３０ヌクレオチド、約２５ヌクレオチド、約２０ヌクレオチド、約１５ヌクレオチド、約１０ヌクレオチド、約８ヌクレオチドまたは約４ヌクレオチド（もしくはこれらの間の任意の他の長さ）、あるいは全長遺伝子または全タンパク質コード配列（またはエクソンのようなその任意の一部分）までである。
全長遺伝子および全タンパク質コード配列について、ＳＮＰ隣接配列は、例えば、ＳＮＰの両側の約５ＫＢ、約４ＫＢ、約３ＫＢ、約２ＫＢ、約１ＫＢまでである。さらに、この場合には、単離核酸分子は、エクソンの配列を含む（タンパク質をコードするエクソン配列および／または非コードエクソン配列を含む）が、イントロンの配列も含み得る。従って、任意のタンパク質コード配列は、隣接しているか、またはイントロンによって分離され得る。重要な点は、核酸が、遠く離れかつ重要ではない隣接配列から単離され、および適切な長さであり、その結果、特定の処置または組換えタンパク質の発現、ＳＮＰ位置をアッセイするためのプローブおよびプライマーの調製、およびＳＮＰ含有核酸配列特異的な他の用途のような本明細書中で所望される用途に供され得る。
単離されたＳＮＰ含有核酸分子は、例えば、ゲノムＤＮＡから単離された遺伝子（例えば、クローニングまたはＰＣＲ増幅による）、ｃＤＮＡ分子、またはｍＲＮＡ転写分子のような全長遺伝子または転写物を含み得る。多型の転写配列は、表１中で言及され配列表（配列番号１〜１２５）で提供され、そして多型ゲノム配列は、表２中で言及され配列表（配列番号４０４〜６０１）で提供される。さらに、本明細書中に開示される一以上のＳＮＰを含むこのような全長遺伝子および転写物もまた、本発明に包含され、そしてこのようなフラグメントは、使用され、例えば、特定の機能ドメインまたは抗原エピトープのようなタンパク質の任意の一部分を発現し得る。
従って、本発明はまた、表１〜２で開示される核酸配列（転写配列は、配列番号１〜１２５のような表１に提供され、ゲノム配列は、配列番号４０４〜６０１のような表２で言及され、転写物ベースのＳＮＰ関連配列は、配列番号２５１〜４０３のような表１で言及され、そしてゲノムベースのＳＮＰ関連配列は、配列番号６０２〜１５８７として表２で言及される）およびその相補体のフラグメントも含む。表で言及される実際の配列は、配列表で提供される。フラグメントは代表的に、少なくとも約８以上のヌクレオチド、より好ましくは少なくとも約１２以上のヌクレオチド、そしてさらに好ましくは、少なくとも約１６以上のヌクレオチチドの隣接したヌクレオチド配列を含む。さらに、フラグメントは、少なくとも約１８ヌクレオチド、約２０ヌクレオチド、約２２ヌクレオチド、約２５ヌクレオチド、約３０ヌクレオチド、約４０ヌクレオチド、約５０ヌクレオチド、約６０ヌクレオチド、約８０ヌクレオチド、約１００ヌクレオチド、約１５０ヌクレオチド、約２００ヌクレオチド、約２５０ヌクレオチド、または約５００ヌクレオチドの長さを含み得る。フラグメントの長さは、意図される用途に基づく。例えば、このフラグメントは改変体ペプチドのエピトープ保有領域または、正常／野生型のタンパク質と異なる改変体ペプチドの領域をコードし得るか、またはポリヌクレオチドプローブまたはポリヌクレオチドプライマーとして有用であり得る。このようなフラグメントは、ポリヌクレオチドプローブの合成ために表１および／または表２で言及されるヌクレオチド配列を使用して単離され得る。次いで、標識されたプローブが、使用され、上記コード領域に一致する核酸を単離するために、例えば、ｃＤＮＡライブラリー、ゲノムＤＮＡライブラリー、またはｍＲＮＡをスクリーニングし得る。さらに、プライマーが、一以上のＳＮＰ部位をアッセイする目的で、または遺伝子の特定領域をクローニングするために、増幅反応において使用され得る。
本発明の単離核酸分子はさらに、核酸サンプル中の目的のポリヌクレオチドのコピー数を増加するために使用される種々の核酸増幅方法のうちの一つの産物である、ＳＮＰ含有ポリヌクレオチドをさらに含む。このような増幅方法は、当該分野において周知であり、そしてこれらとしては、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）（米国特許第４，６８３，１９５号および同第４，６８３，２０２号、ＰＣＲ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｆｏｒ ＤＮＡ Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ，Ｈ．Ａ．Ｅｒｌｉｃｈ編，Ｆｒｅｅｍａｎ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ，ＮＹ，１９９２）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）（ＷｕおよびＷａｌｌａｃｅ，Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ４：５６０，１９８９；Ｌａｎｄｅｇｒｅｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４１：１０７７，１９８８）、鎖置換増幅（ＳＤＡ）（米国特許第５，２７０，１８４号；および同第５，４２２，２５２号）、転写媒介性増幅（ＴＭＡ）（米国特許出願第５，３９９，４９１号）、連鎖直線増幅（ｌｉｎｋｅｄ ｌｉｎｅａｒ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ）（ＬＬＡ）（米国特許第６，０２７，９２３号）など、ならびに等温増幅方法［例えば、核酸配列ベースの増幅（ＮＡＳＢＡ）ならびに自己維持配列複製（ｓｅｌｆ−ｓｕｓｔａｉｎｅｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ）のような（Ｇｕａｔｅｌｌｉら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８７：１８７４，１９９０）］が挙げられるがこれらに限定されない。このような方法論に基づいて、当業者は、本明細書中に開示されるＳＮＰの５’側および３’側の領域任意の適切なにプライマーを容易に設計し得る。このようなプライマーは、その配列中に目的のＳＮＰを含む限り任意の長さのＤＮＡを増幅するために使用され得る。
本明細書中で使用される場合、本発明の「増幅ポリヌクレオチド」は、ＳＮＰ含有核酸分子であり、その量は、試験サンプル中のその開始量と比較した場合、インビトロで実施された任意の核酸増幅方法によって少なくとも２倍に増加している。他の好ましい実施形態において、増幅ポリヌクレオチドは、試験サンプル中のその開始量と比較した場合、少なくとも１０倍、５０倍、１００倍、１０００倍、または１０，０００倍もの増加の結果である。代表的なＰＣＲ増幅において、目的のポリヌクレオチドは、増幅されないゲノムＤＮＡの少なくとも５０，０００倍の量上まってしばしば増幅されるが、アッセイのために必要とされる増幅の正確な量は、その後使用される検出方法の感度に依存する。
一般に、増幅ポリヌクレオチドは、少なくとも約１６ヌクレオチドの長さである。より代表的には、増幅ポリヌクレオチドは、少なくとも約２０ヌクレオチドの長さである。本発明の好ましい実施形態において、増幅ポリヌクレオチドは、少なくとも約３０ヌクレオチドの長さである。本発明のより好ましい実施形態において、増幅ポリヌクレオチドは、少なくとも約３２ヌクレオチド、約４０ヌクレオチド、約４５ヌクレオチド、約５０ヌクレオチド、または約６０ヌクレオチドの長さである。本発明のさらに別の好ましい実施形態において、増幅ポリヌクレオチドは、少なくとも約１００ヌクレオチド、約２００ヌクレオチド、約３００ヌクレオチド、約４００ヌクレオチドまたは約５００ヌクレオチドの長さである。本発明の増幅ポリヌクレオチドの全長は、目的のＳＮＰが存在するエクソン、イントロン、または遺伝子全体程度の長さであり得るが、増幅産物は、代表的には約１，０００ヌクレオチドまでの長さである（しかし、特定の増幅方法は、１０００ヌクレオチドの長さよりも長い増幅産物を生じ得る）。より好ましくは、増幅ポリヌクレオチドは、約６００〜７００ヌクレオチド以下の長さである。増幅ポリヌクレオチドの長さに関わらず、目的のＳＮＰは、その配列に沿って至る所に位置し得ることが理解される。
本発明の具体的な実施形態において、増幅産物は、少なくとも約２０１ヌクレオチドの長さであり、表１〜２に示される転写ベースの関連配列またはゲノムベースの関連配列の一つを含む。このような産物は、その５’末端もしくは３’末端またはその両方に付加的な配列を有し得る。別の実施形態において、増幅産物は、約１０１ヌクレオチドの長さであり、そして本明細書中に開示されるＳＮＰを含む。好ましくは、そのＳＮＰは、増幅産物の中央に位置する（例えば、２０１ヌクレオチドの長さである増幅産物において１０１位、または１０１ヌクレオチドの長さである増幅産物において５１位）か、または増幅産物の中央から１ヌクレオチド、２ヌクレオチド、３ヌクレオチド、４ヌクレオチド、５ヌクレオチド、６ヌクレオチド、７ヌクレオチド、８ヌクレオチド、９ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、１２ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、もしくは２０ヌクレオチド以内に位置する（しかし、上に示したように、目的のＳＮＰは、増幅産物の長さに沿って至る所に位置し得る）。
本発明は、本明細書中に開示される一以上のＳＮＰ、その相補体およびそのＳＮＰ含有フラグメントを含む、一以上のポリヌクレオチド配列を含むか、このポリヌクレオチドからなるか、または本質的にこのポリヌクレオチドから構成される単離核酸分子を提供する。
従って、本発明は、表１および／もしくは表２に示されるヌクレオチド配列のうちのいずれかから核酸分子（転写物配列は、配列番号１〜１２５として表１で言及され、ゲノム配列は、配列番号４０４〜６０１として表２で言及され、転写物ベースのＳＮＰ関連配列は、配列番号２５１〜４０３として表１で言及され、そしてゲノムベースのＳＮＰ関連配列は、配列番号６０２〜１５８７として表２で言及される）または表１で言及される改変タンパク質のうちのいずれか（配列番号１２６〜２５０）をコードする任意の核酸分子を提供する。表で言及される実際の配列は、配列表で提供される。核酸分子は、ヌクレオチド配列が、この核酸分子の全長ヌクレオチド配列である場合、そのヌクレオチド配列からなる。
本発明はさらに、表１および／もしくは表２に示されるヌクレオチド配列のいずれかから本質的になる核酸分子（転写配列は、配列番号１〜１２５として表１で言及され、ゲノム配列は、配列番号４０４〜６０１として表２で言及され、転写物ベースのＳＮＰ関連配列は、配列番号２５１〜４０３として表１で言及され、そしてゲノムベースのＳＮＰ関連配列は、配列番号６０２〜１５８７として表２で言及される）または表１で言及される改変タンパク質（配列番号１２６〜２５０）のいずれかをコードする任意の核酸分子を提供する。表で言及される実際の配列は、配列表で提供される。核酸分子は、そのヌクレオチド配列が、最終の核酸分子において少数の付加的なヌクレオチド残基しか伴わずに存在する場合、本質的にそのようなヌクレオチド配列から成る。
本発明はさらに、表１および／もしくは表２に示されるヌクレオチド配列のいずれかまたはそのＳＮＰ含有フラグメントを含む核酸分（転写物配列は、配列番号１〜１２５として表１で言及され、ゲノム配列は、配列番号４０４〜６０１として表２で言及され、転写物ベースのＳＮＰ関連配列は、配列番号２５１〜４０３として表１で言及され、そしてゲノムベースのＳＮＰ関連配列は、配列番号６０２〜１５８７として表２で言及される）または表１で言及される改変タンパク質（配列番号１２６〜２５０）のうちのいずれかをコードする任意の核酸分子を提供する。表で言及される実際の配列は、配列表で提供される。核酸分子は、ヌクレオチド配列が、その核酸分子の最終のヌクレオチド配列の少なくとも一部である場合、そのヌクレオチド配列を含む。このような様式において、その核酸分子は、ヌクレオチド配列のみであり得るか、または付加的なヌクレオチド残基（例えば、天然にそれに関係する残基）かもしくは異種ヌクレオチド配列を有する。このような核酸分子は、１個〜少数の付加的なヌクレオチドを有し得るか、またはさらに多くの付加的なヌクレオチドを含み得る。種々の型のこれら核酸分子がどのようにして容易に作製され得、そして単離され得るのかの簡単な説明を、以下に提供する。そしてこのような技術は、当業者にとって周知である（ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ，２０００，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ）。
単離核酸分子は、成熟タンパク質に加え付加的なアミノ末端アミノ酸もしくはカルボキシル末端アミノ酸またはその両方、あるいは成熟ペプチド内のアミノ酸をコードし得る（成熟形態が、例えば、一より多くのペプチド鎖を有する場合）。このような配列は、前駆体から成熟形態へのタンパク質のプロセッシングにおいて一定の役割を果たし得、タンパク質の輸送を容易にすること、タンパク質の半減期を伸長もしくは短縮し得、またはアッセイもしくは産生のためにタンパク質の操作を容易にし得る。一般的なインサイチュの場合と同様に、一般的であるように、付加的なアミノ酸は、細胞の酵素によって成熟タンパク質からプロセッシングされ除去され得る。
従って、単離核酸分子としては、ペプチドをコードする配列のみを有する核酸分子、成熟ペプチドをコードする配列およびさらなるコード配列（例えば、リーダー配列または分泌配列（例えば、プレ−プロタンパク質配列またはプロタンパク質配列））を有する核酸分子、付加的なコード配列を有する成熟ペプチドをコードする配列または付加的なコード配列を有さない成熟ペプチドをコードする配列に加えて付加的な非コード配列（例えば、ｍＲＮＡの転写、ｍＲＮＡプロセッシング（スプライシングシグナル、およびポリアデニル化シグナルを含む）リボソーム結合、および／または安定性において一定の役割を果たす、転写されるが翻訳されない配列のような、例えば、イントロンおよび非コード５’配列および非コード３’配列）、が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、核酸分子は、例えば、精製を容易にするペプチドをコードする異種マーカー配列へ融合され得る。
単離核酸分子は、ｍＲＮＡのようなＲＮＡの形態、またはｃＤＮＡおよびゲノムＤＮＡを含むＤＮＡ形態であり得、例えば、分子クローニングによって得られ得るかまたは化学合成技術による産生またはその組合せにより産生され得る（ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ，２０００，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，ＮＹ）。さらに、単離核酸分子（特にプローブおよびプライマーのようなＳＮＰ検出試薬）はまた、部分的または全体的にペプチド核酸（ＰＮＡ）のような一以上の型の核酸アナログ形態（米国特許第５，５３９，０８２号；同第５，５２７，６７５号；同第５，６２３，０４９号；同第５，７１４，３３１号）であり得る。核酸、特にＤＮＡは、二本鎖であってもまたは一本鎖であってもよい。一本鎖核酸は、コード鎖（センス鎖）または相補的非コード鎖（アンチセンス鎖）であり得る。ＤＮＡセグメント、ＲＮＡセグメント、またはＰＮＡセグメントは、例えば、ヒトゲノムのフラグメント（ＤＮＡまたはＲＮＡの場合）、または単一のヌクレオチド、短いオリゴヌクレオチドリンカーから、あるいは一連のオリゴヌクレオチドから構築され、合成核酸分子を提供し得る。核酸分子は、参考として本明細書中に提供される配列を使用して容易に合成され得、オリゴヌクレオチドおよびＰＮＡオリゴマーの合成技術は、当該分野で周知である（例えば、Ｃｏｒｅｙ、「Ｐｅｐｔｉｄｅ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄｓ：ｅｘｐａｎｄｉｎｇ ｔｈｅ ｓｃｏｐｅ ｏｆ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ」、Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１９９７年６月；１５（６）：２２４−９、およびＨｙｒｕｐら、「Ｐｅｐｔｉｄｅ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄｓ（ＰＮＡ）：ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ａｎｄ ｐｏｔｅｎｔｉａｌ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ」、Ｂｉｏｏｒｇ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ．１９９６年１月；４（１）：５−２３を参照のこと）。さらに、大規模な自動化オリゴヌクレオチド／ＰＮＡ合成（アレイまたはビーズ表面または他の固体支持体上での合成を含む）が、市販の核酸合成機（例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，ＣＡ）３９００ Ｈｉｇｈ−Ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ＤＮＡ ＳｙｎｔｈｅｓｉｚｅｒまたはＥｘｐｅｄｉｔｅ ８９０９ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｓｙｓｔｅｍ）、および本明細書中に提供される配列情報を使用して容易に達成され得る。
本発明は、当該分野で公知の改変されたヌクレオチド、合成ヌクレオチド、もしくは天然に生じないヌクレオチド、または改変された構造エレメント、合成の構造エレメント、もしくは天然に生じない構造エレメント、または他の代替的な／改変された核酸化学を含む、核酸アナログを含む。このような核酸アナログは、例えば、表１および／または表２において同定される一以上のＳＮＰを検出するための検出試薬（例えば、プライマー／プローブ）として有用である。さらに、これらアナログを含むキット／系（例えば、ビーズ、アレイなど）もまた、本発明に含まれる。例えば、本発明の多型配列に基づくＰＮＡオリゴマーは、特に企図される。ＰＮＡオリゴマーは、ＤＮＡのアナログであり、そのリン酸骨格は、ペプチド様骨格で置換されている（Ｌａｇｒｉｆｆｏｕｌら、Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ ＆ Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ Ｌｅｔｔｅｒｓ，４：１０８１−１０８２（１９９４）、Ｐｅｔｅｒｓｅｎら、Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ ＆ Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ Ｌｅｔｔｅｒｓ，６：７９３−７９６（１９９６）、Ｋｕｍａｒら、Ｏｒｇａｎｉｃ Ｌｅｔｔｅｒｓ ３（９）：１２６９−１２７２（２００１）、ＷＯ９６／０４０００）。ＰＮＡは、従来のオリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチドアナログよりも、高い親和性および特異性で、相補的なＲＮＡまたはＤＮＡとハイブリダイズする。このＰＮＡの特性は、従来のオリゴヌクレオチドおよびペプチドを用いては達成し得ない新規な分子生物学適用および生化学の適用を可能とする。
核酸の結合特性および／または安定性を改善する核酸改変のさらなる例は、イノシンのような塩基アナログ、インターカレーター（米国特許第４，８３５，２６３号）および副溝の結合体（米国特許第５，８０１，１１５号）の使用を含む。従って、核酸分子、ＳＮＰ含有核酸分子、ＳＮＰ検出試薬（例えば、プローブおよびプライマー）、オリゴヌクレオチド／ポリヌクレオチドに対する本明細書中における言及は、ＰＮＡオリゴマーおよび他の核酸アナログを含む。当該分野で公知の核酸アナログおよび選択的核酸化学／改変核酸化学の他の例は、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（２００２）に記載される。
本発明はさらに、本明細書中に開示される改変体ポリペプチドのフラグメントをコードする核酸分子および改変体ポリペプチドの明白な改変体をコードする核酸分子を提供する。このような核酸分子は、パラログ（ｐａｒａｌｏｇ）（異なる遺伝子座）およびオーソログ（ｏｒｔｈｏｌｏｇ）（異なる生物体）のように、天然に生じ得るか、または組換えＤＮＡ方法もしくは化学合成によって構築され得る。天然に生じない改変体は、核酸分子、細胞、または生物への適用されるものを含む、変異誘発技術によって作製され得る。従って、その改変体は、ヌクレオチドの置換、欠失、転位、および挿入を含み得る（表１〜２において開示されるＳＮＰに加えて）。改変体は、コード領域および非コード領域のいずれかまたは両方に生じ得る。この改変体は、保存的および／または非保存的なアミノ酸置換を生じ得る。
さらに、天然に生じる対立遺伝子改変体（ならびにオルソログおよびパラログ）ならびに変異誘発技術によって産生される合成改変体のような、表１〜２に開示される核酸分子の改変体は、当該分野において周知の方法を使用して同定および／または産生され得る。さらにこのような改変体は、表１および／または表２において開示される核酸配列（またはそのフラグメント）と少なくとも、７０％〜８０％、８０％〜８５％、８５％〜９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を共有し、かつ表１および／または表２に開示される新規ＳＮＰ対立遺伝子を含む、ヌクレオチド配列を含み得る。さらに、改変体は、表１に開示されたポリペプチド配列（またはそのフラグメント）と少なくとも７０％〜８０％、８０％〜８５％、８５％〜９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を共有し、かつ表１および／または表２に開示される新規ＳＮＰ対立遺伝子を含む、ヌクレオチド配列を含み得る。従って、本発明の一つの局面は、表１〜２において示される配列と比較した場合ある程度の配列改変体を有するが、本明細書中に開示される新規ＳＮＰ対立遺伝子を含む、単離核酸分子を特に企図する。言い換えれば、単離核酸分子が、本明細書中に開示された新規ＳＮＰ対立遺伝子を含む限り、この新規ＳＮＰ対立遺伝子に隣接する核酸分子の他の部分は、表１〜２で言及され示される特定の転写物配列、ゲノム配列、および関連配列からある程度変化し得、表１で言及される特定のポリペプチド配列からある程度変化したポリペプチにコードし得る。
配列相同性を共有する二つの分子の二つのアミノ酸配列または二つのヌクレオチド配列の同一性のパーセントを決定するために、これらの配列は、最適な比較を目的としてアライメントされる（例えば、ギャップが、最適なアライメントのために第一および第二のアミノ酸配列または核酸配列の一方または両方に導入され得、そして非相同性配列は、比較目的のために、無視され得る）。好ましい実施形態において、参照配列の長さの少なくとも３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％以上は、比較の目的でアライメントされる。次いで対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置でのアミノ酸残基またはヌクレオチドが、比較される。第一の配列におけるある位置が、第二の配列における対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占められている場合、その分子は、その位置で同一である（本明細書中で使用される場合、アミノ酸または核酸の「同一性」は、アミノ酸または核酸の「相同性」と等しい）。二つの配列の間の同一性のパーセントは、二つの配列の最適なアライメントのために導入される必要性があるギャップの数および各ギャップの長さを考慮して、それらの配列により共有される同一位置の数の関数である。
二つの配列間の配列の比較および同一性のパーセントの決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成され得る。（Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｌｅｓｋ，Ａ．Ｍ．編、Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９８８；Ｂｉｏｃｏｍｐｕｔｉｎｇ：Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ａｎｄ
Ｇｅｎｏｍｅ Ｐｒｏｊｅｃｔｓ，Ｓｍｉｔｈ，Ｄ．Ｗ．編、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９９３；Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｄａｔａ，Ｐａｒｔ １、Ｇｒｉｆｆｉｎ，Ａ．Ｍ．およびＧｒｉｆｆｉｎ，Ｈ．Ｇ．、ｅｄｓ．，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｊｅｒｓｅｙ，１９９４；Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，ｖｏｎ Ｈｅｉｎｊｅ，Ｇ．，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，１９８７；およびＳｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｐｒｉｍｅｒ，Ｇｒｉｂｓｋｏｖ，Ｍ．およびＤｅｖｅｒｅｕｘ，Ｊ．編、Ｍ Ｓｔｏｃｋｔｏｎ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９１）。好ましい実施形態において、二つのアミノ酸配列間の同一性のパーセントは、Ｂｌｏｓｓｏｍ ６２マトリックスまたはＰＡＭ２５０マトリックスのいずれか、ギャップウェート（ｇａｐ ｗｅｉｇｈｔ）１６、１４、１２、１０、８、６または４、長さウェート（ｌｅｎｇｔｈ ｗｅｉｇｈｔ）１、２、３、４、５または６）を使用して、ＮｅｅｄｌｅｍａｎおよびＷｕｎｓｃｈのアルゴリズム（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．（４８）：４４４−４５３ １９７０））を用いて決定され、これは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ内のＧＡＰプログラムへ組み込まれている。
さらに別の好ましい実施形態においては、二つのヌクレオチド配列間の同一性のパーセントは、ＮＷＳｇａｐｄｎａ．ＣＭＰマトリックスならびにギャップウェート（４０、５０、６０、７０、または８０）および長さウェート（１、２、３、４、５、または６）を使用してＧＣＧソフトウェアパッケージ内のＧＡＰプログラム（Ｄｅｖｅｒｅｕｘ，Ｊ．ら、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１２（１）：３８７（１９８４））を用いて決定される。別の実施形態において、二つのアミノ酸配列または二つのヌクレオチド配列の間の同一性のパーセントは、ＰＡＭ１２０ウェート残基表、ギャップ長ペナルティー１２およびギャップペナルティー４を用いて、ＡＬＩＧＮプログラム（バージョン２．０）へ組み込まれているＥ．ＭｙｅｒｓおよびＷ．Ｍｉｌｌｅｒのアルゴリズム（ＣＡＢＩＯＳ，４：１１−１７（１９８９））を使用して決定される。
本発明のヌクレオチド配列およびアミノ酸配列は、さらに「照会配列」として使用され、例えば、他のファミリーメンバーまたは関連配列を同定するために、配列データベースに対して検索を実施し得る。このような検索は、Ａｌｔｓｃｈｕｌら（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２１５：４０３−１０（１９９０））のＮＢＬＡＳＴプログラムおよびＸＢＬＡＳＴプログラム（バージョン２．０）を使用して実施し得る。ＢＬＡＳＴヌクレオチド検索は、ＮＢＬＡＳＴプログラム（スコア＝１００、ワード長（ｗｏｒｄｌｅｎｇｔｈ）＝１２）を用いて実施し、本発明の核酸分子に相同なヌクレオチド配列を得ることが可能である。ＢＬＡＳＴのタンパク質検索は、ＸＢＬＡＳＴプログラム（スコア＝５０、ワード長＝３）を用いて実施し、本発明のタンパク質に相同なアミノ酸配列を得ることが可能である。比較目的のためにギャップをいれたアライメントを得るために、Ｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴが、Ａｌｔｓｃｈｕｌら（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５（１７）：３３８９−３４０２（１９９７））に記載されるように利用され得る。ＢＬＡＳＴおよびｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴプログラムを利用した場合、それぞれのプログラム（例えば、ＸＢＬＡＳＴおよびＮＢＬＡＳＴ）のデフォルトパラメーターが、使用され得る。ＢＬＡＳＴに加えて、当該分野で使用される他の検索プログラムおよび配列比較プログラムの例としては、ＦＡＳＴＡ（Ｐｅａｒｓｏｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２５，３６５−３８９（１９９４））およびＫＥＲＲ（Ｄｕｆｒｅｓｎｅら、Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ２００２ Ｄｅｃ；２０（１２）：１２６９−７１）が挙げられるが、これらに限定されない。生命情報科学技術に関するさらなる情報については、Ｃｕｒｒｅｎｔ
Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎ．Ｙ．を参照のこと。
本発明はさらに、表１および／または表２に開示される核酸分子の非コードフラグメントを提供する。好ましい非コードフラグメントとしては、プロモーター配列、エンハンサー配列、イントロン配列、５’非翻訳領域（ＵＴＲ）、３’非翻訳領域、遺伝子調節配列および遺伝子終止配列が挙げられるが、これらに限定されない。このようなフラグメントは、例えば、異種遺伝子の発現を制御することおよび遺伝子調節剤を同定するためにスクリーニングを開発することにおいて有用である。
（ＳＮＰ検出試薬）
本発明の特定の局面において、表１および／または表２に開示されたＳＮＰおよびその関連転写物配列（配列番号１〜１２５として表１で言及される）、ゲノム配列（配列番号４０４〜６０１として表２で言及される）および関連配列（転写物ベースの関連配列が、配列番号２５１〜４０３として表１で言及され、ゲノムベースの関連配列が、配列番号６０２〜１５８７として表２に提供される）は、ＳＮＰ検出試薬の設計のために使用され得る。これらの表で言及される実際の配列は、配列表で提供される。本明細書中で使用される場合、「ＳＮＰ検出試薬」は、本明細書中に開示される特定の標的ＳＮＰ位置を特異的に検出し、好ましくは、標的ＳＮＰ位置の特定のヌクレオチド（対立遺伝子）に対して特異的である（すなわち、検出試薬は、好ましくは、標的ＳＮＰ位置にある異なる選択的ヌクレオチドを区別し得、これによって標的ＳＮＰ位置に存在するヌクレオチドの正体を決定することを可能とする）。代表的に、このような検出試薬は、標的ＳＮＰ含有核酸分子に対して配列特異的様式の相補的な塩基対合によってハイブリダイズし、試験サンプル中において当該分野で公知の形態のような他の核酸配列から標的改変体の配列を区別する。検出試薬の例は、表１および／または表２で言及される一以上のＳＮＰを含有する標的核酸にハイブリダイズするプローブである。好ましい実施形態において、このようなプローブは、同一の標的ＳＮＰ位置において異なるヌクレオチドを有する他の核酸から標的ＳＮＰ位置で特定のヌクレオチド（対立遺伝子）を有する核酸を区別し得る。さらに、検出試薬は、ＳＮＰ位置に対して５’側および／または３’側にある特定の領域にハイブリダイズし得、特に表１および／または表２で言及される関連配列（転写物ベースの関連配列が、配列番号２５１〜４０３として表１で言及され；ゲノムベースの関連配列が、配列番号６０２〜１５８７として表２で言及される）に対応している領域にハイブリダイズし得る。検出試薬の別の例は、標的ポリヌクレオチドの相補鎖に沿うヌクレオチドの伸長の開始点として作用するプライマーである。本明細書中に提供されるＳＮＰ配列の情報はまた、本発明の任意のＳＮＰを（例えば、ＰＣＲを使用に）増幅するためのプライマー（例えば、対立遺伝子特異的プライマー）を設計するためにも有用である。
本発明の一つの好ましい実施形態において、ＳＮＰ検出試薬は、単離もしくは合成されたＤＮＡ、あるいはＲＮＡのポリヌクレオチドプローブはプライマー、またはＰＮＡオリゴマーまたはＤＮＡ、ＲＮＡおよび／もしくはＰＮＡの組合せであり、表１および／または表２に同定されたＳＮＰを含有する標的核酸分子のセグメントに対してハイブリダイズする。ポリヌクレオチドの形態の検出試薬は必要に応じて、改変塩基アナログ、インターカレート剤、または副溝に結合体を含み得る。プローブのような複数の検出試薬は、ＳＮＰ検出キットを形成するために、例えば、固体支持体（例えば、アレイもしくはビーズ）に付着させられるか、または溶液中にて供給され得る（例えば、ＰＣＲ、ＲＴ−ＰＣＲ、ＴａｑＭａｎアッセイ、もしくはプライマー伸長反応のような酵素反応のためのプローブ／プライマーセット）。
プローブまたはプライマーは代表的には、精製されたオリゴヌクレオチドまたはＰＮＡオリゴマーである。このようなオリゴヌクレオチドは、代表的に、ストリンジェントな条件下で、標的核酸分子の少なくとも約８個、約１０個、約１２個、約１６個、約１８個、約２０個、約２２個、約２５個、約３０個、約４０個、約５０個、約５５個、約６０個、約６５個、約７０個、約８０個、約９０個、約１００個、約１２０個（またはこれらの間のいずれか他の個数）連続するヌクレオチドに対してハイブリダイズする、相補的なヌクレオチド配列の領域を含む。特定のアッセイに依存して、その連続するヌクレオチドは、標的ＳＮＰ位置を含み得るかあるいは所望されるアッセイを実施するためにＳＮＰ位置に十分に近い、５’側および／または３’側の特定の領域含み得るかいずれかである。
他の好ましいプライマー配列およびプローブ配列は、配列表および表１〜２に開示される転写物配列（配列番号１〜１２５）、ゲノム配列（配列番号４０４〜６０１）およびＳＮＰ関連配列（転写物ベースの関連配列か、配列番号２５１〜４０３として表１で言及され、ゲノムベースの関連配列か、配列番号６０２〜１５８７として表２で言及される）を使用して容易に決定される。これらの表で言及される実際の配列は、配列表で提供される。このようなプライマーおよびプローブが、本発明のＳＮＰの遺伝子型分類のための試薬として直接的に有用であり、任意のキット／システム形態へ組込まれ得ることは、当業者に明らかである。
標的ＳＮＰ含有配列に特異的なプローブまたはプライマーを作製するために、そのヌクレオチド配列の５’末端または３’末端において開始する、目的のＳＮＰ周辺の遺伝子配列／転写物配列および／または関連配列が代表的には、コンピューターアルゴリズムを使用して調べられる。次いで代表的なアルゴリズムは、その遺伝子配列／ＳＮＰ関連配列に特有であり、このオリゴマーは、ハイブリダイゼーションのために適切な範囲内のＧＣ含量を有し、ハイブリダイゼーションを妨げ得る推定二次構造を有さず、かつ／または所望される他の特性を保有するか、あるいは、所望されない他の特質を欠く、規定された長さのオリゴマーを同定する。
本発明のプライマ−またはプロ−ブは、代表的には、少なくとも約８ヌクレオチド長である。本発明の一実施形態において、プライマ−またはプロ−ブは、少なくとも約１０ヌクレオチド長である。好ましい実施形態において、プライマ−またはプロ−ブは、少なくとも約１２ヌクレオチド長である。より好ましい実施形態において、プライマ−またはプロ−ブは、少なくとも約１６ヌクレオチド長、１７ヌクレオチド長、１８ヌクレオチド長、１９ヌクレオチド長、２０ヌクレオチド長、２１ヌクレオチド長、２２ヌクレオチド長、２３ヌクレオチド長、２４ヌクレオチド長、または２５ヌクレオチド長である。プロ−ブの最大の長さは、使用されるアッセイの型に依存して、標的配列が検出される限りであり得るが、その最大長は、代表的には、約５０ヌクレオチド長未満、６０ヌクレオチド長未満、６５ヌクレオチド長未満、または７０ヌクレオチド長未満である。プライマ−の場合には、その最大長は、代表的には、約３０ヌクレオチド長未満である。本発明の具体的な好ましい実施形態において、プライマ−またはプロ−ブは、約１８ヌクレオチド長〜約２８ヌクレオチド長の範囲内にある。しかし、他の実施形態（例えば、核酸アレイ、およびプロ−ブが基材に付着する他の実施形態）において、上記プロ−ブは、より長い（例えば、約３０〜７０ヌクレオチド長、７５ヌクレオチド長、８０ヌクレオチド長、９０ヌクレオチド長、１００ヌクレオチド長以上）ものであり得る（以下の「ＳＮＰ検出キットおよびシステム」と題する節を参照のこと）。
ＳＮＰを分析するために、選択的ＳＮＰ対立遺伝子に特異的なオリゴヌクレオチドを使用することが、適切であり得る。標的配列における単一ヌクレオチド変化を検出するそのようなオリゴヌクレオチドは、「対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド」、「対立遺伝子特異的プロ−ブ」または「対立遺伝子特異的プライマ−」のような用語によって呼ばれ得る。多型を分析するための対立遺伝子特異的プロ−ブの設計および使用は、例えば、Ｍｕｔａｔｉｏｎ Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｃｏｔｔｏｎら編，Ｏｘｆｏｒｄ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ，１９９８；Ｓａｉｋｉら，Ｎａｔｕｒｅ ３２４，１６３〜１６６（１９８６）；Ｄａｔｔａｇｕｐｔａ，ＥＰ２３５，７２６；およびＳａｉｋｉ，ＷＯ８９／１１５４８に記載される。
各々の対立遺伝子特異的プライマ−または対立遺伝子特異的プロ−ブの設計は、変数（例えば、標的核酸分子中のＳＮＰ位置に隣接するヌクレオチド配列の正確な組成、ならびにそのプライマ−またはプロ−ブの長さ）に依存するが、プライマ−およびプロ−ブの使用における別の要因は、そのプロ−ブまたはプライマ−と、標的配列との間のハイブリダイゼ−ションが実施される条件のストリンジェンシ−である。より高いストリンジェンシ−条件は、より低いイオン強度の緩衝液および／またはより高い反応温度を利用し、そして安定な二重鎖を形成するためには、プロ−ブ／プライマ−と標的配列との間のより完全な一致を必要とする傾向がある。しかし、そのストリンジェンシ−が高すぎる場合、ハイブリダイゼ−ションは、全く生じないかもしれない。対照的に、より低いストリンジェンシ−条件は、より高いイオン強度の緩衝液および／またはより低い反応温度を利用し、そしてプロ−ブ／プライマ−と標的配列との間のよりミスマッチした塩基による安定な二重鎖の形成を可能にする。例としてであって限定としてではないが、対立遺伝子特異的プロ−ブを使用する高ストリンジェンシ−ハイブリダイゼ−ション条件についての例示的な条件は、以下の通りである：５×標準的生理食塩水リン酸ＥＤＴＡ（ＳＳＰＥ）、０．５％
ＮａＤｏｄＳＯ４（ＳＤＳ）を含む溶液を用いる５５℃でのプレハイブリダイゼ−ション；同じ溶液中にある標的核酸分子とともに同じ温度でプロ−ブをインキュベ−トすること、その後、２×ＳＳＰＥおよび０．１％ ＳＤＳを含む溶液を用いて５５℃または室温で洗浄すること。
中程度のストリンジェンシ−のハイブリダイゼ−ション条件が、例えば、約５０ｍＭ ＫＣｌを含む溶液を用いて、約４６℃にて、対立遺伝子特異的プライマ−伸長反応のために使用され得る。あるいは、上記反応は、高温（例えば、６０℃）にて実行され得る。別の実施形態において、オリゴヌクレオチド連結アッセイ（ＯＬＡ）反応（この反応において、２つのプロ−ブが、それらが標的配列と完全に相補的な場合に連結される）のために適切な中程度にストリンジェントなハイブリダイゼ−ション条件は、約１００ｍＭ ＫＣｌの溶液を、温度４６℃にて利用し得る。
ハイブリダイゼ−ションベ−スのアッセイにおいて、ある個体由来の標的ＤＮＡのセグメントにハイブリダイズするが、別の個体由来の対応するセグメントには、その２つの個体由来の個々のＤＮＡセグメントにおける異なる多型形態（例えば、選択的ＳＮＰ対立遺伝子／ヌクレオチド）の存在に起因してハイブリダイズしない、対立遺伝子特異的プロ−ブが、設計され得る。ハイブリダイゼ−ション条件は、対立遺伝子間のハイブリダイゼ−ション強度における検出可能な有意な差異が存在し、好ましくは、本質的には二元の応答が存在し、それによって、プロ−ブが対立遺伝子のうちの一方のみにハイブリダイズするかまたは一方の対立遺伝子に対して有意により強くハイブリダイズするに充分に、ストリンジェントであるべきである。プロ−ブは、ＳＮＰ部位を含む標的配列にハイブリダイズしてそのＳＮＰ部位がそのプロ−ブの配列に沿ったどこかに整列するように設計され得るが、そのプロ−ブは、好ましくは、標的配列のセグメントにハイブリダイズして、そのＳＮＰ部位が、そのプロ−ブの中心位置（例えば、そのプロ−ブのいずれかの末端から少なくとも３ヌクレオチド離れているそのプロ−ブ内の位置）と整列するように設計される。このプロ−ブ設計は、一般的には、異なる対立遺伝子形態間でのハイブリダイゼ−ションにおける良好な識別を達成する。
別の実施形態において、プロ−ブまたはプライマ−は、標的ＤＮＡのセグメントにハイブリダイズして、そのＳＮＰがそのプロ−ブまたはプライマ−の最も５’側の末端または最も３’側の末端のいずれかと整列するように、設計され得る。オリゴヌクレオチド連結アッセイ（米国特許第４，９８８，６１７号）における使用のために特に適切な具体的な好ましい実施形態において、上記プロ−ブの最も３’側のヌクレオチドは、その標的配列中のＳＮＰ位置と整列する。
オリゴヌクレオチドプロ−ブおよびオリゴヌクレオチドプライマ−は、当該分野で周知の方法によって調製され得る。化学合成方法としては、Ｎａｒａｎｇら、１９７９、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ６８：９０により記載されるホスホトリエステル法；Ｂｒｏｗｎら、１９７９，Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ６８：１０９により記載されるホスホジエステル法；Ｂｅａｕｃａｇｅら、１９８１、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔｅｒｓ ２２：１８５９により記載されるジエチルホスホロアミデ−ト法；および米国特許第４，４５８，０６６号に記載される固体支持体法が挙げられるが、これらに限定されない。
対立遺伝子特異的プロ−ブは、しばしば、対の状態で（または、より一般的ではないが、３個または４個の組の状態で（例えば、ＳＮＰ位置がそれぞれ３個または４個の対立遺伝子を有することが公知である場合、あるいは、標的ＳＮＰ対立遺伝子の核酸分子の両方の鎖をアッセイするために））使用され、そのような対は、そのＳＮＰ位置で対立遺伝子改変体を示す１ヌクレオチドミスマッチ以外は同一であり得る。一般的に、１つの対のうちの一方のメンバ−は、より一般的なＳＮＰ対立遺伝子（すなわち、標的集団中においてより頻繁である対立遺伝子）を有する標的配列参照形態と完全に一致し、その対のうちのもう一方のメンバ−は、より一般的ではないＳＮＰ対立遺伝子（すなわち、その標的集団において稀な対立遺伝子）を有する標的配列形態と完全に一致する。アレイの場合には、複数のプロ−ブ対が、複数の異なる多型を同時に分析するために同じ支持体上に固定され得る。
ある型のＰＣＲベ−スのアッセイにおいて、対立遺伝子特異的プライマ−は、ＳＮＰ位置と重複し、そのプライマ−が完全相補性を示す対立遺伝子形態の増幅のみをプライミングする、標的核酸分子上の領域にハイブリダイズする（Ｇｉｂｂｓ，１９８９，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１７：２４２７〜２４４８）。代表的には、それらのプライマ−の最も３’側のヌクレオチドは、その標的核酸分子のＳＮＰ位置と整列し、かつそのＳＮＰ位置と相補的である。このプライマ−は、遠位部位にてハイブリダイズする第二のプライマ−と整列の結合に使用される。増幅は、これらの２つのプライマ−から進行し、どの対立遺伝子形態が試験サンプル中に存在するかを示す検出可能な産物を生じる。コントロ−ルが、通常、第二のプライマ−対を用いて実施される。この第二のプライマ−対のうちの一方は、その多型部位で一塩基ミスマッチを示し、この第二のプライマ−対のうちのもう一方は、遠位部位に対して完全相補性を示す。この一塩基ミスマッチは、増幅を防止するかまたは増幅効率を実質的に減少させ、その結果、検出可能な産物が形成されないか、または検出可能な産物がより低量もしくはより低速度で形成される。上記の方法は、一般的には、そのミスマッチがそのオリゴヌクレオチドの最も３’側の位置にある（すなわち、そのオリゴヌクレオチドの最も３’側の位置が、標的ＳＮＰ位置と整列する）場合に、最も効率的に作用する。なぜなら、この位置は、上記プライマ−からの伸長に対して最も不安定であるからである（例えば、ＷＯ９３／２２４５６参照）。このＰＣＲベ−スアッセイは、下記のＴａｑＭａｎアッセイの一部として利用され得る。
本発明の具体的実施形態において、本発明のプライマ−は、標的ＳＮＰを含む核酸分子のセグメントに対して実質的に相補的な配列を含み、但し、そのプライマ−は、そのプライマ−の最も３’側の末端にある３つのヌクレオチド位置のうちの１つにおいてミスマッチヌクレオチドを有し、その結果、そのミスマッチヌクレオチドは、そのＳＮＰ部位において特定の対立遺伝子と塩基対形成しない。好ましい実施形態において、上記プライマ−中のミスマッチヌクレオチドは、そのプライマ−の最も３’側の位置にある最後のヌクレオチドから２番目にある。より好ましい実施形態において、上記プライマ−中のミスマッチヌクレオチドは、そのプライマ−の最も３’側の位置にある最後のヌクレオチドである。
本発明の別の実施形態において、本発明のＳＮＰ検出試薬は、検出可能なシグナルを発する蛍光発生レポ−タ−色素で標識される。好ましいレポ−タ−色素は、蛍光色素であるが、検出試薬（例えば、オリゴヌクレオチドまたはプライマ−）に結合され得る任意のレポ−タ−色素が、本発明における使用のために適切である。そのような色素としては、アクリジン、ＡＭＣＡ，ＢＯＤＩＰＹ、カスケ−ドブル−、Ｃｙ２、Ｃｙ３、Ｃｙ５、Ｃｙ７、ダブシル、エダンス、エオシン、エリスロシン、フルオレセイン、６−Ｆａｍ、Ｔｅｔ、Ｊｏｅ、Ｈｅｘ、オレゴングリ−ン、ロ−ダミン、Ｒｈｏｄｏｌ Ｇｒｅｅｎ、Ｔａｍｒａ、Ｒｏｘ、およびテキサスレッドが挙げられるが、これらに限定されない。
本発明のなお別の実施形態において、その検出試薬は、特に、その試薬が自己クエンチングプロ−ブ（例えば、ＴａｑＭａｎ）（米国特許第５，２１０，０１５号および同第５，５３８，８４８号）または分子ビ−コンプロ−ブ（米国特許第５，１１８，８０１号および同第５，３１２，７２８号）または他のステムレスプロ−ブもしくは直鎖状ビ−コンプロ−ブ（Ｌｉｖａｋら、１９９５、ＰＣＲ Ｍｅｔｈｏｄ Ａｐｐｌ．４：３５７〜３６２；Ｔｙａｇｉら、１９９６、Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １４：３０３〜３０８；Ｎａｚａｒｅｎｋｏら、１９９７、Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５：２５１６〜２５２１；米国特許第５，８６６，３３６号および同第６，１１７，６３５号）として使用される場合に、クエンチャ−色素（例えば、Ｔａｍｒａ）でさらに標識され得る。
本発明の検出試薬はまた、他の標識（ストレプトアビジン結合のためのビオチン、抗体結合のためのハプテン、および別の相補的オリゴヌクレオチド（例えば、ジップコ−ドの対）に結合するためのオリゴヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない）を含み得る。
本発明はまた、本明細書中で同定されたＳＮＰヌクレオチドを含まない（またはそのＳＮＰヌクレオチドと相補的である）が、本明細書中に開示される１つ以上のＳＮＰをアッセイするために使用される、試薬も企図する。例えば、本明細書中に提供される標的ＳＮＰ位置に隣接はするが直接的にはハイブリダイズしないプライマ−が、それらのプライマ−が、その標的ＳＮＰ位置と近接する（すなわち、その標的ＳＮＰ部位から１ヌクレオチド以上以内にある）領域にハイブリダイズプライマ−伸長反応において、有用である。そのプライマ−伸長反応の間に、プライマ−は、代表的には、特定のヌクレオチド（対立遺伝子）が標的ＳＮＰ部位に存在する場合にはその標的ＳＮＰ部位を過ぎては伸長できず、そのプライマ−伸長産物は、ＳＮＰ対立遺伝子がどの標的ＳＮＰ部位に存在するかを決定するために検出され得る。例えば、特定のｄｄＮＴＰが、一旦ｄｄＮＴＰが上記伸長産物（その最も３’側の末端にｄｄＮＴＰを含み、そのｄｄＮＴＰが本明細書中に開示されるＳＮＰのヌクレオチドである、プライマ−伸長産物は、本発明により特に企図される組成物である）に組み込まれるとプライマ−伸長を終結させるために、上記プライマ−伸長反応において使用される。従って、ＳＮＰ部位に近接する領域中の核酸分子に結合し、ＳＮＰ部位のアッセイのために使用される試薬は、結合した配列はそのＳＮＰ部位自体を必ずしも含まないけれども、これもまた本発明によって企図される。
（ＳＮＰ検出キットおよびＳＮＰ検出システム）
当業者は、本明細書中に開示されるＳＮＰおよび関連する配列情報に基づいて、検出試薬が、本発明の任意のＳＮＰを個別にかまたは組み合わせてアッセイするために開発および使用され得、そのような検出試薬は、当該分野で周知である確立されたキット形態またはシステム形態のうちの１つに容易に組み込まれ得ることを、認識する。用語「キット」および「システム」とは、本明細書中でＳＮＰ検出試薬の文脈で使用される場合、複数のＳＮＰ検出試薬の組み合わせ、または１つ以上の他の型のエレメントまたは構成要素（例えば、他の型の生化学試薬、容器、パッケ−ジ（例えば、市販用に意図されるパッケ−ジング）、ＳＮＰ検出試薬が結合している基材、電子ワ−ドウェア構成要素など）と組み合わせた１種以上のＳＮＰ検出試薬のようなものを指す。従って、本発明は、ＳＮＰ検出キットおよびＳＮＰ検出システム（パッケ−ジされたプロ−ブとプライマ−との組（例えば、ＴａｑＭａｎプロ−ブ／プライマ−の組）、核酸分子のアレイ／マイクロアレイ、および本発明の１種以上のＳＮＰを検出するための１種以上のプロ−ブ、プライマ−、または他の検出試薬を含むビ−ズが挙げられるが、これらに限定されない）をさらに提供する。上記キット／システムは、種々の電子ハ−ドウェア構成要素を必要に応じて含み得る。例えば、種々の製造業者により提供されるアレイ（「ＤＮＡチップ」）および微小流体システム（「ラブ・オン・ア・チップ（ｌａｂ−ｏｎ−ａ−ｃｈｉｐ）」システム）は、代表的には、ハ−ドウェア構成要素を含む。上記キット／システム（例えば、プロ−ブ／プライマ−の組）は、電子ハ−ドウェア構成要素を含まないかもしれないが、例えば、１つ以上の容器中にパッケ−ジングされた１種以上のＳＮＰ検出試薬を（必要に応じて、他の生化学試薬とともに）含み得る。
いくつかの実施形態において、ＳＮＰ検出キットは、代表的には、１種以上の検出試薬と、アッセイまたは反応（例えば、ＳＮＰ含有核酸分子の増幅および／または検出）を実行するための必要な他の構成要素（例えば、緩衝液、酵素（例えば、ＤＮＡポリメラ−ゼもしくはリガ−ゼ）、鎖伸長ヌクレオチド（例えば、デオキシヌクレオチド三リン酸）、Ｓａｎｇｅｒ型ＤＮＡ配列決定反応の場合には鎖終結ヌクレオチド、ポジティブコントロ−ル配列、ネガティブコントロ−ル配列など）を含む。キットは、標的核酸の量を決定するための手段、およびその量を標準物と比較するための手段をさらに含み得る。キットは、そのキットを使用して目的のＳＮＰ含有核酸分子を検出するための指示書を含み得る。本発明の一実施形態において、１種以上のアッセイを実行して本明細書中に開示される１種以上のＳＮＰを検出するための必要試薬を含むキットが、提供される。本発明の好ましい実施形態において、ＳＮＰ検出キット／システムは、核酸アレイの形態、または区画分けされたキット（微小流体システム／ラブ・オン・ア・チップ（ｌａｂ−ｏｎ−ａ−ｃｈｉｐ）システムを含む）の形態である。
ＳＮＰ検出キット／システムは、例えば、各標的ＳＮＰ位置またはその付近にある拡散分子にハイブリダイズする１つ以上のプロ−ブまたはプロ−ブ対を含み得る。複数の対立遺伝子特異的プロ−ブ対が、多数のＳＮＰを同時にアッセイするためにこのキット／システム中に含まれ得る。上記多数のＳＮＰのうちの少なくとも１つは、本発明のＳＮＰである。いくつかのキット／システムにおいて、上記対立遺伝子特異的プロ−ブは、基材（例えば、アレイまたはビ−ズ）に固定される。例えば、同じ基材は、表１および／または表２に示されるＳＮＰのうちの少なくとも１個、１０個、１００個、１０００個、１０，０００個、１００，０００個（もしくはこれらの間の他の任意の個数）または実質的にすべてを検出するための、対立遺伝子特異的プロ−ブを含み得る。
用語「アレイ」、「マイクロアレイ」、および「ＤＮＡチップ」とは、基材（例えば、ガラス、プラスチック、紙、ナイロン、または他の型の膜、フィルタ−、チップ、もしくは他の適切な固体支持体）に付着された、別個のポリヌクレオチド群を指すために本明細書中で互換可能に使用される。上記ポリヌクレオチドは、上記基材上で直接合成され得るか、または上記基材とは別個に合成された後で上記基材に付着される。一実施形態において、上記マイクロアレイは、米国特許第５，８３７，８３２号、ＣｈｅｅらのＰＣＴ出願ＷＯ９５／１１９９５（Ｃｈｅｅら）、Ｌｏｃｋｈａｒｔ，Ｄ．Ｊ．ら（１９９６；Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈ．１４：１６７５〜１６８０）およびＳｃｈｅｎａ，Ｍ．ら（１９９６；Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９３：１０６１４〜１０６１９）（これらすべては、その全体が参考として本明細書中に援用される）に記載される方法に従って、調製されそして使用される。他の実施形態において、このようなアレイは、Ｂｒｏｗｎら、米国特許第５，８０７，５２２号により記載される方法により生成される。
核酸アレイは、以下の参考文献中に概説されている：Ｚａｍｍａｔｔｅｏら「Ｎｅｗ ｃｈｉｐｓ ｆｏｒ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ」Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ Ａｎｎｕ Ｒｅｖ．２００２；８：８５〜１０１；Ｓｏｓｎｏｗｓｋｉら「Ａｃｔｉｖｅ ｍｉｃｒｏｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃ ａｒｒａｙ ｓｙｓｔｅｍ ｆｏｒ ＤＮＡ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ，ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ ａｎｄ ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ」Ｐｓｙｃｈｉａｔｒ
Ｇｅｎｅｔ．２００２ Ｄｅｃ；１２（４）：１８１〜９２；Ｈｅｌｌｅｒ「ＤＮＡ ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：ｄｅｖｉｃｅｓ，ｓｙｓｔｅｍｓ，ａｎｄ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ」Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｂｉｏｍｅｄ Ｅｎｇ．２００２；４：１２９〜５３、Ｅｐｕｂ ２００２ Ｍａｒ ２２；Ｋｏｌｃｈｉｎｓｋｙら「Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＳＮＰｓ ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ｇｅｎｏｍｉｃ ｖａｒｉａｔｉｏｎｓ ｕｓｉｎｇ ｇｅｌ−ｂａｓｅｄ ｃｈｉｐｓ」Ｈｕｍ Ｍｕｔａｔ．２００２
Ａｐｒ；１９（４）：３４３〜６０；およびＭｃＧａｌｌら「Ｈｉｇｈ−ｄｅｎｓｉｔｙ ｇｅｎｅｃｈｉｐ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｒｏｂｅ ａｒｒａｙｓ」Ａｄｖ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｅｎｇ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００２；７７：２１〜４２。
多数のプロ−ブ（例えば、対立遺伝子特異的プロ−ブ）が、アレイにおいて実施され得、各プロ−ブまたはプロ−ブ対は、異なるＳＮＰ位置にハイブリダイズし得る。ポリヌクレオチドプロ−ブの場合、これらのプロ−ブは、光指向性化学プロセスを使用して、基材上の指定領域で合成され得る（かまたは、別個に合成され得、その後、指定領域に付着され得る）。各ＤＮＡチップは、格子様パタ−ンで整列され（例えば、１０セント銀貨の大きさまで）小型化された、例えば、数千〜数億個の個々の合成ポリヌクレオチドプロ−ブを含み得る。好ましくは、プロ−ブは、順序立ったアドレス指定可能なアレイ状に固体支持体に付着される。
マイクロアレイは、固体支持体に付着した多数の独特の一本鎖ポリヌクレオチド（通常は、合成アンチセンスポリヌクレオチドまたはｃＤＮＡフラグメントのいずれか）から構成され得る。代表的なポリヌクレオチドは、好ましくは、約６〜６０ヌクレオチド長、より好ましくは約１５〜３０ヌクレオチド長、最も好ましくは約１８〜２５ヌクレオチド長である。特定の型のマイクロアレイまたは他の検出キット／システムについて、ほんの約７〜２０ヌクレオチド長であるオリゴヌクレオチドを使用することが、好ましくあり得る。他の型のアレイ（例えば、化学発光検出技術と組み合わせて使用されるアレイ）において、好ましいプロ−ブの長さは、例えば、約１５〜８０ヌクレオチド長、好ましくは約５０〜７０ヌクレオチド長、より好ましくは約５５〜６５ヌクレオチド長、最も好ましくは約６０ヌクレオチドであり得る。このマイクロアレイまたは検出キットは、遺伝子／転写物または標的ＳＮＰ部位の既知の５’配列または３’配列を網羅するポリヌクレオチド；遺伝子／転写物の全長配列を網羅する連続するポリヌクレオチド；または標的遺伝子／転写物配列の長さに沿った特定の領域（特に、表・および／または表２に開示される１つ以上のＳＮＰに対応する領域）から選択される独特のポリヌクレオチドを含み得る。上記マイクロアレイまたは検出キットにおいて使用されるポリヌクレオチドは、目的のＳＮＰに対して特異的（例えば、標的ＳＮＰ部位の特定のＳＮＰ対立遺伝子に対して特異的、または複数の異なるＳＮＰ部位にある特定のＳＮＰ対立遺伝子に対して特異的）であり得るか、あるいは目的の多型遺伝子／転写物に対して特異的であり得る。
ポリヌクレオチドアレイに基づくハイブリダイゼ−ションアッセイは、完全一致標的配列改変体およびミスマッチ標的配列改変体に対する、上記プロ−ブのハイブリダイゼ−ション安定性の差異に依存する。ＳＮＰ遺伝子型決定のために、ハイブリダイゼ−ションアッセイにおいて使用されるストリンジェンシ−条件は、１ＳＮＰ位置程度にしか互いと異ならない核酸分子が区別され得るのに充分に高いことが、一般的には好ましい（例えば、代表的ＳＮＰハイブリダイゼ−ションアッセイが、１つの特定のヌクレオチドがＳＮＰ位置に存在する場合にハイブリダイゼ−ションが生じるが、代替的ヌクレオチドがそのＳＮＰ位置に存在する場合にはハイブリダイゼ−ションは生じないように、設計される）。そのような高いストリンジェンシ−の条件は、例えば、ＳＮＰ検出のために対立遺伝子特異的プロ−ブの核酸アレイを使用する場合に、好ましくあり得る。そのような高いストリンジェンシ−の条件は、先の節において記載されており、当業者にとって周知であり、そして例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（１９８９）６．３．１〜６．３．６において見出され得る。
他の実施形態において、上記アレイは、化学発光検出技術と組み合わせて使用される。以下の特許および特許出願（これらはすべて、本明細書により参考として援用される）は、化学発光検出に関するさらなる情報を提供する：米国特許出願１０／６２０３３２および同１０／６２０３３３は、マイクロアレイ検出のための化学発光アプロ−チを記載し、米国特許第６１２４４７８号、同第６１０７０２４号、同第５９９４０７３号、同第５９８１７６８号、同第５８７１９３８号、同第５８４３６８１号、同第５８００９９９号、および同第５７７３６２８号は、化学発光検出を実施するためのジオキセタンの方法および組成物を記載し；公開された米国出願ＵＳ２００２／０１１０８２８は、マイクロアレイコントロ−ルのための方法および組成物を開示する。
本発明の一実施形態において、核酸アレイは、約１５〜２５ヌクレオチド長のプロ−ブのアレイを含み得る。さらなる実施形態において、核酸アレイは、多数のプロ−ブを含み得、ここで、少なくとも１つのプロ−ブは、表１および／もしくは表２において開示される１つ以上のＳＮＰを検出可能であり、かつ／または少なくとも１つのプロ−ブは、表１、表２、配列表、およびそれらの相補的な配列に開示される配列からなる群より選択される配列のうちの１つのフラグメントを含み、そのフラグメントは、少なくとも約８個連続するヌクレオチド（好ましくは、１０個、１２個、１５個、１６個、１８個、２０個、より好ましくは２２個、２５個、３０個、４０個、４７個、５０個、５５個、６０個、６５個、７０個、８０個、９０個、１００個（またはこれらの間の他の任意の個数）以上連続するヌクレオチドを含み、かつ表１および／または表２において開示される新規なＳＮＰ対立遺伝子を含む。いくつかの実施形態において、上記ＳＮＰ部位に対して相補的なヌクレオチドは、上記プロ−ブの中心から５ヌクレオチド内、４ヌクレオチド内、３ヌクレオチド内、２ヌクレオチド内、または１ヌクレオチド内、より好ましくは上記プロ−ブの中心にある。
ポリヌクレオチドプロ−ブは、ＰＣＴ出願ＷＯ９５／２５１１１６（Ｂａｌｄｅｓｃｈｗｅｉｌｅｒら）（これは、本明細書中にその全体が参考として援用される）に記載されるように、化学カップリング手順およびインクジェット適用装置を使用することによって、基材表面上で合成され得る。別の局面において、ドット（またはスロット）ブロットと類似する「格子状」アレイが、真空系、熱的結合手順、ＵＶ結合手順、機械的結合手順、または化学結合手順を使用して、基材表面にｃＤＮＡフラグメントまたはオリゴヌクレオチドを整列させて結合するために使用され得る。アレイ（例えば、上記のアレイ）は、手によってか、あるいは利用可能なデバイス（スロットブロット装置またはドットブロット装置）、材料（適切な任意の固体支持体）、および機器（ロボット機器を含む）を使用することによって、生成され得、そして８個、２４個、９６個、３８４個、１５３５個、６１４４個以上のポリヌクレオチド、または市販の機器の効率的使用のために適する他の任意の数のポリヌクレオチドを含み得る。
そのようなアレイまたは他のキット／システムを使用して、本発明は、試験サンプル中にある本明細書中に開示されるＳＮＰを同定するための方法を提供する。そのような方法は、代表的には、試験核酸サンプルを、本発明の少なくとも１つのＳＮＰ位置に対応する１つ以上のプロ−ブを含むアレイとともにインキュベ−トする工程、ならびに上記試験サンプル由来の核酸と上記プロ−ブのうちの１つ以上との結合についてアッセイする工程を包含する。ＳＮＰ検出試薬（またはそのような１種以上のＳＮＰ検出試薬を使用する、キット／システム）を、インキュベ−ション条件は、上記アッセイにおいて使用される形式、使用される検出方法、ならびに上記アッセイにおいて使用される検出試薬の型および性質に依存する。当業者は、市販のハイブリダイゼ−ション形式、増幅形式、およびアレイアッセイ形式のうちのいずれか１つが、本明細書中に開示されるＳＮＰを検出するために容易に適合され得ることを、認識する。
本発明のＳＮＰ検出キット／システムは、ＳＮＰ含有核酸分子の後の増幅および／または検出のために、試験サンプルから核酸を調製するために使用される構成要素を含み得る。そのようなサンプル調製構成要素は、任意の体液（例えば、血液、血清、血漿、尿、唾液、粘液質、胃液、精液、涙、汗など）、皮膚、毛髪、細胞（特に、有核細胞）、生検、口腔、スワブまたは組織標本からの、核酸抽出物（ＤＮＡおよび／またはＲＮＡを含む）、タンパク質抽出物もしくは膜抽出物を生成するために使用され得る。上記の方法において使用される試験サンプルは、上記アッセイ形式、上記検出方法の性質、およびアッセイされるべき試験サンプルとして使用される具体的な組織、細胞、または抽出物に基づいて、変化する。核酸抽出物、タンパク質抽出物、および細胞抽出物を調製する方法は、当該分野で周知であり、利用されるシステムと適合するサンプルを得るために容易に適合され得る。試験サンプルから核酸を抽出するための自動サンプル調製システムは、市販されており、その例は、ＱｉａｇｅｎのＢｉｏＲｏｂｏｔ ９６００、Ａｐｐｌｉｅｄ ＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓのＰＲＩＳＭＴＭ ６７００サンプル調製システム、およびＲｏｃｈｅ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ＳｙｓｔｅｍｓのＣＯＢＡＳ ＡｍｐｌｉＰｒｅｐ Ｓｙｓｔｅｍである。
本発明により企図される別の形態のキットは、区画分けされたキットである。区画分けされたキットは、試薬が別個の容器中に含まれる任意のキットを包含する。そのような容器としては、例えば、小さいガラス容器、プラスチック容器、プラスチック片、ガラス片、または紙片、またはアレイ形成材料（例えば、シリカ）が挙げられる。そのような容器によって、試験サンプルおよび試薬が相互混入しないようにある区画から別の区画へと試薬を効率的に移動することが可能であるか、またはある区画からそのキット中に含まれない別の容器に移動することが可能であり、各容器の薬剤または溶液は、ある区画から別の区画または別の容器へと、定量的様式で添加され得る。そのような容器としては、例えば、試験サンプルを受容する１つ以上の容器、本発明の１つ以上のＳＮＰを検出するための少なくとも１つのプロ−ブまたは他のＳＮＰ検出試薬を含む１つ以上の容器、洗浄試薬（例えば、リン酸緩衝化生理食塩水、Ｔｒｉｓ緩衝液など）を含む１つ以上の容器、および結合したプロ−ブまたは他のＳＮＰ検出試薬の存在を明らかにするために使用される試薬を含む１つ以上の容器が、挙げられ得る。上記キットは、例えば、核酸増幅反応または他の酵素反応（例えば、プライマ−伸長反応）、ハイブリダイゼ−ション、ライゲ−ション、電気泳動（好ましくは、キャピラリ−電気泳動）、質量分析法、および／またはレ−ザ−誘導蛍光検出のための、区画および／もしくは試薬を必要に応じてさらに含み得る。上記キットはまた、そのキットを使用するための指示書を備え得る。例示的な区画分けされたキットとしては、当該分野で公知の微小流体デバイス（例えば、Ｗｅｉｇｌら「Ｌａｂ−ｏｎ−ａ−ｃｈｉｐ ｆｏｒ ｄｒｕｇ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ」Ａｄｖ Ｄｒｕｇ
Ｄｅｌｉｖ Ｒｅｖ．２００３ Ｆｅｂ ２４；５５（３）：３４９〜７７参照）が挙げられる。そのような微小流体デバイスにおいて、上記容器は、例えば、微小流体「容器」、微小流体「チャンバ」、または微小流体「チャネル」と呼ばれ得る。
マイクロ流体デバイスは、「ラボオンチップ（ｌａｂ−ｏｎ−ａ−ｃｈｉｐ）」系とも称され得、生物医学的なマイクロ電気機械系（ｂｉｏＭＥＭ）または多構成の集積系は、ＳＮＰを分析するための本発明の典型的なキット／系である。このような系は、単一の機能性デバイスにおいてプローブ／標的ハイブリダイゼーション、核酸増幅、およびキャピラリー電気泳動法の反応のような過程を縮小化および分画化する。このようなマイクロ流体デバイスは代表的に、系の少なくとも一つの局面において検出試薬を利用し、そしてこのような検出試薬は使用され、本発明の一以上のＳＮＰを検出し得る。マイクロ流体系の一つの例は、米国特許第５，５８９，１３６号に開示され、この開示はチップにおいてＰＣＲ増幅の統合およびキャピラリー電気泳動が記載される。典型的なマイクロ流体系は、マイクロチップ上に含まれるガラス、シリコン、石英、またはプラスチックのウエハ上に設計されるマイクロチャネルのパターンを含む。サンプルの移動は、電気、電気浸透性、または流体静力学の力によって制御され得、この力は、機能的顕微鏡バルブおよび可動部分を伴わないポンプを作成するためにマイクロチップの異なる範囲にわたって適用される。電圧の変化は、マイクロ機械加工チャンネル間の交点で液体の流動を制御する方法およびマイクロチップの異なるセクションにわたりポンプ注入するための液体流量を変化させるための方法として使用され得る。例えば、米国特許第６，１５３，０７３号（Ｄｕｂｒｏｗら）および同第６，１５６，１８１号（Ｐａｒｃｅら）を参照のこと。
ＳＮＰの遺伝子型を特定するために、典型的なマイクロ流動系は、例えば、核酸増幅、プライマー伸長、キャピラリー電気泳動、およびレーザー光誘導蛍光検出のような検出方法を統合し得る。このような典型的な系を使用するための典型的なプロセスの最初の工程において、核酸サンプルは、好ましくはＰＣＲによって増幅される。次いで、増幅産物は、ｄｄＮＴＰ（各ｄｄＮＴＰに対して特異的な蛍光）および適切なオリゴヌクレオチドプライマーを使用する自動プライマー伸長反応に供され標的ＳＮＰのちょうど上流にハイブリダイズするプライマー伸長反応を実施する。３’末端において伸長が一旦完了すると、このプライマーは、キャピラリー電気泳動によって組込まれていない蛍光ｄｄＮＴＰから分離される。キャピラリー電気泳動に使用される分離培地は、例えば、ポリアクリルアミド、ポリエチレングリコールまたはデキストランであり得る。単一のヌクレオチドプライマーの伸長産物中に組込まれたｄｄＮＴＰは、レーザー光誘導蛍光検出によって同定される。このような典型的なマイクロチップが、使用され例えば、少なくとも９６サンプル〜３８４サンプル、またはそれ以上が同時に処理され得る。
（核酸分子の使用）
本発明の核酸分子は、特にＶＴの診断および処置において種々の用途を有する。例えば、核酸分子は、ハイブリダイゼーションプローブとして、例えば、メッセンジャーＲＮＡ、転写物、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ、増幅されたＤＮＡまたは他の核酸分子においてＳＮＰの遺伝子型を特定するために、ならびに全長ｃＤＮＡおよび表１に開示される改変体ペプチドをコードするゲノムクローンおよびそのオーソログを単離するために有用である。
プローブは、表１および／または表２で言及される核酸分子の全長に沿って任意のヌクレオチド配列にハイブリダイズし得る。好ましくは本発明のプローブは、表１および／または表２に示されるＳＮＰ位置を含む標的配列の領域にハイブリダイズする。より好ましくは、プローブは、配列特異的様式でＳＮＰ含有標的配列にハイブリダイズし、その結果、標的配列を、どのヌクレオチドがＳＮＰ部位に存在するかによって標的配列と異なる他のヌクレオチド配列とを識別する。このようなプローブは、試験サンプル中のＳＮＰ含有核酸の存在を検出するために、またはどのヌクレオチド（対立遺伝子）が、特定のＳＮＰ部位に存在するかを決定する（すなわち、ＳＮＰ部位の遺伝子型決定）ために特に有用である。
核酸のハイブリダイゼーションプローブは、核酸発現の存在、レベル、形態、および／または分布を決定するために使用され得る。レベルが決定される核酸は、ＤＮＡまたはＲＮＡであり得る。従って、本明細書中に記載されるＳＮＰに特異的なプローブが、使用され所定の細胞、組織、または生物において存在、発現および／または遺伝子のコピー数を調べ得る。これらの用途は、正常レベルに対する遺伝子発現の増加または減少に関与する障害の診断に関連する。ｍＲＮＡ検出のためのインビトロ技術としては、例えば、ノーザンブロットハイブリダイゼーションおよびインサイチュハイブリダイゼーションが挙げられる。ＤＮＡを検出するためのインビトロ技術としては、サザンブロットハイブリダイゼーションおよびインサイチュハイブリダイゼーションが挙げられる（ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ、２０００、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ）。
プローブは、例えば、被験体に由来する細胞のサンプルにおいて改変タンパク質コード核酸（例えば、ｍＲＮＡ）のレベルを測定することのよって、またはポリヌクレオチドが、目的のＳＮＰを含有するか否かを決定することによって、改変タンパク質が発現される細胞または組織を同定するための診断試験キットの一部として使用され得る。
従って、本発明の核酸分子は、ハイブリダイゼーションプローブとして使用され本明細書中に開示されるＳＮＰを検出し得、それによって多型を有する個体が、ＶＴの危険性にあるか否か、あるいは初期の段階のＶＴを発症しているか否かを決定し得る。疾患の表現型に関連するＳＮＰの検出は、活性疾患および／または疾患の遺伝的疾病素質についての診断ツールを提供する。
さらに、従って、本発明の核酸分子は、本明細書において開示されるＳＮＰを含む遺伝子（遺伝子情報は、例えば、表２に開示される）、および／またはそのような遺伝子の産物、例えば、発現したｍＲＮＡ転写物分子（転写物情報は、例えば、表１に開示される）を検出するために有用であり、従って、遺伝子の発現を検出するために有用である。核酸分子は場合により、遺伝子発現の検出において使用するために、例えば、アレイまたはキットのフォーマットで実装され得る。
本発明の核酸分子はまた、核酸分子の任意の所定領域、特に表１および／または表２に同定されるＳＮＰ含有領域を増幅するためのプライマーとしても有用である。
本発明の核酸分子はまた、組換えベクターを構築するためにも有用である（以下により詳細に記載される）。このようなベクターとしては、表１で言及される任意の改変体ペプチド配列の一部または全体を発現する発現ベクターが挙げられる。ベクターはまた、例えば細胞のゲノムのような別の核酸分子配列へ組み込むために使用され、遺伝子および／または遺伝子産物のインサイチュでの発現を変化させる、挿入ベクターも含む。例えば、内因性のコード配列は、相同組換えを介して、一以上の特異的に導入されたＳＮＰを含有するコード領域の全体または一部分と置換され得る。
本発明の核酸分子はまた、改変タンパク質の抗原部分、特に、表１および／または表２に開示されるＳＮＰによって生じる改変体アミノ酸配列（例えば、アミノ酸置換）を含む抗原部分を発現するのにも有用である。
本発明の核酸分子はまた、本発明の核酸分子の遺伝子調節領域を含むベクターを構築するのにも有用である。
本発明の核酸分子はまた、本明細書中に記載されるＳＮＰ含有核酸分子に由来する発現されたｍＲＮＡ分子の全体または一部分に対応するリボザイムを設計するのにも有用である。
本発明の核酸分子はまた核酸分子および改変体ペプチドの一部分または全体を発現する宿主細胞を構築するのにも有用である。
本発明の核酸分子はまた、核酸分子および改変体ペプチドの全体または一部分を発現するトランスジェニック動物を構築するためにも有用である。表１および／または表２に開示されるＳＮＰを含有する核酸分子を有する組換え細胞およびトランスジェニック動物の産生は、例えば、処置化合物および投薬レジメンの効果的な臨床設計を可能とする。
本発明の核酸分子はまた、例えば、核酸の発現を調節する化合物を同定するための薬物スクリーニングのアッセイにおいても有用である。
本発明の核酸分子はまた、細胞が異常な遺伝子発現をしている患者の遺伝子治療においても有用である。従って、エキソビボで操作されそして患者に戻された患者の細胞を含む組換え細胞は、個体へ導入され、ここで組換え細胞は、所望されるタンパク質を産生し個体を処置する。
（ＳＮＰ遺伝子決定方法）
どの特定のヌクレオチド（すなわち対立遺伝子）が、一以上のＳＮＰ位置の各々に存在するかを決定するプロセス（例えば、表１および／または表２に開示される核酸分子のＳＮＰ位置）は、ＳＮＰ遺伝子型特定と称される。本発明は、ＶＴまたは関連の病態についてのスクリーニングまたはそれの疾病素質の決定、または処置形態の応答性の決定、あるいは遺伝子地図またはＳＮＰ関連分析などにおいて用途のための、ＳＮＰ遺伝子型特定の方法を提供する。
核酸サンプルは、当該分野において周知の方法によって遺伝子特定され、どの対立遺伝子が、目的の任意の所定遺伝子領域（例えば、ＳＮＰ位置）に存在するかを決定し得る。隣接する配列が、オリゴヌクレオチドプローブのようなＳＮＰ検出試薬を設計するために使用され得、このプローブは必要に応じてキットフォーマット中に与えられ得る。代表的なＳＮＰ遺伝子特定方法は、Ｃｈｅｎら、「Ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ：ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，ｐｒｏｔｏｃｏｌ，ｃｏｓｔ ａｎｄ ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ」、Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ Ｊ．２００３；３（２）：７７−９６；Ｋｗｏｋら、「Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ」、Ｃｕｒｒ Ｉｓｓｕｅｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．２００３ Ａｐｒ；５（２）：４３−６０；Ｓｈｉ、「Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ ｆｏｒ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ： ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ ｉｎ ｄｒｕｇ ｔａｒｇｅｔｓ ａｎｄ ｄｉｓｅａｓｅ ｇｅｎｅｓ」、Ａｍ Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ．２００２；２（３）：１９７−２０５；およびＫｗｏｋ、「Ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ」、Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ２００１；２：２３５−５８に記載される。高処理のＳＮＰ遺伝子型特定についての代表的な技術は、Ｍａｒｎｅｌｌｏｓ、「Ｈｉｇｈ−ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ＳＮＰ ａｎａｌｙｓｉｓ ｆｏｒ ｇｅｎｅｔｉｃ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｓｔｕｄｉｅｓ」、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ Ｄｅｖｅｌ．２００３ Ｍａｙ；６（３）：３１７−２１に記載される。一般のＳＮＰ遺伝子特定方法としては、ＴａｑＭａｎアッセイ、分子ビーコンアッセイ、核酸アレイ、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的ＰＣＲ、配列されたプライマー伸長、均質なプライマーの伸長アッセイ、質量分析法による検出を伴うプライマー伸長、高熱配列決定（ｐｙｒｏｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、遺伝子アレイで選別される複合プライマーの伸長、周期的増幅（ｒｏｌｌｉｎｇ ｃｉｒｃｌｅ）を伴うライゲーション、同質のライゲーション、ＯＬＡ（米国特許第４，９８８，１６７号）、遺伝子アレイで選別される複合ライゲーション反応、制限断片長の多型、一塩基の伸長タグアッセイおよびインベーダーアッセイが挙げられるが、これらに限定されない。このような方法は、例えば、発光または化学発光の検出、蛍光検出、時間分解型蛍光検出、蛍光共鳴エネルギー伝達、蛍光偏光、質量分析、および電気検出のような検出機構と組み合わせて用いられ得る。
多型を検出するための種々の方法としては、切断因子からの保護がＲＮＡ／ＲＮＡ二重鎖またはＲＮＡ／ＤＮＡ二重鎖において不一致の塩基を検出する方法（Ｍｙｅｒｓら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３０：１２４２（１９８５）；Ｃｏｔｔｏｎら、ＰＮＡＳ ８５：４３９７（１９８８）およびＳａｌｅｅｂａら、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．２１７：２８６−２９５（１９９２））、改変体および野生型の核酸分子の電気泳動の移動度の比較（Ｏｒｉｔａら、ＰＮＡＳ ８６：２７６６（１９８９）；Ｃｏｔｔｏｎら、Ｍｕｔａｔ．Ｒｅｓ．２８５：１２５−１４４（１９９３）；およびＨａｙａｓｈｉら、Ｇｅｎｅｔ．Ａｎａｌ．Ｔｅｃｈ．Ａｐｐｌ．９：７３−７９（１９９２））ならびに変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）を用いる変性剤の勾配を含むポリアクリルアミドゲルにおいて多型フラグメントまたは野生型フラグメントの移動をアッセイすること（Ｍｙｅｒｓら、Ｎａｔｕｒｅ ３１３：４９５（１９８５））が挙げられるが、これらに限定されない。特定の位置での配列変動はまた、ＲＮａｓｅ保護およびＳ１保護のような、ヌクレアーゼプロテクションアッセイまたは化学切断方法によっても調べられ得る。
好ましい実施形態において、ＳＮＰ遺伝子型特定は、５’ヌクレアーゼアッセイとしても公知であるＴａｑＭａｎアッセイを用いて実施される（米国特許第５，２１０，０１５号および同第５，５３８，８４８号）。ＴａｑＭａｎアッセイは、ＰＣＲの間に特定の増幅産物の蓄積を検出する。ＴａｑＭａｎアッセイは、蛍光レポーター色素およびクエンチャー色素を用いて標識されたオリゴヌクレオチドプローブを利用する。レポーター色素は、適切な波長での放射線照射によって励起され、蛍光共鳴エネルギー伝達（ＦＲＥＴ）と呼ばれるプロセスを介して同一のプローブ中のクエンチャー色素へエネルギーを伝達する。このプローブへ取り付けられた場合、励起されたレポーター色素は、シグナルを放射しない。インタクトのプローブにおいてクエンチャー色素とレポーター色素の近さは、レポーターについての減少した蛍光を維持する。レポーター色素およびクエンチャー色素は、それぞれ最も５’の末端および最も３’の末端に有り得るか、またはその逆であり得る。あるいは、レポーター色素は、最も５’の末端または最も３’の末端にあり得るが、クエンチャー色素は、内部のヌクレオチドに取り付けられる（またはこの逆）。さらに別の実施形態において、レポーターおよびクエンチャーの両方、互いに離れて内部のヌクレオチドへ取り付けられ得、その結果レポーターの蛍光は、減少される。
ＰＣＲの間、ＤＮＡポリメラーゼの５’ヌクレアーゼ活性がプローブを切断し、それによってレポーター色素とクエンチャー色素とを分離し、そして結果として、レポーターの蛍光の上昇を生じる。ＰＣＲ産物の蓄積は、レポーター色素の蛍光の上昇を直接モニタリングすることにより検出される。ＤＮＡポリメラーゼは、プローブがＰＣＲの間に増幅される標的ＳＮＰ含有鋳型にハイブリダイズする場合にのみ、レポーター色素とクエンチャー色素との間のプローブを切断し、かつプローブは、特定のＳＮＰ対立遺伝子が存在する場合にのみ、標的ＳＮＰ部位にハイブリダイズするように設計されている。
好ましいＴａｑＭａｎプライマーおよびＴａｑＭａｎプローブの配列は、本明細書中で提供されるＳＮＰおよび関連する核酸配列情報を用いて、容易に決定され得る。Ｐｒｉｍｅｒ Ｅｘｐｒｅｓｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ、ＣＡ）のようなコンピュータープログラムの多くは、最適なプライマー／プローブのセットを容易に得るために使用され得る。本発明のＳＮＰを検出するためのこのようなプライマーおよびプローブが、ＶＴを決定するための診断アッセイにおいて有用であり、かつキット形式に容易に組み込まれることが、当業者に明らかである。本発明はまた、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｅａｃｏｎプローブ（米国特許第５，１１８，８０１号および同第５，３１２，７２８号）ならびに他の改変形式（米国特許第５，８６６，３３６号および同第６，１１７，６３５号）の使用のような、当該分野において周知のＴａｑｍａｎアッセイの改変を含む。
本発明のＳＮＰの遺伝型を決定するための別の好ましい方法は、ＯＬＡにおける二つのオリゴヌクレオチドプローブの使用である（例えば、米国特許第４，９８８，６１７号を参照）。この方法において、一つのプローブは、その最も３’末端にＳＮＰ部位が整列した、標的核酸のセグメントにハイブリダイズする。第二のプローブは、標的核酸分子の第一のプローブのすぐ３’に隣接するセグメントにハイブリダイズする。二つの並列したプローブは、標的核酸分子にハイブリダイズし、そして、もし第一のプローブの最も３’のヌクレオチドとＳＮＰ部位との間に完全な相補性があれば、リガーゼのような結合剤の存在下で連結される。ミスマッチがある場合、連結は起こらない。反応後、連結されたプローブは、標的核酸分子から分離され、そしてＳＮＰの存在の指標として検出される。
以下の特許、特許出願、および公開されている国際特許出願は、全て、本明細書で参考により援用され、種々の形式のＯＬＡを実施するための技術に関するさらなる情報を提供する：米国特許第６０２７８８９号、同第６２６８１４８号、同第５４９４８１０号、同第５８３０７１１号、および同第６０５４５６４号は、ＳＮＰ検出を実施するためのＯＬＡストラテジーを記載する；ＷＯ ９７／３１２５６およびＷＯ ００／５６９２７は、ユニバーサルアレイを用いたＳＮＰ検出を実施するためのＯＬＡストラテジーを記載し、ここで、ジップコード配列は、ハイブリダイゼーションプローブの一つに導入され得、かつ結果として生じた産物（もしくは増幅産物）は、ユニバーサルジップコードアレイにハイブリダイズし得る；米国特許出願ＵＳ０１／１７３２９（および０９／５８４，９０５）は、ＯＬＡ（もしくはＬＤＲ）、続いてＰＣＲを記載し、ここで、ジップコードはＯＬＡプローブに組み込まれ、かつ増幅されたＰＣＲ産物は、電気泳動もしくはユニバーサルジップコードアレイ読み出し装置により決定される；米国特許出願６０／４２７８１８、同６０／４４５６３６および同６０／４４５４９４は、ＳＮＰｌｅｘ法およびＯＬＡに続くＰＣＲを用いた多重ＳＮＰ検出のためのソフトウェアを記載し、ここで、ジップコードは、ＯＬＡプローブに組み込まれ、かつ増幅されたＰＣＲ産物は、ジップシュート（ｚｉｐｃｈｕｔｅ）試薬とハイブリダイズし、かつＳＮＰの同定は、ジップシュートの電気泳動読み出し装置により決定される。いくつかの実施形態において、ＯＬＡは、ＰＣＲ（もしくは別の核酸増幅方法）の前に実施される。他の実施形態において、ＰＣＲ（もしくは他の核酸増幅方法）は、ＯＬＡの前に実施される。
ＳＮＰを遺伝子型決定するための別の方法は、質量分析に基づく。質量分析は、ＤＮＡの４種のヌクレオチドの各々の固有の質量を利用する。ＳＮＰは、代替的なＳＮＰ対立遺伝子を有する核酸の質量の差異を測定することにより、質量分析によって明白に遺伝子型決定され得る。ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ（Ｍａｔｒｉｘ Ａｓｓｉｓｔｅｄ Ｌａｓｅｒ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ Ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ−Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ）質量分析技術が、ＳＮＰのような分子質量のきわめて正確な決定のために好ましい。ＳＮＰ分析に対する数多くのアプローチが、質量分析に基づいて開発されている。好ましい質量分析に基づくＳＮＰを遺伝子型決定する方法は、プライマー伸長アッセイを含み、これも、従来のゲルに基づく形式およびマイクロアレイのような他の適用と組み合わせて利用され得る。
代表的に、プライマー伸長アッセイは、標的ＳＮＰ部位から（５’）上流の鋳型ＰＣＲアプリコンに対する、プライマーの設計およびアニールを含む。ジデオキシヌクレオチド三リン酸（ｄｄＮＴＰ）および／もしくはデオキシヌクレオチド三リン酸（ｄＮＴＰ）の混合物を、鋳型（例えば、ＰＣＲなどにより代表的に増幅されている、ＳＮＰ含有核酸分子）、プライマー、およびＤＮＡポリメラーゼを含有する反応混合物に添加する。プライマーの伸長は、混合物中のｄｄＮＴＰのうちの一つに対して相補的なヌクレオチドが生じる鋳型中の最初の部位で、終結する。プライマーは、ＳＮＰ部位に直接隣接する（すなわち、プライマーの３’末端のヌクレオチドは、標的ＳＮＰ部位の隣のヌクレオチドにハイブリダイズする）か、もしくはＳＮＰ部位から二つ以上のヌクレオチド離れているかのどちらかであり得る。プライマーが、標的ＳＮＰ部位から数ヌクレオチド離れている場合、唯一の制限は、プライマーの３’末端とＳＮＰ部位との間の鋳型配列が、検出されるべきものと同じ型のヌクレオチドを含まないこと、またはこのことが、伸長プライマーの未完成な終結を引き起こすことである。あるいは、全ての４種のｄｄＮＴＰのみが、ｄＮＴＰなしで反応混合物に添加される場合、プライマーは常に、標的ＳＮＰ部位に対応するただ一つのヌクレオチドにより伸長される。この場合、プライマーは、ＳＮＰ部位より一つ上流のヌクレオチドに結合するために設計される（すなわち、プライマーの３’末端のヌクレオチドは、標的ＳＮＰ部位の５’側で標的ＳＮＰ部位に直接隣接するヌクレオチドにハイブリダイズする）。ただ一つのヌクレオチドによる伸長は、伸長されるプライマーの全体の質量を最小にし、それにより、代替的なＳＮＰヌクレオチドの間の質量の差異の分解能を上昇させるので、ただ一つのヌクレオチドによる伸長が好ましい。さらに、非改変ｄｄＮＴＰのプライマー伸長反応に代えて、質量標識されたｄｄＮＴＰが用いられ得る。このことは、これらのｄｄＮＴＰにより伸長されたプライマーの間の質量の差異を上昇させ、それにより、上昇する感度および精度を提供し、そして特に、ヘテロ接合の塩基部位を決定するために有用である。質量標識はまた、集中的なサンプル調製手順の必要性を軽減し、そして質量分析の必要とされる分解能を低下させる。
伸長されたプライマーは、次に精製され得、そして、標的ＳＮＰ部位に存在しているヌクレオチドの同一性を決定するために、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ質量分析により分析され得る。分析の一つの方法において、プライマー伸長反応からの生成物は、マトリックスを形成する光吸収結晶と組み合わせられる。次に、このマトリックスは、核酸分子をイオン化し、そして気体相に脱着するために、レーザーのようなエネルギー源により打ち付けられる。次に、イオン化された分子は、飛行管内に放射され、そして加速されて検出器に向かってこの管を下る。レーザーパルスのようなイオン化現象と分子が検出器と衝突する間の時間は、その分子の飛行時間である。飛行時間は、イオン化された分子の電荷に対する質量比（ｍ／ｚ）と正確に相関する。より小さいｍ／ｚを有するイオンは、より大きいｍ／ｚを有するイオンよりも早くこの管を下って進行し、そしてそのため、このより軽いイオンは、より重いイオンの前に検出器に到達する。したがって、飛行時間は、対応する、かつ非常に正確なｍ／ｚに変換される。この様式で、ＳＮＰは、一塩基部分に異なるヌクレオチドを有する核酸分子において固有の、質量のわずかな差異、および対応する飛行時間の差異に基づいて同定され得る。ＳＮＰ遺伝子型決定のための、ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ質量分析と関連するプライマー伸長反応アッセイの使用に関するさらなる情報については、例えば、Ｗｉｓｅら、「Ａ ｓｔａｎｄａｒｄ ｐｒｏｔｏｃｏｌ ｆｏｒ ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｒｉｍｅｒ ｅｘｔｅｎｓｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ ｈｕｍａｎ
ｇｅｎｏｍｅ ｕｓｉｎｇ ｍａｔｒｉｘ−ａｓｓｉｓｔｅｄ ｌａｓｅｒ ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ／ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ ｔｉｍｅ−ｏｆ−ｆｌｉｇｈｔ ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ」、Ｒａｐｉｄ Ｃｏｍｍｕｎ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍ．２００３；１７（１１）：１１９５−２０２を参照のこと。
以下の参考は、ＳＮＰ遺伝子型決定のための質量分析に基づく方法を記載する、さらなる情報を提供する：Ｂｏｃｋｅｒ、「ＳＮＰ ａｎｄ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ｕｓｉｎｇ ｂａｓｅ−ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｃｌｅａｖａｇｅ ｓｎｄ ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ」、Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．２００３年７月；１９補遺１：Ｉ４４−Ｉ５３；Ｓｔｏｒｍら、「ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ
ｍａｓｓ ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ−ｂａｓｅｄ ＳＮＰ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ」、Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．２００３；２１２：２４１−６２；Ｊｕｒｉｎｋｅら、「Ｔｈｅ ｕｓｅ ｏｆ ＭａｓｓＡＲＲＡＹ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｆｏｒ ｈｉｇｈ ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ」、Ａｄｖ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｅｎｇ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００２；７７：５７−７４；およびＪｕｒｉｎｋｅら、「Ａｕｔｏｍａｔｅｄ ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ ｕｓｉｎｇ ｔｈｅ ＤＮＡ ＭａｓｓＡｒｒａｙ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ」、Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ．２００２；１８７：１７９−９２。
ＳＮＰはまた、直接のＤＮＡ配列決定によっても評価され得る。種々の自動化配列決定手順が利用され得（（１９９５）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １９：４４８）、これらとしては、質量分析による配列決定が挙げられる（例えば、ＰＣＴ国際公開番号ＷＯ９４／１６１０１；Ｃｏｈｅｎら、Ａｄｖ．Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒ．３６：１２７−１６２（１９９６）；およびＧｒｉｆｆｉｎら、Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．３８：１４７−１５９（１９９３）を参照のこと）。本発明の核酸配列は、当業者がこのような自動化配列決定手順のための配列決定プライマーを容易に設計することを可能にする。Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ３７７、３１００、３７００、３７３０、および３７３０ｘｌ ＤＮＡ Ａｎａｌｙｚｅｒｓ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ、ＣＡ）のような商業的な機器が、自動化配列決定のために、当該分野において一般的に使用される。
本発明のＳＮＰの遺伝子型を決定するために使用され得る他の方法としては、一本鎖高次構造多型（ＳＳＣＰ）および変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）が挙げられる（Ｍｙｅｒｓら、Ｎａｔｕｒｅ ３１３：４９５（１９８５））。ＳＳＣＰは、Ｏｒｉｔａら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ．Ａｃａｄ．に記載のように、一本鎖ＰＣＲ産物の電気泳動移動度の変化により、塩基の差異を識別する。一本鎖ＰＣＲ産物は、二本鎖ＰＣＲ産物を加熱するか、もしくはそれ以外で変性させることにより生成され得る。一本鎖核酸は、塩基配列に部分的に依存する二次構造を、再び折りたたむか、もしくは形成し得る。一本鎖増幅産物の異なる電気泳動移動度は、ＳＮＰ部位の塩基配列の差異に関連する。ＤＧＧＥは、多型ＤＮＡに固有の異なる配列依存的安定性および融解特性、ならびに変性勾配ゲルにおける電気泳動移動度パターンの対応する差異に基づいて、ＳＮＰ対立遺伝子を識別する（Ｅｒｌｉｃｈ、編、ＰＣＲ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｆｏｒ ＤＮＡ Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ、Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、１９９２、７章）。
配列特異的リボザイム（米国特許第５，４９８，５３１号）はまた、リボザイム切断部位の発生もしくは消失に基づいてＳＮＰを評価するために、使用され得る。完全にマッチする配列は、ヌクレアーゼ切断消化アッセイによるか、もしくは融解温度の差異により、ミスマッチ配列と区別され得る。ＳＮＰが制限酵素切断部位に影響する場合、ＳＮＰは、制限酵素消化パターンの変化、およびゲル電気泳動により決定される核酸フラグメントの長さの対応する変化により確認され得る。
ＳＮＰ遺伝子型決定は、例えば、ヒト被験体から生物学的サンプル（例えば、組織、細胞、流体、分泌物などのサンプル）を収集する工程、サンプルの細胞から核酸（例えば、ゲノムＤＮＡ、ｍＲＮＡもしくは両方）を単離する工程、標的核酸領域のハイブリダイゼーションおよび増幅が生じるような条件下で、標的ＳＮＰを含む単離された核酸の領域に特異的にハイブリダイズする一つ以上のプライマーに、核酸を接触させる工程、そして、本発明のＳＮＰ部位に存在するヌクレオチドを決定する工程、または、いくつかのアッセイにおいては、増幅産物の存在もしくは非存在を検出する工程（アッセイは、特定のＳＮＰ対立遺伝子が存在するか、もしくは存在しない場合にのみ、ハイブリダイゼーションおよび／もしくは増幅が生じるように設計され得る）を包含し得る。いくつかのアッセイにおいて、増幅産物の大きさは、検出され、そしてコントロールサンプルの長さと比較される；例えば、欠損および挿入は、正常な遺伝子型と比較した増幅産物の大きさの変化により検出され得る。
ＳＮＰ遺伝子型決定は、以下に記載のような数多くの実用的な適用のために有用である。このような適用の例としては、ＳＮＰ−疾患関連分析、疾患素因スクリーニング、疾患診断、疾患予後判断、疾患経過モニタリング、個体の遺伝子型に基づく治療ストラテジーの決定（薬理ゲノミクス）、疾患もしくは薬物に対する応答の見込みに関連したＳＮＰ遺伝子型に基づく治療剤の開発、処置レジメンについての臨床試験のための患者母集団の階層化、個体が治療剤により有害な副作用を経験する可能性の予測、ならびに法医学のようなヒトの確認適用が挙げられるが、これらに限定されない。
（ＳＮＰと表現型形質との間の遺伝子型関連の分析）
疾患診断、疾患素因スクリーニング、疾患予後、薬物反応性の決定（薬理ゲノム学）、薬物毒性スクリーニングおよび本明細書中に記載される他の用途のためのＳＮＰ遺伝子型特定は、代表的に、１種以上の特定のＳＮＰと目的の特定の表現型形質との間の遺伝的関連を最初に確立することに依存する。
異なる研究設計が、遺伝的関連研究のために使用され得る（Ｍｏｄｅｒｎ Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ Ｗｉｌｌｉａｍｓ ＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ（１９９８），６０９−６２２）。観察研究は最も頻繁に実施され、この研究において、患者の応答は妨害されない。第１の型の観察研究は、疾患の予測される原因が存在する人のサンプルと、予測される原因が存在しない人の別のサンプルを同定し、次いで、２つのサンプルにおける疾患の発症頻度が比較される。これらの標本抽出された集団はコホートと呼ばれ、この研究は、前向き研究である。他の型の観察研究は、ケース−コントロールまたは後向き研究である。代表的なケース−コントロール研究において、サンプルは、疾患の特定の徴候のような目的の表現型を有する個体（ケース）、および、結論が導かれる集団（標的集団）における表現型（コントロール）を有さない個体から、収集される。次いで、疾患の可能な原因が、過去に遡って調査される。ケース−コントロール研究においてサンプルを収集する時間および費用が、前向き研究にかかるものよりもかなり少ないので、ケース−コントロール研究は、少なくとも、探索および発見の段階の間、遺伝的関連の研究において、最も一般的に使用される研究設計である。
両方の型の観察研究において、考慮されるべき強力な交絡因子が存在し得る。交絡因子は、疾患の実際の原因および疾患自体の両方に関連するものであり、そして、年齢、性別、民族性ならびに環境因子のような人口統計学的情報を含む。研究において、交絡因子がケースおよびコントロールで適合せず、そして、適切に制御されない場合、偽の関連結果が生じ得る。強力な交絡因子が同定される場合、これらは、以下に説明される分析方法により制御されるべきである。
遺伝的関連研究において、試験されるべき目的の原因は、特定の対立遺伝子またはＳＮＰ、またはいくつかのＳＮＰからの対立遺伝子もしくはハプロタイプの組合せである。従って、標本抽出された個体からの組織生検（例えば、全血）が収集され得、ゲノムＤＮＡが、目的のＳＮＰについて遺伝子型を特定される。目的の表現型形質に加えて、人口統計学的情報（例えば、年齢、性別、民族性など）、臨床的情報および環境的情報のような、形質の出現に影響を及ぼし得る他の情報が収集されて、サンプルセットをさらに特徴付け、そして定義し得る。多くの場合、これらの因子は、疾患および／またはＳＮＰ対立遺伝子頻度に関連することが知られている。見込みのある遺伝子−環境および／または遺伝子−遺伝子の相互作用もまた存在する。遺伝子−環境および遺伝子−遺伝子の相互作用に取り組むための分析方法（例えば、２つの異なる遺伝子における両方の感受性対立遺伝子の存在の効果が、２つの遺伝子における個々の対立遺伝子の効果を合わせたものよりも大きい可能性がある）は、以下に議論される。
全ての関連する表現型および遺伝子型情報が得られた後、統計的分析を実施して、対立遺伝子または遺伝子型の存在と個体の表現型特徴との間に任意の有意な相関があるかどうかを決定する。好ましくは、遺伝的関連についての統計的試験を実施する前に、データの検査および精選がまず実施される。サンプルの疫学的および臨床的データは、表およびグラフを用いて、記述統計学によりまとめられ得る。データの評価は、好ましくは、データの完成性、矛盾したエントリーおよび異常値についてチェックするために実施される。次いで、χ二乗検定およびｔ検定（分布が正常でない場合は、ウィルソン順位和検定）を用いて、それぞれ、離散型変数および連続型変数についてのケースとコントロールとの間の有意差についてチェックし得る。遺伝子型の質を保証するために、Ｈａｒｄｙ−Ｗｅｉｎｂｅｒｇ不均衡検定がケースおよびコントロールについて別個に実施され得る。個々のマーカーについてのケースおよびコントロールの両方におけるＨａｒｄｙ−Ｗｅｉｎｂｅｒｇ不均衡（ＨＷＥ）からの有意な偏差は、遺伝子型の誤差の指標であり得る。ＨＷＥがマーカーの大半で違反される場合、これは、さらに調査されるべき集団下部構造の指標である。さらに、ケースのみにおいて、Ｈａｒｄｙ−Ｗｅｉｎｂｅｒｇ不均衡は、マーカーの疾患との遺伝的関連を示唆し得る（Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｗｅｉｒ Ｂ．，Ｓｉｎａｕｅｒ（１９９０））。
単一のＳＮＰの対立遺伝子が、表現型形質のケースまたはコントロールの状態に関連するかどうかを試験するために、当業者は、ケースおよびコントロールにおける対立遺伝子の頻度を比較し得る。標準的なχ二乗検定およびフィッシャーの正確検定が、２×２の表（２つのＳＮＰ対立遺伝子×２つの目的の分類形質における結果）について実施され得る。ＳＮＰの遺伝子型が関連するかどうかを試験するために、χ二乗検定が、３×２の表（３つの遺伝子型×２つの結果）について実施され得る。スコア検定がまた、遺伝子型関連について実施され、ケースおよびコントロールにおける３つの遺伝子型頻度（主なホモ接合型、ヘテロ接合型および少数のホモ接合型）を対照させ、そして、遺伝の３つの異なる様式、すなわち、優性（対比係数２，−１，−１）、相加的（対比係数１，０，−１）および劣性（対比係数１，１，−２）を用いて、傾向を探索する。少数の対立遺伝子 対 主要な対立遺伝子についてのオッズ比、ならびに、ヘテロ接合性改変体およびホモ接合性改変体 対 野生型の遺伝子型についてのオッズ比が、所望の信頼限界（通常は９５％）を用いて算出される。
混同（ｃｏｎｆｏｕｎｄｅｒ）を制御し、交互作用および効果モディファイアを試験するために、人口統計学的情報（例えば、年齢、民族および性別）または交互作用要素もしくは効果モディファイア（例えば、公知の主要遺伝子（例えば、アルツハイマー病についてのＡＰＯＥ、または自己免疫疾患についてのＨＬＡ））または環境因子（例えば、肺癌における喫煙）を含む、混乱を生じる可能性のある階層化した因子を用いて、階層化した分析が実施され得る。階層化した関連試験は、０、１および２の改変体の対立遺伝子を有する遺伝子型の序数的性質を考慮に入れるＣｏｃｈｒａｎ−Ｍａｎｔｅｌ−Ｈａｅｎｓｚｅｌ検定を用いて実施され得る。ＳｔａｔＸａｃｔによる完全検定（ｅｘａｃｔ ｔｅｓｔ）がまた、計算的に可能な場合実施され得る。混乱モディファイア効果を調節し、交互作用について試験するための別の方法は、ＳＡＳまたはＲのような統計的パッケージを用いて、逐次重ロジスティック回帰分析を実施することである。ロジスティック回帰は、モデル構築技術であり、ここで、最もフィットし、かつ最も倹約な（ｐａｒｓｉｍｏｎｉｏｕｓ）モデルが構築され、二分法の結果（例えば、特定の疾患を有するか否か）と、一連の独立した変数（例えば、別個の関連する遺伝子の遺伝子型、ならびに関連す得る人口統計学因子および環境因子）との間の関連を記述する。最も一般的なモデルは、オッズ比のロジット変換が、変数（主要効果）とそのクロス積項（ｃｒｏｓｓ−ｐｒｏｄｕｃｔ ｔｅｒｍｓ）（交互作用）との一次結合（ｌｉｎｅａｒ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ）として表されるものである（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｌｏｇｉｓｔｉｃ Ｒｅｇｒｅｓｓｉｏｎ，Ｈｏｓｍｅｒ ａｎｄ Ｌｅｍｅｓｈｏｗ，Ｗｉｌｅｙ（２０００））。特定の変数または交互作用が、結果と有意に関連するかどうかを試験するために、このモデルにおける係数をまず推定し、次いで、ゼロからのその逸脱（ｄｅｐａｒｔｕｒｅ）の統計的有意差について試験される。
１つのマーカーについての関連の検定を同時に実施することに加え、ハプロタイプ関連分析がまた、互いに密接に連鎖される多数のマーカーを調べるために実施され得る。試験されるマーカーが、それ自体疾患を生じる変異ではないが、このような変異と連鎖不均衡である場合、ハプロタイプ関連試験は、遺伝子型関連試験または対立遺伝子関連試験よりも強力であり得る。この試験は、なお、疾患が、実際に、ハプロタイプに関する対立遺伝子の組み合わせにより生じる場合により強力である（例えば、ＡＰＯＥは、互いに非常に密接している２つのＳＮＰにより形成されたハプロタイプである）。ハプロタイプ関連を効果的に実施するために、マーカー−マーカー連鎖不均衡の指標（Ｄ’およびｒ２の両方）が、代表的には、ハプロタイプ構造を明らかにするために、遺伝子内のマーカーについて算出される。連鎖不均衡における最近の研究（Ｄａｌｙら、Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，２９，２３２−２３５，２００１）は、遺伝子内のＳＮＰが、ブロックパターンで組織化され、ブロック内に高い程度の連鎖不均衡が存在し、そして、ごくわずかの連鎖不均衡しかブロック間に存在しないことを示している。一旦これらが明らかにされると、疾患状態とのハプロタイプ関連が、このようなブロックを用いて実施され得る。
ハプロタイプ関連試験は、対立遺伝子関連試験および遺伝子型関連試験と同じ様式で実施され得る。遺伝子における各ハプロタイプは、多対立遺伝子マーカーにおける対立遺伝子と類似する。当業者は、ケースおよびコントロールにおけるハプロタイプの頻度を比較するか、または、異なる対のハプロタイプとの遺伝子関連を試験し得る。プログラム「ｈａｐｌｏ．ｓｃｏｒｅ」を用いて、ハプロタイプについてスコア試験がなされ得ることが提案されている（Ｓｃｈａｉｄら、Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．，７０，４２５−４３４，２００２）。この方法において、ハプロタイプはまず、ＥＭアルゴリズムによって推測され、そして、他の因子の調節を可能にする一般化線形モデル（ＧＬＭ）フレームワークを用いて、スコア試験が実施される。
遺伝子関連試験の実施における重要な決定は、有意なレベルの決定であり、試験のｐ値がそのレベルに到達するときに、有意な関連が示され得る。正のヒットがその後の確認試験において追跡される、探索分析において、調節されていないｐ値＜０．２（寛大な側の有意差レベル）が、例えば、ＳＮＰの、疾患の特定の表現型特徴との有意な関連についての仮説を作成するために使用され得る。ＳＮＰが疾患と関連を有するとみなされるためには、ｐ値＜０．０５（当該分野で従来使用されている有意差レベル）が達成されることが好ましい。関連が示されるためには、ｐ値＜０．０１（厳密な側の有意差レベル）が達成されることがより好ましい。ヒットが、同じ供給源のより多くのサンプル、または、異なる供給源の異なるサンプルにおける確認分析において追跡される場合、複数の試験についての調節が、実験−ワイド（ｗｉｄｅ）誤差率を０．０５に維持しつつ、過剰数のヒットを避けるように実施される。異なる種類の誤差率をコントロールするための複数の試験について調節するための異なる方法が存在するが、一般に使用されるがやや保守的な方法は、実験−ワイズ誤差率またはファミリー−ワイズ誤差率を制御するためのＢｏｎｆｅｒｒｏｎｉ補正である（Ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓ ａｎｄ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｔｅｓｔｓ，Ｗｅｓｔｆａｌｌら、ＳＡＳ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ（１９９９））。誤り発見率（ＦＤＲ）を制御するための並べ替え検定が、より強力であり得る（Ｂｅｎｊａｍｉｎｉ ａｎｄ Ｈｏｃｈｂｅｒｇ，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｔｈｅ Ｒｏｙａｌ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｓｏｃｉｅｔｙ，Ｓｅｒｉｅｓ Ｂ ５７，１２８９−１３００，１９９５，Ｒｅｓａｍｐｌｉｎｇ−ｂａｓｅｄ Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｔｅｓｔｉｎｇ，Ｗｅｓｔｆａｌｌ ａｎｄ Ｙｏｕｎｇ，Ｗｉｌｅｙ（１９９３））。多様性を制御するためのこのような方法は、試験が依存的である場合に好まれ、誤り発見率の制御は、実験−ワイズ誤差率の制御と対抗するのに十分である。
統計学的に有意なマーカーが探索段階で同定された後の異なる集団に由来するサンプルを用いる複製研究において、次いで、メタ分析が異なる研究の証拠を合わせることによって実施され得る（Ｍｏｄｅｒｎ Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ，Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ Ｗｉｌｌｉａｍｓ ＆ Ｗｉｌｋｉｎｓ，１９９８，６４３−６７３）。利用可能な場合、同じＳＮＰについての当該分野で公知の関連結果がメタ分析に包含され得る。
遺伝子型の特定と疾患状態の分類の両方が、誤りを含み得るので、オッズ比およびｐ値が、遺伝子型の特定および疾患分類の誤差率についての種々の推定の際にどのように変化するかを見るために、感度分析を実施し得る。
疾患の有病率が異なる下位集団群と関連する場合、ケースとコントロールとの間の下位集団ベースの標本抽出の偏りが、ケース−コントロール関連研究における偽の結果をもたらし得ることは周知である（ＥｗｅｎｓおよびＳｐｉｅｌｍａｎ，Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．６２，４５０−４５８，１９９５）。このような偏りはまた、遺伝的関連研究における統計学的な力の消失をもたらし得る。集団の層化を検出するために、ＰｒｉｔｃｈａｒｄおよびＲｏｓｅｎｂｅｒｇは、疾患と連鎖しないマーカーを分類し、これらのマーカーに関する関連試験の結果を使用して、任意の集団層化が存在するかどうかを決定することを示唆した（Ｐｒｉｔｃｈａｒｄら、Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎ．１９９９，６５：２２０−２２８）。層化が検出される場合、ＤｅｖｌｉｎおよびＲｏｅｄｅｒに提案されたようなゲノムコントロール（ＧＣ）法（Ｄｅｖｌｉｎら、Ｂｉｏｍｅｔｒｉｃｓ １９９９，５５：９９７−１００４）が、集団層化に起因する試験統計のインフレーションを調節するために使用され得る。ＧＣ法は、集団構造レベルの変化に対して堅固であり、かつ、ＤＮＡプール設計に適用可能である（Ｄｅｖｌｉｎら、Ｇｅｎｅｔ．Ｅｐｉｄｅｍ．２０００１，２１：２７３−２８４）。
１５〜２０のリンクしないマイクロサテライトマーカーを用いる、Ｐｒｉｔｃｈａｒｄ法が推奨されるが、集団層化を検出するのに十分な力を得るために、３０以上の二対立遺伝子マーカーを使用することを示唆した。ＧＣ法については、約６０〜７０の二対立遺伝子マーカーが、集団層化に起因する試験統計についてのインフレーション因子を推定するために十分であることが示されている（Ｂａｃａｎｕら、Ａｍ．Ｊ．Ｈｕｍ．Ｇｅｎｅｔ．２０００，６６：１９３３−１９４４）。従って、７０の遺伝子間のＳＮＰは、ゲノムスキャンにおいて示されるものとリンクしない領域において選択され得る（Ｋｅｈｏｅら、Ｈｕｍ．Ｍｏｌ．Ｇｅｎｅｔ．１９９９，８：２３７−２４５）。
一旦、個々の危険因子（遺伝的または非遺伝的）が、疾患に対する素因について見出されると、次の工程は、カテゴリー（例えば、疾患または疾患なし）を予測するための分類／予測スキームを設定することであり、このカテゴリーは、個体がその関連するＳＮＰの遺伝子型および他の非遺伝的危険因子に依存しているかということである。別個の形質についてのロジスティック回帰、および、連続的な形質についての線形回帰は、このような仕事についての標準的な技術である（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｒｅｇｒｅｓｓｉｏｎ Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｄｒａｐｅｒ ａｎｄ Ｓｍｉｔｈ，Ｗｉｌｅｙ（１９９８））。さらに、他の技術がまた、分類を設定するために使用され得る。このような技術としては、異なる方法の性能の比較における用途に適切なＭＡＲＴ、ＣＡＲＴ、神経ネットワークおよび判別分析が挙げられるが、これらに限定されない（Ｔｈｅ Ｅｌｅｍｅｎｔｓ ｏｆ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｌｅａｒｎｉｎｇ，Ｈａｓｔｉｅ，Ｔｉｂｓｈｉｒａｎｉ ＆ Ｆｒｉｅｄｍａｎ，Ｓｐｒｉｎｇｅｒ（２００２））。
（疾患の診断および素因のスクリーニング）
遺伝子型と疾患に関連する表現型との間の関連／相関に関する情報は、いくつかの方法で活用され得る。例えば、１つ以上のＳＮＰと、処置が利用可能な疾患に対する素因との間の高度に統計的に有意な関連の場合は、個体におけるこのような遺伝子型パターンの検出は、処置の即時管理、または、少なくとも、個体の定期的なモニタリングの制度を正当化し得る。子供をもうけようと意図している夫婦における、深刻な疾患に関連する感受性対立遺伝子の検出はまた、その生殖決定において、夫婦に価値あるものであり得る。ＳＮＰとヒトの疾患との間の、弱いが、なお統計学的に有意な関連の場合、即時の治療的介入またはモニタリングは、感受性対立遺伝子またはＳＮＰを検出した後に正当化されないこともある。それにもかかわらず、被験体は、単純なライフスタイルの変化（例えば、食事、運動）を始めることを動機付けされ得、このライフスタイルの変化は、個体がほとんど、または全く費用をかけずに達成され得るが、個体がリスク対立遺伝子を有することによって危険性が増加し得る、状態を発症する危険性を減少するという、強力な利点を与え得る。
本発明のＳＮＰは、異なる方法で、個体におけるＶＴの発症に対して寄与し得る。いくつかの多型は、タンパク質コード配列内で生じ、そして、タンパク質の構造に影響を及ぼすことによって、疾患の表現型に寄与する。他の多型が、非コーディング領域で生じるが、例えば、複製、転写および／または翻訳への影響を介して、間接的に表現型上の効果を発揮し得る。単一のＳＮＰが、１つ以上の表現型形質に影響を及ぼし得る。同様に、単一の表現型形質は、異なる遺伝子の複数のＳＮＰにより影響を受け得る。
本明細書において使用されるように、「診断する」、「診断」、および「診断薬」という用語は、これらに限定されないが、以下のいずれかを含む：個体が現在有し得るＶＴの検出、素因／感受性スクリーニング（すなわち、今後、ＶＴを発症する、個体の危険性の増加の決定、または個体が、今後、ＶＴを発症する、危険性が減少しているかどうかの決定）、ＶＴを有することが公知の個体におけるＶＴの特定の型またはサブクラスの決定、以前になされたＶＴの診断の確認または強化、個体が陽性に応答する可能性が最も高い治療的ストラテジーを決定するためのまたは患者が特定の処置に対して応答する可能性があるかどうかを予測するための個体の薬理ゲノム学的評価、患者が、特定の処置または治療化合物由来の毒作用を受ける可能性があるかどうかの予測、ならびにＶＴを有する個体の将来の予後の評価。そのような診断用途は、本発明のＳＮＰに個別にもしくは固有の組合せでまたはＳＮＰハプロタイプに基づく。
ハプロタイプは、例えば、特定のゲノム領域が、特定の表現型に影響を与える遺伝子座を有するかどうかを決定するために、より少ない数のＳＮＰが遺伝子型を特定され得る点で、特に有用である（例えば、連鎖不均衡ベースのＳＮＰ関連分析）。
連鎖不均衡（ＬＤ）とは、所定の集団における各対立遺伝子の存在の別個の頻度から予測されるものよりも多い頻度での、２つ以上の異なるＳＮＰ部位における対立遺伝子の同時遺伝（例えば、選択的なヌクレオチド）をいう。独立して遺伝される２つの対立遺伝子の同時遺伝の予測される頻度は、第１の対立遺伝子の頻度に第２の対立遺伝子の頻度を乗じたものである。予測された頻度で同時に生じる対立遺伝子は、「連鎖不均衡」であると言われる。対照的に、ＬＤは、２つ以上の異なるＳＮＰ部位における対立遺伝子の間の任意の非ランダムな遺伝的関連をいい、この遺伝的関連は一般に、染色体に沿う２つの遺伝子座の物理的な近接性に起因する。ＬＤは、２つ以上のＳＮＰ部位が、所定の染色体上で互いに密接に物理的に近接している場合に生じ得、従って、これらのＳＮＰ部位における対立遺伝子は、１つのＳＮＰ部位における特定のヌクレオチド（対立遺伝子）が、近くに位置する異なるＳＮＰ部位における特定のヌクレオチド（対立遺伝子）と非ランダムな関連を示す結果のために、複数の世代について分離されていないままである傾向がある。従って、ＳＮＰ部位の１つの遺伝子型を特定することにより、ＬＤにおける他のＳＮＰの遺伝子型を特定したものとほとんど同じ情報が生じる。
種々の程度のＬＤが、いくつかのＳＮＰが他よりもより密接に関連している（すなわち、ＬＤにおいてより強い）という結果を有する２つ以上のＳＮＰの間で遭遇され得る。さらに、染色体に沿ってＬＤが延びる物理的な距離は、ゲノムの異なる領域間で異なり、従って、ＬＤが生じるために必要とされる２つ以上のＳＮＰ部位の間の物理的分離の程度は、ゲノムの異なる領域の間で異なり得る。
診断目的および類似の用途の場合、特定のＳＮＰ部位が、ＶＴの診断を決定するために有用である（例えば、そうした状態と有意な統計学的関連性があり、かつ／またはそうした状態の原因となる多型として認識される）ことが見出されるならば、当業者であれば、このＳＮＰ部位を有するＬＤ中にある他のＳＮＰ部位もまた、そうした状態を診断するために有用であろうことを認識するであろう。したがって、実際に疾患を生じる（原因となる）多型ではないが、このような原因となる多型を有するＬＤ中にある多型（例えば、ＳＮＰおよび／またはハプロタイプ）がまた、有用である。このような場合、原因となる多型を有するＬＤ中にある多型の遺伝子型は、原因となる多型の遺伝子型の予測となり、従って、原因となるＳＮＰにより影響を受ける表現型（例えば、ＶＴ）の予測となる。従って、原因となる多型を有するＬＤ中にある多型マーカーは、診断マーカーとして有用であり、そして、実際の原因となる多型が未知である場合、特に有用である。
１つ以上の原因となる多型を有するＬＤ中（および／またはある状態と有意な統計学的関連性がある１つ以上の多型を有するＬＤ中）にあり、したがって、診断のために使用される、原因となる／関連性のある（１種以上の）ＳＮＰと同じ状態を診断するために有用であり得る多型の例として、例えば、原因となる／関連性のあるＳＮＰと同じ遺伝子領域、タンパク質コード領域またはｍＲＮＡ転写物コード領域の中の他のＳＮＰ、原因となる／関連性のあるＳＮＰと同じエクソンまたは同じイントロンの中の他のＳＮＰ、原因となる／関連性のあるＳＮＰと同じハプロタイプブロック中の他のＳＮＰ、原因となる／関連性のあるＳＮＰと同じ遺伝子間領域中の他のＳＮＰ、原因となる／関連性のあるＳＮＰを有する遺伝子の外側ではあるがそれに近いＳＮＰ（例えば、遺伝子の境界の５’側または３’側のいずれかの６ｋｂ以内）が挙げられる。そのような有用なＬＤ ＳＮＰは、例えば、表１〜２に開示されるＳＮＰの間から選択され得る。
ヒトのゲノムにおける連鎖不均衡は、以下で総説されている：
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
 上述のように、本発明の１つの局面は、照会ＳＮＰから特定のＬＤの距離にあるＳＮＰがまた、ＶＴを有するかまたはＶＴを発症する増加した危険性または減少した危険性を同定するための確実なマーカーとして使用され得るという発見である。本明細書において使用される場合、用語「照会ＳＮＰ」とは、遺伝子型決定の結果および解析、または、本願に記載される実際に行った実施例において例示されるような他の適切な実験方法を用いて、疾患の増加した危険性または減少した危険性に関連することが見出されたＳＮＰをいう。本明細書において使用される場合、用語「ＬＤ ＳＮＰ」とは、本願に記載される計算方法の下で、「照会ＳＮＰ」とＬＤであることに起因して、疾患の増加した危険性または減少した危険性に関連するＳＮＰとして特徴付けられたＳＮＰをいう。以下、出願人は、特定のＳＮＰが照会ＳＮＰとＬＤであるかどうかを当業者が決定し得る計算方法を記載する。パラメーターｒ２は、マーカー間の連鎖不均衡の程度を特徴付けるために、遺伝学の分野において一般に使用される（Ｈｕｄｓｏｎ，２００１）。本明細書において使用される場合、用語「〜とＬＤである」とは、照会ＳＮＰに対し、ｒ２のようなパラメーターの閾値の上で測定される特定のＳＮＰをいう。
任意の２つ以上のＳＮＰの間のｒ２値は、ＨａｐＭａｐなどのデータベースから得ることができる。例えば、ＳＮＰ１およびＳＮＰ２の間のｒ２値が、０．８である場合（０．８が閾値として使用されると仮定して）、これらの２つのＳＮＰは、互いにＬＤにあり、したがって、ＳＮＰ１が、疾患と関連する場合、ＳＮＰ２は、同様に、その疾患と関連するであろうと結論づけるに至る。
現在、ある集団から得られた染色体のサンプルにおいて遺伝子の改変を直接観察することは、通常行われていることである。マーカーＡおよびＢについて、同じ染色体上に位置する２つの遺伝子マーカーにおいて、遺伝子型のデータを有すると仮定する。さらに、２つの対立遺伝子が、これらの２つのマーカーの各々において分離しており、その結果、対立遺伝子Ａ１およびＡ２がマーカーＡにおいて見出され得、そして、対立遺伝子Ｂ１およびＢ２がマーカーＢにおいて見出され得ると仮定する。また、これらの２つのマーカーが、ヒトの常染色体上にあると推定する。特定の個体について試験し、そして、これらの対立遺伝子が、両方のマーカーにおいてヘテロ接合性であることを見出し、その結果、その２つのマーカーの遺伝子型がＡ１Ａ２Ｂ１Ｂ２である場合、２つの可能な構成が存在する：問題の個体が、１つの染色体上に対立遺伝子Ａ１Ｂ１を有し得、そして、残りの染色体上に対立遺伝子Ａ２Ｂ２を有し得る；あるいは、個体は、一方の染色体上に対立遺伝子Ａ１Ｂ２を有し得、そして、もう一方の染色体上に対立遺伝子Ａ２Ｂ１を有し得る。染色体上の対立遺伝子の配列は、ハプロタイプと呼ばれる。この例において、個体は、ハプロタイプＡ１Ｂ１／Ａ２Ｂ２またはＡ１Ｂ２／Ａ２Ｂ１を有し得る（より完全な説明については、ＨａｒｔｌおよびＣｌａｒｋ（１９８９）を参照のこと）。連鎖平衡の概念は、ハプロタイプの頻度を、対立遺伝子の頻度に対して関連付ける。
個体のサンプルが、より大きな集団から選択されると推定する。各々が２つの対立遺伝子を有する上記２つのマーカーを考慮すると、以下の４つの可能なハプロタイプが存在する：Ａ１Ｂ１、Ａ１Ｂ２、Ａ２Ｂ１およびＡ２Ｂ２。以下の式を用いて、これらの４つのハプロタイプの頻度を表す：
Ｐ１１＝ｆｒｅｑ（Ａ１Ｂ１） （１）
Ｐ１２＝ｆｒｅｑ（Ａ１Ｂ２） （２）
Ｐ２１＝ｆｒｅｑ（Ａ２Ｂ１） （３）
Ｐ２２＝ｆｒｅｑ（Ａ２Ｂ２） （４）。
２つのマーカーにおける対立遺伝子の頻度は、異なるハプロタイプの頻度の合計であり、単一のマーカーの対立遺伝子の頻度を２つのマーカーのハプロタイプの頻度に対して関連付ける、類似の式のセットを記述することは簡単である：
ｐ１＝ｆｒｅｑ（Ａ１）＝Ｐ１１＋Ｐ１２ （５）
ｐ２＝ｆｒｅｑ（Ａ２）＝Ｐ２１＋Ｐ２２ （６）
ｑ１＝ｆｒｅｑ（Ｂ１）＝Ｐ１１＋Ｐ２１ （７）
ｑ２＝ｆｒｅｑ（Ｂ２）＝Ｐ１２＋Ｐ２２ （８）。
各マーカーにおける４つのハプロタイプの頻度と、対立遺伝子の頻度とは、合計して１の頻度にならなければならないことに注意されたい：
Ｐ１１＋Ｐ１２＋Ｐ２１＋Ｐ２２＝１ （９）
ｐ１＋ｐ２＝１ （１０）
ｑ１＋ｑ２＝１ （１１）。
２つのマーカーにおける対立遺伝子の間に相関がない場合、ハプロタイプの頻度は、複合対立遺伝子の積に近似することを予想する。したがって、
Figure 0005409658
 となる。
これらの近似式（１２）〜（１５）は、２つのマーカーの間に独立した組み合わせが存在する、すなわち、２つのマーカーにおける対立遺伝子は、一緒に、不規則に生じる、という連鎖平衡の概念を表す。これらは、近似値として表される。なぜならば、連鎖平衡および連鎖不均衡は、代表的には、染色体のサンプルの特性と考えられる概念であり；したがって、これらは、サンプル収集のプロセスに起因して、確率変動に対して感度が高いからである。経験的に、多くの対の遺伝子マーカーが、連鎖平衡であるが、確実に、全ての対が連鎖平衡であるわけではない。
上記の連鎖平衡の概念を確立したので、出願人は、連鎖不均衡（ＬＤ）の概念を説明し得る。ＬＤは、連鎖平衡からの逸脱である。Ａ１Ｂ１ハプロタイプの頻度が、（１２）において数学的に記述された連鎖平衡の仮定の下のＡ１およびＢ１についての対立遺伝子の積に近似するので、連鎖平衡からの偏差の量についての単純な指標は、これら２つの量における差、Ｄ
Ｄ＝Ｐ１１−ｐ１ｑ１ （１６）
であり、Ｄ＝０は、完全な連鎖平衡を示す。Ｄ＝０からの実質的な偏差は、試験される染色体のサンプルにおけるＬＤを示す。Ｄがとり得る最大値および最小値を含めた、Ｄの多くの特性が、Ｌｅｗｏｎｔｉｎ（１９６４）において考察される。数学的には、基本的な代数学を用いて、Ｄがハプロタイプの観点だけから記述され得ることが示され得る：
Ｄ＝Ｐ１１Ｐ２２−Ｐ１２Ｐ２１ （１７）。
Ｄを二乗し、その後、Ａ１、Ａ２、Ｂ１およびＢ２の対立遺伝子の頻度の積で割ることによってＤを変換すると、その結果得られるｒ２と呼ばれる量は、統計学において一般に使用されるピアソンの相関係数の二乗と等価である（例えば、Ｈｏｅｌ，１９５４）。
Figure 0005409658
 Ｄについて、０に近いｒ２の値は、サンプルセットにおいて試験される２つのマーカー間の連鎖平衡を示す。ｒ２の値が増加するにつれて、これら２つのマーカーは連鎖不均衡であるといわれる。ｒ２がとり得る値の範囲は、０〜１である。ｒ２＝１のとき、これら２つのマーカーにおける対立遺伝子の間には完全な相関が存在する。
さらに、上述の量はサンプル特異的なものである。従って、研究されるサンプルに特異的な表記を公式化する必要がある。ここで考察されるアプローチにおいて、主要な関心となるのは以下の３つの型のサンプルである：（ｉ）疾患に関連する表現型により影響を受ける個体からの染色体のサンプル（症例）、（ｉｉ）疾患に関連する表現型により影響を受けない個体から得られた染色体のサンプル（対照）、ならびに（ｉｉｉ）ハプロタイプの構築およびペアワイズの連鎖不均衡の計算のために使用される標準的なサンプルセット。以下に記載される方法の展開において使用される対立遺伝子の頻度について、症例または対照のいずれかのサンプルセットを示すために、さらなるサブスクリプトが追加される。
ｐ１，ｃｓ＝ｆｒｅｑ（症例におけるＡ１） （１９）
ｐ２，ｃｓ＝ｆｒｅｑ（症例におけるＡ２） （２０）
ｑ１，ｃｓ＝ｆｒｅｑ（症例におけるＢ１） （２１）
ｑ２，ｃｓ＝ｆｒｅｑ（症例におけるＢ２） （２２）
同様に、
ｐ１，ｃｔ＝ｆｒｅｑ（対照におけるＡ１） （２３）
ｐ２，ｃｔ＝ｆｒｅｑ（対照におけるＡ２） （２４）
ｑ１，ｃｔ＝ｆｒｅｑ（対照におけるＢ１） （２５）
ｑ２，ｃｔ＝ｆｒｅｑ（対照におけるＢ２） （２６）。
ロバストな連鎖不均衡の計算には、十分に容認されるサンプルセットが必要であるので、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔ（Ｔｈｅ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ ２００３，２００５；Ｔｈｏｒｉｓｓｏｎら、２００５；ＭｃＶｅａｎら、２００５）から得られるデータが、ペアワイズのｒ２値の計算のために使用され得る。実際、国際ＨａｐＭａｐプロジェクトのために遺伝子型決定されたサンプルは、観察される遺伝的バリエーションのパターンから、十分な数の染色体が試験して有意義かつロバストな結論を導くように、種々のヒト部分集団からの代表例として選択された。Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａ ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔのウェブサイト（ｈａｐｍａｐ．ｏｒｇ）は、プロジェクトの説明、利用された方法および試験されたサンプルを含む。このようなデータ中に存在するパターンの意味を得るために経験的なデータを試験することも有用である。
ハプロタイプの頻度は、上記の式（１８）においては明白な独立変数であった。しかし、２マーカーのハプロタイプの頻度を知るためには、位相が二重ヘテロ接合性サンプルについて決定されることを必要とする。試験されるデータにおいて位相が未知であるとき、遺伝子型データから位相を推論するために種々のアルゴリズムが使用され得る。この問題は、以前に考察されており、その考察においては、Ａ１Ａ２Ｂ１Ｂ２の２つのＳＮＰ遺伝子型を有する二重ヘテロ接合性の個体は、以下の２つの異なる染色体セットのうちの１つを有し得る：Ａ１Ｂ１／Ａ２Ｂ２またはＡ１Ｂ２／Ａ２Ｂ１。ハプロタイプの頻度を推定するための１つのこのようなアルゴリズムは、Ｄｅｍｐｓｔｅｒら（１９７７）によって最初に公式化された、期待値最大化（ＥＭ）アルゴリズムである。このアルゴリズムは、しばしば、遺伝子型データからハプロタイプの頻度を推論するために、遺伝学において使用される（例えば、ＥｘｃｏｆｆｉｅｒおよびＳｌａｔｋｉｎ、１９９５；Ｔｒｅｇｏｕｅｔら、２００４）。２つのＳＮＰについての場合がここで検査されているが、ＥＭアルゴリズムは、対立遺伝子の頻度とサンプルサイズとが小さ過ぎないという条件で、誤差がほとんどないということに注意すべきである。ｒ２値に対するインパクトは、代表的には無視できる。
相関する遺伝子マーカーは情報を共有するので、疾患に関連するＳＮＰマーカーを用いたＬＤにおけるＳＮＰマーカーの照会もまた、疾患の関連を検出するために十分な検出力を有し得る（ＬｏｎｇおよびＬａｎｇｌｅｙ、１９９９）。疾患に関連する対立遺伝子を直接見出す検出力と、疾患との関連性を間接的に検出する検出力との間の関係性は、ＰｒｉｔｃｈａｒｄおよびＰｒｚｅｗｏｒｓｋｉ（２００１）によって調査された。真っ直ぐに向かう（ｓｔｒａｉｇｈｔ−ｆｏｒｗａｒｄ）偏差において、疾患に関連する遺伝子座と比較して、サンプルサイズが係数
Figure 0005409658
 （式（１８）の逆数）によって増加される場合、疾患に関連する遺伝子座と連鎖不均衡であるマーカーの遺伝子座において疾患との関連性を間接的に検出する検出力は、疾患に関連する遺伝子座において疾患との関連性を直接検出する検出力とほぼ同じであることが示され得る。
従って、Ｎ個のサンプルを有する実験を用いて、疾患との関連性を間接的に検出する検出力を計算した場合、（実際の疾患に感受性のある遺伝子座において）疾患との関連性を直接検出するのと等価な検出力は、およそｒ２Ｎ個のサンプルを用いる実験を必要とする。検出力、サンプルサイズおよび連鎖不均衡の間のこの基本的な関係性を用いて、疾患状態に直接関連するＳＮＰマーカーと連鎖不均衡状態にある遺伝子型決定マーカーが、疾患との関連性を間接的に検出する十分な検出力を有するかどうかを決定する際に有用なｒ２閾値を導出し得る。
間接的なプロセスによる疾患に関連するマーカーを検出する検出力の導出を開始するために、以下のように有効な染色体サンプルサイズを規定する：
Figure 0005409658
 上記式において、ＮｃｓおよびＮｃｔは、それぞれ、二倍体の症例および対照の数である。この式は、症例と対照の数が等価ではない状況を扱うために必要となる。症例と対照のサンプルサイズが等しい場合、すなわち、Ｎｃｓ＝Ｎｃｔ＝Ｎである場合、染色体の有効数の値は、予想通り、単に、ｎ＝２Ｎである。検出力を、有意性レベルαについて計算させる（その結果、αを下回る従来のＰ値が、統計的に有意であるとみなされる）。標準的なガウス分布の関数を
Figure 0005409658
 として定義する。数学的には、
Figure 0005409658
 である。あるいは、以下の誤差関数表記（Ｅｒｆ）
Figure 0005409658
 がまた使用され得る。
例えば、Φ（１．６４４８５４）＝０．９５である。ｒ２の値は、間接的な照会により疾患との関連性を検出する検出力の予め特定された最小量を得るために導出され得る。ＬＤ ＳＮＰマーカーが、疾患に関連する対立遺伝子を有するものであり得、それゆえ、このアプローチが、全ての間接的なプロセスによる検出力の結果が少なくとも照会したＳＮＰマーカーと同程度に大きいと予測されるような、下界モデルを構成することに注意されたい。
βにより、本当に疾患に関連するマーカーを検出しない誤り率を示す。従って、１−βは、統計学的な検出力の古典的な定義である。Ｐｒｉｔｃｈａｒｄ−Ｐｚｒｅｗｏｒｓｋｉの結果をサンプルサイズへと代入すると、αの有意性レベルにおいて疾患との関連性を検出する検出力は、以下の近似
Figure 0005409658
 により与えられ、上記式において、Ｚｕは、ｕ（ｕ∈（０，１））において評価した標準的な正規累積分布の逆数である。Ｚｕ＝Φ−１（ｕ）（ここで、Φ（Φ−１（ｕ））＝Φ−１（Φ（ｕ））＝ｕである）。例えば、α＝０．０５に設定し、従って、１−α／２＝０．９７５である場合、Ｚ０．９７５＝１．９５９９６が得られる。次に、Ｔの最小検出力の閾値に等しい検出力を設定し、
Figure 0005409658
 そして、ｒ２について解くと、以下の閾値ｒ２が得られる：
Figure 0005409658
 あるいは、
Figure 0005409658
 ｒ２が、照会ＳＮＰと、この照会ＳＮＰと種々のレベルのＬＤにある他の多数のＳＮＰとの間で計算されると仮定する。閾値
Figure 0005409658
 は、照会ＳＮＰと、潜在的なＬＤ ＳＮＰとの間の連鎖不均衡の最小値であり、その結果、ＬＤ ＳＮＰは、依然として、疾患との関連性を検出するためのＴ以上の検出力を保持する。例えば、ＳＮＰ ｒｓ２００が症例−対照の疾患−関連性研究において遺伝子型決定され、ＳＮＰ ｒｓ２００が疾患の表現型と関連することが見出されると仮定する。さらに、１，０００個の症例の染色体においては、少数の対立遺伝子の頻度が１６％であると見出され、１，０００個の対照の染色体においては、少数の対立遺伝子の頻度が１０％であると見出されたと仮定する。これらの測度を考慮すると、０．０５の有意性レベルにおいて疾患との関連性を検出する検出力は、極めて高い、すなわち、対立遺伝子関連性試験を用いて、およそ９８％であったことを、実験前に、推測し得る。式（３２）を適用すると、ｒ２の最小値を計算して、疾患との関連性を間接的に評価し、検出力の閾値レベルについて、ＳＮＰ ｒｓ２００における少数の対立遺伝子が、本当に疾患に対する素因であると考えることができる。検出力の閾値レベルを８０％に設定するとき、
Figure 0005409658
 は、上記のものと同じ有意性レベルおよび染色体の数を与える。従って、ｒｓ２００が０．４８９よりも大きいペアワイズのｒ２値を有するあらゆるＳＮＰは、８０％より大きい疾患との関連性を検出する検出力を有すると期待される。さらに、この結果は、ＬＤ ＳＮＰが、照会ＳＮＰ ｒｓ２００との連鎖不均衡によってのみ疾患に関連付けられるような保存的なモデルを考慮する。
疾患の表現型（例えば、ＶＴ）を有する特定のＳＮＰおよび／またはＳＮＰハプロタイプの寄与または関連は、本発明のＳＮＰを使用して、その遺伝子型を有さない個体と比較して、特定の遺伝子型の結果として検出可能な形質（例えば、ＶＴ）を発現する個体、または、その後に、検出可能な形質（例えば、ＶＴ）を発現する危険性を増加もしくは減少してその遺伝子型を配置する個体を同定し得る、優れた診断試験を開発し得る。本明細書中で使用される場合、診断は、単一のＳＮＰまたは一群のＳＮＰに基づき得る。複数のＳＮＰ（例えば、表１および／または表２に提供されるＳＮＰの、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２４、２５、３０、３２、４８、５０、６４、９６、１００、または、これらの間の任意の数、もしくはこれ以上）の組合せた検出は、代表的に、正確な診断の可能性を増加する。例えば、ＶＴと相関することが公知の単一のＳＮＰの存在は、個体がＶＴを有するか、発症する危険性があるという、２０％の可能性を示唆し得るのに対して、各々がＶＴと相関する５つのＳＮＰの検出は、個体がＶＴを有するか、発症する危険性があるという、８０％の可能性を示唆し得る。診断もしくは素因のスクリーニングの精度をさらに高めるために、本発明のＳＮＰの分析は、ＶＴの他の多型もしくは他の危険因子（例えば、疾患の症状、病理学的特徴、家族歴、食事、環境因子またはライフスタイル因子）の分析と組合せられ得る。
当然、ＶＴの処置もしくは診断において、本発明は一般に、ＶＴを発症する危険性のある（または危険性の低い）個体、および／または、ＶＴに関連する病理の絶対的な同定は提供しないが、むしろ、統計的に有意な関連結果に基づいて、疾患を発症する程度もしくは可能性の特定の増加（または減少）を示唆することは、当業者により理解される。しかし、この情報は、例えば、予防処置を開始するため、または、１つ以上の有意なＳＮＰもしくはＳＮＰハプロタイプを保有する個体に、軽微な臨床症状のような警告的な徴候を予見するため、または、初期段階で状態の処置を同定および開始するために、状態の発生をモニターする、定期的な健康診断を有するために使用され得るものとして、非常に価値がある。適時処置されないと非常に衰弱するかまたは致死である疾患の場合特に、潜在的な素因の知識が、たとえ、この素因が絶対的なものでないとしても、効率的に処置するためのまさに有意な様式に貢献する可能性がある。
本発明の診断技術は、種々の方法論（例えば、ハプロタイプ決定のための個体の染色体の分析を可能にする方法、家族研究、単一精子ＤＮＡ分析または体細胞ハイブリッドが挙げられる）を採用して、検出可能な形質を発症する危険性の増加もしくは減少に関連するＳＮＰもしくはＳＮＰパターンを試験被験体が有するかどうか、または、個体が特定の多型／変異の結果として検出可能な形質を罹患するかどうかを決定し得る。本発明の診断を用いて分析された形質は、ＶＴに関連する病理および傷害において通常観察される、任意の検出可能な形質であり得る。
本発明の別の局面は、個体が、１つ以上の形質を発症する危険性がある（または危険性が低い）かどうか、または、個体が、特定の形質が原因となる対立遺伝子もしくは形質が影響を与える対立遺伝子を保有する結果として、１つ以上の形質を発現するかどうかを決定する方法に関連する。これらの方法は一般に、個体から核酸サンプルを得る工程、および、この核酸サンプルをアッセイして、１つ以上のＳＮＰ位置にどのヌクレオチドが存在するかを決定する工程を包含し、ここで、アッセイされるヌクレオチドは、形質を発症する危険性の増加もしくは減少の指標、または、個体が、特定の形質が原因となる対立遺伝子もしくは形質が影響を与える対立遺伝子を保有する結果として、１つ以上の形質を発現することの指標である。
別の実施形態において、本発明のＳＮＰ検出試薬を用いて、個体が、遺伝子発現（集合的に、細胞もしくは体液の「遺伝子応答」）のレベル（例えば、サンプル中のｍＲＮＡもしくはタンパク質の濃度など）またはパターン（例えば、発現の反応速度論、分解速度、安定性プロフィール、Ｋｍ、Ｖｍａｘなど）に影響を及ぼす、１つ以上のＳＮＰ対立遺伝子を有するかどうかを決定する。このような決定は、（例えば、核酸アレイ、ＲＴ−ＰＣＲ、ＴａｑＭａｎアッセイもしくは質量分析を用いることによって）ｍＲＮＡもしくはタンパク質の発現をスクリーニングすること、個体において変更された発現を有する遺伝子を同定すること、変更された発現を有する遺伝子の発現に影響を与え得る、表１および／もしくは表２に開示されるＳＮＰの遺伝子型（例えば、変更された発現を有する遺伝子内および／もしくはその周囲にあるＳＮＰ、調節／制御領域にあるＳＮＰ、変更された発現を有する遺伝子の発現に影響を与え得る経路に関与する他の遺伝子内および／もしくはその周囲にあるＳＮＰ、または、遺伝子型が特定され得る全てのＳＮＰ）を特定すること、ならびに、ＳＮＰ遺伝子型を変更された遺伝子発現と相関させることによって達成され得る。この様式において、特定のＳＮＰ部位における特定のＳＮＰ対立遺伝子は、遺伝子発現に影響を与えると同定され得る。
（薬理ゲノム学および治療学／薬物開発）
本発明は、特定の治療剤もしくは薬学的化合物、またはこのような化合物のクラスに対して、特定のＳＮＰ対立遺伝子もしくはハプロタイプを有する被験体の薬理ゲノム学を評価するための方法を提供する。薬理ゲノム学は、臨床的に有意な遺伝性のバリエーション（例えば、ＳＮＰ）が、影響を受けた人における変化した薬物の性質および／または異常作用に起因する薬物に対する応答において機能する役割を扱う。例えば、Ｒｏｓｅｓ、Ｎａｔｕｒｅ ４０５、８５７−８６５（２０００）；Ｇｏｕｌｄ
Ｒｏｔｈｂｅｒｇ、Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １９、２０９−２１１（２００１）；Ｅｉｃｈｅｌｂａｕｍ、Ｃｌｉｎ．Ｅｘｐ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｐｈｙｓｉｏｌ．２３（１０−１１）：９８３−９８５（１９９６）；およびＬｉｎｄｅｒ、Ｃｌｉｎ．Ｃｈｅｍ．４３（２）：２５４−２６６（１９９７）を参照のこと。こららのバリエーションの臨床結果は、代謝における個々のバリエーションの結果として、特定の個体における治療用薬物の重篤な毒性、または特定の個体における薬物の治療不全を生じ得る。従って、個体のＳＮＰ遺伝子型は、治療用化合物が身体に作用する様式、または身体がその化合物を代謝する様式を決定し得る。例えば、薬物代謝酵素におけるＳＮＰは、これらの酵素の活性に影響を与え得、これは次々に薬物作用の強度および期間の両方、ならびに薬物代謝および薬物浄化に影響を与え得る。
薬物代謝酵素、薬物輸送体、製剤用のタンパク質、および他の薬物標的におけるＳＮＰの発見は、なぜ数名の患者が期待された薬物効果を得ず、過度の薬物効果を示すのか、またはなぜ標準的な薬物投薬量から重篤な毒性を受けるのかを説明してきた。ＳＮＰは、代謝の速い人（ｅｘｔｅｎｓｉｖｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｚｅｒ）の遺伝子型、および代謝の遅い人（ｐｏｏｒ ｍｅｔａｂｏｌｉｚｅｒ）の表現型において発現し得る。従って、ＳＮＰは、タンパク質の対立遺伝子改変体をもたらし得、その改変体において、ある集団の１以上のタンパク質機能が、別の集団におけるタンパク質機能と異なる。従って、ＳＮＰおよびコードされる改変ペプチドは、処置様式に影響を与え得る遺伝的素因を確認するための標的を提供する。例えば、リガンドベースの処置において、ＳＮＰは、リガンド結合においてほぼ活性なアミノ末端細胞外ドメインおよび／またはレセプターの他のリガンド結合領域に対する上昇を与え得、それによって、その後のタンパク質活性化に影響を与える。従って、リガンド投薬量は、必然的に特定のＳＮＰ対立遺伝子もしくはハプロタイプを含む所定の集団内の治療効果を最大化するように修正される。
遺伝子タイピング（ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ）の代替として、代替のＳＮＰ対立遺伝子によってコードされる改変アミノ酸配列を含む特定の改変タンパク質が同定され得る。従って、個体の薬理ゲノム的特徴付けは、個々のＳＮＰ遺伝子型に基づく予防的用途または治療的用途のために有効な化合物およびそのような化合物の有効投薬量の選択を可能にし、それによって、治療の有効性を増強および最適化する。さらに、特定のＳＮＰ／ハプロタイプを含む組み換え細胞およびトランスジェニック動物の作製は、有効な臨床設計ならびに処置化合物および投薬レジメンの試験を可能にする。例えば、トランスジェニック動物は、ヒト疾患感受性遺伝子に対してオルソログな遺伝子における特定のＳＮＰ対立遺伝子のみが異なるように作製され得る。
本発明のＳＮＰの薬理ゲノム学的使用は、患者の介護に対して（特に、ＶＴを処置することにおいて）いくつかの有意な利点を提供する。個々のＳＮＰ遺伝子型に基づく個体の薬理ゲノム学的特徴付けは、特定の医薬での処置に対して応答しそうにない個体を同定し得、それによって、医師が、それらの個体に対して効果のない医薬を処方するのを回避することを可能にする。一方で、個体のＳＮＰ遺伝子タイピングは、医師に、個々のＳＮＰ遺伝子型に基づいて最も有効な適切な医薬および投薬レジメンを選択することを可能にし得る。この情報は、医薬を処方することにおける医師の信頼を増加させ、そして患者に彼らの薬物レジメンに従うように動機付けする。さらに、薬理ゲノム学は、毒性に対する素因のある患者、および特定の薬物または薬物投薬に対する副作用を同定し得る。薬物副作用は、米国単独で１年あたり１００，０００件を超える可避可能な死亡をもたらし、従って、入院および死亡の重要な原因、ならびに保健医療システムにおける重要な経済的な負担を表す（Ｐｆｏｓｔら、Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ、２０００年８月）。従って、本明細書中に開示されるＳＮＰに基づく薬理ゲノム学は、生命を維持することおよび保健医療費を実質的に減少させることの両方に対する可能性を有する。
薬理ゲノム学は、一般的には、Ｒｏｓｅら、「Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｃｌｉｎｉｃａｌｌｙ ｒｅｌｅｖａｎｔ ｇｅｎｅｔｉｃ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ」、Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｍｅｄ．２００３；８５：２２５−３７においてさらに議論されている。アルツハイマー病および他の神経変性障害に関する薬理ゲノム学は、Ｃａｃａｂｅｌｏｓ、「Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ｆｏｒ
ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ ｄｅｍｅｎｔｉａ」、Ａｎｎ Ｍｅｄ．２００２；３４（５）：３５７−７９、Ｍａｉｍｏｎｅら、「Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ
ｏｆ ｎｅｕｒｏｄｅｇｅｎｅｒａｔｉｖｅ ｄｉｓｅａｓｅｓ」、Ｅｕｒ Ｊ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．２００１年２月９日；４１３（１）：１１−２９、およびＰｏｉｒｉｅｒ、「Ａｐｏｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｅ：ａ ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔａｒｇｅｔ ｆｏｒ ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ ｄｉｓｅａｓｅ」、Ｍｏｌ Ｄｉａｇｎ．１９９９年１２月；４（４）：３３５−４１において議論されている。心血管疾患に関する薬理ゲノム学は、Ｓｉｅｓｔら、「Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ｏｆ ｄｒｕｇｓ ａｆｆｅｃｔｉｎｇ ｔｈｅ ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ｓｙｓｔｅｍ」、Ｃｌｉｎ Ｃｈｅｍ Ｌａｂ Ｍｅｄ．２００３年４月；４１（４）：５９０−９、Ｍｕｋｈｅｒｊｅｅら、「Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ ｉｎ ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ｄｉｓｅａｓｅｓ」、Ｐｒｏｇ Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃ Ｄｉｓ．２００２年５月〜６月；４４（６）：４７９−９８、およびＭｏｏｓｅｒら、「Ｃａｒｄｉｏｖａｓｃｕｌａｒ ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｅｔｉｃｓ ｉｎ ｔｈｅ ＳＮＰ ｅｒａ」、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ．２００３年７月；１（７）：１３９８−４０２において議論されている。癌に関連する薬理ゲノム学は、ＭｃＬｅｏｄら、「Ｃａｎｃｅｒ ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ：ＳＮＰｓ、ｃｈｉｐｓ、ａｎｄ ｔｈｅ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｐａｔｉｅｎｔ」、Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｖｅｓｔ．２００３；２１（４）：６３０−４０、およびＷａｔｔｅｒｓら、「Ｃａｎｃｅｒ ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ：ｃｕｒｒｅｎｔ ａｎｄ ｆｕｔｕｒｅ ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ」、Ｂｉｏｃｈｉｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ａｃｔａ．２００３年３月１７日；１６０３（２）；９９−１１１において議論されている。
本発明のＳＮＰはまた、ＶＴに対する新規な治療標的を同定するために使用され得る。例えば、疾患に関連する改変体（「改変遺伝子」）もしくはそれらの産物、ならびにこれらの改変遺伝子もしくはそれらの産物と相互作用することによって直接的もしくは間接的に調節される遺伝子またはそれらの産物を含む遺伝子は、例えば、疾患を処置するかまたは疾患の発症を予防もしくは遅延させる治療剤の開発のために標的化され得る。その治療剤は、例えば、標的遺伝子もしくは遺伝子産物の機能またはレベルを調節する低分子、タンパク質、タンパク質フラグメンもしくはペプチド、抗体、核酸、またはそれらの誘導体もしくは模倣物から構成され得る。
本明細書中で開示されるＳＮＰ含有核酸分子、およびそれらの相補的核酸分子は、細胞、組織、および生物における遺伝子発現を制御するためのアンチセンス構築物として使用され得る。アンチセンス技術は、当該分野で十分に確立されており、Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｄｒｕｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ，Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ，ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｃｒｏｏｋｅ（編）、Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ、Ｉｎｃ．：Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（２００１）において広範に概説されている。アンチセンス核酸分子は、一般的には、遺伝子によって発現されるｍＲＮＡの領域に相補的であるように設計され、その結果、アンチセンス分子がｍＲＮＡとハイブリダイズし、それによってタンパク質へのｍＲＮＡの翻訳をブロックする。種々のクラスのアンチセンスオリゴヌクレオチドが、当該分野で使用され、そのうちの２つが切断剤（ｃｌｅａｖｅｒ）および遮断剤（ｂｌｏｃｋｅｒ）である。切断剤は、標的ＲＮＡに結合することによって、その標的ＲＮＡを切断する細胞内のヌクレアーゼ（例えば、ＲＮａｓｅＨまたはＲＮａｓｅＬ）を活性化する。遮断剤（これもまた、標的ＲＮＡに結合する）は、リボソームの立体障害を通してタンパク質翻訳を阻害する。例示的な遮断剤としては、ペプチド核酸、モルホリノ、ロックされた核酸（ｌｏｃｋｅｄ ｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ）、およびメチルホスホネートが挙げられる（例えば、Ｔｈｏｍｐｓｏｎ、Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ Ｔｏｄａｙ、７（１７）：９１２−９１７（２００２））。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、治療剤として直接的に有用であり、そして（例えば、遺伝子ノックアウト実験または遺伝子ノックダウン実験において）遺伝子機能を決定および確認するためにもまた有用である。
アンチセンス技術は、以下：Ｌａｖｅｒｙら、「Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ａｎｄ ＲＮＡｉ：ｐｏｗｅｒｆｕｌ ｔｏｏｌｓ ｉｎ ｄｒｕｇ ｔａｒｇｅｔ ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ａｎｄ ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ」、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ Ｄｅｖｅｌ．２００３年７月；６（４）：５６１−９；Ｓｔｅｐｈｅｎｓら、「Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｔｈｅｒａｐｙ ｉｎ ｃａｎｃｅｒ」、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｍｏｌ Ｔｈｅｒ．２００３年４月；５（２）：１１８−２２；Ｋｕｒｒｅｃｋ、「Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ．Ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ ｔｈｒｏｕｇｈ ｎｏｖｅｌ ｃｈｅｍｉｃａｌ ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ」、Ｅｕｒ Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ．２００３年４月；２７０（８）：１６２８−４４；Ｄｉａｓら、「Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ：ｂａｓｉｃ ｃｏｎｃｅｐｔｓ ａｎｄ ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ」、Ｍｏｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．２００２年３月；１（５）：３４７−５５；Ｃｈｅｎ、「Ｃｌｉｎｉｃａｌ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｓ ａｎｔｉ−ｃａｎｃｅｒ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ」、Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｍｅｄ．２００３；７５：６２１−３６；Ｗａｎｇら、「Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ」、Ｃｕｒｒ Ｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｔａｒｇｅｔｓ．２００１年１１月；１（３）：１７７−９６；およびＢｅｎｎｅｔｔ、「Ｅｆｆｉｃｉｅｎｃｙ ｏｆ ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｄｒｕｇ ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ」、Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖ．２００２年６月；１２（３）：２１５−２４においてさらに概説されている。
本発明のＳＮＰは、特定の核酸改変体に対して特異的なアンチセンス試薬を設計するために特に有用である。本明細書中に開示されるＳＮＰ情報に基づいて、アンチセンスオリゴヌクレオチドが、１以上の特定のＳＮＰヌクレオチドを含むｍＲＮＡ分子を特異的に標的するように生成され得る。この様式において、１以上の望ましくない多型（例えば、欠損タンパク質（例えば、触媒ドメインにおけるアミノ酸置換をもたらすＳＮＰヌクレオチド）を含むｍＲＮＡ分子の発現は、阻害され得るかまたは完全にブロックされ得る。従って、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、特定の多型形態（例えば、欠損タンパク質をコードするＳＮＰ対立遺伝子）に特異的に結合するように使用され得、それによって、この形態の翻訳を阻害するが、代替の多型形態（例えば、正常な機能を有するタンパク質をコードする代替のＳＮＰヌクレオチド）には結合しない。
アンチセンス分子は、遺伝子発現および欠損タンパク質の産生を阻害するために、ｍＲＮＡを不活性化するように使用され得る。従って、これらの分子は、異常な遺伝子発現もしくは望ましくない遺伝子発現、または特定の欠損タンパク質の発現によって特徴付けられる障害（例えば、ＶＴ）を処置するために使用され得る。この技術は、翻訳されるべきｍＲＮＡの能力を減弱する、ｍＲＮＡにおける１以上の領域に相補的なヌクレオチド配列を含むリボザイムによる切断に関与し得る。考え得るｍＲＮＡ領域としては、例えば、タンパク質コード領域、特に、タンパク質の触媒活性、基質／リガンド結合、もしくは他の機能的活性に対応するタンパク質コード領域が挙げられる。
本発明のＳＮＰはまた、特定のＳＮＰ改変体を有する核酸分子を特異的に標的にするＲＮＡ干渉試薬を設計するために有用である。ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）（遺伝子サイレンシングとしてもまた称される）は、遺伝子をオフ（ｏｆｆ）にするための二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）分子の使用に基づいている。細胞に導入される場合、ｄｓＲＮＡは、その細胞によって低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）として公知の短いフラグメント（一般的には、長さが約２１、２２、または２３ヌクレオチド）にプロセシングされ、このｓｉＲＮＡは、細胞が配列特異的様式で使用して、相補的なＲＮＡを認識し、そして破壊する（Ｔｈｏｍｐｓｏｎ、Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ Ｔｏｄａｙ、７（１７）：９１２−９１７（２００２））。したがって、本発明のある局面は、約１８〜２６ヌクレオチド長、好ましくは１９〜２５ヌクレオチド長、より好ましくは２０、２１、２２または２３のヌクレオチド長である単離された核酸分子、およびこれらの核酸分子のＲＮＡｉのための使用を具体的に企図する。ＲＮＡｉ分子（ｓｉＲＮＡを含む）は配列特異的様式で作用するので、本発明のＳＮＰは、特定のＳＮＰ対立遺伝子／ヌクレオチド（例えば、欠損タンパク質の産生をもたらす有害な対立遺伝子）を有する核酸分子を認識し、そして破壊するが、代替のＳＮＰ対立遺伝子（例えば、正常な機能を有するタンパク質をコードする対立遺伝子）を有する核酸分子に影響を与えないＲＮＡｉ試薬を設計するために使用され得る。アンチセンス試薬のように、ＲＮＡｉ試薬は、（例えば、欠損した、疾患を引き起こす遺伝子をターンオフ（ｔｕｒｎ ｏｆｆ）するための）治療剤として、直接的に有用であり得、また、（例えば、遺伝子ノックアウト実験または遺伝子ノックダウン実験において）遺伝子機能を特徴付けし、そして確認するのに有用であり得る。
以下の参考文献は、ＲＮＡｉのさらなる概説を提供する：Ｒｅｙｎｏｌｄｓ ｅｔ ａｌ．， “Ｒａｔｉｏｎａｌ ｓｉＲＮＡ ｄｅｓｉｇｎ ｆｏｒ ＲＮＡ ｉｎｔｅｒｆｅｒｅｎｃｅ”， Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ． ２００４ Ｍａｒ；２２（３）：３２６−３０． Ｅｐｕｂ ２００４ Ｆｅｂ ０１； Ｃｈｉ ｅｔ ａｌ．， “Ｇｅｎｏｍｅｗｉｄｅ ｖｉｅｗ ｏｆ ｇｅｎｅ ｓｉｌｅｎｃｉｎｇ ｂｙ ｓｍａｌｌ ｉｎｔｅｒｆｅｒｉｎｇ ＲＮＡｓ”， ＰＮＡＳ １００（１１）：６３４３−６３４６， ２００３； Ｖｉｃｋｅｒｓ ｅｔ ａｌ．， “Ｅｆｆｉｃｉｅｎｔ Ｒｅｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｔａｒｇｅｔ ＲＮＡｓ ｂｙ Ｓｍａｌｌ Ｉｎｔｅｒｆｅｒｉｎｇ ＲＮＡ ａｎｄ ＲＮａｓｅ Ｈ−ｄｅｐｅｎｄｅｎｔ Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ
Ａｇｅｎｔｓ”， Ｊ． Ｂｉｏｌ． Ｃｈｅｍ． ２７８： ７１０８−７１１８，
２００３；Ａｇａｍｉ、「ＲＮＡｉ ａｎｄ ｒｅｌａｔｅｄ ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ
ａｎｄ ｔｈｅｉｒ ｐｏｔｅｎｔｉａｌ ｕｓｅ ｆｏｒ ｔｈｅｒａｐｙ」、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｃｈｅｍ Ｂｉｏｌ．２００２年１２月；６（６）：８２９−３４；Ｌａｖｅｒｙら、「Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ａｎｄ ＲＮＡｉ：ｐｏｗｅｒｆｕｌ ｔｏｏｌｓ ｉｎ ｄｒｕｇ ｔａｒｇｅｔ ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ａｎｄ ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ」、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ Ｄｅｖｅｌ．２００３年７月；６（４）：５６１−９；Ｓｈｉ、「Ｍａｍｍａｌｉａｎ ＲＮＡｉ ｆｏｒ ｔｈｅ ｍａｓｓｅｓ」、Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｅｎｅｔ ２００３年１月；１９（１）：９−１２）、Ｓｈｕｅｙら、「ＲＮＡｉ：ｇｅｎｅ−ｓｉｌｅｎｃｉｎｇ ｉｎ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ｉｎｔｅｒｖｅｎｔｉｏｎ」、Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ Ｔｏｄａｙ ２００２年１０月；７（２０）：１０４０−１０４６；ＭｃＭａｎｕｓら、Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｇｅｎｅｔ ２００２年１０月；３（１０）：７３７−４７；Ｘｉａら、Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ２００２年１０月；２０（１０）：１００６−１０；Ｐｌａｓｔｅｒｋら、Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｇｅｎｅｔ Ｄｅｖ ２０００年１０月；１０（５）：５６２−７；Ｂｏｓｈｅｒら、Ｎａｔ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ ２０００年２月；２（２）：Ｅ３１−６；およびＨｕｎｔｅｒ、Ｃｕｒｒ Ｂｉｏｌ １９９９年６月１７日；９（１２）：Ｒ４４０−２）。
ＳＮＰの原因とされる病的状態（例えば、ＶＴ）を有する被験体は、遺伝的欠損を修正する（ｃｏｒｒｅｃｔ）ように処置され得る（Ｋｒｅｎら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９６：１０３４９−１０３５４（１９９９）を参照のこと）。そのような被験体は、その被験体から取り出された生物学的サンプル中の多型を検出し得る任意の方法によって同定され得る。そのような遺伝的欠損は、そのような被験体にＳＮＰの位置で正常／野生型ヌクレオチドを供給する修復配列を組み込んでいる核酸フラグメントを投与することによって、持続的に修正され得る。この部位特異的修復配列は、被験体のゲノムＤＮＡの内因性修復を促進するように作動するＲＮＡ／ＤＮＡオリゴヌクレオチドを含み得る。部位特異的修復配列は、適切なビヒクル（例えば、ポリエチレンイミンとの複合体）中で投与されるか、アニオン性リポソーム、ウイルスベクター（例えば、アデノウイルス）もしくは投与された核酸の細胞内取り込みを促進する他の薬学的組成物中にカプセル化される。次いで、キメラオリゴヌクレオチドが被験体のゲノムへの正常配列の取り込みを誘導するにつれて、先天的病理をもたらす遺伝的欠損が克服され得る。取り込みの際に、正常な遺伝子産物が発現され、置換が広められ、それによって、被験体の臨床状態の持続的修復および治療的増強が引き起こされる。
ｃＳＮＰが、病的状態の原因とされるかまたは病的状態の要因とされる改変タンパク質を生じる場合において、そのような状態を処置する方法は、その病理を有する被験体にその改変タンパク質の野生型同族体／正常同族体を投与する工程を包含し得る。一旦、有効な投薬レジメンで投与されると、野生型同族体は、病理状態の補完または改善を提供する。
本発明はさらに、ＶＴを処置するために使用され得る化合物または薬剤を同定するための方法を提供する。本明細書中で開示されるＳＮＰは、治療剤の同定および／または開発のための標的として有用である。治療剤または治療用化合物を同定するための方法は、代表的には、その薬剤または化合物がＳＮＰ含有核酸またはコードされる産物の活性および／または発現を調節する能力をアッセイする工程、そしてＳＮＰ含有核酸またはコードされる産物の所望でない活性または発現によって特徴付けられる障害を処置するために使用され得る薬剤または化合物を同定する工程を包含する。そのアッセイは、細胞ベースのシステムおよび細胞を含まないシステムで実施され得る。細胞ベースのアッセイは、目的の核酸分子を天然に発現する細胞、または特定の核酸分子を発現するように遺伝的に操作された組換え細胞を含み得る。
ＶＴ患者における改変遺伝子発現としては、例えば、ＳＮＰ含有核酸配列（例えば、ＳＮＰを含むｍＲＮＡ転写物分子に転写され得るＳＮＰを含み、順に改変タンパク質に翻訳され得る遺伝子）、または１以上のＳＮＰに起因して発現が変化する正常／野生型核酸配列（例えば、正常な転写物の発現レベルまたは発現パターンに影響を与えるＳＮＰを含み得る調節／制御領域）の発現のいずれかが挙げられ得る。
改変体遺伝子発現のためのアッセイは、核酸レベル（例えば、ｍＲＮＡレベル）、発現したタンパク質レベル、またはシグナル伝達経路に関連する対応化合物の直接アッセイを含み得る。さらに、シグナル伝達経路に応じてアップレギュレートもしくはダウンレギュレートする遺伝子の発現もまた、アッセイされ得る。この実施形態において、これらの遺伝子の調節領域は、レポーター遺伝子（例えば、ルシフェラーゼ）に対して作動可能に連結され得る。
改変体遺伝子発現の調節因子は、例えば、細胞が候補化合物／薬剤と接触され、そしてｍＲＮＡの発現が決定される方法において同定され得る。候補化合物の存在下でのｍＲＮＡの発現のレベルは、その候補化合物の非存在下でのｍＲＮＡの発現のレベルと比較される。次いで、候補化合物は、この比較に基づいて改変体遺伝子発現の調節因子として同定され得、そして本発明の１以上のＳＮＰに起因する改変体遺伝子発現（例えば、ＳＮＰ含有核酸の発現、または核酸分子の発現に影響を与える１以上のＳＮＰに起因する正常／野生型核酸分子の発現の変化のいずれか）によって特徴付けられる障害（例えば、ＶＴ）を処置するために使用され得る。ｍＲＮＡの発現が、候補化合物の非存在下よりもその存在下において統計的に有意に大きい場合、その候補化合物は、核酸発現の刺激物質として同定される。核酸発現が候補化合物の非存在下よりもその存在下において統計的に有意に小さい場合、その候補化合物は、核酸発現のインヒビターとして同定される。
本発明はさらに、標的として、改変体核酸発現を調節する遺伝子として薬物をスクリーニングすることを通して同定される化合物を使用して、ＳＮＰまたは関連する核酸ドメイン（例えば、触媒ドメイン、リガンド／基質結合ドメイン、調節／制御領域など）または遺伝子、あるいはコードされるｍＲＮＡ転写物を用いる処置方法を提供する。調節としては、核酸発現のアップレギュレーション（すなわち、活性化または作動化（ａｇｏｎｉｚａｔｉｏｎ））あるいはダウンレギュレーション（すなわち、抑制または拮抗化（ａｎｔａｇｏｎｉｚａｔｉｏｎ））のいずれかが挙げられ得る。
ｍＲＮＡ転写物およびコードされるタンパク質の発現は、野生型でも改変体でも、調節／制御エレメント（例えば、発現を調節するプロモーターまたは転写調節因子結合ドメイン）中の特定のＳＮＰ対立遺伝子に伴って個々に変更され得る。この状況において、処置方法および化合物は、本明細書中で議論されるように、改変体調節／制御エレメントを調節または克服し、それによって、野生型タンパク質もしくは改変タンパク質のいずれかの正常または健常な発現レベルを生じることを確認する。
本発明のＳＮＰ含有核酸分子はまた、臨床試験または処置レジメンにおいて、改変遺伝子またはコードされる産物の発現もしくは活性における化合物を調節することの有効性をモニタリングするのに有用である。従って、遺伝子発現パターンは、化合物（特に、患者が耐性を発達させ得る化合物）を用いる処置の有効性を持続させることについての指標、ならびに毒性についての指標として役立ち得る。遺伝子発現パターンはまた、その化合物に対して影響を受けた細胞の生理学的応答を示すマーカーとして役立ち得る。従って、そのようなモニタリングは、その化合物の投与の増加、または患者が耐性を生じていない代替の化合物の投与のいずれかを可能にする。同様に、核酸発現レベルが、望ましいレベルより低い場合、その化合物の投与は、相応に減少され得る。
本発明の別の局面において、薬学的パックが提供され、そのパックは、治療剤（例えば、低分子薬物、抗体、ペプチド、アンチセンス核酸分子またはＲＮＡｉ核酸分子など）、および本発明によって提供される１以上のＳＮＰもしくはＳＮＰハプロタイプについて診断的に試験されるヒトへの治療剤の投与のための指示書のセットを含む。
本発明のＳＮＰ／ハプロタイプはまた、薬物開発プロセスの多くの様々な局面を改良するのに有用である。例えば、本発明の一局面は、ＳＮＰ遺伝子型に基づく臨床試験のための個体を選択することを含む。例えば、薬物に対して陽性に応答しそうであることを示すＳＮＰ遺伝子型を有する個体は、その試験に含まれ得、一方、個体のＳＮＰ遺伝子型が、個体がその薬物に対してあまり応答しそうにないかまたは応答しないことを示すか、あるいは毒性作用または他の有害反応を羅患する危険性のある個体は、その臨床試験から除外され得る。このことは、臨床試験の安全性を改善し得るだけでなく、その試験が統計学的に有意な効力を示す機会を高め得る。さらに、本発明のＳＮＰは、特定の以前に開発された薬物が、臨床試験において不十分に実施された理由を説明し得、そして臨床試験において以前に不十分に実施された薬物から恩恵を受ける集団のサブセットを同定する一助となり、それによって、以前に開発された薬物を「救い」、そしてその薬物を、それから恩恵を受け得る特定のＶＴ患者集団に利用可能にする。
ＳＮＰは、薬物発見、薬物スクリーニング、および薬物開発において、多くの重要な用途を有する。潜在的な薬物標的として選択される任意の遺伝子／タンパク質について、その遺伝子／タンパク質の改変体が、患者集団中に存在するという高い確率が存在する。従って、治療剤の選択および送達における遺伝子／タンパク質の改変体の影響を決定することは、薬物発見および薬物開発プロセスの不可欠な局面であるべきである。（Ｊａｚｗｉｎｓｋａ，Ａ Ｔｒｅｎｄｓ Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｖａｒｉａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｇｅｎｏｍｉｃ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，２００２年３月；Ｓ３０−Ｓ３６）。
特定の治療標的（例えば、遺伝子、ｍＲＮＡ転写物、またはタンパク質）の改変体（例えば、ＳＮＰおよび任意の対応するアミノ酸多型）に関する知識は、改変体を超える効力を示す治療剤候補（例えば、低分子化合物、抗体、アンチセンス核酸化合物またはＲＮＡｉ核酸化合物など）を同定するために、改変体のパラレルスクリーニングを可能にする（Ｒｏｔｈｂｅｒｇ，Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ ２００１年３月；１９（３）：２０９−１１）。このような治療剤候補は、患者集団のより大きいセグメントにわたって等しい効力を示し、それによって、治療剤候補についてのより大きい潜在的な市場をもたらすことが期待される。
さらに、潜在的な治療標的の改変体を同定することは、その標的の最も一般的な形態が、治療剤候補の選択のために使用されることを可能にし、それによって、選択された候補物について観察される実験的な活性が、患者集団の最も大きい集団において期待される実際の活性を反映することを確認する一助となる（Ｊａｚｗｉｎｓｋａ，Ａ Ｔｒｅｎｄｓ
Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｖａｒｉａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｇｅｎｏｍｉｃ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，２００２年３月；Ｓ３０−Ｓ３６）。
さらに、標的の全ての公知の改変体に対して治療候補をスクリーニングすることは、特定の改変体に関連した潜在的毒性および有害な反応の早期同定を可能にし得る。例えば、治療標的または薬物代謝遺伝子におけるＳＮＰによって引き起こされる、例えば、薬物の吸収、分布、代謝および排出（ＡＤＭＥ）における変動性が同定され得、そしてこの情報は、薬物開発プロセスの間に利用されて、薬物の廃棄における変動性が最小にされ得、そして広範囲の患者集団にわたってより安全である治療薬剤が開発され得る。改変タンパク質および表１〜２に提供されるコード多型核酸分子を含め、本発明のＳＮＰは、当該分野で確立された種々の毒物学的方法（例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ
Ｔｏｘｉｃｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎ．Ｙ．に記載される方法）に関連して有用である。
さらに、当該分野で公知の任意のタンパク質（またはＲＮＡもしくはＤＮＡのいずれかの核酸分子）を標的とする治療薬剤は、表１に開示される改変タンパク質（または多型核酸分子）と交叉反応し得、それにより、薬物の薬物動態特性に顕著に影響を与え得る。その結果、表１〜２に開示されるタンパク質改変体およびＳＮＰ含有核酸分子は、対応する当該分野で公知のタンパク質形態（またはその核酸分子）を標的とする治療薬剤を開発、スクリーニングおよび評価する際に有用である。さらに、上記で考察されるように、特定の薬物標的の全ての多型形態の知識は、この薬物標的のこのような多型形態の大部分または全てに対して有効である治療薬剤の設計を可能にする。
（薬学的組成物およびその投与）
本明細書中に開示される任意のＶＴ関連タンパク質（およびコードする核酸分子）は、ＶＴおよび関連の病状を処置するための治療標的として用いられ得（またはそれ自体が治療用化合物として直接用いられ得）、そして本開示は、これらの治療標的のいずれかを標的とする（またはそれらから構成される）治療用化合物（例えば、低分子、抗体、治療タンパク質、ＲＮＡｉおよびアンチセンス分子など）が開発されることを可能にする。
一般に、治療用化合物は、類似の有用性を果たす薬剤についての受け入れられた投与形態のいずれかによって、治療有効量で投与される。本発明の治療用化合物の実際の量、すなわち、有効成分は、多数の要因（例えば、処置すべき疾患の重篤度、被験体の年齢および関連の健康状態、用いられる化合物の効力、投与経路および投与形態、ならびに他の要因）に依存する。
治療有効量の治療用化合物は、例えば、１日あたりレシピエントの体重１ｋｇあたり約０．０１〜５０ｍｇ（好ましくは約０．１〜２０ｍｇ／ｋｇ／日）の範囲であり得る。従って、一例として、７０ｋｇのヒトに対する投与については、投薬範囲は、最も好ましくは、１日あたり約７ｍｇ〜１．４ｇである。
一般に、治療用化合物は、以下の経路のうちの任意の１つによって薬学的組成物として投与される：経口投与、全身投与（例えば、経皮投与、鼻腔内投与または坐剤投与）、または非経口投与（例えば、筋肉内投与、静脈内投与または皮下投与）。好ましい投与様式は、苦痛の程度に従って調整され得る、従来の毎日の投薬レジメンを用いた、経口投与様式または非経口投与様式である。経口用組成物は、錠剤、丸剤、カプセル剤、半固体、散剤、徐放性処方物、液剤、懸濁剤、エリキシル剤、エアロゾル剤または任意の他の適切な組成物の形態を採り得る。
処方物の選択は、種々の要因（例えば、薬物の投与形態（例えば、経口投与については、錠剤、丸剤またはカプセル剤の形態の処方物が好ましい）および薬物物質のバイオアベイラビリティ）に依存する。近年、薬学的処方物は、表面積を増大させる、すなわち、粒子サイズを減少させることによってバイオアベイラビリティが増大し得るという原理に基づいて、より乏しいバイオアベイラビリティを示す薬物について特に開発されている。例えば、米国特許第４，１０７，２８８号は、活性な物質が高分子の架橋マトリクス上に保持される、１０ｎｍ〜１，０００ｎｍの〜サイズ範囲の粒子を有する薬学的処方物を記載する。米国特許第５，１４５，６８４号は、薬物物質が、表面モディファイヤの存在下でナノ粒子（４００ｎｍの平均粒子サイズ）まで粉砕され、次いで、液体媒体中に分散されて、顕著に高いバイオアベイラビリティを示す薬学的処方物が得られる、薬学的処方物の生産を記載する。
薬学的組成物は、一般に、少なくとも１つの薬学的に受容可能な賦形剤と組み合わせた治療用化合物から構成される。受容可能な賦形剤は、無毒性であり、投与を補助し、そしてこの治療用化合物の治療的利益に対して有害には影響を与えない。このような賦形剤は、任意の固体、液体、半固体、またはエアロゾル組成物の場合は気体の、当業者に一般的に入手可能である賦形剤であり得る。
固体の薬学的賦形剤としては、デンプン、セルロース、滑石、グルコース、ラクトース、スクロース、ゼラチン、麦芽、イネ、粉、チョーク、シリカゲル、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸ナトリウム、モノステアリン酸グリセロール、塩化ナトリウム、脱脂粉乳などが挙げられる。液体賦形剤および半固体賦形剤は、グリセロール、プロピレングリコール、水、エタノールおよび種々の油（石油起源、動物起源、植物起源もしくは合成起源の油（例えば、落花生油、大豆油、鉱油、胡麻油など）を含む）から選択され得る。（特に注射可能溶液用に）好ましい液体キャリアとしては、水、生理食塩水、水性デキストロースおよびグリコールが挙げられる。
圧縮ガスは、エアロゾル形態で本発明の化合物を分散させるために使用され得る。この目的で適切な不活性ガスは、窒素、二酸化炭素などである。
他の適切な薬学的賦形剤およびそれらの処方物は、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｅ．Ｗ．Ｍａｒｔｉｎ編（Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ，第１８版，１９９０）に記載される。
処方物中のその治療化合物の量は、当業者によって採用される十分な範囲内で変化し得る。代表的には、その処方物は、重量％（ｗｔ％）ベースで、処方物全体に基づいて、約０．０１〜９９．９９ｗｔ％の治療化合物を含み、そのバランスをとるものは、１種以上の適切な薬学的賦形剤である。好ましくは、その化合物は、約１〜８０ｗｔ％のレベルで存在する。
治療化合物は、単独で、または他の治療化合物もしくは１種以上の他の活性成分と組み合わせて投与され得る。例えば、ＶＴ関連タンパク質のインヒビターまたは刺激剤は、同じＶＴ関連タンパク質または異なるＶＴ関連タンパク質の活性を阻害するかまたは刺激する別の薬剤と組み合わせて投与されて、それによりＶＴの影響に対抗し得る。
薬理学に関するさらなる情報については、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ
Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．，Ｎ．Ｙ．を参照のこと。
（ヒト識別適用）
ＶＴおよび関連病態におけるそれらの診断および治療用途に加えて、本発明により提供されるＳＮＰはまた、法医学、親子鑑定、および生物測定法（例えば、Ｇｉｌｌ，「Ａｎ ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ ｏｆ ｔｈｅ ｕｔｉｌｉｔｙ ｏｆ ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ（ＳＮＰｓ） ｆｏｒ ｆｏｒｅｎｓｉｃ ｐｕｒｐｏｓｅｓ」，Ｉｎｔ Ｊ Ｌｅｇａｌ Ｍｅｄ．２００１；１１４（４−５）：２０４−１０を参照のこと）のような適用のためのヒト識別マーカーとして有用である。個体間の核酸配列における遺伝的変動は、個体を識別し、生物学的サンプルと個体とを識別するために遺伝マーカーとして使用され得る。どのヌクレオチドが個体におけるＳＮＰ位置のセットを占めるかという決定は、その個体を区別するＳＮＰマーカーのセットを識別する。分析されるＳＮＰ位置が多いほど、１個体におけるＳＮＰのセットが、関連しない個体におけるＳＮＰのセットと同じである確率は、低くなる。好ましくは、複数の部位が分析される場合、その部位は、連鎖していない（すなわち、独立して遺伝する）。従って、ＳＮＰの好ましいセットは、本明細書中に開示されるＳＮＰの中から選択され得、これらのＳＮＰとしては、異なる染色体上のＳＮＰ、異なる染色体アーム上のＳＮＰ、および／または同じ染色体アームに沿って実質的な距離だけ離れて分散されるＳＮＰが挙げられ得る。
さらに、本明細書中に開示されるＳＮＰの中でも、特定の法医学的適用／ヒト識別適用における使用に好ましいＳＮＰとしては、縮重コドン位置（すなわち、２以上の選択的ヌクレオチドのうちの１つであり得、同じアミノ酸をなおコードし得る特定のコドンにおける三番目の位置）に位置するＳＮＰが挙げられる。なぜなら、これらのＳＮＰは、コードされるタンパク質に影響を及ぼさないからである。そのコードされるタンパク質に影響を及ぼさないＳＮＰは、少ない選択圧下にあると予測され、よって、集団中でより多型性であると予測され、これは、代表的には、法医学適用／ヒト識別適用の利点である。しかし、特定の法医学適用／ヒト識別適用（例えば、ＤＮＡサンプルから表現型的特性を推測する（個体の家系を推論するかまたはその個体の１種以上の物理的特性を推論する））に関して、そのコードされるタンパク質に影響を及ぼすＳＮＰを利用することは望ましいことであり得る。
表１〜２（これは、「Ａｐｐｌｅｒａ」ＳＮＰソースと識別される）に開示されるＳＮＰの多くについては、表１〜２は、３９個体に由来する染色体のＤＮＡを再配列決定することによって得られたＳＮＰ対立遺伝子頻度を提供する（表１〜２はまた、「Ｃｅｌｅｒａ」ソースＳＮＰ、利用可能な場合、ｄｂＥＳＴ、ＨＧＢＡＳＥ、および／またはＨＧＭＤからの公的なＳＮＰについての対立遺伝子頻度情報を提供する）。表１〜２に提供されるその対立遺伝子頻度は、これらのＳＮＰが、ヒト識別適用のために容易に使用されるようにし得る。表１および／または表２に開示される任意のＳＮＰは、ヒト識別のために使用され得るが、特定のＳＮＰ部位における少数の対立遺伝子の頻度が、５０％に近くなるほど、そのＳＮＰが、集団中の異なる個体の間を区別する能力が大きくなる。なぜなら、２つの無作為に選択された個体が、そのＳＮＰ部位において異なる対立遺伝子を有する可能性は、興味深いことに高くなるからである。表１〜２に提供されるＳＮＰ対立遺伝子頻度を使用すると、当業者は、その少数の対立遺伝子の頻度が、例えば、少なくとも１％、２％、５％、１０％、２０％、２５％、３０％、４０％、４５％、または５０％であるか、あるいはその間の任意の他の頻度であるＳＮＰのサブセットを容易に選択し得る。従って、表１〜２は、３９個体に由来する染色体の再配列決定に基づいて対立遺伝子頻度を提供するので、ＳＮＰのサブセットは、ヒト識別について容易に選択され得、そのサブセットにおいて、特定のＳＮＰ部位における少数の対立遺伝子の総対立遺伝子数は、例えは、少なくとも１個、２個、４個、８個、１０個、１６個、２０個、２４個、３０個、３２個、３６個、３８個、３９個、４０個、またはその間の任意の他の数である。
さらに、表１〜２はまた、広い対立遺伝子頻度情報と合わせて個体群（民族群または人種群と本明細書中で交換可能にいわれる）情報を提供する。例えば、３９個体の群（ＤＮＡを再配列決定した）を、２０名の白人および１９名のアフリカ系アメリカ人で構成した。この個体群情報は、ヒト識別のためのＳＮＰ選択をさらに精緻にし得る。例えば、ヒト識別についての好ましいＳＮＰは、白人集団およびアフリカ系アメリカ人集団の両方において類似の対立遺伝子頻度を有する表１〜２から選択され得る；従って、例えば、両方の集団において等しく高い識別能を有するＳＮＰが選択され得る。あるいは、白人集団とアフリカ系アメリカ人集団との間で対立遺伝子頻度は統計学的に有意に異なる（極端な例として、特定の対立遺伝子が、白人個体群またはアフリカ系アメリカ人個体群のいずれかでのみ観察され得るが、他方の個体群においては観察されない）ＳＮＰが選択され得る；このようなＳＮＰは、例えば、ある犯罪現場で回収された生物学的サンプル（例えば、毛髪または血痕）から、未知の加害者の人種／民族を推定するために有用である。統計学的方法を含め、ＳＮＰを使用して、ＤＮＡサンプルから家系を推定するという議論については、Ｆｒｕｄａｋｉｓら、「Ａ Ｃｌａｓｓｉｆｉｅｒ ｆｏｒ ｔｈｅ ＳＮＰ−Ｂａｓｅｄ Ｉｎｆｅｒｅｎｃｅ ｏｆ Ａｎｃｅｓｔｒｙ」，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｆｏｒｅｎｓｉｃ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ ２００３；４８（４）：７７１−７８２を参照のこと。
ＳＮＰは、短い直列反復（ＳＴＲ）のような多型マーカーの他のタイプより多くの利点を有する。例えば、ＳＮＰは、容易にスコア付けされ得、自動化しやすく、このことにより、ＳＮＰは、大規模な法医学的データベースについて選択されたマーカーにされる。ＳＮＰは、反復多型よりもゲノム全体を通して遙かに多く見出される。２つの多型形態の集団頻度は、通常、複数対立遺伝子座における複数の多型形態のものよりも高い正確性で決定され得る。ＳＮＰは、反復多型よりも変異として安定である。ＳＮＰは、分析を妨害し得る人工産物（例えば、スタッターバンド（ｓｔｕｔｔｅｒ ｂａｎｄ））に感受性でない。スタッターバンドは、反復多型を分析する場合に頻繁に遭遇し、サンプル（例えば、多数の供給源に由来するＤＮＡの混合物を含み得る犯行現場サンプル）を分析する場合に、特に煩わしい。ＳＴＲマーカーを超えるＳＮＰマーカーの別の有意な利点は、ＳＮＰをスコア付けするために必要な核酸の長さがより短いことである。例えば、ＳＴＲマーカーは、一般に、長さが数百塩基対である。他方、ＳＮＰは、単一のヌクレオチド、一般には、プライマーおよび／またはプローブ結合のためのＳＮＰ位置のいずれかの側の短い保存領域を含む。これは、ＳＮＰを、ＤＮＡが、短い小片にフラグメント化され得る、法医学的ケースワークにおいて頻繁に遭遇する高度に分解した、または時間が経った生物学的サンプルにおける型決定により扱いやすくする。
ＳＮＰはまた、ＳＴＲ遺伝子座を分析する場合に頻繁に遭遇する微小改変体（ｍｉｃｒｏｖａｒｉａｎｔ）および「オフラダー（ｏｆｆ−ｌａｄｄｅｒ）」対立遺伝子になりにくい。微小改変体は、増幅されたＤＮＡ生成物のサイズを変化させる反復単位内の欠失または挿入であり、その結果、その増幅された生成物は、正常サイズの反復単位を有する参照対立遺伝子と同じ速度で移動しない。サイズによって（例えば、ポリアクリルアミドゲルでの電気泳動によって）分離される場合、微小改変体は、標準サイズの反復単位の参照対立遺伝子ラダーと整列しないが、むしろ、参照対立遺伝子の間に移動する。その参照対立遺伝子ラダーは、対立遺伝子分類のために対立遺伝子の正確なサイズ分けのために使用される；従って、参照対立遺伝子ラダーと整列しない対立遺伝子は、実質的な分析の問題をもたらす。さらに、複数対立遺伝子の反復多型を分析する場合、ときおり、その集団中であらかじめ認められるよりも多いかまたは少ない反復単位、あるいは参照対立遺伝子ラダーに含まれるよりも多いかまたは少ない反復単位からなる対立遺伝子が見出される。これらの対立遺伝子は、参照対立遺伝子ラダーにおける既知の対立遺伝子のサイズ範囲の外側に移動し、そのために、「オフラダー」対立遺伝子といわれる。極端な場合、その対立遺伝子は、ごく少数の反復しか含まないかまたは非常に多くの反復を含み得るので、それは、その参照対立遺伝子ラダーの範囲の十分外に移動する。この状況において、その対立遺伝子は、観察すらされないかもしれないか、または、多重分析を用ると、別の遺伝子座についてのサイズ範囲内にまたはそのサイズ範囲近くに移動し得、さらに分析を混乱させる。
ＳＮＰ分析は、ＳＴＲ分析において遭遇する微小改変体およびオフラダー対立遺伝子の問題を回避する。重要なことに、微小改変体およびオフラダー対立遺伝子は、顕著な問題を生じ得、そして特定の既知の対立遺伝子に特異的なオリゴヌクレオチドプローブを利用する、オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーションアレイのような分析法を使用する場合に、完全に見逃され得る。さらに、ＳＴＲ分析で遭遇するオフラダー対立遺伝子および微小改変体は、たとえ正しく型分類されたとしても、不適切な統計学的分析をもたらし得る。なぜなら、その集団中のそれらの頻度は、一般に、未知であるかまたは特徴付けが乏しく、よって、その適合する遺伝子型の統計学的有意性には疑問が残り得る。ＳＮＰ分析の全てのこれらの利点は、大部分のＤＮＡ識別例の結論（個体の終身刑、または死亡した個体の家族に対する遺体の再関連づけをもたらし得る）に鑑みて、注目に値する。
ＤＮＡは、生物学的サンプル（例えば、血液、骨、毛髪、唾液、または精液）から単離され得、特定のＳＮＰ位置における参照供給源からのＤＮＡと比較され得る。複数のＳＮＰマーカーは、適合している遺伝子型の識別能および統計学的有意性を増大させるために、同時にアッセイされ得る。例えば、オリゴヌクレオチドアレイは、多数のＳＮＰを同時に遺伝子型決定するために使用され得る。本発明により提供されるＳＮＰは、個体を識別するか、または特定の生物学的サンプルと個体を関連づけるために、他の多型遺伝マーカー（例えば、当該分野で公知の他のＳＮＰ）またはＳＴＲと組み合わせてアッセイされ得る。
さらに、本発明により提供されるＳＮＰは、ＤＮＡ遺伝子型のデータベース（例えば、犯罪者ＤＮＡデータバンク（例えば、ＦＢＩのＣｏｍｂｉｎｅｄ ＤＮＡ Ｉｎｄｅｘ Ｓｙｓｔｅｍ（ＣＯＤＩＳ）データベース））中に含めるために遺伝子型決定され得る。次いで、未知の供給源の生物学的サンプルから得られた遺伝子型が、適合している遺伝子型を見出すためにデータベースに対して問い合わせられ得、本発明のＳＮＰは、そこで既知のＤＮＡ配列および未知のＤＮＡ配列を同一性について比較するヌクレオチド位置を提供する。従って、本発明は、例えば、法医学的適用、生物測定法適用、または他のヒト識別適用において使用するために、本発明の新規なＳＮＰまたはＳＮＰ対立遺伝子を含むデータベース（例えば、そのデータベースは、集団の個々のメンバーが、本発明の１以上の新規なＳＮＰ部位において、どの対立遺伝子を保有するかを示す情報を含み得る）を提供する。このようなデータベースは、代表的には、本発明のＳＮＰまたはＳＮＰ対立遺伝子が、コンピューター読み取り可能な媒体（本明細書中の、標題「コンピューター関連実施形態」の節を参照のこと）上に記録される、コンピューターベースのシステムを含む。
本発明のＳＮＰはまた、親子鑑定において使用するためにアッセイされ得る。親子鑑定の目的は、通常、ある男性が子供の父親であるか否かを決定することである。大部分の例において、その子供の母親は、既知であり、よって、その子供の遺伝子型に対する母親の寄与が追跡され得る。親子鑑定は、その母親に帰さない子供の遺伝子型の一部が、推定の父親の遺伝子型と一致するか否かを調査する。親子鑑定は、その推定の父親およびその子供における多型のセットを分析することによって行われ得、本発明のＳＮＰは、ここで同一性についてその推定の父親および子供のＤＮＡ配列を比較するためのヌクレオチド位置を提供する。その父親に帰する、子供における多型のセットが、その推定の父親の多型のセットと適合しない場合、実験誤差を除いて、その推定の父親が、その子供の父親でないと結論づけられ得る。その父親に帰する子供における多型のセットが、推定の父親の多型のセットと適合する場合、統計学的計算は、偶然一致した適合の可能性、および推定の父親がその子供の真の生物学的父親であるという可能性に関して引き出される結論を決定するために行われ得る。
親子鑑定に加えて、ＳＮＰは、血族鑑定の他の型についても（例えば、移民目的の家族関係を確証するため、またはある個人が、死亡した個人からの相続を主張するために、その死亡した個人の血縁関係にあると主張する場合のため、など）に有用である。親子鑑定および他の型の血族鑑定についてのＳＮＰの有用性に関するさらなる情報に関しては、統計学的分析のための方法を含め、Ｋｒａｗｃｚａｋ，「Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｖｉｔｙ ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ ｆｏｒ ｂｉａｌｌｅｌｉｃ ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｓ」，Ｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ １９９９ Ｊｕｎ；２０（８）：１６７６−８１を参照のこと。
ヒト識別のための本発明のＳＮＰの用途は、生物測定系と一般にいわれる種々の鑑定システムにさらに拡張し、代表的には、ヒト（または他の生物）の物理的特性をデジタルデータに変換する。生物測定系は、このような独自の解剖学的または生理学的特性（人差し指、親指の指紋または掌紋；手の形状；手の甲側の静脈パターン；網膜の血管パターンならびに虹彩の色および外観；顔の特徴；声のパターン；サインおよびタイピングの強弱；ならびにＤＮＡとして）を測定する種々の技術的デバイスを含む。このような生理学的測定値は、同一性を確認し、例えば、その識別に基づいて、アクセスを制限または許容するために使用され得る。生物測定法のための適用の例としては、物理的区域のセキュリティー、コンピューターおよびネットワークのセキュリティー、航空機乗客のチェックインおよび搭乗手続、金銭取引、医療記録アクセス、政府機関配電、投票、法執行、パスポート、査証および入国管理、刑務所、種々の軍事的用途、ならびに高価なもしくは危険な品物（例えば、自動車もしくは銃）へのアクセス制限目的（例えば、Ｏ’Ｃｏｎｎｏｒ，Ｓｔａｎｆｏｒｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｌａｗ Ｒｅｖｉｅｗおよび米国特許第６，１１９，０９６号を参照のこと）が挙げられる。
ＳＮＰ（特に、本発明によって提供されるＳＮＰ）の群は、生物測定法適用（例えば、上記のもの）のために個体を固有に識別するために、分類され得る。このようなＳＮＰ分類は、例えば、ＤＮＡチップ／アレイを用いて、達成され得る。好ましくは、ＤＮＡサンプルを取得するための最小限に侵襲性の手段が利用される。例えば、ＰＣＲ増幅により、頬内のぬぐい液または指紋（これらは、ＤＮＡ含有皮膚細胞および接触する間に自然に移った油を含む）から、分析に十分な量のＤＮＡを得られるようになる。法医学的／ヒト識別適用においてＳＮＰを使用するための技術に関するさらなる情報は、例えば、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（２００２），１４．１−１４．７に見出され得る。
（改変タンパク質、抗体、ベクターおよび宿主細胞、ならびにその使用）
（ＳＮＰ含有核酸分子によりコードされる改変タンパク質）
本発明は、ＳＮＰ含有核酸分子を提供し、その多くは、当該分野で公知の（すなわち、野生型）タンパク質と比較して、改変体アミノ酸配列をコードするタンパク質をコードする。本発明の多型核酸分子によりコードされるアミノ酸配列は、表１において配列番号１２６〜２５０として言及され、そして配列表で提供される：これらの改変体は、一般に、本発明の改変タンパク質／ペプチド／ポリペプチド、または多型タンパク質／ペプチド／ポリペプチドといわれる。用語「タンパク質」、「ペプチド」、および「ポリペプチド」は、交換可能に本明細書中で使用される。
本発明の改変タンパク質は、例えば、本明細書中に開示されるｃＳＮＰ位置のいずれか１つにおいて非類似のヌクレオチド置換によってコードされ得る。さらに、改変タンパク質はまた、発現、構造、および／または機能が本明細書中で開示されるＳＮＰ（例えば、終止コドンを作り出すまたは破壊するＳＮＰ、スプライシングに影響を及ぼすＳＮＰ、および制御エレメント／調節エレメント（例えば、プロモーター、エンハンサー、または転写因子結合ドメイン）におけるＳＮＰ）によって改変されるタンパク質が挙げられ得る。
本明細書中で使用される場合、タンパク質またはペプチドは、細胞物質も化学的前駆物質も他の化学物質も実質的に含まない場合に、「単離される」または「精製される」といわれる。本発明の改変タンパク質は、均質にまで、または他のより低い純度まで精製され得る。精製のレベルは、意図される用途に基づく。その重要な特徴は、その調製物が、他の成分のかなりの量が存在しても、改変タンパク質の望ましい機能を与えることである。
本明細書中で使用される場合、「細胞物質を実質的に含まない」とは、約３０％（乾燥重量で）の他のタンパク質（すなわち、夾雑タンパク質）、約２０％未満の他のタンパク質、約１０％未満の他のタンパク質、または約５％未満の他のタンパク質を有する、その改変タンパク質の調製物を包含する。その改変タンパク質が組換え生成される場合、それはまた、培養培地を実質的に含まないことであり得る（すなわち、培養培地は、そのタンパク質調製物の容量の約２０％未満を表す）。
語句「化学前駆物質も他の化学物質も実質的に含まない」は、改変タンパク質の合成に関与する化学前駆物質または他の化学物質から分離されている、その改変タンパク質の調製物を包含する。一実施形態において、語句「化学前駆物質も他の化学物質も実質的に含まない」は、約３０％（乾燥重量で）未満の化学前駆物質もしくは他の化学物質または約２０％未満の化学前駆物質もしくは他の化学物質、約１０％未満の化学前駆物質または他の化学物質、または約５％未満の化学前駆物質もしくは他の化学物質を有する、その改変タンパク質の調製物を包含する。
単離された改変タンパク質は、その改変タンパク質を天然に発現する細胞から精製され得るか、これを発現するように改変された細胞（組換え宿主細胞）から精製され得るか、または公知のタンパク質合成方法を使用して合成され得る。例えば、ＳＮＰを含有する、改変タンパク質をコードする核酸分子は、発現ベクターにクローニングされ得、その発現ベクターは、宿主細胞に導入され得、およびその改変タンパク質は、その宿主細胞において発現され得る。次いで、その改変タンパク質は、標準的なタンパク質精製技術を使用して、任意の適切な精製スキームによってその細胞から単離され得る。これらの技術の例は、以下に詳細に記載される（Ｓａｍｂｒｏｏｋ ａｎｄ Ｒｕｓｓｅｌｌ，２０００，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ）。
本発明は、本発明のＳＮＰを含む１以上のコドンによってコードされる１以上の改変体アミノ酸を含むアミノ酸配列を含むか、またはこれらからなるか、またはこれらから本質的になる単離された改変タンパク質を提供する。
従って、本発明は、表１および／または表２に提供されるＳＮＰによってコードされる１以上のアミノ酸多型（または終止コドンの生成または破壊にそれぞれ起因する、短縮または伸長）を含むアミノ酸配列からなる改変タンパク質を提供する。タンパク質は、そのアミノ酸配列は、そのタンパク質のアミノ酸配列全体である場合に、アミノ酸配列からなる。
本発明は、表１および／または表２に提供されるＳＮＰによってコードされる１以上のアミノ酸多型（または終止コドンの生成もしくは破壊にそれぞれ起因する、短縮もしくは伸長）を含むアミノ酸配列から本質的になる改変タンパク質をさらに提供する。タンパク質は、アミノ酸配列が、最終的なタンパク質中にわずか数個のさらなるアミノ酸残基とともに存在する場合、このようなアミノ酸配列から本質的になる。
本発明は、表１および／または表２に提供されるＳＮＰによってコードされる１以上のアミノ酸多型（または終止コドンの生成または破壊にそれぞれ起因する短縮または伸長）を含むアミノ酸配列を含む改変タンパク質をさらに提供する。タンパク質は、アミノ酸配列が、そのタンパク質の最終的なアミノ酸配列の少なくとも一部である場合に、そのアミノ酸配列を含む。このようにして、そのタンパク質は、その改変体アミノ酸配列のみを含んでいてもよいし、さらなるアミノ酸残基（例えば、そのタンパク質と天然に関連しているか、または異種アミノ酸残基である、連続したコードされる配列）を有していてもよい。このようなタンパク質は、数個のさらなるアミノ酸残基を有し得るか、または多くのさらなるアミノ酸を含み得る。これらのタンパク質のどの程度種々の型が作製されかつ単離され得るかの簡単な説明は、以下に提供される。
本発明の改変タンパク質は、キメラタンパク質または融合タンパク質を形成するために、異種配列に結合され得る。このようなキメラタンパク質および融合タンパク質は、改変タンパク質に実質的に相同でないアミノ酸配列を有する異種タンパク質に作動可能に連結されたその改変タンパク質を含む。「作動可能に連結される」とは、その改変タンパク質およびその異種タンパク質についてのコード配列が、インフレームで連結されることを示す。その異種タンパク質は、その改変タンパク質のＮ末端またはＣ末端に融合され得る。別の実施形態において、その融合タンパク質は、自動化ＤＮＡ合成機を含む従来の技術によって合成される融合ポリヌクレオチドによってコードされる。あるいは、遺伝子フラグメントのＰＣＲ増幅は、２つの連続した遺伝子フラグメントの間に相補的な突出部（ｏｖｅｒｈａｎｇ）を生じる別のプライマーを使用して行われ得、これらのフラグメントは、その後、キメラ遺伝子配列を生成するためにアニールおよび再増幅され得る（Ａｕｓｕｂｅｌら，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，１９９２を参照のこと）。さらに、多くの発現ベクターが、市販されており、これらはすでに融合部分（例えば、ＧＳＴタンパク質）をコードしている。改変タンパク質をコードする核酸は、その融合部分がその改変タンパク質にインフレームで連結されるように、このような発現ベクターにクローニングされ得る。
多くの場合、その融合タンパク質は、その改変タンパク質の活性に影響を及ぼさない。その融合タンパク質としては、酵素融合タンパク質（例えば、β−ガラクトシダーゼ融合物）、酵母ツーハイブリッドＧＡＬ融合物、ポリ−Ｈｉｓ融合物、ＭＹＣタグ化融合物、ＨＩタグ化融合物およびＩｇ融合物が挙げられるが、これらに限定されない。このような融合タンパク質（特に、ポリ−Ｈｉｓ融合物）は、組換え発現後のそれらの精製を容易にし得る。特定の宿主細胞（例えば、哺乳動物宿主細胞）において、タンパク質の発現および／または分泌は、異種シグナル配列を使用することで増大され得る。融合タンパク質は、例えば、Ｔｅｒｐｅ，「Ｏｖｅｒｖｉｅｗ ｏｆ ｔａｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ｆｕｓｉｏｎｓ：ｆｒｏｍ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ａｎｄ ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ ｆｕｎｄａｍｅｎｔａｌｓ ｔｏ ｃｏｍｍｅｒｃｉａｌ ｓｙｓｔｅｍｓ」，Ａｐｐｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００３ Ｊａｎ；６０（５）：５２３−３３．Ｅｐｕｂ ２００２ Ｎｏｖ ０７；Ｇｒａｄｄｉｓら，「Ｄｅｓｉｇｎｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｔｈａｔ ｗｏｒｋ ｕｓｉｎｇ ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ」，Ｃｕｒｒ Ｐｈａｒｍ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００２ Ｄｅｃ；３（４）：２８５−９７；およびＮｉｌｓｓｏｎら，「Ａｆｆｉｎｉｔｙ ｆｕｓｉｏｎ ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｆｏｒ ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ，ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ，ａｎｄ
ｉｍｍｏｂｉｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ ｐｒｏｔｅｉｎｓ」，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｘｐｒ Ｐｕｒｉｆ．１９９７ Ｏｃｔ；１１（１）：１−１６にさらに記載される。
本発明はまた、本発明の改変体ポリペプチドのさらに明らかな改変体（例えば、天然に存在する成熟形態（例えば、対立遺伝子改変体）、天然に存在しない組換え由来改変体、ならびに配列相同性を共有するこのようなタンパク質のオルソログおよびパラログ）に関する。このような改変体は、組換え核酸技術およびタンパク質生化学の分野における分野で公知の技術を使用して容易に生成され得る。しかし、改変体は、本発明より前の先行技術において公知であるものを除くことが理解される。
表１に開示される改変体ポリペプチドのさらなる改変体は、表１に開示されるアミノ酸配列（またはそれらのフラグメント）と少なくとも７０〜８０％、８０〜８５％、８５〜９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を共有し、かつ表１に開示される新規なアミノ酸残基（対立遺伝子）（新規ＳＮＰ対立遺伝子によってコードされる）を含むアミノ酸配列を包含し得る。従って、本発明の一局面は、表１に示されるポリペプチド配列と比較して、ある程度の配列の変化を有するが、本明細書中に開示される新規ＳＮＰ対立遺伝子によってコードされる新規アミノ酸残基（対立遺伝子）を含む、ポリペプチドを具体的に企図する。言い換えると、ポリペプチドが本明細書中に開示される新規なアミノ酸残基を含む限りにおいて、その新規なアミノ酸残基に隣接するポリペプチドの他の部分は、表１に示されるポリペプチド配列からある程度変化し得る。
本明細書中に開示されるアミノ酸配列のうちの１つを含むタンパク質の全長の予めプロセシングされた形態、ならびに成熟プロセシング形態は、本発明の改変タンパク質のうちの１つに対して完全な配列同一性を有し、本明細書中に提供される改変タンパク質と同じ遺伝子座によってコードされると容易に同定され得る。
改変体ペプチドのオルソログは、改変体ペプチドの少なくとも一部に対してある程度有意な配列相同性／同一性を有し、別の生物に由来する遺伝子によってコードされると容易に同定され得る。好ましいオルソログは、ヒト治療標的および因子の開発のために、非ヒト哺乳動物（好ましくは、霊長類）から単離される。このようなオルソログは、そのオルソログタンパク質を生じる２つの生物の関連性の程度に依存して、中程度からストリンジェントな条件下で、改変体ペプチドコード核酸分子にハイブリダイズする核酸配列によってコードされ得る。
改変タンパク質としては、本発明のＳＮＰによって引き起こされる、アミノ酸配列における欠失、付加および置換を含むタンパク質が挙げられるが、これらに限定されない。１つのクラスの置換は、ポリペプチド中の所定のアミノ酸が類似の特性の別のアミノ酸で置換される、保存的アミノ酸置換である。代表的な保存的置換は、脂肪族アミノ酸の中では、Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、およびＩｌｅの１つを別のアミノ酸で置換すること；ヒドロキシル残基ＳｅｒとＴｈｒとの交換；酸性残基ＡｓｐとＧｌｕとの交換；アミド残基ＡｓｎとＧｌｎとの間の置換；塩基性残基ＬｙｓとＡｒｇとの交換；ならびに芳香族残基ＰｈｅとＴｙｒとの置換である。どのアミノ酸変化が表現系的にサイレントであり得るかに関してのガイダンスは、例えば、Ｂｏｗｉｅら，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４７：１３０６−１３１０（１９９０）において見出される。
改変タンパク質は、１つ以上の活性（例えば、別の分子に結合する能力、基質に触媒作用を及ぼす能力、シグナル伝達を媒介する能力など）において十分に機能的であり得るか、またはこれらの活性において機能を欠き得る。十分に機能的な改変体は、代表的には、保存的改変または重要でない残基または重要でない領域における改変を含む。機能的な改変体はまた、機能において何の変化ももたらさないか、またはわずかな変化しかもたらさない、類似のアミノ酸の置換を含み得る。あるいは、このような置換は、ある程度まで、機能に正にまたは負に影響を及ぼし得る。非機能的改変体は、代表的には、１つ以上の非保存的アミノ酸置換、欠失、挿入、逆位、短縮もしくは伸長、または重要な残基もしくは重要な領域における置換、挿入、逆位、もしくは欠失を含む。
タンパク質の機能のために必要不可欠なアミノ酸は、当該分野で公知の方法（例えば、部位特異的突然変異誘発またはアラニン走査突然変異誘発（Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４４：１０８１−１０８５（１９８９）））によって、特に、表１に提供されるアミノ酸配列および多型情報を用いて同定され得る。後者の手順は、分子中の全ての残基において単一のアラニン変異を誘発する。次いで、生じる変異体分子は、生物活性（例えば、酵素活性）について試験されるか、またはアッセイ（例えば、インビトロ増殖活性）で試験される。結合パートナー／基質結合について重要な部位はまた、構造分析（例えば、結晶化、核磁気共鳴または光アフィニティーラベリング）によって決定され得る（Ｓｍｉｔｈら、Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．２２４：８９９−９０４（１９９２）；ｄｅ
Ｖｏｓら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５５：３０６−３１２（１９９２））。
ポリペプチドは、２０種の天然に生ずるアミノ酸と一般的に言われる２０種のアミノ酸以外のアミノ酸を含み得る。さらに、多くのアミノ酸（末端アミノ酸を含む）は、天然のプロセス（例えば、プロセシングおよび他の翻訳後修飾）によって、または当該分野で周知の化学的修飾技術によって修飾され得る。従って、本発明の変異タンパク質はまた、誘導体またはアナログを含み、この誘導体またはアナログにおいては、置換されたアミノ酸残基は、遺伝暗号によってコードされるものでないか、置換基が含まれるか、成熟ポリペプチドが別の化合物（例えば、ポリペプチドの半減期を増加させる化合物（例えば、ポリエチレングリコール））と融合されるか、または、さらなるアミノ酸がこの成熟ポリペプチド（例えば、リーダー配列もしくは分泌配列またはこの成熟ポリペプチドの精製のための配列あるいはプロタンパク質配列）に融合される。
公知のタンパク質修飾としては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：アセチル化、アシル化、ＡＤＰリボシル化、アミド化、フラビンの共有結合、ヘム部分の共有結合、ヌクレオチドまたはヌクレオチド誘導体の共有結合、脂質または脂質誘導体の共有結合、ホスファチジルイノシトールの共有結合、架橋、環化、ジスルフィド結合形成、脱メチル化、共有結合架橋の形成、シスチンの形成、ピログルタメートの形成、ホルミル化、γカルボキシル化、グリコシル化、ＧＰＩアンカー形成、ヒドロキシル化、ヨウ素化、メチル化、ミリストイル化、酸化、タンパク質分解プロセシング、ホスホリル化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸化、タンパク質へのアミノ酸の転移ＲＮＡ媒介性付加（例えば、アルギニル化）、およびユビキチン化。
このようなタンパク質修飾は、当業者に周知であり、科学文献に非常に詳細に記載されている。いくつかの特に一般的な修飾、グリコシル化、脂質結合、硫酸化、グルタミン酸残基のγカルボキシル化、ヒドロキシル化およびＡＤＰリボシル化は、例えば、以下の最も基本的な教科書に記載される：例えば、Ｐｒｏｔｅｉｎｓ−Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ，第２版，Ｔ．Ｅ．Ｃｒｅｉｇｈｔｏｎ，Ｗ．Ｈ．Ｆｒｅｅｍａｎ ａｎｄ Ｃｏｍｐａｎｙ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９９３）；Ｗｏｌｄ，Ｆ．，Ｐｏｓｔｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ Ｃｏｖａｌｅｎｔ Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ，Ｂ．Ｃ．Ｊｏｈｎｓｏｎ（編），Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ １−１２（１９８３）；Ｓｅｉｆｔｅｒら，Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１８２：６２６−６４６（１９９０）；およびＲａｔｔａｎら，Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．６６３：４８−６２（１９９２）。
本発明は、変異タンパク質のフラグメントをさらに提供する。このフラグメントは、本明細書中に開示される１つ以上のＳＮＰによってコードされる、１つ以上のアミノ酸配列改変体（例えば、置換、または停止コドンの作製もしくは破壊に起因する切断または伸長）を含む。しかし、本発明が関係するフラグメントは、本発明の前の先行技術で開示されているフラグメントを包含するようには解釈されない。
本明細書中で使用される場合、フラグメントは、改変タンパク質由来の、少なくとも約４、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１２、少なくとも約１４、少なくとも約１６、少なくとも約１８、少なくとも約２０、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約５０、少なくとも約１００（もしくは合間の任意の他の数）またはそれ以上連続するアミノ酸残基を含み得る。ここで、少なくとも１つのアミノ酸残基（例えば、本発明によって提供されるｃＳＮＰ位での非同義ヌクレオチド置換によってコードされる改変体アミノ酸残基）は、本発明のＳＮＰによって影響を受ける。ｃＳＮＰによってコードされる改変体アミノ酸は、フラグメントの配列に沿って任意の残基位置を占め得る。このようなフラグメントは、改変タンパク質の１つ以上の生物活性を保持する能力、または機能を行う（例えば、免疫原として作用する）能力に基づいて選択され得る。特別に重要なフラグメントは、生物活性フラグメントである。このようなフラグメントは、代表的には、本発明の改変タンパク質のドメインもしくはモチーフ（例えば、活性部位、膜貫通ドメイン、またはリガンド／基質結合ドメイン）を含む。他のフラグメントとしては、ドメイン含有フラグメントまたはモチーフ含有フラグメント、可溶性ペプチドフラグメント、および免疫原構造を含むフラグメントが挙げられるが、これらに限定されない。予想されるドメインおよび機能的部位は、当業者に周知のコンピュータープログラムによって容易に同定可能である（例えば、ＰＲＯＳＩＴＥ分析）（Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（２００２））。
（改変タンパク質の使用）
本発明の改変タンパク質は、種々の方法で使用され得る以下が挙げられるが、これらに限定されない：改変タンパク質の生物活性を決定するためのアッセイ（例えば、高処理能力スクリーニングのための複数タンパク質の一団におけるアッセイ）において使用され得る；抗体を産生させるか、または別の型の免疫応答を誘発するため使用され得る；生体液中の改変タンパク質（またはその結合パートナー）のレベルを定量的に決定するために設計されたアッセイにおける試薬（標識された試薬を含む）として使用され得る；細胞または組織に対するマーカーとして（この細胞または組織において、このマーカーは、（構成的に、または組織分化もしくは組織発生の特定の段階で、あるいは疾患状態でのいずれかで）優先的に発現される）；治療剤のスクリーニングのための標的として使用され得る；およびヒト被験体に投与される直接的治療剤として使用され得る。本明細書中に開示される任意の改変タンパク質は、研究用製品としての商品化のために試薬等級またはキット型へと開発され得る。上記で列挙された用途を実行するための方法は、当業者に周知である（例えば、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ，２０００，ならびにＭｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ：Ｇｕｉｄｅ ｔｏ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｂｅｒｇｅｒ，Ｓ．Ｌ．およびＡ．Ｒ．Ｋｉｍｍｅｌ（編），１９８７を参照のこと）。
本発明の特定の実施形態において、本発明の方法は、本明細書中に開示される１つ以上の改変タンパク質の検出を含む。改変タンパク質は、配列番号１２６〜２５０として、表１および配列表に開示される。このようなタンパク質の検出は、例えば、抗体、低分子化合物、アプタマー、リガンド／基質、他のタンパク質もしくはタンパク質フラグメント、または他のタンパク質結合剤を用いて達成され得る。好ましくは、タンパク質検出剤は、本発明の改変タンパク質に特異的であり、従って、本発明の改変タンパク質と野生型のタンパク質または別の改変体形態との間を識別し得る。これは、一般的には、例えば、改変タンパク質と野生型タンパク質との間で異なるタンパク質の領域（例えば、本発明の非同義ｃＳＮＰによってコードされた１つ以上のアミノ酸置換を含む、タンパク質の領域、または、停止コドンを作製し、それによってより短いポリペプチドをもたらすナンセンス改変体型ＳＮＰに従うタンパク質の領域、または、停止コドンを破壊し、それによってより長いポリペプチドをもたらす読み通し改変体型ＳＮＰに従うタンパク質の領域（ここで、このポリペプチドの部分は、このポリペプチドのうちの１つのバージョンでは存在するが、他のバージョンでは存在しない））に結合する検出薬剤を選択するか、または設計することによって達成され得る。
本発明の別の特定の局面において、本発明の改変タンパク質は、ヒトにおいて、ＶＴを診断するための、またはＶＴに対する素因を決定するための標的として使用される。従って、本発明は、細胞、組織、または生体における本発明の１つ以上の改変タンパク質の存在もしくはレベルを検出するための方法を提供する。このような方法は、代表的には、試験サンプルと薬剤（例えば、抗体、低分子化合物、またはペプチド）とを接触させる工程を包含する。この薬剤は、改変タンパク質と相互作用することが可能であり、その結果、改変タンパク質への薬剤の特異的な結合が検出され得る。このようなアッセイは、単一検出フォーマットまたはアレイのような複数検出形式（例えば、抗体アレイまたはアプタマーアレイ（タンパク質検出のためのアレイはまた、「タンパク質チップ」とも呼べれ得る））で提供され得る。目的の改変タンパク質は、試験サンプルから単離され得、そして本発明によって開示される１つ以上のＳＮＰによってコードされた改変体アミノ酸配列の存在についてアッセイされ得る。このＳＮＰは、タンパク質および対応するタンパク質機能／活性に対して、（例えば、アミノ酸の置換、欠失、挿入および／もしくは再配列をもたらし得るタンパク質コード領域における非同義置換；停止コドンの形成もしくは破壊；またはプロモーターのような制御要素の変更を介して）変化を引き起こし得る。ＳＮＰはまた、非適切な翻訳後修飾をもたらし得る。
サンプルにおける改変タンパク質を検出するための１つの好ましい薬剤は、タンパク質の改変体形態に選択的に結合することが可能な抗体である（抗体は、次節でより詳細に記載される）。このようなサンプルとしては、例えば、被験体から単離された組織、細胞、および生体液、ならびに被験体内に存在する組織、細胞、および液体が挙げられる。
本明細書中に開示されるＶＴに関連する改変タンパク質およびそのフラグメントの検出のためのインビトロ法としては、酵素結合イムノソルベントアッセイ（ＥＬＩＳＡ）、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、ウエスタンブロット法、免疫沈降、免疫蛍光、およびタンパク質アレイ／チップ（例えば、抗体またはアプタマーのアレイ）が挙げられるが、これらに限定されない。イムノアッセイおよび関連するタンパク質検出法に関するさらなる情報については、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．，およびＨａｇｅ，「Ｉｍｍｕｎｏａｓｓａｙｓ」，Ａｎａｌ Ｃｈｅｍ．１９９９ Ｊｕｎ １５；７１（１２）：２９４Ｒ−３０４Ｒを参照のこと。
アミノ酸改変体を検出するさらなる分析法としては、電気泳動移動度の変化、トリプシンペプシド消化の変化、細胞ベースのまたは細胞フリーのアッセイにおけるタンパク質活性の変化、リガンドまたは抗体結合パターンにおける変化、等電点の変化、および直接アミノ酸シークエンシングが挙げられるが、これらに限定されない。
あるいは、改変タンパク質は、改変タンパク質に特異的な標識抗体（または他の型の検出試薬）を被験体に導入することによって、その被験体においてインビボで検出され得る。例えば、この抗体は、放射性マーカーで標識され得る。被験体におけるこの放射性マーカーの存在および位置は、標準画像化技術によって検出され得る。
本発明の改変タンパク質の他の使用は、そのタンパク質の分類または作用に基づく。例えば、ヒトから単離されたタンパク質およびそれらの哺乳動物相同分子種は、特に、このタンパク質を発現する細胞または組織における生物学的応答または病理学的応答を調節するための治療用途での使用のための薬剤（例えば、低分子薬または抗体）を同定するための標的として作用する。薬学的薬剤は、タンパク質活性を調節するように開発され得る。
遺伝子発現を調節するための代替物として、治療化合物が、タンパク質機能を調節するように開発され得る。例えば、本明細書中に開示される多くのＳＮＰ（例えば、非同義ｃＳＮＰおよびナンセンス変異型ＳＮＰ）は、コードされたタンパク質のアミノ酸配列に影響を与える。コードされたアミノ酸配列におけるこのような変化は、特に、このようなアミノ酸配列改変体が機能的タンパク質ドメイン（例えば、触媒ドメイン、ＡＴＰ結合ドメイン、またはリガンド／基質結合ドメイン）において起こる場合、タンパク質機能に影響を与え得る。機能的ドメインにアミノ酸配列の変化を有する改変タンパク質が、病理学的状態を引き起こし得るか、または病状学的状態に影響を与え得るということは当該分野で確立されている。このような例において、化合物（例えば、低分子薬または抗体）は、改変タンパク質を標的にするように開発され得、そしてタンパク質機能／活性を調節（例えば、アップレギュレーションまたはダウンレギュレーション）し得る。
本発明の治療方法は、本発明の１つ以上の改変タンパク質を標的にする方法をさらに含む。改変タンパク質は、例えば、低分子化合物、抗体、アプタマー、リガンド／基質、他のタンパク質、または他のタンパク質結合剤を用いて、標的され得る。さらに、当業者は、表１に開示される新規のタンパク質改変体（および多型核酸分子）が、対応する当該分野で公知のタンパク質（またはｍＲＮＡ分子のような核酸分子）の競合的インヒビターとして作用することによって、それら自身で治療剤として直接的に使用され得ることを認識する。
本発明の改変タンパク質は、薬物スクリーニングアッセイ、細胞ベース系または細胞フリー系において特に有用である。細胞ベース系は、タンパク質を自然に発現する、生検標本、または細胞培養物細胞を利用し得る。１つの実施形態において、細胞ベースのアッセイは、改変タンパク質を発現する組換え宿主細胞を含む。細胞フリーのアッセイは、改変タンパク質またはその改変タンパク質をコードする対応するＳＮＰ含有核酸フラグメントに直接結合する化合物の能力を検出するために使用され得る。
本発明の改変タンパク質、およびその適切なフラグメントは、高処理能力スクリーニングアッセイにおいて使用され、この改変タンパク質を結合する能力および／またはこの改変タンパク質の活性を調節する能力について候補化合物を試験し得る。これらの候補化合物は、正常機能（例えば、野生型／非改変タンパク質）を有するタンパク質に対してさらにスクリーニングされ、タンパク質活性に対する化合物の効果をさらに決定し得る。さらに、これらの化合物は、インビボ活性／有効性を決定するために、動物系または無脊椎動物系において試験され得る。化合物は、この改変タンパク質を活性化する（アゴニスト）か、または不活性化（アンタゴニスト）すると同定され得、そして異なる化合物は、この改変タンパク質の種々の程度の活性化または不活性化を引き起こすと同定され得る。
さらに、改変タンパク質は、この改変タンパク質とこのタンパク質と正常に相互作用する標的分子との間の相互作用を刺激するか、または阻害する能力について化合物をスクリーニングするために使用され得る。標的は、リガンド、基質、またはこのタンパク質が正常に相互作用する結合パートナー（例えば、エピネフリンまたはノルエピネフリン）であり得る。このようなアッセイは、代表的に、改変タンパク質またはそのフラグメントをこの標的分子と相互作用させ、そしてこのタンパク質とこの標的との間の複合体の形成を検出するか、またはこの改変タンパク質とこの標的との相互作用の生化学的因果関係（例えば、シグナル伝達の任意の関連する効果）を決定することを可能にする条件下で、この改変タンパク質と候補化合物とを組み合わせる工程を包含する。
候補化合物としては、例えば、以下が挙げられる：１）可溶性ペプチドのようなペプチド（Ｉｇテイル融合ペプチド、ならびにランダムペプチドライブラリーのメンバー（例えば、Ｌａｍら，Ｎａｔｕｒｅ ３５４：８２−８４（１９９１）；Ｈｏｕｇｈｔｅｎら，Ｎａｔｕｒｅ ３５４：８４−８６（１９９１）を参照のこと）、およびＤ−立体配置アミノ酸および／またはＬ−立体配置アミノ酸から作製されるコンビナトリアルケミストリー由来の分子ライブラリーのメンバーを含む）；２）リンペプチド（例えば、ランダムかつ部分的に変性した、リンペプチドライブラリーに指向するメンバー（例えば、Ｓｏｎｇｙａｎｇら，Ｃｅｌｌ ７２：７６７−７７８（１９９３）を参照のこと））；３）抗体（例えば、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、抗イディオタイプ抗体、キメラ抗体、および単鎖抗体、ならびにＦａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ発現ライブラリーフラグメント、および抗体のエピトープ結合フラグメント）；そして４）有機低分子および無機低分子（例えば、コンビナトリアルライブラリーおよび天然産物ライブラリーから得られる分子）。
１つの候補化合物は、リガンド結合に対して競合する改変タンパク質の可溶性フラグメントである。他の候補化合物としては、突然変異体タンパク質、または改変タンパク質機能に影響を与え、従ってリガンドに対して競合する突然変異を含む適切なフラグメントが挙げられる。従って、リガンドに対して（例えば、より高い親和性で）競合するフラグメント、またはリガンドに結合するが、放出させないフラグメントは、本発明によって包含される。
本発明は、改変タンパク質活性を調節する（刺激するか、または阻害する）化合物を同定するための他の終点アッセイをさらに含む。このアッセイは、代表的に、タンパク質活性を示すシグナル伝達経路における現象のアッセイを包含する。従って、改変タンパク質依存性シグナルカスケードに応答してアップレギュレーションされるか、またはダウンレギュレーションされる遺伝子の発現が、アッセイされ得る。１つの実施形態において、このような遺伝子の調節領域は、容易に検出可能なマーカー（例えば、ルシフェラーゼ）に作動可能に連結され得る。あるいは、この改変タンパク質のリン酸化、または改変タンパク質の標的もまた、測定され得る。この改変タンパク質によって媒介される生物学的機能および生化学的機能のいずれ、終点アッセイとして使用され得る。これらは、本明細書中、本明細書中で引用される参考文献（これらの終点アッセイの標的および当業者に公知の他の機能について、参考として援用される）に記載される生化学的現象または生物学的現象の全てを含む。
結合化合物および／または活性化化合物もまた、キメラ改変タンパク質を用いることによってスクリーニングされ得る。ここで、アミノ末端細胞外ドメインもしくはその部分、膜貫通ドメインの全体もしくは部分領域、および／またはカルボキシル末端細胞内ドメインもしくはその部分は、異種ドメインまたは部分領域によって置換され得る。例えば、基質結合領域は、改変タンパク質によって正常に認識される基質とは異なる基質と相互作用するように使用され得る。従って、異なる一組のシグナル伝達成分は、活性化についての終点アッセイとして利用可能である。これは、アッセイが、改変タンパク質が誘導される特異的宿主細胞以外において実行されることを可能にする。
改変タンパク質はまた、この改変タンパク質と相互作用する化合物を発見するために設計された方法での競合的結合アッセイにおいて有用である。従って、化合物は、化合物を改変タンパク質に結合させるか、または別に改変タンパク質と相互作用させる条件下で、この改変タンパク質に曝露され得る。この改変タンパク質と正常に相互作用する結合パートナー（例えば、リガンド）もまた、混合物に添加される。試験化合物が、この改変タンパク質またはその結合パートナーと相互作用する場合、この改変タンパク質から形成される複合体の量、またはこの改変タンパク質由来の活性を減少させる。この型のアッセイは、改変タンパク質の特定領域と相互作用する化合物についてスクリーニングすることに特に有用である（Ｈｏｄｇｓｏｎ，Ｂｉｏ／ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，１９９２，Ｓｅｐｔ １０（９），９７３−８０）。
細胞フリーの薬物スクリーニングアッセイを実行するために、改変タンパク質もしくはそのフラグメントのいずれか、またはその標的分子を固定化して、１つまたは両方のタンパク質の非複合形態からの複合体の分離を促進すること、およびアッセイの自動化を適応することが、時に所望される。マトリックスにタンパク質を固定化するための任意の方法が、薬物スクリーニングアッセイにおいて使用され得る。１つの実施形態において、さらなるドメインを含む融合タンパク質が、タンパク質をマトリックスに結合させる。例えば、グルタチオン−Ｓ−トランスフェラーゼ／１２５Ｉ融合タンパク質は、グルタチオンセファロースビーズ（Ｓｉｇｍａ Ｃｈｅｍｉｃａｌ，Ｓｔ．Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）、またはグルタチオン誘導化マイクロタイタープレートに吸着され得、これは次いで、細胞溶解物（例えば、３５Ｓ標識化）および候補化合物（例えば、薬物候補）と組み合わされ、そしてこの混合物は、複合体形成をもたらす条件下で（例えば、塩およびｐＨについて生理学的な条件で）インキュベートされる。インキュベーションに続いて、このビーズは任意の未結合標識を取り除くために洗浄され、そして固定化されたマトリックスおよび放射標識が直接的に、またはこの複合体が解離された後の上清において、決定され得る。あるいは、この複合体は、マトリックスから解離され得、ＳＤＳ−ＰＡＧＥによって分離され得、そしてビーズ画分に見出される結合物質のレベルは、標準的な電気泳動技術を用いてゲルから定量され得る。
改変タンパク質またはその標的分子のいずれかは、ビオチンおよびストレプトアビジンの結合を利用して固定化され得る。あるいは、改変タンパク質と反応するが、この改変タンパク質のその標的分子への結合を妨害しない抗体が、プレートのウェルへと誘導体化され、そして、改変タンパク質が抗体結合によってこのウェルにトラップされ得る。標的分子および候補化合物の調製物は、この改変タンパク質が存在するウェル中でインキュベートされ、そしてこのウェルにトラップされた複合体の量が、定量され得る。ＧＳＴ−固定化複合体について上記された方法に加えて、このような複合体を検出するための方法としては、タンパク質標的分子と反応する抗体、または改変タンパク質と反応して標的分子と競合する抗体を用いた複合体の免疫検出、および標的分子に関する酵素活性を検出することに依存する酵素結合アッセイが挙げられる。
これらの薬物スクリーニングアッセイに従って同定される改変タンパク質活性の調節因子は、このタンパク質経路によって媒介される障害（例えば、ＶＴ）を有する被験体を処置するために使用され得る。これらの処置方法は、代表的には、このような処置を必要とする被験体に、薬学的組成物におけるタンパク質活性の調節因子を投与する工程を包含する。
本明細書中に開示される改変タンパク質、またはそのフラグメントは、この改変タンパク質の発現もしくは活性の不適切な欠如、またはこの改変タンパク質の所望しない発現もしくは活性によって特徴付けられる障害を処置するために、それ自身直接的に使用され得る。従って、処置するための方法は、本明細書中に開示される改変タンパク質またはそのフラグメントの使用を包含する。
本発明のさらに別の局面において、改変タンパク質は、２−ハイブリッドアッセイまたは３−ハイブリッドアッセイで「おとり（ｂａｉｔ）タンパク質」として使用され（例えば、米国特許第５，２８３，３１７号；Ｚｅｒｖｏｓら（１９９３）Ｃｅｌｌ ７２：２２３−２３２；Ｍａｄｕｒａら（１９９３）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２６８：１２０４６−１２０５４；Ｂａｒｔｅｌら（１９９３）Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ １４：９２０−９２４；Ｉｗａｂｕｃｈｉら（１９９３）Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ８：１６９３−１６９６；およびＢｒｅｎｔ Ｗ０９４／１０３００を参照のこと）、この改変タンパク質に結合するか、またはこの改変タンパク質と相互作用し、そして改変タンパク質活性に関係している他のタンパク質を同定し得る。このような改変タンパク質結合タンパク質はまた、例えば、タンパク質媒介シグナル伝達経路の要素として改変タンパク質または改変タンパク質標的によるシグナルの伝達に関係している可能性がある。あるいは、このような改変タンパク質結合タンパク質は、改変タンパク質のインヒビターである。
２−ハイブリッド系は、大部分の転写因子（代表的に、別個のＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインからなる）のモジュール的性質に基づく。簡単に言うと、このアッセイは、代表的に、２つの異なるＤＮＡ構築物を利用する。１つの構築物において、改変タンパク質をコードする遺伝子は、公知の転写因子（例えば、ＧＡＬ−４）のＤＮＡ結合ドメインをコードする遺伝子に融合される。他の構築物において、ＤＮＡ配列のライブラリーに由来し、非同定タンパク質（「おとり（ｐｒｅｙ）」または「サンプル」）をコードするＤＮＡ配列は、公知の転写因子の活性化ドメインをコードする遺伝子に融合される。「おとり（ｂａｉｔ）」タンパク質および「おとり（ｐｒｅｙ）」タンパク質がインビボで相互作用し、改変タンパク質依存性複合体を形成し得る場合、この転写因子のＤＮＡ結合ドメインおよび活性化ドメインは、極めて近接する。この近接は、この転写因子に対応する転写調節部位に作動可能に連結されるレポーター遺伝子（例えば、ＬａｃＺ）の転写を可能にする。レポーター遺伝子の発現が検出され得、そして機能的転写因子を含む細胞コロニーが単離され得、改変タンパク質と相互作用するタンパク質をコードするクローン化遺伝子を得るために使用され得る。
（改変タンパク質に対する抗体）
本発明はまた、本明細書中に開示される改変タンパク質およびそのフラグメントに選択的に結合する抗体を提供する。このような抗体は、本発明の改変タンパク質を定量的に、または定性的に検出するために使用され得る。本明細書中で使用される場合、抗体が改変タンパク質に結合するが、非改変タンパク質に有意に結合しない場合（すなわち、抗体が、本発明の１つ以上のＳＮＰに起因する改変体アミノ酸配列を含まない、正常タンパク質、野生型タンパク質、または当該分野で公知のタンパク質に有意に結合しない場合）、この抗体は、標的改変タンパク質に選択的に結合する（改変体アミノ酸配列は、例えば、非同義的ｃＳＮＰ、停止コドンを作製し、それによってポリペプチドの短縮を引き起こすナンセンスＳＮＰ、またはポリペプチドの伸長をもたらす読み通し変異を引き起こすＳＮＰに起因し得る）。
本明細書中で使用される場合、抗体は、当該分野で認識される用語と一致した用語において定義される：抗体は、抗原初回刺激に応答して生体より産生される、複数サブユニットのタンパク質である。本発明の抗体は、モノクローナル抗体およびポリクローナル抗体の両方、ならびにこのような抗体の抗原応答性のタンパク質分解性フラグメント（例えば、Ｆａｂフラグメント、Ｆ（ａｂ）’２フラグメント、およびＦｖフラグメント）を含む。さらに、本発明の抗体は、任意の種々の操作された抗原結合分子（例えば、キメラ抗体（米国特許第４，８１６，５６７号、同第４，８１６，３９７号；Ｍｏｒｒｉｓｏｎら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：６８５１，１９８４；Ｎｅｕｂｅｒｇｅｒら，Ｎａｔｕｒｅ ３１２：６０４，１９８４）、ヒト化抗体（米国特許第５，６９３，７６２号；同第５，５８５，０８９号；および同第５，５６５，３３２号）、単鎖Ｆｖ（米国特許第４，９４６，７７８号；Ｗａｒｄら，Ｎａｔｕｒｅ ３３４：５４４，１９８９）、２つの結合特異的部位を有する二重特異性抗体（ｂｉｓｐｅｃｉｆｉｃ
ａｎｔｉｂｏｄｙ）（Ｓｅｇａｌら，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２４８：１，２００１；Ｃａｒｔｅｒ，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２４８：７，２００１）、ダイアボディ（ｄｉａｂｏｄｙ）、トリアボディ（ｔｒｉａｂｏｄｙ）、およびテトラボディ（ｔｅｔｒａｂｏｄｙ）（Ｔｏｄｏｒｏｖｓｋａら，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ，２４８：４７，２００１））、ならびにＦａｂ接合体（ダイマーまたはトリマー）、およびミニボディ（ｍｉｎｉｂｏｄｙ）をさらに含む。
多くの方法が、所定の標的抗原に対する抗体を産生するか、および／または同定するために、当該分野で公知である（Ｈａｒｌｏｗ，Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ，（１９８９））。一般的に、単離されたペプチド（例えば、本発明の改変タンパク質）が、免疫原として使用され、そして哺乳動物生物体（例えば、ラット、ウサギ、ハムスター、またはマウス）に投与される。全長タンパク質、抗原性ペプチドフラグメント（例えば、改変タンパク質と対応する野生型タンパク質との間で変動する領域を含むペプチドフラグメント）、または融合タンパク質のいずれかが使用され得る。免疫原として使用されるタンパク質は、天然に存在し得るか、合成または組換えで産生され得、そしてアジュバントと組み合わせて投与され得る。このアジュバントとしては、以下が挙げられるが、これらに限定されない：フロイントアジュバント（フロイント完全アジュバントおよびフロイント不完全アジュバント）、鉱物ゲル（例えば、水酸化アルミニウム）、界面活性物質（例えば、リソレクチン、プルロニック（ｐｌｕｒｏｎｉｃ）ポリオール、ポリアニオン、ペプチド、油性乳濁液、スカシ貝（ｋｅｙｈｏｌｅ
ｌｉｍｐｅｔ）ヘモシアニン、ジニトロフェノールなど）。
モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術によって産生され得る（ＫｏｈｌｅｒおよびＭｉｌｓｔｅｉｎ，Ｎａｔｕｒｅ，２５６：４９５，１９７５）。ハイブリドーマ技術は、特異的モノクローナル抗体を分泌する細胞を不死化させる。この不死化細胞株は、２つの異なる細胞型（代表的には、リンパ球、および腫瘍細胞）を融合させることによってインビトロで作製され得る。ハイブリドーマ細胞は、インビトロまたはインビボで培養され得る。さらに、全てのヒト抗体は、トランスジェニック動物によって産生され得る（Ｈｅら，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１６９：５９５，２００２）。ＦｄファージおよびＦｄファージミド技術は、インビトロで組換え抗体を産生し、選択するために使用され得る（ＨｏｏｇｅｎｂｏｏｍおよびＣｈａｍｅｓ，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｔｏｄａｙ ２１：３７１，２０００；Ｌｉｕら，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．３１５：１０６３，２００２）。抗体の相補決定領域が同定され得、そしてこのような領域に対応する合成ペプチドが、抗原結合を媒介するために使用され得る（米国特許第５，６３７，６７７号）。
抗体は、好ましくは、対応する野生型タンパク質と比較して、改変体アミノ酸配列を含む改変タンパク質の領域または別個のフラグメント（例えば、非同意語（ｎｏｎｓｙｎｏｎｙｍｏｕｓ）的ｃＳＮＰによってコードされるアミノ酸を含む改変タンパク質の領域、停止コドンを作製するナンセンスＳＮＰによってもたらされる短縮によって影響を受ける領域、またはＳＮＰによってもたらされる読み過ごし変異（ｒｅａｄ−ｔｈｒｏｕｇｈ ｍｕｔａｔｉｏｎ）に起因する停止コドンの破壊から生じる領域）に対して調製される。さらに、好ましい領域は、機能／活性および／またはタンパク質／結合パートナー相互作用に関与する領域を含む。このようなフラグメントは、タンパク質の表面に位置する領域に対応するフラグメント（例えば、親水性領域）のような物理的特性について選択され得るか、あるいは配列のユニークさに基づいてまたは本発明によって提供されるＳＮＰによってコードされる改変体アミノ酸残基の位置に基づいて選択され得る。抗原性フラグメントは、代表的に、少なくとも約８〜１０個の連続したアミノ酸残基を含み、ここで、このアミノ酸残基の少なくとも１つは、本明細書中に開示されるＳＮＰによって影響を受けるアミノ酸である。しかし、抗原性ペプチドは、少なくとも、１２個、１４個、１６個、２０個、２５個、５０個、１００個（もしくはこれらの間の任意の他の数）またはそれ以上のアミノ酸残基を含み得、但し、少なくとも１つのアミノ酸は、本明細書中に開示されるＳＮＰによって影響を受ける。
本発明の抗体の検出は、抗体またはその抗原反応性フラグメントを検出可能物質に結合する（すなわち、物理的に連結する）ことによって促進され得る。検出可能物質としては、種々の酵素、補欠分子団、蛍光物質、発光物質、生物発光物質、および放射性物質が挙げられるが、これらに限定されない。適切な酵素の例としては、セイヨウワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、β−ガラクトシダーゼ、またはアセチルコリンエステラーゼが挙げられ；適切な補欠分子団複合体の例としては、ストレプトアビジン／ビオチンおよびアビジン／ビオチンが挙げられ；適切な蛍光物質の例としては、ウンベリフェロン、フルオロセイン、フルオロセインイソチオシアネート、ローダミン、ジクロロトリアジニルアミンフルオレセイン、ダンシルクロリドまたはフィコエリトリンが挙げられ；発光物質の例としては、ルミノールが挙げられ；生物発光物質の例としては、ルシフェラーゼ、ルシフェリン、およびエクオリンが挙げられ、そして適切な放射性物質の例としては、１２５Ｉ、１３１Ｉ、３５Ｓまたは３Ｈが挙げられる。
抗体（特に、治療剤としての抗体の使用）は、以下で概説される：Ｍｏｒｇａｎ，「Ａｎｔｉｂｏｄｙ ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ ｄｉｓｅａｓｅ」，Ｅｘｐｅｒｔ Ｒｅｖ Ｖａｃｃｉｎｅｓ．２００３ Ｆｅｂ；２（１）：５３−９；Ｒｏｓｓら，「Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ」，Ａｍ Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐａｔｈｏｌ．２００３ Ａｐｒ；ｌ１９（４）：４７２−８５；Ｇｏｌｄｅｎｂｅｒｇ，「Ａｄｖａｎｃｉｎｇ ｒｏｌｅ ｏｆ ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｔｈｅｒａｐｙ ｏｆ ｃａｎｃｅｒ」，Ｃａｎｃｅｒ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｔｈｅｒ．２００３ Ｍａｙ；５２（５）：２８１−９６．Ｅｐｕｂ ２００３ Ｍａｒ １１；Ｒｏｓｓら，「Ａｎｔｉｂｏｄｙ−ｂａｓｅｄ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ ｉｎ ｏｎｃｏｌｏｇｙ」，Ｅｘｐｅｒｔ Ｒｅｖ Ａｎｔｉｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ．２００３ Ｆｅｂ；３（１）：１０７−２１；Ｃａｏら，「Ｂｉｓｐｅｃｉｆｉｃ ａｎｔｉｂｏｄｙ ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ ｉｎ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ」，Ａｄｖ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖ Ｒｅｖ．２００３ Ｆｅｂ １０；５５（２）：１７１−９７；ｖｏｎ Ｍｅｈｒｅｎら，「Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ ａｎｔｉｂｏｄｙ ｔｈｅｒａｐｙ ｆｏｒ ｃａｎｃｅｒ」，Ａｎｎｕ Ｒｅｖ Ｍｅｄ．２００３；５４：３４３−６９．Ｅｐｕｂ ２００１ Ｄｅｃ ０３；Ｈｕｄｓｏｎら，「Ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ」，Ｎａｔ Ｍｅｄ．２００３ Ｊａｎ；９（１）：１２９−３４；Ｂｒｅｋｋｅら，「Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｆｏｒ ｈｕｍａｎ ｄｉｓｅａｓｅｓ ａｔ ｔｈｅ ｄａｗｎ ｏｆ ｔｈｅ ｔｗｅｎｔｙ−ｆｉｒｓｔ ｃｅｕｔｕｒｙ」，Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．２００３ Ｊａｎ；２（１）：５２−６２（Ｅｒｒａｔｕｍ ｉｎ：Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．２００３ Ｍａｒ；２（３）：２４０）；Ｈｏｕｄｅｂｉｎｅ，
「Ａｎｔｉｂｏｄｙ ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｅ ｉｎ ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ａｎｉｍａｌｓ ａｎｄ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓ ｗｉｔｈ ｏｔｈｅｒ ｓｙｓｔｅｍｓ」，Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００２ Ｄｅｃ；１３（６）：６２５−９；Ａｎｄｒｅａｋｏｓら，「Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｉｎ ｉｍｍｕｎｅ ａｎｄ ｉｎｆｌａｍｍａｔｏｒｙ ｄｉｓｅａｓｅｓ」，Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００２ Ｄｅｃ；１３（６）：６１５−２０；Ｋｅｌｌｅｒｍａｎｎら，「Ａｎｔｉｂｏｄｙ ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ：ｔｈｅ ｕｓｅ ｏｆ ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ｍｉｃｅ ｔｏ ｇｅｎｅｒａｔｅ ｈｕｍａｎ ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｆｏｒ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ」，Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００２ Ｄｅｃ；１３（６）：５９３−７；Ｐｉｎｉら，「Ｐｈａｇｅ ｄｉｓｐｌａｙ ａｎｄ ｃｏｌｏｎｙ ｆｉｌｔｅｒ ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ ｆｏｒ ｈｉｇｈ−ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ ｓｅｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ ａｎｔｉｂｏｄｙ ｌｉｂｒａｒｉｅｓ」，Ｃｏｍｂ Ｃｈｅｍ Ｈｉｇｈ Ｔｈｒｏｕｇｈｐｕｔ Ｓｃｒｅｅｎ．２００２ Ｎｏｖ；５（７）：５０３−１０；Ｂａｔｒａら，「Ｐｈａｒｍａｃｏｋｉｎｅｔｉｃｓ ａｎｄ ｂｉｏｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ ｇｅｎｅｔｉｃａｌｌｙ ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ」，Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００２ Ｄｅｃ；１３（６）：６０３−８；およびＴａｎｇｒｉら，「Ｒａｔｉｏｎａｌｌｙ ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｒ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ｗｉｔｈ ａｂｓｅｎｔ ｏｒ ｒｅｄｕｃｅｄ ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ」，Ｃｕｒｒ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ．２００２ Ｄｅｃ；９（２４）：２１９１−９。
（抗体の使用）
抗体は、標準的な技術（例えば、アフィニティークロマトグラフィーまたは免疫沈降）によって天然の細胞供給源からまたは組換え宿主細胞から、本発明の改変タンパク質を単離するために使用され得る。さらに、抗体は、生物の種々の組織の間、および正常な発生または疾患の進行の過程にわたって、種々のタンパク質の発現のパターンを決定するために、細胞または組織において本発明の改変タンパク質の存在を検出するために有用である。さらに、抗体は、発現の量およびパターンを評価するためにに、インサイチュ、インビトロ、体液中、または細胞溶解物もしくは懸濁液において、改変タンパク質を検出するために使用され得る。また、抗体は、異常な組織分布、発生の間の異常な発現、または異常な状態（例えば、ＶＴ）における発現を評価するために使用され得る。さらに、全長改変タンパク質の循環するフラグメントの抗体検出は、代謝回転を同定するために使用され得る。
本発明の改変タンパク質に対する抗体はまた、遺伝薬理学の分析において有用である。従って、代替のＳＮＰ対立遺伝子によってコードされる改変タンパク質に対する抗体は、改変された処置の様式を必要とする個体を同定するために使用され得る。
さらに、抗体は、疾患の活性段階のような疾患の状態において、またはタンパク質の機能に関連する疾患（特に、ＶＴ）に対する素因を有する個体において、改変タンパク質の発現を評価するために使用され得る。本発明のＳＮＰ含有核酸分子によってコードされる改変タンパク質に特異的な抗体は、改変タンパク質の存在をアッセイするために（例えば、改変タンパク質の存在によって示されるようなＶＴに対する素因についてスクリーニングするために）、使用され得る。
抗体はまた、電気泳動度、等電点、トリプシンペプチド消化、および当該分野で周知の他の物理的アッセイによる分析とともに、改変タンパク質を評価するための診断ツールとして有用である。
抗体はまた、組織型別のために有用である。従って、特定の改変タンパク質が特定の組織における発現と相関している場合、このタンパク質に対して特異的な抗体は、組織型を同定するために使用され得る。
抗体はまた、種々の組織における細胞内の改変タンパク質の異常な細胞内局在化を評価するために使用され得る。診断的使用は、遺伝的試験だけではなく、処置様式をモニタリングする際にも適用され得る。従って、処置が、改変タンパク質の発現レベルまたは存在、あるいは改変タンパク質の異常な組織分布または発展的な発現を直すことを最終的な目標とする場合、改変タンパク質または関連するフラグメントに対する抗体は、治療効力をモニターするために使用され得る。
抗体はまた、例えば、結合パートナーに対する改変タンパク質の結合を遮断することによって、改変タンパク質の機能を阻害するために有用である。これらの使用はまた、処置が改変タンパク質の機能を阻害することを包含する治療的文脈において適用され得る。抗体は、例えば、結合を遮断するかまたは競合的に阻害し、従って、改変タンパク質の活性を調節する（作用するかまたは拮抗する）ために使用され得る。抗体は、機能に必要とされる部位を含む特異的改変タンパク質フラグメントに対して、または細胞もしくは細胞膜と関連するインタクトな改変タンパク質に対して調製され得る。インビボ投与について、抗体は、放射性核種、酵素、免疫原性エピトープ、または細胞傷害性剤のようなさらなる治療的ペイロードと連結され得る。適切な細胞傷害性剤としては、ジフテリアのような細菌性毒素、およびリシンのような植物性毒素が挙げられるが、これらに限定されない。抗体またはそのフラグメントのインビボ半減期は、ポリエチレングリコールに対する結合を介するペグ化によって延長され得る（Ｌｅｏｎｇら、Ｃｙｔｏｋｉｎｅ １６：１０６，２００１）。
本発明はまた、抗体を使用するためのキット（例えば、試験サンプル中の改変タンパク質の存在を検出するためのキット）を包含する。例示的なキットは、抗体（例えば、標識された抗体または標識可能な抗体）および生物学的サンプル中の改変タンパク質を検出するための化合物または薬剤；サンプル中の改変タンパク質の量、または存在／非存在を決定するための手段；サンプル中の改変タンパク質の量と標準とを比較するための手段；および使用のための説明書を含み得る。
（ベクターおよび宿主細胞）
本発明はまた、本明細書中に記載されるＳＮＰ含有核酸分子を含むベクターを提供する。用語「ベクター」は、ビヒクル、好ましくは、核酸分子をいい、これは、ＳＮＰ含有核酸分子を輸送し得る。このベクターが核酸分子である場合、ＳＮＰ含有核酸分子は、ベクター核酸に共有結合的に連結され得る。このようなベクターとしては、プラスミド、一本鎖ファージもしくは二本鎖ファージ、一本鎖ＲＮＡウイルスベクターもしくは二本鎖ＲＮＡウイルスベクター、または一本鎖ＤＮＡウイルスベクターもしくは二本鎖ＤＮＡウイルスベクター、あるいは人工染色体（例えば、ＢＡＣ、ＰＡＣ、ＹＡＣ、またはＭＡＣ）が挙げられるが、これらに限定されない。
ベクターは、染色体外エレメントとして宿主細胞内で維持され得、ここで、このベクターは、ＳＮＰ含有核酸分子を複製し、そしてそのさらなるコピーを産生する。あるいは、ベクターは、宿主細胞ゲノム内に組み込まれ得、宿主細胞が複製する場合にＳＮＰ含有核酸分子のさらなるコピーを産生し得る。
本発明は、ＳＮＰ含有核酸分子の維持のためのベクター（クローニングベクター）または発現のためのベクター（発現ベクター）を提供する。ベクターは、原核生物細胞または真核生物細胞あるいはその両方（シャトルベクター）において機能し得る。
発現ベクターは、代表的に、ＳＮＰ含有核酸分子の転写が宿主細胞において許容されるように、ＳＮＰ含有核酸分子に対してベクター内で作動可能に連結されるシス作用性調節領域を含む。ＳＮＰ含有核酸分子はまた、転写に影響し得る別の核酸分子を用いて、宿主細胞中に導入され得る。従って、第２の核酸分子は、ベクターからのＳＮＰ含有核酸分子の転写を可能にするために、シス調節制御領域と相互作用するトランス作用因子を提供し得る。あるいは、トランス作用因子は、宿主細胞によって供給され得る。最終的に、トランス作用因子は、ベクター自体から産生され得る。しかし、いくつかの実施形態において、核酸分子の転写および／または翻訳が無細胞系において行われ得ることが理解される。
本明細書中に記載されるＳＮＰ含有核酸分子が作動可能に連結され得る調節配列は、ｍＲＮＡ転写を指向するためのプロモーターを含む。これらの調節配列には、バクテリオファージλ由来の左プロモーター、Ｅ．ｃｏｌｉ由来のｌａｃプロモーター、ＴＲＰプロモーター、およびＴＡＣプロモーター、ＳＶ４０由来の初期プロモーターおよび後期プロモーター、ＣＭＶ最初期プロモーター、アデノウイルス初期プロモーターおよびアデノウイルス後期プロモーター、ならびにレトロウイルス末端反復配列が挙げられるがこれらに限定されない。
転写を促進する制御領域に加えて、発現ベクターはまた、転写を調節する領域（例えば、リプレッサー結合部位およびエンハンサー）を含み得る。例としては、ＳＶ４０エンハンサー、サイトメガロウイルス最初期エンハンサー、ポリオーマエンハンサー、アデノウイルスエンハンサー、およびレトロウイルスＬＴＲエンハンサーが挙げられる。
転写開始および制御のための部位を含むことに加えて、発現ベクターはまた、転写終結に必要な配列、および転写される領域において、翻訳のためのリボソーム結合部位を含み得る。発現のための他の調節制御エレメントとしては、開始コドンおよび終止コドンならびにポリアデニル化シグナルが挙げられる。当業者は、発現ベクターにおいて有用な多くの調節配列を知っている（例えば、ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ、２０００，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹを参照のこと）。
種々の発現ベクターは、ＳＮＰ含有核酸分子を発現するために使用され得る。このようなベクターとしては、染色体ベクター、エピソームベクター、およびウイルス由来のベクター（例えば、細菌性プラスミド由来、バクテリオファージ由来、酵母エピソーム由来、酵素染色体エレメント（酵母人工染色体を含む）由来、バキュロウイルス、パポバウイルス（例えば、ＳＶ４０）、ワクシニアウイルス、アデノウイルス、ポックスウイルス、偽狂犬病ウイルス、およびレトロウイルスのようなウイルス由来のベクター）が挙げられる。ベクターはまた、プラスミド由来のものおよびバクテリオファージ遺伝子エレメント（例えば、コスミドおよびファージミド）由来のもののようなこれらの供給源の組み合わせ由来であり得る。原核生物宿主および真核生物宿主に対する適切なクローニングベクターおよび発現ベクターは、ＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ、２０００，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹに記載されている。
ベクター中の調節配列は、１つ以上の宿主細胞における構成的発現（例えば、組織特異的発現）を提供し得るか、または例えば、温度、栄養添加剤、または外来因子（例えば、ホルモンもしくは他のリガンド）によって、１つ以上の細胞型における誘導性発現を提供し得る。原核生物宿主細胞および真核生物宿主細胞における核酸配列の構成的発現または誘導性発現を提供する種々のベクターは、当業者に周知である。
ＳＮＰ含有核酸分子は、当該分野で周知の方法論によってベクター中に挿入され得る。一般的に、最終的に発現されるＳＮＰ含有核酸分子は、ＳＮＰ含有核酸分子および発現ベクターを、１つ以上の制限酵素を用いて切断し、次いで、フラグメントを一緒に連結することによって、発現ベクターに連結される。制限酵素消化および連結についての手順は、当業者に周知である。
適切な核酸分子を含むベクターは、周知の技術を使用して、増殖または発現のための適切な宿主細胞内に導入され得る。細菌宿主細胞としては、Ｅ．ｃｏｌｉ、Ｓｔｒｅｐｔｏｍｙｃｅｓ、およびＳａｌｍｏｎｅｌｌａ ｔｙｐｈｉｍｕｒｉｕｍが挙げられるが、これらに限定されない。真核生物宿主としては、酵母、昆虫細胞（例えば、Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）、動物細胞（例えば、ＣＯＳ細胞およびＣＨＯ細胞）、ならびに植物細胞が挙げられるが、これらに限定されない。
本明細書中に記載されるように、融合タンパク質として改変体ペプチドを発現することが望ましくあり得る。従って、本発明は、改変体ペプチドの産生を可能にする融合ベクターを提供する。融合ベクターは、例えば、組換えタンパク質の発現を増加し得、組換えタンパク質の溶解性を増加し得、そして例えば、アフィニティー精製のためのリガンドとして作用することによってタンパク質の精製を補助し得る。タンパク質分解性切断部位は、融合部分の接合において導入され得、その結果、所望の改変体ペプチドが、最終的に、融合部分から分離され得る。このような使用に適切なタンパク質分解性酵素としては、Ｘａ因子、トロンビン、およびエンテロキナーゼが挙げられるが、これらに限定されない。代表的な融合発現ベクターとしては、ｐＧＥＸ（Ｓｍｉｔｈら，Ｇｅｎｅ ６７；３１−４０（１９８８））、ｐＭＡＬ（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｂｅｖｅｒｌｙ，ＭＡ）およびｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）（これらは、それぞれグルタチオンＳ−トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトースＥ結合タンパク質、またはプロテインＡを標的組換えタンパク質に融合する）が挙げられる。適切な誘導性非融合Ｅ．ｃｏｌｉ発現ベクターの例としては、ｐＴｒｃ（Ａｍａｎｎら，Ｇｅｎｅ ６９：３０１−３１５（１９８８））およびｐＥＴ １１ｄ（Ｓｔｕｄｉｅｒら，Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ １８５：６０−８９（１９９０））が挙げられる。
組換えタンパク質発現は、遺伝子的背景を提供することによって細菌宿主において最大化され得、ここで、宿主細胞は、組換えタンパク質をタンパク質分解的に切断する能力を損なっている（Ｇｏｔｔｅｓｍａｎ，Ｓ．，Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ １８５，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｃａｌｉｆｏｎｉａ（１９９０）１１９−１２８）。あるいは、目的のＳＮＰ含有核酸分子の配列は、特定の宿主細胞（例えば、Ｅ．ｃｏｌｉ）についての優先的なコドン利用を提供するように変更され得る（Ｗａｄａら，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２０：２１１１−２１１８（１９９２））。
ＳＮＰ含有核酸分子はまた、酵母において作動する発現ベクターによって発現され得る。酵母（例えば、Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）における発現のためのベクターの例としては、ｐＹｅｐＳｅｃ１（Ｂａｌｄａｒｉら，ＥＭＢＯ Ｊ．６：２２９−２３４（１９８７））、ｐＭＦａ（Ｋｕｒｊａｎら，Ｃｅｌｌ ３０：９３３−９４３（１９８２））、ｐＪＲＹ８８（Ｓｃｈｕｌｔｚら，Ｇｅｎｅ ５４：１１３−１２３（１９８７））、およびｐＹＥＳ２（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）が挙げられる。
ＳＮＰ含有核酸分子はまた、例えば、バキュロウイルス発現ベクターを使用して、昆虫細胞中で発現され得る。培養された昆虫細胞（例えば、Ｓｆ９細胞）中のタンパク質の発現に利用可能なバキュロウイルスベクターとしては、ｐＡｃシリーズ（Ｓｍｉｔｈら，Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．３：２１５６−２１６５（１９８３））およびｐＶＬシリーズ（Ｌｕｃｋｌｏｗら，Ｖｉｒｏｌｏｇｙ １７０：３１−３９（１９８９）が挙げられる。
本発明の特定の実施形態において、本明細書中に記載されるＳＮＰ含有核酸分子は、哺乳動物発現ベクターを使用して哺乳動物細胞において発現される。哺乳動物発現ベクターの例としては、ｐＣＤＭ８（Ｓｅｅｄ，Ｂ．Ｎａｔｕｒｅ ３２９：８４０（１９８７））およびｐＭＴ２ＰＣ（Ｋａｕｆｍａｎら，ＥＭＢＯ Ｊ．６：１８７−１９５（１９８７））が挙げられる。
本発明はまた、本明細書中に記載されるＳＮＰ含有核酸分子が逆方向でベクター中にクローニングされるが、アンチセンスＲＮＡの転写を可能にする調節配列に作動可能に連結されるベクターを包含する。従って、アンチセンス転写は、本明細書中に記載されるＳＮＰ含有核酸配列（コード領域および非コード領域の両方を含む）に対して産生され得る。このアンチセンスＲＮＡの発現は、センスＲＮＡの発現に関連する上記のパラメーター（調節配列、構成的発現または誘導性発現、組織特異的発現）のそれぞれに供される。
本発明はまた、本明細書中に記載されるベクターを含む組換え宿主細胞に関連する。従って、宿主細胞としては、例えば、原核生物細胞、下等真核生物細胞（例えば、酵母）、他の真核生物細胞（例えば、昆虫細胞）、および高等真核生物細胞（例えば、哺乳動物細胞）が挙げられる。
組換え宿主細胞は、当業者が容易に利用可能な技術によって、本明細書中に記載のベクター構築物を細胞に導入することによって調製され得る。これらには、リン酸カルシウムトランスフェクション、ＤＥＡＥ−デキストラン媒介トランスフェクション、カチオン性脂質媒介トランスフェクション、エレクトロポレーション、形質導入、感染、リポフェクション、およびＳａｍｂｒｏｏｋおよびＲｕｓｓｅｌｌ，２０００，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ
Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，ＮＹ）に記載されるような他の技術が挙げられるがこれらに限定されない。
宿主細胞は、１つより多くのベクターを含み得る。従って、異なるＳＮＰ含有ヌクレオチド配列が、同じ細胞中に、異なるベクターで導入され得る。同様に、ＳＮＰ含有核酸分子は、単独で、またはＳＮＰ含有核酸分子に関連しない他の核酸分子（例えば、発現ベクターにトランス作用因子を提供する核酸分子）のいずれかで導入され得る。１つより多くのベクターが細胞内に導入される場合、ベクターは、独立して導入され得るか、同時に導入され得るか、または核酸分子ベクターに連結され得る。
バクテリオファージおよびウイルスベクターの場合、これらは、感染および形質導入のための標準的な手順によって、パッケージされたウイルスまたはカプセル化されたウイルスとして細胞に導入され得る。ウイルスベクターは、複製コンピテントであり得るかまたは複製欠損であり得る。ウイルス複製が欠損である場合、複製は、欠損を補う機能を提供する宿主細胞中で行われ得る。
ベクターは、一般的に、組換えベクター構築物を含む細胞の亜集団の選択を可能にする選択マーカーを含む。マーカーは、本明細書中に記載されるＳＮＰ含有核酸分子を含む同じベクター中に挿入され得るか、または別のベクター内であり得る。マーカーとしては、例えば、原核宿主細胞についてのテトラサイクリン耐性遺伝子またはアンピシリン耐性遺伝子、および真核生物宿主細胞についてのジヒドロ葉酸レダクターゼ耐性遺伝子またはネオマイシン耐性遺伝子が挙げられる。しかし、発現型の特性についての選択を提供する任意のマーカーが有効であり得る。
成熟改変タンパク質が、適切な調節配列の制御下で、細菌、酵母、哺乳動物細胞および他の細胞において産生され得る場合、無細胞転写および翻訳系がまた、本明細書中に記載されるＤＮＡ構築物由来のＲＮＡを使用して、これらの改変タンパク質を産生するために使用され得る。
改変タンパク質（Ｇタンパク質共役レセプター（ＧＰＣＲ）のようなタンパク質を含む複数膜貫通ドメインを用いて達成することが困難である）の分泌が所望される場合、適切な分泌シグナルは、ベクター中に組み込まれ得る。シグナル配列は、ペプチドに対して内因性であり得るかまたはこれらのペプチドに対して異種であり得る。
改変タンパク質が媒体中に分泌されない場合、タンパク質は、標準的な破壊手順（凍結／解凍、超音波、機械的破壊、溶解剤の使用などを含む）によって、宿主細胞から単離され得る。次いで、改変タンパク質は、回収され得、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、酸抽出、アニオン交換クロマトグラフィーまたはカチオン交換クロマトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、ヒドロキシアパタイトクロマトグラフィー、レクチンクロマトグラフィー、または高速液体クロマトグラフィーを含む周知の精製方法によって精製され得る。
本明細書中に記載される改変タンパク質の組換え産生が行われる宿主細胞に依存して、これらは、種々のグリコシル化パターンを有し得るか、または細菌において産生される場合、非グリコシル化であり得ることもまた理解される。さらに、改変タンパク質は、宿主媒介プロセスの結果として、いくらかの場合で、初期改変メチオニンを含み得る。
ベクターおよび宿主細胞に関するさらなる情報について、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．を参照のこと。
（ベクターおよび宿主細胞の使用、ならびにトランスジェニック動物）
本明細書中に記載される改変タンパク質を発現する組換え宿主細胞は、種々の用途を有する。例えば、細胞は、所望量の改変タンパク質またはそのフラグメントの調製物に精製され得る改変タンパク質を産生するために有用である。従って、発現ベクターを含む宿主細胞は、改変タンパク質産生に有用である。
宿主細胞はまた、改変タンパク質または改変タンパク質フラグメントを含む細胞ベースのアッセイ（例えば、上記のものおよび当該分野で公知の他の形式）を行うために有用である。従って、改変タンパク質を発現する組換え宿主細胞は、改変タンパク質機能を刺激するかまたは阻害する化合物をアッセイするために有用である。改変タンパク質の機能を調節する化合物のこのような能力は、ネイティブ／野生型タンパク質に対する化合物のアッセイから、または化合物の無細胞アッセイから明らかではないかもしれない。組換え宿主細胞はまた、公知の機能と比較して、改変タンパク質における機能的変化をアッセイするために有用である。
遺伝的に操作された宿主細胞は、非ヒトトランスジェニック動物を作製するためにさらに使用され得る。トランスジェニック動物は、好ましくは、動物の１つ以上の細胞が導入遺伝子である非ヒト哺乳動物（例えば、齧歯類動物（例えば、ラットまたはマウス））である。導入遺伝子は、トランスジェニック動物が発生する細胞のゲノム内に組み込まれ、そしてその細胞型または組織の１つ以上において成熟動物のゲノムに残る本発明のＳＮＰを含む外来ＤＮＡである。このような動物は、インビボで改変タンパク質の機能を研究するため、ならびに改変タンパク質活性のモジュレーターを同定および評価するために有用である。トランスジェニック動物の他の例としては、非ヒト霊長類、ヒツジ、イヌ、ウシ、ヤギ、ニワトリ、および両生類が挙げられるが、これらに限定されない。トランスジェニック非ヒト哺乳動物（例えば、ウシおよびヤギ）は、動物の乳に分泌され得、次いで回収され得る改変タンパク質を産生するように使用され得る。
トランスジェニック動物は、ＳＮＰ含有核酸分子を受精された卵母細胞の雄性前核内に導入し（例えば、マイクロインジェクションまたはレトロウイルス感染によって）、そして偽妊娠した雌性養育動物において卵母細胞を発生させることによって作製され得る。本発明の１つ以上のＳＮＰを含む任意の核酸分子は、潜在的に、非ヒト動物のゲノム内に導入遺伝子として導入され得る。
発現ベクターにおいて有用な調節配列または他の配列のいずれも、トランスジェニック配列の一部分を形成し得る。これは、まだ含まれていない場合、イントロン配列およびポリアデニル化シグナルを含む。組織特異的調節配列は、特定の細胞または組織中の改変タンパク質の発現を指向するために、導入遺伝子に作動可能に連結され得る。
胚操作およびマイクロインジェクションによりトランスジェニック動物（特に、マウスのような動物）を作製するための方法は、当該分野において慣用的であり、例えば、両方ともＬｅｄｅｒらによる、米国特許第４，７３６，８６６号および同第４，８７０，００９号、Ｗａｇｎｅｒらによる米国特許第４，８７３，１９１号、ならびにＨｏｇａｎ，Ｂ．，Ｍａｎｉｐｕｌａｔｉｎｇ ｔｈｅ Ｍｏｕｓｅ Ｅｍｂｒｙｏ，（Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ
Ｈａｒｂｏｒ，Ｎ．Ｙ．１９８６）に記載される。同様の方法は、他のトランスジェニック動物の作製に使用される。トランスジェニック創始動物は、そのゲノム中の導入遺伝子の存在、および／または動物の組織または細胞におけるトランスジェニックｍＲＮＡの発現に基づいて、同定され得る。次いで、トランスジェニック創始動物は、導入遺伝子を保有するさらなる動物を繁殖させるために使用され得る。さらに、導入遺伝子を保有するトランスジェニック動物は、さらに、他の導入遺伝子を保有する他のトランスジェニック動物に繁殖され得る。トランスジェニック動物はまた、動物全体または動物の組織が本明細書中に記載される相同組換え宿主細胞を使用して作製されている非ヒト動物を含む。
別の実施形態において、導入遺伝子の調節された発現を可能にする選択された系を含むトランスジェニック非ヒト動物が作製され得る。このような系の１つの例は、バクテリオファージＰ１のｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系である（Ｌａｋｓｏら、ＰＮＡＳ８９：６２３２−６２３６（１９９２））。リコンビナーゼ系の別の例は、Ｓ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅのＦＬＰリコンビナーゼ系である（Ｏ’Ｇｏｒｍａｎら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ２５１：１３５１−１３５５（１９９１））。ｃｒｅ／ｌｏｘＰリコンビナーゼ系が導入遺伝子の発現を調節するために使用される場合、Ｃｒｅリコンビナーゼおよび選択されたタンパク質の両方をコードする導入遺伝子を含む動物が一般的に必要とされる。このような動物は、例えば、２匹のトランスジェニック動物を交配することにより、「二重」トランスジェニック動物を構築することによって提供され得、一方は、選択された改変タンパク質をコードする導入遺伝子を含み、他方は、リコンビナーゼをコードする導入遺伝子を含む。
本明細書中に記載される非ヒトトランスジェニック動物のクローンもまた、例えば、Ｗｉｌｍｕｔ，Ｉら、Ｎａｔｕｒｅ ３８５：８１０−８１３（１９９７）およびＰＣＴ国際公開番号ＷＯ ９７／０７６６８およびＷＯ ９７／０７６６９に記載される方法に従って作製され得る。簡単に述べると、トランスジェニック動物由来の細胞（例えば、体細胞）は、単離され、増殖周期を出て、Ｇ０期に入るように誘導され得る。次いで、静止細胞は、静止細胞が単離される同じ種の動物由来の除核された卵母細胞に、例えば、電気パルスの使用によって、融合され得る。次いで、再構築された卵母細胞は、桑実胚または胚盤胞まで発生するように培養され、次いで、偽妊娠雌性養育動物に移される。この雌性養育動物から生まれた子孫は、細胞（例えば、体細胞）が単離される動物のクローンである。
本明細書中に記載される改変タンパク質を発現する組換え細胞を含むトランスジェニック動物は、インビボの文脈で、本明細書中に記載されるアッセイを行うために有用である。従って、インビボで存在し、リガンドまたは基質の結合、改変タンパク質活性化、シグナル伝達、または他のプロセスもしくは相互作用に影響し得る種々の生理学的因子は、インビトロ無細胞アッセイまたは細胞ベースのアッセイから明らかではないかもしれない。従って、本発明の非ヒトトランスジェニック動物は、インビトロ改変タンパク質機能および改変タンパク質機能／活性もしくは発現を調節する治療剤または化合物の活性をアッセイするために使用され得る。このような動物はまた、ヌル変異（ｎｕｌｌ ｍｕｔａｔｉｏｎ）（すなわち、１つ以上の改変タンパク質を実質的にまたは完全に排除する変異）の効果を評価するために適切である。
トランスジェニック動物に関するさらなる情報について、Ｈｏｕｄｅｂｉｎｅ，「Ａｎｔｉｂｏｄｙ ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｅ ｉｎ ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ａｎｉｍａｌｓ
ａｎｄ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓ ｗｉｔｈ ｏｔｈｅｒ ｓｙｓｔｅｍｓ」，Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００２ Ｄｅｃ；１３（６）：６２５−９；Ｐｅｔｔｅｒｓら，「Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ａｎｉｍａｌｓ ａｓ ｍｏｄｅｌｓ ｆｏｒ ｈｕｍａｎ ｄｉｓｅａｓｅ」，Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ Ｒｅｓ．２０００；９（４−５）：３４７−５１；ｄｉｓｃｕｓｓｉｏｎ ３４５−６；Ｗｏｌｆら，「Ｕｓｅ ｏｆ ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ａｎｉｍａｌｓ ｉｎ ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ ｏｆ ｔｏｘｉｃｉｔｙ」，Ｊ Ｐｈａｒｍ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．１９９８ Ｊｕｎ；５０（６）：５６７−７４；Ｅｃｈｅｌａｒｄ，「Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ ｐｒｏｔｅｉｎ ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ ｉｎ ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ａｎｉｍａｌｓ」，Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１９９６ Ｏｃｔ；７（５）：５３６−４０；Ｈｏｕｄｅｂｉｎｅ，「Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ａｎｉｍａｌ ｂｉｏｒｅａｃｔｏｒｓ」，Ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ Ｒｅｓ．２０００；９（４−５）：３０５−２０；Ｐｉｒｉｔｙら，「Ｅｍｂｒｙｏｎｉｃ ｓｔｅｍ ｃｅｌｌｓ，ｃｒｅａｔｉｎｇ ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ａｎｉｍａｌｓ」，Ｍｅｔｈｏｄｓ
Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ．１９９８；５７：２７９−９３；およびＲｏｂｌら，「Ａｒｔｉｆｉｃｉａｌ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ ｖｅｃｔｏｒｓ ａｎｄ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ
ｏｆ ｃｏｍｐｌｅｘ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｉｎ ｔｒａｎｓｇｅｎｉｃ ａｎｉｍａｌｓ」，Ｔｈｅｒｉｏｇｅｎｏｌｏｇｙ．２００３ Ｊａｎ １；５９（１）：１０７−１３を参照のこと。
以下の実施例を例証のために提供するが、これによって、特許請求する発明が限定されることはない。
（実施例１）
深部静脈血栓症と関連するＳＮＰ
序論
ＤＶＴと関連するＳＮＰを同定するために、１９，６８２のＳＮＰ（それらは主としてミスセンスＳＮＰであった）を、３つの大規模な症例−対照研究においてＤＶＴとの関連性について調査した。
方法
研究集団およびデータ収集
本分析における３つの研究（ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２）は、２つの大規模な集団ベースの症例−対照研究：静脈血栓症についての危険因子のＬｅｉｄｅｎ Ｔｈｒｏｍｂｏｐｈｉｌｉａ Ｓｔｕｄｙ（ＬＥＴＳ）およびＭｕｌｔｉｐｌｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ（ＭＥＧＡ研究）（Ｋｏｓｔｅｒら、Ｌａｎｃｅｔ １９９３年；３４２巻（８８８６〜８８８７号）：１５０３〜１５０６頁およびＢｌｏｍら、ＪＡＭＡ ２００５年；２９３巻（６号）：７１５〜７２２頁）に由来する。これらの研究は、Ｌｅｉｄｅｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｃｅｎｔｅｒ、Ｌｅｉｄｅｎ、 Ｔｈｅ ＮｅｔｈｅｒｌａｎｄｓのＭｅｄｉｃａｌ Ｅｔｈｉｃｓ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって承認された。すべての参加者は、参加するためにインフォームドコンセントを示した。
ＬＥＴＳ集団
ＬＥＴＳにおけるＤＶＴの事象の収集および確定は、以前に記載されている（Ｋｏｓｔｅｒら、Ｌａｎｃｅｔ １９９３年；３４２巻（８８８６〜８８８７号）：１５０３〜１５０６頁）。手短に述べると、公知の悪性疾患を有していない７０歳以下の４７４人の継続患者を、オランダ国における３つの抗凝固クリニックから１９８８年１月１日および１９９２年１２月３０日の間に動員した。それぞれの患者に対して、ＤＶＴの病歴を有していない、年齢および性別をあわせた対照参加者を登録した。参加者は、ＤＶＴについての危険因子についての質問票を完了し、血液サンプルを提供した。人種情報は収集しなかった。不適切なサンプルにより５２人の参加者を除外した後に、４４３の症例および４５３の対照が、分析に残った。
ＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２の研究
ＭＥＧＡにおけるＤＶＴの事象の収集および確定は、以前に記載されている（Ｂｌｏｍら、ＪＡＭＡ ２００５年；２９３巻（６号）：７１５〜７２２頁；ｖａｎ Ｓｔｒａｌｅｎら、Ａｒｃｈ Ｉｎｔｅｒｎ Ｍｅｄ ２００８年；１６８巻（１号）：２１〜２６頁）。ＭＥＧＡは、１９９９年３月１日および２００４年５月３１日の間にオランダ国における６つの抗凝固クリニックのうちのいずれかでＤＶＴまたは肺塞栓症（ＰＥ）の最初の診断を受けた、１８〜７０歳の継続患者を登録した。対照被験体は、患者のパートナーおよび患者群に対して年齢および性別についての頻度をあわせた無作為集団対照被験体を含んだ。参加者は、ＤＶＴについての危険因子についての質問票を完了し、血液サンプルまたは口腔スワブサンプルを提供した。質問票は、人種の代用物として、親の誕生国についての項目を含んだ。
本分析のために、ＭＥＧＡ研究は、動員日およびサンプル利用可能性（血液または口腔スワブ）に基づいて、分割して、２つの症例−対照研究を形成した。孤立性の（ｉｓｏｌａｔｅｄ）肺塞栓症または悪性障害の病歴を有する個体は、ＬＥＴＳ集団に類似する研究集団を得るために除外した。ＭＥＧＡの第１のサブセット、「ＭＥＧＡ−１」は、全員、血液サンプルを提供した１３９８の症例および１７５７の対照を含んだ。血液サンプルまたは口腔スワブサンプルのいずれかを提供した、残りの１３１４の症例および２８７７の対照は、「ＭＥＧＡ−２」に含まれた。
上記に記載される研究における参加者のベースラインの特徴は、表５において示す。
ＳＮＰ関連性研究
本研究において試験した１９，６８２のＳＮＰは、１０，８８７の遺伝子に位置し、遺伝子の機能または発現に影響する可能性があるため選択した（Ｓｈｉｆｆｍａｎら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ２００５年；７７巻（４号）：５９６〜６０５頁）。ほとんどのＳＮＰ（６９％）は、ミスセンスである。ＳＮＰの他の２４％は、ｍＲＮＡの転写因子結合部位または非翻訳領域に位置し、これらは、ｍＲＮＡの発現または安定性に影響し得る。研究したＳＮＰの９１％は、白人において少数の対立遺伝子頻度≧５％を有する。
ＳＮＰ関連性研究の設計を図１に示す。最初に、１９，６８２のＳＮＰはすべて、ＬＥＴＳのプールＤＮＡサンプルにおいて試験した。ＤＶＴと関連したＳＮＰ（Ｐ≦．０５）は、ＭＥＧＡ−１のプールＤＮＡサンプルにおいて試験した。ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１のプールの両方において関連したＳＮＰ（Ｐ≦．０５）は、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の個別のサンプルを遺伝子型解析することによって確認した。ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１において一貫してＤＶＴと関連するＳＮＰ遺伝子型（Ｐ≦．０５）は、ＭＥＧＡ−２において遺伝子型解析した。
対立遺伝子頻度および遺伝子型決定
ＤＮＡ濃度は、ＰｉｃｏＧｒｅｅｎ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ Ｃｏｒｐ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）蛍光色素を使用して、１０ｎｇ／μＬに標準化した。典型的には３０〜１００サンプルのＤＮＡプールは、症例対照状況、性別、年齢、および第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎの状況に基づいて構築した。ＤＮＡプールは、それぞれの個別のサンプルに由来する標準化ＤＮＡ溶液の等容量を混合することによって作製した。それぞれの対立遺伝子は、３ｎｇのプールＤＮＡを使用して、ＰＣＲによって別々に増幅した。プールステージにおいて、６の症例プールおよび４の対照プールをＬＥＴＳについて使用し、１３の症例プールおよび１８の対照プールをＭＥＧＡ−１について使用した。プールＤＮＡにおける対立遺伝子頻度は、動態ポリメラーゼ連鎖反応（ｋｉｎｅｔｉｃ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｃｈａｉｎ ｒｅａｃｔｉｏｎ）（ｋＰＣＲ）によって決定した（Ｇｅｒｍｅｒら、Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ ２０００年；１０巻（２号）：２５８〜２６６頁）。２つ組のｋＰＣＲアッセイをそれぞれの対立遺伝子について実行し、これらのアッセイに由来する増幅曲線は、ＳＮＰの対立遺伝子頻度を計算するために使用した（Ｇｅｒｍｅｒら、Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ ２０００年；１０巻（２号）：２５８〜２６６頁）。個別のＤＮＡサンプルの遺伝子型解析は、ｋＰＣＲアッセイにおいて０．３ｎｇのＤＮＡを使用してまたは多重オリゴライゲーションアッセイ（ＯＬＡ）を使用して、同様に実行した（Ｓｈｉｆｆｍａｎら、Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ Ｔｈｒｏｍｂ Ｖａｓｃ Ｂｉｏｌ ２００８年；２８巻（１号）：１７３〜１７９頁）。多重方法論およびｋＰＣＲの遺伝子型解析の正確さは、３つの先の研究において評価し、これらの２つの方法に由来する遺伝子型コールの全体的な一致は、＞９９％であった（Ｓｈｉｆｆｍａｎら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ２００５年；７７巻（４号）：５９６〜６０５頁；Ｉａｋｏｕｂｏｖａら、Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ Ｔｈｒｏｍｂ Ｖａｓｃ Ｂｉｏｌ ２００６年；２６巻（１２号）：２７６３〜２７６８頁；およびＳｈｉｆｆｍａｎら、Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ Ｔｈｒｏｍｂ Ｖａｓｃ Ｂｉｏｌ ２００６年；２６巻（７号）：１６１３〜１６１８頁）。ＭＥＧＡ−２においてＤＶＴと関連するＳＮＰは、ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２における被験体の＞９５％において、遺伝子型解析に成功した。
ＣＹＰ４Ｖ２領域における遺伝子改変体およびＤＶＴリスク
遺伝子ＣＹＰ４Ｖ２におけるｒｓ１３１４６２７２ ＳＮＰは、ＳＮＰ関連性研究において最も強くＤＶＴと関連した。この領域における他のＳＮＰがＤＶＴと関連するかどうかを調査するために、ＨａｐＭａｐプロジェクトからの結果を、ｒｓ１３１４６２７２（ｃｈｒ ４：１８７、２９７、２４９〜１８７、４６７、７３１）を囲む領域を同定するために使用した（Ｎａｔｕｒｅ ２００５年；４３７巻（７０６３号）：１２９９〜１３２０頁）。この領域は、対立遺伝子頻度＞２％を有する１４９のＳＮＰを含んだ（ＨａｐＭａｐ ＮＣＢＩ ｂｕｉｌｄ ３６）。対立遺伝子頻度および連鎖不均衡は、北欧および西欧に由来する祖先を有するＵｔａｈ住民を含むＨａｐＭａｐ ＣＥＰＨ集団におけるＳＮＰ遺伝子型から計算した。これらの１４９のＳＮＰのうちの４８は、直接遺伝子型解析されたまたは４８の遺伝子型解析されたＳＮＰの少なくとも１つと強い連鎖不均衡（ｒ２＞０．８）にあるこの領域における１４９のＳＮＰのうちの１４２についての代替として遺伝子型解析のために選択した（１４９のＳＮＰの残りの７つは、ｒｓ１３１４６２７２と低い連鎖不均衡にあり（ｒ２＜０．２）、そのため、観察された関連性の原因である可能性は低い）。４８のＳＮＰは、ｔａｇｇｅｒにおいてペアワイズタギングを使用して選んだ（Ｈａｐｌｏｖｉｅｗにおいて実行）（Ｂａｒｒｅｔｔら、Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ２００５年；２１巻（２号）：２６３〜２６５頁）。
４８のＳＮＰは、ＬＥＴＳにおいて最初に調査され、ｒｓ１３１４６２７２と等しくまたはそれよりも強くＤＶＴと関連したＳＮＰは、ＭＥＧＡ−１において調査した。
第ＸＩ因子アッセイ
ＬＥＴＳにおける第ＸＩ因子抗原測定は、以前に記載されている（Ｍｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ２０００年；３４２巻（１０号）：６９６〜７０１頁）。ＭＥＧＡにおいて、第ＸＩ因子レベルは、ＳＴＡ−Ｒ凝固分析機器で測定した（Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃａ Ｓｔａｇｏ、Ａｓｎｉｅｒｅｓ、Ｆｒａｎｃｅ）。ＳＴＡ ＣａＣｌ２溶液は、活性化剤として使用し、ＳＴＡ Ｕｎｉｃａｌｉｂｒａｔｏｒは、参照標準として使用し、Ｐｒｅｃｉｃｌｏｔ ｐｌｕｓ Ｉ（正常な第ＸＩ因子範囲）は、対照血漿として使用した。アッセイ内の変動係数（ＣＶ）は、５．８％であった（１０アッセイ）。アッセイ間のＣＶは、８．７％であった（４８アッセイ）。
統計分析
ハーディ−ワインベルグ期待値からの偏差は、対照において正確確率検定を使用して評価した（Ｗｅｉｒ、Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓ ＩＩ Ｓｕｎｄｅｒｌａｎｄ：Ｓｉｎａｕｅｒ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ Ｉｎｃ １９９６年）。プールＤＮＡ分析のために、フィッシャー正確確率検定は、症例と対照との間の対立遺伝子頻度の差異を評価するために使用した。表６において示されるＳＮＰの最後のセットについては、ロジスティック回帰モデルを用いて、ＤＶＴとのそれぞれのＳＮＰの関連性についてのオッズ比（ＯＲ）、９５％信頼区間（９５％ＣＩ）、および両側Ｐ値を計算し、年齢および性別について調整した。それぞれのＳＮＰについては、危険対立遺伝子の非保有者と比較した遺伝子型当たりのＯＲおよび付加モデルからの危険対立遺伝子のＯＲを計算した。この危険対立遺伝子のＯＲは、危険対立遺伝子のコピー当たりのリスク増加として解釈することができ、対応するＰ値は、ＳＮＰがＤＶＴと関連するかどうかを決定するために使用した（Ｐ≦．０５）。Ｘ染色体上のＳＮＰについては、分析は、男性および女性において別々に実施した。
ＣＹＰ４Ｖ２領域におけるＳＮＰについてのＯＲ（９５％ ＣＩ）は、第ＸＩ因子レベルおよびその領域における他のＳＮＰについての調節と共に、ロジスティック回帰によって推定した。群間の第ＸＩ因子レベルにおける差異は、ｔ−検定を用いて試験し、対立遺伝子当たりの第ＸＩ因子レベルにおける変化は、線形回帰によって推定した。分析は、ＳＡＳ バージョン９およびＳＰＳＳ ｆｏｒ Ｗｉｎｄｏｗｓ（登録商標）、１４．０．２（ＳＰＳＳ Ｉｎｃ、Ｃｈｉｃａｇｏ、Ｉｌｌ）を用いて行った。
誤り発見率
数千ものＳＮＰに関する研究は、偽陽性の付随をもたらし得る。そのため、２回の反復を、ＬＥＴＳにおける最初の発見ステージの後に実行し、誤り発見率は、ＭＥＧＡ−２において遺伝子型解析したＳＮＰについて計算した。誤り発見率は、ＳＮＰ群の間の偽陽性の予想される割合を推定し、Ｐ値および試験の数の関数となる（Ｂｅｎｊａｍｉｎｉら、Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ｔｈｅ Ｒｏｙａｌ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｓｏｃｉｅｔｙ １９９５年；（Ｓｅｒｉａｌｓ Ｂ（５７巻））：１２８９〜１３００頁）。誤り発見率は、付加モデルからの両側の調整しなかったＰ値を使用して推定した。．１０の誤り発見率は、さらなる分析のための基準として使用した（．１０の誤り発見率について、群におけるＳＮＰの１０％が、偽陽性であることに関連するとみなされることを予想する）。
結果
ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１においてＤＶＴと関連するＳＮＰ
ＬＥＴＳにおいて、１９，６８２のＳＮＰは、プールＤＮＡサンプルを使用して、患者および対照の対立遺伝子頻度を比較することによって調査した（Ｇｅｒｍｅｒら、Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ ２０００年；１０巻（２号）：２５８〜２６６頁）。これらの１９，６８２のＳＮＰのうちの１２０６がＤＶＴと関連したことが分かった（Ｐ≦．０５）。次いで、これらの１２０６のＳＮＰは、プールＤＮＡサンプルを使用して、ＭＥＧＡ−１からの患者および対照において調査した。ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の両方においてＤＶＴと関連したＳＮＰは、両方の研究において遺伝子型解析することによって確認し、１８のＳＮＰが、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の両方において、一貫して（同じ危険対立遺伝子で）ＤＶＴと関連したことが分かった（Ｐ≦．０５）（表６）。
ＭＥＧＡ−２においてＤＶＴと関連するＳＮＰ
これらの１８のＳＮＰのうちの９つは、ＤＶＴとの関連性についてＭＥＧＡ−２において引き続いて試験し（表７）、他の９つのＳＮＰについてのアッセイは、その時に利用可能ではなかった。これらの９のＳＮＰの遺伝子型は、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡの対照においてハーディ−ワインベルグ平衡から逸脱しなかった（Ｐ≦．０１）。
多くの試験を説明するために、誤り発見率を、ＭＥＧＡ−２において試験したＳＮＰについて推定した。表６において、第Ｖ因子ＬｅｉｄｅｎおよびプロトロンビンＧ２０２１０Ａ突然変異は、参照のために示すが、これらの改変体が、ＳＮＰ関連性研究に含まれなかったので、それらの誤り発見率は、計算されなかった。Ｆ９（ｒｓ６０４８）におけるＳＮＰについて、ＤＶＴとの関連性が、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１における女性において観察されなかったので、男性のみを含めた。３つのＳＮＰが、再度、ＭＥＧＡ−２においてＤＶＴと関連し（Ｐ＜．０５）、誤り発見率≦．１０であることが分かった。これらの３つのＳＮＰは、遺伝子ＣＹＰ４Ｖ２、ＳＥＲＰＩＮＣ１、およびＧＰ６に存在した。次に低いＰ値（．０６〜．１５の範囲に及ぶ）を有する４つのＳＮＰもまた、低い誤り発見率（≦．２０）を有した。これらのＳＮＰは、遺伝子ＲＧＳ７、ＮＲ１Ｉ２、ＮＡＴ８Ｂ、およびＦ９にあった。これらの７つのＳＮＰについての危険対立遺伝子の頻度は、対照の間で１０％〜８２％の範囲に及んだ。ホモ接合型保有者についてのＯＲは、他の対立遺伝子のホモ接合型と比較して、１．１９〜１．４９の範囲に及んだ。最も強くＤＶＴと関連する２つのＳＮＰは、ＣＹＰ４Ｖ２（ｒｓ１３１４６２７２、Ｐ＜．００１、誤り発見率．０００６）およびＳＥＲＰＩＮＣ１（ｒｓ２２２７５８９、Ｐ＜．００１、誤り発見率．００４）にあった。
第１染色体上の２つのＳＮＰ（ｒｓ２２２７５８９およびｒｓ６７０６５９）について、第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎ（ＦＶＬ）改変体との連鎖不均衡を調査した。アンチトロンビンをコードするＳＥＲＰＩＮＣ１におけるＳＮＰ（ｒｓ２２２７５８９）は、ＦＶＬ改変体から４．３７メガベース離れている。ＲＧＳ７におけるＳＮＰ（ｒｓ６７０６５９）は、ＦＶＬから７１．４８メガベースにある。それぞれは、ＦＶＬと弱い連鎖不均衡にあった（ｒ２＜．０１）。ＦＶＬの非保有者に分析を制限しても、どちらのＳＮＰのリスク推定値も目に見えては変化させなかった。
ＣＹＰ４Ｖ２領域におけるＳＮＰおよびＤＶＴリスク
ＤＶＴと最も強い関連性を有するＳＮＰは、シトクロムＰ４５０ファミリー４（ＣＹＰ４Ｖ２）のメンバーをコードする遺伝子に位置するｒｓ１３１４６２７２であった。この領域における４８のＳＮＰは、ＬＥＴＳ集団において遺伝子型解析し、リスクを増加させる対立遺伝子のコピー当たりのＤＶＴについてのＯＲを推定した。ｒｓ１３１４６２７２を含む４８のＳＮＰの多くについては、共通の対立遺伝子は、危険対立遺伝子であった。ＬＥＴＳにおいて、ｒｓ１３１４６２７２は、ＤＶＴについて１．２２のＯＲを有した（９５％ ＣＩ、１．００〜１．４９）。より高いＯＲは、この領域において試験した他のＳＮＰのうちの９つについて観察された。これらのＳＮＰは、ＣＹＰ４Ｖ２遺伝子、ＫＬＫＢ１（プレカリクレインをコード）遺伝子、およびＦ１１（血液凝固第ＸＩ因子をコード）遺伝子に位置した。
次いで、ＯＲ＞１．２２（ｒｓ１３１４６２７２のＯＲ）を有した４８のＳＮＰのうちの９つを選択し、ＭＥＧＡ−１において調査した。これらのＳＮＰのうちの５つが、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の両方においてＤＶＴと関連することが分かった：ｒｓ１３１４６２７２、ｒｓ３０８７５０５、ｒｓ３７５６００８、ｒｓ２０３６９１４、およびｒｓ４２５３４１８（表８）。ＫＬＫＢ１におけるｒｓ３０８７５０５ ＳＮＰは、最も高いリスク推定値を有した：主要な対立遺伝子ホモ接合型対少数の対立遺伝子ホモ接合型についてＯＲ３．６１（９５％ ＣＩ、１．４８〜８．８２）。これらの５つのＳＮＰの間の相互調整は、これらの５つの関連性のうちのいずれかが、他の４つのＳＮＰによって説明されることを示さなかった。
ＣＹＰ４Ｖ２領域におけるＳＮＰおよび第ＸＩ因子レベル
Ｆ１１遺伝子が、ｒｓ１３１４６２７２の近くに位置し、第ＸＩ因子レベルが、ＬＥＴＳ集団においてＤＶＴと関連することが以前に報告されているので、ＳＮＰおよび第ＸＩ因子レベルの間の関連性が、ＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性を説明するかどうかを調査した（Ｍｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ２０００年；３４２巻（１０号）：６９６〜７０１頁）。ＬＥＴＳにおいて、第９０百分位数以上の第ＸＩ因子レベルは、ＤＶＴの２倍のリスクの増加と関連することが示された（Ｍｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ２０００年；３４２巻（１０号）：６９６〜７０１頁）。高い第ＸＩ因子レベル（＞第９０百分位数）もまた、ＭＥＧＡにおいてＤＶＴと関連することが分かった（ＯＲ１．９、９５％ ＣＩ、１．６〜２．３）。
１８のステージ３のＳＮＰのうちの９つのみを、ステージ４におけるＭＥＧＡ−２ ＤＮＡにおいて実際に試験した。これについての理由は、ＭＥＧＡ−２ ＤＮＡを保存するために、ステージ４ ＳＮＰは、多重オリゴライゲーションアッセイを使用して遺伝子型解析し、９つのステージ３のＳＮＰのみについてのアッセイが、この研究の時点で利用可能であったからである。
ＤＶＴと関連したＣＹＰ４Ｖ２領域の７つのＳＮＰはすべて、リスクを増加させる対立遺伝子を保有したものについてのより高い第ＸＩ因子レベルと共に、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１における第ＸＩ因子レベルと関連した（表８）。組み合わせたＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の研究において第ＸＩ因子レベルを調整することによって、第ＸＩ因子レベルが、これらの５つのＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性を媒介するかどうかを調査した。５つのＳＮＰすべてについて、第ＸＩ因子レベルの調節は、ＤＶＴとの関連性を弱めたが、関連性はどれもなくならなかった。興味深いことに、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の組み合わせた分析においてＤＶＴと関連しなかった５つのＳＮＰ（ｒｓ３７３６４５６、ｒｓ４２５３２５９、ｒｓ４２５３４０８、ｒｓ４２５３３２５、およびｒｓ３７７５３０２）もまた、ＬＥＴＳにおいて第ＸＩ因子レベルと関連しなかった。
分析はすべて、年齢および性別について、調整した状態および調節しない状態で実行し、ＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２における分析は、両親が、北−西欧に生まれた群に制限した状態および制限しない状態で実行した。どちらも結果に影響を与えなかったので、非調整ＯＲを示す。
考察
３１５５の症例および５０８７の対照を含む、３つの大規模な十分に特徴づけられた集団においてＤＶＴと関連する７つのＳＮＰが同定された。証拠は、ＣＹＰ４Ｖ２、ＳＥＲＰＩＮＣ１、およびＧＰ６における３つのＳＮＰについて最も強かった。これらのＳＮＰが、血液凝固において明瞭な役割を有する遺伝子にあるまたはそれに近いことが示されることは興味深い。
１９，６８２のＳＮＰの試験は、偽陽性の関連性をもたらすであろう。そのため、ＳＮＰは、３つの大規模な研究において調査し、試験したＳＮＰについての誤り発見率は、第３の研究において推定した。ＣＹＰ４Ｖ２、ＳＥＲＰＩＮＣ１、およびＧＰ６における３つのＳＮＰは、ＤＶＴと関連し、誤り発見率は＜１０％であり、これは、これらの３つのＳＮＰの＜１０％が、偽陽性であることが予想されることになるということを意味する。＜２０％に誤り発見率を緩めることにより、ＤＶＴと関連するＲＧＳ７、ＮＲ１Ｉ２、ＮＡＴ８Ｂ、およびＦ９における４つのＳＮＰが追加されることになる。
ＤＶＴとの関連性についての最も強い証拠を有する３つのＳＮＰは、ＣＹＰ４Ｖ２、ＳＥＲＰＩＮＣ１、およびＧＰ６にあった。ＣＹＰ４Ｖ２は、血栓症に関連づけられることが公知ではないＣＹＰ４５０ファミリー４のメンバーをコードする（Ｌｅｅら、Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ ２００１年；４２巻（８号）：１７０７〜１７１４頁およびＬｉら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ２００４年；７４巻（５号）：８１７〜８２６頁）。ＣＹＰ４Ｖ２は、凝固タンパク質プレカリクレイン（ＫＬＫＢ１）および第ＸＩ因子（Ｆ１１）をコードする遺伝子を含む領域において第４染色体上に位置する。ＣＹＰＶ４２／ＫＬＫＢ１／Ｆ１１遺伝子座における他の４つのＳＮＰもまた、ＤＶＴと関連すると同定された。ＤＶＴとの、ＣＹＰ４Ｖ２およびＫＬＫＢ１における遺伝子改変体の関連性についての先の報告は存在しない。プレカリクレインレベルおよびＤＶＴの間の関連性についての証拠は存在しないが、第ＸＩ因子レベルの上昇についての証拠はある（Ｓｏｕｔｏら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ２０００年；６７巻（６号）：１４５２〜１４５９頁；Ｍｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ２０００年；３４２巻（１０号）：６９６〜７０１頁；およびＧａｌｌｉｍｏｒｅら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｒｅｓ ２００４年；１１４巻（２号）：９１〜９６頁）。
ＳＥＲＰＩＮＣ１は、自然の抗凝固における中心的な役割を果たす、第１染色体上に位置するセリンプロテアーゼ阻害剤であるアンチトロンビンをコードする。アンチトロンビンの欠乏は、まれであるが、強い血栓症の傾向をもたらす（Ｇａｌｌｉｍｏｒｅら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｒｅｓ ２００４年；１１４巻（２号）：９１〜９６頁）。ＳＥＲＰＩＮＣ１におけるＳＮＰ（ｒｓ２２２７５８９）は、対照において１０％の少数の対立遺伝子頻度を有し、中程度の血栓症の傾向と関連した。ＧＰ６は、血小板のコラーゲン誘発性の活性化および凝集における重大な役割を果たす５８ｋＤ血小板膜糖タンパク質である糖タンパク質ＶＩをコードし、ＤＶＴにおける役割を果たし得る（Ｍａｓｓｂｅｒｇら、Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ ２００３年；１９７巻（１号）：４１〜４９頁およびＣｈｕｎｇら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ ２００７年；５巻（５号）：９１８〜９２４頁）。
遺伝子Ｆ９、ＮＲ１Ｉ２、ＲＧＳ７、およびＮＡＴ８ＢにおけるＳＮＰは重要である。Ｆ９は、ビタミンＫ依存性凝固因子である第ＩＸ因子をコードし、高いレベルの第ＩＸ因子は、ＤＶＴのリスクを増加させることが示された（ｖａｎ Ｈｙｌｃｋａｍａ Ｖｌｉｅｇら、Ｂｌｏｏｄ ２０００年；９５巻（１２号）：３６７８〜３６８２頁）。Ｆ９ Ｍａｌｍｏとしても公知であるＳＮＰ ｒｓ６０４８は、第ＩＸ因子の活性化ペプチドの第３のアミノ酸残基に共通の多型である（ＭｃＧｒａｗら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ Ｕ Ｓ Ａ １９８５年；８２巻（９号）：２８４７〜２８５１頁）。
ＣＹＰ４Ｖ２におけるＳＮＰ（ｒｓ１３１４６２７２）は、血液凝固第ＸＩ因子をコードする遺伝子の近くに位置する。第ＸＩ因子レベルは、ＬＥＴＳおよび家系図の大規模な分析においてＤＶＴと関連することが報告された（Ｓｏｕｔｏら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ２０００年；６７巻（６号）：１４５２〜１４５９頁およびＭｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ２０００年；３４２巻（１０号）：６９６〜７０１頁）。ＤＶＴおよび第ＸＩ因子のレベルの間の関連性は、ＭＥＧＡにおいて確認した。興味深いことに、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の両方においてＤＶＴと関連した、ＣＹＰ４Ｖ２領域における５つのＳＮＰもまた、第ＸＩ因子レベルと関連した。しかしながら、これらの５つのＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性は、第ＸＩ因子レベルの調整が、これらの５つのＳＮＰの過剰なＤＶＴリスクを除去しなかったので、第ＸＩ因子レベルにおける変化によって完全に説明されるようにはみえない。したがって、これらの遺伝子改変体と関連するリスクのほんの一部が、第ＸＩ因子のレベルを通して媒介される場合、リスクのうちのいくつかはまた、タンパク質機能に対する影響に起因する可能性もある。
Ｆ１１遺伝子におけるいくつかの改変体（ｒｓ５９７４、ｒｓ５９７０、ｒｓ５９７１、ｒｓ５９６６、ｒｓ５９７６、およびｒｓ５９７３）は、ＤＶＴおよびアテローム性動脈硬化症を有する患者において第ＸＩ因子レベルとの関連性について以前に試験されたが、関係は観察されなかった（Ｇｅｒｄｅｓら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ ２００４年；２巻（６号）：１０１５〜１０１７頁）。本研究において、ｒｓ５９７４（５９７０とｒ２＝１．０）およびｒｓ５９７１（５９６６およびｒｓ５９７６とｒ２＝１．０）は、ＬＥＴＳにおいてＤＶＴと関連しなかった。ｒｓ５９７３は、その少数の対立遺伝子頻度が２％未満だったので、遺伝子型解析されなかった（ＨａｐＭａｐ ＣＥＰＨ集団）。西アフリカのボランティアに関する研究において、ｒｓ３８２２０５６およびｒｓ３７３３４０３は、転写因子結合親和性およびわずかに増加した第ＸＩ因子レベルと関連したが、どちらのＳＮＰも、ＬＥＴＳにおいてＤＶＴと関連しなかった。白人の閉経後の女性の間の研究において、ｒｓ３８２２０５７およびｒｓ２２８９２５２は、ＤＶＴと関連した（Ｔａｒｕｍｉら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ ２００３年；１巻（８号）：１８５４〜１８５６頁およびＳｍｉｔｈら、ＪＡＭＡ ２００７年；２９７巻（５号）：４８９〜４９８頁）。ＣＹＰＶ４２領域における５つのＳＮＰのうちの２つが、ＤＶＴと一貫して関連し、第ＸＩ因子レベルが、ｒｓ３８２２０５７（ｒｓ２０３６９１４とｒ２＝０．９）およびｒｓ２２８９２５２（ｒｓ３７５６００８とｒ２＝０．８）と連鎖不均衡にあるので、これらの関連性の両方は、本研究において間接的に確認された。
本明細書において記載された改変体が一般的であるので、それらは、とりわけ他の危険因子と組み合わせた場合、ＤＶＴリスクの決定のための特に有用なマーカーとなり得る。
この分析は、北−西欧の集団に限られた。ＬＥＴＳにおいて、人種についての情報は、収集しなかった。しかしながら、ＭＥＧＡ参加者がＬＥＴＳと同じ集団から動員されたので、集団の層別化は、結果をかたよらせなかったと考えられるが、１０年後の、ＭＥＧＡの９０％は、北−西欧に生まれた両親を有した。さらに、ＭＥＧＡのこの９０％に分析を制限することにより、結果を改変しなかった。
結論
数千ものＳＮＰを、無関係の個体においてＤＶＴとの関連性について試験し、これらのＳＮＰのうちの７つは、一貫してＤＶＴリスクと関連することが分かった。ＣＹＰ４Ｖ２領域において、ＤＶＴおよび第ＸＩ因子のレベルの両方と関連するいくつかのＳＮＰが同定された。
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
 （実施例２）
Ｆ９ ＭＡＬＭＯおよび深部静脈血栓症の間の関連性
序論
ＬＥＴＳにおいて、第９０百分位数（１２９Ｕ／ｄＬ）を超える第ＩＸ因子のレベルの上昇は、ＤＶＴの２〜３倍のリスクの増加と関連した（ｖａｎ Ｈｙｌｃｋａｍａ Ｖｌｉｅｇら、Ｂｌｏｏｄ． ２０００年；９５巻：３６７８〜３６８２頁）。全ゲノムスキャンは、実施例１において上記に記載されるように、ＤＶＴのリスクと関連した新規な遺伝子多型について最近実行された。同定されたＳＮＰのうちの１つは、第ＩＸ因子をコードする遺伝子におけるＡ−Ｇ多型（ｒｓ６０４８、Ｆ９「Ｍａｌｍｏ」）であり、ＤＶＴの３つの症例−対照研究におけるＤＶＴリスクにおける１８％の減少と関連した。この共通改変体（少数の対立遺伝子頻度＝．３２）は、第ＩＸ因子チモーゲンの位置１４８でのＴｈｒに対するＡｌａへの置換を引き起こし、チモーゲンから切断されて、第ＩＸ因子プロテアーゼを活性化し、ＤＶＴまたは血友病Ｂのリスクと以前に関連していなかった領域内に位置する（Ｇｒａｈａｍら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ． １９８８年；４２巻：５７３〜５８０頁）。したがって、Ｆ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰがＤＶＴのリスクの低下に至るメカニズムは不明である。
実施例２においてここで記載される研究において、Ｆ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性が、トロンビン生成、第ＩＸ因子血漿レベル、または第ＩＸ因子の活性化に影響するＭａｌｍｏ ＳＮＰによって説明することができるかどうかを決定した。Ｆ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性が、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよび他の第ＩＸ因子改変体の間の連鎖不均衡によって説明することができるかどうかもまた決定した。
方法
研究集団およびデータ収集
ＤＶＴとの遺伝子型の関連性を分析するために使用した症例対照集団（ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２）は、２つの大規模な集団ベースの症例−対照研究に由来する；静脈血栓症研究についての危険因子のＬｅｉｄｅｎ Ｔｈｒｏｍｂｏｐｈｉｌｉａ Ｓｔｕｄｙ（ＬＥＴＳ）およびＭｕｌｔｉｐｌｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ（ＭＥＧＡ）（ｖａｎ ｄｅｒ Ｍｅｅｒら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． １９９７年；７８巻：６３１〜６３５頁；Ｂｌｏｍら、ＪＡＭＡ． ２００５年；２９３巻：７１５〜７２２頁）。ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡの研究は、Ｌｅｉｄｅｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｃｅｎｔｅｒ、Ｌｅｉｄｅｎ、Ｔｈｅ ＮｅｔｈｅｒｌａｎｄｓのＭｅｄｉｃａｌ Ｅｔｈｉｃｓ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって承認された。すべての参加者は、研究に参加するためにインフォームドコンセントを示し、静脈血栓症に対する危険因子についての質問票を完成し、血液サンプルまたは口腔スワブサンプルを提供した。診断は、病院退院記録および一般開業医からの情報を使用して、客観的に確認した。ＬＥＴＳは、ＤＶＴが確認された患者のみを含んだ。ＭＥＧＡにおいて、患者の９０％は、彼らの医療記録を閲覧することに同意し、この群内で、９７％の診断を確認した。ＤＶＴが医療記録に従って除外された患者は、ＭＥＧＡ研究から除外した。Ｎｏｒｔｈｗｉｃｋ Ｐａｒｋ Ｈｅａｒｔ Ｓｔｕｄｙ−ＩＩ（ＮＰＨＳ−ＩＩ）からのサンプルは、Ｆ９切断ペプチドの関連性およびＭａｌｍｏ遺伝子型との関連性を評価するために使用した（Ｍｉｌｌｅｒら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． １９９６年；７５巻：７６７〜７７１頁）。
ＬＥＴＳにおける事象の収集および確定は、以前に記載されている（ｖａｎ ｄｅｒ Ｍｅｅｒら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． １９９７年；７８巻：６３１〜６３５頁）。手短に述べると、症例は、オランダ国の西部における３つの抗凝固クリニック：Ｌｅｉｄｅｎ、Ａｍｓｔｅｒｄａｍ、およびＲｏｔｔｅｒｄａｍから１９８８年１月１日および１９９２年１２月３０日の間に動員した。最初のＤＶＴの診断を有し、公知の悪性疾患を有していない７０歳以下の総数４７４の継続症例を含んだ。それぞれの症例について、ＤＶＴの病歴を有していない、年齢（±５歳）および性別をあわせた対照参加者を登録した。ＬＥＴＳの本研究において、５２人の参加者は、ＤＮＡの不適切な量または質により除外した。これらの除外の後に、４４３の症例および４５３の対照が残った。
ＭＥＧＡにおける事象の収集および確定は、以前に記載されている（Ｂｌｏｍら、ＪＡＭＡ． ２００５年；２９３巻：７１５〜７２２頁）。手短に述べると、ＭＥＧＡ−１は、１９９９年３月１日および２００４年５月３１日の間にオランダ国における６つの抗凝固クリニック（Ａｍｓｔｅｒｄａｍ、Ａｍｅｒｓｆｏｏｒｔ、Ｔｈｅ Ｈａｇｕｅ、Ｌｅｉｄｅｎ、Ｒｏｔｔｅｒｄａｍ、およびＵｔｒｅｃｈｔ）のうちのいずれかでＤＶＴまたは肺塞栓症（ＰＥ）の彼らの最初の診断を示した、１８〜７０歳の継続患者を登録した。ＭＥＧＡにおける対照被験体は、患者のパートナーおよび無作為集団対照被験体を含み、年齢および性別の分布が患者群と一致するように選択した。血液サンプルを提供した最初の４，５００人のＭＥＧＡ参加者を、ＭＥＧＡ−１研究に含めた。ＤＮＡの不適切な量もしくは質（ｎ＝３７０）、悪性疾患（ｎ＝２７２）、または孤立性のＰＥ（ｎ＝７１１）の診断を有するＭＥＧＡ−１参加者は除外した。これらの除外の後で、１，３９８の症例および１，７８５の対照が、ＭＥＧＡ−１集団に残った。血液サンプルまたは口腔スワブサンプルのいずれかを提供した、さらなる５，６７３のＭＥＧＡ参加者を、ＭＥＧＡ−２研究に含めた。ＭＥＧＡ−２参加者は、彼らが、ＤＮＡの不適切な量もしくは質（ｎ＝４６７）、悪性疾患（ｎ＝４３３）、または孤立性のＰＥ（ｎ＝６３９）の診断を有した場合、分析から除外した。これらの除外の後に、１，３１４の症例および２，８７７の対照が、ＭＥＧＡ−２研究に残った。
Ｎｏｒｔｈｗｉｃｋ Ｐａｒｋ Ｈｅａｒｔ Ｓｔｕｄｙ−ＩＩ（ＮＰＨＳ−ＩＩ）は以前に記載されている（Ｍｉｌｌｅｒら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． １９９６年；７５巻：７６７〜７７１頁）。手短に述べると、ＥｎｇｌａｎｄおよびＳｃｏｔｌａｎｄにおける９つの一般的な医療機関に登録された５０〜６３歳の４６００人の男性を、ＮＰＨＳ−ＩＩにおける適格性についてスクリーニングした。元の研究に関しての除外基準は、不安定狭心症または急性心筋梗塞（ＡＭＩ）の病歴；心電図（ＥＣＧ）上の大きなＱ波；定期的な抗血小板療法または抗凝固療法；脳血管疾患；生命に危険のある悪性疾患；スタッフを危険にさらすまたはインフォームドコンセントをできなくする条件を含んだ。これらのうち、７９６人が書面のインフォームドコンセントを示し、施設倫理委員会によって承認され、ベースラインでのＦ９切断ペプチドを測定した。
対立遺伝子頻度および遺伝子型決定
ＤＮＡ濃度は、ＰｉｃｏＧｒｅｅｎ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ、Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ Ｃｏｒｐ、Ｃａｒｌｓｂａｄ、ＣＡ）蛍光色素を使用して、１０ｎｇ／μＬに標準化した。個別のＤＮＡサンプルの遺伝子型解析は、ｋＰＣＲアッセイにおいて０．３ｎｇのＤＮＡを使用してまたは多重オリゴライゲーションアッセイ（ＯＬＡ）を使用して、実施例１において先に記載されるように実行した（Ｉａｎｎｏｎｅら、Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ． ２０００年；３９巻：１３１〜１４０頁）。多重方法論およびｋＰＣＲの遺伝子型解析の正確さは、同じＳＮＰについて、多重ＯＬＡアッセイからの遺伝子型コールをリアルタイムｋＰＣＲアッセイからのものと比較することによって、３つの先の研究において評価し、これらの２つの方法に由来する遺伝子型コールの全体的な一致は、これらの研究のそれぞれにおいて＞９９％であった（Ｉａｋｏｕｂｏｖａら、Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ Ｔｈｒｏｍｂ Ｖａｓｃ Ｂｉｏｌ． ２００６年；２６巻：２７６３〜２７６８頁；Ｓｈｉｆｆｍａｎら、Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ Ｔｈｒｏｍｂ Ｖａｓｃ Ｂｉｏｌ． ２００６年；２６巻：１６１３〜１６１８頁；およびＳｈｉｆｆｍａｎら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ． ２００５年；７７巻：５９６〜６０５頁）。
統計分析
ハーディ−ワインベルグ期待値からの偏差は、対照において正確確率検定を使用して評価した（Ｗｅｉｒ、Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓ ＩＩ． Ｓｕｎｄｅｒｌａｎｄ：Ｓｉｎａｕｅｒ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ Ｉｎｃ．；１９９６年）。共変量（年齢および性別）についての調節は、それぞれ、非危険ホモ接合型、ヘテロ接合型、および危険ホモ接合型について０、１、および２とコードした遺伝子型を用いて、ロジスティック回帰分析を使用して実行した。ロジスティック回帰モデルは、結果と共に、それぞれの遺伝子型（２つの指標変数としてコードしたヘテロ接合型および危険ホモ接合型）の関連性を評価するために実行した。ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１における統計的検定のＰ値はすべて両側とした。ＳＮＰの分析は、ＳＮＰが、Ｘ染色体上にあったので、男性および女性において別々に実施した。ＳＡＳバージョン９は、すべての回帰モデルに関して使用した。
オッズ比（ＯＲ）および９５％信頼区間（９５％ ＣＩ）は、先に記載されるように年齢についての調節を伴うロジスティック回帰を使用して、男性におけるそれぞれのタグＳＮＰと関連するＤＶＴのリスクの推定値として算出した。対立遺伝子ＯＲについて、主要な対立遺伝子ホモ接合型は、参照群として使用した。遺伝子型カテゴリーの間の第ＩＸ因子レベルにおける差異は、ｔ−検定を使用して、ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２の対照被験体において評価した。経口抗凝固物質を用いる被験体は除外した。第ＩＸ因子レベルは、ＬＥＴＳにおける１９１人の男性および２６１人の女性の被験体、ＭＥＧＡ１における８２９人の男性および９１６人の女性の被験体、ＭＥＧＡ２における、４８４人の男性および２５３４人の女性の被験体について入手可能であった。ＮＰＨＳ−ＩＩにおけるベースラインでのＦ９切断ペプチドの測定値を有する７９６人の中で、遺伝子型カテゴリーの間の第ＩＸ因子切断ペプチドにおける差異は、ｔ−検定を使用して、ＮＰＨＳ−ＩＩにおいて評価した。回帰分析およびｔ−検定は、ＳＡＳを用いて実行した。ＮＰＨＳ−ＩＩにおける回帰は、年齢、フィブリノーゲンおよびクレアチニンのレベルについて調整した。
Ｆ９遺伝子型によって規定される群の間の平均Ｆ９切断ペプチドにおける差異を検出するための検出力は、両側有意性レベル０．０５で２サンプルｔ−検定についてｎＱｕｅｒｙ Ａｄｖｉｓｏｒバージョン４．０（ｒｅｆ）を使用し、群の間の等分散を仮定して計算した（Ｅｌａｓｈｏｆｆ、ｎＱｕｅｒｙ Ａｄｖｉｓｏｒ Ｖｅｒｓｉｏｎ ４．０ Ｕｓｅｒ’ｓ Ｇｕｉｄｅ． Ｌｏｓ Ａｎｇｅｌｅｓ、ＣＡ（２０００年））。
メタ分析は、固定効果として個別の研究を処理することによって、Ｒソフトウェア言語バージョン２．４．１において利用可能なメタパッケージバージョン０．８〜２を使用して（Ｒ： Ａ Ｌａｎｇｕａｇｅ ａｎｄ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔ ｆｏｒ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｃｏｍｐｕｔｉｎｇ、Ｒ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ Ｃｏｒｅ Ｔｅａｍ、Ｒ Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ ｆｏｒ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｃｏｍｐｕｔｉｎｇ、Ｖｉｅｎｎａ Ａｕｓｔｒａｌｉａ、２００７年、ＩＳＢＮ ３−９０００５１−０７−０）およびＳＮＰのプール効果を推定するために逆分散法を使用して（Ｃｏｏｐｅｒら、Ｔｈｅ Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ． Ｎｅｗｂｕｒｙ Ｐａｒｋ、ＣＡ：Ｒｕｓｓｅｌｌ Ｓａｇｅ Ｆｏｕｎｄａｔｉｏｎ（１９９４年））実行した。
Ｆ９領域における遺伝子改変体およびＤＶＴリスク
この領域における他のＳＮＰがＤＶＴと関連し得るかどうかを調査するために、ＨａｐＭａｐプロジェクトからの結果を用いて、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰ ｒｓ６０４８（ｃｈｒＸ：１３８，４０４，９５１〜１３８，４９４，０６３）を囲む領域を同定した。この領域は、対立遺伝子頻度＞２％を有する４８のＳＮＰを含んだ（ＨａｐＭａｐデータリリース＃２２１、フェーズＩＩ ４月０７、ＮＣＢＩ Ｂ３６アセンブリ、ｄｂＳＮＰ １２６）（Ｂｅｒｔｉｎａら、Ｐａｔｈｏｐｈｙｓｉｏｌ Ｈａｅｍｏｓｔ Ｔｈｒｏｍｂ． ２００３年；３３巻：３９５〜４００頁）。対立遺伝子頻度およびＬＤは、北欧および西欧に由来する祖先を有するＵｔａｈ住民を含むＨａｐＭａｐ ＣＥＰＨ集団におけるＳＮＰ遺伝子型から計算した。１８のＳＮＰは、Ｔａｇｇｅｒにおけるペアワイズタギングを使用して選ばれた（Ｈａｐｌｏｖｉｅｗにおいて実行（Ｓｃｈａｉｄら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ． ２００２年；７０巻：４２５〜４３４頁））。これらの１８のＳＮＰのうちの１５を、遺伝子型解析のために選択した。４５のＳＮＰが、直接遺伝子型解析されるまたは４８の遺伝子型解析したＳＮＰの少なくとも１つと強い連鎖不均衡（ｒ２＞０．８）にあるかのいずれかであるので、これらの１５のＳＮＰは、この領域における４８のＳＮＰのうちの４５についての適切な代替である。１８のＳＮＰのうちの３つについてのアッセイは、構築することができず（ｒｓ４１４９７５４、ｒｓ４３８６０１、およびｒｓ１７３４０１４８）、これらの３つのＳＮＰは、それらがｒｓ６０４８と強いＬＤになかった（ｒ２＜０．２）ので、ｒｓ６０４８およびＤＶＴの間で観察された関連性の原因である可能性は低い。４８のＳＮＰの残りの１４は、候補ＳＮＰとした（Ｋｈａｃｈｉｄｚｅ、Ｓｅａｔｔｌｅ ＳＮＰｓ ｄｂ、Ｐｓａｔｙ ＪＡＭＡ）。全体で２９のＳＮＰを、ＬＥＴＳの男性において最初に調査し、ＤＶＴと関連したＳＮＰは、ＭＥＧＡ−１の男性において調査した。それぞれの遺伝子型およびＤＶＴの間の関連性は、フィッシャー正確確率検定を使用して評価した。
ハプロタイプおよびＤＶＴの間の関連性は、ハプロタイプ頻度を推定するための期待値最大化アルゴリズムを使用するｈａｐｌｏ．ｓｔａｔｓのＲ言語パッケージを使用して評価し（Ｓｃｈａｉｄら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ． ２００２年；７０巻：４２５〜４３４頁）、その後、スコア検定を使用してハプロタイプおよび疾患の間の関連性について試験した。スライドウィンドウを使用して、男性の被験体において、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよび２８の他のタギングＳＮＰを含むＳＮＰのセットから、３、５、および７つの隣接したＳＮＰからなるハプロタイプを選択し、試験した。
第ＩＸ因子アッセイ
第ＩＸ因子のレベルは、以前に記載されるように酵素結合イムノソルベントアッセイ（ＥＬＩＳＡ）によって決定した（ｖａｎ Ｈｙｌｃｋａｍａ Ｖｌｉｅｇら、Ｂｌｏｏｄ． ２０００年；９５巻：３６７８〜３６８２頁）。このＥＬＩＳＡは、第ＩＸ因子に対して高度に特異的であり、結果は、他のビタミンＫ依存性タンパク質のレベルによって影響されない。これらの条件下で、アッセイ内およびアッセイ間のＣＶは、約１００Ｕ／ｄＬの第ＩＸ因子抗原レベルで、それぞれ、７％（ｎ ５ ９）および７．２％（ｎ ５ ４１）であった。結果は、１デシリットル当たりの単位で表現し、ここで、１Ｕは、１ｍＬのプールした正常血漿中に存在する第ＩＸ因子の量である。
ＮＰＨＳ−ＩＩにおけるＦ９切断ペプチド
Ｆ９切断ペプチドは、ＮＰＨＳ−ＩＩサンプルにおける第ＩＸ因子の代謝回転のマーカーとして二重抗体ラジオイムノアッセイによって決定した（Ｂａｕｅｒら、Ｂｌｏｏｄ． １９９０年；７６巻：７３１〜７３６頁）。分割したサンプルの反復測定の間になされた測定についての変動係数（ＣＶ）は、第ＩＸ因子切断ペプチドについて１４．７％であった。血漿における切断ペプチドのレベルは、第ＩＸ因子レベルに依存し、これは、年齢および炎症によって、また腎臓機能に影響される。炎症および腎臓機能の影響は、それぞれ、フィブリノーゲンおよびクレアチニンのレベルについての分析を調整することによって評価した。
内因性トロンビン生成能（Ｅｎｄｏｇｅｎｏｕｓ Ｔｈｒｏｍｂｉｎ Ｐｏｔｅｎｔｉａｌ）（ＥＴＰ）ベースのＡＰＣ感受性試験
内因性トロンビン生成能（ＥＴＰ）は、凝固が、外因性の経路を介して開始される、血漿において生成されたトロンビンの時間積分を定量する活性化プロテインＣ（ＡＰＣ）感受性試験である（Ｈｅｍｋｅｒら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． １９９５年；７４巻：１３４〜１３８頁およびＮｉｃｏｌａｅｓら、Ｂｌｏｏｄ Ｃｏａｇｕｌ Ｆｉｂｒｉｎｏｌｙｓｉｓ． １９９７年；８巻：２８〜３８頁）。ＡＰＣに対する血漿ＥＴＰの感度は、以前に記載されるように、試験が、血漿中に存在する少量のリン脂質に対して非感受性である条件下で測定した（Ｒｏｓｉｎｇら、Ｂｒ Ｊ Ｈａｅｍａｔｏｌ． １９９７年；９７巻：２３３〜２３８頁；Ｔａｎｓら、Ｂｒ Ｊ Ｈａｅｍａｔｏｌ． ２００３年；１２２巻：４６５〜４７０頁；およびＣｕｒｖｅｒｓら、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． ２００２年；８７巻：４８３〜４９２頁）。
結果
Ｍａｌｍｏ ＳＮＰは、女性ではなく男性においてＤＶＴと関連することが以前に分かった。先の分析において、１つを超える、細胞のすべてのＸ染色体がランダムな方式で不活性化されるプロセスであるライオニゼーションが、発現された遺伝子型を、決定された遺伝子型とは異なるようにするので、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰに対してヘテロ接合型であった女性は分析から除外した。女性における分析においてヘテロ接合型を除去することにより、女性における、遺伝子型およびＤＶＴの間の関連性を検出するための検出力を低下させ、このことは、女性におけるＤＶＴとのＭａｌｍｏの関連性が、男性において見つけられたＯＲに類似する、ＤＶＴについてのＯＲを有したが、有意ではなかった理由を説明することができる。Ｍａｌｍｏ ＳＮＰ（ｒｓ６０４８）は、男性においてＤＶＴと関連し、プールオッズ比は、Ｇ遺伝子型（ｎ＝１１０８）と比較して、Ａ遺伝子型（ｎ＝２６８８）について０．８０（９５％ ＣＩ、０．７１〜０．９２）であったが、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰは、女性においてＤＶＴと関連せず、プールオッズ比は、ＧＧ遺伝子型（ｎ＝４０５）と比較して、ＡＡ遺伝子型（ｎ＝２１９０）について０．８６（９５％ ＣＩ、０．７０〜０．１．０５）であったことが分かった（図２）。したがって、この研究についての分析は、男性において行った。
Ｆ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性は、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよび内因性トロンビン生成能（ＥＴＰ）の間の関連性によって説明することができるかどうかを決定した。ＥＴＰ測定値が入手可能であったＬＥＴＳの１６１人の男性被験体の間で、Ｍａｌｍｏ遺伝子型が、ＥＴＰと関連しなかったことが分かった（Ａ遺伝子型について中央値ＥＴＰ＝１６５７±３４１およびＧ遺伝子型について１５８３±３６１）。
Ｆ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性は、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよび第ＩＸ因子血漿レベルの間の関連性によって説明することができるかどうかを決定した。第ＩＸ因子血漿レベルが入手可能であった男性の被験体の間で（ＬＥＴＳにおいて１６１人、ＭＥＧＡ１において８２９人、およびＭＥＧＡ２において４８４人）、Ａ遺伝子型およびＧ遺伝子型の間の第ＩＸ因子レベルにおいて有意差はなかった。ＬＥＴＳ被験体について、平均ＦＩＸレベルは、Ａ遺伝子型について１０４±１７％およびＧ遺伝子型について１０９±２４％、Ｐ＝０．０９６５であった。ＭＥＧＡ−１被験体について、平均第ＩＸ因子レベルは、遺伝子型Ａを有する患者について１０４±１７％およびＧ遺伝子型について１０２±１８％、Ｐ＝０．１１９であった。ＭＥＧＡ−２被験体について、平均第ＩＸ因子レベルは、遺伝子型Ａについて１０４±１５％およびＧ遺伝子型について１０４±１８％、Ｐ＝１．０であった）。
Ｆ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性は、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよび第ＩＸ因子の活性化の間の関連性によって説明することができるかどうかを決定した。血漿Ｆ９切断ペプチドレベルが入手可能であったＮＰＨＳ−ＩＩの７９６人の男性被験体の間で、Ａ遺伝子型およびＧ遺伝子型の間の第ＩＸ因子レベルにおいて有意差はなく、Ｆ９切断ペプチドの平均血漿濃度は、Ａ遺伝子型について２１０．９＋−７５．０４（９５％ Ｃｌ：２０４．６〜２１７．２）およびＧ遺伝子型について２１４．１＋−７３．８２（９５％ Ｃｌ：２０４．７〜２２３．４）であった。年齢、フィブリノーゲンおよびクレアチニンのレベルについての調節は、目に見えてはこの結果を変化させなかった。研究は、０．２２の標準偏差の平均値において差異を検出するための８０％以上の検出力または．２５の標準偏差の平均値において差異を検出するための９０％以上の検出力を有した。
次いで、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰは、ＤＶＴと関連する他のＦ９改変体と連鎖不均衡（ＬＤ）にあるかどうかを決定した。ＬＥＴＳ集団において、Ｘ染色体上でＭａｌｍｏ ＳＮＰを囲む８９ｋｂの領域において０．８以上のＬＤを有するＳＮＰ群を代表する２９のＳＮＰを調査した。Ｍａｌｍｏ ＳＮＰを含む２９のＳＮＰのうちの６つが、ＤＶＴと関連することが分かった（Ｐ≦０．０５）（表９）。次いで、これらの６つのＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性を、ＭＥＧＡ−１研究において調査し、これらのＳＮＰのうちの２つは、ＭＥＧＡ−１においてＤＶＴと有意に関連することが分かった：Ｍａｌｍｏ ＳＮＰおよびｒｓ４２２１８７（Ｍａｌｍｏ ＳＮＰから３００ｂｐのイントロン性ＳＮＰ）（表９）。ｒｓ４２２１８７およびＤＶＴの間の関連性についてのリスク推定値は、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰのそれに類似し、ｒｓ４２２１８７およびＭａｌｍｏ ＳＮＰの間のＬＤは高かった（ｒ２＝０．９４）。さらに、Ｆ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰよりも、ＬＥＴＳまたはＭＥＧＡの研究においてＤＶＴと強い関連性を有することが分かったＳＮＰまたはハプロタイプはなかった。
考察
ＤＶＴおよびＦ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰの間の以前に報告された関連性を、第ＩＸ因子の血漿レベルの変化、外因性凝固、第ＩＸ因子活性化、またはＭａｌｍｏ ＳＮＰよりもＤＶＴと強い関連性を有するＳＮＰとのＬＤによって説明することができるかどうかを調査した。しかしながら、直接または間接的にこれらの仮説を試験するための分析は、それらのうちのいずれも支持しなかった。Ｍａｌｍｏ ＳＮＰは、ＴＦ：ＦＶＩＩａによって開始される、外因性経路の凝固を測定するアッセイであるＥＴＰに影響しなかったが、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰは、ＦＸＩａによって開始される内因性経路の凝固によって開始される凝固に対する効果を有し得た。第ＩＸ因子レベルとのＭａｌｍｏ ＳＮＰの関連性の欠如は、Ｆ９ Ｍａｌｍｏを含む２７のＳＮＰが、ＧＡＩＴ研究においてＦＩＸ：Ｃと関連しなかったことを報告したＫｈａｄｈｉｄｚｅらの結果と一致している（Ｋｈａｃｈｉｄｚｅら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ． ２００６年；４巻：１５３７〜１５４５頁）。実施例２において本明細書に記載される活性化の分析は、第ＩＸ因子の活性化を推定するために間接的なアッセイを使用した。Ｆ９切断ペプチドの血漿レベルは、ＦＩＸが活性化されてＦＩＸａになる場合に生じる切断ペプチドの放出および腎臓における切断ペプチドの安定したクリアランス速度に依存する（Ｌｏｗｅ、Ｂｒ Ｊ Ｈａｅｍａｔｏｌ． ２００１年；１１５巻：５０７〜５１３頁）。ＴＦ：ＦＶＩＩＡまたはＦＸＩａによる第ＩＸ因子活性化の直接の測定は、Ｆ９ Ｍａｌｍｏ ＳＮＰによって引き起こされる第ＩＸ因子の活性化に対する影響を明らかにすることができる。
ＤＶＴとのＭａｌｍｏ ＳＮＰの関連性は、実施例１において記載されるように男性において以前に報告された。女性におけるオッズ比が、男性において見つけられたものに類似したが、結果は、女性において有意ではなかった。これらのサンプルを、類似する組み入れ基準を使用して、同じ医療制度のオランダ国において収集したので、ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２のサンプルをプールした。ＬＥＴＳ組み入れ基準および除外基準は、ＭＥＧＡサンプルに適用し、それらは、メタ分析のためにプールした。メタ分析において、男性および女性についてのオッズ比が類似したものの、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰは、男性においてＤＶＴと関連したが、女性と関連しなかった。女性の分析において、ＡＡ遺伝子型をＧＧ遺伝子型と比較した。しかしながら、女性のヘテロ接合型の評価がライオニゼーションによって混乱するので、ヘテロ接合型は、分析から除外した。そのため、女性における関連性の欠如は、男性および女性の間の浸透率における差異または女性のホモ接合型における関連性を検出するための検出力の欠如による可能性がある。女性におけるＭａｌｍｏ ＳＮＰおよびＤＶＴの間の関連性の欠如は、閉経後の女性において観察された最近の結果と一致している（Ｓｍｉｔｈら、ＪＡＭＡ． ２００７年；２９７巻：４８９〜４９８頁）。
ファインマッピングは、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１のサンプルにおいて、Ｍａｌｍｏ ＳＮＰよりも強くＤＶＴと関連したいかなるＳＮＰも同定しなかった。最近の研究で、Ｆ９遺伝子におけるｒｓ４１４９７５５が、閉経後の女性においてＤＶＴと関連することが分かった（Ｓｍｉｔｈら、ＪＡＭＡ． ２００７年；２９７巻：４８９〜４９８頁）。ｒｓ４１４９７５５は、ＬＥＴＳにおけるファインマッピング分析において含まれたが、ｒｓ４１４９７５５は男性（表９）または女性においてＤＶＴと関連しなかった。ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の両方においてＤＶＴとより強く関連した、評価したファインマッピングＳＮＰを使用して見つけられたハプロタイプはなかった。
結論として、Ｆ９におけるＭａｌｍｏ ＳＮＰは、ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２に由来する男性のプール分析において、ＤＶＴのリスクにおける１８％の低下と有意に関連した。Ｍａｌｍｏ ＳＮＰを囲むＦ９領域のファインマッピングは、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１においてＤＶＴと関連するさらなるＳＮＰ、またはＭａｌｍｏ ＳＮＰよりも高い有意性を有するＳＮＰを明らかにしなかった。
Figure 0005409658
 （実施例３）
ＣＹＰ４Ｖ２、ＳＥＲＰＩＮＣ１、およびＧＰ６の遺伝子改変体は、肺塞栓症と関連する
概説
肺塞栓症（ＰＥ）は、深部静脈血栓症（ＤＶＴ）と共通する遺伝危険因子を共有し得る静脈血栓症（ＶＴ）の徴候である。孤立性のＰＥと関連するＳＮＰを同定するために、ＤＶＴと関連することが以前に分かった１１のＳＮＰを、Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ（ＭＥＧＡ）研究に由来する１２０６の症例および４６３４の対照の症例−対照研究において、孤立性のＰＥとのそれらの関連性について分析した。孤立性のＰＥについてのオッズ比（ＯＲ）は、年齢および性別に対して調整したロジスティック回帰モデルにおいて推定した。
孤立性のＰＥと関連することが決定したＳＮＰは、ＣＹＰ４Ｖ２（ｒｓ１３１４６２７２：ＯＲ、１．１５；９５％ ＣＩ、１．０４〜１．２７）、ＧＰ６（ｒｓ１６１３６６２：ＯＲ、１．１８；９５％ ＣＩ、１．０４〜１．３３）、およびＳＥＲＰＩＮＣ１（ｒｓ２２２７５８９：ＯＲ、１．２８；９５％ ＣＩ、１．１１〜１．４８）ならびに女性におけるＦ９（ｒｓ６０４８：ＯＲ、１．２０；９５％ ＣＩ、１．０６〜１．３８）についての遺伝子におけるＳＮＰを含んだ。これらのＳＮＰの多くは、ＶＴに関与することが以前に報告されていない遺伝子において見つけられた。第Ｖ因子ＬｅｉｄｅｎおよびプロトロンビンＧ２０２１０Ａ改変体は、孤立性のＤＶＴ（ｒｓ６０２５：ＯＲ、４．４３；９５％ ＣＩ、３．７６〜５．２２；ｒｓ１７９９９６３：ＯＲ、３．０１；９５％ ＣＩ、２．２９〜３．９５）および孤立性のＰＥ（ｒｓ６０２５：ＯＲ、１．８２；９５％ ＣＩ、１．４５〜２．２８；ｒｓ１７９９９６３：ＯＲ、１．８２；９５％ ＣＩ、１．２７〜２．６２）と関連したが、症例頻度は、孤立性のＤＶＴ研究と比較して、孤立性のＰＥ研究において有意に低かった（Ｐ＜０．０１）。
序論
肺塞栓症（ＰＥ）は、ＶＴの一般的で、潜在的に致命的な徴候であり、これは、肺に塞栓形成するＤＶＴの結果として生じる。ＶＴは、ＥＵにおいて毎年約７５０，０００人の患者および米国において毎年約６００，０００人の患者を冒す。それは、ＣＨＤおよび脳卒中に次ぎ、世界的に３番目に多い心血管疾患である（Ｚｉｄａｎｅら、Ｔｈｒｏｍ Ｈａｅｍｏｓｔ ２００３年 ９０巻：４３９〜４４５頁およびＰｅｒｒｉｅｒ、Ｃｈｅｓｔ ２００ １１８巻：１２３４〜６頁）。
アメリカ合衆国において、症候性のＰＥの全発生率は、１年当たり約６３０，０００症例である。これらの患者の約３分の１は死亡し、死亡する患者のほぼ半分において、ＰＥが唯一の死因となる（Ｄｉｓｅａｓｅｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｖｅｉｎｓ． Ｐａｔｈｏｌｏｇｙ， ｄｉａｇｎｏｓｉｓ ａｎｄ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ． Ｉｎ： Ｂｒｏｗｓｅら編 Ｐｕｌｍｏｎａｒｙ ｅｍｂｏｌｉｓｍ． Ｌｏｎｄｏｎ：Ｅｄｗａｒｄｓ Ａｒｎｏｌｄｓ；１９８９年 ５５７〜８０頁）。欧州にわたる、致命的ではないＰＥ事象の総数の推定値は、１年当たり４００，０００を超え、ＰＥ関連性の死亡の総数は、約５１４，０００である（Ｃｏｈｅｎ、Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ（２００７年）９８巻、７５６〜７６４頁およびＬｉｎｄｂｌａｄ、ＢＭＪ １９９１年；３０２巻；７０９〜７１１頁）。ＰＥは、ＶＴ死亡の主要な原因である。
ＰＥについての遺伝危険因子は、ＤＶＴに対して異なり得る。ＰＥおよびＤＶＴは、同じ遺伝危険因子を共有することが仮定されてきた。しかしながら、ＰＥを有するがＤＶＴを有していない患者において、第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎ（ＦＶＬ）改変体（これは、ＤＶＴと関連することが公知である）を評価した研究により、それが、ＰＥと弱く関連することが分かった。さらに、遺伝子改変体は、特定の血管床に血栓を起こしやすくし得る。例えば、ＰＴ Ｇ２０２１０Ａ突然変異を有する患者は、門脈血栓症を起こしやすいのに対して、ＦＶＬ改変体を有する個体は、そうではなく、ＦＶＬを有する患者は、ふくらはぎのＤＶＴを起こしやすいことが示唆された。したがって、ＤＶＴおよびＰＥは、同じ疾患の異なる徴候であり得るが、それらは、全く同じ危険因子を共有しない可能性がある。
ＤＶＴの機能的全ゲノムスキャンが最近実行され、３つの症例−対照研究においてＤＶＴと関連した７つのＳＮＰが、上記の実施例１において記載されるように同定された。本明細書の、実施例３において、これらの７つのＳＮＰのうちのいずれかならびに４つの他のＳＮＰ（Ｆ２、Ｆ５、およびＦ１１における）もまた、孤立性のＰＥと関連するかどうかを決定した。
方法
研究集団およびデータ収集
ＰＥのこの遺伝的研究は、静脈血栓症研究における危険因子のＭｕｌｔｉｐｌｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ（ＭＥＧＡ）から選択した、ＰＥを有する患者を調査した（Ｂｌｏｍら、ＪＡＭＡ．２００５年２月９日；２９３巻（６号）：７１５〜７２２頁）。ＭＥＧＡ研究は、Ｌｅｉｄｅｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｃｅｎｔｅｒ、Ｌｅｉｄｅｎ、Ｔｈｅ ＮｅｔｈｅｒｌａｎｄｓのＭｅｄｉｃａｌ Ｅｔｈｉｃｓ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅによって承認された。すべての参加者は、研究に参加するためにインフォームドコンセントを示し、施設内倫理委員会が承認した質問票を完成した。研究における、ＰＥおよびＤＶＴの診断は、病院退院記録および一般開業医からの情報を使用して、客観的に確認した。孤立性のＰＥを有する患者は、確認されたＰＥを有し、ＤＶＴの記録を有していなかった、また、孤立性のＤＶＴを有する患者は、確認されたＤＶＴを有し、ＰＥの記録を有していなかった。
Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ研究（ＭＥＧＡ）
ＭＥＧＡにおける事象の収集および確定は、以前に記載されている（Ｂｌｏｍら、ＪＡＭＡ．２００５年２月９日；２９３巻（６号）：７１５〜７２２頁）。ＭＥＧＡは、１９９９年３月１日および２００４年５月３１日の間にオランダ国における６つの抗凝固クリニック（Ａｍｓｔｅｒｄａｍ、Ａｍｅｒｓｆｏｏｒｔ、Ｔｈｅ Ｈａｇｕｅ、Ｌｅｉｄｅｎ、Ｒｏｔｔｅｒｄａｍ、およびＵｔｒｅｃｈｔ）のうちのいずれかでＤＶＴまたはＰＥの彼らの最初の診断を示した、１８〜７０歳の継続患者を登録した。抗凝固クリニックは、オランダ国の規定された地域におけるすべての患者の抗凝固療法をモニターし、これは、ＤＶＴを有する継続した未選択の症例を同定することを可能にした。症例のパートナーは、対照として参加するように依頼された。さらなる対照参加者は、症例を収集した同じ地域から無作為番号ダイアルによって動員した（Ｃｈｉｎｔｈａｍｍｉｔｒら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ．２００６年１２月；４巻（１２号）：２５８７〜２５９２頁）。対照の年齢および性別は、症例にあわせた。ＭＥＧＡ ＤＮＡは、先に記載されるように、血液または口腔スワブから収集し、抽出した（Ｂｌｏｍら、ＪＡＭＡ．２００５年２月９日；２９３巻（６号）：７１５〜７２２頁）。ＭＥＧＡは、約１０，０００人の参加者を含んだ。被験体は、ＤＮＡの不適切な量または質により（ｎ＝３７０＋４６７）、悪性疾患（ｎ＝２７２＋４３３）のために除外した。
対立遺伝子頻度および遺伝子型決定
遺伝子型は、ｋＰＣＲまたは多重オリゴライゲーションアッセイによって決定した。ＤＮＡ濃度は、ＰｉｃｏＧｒｅｅｎ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ）蛍光色素を使用して、１０ｎｇ／μＬに標準化した。それぞれの対立遺伝子は、個別のＤＮＡサンプルの遺伝子型解析を使用して、ＰＣＲによって別々に増幅し、同様に、動態ポリメラーゼ連鎖反応（ｋＰＣＲ）アッセイにおいてＤＮＡ０．３ｎｇを使用して（Ｇｅｒｍｅｒら、Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ．２０００年２月；１０巻（２号）：２５８〜２６６頁）または単一の反応において５０までのＳＮＰを遺伝子型解析することができる多重ＰＣＲアッセイを使用して（Ｉａｎｎｏｎｅら、Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ．２０００年２月１日；３９巻（２号）：１３１〜１４０頁）実行した。多重方法論の遺伝子型解析の正確さは、同じＳＮＰについて、多重ＯＬＡアッセイからの遺伝子型コールをリアルタイム動態ＰＣＲアッセイからのものと比較することによって、３つの先の研究において評価し、これらの２つの方法に由来する遺伝子型コールの全体的な一致は、これらの研究のそれぞれにおいて＞９９％であった（Ｉａｋｏｕｂｏｖａら、Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ Ｔｈｒｏｍｂ Ｖａｓｃ Ｂｉｏｌ．２００６年９月２８日；２６巻（２６号）：２７６３〜２７６８頁；Ｓｈｉｆｆｍａｎら、Ａｒｔｅｒｉｏｓｃｌｅｒ Ｔｈｒｏｍｂ Ｖａｓｃ Ｂｉｏｌ．２００６年７月；２６巻（７号）：１６１３〜１６１８頁；およびＳｈｉｆｆｍａｎら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ．２００５年１０月；７７巻（４号）：５９６〜６０５頁）。ＭＥＧＡにおいてＤＶＴと関連した７つのアッセイは、ＭＥＧＡにおける被験体の＞９５％において遺伝子型解析に成功した。
研究設計
孤立性のＰＥと関連した遺伝リスク改変体を同定するために、以前にＤＶＴと関連した１１のＳＮＰの危険対立遺伝子を、ＭＥＧＡにおける孤立性のＰＥとのそれらの関連性について評価した。これらのＳＮＰのうちの（１１のＳＮＰからの）７つを同定するために使用したＤＶＴの症例−対照研究は、孤立性のＰＥを有する患者を除外した。この研究は、これらのＳＮＰを同定するために使用する研究から除外した孤立性のＰＥを有する患者を評価する。ＤＶＴ発見研究において使用する同じ対照を、この研究のために使用した。その対照は、ＶＴの病歴を有していない被験体であった。
研究集団
ＭＥＧＡの孤立性のＰＥおよび孤立性のＤＶＴの研究における症例および対照のベースラインの特徴を表１０に示す。
統計分析
ハーディ−ワインベルグ期待値からの偏差は、対照において正確確率検定を使用して評価した（Ｗｅｉｒ、Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓ ２：Ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ Ｄｉｓｃｒｅｔｅ Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄａｔａ 第２版（１９９６年４月）Ｓｕｎｄｅｒｌａｎｄ編：Ｓｉｎａｕｅｒ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ；１９９６年）。共変量（年齢および性別）についての調整は、それぞれ、非危険ホモ接合型、ヘテロ接合型、および危険ホモ接合型について０、１、および２とコードした遺伝子型を用いて、ロジスティック回帰分析を使用して実行した。表１１において示されるＳＮＰについて、ロジスティック回帰モデルは、結果と共に、それぞれの遺伝子型（２つの指標変数としてコードしたヘテロ接合型および危険ホモ接合型）の関連性を評価するために実行した。ＭＥＧＡにおける統計的検定はすべて両側とした。
結果
ＭＥＧＡにおけるＰＥと関連するＳＮＰ
ＭＥＧＡにおいて、以前にＤＶＴと関連することが分かった７つのＳＮＰの孤立性のＰＥとの関連性を分析した。ＭＥＧＡの対照において、１１のＳＮＰの遺伝子型は、ハーディ−ワインベルグ平衡下で予想される分布から逸脱しなかった（Ｐ≦０．０１）（Ｗｅｉｒ、Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄａｔａ Ａｎａｌｙｓｉｓ ２： Ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ Ｄｉｓｃｒｅｔｅ Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ｄａｔａ 第２版（１９９６年４月）Ｓｕｎｄｅｒｌａｎｄ編：Ｓｉｎａｕｅｒ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ；１９９６年）。Ｂｏｎｆｅｒｏｎｉ法は、多重比較について補正するために使用した。ＭＥＧＡの孤立性のＤＶＴおよび孤立性のＰＥの研究の両方は、７つのＳＮＰの関連性を検出するために８０％以上を有した（検出力＝０．１の対立遺伝子頻度に対して０．５）。
評価した１１のＳＮＰのうちの８つは、孤立性のＰＥと関連した（Ｐ≦０．０５）。これらは、ＣＹＰ４Ｖ２、ＧＰ６、ＳＥＲＰＩＮＣ１、Ｆ２、Ｆ５、およびＦ１１についての遺伝子にあった。これらのＳＮＰの危険対立遺伝子およびＯＲは、表１１において見つけることができる。孤立性のＰＥおよびこれらの８つの関連するＳＮＰのそれぞれの遺伝子型の間の関連性は、表１２に示す。
評価した１１のＳＮＰのうちの６つは、孤立性のＤＶＴと関連した（Ｐ≦０．０５）。これらは、ＣＹＰ４Ｖ２、ＧＰ６、ＳＥＲＰＩＮＣ１、ＲＧＳ７、ＮＲＩ１２、およびＮＡＴ８についての遺伝子にあった。孤立性のＤＶＴおよびこれらのＳＮＰのそれぞれの遺伝子型の間の関連性は、表１３に示す。
ＦＶＬおよびＰＴについての症例対立遺伝子頻度は、孤立性のＰＥ研究においてよりも、孤立性のＤＶＴ研究の症例頻度において実質的に低く（Ｐ＜０．０５）、これは、孤立性のＤＶＴ研究においてよりも、孤立性のＰＥ研究におけるＦＶＬおよびＰＴについてのより低いリスク推定値として反映される。頻度差異は統計的に有意ではなかったが、孤立性のＰＥとではなく孤立性のＤＶＴと関連した、ＮＲＩ１２、ＮＡＴ８、およびＲＧＳ７についての遺伝子における３つのＳＮＰもまた、孤立性のＰＥ研究と比較して、孤立性のＤＶＴ研究においてわずかにより低い症例頻度を有する。
考察
大規模な、十分に特徴づけられた症例対照集団（ＭＥＧＡ）（１２０６のＰＥ症例および４６３４の対照）において孤立性のＰＥと関連したＣＹＰ４Ｖ２、ＳＥＲＰＩＮＣ１、ＧＰ６、Ｆ２、Ｆ５、およびＦ１１についての遺伝子における８つのＳＮＰを同定した（表１２）。関連性は、Ｂｏｎｆｅｒｒｏｎｉ法を使用して、多重検定について補正した。ＳＮＰのそれぞれについての孤立性のＰＥと関連する危険対立遺伝子は、実施例１において記載されるように、ＤＶＴと関連することが以前に報告された同じ危険対立遺伝子である。
この研究はまた、静脈血栓症、特にＦＶＬについての確証された遺伝危険因子（Ｃｈｉｎｔｈａｍｍｉｔｒら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ．２００６年１２月；４巻（１２号）：２５８７〜２５９２頁およびＢｅｒｔｉｎａら、Ｎａｔｕｒｅ．１９９４年５月５日；３６９巻（６４７５号）：６４〜６７頁）およびプロトロンビンＧ２０２１０Ａ（Ｃｈｉｎｔｈａｍｍｉｔｒら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ．２００６年１２月；４巻（１２号）：２５８７〜２５９２頁およびＰｏｏｒｔら、Ｂｌｏｏｄ．１９９６年１１月１５日；８８巻（１０号）：３６９８〜３７０３頁）が、ＭＥＧＡにおいて孤立性のＰＥと関連することを確認した。しかしながら、孤立性のＰＥを有するＦＶＬおよびプロトロンビンＧ２０２１０Ａについてのリスク推定値は、孤立性のＤＶＴについて分かった、推定したリスクの約半分である（ＦＶＬ、それぞれＯＲ＝４．４３およびＯＲ＝１．８２；ＰＴ、ＯＲ＝３．０１およびＯＲ＝１．８２）（Ｃｈｉｎｔｈａｍｍｉｔｒら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ．２００６年１２月；４巻（１２号）：２５８７〜２５９２頁およびＰｏｏｒｔら、Ｂｌｏｏｄ．１９９６年１１月１５日；８８巻（１０号）：３６９８〜３７０３頁）。
これらの結果は、孤立性のＤＶＴおよび孤立性のＰＥとのＦＶＬおよびＰＴの先の関連性と一致している。ＤＶＴについての遺伝危険因子のうちで最も顕著なものは第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎであり、これは、６のＤＶＴについてのＯＲを有する。興味深いことに、継続した疑わしいＰＥ患者の研究により、確認されたＰＥを有するまたは有していない患者においてＦＶＬの罹患の差異はなかったことが分かった。これは、多くの他の研究において繰り返された（Ｐｅｒｒｉｅｒ、Ｃｈｅｓｔ ２００ １１８巻：１２３４〜６頁）。ＰＥとのＦＶＬのこの弱い関連性は、ＤＶＴとのその関連性と際立つ対照をなし、第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎ逆説と呼ばれている。この逆説についての理由は、ＦＶＬを有するＤＶＴ患者が、おそらくそれほど塞栓形成しそうにない遠位ＤＶＴを有する可能性がより高い（すなわち、その保有者が腸骨大腿骨のＤＶＴを発症する傾向がより低い）からであることが示唆された。しかしながら、これは、Ｍａｒｔｉｎｅｌｌｉによって実証されてはいなかった（ＪＴＨ ５巻：９８〜１０１頁）。逆説は、ＦＶＬが、ＤＶＴに対する重要な危険因子であるが、それが、ＰＥのリスクを増加させ得ないことを示唆する。ＰＥが、ほとんどのＶＴ死亡を引き起こし、そのため、ＤＶＴよりも臨床的に重要であるので（Ｍａｒｔｉｎｅｌｌｉ、ＪＴＨ ５巻：９８〜１０１頁）、ＦＶＬを有する患者は、積極的にではなくそれほど積極的に処置されるべきでないことが示唆された（Ｂｏｕｎａｍｅａｕｘ、Ｌａｎｃｅｔ（２０００年）３５６巻：１８２〜１８３頁）。
ＰＴ Ｇ２０２１０Ａは、ＶＴの異なる徴候と関連する他の遺伝危険因子である。ＰＴ Ｇ２０２１０Ａは、門脈ＶＴの増加と関連するのに対して、ＦＶＬはそうではない（Ｐｒｉｍｉｇｎａｍｉら、Ｈｅｐｔｏｌｏｇｙ ２００５年 ４１巻：６０３〜８頁）。さらに、いくつかの研究は、ＰＴ Ｇ２０２１０Ａの保有者が、ＰＥを発症するリスクが増加していることを示唆し、これは、ＤＶＴについて見られるものに類似している。ＰＴ Ｇ２０２１０は、ＤＶＴに対する３．０のＯＲを有する。しかしながら、他の研究は、ＰＴ Ｇ２０２１０Ａが、ＰＥにおけるリスクと関連しないことを示唆し、これは（ＦＶＬのように）、遠位対近位ＤＶＴの率における差異によって説明されない。あいにく、これらの研究は、ＰＴ Ｇ２０２１０Ａ改変体の低い対立遺伝子頻度によって複雑になる。ＭＥＧＡ研究の利点のうちの１つは、その大規模なサイズであり、これは、関連性を検出するためのより高い検出力を提供する。現在の研究において、ＦＶＬおよびＰＴは、共に、孤立性のＰＥおよび孤立性のＤＶＴと関連することが分かった。しかしながら、リスク推定値は、孤立性のＤＶＴよりも孤立性のＰＥ研究においてより低く、これは、より小さな検出力を有する、より小さな研究における孤立性のＰＥと関連しないＦＶＬおよびＰＴの文献の報告と一致している。
ＳＥＲＰＩＮＣ１は、第Ｖ因子遺伝子と同じ第１染色体の領域に位置するが、孤立性のＤＶＴまたは孤立性のＰＥとのその関連性は、ＦＶＬ改変体との連鎖不均衡によるものではない （実施例１を参照されたい）。
結論
ＭＥＧＡ研究において孤立性のＰＥと関連した８つのＳＮＰが同定された。これらの改変体は、ＰＥの遺伝的リスクを評価するのに有用であり、これらの改変体を含む遺伝子ならびにこれらの遺伝子によってコードされる産物（例えばタンパク質およびｍＲＮＡ）は、ＰＥを処置するための治療標的として有用である。
ＰＥと関連するさらなるＳＮＰは、表２５において提供する（下記の実施例７）。
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
 （実施例４）
第ＸＩ因子の発現および深部静脈血栓症のリスクと独立して関連する複数のＳＮＰ
概説
最近の２つの研究は、シトクロムＰ４５０、ファミリー４、サブファミリーＶ、ポリペプチド２（ＣＹＰ４Ｖ２）、第ＸＩ因子（Ｆ１１）、およびプレカリクレイン（ＫＬＫＢ１）をコードする遺伝子を含む４ｑ３５遺伝子座におけるＳＮＰとのＤＶＴリスクの関連性を検出した（Ｓｍｉｔｈら、ＪＡＭＡ ２９７巻、４８９〜９８頁（２００７年）およびＢｅｚｅｍｅｒら、ＪＡＭＡ ２９９巻、１３０６〜１４頁（２００８年））。これらの候補の中で（１つ以上の）リスク遺伝子を決定し、ＤＶＴのリスクを改変するのに機能的役割を有する可能性が最も高い改変体を同定するために、大規模な症例対照サンプルセットにおけるＣＹＰ４Ｖ２／ＫＬＫＢ１／Ｆ１１遺伝子座における２００ｋｂｐ以上の１０３のＳＮＰの高密度遺伝子型解析および関連性試験を含む分析（３，１５５までの症例および５，０８７の対照）を実行した。疾患ＳＮＰモデリングは、３つの独立したリスク関連ＳＮＰを同定した：ｒｓ２２８９２５２（Ｆ１１中、ＯＲホモ接合型［９５％ ＣＩ］＝１．８４［１．６２〜２．１０］、Ｐ遺伝子型＝１．７×１０−２０）、ｒｓ２０３６９１４（Ｆ１１中：ＯＲホモ接合型［９５％ ＣＩ］＝１．８４［１．６１〜２．１０］、Ｐ遺伝子型＝６．５×１０−１９）、およびｒｓ１３１４６２７２（ＣＹＰ４Ｖ２中、ＯＲホモ接合型［９５％ ＣＩ］＝１．５８［１．２９〜１．７６］、Ｐ遺伝子型＝２．１×１０−７）。これらのマーカーの遺伝子型は、ＤＶＴと関連することが公知の第ＸＩ因子（ＦＸＩ）のレベルと関連し（例えばｒｓ２２８９２５２についてＰ＝２．１×１０−２０）（Ｍｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ３４２巻、６９６〜７０１頁（２０００年））、リスク遺伝子型の保有者は、非保有者よりも高いレベルのＦＸＩを有する。これらのデータは、ＣＹＰ４Ｖ２およびＦ１１におけるＳＮＰが、ＦＸＩレベルによって少なくとも部分的に説明されるＤＶＴのリスクを与えることを示す。
序論
大規模な遺伝子中心のＳＮＰベースの関連性研究において、統計的に有意な関連性は、実施例１において上記に記載されるように、ＤＶＴと、第４染色体上のＣＹＰ４Ｖ２領域、第１染色体上のＳＥＲＰＩＮＣ１、および第１９染色体上のＧＰ６におけるＳＮＰとの間で見つけられた（Ｂｅｚｅｍｅｒら、ＪＡＭＡ ２９９巻、１３０６〜１４頁（２００８年））。ＣＹＰ４Ｖ２領域における追加の遺伝子型解析は、第ＸＩ因子（Ｆ１１）およびプレカリクレイン（ＫＬＫＢ１）をコードする近隣の遺伝子におけるいくつかの関連するマーカーを同定した。候補遺伝子ベースの関連性研究において、Ｓｍｉｔｈらは、Ｆ１１における２つのＳＮＰが、ＤＶＴを有する閉経後の女性においてＤＶＴのリスクと関連したことを報告した（Ｓｍｉｔｈら、ＪＡＭＡ ２９７巻、４８９〜９８頁（２００７年））。
しかしながら、ＬＤおよび最初の特徴づけによるゲノムの限られた適用範囲のために、観察されたマーカーが、「原因である」または試験していない原因の改変体に対する代用物として役に立つかどうか、およびこの遺伝子座の他の改変体がＤＶＴリスクを付け加えるかどうかが決定されないままであった。原因の改変体の同定は、適切な効果のサイズのよりよい評価および適切な生物学的メカニズムをさらに理解することを可能にする。Ｆ１１およびその相同体ＫＬＫＢ１が、共に、内因性の血液凝固カスケードに関与することが公知であるので、これは、４ｑ３５領域について特に重要であり、最初の接触相において、第ＸＩＩ因子の活性化は、セリンプロテアーゼであるプレカリクレインの存在下において引き起こされ、血液凝固の内因性の経路の中間相にさらに至る、第ＸＩ因子（ＦＸＩ）の続く活性化をもたらす（Ｇａｉｌａｎｉら、Ｊ Ｔｈｒｏｍｂ Ｈａｅｍｏｓｔ ５巻、１１０６〜１２頁（２００７年））。そのため、Ｆ１１またはＫＬＫＢ１のいずれかにおける機能的な遺伝子改変体は、ＤＶＴリスクを調節し得る。例えば、高レベルのＦＸＩが、ＤＶＴのリスクの増加と関連することは公知である（Ｍｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ３４２巻、６９６〜７０１頁（２０００年））。原因のマーカーを同定するために、ＣＹＰ４Ｖ２／ＫＬＫＢ１／Ｆ１１遺伝子座における包括的な遺伝子型解析およびＤＶＴとの関連性の試験を含む分析が実行され、これは、本明細書の実施例４において記載される。
結果および考察
ＨａｐＭａｐ ＣＥＰＨデータセットに従って、ＣＹＰ４Ｖ２、ＫＬＫＢ１、およびＦ１１を含む全遺伝子座は、隣接したＬＤ領域とは異なる、高度なＬＤの領域に存在する。原因の（１つ以上の）マーカーを同定するために、これらの遺伝子を含んでいる領域を、１０３のＳＮＰを用いて調べた。大多数のこれらのマーカー（９０．３％）を、領域におけるＳＮＰ多様性をカバーするために選択した。これらの１０３のＳＮＰは、２，２１０の対照および１，８４１のＤＶＴ症例を含む２つのサンプルセット：Ｔｈｅ Ｌｅｉｄｅｎ Ｔｈｒｏｍｂｏｐｈｉｌｉａ Ｓｔｕｄｙ（ＬＥＴＳ）およびＴｈｅ Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ（ＭＥＧＡ）研究、ＭＥＧＡ−１のサブセットにおいて最初に評価した。５４のＳＮＰおよびＤＶＴの間の対立遺伝子関連性は、０．０５の有意性レベルに達し、７つの最も有意なマーカーをＦ１１遺伝子においてクラスター化した（表１７）。２つの高度に相関するＦ１１ ＳＮＰ、ｒｓ３７５６０１１およびｒｓ２２８９２５２（ｒ２＝０．９８）は、ＤＶＴとの最も強い関連性を示した（それぞれ、Ｐ＝５．２×１０−９および３．２×１０−９ならびにＯＲ＝１．３０［１．１９〜１．４２］および１．３１［１．２０〜１．４３］）。
これらの５４のＳＮＰの有意な関連性が互いに独立しているかどうかを検査するために、ロジスティック回帰モデルは、ＳＮＰそれぞれの可能性のあるペアについて評価した。ＤＶＴリスクとの非依存的な関連性を示したＳＮＰのうちで最も簡潔なセットを同定する試みにおいて、Ｆ１１における２つの最も強いマーカー、ｒｓ３７５６０１１およびｒｓ２２８９２５２が、互い以外の任意の他のマーカーに対する調節の後に有意なままであったことが観察された。さらに、それらは、有意性が他のマーカーによる調整の後に目に見えては減じられなかった唯一のマーカーであった。ｒｓ３７５６０１１およびｒｓ２２８９２５２の間のＬＤが、非常に高かったので（ｒ２＝０．９８）、さらなる分析は、ｒｓ２２８９２５２のみを含んだ。
他のマーカーのうちのいずれかがＤＶＴリスクに対して寄与したかどうかを判断するために、検索を、ｒｓ２２８９２５２に対する調整の後にＤＶＴと有意に関連したそれらのマーカーについて実行した。これは、１７のマーカーの同定に至った。これらの１７のマーカーの有意性は、調整の後、中程度であった（Ｐは０．００４３〜０．０４６の範囲に及んだ）。これらのマーカー内で、他の有意なマーカーのうちの１つと高度なＬＤにある（ｒ２＞０．９５）６つが同定され、より弱い関連性を有するマーカーは、１７のマーカーの表から除き、１１のマーカーを残した。
上記の１１のマーカーおよびｒｓ２２８９２５２の間の関係をさらに検査するために、次いで、マーカーを、他の大規模なＤＶＴ症例−対照研究（ＭＥＧＡ−２：１，３１４の症例および２，８７７の対照）において試験した。発見−反復アプローチを使用する代わりに組み合わせた３つのサンプルセットにおいて、該サンプルセットがより高い検出力を提供するので、さらなる統計分析を実行した（Ｓｋｏｌら、Ｎａｔ Ｇｅｎｅｔ ３８巻、２０９〜３頁（２００６年））。１１のＳＮＰはすべて、すべてのサンプルの組み合わせた分析において有意なままであった（Ｍａｎｔｅｌ−Ｈａｅｎｓｚｅｌ Ｐ＜０．０５、表１８）。
独立して関連性シグナルに寄与した１１のＳＮＰのサブセットを同定するために、異なる２つの分析：前進ステップワイズロジスティック回帰および多重ロジスティック回帰、を実行した。前進ステップワイズロジスティック回帰分析について、選択手順は、モデルへのエントリのための基準としてＰ値＜０．０５を必要とし、サンプルセット、性別、および年齢は、共変量とした。３つのマーカー、ｒｓ２２８９２５２、ｒｓ２０３６９１４、およびｒｓ１３１４６２７２を含む最後のモデルを得た（表１４）。他のＳＮＰは、０．０５の有意性閾値でモデルに入ることができなかった。多重ロジスティック回帰分析は、年齢、性別、および研究についての調節の後に、最も有意な関連性としてｒｓ２２８９２５２を同定した（ＯＲ［９５％ ＣＩ］＝１．２１［１．１１〜１．３２］）。次に強い関連性は、ｒｓ２０３６９１４（ＯＲ［９５％ ＣＩ］＝１．１３［０．９８〜１．３２）およびｒｓ１３１４６２７２（ＯＲ［９５％ ＣＩ］＝１．０９［０．９８〜１．２１］）であった。したがって、これらの３つのマーカーは、この研究において調べられたものの間で最も有益なものであった。
２つの独立したマーカー、ｒｓ２２８９２５２（Ｓｍｉｔｈら、ＪＡＭＡ ２９７巻、４８９〜９８頁（２００７年）において報告されるものと同じマーカー）およびｒｓ２０３６９１４は、Ｆ１１にあり、第３のもの、ｒｓ１３１４６２７２は、ＣＹＰ４Ｖ２にある。３つのマーカーはすべて、付加モデルにおいて作動するように思われ、オッズ比は、危険ホモ接合型について１．８４までであった（表１５）。ＬＤは、２つのＦ１１マーカーの間で中程度であり（ｒ２＝０．３８）、Ｆ１１マーカーのどちらかおよびＣＹＰ４Ｖ２マーカーの間で低かった（それぞれｒ２＝０．１２および０．０４）（表１９）。これらのマーカーは、共通しており（例えば、これらのサンプルセットにおいて試験した集団の約２７％は、ｒｓ２０３６９１４の危険ホモ接合型保有者である）、集団の大部分の間での高度なＤＶＴリスクを示す。さらに、ほとんどは白人において存在する、まれな第Ｖ因子Ｌｅｉｄｅｎ改変体およびプロトロンビンＧ２０２１０Ａ多型とは対照的に、本明細書で示す３つの独立したＳＮＰはすべて、同様に、アジア人およびアフリカ人において高頻度であり、それらがまた、これらの集団におけるＤＶＴリスクに実質的に寄与することを示す。
Ｆ１１ ＳＮＰである、ｒｓ２０３６９１４およびｒｓ２２８９２５２の両方は、イントロン性であり、したがって、これらのマーカー（または高度なＬＤの改変体）は、エンハンサーなどの転写調節エレメントを改変し得る、また、これらの改変体は、Ｆ１１の発現を調節し得る。そのため、個別の遺伝子型およびＦＸＩのレベルの関連性を、ＬＥＴＳサンプルセットにおいて試験した。ｒｓ２２８９２５２の遺伝子型は、有意にＦＸＩレベルと関連した（Ｐｔｒｅｎｄ＝２．１×１０−２０、Ｎ＝８９５）。ｒｓ２０３６９１４の遺伝子型は、ＦＸＩのレベルと関連することが示された（Ｂｅｚｅｍｅｒら、ＪＡＭＡ ２９９巻、１３０６〜１４頁（２００８年））。第３のＳＮＰ、ｒｓ１３１４６２７２は、ＣＹＰ４Ｖ２のミスセンス改変体（Ｋ２５９Ｑ）である。ＣＹＰ４Ｖ２は、脂肪酸およびステロイドの代謝において役割を果たし得る、また、遺伝子における突然変異は、常染色体劣性網膜ジストロフィーを引き起こす（Ｌｉら、Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ７４巻、８１７〜２６頁（２００４年））。しかしながら、ＦＸＩのレベルとのＣＹＰ４Ｖ２マーカーの相関を考慮すれば（Ｂｅｚｅｍｅｒら、ＪＡＭＡ ２９９巻、１３０６〜１４頁（２００８年））、ＤＶＴ感受性に対するその遺伝的影響は、ＦＸＩタンパク質を通して間接的に媒介され得る。この間接的な影響は、ＣＹＰ４Ｖ２ ＳＮＰまたはその代用物を包含するＦ１１の遠距離の転写調節エレメントから発生し得（例えば、最適なＬＤにある［ｒ２＝１］、ｒｓ２２９２４２５、これもまたＣＹＰ４Ｖ２のイントロン性ＳＮＰ）、ｒｓ１３１４６２７２は、Ｆ１１遺伝子の６７ｋｂ上流に位置し、遠距離調節エレメントは、複数の遺伝子にわたって観察された（Ｋａｐｒａｎｏｖら、Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｇｅｎｅｔ ８巻、４１３〜２３頁（２００７年））。その代わりに、ＣＹＰ４Ｖ２ ＳＮＰは、Ｆ１１発現を直接調節することができる、Ｆ１１遺伝子におけるまたはＦ１１遺伝子により近位にある他の改変体と高度なＬＤにあり得る。
３つのマーカーすべてについて、危険対立遺伝子保有者は、危険対立遺伝子を有していないものよりも高いレベルのＦＸＩを有し、危険ホモ接合型保有者は、ヘテロ接合型保有者よりも高いレベルのＦＸＩを有した。さらに、異なる遺伝子型の個体の間の平均ＦＸＩレベルの相対的な差異は、ＣＹＰ４Ｖ２マーカーについてよりもＦ１１マーカーについてより大きかった。例えば、危険ホモ接合型保有者におけるＦＸＩの平均レベルは、非保有者と比較して、ｒｓ２２８９２５２について１１９％、ｒｓ２０３６９１４について１１９％、ｒｓ１３１４６２７２について１０８％であった。さらに、３つのＳＮＰすべてを有するモデルにおいて、ｒｓ２２８９２５２のそれぞれの危険対立遺伝子は、平均で７．６ユニットのＦＸＩレベルの増加をもたらしたが（Ｐ＝３．７×１０−１０；それは、他の２つのＳＮＰによる調整前に８．８ユニットの影響およびＰ＝２．１×１０−２０を有した）、ｒｓ２０３６９１４対立遺伝子の影響は、たった１．９ユニットのＦＸＩレベルであり（Ｐ＝０．１５；調整前の７．２の影響およびｐ＝５．６×１０−１３と比較して）、ｒｓ１３１４６２７２の影響は、調整の後に対立遺伝子当たり０．６ユニットであった（Ｐ＝０．６０；調整前の３．４の影響およびＰ＝０．００２と比較して）。影響の方向は、高レベルのＦＸＩを伴うＤＶＴリスクの予想される増加と一致していた（Ｍｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ３４２巻、６９６〜７０１頁（２０００年））。
ＦＸＩレベルが、観察されたＳＮＰ疾患関連性に寄与したかどうかを決定するために、ＤＶＴとの３つの独立したマーカーの関連性を、第ＸＩ因子レベルによる調節後に再試験した。組み合わせたＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１のサンプルセットにおける３つのＳＮＰのそれぞれについて、ＦＸＩレベルの調整は、リスク推定値を低下させ、Ｐ値を増加させたが、ＤＶＴとの関連性は、有意なままであった（表１６）。
要約すると、ＣＹＰ４Ｖ２／ＫＬＫＢ１／Ｆ１１遺伝子座における大多数の共通の遺伝子改変体を分析した。さらに、総数＞８，０００人の個体を有する大規模な症例対照収集は、中程度の影響の共通のＳＮＰでさえ疾患感受性に説得力をもって関係させるだけではなく、様々なマーカーの間のそれらの関係（依存）を適切に区別する高度な検出力を提供した。ＤＶＴと関連する独立した３つのＳＮＰは、特に、ＣＹＰ４Ｖ２／ＫＬＫＢ１／Ｆ１１遺伝子座において同定された。さらに、これらの独立した３つのマーカーのそれぞれの遺伝子型およびＦＸＩレベルの間に強い相関があった。ＤＶＴリスクに対する遺伝子型の影響の方向性およびＦＸＩレベルの方向性は、高レベルのＦＸＩを有する個体のＤＶＴのリスクが上昇しているという以前の証拠と一致し（Ｂｅｚｅｍｅｒら、ＪＡＭＡ ２９９巻、１３０６〜１４頁（２００８年）およびＭｅｉｊｅｒｓら、Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ３４２巻、６９６〜７０１頁（２０００年））、ＦＸＩにおけるより高度な増加と関連したＳＮＰは、疾患リスクとのより強い関連性を示す。さらに、ＦＸＩタンパク質によるＳＮＰ疾患関連性の調節は、観察された関連性を弱めなかった。プレカリクレインおよびＦＸＩ発現が同時制御され得るが、これらの遺伝子改変体は、直接または間接的にＦ１１発現を調節し、これにより差次的ＤＶＴのリスクに寄与し得る。
これらのマーカーはまた、心筋梗塞（Ｄｏｇｇｅｎら、Ｂｌｏｏｄ １０８巻、４０４５〜５１頁（２００６年）およびＭｅｒｌｏら、Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ １６１巻、２６１〜７頁（２００２年））および虚血性脳卒中（Ｙａｎｇら、Ａｍ Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐａｔｈｏｌ １２６巻、４１１〜５頁（２００６年））などの他の状態とも関連し得、高レベルのＦＸＩは、同様に危険因子となり得る。したがって、ＤＶＴリスクの予測におけるそれらの有用性に加えて、これらのマーカーはまた、高レベルのＦＸＩが、疾患に対する危険因子となる心筋梗塞、虚血性脳卒中、および他の疾患に対する個体のリスクを予測するのに有用となり得る。
方法
ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡのサンプル
本研究において使用する３つの症例対照サンプルセットは、白人の個体、主として北西ヨーロッパ人を含み、すべての人が、インフォームドコンセントを提供した。Ｔｈｅ Ｌｅｉｄｅｎ Ｔｈｒｏｍｂｏｐｈｉｌｉａ Ｓｔｕｄｙ（ＬＥＴＳ）サンプルセットは、最初の確認されたＤＶＴを有する４４３の症例（４３％の男性）およびＤＶＴまたはＰＥの病歴を有していない４５３の対照（４２％の男性）からなるものとした。参加者は、研究に登録されたとき、癌を有しておらず、１８〜７０歳であり、平均年齢（±ＳＤ）は、症例について４５（±１４）歳および対照について４５（±１５）歳であった。Ｔｈｅ Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｎｄ Ｇｅｎｅｔｉｃ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ（ＭＥＧＡ）研究は、１８〜８０歳の参加者を含み、症例は、最初のＤＶＴを有し、対照は、ＤＶＴまたはＰＥの病歴を有していなかった。２つのサンプルセットを本研究に由来し、ＭＥＧＡ−１は、１，３９８の症例（４７％の男性）および１，７５７の対照（４８％の男性）を有し、ＭＥＧＡ−２は、１，３１４の症例（４８％の男性）および２，８７７の対照（４７％の男性）を有した。症例および対照の平均年齢は、それぞれＭＥＧＡ−１において４７±１３および４８±１２歳、ＭＥＧＡ−２において４８±１３および４７±１２歳である。総サンプルサイズは、３，１５５の症例および５，０８７の対照である。追加の情報は、Ｂｅｚｅｍｅｒら、ＪＡＭＡ ２９９巻、１３０６〜１４頁（２００８年）において見つけることができる。
ＳＮＰ選択
ＤＶＴとのＣＹＰ４Ｖ２の関連性の最初の発見に際して、さらなる遺伝子型解析および統計の分析は、限られた範囲で実行された（Ｂｅｚｅｍｅｒら、ＪＡＭＡ ２９９巻、１３０６〜１４頁（２００８年））。本明細書の実施例４において記載される研究において、４ｑ３５遺伝子座におけるＳＮＰの包括的な分析および推定上の機能的な有意性の包括的な分析を実行した。ファインマッピング領域は、ＨａｐＭａｐ ＣＥＰＨデータセットにおけるＣＹＰ４Ｖ２／ＫＬＫＢ１／Ｆ１１遺伝子座でのＬＤ構造の検査によって決定し、２００ ｋｂｐを包含する、第４染色体上の２つのＳＮＰ標識、１８７，２９４，８０６ｂｐのｒｓ４８６２６４４および１８７，４９４，７７４ｂｐのｒｓ１３１５００４０によって規定した（ＮＣＢＩ Ｂｕｉｌｄ３６）。標的とされた領域は、最初の有意なマーカーおよび近隣のブロックの部分を含むＬＤブロックをカバーし、ＨａｐＭａｐデータセットにおける３２０の公知のＳＮＰを含む（これらのうちの１８７は２％より多い対立遺伝子頻度を有する）。選択マーカーは、規定された領域においてＳＮＰ多様性を獲得するものを含み、それらはＨａｐＭａｐ ＣＥＰＨデータセットおよび以下の基準を使用して、ｔａｇｇｅｒプログラムによって同定した：０．０２の最小対立遺伝子頻度および０．８のペアワイズｒ２閾値。さらなるマーカーは、ミスセンス／ナンセンスＳＮＰならびに以前に報告された３つの有意なＳＮＰ、ＣＹＰ４Ｖ２におけるｒｓ１３１４６２７２、共にＦ１１におけるｒｓ２０３６９１４、およびｒｓ３７５６００８のうちのいずれかと高度なＬＤにあるもの（ｒ２＞０．２）を含んだ。
遺伝子型解析
個別のサンプルの遺伝子型解析は、設計したプライマーを使用して、対立遺伝子特異的リアルタイムＰＣＲによって決定し、Ｃｅｌｅｒａのハイスループット遺伝子型解析実験室において検証した（Ｇｅｒｍｅｒら、Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ １０巻、２５８〜６６頁（２０００年））。症例および対照のサンプルをＰＣＲ反応のために３８４ウェルプレートに無作為に整列させ、遺伝子型を自動アルゴリズムによって割り当て、症例および対照の状況についての情報を有していない技術者によるアッセイ品質の手動の検査にかけた。この実験室における遺伝子型解析の正確さは、一貫して、９９％よりも高かった（Ｌｉら、Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ １０１巻、１５６８８〜９３頁（２００４年））。
統計分析
それぞれの遺伝子型解析したＳＮＰについてのハーディ−ワインベルグ平衡は、正確確率検定によって症例および対照において別々に検査した。連鎖不均衡測定値、Ｄ’およびｒ２は、ＧＯＬＤパッケージにおけるＬＤＭａｘを使用して、非段階的（ｕｎｐｈａｓｅｄ）遺伝子型データから計算した（Ａｂｅｃａｓｉｓら、Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ １６巻、１８２〜３頁（２０００年））。個別のサンプルセットにおけるオッズ比は、観察された対立遺伝子数を使用して計算した。疾患とのＳＮＰの対立遺伝子関連性は、個別のサンプルセットにおけるχ２検定によっておよびマンテル−ヘンツェル法によって決定し、サンプルセットにわたってオッズ比（ＯＲ）を組み合わせた。Ｐ値は、両側とした。サンプルセットにわたる影響の不均一性についての証拠は、Ｂｒｅｓｌｏｗ−Ｄａｙ検定によって検査した（Ｂｒｅｓｌｏｗら、ＩＡＲＣ Ｓｃｉ Ｐｕｂｌ、５〜３３８頁（１９８０年））。ロジスティック回帰は、オッズ比を推定するために使用したが、年齢、性別、サンプルセット、および第ＸＩ因子レベルなどの共変量を調整した。有意なマーカーの間の相対的重要度を評価するために（ここで参考文献ＣｏｒｄｅｌｌおよびＣｌａｙｔｏｎ）、ロジスティック回帰モデルは、ＳＮＰのそれぞれの可能性のあるペアおよびステップワイズロジスティック回帰モデルについて実行した。これらのモデルは、ＤＶＴの対数オッズに対するそれぞれのさらなる危険対立遺伝子の相加的な影響を仮定した。線形回帰モデルは、第ＸＩ因子レベルに対するＳＮＰの影響を推定し、平均第ＸＩ因子レベルの増加傾向について試験するために実行し、所与のＳＮＰに対するそれぞれのさらなる危険対立遺伝子の相加的な影響を仮定した。
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
 表１７において提供されるＳＮＰについて、例示的な配列の配列番号は、表１〜２において示されるが、配列表において提供される例示的なゲノムコンテクスト配列の配列番号が以下の通りである以下のＳＮＰは例外とする。
ｒｓ１００１７４１９＝配列番号２５５９
ｒｓ１０８６６２９０＝配列番号２５６０
ｒｓ２２７６９１７＝配列番号２５６１
ｒｓ１８７７３２０＝配列番号２５６２
ｒｓ９９９５３６６＝配列番号２５６３
ｒｓ２１０２５７５＝配列番号２５６４
ｒｓ６８４２０４７＝配列番号２５６５
ｒｓ２０４８＝配列番号２５６６
ｒｓ４２５３２３８＝配列番号２５６７
ｒｓ１９１２８２６＝配列番号２５６８
ｒｓ４２５３２５２＝配列番号２５６９
ｒｓ４２５３２６０＝配列番号２５７０
ｒｓ４２５３３１１＝配列番号２５７１
ｒｓ９２５４５３＝配列番号２５７２
ｒｓ４２５３３３２＝配列番号２５７３
ｒｓ１５９３＝配列番号２５７４
ｒｓ４２５３４２２＝配列番号２５７５
ｒｓ１１９３８５６４＝配列番号２５７６
ｒｓ１００２５１５２＝配列番号２５７７
ｒｓ１００８７２８＝配列番号２５７８
ｒｓ１３１３３０５０＝配列番号２５７９
ｒｓ９９９３７４９＝配列番号２５８０
Figure 0005409658
Figure 0005409658
 （実施例５）
静脈血栓症と関連するＳＮＰ（ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、および／またはＭＥＧＡ−２における分析）
表２０〜２３は、ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、および／またはＭＥＧＡ−２のサンプルセットにおいて、ＶＴ、特にＤＶＴと関連するＳＮＰを提供する（これらのサンプルセットは、実施例１〜４において上記に記載される）。特に、表２０は、ＭＥＧＡ−１およびＬＥＴＳの両方において試験し、これらのサンプルセットの両方においてＤＶＴと関連した１４９のＳＮＰに対する、ＤＶＴとの調整しなかった相加的な遺伝子型の関連性を提供する（少なくとも１つのモデルにおいて、ＭＥＧＡ−１におけるｐ値カットオフ＜＝０．０５およびＬＥＴＳにおけるｐ値カットオフ＜＝０．１）。表２１は、ＭＥＧＡ−１サンプルセットにおいてまだ試験されていない、ＬＥＴＳにおけるＤＶＴとの９２のＳＮＰの、調整しなかった関連性を提供し（ｐ＜＝０．０５）、表２２は、ＬＥＴＳサンプルセットにおいてまだ試験されていない、ＭＥＧＡ−１におけるＤＶＴとの９つのＳＮＰの調整しなかった関連性を提供する（ｐ＜＝０．０５）。表２３は、３つのサンプルセットＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２において試験された４１のＳＮＰについての、ＤＶＴとの年齢および性別を調整した関連性を提供する。
（実施例６）
再発性静脈血栓症と関連するＳＮＰ
表２４は、ＶＴの再発と関連するＳＮＰの例である３つのＳＮＰを提供する（組み合わせたＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２におけるｐ値カットオフ＜＝０．０５）。
ＭＥＧＡ研究は、以前に記載されている（Ｂｌｏｍら、ＪＡＭＡ ２００５年；２９３巻（６号）：７１５〜７２２頁）。ＭＥＧＡにおける再発性ＶＴとの特異的なＳＮＰの関連性についての分析は、進行中である。手短に述べると、ＭＥＧＡにおいて初めてのＶＴを有した約４０００人の個体（症例）は、約５年間追跡調査されており、次の事象（もしあれば）までの時間が、記録されている。現在、ＭＥＧＡにおけるこの再発性ＶＴ分析は、ほぼ中間点にあり、約６００の再発性症例が記録された。ある種のＳＮＰは、再発性ＶＴと関連するＳＮＰの例として特異的に同定され、これらのＳＮＰは、下記の表２４において提供される。これらのＳＮＰは、例えば、既にＶＴを有している個体がＶＴの他の発生を有するリスクを決定するのに特に有用である。
Figure 0005409658
 （実施例７）
肺塞栓症（ＰＥ）と関連するＳＮＰ
表２５は、肺塞栓症（ＰＥ）と関連するＳＮＰの例である５２のＳＮＰを提供する（組み合わせたＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２におけるｐ値カットオフ＜＝０．０５）。ＰＥと関連するＳＮＰはまた、上記の実施例３において記載される。実施例３はまた、ＰＥに関するさらなる情報ならびにＰＥとの関連性を決定するためのＭＥＧＡにおける方法および研究集団に関する情報を提供する。症例は、確認されたＰＥを有し、ＶＴの病歴のない個体とし、対照は、ＰＥとＶＴとのいずれの病歴も有していない個体とした。表２５において提供されるＳＮＰは、組み合わせたＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２の研究において、これらの症例および対照を比較した場合、ｐ値＜＝０．０５を有した。これらのＳＮＰは、例えば、ＰＥに対する個体のリスクを決定するのに、特に有用である。
（実施例８）
癌を有する個体における静脈血栓症と関連するＳＮＰ
表２６は、癌を有する個体において、ＶＴ、特にＤＶＴと関連するＳＮＰの例である３１のＳＮＰを提供する（組み合わせたＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２におけるｐ値カットオフ＜＝０．０５）。表２６において提供されるＳＮＰは、癌もＤＶＴも有していない個体（対照）と比較して、（任意の型の）癌およびＤＶＴの両方を有する、組み合わせたＭＥＧＡ−１およびＭＥＧＡ−２の研究における個体（症例）を比較した場合、ｐ値＜＝０．０５を有した。これらのＳＮＰは、例えば、癌を有する個体におけるＶＴのリスクを決定するのに特に有用である。
（実施例９）
静脈血栓症と関連するファインマッピング／連鎖不均衡ＳＮＰ
表２７は、ファインマッピング／連鎖不均衡分析に基づく、ＬＥＴＳにおける、ＶＴ、特にＤＶＴと関連する１２３のＳＮＰを提供する（ＬＥＴＳにおけるｐ値カットオフ＜＝０．１）。表２７は、それぞれのＳＮＰについてのＤＶＴとの相加的な関連性およびＨａｐｍａｐに由来する連鎖不均衡データを提供する。表２７は、以下の標的遺伝子およびＳＮＰのまわりのファインマッピング／連鎖不均衡分析に基づくＳＮＰを特に提供する（表２７において示されるような）：遺伝子ＡＫＴ３（ＳＮＰ ｈＣＶ２３３１４８）、遺伝子ＳＥＲＰＩＮＣ１（ＳＮＰ ｈＣＶ１６１８０１７０）、遺伝子ＲＧＳ７（ＳＮＰ ｈＣＶ９１６１０７）、遺伝子ＮＲ１Ｉ２（ＳＮＰ ｈＣＶ２６３８４１）、遺伝子ＦＧＧ（ＳＮＰ ｈＣＶ１１５０３４６９）、遺伝子ＣＹＰ４Ｖ２（ＳＮＰ ｈＣＶ２５９９０１３１）、遺伝子ＧＰ６（ＳＮＰ ｈＣＶ８７１７８７３）、および遺伝子Ｆ９（ＳＮＰ ｈＣＶ５９６３３１）。
ＡＫＴ３遺伝子およびＳＮＰ ｒｓ１４１７１２１／ｈＣＶ２３３１４８は、そのあたりでファインマッピング／連鎖不均衡分析を実行した標的の例である。ＤＶＴとのＡＫＴ３ ＳＮＰの関連性の結果は、表２７（ＬＥＴＳにおいて）ならびに下記の表２８〜２９において提供される（これは、ＭＥＧＡ−１においても、ＬＥＴＳ（表２９）およびｒｓ１４１７１２１についてのＭＥＧＡ−２（表２８）においても結果を提供する）。
ＡＫＴ３遺伝子におけるＳＮＰ ｒｓ１４１７１２１／ｈＣＶ２３３１４８は、機能的ゲノムスキャンにおいて試験した２４，９６５のＳＮＰの中で同定され（ｓｃａｎ ＷＧＳ３８−Ｖ００１３；Ｂｅｚｅｍｅｒら、ＪＡＭＡ ２９９巻、１３０６〜１４頁（２００８年））、ＬＥＴＳ、ＭＥＧＡ−１、およびＭＥＧＡ−２において、遺伝子型解析することによって、ＤＶＴおよびＰＥと関連すること（ｐ値＜０．０５で）、３つのすべての研究において一貫した危険対立遺伝子であることがわかった（表２８〜２９）。このＳＮＰについてのＦＤＲは、ＭＥＧＡ−２において０．０４４である。この領域における他のＳＮＰがＤＶＴと関連するかどうかを決定するために、ＨａｐＭａｐプロジェクトからの結果を、ＳＮＰ ｒｓ１４１７１２１／ｈＣＶ２３３１４８（ｃｈｒ１：２４１７３５９７３）を囲む領域を同定するために使用した。この領域は、対立遺伝子頻度＞２％を有する２２８のＳＮＰを含んだ（ＨａｐＭａｐ ＮＣＢＩ ｂｕｉｌｄ ３６、２００５年）。対立遺伝子頻度および連鎖不均衡は、北欧および西欧に由来する祖先を有するＵｔａｈ住民を含む、ＨａｐＭａｐ ＣＥＰＨ集団におけるＳＮＰ遺伝子型から計算した。これらの２２８のＳＮＰのうちの３６は、これらの２２８のＳＮＰのうちの２０５についての代替としてＬＥＴＳにおいて遺伝子型解析するために選択した。したがって、これらの２０５のＳＮＰは、３６の遺伝子型解析したＳＮＰの少なくとも１つと強い連鎖不均衡（ｒ２＞０．８）にあった１６９のＳＮＰに加えて、直接遺伝子型解析した３６のＳＮＰを含んだ（これらの３６のＳＮＰは、「タギングＳＮＰ」と呼ばれ得る）。３６のタギングＳＮＰは、Ｔａｇｇｅｒにおけるペアワイズタギングを使用して選んだ（ｄｅ Ｂａｋｋｅｒら、２００５年）（Ｈａｐｌｏｖｉｅｗ（Ｂａｒｒｅｔｔら、２００５年）において実行）。６２のＳＮＰ（３６のタギングＳＮＰを含む）は、ＬＥＴＳにおいて最初に調査し、ＬＥＴＳにおいてＳＮＰ ｒｓ１４１７１２１／ｈＣＶ２３３１４８と等しくまたはそれよりも強くＤＶＴと関連した２９のＳＮＰは、ＭＥＧＡ−１において調査した。２０のＳＮＰは、ＬＥＴＳおよびＭＥＧＡ−１の両方においてＤＶＴと関連し、相加的なｐ値＜０．０５であり、一貫した危険対立遺伝子を有した（これらの２０のＳＮＰは、表２９において下記に示す）。
Figure 0005409658
Figure 0005409658
 （実施例１０）
静脈血栓症関連性の照会ＳＮＰと連鎖不均衡にあるさらなるＳＮＰ
追加の分析は、表において示され、実施例において記載されているような、ＶＴと関連することが分かったＳＮＰと連鎖不均衡（ＬＤ）にあるさらなるＳＮＰマーカーを同定するために実施した。手短に述べると、検出力閾値（Ｔ）は、ＬＤマーカーを使用して、疾患関連性を検出するために５１％に設定した。この検出力の閾値は、上記の式（３１）に基づいており、これには、以前の疾患関連性研究からの対立遺伝子頻度のデータ、真の疾患関連マーカーを検出しない予測される過誤率、および０．０５の有意性レベルが組み込まれている。この検出力の計算およびサンプルサイズを使用して、ＬＤの閾値レベル、またはｒ２値を、各照会ＳＮＰについて導出した（ｒＴ ２、式（３２）および（３３））。閾値ｒＴ ２は、非照会ＳＮＰが疾患関連性を検出するためのＴ以上の検出力を依然として保持することを可能とする、照会ＳＮＰとそのＬＤ ＳＮＰとの間の連鎖不均衡の最小値である。
上記の方法に基づいて、ＬＤ ＳＮＰを、照会ＳＮＰについて見出した。ＬＤ ＳＮＰは、表４において挙げ、各々は、そのそれぞれの照会ＳＮＰと関連する。また、照会ＳＮＰおよびＬＤ ＳＮＰについての公開ＳＮＰ ＩＤ（ｒｓ番号）、閾値のｒ２値、ならびにこれを決定するために使用した検出力、さらに、照会ＳＮＰとその一致するＬＤ ＳＮＰとの間の連鎖不均衡のｒ２値も示す。表４中の例として、５１％検出力を使用して、ＶＴ関連照会ＳＮＰ ｈＣＶ１１５０３４１４（ｒｓ２０６６８６５）が、１のｒＴ ２値で、ｈＣＶ１１５０３４１６（ｒｓ２０６６８６４）とＬＤにあると計算され、したがって、ＳＮＰ ｈＣＶ１１５０３４１６もまた、ＶＴと関連するマーカーとして確立された。
一般に、閾値ｒＴ ２の値以上のｒ２値を有する、任意の２つのＳＮＰは、相互に十分なＬＤ中にあり、したがって、各ＳＮＰが、個体のＶＴの危険性の決定などの同じ用途のために有用であると当業者がみなすように、閾値ｒＴ ２の値を設定し得る。例えば、種々の実施形態において、ＳＮＰを、照会ＳＮＰを有する十分なＬＤ中にある（したがって、これらのＬＤ ＳＮＰは、照会ＳＮＰと同じ用途、例えば、ＶＴの危険性の決定などのために有用であり得る）として分類するために使用される閾値ｒＴ ２の値は、例えば、０．７、０．７５、０．８、０．８５、０．９、０．９５、０．９６、０．９７、０．９８、０．９９、１など（またはこれらの値の間の任意の他のｒ２値）に設定し得る。閾値ｒＴ ２の値は、検出力もしくは他の計算を考慮して活用してもよく、またはそれらを考慮せずに活用してもよい。
本明細書中に引用される全ての刊行物および特許は、本明細書中で完全に参考として援用される。記載されている本発明の組成物、方法およびシステムの改変および変化が、本発明の範囲および精神から逸脱することなく、当業者に明らかである。本発明は、特定の好ましい実施形態および特定の実施例と関連して記載されているが、特許請求されているような本発明が、このような特定の実施形態に不当に限定されるべきではないことが理解されるべきである。実際に、分子生物学、遺伝学および関連する分野の当業者に明らかな、本発明を実施するための上に記載された様式の種々の改変が、添付の特許請求の範囲の範囲内であることが意図される。
（表 1）

遺伝子番号: 1
遺伝子記号 ACE - 1636
遺伝子名: アンギオテンシンI変換酵素 (ペプチジル−ジペプチダーゼ A) 1
公開転写物受託番号: NM_000789
公開タンパク質受託番号: NP_000780
染色体: 17
OMIM番号: 106180
OMIM情報: {心筋梗塞, 罹患しやすい} (3); {アルツハイマー病, 罹患しやすい}, 104300 (3);
{糖尿病性腎症, 罹患しやすい}, 603933 (3); [アンギオテンシン I-
変換酵素, 良性血清の増加] (3)

転写物配列 (配列番号 1):

タンパク質配列 (配列番号 126):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 251):
CCTGTTGGATATGGAAACCACCTACAGCGTGGCCACTGTGTGCCACCCGAATGGCAGCTGCCTGCAGCTCGAGCCAGATCTGACGAATGTGATGGCCACG
R
CCCGGAAATATGAAGACCTGTTATGGGCATGGGAGGGCTGGCGAGACAAGGCGGGGAGAGCCATCCTCCAGTTTTACCCGAAATACGTGGAACTCATCAA
Celera SNP ID: hCV11942562
公開SNP ID: rs4343
SNP染色体部位: 58919763
転写物配列中のSNP 配列番号 1
SNP部位転写物: 2351
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,6|G,26) アフリカ系アメリカ人 (A,22|G,14) 全体 (A,28|G,40)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 126, 位置776,(T,ACG) (T,ACA)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,57|A,63)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 126, 位置776,(T,ACG) (T,ACA)

遺伝子番号: 1
遺伝子記号 ACE - 1636
遺伝子名: アンギオテンシンI変換酵素 (ペプチジル−ジペプチダーゼ A) 1
公開転写物受託番号: NM_152830
公開タンパク質受託番号: NP_690043
染色体: 17
OMIM番号: 106180
OMIM情報: {心筋梗塞, 罹患しやすい} (3); {アルツハイマー病, 罹患しやすい},
104300 (3); {糖尿病性腎症, 罹患しやすい}, 603933 (3); [アンギオテンシン I-
変換酵素, 良性血清の増加] (3)

転写物配列 (配列番号 2):

タンパク質配列 (配列番号 127):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 252):
CCTGTTGGATATGGAAACCACCTACAGCGTGGCCACTGTGTGCCACCCGAATGGCAGCTGCCTGCAGCTCGAGCCAGATCTGACGAATGTGATGGCCACG
R
CCCGGAAATATGAAGACCTGTTATGGGCATGGGAGGGCTGGCGAGACAAGGCGGGGAGAGCCATCCTCCAGTTTTACCCGAAATACGTGGAACTCATCAA
Celera SNP ID: hCV11942562
公開SNP ID: rs4343
SNP染色体部位: 58919763
転写物配列中のSNP 配列番号 2
SNP部位転写物: 659
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,6|G,26) アフリカ系アメリカ人 (A,22|G,14) 全体 (A,28|G,40)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 127, 位置202,(T,ACG) (T,ACA)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,57|A,63)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 127, 位置202,(T,ACG) (T,ACA)

遺伝子番号: 2
遺伝子記号 ADCY9 - 115
遺伝子名: アデニレートシクラーゼ 9
公開転写物受託番号: NM_001116
公開タンパク質受託番号: NP_001107
染色体: 16
OMIM番号: 603302
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 3):

タンパク質配列 (配列番号 128):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 253):
AGCCCTCAAAGAGAGGATGATTCATTCCGTGATGCCAAGAATCATAGCCGATGACTTAATGAAGCAGGGAGATGAGGAGAGTGAGAATTCTGTCAAGAGG
R
ATGCCACCTCGAGCCCCAAGAACAGGAAGAAAAAGTCTTCCATCCAAAAAGCTCCTATAGCCTTCCGCCCTTTTAAGATGCAGCAGATCGAAGAAGTCAG
Celera SNP ID: hCV2590858
公開SNP ID: rs2230738
SNP染色体部位: 4104365
転写物配列中のSNP 配列番号 3
SNP部位転写物: 1620
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,32|A,4) アフリカ系アメリカ人 (G,32|A,4) 全体 (G,64|A,8)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 128, 位置360,(R,AGG) (R,AGA)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,94|A,22)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 128, 位置360,(R,AGG) (R,AGA)

遺伝子番号: 3
遺伝子記号 AGTR1 - 185
遺伝子名: アンギオテンシン II レセプター, １型
公開転写物受託番号: NM_000685
公開タンパク質受託番号: NP_000676
染色体: 3
OMIM番号: 106165
OMIM情報: 本態性高血圧, 145500 (3)

転写物配列 (配列番号 4):

タンパク質配列 (配列番号 129):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 254):
TTTGAGGTTGAGTGACATGTTCGAAACCTGTCCATAAAGTAATTTTGTGAAAGAAGGAGCAAGAGAACATTCCTCTGCAGCACTTCACTACCAAATGAGC
M
TTAGCTACTTTTCAGAATTGAAGGAGAAAATGCATTATGTGGACTGAACCGACTTTTCTAAAGCTCTGAACAAAAGCTTTTCTTTCCTTTTGCAACAAGA
Celera SNP ID: hCV3187716
公開SNP ID: rs5186
SNP染色体部位: 149942678
転写物配列中のSNP 配列番号 4
SNP部位転写物: 1554
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|C,4) アフリカ系アメリカ人 (A,28|C,4) 全体 (A,62|C,8)
SNP型: UTR3
SNP供給源: Celera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|C,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 3
遺伝子記号 AGTR1 - 185
遺伝子名: アンギオテンシン II レセプター, １型
公開転写物受託番号: NM_004835
公開タンパク質受託番号: NP_004826
染色体: 3
OMIM番号: 106165
OMIM情報: 本態性高血圧, 145500 (3)

転写物配列 (配列番号 5):

タンパク質配列 (配列番号 130):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 255):
TTTGAGGTTGAGTGACATGTTCGAAACCTGTCCATAAAGTAATTTTGTGAAAGAAGGAGCAAGAGAACATTCCTCTGCAGCACTTCACTACCAAATGAGC
M
TTAGCTACTTTTCAGAATTGAAGGAGAAAATGCATTATGTGGACTGAACCGACTTTTCTAAAGCTCTGAACAAAAGCTTTTCTTTCCTTTTGCAACAAGA
Celera SNP ID: hCV3187716
公開SNP ID: rs5186
SNP染色体部位: 149942678
転写物配列中のSNP 配列番号 5
SNP部位転写物: 1528
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|C,4) アフリカ系アメリカ人 (A,28|C,4) 全体 (A,62|C,8)
SNP型: UTR3
SNP供給源: Celera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|C,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 3
遺伝子記号 AGTR1 - 185
遺伝子名: アンギオテンシン II レセプター, １型
公開転写物受託番号: NM_009585
公開タンパク質受託番号: NP_033611
染色体: 3
OMIM番号: 106165
OMIM情報: 本態性高血圧, 145500 (3)

転写物配列 (配列番号 6):

タンパク質配列 (配列番号 131):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 256):
TTTGAGGTTGAGTGACATGTTCGAAACCTGTCCATAAAGTAATTTTGTGAAAGAAGGAGCAAGAGAACATTCCTCTGCAGCACTTCACTACCAAATGAGC
M
TTAGCTACTTTTCAGAATTGAAGGAGAAAATGCATTATGTGGACTGAACCGACTTTTCTAAAGCTCTGAACAAAAGCTTTTCTTTCCTTTTGCAACAAGA
Celera SNP ID: hCV3187716
公開SNP ID: rs5186
SNP染色体部位: 149942678
転写物配列中のSNP 配列番号 6
SNP部位転写物: 1470
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|C,4) アフリカ系アメリカ人 (A,28|C,4) 全体 (A,62|C,8)
SNP型: UTR3
SNP供給源: Celera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|C,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 3
遺伝子記号 AGTR1 - 185
遺伝子名: アンギオテンシン II レセプター, １型
公開転写物受託番号: NM_031850
公開タンパク質受託番号: NP_114038
染色体: 3
OMIM番号: 106165
OMIM情報: 本態性高血圧, 145500 (3)

転写物配列 (配列番号 7):

タンパク質配列 (配列番号 132):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 257):
TTTGAGGTTGAGTGACATGTTCGAAACCTGTCCATAAAGTAATTTTGTGAAAGAAGGAGCAAGAGAACATTCCTCTGCAGCACTTCACTACCAAATGAGC
M
TTAGCTACTTTTCAGAATTGAAGGAGAAAATGCATTATGTGGACTGAACCGACTTTTCTAAAGCTCTGAACAAAAGCTTTTCTTTCCTTTTGCAACAAGA
Celera SNP ID: hCV3187716
公開SNP ID: rs5186
SNP染色体部位: 149942678
転写物配列中のSNP 配列番号 7
SNP部位転写物: 1612
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|C,4) アフリカ系アメリカ人 (A,28|C,4) 全体 (A,62|C,8)
SNP型: UTR3
SNP供給源: Celera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|C,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 3
遺伝子記号 AGTR1 - 185
遺伝子名: アンギオテンシン II レセプター, １型
公開転写物受託番号: NM_032049
公開タンパク質受託番号: NP_114438
染色体: 3
OMIM番号: 106165
OMIM情報: 本態性高血圧, 145500 (3)

転写物配列 (配列番号 8):

タンパク質配列 (配列番号 133):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 258):
TTTGAGGTTGAGTGACATGTTCGAAACCTGTCCATAAAGTAATTTTGTGAAAGAAGGAGCAAGAGAACATTCCTCTGCAGCACTTCACTACCAAATGAGC
M
TTAGCTACTTTTCAGAATTGAAGGAGAAAATGCATTATGTGGACTGAACCGACTTTTCTAAAGCTCTGAACAAAAGCTTTTCTTTCCTTTTGCAACAAGA
Celera SNP ID: hCV3187716
公開SNP ID: rs5186
SNP染色体部位: 149942678
転写物配列中のSNP 配列番号 8
SNP部位転写物: 1428
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|C,4) アフリカ系アメリカ人 (A,28|C,4) 全体 (A,62|C,8)
SNP型: UTR3
SNP供給源: Celera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|C,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 4
遺伝子記号 ANK1 - 286
遺伝子名: アンキリン 1, 赤血球
公開転写物受託番号: NM_000037
公開タンパク質受託番号: NP_000028
染色体: 8
OMIM番号: 182900
OMIM情報: 球状赤血球症-2 (3)

転写物配列 (配列番号 9):

タンパク質配列 (配列番号 134):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 259):
AGAGGAGGTCACGCAAGGTCCACACTCATTCCAGGGAACAAGTACCATGACTGAAGGGCTAGAGCCCGGTGGATCTCAGGAGTACGAGAAGGTCCTGGTG
R
CTGTAAGTGAGCACACGTGGACAGAACAGCCCGAGGCTGAGAGCTCCCAGGCCGACAGGGACCGGAGGCAGCAAGGCCAAGAAGAGCAGGTGCAGGAGGC
Celera SNP ID: hCV10008773
公開SNP ID: rs750625
SNP染色体部位: 41645071
転写物配列中のSNP 配列番号 9
SNP部位転写物: 5350
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,25|A,13) アフリカ系アメリカ人 (G,26|A,12) 全体 (G,51|A,25)
SNP型: ESE synonymous
タンパク質コーディング: 配列番号 134, 位置None
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|A,22)
SNP型: ESE synonymous
タンパク質コーディング: 配列番号 134, 位置None

遺伝子番号: 4
遺伝子記号 ANK1 - 286
遺伝子名: アンキリン 1, 赤血球
公開転写物受託番号: NM_020475
公開タンパク質受託番号: NP_065208
染色体: 8
OMIM番号: 182900
OMIM情報: 球状赤血球症-2 (3)

転写物配列 (配列番号 10):

タンパク質配列 (配列番号 135):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 260):
AGAGGAGGTCACGCAAGGTCCACACTCATTCCAGGGAACAAGTACCATGACTGAAGGGCTAGAGCCCGGTGGATCTCAGGAGTACGAGAAGGTCCTGGTG
R
CTGTAAGTGAGCACACGTGGACAGAACAGCCCGAGGCTGAGAGCTCCCAGGCCGACAGGGACCGGAGGCAGCAAGGCCAAGAAGAGCAGGTGCAGGAGGC
Celera SNP ID: hCV10008773
公開SNP ID: rs750625
SNP染色体部位: 41645071
転写物配列中のSNP 配列番号 10
SNP部位転写物: 5350
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,25|A,13) アフリカ系アメリカ人 (G,26|A,12) 全体 (G,51|A,25)
SNP型: ESE synonymous
タンパク質コーディング: 配列番号 135, 位置None
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|A,22)
SNP型: ESE synonymous
タンパク質コーディング: 配列番号 135, 位置None

遺伝子番号: 4
遺伝子記号 ANK1 - 286
遺伝子名: アンキリン 1, 赤血球
公開転写物受託番号: NM_020476
公開タンパク質受託番号: NP_065209
染色体: 8
OMIM番号: 182900
OMIM情報: 球状赤血球症-2 (3)

転写物配列 (配列番号 11):

タンパク質配列 (配列番号 136):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 261):
AGAGGAGGTCACGCAAGGTCCACACTCATTCCAGGGAACAAGTACCATGACTGAAGGGCTAGAGCCCGGTGGATCTCAGGAGTACGAGAAGGTCCTGGTG
R
CTGTAAGTGAGCACACGTGGACAGAACAGCCCGAGGCTGAGAGCTCCCAGGCCGACAGGGACCGGAGGCAGCAAGGCCAAGAAGAGCAGGTGCAGGAGGC
Celera SNP ID: hCV10008773
公開SNP ID: rs750625
SNP染色体部位: 41645071
転写物配列中のSNP 配列番号 11
SNP部位転写物: 5350
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,25|A,13) アフリカ系アメリカ人 (G,26|A,12) 全体 (G,51|A,25)
SNP型: ESE synonymous
タンパク質コーディング: 配列番号 136, 位置None
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|A,22)
SNP型: ESE synonymous
タンパク質コーディング: 配列番号 136, 位置None

遺伝子番号: 4
遺伝子記号 ANK1 - 286
遺伝子名: アンキリン 1, 赤血球
公開転写物受託番号: NM_020477
公開タンパク質受託番号: NP_065210
染色体: 8
OMIM番号: 182900
OMIM情報: 球状赤血球症-2 (3)

転写物配列 (配列番号 12):

タンパク質配列 (配列番号 137):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 262):
AGAGGAGGTCACGCAAGGTCCACACTCATTCCAGGGAACAAGTACCATGACTGAAGGGCTAGAGCCCGGTGGATCTCAGGAGTACGAGAAGGTCCTGGTG
R
CTGTAAGTGAGCACACGTGGACAGAACAGCCCGAGGCTGAGAGCTCCCAGGCCGACAGGGACCGGAGGCAGCAAGGCCAAGAAGAGCAGGTGCAGGAGGC
Celera SNP ID: hCV10008773
公開SNP ID: rs750625
SNP染色体部位: 41645071
転写物配列中のSNP 配列番号 12
SNP部位転写物: 4864
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,25|A,13) アフリカ系アメリカ人 (G,26|A,12) 全体 (G,51|A,25)
SNP型: ESE synonymous
タンパク質コーディング: 配列番号 137, 位置None
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|A,22)
SNP型: ESE synonymous
タンパク質コーディング: 配列番号 137, 位置None

遺伝子番号: 5
遺伝子記号 ANKRD6 - 22881
遺伝子名: アンキリン反復ドメイン6
公開転写物受託番号: NM_014942
公開タンパク質受託番号: NP_055757
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 13):

タンパク質配列 (配列番号 138):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 263):
TTTATAACCTATTCCTAATCAAACCCAATTATATCAGAATACCTTTCTGAATTTGAGATTTTTGCTCTACATTTTATAATGAATAAGGCTATTTTTTGAA
R
GTATTTCATTTTGAATTCTGTCATTAACCTCAAAAGCTTTCTACTGCTTTGCGGTGAAGGCAAAATATTCGATAACTCAACTTAGGCCCCACTGTTCCCC
Celera SNP ID: hCV30454683
公開SNP ID: rs9351210
SNP染色体部位: 90398328
転写物配列中のSNP 配列番号 13
SNP部位転写物: 3394
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,87|G,33)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 6
遺伝子記号 APOH - 350
遺伝子名: アポリポ蛋白 H (β-2-糖蛋白 I)
公開転写物受託番号: NM_000042
公開タンパク質受託番号: NP_000033
染色体: 17
OMIM番号: 138700
OMIM情報: [アポリポ蛋白 H 欠損] (3)

転写物配列 (配列番号 14):

タンパク質配列 (配列番号 139):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 264):
TGATAAAGTTTCTTTCTTCTGCAAAAATAAGGAAAAGAAGTGTAGCTATACAGAGGATGCTCAGTGTATAGATGGCACTATCGAAGTCCCCAAATGCTTC
S
AGGAACACAGTTCTCTGGCTTTTTGGAAAACTGATGCATCCGATGTAAAGCCATGCTAAGGTGGTTTTCAGATTCCACACAAAATGTCACACTTGTTTCT
Celera SNP ID: hCV2303891
公開SNP ID: rs1801690
SNP染色体部位: 61638747
転写物配列中のSNP 配列番号 14
SNP部位転写物: 1038
SNP供給源: HGMD; dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,114|G,6)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 139, 位置335,(W,TGG) (S,TCG)

遺伝子番号: 7
遺伝子記号 BLZF1 - 8548
遺伝子名: 塩基性ロイシンジッパー核性因子 1 (JEM-1)
公開転写物受託番号: NM_003666
公開タンパク質受託番号: NP_003657
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 15):

タンパク質配列 (配列番号 140):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 265):
TTTTATTTTAAAGTAGAAATCTGTCCGCTTTTCACTTACGGAGGCCTTACAGTGTGTGTTCTGTGTTACTTGAGTTTATACGCACTGCAGAATTTGTTTA
Y
CCTGCTCTTTTGGAAACGTATTCCGGAAGCGAAACCCTGAGTAATCGGAAGTGGTTAGGAGTGAGAGAGCTGCTGGATATGCGGAGGGACTGGGCGGGTC
Celera SNP ID: hCV15878582
公開SNP ID: rs2275299
SNP染色体部位: 167604000
転写物配列中のSNP 配列番号 15
SNP部位転写物: 183
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,11|T,29) アフリカ系アメリカ人 (C,22|T,14) 全体 (C,33|T,43)
SNP型: UTR5
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,65)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 8
遺伝子記号 C1QTNF6 - 114904
遺伝子名: C1q および腫瘍壊死因子関連タンパク質 6
公開転写物受託番号: NM_031910
公開タンパク質受託番号: NP_114116
染色体: 22
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 16):

タンパク質配列 (配列番号 141):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 266):
CGCCTGGGGAGGCCACAGGACACAGGGTCACCATGGGGACAGCCGCCCTGGGTCCCGTCTGGGCAGCGCTCCTGCTCTTTCTCCTGATGTGTGAGATCCC
S
ATGGTGGAGCTCACCTTTGACAGAGCTGTGGCCAGCGGCTGCCAACGGTGCTGTGACTCTGAGGACCCCCTGGATCCTGCCCATGTATCCTCAGCCTCTT
Celera SNP ID: hCV2403368
公開SNP ID: rs229526
SNP染色体部位: 35911368
転写物配列中のSNP 配列番号 16
SNP部位転写物: 203
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,10|C,28) アフリカ系アメリカ人 (G,4|C,20) 全体 (G,14|C,48)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 141, 位置42,(P,CCT) (R,CGT)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,95|C,25)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 141, 位置42,(P,CCT) (R,CGT)

遺伝子番号: 8
遺伝子記号 C1QTNF6 - 114904
遺伝子名: C1q および腫瘍壊死因子関連タンパク質 6
公開転写物受託番号: NM_182486
公開タンパク質受託番号: NP_872292
染色体: 22
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 17):

タンパク質配列 (配列番号 142):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 267):
CGCCTGGGGAGGCCACAGGACACAGGGTCACCATGGGGACAGCCGCCCTGGGTCCCGTCTGGGCAGCGCTCCTGCTCTTTCTCCTGATGTGTGAGATCCC
S
ATGGTGGAGCTCACCTTTGACAGAGCTGTGGCCAGCGGCTGCCAACGGTGCTGTGACTCTGAGGACCCCCTGGATCCTGCCCATGTATCCTCAGCCTCTT
Celera SNP ID: hCV2403368
公開SNP ID: rs229526
SNP染色体部位: 35911368
転写物配列中のSNP 配列番号 17
SNP部位転写物: 203
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,10|C,28) アフリカ系アメリカ人 (G,4|C,20) 全体 (G,14|C,48)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 142, 位置42,(P,CCT) (R,CGT)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,95|C,25)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 142, 位置42,(P,CCT) (R,CGT)

遺伝子番号: 9
遺伝子記号 C1orf114 - 57821
遺伝子名: 染色体 1 オープンリ−ディングフレーム114
公開転写物受託番号: NM_021179
公開タンパク質受託番号: NP_067002
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 18):

タンパク質配列 (配列番号 143):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 268):
AGAATCAAGAACCGGTGAATGATAAAAGGGAGCGAAAACTTAAGTTCAAGGACCAGTTAGTTGATTTGGAAGTTCCTCCACTAGAAGACACTACTACTTT
Y
AAAAATTATTTTGAAAACGAAAGGAATATGTTTGGGAAACTGTCACAATTATGTATTTCCAATGATTTTGGACAAGAAGATGTGCTCCTGTCACTTACTA
Celera SNP ID: hCV2456747
公開SNP ID: rs3820059
SNP染色体部位: 167657778
転写物配列中のSNP 配列番号 18
SNP部位転写物: 684
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,12|C,22) アフリカ系アメリカ人 (T,18|C,4) 全体 (T,30|C,26)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 143, 位置172,(F,TTT) (S,TCT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,6|C,30) アフリカ系アメリカ人 (T,6|C,12) 全体 (T,12|C,42)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 143, 位置172,(F,TTT) (S,TCT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,8|C,30) アフリカ系アメリカ人 (T,9|C,11) 全体 (T,17|C,41)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 143, 位置172,(F,TTT) (S,TCT)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,70)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 143, 位置172,(F,TTT) (S,TCT)

遺伝子番号: 10
遺伝子記号 C3orf15 - 89876
遺伝子名: 染色体 3 オープンリ−ディングフレーム15
公開転写物受託番号: NM_033364
公開タンパク質受託番号: NP_203528
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 19):

タンパク質配列 (配列番号 144):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 269):
TACACAGGCAAATATCCAAGCTACCCTGATTCGCAGCAGACTGAGAAAAGTTCCCAGGTTTAAAACCATGTTCAGTAACCTGATCCATTATCCAAGATAT
Y
CTCTATATTGGAGCAAGTCAGATCCTGTCCCACCATTTATCAGTCGGGAATGGAAGGGACATAAGGAGAAACACAGAGAAGCCCTCCGGCAGCTCACCAC
Celera SNP ID: hCV134278
公開SNP ID: rs9848716
SNP染色体部位: 120908997
転写物配列中のSNP 配列番号 19
SNP部位転写物: 336
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,28|C,86)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 144, 位置86,(Y,TAT) (Y,TAC)

コンテクスト (配列番号 270):
GTGTGTTCATGCAACAGCCATAGAGATGGTGCTATTGAAAGGCAATCTGCCCATCCTGTGTATTGACAAGCATCAGGATTCCAGGAGGATTCTTCCTGAT
K
CAAAGACTGTCAAATAGGAAAAAAGAAAACAGTAAATGAACAAAAACATCAACATGGAGTCCAAGTAATGAATTTATAGAGGAAAATGTATGCTACTCTG
Celera SNP ID: hCV255886
公開SNP ID: rs10511394
SNP染色体部位: 120967291
転写物配列中のSNP 配列番号 19
SNP部位転写物: 3085
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,85|G,35)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 11
遺伝子記号 C6orf167 - 253714
遺伝子名: 染色体 6 オープンリ−ディングフレーム167
公開転写物受託番号: NM_198468
公開タンパク質受託番号: NP_940870
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 20):

タンパク質配列 (配列番号 145):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 271):
AAGAGGCAGTTGAAAAAGAGTACATGAAACAGTTGGTCAAACTGACAAGATTACTATTTAATCTCTCAGAAGTAAAGAGTATTTTCTCAAAGGCCCAAGT
Y
GAATATTTATCCATCTCAGAAGACCCTAAAAAAGCACTTGTTCGATTCTTTGAGGCTGTTGGTGTAACTTACGGGAACGTCCAGACACTTTCTGATAAAT
Celera SNP ID: hCV7574127
公開SNP ID: rs1737145
SNP染色体部位: 97733095
転写物配列中のSNP 配列番号 20
SNP部位転写物: 2891
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,59|C,61)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 145, 位置875,(V,GTT) (A,GCT)

遺伝子番号: 12
遺伝子記号 C7orf46 - 340277
遺伝子名: 染色体 7 オープンリ−ディングフレーム46
公開転写物受託番号: hCT1968190
公開タンパク質受託番号: hCP1782649
染色体: 7
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 21):

タンパク質配列 (配列番号 146):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 272):
TTGACGTTGCCTCTCGGCGGCGCGGCGGCGGTGGACGAGTACCTGGAGTACCGGAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAGCGATTCCTCAGCAGT
Y
CCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGCTGCAGGTGCAAACAC
Celera SNP ID: hCV25959466
公開SNP ID: rs35495590
SNP染色体部位: 23695456
転写物配列中のSNP 配列番号 21
SNP部位転写物: 732
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,1|T,37) アフリカ系アメリカ人 (C,6|T,32) 全体 (C,7|T,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 146, 位置37,(C,TGC) (R,CGC)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 146, 位置37,(C,TGC) (R,CGC)

コンテクスト (配列番号 273):
CCGGCAATGGAGCGGTTGACGTTGCCTCTCGGCGGCGCGGCGGCGGTGGACGAGTACCTGGAGTACCGGAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAG
R
GATTCCTCAGCAGTGCCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGC
Celera SNP ID: hCV25959498
公開SNP ID: rs34518648
SNP染色体部位: 23695441
転写物配列中のSNP 配列番号 21
SNP部位転写物: 717
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,32) 全体 (A,7|G,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 146, 位置32,(A,GCG) (T,ACG)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 146, 位置32,(A,GCG) (T,ACG)

遺伝子番号: 12
遺伝子記号 C7orf46 - 340277
遺伝子名: 染色体 7 オープンリ−ディングフレーム46
公開転写物受託番号: hCT1968191
公開タンパク質受託番号: hCP1782654
染色体: 7
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 22):

タンパク質配列 (配列番号 147):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 274):
ACAGGGATGGATTGTAAACTTGTGGGCCCAGAGACACTGTGTTTTTGTACACATAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAGCGATTCCTCAGCAGT
Y
CCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGCTGCAGGTGCAAACAC
Celera SNP ID: hCV25959466
公開SNP ID: rs35495590
SNP染色体部位: 23695456
転写物配列中のSNP 配列番号 22
SNP部位転写物: 906
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,1|T,37) アフリカ系アメリカ人 (C,6|T,32) 全体 (C,7|T,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 147, 位置95,(C,TGC) (R,CGC)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 147, 位置95,(C,TGC) (R,CGC)

コンテクスト (配列番号 275):
AGCTGGCGGTCACCAACAGGGATGGATTGTAAACTTGTGGGCCCAGAGACACTGTGTTTTTGTACACATAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAG
R
GATTCCTCAGCAGTGCCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGC
Celera SNP ID: hCV25959498
公開SNP ID: rs34518648
SNP染色体部位: 23695441
転写物配列中のSNP 配列番号 22
SNP部位転写物: 891
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,32) 全体 (A,7|G,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 147, 位置90,(A,GCG) (T,ACG)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 147, 位置90,(A,GCG) (T,ACG)

遺伝子番号: 12
遺伝子記号 C7orf46 - 340277
遺伝子名: 染色体 7 オープンリ−ディングフレーム46
公開転写物受託番号: hCT1968192
公開タンパク質受託番号: hCP1782653
染色体: 7
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 23):

タンパク質配列 (配列番号 148):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 276):
TTGACGTTGCCTCTCGGCGGCGCGGCGGCGGTGGACGAGTACCTGGAGTACCGGAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAGCGATTCCTCAGCAGT
Y
CCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGCTGCAGGTGCAAACAC
Celera SNP ID: hCV25959466
公開SNP ID: rs35495590
SNP染色体部位: 23695456
転写物配列中のSNP 配列番号 23
SNP部位転写物: 732
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,1|T,37) アフリカ系アメリカ人 (C,6|T,32) 全体 (C,7|T,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 148, 位置37,(C,TGC) (R,CGC)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 148, 位置37,(C,TGC) (R,CGC)

コンテクスト (配列番号 277):
CCGGCAATGGAGCGGTTGACGTTGCCTCTCGGCGGCGCGGCGGCGGTGGACGAGTACCTGGAGTACCGGAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAG
R
GATTCCTCAGCAGTGCCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGC
Celera SNP ID: hCV25959498
公開SNP ID: rs34518648
SNP染色体部位: 23695441
転写物配列中のSNP 配列番号 23
SNP部位転写物: 717
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,32) 全体 (A,7|G,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 148, 位置32,(A,GCG) (T,ACG)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 148, 位置32,(A,GCG) (T,ACG)

遺伝子番号: 12
遺伝子記号 C7orf46 - 340277
遺伝子名: 染色体 7 オープンリ−ディングフレーム46
公開転写物受託番号: hCT29221
公開タンパク質受託番号: hCP47911
染色体: 7
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 24):

タンパク質配列 (配列番号 149):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 278):
ACAGGGATGGATTGTAAACTTGTGGGCCCAGAGACACTGTGTTTTTGTACACATAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAGCGATTCCTCAGCAGT
Y
CCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGCTGCAGGTGCAAACAC
Celera SNP ID: hCV25959466
公開SNP ID: rs35495590
SNP染色体部位: 23695456
転写物配列中のSNP 配列番号 24
SNP部位転写物: 906
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,1|T,37) アフリカ系アメリカ人 (C,6|T,32) 全体 (C,7|T,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 149, 位置95,(C,TGC) (R,CGC)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 149, 位置95,(C,TGC) (R,CGC)

コンテクスト (配列番号 279):
AGCTGGCGGTCACCAACAGGGATGGATTGTAAACTTGTGGGCCCAGAGACACTGTGTTTTTGTACACATAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAG
R
GATTCCTCAGCAGTGCCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGC
Celera SNP ID: hCV25959498
公開SNP ID: rs34518648
SNP染色体部位: 23695441
転写物配列中のSNP 配列番号 24
SNP部位転写物: 891
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,32) 全体 (A,7|G,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 149, 位置90,(A,GCG) (T,ACG)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 149, 位置90,(A,GCG) (T,ACG)

遺伝子番号: 13
遺伝子記号 CASP5 - 838
遺伝子名: カスパーゼ 5, アポトーシス関連システインペプチダーゼ
公開転写物受託番号: NM_004347
公開タンパク質受託番号: NP_004338
染色体: 11
OMIM番号: 602665
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 25):

タンパク質配列 (配列番号 150):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 280):
AGTGTAAAAAAAGACAACCACAAAAAAAAAACAGTTAAGATGTTGGAATACCTGGGCAAAGATGTTCTTCATGGTGTTTTTAATTATTTGGCAAAACACG
R
TGTTCTGACATTGAAGGAAGAGGAAAAGAAAAAATATTATGATACCAAAATTGAAGACAAGGCCCTGATCTTGGTAGACTCTTTGCGAAAGAATCGCGTG
Celera SNP ID: hCV12092542
公開SNP ID: rs507879
SNP染色体部位: 104383137
転写物配列中のSNP 配列番号 25
SNP部位転写物: 304
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,3|A,5) アフリカ系アメリカ人 (G,4|A,4) 全体 (G,7|A,9)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 150, 位置90,(A,GCC) (T,ACC)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,65|G,53)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 150, 位置90,(A,GCC) (T,ACC)

遺伝子番号: 14
遺伝子記号 CCDC8 - 83987
遺伝子名: コイルドコイルドメイン含有8
公開転写物受託番号: NM_032040
公開タンパク質受託番号: NP_114429
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 26):

タンパク質配列 (配列番号 151):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 281):
GAGGAGGGGGCAGAGGCTGCAGATAACCAGAGGGAAGAGGCTGCAGATAATCAGAGGGCAGAGGCCCCAGCTGACCAGAGGTCACAGGGCACAGATAACC
Y
CAGGGAAGAGGCTGCAGATAATCAGAGGGCGGAGGCCCCAGCTGACCAGGGGTCAGAGGTTACAGATAATCAAAGGGAAGAGGCCGTACATGACCAGAGG
Celera SNP ID: hCV1937195
公開SNP ID: rs34186470
SNP染色体部位: 51606761
転写物配列中のSNP 配列番号 26
SNP部位転写物: 1922
SNP供給源: Celera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (T,-|C,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 151, 位置383,(H,CAC) (Y,TAC)

遺伝子番号: 15
遺伝子記号 CDSN - 1041
遺伝子名: corneodesmosin
公開転写物受託番号: NM_001264
公開タンパク質受託番号: NP_001255
染色体: 6
OMIM番号: 602593
OMIM情報: 頭皮の先天性貧毛症, 146520 (3)

転写物配列 (配列番号 27):

タンパク質配列 (配列番号 152):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 282):
GGTGGGGTCCAGCTCTGTGGAGGCGGCTCCACGGGCTCCAAGGGACCCTGCTCTCCCTCCAGTTCTCGAGTCCCCAGCAGTTCTAGCATTTCCAGCAGCT
K
CGGTTTACCCTACCATCCCTGCGGCAGTGCTTCCCAGAGCCCCTGCTCCCCACCAGGCACCGGCTCCTTCAGCAGCAGCTCCAGTTCCCAATCCAGTGGC
Celera SNP ID: hCV8941510
公開SNP ID: rs1042127
SNP染色体部位: 31192149
転写物配列中のSNP 配列番号 27
SNP部位転写物: 1250
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,32|G,6) アフリカ系アメリカ人 (T,33|G,3) 全体 (T,65|G,9)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 152, 位置408,(S,TCC) (A,GCC)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,102|G,18)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 152, 位置408,(S,TCC) (A,GCC)

遺伝子番号: 16
遺伝子記号 CFHR5 - 81494
遺伝子名: 補体因子Ｈ関連 5
公開転写物受託番号: hCT2323523
公開タンパク質受託番号: hCP1800166
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 28):

タンパク質配列 (配列番号 153):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 283):
AGTACATTGAAATTCAAAGTCATGCTTGTAACTGTTAATGAAAGCAGATTTAAAGCAACACCACCATCACTGGAGTATTTTTAGTTATA
Y
ACGATTGAGACTACCAAGCATGTTGCTCTTATTCAGTGTAATCCTAATCTCATGGGTATCCACTGTTGGGGGAGAAGGAACACTTTGTGATTTTCCAAAA
Celera SNP ID: hCV9114656
公開SNP ID: rs9427662
SNP染色体部位: 195213398
転写物配列中のSNP 配列番号 28
SNP部位転写物: 90
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,4|T,34) アフリカ系アメリカ人 (C,10|T,28) 全体 (C,14|T,62)
SNP型: UTR5
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,109|C,9)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 17
遺伝子記号 CTSB - 1508
遺伝子名: カテプシン B
公開転写物受託番号: NM_001908
公開タンパク質受託番号: NP_001899
染色体: 8
OMIM番号: 116810
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 29):

タンパク質配列 (配列番号 154):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 284):
TGGTGTCTTGGTGATCTCACATAACCAAGATGCTACCCCGTGGGGAACCACATCCCCCTGGATGCCCTCCAGCCTTGGTTTGGGCTGGAGTCAGGGCCTG
K
ATACAGTATTTTGAATTTGTATGCCACTGGTTTGCATTGCTGGTCAGGAACTCTAGTGCTTTGCATAGCCCTGGTTTAGAAACATGTTATAGCAGTTCTT
Celera SNP ID: hCV2716314
公開SNP ID: rs8005
SNP染色体部位: 11738505
転写物配列中のSNP 配列番号 29
SNP部位転写物: 2720
SNP供給源: Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (T,-|G,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 17
遺伝子記号 CTSB - 1508
遺伝子名: カテプシン B
公開転写物受託番号: NM_147780
公開タンパク質受託番号: NP_680090
染色体: 8
OMIM番号: 116810
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 30):

タンパク質配列 (配列番号 155):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 285):
TGGTGTCTTGGTGATCTCACATAACCAAGATGCTACCCCGTGGGGAACCACATCCCCCTGGATGCCCTCCAGCCTTGGTTTGGGCTGGAGTCAGGGCCTG
K
ATACAGTATTTTGAATTTGTATGCCACTGGTTTGCATTGCTGGTCAGGAACTCTAGTGCTTTGCATAGCCCTGGTTTAGAAACATGTTATAGCAGTTCTT
Celera SNP ID: hCV2716314
公開SNP ID: rs8005
SNP染色体部位: 11738505
転写物配列中のSNP 配列番号 30
SNP部位転写物: 2882
SNP供給源: Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (T,-|G,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 17
遺伝子記号 CTSB - 1508
遺伝子名: カテプシン B
公開転写物受託番号: NM_147781
公開タンパク質受託番号: NP_680091
染色体: 8
OMIM番号: 116810
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 31):

タンパク質配列 (配列番号 156):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 286):
TGGTGTCTTGGTGATCTCACATAACCAAGATGCTACCCCGTGGGGAACCACATCCCCCTGGATGCCCTCCAGCCTTGGTTTGGGCTGGAGTCAGGGCCTG
K
ATACAGTATTTTGAATTTGTATGCCACTGGTTTGCATTGCTGGTCAGGAACTCTAGTGCTTTGCATAGCCCTGGTTTAGAAACATGTTATAGCAGTTCTT
Celera SNP ID: hCV2716314
公開SNP ID: rs8005
SNP染色体部位: 11738505
転写物配列中のSNP 配列番号 31
SNP部位転写物: 2839
SNP供給源: Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (T,-|G,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 17
遺伝子記号 CTSB - 1508
遺伝子名: カテプシン B
公開転写物受託番号: NM_147782
公開タンパク質受託番号: NP_680092
染色体: 8
OMIM番号: 116810
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 32):

タンパク質配列 (配列番号 157):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 287):
TGGTGTCTTGGTGATCTCACATAACCAAGATGCTACCCCGTGGGGAACCACATCCCCCTGGATGCCCTCCAGCCTTGGTTTGGGCTGGAGTCAGGGCCTG
K
ATACAGTATTTTGAATTTGTATGCCACTGGTTTGCATTGCTGGTCAGGAACTCTAGTGCTTTGCATAGCCCTGGTTTAGAAACATGTTATAGCAGTTCTT
Celera SNP ID: hCV2716314
公開SNP ID: rs8005
SNP染色体部位: 11738505
転写物配列中のSNP 配列番号 32
SNP部位転写物: 2808
SNP供給源: Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (T,-|G,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 17
遺伝子記号 CTSB - 1508
遺伝子名: カテプシン B
公開転写物受託番号: NM_147783
公開タンパク質受託番号: NP_680093
染色体: 8
OMIM番号: 116810
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 33):

タンパク質配列 (配列番号 158):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 288):
TGGTGTCTTGGTGATCTCACATAACCAAGATGCTACCCCGTGGGGAACCACATCCCCCTGGATGCCCTCCAGCCTTGGTTTGGGCTGGAGTCAGGGCCTG
K
ATACAGTATTTTGAATTTGTATGCCACTGGTTTGCATTGCTGGTCAGGAACTCTAGTGCTTTGCATAGCCCTGGTTTAGAAACATGTTATAGCAGTTCTT
Celera SNP ID: hCV2716314
公開SNP ID: rs8005
SNP染色体部位: 11738505
転写物配列中のSNP 配列番号 33
SNP部位転写物: 2794
SNP供給源: Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (T,-|G,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 18
遺伝子記号 CUEDC1 - 404093
遺伝子名: CUEドメイン含有1
公開転写物受託番号: NM_017949
公開タンパク質受託番号: NP_060419
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 34):

タンパク質配列 (配列番号 159):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 289):
ACCACATGCACGTGTTCGACCGACCCTACCCTCTGGCTCCCCCGACTCCGCCTCCCCGTATCGACGCGCTGGGCTCTGGAGCCCCTACAAGCCAGAGACG
R
TATCGGAACTGGAACCCACCACTGCTGGGCAACCTTCCGGATGACTTTCTCCGCATCCTGCCCCAGCAGCTGGACAGCATACAGGGTAACGCTGGGGGCC
Celera SNP ID: hCV25615302
公開SNP ID: rs17762338
SNP染色体部位: 53306036
転写物配列中のSNP 配列番号 34
SNP部位転写物: 1226
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,33|A,7) アフリカ系アメリカ人 (G,38|A,0) 全体 (G,71|A,7)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 159, 位置169,(R,CGC) (H,CAC)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,100|A,16)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 159, 位置169,(R,CGC) (H,CAC)

遺伝子番号: 19
遺伝子記号 CYP17A1 - 1586
遺伝子名: シトクロム P450,ファミリー 17, サブファミリーA,
ポリペプチド 1
公開転写物受託番号: NM_000102
公開タンパク質受託番号: NP_000093
染色体: 10
OMIM番号: 202110
OMIM情報: 17-α-ヒドロキシラーゼ/17,20-リアーゼ 欠損, 202110 (3); 17,20-リアーゼ/欠損, 単離, 202110 (3)


転写物配列 (配列番号 35):

タンパク質配列 (配列番号 160):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 290):
TCCACAAGGCAAGAGATAACACAAAGTCAAGGTGAAGATCAGGGTAGCCCTTTAAAAGGCCTCCTTGTGCCCTAGAGTTGCCACAGCTCTTCTACTCCAC
Y
GCTGTCTATCTTGCCTGCCGGCACCCAGCCACCATGTGGGAGCTCGTGGCTCTCTTGCTGCTTACCCTAGCTTATTTGTTTTGGCCCAAGAGAAGGTGCC
Celera SNP ID: hCV2852784
公開SNP ID: rs743572
SNP染色体部位: 104587142
転写物配列中のSNP 配列番号 35
SNP部位転写物: 139
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,70|C,46)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 291):
GTCCCTGCCCCTGGTGGGCAGCCTGCCATTCCTCCCCAGACACGGCCATATGCATAACAACTTCTTCAAGCTGCAGAAAAAATATGGCCCCATCTATTCG
K
TTCGTATGGGCACCAAGACTACAGTGATTGTCGGCCACCACCAGCTGGCCAAGGAGGTGCTTATTAAGAAGGGCAAGGACTTCTCTGGGCGGCCTCAAAT
Celera SNP ID: hCV12119916
公開SNP ID: rs6163
SNP染色体部位: 104586914
転写物配列中のSNP 配列番号 35
SNP部位転写物: 368
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,73|T,47)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 160, 位置65,(S,TCG) (S,TCT)

コンテクスト (配列番号 292):
TTATTTGTTTTGGCCCAAGAGAAGGTGCCCTGGTGCCAAGTACCCCAAGAGCCTCCTGTCCCTGCCCCTGGTGGGCAGCCTGCCATTCCTCCCCAGACAC
Y
GCCATATGCATAACAACTTCTTCAAGCTGCAGAAAAAATATGGCCCCATCTATTCGGTTCGTATGGGCACCAAGACTACAGTGATTGTCGGCCACCACCA
Celera SNP ID: hCV12119917
公開SNP ID: rs6162
SNP染色体部位: 104586971
転写物配列中のSNP 配列番号 35
SNP部位転写物: 311
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,71|T,49)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 160, 位置46,(H,CAC) (H,CAT)

遺伝子番号: 20
遺伝子記号 DEGS1 - 8560
遺伝子名: 変性精母細胞 ホモログ 1, 脂質デサチュラーゼ (Drosophila)
公開転写物受託番号: NM_003676
公開タンパク質受託番号: NP_003667
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 36):

タンパク質配列 (配列番号 161):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 293):
ACATGTTCTTAAAGGGTCATGAAACTTACTCATATTATGGGCCTCTGAATTTACTTACCTTCAATGTGGGTTATCATAATGAACATCATGATTTCCCCAA
R
ATTCCTGGAAAAAGTCTTCCACTGGTGAGGAAAATAGCAGCTGAATACTATGACAACCTCCCTCACTACAATTCCTGGATAAAAGTACTGTATGATTTTG
Celera SNP ID: hCV25649928
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 222444619
転写物配列中のSNP 配列番号 36
SNP部位転写物: 912
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,35|G,1) アフリカ系アメリカ人 (A,36|G,0) 全体 (A,71|G,1)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 161, 位置267,(N,AAC) (S,AGC)

遺伝子番号: 20
遺伝子記号 DEGS1 - 8560
遺伝子名: 変性精母細胞 ホモログ 1, 脂質デサチュラーゼ (Drosophila)
公開転写物受託番号: NM_144780
公開タンパク質受託番号: NP_659004
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 37):

タンパク質配列 (配列番号 162):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 294):
ACATGTTCTTAAAGGGTCATGAAACTTACTCATATTATGGGCCTCTGAATTTACTTACCTTCAATGTGGGTTATCATAATGAACATCATGATTTCCCCAA
R
ATTCCTGGAAAAAGTCTTCCACTGGTGAGGAAAATAGCAGCTGAATACTATGACAACCTCCCTCACTACAATTCCTGGATAAAAGTACTGTATGATTTTG
Celera SNP ID: hCV25649928
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 222444619
転写物配列中のSNP 配列番号 37
SNP部位転写物: 912
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,35|G,1) アフリカ系アメリカ人 (A,36|G,0) 全体 (A,71|G,1)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 162, 位置267,(N,AAC) (S,AGC)

遺伝子番号: 21
遺伝子記号 DHX38 - 9785
遺伝子名: DEAH (Asp-Glu-Ala-His) ボックスポリペプチド 38
公開転写物受託番号: NM_014003
公開タンパク質受託番号: NP_054722
染色体: 16
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 38):

タンパク質配列 (配列番号 163):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 295):
GACAGACATTATCGGTCTGCTCGGGTAGAGACTCCATCCCATCCGGGTGGTGTGAGCGAAGAGTTTTGGGAACGCAGTCGGCAGAGAGAGCGGGAGCGGC
M
GGAACATGGTGTCTATGCCTCGTCCAAAGAAGAAAAGGATTGGAAGAAGGAGAAATCGCGGGATCGAGACTATGACCGCAAGAGGGACAGAGATGAGCGG
Celera SNP ID: hCV9860072
公開SNP ID: rs1050362
SNP染色体部位: 70688316
転写物配列中のSNP 配列番号 38
SNP部位転写物: 774
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,14|C,26) アフリカ系アメリカ人 (A,19|C,13) 全体 (A,33|C,39)


SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 163, 位置140,(R,CGG) (R,AGG)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,77|A,35)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 163, 位置140,(R,CGG) (R,AGG)

遺伝子番号: 22
遺伝子記号 DUSP11 - 8446
遺伝子名: 二重特異的ホスファターゼ 11 (RNA/RNP 複合体 1-相互作用)
公開転写物受託番号: NM_003584
公開タンパク質受託番号: NP_003575
染色体: 2
OMIM番号: 603092
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 39):

タンパク質配列 (配列番号 164):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 296):
CTGGGAGCGCGGCGTAGGTGGCTGCCGAGTCTTTTCCTGTTTAGGGTCTTATCCTGGCATTGAGGGCGCCGGACTGGCGCTTTTGG
R
CGGCTTGGCATTGGGTGGGCGGCTTCTTGGGACCCACATGAGCCAGTGGCATCATCCCCGCAGTGGCTGGGGCCGGAGACGCGACTTTTCAGGACGCTCC
Celera SNP ID: hCV25473516
公開SNP ID: rs2272051
SNP染色体部位: 73860644
転写物配列中のSNP 配列番号 39
SNP部位転写物: 87
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,13|A,9) アフリカ系アメリカ人 (G,3|A,5) 全体 (G,16|A,14)
SNP型: UTR5
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,23|A,17) アフリカ系アメリカ人 (G,20|A,18) 全体 (G,43|A,35)
SNP型: UTR5
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,36|G,82)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 23
遺伝子記号 EPS8L3 - 79574
遺伝子名: EPS8様3
公開転写物受託番号: NM_024526
公開タンパク質受託番号: NP_078802
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 40):

タンパク質配列 (配列番号 165):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 297):
CAGGCAAAGACCAGCAGGAAGAAGAAATTTGGGAAAAAAAACAAGGACCAGGGAGGTCTCACCCAGGCACAGTACATTGACTGCTTCCAGAAGATCAAGC
Y
CAGCTTCAACCTCCTGGGAAGGCTGGCCACCTGGCTGAAGGAGACAAGTGCCCCTGAGCTCGTACACATCCTCTTCAAGTCCCTGAACTTCATCCTGGCC
Celera SNP ID: hCV2017876
公開SNP ID: rs3818562
SNP染色体部位: 110101964
転写物配列中のSNP 配列番号 40
SNP部位転写物: 1023
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,52|T,68)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 165, 位置293,(H,CAC) (Y,TAC)

遺伝子番号: 23
遺伝子記号 EPS8L3 - 79574
遺伝子名: EPS8様3
公開転写物受託番号: NM_133181
公開タンパク質受託番号: NP_573444
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 41):

タンパク質配列 (配列番号 166):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 298):
CAGGCAAAGACCAGCAGGAAGAAGAAATTTGGGAAAAAAAACAAGGACCAGGGAGGTCTCACCCAGGCACAGTACATTGACTGCTTCCAGAAGATCAAGC
Y
CAGCTTCAACCTCCTGGGAAGGCTGGCCACCTGGCTGAAGGAGACAAGTGCCCCTGAGCTCGTACACATCCTCTTCAAGTCCCTGAACTTCATCCTGGCC
Celera SNP ID: hCV2017876
公開SNP ID: rs3818562
SNP染色体部位: 110101964
転写物配列中のSNP 配列番号 41
SNP部位転写物: 1023
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,52|T,68)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 166, 位置293,(H,CAC) (Y,TAC)

遺伝子番号: 23
遺伝子記号 EPS8L3 - 79574
遺伝子名: EPS8様3
公開転写物受託番号: NM_139053
公開タンパク質受託番号: NP_620641
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 42):

タンパク質配列 (配列番号 167):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 299):
CAGGCAAAGACCAGCAGGAAGAAGAAATTTGGGAAAAAAAACAAGGACCAGGGAGGTCTCACCCAGGCACAGTACATTGACTGCTTCCAGAAGATCAAGC
Y
CAGCTTCAACCTCCTGGGAAGGCTGGCCACCTGGCTGAAGGAGACAAGTGCCCCTGAGCTCGTACACATCCTCTTCAAGTCCCTGAACTTCATCCTGGCC
Celera SNP ID: hCV2017876
公開SNP ID: rs3818562
SNP染色体部位: 110101964
転写物配列中のSNP 配列番号 42
SNP部位転写物: 1026
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,52|T,68)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 167, 位置294,(H,CAC) (Y,TAC)

遺伝子番号: 24
遺伝子記号 F11 - 2160
遺伝子名: 凝固因子 XI (血漿トロンボプラスチン前駆物質)
公開転写物受託番号: NM_000128
公開タンパク質受託番号: NP_000119
染色体: 4
OMIM番号: 264900
OMIM情報: 第XI因子 欠損, 常染色体劣性 (3); 第XI因子 欠損,/
常染色体優性 (3)

転写物配列 (配列番号 43):

タンパク質配列 (配列番号 168):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 300):
TGTTTGAGCATTCAGTCTCTTTGTTTTTGATCACGCTTCTATGGAGTCCAAGAATTACCATAAGGCAATATTTCTGAAGATTACTATATAGGCAGATATA
S
CAGAAAATAACCAAGTAGTGGCAGTGGGGATCAGGCAGAAGAACTGGTAAAAGAAGCCACCATAAATAGATTTGTTCGATGAAAGATGAAAACTGGAAGA
Celera SNP ID: hCV3230119
公開SNP ID: rs4253430
SNP染色体部位: 187447058
転写物配列中のSNP 配列番号 43
SNP部位転写物: 2507
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,76|C,44)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 25
遺伝子記号 F13B - 2165
遺伝子名: 凝固因子 XIII, B ポリペプチド
公開転写物受託番号: NM_001994
公開タンパク質受託番号: NP_001985
染色体: 1
OMIM番号: 134580
OMIM情報: 第XIII因子 B 欠損 (3)

転写物配列 (配列番号 44):

タンパク質配列 (配列番号 169):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 301):
CTCCAGAGCCAAGGTGCTTCAAAAAATGCACTAAGCCTGACCTGAGTAATGGTTACATCTCTGATGTAAAGTTATTGTATAAAATTCAAGAGAACATGCG
R
TATGGTTGCGCTTCAGGGTACAAAACCACTGGAGGGAAGGATGAAGAAGTGGTTCAATGTCTCTCTGATGGATGGTCTTCTCAACCAACCTGTAGGAAAG
Celera SNP ID: hCV2532034
公開SNP ID: rs6003
SNP染色体部位: 195297644
転写物配列中のSNP 配列番号 44
SNP部位転写物: 389
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,2|A,32) アフリカ系アメリカ人 (G,13|A,23) 全体 (G,15|A,55)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 169, 位置115,(R,CGT) (H,CAT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,5|A,35) アフリカ系アメリカ人 (G,14|A,18) 全体 (G,19|A,53)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 169, 位置115,(R,CGT) (H,CAT)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,9|A,111)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 169, 位置115,(R,CGT) (H,CAT)

遺伝子番号: 26
遺伝子記号 F2 - 2147
遺伝子名: 凝固因子 II (トロンビン)
公開転写物受託番号: hCT10679
公開タンパク質受託番号: hCP37454
染色体: 11
OMIM番号: 176930
OMIM情報: 低プロトロンビン血症 (3); プロトロンビン異常症 (3)

転写物配列 (配列番号 45):

タンパク質配列 (配列番号 170):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 302):
GTAGGGGGCCACTCATATTCTGGGCTCCTGGAACCAATCCCGTGAAAGAATTATTTTTGTGTTTCTAAAACTATGGTTCCCAATAAAAGTGACTCTCAGC
R
AGCCTC
Celera SNP ID: hCV8726802
公開SNP ID: rs1799963
SNP染色体部位: 46717631
転写物配列中のSNP 配列番号 45
SNP部位転写物: 2023
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 26
遺伝子記号 F2 - 2147
遺伝子名: 凝固因子 II (トロンビン)
公開転写物受託番号: hCT1968894
公開タンパク質受託番号: hCP1782758
染色体: 11
OMIM番号: 176930
OMIM情報: 低プロトロンビン血症 (3); プロトロンビン異常症 (3)

転写物配列 (配列番号 46):

タンパク質配列 (配列番号 171):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 303):
GTAGGGGGCCACTCATATTCTGGGCTCCTGGAACCAATCCCGTGAAAGAATTATTTTTGTGTTTCTAAAACTATGGTTCCCAATAAAAGTGACTCTCAGC
R
AGCCTC
Celera SNP ID: hCV8726802
公開SNP ID: rs1799963
SNP染色体部位: 46717631
転写物配列中のSNP 配列番号 46
SNP部位転写物: 1961
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 26
遺伝子記号 F2 - 2147
遺伝子名: 凝固因子 II (トロンビン)
公開転写物受託番号: hCT1968895
公開タンパク質受託番号: hCP1782762
染色体: 11
OMIM番号: 176930
OMIM情報: 低プロトロンビン血症 (3); プロトロンビン異常症 (3)

転写物配列 (配列番号 47):

タンパク質配列 (配列番号 172):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 304):
GTAGGGGGCCACTCATATTCTGGGCTCCTGGAACCAATCCCGTGAAAGAATTATTTTTGTGTTTCTAAAACTATGGTTCCCAATAAAAGTGACTCTCAGC
R
A
Celera SNP ID: hCV8726802
公開SNP ID: rs1799963
SNP染色体部位: 46717631
転写物配列中のSNP 配列番号 47
SNP部位転写物: 2027
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 27
遺伝子記号 F5 - 2153
遺伝子名: 凝固因子 V (プロアクセレリン, 不安定因子)
公開転写物受託番号: NM_000130
公開タンパク質受託番号: NP_000121
染色体: 1
OMIM番号: 227400
OMIM情報: 第V因子欠損に起因する出血性素因 (3);/{第V因子Leidenに起因する血栓塞栓症感受性} (3); {第V因子Liverpoolに起因する血栓性素因} (3)

転写物配列 (配列番号 48):

タンパク質配列 (配列番号 173):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 305):
CTGAAGACCCTATAGAGGATCCTCTACAGCCAGATGTCACAGGGATACGTCTACTTTCACTTGGTGCTGGAGAATTCAAAAGTCAAGAACATGCTAAGCA
R
AAGGGACCCAAGGTAGAAAGAGATCAAGCAGCAAAGCACAGGTTCTCCTGGATGAAATTACTAGCACATAAAGTTGGGAGACACCTAAGCCAAGACACTG
Celera SNP ID: hCV8919442
公開SNP ID: rs4525
SNP染色体部位: 167778358
転写物配列中のSNP 配列番号 48
SNP部位転写物: 2740
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,3|A,25) アフリカ系アメリカ人 (G,1|A,19) 全体 (G,4|A,44)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 173, 位置865,(H,CAT) (R,CGT)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,87|G,31)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 173, 位置865,(H,CAT) (R,CGT)

コンテクスト (配列番号 306):
TTTAGAACCTGAAGATGAAGAGAGTGATGCTGACTATGATTACCAGAACAGACTGGCTGCAGCATTAGGAATCAGGTCATTCCGAAACTCATCATTGAAT
Y
AGGAAGAAGAAGAGTTCAATCTTACTGCCCTAGCTCTGGAGAATGGCACTGAATTCGTTTCTTCAAACACAGATATAATTGTTGGTTCAAATTATTCTTC
Celera SNP ID: hCV8919450
公開SNP ID: rs6017
SNP染色体部位: 167778717
転写物配列中のSNP 配列番号 48
SNP部位転写物: 2381
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,32|C,8) アフリカ系アメリカ人 (T,29|C,5) 全体 (T,61|C,13)
SNP型: ESE
タンパク質コーディング: 配列番号 173, 位置None
SNP供給源: dbSNP; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,82|C,28)
SNP型: ESE
タンパク質コーディング: 配列番号 173, 位置None

コンテクスト (配列番号 307):
CATGGCTACACGGAAAATGCATGATCGTTTAGAACCTGAAGATGAAGAGAGTGATGCTGACTATGATTACCAGAACAGACTGGCTGCAGCATTAGGAATC
Y
GGTCATTCCGAAACTCATCATTGAATCAGGAAGAAGAAGAGTTCAATCTTACTGCCCTAGCTCTGGAGAATGGCACTGAATTCGTTTCTTCAAACACAGA
Celera SNP ID: hCV8919451
公開SNP ID: rs6016
SNP染色体部位: 167778744
転写物配列中のSNP 配列番号 48
SNP部位転写物: 2354
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,8|C,32) アフリカ系アメリカ人 (T,5|C,27) 全体 (T,13|C,59)
SNP型: ESS
タンパク質コーディング: 配列番号 173, 位置None
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,86|T,30)
SNP型: ESS
タンパク質コーディング: 配列番号 173, 位置None

コンテクスト (配列番号 308):
CAGAGCATTCCAGCCCATATTCTGAAGACCCTATAGAGGATCCTCTACAGCCAGATGTCACAGGGATACGTCTACTTTCACTTGGTGCTGGAGAATTCAA
R
AGTCAAGAACATGCTAAGCATAAGGGACCCAAGGTAGAAAGAGATCAAGCAGCAAAGCACAGGTTCTCCTGGATGAAATTACTAGCACATAAAGTTGGGA
Celera SNP ID: hCV8919444
公開SNP ID: rs4524
SNP染色体部位: 167778379
転写物配列中のSNP 配列番号 48
SNP部位転写物: 2719
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,89|G,31)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 173, 位置858,(K,AAA) (R,AGA)

コンテクスト (配列番号 309):
TAACAAGACCATACTACAGTGACGTGGACATCATGAGAGACATCGCCTCTGGGCTAATAGGACTACTTCTAATCTGTAAGAGCAGATCCCTGGACAGGCG
R
GGAATACAGAGGGCAGCAGACATCGAACAGCAGGCTGTGTTTGCTGTGTTTGATGAGAACAAAAGCTGGTACCTTGAGGACAACATCAACAAGTTTTGTG
Celera SNP ID: hCV11975250
公開SNP ID: rs6025
SNP染色体部位: 167785673
転写物配列中のSNP 配列番号 48
SNP部位転写物: 1747
SNP供給源: HGMD; dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,119)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 173, 位置534,(R,CGA) (Q,CAA)

遺伝子番号: 28
遺伝子記号 F9 - 2158
遺伝子名: 凝固因子 IX (血漿トロンボプラスチン成分、クリスマス病、血友病B)
公開転写物受託番号: hCT2345281
公開タンパク質受託番号: hCP1910567
染色体: X
OMIM番号: 306900
OMIM情報: 血友病B (3); ワルファリン感受性(3)

転写物配列 (配列番号 49):

タンパク質配列 (配列番号 174):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 310):
TGCGAGCAGTTTTGTAAAAATAGTGCTGATAACAAGGTGGTTTGCTCCTGTACTGAGGGATATCGACTTTCACAAACTTCTAAGCTCACCCGTGCTGAGA
R
TGTTTTTCCTGATGTGGACTATGTAAATTCTACTGAAGCTGAAACCATTTTGGATAACATCACTCAAAGCACCCAATCATTTAATGACTTCACTCGGGTT
Celera SNP ID: hCV596331
公開SNP ID: rs6048
SNP染色体部位: 138460946
転写物配列中のSNP 配列番号 49
SNP部位転写物: 579
SNP供給源: dbSNP; HapMap;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,61|G,29)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 174, 位置174,(T,ACT) (A,GCT)

遺伝子番号: 28
遺伝子記号 F9 - 2158
遺伝子名: 凝固因子 IX (血漿トロンボプラスチン成分、クリスマス病、血友病B)
公開転写物受託番号: hCT2345282
公開タンパク質受託番号: hCP1910569
染色体: X
OMIM番号: 306900
OMIM情報: 血友病B (3); ワルファリン感受性(3)

転写物配列 (配列番号 50):

タンパク質配列 (配列番号 175):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 311):
TATCGACTTGCAGAAAACCAGAAGTCCTGTGAACCAGCAGTGCCATTTCCATGTGGAAGAGTTTCTGTTTCACAAACTTCTAAGCTCACCCGTGCTGAGA
R
TGTTTTTCCTGATGTGGACTATGTAAATTCTACTGAAGCTGAAACCATTTTGGATAACATCACTCAAAGCACCCAATCATTTAATGACTTCACTCGGGTT
Celera SNP ID: hCV596331
公開SNP ID: rs6048
SNP染色体部位: 138460946
転写物配列中のSNP 配列番号 50
SNP部位転写物: 585
SNP供給源: dbSNP; HapMap;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,61|G,29)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 175, 位置176,(T,ACT) (A,GCT)

遺伝子番号: 28
遺伝子記号 F9 - 2158
遺伝子名: 凝固因子 IX (血漿トロンボプラスチン成分、クリスマス病、血友病B)
公開転写物受託番号: hCT5715
公開タンパク質受託番号: hCP35448
染色体: X
OMIM番号: 306900
OMIM情報: 血友病B (3); ワルファリン感受性(3)

転写物配列 (配列番号 51):

タンパク質配列 (配列番号 176):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 312):
TATCGACTTGCAGAAAACCAGAAGTCCTGTGAACCAGCAGTGCCATTTCCATGTGGAAGAGTTTCTGTTTCACAAACTTCTAAGCTCACCCGTGCTGAGA
R
TGTTTTTCCTGATGTGGACTATGTAAATTCTACTGAAGCTGAAACCATTTTGGATAACATCACTCAAAGCACCCAATCATTTAATGACTTCACTCGGGTT
Celera SNP ID: hCV596331
公開SNP ID: rs6048
SNP染色体部位: 138460946
転写物配列中のSNP 配列番号 51
SNP部位転写物: 639
SNP供給源: dbSNP; HapMap;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,61|G,29)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 176, 位置194,(T,ACT) (A,GCT)

遺伝子番号: 29
遺伝子記号 FGA - 2243
遺伝子名: フィブリノゲンα鎖
公開転写物受託番号: NM_000508
公開タンパク質受託番号: NP_000499
染色体: 4
OMIM番号: 134820
OMIM情報: 異常フィブリノゲン血症,α型，出血性素質を引き起こす (3);/異常フィブリノゲン血症,α型， 再発性血栓症を引き起こす (3); 遺伝性腎アミロイドーシス, 105200 (3);
無フィブリノゲン血症, 202400 (3)

転写物配列 (配列番号 52):

タンパク質配列 (配列番号 177):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 313):
GGGAGCTCTGGACCTGGAAGTACTGGAAACCGAAACCCTGGGAGCTCTGGGACTGGAGGGACTGCAACCTGGAAACCTGGGAGCTCTGGACCTGGAAGTA
R
TGGAAGCTGGAACTCTGGGAGCTCTGGAACTGGAAGTACTGGAAACCAAAACCCTGGGAGCCCTAGACCTGGTAGTACCGGAACCTGGAATCCTGGCAGC
Celera SNP ID: hCV2892877
公開SNP ID: rs6050
SNP染色体部位: 155727040
転写物配列中のSNP 配列番号 52
SNP部位転写物: 1050
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,10|A,28) アフリカ系アメリカ人 (G,2|A,22) 全体 (G,12|A,50)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 177, 位置331,(T,ACT) (A,GCT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,13|A,27) アフリカ系アメリカ人 (G,7|A,29) 全体 (G,20|A,56)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 177, 位置331,(T,ACT) (A,GCT)
SNP供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,89|G,31)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 177, 位置331,(T,ACT) (A,GCT)

コンテクスト (配列番号 314):

R
GCAATCCTTTCTTTCAGCTGGAGTGCTCCTCAGGAGCCAGCCCCACCCTTAGAAAAGATGTTTTCCATGAGGATCGTCTGCCTGGTCCTAAGTGTGGTGG
Celera SNP ID: hCV2892870
公開SNP ID: rs2070011
SNP染色体部位: 155731347
転写物配列中のSNP 配列番号 52
SNP部位転写物: 1
関連した照会SNP: hCV15860433 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27020269 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,23|A,15) アフリカ系アメリカ人 (G,24|A,12) 全体 (G,47|A,27)
SNP型: UTR5
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,24|A,16) アフリカ系アメリカ人 (G,20|A,12) 全体 (G,44|A,28)
SNP型: UTR5
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,46|G,70)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 29
遺伝子記号 FGA - 2243
遺伝子名: フィブリノゲンα鎖
公開転写物受託番号: NM_021871
公開タンパク質受託番号: NP_068657
染色体: 4
OMIM番号: 134820
OMIM情報: 異常フィブリノゲン血症,α型，出血性素質を引き起こす (3);/ 異常フィブリノゲン血症,α型，再発性血栓症を引き起こす (3); 遺伝性腎アミロイドーシス, 105200 (3);
無フィブリノゲン血症, 202400 (3)

転写物配列 (配列番号 53):

タンパク質配列 (配列番号 178):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 315):
GGGAGCTCTGGACCTGGAAGTACTGGAAACCGAAACCCTGGGAGCTCTGGGACTGGAGGGACTGCAACCTGGAAACCTGGGAGCTCTGGACCTGGAAGTA
R
TGGAAGCTGGAACTCTGGGAGCTCTGGAACTGGAAGTACTGGAAACCAAAACCCTGGGAGCCCTAGACCTGGTAGTACCGGAACCTGGAATCCTGGCAGC
Celera SNP ID: hCV2892877
公開SNP ID: rs6050
SNP染色体部位: 155727040
転写物配列中のSNP 配列番号 53
SNP部位転写物: 1050
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,10|A,28) アフリカ系アメリカ人 (G,2|A,22) 全体 (G,12|A,50)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 178, 位置331,(T,ACT) (A,GCT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,13|A,27) アフリカ系アメリカ人 (G,7|A,29) 全体 (G,20|A,56)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 178, 位置331,(T,ACT) (A,GCT)
SNP供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,89|G,31)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 178, 位置331,(T,ACT) (A,GCT)

コンテクスト (配列番号 316):

R
GCAATCCTTTCTTTCAGCTGGAGTGCTCCTCAGGAGCCAGCCCCACCCTTAGAAAAGATGTTTTCCATGAGGATCGTCTGCCTGGTCCTAAGTGTGGTGG
Celera SNP ID: hCV2892870
公開SNP ID: rs2070011
SNP染色体部位: 155731347
転写物配列中のSNP 配列番号 53
SNP部位転写物: 1
関連した照会SNP: hCV15860433 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27020269 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,23|A,15) アフリカ系アメリカ人 (G,24|A,12) 全体 (G,47|A,27)
SNP型: UTR5
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,24|A,16) アフリカ系アメリカ人 (G,20|A,12) 全体 (G,44|A,28)
SNP型: UTR5
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,46|G,70)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 30
遺伝子記号 FGG - 2266
遺伝子名: フィブリノゲンγ鎖
公開転写物受託番号: NM_021870
公開タンパク質受託番号: NP_068656
染色体: 4
OMIM番号: 134850
OMIM情報: 異常フィブリノゲン血症, γ型 (3); 低フィブリノゲン血症，γ／型 (3);
血栓性素因, 異常フィブリノゲン血症 (3)

転写物配列 (配列番号 54):

タンパク質配列 (配列番号 179):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 317):
CCACCTGGGGGGAGCCAAACAGGTCAGACCAGAGCACCCTGCGGAAACAGAATATGACTCACTTTACCCTGAGGATGATTTGTAGAAAATTAACTGCTAA
Y
TTCTATTGACCCACAAAGTTTCAGAAATTCTCTGAAAGTTTCTTCCTTTTTTCTCTTACTATATTTATTGATTTCAAGTCTTCTATTAAGGACATTTAGC
Celera SNP ID: hCV2892863
公開SNP ID: rs1049636
SNP染色体部位: 155745420
転写物配列中のSNP 配列番号 54
SNP部位転写物: 1519
関連した照会SNP: hCV2892855 (検出力=.6)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,18|C,0) アフリカ系アメリカ人 (T,9|C,5) 全体 (T,27|C,5)
SNP型: UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,32|T,84)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 31
遺伝子記号 GOLGA3 - 2802
遺伝子名: ゴルジ自己抗原, ゴルジン(golgin)サブファミリーa, 3
公開転写物受託番号: NM_005895
公開タンパク質受託番号: NP_005886
染色体: 12
OMIM番号: 602581
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 55):

タンパク質配列 (配列番号 180):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 318):
TGAACCTTCAGGTGCAGGCAGTTTTGCAGCGCAAAGAAGAGGAGGATCGCCAGATGAAGCATCTTGTCCAGGCCCTGCAGGCCTCACTAGAGAAGGAGAA
R
GAGAAGGTGAACAGCCTCAAGGAGCAGGTGGCTGCTGCCAAGGTGGAAGCCGGGCATAACCGCCGCCACTTCAAGGCGGCCTCCTTGGAGCTGAGTGAGG
Celera SNP ID: hCV1859855
公開SNP ID: rs2291260
SNP染色体部位: 131867485
転写物配列中のSNP 配列番号 55
SNP部位転写物: 4114
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,89|G,31)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 180, 位置1185,(K,AAG) (R,AGG)

遺伝子番号: 32
遺伝子記号 GP6 - 51206
遺伝子名: 糖蛋白 VI (血小板)
公開転写物受託番号: NM_001083899
公開タンパク質受託番号: NP_001077368
染色体: 19
OMIM番号: 605546
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 56):

タンパク質配列 (配列番号 181):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 319):
GGAACCTCTGTGACCCCCAGCCGGTTACCAACAGAACCACCTTCCCCGGTAGCAGAATTCTCAGAAGCCACCGCTGAACTGACCGTCTCATTCACAAACG
R
AGTCTTCACAACTGAGACTTCTAGGAGTATCACCGCCAGTCCAAAGGAGTCAGACTCTCCAGCTGGTGAGTCCTGCCCGCCAGTACTACACCAAGGGCAA
Celera SNP ID: hCV1376342
公開SNP ID: rs1654416
SNP染色体部位: 60221847
転写物配列中のSNP 配列番号 56
SNP部位転写物: 738
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,0|A,16) アフリカ系アメリカ人 (G,8|A,22) 全体 (G,8|A,38)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 181, 位置237,(E,GAA) (K,AAA)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,22|A,98)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 181, 位置237,(E,GAA) (K,AAA)

コンテクスト (配列番号 320):
AGGGACCCATACCTGTGGTCAGCCCCCAGCGACCCCCTGGAGCTTGTGGTCACAGGAACCTCTGTGACCCCCAGCCGGTTACCAACAGAACCACCTTCCC
Y
GGTAGCAGAATTCTCAGAAGCCACCGCTGAACTGACCGTCTCATTCACAAACGAAGTCTTCACAACTGAGACTTCTAGGAGTATCACCGCCAGTCCAAAG
Celera SNP ID: hCV8717873
公開SNP ID: rs1613662
SNP染色体部位: 60228407
転写物配列中のSNP 配列番号 56
SNP部位転写物: 684
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,19|T,101)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 181, 位置219,(P,CCG) (S,TCG)

遺伝子番号: 32
遺伝子記号 GP6 - 51206
遺伝子名: 糖蛋白 VI (血小板)
公開転写物受託番号: NM_016363
公開タンパク質受託番号: NP_057447
染色体: 19
OMIM番号: 605546
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 57):

タンパク質配列 (配列番号 182):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 321):
GGAACCTCTGTGACCCCCAGCCGGTTACCAACAGAACCACCTTCCCCGGTAGCAGAATTCTCAGAAGCCACCGCTGAACTGACCGTCTCATTCACAAACG
R
AGTCTTCACAACTGAGACTTCTAGGAGTATCACCGCCAGTCCAAAGGAGTCAGACTCTCCAGCTGGTCCTGCCCGCCAGTACTACACCAAGGGCAACCTG
Celera SNP ID: hCV1376342
公開SNP ID: rs1654416
SNP染色体部位: 60221847
転写物配列中のSNP 配列番号 57
SNP部位転写物: 738
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,0|A,16) アフリカ系アメリカ人 (G,8|A,22) 全体 (G,8|A,38)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 182, 位置237,(E,GAA) (K,AAA)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,22|A,98)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 182, 位置237,(E,GAA) (K,AAA)

コンテクスト (配列番号 322):
AGGGACCCATACCTGTGGTCAGCCCCCAGCGACCCCCTGGAGCTTGTGGTCACAGGAACCTCTGTGACCCCCAGCCGGTTACCAACAGAACCACCTTCCC
Y
GGTAGCAGAATTCTCAGAAGCCACCGCTGAACTGACCGTCTCATTCACAAACGAAGTCTTCACAACTGAGACTTCTAGGAGTATCACCGCCAGTCCAAAG
Celera SNP ID: hCV8717873
公開SNP ID: rs1613662
SNP染色体部位: 60228407
転写物配列中のSNP 配列番号 57
SNP部位転写物: 684
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,19|T,101)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 182, 位置219,(P,CCG) (S,TCG)

遺伝子番号: 33
遺伝子記号 GPATCH4 - 54865
遺伝子名: G パッチドメイン含有4
公開転写物受託番号: NM_015590
公開タンパク質受託番号: NP_056405
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 58):

タンパク質配列 (配列番号 183):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 323):
GAGCAGAGCATGCAGTGATGGAAGAAGCAGGAAAAGCAAGAAGAAAAGACAGCAGCATCAAGAGGAGGAGGACATCTTGGATGTAAGGGATGAGAAGGAT
R
GCGGGGCTAGGGAAGCAGAGAGCAGAGCACACACTGGCTCAAGCAGCAGAGGTAAGAGGAAGAGGCAGCAGCATCCCAAGAAGGAAAGAGCTGGAGTCAG
Celera SNP ID: hCV9102827
公開SNP ID: rs3795733
SNP染色体部位: 154831546
転写物配列中のSNP 配列番号 58
SNP部位転写物: 1250
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,10|A,30) アフリカ系アメリカ人 (G,26|A,10) 全体 (G,36|A,40)
SNP型: UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,34|A,78)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 33
遺伝子記号 GPATCH4 - 54865
遺伝子名: G パッチドメイン含有4
公開転写物受託番号: NM_182679
公開タンパク質受託番号: NP_872620
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 59):

タンパク質配列 (配列番号 184):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 324):
GAGCAGAGCATGCAGTGATGGAAGAAGCAGGAAAAGCAAGAAGAAAAGACAGCAGCATCAAGAGGAGGAGGACATCTTGGATGTAAGGGATGAGAAGGAT
R
GCGGGGCTAGGGAAGCAGAGAGCAGAGCACACACTGGCTCAAGCAGCAGAGGTAAGAGGAAGAGGCAGCAGCATCCCAAGAAGGAAAGAGCTGGAGTCAG
Celera SNP ID: hCV9102827
公開SNP ID: rs3795733
SNP染色体部位: 154831546
転写物配列中のSNP 配列番号 59
SNP部位転写物: 1324
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,10|A,30) アフリカ系アメリカ人 (G,26|A,10) 全体 (G,36|A,40)
SNP型: UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,34|A,78)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 34
遺伝子記号 HEPHL1 - 341208
遺伝子名: hephaestin様1
公開転写物受託番号: NM_001098672
公開タンパク質受託番号: NP_001092142
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 60):

タンパク質配列 (配列番号 185):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 325):
TAATCCTCAGGTATAAAACACAGAAAAAGGAGAATGGGCATGGCTGAGAATGTCAACTCTTAGTCTATTCTTTGGTTGGATTCACTGAATAGGAGACACT
S
TGAAAGATATCTTTATATTCCATCTTTTATAATTCTTGAACAGTGCTTTCTTAGCTAACCACCAAAGTTTCTAGGTGAACAGCTTCTAGAAAAAGTTAGA
Celera SNP ID: hCV29137668
公開SNP ID: rs7108501
SNP染色体部位: 93485000
転写物配列中のSNP 配列番号 60
SNP部位転写物: 3929
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,41|G,77)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 35
遺伝子記号 KIAA1546 - 54790
遺伝子名: KIAA1546
公開転写物受託番号: NM_017628
公開タンパク質受託番号: NP_060098
染色体: 4
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 61):

タンパク質配列 (配列番号 186):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 326):
CAGGAGGGGAAAAGTGCTAATTACCATGACAAGAACATTGTATTACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTTCCG
R
GGAACACACACATGGTGAACTCCTGGAAAAAACACTGTCTCAATATTATCCAGATTGTGTTTCCATTGCGGTGCAGAAAACCACATCTCACATAAATGCC
Celera SNP ID: hCV25767872
公開SNP ID: rs6843141
SNP染色体部位: 106375200
転写物配列中のSNP 配列番号 61
SNP部位転写物: 1039
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,10|G,24) 全体 (A,11|G,61)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 186, 位置218,(V,GTG) (M,ATG)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,116|A,4)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 186, 位置218,(V,GTG) (M,ATG)

遺伝子番号: 36
遺伝子記号 KLKB1 - 3818
遺伝子名: カリクレインB, 血漿(フレッチャー因子)1
公開転写物受託番号: NM_000892
公開タンパク質受託番号: NP_000883
染色体: 4
OMIM番号: 229000
OMIM情報: フレッチャー因子欠損 (1); プレカリクレイン欠損 (3)

転写物配列 (配列番号 62):

タンパク質配列 (配列番号 187):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 327):
CTTGCCATCGAGACATTTATAAAGGAGTTGATATGAGAGGAGTCAATTTTAATGTGTCTAAGGTTAGCAGTGTTGAAGAATGCCAAAAAAGGTGCACCAG
R
AACATTCGCTGCCAGTTTTTTTCATATGCCACGCAAACATTTCACAAGGCAGAGTACCGGAACAATTGCCTATTAAAGTACAGTCCCGGAGGAACACCTA
Celera SNP ID: hCV22272267
公開SNP ID: rs3733402
SNP染色体部位: 187395028
転写物配列中のSNP 配列番号 62
SNP部位転写物: 500
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,11|G,17) アフリカ系アメリカ人 (A,19|G,3) 全体 (A,30|G,20)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 187, 位置143,(S,AGT) (N,AAT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,14|G,18) アフリカ系アメリカ人 (A,21|G,7) 全体 (A,35|G,25)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 187, 位置143,(S,AGT) (N,AAT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,15|G,21) アフリカ系アメリカ人 (A,27|G,7) 全体 (A,42|G,28)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 187, 位置143,(S,AGT) (N,AAT)
SNP供給源: dbSNP; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,56|A,58)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 187, 位置143,(S,AGT) (N,AAT)

コンテクスト (配列番号 328):
AGAAAGGTGAAATCCAAAATATTCTACAAAAGGTAAATATTCCTTTGGTAACAAATGAAGAATGCCAGAAAAGATATCAAGATTATAAAATAACCCAACG
R
ATGGTCTGTGCTGGCTATAAAGAAGGGGGAAAAGATGCTTGTAAGGGAGATTCAGGTGGTCCCTTAGTTTGCAAACACAATGGAATGTGGCGTTTGGTGG
Celera SNP ID: hCV3230016
公開SNP ID: rs4253325
SNP染色体部位: 187415467
転写物配列中のSNP 配列番号 62
SNP部位転写物: 1751
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,2|G,38) アフリカ系アメリカ人 (A,3|G,31) 全体 (A,5|G,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 187, 位置560,(R,CGG) (Q,CAG)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,107|A,13)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 187, 位置560,(R,CGG) (Q,CAG)

コンテクスト (配列番号 329):
GCAATTTTTACAACCTGAGTTCAAGTCAAATTCTGAGCCTGGGGGGTCCTCATCTGCAAAGCATGGAGAGTGGCATCTTCTTTGCATCCTAAGGACGAAA
R
ACACAGTGCACTCAGAGCTGCTGAGGACAATGTCTGGCTGAAGCCCGCTTTCAGCACGCCGTAACCAGGGGCTGACAATGCGAGGTCGCAACTGAGATCT
Celera SNP ID: hCV15793897
公開SNP ID: rs3087505
SNP染色体部位: 187416480
転写物配列中のSNP 配列番号 62
SNP部位転写物: 2108
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,12|G,108)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 37
遺伝子記号 LOC200420 - 200420
遺伝子名: LOC200420
公開転写物受託番号: hCT1815586
公開タンパク質受託番号: hCP1720929
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 63):

タンパク質配列 (配列番号 188):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 330):
GTCCACAGAGAGATGAAACAGCTGCAACCGCTTCTCCCTCAAGGTGGGATCATCAACGGGCAGAGCTCCTACTGTGCCCACCACCTTCTCTTCAGATTCA
S
CCACCCAGA
Celera SNP ID: hCV11541681
公開SNP ID: rs2001490
SNP染色体部位: 73781606
転写物配列中のSNP 配列番号 63
SNP部位転写物: 1660
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|G,10) アフリカ系アメリカ人 (C,18|G,14) 全体 (C,28|G,24)
SNP型: UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,40|G,80)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 38
遺伝子記号 LOC387646 - 387646
遺伝子名: leucine rich repeat containing 37, メンバーAファミリー 偽遺伝子
公開転写物受託番号: hCT1648346
公開タンパク質受託番号: hCP1617957
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 64):

タンパク質配列 (配列番号 189):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 331):
CTTCCCAAGCCCAGCAGGAGGCTCCAGTTCAGTTTCCAGAGGAGGTGGAACCTTCTGCAACCCAACAGTAGGCCCCAACCGAGCCTCCATGTCATCCTAC
R
GAGCGTGAACTTTCCATTAGTGAGCAGGAGCAGCCAGCTCAGCCTTCTGAGTCTTCTGGGGAGGTTGAATCTTCTCAGACTCGGCAGGAGACCCCAGCTC
Celera SNP ID: hCV2706410
公開SNP ID: rs7896532
SNP染色体部位: 27579513
転写物配列中のSNP 配列番号 64
SNP部位転写物: 610
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,0|A,6) アフリカ系アメリカ人 (G,3|A,1) 全体 (G,3|A,7)
SNP型: UTR5
SNP供給源: Celera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|A,-)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 39
遺伝子記号 LOC644269 - 644269
遺伝子名: Ｇタンパク質経路抑制因子1アイソフォーム1に類似
公開転写物受託番号: hCT1831459
公開タンパク質受託番号: hCP1724395
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 65):

タンパク質配列 (配列番号 190):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 332):
GGAGGGGCTGACGCGCCCGCGTGGACTCGCACAGCAAGATCCTGGACGCCCGGGATGTGGATCAGCGCAAGCACCACCTTCGAGAAGTCTCTGCGGATCG
R
CAGGGAGTTTCAGCACCGCGCCAAAGGCCGGATGCTGAGGGTAGCTGTGCTGCGCAACCAGATCCACGTGAAATCCCTTCCAGAGAAGGGAGCCCGGGGA
Celera SNP ID: hCV2956500
公開SNP ID: rs11755610
SNP染色体部位: 90654149
転写物配列中のSNP 配列番号 65
SNP部位転写物: 1270
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,71|A,49)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 190, 位置144,(S,TCG) (S,TCA)

遺伝子番号: 39
遺伝子記号 LOC644269 - 644269
遺伝子名: Ｇタンパク質経路抑制因子1アイソフォーム1に類似
公開転写物受託番号: hCT2333145
公開タンパク質受託番号: hCP1877081
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 66):

タンパク質配列 (配列番号 191):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 333):
ACGCAGCAAGTCCGGGAGGGGCTGACGCGCCCGCCAAGATCCTGGACGCCCGGGATGTGGATCAGCGCAAGCACCACCTTCGAGAAGTCTCTGCGGATCG
R
CAGGGAGTTTCAGCACCGCGCCAAAGGCCGGATGCTGAGGGTAGCTGTGCTGCGCAACCAGATCCACGTGAAATCCCTTCCAGAGAAGGGAGCCCGGGGA
Celera SNP ID: hCV2956500
公開SNP ID: rs11755610
SNP染色体部位: 90654149
転写物配列中のSNP 配列番号 66
SNP部位転写物: 626
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,71|A,49)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 191, 位置209,(G,GGC) (S,AGC)

遺伝子番号: 40
遺伝子記号 LOC646037 - 646037
遺伝子名: CG11835-PAに類似
公開転写物受託番号: hCT1813640
公開タンパク質受託番号: hCP1711919
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 67):

タンパク質配列 (配列番号 192):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 334):
AATCTTCAAGGCAGCAAATGGTCCCAGTTCAGCTTCCAGAGCCACCTAAGGAAGTTGCAGCTCAACCTCCAGCTCATTATGAGGTGACAGTCCCAACACT
Y
GGCCAGGATCCAGCTCAGAATTCAACATTGCCCAGTGTCACTGTTCAACCTTTGGACCTGGGACTTACCATCATTCCAGAATCAACGACAGAGGTTGAAC
Celera SNP ID: hCV1547677
公開SNP ID: rs6505228
SNP染色体部位: 26399303
転写物配列中のSNP 配列番号 67
SNP部位転写物: 2673
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,24|C,0) アフリカ系アメリカ人 (T,11|C,21) 全体 (T,35|C,21)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 192, 位置891,(L,CTA) (P,CCA)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,34|C,0) アフリカ系アメリカ人 (T,10|C,24) 全体 (T,44|C,24)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 192, 位置891,(L,CTA) (P,CCA)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,119|C,1)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 192, 位置891,(L,CTA) (P,CCA)

遺伝子番号: 41
遺伝子記号 LUZP1 - 7798
遺伝子名: ロイシンジッパープロテイン 1
公開転写物受託番号: NM_033631
公開タンパク質受託番号: NP_361013
染色体: 1
OMIM番号: 601422
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 68):

タンパク質配列 (配列番号 193):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 335):
AACAGGAGGGCAGCAAAAGCTTCTCACATGGGGGTGAGTACAGACAGTGGGACTCAGGAGACAAAGAAAACTGAAGACCGGTTTGTACCCAGCTCCTCCA
M
GAGCGAAGGGAAGAAGTCTAGGGAGCAGCCCTCAGTGCTGAGTCGCTACCCCCCGGCTGCTCAGGAGCACAGTAAAGCGTGGAAGGGGACTTCCAAGCCA
Celera SNP ID: hCV2494846
公開SNP ID: rs3765407
SNP染色体部位: 23291961
転写物配列中のSNP 配列番号 68
SNP部位転写物: 1753
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,8|A,30) アフリカ系アメリカ人 (C,15|A,23) 全体 (C,23|A,53)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 193, 位置461,(K,AAG) (Q,CAG)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,12|A,108)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 193, 位置461,(K,AAG) (Q,CAG)

遺伝子番号: 42
遺伝子記号 MCF2 - 4168
遺伝子名: MCF.2 細胞株由来形質転換配列
公開転写物受託番号: hCT1775121
公開タンパク質受託番号: hCP1698937
染色体: X
OMIM番号: 311030
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 69):

タンパク質配列 (配列番号 194):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 336):
GGATTTGGCTAGATTCAAACCAATGCAGCGACACCTTTTCTTGTATGAAAAAGCCATTGTTTTTTGCAAAAGGCGTGTTGAAAGTGGAGAAGGCTCTGAC
Y
GATACCCGTCATACAGTTTTAAACACTGTTGGAAAATGGATGAAGTTGGAATCACTGAATATGTAAAAGGTGATAACCGCAAGTTTGAAATCTGGTATGG
Celera SNP ID: hCV15952952
公開SNP ID: rs2235708
SNP染色体部位: 138506410
転写物配列中のSNP 配列番号 69
SNP部位転写物: 2136
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,88|T,2)
SNP型: ESS
タンパク質コーディング: 配列番号 194, 位置None

遺伝子番号: 42
遺伝子記号 MCF2 - 4168
遺伝子名: MCF.2 細胞株由来形質転換配列
公開転写物受託番号: hCT2250816
公開タンパク質受託番号: hCP1866697
染色体: X
OMIM番号: 311030
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 70):

タンパク質配列 (配列番号 195):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 337):
GGATTTGGCTAGATTCAAACCAATGCAGCGACACCTTTTCTTGTATGAAAAAGCCATTGTTTTTTGCAAAAGGCGTGTTGAAAGTGGAGAAGGCTCTGAC
Y
GATACCCGTCATACAGTTTTAAACACTGTTGGAAAATGGATGAAGTTGGAATCACTGAATATGTAAAAGGTGATAACCGCAAGTTTGAAATCTGGTATGG
Celera SNP ID: hCV15952952
公開SNP ID: rs2235708
SNP染色体部位: 138506410
転写物配列中のSNP 配列番号 70
SNP部位転写物: 2466
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,88|T,2)
SNP型: ESS
タンパク質コーディング: 配列番号 195, 位置None

遺伝子番号: 42
遺伝子記号 MCF2 - 4168
遺伝子名: MCF.2 細胞株由来形質転換配列
公開転写物受託番号: hCT2250817
公開タンパク質受託番号: hCP1866695
染色体: X
OMIM番号: 311030
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 71):

タンパク質配列 (配列番号 196):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 338):
GGATTTGGCTAGATTCAAACCAATGCAGCGACACCTTTTCTTGTATGAAAAAGCCATTGTTTTTTGCAAAAGGCGTGTTGAAAGTGGAGAAGGCTCTGAC
Y
GATACCCGTCATACAGTTTTAAACACTGTTGGAAAATGGATGAAGTTGGAATCACTGAATATGTAAAAGGTGATAACCGCAAGTTTGAAATCTGGTATGG
Celera SNP ID: hCV15952952
公開SNP ID: rs2235708
SNP染色体部位: 138506410
転写物配列中のSNP 配列番号 71
SNP部位転写物: 2452
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,88|T,2)
SNP型: ESS
タンパク質コーディング: 配列番号 196, 位置None

遺伝子番号: 43
遺伝子記号 MDN1 - 23195
遺伝子名: MDN1, midasin ホモログ (酵母)
公開転写物受託番号: NM_014611
公開タンパク質受託番号: NP_055426
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 72):

タンパク質配列 (配列番号 197):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 339):
ACCCTTGGGCTTTGATGAGATGGAAGTGGAGATCCAAACTGTTAAAACAGAGGAAGACCAAGACCCCAGAACAGACAAAGCCCATAAGGAGACAGAAAAT
K
AGAAACCAGAAAGAAGCCGAGAGTCTACCATTCATACAGCTCATCAATTCCTCATGGACACGATCTTCCAGCCCTTTTTAAAAGATGTCAATGAGCTAAG
Celera SNP ID: hCV25752810
公開SNP ID: rs4707557
SNP染色体部位: 90419504
転写物配列中のSNP 配列番号 72
SNP部位転写物: 15870
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,38|G,2) アフリカ系アメリカ人 (T,22|G,4) 全体 (T,60|G,6)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 197, 位置5251,(N,AAT) (K,AAG)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,117|G,3)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 197, 位置5251,(N,AAT) (K,AAG)

遺伝子番号: 44
遺伝子記号 MMEL1 - 79258
遺伝子名: メンブレンメタロエンドペプチダーゼ様1
公開転写物受託番号: NM_033467
公開タンパク質受託番号: NP_258428
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 73):

タンパク質配列 (配列番号 198):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 340):
AGCTGGGCTGGATGGACGAGGAGTCCAAGAAGAAGGCGCAGGAGAAGGCCATGAGCATCCGGGAGCAGATCGGGCACCCTGACTACATCCTGGAGGAGAT
Y
AACAGGCGCCTGGACGAGGAGTACTCCAATCTGAACTTCTCAGAGGACCTGTACTTTGAGAACAGTCTGCAGAACCTCAAGGTGGGCGCCCAGCGGAGCC
Celera SNP ID: hCV1974927
公開SNP ID: rs3748816
SNP染色体部位: 2516606
転写物配列中のSNP 配列番号 73
SNP部位転写物: 1716
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|T,2) アフリカ系アメリカ人 (C,20|T,6) 全体 (C,20|T,8)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 198, 位置509,(M,ATG) (T,ACG)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,81|C,39)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 198, 位置509,(M,ATG) (T,ACG)

コンテクスト (配列番号 341):
ACAGGAGGAGAGGACCTTTGTAAAACGAAAACCCCGAGGGATCCCAGAGGCCCAAGAGGTGAGCGAGGTCTGCACCACCCCTGGCTGCGTGATAGCAGCC
Y
CCAGGATCCTCCAGAACATGGACCCGACCACGGAACCGTGTGACGACTTCTACCAGTTTGCATGCGGAGGCTGGCTGCGGCGCCACGTGATCCCTGAGAC
Celera SNP ID: hCV403768
公開SNP ID: rs10797440
SNP染色体部位: 2531129
転写物配列中のSNP 配列番号 73
SNP部位転写物: 457
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|T,6) アフリカ系アメリカ人 (C,20|T,8) 全体 (C,20|T,14)
SNP型: ESE
タンパク質コーディング: 配列番号 198, 位置None
SNP供給源: dbSNP; Celera; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,78|C,38)
SNP型: ESE
タンパク質コーディング: 配列番号 198, 位置None

遺伝子番号: 45
遺伝子記号 MTHFR - 4524
遺伝子名: 5,10-メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ (NADPH)
公開転写物受託番号: NM_005957
公開タンパク質受託番号: NP_005948
染色体: 1
OMIM番号: 607093
OMIM情報: MTHFR 欠損によるホモシスチン尿症, 236250 (3)

転写物配列 (配列番号 74):

タンパク質配列 (配列番号 199):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 342):
ACTTTGACATCTGTGTGGCAGGTTACCCCAAAGGCCACCCCGAAGCAGGGAGCTTTGAGGCTGACCTGAAGCACTTGAAGGAGAAGGTGTCTGCGGGAGC
Y
GATTTCATCATCACGCAGCTTTTCTTTGAGGCTGACACATTCTTCCGCTTTGTGAAGGCATGCACCGACATGGGCATCACTTGCCCCATCGTCCCCGGGA
Celera SNP ID: hCV1202883
公開SNP ID: rs1801133
SNP染色体部位: 11778965
転写物配列中のSNP 配列番号 74
SNP部位転写物: 850
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,14|C,24) アフリカ系アメリカ人 (T,8|C,30) 全体 (T,22|C,54)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 199, 位置222,(A,GCC) (V,GTC)
SNP供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,91|T,29)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 199, 位置222,(A,GCC) (V,GTC)

遺伝子番号: 46
遺伝子記号 NAP5 - 344148
遺伝子名: Nck-関連タンパク質 5
公開転写物受託番号: NM_207363
公開タンパク質受託番号: NP_997246
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 75):

タンパク質配列 (配列番号 200):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 343):
GGCCGCATGGCTCTCAACCTCCAGCTTTCAGACACTGATGACAATGAAACGTTTGATGAGCTGCACATAGAGAGCAGTGATGAGAAAAGTCCTTCAGACG
R
GTCATTGGCTGCCGACACCGATAAGTCCGTGGAGAACCTGGATGTCCTTGTGGGGTTTGGAAAATCTCTATGTGGGTCTCCTGAAGAGGAGGAAAAACAA
Celera SNP ID: hCV25748719
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 133259044
転写物配列中のSNP 配列番号 75
SNP部位転写物: 2185
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,35|A,5) アフリカ系アメリカ人 (G,33|A,5) 全体 (G,68|A,10)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 200, 位置604,(V,GTG) (M,ATG)

遺伝子番号: 47
遺伝子記号 NAT8B - 51471
遺伝子名: N-アセチルトランスフェラーゼ 8B (遺伝子/偽遺伝子)
公開転写物受託番号: NM_016347
公開タンパク質受託番号: NP_057431
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 76):

タンパク質配列 (配列番号 201):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 344):
AAAAACCCTGGACGCGGTATGTAGACATAGCATTGCGCACAGACATGTCTGACATCACCAAATCCTACCTGAGTGAGTGTGGCTCCTGCTTCTGGGTGGG
S
GAATCTGAAGAGAAGGTGGTGGGCACAGTAGGAGCTCTGCCCGTTGATGATCCCACCTTGAGGGAGAAGCGGTTGCAGCTGTTTCATCTCTCTGTGGACA
Celera SNP ID: hCV11541681
公開SNP ID: rs2001490
SNP染色体部位: 73781606
転写物配列中のSNP 配列番号 76
SNP部位転写物: 371
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,10|C,10) アフリカ系アメリカ人 (G,18|C,14) 全体 (G,28|C,24)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 201, 位置112,(G,GGT) (A,GCT)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,40|C,80)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 201, 位置112,(G,GGT) (A,GCT)

遺伝子番号: 48
遺伝子記号 NLRP2 - 55655
遺伝子名: NLRファミリー, ピリンドメイン含有2
公開転写物受託番号: NM_017852
公開タンパク質受託番号: NP_060322
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 77):

タンパク質配列 (配列番号 202):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 345):
GGCCACACCTGGGACATTGGGGACGTACAGAAGCTGCTTTCCGGAGTAGAAAGACTCAGGAACCCCGACCTGATCCAAGCAGGCTACTACTCCTTTGGCC
Y
CGCTAACGAGAAGAGAGCCAAGGAGTTGGAGGCCACTTTTGGCTGCCGGATGTCACCGGACATCAAACAGGAATTGCTGCGATGCGACATAAGTTGTAAG
Celera SNP ID: hCV1376206
公開SNP ID: rs10412915
SNP染色体部位: 60186552
転写物配列中のSNP 配列番号 77
SNP部位転写物: 1765
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|T,26) アフリカ系アメリカ人 (C,11|T,21) 全体 (C,21|T,47)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置558,(L,CTC) (L,CTT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,2) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,20) 全体 (C,10|T,22)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置558,(L,CTC) (L,CTT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,9|T,21) アフリカ系アメリカ人 (C,10|T,18) 全体 (C,19|T,39)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置558,(L,CTC) (L,CTT)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,82|C,38)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置558,(L,CTC) (L,CTT)

コンテクスト (配列番号 346):
CTGGGTCAGAATCCCTTGGGGTCTAGTGGAGTGAAGATGCTGTTTGAAACCTTGACATGTTCCAGTGGCACCCTCCGGACACTCAGGTTGAAAATAGATG
M
CTTTAATGATGAACTCAATAAGCTGCTGGAAGAAATAGAAGAAAAAAACCCACAACTGATTATTGATACTGAGAAACATCATCCCTGGGCAGAAAGGCCT
Celera SNP ID: hCV1376246
公開SNP ID: rs12768
SNP染色体部位: 60203949
転写物配列中のSNP 配列番号 77
SNP部位転写物: 3151
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,24|C,12) アフリカ系アメリカ人 (A,16|C,14) 全体 (A,40|C,26)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置1020,(E,GAA) (D,GAC)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|C,6) アフリカ系アメリカ人 (A,25|C,3) 全体 (A,33|C,9)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置1020,(E,GAA) (D,GAC)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,62|A,58)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置1020,(E,GAA) (D,GAC)

コンテクスト (配列番号 347):
GGCTGCCGGATGTCACCGGACATCAAACAGGAATTGCTGCGATGCGACATAAGTTGTAAGGGTGGACATTCAACGGTGACAGACCTGCAGGAGCTCCTCG
S
CTGTCTGTACGAGTCTCAGGAGGAGGAGCTGGTGAAGGAGGTGATGGCTCAGTTCAAAGAAATATCCCTGCACTTAAATGCAGTAGACGTTGTGCCATCT
Celera SNP ID: hCV1376207
公開SNP ID: rs11672113
SNP染色体部位: 60186693
転写物配列中のSNP 配列番号 77
SNP部位転写物: 1906
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|G,2) アフリカ系アメリカ人 (C,17|G,5) 全体 (C,17|G,7)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置605,(L,CTC) (L,CTG)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,23|G,15) アフリカ系アメリカ人 (C,29|G,7) 全体 (C,52|G,22)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置605,(L,CTC) (L,CTG)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,67|G,53)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 202, 位置605,(L,CTC) (L,CTG)

遺伝子番号: 49
遺伝子記号 NR1I2 - 8856
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー1, グループI, メンバー2
公開転写物受託番号: NM_003889
公開タンパク質受託番号: NP_003880
染色体: 3
OMIM番号: 603065
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 78):

タンパク質配列 (配列番号 203):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 348):
AAGCACTGCCTTTACTTCAGTGGGAATCTCGGCCTCAGCCTGCAAGCCAAGTGTTCACAGTGAGAAAAGCAAGAGAATAAGCTAATACTCCTGTCCTGAA
M
AAGGCAGCGGCTCCTTGGTAAAGCTACTCCTTGATCGATCCTTTGCACCGGATTGTTCAAAGTGGACCCCAGGGGAGAAGTCGGAGCAAAGAACTTACCA
Celera SNP ID: hCV263841
公開SNP ID: rs1523127
SNP染色体部位: 120983729
転写物配列中のSNP 配列番号 78
SNP部位転写物: 1709
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,49|A,71)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 349):
GCAGGCCCCAGATATAGCCCCATGCTGTCCTCCTACCCCAGAGCACACTGTTCAGGCTACTTCCACTGGTACTGAAATCCAGTATTTCACTTACTCTTTT
Y
CTTTCCAATATCCTCATGACATTCAATATTTCACTTACTCTAGGTCCTCCCTGCCTAAGGCCCAAGTCAACTTTCTGTCCAGTGGGATTTGTAATCCAAT
Celera SNP ID: hCV9152783
公開SNP ID: rs1523130
SNP染色体部位: 120982197
転写物配列中のSNP 配列番号 78
SNP部位転写物: 177
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,49|C,71)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 350):
GTACTTCAAAATAATAACAACTTAAGTCAATAAATAAATGTAAGGAAGTCCAAATGTTCACCTGAAGACAACTGTGGTCATTTTTTGGCAATCCCAGGTT
Y
TCTTTTCTACCTGTTTGCTCAATCGTGGTCTCCCTCTCCCTCTCTTGTTGGGGCCCATGCCCCTGCTTTACTGTTGCCAGAGGCTTGTACTTGTTTGCCT
Celera SNP ID: hCV27504984
公開SNP ID: rs3814055
SNP染色体部位: 120982725
転写物配列中のSNP 配列番号 78
SNP部位転写物: 705
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,72|T,48)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 49
遺伝子記号 NR1I2 - 8856
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー1, グループI, メンバー2
公開転写物受託番号: NM_033013
公開タンパク質受託番号: NP_148934
染色体: 3
OMIM番号: 603065
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 79):

タンパク質配列 (配列番号 204):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 351):
AAGCACTGCCTTTACTTCAGTGGGAATCTCGGCCTCAGCCTGCAAGCCAAGTGTTCACAGTGAGAAAAGCAAGAGAATAAGCTAATACTCCTGTCCTGAA
M
AAGGCAGCGGCTCCTTGGTAAAGCTACTCCTTGATCGATCCTTTGCACCGGATTGTTCAAAGTGGACCCCAGGGGAGAAGTCGGAGCAAAGAACTTACCA
Celera SNP ID: hCV263841
公開SNP ID: rs1523127
SNP染色体部位: 120983729
転写物配列中のSNP 配列番号 79
SNP部位転写物: 1709
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,49|A,71)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 352):
GCAGGCCCCAGATATAGCCCCATGCTGTCCTCCTACCCCAGAGCACACTGTTCAGGCTACTTCCACTGGTACTGAAATCCAGTATTTCACTTACTCTTTT
Y
CTTTCCAATATCCTCATGACATTCAATATTTCACTTACTCTAGGTCCTCCCTGCCTAAGGCCCAAGTCAACTTTCTGTCCAGTGGGATTTGTAATCCAAT
Celera SNP ID: hCV9152783
公開SNP ID: rs1523130
SNP染色体部位: 120982197
転写物配列中のSNP 配列番号 79
SNP部位転写物: 177
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,49|C,71)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 353):
GTACTTCAAAATAATAACAACTTAAGTCAATAAATAAATGTAAGGAAGTCCAAATGTTCACCTGAAGACAACTGTGGTCATTTTTTGGCAATCCCAGGTT
Y
TCTTTTCTACCTGTTTGCTCAATCGTGGTCTCCCTCTCCCTCTCTTGTTGGGGCCCATGCCCCTGCTTTACTGTTGCCAGAGGCTTGTACTTGTTTGCCT
Celera SNP ID: hCV27504984
公開SNP ID: rs3814055
SNP染色体部位: 120982725
転写物配列中のSNP 配列番号 79
SNP部位転写物: 705
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,72|T,48)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 50
遺伝子記号 NR3C1 - 2908
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー3, グループC, メンバー1 (グルココルチコイドレセプター)
公開転写物受託番号: NM_000176
公開タンパク質受託番号: NP_000167
染色体: 5
OMIM番号: 138040
OMIM情報: コルチゾール耐性 (3)

転写物配列 (配列番号 80):

タンパク質配列 (配列番号 205):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 354):
AGCGGCTCCTCTGCCAGAGTTGATATTCACTGATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAG
R
GGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCA
Celera SNP ID: hCV4041
公開SNP ID: rs6190
SNP染色体部位: 142760530
転写物配列中のSNP 配列番号 80
SNP部位転写物: 561
SNP供給源: HGBASE;HGMD;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|A,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 205, 位置23,(R,AGG) (K,AAG)

遺伝子番号: 50
遺伝子記号 NR3C1 - 2908
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー3, グループC, メンバー1 (グルココルチコイドレセプター)
公開転写物受託番号: NM_001018074
公開タンパク質受託番号: NP_001018084
染色体: 5
OMIM番号: 138040
OMIM情報: コルチゾール耐性 (3)

転写物配列 (配列番号 81):

タンパク質配列 (配列番号 206):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 355):
GAATAGAAACAGAAAGAGGTTGATATTCACTGATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAG
R
GGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCA
Celera SNP ID: hCV4041
公開SNP ID: rs6190
SNP染色体部位: 142760530
転写物配列中のSNP 配列番号 81
SNP部位転写物: 391
SNP供給源: HGBASE;HGMD;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|A,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 206, 位置23,(R,AGG) (K,AAG)

遺伝子番号: 50
遺伝子記号 NR3C1 - 2908
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー3, グループC, メンバー1 (グルココルチコイドレセプター)
公開転写物受託番号: NM_001018075
公開タンパク質受託番号: NP_001018085
染色体: 5
OMIM番号: 138040
OMIM情報: コルチゾール耐性 (3)

転写物配列 (配列番号 82):

タンパク質配列 (配列番号 207):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 356):
AATCACTGGACCTTAGAAGTTGATATTCACTGATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAG
R
GGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCA
Celera SNP ID: hCV4041
公開SNP ID: rs6190
SNP染色体部位: 142760530
転写物配列中のSNP 配列番号 82
SNP部位転写物: 294
SNP供給源: HGBASE;HGMD;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|A,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 207, 位置23,(R,AGG) (K,AAG)

遺伝子番号: 50
遺伝子記号 NR3C1 - 2908
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー3, グループC, メンバー1 (グルココルチコイドレセプター)
公開転写物受託番号: NM_001018076
公開タンパク質受託番号: NP_001018086
染色体: 5
OMIM番号: 138040
OMIM情報: コルチゾール耐性 (3)

転写物配列 (配列番号 83):

タンパク質配列 (配列番号 208):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 357):
GACTCCCCCCGGGCCCAAATTGATATTCACTGATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAG
R
GGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCA
Celera SNP ID: hCV4041
公開SNP ID: rs6190
SNP染色体部位: 142760530
転写物配列中のSNP 配列番号 83
SNP部位転写物: 187
SNP供給源: HGBASE;HGMD;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|A,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 208, 位置23,(R,AGG) (K,AAG)

遺伝子番号: 50
遺伝子記号 NR3C1 - 2908
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー3, グループC, メンバー1 (グルココルチコイドレセプター)
公開転写物受託番号: NM_001018077
公開タンパク質受託番号: NP_001018087
染色体: 5
OMIM番号: 138040
OMIM情報: コルチゾール耐性 (3)

転写物配列 (配列番号 84):

タンパク質配列 (配列番号 209):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 358):
AAAGTGTCTGAGAAGGAAGTTGATATTCACTGATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAG
R
GGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCA
Celera SNP ID: hCV4041
公開SNP ID: rs6190
SNP染色体部位: 142760530
転写物配列中のSNP 配列番号 84
SNP部位転写物: 1063
SNP供給源: HGBASE;HGMD;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|A,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 209, 位置23,(R,AGG) (K,AAG)

遺伝子番号: 50
遺伝子記号 NR3C1 - 2908
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー3, グループC, メンバー1 (グルココルチコイドレセプター)
公開転写物受託番号: NM_001020825
公開タンパク質受託番号: NP_001018661
染色体: 5
OMIM番号: 138040
OMIM情報: コルチゾール耐性 (3)

転写物配列 (配列番号 85):

タンパク質配列 (配列番号 210):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 359):
AGCGGCTCCTCTGCCAGAGTTGATATTCACTGATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAG
R
GGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCA
Celera SNP ID: hCV4041
公開SNP ID: rs6190
SNP染色体部位: 142760530
転写物配列中のSNP 配列番号 85
SNP部位転写物: 561
SNP供給源: HGBASE;HGMD;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|A,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 210, 位置23,(R,AGG) (K,AAG)

遺伝子番号: 50
遺伝子記号 NR3C1 - 2908
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー3, グループC, メンバー1 (グルココルチコイドレセプター)
公開転写物受託番号: NM_001024094
公開タンパク質受託番号: NP_001019265
染色体: 5
OMIM番号: 138040
OMIM情報: コルチゾール耐性 (3)

転写物配列 (配列番号 86):

タンパク質配列 (配列番号 211):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 360):
AGCGGCTCCTCTGCCAGAGTTGATATTCACTGATGGACTCCAAAGAATCATTAACTCCTGGTAGAGAAGAAAACCCCAGCAGTGTGCTTGCTCAGGAGAG
R
GGAGATGTGATGGACTTCTATAAAACCCTAAGAGGAGGAGCTACTGTGAAGGTTTCTGCGTCTTCACCCTCACTGGCTGTCGCTTCTCAATCAGACTCCA
Celera SNP ID: hCV4041
公開SNP ID: rs6190
SNP染色体部位: 142760530
転写物配列中のSNP 配列番号 86
SNP部位転写物: 561
SNP供給源: HGBASE;HGMD;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|A,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 211, 位置23,(R,AGG) (K,AAG)

遺伝子番号: 51
遺伝子記号 OR1B1 - 347169
遺伝子名: 嗅覚レセプター,ファミリー 1, サブファミリーB, メンバー1
公開転写物受託番号: NM_001004450
公開タンパク質受託番号: NP_001004450
染色体: 9
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 87):

タンパク質配列 (配列番号 212):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 361):
TCATTGCTGTCATGGCTCTGGATCGCTATGTGGCCATCTGTGACCCCCTGCACTATGCTTTGGTAATGAATCACCAACGGTGTGCCTGCTTACTAGCCTT
Y
AGCTGGGTGGTGTCCATACTGCACACCATGTTGCGTGTGGGACTCGTCCTGCCTCTTTGCTGGACTGGGGATGCTGGGGGCAACGTTAACCTTCCTCACT
Celera SNP ID: hCV7584272
公開SNP ID: rs1536929
SNP染色体部位: 124431190
転写物配列中のSNP 配列番号 87
SNP部位転写物: 447
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,25|C,95)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 212, 位置149,(L,TTG) (S,TCG)

遺伝子番号: 52
遺伝子記号 OR4C11 - 219429
遺伝子名: 嗅覚レセプター,ファミリー 4, サブファミリーC, メンバー11
公開転写物受託番号: NM_001004700
公開タンパク質受託番号: NP_001004700
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 88):

タンパク質配列 (配列番号 213):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 362):
ATGCAGCAAAATAACAGTGTGA
M
TGAATTCATACTGTTAGGATTAACACAGGATCCCTTGAGGCAGAAAATAGTGTTTGTAATCTTCTTAATTTTCTATATGGGAACTGTGGTGGGGAATATG
Celera SNP ID: hCV813581
公開SNP ID: rs491160
SNP染色体部位: 55128404
転写物配列中のSNP 配列番号 88
SNP部位転写物: 23
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,29|A,3) アフリカ系アメリカ人 (C,30|A,4) 全体 (C,59|A,7)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 213, 位置8,(T,ACT) (P,CCT)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,31|A,3) アフリカ系アメリカ人 (C,30|A,2) 全体 (C,61|A,5)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 213, 位置8,(T,ACT) (P,CCT)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,96|A,14)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 213, 位置8,(T,ACT) (P,CCT)

遺伝子番号: 53
遺伝子記号 OR7G1 - 125962
遺伝子名: 嗅覚レセプター,ファミリー 7, サブファミリーG, メンバー1
公開転写物受託番号: NM_001005192
公開タンパク質受託番号: NP_001005192
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 89):

タンパク質配列 (配列番号 214):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 363):
TGGCTTGGAAAGTTGCTTTCTTGCAGTCATGGCCTACGACCGCTATGTGGCCATTTGCCACCCACTGAGGTACACAGTCCTCATGAATGTCCATTTCTGG
S
GCTTGCTGATTCTTCTCTCCATGTTCATGAGCACTATGGATGCCCTGGTTCAGAGTCTGATGGTATTGCAGCTGTCCTTCTGCAAAAACGTTGAAATCCC
Celera SNP ID: hCV9327878
公開SNP ID: rs2217657
SNP染色体部位: 9087017
転写物配列中のSNP 配列番号 89
SNP部位転写物: 424
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,23|C,7) アフリカ系アメリカ人 (G,5|C,15) 全体 (G,28|C,22)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 214, 位置141,(W,TGG) (C,TGC)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,27|C,13) アフリカ系アメリカ人 (G,6|C,32) 全体 (G,33|C,45)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 214, 位置141,(W,TGG) (C,TGC)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,81|G,39)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 214, 位置141,(W,TGG) (C,TGC)

遺伝子番号: 54
遺伝子記号 OTOG - 340990
遺伝子名: otogelin
公開転写物受託番号: hCT1951300
公開タンパク質受託番号: hCP1767857
染色体: 11
OMIM番号: 604487
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 90):

タンパク質配列 (配列番号 215):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 364):
GCAGGCCAGGTCTTCGTGAACTGCAGCGACCTGCACACGGACCTGGAGCTGAGCAGGGAGAGGACGTGTGAGCAGCAACTGCTGAACCTGAGCGTGTCAG
R
CCGTGGCCCCTGCCTCTCGGGCTGCGCCTGTCCCCAGGGTCTGCTCAGACACGGGGATGCATGTTTCCTGCCAGAGGAGTGCCCCTGCACTTGGAAGGGG
Celera SNP ID: hCV15990789
公開SNP ID: rs2355466
SNP染色体部位: 17556609
転写物配列中のSNP 配列番号 90
SNP部位転写物: 2603
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,10|G,26) アフリカ系アメリカ人 (A,7|G,23) 全体 (A,17|G,49)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 215, 位置846,(A,GCC) (T,ACC)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,77|A,41)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 215, 位置846,(A,GCC) (T,ACC)

遺伝子番号: 55
遺伝子記号 PANK4 - 55229
遺伝子名: パントテン酸キナーゼ 4
公開転写物受託番号: NM_018216
公開タンパク質受託番号: NP_060686
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 91):

タンパク質配列 (配列番号 216):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 365):
TGAACGAGTTCAACTTCCCGGATCCCTACTCCAAAGTGAAGCAGCGGGAGAATGGCGTGGCGCTGAGGTGCTTCCCCGGGGTCGTGCGCTCCCTGGACGC
Y
CTGGGCTGGGAGGAACGGCAGCTGGCGCTGGTGAAAGGCCTCCTGGCGGGGAATGTCTTCGACTGGGGGGCCAAAGCCGTGTCTGCTGTCCTTGAATCCG
Celera SNP ID: hCV25981574
公開SNP ID: rs7535528
SNP染色体部位: 2434274
転写物配列中のSNP 配列番号 91
SNP部位転写物: 1650
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,21|T,7) アフリカ系アメリカ人 (C,16|T,0) 全体 (C,37|T,7)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 216, 位置547,(A,GCG) (V,GTG)
SNP供給源: dbSNP; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,70|T,50)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 216, 位置547,(A,GCG) (V,GTG)

遺伝子番号: 56
遺伝子記号 PANX1 - 24145
遺伝子名: パネキシン(pannexin) 1
公開転写物受託番号: NM_015368
公開タンパク質受託番号: NP_056183
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 92):

タンパク質配列 (配列番号 217):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 366):
GCCGGTGACTGGGTGAAGGCGCCGCGCAGCTTTCCCGACGCCGGCTGTACCCGGACCTCCTGGTCGAGCCTGGCGCGCCGCAGCCATGGCCATCGCTCAA
M
TGGCCACGGAGTACGTGTTCTCGGATTTCTTGCTGAAGGAGCCCACGGAGCCCAAGTTCAAGGGGCTGCGACTGGAGCTGGCTGTGGACAAGATGGTCAC
Celera SNP ID: hCV8361354
公開SNP ID: rs1138800
SNP染色体部位: 93502141
転写物配列中のSNP 配列番号 92
SNP部位転写物: 401
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,48|C,72)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 217, 位置5,(Q,CAA) (H,CAC)

遺伝子番号: 57
遺伝子記号 PIK3R1 - 5295
遺伝子名: ホスホイノシチド-3-キナーゼ, 制御サブユニット 1 (p85 α)
公開転写物受託番号: NM_181504
公開タンパク質受託番号: NP_852556
染色体: 5
OMIM番号: 171833
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 93):

タンパク質配列 (配列番号 218):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 367):
GCCTTATTTTTGCATCTCACAAACATAAGTGCAATAGATCTTTTCATTGAACAGCAAAGTAGGATTCATCATTCCATATGACTTGAGTTACACCAGACCT
R
TTCTGCCCAATGCCTTTTTGATTACAGTGTAGCTTGCCCACCGCATTTGTCGTTTTAGATACTTTGCTAGCCGGCCACTTTGGATTTCATCAGACAGTCC
Celera SNP ID: hCV27474984
公開SNP ID: rs3756668
SNP染色体部位: 67631844
転写物配列中のSNP 配列番号 93
SNP部位転写物: 4086
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|A,53)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 57
遺伝子記号 PIK3R1 - 5295
遺伝子名: ホスホイノシチド-3-キナーゼ, 制御サブユニット 1 (p85 α)
公開転写物受託番号: NM_181523
公開タンパク質受託番号: NP_852664
染色体: 5
OMIM番号: 171833
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 94):

タンパク質配列 (配列番号 219):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 368):
GCCTTATTTTTGCATCTCACAAACATAAGTGCAATAGATCTTTTCATTGAACAGCAAAGTAGGATTCATCATTCCATATGACTTGAGTTACACCAGACCT
R
TTCTGCCCAATGCCTTTTTGATTACAGTGTAGCTTGCCCACCGCATTTGTCGTTTTAGATACTTTGCTAGCCGGCCACTTTGGATTTCATCAGACAGTCC
Celera SNP ID: hCV27474984
公開SNP ID: rs3756668
SNP染色体部位: 67631844
転写物配列中のSNP 配列番号 94
SNP部位転写物: 4876
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|A,53)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 57
遺伝子記号 PIK3R1 - 5295
遺伝子名: ホスホイノシチド-3-キナーゼ, 制御サブユニット 1 (p85 α)
公開転写物受託番号: NM_181524
公開タンパク質受託番号: NP_852665
染色体: 5
OMIM番号: 171833
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 95):

タンパク質配列 (配列番号 220):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 369):
GCCTTATTTTTGCATCTCACAAACATAAGTGCAATAGATCTTTTCATTGAACAGCAAAGTAGGATTCATCATTCCATATGACTTGAGTTACACCAGACCT
R
TTCTGCCCAATGCCTTTTTGATTACAGTGTAGCTTGCCCACCGCATTTGTCGTTTTAGATACTTTGCTAGCCGGCCACTTTGGATTTCATCAGACAGTCC
Celera SNP ID: hCV27474984
公開SNP ID: rs3756668
SNP染色体部位: 67631844
転写物配列中のSNP 配列番号 95
SNP部位転写物: 4246
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|A,53)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 58
遺伝子記号 PKNOX1 - 5316
遺伝子名: PBX/knotted 1 ホメオボックス 1
公開転写物受託番号: NM_004571
公開タンパク質受託番号: NP_004562
染色体: 21
OMIM番号: 602100
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 96):

タンパク質配列 (配列番号 221):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 370):
GGACATTTTAAGCTAGTGAAGAGTTTTTTCTGGAATTGATTTTTCCCAAAAGAATATATTAATTGAGGTTAAGAAGTCAGTGGGAAACACACAGAAATTT
R
TTTTAAAATCTTTCAGGAGCTTTACTGAAAGACTTGGTTATCAAGTCTTTTGGGGAGAGAATGACATTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTTGCTCTTGTTGC
Celera SNP ID: hCV1605386
公開SNP ID: rs234736
SNP染色体部位: 43324981
転写物配列中のSNP 配列番号 96
SNP部位転写物: 3200
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,85|A,31)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 59
遺伝子記号 PLEKHG4 - 25894
遺伝子名: プレクストリン相同ドメイン含有,ファミリー G (RhoGefドメインを有する) メンバー4
公開転写物受託番号: NM_015432
公開タンパク質受託番号: NP_056247
染色体: 16
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 97):

タンパク質配列 (配列番号 222):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 371):
TGGAGGCTTGCACCCGGCACCCACCACGAGTGGCCTATGCCTTCCTGCGCCATAGGGTGCAGTTTGGGATGTACGCGCTCTACAGCAAGAATAAGCCTCG
R
TCCGATGCCCTGATGTCAAGCTATGGGCACACCTTCTTCAAGGACAAGCAGCAAGCACTGGGGGACCACCTGGACCTGGCCTCCTACCTGCTAAAGCCCA
Celera SNP ID: hCV7625318
公開SNP ID: rs3868142
SNP染色体部位: 65877724
転写物配列中のSNP 配列番号 97
SNP部位転写物: 5025
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,29) アフリカ系アメリカ人 (A,19|G,13) 全体 (A,20|G,42)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 222, 位置830,(R,CGC) (H,CAC)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,111|A,9)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 222, 位置830,(R,CGC) (H,CAC)

遺伝子番号: 60
遺伝子記号 POLR1A - 25885
遺伝子名: ポリメラーゼ(RNA) I ポリペプチドA, 194kDa
公開転写物受託番号: NM_015425
公開タンパク質受託番号: NP_056240
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 98):

タンパク質配列 (配列番号 223):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 372):
AGAGGACTGTGCCGCCCTGTTCTTGGCCGTCCACGTTTCCTCTCCCTCTAGCACCAGCAATACATTTCCCTGGCATGGACAGAAAAGACAGAGAGGACTT
R
TACAAAGGCTTTGTAAAACCAGAGGCTAGCTTCTATCTTTGTCTACTGTTATTTCAGCTCAGGGCGGGTAATTAACATCATTGGAACTAGCTATTAGGAA
Celera SNP ID: hCV29665700
公開SNP ID: rs10173155
SNP染色体部位: 86107092
転写物配列中のSNP 配列番号 98
SNP部位転写物: 6507
関連した照会SNP: hCV8598986 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|G,78)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 61
遺伝子記号 PPP1R15A - 23645
遺伝子名: プロテインホスファターゼ 1, 制御(阻害)サブユニット 15A
公開転写物受託番号: NM_014330
公開タンパク質受託番号: NP_055145
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 99):

タンパク質配列 (配列番号 224):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 373):
AAAAGGCACACAAAGAAACTGGGAAAGGAGAAGCTGCCCCAGGGCCGCAATCCTCAGCCCCAGCCCAGAGGCCCCAGCTCAAGTCCTGGTGGTGCCAACC
S
AGTGATGAAGAGGAGGGTGAGGTCAAGGCTTTGGGGGCAGCTGAGAAGGATGGAGAAGCTGAGTGTCCTCCCTGCATCCCCCCACCAAGTGCCTTCCTGA
Celera SNP ID: hCV3170967
公開SNP ID: rs556052
SNP染色体部位: 54069248
転写物配列中のSNP 配列番号 99
SNP部位転写物: 1187
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|G,26) アフリカ系アメリカ人 (C,29|G,9) 全体 (C,39|G,35)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 224, 位置316,(P,CCT) (A,GCT)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,81|G,35)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 224, 位置316,(P,CCT) (A,GCT)

遺伝子番号: 62
遺伝子記号 PROCR - 10544
遺伝子名: プロテインC, 内皮(EPCR)
公開転写物受託番号: NM_006404
公開タンパク質受託番号: NP_006395
染色体: 20
OMIM番号: 600646
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 100):

タンパク質配列 (配列番号 225):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 374):
TGTGTGCAGTATGTGCAGAAACATATTTCCGCGGAAAACACGAAAGGGAGCCAAACAAGCCGCTCCTACACTTCGCTGGTCCTGGGCGTCCTGGTGGGCA
R
TTTCATCATTGCTGGTGTGGCTGTAGGCATCTTCCTGTGCACAGGTGGACGGCGATGTTAATTACTCTCCAGCCCCCTCAGAAGGGGCTGGATTGATGGA
Celera SNP ID: hCV25620145
公開SNP ID: rs867186
SNP染色体部位: 33228215
転写物配列中のSNP 配列番号 100
SNP部位転写物: 840
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|G,2) アフリカ系アメリカ人 (A,32|G,6) 全体 (A,70|G,8)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 225, 位置219,(S,AGT) (G,GGT)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,110|G,10)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 225, 位置219,(S,AGT) (G,GGT)

コンテクスト (配列番号 375):
GGTCCTGGGCGTCCTGGTGGGCAGTTTCATCATTGCTGGTGTGGCTGTAGGCATCTTCCTGTGCACAGGTGGACGGCGATGTTAATTACTCTCCAGCCCC
S
TCAGAAGGGGCTGGATTGATGGAGGCTGGCAAGGGAAAGTTTCAGCTCACTGTGAAGCCAGACTCCCCAACTGAAACACCAGAAGGTTTGGAGTGACAGC
Celera SNP ID: hCV1825047
公開SNP ID: rs9574
SNP染色体部位: 33228293
転写物配列中のSNP 配列番号 100
SNP部位転写物: 917
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,53|C,63)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 63
遺伝子記号 PTCRA - 171558
遺伝子名: プレ T-細胞抗原 レセプター α
公開転写物受託番号: NM_138296
公開タンパク質受託番号: NP_612153
染色体: 6
OMIM番号: 606817
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 101):

タンパク質配列 (配列番号 226):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 376):
GCCTTCACCTATGGCCCTTCCCCAGCAACGGATGGCACCTGGACCAACTTGGCCCATCTCTCCCTGCCTTCTGAGGAGCTGGCATCCTGGGAGCCTTTGG
R
CTGCCACACTGGGCCTGGGGCTGAGGGTCACAGCAGGAGTACACAGCCCATGCATCTGTCAGGAGAGGCTTCTACAGCCAGGACCTGCCCCCAGGAGCCT
Celera SNP ID: hCV3180954
公開SNP ID: rs9471966
SNP染色体部位: 42999000
転写物配列中のSNP 配列番号 101
SNP部位転写物: 398
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|G,26) アフリカ系アメリカ人 (A,16|G,22) 全体 (A,24|G,48)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 226, 位置106,(V,GTC) (I,ATC)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,87|A,31)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 226, 位置106,(V,GTC) (I,ATC)

遺伝子番号: 64
遺伝子記号 RAC2 - 5880
遺伝子名: ras-関連 C3 ボツリヌストキシン 基質 2 (rhoファミリー, 小GTP 結合タンパク質 Rac2)
公開転写物受託番号: NM_002872
公開タンパク質受託番号: NP_002863
染色体: 22
OMIM番号: 602049
OMIM情報: 好中球、免疫不全症候群, 608203 (3)

転写物配列 (配列番号 102):

タンパク質配列 (配列番号 227):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 377):
CATAAAACAAATTTAATTTTCTACGCCTCTGGGGATATCTGCTCAGCCAATGGAAAATCTGGGTTCAACCAGCCCCTGCCATTTCTTAAGACTTTCTGCT
S
CACTCACAGGATCCTGAGCTGCACTTACCTGTGAGAGTCTTCAAACTTTTAAACCTTGCCAGTCAGGACTTTTGCTATTGCAAATAGAAAACCCAACTCA
Celera SNP ID: hCV8957432
公開SNP ID: rs6572
SNP染色体部位: 35951391
転写物配列中のSNP 配列番号 102
SNP部位転写物: 1333
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,14|C,12) アフリカ系アメリカ人 (G,27|C,11) 全体 (G,41|C,23)
SNP型: UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,50|G,70)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 65
遺伝子記号 RDH13 - 112724
遺伝子名: レチノールデヒドロゲナーゼ 13 (オール-trans/9-cis)
公開転写物受託番号: hCT1969258
公開タンパク質受託番号: hCP1783091
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 103):

タンパク質配列 (配列番号 228):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 378):
CACATAGACTTTGACGACTTGAACTGGCAGACGAGGAAGTATAACACCAAAGCCGCCTACTGCCAGAGCAAGCTCGCCATCGTCCTCTTCACCAAGGAGC
Y
GAGCCGGCGGCTGCAAGGCTCTGGTGTGACTGTCAACGCCCTGCACCCCGGCGTGGCCAGGACAGAGCTGGGCAGACACACGGGCATCCATGGCTCCACC
Celera SNP ID: hCV15977624
公開SNP ID: rs2305543
SNP染色体部位: 60251527
転写物配列中のSNP 配列番号 103
SNP部位転写物: 907
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,8|C,28) アフリカ系アメリカ人 (T,9|C,27) 全体 (T,17|C,55)
SNP型: ESE
タンパク質コーディング: 配列番号 228, 位置None
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,95|T,25)
SNP型: ESE
タンパク質コーディング: 配列番号 228, 位置None

遺伝子番号: 65
遺伝子記号 RDH13 - 112724
遺伝子名: レチノールデヒドロゲナーゼ 13 (オール-trans/9-cis)
公開転写物受託番号: hCT2297196
公開タンパク質受託番号: hCP1874778
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 104):

タンパク質配列 (配列番号 229):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 379):
CACATAGACTTTGACGACTTGAACTGGCAGACGAGGAAGTATAACACCAAAGCCGCCTACTGCCAGAGCAAGCTCGCCATCGTCCTCTTCACCAAGGAGC
Y
GAGCCGGCGGCTGCAAGGCTCTGGTGTGACTGTCAACGCCCTGCACCCCGGCGTGGCCAGGACAGAGCTGGGCAGACACACGGGCATCCATGGCTCCACC
Celera SNP ID: hCV15977624
公開SNP ID: rs2305543
SNP染色体部位: 60251527
転写物配列中のSNP 配列番号 104
SNP部位転写物: 907
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,8|C,28) アフリカ系アメリカ人 (T,9|C,27) 全体 (T,17|C,55)
SNP型: ESE
タンパク質コーディング: 配列番号 229, 位置None
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,95|T,25)
SNP型: ESE
タンパク質コーディング: 配列番号 229, 位置None

遺伝子番号: 66
遺伝子記号 RIC8A - 60626
遺伝子名: コリンエステラーゼ8 ホモログ Aのインヒビターに耐性 (C. elegans)
公開転写物受託番号: NM_021932
公開タンパク質受託番号: NP_068751
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 105):

タンパク質配列 (配列番号 230):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 380):
TCCTCGGACCCTGACTCGGACCCTGACTGAGGATGGCAGCTCTTCTGCTCCCCCATCAGGACTGGTGCTGCTTCCAGAGACTTCCTTGGGGTTGCAACCT
S
GGGAAGCCACATCCCACTGGATCCACACCCGCCCCCACTTCTCCATCTTAGAAACCCCTTCTCTTGACTCCCGTTCTGTTCATGATTTGCCTCTGGTCCA
Celera SNP ID: hCV12098639
公開SNP ID: rs3216
SNP染色体部位: 204421
転写物配列中のSNP 配列番号 105
SNP部位転写物: 2010
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|C,16)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 67
遺伝子記号 RNMTL1 - 55178
遺伝子名: RNAメチルトランスフェラーゼ様1
公開転写物受託番号: NM_018146
公開タンパク質受託番号: NP_060616
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 106):

タンパク質配列 (配列番号 231):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 381):
TGCGACCGTTGCTGCAGGTGGTCCAGGCTTGGGACCTTGACGCGAGGCGCTGGGTCCGGGCGCTGCGGCGGAGCCCAGTGAAAGTGGTGTTTCCTTCCGG
R
GAGGTGGTGGAACAGAAGCGCGCTCCTGGGAAGCAGCCCCGCAAGGCACCATCTGAGGCCAGTGCCCAGGAGCAACGAGAGAAACAACCGCTCGAGGAGT
Celera SNP ID: hCV22272816
公開SNP ID: rs2249542
SNP染色体部位: 632502
転写物配列中のSNP 配列番号 106
SNP部位転写物: 241
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,83|A,37)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 231, 位置45,(G,GGA) (E,GAA)

遺伝子番号: 68
遺伝子記号 SDCCAG8 - 10806
遺伝子名: serologically defined colon cancer antigen 8
公開転写物受託番号: NM_006642
公開タンパク質受託番号: NP_006633
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 107):

タンパク質配列 (配列番号 232):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 382):
AGATAGCATTCAGCAGAGCTTTAGCAAGGAAGCAAAGGCCCAAGCCCTTCAGGCCCAGCAAAGAGAGCAGGAGCTGACACAGAAGATACAGCAAATGGAG
R
CCCAGCATGACAAAACTGAAAATGAACAGTATTTGTTGCTGACCTCCCAGAATACATTTTTGACAAAGTTAAAGGAAGAATGCTGTACATTAGCCAAGAA
Celera SNP ID: hCV26338456
公開SNP ID: rs10927011
SNP染色体部位: 241645735
転写物配列中のSNP 配列番号 107
SNP部位転写物: 1882
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,58|A,58)
SNP型: サイレント変異
タンパク質コーディング: 配列番号 232, 位置575,(E,GAG) (E,GAA)

遺伝子番号: 69
遺伝子記号 SEC31B - 25956
遺伝子名: SEC31 ホモログ B (S. cerevisiae)
公開転写物受託番号: NM_015490
公開タンパク質受託番号: NP_056305
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 108):

タンパク質配列 (配列番号 233):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 383):
ACTTGAAACACAGAGGAGTCCTTTCTGCCTTGAGCAGGTTTCACAAGCTGGTCTGGGGGAGCTTTGGCAGTGGGCTTCTGGAAAGCTCCGGGGTTATTGT
Y
GGCGGCGGGGACAATGGCATGCTTATTCTATACAATGTGACCCACATCCTGTCTTCGGGGAAGGAGCCTGTGATTGCTCAGAAACAGAAGCACACGGGGG
Celera SNP ID: hCV2144411
公開SNP ID: rs3763695
SNP染色体部位: 102259196
転写物配列中のSNP 配列番号 108
SNP部位転写物: 369
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,100|C,20)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 233, 位置89,(V,GTT) (A,GCT)

遺伝子番号: 70
遺伝子記号 SERPINC1 - 462
遺伝子名: セルピンペプチダーインヒビター, クレードC (抗トロンビン), メンバー1
公開転写物受託番号: NM_000488
公開タンパク質受託番号: NP_000479
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 109):

タンパク質配列 (配列番号 234):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 384):
GCCCTTCAAAGGTGATGACATCACCATGGTCCTCATCTTGCCCAAGCCTGAGAAGAGCCTGGCCAAGGTAGAGAAGGAACTCACCCCAGAGGTGCTGCAA
R
AGTGGCTGGATGAATTGGAGGAGATGATGCTGGTGGTCCACATGCCCCGCTTCCGCATTGAGGACGGCTTCAGTTTGAAGGAGCAGCTGCAAGACATGGG
Celera SNP ID: hCV1650632
公開SNP ID: rs5878
SNP染色体部位: 172145455
転写物配列中のSNP 配列番号 109
SNP部位転写物: 1088
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,4|A,36) アフリカ系アメリカ人 (G,14|A,24) 全体 (G,18|A,60)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 234, 位置337,(Q,CAA) (Q,CAG)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,7|A,27) アフリカ系アメリカ人 (G,15|A,13) 全体 (G,22|A,40)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 234, 位置337,(Q,CAA) (Q,CAG)
SNP供給源: dbSNP; Celera; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,75|G,45)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 234, 位置337,(Q,CAA) (Q,CAG)

遺伝子番号: 71
遺伝子記号 SFRS2IP - 9169
遺伝子名: スプライシング因子, アルギニン/セリン-リッチ2, 相互作用タンパク質
公開転写物受託番号: NM_004719
公開タンパク質受託番号: NP_004710
染色体: 12
OMIM番号: 603668
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 110):

タンパク質配列 (配列番号 235):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 385):
GACAATCTGTTAAGAGCCCAGAGGTTCAATTGCTTGGGCATGTTGAAACTGAAGATGTAGAAATAATTGCAACATGTGATACTTTTGGGAATGAAGATTT
W
AATAATATTCAAGACTCTGAAAATAACTTACTAAAAAATAATCTTCTGAACACCAAATTGGAAAAATCTTTAGAAGAAAAGAATGAATCGCTGACCGAAC
Celera SNP ID: hCV3216426
公開SNP ID: rs7315731
SNP染色体部位: 44607781
転写物配列中のSNP 配列番号 110
SNP部位転写物: 2258
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,19|A,21) アフリカ系アメリカ人 (T,28|A,4) 全体 (T,47|A,25)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 235, 位置657,(F,TTC) (Y,TAC)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,21|A,17) アフリカ系アメリカ人 (T,26|A,2) 全体 (T,47|A,19)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 235, 位置657,(F,TTC) (Y,TAC)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,51|A,69)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 235, 位置657,(F,TTC) (Y,TAC)

コンテクスト (配列番号 386):
CCTAAGCTGATTAATCACACAATACATACTTTTCCTGCATTTTCTTTCAGTGACATTTGAGAATTGGGTGACATTTTAAAATGTGTTTTATACCATTTAG
Y
TTTTGCAAACAAGTTCTAAAGTTTTGGAGAAAAAGTGATGTGGTCAAGAGTTGAAGTCTCATATATCTTTAGTAGCACTCCCATGAATTATTTCCGTGAC
Celera SNP ID: hCV3216425
公開SNP ID: rs1366024
SNP染色体部位: 44599905
転写物配列中のSNP 配列番号 110
SNP部位転写物: 6872
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,52|T,68)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 72
遺伝子記号 STK11IP - 114790
遺伝子名: セリン/スレオニンキナーゼ 11 相互作用タンパク質
公開転写物受託番号: NM_052902
公開タンパク質受託番号: NP_443134
染色体: 2
OMIM番号: 607172
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 111):

タンパク質配列 (配列番号 236):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 387):
CTAACTGTGGTAGTGACCACGTGGTTCTCCTCGCTGTGTCTCGGGGAACCCCCAACAGGGAGCGGAAACAGGGAGAGCAGTCTCTGGCTCCTTCTCCGTC
Y
GCCAGCCCTGTCTGCCACCCTCCTGGCCATGGTGACCACCTTGACAGGGCCAAGAACAGCCCACCTCAGGCACCGAGCACCCGTGACCATGGTAGTTGGA
Celera SNP ID: hCV2915511
公開SNP ID: rs627530
SNP染色体部位: 220184687
転写物配列中のSNP 配列番号 111
SNP部位転写物: 2299
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,1|T,39) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,24) 全体 (C,9|T,63)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 236, 位置752,(S,TCT) (F,TTT)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,118)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 236, 位置752,(S,TCT) (F,TTT)

遺伝子番号: 73
遺伝子記号 TACR1 - 6869
遺伝子名: タキキニン レセプター 1
公開転写物受託番号: hCT32334
公開タンパク質受託番号: hCP50890
染色体: 2
OMIM番号: 162323
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 112):

タンパク質配列 (配列番号 237):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 388):
CACTGCCTTTGACCTGCCTCCCTTCATGCATGGAAATTCCCTTCATCTGGAACCATCAGAAACACCCTCACACTGGGACTTGCAAAAAGGGTCAGTATGG
S
TTAGGGAAAACATTCCATCCTTGAGTCAAAAAATCTCAATTCTTCCCTATCTTTGCCACCCTCATGCTGTGTGACTCAAACCAAATCACTGAACTTTGCT
Celera SNP ID: hCV11466393
公開SNP ID: rs881
SNP染色体部位: 75129937
転写物配列中のSNP 配列番号 112
SNP部位転写物: 1567
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,97|G,17)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 74
遺伝子記号 TAF1B - 9014
遺伝子名: TATA ボックス結合タンパク質 (TBP)-関連因子, RNA ポリメラーゼ I, B,
63kDa
公開転写物受託番号: NM_005680
公開タンパク質受託番号: NP_005671
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 113):

タンパク質配列 (配列番号 238):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 389):
CCTGATGAAATGCATAGCTTAACTTGCCACGTGGTAAAAATGACTGGAATGGGAGAAGTGGATTTTCTGACATTTGATCCTATAGCTAAAATGGCAAAAA
R
TGTTAAGTACGATGTACAAGCTGTAGCTATCATTGTGGTGGTATTGAAACTGCTCTTTCTATTGGATGACAGTTTCGAGTGGTCTTTGTCTAATCTTGCT
Celera SNP ID: hCV3216649
公開SNP ID: rs1054565
SNP染色体部位: 9968411
転写物配列中のSNP 配列番号 113
SNP部位転写物: 1150
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,9|G,31) アフリカ系アメリカ人 (A,31|G,7) 全体 (A,40|G,38)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 238, 位置351,(T,ACT) (A,GCT)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|G,80)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 238, 位置351,(T,ACT) (A,GCT)

遺伝子番号: 75
遺伝子記号 TNFRSF14 - 8764
遺伝子名: 腫瘍壊死因子 レセプター スーパーファミリー, メンバー14 (ヘルペスウイルスエントリーメディエーター)
公開転写物受託番号: NM_003820
公開タンパク質受託番号: NP_003811
染色体: 1
OMIM番号: 602746
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 114):

タンパク質配列 (配列番号 239):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 390):
ATTGCCCACCTCAATGGCCTAAGCAAGTGTCTGCAGTGCCAAATGTGTGACCCAGCCATGGGCCTGCGCGCGAGCCGGAACTGCTCCAGGACAGAGAACG
R
CGTGTGTGGCTGCAGCCCAGGCCACTTCTGCATCGTCCAGGACGGGGACCACTGCGCCGCGTGCCGCGCTTACGCCACCTCCAGCCCGGGCCAGAGGGTG
Celera SNP ID: hCV15947925
公開SNP ID: rs2234163
SNP染色体部位: 2483112
転写物配列中のSNP 配列番号 114
SNP部位転写物: 649
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,119|A,1)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 239, 位置117,(A,GCC) (T,ACC)

遺伝子番号: 76
遺伝子記号 UMODL1 - 89766
遺伝子名: ウロモジュリン(uromodulin)様1
公開転写物受託番号: NM_001004416
公開タンパク質受託番号: NP_001004416
染色体: 21
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 115):

タンパク質配列 (配列番号 240):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 391):
CGGGAAACACTTCTGAATCCCACGTGGCTGCGAAATGAGGACAGTGGACCCTCCGGTTCTGTAGACCTGCCATTGACCTCCACCCTCACAGCTCTGAAGA
M
CCCCGCCTGTGTTCCTGTCTCCATTGGGAGGATCATGGTCTCCAATGTGACCAGCACCGGCTTCCACCTGGCATGGGAGGCGGATCTTGCTATGGACTCC
Celera SNP ID: hCV1723643
公開SNP ID: rs220130
SNP染色体部位: 42404877
転写物配列中のSNP 配列番号 115
SNP部位転写物: 2093
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,93|C,21)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 240, 位置698,(T,ACC) (P,CCC)

遺伝子番号: 76
遺伝子記号 UMODL1 - 89766
遺伝子名: ウロモジュリン様1
公開転写物受託番号: NM_173568
公開タンパク質受託番号: NP_775839
染色体: 21
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 116):

タンパク質配列 (配列番号 241):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 392):
CGGGAAACACTTCTGAATCCCACGTGGCTGCGAAATGAGGACAGTGGACCCTCCGGTTCTGTAGACCTGCCATTGACCTCCACCCTCACAGCTCTGAAGA
M
CCCCGCCTGTGTTCCTGTCTCCATTGGGAGGATCATGGTCTCCAATGTGACCAGCACCGGCTTCCACCTGGCATGGGAGGCGGATCTTGCTATGGACTCC
Celera SNP ID: hCV1723643
公開SNP ID: rs220130
SNP染色体部位: 42404877
転写物配列中のSNP 配列番号 116
SNP部位転写物: 2477
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,93|C,21)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 241, 位置826,(T,ACC) (P,CCC)

遺伝子番号: 77
遺伝子記号 USP45 - 85015
遺伝子名: ユビキチン特異的ペプチダーゼ 45
公開転写物受託番号: NM_001080481
公開タンパク質受託番号: NP_001073950
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 117):

タンパク質配列 (配列番号 242):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 393):
CTCCATCCACCGCTTACTGGCTTTGGGACCTCTGCAAGTCACTTCACTTCTCTTTCTCAGTTTCAAGTGTAAAATGCGGAAAATAATAGCAACTTATCTC
S
TAAGTAAATAACAGATGCGGGTGAAAGATCCAACTAAAGCTTTACCTGAGAAAGCCAAAAGAAGTAAAAGGCCTACTGTACCTCATGATGAAGACTCTTC
Celera SNP ID: hCV7581501
公開SNP ID: rs1323717
SNP染色体部位: 100069455
転写物配列中のSNP 配列番号 117
SNP部位転写物: 519
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,107|G,13)
SNP型: UTR5

遺伝子番号: 78
遺伝子記号 ZWINT - 11130
遺伝子名: ZW10 相互作用因子
公開転写物受託番号: NM_001005413
公開タンパク質受託番号: NP_001005413
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 118):

タンパク質配列 (配列番号 243):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 394):
GATTGTGGGAAGGCAGCTGAACTCGGCGCCTGGAAAGATGGAGGCAG
K
GGAGACAGAGGCGGAAGCTGCAGCCCTAGAGGTCCTGGCTGAGGTGGCAGGCATCTTGGAACCTGTAGGCCTGCAGGAGGAGGCAGAACTGCCAGCCAAG
Celera SNP ID: hCV25951992
公開SNP ID: rs11005328
SNP染色体部位: 57790994
転写物配列中のSNP 配列番号 118
SNP部位転写物: 48
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,0|G,2) アフリカ系アメリカ人 (T,7|G,21) 全体 (T,7|G,23)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 243, 位置4,(A,GCG) (S,TCG)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,119|T,1)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 243, 位置4,(A,GCG) (S,TCG)

遺伝子番号: 78
遺伝子記号 ZWINT - 11130
遺伝子名: ZW10 相互作用因子
公開転写物受託番号: NM_007057
公開タンパク質受託番号: NP_008988
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 119):

タンパク質配列 (配列番号 244):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 395):
GATTGTGGGAAGGCAGCTGAACTCGGCGCCTGGAAAGATGGAGGCAG
K
GGAGACAGAGGCGGAAGCTGCAGCCCTAGAGGTCCTGGCTGAGGTGGCAGGCATCTTGGAACCTGTAGGCCTGCAGGAGGAGGCAGAACTGCCAGCCAAG
Celera SNP ID: hCV25951992
公開SNP ID: rs11005328
SNP染色体部位: 57790994
転写物配列中のSNP 配列番号 119
SNP部位転写物: 48
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,0|G,2) アフリカ系アメリカ人 (T,7|G,21) 全体 (T,7|G,23)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 244, 位置4,(A,GCG) (S,TCG)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,119|T,1)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 244, 位置4,(A,GCG) (S,TCG)

遺伝子番号: 78
遺伝子記号 ZWINT - 11130
遺伝子名: ZW10 相互作用因子
公開転写物受託番号: NM_032997
公開タンパク質受託番号: NP_127490
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 120):

タンパク質配列 (配列番号 245):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 396):
GATTGTGGGAAGGCAGCTGAACTCGGCGCCTGGAAAGATGGAGGCAG
K
GGAGACAGAGGCGGAAGCTGCAGCCCTAGAGGTCCTGGCTGAGGTGGCAGGCATCTTGGAACCTGTAGGCCTGCAGGAGGAGGCAGAACTGCCAGCCAAG
Celera SNP ID: hCV25951992
公開SNP ID: rs11005328
SNP染色体部位: 57790994
転写物配列中のSNP 配列番号 120
SNP部位転写物: 48
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,0|G,2) アフリカ系アメリカ人 (T,7|G,21) 全体 (T,7|G,23)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 245, 位置4,(A,GCG) (S,TCG)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,119|T,1)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 245, 位置4,(A,GCG) (S,TCG)

遺伝子番号: 79
遺伝子記号 hCG1647019 -
遺伝子名:
公開転写物受託番号: hCT2262545
公開タンパク質受託番号: hCP1815646
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 121):

タンパク質配列 (配列番号 246):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 397):
CCAACAGCTGCCCATACGGCACCTGGGTCCCAGGACGTGCACCAGAAAAAAGTCTTACTGTTAACAGTCCCAGGAATGGAAGAGACCATATCAGAGGCAG
R
CAAAAACCTTTCCAAGCAAGCGTGGGGAAACCAAGAAGACGGGATCCAGGACCAAGTCCTGCGCGGAATCAACGAATCAACATCTTCCCGTCCGCCGACC
Celera SNP ID: hDV70662128
公開SNP ID: rs17043082
SNP染色体部位: 52651845
転写物配列中のSNP 配列番号 121
SNP部位転写物: 450
SNP供給源: CDX; dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,117|A,3)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 246, 位置150,(R,AGA) (K,AAA)

遺伝子番号: 80
遺伝子記号 hCG2002964 -
遺伝子名:
公開転写物受託番号: hCT2288184
公開タンパク質受託番号: hCP1804487
染色体: 7
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 122):

タンパク質配列 (配列番号 247):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 398):
TTCTCCTGGTGAAGAAGTCGCCCAGACTCCAAAACATCTTGTCAGAGGGGAAGGACAGAAAGCAAAATTATATTGTGCCCCAATAAAAGGACACAGTTAT
K
TTTTTTGGTACCAACAGGTCCTGAAAAACGAGTTCAAGTTCTTGATTTCCTTCCAGAATGAAAATGTCTTTGATGAAACAGGTATGCCCAAGGAAAGATT
Celera SNP ID: hCV11629656
公開SNP ID: rs17284
SNP染色体部位: 141986872
転写物配列中のSNP 配列番号 122
SNP部位転写物: 151
SNP供給源: HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|T,-)
SNP型: ナンセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 247, 位置50,(Y,TAT) (*,TAG)

コンテクスト (配列番号 399):
TCAGCTAAGTGCCTCCCAAATTCACCCTGTAGCCTTGAGATCCAGGCTACGAAGCTTGAGGATTCAGCAGTGTATTTTTGTGCCAGCAGCCAATCCACAG
R
GTTAAATATTA
Celera SNP ID: hCV11629657
公開SNP ID: rs17286
SNP染色体部位: 141987074
転写物配列中のSNP 配列番号 122
SNP部位転写物: 353
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,-|G,120)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 247, 位置118,(V,GTG) (M,ATG)

遺伝子番号: 81
遺伝子記号 hCG41016 -
遺伝子名:
公開転写物受託番号: hCT32285
公開タンパク質受託番号: hCP50855
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 123):

タンパク質配列 (配列番号 248):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 400):
TCAATCCTAAGCTCCATACCACCATGTACTTTTTCCTCAGTCATCTATCCTTTTTGGATACTTGTTATTCCAATGTATTTACACCCAAACTGTTAGAGAT
Y
TTGGTTGTGGAAGACAGAACTATCTCCTTCAAAGGATGCATGGTACAATTTTTCTTTGGTTGTGCATTTGTAATCACAGAAATGTTCATGTTAGCGGTGA
Celera SNP ID: hCV25995678
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 55279315
転写物配列中のSNP 配列番号 123
SNP部位転写物: 1923
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,38) アフリカ系アメリカ人 (C,5|T,29) 全体 (C,7|T,67)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 248, 位置641,(I,ATT) (T,ACT)

コンテクスト (配列番号 401):
CATCTATCCTTTTTGGATACTTGTTATTCCAATGTATTTACACCCAAACTGTTAGAGATTTTGGTTGTGGAAGACAGAACTATCTCCTTCAAAGGATGCA
W
GGTACAATTTTTCTTTGGTTGTGCATTTGTAATCACAGAAATGTTCATGTTAGCGGTGATGGCTTATGACTTGTTTATGGCTGTTTGTAACCCCCTGCTC
Celera SNP ID: hCV25996277
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 55279356
転写物配列中のSNP 配列番号 123
SNP部位転写物: 1964
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|T,2) アフリカ系アメリカ人 (A,25|T,5) 全体 (A,63|T,7)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 248, 位置655,(M,ATG) (L,TTG)

遺伝子番号: 82
遺伝子記号 hCG2021365 -
遺伝子名:
公開転写物受託番号: hCT2317164
公開タンパク質受託番号: hCP1784832
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 124):

タンパク質配列 (配列番号 249):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 402):
GCTGCCAACATACGGGCTGCAGTGGGGAGGCACAGCCAGTCCTCCCACTCCACAGAGCAGGCAGGAGTCCCGCCCCTGGGCCCCAGGCCTCCTGCTCCAG
R
GGACAAGTGCAAGCCCTGCCCCTTCCGAATTGGCAGGGCAGGAGCTCCTCATGGGCAGCTGCAGTCACCCAAGCCCGGCTGTGGACCTGGGCATCTCTGT
Celera SNP ID: hCV2879752
公開SNP ID: rs1244565
SNP染色体部位: 179117903
転写物配列中のSNP 配列番号 124
SNP部位転写物: 530
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,65|G,51)
SNP型: サイレントな稀なコドン
タンパク質コーディング: 配列番号 249, 位置43,(Q,CAG) (Q,CAA)

遺伝子番号: 83
遺伝子記号 hCG2038364 -
遺伝子名:
公開転写物受託番号: hCT2342790
公開タンパク質受託番号: hCP1908750
染色体: 22
OMIM番号:
OMIM情報:

転写物配列 (配列番号 125):

タンパク質配列 (配列番号 250):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 403):
ACCCCAGGGCCTGAGGACAGGTCCCCAAGTGGACGTCTCAAAGAGAGTCCCACATTCCAGGGCACATGGGAACTATGGCCTTCTGGCAGCTGGAGGGCAG
S
AGGAAGGGCACAGCTGTCTGAGACCCGTGTGGCTTCCCAGAAAGAGGTGCCACCCCTGAGGAGGCACCGGTGCTCACGGACTCCTGGTTGCCAGTCTTGC
Celera SNP ID: hCV305844
公開SNP ID: rs4823562
SNP染色体部位: 45321840
転写物配列中のSNP 配列番号 125
SNP部位転写物: 2033
SNP供給源: Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異
タンパク質コーディング: 配列番号 250, 位置58,(A,GCA) (P,CCA)

（表 ２）

遺伝子番号: 1
遺伝子記号: ACE - 1636
遺伝子名: アンギオテンシンI変換酵素 (ペプチジル−ジペプチダーゼ A) 1
染色体: 17
OMIM番号: 106180
OMIM情報: {心筋梗塞, 罹患しやすい} (3); {アルツハイマー病,
罹患しやすい}, 104300 (3); {糖尿病性腎症, 罹患しやすい}, 603933 (3); [アンギオテンシン I-
変換酵素, 良性血清の増加] (3)

ゲノム配列 (配列番号 404):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 602):
CTCTGAAATTCTCTGAGCTCCCCTTACAAGCAGAGGTGAGCTAAGGGCTGGAGCTCAAGGCATTCAAACCCCTACCAGATCTGACGAATGTGATGGCCAC
R
TCCCGGAAATATGAAGACCTGTTATGGGCATGGGAGGGCTGGCGAGACAAGGCGGGGAGAGCCATCCTCCAGTTTTACCCGAAATACGTGGAACTCATCA
Celera SNP ID: hCV11942562
公開SNP ID: rs4343
SNP染色体部位: 58919763
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 404
SNP部位ゲノム: 21597
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,6|G,26) アフリカ系アメリカ人 (A,22|G,14) 全体 (A,28|G,40)
SNP型: MICRORNA;UTR5;UTR3;サイレントな稀なコドン;サイレント変異
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,57|A,63)
SNP型: MICRORNA;UTR5;UTR3;サイレントな稀なコドン;サイレント変異

遺伝子番号: 2
遺伝子記号: ADCY9 - 115
遺伝子名: アデニレートシクラーゼ 9
染色体: 16
OMIM番号: 603302
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 405):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 603):
TGACTTCTTCGATCTGCTGCATCTTAAAAGGGCGGAAGGCTATAGGAGCTTTTTGGATGGAAGACTTTTTCTTCCTGTTCTTGGGGCTCGAGGTGGCATG
Y
CTCTTGACAGAATTCTCACTCTCCTCATCTCCCTGCTTCATTAAGTCATCGGCTATGATTCTTGGCATCACGGAATGAATCATCCTCTCTTTGAGGGCTT
Celera SNP ID: hCV2590858
公開SNP ID: rs2230738
SNP染色体部位: 4104365
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 405
SNP部位ゲノム: 161712
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,32|T,4) アフリカ系アメリカ人 (C,32|T,4) 全体 (C,64|T,8)
SNP型: サイレント変異
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,94|T,22)
SNP型: サイレント変異

遺伝子番号: 3
遺伝子記号: AGTR1 - 185
遺伝子名: アンギオテンシン II レセプター, １型
染色体: 3
OMIM番号: 106165
OMIM情報: 本態性高血圧, 145500 (3)

ゲノム配列 (配列番号 406):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 604):
TTTGAGGTTGAGTGACATGTTCGAAACCTGTCCATAAAGTAATTTTGTGAAAGAAGGAGCAAGAGAACATTCCTCTGCAGCACTTCACTACCAAATGAGC
M
TTAGCTACTTTTCAGAATTGAAGGAGAAAATGCATTATGTGGACTGAACCGACTTTTCTAAAGCTCTGAACAAAAGCTTTTCTTTCCTTTTGCAACAAGA
Celera SNP ID: hCV3187716
公開SNP ID: rs5186
SNP染色体部位: 149942678
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 406
SNP部位ゲノム: 54323
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|C,4) アフリカ系アメリカ人 (A,28|C,4) 全体 (A,62|C,8)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン
SNP供給源: Applera;Celera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|C,-)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 4
遺伝子記号: ANK1 - 286
遺伝子名: アンキリン 1, 赤血球
染色体: 8
OMIM番号: 182900
OMIM情報: 球状赤血球症-2 (3)

ゲノム配列 (配列番号 407):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 605):
CCTCCTGCACCTGCTCTTCTTGGCCTTGCTGCCTCCGGTCCCTGTCGGCCTGGGAGCTCTCAGCCTCGGGCTGTTCTGTCCACGTGTGCTCACTTACAGA
Y
ACCAGGACCTTCTCGTACTCCTGAGATCCACCGGGCTCTAGCCCTTCAGTCATGGTACTTGTTCCCTGGAATGAGTGTGGACCTTGCGTGACCTCCTCTT
Celera SNP ID: hCV10008773
公開SNP ID: rs750625
SNP染色体部位: 41645071
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 407
SNP部位ゲノム: 25170
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,25|T,13) アフリカ系アメリカ人 (C,26|T,12) 全体 (C,51|T,25)
SNP型: MICRORNA;UTR3;ESE SYNONYMOUS;サイレントな稀なコドン;サイレント変異
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,98|T,22)
SNP型: MICRORNA;UTR3;ESE SYNONYMOUS;サイレントな稀なコドン;サイレント変異

遺伝子番号: 5
遺伝子記号: ANKRD6 - 22881
遺伝子名: アンキリン反復ドメイン6
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 408):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 606):
TTTATAACCTATTCCTAATCAAACCCAATTATATCAGAATACCTTTCTGAATTTGAGATTTTTGCTCTACATTTTATAATGAATAAGGCTATTTTTTGAA
R
GTATTTCATTTTGAATTCTGTCATTAACCTCAAAAGCTTTCTACTGCTTTGCGGTGAAGGCAAAATATTCGATAACTCAACTTAGGCCCCACTGTTCCCC
Celera SNP ID: hCV30454683
公開SNP ID: rs9351210
SNP染色体部位: 90398328
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 408
SNP部位ゲノム: 208677
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,87|G,33)
SNP型: UTR3;イントロン

遺伝子番号: 6
遺伝子記号: APOH - 350
遺伝子名: アポリポ蛋白 H (β-2-糖蛋白 I)
染色体: 17
OMIM番号: 138700
OMIM情報: [アポリポ蛋白 H 欠損] (3)

ゲノム配列 (配列番号 409):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 607):
TTCAATTAGGTTCCTTGGATGAACAAGAAACAAGTGTGACATTTTGTGTGGAATCTGAAAACCACCTTAGCATGGCTTTACATCGGATGCATCAGTTTTC
S
AAAAAGCCAGAGAACTGTGTTCTGTTGGGGGAGAAAAAGATAAACATTCTAAGAGAAACAATCATTTCTTAAATGTGGTAAATAGCTAAGCCAAACCAAA
Celera SNP ID: hCV2303891
公開SNP ID: rs1801690
SNP染色体部位: 61638747
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 409
SNP部位ゲノム: 10134
SNP供給源: HGMD; dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,114|C,6)
SNP型: ミスセンス変異;TFBS SYNONYMOUS;偽遺伝子

遺伝子番号: 7
遺伝子記号: BLZF1 - 8548
遺伝子名: 塩基性ロイシンジッパー核性因子 1 (JEM-1)
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 410):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 608):
TTTTATTTTAAAGTAGAAATCTGTCCGCTTTTCACTTACGGAGGCCTTACAGTGTGTGTTCTGTGTTACTTGAGTTTATACGCACTGCAGAATTTGTTTA
Y
CCTGCTCTTTTGGAAACGTATTCCGGAAGCGAAACCCTGAGTAATCGGAAGTGGTTAGGAGTGAGAGAGCTGCTGGATATGCGGAGGGACTGGGCGGGTC
Celera SNP ID: hCV15878582
公開SNP ID: rs2275299
SNP染色体部位: 167604000
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 10182
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,11|T,29) アフリカ系アメリカ人 (C,22|T,14) 全体 (C,33|T,43)
SNP型: UTR5;TFBS SYNONYMOUS
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,65)
SNP型: UTR5;TFBS SYNONYMOUS

コンテクスト (配列番号 609):
GCTTGTGACTTTTCCATCTCAGACTTTTTTCTGAGTCTGAGAGATTTATATCCAGCCAGGTATTTCCATCTACTTGTTCCACAGATGGCTAAAAATATAA
Y
CTCTTTTCTCCTTGCTTTTGCATTTGTACAACCCCCCACCCCTAAAAATCTCCTCCTTTTCCTGTATTCCCTATCTTGATGAATTATACCTACTCTATAG
Celera SNP ID: hCV221700
公開SNP ID: rs6677410
SNP染色体部位: 167619919
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 26101
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,53|C,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 610):
ATAGTCCTATAGTCTAGCAATATAACTTTAAGATTTACATAACAGAATGAAAGTCAGAATTGTATTTTATGGCATTAAATAAATTAACTTTATTTCTGTC
Y
ATATCAACATCCAAAGTTTATTAGGAATTTATTTAAAGAATAATAAAAGCAATAGGACCTAACATTTAATGAGTGCTTACTGTGTCAAATACCATTCTAA
Celera SNP ID: hCV279320
公開SNP ID: rs10800441
SNP染色体部位: 167610647
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 16829
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 611):
ACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATCGCGCCACTGCACTCCACAGCCGGGTCGACAGAACAAAACTCTGTCTAAAAAAAAAAAAAGGCAGGT
S
CTAAAAACAAAACCAGAAAAGCTATTAGGAGAAACGTCATAAAGTTGGAAACTGAAAAGCATTTCATTTCATGGAATAAAATTTTGTTCTTCAGTAATTA
Celera SNP ID: hCV459880
公開SNP ID: rs10800439
SNP染色体部位: 167597663
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 3845
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,58|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 612):
GGCATTTAGATACAAACAGGTCTAATATTTAAGAAATGAAAAGATGAATATAAAAAAGGTCTAATATGTAAGAAATGAACAGGTGAATATAATGAATAAA
M
AGAGAATCTCAGTAAAGAAATGGAAATTTAAAAAAATAAACTGATAGGAGGATCCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTATAGCTCCCAGCGTG
Celera SNP ID: hCV2456767
公開SNP ID: rs2014061
SNP染色体部位: 167636507
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 42689
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,53|C,65)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 613):
GGCAAGGTAGAAGGGGGCTGGGTTATTAGGCTTTTGTAACAGCCCAGCCAACAGAAGAAAATAGTGGTTTAGATTAGGGTAGTGGGACTCTGTATATGCA
S
TGAAGATAGAACCAACATAATTTGCTCAAAAATTGAATGGATAGTTTTATGTCATGCTTTAAATGATTATTTTTTAAATTATTCCAGGTTTATTAGTATA
Celera SNP ID: hCV2456768
公開SNP ID: rs6427186
SNP染色体部位: 167635186
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 41368
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 614):
AGAAGAAGGAAGGAAATTAAGATTAGAGTGCAGACAAATAGAGAATAGAAAAACAAGAGAGATCAAAGAAGTCAACAGTTAGTTCTTTAAAAAGAAAGAC
Y
AAATTGACAAATCTGTAGCCATACTGACTAAGAAAAATAAAACAGGTAAAACTAAAATCAGAAATGAAAGTGGGGACATTATTAGTCACCTTACATAAAG
Celera SNP ID: hCV2456776
公開SNP ID: rs6669741
SNP染色体部位: 167626278
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 32460
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 615):
TCTCCTTTTCTATTCTCTTTGTTGGGAAATTGTGTCACTGCCTACTTAGTTGCTGCCAGTAGCATTTGGTATAGTTGACCACTCCCTCTTTCTCGAACTA
Y
TCTTTCCGAGGTTTATATAACTTTATAGCTTACAGGCTTTTCTCTTTTATCCAACCATTTTATTTCACTATACAATGTTAGGTATCCTCAGGGCTTGATT
Celera SNP ID: hCV2456780
公開SNP ID: rs7534737
SNP染色体部位: 167620960
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 27142
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 616):
CCAGCTGAGAAAATGGCTGAAACGGTAAAATATTTTCTTTTGTGATCTATGGAACTTCTAACACTGTCCTTTTACTGAAAGGTGACATATCATGGAAAGC
R
TTTGGCATTAGGAATTAGGAAATGTGGGATCTAAACCACTCATGCTATTGAGTGTGTTATCTTGGAGAAAATTATTTCCTCTTCTGCGCTTTAATATTTT
Celera SNP ID: hCV8688930
公開SNP ID: rs3905328
SNP染色体部位: 167618220
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 24402
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,46|G,68)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 617):
AGTTTTGGAGACATTGGAGTTCCAATCCAACTATAGTGGGAATACTTCATTGCTTACCTTGGTCAACCACTTACAACCCTAAAAAGGCCATGCTTTGGAA
R
TAAGGGTCATGTCCTAGAGTAAGGACCATGCTCTAGGACTAAGGACAAAAGCAAAATAAACCCATCCTAACAAAGCATAAAACAAAGTCTGACAGGATCA
Celera SNP ID: hCV8690976
公開SNP ID: rs1124843
SNP染色体部位: 167636082
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 42264
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,50|G,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 618):
GCTTCATCTTAAATGAGGTGTATGAGAAACATGCTAAACTATGGTTCCCTATCTCTGCTTCACAATATAAAGGTGATTCCAGAATTTGGAAGCCTCAACT
R
TAACAAACTAGATGAAGACAGAAGCTGATTAGATAAACTGCAGTGGTCAGGAAGCCTCACCAACAGAGCAAACAACCTCCATCTTCAGCTGCTTATTGAG
Celera SNP ID: hCV11341869
公開SNP ID: rs2176473
SNP染色体部位: 167598426
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 4608
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 619):
TCTTTCTATCCTCCAGTCCGTTATCCATAAGTGCTTAAAAGATATGGTAGTTAAGTGAATTAACTAGAACCCTCTCAAACATAGGGGTGAATTAAAATAA
Y
CTATAGGCTTATTTAAAATGCAAATACCGAGCTCCATTCCTTTCATTCAGAATTTCCAGGGGTGAAGCCCAAACAGTGAATTCCAGAAGCTCTCCAAGCA
Celera SNP ID: hCV11341876
公開SNP ID: rs1980198
SNP染色体部位: 167602883
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 9065
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,49|T,55)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 620):
TAGGGGTGAATTAAAATAACCTATAGGCTTATTTAAAATGCAAATACCGAGCTCCATTCCTTTCATTCAGAATTTCCAGGGGTGAAGCCCAAACAGTGAA
K
TCCAGAAGCTCTCCAAGCAATCCCAGGAGAAATTTCTGTTTAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAGAAAAGAAAAGAGAAAAGAAAAGCAAGCACAGACCTAGA
Celera SNP ID: hCV11341878
公開SNP ID: rs4656670
SNP染色体部位: 167602964
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 9146
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 621):
TTGCTGTAACAAAGTACCACAAACTGCATGGCTTGAACAACAAAATGTATTCTCTCAGTTCTGGAGGCTAGAAGTCCAAGATGAAAATGTCAACAAGGCT
R
TGCTCCTTCGGAAGGCATTAGAGACACTCTCCTAGCTTCCAGTGGCTTGCTGGCAGTCTTTGGTGCTCCTTGTCTTGTAGACGTACCACCCTTATCTCCG
Celera SNP ID: hCV11341882
公開SNP ID: rs12024897
SNP染色体部位: 167605892
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 12074
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,54|A,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 622):
TCCTGTTTCCAAATGAAGTCTCATTCTGAGGTAGTGGGGGGTTAGTACTTCAACAAATAAAGATTTGGGGGACACAATTCAACCCCTAAATTGCTAAATA
Y
AGTAGTCACTTTTTAGTCCTAGCTGATTTGTCCTCTCTAATATTTAATACTGTTGACCATTCCCTGCCTTTTGAGATACGTTCTTTTGATGACTTCCATG
Celera SNP ID: hCV11341886
公開SNP ID: rs7539415
SNP染色体部位: 167606236
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 12418
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 623):
ATTCCATGAGCAGATAAATTTGATAAATGCTGTATTAAAAGAGAGGCTATACTATGGGACCTCTCAGAGTCCTATAGTATAACTTTAATACTAATGTACA
Y
TGAAACTCTGTAGAGATGCAGTATGCAACATTGCCCACACTTATTTGACCAGGGATCTCTATCCATAGAGCCTGTGGTAAGAAGAATGCTTAGATTCCAC
Celera SNP ID: hCV11341887
公開SNP ID: rs3766095
SNP染色体部位: 167607874
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 14056
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 624):
TTAAACATGTATCTTTTGTTGACACATGATTGTTTTGAAAATTACTTTTTCTCTGATTTTTTTTTTGCATTCTTTTTAGTGCCAGTAATTTTGAATATAG
R
GTATAGCATGTATTAGCATTTTCTTGGCATTTCTTCTTGGTAAGTAGTTTCTGTTTTGTTTCCTTTTTGTTAGTCACCGTTACTTCATCCCCAATCCGAG
Celera SNP ID: hCV11341898
公開SNP ID: rs12563090
SNP染色体部位: 167612328
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 18510
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,51|A,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 625):
TCAAGTGAAGCCCCCTGAAATACGGAGAATAAGAATCTTAGAGGTAAATCCGAGGACAAGCAGGTATAACTAAGGATGTTGGAAAGGGACGGAGGTCTGG
Y
TGGAGCTCGGTGGCCAGTAGCTTTGGATTTAGGGAAAGATTGTTCCGGGAAGACTTTTTCAGACAGGGATGAAACTTAGGTTTCGACTTCCCCGGACAGC
Celera SNP ID: hCV27242515
公開SNP ID: rs3818844
SNP染色体部位: 167604262
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 10444
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|T,65)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 626):
TAAATGTCAAAGATGTGGAGAAATTGGAACCCCTATGCATTGTTTGTGGGAATGTAAAATGTTGAAAACAGTGTGGCAGATCCTCAAAATATTAAACATA
S
AGTTACCATATGGCCTAGCAATTCTGCTTCTAGGTAGATTCCCAAAAGAAAGCAGAAACTAGAATAGGTATTTGTACAACAGTGTTCACAGCTGCATTAT
Celera SNP ID: hCV27242533
公開SNP ID: rs2138898
SNP染色体部位: 167625435
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 31617
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|G,67)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 627):
AAAAAAAAAGCAGGGGTTGCAATCCTAGTCTCTGAAAAAACCAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAGATACAAAAAAGGCCATTATATAATGATGGGG
K
ATCAATCCAATGAGAAGAGCGAACTATCCTAAATATATATGCACCCAATACAGGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAACCCTTAGAGACCTACAGAGAAAC
Celera SNP ID: hCV27242578
公開SNP ID: rs6427187
SNP染色体部位: 167638950
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 45132
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,49|G,71)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 628):
CTTTAAGAACCTGCCTTCTCTGAATCTTGCTGGCAATCTGAAGTGTTCCTTCTCCATCCTTCCATTGTACTTTGCACTTATATCTGTAACTGCTCTTTAC
Y
GTATTAAATTATAATAGTTTTATTTTCCATCCCTCTCCCAAATTGTAAACTCCTAAAGGGCTGGGGACTTTGTGTTTTTATGTTTCCTCAAGGTCTGGCA
Celera SNP ID: hCV27928246
公開SNP ID: rs4656672
SNP染色体部位: 167620675
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 26857
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 629):
ATCTTGCTGGATATTTTATATGAACAGTGTTAATTTAGATGCACTAAAGCAAAGGTAGGCAAACTACAACCATGAGTCAAACATGGCCACACCCATTCAT
K
TGCTATTGTCTAAGCTGGTTTTGCACTACAACTGCAGAGTTGAATAGATGCAGCAGATCCTTTACAGAAAAAGTTTTCTGACCTCAATTCTAAAGTAATT
Celera SNP ID: hCV29397237
公開SNP ID: rs6427185
SNP染色体部位: 167623457
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 29639
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|T,70)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 630):
GAAGTCATGTAGCCAGAGGTCACAAGATTTGTAACTTCACCAATTGCTCCTTTAGATAACATCACTATTGTAAAACCTAAGATTGGTCTTGAGATATTTT
Y
CAGGCTTCTGCATTCTGGCAAACCTCCTGATGCCACCCAGATACATGCCTCATACCAAGAAACTGACTCTACTAGTCCTATGACTCTCACCTAGACAACT
Celera SNP ID: hCV30180981
公開SNP ID: rs7415756
SNP染色体部位: 167600906
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 7088
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 631):
CTCCCAAGTTCCATAAGTCTCAGTATTCCTGGCTCCTTCCTGCCTCTCAGATCTCTTCTCCTCCAGCTGTCCTCTCATTCCCTAGGCCCCAGCCACACTA
K
CTCCCTCCTGTTCCTCTAATGCACCTCTGTGCTCACTATTGACTCTGCCTGGAATGCTCTTCTCCTAGGTTTCACCTGGCAAGCTGCTTTCTATCATTGA
Celera SNP ID: hCV32141293
公開SNP ID: rs10800438
SNP染色体部位: 167596456
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 2638
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 632):
GTATTAGAGCTTGTTTTCATGTCCATATACTCCAGAACTATCAAAATTGATGGTCTTCCTTAAAAGCCTTTTGCATTTTTATATAGTTGATTTATTACAC
R
TAGAATCAGTAAGTGTCAAAGAGCAAATTATAGGGGAAATTAGAAGAATGAAAACACAAGAAACGTCTAACCAGTTTAATCAGGAAAAAAAGAGAAGATA
Celera SNP ID: hCV30126929
公開SNP ID: rs10429893
SNP染色体部位: 167616933
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 23115
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|A,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 633):
CTCTGACCTCAGCCTCTTCAATAGCTGGGACTACACACATATGCCACCGCACCTGACTCGACTCAACCCTCTTTGAGTAGGGAAGGAAGGCATCACAGAA
R
AGACACCTACACTGGGTCTGGAAGTGAATCCACCTTTGCAAAAATTATAACAGTGAGAGAAATCTAACCTAACTGACTCCATATTGCTTCTAACCTCACA
Celera SNP ID: hCV32141297
公開SNP ID: rs10800440
SNP染色体部位: 167600450
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 410
SNP部位ゲノム: 6632
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,52|G,66)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 8
遺伝子記号: C1QTNF6 - 114904
遺伝子名: C1q および腫瘍壊死因子関連タンパク質 6
染色体: 22
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 411):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 634):
AGAGGCTGAGGATACATGGGCAGGATCCAGGGGGTCCTCAGAGTCACAGCACCGTTGGCAGCCGCTGGCCACAGCTCTGTCAAAGGTGAGCTCCACCATA
S
GGATCTCACACATCAGGAGAAAGAGCAGGAGCGCTGCCCAGACGGGACCCAGGGCGGCTGTCCCCATGGTGACCTGGAACAAGGAAGGAGGGACAGGAAC
Celera SNP ID: hCV2403368
公開SNP ID: rs229526
SNP染色体部位: 35911368
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 411
SNP部位ゲノム: 15216
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|G,28) アフリカ系アメリカ人 (C,4|G,20) 全体 (C,14|G,48)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,95|G,25)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;偽遺伝子

遺伝子番号: 9
遺伝子記号: C1orf114 - 57821
遺伝子名: 染色体 1 オープンリ−ディングフレーム114
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 412):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 635):
AGTAAGTGACAGGAGCACATCTTCTTGTCCAAAATCATTGGAAATACATAATTGTGACAGTTTCCCAAACATATTCCTTTCGTTTTCAAAATAATTTTTA
R
AAGTAGTAGTGTCTTCTAGTGGAGGAACTTCCAAATCAACTAACTGGTCCTTGAACTTAAGTTTTCGCTCCCTTTTATCATTCACCGGTTCTTGATTCTG
Celera SNP ID: hCV2456747
公開SNP ID: rs3820059
SNP染色体部位: 167657778
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 37040
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,12|G,22) アフリカ系アメリカ人 (A,18|G,4) 全体 (A,30|G,26)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;TFBS SYNONYMOUS
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,6|G,30) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,12) 全体 (A,12|G,42)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;TFBS SYNONYMOUS
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|G,30) アフリカ系アメリカ人 (A,9|G,11) 全体 (A,17|G,41)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;TFBS SYNONYMOUS
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,50|G,70)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;TFBS SYNONYMOUS

コンテクスト (配列番号 636):
CTTCACTTTTCTTTGAATCAGTATCTTTATTTTCATTCATTTTCTGTTTGTGAAGGAAATATGCTGTAAGATTTTAAAAGATAAGGTATATGTTATGCCC
R
CTCTAGAGGAGGAATGGAGTATGGAGATTAATGCTGTAGGTAAGCTAATTAACACAGAGAAACACAAAATAGAATGTTCAAAATGAACATGCACTTGAAT
Celera SNP ID: hCV25616192
公開SNP ID: rs10919168
SNP染色体部位: 167660850
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 40112
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,7) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,22) 全体 (A,7|G,29)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,41|G,79)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 637):
TCTCAAAGGTTGACAGACTGACATGCAGAAAACAAAAAATAAAAAGAATGAAAAGCAAAGACGACCTAGACTAAAAGAAAATTTTTTTGTCTCTTCTAAC
R
GCAAGCAGAGACAAACATTAAATTGCAATATCGTACAATCATTCACCATCTGTAATTCACAATCTATAGTGACAATCTTGAGCTTCTAAAAAAGGTTGAT
Celera SNP ID: hCV2456730
公開SNP ID: rs961404
SNP染色体部位: 167672474
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 51736
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,54|A,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 638):
CCAAGAGAGGCAATGTAAAATTAAATTTTTAGATATTCTTCAAGTTATAGACTTAAGGTCTTTTAAAATGGAAGGTTAAAATGAATTGTAATATTGAGTG
Y
ACTTCCTAGATGTGGTGTAGTTGTAATGACCTAATGTTGCTACTGCTTCAGCGCTTGAAAAAAGACGCTCCCAAAAAAGGTTATTCACTGCTAAAGGTTG
Celera SNP ID: hCV2456741
公開SNP ID: rs6696810
SNP染色体部位: 167664108
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 43370
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 639):
CCTTCTAGTCAAGTTTGATGAGAGAACCTGGATACCTTGGTTGCCAGTGAAGGATTCACATGCTTATTATGTTTTTTTCCGATAGGAGCCTCTGAGCCCC
M
CTGCTTCTAGTCAGCCATCTTGGCCCCGTCACTCCTATTATTTTTACCTCATTTCCTTTTCTTAATGAATTGGATTGAAACACCAGAATACAGTTATTTA
Celera SNP ID: hCV2456753
公開SNP ID: rs7528375
SNP染色体部位: 167652270
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 31532
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,52|A,64)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 640):
GGCATTTAGATACAAACAGGTCTAATATTTAAGAAATGAAAAGATGAATATAAAAAAGGTCTAATATGTAAGAAATGAACAGGTGAATATAATGAATAAA
M
AGAGAATCTCAGTAAAGAAATGGAAATTTAAAAAAATAAACTGATAGGAGGATCCAAGATGGCCAAATAGGAACAGCTCCAGTCTATAGCTCCCAGCGTG
Celera SNP ID: hCV2456767
公開SNP ID: rs2014061
SNP染色体部位: 167636507
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 15769
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,53|C,65)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 641):
GGCAAGGTAGAAGGGGGCTGGGTTATTAGGCTTTTGTAACAGCCCAGCCAACAGAAGAAAATAGTGGTTTAGATTAGGGTAGTGGGACTCTGTATATGCA
S
TGAAGATAGAACCAACATAATTTGCTCAAAAATTGAATGGATAGTTTTATGTCATGCTTTAAATGATTATTTTTTAAATTATTCCAGGTTTATTAGTATA
Celera SNP ID: hCV2456768
公開SNP ID: rs6427186
SNP染色体部位: 167635186
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 14448
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 642):
AGAAGAAGGAAGGAAATTAAGATTAGAGTGCAGACAAATAGAGAATAGAAAAACAAGAGAGATCAAAGAAGTCAACAGTTAGTTCTTTAAAAAGAAAGAC
Y
AAATTGACAAATCTGTAGCCATACTGACTAAGAAAAATAAAACAGGTAAAACTAAAATCAGAAATGAAAGTGGGGACATTATTAGTCACCTTACATAAAG
Celera SNP ID: hCV2456776
公開SNP ID: rs6669741
SNP染色体部位: 167626278
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 5540
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 643):
TCTCCTTTTCTATTCTCTTTGTTGGGAAATTGTGTCACTGCCTACTTAGTTGCTGCCAGTAGCATTTGGTATAGTTGACCACTCCCTCTTTCTCGAACTA
Y
TCTTTCCGAGGTTTATATAACTTTATAGCTTACAGGCTTTTCTCTTTTATCCAACCATTTTATTTCACTATACAATGTTAGGTATCCTCAGGGCTTGATT
Celera SNP ID: hCV2456780
公開SNP ID: rs7534737
SNP染色体部位: 167620960
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 222
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 644):
AGTTTTGGAGACATTGGAGTTCCAATCCAACTATAGTGGGAATACTTCATTGCTTACCTTGGTCAACCACTTACAACCCTAAAAAGGCCATGCTTTGGAA
R
TAAGGGTCATGTCCTAGAGTAAGGACCATGCTCTAGGACTAAGGACAAAAGCAAAATAAACCCATCCTAACAAAGCATAAAACAAAGTCTGACAGGATCA
Celera SNP ID: hCV8690976
公開SNP ID: rs1124843
SNP染色体部位: 167636082
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 15344
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,50|G,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 645):
TACTTCGGTGGTCAGACAAATAAATTAATATTCTCTTCATTCCCCCATACGTCTTCTGAATTGTATTTCTGTTTTCCTGAGAAAACCCATCCTCCTTTGA
Y
ATTTGTATCATTTGGCTCTATTAAAAATAGTTATGTAACCACCTCTGATCACTCCTGACTCAATATTCCTCTCCATGCCAGTCCCAAGGTATATTTTTAA
Celera SNP ID: hCV8697018
公開SNP ID: rs932301
SNP染色体部位: 167651523
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 30785
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,50|T,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 646):
ATATTTTTGACCCTCAGCTTCTTTTTTTCCTAATCAAAACCAAAACTTTACCCAAGAGAGTTGCCAAAGAAAATAGGATTTTTGCTCTAGCTTTGAGGCA
Y
GTCAAAATGGTCAACTAGAATTTTCTCAAATTCTGCTTATCTTTATGTATAAAGGCAAAGCAAGATGAATTTAGATTGTGGTGAAAGTTGAGATGATTTT
Celera SNP ID: hCV8697031
公開SNP ID: rs1400836
SNP染色体部位: 167663761
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 43023
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 647):
TGAAAGCAATAATGCAAAGCTAATACAGTTTGTGAACTAAGCTTGAGCCATTTTTAGGACAGTCTTTCACAGTCCTTTCACTTACTTTAGTCTCATAAAC
Y
CAGGTCTCTGAATTCCCAGCCCAGAAATTAGGACGTGATAATTTCAAAAAAGAAAAACAGTTGTGTTGTTAAAAGTAGGTACTCTGACACCAGAAAAAAA
Celera SNP ID: hCV8697038
公開SNP ID: rs961403
SNP染色体部位: 167671990
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 51252
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 648):
TAAATGTCAAAGATGTGGAGAAATTGGAACCCCTATGCATTGTTTGTGGGAATGTAAAATGTTGAAAACAGTGTGGCAGATCCTCAAAATATTAAACATA
S
AGTTACCATATGGCCTAGCAATTCTGCTTCTAGGTAGATTCCCAAAAGAAAGCAGAAACTAGAATAGGTATTTGTACAACAGTGTTCACAGCTGCATTAT
Celera SNP ID: hCV27242533
公開SNP ID: rs2138898
SNP染色体部位: 167625435
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 4697
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|G,67)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 649):
AAAAAAAAAGCAGGGGTTGCAATCCTAGTCTCTGAAAAAACCAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAGATACAAAAAAGGCCATTATATAATGATGGGG
K
ATCAATCCAATGAGAAGAGCGAACTATCCTAAATATATATGCACCCAATACAGGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAACCCTTAGAGACCTACAGAGAAAC
Celera SNP ID: hCV27242578
公開SNP ID: rs6427187
SNP染色体部位: 167638950
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 18212
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,49|G,71)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 650):
ACTCTCACACACTGTTGGAGGAACTATAAATTCATATTATCTTTTGGGAGGTTACTTTTGCATCTTTAACGAAACATTTCACTCTAAGCCTTCAAACATT
W
TAAATTCACCTCTGAAGAACTTCTCCTACAGATTACTGATGTTCCCATAGAATGTACCTCTTCACTACAGCACTGTTAACTAACGCAACATTGGAACCAA
Celera SNP ID: hCV27242639
公開SNP ID: rs7544221
SNP染色体部位: 167654005
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 33267
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|A,70)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 651):
TTTCTCTATTTTCTGTTTTAGTTTTTTTAATTCTTTTAAATTAAATAATTTGGTGTCTTTAATTTGCTAAAGATTTACATAATATTTCTATACGTCTAGT
S
TTAAGTGAGACCAGTCTCTAGGGTTTTGTGGGGGGGTGTGTGTGTATCTTTGCCCTGTTTGAATAACAAAGTTACACCTTGAAAAAACGAATTGATAGTT
Celera SNP ID: hCV27242642
公開SNP ID: rs10919167
SNP染色体部位: 167654542
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 33804
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,49|G,69)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 652):
ATGCTGTGCTGCTTCTTCACCCAATCCCAAATTCCTCCTGTCCTTCATAACCCTTGTTAGTTCTCTGTAATTCCTACTCAATGATATAAAAACTCCCAAA
Y
AACATCCATCCTCCCAAGTCACTGAAAGGGATCTGGCCCTAAATTTCCTATCTTATGCAAATTCTGATTCTCCCCCAAGCCACATCTTCTCTGAAACAGA
Celera SNP ID: hCV27496192
公開SNP ID: rs3753303
SNP染色体部位: 167651296
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 30558
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,43|T,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 653):
ATCTTGCTGGATATTTTATATGAACAGTGTTAATTTAGATGCACTAAAGCAAAGGTAGGCAAACTACAACCATGAGTCAAACATGGCCACACCCATTCAT
K
TGCTATTGTCTAAGCTGGTTTTGCACTACAACTGCAGAGTTGAATAGATGCAGCAGATCCTTTACAGAAAAAGTTTTCTGACCTCAATTCTAAAGTAATT
Celera SNP ID: hCV29397237
公開SNP ID: rs6427185
SNP染色体部位: 167623457
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 2719
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|T,70)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 654):
AGATCAGATGAGCCAGTTTATTGATCTGAGTGGTGCCAGCTGATCCATCAAGTGCAGGGTCTGCAAAATGTCTCAGGTACTGATCTTAAGGGCAGTGTAT
Y
CTTAAATATTGTAGCCTCTAGCTGCATGATTCCTAAACCATAATTTCTAATCCTGTGGCTAATGTTAGTCCTACAAAGGCAGTCTAGCGCCCAGGCAAGA
Celera SNP ID: hCV30577322
公開SNP ID: rs7516248
SNP染色体部位: 167673157
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 52419
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 655):
CTATTTACTATGTACAAATACAGCACAATTATGTGCAAATATTGCACAATATACTGTACATTTATTTTTGCAAATACCCCATTTAAAAAATTATAATACT
Y
GGAATGCCATGAGGCCTGAAGGCCCATCATCGTCCAAGAAGCTATCAGCAGTATGGCCATAGCTGTGTTTTCCGTGGTCACTGACTGAAACATAAACTCC
Celera SNP ID: hCV32141337
公開SNP ID: rs10919164
SNP染色体部位: 167651061
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 30323
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,53|C,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 656):
ACAAATATGAAAAACAAAAAAAATTAATTTGGGATTCTATATGGCATTTTGGAGACATTTCGTTAAGAATATTAGGCTATATTCTTAATCTGAAACTAAA
M
TCCTGGAAATAAAAGAATTGTAAGCATAGAACATAACATGAAACACATGCAAATAAAAGAATTATAGTCCAAGTCTTCCTGTTGCCTCCTAAACCTCTAC
Celera SNP ID: hCV30523079
公開SNP ID: rs10489189
SNP染色体部位: 167656760
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 36022
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,50|A,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 657):
AATCCTTTACAGACAAGCAAATGCTGAGAGATTTTGTCACCACCAGGCCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGGAAGGACTAAATATGTAAAGGAAAAACAG
R
TACCAACCACTGCCGAAACATGCCAATTGTAAAGACCATTGACACTATGAAGAAACTGCATCAACTAACAGGCAAAATAACCAACTAGCATCATAATGAC
Celera SNP ID: hCV32141333
公開SNP ID: rs10800446
SNP染色体部位: 167645774
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 412
SNP部位ゲノム: 25036
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,54|G,64)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 10
遺伝子記号: C3orf15 - 89876
遺伝子名: 染色体 3 オープンリ−ディングフレーム15
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 413):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 658):
TTTTTTAAAAATAACAACCCTCAAATTCTAATGTGTAATTTGCTAGTTTATTATGTTTGTTGTTTGTTGTCTCTCTCTCATGAAGTCAAAGATTTTTGTC
R
TTTTGTTGATGTATTCTAAGCACCTAGATAGAGTAGCCAGTCAATAAACATGTGTTGAATGAAGGAGCAAAAAGAGCCTGAGCCTCTTGCAGCTTTTCAG
Celera SNP ID: hCV134275
公開SNP ID: rs9847068
SNP染色体部位: 120907303
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 12740
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,40|A,80)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 659):
CTGATGGTATAATTTTGTCCTTTGCCTCCCTTCTCTAACATTAGAGAAAAGTTCCCAGGTTTAAAACCATGTTCAGTAACCTGATCCATTATCCAAGATA
Y
TCTCTATATTGGAGCAAGTCAGATCCTGTCCCACCATTTATCAGTCGGGAATGGAAGGGACATAAGGAGAAACACAGAGAAGCCCTCCGGCAGCTCACCA
Celera SNP ID: hCV134278
公開SNP ID: rs9848716
SNP染色体部位: 120908997
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 14434
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,28|C,86)
SNP型: UTR5;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 660):
GATACAGTATAGGCAGATTGTCAGAAGACAAAGAGAATCTTGAGAACAGTGAGAGAGAGGCAACTCATCCTGTACAAGGGAGCCTTAATAAGATTAACAG
Y
TGATTTCGCATCAGAAACCATGGAGGCCTGAAAACAGGAGGCCTGATGCCACTTCACACCTACTAGGATGGATATAATTTTTTTTAATGGAAAATAACAA
Celera SNP ID: hCV1833991
公開SNP ID: rs11926554
SNP染色体部位: 120978246
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 83683
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,73|C,27)
SNP型: 転写因子結合部位;INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 661):
AGCATCATATCATATGAAAATATATAAAGTTGTAAATTAGGCTAACATACTGTTATATAAAATTTATTCTACCCACCTACTTTCACAAACATATCTTTGA
R
ATGATAACATTGAAAAACGGGTAAGCAGCTATGGGCTTTATGTAATTGAAAGATGGCAAGAACCAAAGATGGTAAGCTTAGTTATTATTGTACATGTCTG
Celera SNP ID: hCV1834242
公開SNP ID: rs11712308
SNP染色体部位: 120965957
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 71394
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|A,56)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 662):
ATCACTGGCCCATGCATGCTTGTTTGTTCAGTTGATTTTAGTAGTTAATAAAAATTGATGGGAACCTATCCTCAAAACAGGACCTTAACAGTAATTTATG
Y
ATATCGAGGTGGTTCTTTCCCACCTCATCCCCACGCCCCCATCTCCTTTCACCCATCCTGAATGCTGTGTTCATCATTCTGTCACTTTCTGTTAAGATTT
Celera SNP ID: hCV30699692
公開SNP ID: rs6781992
SNP染色体部位: 120935873
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 41310
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,112|C,8)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 663):
TGGGACCCTGGGTCAGCAGAGCTACAGGGACAGGACACTTACCTAGAGCCATGGGGATGGGGCATTGTAGAGTCAAAGGGGCAGAGCCATGGGAATGATG
Y
TGCCACCCCAGTGGGCTTAGAAAGCAAGACACTAAGCCAAAGAAGACTATACTCAAGAATTAAGATCCAGTGGAATTTGCCTTGCCAGGTCGTGGACTTG
Celera SNP ID: hCV105917
公開SNP ID: rs9289134
SNP染色体部位: 120956409
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 61846
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,84|C,36)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 664):
CAAGAGTCTCACTTCACAGTTTAAGGACTCACATAGACTGAAAGTGAAAGGATGAAAAAAGATACTCAATGCAAATGGAAACCAAAATAGAACAAGTGTA
R
CTAAACTTACATCAGATAAAATAGGTTTTAAGTAAAAAACTATAAAATGAGACCAAAAAGGTCATTGTGTGGTGATAAAGGGGTCGATTCATCAAGAGGC
Celera SNP ID: hCV178227
公開SNP ID: rs13070374
SNP染色体部位: 120961769
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 67206
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,66|A,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 665):
TGAAATAGAAACTAGAAAAATAATAGAAAAGATCAACAAAACTAAAATTCGGTATTTTGAAAAGATAAAATTGACAAACCTTTAACTAGACTACTTAAGG
M
CAAAGAGGGAAGACTTAAGGAAAATCAGAAGTGAAAGAGGAGACATTACAACTGATACCACAGAAATGCAAAAGATAAGACTACTATAAACAATTATATA
Celera SNP ID: hCV178228
公開SNP ID: rs4687882
SNP染色体部位: 120962677
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 68114
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,83|A,35)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 666):
ATATCTACCCCCACCACAATGCTATTTAATACTGTATTAATCGTTCCAACTAATGCAATAAGGAAAGAAAAAAAGCATAAAGATCAGAAAAGAAGAAAAC
W
GTCTTTCTTTGCAGAAAACATAATTATTTACATTGAACATCCTCAGTAATACTAAGGAATAACTACTAGAACTATTTAATAAAGTCACAGTTATATCTCA
Celera SNP ID: hCV192027
公開SNP ID: rs9821892
SNP染色体部位: 120974639
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 80076
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,84|T,36)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 667):
GTGTGTTCATGCAACAGCCATAGAGATGGTGCTATTGAAAGGCAATCTGCCCATCCTGTGTATTGACAAGCATCAGGATTCCAGGAGGATTCTTCCTGAT
K
CAAAGACTGTCAAATAGGAAAAAAGAAAACAGTAAATGAACAAAAACATCAACATGGAGTCCAAGTAATGAATTTATAGAGGAAAATGTATGCTACTCTG
Celera SNP ID: hCV255886
公開SNP ID: rs10511394
SNP染色体部位: 120967291
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 72728
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,85|G,35)
SNP型: MICRORNA;UTR3

コンテクスト (配列番号 668):
ATATTGTCTATAAAATGTAAATTCAAGGACCAAAGCATTTGGCTACCTTATTATTGTGATAAAAGCAAGCCTTAAGGTTGGGGTAGTCATTTTTCTGACA
Y
GCAAATTTAATAAGATTAATAATTTACACAATTTGCATTGAATGCATCTGCCTTTACTTCTGATTATGGTACCTACTCTATGACATCCATAGTGACCTGT
Celera SNP ID: hCV278948
公開SNP ID: rs1464599
SNP染色体部位: 120954163
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 59600
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,81|C,35)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 669):
TTACTTATAATGGCTTGAGTTAAAATGCTCCAACTTTTCTAATTTTTGCTTTTGAAAATAAAACACCTATAGTGACAATAAAAACACACATTTAAAGCCA
W
GTGGTCATAGTGACTGGAGCCATGTAGTGAATTGGGGCTAGACTAGTACGATCAATAGCGATACAAAATCACAATGAACTGTCTGAGGCAGAAAACTTTT
Celera SNP ID: hCV1834237
公開SNP ID: rs9865270
SNP染色体部位: 120968639
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 74076
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,84|T,36)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 670):
ACATATCCAGGAAGCTCAACAAAGCCCAAGCAAAATAAACACGAAGAGATACACCAAGATACAGTATAGGCAGATTGTCAGAAGACAAAGAGAATCTTGA
R
AACAGTGAGAGAGAGGCAACTCATCCTGTACAAGGGAGCCTTAATAAGATTAACAGTTGATTTCGCATCAGAAACCATGGAGGCCTGAAAACAGGAGGCC
Celera SNP ID: hCV1834240
公開SNP ID: rs1581451
SNP染色体部位: 120978189
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 83626
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,48|A,72)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 671):
GGTATTTGCAAGACCCAGGTCAAGAGGATGAATTGAAGCATCATATCATATGAAAATATATAAAGTTGTAAATTAGGCTAACATACTGTTATATAAAATT
K
ATTCTACCCACCTACTTTCACAAACATATCTTTGAGATGATAACATTGAAAAACGGGTAAGCAGCTATGGGCTTTATGTAATTGAAAGATGGCAAGAACC
Celera SNP ID: hCV1834243
公開SNP ID: rs9682652
SNP染色体部位: 120965921
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 71358
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,85|G,35)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 672):
CTAAGGCTCAAAGAGAAGTATAAGACTAGGTCTTTATATTTGTAAGTTACTTACACTCTAGATATCAAACGAAATGTAACTCACATGAAGTGCTTCAATG
Y
TGAATAGGTTGGTACAAACTCAAGTGCGGTAAGTGGTAAATCTGGGCTGATGTAGTCAGAGGAGACTTCCTGGAGGATCTTGGACATGAGCTTTCCAGGT
Celera SNP ID: hCV1834256
公開SNP ID: rs2472662
SNP染色体部位: 120952129
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 57566
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,64|T,54)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 673):
AAATTCAGCTCTGGTCTTCCCGAGTGTAAAGCCTTAGCCAGATTATTTGTGTTGCTGGAGCAGGCACACTTCACTTAAAAAATGGACTGATATAAAGCCC
Y
AGTTAATTTTTTTTCCCAGATAGCTATAACTCATAAGAGATTCAGATATGATGAGTAAATCATCTGGATGAACAACTTGTGTTTAGCACTGTTCTTTACT
Celera SNP ID: hCV1834260
公開SNP ID: rs4688033
SNP染色体部位: 120941541
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 46978
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,85|T,35)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 674):
GTTGTGACACATCGAGATACATTTTCATCTGTGGGGGAGCCTACAGTCAGCTTTATTCATGGGCAACATCATGTCTCAATAAATGGAAAATAAAGCACCA
R
TGTGGTCTGGGATATTTCTACATTCAATTTAAACTTGCAAAATCTGAACATTGGTTGACATCTACTAACTTGCACCATCATATCAAAAAAGACACTCTAC
Celera SNP ID: hCV8830526
公開SNP ID: rs940181
SNP染色体部位: 120895761
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 1198
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 675):
GCCTTGGCACTAGTCCTAGCTCTTACCCACCCCCCACCCCGACCCAAGACACTGGGTTCACAGTCAGGATGCCTTGCGTGCTAGCTAGAGCTGATGGGGC
M
TTTCCTAGTTAAAAGACAAATTATGGAATTCTTCCATTAAGAGATGAGTATATAACAATATACATAAATAACAATATGCTGAGGTACTTGTGGTTGGGTT
Celera SNP ID: hCV30699687
公開SNP ID: rs11711386
SNP染色体部位: 120928425
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 33862
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,66|C,54)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 676):
GCCGAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAAGAGCAAGACTTCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAGTGCTTGGCATAATAAAAATGCTTAAGTA
R
TGTTAGGTTTTATTATTATTATAATTCATAGACACATAAATTTGTATATAAAATGTTAAGATTGAATAGAAAACCACAAATTCCTTTTTGTGTTTACTTG
Celera SNP ID: hCV29841665
公開SNP ID: rs7623217
SNP染色体部位: 120925751
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 31188
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,56|G,62)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 677):
TGTAACTATAAGGTGTTTTATATATTCCTCATGGTAAGTACAAAACAAAAAACCTATATTAAATACACAAAAGGTGAAGAGTAAGAAATCAAGGCATGGC
R
CTAGAGAAAGTCACCTAATTACAAAGGAATACAGCAAGAGAGGAAGAAAGGAATAAGGACCTACAAAACAACCATAAAACAATGAACCAGATGATAGTAG
Celera SNP ID: hCV30562884
公開SNP ID: rs9815093
SNP染色体部位: 120961453
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 413
SNP部位ゲノム: 66890
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,84|A,36)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 11
遺伝子記号: C6orf167 - 253714
遺伝子名: 染色体 6 オープンリ−ディングフレーム167
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 414):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 678):
TAATTGTAATTAATCTGGACAATTATACTAATAAATGACAAATACCTCAAAGAATCGAACAAGTGCTTTTTTAGGGTCTTCTGAGATGGATAAATATTCA
R
CTTGGGCCTTTGAGAAAATACTCTTTACTTCTGAGAGATTAAATAGTAATCTTGTCAGTTTGACCAACTGTTTCATGTACTCTTTTTCTGTTAAAATAAA
Celera SNP ID: hCV7574127
公開SNP ID: rs1737145
SNP染色体部位: 97733095
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 414
SNP部位ゲノム: 41963
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,59|G,61)
SNP型: ミスセンス変異;ESE

遺伝子番号: 12
遺伝子記号: C7orf46 - 340277
遺伝子名: 染色体 7 オープンリ−ディングフレーム46
染色体: 7
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 415):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 679):
TAATTTTTGATAATACCTGTATTGTGTTTATATTTCTCTCTCTTTCTCCTTTTTTAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAAGCGATTCCTCAGCAG
Y
GCCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCGCTGCAGGTGCAAACA
Celera SNP ID: hCV25959466
公開SNP ID: rs35495590
SNP染色体部位: 23695456
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 415
SNP部位ゲノム: 19109
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,1|T,37) アフリカ系アメリカ人 (C,6|T,32) 全体 (C,7|T,69)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;偽遺伝子
SNP供給源: Applera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 680):
ATATAATAGAAATTGTAATTTTTGATAATACCTGTATTGTGTTTATATTTCTCTCTCTTTCTCCTTTTTTAGGTATAAACAACATAAAACTGACTTGGAA
R
CGATTCCTCAGCAGTGCCCCATTGATCTGCCCTGCCAAGTGACTGGCTGCCAGTGCAGGGCTTACCTTTATGTCCCCTTGAATGGTAGCCAGCCCATTCG
Celera SNP ID: hCV25959498
公開SNP ID: rs34518648
SNP染色体部位: 23695441
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 415
SNP部位ゲノム: 19094
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,32) 全体 (A,7|G,69)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3;ESE SYNONYMOU
S;偽遺伝子
SNP供給源: Applera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3;ESE SYNONYMOU
S;偽遺伝子

遺伝子番号: 13
遺伝子記号: CASP5 - 838
遺伝子名: カスパーゼ 5, アポトーシス関連システインペプチダーゼ
染色体: 11
OMIM番号: 602665
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 416):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 681):
TTTTGGTCCATATTGAGAAGTGTTTGGGTAAACATTTGATGAGCCACGCGATTCTTTCGCAAAGAGTCTACCAAGATCAGGGCCTTGTCTTCAATTTTGG
Y
ATCATAATATTTTTTCTTTTCCTCTTCCTTCAATGTCAGAACATCGTGTTTTGCCAAATAATTAAAAACACCATGAAGAACATCTTTGCCCAGGTATTCC
Celera SNP ID: hCV12092542
公開SNP ID: rs507879
SNP染色体部位: 104383137
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 416
SNP部位ゲノム: 22957
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,3|T,5) アフリカ系アメリカ人 (C,4|T,4) 全体 (C,7|T,9)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;転写因子結合部位;UTR5;CODING RE
GION
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,65|C,53)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;転写因子結合部位;UTR5;CODING RE
GION

遺伝子番号: 14
遺伝子記号: CCDC8 - 83987
遺伝子名: コイルドコイルドメイン含有8
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 417):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 682):
CTCTGGTCATGTACGGCCTCTTCCCTTTGATTATCTGTAACCTCTGACCCCTGGTCAGCTGGGGCCTCCGCCCTCTGATTATCTGCAGCCTCTTCCCTGT
R
GTTATCTGTGCCCTGTGACCTCTGGTCAGCTGGGGCCTCTGCCCTCTGATTATCTGCAGCCTCTTCCCTCTGGTTATCTGCAGCCTCTGCCCCCTCCTCA
Celera SNP ID: hCV1937195
公開SNP ID: rs34186470
SNP染色体部位: 51606761
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 417
SNP部位ゲノム: 10836
SNP供給源: Celera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異

遺伝子番号: 15
遺伝子記号: CDSN - 1041
遺伝子名: corneodesmosin
染色体: 6
OMIM番号: 602593
OMIM情報: 頭皮の先天性貧毛症, 146520 (3)

ゲノム配列 (配列番号 418):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 683):
CCACTGGATTGGGAACTGGAGCTGCTGCTGAAGGAGCCGGTGCCTGGTGGGGAGCAGGGGCTCTGGGAAGCACTGCCGCAGGGATGGTAGGGTAAACCGG
M
GCTGCTGGAAATGCTAGAACTGCTGGGGACTCGAGAACTGGAGGGAGAGCAGGGTCCCTTGGAGCCCGTGGAGCCGCCTCCACAGAGCTGGACCCCACCA
Celera SNP ID: hCV8941510
公開SNP ID: rs1042127
SNP染色体部位: 31192149
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 418
SNP部位ゲノム: 11300
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,32|C,6) アフリカ系アメリカ人 (A,33|C,3) 全体 (A,65|C,9)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;転写因子結合部位;UTR5;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,102|C,18)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;転写因子結合部位;UTR5;イントロン

遺伝子番号: 16
遺伝子記号: CFHR5 - 81494
遺伝子名: 補体因子Ｈ関連 5
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 419):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 684):
AGCTTCCCCTTAGTACATTGAAATTCAAAGTCATGCTTGTAACTGTTAATGAAAGCAGATTTAAAGCAACACCACCATCACTGGAGTATTTTTAGTTATA
Y
ACGATTGAGACTACCAAGCATGTTGCTCTTATTCAGTGTAATCCTAATCTCATGGGTATCCACTGTTGGGGGAGAAGGTAAGTTGAAAACAGATCCGAAT
Celera SNP ID: hCV9114656
公開SNP ID: rs9427662
SNP染色体部位: 195213398
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 419
SNP部位ゲノム: 10071
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,4|T,34) アフリカ系アメリカ人 (C,10|T,28) 全体 (C,14|T,62)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,109|C,9)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5

遺伝子番号: 17
遺伝子記号: CTSB - 1508
遺伝子名: カテプシン B
染色体: 8
OMIM番号: 116810
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 420):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 685):
AAGAACTGCTATAACATGTTTCTAAACCAGGGCTATGCAAAGCACTAGAGTTCCTGACCAGCAATGCAAACCAGTGGCATACAAATTCAAAATACTGTAT
M
CAGGCCCTGACTCCAGCCCAAACCAAGGCTGGAGGGCATCCAGGGGGATGTGGTTCCCCACGGGGTAGCATCTTGGTTATGTGAGATCACCAAGACACCA
Celera SNP ID: hCV2716314
公開SNP ID: rs8005
SNP染色体部位: 11738505
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 420
SNP部位ゲノム: 11063
SNP供給源: Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|C,-)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン;偽遺伝子

遺伝子番号: 18
遺伝子記号: CUEDC1 - 404093
遺伝子名: CUEドメイン含有1
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 421):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 686):
GGCGGCCCCTGTTACCTGTATGCTGTCCAGCTGCTGGGGCAGGATGCGGAGAAAGTCATCCGGAAGGTTGCCCAGCAGTGGTGGGTTCCAGTTCCGATAG
Y
GTCTCTGGCTTGTAGGGGCTCCAGAGCCCAGCGCGTCGATACTAGGGGATGGCAGGTGACAGGGAAGAGGAAGTCATTAAGCCCAACCCCAGGTCTCCTG
Celera SNP ID: hCV25615302
公開SNP ID: rs17762338
SNP染色体部位: 53306036
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 421
SNP部位ゲノム: 20700
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,33|T,7) アフリカ系アメリカ人 (C,38|T,0) 全体 (C,71|T,7)
SNP型: ミスセンス変異;ESE
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,100|T,16)
SNP型: ミスセンス変異;ESE

遺伝子番号: 19
遺伝子記号: CYP17A1 - 1586
遺伝子名: シトクロム P450,ファミリー 17, サブファミリーA,
ポリペプチド 1
染色体: 10
OMIM番号: 202110
OMIM情報: 17-α-ヒドロキシラーゼ/17,20-リアーゼ 欠損, 202110 (3); 17,20-リアーゼ/欠損, 単離, 202110 (3)

ゲノム配列 (配列番号 422):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 687):
GGCACCTTCTCTTGGGCCAAAACAAATAAGCTAGGGTAAGCAGCAAGAGAGCCACGAGCTCCCACATGGTGGCTGGGTGCCGGCAGGCAAGATAGACAGC
R
GTGGAGTAGAAGAGCTGTGGCAACTCTAGGGCACAAGGAGGCCTTTTAAAGGGCTACCCTGATCTTCACCTTGACTTTGTGTTATCTCTTGCCTTGTGGA
Celera SNP ID: hCV2852784
公開SNP ID: rs743572
SNP染色体部位: 104587142
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 422
SNP部位ゲノム: 16864
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,70|G,46)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 688):
TTTGAGGCCGCCCAGAGAAGTCCTTGCCCTTCTTAATAAGCACCTCCTTGGCCAGCTGGTGGTGGCCGACAATCACTGTAGTCTTGGTGCCCATACGAAC
M
GAATAGATGGGGCCATATTTTTTCTGCAGCTTGAAGAAGTTGTTATGCATATGGCCGTGTCTGGGGAGGAATGGCAGGCTGCCCACCAGGGGCAGGGACA
Celera SNP ID: hCV12119916
公開SNP ID: rs6163
SNP染色体部位: 104586914
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 422
SNP部位ゲノム: 16636
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,73|A,47)
SNP型: UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 689):
GGTGGTGGCCGACAATCACTGTAGTCTTGGTGCCCATACGAACCGAATAGATGGGGCCATATTTTTTCTGCAGCTTGAAGAAGTTGTTATGCATATGGCC
R
TGTCTGGGGAGGAATGGCAGGCTGCCCACCAGGGGCAGGGACAGGAGGCTCTTGGGGTACTTGGCACCAGGGCACCTTCTCTTGGGCCAAAACAAATAAG
Celera SNP ID: hCV12119917
公開SNP ID: rs6162
SNP染色体部位: 104586971
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 422
SNP部位ゲノム: 16693
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,71|A,49)
SNP型: UTR5;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 690):
GCTTCCAGAAGATGGGGCAGCTCTACTCTGGGGTCAAAGCCAACTACTGCTTGGGTAAGGAGCAGGGCAGGCCTAGTCTTCCTGCACAGAAAGCCTGAGA
S
AATTGGCTCTCCCTTTCTCTGGAGCCCAGAGATTGGGCTGGCTGGGGTCTAGGATCAATGAGGGGGAAGCACACCTGAGGATTGTGCAGCAGGAAGGCCA
Celera SNP ID: hCV25761532
公開SNP ID: rs3740397
SNP染色体部位: 104582665
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 422
SNP部位ゲノム: 12387
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,73|G,47)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 691):
GGGCTGGGCGCAGTGGCCCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAATGCAGGTGGATCACATGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACTGACA
Y
GCCAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCTGGTCATGGTGGCGTGCATCTGCAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCT
Celera SNP ID: hCV3284571
公開SNP ID: rs7097872
SNP染色体部位: 104596626
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 422
SNP部位ゲノム: 26348
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,69|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 692):
TGTAGAAAACTGCCCCTGTGAGCCTGAGTAGCTGGAAATAGCACCAGGAAAGCAGCAATCCCAGCCTGCAATAGCTAGGCTAATTCTCCCCAGCAGCTTT
Y
ATGGAGGACAGTAGTCACTGCCCCCATTTTCCATGAAAAGTAACATGAATCCTGGCTGTATAAGGGGCACTTACTGTGCTGGGTGCTAGGCTAAGTGCTG
Celera SNP ID: hCV3284577
公開SNP ID: rs10786712
SNP染色体部位: 104586386
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 422
SNP部位ゲノム: 16108
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,73|T,47)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 693):
GACAGACCCTAAGGCCTCCTACTCCCAATTCCTTCAGAAATACAGTAGATCAAGGAGAAAGAAAGAACCCTTAATTAGAATGCAGCAGCATTGGGGTTCT
K
TTCGCTGACAGGGTGCCCTCTGGGCTTCTTTTTGCTCATCAGTTTCTGACCACAGGAAGGCAACTCTGGATGGGATAAACTCTCTAAACTATGCCTGTCC
Celera SNP ID: hCV11201601
公開SNP ID: rs3781287
SNP染色体部位: 104585410
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 422
SNP部位ゲノム: 15132
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,71|G,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 694):
CGATCCCATAGTTCCACGTCTAATGTTCCCTTTTCAGGAAACAAAGGACAATGTTCTTCCACTGCCCTGAATAGGGTGACCATATTTTCCATGGGTACCC
R
AACTCCCCCCTGTTTTAACAGGAGTTTAATATGGCAGAGATAAGCATAATGTTTAGACTCTGAGTGACCCAAAGTTAGCCTGGACAATACACAGACAACT
Celera SNP ID: hCV27433651
公開SNP ID: rs10883785
SNP染色体部位: 104593578
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 422
SNP部位ゲノム: 23300
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,73|G,47)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 20
遺伝子記号: DEGS1 - 8560
遺伝子名: 変性精母細胞 ホモログ 1, 脂質デサチュラーゼ (Drosophila)
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 423):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 695):
TACATGTTCTTAAAGGGTCATGAAACTTACTCATATTATGGGCCTCTGAATTTACTTACCTTCAATGTGGGTTATCATAATGAACATCATGATTTCCCCA
R
CATTCCTGGAAAAAGTCTTCCACTGGTAAGTAAAGGATTTGATACATATTCTAATTTTGTTTTTTCATTTGTTTGTTTTTTGAGACGGTGTCTCACTCAG
Celera SNP ID: hCV25649928
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 222444619
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 423
SNP部位ゲノム: 17068
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,35|G,1) アフリカ系アメリカ人 (A,36|G,0) 全体 (A,71|G,1)
SNP型: ミスセンス変異;TFBS SYNONYMOUS;イントロン

遺伝子番号: 21
遺伝子記号: DHX38 - 9785
遺伝子名: DEAH (Asp-Glu-Ala-His) ボックスポリペプチド 38
染色体: 16
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 424):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 696):
TTTCAGACATTATCGGTCTGCTCGGGTAGAGACTCCATCCCATCCGGGTGGTGTGAGCGAAGAGTTTTGGGAACGCAGTCGGCAGAGAGAGCGGGAGCGG
M
GGGAACATGGTGTCTATGCCTCGTCCAAAGAAGAAAAGGATTGGAAGAAGGAGAAATCGCGGGATCGAGACTATGACCGCAAGAGGGACAGAGGTAAACT
Celera SNP ID: hCV9860072
公開SNP ID: rs1050362
SNP染色体部位: 70688316
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 424
SNP部位ゲノム: 13200
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,14|C,26) アフリカ系アメリカ人 (A,19|C,13) 全体 (A,33|C,39)
SNP型: サイレント変異;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,77|A,35)
SNP型: サイレント変異;イントロン

遺伝子番号: 22
遺伝子記号: DUSP11 - 8446
遺伝子名: 二重特異的ホスファターゼ 11 (RNA/RNP 複合体 1-相互作用)
染色体: 2
OMIM番号: 603092
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 425):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 697):
TGAGGAGCGTCCTGAAAAGTCGCGTCTCCGGCCCCAGCCACTGCGGGGATGATGCCACTGGCTCATGTGGGTCCCAAGAAGCCGCCCACCCAATGCCAAG
Y
CGGCCAAAAGCGCCAGTCCGGCGCCCTCAATGCCAGGATAAGACCCTAAACAGGAAAAGACTCGGCAGCCACCTACGCCGCGCTCCAGCGTCTCGCTATT
Celera SNP ID: hCV25473516
公開SNP ID: rs2272051
SNP染色体部位: 73860644
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 425
SNP部位ゲノム: 53259
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,13|T,9) アフリカ系アメリカ人 (C,3|T,5) 全体 (C,16|T,14)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,23|T,17) アフリカ系アメリカ人 (C,20|T,18) 全体 (C,43|T,35)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,36|C,82)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5

コンテクスト (配列番号 698):
ATGGGCTTAAAGAATGTGAACGATGTGCTCACAGAGGCCACAGAAGAGAAATTATAGCCAGGAGAACAACCTGAAAGACAAAGGACACGGTGGCATAAGC
R
CATGTAACACAATGTACTCAGGAAATGGCTGGCATCCTGAGATATGGAGTGGAATACAGTACAGGGCTTTGTAAACTCAGCTTGGAGTCAGATCACAGAA
Celera SNP ID: hCV505733
公開SNP ID: rs11126416
SNP染色体部位: 73827385
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 425
SNP部位ゲノム: 20000
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|G,82)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 23
遺伝子記号: EPS8L3 - 79574
遺伝子名: EPS8様3
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 426):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 699):
GATGGTTGAGTCCAGACAGCAGAGGATTACTGGGGAGGAAGGGGAAGAGGAGAGGCCTGGTGAACTTGTGGGGAGCCACCTACCAGGAGGTTGAAGCTGT
R
CTTGATCTTCTGGAAGCAGTCAATGTACTGTGCCTGGGTGAGACCTGGGAGAAGGGGCCAAGACGGTGGGCCAGAGATCACCCTGAGACACCCCTACTCC
Celera SNP ID: hCV2017876
公開SNP ID: rs3818562
SNP染色体部位: 110101964
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 426
SNP部位ゲノム: 17739
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,52|A,68)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 24
遺伝子記号: F11 - 2160
遺伝子名: 凝固因子 XI (血漿トロンボプラスチン前駆物質)
染色体: 4
OMIM番号: 264900
OMIM情報: 第XI因子 欠損, 常染色体劣性 (3); 第XI因子 欠損,/
常染色体優性 (3)

ゲノム配列 (配列番号 427):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 700):
CTGCTTCCCTGTGGGTTCCGGCTTCTGCAGAGCTGTAAGAGTTGAATGCCACACACAGTCACACTAAGGAATGCTCCAGGATTGGGAAAGAAAATTCAAC
M
TTATAATGAGAACACTGTGAATGCTATTGAATTAACTACTCCCCTCTCTCCCTATTTCTTGTAAGTCTTAGTGTCAGTAAACTAATTATAAATTTACATT
Celera SNP ID: hCV25474413
公開SNP ID: rs3822057
SNP染色体部位: 187425146
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 10874
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,16|C,14) アフリカ系アメリカ人 (A,7|C,11) 全体 (A,23|C,25)
SNP型: イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,16|C,18) アフリカ系アメリカ人 (A,12|C,20) 全体 (A,28|C,38)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,57|C,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 701):
AGGATCTGAACACAGAGAGCGGCGGGGCCGGCGGGGAAGGAGGGAGGAGGGGAGAGCGCTGCTTCCCTGTGGGTTCCGGCTTCTGCAGAGCTGTAAGAGT
K
GAATGCCACACACAGTCACACTAAGGAATGCTCCAGGATTGGGAAAGAAAATTCAACATTATAATGAGAACACTGTGAATGCTATTGAATTAACTACTCC
Celera SNP ID: hCV25474414
公開SNP ID: rs4253399
SNP染色体部位: 187425088
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 10816
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,12|T,18) アフリカ系アメリカ人 (G,1|T,15) 全体 (G,13|T,33)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,16|T,14) アフリカ系アメリカ人 (G,1|T,25) 全体 (G,17|T,39)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,7|T,19) アフリカ系アメリカ人 (G,0|T,14) 全体 (G,7|T,33)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,71|G,47)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 702):
AACCCATCTCTACAAAAAAATATGAAAGTATCTGTGTGTGTGTGTTGCTGTGTAGTGGACTACAGAACTTTAGAGGCAGTCACTTATTTGAATCCCATTG
Y
CGTAACTTTCTACTATTTTATTTTTCCACTGTGACTCAGGGAGATTCAGGTGGTCCCTTAGTTTGCAAACACAATGGAATGTGGCGTTTGGTGGGCATCA
Celera SNP ID: hCV25634754
公開SNP ID: rs4253331
SNP染色体部位: 187416129
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 1857
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,5|T,35) アフリカ系アメリカ人 (C,0|T,24) 全体 (C,5|T,59)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,110|C,10)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 703):
CTCACAGGTGAAATCCAAAATATTCTACAAAAGGTAAATATTCCTTTGGTAACAAATGAAGAATGCCAGAAAAGATATCAAGATTATAAAATAACCCAAC
R
GATGGTCTGTGCTGGCTATAAAGAAGGGGGAAAAGATGCTTGTAAGGTAACTCATGAGATTATGAAAAACACAATAGGCTGCTTGAGAAAATTCATTTCA
Celera SNP ID: hCV3230016
公開SNP ID: rs4253325
SNP染色体部位: 187415467
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 1195
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,2|G,38) アフリカ系アメリカ人 (A,3|G,31) 全体 (A,5|G,69)
SNP型: ミスセンス変異;ESE
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,107|A,13)
SNP型: ミスセンス変異;ESE

コンテクスト (配列番号 704):
AGGGATGAAGGATTGAAGGTTAGAACAATTAAGCAACTTGTGCAGGATCAAAGTGAGTTGGATGAGGAGTTAGCGGTGAGGGTGAGGCTTGTCTCTCTCT
Y
GCCCTCTCATCCTGGCACATGTGCGATATCGTGCTGAACCTGAGGGAGGAAAATACACGACAACAAGGCAAAAAATGAATATAGTAAACAAAGAAAACAC
Celera SNP ID: hCV3230038
公開SNP ID: rs2289252
SNP染色体部位: 187444375
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 30103
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,18|T,12) アフリカ系アメリカ人 (C,19|T,5) 全体 (C,37|T,17)
SNP型: UTR3;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,72|T,44)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 705):
TAAAATTTACTATTCCAGAACCTAGAGCAGGGATTGGCAAATGTCTTCTTAATAACGCAGAGTAAATATGTTAGGCTTTGTGGGCAAAACCCACAGTAAA
R
CCAAGGATATTATTTAAGTATTTATGTCACCACTTAAAATGTAACAATTTGAAAATATAAAAATCATTTTGTATAGCTAACAGGCTAAACAGAAACACAC
Celera SNP ID: hCV3230030
公開SNP ID: rs4253408
SNP染色体部位: 187430852
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 16580
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,111|A,9)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 706):
TGTTTGAGCATTCAGTCTCTTTGTTTTTGATCACGCTTCTATGGAGTCCAAGAATTACCATAAGGCAATATTTCTGAAGATTACTATATAGGCAGATATA
S
CAGAAAATAACCAAGTAGTGGCAGTGGGGATCAGGCAGAAGAACTGGTAAAAGAAGCCACCATAAATAGATTTGTTCGATGAAAGATGAAAACTGGAAGA
Celera SNP ID: hCV3230119
公開SNP ID: rs4253430
SNP染色体部位: 187447058
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 32786
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,76|C,44)
SNP型: MICRORNA;UTR3

コンテクスト (配列番号 707):
ACTCCACCATGCCCAGCTAATTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCGGCTTCCGGTGTTGTTTCAGCATA
Y
GGCTAAATTAAAGGCTTAGATTCTCAGTTTGCTCATTCTAATTTAGCTGAATTCTGAGTATTATGCATTTGTATCTGAGGTTCCAGGCCTCTCCCTCCTC
Celera SNP ID: hCV3230131
公開SNP ID: rs13136269
SNP染色体部位: 187454002
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 39730
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,83|C,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 708):
TGCTGACAGCAATGGCAGGCTGCCATCCTTGGAGTGAGGACCTGTGCTTCTACTTCCTGCTTCCTCTGAACCCCAGCAGCTGCCAGCACAGCGTCTAGGA
R
TAGTGGCTGTGGACATAATTAGGAGTTTCTTGAGCAGCCTAGTTAACAGCCCCACAGAGGGCATGATCATATAAGAACGTCACTCATGTCATTATCATTT
Celera SNP ID: hCV3230136
公開SNP ID: rs13116273
SNP染色体部位: 187454880
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 40608
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,83|A,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 709):
TATTTAACATTCCTCTCAAGCAAATACGCCTTGAAATGCTTTTTTTAAATCATAGGAATTTAAAAACACTTTACAATAGAGAATGATTGATTTTTAAAAT
R
TGTCTGATTTAGCTTTGTAGAGATGTTCCGCTAATATCCATAACTAATCTGAGAGGAAATGTGGAACAACAGAAGAGTAACAGTGTCTACTCAGTAACAA
Celera SNP ID: hCV8241630
公開SNP ID: rs925451
SNP染色体部位: 187424563
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 10291
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,69|A,35)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 710):
AGGGTTTGGATAAAGAGACGCAATTAGGAAAGGAAAAAGCAGAAGGCTCGTTCCAGACCTGGATGAGATCCTAAAAAGCAGCAGCTTTTGCCAGTAAAGA
Y
CCTTGAAATGATTCAATTACCCTCAAAGCACTCCTTGTCTCCAAGACAATCACTCATAAGCACAATTCCATTGAAGCCAACGTACCATTTTGTGATTTTC
Celera SNP ID: hCV12066124
公開SNP ID: rs2036914
SNP染色体部位: 187429475
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 15203
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 711):
GCAATTTTTACAACCTGAGTTCAAGTCAAATTCTGAGCCTGGGGGGTCCTCATCTGCAAAGCATGGAGAGTGGCATCTTCTTTGCATCCTAAGGACGAAA
R
ACACAGTGCACTCAGAGCTGCTGAGGACAATGTCTGGCTGAAGCCCGCTTTCAGCACGCCGTAACCAGGGGCTGACAATGCGAGGTCGCAACTGAGATCT
Celera SNP ID: hCV15793897
公開SNP ID: rs3087505
SNP染色体部位: 187416480
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 2208
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,12|G,108)
SNP型: MICRORNA;UTR3

コンテクスト (配列番号 712):
TACTAGGAAGACTGACAATAGAGCAAGCTCAGAAAATTTTTATGGAGGTGATTTAGTTAGAAAATTTGTCTGCAACCTAAGGGCCATGGAGTGTGACTCC
R
TGGTTTATGGGTGTAACTCCGTGGTTTATGAAGAGTACTTTCAAAATAGGAAAATCTTCACAACTAAGTGCTAGCATGAGCTGACTTTACTTTCTCTAGG
Celera SNP ID: hCV16172935
公開SNP ID: rs2241817
SNP染色体部位: 187437995
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 23723
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,76|G,44)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 713):
CAAGACGGAAATTAGAACAGAGGTTGCCAGGGGCCGAGGGGCCAGGGGAAGGGCTGAGGGTTGGTGTTTAATGGGCACAGAGCATCAGCTGGCGAAGTTG
R
AAAGTTCTGGAGGTGGATGGTGCTGATGGTTGCACAGCAATGTAAATACCCTTAGTGCCACAGAACTGTACACTCAAGATGGCTACATGGCACATGGTAT
Celera SNP ID: hCV26038139
公開SNP ID: rs4253405
SNP染色体部位: 187427804
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 13532
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,76|G,42)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 714):
CATTGGATTCCTTACTTAGGTCACTTTCAGCGTTGGCCAAACAAAAAGGCTCCAGCTGGGGGTATATATATTCCAGGGAAGTTAAGTTGGCCAAACTTTC
M
GTTTGCTACTTCAGTATCCTCCGAGTTGTTTCCAGACACAGTTTTGTGTGCTTTTTAGTTTTGGTTTTCTTTTTTAATCAATCTGCAGCACACTCATGTT
Celera SNP ID: hCV27474895
公開SNP ID: rs3756011
SNP染色体部位: 187443243
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 28971
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,45|C,75)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 715):
TTAGAGCCTTTCTGTTTCTCTCAATAGGGTTGGAGAGTTATCCTTATCTTCTTTTTATTGGGGCTTAAGAAGAGAGATGAGGTTCCATGGAGTAAACAAT
W
CAAGGATATAAGGACCTCATATAATCTCACGTATCCATTTTCCATGAAAGCCATTCTTGGCACGAATTTGCCATTCTATGTTTGAGCCTCATAAAAGGCA
Celera SNP ID: hCV27477533
公開SNP ID: rs3756008
SNP染色体部位: 187422379
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 8107
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,71|T,47)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 716):
AGCAACAGAGCAAGACCCTATCTCTAAGTAAATAAATAAAATACAGAACGAGTTCGGTATGCATCCTCACATTGGATTCCTTACTTAGGTCACTTTCAGC
R
TTGGCCAAACAAAAAGGCTCCAGCTGGGGGTATATATATTCCAGGGAAGTTAAGTTGGCCAAACTTTCCGTTTGCTACTTCAGTATCCTCCGAGTTGTTT
Celera SNP ID: hCV27490984
公開SNP ID: rs3822058
SNP染色体部位: 187443174
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 28902
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,76|A,44)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 717):
TGCTAACAGGCCATGGACCAGGTACTGTTCTGGGCCCCGGGGGTTGGGAACCCCTGCTCAGAGACACACCGGGTGGTAGGAGGAGCTAAAGGTGGAGAGG
S
TGAAGGAAAATATGAGGTCTGGGCTATCCACAAACCAGATAGCAGGAAACTGAAGAGTTAAACATTTACTTCAGAATTGAATGGCTTTTGTAAAATCTGG
Celera SNP ID: hCV28960679
公開SNP ID: rs6844764
SNP染色体部位: 187418527
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 4255
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,61|C,53)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 718):
AAAAGTTGTCCTCCAGACAACTCAGCCAAGGGAGGCCCTGTGTGCCTTGCCTATCACATGAGCCTCACTTTCCACTGAGTGAGGCTGTCATTTCAGAAGC
R
CCGGGTCTGTCACATGAAAATATATCTGTTACCATCACTTACTAAACAAATTTAGTAGAATTTGTTTGGTGCTTATTATGTATCAGGCATTGTTCTGAAG
Celera SNP ID: hCV30562347
公開SNP ID: rs4253418
SNP染色体部位: 187436491
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 22219
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|G,112)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 719):
GACTCGTCAGCCAGTGAGTAGGTCTGGGTAGCAGTTGGCATGGATGAACATGCCCTCCATAGGCTTTCAGACCTTCTTCAAGGCCAAAGGGAAGGCCTTC
R
TGGAAATATAATTATGTGAAACACCCCAGAATTTTTTCACAAACTTTCCTGCCTATAAACGCCAGGTCCTACCACTGTCCAGTGTCCCACTTCCCACTGT
Celera SNP ID: hCV3230025
公開SNP ID: rs3756009
SNP染色体部位: 187423105
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 8833
関連した照会SNP: hCV25474414 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27477533 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,60|G,40)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 720):
AACGCTCACCCCACTCCCATCCTCCCATCTAGTGGCATATTGAAAATCAATTTGTCTTGTAAAATTAAATAATCCAATTAGGAGGGGGATATATTCTAAG
R
AAATTAGTGCATGATGCACACACACACACACACACAGAACACGTGTGTGCGCATGTGCACATGAGAGAGAGTGAGAGAGAAACTGGGTCTTGCTCTGTCG
Celera SNP ID: hCV2103343
公開SNP ID: rs4241824
SNP染色体部位: 187428781
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 14509
関連した照会SNP: hCV12066124 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,56|A,64)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 721):
ATTTCTTTGATTATCAAAAGTACACTAGCTAAGGTTGCTGTCCCTCTTTTATTTATTTATTTATTTGAGACAGGGTCTTGCTCTGTCACTCAGATTTGGT
Y
GCACTGGGTGTGATCTCAGCCCACTGCAGCCTCCACTTCCTAGGCTCAAGCAATCCACCCGTCTCATCCTCCCAAGTTGCTGGGACCACAGGTGTGCACC
Celera SNP ID: hCV32291269
公開SNP ID: rs4253417
SNP染色体部位: 187435999
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 427
SNP部位ゲノム: 21727
関連した照会SNP: hCV27474895 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,73|C,47)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 25
遺伝子記号: F13B - 2165
遺伝子名: 凝固因子 XIII, B ポリペプチド
染色体: 1
OMIM番号: 134580
OMIM情報: 第 XIIIB因子 欠損 (3)

ゲノム配列 (配列番号 428):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 722):
TAAATAATTTTTTTTCCCATAGAAAAATGCACTAAGCCTGACCTGAGTAATGGTTACATCTCTGATGTAAAGTTATTGTATAAAATTCAAGAGAACATGC
R
TTATGGTTGCGCTTCAGGGTACAAAACCACTGGAGGGAAGGATGAAGAAGTGGTTCAATGTCTCTCTGATGGATGGTCTTCTCAACCAACCTGTAGGAAA
Celera SNP ID: hCV2532034
公開SNP ID: rs6003
SNP染色体部位: 195297644
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 428
SNP部位ゲノム: 32700
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,2|A,32) アフリカ系アメリカ人 (G,13|A,23) 全体 (G,15|A,55)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,5|A,35) アフリカ系アメリカ人 (G,14|A,18) 全体 (G,19|A,53)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,9|A,111)
SNP型: ミスセンス変異

遺伝子番号: 26
遺伝子記号: F2 - 2147
遺伝子名: 凝固因子 II (トロンビン)
染色体: 11
OMIM番号: 176930
OMIM情報: 低プロトロンビン血症 (3); プロトロンビン異常症 (3);/高プロトロンビン血症
(3)

ゲノム配列 (配列番号 429):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 723):
GTAGGGGGCCACTCATATTCTGGGCTCCTGGAACCAATCCCGTGAAAGAATTATTTTTGTGTTTCTAAAACTATGGTTCCCAATAAAAGTGACTCTCAGC
R
AGCCTCAATGCTCCCAGTGCTATTCATGGGCAGCTCTCTGGGCTCAGGAAGAGCCAGTAATACTACTGGATAAAGAAGACTTAAGAATCCACCACCTGGT
Celera SNP ID: hCV8726802
公開SNP ID: rs1799963
SNP染色体部位: 46717631
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 429
SNP部位ゲノム: 30300
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: UTR3;偽遺伝子

遺伝子番号: 27
遺伝子記号: F5 - 2153
遺伝子名: 凝固因子 V (プロアクセレリン, 不安定因子)
染色体: 1
OMIM番号: 227400
OMIM情報: 第V因子欠損に起因する出血性素因 (3);/{第V因子Leidenに起因する血栓塞栓症感受性} (3); {第V因子Liverpoolに起因する血栓性素因} (3)

ゲノム配列 (配列番号 430):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 724):
AGTGTCTTGGCTTAGGTGTCTCCCAACTTTATGTGCTAGTAATTTCATCCAGGAGAACCTGTGCTTTGCTGCTTGATCTCTTTCTACCTTGGGTCCCTTA
Y
GCTTAGCATGTTCTTGACTTTTGAATTCTCCAGCACCAAGTGAAAGTAGACGTATCCCTGTGACATCTGGCTGTAGAGGATCCTCTATAGGGTCTTCAGA
Celera SNP ID: hCV8919442
公開SNP ID: rs4525
SNP染色体部位: 167778358
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 430
SNP部位ゲノム: 38325
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,3|T,25) アフリカ系アメリカ人 (C,1|T,19) 全体 (C,4|T,44)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,87|C,31)
SNP型: ミスセンス変異

コンテクスト (配列番号 725):
AAGAATAATTTGAACCAACAATTATATCTGTGTTTGAAGAAACGAATTCAGTGCCATTCTCCAGAGCTAGGGCAGTAAGATTGAACTCTTCTTCTTCCTG
R
TTCAATGATGAGTTTCGGAATGACCTGATTCCTAATGCTGCAGCCAGTCTGTTCTGGTAATCATAGTCAGCATCACTCTCTTCATCTTCAGGTTCTAAAC
Celera SNP ID: hCV8919450
公開SNP ID: rs6017
SNP染色体部位: 167778717
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 430
SNP部位ゲノム: 38684
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,32|G,8) アフリカ系アメリカ人 (A,29|G,5) 全体 (A,61|G,13)
SNP型: ESE;サイレント変異
SNP供給源: dbSNP; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,82|G,28)
SNP型: ESE;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 726):
CTGTGTTTGAAGAAACGAATTCAGTGCCATTCTCCAGAGCTAGGGCAGTAAGATTGAACTCTTCTTCTTCCTGATTCAATGATGAGTTTCGGAATGACCT
R
ATTCCTAATGCTGCAGCCAGTCTGTTCTGGTAATCATAGTCAGCATCACTCTCTTCATCTTCAGGTTCTAAACGATCATGCATTTTCCGTGTAGCCATGA
Celera SNP ID: hCV8919451
公開SNP ID: rs6016
SNP染色体部位: 167778744
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 430
SNP部位ゲノム: 38711
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|G,32) アフリカ系アメリカ人 (A,5|G,27) 全体 (A,13|G,59)
SNP型: ESS;サイレント変異
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,86|A,30)
SNP型: ESS;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 727):
CCCAACTTTATGTGCTAGTAATTTCATCCAGGAGAACCTGTGCTTTGCTGCTTGATCTCTTTCTACCTTGGGTCCCTTATGCTTAGCATGTTCTTGACTT
Y
TGAATTCTCCAGCACCAAGTGAAAGTAGACGTATCCCTGTGACATCTGGCTGTAGAGGATCCTCTATAGGGTCTTCAGAATATGGGCTGGAATGCTCTGC
Celera SNP ID: hCV8919444
公開SNP ID: rs4524
SNP染色体部位: 167778379
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 430
SNP部位ゲノム: 38346
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,89|C,31)
SNP型: ミスセンス変異;ESE

コンテクスト (配列番号 728):
AATGCCCCATTATTTAGCCAGGAGACCTAACATGTTCTAGCCAGAAGAAATTCTCAGAATTTCTGAAAGGTTACTTCAAGGACAAAATACCTGTATTCCT
Y
GCCTGTCCAGGGATCTGCTCTTACAGATTAGAAGTAGTCCTATTAGCCCAGAGGCGATGTCTCTCATGATGTCCACGTCACTGTAGTATGGTCTTGTTAA
Celera SNP ID: hCV11975250
公開SNP ID: rs6025
SNP染色体部位: 167785673
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 430
SNP部位ゲノム: 45640
SNP供給源: HGMD; dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,1|C,119)
SNP型: ミスセンス変異

コンテクスト (配列番号 729):
CAGGAAACTGATTCCAGGTTTCAGCTACTTTCTCCATTGTGAATCATGGTGGCTTCTCTCCACCCAAAGGGAAGTACTGCAACTCCTGACAGGTGTGCCA
Y
GGCAGGTTTCTAGTGCACCTATTTATTGATCCCTCTTCCCACCTCCAGCCCTTCAGCAGCCAAGTGGGGCCTGGATCAGCCAAGCCTTAGATTTATTGCT
Celera SNP ID: hCV27480803
公開SNP ID: rs3766103
SNP染色体部位: 167755551
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 430
SNP部位ゲノム: 15518
SNP供給源: HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 28
遺伝子記号: F9 - 2158
遺伝子名: 凝固因子 IX (血漿トロンボプラスチン成分、クリスマス病、血友病B)
染色体: X
OMIM番号: 306900
OMIM情報: 血友病B (3); ワルファリン感受性(3)

ゲノム配列 (配列番号 431):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 730):
TGAGAAATATCAGGTTACTAATTTTTCTTCTATTTTTCTAGTGCCATTTCCATGTGGAAGAGTTTCTGTTTCACAAACTTCTAAGCTCACCCGTGCTGAG
R
CTGTTTTTCCTGATGTGGACTATGTAAATTCTACTGAAGCTGAAACCATTTTGGATAACATCACTCAAAGCACCCAATCATTTAATGACTTCACTCGGGT
Celera SNP ID: hCV596331
公開SNP ID: rs6048
SNP染色体部位: 138460946
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 98317
SNP供給源: dbSNP; HapMap;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,61|G,29)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン

コンテクスト (配列番号 731):
CATATAATGGGAATTCTCCACATGTACAAACCACTTCATATGCTAAACTTGTTGACAACATTCAAAGCTCATCCCTGAATTTGACTATATTGATTACATC
R
AAAATGTTACATAGCAACCTTAGAATCCTTGTGTACCTTTTCTTCTCAAAGCCTAGATTATTTCTTTTTCCGACGTTTCAGTAATTGGAGCAGTAAACCC
Celera SNP ID: hCV596326
公開SNP ID: rs398101
SNP染色体部位: 138451623
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 88994
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,69|G,31)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 732):
CTAGAAGGCCTTTTAGTCTGCAAAAGAAACCTTCTTAATCATAAGCAGCAGAAGTCCCATTTACCAAATTGGAAAGTTAAAGTTACAAAGCATCAATCAT
M
AGACTTCCATTCAGGGATGGCAATTGGGAGTAAGACTTTTTAGTAAAGAAACTAAACACAAAGTCATTAGACTCTGTAAAAGTCTTACCAAATTTGATTC
Celera SNP ID: hCV596330
公開SNP ID: rs422187
SNP染色体部位: 138460525
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 97896
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,61|C,29)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 733):
GCCAGAGATCAGAGCAGGCTAAGGGACTGCTGGGATCCTGTCCAGCTTTGAGACCCTACAGAGCCATGTTCACCTAGCACGTATCCCGTCTGCGGTCACG
S
TCATTTCTTACCTTATTCCAGGGCTTTCACCTCAGCTTGCCAGGCTGGAGCCAAGGGCCAACGCAGCCGCGCCTTGTTCGCGATGGTAGCTTCCCAGGAG
Celera SNP ID: hCV596335
公開SNP ID: rs413957
SNP染色体部位: 138465182
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 102553
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,73|G,17)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 734):
TACAGAAAATGTCCAGGGAAATGGTCTATTTCTTATTCTATTTTTGACCTAAAGAAAATCTTTAAAATGTCTTAGCATTTTCCCCAGTCTCCATCCACTT
Y
CCTCAGCTTTGGCCTGAAGCTATCTTTAAAGGTACCCTGTACAGCTCTTGCCCTGTACAGCTAGCTACAGAGATTCAATCCTTTCTGTTCGATTAGGACA
Celera SNP ID: hCV596336
公開SNP ID: rs110583
SNP染色体部位: 138466197
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 103568
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,17|C,73)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 735):
GCCACAGTAGGCCAGTGACAAGGGAAGATTGACACATCATCCCCTGCTGGGGCCCAGTGTCCTGTGGCTGGCAGGCAGGGGATCCTAAGGACATGTGGGT
S
TTAAATTGTAGGGTGCACTTCCTGGGCACCTTTGAGGGTCTGCACTGCCCCAGCAAATATCCCCATGCTAGAAGGAGCAAAATATTAAATGGCAAATTTT
Celera SNP ID: hCV596337
公開SNP ID: rs421766
SNP染色体部位: 138468258
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 105629
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,-|G,73)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 736):
GATAAATACATCAATGGCACAAAGAATAGATAGAGAAACTGGAAGTAGACCCAAAACAATATGGTTAACTGACTTACGAAAAAATTTCAGAAGCCATTCA
R
TCGAGGAAGGATAGGGTGGTATTGTTGTTTTTTGTTTTAACAAATTGTGCTGGATAAATTGGACATACCTATGGAAAAAAAAATGAAGTTTGACTTAAAC
Celera SNP ID: hCV596663
公開SNP ID: rs411017
SNP染色体部位: 138439768
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 77139
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,26|G,64)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 737):
TAAAGTGAACAGCTGCAATGAAAATAAGGGAAGAAAGTTTAGTTCATCTCCGTTTCTTTCCTTTCCTTTTTACTTTCCTTTCTCTTCCTTTTTGGAGTTA
R
TCAGGAAGTAGTCCCAAATACCCCAGAAAGTTCATCTTATAAGCCCTTGGTCCTCTTGAGATGGTATCAGATATATTGCTAGACCCTTGAAGAAAGGAAC
Celera SNP ID: hCV596669
公開SNP ID: rs376165
SNP染色体部位: 138445399
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 82770
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,55|G,35)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 738):
ATTCAATCGAGGAAGGATAGGGTGGTATTGTTGTTTTTTGTTTTAACAAATTGTGCTGGATAAATTGGACATACCTATGGAAAAAAAAATGAAGTTTGAC
Y
TAAACATCATACTTTACACAAATATTAACTCAAAATGGAGCATGGGCATAAATCTAAAACTTCAAACTGTAAAACATTTAGAAAAAAATAGGAAAAAAAT
Celera SNP ID: hCV2288095
公開SNP ID: rs378815
SNP染色体部位: 138439863
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 77234
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,26|C,64)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 739):
ACAGTGGTCTGAATCCACCTGAGACAGAATTGGGTCTAACTAACTGTGAGTATGGCCTTCAATAAGTCACTCTCCATTTGGGAATTTGATTTCTCCACTT
S
TATAATGAGAGTATTTGACAGGATGCTCTCCCAAATCCCTTGCAATTTTGTTAGTCTGTGATTTCATGTTTTTATTTTTATTCCTTCATCCAACAAATAG
Celera SNP ID: hCV2969899
公開SNP ID: rs434144
SNP染色体部位: 138474091
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 111462
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,71|G,19)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 740):
ACTGAACATGTACAGACTCTTTTATCTTTCATTATTCCCTAAACAATACAGCATAACAACTATTTACATAGCATTTACATTGTATTAGCTATTAAGAGAA
W
CCTAGAGATGATTTAAAGTACAAAGGAGGATGTGTTTAGGTTATATGCAAATAGTAAGCCATTTTTATATCGGAGACTTGAGCATCCACAGATCTTGATA
Celera SNP ID: hCV2986575
公開SNP ID: rs4149674
SNP染色体部位: 138444467
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 81838
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,56|T,34)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 741):
GAAGTGATGATGAGAAATTACCTAATGGGTACAATGTGCATTATTTGGGTGATGGATACGATAAAAGCCCTGACTACACTACTATGCAATATATCTATGT
R
ACAAAATTATTCTTGTACCCCATAAATTTATACAAATTTTTTAAAATTGTAAAAGAAAAAACAATATGTCAGGAAATCAGGGGAAGGTGAAAATAATGGT
Celera SNP ID: hCV27904396
公開SNP ID: rs4829996
SNP染色体部位: 138418800
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 56171
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,23|G,77)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 742):
GTTCTAATACTTACTAAATAATAAGCATTTTCCTCAGTGAAAGTCTGTTGAGTGAAACCAGGTTGATTTCTGACTAGACCCAAAACAAAATCACTGACCT
R
ATTTCTCTTCAAGTCAAGTATTTCTTCTGCTCTCCTACACTTTCCACAATGTATTATGAAATTTTTCTCTTAAGAGAATGTAAACGCTTAGATGTCAGGG
Celera SNP ID: hDV70941043
公開SNP ID: rs17342358
SNP染色体部位: 138482244
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 119615
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,88|A,2)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 743):
GGATTTCTCTACTGAGGTTAGAATCTCTGCCATTAGAGACTGATAAATTTAAAGTTTGCAATTATCAAACTGGTGACAATTTAAGCCAGAATCAGGTAAA
Y
GTCCTCAGTTTTAACAGCATTGGAATTTTCTGGGACTAGCTGTGTATCTATCCAGGATTCTTGAGAATGCCTGCCATTTTTCAACATAATGGATGTAAGG
Celera SNP ID: hDV76976792
公開SNP ID: rs4149759
SNP染色体部位: 138462720
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 100091
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,81|C,9)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 744):
TGAGATGGAGAAAATATTCATTGTCGACTGTAATTATGCAACGAATATCCAGTTGAGATAATGGACTTGCCTCTTATCTAATAATACCCAGGCTCAATGC
R
TCACTGCTTTGTCCACTTTGCCCAAAATTCAAGCACAGCTAAGTTGATATTTTAGGACAAAGGCAGCTTACTATCCAGCCAGAGGGGAGTAGAATATGGT
Celera SNP ID: hDV76976795
公開SNP ID: rs4149762
SNP染色体部位: 138469863
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 107234
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,81|A,9)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 745):
TGGAATTTTGAAATTAAAACAGTTCTGTAAAACCAGTTTAGTTTTGTAAAGTGTATGCATCAAAGATGTCCTTCATTCAGACATTACTGAGTTACAACTA
Y
GGTGCCAGGTACTGTGTCAGGGTACTAGGGGTATGGGGATAAACCAGACTCCCTCTTTGATCTAAAGCAGCATGAGGCCAGGTGAGAGGTTTCAATATAA
Celera SNP ID: hCV596665
公開SNP ID: rs401597
SNP染色体部位: 138442337
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 79708
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,77|T,23)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 746):
TCATAGAGGGTAAAAGTCAAAGAGCAGAGAACCAAAAATTGGGCTAAATCTTCAATTCACAATACACATGGCCTTAAACTTCTGCTTCAGAAGAGATTTG
Y
ACATCAAGGTTGGCTCTTCACACTAGCAGAGATACGGAATCAGCCTCCAAATTGTCACTGCTGACATGACATTTAATGGTGGGGAAAAACCCAAGTGTCC
Celera SNP ID: hCV11780206
公開SNP ID: rs5931656
SNP染色体部位: 138404183
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 41554
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,25|C,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 747):
CATAGAGTGAACAGACTCTTAAGAAACAAAAGTTGTTCTCATTTACTCTCACCGCCAGGCACACACTTAAGGGTTCTTCAATTACCTCACTGGTCTCTCT
Y
TTAAGTGACCTCTGCTAGCTCTTCCTTATCTCCTTGAACTTTAAGTGTTAGAGGGCACCAGGGCCTTGTTTTTGGACATTTTCCCTTCTCTATGCTCACT
Celera SNP ID: hCV11780209
公開SNP ID: rs5930009
SNP染色体部位: 138404771
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 42142
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,25|C,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 748):
TTTCCCTTCTCTATGCTCACTCCCTTGGTGATCTCATCTGTGTCATTGCTTTAATTTCCATCTACATAGACACAACTTCTAAATGTTTGTGCGTGTGTGG
R
AAGGGGGATGTGATCTTTTGAGGCCCAGATATATGCATCAAACTGCCTCCTCAATATCTCCTTTTGGATATCAATAGGTGCCTCAAATTTAACATATCCA
Celera SNP ID: hCV11780214
公開SNP ID: rs7878061
SNP染色体部位: 138404951
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 42322
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,25|G,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 749):
AGAAACACTCTAACTGCCCTCTTACCAGCAAGAGACAGGGCTCCACTCTGTGCAGAACTTTCACAAGCTGCCCCTACTACAACACGCAACGTGCTCAGTG
W
TCATAACTTCCCACCCTCACTCACTCTGTACCTTTTTCCTCACTCTGATTTCTTTCATCCACTGACCATCAACCATTTCATCTCTAAATCACTCCCTTAG
Celera SNP ID: hCV26011954
公開SNP ID: rs4620439
SNP染色体部位: 138417152
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 54523
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,25|A,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 750):
AGGCTTGAGTAGCAGGGCACTAAAGAAGCAAGCCACTCCCCCTGTCAACCACCCTGCGAGAGGGACAAGGGAGCTTTTTCCTTTTCACCTCTCTCTGTTT
Y
TCATCCCACTTCTTGCATTATCCCAGTGGTAGTTTCTTTTAAGATCAATCTCCACTATTGCCCTAAATTAATGTTCCCTCCATAAGTCTTCTTTATCAGT
Celera SNP ID: hCV26011955
公開SNP ID: rs5930013
SNP染色体部位: 138418259
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 55630
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,25|C,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 751):
GGATGGCTGAGCCAAATCTGGGAGGATAAGTCTAACACCATTTCTTCGTAATAGCTCAGTTGTTCCAATACCATTTTCTTCTCAACCTCCAAAATACAGG
K
TACTTTATTTATTTCAGTATTCTTTGTGCATTTAACCACCATTCTCATTCCACAGGCTTTGGTGAATTAAAGTAACTACAGTTACCAACTCTTTTTATTG
Celera SNP ID: hCV26016182
公開SNP ID: rs11796672
SNP染色体部位: 138415291
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 52662
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,65|G,25)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 752):
CCAATACCATTTTCTTCTCAACCTCCAAAATACAGGTTACTTTATTTATTTCAGTATTCTTTGTGCATTTAACCACCATTCTCATTCCACAGGCTTTGGT
R
AATTAAAGTAACTACAGTTACCAACTCTTTTTATTGAAAAACTCTTTATGAGTTGATTGTAACTGCTTCTCCAATTATAATTGCTTCCTCTCCACAGGCC
Celera SNP ID: hCV26016183
公開SNP ID: rs9887617
SNP染色体部位: 138415355
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 52726
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,26|A,59)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 753):
CAATGGCCTCAGGATGAGGAGTGGCAATGACACACAGCACCTAAAGATCACTGGTCCATCAACAAAAGGAAGGAAATGAGGCTGGCATGGTAGGCAGTGT
M
AGGTTACCAACAAGCCTCTTCCACTAAGCAAATAGAAACAACAAAATATCTGCAAATTCTCTACCTGTGATGTTTGGGAAATATCTTCAGTGACCTGGGA
Celera SNP ID: hCV28962605
公開SNP ID: rs5930005
SNP染色体部位: 138395338
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 32709
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,25|A,64)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 754):
GAACATGCAATGTTAGTCTTCCTGTGCCTGGCTTATTTCCCTTAACATAATGATCACCTCTTGCCAGCATTTGAGGTAGGGAGAGTGTAGGCACTTATGG
R
AACCTATTGCAGTAGGATCTACCCTAGTTTTATTTTACATTTCCAACTGCCTTTTGGCAGTATCTCCATTCAAATGTTTAACCACCATTGTAAACCCAAC
Celera SNP ID: hCV30700232
公開SNP ID: rs12687091
SNP染色体部位: 138392370
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 29741
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,25|A,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 755):
CTAGTTCTGTGAGTGATCCTATGTATCTAGTCACCCAGGCTTACAAATTTGCTGTCACGTTTGTTTCCTCTCTACCTTATTTCCAACATTCAGTGAGTTA
Y
CTAGTATGATGGTTAATTTTAGGTGTCATCTGGATTAAGGAATACCCAGATAACTGGTAAAGTGTGTCTGTGAGGGTGTTTCCAAAGGAGACTGACTCAT
Celera SNP ID: hCV30201992
公開SNP ID: rs5931641
SNP染色体部位: 138392629
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 30000
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,25|T,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 756):
CTATATCTGATCTATATCATCTATATCTACATCCTATCTGTTCTATCTTCATGAAAAACCCTGACACCAAGTCAGAACCAATTTAGCTCTCCAATATGTC
R
CTCAGTCCTGTCGCCTCTGTTCTCTTTCCACTGCCACCAGAGTAAGTCAGGCTCACATCATCTCTACCTAGACCAGTGCAGTGGCCTAACTACCTTTCGC
Celera SNP ID: hCV29967889
公開SNP ID: rs5931645
SNP染色体部位: 138393121
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 30492
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,65|G,25)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 757):
TATTAGATTTGGGTGGGGACACACATCCAAACTATATCACTGAGGAAGCCCATTCTTGTGAACGTCCAGCTTACGTTTTGAAACTACAAGAGAAGTAGAC
M
GTTCCAATGTACTTATATTTGTGATTTCCAGGTTTACTGCCACATAATTTTGGCCCATAAAGTGAATACTCTTTCTGATTTGGGATTGTGCATTCATAAA
Celera SNP ID: hCV29732937
公開SNP ID: rs5931647
SNP染色体部位: 138397993
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 35364
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,25|A,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 758):
ACGTAAGAGGTGTTCAATGTTAGACTACTTCCTTCTCTCCCTGTAAGTTAGTACAAAAAGGGCAAATGAATGAGTTTATATGTTACCTTATCATGCTTTA
M
ATCTAAACATTTCACCAAAATTCATAGGAAGAAATATAGTAAAGAAATAAACTGAAAAATCAAGCCATCTTGGAAGAAAGCTGAAAGGATATTTTTATCT
Celera SNP ID: hCV30291634
公開SNP ID: rs5931666
SNP染色体部位: 138416680
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 54051
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,25|C,57)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 759):
GGATCTGATAATTAAATTGGAATTATGGCCCAGAAAATTAGGCCAGGACCTGTGTGTTAACCCTAAAAAGGGTTACTGCCCGCTAAATAGGATCCAGAGT
Y
TGCTAACACACTTTACAAAATGTCCAGAATACACATAACAACCACCTTTCATATCAAGACGCAGGAAAATCACAATTGTAATAAACAGAGATAGTCAAGG
Celera SNP ID: hCV29515877
公開SNP ID: rs5930015
SNP染色体部位: 138427194
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 64565
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,65|T,25)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 760):
TAAGGTCACATTCATAGGTTCTGGGGGTTAGGATGTAAACATATATTTTGGGGGCCACCATTCAACCCATTACATAGTGTTTATGTGGGGGAGAGATATC
Y
TCCCTTTTTGTCTTCCTGATTGTAATGTTAATATACGTTCATCATAAAAATATAGTGAATATAGAAAATCACAAAGAAACTTAAAACTCATCTTTAATTT
Celera SNP ID: hCV30130033
公開SNP ID: rs5931646
SNP染色体部位: 138396396
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 33767
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,25|T,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 761):
TGAAAAATGGCCAAACATAAATCTTTTACCCTCAATTTATGTCATAGCAATCGATAACCAGGGTGGCTGGCTGACTTGTAATTGGCTGTATTCTACCCAA
W
ATGTCTCTTGATTCTAGAATGCAGGGTTACAGCAACTACTTTTACAAGACCCTGAGATACATATTGAAAACCAGCTACCTATATAACACTAGTTTCTAAT
Celera SNP ID: hDV77022847
公開SNP ID: rs4598407
SNP染色体部位: 138407475
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 44846
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,65|T,25)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 762):
AAGGACTTATAGATACTGTGTCACTTATTCATTCATTCATTTATTCATAAATAACTTATTAAATGTTAGACAACCCAAAATAAGCAAAGCAGAAAACGTT
Y
CTACATTCGCGTAGCTTAAAATTGAGTGTGAGAGACAGCTATTTAAACATTATCATACTACTTCTGCTTCCAAGTAGAATGTAATAAGTCACAGTAAATA
Celera SNP ID: hDV77148131
公開SNP ID: rs5931661
SNP染色体部位: 138408224
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 45595
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,63|T,22)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 763):
GACACTTCTGCTGTAATAATTACTTAAATATGAATAAATTATAAAAATGGTATTTAGATGCCTGAGAGAGCTTTGATAACAATTAGGACTAGATGAATTA
W
ATTTCCATAGAGTAGACAACCATTCCAAGCCCTGCACCACAAAAAAATATAAAAGGAATCCTTGAGACAGAAAAAAAAAGATACCAGACAGGAAAATGGA
Celera SNP ID: hDV77150953
公開SNP ID: rs5976389
SNP染色体部位: 138408425
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 431
SNP部位ゲノム: 45796
関連した照会SNP: hCV2288095 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV596663 (検出力=.6)
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,25|T,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 29
遺伝子記号: FGA - 2243
遺伝子名: フィブリノゲンα鎖
染色体: 4
OMIM番号: 134820
OMIM情報: 異常フィブリノゲン血症,α型，出血性素質を引き起こす (3);/D異常フィブリノゲン血症,α型，再発性血栓症を引き起こす (3); 遺伝性腎アミロイドーシス, 105200 (3);
無フィブリノゲン血症, 202400 (3)

ゲノム配列 (配列番号 432):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 764):
TACTAAGCTTAGATTTGTTTTCTCACATATTCTTTCGGAGCTTGTGTAGTTTCCACATTAATTTACCAGAAACAAGATACACATCTCTCTTTGAGGAGTG
Y
CCTAACTTCCCATCATTTTGTCCAATTAAATGAATTGAAGAAATTTAATGTTTCTAAACTAGACCAACAAAGAATAATAGTTGTATGACAAGTAAATAAG
Celera SNP ID: hCV11503470
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 155703364
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 20000
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,88|T,24)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 765):
CTGCCAGGATTCCAGGTTCCGGTACTACCAGGTCTAGGGCTCCCAGGGTTTTGGTTTCCAGTACTTCCAGTTCCAGAGCTCCCAGAGTTCCAGCTTCCAG
Y
ACTTCCAGGTCCAGAGCTCCCAGGTTTCCAGGTTGCAGTCCCTCCAGTCCCAGAGCTCCCAGGGTTTCGGTTTCCAGTACTTCCAGGTCCAGAGCTCCCA
Celera SNP ID: hCV2892877
公開SNP ID: rs6050
SNP染色体部位: 155727040
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 43676
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|T,28) アフリカ系アメリカ人 (C,2|T,22) 全体 (C,12|T,50)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;サイレント変異;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,13|T,27) アフリカ系アメリカ人 (C,7|T,29) 全体 (C,20|T,56)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;サイレント変異;イントロン
SNP供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,89|C,31)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 766):
GGTTTTTCCACGCAGTACCTTATAACTCCTGGACAATGTGCATTTGGGAAGGTATTTGTTTATTCTGTGTCTTGCCTACACAAAGCTTCCTGAGGCCAAG
R
CACAAGGACTGGCACAAATGTCAGGCATAGAGCAATTGCTGCTCAGTATCTGCTGGAGAAATGGAAGGCTGTCACCATATGGTGGTGACAATGCATGGTG
Celera SNP ID: hCV2892869
公開SNP ID: rs13109457
SNP染色体部位: 155734329
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 50965
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,82|A,32)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 767):
AAAGACAAGGCACATGGACAGGCAGTTCACAGAAAGACCACTGACATTGTGGCTGATATGTAAATTGAAAAGATTCTCAGTGTGCTCATGATGAAAGAAA
W
TTTAATCACAATAACAATAAGATAACATATTTCACCTAATAGGTTGGCAAAAAATTTTAAAATTTGACAACAACAAGTGATGACAAGGATGAGGGACAAC
Celera SNP ID: hCV2892893
公開SNP ID: rs12648258
SNP染色体部位: 155696822
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 13458
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,91|A,27)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 768):
GGCTTCGCCAAGGTCTCCCCGGCCCCCAGCAAACTACCTGCTATGAAGTAGATGCTCTGTAAATAGTTGTTAAGCACAAATTGCCTTGTGCTATGGAGAC
Y
GGGCCTGACATGAGTTGTAAAAGTATCAACAAGTGTATTGACAATGGGTATCGGCAAGTCTTTGCCCTTCAAGCCAGAGAGCTGCTGGGCAGGACAGATT
Celera SNP ID: hCV7429793
公開SNP ID: rs1025154
SNP染色体部位: 155700813
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 17449
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,28|C,92)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 769):
ACTTTACTGGACATCCTGTACTTTATCTGGCAATCCTACCTTGCCTCAAATTCTGCTTCCTACATGAAGCCAATCCTAATAGAGTAATAGCTAATGTGTA
Y
TGAATGTTTACTAAGTCTTGGGTTCTTTGCTAGACATTTTGCAGGGTACCTGATTCAATGTCCAATTAAAAGGAATCTCATGTTCTTTCATACTTCCTTA
Celera SNP ID: hCV15860433
公開SNP ID: rs2070006
SNP染色体部位: 155733316
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 49952
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,48|C,72)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 770):
ATTGTAAGCTTTGGAGGAGTAGGTTTTGTTTAGCTGGAAAACCATGCAAATTAATAGGCATGATACGAGTATCATTTTTTAAAAAGCATGTGACAATAAG
S
GTATCTTTAAATGTGCAAAACTGGAAAAAAGATGGAAGAAATTTTCAGTTGCTTAAATTATAATCTGCCGTGCATTGGCTTTTTCTTTTTGAGATGGAGT
Celera SNP ID: hCV27020269
公開SNP ID: rs7659613
SNP染色体部位: 155734866
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 51502
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,48|G,72)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 771):
TGTTAATGCCTGGAAAGACTTTGGGAATAATTAGATTGTACTATCAGTTATAAACTGTCAGTTATAAATATCTTAGCAAGGTGTATGTGTGTGTGTGAGA
R
AGAGAGAGAGAGTCCTCGGGTCTTACTTATCACAATTTCACCATCCTCTACTACATGAAGCCCCATCTCATGTGTATTAGTTTGCTAGGGCTGATGTAAC
Celera SNP ID: hCV30711231
公開SNP ID: rs12642469
SNP染色体部位: 155693672
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 10308
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,93|A,27)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 772):
TTTCCTTTTCATTCTGCTTTCAAACCACAAATTCATGTGTGGATAGATCTTAAAAACACAATGCTGAAATAAAAAAGTAGTAAGTATGATGAAGACTTCA
R
CAGTGATTGTCAAAGGATTTGTGGTGAAGGACTAGTTTTATTAAAATTCTAATCAGCCACAGACCAGGTTTTTATAGAATTCAATAAAAATAATTACTAA
Celera SNP ID: hCV31863982
公開SNP ID: rs7659024
SNP染色体部位: 155740380
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 57016
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,89|A,31)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 773):
CCACCACACTTAGGACCAGGCAGACGATCCTCATGGAAAACATCTTTTCTAAGGGTGGGGCTGGCTCCTGAGGAGCACTCCAGCTGAAAGAAAGGATTGC
Y
GCCACTCCTAGTTCCCATCCTATTTAAATCTGCAAGAGGTTTGGTTAATCATTGGCTTTGTCCTGTGTAGACAGTCAACCCTCCCTCTACGTCCTTTGTT
Celera SNP ID: hCV2892870
公開SNP ID: rs2070011
SNP染色体部位: 155731347
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 47983
関連した照会SNP: hCV15860433 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27020269 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,23|T,15) アフリカ系アメリカ人 (C,24|T,12) 全体 (C,47|T,27)
SNP型: ESE;UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,24|T,16) アフリカ系アメリカ人 (C,20|T,12) 全体 (C,44|T,28)
SNP型: ESE;UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,46|C,70)
SNP型: ESE;UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 774):
TTTCATGCACTGTATAAGGAAGGAGCCAACCTTATGAAACAGAATTCCTAAAATGCAGAGACCACACACATGCACAGAACCACAGAGTGAGGTCTTTTTA
Y
ACACACACACACAAAAACATGATGAAAATCTCATAACTATAATCCCAGTGCTTTGGGAGGCCAAGGCAAGAGGCCAGGAGTTTGAGCCTCCAGTGAGCTA
Celera SNP ID: hCV27020277
公開SNP ID: rs6825454
SNP染色体部位: 155720638
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 432
SNP部位ゲノム: 37274
関連した照会SNP: hCV11503414 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11503431 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11853483 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV31863982 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11853496 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV2892869 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,84|C,30)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 30
遺伝子記号: FGG - 2266
遺伝子名: フィブリノゲンγ鎖
染色体: 4
OMIM番号: 134850
OMIM情報: 異常フィブリノゲン血症, γ型 (3); 低フィブリノゲン血症，γ／型 (3);
血栓性素因, 異常フィブリノゲン血症 (3)

ゲノム配列 (配列番号 433):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 775):
ATACACATTATATATACATATACATACATATGAAACCTTTGCTGTTAGATATGTCAGATAATACAGAATGAGTGGTAATCATTTAACACATTTCATGTTC
Y
GTGGTGCCAGAAATGGGTAGGCTGTCTAGTAAATAGATTTTGTTAATTAGTACATTCTGTGATATAATCTAGTTGTGCTGAATTTCCTGAGATGCTTGGA
Celera SNP ID: hCV2892855
公開SNP ID: rs6536024
SNP染色体部位: 155762819
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 28083
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,43|C,61)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 776):
GGAGGAGGATGAGATGGTAGCAGGAGAGGCTGGATGTAAGAAAGGGAACAGGAAGTGGGTGATTGCCCTTATCCTGGCAAGAGATGTATCTCAACTACAA
W
GGTGACAATCGGTATACAGGAAAAAAGTGAATATGATAAATATATAGGAGGTGAATTCAGCAGGCTTGATGAGTAATTGGATATAGGGAGGTAGAAATTG
Celera SNP ID: hCV7429782
公開SNP ID: rs1118823
SNP染色体部位: 155743296
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 8560
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|T,84)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 777):
ATAACATTTAGCATAAAATGAGGACTCAATTACTACTGATGGTTGCCCAATTGTAATTGGTAAATTGGCAAAAAGTGGTGGTTTTTAATGGTCAATAAAG
R
TACCATGTATCTAGTCTTAGGAAACAAAAGGTTTATTGAAATGCATGTAGATAAATTATCATCAGCATAAAACTGTTATGGAGTTTTCAACATGGGGTCT
Celera SNP ID: hCV11503414
公開SNP ID: rs2066865
SNP染色体部位: 155744726
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 9990
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,89|A,31)
SNP型: UTR3

コンテクスト (配列番号 778):
CTCATCCAACCCCCATCCTAAAATAAGTGTCTACTGTCCTCAGACTGGTCTCTTCTCTCAAGCTTTCACAAACCCCTGCCCTTACCAGTGCTTGCCTTCT
Y
TTTATTCTGTTCCTCCAAACACCTGTTCACTGCGTGTATCTGACACAAAGCTCATGGGAAGCCAGGTTAATGTGTCAACAAGCATCCATGTAGTAATGTT
Celera SNP ID: hCV11503431
公開SNP ID: rs2066861
SNP染色体部位: 155746886
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 12150
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,89|T,31)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 779):
AAGTCAGTTGAATTAAACATTTAAGTATTAGTATTCTTTCAAACAGCTCTACCTCAGATAGCATTTGTAGCAACCTTATATTATATGTATACATGCTGTA
W
CCACTGCATTAGATTGTAAACTGATTTCTGTGGCTACGGCATCTAACATATATAGCTGTACTTAACATAGTTGTAGTTAACACTCAATAACTATGTAATG
Celera SNP ID: hCV11503469
公開SNP ID: rs2066854
SNP染色体部位: 155754631
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 19895
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,31|T,87)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 780):
CCTGTGCTCTTAACCATGAATCTTAATACAACCATGAAGCCCTTCTTAATTTAAAATAATACACAGATACAAGGTGTTATGAGACTCAAAGTTATTCACT
R
ATAGAATGGATTTTAAAGATGTGTGTGTGCATCTACATAACTGTGTGCATGATTATTTGAACACACATTTACATCTATCTACCAACTTATCTATCTTCTT
Celera SNP ID: hCV11853483
公開SNP ID: rs12644950
SNP染色体部位: 155756771
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 22035
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,88|A,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 781):
GCAAACCTGTTAAAGTGCTTCCAAAATAGAGCTCATTGTGTGCTACTCCCACTTCATTATTATGTTTTTTTCCTTGATCAGCCTCAAAATCCCTTGAAAA
W
CTCATTCTATCAGGTGAGAAAGGCCTCACCTCAGCAGGGAGAAAGAAATGAATGTCATAAACTCTGGTAACTCTGGTTTTTCATATGGTCATGGCCCTAA
Celera SNP ID: hCV11853496
公開SNP ID: rs7654093
SNP染色体部位: 155764522
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 29786
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,87|T,31)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 782):
ATTGTAAGCTTTGGAGGAGTAGGTTTTGTTTAGCTGGAAAACCATGCAAATTAATAGGCATGATACGAGTATCATTTTTTAAAAAGCATGTGACAATAAG
S
GTATCTTTAAATGTGCAAAACTGGAAAAAAGATGGAAGAAATTTTCAGTTGCTTAAATTATAATCTGCCGTGCATTGGCTTTTTCTTTTTGAGATGGAGT
Celera SNP ID: hCV27020269
公開SNP ID: rs7659613
SNP染色体部位: 155734866
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 130
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,48|G,72)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 783):
TTTCCTTTTCATTCTGCTTTCAAACCACAAATTCATGTGTGGATAGATCTTAAAAACACAATGCTGAAATAAAAAAGTAGTAAGTATGATGAAGACTTCA
R
CAGTGATTGTCAAAGGATTTGTGGTGAAGGACTAGTTTTATTAAAATTCTAATCAGCCACAGACCAGGTTTTTATAGAATTCAATAAAAATAATTACTAA
Celera SNP ID: hCV31863982
公開SNP ID: rs7659024
SNP染色体部位: 155740380
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 5644
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,89|A,31)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 784):
GCTAAATGTCCTTAATAGAAGACTTGAAATCAATAAATATAGTAAGAGAAAAAAGGAAGAAACTTTCAGAGAATTTCTGAAACTTTGTGGGTCAATAGAA
R
TTAGCAGTTAATTTTCTACAAATCATCCTCAGGGTAAAGTGAGTCATATTCTGTTTCCGCAGGGTGCTCTGGTCTGACCTGTTTGGCTCCCCCCAGGTGG
Celera SNP ID: hCV2892863
公開SNP ID: rs1049636
SNP染色体部位: 155745420
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 10684
関連した照会SNP: hCV2892855 (検出力=.6)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,18|G,0) アフリカ系アメリカ人 (A,9|G,5) 全体 (A,27|G,5)
SNP型: UTR3;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,32|A,84)
SNP型: UTR3;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 785):
CCTAACCAAACAGTACAACTTTAACAAAGGTCAGTCAAATCCTAGAAGATAGGGAAATGAGGGAGTTTATAGCATTGTGTTGTGCATATTCTCTAGAATA
Y
GCAGAACTAGGGCTAGAATGTGTCATAGAGAAAGCCAAGTAACCTTCACCTGGCCCTTTCCTTAGGTTTGTCTGTCTTGGTCCCATGCTTTAGCTCAGCT
Celera SNP ID: hCV2892858
公開SNP ID: rs12648395
SNP染色体部位: 155760739
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 26003
関連した照会SNP: hCV2892855 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,34|T,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 786):
AGACTAAGGAATGATCTGAGGTGCCCTGGATTGAGACAAATTGAACAGAGAAGTTGGATTTAAGTGTTTTGCTGTGCCACATTGGTATCTGCTACTGGTT
K
GTTTGTGTTTTTCCATCTTTGTGTAATCTACGATTTTAAATCTCTCACCCCATGAAAGAATTTTCATGACTAAATATGATTAGCAGGAGATTTACAAGAG
Celera SNP ID: hCV2892859
公開SNP ID: rs13130318
SNP染色体部位: 155757920
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 23184
関連した照会SNP: hCV11503414 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11503431 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11853483 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV31863982 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11853496 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV2892869 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,74|G,30)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 787):
GTAATAAACAAGGAAAATACCTGGGAATTTGAAACTCTAAAATGTTCTCCTATTTTATTAAGTACATACTAAAATATTTGATATAATGAAAATAATTTAC
R
AAGACAAAATAAATGACAAGTGGTCATAAAAATGCAAATAAAGTCAATCATTTTATTATTATATATTTAGGAACAAAGTTGAAATGTTATCTCCTCAAAT
Celera SNP ID: hCV11503416
公開SNP ID: rs2066864
SNP染色体部位: 155745145
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 10409
関連した照会SNP: hCV31863982 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV11503414 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11503431 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11853483 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11853496 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV2892869 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,89|A,31)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 788):
CATTAGACAATCTCAAATCTTGTATACTTCCTCTTTGTTAGAGTATTTAATACTGAAGATATGCCATAATCATTTCTTGTTGCAAAAAGAATTTAAAAAC
Y
AACGGTATCAGTTTTTTTCTATTGAAGTTTAAAATTAGATTTTGGTAATTCAGAAACAAAAAGACAAATACAGCATGTTCTCAGTTATAAGTGGGAGCTA
Celera SNP ID: hCV11853489
公開SNP ID: rs7681423
SNP染色体部位: 155761698
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 433
SNP部位ゲノム: 26962
関連した照会SNP: hCV31863982 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV11503414 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11503431 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11853483 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV11853496 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV2892869 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,89|T,31)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 31
遺伝子記号: GOLGA3 - 2802
遺伝子名: ゴルジ自己抗原, ゴルジンサブファミリーa, 3
染色体: 12
OMIM番号: 602581
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 434):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 789):
AGGACCCTGCATAGATTTCTAGGCACTGGAGCGTCCTCTGGAACGCCCTGTGAGACGGAAGGTGGCACGCACCTGCTCCTTGAGGCTGTTCACCTTCTCC
Y
TCTCCTTCTCTAGTGAGGCCTGCAGGGCCTGGACAAGATGCTTCATCTGGCGATCCTCCTCTTCTTTGCGCTGCAAAACTGCCTGCACCTAGATCAGATT
Celera SNP ID: hCV1859855
公開SNP ID: rs2291260
SNP染色体部位: 131867485
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 434
SNP部位ゲノム: 21917
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,89|C,31)
SNP型: ミスセンス変異;ESE SYNONYMOUS;イントロン

遺伝子番号: 32
遺伝子記号: GP6 - 51206
遺伝子名: 糖蛋白 VI (血小板)
染色体: 19
OMIM番号: 605546
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 435):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 790):
TAAAAGCCTACAGGCTTAGATAATGGAAGAGAGAGCTCCGTCCTCACACTCCTTTCTGCTGAGCATGAAATGCCTGGTTACTCACCAGTTGTGAAGACTT
Y
GTTTGTGAATGAGACGGTCAGTTCAGCGGTGGCTTCTGAGAATTCTAAGAAAGCAAAACAATGTTAGGTCTTCCCCGTGGTTCCCTATATCCTCTAGATA
Celera SNP ID: hCV1376342
公開SNP ID: rs1654416
SNP染色体部位: 60221847
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 435
SNP部位ゲノム: 14962
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|T,16) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,22) 全体 (C,8|T,38)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,22|T,98)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 791):
ACGCACGTGGTTGTTGGTGTGATTCTGTTTCTCCAGATTGTCTCCATTCCTCCCTGGCTTCTCCACAGGGCCGCTCACCATGGCAGCCGGCTCCATCACC
R
CCAGCCAGCGAGAGGGCAAGACAAGAGGGCTGACGAGGGACGCTACCATCACAGAGGTCAGTTTTGTAACCTAACCACAAGACTAACCTACTGTCACTTC
Celera SNP ID: hCV8717752
公開SNP ID: rs1671217
SNP染色体部位: 60246044
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 435
SNP部位ゲノム: 39159
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,17) アフリカ系アメリカ人 (A,2|G,26) 全体 (A,3|G,43)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,3|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,4|G,30) 全体 (A,7|G,67)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,21|G,99)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 792):
AAACGCTCCTCCTTCTGAACCCCAGAGCTCCACTCTGCACCCATGCTCTAGCCTCACACCAAGGACTTTCTTGGTAAGAGACGGACAGTTCGGTGAAGTG
R
TTAAAAGCCTACAGGCTTAGATAATGGAAGAGAGAGCTCCGTCCTCACACTCCTTTCTGCTGAGCATGAAATGCCTGGTTACTCACCAGTTGTGAAGACT
Celera SNP ID: hCV8717893
公開SNP ID: rs1671192
SNP染色体部位: 60221745
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 435
SNP部位ゲノム: 14860
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,21) アフリカ系アメリカ人 (A,12|G,18) 全体 (A,13|G,39)
SNP型: イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,19|G,91)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 793):
ATTAAATCGAGAAGTCTAGGCAGAGAGGAGAGAGAGAAGGGGTCCGTGTACCTCATACGCTGTGCACCAGAATGGACCCTGCAGAACCTACCTGCTACCG
R
GGAAGGTGGTTCTGTTGGTAACCGGCTGGGGGTCACAGAGGTTCCTGGGAAATCAGAAAATGAGATAAATCTGTGCTCTGTCGCTGTGGGTCCTGAACAA
Celera SNP ID: hCV8717873
公開SNP ID: rs1613662
SNP染色体部位: 60228407
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 435
SNP部位ゲノム: 21522
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,19|A,101)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 794):
CTCTGAGACACAGGGAATGTTAGACACGCCCAGCCTCCAGCCTAGCGTATGATATTCTTAAAGTGCAGGCCGTAGTCTGGTACACCGTATTCAGCTGAGA
Y
GTTTGTGAAAGTGGAGGGGATAACACGCCTCACACAAAACTTACCGCAGTGGTTCTCAAAGCAGCATTCTGGAGCCATAGCATCAGCATCACCTGGGAAC
Celera SNP ID: hCV26895255
公開SNP ID: rs11669150
SNP染色体部位: 60227784
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 435
SNP部位ゲノム: 20899
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,86|C,22)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 795):
TCAGCTCCACGGCCTCTTCCTCTGAGACACGGTTTTCTCATCCGCCAGCAGGGCTCTGCCTGCTTCCCGGGGCTGTTAGAGGCTGGCAGGCCAGGTCAAC
R
GAGGAAAGGGACCTGTGCTCTGTGCCTCAGAAGACGTAGGCGAGGAGCAGGCATGAGGCCTCAGGGACGGTCTCTGAGGGAGGGTCCTGGGCCCTGGGCT
Celera SNP ID: hCV27476043
公開SNP ID: rs3745912
SNP染色体部位: 60250410
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 435
SNP部位ゲノム: 43525
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,107|A,13)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 796):
AGCTCTCTTCCTCTTGGTCAGCCCCAGTCCTCACCCTACCCCATTTCTCCTTTAATAACATCTTATTAAATGCACCTGGCACCAGCCTCAGGTTAAGGAT
Y
TTTTTTTGGCCAGGCGAGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATTACCTGGGGTCGGGAGTTCCAGACCAGCCTGG
Celera SNP ID: hCV29271569
公開SNP ID: rs1626971
SNP染色体部位: 60248836
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 435
SNP部位ゲノム: 41951
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,21|T,99)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 33
遺伝子記号: GPATCH4 - 54865
遺伝子名: G パッチドメイン含有4
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 436):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 797):
CTGACTCCAGCTCTTTCCTTCTTGGGATGCTGCTGCCTCTTCCTCTTACCTCTGCTGCTTGAGCCAGTGTGTGCTCTGCTCTCTGCTTCCCTAGCCCCGC
Y
ATCCTTCTCATCCCTTACATCCAAGATGTCCTCCTCCTCTTGATGCTGCTGTCTTTTCTTCTTGCTTTTCCTGCTTCTTCCATCACTGCATGCTCTGCTC
Celera SNP ID: hCV9102827
公開SNP ID: rs3795733
SNP染色体部位: 154831546
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 436
SNP部位ゲノム: 10643
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|T,30) アフリカ系アメリカ人 (C,26|T,10) 全体 (C,36|T,40)
SNP型: MICRORNA;UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,34|T,78)
SNP型: MICRORNA;UTR3

コンテクスト (配列番号 798):
GTGTGCCAGAACTTGTCCCTTTGGTACTGGGGGATAAAAAGACGCATAAGACACAGGTCTTGATTTAGGGGAACACCCAGTCTAGCCTGGGAAACTTGGG
R
CCTTGAGTGGGATTAGATGGAGGACATGCCAGTGGGACTTGGAGAAAGATACAGGATGGGTGAGACGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGG
Celera SNP ID: hCV31431621
公開SNP ID: rs11576266
SNP染色体部位: 154838783
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 436
SNP部位ゲノム: 17880
関連した照会SNP: hCV9102827 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,31|G,81)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 34
遺伝子記号: HEPHL1 - 341208
遺伝子名: hephaestin様1
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 437):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 799):
ATTCTTGATTCCTGCTCTTTCTTATGTCCTTCCTTTTGCTTACTGTGGGTTTTATTTGTTTTTGCTCTTCTTTCTGTTCTTGCTGTTCTGAGCAAAGAAG
K
CTACTAGCTGTTGTTTTTTAAAACGTTTTTGCAGATAGATAAATCTTACCGAGAAGATGTGTATGATCTCTTTCCTGGGACATTCCAAACCATTGAACTG
Celera SNP ID: hCV389119
公開SNP ID: rs7925817
SNP染色体部位: 93483682
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 100270
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,5|T,13) アフリカ系アメリカ人 (G,10|T,12) 全体 (G,15|T,25)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|T,77)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 800):
TAGTCCAAGGTTACAAGTGCCCCATGGCAACCAGGTCACAGACCCTATGGTCCCAGATGCTCATTTCCAACAGAGTCCCCTCTTGTGCCAATGGAAAGCA
Y
GGAGTAGTACATTTCAGTGTCATCTTCTACAAAAGGTTTTGCTGTAACTGAATATGAATATTGTTTCCAAACTTCTTAGTAGACAATATAAAGGGGAAAT
Celera SNP ID: hCV89001
公開SNP ID: rs2949858
SNP染色体部位: 93456570
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 73158
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,40|C,80)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 801):
TTAAAAGGCTACCATAACTAAAGAAATAATTGTATAATAACTTTGTCATGTGTACAATCTTAGCCCATGAATGTATAAAAATATAGCCTTTATGATGTTC
W
TACAACTAATATGAACTCCTACTTTAAGTCTCCATCCCACGGGGCTAGCAGGAAGGTCTAGCTTCAGTCTTCTGAGACTCCCTCCCAAGTGACATAAGGA
Celera SNP ID: hCV204260
公開SNP ID: rs4753535
SNP染色体部位: 93463213
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 79801
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 802):
CTTACCCAAGGCCCCTCTAATAAATGAAGGAAGCAGAATTTAAACCCATTGCTAAAGACTACATGATATTTAATACTACACAATGTTGCTCTCTAAAGTG
R
AGTAGAGTTATATATGCCTTTCTCGGAAAAACAACTAAAGCCAAACTATTTTATTTGACTAACTACTGCCTATATTTAAATTACACTAATGTTGAAAGAG
Celera SNP ID: hCV389113
公開SNP ID: rs7927016
SNP染色体部位: 93473871
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 90459
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|A,79)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 803):
CTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTTTGAAAGGTTATGTGGAAATCATAGGTTGTAGCATCTTGAATCTGGCTTGTTTGATTTAACATAGGCATTCAAATTG
Y
ATCCATCTTGTTATGTGTATCAGTGGTTTGTTTCTTGTGACTGTTGAGTAGTATTCCATTGTAAGGATATAATGCAGTTTGTTTATCTATTCTCCTGTTG
Celera SNP ID: hCV389115
公開SNP ID: rs4531426
SNP染色体部位: 93480506
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 97094
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,41|C,79)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 804):
TCAACAAATGTTAAATTCTATCAAATGGTTTTTCTGCATCTATTGAGATGATCAGATGCTTTTTCTTCTTTAATCTGTTGCTGAATTACATTTATTGATT
K
TGGAGTTTTTAAACACTTTTTCATTCCCAGGATAAACCTTACTTGGTCATGATGTATTATTCCTTTTTGTGGAATTGATTTGCTAGTATTTTGTTATGGA
Celera SNP ID: hCV389118
公開SNP ID: rs10437575
SNP染色体部位: 93482465
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 99053
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|T,77)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 805):
TTTTCTTCTTCATGCTACCTTGTCTAAGATCCTCTTTGTTCTTAGAGGAGACAATTCCTCAACTATTGAAGTGCCATGATCAATACATAAAAAATAGGCT
K
CCTGGAAAAAACAAATGTAGGGGACAGTCTTTCCAAGTCTGTCTTCAAAGGTATCTTCTCTGTGGTTTCATATAAAGACCCTTCCTCATGTGTCCTCATC
Celera SNP ID: hCV16176508
公開SNP ID: rs2949857
SNP染色体部位: 93460495
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 77083
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,41|G,79)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 806):
GCCTACTTGCTAAAATTTATTTTTAACCCCAAAATCAATTCCTGTGACATTTTTGTGGTCATTTGCAGGTACATGTAGAGTGGCAAAAAATTTACGTTGC
Y
TGATGCACACATTTTCAGCTGAGGTCAAACAAGGAGTCTCTCTGCCTTCTTGTTTCAGCTCTCATACTGTAAACAAATGTCCTTGTTTTCAGATTATTTA
Celera SNP ID: hCV16176534
公開SNP ID: rs2949863
SNP染色体部位: 93465248
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 81836
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,41|C,79)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 807):
TAATCCTCAGGTATAAAACACAGAAAAAGGAGAATGGGCATGGCTGAGAATGTCAACTCTTAGTCTATTCTTTGGTTGGATTCACTGAATAGGAGACACT
S
TGAAAGATATCTTTATATTCCATCTTTTATAATTCTTGAACAGTGCTTTCTTAGCTAACCACCAAAGTTTCTAGGTGAACAGCTTCTAGAAAAAGTTAGA
Celera SNP ID: hCV29137668
公開SNP ID: rs7108501
SNP染色体部位: 93485000
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 101588
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,41|G,77)
SNP型: UTR3

コンテクスト (配列番号 808):
AGCTATTCTAGATGTTTGCCTTCCCAGATAAATTTTAGAAATAATTTGTTGATTTTGATTTTTAAAATCCTGTTGGGATTTTGATTGGTATTGCACTGAA
K
CTATACAATGGGTTGGACAGAACTGACATAACAATATTGAGGCTTCCAATCCATGAACATGGTATATCTATCGTTTAGCTCTTCTTTGATTTCTTTCATC
Celera SNP ID: hCV31252429
公開SNP ID: rs12222234
SNP染色体部位: 93481752
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 98340
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,40|T,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 809):
TCACCATATTTAGTGTACAGTTCTCTTTTGATAAGCACATACAGTAGTGTAACGAACAACAATCACAATATAGAATACTTTTATTTCCCCCACAAATTTT
M
CCATTGCACCCTCTAGTGTCAACTACTTCCCCATACTTAACACTTGTCAACCACTGTCTCTATAGTTTTGCCTTTTTTGAAAGGTTATGTGGAAATCATA
Celera SNP ID: hCV31252427
公開SNP ID: rs4625415
SNP染色体部位: 93480352
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 437
SNP部位ゲノム: 96940
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,41|C,79)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 35
遺伝子記号: KIAA1546 - 54790
遺伝子名: KIAA1546
染色体: 4
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 438):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 810):
GCAGGAGGGGAAAAGTGCTAATTACCATGACAAGAACATTGTATTACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTTCC
R
TGGAACACACACATGGTGAACTCCTGGAAAAAACACTGTCTCAATATTATCCAGATTGTGTTTCCATTGCGGTGCAGAAAACCACATCTCACATAAATGC
Celera SNP ID: hCV25767872
公開SNP ID: rs6843141
SNP染色体部位: 106375200
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 438
SNP部位ゲノム: 98719
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,10|G,24) 全体 (A,11|G,61)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,116|A,4)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;イントロン

遺伝子番号: 36
遺伝子記号: KLKB1 - 3818
遺伝子名: カリクレインB, 血漿(フレッチャー因子)1
染色体: 4
OMIM番号: 229000
OMIM情報: フレッチャー因子欠損 (1); プレカリクレイン欠損 (3)

ゲノム配列 (配列番号 439):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 811):
AGAAGAATTCTGAAATATACAAGGACAAAGCAGGATGTACGTCTTTAGTGTCTGCCGCTGCAAAATAAACACGAGATAACTAACGTGCGTGAATTGAATG
K
TTGCTTCTCACCCATATTTTATAGAAACAGCTATGGGGAAGAATATTGGTGCTCAAAGTAATGATGATTCCGAGTATGTCCGTGCAGTTTATAGGTAAAT
Celera SNP ID: hCV11786147
公開SNP ID: rs4862662
SNP染色体部位: 187355656
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 32821
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,27|T,11) アフリカ系アメリカ人 (G,23|T,13) 全体 (G,50|T,24)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,48|T,72)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 812):
GGAGAAAATGTGTCCTATGTATTTCCTTCCCAGTTCTTTGAAAGAGAGTGATAGGAAAAAGGAACACTATTGAAGGAAGGACTGCCCAGTTTCAAACAGG
W
ATTTATTTTTCTCTCCTAGGCTTCCCCTGCAGGATGTTTGGCGCATCTATAGTGGCATTTTAAATCTGTCAGACATTACAAAAGATACACCTTTCTCACA
Celera SNP ID: hCV15968043
公開SNP ID: rs2292423
SNP染色体部位: 187412716
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 89881
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,13|T,27) アフリカ系アメリカ人 (A,6|T,30) 全体 (A,19|T,57)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,68|A,48)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 813):
GCTTGCCATCGAGACATTTATAAAGGAGTTGATATGAGAGGAGTCAATTTTAATGTGTCTAAGGTTAGCAGTGTTGAAGAATGCCAAAAAAGGTGCACCA
R
TAACATTCGCTGCCAGTTTTTTTCATATGCCACGCAAACATTTCACAAGGCAGAGTACCGGTGAGTACAATTCAAGGTGTGTGTTCTTTGTATTGGTGCC
Celera SNP ID: hCV22272267
公開SNP ID: rs3733402
SNP染色体部位: 187395028
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 72193
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,11|G,17) アフリカ系アメリカ人 (A,19|G,3) 全体 (A,30|G,20)
SNP型: ミスセンス変異;INTERGENIC;未知
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,14|G,18) アフリカ系アメリカ人 (A,21|G,7) 全体 (A,35|G,25)
SNP型: ミスセンス変異;INTERGENIC;未知
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,15|G,21) アフリカ系アメリカ人 (A,27|G,7) 全体 (A,42|G,28)
SNP型: ミスセンス変異;INTERGENIC;未知
SNP供給源: dbSNP; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,56|A,58)
SNP型: ミスセンス変異;INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 814):
CTGCTTCCCTGTGGGTTCCGGCTTCTGCAGAGCTGTAAGAGTTGAATGCCACACACAGTCACACTAAGGAATGCTCCAGGATTGGGAAAGAAAATTCAAC
M
TTATAATGAGAACACTGTGAATGCTATTGAATTAACTACTCCCCTCTCTCCCTATTTCTTGTAAGTCTTAGTGTCAGTAAACTAATTATAAATTTACATT
Celera SNP ID: hCV25474413
公開SNP ID: rs3822057
SNP染色体部位: 187425146
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 102311
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,16|C,14) アフリカ系アメリカ人 (A,7|C,11) 全体 (A,23|C,25)
SNP型: イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,16|C,18) アフリカ系アメリカ人 (A,12|C,20) 全体 (A,28|C,38)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,57|C,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 815):
AGGATCTGAACACAGAGAGCGGCGGGGCCGGCGGGGAAGGAGGGAGGAGGGGAGAGCGCTGCTTCCCTGTGGGTTCCGGCTTCTGCAGAGCTGTAAGAGT
K
GAATGCCACACACAGTCACACTAAGGAATGCTCCAGGATTGGGAAAGAAAATTCAACATTATAATGAGAACACTGTGAATGCTATTGAATTAACTACTCC
Celera SNP ID: hCV25474414
公開SNP ID: rs4253399
SNP染色体部位: 187425088
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 102253
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,12|T,18) アフリカ系アメリカ人 (G,1|T,15) 全体 (G,13|T,33)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,16|T,14) アフリカ系アメリカ人 (G,1|T,25) 全体 (G,17|T,39)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,7|T,19) アフリカ系アメリカ人 (G,0|T,14) 全体 (G,7|T,33)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,71|G,47)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 816):
AACCCATCTCTACAAAAAAATATGAAAGTATCTGTGTGTGTGTGTTGCTGTGTAGTGGACTACAGAACTTTAGAGGCAGTCACTTATTTGAATCCCATTG
Y
CGTAACTTTCTACTATTTTATTTTTCCACTGTGACTCAGGGAGATTCAGGTGGTCCCTTAGTTTGCAAACACAATGGAATGTGGCGTTTGGTGGGCATCA
Celera SNP ID: hCV25634754
公開SNP ID: rs4253331
SNP染色体部位: 187416129
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 93294
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,5|T,35) アフリカ系アメリカ人 (C,0|T,24) 全体 (C,5|T,59)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,110|C,10)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 817):
AATGAGTGAGATGATATTTCGAAGAATAAAGATGCCCTGGCTTTGGCTTGATCTCTGGTACCTTATGTTTAAAGAAGGATGGGAACACAAAAAGAGCCTT
M
AGATCCTACATACTTTTACCAACAGTGTAAGTCCCTGACTTTTACAATTGTGGTAAAATAGACATAACATAAAATTTCCCTTTATAACCATTTTAACTGT
Celera SNP ID: hCV25990131
公開SNP ID: rs13146272
SNP染色体部位: 187357205
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 34370
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,22|C,16) アフリカ系アメリカ人 (A,7|C,11) 全体 (A,29|C,27)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;ESE SYNONYMOUS;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,45|A,75)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;ESE SYNONYMOUS;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 818):
CTCACAGGTGAAATCCAAAATATTCTACAAAAGGTAAATATTCCTTTGGTAACAAATGAAGAATGCCAGAAAAGATATCAAGATTATAAAATAACCCAAC
R
GATGGTCTGTGCTGGCTATAAAGAAGGGGGAAAAGATGCTTGTAAGGTAACTCATGAGATTATGAAAAACACAATAGGCTGCTTGAGAAAATTCATTTCA
Celera SNP ID: hCV3230016
公開SNP ID: rs4253325
SNP染色体部位: 187415467
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 92632
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,2|G,38) アフリカ系アメリカ人 (A,3|G,31) 全体 (A,5|G,69)
SNP型: ミスセンス変異;ESE
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,107|A,13)
SNP型: ミスセンス変異;ESE

コンテクスト (配列番号 819):
CCTCTAACAGTAACATATTACAGAATTAGTATATTCATCAAAATGAGAAAACAAACCTTTGTCCAATACTGGTCACAACTTTCTCATCTTGATTGAATTT
M
AAATTTGATGTTTTTCCCCAGAATTTTTTCAGCAGATCATTGAGTACACAGAGGAATACCGCCACATGCCGCTGCTGAAGCTCTGGGTCGGGCCAGTGCC
Celera SNP ID: hCV3230083
公開SNP ID: rs10013653
SNP染色体部位: 187352626
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 29791
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,12|C,24) アフリカ系アメリカ人 (A,20|C,6) 全体 (A,32|C,30)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|A,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 820):
CTTAGAAAAATAAATGAAAGAAACTAGCATATTTTATAAGAAAATGTGTTAACTAGGGTGCATCCAAGTCCAAACAGAAGCATGTGATTATCATTCAAAT
Y
ATACAGGTCATCGCTGAACGGGCCAATGAAATGAACGCCAATGAAGACTGTAGAGGTGATGGCAGGGGCTCTGCCCCCTCCAAAAATAAACGCAGGGCCT
Celera SNP ID: hCV3230096
公開SNP ID: rs3817184
SNP染色体部位: 187359298
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 36463
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,28|T,12) アフリカ系アメリカ人 (C,13|T,3) 全体 (C,41|T,15)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,71|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 821):
ACTAGGGTGCATCCAAGTCCAAACAGAAGCATGTGATTATCATTCAAATCATACAGGTCATCGCTGAACGGGCCAATGAAATGAACGCCAATGAAGACTG
Y
AGAGGTGATGGCAGGGGCTCTGCCCCCTCCAAAAATAAACGCAGGGCCTTTCTTGACTTGCTTTTAAGTGTGACTGATGACGAAGGGAACAGGCTAAGTC
Celera SNP ID: hCV3230099
公開SNP ID: rs3736456
SNP染色体部位: 187359349
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 36514
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,4|T,34) アフリカ系アメリカ人 (C,2|T,12) 全体 (C,6|T,46)
SNP型: ESE;転写因子結合部位;UTR5;サイレント変異
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,112|C,8)
SNP型: ESE;転写因子結合部位;UTR5;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 822):
CCCTTTATAATGCAGAAAATGTGGAGGTGGGTACATGTGAATATGATCAGTATTGTACTGTGTATCTGACAGTGTGAGAATCTCACCAGAATCAATATAA
Y
GTGTCCTTATATTTCAGCCATTTCAGCACAAAAAACATTCCACTAAGTATTTTAGACTATATAGGTGCAATTTAATGCTTTCCAGGTATAGCCCGAATCC
Celera SNP ID: hCV3230084
公開SNP ID: rs7682918
SNP染色体部位: 187352835
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 30000
SNP供給源: dbSNP; Celera;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,71|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 823):
AGTTATGACAAGAATAATCATTATAGTACTTTTCAGATTTTATAACCTGGAGCAGATTATTTTAAGTTGATTAGTAGGTTCTGTTACAGTTTTTCTTTTG
W
TCGTGCACTTATAGTCTTCATTTAATTCCTCATAGAATCCCAGTCACCTTTATATATCATATTATTGGAAGAGATTCATCTTCATAATCTCCAGTTTTTT
Celera SNP ID: hCV3230113
公開SNP ID: rs1053094
SNP染色体部位: 187370025
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 47190
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE;
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,60|T,60)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 824):
TATTTAACATTCCTCTCAAGCAAATACGCCTTGAAATGCTTTTTTTAAATCATAGGAATTTAAAAACACTTTACAATAGAGAATGATTGATTTTTAAAAT
R
TGTCTGATTTAGCTTTGTAGAGATGTTCCGCTAATATCCATAACTAATCTGAGAGGAAATGTGGAACAACAGAAGAGTAACAGTGTCTACTCAGTAACAA
Celera SNP ID: hCV8241630
公開SNP ID: rs925451
SNP染色体部位: 187424563
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 101728
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,69|A,35)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 825):
TAAAGCGGGGATGGTATTCACAACATTTAACTTATAGGGTCCAAGCACTGACCAACCTGACCATTAGAACAGAGTGTGGTCTCTGTACAGGGCAGATGGC
R
CTGAGTGGGTATTCTCCACAGAAAGAGAAACGAAGACAGTACCCCACTCCTCCAACCCACCACCCACCACCAATCCCACCACCAATTCCACCACCAATCC
Celera SNP ID: hCV11786258
公開SNP ID: rs4253303
SNP染色体部位: 187410540
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 87705
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,72|A,42)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 826):
GCAATTTTTACAACCTGAGTTCAAGTCAAATTCTGAGCCTGGGGGGTCCTCATCTGCAAAGCATGGAGAGTGGCATCTTCTTTGCATCCTAAGGACGAAA
R
ACACAGTGCACTCAGAGCTGCTGAGGACAATGTCTGGCTGAAGCCCGCTTTCAGCACGCCGTAACCAGGGGCTGACAATGCGAGGTCGCAACTGAGATCT
Celera SNP ID: hCV15793897
公開SNP ID: rs3087505
SNP染色体部位: 187416480
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 93645
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,12|G,108)
SNP型: MICRORNA;UTR3

コンテクスト (配列番号 827):
CTCAAGTTGCTCAGGGTCTCATATCAATGATAAACTTAGTCCAAATTTAAAAGACAATGCAAATTTGATATTTATGGGATAAATATTACAAACCCATGCT
R
TTGAAATTAGTCCTCCAAAAAGCTGTAGTCTTTTTACTTGTTGAAAGGTCTGGGGAAATCATCTTGTAGTATGGTGAGAAAAGGATTTGGGTCAGGAAAC
Celera SNP ID: hCV26265231
公開SNP ID: rs7684025
SNP染色体部位: 187353221
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 30386
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,66|A,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 828):
TTAGAGCCTTTCTGTTTCTCTCAATAGGGTTGGAGAGTTATCCTTATCTTCTTTTTATTGGGGCTTAAGAAGAGAGATGAGGTTCCATGGAGTAAACAAT
W
CAAGGATATAAGGACCTCATATAATCTCACGTATCCATTTTCCATGAAAGCCATTCTTGGCACGAATTTGCCATTCTATGTTTGAGCCTCATAAAAGGCA
Celera SNP ID: hCV27477533
公開SNP ID: rs3756008
SNP染色体部位: 187422379
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 99544
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,71|T,47)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 829):
ATGGGTGCCAACTTGGAGCCTGGGGTTGCTGGGGCTAACGTGGAGGCTAGATAGAGTCTTGGGGGCCAGGCTAGAGCTGGAGCAGGCCTGAAGTCTAGGT
Y
TTGTGTGGCCATCTTGGAGCCTGAAGCCCCAGGGGCTGACCTGGTCTGGGGTGAGCATGGGGCTGAGGCCACAGAGGCTGGTCTGGCCTGTGGCAGGCCT
Celera SNP ID: hCV27902808
公開SNP ID: rs4253236
SNP染色体部位: 187385065
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 62230
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,46|C,74)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 830):
TGCTAACAGGCCATGGACCAGGTACTGTTCTGGGCCCCGGGGGTTGGGAACCCCTGCTCAGAGACACACCGGGTGGTAGGAGGAGCTAAAGGTGGAGAGG
S
TGAAGGAAAATATGAGGTCTGGGCTATCCACAAACCAGATAGCAGGAAACTGAAGAGTTAAACATTTACTTCAGAATTGAATGGCTTTTGTAAAATCTGG
Celera SNP ID: hCV28960679
公開SNP ID: rs6844764
SNP染色体部位: 187418527
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 95692
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,61|C,53)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 831):
TTGAAGGATCTATGATCAGCTGCTTCACCGCCATGTGACTTTATGAATAGAGACGTGTTAAAGCGGGGATGGTATTCACAACATTTAACTTATAGGGTCC
R
AGCACTGACCAACCTGACCATTAGAACAGAGTGTGGTCTCTGTACAGGGCAGATGGCGCTGAGTGGGTATTCTCCACAGAAAGAGAAACGAAGACAGTAC
Celera SNP ID: hCV32291301
公開SNP ID: rs4253302
SNP染色体部位: 187410482
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 87647
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,97|G,21)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 832):
GACTCGTCAGCCAGTGAGTAGGTCTGGGTAGCAGTTGGCATGGATGAACATGCCCTCCATAGGCTTTCAGACCTTCTTCAAGGCCAAAGGGAAGGCCTTC
R
TGGAAATATAATTATGTGAAACACCCCAGAATTTTTTCACAAACTTTCCTGCCTATAAACGCCAGGTCCTACCACTGTCCAGTGTCCCACTTCCCACTGT
Celera SNP ID: hCV3230025
公開SNP ID: rs3756009
SNP染色体部位: 187423105
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 439
SNP部位ゲノム: 100270
関連した照会SNP: hCV25474414 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27477533 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,60|G,40)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 37
遺伝子記号: LOC200420 - 200420
遺伝子名: LOC200420
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 440):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 833):
GTCCACAGAGAGATGAAACAGCTGCAACCGCTTCTCCCTCAAGGTGGGATCATCAACGGGCAGAGCTCCTACTGTGCCCACCACCTTCTCTTCAGATTCA
S
CCACCCAGAAGCAGGAGCCACACTCACTCAGGTAGGATTTGGTGATGTCAGACATGTCTGTGCGCAATGCTATGTCTACATACCGCGTCCAGGGTTTTTT
Celera SNP ID: hCV11541681
公開SNP ID: rs2001490
SNP染色体部位: 73781606
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 440
SNP部位ゲノム: 66052
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|G,10) アフリカ系アメリカ人 (C,18|G,14) 全体 (C,28|G,24)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,40|G,80)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3

遺伝子番号: 38
遺伝子記号: LOC387646 - 387646
遺伝子名: leucine rich repeat containing 37, メンバーAファミリー 偽遺伝子
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 441):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 834):
GAGCTGGGGTCTCCTGCCGAGTCTGAGAAGATTCAACCTCCCCAGAAGACTCAGAAGGCTGAGCTGGCTGCTCCTGCTCACTAATGGAAAGTTCACGCTC
Y
GTAGGATGACATGGAGGCTCGGTTGGGGCCTACTGTTGGGTTGCAGAAGGTTCCACCTCCTCTGGAAACTGAACTGGAGCCTCCTGCTGGGCTTGGGAAG
Celera SNP ID: hCV2706410
公開SNP ID: rs7896532
SNP染色体部位: 27579513
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 441
SNP部位ゲノム: 13277
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|T,6) アフリカ系アメリカ人 (C,3|T,1) 全体 (C,3|T,7)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;UTR3
SNP供給源: Applera;Celera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;UTR3

遺伝子番号: 39
遺伝子記号: LOC644269 - 644269
遺伝子名: Ｇタンパク質経路抑制因子1アイソフォーム1に類似
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 442):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 835):
AAAATAATTTTGAATGATACTTCAATTAATCCTTTTATATTTTATAGTTGCAAGTAGAATATGGAAAATGTCAACTACAAATGAAAGAGCTGATGAAAAA
R
TTTAAAGAAATACAGACACAGGTAGAGTATAAATGAAAACATAAAAAACAAATTACCAGGCACAGTGACTCACACCAGTAATTTCAGCACTTTGAGAGGC
Celera SNP ID: hCV2744023
公開SNP ID: rs369328
SNP染色体部位: 90621963
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 48932
SNP供給源: dbSNP; Celera; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,50|G,70)
SNP型: 転写因子結合部位;ESS SYNONYMOUS;サイレント変異;PSEUD
OGENE

コンテクスト (配列番号 836):
AGTGGGGAAATAATTAGGTAGCTATAGTGGGGTCCTGAAACAAATCGAAATGGCAAGAATGGGAATAAATGGGAGAAATATTTCAGAGGTAGCATCAGTA
R
ATCAGTAGTCTGTTAGGGAATGTTAGTGCTACTCCAAGAAATTAGAGAAATGAGGAGGTGAGCAGATATGGATGGAAAGATGATCTCTTGTTTTGGACTT
Celera SNP ID: hCV996140
公開SNP ID: rs457665
SNP染色体部位: 90603031
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 30000
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|G,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 837):
GAAGGTGAGGAAAAGTGAAAAAGACCCATTTTCCAAGAGATTCTGATACATTTTTCTTCCTCCTCTCCTTCCTCTCCTTCCAGGAGAATCACTGGCCTAT
R
TGATTTCAAGAGTGTAATCTCACGTATCACTAAGGTGCTGATGAGTCCCAAATCATAATACCTACCATGCCTTTTCTGTATGACATTTCCAGCTGTTGGA
Celera SNP ID: hCV996141
公開SNP ID: rs409320
SNP染色体部位: 90598857
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 25826
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,50|G,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 838):
CACATTGGTAAGCTTTGAGAAAAACCCAGAATCGTATATAGAAAACCTTCCCCCGAGCTAAGAGGGAGCCAGGAGACCAAAGGATGACTCACAAGTCCAG
S
TTGGTGAATAGATACATTTACTAGGACTAATAAGTTTATTTATTACAAGGCACTCCTGGATGGCAGCAGGACAGCTGTAGAGATCCATGCTGCCCTTTGT
Celera SNP ID: hCV2950250
公開SNP ID: rs292259
SNP染色体部位: 90609662
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 36631
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,34|G,86)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 839):
GGGAGGGGCTGACGCGCCCGCGTGGACTCGCACAGCAAGATCCTGGACGCCCGGGATGTGGATCAGCGCAAGCACCACCTTCGAGAAGTCTCTGCGGATC
R
GCAGGGAGTTTCAGCACCGCGCCAAAGGCCGGATGCTGAGGGTAGCTGTGCTGCGCAACCAGATCCACGTGAAATCCCTTCCAGAGAAGGGAGCCCGGGG
Celera SNP ID: hCV2956500
公開SNP ID: rs11755610
SNP染色体部位: 90654149
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 81118
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,71|A,49)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 840):
TTTTCGCACCTATCAATGCTCAGGCTGAGCTCCTGAGGCTAGACCTACCGGCACCCCCCATTCCTACAGGTTCTATAAGGCAAGTCAGGTATTCCACCCT
S
TAAAAAGCTCTTCTCTCTCCTGCCCCGCTAGACTAGTATCCCCTCCTTAAGGCTCCCAACATCCGAAGCTAAGTTGTTTGTCTGCCTATCATCCAGGAAC
Celera SNP ID: hCV3180831
公開SNP ID: rs456671
SNP染色体部位: 90595803
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 22772
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,34|G,86)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 841):
TTTGTTAGTATTGGTCTAGAAAGGCCTTTGAGGGCTGATTTAGCCCTAGAGTGTGGCCCTTCTGGGTTCCACACTAATTATGCCAGTATTCAACTTGGTC
K
TTCCACTCCAACTAGTAGGAGTTGAACATCTCCTACACAGAAAAACTCCAGTAGTTATTCTTTGCATAGCTCACGAAATTTCCCTAAGAAGACACAGCTT
Celera SNP ID: hCV3180835
公開SNP ID: rs292222
SNP染色体部位: 90574908
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 1877
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|T,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 842):
CAGTGGTTTTGTAGTGCTAGGGCTCTCCAACATGGGGCTTGTCCCCTTCCCTCTCTTTGAACCCTTAATACCAACTAGAGGGTTGGCCATCAGTCCTTCT
S
CAGTGCATACTCTCACTCAGAAGATCTCATACCACCAGGTAAGTGAGTTCACAAACAATATGATAACCGAAAGATACTACTGGTTCAAAAGAAAACTGGA
Celera SNP ID: hCV11569192
公開SNP ID: rs2585018
SNP染色体部位: 90641439
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 68408
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,50|G,70)
SNP型: 偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 843):
CTGCCTTCTCACAGCAAGTACTAGAACGGTGAACCATATCTCTGCTGCAGGTGTCCTCACAGATAAAATTAGAGTAGCACAAGAGCTTTTTGGGTGAAGC
K
TTGGAGAAAACAGGTGTAAGGATTGATTAGCTTGGGCATTACTTCTTCACCCTTCAGCCTTCAGACTCACAGAACTTCTCAGTTAATAATCTAGGCCCTA
Celera SNP ID: hCV11569204
公開SNP ID: rs9344968
SNP染色体部位: 90641145
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 68114
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,73|G,47)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 844):
TTCTTTCAGTTGTCATTACCCTTTTAGTTTTTGCCTGCTTTAGGTTGTTCTCTAGCTCTTTAGATAGCTTCACATATTTTATTTAGTGTCAACAGTAGTT
R
CCTGCAGGAGGATTGGTTTCATAGAAACTACTCTGCTATAACTGGAATTGGAACTCTTTCAGTAGAATATATATATATGAGACAGGATCTCGCACTGTCA
Celera SNP ID: hCV26081278
公開SNP ID: rs2585008
SNP染色体部位: 90618600
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 45569
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,47|A,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 845):
TCTAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACACAAAACAAAACAAAAAACAAATTAAAAAAACAGAAATGTGTTGTCTCACAATTCTAAAGT
Y
TGGAAGTCCAAGATCAGGGTGTCAGCAAGGCCATATTCCTTTGAAACCTATAGGGGAGAATCCTTCCTTGCCTCTTCCTAGCTTCTGGTTGTCATCATCA
Celera SNP ID: hCV27392140
公開SNP ID: rs12661693
SNP染色体部位: 90576943
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 3912
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 846):
GACAATAAATCTGCTGGCTCCTTGATCTTGGATCTCCCAGCCTCTAGAACTGTAAGAAATTTTTGCTTGTTGATTAAGTTAAAGAGGTTCAGAACGTGCA
R
CCCCGAAACAGACCATTTTGACATACTGATTATTTTGAAGTAAAGAAAAATCAGAACCAGCCAACTCAGTGAAACGTCTTTACCTCCCCAATTGCCTAAA
Celera SNP ID: hCV30749473
公開SNP ID: rs12661230
SNP染色体部位: 90592188
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 19157
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,73|G,47)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 847):
GCTCCCCTCTCCATGTGACCACTTACAGCTACTAATAGTAGATTTCTCATTAGGAAACCTCTGAGTATCTGATTTCACCAGTTGAATTTTGCTTTGCAAA
S
AGTCAGTTGTGTTATTTACCAAACGTGATCGTGTTATTTGTGCTTTTTGTAATTGTGCAGGCTATTTTATAACAGCTAATCAAATGAACTAATTGAAACA
Celera SNP ID: hCV30580828
公開SNP ID: rs9344964
SNP染色体部位: 90608926
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 442
SNP部位ゲノム: 35895
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|C,46)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 40
遺伝子記号: LOC646037 - 646037
遺伝子名: CG11835-PAに類似
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 443):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 848):
TTCAACCTCTGTCGTTGATTCTGGAATGATGGTAAGTCCCAGGTCCAAAGGTTGAACAGTGACACTGGGCAATGTTGAATTCTGAGCTGGATCCTGGCCT
R
GTGTTGGGACTGTCACCTCATAATGAGCTGGAGGTTGAGCTGCAACTTCCTTAGGTGGCTCTGGAAGCTGAACTGGGACCATTTGCTGCCTTGAAGATTC
Celera SNP ID: hCV1547677
公開SNP ID: rs6505228
SNP染色体部位: 26399303
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 443
SNP部位ゲノム: 9642
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,24|G,0) アフリカ系アメリカ人 (A,11|G,21) 全体 (A,35|G,21)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|G,0) アフリカ系アメリカ人 (A,10|G,24) 全体 (A,44|G,24)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,119|G,1)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子

遺伝子番号: 41
遺伝子記号: LUZP1 - 7798
遺伝子名: ロイシンジッパープロテイン 1
染色体: 1
OMIM番号: 601422
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 444):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 849):
GGCTTGGAAGTCCCCTTCCACGCTTTACTGTGCTCCTGAGCAGCCGGGGGGTAGCGACTCAGCACTGAGGGCTGCTCCCTAGACTTCTTCCCTTCGCTCT
K
GGAGGAGCCGGGTACAAACCGGTCTTCAGTTTTCTTTGTCTCCTGAGTCCCACTGTCTGTACTCACCCCCATGTGAGAAGCTTTTGCTGCCCTCCTGTTG
Celera SNP ID: hCV2494846
公開SNP ID: rs3765407
SNP染色体部位: 23291961
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 444
SNP部位ゲノム: 17923
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,8|T,30) アフリカ系アメリカ人 (G,15|T,23) 全体 (G,23|T,53)
SNP型: ミスセンス変異;TFBS SYNONYMOUS
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,12|T,108)
SNP型: ミスセンス変異;TFBS SYNONYMOUS

遺伝子番号: 42
遺伝子記号: MCF2 - 4168
遺伝子名: MCF.2 細胞株由来形質転換配列
染色体: X
OMIM番号: 311030
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 445):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 850):
TGTACAAACTGGGAGACACACACACACGAAACAATACTACATTACCCGATACAAATTGTCTTACTTTCCAACAGTGTTTAAAACTGTATGACGGGTATCT
R
TCAGAGCCTTCTCCACTTTCAACACGCCTTTTGCAAAAAACAATGGCTTTTTCATACAAGAAAAGGTGTCGCTGCATTGGTTTGAATCTAGCCAAATCCT
Celera SNP ID: hCV15952952
公開SNP ID: rs2235708
SNP染色体部位: 138506410
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 445
SNP部位ゲノム: 24814
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,88|A,2)
SNP型: ESS;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 851):
GTTCTAATACTTACTAAATAATAAGCATTTTCCTCAGTGAAAGTCTGTTGAGTGAAACCAGGTTGATTTCTGACTAGACCCAAAACAAAATCACTGACCT
R
ATTTCTCTTCAAGTCAAGTATTTCTTCTGCTCTCCTACACTTTCCACAATGTATTATGAAATTTTTCTCTTAAGAGAATGTAAACGCTTAGATGTCAGGG
Celera SNP ID: hDV70941043
公開SNP ID: rs17342358
SNP染色体部位: 138482244
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 445
SNP部位ゲノム: 648
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,88|A,2)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 43
遺伝子記号: MDN1 - 23195
遺伝子名: MDN1, midasin ホモログ (酵母)
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 446):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 852):
TAATGCAGTAATTTGTGAGTTTTACTACCTGGAAGATCGTGTCCATGAGGAATTGATGAGCTGTATGAATGGTAGACTCTCGGCTTCTTTCTGGTTTCTC
M
TTTTCTGTCTCCTTATGGGCTTTGTCTGTTCTGGGGTCTTGGTCTTCCTCTGTTTTAACAGTTTGGATCTCCACTTCCATCTCATCAAAGCCTATTTTCA
Celera SNP ID: hCV25752810
公開SNP ID: rs4707557
SNP染色体部位: 90419504
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 19552
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|C,2) アフリカ系アメリカ人 (A,22|C,4) 全体 (A,60|C,6)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;UTR3;ESE SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,117|C,3)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;UTR3;ESE SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 853):
AATAACCCACAGTTGTACATTCTTTCAGAGAAGGGCATAAAGTAGGAAAACAGCCACTTGTTGAACAAGCTGTCTTGTTCTGCATACTTTCAACATTAAA
R
CTGGATGAAATATGAACATAAAATTATGAGGAATGAGAACAAAATGGTGTTATATATTGGTTTTAAAACTGAAGTGGAGTAGGTGGGTTTGGAAAAAAGC
Celera SNP ID: hCV2012677
公開SNP ID: rs1470263
SNP染色体部位: 90518146
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 118194
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,87|G,33)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 854):
TTTCTTACACCCTACTCAGCTTTATATGTTTTCACTTATCACAACCTAAAATTACAGTACCTGACTCCTCTAGAATTAAAGCTCAATGAGAAGAACCAGG
W
TTTTTGTCTGCCTTACTCATAGCTATAACCACAGCACCAGGGCACTCAATAAGTATTTGTATTAAGGAAGAGAAAAAATACACAAACACACAGTAAAACA
Celera SNP ID: hCV2012681
公開SNP ID: rs6918308
SNP染色体部位: 90521959
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 122007
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,71|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 855):
GGACAGCAAACAGTAGAGATGTCCATGCCCTGGGATTAAAATTGGGGCAATGAAGTGAACGGGTCCAAATCCCTCTCTCACATCCACACACTCTTTCCCC
R
GAGACACACATGGTGAGAGAAAGAATCCAGAGTTCACTAGCTGTCATCAATTGCATCTTTAAAAATAGTAATAGATCCAGCAATCTCACTTCCAGGTATT
Celera SNP ID: hCV2012686
公開SNP ID: rs9362676
SNP染色体部位: 90526820
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 126868
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,87|A,33)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 856):
TAAATTCCTCTGGCTAAGGAGCTAGGAAATTAACTTAAATTTGAATATTTGGGGGAGGTAAGAGATAATTTTTTAAAAGGTTGAAAAACATTGCTCTAGC
Y
TAAACATACGATGTCTAAGAGGCACTAGTTATTCCTAGAAAATCTTAAGTACCCAATTTTGTATGGCATACCATTACAATTCAGGAAGAATGAGATAAAT
Celera SNP ID: hCV2012692
公開SNP ID: rs4707565
SNP染色体部位: 90529981
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 130029
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,65|C,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 857):
ACTTTGCAAATCCTAGCTTCGGGCAAAGAAGAGCAATTAGTGTTGACCACTGGGTACATGGTTCAAGGAGAACTGACTCATATAGTGCTGAGGTAATATC
M
AAAGACTGCTTTCTAACTGCAAGGGAAACACTAGGTGTGCAATACCTCATGGTCATTATCTTAACCTAGTACTCAATCTTAGCAACTACCAGTGAGCCAA
Celera SNP ID: hCV2012696
公開SNP ID: rs4142648
SNP染色体部位: 90543492
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 143540
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,87|C,33)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 858):
TTTTCGCACCTATCAATGCTCAGGCTGAGCTCCTGAGGCTAGACCTACCGGCACCCCCCATTCCTACAGGTTCTATAAGGCAAGTCAGGTATTCCACCCT
S
TAAAAAGCTCTTCTCTCTCCTGCCCCGCTAGACTAGTATCCCCTCCTTAAGGCTCCCAACATCCGAAGCTAAGTTGTTTGTCTGCCTATCATCCAGGAAC
Celera SNP ID: hCV3180831
公開SNP ID: rs456671
SNP染色体部位: 90595803
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 195851
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,34|G,86)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 859):
TTTGTTAGTATTGGTCTAGAAAGGCCTTTGAGGGCTGATTTAGCCCTAGAGTGTGGCCCTTCTGGGTTCCACACTAATTATGCCAGTATTCAACTTGGTC
K
TTCCACTCCAACTAGTAGGAGTTGAACATCTCCTACACAGAAAAACTCCAGTAGTTATTCTTTGCATAGCTCACGAAATTTCCCTAAGAAGACACAGCTT
Celera SNP ID: hCV3180835
公開SNP ID: rs292222
SNP染色体部位: 90574908
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 174956
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|T,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 860):
GACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTCTATCTTAAAAAATTGTGTACAAATGCTCAAAAATGGACTGTAGCGGGTTCTGTTCTTGTGGTCGG
Y
GGCTGTGTTGCTCTCTGATAAAGGTATGTGGTTGTTGGCTGCAACCCCTGGGCTGGGATGATTCACGTTCCTGGTGGAGGCAGGGGAGCCCAGCTGGAGC
Celera SNP ID: hCV11420034
公開SNP ID: rs9351219
SNP染色体部位: 90563902
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 163950
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,78|T,34)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 861):
CTATCCTTGTCCTCTGGACTGCCTTTTTCAGCTAATACCAGAGACTTTTCTACTTCAAGGACACTAAAAGAAAAATTGAAGAACAGTGAAAAGGGCTTAT
R
CAATCTTTCTGTTTTACAATCTTCAATGCTCTTTAAAAGAAAAAAAAAAGTTATCTTCTTTCTACTGAATTTTTACTTTAGTTAATGGTTTCCTATCACA
Celera SNP ID: hCV15840762
公開SNP ID: rs2180140
SNP染色体部位: 90506856
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 106904
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,85|G,33)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 862):
TCTAGCCTGGGCAACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACACAAAACAAAACAAAAAACAAATTAAAAAAACAGAAATGTGTTGTCTCACAATTCTAAAGT
Y
TGGAAGTCCAAGATCAGGGTGTCAGCAAGGCCATATTCCTTTGAAACCTATAGGGGAGAATCCTTCCTTGCCTCTTCCTAGCTTCTGGTTGTCATCATCA
Celera SNP ID: hCV27392140
公開SNP ID: rs12661693
SNP染色体部位: 90576943
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 176991
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 863):
TGTTTTAAACTGGTTACTTATTTTTAAGTCGGGGGGGGGACCTCTTATTTTATAAATTATCTTCATTAAAAATAATCAGGAATGAGAAGGTTAGACCTGT
Y
ATCACTTCCAACTAACCTTGCTTGAAGTAGACCCAGAGAACTCTATTACAGGACCTCTGGCTCAGCATGCAGACTTACGAGTAAGTGGCTCCAGAGTGAA
Celera SNP ID: hCV28980044
公開SNP ID: rs6923604
SNP染色体部位: 90554169
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 154217
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,71|C,49)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 864):
GACAATAAATCTGCTGGCTCCTTGATCTTGGATCTCCCAGCCTCTAGAACTGTAAGAAATTTTTGCTTGTTGATTAAGTTAAAGAGGTTCAGAACGTGCA
R
CCCCGAAACAGACCATTTTGACATACTGATTATTTTGAAGTAAAGAAAAATCAGAACCAGCCAACTCAGTGAAACGTCTTTACCTCCCCAATTGCCTAAA
Celera SNP ID: hCV30749473
公開SNP ID: rs12661230
SNP染色体部位: 90592188
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 192236
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,73|G,47)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 865):
CAACGGGAACCAACCTGACACCTCAGAGAACTGAGGATATAAACTACAAACAACCAAACAACTAAAGAGCAAGATTTTCAAACCGTCTTCTGCAGAAAGG
Y
ACCTTGGGAGCCACTTAAATGCCAAGAAGGTCCATAACACCTGCCTTCATGGAAAATAACTTTGCTTATATCTGTTACATACACTGGAACCACATGTAAG
Celera SNP ID: hCV30238224
公開SNP ID: rs6910277
SNP染色体部位: 90532997
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 133045
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,69|T,47)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 866):
ATGATGGCCAGTATAGTCTCAATCTCTTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAAAGAAAGCACCCGGCCAA
Y
AGTTTGTTTTAATGAAACAGAATGGTTCATTAAAGTATTGACTAATGTACCAATACTTGGTACATTAACCAATGTAATACAGAAGTATTGTTTACAAAAG
Celera SNP ID: hCV30749435
公開SNP ID: rs7762262
SNP染色体部位: 90501630
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 101678
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,84|C,26)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 867):
AAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGAAAGAAATCAGGAAGAGGCAAGAAAGCATTCTCCCCTAGAGCCTTCAGAGGGAGGAGCATGGCCCTGTCGAAAC
M
TTGATTTTACACTTCCAGCCTCCAGGACTGTGAAAGAATAATGTCATTGTTTAAAACCACCAAGTTTATGGTAATTTGTTATGGCAGCCCTAGGATACTA
Celera SNP ID: hCV30562928
公開SNP ID: rs9342209
SNP染色体部位: 90540513
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 140561
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,87|A,33)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 868):
TGGTGCACGTCTGTAGTCCCAGTTACTCGGGAGGCTGAGGCAAGAGGATCACATGAGCCTAGGAGGTACAGGCTGCAGCAAACTATGAGGGCACCATGGT
M
CTCCAGGCTGGGCAACAGAGTGAGACCCTGTCCCCCCCCAAAAAAAGAGTTAAAATTAAATAAATAAATAAAATCCAAGACCAGCTACAGTGCCTATAAT
Celera SNP ID: hCV29986476
公開SNP ID: rs9451269
SNP染色体部位: 90535142
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 446
SNP部位ゲノム: 135190
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,70|C,50)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 44
遺伝子記号: MMEL1 - 79258
遺伝子名: メンブレンメタロエンドペプチダーゼ様1
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 447):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 869):
TCTTCTCGTGTTTACATCTCTGTTCTAGCCCTGGGCCCTGCAAACCTTAGGGGAGGTGTGCCCAGTACACAAACACACGTGTGTGCACAAAGATAGGTCA
Y
TGTCAGGGCGTGGGGAGATCGCAGGACCTGCATCAGACCAGGGCTTATTCAGATGCTGGCTCTGGCACCGCCCAGCTGGGTCACTGTGGGTAAGTCACCA
Celera SNP ID: hCV1974936
公開SNP ID: rs4648648
SNP染色体部位: 2502312
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 371
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,62|T,58)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 870):
GCTGGAGTCCTGGAGAGCAGAGTCCAGCCAGACAACCAGGACAGGGGCCGGGGAGGAACCCCCCCAACTCCTCAGGGTAAAGGCCCAGCTCTCAGTCTGC
K
GAAGTTCCCCAATCACAATACCATGCCCATCCTTCCCCCCGCCGCAGCAGCACCCAGAGGTGAGGCTGAGATCATCCCGTGCCCCCGCTAGCCCCGGGGC
Celera SNP ID: hCV31475431
公開SNP ID: rs12133956
SNP染色体部位: 2518200
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 16259
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|T,22)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 871):
TCCATCCGCAGTGGGGCACCCACTGACCAGTCCCTCCTCCCCACTCAGGCCATGAGCATCCGGGAGCAGATCGGGCACCCTGACTACATCCTGGAGGAGA
Y
GAACAGGCGCCTGGACGAGGAGTACTCCAATGTGCGCCCCCAACCCCAGCCCTAAACTGCCCCCCACACCGTGGACATGGGCCCTGATTGCCTGGGGGCT
Celera SNP ID: hCV1974927
公開SNP ID: rs3748816
SNP染色体部位: 2516606
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 14665
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|T,2) アフリカ系アメリカ人 (C,20|T,6) 全体 (C,20|T,8)
SNP型: ミスセンス変異;ESE SYNONYMOUS
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,81|C,39)
SNP型: ミスセンス変異;ESE SYNONYMOUS

コンテクスト (配列番号 872):
GCTTGCAGCCCCCTGCCCATCCCTTCCTCCTGGGGGCACCCCAGCCTGTTCTTGGAACATTCTCCTATGTCACCCCTTGCTGCCCCCGTGGGGAACACTC
R
CTCCCGTGCCCATGAGCGGCTTCGGGAGGGACTTGGCAGGCGGCCCAGAGCCTTTCCTGCAGGCAGAACAGGATGGTGGGAGGAGGCCGGACTGAGGTCC
Celera SNP ID: hCV25602566
公開SNP ID: rs3748817
SNP染色体部位: 2515525
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 13584
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,20|G,20) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,22) 全体 (A,26|G,42)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,77|G,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 873):
AGGGACCAGGCTGTGTCTTGGACCGGGAGACAGGCTTCTGGGCTGTCCACAACTCTCTCTGTCTCCCCTCTCCCTGCTCCACGCCATGGGGACGAGCAGC
Y
GCCAGGATCCTCCAGAACATGGACCCGACCACGGAACCGTGTGACGACTTCTACCAGTTTGCATGCGGAGGCTGGCTGCGGCGCCACGTGATCCCTGAGA
Celera SNP ID: hCV403768
公開SNP ID: rs10797440
SNP染色体部位: 2531129
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 29188
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|T,6) アフリカ系アメリカ人 (C,20|T,8) 全体 (C,20|T,14)
SNP型: ESE;UTR5;サイレント変異;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; Celera; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,78|C,38)
SNP型: ESE;UTR5;サイレント変異;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 874):
TGCCAGCACTGAAGCCTTCACTTTGCCCTGTGGGTGGTCTTCACTTATTCCCACAGTGACTATCTCCGCGTCCCCACCTTTACCTAATCTTCGACTGCAA
R
AGCCCTGCTTGTCGGGGCCCCACCGTGCTGAGCCGAGACACAGGACACACACAGGCCCCAGGGCTCCCCTGCCTACCCCGCGCCCCCTCCCAGCCCACCC
Celera SNP ID: hCV403772
公開SNP ID: rs10797437
SNP染色体部位: 2528866
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 26925
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,82|G,38)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 875):
CTCCTACTCAAAGTGTGGCCCACAGACCAGTGGTGTCAGCCATTGCCTGGGAGCCTGTTAGAAATTCAGAAACTCAAGGTCCAACCAAGGCCGCAGGACC
R
GTGTTGGTATTTCAGCAAGACCCCCAGGTGATTCATCTGCACATTCATGTTAGGGAAGCACTGGTTTAAAACAGTGTTGACCAAATTTGCTTGATAATTG
Celera SNP ID: hCV441460
公開SNP ID: rs4474198
SNP染色体部位: 2543618
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 41677
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,83|A,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 876):
TGACTCCCAGCATGGAGGAGGGGACCCAGGGACTCCAGCCCATGACCCTGACTCCACCTGGCACTGGGCACTTCCCTCCCACGGCCTGTGACATGGGGAC
R
ACAACACTGCCCAATACAGCAGCGAAGCCCAGATCCCAGCCTGGGAGACTCTCCAGACGGCCAGCATCCTCCACCGGGGGGTGTGCTACCCCCGCCATGG
Celera SNP ID: hCV1974928
公開SNP ID: rs3748819
SNP染色体部位: 2514826
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 12885
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,82|A,38)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 877):
CTCCACCTGGCACTGGGCACTTCCCTCCCACGGCCTGTGACATGGGGACGACAACACTGCCCAATACAGCAGCGAAGCCCAGATCCCAGCCTGGGAGACT
M
TCCAGACGGCCAGCATCCTCCACCGGGGGGTGTGCTACCCCCGCCATGGCCATGCTGACCTCCGCCCCTCGGTGGGGACTGCCCTGCCTGGGACAGGGGC
Celera SNP ID: hCV1974930
公開SNP ID: rs10752747
SNP染色体部位: 2514775
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 12834
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,82|A,38)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 878):
TTCCTTCCTCTTATTCTGGGAAGCCCCATACGCATATATTAGATCTTTTAACTAATGCGTCTTGTTGAGTCGGAGTCACATAAGTCTCCTGTTCTCTGTT
R
TGCTTTTCTTTCCCACGGGTATTTCAGTGGCTGTTTGCACCGTTTCTGTTGCCCTGTCTCTGTCTCCCCTCCATGGTCCACCTGCCACGGGGTCCAGTCT
Celera SNP ID: hCV1974933
公開SNP ID: rs734999
SNP染色体部位: 2503076
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 1135
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|A,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 879):
CTACCAAATGGCCACCTTCTTGCTGTGTCCTCATGTGGTGGAAAGAGACAGTGAGCTCTGTCATTTCTTCCCCCTCTTATGAGGGCACCAGACTTACCAG
R
TTATGCCCCCCACCAGCCCTGCCCATTGAGCTGATTTTAAACCTCCTCACAGGCCCTATCCCCAAATAGTCACATTAGGGGTTAGGGCTTCAAACCACAA
Celera SNP ID: hCV9688194
公開SNP ID: rs6673993
SNP染色体部位: 2541931
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 39990
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,82|G,38)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 880):
CTCGCACTCACCACCTCCTTTCCGTTGCTGGCCTGGGGGATTCCTTTGCTCTGAAGCTCAGCCTTGCCCTTCAGCACTTTACCTCGGTGTATGCAGCATG
Y
GGCACTTTCTCCCTGTTTCCACCGGGCGGGGGGCTCCTTGAGGGCTGGGCCCTGTCAGGCTCACATCTGAACTGCAGCATCTGGCCTGGCTCACAGTCAT
Celera SNP ID: hCV11612179
公開SNP ID: rs10752748
SNP染色体部位: 2534500
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 32559
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,83|T,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 881):
AGGCTGAGGATAGGTGGGTCTGCTCACCCCGTAAGCCCAGGGCCCCACGCCAGGCCTGGGAAGGCTGACGTGGGGGCCCGTGGGATGATCGGGTGGCCCC
V
CCAGGCGCTGTTTGGCACAATGGTGGAGGAGGTGCGCTGGCGTGAATGTGTGGGCTACGTCAACAGCAACATGGAGAACGCCGTGGGCTCCCTCTACGTC
Celera SNP ID: hCV15976797
公開SNP ID: rs2843401
SNP染色体部位: 2517993
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 16052
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,0|C,0) アフリカ系アメリカ人 (A,9|C,2) 全体 (A,9|C,2)
SNP型: イントロン;INTERGENIC;未知
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,38|C,82)
SNP型: イントロン;INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 882):
GCCATGGGGGGGTAGGTCAGAGACATCTGTGAGTCAAGCGTCAGGGGGGCACTGAGTCTAGGAGCTTTGGGGAGGAAGAAAGGGCTGCCTCCCTTTCCTA
R
AGGGCAGGAAGTCCTGCAGCCCAGAAGGTGTGGCAGGACGCTGGGCAGAGTGCTCCCTGGGCTTTGCCTGAGTCTGGGGCCCAGAGTCTCGTGCTCCTGT
Celera SNP ID: hCV15976807
公開SNP ID: rs2843402
SNP染色体部位: 2518542
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 16601
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|G,80)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 883):
AAAACCGCAGAGTATGATGTGGCGGGGAGGCAGGGAGGGACGAGGACAGGGAGCACTGCTCCGGGGAGGCGACATTTGAGACCTTAAAGGCCTGAAGAGG
Y
GGCGGGGTGATTTCCCGGGAGCAGAAACAGCCAGTGCCAGTGCAGAGGCCAGAGGCAGGAGCAGGCAGGGGCCGGACCCGTGGTCAGCAGCGGACAGGAA
Celera SNP ID: hCV16186317
公開SNP ID: rs2764841
SNP染色体部位: 2519220
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 17279
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,39|T,77)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 884):
AAAAAGAAAACTCTGCTAGAAATTTGATAGGGATCACTTTGAATCTCTCTATCAATTTGGGGAGACTTTGCAATGCTGAGTCTTCCAATCCATGAACATG
R
TATATGCTTCCATTTATGCTTCAATTTTTCTTAATAACTTTTAAAGCTTTCAGTGTCAAGTTCTTATACATATTTTATTAGATAAATTACAGGTGTTTGG
Celera SNP ID: hCV16186318
公開SNP ID: rs2985859
SNP染色体部位: 2522276
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 20335
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,37|G,81)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 885):
CATCTGCACATTCATGTTAGGGAAGCACTGGTTTAAAACAGTGTTGACCAAATTTGCTTGATAATTGGAATCACCTGGGGAAATTGTTACAAATCCAGAC
R
TTGGGCCCTCCCTCAGTTTGCCTGGGCTACAGTCACAAAATGCTCAGGTGGCTTAAAAACAGAAACATATTTTCTCCTCCTAGTTCTGGAGGCTGTGAAG
Celera SNP ID: hCV26678889
公開SNP ID: rs3890745
SNP染色体部位: 2543484
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 41543
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,82|G,36)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 886):
TTACTTTTTGACATTTCAACATGCTCCAAGCTCATCTCGTATGTTTCCTACCCCAGTTGTATAATCAACCATTTTTCTAAGGAGCCCTGGCTTCTTTTAT
Y
GGATAATGGTATCAAAAACCAACAGCTTCTAGGATAATGTGGTGTCTGAAAAACAAACAGAAACCAAGAGCTGGGTCCTATTCTTTGCTTATTGCTACTC
Celera SNP ID: hCV30497685
公開SNP ID: rs6684865
SNP染色体部位: 2536089
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 34148
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,81|T,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 887):
TAAATGAGTCTGAGCTGTTATTTTCTCTCAATATCTTGAAGATTTAGCTCTCATGCCTTCTGACTCCCCTTGCTGCTGTTCAGACGTGGCTTCAGAGAAA
M
GTACAGTCAGCCTAACTGCCGCTCCTCTGTTGGGTGAACAATCTTTTCTCCTTGAGCTATGTTCTCTTTGTCTTGGGTATTCTGAATTGTTATCATGAGT
Celera SNP ID: hCV31475405
公開SNP ID: rs10797441
SNP染色体部位: 2541520
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 39579
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,83|C,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 888):
TGCCTCCTTCCCTGGAGAAGAGACCCTGACTTCTCCCTGGAGGGAGGCCGGTCCCTGACGTGGCCTCTAGATTGCTGAGTGGCCTCTGACTCTAAGAACA
K
GCGACAACTCGGGTCCCACTGTGCTGTCTCTGGGCCTTTTCTGAGTGATGTTGTCATGCCCATGCCTGTGTGTGCCTGTGGCAGGCAAGTGGGTAGGAGT
Celera SNP ID: hCV31475429
公開SNP ID: rs10910099
SNP染色体部位: 2523412
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 21471
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,82|G,38)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 889):
GAGGTCTGCACCACCCCTGGCTGCGTGATAGCAGGTAAGCCCCGCCCCCTTGCCGTCCACAGCCTGCCCAAGGGCTGGGGGCTCCCGGCTGACACTGACG
Y
AGGCCCCGCCCAAGGCCCAGGGAAGCAACTCCAAGACACGGCGGGCGGTGGAGCCGGGTGGGCCGGACTCGGACTCGCTGTGGAGCGGGCGGAGCTGGTG
Celera SNP ID: hCV31475409
公開SNP ID: rs10910111
SNP染色体部位: 2532513
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 30572
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,74|C,38)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 890):
TGTCTCCCCTCCATGGTCCACCTGCCACGGGGTCCAGTCTGCCATCACCCGTCTCATGACACTGACCTGCAGCCCTGGGATGTCCATTTGGTTCTCTCGT
W
TAGGTTCCAATCAGCTGTGGAATTCTCCATCCAGAGATCCCGTTAGACGGCATTTCCTGTTTTTAGTAACACATGAATGAGTTATTTTAAAATACCTGTC
Celera SNP ID: hCV31475436
公開SNP ID: rs4486391
SNP染色体部位: 2502915
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 974
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|T,54)
SNP型: 偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 891):
GTGCTCCAAGCACGTGAATTCCTTTAATAGGAACTGAAACATGGATAATCTGCCCCCCACACCACACACACACATCCACATACATCCACATGCACACACA
M
GCACATATGACACACATACAGCACACACATAACATGTATACACACATAACACATATACACACATACACATACACACATACACATACACACATATACACAT
Celera SNP ID: hDV76957636
公開SNP ID: rs4073286
SNP染色体部位: 2529761
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 447
SNP部位ゲノム: 27820
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,82|C,38)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 45
遺伝子記号: MTHFR - 4524
遺伝子名: 5,10-メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ (NADPH)
染色体: 1
OMIM番号: 607093
OMIM情報: MTHFR 欠損によるホモシスチン尿症, 236250 (3)

ゲノム配列 (配列番号 448):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 892):
CCCGGGGACGATGGGGCAAGTGATGCCCATGTCGGTGCATGCCTTCACAAAGCGGAAGAATGTGTCAGCCTCAAAGAAAAGCTGCGTGATGATGAAATCG
R
CTCCCGCAGACACCTTCTCCTTCAAGTGCTTCAGGTCAGCCTCAAAGCTCCCTGCTTCGGGGTGGCCTTTGGGGTAACCTGCCAATAGGGATGACAGTCA
Celera SNP ID: hCV1202883
公開SNP ID: rs1801133
SNP染色体部位: 11778965
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 448
SNP部位ゲノム: 20591
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,14|G,24) アフリカ系アメリカ人 (A,8|G,30) 全体 (A,22|G,54)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5
SNP供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,91|A,29)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5

遺伝子番号: 46
遺伝子記号: NAP5 - 344148
遺伝子名: Nck-関連タンパク質 5
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 449):


SNP情報

コンテクスト (配列番号 893):
TGTTTTTCCTCCTCTTCAGGAGACCCACATAGAGATTTTCCAAACCCCACAAGGACATCCAGGTTCTCCACGGACTTATCGGTGTCGGCAGCCAATGACA
Y
GTCTGAAGGACTTTTCTCATCACTGCTCTCTATGTGCAGCTCATCAAACGTTTCATTGTCATCAGTGTCTGAAAGCTGGAGGTTGAGAGCCATGCGGCCA
Celera SNP ID: hCV25748719
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 133259044
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 449
SNP部位ゲノム: 129916
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,35|T,5) アフリカ系アメリカ人 (C,33|T,5) 全体 (C,68|T,10)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;イントロン

遺伝子番号: 47
遺伝子記号: NAT8B - 51471
遺伝子名: N-アセチルトランスフェラーゼ 8B (遺伝子/偽遺伝子)
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 450):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 894):
GTCCACAGAGAGATGAAACAGCTGCAACCGCTTCTCCCTCAAGGTGGGATCATCAACGGGCAGAGCTCCTACTGTGCCCACCACCTTCTCTTCAGATTCA
S
CCACCCAGAAGCAGGAGCCACACTCACTCAGGTAGGATTTGGTGATGTCAGACATGTCTGTGCGCAATGCTATGTCTACATACCGCGTCCAGGGTTTTTT
Celera SNP ID: hCV11541681
公開SNP ID: rs2001490
SNP染色体部位: 73781606
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 450
SNP部位ゲノム: 10460
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|G,10) アフリカ系アメリカ人 (C,18|G,14) 全体 (C,28|G,24)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,40|G,80)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3

遺伝子番号: 48
遺伝子記号: NLRP2 - 55655
遺伝子名: NLRファミリー, ピリンドメイン含有2
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 451):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 895):
GGGACGGCCACACCTGGGACATTGGGGACGTACAGAAGCTGCTTTCCGGAGTAGAAAGACTCAGGAACCCCGACCTGATCCAAGCAGGCTACTACTCCTT
Y
GGCCTCGCTAACGAGAAGAGAGCCAAGGAGTTGGAGGCCACTTTTGGCTGCCGGATGTCACCGGACATCAAACAGGAATTGCTGCGATGCGACATAAGTT
Celera SNP ID: hCV1376206
公開SNP ID: rs10412915
SNP染色体部位: 60186552
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 451
SNP部位ゲノム: 26973
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|T,26) アフリカ系アメリカ人 (C,11|T,21) 全体 (C,21|T,47)
SNP型: サイレント変異;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,2) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,20) 全体 (C,10|T,22)
SNP型: サイレント変異;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,9|T,21) アフリカ系アメリカ人 (C,10|T,18) 全体 (C,19|T,39)
SNP型: サイレント変異;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,82|C,38)
SNP型: サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 896):
CTTTTGGCTGCCGGATGTCACCGGACATCAAACAGGAATTGCTGCGATGCGACATAAGTTGTAAGGGTGGACATTCAACGGTGACAGACCTGCAGGAGCT
S
CTCGGCTGTCTGTACGAGTCTCAGGAGGAGGAGCTGGTGAAGGAGGTGATGGCTCAGTTCAAAGAAATATCCCTGCACTTAAATGCAGTAGACGTTGTGC
Celera SNP ID: hCV1376207
公開SNP ID: rs11672113
SNP染色体部位: 60186693
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 451
SNP部位ゲノム: 27114
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|G,2) アフリカ系アメリカ人 (C,17|G,5) 全体 (C,17|G,7)
SNP型: ミスセンス変異;ESE SYNONYMOUS;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;COD
ING REGION;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,23|G,15) アフリカ系アメリカ人 (C,29|G,7) 全体 (C,52|G,22)
SNP型: ミスセンス変異;ESE SYNONYMOUS;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;COD
ING REGION;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,67|G,53)
SNP型: ミスセンス変異;ESE SYNONYMOUS;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;COD
ING REGION;イントロン

コンテクスト (配列番号 897):
TGCCTCCTTAACAGACTTTCAGGTACTTGGGAATTTGAAACAAATCTCCTTGATGCACAAAGTAACCTTTTCTTCCCCCATTGTACCCCAGGTTGAAAAT
M
GATGACTTTAATGATGAACTCAATAAGCTGCTGGAAGAAATAGAAGAAAAAAACCCACAACTGATTATTGATACTGAGAAACATCATCCCTGGGCAGAAA
Celera SNP ID: hCV1376246
公開SNP ID: rs12768
SNP染色体部位: 60203949
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 451
SNP部位ゲノム: 44370
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,24|C,12) アフリカ系アメリカ人 (A,16|C,14) 全体 (A,40|C,26)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3;SILENT RARE C
ODON;サイレント変異;偽遺伝子
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|C,6) アフリカ系アメリカ人 (A,25|C,3) 全体 (A,33|C,9)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3;SILENT RARE C
ODON;サイレント変異;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,62|A,58)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3;SILENT RARE C
ODON;サイレント変異;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 898):
AAAATCGATGACTTTAATGATGAACTCAATAAGCTGCTGGAAGAAATAGAAGAAAAAAACCCACAACTGATTATTGATACTGAGAAACATCATCCCTGGG
M
AGAAAGGCCTTCTTCTCATGACTTCATGATCTGAATCCCCCCGAGTCATTCATTCTCCATGAAGTCATCGATTTTCCAGGTGTTGGTGAACTGCCTGTGA
Celera SNP ID: hCV8717916
公開SNP ID: rs1043673
SNP染色体部位: 60204044
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 451
SNP部位ゲノム: 44465
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,13|C,5) アフリカ系アメリカ人 (A,7|C,21) 全体 (A,20|C,26)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;コード領域;偽遺伝子
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,21|C,19) アフリカ系アメリカ人 (A,7|C,21) 全体 (A,28|C,40)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;コード領域;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,63|A,57)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;コード領域;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 899):
CCGACAATGAGCTTCTGGATGAGGGTGCTAAGTTGCTGTACACAACTTTGAGACACCCCAAGTGCTTTCTGCAGAGGTTGTCGTAAGTCTCTCCTCTCTT
M
CAGAGCAGCTGTGCTTTCGATCTGGGGCCACAGACGAGCAATGGTCATGCCTGACTTGGCTGTATGGAACCTCTCGCTGATGTGAACACCTGTTCCCATG
Celera SNP ID: hCV8717949
公開SNP ID: rs1654495
SNP染色体部位: 60193391
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 451
SNP部位ゲノム: 33812
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,17|C,19) アフリカ系アメリカ人 (A,21|C,9) 全体 (A,38|C,28)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,7|C,11) アフリカ系アメリカ人 (A,17|C,5) 全体 (A,24|C,16)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,52|C,52)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 900):
TCTCAGGAAAAAATAAAAAAGAGGTAGGAATTAGATATCGTGCCAGAAAATGCTGGCTCTATCAGCAGGTGAGTGGTCTCAACTTGGCTATCTTACAAAT
M
CCTTGTGAGTTAGCTACAATCAGATGCACTTGAACCTGGAATCCTATCTGGGAGGCAATCTTAAAAGAATTTGACTCGGGATGGGCAAGGTGGCTCATGC
Celera SNP ID: hCV1376227
公開SNP ID: rs1671133
SNP染色体部位: 60198861
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 451
SNP部位ゲノム: 39282
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,59|C,61)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 49
遺伝子記号: NR1I2 - 8856
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー1, グループI, メンバー2
染色体: 3
OMIM番号: 603065
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 452):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 901):
AAGCACTGCCTTTACTTCAGTGGGAATCTCGGCCTCAGCCTGCAAGCCAAGTGTTCACAGTGAGAAAAGCAAGAGAATAAGCTAATACTCCTGTCCTGAA
M
AAGGCAGCGGCTCCTTGGTAAAGCTACTCCTTGATCGATCCTTTGCACCGGATTGTTCAAAGTGGACCCCAGGGGAGAAGTCGGAGCAAAGAACTTACCA
Celera SNP ID: hCV263841
公開SNP ID: rs1523127
SNP染色体部位: 120983729
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 11708
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,49|A,71)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 902):
GATACAGTATAGGCAGATTGTCAGAAGACAAAGAGAATCTTGAGAACAGTGAGAGAGAGGCAACTCATCCTGTACAAGGGAGCCTTAATAAGATTAACAG
Y
TGATTTCGCATCAGAAACCATGGAGGCCTGAAAACAGGAGGCCTGATGCCACTTCACACCTACTAGGATGGATATAATTTTTTTTAATGGAAAATAACAA
Celera SNP ID: hCV1833991
公開SNP ID: rs11926554
SNP染色体部位: 120978246
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 6225
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,73|C,27)
SNP型: 転写因子結合部位;INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 903):
TCTTTACAAACACTTAGATGTCCTAGGAATTCTTGTCATGTTCCTGATTTCCATTTTTATTTTGTACTATGAACTCATTTGGAAACTTCTCTTTGGGACT
Y
GTTGAGATTGAAATTGTTTTCCTCTAGAGGATTTATTTTTGCTTTTGCCAGGAACCTGAGGACAGAACTAACTGGGACCACCATAAGCTTGGGGTCTACT
Celera SNP ID: hCV30747430
公開SNP ID: rs11712211
SNP染色体部位: 120986830
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 14809
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,13|C,107)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 904):
ATATCTACCCCCACCACAATGCTATTTAATACTGTATTAATCGTTCCAACTAATGCAATAAGGAAAGAAAAAAAGCATAAAGATCAGAAAAGAAGAAAAC
W
GTCTTTCTTTGCAGAAAACATAATTATTTACATTGAACATCCTCAGTAATACTAAGGAATAACTACTAGAACTATTTAATAAAGTCACAGTTATATCTCA
Celera SNP ID: hCV192027
公開SNP ID: rs9821892
SNP染色体部位: 120974639
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 2618
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,84|T,36)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 905):
ACATATCCAGGAAGCTCAACAAAGCCCAAGCAAAATAAACACGAAGAGATACACCAAGATACAGTATAGGCAGATTGTCAGAAGACAAAGAGAATCTTGA
R
AACAGTGAGAGAGAGGCAACTCATCCTGTACAAGGGAGCCTTAATAAGATTAACAGTTGATTTCGCATCAGAAACCATGGAGGCCTGAAAACAGGAGGCC
Celera SNP ID: hCV1834240
公開SNP ID: rs1581451
SNP染色体部位: 120978189
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 6168
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,48|A,72)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 906):
ATTGCAGGCCTGTTGTTAAGAATTTCAAAGGAGACTTTTCTTTTTGCTCTACCCAGAGCCAAGGCTGAGAAGGCCTGGGATAGACCTGTCTCCCTCCATG
R
TTTCTACTGAGGATGTCACCCTTAGGGGATCTTGAGTTTATAGTCTATGATCTGGTTAGGCTCCAGGCTTTGTCTCCTATTCTACCATTAAAATCCAGGC
Celera SNP ID: hCV1834252
公開SNP ID: rs10934498
SNP染色体部位: 120987071
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 15050
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,49|A,71)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 907):
GCAGGCCCCAGATATAGCCCCATGCTGTCCTCCTACCCCAGAGCACACTGTTCAGGCTACTTCCACTGGTACTGAAATCCAGTATTTCACTTACTCTTTT
Y
CTTTCCAATATCCTCATGACATTCAATATTTCACTTACTCTAGGTCCTCCCTGCCTAAGGCCCAAGTCAACTTTCTGTCCAGTGGGATTTGTAATCCAAT
Celera SNP ID: hCV9152783
公開SNP ID: rs1523130
SNP染色体部位: 120982197
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 10176
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,49|C,71)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 908):
CTTATAAAAATAAAATAAATACATAAAATGTGACTAGCAATTTTAAGACACTTAAATATTTGAATTAATTTATTGAATACCTGCTCTGGGAATTAGTGTT
R
TGTTTCCATTTACAGAGACAAAACAGGTCTAATTGATTGACTAAACAATAGATGTAAATGTGGTCAGTGTTTGGATGTCTATTCATAGAATAGGAACAAT
Celera SNP ID: hCV11230788
公開SNP ID: rs7643038
SNP染色体部位: 120979735
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 7714
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,48|A,72)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 909):
AAGATGTGTGTGAACACAAATATACCTTCTGTTTGAGGTCAGCATCATAGTGGGTCGTGAATCATGTTGGCCTTGCTGCTGTCTCCTCATTTCTAGGGTG
R
AAAAAAAAAAGCATGAAAACAATCACTTAATGTTGAGCCCCATTACTGATGCTCTCTGGTCCTGCACTAGCCTCCTAGAAAAATCACCACAGGAGAAGCC
Celera SNP ID: hCV15882316
公開SNP ID: rs2276706
SNP染色体部位: 120983997
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 11976
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,72|A,48)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 910):
GTACTTCAAAATAATAACAACTTAAGTCAATAAATAAATGTAAGGAAGTCCAAATGTTCACCTGAAGACAACTGTGGTCATTTTTTGGCAATCCCAGGTT
Y
TCTTTTCTACCTGTTTGCTCAATCGTGGTCTCCCTCTCCCTCTCTTGTTGGGGCCCATGCCCCTGCTTTACTGTTGCCAGAGGCTTGTACTTGTTTGCCT
Celera SNP ID: hCV27504984
公開SNP ID: rs3814055
SNP染色体部位: 120982725
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 10704
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,72|T,48)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 911):
AAAGGATGCTAAGGGAGGCCTCAGAGGCTTATTTAATCAGTTGGTTAATGGGAAAAAGTATTTTGTGGTACACAAATACGCTTTAAAAATATTTTAGTTA
Y
GTCATAAAAGTCTAAACCTGGGGTTGACAAACTATGGCTCACAGGCTAACTCTGGCCCACCAGCTGTTTTTATAAATGAAGCTTTATTGGAACACAGCCA
Celera SNP ID: hCV30747432
公開SNP ID: rs12488820
SNP染色体部位: 120984759
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 452
SNP部位ゲノム: 12738
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,41|C,65)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 50
遺伝子記号: NR3C1 - 2908
遺伝子名: 核内レセプター サブファミリー3, グループC, メンバー1 (グルココルチコイドレセプター)
染色体: 5
OMIM番号: 138040
OMIM情報: コルチゾール耐性 (3)

ゲノム配列 (配列番号 453):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 912):
GGAGTCTGATTGAGAAGCGACAGCCAGTGAGGGTGAAGACGCAGAAACCTTCACAGTAGCTCCTCCTCTTAGGGTTTTATAGAAGTCCATCACATCTCCC
Y
TCTCCTGAGCAAGCACACTGCTGGGGTTTTCTTCTCTACCAGGAGTTAATGATTCTTTGGAGTCCATCAGTGAATATCAACTACAAAACAAAAAACAAAA
Celera SNP ID: hCV4041
公開SNP ID: rs6190
SNP染色体部位: 142760530
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 453
SNP部位ゲノム: 132841
SNP供給源: HGBASE;HGMD;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR3;偽遺伝子

遺伝子番号: 51
遺伝子記号: OR1B1 - 347169
遺伝子名: 嗅覚レセプター,ファミリー 1, サブファミリーB, メンバー1
染色体: 9
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 454):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 913):
GTGAGGAAGGTTAACGTTGCCCCCAGCATCCCCAGTCCAGCAAAGAGGCAGGACGAGTCCCACACGCAACATGGTGTGCAGTATGGACACCACCCAGCTC
R
AGGCTAGTAAGCAGGCACACCGTTGGTGATTCATTACCAAAGCATAGTGCAGGGGGTCACAGATGGCCACATAGCGATCCAGAGCCATGACAGCAATGAC
Celera SNP ID: hCV7584272
公開SNP ID: rs1536929
SNP染色体部位: 124431190
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 454
SNP部位ゲノム: 10511
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,25|G,95)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン

遺伝子番号: 52
遺伝子記号: OR4C11 - 219429
遺伝子名: 嗅覚レセプター,ファミリー 4, サブファミリーC, メンバー11
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 455):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 914):
ATATTCCCCACCACAGTTCCCATATAGAAAATTAAGAAGATTACAAACACTATTTTCTGCCTCAAGGGATCCTGTGTTAATCCTAACAGTATGAATTCAG
K
CACACTGTTATTTTGCTGCATTGTTTCAGTTGATGTGAAGAAACCACAGATTAGAACTAGTTAATCTGCAAAAGAAAAAAAGAAATAGATTCTAAATTTA
Celera SNP ID: hCV813581
公開SNP ID: rs491160
SNP染色体部位: 55128404
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 455
SNP部位ゲノム: 10911
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,29|T,3) アフリカ系アメリカ人 (G,30|T,4) 全体 (G,59|T,7)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,31|T,3) アフリカ系アメリカ人 (G,30|T,2) 全体 (G,61|T,5)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,96|T,14)
SNP型: ミスセンス変異

遺伝子番号: 53
遺伝子記号: OR7G1 - 125962
遺伝子名: 嗅覚レセプター,ファミリー 7, サブファミリーG, メンバー1
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 456):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 915):
GGATTTCAACGTTTTTGCAGAAGGACAGCTGCAATACCATCAGACTCTGAACCAGGGCATCCATAGTGCTCATGAACATGGAGAGAAGAATCAGCAAGCC
S
CAGAAATGGACATTCATGAGGACTGTGTACCTCAGTGGGTGGCAAATGGCCACATAGCGGTCGTAGGCCATGACTGCAAGAAAGCAACTTTCCAAGCCAG
Celera SNP ID: hCV9327878
公開SNP ID: rs2217657
SNP染色体部位: 9087017
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 456
SNP部位ゲノム: 10743
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,23|G,7) アフリカ系アメリカ人 (C,5|G,15) 全体 (C,28|G,22)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,27|G,13) アフリカ系アメリカ人 (C,6|G,32) 全体 (C,33|G,45)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,81|C,39)
SNP型: ミスセンス変異

遺伝子番号: 54
遺伝子記号: OTOG - 340990
遺伝子名: otogelin
染色体: 11
OMIM番号: 604487
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 457):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 916):
AGCAGGCCAGGTCTTCGTGAACTGCAGCGACCTGCACACGGACCTGGAGCTGAGCAGGGAGAGGACGTGTGAGCAGCAACTGCTGAACCTGAGCGTGTCA
R
CCCGTGGCCCCTGCCTCTCGGGCTGCGCCTGTCCCCAGGGGTAAGTACCCATGGTGTCGTGGGCCCGTGATCCTGAAGGCTGGCAGAACCAAGGGCCACA
Celera SNP ID: hCV15990789
公開SNP ID: rs2355466
SNP染色体部位: 17556609
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 457
SNP部位ゲノム: 41113
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,10|G,26) アフリカ系アメリカ人 (A,7|G,23) 全体 (A,17|G,49)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,77|A,41)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5

遺伝子番号: 55
遺伝子記号: PANK4 - 55229
遺伝子名: パントテン酸キナーゼ 4
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 458):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 917):
TCTTCACTCAGGCCTGGCATCTGGCACTCTCCACAGGTGAAGCAGCGGGAGAATGGCGTGGCGCTGAGGTGCTTCCCCGGGGTCGTGCGCTCCCTGGACG
Y
GCTGGGCTGGGAGGAACGGCAGCTGGCGCTGGTGAAAGGCCTCCTGGCGGGGAATGTCTTCGACTGGGGGGCCAAAGCCGTGTCTGCGTAGGTGTCTGCG
Celera SNP ID: hCV25981574
公開SNP ID: rs7535528
SNP染色体部位: 2434274
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 458
SNP部位ゲノム: 14439
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,21|T,7) アフリカ系アメリカ人 (C,16|T,0) 全体 (C,37|T,7)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,70|T,50)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン

遺伝子番号: 56
遺伝子記号: PANX1 - 24145
遺伝子名: パネキシン 1
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 459):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 918):
GGCCGGTGACTGGGTGAAGGCGCCGCGCAGCTTTCCCGACGCCGGCTGTACCCGGACCTCCTGGTCGAGCCTGGCGCGCCGCAGCCATGGCCATCGCTCA
M
CTGGCCACGGAGTACGTGTTCTCGGATTTCTTGCTGAAGGAGCCCACGGAGCCCAAGTTCAAGGGGCTGCGACTGGAGCTGGCTGTGGACAAGATGGTCA
Celera SNP ID: hCV8361354
公開SNP ID: rs1138800
SNP染色体部位: 93502141
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 459
SNP部位ゲノム: 10399
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,48|C,72)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位

コンテクスト (配列番号 919):
CTGCTTCCCTCTCTGGTGCTTGGAATACTCTTTTGTTGAACTTAACACAGAGCTTTATAACCTGTCTATGCATGTTTTGCATGGAGATTGAAACTACTCT
R
TAAACATTTGTTGTGAATTAAAGGTGATAGCTTTTGGCATCATCAGACCTTGCTAATTGATTGTTATGTGCATGATGCTGTACCTTGGCAATGGGGTGTC
Celera SNP ID: hCV260722
公開SNP ID: rs4073615
SNP染色体部位: 93504930
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 459
SNP部位ゲノム: 13188
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,49|G,71)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 920):
CTTGTCAAACCCCTAACTGAGGCAGCGAGAGCTTGGTCCAAAGTGGAGAAAGGGAGGCAATTTGGGGGCATTTGCCCTGGCTAAGCTAGGAACTCTGGGC
S
AGGCAGGCCCCGCTGCATGCTGTGGGGTTTCTGGGGGCAGCAGGGAGACATTAGTTACTTGGGGAGAAGGGGGCCTAAAGAGAATCTACCATCTGCTTGG
Celera SNP ID: hCV26487026
公開SNP ID: rs4753543
SNP染色体部位: 93510356
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 459
SNP部位ゲノム: 18614
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,52|C,68)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 921):
TGGAGATAATCTCTCCCTTTGGTCAATTCCTCCTTCAGTACTGGCTGTGTGCTGAACTCGGTGCTGACCTCCAAGGACCCGGGAGTAAAAGAGGCATGAT
Y
CCTGTCTTGGAGGTGCAAGTCTTGGGTACCTGGTTGGGACAGAAAGGCAGGAGGAAGGAGTTAGTCACCCTCTGTGACCAATCTCCACCTCTAGCACATG
Celera SNP ID: hCV29137679
公開SNP ID: rs6483293
SNP染色体部位: 93503969
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 459
SNP部位ゲノム: 12227
関連した照会SNP: hCV8361354 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,48|T,72)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 57
遺伝子記号: PIK3R1 - 5295
遺伝子名: ホスホイノシチド-3-キナーゼ, 制御サブユニット 1 (p85 α)
染色体: 5
OMIM番号: 171833
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 460):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 922):
GCCTTATTTTTGCATCTCACAAACATAAGTGCAATAGATCTTTTCATTGAACAGCAAAGTAGGATTCATCATTCCATATGACTTGAGTTACACCAGACCT
R
TTCTGCCCAATGCCTTTTTGATTACAGTGTAGCTTGCCCACCGCATTTGTCGTTTTAGATACTTTGCTAGCCGGCCACTTTGGATTTCATCAGACAGTCC
Celera SNP ID: hCV27474984
公開SNP ID: rs3756668
SNP染色体部位: 67631844
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 460
SNP部位ゲノム: 83626
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|A,53)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3

遺伝子番号: 58
遺伝子記号: PKNOX1 - 5316
遺伝子名: PBX/knotted 1 ホメオボックス 1
染色体: 21
OMIM番号: 602100
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 461):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 923):
GGACATTTTAAGCTAGTGAAGAGTTTTTTCTGGAATTGATTTTTCCCAAAAGAATATATTAATTGAGGTTAAGAAGTCAGTGGGAAACACACAGAAATTT
R
TTTTAAAATCTTTCAGGAGCTTTACTGAAAGACTTGGTTATCAAGTCTTTTGGGGAGAGAATGACATTTTTTTTTTGAGACAGAGTTTTGCTCTTGTTGC
Celera SNP ID: hCV1605386
公開SNP ID: rs234736
SNP染色体部位: 43324981
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 461
SNP部位ゲノム: 67269
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,85|A,31)
SNP型: MICRORNA;UTR3;TFBS SYNONYMOUS;イントロン

遺伝子番号: 59
遺伝子記号: PLEKHG4 - 25894
遺伝子名: プレクストリン相同ドメイン含有,ファミリー G (RhoGefドメインを有する) メンバー4

染色体: 16
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 462):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 924):
CAGCCTTAGGGAGCTGGCCCCTTTGCACTGGGGCTGAGCCACATGTCCTTGTAGAGGGTGCAGTTTGGGATGTACGCGCTCTACAGCAAGAATAAGCCTC
R
CTCCGATGCCCTGATGTCAAGCTATGGGCACACCTTCTTCAAGGTAAGTGAACCTGAGATTAGGAGGAGTAGGGGATGCGGGGAGTGCCCCCAAACCACT
Celera SNP ID: hCV7625318
公開SNP ID: rs3868142
SNP染色体部位: 65877724
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 462
SNP部位ゲノム: 18810
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,29) アフリカ系アメリカ人 (A,19|G,13) 全体 (A,20|G,42)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,111|A,9)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 60
遺伝子記号: POLR1A - 25885
遺伝子名: ポリメラーゼ(RNA) I ポリペプチドA, 194kDa
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 463):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 925):
CGCACGTGGAACATCAGGTTCATGTTTCCAAGCAAGAATCATGGGTTGGGGAAGGCAAGTGTTTACTGTGGTCCAGCTGAGGACTGTGGTGTCTGAAACT
Y
TGTCACATGGGAGGCTACAGGCCCGGGGCTGGCTTGGCTCCCGTGAAAACACTGCAGCGGGCAGCCAGTCCGGAAGGCAGCATCTGGCAGGGCCTCCAGG
Celera SNP ID: hCV8598986
公開SNP ID: rs4832233
SNP染色体部位: 86101820
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 463
SNP部位ゲノム: 69213
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|C,78)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3

コンテクスト (配列番号 926):
TGTCATTCCTTCCTGACTTCACCCTCTCTCTAGGACTGAAGGACTCCTAAAGCTAGATCTCCAGCCCAGACCTTTACCCCAAACTCCAGACTTCTATACC
Y
AACTTAAAACTCGACCTTTCTACTTGGATGTCTAATGGGCAATTCAAACTTTCGTTGTTTTTTTTTTAAGACAAGGTCTTGCTCTAATGCCCAGGCTGGA
Celera SNP ID: hCV2105930
公開SNP ID: rs2083168
SNP染色体部位: 86062607
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 463
SNP部位ゲノム: 30000
関連した照会SNP: hCV8598986 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 927):
TTTAAAAACTCAAGTCAAATCATTCTACTCCTCTATTCAAAACCCTCCTGTGGCTTTTCATCTCATGCAAAGTAAAACCCCAAATCCTTAGCGATGGCCA
Y
GACGCGTGACGTTGTCTGGTCCCCAGCACCCCTCTGACCGGGTCCGCTCTTTCCCCACGCTCACTCCACTTGAGCTCTGCTGGTCCCGGCTCTTCCTTGG
Celera SNP ID: hCV2105934
公開SNP ID: rs2099616
SNP染色体部位: 86063682
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 463
SNP部位ゲノム: 31075
関連した照会SNP: hCV8598986 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,78|C,42)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 928):
ACGCGTGACGTTGTCTGGTCCCCAGCACCCCTCTGACCGGGTCCGCTCTTTCCCCACGCTCACTCCACTTGAGCTCTGCTGGTCCCGGCTCTTCCTTGGA
Y
GCACTGAGCATATTCATTCCTGCTTTGGGGTCCATGCACTTTGCTGCTCCCTTTTCCTAGGAGAGTTGTGCCCACATAGTCACAGGGCTTGTGTCCTCAC
Celera SNP ID: hCV2105935
公開SNP ID: rs3937593
SNP染色体部位: 86063784
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 463
SNP部位ゲノム: 31177
関連した照会SNP: hCV8598986 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,78|T,42)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 929):
TGGCTCTACCCAAACCAAAGCTTGGGGGTGTCGCACCTTGGGTGGGACTGGCTCCACAGTGTACCAGCTGTGTGACCCCGGCTGAGTCTCCCTGACCTCC
R
GTTGTTTCTCTGCAGAATGAGTGGGCACAAGGAGGATGAAGAGGGCTCGGGGCACCGCCTGGCATGGATGATGCCATCTGTCAAGGAGAGTCACTGGTAG
Celera SNP ID: hCV2105948
公開SNP ID: rs6547655
SNP染色体部位: 86075760
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 463
SNP部位ゲノム: 43153
関連した照会SNP: hCV8598986 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|A,78)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 930):
TTCCTAATAGCTAGTTCCAATGATGTTAATTACCCGCCCTGAGCTGAAATAACAGTAGACAAAGATAGAAGCTAGCCTCTGGTTTTACAAAGCCTTTGTA
Y
AAGTCCTCTCTGTCTTTTCTGTCCATGCCAGGGAAATGTATTGCTGGTGCTAGAGGGAGAGGAAACGTGGACGGCCAAGAACAGGGCGGCACAGTCCTCT
Celera SNP ID: hCV29665700
公開SNP ID: rs10173155
SNP染色体部位: 86107092
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 463
SNP部位ゲノム: 74485
関連した照会SNP: hCV8598986 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|C,78)
SNP型: MICRORNA;UTR3

コンテクスト (配列番号 931):
TCTCATCTCGATCCTTGAGGACTTTGAGTTCATTCTCAGTCTCTCCAGCACTGTATTTATCTCACACTGATTTCAATATCCACACAGAAGATCCTTGTGT
R
CCTCTCAGTTCTGTGTCCTACTGTCCACCTGGTCACCTCCACCCTAACCTCTCACTCCCACGGTCGCACCCTAGAACTGTCATTTTCTCTGGCTGCAGTT
Celera SNP ID: hCV31173526
公開SNP ID: rs6547654
SNP染色体部位: 86060942
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 463
SNP部位ゲノム: 28335
関連した照会SNP: hCV8598986 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,78|G,42)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 61
遺伝子記号: PPP1R15A - 23645
遺伝子名: プロテインホスファターゼ 1, 制御(阻害)サブユニット 15A
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 464):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 932):
AGAAGCTGCCCCAGGGCCGCAATCCTCAGCCCCAGCCCAGAGGCCCCAGCTCAAGTCCTGGTGGTGCCAACCCAGTGATGAAGAGGAGGGTGAGGTCAAG
S
CTTTGGGGGCAGCTGAGAAGGATGGAGAAGCTGAGTGTCCTCCCTGCATCCCCCCACCAAGTGCCTTCCTGAAGGCCTGGGTGTATTGGCCAGGAGAGGA
Celera SNP ID: hCV3170967
公開SNP ID: rs556052
SNP染色体部位: 54069248
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 464
SNP部位ゲノム: 11758
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|G,26) アフリカ系アメリカ人 (C,29|G,9) 全体 (C,39|G,35)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,81|G,35)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 62
遺伝子記号: PROCR - 10544
遺伝子名: プロテインＣ, 内皮(EPCR)
染色体: 20
OMIM番号: 600646
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 465):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 933):
ACTCCCCTCTCCTCACAGCACTGACTCTTGCCTTCTCATGTTCTTTTCCCCTTGGTGGGCCTCGCCCCACACCTGGCACCCTCTCTGCACAGTCCCCTGA
Y
CCTGACTGTCTATCCACAGTTCCTCTGACCATCCGCTGCTTCCTGGGCTGTGAGCTGCCTCCCGAGGGCTCTAGAGCCCATGTCTTCTTCGAAGTGGCTG
Celera SNP ID: hCV1825046
公開SNP ID: rs2069952
SNP染色体部位: 33227612
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 14177
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,9|T,13) アフリカ系アメリカ人 (C,4|T,28) 全体 (C,13|T,41)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 934):
CTCCTTGGGGGCCTATTCTTCGGGCTAACTCTTTGCATGTTCTGCAGGGAGCCAAACAAGCCGCTCCTACACTTCGCTGGTCCTGGGCGTCCTGGTGGGC
R
GTTTCATCATTGCTGGTGTGGCTGTAGGCATCTTCCTGTGCACAGGTGGACGGCGATGTTAATTACTCTCCAGCCCCCTCAGAAGGGGCTGGATTGATGG
Celera SNP ID: hCV25620145
公開SNP ID: rs867186
SNP染色体部位: 33228215
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 14780
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|G,2) アフリカ系アメリカ人 (A,32|G,6) 全体 (A,70|G,8)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,110|G,10)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 935):
GCTGTCACTCCAAACCTTCTGGTGTTTCAGTTGGGGAGTCTGGCTTCACAGTGAGCTGAAACTTTCCCTTGCCAGCCTCCATCAATCCAGCCCCTTCTGA
S
GGGGCTGGAGAGTAATTAACATCGCCGTCCACCTGTGCACAGGAAGATGCCTACAGCCACACCAGCAATGATGAAACTGCCCACCAGGACGCCCAGGACC
Celera SNP ID: hCV1825047
公開SNP ID: rs9574
SNP染色体部位: 33228293
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 14858
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|G,63)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 936):
ATTTTTCTCAGCAAAACAAAAGCCCTGTAGTTTTTCTTATTTCCTTAAACATGGTGTTTTATTTCATCCAAATGCAAGTGAAGAGGAGATTAGATTTGGT
Y
TGTGGAATTCCAGGGAACAGATTAATGAATGAGAGGAAGTCAGAGAGAAATAAATGTTAGTTTAATGTAACTTTCTGACCCAGCAATTCAATAATGGAAC
Celera SNP ID: hCV599565
公開SNP ID: rs633198
SNP染色体部位: 33242095
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 28660
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,66|C,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 937):
GTTATTAGACATAATGTTATTGCACATTTATTAGACTATAATATAGTATAAACATAACTTTTATTTATTATTGTTTTTCTTTTTAGACGAACTCTTGGGC
R
TGATAGTGCGCGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAATCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCAC
Celera SNP ID: hCV1271671
公開SNP ID: rs2093058
SNP染色体部位: 33254942
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 41507
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,66|A,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 938):
ACCCCAAAAGGATAAAAGCAATGAAAACCCCACCCACCCTAATCAAACTTCTGAAAACCAAATATTAGGAAAAAAATTTTAAGAGTAGCCACCAAAAAAT
S
ACATGTTACATATGGGGGAACAATAATTCTTATGACTGTAGATTTTTCATCAGAGACCATGGAAGCCAGAAGACAATGGAATAACACCTTTAAAGTGCTG
Celera SNP ID: hCV1271676
公開SNP ID: rs1577924
SNP染色体部位: 33247949
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 34514
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,66|G,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 939):
CTGTTTTAGGACGTGGGAATAGAGCAATATAGCAGAGAACAAAAACAAAGTCTGTCTTAGAAGCTACAGTTTACTGGGAGGGACAGACCCTAAACAAATA
W
TTTTTTTTTAATGTCAGAGATAATTAGTAGGAAATAGGTAGAAAAATAAGGAAGGTCGAAGGGAGAATAACTGAGTTGCTGTTTTAGACAGCATAATCAG
Celera SNP ID: hCV1271685
公開SNP ID: rs663550
SNP染色体部位: 33242929
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 29494
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,64|A,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 940):
GATGTTATTATTCTCATTTCCTGGCAACGTTATTATTCTCACACCCAGTAAAAAGAAACCAAAACTCTATTTCTTCTAATATCTCTTGGTATATCCGATG
R
TCTGTTGTATGTGTACTGGCATATAACAGGGTTCTCATGGGTAGCCTTAATCTTGCATCACACTCACTATAATCAGGATTTCTACATATCCCAAAAAATA
Celera SNP ID: hCV1271688
公開SNP ID: rs6058202
SNP染色体部位: 33241644
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 28209
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,52|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 941):
AAGGAGCCCAGTCTTTTCTTGGGAAGATAAAACATACAAAAGAGAACAACACAAGGCAAGATGCATTGTATAACTAGAAGAAACACACAAATAAAAATGT
K
ATGTTATGTGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGTTCACCTGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCT
Celera SNP ID: hCV1825056
公開SNP ID: rs6060285
SNP染色体部位: 33234148
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 20713
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 942):
AGCCACTGCGCCTGGTCTTCTCACTCATTCTTAGACCCAGTGCAATCTGACTTCTCTATAAACTACTCTGAGATCACCAGTAACCTCTAATTGTCAAACC
R
TCACCCTACATGGTATCTGCAAATTTGCGGACTAGAACTCTCTTTTTGCCTTAACTTCTGAGATACCATACTTCAATTTTTAAAACTGTTCTGTCTACTT
Celera SNP ID: hCV7499886
公開SNP ID: rs1415774
SNP染色体部位: 33229277
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 15842
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 943):
TTAACCTTTATTTACTCCCTCTTATTTATCCCCATCTACCAACTACAGTATCTATAAAACACATTCACTCCTTTCTACCCCATTGCTTTTGTTCAAGATA
Y
CATAATTCCTCTCTTTCTTTGTGGTAAACATGAAGGTGTACCATCCAGTTCTACCTCCAAAGAAAGACTTCCTGTTGGCCGGGCATGATGGTTCACGCTT
Celera SNP ID: hCV11189130
公開SNP ID: rs2065979
SNP染色体部位: 33231351
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 17916
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 944):
TAGTTTATGAAGGGTCGAGAAGGCGGGCGGCCAGCCTCGAGGTAGGGGGTTATTATCTTCCGCTGCCCGCCGCCCCCTCCCACGCCGGCCCAGGCTGAAG
Y
TGACTCTGCCCGCAGGCCTCCAAAGACTTCATATGCTCCAGATCTCCTACTTCCGCGACCCCTATCACGTGTGGTACCAGGGCAACGCGTCGCTGGGGGG
Celera SNP ID: hCV15860322
公開SNP ID: rs2069948
SNP染色体部位: 33226150
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 12715
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,63)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 945):
AGAGTGGCATGGGGTAGATTCAAACAGCCTAGCAAAGACTCTGAAAATGAACTGACACTGCAACCACCCACAGCAGGTGAGACAAAGCTTGTAGTCTGAA
M
CTAATTGAGTTATTTGCCTGCTAAAATAAACTAGTCACCATCCAGATAATTTAAACAGGACTCAGAGTCCCACAATCTAACACTCAAGATGGGCAAGATA
Celera SNP ID: hCV30450320
公開SNP ID: rs4911478
SNP染色体部位: 33246286
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 32851
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,66|C,50)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 946):
CACCTCAGCCACCCAGGCCAGATGCAGTGTAGGCCATGGCTCCAACAGCAGCATTTCTCTTTTCTTCCCCACCCCCATCCCTGGGTTTAGAATGAGAAAA
K
GCTCAAGTTGCCCCCCTCCCAACTTCCCTACCCGCAACACTCTTTTTATTTTCTCTGTTCCCAGCTCCATACTTCCATGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT
Celera SNP ID: hCV29530377
公開SNP ID: rs6088747
SNP染色体部位: 33218265
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 4830
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 947):
TGTGTATTATTATCCCTAGATCAACAGCTAAAAAAAAAAAACCACAAAAGATATAGACAACCAATATATTAAATTGGAATATAAAACATATTCAAATAAT
Y
CAAAATATAACAGGAAAGGGGACATTGAGAGGCAAAAAAATGGAGGAGACAAGCAGAAAAATAACAAATTGTAGACCAAAATCCACTCTTATCAATAACT
Celera SNP ID: hCV29909897
公開SNP ID: rs6142324
SNP染色体部位: 33252704
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 39269
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,66|T,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 948):
TCCAAAATATAACAGGAAAGGGGACATTGAGAGGCAAAAAAATGGAGGAGACAAGCAGAAAAATAACAAATTGTAGACCAAAATCCACTCTTATCAATAA
M
TACATTAAATGTAAATGGTCTTTAAAAATGTAAATGGTCTAAACACACCAATTAAAAGACAAAGATGGCTGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGCAATCCCAG
Celera SNP ID: hDV72053898
公開SNP ID: rs8114671
SNP染色体部位: 33252803
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 465
SNP部位ゲノム: 39368
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,66|A,54)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 63
遺伝子記号: PTCRA - 171558
遺伝子名: プレ T-細胞抗原 レセプター α
染色体: 6
OMIM番号: 606817
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 466):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 949):
TGCCTTCACCTATGGCCCTTCCCCAGCAACGGATGGCACCTGGACCAACTTGGCCCATCTCTCCCTGCCTTCTGAGGAGCTGGCATCCTGGGAGCCTTTG
R
TCTGCCACACTGGGCCTGGGGCTGAGGGTCACAGCAGGAGTACACAGCCCATGCATCTGTCAGGTGGGGATGGAGCCTGGGCCCTTGCGGATGCTCCCTG
Celera SNP ID: hCV3180954
公開SNP ID: rs9471966
SNP染色体部位: 42999000
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 466
SNP部位ゲノム: 17295
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|G,26) アフリカ系アメリカ人 (A,16|G,22) 全体 (A,24|G,48)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,87|A,31)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 64
遺伝子記号: RAC2 - 5880
遺伝子名: ras-関連 C3 ボツリヌストキシン 基質 2 (rhoファミリー, 小GTP 結合タンパク質 Rac2)
染色体: 22
OMIM番号: 602049
OMIM情報: 好中球、免疫不全症候群, 608203 (3)

ゲノム配列 (配列番号 467):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 950):
TGAGTTGGGTTTTCTATTTGCAATAGCAAAAGTCCTGACTGGCAAGGTTTAAAAGTTTGAAGACTCTCACAGGTAAGTGCAGCTCAGGATCCTGTGAGTG
S
AGCAGAAAGTCTTAAGAAATGGCAGGGGCTGGTTGAACCCAGATTTTCCATTGGCTGAGCAGATATCCCCAGAGGCGTAGAAAATTAAATTTGTTTTATG
Celera SNP ID: hCV8957432
公開SNP ID: rs6572
SNP染色体部位: 35951391
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 467
SNP部位ゲノム: 10135
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,14|G,12) アフリカ系アメリカ人 (C,27|G,11) 全体 (C,41|G,23)
SNP型: UTR3
SNP供給源: dbSNP; Celera; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|C,70)
SNP型: UTR3

遺伝子番号: 65
遺伝子記号: RDH13 - 112724
遺伝子名: レチノールデヒドロゲナーゼ 13 (オール-trans/9-cis)
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 468):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 951):
TGCCTCCTTAACAGACTTTCAGGTACTTGGGAATTTGAAACAAATCTCCTTGATGCACAAAGTAACCTTTTCTTCCCCCATTGTACCCCAGGTTGAAAAT
M
GATGACTTTAATGATGAACTCAATAAGCTGCTGGAAGAAATAGAAGAAAAAAACCCACAACTGATTATTGATACTGAGAAACATCATCCCTGGGCAGAAA
Celera SNP ID: hCV1376246
公開SNP ID: rs12768
SNP染色体部位: 60203949
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 33570
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,24|C,12) アフリカ系アメリカ人 (A,16|C,14) 全体 (A,40|C,26)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3;SILENT RARE C
ODON;サイレント変異;偽遺伝子
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|C,6) アフリカ系アメリカ人 (A,25|C,3) 全体 (A,33|C,9)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3;SILENT RARE C
ODON;サイレント変異;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,62|A,58)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;UTR3;SILENT RARE C
ODON;サイレント変異;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 952):
TAAAAGCCTACAGGCTTAGATAATGGAAGAGAGAGCTCCGTCCTCACACTCCTTTCTGCTGAGCATGAAATGCCTGGTTACTCACCAGTTGTGAAGACTT
Y
GTTTGTGAATGAGACGGTCAGTTCAGCGGTGGCTTCTGAGAATTCTAAGAAAGCAAAACAATGTTAGGTCTTCCCCGTGGTTCCCTATATCCTCTAGATA
Celera SNP ID: hCV1376342
公開SNP ID: rs1654416
SNP染色体部位: 60221847
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 15672
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,0|T,16) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,22) 全体 (C,8|T,38)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,22|T,98)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 953):
CTCCCATCAGCCTAGGATCATGGAAAGGCCGCTCTAGGCTCAGAGTAAAGCAAGAGGGAGGCCGAGCCTAGCGCCCCCGTACCTTGCAGCCGCCGGCTCA
R
CTCCTTGGTGAAGAGGACGATGGCGAGCTTGCTCTGGCAGTAGGCGGCTTTGGTGTTATACTTCCTCGTCTGCCAGTTCAAGTCGTCAAAGTCTATGTGC
Celera SNP ID: hCV15977624
公開SNP ID: rs2305543
SNP染色体部位: 60251527
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 14008
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|G,28) アフリカ系アメリカ人 (A,9|G,27) 全体 (A,17|G,55)
SNP型: ESE;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,95|A,25)
SNP型: ESE;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 954):
ACGCACGTGGTTGTTGGTGTGATTCTGTTTCTCCAGATTGTCTCCATTCCTCCCTGGCTTCTCCACAGGGCCGCTCACCATGGCAGCCGGCTCCATCACC
R
CCAGCCAGCGAGAGGGCAAGACAAGAGGGCTGACGAGGGACGCTACCATCACAGAGGTCAGTTTTGTAACCTAACCACAAGACTAACCTACTGTCACTTC
Celera SNP ID: hCV8717752
公開SNP ID: rs1671217
SNP染色体部位: 60246044
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 8525
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,17) アフリカ系アメリカ人 (A,2|G,26) 全体 (A,3|G,43)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,3|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,4|G,30) 全体 (A,7|G,67)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,21|G,99)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 955):
AAACGCTCCTCCTTCTGAACCCCAGAGCTCCACTCTGCACCCATGCTCTAGCCTCACACCAAGGACTTTCTTGGTAAGAGACGGACAGTTCGGTGAAGTG
R
TTAAAAGCCTACAGGCTTAGATAATGGAAGAGAGAGCTCCGTCCTCACACTCCTTTCTGCTGAGCATGAAATGCCTGGTTACTCACCAGTTGTGAAGACT
Celera SNP ID: hCV8717893
公開SNP ID: rs1671192
SNP染色体部位: 60221745
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 15774
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,21) アフリカ系アメリカ人 (A,12|G,18) 全体 (A,13|G,39)
SNP型: イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,19|G,91)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 956):
GTGTATTCTTGAGTCTATTTAAAGATGAACAAGAATAGAAAAGCTAGAGGATGGTCCCAGTTTTACATAAAAATATATAAATACACACACAAACCTATTA
K
AAACAAGACTAGAAAGATCCATAAAAGTGATTCTCCTGGGGCTGGTGCAGATCAAAGTTGTTTAGTTCTGTCTTCTTTTTTATTGAGACAGAGTCTCACT
Celera SNP ID: hCV8703249
公開SNP ID: rs1654444
SNP染色体部位: 60258266
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 20747
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,21|G,99)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 957):
ATTAAATCGAGAAGTCTAGGCAGAGAGGAGAGAGAGAAGGGGTCCGTGTACCTCATACGCTGTGCACCAGAATGGACCCTGCAGAACCTACCTGCTACCG
R
GGAAGGTGGTTCTGTTGGTAACCGGCTGGGGGTCACAGAGGTTCCTGGGAAATCAGAAAATGAGATAAATCTGTGCTCTGTCGCTGTGGGTCCTGAACAA
Celera SNP ID: hCV8717873
公開SNP ID: rs1613662
SNP染色体部位: 60228407
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 9112
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,19|A,101)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 958):
CTCTGAGACACAGGGAATGTTAGACACGCCCAGCCTCCAGCCTAGCGTATGATATTCTTAAAGTGCAGGCCGTAGTCTGGTACACCGTATTCAGCTGAGA
Y
GTTTGTGAAAGTGGAGGGGATAACACGCCTCACACAAAACTTACCGCAGTGGTTCTCAAAGCAGCATTCTGGAGCCATAGCATCAGCATCACCTGGGAAC
Celera SNP ID: hCV26895255
公開SNP ID: rs11669150
SNP染色体部位: 60227784
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 9735
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,86|C,22)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 959):
TCAGCTCCACGGCCTCTTCCTCTGAGACACGGTTTTCTCATCCGCCAGCAGGGCTCTGCCTGCTTCCCGGGGCTGTTAGAGGCTGGCAGGCCAGGTCAAC
R
GAGGAAAGGGACCTGTGCTCTGTGCCTCAGAAGACGTAGGCGAGGAGCAGGCATGAGGCCTCAGGGACGGTCTCTGAGGGAGGGTCCTGGGCCCTGGGCT
Celera SNP ID: hCV27476043
公開SNP ID: rs3745912
SNP染色体部位: 60250410
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 12891
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,107|A,13)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 960):
AGCTCTCTTCCTCTTGGTCAGCCCCAGTCCTCACCCTACCCCATTTCTCCTTTAATAACATCTTATTAAATGCACCTGGCACCAGCCTCAGGTTAAGGAT
Y
TTTTTTTGGCCAGGCGAGGTGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATTACCTGGGGTCGGGAGTTCCAGACCAGCCTGG
Celera SNP ID: hCV29271569
公開SNP ID: rs1626971
SNP染色体部位: 60248836
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 468
SNP部位ゲノム: 11317
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,21|T,99)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 66
遺伝子記号: RIC8A - 60626
遺伝子名: コリンエステラーゼ8 ホモログ Aのインヒビターに耐性 (C. elegans)
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 469):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 961):
TGGACCAGAGGCAAATCATGAACAGAACGGGAGTCAAGAGAAGGGGTTTCTAAGATGGAGAAGTGGGGGCGGGTGTGGATCCAGTGGGATGTGGCTTCCC
S
AGGTTGCAACCCCAAGGAAGTCTCTGGAAGCAGCACCAGTCCTGATGGGGGAGCAGAAGAGCTGCCATCCTCAGTCAGGGTCCGAGTCAGGGTCCGAGGA
Celera SNP ID: hCV12098639
公開SNP ID: rs3216
SNP染色体部位: 204421
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 469
SNP部位ゲノム: 15891
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,98|G,16)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3

遺伝子番号: 67
遺伝子記号: RNMTL1 - 55178
遺伝子名: RNAメチルトランスフェラーゼ様1
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 470):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 962):
CTCCTCGAGCGGTTGTTTCTCTCGTTGCTCCTGGGCACTGGCCTCAGATGGTGCCTTGCGGGGCTGCTTCCCAGGAGCGCGCTTCTGTTCCACCACCTCT
Y
CGGAAGGAAACACCACTTTCACTGGGCTCCGCCGCAGCGCCCGGACCCAGCGCCTCGCGTCAAGGTCCCAAGCCTGGACCACCTGCAGCAACGGTCGCAC
Celera SNP ID: hCV22272816
公開SNP ID: rs2249542
SNP染色体部位: 632502
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 470
SNP部位ゲノム: 10239
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,83|T,37)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;サイレント変異

遺伝子番号: 68
遺伝子記号: SDCCAG8 - 10806
遺伝子名: serologically defined colon cancer antigen 8
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 471):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 963):
ATCTTCACTTTCAGGGTGTTCACAATCCCCTTGTGGCCAGACCATGGTCCCAAGATTAAGACCTCTTGGCCCACATGACCCCTTGTTTGCCTCTCGACAG
K
AGAATCTGCTGCCTGTGACCATCTCTGGCACAGCATTAGCCTCCAATCGCCCCTCTCCCGGACACTGAGTCCACATCAGCACTATGGATAAATCTGCCTC
Celera SNP ID: hCV97631
公開SNP ID: rs1538773
SNP染色体部位: 241741305
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 265206
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,96|G,24)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 964):
ACTTGAAAGGCATCAAAACAGGCCGCTGACAATCACAGTGTTCCTCCTGTCAGCTTTCCTGGTTTCCTGTATTTCAAAGATCACAGATGATCAGCACCCT
S
TTCTCATAAATGTCCTGTGATGACAGTCCTGTGCTGTTGGAAGCTCTTCCTGGTATGTGGCCACGTGGTCAGCCACTCAGTCAACATGCGCTCCCACGCA
Celera SNP ID: hCV233148
公開SNP ID: rs1417121
SNP染色体部位: 241735973
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 259874
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,86|G,30)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 965):
TCGTTTTCAGTCCATTCAAAATACTTTCTCATTTCCCTTTGATTTCTTCTTTGATCCATGGATTAATATTTAGTTTCCAAGAACTTGGGGATTTTCCATA
S
ATCTGTGTTTTTTTAATTTCATTTCCTTCAAAGAGAAAATGTTTTACAGTACTTAAATCCTTTAAAATTCATGGAGTTGTTTTGCTCAACATATGGTACA
Celera SNP ID: hCV8688111
公開SNP ID: rs1578275
SNP染色体部位: 241747065
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 270966
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|C,22)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 966):
GAGACCTCCTTCATCCCTGGCTTCACAGTACATCCATCCTAAATCCAGTGCTGAGAGGTCAGCGTTTCCCCTCAGAAGCAGCCGTTCATCAAAGTTTGCA
Y
AACCGCACTACTGCCATTTCACTGAAGTAAAAATGATCCCCTATGTGTGTGTGTGTGAGCTACAAGGAATTATTTCTATATTTTCCTGTCACATTTTATA
Celera SNP ID: hCV9493081
公開SNP ID: rs1058304
SNP染色体部位: 241731480
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 255381
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,90|T,30)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 967):
TATCTGTACACAGATAATTATTTGTCTAAAATAGTATTTCTACTATACACAATTAAGCCCTCAAATGCTTTAAAGTAATAAAAACGGACACTGGACATAC
Y
GTGTTGTATCTGAGAATGACAAACACTAAAGGCAAGGCTGCAGTTAGTTAGGACAGGTCCCTGACCTTCGGCTGCCCTGCCTGGCCAGCGAGCCATCATC
Celera SNP ID: hCV12073840
公開SNP ID: rs14403
SNP染色体部位: 241730516
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 254417
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,93|T,27)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 968):
GGATTTTACTGAAGATATTGTAAGATGGAAAACATTCATGCCATACCTCCCTTAGAAACAACATAACAATCTCCATTAATACTTAGTTCTCCCCTCCATA
R
TCCTTTCCTGGGTGCATTCCCAACTTGGAACTTTTTTTTGTCCTATCTCCCGCTTTCCTTAACCCTATAACTTTCTAATTCTTTGCCTTCTCATATTTCT
Celera SNP ID: hCV15755949
公開SNP ID: rs2997494
SNP染色体部位: 241681304
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 205205
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,12|G,108)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 969):
ACTTTTTCTCATTTTTCATAAAAGGCAACAGGCTGATGTTCATATATTTCTCTTGAATGCGGATTCAGTTTCACTCATTGCCCTGTCTTGGAAATCCCCA
Y
GTTAATGATGGCTTAAATTAGGTTGATAGAGTCCTCCCTTGGAGTCCAGCTTGGAAAATCCTCACTGGAGAGGGGCAGGCCCACTTCTCTTTTTGGAAGA
Celera SNP ID: hCV26034142
公開SNP ID: rs9428576
SNP染色体部位: 241728650
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 252551
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,67|C,53)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 970):
ACATAAAAGTGCTCAGCATACGACGATCATGAGCCATGTCTAAGCAGGCGCAAGCCCTCCCAGGCTTCTCATCTGCAATATTGGCCATTTCTCTTCATGC
Y
TCAGTGTCCTGTTTGAGTTGAGCATGTTTTTTTTACAAGTGAGTCTCTCCTCCATTGGCCGGGAACCGCCCGAGAGCCGGGAGCATTTGTCATTCTTGAT
Celera SNP ID: hCV26034157
公開SNP ID: rs2994329
SNP染色体部位: 241714544
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 238445
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,98|T,22)
SNP型: UTR5;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 971):
AAGATAGCATTCAGCAGAGCTTTAGCAAGGAAGCAAAGGCCCAAGCCCTTCAGGCCCAGCAAAGAGAGCAGGAGCTGACACAGAAGATACAGCAAATGGA
R
GCCCAGCATGACAAAACTGGTAGGTGGTAGGGAAAGATTAGAGCCTGGGCACTAGCTCACAAGTCAGGCCCACGCCTTACTGTGAAATGACATCAGGAAC
Celera SNP ID: hCV26338456
公開SNP ID: rs10927011
SNP染色体部位: 241645735
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 169636
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,58|A,58)
SNP型: UTR3;サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 972):
GGTGTGCCTTCTTCCACTGCACTTTCTGGCCATTTCTAAGTTTTCTGCACTAAGCATGTGTTAGTTGTGTAAAAGGAAATGCAAACAGTAACAGGCTCAG
Y
TGGGGTTTTTCGTCTTCCCCTTTTTGTTACCTCCCCTAGTAACCCTTGCAAACAGAGTTAGACTCCTCTATCTCTTTCTCTGTCATACCTTTTTGACTTC
Celera SNP ID: hCV26338482
公開SNP ID: rs10803143
SNP染色体部位: 241682212
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 206113
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,90|T,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 973):
AAAGAATTAAAATCAAGTCTGGTTCTCCTCACTGAGCTCATTGGGGAATCCCTGGCCTAGGGATTTCCCTCTTCTCCCGCCCCCAGGCCTCGGAAAATGA
R
CTGGTGTCAGCTGCTGCCCAGAAGGTTACCCAGCGTGTTCTCTCTCTCAGGGTCCTTCCCTTAAATTCTCAAGTTTGACATGGAATAGAAGAATGTCGGG
Celera SNP ID: hCV26338512
公開SNP ID: rs2994339
SNP染色体部位: 241708043
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 231944
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,96|G,18)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 974):
GTGGTACCCCCTCCCCACTGCACGATCCTCAGGAAGAATTCCTTTATTGAAACCATTATTGAATAGGGTAGATTTAGGCACGGGAAATGTAAACAGCAAA
Y
CAGCCACTAAAAGTGCGTTAATGTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGTGGGCGGATCATGAGATCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCC
Celera SNP ID: hCV26338513
公開SNP ID: rs3006917
SNP染色体部位: 241708594
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 232495
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,97|T,21)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 975):
ATACAGTAACACTATGGACTAGCCAATCTGGTGCTTGAGCAGAATTGAAAATAGGGTGATTCAAATTGGCAGAACTCTCGGTGCCTCTCCTAAAGAGACG
R
CTTCTCAGGCACACGGGAGGACAAAAACGCCACTGAGAGACTATCAGCCCTGCTCCCTGCTTTTCCAGGGGACAAAGTGACCGGCCATCGCCCAGAACTG
Celera SNP ID: hCV30690777
公開SNP ID: rs12045585
SNP染色体部位: 241739722
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 263623
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,104|A,16)
SNP型: ESE;サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 976):
GATTTCTACTCAGCGCTGAGCTACTTGCCCATGACTCCACAGGCTTTCCAACATTGTCTGTGACTCTTAGTGATTCTAAAATTCTAGCAATGGCACAAGA
Y
TGAGTGGAAACTCTGCCTCACCACAGGACTGACCATGAGTAGCTCACTTCAATGGATTGGTATTTCACAACTTAGCCTGGACATCGGTCAAGTTGGTAAG
Celera SNP ID: hCV30690778
公開SNP ID: rs12140414
SNP染色体部位: 241741010
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 264911
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,98|C,22)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 977):
TAGCATTATTACTTTGATATTCATCCATGTCACCACATGTATCAATAGTTTACTCACTTTGCTGGGTAATATTTCAGTACATAGATGTATCACAATGGAC
M
CACTCATCTGTCAATGAACACAGGGCCTGCTCCCAGTTTGGGGCAATTACAAACAAAATTGCTATTAACTTTTATGTCCACGTCTTTGTGTAGACATATG
Celera SNP ID: hCV30690780
公開SNP ID: rs10737888
SNP染色体部位: 241745106
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 269007
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,96|C,24)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 978):
TAGTTGGTATGCATGTCAAAATATTTTTCTAAATTATAAAATGAAATCACATTACACATGCTGACTTTTAATGTTTTCTCTTTGTTACTAATATGTCACA
S
TTTTAGATCAATAAATATCACTTATAAATAGCCACATTATCAGAATAATAAGTAACATAACCAAGCTCCTGTTGATAGATTTCTTGGTTAAGTTTCCAGA
Celera SNP ID: hCV31056155
公開SNP ID: rs12131952
SNP染色体部位: 241654510
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 178411
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,112|C,8)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 979):
GCTTTGAGGGTAGCTCCCAGGAAAGGCTGCCTCAGCCCCAGCGTGATGGGGACGGGTAGGGGCCGATGAGGCTTCCCAGAGCAGCGATGGCCTTAGGTAT
Y
GCCAGAAGGAAACCTACTTTTCCTCCAAGATCAGAGGGAAGGATGAGGTGGGGTGTTGGAGCATCACCATATATATACATCACACACACAGGGAAACACT
Celera SNP ID: hCV30690784
公開SNP ID: rs4658574
SNP染色体部位: 241717339
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 241240
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,92|C,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 980):
GCTCTGTGAGTGCCCTGGGGACTTCAGGCAGTAAGTGCTTGGAATGATTAATATGAAAAATGCATCTGGAAATGAAAACGAAGAGGAGTCTCATTCTCCT
Y
ACAAAATGACCCTGTGCTCAAGGAACCTGTAAGTACTGACTTTTCCCACTCGGTCCAAAATCCCTCTGCCAAACATGTGTTCACAGACAGTAAATGAGCA
Celera SNP ID: hCV8688079
公開SNP ID: rs884808
SNP染色体部位: 241720062
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 243963
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,92|T,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 981):
CAGGGAGGGCCCCAGCAGCACCTGCTTTAGGCCTGGCCAGCCAAAGATCAGGACCACTGGAGCCACTAGGTCTCCTGGCAGGTGACTAGGCTCTTGTCAC
R
TAGGAGGGAGGGACCGTGACTCCTGGCATGAGTGAATCTTCAGCCTCTAAAGCCAAGAACTCTGTCAGACCTCAGGTTGTGGGGAGTCTTCCGTGGAAGC
Celera SNP ID: hCV8688080
公開SNP ID: rs884328
SNP染色体部位: 241720901
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 244802
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,90|G,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 982):
GCCTTCTTACATTAAACAGCTATCCTCCCCCTCACTTTCTATCTTCACATTGCTTTTTCTTCAAGACTTTGCGACATCTGATACACAGGCACGTATACAT
R
CACACATATGATATACATGTATTTGTTACTGTCAATGTTCATCACCAATAAAATATAAGTTCCACGAGGGCAAGGACTTTAAAAAAAAGTTTATTGATGC
Celera SNP ID: hCV15760229
公開SNP ID: rs3006939
SNP染色体部位: 241744457
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 268358
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,93|A,23)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 983):
CTCTCGACAGTAGAATCTGCTGCCTGTGACCATCTCTGGCACAGCATTAGCCTCCAATCGCCCCTCTCCCGGACACTGAGTCCACATCAGCACTATGGAT
R
AATCTGCCTCCAAAAAAGGAATGAGAGGAGAAGACATATAGGGAAGGAATCAAAAAGAAAAGGAAAGAAAAACTATGATGTGAACCCAAAGATGTGTAAC
Celera SNP ID: hCV15760238
公開SNP ID: rs3006936
SNP染色体部位: 241741395
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 265296
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,96|G,24)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 984):
TGTGGCGCAGTGAGCCCAGGGGCTCAAGGTGTTAGCAGTCATCAACAGTGCTATTTGAAACTGTGGGTGGATGAAGAGGTGAACTCAACACCACAAATAT
S
ACAGAGCAGTAACCACCATGGAAAAGAAAAGAGAGCTTATGTGTCTAGGACACCCCAAGAAATCTCTTCTGAATGAATGATGGCAATGAAATAGCCATTA
Celera SNP ID: hCV15760239
公開SNP ID: rs3006923
SNP染色体部位: 241715380
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 239281
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,81|C,25)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 985):
GATGAGGTGGGGTGTTGGAGCATCACCATATATATACATCACACACACAGGGAAACACTCCTACTTGGATGGAGGATCTTTGCTGTTCTGTTGAGGCCAG
Y
CTGATCCTGGAGGCAGGGCAGGGCCTGGCTGTTGCCCAGGCTCCAAAGAGGCGCCAGGGCGTCCCTTAGTCCTTACACTTTCTCCAGAACCTGCGGGCAG
Celera SNP ID: hCV26034160
公開SNP ID: rs2994327
SNP染色体部位: 241717481
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 471
SNP部位ゲノム: 241382
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,28|T,92)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 69
遺伝子記号: SEC31B - 25956
遺伝子名: SEC31 ホモログ B (S. cerevisiae)
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 472):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 986):
CCCCGTGTGCTTCTGTTTCTGAGCAATCACAGGCTCCTTCCCCGAAGACAGGATGTGGGTCACATTGTATAGAATAAGCATGCCATTGTCCCCGCCGCCA
R
CAATAACCCCGGAGCTTTCCAGAAGCCCACTGCCAAAGCTCCCCCAGACCAGCTTGTGAAACCTATAAAGAGGAGGAACTGGCATCAGTACAAACTTAGG
Celera SNP ID: hCV2144411
公開SNP ID: rs3763695
SNP染色体部位: 102259196
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 472
SNP部位ゲノム: 32803
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,100|G,20)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;MICRORNA;UTR5;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 70
遺伝子記号: SERPINC1 - 462
遺伝子名: セルピンペプチダーインヒビター, クレードC (抗トロンビン), メンバー1
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 473):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 987):
CTGTATTATAGCAGGCCTGTGGAGGCCTTTTGCATGCCTTAACACTGGAAACAGGCCTTTTCCACGTGTTCCTGCTGTTCATGCATCTCCTTTCTGTACC
S
TAAGAGAGTGGGGAAGGTGTACTCACCTCAAGAAATGCCTTATGGAATGCATCTGAGACATAGAGGTCATCTCGGCCTTCTGCAACAATACCTGGAAGGA
Celera SNP ID: hCV11975651
公開SNP ID: rs677
SNP染色体部位: 172143184
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 13619
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,32|G,6) アフリカ系アメリカ人 (C,35|G,3) 全体 (C,67|G,9)
SNP型: イントロン
SNP供給源: Applera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|G,-)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 988):
GGATGACATCCCCCTTGTTTCTTAGGCTAGGGACCCAAGGGGTAGCTTAGGAAAGGCCTTACCCCAAGAGGTGGGGTGGGAGGGAGAGCACTTGAAATGA
Y
GTCTTCCAAACAGGTCTTTGACTGTAACTACCAGGGAGAGGGCCTGGTCTTCTCAAAGGTGTTGGAGGTCATTCCTGTGAGTCCTTTGGAGGTCACAAAA
Celera SNP ID: hCV16180170
公開SNP ID: rs2227589
SNP染色体部位: 172152839
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 23274
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,38|T,2) アフリカ系アメリカ人 (C,35|T,3) 全体 (C,73|T,5)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,109|T,9)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 989):
CCATGTCTTGCAGCTGCTCCTTCAAACTGAAGCCGTCCTCAATGCGGAAGCGGGGCATGTGGACCACCAGCATCATCTCCTCCAATTCATCCAGCCACTC
Y
TGCAGCACCTCTGGGGTGAGTTCCTTCTCTACCTTGGCCAGGCTCTTCTCAGGCTTGGGCAAGATGAGGACCATGGTGATGTCATCACCTTTGAAGGGCA
Celera SNP ID: hCV1650632
公開SNP ID: rs5878
SNP染色体部位: 172145455
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 15890
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,4|T,36) アフリカ系アメリカ人 (C,14|T,24) 全体 (C,18|T,60)
SNP型: 転写因子結合部位;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;IN
TRON
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,7|T,27) アフリカ系アメリカ人 (C,15|T,13) 全体 (C,22|T,40)
SNP型: 転写因子結合部位;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;IN
TRON
SNP供給源: dbSNP; Celera; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,75|C,45)
SNP型: 転写因子結合部位;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;IN
TRON

コンテクスト (配列番号 990):
TGGTTTTCCTGATTTTGCTCCAATAGGCACTTTTTTTAGGGGGGGATTATGCTTTTGATCAAAAGCTTGGTGCTGAATCTCTCTTTTCTCCAGAGAGATT
Y
AGTCTCACCCTGCTTTCCCAACACATGGCGTTTGTGTAGAGGGGAGGACCAAAGGAACATGTGTGGTTTGGAAGCAGTGTTCTGTTCTGTTCTTCTTGTA
Celera SNP ID: hCV8911768
公開SNP ID: rs941988
SNP染色体部位: 172148516
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 18951
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,106|T,10)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 991):
CTTGGGGAGAGAAGAGGAGCAGGGCAGGATGAGGGCAGTGGCAGCACCAAAGAGGAACCTGAGGCAGGCTGAGTGCCTGGCTGGTGACAGGGGAGAAAAG
R
AGAACGGGTCTGCAGGTGGAAAGAGGTGTTTAGGTGTGCCCTGCCTGTGAAAGTAGTTTCTAATGGCTGTATAATATTCAGTAGTCTAGAACTTAACCAT
Celera SNP ID: hCV11975658
公開SNP ID: rs1951626
SNP染色体部位: 172158724
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 29159
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,85|A,35)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 992):
CAATCTATGACATTTCATCTTATCATGCCCTACTTCCCTCCCACAAAAGGCAGTGGGGGGAAGGGGGTGGGAACTAAGTCACTGAGCTGAAATGATCCAT
M
CTTCCCAGAGCCAGAAAACACTCTCACGTCCTTGAGGCTTCTCTTGGCTTTCCTGGGCCCCTGGTCTCAATATACCATCCTAGGCCCCGTGCAGTGGCTC
Celera SNP ID: hCV15956034
公開SNP ID: rs2227603
SNP染色体部位: 172149171
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 19606
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,103|C,3)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 993):
GGTTTATGGTTCCTGCGTGTACACAAGGGGGTCTGTGTGTGGGTACTGGATCTTCCCATCTTCTCCTGGGAGAGAAAGACAGGCACCCAGTGCAGATTCA
Y
GGACGTGGTCCGTTGGGCAAGCCTGGGGCTGGCTGGAAGCTGGGGCAGCTGAGGGGGACTTGCCTTCTTGCGTGGTCTGAGTCCAGTTCTGCAGCCCTTT
Celera SNP ID: hCV15956054
公開SNP ID: rs2227594
SNP染色体部位: 172152104
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 22539
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 994):
CCATCTTCTCCTGGGAGAGAAAGACAGGCACCCAGTGCAGATTCACGGACGTGGTCCGTTGGGCAAGCCTGGGGCTGGCTGGAAGCTGGGGCAGCTGAGG
K
GGACTTGCCTTCTTGCGTGGTCTGAGTCCAGTTCTGCAGCCCTTTCAAGAACAGAGGTGCAAAGCCGGAGAGAAGCAGCGGCACCAAGGGAGATGTGGAA
Celera SNP ID: hCV15956055
公開SNP ID: rs2227593
SNP染色体部位: 172152159
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 22594
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|T,-)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 995):
CAGCGGCACCAAGGGAGATGTGGAAGGCAGGCTGAAGAAGCAGAGAGAGAGAGGAGAGGACCCTGCCATTCATCTTCCCATCTCCACTGCCTTCGGTTGC
Y
CACTCTGTCCTTCAACTACATTTGGAAATGCAATTTGAGGCTGAGAGGACCCTGGGAGGGCTATGAAGCACAAATTAAAACCAAGACAGTTGTGCCACCA
Celera SNP ID: hCV15956059
公開SNP ID: rs2227592
SNP染色体部位: 172152335
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 22770
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,110|T,10)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 996):
CTCCCCAGATAACTACTGCTGTTGGTCCATAGTTTAGTGTTTACTTGAGAACCAGAAGTTCCACAGGCTGTACACGGCTATTACTCTAACACAGGGTTCC
R
TGCACATCTCATTTGGGGGAACACGTTAAGTGATATTCAACCGTCTTCTTTACTGTGGGACTTGTCAGACCTCAGCATGTCAGTGTGTACTGTTCATCTC
Celera SNP ID: hCV15956077
公開SNP ID: rs2227611
SNP染色体部位: 172142090
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 12525
SNP供給源: HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 997):
AAGTAACTCCCAAATGAGGTTCCAGATTCATTTTTCTCATCCCAGGTAGTAAACGTGTTTTAATGGGTTTGTTTCTTGCCCATGGCAACCTCAACACAGA
S
GGGAGAACTGTTTTATTACCCTAAAATAGTGAGAACCACTGTTCAAACTAACTAGCTACCAAGTGACTTCTAACTCATGAAGAAAATTTGTATTTAAGAG
Celera SNP ID: hCV16135173
公開SNP ID: rs2146372
SNP染色体部位: 172136192
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 6627
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,110|G,10)
SNP型: 偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 998):
CAACTGCTTTTCATCTGGTTCTCCTCTGGATAGTCTCTGTCAAACTTGTTCACAATTCCCTCCAAATCCAGTGCCCAGAAATGAACCCAGGGACTACCAC
M
TTTTCCTTTGCCTCTATCTCTCTCTCTCCCCCACCCCTCTCTCTCTATATATAATATCTATATATAATATAGATATAATATATATACAGCCTCCACAGCT
Celera SNP ID: hCV30548253
公開SNP ID: rs9425773
SNP染色体部位: 172159283
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 29718
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,22|C,98)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 999):
CTGGAGGGAGATATTGTCATCCATCCAGTTTCCTCTCTATACCAAATACAAAGTACACATAAATAAGCAAAACAAATTTTCAAAGTTCCTTCTCTAGAAT
S
CTCTTTCTTTTGCATATGTAGTTTCAGTGGAGATTTCTCAACTAGCTGAAATGGAGCACTTGAATATATTAAAAGAGCCCAAACTGCTTACAGCAATTTC
Celera SNP ID: hDV70683187
公開SNP ID: rs16846561
SNP染色体部位: 172135734
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 473
SNP部位ゲノム: 6169
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,110|G,10)
SNP型: 偽遺伝子

遺伝子番号: 71
遺伝子記号: SFRS2IP - 9169
遺伝子名: スプライシング因子, アルギニン/セリン-リッチ2, 相互作用タンパク質
染色体: 12
OMIM番号: 603668
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 474):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1000):
TTCGGTCAGCGATTCATTCTTTTCTTCTAAAGATTTTTCCAATTTGGTGTTCAGAAGATTATTTTTTAGTAAGTTATTTTCAGAGTCTTGAATATTATTG
W
AATCTTCATTCCCAAAAGTATCACATGTTGCAATTATTTCTACATCTTCAGTTTCAACATGCCCAAGCAATTGAACCTCTGGGCTCTTAACAGATTGTCT
Celera SNP ID: hCV3216426
公開SNP ID: rs7315731
SNP染色体部位: 44607781
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 16319
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,19|T,21) アフリカ系アメリカ人 (A,28|T,4) 全体 (A,47|T,25)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;ESS SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,21|T,17) アフリカ系アメリカ人 (A,26|T,2) 全体 (A,47|T,19)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;ESS SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,51|T,69)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;ESS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1001):
GTTCATATATTTTTTAATAATGCATTGTCTAGTTCGAAGAACTTAACATCATAACCATTGCTGTTTATCCCAGTGGCATACCCTGTATGAAATTTCTTAA
R
AGATTATATTAATGCTACATTTATGGTTTTCAAAAATATTTAAAAGTTGAAATCTGGCTGAGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATGCCAACACTTTGAGAG
Celera SNP ID: hCV1026405
公開SNP ID: rs997307
SNP染色体部位: 44633391
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 41929
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,51|A,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1002):
AAAAGCCACCTAAATAGTCAATTTCCACTTCTACTCTTATTCGTCTATGATTTTCTTCCCTTCACAGCCAGAGTAATCCTTTTAAAATGTACCAGATCAC
R
TTACTCCTGAAAACACTCCCTAGCTCACATTGGCCCTAAATGATCTCCCCTTATGTCTTACTCTTTCTCCTCCATCTACCTAATTCAGTCATTCTAGCCA
Celera SNP ID: hCV3201166
公開SNP ID: rs11183243
SNP染色体部位: 44622525
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 31063
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,51|A,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1003):
GTCACGGAAATAATTCATGGGAGTGCTACTAAAGATATATGAGACTTCAACTCTTGACCACATCACTTTTTCTCCAAAACTTTAGAACTTGTTTGCAAAA
R
CTAAATGGTATAAAACACATTTTAAAATGTCACCCAATTCTCAAATGTCACTGAAAGAAAATGCAGGAAAAGTATGTATTGTGTGATTAATCAGCTTAGG
Celera SNP ID: hCV3216425
公開SNP ID: rs1366024
SNP染色体部位: 44599905
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 8443
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,52|A,68)
SNP型: 転写因子結合部位;MICRORNA;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1004):
CACTTTACGTCCACTCTCTAGCAATTTTCAAAAATACAATATAGTCGACCCTTTAACAACACAGGGATTAGGAGCACCAACCCCCAACACAGTCAAAAAT
K
GAAACAGTTTTTACTCCCCAAAACTTAACTGTTATTCACCAGACTCCTTACTGATAACAGTGAATTAATATATTTTTTATGTTATGTGTTACATACTGTA
Celera SNP ID: hCV3216427
公開SNP ID: rs724909
SNP染色体部位: 44609978
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 18516
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,51|G,69)
SNP型: UTR5;TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1005):
TGTGTATCACCACACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGGTGGGTTTCGCCACGTTGCCTCAATCTTATTTCTGATCATCATTAGTCTTAAACATT
Y
TGCCTGAACTCAAGAGTGAGAAAAGAAATGACAACTGGAAGAAACCATCAATTTAACTGAGGAGTCAAGCATAAATAAACATATATCAACACAAACTGTT
Celera SNP ID: hCV3216433
公開SNP ID: rs7306229
SNP染色体部位: 44621099
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 29637
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|T,69)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1006):
TATAGCAAATAAATATTAACATAGTGAATTAAATGAAATTAAATGTTAGAATGTGTATGACAGCCTAGGCATAAGGCATGGCCTGTTAGAAGGCTGAAGA
Y
ACTTATTCCTGATCCTGAAATCCGAAGTAAACTGTAAACTTTGCTTTTAGATGGAAGAAGACTGAGGGAAATGAGAGGATGGAGCTTAATTTATAATGAT
Celera SNP ID: hCV26173972
公開SNP ID: rs1012642
SNP染色体部位: 44639546
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 48084
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|T,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1007):
CAAAGACATCATGGGTCTAGGTCCAGACCGGAGTAATAAAACAATATTGCAATAAAGCAAGTCACACAAAATTTTTGGTTTCCTAGTATATATGTTTATA
Y
TATACTGTAGTCCATGAAGTGTGCAACAGCATTATGTCTAAAAACTGTACATACTTGATTTAAAAATACCTTATTGCTAAAAATGCTAACAATCATCTCA
Celera SNP ID: hCV12058175
公開SNP ID: rs10880879
SNP染色体部位: 44654170
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 62708
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,51|C,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1008):
TTGTATCAAAATAATCTCTAAACAAATAGCCCCTTACAGCTCTGAGATTCCTGTCTCCCAAAAAGATCCAAAAACCGAAACATCATTCTCCCATTTTCTG
R
GGAATAAATATAATCCGTCATCCTTGAATAAATACGTTTTTGTTTTTTATCTCATTTCCCCAAGTTATTCTAGTTACAGATTAACTCTAGACTGTTCACC
Celera SNP ID: hCV26173968
公開SNP ID: rs10880880
SNP染色体部位: 44661573
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 70111
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,51|G,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1009):
GGCTCATGGGTAGGCTCTTGGAGGGGGTATTCCATGAATACCTTGAAATCATATACAAAGTTTTATGTCTGTAAACGTGTATTTTTCTAGCAGAAGGGAT
S
TGAATCATTCTTCACATTCTTAAAGAATGCCATAACTACCCAAAAGTTAACATCTAAGGAGCTTACAGTGTTATAAATTAGTAATAGGTTGAATTAATCT
Celera SNP ID: hCV30870137
公開SNP ID: rs10880871
SNP染色体部位: 44627005
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 35543
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|G,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1010):
CTAGCTACTTAGGAGGCCGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCAAGAAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACACAGCAAGACCCTGTTAAAAAAAAAACAACC
Y
ACAATTAATATTTTATAGTAAGCACTGTCTTCTCTATTTTAAGACCCATATAGTGAAATATACATGAGAAACTGAGAAACCTCAATCAAGTTACACACTG
Celera SNP ID: hCV30870104
公開SNP ID: rs10880875
SNP染色体部位: 44647286
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 55824
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,51|C,67)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1011):
TATTTTCTGATTACTAAAAGATGTTACTGATGATGAATCAACAGTATCATGTAACTGCACTGATTCATCCTATCTCTGCTGAATAAAAGCACAGGTTTTC
M
AGAAAACTGTCTAAGCTCTAGTTGGTGCCAAAGGACGATAGAGAGCTAAGTAACTCCTGAAAAGTTTCGATCTTAACACACTAGCCCTATTACCACATGA
Celera SNP ID: hCV30870058
公開SNP ID: rs11183272
SNP染色体部位: 44668523
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 474
SNP部位ゲノム: 77061
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|A,69)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 72
遺伝子記号: STK11IP - 114790
遺伝子名: セリン/スレオニンキナーゼ 11 相互作用タンパク質
染色体: 2
OMIM番号: 607172
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 475):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1012):
CCTAACTGTGGTAGTGACCACGTGGTTCTCCTCGCTGTGTCTCGGGGAACCCCCAACAGGGAGCGGAAACAGGGAGAGCAGTCTCTGGCTCCTTCTCCGT
Y
TGCCAGCCCTGTCTGCCACCCTCCTGGCCATGGTGACCACCTTGACAGGGCCAAGAACAGCCCACCTCAGGCACCGAGCACCCGTGACCATGGTAGTTGG
Celera SNP ID: hCV2915511
公開SNP ID: rs627530
SNP染色体部位: 220184687
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 475
SNP部位ゲノム: 23847
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,1|T,39) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,24) 全体 (C,9|T,63)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,118)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 73
遺伝子記号: TACR1 - 6869
遺伝子名: タキキニン レセプター 1
染色体: 2
OMIM番号: 162323
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 476):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1013):
AGCAAAGTTCAGTGATTTGGTTTGAGTCACACAGCATGAGGGTGGCAAAGATAGGGAAGAATTGAGATTTTTTGACTCAAGGATGGAATGTTTTCCCTAA
S
CCATACTGACCCTTTTTGCAAGTCCCAGTGTGAGGGTGTTTCTGATGGTTCCAGATGAAGGGAATTTCCATGCATGAAGGGAGGCAGGTCAAAGGCAGTG
Celera SNP ID: hCV11466393
公開SNP ID: rs881
SNP染色体部位: 75129937
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 476
SNP部位ゲノム: 10199
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,97|C,17)
SNP型: MICRORNA;UTR3

遺伝子番号: 74
遺伝子記号: TAF1B - 9014
遺伝子名: TATA ボックス結合タンパク質 (TBP)-関連因子, RNA ポリメラーゼ I, B,
63kDa
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 477):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1014):
TTCAGATGAAATGCATAGCTTAACTTGCCACGTGGTAAAAATGACTGGAATGGGAGAAGTGGATTTTCTGACATTTGATCCTATAGCTAAAATGGCAAAA
R
CTGTTAAGTACGATGTACAAGCTGTAGCTATCATTGTGGTGGTATTGAAACTGCTCTTTCTATTGGATGACAGTTTCGAGTGGTAAGTGTACGTCAATTT
Celera SNP ID: hCV3216649
公開SNP ID: rs1054565
SNP染色体部位: 9968411
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 477
SNP部位ゲノム: 77387
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,9|G,31) アフリカ系アメリカ人 (A,31|G,7) 全体 (A,40|G,38)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|G,80)
SNP型: ミスセンス変異

遺伝子番号: 75
遺伝子記号: TNFRSF14 - 8764
遺伝子名: 腫瘍壊死因子 レセプター スーパーファミリー, メンバー14 (ヘルペスウイルスエントリーメディエーター)
染色体: 1
OMIM番号: 602746
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 478):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1015):
GTTCTCTGTCCTGGAGCAGTTCCGGCTCGCGCGCAGGCCCATGGCTGGAGTCCAAGAGGAGGGGCTGAGAGGGGTACGTGGAGGCCGGGACACCATCCAC
R
GGCCAGGACAGCATCCACAGGCCAAGGACTGCTGCCAGGGCGCCCTGCCAGGCTGAACCCCTGGCTCAGCCAAACGAGGTGCCCAGAGGTACCCAGCATG
Celera SNP ID: hCV1974951
公開SNP ID: rs2234161
SNP染色体部位: 2483213
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 14063
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,15|G,17) アフリカ系アメリカ人 (A,18|G,2) 全体 (A,33|G,19)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;ESE SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|A,53)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;ESE SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1016):
AGCGCAGCGTCCTTTAAAGGAAGGCCAAAAACAACCCAACAAAAATGCCAGGTGATCAAAGCGGTCACAGCACAATGTCCACATCCAACGAGAAATTGCT
R
CTACGTCCAGACGCAGGGAAAGGTGGCCGTGGGAACGTGAGTCAGCAGCAACAGGCCCAGAAGGGCAGCCACGGTGGACTTGTCAGACGTGGACCCTGAA
Celera SNP ID: hCV1974967
公開SNP ID: rs2147905
SNP染色体部位: 2472781
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 3631
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,65|G,55)
SNP型: UTR5;UTR3

コンテクスト (配列番号 1017):
ACCCTCTGGCCCGGGCTGGAGGTGGCGTAAGCGCGGCACGCGGCGCAGTGGTCCCCGTCCTGGACGATGCAGAAGTGGCCTGGGCTGCAGCCACACACGG
Y
GTTCTCTGTCCTGGAGCAGTTCCGGCTCGCGCGCAGGCCCATGGCTGGAGTCCAAGAGGAGGGGCTGAGAGGGGTACGTGGAGGCCGGGACACCATCCAC
Celera SNP ID: hCV15947925
公開SNP ID: rs2234163
SNP染色体部位: 2483112
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 13962
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,119|T,1)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;ESE SYNONYMOUS;サイレントな稀なコドン;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 1018):
CCTGGACTGCTGGAGTCTGCATTCCAGGAGAGCGGGCAGACCACAGAAAAGGGAGAAAAGGGGTGGAGGGTCAAGGCGGGCGGACACAGGGAACAGGGAG
Y
GGGGACAGGGCTTACTCAGCAATCAGAGAAGACCTCACGGAGGAGGTGAGGTGTTTAGGTGGTTGGTGAAGGCGGAAGCCCCAGGAATGGGTTAGTGCCC
Celera SNP ID: hCV1974957
公開SNP ID: rs7550231
SNP染色体部位: 2476777
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 7627
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,11|T,5) アフリカ系アメリカ人 (C,3|T,19) 全体 (C,14|T,24)
SNP型: INTERGENIC;未知
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,67|T,53)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1019):
ACACCATCTTTCTATTATTTGCTGTTTCATATTTCTGATTTCCCGTTGTCCTACCTTCTGTTTGATTATTTCTGTAGTATTTCATTTCATCCCCATGGTT
K
CCTTCTTAGTGATACATCTTTGTTTTCCTTATTTAGTGGTTATTGAAGGGTTTGTGACATCCATCTGCACTTATCACAGCCTATATTCAGGTTGTGTGAC
Celera SNP ID: hCV1974942
公開SNP ID: rs6671426
SNP染色体部位: 2494094
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 24944
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|T,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1020):
CCTGGGGACAAGTCCGCACGGCCCTTATCTTTGCGTCTTTGTACCCAAAGGTGGCCTCACCTGACCCCGGTGTCCAGGTCCCCTCTGTGTCCCTGGTTCC
Y
GGGCATTGATTAGGATTTGCTGTGCAGTGCATGCCTCTCTATTTACCCCTCTTGGGGTCTGTTGAGCTTTCTGCATTTGTGGGATCACAGTTTTCTTGTA
Celera SNP ID: hCV1974943
公開SNP ID: rs6672381
SNP染色体部位: 2492694
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 23544
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,62|C,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1021):
CCTCACCTGACCCCGGTGTCCAGGTCCCCTCTGTGTCCCTGGTTCCTGGGCATTGATTAGGATTTGCTGTGCAGTGCATGCCTCTCTATTTACCCCTCTT
R
GGGTCTGTTGAGCTTTCTGCATTTGTGGGATCACAGTTTTCTTGTAGTTTAGAAAACTTTCACTGCTTTTTCTTCAAATGATTTTCTGTTCCTGCCTCTT
Celera SNP ID: hCV1974944
公開SNP ID: rs6667605
SNP染色体部位: 2492640
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 23490
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,66|A,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1022):
TCTGCCCAGATGGGCAGGACGCCGAGCTTGCACTGTCAGTTCCAGGGCAGGGTCCCGCAGGCAGGTCCTCGCCCCACGTGCCCACCCAGACACCCACCCC
K
CAAACGGGTTTCCCATCTGTGCAAACCAGGCCATTCCAATGGCAGAGGCAGGTAGGGTGAGAGCCCCACTTCTTCAGGTACTGGTGGAGGTGGGGTACAA
Celera SNP ID: hCV1974949
公開SNP ID: rs2257763
SNP染色体部位: 2483520
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 14370
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|T,53)
SNP型: ナンセンス変異;ESE;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1023):
CAGGAAGGTCCTGGGAGGGCTTCGTTGATGGGAGAAACCAGCCTTCTGCCCAGATGGGCAGGACGCCGAGCTTGCACTGTCAGTTCCAGGGCAGGGTCCC
K
CAGGCAGGTCCTCGCCCCACGTGCCCACCCAGACACCCACCCCGCAAACGGGTTTCCCATCTGTGCAAACCAGGCCATTCCAATGGCAGAGGCAGGTAGG
Celera SNP ID: hCV1974950
公開SNP ID: rs2281852
SNP染色体部位: 2483476
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 14326
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,62|T,44)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1024):
TCTGCCGTGGCCTCGTTCCTGGGCTGGCTGATGGGCAGTCGGGGGCCCCTGATGGGGATAGTGGCTGGACAGGCAGGAGTGCCACATGAGCATGGAGAGT
R
TCCCCACCCCACCCACCTGGGTCCAGCCCCCTGCTGCACACTGATCTTATCACCTGTCACCAAGGTCAGGGCTGCCGGGGAGTTGGGTCACCTGCTCGAG
Celera SNP ID: hCV11448257
公開SNP ID: rs1886730
SNP染色体部位: 2485810
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 16660
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,67|G,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1025):
GCCATGCATGTGGAAGGTGGACTTTCAGCATGGGTGGGACCCTAGGGGGCTGTGGACCCCCGGCCCCTGGGACTCACAGGTGGGAGACAGGAGTTCCGAC
Y
GCCAGGGGGAGAGTCCTGGAGGATCCTGGGCTGTCGGCAGCCACCCAGCAGGGCCCGTCCTGGGAGTGGGGCTGGACTCTTCCTGCAGGAAAGGCTGGGC
Celera SNP ID: hDV68598166
公開SNP ID: rs10797432
SNP染色体部位: 2491198
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 478
SNP部位ゲノム: 22048
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,67|T,53)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 76
遺伝子記号: UMODL1 - 89766
遺伝子名: ウロモジュリン様1
染色体: 21
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 479):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1026):
CCGGGAAACACTTCTGAATCCCACGTGGCTGCGAAATGAGGACAGTGGACCCTCCGGTTCTGTAGACCTGCCATTGACCTCCACCCTCACAGCTCTGAAG
M
CCCCCGCCTGTGGTGAGTTCCTCGAATGGTGCATGGGGACTAGGACTAATAGGACCCATAGCCTGTGTGAGCCTCTGGGGCAAAGCTCCTGCAGCCGTGG
Celera SNP ID: hCV1723643
公開SNP ID: rs220130
SNP染色体部位: 42404877
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 479
SNP部位ゲノム: 58740
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,93|C,21)
SNP型: ミスセンス変異;ESE

遺伝子番号: 77
遺伝子記号: USP45 - 85015
遺伝子名: ユビキチン特異的ペプチダーゼ 45
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 480):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1027):
AGCTCAAAAAGATGAGCAGCACTTATGGTTTTGCTGTGTATCACGCTCAGTTCTAAGCACTTCACAAATATTAACCCACGCAACCCTCACAACCACCTTA
S
GAGATAAGTTGCTATTATTTTCCGCATTTTACACTTGAAACTGAGAAAGAGAAGTGAAGTGACTTGCAGAGGTCCCAAAGCCAGTAAGCGGTGGATGGAG
Celera SNP ID: hCV7581501
公開SNP ID: rs1323717
SNP染色体部位: 100069455
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 480
SNP部位ゲノム: 92552
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,107|C,13)
SNP型: UTR5;イントロン

遺伝子番号: 78
遺伝子記号: ZWINT - 11130
遺伝子名: ZW10 相互作用因子
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 481):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1028):
ATTACACATAGGGGCCCACAAGGTCCTCCCAGGCCCGGCCCCAGCTGCCACTTAGCCGCAAACACTTACTCTAGGGCTGCAGCTTCCGCCTCTGTCTCCG
M
TGCCTCCATCTTTCCAGGCGCCGAGTTCAGCTGCCTTCCCACAATCCCTAAGATTACTTTGAAGTCACAGTCGACTTCGCGCCGGGGCAGGCGATTGGCT
Celera SNP ID: hCV25951992
公開SNP ID: rs11005328
SNP染色体部位: 57790994
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 481
SNP部位ゲノム: 13789
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,0|C,2) アフリカ系アメリカ人 (A,7|C,21) 全体 (A,7|C,23)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,119|A,1)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5

遺伝子番号: 79
遺伝子記号: hCG1647019
遺伝子名:
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 482):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1029):
CATGCAGCCAGAATCCTTTACTAGTGGGTCCCAGGACGTGCACCAGAAAAAAGTCTTACTGTTAACAGTCCCAGGAATGGAAGAGACCATATCAGAGGCA
R
ACAAAAACCTTTCCAAGCAAGCGTGGGGAAACCAAGAAGACGGGATCCAGGACCAAGTCCTGCGCGGAATCAACGAATCAACATCTTCCCGTCCGCCGAC
Celera SNP ID: hDV70662128
公開SNP ID: rs17043082
SNP染色体部位: 52651845
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 482
SNP部位ゲノム: 81843
SNP供給源: CDX; dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,117|A,3)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;偽遺伝子

遺伝子番号: 80
遺伝子記号: hCG2002964
遺伝子名:
染色体: 7
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 483):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1030):
GTTCTCCTGGTGAAGAAGTCGCCCAGACTCCAAAACATCTTGTCAGAGGGGAAGGACAGAAAGCAAAATTATATTGTGCCCCAATAAAAGGACACAGTTA
K
GTTTTTTGGTACCAACAGGTCCTGAAAAACGAGTTCAAGTTCTTGATTTCCTTCCAGAATGAAAATGTCTTTGATGAAACAGGTATGCCCAAGGAAAGAT
Celera SNP ID: hCV11629656
公開SNP ID: rs17284
SNP染色体部位: 141986872
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 483
SNP部位ゲノム: 10256
SNP供給源: HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|T,-)
SNP型: ナンセンス変異;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1031):
TTCAGCTAAGTGCCTCCCAAATTCACCCTGTAGCCTTGAGATCCAGGCTACGAAGCTTGAGGATTCAGCAGTGTATTTTTGTGCCAGCAGCCAATCCACA
R
TGTTAAATATTAGCTAATCTTAGGACACAGACTCATCACGGACTCAGCTCAGGAAGCAGGTGGTATACTAGGTTGGAAGGAAATAACAGAAACTAGAGCT
Celera SNP ID: hCV11629657
公開SNP ID: rs17286
SNP染色体部位: 141987074
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 483
SNP部位ゲノム: 10458
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,-|G,120)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;イントロン

遺伝子番号: 81
遺伝子記号: hCG41016
遺伝子名:
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 484):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1032):
ATCAATCCTAAGCTCCATACCACCATGTACTTTTTCCTCAGTCATCTATCCTTTTTGGATACTTGTTATTCCAATGTATTTACACCCAAACTGTTAGAGA
Y
TTTGGTTGTGGAAGACAGAACTATCTCCTTCAAAGGATGCATGGTACAATTTTTCTTTGGTTGTGCATTTGTAATCACAGAAATGTTCATGTTAGCGGTG
Celera SNP ID: hCV25995678
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 55279315
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 484
SNP部位ゲノム: 84194
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,38) アフリカ系アメリカ人 (C,5|T,29) 全体 (C,7|T,67)
SNP型: ミスセンス変異

コンテクスト (配列番号 1033):
TCATCTATCCTTTTTGGATACTTGTTATTCCAATGTATTTACACCCAAACTGTTAGAGATTTTGGTTGTGGAAGACAGAACTATCTCCTTCAAAGGATGC
W
TGGTACAATTTTTCTTTGGTTGTGCATTTGTAATCACAGAAATGTTCATGTTAGCGGTGATGGCTTATGACTTGTTTATGGCTGTTTGTAACCCCCTGCT
Celera SNP ID: hCV25996277
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 55279356
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 484
SNP部位ゲノム: 84235
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|T,2) アフリカ系アメリカ人 (A,25|T,5) 全体 (A,63|T,7)
SNP型: ミスセンス変異

遺伝子番号: 82
遺伝子記号: hCG2021365
遺伝子名:
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 485):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1034):
TGCTGCCAACATACGGGCTGCAGTGGGGAGGCACAGCCAGTCCTCCCACTCCACAGAGCAGGCAGGAGTCCCGCCCCTGGGCCCCAGGCCTCCTGCTCCA
R
GGGACAAGTGCAAGCCCTGCCCCTTCCGAATTGGCAGGGCAGGAGCTCCTCATGGGCAGCTGCAGTCACCCAAGCCCGGCTGTGGACCTGGGCATCTCTG
Celera SNP ID: hCV2879752
公開SNP ID: rs1244565
SNP染色体部位: 179117903
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 485
SNP部位ゲノム: 99621
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,65|G,51)
SNP型: サイレントな稀なコドン;サイレント変異

遺伝子番号: 83
遺伝子記号: hCG2038364
遺伝子名:
染色体: 22
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 486):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1035):
GACCCCAGGGCCTGAGGACAGGTCCCCAAGTGGACGTCTCAAAGAGAGTCCCACATTCCAGGGCACATGGGAACTATGGCCTTCTGGCAGCTGGAGGGCA
S
CAGGAAGGGCACAGCTGTCTGAGACCCGTGTGGCTTCCCAGAAAGAGGTGCCACCCCTGAGGAGGCACCGGTGCTCACGGACTCCTGGTTGCCAGTCTTG
Celera SNP ID: hCV305844
公開SNP ID: rs4823562
SNP染色体部位: 45321840
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 486
SNP部位ゲノム: 15784
SNP供給源: Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 84
遺伝子記号: ACSL5 - 51703
遺伝子名: アシル-CoA シンテターゼ 長鎖ファミリー メンバー5
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 487):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1036):
GGCTCTTCGGTGCAGGGACTTGTGAAGAAGGTTTTGATTCCTTTATTCAGAGGGCAGCAGGCACCACTATAATCTTCTATTACTTTATAGCGAACCTGTC
R
TCAGTGATCAGAAGAAACCTTTAAATATTCACCCATGATATCTGAGTTTTAAGTCTGAATTTCAAATTTTAAAGCAAGATCCAAAATATCCAGTGACAAG
Celera SNP ID: hCV1874482
公開SNP ID: rs2306158
SNP染色体部位: 114182275
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 487
SNP部位ゲノム: 68369
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,73|A,47)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1037):
TCACAGAGTAATACAGGTTGAGTATCTCCCTATTTGAAATGCTTGGGACTAAAAGTGTTTTGAATTTTGCATTTTTTTCCAATTTTGTAATGTTTGCATT
R
TAAAACAGTTGAGCATTCTGAATCTGAAAATCCAAAATCTGAAATGCTCCAAAAAGCATTTCCTTGGAACATCATGTTGGCACTCAAAAAGTTTTGGATT
Celera SNP ID: hCV1874474
公開SNP ID: rs2419629
SNP染色体部位: 114169273
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 487
SNP部位ゲノム: 55367
関連した照会SNP: hCV1874482 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,73|G,47)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1038):
TTCATTTATCATCAATGGAATGTTTCAGGTTGTACATTATAAATCTGATTTGCAGGTGTAATCTCCTTTGGACACCTGTTAGCTTTGAAAACTTTTAAAA
M
CTCTTCCTTCTTGCAAGGCAATCAGGTACTTAGCAGAGAGAGGGAATGACCTCTGGTTCTATTTTGGCTTCCAGCTGATATCGCCATGGTGATCTGTGAC
Celera SNP ID: hCV11197524
公開SNP ID: rs3736947
SNP染色体部位: 114159180
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 487
SNP部位ゲノム: 45274
関連した照会SNP: hCV1874482 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,72|A,48)
SNP型: UTR5;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1039):
AAGTGAATTGTCACATCTGCTCCAGTAAGCAGTGTGGTCTAGGTATCAAAAGCCTGACTGTTCTGAGCCCCTATTCCCTTCCCTTATTATATTTTAGGGG
Y
TCTATTCTAAGGAAATGGTCTAAATTTAAAAGGATCAATTTGAAAATATTTAGCGTAATTTAAAGTGTCAAGCTTGAAAACAATCTAAATACCCACGATG
Celera SNP ID: hCV31262197
公開SNP ID: rs11195948
SNP染色体部位: 114153505
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 487
SNP部位ゲノム: 39599
関連した照会SNP: hCV1874482 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,70|T,46)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1040):
CTAACTAGAGTCAGGGGGAACTCGGTATGGGTGTTTACTTATATGTGTATGATCAGGAAAGGTGTTTTTGGCACACCATCACACTGTCTTTTCCAGGGAA
S
TATCTTCTTGTAGTCTTTGTAAATTTCCTTTTTAGACTTTTTCTAACATATATATTTCTTTCTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCTA
Celera SNP ID: hCV31261952
公開SNP ID: rs12414780
SNP染色体部位: 114181005
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 487
SNP部位ゲノム: 67099
関連した照会SNP: hCV1874482 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,69|G,45)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 85
遺伝子記号: ACSS2 - 55902
遺伝子名: アシル-CoA シンテターゼ 短鎖ファミリー メンバー2
染色体: 20
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 488):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1041):
AGGATTGCAGGAGCTACACCAAAGAATGGGAAAGTCTAGAAGCAAACGGGAGACAGAACCCAAGAAGAGGAATGAGGCAACTCTGACTCAACTCCCAAGG
R
GCCCCAGAACCCCAAATTCTTCACACATGTCAGTCCAGTTCTCCACTATCTAACTAGGCCAAGTGCCCCAAGACACCATCCCTGCCTAGCCCAAGACCAG
Celera SNP ID: hCV11189332
公開SNP ID: rs2273683
SNP染色体部位: 32973184
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 56682
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|A,75)
SNP型: UTR3;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1042):
CAGAATTCTGGGGAGACATTGCCAAGGAATTTTACTGGAAGACTCCATGCCCTGGCCCATTCCTTCGGTACAACTTTGATGTGACTAAAGGGAAAATCTT
Y
ATTGAGTGGATGAAAGGAGCAACTACCAACATCTGCTACAATGTACTGGATCGAAATGTCCATGAGAAAAAGCTTGGAGATAAAGTTGCTTTTTACTGGT
Celera SNP ID: hCV25750225
公開SNP ID: rs4911163
SNP染色体部位: 32934355
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 17853
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,12|T,22) アフリカ系アメリカ人 (C,23|T,15) 全体 (C,35|T,37)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;サイレント変異;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,41|T,75)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;サイレント変異;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1043):
GGCCAATGGTGCCACCAGTGTTTTGGTGAGAAGGGAGCCACCTGGCCTAGCTGGGGGATGGACAAGATTATCCTGGGTGACTACCTCCCAAGGCTGCTTG
K
TCTAGAGGGAGGGGGACTTATACAATCATCTGTTTTCTGGAGAAAGAGAAGTCCTGAGGGGGTTGCGTATCCTGACTAGGATGGTATCTTGGCTTGTCTG
Celera SNP ID: hCV1361223
公開SNP ID: rs3746450
SNP染色体部位: 32972249
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 55747
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|T,78)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1044):
GATAGAGATAAATGCTGTTAAGAAAAATAAACAGGGTAGCATGATAGTGTGTGCAGGGATGGCTACTGTACACAGGATCGTCGGAGAAGACTTCTCTGAA
K
TGACATTTGAGCAGAGGCCTGAAGGGTGAGAAGGAAACAGGCATGGGAAAATCTAGAGTAAGAGTGTTTTGTGCAGAGGGACACAGCTTGAGATGTCTGA
Celera SNP ID: hCV2142560
公開SNP ID: rs4911449
SNP染色体部位: 32975897
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 59395
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|G,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1045):
TGTGCAGAGGGACACAGCTTGAGATGTCTGAAGAATGGACTGAAGCCTGTGTGGCTGGAGCGTAGCAAGCAAAGGGAAGAATATTACATGACGTTGGAGA
Y
GTACATAATACAGGGAGGGTCTTGTGGGCCATGGTGAGGAGTTTGAATTTTATTCAAAGTACAGTGGGAAACCTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
Celera SNP ID: hCV2142561
公開SNP ID: rs4911450
SNP染色体部位: 32976067
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 59565
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1046):
CGTAGCAAGCAAAGGGAAGAATATTACATGACGTTGGAGACGTACATAATACAGGGAGGGTCTTGTGGGCCATGGTGAGGAGTTTGAATTTTATTCAAAG
K
ACAGTGGGAAACCTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTGTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCGGTGGCACG
Celera SNP ID: hCV2142562
公開SNP ID: rs4911451
SNP染色体部位: 32976127
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 59625
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,41|G,77)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1047):
TCTTATTGTTACCTTCATGCTAAAGATGATGAAACTGAGACTCATGGAAGTTAAATCACTTGCCCAAGGCCACACTGCTAGAAAGGTGGCATTTAAACTC
Y
AGCAGGCTCATTCTACAGCCTGAGTTCCATAAGATAAAATGAGAGAGTAAAGAGACAAGTGTGTTGAGAGCAAGAGAAGCAGTGAACCTGAGGCTGTCTC
Celera SNP ID: hCV2142566
公開SNP ID: rs6088650
SNP染色体部位: 32978126
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 61624
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|C,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1048):
AAGCCAGTTCACAACTGTTATGTATGTCCCATCTTGGTTGCCTTCCCTCCTGGGCTCCTGCCAGGGACTCTCATTCCTCCCTGTGATCCAGTAAGAGCAT
Y
AGTGGGTGGCTAAGGATTGAAACTTCAGGGTTCCACCTGTAGAGACTGGTCTAGGGGGACCCTGATTACAGACCAGTCACTTCCCTGCTCTAATACATCT
Celera SNP ID: hCV2142567
公開SNP ID: rs725521
SNP染色体部位: 32979732
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 63230
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,41|C,75)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1049):
ATACAAATGTTGGCTCGAAATTACCGAGCAGCAGAATCATACTGCCATGTGTAGTAAAACACACTTTATATTTCCACTGCTTAAAGCAGCTGAAACCAGA
M
TGAAAAAATTTTTAATGGCAGGGGTGAAGGTGAAAACGCAAACATGTAAAATGATGAGTCTGATTAAGACACAGGCTTTTTAAATGTCTTTTCCTTTTCT
Celera SNP ID: hCV2142576
公開SNP ID: rs2236271
SNP染色体部位: 32987501
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 70999
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|C,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1050):
AAAACATGTCAGGCAGTTCCAATCTCTAGGTCAAGAGAGACAGGCATTCTCTGTTGAGCTGGAAGAGGAAACTAAGGCCCAGGACAGGGTAGGTGTGCCT
R
TTGTCGCTTGGTGAGTCAGGGCTGTATTAGGACCAGAAGTCTCACTCCTGACTACTGAATAAAAGGCCTAGCTTCAGGCTGATATCCATCATGACACATC
Celera SNP ID: hCV3249260
公開SNP ID: rs7263157
SNP染色体部位: 32922788
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 6286
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|A,75)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1051):
GTTGGGATTTGAACCAAGACAGTTTGACTGCAGAATCCATATCCTAATAGCAATGCTATTCCTCTTCCATGACCCCACAGAATGCATTTCACCAAATTCC
R
TCAAATACAGAATTTCTACCAGGGAAGCAGCCTCCTAATTTGTCCTCTCTTGCCTAGTTTCGCCAACTTGAGTCTTTCCAGTAGATTTATCAAGACACCA
Celera SNP ID: hCV3249263
公開SNP ID: rs6088635
SNP染色体部位: 32930162
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 13660
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|G,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1052):
AAGCTAAGTGATTTGCCTAAGGGTCATACACCTGTTTGAAGACAGAACTGAGACTAATCTCCAGATACTCTCACTCCTAGTCAACTATTTTTTTTCACTC
R
TGACACTACCTCATTATTCTAGTAGTCCAGCACTTGGCTGTGACAGATAAAAAGAGAAATTAGCCACATTAGCCAAACTGATTTAAATTAACTTTAAAAT
Celera SNP ID: hCV3249268
公開SNP ID: rs6058137
SNP染色体部位: 32938735
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 22233
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|A,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1053):
GGAGGTTATAGTCCAGCTTGAGGAGACAGACAATAAACATAGAAACCAGTAAGTATATGACAGGTAGTGATGAGTACTATAGAAAAATATAGAGCAGAGT
S
AGGGGAAAGGGAAGTGACAGTGCAGAGTGGGAGCTGATAAGGAAAGAACCTTTTGATAAATATGACATTTGAGCAGAGATCTGAAGGAAAGTATGGAGTG
Celera SNP ID: hCV3249269
公開SNP ID: rs8116657
SNP染色体部位: 32940135
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 23633
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|G,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1054):
TGCCTGAGGGTTGTTTGTGGCTGGTAGCATAAATACTCAAAGCTAATGGGAGATACATGGGAAATACCTGTTGTTGGGAACAGTCTTTCTCCACTTGAAT
S
AGGTGAGCAGATTGTGGAGGTGAGCTGGAGGATTTCATGTTTAAGGTGGATTTCTAACCTGCTTCTCTCATTTCTCCCTGAGTTTTATGACCCTTGACAC
Celera SNP ID: hCV3249271
公開SNP ID: rs4911164
SNP染色体部位: 32943149
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 26647
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|C,78)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1055):
AGTATTCCAGCTATGGTCTGACTTGAACAGGGTACTATTACCATTCTTTCACTTTACATATCTAAGATTATATTAGCCTCATTGACAGCCACACTCTCCA
S
TCAGTTTATAATCTCTCATAATACTTAAGATTTTCCTTTTCTTTCTCTCTTTCTCTCTCCTTTTCCTTTTTCCTCTTTCTCCTTTCATTTCCTTCCCTTT
Celera SNP ID: hCV3249272
公開SNP ID: rs6087644
SNP染色体部位: 32944578
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 28076
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|C,79)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1056):
CTGCAAATTTAGCTCATATAATTTATAGAAGACATCTACCATACAACCTGTTTTGCATAGCCAGTTATCACCCAACATAATCAGCCAAATCAGATCTACT
K
TGTTAGAAATTGCCTAACTTCTTTCTTAAGATAAATATGTTAATATATGACTCTGTGATAACTGTTTCACTTCTGAGTTGTAATTCTAAGAGATATAAGG
Celera SNP ID: hCV3249275
公開SNP ID: rs6088642
SNP染色体部位: 32946847
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 30345
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|T,78)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1057):
TTTCCTTATGCTAATTCTGAATTTGGAAACAATACCCCCCTTTTGGAGGCCATGTCATTTAGGAGGAGAAGGCCCTGAACTAGACATTTAGACTCAAGAA
Y
TGTGCTATCCAACATGGAAGCCACTAGCTACATGTAACTATTGATATTTATAGTAATTAAAATTAAGTAAAATAAATAATCCAGTTCTTCCGCCACATTT
Celera SNP ID: hCV3249278
公開SNP ID: rs6120757
SNP染色体部位: 32952432
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 35930
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1058):
AGATGTGAAGAGAGGTAGTCTAATTCTAAATGGATTTTGAATCAATAATGGGTTAAAGTAAATTTCGAGAGTGTGAGAATGAAGTAGTTGGAGAAGACTC
Y
TTGGAGGAGGTTCCCTAGGGGAAGAAGATGAGAAGGACTAGTGACTGTGTACCATGGGTTGTCACACCAACCATATGGCCTCCAGGTGAAGGAAAAGTAG
Celera SNP ID: hCV3249280
公開SNP ID: rs6120758
SNP染色体部位: 32956184
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 39682
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1059):
GGCGTGAGCCACCGCGCCCAGCCCCACACTCTTAAGTTTAACTCCCAGTAGTCACTGAACTAACCTCTGTCTCTCCTGACATTCATCAGTCTTCCTCATC
Y
CACCCCAACCTCTACCCTTGGGGCAATCCAAGGCTTGATGTTTACTAGATAATACTTTTTTCTTTTGGTGTTTACCACATCCTGTGAGTCTGTTAAGGCA
Celera SNP ID: hCV3249286
公開SNP ID: rs6088646
SNP染色体部位: 32969598
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 53096
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|C,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1060):
TTCCTGCTGAATGGAACCTGTCCCCTCAAGCAAAAGTCTCTATGGGAAACCCTATTGGTACCAGTGGTGTAAAGGCAGGAGCAGAGCTAGGGTAGGAAAC
M
CGCAGATGTGGATTGGGTCTGGACATGTAGGCAAAAGTGCTTGGACCAAGATCTGTTGACTTATTTTACTACTAACAGGGTCAGGTGCCCACCTCACCTG
Celera SNP ID: hCV3249289
公開SNP ID: rs2223881
SNP染色体部位: 32970124
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 53622
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|C,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1061):
TGATCAATAATAATAGCAGGGTTGGGGGTAGCAATCTATCAGATACTGTTCAGGTAAAGGCTTTCCAAGAAGGTGACATTTCAGCTCAGAATTGAAGGAT
R
GGAAGGGACCAGCCAAGGGTTCCTCCTCAGCCTGAGGCCAGGTGAGAGGAGTTCTGGGGTAGAGATGGGGGTAGGATGGCAGGGTGGTTGGAGTACTCAG
Celera SNP ID: hCV3249290
公開SNP ID: rs2076667
SNP染色体部位: 32970625
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 54123
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|A,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1062):
GCTAGTTGAAGGAACACTGGAGGACTGTCGGGGATTTGGGGGATTAAGTAAAAGGTTTATAAGGAGAGGGTGGAAAGAGTGGTTGATGGCTGATATTCTG
R
TCATTTATACTAGCTACTCAGTCTCTACTTTTTCTAGAAGTCCCCAGTAACCAAAGCCCAACACATTTGGTATCGTTGATTCCTTCCATTGTTTGCTTTG
Celera SNP ID: hCV7593320
公開SNP ID: rs1060615
SNP染色体部位: 32942042
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 25540
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,43|G,77)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1063):
AATTGTGTAACCTGAAACAAATGACTTAGCTTCTATGAATTTTATTTCTTATGAAATGAAATGAGGGGGTGATAATCTGTAAGGTTACTTCCATTGTTAC
R
GTTCTAATTGCTTCTCTTTCCTCCAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTTGTTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTACAGTGGTGCA
Celera SNP ID: hCV7593321
公開SNP ID: rs1013677
SNP染色体部位: 32932454
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 15952
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|A,78)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1064):
TAAAAAGATATCCTGTCTGCCATTAAGGAACTCATAATCCAGTGAGGGAAACAGATGTCTACATAGGACTCTAGTGCTAGAAAAAAATAAGTGCCCAAGT
K
TTGTCTTTAGAAATAAACAGGCTGGGCGTGGTGGCTCACGCCTGCAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACTTGAGGTCAAGAGCCTG
Celera SNP ID: hCV27166987
公開SNP ID: rs6119542
SNP染色体部位: 32948206
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 31704
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1065):
TTATACAAGTGAGCGCACATAGGTGAGTTGGTATGTGGTTTGCATATGGGGACACATGTGCTTGGGTATGTATATGTTGGCATTCAGCCATAACCGGAGA
Y
GTTCTGAAGTTCCTGTGGCACTTGTCAGTGAGCCAGTTAAGGAAATGGCTTTTCTGCCTCTGGCATTCAGGGCCGTTTGCCAGCTTCCTCTCTCCCTGTT
Celera SNP ID: hCV29372811
公開SNP ID: rs7266550
SNP染色体部位: 32959171
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 42669
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1066):
TACCATTGCTTAGTTGGGGGCCAGTTTGTCACTGAAATTCACTGTCCATTGTGTCTGTTGAGACTCTCTTTAGCTTCTGCTCTAGAGCTTTATGCTTGAG
Y
TCCAGCCAACACTTGGGCTCATTTCCCAGGCTCTTTAAAGATCAGAAAACCTTTAAAGATCTTCAAAGGAGGCCGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATC
Celera SNP ID: hCV29747405
公開SNP ID: rs6088640
SNP染色体部位: 32936170
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 19668
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1067):
GAAGAGGAAGTGGTAGAAACTACGGCAAACTGGACAGTGCATGCCCATCATGGGAAGCAGCTTCTATTCCACGCCAGGTAACTTCAGCCATGTGAGAATG
Y
GGGCCCAAGTTGTTATCGGATTTCCCGATTGTTCAAGAGATGTTGGAAATCTGGATTTTTATGAAAATTCTCAACTTTTTAACAAAAGCAAACAAAATTT
Celera SNP ID: hCV29711231
公開SNP ID: rs6119536
SNP染色体部位: 32913702
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 2800
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1068):
TGGTCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTCTACCTCTTTAAACACTACTTTCCTTCCTTGTTATCTCAAACTCTTCTAAGTTTTCT
Y
TGTCGTGTTTTGAAATCTAGACCCATTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCAGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAACTTA
Celera SNP ID: hCV30485907
公開SNP ID: rs6087653
SNP染色体部位: 32985715
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 488
SNP部位ゲノム: 69213
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|C,78)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 86
遺伝子記号: AKT3 - 10000
遺伝子名: v-akt マウス胸腺腫 ウイルス癌遺伝子 ホモログ 3(プロテインキナーゼ B, γ)
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 489):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1069):
ATCTTCACTTTCAGGGTGTTCACAATCCCCTTGTGGCCAGACCATGGTCCCAAGATTAAGACCTCTTGGCCCACATGACCCCTTGTTTGCCTCTCGACAG
K
AGAATCTGCTGCCTGTGACCATCTCTGGCACAGCATTAGCCTCCAATCGCCCCTCTCCCGGACACTGAGTCCACATCAGCACTATGGATAAATCTGCCTC
Celera SNP ID: hCV97631
公開SNP ID: rs1538773
SNP染色体部位: 241741305
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 33147
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,96|G,24)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1070):
ACTTGAAAGGCATCAAAACAGGCCGCTGACAATCACAGTGTTCCTCCTGTCAGCTTTCCTGGTTTCCTGTATTTCAAAGATCACAGATGATCAGCACCCT
S
TTCTCATAAATGTCCTGTGATGACAGTCCTGTGCTGTTGGAAGCTCTTCCTGGTATGTGGCCACGTGGTCAGCCACTCAGTCAACATGCGCTCCCACGCA
Celera SNP ID: hCV233148
公開SNP ID: rs1417121
SNP染色体部位: 241735973
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 27815
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,86|G,30)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1071):
TTCATCACTATTCATAGATGCCTGTCACTATTCAGAAAAAGAAGAAAGAAAGAGCCATACTTTCAAAGCTATTTTCTTTTTCTATATGTCCTAGTAGAGG
Y
GAATATAGAATTTATCACTTTGAAGCCAATGTAGTCTGAATCAACCGGTCCTCCATCTCCAGATCTAAGAATGCAAGTTAAATGTTCTCTAGAAATTATA
Celera SNP ID: hCV1678674
公開SNP ID: rs1458023
SNP染色体部位: 241953296
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 245138
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,105|C,15)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1072):
CCTTCCACTGAATTTACTACTAAACATTGCAATGTTTCTTTCAAATTATAAGAAAGTTACTCCATACAAAAAGAAAAAAGGACACAACTCATTATTCTGG
K
TTTTTTTAATTTTAGATTCAGAAGGTACATGTGCAGGTTTGTTACATGGATATACAGCATGATGCTGAACACCTCATTATTTTGACATCAGGCCTTCCCC
Celera SNP ID: hCV1678682
公開SNP ID: rs320339
SNP染色体部位: 241937533
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 229375
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,104|T,16)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1073):
TCGTTTTCAGTCCATTCAAAATACTTTCTCATTTCCCTTTGATTTCTTCTTTGATCCATGGATTAATATTTAGTTTCCAAGAACTTGGGGATTTTCCATA
S
ATCTGTGTTTTTTTAATTTCATTTCCTTCAAAGAGAAAATGTTTTACAGTACTTAAATCCTTTAAAATTCATGGAGTTGTTTTGCTCAACATATGGTACA
Celera SNP ID: hCV8688111
公開SNP ID: rs1578275
SNP染色体部位: 241747065
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 38907
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|C,22)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1074):
GAGACCTCCTTCATCCCTGGCTTCACAGTACATCCATCCTAAATCCAGTGCTGAGAGGTCAGCGTTTCCCCTCAGAAGCAGCCGTTCATCAAAGTTTGCA
Y
AACCGCACTACTGCCATTTCACTGAAGTAAAAATGATCCCCTATGTGTGTGTGTGTGAGCTACAAGGAATTATTTCTATATTTTCCTGTCACATTTTATA
Celera SNP ID: hCV9493081
公開SNP ID: rs1058304
SNP染色体部位: 241731480
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 23322
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,90|T,30)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1075):
TATCTGTACACAGATAATTATTTGTCTAAAATAGTATTTCTACTATACACAATTAAGCCCTCAAATGCTTTAAAGTAATAAAAACGGACACTGGACATAC
Y
GTGTTGTATCTGAGAATGACAAACACTAAAGGCAAGGCTGCAGTTAGTTAGGACAGGTCCCTGACCTTCGGCTGCCCTGCCTGGCCAGCGAGCCATCATC
Celera SNP ID: hCV12073840
公開SNP ID: rs14403
SNP染色体部位: 241730516
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 22358
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,93|T,27)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1076):
CAATGAGGAACATAAAGAACTTCCAAGAATACCACAGTATTAGCATATTTGGTCAAAAAAAGATAAATTCCAGATACATTTACAATGTAACAGCAAAACC
M
AGTAAGTAGAAAGAGGAAAAGAGCTCTGACGAAGTTCACTCCTTTGCCTCCATCTCTGCCCACTTCTCCTGGTGCTCTTTCTCACGGGAAGAGGTGGAGC
Celera SNP ID: hCV15885425
公開SNP ID: rs2290754
SNP染色体部位: 241872891
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 164733
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,102|C,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1077):
ACTTTTTCTCATTTTTCATAAAAGGCAACAGGCTGATGTTCATATATTTCTCTTGAATGCGGATTCAGTTTCACTCATTGCCCTGTCTTGGAAATCCCCA
Y
GTTAATGATGGCTTAAATTAGGTTGATAGAGTCCTCCCTTGGAGTCCAGCTTGGAAAATCCTCACTGGAGAGGGGCAGGCCCACTTCTCTTTTTGGAAGA
Celera SNP ID: hCV26034142
公開SNP ID: rs9428576
SNP染色体部位: 241728650
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 20492
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,67|C,53)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1078):
ACATAAAAGTGCTCAGCATACGACGATCATGAGCCATGTCTAAGCAGGCGCAAGCCCTCCCAGGCTTCTCATCTGCAATATTGGCCATTTCTCTTCATGC
Y
TCAGTGTCCTGTTTGAGTTGAGCATGTTTTTTTTACAAGTGAGTCTCTCCTCCATTGGCCGGGAACCGCCCGAGAGCCGGGAGCATTTGTCATTCTTGAT
Celera SNP ID: hCV26034157
公開SNP ID: rs2994329
SNP染色体部位: 241714544
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 6386
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,98|T,22)
SNP型: UTR5;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1079):
GTGGTACCCCCTCCCCACTGCACGATCCTCAGGAAGAATTCCTTTATTGAAACCATTATTGAATAGGGTAGATTTAGGCACGGGAAATGTAAACAGCAAA
Y
CAGCCACTAAAAGTGCGTTAATGTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGTGGGCGGATCATGAGATCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCC
Celera SNP ID: hCV26338513
公開SNP ID: rs3006917
SNP染色体部位: 241708594
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 436
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,97|T,21)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1080):
TCTTGTATAGCCATAGTATGAATATCAAAACAAAGAAATTAACATCAGTGCAATACTATTAACTAAACTACCAACTTTATTTCAATTTCACCAGTTTTTC
Y
ACCAATGCCCCTGCCTAGTCCAGGACCCAACCCAGGATCCCACATCGCAGTTAAGTCATCATGCCACTTTAGTCTCTCCAATCTATGAGTGTTCCATCAT
Celera SNP ID: hCV26719108
公開SNP ID: rs10927035
SNP染色体部位: 241770605
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 62447
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,62)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1081):
TTGTAAATTAGTCACCTGATTCTCACAGAAAACTTGTTAATTTCTGCTGTACGCCAAAGCCACTAATGGATGAAACTTACGATTAGTTCCAACATGAATA
Y
TGGTTGACATTTTTGTTTATGTTAAAGTCAAAGCTGAAAGTGATACAATGGAGACTTCAGAACTTCACTTGTCAGTTATGTGAGTGATTTCTTTGCTAAA
Celera SNP ID: hCV26719113
公開SNP ID: rs7517340
SNP染色体部位: 241776813
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 68655
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,16|C,100)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1082):
AAAGGGTAACATTTTTTGCCCAGTTGAAGTGGACAGGCATTACTTGACAGAGGGTCTTGATTCAGTGTGTATATGAAGAAATGGTAGATTTTTAAATCTT
Y
TTTCCTGTGCTTAGTGGGCACAAAATTGTAACAAAAATTACTATGTTTCCTCCTGTTCTTGCTGATGGCTAGCATAAAATTAAACTTTAAAAATCCTAGC
Celera SNP ID: hCV26719121
公開SNP ID: rs10927041
SNP染色体部位: 241798513
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 90355
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,101|C,19)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1083):
TTGCTCCCACTCTTCCTACTACACACCTCCATTACTATGATTATTAGAGTGTATTCTATTAATTACATCATGTTTGCCTCCCTCCTAAACTACCTTCTCA
Y
TGAGGGCACAGACCATGTGTTTTCCATGTTCTATTCTGTGCAGAACCTAACATAGCCCTGGCACATGTAAGTACTTTGTAACTCTTTGTTGAATGGATAT
Celera SNP ID: hCV26719154
公開SNP ID: rs11588042
SNP染色体部位: 242001254
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 293096
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,114|C,4)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1084):
AGAACAATATTTGAAGCCTCTATACAACTTTTATAAAACATTTGCCACAAGGCAAGTTTTGGTGTGTGCAAAAATCCATTTGTAGACCAGCTGTGACAGA
M
TCTTTAAAGCATATCCAAGGCAATGATAAATGAAGCAGACATTCATGCCAAACGCTTGGATTTAGATTTACGTATCAAGAAAGCTTTAATAAGTAATCCT
Celera SNP ID: hCV26719227
公開SNP ID: rs10927065
SNP染色体部位: 241981234
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 273076
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,15|A,105)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1085):
AGAAACTCAAATTTAAAAGTGCTGCTATAATAAAGTTGCTCCTTCAAGTATATATGGGGCGGCAGAGAACACCAGAGCCTCGCGGGTCACACAGGACACC
R
TGAGTAAGCCTGTAGATGGCACCAATCCACGACCAATCTATTGTTTACAGAAACAGTCATTTTGGGTTGTGCTTCTTTATGCAAGATATTTAACACCTTT
Celera SNP ID: hCV29210363
公開SNP ID: rs6656918
SNP染色体部位: 241772847
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 64689
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,23|A,95)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1086):
TGCATGCAAGACCAACAGAGTGGCCCAAACTACAAAATCATGAGATATTTACATGGCTATTGTTTTAAGACATTAAATTTGAGGTAGTTTGTTCCACAGC
R
TGAGGGTTAATACTGAGTGTCAATTTGATTGTATTGAAAGATGCAAAATATTGATCCTGGGTGTATCTGTGAGGGTGTTGCCAAAGGAGATTAATATTTG
Celera SNP ID: hCV31523557
公開SNP ID: rs10754807
SNP染色体部位: 241870781
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 162623
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,100|A,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1087):
ATACAGTAACACTATGGACTAGCCAATCTGGTGCTTGAGCAGAATTGAAAATAGGGTGATTCAAATTGGCAGAACTCTCGGTGCCTCTCCTAAAGAGACG
R
CTTCTCAGGCACACGGGAGGACAAAAACGCCACTGAGAGACTATCAGCCCTGCTCCCTGCTTTTCCAGGGGACAAAGTGACCGGCCATCGCCCAGAACTG
Celera SNP ID: hCV30690777
公開SNP ID: rs12045585
SNP染色体部位: 241739722
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 31564
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,104|A,16)
SNP型: ESE;サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 1088):
GAATTACCCAAAATGTGACACAGAGGCACAACATAAGCACATGCTCTTGGAAAAATGGCACTGATAGACTGGCTCGACTCAAGGTTGCCACAAATCTTCA
M
TTTGTAAGAAATGCAGTATTAGCAAAGTGCAATAAAACAAGCTAGGCCTGTACTTTAAATCATCTCTAGATTATTTAAAACACCTAATACAATGTAGATA
Celera SNP ID: hCV31523658
公開SNP ID: rs12047209
SNP染色体部位: 242021030
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 312872
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,104|C,16)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1089):
AAAAATTATAGCTTACACAGACTAAATAACCTCCCTACAGTGGATCCAAGAGATAGTGATAGGGCCAGAATTTAAACTCAACTTTTAACCAGTACTGTTC
Y
GCTGATGTCTCTGATATGTCTGAGTGCCTAAATGTATCATGAGTTGTGCTAAGTGCAATAAAAAAAGATAAGGTGCCCTTAAGGAATTCGTATATCTAAT
Celera SNP ID: hCV31523650
公開SNP ID: rs12048930
SNP染色体部位: 242006699
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 298541
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,101|T,19)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1090):
GATTTCTACTCAGCGCTGAGCTACTTGCCCATGACTCCACAGGCTTTCCAACATTGTCTGTGACTCTTAGTGATTCTAAAATTCTAGCAATGGCACAAGA
Y
TGAGTGGAAACTCTGCCTCACCACAGGACTGACCATGAGTAGCTCACTTCAATGGATTGGTATTTCACAACTTAGCCTGGACATCGGTCAAGTTGGTAAG
Celera SNP ID: hCV30690778
公開SNP ID: rs12140414
SNP染色体部位: 241741010
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 32852
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,98|C,22)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1091):
TAGCATTATTACTTTGATATTCATCCATGTCACCACATGTATCAATAGTTTACTCACTTTGCTGGGTAATATTTCAGTACATAGATGTATCACAATGGAC
M
CACTCATCTGTCAATGAACACAGGGCCTGCTCCCAGTTTGGGGCAATTACAAACAAAATTGCTATTAACTTTTATGTCCACGTCTTTGTGTAGACATATG
Celera SNP ID: hCV30690780
公開SNP ID: rs10737888
SNP染色体部位: 241745106
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 36948
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,96|C,24)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1092):
AGTTCCAAATATTCCTTAGATGAAGGCCAAATGAACTCCTTTGACTTCCATCATGATATAATCACTTTGGACTCCAGTCTTTCTTCTGCCTCTCTCATAC
R
CGGTATTGGGACAAGTTCATCTCTACCCTCTTAACTCTATATTTCACATCTAAAGATAAATTTACACAAACATATTGACTAACACCATTGGAATCTCCCT
Celera SNP ID: hCV31523638
公開SNP ID: rs12037013
SNP染色体部位: 241850830
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 142672
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|A,16)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1093):
CTGTGCACGTGGTAACTAATTGACTGATATTCATATATAAAGTAGGTACTTTATATTGCAGTTTGACAAATTTAGTCTAATTCCATCATCAGAAAGAATG
R
GGCAGTGGAACTCATTTAATGAGCTTCAATATACCAATATGTTGGCTGGGCATGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCATTTTGGAAGGTCGAGGCAGGC
Celera SNP ID: hCV31523608
公開SNP ID: rs12744297
SNP染色体部位: 241800919
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 92761
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,35|A,83)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1094):
GCTTTGAGGGTAGCTCCCAGGAAAGGCTGCCTCAGCCCCAGCGTGATGGGGACGGGTAGGGGCCGATGAGGCTTCCCAGAGCAGCGATGGCCTTAGGTAT
Y
GCCAGAAGGAAACCTACTTTTCCTCCAAGATCAGAGGGAAGGATGAGGTGGGGTGTTGGAGCATCACCATATATATACATCACACACACAGGGAAACACT
Celera SNP ID: hCV30690784
公開SNP ID: rs4658574
SNP染色体部位: 241717339
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 9181
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,92|C,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1095):
CTGAAAAGGGAAATGGTCCTTCCCCTCCTTTAAATGCCAAGTGGCACTCCTCCATAGATGACATAGCTGGTAAGCTGCATATGCAAACCATGCTGGATTA
R
CTTCATGGTCATCAGGATGTTTGTTCATCCTTAATATGCCCTTTAAATCATGGTAAATACTGTGACTGAAGGGGCCCCGCTAGGCAGGCATCTGATATAA
Celera SNP ID: hCV31523643
公開SNP ID: rs6671475
SNP染色体部位: 241855965
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 147807
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,96|G,18)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1096):
GAGCAAATTTACAAGACTCAGGCAAGCTAAATAACTTGCCCCAAAACACACAACTGTGAGTCATTATATAAGGATTTATTCCAAGTCTATCTCAATCCCA
R
TCCCATGCTCTTCTGAAGAGAATACACTGCTAGGAAAAATGCCTTAAAAATCAGTAATCATCTGTCAAAGCCATAGGAATGTCTGTTCCCTCTTCTATAC
Celera SNP ID: hCV804126
公開SNP ID: rs320320
SNP染色体部位: 241901809
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 193651
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,102|G,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1097):
GTGTGAAAGAGCAAGAAAAAAAAGGTCACAAAAGGGTCCTAGAGACAAACTTTTCCTACTTTGTAGTATTTCTTACTATTAGTCCCATCTAACAGAATAA
S
CTCTACATAAATTCATTGAAAATTCATAAATTCATTAGTAAACCAGTATATCAATTTAAGTTTATTTTTTACACTGTGAAATATAAACACCTGCCATAGT
Celera SNP ID: hCV1678656
公開SNP ID: rs1458024
SNP染色体部位: 242004068
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 295910
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,102|G,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1098):
AACTCTAAAATTCAGCTTTAATGCAGGTATCAAAAACTTCAAAAAAACAAATTCCCTATGTGGAATCAAAAAGATCTTTCAGGTTCATTCGATGATTTTT
Y
ACTTTGCTTTGTTTCTGTTTCCATTTAGCCCTATTTTAATGCTTATTTTACTAAACTCAAACATAGGGAGTACTTTATTTTCTAACATGTTTGTCTCCGT
Celera SNP ID: hCV1678668
公開SNP ID: rs1379700
SNP染色体部位: 241976025
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 267867
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,33|C,87)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1099):
CTAGGTAGTCTGCAAAGATGGCTGCCACAAATTCCCATTTCTCCCTGTATGCACATTCCACTCTTCCCATGAAGGGGTGGAGTCAACTTTCTCTCTCCCC
R
GGCTAACCCTGTATCTTGCTTTGAACACAGAATATGATCAAACTGATACTATGCCAGTAACAGACAAAGCCTTTAAGCCTGGCAGTTTATGCGTTCTCTC
Celera SNP ID: hCV1678723
公開SNP ID: rs1486472
SNP染色体部位: 241870337
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 162179
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,39|A,75)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1100):
GCTCTGTGAGTGCCCTGGGGACTTCAGGCAGTAAGTGCTTGGAATGATTAATATGAAAAATGCATCTGGAAATGAAAACGAAGAGGAGTCTCATTCTCCT
Y
ACAAAATGACCCTGTGCTCAAGGAACCTGTAAGTACTGACTTTTCCCACTCGGTCCAAAATCCCTCTGCCAAACATGTGTTCACAGACAGTAAATGAGCA
Celera SNP ID: hCV8688079
公開SNP ID: rs884808
SNP染色体部位: 241720062
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 11904
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,92|T,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1101):
CAGGGAGGGCCCCAGCAGCACCTGCTTTAGGCCTGGCCAGCCAAAGATCAGGACCACTGGAGCCACTAGGTCTCCTGGCAGGTGACTAGGCTCTTGTCAC
R
TAGGAGGGAGGGACCGTGACTCCTGGCATGAGTGAATCTTCAGCCTCTAAAGCCAAGAACTCTGTCAGACCTCAGGTTGTGGGGAGTCTTCCGTGGAAGC
Celera SNP ID: hCV8688080
公開SNP ID: rs884328
SNP染色体部位: 241720901
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 12743
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,90|G,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1102):
CAGCCTCCAGAACTGTGAGAAAACACCTAGACTATGAAATTTTGTTATGGCAGCTTGAACAGACTAATTCAGATGGAAACTATTATTTCCCCCATTTTAC
R
GAAGAAAAAATTATAGCTTACACAGACTAAATAACCTCCCTACAGTGGATCCAAGAGATAGTGATAGGGCCAGAATTTAAACTCAACTTTTAACCAGTAC
Celera SNP ID: hCV8688098
公開SNP ID: rs1531244
SNP染色体部位: 242006593
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 298435
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,31|G,79)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1103):
TTCTGAGAAATGCATCATTAGGCAATTTCCTCACTGAGTGAACATCATAGAAACACCTAGTTTTTAGGCTACAAATCTGAACATGTTACTGTACTGAATA
Y
GCAGTTCTAACACAATGGTATCTGTGTATCTAGACAAATCTAAACATAGAGAAGGTACAGTAAAAATACAGTACACAGGGTAAAAAAAAAAGTGGCACAC
Celera SNP ID: hCV8689016
公開SNP ID: rs897959
SNP染色体部位: 241964397
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 256239
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,36|T,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1104):
CAATTATATCAATGTTTGTTTTACGGCTAAAAAACTGAAAACTTCACTGGTAAGATATGAACACATGTTTAGATCCTATGCTTTTCTAGAAATGTTTTGT
R
AATCACAAACTAACAAAAAAACATTTTCTGGAAGAACAACAAATTCTAGTTTTCATCATCAGCGCAAAGAATGTCATATTTTTACTTGTTTGAAATGAGT
Celera SNP ID: hCV9115290
公開SNP ID: rs1352162
SNP染色体部位: 241784305
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 76147
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,37|G,83)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1105):
TATATATATATATATAACATTTCCCAACATACCTTAGAAATACCTTGTAAAATTATCTTTTTAAAAATGTACTAAAGGGGGCTAGGGCAAAGGAAAAAGC
R
ATGGTGAAGTAACCCTCTCTTGCACCAATTGTTCCTTCCTTAATTCCTCATAAAGACATTCTTCATTGCCCTCTGCCTGGAATATTCTTCTTCTCTGTTT
Celera SNP ID: hCV12073160
公開SNP ID: rs1973284
SNP染色体部位: 241923304
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 215146
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,36|G,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1106):
TGTTAGTTCAAGACAGAACTAAGAGTCCCTACTAAAGCTTGAAGTAATCTGTCTTTAGAAGAAAGACTGTGACTCCACCCAGGAAATTGGGCATAATTAC
R
TTAAGAAGGAATGGCTTCATCCAGAAAGTACCACTAATAATTTTCTACAATAAATCTCCATTTTGGCTTAACAGAAATAAACTTGGTCACCCACTACTAG
Celera SNP ID: hCV12073167
公開SNP ID: rs2034915
SNP染色体部位: 241945126
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 236968
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,36|G,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1107):
GCGGAGCTGGGACCATCTTACTGTGCCAGAGAGTAAGAAGGTGCTCAGAGAATGATGGGGACATGTTAAAGGGCACAGAAGTTTGAAGGGAATCCCGCTG
R
CCACATCTGAGACAATCTGGATATCAAAATACATAATACGAAAACACTATGACTCATTTGTTGAATAAAACAAGAATCCATGAGCCCATATTGATAAAAA
Celera SNP ID: hCV12073172
公開SNP ID: rs971285
SNP染色体部位: 241986396
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 278238
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,36|A,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1108):
AATATCATAATTTAGACAGAGGAATGCTTATCTTCAGTGAGTAAAAGAAAATAAACCCTGACCTAGAACTGTCTTACTCAGTAAAAACATCCTTTAAAAA
W
ATGGAAAAAATGAATGCATTTTCGCACAAATAAAAACTAAAAGACCATCAATGGATAAATGGATAAACAATATGTGGCATATACATACAATGGAACATTA
Celera SNP ID: hCV12073180
公開SNP ID: rs1870272
SNP染色体部位: 241991366
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 283208
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,36|A,84)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1109):
GCCTTCTTACATTAAACAGCTATCCTCCCCCTCACTTTCTATCTTCACATTGCTTTTTCTTCAAGACTTTGCGACATCTGATACACAGGCACGTATACAT
R
CACACATATGATATACATGTATTTGTTACTGTCAATGTTCATCACCAATAAAATATAAGTTCCACGAGGGCAAGGACTTTAAAAAAAAGTTTATTGATGC
Celera SNP ID: hCV15760229
公開SNP ID: rs3006939
SNP染色体部位: 241744457
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 36299
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,93|A,23)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1110):
CTCTCGACAGTAGAATCTGCTGCCTGTGACCATCTCTGGCACAGCATTAGCCTCCAATCGCCCCTCTCCCGGACACTGAGTCCACATCAGCACTATGGAT
R
AATCTGCCTCCAAAAAAGGAATGAGAGGAGAAGACATATAGGGAAGGAATCAAAAAGAAAAGGAAAGAAAAACTATGATGTGAACCCAAAGATGTGTAAC
Celera SNP ID: hCV15760238
公開SNP ID: rs3006936
SNP染色体部位: 241741395
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 33237
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,96|G,24)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1111):
TGTGGCGCAGTGAGCCCAGGGGCTCAAGGTGTTAGCAGTCATCAACAGTGCTATTTGAAACTGTGGGTGGATGAAGAGGTGAACTCAACACCACAAATAT
S
ACAGAGCAGTAACCACCATGGAAAAGAAAAGAGAGCTTATGTGTCTAGGACACCCCAAGAAATCTCTTCTGAATGAATGATGGCAATGAAATAGCCATTA
Celera SNP ID: hCV15760239
公開SNP ID: rs3006923
SNP染色体部位: 241715380
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 7222
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,81|C,25)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1112):
AAAATCGCCATTTTAAAGTATACAAGCCATAGTTTTTATTACATTCACAAGGCAGTGCAACTACCACTACTAATTCCAGAACTTTTCATCGCCCCAAATA
Y
AAATCCAGAACTCATTAGCAGTCATTCTCCATTCCCTCATCCCCTCATCTCCTGACCATGAAACCACTTTCTGTCCCTAAGGATTTTCCTATTTTGGATA
Celera SNP ID: hCV15776869
公開SNP ID: rs2345994
SNP染色体部位: 241998898
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 290740
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,32|C,80)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1113):
GAAAACAACATAATTGCCAAAATTTGTTTTATAAAAGGCATTTCCCCCATCACATAACTTCACCATTTCTAGTAATCATCACACCCCCAGACCAAAGCAC
R
AAGTTAAAGAAGGCCCTTATAATACACATAAAAAGTCAACAACTTCCTTCAGACTAAGAAGAACAAATTCTAAACTAGAGAACCCTGGATGAGAATGACC
Celera SNP ID: hCV15823024
公開SNP ID: rs2125230
SNP染色体部位: 241952471
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 244313
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|A,18)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1114):
TAATACATACTTTTGATTGAATGAGCTAATCTTATTTGGGGAACATACCTGTTCTTGAAGATTTAGTTCAAATGCACCTTTCCTCCTAAAATCTCCTGTA
Y
AGGAGAACATTTGTGGGGATGTTATTTTTATCGTGGTGATGATTTCATGGGTCAAAAGTTATCAGATTGTACACTTTAAATATGTACAAATTATTTATAA
Celera SNP ID: hCV15823033
公開SNP ID: rs2125231
SNP染色体部位: 241828922
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 120764
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,36|C,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1115):
TGGTGCTCTTTCTCACGGGAAGAGGTGGAGCTAATGTTATTAGTCAACTTCTACATTGGTTACGTCGCTTCTCCCTTTTAAATAAGCAGATTCATGCAGT
R
TGAGATCATGAGATTTCAGCAGGTCTGGCCATTGTTCTTTTTTTCCTTCTCTTTTTCTCTGGATACTGGCCACTGGTATGAGTTACTACAGCCAGGAATT
Celera SNP ID: hCV15885435
公開SNP ID: rs2290753
SNP染色体部位: 241873061
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 164903
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,36|A,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1116):
TCACTGGCCTGGAAGCTTCTCTGAACACTTTGCAGGCCGAGGCATGGTTGTAACCTGTTTGTAGCACCCAGTCTGAGAAGCTAGGCTTGAATGTAGGCCA
R
ACTAAATATTTGAAAGTTTAAAAACACCATATATATGGTATCATTTTAATTAAACGACTGACATTGTGATTAAACAAAGGAATGAAAATAGCAGTTCCTA
Celera SNP ID: hCV15965328
公開SNP ID: rs2291409
SNP染色体部位: 241798820
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 90662
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,37|A,83)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1117):
TATTTTTTCTTAGGCCTACTGACTTTTTCATTCTGGTTCCACCCATGTGGACTTCAAGTAACAACTCAGAGCTAGGGTGTGCTGATTATAGAGCACATAA
N
GTGCACTGTACATTCTTGCCTTAAGAAGAACTAAGTAATACAAATTAAACAGTGAAAGACAGTAGTAAACAAAGGCAATGTAATGGAGAAGTCTACAGGG
Celera SNP ID: hCV15965338
公開SNP ID: rs2291410
SNP染色体部位: 241783277
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 75119
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|T,-)
SNP型: イントロン;INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1118):
GAATGATCGGGTTCAAAAATGCTGAAGTGAGGAAACCATTCCATGAAGTCAAGAACCCTATTTTGACTTACAGTCTTCCAGCAGAGCAGCTTGATATGTA
S
GAAATCATCAATAAATATTTGCCAAATTAATAAATGTATCACTCAAGTCCTTTTTAATTATTATTGGTTTTTTTGGAGACAGAGTCTCGCTGTGTCCCCC
Celera SNP ID: hCV16082410
公開SNP ID: rs2881275
SNP染色体部位: 241984936
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 276778
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|C,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1119):
GTGTCTTTAAACTGACAAAATATTCACATTGAAAATAATCTTATAGATCTAGTCCAATCCCCTCATTTTAAGATGAAGAAAACACTGAGCCCCTAAATAT
Y
CATACTAAAGTCATACTAAAGCATCACAATATCAACCACCACCCAATTAATTTTAATCCAATCCTAACTGCAGCTTCTATAACAGGTCCTTTACTCTTAA
Celera SNP ID: hCV26034158
公開SNP ID: rs4515770
SNP染色体部位: 241753536
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 45378
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,89|C,19)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1120):
GATGAGGTGGGGTGTTGGAGCATCACCATATATATACATCACACACACAGGGAAACACTCCTACTTGGATGGAGGATCTTTGCTGTTCTGTTGAGGCCAG
Y
CTGATCCTGGAGGCAGGGCAGGGCCTGGCTGTTGCCCAGGCTCCAAAGAGGCGCCAGGGCGTCCCTTAGTCCTTACACTTTCTCCAGAACCTGCGGGCAG
Celera SNP ID: hCV26034160
公開SNP ID: rs2994327
SNP染色体部位: 241717481
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 9323
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,28|T,92)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1121):
ATTTATTTGTTAGCATATATATATGTGTTTGCAATATCCACTCAAAACCAAATTTTACCAATTTATAAGCACATTTAAATGAAAAAGAATCAGACTGGCA
Y
TGGCTGTCTCATTAGCAACCATGGATGCTGAAAATAATTTAAGCAGTTCTCAGATGTTGGAGAAAATGATTTTGAACCTAGAATTCCTCAGCGAAATTAT
Celera SNP ID: hCV26719082
公開SNP ID: rs10927046
SNP染色体部位: 241867813
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 159655
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,102|C,16)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1122):
AAAAAATCAGGGAATACTACATAACAAGCTATTTGTGCTAGGTAGTCTGCAAAGATGGCTGCCACAAATTCCCATTTCTCCCTGTATGCACATTCCACTC
W
TCCCATGAAGGGGTGGAGTCAACTTTCTCTCTCCCCGGGCTAACCCTGTATCTTGCTTTGAACACAGAATATGATCAAACTGATACTATGCCAGTAACAG
Celera SNP ID: hCV26719085
公開SNP ID: rs10927047
SNP染色体部位: 241870300
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 162142
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,101|A,15)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1123):
AAGCTCTAGAAAGCCAGCTCTAATGCTGTCAGTTAGTCCATATTATCCTGCTGGAGAGAGAGGCCATGTGGAGAGACCCTGGAAGATAAATTACCACTCC
R
AGAGAGAGACCAAGTGGAGGAGAACCAAGACACCATAGCCAACAGTCAGCACCAAGGCCCCAGACACATAAGGAAGGTTTTGTTGGATTTTCCAGCCCAC
Celera SNP ID: hCV26719086
公開SNP ID: rs4658585
SNP染色体部位: 241870545
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 162387
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,37|A,81)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1124):
GAGAGGCCATGTGGAGAGACCCTGGAAGATAAATTACCACTCCGAGAGAGAGACCAAGTGGAGGAGAACCAAGACACCATAGCCAACAGTCAGCACCAAG
K
CCCCAGACACATAAGGAAGGTTTTGTTGGATTTTCCAGCCCACCCATGTATAAGCTGTAGGCAGCTGATTGAGAGCCATGCATGCAAGACCAACAGAGTG
Celera SNP ID: hCV26719087
公開SNP ID: rs4658401
SNP染色体部位: 241870602
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 162444
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,32|T,68)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1125):
ACAGGACAAACACTGTATGATTCCACTTATGTGATGTGTCTAAAGTAGTCGAATTCACAGAAGCAGAAAGTAGAACGGTGGTTTCCAGGGGCTGGGGGTA
Y
GGGAATGGAGAGCTACTGTTCAATGGGAACAGAGGTTCAGTCATGCCAGATGAAAACGTTCTAGAGATCTGCTGTACAATAATATGCACATAGTTAACAA
Celera SNP ID: hCV26719102
公開SNP ID: rs10927056
SNP染色体部位: 241889193
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 181035
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,34|C,86)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1126):
CAGTGAAAAACTTACCAACAAAGACAAAACTCCAGGTCTAGGGAGAGCTTCACTAGTAAATCCCACCAAATATTTCATTAATAAATAATACAAATCCCAT
R
CAAACAATTCAATAAAATTAAAGAGAAAGGAGGAGTACTTCCCCTTTTGTTTTTAAAAAGCAAACATGATCCTGAAGTGAAAATTATACAAAGACATTTT
Celera SNP ID: hCV26719107
公開SNP ID: rs7538011
SNP染色体部位: 241769967
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 61809
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,103|G,17)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1127):
TCCTTATCCACTACCCTTGCCACTACTGCCTTGGCTCTAGCTACCTCCTAGATATAGTTATGGTTCCCAATCCATGTAGTCAGTTACTGTGTTTCTTTTA
M
GCATTCATTCTATTATTTCCAGCTGCTCACTTGACATTTCCATCTTGGTTTTATATAGAAACTTCAGACTCAGTGTACCCAAAGTTATTATCAACATCTA
Celera SNP ID: hCV26719114
公開SNP ID: rs7549780
SNP染色体部位: 241779078
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 70920
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,34|C,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1128):
AATGACTTTGAGCAAATCTTTGTATCAAAATAGTTGTCAAAATATTCTCATCTATTTCAGCTATTTTAAAAATGTTACATTATATGCAAGATATTAAAGA
Y
AGTAGGTTTCAAAGAAAAAATCAGGAAAATTTTGGCAAGCAAAACATTTTCTAAGAATGGGGTTCTAAAAAACTAAAAAGAATGCATCAAATACTGCACT
Celera SNP ID: hCV26719116
公開SNP ID: rs10927039
SNP染色体部位: 241788349
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 80191
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,98|C,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1129):
ATTACAGATCTGATACACAACTACTACTTCTAGTACTGTCACGAAAAGCCCAGCATTAATAATGGTAATGTACTAGAAATTTCAAGGTCCAAAAAAAGTG
M
GAGACACCATCTGAGGTAAAAGGAAGAGGCTGGCTTCAGCTCCTGCCAATCGCTCCCTAACACTGACCATGTAAATCTGATCACAGTATCGCCTTGCTCT
Celera SNP ID: hCV26719117
公開SNP ID: rs12144559
SNP染色体部位: 241789837
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 81679
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,34|A,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1130):
ATGCTTAATGGATGCATCCACTAACAAAAGTAGTGATGAAGTCAAATATGAAGTCATAAGAAACAAGATTGTATATTAAAAATCTAAGTAATGCTTACTA
Y
TTCTATCAGAGGGTTGTTATCTAAAAGGTCATGCTTTTGAGGAGAGAGAAAAAAAAAAACACTAGACATAATACATCATAGAATTTCCACCAAAAAAAAG
Celera SNP ID: hCV26719120
公開SNP ID: rs10927040
SNP染色体部位: 241798316
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 90158
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523650 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,98|C,16)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1131):
AGTTGCCATCATAAGTAGGACTCATTAAAGCATGGCAAAAACATTGTTTCAAAAAAGGAAGAATGACAGGGCAGACAATGACAAACTCTGATGCCTAAAT
R
GGTATACAGTCACCAATGGCATGAGACGGCAGCTGTACTGTGCTGTTACTACATATAGAAGTTGTCAATGGAATTTAGAAATGACAGACCAAAATCTCAA
Celera SNP ID: hCV26719149
公開SNP ID: rs6675851
SNP染色体部位: 241854117
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 145959
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|A,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1132):
AAATAAAAGAATTAAAAATAAAGGAAAGTTAATACTATTTTCCACTAAGAAGAACCAGAGCTCCCTAGAGAGCTGCTTCTAGAGGTAGGAAAGTATATGA
M
GAGACTGGAATATCTTGTTGTCCCAGCAAGTCCTCAAAAATTGATGGAGACATGTCAAAAGAATTTAAAAGCCGGCCTGAAAGTGCTTTCATGGGCCCAA
Celera SNP ID: hCV26719162
公開SNP ID: rs4132509
SNP染色体部位: 242009707
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 301549
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,102|A,18)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1133):
GATCACTTATCTCTGTAGGAAGAAAAGCAATGGCCATTCCTAGCATACTTTCACTCAAAAACAGGTTTCGTAGCTAGAACTATTTTCCAATAATAAAGCC
W
AACATCAGCTATCAATCTAATAATCTCCAATCATCTCAAGTCCTCCAAACACATTAAAATGAATTTATAACAGTAAATGTATCACAAGCCTCAACACCCC
Celera SNP ID: hCV26719171
公開SNP ID: rs10927075
SNP染色体部位: 242022743
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 314585
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,36|T,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1134):
TCACGCACCAGGTTCTCAGCTTCCAATATTTAGTTGACGTTGTTTGCCTGCTGTCATCTCTCATCTCGTTCTCTTTACCCTCATGGATTTCTGCTTTTAT
R
TGTGTTCACTATCATTTAAGTGGGGAAGGAAATACATGTCTTCTCTGATAATACTGGAGATTTTTAAAGTTTTCTTTTGATCCCTTATGGTATCTGTTTT
Celera SNP ID: hCV26719176
公開SNP ID: rs10927076
SNP染色体部位: 242024916
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 316758
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,97|G,15)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1135):
TCCATCTGCTTATTTGAAAGAGGTATAGCAGCTTCTGTCTCCTGTTGTAACCTCTCCCAGTCTCTGATTTCTTTCTTCCATTTAGGCAGGGATTAGGAAA
Y
AAGAAGAGATGTACAGGTGTAGCCAATCTGTCACTTTTGGTCAGAAGCCCTGAGAGAGCTCTTTTGAAATCAGCTATCTCAGGATACTGACTTAAGGACT
Celera SNP ID: hCV26719179
公開SNP ID: rs6672195
SNP染色体部位: 242026166
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 318008
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,36|C,84)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1136):
ACCTATTAACCACATCAAATGACTTCTTACTATAAAGATTGAGAAATTAAGATACCCTCTGCCCTTTCTTCCCAATTTTTGTTACTTTCATTTTCATTTT
Y
AGCTTTTCTACTGGTTTGTATTCCACATTAAAAAAATACACTTAAGCCTCTATTTCTTGACCCAGGAATTTTAGATGGAAATGTCTTAGCTCCTAACTGT
Celera SNP ID: hCV26719192
公開SNP ID: rs10803161
SNP染色体部位: 242057393
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 349235
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,99|C,17)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1137):
CTTACCTAATTTAGATACCTTATTTACTAGTCCATTCTGGGACAATCAGGGTACAACCCACTATCTTTGTCAGGAATAACCATTCAGTCAAATCTACCAA
Y
TCCTACCCTGTCAGTTCTGTTTTGCTACACAAAAATTTGACAGATATACAACATGGTTCTAGAATTCCAGTGCTGCCCTTACCGAAACTCTCTCCTGAAC
Celera SNP ID: hCV26719194
公開SNP ID: rs10927081
SNP染色体部位: 242060839
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 352681
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,36|C,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1138):
CAGAGATGCCTCCTATGCTGATGTGCAACCAAGTTGTAAGGAGCTGTCCTGGATCCATCAAGGAGGAAAACGCAGACAATACTTTACTTGATGTTTGCTC
Y
GTGATGTTTCTTTTATTGCCATTTCTAACACCAACAATACTATGGTAATGTGTTATCTCAATTAATACTTATCATTTTCAACTGTCCAGAAAAGTGTAAA
Celera SNP ID: hCV26719197
公開SNP ID: rs4590656
SNP染色体部位: 242069396
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 361238
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,36|T,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1139):
TGTTTGTCCTCCAAAGATGTTAGTAACATTAAATATATCTTACTAACACACACATATATGTGTATGTATGTACATATATATATGTATGTAAAATACGAGG
Y
AGAAGGTACTCAACAAGTGGTAATTTATTACTATACTACTCCACAATATACTCAATATTTCAAGAAATAATTATCTGCTGCTGATAGGCAAACCACTGAA
Celera SNP ID: hCV26719201
公開SNP ID: rs4478795
SNP染色体部位: 241911199
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 203041
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,100|T,10)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1140):
TGTCAAAATATAATTAAAAGCTAAGTATAATATAATCTTCATGTGTTTTATCAATACTACATAGAGTTCTATGATTTTTATCATAAATAGGATCTCAGCC
K
GACTTGGCCTGTCTGCTCTGGTCTAAAAGATGTGAGGAGAAAAAAAGAGACTTGTTAATATCATAATATTATCTTAAACCAGTAATTCGAATAAAGAGAT
Celera SNP ID: hCV26719215
公開SNP ID: rs12144546
SNP染色体部位: 241950500
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 242342
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,34|G,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1141):
AAAAGATCTGAAATCTATCTTAACTGTCTAATGATCAGGGAGAACTGTTAGGTAAATAATTATAAAATGCTATTAAAAGTCCTTAATGATATGGGAAAAC
S
TTCATAATATTAAGAGAAAAAAAGCAAGATATAAAATTCCAAATGTTGTATTTTAAAAATAAAAATATGTGCATAGACAAAAGATTAAGGAGACATAAAA
Celera SNP ID: hCV26719219
公開SNP ID: rs9782958
SNP染色体部位: 241959595
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 251437
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|C,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1142):
TACTCATCTGCAAAATGGGGGTGATAGCGCTTTCCTCATAAGGTTGCTATGAGAATTAAATGAGATTAATTCAGGTAAAACACCTAAAATAGTGCTTGGC
R
TGTAGTAACAGCTCAGTAAGGCATGGGTGTAATTGTTATTCCCTGACTCCTAAATCCAGGTTAGGAGCCCCTTCTGTTATTCCTTCTTCTTCTTCTTACT
Celera SNP ID: hCV26719222
公開SNP ID: rs4553169
SNP染色体部位: 241967263
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 259105
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|A,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1143):
CATAACCTCTGCATATTCAATGCTTTCATATTCAATTGTTTGTTTTTAAAGAAATTAGTTTATTAGAGACAGAGAGAGAACGAATCTTTCCCTTGATAAT
Y
TCCACTAAACTTTATAAATATGCTTAGAATGGAAATGAATGAGAAGAAACAGAGGATGAAGGAGACATCAGAAATTTTCAGCCCTGTGTTTTACCTCTGG
Celera SNP ID: hCV26719225
公開SNP ID: rs11586029
SNP染色体部位: 241976690
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 268532
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,36|T,82)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1144):
AAATATCAGATTGAATAATTCAGATGAATACTCCACTGAGAACAATTTAAAATGTAAGACAAAATTAGGACTCTGATAAGTCAATTGCCACATTAAGCTG
R
AATCACAAATGGCTGATCGTTAATGTCAATGGGGAACCAAAAAATAAACTAAATCTTGCACAGATCTGCACCCTAGATTCATGTCACCTGAGTGGACCAG
Celera SNP ID: hCV26719232
公開SNP ID: rs10803158
SNP染色体部位: 241989852
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 281694
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,102|G,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1145):
TAATTCAGATGAATACTCCACTGAGAACAATTTAAAATGTAAGACAAAATTAGGACTCTGATAAGTCAATTGCCACATTAAGCTGAAATCACAAATGGCT
R
ATCGTTAATGTCAATGGGGAACCAAAAAATAAACTAAATCTTGCACAGATCTGCACCCTAGATTCATGTCACCTGAGTGGACCAGGAAACTTTAGGCTTT
Celera SNP ID: hCV26719233
公開SNP ID: rs10927067
SNP染色体部位: 241989867
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 281709
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|A,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1146):
GTACTTTCAAAAGCAAACTCTGGCTAGCACAGGAAAAATCCTTTGACAAGAGAAAGGCTAAATGGATACAATAATGATGATTAGATCATACTTACACATA
Y
CTTCCAAGAAATTTCTATACTTCTTTTTTATTCTGAAGCAATAGACATTATGGGATTCCAAGAAACTGAGCCTTCATAACCCAAGTAACAATAGCCATTG
Celera SNP ID: hCV27498250
公開SNP ID: rs3766673
SNP染色体部位: 241787096
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 78938
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,91|C,9)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1147):
CTTTCTTCCCAATTTTTGTTACTTTCATTTTCATTTTTAGCTTTTCTACTGGTTTGTATTCCACATTAAAAAAATACACTTAAGCCTCTATTTCTTGACC
Y
AGGAATTTTAGATGGAAATGTCTTAGCTCCTAACTGTGTAAGATAAGGAAATTAGTATTCTTACACAGCAAGCATTTTTAATCATAAAGTTTAACCAAAG
Celera SNP ID: hCV29210367
公開SNP ID: rs4518884
SNP染色体部位: 242057456
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 349298
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,36|T,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1148):
GTGGACTGGGTAAAAGCCACTGTAAAATTTGTTTACCCTGAAAAGGGAAATGGTCCTTCCCCTCCTTTAAATGCCAAGTGGCACTCCTCCATAGATGACA
W
AGCTGGTAAGCTGCATATGCAAACCATGCTGGATTAACTTCATGGTCATCAGGATGTTTGTTCATCCTTAATATGCCCTTTAAATCATGGTAAATACTGT
Celera SNP ID: hCV29795761
公開SNP ID: rs7528450
SNP染色体部位: 241855928
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 147770
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,33|A,77)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1149):
AGGCCTGTACTTTAAATCATCTCTAGATTATTTAAAACACCTAATACAATGTAGATACTATATAAATAGTCACACTGTATTGTTTAGGGGAAAATAAGGG
R
AAAAAGTCTATGCATGTTCAGTATGAACGTAACCATTCTTTTTTTTTTTTCTCAAGTATTTTTGACACACAGTTGATAGAACCACAGATGCAGAACCCAC
Celera SNP ID: hCV30084348
公開SNP ID: rs9287269
SNP染色体部位: 242021174
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 313016
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|A,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1150):
GCAGAAAATTAACTACAAGGTGAGAATATGAAAGATGCCAGTGTGGACAAACCATGCAATAAAATTTTATTAAAAGAGAAGCAGAAATAGAGGCAGTAGC
R
GAATGGGAAGCAATATGTCAAGAGGGGGCTTTTCTTTTTAGGATGGAAGATACTATTGCACCTTTATATGCCGGTGTGAATGATAAAGCAGAGAGGGAGA
Celera SNP ID: hCV30372886
公開SNP ID: rs9782883
SNP染色体部位: 241959155
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 250997
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,102|G,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1151):
AGAGAAAACACAAGTTCAAGAGGTACAGCTTCTCTGCATTCTCCACTGGGAAGTAGAGCAGTGAATAATATTACTCACACAGTGTGAGGATTCCACAAGG
Y
GGAAGATACTCCCCCTTTTCCATACTCAGAGGATTTTAAATCTTTCCACCCAAAACTTCTGAGCCCCTCCCCCCCAACAAGATACAAAATATTTTTTGAA
Celera SNP ID: hCV29633221
公開SNP ID: rs10157763
SNP染色体部位: 242061664
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 353506
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,35|C,83)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1152):
GAAATAATTTTTCAAATTAATGCTATTCTTGTTACCTGGAAAGTAACTTTATCTTTTGAAATCTTACTATTTCTCCAAACAATCTCAATGTCCAAAGAAG
M
TTTTCTTGATGATTCTGTCTTTAATGATACCTCTTTTTCCTAAATTGTAACTGCATGTATTAATTGCAAAACTCCCTTCAAAACTTAGCCATAAAACATC
Celera SNP ID: hCV31523707
公開SNP ID: rs10803152
SNP染色体部位: 241912790
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 204632
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,103|A,15)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1153):
CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCTCAGGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCATAGTGCTGAGATTCCAAGCATGAGCCACCACATCC
R
ACAACCTTATCATTTTTATAAGTGAATTACTGAAAACCTTCTAACTGCAGCAACCTCCCAAGTATTTTCCTTGCTTCCACTTTTGTCCTCTCTACTTCAA
Celera SNP ID: hCV31523624
公開SNP ID: rs10927044
SNP染色体部位: 241834116
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 125958
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,37|A,83)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1154):
CTCCTGACCTTGTGATCCGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGCCCAGCCACAGTAAGTCTTTAATAAAAATATA
S
GAGTATGAATACTCTCCAGAAAAATAATCCTCCTCCAAAGCCTGATCTTAAGAATTTATTGGGGAAATACTTTACAGTTACACTCTTCCCTTTACATGTT
Celera SNP ID: hCV31523563
公開SNP ID: rs10927051
SNP染色体部位: 241872559
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 164401
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523650 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,90|C,14)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1155):
AAAGAAAAAAGGAGAAAAGTCAGAGCTTCTCTTTTTTGTTTTCTAGTTATTCCATTCATATTGATTGGTTCTGAAATGTTACAAAAATTTTTGGTGTTCT
R
GAAAATAAGTAATATGGAAAATTTTTACCTAAGGTCACTGTTTCTTCTCAATTATTTAAGGTGAAAGTAATAAACCAGACATTTAAGTAAACATGCTCAC
Celera SNP ID: hCV31523725
公開SNP ID: rs10927060
SNP染色体部位: 241942612
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 234454
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,36|G,84)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1156):
CCTCTCTTCTAATAATGTGACATAGGTTAGCGCTTAATGTATATACTGTCTTGAATTATTCTCTGTGTGTTTCATATACTGGTCTTATTCTCTGGGTAGA
Y
AATGAAAGCCTGGAAGTAGATTATGTACAATTTGCCTCATCTCTATTTATTTTCCCAGTTTCCTTATTATAGAGCACGCTTTCACTCTCAACAGGGTACT
Celera SNP ID: hCV31523744
公開SNP ID: rs12031994
SNP染色体部位: 241983932
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 275774
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,105|C,15)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1157):
TGTTTAGATTAAAATGTTTAAAGGTTTAATTTCAACCAACCTCTTTAGCCATTTAAACACTAATTTTATTCTTTCTAAAATAACATCCAATGTGAAAAAC
R
AAGGCATAATAATAGATTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCATGCAA
Celera SNP ID: hCV31523740
公開SNP ID: rs12032342
SNP染色体部位: 241900983
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 192825
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|A,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1158):
CCATTGGAATCTCCCTAAAAACTCAGCTGAATCTTCTGAGGCCTCTTTCATCCATCGCTACTTAGGTCACTCTTCAATTTCTCAGGATGGTTGTTTCAAA
W
CTTTCCCAGGCCTTCTTCCTTGCCTGGTAGGTATACTTAAATGTACACACTAACCCTTACCTAGTCAAGCTACTAAGCTAAGACTAGAACCCAGGTCTGT
Celera SNP ID: hCV31523639
公開SNP ID: rs12034588
SNP染色体部位: 241851015
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 142857
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523650 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,99|A,17)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1159):
AAAATTTCAGGGGAGGGGTCTCATCAAATATTTGTTCAAGCTATGAAATACCTGGAAATCTGATTTTTGAAGAAGTGTTAGCCCTACATCTGGGAAATTT
R
TATCATTAATGTTAACTTCATCACATATATAACTGTATGTTCCATATATCGTCAATAAAGAACACTAACAGTATAAACTCCAGCCTAGTTCTTCAAAGAC
Celera SNP ID: hCV31523736
公開SNP ID: rs12124113
SNP染色体部位: 241970989
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 262831
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,103|G,15)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1160):
TCATCATTATCTGTACCTCAGTAAGCATAATAATGCTGTTTTCAAATGTTTCCAGTGACTTTGAAAGGAAAGATTTTCTTAAAACCAAGGCATCAGGAAG
R
AAAATGCATGGAATCATCAGTATCACTGAAGTCATCCAAAATACAATAAAATAAAAAAGTATATAAGAATTTTACATTGCATAAATAATCTAAGTTCCTG
Celera SNP ID: hCV31523723
公開SNP ID: rs12140040
SNP染色体部位: 241938545
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 230387
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,106|A,14)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1161):
CACACAAAAATGAGTAGGAAACTCTATGAGCTCATGGTACACACCATACTACTGATCATTCTACCCATGTAATTATAAAGTAGTATTTCATTTATGCTAT
M
AAGGGTTTAATCAGGTCCTGTGAACCCTCTAGTCCAACAAAAATAATGTTACGTGTAATTACAAATAAACAGTATAATAGAAATAAACCTATATTTTTTA
Celera SNP ID: hCV30012351
公開SNP ID: rs10158245
SNP染色体部位: 241900020
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 191862
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,31|C,81)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1162):
TTAAGGATGTATCCCCTCCACTGCACACTATAACCAGGTACATCCTTTTAAAAAAATTGAATACTGATTTGGAAACCGGATGTTCAAAAATTTCATCACA
Y
TGATATTTAAGACTTTCCATAATCTGATTACTAACTCTCTAATCTGAGCTTTTTTTTTTCCTCCAGCATAAATTCTCCATCCATCTAGGATATTGCCTAT
Celera SNP ID: hCV31523710
公開SNP ID: rs10927059
SNP染色体部位: 241918702
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 210544
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,102|C,18)
SNP型: サイレントな稀なコドン;サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 1163):
TTGGGGATTTTCCCACTATCTTTGTTTTTTAATAGTCTAATGAGATTAGGGATTTTCTTCATATTTTTCCTACTTGAGATTTATAGGACTTTTGAAACTA
Y
GGTTTGGTATCTTTAACTATTTTTTAAAAAATTTCAATCATTATATTTTCAAATACTTTTTGCTCTATTCTCTCCTCTCCTTCTAAGGCTCCAGTTATAT
Celera SNP ID: hCV31523573
公開SNP ID: rs11589907
SNP染色体部位: 241884883
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 176725
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,34|C,84)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1164):
TTGGGGGCGAGGCATACGTGTGCGCATGCACATGTGTCTCTGTATGTGAGTGTGAGTGTCGTGGCCATGGTTGTGACAGTGAAAGTAGTTAGCTGTTAAG
R
AAGAAAAATGACCTTTGTCTATATTGTGGATGGTCATGTGCAGCATAATAAAGTACATATACAAATCATATTTAACAGTAAATTAGTGGTGTATCCAATA
Celera SNP ID: hCV31523576
公開SNP ID: rs12691548
SNP染色体部位: 241886751
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 178593
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,33|G,85)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1165):
GCAGGCTATTATCTAAGTTGCAGTGGCTCAATTAATGCCTTTGGGTCCTTACGATATACACTCAGATATGATTTTAGAAGTATCTGCAACTCAGACTGGA
S
CTTATGGCAAAAAGCCCATGAATGCTGTCCAGCAGTAACCACTGGGACCATGGGCCAGACAAGAAAGTATAGAACACATCATTAGAGAGACGATTATTGG
Celera SNP ID: hCV31523552
公開SNP ID: rs12739344
SNP染色体部位: 241857935
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 149777
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,36|C,80)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1166):
GGACATGTTGATGGTCATCAAAAGAACTTCTTTCAGGATCAGGAGATGACTGGAACCAGCAAGTGGATGTCCCAGCATGCTTGTTTGAGGTGGCTATCTG
R
GTCCCCAAAATAAGTAGATATGGGAGATATTGGCCGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGTGGATCATGAGGT
Celera SNP ID: hCV31523555
公開SNP ID: rs12749316
SNP染色体部位: 241859404
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 151246
関連した照会SNP: hCV26719108 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523608 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,37|A,83)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1167):
AACACTACTGATGTTTATCCAGCCAACAAAAAAGTATAATAGCACAAAGACTGCCTTCTGAATACTCCCTAGAGGCCAATCAGCCAGGTGTGAGAATTCT
K
AGGTTAGGGAAACTCTTTGAAACAGAGTTCAAGAAGAGCTACTTAGAAATAAAGAAACAAATTCAGATCATGATAGCCATAAAGCAGAACCTGCAGAAGG
Celera SNP ID: hCV29542869
公開SNP ID: rs7534117
SNP染色体部位: 242031525
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 323367
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,102|T,18)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1168):
TAAGAAAGTAGAACCCTTCACATATTAGTGCTAGGAATGTAAACTGGTAACATCTGGACAATAAACTGACTTTATAAATGATTTATATAATCAAAACATA
R
TAAAAGTTCCCTTAAAGAGTAAAACTGAGAAAAAGTGGCTACAGCCTTTAATCGCACCGAAGGCCCCTACAGTGACAGACTATGAGAAGAGGCTAACAGT
Celera SNP ID: hCV29560960
公開SNP ID: rs7519673
SNP染色体部位: 242059746
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 351588
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,105|G,15)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1169):
ACTATCTTTTTGAAAAATTTAAATCAGGAGGGAAGCAATTCAAAATTTAATTAAGATTGGAAGTTCTCAAACCCCTTTACAGTTCTCATACTCTGTTCTT
Y
TCATATAAATAAAAAGCCTATTTTGGTAAAATTTCATTAAAACCCATATTGATTAAATATGAAGTAATATCTTTAATTATCAGAAAAATGAGGGATATAT
Celera SNP ID: hCV29741723
公開SNP ID: rs7517921
SNP染色体部位: 241923043
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 214885
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,97|C,19)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1170):
TTATAAATATGAATGAATGTATAAACATGAATAAAAATACTGTAGCTCATTGAACAAAGCAGCAAGAGCCATAGAGTTCTTCAATTCATAGCTGTAGCTA
M
AAAAACAGAAATTAAAAGTGTGTACAATTATTTTTTGCCATCAACTCTTTCAGCTATGCATAGAAAAGATTATTTTCAAATGACAAAAAAGCAGTTAGAG
Celera SNP ID: hCV29994467
公開SNP ID: rs6694738
SNP染色体部位: 241781833
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 73675
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,103|A,17)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1171):
AAGAAACAAAATCTGAAGTATCTAAGATCAGCAAAAAAGAAATCTCAGGTACTAATCCTGGCTCTATACCTAACTTGAAATATGGCCTCAGTTTTGAAAT
M
TGTCAGATGAATGGATATAAGACTAGAGAGGCCACCAACAGTGGCTCCTGCCTGTAATCCCAACATTTTGGGAGGCCGAGGCATGAGGACTCCTGAAGGC
Celera SNP ID: hCV31523688
公開SNP ID: rs12049228
SNP染色体部位: 242061894
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 353736
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,101|A,17)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1172):
ATAAGTGATTCAAACTCGGTTTAAACTATTAGTTTCATACACCTCATAACTTGTAGTACTCATAATTTCTGATAAATTTTTATAAACTGTACTCCTACTT
Y
TCACAAACTTCTTCTCCTCATAATTTAAGAATTAAATTGGAATACAGCAGTATGTGAATCATGAAGCTTAAATAAATTTGTGTATCTATACATTAAAACA
Celera SNP ID: hCV31523691
公開SNP ID: rs12021907
SNP染色体部位: 242062263
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 354105
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,105|T,15)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1173):
TTATTGTTTTATCTTTTTCTTAAAAAAAATACAGTAGCCATTCTAACCCACTAATAAGGGCTAACCTGAATTAAACAATAGGAGTAAAAAAAGATCACGG
Y
TTTTATAATGGTAAAATGAAATTTGTAACATTCAAAGACTTATTTTCTTGAATTTTTTGTTATATTATTGCATTTTTTAGCTTCAAATTTCCCTTGTATC
Celera SNP ID: hDV71836703
公開SNP ID: rs6429433
SNP染色体部位: 241924617
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 489
SNP部位ゲノム: 216459
関連した照会SNP: hCV15885425 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV26719113 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV97631 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1678674 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523643 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV26719121 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31523557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1678682 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,103|T,17)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 87
遺伝子記号: ANKS1B - 56899
遺伝子名: ankyrin repeat and sterile alpha motifドメイン含有1B
染色体: 12
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 490):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1174):
TAGGCTGTAATTCAGCAGCTTTGGTAACTTTTCTGATTCATGAGGTAAATTTCTCATCTCAAATATCTGGTCATTTGAAGTAATACTGGAGATCAAATTA
Y
GCAAATATGCTGCATGACTAAATTAAAGGCCTATTCATGTGAGCATTAGTTAGTAATGGGAGTTGTATTATATACTGCATTATTAGAAAATGGGGCAGCA
Celera SNP ID: hCV18996
公開SNP ID: rs638177
SNP染色体部位: 98066139
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 490
SNP部位ゲノム: 422937
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,29|T,89)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 88
遺伝子記号: AQP2 - 359
遺伝子名: アクアポリン 2 (集合管)
染色体: 12
OMIM番号: 107777
OMIM情報: 腎性尿崩症, 常染色体劣性, 222000 (3);/腎性尿崩症,常染色体優性, 125800 (3)

ゲノム配列 (配列番号 491):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1175):
ACAAGGGGCAGGTCCTGGGGAATCCCTTGTAAAGGATGAGATGGGAGGGATGGGCTCTGGGTGATGTAGGGAGAGAGATGGAGACAGAGGCAGAGAGAGA
R
GCTGGAGCCAGGAACACAGCCACCATAGGAGGGTCAGGATGAAAGGAGCAATGATACCAGAGCAAAGCAGGATGCAGACAGACTGCTGGCTTCTTCCACC
Celera SNP ID: hCV25597241
公開SNP ID: rs3782320
SNP染色体部位: 48631366
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 491
SNP部位ゲノム: 10570
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,5|G,35) アフリカ系アメリカ人 (A,5|G,33) 全体 (A,10|G,68)
SNP型: イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,8|G,112)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1176):
GTGATGGGGTTTGTAACCACTTCTCACATCGTTGAGAGAAAAGGGTGAGCCTGACTCAGAGGTGTGGCAAAGGAAGGGCAGGGCAGGCTTTAAGGACAGG
S
ACAGGGCTGTCAGAGGCTGAGGCTAGGGAGGGGCAGGAAGGGGTGTGAGGCAGGGCGGAAGAGAGCAGGGCCCTGGGCAGGTGCTGAGCCAGGTCCTGCA
Celera SNP ID: hCV1420741
公開SNP ID: rs444124
SNP染色体部位: 48623186
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 491
SNP部位ゲノム: 2390
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,88|G,28)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 89
遺伝子記号: ARID2 - 196528
遺伝子名: AT リッチ相互作用ドメイン 2 (ARID, RFX-様)
染色体: 12
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 492):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1177):
TTCGGTCAGCGATTCATTCTTTTCTTCTAAAGATTTTTCCAATTTGGTGTTCAGAAGATTATTTTTTAGTAAGTTATTTTCAGAGTCTTGAATATTATTG
W
AATCTTCATTCCCAAAAGTATCACATGTTGCAATTATTTCTACATCTTCAGTTTCAACATGCCCAAGCAATTGAACCTCTGGGCTCTTAACAGATTGTCT
Celera SNP ID: hCV3216426
公開SNP ID: rs7315731
SNP染色体部位: 44607781
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 207894
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,19|T,21) アフリカ系アメリカ人 (A,28|T,4) 全体 (A,47|T,25)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;ESS SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,21|T,17) アフリカ系アメリカ人 (A,26|T,2) 全体 (A,47|T,19)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;ESS SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,51|T,69)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;ESS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1178):
GAAATGGTCTATACTTTGATTAGGAAGTAGACTACGATTTGATTAAGAAGTATTATAGCTCCCTACCCCCTACCCAGGATATGGGAGTTTATAATACTCC
Y
ATAGTGAAAAATTTCAAGGAAATTTCTTTTGTATTCCCCAAACTGAAGGTTTCTACCACCCTTTTTGTTTCCCAGCAGTGAGAGATGGAATTCTGAATTC
Celera SNP ID: hCV345121
公開SNP ID: rs10748432
SNP染色体部位: 44468682
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 68795
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,52|C,42)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1179):
TTTGGTTGGTCGTGCTTTTAGGGTGATGACTCTGTATGAGTTCCTTGGTTATGGAGAGTGTTTGTATGATAGCTTCCTCAGATACTGGTTGTAGAAGCTA
Y
GTACTTGGTGTGTGGATAAGTTCACTATCTCCTATGGGGTTGGAATGACAGAGGTCTTTTGAAGCTTATCCCATTTCCGTGTGGTGTGCACTTATTTATT
Celera SNP ID: hCV389695
公開SNP ID: rs2408461
SNP染色体部位: 44703098
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 303211
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,55|T,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1180):
GGGAAATGGGAGTGTGCAGCATGGAAAGTGTCATTGTTTTAGGAAGTAGCTGAAAAGCTTGGATAAGTTTTTTCTGAAGGAATTTGATCCAAGAGCCAAG
R
AAAGTTTAACCTTAGTTCAGTTTCCCCCCATTTTCTTCAGCTACAATGCAAATAGCACGTAATTGGGAACTTGTTTTATGTTATGATTATTACAAGACAG
Celera SNP ID: hCV1026394
公開SNP ID: rs35117
SNP染色体部位: 44528462
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 128575
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,68|A,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1181):
TTTTTATAGATGATGAAGTACCTATTGGGGCTAAATATTTTTAACAGACAAAAAAATTAACTGTTCAAGATGGCGTTATAAGTTTCTTTTGAAGAGAAGG
Y
TGTTGGGCCTTCTGAAAAGCATGCTAATTAACAGAAAGCCATAACCATTATTGCCCCCATCCTTTTAATTTCTTTCTTTTTTGGGTGGGGAAGACAGGGG
Celera SNP ID: hCV1026396
公開SNP ID: rs35115
SNP染色体部位: 44535694
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 135807
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,67|C,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1182):
AGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAGCTCTAATGAAAT
R
AACTTATTTTTTCAGTAATAAGCATTTTTTTCAGAGACAAATGTAAGATACTGTCTCTAAATTTACAAATACACACAAGTACAGAGGAAGACAAGCTCTA
Celera SNP ID: hCV1026401
公開SNP ID: rs35122
SNP染色体部位: 44568273
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 168386
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|A,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1183):
TGGTGGGTCCTTTCAATCTGGAGATTTATATCCTTCAGTAATGGGAACTTTTCTGGTATGTTTCTTTTTCTTTTCTCTTTTAGCTTTCTGTTTTCTCTCT
S
TTTAATCTATTTTTTGGAAATTTCCTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCCGTTGCCCAGGCTGGAATGC
Celera SNP ID: hCV1026402
公開SNP ID: rs247929
SNP染色体部位: 44581175
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 181288
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,67|G,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1184):
GTTCATATATTTTTTAATAATGCATTGTCTAGTTCGAAGAACTTAACATCATAACCATTGCTGTTTATCCCAGTGGCATACCCTGTATGAAATTTCTTAA
R
AGATTATATTAATGCTACATTTATGGTTTTCAAAAATATTTAAAAGTTGAAATCTGGCTGAGCATGGTGGTGCATGCCTGTAATGCCAACACTTTGAGAG
Celera SNP ID: hCV1026405
公開SNP ID: rs997307
SNP染色体部位: 44633391
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 233504
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,51|A,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1185):
CTCCTTCCTCTTCTCCTCCAGAATGGCTGTCACTGGTTGGTACTTCCAGGCAAATTTATGAACCAGGTGCCCCAGGTAGGCAAACTTCAGTGTGGGCTTC
R
GGTGCACAACCTTGAGTAGAGTAGAAATCACCATCCACTTTTGCAAAGGGCAGGGCACAGGGGGTGTGGATCCCATCAAATACCTTGAGGTGGTCCAGGT
Celera SNP ID: hCV2071465
公開SNP ID: rs10880884
SNP染色体部位: 44684330
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 284443
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,50|G,70)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1186):
GTTAAATTTTTTTCTTTCTGTTGATTTCCTGTTTTCAGTTTCATTAATTTCTGCTCTTTTATTATTTTTTTTCTTCTGCCTGCTTTGGGTTTAATGTGCT
Y
TTCTTTGTCTAGTTTCCTAAGGTAGAAGCTTGCATTATTATTTTAGATCTTTCTTCTTTTTTAGTATATAAGTTCAATGCTAAAGCCTTCCCTCTAAGTA
Celera SNP ID: hCV2362878
公開SNP ID: rs247918
SNP染色体部位: 44552230
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 152343
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,64|T,44)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1187):
AAGGTGGTATCCTCCTGATTTCTCCACTGTAAAGTTACCATTTTCTCTTTTTGAATTAATAAGTATTCTGTAGCGACATACCTTGAGACCATGAAACTAT
Y
TTGCTTACCATCAAACTTTTACCCAGTAGTTTTAACATCCACTGATGGTTTGGGCTTGAATCAGTTATTAATATGATACTTGCATTTATTTGTGCTTGAA
Celera SNP ID: hCV2773478
公開SNP ID: rs2193749
SNP染色体部位: 44421079
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 21192
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,68|C,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1188):
CTAATGTAACAATGGACAGTTATTACATTCAGAAACCTTAACATGGATAAAATTGTATTCTCTATTATGTAGACCTTAAATCAAATTTTAACAGTTGTCC
Y
AAAGATGCCTTTTATAGCAATCATATCCCCCAACCCCATTCATTATCTTGTATTGCATGTAGTTATCATATCTGTAGTTCTTCAGCCTTTTTGTGTCTTT
Celera SNP ID: hCV2773479
公開SNP ID: rs7138997
SNP染色体部位: 44420742
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 20855
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,67|C,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1189):
CATTTACTATAAAATAATTTTTAGTACACAAGATATATTAAGATGTAGTTTTGTTGTTTTTCCAAGCCTATTATTAAATAATTAATTGAAAGAATTTATT
R
CATTTTATTGAATGTACTATTTATTTATTTGTTTTTTAGCTTTAGGATCCTTTTCCACTGTATTTGGAGAAGAATGGAAAGAGAAGACTGATAGAGACTT
Celera SNP ID: hCV2791821
公開SNP ID: rs2059404
SNP染色体部位: 44501430
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 101543
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,59|A,47)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1190):
AAAATTTCAGGCAGGAGAATCCATCTGGACAAGGGTGTTATCTGTTCATGCTTTAGCTGCCTGGAAGTGGAGAGTAGGCTTTTTCAAGCTTTTAGGATTT
W
TAGTTTAAGCCAGACTCTAATGCCCATCAGTTAAGCAAGTTCTTCTAAAAGTAAGGTACTTGAATGTGGGATATCAACAAACAAGCAATACAGTTATCAT
Celera SNP ID: hCV2791832
公開SNP ID: rs2408435
SNP染色体部位: 44478624
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 78737
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|T,48)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1191):
CAGCAAGACTAGCAGTTTATTTTTCCTTCTTCACAATTTTAGGGATGGAATATTTGTTCTTTCCATAGAGCTGAGCAACCTCAGCGTATGATTTTTTCTT
R
TTATTAATTTTCAAAAATTATTGGAAAATATGAAGAAAACATCTTGCATAAATGACCTACATTGGAACCCTTTGCTCTATCTCTTTATTTCATGCAATTT
Celera SNP ID: hCV2791836
公開SNP ID: rs7132422
SNP染色体部位: 44474393
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 74506
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|A,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1192):
AAAAGCCACCTAAATAGTCAATTTCCACTTCTACTCTTATTCGTCTATGATTTTCTTCCCTTCACAGCCAGAGTAATCCTTTTAAAATGTACCAGATCAC
R
TTACTCCTGAAAACACTCCCTAGCTCACATTGGCCCTAAATGATCTCCCCTTATGTCTTACTCTTTCTCCTCCATCTACCTAATTCAGTCATTCTAGCCA
Celera SNP ID: hCV3201166
公開SNP ID: rs11183243
SNP染色体部位: 44622525
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 222638
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,51|A,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1193):
ACATTGTTTATAAAGACTTCTCATGATTTCAACGTAATTTCTAGTGTTTCATGAAATTGATTGCTAATTCATTCAGGAAATTTCAGTCTAAGTAGGGTAT
R
CTCTTTCATAGTAGAGATGATAAAGGGAGGAAGATTTCTACACAGTTTCAGGCCCTAGAAAGTATTTTCTGTATTAATATCGTCAACTTAGAAGGGGAAG
Celera SNP ID: hCV3216410
公開SNP ID: rs247930
SNP染色体部位: 44525279
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 125392
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,68|A,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1194):
GAAGGCCAAAGCAGGAAGATGGCTTGAACCTAGGAGTTCAAGATGAGGCTGGCAATATAGCAAGACCTTGTTCCTACAAAAAAAATAAAAAATAGGTGGT
S
ATGGTGGCCCTTGCCTGTGGTCCCAGTTACTCAGGAGGCTTTGGTGGAAGGATCGCTTGAGCCCAGGAGGCGGAGTTTGCAGTGAGCGGAGATGTACCAC
Celera SNP ID: hCV3216415
公開SNP ID: rs247920
SNP染色体部位: 44555033
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 155146
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|C,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1195):
TAAAAGATTTTGTTTGAGGCATTGGAGAAGCCAAAGCCTGCTCCTAGGTTGAACTTCCAGCTCATGGCCTAGTTGTAGTCCTGCTGCAGGTTCTGCTGCA
R
GCTATTTGCTGCCTTCTTGCTGAGGGTCATGTTGGGCCTTGCAGTCATGCTAGGGGGGCAGCTGAATGAAGGGGTCAGATTTTTGAATCCACCCATGTTT
Celera SNP ID: hCV3216418
公開SNP ID: rs35125
SNP染色体部位: 44561125
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 161238
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,68|A,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1196):
GTCACGGAAATAATTCATGGGAGTGCTACTAAAGATATATGAGACTTCAACTCTTGACCACATCACTTTTTCTCCAAAACTTTAGAACTTGTTTGCAAAA
R
CTAAATGGTATAAAACACATTTTAAAATGTCACCCAATTCTCAAATGTCACTGAAAGAAAATGCAGGAAAAGTATGTATTGTGTGATTAATCAGCTTAGG
Celera SNP ID: hCV3216425
公開SNP ID: rs1366024
SNP染色体部位: 44599905
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 200018
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,52|A,68)
SNP型: 転写因子結合部位;MICRORNA;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1197):
CACTTTACGTCCACTCTCTAGCAATTTTCAAAAATACAATATAGTCGACCCTTTAACAACACAGGGATTAGGAGCACCAACCCCCAACACAGTCAAAAAT
K
GAAACAGTTTTTACTCCCCAAAACTTAACTGTTATTCACCAGACTCCTTACTGATAACAGTGAATTAATATATTTTTTATGTTATGTGTTACATACTGTA
Celera SNP ID: hCV3216427
公開SNP ID: rs724909
SNP染色体部位: 44609978
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 210091
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,51|G,69)
SNP型: UTR5;TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1198):
TGTGTATCACCACACTTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGGTGGGTTTCGCCACGTTGCCTCAATCTTATTTCTGATCATCATTAGTCTTAAACATT
Y
TGCCTGAACTCAAGAGTGAGAAAAGAAATGACAACTGGAAGAAACCATCAATTTAACTGAGGAGTCAAGCATAAATAAACATATATCAACACAAACTGTT
Celera SNP ID: hCV3216433
公開SNP ID: rs7306229
SNP染色体部位: 44621099
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 221212
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|T,69)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1199):
TATAGCAAATAAATATTAACATAGTGAATTAAATGAAATTAAATGTTAGAATGTGTATGACAGCCTAGGCATAAGGCATGGCCTGTTAGAAGGCTGAAGA
Y
ACTTATTCCTGATCCTGAAATCCGAAGTAAACTGTAAACTTTGCTTTTAGATGGAAGAAGACTGAGGGAAATGAGAGGATGGAGCTTAATTTATAATGAT
Celera SNP ID: hCV26173972
公開SNP ID: rs1012642
SNP染色体部位: 44639546
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 239659
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|T,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1200):
CAAAGACATCATGGGTCTAGGTCCAGACCGGAGTAATAAAACAATATTGCAATAAAGCAAGTCACACAAAATTTTTGGTTTCCTAGTATATATGTTTATA
Y
TATACTGTAGTCCATGAAGTGTGCAACAGCATTATGTCTAAAAACTGTACATACTTGATTTAAAAATACCTTATTGCTAAAAATGCTAACAATCATCTCA
Celera SNP ID: hCV12058175
公開SNP ID: rs10880879
SNP染色体部位: 44654170
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 254283
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,51|C,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1201):
TTCAGCTGTGCCTAATATGCTGCTTGACTTATTTGTTAAATTTCTATTTTAGTGATCATGTTTTAATTTCTAGAAATTCTCTCCATCCTATTTTAGATTT
K
CCCTTTTGATCTTCTTTTTTATGTTTTTAATAATTTTGAAGATTTTTAAAAATCTTTTAATAAATTAATTTGAATTATATAAATATATAGAAACAAAATA
Celera SNP ID: hCV26024786
公開SNP ID: rs7976870
SNP染色体部位: 44510041
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 110154
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1202):
AATGGCTTCCCTTGGTCTGCACTGGAGATTGGGAATGCCTGCAAGGCACTTCCCACTGCTGCTTCTACTTTTATATTTCACTGCTCCCTAAATCAGTTCC
W
GTTCTGTGTTGGATTAAGGCCTTCACCTGTGGCCTGGATTTTTAAGTTCCTTAATGGGGATATGTATCCTGGAGGCAGTCTCTCCCACTCTAACACTCTG
Celera SNP ID: hCV26173954
公開SNP ID: rs7308284
SNP染色体部位: 44705181
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 305294
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,55|A,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1203):
TTGTATCAAAATAATCTCTAAACAAATAGCCCCTTACAGCTCTGAGATTCCTGTCTCCCAAAAAGATCCAAAAACCGAAACATCATTCTCCCATTTTCTG
R
GGAATAAATATAATCCGTCATCCTTGAATAAATACGTTTTTGTTTTTTATCTCATTTCCCCAAGTTATTCTAGTTACAGATTAACTCTAGACTGTTCACC
Celera SNP ID: hCV26173968
公開SNP ID: rs10880880
SNP染色体部位: 44661573
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 261686
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,51|G,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1204):
TTATTCATTAATTTAATGAATAATAATTGATCACGTATCTTGTGCTAGACTCTATGCACTGGACATATATCAATGATGAGAACAGAGAAAAATTATTTCC
Y
CTTTAGAGTGAGGGAAAGGAGACAAATAAGAGTATGCTAGCTAATAGCACAAGGAGAAAAATAAAGCAAATAAAGGGAGATGGCTTTTGCTTGAGTAGGG
Celera SNP ID: hCV31416750
公開SNP ID: rs10880855
SNP染色体部位: 44431122
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 31235
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,68|T,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1205):
GGCTCATGGGTAGGCTCTTGGAGGGGGTATTCCATGAATACCTTGAAATCATATACAAAGTTTTATGTCTGTAAACGTGTATTTTTCTAGCAGAAGGGAT
S
TGAATCATTCTTCACATTCTTAAAGAATGCCATAACTACCCAAAAGTTAACATCTAAGGAGCTTACAGTGTTATAAATTAGTAATAGGTTGAATTAATCT
Celera SNP ID: hCV30870137
公開SNP ID: rs10880871
SNP染色体部位: 44627005
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 227118
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|G,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1206):
CTAGCTACTTAGGAGGCCGAGGTGGGAGGATCGCTTGAGCCCAAGAAGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACACAGCAAGACCCTGTTAAAAAAAAAACAACC
Y
ACAATTAATATTTTATAGTAAGCACTGTCTTCTCTATTTTAAGACCCATATAGTGAAATATACATGAGAAACTGAGAAACCTCAATCAAGTTACACACTG
Celera SNP ID: hCV30870104
公開SNP ID: rs10880875
SNP染色体部位: 44647286
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 247399
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,51|C,67)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1207):
CAAGTAGCTTAATAACCTTCTGAATCTTTATTTGGTATTTCAAAGATTTCATCTTGGTTTGGATCCATTGCTGGGGAGCTAGTGTGATCTGTTATAGAAC
Y
CTGGTTTTTTTTGTGTGTGTGTCACCAAAATTAACTTTTCTGGTTCCTTCTCATTAGGGTAGACTATTTCTGTTAAGTATTCTTGAATTTAAGATTTCTT
Celera SNP ID: hCV30311491
公開SNP ID: rs6582585
SNP染色体部位: 44702835
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 302948
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,55|C,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1208):
CTATTTTTTAAATAAGATATTTTATATAAAAAAGGAAACTTTAAAAATGGAAATTAGGATGATAATATATAAGAAGAGGTAGTATGCTGAAAACTGCAAT
Y
ATTTAAAGAAAAGAAGTCTAAAAATATATTCTAAAAGTTCATAGTATAGTATATATTGTATAGAGATGTTCTTTTAAATAGTGGTAGAAAAGAATTCCAG
Celera SNP ID: hCV31416770
公開SNP ID: rs11183201
SNP染色体部位: 44457249
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 57362
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,66|C,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1209):
TATTTTCTGATTACTAAAAGATGTTACTGATGATGAATCAACAGTATCATGTAACTGCACTGATTCATCCTATCTCTGCTGAATAAAAGCACAGGTTTTC
M
AGAAAACTGTCTAAGCTCTAGTTGGTGCCAAAGGACGATAGAGAGCTAAGTAACTCCTGAAAAGTTTCGATCTTAACACACTAGCCCTATTACCACATGA
Celera SNP ID: hCV30870058
公開SNP ID: rs11183272
SNP染色体部位: 44668523
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 268636
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|A,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1210):
AAGATTTATTATGCAAATTATAACCATAAGAAAGCTGGAGTGGCTATATTAATATCAGGCAAAATAGATTTTAAAACAAAAAAAAGTTACTGAAGCTAAA
R
AGGGACATTTTATATTCATAAAAAAATTGCAGTTCATTAAGAAGACATAATAATTGTAAATTGTGAATATCTGCATCTAACAACAAAGCTCCAAAATAGT
Celera SNP ID: hCV31416763
公開SNP ID: rs12319077
SNP染色体部位: 44452703
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 52816
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,67|G,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1211):
AAAAAAAAGAGATACTTGTTTTTCAAGCTATGTTCTTTATAAAAATTATAATTATTCTAAATATTTATTATCATTATTATTATTTACTGGTACTAGTTCT
R
TACTCTTACAGGTTATCCTTAGATTTATACTGTCTCATTTGTGGACTATCATCAGTATCATCAACTTTTTTTTCGTATTATCTATTTTCAAAGTTTCTTA
Celera SNP ID: hCV30680015
公開SNP ID: rs6582574
SNP染色体部位: 44492360
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 492
SNP部位ゲノム: 92473
関連した照会SNP: hCV3216426 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,68|A,50)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 90
遺伝子記号: C10orf26 - 54838
遺伝子名: 染色体 10 オープンリ−ディングフレーム26
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 493):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1212):
GCTTCCAGAAGATGGGGCAGCTCTACTCTGGGGTCAAAGCCAACTACTGCTTGGGTAAGGAGCAGGGCAGGCCTAGTCTTCCTGCACAGAAAGCCTGAGA
S
AATTGGCTCTCCCTTTCTCTGGAGCCCAGAGATTGGGCTGGCTGGGGTCTAGGATCAATGAGGGGGAAGCACACCTGAGGATTGTGCAGCAGGAAGGCCA
Celera SNP ID: hCV25761532
公開SNP ID: rs3740397
SNP染色体部位: 104582665
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 493
SNP部位ゲノム: 66669
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,73|G,47)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 91
遺伝子記号: C17orf81 - 23587
遺伝子名: 染色体 17 オープンリ−ディングフレーム81
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 494):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1213):
GAAAACCCCTGAGCACCACGGACAGATGTCCCCAACACCGCCAGACGTCCCCAACACCGCCAGCGCCCACCCTGGCTCACCGTGCGGATCTGCCTCCGCA
R
AAGGTAAATGAAGAAGCTCCAGAGCTTGGCGGCGAAGGCCACGAACGTGCGCAGCCCCAGCAGACACTGCGTCCGCATCATCCCGATGACCCCGGCACCG
Celera SNP ID: hCV8727391
公開SNP ID: rs414206
SNP染色体部位: 7095258
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 494
SNP部位ゲノム: 9162
SNP供給源: Celera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: ESE;UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異

遺伝子番号: 92
遺伝子記号: C1orf164 - 55182
遺伝子名: 染色体 1 オープンリ−ディングフレーム164
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 495):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1214):
TTCCCGGGCAGTGCACCATTTCTTTATTTCCAAGGATAATTCAGTGTAAATCACCTTAATTAAAAGTGTCAGCCCAGCCCATGAATATTGTACTTAGGAA
Y
GCGTTTCCTGGGTCCCAGTTATAATTTAAAACCCATGGATCACTAGGCAGCGAGTGACTGAGCAAGGGAGGAAATCGTTGGGGGCGGGCTGTGGAAATAG
Celera SNP ID: hCV3210786
公開SNP ID: rs11582970
SNP染色体部位: 44857869
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 495
SNP部位ゲノム: 224322
SNP供給源: Celera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 93
遺伝子記号: C9orf103 - 414328
遺伝子名: 染色体 9 オープンリ−ディングフレーム103
染色体: 9
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 496):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1215):
TTTGAGACTCTGGAGCCCCCAGCAGCTCCAGAAAACTTTATCCAAATAAGTGTGGACAAAAATGTTTCAGAGATAATTGCTACAATTATGGAAACCCTAA
M
AATGAAATGACAATGATTTTGTATCAGTGGTCCAAACAGAACTAAGCATAAATCATTGTGCCATCCCAAACCTCGTTCCAGCCGCCTTGCCCATACTAGA
Celera SNP ID: hCV7422466
公開SNP ID: rs1052690
SNP染色体部位: 85448505
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 496
SNP部位ゲノム: 30719
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,32|C,6) アフリカ系アメリカ人 (A,37|C,1) 全体 (A,69|C,7)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,100|C,20)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3

遺伝子番号: 94
遺伝子記号: CCDC36 - 339834
遺伝子名: コイルドコイルドメイン含有36
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 497):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1216):
CATCTTGAGCCGCTTGGTCGACAGCCAGAGTGCCCCGGGGTCGGCAACAGCGTCTGGGTCAGGGCTGCGGCGCTTTCTTCCTGGCCCAGCTATCTTGGCA
R
CTCTTTGTGGCCAAATTCTCCAGCAAGGAACGGACAGCCTAATGGAAAGAAGCCAGTGATCACTGCCAAGACCCAACAACTTGCTCTTTAGCTACACCCA
Celera SNP ID: hCV25768636
公開SNP ID: rs4279134
SNP染色体部位: 49131680
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 497
SNP部位ゲノム: 69185
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,6|G,18) アフリカ系アメリカ人 (A,3|G,7) 全体 (A,9|G,25)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,50|G,70)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン

遺伝子番号: 95
遺伝子記号: CCDC41 - 51134
遺伝子名: コイルドコイルドメイン含有41
染色体: 12
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 498):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1217):
TCCATCAGCAACAGTAAAGGGCAGGAACATAGAGATTTCTTTTTCCAGGCCCAGGCCTGTGAAAAACGATGGCTAAGTGTTAGTCCTTAGCAGGGCCGAC
R
GATGGTCTCCATTCCTGGTTAACCCTCTGGAATTTGGGAGCATGAGTATCTCCAAGAATTCATTTCTACTCAGTAAAGATGGGGAGGGGAATCCCACTGT
Celera SNP ID: hCV25991132
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 93341551
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 498
SNP部位ゲノム: 125358
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,3|G,35) アフリカ系アメリカ人 (A,1|G,37) 全体 (A,4|G,72)
SNP型: ミスセンス変異;ESE SYNONYMOUS;イントロン;偽遺伝子

遺伝子番号: 96
遺伝子記号: CDK6 - 1021
遺伝子名: サイクリン依存性キナーゼ 6
染色体: 7
OMIM番号: 603368
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 499):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1218):
CCTCTCTGGCATGGGCCCCAGCATGAGACACATGGAGAAGACCTGTGCTTCACCCACGGGCAGAAGCAGATATCAAAGGCTGTTAATTCAGGAGGTAAAG
S
AGACACTCATTACTCACTGGGTTTCAGACATCAAGAACAGCCCAACAGGTACACTTTTCTACCTATTGTTCTGGCCTCCAAGTATAGGAAATTATGTATA
Celera SNP ID: hCV2605707
公開SNP ID: rs42041
SNP染色体部位: 92084680
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 499
SNP部位ゲノム: 22509
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,82|G,34)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 97
遺伝子記号: CHMP7 - 91782
遺伝子名: CHMPファミリー, メンバー7
染色体: 8
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 500):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1219):
AGCTCCTTTGCATCTCCTTTGGTCCACACCAGGAGACTCCCAGCAGATCCGTAGCCCTCGATCAGCCACATGGGGTTTACCACCCCTGCTGGAGAAAATC
R
CCTGTCATCAGACTGCGGTCCCCTTCATGGTCCCCAGCTGTGGGAGGCCCTCGGAGCCACACCACAGCCTTATTTTTCTTTCTCTCTGTCCCCTCACACG
Celera SNP ID: hCV31997958
公開SNP ID: rs12544038
SNP染色体部位: 23163523
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 500
SNP部位ゲノム: 16409
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|A,79)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 98
遺伝子記号: CMYA5 - 202333
遺伝子名: 心筋症関連 5
染色体: 5
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 501):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1220):
TTGCTCTTCATCATCAGGCACAGGTTTAATGAGGGTGTCCACCCTGCCTTTGCCCTGGAGAAACCTGGAAAATGTACTTTGCACCTGGGGATAGAGCCCC
Y
GGATTCTGTAAGGCACAAGTGATCCTTGGCTTTCAGAATTTGCAAGAACAGCGATTTGAATTTTGGGGGGGTCTGCTGTTCATTCCTTTAGGTGCTATAC
Celera SNP ID: hCV3164397
公開SNP ID: rs10043986
SNP染色体部位: 79131173
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 501
SNP部位ゲノム: 119758
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,109|T,11)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 99
遺伝子記号: DARS2 - 55157
遺伝子名: アスパルチル-tRNA シンテターゼ 2, ミトコンドリア
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 502):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1221):
TTTTAGTTTTGAAAGACCCAAGTGTCATTCTCAGTAGACATTTTGAAAGACCCAAATGTCATTCTCAGTAGGTACATCTCAGTAACATCTGTTGAAGGGT
R
TAACAACGAAGCTTGATCCACCAGTGGACTGAAATGATACTGGGCTTACTAAGACTGAAGAGTTCCTATAACCAGTAATTAAAAATGGGCCAGCCTCCTA
Celera SNP ID: hCV15864094
公開SNP ID: rs2068871
SNP染色体部位: 172062792
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 502
SNP部位ゲノム: 12211
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,110|G,10)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 100
遺伝子記号: DDT - 1652
遺伝子名: D-ドパクロム互変異性化酵素
染色体: 22
OMIM番号: 602750
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 503):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1222):
AGCATCCCTTGGGCATCCCGGGAGGTGTCCCTGCCCTCCATGGCTCACCGTCTGCCACATGGCCCAGCAGCAGCTACTCTGCAGGGCCATGTGCTGCCAT
S
ACAGGTACTGATCCCCATGGGCGCGGGCCTGCAGGTCCTGGAGGTACCAGTGGTCAGGTGCTTTGTACATGCAGCTCATATAGAGCAAGCTAGCCACACT
Celera SNP ID: hCV2211618
公開SNP ID: rs12483950
SNP染色体部位: 22626175
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 503
SNP部位ゲノム: 7384
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|G,-)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 101
遺伝子記号: DEC1 - 50514
遺伝子名: deleted in esophageal cancer 1
染色体: 9
OMIM番号: 604767
OMIM情報: 食道扁平上皮癌, 133239 (1)

ゲノム配列 (配列番号 504):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1223):
GTGAGGGAGGCTGTCTACTCCAGTGTTGGAGTCAGCTGGAGGTGCAGCAGCGCTTGAGCTATCCAAACTGCTAGGATGTTGTTAATAAAAGAACCTTCTC
R
TTCTCGAGTCAACATGGCTAAAACAGCCAGCCATGAGATGTATGGGAAAGAAGTGCAGAGCAAGTTGTTATTTATTGAATGTGTAGTTAGGAATTACTAT
Celera SNP ID: hCV2734332
公開SNP ID: rs10759757
SNP染色体部位: 116949164
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 504
SNP部位ゲノム: 15246
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,32|A,88)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 102
遺伝子記号: DKFZP564J102 - 25854
遺伝子名: DKFZP564J102 タンパク質
染色体: 4
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 505):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1224):
CCAGGCCATCTCACCGCTTCTGGGAAGAGAACCCAGGCAAGTGTGGAGAGGAGGAGAGGAGAGGTCCCAGGCAAGCAGGACAATGAGGAGCCATGATGCC
Y
GGCCTGTGCTTCTCCCAGTTCTCTCTCTGCCTTCCTCACCCTGGAGTTACCAGAGGCTGATACACGTTGACCACACCAGTGCTCCCTTGCCCTCCAACCT
Celera SNP ID: hCV2103346
公開SNP ID: rs11733307
SNP染色体部位: 187320510
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 505
SNP部位ゲノム: 27465
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,48|T,72)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1225):
TGTCTGTCACCTCAGTTTGTCGTTCTGTTAAACTGCAGTACTGAGATATTTGGGGCTGCTTTCCACGCTGCCCGCAGAGGGGTCCATGCAGGCTTTCCAT
R
GTAACTTAAAGGGAAACCTTCACAGTGTCACAATGCCTGGAGACCTGGACGTCCTGCCTATGAAGGACGAGGATGTGCTCAAGTTCCTTGCGGTAGGAGC
Celera SNP ID: hCV12086148
公開SNP ID: rs1877321
SNP染色体部位: 187316011
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 505
SNP部位ゲノム: 22966
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,86|A,34)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 103
遺伝子記号: EDEM2 - 55741
遺伝子名: ER 分解エンハンサー, マンノシダーゼ α様2
染色体: 20
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 506):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1226):
GAAGACTGGCATGGACACAGTCCCCTTGTACATCTGAACCCACAGGTACCAGTCATCGAAGCGGGTGTAGTTCCGGATGGCTTTGTTATACTCTGCAGTG
R
GGGAGATGGGATAATGGACATATGAGTGATTAGGGAGAAAAAAGGCAGGCCTGGACAGCGGAAGCGAGAACTTACACTTTGGAAAGAGCACCAGGATGCA
Celera SNP ID: hCV16191203
公開SNP ID: rs2295887
SNP染色体部位: 33177848
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 21017
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,19|G,5) アフリカ系アメリカ人 (A,6|G,16) 全体 (A,25|G,21)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,47|A,73)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1227):
ACAGGGCGGAAAGTGGGAATCACTAGCTGATTTCTCCCTGGGACCTAGCGGCTGTGTCGGAGCAAGTCGGGGTCTGGGATGGACGGAAAGGGAAAGGACC
S
GGTTCACGCTTCCCATTCCCCAACTGCGAAAGGGCGGGTCACAGTTCACCTGTAGTGGGCGGGATCTGGCGCGGAGCCGTCGGGACCTGGCGCACCATGG
Celera SNP ID: hCV1825005
公開SNP ID: rs945959
SNP染色体部位: 33198566
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 41735
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|C,56)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1228):
CATGGGGATAATTAACTCCTAGTAAGAAAACCACCCAGAGCCACTGAAAGGAACAGATGGAAAGAAATGAACTTGTGGGCAGTTGTGGAGGATGGAGCCT
W
GTAGAGGGGATTTGGGGTTTCAGCAACCAGAGCCTGTGGGCAGATGACAAGCCAGAAATGCTGCTCACCTGGCCGAAGTGGGTAGCCCTCTCGCTTCTCC
Celera SNP ID: hCV25619982
公開SNP ID: rs6120838
SNP染色体部位: 33175285
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 18454
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,12|T,12) アフリカ系アメリカ人 (A,10|T,10) 全体 (A,22|T,22)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,40|A,64)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1229):
AACTCCATCTCAAAAAGAAAAAAGCAGAAAATAATTGATGTGGTTTGGCTGTGTCCCCACCTAAATCTCACCTTGAATTGTAGCTCCCATATTTCTCACG
Y
GTTGTGGAAGGGACCTGGTGGGAGATAATTGAATCATGGGGGCCGTTTCCCCCATACTGTTCTCATGGTAGTGAATAAGTCTCACAAGATCTGATGGTTT
Celera SNP ID: hCV1348023
公開SNP ID: rs6087677
SNP染色体部位: 33178466
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 21635
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,47|C,71)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1230):
GGGCTGAGCTCAGCGATCCAGCCCACCCGGCTAATCCAGGACTTTTTTTTTCACTGCGAGAGGCTAAGTGGATCCTGGAGGTGATAGTAAGAATTGCGGG
R
AGCGCGGCTCTAGCTCAGCTGGGAGCTTTCTGGTGCCGGTGAGGAGACCATGAAGCCACCAGCCCCAGCTGACCCGCCCGCCGAGGCCCAGAGAGTCAGA
Celera SNP ID: hCV1825004
公開SNP ID: rs1415771
SNP染色体部位: 33198154
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 41323
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|A,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1231):
TCTCCATTCCCCTTATTCCCAAGTTTCTAAAATTTGGTCAGCACCTTAGACCACAGCAACACCCATGACTTTGGTCAGTGTGACATGCGGTAGAACCAAC
M
CTGGATTTGAAGTCAGATCTAGGATCCAGTTAATTACAACTCTGTCACTCATCTATAACCTGTGTATGTGACCCTCTCCTTCTCTGGGGCTAGCATCCTT
Celera SNP ID: hCV1825006
公開SNP ID: rs1124511
SNP染色体部位: 33200358
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 43527
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1232):
GCCCTCACTAATTCCACTTAAGACCTCCAGTTTCTGTCCTAGGATTGGTGACAGCAGAAGAAAACACTGAGAGCTAGAAATCATCTAGAGACTTCATACC
R
AGAGACTGGTTAAGTAAATTCCTAGGTCCCAATTAAGAGTCACGATGTTGTCATTTAAATGGACACAATATAAAGAACGCAAACTACGCATAGAAGTCTT
Celera SNP ID: hCV11189164
公開SNP ID: rs3746427
SNP染色体部位: 33194125
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 37294
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1233):
GGCTGACCAGTGACTTCCACCACAAGGGAGAGAAAGGTGGCCAGGTTCTGGCATAGAGAAGGTGGCGGAGGTTGTTGCCTAATTCCCAATATCTGTTCCC
Y
GCTTCCTCCTTAGTAGCAGGATTCCTAACTTTAGCTAAGCACAGGCTGCCTGGCTGCCAACACTAACTATTCTAACAGCTAGGTGGGATTAAGGACACCA
Celera SNP ID: hCV11656979
公開SNP ID: rs2065108
SNP染色体部位: 33170483
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 13652
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,47|T,73)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1234):
TGGGATCCCCCGTGGCACGGTAGAGGTACATTGCGCTTTCAATAAGTTCTGCAAAGTCCAAAGCAGACCCTCCTCACTCAGTGGCTGCACAGAGATGGCC
W
GGGGCCTCTTAGGGCCGTGAGGGACTACTCCCCTCCATATCTTGTCCATAAGGCCCCAACTAGCAGGAACACAGGATACCTCACCCAGTGCTGAGTTTCA
Celera SNP ID: hCV16179908
公開SNP ID: rs2273805
SNP染色体部位: 33170236
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 13405
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,47|A,73)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1235):
TTATTGCTTTACTTTCCTGTGCATCTGACCAACTCTGTCGAGCAGTGGTCCCCAACCGTTTTGGCACCAGGGACCAGTTTCATGGAAGACAATTTTTCCA
K
GAACTGGGCTTGTAGGAGATGGTTTTGGGATAATTCATGTGCATTACATTTATTGTGCACTTTATTTATATTATTATTACATTGTAATATATAATGAAAT
Celera SNP ID: hCV27167691
公開SNP ID: rs2378333
SNP染色体部位: 33172551
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 15720
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,47|G,73)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1236):
ACCCCATCTAAACAAAAAATTTAAAAATTAGCCAGGTGTGGTGGTGTGGGCCTGTAGTCCCAGCTATTCGGGAGGCTGAGGCGGGAGAATCACTTGTGCC
Y
GTGAGGCTGCAGTGAACTGTGATCACCCCACTGGGTGACAGGGTGAGACGCTGTCTCAAAATACATAAATACACAAATAAAAATAAAAACAAAAGTAAAA
Celera SNP ID: hCV27167696
公開SNP ID: rs6088716
SNP染色体部位: 33164160
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 7329
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,43|T,69)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1237):
GCAAGGCCACTGCTGTAACCCTTGGGCCTAGCAGAGTGCCTGGCATGTGAAAGACATTCAAGAAATATCTGTGAGACTAAGCAGGACTGCTTTGTTAAGG
M
GTCCCAGGTTTGAATATAGGGCTATGGGACTCTGGATTCCCCTTAAAATCTATTTTAGTGTCTCACAAAACTTTTCGCTAAACTCACCTTTTCAAAGTCA
Celera SNP ID: hCV29837748
公開SNP ID: rs6088721
SNP染色体部位: 33169672
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 12841
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,47|C,73)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1238):
CACAGGGAAGCAGCTGACCCTGACATCTTCATTGGATGTCTCATGGACAGAACAAACTTGGCACTTCCTAAACAAAATTCTTGGTTCCCTTACTTTCCCA
Y
GAAATTGCCTCCCTACTTTGGCCTTTTTCCCTTCTTGGTAAATGACACAATGTCTACCTGGTTATTCTGGATAGAAACCCGGTGGCCACTTTTTTTTTTT
Celera SNP ID: hCV29620866
公開SNP ID: rs6088724
SNP染色体部位: 33176576
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 19745
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,47|T,73)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1239):
CTACTTTTTCTTAAAACTTTTAAAAACGTAGATTATAAAAACATTTTGGTACATGCACTATTTTGGAACACCAAAGTGGGGTAGATTAGATAAGCTCTAA
R
ATCCTTCCAGCTGCAACTCTACCAGACCATGTAATGGAAAAACAACGAGATGGCACAGCGGCACAAGCTGCTTCCTGCCCTTCCTGAGGCCCACTGTCAA
Celera SNP ID: hCV30342055
公開SNP ID: rs6088727
SNP染色体部位: 33177300
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 20469
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,47|A,73)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1240):
TAAAAACATTTTGGTACATGCACTATTTTGGAACACCAAAGTGGGGTAGATTAGATAAGCTCTAAGATCCTTCCAGCTGCAACTCTACCAGACCATGTAA
Y
GGAAAAACAACGAGATGGCACAGCGGCACAAGCTGCTTCCTGCCCTTCCTGAGGCCCACTGTCAAGAATGAGATTGGACAGAAACGCCCAGTGGAGAAAC
Celera SNP ID: hCV29837747
公開SNP ID: rs6088728
SNP染色体部位: 33177335
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 506
SNP部位ゲノム: 20504
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,47|C,73)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 104
遺伝子記号: EPS8L2 - 64787
遺伝子名: EPS8様2
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 507):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1241):
CATCACGTCTGTGGACGACGCCATCCGGAAGCTGGTGCAGCTGAGCTCCAAGGAGAAGATCTGGACCCAGGAGATGCTGCTGCAGGTGAACGACCAGTCG
Y
TGCGGCTGCTGGACATCGAGTCACAGGTGGGGCCCAGCGCCACGGGGGACAGGGAGCACAGTGGGTAGAGGCGGTGGCAGCCACCGGCTGCAGCCCGGAT
Celera SNP ID: hCV491830
公開SNP ID: rs3087546
SNP染色体部位: 710197
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 507
SNP部位ゲノム: 24077
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,11|T,23) アフリカ系アメリカ人 (C,13|T,19) 全体 (C,24|T,42)
SNP型: UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;コード領域
SNP供給源: dbSNP; Celera; Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,74)
SNP型: UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;コード領域

コンテクスト (配列番号 1242):
TCAGAATGCTTTCTAGTTTTCTTGTGACTTCATCTTTGATGCATGGGTTATTTAGAAATATGTTGCTTTGTTTCTAAACATTTGGGGATTTTCTGGTTTT
M
TTTTTATTATGGGTTTCTACCTTAATTCTGTTATGATCAAAAAACATATTCTGTACTGTTGCAGTCACTTGAGATTTACTGAGACTTGTTCTGTGGCCCA
Celera SNP ID: hCV11280343
公開SNP ID: rs12222447
SNP染色体部位: 706765
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 507
SNP部位ゲノム: 20645
関連した照会SNP: hCV491830 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,41|C,79)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 105
遺伝子記号: FTO - 79068
遺伝子名: fat mass and obesity associated
染色体: 16
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 508):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1243):
ACACTGAAGGTTGGTTTATGAGCAGCAGGCATACAAAGGAGGAAGCTGGAGTGGAAGGAGCCGTAAAATTGACAAAGTGGTCTCTAATATAACCCTCCCC
M
GACACACATACAAATACAACACTTTCTTCCTAACTTTCACTTAGCTTAGCTGTAGACAGTTCCAGCAAACCTTGTTTAGCACTGCTCCGTGCTACATTGA
Celera SNP ID: hCV2811695
公開SNP ID: rs940214
SNP染色体部位: 52648579
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 508
SNP部位ゲノム: 363203
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,104|C,16)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 106
遺伝子記号: GGTL3 - 2686
遺伝子名: γ-グルタミルトランスフェラーゼ様3
染色体: 20
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 509):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1244):
AAAACATGTCAGGCAGTTCCAATCTCTAGGTCAAGAGAGACAGGCATTCTCTGTTGAGCTGGAAGAGGAAACTAAGGCCCAGGACAGGGTAGGTGTGCCT
R
TTGTCGCTTGGTGAGTCAGGGCTGTATTAGGACCAGAAGTCTCACTCCTGACTACTGAATAAAAGGCCTAGCTTCAGGCTGATATCCATCATGACACATC
Celera SNP ID: hCV3249260
公開SNP ID: rs7263157
SNP染色体部位: 32922788
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 509
SNP部位ゲノム: 36604
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|A,75)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1245):
GTTGGGATTTGAACCAAGACAGTTTGACTGCAGAATCCATATCCTAATAGCAATGCTATTCCTCTTCCATGACCCCACAGAATGCATTTCACCAAATTCC
R
TCAAATACAGAATTTCTACCAGGGAAGCAGCCTCCTAATTTGTCCTCTCTTGCCTAGTTTCGCCAACTTGAGTCTTTCCAGTAGATTTATCAAGACACCA
Celera SNP ID: hCV3249263
公開SNP ID: rs6088635
SNP染色体部位: 32930162
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 509
SNP部位ゲノム: 43978
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|G,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1246):
AATTGTGTAACCTGAAACAAATGACTTAGCTTCTATGAATTTTATTTCTTATGAAATGAAATGAGGGGGTGATAATCTGTAAGGTTACTTCCATTGTTAC
R
GTTCTAATTGCTTCTCTTTCCTCCAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGATAGAGTCTTGTTCTGTTGCCTAGGCTGGAGTACAGTGGTGCA
Celera SNP ID: hCV7593321
公開SNP ID: rs1013677
SNP染色体部位: 32932454
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 509
SNP部位ゲノム: 46270
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|A,78)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1247):
GAAGAGGAAGTGGTAGAAACTACGGCAAACTGGACAGTGCATGCCCATCATGGGAAGCAGCTTCTATTCCACGCCAGGTAACTTCAGCCATGTGAGAATG
Y
GGGCCCAAGTTGTTATCGGATTTCCCGATTGTTCAAGAGATGTTGGAAATCTGGATTTTTATGAAAATTCTCAACTTTTTAACAAAAGCAAACAAAATTT
Celera SNP ID: hCV29711231
公開SNP ID: rs6119536
SNP染色体部位: 32913702
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 509
SNP部位ゲノム: 27518
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 107
遺伝子記号: GLOD4 - 51031
遺伝子名: グリオキサラーゼドメイン含有4
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 510):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1248):
CTCCTCGAGCGGTTGTTTCTCTCGTTGCTCCTGGGCACTGGCCTCAGATGGTGCCTTGCGGGGCTGCTTCCCAGGAGCGCGCTTCTGTTCCACCACCTCT
Y
CGGAAGGAAACACCACTTTCACTGGGCTCCGCCGCAGCGCCCGGACCCAGCGCCTCGCGTCAAGGTCCCAAGCCTGGACCACCTGCAGCAACGGTCGCAC
Celera SNP ID: hCV22272816
公開SNP ID: rs2249542
SNP染色体部位: 632502
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 510
SNP部位ゲノム: 33182
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,83|T,37)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;サイレント変異

遺伝子番号: 108
遺伝子記号: GNG12 - 55970
遺伝子名: グアニンヌクレオチド結合タンパク質（Ｇタンパク質）, γ12
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 511):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1249):
TTGTTTATAAAGGGAACACATTAGAAGCTAAGTAATTGGGTCAGATTTGGTAATTAAAAGCAGCTGAATAATCAACAAACGCTTAACAAAGGTGTTAGAA
Y
AAGATCATATTTTAACAGAAGATGAAATACATAGAAAGGTTTGTATATTTCAACCCTTATTCTTCTGCCTGTTTTGCATTTTTCTTTTAAAAATACACAA
Celera SNP ID: hCV30505633
公開SNP ID: rs7530537
SNP染色体部位: 68003825
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 511
SNP部位ゲノム: 74015
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,112|T,8)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 109
遺伝子記号: GRB10 - 2887
遺伝子名: 成長因子レセプター結合タンパク質10
染色体: 7
OMIM番号: 601523
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 512):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1250):
CTGATGTTGGCTCTGGAGAATGAGACAGAAGGGGAAGTAGGCACCATGGGGAGAAGACAGGTGCCCCTCCAGAGGCAGGGCCCTTTGGTGAGGGAGGAGA
R
TTGTTGCAGGCATAAACTGACCTGCATCTCCAGAAGAACCCCCGACCTCAGACTCAAGAAACAATGCTGGACACACCCCAGCTCTCCCTCCCAAGAATCT
Celera SNP ID: hCV2575036
公開SNP ID: rs34432772
SNP染色体部位: 50648675
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 512
SNP部位ゲノム: 33416
SNP供給源: Celera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 110
遺伝子記号: GSS - 2937
遺伝子名: グルタチオン シンテターゼ
染色体: 20
OMIM番号: 601002
OMIM情報: グルタチオン シンテターゼ 欠損に起因する溶血性貧血, 231900/(3);
5-オキソプロリン尿症, 266130 (3)

ゲノム配列 (配列番号 513):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1251):
AGGATTGCAGGAGCTACACCAAAGAATGGGAAAGTCTAGAAGCAAACGGGAGACAGAACCCAAGAAGAGGAATGAGGCAACTCTGACTCAACTCCCAAGG
R
GCCCCAGAACCCCAAATTCTTCACACATGTCAGTCCAGTTCTCCACTATCTAACTAGGCCAAGTGCCCCAAGACACCATCCCTGCCTAGCCCAAGACCAG
Celera SNP ID: hCV11189332
公開SNP ID: rs2273683
SNP染色体部位: 32973184
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 3287
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|A,75)
SNP型: UTR3;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1252):
GGCCAATGGTGCCACCAGTGTTTTGGTGAGAAGGGAGCCACCTGGCCTAGCTGGGGGATGGACAAGATTATCCTGGGTGACTACCTCCCAAGGCTGCTTG
K
TCTAGAGGGAGGGGGACTTATACAATCATCTGTTTTCTGGAGAAAGAGAAGTCCTGAGGGGGTTGCGTATCCTGACTAGGATGGTATCTTGGCTTGTCTG
Celera SNP ID: hCV1361223
公開SNP ID: rs3746450
SNP染色体部位: 32972249
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 2352
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|T,78)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1253):
GATAGAGATAAATGCTGTTAAGAAAAATAAACAGGGTAGCATGATAGTGTGTGCAGGGATGGCTACTGTACACAGGATCGTCGGAGAAGACTTCTCTGAA
K
TGACATTTGAGCAGAGGCCTGAAGGGTGAGAAGGAAACAGGCATGGGAAAATCTAGAGTAAGAGTGTTTTGTGCAGAGGGACACAGCTTGAGATGTCTGA
Celera SNP ID: hCV2142560
公開SNP ID: rs4911449
SNP染色体部位: 32975897
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 6000
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|G,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1254):
TGTGCAGAGGGACACAGCTTGAGATGTCTGAAGAATGGACTGAAGCCTGTGTGGCTGGAGCGTAGCAAGCAAAGGGAAGAATATTACATGACGTTGGAGA
Y
GTACATAATACAGGGAGGGTCTTGTGGGCCATGGTGAGGAGTTTGAATTTTATTCAAAGTACAGTGGGAAACCTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTG
Celera SNP ID: hCV2142561
公開SNP ID: rs4911450
SNP染色体部位: 32976067
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 6170
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1255):
CGTAGCAAGCAAAGGGAAGAATATTACATGACGTTGGAGACGTACATAATACAGGGAGGGTCTTGTGGGCCATGGTGAGGAGTTTGAATTTTATTCAAAG
K
ACAGTGGGAAACCTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTGTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCGGTGGCACG
Celera SNP ID: hCV2142562
公開SNP ID: rs4911451
SNP染色体部位: 32976127
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 6230
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,41|G,77)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1256):
TCTTATTGTTACCTTCATGCTAAAGATGATGAAACTGAGACTCATGGAAGTTAAATCACTTGCCCAAGGCCACACTGCTAGAAAGGTGGCATTTAAACTC
Y
AGCAGGCTCATTCTACAGCCTGAGTTCCATAAGATAAAATGAGAGAGTAAAGAGACAAGTGTGTTGAGAGCAAGAGAAGCAGTGAACCTGAGGCTGTCTC
Celera SNP ID: hCV2142566
公開SNP ID: rs6088650
SNP染色体部位: 32978126
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 8229
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|C,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1257):
AAGCCAGTTCACAACTGTTATGTATGTCCCATCTTGGTTGCCTTCCCTCCTGGGCTCCTGCCAGGGACTCTCATTCCTCCCTGTGATCCAGTAAGAGCAT
Y
AGTGGGTGGCTAAGGATTGAAACTTCAGGGTTCCACCTGTAGAGACTGGTCTAGGGGGACCCTGATTACAGACCAGTCACTTCCCTGCTCTAATACATCT
Celera SNP ID: hCV2142567
公開SNP ID: rs725521
SNP染色体部位: 32979732
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 9835
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,41|C,75)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1258):
ATACAAATGTTGGCTCGAAATTACCGAGCAGCAGAATCATACTGCCATGTGTAGTAAAACACACTTTATATTTCCACTGCTTAAAGCAGCTGAAACCAGA
M
TGAAAAAATTTTTAATGGCAGGGGTGAAGGTGAAAACGCAAACATGTAAAATGATGAGTCTGATTAAGACACAGGCTTTTTAAATGTCTTTTCCTTTTCT
Celera SNP ID: hCV2142576
公開SNP ID: rs2236271
SNP染色体部位: 32987501
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 17604
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|C,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1259):
GCTGGGATTAGAGGTGTGAGCCACTGCACCCGGCCTATTATTATTATTGAAAGTACCACATAATGATCCACACAGATTTTTAAAAACATTTTTCAGATCC
R
TGATCTCATTTAATTCTCACTAACACCCCTTTAGGTATTATTATTACTCCTATTTTACAAATGAGGAAACTGAAGCTCAGAGAAGAACTAACTTGCCAAG
Celera SNP ID: hCV2142578
公開SNP ID: rs6088655
SNP染色体部位: 32991499
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 21602
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|G,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1260):
CAGGGGCTGAGCCTGTATTAGAACCCAGGCTTGTTTCCCAGCCCAGCCAAGTCCCAGAAAAATCCCCCTGATTTTATCTATTTTTTTTTAACCTGGGATA
S
CAGCAGGGAAAGCATTAGAGGCAAAAGGAAAGGATTTTCATTTTTCCAGGAATGCTGAAGTCAGGACTGTTTGAGGGGAGCCCTGTGTTTCTCAGACTCT
Celera SNP ID: hCV2142584
公開SNP ID: rs3761144
SNP染色体部位: 33007736
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 37839
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,45|C,71)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1261):
CCATGACTGACCCCCCAACCCAAGAAGTAAAGACTCTCCTGATTTGGTGTTTATTATTCCTATGCAATGTTTATTGAGATATAATTCATGCACCATAAAA
Y
TCCCCCTTTAAAGTGTGCAATTCAGTGGTTCTTGGTATATTTACAAGATTGTACAACCATTACCACTGTCTCATTCCAGAATATTTTCATCACCACAGAA
Celera SNP ID: hCV2142586
公開SNP ID: rs6060130
SNP染色体部位: 33012980
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 43083
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,46|T,74)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1262):
ATTGTTTTCAAATATTTTCAAGCTGCAGTTGGTTGAATACACAGATGTGGAACCCATGGATATGGAGGTCCCACTGTACTTGTCTGATTGTGGCCATCCT
R
GTTGGTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTTCCTAATGACAAATAATGCGCATATCTTTTCATGTGCTTATTGGTAGTTTGTATATCTTCTTTGGAGAAGG
Celera SNP ID: hCV2142587
公開SNP ID: rs6088664
SNP染色体部位: 33014761
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 44864
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,46|A,72)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1263):
TTCCTGCTGAATGGAACCTGTCCCCTCAAGCAAAAGTCTCTATGGGAAACCCTATTGGTACCAGTGGTGTAAAGGCAGGAGCAGAGCTAGGGTAGGAAAC
M
CGCAGATGTGGATTGGGTCTGGACATGTAGGCAAAAGTGCTTGGACCAAGATCTGTTGACTTATTTTACTACTAACAGGGTCAGGTGCCCACCTCACCTG
Celera SNP ID: hCV3249289
公開SNP ID: rs2223881
SNP染色体部位: 32970124
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 227
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|C,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1264):
TGATCAATAATAATAGCAGGGTTGGGGGTAGCAATCTATCAGATACTGTTCAGGTAAAGGCTTTCCAAGAAGGTGACATTTCAGCTCAGAATTGAAGGAT
R
GGAAGGGACCAGCCAAGGGTTCCTCCTCAGCCTGAGGCCAGGTGAGAGGAGTTCTGGGGTAGAGATGGGGGTAGGATGGCAGGGTGGTTGGAGTACTCAG
Celera SNP ID: hCV3249290
公開SNP ID: rs2076667
SNP染色体部位: 32970625
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 728
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|A,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1265):
ATGGACCTGGAAGACCCCTCTGCCCATGACCTCATATATACAGCAACATGACTCTGAGAATCAGCTGAGCACTAAAAAGCATCCTCCCATCACATTCCTG
K
AAGATCCACTTCAGGTTGGAATATGCTGGGCTGCCCTAACCTTGGCCCCTGGTGTATATGCCTGGAGGAGACCTGAGAGCCTCTGTCCCCACCCCAACCT
Celera SNP ID: hCV16179579
公開SNP ID: rs2273684
SNP染色体部位: 32993427
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 23530
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,61|G,59)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1266):
TGGTCAACAAGAGCAAAACTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTCTACCTCTTTAAACACTACTTTCCTTCCTTGTTATCTCAAACTCTTCTAAGTTTTCT
Y
TGTCGTGTTTTGAAATCTAGACCCATTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTCAGCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCAACTTA
Celera SNP ID: hCV30485907
公開SNP ID: rs6087653
SNP染色体部位: 32985715
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 513
SNP部位ゲノム: 15818
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,42|C,78)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 111
遺伝子記号: GUCY1B2 - 2974
遺伝子名: グアニル酸シクラーゼ1, 可溶性，β２
染色体: 13
OMIM番号: 603695
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 514):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1267):
TTCTGTTGTTTGCATAGATTTTTCCAAGACTCGTAGCTCTACTTAAGTGCAACTGTTCTTTCTAAAGGCACAGCAAACCCAGTACCTCTTGGTCTCTCTC
S
ATGCCCTGACTGTCTTGTAACCTTTTTGGCTTTGTCTTTCTCATCTTCCTGTGAGCCTTCTGTACAATCAGAAACACAACATGCTCCTTCTTCCCTGTCC
Celera SNP ID: hCV2699725
公開SNP ID: rs11841997
SNP染色体部位: 50500360
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 514
SNP部位ゲノム: 43712
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,39|G,1) アフリカ系アメリカ人 (C,23|G,11) 全体 (C,62|G,12)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,116|G,4)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 112
遺伝子記号: KCTD10 - 83892
遺伝子名: potassium channel tetramerisation domain containing 10
染色体: 12
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 515):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1268):
AACGCCAAACGCTCCGCCCCAAGGAATCCTACCTCACCTTCTCATAACCTGCCCATTCATTCTCCTTCATAATCCTCCAAATCCTCATTTTCCACCCCCA
M
ATGTCCGTTTTCAATTGATATCTCTTTGTTCTCCTCGCAATCACCAACTCCCATCTCCAACCAGCACTCAGGACTCACTTGGAGACACCCCTTCCTCACG
Celera SNP ID: hCV31199195
公開SNP ID: rs10850234
SNP染色体部位: 108399078
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 515
SNP部位ゲノム: 38235
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,100|C,20)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 113
遺伝子記号: KLF3 - 51274
遺伝子名: Kruppel様因子3 (塩基性)
染色体: 4
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 516):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1269):
CTTACCTCAAAAAAAACCTTCCCAGGTGTTTTCAAAGGAATTATTTTATTCCTCCACAACAAGCCTGTGGGAGTCGGAGCAAAAGGCAAAGTGATTACCT
R
AGACATTAGATAACTCGCCAATATTCACCCTGCTAACAACTGAGGGGCCTTGGGCTTGATCTCCTGCTTCCGAATCAGGGCTTTTCCTGCCATCTTGTCA
Celera SNP ID: hCV27502514
公開SNP ID: rs3796533
SNP染色体部位: 38369201
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 516
SNP部位ゲノム: 36989
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,106|A,14)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 114
遺伝子記号: KRT8 - 3856
遺伝子名: keratin 8
染色体: 12
OMIM番号: 148060
OMIM情報: 特発性肝硬変 (3); {非特発性肝硬変,/罹患しやすい}, 215600 (3)

ゲノム配列 (配列番号 517):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1270):
CACTTGCATGCCCTAGCACAGATGCCCACCCTAGGCCTGGCCCCTTTCTTGCTTTCCCAATCCACGGGACCAGTGACACTTCCATGCCTGATACAGAAGA
S
AAAGTTGCATAGGACTGGTGAAAAGACGTGGGCAGGGGATGGTCCTCTGCAGTCGCCTGGCCTCCATGTCTCATCCCACCTGACACAGAGAGGCAGCCAC
Celera SNP ID: hCV1198623
公開SNP ID: rs2638504
SNP染色体部位: 51592662
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 517
SNP部位ゲノム: 25424
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,38|C,80)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1271):
AGGAATTGAACCCAAGTCTGGAGTAATTTTAGAGCTTGAACATTCTCTTTTCAATTATGCTGTTTTATAGTCAGGATCCAATTATGTCCATTAAGAGATG
Y
AATAATGTCAATAACTCAAAAGGGAGGATTCAAAACATGTTTATTATTTTATTTAGCAATCCAAAAGAGCTATATTACATTTATTTATTGAGCATCTGTA
Celera SNP ID: hCV444705
公開SNP ID: rs6580917
SNP染色体部位: 51600198
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 517
SNP部位ゲノム: 32960
関連した照会SNP: hCV1198623 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,38|C,80)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1272):
GACAACCAGCGACATAGCAAGACCCTGCATGTGTGCATATATGTCTGTAAGACAGAAAATGAGACAGAGAGACTCTAGAGAGCACGCAGCTCAGCTAAAG
R
AAAGACCTGCTACCCACCACTCTGTAACCAACCTGCCCCCACCCCATTCCCTGGTCTCTAAGGACTAAGATAACCCCAACTCAGATACAATGACCCATTC
Celera SNP ID: hCV16269565
公開SNP ID: rs2682338
SNP染色体部位: 51601000
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 517
SNP部位ゲノム: 33762
関連した照会SNP: hCV1198623 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,39|G,81)
SNP型: UTR5;イントロン

遺伝子番号: 115
遺伝子記号: LIMD1 - 8994
遺伝子名: LIMドメイン含有1
染色体: 3
OMIM番号: 604543
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 518):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1273):
TTATTTATATTTTTTATATATATATAGCATATGGCATATGGAGGTATCTGTTGGTATATACACATACTTCCTGAGGTCCATTGATACTGCATTAAACCAT
R
GTATTTGGATACTGTTAAGCTCACACACATTTACAGGGCAAGTCCAGGGCCTGACTAGTTTGGTAAAGATACAACAAGCCACTGTTACTTTAGGCAGTTT
Celera SNP ID: hCV29521317
公開SNP ID: rs7648441
SNP染色体部位: 45658111
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 518
SNP部位ゲノム: 56756
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,6|A,114)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 116
遺伝子記号: LOC390988 - 390988
遺伝子名: 仮想 LOC390988
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 519):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1274):
CAGCCATGTCCACTCCTGGCACACTTGGCTCTCCTCCCAAACCTACTGCCACCTTGACCGCCAGGGCCATAGCTTGGTTTTGCCCCTCTCTGAATTTTAC
R
TAAATAGAATCATGCCATGTGCCCTCCTGTGTGTCTGGCTTCTTTCCCTCAACATTACGTTGCTGCAATGACTCCGTGACAGGCAGAGCTGTGACTTGTC
Celera SNP ID: hCV788647
公開SNP ID: rs729045
SNP染色体部位: 2744266
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 64270
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1275):
CCCTCCCTCCTGGAGCCCCCTTGCTGTGGGCATGGTCCTCACCAGCCCCTGAGTGCCTGTGCTCTGGGCACCCGGGGTCCCCTCCTTCCTCAGAAGCTCA
Y
GATTCGGTGTGACTTTGTTGATCATTTTCTGGTAATGCTCAACATATTTGAGCATATTTCCAGAAACAAATTTTCCTGCTCACTTTGCAGCTCTCTCTAA
Celera SNP ID: hCV16000557
公開SNP ID: rs2377041
SNP染色体部位: 2703187
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 23191
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,62|T,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1276):
TGAACTAACGAAGTTTATTAACCAGGCAACCCAGAATCATTAATCACGCAGAAAAATAACACAGCGAAATGACTTTTCAAAATGCCATTGGTATAATTAT
Y
GTCTTGCCCATTACACTAAATGCCGCCATTTATATCTGTGATACTTAAGTATGCAAACAGTAATTAACGTGGTAATGAACCGGGGGCCCCAGAGCCTCCC
Celera SNP ID: hCV27102953
公開SNP ID: rs4648360
SNP染色体部位: 2713205
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 33209
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,65|T,55)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1277):
TCACTCACTGGCCTGAGGGCCACAGGGCCCTGGTGCTGGTGGGAAGGGGGGCGGTGAGGACCCTGCCAGGCAGCCTCATGGTGCCCTGGCCTCACTGGGC
M
ACGGAGACAGGAGGAGCTCGGTGGGGACGCACGGTGGAAGGTCTGGGGCTGTGGAGGAGCTGGGGCTGCCGGCCTCGCAGGTGTGGTTGGGGTGGGTGGG
Celera SNP ID: hCV27102978
公開SNP ID: rs7537581
SNP染色体部位: 2715335
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 35339
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,56|A,60)
SNP型: ミスセンス変異;ESE

コンテクスト (配列番号 1278):
CTTATATGTGAATTTTTTTCAATAAATACAGCCAGCCTTTCATATTGGTGGGTTCCGAATCCACAGCCAAATGCAGATCAGTTCTTGGGATGTGCAACCC
K
CGTACACAGAGGGCCAACTTTTCATATCTAGGGGTTGGGGGTTCCACAGGGCTGACTGTAGGACTTCAGTATGTGGGGATTTCAGTATCTGAGGGTTGTC
Celera SNP ID: hCV27103080
公開SNP ID: rs4648459
SNP染色体部位: 2687573
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 7577
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|T,55)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1279):
CTTGGCATCTGAGTTTGCCTGACACAGCCAGGGAGGTGAGGTGGTGGCCCGTTGGTGGTGTGCGATTGAGTTTGGGTCGAAATCCAAGGGTGGGAAGGAC
Y
GTAGGGATTGAGAGATGCCTGAGTGTAGAAACCATTGACTACCAGGTAACAGATTTGATTAATTTTGTGCCTGGAGGTTTTTTTTTTCCCCCTTCCCTTT
Celera SNP ID: hCV27103182
公開SNP ID: rs4609377
SNP染色体部位: 2735743
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 55747
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,59|T,61)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1280):
GTCATCTGGAAAAACATCAAGTGGCCCCCACTGAGAATGGTCTCAATGCCCCCAGTCCCTTTAAATCTCACCTTAAGGTTTCAAGCGTCGAGCAGGGGTA
R
TTTCCAAGTCATTGTCCAAACAAGAGTGGCTCAGTGGTGGTCCCACACCTGGCTGGGCAGCTCCCCCTCCCACACAGCGGCCACTCGGCCCCCCAGTTCT
Celera SNP ID: hCV27103188
公開SNP ID: rs7511879
SNP染色体部位: 2742125
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 62129
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,63|G,57)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1281):
ACGGGGCAGATGTGAATTAGTGTCTGGCCCTGGGTGACTTGGGAGTGCTTCAAAACCATTTGTCCCATTGTCTCCCGAAACTGGTGATAGAAGCAAGGAC
R
TTTCATTGGCTTGACCTCTTTTGGGGAGGACCACTGTGCCGCCAGGAGGGCCCAGAGCAGGAGGGCCCGGAATGCAGCGAACACAGGGATTGATTCACAG
Celera SNP ID: hCV27103189
公開SNP ID: rs12031493
SNP染色体部位: 2743097
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 63101
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,61|G,57)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1282):
AGGAGGGGACAGGATCCTGTGGTACCCCTTGGAGGAGGTTCCGGCACCTGTAGGCAGTTTCCAAGGATCCCTTGTGGCCACATCCAGCTGTTAAATGGGC
R
TGTCCCTGGCAGCCACAGATGTCTGTCCAGTGCAGGAAAGTCTGTCCAGTGCAGGAAAGGGCAGGCAGAGAGCTGGCTCCCAGCCCCAAATGCATGTCTC
Celera SNP ID: hCV27103207
公開SNP ID: rs6424062
SNP染色体部位: 2684356
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 4360
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|A,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1283):
GAAGAAAAAGTGCTGGAGCAATTTGGTTCAGATATATTCACTAATGTGAAATTTAAGATTAATTATGATTTCTGCAGAAATCCCATTATGCAAATAATAA
Y
TGTTTTCTTCTGAAGGGCTGCACAGCGGCTGTGAGGCCTGCGGGGGCCGAGATCCATCTCCCTGACCCCCGGGGCATTATCTGCTAGGAAACTTTGTCAA
Celera SNP ID: hCV31965333
公開SNP ID: rs10797390
SNP染色体部位: 2742553
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 62557
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,52|T,50)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1284):
ATCATGGCAGGACATAACCATGTGGGGAGGGAGTGGCGGGGGCAGCTTTCACCCTGGCTCTGCAGGGGCCATGCCGTCCTCCTACCTTGGGGTTCGCTGC
Y
GGTGGGATGGGCCTCGAGGGCCCGGCTGCATGCTGCCAGGCAGTCCTCAAACCTGCCGCTGTGGAGCAGAGCTTCAGGTGACAGGGTGTCACTCCGGGTG
Celera SNP ID: hCV8725809
公開SNP ID: rs897628
SNP染色体部位: 2706484
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 26488
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,8|T,2) アフリカ系アメリカ人 (C,15|T,15) 全体 (C,23|T,17)
SNP型: ミスセンス変異;ESE
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,79|T,35)
SNP型: ミスセンス変異;ESE

コンテクスト (配列番号 1285):
CTCTGCCTCCAGTGGGGAAGGAAACAGGGTCCATGTTTTGGCTGAAGCCCCTTCAGCTAAAGACCCCCCCGGAAAGAGGGAGAGCCCTATTCCCCTCCAC
Y
GTGCACCCCGGCACTGTGCTGTAGCCATGCATGCTGCCCTTTTGCAGGATTGCCAGAGAATCGTTTGCCGAGACTGGGGTGCTTTTGAGAGTGGGGGAAG
Celera SNP ID: hCV1642008
公開SNP ID: rs1563471
SNP染色体部位: 2740297
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 60301
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103188 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27102953 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103080 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103189 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103207 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31965333 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,44)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1286):
TTACTTCATCAGTCTGATGGTTTATCTGTAGCGTCCTTAAGATATTTTACATATAAAATCATGTTGTCCACCTATAATAAAAGTTTTATTTCTTCCTTTC
Y
AATCAAATGCCTCTTATTTCCTTTTCTTGGTGTGATCACACTGGTGAGGACCTCAGCATGTGTGACTTAAACTACACAGGGGAGCTGCCATCTTTGTCTC
Celera SNP ID: hCV8725828
公開SNP ID: rs1456461
SNP染色体部位: 2747660
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 67664
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103080 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103207 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,57|T,51)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1287):
AGCCTGGGTGACAGAGAGAGACTCCATCTCAAAAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACAAAACACAGGATCTTAATGTCTCAGTTGTGGAGACCA
K
AAGCCCCCAGTCAAGGTATGGGCAGGGCTGCACTCCCTCCAGTGCCTCTGGGGGAACCCTCCCTTGCATCTTCCAGCTGCTGTGGCTTCAGGAATTCCTT
Celera SNP ID: hCV8725829
公開SNP ID: rs1456460
SNP染色体部位: 2751723
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 71727
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,70|T,50)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1288):
TTATGGGGTCTAAGGGCGGTCCCAGCCCCACCAGCTGAGGCCCTGCTCAGCCCTCTACTTCCCCTGCACCAGACACCCCCTTCTGGGCCTCCCTCCAGAG
Y
GTCCCTGCCTGAGGCAGCCCCCGGATCACTGCCCTGTGGGAGGATGAGCTCTTGATAGGGGCCGGCCAGGACATGGGGCCTGGGGCTCCAGGCCTCAGTT
Celera SNP ID: hCV27103144
公開SNP ID: rs11584658
SNP染色体部位: 2728125
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 48129
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103188 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103207 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103080 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27102953 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103189 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31965333 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,62|T,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1289):
GAGGGTGGCCCTTGTCCATTGCAGGCATGCAGGGGTGAGAACGGTCCGAGGGGCTCACAAGGGTGAACTGGGGGCCACGGATGTACGCTCCAGGCTGGGG
R
CTCAGGCAAGGCCCCAGGGGGCCCCACAGAGCTCCCTGCATAAAATCAGGGGCCAGTGAAGGGGGTCGGCCTCTGTCCCAGCCATATACCCAGAGGTGCA
Celera SNP ID: hCV27103185
公開SNP ID: rs10797389
SNP染色体部位: 2739474
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 59478
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103188 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103207 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103080 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27102953 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103189 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31965333 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,52|A,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1290):
TCAGGCAAGGCCCCAGGGGGCCCCACAGAGCTCCCTGCATAAAATCAGGGGCCAGTGAAGGGGGTCGGCCTCTGTCCCAGCCATATACCCAGAGGTGCAG
K
ATGCAGAGTCTGTAGCCCCCTCTCTGGGGTCTTGGTGCCCCTGCCTCACCTACACTTCCTCTCCTGGTGGCCCCAGACCCCTGGGGTGGGAGCTGACCCG
Celera SNP ID: hCV27103186
公開SNP ID: rs4648481
SNP染色体部位: 2739576
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 59580
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103188 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103207 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103080 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27102953 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103189 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31965333 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|T,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1291):
GAGCACCAGACGGGGTCGCGACACTCACCCCGTGGCCACCGCCAGCAGCGTGGAGAGCTCACCAAGGGTGTGATGGATGGGGGCGCCCATCCTGCAAAGC
Y
GTGACAAATGTGCCTCCCGCTCACAGACTCTCTTTGGAATCCGCTAATACTCCTTGAAGGTGAAGTCCCATTTTTCCCCTGCAATCACAGTATTAAACTT
Celera SNP ID: hCV27103187
公開SNP ID: rs4648482
SNP染色体部位: 2739781
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 59785
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,82|C,38)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1292):
AGAATCATGCCATGTGCCCTCCTGTGTGTCTGGCTTCTTTCCCTCAACATTACGTTGCTGCAATGACTCCGTGACAGGCAGAGCTGTGACTTGTCACCTT
Y
GATACATAGCATCCCGTGTTGTGACGATGCTGCAGTCTATTTGCCTGTCCTATTGTCAGTGGGTCATGCCGACCTCGGCAATATTGCTAACCATGCTGCC
Celera SNP ID: hCV27103192
公開SNP ID: rs6680471
SNP染色体部位: 2744372
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 64376
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103188 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103189 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27102953 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103080 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103207 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV31965333 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,63|T,57)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1293):
TGGAGGGATTTTTCAGTCCTAGAATTTCTATGTATTATTTTTTCACAGATTTCAATTGTCTGGTGAAATTCTCTACTTTCTTAAGTGCACTTTTGTTAAG
M
CTGTCTCTGTAACTCCAATAGCGGGATCACCTGTGGGTCTGCTTCTATCGTCTGCTTTGCTGTTCCTCTCTTGGCTTACCTGGTGTATTAGTTTCCCATG
Celera SNP ID: hCV27103201
公開SNP ID: rs12049543
SNP染色体部位: 2751235
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 71239
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,70|A,50)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1294):
TCAAGGCCATATTTTAAAAGTTCATGTCGATTCTGCAACAGAGCATGGAGAAACCCCTTGAGAACCTCCTAAAACCAAAGAGGGGCTTAGGAGTTCTTTG
S
CCCCTATCTCCCGAGCCCGATGGCTCACACTGTGGGAATGACACGGGGTCCTGGGGGCCTCAGTTCAAATCGCGGCTCCACCTCGGACTAACCGGATGGC
Celera SNP ID: hCV27103202
公開SNP ID: rs6424081
SNP染色体部位: 2753241
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 73245
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|C,70)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1295):
TTTGTTGGTAAAGTCACGGACGTGCTGAACAGTCGTTAGTGGGGTTCACTGGAAATGGGGCCGATCATTTCTCTTCACGCCGTGCTTCCTACCAAGGGAC
R
CCTCCTTGCCTGGGGTCCAGGGCTGAGCTCAGTGCTGGGCCCCTGGTGGTCACTGCAACCCTCACCCTGTGCTCAGGTGGAGCCTCTGCTTTTCAGGGAC
Celera SNP ID: hCV27103209
公開SNP ID: rs7529000
SNP染色体部位: 2763913
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 83917
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,71|G,49)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1296):
GTTCAGTTACATTCCTCTGAAGAGAGCTGAGTTTTGTTTTAGTAGCAGTGAAATTGGCTGGGTTTAAACTCCAAATTCTATTGCTTTTTGGTGGACAGAG
M
TGAAGTCTCCATTTAGCTTTTGCAGCTTCCAGTGCCTGTTCTTTCAGCCCAGCTAGTCTTTACCTCTGTATGTGCAGTTCTGTAGGCTGGAGATTTAAGT
Celera SNP ID: hCV27972176
公開SNP ID: rs4648356
SNP染色体部位: 2699024
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 19028
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,82|A,36)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1297):
AGGAAAGCACAGACTTATGGAAACAAAAGTACATTCCCCAGAGTGAGAGTGGGCTCGAGCCAATAGCTCAAGAGCACTGCTTAAGAATGTTCTGGGGTTT
M
AACAGCCTCTAGAGGTTTCTCATTGGTTACTTGGTTACAATCTATGTAAATGGAGTGGCCCACGACCAGTCTGAGTGATTGGGACCAATCAGAGGCTGAA
Celera SNP ID: hCV28001111
公開SNP ID: rs4648384
SNP染色体部位: 2746481
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 66485
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,59|A,61)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1298):
CCCTCTCCTACTGCAGGGCAGAGTGACCCCTGTCCTGTGAGGATGTGGCCTTGAATGGCCCAATGGGCCAGGAATTCCTCGGGGACAAGAGCTGCATTCT
Y
CCTGCCTCCCCAGCACCCAGCCCAGTGGGCCCTGCAGGGCACAATGACCTGGTTTGTTGGTTCCAGGCAGGCAGGGTGGCAGTGGGCCCCAGGGGTCACA
Celera SNP ID: hCV31965210
公開SNP ID: rs10909880
SNP染色体部位: 2717664
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 37668
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.9)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.8)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103188 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103207 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103080 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27102953 (検出力=.7)
関連した照会SNP: hCV27103189 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV31965333 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,64|T,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1299):
GCATCCAAGGGAGGCTGATCAGGGTTTCAGAGATTCTGCTCACTGGGGGCTGAACGAACCGTCAGGCTCTGAGCTGCAAACTTGCAGAAGGGCACTCAGG
Y
CGTGATCAATTTGTTAGCGATAGCCGCCATAAATACTTGATTCCCCATCTGGCTGGACAGCTCCGAGGGCGCTGACGTTAACTAATTGCCCGTGGTGGGA
Celera SNP ID: hCV31965380
公開SNP ID: rs12409348
SNP染色体部位: 2768903
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 88907
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,47|C,73)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1300):
GGAGGTGACCAATCAGAGGTACTTTCCGTTTTTCATCTGCAACGCAGTGGAGGTGGTGGGGACATTGCTAAGGGAGTCGCCTCTGATCATTTTGTTACTT
K
GGTGGGAAGAGGTGAGGTTTTCCTTTTGATTCAGTTCTAGGAAGTCAGGGCGAATCAGCCTTAGACTCCAGACCCTATTCTCCTGCCTCAGTATCATTTT
Celera SNP ID: hCV29511345
公開SNP ID: rs7548023
SNP染色体部位: 2746749
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 519
SNP部位ゲノム: 66753
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,59|G,61)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 117
遺伝子記号: LOC442086 - 442086
遺伝子名: similar to ribosomal protein L10
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 520):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1301):
AAAGTTTGAAGACTACCAGATATCAAAACTTACTGTAAAGCTACAATAATTACAACCAGATGGTACTGCCAAAGGGTAGAAAAATAGAACCATCAGACAA
Y
AGAAAATTCAGAAACAGACCTACATCTATAGGAAAATTTGATTTGTCACAAAGGATAAGCTGAACACTAGTAGGGATAGGATAATCATTTCAATAGGGAG
Celera SNP ID: hCV965698
公開SNP ID: rs571352
SNP染色体部位: 120841735
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 520
SNP部位ゲノム: 14672
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,56|T,64)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1302):
AGAGAAACAGGGAAGACTGCTCTGTTGGAAAACAGAAACATGTTGCAGTTCTCCTAAGAGAAACAGAAACAGAAGATGGTGACTGGGTCCCTGACAGCTT
Y
CTGCTTTCCCTGATGGCTTTCTGATCTAGTCCCATATTAAAATCTAGTGGCATTTCTGACTTTGAATTCCATAAGACACCCCTGTGTCCTTATAAATTCT
Celera SNP ID: hCV11232111
公開SNP ID: rs17203235
SNP染色体部位: 120838101
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 520
SNP部位ゲノム: 11038
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,68|T,46)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1303):
ACATATGCATAACTTATCTTCACTCTTGGACCACAAAGATCTATTTCAGAGACAAATTTGGAGTGGAATTTTCCTTAACATTATCCTCAATAGAGCCTAA
R
GTATAGAATACACTCATTTTCTCACTCATATCCTGAGACCTCAGTGGTCGTTTACCAGACGTTGGAATTCCTAAATGAATACCATTGCCTTAAAAATCAT
Celera SNP ID: hCV26920316
公開SNP ID: rs2692618
SNP染色体部位: 120836534
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 520
SNP部位ゲノム: 9471
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,55|G,63)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 118
遺伝子記号: LOC728221 - 728221
遺伝子名: 仮想タンパク質 LOC728221
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 521):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1304):
AGAAGATGACCCATTTGACTCTAGGACTTCAGATGTAACTCTTATGGCAAAAGGAAAATCTTTGGGAATAACAGGATACAAAGCTTTCTCAGCAAGAGCA
Y
CAGGCCCAAGTTCTCTTCTATTTATACCGGTGACTTTGACAATTTCATTAGTTGCATAAGGAGGAAACTCATAGTGCAGCATGAAATTTTTATCTTTTAT
Celera SNP ID: hCV8827309
公開SNP ID: rs1110796
SNP染色体部位: 3999657
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 521
SNP部位ゲノム: 194121
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,33|T,5) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,0) 全体 (C,41|T,5)
SNP型: UTR5;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,14|C,104)
SNP型: UTR5;イントロン;偽遺伝子

遺伝子番号: 119
遺伝子記号: LOC728284 - 728284
遺伝子名: 仮想タンパク質 LOC728284
染色体: 4
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 522):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1305):
AGGGATGAAGGATTGAAGGTTAGAACAATTAAGCAACTTGTGCAGGATCAAAGTGAGTTGGATGAGGAGTTAGCGGTGAGGGTGAGGCTTGTCTCTCTCT
Y
GCCCTCTCATCCTGGCACATGTGCGATATCGTGCTGAACCTGAGGGAGGAAAATACACGACAACAAGGCAAAAAATGAATATAGTAAACAAAGAAAACAC
Celera SNP ID: hCV3230038
公開SNP ID: rs2289252
SNP染色体部位: 187444375
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 130695
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,18|T,12) アフリカ系アメリカ人 (C,19|T,5) 全体 (C,37|T,17)
SNP型: UTR3;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,72|T,44)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1306):
GGCACAGCATTTGTCATTGCTTCTGCCTGCCCCTTAATAACCATATCCACCTGCTTGTGTCTTTTAACTGAGTTATCAGTCACCTCCTCCATGAAGCTGT
Y
GCAAGCTTTCTCAGGATGACGCCCCTCTTGCTGCATTGTTGCCTGGTCTGTGCCTCTGTGTAGAACTTGCCACATTGCATTATGGCCAGAGGCTTGTGTG
Celera SNP ID: hCV2103392
公開SNP ID: rs12500826
SNP染色体部位: 187464445
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 110625
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,40|C,72)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1307):
TGTTTGAGCATTCAGTCTCTTTGTTTTTGATCACGCTTCTATGGAGTCCAAGAATTACCATAAGGCAATATTTCTGAAGATTACTATATAGGCAGATATA
S
CAGAAAATAACCAAGTAGTGGCAGTGGGGATCAGGCAGAAGAACTGGTAAAAGAAGCCACCATAAATAGATTTGTTCGATGAAAGATGAAAACTGGAAGA
Celera SNP ID: hCV3230119
公開SNP ID: rs4253430
SNP染色体部位: 187447058
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 128012
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,76|C,44)
SNP型: MICRORNA;UTR3

コンテクスト (配列番号 1308):
ACTCCACCATGCCCAGCTAATTATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCGGCTTCCGGTGTTGTTTCAGCATA
Y
GGCTAAATTAAAGGCTTAGATTCTCAGTTTGCTCATTCTAATTTAGCTGAATTCTGAGTATTATGCATTTGTATCTGAGGTTCCAGGCCTCTCCCTCCTC
Celera SNP ID: hCV3230131
公開SNP ID: rs13136269
SNP染色体部位: 187454002
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 121068
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,83|C,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1309):
TGCTGACAGCAATGGCAGGCTGCCATCCTTGGAGTGAGGACCTGTGCTTCTACTTCCTGCTTCCTCTGAACCCCAGCAGCTGCCAGCACAGCGTCTAGGA
R
TAGTGGCTGTGGACATAATTAGGAGTTTCTTGAGCAGCCTAGTTAACAGCCCCACAGAGGGCATGATCATATAAGAACGTCACTCATGTCATTATCATTT
Celera SNP ID: hCV3230136
公開SNP ID: rs13116273
SNP染色体部位: 187454880
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 120190
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,83|A,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1310):
CAGATACCTCATCCAAGATATACAGGTAGCAAATAAGCATATGGAAAGATGCTCAACATCATGTTATTAGAGAAATGCAAACTAAAGCAACAATAAGACA
Y
CACTACATACCTATTAGAATGGCTAAAATCCAAAATGCTGACACCACCAAATGCTAGAGAGGATGTGAAGCAACAGGAGCTCTCATTCATTGTTTTGTCC
Celera SNP ID: hCV29821005
公開SNP ID: rs6552970
SNP染色体部位: 187475220
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 99850
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,99|T,21)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1311):
GATGTGAAGCAACAGGAGCTCTCATTCATTGTTTTGTCCTTACAAAACTAAATAAACTCTTACTATATAACATGGAAAATGCATGTCTTGGTATTTATCC
R
AAAGGGCTGAAAAACTATGCACACATAAAAGCCTGAATGTAGATTGTATATGCTTTACTCATAATTGCCAAAACTAGAAAGCACCTAAGATGTTATCCAA
Celera SNP ID: hCV32209621
公開SNP ID: rs6552971
SNP染色体部位: 187475382
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 99688
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,59|A,61)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1312):
AGCTCTCATTCATTGTTTTGTCCTTACAAAACTAAATAAACTCTTACTATATAACATGGAAAATGCATGTCTTGGTATTTATCCGAAAGGGCTGAAAAAC
Y
ATGCACACATAAAAGCCTGAATGTAGATTGTATATGCTTTACTCATAATTGCCAAAACTAGAAAGCACCTAAGATGTTATCCAATAGGAGAATAAATAAA
Celera SNP ID: hCV32209620
公開SNP ID: rs6552972
SNP染色体部位: 187475398
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 99672
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,99|C,21)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1313):
ATTTGCGCTCTTTGACAATGCAATGGTCACTCAAAAGCTCTGGTGGAGACATACAAAAAGATTAATGTTGTTTTACTGCTAACACAACATCCATTATGCA
Y
CCTGATGAAGGAGTAATTTCACCTTTCAAGTCTTATTATTTAAGAAATCTATCTTGTTAGGCTGTAGCTACCATAGACAGTGATTCTTCTGATAGATTAG
Celera SNP ID: hCV32209605
公開SNP ID: rs6829128
SNP染色体部位: 187493998
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 522
SNP部位ゲノム: 81072
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,83|T,35)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 120
遺伝子記号: LOC729199 - 729199
遺伝子名: 仮想タンパク質 LOC729199
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 523):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1314):
ACATAAAAGTGCTCAGCATACGACGATCATGAGCCATGTCTAAGCAGGCGCAAGCCCTCCCAGGCTTCTCATCTGCAATATTGGCCATTTCTCTTCATGC
Y
TCAGTGTCCTGTTTGAGTTGAGCATGTTTTTTTTACAAGTGAGTCTCTCCTCCATTGGCCGGGAACCGCCCGAGAGCCGGGAGCATTTGTCATTCTTGAT
Celera SNP ID: hCV26034157
公開SNP ID: rs2994329
SNP染色体部位: 241714544
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 523
SNP部位ゲノム: 11791
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,98|T,22)
SNP型: UTR5;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1315):
AAAGAATTAAAATCAAGTCTGGTTCTCCTCACTGAGCTCATTGGGGAATCCCTGGCCTAGGGATTTCCCTCTTCTCCCGCCCCCAGGCCTCGGAAAATGA
R
CTGGTGTCAGCTGCTGCCCAGAAGGTTACCCAGCGTGTTCTCTCTCTCAGGGTCCTTCCCTTAAATTCTCAAGTTTGACATGGAATAGAAGAATGTCGGG
Celera SNP ID: hCV26338512
公開SNP ID: rs2994339
SNP染色体部位: 241708043
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 523
SNP部位ゲノム: 5290
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,96|G,18)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1316):
GTGGTACCCCCTCCCCACTGCACGATCCTCAGGAAGAATTCCTTTATTGAAACCATTATTGAATAGGGTAGATTTAGGCACGGGAAATGTAAACAGCAAA
Y
CAGCCACTAAAAGTGCGTTAATGTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGTGGGCGGATCATGAGATCAAGAGATCGAGACCATCCTGGCC
Celera SNP ID: hCV26338513
公開SNP ID: rs3006917
SNP染色体部位: 241708594
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 523
SNP部位ゲノム: 5841
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,97|T,21)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1317):
GCTTTGAGGGTAGCTCCCAGGAAAGGCTGCCTCAGCCCCAGCGTGATGGGGACGGGTAGGGGCCGATGAGGCTTCCCAGAGCAGCGATGGCCTTAGGTAT
Y
GCCAGAAGGAAACCTACTTTTCCTCCAAGATCAGAGGGAAGGATGAGGTGGGGTGTTGGAGCATCACCATATATATACATCACACACACAGGGAAACACT
Celera SNP ID: hCV30690784
公開SNP ID: rs4658574
SNP染色体部位: 241717339
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 523
SNP部位ゲノム: 14586
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,92|C,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1318):
GCTCTGTGAGTGCCCTGGGGACTTCAGGCAGTAAGTGCTTGGAATGATTAATATGAAAAATGCATCTGGAAATGAAAACGAAGAGGAGTCTCATTCTCCT
Y
ACAAAATGACCCTGTGCTCAAGGAACCTGTAAGTACTGACTTTTCCCACTCGGTCCAAAATCCCTCTGCCAAACATGTGTTCACAGACAGTAAATGAGCA
Celera SNP ID: hCV8688079
公開SNP ID: rs884808
SNP染色体部位: 241720062
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 523
SNP部位ゲノム: 17309
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,92|T,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1319):
CAGGGAGGGCCCCAGCAGCACCTGCTTTAGGCCTGGCCAGCCAAAGATCAGGACCACTGGAGCCACTAGGTCTCCTGGCAGGTGACTAGGCTCTTGTCAC
R
TAGGAGGGAGGGACCGTGACTCCTGGCATGAGTGAATCTTCAGCCTCTAAAGCCAAGAACTCTGTCAGACCTCAGGTTGTGGGGAGTCTTCCGTGGAAGC
Celera SNP ID: hCV8688080
公開SNP ID: rs884328
SNP染色体部位: 241720901
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 523
SNP部位ゲノム: 18148
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,90|G,28)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1320):
TGTGGCGCAGTGAGCCCAGGGGCTCAAGGTGTTAGCAGTCATCAACAGTGCTATTTGAAACTGTGGGTGGATGAAGAGGTGAACTCAACACCACAAATAT
S
ACAGAGCAGTAACCACCATGGAAAAGAAAAGAGAGCTTATGTGTCTAGGACACCCCAAGAAATCTCTTCTGAATGAATGATGGCAATGAAATAGCCATTA
Celera SNP ID: hCV15760239
公開SNP ID: rs3006923
SNP染色体部位: 241715380
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 523
SNP部位ゲノム: 12627
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,81|C,25)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1321):
GATGAGGTGGGGTGTTGGAGCATCACCATATATATACATCACACACACAGGGAAACACTCCTACTTGGATGGAGGATCTTTGCTGTTCTGTTGAGGCCAG
Y
CTGATCCTGGAGGCAGGGCAGGGCCTGGCTGTTGCCCAGGCTCCAAAGAGGCGCCAGGGCGTCCCTTAGTCCTTACACTTTCTCCAGAACCTGCGGGCAG
Celera SNP ID: hCV26034160
公開SNP ID: rs2994327
SNP染色体部位: 241717481
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 523
SNP部位ゲノム: 14728
関連した照会SNP: hCV233148 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV9493081 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV29210363 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV30690780 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,28|T,92)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 121
遺伝子記号: LOC730144 - 730144
遺伝子名: コドン変異イニシエーターの抑制因子に類似, 関連タンパク質 1
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 524):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1322):
ATTTTTGGTGGGCAGCAACTGGCTGGAGTAAAGGGCAGCTGTCCCTTACTGAGAGCACCCATTCTCCAGTTCACACAGTCCCCAGAGGTCTACTATCTGA
Y
TCACGGAGCGGACTTCAGATACGTCATCCACCTGGCCCTTGGTAGGCATTTGTGTTTGTGACTACAGCTGAAGTCAATCTAAGTCATGAACTGCTACATG
Celera SNP ID: hCV11633415
公開SNP ID: rs4262503
SNP染色体部位: 180518932
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 524
SNP部位ゲノム: 61111
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,111|C,9)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 122
遺伝子記号: LYRM2 - 57226
遺伝子名: LYR motif containing 2
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 525):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1323):
TTTATAACCTATTCCTAATCAAACCCAATTATATCAGAATACCTTTCTGAATTTGAGATTTTTGCTCTACATTTTATAATGAATAAGGCTATTTTTTGAA
R
GTATTTCATTTTGAATTCTGTCATTAACCTCAAAAGCTTTCTACTGCTTTGCGGTGAAGGCAAAATATTCGATAACTCAACTTAGGCCCCACTGTTCCCC
Celera SNP ID: hCV30454683
公開SNP ID: rs9351210
SNP染色体部位: 90398328
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 525
SNP部位ゲノム: 5188
関連した照会SNP: hCV2744023 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,87|G,33)
SNP型: UTR3;イントロン

遺伝子番号: 123
遺伝子記号: MDM2 - 4193
遺伝子名: Mdm2, transformed 3T3 cell double minute 2, p53 結合タンパク質
染色体: 12
OMIM番号: 164785
OMIM情報: {腫瘍形成の加速, 罹患しやすい} (3)

ゲノム配列 (配列番号 526):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1324):
TTTCCCACTGCTGGACAGCAATCTGTCCAATCCACAGTCACATAAGAATATTCCTTTAAGGCCGATGCCTGCTTAGCCAGTTAAATCCAAAGACAGTGTT
Y
GTAGGAAAGGGCCAGGTTAAATGGTATTTTTAAGGCTAATTTGGGATTGACCTTATTATCATTGGATAATCAGTTAAGGAAACAAAAAAGTATGGATTTA
Celera SNP ID: hCV11922386
公開SNP ID: rs1846401
SNP染色体部位: 67495166
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 526
SNP部位ゲノム: 16919
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,120|C,-)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 124
遺伝子記号: MET - 4233
遺伝子名: met proto-oncogene (肝細胞増殖因子 レセプター)
染色体: 7
OMIM番号: 164860
OMIM情報: 乳頭状腎細胞癌, 家族性および散発性, 605074 (3);/肝細胞癌, 小児型, 114550 (3)

ゲノム配列 (配列番号 527):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1325):
AAATCCTATAAACAGCATGTGATCATATTGCTTCTAGAATTTATGATTGTTTTCTTCCAAAAGGAAGCTAAATTTAGCCTAGTAATTCTACATGCGCTCA
R
GAAAACAATGCCTGCTGTGATTTCTAGAATAAATGAATGTGAACCACAGTTCCTTTACTTGACTAACAGAGAAAGTTTAAATATCAACCTAGTCATTAAC
Celera SNP ID: hCV16170613
公開SNP ID: rs2237712
SNP染色体部位: 116125894
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 527
SNP部位ゲノム: 36199
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,32|G,6) アフリカ系アメリカ人 (A,31|G,3) 全体 (A,63|G,9)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,112|G,8)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 125
遺伝子記号: MIPEP - 4285
遺伝子名: ミトコンドリア中間ペプチダーゼ
染色体: 13
OMIM番号: 602241
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 528):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1326):
ATATTTTAGTTGGCAAGACAACATGAATAAAGACATTCTGTTTAATTTCAAAAAGTGGTAATTGTCAAATAAGGGTTTGTACATGAAAATACAGGATTAC
R
TGGAACTAAGACACTGGCGCCGATCTTTAAAAATCTATTTAAAACCTCAAAGGGAATACTTTTTCTGTTCCTTTGCTATTAGTGAGTGCCTGTTCAAATA
Celera SNP ID: hCV9680592
公開SNP ID: rs17079372
SNP染色体部位: 23282305
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 528
SNP部位ゲノム: 89977
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,100|A,20)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 126
遺伝子記号: MYH7B - 57644
遺伝子名: ミオシン, 重鎖 7B, 心筋, β
染色体: 20
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 529):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1327):
AGTGGGTACAGAGATGCCAGCTTGGGTTTGCCATTGTTAGAAGTGAAGATGACACCTCAGTGCTGCAGATTTTGCAGGAGGGGACTGGAGCCAAGCCACA
R
ACTTTTCTCTGTTAGGAGATGGGTTCTTGGAGTGGGTGTGGTGTCTGACCATCCGGGGAGATGGCTGAAGCTGGGGATCTGGGAAGGCTCCCAGAAGGGA
Celera SNP ID: hCV2142611
公開SNP ID: rs1885114
SNP染色体部位: 33041022
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 529
SNP部位ゲノム: 24155
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,10|G,8) アフリカ系アメリカ人 (A,19|G,5) 全体 (A,29|G,13)
SNP型: UTR3;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,69|G,51)
SNP型: UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1328):
CAGGGGCTGAGCCTGTATTAGAACCCAGGCTTGTTTCCCAGCCCAGCCAAGTCCCAGAAAAATCCCCCTGATTTTATCTATTTTTTTTTAACCTGGGATA
S
CAGCAGGGAAAGCATTAGAGGCAAAAGGAAAGGATTTTCATTTTTCCAGGAATGCTGAAGTCAGGACTGTTTGAGGGGAGCCCTGTGTTTCTCAGACTCT
Celera SNP ID: hCV2142584
公開SNP ID: rs3761144
SNP染色体部位: 33007736
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 529
SNP部位ゲノム: 9131
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,45|C,71)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1329):
CCATGACTGACCCCCCAACCCAAGAAGTAAAGACTCTCCTGATTTGGTGTTTATTATTCCTATGCAATGTTTATTGAGATATAATTCATGCACCATAAAA
Y
TCCCCCTTTAAAGTGTGCAATTCAGTGGTTCTTGGTATATTTACAAGATTGTACAACCATTACCACTGTCTCATTCCAGAATATTTTCATCACCACAGAA
Celera SNP ID: hCV2142586
公開SNP ID: rs6060130
SNP染色体部位: 33012980
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 529
SNP部位ゲノム: 3887
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,46|T,74)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1330):
ATTGTTTTCAAATATTTTCAAGCTGCAGTTGGTTGAATACACAGATGTGGAACCCATGGATATGGAGGTCCCACTGTACTTGTCTGATTGTGGCCATCCT
R
GTTGGTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTTCCTAATGACAAATAATGCGCATATCTTTTCATGTGCTTATTGGTAGTTTGTATATCTTCTTTGGAGAAGG
Celera SNP ID: hCV2142587
公開SNP ID: rs6088664
SNP染色体部位: 33014761
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 529
SNP部位ゲノム: 2106
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,46|A,72)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1331):
CCAATCTCAGTAGGCATTCTGTGGTTTCCCCTCTGAGTGTCCTTGCTCTCTGTATCTGGAGGTGGGGTATTTTTCTGGGTGTGTCAGACTCTGCGTGACT
Y
GGTTTCTCCCCGTGAGCTCTTCAGTCTCCTGAACCTCTTACTGCCTTGTCCCTGTCCCCGTCAGTCTCTGCACCCAGCCTCCCTGTCTCTCAGTGGAGTG
Celera SNP ID: hCV2142597
公開SNP ID: rs6120778
SNP染色体部位: 33028830
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 529
SNP部位ゲノム: 11963
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,51|C,69)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1332):
ATGACTTTCCATGCATCATCTCAACAACCTGGGGAGGTGGGGCCAGCACCAGACCTAGCTTCACAGGGCGCCAGGCTAAGAGGGACCTTGTGTTTGATTC
R
ACACTCTGCTGTTGCCGTCTTGAAAGTTTTAATTGTTTTCAACAAGGGGACCCACATCGTCATTTTGTACTGGGGTCTGTAGGTTATGTAGATGGTCCTA
Celera SNP ID: hCV2142599
公開SNP ID: rs6060140
SNP染色体部位: 33030168
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 529
SNP部位ゲノム: 13301
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|A,58)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1333):
ACTTAATACCTGTCCTCTCTTCCTGTCCTGAACCCCAGCACCCTAGCCTTAACCCCTGACCTTTCTACCACATAATCCTGACAGCTGACCTCTGACCATT
R
TCCCCAGGTGACTCCGCAGCTACCATCCCAACTCTCACCCTGACCCACTGCCCTGGGACTGGCCCAGCCCTGTCAGTTCTGACACCTGTTAAGCCCAGCA
Celera SNP ID: hCV3249293
公開SNP ID: rs6058154
SNP染色体部位: 33049495
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 529
SNP部位ゲノム: 32628
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,69|A,51)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 127
遺伝子記号: NCOA6 - 23054
遺伝子名: 核内レセプター 共活性因子 6
染色体: 20
OMIM番号: 605299
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 530):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1334):
GCAATCTAGATCTTAGAGAAGTGGCCTTTGTAATTCTGGATATACAGAGCAAAATCTGCTGGTACTATTCGATAAAATAAATGCTTGTGAATACCTTCTA
Y
GTATGAAGCAACATACCAAGATGATGAATTCTGTCTTAAAAAGAGCTTGGTCAGTAGTGGACATTAAGAGCGAAGTGTAAAACATGGAGACCAGTATTTA
Celera SNP ID: hCV1207887
公開SNP ID: rs959829
SNP染色体部位: 32809708
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 102644
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,78|C,42)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1335):
TTTGGGTCAGATCCTGCCTGGCTTTCTCCTTCTTTTGCTTTCAGGGTCAAACAACTGTTCTTTAGAAGACAGCTGCAAGGACTATTATTAATATTAATAT
S
AATGGTAACAACAGCTCCCATATATTGAACATTTACTATTTCCTCATTATGCAGAACATGTTATCTCACTCAGCTTTGAAAACAACCATAAAAGGTAGAA
Celera SNP ID: hCV1207902
公開SNP ID: rs2295352
SNP染色体部位: 32783716
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 76652
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,78|G,42)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1336):
ATTTTGGTCAACGTTGGACTGCATATACCACAGTGGTCCCCTACGATTATAGTGGAGCTGAAAAATTCCTCTTGCCTACTGATGTTGTAGCCATCATAAC
R
TCGTGGCTTAATTTGTTATCTTTTCTATGTTTCCATATGTTTAGATACACAAATACTTACCACTGTGTTACAATTGCCTGTAGTATCCAGTATAGTAACA
Celera SNP ID: hCV1265082
公開SNP ID: rs6088575
SNP染色体部位: 32737064
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 30000
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,79|G,41)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1337):
GGCTCAACTTTCCTGCTGCCTTCTACGCCAACTACCATTTCACTTTATTCACCGTTTTGGATTTGAAGCTGCTGCTTGATACTGACATTTTGTAGATGTA
R
TATGGCTATGCCGGTACGTTTCTGCCTATTGAAGAAGATCATGTTCTTTTAGTATTAAACAGTACAGTTGACTTCCAATCAATTAGTTTATATATAGGAA
Celera SNP ID: hCV1265086
公開SNP ID: rs2378251
SNP染色体部位: 32740411
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 33347
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,79|A,41)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1338):
TGGCTATGCCGGTACGTTTCTGCCTATTGAAGAAGATCATGTTCTTTTAGTATTAAACAGTACAGTTGACTTCCAATCAATTAGTTTATATATAGGAATC
Y
TGTGTAGCCTGCAGTGGGGTTGTGGGGAGCAAGGCAGAAGCAGCCACTCCAGAGAGGATTTACATTTATTTCTTCCAGGCATCTGAGAGATCATTTCAGA
Celera SNP ID: hCV1265087
公開SNP ID: rs2889855
SNP染色体部位: 32740514
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 33450
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,79|C,41)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1339):
GGGTTGTATCTCCAGAAGCCCCATCGATGTCAGGTTGGGCAGAGCCAGCCCAGGAAACATGGAACATCTGCCTCTGGCCTCTCACCTCTTTGTTCTCCTA
Y
GAAGCCCGGCTTTTTTTTCTTTTTTTGAGACGGAGTCTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGGTCTCAGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCC
Celera SNP ID: hCV1265092
公開SNP ID: rs6088578
SNP染色体部位: 32745265
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 38201
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,81|T,39)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1340):
ACCCTATGAGATTACTATTATCCTTAAAGACTGAGGCGCAATGAGGTTTTATTTGTCCAAGGTCACACAATCAGCAAGCAGCAGTGCTTAATAAGGACCT
S
AGACAGACTCCACCAAAAAGAGCTCACAATTTGAAAGCAAGCCCCATTCAATAAATGATGCTGGGATCACTGGTTATACATAGGGAAAAAAAATGAAACT
Celera SNP ID: hCV2988252
公開SNP ID: rs2425005
SNP染色体部位: 32871376
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 164312
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|C,78)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1341):
TTTTTTTAAGTTTTATTTATTTTAGGTTTTATCTATTATTGTTACTATTGTTCATCTCCATTTCCACCCTTAATTCCAACAACACCCTTATAACAATCCT
S
TTCTCCAAGCAAAGTGGACTCTTTACCATCTCCTAAATACCCACCTCTGTGTTTATGCTTTCACTCAGCCTGGAAAATACAGCACTGTCTCATCTCCAAG
Celera SNP ID: hCV2988254
公開SNP ID: rs6060064
SNP染色体部位: 32870000
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 162936
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|G,78)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1342):
CTCACCCAATCTAGTGAGAAGTAAGAGAGTAAACTAGCTCCATATCTCTCCTTTCTCCCCATGCTGATCCTACACTTCACAATCAGGCTTCCTTTCCTAA
Y
GTACAGCTTTCATCACATCACTGGCGAAAAACATTTGATGACTTCCCACTACCTAGTCAATCAAGTTCAAACTTCCCAGCTTGGAATAGAAATGGGTATT
Celera SNP ID: hCV3010271
公開SNP ID: rs2889861
SNP染色体部位: 32869325
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 162261
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1343):
AGCCCACAAAACTGAAGAACTGCTATTATACTAGAAGAAAAAATTTATGAAATTCAATTTTAACTAGTAGCTAGTGGCACTATAAACTGGTAGTTGTTCT
R
AAGAATAATCTGACAATGTGGCTAAAAAGTGATAGCCTCAGACCTAATGAAATCATTTTAGGGAATATATTCTAAGAAAAAAACTGGAAGAAAAAAGATT
Celera SNP ID: hCV7593328
公開SNP ID: rs1018447
SNP染色体部位: 32865368
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 158304
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,42|A,78)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1344):
TATAGTTAATTTATTAACTGATAATGAATATTATAACTGACATAGAATACACAATTCATCACAAAGTAAAGGTATGGTCCTGGCCTTCTGCTTTATAGAG
W
TTGTATATCAAATAAAGCATATGACCAACTCTAGGGCTGCATTCCTCCTTCCATCAAAGCCATAGTATTTCATTTGTGTATACATCTAAATGTAACTCTA
Celera SNP ID: hCV16013581
公開SNP ID: rs2253484
SNP染色体部位: 32868924
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 161860
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|T,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1345):
GTGCTGGCTTTAGGTCTGACCCAGTGTAGTTTCAGTGGTGGGGTGGCCACAGGGGTGCTTGTGTAACCTCTCCCCTAGCTCCAGGTAGCTCAGCATAGAC
R
GACAAATTCCAGTTGTTTGGGAGAGAGTAAGAGGAGAGAACAAGAGTCTCTCCCTGGTAATCCAGAGAATTATTCTGGATTTTACCTAAAACCACCAAGG
Celera SNP ID: hCV16013594
公開SNP ID: rs2424999
SNP染色体部位: 32850091
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 143027
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,41|A,75)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1346):
TCTGCTGACACCTCTGATTTCCTTAACCAAAAACTACACCACACTTGACAGCTTTGCAATGGTTTCCAAAACTCTATTACTCTGCCAAAAAAACCTTTTC
R
CCCTTATTATCAATGAGAATTCTCCCCTCATTTTCCTTTCACTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACGGAGTCACGCTCTGTTGCCTGGGCTGGAGTGCAGTGG
Celera SNP ID: hCV27166995
公開SNP ID: rs6088618
SNP染色体部位: 32873011
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 165947
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,61|A,59)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1347):
TGCCCTCTGAATTTGGTGCTCATTAATATTAACTGATATAGTTAATTTATTAACTGATAATGAATATTATAACTGACATAGAATACACAATTCATCACAA
R
GTAAAGGTATGGTCCTGGCCTTCTGCTTTATAGAGATTGTATATCAAATAAAGCATATGACCAACTCTAGGGCTGCATTCCTCCTTCCATCAAAGCCATA
Celera SNP ID: hCV29372820
公開SNP ID: rs6120739
SNP染色体部位: 32868888
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 161824
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,42|G,78)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1348):
TCAAGGCCTCGATATTCCCTTCCTTCAAGAGGGGCCAAACTTTCTGGGCTTTTGGTAATGGAGTCACTAGCTCCCTGTGGCTACATATGGGTTGGGATAC
R
TGAATTGTGCTGGGTGGACACTAGTTGGGGGTGGCCCCACCTTCTTAATCCCTGTAGATCTCCCACCCCCATCCCACCAGAGAAGCCAGCATCTTAAGCC
Celera SNP ID: hCV29372834
公開SNP ID: rs6060001
SNP染色体部位: 32758014
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 50950
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,61|G,59)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1349):
TCTGCAGTAGGGGGCCTCCCTCTTCATCTTCACCCAGGGAAGGATTGGTTAAGGGCTTACCTCGGTCTGGGTCCAACCCTCAGTGCTCATCCTTAAGGGC
Y
CCTGGGAACTGACAGCTCCCTCCCTTCATCATCACCTCCCACTGACCTGCTGTCTCACTGAGCCCAAGCAACCTGATCTTCCTCCTACCCCTGGATGCTG
Celera SNP ID: hCV29693120
公開SNP ID: rs6060003
SNP染色体部位: 32758606
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 51542
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,61|C,59)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1350):
ACAGATGCGTTTTGGAGTAGTAGACTGATTTATTAGCTAGTTCAACAAGTCGCTTAACCCTTGTGTGCTGAAAAATGTGCTGATTATAGGCTAACTAGGG
M
CAGTTGAGGAAGGCTTAGAAATTTTTTTTTTGTTTTGGAAACGGAGTTTCGCTCTTATTGCCCGGGTTGGAGTGCAATGGCGCGATCTCAGCTCACTGCA
Celera SNP ID: hCV30360331
公開SNP ID: rs6088568
SNP染色体部位: 32729632
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 22568
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,79|C,41)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1351):
ACCACTCTCAACTCTCAGCTTGTAGAGGTCCCTCTTGGGTCCTCCTCTTGTGGCCCTCTCCACACATAGCATTTGGTCCTTCATGGGAGCACCAGCTGCT
S
GAAAAAATGATTCTGTTAGGTAAAAATACTATACATTTTTGAAACATGCACCAATTATTTAGCTCTGTGATTGTGGGCAATTTCTTCAAGCAGCCTGAGC
Celera SNP ID: hCV29982073
公開SNP ID: rs6088580
SNP染色体部位: 32748714
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 530
SNP部位ゲノム: 41650
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,48|C,48)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 128
遺伝子記号: NDUFB8 - 4714
遺伝子名: NADH デヒドロゲナーゼ (ubiqui) 1 β 半複合体, 8, 19kDa
染色体: 10
OMIM番号: 602140
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 531):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1352):
CCCCGTGTGCTTCTGTTTCTGAGCAATCACAGGCTCCTTCCCCGAAGACAGGATGTGGGTCACATTGTATAGAATAAGCATGCCATTGTCCCCGCCGCCA
R
CAATAACCCCGGAGCTTTCCAGAAGCCCACTGCCAAAGCTCCCCCAGACCAGCTTGTGAAACCTATAAAGAGGAGGAACTGGCATCAGTACAAACTTAGG
Celera SNP ID: hCV2144411
公開SNP ID: rs3763695
SNP染色体部位: 102259196
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 531
SNP部位ゲノム: 4291
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,100|G,20)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;MICRORNA;UTR5;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 129
遺伝子記号: NME7 - 29922
遺伝子名: non-metastatic cells 7, タンパク質 (ヌクレオシドジホシファターゼキナーゼ)で発現される
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 532):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1353):
TTTTATTTTAAAGTAGAAATCTGTCCGCTTTTCACTTACGGAGGCCTTACAGTGTGTGTTCTGTGTTACTTGAGTTTATACGCACTGCAGAATTTGTTTA
Y
CCTGCTCTTTTGGAAACGTATTCCGGAAGCGAAACCCTGAGTAATCGGAAGTGGTTAGGAGTGAGAGAGCTGCTGGATATGCGGAGGGACTGGGCGGGTC
Celera SNP ID: hCV15878582
公開SNP ID: rs2275299
SNP染色体部位: 167604000
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 245607
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,11|T,29) アフリカ系アメリカ人 (C,22|T,14) 全体 (C,33|T,43)
SNP型: UTR5;TFBS SYNONYMOUS
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,65)
SNP型: UTR5;TFBS SYNONYMOUS

コンテクスト (配列番号 1354):
ATAGTCCTATAGTCTAGCAATATAACTTTAAGATTTACATAACAGAATGAAAGTCAGAATTGTATTTTATGGCATTAAATAAATTAACTTTATTTCTGTC
Y
ATATCAACATCCAAAGTTTATTAGGAATTTATTTAAAGAATAATAAAAGCAATAGGACCTAACATTTAATGAGTGCTTACTGTGTCAAATACCATTCTAA
Celera SNP ID: hCV279320
公開SNP ID: rs10800441
SNP染色体部位: 167610647
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 252254
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1355):
ACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGTGGAAATCGCGCCACTGCACTCCACAGCCGGGTCGACAGAACAAAACTCTGTCTAAAAAAAAAAAAAGGCAGGT
S
CTAAAAACAAAACCAGAAAAGCTATTAGGAGAAACGTCATAAAGTTGGAAACTGAAAAGCATTTCATTTCATGGAATAAAATTTTGTTCTTCAGTAATTA
Celera SNP ID: hCV459880
公開SNP ID: rs10800439
SNP染色体部位: 167597663
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 239270
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,58|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1356):
TTAAAAATTCAAAAGGTGATTTAGTTCAAAAGGTTATTTAGGTCAATCTCCCTACCTCCAGGGAGAAGTATTCTTAAGCCCCTTCCAAGCACAGGTCTCA
Y
CTAAAATACGGCTTGTTTTTTTATCCATATACCATTTCAGTACATCTCCAAGAGGACAGGAAAATGCATACTGTGACTGAGTTCCTGCTGTGATGGAGCC
Celera SNP ID: hCV2520836
公開SNP ID: rs10753786
SNP染色体部位: 167555394
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 197001
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1357):
CAAGAATACTATTTGCAAATGCAACATAAAAACTATATTAGCTGGAGTAATTCTGCTTTTGTGATAAAGAATTGCTGCTACTTTTCCCTCTGCATTTCCA
R
TTGTTCTTATAACACTGGCATTAATTCAAGGAATCCATAAAAGGAGAAAGGTTGGTCTTTTCATTTTGGATTTTTTTCACCAATAAGACAAACTTAGCTC
Celera SNP ID: hCV2520851
公開SNP ID: rs10919132
SNP染色体部位: 167546877
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 188484
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,55|A,61)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1358):
ACGGGGTTAGAGTTACTTACTTCATGATAGAAAGGGATAAGTAAATGTATAAGTCTTATTTTCACTAAATAACTTAGAAAATATCTGGTCAAACAGGTTG
K
ACTGCTTGTTAGATAGGTATATTTACCTATCTAGGTAAAAAATAAATAGGTATATTTGCCTATTATTTATAATAAGAAGAGCTAAATGTAAACATTTCCA
Celera SNP ID: hCV2520854
公開SNP ID: rs2300158
SNP染色体部位: 167544704
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 186311
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,58|G,62)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1359):
TTGGTCCTCTTTACTTCTCTATCTATACCTTCTCCTTGGTAATCTCAACCAGTCTCCCGGCTTTAAATACCATTTATGTGCTGATAACTCTAAGCTGTCA
Y
ACTAATTTTTTTCATCAGTCTAATTGGAAAACTAACAAACAGGTTAAGTTTATAAATGTCCAAAACGTTAACTCCTGATTGTCCATTCATTCTGACTCTA
Celera SNP ID: hCV2520874
公開SNP ID: rs1591733
SNP染色体部位: 167532460
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 174067
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,57|T,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1360):
CTTTGTTCATTTCTTTTTATTCTTTTTTCTCTAATCTGGTCTTCTCTTTTTATTTCATTAAGTTGATCTTCAGTCACTGACATCCTTTCTTCTACTTGAT
Y
GATTTGACTATTGATAGTTGTGTATTCTTCACAAAGTTCTTGTGCTATGCTTTTCAGCTCCATCAGGTCATTCATGTTCTTCTCTGCATTGGTTATTCTA
Celera SNP ID: hCV2986550
公開SNP ID: rs10919124
SNP染色体部位: 167520095
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 161702
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,57|C,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1361):
CTCACACCAGGAGTGTTGGGAGACCATCAGGTGATGGTCAGGTGGTTGTTAACTGTCTCTCTGAAGTAATAATTGGTCACAGCTGGCGCCAGGGAACGGC
R
GTCTCCTAGTAGATAGAAAACACCTAAAACTGGTGACGAGCGGCTTCTCAATAAGATCTCAGGAGTTGGGCAAGTGGTCAGAAGTAGTGCAAGACCCTGG
Celera SNP ID: hCV27242011
公開SNP ID: rs1200083
SNP染色体部位: 167403901
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 45508
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,55|A,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1362):
AAAGCTTTTAAGTAAACTTTCACTCCTGCTCTAAAACTTGCCTCAGTCTCTCCTTCTGCCTTATGCTTCCTCAGTTGAATTCTTTCTTCTGAAGAGGCAG
R
TACTGAGGTTGCTGCAGACCCATATGAATTTGCCATGGGTAACACTATCACACTGTATATTAGACTCCTTCCCCGCCTTTTTTGGAGGCAAAGTCTCGCT
Celera SNP ID: hCV8919256
公開SNP ID: rs1200085
SNP染色体部位: 167404216
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 45823
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,55|G,61)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1363):
AACTAGCCAATCCTGAACTTGTTAGCCCTTCCTCACCCATTCCTTCCCAAGGAAATCACAATAGAAGCTCTTGCCCATATTTCCCCCTATTCTTCTGTTT
Y
CTGACCCACCCTCATGTTTCCCTGTGTGGCCCTGCATGTGCAGTGTGCACTGTCCTCTTGGGGATTGTAGCTATCTTTTCAATGGCAATCATCTGATGCA
Celera SNP ID: hCV8919302
公開SNP ID: rs1208370
SNP染色体部位: 167436655
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 78262
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,55|T,59)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1364):
AAATAAAACAAAGATTCAGTAAATTCTGCTACATAGACAGAAAGGGGCAAGACCATGTAAAGTGTTGTCTGAGGAGTTTTAACTACTCAGGAGACATTGG
R
AGCCACAGAACAGTGTTAAGCAGGGGCATAATATGACTAGATTTACATTTTAAAAAGATTACTCAGGCAGCAGTGTGGTTACAGAATTGCAGTGAAGTAA
Celera SNP ID: hCV8919303
公開SNP ID: rs1018831
SNP染色体部位: 167437206
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 78813
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,57|A,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1365):
TGGTAATATATTGATTCTGAATAGTAATTTGTGTCTCAGTGTGACCAAATTGACCAGACCTGCTTAGAGACTTTGTTCTGTTAAGACAATAGAGGAACCC
M
GGGCTGAGACCTCAGGACTATGGCGAGGAGAGGAAGGAGCTAAACAATATAATCTATTTCTTTCACATTTTCAGTGGAGCTGGCCTTGACTTCACAGACA
Celera SNP ID: hCV8919327
公開SNP ID: rs1208377
SNP染色体部位: 167458484
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 100091
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,57|A,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1366):
GCTTCATCTTAAATGAGGTGTATGAGAAACATGCTAAACTATGGTTCCCTATCTCTGCTTCACAATATAAAGGTGATTCCAGAATTTGGAAGCCTCAACT
R
TAACAAACTAGATGAAGACAGAAGCTGATTAGATAAACTGCAGTGGTCAGGAAGCCTCACCAACAGAGCAAACAACCTCCATCTTCAGCTGCTTATTGAG
Celera SNP ID: hCV11341869
公開SNP ID: rs2176473
SNP染色体部位: 167598426
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 240033
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1367):
TCTTTCTATCCTCCAGTCCGTTATCCATAAGTGCTTAAAAGATATGGTAGTTAAGTGAATTAACTAGAACCCTCTCAAACATAGGGGTGAATTAAAATAA
Y
CTATAGGCTTATTTAAAATGCAAATACCGAGCTCCATTCCTTTCATTCAGAATTTCCAGGGGTGAAGCCCAAACAGTGAATTCCAGAAGCTCTCCAAGCA
Celera SNP ID: hCV11341876
公開SNP ID: rs1980198
SNP染色体部位: 167602883
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 244490
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,49|T,55)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1368):
TAGGGGTGAATTAAAATAACCTATAGGCTTATTTAAAATGCAAATACCGAGCTCCATTCCTTTCATTCAGAATTTCCAGGGGTGAAGCCCAAACAGTGAA
K
TCCAGAAGCTCTCCAAGCAATCCCAGGAGAAATTTCTGTTTAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAGAAAAGAAAAGAGAAAAGAAAAGCAAGCACAGACCTAGA
Celera SNP ID: hCV11341878
公開SNP ID: rs4656670
SNP染色体部位: 167602964
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 244571
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1369):
TTGCTGTAACAAAGTACCACAAACTGCATGGCTTGAACAACAAAATGTATTCTCTCAGTTCTGGAGGCTAGAAGTCCAAGATGAAAATGTCAACAAGGCT
R
TGCTCCTTCGGAAGGCATTAGAGACACTCTCCTAGCTTCCAGTGGCTTGCTGGCAGTCTTTGGTGCTCCTTGTCTTGTAGACGTACCACCCTTATCTCCG
Celera SNP ID: hCV11341882
公開SNP ID: rs12024897
SNP染色体部位: 167605892
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 247499
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,54|A,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1370):
TCCTGTTTCCAAATGAAGTCTCATTCTGAGGTAGTGGGGGGTTAGTACTTCAACAAATAAAGATTTGGGGGACACAATTCAACCCCTAAATTGCTAAATA
Y
AGTAGTCACTTTTTAGTCCTAGCTGATTTGTCCTCTCTAATATTTAATACTGTTGACCATTCCCTGCCTTTTGAGATACGTTCTTTTGATGACTTCCATG
Celera SNP ID: hCV11341886
公開SNP ID: rs7539415
SNP染色体部位: 167606236
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 247843
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1371):
ATTCCATGAGCAGATAAATTTGATAAATGCTGTATTAAAAGAGAGGCTATACTATGGGACCTCTCAGAGTCCTATAGTATAACTTTAATACTAATGTACA
Y
TGAAACTCTGTAGAGATGCAGTATGCAACATTGCCCACACTTATTTGACCAGGGATCTCTATCCATAGAGCCTGTGGTAAGAAGAATGCTTAGATTCCAC
Celera SNP ID: hCV11341887
公開SNP ID: rs3766095
SNP染色体部位: 167607874
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 249481
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1372):
TTAAACATGTATCTTTTGTTGACACATGATTGTTTTGAAAATTACTTTTTCTCTGATTTTTTTTTTGCATTCTTTTTAGTGCCAGTAATTTTGAATATAG
R
GTATAGCATGTATTAGCATTTTCTTGGCATTTCTTCTTGGTAAGTAGTTTCTGTTTTGTTTCCTTTTTGTTAGTCACCGTTACTTCATCCCCAATCCGAG
Celera SNP ID: hCV11341898
公開SNP ID: rs12563090
SNP染色体部位: 167612328
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 253935
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,51|A,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1373):
CCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGCACCTGGCCTTATCCATCTTTTTACACAGCATCCTGAAC
R
TTCTAGAAACAAAGGTTAATATTTGACCAGTGAGAATATTTGTTCTTTAAAGTCTAAATAAGTTGCATCAAAAAAATGCAAAGCCATCTTCTAATTAAAA
Celera SNP ID: hCV11975148
公開SNP ID: rs2037250
SNP染色体部位: 167539644
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 181251
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,57|A,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1374):
GTCTTTGCTGCTTAATTTTTCAGTAAGTAATAGTAAATTGTATTTTGGAGGGAAAATAAGAGAGAGATCAGCATCATATGTGTTAATTTAAAAATAAAGA
Y
AGCACATGAAGAAACAATAGGGTGACAAAGATATATCAGTAGTATCTCTGTTATCTGTAACTGCATAACAAACCATCCACATATGTAGTGGCGTAAAACA
Celera SNP ID: hCV11975152
公開SNP ID: rs1856303
SNP染色体部位: 167547862
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 189469
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,57|T,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1375):
TCAAGTGAAGCCCCCTGAAATACGGAGAATAAGAATCTTAGAGGTAAATCCGAGGACAAGCAGGTATAACTAAGGATGTTGGAAAGGGACGGAGGTCTGG
Y
TGGAGCTCGGTGGCCAGTAGCTTTGGATTTAGGGAAAGATTGTTCCGGGAAGACTTTTTCAGACAGGGATGAAACTTAGGTTTCGACTTCCCCGGACAGC
Celera SNP ID: hCV27242515
公開SNP ID: rs3818844
SNP染色体部位: 167604262
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 245869
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|T,65)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1376):
CCTTAGATAATACTTTTTCCTTTTTTTCCCCTCAGGCCCTCTTGGATAATATTTTTAATGGGTATAAATTTCATGGTTAATAACATTTCAGTCTCATTAA
R
TAAAAGTCTCTATTCAAACCTAGTTGATAGGTCCAAGCTATCAGAAAGTGAGGAAATATTTATTTATAAAATAAGTTAAAATTTAAAATAAACATTTAAT
Celera SNP ID: hCV27480801
公開SNP ID: rs3766057
SNP染色体部位: 167402053
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 43660
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,57|G,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1377):
ACTCTCCTTAACTGTGGCAAGAAGGGATGGAAACTCCCTTCTGAGAGACACTGGACTAAGCAGCCTATATAAGCTGCAGTGTTTGCTCGATTTCTAGAAA
Y
AGCAACTATATTCTTTCAATTTAACCCCCTATTAAGACAAATCAGGTTTTAAAAACCAACACAACCACAACAATAAAAATCAGGACATACTTATCAGACT
Celera SNP ID: hCV32141272
公開SNP ID: rs4264046
SNP染色体部位: 167569696
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 211303
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,57|C,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1378):
GAAGTCATGTAGCCAGAGGTCACAAGATTTGTAACTTCACCAATTGCTCCTTTAGATAACATCACTATTGTAAAACCTAAGATTGGTCTTGAGATATTTT
Y
CAGGCTTCTGCATTCTGGCAAACCTCCTGATGCCACCCAGATACATGCCTCATACCAAGAAACTGACTCTACTAGTCCTATGACTCTCACCTAGACAACT
Celera SNP ID: hCV30180981
公開SNP ID: rs7415756
SNP染色体部位: 167600906
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 242513
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1379):
TCTATCCCTGTTCCCATAAGAAAGTGCTCTCTCTCTCTACTTCTTCCATTTGCTTCTCCATGTCCGGCCATATTTAAGGGTTTCTGGTTATTTGTGGCCC
K
ACCTCTTTTTTCTCAGACCTGCAGACCCTCAAGTAGGGGATAGTGTACAAGTAAGGGATAGCGTATTGTTCTCCTGCTTTCACATGTTAAGCACATTGGA
Celera SNP ID: hCV30415180
公開SNP ID: rs7533257
SNP染色体部位: 167553784
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 195391
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,57|T,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1380):
ACAAAAATTTTAAAATCTATAAGAAGTTAAAAAAATAAAATATTTATTTACAGTTTCCTTCTTGGATTTTGGCCTAGAAATAACTTTCTTAACCCTAAAC
Y
GGACCCATTTTCACTTATATTTTCTCAGAATTTTTCATTTCATATTTTATGTTAATTTAAAAGATGAGAGATCAAATATGGCTTTGTTTCATATTAGCTG
Celera SNP ID: hCV32141055
公開SNP ID: rs10800408
SNP染色体部位: 167403457
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 45064
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,62)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1381):
CTCCCAAGTTCCATAAGTCTCAGTATTCCTGGCTCCTTCCTGCCTCTCAGATCTCTTCTCCTCCAGCTGTCCTCTCATTCCCTAGGCCCCAGCCACACTA
K
CTCCCTCCTGTTCCTCTAATGCACCTCTGTGCTCACTATTGACTCTGCCTGGAATGCTCTTCTCCTAGGTTTCACCTGGCAAGCTGCTTTCTATCATTGA
Celera SNP ID: hCV32141293
公開SNP ID: rs10800438
SNP染色体部位: 167596456
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 238063
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1382):
GACTCAAGCTCCAAAGAATCTTACCAATGTGTAAAGAGCCACCTCAAATACCACTTTCCACTAGGAGGCATTTCCTGATGCCTCCTTCCGGCAACCTTTG
Y
TCCCCCAAAGTTATGGTTATTTGGGTACTTATCTTCCATCAAATCATAAATTTGAAAAAGAGGGAACTAAGTTGTATAGCTCTGTAGGACCCCTAGCACC
Celera SNP ID: hCV32141218
公開SNP ID: rs10800424
SNP染色体部位: 167524048
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 165655
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,57|C,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1383):
GCAAAGCCAGGATTCAAATCCAAGTGACTGTAGCTCCAAAAACCATGTACTTTTTCTATTATCTGTCTTTCCAAAGTAAAAAGCAGTGATAAATTGTTCT
R
TCTCTAGTTTAACAAATTATTTAACAATTAATTGACCAATTATTTTTGTCTCAACTTTCCTTTGATTTCTTTTCTCGCTCAATTTTTAAAAATAAAAATG
Celera SNP ID: hCV32141221
公開SNP ID: rs10800425
SNP染色体部位: 167525467
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 167074
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,54|A,60)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1384):
TATCCAGCCATAAAAAAATGTGATTCTGTCATTTGCAAAAACATAATGGAATTAAAGGTCATTATGTTAAGTGAAATAAGCCAGGCACAAAAACATTGCA
Y
GTTCTCCCTTACTTGTGAGATGTGAAAATCAAAACAATTGAACTCATGGAGATAGAGAGTAGAAGGCTGGGAAAGGTAGTAGGGGGTTGTGGAGTTGAGG
Celera SNP ID: hCV32141290
公開SNP ID: rs10800435
SNP染色体部位: 167590166
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 231773
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1385):
CTCTGACCTCAGCCTCTTCAATAGCTGGGACTACACACATATGCCACCGCACCTGACTCGACTCAACCCTCTTTGAGTAGGGAAGGAAGGCATCACAGAA
R
AGACACCTACACTGGGTCTGGAAGTGAATCCACCTTTGCAAAAATTATAACAGTGAGAGAAATCTAACCTAACTGACTCCATATTGCTTCTAACCTCACA
Celera SNP ID: hCV32141297
公開SNP ID: rs10800440
SNP染色体部位: 167600450
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 532
SNP部位ゲノム: 242057
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,52|G,66)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 130
遺伝子記号: OBSL1 - 23363
遺伝子名: obscurin様1
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 533):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1386):
CCTAACTGTGGTAGTGACCACGTGGTTCTCCTCGCTGTGTCTCGGGGAACCCCCAACAGGGAGCGGAAACAGGGAGAGCAGTCTCTGGCTCCTTCTCCGT
Y
TGCCAGCCCTGTCTGCCACCCTCCTGGCCATGGTGACCACCTTGACAGGGCCAAGAACAGCCCACCTCAGGCACCGAGCACCCGTGACCATGGTAGTTGG
Celera SNP ID: hCV2915511
公開SNP ID: rs627530
SNP染色体部位: 220184687
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 533
SNP部位ゲノム: 67871
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,1|T,39) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,24) 全体 (C,9|T,63)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,118)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 131
遺伝子記号: ODZ1 - 10178
遺伝子名: odz, odd Oz/ten-m ホモログ 1(Drosophila)
染色体: X
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 534):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1387):
AGAGATAATTGTAAAAGCAACAACAACAGCAACAGCAATCATGGCTGTATGCTTATTTGAACAAGACTAGAAATGAGAGCAGAAATTTGAAAAGTTAAAG
Y
ATTTGAATGACCACCAGATGGCAGTGTGGGGCCACCTGGAAGCTGAAGCCAAAGTCGTCGTTCTGTCTCTCTAGGCAGCCTCTGAAAGTGTCAGCCCCAA
Celera SNP ID: hCV16177220
公開SNP ID: rs2266911
SNP染色体部位: 123350281
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 534
SNP部位ゲノム: 18269
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,72|T,18)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 132
遺伝子記号: OR1J1 - 347168
遺伝子名: 嗅覚レセプター,ファミリー 1, サブファミリーJ, メンバー1
染色体: 9
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 535):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1388):
GTGAGGAAGGTTAACGTTGCCCCCAGCATCCCCAGTCCAGCAAAGAGGCAGGACGAGTCCCACACGCAACATGGTGTGCAGTATGGACACCACCCAGCTC
R
AGGCTAGTAAGCAGGCACACCGTTGGTGATTCATTACCAAAGCATAGTGCAGGGGGTCACAGATGGCCACATAGCGATCCAGAGCCATGACAGCAATGAC
Celera SNP ID: hCV7584272
公開SNP ID: rs1536929
SNP染色体部位: 124431190
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 535
SNP部位ゲノム: 162132
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,25|G,95)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン

遺伝子番号: 133
遺伝子記号: PHACTR3 - 116154
遺伝子名: ホスファターゼおよびアクチン調節因子 3
染色体: 20
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 536):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1389):
ATTCCAGAACCTTTCATCACCTACAAGGAAATTGTGTGATACTCCTCATTCTCCCCTCCTCCAAGCCCCTGATAACTACGCATCTACTTTCTGTCTGTAT
R
AATTGGTCTGTGCTGAACATTTCATGTAAATGGAATCATACGCTGTACGGACGCTATATGGACTTTTGTGGCCGGCTGTCCCCATGCAGCATCATGTTAT
Celera SNP ID: hCV30500334
公開SNP ID: rs6128674
SNP染色体部位: 57735586
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 536
SNP部位ゲノム: 132588
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,58|A,62)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 134
遺伝子記号: PLEKHA4 - 57664
遺伝子名: pleckstrin homology domain containing,ファミリー A (ホスホイノシチド結合特異的) メンバー4
染色体: 19
OMIM番号: 607769
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 537):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1390):
AGAAGCTGCCCCAGGGCCGCAATCCTCAGCCCCAGCCCAGAGGCCCCAGCTCAAGTCCTGGTGGTGCCAACCCAGTGATGAAGAGGAGGGTGAGGTCAAG
S
CTTTGGGGGCAGCTGAGAAGGATGGAGAAGCTGAGTGTCCTCCCTGCATCCCCCCACCAAGTGCCTTCCTGAAGGCCTGGGTGTATTGGCCAGGAGAGGA
Celera SNP ID: hCV3170967
公開SNP ID: rs556052
SNP染色体部位: 54069248
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 537
SNP部位ゲノム: 47081
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,10|G,26) アフリカ系アメリカ人 (C,29|G,9) 全体 (C,39|G,35)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,81|G,35)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 135
遺伝子記号: PLRG1 - 5356
遺伝子名: 多機能調節因子 1 (PRL1 ホモログ, Arabidopsis)
染色体: 4
OMIM番号: 605961
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 538):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1391):
TGGCTTCCTGTAATGGAAACACATATATCCCTCAAAACATAGACCAGGAAAAATAATGCAAAAGTTAAATAAAATACAAAGCATTCTTCCAAAACACATA
Y
GTTCTAAATGAAAGTCATATCACACGCAAATTAGTCTTGGCTAATTTCTTCATAGTTCCAAATTTTTAGGTTGATTTTAATTCTTTAAAAAAATGCAATA
Celera SNP ID: hCV2892905
公開SNP ID: rs12642770
SNP染色体部位: 155679909
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 45038
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,12|T,28) アフリカ系アメリカ人 (C,6|T,28) 全体 (C,18|T,56)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,91|C,29)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1392):
AAAGACAAGGCACATGGACAGGCAGTTCACAGAAAGACCACTGACATTGTGGCTGATATGTAAATTGAAAAGATTCTCAGTGTGCTCATGATGAAAGAAA
W
TTTAATCACAATAACAATAAGATAACATATTTCACCTAATAGGTTGGCAAAAAATTTTAAAATTTGACAACAACAAGTGATGACAAGGATGAGGGACAAC
Celera SNP ID: hCV2892893
公開SNP ID: rs12648258
SNP染色体部位: 155696822
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 61951
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,91|A,27)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1393):
AAACAAACTTTCTGAAAGTCCCACACAACATTTCTGATTAAATCTCACTGGCTAGGACTTGCCTTCATAGCCACACATAACTGAATAAAAGTCTGAGAAA
W
GTAGCATTTTATGTGGATGCATCCCCTACACCTTCCCCACTGACCCCTGCCAAAAAATAAAAATAAAATAAAATAAAGTGAAAGAGGAGAATGCTTATTG
Celera SNP ID: hCV2892918
公開SNP ID: rs12511469
SNP染色体部位: 155671209
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 36338
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,86|A,26)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1394):
CTCAAATCCAAGTCTCTCTTAAAAGATGTTGAACAGAAAGTACTTAAAGGAATATCTTACATTTTTCATCCATAGTTCAAGTTAAATGATAGGGTAATAC
Y
AACACATTAGCTGTCCTTTATACATATTAATCAATAATGCAGTTTTATTATCAATAATTGATTTAAGTCTCAGTAGTGGACAATTTTAAAACAGTCTAAA
Celera SNP ID: hCV2892926
公開SNP ID: rs7662567
SNP染色体部位: 155668598
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 33727
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,90|C,26)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1395):
GTTAATGAGTGTAGACCTCAGAGATTTAAAATGAACTATCTGCAAATCTGTGACATTACACTAGAATAAATGTTTTATTACCCCCTCAAATCCAAGTCTC
W
CTTAAAAGATGTTGAACAGAAAGTACTTAAAGGAATATCTTACATTTTTCATCCATAGTTCAAGTTAAATGATAGGGTAATACTAACACATTAGCTGTCC
Celera SNP ID: hCV2892927
公開SNP ID: rs13123551
SNP染色体部位: 155668514
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 33643
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,52|A,62)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1396):
GGCTTCGCCAAGGTCTCCCCGGCCCCCAGCAAACTACCTGCTATGAAGTAGATGCTCTGTAAATAGTTGTTAAGCACAAATTGCCTTGTGCTATGGAGAC
Y
GGGCCTGACATGAGTTGTAAAAGTATCAACAAGTGTATTGACAATGGGTATCGGCAAGTCTTTGCCCTTCAAGCCAGAGAGCTGCTGGGCAGGACAGATT
Celera SNP ID: hCV7429793
公開SNP ID: rs1025154
SNP染色体部位: 155700813
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 65942
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,28|C,92)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1397):
CCAATCTTAGGTTCTACAAACAGTGCTGTTATCTATAGGAGGAATTGGAGAAGTTACAAACCTTGTGACCTCTAGAACAATGGTCAGTTATTAATTACAC
Y
TATGTCTTCTCAGAATTCAGGCCCCTATCTCATGGTCCTAACCTTGTGGCTTTTCTTTAGTTTTACAAAGGCAGTTTAGTATTCGGAAGGATTATTATCA
Celera SNP ID: hCV27937396
公開SNP ID: rs4634201
SNP染色体部位: 155654871
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 20000
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,95|C,25)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1398):
CACATTTTGATTGGTCCACACAATCAAACCAGAAGAATGTTCCAGTTTATTGAATTTGTCTCCTTATTTAAGAAAAAGAAAATTAAGCCAGGAGAAGTTA
R
CGCTCCATCCACCAGCTGGGTCTTTGATGAAGGGAAGTGAAATGAGGATTCTGCACAGGTGGGCGGTAGCTGGTGGAGTGAGCGCCCTGCAGGTGCAAGT
Celera SNP ID: hCV29983641
公開SNP ID: rs10008078
SNP染色体部位: 155668003
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 33132
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,85|A,21)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1399):
TGTTAATGCCTGGAAAGACTTTGGGAATAATTAGATTGTACTATCAGTTATAAACTGTCAGTTATAAATATCTTAGCAAGGTGTATGTGTGTGTGTGAGA
R
AGAGAGAGAGAGTCCTCGGGTCTTACTTATCACAATTTCACCATCCTCTACTACATGAAGCCCCATCTCATGTGTATTAGTTTGCTAGGGCTGATGTAAC
Celera SNP ID: hCV30711231
公開SNP ID: rs12642469
SNP染色体部位: 155693672
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 58801
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,93|A,27)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1400):
GTGGGGTATGGAATGTGGGCATCCCTAGGTTCCTGGAAGCAGCTCTTATGCTACTCATAGAGATGGGACTGATTTTATTTTTTATAGCGCTTAATTCACC
R
TTATGGGAAATGCTTCCAATCACAAAAATTCAGCCCAGCTCGTTTTGAGGAAGAGGCAGGACATGTTATAGTTTTATACAACTCATTTCCATTAAACTGA
Celera SNP ID: hCV32212664
公開SNP ID: rs12642646
SNP染色体部位: 155665902
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 31031
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,56|A,52)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1401):
CATTCTGACCCCAGTGAAAGTGGACTCTGGTACTTTCATTTAGTCACAGGCTCGCTCAGGGAGTCTTGTTTCTTATTCCTCACTAATAGTCCCAGTCATA
Y
AAGCACTTGAGATTATTTTGGCTCCATCCTACTTCCCTGTAGCTACTATGGCCTCCCACTCTCTCATGGACATTCATCGTATTTTGCTCTTGCAACATTC
Celera SNP ID: hCV2892923
公開SNP ID: rs13435192
SNP染色体部位: 155669608
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 34737
関連した照会SNP: hCV2892855 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV2892927 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,51|T,55)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1402):
ACGTTTTGCATATAGTTACACAGGTTTCCCAACTGAAATAACTAAGAGAAATAAAAACAGAGAAAAACCTGCCTCTGTGCTGGAAGGAGGGAAGGGTGAC
M
TGTCAATAAGTGTTTGTTGAATGAGTGAATGAATCATGCAAAATTCTAATATCTTATTAAAATAGGAGATAACCTGCCATAGCTAGGACCCAGAAATAAA
Celera SNP ID: hCV2892924
公開SNP ID: rs13435101
SNP染色体部位: 155669282
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 34411
関連した照会SNP: hCV2892855 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,52|A,52)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1403):
AAATGAACTGGCAAAATCTGTAATGTTACAAAGTAATAAAATGTAAAACTAAAACTATGGCACATCTGAAAATCAAGAATGACTTGTTTGGCCCACATTA
Y
AATTCCTGTATACTAGAATAATAATATATGTTATGTCATAATTTTTCATAAATGATTTTTCAAAATTCAGCAATAATTTTAAATAAATGTGTGCATATAT
Celera SNP ID: hCV2892925
公開SNP ID: rs7689945
SNP染色体部位: 155669079
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 538
SNP部位ゲノム: 34208
関連した照会SNP: hCV2892855 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV2892927 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,55|T,65)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 136
遺伝子記号: POLE - 5426
遺伝子名: ポリメラーゼ (DNA志向), ε
染色体: 12
OMIM番号: 174762
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 539):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1404):
AGGACCCTGCATAGATTTCTAGGCACTGGAGCGTCCTCTGGAACGCCCTGTGAGACGGAAGGTGGCACGCACCTGCTCCTTGAGGCTGTTCACCTTCTCC
Y
TCTCCTTCTCTAGTGAGGCCTGCAGGGCCTGGACAAGATGCTTCATCTGGCGATCCTCCTCTTCTTTGCGCTGCAAAACTGCCTGCACCTAGATCAGATT
Celera SNP ID: hCV1859855
公開SNP ID: rs2291260
SNP染色体部位: 131867485
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 539
SNP部位ゲノム: 167064
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,89|C,31)
SNP型: ミスセンス変異;ESE SYNONYMOUS;イントロン

遺伝子番号: 137
遺伝子記号: POPDC2 - 64091
遺伝子名: popeyeドメイン含有2
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 540):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1405):
ATATTTTTCCTTTGAAGCTATTCTCAGAAAAATGTGATCTAACAGTCTAAGAAATACCGATTTAGGTTAAGTTTATCTTATAGCAATGCAGACAGTTGTG
Y
TGGATTTCACCCTCCAGCCAATGGCCTGTTTACTGGGTTATATGCAACTGTACATTTCCGCAACAAGTCTTTCTAATTAGCATTCATAATGAGGTTTTAA
Celera SNP ID: hCV114165
公開SNP ID: rs6807079
SNP染色体部位: 120873108
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 39512
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,63|C,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1406):
TTCAGGTAAGGTATAAAAAATGTATAATAGATTTATTCCCAATCTACTGCACTTGAGGTACAATTAAGATCTACTTAGGAATAACATTAAAATCTACAAA
S
GTTTTTGAATTAAGGAACTTTCATGATCGTTGCCAGAGAGATCTAAGTTTGCAAAATATTTTTCCTTTGAAGCTATTCTCAGAAAAATGTGATCTAACAG
Celera SNP ID: hCV114166
公開SNP ID: rs6794579
SNP染色体部位: 120872952
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 39356
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,60|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1407):
CTATCATAGCCCTTACCACGTCGTATACAAGTCACTGGTTTATGTCTCCATTAACTTTAAGCTCCTTTATATCAAGATGCATCTTTATCCATGTCTACAT
S
TTCGGACCTAACGCAGTGCTTAACCCATAACAGATACTCAACACACATTTGTAGGAAGGAATGAGTGGTTGAAGCTTGCCGTTCTCCTCTCTCTCCATCG
Celera SNP ID: hCV965662
公開SNP ID: rs523476
SNP染色体部位: 120878352
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 44756
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,64|G,56)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1408):
GCAGCATATGTCAGCTCCTTAGGCGAGGATTTCGGCCACCCAGGCAAGCCACCAAAGAGTGACAACCGTAGAGTGTAGATAATGTCTAATGATCTTCGTG
S
CTCGCTGAAGCCATTTAAATCGGAATGCTGTGCCCTTTATCATCTGTTTCTTCTTCCTTCTTGATCTACTGGAAGATGGATGATCTTCTCCTAAATGAAT
Celera SNP ID: hCV965695
公開SNP ID: rs552244
SNP染色体部位: 120859272
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 25676
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1409):
AAAGTTTGAAGACTACCAGATATCAAAACTTACTGTAAAGCTACAATAATTACAACCAGATGGTACTGCCAAAGGGTAGAAAAATAGAACCATCAGACAA
Y
AGAAAATTCAGAAACAGACCTACATCTATAGGAAAATTTGATTTGTCACAAAGGATAAGCTGAACACTAGTAGGGATAGGATAATCATTTCAATAGGGAG
Celera SNP ID: hCV965698
公開SNP ID: rs571352
SNP染色体部位: 120841735
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 8139
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,56|T,64)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1410):
CAAAGGGTATTGAGAAGCAGATAAAGATGAGAATGAACAAAGACCTGGGAAATCCAGTGTGGCAGTCTGTTCTCCAGTATCTGCTTTCTTCTCTTCCTTA
R
TGGTGCTAGATTTTAACTGGACACATGACTGCAGAGAAAAAAATCAACATTTCTCTACTTCCCTGGCTGCTAGGCATAGGCAAGTGATAAGTCCTGGCCA
Celera SNP ID: hCV1969071
公開SNP ID: rs7633444
SNP染色体部位: 120858739
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 25143
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1411):
CATTATTTCTGGAGGTTTATTGGCTAAACAAATATTTCTGGAGCATCTCTCATGTTTCTGGAGATCTGGGAATGCAGAGATGGGCACAATCTGGTCTTTG
Y
CTTTGAGGATTTCACAATTTAGTGGAAGTCACAGGCACATAAATAACTGGCTGCAAGTCAATGTGATAGGTGCTATTGTGGAACAGTAACAGAGGAGAGA
Celera SNP ID: hCV1969072
公開SNP ID: rs2670296
SNP染色体部位: 120858468
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 24872
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,56|T,64)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1412):
CCTTTTTATCAAGGCAAGTTCAGCACAAGCCTACAGCTTACACAACTGACGAGGGAGTTAGATCATGAACAAGGAAACCATGTACAAATGTTAAGGTTGC
R
TCTTTAAAAATAGTTAATAAAGTACACATACTTTTTAAGAACACACTCCCCTTCAAATTTACTTATTTTATAAAATAGTTCATTATGGGATTTCTTTAAA
Celera SNP ID: hCV9151800
公開SNP ID: rs6803814
SNP染色体部位: 120874113
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 40517
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,71|G,47)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1413):
AGAGAAACAGGGAAGACTGCTCTGTTGGAAAACAGAAACATGTTGCAGTTCTCCTAAGAGAAACAGAAACAGAAGATGGTGACTGGGTCCCTGACAGCTT
Y
CTGCTTTCCCTGATGGCTTTCTGATCTAGTCCCATATTAAAATCTAGTGGCATTTCTGACTTTGAATTCCATAAGACACCCCTGTGTCCTTATAAATTCT
Celera SNP ID: hCV11232111
公開SNP ID: rs17203235
SNP染色体部位: 120838101
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 4505
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,68|T,46)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1414):
AGTTGTTAAATGGAGTAATAATCATATTCAACCCATAGAGTTGTTATGAGAATCAATGAGGCAATATGATACGTAGTGCCTGCCACATGCTAGCCATTCA
R
TAAGTGAGAGCTACAAAGAAAGTGACCAAAGCCTGAGGGATTGGCAGAGATAAGAAGAGTAGGGGCCAGGCAGCCAGGAACCTGCATTGGAGCATGTATG
Celera SNP ID: hCV11232131
公開SNP ID: rs2698282
SNP染色体部位: 120854854
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 21258
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,63|G,57)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1415):
TTTTTGCAGTTCCAGGACATATTCAAGCAGAGTTTGGATAACCACCTGCCAAAGATCTGTATTGGGTGGGAAGTTGGTTCATACCTGTCTTAATTGTCCA
R
GATTCTATTCTTCACCTAGATTATCTCTGTAAATCATGAAGTGCTTACTAAAAGTATTATATCCAAATGAATATTCAAGTAAAAATATAAACAATAAAAT
Celera SNP ID: hCV11232160
公開SNP ID: rs1880041
SNP染色体部位: 120869889
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 36293
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1416):
ATAAGGATCCAACACCCAGTCCTCTTCCCAAAATATTATTACACTGAAAATGAAAAACATGGCAGTTTGAATTCTCAGAAGGGTCCTATATGGATTCAGA
Y
TGTTCTTCTTGTAACCAGGATTCAATAATAATCAAGTCATATACTTAACAGACCTCAACTGAATGTCTGCTATCCACAACTCTAAAGGTATGAGCTATTC
Celera SNP ID: hCV11232163
公開SNP ID: rs4327424
SNP染色体部位: 120873534
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 39938
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,64|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1417):
TGCTCCACAAGAGAGGCTATATAAAATGAGAACAAATCTTTTGTGGATTGACAATCTAGATGAACTATTCTTAATACTTTGTCCCCTGCGTCGTAGACTG
R
TTGATTTTCAACTTTTGGTTGTCTTAAAAGGGTTGAAGCGTAACTCTTCAGAACTGTAAGGAATACACTCTGTGTCCTACTGTCTCTAAATTTTGGGAGA
Celera SNP ID: hCV26920276
公開SNP ID: rs13062540
SNP染色体部位: 120878103
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 44507
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,56|G,64)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1418):
ACATATGCATAACTTATCTTCACTCTTGGACCACAAAGATCTATTTCAGAGACAAATTTGGAGTGGAATTTTCCTTAACATTATCCTCAATAGAGCCTAA
R
GTATAGAATACACTCATTTTCTCACTCATATCCTGAGACCTCAGTGGTCGTTTACCAGACGTTGGAATTCCTAAATGAATACCATTGCCTTAAAAATCAT
Celera SNP ID: hCV26920316
公開SNP ID: rs2692618
SNP染色体部位: 120836534
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 2938
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,55|G,63)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1419):
TATGGAGTCAGGGAATTAAGACCACTAGAAATGAATGCCTCAGATGAGTAATTAACTAATTGCCAGAATTATTCCAAATCAGTCATAAAATTCAAAATCA
R
CATTTTAAAATTCTAGGTTTGCCTAACTAAAAACATTAGTGAAATTATTCATGATATTATTTACTCTTTAAAAGTTTTTGAAGTAAAAACTCTCTCTGCG
Celera SNP ID: hCV27498971
公開SNP ID: rs3772134
SNP染色体部位: 120871356
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 37760
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1420):
GGTGCACCTCTGGGTAAGAACCACTGGGTGAATGTAGCCTACTTTCAGGTAAGGTATAAAAAATGTATAATAGATTTATTCCCAATCTACTGCACTTGAG
R
TACAATTAAGATCTACTTAGGAATAACATTAAAATCTACAAAGGTTTTTGAATTAAGGAACTTTCATGATCGTTGCCAGAGAGATCTAAGTTTGCAAAAT
Celera SNP ID: hCV29280454
公開SNP ID: rs6794484
SNP染色体部位: 120872909
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 39313
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|A,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1421):
ATATTTTAAGCATCCAACTGTTAAGTTGTTAAACTTAATATTGAGTATCACCACTATTCAGTACTAGTCCTTTAATTTCTTTCAACGACTTTAGTCTCCA
R
AATAGGTTCTTTAGGCTTCTTCTGTCTCCTAAAGGCAGGAAGATAGTAGCCATCTATTTCCTCATATTTCTAATGAGGTTCTAGGTTCTTCTAATTACTC
Celera SNP ID: hCV31747142
公開SNP ID: rs7613999
SNP染色体部位: 120872435
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 540
SNP部位ゲノム: 38839
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 138
遺伝子記号: PPA2 - 27068
遺伝子名: ピロホスファターゼ (無機) 2
染色体: 4
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 541):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1422):
GCAGGAGGGGAAAAGTGCTAATTACCATGACAAGAACATTGTATTACTTAAAAACAAGGCAGTGCTAATGCCTAATGGTGCTACAGTTTCTGCCTCTTCC
R
TGGAACACACACATGGTGAACTCCTGGAAAAAACACTGTCTCAATATTATCCAGATTGTGTTTCCATTGCGGTGCAGAAAACCACATCTCACATAAATGC
Celera SNP ID: hCV25767872
公開SNP ID: rs6843141
SNP染色体部位: 106375200
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 541
SNP部位ゲノム: 124483
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,1|G,37) アフリカ系アメリカ人 (A,10|G,24) 全体 (A,11|G,61)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,116|A,4)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;イントロン

遺伝子番号: 139
遺伝子記号: PPP2R5C - 5527
遺伝子名: プロテインホスファターゼ 2, 制御サブユニット B', γアイソフォーム
染色体: 14
OMIM番号: 601645
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 542):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1423):
GGAAGGTGGGCAGTGCAGGCTCTCATTACTCAACGTGTAGAGCACATTGAAGGCCTGTTCTCCAGGAGAAGAATTGACGAGTTAACGTGGACATGAAGTA
K
TTTCCCTTTTGTCCATGTCATTCCAGATTGTGATGGTCAAAACAAAGAAAGAAATTTGGCAGCTGGGAGGCCGGGCACAATGGCAGATGCCTGTAATCCC
Celera SNP ID: hCV926518
公開SNP ID: rs746781
SNP染色体部位: 101458228
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 542
SNP部位ゲノム: 122303
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|T,-)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 140
遺伝子記号: PROC - 5624
遺伝子名: プロテイン C (凝固因子 Va および VIIIaの不活性因子)
染色体: 2
OMIM番号: 176860
OMIM情報: プロテイン C 欠損に起因する血栓性素因 (3); 電撃性紫斑病,/新生児 (1)

ゲノム配列 (配列番号 543):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1424):
CAACGTTCCTCCCTCAGCCAGCCACTATGGGGCTAAAATGAGACCACATCTGTCAAGGGTTTTGCCCTCACCTCCCTCCCTGCTGGACGGCATCCTTGGT
R
GGCAGAGGTGGGCTTCGGGCAGAACAAGCCGTGCTGAGCTAGGACCAGGAGTGCTAGTGCCACTGTTTGTCTATGGAGAGGGAGGCCTCAGTGCTGAGGG
Celera SNP ID: hCV1841974
公開SNP ID: rs1799809
SNP染色体部位: 127892345
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 543
SNP部位ゲノム: 9858
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,14|G,12) アフリカ系アメリカ人 (A,1|G,17) 全体 (A,15|G,29)
SNP型: INTERGENIC;未知
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,15|G,15) アフリカ系アメリカ人 (A,4|G,26) 全体 (A,19|G,41)
SNP型: INTERGENIC;未知
SNP供給源: Applera;HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1425):
GTTTGTCTATGGAGAGGGAGGCCTCAGTGCTGAGGGCCAAGCAAATATTTGTGGTTATGGATTAACTCGAACTCCAGGCTGTCATGGCGGCAGGACGGCG
W
ACTTGCAGTATCTCCACGACCCGCCCCTGTGAGTCCCCCTCCAGGCAGGTCTATGAGGGGTGTGGAGGGAGGGCTGCCCCCGGGAGAAGAGAGCTAGGTG
Celera SNP ID: hCV1841975
公開SNP ID: rs1799810
SNP染色体部位: 127892510
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 543
SNP部位ゲノム: 10023
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,22|T,18) アフリカ系アメリカ人 (A,9|T,25) 全体 (A,31|T,43)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,73|T,39)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異

遺伝子番号: 141
遺伝子記号: PSORS1C1 - 170679
遺伝子名: 乾癬感受性 1 候補 1
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 544):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1426):
CCACTGGATTGGGAACTGGAGCTGCTGCTGAAGGAGCCGGTGCCTGGTGGGGAGCAGGGGCTCTGGGAAGCACTGCCGCAGGGATGGTAGGGTAAACCGG
M
GCTGCTGGAAATGCTAGAACTGCTGGGGACTCGAGAACTGGAGGGAGAGCAGGGTCCCTTGGAGCCCGTGGAGCCGCCTCCACAGAGCTGGACCCCACCA
Celera SNP ID: hCV8941510
公開SNP ID: rs1042127
SNP染色体部位: 31192149
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 544
SNP部位ゲノム: 11547
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,32|C,6) アフリカ系アメリカ人 (A,33|C,3) 全体 (A,65|C,9)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;転写因子結合部位;UTR5;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,102|C,18)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;転写因子結合部位;UTR5;イントロン

遺伝子番号: 142
遺伝子記号: PTPN22 - 26191
遺伝子名: タンパク質チロシンホスファターゼ, 非レセプター 型 22 (リンパ)
染色体: 1
OMIM番号: 600716
OMIM情報: {糖尿病, インスリン依存性, 罹患しやすい}, 222100/(3);
{関節リウマチ, 罹患しやすい}, 180300 (3); {全身性エリテマトーデス, 罹患しやすい}, 152700 (3)

ゲノム配列 (配列番号 545):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1427):
CTCAAAAACACTCTGCCTTTAGAAATTTCAGCATCTCAGCCCTTTACAGGTACTTATTAGGTCTCTGGACCTATTTCATCTTGTTCTACTCTTTTCCTCC
Y
CACTATGCTCTAGGTATACTGGTTTTCTTGCCATTACTTTAGCATGCCAAACTTATTTCCAAGTCAAGGCTTTTACACTTACTATTCCCCCTGATTAATA
Celera SNP ID: hCV1900162
公開SNP ID: rs11102685
SNP染色体部位: 114183156
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 545
SNP部位ゲノム: 35196
SNP供給源: Celera;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 143
遺伝子記号: PXDNL - 137902
遺伝子名: peroxidasin ホモログ (Drosophila)-様
染色体: 8
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 546):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1428):
TGCAAGAAACACAGAAATCAGAGTGACCATTATAAGGCCTGTTGGATCAGGCATGCCAACTGTCCTTCAAAACCCTCCAGTGCTCACTCAGAATAAAATG
Y
ACATCGCTCACAATGATACAAATCAAATCTGTTCCTCTGATCTACACAGTTCTGTGCTAACTGGGCCTGTCTCTCTGCTCCAGCCACATCAGCATTCAAG
Celera SNP ID: hCV3205858
公開SNP ID: rs2979122
SNP染色体部位: 52584503
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 546
SNP部位ゲノム: 199812
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,82|C,38)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 144
遺伝子記号: RABGAP1L - 9910
遺伝子名: RAB GTPase 活性化タンパク質 1-様
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 547):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1429):
TAAGCGATATTTCTTCAATATTTCCCTTCTTGGACTTCACATTGATGATAGTTTTTAGGTTGTAATAATTTAGAGTTTGGATGGTCTACATTTACCATCT
R
CAGTTGTTTACTCCCTCTTTTTTTAATGCACAAGTGATGAAAATGTTGTCATGTAATATCTAAACAATGATAAATACTTAGACTATATATAAAAATATAT
Celera SNP ID: hCV25932979
公開SNP ID: rs16846809
SNP染色体部位: 172486021
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 547
SNP部位ゲノム: 100764
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,39|G,1) アフリカ系アメリカ人 (A,33|G,3) 全体 (A,72|G,4)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,114|G,4)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1430):
TCCCTTTTGAAATACATTATATTGAACTGACTGAAAAAGGGAGAAAAACATGTTTCAGTGGTTGAAGAACATGGTAGATGAAGTAGTTCATTTTGAATGG
Y
TTTAGTTCCTTAACAAAAAAGTCAGTGGTGAAGTTGCATATTTTAGTATAATATTTAGGAGCTGCAGTTGGGGAATTTGAAATGGCTTTTGTGAATTATT
Celera SNP ID: hCV30205817
公開SNP ID: rs10489254
SNP染色体部位: 172464424
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 547
SNP部位ゲノム: 79167
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,115|T,5)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1431):
AAAATTGTTTTTAACAGTAACTGATAATATATGGTTTGACCACCACTTAATTAACCATTTCTTTTTTTTTTGTACATTTAGAATGTTTTCCTCCAGTTCA
S
ATATAGACAGTTAATAGGAAACAGTTATATTATTTAATGCTCAACTTTGTTCCTTAGCTGTGCCTTTAATTCTAAGAGTAGTTGCTAGCTAGGTATTTTA
Celera SNP ID: hDV70683382
公開SNP ID: rs16846815
SNP染色体部位: 172487165
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 547
SNP部位ゲノム: 101908
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,115|C,5)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 145
遺伝子記号: RAF1 - 5894
遺伝子名: v-raf-1 ネズミ白血病 ウイルス癌遺伝子 ホモログ 1
染色体: 3
OMIM番号: 164760
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 548):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1432):
CGTCTTCCAAGCTCCCTGTATGTGCTCCATTGATGCAGCTTAAACAATTCTTAAACCTGGTAAGAAACACAAATAATTGTAACTCTAGAACAAAAGTATT
Y
AACCCAAGAACACAATACATAAAGAGTAATTATGAAAATAGCACTATGTGGGTTTTTAATGATACCTCCTGCATTCATCAGCAAAGAAAAGTTTCTTTAA
Celera SNP ID: hCV25611352
公開SNP ID: rs3729926
SNP染色体部位: 12635291
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 548
SNP部位ゲノム: 45183
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|T,-)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

遺伝子番号: 146
遺伝子記号: RC3H1 - 149041
遺伝子名: リングフィンガーおよび CCCH-型 ジンクフィンガードメイン 1
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 549):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1433):
TAAGTCTTCCTTGGATACCATCTCACTGCTCCTTGCTCTTCTGAGGACAAGTATGGTTGAAAAATTCTTTGGTAATTCTGTTTAGTGTTTTGTCAAGTTC
S
AGAATTAAAGTTCATTGCGGGTGGAGGCAGTATTTTCTAACTCTTTGTCCTCTACCGGGCTGTGCATATGGGAAGTACTCAATACATTTCTTTAGTAAAT
Celera SNP ID: hDV70683212
公開SNP ID: rs16846593
SNP染色体部位: 172164840
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 549
SNP部位ゲノム: 2300
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,116|G,4)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 147
遺伝子記号: RGS7 - 6000
遺伝子名: G-タンパク質シグナル伝達の制御因子 7
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 550):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1434):
TTGGGAATAAAATGGGATCTCAAAATCAGATTCCATTTTGCACCCAACCACAACTGAGAAAACTGAGGCTCAAAAAAGTGAAGTCATTGACACAAGGTGT
Y
GACTATTAATTGCTGAGTCAGGATATGAAGCCCAGTTAGTCTGATTCCAAAACTTATATTCTTCCTGGTGGATCAGACAGAAGGAATGGGAAAATGCAAT
Celera SNP ID: hCV815038
公開SNP ID: rs390488
SNP染色体部位: 239135475
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 139981
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,45|C,75)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1435):
TGTCTGCAGTTTTCAAATGTTTATTAAGTGGCTTGGTATGCATTTCGTTGGGCTTATTTATCCTATTTGGGCTTCTCTCAGCTTCTTCAACTGAAGGTTT
R
TATCTTTGCTATGCTTGTGATGTTTTTAAGCCATTATTTCTTCAAGTACTTTTTTTTTTTAAGTTCAGCTTTTTATTGAACACATTATAAAAGAGGTTTC
Celera SNP ID: hCV916106
公開SNP ID: rs575226
SNP染色体部位: 239228271
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 232777
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,77|G,41)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1436):
TAAGCCATTATTTCTTCAAGTACTTTTTTTTTTTAAGTTCAGCTTTTTATTGAACACATTATAAAAGAGGTTTCGTCAAAAAGACCAAAGCCCATGTCAC
Y
ATCAGACTTCTCGGATTCTTCTTTCTTTGCTTCCACTTTCTTCTCCTCAGCTGGAGCAGCAGCAGCAGAGGCGGGCAGAAGCTCCTGCTGGTACAGATAG
Celera SNP ID: hCV916107
公開SNP ID: rs670659
SNP染色体部位: 239228398
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 232904
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,78|T,40)
SNP型: イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1437):
TCCTGTAGACACATTTACCAACCAAGTGAAACATGGCGTCTTGTCGGCCTTAACCGCTAGACTTGAGAGAATGGAATTTTCATGAAATAAGAGTGCCGAT
Y
CATAAAATACATGCCATTCGTTTTGATTTAAATTATAAACAATCTTATCCATGGTCTTCTTTTATTTTTATTTTTTAATTTTCCCTTCCATTCTTTGATT
Celera SNP ID: hCV1703855
公開SNP ID: rs261828
SNP染色体部位: 239137822
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 142328
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,46|T,74)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1438):
GGCCCCCCCGACTACCATCACCCAGGGATTTCAACTTACCCTCCGTTCTTTCTTGGGAATTACAGTAGTAAAATAAAGAAGGCTACTAACAGTAGTTTTG
Y
GAACATGAGAACAAAATCATCGTAGGAATTCTGAAGAAAGAAAAAAAGACTAAACTGCTAGACAAAAGAGGATAGTAAGACTTTATGTGGGTCACCCTTA
Celera SNP ID: hCV1703867
公開SNP ID: rs261861
SNP染色体部位: 239162199
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 166705
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,55|C,65)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1439):
TGTTGTTTGAAACAATTTGAAGAGCATACAGAAAAGATCTGTTTTTATTGACCTGTAATATACGAGTTGAAATACATAGGAAATTGCTCTAACAAAATGG
W
GTATCCAGAATGCAACAGGTAAATATAACATCAAATCCAAGGAAATACATTACTTTATTCCAAAAGACATTATGTAATGTACCTTTGGGTCAGTTGGGTC
Celera SNP ID: hCV1703892
公開SNP ID: rs3893179
SNP染色体部位: 239201987
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 206493
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,71|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1440):
AATTAAAACCTTGCATCTTCGTATACTGTTAATTCTAAACCATTTTAAGGCAATAATTACCAGAGGCAGGAACCACAGCTATGCCGAGTTCCTCTCTATC
R
ATAGAAGGGTGTGTTACATAGGTTGGCATATCACTGACCTTTTCTGCAGTCACTGTAATGCCAGCTTTTCATAACTATTGTTTTCTGTTTTCTCAGAATC
Celera SNP ID: hCV1703910
公開SNP ID: rs3911618
SNP染色体部位: 239211866
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 216372
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|A,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1441):
TATTTCCCTACCCTCTGGCAAGGTACAATGAAAACAAATTAGAGTTCTGTGGTAGAGCTCCTTGGCTGTTCCTTGAGCAGACATTTTCTCAAGATCATGG
S
GATTTAACTAGATTTTTAATCTTTGTTGTGTAAGTTCCAGAAATCATAAAAATATCTCTTCAGACGCAAAGCAGGCATTTTGTCTCTCTTCAAAGCCCAA
Celera SNP ID: hCV8856223
公開SNP ID: rs1382243
SNP染色体部位: 239221124
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 225630
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,62|C,48)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1442):
CCAGACCTCCTTAAACATGAATTCATGCCTAGGTCTCCAGCCTGCTGTCCTGCTCTATGAATTTCAGAAGTACCAGTTCTCAAAATTGTGTGAGCAAATT
Y
CTCAAAATCTCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATCGATCTATCATCTATTATCCATCTATCTATCATCTATCTATAT
Celera SNP ID: hCV8857351
公開SNP ID: rs2341021
SNP染色体部位: 239206639
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 211145
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,71|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1443):
ACTATGACTTCTTGCATATTATCATCAGAGTGTTAAATATATCTCAGAAACCTAGAATGTTTTTATATAGTGGTCTACTAGCACTGGAACGATAATAAAG
M
GGTCATTTTTATTGATCTCCTATGGACATGACAGCTTGCTCAGTGGACAATAAAATATATATTTTGTAGGTTTATAGGTTTGTAAGGGTCTTAATGGTTA
Celera SNP ID: hCV26887403
公開SNP ID: rs6682084
SNP染色体部位: 239201733
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 206239
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,62|A,52)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1444):
CAAGGATGAAGGGAAAAGGTCTTAGTTCAGTGTACAAAGGAATTTCTTAAAAAATTACAGACTTCTTTCAGGACTTTACGACTAATTAGGTATAAAGGTT
M
TAAGTAGGAGAGATTAAAAAAGAAGTCAAGGTTTCTAGCCCGGAAGCATAGATGAATAGAATGATGAAAATAAGAGCAGAAATGGGAGATTTAGCAACTG
Celera SNP ID: hCV26887434
公開SNP ID: rs12723522
SNP染色体部位: 239214362
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 218868
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,69|C,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1445):
GAGCAGCATTCCTTCCTTCTGGGTATGGGGCAGAGCTCTCTCTGGACTGGGGGTCTTAGGACCTACAGTCCAACAAGGCAGGTCAGATAACTTCTTTATG
R
CTACTTTTACGGCTGGCTTTGAGGAGAAGGGGTTCTGATTTCCATGACCCGCCTCGGGCCAGAGGGATTCTAGTCTCTGGGGAGAATGGAACAGGTCAGG
Celera SNP ID: hCV26887464
公開SNP ID: rs6669640
SNP染色体部位: 239234753
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 239259
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,72|G,48)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1446):
AATTGCTCTAACAAAATGGAGTATCCAGAATGCAACAGGTAAATATAACATCAAATCCAAGGAAATACATTACTTTATTCCAAAAGACATTATGTAATGT
R
CCTTTGGGTCAGTTGGGTCCATGCCTCTCTTATGGTTGCCCGCCATTTATGCAAAAGCAGAATCCAGGTCTGAAATAGTTGTTCAAAAAGGTGCAGGACA
Celera SNP ID: hCV27878067
公開SNP ID: rs4660016
SNP染色体部位: 239202068
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 206574
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,71|G,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1447):
TACATTACTTTATTCCAAAAGACATTATGTAATGTACCTTTGGGTCAGTTGGGTCCATGCCTCTCTTATGGTTGCCCGCCATTTATGCAAAAGCAGAATC
M
AGGTCTGAAATAGTTGTTCAAAAAGGTGCAGGACACGTATGTTTATTGCGGCATTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAAGCCAAATGTCCAACAAT
Celera SNP ID: hCV27956129
公開SNP ID: rs4659585
SNP染色体部位: 239202133
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 206639
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,71|A,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1448):
CATAGGATGATTTCACCCCAAACTCTAAAGGAATGGTATTATCAACATCCTCGGATAGCGAAGAGAATTCTCCACAGCATAATTTGCTTTTGACCACAAC
R
ATTTCAAAAAGTTAACAGGATGAAAACCACAGTATAAAAGAGGCTTGTGGAACTCCAGGGGTGCAATCGGTTAGCTCACGGTGCTTATAAAAGAGGCTTG
Celera SNP ID: hCV29269378
公開SNP ID: rs6657406
SNP染色体部位: 239172136
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 176642
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,115|A,3)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1449):
CTTCTACCATGTGAGGCCACAGCGAGAAGACAGCCATCCATGAACCAGAACGCAGACCCTCAGCAGACACAAAGGCCACCAGCACCTTGACCTTGGACTT
Y
CCAGTTTCCCAAACTGTGAGAAATAAATCTTTCTGTTGTTTGAGCCACTCAGTCTATTGCATTCTGTTATAGCACCCTGAATGAACATAGATAGGGTACC
Celera SNP ID: hCV31714450
公開SNP ID: rs6429232
SNP染色体部位: 239201193
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 205699
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,67|T,47)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1450):
GTTCTTTTTTGCTGGAACTGCAATATAGTGATAGAGGTGGGAAGTGAAGGCAGCCAGAAACTCAAACCTGAAAAAGCCTTTATCAACGGGAAAGATGGTC
K
GAAATAATGGCAGACATCCTGGGGGAAATACCCCCTACTTTGGCAATGAAAACTTCAACGTATGGCCTTCATGAAGACCTTTCAGTACATTCTAGGTTTG
Celera SNP ID: hCV30626715
公開SNP ID: rs6690744
SNP染色体部位: 239200183
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 550
SNP部位ゲノム: 204689
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,67|G,49)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 148
遺伝子記号: SELP - 6403
遺伝子名: セレクチン P (顆粒膜タンパク質 140kDa, 抗原 CD62)
染色体: 1
OMIM番号: 173610
OMIM情報: 血小板α/δ保存プール 欠損 (1); {アトピー,/罹患しやすい}, 147050 (3)

ゲノム配列 (配列番号 551):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1451):
GTCCAAGCCCCTCACTCTGTAGCCGGGCTGGCACTCAAATTTACAGCTGGAGCCATAGGCAAAAGCAGTGAGCGGATGAACACAGTCCATGGTTCCTTCA
Y
TGGGGGCTTCCAGGTGCTGACACTGCACAGCTGGAGAGAATAACCAAGGATAAAGAGAAAGATACTGAGAAAGGAGAAAAGCCACACAGAGAGCAATGGT
Celera SNP ID: hCV11975296
公開SNP ID: rs6131
SNP染色体部位: 167847509
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 551
SNP部位ゲノム: 32795
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,8|T,2) アフリカ系アメリカ人 (C,9|T,7) 全体 (C,17|T,9)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,96|T,24)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 149
遺伝子記号: SERPINA5 - 5104
遺伝子名: セルピンペプチダーゼインヒビター, クレードA (α-1 抗プロテイナーゼ, 抗トリプシン), メンバー5
染色体: 14
OMIM番号: 601841
OMIM情報: プロテイン C インヒビター 欠損 (2)

ゲノム配列 (配列番号 552):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1452):
GTCGAGGACCTCCATGTAGGTGCCACGGTGGCCCCCAGCAGCAGAAGGGACTTTACCTTTGACCTCTACAGGGCCTTGGCTTCCGCTGCCCCCAGCCAGA
R
CATCTTCTTCTCCCCTGTGAGCATCTCCATGAGCCTGGCCATGCTCTCCCTGGGGGCTGGGTCCAGCACAAAGATGCAGATCCTGGAGGGCCTGGGCCTC
Celera SNP ID: hCV9596963
公開SNP ID: rs6115
SNP染色体部位: 94123643
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 552
SNP部位ゲノム: 16079
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,23|G,11) アフリカ系アメリカ人 (A,17|G,5) 全体 (A,40|G,16)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,7|G,5) アフリカ系アメリカ人 (A,12|G,2) 全体 (A,19|G,7)
SNP型: ミスセンス変異
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,46|A,74)
SNP型: ミスセンス変異

遺伝子番号: 150
遺伝子記号: SIRT3 - 23410
遺伝子名: サーチュイン(sirtuin) (silent mating type information regulation 2 ホモログ) 3 (S. ce
revisiae)
染色体: 11
OMIM番号: 604481
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 553):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1453):
TGGACCAGAGGCAAATCATGAACAGAACGGGAGTCAAGAGAAGGGGTTTCTAAGATGGAGAAGTGGGGGCGGGTGTGGATCCAGTGGGATGTGGCTTCCC
S
AGGTTGCAACCCCAAGGAAGTCTCTGGAAGCAGCACCAGTCCTGATGGGGGAGCAGAAGAGCTGCCATCCTCAGTCAGGGTCCGAGTCAGGGTCCGAGGA
Celera SNP ID: hCV12098639
公開SNP ID: rs3216
SNP染色体部位: 204421
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 553
SNP部位ゲノム: 9390
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,98|G,16)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3

遺伝子番号: 151
遺伝子記号: SIRT6 - 51548
遺伝子名: サーチュイン(silent mating type information regulation 2 ホモログ) 6 (S. ce
revisiae)
染色体: 19
OMIM番号: 606211
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 554):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1454):
CTCATCGGCGAGTGCCAGGTCCCGGTCGGGCAGGGAGTCCTCCCAGTCTAGGATGGTGTCCCTCAGCTCTCCCCTGCAATGAGGAAGCTGAGGAGAGTCC
K
CAGGGGCCTCGCAGCCTCCCCTGGAGCCCAGGGCATGGGTGGGGGTGGCTCACCTGCAGGCTCGCAGCCCCCTTGCCTTAGCCACGGTGCAGAGCCGGCC
Celera SNP ID: hCV25602230
公開SNP ID: rs7246235
SNP染色体部位: 4126785
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 554
SNP部位ゲノム: 11679
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,1|T,35) アフリカ系アメリカ人 (G,4|T,12) 全体 (G,5|T,47)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;ESE SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,1|T,37) アフリカ系アメリカ人 (G,5|T,29) 全体 (G,6|T,66)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;ESE SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,119|G,1)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;ESE SYNONYMOUS;イントロン

遺伝子番号: 152
遺伝子記号: SPARC - 6678
遺伝子名: 分泌タンパク質, 酸性, システインリッチ (オステオネクチン)
染色体: 5
OMIM番号: 182120
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 555):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1455):
CCTCAGCTCTTTCCTTTCCTTCACCATTCTTTCTTATTTATAGCTTGTTTTCAGCAAGGAAAGCTGCTCTCATGAATAGCAAACCCCAGCCACACTGTTG
R
TTGACAAATCTCTACAGATGGATAAGGATTACAGCATGATGGTTATGCAACTCAAGATCCCCTAGCCCATCTTTTCTTGTTTTCTTTTCAACTGGGGGTG
Celera SNP ID: hCV2086329
公開SNP ID: rs4958487
SNP染色体部位: 151043867
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 555
SNP部位ゲノム: 32666
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,74|G,46)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 153
遺伝子記号: STAG2 - 10735
遺伝子名: 間質抗原 2
染色体: X
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 556):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1456):
AGAGATAATTGTAAAAGCAACAACAACAGCAACAGCAATCATGGCTGTATGCTTATTTGAACAAGACTAGAAATGAGAGCAGAAATTTGAAAAGTTAAAG
Y
ATTTGAATGACCACCAGATGGCAGTGTGGGGCCACCTGGAAGCTGAAGCCAAAGTCGTCGTTCTGTCTCTCTAGGCAGCCTCTGAAAGTGTCAGCCCCAA
Celera SNP ID: hCV16177220
公開SNP ID: rs2266911
SNP染色体部位: 123350281
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 556
SNP部位ゲノム: 437011
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,72|T,18)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 154
遺伝子記号: SUMF1 - 285362
遺伝子名: スルファターゼ改変因子 1
染色体: 3
OMIM番号: 607939
OMIM情報: 多種スルファターゼ欠損症, 272200 (3)

ゲノム配列 (配列番号 557):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1457):
AGAAGATGACCCATTTGACTCTAGGACTTCAGATGTAACTCTTATGGCAAAAGGAAAATCTTTGGGAATAACAGGATACAAAGCTTTCTCAGCAAGAGCA
Y
CAGGCCCAAGTTCTCTTCTATTTATACCGGTGACTTTGACAATTTCATTAGTTGCATAAGGAGGAAACTCATAGTGCAGCATGAAATTTTTATCTTTTAT
Celera SNP ID: hCV8827309
公開SNP ID: rs1110796
SNP染色体部位: 3999657
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 557
SNP部位ゲノム: 368173
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,33|T,5) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,0) 全体 (C,41|T,5)
SNP型: UTR5;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,14|C,104)
SNP型: UTR5;イントロン;偽遺伝子

遺伝子番号: 155
遺伝子記号: THBS2 - 7058
遺伝子名: トロンボスポンジン 2
染色体: 6
OMIM番号: 188061
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 558):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1458):
CCTGGCACGCAGAGTGCTGGAGCCAAGATAACTCTGCCTGTGCTGCAAATCACCCCTCAGGTAACAGGCACAGTGAGGGTCGTGGTGGGGGTGACAGTTG
K
AGCTGGAATGAGGGTTGGTCTTAGAACACCCTTCTCCCTGCATTGATGATCAAATGTCTCCTTGTTCTCCTTCCTCACAGGACGTGCACAAGGACCCGGA
Celera SNP ID: hCV470708
公開SNP ID: rs10945408
SNP染色体部位: 169386859
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 558
SNP部位ゲノム: 39059
SNP供給源: Celera;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (G,-|T,-)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;イントロン;偽遺伝子

遺伝子番号: 156
遺伝子記号: TIAM1 - 7074
遺伝子名: T-細胞リンパ腫 侵入および転移 1
染色体: 21
OMIM番号: 600687
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 559):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1459):
GAGGCAGAGATTGCAGTGAGCCAAGATCGCACTCCGGCCTGGGCCACAGAGCAAGACCCTATTTCGAAACAACAACAACAAAAGAAAGGTTATAAGCGCC
W
TGGCTATGACTAGTGTCAAATTGCTTGCCATTGTTTTAAGAAAGCCAGATACCTGGATTGGACTCTGGGGTGTTCTCCGAGGGACACCTTCGTCACACAA
Celera SNP ID: hCV3272537
公開SNP ID: rs497689
SNP染色体部位: 31746650
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 559
SNP部位ゲノム: 342298
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,47|T,73)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 157
遺伝子記号: TNFSF4 - 7292
遺伝子名: 腫瘍壊死因子 (リガンド) スーパーファミリー, メンバー4 (tax-転写活性糖蛋白 1, 34kDa)
染色体: 1
OMIM番号: 603594
OMIM情報: {心筋梗塞, 罹患しやすい}, 608446 (3)

ゲノム配列 (配列番号 560):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1460):
ACTTGTATTCCTCTGCAGGATTTACTGTCCTGCACATAATAGGAAAATAAAGCCATGTTACAGTCCCACAGCTATACGAGAACACCTCTCCCCCACAATG
Y
CAAGGTTAGTCCCTAGCAGAAAAAAAAGCGGCAACAAAGGAACGTTTAAAGGAGTTTAAACATGCAAAGTGCTTAGAACAGTGCCAGCCAAATAGTAAGT
Celera SNP ID: hCV27833944
公開SNP ID: rs6702339
SNP染色体部位: 171657831
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 560
SNP部位ゲノム: 248338
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,32) アフリカ系アメリカ人 (C,10|T,24) 全体 (C,12|T,56)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;TFBS SYNONYMOUS;IN
TRON
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,106|C,12)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;TFBS SYNONYMOUS;IN
TRON

コンテクスト (配列番号 1461):
GAGAGAAAGGACTCCAGCAGACTAACATTTGGGCCTCTAAGGAGATGGTTCAGCTGGTGCAGAAACATGTCACCCACTGCTGGGGTGAAGAAGAAACCTC
Y
GGGGGACATTCACTTGCTGGAACCACAGGAACAATTCACCACCACAAGGAATACTGCCGGGGCCAGGTATGTGCTGACCCATTCACTGTCATGTGGAGAA
Celera SNP ID: hCV30040828
公開SNP ID: rs6700269
SNP染色体部位: 171691245
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 560
SNP部位ゲノム: 281752
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,108|T,12)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 158
遺伝子記号: TP53INP2 - 58476
遺伝子名: 腫瘍タンパク質p53 誘発性核内タンパク質 2
染色体: 20
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 561):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1462):
TCAAGGCCTCGATATTCCCTTCCTTCAAGAGGGGCCAAACTTTCTGGGCTTTTGGTAATGGAGTCACTAGCTCCCTGTGGCTACATATGGGTTGGGATAC
R
TGAATTGTGCTGGGTGGACACTAGTTGGGGGTGGCCCCACCTTCTTAATCCCTGTAGATCTCCCACCCCCATCCCACCAGAGAAGCCAGCATCTTAAGCC
Celera SNP ID: hCV29372834
公開SNP ID: rs6060001
SNP染色体部位: 32758014
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 561
SNP部位ゲノム: 12205
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,61|G,59)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1463):
TCTGCAGTAGGGGGCCTCCCTCTTCATCTTCACCCAGGGAAGGATTGGTTAAGGGCTTACCTCGGTCTGGGTCCAACCCTCAGTGCTCATCCTTAAGGGC
Y
CCTGGGAACTGACAGCTCCCTCCCTTCATCATCACCTCCCACTGACCTGCTGTCTCACTGAGCCCAAGCAACCTGATCTTCCTCCTACCCCTGGATGCTG
Celera SNP ID: hCV29693120
公開SNP ID: rs6060003
SNP染色体部位: 32758606
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 561
SNP部位ゲノム: 12797
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,61|C,59)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1464):
ACCACTCTCAACTCTCAGCTTGTAGAGGTCCCTCTTGGGTCCTCCTCTTGTGGCCCTCTCCACACATAGCATTTGGTCCTTCATGGGAGCACCAGCTGCT
S
GAAAAAATGATTCTGTTAGGTAAAAATACTATACATTTTTGAAACATGCACCAATTATTTAGCTCTGTGATTGTGGGCAATTTCTTCAAGCAGCCTGAGC
Celera SNP ID: hCV29982073
公開SNP ID: rs6088580
SNP染色体部位: 32748714
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 561
SNP部位ゲノム: 2905
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,48|C,48)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 159
遺伝子記号: TRPC4AP - 26133
遺伝子名: 一過性レセプター電位カチオンチャネル, サブファミリーC, メンバー4 関連タンパク質
染色体: 20
OMIM番号: 608430
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 562):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1465):
CCTGAATGGGATAGGAAGGAAAAAGTATTAAGACAAATGTGCTTGAAAAATCTAGCAAAACCTCGTGCTCAGTACACACGATAATGATATTCAGGACAAG
Y
ATCAGTACTGTCAGTAAGGAGGGCCAGGGTCTGAAGAAAACATCCGTGTATCCCCTATGCCCAGCACACACAAACCCACTTTCTAACTTTGCTCATTAAT
Celera SNP ID: hCV1347930
公開SNP ID: rs3736802
SNP染色体部位: 33067703
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 23835
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.6)
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,16|T,16) アフリカ系アメリカ人 (C,17|T,21) 全体 (C,33|T,37)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,57|C,61)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1466):
AGTGAATGTGCCCAAAACGAGTGCATGATTCCTAGAAGCTCTCATGAATCCCATACTCGCCTCTATTTCTAGTAATGGAGGACAGGAATTTGCTGTGCAG
R
GGGCATTGGGGAACAACTGCTTCCACTTTTCCTTTTCCCTAGTACAAAACAAATGTAAGCTACTACTATTATTGGCAACTGTAACTTGTAGCTCACCAGT
Celera SNP ID: hCV1347963
公開SNP ID: rs13042358
SNP染色体部位: 33098140
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 54272
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|A,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1467):
ACTTAATACCTGTCCTCTCTTCCTGTCCTGAACCCCAGCACCCTAGCCTTAACCCCTGACCTTTCTACCACATAATCCTGACAGCTGACCTCTGACCATT
R
TCCCCAGGTGACTCCGCAGCTACCATCCCAACTCTCACCCTGACCCACTGCCCTGGGACTGGCCCAGCCCTGTCAGTTCTGACACCTGTTAAGCCCAGCA
Celera SNP ID: hCV3249293
公開SNP ID: rs6058154
SNP染色体部位: 33049495
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 5627
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,69|A,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1468):
ACACATACAAAAAGGATTATACTCCACGCATGATGGCTTATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGAGACGTCAAGGCAGGAGGACTACTTAAGCCCAAGAGTA
Y
GCAACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACCCTGTCTCTACAAAAATTAAAACCAAAAATTAGCCAAGCATGGTAGCATGCTCCTGTAGTCCCAGCTACTCA
Celera SNP ID: hCV11189240
公開SNP ID: rs2038504
SNP染色体部位: 33111848
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 67980
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,69|C,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1469):
AAACACAAATTACTAATATGTGGTACATAAGAGGAGTTATTATTACTGACTCCATGGACTTCGAAGGATGATAAAGGAGTATTATGAACCGTTTGCCCCA
R
TATTTGCCTAGCACTTTGGGAGGCTAAGGCGGGAGGATTGCTTCAGCTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGAGCAACATAGCGAGAGCTCGCCTCTACTAAA
Celera SNP ID: hCV16076405
公開SNP ID: rs2145557
SNP染色体部位: 33131221
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 87353
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,46|G,74)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1470):
ATCCCCTTACATACGGGGCTTAGTGGCTAGATCACTTAGGTTCCTATCCCAGCTCTGTAACTTGCAGCTCTGAAACTTTGGTTAAGTTACAAAAACCTTT
M
GAGTCTTTGCTTGTTTATCTGTAAAACGGAACTAATCTACCTCACAGGATTAGTCTGAGGACTAAATTTACCTTTTGAGCACCACTGTTTTCAATTGTTC
Celera SNP ID: hCV27486123
公開SNP ID: rs3803937
SNP染色体部位: 33096348
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 52480
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,42|A,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1471):
ACTGCGCCCGGCCTAAAATTGTTTTAATTAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAAGAAGGTACAGAATAGTGTAGCCGTGTATATGGTATATCACTCTATGTG
S
GGAGAAAATAAACTAAGGTGGAGGTGGTGGGGAATATTTACACACACACACACACACACACACACACACACAAAAAAAACAAAACATCTTAAGCAGGACA
Celera SNP ID: hCV30450323
公開SNP ID: rs6058166
SNP染色体部位: 33120371
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 76503
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,44|G,72)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1472):
GGACAAATAATCAAATCGAAAAAGGTGCAAAACAGAAAACTGGCAGAAAAGGAACTACTTATAAACACAAGAAAAAATATCCAATCTCAGTCATAGAAGA
R
TGAATTTTAAAAACTATGCAGAGAATTTATAAAGAACTCTTACAACACAATATTCAAAAGAGATATATCTCAACTAAGAAATTGAAAAAGGAGAGACAGA
Celera SNP ID: hCV29747445
公開SNP ID: rs6060199
SNP染色体部位: 33118434
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 74566
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,70|G,46)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1473):
AGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAATTACAGGAAAATAACTTCCAATTTATACTTCTATACCCAGTCAAACTAAATATATGTGTCAGAATAAGAC
R
TTTTCTGATCTGCAAGCTTTAAAAAAAAAAAAAAAGTTACCTCCCATGTACTCTTTCTTGGGAGGCTACCAGAGAGTGTGCCCCAGGAAAAAGGAAGACA
Celera SNP ID: hCV29729418
公開SNP ID: rs6142294
SNP染色体部位: 33135158
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 91290
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,68|G,46)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1474):
TAAATTAAAAAAAAAAAAAACTAAGAAAAGAAATATTTGAAAGATGAAGGTCCCCATTTTATCCTCACTATAGCTCCAGGCAGGGGGTCTCTACTTCAAC
Y
TCTGAAATAGCTCCCACACCTATATACAACCATCAGTTACCACAATAACCTGCCTTGCTTTTGTGGCTCCAGAATATTCCAGCAGCCTTGTATCTGGTGA
Celera SNP ID: hCV30180146
公開SNP ID: rs6060216
SNP染色体部位: 33141739
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 97871
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,46|C,74)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1475):
AAAAAGTTTGATAATGCTCTGTACTGGGAAAGGCTACAGACAACACGGTGGGGAAGATGAACAAGTAATTTCTTTGGAGGGTTAATTTGTCAACACTTAC
S
AATTTCCATTAATGGGGGACTAATTAAATTACAGTATGCCTGTATAATAGAATATTATATAATTACAAAAAGGAATCATATAATTCTATATATACTAGAG
Celera SNP ID: hCV30540259
公開SNP ID: rs6087664
SNP染色体部位: 33089877
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 46009
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,45|G,73)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1476):
AACATGGGAGACAGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATTGTGCCACTGCCCTCCAACCTGGGCGACAAGAGACTCCATCTCAAAAAAGGACATTTTAAGTAATA
Y
ACTGTAGCAACTCTGGATACTGATTCCCCCTCCTTCAGGGTTTGTTGTTGTTATTTGCTTATTTATTAGTTTAGTGACTTGGTTAGACTATTTTCGTAAA
Celera SNP ID: hCV30612241
公開SNP ID: rs6060168
SNP染色体部位: 33084678
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 40810
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,69|C,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1477):
ACTGATTTTCAAATGTTGAACCAAACTTGCATAAATCCATTTGGTCATGGTATACAATCCTTGTATGTTGCTATACTTGGTGTGCTAGTATTTTGTTGAA
K
ATTTTTGCACCTATAATCATAAGAGATACTGGTCTTGTGATGTCTTTATCTGGTTTTGGTATCATGATAATATGACCTCAAAGAGTAAGTTGGGAACTGT
Celera SNP ID: hCV30630342
公開SNP ID: rs6141526
SNP染色体部位: 33078916
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 35048
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,69|T,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1478):
AGTGTAAAACCTCTGTACATGAGCAAGCTAGGGCAAAGGTGATCAGAGCCATAGAATTCTTGGCCTCAAGTATGTGGGATAGAGCTTCCACACCGTGAGT
M
CAGTATGGAGCTGGGTGGAGGAAGGAAGCCTCTGACCTCTTTGCCATACTCACCGAGAACTTAGTCTCTTCAATTTGGAGCTGGAGGGAAGAAGAAAAGC
Celera SNP ID: hDV71833331
公開SNP ID: rs6142280
SNP染色体部位: 33085903
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 562
SNP部位ゲノム: 42035
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.7)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|C,42)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 160
遺伝子記号: TUBA4A - 7277
遺伝子名: チューブリン, α4a
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 563):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1479):
GCCCTCAATGTGGACCTGACAGAGTTCCAGACCAACCTGGTGTCCTACCTCACATCCACTTCCCCCTGGCCACCTATGCACCAGTCATCTCTGCAGAAAA
R
GTATACCACGAGCAGCTGTTGGTGGCAGAGATTACCAATGCCTGCTTTGAGCCTGCCAACCAGATGGTGAAGTGTGATCCCCGGCACGGCAAGTACATGG
Celera SNP ID: hCV26175114
公開SNP ID: rs3731892
SNP染色体部位: 219844595
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 563
SNP部位ゲノム: 31350
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,14|A,106)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 161
遺伝子記号: UNC5C - 8633
遺伝子名: unc-5 ホモログ C (C. elegans)
染色体: 4
OMIM番号: 603610
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 564):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1480):
TTTCCTTTTATCATTAAAGCTTATTTGTTTGAAATCTATACAAATACATGAGCTGAAACAAATAAAACTCAATCCACTTGAGATTTTGAAGACATCTGGT
R
GAGTTATTTTCTGAGTAATTAGACCAAGAGGTGGGACAATTCCCTGAAGTAAGCTACCCTATAATTGGATACCCAGTTATATCTGCAGTCATCAGCTTGC
Celera SNP ID: hCV11559107
公開SNP ID: rs2626053
SNP染色体部位: 96474111
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 564
SNP部位ゲノム: 175399
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,98|A,22)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 162
遺伝子記号: USP19 - 10869
遺伝子名: ユビキチン特異的ペプチダーゼ 19
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 565):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1481):
CATCTTGAGCCGCTTGGTCGACAGCCAGAGTGCCCCGGGGTCGGCAACAGCGTCTGGGTCAGGGCTGCGGCGCTTTCTTCCTGGCCCAGCTATCTTGGCA
R
CTCTTTGTGGCCAAATTCTCCAGCAAGGAACGGACAGCCTAATGGAAAGAAGCCAGTGATCACTGCCAAGACCCAACAACTTGCTCTTTAGCTACACCCA
Celera SNP ID: hCV25768636
公開SNP ID: rs4279134
SNP染色体部位: 49131680
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 565
SNP部位ゲノム: 20568
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,6|G,18) アフリカ系アメリカ人 (A,3|G,7) 全体 (A,9|G,25)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,50|G,70)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン

遺伝子番号: 163
遺伝子記号: XYLB - 9942
遺伝子名: キシルロキナーゼ ホモログ (H. インフルエンザ)
染色体: 3
OMIM番号: 604049
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 566):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1482):
GCCCTTTTCAGAGGTTGTGAAGTTAGCTCCAAATCCCAGACTAGCTGCTACCCCAAGCCCGGGAGCTTCTCAGGTGAGAGACCATCGGAATTTGTTTGTA
R
CATTTGCATTATGAAAGCCCGCTAGGGTTTTTTCCCCCACCAAAAGGTCACCTACATTGAACGTGATGTGCTCAACTAAAGGAGAAATTCTGCTTTATTG
Celera SNP ID: hCV15949414
公開SNP ID: rs2234628
SNP染色体部位: 38417508
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 566
SNP部位ゲノム: 64264
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,110|A,6)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 164
遺伝子記号: ZBTB41 - 360023
遺伝子名: ジンクフィンガーおよび BTBドメイン含有41
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 567):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1483):
GAACTCCTGGGCTCAAGCAAATCATCCACCTCGACTTCCCAAAGCGCTGGGATTACAGGGGTTTGTGAGCCATCGCACCAAGCATGAACAGGATATATTA
Y
ATCTTCAATACACCATGAACAGGATAAACAAGATAATATATCATTAGCAAGATACTATATCAAACCAGTCTGGGTTTATTCCAGAAATGAGGTTTAATAT
Celera SNP ID: hCV356522
公開SNP ID: rs10732295
SNP染色体部位: 195403268
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 567
SNP部位ゲノム: 23831
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,10|C,110)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 165
遺伝子記号: ZDHHC6 - 64429
遺伝子名: ジンクフィンガー, DHHC型含有6
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 568):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1484):
GGCTCTTCGGTGCAGGGACTTGTGAAGAAGGTTTTGATTCCTTTATTCAGAGGGCAGCAGGCACCACTATAATCTTCTATTACTTTATAGCGAACCTGTC
R
TCAGTGATCAGAAGAAACCTTTAAATATTCACCCATGATATCTGAGTTTTAAGTCTGAATTTCAAATTTTAAAGCAAGATCCAAAATATCCAGTGACAAG
Celera SNP ID: hCV1874482
公開SNP ID: rs2306158
SNP染色体部位: 114182275
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 568
SNP部位ゲノム: 12227
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,73|A,47)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1485):
CTAACTAGAGTCAGGGGGAACTCGGTATGGGTGTTTACTTATATGTGTATGATCAGGAAAGGTGTTTTTGGCACACCATCACACTGTCTTTTCCAGGGAA
S
TATCTTCTTGTAGTCTTTGTAAATTTCCTTTTTAGACTTTTTCTAACATATATATTTCTTTCTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTTGCTCTGTCACCTA
Celera SNP ID: hCV31261952
公開SNP ID: rs12414780
SNP染色体部位: 114181005
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 568
SNP部位ゲノム: 10957
関連した照会SNP: hCV1874482 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,69|G,45)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 166
遺伝子記号: hCG1790803
遺伝子名:
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 569):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1486):
AAACCTTTAGTGATTATTAGATAGTGGGCTTTGAGGAAGCAAAATGTCTAAGACCTAATGTATGCTGATTAAGGTATGCTGGTTGGAATTGAGGCTTATG
Y
AAGTCAGCTGATAAGCAGAATTCTGTCCTAAAACCATCTAACTATAGGCCTAATCAGACTCAAACCCAAAGCTTTCATTCCTTCCCTAGGACTGAGAGCA
Celera SNP ID: hCV31749285
公開SNP ID: rs8178591
SNP染色体部位: 95164179
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 569
SNP部位ゲノム: 99532
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,92|T,28)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 167
遺伝子記号: hCG1817226
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 570):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1487):
GTTCTCTGTCCTGGAGCAGTTCCGGCTCGCGCGCAGGCCCATGGCTGGAGTCCAAGAGGAGGGGCTGAGAGGGGTACGTGGAGGCCGGGACACCATCCAC
R
GGCCAGGACAGCATCCACAGGCCAAGGACTGCTGCCAGGGCGCCCTGCCAGGCTGAACCCCTGGCTCAGCCAAACGAGGTGCCCAGAGGTACCCAGCATG
Celera SNP ID: hCV1974951
公開SNP ID: rs2234161
SNP染色体部位: 2483213
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 4479
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,15|G,17) アフリカ系アメリカ人 (A,18|G,2) 全体 (A,33|G,19)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;ESE SYNONYMOUS;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|A,53)
SNP型: ミスセンス変異;UTR5;ESE SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1488):
TCTTCTCGTGTTTACATCTCTGTTCTAGCCCTGGGCCCTGCAAACCTTAGGGGAGGTGTGCCCAGTACACAAACACACGTGTGTGCACAAAGATAGGTCA
Y
TGTCAGGGCGTGGGGAGATCGCAGGACCTGCATCAGACCAGGGCTTATTCAGATGCTGGCTCTGGCACCGCCCAGCTGGGTCACTGTGGGTAAGTCACCA
Celera SNP ID: hCV1974936
公開SNP ID: rs4648648
SNP染色体部位: 2502312
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 23578
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,62|T,58)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1489):
ACCCTCTGGCCCGGGCTGGAGGTGGCGTAAGCGCGGCACGCGGCGCAGTGGTCCCCGTCCTGGACGATGCAGAAGTGGCCTGGGCTGCAGCCACACACGG
Y
GTTCTCTGTCCTGGAGCAGTTCCGGCTCGCGCGCAGGCCCATGGCTGGAGTCCAAGAGGAGGGGCTGAGAGGGGTACGTGGAGGCCGGGACACCATCCAC
Celera SNP ID: hCV15947925
公開SNP ID: rs2234163
SNP染色体部位: 2483112
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 4378
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,119|T,1)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;ESE SYNONYMOUS;サイレントな稀なコドン;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 1490):
TTCCTTCCTCTTATTCTGGGAAGCCCCATACGCATATATTAGATCTTTTAACTAATGCGTCTTGTTGAGTCGGAGTCACATAAGTCTCCTGTTCTCTGTT
R
TGCTTTTCTTTCCCACGGGTATTTCAGTGGCTGTTTGCACCGTTTCTGTTGCCCTGTCTCTGTCTCCCCTCCATGGTCCACCTGCCACGGGGTCCAGTCT
Celera SNP ID: hCV1974933
公開SNP ID: rs734999
SNP染色体部位: 2503076
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 24342
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|A,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1491):
GTGCTCGGGGGAGGGGACACCAGACCTTGAGGAAGTGAACCCAGGGCAGGGCTGGGCCGGGAGTGGCTGGGGTGGGGAGACCTGGGTTTGCCGGAGCCCG
M
GGTGGAGCAGGTGGAATGCGACCTCCTCAGAGCCTGTGACTATCAGGGAAGGAGCGGCCCAAGGAGGCCCGAGCAGTCTGCCAGGGGCAGGGCCCCTATG
Celera SNP ID: hCV1974940
公開SNP ID: rs4310388
SNP染色体部位: 2497275
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 18541
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,80|A,40)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1492):
ACACCATCTTTCTATTATTTGCTGTTTCATATTTCTGATTTCCCGTTGTCCTACCTTCTGTTTGATTATTTCTGTAGTATTTCATTTCATCCCCATGGTT
K
CCTTCTTAGTGATACATCTTTGTTTTCCTTATTTAGTGGTTATTGAAGGGTTTGTGACATCCATCTGCACTTATCACAGCCTATATTCAGGTTGTGTGAC
Celera SNP ID: hCV1974942
公開SNP ID: rs6671426
SNP染色体部位: 2494094
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 15360
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,67|T,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1493):
CCTGGGGACAAGTCCGCACGGCCCTTATCTTTGCGTCTTTGTACCCAAAGGTGGCCTCACCTGACCCCGGTGTCCAGGTCCCCTCTGTGTCCCTGGTTCC
Y
GGGCATTGATTAGGATTTGCTGTGCAGTGCATGCCTCTCTATTTACCCCTCTTGGGGTCTGTTGAGCTTTCTGCATTTGTGGGATCACAGTTTTCTTGTA
Celera SNP ID: hCV1974943
公開SNP ID: rs6672381
SNP染色体部位: 2492694
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 13960
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,62|C,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1494):
CCTCACCTGACCCCGGTGTCCAGGTCCCCTCTGTGTCCCTGGTTCCTGGGCATTGATTAGGATTTGCTGTGCAGTGCATGCCTCTCTATTTACCCCTCTT
R
GGGTCTGTTGAGCTTTCTGCATTTGTGGGATCACAGTTTTCTTGTAGTTTAGAAAACTTTCACTGCTTTTTCTTCAAATGATTTTCTGTTCCTGCCTCTT
Celera SNP ID: hCV1974944
公開SNP ID: rs6667605
SNP染色体部位: 2492640
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 13906
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,66|A,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1495):
TCTGCCCAGATGGGCAGGACGCCGAGCTTGCACTGTCAGTTCCAGGGCAGGGTCCCGCAGGCAGGTCCTCGCCCCACGTGCCCACCCAGACACCCACCCC
K
CAAACGGGTTTCCCATCTGTGCAAACCAGGCCATTCCAATGGCAGAGGCAGGTAGGGTGAGAGCCCCACTTCTTCAGGTACTGGTGGAGGTGGGGTACAA
Celera SNP ID: hCV1974949
公開SNP ID: rs2257763
SNP染色体部位: 2483520
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 4786
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,63|T,53)
SNP型: ナンセンス変異;ESE;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1496):
CAGGAAGGTCCTGGGAGGGCTTCGTTGATGGGAGAAACCAGCCTTCTGCCCAGATGGGCAGGACGCCGAGCTTGCACTGTCAGTTCCAGGGCAGGGTCCC
K
CAGGCAGGTCCTCGCCCCACGTGCCCACCCAGACACCCACCCCGCAAACGGGTTTCCCATCTGTGCAAACCAGGCCATTCCAATGGCAGAGGCAGGTAGG
Celera SNP ID: hCV1974950
公開SNP ID: rs2281852
SNP染色体部位: 2483476
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 4742
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,62|T,44)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1497):
TCTGCCGTGGCCTCGTTCCTGGGCTGGCTGATGGGCAGTCGGGGGCCCCTGATGGGGATAGTGGCTGGACAGGCAGGAGTGCCACATGAGCATGGAGAGT
R
TCCCCACCCCACCCACCTGGGTCCAGCCCCCTGCTGCACACTGATCTTATCACCTGTCACCAAGGTCAGGGCTGCCGGGGAGTTGGGTCACCTGCTCGAG
Celera SNP ID: hCV11448257
公開SNP ID: rs1886730
SNP染色体部位: 2485810
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 7076
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,67|G,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1498):
GCCATGCATGTGGAAGGTGGACTTTCAGCATGGGTGGGACCCTAGGGGGCTGTGGACCCCCGGCCCCTGGGACTCACAGGTGGGAGACAGGAGTTCCGAC
Y
GCCAGGGGGAGAGTCCTGGAGGATCCTGGGCTGTCGGCAGCCACCCAGCAGGGCCCGTCCTGGGAGTGGGGCTGGACTCTTCCTGCAGGAAAGGCTGGGC
Celera SNP ID: hDV68598166
公開SNP ID: rs10797432
SNP染色体部位: 2491198
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 12464
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,67|T,53)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1499):
CCATCCATAGCACAGCCTGTGTTCGATCTCCTTTCCAAGGCTGAGCACCTTCCACTGGACCTCTCGGCCACATTTTCCTTATTCTTGTACCTGTTGATGG
R
CTTTTGCGTGGCGTCTACATTCGAGCTCTTGTGGACACTGCGGCTGTGAACCTGGGTGTGCAAATATGTGCTCAAGTCCCTGTTTTCAGTCCTTTGGGAT
Celera SNP ID: hCV31475439
公開SNP ID: rs10797434
SNP染色体部位: 2501140
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 22406
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,66|A,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1500):
TGTCTCCCCTCCATGGTCCACCTGCCACGGGGTCCAGTCTGCCATCACCCGTCTCATGACACTGACCTGCAGCCCTGGGATGTCCATTTGGTTCTCTCGT
W
TAGGTTCCAATCAGCTGTGGAATTCTCCATCCAGAGATCCCGTTAGACGGCATTTCCTGTTTTTAGTAACACATGAATGAGTTATTTTAAAATACCTGTC
Celera SNP ID: hCV31475436
公開SNP ID: rs4486391
SNP染色体部位: 2502915
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 570
SNP部位ゲノム: 24181
関連した照会SNP: hCV27102978 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV27103182 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV16000557 (検出力=.51)
関連した照会SNP: hCV1974936 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|T,54)
SNP型: 偽遺伝子

遺伝子番号: 168
遺伝子記号: hCG27764
遺伝子名:
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 571):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1501):
GCCGCGGACAGAGGACTCACTTCTGCCACCTCCTTGGCTTTCTGTAGGGCAAGTTTCTGGTTCGCTGCTTCTTCTTCCTCTTGCTCGTCCTAAAAGGCAC
R
TGGAATCTTTGTTCACAAAACATGAACTAGGCCTTGGGGACTCACTTCTGACCCTGTTGCTGACCAGGGGCAACATTTGAAATATTTCGACCAATCAGAA
Celera SNP ID: hCV1455329
公開SNP ID: rs16018
SNP染色体部位: 13272482
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 571
SNP部位ゲノム: 126571
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,2|G,0) アフリカ系アメリカ人 (A,13|G,17) 全体 (A,15|G,17)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,34|A,86)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 169
遺伝子記号: hCG2038746
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 572):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1502):
TCTCAAAGGTTGACAGACTGACATGCAGAAAACAAAAAATAAAAAGAATGAAAAGCAAAGACGACCTAGACTAAAAGAAAATTTTTTTGTCTCTTCTAAC
R
GCAAGCAGAGACAAACATTAAATTGCAATATCGTACAATCATTCACCATCTGTAATTCACAATCTATAGTGACAATCTTGAGCTTCTAAAAAAGGTTGAT
Celera SNP ID: hCV2456730
公開SNP ID: rs961404
SNP染色体部位: 167672474
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 572
SNP部位ゲノム: 3973
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,54|A,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1503):
CCAAGAGAGGCAATGTAAAATTAAATTTTTAGATATTCTTCAAGTTATAGACTTAAGGTCTTTTAAAATGGAAGGTTAAAATGAATTGTAATATTGAGTG
Y
ACTTCCTAGATGTGGTGTAGTTGTAATGACCTAATGTTGCTACTGCTTCAGCGCTTGAAAAAAGACGCTCCCAAAAAAGGTTATTCACTGCTAAAGGTTG
Celera SNP ID: hCV2456741
公開SNP ID: rs6696810
SNP染色体部位: 167664108
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 572
SNP部位ゲノム: 4393
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1504):
ATATTTTTGACCCTCAGCTTCTTTTTTTCCTAATCAAAACCAAAACTTTACCCAAGAGAGTTGCCAAAGAAAATAGGATTTTTGCTCTAGCTTTGAGGCA
Y
GTCAAAATGGTCAACTAGAATTTTCTCAAATTCTGCTTATCTTTATGTATAAAGGCAAAGCAAGATGAATTTAGATTGTGGTGAAAGTTGAGATGATTTT
Celera SNP ID: hCV8697031
公開SNP ID: rs1400836
SNP染色体部位: 167663761
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 572
SNP部位ゲノム: 4740
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,50|C,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1505):
TGAAAGCAATAATGCAAAGCTAATACAGTTTGTGAACTAAGCTTGAGCCATTTTTAGGACAGTCTTTCACAGTCCTTTCACTTACTTTAGTCTCATAAAC
Y
CAGGTCTCTGAATTCCCAGCCCAGAAATTAGGACGTGATAATTTCAAAAAAGAAAAACAGTTGTGTTGTTAAAAGTAGGTACTCTGACACCAGAAAAAAA
Celera SNP ID: hCV8697038
公開SNP ID: rs961403
SNP染色体部位: 167671990
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 572
SNP部位ゲノム: 3489
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1506):
ACCCCTTTCCCTGGTTCCAGGCTAAACAATACCCAGGTAACAAGCATAAATAAATAACATCACAAAGAATTACACAATACCCAAGCTGGCGCAATTTAAA
R
AAAAAAAAAAGATGACATGAAAATTGTAGAGAAATTTTGTCAAGATAATGTGCTAATAGGGTAAGGAGTGAGTGAAAGGACAGAGGAGTCAAAGATAACT
Celera SNP ID: hCV27242694
公開SNP ID: rs6673326
SNP染色体部位: 167687597
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 572
SNP部位ゲノム: 19096
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|A,70)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1507):
GAAGAAAATTTAAATAAGTTGAGTGCCAGGAATTGAGAACATGTGACCATGCACATCTCCTATAAAACTGTTCAAAGTAACACACTTTATAAAAAATGTT
Y
AGATTCTACATAGATTCATGAAATTTTAAATCACTTAAAAATAGTTATTCAGAACATATGTGCAAAACACTGTTTTTATATATTTGGAATATATCAGCAA
Celera SNP ID: hCV29397241
公開SNP ID: rs4656183
SNP染色体部位: 167678060
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 572
SNP部位ゲノム: 9559
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,49|C,71)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1508):
AGATCAGATGAGCCAGTTTATTGATCTGAGTGGTGCCAGCTGATCCATCAAGTGCAGGGTCTGCAAAATGTCTCAGGTACTGATCTTAAGGGCAGTGTAT
Y
CTTAAATATTGTAGCCTCTAGCTGCATGATTCCTAAACCATAATTTCTAATCCTGTGGCTAATGTTAGTCCTACAAAGGCAGTCTAGCGCCCAGGCAAGA
Celera SNP ID: hCV30577322
公開SNP ID: rs7516248
SNP染色体部位: 167673157
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 572
SNP部位ゲノム: 4656
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1509):
GATCAGAGTCTGTAGTTTTTCTTTCTTATAATGTCTGTTTTTGGCATTAGGATAATGATGTCCTTATAGAATGAGTCAGGAAGTGTTCCCTTTGCTTCTA
Y
TTTCTAGAAGAGATTGTGGAGAATTGGTATCATTTCTTGCTTAAATATTTGGTACATTTCACCAGTGAAACAATCTGGGCTTAGTGCTTTCTTTCTTGGA
Celera SNP ID: hCV32141359
公開SNP ID: rs12022776
SNP染色体部位: 167681541
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 572
SNP部位ゲノム: 13040
関連した照会SNP: hCV2456747 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,64)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 170
遺伝子記号: hCG2039022
遺伝子名:
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 573):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1510):
TACTTTAAGCCTTCTACCTACAACATTACCTACAAGTACAGGTTTCCCTAAGCCCAACTCACAAGTTAAAGAGTTGAAACAAAATTCAGCTTTCATTAAT
S
ATGAGAAAAATGGAGCAGATGGGAAGCACTGTGAGAGTCATCAGTGTGCTAGAGCTTTCTGTCAGAGTATTTACTTGAGTAAACTTGGAAACGTTGAAAC
Celera SNP ID: hCV25596789
公開SNP ID: rs6510130
SNP染色体部位: 63464391
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 573
SNP部位ゲノム: 13940
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,36|G,2) アフリカ系アメリカ人 (C,29|G,5) 全体 (C,65|G,7)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,37|G,3) アフリカ系アメリカ人 (C,32|G,6) 全体 (C,69|G,9)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;イントロン
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,118|G,2)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 171
遺伝子記号: hCG2042173
遺伝子名:
染色体: 10
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 574):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1511):
GGCACCTTCTCTTGGGCCAAAACAAATAAGCTAGGGTAAGCAGCAAGAGAGCCACGAGCTCCCACATGGTGGCTGGGTGCCGGCAGGCAAGATAGACAGC
R
GTGGAGTAGAAGAGCTGTGGCAACTCTAGGGCACAAGGAGGCCTTTTAAAGGGCTACCCTGATCTTCACCTTGACTTTGTGTTATCTCTTGCCTTGTGGA
Celera SNP ID: hCV2852784
公開SNP ID: rs743572
SNP染色体部位: 104587142
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 2259
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,70|G,46)
SNP型: UTR5

コンテクスト (配列番号 1512):
TTTGAGGCCGCCCAGAGAAGTCCTTGCCCTTCTTAATAAGCACCTCCTTGGCCAGCTGGTGGTGGCCGACAATCACTGTAGTCTTGGTGCCCATACGAAC
M
GAATAGATGGGGCCATATTTTTTCTGCAGCTTGAAGAAGTTGTTATGCATATGGCCGTGTCTGGGGAGGAATGGCAGGCTGCCCACCAGGGGCAGGGACA
Celera SNP ID: hCV12119916
公開SNP ID: rs6163
SNP染色体部位: 104586914
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 2031
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,73|A,47)
SNP型: UTR5;サイレントな稀なコドン;サイレント変異;イントロン

コンテクスト (配列番号 1513):
GGTGGTGGCCGACAATCACTGTAGTCTTGGTGCCCATACGAACCGAATAGATGGGGCCATATTTTTTCTGCAGCTTGAAGAAGTTGTTATGCATATGGCC
R
TGTCTGGGGAGGAATGGCAGGCTGCCCACCAGGGGCAGGGACAGGAGGCTCTTGGGGTACTTGGCACCAGGGCACCTTCTCTTGGGCCAAAACAAATAAG
Celera SNP ID: hCV12119917
公開SNP ID: rs6162
SNP染色体部位: 104586971
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 2088
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,71|A,49)
SNP型: UTR5;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 1514):
GGGCTGGGCGCAGTGGCCCACGCCTATAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAATGCAGGTGGATCACATGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACTGACA
Y
GCCAAAACCCCATCTCTACTAAAAATACACAAATTAGCTGGTCATGGTGGCGTGCATCTGCAATCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCT
Celera SNP ID: hCV3284571
公開SNP ID: rs7097872
SNP染色体部位: 104596626
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 11743
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,69|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1515):
TGTAGAAAACTGCCCCTGTGAGCCTGAGTAGCTGGAAATAGCACCAGGAAAGCAGCAATCCCAGCCTGCAATAGCTAGGCTAATTCTCCCCAGCAGCTTT
Y
ATGGAGGACAGTAGTCACTGCCCCCATTTTCCATGAAAAGTAACATGAATCCTGGCTGTATAAGGGGCACTTACTGTGCTGGGTGCTAGGCTAAGTGCTG
Celera SNP ID: hCV3284577
公開SNP ID: rs10786712
SNP染色体部位: 104586386
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 1503
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,73|T,47)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1516):
GACAGACCCTAAGGCCTCCTACTCCCAATTCCTTCAGAAATACAGTAGATCAAGGAGAAAGAAAGAACCCTTAATTAGAATGCAGCAGCATTGGGGTTCT
K
TTCGCTGACAGGGTGCCCTCTGGGCTTCTTTTTGCTCATCAGTTTCTGACCACAGGAAGGCAACTCTGGATGGGATAAACTCTCTAAACTATGCCTGTCC
Celera SNP ID: hCV11201601
公開SNP ID: rs3781287
SNP染色体部位: 104585410
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 527
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,71|G,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1517):
CGATCCCATAGTTCCACGTCTAATGTTCCCTTTTCAGGAAACAAAGGACAATGTTCTTCCACTGCCCTGAATAGGGTGACCATATTTTCCATGGGTACCC
R
AACTCCCCCCTGTTTTAACAGGAGTTTAATATGGCAGAGATAAGCATAATGTTTAGACTCTGAGTGACCCAAAGTTAGCCTGGACAATACACAGACAACT
Celera SNP ID: hCV27433651
公開SNP ID: rs10883785
SNP染色体部位: 104593578
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 8695
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,73|G,47)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1518):
AATAAAAATGAACAGGCTAGTTATATGCACAACAACATGTCAAATCATCATGCTGCAAGAATGAAGCCAGACAAAAAAAGACCCCCCTCCCCTCAAAAAA
K
CCTGTATGATGCTATTTATTTGCCATTCTAGAAATGCAAATTAATCTATAGTTCCCAAAAGCAGGGCAGTGGTTGCCCGGGTGAGACAGAGAAGGAGAGA
Celera SNP ID: hCV31979198
公開SNP ID: rs4290163
SNP染色体部位: 104600916
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 16033
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,71|T,49)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1519):
ATTACCAGAAACTTTGTGGCTTAAAACAACACACATGTATTATCTTACAGTCTTGGTGGGTTAGGAACCTAAGTATAGCTTCTCTGGGCCATCTACTTAG
Y
GTCTCACAGGCTGCAGTAAAGGTGTGGGCCAGGGTTGGGTTCCATCTGGAGGCTCTACTGGGGAAGAATCTGCTTCCTATGTGCCTGGTTGTTAGCAGGA
Celera SNP ID: hCV31979199
公開SNP ID: rs7096475
SNP染色体部位: 104599666
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 574
SNP部位ゲノム: 14783
関連した照会SNP: hCV2852784 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,71|C,49)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 172
遺伝子記号: Chr1:38413504..38433504
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 575):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1520):
TTGCCTCAAGTCACAGGTGGAGGCAGAGCTGGGAGTGGAACACAGGTGAGAGTCTGGACTCCTTAGGCAGTGAAAACTGTGTGAAAGGTAATCTTTTTTC
R
GAGTGGAACGGGAGCTGGAAGAGGAGTGCTCAGTGGAGGGCTGCAGGGGTGAGCTGATGGAGGTGGAGGTGGGCAGAGAGAGAACAACACAGGCAGGAGG
Celera SNP ID: hDV70965621
公開SNP ID: rs17534243
SNP染色体部位: 38423504
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 575
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,101|G,19)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 173
遺伝子記号: Chr1:61491185..61511185
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 576):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1521):
CCAGAATCAAAGGAAATGAAAGAAGGACTTTCATCCCTTCTTTCACCTCATTCCCATGTAGCTCTGCTGTGTTGTTCCATCCATCCCCAACACTAACCTG
R
TAATTCGGAGACACCTTGCCGCATATTGTTTCACCTTTAATTCTTGAATAAACTCTGATTCTTACTTATAACTTTTCCCATGTTTGTTGCCAATAAAATT
Celera SNP ID: hCV11726971
公開SNP ID: rs2065841
SNP染色体部位: 61501185
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 576
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,85|G,35)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 174
遺伝子記号: Chr1:164857338..164877338
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 577):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1522):
AGTGAGGACAGCCACCCATCCTAACAGCTCTCTTGGATAAAGATGGCCCCAGTGAGCCTGGCATTTCTGGCTGCTGGCTTGGCATACTTTCGATATACTC
M
TTACGGTAAATGGAAATAAATGAAAGAACACTGAGGGGGAAAAGCATGGAATAGTTTCTACTCATCCTGATCGTTATATCTTTTAAAGTCAATAGCATAT
Celera SNP ID: hCV837462
公開SNP ID: rs528088
SNP染色体部位: 164867338
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 577
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,29|C,1) アフリカ系アメリカ人 (A,27|C,1) 全体 (A,56|C,2)
SNP型: イントロン
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|C,0) アフリカ系アメリカ人 (A,32|C,6) 全体 (A,70|C,6)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,9|A,111)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 175
遺伝子記号: Chr1:171647831..171667831
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 578):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1523):
ACTTGTATTCCTCTGCAGGATTTACTGTCCTGCACATAATAGGAAAATAAAGCCATGTTACAGTCCCACAGCTATACGAGAACACCTCTCCCCCACAATG
Y
CAAGGTTAGTCCCTAGCAGAAAAAAAAGCGGCAACAAAGGAACGTTTAAAGGAGTTTAAACATGCAAAGTGCTTAGAACAGTGCCAGCCAAATAGTAAGT
Celera SNP ID: hCV27833944
公開SNP ID: rs6702339
SNP染色体部位: 171657831
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 578
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,2|T,32) アフリカ系アメリカ人 (C,10|T,24) 全体 (C,12|T,56)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;TFBS SYNONYMOUS;IN
TRON
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,106|C,12)
SNP型: ミスセンス変異;転写因子結合部位;TFBS SYNONYMOUS;IN
TRON

遺伝子番号: 176
遺伝子記号: Chr1:171681245..171701245
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 579):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1524):
GAGAGAAAGGACTCCAGCAGACTAACATTTGGGCCTCTAAGGAGATGGTTCAGCTGGTGCAGAAACATGTCACCCACTGCTGGGGTGAAGAAGAAACCTC
Y
GGGGGACATTCACTTGCTGGAACCACAGGAACAATTCACCACCACAAGGAATACTGCCGGGGCCAGGTATGTGCTGACCCATTCACTGTCATGTGGAGAA
Celera SNP ID: hCV30040828
公開SNP ID: rs6700269
SNP染色体部位: 171691245
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 579
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,108|T,12)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 177
遺伝子記号: Chr1:172313383..172353383
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 580):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1525):
CTCTGTGTTAGGATTAATTTTGTCATTTTTCTTTACCTTTTTATGGGTTTTAGGCAGCAGTTGAGAGACCCTGAGGCAGGGCTGCTAGCCAAATACTATT
W
AAAGCTAGAAATGCCTCACTGATTTTTATCGTAGATTGTTTCAACCTGTGTTCATTTCTTCAGCCTCTGACTATAGGATTTCCCAGGTTGCAGTCTTTGG
Celera SNP ID: hCV11342584
公開SNP ID: rs6696864
SNP染色体部位: 172333383
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 580
SNP部位ゲノム: 20000
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,72|A,46)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1526):
ATAGTACTCTATTTTGGATTTCCTCAAAGCTGGACAGTTTTCAGTGTGGATAGCCAATTTTGCTTTGCCTTGCCTGATCATCTTTGGAGTCTGCTTGTAC
S
CCAGTATGTACTTTCCACTTTTTATAACAAGTAGAAGCCTAGAGTTGATCCATTCCACTGACTTTTTAATCTTCTTTGCAAGCACCATCTTCCTGCATTA
Celera SNP ID: hCV30440155
公開SNP ID: rs6699146
SNP染色体部位: 172326145
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 580
SNP部位ゲノム: 12762
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,68|C,52)
SNP型: 偽遺伝子

遺伝子番号: 178
遺伝子記号: Chr1:242080891..242100891
遺伝子名:
染色体: 1
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 581):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1527):
GGGAGAAATGTGACAGGTTTCATGCTTCATGGCATGGAGGAGGAAGGGCCACGTGGTAATGCTTGTTGGATGCCTGTTGGAAATAATGTAGGATGAAGAC
R
GAACCATAACACAGTTTACTTCCTTGAGCGTTAGGTGGTATATGTATTGCATTCGACTTCCTTCATTGAAGTTGTGGATGCTGCAGTCACTGCCGGGATC
Celera SNP ID: hCV15953063
公開SNP ID: rs2953331
SNP染色体部位: 242090891
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 581
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,39|G,81)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 179
遺伝子記号: Chr11:128574328..128622789
遺伝子名:
染色体: 11
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 582):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1528):
AACAGTTCGAGGATACACACAATCTCATTAATAACAATGACTCATAACCTATTTAGAGATTTATTTTGATAAACAATTTTAAAAGCAAATTATCTTTGAA
R
GTGTCAAGCTGGTTGAGCATTCAAACCTTAAGGTGAAAATTATTTTAATTAGAACTTAATTTAGTTGAAATCTGCAGCACAAAAGAAGTTAGAGAGAGGC
Celera SNP ID: hCV7504118
公開SNP ID: rs967257
SNP染色体部位: 128584328
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 582
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,89|G,29)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1529):
TTTCATGAAAACAATACCAAAAGGAGAGATGAAAATGGCTACACTAACATCTAACAAAATAAGACTTTAAGAAAAAAACTGTTACTAGAGACAAGGGATA
Y
TTTAGAATGATAGAGGTAAATTTGTAGCAGACATCCAACAACAGACACCCAAAATACATGAAACAAAACTGACAGATTTCAGAGGACAAATAGACAATGC
Celera SNP ID: hCV30922162
公開SNP ID: rs4334028
SNP染色体部位: 128602789
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 582
SNP部位ゲノム: 28461
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,89|T,29)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 180
遺伝子記号: Chr12:51581000..51621000
遺伝子名:
染色体: 12
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 583):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1530):
CACTTGCATGCCCTAGCACAGATGCCCACCCTAGGCCTGGCCCCTTTCTTGCTTTCCCAATCCACGGGACCAGTGACACTTCCATGCCTGATACAGAAGA
S
AAAGTTGCATAGGACTGGTGAAAAGACGTGGGCAGGGGATGGTCCTCTGCAGTCGCCTGGCCTCCATGTCTCATCCCACCTGACACAGAGAGGCAGCCAC
Celera SNP ID: hCV1198623
公開SNP ID: rs2638504
SNP染色体部位: 51592662
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 583
SNP部位ゲノム: 11662
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,38|C,80)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1531):
AGGAATTGAACCCAAGTCTGGAGTAATTTTAGAGCTTGAACATTCTCTTTTCAATTATGCTGTTTTATAGTCAGGATCCAATTATGTCCATTAAGAGATG
Y
AATAATGTCAATAACTCAAAAGGGAGGATTCAAAACATGTTTATTATTTTATTTAGCAATCCAAAAGAGCTATATTACATTTATTTATTGAGCATCTGTA
Celera SNP ID: hCV444705
公開SNP ID: rs6580917
SNP染色体部位: 51600198
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 583
SNP部位ゲノム: 19198
関連した照会SNP: hCV1198623 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,38|C,80)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1532):
GACAACCAGCGACATAGCAAGACCCTGCATGTGTGCATATATGTCTGTAAGACAGAAAATGAGACAGAGAGACTCTAGAGAGCACGCAGCTCAGCTAAAG
R
AAAGACCTGCTACCCACCACTCTGTAACCAACCTGCCCCCACCCCATTCCCTGGTCTCTAAGGACTAAGATAACCCCAACTCAGATACAATGACCCATTC
Celera SNP ID: hCV16269565
公開SNP ID: rs2682338
SNP染色体部位: 51601000
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 583
SNP部位ゲノム: 20000
関連した照会SNP: hCV1198623 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,39|G,81)
SNP型: UTR5;イントロン

遺伝子番号: 181
遺伝子記号: Chr17:34559603..34579603
遺伝子名:
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 584):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1533):
TACCTGGCACAAAGGAGGTGCTCAAGAAAGATTTGTGTACTGAATGGTGTCATTTACTCTACAGAAACTCTAGGAGGTATAATGATCCTCTTCCTTACAG
W
TAAGAAACTGAAGTCAGAGTGAGTCAATGATTTCTGCCTGGAAGGCTTGTTCCCCAGGTCTCCCCATGGCTGTCTCCTACTCTTCACTCAGGTCTCAGCT
Celera SNP ID: hCV540410
公開SNP ID: rs609529
SNP染色体部位: 34569603
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 584
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|T,-)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

遺伝子番号: 182
遺伝子記号: Chr17:37821106..37841106
遺伝子名:
染色体: 17
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 585):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1534):
GCAAAAGGTCACTTCTAGTCTGGTATCCATTATCATTAGGAAGAGTGAAAAACTGGTCTATGGGGACCCAGGGCCTCCTCAACCCAGACAGAGAACCCAC
M
AACTCAGAAAGGAGACCGACAGTGCAGGGACTGGGTTAGTGCCCTAACAACATTGTAGGGTTTTTTAAGGGTTTACAACACCATATTTGTTATCCGAAAT
Celera SNP ID: hCV1952126
公開SNP ID: rs7223784
SNP染色体部位: 37831106
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 585
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,21|C,11) アフリカ系アメリカ人 (A,25|C,13) 全体 (A,46|C,24)


SNP型: INTERGENIC;未知
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,88|C,32)
SNP型: INTERGENIC;未知
遺伝子番号: 183
遺伝子記号: Chr18:10645770..10665770
遺伝子名:
染色体: 18
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 586):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1535):
GTGAGGTGCTGGGGGAGAGTCATTTCCACTGCCCTCATTACTTGAAGGATGCAGGTTGAAAATTCCCTGTTGGTAATTCATTAGCCTGGGAAATAAATAA
Y
GTGGAAGGCACAGAGGTGGCATAGAGGAAAGTTGCTCACCAGTACCCAACCCCCACACCGGCCATACCAAACAGGTATGTGGGAACCCAGGTGCGGGGCA
Celera SNP ID: hCV949676
公開SNP ID: rs480802
SNP染色体部位: 10655770
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 586
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,29|T,91)
SNP型: 偽遺伝子

遺伝子番号: 184
遺伝子記号: Chr18:28336325..28356325
遺伝子名:
染色体: 18
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 587):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1536):
CCTTTACCAGATATGCCACATGCTTCTTCTAACATTTTGATCCAGGAAATTCCACTTCCTGGTGCCCAGCCACCCTCCATCCTTAAGAAACCCTCAGCCT
R
TGGACCTCCAACTCAGGCAGTTTCTATCCTTCTCTTCTTGGGACGTGGTGTTCCACATTTGCCTCCTGGCAGAAAACCTCTTGGCCCTCCCCCTGGTCCA
Celera SNP ID: hCV7459627
公開SNP ID: rs1985293
SNP染色体部位: 28346325
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 587
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,22|G,14) アフリカ系アメリカ人 (A,21|G,13) 全体 (A,43|G,27)
SNP型: UTR5;偽遺伝子
SNP供給源: ABI_Val;Applera;HGBASE;HapMap;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (A,-|G,-)
SNP型: UTR5;偽遺伝子

遺伝子番号: 185
遺伝子記号: Chr18:55818284..55838284
遺伝子名:
染色体: 18
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 588):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1537):
ACACCCAGGGGTCCTCTAGAGTCTTCCTCCTCGTCTTTAATTTCAGAAATTCTGTCTACAGATTTAAGGATTTCGGCAGCAAGATTCAGTATCTCAGCTC
Y
GGAAACCAGTTGCTTAATGGAAGCCTGTGCGCTGTTCATGACCACCCAGAGGTTCTGCAAGGCCACGTCGGCGTTCTGCTTCACCACTGTCAGGCTGGCC
Celera SNP ID: hCV11962159
公開SNP ID: rs2000745
SNP染色体部位: 55828284
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 588
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,38|T,2) アフリカ系アメリカ人 (C,29|T,9) 全体 (C,67|T,11)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,16|C,104)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;偽遺伝子

遺伝子番号: 186
遺伝子記号: Chr19:13262482..13282482
遺伝子名:
染色体: 19
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 589):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1538):
GCCGCGGACAGAGGACTCACTTCTGCCACCTCCTTGGCTTTCTGTAGGGCAAGTTTCTGGTTCGCTGCTTCTTCTTCCTCTTGCTCGTCCTAAAAGGCAC
R
TGGAATCTTTGTTCACAAAACATGAACTAGGCCTTGGGGACTCACTTCTGACCCTGTTGCTGACCAGGGGCAACATTTGAAATATTTCGACCAATCAGAA
Celera SNP ID: hCV1455329
公開SNP ID: rs16018
SNP染色体部位: 13272482
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 589
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,2|G,0) アフリカ系アメリカ人 (A,13|G,17) 全体 (A,15|G,17)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,34|A,86)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 187
遺伝子記号: Chr2:133249044..133269044
遺伝子名:
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 590):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1539):
TGTTTTTCCTCCTCTTCAGGAGACCCACATAGAGATTTTCCAAACCCCACAAGGACATCCAGGTTCTCCACGGACTTATCGGTGTCGGCAGCCAATGACA
Y
GTCTGAAGGACTTTTCTCATCACTGCTCTCTATGTGCAGCTCATCAAACGTTTCATTGTCATCAGTGTCTGAAAGCTGGAGGTTGAGAGCCATGCGGCCA
Celera SNP ID: hCV25748719
公開SNP ID:
SNP染色体部位: 133259044
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 590
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,35|T,5) アフリカ系アメリカ人 (C,33|T,5) 全体 (C,68|T,10)
SNP型: ミスセンス変異;ESS;イントロン

遺伝子番号: 188
遺伝子記号: Chr2:219834595..219854595
遺伝子名:
染色体: 2
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 591):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1540):
GCCCTCAATGTGGACCTGACAGAGTTCCAGACCAACCTGGTGTCCTACCTCACATCCACTTCCCCCTGGCCACCTATGCACCAGTCATCTCTGCAGAAAA
R
GTATACCACGAGCAGCTGTTGGTGGCAGAGATTACCAATGCCTGCTTTGAGCCTGCCAACCAGATGGTGAAGTGTGATCCCCGGCACGGCAAGTACATGG
Celera SNP ID: hCV26175114
公開SNP ID: rs3731892
SNP染色体部位: 219844595
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 591
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,14|A,106)
SNP型: ミスセンス変異;UTR3;イントロン

遺伝子番号: 189
遺伝子記号: Chr20:33222095..33272704
遺伝子名:
染色体: 20
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 592):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1541):
ACTCCCCTCTCCTCACAGCACTGACTCTTGCCTTCTCATGTTCTTTTCCCCTTGGTGGGCCTCGCCCCACACCTGGCACCCTCTCTGCACAGTCCCCTGA
Y
CCTGACTGTCTATCCACAGTTCCTCTGACCATCCGCTGCTTCCTGGGCTGTGAGCTGCCTCCCGAGGGCTCTAGAGCCCATGTCTTCTTCGAAGTGGCTG
Celera SNP ID: hCV1825046
公開SNP ID: rs2069952
SNP染色体部位: 33227612
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 5517
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,9|T,13) アフリカ系アメリカ人 (C,4|T,28) 全体 (C,13|T,41)
SNP型: イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,63)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1542):
CTCCTTGGGGGCCTATTCTTCGGGCTAACTCTTTGCATGTTCTGCAGGGAGCCAAACAAGCCGCTCCTACACTTCGCTGGTCCTGGGCGTCCTGGTGGGC
R
GTTTCATCATTGCTGGTGTGGCTGTAGGCATCTTCCTGTGCACAGGTGGACGGCGATGTTAATTACTCTCCAGCCCCCTCAGAAGGGGCTGGATTGATGG
Celera SNP ID: hCV25620145
公開SNP ID: rs867186
SNP染色体部位: 33228215
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 6120
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,38|G,2) アフリカ系アメリカ人 (A,32|G,6) 全体 (A,70|G,8)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;イントロン
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,110|G,10)
SNP型: ミスセンス変異;MICRORNA;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1543):
GCTGTCACTCCAAACCTTCTGGTGTTTCAGTTGGGGAGTCTGGCTTCACAGTGAGCTGAAACTTTCCCTTGCCAGCCTCCATCAATCCAGCCCCTTCTGA
S
GGGGCTGGAGAGTAATTAACATCGCCGTCCACCTGTGCACAGGAAGATGCCTACAGCCACACCAGCAATGATGAAACTGCCCACCAGGACGCCCAGGACC
Celera SNP ID: hCV1825047
公開SNP ID: rs9574
SNP染色体部位: 33228293
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 6198
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|G,63)
SNP型: MICRORNA;UTR3;イントロン

コンテクスト (配列番号 1544):
ATTTTTCTCAGCAAAACAAAAGCCCTGTAGTTTTTCTTATTTCCTTAAACATGGTGTTTTATTTCATCCAAATGCAAGTGAAGAGGAGATTAGATTTGGT
Y
TGTGGAATTCCAGGGAACAGATTAATGAATGAGAGGAAGTCAGAGAGAAATAAATGTTAGTTTAATGTAACTTTCTGACCCAGCAATTCAATAATGGAAC
Celera SNP ID: hCV599565
公開SNP ID: rs633198
SNP染色体部位: 33242095
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 20000
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,66|C,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1545):
GTTATTAGACATAATGTTATTGCACATTTATTAGACTATAATATAGTATAAACATAACTTTTATTTATTATTGTTTTTCTTTTTAGACGAACTCTTGGGC
R
TGATAGTGCGCGCCTGTAATCTCAGCTATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAATCCAGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCACCAC
Celera SNP ID: hCV1271671
公開SNP ID: rs2093058
SNP染色体部位: 33254942
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 32847
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,66|A,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1546):
ACCCCAAAAGGATAAAAGCAATGAAAACCCCACCCACCCTAATCAAACTTCTGAAAACCAAATATTAGGAAAAAAATTTTAAGAGTAGCCACCAAAAAAT
S
ACATGTTACATATGGGGGAACAATAATTCTTATGACTGTAGATTTTTCATCAGAGACCATGGAAGCCAGAAGACAATGGAATAACACCTTTAAAGTGCTG
Celera SNP ID: hCV1271676
公開SNP ID: rs1577924
SNP染色体部位: 33247949
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 25854
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,66|G,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1547):
CTGTTTTAGGACGTGGGAATAGAGCAATATAGCAGAGAACAAAAACAAAGTCTGTCTTAGAAGCTACAGTTTACTGGGAGGGACAGACCCTAAACAAATA
W
TTTTTTTTTAATGTCAGAGATAATTAGTAGGAAATAGGTAGAAAAATAAGGAAGGTCGAAGGGAGAATAACTGAGTTGCTGTTTTAGACAGCATAATCAG
Celera SNP ID: hCV1271685
公開SNP ID: rs663550
SNP染色体部位: 33242929
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 20834
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,64|A,52)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1548):
GATGTTATTATTCTCATTTCCTGGCAACGTTATTATTCTCACACCCAGTAAAAAGAAACCAAAACTCTATTTCTTCTAATATCTCTTGGTATATCCGATG
R
TCTGTTGTATGTGTACTGGCATATAACAGGGTTCTCATGGGTAGCCTTAATCTTGCATCACACTCACTATAATCAGGATTTCTACATATCCCAAAAAATA
Celera SNP ID: hCV1271688
公開SNP ID: rs6058202
SNP染色体部位: 33241644
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 19549
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,52|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1549):
AAGGAGCCCAGTCTTTTCTTGGGAAGATAAAACATACAAAAGAGAACAACACAAGGCAAGATGCATTGTATAACTAGAAGAAACACACAAATAAAAATGT
K
ATGTTATGTGGCCGGGCATGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGCAGTTCACCTGAGGTCAGGTGTTCGAGACCAGCCT
Celera SNP ID: hCV1825056
公開SNP ID: rs6060285
SNP染色体部位: 33234148
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 12053
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,54|T,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1550):
AGCCACTGCGCCTGGTCTTCTCACTCATTCTTAGACCCAGTGCAATCTGACTTCTCTATAAACTACTCTGAGATCACCAGTAACCTCTAATTGTCAAACC
R
TCACCCTACATGGTATCTGCAAATTTGCGGACTAGAACTCTCTTTTTGCCTTAACTTCTGAGATACCATACTTCAATTTTTAAAACTGTTCTGTCTACTT
Celera SNP ID: hCV7499886
公開SNP ID: rs1415774
SNP染色体部位: 33229277
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 7182
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,54|G,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1551):
TTAACCTTTATTTACTCCCTCTTATTTATCCCCATCTACCAACTACAGTATCTATAAAACACATTCACTCCTTTCTACCCCATTGCTTTTGTTCAAGATA
Y
CATAATTCCTCTCTTTCTTTGTGGTAAACATGAAGGTGTACCATCCAGTTCTACCTCCAAAGAAAGACTTCCTGTTGGCCGGGCATGATGGTTCACGCTT
Celera SNP ID: hCV11189130
公開SNP ID: rs2065979
SNP染色体部位: 33231351
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 9256
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,54|C,66)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1552):
TAGTTTATGAAGGGTCGAGAAGGCGGGCGGCCAGCCTCGAGGTAGGGGGTTATTATCTTCCGCTGCCCGCCGCCCCCTCCCACGCCGGCCCAGGCTGAAG
Y
TGACTCTGCCCGCAGGCCTCCAAAGACTTCATATGCTCCAGATCTCCTACTTCCGCGACCCCTATCACGTGTGGTACCAGGGCAACGCGTCGCTGGGGGG
Celera SNP ID: hCV15860322
公開SNP ID: rs2069948
SNP染色体部位: 33226150
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 4055
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,53|T,63)
SNP型: ミスセンス変異;ESE;転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1553):
AGAGTGGCATGGGGTAGATTCAAACAGCCTAGCAAAGACTCTGAAAATGAACTGACACTGCAACCACCCACAGCAGGTGAGACAAAGCTTGTAGTCTGAA
M
CTAATTGAGTTATTTGCCTGCTAAAATAAACTAGTCACCATCCAGATAATTTAAACAGGACTCAGAGTCCCACAATCTAACACTCAAGATGGGCAAGATA
Celera SNP ID: hCV30450320
公開SNP ID: rs4911478
SNP染色体部位: 33246286
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 24191
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,66|C,50)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1554):
TGTGTATTATTATCCCTAGATCAACAGCTAAAAAAAAAAAACCACAAAAGATATAGACAACCAATATATTAAATTGGAATATAAAACATATTCAAATAAT
Y
CAAAATATAACAGGAAAGGGGACATTGAGAGGCAAAAAAATGGAGGAGACAAGCAGAAAAATAACAAATTGTAGACCAAAATCCACTCTTATCAATAACT
Celera SNP ID: hCV29909897
公開SNP ID: rs6142324
SNP染色体部位: 33252704
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 30609
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,66|T,54)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1555):
TCCAAAATATAACAGGAAAGGGGACATTGAGAGGCAAAAAAATGGAGGAGACAAGCAGAAAAATAACAAATTGTAGACCAAAATCCACTCTTATCAATAA
M
TACATTAAATGTAAATGGTCTTTAAAAATGTAAATGGTCTAAACACACCAATTAAAAGACAAAGATGGCTGGGTGCGGTGGCTCACGCCTGCAATCCCAG
Celera SNP ID: hDV72053898
公開SNP ID: rs8114671
SNP染色体部位: 33252803
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 592
SNP部位ゲノム: 30708
関連した照会SNP: hCV1825046 (検出力=.8)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,66|A,54)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 190
遺伝子記号: Chr22:22616175..22636175
遺伝子名:
染色体: 22
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 593):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1556):
AGCATCCCTTGGGCATCCCGGGAGGTGTCCCTGCCCTCCATGGCTCACCGTCTGCCACATGGCCCAGCAGCAGCTACTCTGCAGGGCCATGTGCTGCCAT
S
ACAGGTACTGATCCCCATGGGCGCGGGCCTGCAGGTCCTGGAGGTACCAGTGGTCAGGTGCTTTGTACATGCAGCTCATATAGAGCAAGCTAGCCACACT
Celera SNP ID: hCV2211618
公開SNP ID: rs12483950
SNP染色体部位: 22626175
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 593
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: HGBASE;dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): no_pop (C,-|G,-)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 191
遺伝子記号: Chr3:3989657..4009657
遺伝子名:
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 594):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1557):
AGAAGATGACCCATTTGACTCTAGGACTTCAGATGTAACTCTTATGGCAAAAGGAAAATCTTTGGGAATAACAGGATACAAAGCTTTCTCAGCAAGAGCA
Y
CAGGCCCAAGTTCTCTTCTATTTATACCGGTGACTTTGACAATTTCATTAGTTGCATAAGGAGGAAACTCATAGTGCAGCATGAAATTTTTATCTTTTAT
Celera SNP ID: hCV8827309
公開SNP ID: rs1110796
SNP染色体部位: 3999657
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 594
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: Applera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,33|T,5) アフリカ系アメリカ人 (C,8|T,0) 全体 (C,41|T,5)
SNP型: UTR5;イントロン;偽遺伝子
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,14|C,104)
SNP型: UTR5;イントロン;偽遺伝子

遺伝子番号: 192
遺伝子記号: Chr3:120852909..120913933
遺伝子名:
染色体: 3
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 595):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1558):
TTTTTTAAAAATAACAACCCTCAAATTCTAATGTGTAATTTGCTAGTTTATTATGTTTGTTGTTTGTTGTCTCTCTCTCATGAAGTCAAAGATTTTTGTC
R
TTTTGTTGATGTATTCTAAGCACCTAGATAGAGTAGCCAGTCAATAAACATGTGTTGAATGAAGGAGCAAAAAGAGCCTGAGCCTCTTGCAGCTTTTCAG
Celera SNP ID: hCV134275
公開SNP ID: rs9847068
SNP染色体部位: 120907303
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 54394
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,40|A,80)
SNP型: 転写因子結合部位;UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1559):
CTGATGGTATAATTTTGTCCTTTGCCTCCCTTCTCTAACATTAGAGAAAAGTTCCCAGGTTTAAAACCATGTTCAGTAACCTGATCCATTATCCAAGATA
Y
TCTCTATATTGGAGCAAGTCAGATCCTGTCCCACCATTTATCAGTCGGGAATGGAAGGGACATAAGGAGAAACACAGAGAAGCCCTCCGGCAGCTCACCA
Celera SNP ID: hCV134278
公開SNP ID: rs9848716
SNP染色体部位: 120908997
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 56088
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,28|C,86)
SNP型: UTR5;サイレント変異

コンテクスト (配列番号 1560):
ATATTTTTCCTTTGAAGCTATTCTCAGAAAAATGTGATCTAACAGTCTAAGAAATACCGATTTAGGTTAAGTTTATCTTATAGCAATGCAGACAGTTGTG
Y
TGGATTTCACCCTCCAGCCAATGGCCTGTTTACTGGGTTATATGCAACTGTACATTTCCGCAACAAGTCTTTCTAATTAGCATTCATAATGAGGTTTTAA
Celera SNP ID: hCV114165
公開SNP ID: rs6807079
SNP染色体部位: 120873108
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 20199
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,63|C,51)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1561):
TTCAGGTAAGGTATAAAAAATGTATAATAGATTTATTCCCAATCTACTGCACTTGAGGTACAATTAAGATCTACTTAGGAATAACATTAAAATCTACAAA
S
GTTTTTGAATTAAGGAACTTTCATGATCGTTGCCAGAGAGATCTAAGTTTGCAAAATATTTTTCCTTTGAAGCTATTCTCAGAAAAATGTGATCTAACAG
Celera SNP ID: hCV114166
公開SNP ID: rs6794579
SNP染色体部位: 120872952
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 20043
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,60|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1562):
CTATCATAGCCCTTACCACGTCGTATACAAGTCACTGGTTTATGTCTCCATTAACTTTAAGCTCCTTTATATCAAGATGCATCTTTATCCATGTCTACAT
S
TTCGGACCTAACGCAGTGCTTAACCCATAACAGATACTCAACACACATTTGTAGGAAGGAATGAGTGGTTGAAGCTTGCCGTTCTCCTCTCTCTCCATCG
Celera SNP ID: hCV965662
公開SNP ID: rs523476
SNP染色体部位: 120878352
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 25443
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,64|G,56)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1563):
GCAGCATATGTCAGCTCCTTAGGCGAGGATTTCGGCCACCCAGGCAAGCCACCAAAGAGTGACAACCGTAGAGTGTAGATAATGTCTAATGATCTTCGTG
S
CTCGCTGAAGCCATTTAAATCGGAATGCTGTGCCCTTTATCATCTGTTTCTTCTTCCTTCTTGATCTACTGGAAGATGGATGATCTTCTCCTAAATGAAT
Celera SNP ID: hCV965695
公開SNP ID: rs552244
SNP染色体部位: 120859272
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 6363
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1564):
CAAAGGGTATTGAGAAGCAGATAAAGATGAGAATGAACAAAGACCTGGGAAATCCAGTGTGGCAGTCTGTTCTCCAGTATCTGCTTTCTTCTCTTCCTTA
R
TGGTGCTAGATTTTAACTGGACACATGACTGCAGAGAAAAAAATCAACATTTCTCTACTTCCCTGGCTGCTAGGCATAGGCAAGTGATAAGTCCTGGCCA
Celera SNP ID: hCV1969071
公開SNP ID: rs7633444
SNP染色体部位: 120858739
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 5830
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: UTR5;イントロン

コンテクスト (配列番号 1565):
CATTATTTCTGGAGGTTTATTGGCTAAACAAATATTTCTGGAGCATCTCTCATGTTTCTGGAGATCTGGGAATGCAGAGATGGGCACAATCTGGTCTTTG
Y
CTTTGAGGATTTCACAATTTAGTGGAAGTCACAGGCACATAAATAACTGGCTGCAAGTCAATGTGATAGGTGCTATTGTGGAACAGTAACAGAGGAGAGA
Celera SNP ID: hCV1969072
公開SNP ID: rs2670296
SNP染色体部位: 120858468
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 5559
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,56|T,64)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン

コンテクスト (配列番号 1566):
AAGCCACTAAAATGCTTATTTGACTTTTACCACCTGTCCTAAATTTAACCAAGGAAAATCTGTATAGACTCCTCCTTGACATTTAAATTTACCTAATAGG
M
CATTCAAGGTTTGGCAACTGAATTTTTTCCAACTACCTCCCTCCCATGAGTATACATATATATTGGTTATGATCTGTATGTTTTCCCATTGGGTGGAAGG
Celera SNP ID: hCV3150918
公開SNP ID: rs11720605
SNP染色体部位: 120893933
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 41024
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,64|A,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1567):
GTTGTGACACATCGAGATACATTTTCATCTGTGGGGGAGCCTACAGTCAGCTTTATTCATGGGCAACATCATGTCTCAATAAATGGAAAATAAAGCACCA
R
TGTGGTCTGGGATATTTCTACATTCAATTTAAACTTGCAAAATCTGAACATTGGTTGACATCTACTAACTTGCACCATCATATCAAAAAAGACACTCTAC
Celera SNP ID: hCV8830526
公開SNP ID: rs940181
SNP染色体部位: 120895761
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 42852
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1568):
CCTTTTTATCAAGGCAAGTTCAGCACAAGCCTACAGCTTACACAACTGACGAGGGAGTTAGATCATGAACAAGGAAACCATGTACAAATGTTAAGGTTGC
R
TCTTTAAAAATAGTTAATAAAGTACACATACTTTTTAAGAACACACTCCCCTTCAAATTTACTTATTTTATAAAATAGTTCATTATGGGATTTCTTTAAA
Celera SNP ID: hCV9151800
公開SNP ID: rs6803814
SNP染色体部位: 120874113
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 21204
関連した照会SNP: hCV263841 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,71|G,47)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1569):
AGTTGTTAAATGGAGTAATAATCATATTCAACCCATAGAGTTGTTATGAGAATCAATGAGGCAATATGATACGTAGTGCCTGCCACATGCTAGCCATTCA
R
TAAGTGAGAGCTACAAAGAAAGTGACCAAAGCCTGAGGGATTGGCAGAGATAAGAAGAGTAGGGGCCAGGCAGCCAGGAACCTGCATTGGAGCATGTATG
Celera SNP ID: hCV11232131
公開SNP ID: rs2698282
SNP染色体部位: 120854854
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 1945
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,63|G,57)
SNP型: TFBS SYNONYMOUS;イントロン

コンテクスト (配列番号 1570):
TTTTTGCAGTTCCAGGACATATTCAAGCAGAGTTTGGATAACCACCTGCCAAAGATCTGTATTGGGTGGGAAGTTGGTTCATACCTGTCTTAATTGTCCA
R
GATTCTATTCTTCACCTAGATTATCTCTGTAAATCATGAAGTGCTTACTAAAAGTATTATATCCAAATGAATATTCAAGTAAAAATATAAACAATAAAAT
Celera SNP ID: hCV11232160
公開SNP ID: rs1880041
SNP染色体部位: 120869889
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 16980
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1571):
ATAAGGATCCAACACCCAGTCCTCTTCCCAAAATATTATTACACTGAAAATGAAAAACATGGCAGTTTGAATTCTCAGAAGGGTCCTATATGGATTCAGA
Y
TGTTCTTCTTGTAACCAGGATTCAATAATAATCAAGTCATATACTTAACAGACCTCAACTGAATGTCTGCTATCCACAACTCTAAAGGTATGAGCTATTC
Celera SNP ID: hCV11232163
公開SNP ID: rs4327424
SNP染色体部位: 120873534
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 20625
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,64|C,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1572):
TGTGAACCATCATTTAATCTTCATGGCAGTCAAAATTATTATCTACATTTATAGTTGGGGAAAAATTGAAGTTCAGAGGTGTACATTTGTTCAAGGCTGC
R
TAACTTGAAAGTGGCAATCCTGAGTCTCATCATCTTCTCCCTGTACTCTGTCTACTATCCTACTTAATTTATCTAAATGCAAGGCAAGGCCTGGTGTAGT
Celera SNP ID: hCV11232169
公開SNP ID: rs6438542
SNP染色体部位: 120881010
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 28101
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.51)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,57|A,63)
SNP型: INTERGENIC;未知

コンテクスト (配列番号 1573):
TGCTCCACAAGAGAGGCTATATAAAATGAGAACAAATCTTTTGTGGATTGACAATCTAGATGAACTATTCTTAATACTTTGTCCCCTGCGTCGTAGACTG
R
TTGATTTTCAACTTTTGGTTGTCTTAAAAGGGTTGAAGCGTAACTCTTCAGAACTGTAAGGAATACACTCTGTGTCCTACTGTCTCTAAATTTTGGGAGA
Celera SNP ID: hCV26920276
公開SNP ID: rs13062540
SNP染色体部位: 120878103
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 25194
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,56|G,64)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1574):
TATGGAGTCAGGGAATTAAGACCACTAGAAATGAATGCCTCAGATGAGTAATTAACTAATTGCCAGAATTATTCCAAATCAGTCATAAAATTCAAAATCA
R
CATTTTAAAATTCTAGGTTTGCCTAACTAAAAACATTAGTGAAATTATTCATGATATTATTTACTCTTTAAAAGTTTTTGAAGTAAAAACTCTCTCTGCG
Celera SNP ID: hCV27498971
公開SNP ID: rs3772134
SNP染色体部位: 120871356
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 18447
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: 転写因子結合部位;イントロン;偽遺伝子

コンテクスト (配列番号 1575):
GGTGCACCTCTGGGTAAGAACCACTGGGTGAATGTAGCCTACTTTCAGGTAAGGTATAAAAAATGTATAATAGATTTATTCCCAATCTACTGCACTTGAG
R
TACAATTAAGATCTACTTAGGAATAACATTAAAATCTACAAAGGTTTTTGAATTAAGGAACTTTCATGATCGTTGCCAGAGAGATCTAAGTTTGCAAAAT
Celera SNP ID: hCV29280454
公開SNP ID: rs6794484
SNP染色体部位: 120872909
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 20000
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,64|A,56)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1576):
ATATTTTAAGCATCCAACTGTTAAGTTGTTAAACTTAATATTGAGTATCACCACTATTCAGTACTAGTCCTTTAATTTCTTTCAACGACTTTAGTCTCCA
R
AATAGGTTCTTTAGGCTTCTTCTGTCTCCTAAAGGCAGGAAGATAGTAGCCATCTATTTCCTCATATTTCTAATGAGGTTCTAGGTTCTTCTAATTACTC
Celera SNP ID: hCV31747142
公開SNP ID: rs7613999
SNP染色体部位: 120872435
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 595
SNP部位ゲノム: 19526
関連した照会SNP: hCV1834242 (検出力=.6)
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (A,64|G,56)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 193
遺伝子記号: Chr4:187454445..187513998
遺伝子名:
染色体: 4
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 596):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1577):
GGCACAGCATTTGTCATTGCTTCTGCCTGCCCCTTAATAACCATATCCACCTGCTTGTGTCTTTTAACTGAGTTATCAGTCACCTCCTCCATGAAGCTGT
Y
GCAAGCTTTCTCAGGATGACGCCCCTCTTGCTGCATTGTTGCCTGGTCTGTGCCTCTGTGTAGAACTTGCCACATTGCATTATGGCCAGAGGCTTGTGTG
Celera SNP ID: hCV2103392
公開SNP ID: rs12500826
SNP染色体部位: 187464445
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 596
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,40|C,72)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1578):
TGCTGACAGCAATGGCAGGCTGCCATCCTTGGAGTGAGGACCTGTGCTTCTACTTCCTGCTTCCTCTGAACCCCAGCAGCTGCCAGCACAGCGTCTAGGA
R
TAGTGGCTGTGGACATAATTAGGAGTTTCTTGAGCAGCCTAGTTAACAGCCCCACAGAGGGCATGATCATATAAGAACGTCACTCATGTCATTATCATTT
Celera SNP ID: hCV3230136
公開SNP ID: rs13116273
SNP染色体部位: 187454880
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 596
SNP部位ゲノム: 435
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,83|A,37)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1579):
CAGATACCTCATCCAAGATATACAGGTAGCAAATAAGCATATGGAAAGATGCTCAACATCATGTTATTAGAGAAATGCAAACTAAAGCAACAATAAGACA
Y
CACTACATACCTATTAGAATGGCTAAAATCCAAAATGCTGACACCACCAAATGCTAGAGAGGATGTGAAGCAACAGGAGCTCTCATTCATTGTTTTGTCC
Celera SNP ID: hCV29821005
公開SNP ID: rs6552970
SNP染色体部位: 187475220
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 596
SNP部位ゲノム: 20775
SNP供給源: dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,99|T,21)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1580):
GATGTGAAGCAACAGGAGCTCTCATTCATTGTTTTGTCCTTACAAAACTAAATAAACTCTTACTATATAACATGGAAAATGCATGTCTTGGTATTTATCC
R
AAAGGGCTGAAAAACTATGCACACATAAAAGCCTGAATGTAGATTGTATATGCTTTACTCATAATTGCCAAAACTAGAAAGCACCTAAGATGTTATCCAA
Celera SNP ID: hCV32209621
公開SNP ID: rs6552971
SNP染色体部位: 187475382
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 596
SNP部位ゲノム: 20937
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,59|A,61)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1581):
AGCTCTCATTCATTGTTTTGTCCTTACAAAACTAAATAAACTCTTACTATATAACATGGAAAATGCATGTCTTGGTATTTATCCGAAAGGGCTGAAAAAC
Y
ATGCACACATAAAAGCCTGAATGTAGATTGTATATGCTTTACTCATAATTGCCAAAACTAGAAAGCACCTAAGATGTTATCCAATAGGAGAATAAATAAA
Celera SNP ID: hCV32209620
公開SNP ID: rs6552972
SNP染色体部位: 187475398
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 596
SNP部位ゲノム: 20953
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,99|C,21)
SNP型: イントロン

コンテクスト (配列番号 1582):
ATTTGCGCTCTTTGACAATGCAATGGTCACTCAAAAGCTCTGGTGGAGACATACAAAAAGATTAATGTTGTTTTACTGCTAACACAACATCCATTATGCA
Y
CCTGATGAAGGAGTAATTTCACCTTTCAAGTCTTATTATTTAAGAAATCTATCTTGTTAGGCTGTAGCTACCATAGACAGTGATTCTTCTGATAGATTAG
Celera SNP ID: hCV32209605
公開SNP ID: rs6829128
SNP染色体部位: 187493998
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 596
SNP部位ゲノム: 39553
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (C,83|T,35)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 194
遺伝子記号: Chr5:158219574..158239574
遺伝子名:
染色体: 5
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 597):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1583):
TGTGCTTTGGAAAAAAAACTTTGTTTTGGCATGAAGTGCACTGCTTGTTGATACACAGTGGCAGCTTTGGAGCATGAAATCTTGCTCTTTATGAGTATTT
R
GCATATTGTGGAATTAGAGTTTTGCCTTCTCTGGGTTTTCTTGGCTTTCTTCAACAGCCTCCCTACCTGGTCCCCAAAACAAAACAGCAGGAATAAATAT
Celera SNP ID: hCV15871021
公開SNP ID: rs2072495
SNP染色体部位: 158229574
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 597
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,74|A,46)
SNP型: ミスセンス変異;イントロン

遺伝子番号: 195
遺伝子記号: Chr6:33157647..33177647
遺伝子名:
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 598):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1584):
TTGGTCTTTGAGACAATGGTGCCATTAAGGACCCCCGCCAGGCCCACCAGCAGGCCGAGGGCACAGACCAGCATCTCCATGGTCTCAGGCACCTGGATTA
K
TTCATGGACCTCTGGGGCACCAAGGGAAGACAGAGTTATAAGGTACAGAGAGCAGGGGCTGGCCTTGGATGTGGGAGGTGTTGGGTATTCGAAACCATGA
Celera SNP ID: hCV1842260
公開SNP ID: rs2281390
SNP染色体部位: 33167647
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 598
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; Celera; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,99|T,19)
SNP型: 転写因子結合部位;偽遺伝子

遺伝子番号: 196
遺伝子記号: Chr6:138281449..138301449
遺伝子名:
染色体: 6
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 599):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1585):
TCCTGCCACCTCCCTCCACTGTGCAGCCCCAAAGTGACAGAGGCTGAGGATCCCCAGCAAAGCAAACTGCTTCTGTCATCTGCTTTCAGGCAATTTTGAG
R
CACCTTTTCTTGGCTTATTTCCACTGCTAAGCCCTGACACAATATAATATTTCAAAAGCCCCTAAGTGCTGACAGAATACTCAAAATCACATTTTACAAA
Celera SNP ID: hCV30002208
公開SNP ID: rs9402927
SNP染色体部位: 138291449
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 599
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; HapMap
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (G,50|A,70)
SNP型: INTERGENIC;未知

遺伝子番号: 197
遺伝子記号: Chr8:52574503..52594503
遺伝子名:
染色体: 8
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 600):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1586):
TGCAAGAAACACAGAAATCAGAGTGACCATTATAAGGCCTGTTGGATCAGGCATGCCAACTGTCCTTCAAAACCCTCCAGTGCTCACTCAGAATAAAATG
Y
ACATCGCTCACAATGATACAAATCAAATCTGTTCCTCTGATCTACACAGTTCTGTGCTAACTGGGCCTGTCTCTCTGCTCCAGCCACATCAGCATTCAAG
Celera SNP ID: hCV3205858
公開SNP ID: rs2979122
SNP染色体部位: 52584503
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 600
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,82|C,38)
SNP型: イントロン

遺伝子番号: 198
遺伝子記号: Chr9:135112730..135132730
遺伝子名:
染色体: 9
OMIM番号:
OMIM情報:

ゲノム配列 (配列番号 601):

SNP情報

コンテクスト (配列番号 1587):
GGGGCGGCCGTGTGCCAGAGGCGCATGTGGGTGGCACCCTGCCAGCTCCATGTGACCGCACGCCTCTCTCCATGTGCAGTAGGAAGGATGTCCTCGTGGT
G
ACCCCTTGGCTGGCTCCCATTGTCTGGGAGGGCACATTCAACATCGACATCCTCAACGAGCAGTTCAGGCTCCAGAACACCACCATTGGGTTAACTGTGT
Celera SNP ID: hDV71075942
公開SNP ID: rs8176719
SNP染色体部位: 135122730
ゲノム配列中のSNP: 配列番号 601
SNP部位ゲノム: 10000
SNP供給源: CDX; dbSNP
母集団(対立遺伝子、数): 白色人種 (T,4|G,18)
SNP型: FRAME SHIFT INDEL;イントロンIC INDEL
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658
Figure 0005409658

Claims (38)

  1. ヒト由来の核酸の多型を、前記ヒトが静脈血栓症（ＶＴ）の危険性の変化を有しているかどうかの指標とする方法であって、前記多型は、配列番号７１０のヌクレオチド配列またはその相補体の１０１位によって表され、配列番号７１０の１０１位におけるＣ、または、その相補体の１０１位におけるＧの有無は、前記ヒトがＶＴの危険性の変化を有していることを示す、方法。
  2. 前記ＶＴが、深部静脈血栓症（ＤＶＴ）である、請求項１に記載の方法。
  3. 前記危険性の変化が、危険性の増加である、請求項１に記載の方法。
  4. 前記危険性の変化が、危険性の減少である、請求項１に記載の方法。
  5. 前記核酸が、前記ヒト由来の生物学的サンプルからの核酸抽出物である、請求項１に記載の方法。
  6. 前記生物学的サンプルが、血液、唾液または頬の細胞である、請求項５に記載の方法。
  7. 前記生物学的サンプルから前記核酸抽出物が調製される、請求項５に記載の方法。
  8. 前記調製の前に、前記生物学的サンプルが前記ヒトから得られる、請求項７に記載の方法。
  9. 前記核酸が、核酸増幅によって試験される、請求項１に記載の方法。
  10. 前記核酸増幅が、ポリメラーゼ連鎖反応によって実施される、請求項９に記載の方法。
  11. 前記配列番号７１０の１０１位におけるＣ、または、その相補体の１０１位におけるＧの存在がＶＴの危険性の増加と相関付けられる、請求項１に記載の方法。
  12. 前記相関付けが、コンピューターソフトウェアによって実施される、請求項１１に記載の方法。
  13. 前記核酸が、配列決定、５’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチド連結アッセイ、サイズ解析、一本鎖高次構造多型分析、または変性勾配ゲル電気泳動（ＤＧＧＥ）を使用して試験される、請求項１に記載の方法。
  14. 前記核酸が、対立遺伝子に特異的な方法を用いて試験される、請求項１に記載の方法。
  15. 前記対立遺伝子に特異的な方法が、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、または対立遺伝子特異的増幅である、請求項１４に記載の方法。
  16. 配列番号１６６６〜１６６７で示される配列を含む対立遺伝子特異的プライマーを使用して実施される、請求項１４に記載の方法。
  17. 自動化された方法である、請求項１に記載の方法。
  18. 前記ＶＴが、再発性ＶＴである、請求項１に記載の方法。
  19. 前記ＶＴが、肺塞栓症（ＰＥ）を含む、請求項１に記載の方法。
  20. 前記ヒトが、癌を有する、請求項１に記載の方法。
  21. ａ）前記ヒトが、治療剤の臨床試験に含まれるように選択されるか、そして／または
    ｂ）前記ヒトが、臨床試験内の群に割り当てられる、
    請求項１に記載の方法。
  22. 前記治療剤が、抗凝固剤または抗血小板薬である、請求項２１に記載の方法。
  23. ヒトにおいて静脈血栓症（ＶＴ）の危険性が変化しているかどうかを決定するためのキットであって、少なくとも１つの容器および前記容器中に保管される少なくとも１つのポリヌクレオチド検出試薬を含み、前記ポリヌクレオチド検出試薬が、配列番号７１０のヌクレオチド配列またはその相補体の１０１位によって表される多型の有無を検出することができるキット。
  24. 前記ポリヌクレオチド検出試薬が、前記多型の存在下では前記核酸に選択的にハイブリダイズし、前記多型の非存在下では前記核酸にハイブリダイズしない、請求項２３に記載のキット。
  25. 前記ヒトが前記Ｃまたは前記Ｇについてホモ接合性である、請求項１〜２２のいずれかに記載の方法。
  26. 前記ヒトが前記Ｃまたは前記Ｇについてヘテロ接合性である、請求項１〜２２のいずれかに記載の方法。
  27. ヒトにおいて静脈血栓症（ＶＴ）の危険性が変化しているかどうかを決定するためのポリヌクレオチド検出試薬であって、前記ポリヌクレオチド検出試薬は、配列番号７１０のヌクレオチド配列またはその相補体の１０１位によって表される多型の有無を検出することができる、ポリヌクレオチド検出試薬。
  28. 前記ポリヌクレオチド検出試薬が、前記多型の存在下では前記核酸に選択的にハイブリダイズし、前記多型の非存在下では前記核酸にハイブリダイズしない、請求項２７に記載のポリヌクレオチド検出試薬。
  29. 前記ポリヌクレオチド検出試薬が、対立遺伝子特異的プローブまたは対立遺伝子特異的プライマーである、請求項２７または２８に記載のポリヌクレオチド検出試薬。
  30. 前記ポリヌクレオチド検出試薬が、配列番号１６６６、配列番号１６６７およびこれらの相補体のうちいずれか１つのヌクレオチド配列を含む、請求項２７または２８に記載のポリヌクレオチド検出試薬。
  31. 前記ポリヌクレオチド検出試薬が、配列番号１６６６、配列番号１６６７およびこれらの相補体のうちいずれか１つのヌクレオチド配列からなる、請求項２７または２８に記載のポリヌクレオチド検出試薬。
  32. 前記検出試薬が検出可能に標識される、請求項２７〜３１のいずれかに記載のポリヌクレオチド検出試薬。
  33. 前記検出試薬が固体支持体に結合される、請求項２７〜３２のいずれかに記載のポリヌクレオチド検出試薬。
  34. 前記固体支持体が核酸アレイを含む、請求項３３に記載のポリヌクレオチド検出試薬。
  35. 前記ポリヌクレオチド検出試薬が、対立遺伝子特異的プローブまたは対立遺伝子特異的プライマーである、請求項２３または２４に記載のキット。
  36. 前記ポリヌクレオチド検出試薬が、配列番号１６６６、配列番号１６６７およびこれらの相補体のうちいずれか１つのヌクレオチド配列を含む、請求項２３または２４に記載のキット。
  37. 前記ポリヌクレオチド検出試薬が、配列番号１６６６、配列番号１６６７およびこれらの相補体のうちいずれか１つのヌクレオチド配列からなる、請求項２３または２４に記載のキット。
  38. 前記検出試薬が検出可能に標識される、請求項２３、２４および３５〜３７のいずれかに記載のキット。
JP2010550884A 2008-03-13 2009-03-13 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用 Active JP5409658B2 (ja)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US6968708P 2008-03-13 2008-03-13
US61/069,687 2008-03-13
US12/403,552 US8071291B2 (en) 2008-03-13 2009-03-13 Genetic polymorphisms associated with venous thrombosis, methods of detection and uses thereof
US12/403,552 2009-03-13
PCT/US2009/037069 WO2009151691A2 (en) 2008-03-13 2009-03-13 Genetic polymorphisms associated wiith venous thrombosis, methods of detection and uses thereof

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2013212559A Division JP2014003985A (ja) 2008-03-13 2013-10-10 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用

Publications (3)

Publication Number Publication Date
JP2011517935A JP2011517935A (ja) 2011-06-23
JP2011517935A5 JP2011517935A5 (ja) 2013-04-04
JP5409658B2 true JP5409658B2 (ja) 2014-02-05

Family

ID=41215588

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2010550884A Active JP5409658B2 (ja) 2008-03-13 2009-03-13 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用
JP2013212559A Withdrawn JP2014003985A (ja) 2008-03-13 2013-10-10 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2013212559A Withdrawn JP2014003985A (ja) 2008-03-13 2013-10-10 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用

Country Status (5)

Country Link
US (5) US8071291B2 (ja)
EP (1) EP2276855B1 (ja)
JP (2) JP5409658B2 (ja)
CA (1) CA2717045C (ja)
WO (1) WO2009151691A2 (ja)

Families Citing this family (39)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2007000060A (ja) * 2005-06-23 2007-01-11 Sumitomo Chemical Co Ltd 昆虫由来のペプチジルジペプチダーゼａ活性に関わる有害生物の生理状態に変化を与える薬剤
JP5409658B2 (ja) * 2008-03-13 2014-02-05 セレラ コーポレーション 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用
DK2282764T3 (da) * 2008-04-22 2019-10-14 Vib Vzw Leverspecifikke nukleinsyreregulerende elementer samt fremgangsmåder og anvendelser heraf
TW201100090A (en) * 2009-04-01 2011-01-01 Oncotherapy Science Inc C6orf167 peptides and vaccines containing the same
RU2693462C2 (ru) * 2010-05-03 2019-07-03 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных с сиртуином (sirt), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к сиртуину (sirt)
US11869024B2 (en) * 2010-09-22 2024-01-09 The Nielsen Company (Us), Llc Methods and apparatus to analyze and adjust demographic information
US20120108651A1 (en) * 2010-11-02 2012-05-03 Leiden University Medical Center (LUMC) Acting on Behalf of Academic Hospital Leiden (AZL) Genetic polymorphisms associated with venous thrombosis and statin response, methods of detection and uses thereof
WO2013130868A1 (en) * 2012-02-29 2013-09-06 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods for modulating fibrinogen expression
US9127274B2 (en) * 2012-04-26 2015-09-08 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Serpinc1 iRNA compositions and methods of use thereof
US9938576B1 (en) 2012-09-21 2018-04-10 Ohio State Innovation Foundation Materials and methods for determining metabolizer status in humans
RU2712559C9 (ru) 2013-08-28 2020-10-08 Ионис Фармасьютикалз, Инк. Модуляция экспрессии прекалликреина (пкк)
US9209571B2 (en) * 2013-10-16 2015-12-08 Tyco Electronics Corporation Connector assembly having multiple shield current paths
HUE052709T2 (hu) 2014-05-01 2021-05-28 Ionis Pharmaceuticals Inc Módosított antiszensz oligonukleotidok konjugátumai és azok alkalmazása PKK expressziójának módosítására
GB201410693D0 (en) 2014-06-16 2014-07-30 Univ Southampton Splicing modulation
AU2015327836B2 (en) 2014-10-03 2021-07-01 Cold Spring Harbor Laboratory Targeted augmentation of nuclear gene output
WO2016069694A2 (en) 2014-10-30 2016-05-06 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Polynucleotide agents targeting serpinc1 (at3) and methods of use thereof
CN105039348B (zh) * 2015-02-28 2019-01-01 南开大学 具有抑制hiv-1的卷曲螺旋结构蛋白8及其应用
US10900027B2 (en) 2015-10-09 2021-01-26 Cleveland State University Recombinant prothrombin analogues and uses thereof
CN108603230A (zh) 2015-10-09 2018-09-28 南安普敦大学 基因表达的调节与蛋白质表达失调的筛选
KR20210157474A (ko) 2015-12-07 2021-12-28 젠자임 코포레이션 Serpinc1-연관 장애의 치료를 위한 방법 및 조성물
EP3390636B1 (en) 2015-12-14 2021-05-19 Cold Spring Harbor Laboratory Antisense oligomers for treatment of dravet syndrome
US11096956B2 (en) 2015-12-14 2021-08-24 Stoke Therapeutics, Inc. Antisense oligomers and uses thereof
WO2018104545A1 (en) * 2016-12-09 2018-06-14 Gene Predictis Sa Method and kit for predicting the risk of deep vein thrombosis and pulmonary embolism
US11377692B2 (en) * 2016-12-09 2022-07-05 Gene Gender S.R.L. Method for predicting the risk of deep vein thrombosis and pulmonary embolism associated with hormonal preparations and hormone levels
JP6829878B2 (ja) * 2017-03-10 2021-02-17 国立大学法人浜松医科大学 加齢黄斑変性の発症リスクの評価方法
EP3673080B1 (en) 2017-08-25 2023-10-18 Stoke Therapeutics, Inc. Antisense oligomers for treatment of conditions and diseases
RS66633B1 (sr) 2017-10-23 2025-08-29 Stoke Therapeutics Inc Antisens oligomeri za lečenje bolesti i stanja na bazi besmisleno posredovanog raspadanja rnk
JP2021523227A (ja) 2018-05-04 2021-09-02 ストーク セラピューティクス，インク． コレステリルエステル蓄積症の処置のための方法及び組成物
SG11202010012PA (en) 2018-05-09 2020-11-27 Ionis Pharmaceuticals Inc Compounds and methods for reducing fxi expression
CA3113435A1 (en) 2018-09-25 2020-04-02 Emory University Nucleic acids for cell recognition and integration
WO2020136216A1 (en) * 2018-12-27 2020-07-02 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods of identifying subjects having or at risk of having a coagulation related disorder
CN113748209A (zh) 2019-02-27 2021-12-03 斯托克制药公司 用于治疗病况和疾病的反义寡聚体
US11216742B2 (en) 2019-03-04 2022-01-04 Iocurrents, Inc. Data compression and communication using machine learning
GB202002202D0 (en) * 2020-02-18 2020-04-01 Ucl Business Plc Gene therapy
AU2021270720A1 (en) 2020-05-11 2022-12-08 Stoke Therapeutics, Inc. OPA1 antisense oligomers for treatment of conditions and diseases
EP3982367A1 (en) * 2020-10-09 2022-04-13 KWS SAAT SE & Co. KGaA Haplotype-block-based imputation of genomic markers
EP4373950A1 (en) * 2021-07-22 2024-05-29 Altius Institute For Biomedical Sciences Erythroid specific enhancers
CN114646664B (zh) * 2022-05-20 2022-08-12 领合(南通)新型建材科技有限公司 新型复合门窗型材隔热性能质量监测方法与系统
CN115198011A (zh) * 2022-08-15 2022-10-18 中日友好医院(中日友好临床医学研究所) 静脉血栓栓塞症多基因检测试剂盒及其应用

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2186913B1 (en) 2003-11-26 2016-02-10 Celera Corporation Genetic polymorphisms associated with cardiovascular disorders and drug response, methods of detection and uses thereof
US20070269827A1 (en) * 2006-05-18 2007-11-22 Oklahoma Medical Research Foundation Predicting and Diagnosing Patients With Autoimmune Disease
JP5409658B2 (ja) * 2008-03-13 2014-02-05 セレラ コーポレーション 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用
US20120108651A1 (en) * 2010-11-02 2012-05-03 Leiden University Medical Center (LUMC) Acting on Behalf of Academic Hospital Leiden (AZL) Genetic polymorphisms associated with venous thrombosis and statin response, methods of detection and uses thereof

Also Published As

Publication number Publication date
US8071291B2 (en) 2011-12-06
CA2717045C (en) 2018-04-10
US20120264692A1 (en) 2012-10-18
EP2276855A4 (en) 2012-02-08
US20090270332A1 (en) 2009-10-29
CA2717045A1 (en) 2009-12-17
US20190249253A1 (en) 2019-08-15
WO2009151691A2 (en) 2009-12-17
US20160281164A1 (en) 2016-09-29
JP2011517935A (ja) 2011-06-23
US11124834B2 (en) 2021-09-21
WO2009151691A3 (en) 2010-06-03
EP2276855A2 (en) 2011-01-26
JP2014003985A (ja) 2014-01-16
EP2276855B1 (en) 2016-05-11
US20130274195A1 (en) 2013-10-17

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP5409658B2 (ja) 静脈血栓症に関連した遺伝子多型、その検出方法および使用
JP6124968B2 (ja) 肝線維症に関連する遺伝的多型、その検出方法および使用
JP6105765B2 (ja) 脳卒中に関連した遺伝子遺伝子多型およびその検出方法および使用
JP5111380B2 (ja) 心臓血管障害および薬物応答に関連する遺伝的多型、その検出方法および使用
JP6147192B2 (ja) 静脈血栓症と関連する遺伝子多型およびスタチン応答、その検出方法ならびにその用途
US7727725B2 (en) Genetic polymorphisms associated with liver fibrosis, methods of detection and uses thereof
JP2009521905A (ja) 冠動脈心疾患に関連する遺伝的多型、その検出方法および使用
US20130078627A1 (en) Genetic polymorphisms associated with liver fibrosis, methods of detection and uses thereof
JP2013078314A (ja) 冠動脈心疾患に関連する遺伝的多型、その検出方法および使用

Legal Events

Date Code Title Description
A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20120309

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20120309

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20130212

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20130712

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20131010

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20131031

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20131105

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Ref document number: 5409658

Country of ref document: JP

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250

R250 Receipt of annual fees

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250