JP4439261B2 - プロテインホスファターゼ2aに結合する、合成または天然ペプチドおよびその同定方法と使用 - Google Patents
プロテインホスファターゼ2aに結合する、合成または天然ペプチドおよびその同定方法と使用 Download PDFInfo
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Description
a)その配列がウィルスタンパク質、寄生虫タンパク質、または細胞タンパク質に由来するペプチドを、スポットの形態で、支持体上にデポジットさせる工程であって、各スポットが、所定の配列を有するペプチドのデポジットに対応している工程、
b)支持体上に存在するペプチドが、プロテインホスファターゼ2Aホロ酵素またはそのサブユニットの一つと結合するのを可能にする条件の下で、該ホロ酵素またはそのサブユニットの一つを含有する溶液と固体支持体を接触させる工程、および、
c)タンパクホスファターゼ2Aまたはそのサブユニットの一つが結合するペプチドを、固体支持体上で同定する工程
を含む方法に関する。
「タンパクホスファターゼ2A型ホロ酵素」という用語は、細胞より精製された二量体(AC)またはヘテロ三量体(ABC)複合体、もしくはプロテインホスファターゼ2A型の二つのサブユニット(A)と(C)、さらに必要に応じてサブユニット(B)を精製した後で再構成した抽出物を意味する。プロテインホスファターゼ2A型は、哺乳動物由来であることが好ましい。
a)VEALIRILQQLLFIHFRI(SEQ ID No: 1)もしくは、
b)RHSRIGIIQQRRTRNG(SEQ ID No: 2)もしくは、
c)アミノ酸の置換もしくは欠失によってSEQ ID No: 1またはSEQ ID No: 2とは別異な配列でありながらプロテインホスファターゼ2A型またはそのサブユニットの一つに結合する特性を保持する配列。
a)RKIGRGKFSEVFEG(SEQ ID No: 3)、
b)TVTKDCVIKILKPVKKKKIKREIKILQNL(SEQ ID No: 4)、
c)KILRLIDWGLAEFYHP(SEQ ID No: 5)、
d)P.ファルシパラムもしくはリーシュマニアに由来するSEQ ID No: 3、SEQ ID No: 4またはSEQ ID No: 5の相同配列、もしくは、
e)アミノ酸の置換もしくは欠失によって上記配列から由来した配列であり、プロテインホスファターゼ2Aまたはそのサブユニットの一つに結合する特性を保持する別異な配列であって、特に配列TVTKDKCVIKILKPVKKKKIKREIKILQNL(SEQ ID No: 43)。
A.材料と方法
A.1 精製PP2Aタンパク質
PP2A1タンパク質三量体をブタの脳から均一に精製した。
PP2Aの構造的サブユニットの組換え体をE coliに発現させ、Cohenらに記載されているプロトコルを用いて(Cohen P, Alemany S, Hemmings B A, Resink T J, Stralfors P, Tung H Y, Protein phosphatase-1 and protein phosphatase 2A from rabbit skeletal muscle. Methods Enzymol 1988 159, 390-408)もしくはBoschらに記載されているプロトコルを用いて精製した(Bosch M, Cayla X, Van Hoof C, Hemmings B A, Ozen R, Merlevede W, Goris J, the PR55 and PR65 subunits of protein phosphatase 2A from Xenopus laevis. Molecular cloning and developmental regulation of expression. Eur J Biochem 1995, 230, 1037-45)。
上記「スポットペプチド」技術(Frank and Overwing, 1996 Meth Mol Biol 66, 149-169)を用いて、PP2Aと、(T.パルバ原虫によってコードされた)CK2αタンパク質もしくは(HIV−1ウィルスによってコードされた)Vprタンパク質由来のペプチドとの結合が同定された。
この方法は、対象となるタンパク質(VprもしくはCK2α)の配列全体がをその一連の配列によりカバーされていることを特徴とする、セルロース膜上の特定の位置において、in situでドデカペプチドを合成することからなる。膜上の2つの連続したスポットのペプチドは、2つのアミノ酸が重複している。
HIV−1のVprタンパクの配列全体をカバーする68個のドデカペプチドとタイレリアのCK2αタンパクの配列をカバーする205個のドデカペプチドを合成し、セルロース膜に共有結合させた。
はじめに、準備した膜を、5%のスキムミルクと3%のBSAを含有するTBSで室温で1時間飽和させ、その後で、4μg/mlの精製タンパク質(PP2AのサブユニットAまたはホロ酵素PP2A1)の存在下で、同じ緩衝液中で一晩培養した。構造タンパクA(図1Aと2A)に対する抗体で、ならびにPP2AのタンパクA、BおよびC(図1Bと2B)を認識する抗体の混合物で膜を培養した後、ウエスタンブロットにより、ペプチド配列と各精製したタンパク質(それぞれ構造サブユニットAまたは三量体のホロ酵素PP2A1)との特異的相互作用を明らかにした。
これらの膜を、培養に使用した通常のTBST緩衝液(TBS+TWEEN)で15分間5回洗浄し、その後で(ペロキシダーゼとカップルさせた)第二の抗体とともに室温でさらに1時間培養した。最後に膜を、TBST緩衝液で15分間5回洗浄し、分析に付した。
1−細胞
ヒト頚ガン由来のヘラ細胞系を分析した。
2−吸収したペプチドの定量的判定
溶解緩衝液
0.1M Tris緩衝液、pH8、0.5% NP40含有
OPD緩衝液
25.7mlの0.2M二塩基リン酸ナトリウム+24.3mlの0.1Mクエン酸+50mlの蒸留水をpH5.0に調整。
ビオチン化アビジンペプチド複合体
4molのペプチドを1molのアビジンペロキシダーゼで培養した。室温で20分間。
−各種ペプチドのヘラ細胞に対する細胞間透過度の分析
ヘラ細胞(100l中104個)を、2.5%のペニシリン/アンピシリンと10%のウシの胎児血清の存在下で、完全DMEM培地が分注された96lのプレート(フラットベース)とともに注入した。CO2オーブン(5%)内で37℃の温度条件下で一晩培養した後に、さまざまに希釈した複合体(ビオチン化アビジンペロキシダーゼペプチド)を添加した。4時間培養した後に、上清を吸引し、細胞をPBSで3回洗浄し、トリプシン化したあとで、PBS内でカウントするために採取した。カウントした後に、細胞を300μlの溶解緩衝液内で回収した。
−ペルオキシダーゼ活性の測定
50μlのOPD緩衝液を50μlの溶解緩衝液もしくは50μlの細胞溶解物(概して、何回かの連続希釈を行った(1/2まで))で96ウェルのELISA内で培養した。分析のために、50μlのOPD溶液を添加した(暗所で)。100μlの1N HClにより反応(約10分)が停止した。
−結果の分析
ペルオキシダーゼの活性は、ELISAリーダー(620nmにおける基準フィルタ)内で490nmで読み取ることにより判定し、溶解物中におけるペルオキシダーゼの量を、較正曲線から計算し、次いで同数の細胞について推定した(103もしくは104)。
ペプチド分子=(6*1023/MWのペプチド)*POのng*10-9。
ヘラ細胞(100μl中104個)を、2.5%のペニシリン/アンピシリンおよび10%のウシの胎児の血清を含有する完全DMEM培地が分注された96ウェルプレート(フラットベース)に播種した。CO2オーブン(5%)内で37℃の温度条件下で一晩培養した後に、さまざまな濃度のペプチドの存在下で細胞を培養した。72時間培養した後に、ペプチドを含有する培地を吸引し、0.5mg/ml(DMEM単独で希釈)のMTTを各ウェルにつき100μl添加した。37℃の温度条件下で暗所で30分間培養し、その後でMTTを吸引して、取り出してから、50μlのDMSOをすべてのウェルに添加した。細胞が完全に溶解するまで10分間待ち、ウェル内の反応生成物の溶解を均質化するために溶解物ウェルを攪拌する必要があった。次に、プレートを690nmの基準フィルタを用いて570nmで読み取りをおこなった。
B.1.2種類の病原菌(HIV−1とT.パルバ)によってコードされたタンパクのPP2A(PP2A1とサブユニットA)との結合部位を含むペプチド配列の同定
生成した三量体PP2Aホロ酵素と共にHIV−1のVprおよびT.パルバのCK2αの配列をカバーするペプチドを含有する膜を培養した結果、VprとCK2αのペプチドの5つの配列が、PP2Aに特異的に結合可能であると判断することができた。その結果を以下の表に示す。
HIV−1のVprの外因的発現またはプロウィルス感染による発現により、ヘラ細胞、Tリンパ系および一次リンパ球内でアポトーシスが誘発される(Stewart et al、1997 J Virol 71:5579-9)。Vprミュータント使用したところ、この作用は、細胞サイクルのG2フェイズにおける停止と相関関係を持つことがまず明らかとなった。最近になりVprが、G2における停止とは関係なく、アポトーシスを誘発可能であるということも実証された(Nishizawa et al、2000、Virology 27、16-26)。
E4orf4アデノウィルスタンパク質との相互作用の結果、PP2Aが活性化すると、形質転換した細胞でアポトーシスが誘発されるという報告がある(Shtrichman R et al、2000、Oncogene 19、3757-3765)。同様に、Vprの発現も、形質転換した細胞でアポトーシスを誘発する(Stewart et al、1999、PNAS、96、12039-12043)。
さらに、当技術分野で周知のVprミュータントを分析したところ、本発明のプロセスによって同定され、PP2Aタンパク質に特異的に結合するペプチドには、Vprのアポトーシス促進効果に必要な配列に関連する配列が含有されていることが示唆される。
このように、PP2Aと相互作用し、本発明のプロセスによって同定されるウィルスタンパク質VprおよびE4orf4のフラグメントは、腫瘍細胞のアポトーシスを誘発するのに効果的である。
同定されたペプチドは、HIVや他の関連するウィルスおよびレトロウィルスによる感染を防止する際にも、当然使用することができる。
オカダ酸とSV40のsmall t抗原を使用したところ、PI3−キナーゼ、PKCζ(MAP−キナーゼ−キナーゼ−キナーゼすなわちMEKKとして同定)、MEKタンパクおよび2個のMAPキナーゼERK−1およびERk−2ならびに転写ファクタNF−κBおよびSp1が関与する新規なリン酸化反応カスケードを介して、PP2Aが細胞の増殖を制御することが実証された(Sontag E、Sontag J M、Garcia A(1997)、EMBO J、16、5662-5671;Ayllon V、Martinez A、C、Garcia A、Cayla XおよびRebollo A(2000)、EMBO J 19、1-10、A Garcia、S Cereghini、E Sontag(2000)、J Biol Chem 275、9385-9389)。さらに、MAPキナーゼのカスケードを調節する際のPP2Aの役割も、細胞CK2αサブユニットの過発現によりMEKタンパク質が活性化され、PP2Aを脱リン酸化することを実証した、Chambazのチーム(Heriche et al、(1997)、Science、276、952-955)による調査研究によって、示唆されている。
Ole-Moiら(Embo J、1993、12、1621-1631)による調査研究から、タイレリアによる形質転換が宿主タンパク質の過剰リン酸化を誘発することが明らかとなっている。この作用は特に、細胞CK2の恒常的な活性化に一部起因しており、その活性化自身は、寄生虫によってコードされ形質転換細胞の細胞質ゾルに分泌されるCK2α型サブユニットの作用に、依存している。
以下に指摘するように、本発明のプロセスによって同定された、PP2Aとの3つの結合部位に対応する配列の比較から、部位2で部分的に複写されているK−I−G/L−R/K型のモチーフの存在を同定することが可能である。
これらペプチドの細胞内の存在は、タンパク質のPP2Aとのin vivoにおける結合部位に対応するため、これら寄生虫の成長を妨げることが可能である。
表3に列挙されている各種ペプチドをビオチン化形態で合成し、HPLC(Neosystem)によって精製し、細胞内透過度と細胞の生存度に対するそれらの作用をヘラ細胞で分析した。表1に示されている一連のペプチドに関する調査研究によって、ヘラ細胞内に透過する可能性がある6個のペプチドを同定することができた(図3)。
・FD6:T.パルバ CK2αタンパク質とPP2AのAサブユニットが相互作用する部位由来の12AAペプチド
・FD7:6AAヘキサモチーフの3回の反復に対応する18AAペプチド。P.ファルシパラム CK2α由来のこの配列は、PP2Aと結合するT.パルバ配列と相同性である
・FD8:プロタミン由来のペプチド(周知のPP2A活性化因子である)
・FD11:FD14の配列由来の6AAヘキサモチーフの3回の反復に対応する18AAペプチド
・FD14:HIV−1 Vprから特徴づけした、PP2Aとの結合部位を再生するFD14
・FD13:このペプチドは、FD14ペプチド配列と相同であるHIV−1 Vpr配列に相当し、別のHIV−1 VprとPP2Aとの結合部位を表す。
さらに、表1に示されている一連のペプチドで実施した生存度に関する調査研究により、ヘラ細胞の生存度を阻害する3個のペプチドを同定することができた。
・FD8:ヘラ細胞の生存度に影響する(図4A)
・FD14:ヘラ細胞の生存度に明らかに影響する(図4B)
・FD12:配列がFD11ペプチドの配列に由来する、18AAペプチド(RをAに変異させている)。Chlamydia muridarumのグルコサミントランスフェラーゼタンパク質と相同なこのペプチドは、ヘラ細胞の生存度に影響を与える(図4C)。この生物学的作用は、原形質膜との相互作用によるものであると考えられる。
PP2Aと相互作用する特定のタンパク質由来のペプチドは、新規な抗腫瘍アプローチとなりうるか。
我々の研究により、PP2Aと相互作用することが知られている2種類のタンパク質すなわちVprとプロタミン由来の2種類の透過性ペプチド(FD8/FD14)を同定することができた。アルギニンとリシンリッチな共通配列を有するこれらのペプチドは、一般的吸収メカニズムを用いて細胞内へ透過することができる。アルギニンリッチな配列を有するペプチドの吸収で共通に使用されるこのようなメカニズムは、最近提案されたものである(Tomoki Suzuki et al、2002、Possible exstence of common interlization mechanisms among arginine-rich peptides、JBC 277、2437-2443)。概して、アルギニンもしくはリシンリッチな配列の存在により、PP2Aと結合するタンパク質が特徴づけられ、他の透過性ペプチドをPP2Aファミリーで同定する可能性を示唆している。
3つのペプチド64〜66の配列により、部位1の配列RHSRIGIIQQRRTRNG(SEQ ID No: 2)を定義している。
10のペプチド74〜83の配列により、部位2の配列TVTKDKCVIKILKPVKKKKIKREIKILQNL(SEQ ID No: 4)を定義している。
3つのペプチドの配列により、部位3の配列KILRLIDWGLAEFTHP(SEQ ID No: 5)を定義している。
Claims (12)
- in vitroで、プロテインホスファターゼ2A型ホロ酵素またはそのサブユニットの一つと特異的に結合すること、および
(i)下記配列の1つからなるか:
a)RKIGRGKFSEVFEG(SEQ ID No: 3)、
b)TVTKDKCVIKILKPVKKKKIKREIKILQNL(SEQ ID No: 43)、
c)KILRLIDWGLAEFYHP(SEQ ID No: 5)、
d)RKIGRGKFSEVF (SEQ ID NO : 31);
e)IGRGKFSEVFEG (SEQ ID NO : 32);
f)TVTKDKCVIKIL (SEQ ID NO : 13);
g)TKDKCVIKILKP (SEQ ID NO : 14);
h)DKCVIKILKPVK (SEQ ID NO : 15);
i)CVIKILKPVKKK (SEQ ID NO : 16);
j)IKILKPVKKKKI (SEQ ID NO : 17);
k)ILKPVKKKKIKR (SEQ ID NO : 18);
l)KPVKKKKIKREI (SEQ ID NO : 19);
m)VKKKKIKREIKI (SEQ ID NO : 20);
n)KKKIKREIKILQ (SEQ ID NO : 21);
o)KIKREIKILQNL (SEQ ID NO : 22);
p)KILRLIDWGLAE (SEQ ID NO : 23);
q)LRLIDWGLAEFY (SEQ ID NO : 24);および
r)LIDWGLAEFYHP (SEQ ID NO : 25);
(ii)(i)a)〜c)に記載のペプチドの配列の相同配列であって、(i)a)〜c)に記載のペプチドの配列と少なくとも90%の同一性を有する配列からなるか;または
(iii)(i)a)〜c)に記載のペプチドの配列とアミノ酸の置換または欠失によって異なる配列であって、(i)a)〜c)に記載のペプチドの配列と比較して異なる配列の置換または欠失されたアミノ酸の数が(i)a)〜c)に記載のペプチドの配列を構成するアミノ酸数の10%以下である配列からなること
を特徴とする、サイズが30アミノ酸未満のペプチド。 - サイズが20アミノ酸未満である、請求項1記載のペプチド。
- その投与により、寄生虫の発育が抑制されることを特徴とする、請求項1または2記載のペプチド。
- 由来元である天然タンパク質と、PP2Aホロ酵素またはそのサブユニットの一つとの相互作用を競合的に阻害することを特徴する、請求項1〜3のいずれか一項記載のペプチド。
- 真核細胞に該ペプチドを移行させることのできるベクターに結合することを特徴とする、請求項1〜4のいずれか一項記載のペプチド。
- 請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドの反復により構成されていることを特徴とするポリペプチド。
- 配列が、請求項1〜6のいずれか一項記載のペプチドをコードする配列からなることを特徴とする、ポリヌクレオチド。
- 配列SEQ ID No: 28、配列SEQ ID No: 29、または配列SEQ ID No: 30からその配列が選択されることを特徴とする、ポリヌクレオチド。
- 請求項7または請求項8に記載のポリヌクレオチドの多量体からなることを特徴とする、ポリヌクレオチド。
- 請求項7〜9のいずれか一項記載のポリヌクレオチドと、請求項1〜6のいずれか一項記載のペプチドの宿主細胞内における発現を可能にする調節配列を含むことを特徴とする、細胞発現ベクター。
- 請求項1〜6のいずれか一項記載のペプチドのいずれか一つに特異的に結合できることを特徴とする、精製されたポリクローナルまたはモノクローナル抗体。
- 請求項10に定義される細胞発現ベクターを使用して宿主細胞を形質転換する工程、その後に、形質転換された宿主細胞を培養し、培地中のペプチドを回収する工程を含む、請求項1〜6のいずれか一項に定義されるペプチドを調製するための方法。
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