JP2549495B2 - 燐酸化剤 - Google Patents
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Description
【0001】本発明は燐酸化剤として有用な式III
【化11】 {式中、R1は式IIIaまたはIIIb
【化12】 で表される基を示し、上記式中R5、R6およびR7は同
一または相異なることができて各々水素またはメチルを
示し、 R8は式IIIc、IIIdまたはIIIeあるいはシアノまたは
Arの基を示し、
一または相異なることができて各々水素またはメチルを
示し、 R8は式IIIc、IIIdまたはIIIeあるいはシアノまたは
Arの基を示し、
【化13】 (上記式中、R10は低級アルキルまたはArを示し、G
は同一または相異なることができて、CまたはNを示す
が、しかし少くとも1個のGはNを表し、Arは塩素、
弗素、ニトロおよびシアノの系に属する1〜5個の同一
または相異なる置換基により置換しうるかあるいは該電
子求引性置換基の外に1個または2個の親油基により置
換しうるフェニル基を示し、yは0、1または2であ
る)、 R9は式IIIfまたはIIIg
は同一または相異なることができて、CまたはNを示す
が、しかし少くとも1個のGはNを表し、Arは塩素、
弗素、ニトロおよびシアノの系に属する1〜5個の同一
または相異なる置換基により置換しうるかあるいは該電
子求引性置換基の外に1個または2個の親油基により置
換しうるフェニル基を示し、yは0、1または2であ
る)、 R9は式IIIfまたはIIIg
【化14】 で表される基を示し、上記式中Yは塩素、臭素または沃
素の系に属する同一または相異なる置換基を示す。R2
はR1の意味を有することができ、その際同一または相
異なっていてもよく、あるいはR2は低級アルキル、式I
IIh −CH2−Ar IIIh を有する基またはArを示すが、ただし後者はアルカリ
によりR1よりも容易に分裂されうることを条件とす
る。
素の系に属する同一または相異なる置換基を示す。R2
はR1の意味を有することができ、その際同一または相
異なっていてもよく、あるいはR2は低級アルキル、式I
IIh −CH2−Ar IIIh を有する基またはArを示すが、ただし後者はアルカリ
によりR1よりも容易に分裂されうることを条件とす
る。
【0002】R5およびR8は一緒になって以下の式
【化15】 を有する基を表し、そしてR3およびR4は同一または
相異なることができて、1〜8個の炭素原子を有するア
ルキル、5〜12個の炭素原子を有するシクロアルキ
ル、ベンジルまたはフェニルを示すかあるいはそれらが
結合している窒素原子と一緒になって、適切ならばさら
に別のヘテロ原子および置換基を含有する飽和または不
飽和複素環式環を示す}を有する化合物に関する。さら
に詳しく言えば本発明は、式IIIにおいてR1および
R2は互いに独立していて、−CH3、NC−CH2−
CH2−またはO2N−C6H4−CH2−CH2−を
示しそしてR3およびR4は両方ともイソプロピル基を
示す化合物に関する。
相異なることができて、1〜8個の炭素原子を有するア
ルキル、5〜12個の炭素原子を有するシクロアルキ
ル、ベンジルまたはフェニルを示すかあるいはそれらが
結合している窒素原子と一緒になって、適切ならばさら
に別のヘテロ原子および置換基を含有する飽和または不
飽和複素環式環を示す}を有する化合物に関する。さら
に詳しく言えば本発明は、式IIIにおいてR1および
R2は互いに独立していて、−CH3、NC−CH2−
CH2−またはO2N−C6H4−CH2−CH2−を
示しそしてR3およびR4は両方ともイソプロピル基を
示す化合物に関する。
【0003】該化合物は式中R5、R6およびR7が水素
を示し、R8がシアノ、フェニルを示すかあるいはニト
ロ、塩素、あるいは1個または2個のC8〜C24炭化水
素基により置換されているフェニルを示し、R9が式III
fを有する基を示し、R2が低級アルキルであるかある
いはR1の意味を有しそしてR3およびR4がC1〜C6ア
ルキル、シクロヘキシル、ベンジルまたはフェニルを示
しあるいは窒素原子と一緒になってピロリジル、ピペリ
ジル、モルホリル、トリアゾロ、ベンゾトリアゾロまた
はテトラゾロを示しさらに塩素、弗素、ニトロまたはシ
アノにより置換されうる芳香族基であることができる化
合物であり、さらに好ましくはR8がモノニトロフェニ
ル、ジニトロフェニル、モノクロロフェニル、ジクロロ
フェニル、トリクロロフェニルまたは2−クロロ−4−
ニトロフェニルあるいは電子求引性置換基の外に1個ま
たは2個のC12〜C18炭化水素基により置換されている
フェニルを示し、R9がトリクロロメチルであり、R2が
メチルでありそしてR3およびR4が低級アルキルを示す
化合物である。
を示し、R8がシアノ、フェニルを示すかあるいはニト
ロ、塩素、あるいは1個または2個のC8〜C24炭化水
素基により置換されているフェニルを示し、R9が式III
fを有する基を示し、R2が低級アルキルであるかある
いはR1の意味を有しそしてR3およびR4がC1〜C6ア
ルキル、シクロヘキシル、ベンジルまたはフェニルを示
しあるいは窒素原子と一緒になってピロリジル、ピペリ
ジル、モルホリル、トリアゾロ、ベンゾトリアゾロまた
はテトラゾロを示しさらに塩素、弗素、ニトロまたはシ
アノにより置換されうる芳香族基であることができる化
合物であり、さらに好ましくはR8がモノニトロフェニ
ル、ジニトロフェニル、モノクロロフェニル、ジクロロ
フェニル、トリクロロフェニルまたは2−クロロ−4−
ニトロフェニルあるいは電子求引性置換基の外に1個ま
たは2個のC12〜C18炭化水素基により置換されている
フェニルを示し、R9がトリクロロメチルであり、R2が
メチルでありそしてR3およびR4が低級アルキルを示す
化合物である。
【0004】本発明はまた式IV
【化16】 〔式中、R1、R2およびnは前述の定義を有し、Rはも
はやそれ以上燐酸化しうる水素原子を有していない有機
基であり、Zは酸素、硫黄、または−NH−を表しそし
てnは1または1より大きい数を示す〕を有する化合物
に関する。
はやそれ以上燐酸化しうる水素原子を有していない有機
基であり、Zは酸素、硫黄、または−NH−を表しそし
てnは1または1より大きい数を示す〕を有する化合物
に関する。
【0005】該化合物は式中R5、R6およびR7が水素
を示し、R8がシアノ、フェニルであるかあるいはニト
ロ、塩素あるいは1個または2個のC8〜C24炭化水素
基により置換されるフェニルであり、R9が式IIIfの基
を示し、R2が低級アルキルであるかあるいはR1の意味
を有しそしてnが1または2を示す化合物であり、さら
に好ましくは式中R8がモノニトロフェニル、ジニトロ
フェニル、モノクロロフェニル、ジクロロフェニル、ト
リクロロフェニルまたは2−クロロ−4−ニトロフェニ
ルを示すかあるいは電子求引性置換基の外に1個または
2個のC12〜C 18炭化水素基により置換されるフェニル
を示し、R9がトリクロロメチルであり、R2がメチルで
ありそしてR3およびR4が低級アルキルを示す化合物で
ある。
を示し、R8がシアノ、フェニルであるかあるいはニト
ロ、塩素あるいは1個または2個のC8〜C24炭化水素
基により置換されるフェニルであり、R9が式IIIfの基
を示し、R2が低級アルキルであるかあるいはR1の意味
を有しそしてnが1または2を示す化合物であり、さら
に好ましくは式中R8がモノニトロフェニル、ジニトロ
フェニル、モノクロロフェニル、ジクロロフェニル、ト
リクロロフェニルまたは2−クロロ−4−ニトロフェニ
ルを示すかあるいは電子求引性置換基の外に1個または
2個のC12〜C 18炭化水素基により置換されるフェニル
を示し、R9がトリクロロメチルであり、R2がメチルで
ありそしてR3およびR4が低級アルキルを示す化合物で
ある。
【0006】アシル化しうるヒドロキシル、メルカプト
およびアミノ化合物を本発明の式IIIを有する亜燐酸ジ
エステル−ジアルキルアミドと反応させ、生成する式IV
の亜燐酸トリエステル、チオエステルまたはジエステル
アミドを酸化して5価の燐を含有する相当する化合物を
得ついで燐酸化試薬から生ずる2個のアルコールまたは
フェノール基を塩基の手段によって分裂させると燐酸、
チオ燐酸およびセレノ燐酸のエステル、チオエステルお
よびアミドが製造される。
およびアミノ化合物を本発明の式IIIを有する亜燐酸ジ
エステル−ジアルキルアミドと反応させ、生成する式IV
の亜燐酸トリエステル、チオエステルまたはジエステル
アミドを酸化して5価の燐を含有する相当する化合物を
得ついで燐酸化試薬から生ずる2個のアルコールまたは
フェノール基を塩基の手段によって分裂させると燐酸、
チオ燐酸およびセレノ燐酸のエステル、チオエステルお
よびアミドが製造される。
【0007】この製造は特に式I
【化17】 を有する化合物の製造であり、それは式II
【化18】 を有する化合物を少くともnモルの式III
【化19】 を有する燐酸化試薬と反応させ、生成する式IV
【化20】 を有する化合物を酸化しついで式V
【化21】 を有する酸化された化合物から前記式Iの化合物を塩基
手段により単離させることからなる。
手段により単離させることからなる。
【0008】前記式中、各記号は以下の意味を有する。
Rはもはやそれ以上燐酸化しうる水素原子を有していな
い有機基であり、Xは酸素、硫黄またはセレンを示し、
Zは酸素、硫黄または−NH−を表し、Katは1モル
当量の陽イオンを表し、R1は式IIIaまたはIIIb
Rはもはやそれ以上燐酸化しうる水素原子を有していな
い有機基であり、Xは酸素、硫黄またはセレンを示し、
Zは酸素、硫黄または−NH−を表し、Katは1モル
当量の陽イオンを表し、R1は式IIIaまたはIIIb
【化22】 で表される基を示し、上記式中R5、R6およびR7は同
一または相異なることができて各々水素またはメチルを
示し、R8は式IIIc、IIIdまたはIIIeあるいはシアノ
またはArの基を示し、
一または相異なることができて各々水素またはメチルを
示し、R8は式IIIc、IIIdまたはIIIeあるいはシアノ
またはArの基を示し、
【化23】 (上記式中、R10は低級アルキルまたはArを示し、G
は同一または相異なることができて、CまたはNを示す
が、しかし少くとも1個のGはNを表し、Arは塩素、
弗素、ニトロおよびシアノの系に属する1〜5個の同一
または相異なる置換基により置換しうるかあるいは該電
子求引性置換基の外に1個または2個の親油基により置
換しうるフェニル基を示し、yは0、1または2であ
る)、nは1または1より大きい数を表し、R9は式III
fまたはIIIg
は同一または相異なることができて、CまたはNを示す
が、しかし少くとも1個のGはNを表し、Arは塩素、
弗素、ニトロおよびシアノの系に属する1〜5個の同一
または相異なる置換基により置換しうるかあるいは該電
子求引性置換基の外に1個または2個の親油基により置
換しうるフェニル基を示し、yは0、1または2であ
る)、nは1または1より大きい数を表し、R9は式III
fまたはIIIg
【化24】 (上記式中Yは塩素、臭素または沃素の系に属する同一
または相異なる置換基を示す)で表される基を示し、R
2はR1の意味を有することができ、かつその際、同一ま
たは相異なることができあるいはR2は低級アルキル、
式IIIh −CH2−Ar IIIh を有する基またはArを示すことができるが、ただし後
者はアルカリによりR1よりも容易に分裂されうること
を条件とし、R5およびR8は一緒になって次の式IIIi
または相異なる置換基を示す)で表される基を示し、R
2はR1の意味を有することができ、かつその際、同一ま
たは相異なることができあるいはR2は低級アルキル、
式IIIh −CH2−Ar IIIh を有する基またはArを示すことができるが、ただし後
者はアルカリによりR1よりも容易に分裂されうること
を条件とし、R5およびR8は一緒になって次の式IIIi
【化25】 を有する基を表すことができそしてR2もメチルの場合
にはR1もメチルを表すことができる。
にはR1もメチルを表すことができる。
【0009】基R3およびR4の性質は臨界的ではない
が、ただし式IIの化合物との反応中、基−NR3R4が分
裂される。R3およびR4は同一または相異なることがで
き、それらは1〜8個の炭素原子を有するアルキル、5
〜12個、好適には8個までの炭素原子を有するシクロ
アルキル、ベンジルまたはフェニルを表すかあるいはそ
れらが結合している窒素原子と一緒になって、適切なら
ばさらに別のヘテロ原子および置換基を含有する飽和ま
たは不飽和複素環式環を表す。
が、ただし式IIの化合物との反応中、基−NR3R4が分
裂される。R3およびR4は同一または相異なることがで
き、それらは1〜8個の炭素原子を有するアルキル、5
〜12個、好適には8個までの炭素原子を有するシクロ
アルキル、ベンジルまたはフェニルを表すかあるいはそ
れらが結合している窒素原子と一緒になって、適切なら
ばさらに別のヘテロ原子および置換基を含有する飽和ま
たは不飽和複素環式環を表す。
【0010】前記各記号の好ましい意味は以下のとおり
である。R5、R6およびR7は水素を示し、R8はシア
ノ、フェニルまたはニトロ化フェニル特にモノニトロフ
ェニル例えばp−ニトロフェニルまたはジニトロフェニ
ル例えば2,5−ジニトロフェニル、塩素化フェニル特
にモノクロロフェニル、ジクロロフェニルまたはトリク
ロロフェニルあるいは2−クロロ−4−ニトロフェニル
および1個または2個の炭化水素基特に6〜24個より
好ましくは12〜18個の炭素原子を有するアルカン基
により置換されるニトロフェニルを示す。R9は好まし
くは式中Yが好適には塩素を表す式IIIfの基を示す。
R2は低級アルキル特にメチルであるかあるいはR1の意
味を有しかつその際それはR1と同一であるのが有利で
ある。
である。R5、R6およびR7は水素を示し、R8はシア
ノ、フェニルまたはニトロ化フェニル特にモノニトロフ
ェニル例えばp−ニトロフェニルまたはジニトロフェニ
ル例えば2,5−ジニトロフェニル、塩素化フェニル特
にモノクロロフェニル、ジクロロフェニルまたはトリク
ロロフェニルあるいは2−クロロ−4−ニトロフェニル
および1個または2個の炭化水素基特に6〜24個より
好ましくは12〜18個の炭素原子を有するアルカン基
により置換されるニトロフェニルを示す。R9は好まし
くは式中Yが好適には塩素を表す式IIIfの基を示す。
R2は低級アルキル特にメチルであるかあるいはR1の意
味を有しかつその際それはR1と同一であるのが有利で
ある。
【0011】R3およびR4は1〜6個の炭素原子を有す
るアルキル特に低級アルキル、シクロヘキシル、ベンジ
ルまたはフェニルを表しそして窒素原子と一緒になって
ピロリジル、ピペリジル、モルホリル、トリアゾロ、ベ
ンゾトリアゾロまたはテトラゾロを表し、そして該芳香
族基は塩素、弗素、ニトロまたはシアノにより置換され
ていてもよい。「低級」なる表現は4個までの炭素原子
を有する基を表す。XおよびZは酸素を表すのが好まし
い。nは1〜6、特に1または2、最適には1を表す。
式中R1がメチル以外である式IIIの化合物は新規であ
り、式VIの化合物も同様である。
るアルキル特に低級アルキル、シクロヘキシル、ベンジ
ルまたはフェニルを表しそして窒素原子と一緒になって
ピロリジル、ピペリジル、モルホリル、トリアゾロ、ベ
ンゾトリアゾロまたはテトラゾロを表し、そして該芳香
族基は塩素、弗素、ニトロまたはシアノにより置換され
ていてもよい。「低級」なる表現は4個までの炭素原子
を有する基を表す。XおよびZは酸素を表すのが好まし
い。nは1〜6、特に1または2、最適には1を表す。
式中R1がメチル以外である式IIIの化合物は新規であ
り、式VIの化合物も同様である。
【0012】式中R1およびR2が2−(4−ニトロフェ
ニル)−エチルを表し、XおよびZが酸素を表しそして
Rがチミジル基を表す式Vの化合物はF. Himmelsbach氏
等による「Tetrahedron Letters」23 (1982) 4793〜47
96に開示されている。これらの化合物はチミジンをビス
−(p−ニトロフェニルエチル)ホスホロモノクロリデ
ートと反応させることにより得られ、その際5′−位置
のヒドロキシル基が第一にアシル化される。この燐酸化
試薬はどちらかと云えば不安定であり、高真空下で蒸留
することもあるいは固体形態で調製することもできなか
った。三塩化燐が出発物質として使用される場合式Vを
有する化合物の製造は既知経路による5個の反応段階を
要するが、一方これらの化合物は本発明による経路によ
っては4個の段階で製造されうる。前述の文献によれば
式Vの化合物はその後さらに反応してオリゴヌクレオチ
ドを与えそして最終的には1,5−ジアザビシクロ〔5,
4,0〕ウンデク−5−エン(DBU)を用いて後者か
らp−ニトロフェニルエチル基が分裂される。
ニル)−エチルを表し、XおよびZが酸素を表しそして
Rがチミジル基を表す式Vの化合物はF. Himmelsbach氏
等による「Tetrahedron Letters」23 (1982) 4793〜47
96に開示されている。これらの化合物はチミジンをビス
−(p−ニトロフェニルエチル)ホスホロモノクロリデ
ートと反応させることにより得られ、その際5′−位置
のヒドロキシル基が第一にアシル化される。この燐酸化
試薬はどちらかと云えば不安定であり、高真空下で蒸留
することもあるいは固体形態で調製することもできなか
った。三塩化燐が出発物質として使用される場合式Vを
有する化合物の製造は既知経路による5個の反応段階を
要するが、一方これらの化合物は本発明による経路によ
っては4個の段階で製造されうる。前述の文献によれば
式Vの化合物はその後さらに反応してオリゴヌクレオチ
ドを与えそして最終的には1,5−ジアザビシクロ〔5,
4,0〕ウンデク−5−エン(DBU)を用いて後者か
らp−ニトロフェニルエチル基が分裂される。
【0013】式IIIの化合物は三塩化燐からそれ自体既
知の方法によって、それをヒドロキシル化合物R1−O
HおよびR2−OHおよび第二アミンH−NR3R4と反
応させることにより入手しうる。遊離第二アミンの代り
に相当するシリル化合物を用いることも可能である。三
塩化燐中の塩素原子の置換順序はヒドロキシルまたはア
ミノ化合物の反応性に左右される。すなわち例えば式VI
知の方法によって、それをヒドロキシル化合物R1−O
HおよびR2−OHおよび第二アミンH−NR3R4と反
応させることにより入手しうる。遊離第二アミンの代り
に相当するシリル化合物を用いることも可能である。三
塩化燐中の塩素原子の置換順序はヒドロキシルまたはア
ミノ化合物の反応性に左右される。すなわち例えば式VI
【化26】 を有する化合物は以下の経路によって得ることができ
る。
る。
【0014】a) 三塩化燐を最初に塩基存在下におい
てメタノールと反応させそしてその反応生成物を塩基存
在下においてジイソプロピルアミンついで2−(p−ニ
トロフェニル)−エタノールと反応させるか、 b) 三塩化燐を最初に2−(p−ニトロフェニル)−
エタノールついでジイソプロピルアミンそして最後にメ
タノールと反応させるかあるいは c) 三塩化燐を最初にジイソプロピルアミンと反応さ
せついでその生成物を2−(p−ニトロフェニル)−エ
タノールついでメタノールと反応させる。 一般式IIIで表される燐酸化試薬とヒドロキシル化合物
との反応は弱酸(例えばテトラゾール)またはアミン塩
酸塩の存在下で等モル量または僅かに過剰量例えば50
モル%まで、好適には25モル%までの燐酸化試薬を使
用して溶液状態で実施されるかあるいは弱酸の存在下大
過剰の燐酸化試薬を使用して固相合成の形態で実施され
る。例えばヒドロキシル成分が担体に付着している場合
燐酸化試薬は10倍〜20倍のモル過剰量で用いられ
る。反応が溶液状態で実施される場合溶媒は勿論、燐酸
化試薬およびアシル化されるべき成分に対して不活性で
なければならない。この反応は−80〜+80℃、好適
には−20〜+50℃、特に好適には0〜25℃の温度
で実施される。
てメタノールと反応させそしてその反応生成物を塩基存
在下においてジイソプロピルアミンついで2−(p−ニ
トロフェニル)−エタノールと反応させるか、 b) 三塩化燐を最初に2−(p−ニトロフェニル)−
エタノールついでジイソプロピルアミンそして最後にメ
タノールと反応させるかあるいは c) 三塩化燐を最初にジイソプロピルアミンと反応さ
せついでその生成物を2−(p−ニトロフェニル)−エ
タノールついでメタノールと反応させる。 一般式IIIで表される燐酸化試薬とヒドロキシル化合物
との反応は弱酸(例えばテトラゾール)またはアミン塩
酸塩の存在下で等モル量または僅かに過剰量例えば50
モル%まで、好適には25モル%までの燐酸化試薬を使
用して溶液状態で実施されるかあるいは弱酸の存在下大
過剰の燐酸化試薬を使用して固相合成の形態で実施され
る。例えばヒドロキシル成分が担体に付着している場合
燐酸化試薬は10倍〜20倍のモル過剰量で用いられ
る。反応が溶液状態で実施される場合溶媒は勿論、燐酸
化試薬およびアシル化されるべき成分に対して不活性で
なければならない。この反応は−80〜+80℃、好適
には−20〜+50℃、特に好適には0〜25℃の温度
で実施される。
【0015】基R1およびR2の選択により、特にR8が
親油性置換基を有するフェニルを表す場合には式IVを有
する燐酸化生成物は幾分か顕著な親油性質を有する。こ
れらの親油性化合物は例えばクロマトグラフィー例えば
“逆相”物質(例えばオクタデシルシリル基を含有する
市販シリカゲル)上の高圧液体クロマトグラフィーによ
り非燐酸化出発物質から容易に分離できる。置換基R1
およびR2の選択は、勿論、基Rの化学的性質すなわち
ホスフェート基が導入されうる化合物に左右される。そ
れ以上の燐酸化可能なH−Z基を含有しない基としての
Rの定義は式IIIを有する燐酸化試薬がかなり非特異的
方法でアシル化し、すなわち選択的燐酸化反応では各水
素原子が、存在しうるさらにそれ以上の燐酸化可能なZ
−H基中の適当な保護基によって既に置換されたことを
意味するものとして理解されるべきである。“燐酸化可
能な”Z−H基とはここではアシル化条件下で反応しう
るZ−H基、すなわちその反応性が立体障害または不活
性化基によって損われてしまったZ−H基はしたがって
除外されるべきであるということを意味するものと解さ
れるべきである。
親油性置換基を有するフェニルを表す場合には式IVを有
する燐酸化生成物は幾分か顕著な親油性質を有する。こ
れらの親油性化合物は例えばクロマトグラフィー例えば
“逆相”物質(例えばオクタデシルシリル基を含有する
市販シリカゲル)上の高圧液体クロマトグラフィーによ
り非燐酸化出発物質から容易に分離できる。置換基R1
およびR2の選択は、勿論、基Rの化学的性質すなわち
ホスフェート基が導入されうる化合物に左右される。そ
れ以上の燐酸化可能なH−Z基を含有しない基としての
Rの定義は式IIIを有する燐酸化試薬がかなり非特異的
方法でアシル化し、すなわち選択的燐酸化反応では各水
素原子が、存在しうるさらにそれ以上の燐酸化可能なZ
−H基中の適当な保護基によって既に置換されたことを
意味するものとして理解されるべきである。“燐酸化可
能な”Z−H基とはここではアシル化条件下で反応しう
るZ−H基、すなわちその反応性が立体障害または不活
性化基によって損われてしまったZ−H基はしたがって
除外されるべきであるということを意味するものと解さ
れるべきである。
【0016】基R1およびR2は大抵ホスフェート基を遊
離させるために塩基を用いて分裂されるので、基R1お
よびR2の性質および用いる塩基の性質が基Rの感度に
左右する。したがって、Rが十分に安定である場合その
切断はアルカリ水溶液によって実施することができ、そ
の際R1およびR2の選択もまた比較的非臨界的である。
基R上に敏感な基が存在する場合、反応は例えば前記文
献に開示されているそれ自体既知の方法で、例えば非水
性系中において適当な塩基例えばDBUを使用して実施
される。基R1およびR2の切断はそれ自体既知の方法に
より実施される。
離させるために塩基を用いて分裂されるので、基R1お
よびR2の性質および用いる塩基の性質が基Rの感度に
左右する。したがって、Rが十分に安定である場合その
切断はアルカリ水溶液によって実施することができ、そ
の際R1およびR2の選択もまた比較的非臨界的である。
基R上に敏感な基が存在する場合、反応は例えば前記文
献に開示されているそれ自体既知の方法で、例えば非水
性系中において適当な塩基例えばDBUを使用して実施
される。基R1およびR2の切断はそれ自体既知の方法に
より実施される。
【0017】ホスフェートトリエステルからのメチル基
の切断は塩基例えばトリエチルアミンの存在下チオフェ
ノールまたはチオクレゾールを用いて実施されうる。こ
の反応は−100〜+100℃、好適には−60〜+6
0℃、特に好適には−20〜+30℃の温度で都合よく
実施される。β−除去反応中に除去されうる群、すなわ
ち例えば基IIIbが存在する化合物は例えば亜鉛のよう
な金属を用いることによりあるいは電圧制御された電解
還元により除去できる。この反応は−50〜+80℃、
好適には−20〜+50℃、特に好適には0〜30℃の
温度で有利に実施される。電気陰性置換基含有のエチル
基は非ヌクレオフィル系塩基によって除去することがで
きそしてこれもまた重合担体に付着しうる。この反応は
−60〜+100℃、好適には−20〜+50℃、特に
好適には0〜30℃の温度で有利に実施される。
の切断は塩基例えばトリエチルアミンの存在下チオフェ
ノールまたはチオクレゾールを用いて実施されうる。こ
の反応は−100〜+100℃、好適には−60〜+6
0℃、特に好適には−20〜+30℃の温度で都合よく
実施される。β−除去反応中に除去されうる群、すなわ
ち例えば基IIIbが存在する化合物は例えば亜鉛のよう
な金属を用いることによりあるいは電圧制御された電解
還元により除去できる。この反応は−50〜+80℃、
好適には−20〜+50℃、特に好適には0〜30℃の
温度で有利に実施される。電気陰性置換基含有のエチル
基は非ヌクレオフィル系塩基によって除去することがで
きそしてこれもまた重合担体に付着しうる。この反応は
−60〜+100℃、好適には−20〜+50℃、特に
好適には0〜30℃の温度で有利に実施される。
【0018】電気陰性置換基含有のエチル基が式Vの化
合物から分裂される場合には、減少する反応性の順序で
示されている以下の塩基を用いることが有利である。 a) 式VII
合物から分裂される場合には、減少する反応性の順序で
示されている以下の塩基を用いることが有利である。 a) 式VII
【化27】 (式中R11、R12およびR13は同一または相異なる低級
アルキル基好ましくはメチルまたはエチルを示しそして
AおよびA′は鎖中に2〜4個の炭素原子を有する低級
アルキレン基好ましくは1,3−プロピレンを示す)を
有する環状燐酸トリアミド−イミド、 b) 1,5,7−トリアザビシクロ〔4,4,0〕デセ−
5−エン(TBD)およびまた7−メチル−1,5,7−
トリアザビシクロ〔4,4,0〕デセ−5−エン、 c) 1,8−ジアザビシクロ〔4,3,0〕ノネ−5−
エン(DBN)、DBUおよびまた低級アルカリ金属ア
ルコレート特にナトリウムアルカノレートおよびカリウ
ムアルカノレート例えばナトリウムメチレート、ナトリ
ウムエチレートまたはカリウム第3ブチレートおよび d) 1,1,3,3−テトラメチルグアニジン。 R1および適切ならばR2もβ−シアノエチルである化合
物はアンモニアにより分裂されることができ、したがっ
てこれら化合物は、他の保護基がアンモニアによって分
裂される場合に用いられるのが好ましい。
アルキル基好ましくはメチルまたはエチルを示しそして
AおよびA′は鎖中に2〜4個の炭素原子を有する低級
アルキレン基好ましくは1,3−プロピレンを示す)を
有する環状燐酸トリアミド−イミド、 b) 1,5,7−トリアザビシクロ〔4,4,0〕デセ−
5−エン(TBD)およびまた7−メチル−1,5,7−
トリアザビシクロ〔4,4,0〕デセ−5−エン、 c) 1,8−ジアザビシクロ〔4,3,0〕ノネ−5−
エン(DBN)、DBUおよびまた低級アルカリ金属ア
ルコレート特にナトリウムアルカノレートおよびカリウ
ムアルカノレート例えばナトリウムメチレート、ナトリ
ウムエチレートまたはカリウム第3ブチレートおよび d) 1,1,3,3−テトラメチルグアニジン。 R1および適切ならばR2もβ−シアノエチルである化合
物はアンモニアにより分裂されることができ、したがっ
てこれら化合物は、他の保護基がアンモニアによって分
裂される場合に用いられるのが好ましい。
【0019】本発明方法の大きな利点は敏感な化合物が
燐酸化されうる点にある。塩基による基R1およびR2の
切断において前記で指摘のように、本発明による方法は
多数の態様を可能にしそれ故に個々の反応段階が基Rに
おけるさらに進んだ各反応と統合されうる。この特徴は
基R1およびR2の切断のためばかりでなく、酸化反応の
ためそして所望ならば1個以上のホスフェート基の導入
のためにも適切である。さらに重要な本発明の利点は、
ホスフェート基それ自体のみならずチオホスフェートお
よびセレノホスフェート基をも導入することができる点
に見ることができる。これにより、例えばHimmelsbach
氏等の方法によっては入手され得ない天然物質の化学的
類似体への簡単な入手経路が達成できる。
燐酸化されうる点にある。塩基による基R1およびR2の
切断において前記で指摘のように、本発明による方法は
多数の態様を可能にしそれ故に個々の反応段階が基Rに
おけるさらに進んだ各反応と統合されうる。この特徴は
基R1およびR2の切断のためばかりでなく、酸化反応の
ためそして所望ならば1個以上のホスフェート基の導入
のためにも適切である。さらに重要な本発明の利点は、
ホスフェート基それ自体のみならずチオホスフェートお
よびセレノホスフェート基をも導入することができる点
に見ることができる。これにより、例えばHimmelsbach
氏等の方法によっては入手され得ない天然物質の化学的
類似体への簡単な入手経路が達成できる。
【0020】一般式V(X=O)を有するホスフェート
を得るための一般式IVを有する化合物の酸化は類似化合
物に関して知られた既知の方法で実施される。使用でき
る酸化剤の例としては四酸化二窒素または沃素を挙げる
ことができるが、特にパーオキシド類とりわけ無水t−
ブチルヒドロパーオキシドが好ましい。反応は適度な極
性溶媒例えばニトリル(例えばアセトニトリル)または
ハロゲン化特に塩素化低級炭化水素(例えばクロロホル
ム)中で実施するのが好ましい。この反応は有利には−
100〜+100℃、好適には−50〜+60℃、特に
好適には−20〜+30℃の温度で実施される。Xが硫
黄またはセレンを示す一般式Vの化合物の製造は一般式
IVを有する化合物と元素状硫黄またはセレンとの直接反
応によって実施される。例えばテトラヒドロフランのよ
うな極性溶媒中において化学量論的量の硫黄またはセレ
ンと共に撹拌すると一般式Vを有する相当するチオホス
フェートまたはセレノホスフェートが良好な収量で生成
する。この反応は有利には−100〜+100℃、好適
には−50〜+60℃、特に好適には−20〜+30℃
の温度で実施される。
を得るための一般式IVを有する化合物の酸化は類似化合
物に関して知られた既知の方法で実施される。使用でき
る酸化剤の例としては四酸化二窒素または沃素を挙げる
ことができるが、特にパーオキシド類とりわけ無水t−
ブチルヒドロパーオキシドが好ましい。反応は適度な極
性溶媒例えばニトリル(例えばアセトニトリル)または
ハロゲン化特に塩素化低級炭化水素(例えばクロロホル
ム)中で実施するのが好ましい。この反応は有利には−
100〜+100℃、好適には−50〜+60℃、特に
好適には−20〜+30℃の温度で実施される。Xが硫
黄またはセレンを示す一般式Vの化合物の製造は一般式
IVを有する化合物と元素状硫黄またはセレンとの直接反
応によって実施される。例えばテトラヒドロフランのよ
うな極性溶媒中において化学量論的量の硫黄またはセレ
ンと共に撹拌すると一般式Vを有する相当するチオホス
フェートまたはセレノホスフェートが良好な収量で生成
する。この反応は有利には−100〜+100℃、好適
には−50〜+60℃、特に好適には−20〜+30℃
の温度で実施される。
【0021】既に強調してきたことだが、本発明は基R
の化学的性質を相当な範囲まで考慮することを可能にし
かつこの基はまた敏感な基あるいは分子部分をも含有し
うる。したがって式IIを有する適当な出発物質は脂肪族
または芳香族ヒドロキシル、メルカプトおよびアミノ化
合物、すなわちアルコール類、フェノール類、メルカプ
タン類、チオフェノール類および脂肪族および芳香族ア
ミンである。天然物質またはこれらに類似の化合物例え
ばステロイド誘導体、燐脂質およびとりわけ糖ないし糖
誘導体例えばヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌク
レオチドまたはポリヌクレオチドが特に有利に燐酸化さ
れうる。
の化学的性質を相当な範囲まで考慮することを可能にし
かつこの基はまた敏感な基あるいは分子部分をも含有し
うる。したがって式IIを有する適当な出発物質は脂肪族
または芳香族ヒドロキシル、メルカプトおよびアミノ化
合物、すなわちアルコール類、フェノール類、メルカプ
タン類、チオフェノール類および脂肪族および芳香族ア
ミンである。天然物質またはこれらに類似の化合物例え
ばステロイド誘導体、燐脂質およびとりわけ糖ないし糖
誘導体例えばヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌク
レオチドまたはポリヌクレオチドが特に有利に燐酸化さ
れうる。
【0022】今日使用されるホスフェート保護基の組み
合わせによって末端未保護ホスフェート基含有ヌクレオ
チドをホスファイト方法にしたがって製造することはさ
らに大きな努力でもって単に可能であるかあるいは全く
不可能であるかである。トリエステル合成で度々使用さ
れる、保護基のo−クロロフェニルβ−シアノエチルホ
スフェート組み合わせも、β−シアノエチル基を維持し
ながらのo−クロロフェニル基の加水分解が可能でない
ので末端ホスフェートを与えない。すなわち末端5′−
ヒドロキシル基の燐酸化はヌクレオシドトリホスフェー
ト通常アデノシントリホスフェートおよびキナーゼ例え
ば(T4)−ポリヌクレオチドキナーゼを用いて従来既
知の方法にしたがって実施されてきた。この方法はどち
らかと云えば費用がかかる。
合わせによって末端未保護ホスフェート基含有ヌクレオ
チドをホスファイト方法にしたがって製造することはさ
らに大きな努力でもって単に可能であるかあるいは全く
不可能であるかである。トリエステル合成で度々使用さ
れる、保護基のo−クロロフェニルβ−シアノエチルホ
スフェート組み合わせも、β−シアノエチル基を維持し
ながらのo−クロロフェニル基の加水分解が可能でない
ので末端ホスフェートを与えない。すなわち末端5′−
ヒドロキシル基の燐酸化はヌクレオシドトリホスフェー
ト通常アデノシントリホスフェートおよびキナーゼ例え
ば(T4)−ポリヌクレオチドキナーゼを用いて従来既
知の方法にしたがって実施されてきた。この方法はどち
らかと云えば費用がかかる。
【0023】本発明によれば、今や5′−ヒドロキシル
基の燐酸化は単離されたオリゴヌクレオチド上のみなら
ず、また担体に付着された化合物上においてさえも化学
的手段によって実施できる。本発明方法はヌクレオシ
ド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチドまたはポリヌク
レオチドが害されないように穏和な条件下で実施する。
しかしながら、本発明はまた例えば3′−ヒドロキシル
基を燐酸化することにより別の点におけるヌクレオチド
あるいは単量体、オリゴマーまたは重合体のヌクレオチ
ド中へのホスフェート基の導入をも可能にし、あるいは
リボヌクレオシドまたはリボヌクレオチドの場合には
2′−位中への導入を可能ならしめる。以下の例におい
て、ヌクレオチドの、困難であることの知られている分
野で本発明をより詳細に説明する。しかしながら、ヌク
レオチドの燐酸化はホスフェート基導入の非常に一般的
な方法において代表的であるのでこれは本発明を限定す
るものとしてみなすべきではない。
基の燐酸化は単離されたオリゴヌクレオチド上のみなら
ず、また担体に付着された化合物上においてさえも化学
的手段によって実施できる。本発明方法はヌクレオシ
ド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオチドまたはポリヌク
レオチドが害されないように穏和な条件下で実施する。
しかしながら、本発明はまた例えば3′−ヒドロキシル
基を燐酸化することにより別の点におけるヌクレオチド
あるいは単量体、オリゴマーまたは重合体のヌクレオチ
ド中へのホスフェート基の導入をも可能にし、あるいは
リボヌクレオシドまたはリボヌクレオチドの場合には
2′−位中への導入を可能ならしめる。以下の例におい
て、ヌクレオチドの、困難であることの知られている分
野で本発明をより詳細に説明する。しかしながら、ヌク
レオチドの燐酸化はホスフェート基導入の非常に一般的
な方法において代表的であるのでこれは本発明を限定す
るものとしてみなすべきではない。
【0024】一般式IIIを有する本発明の燐酸化試薬
の製造 実施例 1 亜燐酸メチルエステル−〔(p−ニトロフェニル)−エ
チルエステル〕−ジイソプロピルアミド(式VI) 5.01g(30ミリモル)の完全に乾燥した2−(p
−ニトロフェニル)エタノールを60mlの新たに蒸留
したメチレンクロライド中に溶解し、これに24mlの
ジイソプロピルアミンを加える。混合物を約0℃に冷却
しそして6ml(33ミリモル)の亜燐酸メチルエステ
ル−ジイソプロピルアミド−クロライドを撹拌しながら
5分間で滴加しそして混合物をこの温度でさらに10分
間撹拌する。ついでこの反応混合物をあらかじめ450
mlのpH7ホスフェートバッファーで洗浄した750
ml酢酸エチルで希釈する。酢酸エチル相を450ml
ホスフェートバッファー(pH7)で振盪させることに
より3回抽出しそして硫酸ナトリウムで乾燥しついで濃
縮する。生成する油状物を30℃で高真空中において乾
燥する。これにより31P−NMRによれば86%純粋
である9gの油状物が得られる。生成物はさらに5:
4:1の容量比である酢酸エチル/メチレンクロライド
/トリエチルアミンで平衡されている短シリカゲルカラ
ム上で、可動相として同一系を使用してクロマトグラフ
ィーにかけることにより濃縮できる。これより冷蔵庫
(−20℃)中で固化する油状物が得られる。 31P−NMR:δ=149ppm 1H−NMR:P−O−CH 2 −CH2−δ−3.75ppm,m〔2〕 P−O−CH2−CH 2 −δ=2.98ppm,t〔2〕 P−OCH 3 δ=3.35ppm,d〔3〕 m=多重線〔強度〕, s=一重線,d=二重線,t=三重線
の製造 実施例 1 亜燐酸メチルエステル−〔(p−ニトロフェニル)−エ
チルエステル〕−ジイソプロピルアミド(式VI) 5.01g(30ミリモル)の完全に乾燥した2−(p
−ニトロフェニル)エタノールを60mlの新たに蒸留
したメチレンクロライド中に溶解し、これに24mlの
ジイソプロピルアミンを加える。混合物を約0℃に冷却
しそして6ml(33ミリモル)の亜燐酸メチルエステ
ル−ジイソプロピルアミド−クロライドを撹拌しながら
5分間で滴加しそして混合物をこの温度でさらに10分
間撹拌する。ついでこの反応混合物をあらかじめ450
mlのpH7ホスフェートバッファーで洗浄した750
ml酢酸エチルで希釈する。酢酸エチル相を450ml
ホスフェートバッファー(pH7)で振盪させることに
より3回抽出しそして硫酸ナトリウムで乾燥しついで濃
縮する。生成する油状物を30℃で高真空中において乾
燥する。これにより31P−NMRによれば86%純粋
である9gの油状物が得られる。生成物はさらに5:
4:1の容量比である酢酸エチル/メチレンクロライド
/トリエチルアミンで平衡されている短シリカゲルカラ
ム上で、可動相として同一系を使用してクロマトグラフ
ィーにかけることにより濃縮できる。これより冷蔵庫
(−20℃)中で固化する油状物が得られる。 31P−NMR:δ=149ppm 1H−NMR:P−O−CH 2 −CH2−δ−3.75ppm,m〔2〕 P−O−CH2−CH 2 −δ=2.98ppm,t〔2〕 P−OCH 3 δ=3.35ppm,d〔3〕 m=多重線〔強度〕, s=一重線,d=二重線,t=三重線
【0025】実施例 2 亜燐酸メチルエステル−2−シアノエチル−エステル−
ジイソプロピルアミド(式VIII)
ジイソプロピルアミド(式VIII)
【化28】 実施例2と類似の方法で0.68ml(10ミリモル)
の2−シアノエタノールを20mlの新たに蒸留したメ
チレンクロライド中において8mlのジイソプロピルエ
チルアミンの存在下、2ml(11ミリモル)の亜燐酸
メチルエステル−ジイソプロピルアミド−クロライドと
反応させる。高真空中30℃で乾燥させて、31P−N
MRによれば94%の式VIIIを有する化合物を含有
する2.5gの油状物を得る。 31P−NMR:δ=150ppm 1H−NMR:P−OCH 2 CH2−CN δ=3.75ppm,m〔2〕 P−OCH2 CH 2 −CN δ=2.60ppm,t〔2〕 P−OCH 3 δ=3.35ppm,d〔3〕
の2−シアノエタノールを20mlの新たに蒸留したメ
チレンクロライド中において8mlのジイソプロピルエ
チルアミンの存在下、2ml(11ミリモル)の亜燐酸
メチルエステル−ジイソプロピルアミド−クロライドと
反応させる。高真空中30℃で乾燥させて、31P−N
MRによれば94%の式VIIIを有する化合物を含有
する2.5gの油状物を得る。 31P−NMR:δ=150ppm 1H−NMR:P−OCH 2 CH2−CN δ=3.75ppm,m〔2〕 P−OCH2 CH 2 −CN δ=2.60ppm,t〔2〕 P−OCH 3 δ=3.35ppm,d〔3〕
【0026】実施例 3 亜燐酸ビス−〔2−(p−ニトロフェニル)−エチルエ
ステル〕−ジイソプロピルアミド(式IX)
ステル〕−ジイソプロピルアミド(式IX)
【化29】 40ml無水テトラヒドロフラン中の16g(0.1モ
ル)2−(p−ニトロフェニル)−エタノールの溶液に
26ml(0.15モル)ジイソプロピルエチルアミン
を加え、混合物を0℃に冷却する。これに撹拌しながら
10g(0.05モル)亜燐酸ジイソプロピルアミド−
ジクロライドを15分で加える。ついで反応混合物を放
置して室温にしそしてさらに約30分間反応させる。ア
ミン塩酸塩を吸引濾去し、フィルターケークを少量のテ
トラヒドロフランで洗浄しそして合一した濾液を濃縮し
て固形残留物を得る。この残留物の1gを7:2:1の
容量比であるトルエン/n−ヘキサン/トリエチルアミ
ンを使用して70gのシリカゲル上でカラムクロマトグ
ラフィーにより精製する。これより0.95gの粉末が
得られ、これは31P−NMRによれば96%純粋であ
る。 31P−NMR:δ=147.5ppm 1H−NMR:P−OCH 2 CH2− δ=3.85ppm,m〔4〕 P−OCH2 CH 2 − δ=2.98ppm,t〔4〕 P−N−CH δ=3.5 ppm,m〔2〕 P−N−CH(CH 3 ) 2 δ=1.13ppm,d〔12〕
ル)2−(p−ニトロフェニル)−エタノールの溶液に
26ml(0.15モル)ジイソプロピルエチルアミン
を加え、混合物を0℃に冷却する。これに撹拌しながら
10g(0.05モル)亜燐酸ジイソプロピルアミド−
ジクロライドを15分で加える。ついで反応混合物を放
置して室温にしそしてさらに約30分間反応させる。ア
ミン塩酸塩を吸引濾去し、フィルターケークを少量のテ
トラヒドロフランで洗浄しそして合一した濾液を濃縮し
て固形残留物を得る。この残留物の1gを7:2:1の
容量比であるトルエン/n−ヘキサン/トリエチルアミ
ンを使用して70gのシリカゲル上でカラムクロマトグ
ラフィーにより精製する。これより0.95gの粉末が
得られ、これは31P−NMRによれば96%純粋であ
る。 31P−NMR:δ=147.5ppm 1H−NMR:P−OCH 2 CH2− δ=3.85ppm,m〔4〕 P−OCH2 CH 2 − δ=2.98ppm,t〔4〕 P−N−CH δ=3.5 ppm,m〔2〕 P−N−CH(CH 3 ) 2 δ=1.13ppm,d〔12〕
【0027】原料化合物の製造 例1 亜燐酸メチルエステル−ジイソプロピルアミド−クロラ
イド 250ml無水エーテルおよび250ml無水ぺンタン
の混合物中に最初に127g(0.96モル)の亜燐酸
メチルエステル−ジクロライドを取り、これに100m
l無水エーテルおよび100ml無水ぺンタン中の27
0ml(1.92モル)ジイソプロピルアミンの溶液を
激しく撹拌しかつ窒素ブランケットしながら−15℃で
2時間を要して滴加する。反応混合物を撹拌しながら室
温まで昇温せしめついでさらに2時間撹拌する。ついで
それを再び−15℃に冷却しそして塩酸塩を不活性ガス
の下、濾過により反応溶液から除去する。フィルターケ
ークを等容量の無水エーテルおよび無水ぺンタンからな
る750ml冷混合物ですすぐ。濾液を一緒にしそして
溶媒を水ポンプ真空下で除去する。残留物を80cmビ
グルーカラム(Vigreuxcolumn)による高
真空蒸留に2回付す。これより、31P−NMRによれ
ば99%の単一物質(δ=185ppm)からなる80
gの主フラクション(沸点38〜41℃,0.1mba
rにおいて)が得られる。
イド 250ml無水エーテルおよび250ml無水ぺンタン
の混合物中に最初に127g(0.96モル)の亜燐酸
メチルエステル−ジクロライドを取り、これに100m
l無水エーテルおよび100ml無水ぺンタン中の27
0ml(1.92モル)ジイソプロピルアミンの溶液を
激しく撹拌しかつ窒素ブランケットしながら−15℃で
2時間を要して滴加する。反応混合物を撹拌しながら室
温まで昇温せしめついでさらに2時間撹拌する。ついで
それを再び−15℃に冷却しそして塩酸塩を不活性ガス
の下、濾過により反応溶液から除去する。フィルターケ
ークを等容量の無水エーテルおよび無水ぺンタンからな
る750ml冷混合物ですすぐ。濾液を一緒にしそして
溶媒を水ポンプ真空下で除去する。残留物を80cmビ
グルーカラム(Vigreuxcolumn)による高
真空蒸留に2回付す。これより、31P−NMRによれ
ば99%の単一物質(δ=185ppm)からなる80
gの主フラクション(沸点38〜41℃,0.1mba
rにおいて)が得られる。
【0028】例2 亜燐酸2−(p−ニトロフェニル)−エチルエステル−
ジクロライド 5g(30ミリモル)の2−(p−ニトロフェニル)−
エタノールを100ml無水エーテル中に溶解して−2
0〜−30℃でかつ撹拌しながら、滴加する25.5m
l(150ミリモル)の新たに蒸留した三塩化燐と40
分間反応させる。エーテルを水ポンプ真空下0℃で除去
しついで過剰の三塩化燐を高真空下で除去しそして残留
油状物を高真空中で乾燥させる。31P−NMR:δ=
179.8ppm,全てのPの93%。
ジクロライド 5g(30ミリモル)の2−(p−ニトロフェニル)−
エタノールを100ml無水エーテル中に溶解して−2
0〜−30℃でかつ撹拌しながら、滴加する25.5m
l(150ミリモル)の新たに蒸留した三塩化燐と40
分間反応させる。エーテルを水ポンプ真空下0℃で除去
しついで過剰の三塩化燐を高真空下で除去しそして残留
油状物を高真空中で乾燥させる。31P−NMR:δ=
179.8ppm,全てのPの93%。
【0029】例3 亜燐酸ジイソプロピルアミド−ジクロライド 87ml(1モル)の三塩化燐を800ml石油エーテ
ル中に溶解し、その溶液を5℃に冷却しついでこれに6
60ml石油エーテル中の283ml(2モル)ジイソ
プロピルアミンの溶液を5℃で1時間撹拌しながら滴加
する。この温度で1時間撹拌を続け、沈殿したアミン塩
酸塩を濾去し、石油エーテルを水ポンプ真空下で除去し
そして残留物を真空(0.2mbar)中で蒸留する。
38〜41℃での得られた主フラクションは98gの油
状物であり、これは冷蔵庫(−20℃)中で放置すると
結晶化しそして99%純粋である(31P−NMR,δ
=170ppm)。
ル中に溶解し、その溶液を5℃に冷却しついでこれに6
60ml石油エーテル中の283ml(2モル)ジイソ
プロピルアミンの溶液を5℃で1時間撹拌しながら滴加
する。この温度で1時間撹拌を続け、沈殿したアミン塩
酸塩を濾去し、石油エーテルを水ポンプ真空下で除去し
そして残留物を真空(0.2mbar)中で蒸留する。
38〜41℃での得られた主フラクションは98gの油
状物であり、これは冷蔵庫(−20℃)中で放置すると
結晶化しそして99%純粋である(31P−NMR,δ
=170ppm)。
【0030】燐酸化反応 5′ホスフェート基:NcoI−リンカーである5′P
CCATGG3′を含有する一本鎖オリゴヌクレオチド
の化学合成 参考例 3′−末端に位置するヌクレオシド、すなわち本実施例
の場合にはグアノシンをm.J.Gait氏等による「ヌクレイ
ックアシッズレス、(Nucleic Acids Res.)」 8(1980);
1081〜1096に記載の方法により3′−ヒドロキシル基を
経る共有結合によって“調整された多孔性ガラス”(co
ntrolled pore glass)(CPG,ピアース社製)に付
ける。これは最初にシリカゲルを3−(トリエトキシシ
リル)−プロピルアミンと、エタノールを除去しつつ反
応させることにより実施されてSi−O−Si結合が生
成される。グアノシンをパラニトロフェノールおよび
N,N′−ジシクロヘキシルカルボジイミドの存在下に
おいてN2′−イソブチリル−3′−O−スクシノイル
−5′−ジメトキシトリチルエーテルの形態において前
記調製担体と反応させ、スクシノイル基の遊離カルボキ
シル基がプロピルアミン基のアミノ基をアシル化する。
CCATGG3′を含有する一本鎖オリゴヌクレオチド
の化学合成 参考例 3′−末端に位置するヌクレオシド、すなわち本実施例
の場合にはグアノシンをm.J.Gait氏等による「ヌクレイ
ックアシッズレス、(Nucleic Acids Res.)」 8(1980);
1081〜1096に記載の方法により3′−ヒドロキシル基を
経る共有結合によって“調整された多孔性ガラス”(co
ntrolled pore glass)(CPG,ピアース社製)に付
ける。これは最初にシリカゲルを3−(トリエトキシシ
リル)−プロピルアミンと、エタノールを除去しつつ反
応させることにより実施されてSi−O−Si結合が生
成される。グアノシンをパラニトロフェノールおよび
N,N′−ジシクロヘキシルカルボジイミドの存在下に
おいてN2′−イソブチリル−3′−O−スクシノイル
−5′−ジメトキシトリチルエーテルの形態において前
記調製担体と反応させ、スクシノイル基の遊離カルボキ
シル基がプロピルアミン基のアミノ基をアシル化する。
【0031】以下の合成段階において、塩基成分は5′
−O−ジメトキシトリチルヌクレオシド−3′−亜燐酸
モリメチルエステル−ジアルキルアミドまたはエステル
−ジクロライドの形態で用いられ、アデニンはN6−ベ
ンゾイル化合物として存在し、シトシンはN4−ベンゾ
イル化合物として、グアニンはN2−イソブチリル化合
物として存在しそしてチミンはアミノ基を含有していな
いために保護基なしで存在する。オリゴヌクレオチド鎖
組立のための反応サイクルは次のとおりである。付着さ
れた1μモルのグアノシンを含有する25mg重合担体を
順次以下の剤で処理する。
−O−ジメトキシトリチルヌクレオシド−3′−亜燐酸
モリメチルエステル−ジアルキルアミドまたはエステル
−ジクロライドの形態で用いられ、アデニンはN6−ベ
ンゾイル化合物として存在し、シトシンはN4−ベンゾ
イル化合物として、グアニンはN2−イソブチリル化合
物として存在しそしてチミンはアミノ基を含有していな
いために保護基なしで存在する。オリゴヌクレオチド鎖
組立のための反応サイクルは次のとおりである。付着さ
れた1μモルのグアノシンを含有する25mg重合担体を
順次以下の剤で処理する。
【0032】a) ニトロメタン b) 1,2−ジクロロエタン中のトリクロロ酢酸の3
%溶液 c) ニトロメタン d) アセトニトリル e) 0.2ml無水アセトニトリル中における10〜2
0μモルの相当するヌクレオシドホスファイトおよび1
00μモルのテトラゾール(5分) f) 40%ルチジンおよび10%ジメチルアミノピリ
ジンを含有するテトラヒドロフラン中の無水酢酸の20
%溶液(2分) g) アセトニトリル h) 水20%およびルチジン40%を含有するテトラ
ヒドロフラン i) 5:4:1の容量比であるコリジン/水/テトラ
ヒドロフラン中における沃素の3%溶液 j) アセトニトリル
%溶液 c) ニトロメタン d) アセトニトリル e) 0.2ml無水アセトニトリル中における10〜2
0μモルの相当するヌクレオシドホスファイトおよび1
00μモルのテトラゾール(5分) f) 40%ルチジンおよび10%ジメチルアミノピリ
ジンを含有するテトラヒドロフラン中の無水酢酸の20
%溶液(2分) g) アセトニトリル h) 水20%およびルチジン40%を含有するテトラ
ヒドロフラン i) 5:4:1の容量比であるコリジン/水/テトラ
ヒドロフラン中における沃素の3%溶液 j) アセトニトリル
【0033】“ホスファイト”は前記の場合にはデオキ
シリボース−3′−モノ亜燐酸モノメチルエステルであ
ると理解されるべきであり、その第3原子価は塩素また
は第三アミノ基例えばモルホリノ基によって飽和されて
いる。種々の合成段階各々における収量は496nmの波
長におけるジメトキシトリチル陽イオンの吸収を測定す
ることによって脱トリチル化反応(b)後に分光測光に
より測定できる。5′−ヒドロキシル基の化学燐酸化の
ための反応サイクルは原則として前記実施例のようにし
て実施されるが、しかし以下の点に相違が見られる。そ
れは第一にe)において20μモルの相当する燐酸化試
薬(例えば式VIを有する化合物)および100μモルの
テトラゾールを0.2mlの無水テトラヒドロフラン/ア
セトニトリル(等容量混合物)中において10〜20分
間反応させる点、第二に段階f)が省略される点そして
第三に段階i)の時間が5分に延長される点である。
シリボース−3′−モノ亜燐酸モノメチルエステルであ
ると理解されるべきであり、その第3原子価は塩素また
は第三アミノ基例えばモルホリノ基によって飽和されて
いる。種々の合成段階各々における収量は496nmの波
長におけるジメトキシトリチル陽イオンの吸収を測定す
ることによって脱トリチル化反応(b)後に分光測光に
より測定できる。5′−ヒドロキシル基の化学燐酸化の
ための反応サイクルは原則として前記実施例のようにし
て実施されるが、しかし以下の点に相違が見られる。そ
れは第一にe)において20μモルの相当する燐酸化試
薬(例えば式VIを有する化合物)および100μモルの
テトラゾールを0.2mlの無水テトラヒドロフラン/ア
セトニトリル(等容量混合物)中において10〜20分
間反応させる点、第二に段階f)が省略される点そして
第三に段階i)の時間が5分に延長される点である。
【0034】オリゴヌクレオチドの合成が完了したらオ
リゴマーのメチルホスフェート保護基をp−チオクレゾ
ールおよびトリエチルアミンを用いて分裂する。ついで
このオリゴヌクレオチドをアンモニアで3時間処理する
ことにより固体担体から分離する。塩基のアミノ保護基
はオリゴマーを濃アンモニアで2〜3日間処理すること
により定量的に分裂される。
リゴマーのメチルホスフェート保護基をp−チオクレゾ
ールおよびトリエチルアミンを用いて分裂する。ついで
このオリゴヌクレオチドをアンモニアで3時間処理する
ことにより固体担体から分離する。塩基のアミノ保護基
はオリゴマーを濃アンモニアで2〜3日間処理すること
により定量的に分裂される。
【0035】a) 燐酸化試薬、亜燐酸メチルエステル
−〔2−(p−ニトロフェニル)−エチルエステル〕−
ジイソプロピルアミド(VI)の場合には5′−ヒドロキ
シル基上に2−(p−ニトロフェニル)−エチルホスフ
ェート基を有するオリゴヌクレオチドが保護基の除去後
に得られる。このホスフェートエステルは“逆相”物質
上のHPLCによって精製できるが、これは特に良好な
ヒドロキシル成分の除去をもたらす。p−ニトロフェニ
ルエチル基は上記エステルを9:1容量比のピリジン/
水中の0.9M TBDで室温において8時間処理するこ
とにより分裂される。この後、HPLCまたは7M尿素
を有する20%強度ポリアクリルアミド上のゲル電気泳
動によれば出発物質はもはや存在しない。この反応混合
物に1mlの2M酢酸を加えついで濃縮する。残留物を可
動相として0.02M炭酸水素トリエチルアンモニウム
(pH7)を使用して、セファデックスG50(RSEP
HADEX G50、登録商標)を含有するカラム上で
塩から取り出す。生成する5′−ホスフェート−オリゴ
ヌクレオチドはポリヌクレオチドリガーゼによって重合
されて二重鎖の反復DNAを与えることができそしてこ
れはついで再び制限酵素Hea III(切断部位:GG↓
CC)で切断されうる。
−〔2−(p−ニトロフェニル)−エチルエステル〕−
ジイソプロピルアミド(VI)の場合には5′−ヒドロキ
シル基上に2−(p−ニトロフェニル)−エチルホスフ
ェート基を有するオリゴヌクレオチドが保護基の除去後
に得られる。このホスフェートエステルは“逆相”物質
上のHPLCによって精製できるが、これは特に良好な
ヒドロキシル成分の除去をもたらす。p−ニトロフェニ
ルエチル基は上記エステルを9:1容量比のピリジン/
水中の0.9M TBDで室温において8時間処理するこ
とにより分裂される。この後、HPLCまたは7M尿素
を有する20%強度ポリアクリルアミド上のゲル電気泳
動によれば出発物質はもはや存在しない。この反応混合
物に1mlの2M酢酸を加えついで濃縮する。残留物を可
動相として0.02M炭酸水素トリエチルアンモニウム
(pH7)を使用して、セファデックスG50(RSEP
HADEX G50、登録商標)を含有するカラム上で
塩から取り出す。生成する5′−ホスフェート−オリゴ
ヌクレオチドはポリヌクレオチドリガーゼによって重合
されて二重鎖の反復DNAを与えることができそしてこ
れはついで再び制限酵素Hea III(切断部位:GG↓
CC)で切断されうる。
【0036】b) 燐酸化試薬、亜燐酸メチルエステル
−2−シアノエチル−エステル−ジイソプロピルアミド
(VIII)および亜燐酸ビス−(2−シアノエチルエステ
ル)−ジイソプロピルアミド(X)
−2−シアノエチル−エステル−ジイソプロピルアミド
(VIII)および亜燐酸ビス−(2−シアノエチルエステ
ル)−ジイソプロピルアミド(X)
【化30】 の場合には遊離5′−ホスフェートpCCATGGがア
ンモニア分裂(室温で3日間または75℃で10時間濃
アンモニアを用いて実施される)直後に得られる。 c) 燐酸化試薬、亜燐酸ビス−〔2−(p−ニトロフ
ェニル)−エチルエステル〕−ジイソプロピルアミド
(IX)の場合には、チオフェノレートおよびアンモニア
処理後にホスフェート2−(p−ニトロフェニル)−エ
チルエステルも得られついでこのエステルは適当な塩基
例えばDBUまたはTBDによって分裂されて保護基を
有していない5′−ホスフェートを与えることができ
る。
ンモニア分裂(室温で3日間または75℃で10時間濃
アンモニアを用いて実施される)直後に得られる。 c) 燐酸化試薬、亜燐酸ビス−〔2−(p−ニトロフ
ェニル)−エチルエステル〕−ジイソプロピルアミド
(IX)の場合には、チオフェノレートおよびアンモニア
処理後にホスフェート2−(p−ニトロフェニル)−エ
チルエステルも得られついでこのエステルは適当な塩基
例えばDBUまたはTBDによって分裂されて保護基を
有していない5′−ホスフェートを与えることができ
る。
Claims (1)
- 【請求項1】 式III 【化1】 {式中、R1およびR2は互いに独立していて、−CH
3、NC−CH2−CH2−またはO2N−C6H4−
CH2−CH2−を示しそしてR3およびR4は両方と
もイソプロピル基を示す)を有する化合物。
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Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
DE19853507881 DE3507881A1 (de) | 1985-03-06 | 1985-03-06 | Verfahren und mittel zur phosphorylierung |
DE3507881:2 | 1985-03-06 |
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---|---|
JPH06228172A JPH06228172A (ja) | 1994-08-16 |
JP2549495B2 true JP2549495B2 (ja) | 1996-10-30 |
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Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP61046486A Expired - Lifetime JPH0643433B2 (ja) | 1985-03-06 | 1986-03-05 | 燐酸化法 |
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---|---|---|---|
JP61046486A Expired - Lifetime JPH0643433B2 (ja) | 1985-03-06 | 1986-03-05 | 燐酸化法 |
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CA (1) | CA1340950C (ja) |
DE (2) | DE3507881A1 (ja) |
DK (1) | DK174772B1 (ja) |
ES (1) | ES8801293A1 (ja) |
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HU (1) | HU202247B (ja) |
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IL (1) | IL78033A (ja) |
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US5071974A (en) * | 1986-10-31 | 1991-12-10 | Amoco Corporation | Compositions and methods for the synthesis of oligonucleotides having 5'-phosphorylated termini |
US5585481A (en) * | 1987-09-21 | 1996-12-17 | Gen-Probe Incorporated | Linking reagents for nucleotide probes |
US6031091A (en) * | 1987-09-21 | 2000-02-29 | Gen-Probe Incorporated | Non-nucleotide linking reagents for nucleotide probes |
SE8802574D0 (sv) * | 1988-07-08 | 1988-07-08 | Wallac Oy | Oligonucleotide hybridization probes and means for the synthesis of the most preferred probes |
US5380835A (en) * | 1991-06-07 | 1995-01-10 | Abbott Laboratories | Silyl phosphorylating reagents and methods of using them |
US6232465B1 (en) | 1994-09-02 | 2001-05-15 | Andrew C. Hiatt | Compositions for enzyme catalyzed template-independent creation of phosphodiester bonds using protected nucleotides |
US5763594A (en) * | 1994-09-02 | 1998-06-09 | Andrew C. Hiatt | 3' protected nucleotides for enzyme catalyzed template-independent creation of phosphodiester bonds |
US5990300A (en) * | 1994-09-02 | 1999-11-23 | Andrew C. Hiatt | Enzyme catalyzed template-independent creation of phosphodiester bonds using protected nucleotides |
US6214987B1 (en) | 1994-09-02 | 2001-04-10 | Andrew C. Hiatt | Compositions for enzyme catalyzed template-independent formation of phosphodiester bonds using protected nucleotides |
US5872244A (en) * | 1994-09-02 | 1999-02-16 | Andrew C. Hiatt | 3' protected nucleotides for enzyme catalyzed template-independent creation of phosphodiester bonds |
US5808045A (en) * | 1994-09-02 | 1998-09-15 | Andrew C. Hiatt | Compositions for enzyme catalyzed template-independent creation of phosphodiester bonds using protected nucleotides |
US6184347B1 (en) | 1998-11-19 | 2001-02-06 | Agilent Technologies Inc. | Minimization of blooming in high-density arrays by using reactive wash reagents |
EP1163251A1 (en) | 1999-03-24 | 2001-12-19 | THE GOVERNMENT OF THE UNITED STATES OF AMERICA, as represented by THE SECRETARY, DEPARTMENT OF HEALTH AND HUMAN SERVICES | N-acylphosphoramidites and their use in oligonucleotide synthesis |
US7355037B2 (en) * | 2001-12-03 | 2008-04-08 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Thermolabile hydroxyl protecting groups and methods of use |
GB0304371D0 (en) | 2003-02-26 | 2003-04-02 | Solexa Ltd | DNA Sequence analysis |
WO2006065751A2 (en) | 2004-12-13 | 2006-06-22 | Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | Cpg oligonucleotide prodrugs, compositions thereof and associated therapeutic methods |
DE102009012640A1 (de) | 2009-03-09 | 2010-09-30 | Freie Universität Berlin | Mit einer Phosphoamidatgruppe modifizierte Verbindung und deren Verwendung |
US10128538B2 (en) | 2014-07-09 | 2018-11-13 | Nec Corporation | Non-aqueous electrolytic solution and lithium ion secondary battery |
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DE1252648B (de) * | 1962-01-29 | 1967-10-26 | Hooker Chemical Corporation, Niagara Falls NY (V St A) | Verfahren zur Herstellung von Tnmethyl phosphit |
US4321365A (en) * | 1977-10-19 | 1982-03-23 | Research Corporation | Oligonucleotides useful as adaptors in DNA cloning, adapted DNA molecules, and methods of preparing adaptors and adapted molecules |
US4415732A (en) * | 1981-03-27 | 1983-11-15 | University Patents, Inc. | Phosphoramidite compounds and processes |
NL8302353A (nl) * | 1983-07-01 | 1985-02-01 | Stichting Katholieke Univ | Fosforyleringsmiddel; werkwijze voor het bereiden daarvan; werkwijze voor het fosforyleren van een organische hydroxyl- of amineverbinding. |
DE3484719D1 (de) | 1983-08-19 | 1991-07-25 | Gen Electric | Modifizierte polyesterzusammensetzung. |
CA1293938C (en) * | 1985-03-28 | 1992-01-07 | Thomas Horn | Purification of synthetic oligomers |
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-
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