JP5112430B2 - マトリックス関連の組織動態及び疾患を定量するシステム及び方法 - Google Patents
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生物組織試料の走査領域を照射しかつ該試料から発光を発生させるための励起光源、ここで、該試料は第一の面及び第二の面を有しており、かつ、使用中、該試料は、該第一の面が該励起光源と反対の方向を向きかつ該第二の面が該励起光源の方向を向くように配置されており、
該励起光源からの光で該試料の走査領域を走査するための二次元走査部、
該励起光源からの光を該試料上に集束させるよう配置された、開口数NA1を有する集束部、
該試料の第一の面からの光を集めるよう配置された第一の集光器であって、光学対物レンズの開口数NA1よりも大きな開口数NA2を有する第一の集光器、ここで、集められた光は、該励起光源からの透過光と、該励起光源からの光に応答して該試料で発生した第一の発光とを含む、
該励起光源からの透過光を遮断するよう配置された第一の光学フィルター、
該試料の照射領域に応じた開口径を有する絞りであって、該第一の集光器によって生成される該試料の共役像の位置に配置されている絞り、及び
該試料の第一の面からの光を集めるよう配置された、該試料の走査領域からの該第一の発光を検出するための第一の光検出器を備える。
該試料からの第一の発光を選択的に検出するための光学分光計、及び
該試料からの第一の発光を該分光計又は該第一の検出器のいずれかに選択的に誘導するための配置変更が可能な鏡をさらに備えてもよい。
該試料からの第二の発光を2つの異なる波長で検出するために該試料の第二の面からの光を集めるよう配置された少なくとも2つの第二の光検出器、ここで該第二の光検出器はそれぞれ、検出のため特定の光波長帯域を選択する光帯域フィルターを有する、及び
該第二の発光の一部を該少なくとも2つの第二の検出器のそれぞれに誘導するための少なくとも1つの光ビームスプリッターをさらに備えてもよい。
励起光源からの励起光を該生物組織試料に照射する工程、ここで、該試料の走査領域が該光で走査され、該第一の面は該励起光源と反対の方向を向いておりかつ該第二の面は該励起光源の方向を向いており、該光は該試料の第二の面側にある集束部によって該試料上に集束されており、該集束部は開口数NA1を有している、
該試料の第一の面からの光を第一の集光器によって集める工程、ここで、集められた光は、該励起光源からの透過光と、該励起光に応答して該試料で発生した第一の発光とを含み、該第一の集光器は、該集束部のNA1より大きな開口数NA2を有する、
該励起光源からの透過光を第一の光学フィルターを用いて遮断する工程、
該第一の発光を、該第一の集光器に対して該試料の共役像の位置に配置された絞りを通過させる工程、及び
該試料の走査領域からの該第一の発光を第一の光検出器を用いて検出する工程を備える。
第一の態様の顕微鏡を用いて、励起光源により照らされる試料の走査領域にわたって該試料から生じる第一の発光を検出し、該第一の発光による少なくとも1つの第一の画像を生成させる工程、
該第一の画像に閾値セグメンテーション法を適用して、該第一の画像のセグメント化画像である第二の画像を生成させる工程、及び
該第二の画像をマスク画像として用い、該第一の画像の各画素に該第二の画像の対応する画素を掛けて第三の画像を生成させる工程を備え、ここで、該第一の画像のバックグラウンドノイズ信号は該第三の画像において除去されている。
第二又は第三の態様の方法を用いて生物組織試料の画像を得る工程、
該画像において、該試料で発生したSHG発光の正規化強度を決定する工程、及び
該SHG強度を該生物組織中のコラーゲン量と関連付ける工程、ここで、該試料中に存在するコラーゲンの量は、該生物組織試料の線維症の重症度と関連付けられる、を備える。
励起光源からの励起光を該生物組織試料に照射する工程、ここで、該試料の走査領域が該光で走査され、該第一の面は該励起光源と反対の方向を向いておりかつ該第二の面は該励起光源の方向を向いており、
開口数NA1を有する集束部を用いて該試料上に該励起光源からの光を集束させる工程、
該試料の第一の面からの光を第一の集光器によって集める工程、ここで、第二の面の集められた光は、該励起光源からの透過光と、該試料によって発生した第一の発光とを含み、該第一の集光器は、該集束部のNA1より大きな開口数NA2を有する、
該試料の第二の面からの光を該集束部によって集める工程、ここで、該第二の面の集められた光は、該試料からの第二の発光を含む、
該試料の第一の面からの該第一の発光を第一の光検出器を用いて検出する工程、
該試料の第二の面からの該第二の発光を第二の光検出器を用いて検出する工程、及び
該励起光源で該走査領域を走査することにより、該生物組織試料の第一の画像及び第二の画像を形成する工程を備え、ここで、該第一の画像は、該第一の発光からなり、かつ該第二の画像は、該試料により発生した該第二の発光からなる。
該複数の二次元画像を合成して該試料の三次元画像にする工程を備える。
複数の反復のため第六の態様の方法を繰り返す工程、ここで、各反復に対し、励起光源からの光は、該生物組織試料中の異なる深さに集束され、それにより該生物組織試料の対応する複数の二次元画像が得られ、各画像は対応する焦点深度での励起光に応答して該試料で発生した発光に対応するものである、
各二次元画像に対して、対応する複数のセグメント化画像を生成させる工程、
該複数の二次元画像を対応するセグメント化画像でマスキングして該二次元画像中のバックグラウンドノイズを除去することにより、対応する複数のノイズ補正画像を生成させる工程、及び
該複数のノイズ補正画像を合成して該試料のノイズ補正三次元画像にする工程を備える。
Claims (31)
- 生物組織の光学イメージングのための顕微鏡装置であって、
生物組織試料の走査領域を照らしかつ該試料から発光を発生させるための励起光源、ここで、該試料は第一の面及び第二の面を有しており、かつ、使用中、該試料は、該第一の面が該励起光源と反対の方向を向きかつ該第二の面が該励起光源の方向を向くように配置されており、
該励起光源からの光で該試料の走査領域を走査するための二次元走査部、
該励起光源からの光を該試料上に集束させるよう配置された、開口数NA1を有する集束部、
該試料の第一の面からの光を集めるよう配置された第一の集光器であって、光学対物レンズの開口数NA1よりも大きな開口数NA2を有する第一の集光器、ここで、集められた光は、該励起光源からの透過光と、該励起光源からの光に応答して該試料で発生した第一の発光とを含む、
該励起光源からの透過光を遮断するよう配置された第一の光帯域フィルター、
該試料の照らされる領域に応じた開口径を有する絞りであって、該第一の発光についてバックグラウンドを抑制するため該第一の集光器によって生成される該試料の共役像の位置に配置されている絞り、及び
該試料の第一の面からの光を集めるよう配置された、該試料の走査領域からの該第一の発光を検出するための第一の光検出器、を備える顕微鏡装置。 - 該第一の集光器の開口数が0.5〜0.8の範囲内にある、請求項1に記載の顕微鏡装置。
- 該試料の第二の面からの第二の発光を検出するよう配置された少なくとも1つの第二の光検出器をさらに備える、請求項1または2に記載の顕微鏡装置。
- 該励起光源からの反射光又は散乱光を遮断して該第二の光検出器が検出しないように配置された第二の光帯域フィルターをさらに備え、
該第二の発光は、該励起光源からの光に応答して該試料で発生した第二高調波信号を少なくとも含む、請求項3に記載の顕微鏡装置。 - 該試料からの第一の発光をコリメートするためのコリメーティングレンズをさらに備え、該コリメーティングレンズは、該絞りと該第一の検出器との間に配置され、
コリメートされる光を集めてそれを該第一の検出器に誘導するよう配置された第二の集光器をさらに備える、請求項1に記載の顕微鏡装置。 - 該第一の発光は、該励起光源からの光に応答して該試料で発生する第二高調波の発光である、請求項1〜5のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。
- 該試料からの第一の発光を選択的に検出するための光学分光計、及び
該試料からの第一の発光を該分光計又は該第一の検出器のいずれかに選択的に誘導するための配置変更が可能な鏡をさらに備える、請求項1〜6のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。 - 該試料の第二の面からの第二の発光を2つの異なる波長で検出するために該試料の第二の面からの光を集めるよう配置された少なくとも2つの第二の光検出器、ここで該第二の光検出器はそれぞれ、検出のため特定の光波長帯域を選択する第二の光帯域フィルターを有する、及び
該第二の発光の一部を該少なくとも2つの第二の検出器のそれぞれに誘導するための少なくとも1つの光ビームスプリッターを備える、請求項3または4に記載の顕微鏡装置。 - 該試料からの第二の発光は、該励起光源からの光に応答して該試料で発生する第二高調波の発生信号と多光子励起蛍光信号の両方を含み、かつ、該2つの第二の検出器の一方は、該多光子励起蛍光信号を検出するため構成されており、かつ第二の検出器の他方は、該第二高調波の発生信号を検出するため構成されている、請求項8に記載の顕微鏡装置。
- 該生物組織は高い光散乱係数を有する、請求項1〜9のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。
- 該生物組織は肝組織である、請求項1〜10のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。
- 第一の面及び第二の面を有する生物組織試料の画像を得る方法であって、
励起光源からの励起光を該生物組織試料に照射する工程、ここで、該試料の走査領域が該光で走査され、該第一の面は該励起光源と反対の方向を向いておりかつ該第二の面は該励起光源の方向を向いており、該光は該試料の第二の面側にある集束部によって該試料上に集束されており、該集束部は開口数NA1を有している、
該試料の第一の面からの光を第一の集光器によって集める工程、ここで、集められた光は、該励起光源からの透過光と、該励起光に応答して該試料で発生した第一の発光とを含み、該第一の集光器は、該集束部のNA1より大きな開口数NA2を有する、
該励起光源からの透過光を第一の光帯域フィルターを用いて遮断する工程、
該第一の発光を、該試料の照射領域に対応する口径を有しかつ該第一の発光についてバックグラウンドを抑制するため該第一の集光器によって生成される該試料の共役像の位置に配置されている絞りを通過させる工程、及び
該試料の走査領域からの該第一の発光を第一の光検出器を用いて検出する工程、を備える方法。 - 生物組織試料の画像を得る方法であって、
請求項1〜11のいずれか1項の顕微鏡装置を用いて、励起光源により照らされる試料の走査領域にわたって該試料から生じる第一の発光を検出し、該第一の発光による少なくとも1つの第一の画像を生成させる工程、
該第一の画像に閾値セグメンテーション法を適用して、該第一の画像のセグメント化画像である第二の画像を生成させる工程、及び
該第二の画像をマスク画像として用い、該第一の画像の各画素に該第二の画像の対応する画素を掛けて第三の画像を生成させる工程を備え、ここで、該第一の画像のバックグラウンドノイズ信号は該第三の画像において除去されている、方法。 - 該第三の画像においてSHG発光により特徴付けられる総面積及びSHG発光の総強度は、異なる生物組織試料から得られる他の画像との比較のため正規化される、請求項13に記載の方法。
- 生物組織試料における線維症の重症度を測定する方法であって、
請求項12又は請求項13に記載の方法を用いて生物組織試料の画像を得る工程、
該画像において、該試料で発生したSHG発光の正規化強度を決定する工程、及び
該SHG強度を該生物組織中のコラーゲン量と関連付ける工程を備え、ここで、該試料中に存在するコラーゲンの量は、該生物組織試料の線維症の重症度と関連付けられる、方法。 - 第一の面及び第二の面を有する、2000μm以下の厚みの生物組織試料の画像を得る方法であって、
励起光源からの励起光を該生物組織試料に照射する工程、ここで、該試料の走査領域が該光で走査され、該第一の面は該励起光源と反対の方向を向いておりかつ該第二の面は該励起光源の方向を向いており、
開口数NA1を有する集束部を用いて該試料上に該励起光源からの光を集束させる工程、
該試料の第一の面からの光を第一の集光器によって集める工程、ここで、第一の面の集められた光は、該励起光源からの透過光と、該試料によって発生した第一の発光とを含み、該第一の集光器は、該集束部のNA1より大きな開口数NA2を有する、
該第一の発光を、該試料の照射領域に対応する口径を有しかつ該第一の発光についてバックグラウンドを抑制するため該第一の集光器によって生成される該試料の共役像の位置に配置されている絞りを通過させる工程、
該試料の第二の面からの光を該集束部によって集める工程、ここで、該第二の面の集められた光は、該試料からの第二の発光を含む、
該試料の第一の面からの該第一の発光を第一の光検出器を用いて検出する工程、
該試料の第二の面からの該第二の発光を第二の光検出器を用いて検出する工程、及び
該励起光源で該走査領域を走査することにより、該生物組織試料の第一の画像及び第二の画像を形成する工程を備え、ここで、該第一の画像は、該第一の発光からなり、かつ該第二の画像は、該試料により発生した該第二の発光からなる、方法。 - 該第一の面の集められた光及び該第二の面の集められた光はそれぞれ、該励起光源からの光に応答して該試料で発生した第二高調波の発生信号を含む、請求項16に記載の方法。
- 該第二の面の集められた光は、該励起光源からの光に応答して該試料で発生した第二高調波の発生信号及び多光子励起蛍光信号の両方を含む、請求項16に記載の方法。
- 生物組織試料の三次元画像を得る方法であって、
複数の反復のため請求項16の方法を繰り返す工程、ここで、各反復に対し、励起光源からの光は、該生物組織試料中の異なる深さに集束され、それにより該生物組織試料の対応する複数の二次元画像が得られ、各画像は対応する焦点深度での励起光に応答して該試料で発生した発光に対応するものである、及び
該複数の二次元画像を合成して該試料の三次元画像にする工程、を備える方法。 - 各二次元画像に対して、対応する複数のセグメント化画像を生成させる工程、
該複数の二次元画像を対応するセグメント化画像でマスキングして該二次元画像中のバックグラウンドノイズを除去することにより、対応する複数のノイズ補正画像を生成させる工程、及び
前記三次元画像にする工程が、該複数のノイズ補正画像を合成して該試料のノイズ補正三次元画像にする工程を含む、請求項19に記載の方法。 - 該合成工程の前に、該複数の画像のそれぞれの強度又は面積のいずれか又は両方を正規化することをさらに備える、請求項19又は20に記載の方法。
- 生物組織中の線維状コラーゲンを定量する時に用いられる、請求項1〜11のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。
- 早期の生物組織線維症を監視する時に用いられる、請求項1〜11のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。
- 癌組織の細胞外マトリックス特性を調べる時に用いられる、請求項1〜11のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。
- 該生物組織は高い光散乱係数を有する、請求項22〜24のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。
- 該生物組織は肝組織である、請求項22〜24のいずれか1項に記載の顕微鏡装置。
- 生物組織中の線維状コラーゲンを定量する時に用いられる、請求項16〜21のいずれか1項に記載の方法。
- 早期の生物組織線維症を監視する時に用いられる、請求項16〜21のいずれか1項に記載の方法。
- 癌組織の細胞外マトリックス特性を調べる時に用いられる、請求項16〜21のいずれか1項に記載の方法。
- 該生物組織は高い光散乱係数を有する、請求項28または29に記載の方法。
- 該生物組織は肝組織である、請求項28または29に記載の方法。
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