JP2747141B2 - 安定性が改良された変異型大腸菌リボヌクレアーゼh - Google Patents

安定性が改良された変異型大腸菌リボヌクレアーゼh

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Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、安定性が改良された変
異型大腸菌リボヌクレアーゼH、該変異型大腸菌リボヌ
クレアーゼHをコードしている遺伝子、該遺伝子を含有
し、大腸菌内で発現可能な発現ベクター、該発現ベクタ
ーを含有している形質転換体、および該形質転換体を用
いて変異型大腸菌リボヌクレアーゼHを製造する方法に
関する。
【0002】
【従来の技術、および発明が解決しようとする課題】大
腸菌の天然型リボヌクレアーゼH(本明細書に於いて
は、単にリボヌクレアーゼH、またはRNaseHと称す
る場合は、天然型の大腸菌リボヌクレアーゼHを意味す
るものとする)は155アミノ酸からなる分子量約19
Kdの加水分解酵素であって、DNA/RNAハイブリ
ッドのRNA鎖のみを特異的にエンド作用で切断すると
いう基質特異性を有する。この酵素は、その基質特異性
に基づき、下記の如き様々な用途を有し、極めて利用価
値の高い酵素として注目されている。 1) cDNAのクローニングの際の鋳型mRNAの除去。 2) mRNAのポリA領域の除去。 3) RNAの断片化。
【0003】リボヌクレアーゼHの重要性は遺伝子工学
の発展に伴ってますます増大すると思われるが、この酵
素は、大腸菌内での産生量が極めて低いことから、組換
えDNA技術による該酵素の生産が試みられており、既
にBRL、ファルマシアおよび宝酒造等から、組換えD
NA技術により生産されたリボヌクレアーゼHが供給さ
れている。これらの市販の組換えリボヌクレアーゼH
は、大腸菌を宿主として生産されるものである(金谷
ら、ジャーナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリ
ー、264、11546−11549(1989))。
【0004】このように利用価値の高いリボヌクレアー
ゼHの安定性、例えば変性剤や熱に対する耐性を高める
ことができれば、従来の組換えリボヌクレアーゼHでは
利用できなかった条件下での利用が可能となる。
【0005】これまでに、本発明者らは組換えDNA技
術を用いて、天然型リボヌクレアーゼHよりも高い安定
性を有する変異型リボヌクレアーゼHを製造したが、そ
の安定化の程度は十分満足し得るものではなかった(特
願平01−284454、特願平03−197703、
特願平03−158332)。また、安定性の改良され
た変異型リボヌクレアーゼHの中には酵素活性が低下し
たものもある(特願平03−197707)。また、大
腸菌リボヌクレアーゼHよりも極めて高い安定性を有す
る好熱菌リボヌクレアーゼHの大腸菌による製造法も報
告されているが(金谷ら、第2回日本蛋白工学会年会プ
ログラム・要旨集(1990)、69頁;特願平02−
111065)、大腸菌を用いて産生された好熱菌リボ
ヌクレアーゼHの酵素活性は大腸菌リボヌクレアーゼH
よりも低いものであった。尚、後者の場合、精製には尿
素を用いて可溶化するという操作が必要であり、大腸菌
リボヌクレアーゼHの場合に較べてその製造方法が複雑
であるという欠点もあった。従って、より酵素活性、安
定性にすぐれた酵素であって、その製造および精製も好
熱菌リボヌクレアーゼHよりも容易である変異リボヌク
レアーゼHをつくることができれば、産業上より利用価
値が高いと考えられる。
【0006】
【課題を解決するための手段】本発明者らは上記の観点
から、大腸菌リボヌクレアーゼHの酵素活性を保持しな
がら、その安定性を高めることを目的として、好熱菌リ
ボヌクレアーゼHのアミノ酸配列を参考にして種々の改
変を試みた結果、該酵素の遺伝子に部位特異的変異を導
入することにより該酵素の第95番目のLys(リシン)
をGly(グリシン)に置換した変異体が、天然型のリボ
ヌクレアーゼHよりも熱に対する安定性が優れているこ
とを見い出し、かつ、その酵素活性も天然型リボヌクレ
アーゼHとほぼ同等であることを確認し、本発明を完成
するに至った。
【0007】即ち、本発明は、天然型大腸菌リボヌクレ
アーゼHの第95番目のLysがGlyで置換されたアミノ
酸配列からなる変異型大腸菌リボヌクレアーゼHを提供
するものである。
【0008】また、本発明は、天然型大腸菌リボヌクレ
アーゼHの第95番目のLysをコードしているコドン、
AAAがGlyをコードするコドンに変換されている変異
型リボヌクレアーゼH構造遺伝子を提供するものであ
る。また、本発明は上記変異型リボヌクレアーゼHを大
腸菌で発現させるための発現ベクターを提供するもので
ある。
【0009】また本発明は、上記の発現ベクターで形質
転換された変異型リボヌクレアーゼH産生性の形質転換
体を提供するものである。さらに本発明は、該形質転換
体を培養することにより、高い安定性を有する変異型リ
ボヌクレアーゼHを製造する方法を提供するものであ
る。大腸菌を用いての遺伝子操作法は成書(Maniatis
ら、Molecular Cloning(1982):A Laboratoy M
anual, Cold Spring HarborLaboratoy)に詳述され
ており、上記変異型リボヌクレアーゼH構造遺伝子、発
現ベクター、形質転換体は、この成書に記載の一般的手
法に従って、例えば後記実施例に示した様に常法通り作
製することができる。尚、本発明の発現ベクターは、大
腸菌内で機能するものであれば特に制限はないが、バク
テリオファージλのPLおよびPRプロモーターの支配下
に上記変異型リボヌクレアーゼH遺伝子を含有している
ものが好ましい。
【0010】
【発明の効果】本発明により安定性が高められた変異型
大腸菌リボヌクレアーゼHは、従来のリボヌクレアーゼ
Hでは変性してしまう高い温度下でさえも変性すること
がない(実施例3参照)ので、このような条件下での取
扱いが可能である。さらに、本発明の変異型大腸菌リボ
ヌクレアーゼHは、耐久性等も向上していると期待さ
れ、従来のリボヌクレアーゼHよりも失活しにくく、安
定に保存することができるので、取り扱いが容易になる
ことは理解されるであろう。また、本発明の変異型大腸
菌リボヌクレアーゼHは天然型リボヌクレアーゼHと同
等の酵素活性を有し、これを用いることにより、天然型
リボヌクレアーゼHと同量で、ほぼ同等の酵素活性を得
ることができる。
【0011】以下に実施例を挙げて本発明をさらに詳細
に説明する。以下に述べる遺伝子操作の一般的手法は、
マニュアル書(Maniatisら、Molecular Cloning(19
82): A Laboratoy Manual, Cold Sping Harbor
Laboratoy)および試薬の仕様書に従った。
【0012】実施例1 プラスミドpJK95Gの作製 プラスミドpJK95Gの作製の概略を図1に示す。ま
ず、天然型リボヌクレアーゼHの大腸菌での発現プラス
ミドpAK600(特開平03−065188参照)のr
nh遺伝子を鋳型とし、プライマーを用いてPCR法によ
りrnh遺伝子への点突然変異の導入を行った。
【0013】プライマーとしては、図2に示す化学合成
したオリゴヌクレオチドを用いた。図1および図2に示
すように、まず、pAK600を鋳型DNAとし、Sph
Iの制限酵素部位を含む5'−プライマー(1)と変異導
入用3'−プライマー(4)により約300bpのDNA断
片を、また、変異導入用5'−プライマー(3)とSalI
部位を含む3'−プライマー(2)により約250bpのD
NA断片をそれぞれPCR反応により増幅し、遺伝子断
片2種を得た。PCR反応は市販のGene AmpKit(Ta
kara)の説明書に従って行った。得られた約300bpの
遺伝子断片を制限酵素SphIおよびPstIで、約250
bpのDNA断片を制限酵素PstIおよびSalIで消化し
た後、消化物を1.5%アガロースゲル電気泳動にか
け、それぞれ約300bp、約250bpのDNA断片を得
た。このうち、約250bp断片には変異導入部位が含ま
れる。
【0014】次に、このようにして得られた変異遺伝子
断片を、大腸菌での発現ベクターにサブクローニング
し、発現ベクターを作製した。プラスミドpJLA50
4(ドイツ:Medac社より購入)をSphIおよびSalIで
消化し、約4.9kbの断片を0.7%アガロース電気泳動
により精製した後、上記約300bp、約250bpの変異
rnh遺伝子SphI−SalI断片とライゲーションするこ
とにより環化した。ライゲーションは市販のライゲーシ
ョンキット(Takara)を用い、添付の説明書に正確に従
って行った。このようにして得られたプラスミドで大腸
菌HB101株を形質転換し、形質転換体より変異型リ
ボヌクレアーゼH発現用プラスミドベクターpJK95
Gを得た。
【0015】上記のようにして得られた形質転換菌エシ
エリシア・コリ(E.coli)HB101/pJK95Gは工
業技術院微生物工業技術研究所に寄託されている(微工
研菌寄第12495号、受託日:平成3年9月10
日)。
【0016】実施例2 変異型リボヌクレアーゼH(K
95G)の大腸菌における生産と精製 大腸菌形質転換体HB101/pJK95Gを100μg
/lのアンピシリンを含むLB培地500ml中、30℃
で振盪培養した。培養液の濁度がクレット値で約100
まで生育した時点で、培養温度を42℃に上げ、更に
3.5時間振盪を続け、次いで遠心して集菌した。この
時のクレット値は約250であった。
【0017】得られた菌体を1mM EDTAを含む10
mMトリス塩酸緩衝液(TE)(pH7.5)15mlに懸濁し
た後、氷中で超音波処理により菌体を破砕した。15,
000rpmで30分間、4℃で遠心して得た遠心上清(粗
抽出液)を、TE(pH7.5)5lに対して4℃で一夜透析
した。透析後の粗抽出液を同緩衝液で平衡化したDE−
52カラム(5ml)およびP−11カラム(2ml)にこの順
序で通した。この条件下、変異型リボヌクレアーゼH
(K95G)は、DE−52カラムを素通りし、P−11
カラムに吸着する。TE(pH7.5)を4ml流した後、N
aCl濃度を0.5Mまで直線的に上昇させることにより
P−11カラムから変異型リボヌクレアーゼH(K95
G)を溶出させた。変異型リボヌクレアーゼH(K95
G)を含むP−11溶出画分をまとめ、精製標品とし
た。精製標品は15%SDS−PAGEで単一バンドを
与え、逆相HPLCでも単一ピークを示した。精製収量
は54.2mg/l培養液であった。精製標品の同定は、ア
クロモバクタープロテアーゼIにより消化して得られる
ペプチドフラグメントを逆相HPLCでマッピングして
各フラグメントピークの溶出位置を確認するとともに、
95位のアミノ酸を含むペプチドを分取後アミノ酸配列
分析により行った。
【0018】得られた精製標品の0.1M NaClを含む
10mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5.5)中における2
00〜250nmでのCDスペクトルは天然型と同一であ
り、CDスペクトルで検出できるような2次構造の変化
は見られなかった。また、以下の方法により酵素活性を
測定し、比活性を測定したところ、得られた変異型酵素
は23U/mgの比活性を有しており、天然型酵素の約1
20%の酵素活性を保持していた。得られた比較結果を
以下の表1に示す。
【0019】活性は、[3H]−M13DNA/RNAを
基質として用い、37℃、1分間に1μmolの酸可溶性
物質を遊離する酵素活性を1ユニット(U)と定義した。
タンパク量は変異型リボヌクレアーゼHと天然型リボヌ
クレアーゼHとが同じ吸光係数を持つという仮定のもと
にε280=1576M-1・cm-1を用いて280nmにおけ
る吸光度を測定することにより求めた。
【表1】 天然型と変異型リボヌクレアーゼHの酵素活性の比較 酵素名 比活性(U/mg) 天然型リボヌクレアーゼH 20 変異型リボヌクレアーゼH(K95G) 23
【0020】実施例3 変異型リボヌクレアーゼH(K
95G)の安定性の評価 天然型リボヌクレアーゼHと変異型リボヌクレアーゼH
(K95G)の熱安定性について測定し、比較した。測
定はpH5.5での変性の割合を220nmにおけるCD値
で熱変性曲線を測定することにより行った。熱変性実験
は光路長2mmのセルを用い、1M塩酸グアニジンおよび
1mMジチオトレイトール(DTT)を含む20mM酢酸
ナトリウム(pH5.5)中で行った。変異型リボヌクレ
アーゼH(K95G)の熱変性曲線は天然型の熱変性曲
線よりも高温側へシフトしており、明らかに熱安定性が
増加していた。全体の50%が変性するときの温度を比
較すると変異型リボヌクレアーゼH(K95G)は天然
型よりも6.8℃安定化していた。得られた結果を以下
の表2に示す。
【表2】 天然型および変異型リボヌクレアーゼHの熱安定性の比較 酵 素 名 50%変性するときの温度(℃) 天然型リボヌクレアーゼH 51.9 変異型リボヌクレアーゼ(K95G) 58.7
【0021】以上の結果から、天然型大腸菌リボヌクレ
アーゼHの第95番目のLysをGlyに変換することによ
り、熱に対する安定性が向上することが確認された。
【図面の簡単な説明】
【図1】 プラスミドpJK95Gの構築を示す模式図
である。
【図2】 部位特異的突然変異を導入するための合成オ
リゴヌクレオチドを示す模式図であり、図中、下線は制
限酵素部位を、●印は変異アミノ酸に対応する塩基(G
ly95に対応する塩基)をそれぞれ示すものである。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI (C12N 9/22 C12R 1:19)

Claims (7)

    (57)【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 天然型大腸菌リボヌクレアーゼHのアミ
    ノ酸配列において、第95番目のリシンがグリシンで置
    換されたアミノ酸配列を有する変異型大腸菌リボヌクレ
    アーゼH。
  2. 【請求項2】 請求項1に記載の変異型大腸菌リボヌク
    レアーゼHを暗号化している変異型大腸菌リボヌクレア
    ーゼH構造遺伝子。
  3. 【請求項3】 請求項2に記載の変異型大腸菌リボヌク
    レアーゼH構造遺伝子を大腸菌の遺伝子発現系制御下に
    含有している組換え体プラスミド。
  4. 【請求項4】 pJK95Gである請求項3に記載の組
    換え体プラスミド。
  5. 【請求項5】 請求項3または4のいずれかに記載の組
    換え体プラスミドで形質転換された大腸菌株。
  6. 【請求項6】 HB101/pJK95Gである請求項
    5に記載の大腸菌株。
  7. 【請求項7】 請求項5または6のいずれかに記載の大
    腸菌株を培養し、得られた培養液から変異型大腸菌リボ
    ヌクレアーゼHを回収することを特徴とする変異型大腸
    菌リボヌクレアーゼHの製造方法。
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J.BIOL.CHEM.267(31) P.22014−22017 (1992)

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