JP5285910B2 - 染色ミクロスフェアと染色ミクロスフェアの集団を形成するための方法 - Google Patents
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Description
分光技術は、化学系や生物系を分析するのに広く用いられている。殆どの場合、これらの技術には、関心のある材料による電磁照射の吸収又は放出を伴う。このような用途の1つは、コンビナトリアル化学や生物学アッセイ産業を含む多数の専門領域で活用される技術であるマイクロアレイの分野である。テキサス州オースティンの企業であるLuminex Corporationは、種々に着色された蛍光ミクロスフェアの表面に生物学的アッセイを行うシステムを開発した。このようなシステムの1つの実施例は、Chandlerらに付与された米国特許第5,981,180号に示されており、該特許は、本明細書で完全に記載されるように引用により組み込まれる。これらのミクロスフェアは、検出ゾーンを通って比較的高速で通過するときに各個々のミクロスフェアのレーザー励起及び蛍光検出により流体流装置で識別される。これらの値は、更に分析するためにデータベースに容易にエクスポートすることができる。
1つの実施態様は、染色ミクロスフェアを形成するための方法に関する。本方法は、熱又は光を用いて色素に連結された化学構造を活性化し、ミクロスフェアの存在下で反応中間体を形成する段階を含む。反応中間体は、共有結合的にミクロスフェアのポリマーに付着し、これにより色素をポリマーに連結して染色ミクロスフェアを形成する。本方法は、本明細書では1つのミクロスフェアに関して説明されているが、本方法は、複数のミクロスフェアを同時に染色するのに用いることができる点は理解すべきである。
本発明には、種々の変更形態及び変形形態が可能であるが、その特定の実施形態は、各図面において例証として示され、本明細書で詳細に説明する。しかしながら、図面及びその詳細な説明は、開示された特定の形態に本発明を限定するものではなく、逆に本発明は、添付の請求項により定義される本発明の精神及び範囲内に含まれる全ての変更形態、均等物及び代替形態を対象とすることは理解されるであろう。
2.45gの2,3,3−トリメチルインドレニン(15.4ミリモル)を20mLのアセトニトリルに入れたものに3.00gの6−ブロモヘキサン酸(15.4ミリモル)を加え、この溶液を還流下で14時間加熱した。真空下で濃縮した後、残留物を100mLの脱イオン水と25mLの酢酸エチルにとった。水性部分を25mLの酢酸エチルで更に2回洗った。水性部分を真空中で濃縮した後、50mLの乾燥ジエチルエーテルを残留物に加えた。4°Cに2日置いた後、ろ過により紫色固体として、1.62g(30%)のN−(ζ−カルボキシヘキシル)−2,3,3−トリメチルインドリニウムヨージドが得られた。
0.80g(2.25ミリモル)のN−(ζ−カルボキシヘキシル)−2,3,3−トリメチルインドリニウムヨージド(例1で調製)、及び0.13g(1.12ミリモル)の3,4−ジヒドロキシ−3−シクロブテン−1,2−ジオンを25mLのトルエンと25mLのブタノールに入れた溶液をディーンスタークトラップで15時間還流した。溶液は、真空下で濃縮し、クロロホルムで充填したシリカゲルカラムスラリー上にこの残留物を装入し、0〜5%メタノールのクロロホルム溶液で溶出した。青色分画を真空下で濃縮すると、青色油が得られた。青色油を10mLの絶対エタノールに溶解して真空下で濃縮し、0.44g(31%)の金メタリック色の固体を得た。
1.98gの5−(2−アミノエチルアミノ)−1−ナフタレンスルホン酸(1,5−EDANS、7.42ミリモル)と2.78gの炭酸ナトリウム(33.0ミリモル)を50mLのメタノールに入れたものに、3.59gのジ−t−ブチルジカルボネート(16.4ミリモル)を加え、浴型超音波処理器で5時間混合した。ろ過後、溶液を真空下で濃縮し、残留物を20mLのヘキサンで完全に粉砕し、ろ過後に黄褐色の固体として2.92gのt−BOC保護1,5−EDANSを得た。
10mLの脱イオン水に1.55g(4.0ミリモル)のt−BOC保護1,5−EDANS(例3で調製)を加えた。全ての固体を溶解した後、2.7mL(4.1ミリモル)のテトラブチル水酸化アンモニウム40%溶液を加えた。混合物は、クロロホルムで抽出し、硫酸マグネシウム(無水物)で乾燥し、結晶発泡体になるまで真空下で濃縮した。この発泡体を100mLのクロロホルムに溶解し、これに、120μLのジメチルホルムアミドと4mLの塩化チオニルを加えた。3.5時間還流した後、この溶液を20gの氷と10mLの塩化アンモニウム(飽和)の上に注いだ。結果として得られる溶液は、クロロホルム中に素早く抽出し、硫酸マグネシウム(無水物)上で乾燥し、真空下で濃縮すると2.67gの粗t−BOC保護1,5−EDANSクロリドである暗黄色の油が得られ、これは、更に精製することなく直ぐに用いた。
0.2g(0.51ミリモル)のt−BOC保護1,5−EDANSアジド(例4で調製)を10mLの0°Cの塩化メチレンに入れたものに、65μLのトリフルオロアセド酸(trifluoroacedic acid)を1mLの0°Cの塩化メチレンに入れたものを5分かけて滴下した。撹拌した溶液を16時間室温まで加温し、1時間還流した。溶液は、40mLの塩化メチレンで希釈し、10mLの飽和重炭酸ナトリウムで4回洗い、真空下で濃縮して黄色の油として0.16gの1,5−EDANSアジドを得た。
12mg(0.04ミリモル)の1,5−EDANSアジド(例5で調製)と13mg(0.02ミリモル)の2,4−ビス[N−(ζ−カルボキシヘキシル)−1,3,3−トリメチル−2−インドリニリデン−メチル]シクロブテンジイリウム(cylclobetenediylium)−1,3−ジオレート(例2で調製)を2mLのクロロホルムに入れたものに18mg(0.09ミリモル)のジシクロヘキシルカルボジイミドと3.5mgの1−ヒドロキシベンゾトリアゾールを加えた。15時間攪拌した後、溶液をろ過し、ろ液を真空下で濃縮すると青色残留物が得られ、これは更に精製することなく用いた。
カルボキシル化架橋ポリスチレンミクロスフェア(直径5.6μm、英国シュロップシャーのPolymer Laboratories,Ltd.又はインディアナ州フィッシャーズのBangs Laboratories,Inc.から入手可能)は、Chandlerらに付与された米国特許第6,514,295号、Chandlerらに付与された第6,599,331号、Chandlerらに付与された第6,632,526号(これらは、本明細書に完全に記載されるように引用により組み込まれる)に記載される手順を用い、実施例6から得られる青色残留物で含浸した。
本請求項において、色素は、ミクロスフェアの内部に位置することで、該色素は表面のカルボキシルとの連結を妨げないようになる。D1では、色素は、一方側ではアジド基に付着し、生体分子(又はポリマー)は他方側にある。アジド基を用いて色素をポリマーに付着させる1つの実施例は、本出願の明細書において出願人により言及される。
Claims (39)
- 染色ミクロスフェアを形成するための方法であって、ミクロスフェアの存在下で熱又は光を用いて色素に連結された化学構造を活性化して反応中間体を形成するステップを含み、
前記化学構造は、芳香族スルホニルアジド、または5−(2−アミノエチル)アミノ−1−ナフタレンスルホニルアジドを含み、
前記反応中間体が、前記ミクロスフェア内のポリマーに共有結合的に付着し、これによって前記色素が前記ポリマーに連結して前記染色ミクロスフェアを形成することを特徴とする方法。 - 前記活性化ステップが、前記色素に連結された前記化学構造を温度110°Cまで加熱するステップを含む請求項1に記載の方法。
- 前記活性化ステップが、前記色素に連結された前記化学構造を温度50°C〜80°Cまで加熱するステップを含む請求項1に記載の方法。
- 前記活性化ステップが、前記色素に連結された前記化学構造を前記ポリマーのガラス転移温度よりも低い温度まで加熱するステップを含む請求項1に記載の方法。
- 前記ミクロスフェアが、前記活性化ステップの前後で同じ形状であることを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 前記色素が、前記活性化ステップの前後で同じ構造で且つ同じ組成であることを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 前記染色ミクロスフェアが有機溶媒中に配置されたときに、前記色素が前記ポリマーから脱離しないことを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 前記ポリマーが、本質的にジビニルベンゼンと架橋したポリスチレンからなる請求項1に記載の方法。
- 1つ又はそれ以上の分子が、1つ又はそれ以上の官能基を介して前記染色ミクロスフェアに付着できるように、前記染色ミクロスフェアが、前記ポリマーに付着した1つ又はそれ以上の官能基を含み、
前記1つ又はそれ以上の分子は、オリゴヌクレオチド、ペプチド、又はオリゴ糖を含む生体分子を含み、前記官能基は、アミノ基又はカルボキシル基を含むことを特徴とする請求項1に記載の方法。 - 前記反応中間体がスルホニルニトレン基を含む請求項1に記載の方法。
- 前記ミクロスフェアの存在下で熱又は光を用いて付加的な異なる色素に連結された付加的な化学構造を活性化して異なる反応中間体を形成するステップを更に含み、前記異なる反応中間体が、前記ミクロスフェアのポリマーに共有結合的に付着し、これによって前記付加的な異なる色素を前記ポリマーに連結することを特徴とする請求項1に記載の方法。
- 前記付加的な異なる色素が前記活性化ステップの前後で同じ構造と組成である請求項11に記載の方法。
- 分子に連結された染色ミクロスフェアを形成するための方法であって、
ミクロスフェアの存在下で反応中間体を形成するために、熱又は光を用いて色素に連結した化学構造を活性化するステップであって、前記反応中間体が、前記ミクロスフェアのポリマーに共有結合的に付着し、これによって前記色素を前記ポリマーに連結して前記染色ミクロスフェアを形成する、前記活性化するステップと、
前記染色ミクロスフェアの外側表面上に前記分子を合成するステップと、
を含み、
前記化学構造は、芳香族スルホニルアジド、または5−(2−アミノエチル)アミノ−1−ナフタレンスルホニルアジドを含み、
前記分子は、オリゴヌクレオチド、ペプチド、又はオリゴ糖を含む生体分子を含むことを特徴とする方法。 - 前記合成するステップが、前記染色ミクロスフェアを有機溶媒中に配置するステップを含む請求項13に記載の方法。
- 前記合成するステップが、前記染色ミクロスフェアを有機溶媒中に配置するステップを含み、前記染色ミクロスフェアが、前記合成するステップの前後で同じ色素特性を有することを特徴とする請求項13に記載の方法。
- 前記分子が水性溶媒中で不溶性であることを特徴とする請求項13に記載の方法。
- 前記合成するステップが水性溶媒中に前記染色ミクロスフェアを配置するステップを含む請求項13に記載の方法。
- 前記活性化するステップが前記色素に連結された前記化学構造を温度110°Cまで加熱するステップを含む請求項13に記載の方法。
- 前記活性化するステップが前記色素に連結された前記化学構造を温度50°C〜80°Cまで加熱するステップを含む請求項13に記載の方法。
- 前記活性化するステップが前記色素に連結された前記化学構造を前記ポリマーの前記ガラス転移温度よりも低い温度まで加熱するステップを含む請求項13に記載の方法。
- 前記ミクロスフェアが、前記活性化するステップの前後で同じ形状であることを特徴とする請求項13に記載の方法。
- 前記色素が、前記活性化するステップの前後で同じ構造で且つ同じ組成であることを特徴とする請求項13に記載の方法。
- 前記染色ミクロスフェアが有機溶媒中に配置されたときに、前記色素が前記ポリマーから脱離しないことを特徴とする請求項13に記載の方法。
- 前記ポリマーが、本質的にジビニルベンゼンと架橋されたポリスチレンからなる請求項13に記載の方法。
- 前記染色ミクロスフェアが、前記ポリマーに付着した1つ又はそれ以上の官能基を含み、
前記官能基は、アミノ基又はカルボキシル基を含み、
前記分子が、前記1つ又はそれ以上の官能基を介して前記染色ミクロスフェアの外側表面上に合成することができるようにすることを特徴とする請求項13に記載の方法。 - 前記反応中間体がスルホニルニトレン基を含む請求項13に記載の方法。
- 前記ミクロスフェアの存在下で熱又は光を用いて付加的な異なる色素に連結された付加的な化学構造を活性化して異なる反応中間体を形成するステップを更に含み、前記異なる反応中間体が前記ミクロスフェアのポリマーに共有結合的に付着し、これによって前記付加的な異なる色素を前記ポリマーに連結することを特徴とする請求項13に記載の方法。
- 前記付加的な異なる色素が、前記活性化するステップの前後で同じ構造と組成である請求項27に記載の方法。
- 染色ミクロスフェアの集団であって、前記染色ミクロスフェアの各々は、各々の内部にあるポリマーに化学構造により付着される色素を含み、
前記化学構造は、芳香族スルホニルアジド、または5−(2−アミノエチル)アミノ−1−ナフタレンスルホニルアジドを含み、
前記染色ミクロスフェアの各々が励起されたときに前記染色ミクロスフェアの各々により放出される蛍光強度の変動係数が10%未満であることを特徴とする染色ミクロスフェアの集団。 - 前記染色ミクロスフェアの各々の前記ポリマーに付着する前記色素の量が等しいことを特徴とする請求項29に記載の集団。
- 前記集団の染色ミクロスフェアの各々が、付加的な化学構造により前記染色ミクロスフェアの各々の前記ポリマーに付着された付加的な異なる色素を更に含むことを特徴とする請求項29に記載の集団。
- 前記付加的な異なる色素に起因する前記蛍光強度の変動係数が10%未満であることを特徴とする請求項31に記載の集団。
- 前記集団の前記染色ミクロスフェアの各々が、前記染色ミクロスフェアの各々の外側表面上に合成された生体分子を含むことを特徴とする請求項29に記載の集団。
- 前記集団の染色ミクロスフェアの各々が、前記染色ミクロスフェアの各々の外側表面上に合成された有機分子を更に含むことを特徴とする請求項29に記載の集団。
- 前記染色ミクロスフェアの各々が、前記色素がポリマーに付着される前後で同じ形状であることを特徴とする請求項29に記載の集団。
- 前記色素は前記色素が前記ポリマーに付着される前後で同じ構造で且つ同じ組成であることを特徴とする請求項29に記載の集団。
- 染色ミクロスフェアの前記集団が有機溶媒中に配置されるときに、前記色素が前記ポリマーから脱離しないことを特徴とする請求項29に記載の集団。
- 前記ポリマーが本質的にジビニルベンゼンで架橋されたポリスチレンからなる請求項29に記載の集団。
- 前記染色ミクロスフェアの各々が、前記染色ミクロスフェアの各々の前記ポリマーに付着した1つ又はそれ以上の官能基を更に含むことで、1つ又はそれ以上の分子が、前記1つ又はそれ以上の官能基を介して前記染色ミクロスフェアの各々に付着することができるようにするものであり、
前記1つ又はそれ以上の分子は、オリゴヌクレオチド、ペプチド、又はオリゴ糖を含む生体分子を含み、前記官能基は、アミノ基またはカルボキシル基を含むことを特徴とする請求項29に記載の集団。
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