JP3416081B2 - ゴムの木から分離したイソペンテニル2リン酸異性化酵素及びこれを用いたゴムの製造方法 - Google Patents
ゴムの木から分離したイソペンテニル2リン酸異性化酵素及びこれを用いたゴムの製造方法Info
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Description
(Hevea Brasilienses)から分離したイソペンテニル2リ
ン酸異性化酵素とこれを用いてゴムを製造する方法に関
する。
きている生物に遍在し、細胞の構造、電子伝達、光合
成、細胞間の信号(情報)伝達、有機体間の相互作用に
おいて極めて重要な役割を果たす23,000個以上の
化合物を生産する(Ramos-Valdivia et al., 1997)。数
個の重要な化合物類はステロール、カロチノイド、ドリ
コール、ユビキノン、プレニル化された(prenylated)タ
ンパク質を含む、かかる複雑な経路から派生される(Hah
n and Poulter, 1995)。かかる化合物等の全ては同一な
ビルディングブロックであるイソペンテニル2リン酸(I
PP)から派生される。大部分の真核生物で、IPPはメ
バロン酸経路を経てアセチル−CoAの3分子等から合
成される(Chappell, 1995)。
路が細菌と植物とから発見された(Lichtenthaler et a
l., 1997: Romer et al.,1993)。かかる経路にはグリセ
ルアルデヒドリン酸、ピルビン酸塩(pyruvate)及びジハ
イドロキシアセトンリン酸のような3−炭素前駆体が用
いられる。IPP異性化酵素(IPI)は、IPPが高度の
親電子性異性体であるジメチルアリル2リン酸(DMAPP)
に相互転換することに触媒作用を行う。かかる二異性体
は、イソプレノイド化合物等の合成で基質として提供さ
れる。
センシャルオイル、薬剤、ゴム及びワックス等のような
植物化合物等の工業的な価値のため大きく注目される。
IPPとDMAPPの相互転換が同様なIPP異性化酵
素により触媒されるとしても、その平衡でDMAPPが
生産される(Sun et al., 1998)。かかる異性化反応は、
イソプレノイド生合成に対して速度を制限する段階であ
るだろう。外因性IPI遺伝子の発現は、大腸菌(E.col
i)でイソプレノイド生合成を増進させる(Kajiwara et a
l.,1997)。ブラジルゴムの木(H.brasiliensis)のHMG
CoA還元酵素に形質転換させた遺伝子導入タバコ植物
は、ステロールを対照群植物が生産する量の6倍まで過
剰生産する(Schaller et al., 1995)。
ン)は多くの工業的な用途において重要な生の原料であ
る。たとえば、約2,000種の植物からゴムが生産さ
れるが(Backhaus, 1985)、ブラジルゴムの木(H.brasili
ensis)がその木にゴムが豊富で品質が優良であり収穫し
やすいので、主に天然ゴムの工業的な源泉となってき
た。需要の増加によって、ゴム栽培院の面積の減少が、
ゴム生合成の研究と他のゴム源泉の開発に対する研究を
惹起させた。ゴム生合成の第1段階は、IPP異性化酵
素によりIPPがDMAPPに異性化する反応である。
ばれる酵素により触媒される5−炭素中間物質の連続的
なヘッド−ツ−テール(head-to-tail)縮合反応がゴムを
産出すると思われてきた。IPP異性化酵素の活性は、
ブラジルゴムの木(H.brasiliensis)のゴム乳液のC−漿
液から発見された(Koyama et al., 1996; Tangpakdeeet
al., 1997)。IPP異性化酵素の活性部位に直接的な
(site-directed)特異阻害剤である3,4−オキシド−
3−メチル−1−ブチル2リン酸(OMBPP)が存在する
と、in vitroのゴム分析でIPPがゴムに結合すること
を阻害する(Cornish, 1993)。
調節物質及び天然ゴムを含む全てのイソプレノイドの生
合成で必須的な段階であるIPPがDMAPPに転換す
る反応を触媒する。広範囲に多様な生物から酵素が研究
されてきた(Ramos-Valdiviaet al., 1997)。高等植物で
IPP異性化酵素は、カプシキュムクロモプラスト(Cap
sicum chromoplasts:Dogbo and Camara, 1987)、シンコ
ナロブスタ(Cinchonarobusta)の細胞懸濁液(Romos-Vald
ivia et al., 1997)及びブラジルゴムの木(H.brasilien
sis:Koyama et al., 1996)から精製され特徴付けられて
きた。現在まで高等植物のIPP異性化酵素の配列がほ
とんど文献に見られなかった。
な遺伝子はアラビドップシス(Arabidopsis:Campbell et
al., 1997)とクラキア種(Clarkia spp.:Blanc et al.,
1996;Blanc and Pichersky, 1995)の二つの開花植物に
対してのみ唯一に知られている。部分的な配列はタバコ
に関しても知られている(Accession No. Y09634)。しか
し、いずれの遺伝子もゴムの生合成に関連するか否かが
調査されていなかった。
ム生合成の第1段階であるので、IPP異性化酵素は、
ゴム生合成で重要な役割を果たす可能性がある。IPP
異性化酵素活性が、へベア(Hevea)乳液の根本とC−漿
液粒子から観察されたが(Tangpakdee et al., 1997)、
IPP異性化酵素でコード化されるcDNAとそのタン
パク質はへベアゴムの木から分離されるかは研究されな
かった。
得たプローブ(probe)を用いて乳液のcDNAライブラ
リーをスクリニングすることにより遺伝子をクローニン
グした。ゴム生合成でIPP異性化酵素が重大な役割を
果たすと考えられることにも拘わらず、その遺伝子は3
0〜50%(wt/wt)のシス−1,4−ポリアイソプレン
(ゴム)を含む乳液から豊富な転写物に発現されなかっ
たと思われる。私は個別的な研究で、ブラジルゴムの木
(H.brasiliensis)の乳液から遺伝子発現プロファイル(p
rofile)を研究するために、245の発現された配列タ
グ(ESTs)を得た(Han et al., 1999)。IPP異性化
酵素がコード化される遺伝子がESTs中から確認され
なかった。
106またはもっと小さいプラーク(plaque)をスクリー
ニングした最初の試みは、ハイブリダイジングcDNA
クローンを生産することに失敗した。2×106以上の
プラークをスクリーニングした後、2つのハイブリダイ
ジングクローンを得た。DMAPPがイソプレノイド生
合成される前駆物質であり、必ずイソプレノイドが合成
される細胞に存在するので、乳液でIPIHbの低い転
写水準は予想外の結果であった。
ブラリーを用いたIPP異性化酵素遺伝子を増幅するた
めに、アラビドップシスタリアナ(A.thaliana:Campbell
et al., 1997)のcDNAに基づいてPCRプライマー
(下流)を構成し、M13逆プライマー(上流)と共に
用いた。PCRによりIPP異性化酵素のコード化領域
の部分的な配列を増幅した。PCRにより遺伝子をクロ
ーンするために、配列情報から2個のPCRプライマー
(IPP-L1及びIPP-L2)をデザインし、ベクター(M13正及
び逆)プライマーと組み合せて用いた。IPP−L2
(下流)とM13逆(上流)プライマーとを用いたPC
R反応で、約700−bpの断片を産出した。
(下流)プライマーでは、増幅された生産物を得ること
ができなかった。700−bpのPCR断片は、アラビ
ドップシスタリアナ(A.thaliana)のcDNA配列と高い
相同性を示し、同じcDNAライブラリーをスクリーニ
ングするためにプローブとして用いられた。全部で2×
106のプラークをスクリーニングした。そのプラーク
等は、プローブにハイブリダイズされ、in vivo除去に
用いた。
むファージミッドとその遺伝子をIPIHbと命名し
た。そのDNA配列は1,288bpであり、予想分子
量が26.7kDaである234アミノ酸のペプチドを
コードする連続的なオープンリーディングフレーム(ope
n reading frame, ORF)を有する(配列番号1と配列番
号2)。推論されたタンパク質は、アラビドップシスタ
リアナ(A.thaliana)のIPP異性化酵素の等電点(pI=
6.0)より低い4.7の等電点を有し酸性である。
分析 IPP異性化酵素遺伝子のコピー数(copy number)を決
定するために、ハイブリダイゼーションプローブで70
0−bpのPCRで増幅したIPIHb断片を用いて、
サザンブロットハイブリダイゼーション分析を遂行し
た。ゲノムのDNAをBamHI、EcoRI及びXh
oIで消化した。かかる酵素等はIPIHbのコード化
領域内に制限部位を有しない。最低55℃と最高65℃
の厳しい条件下で、それぞれの制限分解物から2つのハ
イブリダイジングバンドが観察された(図1)。
ゴムの木から多重性遺伝子によりコード化されることを
暗示する。これは文献における観察結果を確認するもの
である。ケンベルらは、IPP異性化酵素をコードする
2つのcDNAクローンを報告した。その2つの遺伝子
は、小さい遺伝子族から派生されるものと推定した(Cam
pbell et al., 1997)。IPP異性化酵素の多重性イソ
フォーム(isoform)は、クラルキアブリウェリ(C.brewer
i:Blanc et al., 1996)とシンコナロブスタ(C.robusta:
Ramos-Valdivia et al., 1997)で説明している。
が知られていないが、IPI同質体の存在は、高等植物
らの一般的な特徴である。IPIHbのORF上流(ups
tream)と最近接して連続的な71−アミノ酸が存在する
ことは、副細胞の細胞小気管に的中される同質体(ら)
があるということを示す。
した。乳液のブロット(blot)からただ1つのハイブリダ
イジングバンド(10kb)が検出された反面、葉組織の全R
NAを含むブロットで異なる大きさの2つの転写物がプ
ローブにハイブリダイゼーションされた(図2)。傷処
理とIPP異性化酵素の誘導能力を試験するために、傷
付けたブラジルゴムの木から葉と乳液の試料とを得た(O
h et al.,1999)。傷付いた木の滲み出た乳液と葉組織か
ら抽出されたRNAの分析結果、傷がIPP異性化酵素
の発現水準を変化させないことを表した(図2)。
化酵素の機能分析 へベアIPP異性化酵素がコードされ、クローニングさ
れたcDNAを更に特徴付けるために、GST−IPI
Hb融合遺伝子を構成して、pGEX−IPIHbを生
産した。pGEXの発現システムは、粗細菌分解物(cru
de bacterial lysates)から融合タンパク質を簡単に精
製できる方法である。GST−IPIHb融合タンパク
質の発現と精製は、SDS−PAGEによりモニターし
た(試料は示さなかった)。IPP異性化酵素の酵素的
な活性は、細胞抽出物や精製されたGST−IPIHb
融合タンパク質を用いて分析した。対照群実験には、I
PTGにより発現誘導しない同一な細菌の抽出物やGS
Tタンパク質のみをコードするcDNAを運搬するpG
EXが注入された大腸菌(E.coli)の培養液を用いた。
合物で酸に不安定なアリル2リン酸から発生する放射能
の増加により確認した。図3の図示のとおり、酵素のな
い反応混合物に対して基本水準(basal level)の放射能
が観察された。IPTG誘導を行わない細胞の酵素を含
む反応混合物に対して、同様な基本水準の放射能が検出
された。その反対に、IPTGにより誘導された細胞の
精製されたGST−IPIHb融合タンパク質や粗抽出
物を含む反応混合物では、放射能の顕著な増加が観察さ
れた。精製されたGST−IPIHb融合タンパク質を
用いた時間経過実験で、酸に不安定な14Cアリル2リン
酸の放射能が、反応時間により増加することが明らかに
表れた(図4)。
タンパク質の反応混合物に添加された量によって放射能
が増加することが観察された(図5)。酸に不安定な14
Cアリル2リン酸から発生する放射能の時間と濃度によ
る増加は、GST−IPIHb融合タンパク質によるin
vitroIPPからDMAPPへの転換が発生されたこと
を示す。かかる結果は、本発明のcDNAクローンがG
ST−IPIHb融合タンパク質の部分として、機能的
なIPP異性化酵素をコードすることを示している。
酵素 新しいゴム鎖の形成は、GGPP、FPP、GPP及び
DMAPPのような開始分子にIPPが縮合されて発生
される。従って、in vitroゴム生合成の活性分析に対す
る一般的な手順で、反応混合物で開始剤であるアリル2
リン酸の中の1つが含まれる。ゴム生合成に対するIP
P異性化酵素の役割を試験し、分離されたcDNAが機
能性IPP異性化酵素をコード化することに関して更に
確認するために、開始剤であるアリル2リン酸を除去
し、WRPにIPP異性化酵素を添加した反応混合物を
用いて、in vitroゴムの生合成分析を実行した。
効果的な開始分子であるFPPが必要であることが明ら
かに表れた(図6)。GST−IPIHb融合タンパク
質に対する同一なcDNAクローンを有する非誘導性大
腸菌細胞の細菌抽出液を含む反応混合物は、[14C]I
PP結合の基本水準を示した。反対に、精製されたGS
T−IPIHb融合タンパク質とWRPを含む反応混合
物では、ゴムに[14C]IPP結合の顕著な増加が観察
された(図6)。
14C]IPP結合が観察されなかったし、WRPとGS
T−IPIHb融合タンパク質を含む反応混合物で放射
能が増加したことは、新しいゴム鎖の合成によるもので
ある。かかる結果は、本発明のcDNAクローンからコ
ード化されたGST−IPIHb融合タンパク質が、ゴ
ム生合成で5−炭素イソプレン基本単位の重要な活性段
階であるIPPからDMAPPへの転換において触媒と
して作用することを示す。
る能力があるDNA配列(IPIHb DNA配列)を分離し、
IPIHb DNA配列を含むハイブリッドベクターと
形質転換された宿主を提供する。本発明の範囲におい
て、“IPIHb”は、へベアブラシリエンシス(Hevea
brasiliensis)から分離されたIPP異性化酵素をい
う。ここで用いられる“ハイブリッドベクター(Hybrid
vector)”は、IPIHbを生産する能力があるへベア
やまたは他生物のDNAまたはcDNAを有するプラス
ミド、バクテリオファージ、植物ウイルスまたは他のベ
クター等からDNA結合(ligation)により形成されるベ
クターをいうものであり、そのような植物や他の生物
は、ここで総括的に“植物原料”という。
アの植物原料等は、cDNAを生産することに用いられ
る。cDNAライブラリーは、植物原料の全RNAから
分離されたmRNAの配列に基づいて構築される。cD
NAの第1本鎖は、分離されたmRNAを鋳型に用い、
オリゴdT配列をプライマー(primer)に用い、逆転写酵
素を用いて酵素により合成することができる。第1本鎖
のcDNAを構成した後、cDNAの第2本鎖は、第1
本鎖のcDNAを鋳型に用い、酵素としてDNAポリメ
ラーゼを用いて酵素により合成することができる。その
結果で生産された2重鎖のcDNA分子を適切なベクタ
ーに挿入して、cDNAライブラリーを生産する。
ーをIPIHb遺伝子に特異的な核酸プローブ(IPI
Hb遺伝子特異プローブ)を用いて、IPIHb遺伝子
の完全な配列に対してスクリーニングすることができ
る。IPIHb遺伝子を含む細胞を増殖させてIPIH
bをコードする多量のDNA配列を抽出することができ
る。本発明の好ましい実施形態において、IPIHb遺
伝子の同定のための核酸プローブは、IPP異性化酵素
の特異的プライマーを用いてcDNAライブラリーのP
CR増幅により生産される。
れた核酸プローブと、ハイブリダイゼーションした植物
cDNAまたは他の生物のcDNAを確認、分離するこ
とができる。分離されたDNAをベクターDNAに結合
してハイブリッドベクターを生産することができる。ハ
イブリッドベクターは、適切な宿主を形質転換し、宿主
からIPP異性化酵素の生産を誘導するのに用いられ
る。
胞に転移されるか宿主細胞を感染することができるし、
宿主細胞内で複製可能なプラスミドまたはウイルスであ
る。好ましい実施形態において、好ましいベクターの1
つは、ベクターDNAの重要でない領域に完全なIPI
Hb DNA配列を挿入して運搬することができる能力
を有するものである。
DNA配列を発現することができる能力を有するもの
である。好ましい実施形態で、好適な形質転換された宿
主は、IPPをゴムに転換する触媒作用ができないもの
である。そのような宿主は植物、細菌または真菌類であ
ってもよい。植物宿主は、タバコ(tabacco)種、草(gras
s)種または四季(perennial)植物種のような1年生植物
であってもよい。細菌は例えば大腸菌(E.coli)、バシル
ス種(Bacillus species)、またはアグロバクテリウム種
(Agrobacterium species)のような細菌であってもよ
い。真菌類はラクタリウス種(lactarius species)とア
スパージルス種(Aspergillus species)のグループから
選択される。
(promoter)の調節下で遺伝子を配置するように、IPI
Hb遺伝子を含むDNA断片を適切なプロモーターに結
合させることができる。適切なプロモーターは、形質転
換された宿主で機能することができる。例えば、形質転
換された宿主が植物であれば、ノパリン合成酵素(nopal
ine synthetase)に対するプロモーターであるPnos
のような植物プロモーターにIPIHb遺伝子を結合さ
せ、形質転換された宿主が細菌であれば、IPIHb遺
伝子を大腸菌(E.coli)のtrpまたはtacプロモータ
ーのような細菌性プロモーターに結合させる。選択的に
IPIHb遺伝子は、カリフラワーモザイクウイルスの
16Sと35Sプロモーターのようなウイルス性プロモ
ーターに結合させることができる。
DNAライブラリーの代わりにcDNAライブラリー
を、全RNAから分離されたmRNAを用いて構成す
る。全RNAは植物原料からクシらによる方法と実質的
に同一な方法で得る{Kush et al.Proc Natl Acad Sci U
SA 87, 1787-1790(1990)}。mRNAを分離するため
に、植物原料はゴムを合成する能力のある植物や生物か
ら得ることができる。例えばへベアの木が乳液からゴム
を生産するとしたら、IPIHbをコードするmRNA
をへベアの乳液から得ることができる。
3′末端に存在するポリ(A)グループが用いられる。
3′末端は、他のRNA種からmRNAを分離するのに
用いられる。セルロースカラムのT残基とmRNAのポ
リ(A)末端との結合によるオリゴ(dT)セルロース
カラムクロマトグラフィーで分離する。結合されないR
NAはカラムから遊離、洗滌され、mRNAはA−T結
合(duplex)を不安定にする緩衝溶液により溶出するこ
とができる。それからRNAの濃度は分光光度計で測定
する。分離されたmRNAは第1本のcDNA分子を合
成するための鋳型に用いられる。順次にcDNAの第1
本は、DNAの第2本を合成するための鋳型に用いられ
る{Sambrook et al., MOLECULAR CLONING, Cold Spring
Harbor, N.Y. 1987}。
のDNAの重要でない領域に完全な遺伝子を有すること
ができるし、宿主細胞から複製する能力のある適合した
ベクターはDNA断片と結合して、組換えDNA分子の
ライブラリーを産出することができる。かかる組換え分
子を試験管パッケージング(packaging)し、組換えクロ
ーンからなる感染性ファージストック(phage stock)が
得られる。cDNAライブラリーがcDNAを発現すれ
ば、かかる方法により構成された組換えDNAライブラ
リーを、核酸プローブや抗体を用いたゴム生合成で重要
な他の遺伝子らとIPIHb遺伝子の分離に用いること
ができる。
ーブは、例えば従来の技術によるバイオチンの一部分
や、3′または5′末端に[.sup. 32P]−リン酸により
プローブをラベリングすることによって、非常に少量の
遺伝子を検出するために修飾することができる(Sambroo
k et al., MOLECULAR CLONING, Cold Spring Harbor,
N.Y. 1987)。放射能の標識は通常、ニューイングランド
ヌクレアまたはアアーマシャム社の有用な3′または
5′末端ラベリングキット(labeling kit)を用いて遂行
する。DNAライブラリーで、IPIHb遺伝子は、ラ
ベルされたプローブとハイブリダイゼーションして同定
することができる。
ライブラリーを含む組換えλファージは、[.sup.32P]で
ラベルされたIPIHbの特定オリゴヌクレオチドを用
いて、サムブルックら(Sambrook et al., loc.cit.)の
方法によりスクリーニングする。
子の特異プローブと陽性反応するクローンを分離し、c
DNAライブラリーキットによるプロトコル(protocol)
によって、in vivo除去によりプラスミド内に転換させ
る。ファージDNAをプラスミドに転換させるこのよう
な方法は、へベアcDNAライブラリーがそのようなin
vivo除去のためにデザインされたストラタジン社(Stra
tagene)のユニ−ザップIIベクター(Uni-ZAP II vecto
r)内に構成される時に実行することができる。そのプラ
スミドはかかる遺伝子を多量に生産するために、大腸菌
(E.coli)に転移され保全される。IPIHb遺伝子を有
するプラスミドを含んでいる大腸菌細胞らを増殖して、
多量のIPIHb DNA配列を生産する。かかるDN
Aを従来の技術に形質転換された宿主から抽出すること
ができる。
(IPIHb)をコードするDNA配列と、組換えDNA分子
及び組換えタンパク質の生産方法、配列を含むベクタ
ー、生産された組換えタンパク質の培養及び、組換えタ
ンパク質の生産に重要な物質等に関する。ゴム生合成に
対して、事実上IPIHbのような生物学的な活性を有
するタンパク質またはIPIHbをコードするDNA配
列を提供する。
離された組換えベクターを、他の真核または原核生物の
宿主に転移することができるし、その宿主の中でIPI
HbDNAが発現されてゴムの生合成のための機能性I
PIHbを生産する。
に詳しく例示するためのものであり、本発明の範囲を制
限するものではない。
所で成長した成熟されたゴム植物ら(H.brasiliensis cl
one RRIM600)から乳液と葉の試料を得た。ゴムの木に刀
で傷付けて滲み出る乳液を、室温や氷で同一嵩の2×R
NA抽出緩衝溶液(0.1Mトリス−塩酸、0.3M塩化リチウ
ム、0.01M EDTA、10% SDS, pH9.5)に継続的に混合しな
がら受け取った(Han et al., 1999)。収集した試料を液
体窒素で冷凍させ、ドライアイスに入れて実験室に輸送
した。
ニキット(Qiagen Rneasy Plant Minikit)を用いて乳液
からRNAを抽出した(Oh et al., 1999)。キアゼン社
のオリゴテックス−dTTM mRNA(Oligotex-dTTM m
RNA kit)を用いてポリ(A)+RNAを分離した。
b)のPCR増幅 乳液のcDNAライブラリーを鋳型に用いてPCR増幅
を遂行した。アラビドップシスIPP異性化酵素の+6
06bp〜+629bpの配列に相応するPCRプライ
マー(IPP-A2)をデザインした。IPIHb cDNAの
断片を増幅するのに用いたプライマーは、IPP−A2(5'-G
TAATCAAGTTCATGCTCTCCCCA-3')とM13逆プライマーで
ある。PCRは、72℃で5分間熱で前処理し、94℃
で30秒、55℃で30秒、72℃で30秒間、30回
繰り返し、72℃で7分間にかけて最後増幅して遂行し
た。
って、キアゼン社のキエックスIIアガロスゲル抽出キ
ット(QUAEX Agarose Gel Extraction Kit)で精製した。
精製されたPCR生成物をプロメガ社(Promega)のpG
EMR−Tベクターに挿入した。プラスミドを変種XL
1−ブルー大腸菌(E.coli)に形質転換させて分離し、配
列を確認した。へベアIPP異性化酵素のPCRで増幅
された配列に基づいて、下流プライマーでIPP−L1
(5'-TATGAGCTACTCCTTCAGCAACGCTCT-3')とIPP−L2
(5'-ATCAAGTTCATGCTCTCCCCACTTTCC-3')の二プライマー
をデザインした。IPP−L1とIPP−L2プライマ
ーをそれぞれM13正(forward)及び逆(reverse)プライ
マーと共に用いた。
リーニング 前記説明のとおり、乳液から得たポリ(A)+RNAを
用いて、ストラタジン社のユニ−ザップIIベクター内に
cDNAライブラリーを構築した。乳液cDNAライブ
ラリーから部分的なIPP異性化酵素断片を増幅するた
めに、プライマー(IPP-L2、下流)とM13逆プライマ
ー(上流)を用いた。乳液cDNAライブラリーの2×
106プラークをスクリーニングするために、700−
bp PCR生成物を用いた(Oh et al., 1999)。プロ
ーブにハイブリダイゼーションされたcDNAクローン
を、cDNAライブラリーキットによるプロトコルによ
ってin vivoで除去し、配列を確認した。完全なcDN
A挿入物を有するクローンを分離してIPIHbと命名
した。
タ分析 プロメガ社のウイザードプラスSVミニプレップスDN
A精製システムキット(WizardR Plus SV Minipreps DNA
Purification System kit)を用いて、アルカリ溶解方
法(Sambrook et al., 1989)により塩基配列反応に対す
るプラスミドDNAを得た。蛍光性染料でラベルされた
M13正または逆プライマー(キットにより提供され
た)を用いて、ファーマシア社(Pharmacia Biotech)の
アルフエキスプレス自動判読塩基配列キット(ALF Expre
ss Auto Read Sequencing kit)により塩基配列反応を遂
行した。パーキンエルマー社(Perkin Elmer Co.)のAL
F自動シークエンサー(ALF automatic sequencer)で電
気泳動して塩基配列を得た。
で傷付けたゴムの木から乳液と葉の試料を得た(Oh et a
l., 1999)。
析 成熟したブラジルゴムの木(H.Brasiliensis RRIM600)の
葉組織のゲノムDNAを得た(Oh et al., 1999)。ゲノ
ムのDNA(8−10μg)を好ましい制限酵素で消化
し、0.8%(w/v)のアガロースゲルで電気泳動して、
サイズ別に分別しブロッティングして、UV放射でアマ
ーシャム社(Amersham Life Science)のハイボンド−N
(Hybond-N)ナイロン膜に交差結合(cross-link)した。ノ
ーザンブロットでは20μgの全RNAを1.2%アガ
ロース−フォームアルデヒドゲルで電気泳動し、サザン
ブロットでのように交差結合した。2つのハイブリダイ
ゼーションのためのプローブは、PCRで得た32Pで標
識した700-bpのIPIHbcDNAの断片を用いた。
5℃で18時間の間0.9M塩化ナトリウム、50mM
リン酸ナトリウム(pH7.6)、5mM EDTA、
0.4%(w/v)SDS、5×デンハルツ溶液(Denhardts
solution)、200μg鮭の精虫(salmon sperm)DNA
でハイブリダイゼーションした。厳しく最低55℃また
は最高65℃で0.5×SSPE、0.1%SDSで2
回、そして0.1XSSPE、0.1%SDSで2回ず
つブロット(blot)を洗滌した。その膜を−70℃でX−
rayフィルムに一晩中露出した。
誘導性発現ベクター)のEcoRI−XhoI部位にク
ローニングしてpGEX−IPIHbを構成した。pG
EX−IPIHbに形質転換された大腸菌XL−1ブル
ーを、50mg/Lのアンピシリンが含まれたルリアブロ
ス(Luria Broth;LB)で強く通気して、30℃で中央停止
相(mid-stationary phase)まで培養した。0.1mMの
濃度となるようにIPTGを培養液に添加してから、更
に6時間の間培養した。以降の全ての段階は4℃で遂行
した。
を0.1Mのリン酸カリウム(pH7.4)により洗滌
してから超音波で粉砕した。0.1Mのリン酸カルシウ
ム(pH7.4)を含む1mlの緩衝溶液で30秒間超
音波処理することを、30秒間隔で6回にかけて繰り返
した。均質された試料を10分間10,000Xgで遠
心分離し、その上澄液をレムリの標準方法(laemmli, 19
70)によって12.5%のスラブゲール(slab gels)によ
りSDS−PAGEした。タンパク質をクーマッシブリ
リアントブルーR−250(Coomassie Brilliant Blue
R-250)で染色した。ファーマシア社のグルタチオンセ
ファロス4B親和性マトリクス(Glutathione Sepharose
4B affinity matrix)を用いてその融合タンパク質を親
和性精製した。
を実施した(Satterwhite, 1985)。反応混合物は総嵩5
0μlでpH7.5、100mMトリス−塩酸、1.5
mM塩化マグネシウム、1.5mM塩化マンガン、2m
M DTT、25mM KF、20μMアーマシャム社
の[14C]IPP(55mCi mmol-1)及び適当量の酵素液を含
む。30℃で10分間反応してから200μLのメタノ
ール:塩酸(4:1、v/v)と0.1μLの水を添加して、
37℃で15分間反応を進行させた。アリル生成物を2
X200μlのトルエンで抽出した。混合性の抽出物を
ベックマン社(Beckman)のレディーソルブシンチレーシ
ョンカクテル(Ready Solv HP scintillation cocktail)
4mlと混合し、ベックマン社のLS6500液体シン
チレーションカウンターを用いて放射能を測定した。
り返して洗滌されたゴム粒子(WRP)を備えた(Cornish an
d Backhaus, 1990;Siler and Cornish, 1993)。反応混
合物の試験管内のゴム生合成活性を、前に説明した方法
により測定した(Cornish and Backhaus, 1990; Siler a
nd Cornish, 1993)。pH7.5、100mMトリス−塩
酸、80μMアマーシャム社の[14C]IPP(55mCi mmol
-1)、20mM FPP、1mM硫酸マグネシウム及び
1mM DTTを含む50μlの反応混合物にWRPを添加
して、25℃で6時間の間反応させた。
割を調査するために、ゴム生合成の有用な開始分子であ
るFPPを反応混合物から除去し、その代わりにIPP
をゴム生合成の開始分子の中の1つであるDMAPPに
転換させるために、適当量のIPP異性化酵素を添加し
た。対照群にはゴム転移酵素活性に必要なMg2+イオン
と、キレートを形成する25mMのEDTAとを反応混
合物に添加した。その結果で生成された[14C]IPPが
結合されたゴム量を、ろ過法またはベンゼン抽出法によ
り測定した。
hatman)の0.02または0.1μmのアノディスク膜
(anodisc membrane)を通してろ過し、そのフィルターを
1Mの塩酸と95%のエタノールで多数回にかけて洗滌
して、洗滌されたフィルターに残在している放射能を、
ベックマン社の液体シンチレーションカウンターにより
測定した(Cornish and Backhaus, 1990)。ベンゼン抽出
法では、反応混合物を2倍嵩のベンゼンで3回にかけて
抽出し、ベンゼン抽出物をベックマン社のレディーソル
ブシンチレーションカクテルと混合して、液体シンチレ
ーションカウンターにより放射能を測定した。
fragment)を以て試験したブラジルゴムの木(H.brasilie
nsis)の葉ゲノムのDNAのサザンブロットを示したも
ので、ここでレーンB、E及びXは、それぞれBamH
I、EcoRI、XhoIを以て全体DNAを消化した
ことに相応する。
ロット分析を示したもので、ブラジルゴムの木(H.brasi
liensis)の葉と乳液から分離した全RNAを32Pで標識
されたIPIHb cDNAの内部断片とハイブリダイ
ゼーションした。図2において、下部の図面は、全RN
Aと同一量をローディング(loading)するブロッティン
グ(blotting)前の紫外線下で臭化エチジウムで染色され
たrRNAを示す。レーンCとTは、それぞれ処理しな
い対照群と傷付いた試料に相応する。傷の影響のため
に、5個のブラジルゴムの木(H.brasiliensis)は、切り
取った斜面に沿ってその上に6個のネール(nail)で傷付
けた反面、他の5個の対照群の木には傷付けなかった。
傷付けた後約16時間となった時、それぞれの木から乳
液と葉の試料を採取した。
を図示したもので、5μLの酵素液と20μMの
[14C]IPPを含む50μLの反応混合物でIPP異
性化酵素の分析を施し、酸に不安定な生成物の放射能を
液体シンチレーションカウンター(liquid scintillatio
n counter)で測定した。それぞれの値は、3回実験の平
均値;酵素なし(No enzyme)は細胞培養液抽出物がない
もの;C−クルード(C-crude)は、IPTGの誘導なく
GST−IPIHb融合タンパク質を発現する細菌性細
胞の抽出物;クルード(Crude)はIPTGを誘導する細
胞培養液の抽出物;C−精製(C-purified)はIPTGを
誘導しない細胞の精製されたGST−IPIHb融合タ
ンパク質;精製(Purified)はIPTGを誘導する細胞の
精製されたGST−IPIHb融合タンパク質である。
の酵素活性を示したもので、5μLの精製されたGST
−IPIHb融合タンパク質を含む50μLの反応混合
物で時間経過実験に対するIPP異性化酵素の分析を遂
行し、酵素量を異にして10分間反応を進行させた。図
5は、濃度によるIPP異性化酵素の酵素活性を示した
もので、5μLの精製されたGST−IPIHb融合タ
ンパク質を含む50μLの反応混合物で時間経過実験に
対するIPP異性化酵素の分析を遂行し、酵素量を異に
して10分間反応を進行させた。
PP異性化酵素の影響を示したもので、伸長するゴム鎖
への[14C]IPPの結合をゴム生合成に効率的な開始
分子であるFPPなく、10mgのWRPと5μLの指
示された酵素液を含む50μLの反応混合物で測定し
た。それぞれの値は、3回実験の平均値;WRPはWR
Pのみでゴム分析したもの;WRP+FPPはWRPと
FPPで分析したもの;−WRPはWRPなく精製され
たGST−IPIHb融合タンパク質で分析したもの;
C−精製(C-purified)はIPTGを誘導しない細胞の精
製されたGST−IPIHb融合タンパク質とWRPで
分析したもの;精製(Purified)はIPTG誘導性細胞の
精製されたGST−IPIHb融合タンパク質とWRP
で分析したものである。
合成に重要な役割を果たすブラジルゴムの木(Hevea Bra
siliensis)から分離したIPP異性化酵素と、これを用
いてゴムを製造する方法を提供する利点がある。
ルゴムの木の葉ゲノムのDNAのサザンブロットの結果
を示したものである。
果を示したものである。
ものである。
を示したものである。
したものである。
酵素の影響を示したものである。
Claims (2)
- 【請求項1】配列1に記載されたアミノ酸配列を有する
へベアIPP異性化酵素をコードする核酸分子を提供す
る段階と、前記の核酸分子を宿主細胞に転移して形質転
換された宿主細胞を生産する段階と、前記の形質転換さ
れた宿主を適切な培地に培養してIPIHbを生産し、
前記のIPIHbを用いてin vitroのゴム合成を促進す
る段階からなるin vitroゴムの製造方法。 - 【請求項2】配列1に記載の核酸配列を有する核酸分子
を提供する段階と、前記の核酸分子を宿主細胞に転移し
て形質転換された宿主細胞を生産する段階と、前記の形
質転換された宿主を適切な培地に培養してIPIHbを
生産し、前記のIPIHbを用いてin vitroのゴム合成
を促進する段階からなるin vitroゴムの製造方法。
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