JP3520302B2 - ブラシノステロイド応答に関与する新規遺伝子 - Google Patents
ブラシノステロイド応答に関与する新規遺伝子Info
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Description
る。より詳細には、植物においてブラシノステロイドホ
ルモンに対する生理反応系における生体内情報伝達系を
制御する機能を有するタンパク質をコードする新規遺伝
子に関する。
よび植物のゲノムに遍在することが知られる変異誘発遺
伝子である。トランスポゾンは、その転移(trans
position)機構により2つのクラスに分類され
ている。クラスIIに属するトランスポゾンは、複製す
ることなくDNAの形態で転移する。クラスIIに属す
るトランスポゾンとして、トウモロコシ(Zea ma
ys)のAc/Ds、Spm/dSpmおよびMu要素
(Fedoroff、1989、Cell 56、18
1−191;Fedoroffら、1983、Cell
35、235−242;Schiefelbein
ら、1985、Proc.Natl.Acad.Sc
i.USA 82、4783−4787)、キンギョソ
ウ(Antirrhinum majus)のTam要
素(Bonasら、1984、EMBOJ、3、101
5−1019)が知られている。クラスIIに属するト
ランスポゾンは、トランスポゾン・タッギングを利用す
る遺伝子単離に広く利用されている。この技術は、トラ
ンスポゾンがゲノム上で転移して、ある遺伝子中に挿入
されると遺伝子の生理学的および形態学的変異が起こ
り、遺伝子が制御する表現型が変化することを利用す
る。この変化を検出することにより影響を受けた遺伝子
を単離する(Bancroftら、1993、The
Plant Cell、5、631−638;Cola
santiら、1998、Cell、93、593−6
03;Grayら、1997、Cell、89、25−
31;Keddieら、1998、The Plant
Cell、10、877−887;Whitham
ら、1994、Cell、78、1101−111
5)。
ロトランスポゾンとも呼ばれ、複製し、そしてRNA中
間体を介して転移する。クラスIトランスポゾンは、最
初、ショウジョウバエおよび酵母で同定され、そして特
徴付けられたが、最近の研究により植物ゲノム中に遍在
し、そのかなりの部分を占めていることが明らかにされ
ている(Bennetzen、1996、Trends
Microbiolo.、4、347−353;Vo
ytas、1996、Science、274、737
−738)。レトロトランスポゾンの大部分は、非移動
性の組み込みユニットであるようである。最近の研究
は、これらのいくつかが、創傷、病原体の攻撃および細
胞培養などのストレス条件下で活性化されることを示し
ている(Grandbastien、1998、Tre
nds in Plant Science、3、18
1−187;Wessler、1996、Curr.B
iol.6、959−961;Wesslerら、19
95、Curr.Opin.Genet.Devel.
5、814−821。例えば、タバコではTnt1Aお
よびTto1(Pouteauら、1994、Plan
t J.、5、535−542;Takedaら、19
88、Plant Mol. Biol.、36、36
5−376)、およびイネではTos17(Hiroc
hikaら、1996、Proc.Natl.Aca
d.Sci.USA、93、7783−7788)につ
いて、ストレス条件下における活性化が報告されてい
る。
は、最も良く研究されている植物中のクラスI要素であ
る。Tos17は、Ty1−copia群レトロ要素の
間の逆転写酵素ドメインの保存アミノ酸配列を基に作成
された縮重プライマーを用いたRT−PCR法によりク
ローン化された(Hirochikaら、1992、M
ol. Gen. Genet.、233、209−2
16)。Tos17は、4.3kbの長さの、2つの同
じ138bpのLTR(長鎖末端反復)および開始メチ
オニンtRNAの3’末端に相補的なPBS(プライマ
ー結合部位)を持つ(Hirochikaら、199
6、上述)。Tos17転写は、組織培養により強く活
性化され、そして培養時間とともにそのコピー数を増加
する。ゲノム研究のモデルジャポニカ品種である日本晴
では、Tos17の当初のコピー数は2であるが、組織
培養後、再生した植物では、5〜30コピーに増加して
いる(Hirochikaら、1996、上述)。酵母
およびショウジョウバエで特徴付けられたクラスIIト
ランスポゾンとは異なり、Tos17は、染色体中をラ
ンダムな様式で転移し、そして安定な変異を引き起こ
し、そしてそれ故、イネにおける遺伝子の機能解析のた
めの強力なツールを提供する(Hirochika、1
997、Plant Mol.Biol.35,231
−240;1999、Molecular Biolo
gy of Rice(K.Shimamoto編集、
Springer−Verlag、43−58)。
を用いて提供される植物新規遺伝子を提供する。
移したTos17コピーをもつ植物の表現型およびTo
s17標的部位の隣接配列の系統的な分析を鋭意重ねた
結果、Tos17挿入による短稈イネ変異体を発見し、
さらにこの変異の原因遺伝子をTos17を目印として
単離し、本発明を完成するに至った。
ロイドホルモンのシグナル伝達系を制御する遺伝子をコ
ードするポリヌクレオチドであって、配列表の配列番号
2の1位のMetから1057位のArgまでのアミノ
酸配列をコードするポリヌクレオチド、または該アミノ
酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換
もしくは付加されたアミノ酸配列をコードするポリヌク
レオチドを含む、ポリヌクレオチドに関する。
ネに由来する。
列表の配列番号2で示されるヌクレオチド配列を含む。
品質向上、成熟促進、ストレス緩和作用、薬剤耐性とい
った、植物においてブラシノステロイドホルモンが関与
する種々の効果を制御する方法に関する。
供される植物新規遺伝子を包含する、植物の改良方法を
提供する。
モンが関与する種々の効果を制御し得る植物遺伝子をコ
ードするポリヌクレオチドが提供される。本願明細書で
用いる用語「種々の効果を制御し得る」は、植物におい
て、ブラシノステロイドホルモンの働きに関係する、具
体的には、短稈化、草型の立性化、籾の形態異常を含
む、生長促進、増収効果、品質向上、成熟促進、ストレ
ス緩和作用、薬剤耐性といった効果を制御し得、それに
よってブラシノステロイドホルモン農薬処理と同様の多
くの農業上の有益な効果を得ることをいう。用語「植
物」は、単子葉植物、双子葉植物を包含する。
グナル伝達系を制御し得る植物遺伝子をコードするポリ
ヌクレオチドは、代表的には、配列表の配列番号2の1
位のMetから1057位のArgまでのアミノ酸配列
をコードするポリヌクレオチド、または該アミノ酸配列
において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしく
は付加されたアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチ
ドを含む、ポリヌクレオチドである。
与する種々の効果を制御し得る植物遺伝子をコードする
ポリヌクレオチドは、植物においてブラシノステロイド
ホルモンが関与する種々の効果を制御し得る限り、配列
表の配列番号2の1位のMetから1057位のArg
までのアミノ酸配列と、少なくとも80%の配列同一
性、好ましくは少なくとも85%の配列同一性、より好
ましくは少なくとも90%の配列同一性、さらにより好
ましくは少なくとも95%の配列同一性、最も好ましは
少なくとも99%の配列同一性を有するポリヌクレオチ
ドを包含する。用語「配列の同一性」は、対比される2
つのポリヌクレオチド配列が同一であることを意味し、
対比される2つのポリヌクレオチド配列間の配列同一性
の割合(%)は、対比される2つのポリヌクレオチド配
列を最適に整列させた後、同一の核酸塩基(例えば、
A、T、C、G、U、またはI)が両方の配列で生じて
適合した位置の数を得て適合位置数とし、適合した位置
の数を比較ポリヌクレオチド総数で除し、そして、この
結果に100を乗じて計算される。配列同一性は、例え
ば、以下の配列分析用ツールを用いて算出し得る:Un
ixベースのGCG Wisconsin Packa
ge(Program Manual forthe
Wisconsin Package、Version
8、1994年9月、Genetics Comput
er Group、575 Science Driv
e Madison、Wisconsin、USA53
711;Rice、P.(1996)Program
Manual for EGCGPackage、Pe
ter Rice、The Sanger Centr
e、Hinxton Hall、Cambridge、
CB10 1RQ、England)およびthe E
xPASy World Wide Web分子生物学
用サーバー(Geneva University H
ospitaland University of
Geneva、Geneva、Switzerlan
d)。
マイシン耐性等の薬剤耐性で選択され、ついで、常法に
より、植物体に再生され得る。
び以下で記載される実験室手順は、当該分野で周知で一
般的に用いられる手順を使用する。標準的な技術は、組
換え法、ポリヌクレオチド合成、ならびに微生物培養お
よび形質転換(例えば、エレクトロポレーション)につ
いて使用される。この技術および手順は、一般的に、当
該分野、およびこの書類を通じて提供される種々の一般
的な参考文献(一般的には、Sambrookら、Mo
lecular Cloning: A Labora
tory Manual、第2版(1989) Col
d Spring Harbor Laborator
y Press、Cold Spring Harbo
r、N.Y.を参照。これらは、本明細書中で参考とし
て援用される。
は、本明細書に記載の方法に従って得られるが、本発明
に開示された配列を基に、化学合成によっても得られ得
る。例えば、本発明のポリヌクレオチドは、Appli
ed Bio Systemsのポリヌクレオチド合成
機を用いて製造業者によって提供される仕様書に従って
合成され得る。
る(PCR Technology: Princip
les and Applications for
DNA Amplification、HA Erli
ch編、Freeman Press、NewYor
k、NY(1992);PCR Protocols:
A Guide to Methods and Ap
plications、Innis、Gelflan
d、Snisky、およびWhite編、Academ
ic Press、San Diego、CA(199
0);Mattilaら(1991) Nucleic
Acids Res. 19: 4967;Ecke
rt、K.A.およびKunkel、T.A.(199
1)PCRMethods and Applicat
ions 1: 17;PCR、McPherson、
Quirkes、およびTaylor、IRL Pre
ss、Oxford、これらは、本明細書中で参考とし
て援用する。
以下の実施例は、本発明の例示するものであって、本発
明は以下の実施例に限定されるものではない。
化 ジャポニカ種の変種日本晴またはあきたこまちの完熟種
子を出発材料に用い、先に記載のように(Hiroch
ikaら、1996、前述)カルス開始培養および細胞
懸濁培養を行った。遺伝子破壊を行うために用いたTo
s17の活性化は、大槻(1990)の方法(イネ・プ
ロトプラスト培養系、農林水産技術情報協会)に従って
行った。要約すれば、イネの完熟種子を2,4−ジクロ
ロフェノキシ酢酸(2,4−D)(2mg/ml)を添
加したMS培地(大槻(1990)、前述)で培養し
(25℃、1ヶ月間)、カルス誘導を行った。得られた
カルスを、2,4−Dを添加したN6液体培地(大槻
(1990)、前述)で5ヶ月間培養したのち、再分化
培地(大槻(1990)、前述)に移し再分化イネ(第
1世代(R1)植物)を得た。
それぞれの株から約1000個のR1種子を回収し、圃
場に展開し第2世代(R2)植物を得て形態分析を行っ
た。R2集団の各植物の表現型を観察した結果、あきた
こまちの1つの株A0369のR2集団の約1/4が図
1に見られるような「短稈化、草型の立性化、籾の形態
異常」様の表現型を示すことが観察された(図1)。あ
きたこまち再分化系統群では、野生型(図1A右および
1B右)に比べて、ブラシノステロイド非感受性変異体
(図1A左および1B左)では短稈化および草型の立性
化、ならびに籾の形態異常も観察された。表現型と連鎖
する転移Tos17の隣接配列の単離は、IPCR法
(Ochmanら、Genetics Nov;120
(3):621−3(1988)およびTriglia
ら、NucleicAcids Res Aug 2
5;(16):8186(1988))を用いて行っ
た。A0369の全DNAをXbaIにて消化し、大容
量の溶液中でライゲーション処理を行うことにより、自
己閉環化した。閉環化したことにより、隣接配列がTo
s17の内部配列にはさまれるため、Tos17の既知
配列に基づく外向きのプライマー(T17TAIL3;
GAGAGCATCATCGGTTACATCTTCT
C、T17−1950R;TCTAGCAGTCTCA
ATGATGTGGCG)対にて、通常のPCR法によ
り増幅された。
られた配列をもとに、日本晴の再分化イネ集団より、同
じ遺伝子の別の部位にTos17が挿入された系統をP
CRを用いて選抜したところ、同様に短稈化、草型の立
性化、籾の形態異常を呈する系統(NC6148)が選
抜された。すなわち、日本晴再分化系統群でも同様に、
野生型(図2A右および2B右)に比べて、ブラシノス
テロイド非感受性変異体(図2A左および2B左)では
短稈化および草型の立性化、ならびに籾の形態異常も観
察された(図2)。これら共通の変異は同じ遺伝子が破
壊されたことが原因であると結論された。
例2および3で得られたR2イネ(A0369およびN
C6148株の自殖後代)の集団から変異を示す個体と
正常個体とを識別し、それぞれからRNAを調製し、次
いでノーザン解析により発現特異性を解析した。変異を
示す個体と正常個体から得られたRNAを、アガロース
電気泳動後、ナイロンメンブレンに吸着させた。両変異
系統のTos17挿入部位より5’側部位(ゲノミック
シーケンス5775〜6638および3’側部位(ゲノ
ミックシーケンス8175〜8765)の配列をPCR
にて増幅して得られるDNA断片を32P−dCTPで標
識してプローブとして用いて、ノーザン解析により発現
特異性を解析した(図3)。図3Aに示されるノーザン
解析のオートラジオグラムに示されるように、矢印で示
されるバンド(約4.3kb)は野生型では観察された
すべての器官で発現が観察されたが、変異体ではTos
17の挿入によりサイズの異常な転写産物が見られ、本
体の機能が失われていることが明らかとなった(図3
B)。
例2で得られた配列をプローブとし、cDNAライブラ
リおよびゲノミックライブラリから、対応するcDNA
およびゲノミッククローンを得た。これらの構造を図
4、5に示した。この遺伝子は6つのエキソンおよび5
つのイントロンからなり、1057アミノ酸をコードす
る遺伝子であること、変異体ではTos17が第4エキ
ソンおよび第5エキソンに挿入されていることがわかっ
た。また、モチーフ検索の結果から、核移行シグナル1
(配列番号2のアミノ酸残基329〜367、Robb
ins & Dingwallコンセンサス配列、PS
ORTプログラムによる検索(http://psor
t.ims.u−tokyo.ac.jp/))および
核移行シグナル2(配列番号2のアミノ酸残基457〜
460、595〜600、4アミノ酸核移行パターンシ
グナル、PSORTプログラムによる検索(http:
//psort.ims.u−tokyo.ac.jp
/))の存在ならびにATP/GTP結合ドメイン(配
列番号2のアミノ酸残基526〜533、ゲノムネット
(http//www.genome.ad.jp/)
のモチーフ検索サービスによる)の存在が示唆されたこ
とから、この遺伝子はシグナル伝達に関わる遺伝子であ
る可能性が示唆された(図4)。
評価)本遺伝子が全植物体で発現していること、遺伝子
の破壊により多面的な影響を及ぼすこと、シグナル伝達
系に関わる因子である可能性のあることなどから、植物
ホルモンのシグナル伝達系に関わる因子であると推察し
た。草型の立性化という特性からブラシノステロイドホ
ルモンのシグナル伝達系ではないかと仮定し、ブラシノ
ステロイドホルモンの一種であるブラシノライドを用
い、ブラシノステロイドの応答性試験である、葉身屈曲
応答性試験を行った。暗黒下で発芽させたイネ第2葉を
切り取り、1ng/mlのブラシノステロイド溶液に4
8時間浸漬した。野生型の遺伝子を持つ野生型個体では
葉身・葉鞘接合部で屈曲が起こり(図5AおよびBのそ
れぞれ向かって左側)、ブラシノライドに対する応答を
示しているが、変異型固体ではほとんど屈曲せず(図5
AおよびBのそれぞれ向かって右側)、本遺伝子の破壊
により、ブラシノステロイドに対する応答性が失われた
ことを示している。以上の結果より、本遺伝子はブラシ
ノステロイドホルモンのシグナル伝達系に関与する遺伝
子であることが明らかとなった。
よび本発明の特定のオリゴヌクレオドがどのように作成
され、および利用されるのかを例示して記載している。
本発明の範囲を制限するものではない。
ドホルモンが関与する種々の効果を制御し得る新規ポリ
ヌクレオチドが提供される。当該ポリヌクレオチドを植
物に導入し、ブラシノステロイドホルモンが関与する種
々の効果を人為的に制御することにより、生長促進、増
収効果、品質向上、成熟促進、ストレス緩和作用、薬剤
耐性といった効果を制御し得、それによってブラシノス
テロイドホルモン農薬処理と同様の多くの農業上の有益
な効果を得ることが可能になると期待される。
os17挿入ブラシノステロイド非感受性変異体、およ
び野生型イネの植物体を示す写真である。向かって左
は、Tos17挿入ブラシノステロイド非感受性変異
体、そして右は、野生型の植物体である。(A)短稈化
および草型の立性化への影響、(B)籾の形態異常への
影響を示す。
7挿入ブラシノステロイド非感受性変異体、および野生
型イネの植物体を示す写真である。向かって左は、To
s17挿入ブラシノステロイド非感受性変異体、そして
右は、野生型の植物体である。(A)短稈化および草型
の立性化への影響、(B)籾の形態異常への影響を示
す。
こまち)の葉から抽出したRNAと、野生型イネ(日本
晴)の種々の器官から抽出したRNAのノーザン分析の
オートラジオグラムを示す図である。
したRNAと野生型イネから抽出したRNAのノーザン
分析のオートラジオグラムを示す図である。左は5’プ
ローブを使用したときの野生型および変異型の比較、右
は3’プローブを使用したときの野生型および変異型の
比較を示す。
生理反応系を制御する新規イネ遺伝子のアミノ酸配列
と、その中に見られる特徴的な配列を示す。核移行シグ
ナルおよびATP/GTP結合モチーフが見られる。
69)を用いた、ブラシノステロイド葉身屈曲実験の結
果の比較を示す。向かって左側は野生型、向かって右側
は変異型の結果を示す。
8)を用いた、ブラシノステロイド葉身屈曲実験の結果
の比較を示す。向かって左側は野生型、向かって右側は
変異型の結果を示す。
Claims (12)
- 【請求項1】 ブラシノステロイドホルモンのシグナル
伝達系に関与する植物遺伝子をコードするポリヌクレオ
チドであって、配列表の配列番号2の1位のMetから
1057位のArgまでのアミノ酸配列をコードするポ
リヌクレオチド、または該アミノ酸配列において1もし
くは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたア
ミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含み、 ここで、該遺伝子が欠損した植物は、短稈化、草型の立
性化、籾の形態異常様の表現型を示す、 ポリヌクレオチド。 - 【請求項2】 ブラシノステロイドホルモンのシグナル
伝達系に関与する植物遺伝子をコードするポリヌクレオ
チドであって、配列表の配列番号2の1位のMetから
1057位のArgまでのアミノ酸配列をコードするポ
リヌクレオチド、または該アミノ酸配列において1もし
くは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたア
ミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含み、 ここで、該遺伝子が欠損した植物は、ブラシノステロイ
ド非感受性である、 ポリヌクレオチド。 - 【請求項3】 イネ由来の、請求項1または2に記載の
ポリヌクレオチド。 - 【請求項4】 配列表の配列番号1で示される、請求項
1または2に記載のポリヌクレオチド。 - 【請求項5】 短稈化、草型の立性化、籾の形態異常様
の表現型を示す植物であって、配列表の配列番号2の1
位のMetから1057位のArgまでのアミノ酸配列
または該アミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ
酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列をコー
ドする遺伝子が、欠損している、植物。 - 【請求項6】 ブラシノステロイド非感受性植物であっ
て、配列表の配列番号2の1位のMetから1057位
のArgまでのアミノ酸配列または該アミノ酸配列にお
いて1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付
加されたアミノ酸配列をコードする遺伝子が、欠損して
いる、植物。 - 【請求項7】 配列表の配列番号2の1位のMetから
1057位のArgまでのアミノ酸配列をコードする遺
伝子が欠損している、請求項5または6に記載の植物。 - 【請求項8】 単子葉植物である、請求項5〜7のうち
のいずれか1項に記載の植物。 - 【請求項9】 イネである、請求項8に記載の植物。
- 【請求項10】 請求項1〜4のうちのいずれか1項に
記載のポリヌクレオチドが導入された、植物。 - 【請求項11】 単子葉植物である、請求項12に記載
の植物。 - 【請求項12】 イネである、請求項11に記載の植
物。
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