JP5111380B2 - 心臓血管障害および薬物応答に関連する遺伝的多型、その検出方法および使用 - Google Patents
心臓血管障害および薬物応答に関連する遺伝的多型、その検出方法および使用 Download PDFInfo
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Description
本出願は、そのその内容が本出願中にその全体で参考として本明細書によって援用される、2005年9月23日に出願された米国仮出願番号第60/720,274号の利益を主張している。
本発明は、心臓血管障害および薬物応答、特に急性冠状動脈事象および急性冠状動脈事象のスタチン処置の分野に属する。特に、本発明は、ヒトゲノムにおける特定の一塩基多型(SNP)、ならびに異なる個体間のスタチン処置(予防的処置を含む)への応答性における冠状動脈事象および/または変動性とのそれらの関連に関する。本明細書において開示される天然に存在するSNPは、診断試薬の設計および治療剤の開発のため、ならびに疾患関連分析および連鎖分析のための標的として、使用され得る。特に、本発明のSNPは、例えば、個体が急性冠状動脈事象(最初または再発性急性冠状動脈事象のいずか)を経験する可能性があるか否かを識別することにおいて、個体における急性冠状動脈事象の重篤度または結果を予測するため、急性冠状動脈事象からの個体の回復の予後を決定するため、急性冠状動脈事象の処置/予防のためのスタチンへの個体の応答の可能性を評価するため、急性冠状動脈事象の予防および/または処置のための臨床的に重要な情報を提供するため、および治療剤をスクリーニングおよび選択するために有用である。本明細書において開示されるSNPはまた、ヒト同定用途のために有用である。これらの多型およびそれらのコードする産物の存在を検出するための方法、アッセイ、キットおよび試薬が提供される。
(急性冠状動脈事象およびスタチン処置への応答)
本発明は、心臓血管障害の発生、特に心筋梗塞および脳卒中のような急性冠状動脈事象と関連しているSNPに関する。本発明はまた、スタチン(例えば、パラバスタチン)での心臓血管障害の処置(予防的処置を含む)に応答する異なる個体間の変動に関連するSNPに関する。
心筋梗塞(MI)は、先進国における死亡率の最も共通の原因である。それは、アテローム発生、血栓形成および成長を含む多因性疾患である。血栓症は、冠状動脈の完全または部分的閉塞を生じ得る。冠状動脈の管腔狭窄またはブロックは、心筋への酸素および栄養分供給を減少し(心臓虚血)、心筋壊死および/または気絶に至る。MI、不安定アンギナ、または突然の虚血死は、心臓筋肉損傷の臨床的発現である。すべて3つの終点は、急性冠状動脈症候群の一部である。なぜなら、アテローム性動脈硬化症の急性合併症の原因となる機構は、同じであると考えられるからである。
脳卒中は、優勢かつ重篤な疾患である。脳卒中は、障害の最も共通の原因であり、痴呆の第2の先導する原因であり、そして米国における死亡率の第3の先導する原因である。それは、米国で4.7百万の個体に影響し、毎年500,000が最初の攻撃であり、そして200,000が再発事例がある。45才のおよそ4人の男性に1人および5人の女性に1人は、かれらがかれらの85才まで生存する場合、脳卒中を有し得る。脳卒中を有する人々の約25%が1年以内に死亡する。そのため、脳卒中は、米国における死亡率の第3の先導する原因であり、そして1年に170,000の死亡の原因である。脳卒中の攻撃を生存した人々の中で、30〜50%は、機能的独立性を回復しない。従って、脳卒中は、障害の最も共通の原因であり、そして痴呆の第2の先導する原因である。
冠状動脈心臓疾患(CHD)は、米国における心臓血管死亡率の約2/3の原因であり、1998年には、5人の死亡のうちの1人の原因であり、それを死亡率の最も大きな単一の原因にしている(非特許文献6)。脳卒中は、死亡の第3の先導する原因であり、15人の死亡毎に1人の原因である。HMG−CoAレダクターゼインヒビター(スタチン)での処置による、冠状動脈および脳血管事象の減少および全体の死亡率の減少が、多くのランダム化された、二重盲検偽薬コントロール予想試行で示されている(非特許文献7、非特許文献8)。これらの薬物は、肝臓コレステロール合成の阻害を通じてそれらの主要な効果を有し、それによって肝臓中のLDLレセプターを上方制御する。LDL異化における得られる増加は、心臓血管疾患の主要な危険因子である減少した循環性LDLを生じる。さらに、スタチンは、トリグリセリドレベルにおける比較的少ない減少(5〜10%)およびHDLレベルにおける上昇(5〜10%)をもたらす。5年の初期介入試行(WOSCOPS)では、プラバスタチンは、高コレステロール血症被験体中で偽薬と比較して臨床事象を29%減少し、LDL−コレステロール(LDL−C)における26%の減少を達成した(非特許文献9)。平均コレステロールレベルをもつ被験体がロバスタチンで処理された同様の初期予防試行(AFCAPS/TexCARP)(非特許文献10)では、LDL−Cは平均を25%減少し、そして事象は37%だけ減少した。2次的予防スタチン試行は、CARE(非特許文献11)およびLIPID(プラバスタチンでの処置)(非特許文献12)、および4S(シムバスタチンでの処置)(非特許文献13)研究を含む。これらの試行では、臨床事象危険性は、23%〜34%の間から減少され、25%〜35%の間の範囲でLDL−Cが低下した。
全ての生体のゲノムは、それらの継続的な進化の過程で、自然発生性の突然変異を起こし、前駆遺伝子配列の改変形態を生じる(Gusella,Ann.Rev.Biochem.55,831−854(1986))。改変形態は、前駆形態に対して、進化上の利益もしくは不利益を与え得るか、または中立的である。いくつかの例において、改変形態は、その種に進化上の利益を与え、最終的に、その種の多くかまたはほとんどのメンバーのDNAに組み込まれ、効率的にその前駆形態になる。さらに、改変形態の効果は、環境に依存して、有益でもあり有害でもある。例えば、ヘテロ接合性の鎌形赤血球突然変異はマラリアに対する耐性を与えるが、ホモ接合性の鎌形赤血球突然変異は通常は致死性である。多くの場合、前駆形態および改変形態の両方が生き残り、種の集団内で共存する。遺伝子配列の複数の形態の共存は、SNPを含む遺伝的多型をもたらす。
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Atherosclerosis,2001.158(1):p.183−93 Pedro−Botet,J.ら,Apolipoprotein E genotype affects plasma lipid response to atorvastatin in a gender specific manner.Atherosclerosis,2001.158(1):p.183−93
本発明は、新規のSNP、このようなSNPの固有の組み合わせ、ならびに心臓血管障害および/または薬物応答、特に急性冠状動脈事象(例えば、心筋梗塞)および急性冠状動脈事象のような心臓血管障害の処置(予防処置を含む)に関連するSNPのハプロタイプの同定に関する。本明細書において開示される多型は、診断用試薬の設計のための標的として、ならびに心臓血管障害および関連する病態、特に急性冠状動脈事象の診断および処置に使用するための治療剤の開発のための標的として、直接的に有用である。
(i)このヒト被験体が、表1〜2で同定されたSNP、遺伝子、転写物、および/またはコードされたタンパク質を有することを決定する工程、および
(ii)この被験体に、この疾患の影響を相殺する、治療的有効量または予防的有効量の1種以上の薬剤(例えば、スタチン)を投与する工程。
CD000002ORDCDRと名付けられたCD−Rは、以下の5つのテキスト(ASCII)ファイルを含む:
1)ファイルSEQLIST_CD000002ORD.txtは、配列表を提供する。この配列表は、一以上の本発明のSNPを含む各狭窄関連遺伝子に関して、表1に示される転写物配列(配列番号1〜60)およびタンパク質配列(配列番号61〜120)を、そして表2に示されるゲノム配列(配列番号201〜250)を提供する。各SNPに隣接するコンテクスト配列もまた、配列表に提供され、これらは、表1に示される転写物ベースのコンテクスト配列(配列番号121〜200)および表2に示されるゲノムベースのコンテクスト配列(配列番号251〜410)の両方を含む。コンテクスト配列は、一般的に、各SNPを囲む全体で200bpのコンテクスト配列について、このコンテクスト配列の中央にSNPを有し、各SNPの100bp上流(5’)および100bp下流(3’)を提供する。ファイルSEQLIST_CD000002ORD.txtは、サイズ1,451KBであり、そして2006年9月21日に作成された。
表1および表2(どちらもCD−Rで提供される)は、本発明のSNPおよび関連する遺伝子/転写物/タンパク質情報を開示する。各遺伝子について、表1および表2の各々は、遺伝子/転写物/タンパク質情報を含むヘッダーを提供し、このヘッダーの後に、転写物配列およびタンパク質配列(表1)またはゲノム配列(表2)、ならびにその遺伝子/転写物に見出される各SNPに関するSNP情報が続く。
−遺伝子番号(1〜n、ここでn=表の遺伝子の総数)
−遺伝子についてのCelera hCG識別番号およびUID内部識別番号
−転写物についてのCelera hCT識別番号およびUID内部識別番号(表1のみ)
−転写物についての公開Genbank登録番号(例えば、RefSeq NM番号)(表1のみ)
−hCT転写物によりコードされるタンパク質についてのCelera hCP識別番号およびUID内部識別番号(表1のみ)
−タンパク質についての公開Genbank登録番号(例えば、RefSeq NP番号)(表1のみ)
−当該分野で公知の遺伝子記号
−当該分野で公知の遺伝子/タンパク質名
−Celeraゲノム軸位置(開始ヌクレオチド位置−停止ヌクレオチド位置を示す)
−遺伝子が位置する染色体の番号
−各遺伝子の医学的重要性に関するさらなる情報を得るための、OMIM(Onlin
e Mendelian Inheritance in Man;Johns Hop
kins大学/NCBI)公開参照番号
−OMIMエントリにおける代替の遺伝子/タンパク質名および/または記号。
−IUBコードによって同定されたSNPを有する転写産物配列(表1のみ)(配列表の配列番号1〜60に相当する)(転写産物配列は、5’UTR領域、タンパク質コード領域、および3’UTR領域を含み得る)。
−コンテクスト配列(表1の転写産物配列から選択され、そして、表2のゲノム配列から選択される)は、そのIUBコードによって表されるSNPを有し、SNP位置の上流(5’)に100塩基対+SNP位置の下流(3’)に100塩基対を含む(表1の転写産物ベースのSNPコンテクスト配列は、配列表中に配列番号121〜200として提供され、表2のゲノムベースのSNPコンテクスト配列は、配列表中に配列番号251〜410として提供される)。
表3および表4(両方ともCD−Rに提供される)は、表1(表3の場合)または表2(表4の場合)からのSNPの一部のリストを提供し、それらの表では、SNP源は、以下の3つの分類の一つに該当する:1)SNP源が「Applera」のみで、それ以外ではない、SNP、2)SNP源が、「Celera Diagnostics」のみで、それ以外ではない、SNP、および3)SNP源が、「Applera」および「Celera Diagnostics」の両方で、それ以外ではない、SNP。
表5〜21は、表5は、表1〜4に開示されるSNPについての対立遺伝子頻度および統計学的分析の結果を提供する(SNPは、それらのhCV識別番号に基づいて、表の間で相互参照され得る)。統計学的結果は、これらのSNPの冠動脈狭窄との関連に対する支持を提供する。表5〜21に示される結果は、これらのSNPと心臓血管障害(特に、心筋梗塞/再発性MIなどの急性冠状動脈事象)との関連、および/またはこれらのSNPと薬物応答(例えば、急性冠状動脈事象に対する予防的処置として投与されたスタチン)との関連に対する支持を提供する。1つの例として、表5〜21における統計学的結果は、これらのSNPと、MI/RMIの危険性および/またはMIの予防におけるスタチン処置に対する応答との関連が、遺伝子型関連試験における<0.05のP値によって支持されることを示す。
本発明は、心臓血管障害(特に、心筋梗塞および脳卒中などの急性冠状動脈事象(再発性心筋梗塞などの再発性急性冠状動脈事象)と関連するSNP、および心臓血管障害の処置(予防的処置を含む)(特に、急性冠状動脈事象の処置)に使用される治療剤(特に、スタチン)に対する個体の応答性に関連するSNPを提供する。本発明は、これらのSNPを含む核酸分子、本明細書中に開示されるSNPの検出ための方法および試薬、検出試薬の開発のためのこれらのSNPの使用、およびこれらの試薬を使用するアッセイまたはキットをさらに提供する。本明細書中に開示されるスタチン応答関連SNPは、ヒトにおける心臓血管疾患のスタチン処置に対する応答を診断し、スクリーニングし、そして評価するために有用である。さらに、このようなSNPおよびそれらにコードされる産物は、治療薬の開発のための有用な標的である。
表1および表2は、心臓血管障害(例えば、心筋梗塞および脳卒中などの急性冠状動脈事象)および/またはスタチン処置に対する応答性と関連する本発明の各SNPについての種々の情報を提供し、コードされる遺伝子産物(核酸配列中に、IUBコードによって示されるSNPを有する)の転写産物配列(配列番号1〜60)、ゲノム配列(配列番号201〜250)およびタンパク質配列(配列番号61〜120)を含む。さらに、表1および表2は、SNPコンテクスト配列を含み、この配列は、一般に、各SNPの位置の上流(5’)に100ヌクレオチド+下流(3’)に100ヌクレオチド(配列番号121〜200は、表1に開示される転写産物ベースのSNPコンテクスト配列に対応し、配列番号251〜410は、表2に開示されるゲノムベースのコンテクスト配列に対応する)、各SNP位置における代替的なヌクレオチド(対立遺伝子)、および例えば、SNP型(コード部位、ミスセンス部位、スプライシング部位、UTRなど)、SNPが見出されたヒト集団、見出された対立遺伝子頻度、コードされるタンパク質についての情報などに関連する改変体についてのさらなる情報を含む。
本発明は、表1および/または表2に開示された一つ以上のSNPを含む単離された核酸分子を提供する。好ましい単離された核酸分子は、表3および/または表4に同定された一つ以上のSNPを含む。表1〜4の少なくとも一つに開示された一つ以上のSNPを含む単離された核酸分子は、本文を通して相互変換可能に、「SNP含有核酸分子」と言われ得る。単離された核酸分子は、必要に応じて全長改変タンパク質またはそれらのフラグメントをコードし得る。本発明の単離された核酸分子はまた、プローブおよびプライマー(「SNP検出試薬」と題された以下の節により詳細に記載される)を含み、これらは、開示されたSNP、および単離された全長遺伝子、転写産物、cDNA分子、およびこれらのフラグメントをアッセイするために使用され得、これらは、例えば、コードされたタンパク質を発現する目的で使用され得る。
イズする核酸分子を含み、そして、核酸分子の天然供給源に存在するほとんどの他の核酸から分離される。さらに、「単離された」核酸分子(例えば、本発明のSNPを含むcDNA分子)は、他の細胞物質、または組換え技術によって産生される場合、培養培地、または化学合成される場合、化学的前駆物質もしくは他の化学物質を、実質的に含み得ない。核酸分子は、他のコード配列または調節配列に融合され得、それでもなお、「単離された」と考えられ得る。非ヒトトランスジェニック動物に存在する核酸分子は、動物には、天然には存在しないが、やはり「単離された」と考えられる。例えば、ベクター中に含まれる組換えDNA分子は、「単離された」と考えられる。「単離された」DNA分子のさらなる例としては、異種宿主細胞内で維持される組換えDNA分子、および溶液中の(部分的に、または実質的に)精製されたDNA分子が挙げられる。単離されたRNA分子はとしては、本発明の単離されたSNP含有DNA分子のインビボRNA転写産物またはインビトロRNA転写産物が挙げられる。本発明に従う単離された核酸分子としては、さらに、合成により生成されたこのような分子が挙げられる。
65−389(1994))およびKERR(Dufresneら、Nat Biote
chnol 2002 Dec;20(12):1269−71)が挙げられるが、これらに限定されない。生命情報科学技術に関するさらなる情報については、Current Protocols in Bioinformatics,John Wiley & Sons,Inc.,N.Y.を参照のこと。
本発明の特定の局面において、表1および/または表2に開示されたSNPおよびその関連転写物配列(配列番号1〜60として表1に提供される)、ゲノム配列(配列番号201〜250として表2に提供される)および関連配列(転写物ベースの関連配列が、配列番号121〜200として表1に提供され、ゲノムベースの関連配列が、配列番号251〜410として表2に提供される)は、SNP検出試薬の設計のために使用され得る。本明細書中で使用される場合、「SNP検出試薬」は、本明細書中に開示される特定の標的SNP位置を特異的に検出し、好ましくは、標的SNP位置の特定のヌクレオチド(対立遺伝子)に対して特異的である(すなわち、検出試薬は、好ましくは、標的SNP位置にある異なる選択的ヌクレオチドを区別し得、これによって標的SNP位置に存在するヌクレオチドの正体を決定することを可能とする)。代表的に、このような検出試薬は、標的SNP含有核酸分子に対して配列特異的様式の相補的な塩基対合によってハイブリダイズし、試験サンプル中において当該分野で公知の形態のような他の核酸配列から標的改変体の配列を区別する。検出試薬の例は、表1および/または表2に提供される一以上のSNPを含有する標的核酸にハイブリダイズするプローブである。好ましい実施形態において、このようなプローブは、同一の標的SNP位置において異なるヌクレオチドを有する他の核酸から標的SNP位置で特定のヌクレオチド(対立遺伝子)を有する核酸を区別し得る。さらに、検出試薬は、SNP位置に対して5’側および/または3’側にある特定の領域にハイブリダイズし得、特に表1および/または表2に提供される関連配列(転写物ベースの関連配列が、配列番号121〜200として表1に提供され;ゲノムベースの関連配列が、配列番号251〜410として表2に提供される)に対応している領域にハイブリダイズし得る。検出試薬の別の例は、標的ポリヌクレオチドの相補鎖に沿うヌクレオチドの伸長の開始点として作用するプライマーである。本明細書中に提供されるSNP配列の情報はまた、本発明の任意のSNPを(例えば、PCRを使用に)増幅するためのプライマー(例えば、対立遺伝子特異的プライマー)を設計するためにも有用である。
当業者は、本明細書中に開示されるSNPおよび関連する配列情報に基づいて、検出試薬が、本発明の任意のSNPを個別にかまたは組み合わせてアッセイするために開発および使用され得、そのような検出試薬は、当該分野で周知である確立されたキット形態またはシステム形態のうちの1つに容易に組み込まれ得ることを、認識する。用語「キット」および「システム」とは、本明細書中でSNP検出試薬の文脈で使用される場合、複数のSNP検出試薬の組み合わせ、または1つ以上の他の型のエレメントまたは構成要素(例えば、他の型の生化学試薬、容器、パッケ−ジ(例えば、市販用に意図されるパッケ−ジング)、SNP検出試薬が結合している基材、電子ワ−ドウェア構成要素など)と組み合わせた1種以上のSNP検出試薬のようなものを指す。従って、本発明は、SNP検出キットおよびSNP検出システム(パッケ−ジされたプロ−ブとプライマーとの組(例えば、TaqManプロ−ブ/プライマーの組)、核酸分子のアレイ/マイクロアレイ、および本発明の1種以上のSNPを検出するための1種以上のプロ−ブ、プライマー、または他の検出試薬を含むビ−ズが挙げられるが、これらに限定されない)をさらに提供する。上記キット/システムは、種々の電子ハ−ドウェア構成要素を必要に応じて含み得る。例えば、種々の製造業者により提供されるアレイ(「DNAチップ」)および微小流体システム(「ラブ・オン・ア・チップ(lab−on−a−chip)」システム)は、代表的には、ハ−ドウェア構成要素を含む。上記キット/システム(例えば、プロ−ブ/プライマーの組)は、電子ハ−ドウェア構成要素を含まないかもしれないが、例えば、1つ以上の容器中にパッケ−ジングされた1種以上のSNP検出試薬を(必要に応じて、他の生化学試薬とともに)含み得る。
本発明の核酸分子は、特に、心臓血管障害を発症する個体の危険性(特に、心筋梗塞または脳卒中などの初回または再発性の急性冠状動脈事象を経験する危険性)を予測すること、個体における心臓血管障害の進行(例えば、急性冠状動脈事象の重篤度または結果)を予後診断すること、スタチンによる心臓血管障害の処置に応答する心臓血管障害を有する個体の可能性を評価すること、および/あるいは個体がスタチン処置からの毒性または他の望ましくない副作用を経験する可能性を予測することなどにおいて種々の用途を有する。例えば、核酸分子は、ハイブリダイゼーションプローブとして、例えば、メッセンジャーRNA、転写物、cDNA、ゲノムDNA、増幅されたDNAまたは他の核酸分子においてSNPの遺伝子型を特定するために、ならびに全長cDNAおよび表1に開示される改変体ペプチドをコードするゲノムクローンおよびそのオーソログを単離するために有用である。
どの特定のヌクレオチド(すなわち対立遺伝子)が、一以上のSNP位置の各々に存在するかを決定するプロセス(例えば、表1および/または表2に開示される核酸分子のSNP位置)は、SNP遺伝子型特定と称される。本発明は、以下において使用するためのようなSNP遺伝子型特定の方法を提供する:心臓血管疾患(特に、心筋梗塞または脳卒中など急性冠状動脈事象)を発症する個体の危険性を評価することおよび疾患の重篤度および回復に関して個体の予後を評価すること、以前に急性冠状動脈事象を経験している個体が1つ以上の再発性の急性冠状動脈事象を経験する可能性を予測すること、心臓血管障害を発症する感受性の増加(例えば、1つ以上の心筋梗塞または脳卒中を経験する危険性の増加)を有する個体に基づいて個体に対して予防レジメンまたは処置レジメンを実行すること、心臓血管疾患に対するスタチン処置に応答する個体の可能性を評価すること、処置レジメンを選択すること(例えば、心臓血管疾患を有する個体にスタチン処置を適用するか否かを決定すること、または特定のスタチンベースの処置レジメン(例えば、スタチン処置の適用の投薬量および/または頻度)を処方もしくは選択すること、または投与されるスタチンの形態/タイプ(例えば、特定の薬学的組成物または薬学的化合物)を選択することなど)、スタチン処置からの毒性もしくは他の望ましくない副作用を経験する可能性を決定すること、またはスタチンの臨床試験のために個体を選択すること(例えば、スタチン処置から陽性に応答する可能性か最も高い個体を上記臨床試験に参加させるために個体を選択すること)など。
疾患診断、疾患素因スクリーニング、疾患予後、薬物反応性の決定(薬理ゲノム学)、薬物毒性スクリーニングおよび本明細書中に記載される他の用途のためのSNP遺伝子型特定は、代表的に、1種以上の特定のSNPと目的の特定の表現型形質との間の遺伝的関連を最初に確立することに依存する。
.20001,21:273−284)。
遺伝子型と疾患に関連する表現型との間の関連/相関に関する情報は、いくつかの方法で活用され得る。例えば、1つ以上のSNPと、処置が利用可能な疾患に対する素因との間の高度に統計的に有意な関連の場合は、個体におけるこのような遺伝子型パターンの検出は、処置の即時管理、または、少なくとも、個体の定期的なモニタリングの制度を正当化し得る。子供をもうけようと意図している夫婦における、深刻な疾患に関連する感受性対立遺伝子の検出はまた、その生殖決定において、夫婦に価値あるものであり得る。SNPとヒトの疾患との間の、弱いが、なお統計学的に有意な関連の場合、即時の治療的介入またはモニタリングは、感受性対立遺伝子またはSNPを検出した後に正当化されないこともある。それにもかかわらず、被験体は、単純なライフスタイルの変化(例えば、食事、運動)を始めることを動機付けされ得、このライフスタイルの変化は、個体がほとんど、または全く費用をかけずに達成され得るが、個体が感受性対立遺伝子を有することによって危険性が増加し得る、状態を発症する危険性を減少するという、強力な利点を与え得る。
本発明は、特定の治療剤もしくは薬学的化合物、またはこのような化合物のクラスに対して、特定のSNP対立遺伝子もしくはハプロタイプを有する被験体の薬理ゲノム学を評価するための方法を提供する。薬理ゲノム学は、臨床的に有意な遺伝性のバリエーション(例えば、SNP)が、影響を受けた人における変化した薬物の性質および/または異常作用に起因する薬物に対する応答において機能する役割を扱う。例えば、Roses、Nature 405、857−865(2000);Gould Rothberg、Nature Biotechnology 19、209−211(2001);Eichelbaum、Clin.Exp.Pharmacol.Physiol.23(10−11):983−985(1996);およびLinder、Clin.Chem.43(2):254−266(1997)を参照のこと。こららのバリエーションの臨床結果は、代謝における個々のバリエーションの結果として、特定の個体における治療用薬物の重篤な毒性、または特定の個体における薬物の治療不全を生じ得る。従って、個体のSNP遺伝子型は、治療用化合物が身体に作用する様式、または身体がその化合物を代謝する様式を決定し得る。例えば、薬物代謝酵素におけるSNPは、これらの酵素の活性に影響を与え得、これは次々に薬物作用の強度および期間の両方、ならびに薬物代謝および薬物浄化に影響を与え得る。
本明細書中に開示される任意の心臓血管疾患および/またはスタチン応答に関連するタンパク質(およびコードする核酸分子)は、心臓血管障害および関連の病状を処置するための治療標的として用いられ得(またはそれ自体が治療用化合物として直接用いられ得)、そして本開示は、これらの治療標的のいずれかを標的とする(またはそれらから構成される)治療用化合物(例えば、低分子、抗体、治療タンパク質、RNAiおよびアンチセンス分子など)が開発されることを可能にする。
心臓血管障害および心臓血管障害のスタチン処置におけるそれらの診断用途および治療用途に加えて、本発明により提供されるSNPはまた、法医学、親子鑑定、および生物測定法(例えば、Gill,「An assessment of the utility of single nucleotide polymorphisms(SNPs) for forensic purposes」,Int J Legal Med.2001;114(4−5):204−10を参照のこと)のような適用のためのヒト識別マーカーとして有用である。個体間の核酸配列における遺伝的変動は、個体を識別し、生物学的サンプルと個体とを識別するために遺伝マーカーとして使用され得る。どのヌクレオチドが個体におけるSNP位置のセットを占めるかという決定は、その個体を区別するSNPマーカーのセットを識別する。分析されるSNP位置が多いほど、1個体におけるSNPのセットが、関連しない個体におけるSNPのセットと同じである確率は、低くなる。好ましくは、複数の部位が分析される場合、その部位は、連鎖していない(すなわち、独立して遺伝する)。従って、SNPの好ましいセットは、本明細書中に開示されるSNPの中から選択され得、これらのSNPとしては、異なる染色体上のSNP、異なる染色体アーム上のSNP、および/または同じ染色体アームに沿って実質的な距離だけ離れて分散されるSNPが挙げられ得る。
(SNP含有核酸分子によりコードされる改変タンパク質)
本発明は、SNP含有核酸分子を提供し、その多くは、当該分野で公知の(すなわち、野生型)タンパク質と比較して、改変体アミノ酸配列をコードするタンパク質をコードする。本発明の多型核酸分子によりコードされるアミノ酸配列は、表1および配列表において配列番号61〜120として提供される:これらの改変体は、一般に、本発明の改変タンパク質/ペプチド/ポリペプチド、または多型タンパク質/ペプチド/ポリペプチドといわれる。用語「タンパク質」、「ペプチド」、および「ポリペプチド」は、交換可能に本明細書中で使用される。
本発明の改変タンパク質は、種々の方法で使用され得る以下が挙げられるが、これらに限定されない:改変タンパク質の生物活性を決定するためのアッセイ(例えば、高処理能力スクリーニングのための複数タンパク質の一団におけるアッセイ)において使用され得る;抗体を産生させるか、または別の型の免疫応答を誘発するため使用され得る;生体液中の改変タンパク質(またはその結合パートナー)のレベルを定量的に決定するために設計されたアッセイにおける試薬(標識された試薬を含む)として使用され得る;細胞または組織に対するマーカーとして(この細胞または組織において、このマーカーは、(構成的に、または組織分化もしくは組織発生の特定の段階で、あるいは疾患状態でのいずれかで)優先的に発現される);治療剤のスクリーニングのための標的として使用され得る;およびヒト被験体に投与される直接的治療剤として使用され得る。本明細書中に開示される任意の改変タンパク質は、研究用製品としての商品化のために試薬等級またはキット型へと開発され得る。上記で列挙された用途を実行するための方法は、当業者に周知である(例えば、Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,SambrookおよびRussell,2000,ならびにMethods in Enzymology:Guide to Molecular Cloning Techniques,Academic Press,Berger,S.L.およびA.R.Kimmel(編),1987を参照のこと)。
本発明はまた、本明細書中に開示される改変タンパク質およびそのフラグメントに選択的に結合する抗体を提供する。このような抗体は、本発明の改変タンパク質を定量的に、または定性的に検出するために使用され得る。本明細書中で使用される場合、抗体が改変タンパク質に結合するが、非改変タンパク質に有意に結合しない場合(すなわち、抗体が、本発明の1つ以上のSNPに起因する改変体アミノ酸配列を含まない、正常タンパク質、野生型タンパク質、または当該分野で公知のタンパク質に有意に結合しない場合)、この抗体は、標的改変タンパク質に選択的に結合する(改変体アミノ酸配列は、例えば、非同義的cSNP、停止コドンを作製し、それによってポリペプチドの短縮を引き起こすナンセンスSNP、またはポリペプチドの伸長をもたらす読み通し変異を引き起こすSNPに起因し得る)。
抗体は、標準的な技術(例えば、アフィニティークロマトグラフィーまたは免疫沈降)によって天然の細胞供給源からまたは組換え宿主細胞から、本発明の改変タンパク質を単離するために使用され得る。さらに、抗体は、生物の種々の組織の間、および正常な発生または疾患の進行の過程にわたって、種々のタンパク質の発現のパターンを決定するために、細胞または組織において本発明の改変タンパク質の存在を検出するために有用である。さらに、抗体は、発現の量およびパターンを評価するためにに、インサイチュ、インビトロ、体液中、または細胞溶解物もしくは懸濁液において、改変タンパク質を検出するために使用され得る。また、抗体は、異常な組織分布、発生の間の異常な発現、または異常な状態(例えば、心臓血管障害またはスタチン処置の間)における発現を評価するために使用され得る。さらに、全長改変タンパク質の循環するフラグメントの抗体検出は、代謝回転を同定するために使用され得る。
本発明はまた、本明細書中に記載されるSNP含有核酸分子を含むベクターを提供する。用語「ベクター」は、ビヒクル、好ましくは、核酸分子をいい、これは、SNP含有核酸分子を輸送し得る。このベクターが核酸分子である場合、SNP含有核酸分子は、ベクター核酸に共有結合的に連結され得る。このようなベクターとしては、プラスミド、一本鎖ファージもしくは二本鎖ファージ、一本鎖RNAウイルスベクターもしくは二本鎖RNAウイルスベクター、または一本鎖DNAウイルスベクターもしくは二本鎖DNAウイルスベクター、あるいは人工染色体(例えば、BAC、PAC、YAC、またはMAC)が挙げられるが、これらに限定されない。
ーター、およびTACプロモーター、SV40由来の初期プロモーターおよび後期プロモーター、CMV最初期プロモーター、アデノウイルス初期プロモーターおよびアデノウイルス後期プロモーター、ならびにレトロウイルス末端反復配列が挙げられるがこれらに限定されない。
れらは、それぞれグルタチオンS−トランスフェラーゼ(GST)、マルトースE結合タンパク質、またはプロテインAを標的組換えタンパク質に融合する)が挙げられる。適切な誘導性非融合E.coli発現ベクターの例としては、pTrc(Amannら,Gene 69:301−315(1988))およびpET 11d(Studierら,Gene Expression Technology:Methods in Enzymology 185:60−89(1990))が挙げられる。
本明細書中に記載される改変タンパク質を発現する組換え宿主細胞は、種々の用途を有する。例えば、細胞は、所望量の改変タンパク質またはそのフラグメントの調製物に精製され得る改変タンパク質を産生するために有用である。従って、発現ベクターを含む宿主細胞は、改変タンパク質産生に有用である。
本発明において提供されるSNPは、その使用を容易にするために、種々の媒体中に「提供され」得る。この節において使用される場合、「提供される」とは、単離された核酸分子以外の製品をいい、この製品は、本発明のSNP情報を含む。このような製品は、それらが天然もしくは精製された形態にある場合、SNPもしくはその部分集合の試験に直接には適用可能でない手段を用いて、当業者が製品を試験することを可能にする形態で、SNP情報を提供する。このような形態で提供され得るSNP情報は、例えば、配列番号1〜60、配列番号61〜120、配列番号201〜250、配列番号121−200、および配列番号251〜410のような多型核酸配列ならびに/または多型アミノ酸配列の情報;観察されたSNP対立遺伝子、代替的なコドン、母集団、対立遺伝子出現率、SNP型、および/もしくは影響を受けるタンパク質についての情報;または表1〜2および/もしくは配列表において本発明により提供される任意の他の情報のような、本発明により提供される任意のSNP情報を含む。
論および/もしくはデータを読むために適切なソフトウェアを備える。
以下の実施例は、例示のために提供されるが、特許請求の発明を限定するものではない。
急性冠状動脈事象(例えば、MI、脳卒中、不安定狭心症、うっ血性心不全など)または冠状動脈事象の予防のためのスタチン処置に対する応答に関連する遺伝的マーカーを同定するために、サンプルを、2つの臨床試験において遺伝子型特定した:Cholesterol and Recurrent Events(CARE)研究(プラバスタチンに対する急性冠状動脈事象の二次的予防におけるランダム化された多施設二重盲検試験;Sacksら、Am.J.Cardiol.68:1436−1446[1991])、およびWest of Scotland Coronary Prevention Study(WOSCOPS)研究(Shepherdら、N Eng J Med 333(20)、pp.1301−7、1995年11月16日;Packardら、N Eng J Med 343 (16)、pp.1148−55、Oct.19、2000年10月19日)。
hCV3054799と患者におけるMIの危険性との関連を、プラバスタチンまたは偽薬のいずれかによる処置を受容する患者による2つの臨床試験(CAREおよびWOSCOPS)において試験した。CAREは、第二次予防試験(すなわち、エンドポイントとしての再発性MI)であり、WOSCOPSは、第1次予防試験であった。5年間のCARE追跡調査の間に第2のMIを有した244人の患者の群(ケース)におけるSNP遺伝子型頻度を、第2のMIを経験しなかった2471人のCARE患者の群(コントロール)における頻度と比較した。この知見を再現するために、WOSCOPS追跡調査の5年以内にMIを有した483人の患者の群(ケース)におけるSNP遺伝子型頻度を、MIを経験しなかった1094人のWOSCOPS患者の群(コントロール)における頻度と比較した。WOSCOPS(コホート内ケース−コントロール研究)における分析を、エンドポイントとしてMIを使用して行なった。
CARE患者の分析において、統計学的分析を、SASバージョン9を用いて行なった。Cox比例ハザードモデル(ワルド検定)を、遺伝子型と、偽薬治療群における起こり易いMIの危険性および、遺伝子型によって定義されたサブグループにおける偽薬と比較したMIプラバスタチンの効果の両方との関連を評価するためにCAREにおいて使用した。WOSCOPS患者の分析において、条件ロジスティック回帰モデルを、コントロールが以前にケースと一致していたことを前提としてWOSCOPSにおいて使用した。「試験中のMI」と名付けられた欄は、臨床試験期間の間にRMIを罹患した患者の数を列挙する。
さらなる175種のマーカーを、CARE研究(第二次MI予防試験)からのサンプルにおいて分析した。CAREにおける全ての患者は、その試験における登録の10ヶ月前以内にMIを有した。5年間の追跡調査の間、264人の患者は、再発性MIを経験し(ケース)、そして2649人の患者は、再発性MIを経験しなかった。(コントロール)。ケースに関して、150人は、偽薬処置を受容し、そして114人は、プラバスタチンを受容した;コントロールに関して、1290人は、偽薬を受容し、そして1359人は、プラバスタチンを受容した。
研究を、表1〜20に示されるような、MI/RMIの危険性およびスタチン処置に対する応答に関連することが見出されているSNPを有する連鎖不均衡(LD)におけるSNPマーカーを同定するために行なった。簡単にいうと、検出力閾値(T)を、LDマーカーを使用して疾患の関連を検出するために51%に設定した。この検出力閾値は、先の疾患関連研究からの対立遺伝子頻度データ、真に疾患に関連するマーカーを検出しない予想される誤差率、および0.05の有意水準を組み込む上記の方程式(31)に基づく。この検出力の算出およびサンプルサイズを使用して、それぞれの調べられたSNPに対して、LDの閾値レベルまたはr2値を、導出した(r2 T、方程式(32)および(33))。閾値r2 Tは、調べられたSNPとその可能なLD SNPとの間の連鎖不均衡の最小値であり、その結果、調べられていないSNPは、依然として疾患の関連を検出するために、Tより大きいか、またはTに等しい検出力を維持する。
用される。記載されている本発明の組成物、方法およびシステムの種々の改変および変化
が、本発明の範囲および精神から逸脱することなく、当業者に明らかである。本発明は、
特定の好ましい実施形態および特定の実施例と関連して記載されているが、特許請求され
ているような本発明が、このような特定の実施形態に不当に限定されるべきではないこと
が理解されるべきである。実際に、分子生物学、遺伝学および関連する分野の当業者に明
らかな、本発明を実施するための上に記載された様式の種々の改変が、添付の特許請求の
範囲の範囲内であることが意図される。
遺伝子番号: 1
Celera 遺伝子: hCG15777 - 30000022987759
Celera 転写物: hCT6806 - 30000022987761
公開転写物アクセッション: NM_173676
Celera タンパク質: hCP35358 - 30000022987751
公開タンパク質アクセッション: NP_775947
遺伝子シンボル: PNPLA1
タンパク質名: patatin-like phospholipase domain containing 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(9219805..9305282)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号1):
タンパク質配列 (配列番号61):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号121):
TGTAATGGAGAGCCCTGCTGAAGACTCAAACTGGGTGAATAAGGTCTTCAAGAAGAACAAGCAAAAGACAAGTGGCACCAGAAAAGGCTTCCCAAGACAT
Y
CGGGATCCAAAAAACCAAGCAGCAAAGTGCAGTGAGCATGTCTAATGTTCCTTAAATCCCACGGAGAGGAGCAGCTTTGGGAACTGTGTTCAGAGAGATT
Celera SNP ID: hCV2476746
公開 SNP ID: rs4713956
転写配列のSNP 配列番号1
SNP位置, 転写物: 1453
SNP 供給源: ABI_Val;Celera;HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(C,-|T,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号61, 427位において,(S,TCG) (P,CCG)
遺伝子番号: 2
Celera 遺伝子: hCG16019 - 146000220356722
Celera 転写物: hCT1952605 - 146000220356734
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1761679 - 197000064917833
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: MLF1
タンパク質名: myeloid leukemia factor 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(37001831..37057013)
染色体: 3
OMIM 番号: 601402
OMIM 情報: Leukemia, acute myeloid, 601626 (1)
転写配列 (配列番号2):
タンパク質配列 (配列番号62):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号122):
GTCATCATATCCATGACCGAGCTCATGTCATTAAAAAGTCAAAGAACAAGAAGACTGGAGATGAAGAGGTCAACCAGGAGTTCATCAATATGAATGAAAG
Y
GATGCTCATGCTTTTGATGAGGAGTGGCAAAGTGAGGTTTTGAAGTACAAACCAGGACGACACAATCTAGGAAACACTAGAATGAGAAGTGTTGGCCATG
Celera SNP ID: hCV15974589
公開 SNP ID: rs4875
転写配列のSNP 配列番号2
SNP位置, 転写物: 666
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,47|C,73)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号62, 205位において,(S,AGT) (S,AGC)
コンテクスト (配列番号123):
TGATATCTGAATGTTCATGAAGGTCCTAGCTTTATATTGTCCCTCTTTTAGGAATAAAATTTTGATTTTCAACAATGTGAGTAAATTGAGTCTATTTAAT
R
TAAAACTCTTTAAAACATACTAATTTTTTAAAGCTTATATGCTTATTTCGCTTCCCCAGTTGTTTTTGTGTTGGCTAAATATTCTTTTATATTTATCAAG
Celera SNP ID: hCV29114176
公開 SNP ID: rs6804259
転写配列のSNP 配列番号2
SNP位置, 転写物: 1124
Related Interrogated SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,43|A,63)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 2
Celera 遺伝子: hCG16019 - 146000220356722
Celera 転写物: hCT7049 - 146000220356723
公開転写物アクセッション: NM_022443
Celera タンパク質: hCP34143 - 197000064917832
公開タンパク質アクセッション: NP_071888
遺伝子シンボル: MLF1
タンパク質名: myeloid leukemia factor 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(37001831..37057013)
染色体: 3
OMIM 番号: 601402
OMIM 情報: Leukemia, acute myeloid, 601626 (1)
転写配列 (配列番号3):
タンパク質配列 (配列番号63):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号124):
GTCATCATATCCATGACCGAGCTCATGTCATTAAAAAGTCAAAGAACAAGAAGACTGGAGATGAAGAGGTCAACCAGGAGTTCATCAATATGAATGAAAG
Y
GATGCTCATGCTTTTGATGAGGAGTGGCAAAGTGAGGTTTTGAAGTACAAACCAGGACGACACAATCTAGGAAACACTAGAATGAGAAGTGTTGGCCATG
Celera SNP ID: hCV15974589
公開 SNP ID: rs4875
転写配列のSNP 配列番号3
SNP位置, 転写物: 694
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,47|C,73)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号63, 190位において,(S,AGT) (S,AGC)
コンテクスト (配列番号125):
TGATATCTGAATGTTCATGAAGGTCCTAGCTTTATATTGTCCCTCTTTTAGGAATAAAATTTTGATTTTCAACAATGTGAGTAAATTGAGTCTATTTAAT
R
TAAAACTCTTTAAAACATACTAATTTTTTAAAGCTTATATGCTTATTTCGCTTCCCCAGTTGTTTTTGTGTTGGCTAAATATTCTTTTATATTTATCAAG
Celera SNP ID: hCV29114176
公開 SNP ID: rs6804259
転写配列のSNP 配列番号3
SNP位置, 転写物: 1152
Related Interrogated SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,43|A,63)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 3
Celera 遺伝子: hCG1641616 - 79000075093172
Celera 転写物: hCT1641743 - 79000075093173
公開転写物アクセッション: NM_001447
Celera タンパク質: hCP1633863 - 197000069447433
公開タンパク質アクセッション: NP_001438
遺伝子シンボル: FAT2
タンパク質名: FAT tumor suppressor homolog 2 (Drosophila)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VUFE(24331975..24417314)
染色体: 5
OMIM 番号: 604269
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号4):
タンパク質配列 (配列番号64):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号126):
CCCCAAGTACTTCCTGTCCATTGAGTGCAGCCGGAAGAGCTCCTCTTCCCTCAGTGACGTGACCACAGTCATGGTCAACATCACTGATGTCAATGAACAC
Y
GGCCCCAATTCCCCCAAGATCCATATAGCACAAGGGTCTTAGAGAATGCCCTTGTGGGTGACGTCATCCTCACGGTATCAGCGACTGATGAAGATGGACC
Celera SNP ID: hCV15973230
公開 SNP ID: rs2304024
転写配列のSNP 配列番号4
SNP位置, 転写物: 9965
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,92|T,28)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号64, 3318位において,(R,CGG) (W,TGG)
コンテクスト (配列番号127):
TGCAGCTGATCCTGAGTGACCCAGATTCTCCAGAGAATGGCCCCCCCTACTCGTTTCGAATCACCAAGGGGAACAACGGCTCTGCCTTCCGAGTGACCCC
R
GATGGATGGCTGGTGACTGCTGAGGGCCTAAGCAGGAGGGCTCAGGAATGGTATCAGCTTCAGATCCAGGCGTCAGACAGTGGCATCCCTCCCCTCTCGT
Celera SNP ID: hCV25639371
公開 SNP ID: rs3734051
転写配列のSNP 配列番号4
SNP位置, 転写物: 10450
Related Interrogated SNP: hCV15973230 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,86|A,32)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号64, 3479位において,(P,CCG) (P,CCA)
コンテクスト (配列番号128):
TCCGAGTGACCCCGGATGGATGGCTGGTGACTGCTGAGGGCCTAAGCAGGAGGGCTCAGGAATGGTATCAGCTTCAGATCCAGGCGTCAGACAGTGGCAT
M
CCTCCCCTCTCGTCTTCGACGTCTGTCCGTGTCCATGTCACAGAGCAGAGCCACTATGCACCTTCTGCTCTCCCACTGGAGATCTTCATCACTGTTGGAG
Celera SNP ID: hCV25951598
公開 SNP ID: rs3734049
転写配列のSNP 配列番号4
SNP位置, 転写物: 10537
Related Interrogated SNP: hCV15973230 (Power=.8)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,29|A,7) アフリカ系アメリカ人(C,24|A,4) 全体(C,53|A,11)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号64, 3508位において,(I,ATC) (I,ATA)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,92|A,24)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号64, 3508位において,(I,ATC) (I,ATA)
コンテクスト (配列番号129):
CTGAGGGCCTAAGCAGGAGGGCTCAGGAATGGTATCAGCTTCAGATCCAGGCGTCAGACAGTGGCATCCCTCCCCTCTCGTCTTCGACGTCTGTCCGTGT
S
CATGTCACAGAGCAGAGCCACTATGCACCTTCTGCTCTCCCACTGGAGATCTTCATCACTGTTGGAGAGGATGAGTTCCAGGGTGGCATGGTGGGTAAGA
Celera SNP ID: hCV25953895
公開 SNP ID: rs3734047
転写配列のSNP 配列番号4
SNP位置, 転写物: 10570
Related Interrogated SNP: hCV15973230 (Power=.8)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,8|C,30) アフリカ系アメリカ人(G,4|C,28) 全体(G,12|C,58)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号64, 3519位において,(V,GTC) (V,GTG)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,95|G,25)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号64, 3519位において,(V,GTC) (V,GTG)
遺伝子番号: 4
Celera 遺伝子: hCG1643662 - 84000314615955
Celera 転写物: hCT1643789 - 84000314615956
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1639904 - 197000069387300
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VT2P(430754..547362)
染色体: 10
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号5):
タンパク質配列 (配列番号65):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号130):
GCTCCCAGAACTAGGAAACTTATATTTAACTGGTCAGAAGAAGGTATGCAAAGTGGAGAACAGCCCCTGGGTTACCCCAATTGCTGGCCAGTTCCAGCTT
S
ATGTGTCCTGTGTGTCTGAATGTGTCTGTTCTGAGACATATGAGTACCTCTATGGCAGCACATGCAGGCAAATCCAGAACCACCAAAACATAATAATCAC
Celera SNP ID: hCV881283
公開 SNP ID: rs211070
転写配列のSNP 配列番号5
SNP位置, 転写物: 550
SNP 供給源: dbSNP; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,113|C,1)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号65, 184位において,(D,GAT) (H,CAT)
遺伝子番号: 5
Celera 遺伝子: hCG1644106 - 103000085235807
Celera 転写物: hCT1644233 - 103000085235808
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1612404 - 197000069434377
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: FLJ20014
タンパク質名: hypothetical protein FLJ20014
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7319816..7341647)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号6):
タンパク質配列 (配列番号66):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号131):
AACTCAAGATCCGTCTGAGCGGCGCGCCTCCACCCCCGCCTTCTGCCCCTGCGCGGCCCTGCCCAGCGCCTGCACCCACACCCACACCGGCCATTCCCCC
M
ATCGACCCCGAGGTGCTGCGGGATCTGGAGCGGTTGAGTCGGGAGCTGGGAGGCCGGGTGGACCGTCTGCTTCGCGGTCTGGGTGGCGCGGTGCAGGAGC
Celera SNP ID: hCV7453127
公開 SNP ID: rs8531
転写配列のSNP 配列番号6
SNP位置, 転写物: 788
Related Interrogated SNP: hCV22275215 (Power=.51)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,26|A,6) アフリカ系アメリカ人(C,10|A,2) 全体(C,36|A,8)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号66, 255位において,(P,CCC) (P,CCA)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,30|A,6) アフリカ系アメリカ人(C,22|A,14) 全体(C,52|A,20)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号66, 255位において,(P,CCC) (P,CCA)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,16|C,88)
SNP 型: サイレント変異
コードタンパク質: 配列番号66, 255位において,(P,CCC) (P,CCA)
遺伝子番号: 6
Celera 遺伝子: hCG1647070 - 84000313730920
Celera 転写物: hCT1647197 - 84000313730921
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1617236 - 197000069366336
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: KIF6
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(12311520..12426711)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号7):
タンパク質配列 (配列番号67):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号132):
GTGGGCAGAGGAGGCCACCAACCTGCAGGTAAATTCTCCAGCAGTGAATTCACTCGATCACACGAAGCCATTTCTCCAGACATCTGACTCCCAGCATGAA
Y
GGTCCCAACTCCTCTCTAACAAAAGTTCTGGAGGCTGGGAAGTCCAAGATCAAGGCACTGGCAGATTCGATGTCTGTGATGTGAATGCCAGGAAAATCCT
Celera SNP ID: hCV3054799
公開 SNP ID: rs20455
転写配列のSNP 配列番号7
SNP位置, 転写物: 694
SNP 供給源: ABI_Val;Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(T,-|C,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号67, 170位において,(W,TGG) (R,CGG)
遺伝子番号: 7
Celera 遺伝子: hCG16542 - 30000023220752
Celera 転写物: hCT7580 - 30000023220753
公開転写物アクセッション: NM_139209
Celera タンパク質: hCP34181 - 30000023220751
公開タンパク質アクセッション: NP_631948
遺伝子シンボル: GRK7
タンパク質名: G protein-coupled receptor kinase 7
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(53789104..53849271)
染色体: 3
OMIM 番号: 606987
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号8):
タンパク質配列 (配列番号68):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号133):
TTGCAGGCTCTTCTTGGCTAAGAAACCAGAGCAACGCTTAGGAAGCAGAGAAAAGTCTGATGATCCCAGGAAACATCATTTCTTTAAAACGATCAACTTT
M
CTCGCCTGGAAGCTGGCCTAATTGAACCCCCATTTGTGCCAGACCCTTCAGTGGTTTATGCCAAAGACATCGCTGAAATTGATGATTTCTCTGAGGTTCG
Celera SNP ID: hCV465412
公開 SNP ID:
転写配列のSNP 配列番号8
SNP位置, 転写物: 1378
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,4|C,36) アフリカ系アメリカ人(A,3|C,35) 全体(A,7|C,71)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号68, 460位において,(P,CCT) (T,ACT)
SNP 供給源: Celera
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|C,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号68, 460位において,(P,CCT) (T,ACT)
遺伝子番号: 8
Celera 遺伝子: hCG1657517 - 84000314340970
Celera 転写物: hCT1657644 - 84000314340971
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1610709 - 197000069429481
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W8B1(17712978..17756628)
染色体: 13
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号9):
タンパク質配列 (配列番号69):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号134):
ATATGCAAGTGAATCAACTTGCCAGATAAAAGTTTGCTGCCTAAATATGATTACTAGGAAAGCCAAGTCTCTCTTCCTGGATTTCTTCTCCTATAAACCG
Y
CTATTGATACCTACCCACTTCTCTATGGAGCACAGATGAAGGATATTGGTCATCTCCAGCATCTAGCACAACGTCTGCAATGGAACAGGCGAGCTGTGAA
Celera SNP ID: hCV9879153
公開 SNP ID: rs3736919
転写配列のSNP 配列番号9
SNP位置, 転写物: 215
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,61|T,57)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号69, 39位において,(P,CCT) (S,TCT)
遺伝子番号: 9
Celera 遺伝子: hCG1658913 - 61000125195351
Celera 転写物: hCT1659040 - 61000125195352
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1633631 - 197000069405775
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VU0F(3643581..3713961)
染色体: 9
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号10):
タンパク質配列 (配列番号70):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号135):
CCCTGTACCTCATCATGGCCACGGGCATGAGGGAATGATGCTGGATCATGACCTTAAAGGAACCATGCAGCTCTATGGGCATGAAGAAGCCATGCAGTAT
S
ATGGCCATGAGGGAACCATGAGGCTCCATGGGCATGAGGAACCATGCAGCTCCATGGCCATAAGGGAATCATGCAGCTACAGGGCCATGAGGAGCCATGC
Celera SNP ID: hCV25741584
公開 SNP ID: rs12685413
転写配列のSNP 配列番号10
SNP位置, 転写物: 476
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,120|C,-)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 10
Celera 遺伝子: hCG17584 - 146000220354806
Celera 転写物: hCT1952608 - 146000220354817
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1761719 - 197000064917858
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: LXN
タンパク質名: latexin
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(36936789..36983633)
染色体: 3
OMIM 番号: 609305
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号11):
タンパク質配列 (配列番号71):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号136):
TACATCAACTACCAGCAGGGGACCCCGCACAGGGTGTTTGAGGTGCAGAAGGTCAAACAAGCCAGCATGGAGGATATTCCAGGAAGAGGACATAAGTATC
R
CCTTAAATTTGCTGTTGAAGAAATTATACAAAAACAAGTTAAGGTGAACTGCACAGCTGAAGTACTTTACCCTTCAACGGGACAAGAAACTGCACCAGAA
Celera SNP ID: hCV11238304
公開 SNP ID: rs8455
転写配列のSNP 配列番号11
SNP位置, 転写物: 362
Related Interrogated SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,10|A,10) アフリカ系アメリカ人(G,8|A,0) 全体(G,18|A,10)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号71, 53位において,(H,CAC) (R,CGC)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,49|G,71)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号71, 53位において,(H,CAC) (R,CGC)
遺伝子番号: 10
Celera 遺伝子: hCG17584 - 146000220354806
Celera 転写物: hCT8635 - 146000220354807
公開転写物アクセッション: NM_020169
Celera タンパク質: hCP34244 - 197000064917857
公開タンパク質アクセッション: NP_064554
遺伝子シンボル: LXN
タンパク質名: latexin
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(36936789..36983633)
染色体: 3
OMIM 番号: 609305
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号12):
タンパク質配列 (配列番号72):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号137):
TACATCAACTACCAGCAGGGGACCCCGCACAGGGTGTTTGAGGTGCAGAAGGTCAAACAAGCCAGCATGGAGGATATTCCAGGAAGAGGACATAAGTATC
R
CCTTAAATTTGCTGTTGAAGAAATTATACAAAAACAAGTTAAGGTGAACTGCACAGCTGAAGTACTTTACCCTTCAACGGGACAAGAAACTGCACCAGAA
Celera SNP ID: hCV11238304
公開 SNP ID: rs8455
転写配列のSNP 配列番号12
SNP位置, 転写物: 362
Related Interrogated SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,10|A,10) アフリカ系アメリカ人(G,8|A,0) 全体(G,18|A,10)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号72, 53位において,(H,CAC) (R,CGC)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,49|G,71)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号72, 53位において,(H,CAC) (R,CGC)
遺伝子番号: 11
Celera 遺伝子: hCG1772922 - 107000109464830
Celera 転写物: hCT1811512 - 107000109464831
公開転写物アクセッション: NM_021632
Celera タンパク質: hCP1733133 - 197000069407806
公開タンパク質アクセッション: NP_067645
遺伝子シンボル: ZNF350
タンパク質名: zinc finger protein 350
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VY4T(1814231..1856919)
染色体: 19
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号13):
タンパク質配列 (配列番号73):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号138):
CCCCTCAGACATCATTAAACATCAGCGGCCTCCTCGCAAACAGGAACGTAGTCCTTGTGGGACAGCCAGTGGTCAGATGTGCAGCCTCAGGAGATAACAG
W
GGATTTGCACAGGACAGAAACCTTGTGAATGCAGTGAATGTGGTTGTGCCTTCCGTGATCAATTATGTCTTATTTTATGTTACAGAAAACCCATAGGAAG
Celera SNP ID: hCV15965459
公開 SNP ID: rs2278415
転写配列のSNP 配列番号13
SNP位置, 転写物: 1728
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,104|T,16)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号73, 501位において,(R,AGA) (S,AGT)
遺伝子番号: 11
Celera 遺伝子: hCG1772922 - 107000109464830
Celera 転写物: hCT2296352 - 107000109464840
公開転写物アクセッション: NM_021632
Celera タンパク質: hCP1874543 - 197000069407807
公開タンパク質アクセッション: NP_067645
遺伝子シンボル: ZNF350
タンパク質名: zinc finger protein 350
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VY4T(1814231..1856919)
染色体: 19
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号14):
タンパク質配列 (配列番号74):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号139):
CCCCTCAGACATCATTAAACATCAGCGGCCTCCTCGCAAACAGGAACGTAGTCCTTGTGGGACAGCCAGTGGTCAGATGTGCAGCCTCAGGAGATAACAG
W
GGATTTGCACAGGACAGAAACCTTGTGAATGCAGTGAATGTGGTTGTGCCTTCCGTGATCAATTATGTCTTATTTTATGTTACAGAAAACCCATAGGAAG
Celera SNP ID: hCV15965459
公開 SNP ID: rs2278415
転写配列のSNP 配列番号14
SNP位置, 転写物: 1674
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,104|T,16)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号74, 501位において,(R,AGA) (S,AGT)
遺伝子番号: 12
Celera 遺伝子: hCG1783416 - 104000116835546
Celera 転写物: hCT1822355 - 104000116835547
公開転写物アクセッション: NM_024843
Celera タンパク質: hCP1728260 - 197000064925936
公開タンパク質アクセッション: NP_079119
遺伝子シンボル: CYBRD1
タンパク質名: cytochrome b reductase 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W8UP(22874959..22930607)
染色体: 2
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号15):
タンパク質配列 (配列番号75):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号140):
ACCATTCTTCATCCAAATGGAGGCACTGAACAGGGAGCAAGAGGTTCCATGCCAGCCTACTCTGGCAACAACATGGACAAATCAGATTCAGAGTTAAACA
R
TGAAGTAGCAGCAAGGAAAAGAAACTTAGCTCTGGATGAGGCTGGGCAGAGATCTACCATGTAAAATGTTGTAGAGATAGAGCCATATAACGTCACGTTT
Celera SNP ID: hCV3200162
公開 SNP ID: rs10455
転写配列のSNP 配列番号15
SNP位置, 転写物: 870
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,12|G,6) アフリカ系アメリカ人(A,32|G,0) 全体(A,44|G,6)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号75, 266位において,(N,AAT) (S,AGT)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,17|G,13) アフリカ系アメリカ人(A,32|G,6) 全体(A,49|G,19)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号75, 266位において,(N,AAT) (S,AGT)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,31|A,89)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号75, 266位において,(N,AAT) (S,AGT)
コンテクスト (配列番号141):
CAAATTAAAACCTAGAGTAGTGCTTATGCTGAAATGATACTTTTCATTTTTTGGTTGATTTTTTTGCCTTCCCTTCAATTTTAAACTGAAGCATTTTAAT
R
TGGGTAGAAACTCTACACCAAATACACTAAACATTTTGGTGCTTAGTGGATTTCTTTTTAGGTAACTGGTACTTACTTCCAAAGACTGAATACAAGCCAC
Celera SNP ID: hCV27053832
公開 SNP ID: rs2542939
転写配列のSNP 配列番号15
SNP位置, 転写物: 2614
Related Interrogated SNP: hCV3200162 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,32|G,86)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号142):
GTGTCTACTAGTAGTTAATTGGATAAACTGGCAGCATCCCTGGCCTGTTGTCATGCAGTCATTTCCTGTTAATTCTGGGAGACAATGATTTCACAACTAG
M
GGGAAGCAGTCCTAAAAGTTTAAAATCCGATAAGGAATATCTGGGACAGGGTTTAGATCATGACTCTACACAGATACCATGATGAGAGTATATTAAAGAA
Celera SNP ID: hDV71152540
公開 SNP ID: rs950163
転写配列のSNP 配列番号15
SNP位置, 転写物: 1334
Related Interrogated SNP: hCV3200162 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,31|A,87)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 13
Celera 遺伝子: hCG1789838 - 118000094879268
Celera 転写物: hCT1814657 - 118000094879375
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1768958 - 197000069405836
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: ABCA1
タンパク質名: ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VU0F(7748303..7915441)
染色体: 9
OMIM 番号: 600046
OMIM 情報: Tangier disease, 205400 (3); HDL deficiency, familial, 604091 (3);/Cerebral amyloid angiopathy, 105150 (3); {Coronary artery disease in familial hypercholesterolemia, protection against}, 143890 (3)
転写配列 (配列番号16):
タンパク質配列 (配列番号76):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号143):
GGCTACCAGTTACATTTGACAAGTCTGTGCAATGGATCAAAATCAGAAGAGATGATTCAACTTGGTGACCAAGAAGTTTCTGAGCTTTGTGGCCTACCAA
R
GGAGAAACTGGCTGCAGCAGAGCGAGTACTTCGTTCCAACATGGACATCCTGAAGCCAATCCTGAGAACACTAAACTCTACATCTCCCTTCCCGAGCAAG
Celera SNP ID: hCV2741051
公開 SNP ID: rs2230806
転写配列のSNP 配列番号16
SNP位置, 転写物: 811
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|A,14) アフリカ系アメリカ人(G,14|A,24) 全体(G,40|A,38)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号76, 159位において,(R,AGG) (K,AAG)
SNP 供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,101|A,19)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号76, 159位において,(R,AGG) (K,AAG)
遺伝子番号: 13
Celera 遺伝子: hCG1789838 - 118000094879268
Celera 転写物: hCT1829098 - 118000094879269
公開転写物アクセッション: NM_005502
Celera タンパク質: hCP1713177 - 197000069405834
公開タンパク質アクセッション: NP_005493
遺伝子シンボル: ABCA1
タンパク質名: ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VU0F(7748303..7915441)
染色体: 9
OMIM 番号: 600046
OMIM 情報: Tangier disease, 205400 (3); HDL deficiency, familial, 604091 (3);/Cerebral amyloid angiopathy, 105150 (3); {Coronary artery disease in familial hypercholesterolemia, protection against}, 143890 (3)
転写配列 (配列番号17):
タンパク質配列 (配列番号77):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号144):
GGCTACCAGTTACATTTGACAAGTCTGTGCAATGGATCAAAATCAGAAGAGATGATTCAACTTGGTGACCAAGAAGTTTCTGAGCTTTGTGGCCTACCAA
R
GGAGAAACTGGCTGCAGCAGAGCGAGTACTTCGTTCCAACATGGACATCCTGAAGCCAATCCTGAGAACACTAAACTCTACATCTCCCTTCCCGAGCAAG
Celera SNP ID: hCV2741051
公開 SNP ID: rs2230806
転写配列のSNP 配列番号17
SNP位置, 転写物: 969
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|A,14) アフリカ系アメリカ人(G,14|A,24) 全体(G,40|A,38)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号77, 219位において,(R,AGG) (K,AAG)
SNP 供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,101|A,19)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号77, 219位において,(R,AGG) (K,AAG)
遺伝子番号: 13
Celera 遺伝子: hCG1789838 - 118000094879268
Celera 転写物: hCT2274783 - 118000094879323
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1872571 - 197000069405835
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: ABCA1
タンパク質名: ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VU0F(7748303..7915441)
染色体: 9
OMIM 番号: 600046
OMIM 情報: Tangier disease, 205400 (3); HDL deficiency, familial, 604091 (3);/Cerebral amyloid angiopathy, 105150 (3); {Coronary artery disease in familial hypercholesterolemia, protection against}, 143890 (3)
転写配列 (配列番号18):
タンパク質配列 (配列番号78):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号145):
GGCTACCAGTTACATTTGACAAGTCTGTGCAATGGATCAAAATCAGAAGAGATGATTCAACTTGGTGACCAAGAAGTTTCTGAGCTTTGTGGCCTACCAA
R
GGAGAAACTGGCTGCAGCAGAGCGAGTACTTCGTTCCAACATGGACATCCTGAAGCCAATCCTGAGAACACTAAACTCTACATCTCCCTTCCCGAGCAAG
Celera SNP ID: hCV2741051
公開 SNP ID: rs2230806
転写配列のSNP 配列番号18
SNP位置, 転写物: 590
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|A,14) アフリカ系アメリカ人(G,14|A,24) 全体(G,40|A,38)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号78, 159位において,(R,AGG) (K,AAG)
SNP 供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,101|A,19)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号78, 159位において,(R,AGG) (K,AAG)
遺伝子番号: 13
Celera 遺伝子: hCG1789838 - 118000094879268
Celera 転写物: hCT2274784 - 118000094879428
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1872573 - 197000069405837
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: ABCA1
タンパク質名: ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VU0F(7748303..7915441)
染色体: 9
OMIM 番号: 600046
OMIM 情報: Tangier disease, 205400 (3); HDL deficiency, familial, 604091 (3);/Cerebral amyloid angiopathy, 105150 (3); {Coronary artery disease in familial hypercholesterolemia, protection against}, 143890 (3)
転写配列 (配列番号19):
タンパク質配列 (配列番号79):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号146):
GGCTACCAGTTACATTTGACAAGTCTGTGCAATGGATCAAAATCAGAAGAGATGATTCAACTTGGTGACCAAGAAGTTTCTGAGCTTTGTGGCCTACCAA
R
GGAGAAACTGGCTGCAGCAGAGCGAGTACTTCGTTCCAACATGGACATCCTGAAGCCAATCCTGGTGAGTAGACTTGCTCACTGGAGAAACTTCAAGCAC
Celera SNP ID: hCV2741051
公開 SNP ID: rs2230806
転写配列のSNP 配列番号19
SNP位置, 転写物: 969
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|A,14) アフリカ系アメリカ人(G,14|A,24) 全体(G,40|A,38)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号79, 219位において,(R,AGG) (K,AAG)
SNP 供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,101|A,19)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号79, 219位において,(R,AGG) (K,AAG)
遺伝子番号: 13
Celera 遺伝子: hCG1789838 - 118000094879268
Celera 転写物: hCT2274785 - 118000094879439
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1872574 - 197000069405838
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: ABCA1
タンパク質名: ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VU0F(7748303..7915441)
染色体: 9
OMIM 番号: 600046
OMIM 情報: Tangier disease, 205400 (3); HDL deficiency, familial, 604091 (3);/Cerebral amyloid angiopathy, 105150 (3); {Coronary artery disease in familial hypercholesterolemia, protection against}, 143890 (3)
転写配列 (配列番号20):
タンパク質配列 (配列番号80):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号147):
GGCTACCAGTTACATTTGACAAGTCTGTGCAATGGATCAAAATCAGAAGAGATGATTCAACTTGGTGACCAAGAAGTTTCTGAGCTTTGTGGCCTACCAA
R
GGAGAAACTGGCTGCAGCAGAGCGAGTACTTCGTTCCAACATGGACATCCTGAAGCCAATCCTGATGGATGTGACATGTGATGACATTGCACATGGGCAG
Celera SNP ID: hCV2741051
公開 SNP ID: rs2230806
転写配列のSNP 配列番号20
SNP位置, 転写物: 969
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|A,14) アフリカ系アメリカ人(G,14|A,24) 全体(G,40|A,38)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号80, 219位において,(R,AGG) (K,AAG)
SNP 供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,101|A,19)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号80, 219位において,(R,AGG) (K,AAG)
遺伝子番号: 14
Celera 遺伝子: hCG1811418 - 146000220356745
Celera 転写物: hCT1825890 - 146000220356768
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1701302 - 197000064917835
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: GFM1
タンパク質名: mitochondrial elongation factor G1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(36916899..36984944)
染色体: 3
OMIM 番号: 606639
OMIM 情報: Combined oxidative phosphorylation deficiency, 609060 (3)
転写配列 (配列番号21):
タンパク質配列 (配列番号81):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号148):
TGGCGATTGGGAACTCTCAGTTGGCTCCTGTGTTCCTTTAACATCTTCCAATGTTTTGCCTTTTTGAATACTTCCTTACTTGCTGGCACTACAAGACGCC
Y
CAGGCTTATCTTGTATATTCCATGCCCTAACCCTAGAATCAGCCGTTCTCCAAGGAGCACTGGTTCCTTTTTAAGTAAAATGGTATTAGAAACCAAGATT
Celera SNP ID: hCV29593475
公開 SNP ID: rs9819567
転写配列のSNP 配列番号21
SNP位置, 転写物: 2306
Related Interrogated SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,47|C,73)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 15
Celera 遺伝子: hCG1978757 - 146000219433834
Celera 転写物: hCT2250379 - 146000219433846
公開転写物アクセッション: NM_002640
Celera タンパク質: hCP1860312 - 197000069373446
公開タンパク質アクセッション: NP_002631
遺伝子シンボル: SERPINB8
タンパク質名: serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member
8
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VUQQ(16920598..16980347)
染色体: 18
OMIM 番号: 601697
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号22):
タンパク質配列 (配列番号82):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号149):
ATCTCCTCTGCCCTGGCCATGGTCTTCATGGGGGCAAAGGGAAGCACTGCAGCCCAGATGTCCCAGGCACTTTGTTTATACAAAGACGGAGATATTCACC
R
AGGTTTCCAGTCACTTCTCAGTGAAGTTAACAGAACTGGCACTCAGTACTTGCTTAGAACTGCCAACAGACTCTTTGGAGAAAAGACGTGTGATTTCCTT
Celera SNP ID: hCV11450617
公開 SNP ID: rs1944270
転写配列のSNP 配列番号22
SNP位置, 転写物: 525
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,82|A,38)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号82, 68位において,(R,CGA) (Q,CAA)
遺伝子番号: 15
Celera 遺伝子: hCG1978757 - 146000219433834
Celera 転写物: hCT2250381 - 146000219433835
公開転写物アクセッション: NM_002640
Celera タンパク質: hCP1860311 - 197000069373445
公開タンパク質アクセッション: NP_002631
遺伝子シンボル: SERPINB8
タンパク質名: serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member
8
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VUQQ(16920598..16980347)
染色体: 18
OMIM 番号: 601697
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号23):
タンパク質配列 (配列番号83):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号150):
ATCTCCTCTGCCCTGGCCATGGTCTTCATGGGGGCAAAGGGAAGCACTGCAGCCCAGATGTCCCAGGCACTTTGTTTATACAAAGACGGAGATATTCACC
R
AGGTTTCCAGTCACTTCTCAGTGAAGTTAACAGAACTGGCACTCAGTACTTGCTTAGAACTGCCAACAGACTCTTTGGAGAAAAGACGTGTGATTTCCTT
Celera SNP ID: hCV11450617
公開 SNP ID: rs1944270
転写配列のSNP 配列番号23
SNP位置, 転写物: 288
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,82|A,38)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号83, 68位において,(R,CGA) (Q,CAA)
遺伝子番号: 16
Celera 遺伝子: hCG1817372 - 146000220786385
Celera 転写物: hCT1959636 - 146000220786421
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1769466 - 197000069410800
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: KIAA1411
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF0F9(100048640..100216389)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号24):
タンパク質配列 (配列番号84):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号151):
CTCATTGGGAGAGCTGCACATATAGCTGTTCTTGATTCGGAAATATTTTTAGAGAAATTCTTTCTGGTTGCTGCCCTCAAATATTTCCAATAGTATAAAA
R
CATTGTTAGCGACTGGACAATTACCTCATTCAACAATGTTTCAAATAATGTATTATATTAAAATGTAGATGCTGATAAGTTCTAAGAAATATTTATACCT
Celera SNP ID: hCV25936375
公開 SNP ID: rs16869373
転写配列のSNP 配列番号24
SNP位置, 転写物: 5070
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,3|G,37) アフリカ系アメリカ人(A,2|G,36) 全体(A,5|G,73)
SNP 型: UTR3
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 16
Celera 遺伝子: hCG1817372 - 146000220786385
Celera 転写物: hCT1959637 - 146000220786470
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1769478 - 197000069410803
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: KIAA1411
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF0F9(100048640..100216389)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号25):
タンパク質配列 (配列番号85):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号152):
CTCATTGGGAGAGCTGCACATATAGCTGTTCTTGATTCGGAAATATTTTTAGAGAAATTCTTTCTGGTTGCTGCCCTCAAATATTTCCAATAGTATAAAA
R
CATTGTTAGCGACTGGACAATTACCTCATTCAACAATGTTTCAAATAATGTATTATATTAAAATGTAGATGCTGATAAGTTCTAAGAAATATTTATACCT
Celera SNP ID: hCV25936375
公開 SNP ID: rs16869373
転写配列のSNP 配列番号25
SNP位置, 転写物: 4380
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,3|G,37) アフリカ系アメリカ人(A,2|G,36) 全体(A,5|G,73)
SNP 型: UTR3
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 16
Celera 遺伝子: hCG1817372 - 146000220786385
Celera 転写物: hCT1959638 - 146000220786448
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1769491 - 197000069410801
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: KIAA1411
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF0F9(100048640..100216389)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号26):
タンパク質配列 (配列番号86):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号153):
CTCATTGGGAGAGCTGCACATATAGCTGTTCTTGATTCGGAAATATTTTTAGAGAAATTCTTTCTGGTTGCTGCCCTCAAATATTTCCAATAGTATAAAA
R
CATTGTTAGCGACTGGACAATTACCTCATTCAACAATGTTTCAAATAATGTATTATATTAAAATGTAGATGCTGATAAGTTCTAAGAAATATTTATACCT
Celera SNP ID: hCV25936375
公開 SNP ID: rs16869373
転写配列のSNP 配列番号26
SNP位置, 転写物: 4607
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,3|G,37) アフリカ系アメリカ人(A,2|G,36) 全体(A,5|G,73)
SNP 型: UTR3
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 16
Celera 遺伝子: hCG1817372 - 146000220786385
Celera 転写物: hCT1959639 - 146000220786505
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1769456 - 197000069410805
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: KIAA1411
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF0F9(100048640..100216389)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号27):
タンパク質配列 (配列番号87):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号154):
CTCATTGGGAGAGCTGCACATATAGCTGTTCTTGATTCGGAAATATTTTTAGAGAAATTCTTTCTGGTTGCTGCCCTCAAATATTTCCAATAGTATAAAA
R
CATTGTTAGCGACTGGACAATTACCTCATTCAACAATGTTTCAAATAATGTATTATATTAAAATGTAGATGCTGATAAGTTCTAAGAAATATTTATACCT
Celera SNP ID: hCV25936375
公開 SNP ID: rs16869373
転写配列のSNP 配列番号27
SNP位置, 転写物: 4992
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,3|G,37) アフリカ系アメリカ人(A,2|G,36) 全体(A,5|G,73)
SNP 型: UTR3
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 16
Celera 遺伝子: hCG1817372 - 146000220786385
Celera 転写物: hCT2332754 - 146000220786531
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1877542 - 197000069410806
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: KIAA1411
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF0F9(100048640..100216389)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号28):
タンパク質配列 (配列番号88):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号155):
CTCATTGGGAGAGCTGCACATATAGCTGTTCTTGATTCGGAAATATTTTTAGAGAAATTCTTTCTGGTTGCTGCCCTCAAATATTTCCAATAGTATAAAA
R
CATTGTTAGCGACTGGACAATTACCTCATTCAACAATGTTTCAAATAATGTATTATATTAAAATGTAGATGCTGATAAGTTCTAAGAAATATTTATACCT
Celera SNP ID: hCV25936375
公開 SNP ID: rs16869373
転写配列のSNP 配列番号28
SNP位置, 転写物: 4858
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,3|G,37) アフリカ系アメリカ人(A,2|G,36) 全体(A,5|G,73)
SNP 型: UTR3
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 17
Celera 遺伝子: hCG1818187 - 110000085683607
Celera 転写物: hCT1961184 - 110000085683616
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1772331 - 197000064937339
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: IL1F10
タンパク質名: interleukin 1 family, member 10 (theta)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VY9Y(627199..650730)
染色体: 2
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号29):
タンパク質配列 (配列番号89):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号156):
AGTTCCTTCCTGCCTGAGCCTTTACCTGCCAAGAGCCTGCAACATGGGGTTCCCTTGTCCCTTGACTCTTCTCTCTCTTCCCTCCTAGAGAAGATCTGCA
Y
ACTTCCTAACAGAGGCTTGGCCCGCACCAAGGTCCCCATTTTCCTGGGGATCCAGGGAGGGAGCCGCTGCCTGGCATGTGTGGAGACAGAAGAGGGGCCT
Celera SNP ID: hCV2146578
公開 SNP ID: rs6761276
転写配列のSNP 配列番号29
SNP位置, 転写物: 197
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,10|T,20) アフリカ系アメリカ人(C,7|T,11) 全体(C,17|T,31)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号89, 36位において,(I,ATA) (T,ACA)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,53|C,67)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号89, 36位において,(I,ATA) (T,ACA)
遺伝子番号: 17
Celera 遺伝子: hCG1818187 - 110000085683607
Celera 転写物: hCT2273798 - 110000085683608
公開転写物アクセッション: NM_032556
Celera タンパク質: hCP1804697 - 197000064937338
公開タンパク質アクセッション: NP_115945
遺伝子シンボル: IL1F10
タンパク質名: interleukin 1 family, member 10 (theta)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VY9Y(627199..650730)
染色体: 2
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号30):
タンパク質配列 (配列番号90):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号157):
ATAATTAAATATGCAGACCAGAAGGCTCTATACACAAGAGATGGCCAGCTGCTGGTGGGAGATCCTGTTGCAGACAACTGCTGTGCAGAGAAGATCTGCA
Y
ACTTCCTAACAGAGGCTTGGCCCGCACCAAGGTCCCCATTTTCCTGGGGATCCAGGGAGGGAGCCGCTGCCTGGCATGTGTGGAGACAGAAGAGGGGCCT
Celera SNP ID: hCV2146578
公開 SNP ID: rs6761276
転写配列のSNP 配列番号30
SNP位置, 転写物: 552
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,10|T,20) アフリカ系アメリカ人(C,7|T,11) 全体(C,17|T,31)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号90, 44位において,(I,ATA) (T,ACA)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,53|C,67)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号90, 44位において,(I,ATA) (T,ACA)
遺伝子番号: 18
Celera 遺伝子: hCG31282 - 66000115705562
Celera 転写物: hCT1962137 - 66000115705572
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1776915 - 197000069434228
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: RANGNRF
タンパク質名: RAN guanine nucleotide release factor
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7218837..7240942)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号31):
タンパク質配列 (配列番号91):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号158):
TAGCAAAGGACGTGACACTTCATCAGGCCTTGCTGAGGCTGCCCCAGTACCAGACTGATCTCTTGCTTACCTTCAATCAGCCCCCGTAAGGAGGAAGGAA
Y
GGGCGGGTATCTCATGACTGGGTTCCCAGGAGAATCGGGCTGGGAGGGACAGAACAGGGAGACTCACTGGTGGGATCCTCCAAGGAAGCAGGAGTGGGCC
Celera SNP ID: hDV71102112
公開 SNP ID: rs869773
転写配列のSNP 配列番号31
SNP位置, 転写物: 902
Related Interrogated SNP: hCV22275215 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,113|T,5)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 19
Celera 遺伝子: hCG31287 - 103000085235647
Celera 転写物: hCT22464 - 103000085235648
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP45092 - 197000069434366
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: FLJ22170
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7261280..7301962)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号32):
タンパク質配列 (配列番号92):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号159):
GTTGGAGAAAAGGGTTTCCAGATCTCACAATGTTTATTGTTGTTTCCGGTCATCCACTTATGTGCAGGTCCTGAGTTTTCCCCCTGAGACCACCATCAGC
R
TTCCCCTGCCCCACATCTACCTGGCTGAACTTCTGCAGGGTGGTCAGTCCCCATTCCAGGCCACTGCCTCTTGCCATATCGTCTCTGTCTTCAGCCTTCA
Celera SNP ID: hCV22275215
公開 SNP ID: rs3826543
転写配列のSNP 配列番号32
SNP位置, 転写物: 1195
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,19|G,101)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号92, 329位において,(V,GTT) (I,ATT)
遺伝子番号: 19
Celera 遺伝子: hCG31287 - 103000085235647
Celera 転写物: hCT2263346 - 103000085235665
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1891103 - 197000069434367
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: FLJ22170
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7261280..7301962)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号33):
タンパク質配列 (配列番号93):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号160):
GTTGGAGAAAAGGGTTTCCAGATCTCACAATGTTTATTGTTGTTTCCGGTCATCCACTTATGTGCAGGTCCTGAGTTTTCCCCCTGAGACCACCATCAGC
R
TTCCCCTGCCCCACATCTACCTGGCTGAACTTCTGCAGGGTGGTCAGTCCCCATTCCAGGCCACTGCCTCTTGCCATATCGTCTCTGTCTTCAGCCTTCA
Celera SNP ID: hCV22275215
公開 SNP ID: rs3826543
転写配列のSNP 配列番号33
SNP位置, 転写物: 2609
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,19|G,101)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号93, 706位において,(V,GTT) (I,ATT)
遺伝子番号: 19
Celera 遺伝子: hCG31287 - 103000085235647
Celera 転写物: hCT2263351 - 103000085235690
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1891104 - 197000069434368
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: FLJ22170
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7261280..7301962)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号34):
タンパク質配列 (配列番号94):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号161):
GTTGGAGAAAAGGGTTTCCAGATCTCACAATGTTTATTGTTGTTTCCGGTCATCCACTTATGTGCAGGTCCTGAGTTTTCCCCCTGAGACCACCATCAGC
R
TTCCCCTGCCCCACATCTACCTGGCTGAACTTCTGCAGGGTGGTCAGTCCCCATTCCAGGCCACTGCCTCTTGCCATATCGTCTCTGTCTTCAGCCTTCA
Celera SNP ID: hCV22275215
公開 SNP ID: rs3826543
転写配列のSNP 配列番号34
SNP位置, 転写物: 2609
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,19|G,101)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号94, 706位において,(V,GTT) (I,ATT)
遺伝子番号: 19
Celera 遺伝子: hCG31287 - 103000085235647
Celera 転写物: hCT2263353 - 103000085235715
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1891105 - 197000069434369
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: FLJ22170
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7261280..7301962)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号35):
タンパク質配列 (配列番号95):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号162):
GTTGGAGAAAAGGGTTTCCAGATCTCACAATGTTTATTGTTGTTTCCGGTCATCCACTTATGTGCAGGTCCTGAGTTTTCCCCCTGAGACCACCATCAGC
R
TTCCCCTGCCCCACATCTACCTGGCTGAACTTCTGCAGGGTGGTCAGTCCCCATTCCAGGCCACTGCCTCTTGCCATATCGTCTCTGTCTTCAGCCTTCA
Celera SNP ID: hCV22275215
公開 SNP ID: rs3826543
転写配列のSNP 配列番号35
SNP位置, 転写物: 1737
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,19|G,101)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号95, 329位において,(V,GTT) (I,ATT)
遺伝子番号: 20
Celera 遺伝子: hCG37187 - 146000220350063
Celera 転写物: hCT28417 - 146000220350064
公開転写物アクセッション: NM_000271
Celera タンパク質: hCP47700 - 197000069426589
公開タンパク質アクセッション: NP_000262
遺伝子シンボル: NPC1
タンパク質名: Nasopharyngeal carcinoma 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W66L(2585858..2660984)
染色体: 18
OMIM 番号: 607107
OMIM 情報: {Nasopharyngeal carcinoma 1}, 161550 (2)
転写配列 (配列番号36):
タンパク質配列 (配列番号96):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号163):
GACGCCTGTAATGCCACCAACTGGATTGAATACATGTTCAATAAGGACAATGGACAGGCACCTTTTACCATCACTCCTGTGTTTTCAGATTTTCCAGTCC
R
TGGGATGGAGCCCATGAACAATGCCACCAAAGGCTGTGACGAGTCTGTGGATGAGGTCACAGCACCATGTAGCTGCCAAGACTGCTCTATTGTCTGTGGC
Celera SNP ID: hCV25472673
公開 SNP ID: rs1805081
転写配列のSNP 配列番号36
SNP位置, 転写物: 767
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,64|G,56)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号96, 215位において,(H,CAT) (R,CGT)
遺伝子番号: 21
Celera 遺伝子: hCG39290 - 93000022563619
Celera 転写物: hCT1957920 - 93000022563684
公開転写物アクセッション: NM_002344
Celera タンパク質: hCP1762545 - 197000064936662
公開タンパク質アクセッション: NP_002335
遺伝子シンボル: LTK
タンパク質名: leukocyte tyrosine kinase
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W323(8836563..8866805)
染色体: 15
OMIM 番号: 151520
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号37):
タンパク質配列 (配列番号97):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号164):
TGTCACCGAGGTTTCCCCAGCCAATGTTACTCTGCTCAGAGCCCTGGGCCATGGTGCCTTTGGGGAGGTGTATGAGGGACTGGTAATTGGCCTTCCTGGG
R
ACTCCAGTCCCCTGCAGGTAGCTATCAAGACCCTGCCAGAACTCTGCTCGCCTCAGGATGAGCTGGATTTCCTCATGGAGGCCCTCATCATCAGCAAGTT
Celera SNP ID: hCV25623506
公開 SNP ID:
転写配列のSNP 配列番号37
SNP位置, 転写物: 1773
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,36|A,4) アフリカ系アメリカ人(G,37|A,1) 全体(G,73|A,5)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号97, 535位において,(D,GAC) (N,AAC)
遺伝子番号: 21
Celera 遺伝子: hCG39290 - 93000022563619
Celera 転写物: hCT2281697 - 93000022563708
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1804022 - 197000064936663
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: LTK
タンパク質名: leukocyte tyrosine kinase
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W323(8836563..8866805)
染色体: 15
OMIM 番号: 151520
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号38):
タンパク質配列 (配列番号98):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号165):
TGTCACCGAGGTTTCCCCAGCCAATGTTACTCTGCTCAGAGCCCTGGGCCATGGTGCCTTTGGGGAGGTGTATGAGGGACTGGTAATTGGCCTTCCTGGG
R
ACTCCAGTCCCCTGCAGGTAGCTATCAAGACCCTGCCAGAACTCTGCTCGCCTCAGGATGAGCTGGATTTCCTCATGGAGGCCCTCATCATCAGCAAGTT
Celera SNP ID: hCV25623506
公開 SNP ID:
転写配列のSNP 配列番号38
SNP位置, 転写物: 1215
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,36|A,4) アフリカ系アメリカ人(G,37|A,1) 全体(G,73|A,5)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号98, 146位において,(D,GAC) (N,AAC)
遺伝子番号: 21
Celera 遺伝子: hCG39290 - 93000022563619
Celera 転写物: hCT2281698 - 93000022563667
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1804020 - 197000064936661
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: LTK
タンパク質名: leukocyte tyrosine kinase
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W323(8836563..8866805)
染色体: 15
OMIM 番号: 151520
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号39):
タンパク質配列 (配列番号99):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号166):
TGTCACCGAGGTTTCCCCAGCCAATGTTACTCTGCTCAGAGCCCTGGGCCATGGTGCCTTTGGGGAGGTGTATGAGGGACTGGTAATTGGCCTTCCTGGG
R
ACTCCAGTCCCCTGCAGGTAGCTATCAAGACCCTGCCAGAACTCTGCTCGCCTCAGGATGAGCTGGATTTCCTCATGGAGGCCCTCATCATCAGCAAGTT
Celera SNP ID: hCV25623506
公開 SNP ID:
転写配列のSNP 配列番号39
SNP位置, 転写物: 1438
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,36|A,4) アフリカ系アメリカ人(G,37|A,1) 全体(G,73|A,5)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号99, 76位において,(D,GAC) (N,AAC)
遺伝子番号: 21
Celera 遺伝子: hCG39290 - 93000022563619
Celera 転写物: hCT2281701 - 93000022563620
公開転写物アクセッション: NM_206961
Celera タンパク質: hCP1804018 - 197000064936659
公開タンパク質アクセッション: NP_996844
遺伝子シンボル: LTK
タンパク質名: leukocyte tyrosine kinase
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W323(8836563..8866805)
染色体: 15
OMIM 番号: 151520
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号40):
タンパク質配列 (配列番号100):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号167):
TGTCACCGAGGTTTCCCCAGCCAATGTTACTCTGCTCAGAGCCCTGGGCCATGGTGCCTTTGGGGAGGTGTATGAGGGACTGGTAATTGGCCTTCCTGGG
R
ACTCCAGTCCCCTGCAGGTAGCTATCAAGACCCTGCCAGAACTCTGCTCGCCTCAGGATGAGCTGGATTTCCTCATGGAGGCCCTCATCATCAGCAAGTT
Celera SNP ID: hCV25623506
公開 SNP ID:
転写配列のSNP 配列番号40
SNP位置, 転写物: 1590
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,36|A,4) アフリカ系アメリカ人(G,37|A,1) 全体(G,73|A,5)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号100, 474位において,(D,GAC) (N,AAC)
遺伝子番号: 21
Celera 遺伝子: hCG39290 - 93000022563619
Celera 転写物: hCT2281702 - 93000022563727
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1804023 - 197000064936664
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: LTK
タンパク質名: leukocyte tyrosine kinase
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W323(8836563..8866805)
染色体: 15
OMIM 番号: 151520
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号41):
タンパク質配列 (配列番号101):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号168):
TGTCACCGAGGTTTCCCCAGCCAATGTTACTCTGCTCAGAGCCCTGGGCCATGGTGCCTTTGGGGAGGTGTATGAGGGACTGGTAATTGGCCTTCCTGGG
R
ACTCCAGTCCCCTGCAGGTAGCTATCAAGACCCTGCCAGAACTCTGCTCGCCTCAGGATGAGCTGGATTTCCTCATGGAGGCCCTCATCATCAGCAAGTT
Celera SNP ID: hCV25623506
公開 SNP ID:
転写配列のSNP 配列番号41
SNP位置, 転写物: 2071
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,36|A,4) アフリカ系アメリカ人(G,37|A,1) 全体(G,73|A,5)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 21
Celera 遺伝子: hCG39290 - 93000022563619
Celera 転写物: hCT30541 - 93000022563643
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP49089 - 197000064936660
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: LTK
タンパク質名: leukocyte tyrosine kinase
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W323(8836563..8866805)
染色体: 15
OMIM 番号: 151520
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号42):
タンパク質配列 (配列番号102):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号169):
TGTCACCGAGGTTTCCCCAGCCAATGTTACTCTGCTCAGAGCCCTGGGCCATGGTGCCTTTGGGGAGGTGTATGAGGGACTGGTAATTGGCCTTCCTGGG
R
ACTCCAGTCCCCTGCAGGTAGCTATCAAGACCCTGCCAGAACTCTGCTCGCCTCAGGATGAGCTGGATTTCCTCATGGAGGCCCTCATCATCAGCAAGTT
Celera SNP ID: hCV25623506
公開 SNP ID:
転写配列のSNP 配列番号42
SNP位置, 転写物: 1859
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,36|A,4) アフリカ系アメリカ人(G,37|A,1) 全体(G,73|A,5)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号102, 146位において,(D,GAC) (N,AAC)
遺伝子番号: 22
Celera 遺伝子: hCG39602 - 145000147474422
Celera 転写物: hCT1961571 - 145000147474423
公開転写物アクセッション: NM_002417
Celera タンパク質: hCP1774284 - 197000069450827
公開タンパク質アクセッション: NP_002408
遺伝子シンボル: MKI67
タンパク質名: antigen identified by monoclonal antibody Ki-67
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF114(4250619..4300355)
染色体: 10
OMIM 番号: 176741
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号43):
タンパク質配列 (配列番号103):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号170):
CCTAAGGAAAAGGCCCAGGCTCTAGAAGACCTGGCTGGCTTTAAAGAGCTCTTCCAGACTCCTGGTCACACCGAGGAATTAGTGGCTGCTGGTAAAACCA
Y
TAAAATACCCTGCGACTCTCCACAGTCAGACCCAGTGGACACCCCAACAAGCACAAAGCAACGACCCAAGAGAAGTATCAGGAAAGCAGATGTAGAGGGA
Celera SNP ID: hCV1801149
公開 SNP ID: rs4750685
転写配列のSNP 配列番号43
SNP位置, 転写物: 4116
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,112|T,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号103, 1247位において,(T,ACT) (I,ATT)
コンテクスト (配列番号171):
TTGTGATAAGTTCTAGTGCAGTTTTTGTCATAAATTACAAGTGAATTCTGTAAGTAAGGCTGTCAGTCTGCTTAAGGGAAGAAAACTTTGGATTTGCTGG
S
TCTGAATCGGCTTCATAAACTCCACTGGGAGCACTGCTGGGCTCCTGGACTGAGAATAGTTGAACACCGGGGGCTTTGTGAAGGAGTCTGGGCCAAGGTT
Celera SNP ID: hCV11276365
公開 SNP ID: rs4750935
転写配列のSNP 配列番号43
SNP位置, 転写物: 10287
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,109|C,9)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号172):
CGCACTCAGGAAACGAACACCATCAGCAGGCAAAGCCATGCACACACCCAAACCAGCAGTAAGTGGTGAGAAAAACATCTACGCATTTATGGGAACTCCA
R
TGCAGAAACTGGACCTGACAGAGAACTTAACTGGCAGCAAGAGACGGCTACAAACTCCTAAGGAAAAGGCCCAGGCTCTAGAAGACCTGGCTGGCTTTAA
Celera SNP ID: hCV1801150
公開 SNP ID: rs7918199
転写配列のSNP 配列番号43
SNP位置, 転写物: 5051
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,112|A,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号103, 1559位において,(V,GTG) (M,ATG)
コンテクスト (配列番号173):
GTCCTGCAAAACAGCCCCTGCTTCCAGCAGCAAATCTCAGACAGAGGTTCCTAAGAGAGGAGGGAGAAAGAGTGGCAACCTGCCTTCAAAGAGAGTGTCT
M
TCAGCCGAAGTCAACATGATATTTTACAGATGATATGTTCCAAAAGAAGAAGTGGTGCTTCGGAAGCAAATCTGATTGTTGCAAAATCATGGGCAGATGT
Celera SNP ID: hCV8903188
公開 SNP ID: rs997983
転写配列のSNP 配列番号43
SNP位置, 転写物: 2267
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,112|C,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号103, 631位において,(I,ATC) (L,CTC)
遺伝子番号: 22
Celera 遺伝子: hCG39602 - 145000147474422
Celera 転写物: hCT2320220 - 145000147474460
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1897565 - 197000069450829
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: MKI67
タンパク質名: antigen identified by monoclonal antibody Ki-67
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF114(4250619..4300355)
染色体: 10
OMIM 番号: 176741
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号44):
タンパク質配列 (配列番号104):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号174):
CCTAAGGAAAAGGCCCAGGCTCTAGAAGACCTGGCTGGCTTTAAAGAGCTCTTCCAGACTCCTGGTCACACCGAGGAATTAGTGGCTGCTGGTAAAACCA
Y
TAAAATACCCTGCGACTCTCCACAGTCAGACCCAGTGGACACCCCAACAAGCACAAAGCAACGACCCAAGAGAAGTATCAGGAAAGCAGATGTAGAGGGA
Celera SNP ID: hCV1801149
公開 SNP ID: rs4750685
転写配列のSNP 配列番号44
SNP位置, 転写物: 3040
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,112|T,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号104, 792位において,(T,ACT) (I,ATT)
コンテクスト (配列番号175):
TTGTGATAAGTTCTAGTGCAGTTTTTGTCATAAATTACAAGTGAATTCTGTAAGTAAGGCTGTCAGTCTGCTTAAGGGAAGAAAACTTTGGATTTGCTGG
S
TCTGAATCGGCTTCATAAACTCCACTGGGAGCACTGCTGGGCTCCTGGACTGAGAATAGTTGAACACCGGGGGCTTTGTGAAGGAGTCTGGGCCAAGGTT
Celera SNP ID: hCV11276365
公開 SNP ID: rs4750935
転写配列のSNP 配列番号44
SNP位置, 転写物: 9211
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,109|C,9)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号176):
CGCACTCAGGAAACGAACACCATCAGCAGGCAAAGCCATGCACACACCCAAACCAGCAGTAAGTGGTGAGAAAAACATCTACGCATTTATGGGAACTCCA
R
TGCAGAAACTGGACCTGACAGAGAACTTAACTGGCAGCAAGAGACGGCTACAAACTCCTAAGGAAAAGGCCCAGGCTCTAGAAGACCTGGCTGGCTTTAA
Celera SNP ID: hCV1801150
公開 SNP ID: rs7918199
転写配列のSNP 配列番号44
SNP位置, 転写物: 3975
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,112|A,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号104, 1104位において,(V,GTG) (M,ATG)
コンテクスト (配列番号177):
GTCCTGCAAAACAGCCCCTGCTTCCAGCAGCAAATCTCAGACAGAGGTTCCTAAGAGAGGAGGGAGAAAGAGTGGCAACCTGCCTTCAAAGAGAGTGTCT
M
TCAGCCGAAGTCAACATGATATTTTACAGATGATATGTTCCAAAAGAAGAAGTGGTGCTTCGGAAGCAAATCTGATTGTTGCAAAATCATGGGCAGATGT
Celera SNP ID: hCV8903188
公開 SNP ID: rs997983
転写配列のSNP 配列番号44
SNP位置, 転写物: 1191
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,112|C,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号104, 176位において,(I,ATC) (L,CTC)
遺伝子番号: 22
Celera 遺伝子: hCG39602 - 145000147474422
Celera 転写物: hCT30854 - 145000147474442
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP50753 - 197000069450828
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: MKI67
タンパク質名: antigen identified by monoclonal antibody Ki-67
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF114(4250619..4300355)
染色体: 10
OMIM 番号: 176741
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号45):
タンパク質配列 (配列番号105):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号178):
CCTAAGGAAAAGGCCCAGGCTCTAGAAGACCTGGCTGGCTTTAAAGAGCTCTTCCAGACTCCTGGTCACACCGAGGAATTAGTGGCTGCTGGTAAAACCA
Y
TAAAATACCCTGCGACTCTCCACAGTCAGACCCAGTGGACACCCCAACAAGCACAAAGCAACGACCCAAGAGAAGTATCAGGAAAGCAGATGTAGAGGGA
Celera SNP ID: hCV1801149
公開 SNP ID: rs4750685
転写配列のSNP 配列番号45
SNP位置, 転写物: 3036
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,112|T,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号105, 887位において,(T,ACT) (I,ATT)
コンテクスト (配列番号179):
GTCCTGCAAAACAGCCCCTGCTTCCAGCAGCAAATCTCAGACAGAGGTTCCTAAGAGAGGAGGGAGAAAGAGTGGCAACCTGCCTTCAAAGAGAGTGTCT
M
TCAGCCGAAGTCAACATGATATTTTACAGATGATATGTTCCAAAAGAAGAAGTGGTGCTTCGGAAGCAAATCTGATTGTTGCAAAATCATGGGCAGATGT
Celera SNP ID: hCV8903188
公開 SNP ID: rs997983
転写配列のSNP 配列番号45
SNP位置, 転写物: 1187
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,112|C,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号105, 271位において,(I,ATC) (L,CTC)
コンテクスト (配列番号180):
TTGTGATAAGTTCTAGTGCAGTTTTTGTCATAAATTACAAGTGAATTCTGTAAGTAAGGCTGTCAGTCTGCTTAAGGGAAGAAAACTTTGGATTTGCTGG
S
TCTGAATCGGCTTCATAAACTCCACTGGGAGCACTGCTGGGCTCCTGGACTGAGAATAGTTGAACACCGGGGGCTTTGTGAAGGAGTCTGGGCCAAGGTT
Celera SNP ID: hCV11276365
公開 SNP ID: rs4750935
転写配列のSNP 配列番号45
SNP位置, 転写物: 9207
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,109|C,9)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号181):
CGCACTCAGGAAACGAACACCATCAGCAGGCAAAGCCATGCACACACCCAAACCAGCAGTAAGTGGTGAGAAAAACATCTACGCATTTATGGGAACTCCA
R
TGCAGAAACTGGACCTGACAGAGAACTTAACTGGCAGCAAGAGACGGCTACAAACTCCTAAGGAAAAGGCCCAGGCTCTAGAAGACCTGGCTGGCTTTAA
Celera SNP ID: hCV1801150
公開 SNP ID: rs7918199
転写配列のSNP 配列番号45
SNP位置, 転写物: 3971
Related Interrogated SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,112|A,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号105, 1199位において,(V,GTG) (M,ATG)
遺伝子番号: 23
Celera 遺伝子: hCG40340 - 146000220073481
Celera 転写物: hCT1956047 - 146000220073493
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1765048 - 197000069424555
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: TBX3
タンパク質名: T-box 3 (ulnar mammary syndrome)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W46Y(62349384..62383314)
染色体: 12
OMIM 番号: 601621
OMIM 情報: Ulnar-mammary syndrome, 181450 (3)
転写配列 (配列番号46):
タンパク質配列 (配列番号106):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号182):
AGGAGCGGCTTTTTAAAAACGCAAGGCACAAGGACGGTCACCCGCGCGACTATGTTTGCTGATTTTTCGCCTTGCCCTCTTTAAAAGCGGCCTCCCATTC
Y
CCAAAAGACACTTCCCCTCCTCCCTTTGAAGTGCATTAGTTGTGATTTCTGCCTCCTTTTCTTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTGCTTTTTCCCCCCTTTT
Celera SNP ID: hCV25624196
公開 SNP ID: rs12366395
転写配列のSNP 配列番号46
SNP位置, 転写物: 798
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,30|C,8) アフリカ系アメリカ人(T,34|C,4) 全体(T,64|C,12)
SNP 型: UTR5
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(T,-|C,-)
SNP 型: UTR5
遺伝子番号: 23
Celera 遺伝子: hCG40340 - 146000220073481
Celera 転写物: hCT1959859 - 146000220073506
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1768482 - 197000069424556
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: TBX3
タンパク質名: T-box 3 (ulnar mammary syndrome)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W46Y(62349384..62383314)
染色体: 12
OMIM 番号: 601621
OMIM 情報: Ulnar-mammary syndrome, 181450 (3)
転写配列 (配列番号47):
タンパク質配列 (配列番号107):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号183):
AGGAGCGGCTTTTTAAAAACGCAAGGCACAAGGACGGTCACCCGCGCGACTATGTTTGCTGATTTTTCGCCTTGCCCTCTTTAAAAGCGGCCTCCCATTC
Y
CCAAAAGACACTTCCCCTCCTCCCTTTGAAGTGCATTAGTTGTGATTTCTGCCTCCTTTTCTTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTGCTTTTTCCCCCCTTTT
Celera SNP ID: hCV25624196
公開 SNP ID: rs12366395
転写配列のSNP 配列番号47
SNP位置, 転写物: 798
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,30|C,8) アフリカ系アメリカ人(T,34|C,4) 全体(T,64|C,12)
SNP 型: UTR5
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(T,-|C,-)
SNP 型: UTR5
遺伝子番号: 23
Celera 遺伝子: hCG40340 - 146000220073481
Celera 転写物: hCT2307500 - 146000220073519
公開転写物アクセッション: NM_016569
Celera タンパク質: hCP1881293 - 197000069424557
公開タンパク質アクセッション: NP_057653
遺伝子シンボル: TBX3
タンパク質名: T-box 3 (ulnar mammary syndrome)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W46Y(62349384..62383314)
染色体: 12
OMIM 番号: 601621
OMIM 情報: Ulnar-mammary syndrome, 181450 (3)
転写配列 (配列番号48):
タンパク質配列 (配列番号108):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号184):
AGGAGCGGCTTTTTAAAAACGCAAGGCACAAGGACGGTCACCCGCGCGACTATGTTTGCTGATTTTTCGCCTTGCCCTCTTTAAAAGCGGCCTCCCATTC
Y
CCAAAAGACACTTCCCCTCCTCCCTTTGAAGTGCATTAGTTGTGATTTCTGCCTCCTTTTCTTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTGCTTTTTCCCCCCTTTT
Celera SNP ID: hCV25624196
公開 SNP ID: rs12366395
転写配列のSNP 配列番号48
SNP位置, 転写物: 798
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,30|C,8) アフリカ系アメリカ人(T,34|C,4) 全体(T,64|C,12)
SNP 型: UTR5
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(T,-|C,-)
SNP 型: UTR5
遺伝子番号: 23
Celera 遺伝子: hCG40340 - 146000220073481
Celera 転写物: hCT2307501 - 146000220073532
公開転写物アクセッション: NM_005996
Celera タンパク質: hCP1881294 - 197000069424558
公開タンパク質アクセッション: NP_005987
遺伝子シンボル: TBX3
タンパク質名: T-box 3 (ulnar mammary syndrome)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W46Y(62349384..62383314)
染色体: 12
OMIM 番号: 601621
OMIM 情報: Ulnar-mammary syndrome, 181450 (3)
転写配列 (配列番号49):
タンパク質配列 (配列番号109):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号185):
AGGAGCGGCTTTTTAAAAACGCAAGGCACAAGGACGGTCACCCGCGCGACTATGTTTGCTGATTTTTCGCCTTGCCCTCTTTAAAAGCGGCCTCCCATTC
Y
CCAAAAGACACTTCCCCTCCTCCCTTTGAAGTGCATTAGTTGTGATTTCTGCCTCCTTTTCTTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTGCTTTTTCCCCCCTTTT
Celera SNP ID: hCV25624196
公開 SNP ID: rs12366395
転写配列のSNP 配列番号49
SNP位置, 転写物: 798
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,30|C,8) アフリカ系アメリカ人(T,34|C,4) 全体(T,64|C,12)
SNP 型: UTR5
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(T,-|C,-)
SNP 型: UTR5
遺伝子番号: 23
Celera 遺伝子: hCG40340 - 146000220073481
Celera 転写物: hCT31596 - 146000220073482
公開転写物アクセッション: NM_005996
Celera タンパク質: hCP50088 - 197000069424554
公開タンパク質アクセッション: NP_005987
遺伝子シンボル: TBX3
タンパク質名: T-box 3 (ulnar mammary syndrome)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W46Y(62349384..62383314)
染色体: 12
OMIM 番号: 601621
OMIM 情報: Ulnar-mammary syndrome, 181450 (3)
転写配列 (配列番号50):
タンパク質配列 (配列番号110):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号186):
AGGAGCGGCTTTTTAAAAACGCAAGGCACAAGGACGGTCACCCGCGCGACTATGTTTGCTGATTTTTCGCCTTGCCCTCTTTAAAAGCGGCCTCCCATTC
Y
CCAAAAGACACTTCCCCTCCTCCCTTTGAAGTGCATTAGTTGTGATTTCTGCCTCCTTTTCTTTTTTCTTTCTTTTTTGTTTTGCTTTTTCCCCCCTTTT
Celera SNP ID: hCV25624196
公開 SNP ID: rs12366395
転写配列のSNP 配列番号50
SNP位置, 転写物: 798
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,30|C,8) アフリカ系アメリカ人(T,34|C,4) 全体(T,64|C,12)
SNP 型: UTR5
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(T,-|C,-)
SNP 型: UTR5
遺伝子番号: 24
Celera 遺伝子: hCG40416 - 104000117910922
Celera 転写物: hCT31674 - 104000117910923
公開転写物アクセッション: NM_014758
Celera タンパク質: hCP50186 - 197000069365677
公開タンパク質アクセッション: NP_055573
遺伝子シンボル: SNX19
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VVY5(40773551..40834144)
染色体: 11
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号51):
タンパク質配列 (配列番号111):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号187):
CAAAAGTTTCTTCGTCTTATCTTTGGGACCCTAGTTCAAAGGTGGCTAGAGGTGCAGGTAGCTAATTTAACAAGTCCACAGCGCTGGGTGCAGTACCTCC
K
GCTTCTTCAGGAGTCCATCTGGCCTGGTGGAGTTTTGCCTAAGTTTCCACGGCCCGTAAGGACCCAAGAGCAGAAACTGGCTGCTGAGAAACAGGCTTTG
Celera SNP ID: hCV16189747
公開 SNP ID: rs2298566
転写配列のSNP 配列番号51
SNP位置, 転写物: 3161
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,41|G,79)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号111, 878位において,(L,CTG) (R,CGG)
コンテクスト (配列番号188):
AGTAGGCTACAGCTAAGAAGGCCTAGGTTCTCGGTGGCTCACTTCTCTCCCACTTCTGCTCCATTTGTAGCAGGTGACAGGGGTCTGTGTGTCCCAGTTG
Y
ATGCACGTTTATTTCCCTGTTCCTTTTGTGATGTTGGGATTGTTGCTGGTGAGTAGATCCTGTTTCCTTTGGGAAAAGAAGCTGTGAGGTAGAGGAATGA
Celera SNP ID: hCV27467549
公開 SNP ID: rs3190331
転写配列のSNP 配列番号51
SNP位置, 転写物: 3693
Related Interrogated SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,67|C,53)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号189):
AACTGCATGACAAGCTGCATATTCAGCCTCAGTTTTTCCAAGGAGAATGGAAAGCACTTGCCTCCTGTCTTAAGAATGCACAAAGAGTAGGACTAGCAAG
S
CTGGGGGATGAAATCTCCCTTCCTAAGTCTTTGACAGAGAACTTTTATTATTCTGAACAGATAAGATTAGCAAACTTACAAGGAATAGCTTCTTATTTCC
Celera SNP ID: hCV29138827
公開 SNP ID: rs6590520
転写配列のSNP 配列番号51
SNP位置, 転写物: 4438
Related Interrogated SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,67|C,51)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号190):
GCTAGCAAGTCTAGGCTGAGGTTCTCATCCAGTAAAATTTCTCCAGCACTAAGTGTGACTGAAGCACAAGACAAGATTCTTTATTGTCTCCAGGAAGGCA
R
TGTGGAGTCTGAGACTCTATCCATGTCTGCGATGGAATCTTTTATTGAAAAACAGACAAAGTTACTGGAAATGCAGCCAACAAAAGCCCCAGAAAAAGAT
Celera SNP ID: hCV25626077
公開 SNP ID: rs4414223
転写配列のSNP 配列番号51
SNP位置, 転写物: 2786
Related Interrogated SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,25|A,13) アフリカ系アメリカ人(G,16|A,14) 全体(G,41|A,27)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号111, 753位において,(S,AGT) (N,AAT)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,45|G,75)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号111, 753位において,(S,AGT) (N,AAT)
コンテクスト (配列番号191):
AGAGGTTGAAGAAGGCCACGAAGCTGTAGAGGGAGATTTGGGTGGGATGTGTGAAGAAAGAAAAGTAGGAAACAACTCATCTCATTTCCTACAGCCAAAT
S
TTCGAGGTCCCCTGTTCTTATGTGAAGACTCAGAGCTGGAGTCTCCGCTGTCTGAACTGGGCAAAGAAACCATCATGCTCATGACTCCAGGCAGCTTTCT
Celera SNP ID: hCV25759522
公開 SNP ID: rs3751037
転写配列のSNP 配列番号51
SNP位置, 転写物: 1609
Related Interrogated SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,42|G,78)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号111, 361位において,(V,GTT) (L,CTT)
遺伝子番号: 25
Celera 遺伝子: hCG43681 - 30000035144826
Celera 転写物: hCT1952761 - 30000035144827
公開転写物アクセッション: NM_000595
Celera タンパク質: hCP1763834 - 30000035144821
公開タンパク質アクセッション: NP_000586
遺伝子シンボル: LTA
タンパク質名: lymphotoxin alpha (TNF superfamily, member 1)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(4592366..4614637)
染色体: 6
OMIM 番号: 153440
OMIM 情報: {Myocardial infarction, susceptibility to} (3)
転写配列 (配列番号52):
タンパク質配列 (配列番号112):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号192):
GTTCTGCTGCCTGGGGCCCAGGGGCTCCCTGGTGTTGGCCTCACACCTTCAGCTGCCCAGACTGCCCGTCAGCACCCCAAGATGCATCTTGCCCACAGCA
M
CCTCAAACCTGCTGCTCACCTCATTGGAGACCCCAGCAAGCAGAACTCACTGCTCTGGAGAGCAAACACGGACCGTGCCTTCCTCCAGGATGGTTTCTCC
Celera SNP ID: hCV7514870
公開 SNP ID: rs1041981
転写配列のSNP 配列番号52
SNP位置, 転写物: 437
SNP 供給源: HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|C,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号112, 60位において,(T,ACC) (N,AAC)
遺伝子番号: 25
Celera 遺伝子: hCG43681 - 30000035144826
Celera 転写物: hCT34966 - 30000035144820
公開転写物アクセッション: NM_000595
Celera タンパク質: hCP52117 - 30000035144824
公開タンパク質アクセッション: NP_000586
遺伝子シンボル: LTA
タンパク質名: lymphotoxin alpha (TNF superfamily, member 1)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(4592366..4614637)
染色体: 6
OMIM 番号: 153440
OMIM 情報: {Myocardial infarction, susceptibility to} (3)
転写配列 (配列番号53):
タンパク質配列 (配列番号113):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号193):
GTTCTGCTGCCTGGGGCCCAGGGGCTCCCTGGTGTTGGCCTCACACCTTCAGCTGCCCAGACTGCCCGTCAGCACCCCAAGATGCATCTTGCCCACAGCA
M
CCTCAAACCTGCTGCTCACCTCATTGGAGACCCCAGCAAGCAGAACTCACTGCTCTGGAGAGCAAACACGGACCGTGCCTTCCTCCAGGATGGTTTCTCC
Celera SNP ID: hCV7514870
公開 SNP ID: rs1041981
転写配列のSNP 配列番号53
SNP位置, 転写物: 346
SNP 供給源: HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|C,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号113, 60位において,(T,ACC) (N,AAC)
遺伝子番号: 26
Celera 遺伝子: hCG1981506 - 62000133107911
Celera 転写物: hCT2254394 - 62000133108012
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1855116 - 197000069368250
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: HSPG2
タンパク質名: heparan sulfate proteoglycan 2 (perlecan)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W3P1(4938116..5032197)
染色体: 1
OMIM 番号: 142461
OMIM 情報: Schwartz-Jampel syndrome, type 1, 255800 (3); Dyssegmental dysplasia,/Silverman-Handmaker type, 224410 (3)
転写配列 (配列番号54):
タンパク質配列 (配列番号114):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号194):
TCAGGCTACCCCACTCCTGACATCAGCTGGAGCAAGCTGGATGGCAGCCTGCCACCTGACAGCCGCCTGGAGAACAACATGCTGATGCTGCCCTCAGTCC
R
ACCCCAGGACGCAGGTACCTACGTCTGCACCGCCACTAACCGCCAGGGCAAGGTCAAAGCCTTTGCCCACCTGCAGGTGCCAGAGCGGGTGGTGCCCTAC
Celera SNP ID: hCV1603656
公開 SNP ID: rs11552566
転写配列のSNP 配列番号54
SNP位置, 転写物: 10845
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,38|A,2) アフリカ系アメリカ人(G,27|A,7) 全体(G,65|A,9)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号114, 3587位において,(R,CGA) (Q,CAA)
SNP 供給源: CDX_Heart;Celera;HapMap;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(G,-|A,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号114, 3587位において,(R,CGA) (Q,CAA)
遺伝子番号: 26
Celera 遺伝子: hCG1981506 - 62000133107911
Celera 転写物: hCT2254395 - 62000133108113
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1855117 - 197000069368251
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: HSPG2
タンパク質名: heparan sulfate proteoglycan 2 (perlecan)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W3P1(4938116..5032197)
染色体: 1
OMIM 番号: 142461
OMIM 情報: Schwartz-Jampel syndrome, type 1, 255800 (3); Dyssegmental dysplasia,/Silverman-Handmaker type, 224410 (3)
転写配列 (配列番号55):
タンパク質配列 (配列番号115):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号195):
TCAGGCTACCCCACTCCTGACATCAGCTGGAGCAAGCTGGATGGCAGCCTGCCACCTGACAGCCGCCTGGAGAACAACATGCTGATGCTGCCCTCAGTCC
R
ACCCCAGGACGCAGGTACCTACGTCTGCACCGCCACTAACCGCCAGGGCAAGGTCAAAGCCTTTGCCCACCTGCAGGTGCCAGAGCGGGTGGTGCCCTAC
Celera SNP ID: hCV1603656
公開 SNP ID: rs11552566
転写配列のSNP 配列番号55
SNP位置, 転写物: 10784
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,38|A,2) アフリカ系アメリカ人(G,27|A,7) 全体(G,65|A,9)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号115, 2829位において,(R,CGA) (Q,CAA)
SNP 供給源: CDX_Heart;Celera;HapMap;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(G,-|A,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号115, 2829位において,(R,CGA) (Q,CAA)
遺伝子番号: 26
Celera 遺伝子: hCG1981506 - 62000133107911
Celera 転写物: hCT2254396 - 62000133107912
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1855115 - 197000069368249
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル: HSPG2
タンパク質名: heparan sulfate proteoglycan 2 (perlecan)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W3P1(4938116..5032197)
染色体: 1
OMIM 番号: 142461
OMIM 情報: Schwartz-Jampel syndrome, type 1, 255800 (3); Dyssegmental dysplasia,/Silverman-Handmaker type, 224410 (3)
転写配列 (配列番号56):
タンパク質配列 (配列番号116):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号196):
TCAGGCTACCCCACTCCTGACATCAGCTGGAGCAAGCTGGATGGCAGCCTGCCACCTGACAGCCGCCTGGAGAACAACATGCTGATGCTGCCCTCAGTCC
R
ACCCCAGGACGCAGGTACCTACGTCTGCACCGCCACTAACCGCCAGGGCAAGGTCAAAGCCTTTGCCCACCTGCAGGTGCCAGAGCGGGTGGTGCCCTAC
Celera SNP ID: hCV1603656
公開 SNP ID: rs11552566
転写配列のSNP 配列番号56
SNP位置, 転写物: 10848
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,38|A,2) アフリカ系アメリカ人(G,27|A,7) 全体(G,65|A,9)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号116, 3588位において,(R,CGA) (Q,CAA)
SNP 供給源: CDX_Heart;Celera;HapMap;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(G,-|A,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号116, 3588位において,(R,CGA) (Q,CAA)
遺伝子番号: 27
Celera 遺伝子: hCG1991338 - 103000085249050
Celera 転写物: hCT2269195 - 103000085249051
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1891078 - 197000069434342
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7320330..7340729)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号57):
タンパク質配列 (配列番号117):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号197):
GCTCCTGCACCGCGCCACCCAGACCGCGAAGCAGACGGTCCACCCGGCCTCCCAGCTCCCGACTCAACCGCTCCAGATCCCGCAGCACCTCGGGGTCGAT
K
GGGGGAATGGCCGGTGTGGGTGTGGGTGCAGGCGCTGGGCAGGGCCGCGCAGGGGCAGAAGGCGGGGGTGGAGGCGCGCCGCTCAGACGGATCTTGAGTT
Celera SNP ID: hCV7453127
公開 SNP ID: rs8531
転写配列のSNP 配列番号57
SNP位置, 転写物: 126
Related Interrogated SNP: hCV22275215 (Power=.51)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|T,6) アフリカ系アメリカ人(G,10|T,2) 全体(G,36|T,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号117, 42位において,(M,ATG) (I,ATT)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,30|T,6) アフリカ系アメリカ人(G,22|T,14) 全体(G,52|T,20)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号117, 42位において,(M,ATG) (I,ATT)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,16|G,88)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号117, 42位において,(M,ATG) (I,ATT)
遺伝子番号: 28
Celera 遺伝子: hCG2015975 - 145000147245434
Celera 転写物: hCT2308609 - 145000147245435
公開転写物アクセッション: NM_003248
Celera タンパク質: hCP1807556 - 197000064940197
公開タンパク質アクセッション: NP_003239
遺伝子シンボル: THBS4
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W40L(8622353..8690750)
染色体: 5
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号58):
タンパク質配列 (配列番号118):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号198):
CCCAGTGGGCTTCACAGGGCCCATGGTGCAGGGTGTTGGGATCAGTTTTGCCAAGTCAAACAAGCAGGTCTGCACTGACATTGATGAGTGTCGAAATGGA
S
CGTGCGTTCCCAACTCGATCTGCGTTAATACTTTGGGATCTTACCGCTGTGGGCCTTGTAAGCCGGGGTATACTGGTGATCAGATAAGGGGATGCAAAGC
Celera SNP ID: hCV11433557
公開 SNP ID: rs1866389
転写配列のSNP 配列番号58
SNP位置, 転写物: 1349
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,86|G,34)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号118, 387位において,(A,GCG) (P,CCG)
遺伝子番号: 29
Celera 遺伝子: hCG2041118 - 209000073582473
Celera 転写物: hCT2346349 - 209000073582474
公開転写物アクセッション:
Celera タンパク質: hCP1912283 - 232000171436863
公開タンパク質アクセッション:
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6BN(13454338..13474835)
染色体: 18
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号59):
タンパク質配列 (配列番号119):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号199):
AAGATCCGGAGTCATCGACTTCTCATAAACACCTTTCACTCATACAATCCAATTTTTAAGAAGTCCAATTGTTTTGATGGTTTTCAATTTCACCCATTTC
Y
CAAGGACAGCCTCACCAATCGGAGCTCTGGTCTCTGGAATTAAGCATCATCAAGCTCTCCTATTAATAAATTTAATTTAGATCTCCTAA
Celera SNP ID: hCV16054991
公開 SNP ID: rs2689000
転写配列のSNP 配列番号59
SNP位置, 転写物: 324
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,10|C,28) アフリカ系アメリカ人(T,2|C,28) 全体(T,12|C,56)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号119, 43位において,(P,CCC) (L,CTC)
SNP 供給源: HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(T,-|C,-)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号119, 43位において,(P,CCC) (L,CTC)
遺伝子番号: 30
Celera 遺伝子: hCG2043414 - 30000035864837
Celera 転写物: hCT2350235 - 30000035864835
公開転写物アクセッション: NM_176890
Celera タンパク質: hCP1915481 - 30000035864786
公開タンパク質アクセッション: NP_795371
遺伝子シンボル: TAS2R50
タンパク質名: taste receptor, type 2, member 50
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W45C(1391258..1412158)
染色体: 12
OMIM 番号:
OMIM 情報:
転写配列 (配列番号60):
タンパク質配列 (配列番号120):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号200):
AATACAGTACATCTTTCATATTTGACTGTAACTACCCTATGGAGCTTCATACCCTTTACTCTGTCCCTGATATCTTTTCTGATGCTAATCTGTTCTCTGT
R
TAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGAGAAGGATCGCAAGATCTCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTCTGATCTCCTTCCTCTTG
Celera SNP ID: hCV12107274
公開 SNP ID: rs1376251
転写配列のSNP 配列番号60
SNP位置, 転写物: 608
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,77|A,41)
SNP 型: ミスセンス変異
コードタンパク質: 配列番号120, 203位において,(Y,TAT) (C,TGT)
遺伝子番号: 1
Celera 遺伝子: hCG15777 - 30000022987759
遺伝子シンボル: PNPLA1
タンパク質名: patatin-like phospholipase domain containing 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(9219805..9305282)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号201):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号251):
GCCTAGGGAGAGCCCTGCTGAAGACTCAAACTGGGTGAATAAGGTCTTCAAGAAGAACAAGCAAAAGACAAGTGGCACCAGAAAAGGCTTCCCAAGACAT
Y
CGGGATCCAAAAAACCAAGCAGCAAAGTGCAGTGAGCATGTCTAATGTTCCTTAAATCCCACGGAGAGGAGCAGCTTTGGGAACTGTGTTCAGAGAGATT
Celera SNP ID: hCV2476746
公開 SNP ID: rs4713956
ゲノム配列のSNP: 配列番号201
SNP位置, ゲノム: 74563
SNP 供給源: ABI_Val;Celera;HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(C,-|T,-)
SNP 型: ミスセンス変異
遺伝子番号: 2
Celera 遺伝子: hCG16019 - 146000220356722
遺伝子シンボル: MLF1
タンパク質名: myeloid leukemia factor 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(37001831..37057013)
染色体: 3
OMIM 番号: 601402
OMIM 情報: Leukemia, acute myeloid, 601626 (1)
ゲノム配列 (配列番号202):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号252):
AATGAAAACACCAGACTAGACTGAAATATGTGGGAGCAAGGCAGTTACTGACAGTTGATACCTTAATACTTATTCCCATTATTTTTCTGTTTGACATAGG
Y
GATGCTCATGCTTTTGATGAGGAGTGGCAAAGTGAGGTTTTGAAGTACAAACCAGGACGACACAATCTAGGAAACACTAGAATGAGAAGTGTTGGCCATG
Celera SNP ID: hCV15974589
公開 SNP ID: rs4875
ゲノム配列のSNP: 配列番号202
SNP位置, ゲノム: 41531
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,47|C,73)
SNP 型: ESS;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
コンテクスト (配列番号253):
AGAAGGCATGCTCTTTATGGATGACCTATAAATTTCTGGCCCTAACAGTGGCATTTTCTCTTAACCGGCACTGTCCAATGGCATTTTCTGAAATGACTTC
R
GTAATGACAAAAATGCTATATATCTATTCTGTCCAGTGTAGTAATCACTAGCCACATGTGGCTGTTGATTCACATTTGAAGCATTGCTGGTACAACTGAA
Celera SNP ID: hCV3175476
公開 SNP ID: rs6800914
ゲノム配列のSNP: 配列番号202
SNP位置, ゲノム: 43108
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,46|A,70)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号254):
TGATATCTGAATGTTCATGAAGGTCCTAGCTTTATATTGTCCCTCTTTTAGGAATAAAATTTTGATTTTCAACAATGTGAGTAAATTGAGTCTATTTAAT
R
TAAAACTCTTTAAAACATACTAATTTTTTAAAGCTTATATGCTTATTTCGCTTCCCCAGTTGTTTTTGTGTTGGCTAAATATTCTTTTATATTTATCAAG
Celera SNP ID: hCV29114176
公開 SNP ID: rs6804259
ゲノム配列のSNP: 配列番号202
SNP位置, ゲノム: 44146
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,43|A,63)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号255):
CCCACCTACTATTCTACTCTTTATGAGATCAACTTTTTTAGATTCCATATATGAATGAGATCATGTAGTATCAAATTCATCATTTTAAATATTCTTCTGT
R
TCATCAATTTTTAAAATATTTTCCCACAATACTTTTGCTCACCATCCACTTTTTGTACCCCAGACCGTCCATCTGAGATCTTTTTTTTTTCCTTCCTGAA
Celera SNP ID: hCV29864539
公開 SNP ID: rs6803047
ゲノム配列のSNP: 配列番号202
SNP位置, ゲノム: 50465
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,47|G,73)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
遺伝子番号: 3
Celera 遺伝子: hCG1641616 - 79000075093172
遺伝子シンボル: FAT2
タンパク質名: FAT tumor suppressor homolog 2 (Drosophila)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VUFE(24331975..24417314)
染色体: 5
OMIM 番号: 604269
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号203):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号256):
CAAAGAGCAAGGTGGCAGATCCTTACCGTGAGGATGACGTCACCCACAAGGGCATTCTCTAAGACCCTTGTGCTATATGGATCTTGGGGGAATTGGGGCC
R
GTGTTCATTGACATCAGTGATGTTGACCATGACTGTGGTCACGTCACTGAGGGAAGAGGAGCTCTTCCGGCTGCACTCAATGGACAGGAAGTACTTGGGG
Celera SNP ID: hCV15973230
公開 SNP ID: rs2304024
ゲノム配列のSNP: 配列番号203
SNP位置, ゲノム: 35661
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,92|A,28)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
コンテクスト (配列番号257):
GTCACCACCAGAAGCCTAGCACAGCTCTCACCTGGATCTGAAGCTGATACCATTCCTGAGCCCTCCTGCTTAGGCCCTCAGCAGTCACCAGCCATCCATC
Y
GGGGTCACTCGGAAGGCAGAGCCGTTGTTCCCCTTGGTGATTCGAAACGAGTAGGGGGGGCCATTCTCTGGAGAATCTGGGTCACTCAGGATCAGCTGCA
Celera SNP ID: hCV25639371
公開 SNP ID: rs3734051
ゲノム配列のSNP: 配列番号203
SNP位置, ゲノム: 32246
関連照会 SNP: hCV15973230 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,86|T,32)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
コンテクスト (配列番号258):
CTCCAACAGTGATGAAGATCTCCAGTGGGAGAGCAGAAGGTGCATAGTGGCTCTGCTCTGTGACATGGACACGGACAGACGTCGAAGACGAGAGGGGAGG
K
ATGCCACTGTCTGACGCCTGTGGGCAAAACAAACACTGCTGTCACCCAACAGAACTGCAGTGCTCTTGCGCCCGACTGAGGCTGGGCCTCCTTGTGGAGC
Celera SNP ID: hCV25951598
公開 SNP ID: rs3734049
ゲノム配列のSNP: 配列番号203
SNP位置, ゲノム: 28474
関連照会 SNP: hCV15973230 (Power=.8)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,29|T,7) アフリカ系アメリカ人(G,24|T,4) 全体(G,53|T,11)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,92|T,24)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
コンテクスト (配列番号259):
TCTTACCCACCATGCCACCCTGGAACTCATCCTCTCCAACAGTGATGAAGATCTCCAGTGGGAGAGCAGAAGGTGCATAGTGGCTCTGCTCTGTGACATG
S
ACACGGACAGACGTCGAAGACGAGAGGGGAGGGATGCCACTGTCTGACGCCTGTGGGCAAAACAAACACTGCTGTCACCCAACAGAACTGCAGTGCTCTT
Celera SNP ID: hCV25953895
公開 SNP ID: rs3734047
ゲノム配列のSNP: 配列番号203
SNP位置, ゲノム: 28441
関連照会 SNP: hCV15973230 (Power=.8)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,8|G,30) アフリカ系アメリカ人(C,4|G,28) 全体(C,12|G,58)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,95|C,25)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
コンテクスト (配列番号260):
AGGTGTTAAAATCACAGGCAGACTGTGACCTTCCACATGACATAATCCAAATAACTGAATGATTATTACAAAGGAAATTTATTTTTCTTCCATGTGATTC
S
ATGGGGTTTGAGCACCCCCAGTGGTAAGCAATCCCCCCATCCCTGGGAAACACTGGCCTATTACTCAGCAAAAATGATAACGGCACCAGGGCTAGTTGAC
Celera SNP ID: hCV31985917
公開 SNP ID: rs6870052
ゲノム配列のSNP: 配列番号203
SNP位置, ゲノム: 23653
関連照会 SNP: hCV15973230 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,95|G,25)
SNP 型: INTRON;REPEATS
遺伝子番号: 4
Celera 遺伝子: hCG1643662 - 84000314615955
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VT2P(430754..547362)
染色体: 10
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号204):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号261):
GCTCCCAGAACTAGGAAACTTATATTTAACTGGTCAGAAGAAGGTATGCAAAGTGGAGAACAGCCCCTGGGTTACCCCAATTGCTGGCCAGTTCCAGCTT
S
ATGTGTCCTGTGTGTCTGAATGTGTCTGTTCTGAGACATATGAGTACCTCTATGGCAGCACATGCAGGCAAATCCAGAACCACCAAAACATAATAATCAC
Celera SNP ID: hCV881283
公開 SNP ID: rs211070
ゲノム配列のSNP: 配列番号204
SNP位置, ゲノム: 106451
SNP 供給源: dbSNP; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,113|C,1)
SNP 型: ミスセンス変異;INTRON
遺伝子番号: 5
Celera 遺伝子: hCG1644106 - 103000085235807
遺伝子シンボル: FLJ20014
タンパク質名: hypothetical protein FLJ20014
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7319816..7341647)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号205):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号262):
GCTCCTGCACCGCGCCACCCAGACCGCGAAGCAGACGGTCCACCCGGCCTCCCAGCTCCCGACTCAACCGCTCCAGATCCCGCAGCACCTCGGGGTCGAT
K
GGGGGAATGGCCGGTGTGGGTGTGGGTGCAGGCGCTGGGCAGGGCCGCGCAGGGGCAGAAGGCGGGGGTGGAGGCGCGCCGCTCAGACGGATCTTGAGTT
Celera SNP ID: hCV7453127
公開 SNP ID: rs8531
ゲノム配列のSNP: 配列番号205
SNP位置, ゲノム: 11044
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.51)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|T,6) アフリカ系アメリカ人(G,10|T,2) 全体(G,36|T,8)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,30|T,6) アフリカ系アメリカ人(G,22|T,14) 全体(G,52|T,20)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,16|G,88)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
遺伝子番号: 6
Celera 遺伝子: hCG1647070 - 84000313730920
遺伝子シンボル: KIF6
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(12311520..12426711)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号206):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号263):
ACAGGAATAGGTTAAACAGAAAGGTAGGGAGCCTTTTCTGGGAACTCTAACACCTCCGGTGAGTTCTCACCTTACCTTTTGTTAGAGAGGAGTTGGGACC
R
TTCATGCTGGGAGTCAGATGTCTGGAGAAATGGCTTCGTGTGATCGAGTGAATTCACTGCTGGAGAATTTACCTGTTGGCCCCAGAAGGAGTTTCACAGT
Celera SNP ID: hCV3054799
公開 SNP ID: rs20455
ゲノム配列のSNP: 配列番号206
SNP位置, ゲノム: 31149
SNP 供給源: ABI_Val;Applera;Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: ミスセンス変異
遺伝子番号: 7
Celera 遺伝子: hCG16542 - 30000023220752
遺伝子シンボル: GRK7
タンパク質名: G protein-coupled receptor kinase 7
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(53789104..53849271)
染色体: 3
OMIM 番号: 606987
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号207):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号264):
TTTGTTTTGTTAACTCTGTCTCAGGCTGATCATCTCCTTTCTTCACAGAGAAAAGTCTGATGATCCCAGGAAACATCATTTCTTTAAAACGATCAACTTT
M
CTCGCCTGGAAGCTGGCCTAATTGAACCCCCATTTGTGCCAGACCCTTCAGTGGTTTATGCCAAAGACATCGCTGAAATTGATGATTTCTCTGAGGTTCG
Celera SNP ID: hCV465412
公開 SNP ID:
ゲノム配列のSNP: 配列番号207
SNP位置, ゲノム: 48443
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,4|C,36) アフリカ系アメリカ人(A,3|C,35) 全体(A,7|C,71)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
SNP 供給源: Applera;Celera
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|C,-)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
遺伝子番号: 8
Celera 遺伝子: hCG1657517 - 84000314340970
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W8B1(17712978..17756628)
染色体: 13
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号208):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号265):
CTTTTCTCCAAAATGTTTTTCATTTTGTTTGTTTTTGCAAATATCTTAGATTACTAGGAAAGCCAAGTCTCTCTTCCTGGATTTCTTCTCCTATAAACCG
Y
CTATTGATACCTACCCACTTCTCTATGGAGCACAGATGAAGGATATTGGTCATGTATGTTGAAATATTTGTCCAACTTTATCCCTAGTTTTTTGACTTTG
Celera SNP ID: hCV9879153
公開 SNP ID: rs3736919
ゲノム配列のSNP: 配列番号208
SNP位置, ゲノム: 29131
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,61|T,57)
SNP 型: ミスセンス変異;INTRON
遺伝子番号: 9
Celera 遺伝子: hCG1658913 - 61000125195351
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VU0F(3643581..3713961)
染色体: 9
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号209):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号266):
CCCTGTACCTCATCATGGCCACGGGCATGAGGGAATGATGCTGGATCATGACCTTAAAGGAACCATGCAGCTCTATGGGCATGAAGAAGCCATGCAGTAT
S
ATGGCCATGAGGGAACCATGAGGCTCCATGGGCATGAGGAACCATGCAGCTCCATGGCCATAAGGGAATCATGCAGCTACAGGGCCATGAGGAGCCATGC
Celera SNP ID: hCV25741584
公開 SNP ID: rs12685413
ゲノム配列のSNP: 配列番号209
SNP位置, ゲノム: 60264
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,120|C,-)
SNP 型: UTR3
遺伝子番号: 10
Celera 遺伝子: hCG17584 - 146000220354806
遺伝子シンボル: LXN
タンパク質名: latexin
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(36936789..36983633)
染色体: 3
OMIM 番号: 609305
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号210):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号267):
CCACTGCACTTCAGCCTGGGTGATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAGAAAAAAGAAATTTAACTTACTTTTTGTATAATTTCTTCAACAGCAAATTTAAGG
Y
GATACTTATGTCCTCTTCCTGGAATATCCTAAAATTAAGAAAATGTAGTGGAGACAAGAAAATATTATAACAACATTATACTTGCATTGTTAGAAGTATG
Celera SNP ID: hCV11238304
公開 SNP ID: rs8455
ゲノム配列のSNP: 配列番号210
SNP位置, ゲノム: 35153
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,10|T,10) アフリカ系アメリカ人(C,8|T,0) 全体(C,18|T,10)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,49|C,71)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号268):
TGTTAGTTTTCTATTGCTGACTTAAGAAGTTACCACAAACGTAGTGGCTTAAAACAACACAAATATATACTTTTATAGTTCTGTGGATCATAGGCTGATA
R
CTGTTCTCAAAGGGCTAAATTAATCAAGATATTGGTAATGTTGTTTTCCTTTCTGGAGGCTCTATGGGAGAATTTCTCTCCTTCTTACTCAGGTTATTGG
Celera SNP ID: hCV2004219
公開 SNP ID: rs891464
ゲノム配列のSNP: 配列番号210
SNP位置, ゲノム: 28466
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,47|A,73)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号269):
TGGCGATTGGGAACTCTCAGTTGGCTCCTGTGTTCCTTTAACATCTTCCAATGTTTTGCCTTTTTGAATACTTCCTTACTTGCTGGCACTACAAGACGCC
Y
CAGGCTTATCTTGTATATTCCATGCCCTAACCCTAGAATCAGCCGTTCTCCAAGGAGCACTGGTTCCTTTTTAAGTAAAATGGTATTAGAAACCAAGATT
Celera SNP ID: hCV29593475
公開 SNP ID: rs9819567
ゲノム配列のSNP: 配列番号210
SNP位置, ゲノム: 21082
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,47|C,73)
SNP 型: UTR3;INTRON;REPEATS
遺伝子番号: 11
Celera 遺伝子: hCG1772922 - 107000109464830
遺伝子シンボル: ZNF350
タンパク質名: zinc finger protein 350
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VY4T(1814231..1856919)
染色体: 19
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号211):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号270):
CTTCCTATGGGTTTTCTGTAACATAAAATAAGACATAATTGATCACGGAAGGCACAACCACATTCACTGCATTCACAAGGTTTCTGTCCTGTGCAAATCC
W
CTGTTATCTCCTGAGGCTGCACATCTGACCACTGGCTGTCCCACAAGGACTACGTTCCTGTTTGCGAGGAGGCCGCTGATGTTTAATGATGTCTGAGGGG
Celera SNP ID: hCV15965459
公開 SNP ID: rs2278415
ゲノム配列のSNP: 配列番号211
SNP位置, ゲノム: 10815
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,104|A,16)
SNP 型: ミスセンス変異;UTR3
遺伝子番号: 12
Celera 遺伝子: hCG1783416 - 104000116835546
遺伝子シンボル: CYBRD1
タンパク質名: cytochrome b reductase 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W8UP(22874959..22930607)
染色体: 2
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号212):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号271):
ACCATTCTTCATCCAAATGGAGGCACTGAACAGGGAGCAAGAGGTTCCATGCCAGCCTACTCTGGCAACAACATGGACAAATCAGATTCAGAGTTAAACA
R
TGAAGTAGCAGCAAGGAAAAGAAACTTAGCTCTGGATGAGGCTGGGCAGAGATCTACCATGTAAAATGTTGTAGAGATAGAGCCATATAACGTCACGTTT
Celera SNP ID: hCV3200162
公開 SNP ID: rs10455
ゲノム配列のSNP: 配列番号212
SNP位置, ゲノム: 42279
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,12|G,6) アフリカ系アメリカ人(A,32|G,0) 全体(A,44|G,6)
SNP 型: ミスセンス変異
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,17|G,13) アフリカ系アメリカ人(A,32|G,6) 全体(A,49|G,19)
SNP 型: ミスセンス変異
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,31|A,89)
SNP 型: ミスセンス変異
コンテクスト (配列番号272):
AAAAGCAAGATGCAGAACAATATGTATAGGGATAATAAATTTTCTGGAATGATCCATGAGAAGGTGATAAAAGGGGTTACATTAGGTAGTGGAACTGGAG
Y
GAGGAAACTTCATTTTCTACCCTTTGGTTCTATATGAAAGGTTTTGTCATATTACACATATTGCTTTTTAAATAATTTAAAATTAGTTTAGAACTTAAAA
Celera SNP ID: hCV3200161
公開 SNP ID: rs2542941
ゲノム配列のSNP: 配列番号212
SNP位置, ゲノム: 40727
関連照会 SNP: hCV3200162 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,31|T,89)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号273):
TTCTTTAATATACTCTCATCATGGTATCTGTGTAGAGTCATGATCTAAACCCTGTCCCAGATATTCCTTATCGGATTTTAAACTTTTAGGACTGCTTCCC
K
CTAGTTGTGAAATCATTGTCTCCCAGAATTAACAGGAAATGACTGCATGACAACAGGCCAGGGATGCTGCCAGTTTATCCAATTAACTACTAGTAGACAC
Celera SNP ID: hDV71152540
公開 SNP ID: rs950163
ゲノム配列のSNP: 配列番号212
SNP位置, ゲノム: 42744
関連照会 SNP: hCV3200162 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,31|T,87)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号274):
CAAATTAAAACCTAGAGTAGTGCTTATGCTGAAATGATACTTTTCATTTTTTGGTTGATTTTTTTGCCTTCCCTTCAATTTTAAACTGAAGCATTTTAAT
R
TGGGTAGAAACTCTACACCAAATACACTAAACATTTTGGTGCTTAGTGGATTTCTTTTTAGGTAACTGGTACTTACTTCCAAAGACTGAATACAAGCCAC
Celera SNP ID: hCV27053832
公開 SNP ID: rs2542939
ゲノム配列のSNP: 配列番号212
SNP位置, ゲノム: 44023
関連照会 SNP: hCV3200162 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,32|G,86)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号275):
AATCCTGATCTCAAGTGATCCTCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGCAGGCATCCCTTTAAATGCATGCCTTCTGTGAACAGCACTTCCA
S
TACTGACTTAGAGAGACAAAAGGTCTTATAATTTTCGGTCCACTAGGTTATAAATTATCACCTTCACTTGTAAGGTAGTAAGATTAAGATAGTTAAAAGG
Celera SNP ID: hCV31898499
公開 SNP ID: rs11675373
ゲノム配列のSNP: 配列番号212
SNP位置, ゲノム: 37944
関連照会 SNP: hCV3200162 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,32|C,88)
SNP 型: INTRON
遺伝子番号: 13
Celera 遺伝子: hCG1789838 - 118000094879268
遺伝子シンボル: ABCA1
タンパク質名: ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VU0F(7748303..7915441)
染色体: 9
OMIM 番号: 600046
OMIM 情報: Tangier disease, 205400 (3); HDL deficiency, familial, 604091 (3);/Cer
ebral amyloid angiopathy, 105150 (3); {Coronary artery disease in familial hypercholesterolemia, protection against}, 143890 (3)
ゲノム配列 (配列番号213):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号276):
GTGCTTGAAGTTTCTCCAGTGAGCAAGTCTACTCACCAGGATTGGCTTCAGGATGTCCATGTTGGAACGAAGTACTCGCTCTGCTGCAGCCAGTTTCTCC
Y
TTGGTAGGCCACAAAGCTCAGAAACTTCTTGGTCACCAAGTTGAATCATCTCTTCTGATTTTGATCCATTGCACAGACTTGTCAAATGTAACTGGTAGCC
Celera SNP ID: hCV2741051
公開 SNP ID: rs2230806
ゲノム配列のSNP: 配列番号213
SNP位置, ゲノム: 87575
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,26|T,14) アフリカ系アメリカ人(C,14|T,24) 全体(C,40|T,38)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
SNP 供給源: HGMD; dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,101|T,19)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
遺伝子番号: 14
Celera 遺伝子: hCG1811418 - 146000220356745
遺伝子シンボル: GFM1
タンパク質名: mitochondrial elongation factor G1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(36916899..36984944)
染色体: 3
OMIM 番号: 606639
OMIM 情報: Combined oxidative phosphorylation deficiency, 609060 (3)
ゲノム配列 (配列番号214):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号277):
CCACTGCACTTCAGCCTGGGTGATAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAGAAAAAAGAAATTTAACTTACTTTTTGTATAATTTCTTCAACAGCAAATTTAAGG
Y
GATACTTATGTCCTCTTCCTGGAATATCCTAAAATTAAGAAAATGTAGTGGAGACAAGAAAATATTATAACAACATTATACTTGCATTGTTAGAAGTATG
Celera SNP ID: hCV11238304
公開 SNP ID: rs8455
ゲノム配列のSNP: 配列番号214
SNP位置, ゲノム: 36464
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,10|T,10) アフリカ系アメリカ人(C,8|T,0) 全体(C,18|T,10)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,49|C,71)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号278):
TGTTAGTTTTCTATTGCTGACTTAAGAAGTTACCACAAACGTAGTGGCTTAAAACAACACAAATATATACTTTTATAGTTCTGTGGATCATAGGCTGATA
R
CTGTTCTCAAAGGGCTAAATTAATCAAGATATTGGTAATGTTGTTTTCCTTTCTGGAGGCTCTATGGGAGAATTTCTCTCCTTCTTACTCAGGTTATTGG
Celera SNP ID: hCV2004219
公開 SNP ID: rs891464
ゲノム配列のSNP: 配列番号214
SNP位置, ゲノム: 29777
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,47|A,73)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号279):
GATTATAATTTGAGTCTTTTCCTACTATAACTGAGTACTCCATTTTTCTAAGAGAAAGAGAATGAGTTACTTAAAAAACAATTTTTTTCTTTTCTCTTTC
M
GCCTTTTTCCCTGTTCTCTACTTCCTGCTTAGCTCTTTAGAAATGGAATCATAACTTTTACCTTCCCTTTTACCAGACACTCCCTGCATGGCAAGCTTAT
Celera SNP ID: hCV29114183
公開 SNP ID: rs7621897
ゲノム配列のSNP: 配列番号214
SNP位置, ゲノム: 64330
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,47|C,73)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号280):
TTTGCTTCAAGATATGGAAGTCATGGATCCTCATTTTTGTCTTGTCACTGAGTTATATGAAAGTCTGGTTGAATGTCTGTCACTTTTTCTGATGGAGACC
R
AAGTCTGTGGGAATAGGGAGATTCTTTTAACAACCTTAAGGATCTAGATACTGTATATATACCTCAAGCTGATATATTAGCCCTGATATGACAGGCAATA
Celera SNP ID: hCV29114184
公開 SNP ID: rs6772483
ゲノム配列のSNP: 配列番号214
SNP位置, ゲノム: 63683
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,47|G,73)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号281):
TGGCGATTGGGAACTCTCAGTTGGCTCCTGTGTTCCTTTAACATCTTCCAATGTTTTGCCTTTTTGAATACTTCCTTACTTGCTGGCACTACAAGACGCC
Y
CAGGCTTATCTTGTATATTCCATGCCCTAACCCTAGAATCAGCCGTTCTCCAAGGAGCACTGGTTCCTTTTTAAGTAAAATGGTATTAGAAACCAAGATT
Celera SNP ID: hCV29593475
公開 SNP ID: rs9819567
ゲノム配列のSNP: 配列番号214
SNP位置, ゲノム: 22393
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,47|C,73)
SNP 型: UTR3;INTRON;REPEATS
遺伝子番号: 15
Celera 遺伝子: hCG1978757 - 146000219433834
遺伝子シンボル: SERPINB8
タンパク質名: serine (or cysteine) proteinase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 8
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VUQQ(16920598..16980347)
染色体: 18
OMIM 番号: 601697
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号215):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号282):
TTGGAGAAAGCTCTTTGGGAGAGTATAATGGCAGCGTTAAAAGTCAGTGTTGGTTTCTGTTCCCAGGCACTTTGTTTATACAAAGACGGAGATATTCACC
R
AGGTTTCCAGTCACTTCTCAGTGAAGTTAACAGAACTGGCACTCAGTACTTGCTTAGAACTGCCAACAGACTCTTTGGAGAAAAGACGTGTGATTTCCTT
Celera SNP ID: hCV11450617
公開 SNP ID: rs1944270
ゲノム配列のSNP: 配列番号215
SNP位置, ゲノム: 40490
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,82|A,38)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
コンテクスト (配列番号283):
TATCTTATGGTTCTGGAAGTCCTAAGTCCAAAATGGTACAGCATAGCAATGTTATTTTCTGGAGTCTCTAGAAGAAAATCTGTTCCTTGCCTTTTCTGGC
Y
TCTCGAGGAGGTTGCATTCCTTCATCAGTGGCCCCTATCCCTCTGACCTCTGCTTCCGTCCTCATGTCTCTGTCTCTGACTCTGCCCCTCCTGCCTCTCT
Celera SNP ID: hCV27846382
公開 SNP ID: rs7234924
ゲノム配列のSNP: 配列番号215
SNP位置, ゲノム: 38585
関連照会 SNP: hCV11450617 (Power=.6)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,7|T,29) アフリカ系アメリカ人(C,16|T,18) 全体(C,23|T,47)
SNP 型: INTRON;REPEATS
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,85|C,31)
SNP 型: INTRON;REPEATS
遺伝子番号: 16
Celera 遺伝子: hCG1817372 - 146000220786385
遺伝子シンボル: KIAA1411
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF0F9(100048640..100216389)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号216):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号284):
CTCATTGGGAGAGCTGCACATATAGCTGTTCTTGATTCGGAAATATTTTTAGAGAAATTCTTTCTGGTTGCTGCCCTCAAATATTTCCAATAGTATAAAA
R
CATTGTTAGCGACTGGACAATTACCTCATTCAACAATGTTTCAAATAATGTATTATATTAAAATGTAGATGCTGATAAGTTCTAAGAAATATTTATACCT
Celera SNP ID: hCV25936375
公開 SNP ID: rs16869373
ゲノム配列のSNP: 配列番号216
SNP位置, ゲノム: 156437
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,3|G,37) アフリカ系アメリカ人(A,2|G,36) 全体(A,5|G,73)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;UTR3
SNP 供給源: Applera;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;UTR3
遺伝子番号: 17
Celera 遺伝子: hCG1818187 - 110000085683607
遺伝子シンボル: IL1F10
タンパク質名: interleukin 1 family, member 10 (theta)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VY9Y(627199..650730)
染色体: 2
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号217):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号285):
AGTTCCTTCCTGCCTGAGCCTTTACCTGCCAAGAGCCTGCAACATGGGGTTCCCTTGTCCCTTGACTCTTCTCTCTCTTCCCTCCTAGAGAAGATCTGCA
Y
ACTTCCTAACAGAGGCTTGGCCCGCACCAAGGTCCCCATTTTCCTGGGGATCCAGGGAGGGAGCCGCTGCCTGGCATGTGTGGAGACAGAAGAGGGGCCT
Celera SNP ID: hCV2146578
公開 SNP ID: rs6761276
ゲノム配列のSNP: 配列番号217
SNP位置, ゲノム: 12418
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,10|T,20) アフリカ系アメリカ人(C,7|T,11) 全体(C,17|T,31)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,53|C,67)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
遺伝子番号: 18
Celera 遺伝子: hCG31282 - 66000115705562
遺伝子シンボル: RANGNRF
タンパク質名: RAN guanine nucleotide release factor
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7218837..7240942)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号218):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号286):
GGCCCACTCCTGCTTCCTTGGAGGATCCCACCAGTGAGTCTCCCTGTTCTGTCCCTCCCAGCCCGATTCTCCTGGGAACCCAGTCATGAGATACCCGCCC
R
TTCCTTCCTCCTTACGGGGGCTGATTGAAGGTAAGCAAGAGATCAGTCTGGTACTGGGGCAGCCTCAGCAAGGCCTGATGAAGTGTCACGTCCTTTGCTA
Celera SNP ID: hDV71102112
公開 SNP ID: rs869773
ゲノム配列のSNP: 配列番号218
SNP位置, ゲノム: 11191
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,113|A,5)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;UTR3;INTRON
コンテクスト (配列番号287):
AAATACAGGCCAGGCCCTGTACAAGTCAGTGGAAAGTTGATGGTGAAAAGACAGACATGGACCCCTCTCTCCTGGTGCTTAGTGTGTTACACAGTGAGGC
R
CCTGCAGTGGTGACAGGAGCATAGCAGCACAGCAGGAGCCAGCAGTTAATCCACAAATGTTTTCTGGAGATCTGAGGATGAGCTAGCTAGGGAAGAAGGG
Celera SNP ID: hCV27915850
公開 SNP ID: rs4792722
ゲノム配列のSNP: 配列番号218
SNP位置, ゲノム: 4393
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|A,94)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号288):
TCTGTCTCCGCAGGAGGCCCATAGGATTCTGAAGAGCTGTGATGGGAGCCCTGCCTCGGCTCTCCATCAGACTCAGGACAGGCCACCAGGGCTGCTATCC
R
TCACCACACACCACCTCTCCCGTTTGACAGTGTCCAAATTGCCTCCTCTTCCCCACTTCTGGAATATGTGTTGAGAGACAGCAGTGAGATGCAGGAGGGC
Celera SNP ID: hCV30957101
公開 SNP ID: rs6503096
ゲノム配列のSNP: 配列番号218
SNP位置, ゲノム: 524
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,18|A,102)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号289):
CGGGTGGGGTCACATAAGTTCAGGTCCACGCCCTGCTCGGTGCCGGCGCCAGGAGAGCCAGGAAGACGCGGCCCGGCTTGCGGGGGGTAGAGGGACACAC
Y
TGCGCTGCGGGACCAGTCTCCTGAGGCTGCACGGGTTGGTGCTTGGTTAATTAAATCCTTAGTCCTTAGGCTCTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTTGA
Celera SNP ID: hCV30957112
公開 SNP ID: rs7208297
ゲノム配列のSNP: 配列番号218
SNP位置, ゲノム: 17414
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,110|C,10)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
遺伝子番号: 19
Celera 遺伝子: hCG31287 - 103000085235647
遺伝子シンボル: FLJ22170
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7261280..7301962)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号219):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号290):
TGAAGGCTGAAGACAGAGACGATATGGCAAGAGGCAGTGGCCTGGAATGGGGACTGACCACCCTGCAGAAGTTCAGCCAGGTAGATGTGGGGCAGGGGAA
Y
GCTAAATAAATACAGGGAGACAGAGACAGGGGTCAAGATAACAGAACAGGCAAAGGGGTTCTGAAAGCAGGGTGGGTCTAGAAGGACTTAGAGGGCATCA
Celera SNP ID: hCV22275215
公開 SNP ID: rs3826543
ゲノム配列のSNP: 配列番号219
SNP位置, ゲノム: 11628
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,19|C,101)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS
コンテクスト (配列番号291):
TAGACTCTTGGGACCTAGACTTCTACACCAAGCGCTTCCAGGAGCTACAGCGGAACCCGAGCACTGTGGAGGCCTTTGACTTGGCGCAGTCCAATAGGTG
R
GGAGAAATGGGGTTGTTCCCATACCTGAGCCCATGGGTGTTGGGAGAGACCACAGGGGCTCACCTTCATGTTCCTCCCTTGGCTTAGGGGCCTCCCTGAG
Celera SNP ID: hCV25610955
公開 SNP ID: rs7221716
ゲノム配列のSNP: 配列番号219
SNP位置, ゲノム: 38417
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,13|G,107)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号292):
GTGCTCGGATTACAGGCGGGAGCCACCGCGCCCAGCCTCCGTCTCCCTCCTAAGTGACATCCTGTCCGGCATCCCGCAGGCCTTCAGATGGATGGGGTAG
S
AGAGCTCAGGAACTCAAACACAGCCCGCCTGGTGGATGACTTCTAAGCATCTTTCAGTCTCCCTGATCTTGCCAAGCAGAGAAGGGCTTCCTCGTAATGC
Celera SNP ID: hCV26960050
公開 SNP ID: rs7221547
ゲノム配列のSNP: 配列番号219
SNP位置, ゲノム: 31531
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,13|G,105)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
遺伝子番号: 20
Celera 遺伝子: hCG37187 - 146000220350063
遺伝子シンボル: NPC1
タンパク質名: Nasopharyngeal carcinoma 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W66L(2585858..2660984)
染色体: 18
OMIM 番号: 607107
OMIM 情報: {Nasopharyngeal carcinoma 1}, 161550 (2)
ゲノム配列 (配列番号220):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号293):
GCCACAGACAATAGAGCAGTCTTGGCAGCTACATGGTGCTGTGACCTCATCCACAGACTCGTCACAGCCTTTGGTGGCATTGTTCATGGGCTCCATCCCA
Y
GGACTGGAAAATCTACAGAAAGGAATTGTGTTGAGTACAAATCTCAATTAAAAACATCCAAAATTTTGTATTATACTTAAACTCAAAGAAAAGCCCACTG
Celera SNP ID: hCV25472673
公開 SNP ID: rs1805081
ゲノム配列のSNP: 配列番号220
SNP位置, ゲノム: 38962
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,64|C,56)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
遺伝子番号: 21
Celera 遺伝子: hCG39290 - 93000022563619
遺伝子シンボル: LTK
タンパク質名: leukocyte tyrosine kinase
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W323(8836563..8866805)
染色体: 15
OMIM 番号: 151520
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号221):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号294):
CTCTAGTCATTGTCCTTCCCTTCAGGGTGTTCCGCTCTCCTACCCCCAGCCAGAAGTCCCACTCCTCTCACCTTGATAGCTACCTGCAGGGGACTGGAGT
Y
CCCAGGAAGGCCAATTACCAGTCCCTCATACACCTCCCCAAAGGCACCATGGCCCAGGGCTCTGCAGGAAGACACGTTGGAAGGGAGTGGGCAGGCGGCC
Celera SNP ID: hCV25623506
公開 SNP ID:
ゲノム配列のSNP: 配列番号221
SNP位置, ゲノム: 12308
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,36|T,4) アフリカ系アメリカ人(C,37|T,1) 全体(C,73|T,5)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;UTR3
遺伝子番号: 22
Celera 遺伝子: hCG39602 - 145000147474422
遺伝子シンボル: MKI67
タンパク質名: antigen identified by monoclonal antibody Ki-67
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF114(4250619..4300355)
染色体: 10
OMIM 番号: 176741
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号222):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号295):
TCCCTCTACATCTGCTTTCCTGATACTTCTCTTGGGTCGTTGCTTTGTGCTTGTTGGGGTGTCCACTGGGTCTGACTGTGGAGAGTCGCAGGGTATTTTA
R
TGGTTTTACCAGCAGCCACTAATTCCTCGGTGTGACCAGGAGTCTGGAAGAGCTCTTTAAAGCCAGCCAGGTCTTCTAGAGCCTGGGCCTTTTCCTTAGG
Celera SNP ID: hCV1801149
公開 SNP ID: rs4750685
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 21442
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,112|A,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コンテクスト (配列番号296):
GCAGATTAACAAGTTAACTCTCTTCACTGTAAAGCACCTTCCAGCTTTCTATGTATACGCTGCTCTCCAGGGTAAAGACATGCATTTGACATTTCCACAC
Y
TATTTCATGCAGGACATGTGATCCCAAAAATTAGCAGAGACTTGTCTTTGCAAGCCAAAACAGCTTTATCTTCCCTGAACACTAAGACCCCAGAAGGGTG
Celera SNP ID: hCV1801142
公開 SNP ID: rs9787436
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 24765
関連照会 SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,110|T,8)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号297):
TGGCCCTCTTTGGTCAACATTCTGCCTGGACATGTCAGCACGTACACAGCTTCCTACTTCTGTTTAATGGCTGCTTGGCATTCCACAGTATAAACATAAC
R
AAGTCTGGAGAGTCACCTCCACCTCCCCAGTGACAGACATTAACTTCTTTCCACATGCTGCAATTCTATAATTCAACTGTATAATGAATACTCCTGCATG
Celera SNP ID: hCV218623
公開 SNP ID: rs12261926
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 750
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,112|G,8)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN;REPEATS
コンテクスト (配列番号298):
AAACATTAGAAACAAACAGCTGTTTCTTGCCTTAAATCGCCAATAAAATAACATGGATTATCCTTATGTGGTTAGGGTCCATATTACACAGGAAATATTT
R
CCTACCGCAAACATCTTCAGGGTAGCAAGCTGTTCCCTCTGTGACAGGAATACAGTGACCAGTGCCAAATGAGAGATTAGACAGATTCTCATCTCCCATC
Celera SNP ID: hCV1801143
公開 SNP ID: rs7100645
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 23189
関連照会 SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,108|G,8)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号299):
CGCACTCAGGAAACGAACACCATCAGCAGGCAAAGCCATGCACACACCCAAACCAGCAGTAAGTGGTGAGAAAAACATCTACGCATTTATGGGAACTCCA
R
TGCAGAAACTGGACCTGACAGAGAACTTAACTGGCAGCAAGAGACGGCTACAAACTCCTAAGGAAAAGGCCCAGGCTCTAGAAGACCTGGCTGGCTTTAA
Celera SNP ID: hCV1801150
公開 SNP ID: rs7918199
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 20507
関連照会 SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,112|A,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コンテクスト (配列番号300):
CACTGTCCCTATGACTTCTGGTTCTTATTTTCTTGACACACACATTGTCCTCAGCCTGTGTGGGAAGAAAAAAAATAGAACTCTTAAGTAATTTAAACAC
Y
CATTTTTAGAATCGACCTCCTCTGCAAAACCCCAAAGGCTTACTAGGTATTATGCAGGTCCTTAGTTGCAGAAAATTAATTTTGAGGTTGGAAATAAGTT
Celera SNP ID: hCV1801168
公開 SNP ID: rs3781301
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 12643
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,111|T,9)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号301):
TGTATTCTAATGTCAGACTAACCAATCAGATTTGCTTCCGAAGCACCACTTCTTCTTTTGGAACATATCATCTGTAAAATATCATGTTGACTTCGGCTGA
K
AGACACTCTCTTTGAAGGCAGGTTGCCACTCTTTCTCCCTCCTCTCTTAGGAACCTCTGTCTGAGATTTGCTGCTGGAAGCAGGGGCTGTTTTGCAGGAC
Celera SNP ID: hCV8903188
公開 SNP ID: rs997983
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 25553
関連照会 SNP: hCV1801149 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,112|G,8)
SNP 型: ミスセンス変異
コンテクスト (配列番号302):
AACCTTGGCCCAGACTCCTTCACAAAGCCCCCGGTGTTCAACTATTCTCAGTCCAGGAGCCCAGCAGTGCTCCCAGTGGAGTTTATGAAGCCGATTCAGA
S
CCAGCAAATCCAAAGTTTTCTTCCCTTAAGCAGACTGACAGCCTTACTTACAGAATTCACTTGTAATTTATGACAAAAACTGCACTAGAACTTATCACAA
Celera SNP ID: hCV11276365
公開 SNP ID: rs4750935
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 12392
関連照会 SNP: hCV1801149 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,109|G,9)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号303):
GTGAAGGCAGGCACAGACGGTGCACACACATGGCCCATTGCTTCCCCGACCAACCTGGAATCCAAAGGAAGAGGCAGGCGAGCAAAGCGGGCTGTACAGA
K
GAGGGGGCAGAGGTGCTTCTGAGAGGGGTATCGGACGGTGCTCAGGGAGCCTCAGGGGCCACCTAGCGTTGTGTTACCTCCAAAGCAGTGCTTTCTCGGA
Celera SNP ID: hCV31968275
公開 SNP ID: rs11016062
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 5323
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,103|T,3)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号304):
GCCCATTGCTTCCCCGACCAACCTGGAATCCAAAGGAAGAGGCAGGCGAGCAAAGCGGGCTGTACAGAGGAGGGGGCAGAGGTGCTTCTGAGAGGGGTAT
Y
GGACGGTGCTCAGGGAGCCTCAGGGGCCACCTAGCGTTGTGTTACCTCCAAAGCAGTGCTTTCTCGGAGTAACAGAGGGCGGGCCCAGAGCCAAATAGCT
Celera SNP ID: hCV31968274
公開 SNP ID: rs11016063
ゲノム配列のSNP: 配列番号222
SNP位置, ゲノム: 5355
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,112|T,8)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
遺伝子番号: 23
Celera 遺伝子: hCG40340 - 146000220073481
遺伝子シンボル: TBX3
タンパク質名: T-box 3 (ulnar mammary syndrome)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W46Y(62349384..62383314)
染色体: 12
OMIM 番号: 601621
OMIM 情報: Ulnar-mammary syndrome, 181450 (3)
ゲノム配列 (配列番号223):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号305):
AAAAGGGGGGAAAAAGCAAAACAAAAAAGAAAGAAAAAAGAAAAGGAGGCAGAAATCACAACTAATGCACTTCAAAGGGAGGAGGGGAAGTGTCTTTTGG
R
GAATGGGAGGCCGCTTTTAAAGAGGGCAAGGCGAAAAATCAGCAAACATAGTCGCGCGGGTGACCGTCCTTGTGCCTTGCGTTTTTAAAAAGCCGCTCCT
Celera SNP ID: hCV25624196
公開 SNP ID: rs12366395
ゲノム配列のSNP: 配列番号223
SNP位置, ゲノム: 23133
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,30|G,8) アフリカ系アメリカ人(A,34|G,4) 全体(A,64|G,12)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;UTR5
SNP 供給源: Applera;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;UTR5
遺伝子番号: 24
Celera 遺伝子: hCG40416 - 104000117910922
遺伝子シンボル: SNX19
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VVY5(40773551..40834144)
染色体: 11
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号224):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号306):
CAAAGCCTGTTTCTCAGCAGCCAGTTTCTGCTCTTGGGTCCTTACGGGCCGTGGAAACTTAGGCAAAACTCCACCAGGCCAGATGGACTCCTGAAGAAGC
M
GGAGGTACTGCACCCAGCGCTGTGGACTTGTTAAATTAGCTACCTGCACCTCTAGCCACCTGTGGTAGAAGAGAGACGAAAGCTTAGATAAAGCTGAAGG
Celera SNP ID: hCV16189747
公開 SNP ID: rs2298566
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 14868
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,41|C,79)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
コンテクスト (配列番号307):
AGGTAGTCAATAAAAGCTTTCTGATACTCTCAAGGCATTTTTCATCCCTGTAACCCCTGTAACAGAGAATCTATCTTCTCTTACGGCTGCAGATTCCCTG
R
ACACTATTCAGCATCACATCCACCTTCTCTGCAACTTGAGATTCTGATGTGAGGGAGAATTCAGCAGTCTTACCTTTGAACTAGGGTCCCAAAGATAAGA
Celera SNP ID: hCV25626063
公開 SNP ID: rs3751039
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 37308
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,19|G,21) アフリカ系アメリカ人(A,11|G,21) 全体(A,30|G,42)
SNP 型: INTRON
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,69|A,51)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号308):
ACATTTCTGACTTCAGAGAATATCTCAACTACCTGTAACTGCAGGACCAACATCTCAGATATTTTTGCCTCACATTCTCTGGGTTTTGGTTCTTACCACA
Y
TGCCTTCCTGGAGACAATAAAGAATCTTGTCTTGTGCTTCAGTCACACTTAGTGCTGGAGAAATTTTACTGGATGAGAACCTCAGCCTAGACCTGGTACA
Celera SNP ID: hCV25626077
公開 SNP ID: rs4414223
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 40756
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,25|T,13) アフリカ系アメリカ人(C,16|T,14) 全体(C,41|T,27)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,45|C,75)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
コンテクスト (配列番号309):
GAATCTTGTCTTGTGCTTCAGTCACACTTAGTGCTGGAGAAATTTTACTGGATGAGAACCTCAGCCTAGACCTGGTACAGAAACAAAGAGCAGAAACAGG
W
TGTAATTTATGGCCTTGAGCCTCACACTAAGGGCTGGCAAGTACTGATAATAAAACACAACAAGAATATCCATACTTATTCTGGGGAGCTTACTGTGGTC
Celera SNP ID: hCV25626089
公開 SNP ID: rs4586174
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 40878
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,27|T,9) アフリカ系アメリカ人(A,26|T,4) 全体(A,53|T,13)
SNP 型: INTRON
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,41|A,77)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号310):
AGAAAGCTGCCTGGAGTCATGAGCATGATGGTTTCTTTGCCCAGTTCAGACAGCGGAGACTCCAGCTCTGAGTCTTCACATAAGAACAGGGGACCTCGAA
S
ATTTGGCTGTAGGAAATGAGATGAGTTGTTTCCTACTTTTCTTTCTTCACACATCCCACCCAAATCTCCCTCTACAGCTTCGTGGCCTTCTTCAACCTCT
Celera SNP ID: hCV25759522
公開 SNP ID: rs3751037
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 48985
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,42|C,78)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
コンテクスト (配列番号311):
ATGGGCAGAGGTAGCCTACTTGCCCAGCTGGAGAAGAGAAGGTAATCTACCACGTGGAAGGAAGGACATGAACAAAAAAATGAAAGCAGGAAGGAACATG
S
TGGTTTGGGCAGAATAAAAAATCCCTAGATTTTTTTGGAAGTTTCTCGTCTAACCTCCTGCCTAAACCATCTATAATACATTCTGTCCCCAAGAAAATGC
Celera SNP ID: hCV3108695
公開 SNP ID: rs4937582
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 5253
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,41|G,77)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号312):
TGTCCAAAATAGCCAACACGATCGTATTTGTTATTATTAGGGCCGCATCTCCTTTTTATAGGGCTTTTCATTCAGTGAGCCTAAGATGCCTGATGAAAGG
R
ATCCAGTAGCAAGAATTCCTGTTCCTGTTTATGTAAGAGGGTCACTAGAGGGAGGTGGCTGCAATGACCTGATCGGCTTCTCTGCAGGGGATTAAGTGAC
Celera SNP ID: hCV3108709
公開 SNP ID: rs948085
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 16793
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,41|G,79)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号313):
CAATATTATCAGCATGATCTCATCCTGCTGGATTAGAACTTCCTGTGTTTGTGCCCTGTTCTGCTGCTTGATTCCGCTGTGGCAACTATGTACTACTCAT
Y
TCTGTGCCCCAACACAGCACCTCCAACACTGGAGTTCAACACATGGCATGCTCAGCTGAATGGAACAGAAATCAAAGTTACAAACTCCAACTACCCCAAG
Celera SNP ID: hCV3108767
公開 SNP ID: rs3198419
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 39920
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,45|T,75)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号314):
M
ATTTTTTTCAAAGTGATATGGTCAGAAGTGAGGTTCAAGGCTGTTGAGGCCTCCCCTTCACCCACCTCATTTAAGACTGACATAGCTGTGTGGGTCATGG
Celera SNP ID: hDV71141362
公開 SNP ID: rs876641
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 16260
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,65|C,53)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号315):
GAAAGATATTACCCCATCTTTTTAGTTATGCTTCTCAATCTGCAAGGTGGAAAACTGTGTGAGTCATTCTTGATTTGTCTTTTTCTCAACCCTAATCCAA
Y
ACCACATAATCATTTAAATAGTCACTAAATATAGGTGATCCTACCTCCTCAATATCTCATGAATCTATTACCCCTTTACCATCTCTATAGCAATGATCTC
Celera SNP ID: hCV11345437
公開 SNP ID: rs7937411
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 24329
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,45|T,75)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号316):
ACAGTACAGGCTTCTCTGGGTGCATCATTGATTTTTATATAAATCAGAGTAGATACTAATCTATTACTTTAGTAAGCAACAGGATTTTAACCACAACCCC
R
ATATGCTGTTCAGAAAGATATTACCCCATCTTTTTAGTTATGCTTCTCAATCTGCAAGGTGGAAAACTGTGTGAGTCATTCTTGATTTGTCTTTTTCTCA
Celera SNP ID: hCV11345444
公開 SNP ID: rs7937166
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 24216
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,38|G,66)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号317):
GAACCTCAGCCTAGACCTGGTACAGAAACAAAGAGCAGAAACAGGTTGTAATTTATGGCCTTGAGCCTCACACTAAGGGCTGGCAAGTACTGATAATAAA
H
CACAACAAGAATATCCATACTTATTCTGGGGAGCTTACTGTGGTCAGAGCTGCCAGGAAAGACTCGGCCCTGCAATCCCCCAAACAATGTATATTCTGGC
Celera SNP ID: hCV25626101
公開 SNP ID: rs6590537
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 40933
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,13|C,0) アフリカ系アメリカ人(A,11|C,2) 全体(A,24|C,2)
SNP 型: INTRON
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,39|T,65)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号318):
GAAGATGAGTAACAATAAGAATCGTGTTATTTATGGAGCGTTCACTATGTGCCATCTACCGTACAAGAAGTTTTACAGAACAGAACACTAAAAGGGCCTC
S
GTCTCTGGGTGAGCCTGCACCTATACCTTCCCAACTCTCCTCTGGCAAGGCTGCACCTATTATCTTTCTAGCTCTCCTCTGATGGGAAGCATTATAACCT
Celera SNP ID: hCV26490015
公開 SNP ID: rs7942621
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 15534
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,66|G,52)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号319):
CTTTGGCCCCTTCAATTAATTAATCCTCCACAGCACTATTTAAATGATTTTTCTCAATTGCAAATTTGCTCATGTCATCATCTGTTTATGTTTTGTAAAA
Y
TGTTTCCTATCAAATGAGTGACAAATGTTTTGTTCTTGGAATGACTCACAGGAGTCTGAATGAGCAGACTCCCTTTAAACTCTTCACTGTTATCATCAGC
Celera SNP ID: hCV26490026
公開 SNP ID: rs7924461
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 24595
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,45|C,75)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号320):
TTTTGTTCTTGGAATGACTCACAGGAGTCTGAATGAGCAGACTCCCTTTAAACTCTTCACTGTTATCATCAGCCATTATTCTTGCATATCATATATTCCT
W
ATCAATCATACTAACTTCTTTGAGTACCACAAATACACTATATTGTTTTACTGCTCTGCCTTGAATGTTCTCTCTCTCTCTCACTGTCCGCTGGCAACGC
Celera SNP ID: hCV26490027
公開 SNP ID: rs7937782
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 24723
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,45|T,75)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号321):
TCAGCCATTATTCTTGCATATCATATATTCCTAATCAATCATACTAACTTCTTTGAGTACCACAAATACACTATATTGTTTTACTGCTCTGCCTTGAATG
Y
TCTCTCTCTCTCTCACTGTCCGCTGGCAACGCCCCACATTCTTTAAATCTCATCTCTGATGTCATCTACTATAAGCCTTCCCTGCACCTCTCATAATTGA
Celera SNP ID: hCV26490028
公開 SNP ID: rs7924736
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 24791
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,45|C,75)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号322):
GGTCAGGTTACCTTTCTAACAAATGTAGAAAGAGAAAAAGACACTTGGGGTCTGTGTATTTTTAGGATAAATAAGACTGATTGTAAAGGGAAAGCTCTAA
M
AATTTCTATATTTGAGTATTGTGACATGTTTAAGATTTCATTCTGAAAGTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGTCTCATTCTGTCGCCCAGGCTGG
Celera SNP ID: hCV26490038
公開 SNP ID: rs6590523
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 25917
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,44|A,68)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号323):
TGAAACTCCTGACCTCAAATGATCCACCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGCCCGGCCAATCTGAAAGTTTTCTAT
R
CACAAATCTAGTGTGCCTCTGAAGTCTTTCAAGTCAACCTTTTTTTGGCCCCATACTATGTTGCTACCGACATACTATAATCCAGTTCTGAGAAAATCAG
Celera SNP ID: hCV26490043
公開 SNP ID: rs6421609
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 26289
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,45|A,75)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号324):
TTGCACACCAGCCTCCCTCCCAGGAAGGCTGAATCCTCTCCGAGAAATCTTTCGGGGCCAGCATTATATTAGAGCTAAAGTATATTTCCCACCAATTTAC
Y
CAACTCCCTCCCTGCTCCAGTACCAAATAGCTCTACTTCTCCAAAGGGCACTTGGAGAAGCCTGCAAGGACAGAGGTAAAGATCAAAAGTAAGCAATAAC
Celera SNP ID: hCV26490055
公開 SNP ID: rs3794143
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 28004
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,45|T,75)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON
コンテクスト (配列番号325):
GGGCTATTCAGCACTGACAATCTCCATCTTAGTGAATACATAATGTATAAGATTTTAGGATCACAGGAGACCCTGAATATAGGTCCAAGTAGTTTATACA
K
AATATTAACAAAATTCTTGCAATTCAGATGTCTAGCTGGTCTCATCACCACAGACTCTGTTCTGCTCACTCTGTTCTGAATGAATCAGCTCCAGCACTGA
Celera SNP ID: hCV26490056
公開 SNP ID: rs3794140
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 28324
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,52|T,68)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号326):
GACCTATAACTGCAAAACAAACAGGTCTTCCTCAAAGGACAGTGAATGGTATTGTTTAACCTGCAGCGCCACCTGGTGCCCATAGAGAGAATTCCTGTGC
Y
CACGCCATGCAGCAGCAGTTTGGTAGGCTTTTTGTCACCTATTTGAAACAATAAAAGCAACACACATTCAGAAAGAAGCTGGCTAAAAATATTCCAGGTT
Celera SNP ID: hCV26490057
公開 SNP ID: rs7925664
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 28758
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,45|T,75)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON
コンテクスト (配列番号327):
TTTTGACACAGGTCTGATGCCATCGTTGGGGCCATGGGGAGGGCAGCGCCGCGGACGTGGCATTCACGCATTCTGCTGCTGGCATGGTTCCTATTTTTAT
Y
GTGGCATTGCTCTGGGTGTCCAGGCAGGGCGCCGGTCCAGCTTCTCATTCCTTCACTTTCCATCAGGACTCCACACCAATCCTACCCCTTACCTTGGCTG
Celera SNP ID: hCV26490064
公開 SNP ID: rs3829270
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 31687
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,45|T,75)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号328):
GCTAAATCTGATTCTGATGTTTGCAGAGATATTTTCAAGTTTCTTCTGTTTTCGGGCATGAGCAGAGTTTGCACAAGCCGGATTTGCTCCTTGGCTCAGA
S
TGCTACCCGCTCTCCCCTTCCCCTCCCTTTGTCTCTCATTCCAAATAAGGAGTGCTTCTTGTTACATAATTGGATGTTCCCAGCACAGAAGCTGACACAT
Celera SNP ID: hCV26490066
公開 SNP ID: rs3794132
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 31984
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,44|G,76)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号329):
TCATTCCTCTACCTCACAGCTTCTTTTCCCAAAGGAAACAGGATCTACTCACCAGCAACAATCCCAACATCACAAAAGGAACAGGGAAATAAACGTGCAT
R
CAACTGGGACACACAGACCCCTGTCACCTGCTACAAATGGAGCAGAAGTGGGAGAGAAGTGAGCCACCGAGAACCTAGGCCTTCTTAGCTGTAGCCTACT
Celera SNP ID: hCV27467549
公開 SNP ID: rs3190331
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 12357
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,67|G,53)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号330):
TTTTTAAGCTGTAATTCAATTTCTAAGACACACTTTATTATCACTCACTATGCCTTTCTTAAGTTGTAAATGGCTGTATATTCAGGGATTTGGTATACTT
W
GCCTTGCCCAACACCTGGATGGAACCAACTGCCACTGGTTCTTGAGAGCAATGAAGAAGGTGGAGATTTCTTCATCCAAATATCTTTCCTCTCCCTTTCA
Celera SNP ID: hCV27497392
公開 SNP ID: rs3829271
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 18138
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,72|T,48)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON
コンテクスト (配列番号331):
GCTCCCAGACTCTGCCGCAGCTCTCCTGACCTTTCCTAGGAGATGGTTTAGAGAGAGACATCTTCTCTAAGAAAGTGATTCCAAGGTCTGGTGTAAGGTC
Y
AGAGCTTGCCATCAAGTTTCTCCTGGGTGCCCTGCTTGTTGGACTCCTTAAACCTGCACACCCTTTCTTTTCTTCTTCCTCTCTGGATACTTCCTAACTT
Celera SNP ID: hCV27502173
公開 SNP ID: rs3794139
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 31290
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,45|C,75)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON
コンテクスト (配列番号332):
CAATCCAAGGGCAATTATGCTCCAACCTTAAGATACCAAATACAGTTCAAAGGAAAAGAGAAAGAAAAGGAAGATCAAGTTAAAGCTTCTATCATCCTAA
R
TACACCTTCAGTAAATTAGAAGTATTGACTTATTTTATTACCCTGAGAGCAGGGTTTTCAACGTTGGTACTACTGATATTTTGGACTGCGAAATCTTTGT
Celera SNP ID: hCV27869000
公開 SNP ID: rs4436551
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 19965
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,67|A,53)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号333):
TTCAAAGGAAAAGAGAAAGAAAAGGAAGATCAAGTTAAAGCTTCTATCATCCTAAGTACACCTTCAGTAAATTAGAAGTATTGACTTATTTTATTACCCT
K
AGAGCAGGGTTTTCAACGTTGGTACTACTGATATTTTGGACTGCGAAATCTTTGTCATAGGGGCTTTCCTGTGCATTATAAAACATTCCACAACATCCTT
Celera SNP ID: hCV27869001
公開 SNP ID: rs4264159
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 20010
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,61|T,47)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号334):
TCAAGTTAAAGCTTCTATCATCCTAAGTACACCTTCAGTAAATTAGAAGTATTGACTTATTTTATTACCCTGAGAGCAGGGTTTTCAACGTTGGTACTAC
Y
GATATTTTGGACTGCGAAATCTTTGTCATAGGGGCTTTCCTGTGCATTATAAAACATTCCACAACATCCTTGCCCCTCCTCCCCTCAAACTAGATGCTAG
Celera SNP ID: hCV27931232
公開 SNP ID: rs4456262
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 20039
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,67|C,53)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号335):
ATGAAGAGGAGAAAGGGAAGAAGATACTAAAATCATAAAACAGAAAATATTCATAAGATCCACAACAATATTCTAAACAAAAATGCCTGGTGCAGTCTAA
R
TATAAGGAAAATAACAGGTCCATTCCTTCCAGCCTATTTATCTATTGGCTGTACCTCTATAGACAATCCAAGGGCAATTATGCTCCAACCTTAAGATACC
Celera SNP ID: hCV27996234
公開 SNP ID: rs4457753
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 19801
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,65|G,51)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号336):
AGAGTTTTGGCTGGTGCAATCAGACAGTGCTTCTTGAAAATGGAACTTGAATTGGTCCTTATGGGCAGAGGTAGCCTACTTGCCCAGCTGGAGAAGAGAA
R
GTAATCTACCACGTGGAAGGAAGGACATGAACAAAAAAATGAAAGCAGGAAGGAACATGCTGGTTTGGGCAGAATAAAAAATCCCTAGATTTTTTTGGAA
Celera SNP ID: hCV29138826
公開 SNP ID: rs4936123
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 5193
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,67|A,53)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号337):
GGAAATAAGAAGCTATTCCTTGTAAGTTTGCTAATCTTATCTGTTCAGAATAATAAAAGTTCTCTGTCAAAGACTTAGGAAGGGAGATTTCATCCCCCAG
S
CTTGCTAGTCCTACTCTTTGTGCATTCTTAAGACAGGAGGCAAGTGCTTTCCATTCTCCTTGGAAAAACTGAGGCTGAATATGCAGCTTGTCATGCAGTT
Celera SNP ID: hCV29138827
公開 SNP ID: rs6590520
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 11612
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,67|G,51)
SNP 型: UTR3
コンテクスト (配列番号338):
TGCAAATGCAATGCACAGGCACACGGCTGTCAGCTGCCATCCACCTGCTACAATCTCAAAGATATATTCCAGTAGAGACTGTCGCTATGTGACAGGAAAG
S
CATGATGTCTTCATCCTAAGATGGGTGTAGAATAAGTGATACCCAAGAAATATGACAGGCAGACCACTCATATGACAGGGGAAACTGCTAGGGCCCATCC
Celera SNP ID: hCV29138833
公開 SNP ID: rs6590532
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 29955
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,42|G,78)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号339):
CATGATGTCTTCATCCTAAGATGGGTGTAGAATAAGTGATACCCAAGAAATATGACAGGCAGACCACTCATATGACAGGGGAAACTGCTAGGGCCCATCC
Y
GGCCCAGTCTATAGAAGTCAAGAGCTTCCCTTTGGCATGGCCTAATGGAAGAGGCCTGGGACAAGCAGTACTCCTTCCCAGGGAGCCACAGTACAATCTG
Celera SNP ID: hCV29138834
公開 SNP ID: rs6590533
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 30056
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,38|C,72)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号340):
GGGAGCCACAGTACAATCTGAGCAAAGCCATCAATGAGAAAAATTAATTTCAGCACCTCTAAAAACAGCCCAAGCCAATGACTGGAGAGCCAGAAAATAA
S
CGAGAATTCTGAAGACTGAGCTTGAGTTAATTTTGTATGTGGGGGTCTTGCAAAAGTATGCGTATTTCTAGAAAAGCTGTGCATAGGAAGAGATGGGGTA
Celera SNP ID: hDV71218734
公開 SNP ID: rs7110949
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 30217
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,45|C,75)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号341):
AAAATTAATTTCAGCACCTCTAAAATCAGCCCAAGCCAATGACTGGAGAGCCAGAAAATAAGCGAGAATTCTGAAGACTGAGCTTGAGTTAATTTTGTAT
K
TGGGGGTCTTGCAAAAGTATGCGTATTTCTAGAAAAGCTGTGCATAGGAAGAGATGGGGTATAAGACATAGCCAGGCATCAGAGCTGAACTGGAAGAAAA
Celera SNP ID: hCV29138837
公開 SNP ID: rs7110968
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 30276
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,45|T,75)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号342):
CTTAAGTGGAATCTTAAGGTGTGGTTGTTACGACTTTTATGATTTTGGGAACGTTATTTTATCTGAATGTAATTTTCTTCACTTATGAAATGTAGAACTA
Y
ATGTCTATCTCATAGAATTGAACATTAATATAAACAGTACATAGCTGCTTTCCTGGTATTAATATTGTAATAAGCGTCAGTTCCTTTCCCATTGCAATTA
Celera SNP ID: hCV29138841
公開 SNP ID: rs7933747
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 30840
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,39|T,69)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号343):
TCTCATAGAATTGAACATTAATATAAACAGTACATAGCTGCTTTCCTGGTATTAATATTGTAATAAGCGTCAGTTCCTTTCCCATTGCAATTACTCGTGC
M
CTTTTGGTGGCAGACCTGGAGGTTCTCTTAAGAAATAACCAATGTCACAAAGAACTGTTATCCACCTGCTAGTTAGACATGCCCACCAAGAAAGAGGCCC
Celera SNP ID: hCV29138842
公開 SNP ID: rs7933767
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 30948
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,45|C,73)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号344):
CTGGTATTAATATTGTAATAAGCGTCAGTTCCTTTCCCATTGCAATTACTCGTGCACTTTTGGTGGCAGACCTGGAGGTTCTCTTAAGAAATAACCAATG
Y
CACAAAGAACTGTTATCCACCTGCTAGTTAGACATGCCCACCAAGAAAGAGGCCCTTGAAGTAGAGTTCCACAGAAAGCGCCTTGATTCTGGAGCGTTCT
Celera SNP ID: hCV29138843
公開 SNP ID: rs7930661
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 30993
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,45|C,75)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号345):
TGATTCTGGAGCGTTCTAAGAGAACAGTGGAAGCAAGAGGGTTCATGGTCAACCTTTCCCAACTGTCCTTAGGGGAGGTGGACGTTGCGCCTTGCAGCAC
M
GCACTCTCCAGTGCTCCCAGACTCTGCCGCAGCTCTCCTGACCTTTCCTAGGAGATGGTTTAGAGAGAGACATCTTCTCTAAGAAAGTGATTCCAAGGTC
Celera SNP ID: hCV29138844
公開 SNP ID: rs7943935
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 31177
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,45|C,75)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON
コンテクスト (配列番号346):
ATAAAGAAATAAATGCATATTTTAAACAGAGTGGAGCCCCTTTTCAAACAAAGCGTTACCTAGAGCCCCAGTATATTAAACTGATCAAAGTGTAACTTCT
K
TGGTTGGGTCATGGTCCACTCAGTTTTCCCTGAGCTTCTAAGTTGGCTTCAGAAGCACTTCTGCAGAACCCTAGAACTCTAGGAAACATAATGGAAAAAC
Celera SNP ID: hCV29138848
公開 SNP ID: rs7110591
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 35894
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,45|T,75)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号347):
AGGCACTCATTAAAAATTTGCTGAAGATTAAACAGACAGGTGGCATAGAGCAAGTTTTCATTATTGCTATTCATGGTGTATCCTTTTTGGACATCCATTT
W
TTCCCCTTGTGTTCCAAATAAAACCAGAAAAGGAACTGCAAGTGATAACATCAATGTTTCAAGGGACAGAGACTCATAAGCAGAGGTATCATGGTCATCC
Celera SNP ID: hCV29138854
公開 SNP ID: rs7949722
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 41271
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; CDX_Heart
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,41|A,69)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号348):
TGGACTCCTTAAACCTGCACACCCTTTCTTTTCTTCTTCCTCTCTGGATACTTCCTAACTTTACACACTTCACGCTCCCCTCTGCCAGAACCTTTCCCCC
Y
GGCTTTCTGCCAAGCCATTCCATTCCCACATGCCCCCAACACTCACACACACACACTCTGTCTCTATCTTACACACACACACACAGACACACACACACAC
Celera SNP ID: hCV31258124
公開 SNP ID: rs3794136
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 31430
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,45|C,71)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON
コンテクスト (配列番号349):
CGACCTGTGGGCTGGACATCATTAGAGGTCATATCATCTGTTTTGTTGTTTGTGATAACATAAAAAGGCATCTCATGTTTGGAGACACTTGTTTCGTATG
Y
ATGTACATATATATGTATATATCAGATCTGCGTGCATGCATATGTGTGTATGCGCCTGTGCCTATGTGCATGCTCACAGTGGGCTGCAACGTACAATGCA
Celera SNP ID: hCV31258101
公開 SNP ID: rs4459316
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 20402
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,66|C,52)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号350):
GTGCCCCTCTGTTAAGTATAGTCTTGCCCTTCTGTATTTGTGCAATTAAAAAAAAATCTAAATTATAGTTCATCTTGTTGGCTTTAGATTATCATTCTAA
R
TTTTCTAAATGTTTTTGAATCTTAATTTTCATCATCTAGAGTTTTAACTACTCCTCTAAGATTAGAATTACTTGCAAATTTTCTGATGAAAAAATTGATC
Celera SNP ID: hCV31258105
公開 SNP ID: rs7106973
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 22339
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,65|A,45)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号351):
AACCCATAATGGTTTCTAGGGTTCCCCATTGCCCTTCCCAAATGTTCACAAACATCTATTTCGTCATCTGCTTCAGAAATTTCCAGAAATAAATGTTGGG
R
TCAAGAACCTTTAACCATTTTTTAAAAAGGCAAGATATCTGTGCATCTCTAACCCATATGGACAAATGGCAATGTTTCTTAATGACCTTAGGTCTTTAAT
Celera SNP ID: hCV31258108
公開 SNP ID: rs7107595
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 22782
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,67|A,53)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号352):
CACATAATCATTTAAATAGTCACTAAATATAGGTGATCCTACCTCCTCAATATCTCATGAATCTATTACCCCTTTACCATCTCTATAGCAATGATCTCAG
Y
TGAATGCCTCATCACCTTTTCTATCAATGAAACTCCTCCCTAATTTGTCTTCCTGTTTCTAACTTTGGCCCCTTCAATTAATTAATCCTCCACAGCACTA
Celera SNP ID: hCV31258111
公開 SNP ID: rs7937514
ゲノム配列のSNP: 配列番号224
SNP位置, ゲノム: 24432
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,45|T,75)
SNP 型: INTRON;REPEATS
遺伝子番号: 25
Celera 遺伝子: hCG43681 - 30000035144826
遺伝子シンボル: LTA
タンパク質名: lymphotoxin alpha (TNF superfamily, member 1)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(4592366..4614637)
染色体: 6
OMIM 番号: 153440
OMIM 情報: {Myocardial infarction, susceptibility to} (3)
ゲノム配列 (配列番号225):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号353):
CTCAACTCTGTTCTCCCCTAGGGGCTCCCTGGTGTTGGCCTCACACCTTCAGCTGCCCAGACTGCCCGTCAGCACCCCAAGATGCATCTTGCCCACAGCA
M
CCTCAAACCTGCTGCTCACCTCATTGGTAAACATCCACCTGACCTCCCAGACATGTCCCCACCAGCTCTCCTCCTACCCCTGCCTCAGGAACCCAAGCAT
Celera SNP ID: hCV7514870
公開 SNP ID: rs1041981
ゲノム配列のSNP: 配列番号225
SNP位置, ゲノム: 10954
SNP 供給源: HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|C,-)
SNP 型: ミスセンス変異;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
遺伝子番号: 26
Celera 遺伝子: hCG1981506 - 62000133107911
遺伝子シンボル: HSPG2
タンパク質名: heparan sulfate proteoglycan 2 (perlecan)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W3P1(4938116..5032197)
染色体: 1
OMIM 番号: 142461
OMIM 情報: Schwartz-Jampel syndrome, type 1, 255800 (3); Dyssegmental dysplasia,/Silverman-Handmaker type, 224410 (3)
ゲノム配列 (配列番号226):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号354):
TAGGGGTGGTGTCTTACCTGGCACCTGCAGGTGGGCAAAGGCTTTGACCTTGCCCTGGCGGTTAGTGGCGGTGCAGACGTAGGTACCTGCGTCCTGGGGT
Y
GGACTGAGGGCAGCATCAGCATGTTGTTCTCCAGGCGGCTGTCAGGTGGCAGGCTGCCATCCAGCTGCAAATGCACTAGCACTGAGGGCCCTGGCCTTGG
Celera SNP ID: hCV1603656
公開 SNP ID: rs11552566
ゲノム配列のSNP: 配列番号226
SNP位置, ゲノム: 21307
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,38|T,2) アフリカ系アメリカ人(C,27|T,7) 全体(C,65|T,9)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
SNP 供給源: Applera;CDX_Heart;Celera;HapMap;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(C,-|T,-)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
遺伝子番号: 27
Celera 遺伝子: hCG1991338 - 103000085249050
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7320330..7340729)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号227):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号355):
GCTCCTGCACCGCGCCACCCAGACCGCGAAGCAGACGGTCCACCCGGCCTCCCAGCTCCCGACTCAACCGCTCCAGATCCCGCAGCACCTCGGGGTCGAT
K
GGGGGAATGGCCGGTGTGGGTGTGGGTGCAGGCGCTGGGCAGGGCCGCGCAGGGGCAGAAGGCGGGGGTGGAGGCGCGCCGCTCAGACGGATCTTGAGTT
Celera SNP ID: hCV7453127
公開 SNP ID: rs8531
ゲノム配列のSNP: 配列番号227
SNP位置, ゲノム: 10126
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.51)
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|T,6) アフリカ系アメリカ人(G,10|T,2) 全体(G,36|T,8)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,30|T,6) アフリカ系アメリカ人(G,22|T,14) 全体(G,52|T,20)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,16|G,88)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;サイレント変異
遺伝子番号: 28
Celera 遺伝子: hCG2015975 - 145000147245434
遺伝子シンボル: THBS4
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W40L(8622353..8690750)
染色体: 5
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号228):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号356):
AGATTTATTTGCATTTCTATTTAAGCAGCATGTCTCGCTAAACTTTCTTTGAACTTTTCTGCACTAGGTCTGCACTGACATTGATGAGTGTCGAAATGGA
S
CGTGCGTTCCCAACTCGATCTGCGTTAATACTTTGGTAAGTATTTCTCACAGCTGTTGTTATCAAAGCAGAACCGGTTATTAAAACAAGTGTATGTTTAT
Celera SNP ID: hCV11433557
公開 SNP ID: rs1866389
ゲノム配列のSNP: 配列番号228
SNP位置, ゲノム: 40089
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,86|G,34)
SNP 型: ミスセンス変異;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
遺伝子番号: 29
Celera 遺伝子: hCG2041118 - 209000073582473
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6BN(13454338..13474835)
染色体: 18
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号229):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号357):
GGTGAGGCTTGATGAAAAAGTAAAGAGAAATCGTAATTGTATAGTTAAAAACATAACTTTTGTCATCCTCAAAATTCTAAAAATTCTTTACCTGTCCTTG
R
GAAATGGGTGAAATTGAAAACCATCAAAACAATTGGACTTCTTAAAAATTGGATTGTATGAGTGAAAGGTGTTTATGAGAAGTCGATGACTCCGGATCTT
Celera SNP ID: hCV16054991
公開 SNP ID: rs2689000
ゲノム配列のSNP: 配列番号229
SNP位置, ゲノム: 10174
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,10|G,28) アフリカ系アメリカ人(A,2|G,28) 全体(A,12|G,56)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
SNP 供給源: Applera;HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION
遺伝子番号: 30
Celera 遺伝子: hCG2043414 - 30000035864837
遺伝子シンボル: TAS2R50
タンパク質名: taste receptor, type 2, member 50
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W45C(1391258..1412158)
染色体: 12
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号230):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号358):
CAAGAGGAAGGAGATCAGAGTTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGAGATCTTGCGATCCTTCTCCATGGAGCTGCATCTTCTTGAGATGTTTA
Y
ACAGAGAACAGATTAGCATCAGAAAAGATATCAGGGACAGAGTAAAGGGTATGAAGCTCCATAGGGTAGTTACAGTCAAATATGAAAGATGTACTGTATT
Celera SNP ID: hCV12107274
公開 SNP ID: rs1376251
ゲノム配列のSNP: 配列番号230
SNP位置, ゲノム: 10293
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,77|T,41)
SNP 型: ミスセンス変異;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
遺伝子番号: 31
Celera 遺伝子: hCG16018 - 146000220354731
遺伝子シンボル: RARRES1
タンパク質名: retinoic acid receptor responder (tazarotene induced) 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VYQG(36876699..36932362)
染色体: 3
OMIM 番号: 605090
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号231):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号359):
GATTATAATTTGAGTCTTTTCCTACTATAACTGAGTACTCCATTTTTCTAAGAGAAAGAGAATGAGTTACTTAAAAAACAATTTTTTTCTTTTCTCTTTC
M
GCCTTTTTCCCTGTTCTCTACTTCCTGCTTAGCTCTTTAGAAATGGAATCATAACTTTTACCTTCCCTTTTACCAGACACTCCCTGCATGGCAAGCTTAT
Celera SNP ID: hCV29114183
公開 SNP ID: rs7621897
ゲノム配列のSNP: 配列番号231
SNP位置, ゲノム: 11748
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,47|C,73)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号360):
TTTGCTTCAAGATATGGAAGTCATGGATCCTCATTTTTGTCTTGTCACTGAGTTATATGAAAGTCTGGTTGAATGTCTGTCACTTTTTCTGATGGAGACC
R
AAGTCTGTGGGAATAGGGAGATTCTTTTAACAACCTTAAGGATCTAGATACTGTATATATACCTCAAGCTGATATATTAGCCCTGATATGACAGGCAATA
Celera SNP ID: hCV29114184
公開 SNP ID: rs6772483
ゲノム配列のSNP: 配列番号231
SNP位置, ゲノム: 11101
関連照会 SNP: hCV15974589 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,47|G,73)
SNP 型: INTRON
遺伝子番号: 32
Celera 遺伝子: hCG1742080 - 79000075494058
遺伝子シンボル: NFIB
タンパク質名: nuclear factor I/B
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VTY6(24453015..24701324)
染色体: 9
OMIM 番号: 600728
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号232):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号361):
CGCTGAATTTTATATAGTCTAGGAAACATTTTCACATTGGTTGTTTCAGTCAAATACAAAGAAGTTACAGAACAGCATCGAGTACCTAAGAGAGACCAAA
R
GCATTTCCTTCTGTAAAGCCCTGCAGCTGAGGGCTTACATCCGCCTGGTCCAATCAGTTCATTTCCAAACAAAGGTAGGAAATGGCTGCATCCTAGTATT
Celera SNP ID: hCV1690777
公開 SNP ID: rs12684749
ゲノム配列のSNP: 配列番号232
SNP位置, ゲノム: 161940
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,116|G,2)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
遺伝子番号: 33
Celera 遺伝子: hCG2043302 - 30000034795819
遺伝子シンボル: PRKG1
タンパク質名: protein kinase, cGMP-dependent, type I
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VT2P(198014..1522568)
染色体: 10
OMIM 番号: 176894
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号233):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号362):
GCTCCCAGAACTAGGAAACTTATATTTAACTGGTCAGAAGAAGGTATGCAAAGTGGAGAACAGCCCCTGGGTTACCCCAATTGCTGGCCAGTTCCAGCTT
S
ATGTGTCCTGTGTGTCTGAATGTGTCTGTTCTGAGACATATGAGTACCTCTATGGCAGCACATGCAGGCAAATCCAGAACCACCAAAACATAATAATCAC
Celera SNP ID: hCV881283
公開 SNP ID: rs211070
ゲノム配列のSNP: 配列番号233
SNP位置, ゲノム: 339191
SNP 供給源: dbSNP; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,113|C,1)
SNP 型: ミスセンス変異;INTRON
遺伝子番号: 34
Celera 遺伝子: hCG1812098 - 146000219455196
遺伝子シンボル: CDKAL1
タンパク質名: CDK5 regulatory subunit associated protein 1-like 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VT9V(20153063..20871202)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号234):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号363):
GCACCGCAAGATGGGAAGACAGGTGGCAACTCTCTTACAGGGATATCTTTTATTTGAGCAGAACCAGACCAACTGTTCCTCATTAAAACACATTTTGCAA
Y
GTGTTCTCATGTGAGCGCATCAAGTGTGTGTGCATGTGTGTGTTCAGAGCATACTCAGCGATGTGCCATCTACAGGTCACAATTACAAATTCGCAACGTG
Celera SNP ID: hCV16203383
公開 SNP ID: rs2328574
ゲノム配列のSNP: 配列番号234
SNP位置, ゲノム: 698648
SNP 供給源: Celera;HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(C,-|T,-)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
遺伝子番号: 35
Celera 遺伝子: hCG2009327 - 30000035862829
遺伝子シンボル: PRH1
タンパク質名: proline-rich protein HaeIII subfamily 1
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W45C(1286365..1591315)
染色体: 12
OMIM 番号: 168730
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号235):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号364):
CAAGAGGAAGGAGATCAGAGTTTGCAAAGCTTTTATGTGGACCTTGGTGCTGAGATCTTGCGATCCTTCTCCATGGAGCTGCATCTTCTTGAGATGTTTA
Y
ACAGAGAACAGATTAGCATCAGAAAAGATATCAGGGACAGAGTAAAGGGTATGAAGCTCCATAGGGTAGTTACAGTCAAATATGAAAGATGTACTGTATT
Celera SNP ID: hCV12107274
公開 SNP ID: rs1376251
ゲノム配列のSNP: 配列番号235
SNP位置, ゲノム: 115186
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,77|T,41)
SNP 型: ミスセンス変異;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
遺伝子番号: 36
Celera 遺伝子: hCG31283 - 30000023193853
遺伝子シンボル: PFAS
タンパク質名: phosphoribosylformylglycinamidine synthase (FGAR amidotransferase)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7238908..7280052)
染色体: 17
OMIM 番号: 602133
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号236):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号365):
TAGACTCTTGGGACCTAGACTTCTACACCAAGCGCTTCCAGGAGCTACAGCGGAACCCGAGCACTGTGGAGGCCTTTGACTTGGCGCAGTCCAATAGGTG
R
GGAGAAATGGGGTTGTTCCCATACCTGAGCCCATGGGTGTTGGGAGAGACCACAGGGGCTCACCTTCATGTTCCTCCCTTGGCTTAGGGGCCTCCCTGAG
Celera SNP ID: hCV25610955
公開 SNP ID: rs7221716
ゲノム配列のSNP: 配列番号236
SNP位置, ゲノム: 16507
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,13|G,107)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
コンテクスト (配列番号366):
GTGCTCGGATTACAGGCGGGAGCCACCGCGCCCAGCCTCCGTCTCCCTCCTAAGTGACATCCTGTCCGGCATCCCGCAGGCCTTCAGATGGATGGGGTAG
S
AGAGCTCAGGAACTCAAACACAGCCCGCCTGGTGGATGACTTCTAAGCATCTTTCAGTCTCCCTGATCTTGCCAAGCAGAGAAGGGCTTCCTCGTAATGC
Celera SNP ID: hCV26960050
公開 SNP ID: rs7221547
ゲノム配列のSNP: 配列番号236
SNP位置, ゲノム: 9621
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,13|G,105)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号367):
TCTGTCTCCGCAGGAGGCCCATAGGATTCTGAAGAGCTGTGATGGGAGCCCTGCCTCGGCTCTCCATCAGACTCAGGACAGGCCACCAGGGCTGCTATCC
R
TCACCACACACCACCTCTCCCGTTTGACAGTGTCCAAATTGCCTCCTCTTCCCCACTTCTGGAATATGTGTTGAGAGACAGCAGTGAGATGCAGGAGGGC
Celera SNP ID: hCV30957101
公開 SNP ID: rs6503096
ゲノム配列のSNP: 配列番号236
SNP位置, ゲノム: 39634
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,18|A,102)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号368):
GGAGTCGGGGTCCTCGTACCACTGCCAGACTGTTCACCCAGTTCAAAGAAAACCCTGCCCGTTGCAGGCTCATGCCATTCTACTACATCCCTTTCATCCA
R
TTCTTTGTGTTCTACTGACTTCCCCAGCGCTTCCTTTGGGAGAAGGTGCCAATTCTTCAATAGTTGATTCCTCTCTAGAAATACAATGTTCCTGCCAGGT
Celera SNP ID: hCV30957093
公開 SNP ID: rs7225429
ゲノム配列のSNP: 配列番号236
SNP位置, ゲノム: 32261
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,18|A,102)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN;REPEATS
遺伝子番号: 37
Celera 遺伝子: hCG31284 - 66000115704320
遺伝子シンボル: SLC25A35
タンパク質名: similar to 1810012H11Rik
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7213921..7239307)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号237):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号369):
GGCCCACTCCTGCTTCCTTGGAGGATCCCACCAGTGAGTCTCCCTGTTCTGTCCCTCCCAGCCCGATTCTCCTGGGAACCCAGTCATGAGATACCCGCCC
R
TTCCTTCCTCCTTACGGGGGCTGATTGAAGGTAAGCAAGAGATCAGTCTGGTACTGGGGCAGCCTCAGCAAGGCCTGATGAAGTGTCACGTCCTTTGCTA
Celera SNP ID: hDV71102112
公開 SNP ID: rs869773
ゲノム配列のSNP: 配列番号237
SNP位置, ゲノム: 9556
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,113|A,5)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;UTR3;INTRON
コンテクスト (配列番号370):
AAATACAGGCCAGGCCCTGTACAAGTCAGTGGAAAGTTGATGGTGAAAAGACAGACATGGACCCCTCTCTCCTGGTGCTTAGTGTGTTACACAGTGAGGC
R
CCTGCAGTGGTGACAGGAGCATAGCAGCACAGCAGGAGCCAGCAGTTAATCCACAAATGTTTTCTGGAGATCTGAGGATGAGCTAGCTAGGGAAGAAGGG
Celera SNP ID: hCV27915850
公開 SNP ID: rs4792722
ゲノム配列のSNP: 配列番号237
SNP位置, ゲノム: 2758
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,26|A,94)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号371):
GCTACCTACATTAACAGCTTTGCAGACAGAAATGAGGCCCAGGTGTTCTGTGCTCCATGAAAGAGTCTACTGGACTTCCAAGTCCTGGCCCTACCGGAGG
S
AGCTGGACTCAACACTTCTTTTATTAGAAGCTCCCTTTATAAGGGATTGTTTTGTTGTAAGTGACAGAAATCCAACTCAAACTAGCTTACAAAAAGGGAA
Celera SNP ID: hCV30294410
公開 SNP ID: rs9899432
ゲノム配列のSNP: 配列番号237
SNP位置, ゲノム: 20983
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,92|C,20)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号372):
ATGTAACTGCCCAGTGGGCTCTTCCTGTCCTCTGCACAAATAAAGACCACGGCATTGCAGTAAAGAAAGAGTTTAATTGACACGAGGCCGGCCATGCCAC
W
TGCAAAATTGATTATTACTCAAGTCAATCTCCCTGAAAATTCAGAGATCAGGGTTTTTGATAATTTGGTGGGTAGGGGGTCAGAAAGTGGGGAGTGCTAA
Celera SNP ID: hCV29573094
公開 SNP ID: rs8079361
ゲノム配列のSNP: 配列番号237
SNP位置, ゲノム: 21365
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,100|T,8)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN;REPEATS
コンテクスト (配列番号373):
CGGGTGGGGTCACATAAGTTCAGGTCCACGCCCTGCTCGGTGCCGGCGCCAGGAGAGCCAGGAAGACGCGGCCCGGCTTGCGGGGGGTAGAGGGACACAC
Y
TGCGCTGCGGGACCAGTCTCCTGAGGCTGCACGGGTTGGTGCTTGGTTAATTAAATCCTTAGTCCTTAGGCTCTTTATTTTTATTTTTTATTTTTTTTGA
Celera SNP ID: hCV30957112
公開 SNP ID: rs7208297
ゲノム配列のSNP: 配列番号237
SNP位置, ゲノム: 15779
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,110|C,10)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
遺伝子番号: 38
Celera 遺伝子: hCG32832 - 84000314349299
遺伝子シンボル: SPG20
タンパク質名: spastic paraplegia 20, spartin (Troyer syndrome)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W8B1(17669409..17756722)
染色体: 13
OMIM 番号: 607111
OMIM 情報: Troyer syndrome, 275900 (3)
ゲノム配列 (配列番号238):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号374):
CTTTTCTCCAAAATGTTTTTCATTTTGTTTGTTTTTGCAAATATCTTAGATTACTAGGAAAGCCAAGTCTCTCTTCCTGGATTTCTTCTCCTATAAACCG
Y
CTATTGATACCTACCCACTTCTCTATGGAGCACAGATGAAGGATATTGGTCATGTATGTTGAAATATTTGTCCAACTTTATCCCTAGTTTTTTGACTTTG
Celera SNP ID: hCV9879153
公開 SNP ID: rs3736919
ゲノム配列のSNP: 配列番号238
SNP位置, ゲノム: 72700
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,61|T,57)
SNP 型: ミスセンス変異;INTRON
遺伝子番号: 39
Celera 遺伝子: hCG33195 - 84000313730962
遺伝子シンボル: KIF6
タンパク質名: 染色体 6 open reading frame 102
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(12492363..12669871)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号239):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号375):
ACAGGAATAGGTTAAACAGAAAGGTAGGGAGCCTTTTCTGGGAACTCTAACACCTCCGGTGAGTTCTCACCTTACCTTTTGTTAGAGAGGAGTTGGGACC
R
TTCATGCTGGGAGTCAGATGTCTGGAGAAATGGCTTCGTGTGATCGAGTGAATTCACTGCTGGAGAATTTACCTGTTGGCCCCAGAAGGAGTTTCACAGT
Celera SNP ID: hCV3054799
公開 SNP ID: rs20455
ゲノム配列のSNP: 配列番号239
SNP位置, ゲノム: 149694
SNP 供給源: ABI_Val;Applera;Celera;HGBASE;HapMap;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: ミスセンス変異
遺伝子番号: 40
Celera 遺伝子: hCG39289 - 93000022561622
遺伝子シンボル: ITPKA
タンパク質名: inositol 1,4,5-trisphosphate 3-kinase A
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W323(8826725..8856477)
染色体: 15
OMIM 番号: 147521
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号240):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号376):
CTCTAGTCATTGTCCTTCCCTTCAGGGTGTTCCGCTCTCCTACCCCCAGCCAGAAGTCCCACTCCTCTCACCTTGATAGCTACCTGCAGGGGACTGGAGT
Y
CCCAGGAAGGCCAATTACCAGTCCCTCATACACCTCCCCAAAGGCACCATGGCCCAGGGCTCTGCAGGAAGACACGTTGGAAGGGAGTGGGCAGGCGGCC
Celera SNP ID: hCV25623506
公開 SNP ID:
ゲノム配列のSNP: 配列番号240
SNP位置, ゲノム: 22146
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,36|T,4) アフリカ系アメリカ人(C,37|T,1) 全体(C,73|T,5)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;UTR3
遺伝子番号: 41
Celera 遺伝子: hCG40419 - 104000117898327
遺伝子シンボル: ST14
タンパク質名: suppression of tumorigenicity 14 (colon carcinoma, matriptase, epithin
)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VVY5(40056278..40127041)
染色体: 11
OMIM 番号: 606797
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号241):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号377):
CACCCAAATCAAAGTGAAACTGACCAGCCAGCCTCCGGAGGCCCTCGCTGCATTTGTGAGGGAGGGGGAGGTGGGAAGATGAGGGTTTGAATTTGGGAGC
R
GGGAGAAGGAGGGGCATGGTGGAAGGGAGTCTGTGAAGCTCAAAGATAGTTTTGGGGGTCCCTCATGCCCTGGCCACGCCAGCAGTGCTGTGCACGCCAA
Celera SNP ID: hCV25767057
公開 SNP ID: rs12421950
ゲノム配列のSNP: 配列番号241
SNP位置, ゲノム: 50140
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,4|G,36) アフリカ系アメリカ人(A,0|G,36) 全体(A,4|G,72)
SNP 型: INTRON
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,101|A,1)
SNP 型: INTRON
遺伝子番号: 42
Celera 遺伝子: hCG40952 - 30000063684233
遺伝子シンボル: PTPRE
タンパク質名: protein tyrosine phosphatase, receptor type, E
Celera ゲノム軸: GA_x54KRFTF114(4291113..4489962)
染色体: 10
OMIM 番号: 600926
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号242):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号378):
TGGCCCTCTTTGGTCAACATTCTGCCTGGACATGTCAGCACGTACACAGCTTCCTACTTCTGTTTAATGGCTGCTTGGCATTCCACAGTATAAACATAAC
R
AAGTCTGGAGAGTCACCTCCACCTCCCCAGTGACAGACATTAACTTCTTTCCACATGCTGCAATTCTATAATTCAACTGTATAATGAATACTCCTGCATG
Celera SNP ID: hCV218623
公開 SNP ID: rs12261926
ゲノム配列のSNP: 配列番号242
SNP位置, ゲノム: 190357
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,112|G,8)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN;REPEATS
コンテクスト (配列番号379):
TCAGAAGCAAAGTTTCAGGCTCACCTTTTCCTTCTCTGGAAAACTCAGCTCCTTCCCATCCTGGCCAGACCGGGACTCAGGAAGGGCTAAGCTAGCTGTT
Y
GGCATCTTTCCACCCAAAAGCATTTAGATATTTGTTCACTGTGTGCTGAGAAGAGCCCAAGTGCAATGTGTTGGAAAGAAGCAGGGAGGTGCTGAGGACA
Celera SNP ID: hCV374877
公開 SNP ID: rs12252890
ゲノム配列のSNP: 配列番号242
SNP位置, ゲノム: 184829
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,112|C,8)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON
コンテクスト (配列番号380):
GTGAAGGCAGGCACAGACGGTGCACACACATGGCCCATTGCTTCCCCGACCAACCTGGAATCCAAAGGAAGAGGCAGGCGAGCAAAGCGGGCTGTACAGA
K
GAGGGGGCAGAGGTGCTTCTGAGAGGGGTATCGGACGGTGCTCAGGGAGCCTCAGGGGCCACCTAGCGTTGTGTTACCTCCAAAGCAGTGCTTTCTCGGA
Celera SNP ID: hCV31968275
公開 SNP ID: rs11016062
ゲノム配列のSNP: 配列番号242
SNP位置, ゲノム: 194930
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,103|T,3)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号381):
GCCCATTGCTTCCCCGACCAACCTGGAATCCAAAGGAAGAGGCAGGCGAGCAAAGCGGGCTGTACAGAGGAGGGGGCAGAGGTGCTTCTGAGAGGGGTAT
Y
GGACGGTGCTCAGGGAGCCTCAGGGGCCACCTAGCGTTGTGTTACCTCCAAAGCAGTGCTTTCTCGGAGTAACAGAGGGCGGGCCCAGAGCCAAATAGCT
Celera SNP ID: hCV31968274
公開 SNP ID: rs11016063
ゲノム配列のSNP: 配列番号242
SNP位置, ゲノム: 194962
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,112|T,8)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
遺伝子番号: 43
Celera 遺伝子: hCG2016139 - 145000147253802
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W40L(8639312..8690658)
染色体: 5
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号243):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号382):
AGATTTATTTGCATTTCTATTTAAGCAGCATGTCTCGCTAAACTTTCTTTGAACTTTTCTGCACTAGGTCTGCACTGACATTGATGAGTGTCGAAATGGA
S
CGTGCGTTCCCAACTCGATCTGCGTTAATACTTTGGTAAGTATTTCTCACAGCTGTTGTTATCAAAGCAGAACCGGTTATTAAAACAAGTGTATGTTTAT
Celera SNP ID: hCV11433557
公開 SNP ID: rs1866389
ゲノム配列のSNP: 配列番号243
SNP位置, ゲノム: 23130
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,86|G,34)
SNP 型: ミスセンス変異;TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON
遺伝子番号: 44
Celera 遺伝子: hCG2032978 - 208000044094206
遺伝子シンボル: LOC399978
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VVY5(40741875..40779789)
染色体: 11
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号244):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号383):
TTTTCAGAATCTGATTCTCTGCCCCTTTCTCCTAATGAATCTCCATGTTGGTAGAAATACATTTATACCTTCCCTCCTTTAAAAATGGAATATGACACTA
S
AGACAGACGGCATCCTAGTCCCAGTCTTCCAAGTTCACATATGTAACACATCTCTGTATTGTATATTCATATGCATTTTCCCATCTCTATACCTAACAAC
Celera SNP ID: hCV1067003
公開 SNP ID: rs735094
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 21011
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,70|G,50)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号384):
ATGGGCAGAGGTAGCCTACTTGCCCAGCTGGAGAAGAGAAGGTAATCTACCACGTGGAAGGAAGGACATGAACAAAAAAATGAAAGCAGGAAGGAACATG
S
TGGTTTGGGCAGAATAAAAAATCCCTAGATTTTTTTGGAAGTTTCTCGTCTAACCTCCTGCCTAAACCATCTATAATACATTCTGTCCCCAAGAAAATGC
Celera SNP ID: hCV3108695
公開 SNP ID: rs4937582
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 36929
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,41|G,77)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号385):
TAAAACCCAAGTCCCTCGGCCACATTTGCACTGAAATGTAAAATAAAGGGTTAGACAGGTACAATTTCCTTTGTAGTGATAAAATCCTCTGATTCTATTG
Y
ATAATCTCCAAAAGCAGGTCCAAACCGAATAATTTTTTTCCCCTGAAACTAGATTCCTCCCTGTTTAGTAGAGTCCCCATTTCCAATTTAGGACTTTGCC
Celera SNP ID: hCV3251060
公開 SNP ID: rs7943757
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 12063
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,72|T,48)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号386):
ACAAAAAAAATACAGTGAGTAATGGCAATAATGTTCTCATTAAAGGAAAATACCTCACAACTTAGACAGAAACAGAGGGAATTAGTGAAACTCCATCCAT
Y
GAGGGCTCATAGGCTGCCCTTGGAAATACTCTTACCTGGTCACAGTACTAGTGAATTCATTTCCTGGTTAAGTTGGTAAGGTAGGCATCTTGAAAGACAT
Celera SNP ID: hCV3251061
公開 SNP ID: rs4366492
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 13162
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,62|C,58)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号387):
GTGTTCAAGTGACCCTTATTTTACTGAACAGTGGCTCCAAAGAACAAAAGTAGTGATGCTGGCCATTTGAACATGCCTAGGAGAAGCTGGGAAGTGCTTT
Y
GTTAAGTGAAAAGGTGAGAGCTCTTGACTTAATAACGAAAGAATAAAAATTGCAATATTAAAGTTGCTGAGATCTACAGTGAGAATGAATTTTTTTACCT
Celera SNP ID: hCV3251063
公開 SNP ID: rs6590512
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 13822
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,66|T,54)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号388):
CTTTGATGTATTAAAATATATTAATCGCTCTTAAAGTATCTCCTCACATGATGCTTATTAATTGCAAAAAGAAAAACAGTTAACTTTACAGAGGGGAAAC
Y
TGACAGCCTTCCCCATAAGCAAATGACCGGTGTAAGGTACAGTGGCATCATGTGCCTCTGGATACTATGCACTGAGAAGGACATAACACCACTGTGAGTA
Celera SNP ID: hCV3251074
公開 SNP ID: rs7106373
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 16954
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,40|C,80)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号389):
GGGTTTGAATCCCAGCTCTGACCTTTACTAACTGGATAAGTGGGGTGAATTACTTCTCTCTCTAAGCTTCAACTCCTCCATCTGTACATGGGGGTGGGGA
Y
CCTCATACTTCATGCAATCTTTGGGAGAATTAAGTGAGTTAATCCACATAGAGCACGGAAACCAGGCCTTGACATGTTGTGAGCCCTCTCTGATGTTAGC
Celera SNP ID: hCV3251078
公開 SNP ID: rs4601795
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 25332
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,66|C,54)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号390):
TCTCTCTAAGCTTCAACTCCTCCATCTGTACATGGGGGTGGGGATCCTCATACTTCATGCAATCTTTGGGAGAATTAAGTGAGTTAATCCACATAGAGCA
Y
GGAAACCAGGCCTTGACATGTTGTGAGCCCTCTCTGATGTTAGCTATTGCTATTAGAGCAAGTTATTTCCCCTTTTTGGGATTTCATACTGTTGTCCAGC
Celera SNP ID: hCV27868997
公開 SNP ID: rs4622274
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 25388
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,66|T,44)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号391):
AGTGTAACCTGAAGTGATGTAAGCCAGGCACAGAAAGACAAATACCACATGGTCTCACTTACATGTGAACTCTAAAGAGCTGAATTCATAGAAACACTGA
R
TAAAATAGTGGCTAACAGGCTGAAGGGTTGGAGGATTGGGGAGATGTTGGTCAAAGGACACAAAATTTCAGTTAGGAGGAAGAAGTTCAAAGATCTATTG
Celera SNP ID: hCV27868998
公開 SNP ID: rs4936121
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 29780
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,65|G,55)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN;REPEATS
コンテクスト (配列番号392):
TCCAAGCTTAGGGAAGCCACTTAGCTCCCAGGAGCAGATGAGACCCAGTCCTCCTCCTAGCCCAATTGTAAGCAAAAAAATAATAGCAAAGTCTTTGCTC
R
GGGTCTTTTGGGACCAAACCACTTAAAAATAGAATACCCCAGAGAACATTTTAATCCTTGTAATTGAGGTATTTATCATCTGGAAATATAGCTGTTTCTA
Celera SNP ID: hCV29138817
公開 SNP ID: rs4936120
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 19354
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,70|A,48)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号393):
AGCTCAACTTGAAATACACTTCCCTGAAAGGATTACTTTGTTTTGGGACAAGGCTCATATCAATCTGTCCTGCCAAGAGATTACTGCTGTTAAACTGTTG
K
TTTTCACTGCTGTCAAACATAATCTTACAAGGAGAGAGAGGGGCAATCACCCTCAACACCCAGCTGCAAGAGAAGACTTTTGACTGGGCAGGACTTTTCC
Celera SNP ID: hCV29138819
公開 SNP ID: rs7116068
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 28641
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,69|T,49)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号394):
AGGGTTTGGCCTAACACACAAAGGATGGGAAGAATAAAGAAACGATGTTCCAACAGTATTTCTGCAGATCTAAGCTACTGAAGGGATGCTGGACCAACCA
Y
GATAGATGCTTCCTTTTCCGCAGTGCCTCGAAAAACACTTAGGAGTGTGAAGGAGTGAAATTTTATGCTATTGGCCTTGTTCTCATTTACTTTTGATTAT
Celera SNP ID: hCV29138820
公開 SNP ID: rs7119425
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 29087
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,68|T,52)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号395):
CCCTCTCTGGGACTCAGTTTCCTACTCTGTACAATTGGGACGGTGACCTACTTTCAAGGACCTTTATAGTTCAAACGCTCTTCGGTTCTGTGAAAAGAAG
Y
CTTACATCATCCCATGGTGGGCTGCATGTCACATTATCACACAGAGTGGTCCTTGCTTTACAGAAAAATATTCATTTGCTCATTCATTCACCTATCCACT
Celera SNP ID: hCV29138822
公開 SNP ID: rs6590518
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 29432
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,68|T,52)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号396):
AGAGTTTTGGCTGGTGCAATCAGACAGTGCTTCTTGAAAATGGAACTTGAATTGGTCCTTATGGGCAGAGGTAGCCTACTTGCCCAGCTGGAGAAGAGAA
R
GTAATCTACCACGTGGAAGGAAGGACATGAACAAAAAAATGAAAGCAGGAAGGAACATGCTGGTTTGGGCAGAATAAAAAATCCCTAGATTTTTTTGGAA
Celera SNP ID: hCV29138826
公開 SNP ID: rs4936123
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 36869
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,67|A,53)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号397):
TTCTCATTTACTTTTGATTATTATAAAATTATTCTAACGCAAAACCCATAAAAAATTGGTAACTCAGAATCTCGCCAGATGAACTGTTACATCGGACTAC
R
CTCTAGGAAGAAGTATTAAAAATCAAAGATATTAACTTTCCAAGTGTTCATTTCCATCTGTTTTCCCTCTCTGGGACTCAGTTTCCTACTCTGTACAATT
Celera SNP ID: hCV31258077
公開 SNP ID: rs6590515
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 29267
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,68|A,52)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号398):
CCAAGTGTTCATTTCCATCTGTTTTCCCTCTCTGGGACTCAGTTTCCTACTCTGTACAATTGGGACGGTGACCTACTTTCAAGGACCTTTATAGTTCAAA
Y
GCTCTTCGGTTCTGTGAAAAGAAGCCTTACATCATCCCATGGTGGGCTGCATGTCACATTATCACACAGAGTGGTCCTTGCTTTACAGAAAAATATTCAT
Celera SNP ID: hCV31258078
公開 SNP ID: rs6590517
ゲノム配列のSNP: 配列番号244
SNP位置, ゲノム: 29407
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,68|T,52)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN;REPEATS
遺伝子番号: 45
Celera 遺伝子: hCG2039811 - 208000027486904
遺伝子シンボル: KRT5
タンパク質名: keratin 5 (epidermolysis bullosa simplex, Dowling-Meara/Kobner/Weber-C
ockayne types)
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W46Y(168432..194676)
染色体: 12
OMIM 番号: 148040
OMIM 情報: Epidermolysis bullosa simplex, Koebner, Dowling-Meara, and/Weber-Cocka
yne types, 131900, 131760, 131800 (3); Epidermolysis bullosa simplex with mottled pigmentation, 1319
60 (3)
ゲノム配列 (配列番号245):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号399):
CAGCCCCCCAGGTGTGTTCCAGCAAGCTCTATTCCACTAGGGAAGAAATGAGTCATCGTATGTGTTGATACAGGCTGAAGGCCGCCACAAACACATACCT
K
CAGGAGCTTCTAATCTCATCAGGAACATGTTGAGAGTCTGACGGCCTGTTATAACGGCGAACCACCCTGTTCCAAGCAGCGGGACTTGCTCTGCTTTCTC
Celera SNP ID: hCV945276
公開 SNP ID: rs89962
ゲノム配列のSNP: 配列番号245
SNP位置, ゲノム: 16815
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,69|T,49)
SNP 型: TRANSCRIPTION FACTOR BINDING SITE;HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTERGENIC;UNKNOWN
遺伝子番号: 46
Celera 遺伝子: Chr11:127850642..127890642
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VVY5(40719542..40759542)
染色体: 11
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号246):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号400):
TCTTAGCACTCCCCCCACCCCTGCTCCGAAACTTGATTCAATCAGTGGTGGATGGGAAAGGCCCGTTTCCATGACAACCCCACTGTGAGAGAGAAAAATC
R
GCCACAGAGCAGGCTAGAATTTTATCTGGAAGAGGGCACTTGGGTAGGTTTAGAAATGGAGGCCCAGCAAACAGTGCGATGGGCTCGCATCCCATGGTGG
Celera SNP ID: hCV3251044
公開 SNP ID: rs7114655
ゲノム配列のSNP: 配列番号246
SNP位置, ゲノム: 20000
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,28|G,92)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号401):
TAAAACCCAAGTCCCTCGGCCACATTTGCACTGAAATGTAAAATAAAGGGTTAGACAGGTACAATTTCCTTTGTAGTGATAAAATCCTCTGATTCTATTG
Y
ATAATCTCCAAAAGCAGGTCCAAACCGAATAATTTTTTTCCCCTGAAACTAGATTCCTCCCTGTTTAGTAGAGTCCCCATTTCCAATTTAGGACTTTGCC
Celera SNP ID: hCV3251060
公開 SNP ID: rs7943757
ゲノム配列のSNP: 配列番号246
SNP位置, ゲノム: 34396
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.51)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,72|T,48)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号402):
ACAAAAAAAATACAGTGAGTAATGGCAATAATGTTCTCATTAAAGGAAAATACCTCACAACTTAGACAGAAACAGAGGGAATTAGTGAAACTCCATCCAT
Y
GAGGGCTCATAGGCTGCCCTTGGAAATACTCTTACCTGGTCACAGTACTAGTGAATTCATTTCCTGGTTAAGTTGGTAAGGTAGGCATCTTGAAAGACAT
Celera SNP ID: hCV3251061
公開 SNP ID: rs4366492
ゲノム配列のSNP: 配列番号246
SNP位置, ゲノム: 35495
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,62|C,58)
SNP 型: INTRON
コンテクスト (配列番号403):
GTGTTCAAGTGACCCTTATTTTACTGAACAGTGGCTCCAAAGAACAAAAGTAGTGATGCTGGCCATTTGAACATGCCTAGGAGAAGCTGGGAAGTGCTTT
Y
GTTAAGTGAAAAGGTGAGAGCTCTTGACTTAATAACGAAAGAATAAAAATTGCAATATTAAAGTTGCTGAGATCTACAGTGAGAATGAATTTTTTTACCT
Celera SNP ID: hCV3251063
公開 SNP ID: rs6590512
ゲノム配列のSNP: 配列番号246
SNP位置, ゲノム: 36155
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.6)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,66|T,54)
SNP 型: INTRON;REPEATS
コンテクスト (配列番号404):
CTTTGATGTATTAAAATATATTAATCGCTCTTAAAGTATCTCCTCACATGATGCTTATTAATTGCAAAAAGAAAAACAGTTAACTTTACAGAGGGGAAAC
Y
TGACAGCCTTCCCCATAAGCAAATGACCGGTGTAAGGTACAGTGGCATCATGTGCCTCTGGATACTATGCACTGAGAAGGACATAACACCACTGTGAGTA
Celera SNP ID: hCV3251074
公開 SNP ID: rs7106373
ゲノム配列のSNP: 配列番号246
SNP位置, ゲノム: 39287
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; Celera; HapMap
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,40|C,80)
SNP 型: INTRON;REPEATS
遺伝子番号: 47
Celera 遺伝子: Chr11:128036442..128076442
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VVY5(40905342..40945342)
染色体: 11
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号247):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号405):
TTTATATTTTTCCTTCAAGGTTTGGGAGTTAGTAGCTTTATAGATAAGGGCAGTCTTGATCATAAACCTGACTACATTTGCACAAAATGGTGGAGTTAGT
Y
TATCCCTTCCCTGCTTTAAATCCTAGTGCTTACTAATAAATGTCCTTTGTGGCCTGCCCTGCAACCTCCCTCCACTAAATGGTGCACTTTTGTCTGCATT
Celera SNP ID: hCV26490121
公開 SNP ID: rs2875322
ゲノム配列のSNP: 配列番号247
SNP位置, ゲノム: 20000
関連照会 SNP: hCV16189747 (Power=.7)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,31|C,89)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN;REPEATS
遺伝子番号: 48
Celera 遺伝子: Chr2:232460696..232500696
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32VWPT(43375226..43415226)
染色体: 2
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号248):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号406):
AACCTCATCTCAAGACTCTGTGGCCAGGCCCTCACAACCTCCTGCCAGGCTCTCGCTACCTACCCATCAACAGCAAGACTCCCAGGCCATCTCAATCCCC
S
CAAAGAGCCCTGTTCCTCCAGCCCCACGGCTTCTGTTCACCTGCCGTGCTGTCCCCGCCTCTGCCCACCCACTCATCCTGCAGATCTGGAGCAGCATTCC
Celera SNP ID: hCV25963691
公開 SNP ID: rs3754699
ゲノム配列のSNP: 配列番号248
SNP位置, ゲノム: 20000
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(C,35|G,3) アフリカ系アメリカ人(C,31|G,7) 全体(C,66|G,10)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
SNP 供給源: Applera;HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(C,-|G,-)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
遺伝子番号: 49
Celera 遺伝子: Chr17:8125566..8165566
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W2JD(7285976..7325976)
染色体: 17
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号249):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号407):
TGAAGGCTGAAGACAGAGACGATATGGCAAGAGGCAGTGGCCTGGAATGGGGACTGACCACCCTGCAGAAGTTCAGCCAGGTAGATGTGGGGCAGGGGAA
Y
GCTAAATAAATACAGGGAGACAGAGACAGGGGTCAAGATAACAGAACAGGCAAAGGGGTTCTGAAAGCAGGGTGGGTCTAGAAGGACTTAGAGGGCATCA
Celera SNP ID: hCV22275215
公開 SNP ID: rs3826543
ゲノム配列のSNP: 配列番号249
SNP位置, ゲノム: 35642
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val; HGBASE
集団(対立遺伝子,数): 白人(T,19|C,101)
SNP 型: ミスセンス変異;ESS
コンテクスト (配列番号408):
GGTTGAGGGCTCAGTCCCACAAGACTGCCCCTCACTTTGGATGCCAACTGCAAGCCTCAGGTTGTTTTTACCTGTACTCATGACTAACTGGGTGTAAGCT
R
GGGTTCCTACGATTCCCTCTTTATGTTCAATGAATTTGCTAGAGTGGCTGACAGAACTCAGGAAAAAATGTTTACTGGTTTATTATAAAGGATTTTTTTT
Celera SNP ID: hCV31793593
公開 SNP ID: rs4792590
ゲノム配列のSNP: 配列番号249
SNP位置, ゲノム: 20001
関連照会 SNP: hCV22275215 (Power=.8)
SNP 供給源: dbSNP; HapMap; ABI_Val
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,12|G,108)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN;REPEATS
遺伝子番号: 50
Celera 遺伝子: Chr6:34607097..34646076
遺伝子シンボル:
タンパク質名:
Celera ゲノム軸: GA_x5YUV32W6W6(6071418..6110397)
染色体: 6
OMIM 番号:
OMIM 情報:
ゲノム配列 (配列番号250):
SNP 情報
コンテクスト (配列番号409):
AGCAGCAGGGTAGAAAAGGCAGCCATAACTGCAAGGCAGGCAGAAGATGTAGCAGAGTAGACAGGAAGCAGTCCAACTGACAGAGAATACTGGAAGATAT
K
AGAACAACTAAGGGACACAAAATAAAATGACAAACACTTGGATGCAAGAGTGATGCCAGGGCCAAGGAAAATTAAACATGGCCAAGATGGCCACAAAACA
Celera SNP ID: hCV25745415
公開 SNP ID: rs3130210
ゲノム配列のSNP: 配列番号250
SNP位置, ゲノム: 20000
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(G,30|T,8) アフリカ系アメリカ人(G,22|T,10) 全体(G,52|T,18)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
SNP 供給源: Applera;HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(G,-|T,-)
SNP 型: INTERGENIC;UNKNOWN
コンテクスト (配列番号410):
CCCTGTGGAGTCAAAGGTTAAAACTCACAGGTGACAGGGCCAGCACACTAAACCCCACTTGCTTCTCCTCTTTCCACCACCTCAGCCCTGTGACCAGCAT
R
ACTTACAGGTTCCAGCACTGCAGGCTCTCTCTTCTCTCCCTTCAGCCCCCGGGGCCCATGGGCAGCCTAAGGGAGACACACATGTAACCCCAGTGGGGCC
Celera SNP ID: hCV25749177
公開 SNP ID: rs3129196
ゲノム配列のSNP: 配列番号250
SNP位置, ゲノム: 18979
SNP 供給源: Applera
集団(対立遺伝子,数): 白人(A,7|G,29) アフリカ系アメリカ人(A,11|G,23) 全体(A,18|G,52)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTERGENIC;UNKNOWN
SNP 供給源: Applera;HGBASE;dbSNP
集団(対立遺伝子,数): no_pop(A,-|G,-)
SNP 型: HUMAN-MOUSE SYNTENIC REGION;INTERGENIC;UNKNOWN
hCV25623506 配列番号 164
hCV25623506 配列番号 165
hCV25623506 配列番号 166
hCV25623506 配列番号 167
hCV25623506 配列番号 168
hCV25623506 配列番号 169
hCV25623506 配列番号294
hCV25623506 配列番号376
Claims (25)
- 心筋梗塞(MI)を発症する変更された危険性を有する個体を同定するインビトロの方法であって、該方法が、
該個体の核酸における配列番号263のヌクレオチド配列内の一塩基多型(SNP)を検出する工程
を包含し、ここで該個体は、配列番号263の101位におけるGの存在、または、その相補体の101位におけるCの存在に起因して、心筋梗塞を発症する増加した危険性を有す、方法。 - 個体が、心筋梗塞を有する該個体の危険性を低下させるためのHMG−CoAレダクターゼインヒビター処置に応答する可能性を評価するインビトロの方法であって、該方法は、該個体の核酸における配列番号263のヌクレオチド配列内の一塩基多型(SNP)を検出する工程を包含し、ここで、該個体は、配列番号263の101位におけるGの存在、または、その相補体の101位におけるCの存在に起因して、HMG−CoAレダクターゼインヒビター処置に応答するより高い可能性を有する、方法。
- 前記核酸が、前記個体由来の生物学的サンプルから単離された核酸である、請求項1または2に記載の方法。
- 前記核酸は、前記個体の血液細胞、唾液または口腔スワブから調製される、請求項1または2に記載の方法。
- 前記検出する工程が、核酸増幅を含む、請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。
- 前記核酸増幅が、ポリメラーゼ連鎖反応によって行われる、請求項5に記載の方法。
- 前記個体の核酸と検出試薬とを接触させる工程、および配列番号263の101位にどのヌクレオチドが存在するかまたは存在しないかを決定する工程を包含する、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 前記検出試薬は、ポリヌクレオチドプローブである、請求項7に記載の方法。
- 前記プローブの3’末端は、前記核酸内のSNPにハイブリダイズする、請求項8に記載の方法。
- 前記プローブは、レポーター色素によって標識される、請求項8に記載の方法。
- 前記検出工程は、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、配列決定、5’ヌクレアーゼ消化、分子ビーコンアッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ(OLA)、サイズ分析、一本鎖立体配座多型分析(SSCP)または変性勾配ゲル電気泳動(DGGE)を使用して行なわれる、請求項1〜6のいずれか1項に記載の方法。
- 請求項1〜11のいずれか1項に記載の方法における増幅されたポリヌクレオチドの使用であって、該増幅されたポリヌクレオチドが、配列番号263またはその相補体の101位における一塩基多型(SNP)を含み、ここで、該増幅されたポリヌクレオチドが、16ヌクレオチドと1,000ヌクレオチドとの間の長さである、使用。
- 前記増幅されたポリヌクレオチドは、配列番号263のヌクレオチド配列を含む、請求項12に記載の使用。
- 請求項1〜11のいずれか1項に記載の方法における単離されたポリヌクレオチドの使用であって、該単離されたポリヌクレオチドが、配列番号263またはその相補体の101位における一塩基多型(SNP)を含む核酸分子に特異的にハイブリダイズする、使用。
- 前記単離されたポリヌクレオチドが、16ヌクレオチド〜70ヌクレオチドの長さである、請求項14に記載の使用。
- 前記単離されたポリヌクレオチドが対立遺伝子特異的プローブである、請求項14に記載の使用。
- 前記単離されたポリヌクレオチドが対立遺伝子特異的プライマーである、請求項14に記載の使用。
- 請求項1〜11のいずれか1項に記載の方法における試験キットの使用であって、該試験キットが、請求項12〜17のいずれか1項に定義されるポリヌクレオチド、緩衝液、および酵素を備える、使用。
- 前記個体が、前記Gまたは前記Cに関してホモ接合性である、請求項1〜18のいずれか1項に記載の方法または使用。
- 前記個体が、前記Gまたは前記Cに関してヘテロ接合性である、請求項1〜18のいずれか1項に記載の方法または使用。
- 心筋梗塞(MI)を発症する変更された危険性を有する個体を同定するインビトロの方法であって、該方法が、
配列番号67のアミノ酸配列の170位におけるアルギニン(R)またはトリプトファン(W)の存在を検出する工程
を包含し、ここで、該個体は、配列番号67のアミノ酸配列の170位におけるRの存在に起因して、MIを発症する増加した危険性を有する、方法。 - 個体が、心筋梗塞を有する該個体の危険性を低下させるためのHMG−CoAレダクターゼインヒビター処置に応答する可能性を評価するインビトロの方法であって、該方法は、配列番号67のアミノ酸配列の170位におけるアルギニン(R)またはトリプトファン(W)の存在を検出する工程を包含し、ここで、該個体は、配列番号67のアミノ酸配列の170位におけるRの存在に起因して、HMG−CoAレダクターゼインヒビター処置に応答するより高い可能性を有する、方法。
- 請求項21または22に記載の方法におけるタンパク質検出試薬の使用であって、該タンパク質検出試薬は、170位にWを有する配列番号67のアミノ酸配列を有する該タンパク質の改変体形態と比較して、配列番号67のアミノ酸配列の170位にRを有するタンパク質に選択的に結合する、使用。
- 前記試薬は、抗体、抗体フラグメント、アプタマー、ペプチド、リガンドまたは低分子化合物である、請求項23に記載の使用。
- 前記試薬は、レポーター色素または造影剤によって標識される、請求項24に記載の使用。
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