JP4213029B2 - 特異的標識化方法 - Google Patents
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Description
そのような白金化合物のいくつかの例の構造表示が、以下に示されている。
本発明はさらに以下の非限定的な実施例によって説明される。
2つのアミノ酸(ヒスチジンとメチオニン、各0.1ミリモル)が500μl重水素化リン酸ナトリウム緩衝液(50mM、pD=7.00)に溶解され、少量の過剰(0.44ミリモル)の[Pt(en)(NH2−NH−Boc)Cl](NO)3(=PtN3−Cl)、とともにインキュベートされた。ここでBocは((en)=エチレンジアミン、Boc=tert-ブトキシカルボニル)マーカーである。反応過程は、1Hと195Pt核を可視化する高分解能NMR(ブルカー(Bruker)DPX300)で追跡された。結果を図1および2に示す。データ−は、S−反応性部位(メチオニン、図1)の反応が120分以内にほとんど完結したことを示し、PtN3−ClからPtN3−S−付加体への信号の変化によって証明され、一方、N−反応性部位と白金化合物間の反応は緩やかに進行(図2)したことを示した。24時間の後、ヒスチジン分子の4分の1のみが標識化された。
ウシ血清アルブミン(BSA)が0.5×PBS(リン酸塩緩衝化食塩水、pH7.4)中に1mg/ml溶液になるよう溶解された。1mlのBSA検体に、0.5mgのローダミン シス−Pt(シス[Pt(II)(en)(NH2−(CH2)6−NH−ローダミン)Cl](NO3))が加えられた。もう1つの1mlのBSA検体に、0.5mgのローダミン トランス−Pt(トランス[Pt(II)(NH3)2(NH2−(CH2)6−NH−ローダミン)Cl](NO3))が加えられた。両方の検体が37℃で16時間反応させられた。その後、非結合発蛍光団(非結合ローダミンおよび非結合ローダミン−Pt化合物)が、1×PBSを溶出液として使用してゲル濾過(10mlセファデックスG50カラム、10cm長、1ml直径)で除去された。次いで、蛋白質あたりに結合した発蛍光団の比率(F/P比率)が以下の式を使用して決定された。
蛋白質に対する白金化合物の比率(Pt/P比率)は、以下の式を使用して決定された。
結果は以下のとおりである。
ウシ血清アルブミン(BSA、シグマ(Sigma);A−9647)、アビジン−D(ベクター(Vector);A−2000)そしてヤギIgG抗−マウスIgG(全IgG分画、腎臓学部、ライデン大学 メディカルセンター)を、ビオチン−Pt(シス[Pt(II)(en)(NH2−(CH2)2−CO−(CH2)2−CO−(CH2)2−NH−ビオチン)CL](NO3))(KREATECH, ULK001)、DNP−Pt(シス[Pt(II)(en)(NH2−(CH2)6−NH−DNP)CL](NO3))(KREATECH, ULK003)、ローダミン−Pt(シス[Pt(II)(en)(NH2−(CH2)6−NH−ローダミン)CL](NO3))(KREATECH, ULK101)およびdグリーン−Pt(シス[Pt(II)(en)(NH2−(CH2)6−NH−dグリーン)CL](NO3))(KREATECH, ULK301)で標識化するために使用した。BSAとIgGの各標識化のために、250μlPBS中の250μgの蛋白質が125μgの標識化試薬を含有する250μlの水と混合された(標識に対する蛋白質比率=1:0.5)。必要なときには、容量は蒸留水で0.5mlに調節された。反応は37℃で16時間実施された。非結合の標識化試薬が、TBS/0.05%ツイーン20を溶出液として使用して、ゲル濾過(セファデックスG25、PD10;APB)で除去された。アビジン−DのDNP−PT標識化は、システインを有さないかまたは反応し得ないシステインを有しそしてメチオニンアミノ酸を有する蛋白質の標識化を最適にするために選ばれた。アビジン−Dは、種々の蛋白質:標識比率と固定された比率で、75mMと500mMのNa−リン酸塩−、トリスHCl−またはNa−炭酸塩緩衝液中、7から10で変化するpHで標識化された。標識化期間中の蛋白質濃度は0.5mg/mlに保たれたが、標識−白金試薬濃度は、0.25から0.75mg/mlの間で変化した。
通常のヤギ血清とマウスIgGで免疫化されたヤギの血清が、DNP−Pt(シス[Pt(II)(en)(NH2−(CH2)6−NH−DNP)CL](NO3))で、2:1(w/w)のDNP−Ptに対する全蛋白比率で37℃において16時間標識化された。マウスIgGが、マイクロタイタープレート上にウエル当たりコーティング濃度0、0.1、0.3、1、3、10、30、100、300および1000ng/mlの希釈シリーズで固定された。このコーティング段階の後、プレートはPBS−0.05%ツイーン20で3回連続して濯がれ、最後に125μlPBS/2%カゼイン/3%BSAで、37℃において30時間ポストコーティングされた。次に、血清がマレイン酸緩衝液(ロッシュ ダイアグノステックス)で0.5ng/μlの蛋白質濃度溶液になるように希釈された。次いで、標識化された血清の100μlが、固定されたマウスIgGに加えられ37℃で60分間反応された。マイクロタイタ−プレートが1×PBS−0.05%ツイーン20で洗浄され、マレイン酸緩衝液で希釈されたHRP標識化抗−DNP抗体(#NEN7−1−99)と37℃で1時間インキュベートされた。非結合の抗DNP−HRPがそれぞれ1mlの1×PBS−0.05%ツイーン20で3回洗浄されて除去された。次に、pH5.3のクエン酸−リン酸緩衝液に希釈された100μlのTMB基質がウエルに加えられ、室温(22〜22℃)で30分間、暗所で反応された。反応を停止するために100μlの1N H2SO4が加えられた。マウスIgGに結合した本発明の標識化された抗マウスIgGの尺度として、450nmでの吸光度が測定された。結果は、図3に示されている。非免疫化ヤギ血清と対照的に、免疫化されたヤギ血清を使用した試験は、結合された抗NDPのシグナルを示し、抗マウスIgGがマウスIgGに選択的に結合したことを示した。この実験は標識としてDNPの替わりにビオチンそして抗−DNPの代わりに替わりに抗−ビオチンを使用して反復して行われた。同様の結果が観察された。
マイクロタイタープレート(MB,762070、グリーナー(Griener))が、ウサギ抗−ヒトIgG(ダコ(DAKO)、A0424)、ウサギ抗−ヒトIgA(ダコ(DAKO)、A0092)、ウサギ抗−ヒトIgM(ダコ(DAKO)、A0426)、ウサギ抗−ヒトIgD(ダコ(DAKO)、A0093)またはウサギ抗−ヒトIgE(ダコ(DAKO)、A0094)のいずれかでコーティングされた。各抗体が10μg/mlの濃度で1×PBSに溶解された。マイクロタイタープレートが100μlで、室温で1晩コーティングされた。次に、プレートが洗浄用緩衝液(0.15M NaCl、4.9mM Na2HPO4・2H2O、1.2mM KH2PO4、0.005%ツイーン80、0.005%チメラソール(thimerasol))で濯がれそして、150μlの1×PBS、2%カゼイイン、3%BSA)でポストコーティングされた(37℃で30分)。1:250から1:9.105までの範囲の種々希釈比(血清希釈緩衝液:0.1MトリスpH7、0.15M NaCl、1%BSA、2%カゼイン、0.05%ツイーン80、0.025%チメラソール(thimerasol))で未処理の全ヒト血清(100μl)が、抗−ヒトIgGと抗−ヒトIgAでコートされたプレートに加えられ、37℃で1時間インキュベートされた。ウエルが完全に濯がれ、抗−ヒトIgG−HRP(ダコ(DAKO)P−214/保存溶液:スタビルザイムセレクト(サーモディックス)(Stabilzyme Select(Surmodics))での1:20希釈、最後に血清希釈緩衝液で1:100に希釈された)と抗−ヒトIgA−HRP(ダコ(DAKO)P−216/保存溶液:スタビルザイムセレクト(サーモディックス)(Stabilzyme Select(Surmodics))での1:35希釈、最後に血清希釈緩衝液で1:100に希釈された)コンジュゲートおよび標準操作に従うTBS基質を使用することにより、検出限界が確立された。
硫酸アンモニウムの効果が評価された。最初に蛋白質が飽和(NH4)2SO4溶液の50、100、200または400μlのいずれかで沈殿させられた(30分間氷上−30分間室温−遠心分離)。上澄み液は沈殿物から分離された。沈殿物は、0.5mg/mlの濃度になるように0.5×PBSに溶解された(透析なしに)。蛋白質濃度は、BCA試薬(ピース(Pierce)、上記参照)で測定された。次に、最溶解された沈殿物は、4:1比率(w/w)でDNP−Pt(シス[Pt(II)(en)(NH2−(CH2)6−NH−DNP)CL](NO3)]で50℃において4時間標識化された。結果は、図4に示されている。
この実施例で、蛍光共鳴エネルギー移動(FRET)を使用して特異的標識化が実証される。選択された生物有機分子は、ミクロパーオキシダーゼである。ミクロパーオキシダーゼmp−11(シグマM6765)は、2つのN反応性部位(リジンとヒスチジン)と2つのS−反応性部位(システイン)を有する11アミノ酸から構成されている。mp−11の全長の配列は、バリン−グルタミン−リジン(N)−システイン(S)−アラニン−グルタミン−システイン(S)−ヒスチジン(N)−スレオニン−バリン−グルタミン、である。mp−11が0.5×PBS(pH7.2)に1mg/mlの濃度で溶解された。この溶液の1部分(0.25mg)がFlu−ULSで、1:0.25の比率で0.5×PBS(最終容量4999.5μl)中、50℃で4時間標識化された。フルオロレセイン標識mp−11溶液はpD−10カラム(APBnr.17-0851-01 )で精製された。溶液の精製に先立ち、カラムは5mlの0.5×PBSで3回濯がれた。フルオロレセイン標識mp−11溶液は、ウルトロスペクック(Ultrospec)4000分光光度計(APB)で分析された。続いて、フルオロレセイン標識mp−11はローダミン−ULS(比率1:0.25)で標識化された。標識化は、4℃で1晩、実施された。次いで、溶液は上記のように精製され、分析された。
pH4または4でシスまたはトランスローダミン−Ptでウシ血清アルブミン(BSA)が標識化された。BSAが1×PBS(リン酸塩緩衝化食塩水、pH=7.4)中に3%の量で溶解された。この溶液の少量(3.3μl)が以下の計画に従って標識化された:(a)0.0075M NaAc/クエン酸緩衝液pH4(最終容量1ml)中の1mg/ml保存溶液の25μlローダミン シス−Pt(シス[Pt(II)(en)(NH2−(CH2)6−NH−ローダミン)CL](NO3))を加える;(b) 0.0075MNaAc/クエン酸緩衝液pH4(最終容量1ml)中の2mg/ml保存溶液の12.5μlローダミン トランス−Pt(トランス[Pt(II)(NH3)2(NH2−(CH2)6−NH−ローダミン)CL](NO3))を加える;(c)0.5×PBSpH7中である以外は(a)に同じ;(d) 0.5×PBSpH7中である以外は(b)に同じ。すべての場合において、標識に対する蛋白質比率は1:0.25である。標識化は、50℃で4時間実施された。その後、標識化されたBSAはカラムで精製された。検体の目視での評価によると、(b)および(d)には明瞭な着色された溶液を認めなかったが、(a)および(c)では着色されていた(cがaよりも強い)。
ソフト遷移金属の効果が、特異的標識化条件をさらに制御するために評価された。10mM リン酸ナトリウムpH8と20mM NaCl中にDNP−Pt(最終濃度、0.2mM)またはRho−Pt(最終濃度、0.2mM)のいずれかを含んでいる溶液に、N−アセチルメチオニン(最終濃度、2mM)またはN−アセチルヒスチジン(最終濃度、2mM)の10倍過剰量が加えられた。標識−白金化合物とS−反応性部位およびN−反応性部位を含むアミノ酸との反応速度に及ぼすソフト遷移金属の存在の影響を研究するために、各溶液にCdCl2またはK2PdCl4の0、1、2、または5当量が加えられた。反応は37℃で実施された。遷移金属を添加したときにpHが低下したことは注目すべきである。このことはこの実験で使用された全ての遷移金属について観察された。pHの低下は、パラジウムについて最も顕著であり、カドミウムについて最も少なかった。標識−Ptの消失が尺度として選択され、ソフト遷移金属(すなわち、Pd,Cd等)の添加がない検体が対照となった。そのような添加ソフト遷移金属を含有する検体中の測定された相対的変化は、NまたはS−反応性部位を有するアミノ酸の標識化特性に及ぼすそのような化合物の存在と濃度の効果に関する尺度である。結果は表4に示されている。結果は、メチオニンの標識化が極めて速いことを示している。この発見は、上に示されたデータと一致する。相当量のカドミウムの添加は、かすかに反応速度を低下させるだけである。しかしながらパラジウムの添加は、濃度依存的に顕著に反応を阻害する。ヒスチジンの標識化はきわめて遅く、カドミウムが添加されたときに減少する。ヒスチジンに対して5倍の過剰量のカドミウムは、最初の場所で標識化が起こることを妨害した。パラジウムは低濃度で存在するときにはヒスチジンとの反応を加速するように見え、高濃度では反応は低下する。しかしながらこの反応速度の変化は、ソフト遷移金属の存在、またはその混合物によるのではなく、部分的にはpHの変化にもよるだろう。パラジウムはまた、S−反応性部位(たとえばメチオニン)およびN−反応性部位(たとえばヒスチジン)を含有する両方のアミノ酸の標識化に効果があるが、メチオニンに対する効果が大きい。このことは硫黄の標識化を選択的に減少させるための優れた機会を提供する。
牛血清アルブミン(BSA、シグマ;A−9647)が20mMリン酸塩緩衝液pH8または20mM酢酸ナトリウム緩衝液pH4中に、濃度5mg/mlで溶解された。この溶液の1部分に、Flu−Pt、Rho−Pt、Flu−NHS(モレキュラープローブズ(Molecular Probes)、C−6164、10mg/mlの濃度でDMSO中に溶解されている)またはRho−NHS(モレキュラープローブズ(Molecular Probes)、C−6123、5mg/mlの濃度でDMSO中に溶解されている)が10倍の過剰量で添加された。標識化反応は、37℃で1晩実施された。全ての検体がカラム精製(PD10)で精製され、分光光度計で標準の手順に従って分析された。NHS標識に関する標識化は低pHでほとんど起こらないという結果であったが、Flu−Pt標識は顕著に高いF/P比率を示した。ベースラインFlu−NHS値は、標識(陰性荷電)の蛋白質(陽性荷電)への非特異的結合に主として起因していることに注意すべきである。標識両者は、低pHでのFlu−Pt値と相応して、中性pHで匹敵するF/P比率を生成した。低pHでRho−NHS値に比べてRho−Pt値が低かったことを除いて、ローダミンについて同様の結果が得られた。この場合、低pH実験に対応するデータは、実際のベースライン値であり標識化されないかまたはほとんど標識化されないことを示している。この発見は、蛋白質の荷電の観点で標識化化合物の総合的な実質的荷電の結果として少なくとも部分的に説明できるかもしれない。この例は、種々の標識化技術の成功的な使用と本発明の範囲に寄与する強い静電気的相互作用を実証している。
上皮細胞成長因子(EFG、シグマ;E9644)が濃度1mg/mlで50mMリン酸塩緩衝液pH8に溶解された。EFG溶液の1部分に、10倍過剰量のFlu−NHS(モレキュラープローブズ(Molecular Probes)、C−6164、10mg/mlの濃度でDMSO中に溶解されている)またはFlu−Pt(クレアテック(KREATECH)、ULK004)が添加された。標識化反応は、1晩、30℃と37℃でそれぞれFlu−NHSとFlu−Pt標識について実施された。次いで、検体はカラム精製(PD10)で精製され、分光光度計で標準の手順に従って分析された。結果は、Flu−NHSとFlu−Pt標識についてそれぞれ0.07と0.28のF/P比率を示した。EFGはリジンを含有していない、したがって、NHS標識化のための好ましい標的ではない。NHS複合体にとっては末端のアミノ基がただ潜在的な標識化部位として働くだけである。同様の反応条件で顕著に高いF/P比率がFlu−Pt複合体について達成された。
Claims (22)
- 白金−リンカーを介して1種またはそれ以上の物質を特異的に標識化する方法であって、該物質は共に1つまたはそれ以上の硫黄含有反応性部位と1つまたはそれ以上の窒素反応性部位を含み、白金化合物と標識との複合体を形成し、そして、実質的に硫黄含有反応性部位のみまたは実質的に窒素含有反応性部位のみが該白金化合物に結合するように該白金化合物を前記の1種またそれ以上の物質と反応させることを特徴とする、物質を特異的に標識化する方法。
- 硫黄含有反応性部位と窒素含有反応性部位の標識化を区別するためにpHを使用することを特徴とする、請求項1に記載の方法。
- 硫黄含有反応性部位と窒素含有反応性部位の標識化を区別するためにイオン強度を使用することを特徴とする、請求項1または2に記載の方法。
- 塩化物、Cl-、NO3 -、HCO3 -、CO3 2-、SO3 -、I-、Br-、アセタート、カルボキシラート、ホスファート、スルファート、エチルニトラート、オキサラート、シトラート、ホスホナートまたはこれらの混合物を含む1つもしくはそれ以上の塩によってイオン強度を実現することを特徴とする、請求項3に記載の方法。
- 硫黄含有部位またはこの複数部位を最初に遮蔽部分で特異的に遮蔽し、その後に白金化合物を窒素含有反応性部位に特異的に結合することを特徴とする、請求項1〜4のいずれかに記載の方法。
- 遮蔽部分がトランス−白金化合物であることを特徴とする、請求項5に記載の方法。
- 白金化合物が特異的に物質に結合するように白金化合物を反応させた後に、遮蔽部分を遮蔽された反応性部位から選択的に除去することを特徴とする、請求項5または6に記載の方法。
- 窒素含有反応性部位に白金化合物を選択的に標識付けするように選択した濃度で1種またはそれ以上の遷移金属イオンを使用することを特徴とする、請求項1〜7のいずれかに記載の方法。
- 遷移金属をCu(II)、Zn(II)の群から選ぶことを特徴とする、請求項8に記載の方法。
- 窒素含有反応性部位の少なくとも1つがヒスチジン残基であり、白金化合物と標識の複合体を生成し、実質的にヒスチジン残基のみまたは実質的に非ヒスチジン反応性部位のみが該白金化合物に結合するように該白金化合物を1種またそれ以上の物質と反応させることを特徴とする、請求項1〜9のいずれかに記載の方法。
- 白金−リンカーを介して1種またはそれ以上の物質を特異的に標識化する方法であって、該物質は共に1つまたはそれ以上のヒスチジン残基と1つまたはそれ以上の他の窒素含有反応性部位を含んでおり、白金化合物と標識との複合体を形成し、そして、実質的にヒスチジン残基のみまたは実質的に非ヒスチジン反応性部位のみが該白金化合物に結合するように該白金化合物を1種またそれ以上の物質と反応させることを特徴とする、物質を特異的に標識化する方法。
- 窒素含有反応性部位と硫黄含有反応性部位を異なる標識で標識化することを特徴とする、請求項1〜11のいずれかに記載の方法。
- 白金化合物が以下の式のうちの1つで表される、請求項1〜12のいずれかに記載の方法。
X1とX2は、NH3、NH2R、NHRR’、NRR’R’’基によって作られる不活性部分の群から独立して選ばれ、R、R’およびR’’は1〜6の炭素原子を有するアルキル基を表し、そして
X3は、アルキル基が安定化架橋を表す。 - 安定化架橋がアルキルジアミンであることを特徴とする、請求項13に記載の方法。
- アルキル基が2〜6の炭素元素を有することを特徴とする、請求項13または14に記載の方法。
- 標識および/または物質の反応性部位がスペーサーを通して白金化合物の白金部分に結合していることを特徴とする、請求項1〜15のいずれかに記載の方法。
- 標識が、蛍光色素、リン光標識、化学発光標識、特異結合する一対の成分、UVまたは可視光線吸収標識、放射活性標識、コロイド染料物質、還元剤、微粒子ゾルまたは金属であることを特徴とする、請求項1〜16のいずれかに記載の方法。
- 標識が、ジニトロフェノール(DNP)、テトラメチルローダミン、ジゴキシゲニン、シアニン色素、ビオチン、アビジンまたはストレプトアビジンであることを特徴とする、請求項17に記載の方法。
- 物質が1級アミン、2級アミン、3級アミン、芳香族アミン、チオール、チオエーテル、スルフィド、ジスルフィド、チオアミド、チオン、アミド、イミド、イミン、イミノエーテルまたはアジドを含むことを特徴とする、請求項1〜18のいずれかに記載の方法。
- 1種またはそれ以上の物質が、アミノ酸、ペプチド、オリゴペプチド、ポリペプチド、蛋白質、免疫グロブリン、酵素、人工酵素、リン脂質、糖蛋白質、核酸、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチド、ポリヌクレオチド、ペプチド核酸、ペプチド核酸オリゴマー、ペプチド核酸ポリマー、アミン、アミノ配糖体の群から選ばれる物質であることを特徴とする、請求項1〜19のいずれかに記載の方法。
- 1種またはそれ以上の物質が、免疫グロブリン、酵素、抗体−抗原複合体の群から選ばれることを特徴とする、請求項20に記載の方法。
- 標識化された物質を、液状分析物の分析システムを使用して引き続き分析することを特徴とする、請求項1〜21のいずれかに記載の方法。
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