JP2023554317A - 筋強直性ジストロフィー1を調節するための方法及び化合物 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】本開示は、dmpkの発現を調節し、dmpkが活性的な役割を果たす疾患及び状態を治療するための、転写モジュレータ分子化合物、並びに方法に関する。転写モジュレータは、a)ヌクレオチド反復配列CAG又はCTGと非共有結合することができるDNA結合部分を含む第1の末端と、b)ヌクレオチド反復配列CAG又はCTGを含む遺伝子の発現を調節する制御分子と結合することができるタンパク質結合部分を含む第2の末端と、c)第1の末端と第2の末端との間にリンカーを含むオリゴマー骨格と、を含む。【選択図】図1
Description
相互参照
本出願は、2020年12月11日に出願された米国特許出願第63/124,592号の利益を主張し、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、2020年12月11日に出願された米国特許出願第63/124,592号の利益を主張し、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書に開示されるのは、新しいキメラ複素環式ポリアミド化合物及び組成物、並びに疾患の治療のための医薬品としてのそれらの応用である。ヒト又は動物対象においてCAGトリヌクレオチド反復配列を含む標的遺伝子の発現を調節する方法はまた、筋強直性ジストロフィー1型(「DM1」)、脊髄小脳失調症、ハンチントン病、ハンチントン病様症候群、球脊髄性筋萎縮症、及び歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症などの治療疾患のためにも提供される。
本開示は、mRNAの過剰産生を特徴とする遺伝性の遺伝子疾患の治療に関する。
筋強直性ジストロフィー(「DM」)は、筋ジストロフィーとして知られる疾患の一種であり、約8000人に1人が罹患する。DMは、成人発症患者間での筋ジストロフィーの最も一般的な形態であり、ほとんどのDM症例は20歳以降に診断される。DMは、筋肉収縮の持続性を特徴とし、筋肉障害及び白内障、並びに心臓及び呼吸器障害を含むいくつかの症状と関連付けられ、これらの両方は通常、疾患の進行の後半に見られる。関連する症状の改善のための治療法は利用可能であるが、現在、DMの進行を停止又は逆転させることができる治療法は採用されていない。呼吸不全及び心臓不整脈は、DM患者間で最も一般的な死因である。
DMの最も重篤な形態は、筋強直性ジストロフィー1型(「DM1」)である。DM1は、dmpk遺伝子の変異によって引き起こされる常染色体優性遺伝性疾患である。この遺伝子は、ミオトニン-プロテインキナーゼとしても知られる筋強直性ジストロフィープロテインキナーゼ(MDPK)タンパク質をコードする。MDPKタンパク質は、筋肉、心臓、及び神経組織に見出すことができる。
DM1は、DM1対象における欠損dmpk遺伝子の転写によって誘導される。通常、この遺伝子は、5~37のCTGトリヌクレオチド反復数を有する3’非翻訳領域を含む。DM1遺伝子型では、このトリヌクレオチドは50~3,000を超える反復数まで拡大され、そのほとんどが1,000を超えるCTG配列の繰り返しを有する。この数は子孫になるほど増加する傾向があり、その結果、後の世代の発症年齢がより早くなる。更に、異常なDNA修復の可能性があるため、対象の生涯にわたってこの数が増加することが観察されている。
DM1の進行は、拡大されたCTG領域を有するdmpk mRNAからの「RNA毒性」に起因する。このmRNAは特定のタンパク質と凝集体を形成し、これらの凝集体は正常な細胞機能を妨害する。欠陥mRNAの筋盲目タンパク質との結合は、特にハエの適切な筋肉発達のために筋盲目タンパク質活性が必要であるため、おそらくDM1の症状を引き起こすメカニズムである。
脊髄小脳運動失調症は、特に小脳における神経変性を特徴とする遺伝性疾患のファミリーを指す。症状は一般に運動機能の喪失に関連しており、歩行の協調不能、手及び眼の動きの調整不良、構音障害(不明瞭な発話)、及び嚥下障害による栄養不良などの関連する合併症が含まれる。
脊髄小脳失調症のいくつかのサブクラスが同定されており、そのうちのいくつかはオリゴヌクレオチド反復配列の存在と関連している。これらのうち、いくつかは、CAGトリヌクレオチド反復配列の複数のコピーと関連している。6つのサブクラス:SCA1、SCA2、SCA3、SCA6、SCA7、及びSCA17において、CAGトリヌクレオチド反復配列は、コードされるタンパク質内にポリグルタミン(ポリQ)反復配列を生じさせる。これらのSCAのサブクラスは、ハンチントン病、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症、球脊髄性筋萎縮症とともに、総称して「ポリグルタミン伸長障害」と呼ばれている。欠陥ポリQタンパク質を観察された病態に結びつける正確なメカニズムは必ずしも明確ではなく、タンパク質の凝集、及びユビキチン化封入体の形成が提案されている。
上記の疾患群とは対照的に、SCA12のCAGトリヌクレオチド反復配列は、遺伝子のコード領域の外側に位置する。したがって、mRNAは、CAGトリヌクレオチド反復配列を含むが、mRNAの翻訳は、ポリQトラクトを産生しない。この欠陥に関連する病理は、おそらく安定したヘアピン構造の存在により、正常な細胞メカニズムが異常なmRNAを分解できず、細胞内にmRNAが蓄積することが原因であり得る。
脊髄小脳失調症1型(「SCA1」)は、atxn1遺伝子内のCAGトリヌクレオチド反復配列の存在と関連している。罹患した個体は、39以上のトリヌクレオチド反復配列を有し、症状の発症年齢は、トリヌクレオチド反復配列のより高い数と逆相関する。この状態は一般的に10~30年以内に致命的であり、現在利用可能な治療法はない。CAGトリヌクレオチド反復配列は、ゲノムDNAと同様に、mRNAで観察される。遺伝子は、CAGトリヌクレオチド反復配列からのポリQトラクトを含むATXN1と呼ばれるタンパク質をコードする。動物実験では、機能喪失ではなく、タンパク質毒性が、欠陥ATXN1の病態を引き起こす主なメカニズムであることが示されている。欠陥ATXN1はプロテアソームによる分解が損なわれ、タンパク質の蓄積につながる。
脊髄小脳失調症2型(「SCA2」)は、atxn2遺伝子内のCAGトリヌクレオチド反復配列の存在と関連している。罹患した個体は、32以上のトリヌクレオチド反復配列を有し、症状の発症年齢は、トリヌクレオチド反復配列のより高い数と逆相関する。遺伝子は、CAGトリヌクレオチド反復配列からのポリQトラクトを含むATXN2と呼ばれるタンパク質をコードする。ATXN2タンパク質の機能は十分に理解されておらず、それは細胞質であり、ゴルジ体及び小胞体と関連する。mRNA翻訳の制御は、ATXN2のRNA結合特性によって示唆される。
脊髄小脳失調症3型(「SCA3」)は、atxn3遺伝子内のCAGトリヌクレオチド反復配列の存在と関連している。罹患した個体は、50以上のコピーのトリヌクレオチド反復配列を有し、症状の発症年齢は、トリヌクレオチド反復配列のより高い数と逆相関する。遺伝子は、CAGトリヌクレオチド反復配列からのポリQトラクトを含むATXN3と呼ばれるタンパク質をコードする。ATXN3タンパク質は、タンパク質の代謝におけるユビキチン/プロテアソームメカニズムにおいて役割を果たし、タンパク質がユビキチン化によって代謝の対象となった後、プロテアソームによるタンパク質の分解前に、ATXN3はリサイクルのためにユビキチンを除去する。ポリQトラクトを含む欠陥ATXN3は、この触媒特性を失い、したがって不要なタンパク質の蓄積を引き起こす。
脊髄小脳失調症6型(「SCA6」)は、cacna1a遺伝子内のCAGトリヌクレオチド反復配列の存在と関連している。罹患した個体は、20以上のトリヌクレオチド反復配列を有する。症状の平均発症年数は45年であり、病気はゆっくりと進行し、病気の持続期間は25年を超え得る。この疾患の治療は支持的であり、アセタゾールアミドは運動失調症の緩和を提供する。遺伝子は、適切なニューロン機能に不可欠なCaV2.1カルシウムチャネルのアルファ1サブユニットをコードする。罹患した個体における欠陥cacna1a遺伝子によって産生されるアルファ-1サブユニットは、細胞質及び細胞膜に移行し、そこで凝集体を形成する。観察された症状を引き起こすメカニズムは不明であるが、カルシウムチャネルの機能不全、拡大されたタンパク質の翻訳後切断による有毒なC末端セグメントの形成が疑われる。
脊髄小脳失調症7型(「SCA7」)は、atxn7遺伝子内のCAGトリヌクレオチド反復配列の存在と関連している。罹患した個体は、36~300を超えるトリヌクレオチド反復配列を有する。症状の発症は、典型的には20~40年の間に観察され、早期の発症はより重度の症状と相関する。SCAクラスの疾患で観察される症状に加えて、SCA7を有する対象、特に早期発症の対象は、視力低下及び失明を経験し得る。この疾患の治療は支持的なもののみである。遺伝子は、転写に役割を果たす核タンパク質であるアタキシン-7タンパク質をコードする。加えて、欠陥遺伝子産物は錐体桿体ホメオボックスタンパク質を妨害し、この症候群で観察された網膜症の説明を提供する。変異アタキシン-7のタンパク質溶解性切断及び経ニューロン応答が、SCA7の発症の原因であり得る。
脊髄小脳失調症17型(「SCA17」)は、TATAボックス結合タンパク質(TBP)遺伝子におけるCAA妨害を伴う、CAGトリヌクレオチド反復配列の存在と関連している。TBP遺伝子産物は、転写の開始において役割を果たす。罹患した個体は、典型的には、47以上のトリヌクレオチド反復配列を有する。症状の発症は典型的には50歳までに観察され、しばしば嚥下障害により誤嚥及び死亡につながる。拡大されたCAG配列と観察された病理との間の関連性は不明瞭であり、異なる反復長での機能獲得及び機能喪失の両方が示唆されている。
ハンチントン病(「HD」)は、19世紀後半に常染色体優性の神経変性疾患として初めて同定された。様々な運動、認知及び精神障害を含むHDの症状は、一般的に成人期に現れる。HDは、ハンチンチンと呼ばれるタンパク質をコードするhtt遺伝子内のCAGトリヌクレオチド反復配列の存在と関連している。約36を超えるトリヌクレオチド反復配列を有する対象は、一般に、HDの症状を呈し、より多くの数のトリヌクレオチド反復配列が、より早い症状の発症と関連する。病理は、ポリQハンチンチンの生成、続いて伸長したハンチンチンがより小さなペプチドに断片化され、それが一緒に結合してニューロンに蓄積するというステップのカスケードから生じる。このカスケードの影響は、脳の大脳基底核及び皮質で顕著である。
ハンチントン病様症候群とは、ハンチントン病の症状に類似しているが、htt遺伝子の特徴的な変異を欠いている疾患のグループを指す。ハンチントン病様2症候群(「HDL2」)は、ジャンクトフィリン3(jph3)遺伝子内の約40以上のCAGトリヌクレオチド反復配列の数と関連している。HDL2は、アフリカ系統の対象に見られる遺伝性障害である。発症年齢は、トリヌクレオチド反復配列の数と逆相関する。この症候群の症状には、ジストニア及び舞踏病(制御不能な動き)、感情の混乱、構音障害、運動緩慢、新しい学習を取り入れることができないこと、並びに意思決定の困難さなどが含まれる。平均余命は、診断後数年から10年以上に及ぶまで様々であり得る。現在の理論では、jph3遺伝子によってコードされるポリQタンパク質が神経細胞内で凝集体を形成し、これが疾患の病状の原因であると考えられている。しかしながら、mRNAの機能獲得毒性を示唆する証拠も発見されており、病態についての二重経路の可能性を示唆している。
ケネディ病としても知られる球脊髄性筋萎縮症は、男性で観察されるX連鎖遺伝性疾患であり、その症状には、顔及び喉の球筋による筋萎縮、構音障害及び嚥下障害、線維束性収縮(不随意のけいれん)、不妊症が含まれる。この疾患は、アンドロゲン受容体(ar)遺伝子内のCAGトリヌクレオチド反復配列の存在と関連している。病態は、脳及び脊髄の神経細胞におけるアンドロゲン受容体タンパク質の断片の蓄積に起因すると考えられている。治療は症状の管理に限定されており、抗アンドロゲン薬もテストステロンもその類似体も効果を示さない。最近の研究では、ポリQアンドロゲン受容体の病態は、ユビキチンリガーゼ後期促進複合体/サイクロソーム(APC/C)の阻害と、それに続く神経突起形成及び細胞周期の混乱によるものであることが示唆されている。
歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症(「DRPLA」)は、主に日本人の対象において観察される常染色体優性遺伝疾患であり、その症状は通常成人期に現れ、発作、運動失調、及びミオクローヌス(不随意のけいれん性筋収縮)を含む。成人対象でも、認知症及び精神疾患が観察される。DRPLAは、アトロフィン-1(atn1)遺伝子のCAGトリヌクレオチド反復配列と結合される。健常な個体は、約34未満のトリヌクレオチド反復配列を有し、罹患した個体は、一般に、約50を超えるトリヌクレオチド反復配列を有する。アトロフィン-1タンパク質(「ATN1」)は全ての組織で発現するが、ニューロンではタンパク質分解によって切断されるため、神経活動における役割している。毒性はATN1タンパク質の蓄積に起因すると考えられている。
フックス角膜内皮ジストロフィー(「FECD」)のフックス内皮ジストロフィーは、角膜の内皮層に関与する非炎症性、散発性又は常染色体優性のジストロフィーである。フックスジストロフィーでは、角膜が腫れ始め、まぶしさ、光ぼけ、視力の低下を引き起こす。フックス内皮ジストロフィーにおける角膜への損傷は、角膜失明を引き起こすほど深刻であり得る。フックスのジストロフィーは、早発性発症(最初の10年間)及び遅発性発症(40~50年)に分類され、後者では女性が優勢である。早発性発症フックスには、コラーゲン8型α2鎖が関与する。遅発性発症は、転写因子4、転写因子8(TCF8)、ATP/GTP結合タンパク質様1(AGBL1)、リポキシゲナーゼ相同ドメイン1(LOXHD1)、溶質輸送体ファミリー4メンバー11(SLC4A11)遺伝子、及び形質転換成長因子β誘導及びクラスタリン関与を特徴とする。
特定の実施形態では、上記のメカニズムは、標的遺伝子における過剰な数のCAG又はCTGトリヌクレオチド反復配列の存在を特徴とする疾患又は障害の効果的な治療を提供する。いくつかの実施形態では、疾患又は障害の病態は、過剰な数のCAG又はCTGトリヌクレオチド反復配列を含むmRNAの存在によるものである。いくつかの実施形態では、疾患又は障害の病態は、過剰な数のグルタミンアミノ酸残基を含む翻訳産物の存在によるものである。いくつかの実施形態では、疾患又は障害の病態は、翻訳産物の機能喪失によるものである。いくつかの実施形態では、疾患又は障害の病態は、翻訳産物の機能獲得によるものである。いくつかの実施形態では、疾患又は障害の病態は、欠損遺伝子の転写割合を増加させることによって軽減することができる。いくつかの実施形態では、疾患又は障害の病態は、欠損遺伝子の転写割合を減少させることによって軽減することができる。
特定の実施形態では、上記のメカニズムは、dmpkの過剰発現によって引き起こされるDM1の効果的な治療を提供するであろう。したがって、欠陥dmpk遺伝子の過剰発現の修正は、DM1の治療のための有望な方法を表す。
本開示は、遺伝子発現を制御する細胞核に存在する制御分子を利用する。真核細胞は、遺伝子複製、転写、及び/又は翻訳を制御するためのいくつかのメカニズムを提供する。細胞内の様々な生化学的メカニズムによって産生される制御分子は、遺伝情報の細胞成分への変換に関与する様々なプロセスを調節することができる。いくつかの制御分子は、mRNAの産生を調節することが知られており、標的遺伝子(例えば、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1)に指向される場合、例えば、脊髄小脳失調症、ハンチントン病、ハンチントン病様症候群、球脊髄性筋萎縮症、及び歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症、フックス角膜内皮ジストロフィーなどの疾患を引き起こす標的遺伝子mRNAの産生を調節し、これらの疾患の進行を逆転させる。
本開示は、CAG又はCTGトリヌクレオチド反復配列を含む標的遺伝子の近傍へ制御分子をリクルートするための化合物及び方法を提供する。本明細書に開示される化合物には、(a)標的遺伝子と選択的に結合するDNA結合部分、任意に連結する(b)制御分子と結合するであろうリクルート部分が含まれる。化合物は、以下の方法で欠損標的遺伝子の発現に対抗するであろう:
(1)DNA結合部分は、標的遺伝子の特徴的なCAGトリヌクレオチド反復配列を選択的に結合するであろう、
(2)したがって、DNA結合部分と結合されたリクルート部分は、標的遺伝子に近接して保持されるであろう、
(3)標的遺伝子に現在近接しているリクルート部分は、制御分子を遺伝子の近傍へリクルートするであろう、及び
(4)制御分子は、標的遺伝子の発現を調節し、したがって、遺伝子との直接的な相互作用によって、欠損mRNAの発現に対抗するであろう。
(1)DNA結合部分は、標的遺伝子の特徴的なCAGトリヌクレオチド反復配列を選択的に結合するであろう、
(2)したがって、DNA結合部分と結合されたリクルート部分は、標的遺伝子に近接して保持されるであろう、
(3)標的遺伝子に現在近接しているリクルート部分は、制御分子を遺伝子の近傍へリクルートするであろう、及び
(4)制御分子は、標的遺伝子の発現を調節し、したがって、遺伝子との直接的な相互作用によって、欠損mRNAの発現に対抗するであろう。
DNA結合部分は、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1の特徴的なCAGトリヌクレオチド反復配列を選択的に結合するか、又はDNA結合部分は、dmpkの特徴的なCTGトリヌクレオチド反復配列を選択的に結合する。したがって、DNA結合部分に結合されたリクルート部分は、標的遺伝子に近接して保持され、制御分子を遺伝子の近傍へリクルートし、制御分子は、発現を調節し、したがって、標的遺伝子との直接相互作用によって欠陥標的遺伝子の産生に対抗する。
このメカニズムは、欠陥dmpkの発現によって引き起こされるDM1の効果的な治療を提供する。追加的に、メカニズムは、欠陥atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、及び/又はatn1の発現によって引き起こされる、脊髄小脳失調症、ハンチントン病、ハンチントン病様症候群、球脊髄性筋萎縮症、及び歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症に対する有効な治療を提供する。したがって、欠陥標的遺伝子の発現の修正は、これらの疾患の治療のための有効な方法を表す。
本開示は、制御分子と結合するリクルート部分を提供する。制御分子の低分子阻害剤は、これらの阻害剤が通常、制御分子との非共有結合を介して作用するため、リクルート部分の設計のための鋳型として機能する。
本開示は更に、欠損標的遺伝子の特徴であるCAG又はCTGトリヌクレオチド反復の1つ以上のコピーと選択的に結合するDNA結合部分を提供する。欠損標的遺伝子に関連する高いCAG又はCTG数のために可能になった、標的遺伝子とのDNA結合部分の選択的な結合は、リクルート部分を遺伝子の近傍へ向け、制御分子を遺伝子転写を調節する位置にリクルートする。
DNA結合部分は、標的CAG又はCTG配列と選択的に結合するポリアミドセグメントを含む。例えば、Dervan(米国特許第9,630,950号及び同第8,524,899号)などによって設計されたポリアミドは、選択されたDNA配列と選択的に結合することができる。これらのポリアミドは二重らせんDNAの副溝に位置し、ワトソン-クリック塩基対と水素結合相互作用を形成する。特定のDNA配列に選択的に結合するポリアミドは、確立された化学的規則に従ってモノアミド構成要素を連結することによって設計することができる。各DNA塩基対に1つの構成要素が提供され、各構成要素は、DNA塩基対:A/T、T/A、G/C、及びC/Gのうちの1つと非共有結合的かつ選択的に結合する。このガイドラインに従って、トリヌクレオチドは、3つのアミド単位、すなわちトリアミドで分子と結合する。一般に、これらのポリアミドは、DNA配列のいずれかの方向に配向することができる。
原則として、より長いDNA配列は、より多くのモノアミド構成要素をより長いポリアミド鎖に組み合わせることによって、より高い特異性及び/又はより高い親和性で標的化することができる。理想的には、ポリアミドに対する結合親和性は、各個々のモノアミド/DNA塩基対相互作用の合計に単純に等しい。しかしながら、実際には、かなり強固なポリアミドとDNA構造との間の幾何学的ミスマッチのために、より長いポリアミド配列は、単純な付加的寄与から予想されるほどより長いDNA配列に緊密に結合しない。より長いポリアミド配列とより長いDNA配列との間の幾何学的ミスマッチは、そうでなければ予想される結合親和性から差し引く好ましくない幾何学的ひずみを誘導する。
本開示は、可撓性スペーサー(例えば、DNA結合部分をタンパク質結合部分と接続するリンカー部分)によって接続されたDNA結合部分(例えば、マルチアミンサブユニットを含むポリアミド)を含む転写モジュレータ分子を提供する。スペーサーは、そうでなければ、より大きなポリアミド配列の結合親和性を減少させるであろう幾何学的ひずみを軽減する。
本明細書に開示されるのは、CAG又はCTGトリヌクレオチド反復配列の1つ以上のコピーと結合することができ、CAG又はCTGトリヌクレオチド反復配列を含む標的遺伝子の発現を調節することができるポリアミド部分を含む化合物である。これらの化合物による対象の治療は、欠損標的遺伝子の発現を調節し、これは、疾患に関連する症状の発生、重症度、又は頻度を低減することができる。本明細書に開示される特定の化合物は、このクラスの化合物について以前に観察されたよりも高い結合親和性及び選択性を提供する。
しかしながら、本開示の趣旨及び範囲内の様々な変更及び修正がこの発明を実施するための形態から当業者には明らかとなるため、実施するための形態及び具体的な実施例は、具体的な実施形態を示すものであるが、単に例示のみのために提供されていることが理解されるべきである。
参照による援用
本明細書において言及される全ての刊行物、特許、及び特許出願は、各個々の刊行物、特許、又は特許出願が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されたときと同じ程度に、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書において言及される全ての刊行物、特許、及び特許出願は、各個々の刊行物、特許、又は特許出願が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されたときと同じ程度に、参照により本明細書に組み込まれる。
本開示の様々な態様は、添付の特許請求の範囲に詳細に述べられる。本開示の原理が利用される例示的な実施形態を記載する以下の詳細な説明、及び以下の添付の図面を参照することにより、本開示の特徴及び利点のより良い理解が得られるであろう。
本明細書に記載の転写モジュレータ分子は、分子が、ヌクレオチド反復CAG又はCTGを含む標的遺伝子の発現を制御するようにプログラムできるという点で、化学、生物学、及び精密医学の界面を表す。本明細書で使用される場合、「CAG」又は「CTG」は、ヌクレオチドCAG及びその相補的配列CTGを指す。当業者であれば、CAGトリヌクレオチド(5’-3’方向)を含む配列も、その相補鎖上にCTGトリヌクレオチドを有し、1つの鎖内に複数のCAG反復を有する配列も、相補鎖上に複数のCTG反復を有することを理解するであろう。したがって、「CAG又はCTG」反復へのポリアミド結合は、CAG及び/又はその相補的配列CTGとのポリアミド結合を意味し得る。
転写モジュレータ分子は、欠損標的遺伝子(例えば、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の特徴であるCAG又はCTGトリヌクレオチド反復の1つ以上のコピーと選択的に結合するDNA結合部分を含む。転写モジュレータ分子はまた、制御タンパク質と結合する部分も含む。標的遺伝子の選択的な結合は、制御タンパク質を標的遺伝子に近接させ、したがって、標的遺伝子の転写を下方調節する。本明細書に開示される分子及び化合物は、このクラスの化合物について以前に観察されたよりも高い結合親和性及び選択性を提供し、欠損標的遺伝子に関連する疾患の治療においてより効果的であり得る。
これらの化合物による対象の治療は、欠損標的遺伝子の発現を調節し、これは、遺伝性疾患(例えば、DM1など)に関連する症状の発生、重症度、又は頻度を低減することができる。本明細書に記載の転写モジュレータ分子は、制御分子をリクルートして、欠損標的遺伝子の発現を調節し、疾患に関連する症状を効果的に治療及び軽減する。
転写モジュレータ分子
本明細書に開示される転写モジュレータ分子又は化合物は、1つ以上のCAG又はCTG反復(例えば、dmpk又はatxn1)を有する標的遺伝子の転写を調節するための有用な活性を有し、標的遺伝子(例えば、dmpk又はatxn1)が活性的な役割を果たす疾患若しくは状態の治療又は予防に使用され得る。したがって、広範な態様では、特定の実施形態は、本明細書に開示される1つ以上の化合物を薬学的に許容され得る担体と一緒に含む薬学的組成物、並びに化合物及び組成物を製造及び使用する方法も提供する。特定の実施形態は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現を調節するための方法を提供する。他の実施形態は、かかる治療を必要とする患者における、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1媒介性障害を治療するための方法であって、治療有効量の本開示による化合物又は組成物を当該患者に投与することを含む方法を提供する。dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatnlの発現の調節によって緩和された疾患又は状態の治療のための薬剤の製造に使用するための、本明細書に開示される特定の転写モジュレータ分子(すなわち、化合物)の使用も提供される。
本明細書に開示される転写モジュレータ分子又は化合物は、1つ以上のCAG又はCTG反復(例えば、dmpk又はatxn1)を有する標的遺伝子の転写を調節するための有用な活性を有し、標的遺伝子(例えば、dmpk又はatxn1)が活性的な役割を果たす疾患若しくは状態の治療又は予防に使用され得る。したがって、広範な態様では、特定の実施形態は、本明細書に開示される1つ以上の化合物を薬学的に許容され得る担体と一緒に含む薬学的組成物、並びに化合物及び組成物を製造及び使用する方法も提供する。特定の実施形態は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現を調節するための方法を提供する。他の実施形態は、かかる治療を必要とする患者における、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1媒介性障害を治療するための方法であって、治療有効量の本開示による化合物又は組成物を当該患者に投与することを含む方法を提供する。dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatnlの発現の調節によって緩和された疾患又は状態の治療のための薬剤の製造に使用するための、本明細書に開示される特定の転写モジュレータ分子(すなわち、化合物)の使用も提供される。
いくつかの実施形態では、転写モジュレータ分子は、第1の末端、第2の末端、及びオリゴマー骨格を有する化合物であり、a)第1の末端は、ヌクレオチド反復配列CAG又はCTGと非共有結合することができるDNA結合部分を含み、b)第2の末端は、ヌクレオチド反復配列CAG又はCTGを含む遺伝子の発現を調節する制御分子と結合するタンパク質結合部分を含み、c)オリゴマー骨格は、第1の末端と第2の末端との間にリンカーを含む。いくつかの実施形態では、第2の末端は、Brd4結合部分ではない。いくつかの実施形態では、ヌクレオチドは、CAGである。いくつかの実施形態では、ヌクレオチドは、CTGである。
いくつかの実施形態では、化合物は、式(I)の構造、
X-L-Y
式(I)
又はその塩を有し、式中、
Xは、核内の制御部分と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Yは、トリヌクレオチド反復配列CAG又はCTGの1つ以上のコピーと非共有結合することができるDNA認識部分を含み、
Lは、リンカー部分である。
X-L-Y
式(I)
又はその塩を有し、式中、
Xは、核内の制御部分と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Yは、トリヌクレオチド反復配列CAG又はCTGの1つ以上のコピーと非共有結合することができるDNA認識部分を含み、
Lは、リンカー部分である。
いくつかの実施形態では、制御分子は、ポリコーム群(PcG)タンパク質である。特定の実施形態では、制御分子は、ポリコーム抑制複合体(PRC)である。いくつかの実施形態では、制御分子は、それぞれポリコーム抑制複合体1又はポリコーム抑制複合体2、PRC1及びPRC2である。いくつかの実施形態では、制御分子は、CBX2、CBX4。CBX6、CBX7、及びCBX8から選択されるポリコームパラログである。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、Yであり、第2の末端は、Xであり、オリゴマー骨格は、Lである。
いくつかの実施形態では、化合物は、構造式(II)
X-L-(Y1-Y2-Y3)n-Y0
式(II)
又はその塩を有し、式中、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Lは、リンカー部分であり、
Y1、Y2、及びY3は、内部サブユニットであり、それらの各々は、複素環又はC1-6直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含み、それらの各々は、その2つの隣接物と化学的に結合し、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
各サブユニットは、CAG又はCTG反復配列内の個々のヌクレオチドと非共有結合することができ、
nは、1~15の包括的な整数であり、
(Y1-Y2-Y3)n-Y0が結合して、トリヌクレオチド配列CAG又はCTGの1つ以上のコピーと非共有結合することができるDNA認識部分を形成する。
X-L-(Y1-Y2-Y3)n-Y0
式(II)
又はその塩を有し、式中、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Lは、リンカー部分であり、
Y1、Y2、及びY3は、内部サブユニットであり、それらの各々は、複素環又はC1-6直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含み、それらの各々は、その2つの隣接物と化学的に結合し、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
各サブユニットは、CAG又はCTG反復配列内の個々のヌクレオチドと非共有結合することができ、
nは、1~15の包括的な整数であり、
(Y1-Y2-Y3)n-Y0が結合して、トリヌクレオチド配列CAG又はCTGの1つ以上のコピーと非共有結合することができるDNA認識部分を形成する。
いくつかの実施形態では、構造式IIの化合物は、CAG又はCTG反復配列中の個々のヌクレオチドごとにサブユニットを含む。特定の実施形態では、構造式(II)の化合物は、CAG配列中の個々のヌクレオチドごとにサブユニットを含む。特定の実施形態では、構造式IIの化合物は、CTG反復配列中の個々のヌクレオチドごとにサブユニットを含む。
いくつかの実施形態では、各内部サブユニットは、アミノ(-NH-)基及びカルボキシ(-CO-)基を有する。
特定の実施形態では、構造式(II)の化合物は、内部サブユニットの各対の間にアミド(-NHCO-)結合を含む。
いくつかの実施形態では、構造式(II)の化合物は、Lと最も左の内部サブユニットとの間にアミド(-NHCO-)結合を含む。
いくつかの実施形態では、構造式(II)の化合物は、最も右側の内部サブユニットと末端サブユニットとの間にアミド結合を含む。
特定の実施形態では、各サブユニットは、独立して、複素環及び脂肪族鎖から選択される部分を含む。
いくつかの実施形態では、複素環は、単環式複素環である。特定の実施形態では、複素環は、単環式5員複素環である。特定の実施形態では、各複素環は、独立して、N、O、又はSから選択されるヘテロ原子を含む。特定の実施形態では、各複素環は、独立して、ピロール、イミダゾール、トリアゾール、オキサゾール、チオフェン、及びフランから選択される。
いくつかの実施形態では、脂肪族鎖は、C1-6直鎖脂肪族鎖である。特定の実施形態では、脂肪族鎖は、構造式-(CH2)m-を有し、mは、1、2、3、4、及び5から選択される。特定の実施形態では、脂肪族鎖は、-CH2CH2-である。
いくつかの実施形態では、各サブユニットは、独立して、
いくつかの実施形態では、Pyは、
いくつかの実施形態では、nは、1~5の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、nは、1~3の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、nは、1~2の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、nは、1である。
いくつかの実施形態では、Lは、C1-C6直鎖脂肪族セグメントを含む。
いくつかの実施形態では、Lは、(CH2OCH2)mを含み、mは、1~20の包括的な整数である。特定の更なる実施形態では、mは、1~10の包括的な整数である。特定の更なる実施形態では、mは、1~5の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、化合物は、式(III)の構造、
X-L-(Y1-Y2-Y3)-(W-Y1-Y2-Y3)n-Y0
式(III)
又はその塩を有し、式中、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Lは、リンカー部分であり、
Y1、Y2、及びY3は、内部サブユニットであり、それらの各々は、複素環又はC1-6直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含み、それらの各々は、その2つの隣接物と化学的に結合し、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
各サブユニットは、CAG又はCTG反復配列内の個々のヌクレオチドと非共有結合することができ、
Wは、スペーサーであり、
nは、1~10の間の包括的な整数であり、
(Y1-Y2-Y3)-(W-Y1-Y2-Y3)n-Y0が結合して、トリヌクレオチド反復配列CAG又はCTGの1つ以上のコピーと非共有結合することができるDNA認識部分を形成する。
X-L-(Y1-Y2-Y3)-(W-Y1-Y2-Y3)n-Y0
式(III)
又はその塩を有し、式中、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Lは、リンカー部分であり、
Y1、Y2、及びY3は、内部サブユニットであり、それらの各々は、複素環又はC1-6直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含み、それらの各々は、その2つの隣接物と化学的に結合し、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
各サブユニットは、CAG又はCTG反復配列内の個々のヌクレオチドと非共有結合することができ、
Wは、スペーサーであり、
nは、1~10の間の包括的な整数であり、
(Y1-Y2-Y3)-(W-Y1-Y2-Y3)n-Y0が結合して、トリヌクレオチド反復配列CAG又はCTGの1つ以上のコピーと非共有結合することができるDNA認識部分を形成する。
いくつかの実施形態では、Y1-Y2-Y3は、
いくつかの実施形態では、Y1-Y2-Y3は、Im-β-Pyである。
いくつかの実施形態では、化合物は、式(IV)の構造、
X-L-(Y1-Y2-Y3)-V-(Y4-Y5-Y6)-Y0
式(IV)
又はその塩を有し、式中、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Y1、Y2、Y3、Y4、Y5、及びY6は、内部サブユニットであり、それらの各々は、複素環又はC1-6直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含み、それらの各々は、その2つの隣接物と化学的に結合し、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
各サブユニットは、CAG又はCTG反復配列内の個々のヌクレオチドと非共有結合することができ、
Lは、リンカー部分であり、
Vは、ヘアピンカーブを形成するためのカーブ構成要素であり、
(Y1-Y2-Y3)-V-(Y4-Y5-Y6)-Y0が結合して、トリヌクレオチド反復配列CAG又はCTGの1つ以上のコピーと非共有結合することができるDNA認識部分を形成する。
X-L-(Y1-Y2-Y3)-V-(Y4-Y5-Y6)-Y0
式(IV)
又はその塩を有し、式中、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Y1、Y2、Y3、Y4、Y5、及びY6は、内部サブユニットであり、それらの各々は、複素環又はC1-6直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含み、それらの各々は、その2つの隣接物と化学的に結合し、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
各サブユニットは、CAG又はCTG反復配列内の個々のヌクレオチドと非共有結合することができ、
Lは、リンカー部分であり、
Vは、ヘアピンカーブを形成するためのカーブ構成要素であり、
(Y1-Y2-Y3)-V-(Y4-Y5-Y6)-Y0が結合して、トリヌクレオチド反復配列CAG又はCTGの1つ以上のコピーと非共有結合することができるDNA認識部分を形成する。
いくつかの実施形態では、Vは、-HN-CH2CH2CH2-CO-である。
いくつかの実施形態では、化合物は、式(Va)の構造、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
nは、1~5の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、化合物は、式(VI)の構造、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
nは、1~5の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、化合物は、式(VII)の構造、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Wは、スペーサーであり、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
nは、1~200の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、化合物は、構造式(VII)を有し、
Wは、-NHCH2-(CH2OCH2)p-CH2CO-であり、
pは、1~4の包括的な整数である。
Wは、-NHCH2-(CH2OCH2)p-CH2CO-であり、
pは、1~4の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、化合物は、式(VIII)の構造、
Xは、核内の制御分子と非共有結合することができるリクルート部分を含み、
Vは、ヘアピンカーブを形成するためのカーブ構成要素であり、
Y0は、複素環又は直鎖脂肪族セグメントから選択される部分を含む末端サブユニットであり、その単一の隣接する部分と化学的に結合し、
nは、1~200の包括的な整数である。
構造式(VIII)の化合物のいくつかの実施形態では、Vは、-(CH2)q-NH-(CH2)q-であり、qは、2~4の包括的な整数である。
いくつかの実施形態では、Vは、-(CH2)a-NR1-(CH2)b-、-(CH2)a-、-(CH2)a-O-(CH2)b-、-(CH2)a-CH(NHR1)-、-(CH2)a-CH(NHR1)-、-(CR2R3)a-、又は-(CH2)a-CH(NR1
3)+-(CH2)b-であり、式中、各aは、独立して、2~4の整数であり、R1は、H、任意に置換されるC1-6アルキル、任意に置換されるC3-10シクロアルキル、任意に置換されるC6-10アリール、任意に置換される4~10員ヘテロシクリル、又は任意に置換される5~10員ヘテロアリールであり、各R2及びR3は、独立して、H、ハロゲン、OH、NHAc、又はC1-4アルキルである。いくつかの実施形態では、R1は、Hである。いくつかの実施形態では、R1は、-C(O)-フェニルから選択される1~3個の置換基により任意に置換されるC1-6アルキルである。いくつかの実施形態では、Vは、-(CR2R3)-(CH2)a-又は-(CH2)a-(CR2R3)-(CH2)b-であり、式中、各aは、独立して、1~3であり、bは、0~3であり、各R2及びR3は、独立してH、ハロゲン、OH、NHAc、又はC1-4アルキルである。いくつかの実施形態では、Vは、-(CH2)-CH(NH3)+-(CH2)-又は-(CH2)-CH2CH(NH3)+-である。
一態様では、本開示の化合物は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttpk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1のCAG又はCTGと結合し、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の近傍に制御部分をリクルートする。制御部分は、それらが遺伝子と近接しているため、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttpk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現を調節する可能性が高いであろう。
また、式(I)~(VIII)の化合物を含む、上に開示された任意の化合物が、単独、部分的、又は完全に重水素化されている実施形態も提供される。重水素を水素に交換する方法は、当該技術分野で既知である。
また、上記の任意の実施形態が、これらの実施形態のいずれか1つ以上と組み合わされ得る実施形態も提供されるが、ただし、組み合わせは相互に排他的ではない。
本明細書で使用される場合、2つの実施形態は、一方が他方とは異なるものであると定義される場合、「相互に排他的」である。例えば、2つの基が結合してシクロアルキルを形成する実施形態は、一方の基がエチルであり、他方の基が水素である実施形態と相互に排他的である。同様に、1つの基がCH2である実施形態は、同じ基がNHである実施形態と相互に排他的である。
一態様では、本開示の化合物は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttpk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1のCAG又はCTGと結合し、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の近傍に制御部分をリクルートする。制御部分は、それらが遺伝子と近接しているため、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現を調節する可能性が高いであろう。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の分子は、atxn1、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、及びatn1のCAGに結合する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の分子は、TCF4をコードする遺伝子のCAGと結合する。いくつかの実施形態では、本開示の分子は、dmpkのCTGと結合する。いくつかの実施形態では、本開示の分子は、TCF4遺伝子のCAGと結合する。
一態様では、本開示の分子は、CAG又はCTG反復配列中の各塩基対に対する単一のポリアミドサブユニットの相互作用のためのポリアミド配列を提供する。一態様では、本開示の分子は、分子のCAG又はCTGとのヘアピン結合を可能にするためにカーブ構成要素Vを提供し、各ヌクレオチド対がポリアミドの2つのサブユニットと相互作用する。
一態様では、本開示の分子は、CAG又はCTGとの非共有結合のためのポリアミド配列の1つを超えるコピーを提供する。一態様では、本開示の分子は、単一のポリアミド配列を含む対応する分子よりも高い親和性でdmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1と結合する。
一態様では、本開示の分子は、CAT又はCTGとの非共有結合のためのポリアミド配列の1つを超えるコピーを提供し、この分子中の個々のポリアミド配列は、上で定義したように、スペーサーWによって連結される。スペーサーWは、この分子が、そうでなければ、より長いポリアミド配列の非共有結合に影響を与える幾何ひずみを緩和するために必要に応じてその幾何学的形状を調整することを可能にする。
第1の末端DNA結合部分
第1の末端は、遺伝子、特にCAG又はCTG配列の副溝と相互作用して結合する。一態様では、本開示の分子は、CAG又はCTG反復配列中の各塩基対に対する単一のポリアミドサブユニットの相互作用のためのポリアミド配列を提供する。一態様では、本開示の分子は、分子のCAG又はCTGとのヘアピン結合を可能にするためにカーブ構成要素(例えば、脂肪族アミノ酸部分)を提供し、各ヌクレオチド対がポリアミドの2つのサブユニットと相互作用する。
第1の末端は、遺伝子、特にCAG又はCTG配列の副溝と相互作用して結合する。一態様では、本開示の分子は、CAG又はCTG反復配列中の各塩基対に対する単一のポリアミドサブユニットの相互作用のためのポリアミド配列を提供する。一態様では、本開示の分子は、分子のCAG又はCTGとのヘアピン結合を可能にするためにカーブ構成要素(例えば、脂肪族アミノ酸部分)を提供し、各ヌクレオチド対がポリアミドの2つのサブユニットと相互作用する。
一態様では、本開示の分子は、CAG又はCTGとの非共有結合のためのポリアミド配列の1つを超えるコピーを提供する。一態様では、本開示の分子は、単一のポリアミド配列を含む対応する分子よりも高い親和性でdmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1と結合する。一態様では、本開示の分子は、単一のポリアミド配列を含む対応する分子よりも高い親和性でdmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1と結合する。
一態様では、本開示の分子は、CAG又はCTGとの非共有結合のためのポリアミド配列の1つを超えるコピーを提供し、この分子中の個々のポリアミド配列は、上で定義したように、スペーサーWによって連結される。スペーサーWは、この分子が、そうでなければ、より長いポリアミド配列の非共有結合に影響を与える幾何ひずみを緩和するために必要に応じてその幾何学的形状を調整することを可能にする。
いくつかの実施形態では、DNA認識又は結合部分は、DNAの副溝と結合する。
いくつかの実施形態では、DNA認識又は結合部分はモノマーのポリマー配列を含み、ポリマー中の各モノマーは特定のDNA塩基対と選択的に結合する。
いくつかの実施形態では、DNA認識又は結合部分はポリアミド部分を含む。
特定の実施形態では、DNA認識又は結合部分は、ヘテロ芳香族モノマーを含むポリアミド部分を含み、各ヘテロ芳香族モノマーは、特定のヌクレオチドに非共有結合し、各ヘテロ芳香族モノマーは、アミド結合を介してその隣接物又は複数の隣接物と結合する。
いくつかの実施形態では、DNA認識部分は、少なくとも1000ヌクレオチド反復を含む配列と結合する。特定の実施形態では、DNA認識部分は、少なくとも500ヌクレオチド反復を含む配列と結合する。特定の実施形態では、DNA認識部分は、少なくとも200ヌクレオチド反復を含む配列と結合する。特定の実施形態では、DNA認識部分は、少なくとも100ヌクレオチド反復を含む配列と結合する。特定の実施形態では、DNA認識部分は、少なくとも50ヌクレオチド反復を含む配列と結合する。特定の実施形態では、DNA認識部分は、少なくとも20ヌクレオチド反復を含む配列と結合する。
特定の実施形態では、各サブユニットは、独立して、複素環及び脂肪族鎖から選択される部分を含む。
特定の実施形態では、複素環は、単環式複素環である。特定の実施形態では、複素環は、単環式5員複素環である。特定の実施形態では、各複素環は、独立して、N、O、又はSから選択されるヘテロ原子を含む。特定の実施形態では、各複素環は、独立して、ピロール、イミダゾール、チアゾール、オキサゾール、チオフェン、及びフランから選択される。
特定の実施形態では、脂肪族鎖は、C1-6直鎖脂肪族鎖である。特定の実施形態では、脂肪族鎖は、構造式-(CH2)m-を有し、mは、1、2、3、4、及び5から選択される。特定の実施形態では、脂肪族鎖は、-CH2CH2-である。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、-NH-Q-C(O)-を含み、式中、Qは、任意に置換されるC6-10アリーレン基、任意に置換される4~10員のヘテロシクレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン基、又は任意に置換されるアルキレン基である。いくつかの実施形態では、Qは、任意に置換されるC6-10アリーレン基又は任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン基である。いくつかの実施形態では、Qは、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン基である。いくつかの実施形態では、5~10員ヘテロアリーレン基は、H、OH、ハロゲン、C1-10アルキル、NO2、CN、NR′R″、C1-6ハロアルキル、C1-6アルコキシル、C1-6ハロアルコキシ、(C1-6アルコキシ)C1-6アルキル、C2-10アルケニル、C2-10アルキニル、C3-7カルボシクリル、4~10員ヘテロシクリル、C6-10アリール、5~10員ヘテロアリール、(C3-7カルボシクリル)C1-6アルキル、(4~10員ヘテロシクリル)C1-6アルキル、(C6-10アリール)C1-6アルキル、(C6-10アリール)C1-6アルコキシ、(5~10員ヘテロアリール)C1-6アルキル、(C3-7カルボシクリル)-アミン、(4~10員ヘテロシクリル)アミン、(C6-10アリール)アミン、(5~10員ヘテロアリール)アミン、アシル、C-カルボキシ、O-カルボキシ、C-アミド、N-アミド、S-スルホンアミド、N-スルホンアミド、-SR’、COOH、又はCONR′R″から選択される1~4個の置換基で任意に置換され、各R′及びR″が、独立して、H、C1-10アルキル、C1-10ハロアルキル、C1-10アルコキシルである。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、ヌクレオチド反復配列CAG又はCTGに対応するように選択された少なくとも3つの芳香族カルボキサミド部分と、グリシン、β-アラニン、γ-アミノ酪酸、2,4-ジアミノ酪酸、及び5-アミノ吉草酸からなる群から選択された少なくとも1つの脂肪族アミノ酸残基と、を含む。いくつかの実施形態では、第1の末端は、少なくとも1つのβ-アラニンサブユニットを含む。
いくつかの実施形態では、モノマー要素は、独立して、任意に置換されるピロールカルボキサミドモノマー、任意に置換されるイミダゾールカルボキサミドモノマー、任意に置換されるC-C結合ヘテロ単環式/ヘテロ二環式部分、及びβ-アラニンからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、第1の末端は、任意に置換されるN-メチルピロール、任意に置換されるN-メチルイミダゾール、及びβ-アラニン(β)からなる群から選択される1つ以上のサブユニットを含む。
選択されるポリアミドの形態は、標的遺伝子に基づいて変化し得る。第1の末端は、直鎖ポリアミド、ヘアピンポリアミド、Hピンポリアミド、重複ポリアミド、スリップポリアミド、環状ポリアミド、タンデムポリアミド、及び伸長ポリアミドからなる群から選択されるポリアミドを含むことができる。いくつかの実施形態では、第1の末端は、直鎖ポリアミドを含む。いくつかの実施形態では、第1の末端は、ヘアピンポリアミドを含む。
ポリアミドと標的遺伝子との間の結合親和性は、ポリアミドの組成に基づいて調整することができる。いくつかの実施形態では、ポリアミドは、約600nM、約500nM、約400nM、約300nM、約250nM、約200nM、約150nM、約100nM、又は約50nM未満の親和性でDNAと結合することができる。いくつかの実施形態では、ポリアミドは、約300nM未満の親和性でDNAと結合することができる。いくつかの実施形態では、ポリアミドは、約200nM未満の親和性でDNAと結合することができる。いくつかの実施形態では、ポリアミドは、約200nM、約150nM、約100nM、約50nM、約10nM、又は約1nMを超える親和性でDNAと結合することができる。いくつかの実施形態では、ポリアミドは、約1~600nM、10~500nM、20~500nM、50~400nM、又は100~300nMの範囲の親和性でDNAと結合することができる。
ポリアミドと標的DNAとの間の結合親和性は、定量的フットプリント滴定実験を使用して判定することができる。実験は、標準ポリアミドアッセイ溶液条件又は近似細胞内溶液条件のいずれかを使用して、24℃又は37℃のいずれかで標的配列に対するポリアミドの解離定数Kdを測定することを伴う。
制御タンパク質と第2の末端上のリガンドとの間の結合親和性は、特定のタンパク質に好適なアッセイを使用して判定することができる。実験は、タンパク質に対するリガンドの解離定数Kdを測定し、標準的なタンパク質アッセイ溶液条件又は近似的な近似細胞内溶液条件のいずれかを使用することを伴う。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、式(A-1)の構造、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物を含み、
-L1a-[A-M]p1-L2a-[M-A]q1-E1
式(A-1)
式中、
L1aは、結合、C1-6アルキレン、-NH-C0-6アルキレン-C(O)-、-N(CH3)-C0-6アルキレン、又は-O-C0-6アルキレンであり、
L2aは、結合、C1-6アルキレン、-NH-C0-6アルキレン-C(O)-、-N(CH3)-C0-6アルキレン、-O-C0-6アルキレン、-(CH2)a1-NRa-(CH2)b1-、-(CH2)a-、-(CH2)a1-O-(CH2)b1-、-(CH2)a1-CH(NHRa)-、-(CH2)a1-CH(NHRa)-、又は-(CH2)a1-CH(NRaRb)-(CH2)b1-であり、
各a1及びb1は、独立して、2~4の整数であり、
各Ra及びRbは、独立して、H、任意に置換されるC1-6アルキル、任意に置換されるC3-10シクロアルキル、任意に置換されるC6-10アリール、任意に置換される4~10員ヘテロシクリル、及び任意に置換される5~10員ヘテロアリールから選択され、
各[A-M]は、p1回出現し、p1は、1~10の範囲の整数であり、
各[M-A]は、q1回出現し、q1は、1~10の範囲の整数であり、
各Aは、結合、C1-10アルキレン、任意に置換されるC6-10アリーレン基、任意に置換される4~10員ヘテロシクレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン基、-C1-10アルキレン-C(O)-、-C1-10アルキレン-NRa-、-CO-、-NRa-、-CONRa-、-CONRaC1-4アルキレン-、-NRaCO-C1-4アルキレン-、-C(O)O-、-O-、-S-、-C(=S)-NH-、-C(O)-NH-NH-、-C(O)-N=N-、-C(O)-CH=CH-、(CH2)0-4-CH=CH-(CH2)0-4、-N(CH3)-C1-6アルキレン、
-L1a-[A-M]p1-L2a-[M-A]q1-E1
式(A-1)
式中、
L1aは、結合、C1-6アルキレン、-NH-C0-6アルキレン-C(O)-、-N(CH3)-C0-6アルキレン、又は-O-C0-6アルキレンであり、
L2aは、結合、C1-6アルキレン、-NH-C0-6アルキレン-C(O)-、-N(CH3)-C0-6アルキレン、-O-C0-6アルキレン、-(CH2)a1-NRa-(CH2)b1-、-(CH2)a-、-(CH2)a1-O-(CH2)b1-、-(CH2)a1-CH(NHRa)-、-(CH2)a1-CH(NHRa)-、又は-(CH2)a1-CH(NRaRb)-(CH2)b1-であり、
各a1及びb1は、独立して、2~4の整数であり、
各Ra及びRbは、独立して、H、任意に置換されるC1-6アルキル、任意に置換されるC3-10シクロアルキル、任意に置換されるC6-10アリール、任意に置換される4~10員ヘテロシクリル、及び任意に置換される5~10員ヘテロアリールから選択され、
各[A-M]は、p1回出現し、p1は、1~10の範囲の整数であり、
各[M-A]は、q1回出現し、q1は、1~10の範囲の整数であり、
各Aは、結合、C1-10アルキレン、任意に置換されるC6-10アリーレン基、任意に置換される4~10員ヘテロシクレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン基、-C1-10アルキレン-C(O)-、-C1-10アルキレン-NRa-、-CO-、-NRa-、-CONRa-、-CONRaC1-4アルキレン-、-NRaCO-C1-4アルキレン-、-C(O)O-、-O-、-S-、-C(=S)-NH-、-C(O)-NH-NH-、-C(O)-N=N-、-C(O)-CH=CH-、(CH2)0-4-CH=CH-(CH2)0-4、-N(CH3)-C1-6アルキレン、
各[A-M]及び[M-A]単位の各Mは、独立して、任意に置換されるC6-10アリーレン基、任意に置換される4~10員ヘテロシクレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン基、又は任意に置換されるアルキレンであり、
E1は、任意に置換されるC6-10アリール、任意に置換される4~10員ヘテロシクリル、任意に置換される5~10員ヘテロアリール、任意に置換されるC1-6アルキル、C0-4アルキレン-NHC(=NH)NH、-CN、-C0-4アルキレン-C(=NH)(NRaR2)、-C0-4アルキレン-C(=N+H2)(NRaRb)C1-5アルキレン-NRaRb、C0-4アルキレン-NHC(=NH)Ra、及び任意に置換されるアミンからなる群から選択される。
特定の実施形態では、整数p1及びq1は、2≦p1+q1≦20である。
式(A-1)のいくつかの実施形態では、各Aは、独立して、結合、C1-6アルキレン、任意に置換されるフェニレン、任意に置換されるチオフェニレン、任意に置換されるフラニレン、-C1-10アルキレン-C(O)-、-C1-10アルキレン-NH-、-CO-、-NRa-、-CONRa-、-CONRaC1-4アルキレン-、-NRaCO-C1-4アルキレン-、-C(O)O-、-O-、-S-、-S(O)-、-S(O)2-、-C(=S)-NH-、-C(O)-NH-NH-、-C(O)-N=N-、-C(O)-CH=CH-、-CH=CH-、-NH-N=N-、-NH-C(O)-NH-、-N(CH3)-C1-6アルキレン、及び
いくつかの実施形態では、L3aは、結合である。いくつかの実施形態では、L3aは、C1-6アルキレンである。いくつかの実施形態では、L3aは、-NH-C1-6アルキレン-C(O)-である。いくつかの実施形態では、L3aは、-N(CH3)-C1-6アルキレン-C(O)-である。いくつかの実施形態では、L3aは、-O-C0-6アルキレンである。いくつかの実施形態では、L3aは、-(CH2)a-NRa-(CH2)b-である。いくつかの実施形態では、L3aは、-(CH2)a-O-(CH2)b-である。いくつかの実施形態では、L3aは、-(CH2)a-CH(NHRa)-である。いくつかの実施形態では、L3aは、-(CH2)a-CH(NHRa)-である。いくつかの実施形態では、L3aは、-(CR1aR1b)a-である。いくつかの実施形態では、L3aは、-(CH2)a-CH(NRaRb)-(CH2)b-である。
式(A-1)のいくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、NHであり、少なくとも1つのAは、C(O)である。式(A-1)のいくつかの実施形態では、少なくとも2つのAは、NHであり、少なくとも2つのAは、C(O)である。
いくつかの実施形態では、Mが二環式環である場合、Aは結合である。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、1つ以上のアルキルで任意に置換されるフェニレンである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、1つ以上のアルキルで任意に置換されるチオフェニレンである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、1つ以上のアルキルで任意に置換されるフラニレンである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、(CH2)0-4-CH=CH-(CH2)0-4、好ましくは-CH=CH-である。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、-NH-N=N-である。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、-NH-C(O)-NH-である。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、-N(CH3)-C1-6である。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのAは、
いくつかの実施形態では、1つのAは、C1-6アルキルで任意に置換される、少なくとも1つの窒素を有する5~10員ヘテロアリールである。
いくつかの実施形態では、式(A-1)の[A-M]における各Mは、C6-10アリーレン基、4~10員ヘテロシクレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン基、又はC1-6アルキレンであり、各々が、H、OH、ハロゲン、C1-10アルキル、NO2、CN、NRaRb、C1-6ハロアルキル、-C1-6アルコキシル、C1-6ハロアルコキシ、(C1-6アルコキシ)C1-6アルキル、C2-10アルケニル、C2-10アルキニル、C3-7カルボシクリル、44~10員ヘテロシクリル、C6-10アリール、5~10員ヘテロアリール、-(C3-7カルボシクリル)C1-6アルキル、(4~10員ヘテロシクリル)C1-6アルキル、(C6-10アリール)C1-6アルキル、(C6-10アリール)C1-6アルコキシ、(5~10員ヘテロアリール)C1-6アルキル、-(C3-7カルボシクリル)-アミン、(4~10員ヘテロシクリル)アミン、(C6-10アリール)アミン、(5~10員ヘテロアリール)アミン、アシル、C-カルボキシ、O-カルボキシ、C-アミド、N-アミド、S-スルホンアミド、N-スルホンアミド、-SR’、COOH、又はCONRaRbから選択される1~3個の置換基で任意に置換され、各Ra及びRbは、独立して、H、C1-10アルキル、C1-10ハロアルキル、-C1-10アルコキシルである。いくつかの実施形態では、式(A-1)の[A-M]における各Mは、O、S、及びNから選択される少なくとも1つのヘテロ原子を含む5~10員ヘテロアリーレン、又はC1-6アルキレンであり、ヘテロアリーレン又はC1-6アルキレンは、OH、ハロゲン、C1-10アルキル、NO2、CN、NRaRb、C1-6ハロアルキル、-C1-6アルコキシル、C1-6ハロアルコキシ、C3-7カルボシクリル、4~10員ヘテロシクリル、C6-10アリール、5~10員ヘテロアリール、-SR’、COOH、又はCONRaRbから選択される1~3個の置換基で任意に置換され、各Ra及びRbは、独立して、H、C1-10アルキル、C1-10ハロアルキル、-C1-10アルコキシルである。いくつかの実施形態では、式(A-1)の[A-R]の各Rは、O、S、及びNから選択される少なくとも1つのヘテロ原子を含む5~10員ヘテロアリーレンであり、ヘテロアリーレンは、OH、C1-6アルキル、ハロゲン、及びC1-6アルコキシルから選択される1~3個の置換基で任意に置換される。
式(A-1)のいくつかの実施形態では、少なくとも1つのMは、O、N、Sから選択される少なくとも1個のヘテロ原子を有し、1つ以上のC1-10アルキルで任意に置換される5員ヘテロアリーレンである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのMは、1つ以上のC1-10アルキルで任意に置換されるピロールである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのMは、1つ以上のC1-10アルキルで任意に置換されるイミダゾールである。式(A-1)のいくつかの実施形態では、少なくとも1つのMは、1つ以上のC1-10アルキルで任意に置換されるC2-6アルキレンである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのMは、1つ以上のC1-10アルキルで任意に置換されるピロールである。式(A-1)のいくつかの実施形態では、少なくとも1つのMは、二環式ヘテロアリーレン又はアリーレンである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのMは、1つ以上のC1-10アルキルで任意に置換されるフェニレンである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのMは、1つ以上のC1-10アルキルで任意に置換されるベンゾイミダゾールである。
いくつかの実施形態では、Mは、5~10員ヘテロアリール環である。いくつかの実施形態では、Mは、単環式ヘテロアリール環であり、Mと隣接する少なくとも1つのAは、結合である。
式(A-1)のいくつかの実施形態では、各E1は、独立して、任意に置換されるチオフェン含有部分、任意に置換されるピロール含有部分、任意に置換されるイミダゾール含有部分、又は任意に置換されるアミンを含む。
式(A-1)のいくつかの実施形態では、各E1は、独立して、任意に置換されるN-メチルピロール、任意に置換されるN-メチルイミダゾール、任意に置換されるベンズイミダゾール部分、及び任意に置換される3-(ジメチルアミノ)プロパンアミジルからなる群から選択される部分を含む。特定の実施形態では、各E1は、独立して、チオフェン、ベンゾチオフェン、C-C結合ベンズイミダゾール/チオフェン含有部分、又はC-C結合ヒドロキシベンズイミダゾール/チオフェン含有部分を含む。式(A-1)のいくつかの実施形態では、各E1は、独立して、NH又はCO基も含む。
式(A-1)のいくつかの実施形態では、各E1は、独立して、イソフタル酸、フタル酸、テレフタル酸、モルホリン、N,N-ジメチルベンズアミド、N,N-ビス(トリフルオロメチル)ベンズアミド、フルオロベンゼン、(トリフルオロメチル)ベンゼン、ニトロベンゼン、フェニルアセテート、フェニル2,2,2-トリフルオロアセテート、フェニル二水素ホスフェート、2H-ピラン、2H-チオピラン、安息香酸、イソニコチン酸、及びニコチン酸からなる群から選択される部分を含み、末端基候補のうちのいずれかにおける1、2、又は3個の環員は、独立して、C、N、S、又はOで置換することができ、環と結合する水素のうちのいずれか1、2、3、4、又は5個は、R3aで置換することができ、R5は、独立して、H、OH、ハロゲン、C1-10アルキル、NO2、NH2、C1-10ハロアルキル、-OC1-10ハロアルキル、COOH、及びCONR1cR1dから選択され得、各R1c及びR1dは、独立して、H、C1-10アルキル、C1-10ハロアルキル、又は-C1-10アルコキシルである。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、式(A-2’)
式中、
各X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7は、独立して、O、S、又はNR1Dであり、
各Y1、Y2、Y3、Y4、Y5、Y6、及びY7は、独立して、CH又はNであり、
W1は、水素、任意置換される5~10員ヘテロアリール、C1-C6アルキル、-C(O)-NR1ER1F、-NR1E-C(O)-NR1ER1Fであり、
W2は、水素、任意に置換される5~10員ヘテロアリール、C1-C6アルキル、又は-C(O)-NR1ER1Fであり、
m1は、0、1、2、又は3であり、
n1は、0、1、2、又は3であり、
p1は、1、2、3、又は4であり。
各R1D及びR1Eは、独立して、水素、又は任意に置換されるC1-C6アルキルであり、
R1Fは、水素、任意に置換されるC1-C10アルキル、C1-C10ヘテロアルキル、PEG1-20、又は1つ以上のAAであり、AAは、β-アラニン、リジン、及びアルギニンから選択される1つ以上のアミノ酸であり、
R1Hは、水素、アミノ、シアノ、又は任意に置換されるC1-C10アルキル、C1-C10ヘテロアルキルである。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、W1を介してリンカーと接続される。
いくつかの実施形態では、W2は、-C(O)-NR1ER1Fである。いくつかの実施形態では、W2は、-C(O)NH2である。いくつかの実施形態では、W2は、-C(O)-β-アラニンである。
いくつかの実施形態では、W2は、リンカー部分との結合部位を提供する。いくつかの実施形態では、W2は、-C(O)NH-(CH2)2-C(O)-**であり、式中、リンカー部分が、**で結合する。いくつかの実施形態では、W2は、-C(O)-NH-**であり、式中、リンカー部分が、**で結合する。いくつかの実施形態では、W2は、-C(O)-**であり、式中、リンカー部分が、**で結合する。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、式(A-2)
式中、
各X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7は、独立して、O、S、又はNR1Dであり、
各Y1、Y2、Y3、Y4、Y5、Y6、及びY7は、独立して、CH又はNであり、
W1は、水素、任意置換5~10員ヘテロアリール、C1-C6アルキル、-C(O)-NR1ER1F、-NR1E-C(O)-NR1ER1Fであり
m1は、0、1、2、又は3であり、
n1は、0、1、2、又は3であり、
p1は、1、2、3、又は4であり。
各R1D及びR1Eは、独立して、水素、又は任意に置換されるC1-C6アルキルであり、
R1Fは、水素、任意に置換されるC1-C10アルキル、C1-C10ヘテロアルキル、PEG1-20、又は1つ以上のAAであり、AAは、β-アラニン、リジン、及びアルギニンから選択される1つ以上のアミノ酸である。
いくつかの実施形態では、各X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7は、独立して、-NR1Dであり、式中、R1Dは、C1-C6アルキルである。いくつかの実施形態では、各X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7は、独立して、-NCH3である。いくつかの実施形態では、R1Dは、分枝鎖又は直鎖C1-C6アルキルである。
いくつかの実施形態では、m1は、0又は1であり、n1は、0又は1である。
いくつかの実施形態では、p1は、2又は3である。
いくつかの実施形態では、W1は、水素である。
いくつかの実施形態では、W1は、-C(O)-NR1ER1Fであり、R1D及びR1Eは、独立して、水素、又はC1-C6アルキル、又は任意に置換される5~10員ヘテロアリールである。いくつかの実施形態では、W1は、-C(O)-ピラゾール又は-C(O)-イミダゾールである。
いくつかの実施形態では、W1は、
いくつかの実施形態では、W1は、
いくつかの実施形態では、W1は、水素である。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、式(A-3)
いくつかの実施形態では、第1の末端は、式(A-4)
いくつかの実施形態では、第1の末端は、式(A-5)
いくつかの実施形態では、第1の末端は、
本明細書に記載の分子の第1の末端は、CAG又はCTGの複数の反復を有する配列に対して高い結合親和性を有し、他のヌクレオチド反復又は他のヌクレオチド配列よりも優先的に標的ヌクレオチド反復と結合する。いくつかの実施形態では、第1の末端は、CGGの反復を有する配列よりも、CAG又はCTGの複数の反復を有する配列に対してより高い結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、第1の末端は、CCGの反復を有する配列よりも、CAG又はCTGの複数の反復を有する配列に対してより高い結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、第1の末端は、CCTGの反復を有する配列よりも、CAG又はCTGの複数の反復を有する配列に対してより高い結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、第1の末端は、TGGAAの反復を有する配列よりも、CAG又はCTGの複数の反復を有する配列に対してより高い結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、第1の末端は、GGGGCCの反復を有する配列よりも、CAG又はCTGの複数の反復を有する配列に対してより高い結合親和性を有する。いくつかの実施形態では、第1の末端は、GAAの反復を有する配列よりも、CAG又はCTGの複数の反復を有する配列に対してより高い結合親和性を有する。
第1の末端と標的ヌクレオチド反復との間の優先的結合により、本明細書に記載の転写モジュレータ分子は、CAG又はCTGの複数の反復を有する領域の周りに局在化するようになる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第1の末端又は分子の局在性濃度は、CGGの繰り返しを有する配列の近くよりも、CAG又はCTGの複数の繰り返しを有する配列の近くの方がより高い。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第1の末端又は分子の局在性濃度は、CCGの繰り返しを有する配列の近くよりも、CAG又はCTGの複数の繰り返しを有する配列の近くの方がより高い。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第1の末端又は分子の局在性濃度は、CCTGの繰り返しを有する配列の近くよりも、CAG又はCTGの複数の繰り返しを有する配列の近くの方がより高い。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第1の末端又は分子の局在性濃度は、TGGAAの繰り返しを有する配列の近くよりも、CAG又はCTGの複数の繰り返しを有する配列の近くの方がより高い。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第1の末端又は分子の局在性濃度は、GGGGCCの繰り返しを有する配列の近くよりも、CAG又はCTGの複数の繰り返しを有する配列の近くの方がより高い。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第1の末端又は分子の局在性濃度は、GAAの繰り返しを有する配列の近くよりも、CAG又はCTGの複数の繰り返しを有する配列の近くの方がより高い。
一態様では、本開示の分子は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1と関連するCAG又はCTG反復の数が多いため、対象のDNA内の他の場所のCAG又はCTGよりも、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1の反復CAG又はCTGと優先的に結合する。一態様では、本開示の分子は、dmpkと関連するCTG反復の数が多いため、対象のDNA内の他の場所のCTGよりも、dmpkの反復CTGと結合する可能性が高い。一態様では、本開示の分子は、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1と関連するCAG反復の数が多いため、対象のDNA内の他の場所のCAGよりも、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の反復CAGと結合する可能性が高い。一態様では、本開示の分子は、atxn8又はatxn80sと関連するCTG反復の数が多いため、対象のDNA内の他の場所のCTGよりも、atxn8又はatxn80の反復CTGと結合する可能性が高い。一態様では、本開示の分子は、TCF4と関連するCAG反復の数が多いため、対象のDNA内の他の場所のCAGよりも、TCF4遺伝子の反復CAGと結合する可能性が高い。一態様では、本開示の分子は、TTBK2と関連するCAG反復の数が多いため、対象のDNA内の他の場所のCAGよりも、TTBK2遺伝子の反復CAGと結合する可能性が高い。
第1の末端は、CAG又はCTGの複数の反復を有する配列に局在化し、他のヌクレオチド反復よりも優先的に標的ヌクレオチド反復と結合する。いくつかの実施形態では、配列は、CAG又はCTGの少なくとも2、3、4、5、8、10、12、15、20、25、30、40、50、100、200、300、400、又は500の反復を有する。特定の実施形態では、配列は、CAG又はCTGの少なくとも1000のヌクレオチド反復を含む。特定の実施形態では、配列は、CAG又はCTGの少なくとも500のヌクレオチド反復を含む。特定の実施形態では、配列は、CAG又はCTGの少なくとも200のヌクレオチド反復を含む。特定の実施形態では、配列は、CAG又はCTGの少なくとも100のヌクレオチド反復を含む。特定の実施形態では、配列は、CAG又はCTGの少なくとも50のヌクレオチド反復を含む。特定の実施形態では、配列は、CAG又はCTGの少なくとも20のヌクレオチド反復を含む。
サブユニットの予め選択された組み合わせからなるポリアミドは、副溝内のDNAに選択的に結合することができる。それらのヘアピン構造において、2つの芳香族アミノ酸の反平行な並列対は、各DNA塩基に対して特異的に充填されたポリアミド環とともに、DNA配列と結合する。N-メチルピロール(Py)は、Gを除くT、A、及びC塩基が好まれ、N-メチルイミダゾール(Im)は、G読み取り因子であり、3-ヒドロキシル-N-メチルピロール(Hp)は、チミン塩基と特異的である。ヌクレオチド塩基対は、以下の表1A及び1Bに示される対合原理を使用して、アミノ酸サブユニットの異なる対合を使用して認識することができる。例えば、Im/Py対合は対称性によりG・Cを読み取り、Py/Im対合はC・Gを読み取り、Hp/Py対合はA・T、G・C、及びC・GからT・Aを区別することができ、Py/Py対合はG・C及びC・GからA・T及びT・Aの両方を非特異的に区別する。
いくつかの実施形態では、第1の末端は、ヌクレオチドGに対応するIm、ヌクレオチド対Gに対応するIm又はNt、ヌクレオチドCに対応するPyを含み、ImはN-アルキルイミダゾールであり、PyはN-アルキルピロールであり、Hpは3-ヒドロキシN-メチルピロールであり、β-アラニンである。いくつかの実施形態では、第1の末端は、ヌクレオチド対G/Cに対応するIm/Py、ヌクレオチド対C/Gに対応するPy/Imを含み、ImはN-アルキルイミダゾール(例えば、N-メチルイミダゾール)であり、PyはN-アルキルピロール(例えば、N-メチルピロール)であり、Hpは3-ヒドロキシN-メチルピロールである。
ポリアミドのモノマーサブユニットは、表1A及び表1Bに示される対合原理に基づいて一緒に連結することができる。ポリアミドのモノマーサブユニットは、表1C及び表1Dに示される対合原理に基づいて一緒に連結することができる。
表1Cは、特定のヌクレオチドに結合することができるモノマーサブユニットの例を示す。第1の末端は、各列から選択されるモノマーサブユニットを有するいくつかのモノマーサブユニットが互いにスティングすると記載されているポリアミドを含むことができる。例えば、ポリアミドは、CAGと結合するPy-Py-Imを含むことができ、PyはCカラムから選択され、PyはAカラムから選択され、Imは第1のGカラムから選択される。ポリアミドは、表1Cの各カラムから選択されるサブユニットとの、CAGCAGのサブユニットの任意の組み合わせであり得、サブユニットは、CAG結合順序に従って一緒に連結する。別の例では、ポリアミドは、CTGと結合するPy-β-Imを含むことができ、PyはCカラムから選択され、βはTカラムから選択され、ImはGカラムから選択される。
加えて、ポリアミドは、5つのサブユニットの部分的又は複数のセット、例えば、3つのサブユニットの1.5、2、2.5、3、3.5、又は4つのセットを含むこともできる。ポリアミドは、3、4、5、6、7、8、9、10、12、14、及び16個のモノマーサブユニットを含むことができる。複数のセットは、Wによって一緒に結合することができる。5つのサブユニット又は10個のサブユニットに加えて、ポリアミドはまた、5つのサブユニットの複数のセットを連結することができる1~4個の追加のサブユニットを含むことができる。
ポリアミドは、CAG若しくはCTGの2、3、4、又は5ヌクレオチドと結合するモノマーサブユニットを含むことができる。例えば、ポリアミドは、CA、CAG、AGC、CAGC、CAGCA、CAGCAGと結合することができる。ポリアミドは、CAG反復の3、4、5、6、7、8、9、又は10ヌクレオチドと結合するモノマーサブユニットを含むことができる。例えば、ポリアミドは、CT、CTG、TGC、CTGC、CTGCT、CTGCTG、CTGCTGCと結合することができる。ポリアミドは、CTG反復の3、4、5、6、7、8、9、又は10ヌクレオチドと結合するモノマーサブユニットを含むことができる。ヌクレオチドは、Wによって結合され得る。
モノマーサブユニットは、末端ユニットとして位置する場合、末端にアミン基、カルボニル基、カルボン酸基を有さない。末端のアミン又はカルボン酸基は水素に置き換えられる。例えば、Pyは、末端ユニットとして使用される場合、
直鎖ポリアミドは、Py-Py-Im-Py-Py-Im-Py-Py-Im、β-Im-Py-β-Im-Py-β-Im、Im-Py-Py-Im-Py-Py-Im、Im-Py-Py-Im-Py-β、β-Im-Py-Py-Im-Py-β、Py-Py-Im-β-β-Im-Py-Py-Im、及びこれらの任意の組み合わせを含むが、これらに限定されない非限定的な例を有することができる。
DNA結合部分はまた、表1Bに示される対合原理に基づいて一緒に連結するサブユニットを有するヘアピンポリアミドを含むことができる。表1Dは、ヌクレオチド対に選択的に結合するモノマーサブユニット対のいくつかの例を示す。ヘアピンポリアミドは、2n個のモノマーサブユニットを含むことができ(nは、2~8の範囲の整数である)、ポリアミドは、モノマーサブユニットの中心にWを更に含む。Wは、-(CH2)a-NR1-(CH2)b-、-(CH2)a-、-(CH2)a-O-(CH2)b-、-(CH2)a-CH(NHR1)-、-(CH2)a-CH(NHR1)-、-(CR2R3)a-、又は-(CH2)a-CH(NR1
3)+-(CH2)b-であり、式中、各aは、独立して、2~4の整数であり、R1は、H、任意に置換されるC1-6アルキル、任意に置換されるC3-10シクロアルキル、任意に置換されるC6-10アリール、任意に置換される4~10員ヘテロシクリル、又は任意に置換される5~10員ヘテロアリールであり、各R2及びR3は、独立して、H、ハロゲン、OH、NHAc、又はC1-4アルキルである。いくつかの実施形態では、Wは、-(CH2)-CH(NH3)+-(CH2)-又は-(CH2)-CH2CH(NH3)+-である。いくつかの実施形態では、R1は、Hである。いくつかの実施形態では、R1は、-C(O)-フェニルから選択される1~3個の置換基により任意に置換されるC1-6ルキルである。いくつかの実施形態では、Wは、-(CR2R3)-(CH2)a-又は-(CH2)a-(CR2R3)-(CH2)b-であり、式中、各aは、独立して、1~3であり、bは、0~3であり、各R2及びR3は、独立してH、ハロゲン、OH、NHAc、又はC1-4アルキルである。Wは、gABなどの表4に示される脂肪族アミノ酸残基であり得る。Wは、gABであり、Tと結合することが好まれる。
標的遺伝子は、CAG又はCTGの複数の反復を含むことができるため、サブユニットは、1つ以上のCAG又はCTG反復(例えば、CAGCAG、又はCTGCTGCTG)における少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、又は10個のヌクレオチドと結合するために一緒に連結することができる。例えば、ポリアミドは、CAG若しくはCTGの部分コピー、完全コピー、又は複数の反復、例えば、CA、CAG。AGC、CAGC、CAGCA、CAGCAG、CT、CTG、TGC、CTGC、CTGCT、CTGCTGと結合することによって、CAG又はCTG反復と結合することができる。例えば、ポリアミドは、二本鎖DNA上のGGGGCC及びその相補的ヌクレオチドと結合するIm-Im-Im-Im-β-β-W-Im-Im-β-Py-β-Pyを含むことができ、Im/Py対はG・Cと結合し、Im/β対はG・Cと結合し、Im/Py対はG・Cと結合し、Im/βはG・Cと結合し、β/ImはC・Gと結合し、β/ImはC・Gと結合する。一例では、二本鎖DNA上のCTGCと結合するPy-β-Im-β-W-Im-Py-Py-Im及びその相補的ヌクレオチドは、Py/Im対がC・Gと結合し、β/Py対がT・Aと結合し、Im/Im対がC・Gと結合し、β/Py対がC・Gと結合する。Wは、表4に示すように、gABなどの脂肪族アミノ酸残基又は他の適切なスペーサーであり得る。別の例では、ポリアミドは、二本鎖DNA上のGCTGC及びその相補的ヌクレオチドと結合するIm-Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Py-Im-βを含むことができ、Im/β対はG・Cと結合し、Py/Im対はC・Gと結合し、Py/PyはT・Aと結合し、Im/Py対はG・Cと結合し、Py/ImはC・Gと結合する。別の例では、Im-Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Pyは、二本鎖DNA上の相補的ヌクレオチド(ACG)の一部でGCTGCと結合し、ImはGと結合し、PyはCと結合し、Py/PyはT・Aと結合し、Im/PyはG・Cと結合し、Py/ImはC・Gと結合する。
ポリアミドのいくつかの追加の例には、Py-β-Im-β-gAB-Im-Py-Py-Im、Im-Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Py-Im-β、Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Py-Im-β、Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Py-Im、Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Py、Im-Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Py-Im、Im-Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Py、及びこれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
2つの逆平行ポリアミド鎖によるヌクレオチド反復又はDNA配列の認識は、通常、DNAらせんの5’から3’方向に対してNからCに配向された、副溝内の並列芳香族アミノ酸対のコードに依存する。ポリアミドヌクレオチド結合の強化された親和性及び特異性は、逆平行鎖を共有結合することによって達成される。「ヘアピンモチーフ」は、2本の鎖のN末端及びC末端をW(例えば、ガンマアミノ酪酸ユニット(ガンマターン))に接続し、折り畳まれた直鎖を形成する。「Hピンモチーフ」は、短い可撓性架橋によって、中央又は中央付近の環/環対にわたって反平行鎖を接続する。
DNA結合部分はまた、表1A及び/又は表1Bに示される対形成原理に基づいて一緒に連結するサブユニットを有するHピンポリアミドを含むこともできる。表1Cは、ヌクレオチドと選択的に結合するモノマーサブユニットのいくつかの例を示し、表1Dは、ヌクレオチド対と選択的に結合するモノマーサブユニット対のいくつかの例を示す。h-ピンポリアミドは、2本の鎖を含み得、各鎖は、いくつかのモノマーサブユニットを有し得(各鎖は、2~8個のモノマーサブユニットを含み得る)、ポリアミドは、各鎖の中心又は中心付近の2本の鎖を接続するための架橋L1も含む。各鎖上のモノマーサブユニットのうちの少なくとも1つ又は2つは、表1Dの対合原理に従って、他方の鎖上の対応するモノマーサブユニットと対合されて、G・C又はC・G対のいずれかの結合を好み、これらのモノマーサブユニット対は、多くの場合、中央、中央領域に近く、2本の鎖を接続する架橋において、又はその近くに配置される。いくつかの事例では、Hピンポリアミドは、二本鎖DNA上のヌクレオチド対に結合するために、表1B及び1Dの対合原理に基づいて、逆平行鎖上の対応するモノマーサブユニットと対合する全てのモノマーサブユニットを有することができる。いくつかの事例では、Hピンポリアミドは、二本鎖DNA上のヌクレオチド対に結合するために、表1B及び1Dの結合原理に基づいて、逆平行鎖上の対応するモノマーサブユニットと対合するモノマーサブユニットの一部(2、3、4、5、又は6)を有することができ、一方、モノマーサブユニットの残りは、表1A及び1Cの結合原理に基づいてヌクレオチドと結合するが、逆平行鎖上のモノマーサブユニットと対合しない。h-ピンポリアミドは、ヌクレオチドに結合するが、逆平行鎖上のモノマーサブユニットとは対合しない、1つ以上のオーバーハンギングモノマーサブユニットを有することができる。
h-ピン構造に由来する別のポリアミド構造は、架橋を介して末端の2つの逆平行鎖を接続し、架橋によって接続される2つのモノマーサブユニットのみが、表1B/1Dの結合原理に基づいてヌクレオチド対G・C又はC・Gと結合する対を形成するが、鎖上の残りのモノマーサブユニットは、オーバーハングを形成し、表1A及び/又は1Cの結合原理に基づいてヌクレオチドと結合し、他の鎖上のモノマーサブユニットと対合しない。
架橋は、
ポリアミドのいくつかの追加の例には、Py-Py-Im-Py(中央で結合-位置2は3のいずれか)からIm-Py-Py-Im、Py-β-Im-β(中央で結合-位置2又は3のいずれか)Im-Py-Py-Im、Im-Py-Py-Im-Py(中央で結合-位置2、3、又は4のいずれか)Im-Py-Py-Im-β、Py-Py-Im-Py(Py-Py-Im-Pyの中央位置2又は3がIm-Py-Py-Im-βの位置2、3、又は4と結合)Im-Py-Py-Im-β、Py-Py-Im-Py(中央で結合-2位又は3位のいずれか)Im-Py-Py-Im、Py-Py-Im-Py(Py-Py-Im-Pyの中央位置2又は3がIm-Py-Pyの位置2と結合)Im-Py-Py、Im-Py-Py-Im-Py(Im-Py-Py-Im-Pyの中央位置2、3、又は4のいずれかがIm-Py-Py-Imの中央位置2又は3と結合)Im-Py-Py-Im、Im-Py-Py-Im-Py(中央位置2、3、又は4がIm-Py-Pyの中央位置と結合)Im-Py-Pyが含まれるが、これらに限定されない。
第2の末端-制御結合部分
特定の実施形態では、制御分子は、ヌクレオソームリモデリング因子(NURF)、ブロモドメインPHDフィンガー転写因子(BPTF)、テンイレブン転座酵素(TET)、メチルシトシンジオキシゲナーゼ(TET1)、DNAデメチラーゼ、ヘリカーゼ、アセチルトランスフェラーゼ、及びヒストンデアセチラーゼ(「HDAC」)から選択される。特定の実施形態では、制御分子は、CDK9i、CDK7i、CDK12/13i、汎-CDKi、L3MBTL3リクルータ、CBXリクルータ、又はEEDリクルータから選択される。
特定の実施形態では、制御分子は、ヌクレオソームリモデリング因子(NURF)、ブロモドメインPHDフィンガー転写因子(BPTF)、テンイレブン転座酵素(TET)、メチルシトシンジオキシゲナーゼ(TET1)、DNAデメチラーゼ、ヘリカーゼ、アセチルトランスフェラーゼ、及びヒストンデアセチラーゼ(「HDAC」)から選択される。特定の実施形態では、制御分子は、CDK9i、CDK7i、CDK12/13i、汎-CDKi、L3MBTL3リクルータ、CBXリクルータ、又はEEDリクルータから選択される。
調節タンパク質と第2の末端との間の結合親和性は、分子の組成又はタンパク質の種類に基づいて調整することができる。いくつかの実施形態では、第2の末端は、約600nM、約500nM、約400nM、約300nM、約250nM、約200nM、約150nM、約100nM、又は約50nM未満の親和性で制御分子と結合する。いくつかの実施形態では、第2の末端は、約300nM未満の親和性で制御分子と結合する。いくつかの実施形態では、第2の末端は、約200nM未満の親和性で制御分子と結合する。いくつかの実施形態では、ポリアミドは、約200nM、約150nM、約100nM、約50nM、約10nM、又は約1nMを超える親和性でDNAと結合することができる。いくつかの実施形態では、ポリアミドは、約1~600nM、10~500nM、20~500nM、50~400nM、100~300nM、又は50~200nMの範囲の親和性でDNAと結合することができる。
いくつかの実施形態では、タンパク質結合部分は、CREB結合タンパク質(CBP)、P300、O結合型β-N-アセチルグルコサミントランスフェラーゼ(OGT-)、P300-CBP関連因子-(PCAF-)、ヒストンメチルトランスフェラーゼ、ヒストンデメチラーゼ、クロモドメイン、サイクリン依存性キナーゼ-9-(CDK9-)、ヌクレオソームリモデリング因子(NURF-)、ブロモドメインPHDフィンガー転写因子(BPTF-)、テンイレブン転座酵素(TET-)、メチルシトシンジオキシゲナーゼ(TET1-)、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(HAT)、ヒストン デアセチラーゼ(HDAC)、宿主細胞因子1(HCF1-)、オクタマー結合転写因子(OCT1-)、P-TEFb-、サイクリン-T1-、PRC2-、DNA-デメチラーゼ、ヘリカーゼ、アセチルトランスフェラーゼ、ヒストン脱アセチル化酵素、メチル化ヒストンリジンタンパク質からなる群から選択される制御分子と結合する。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、O結合型β-N-アセチルグルコサミントランスフェラーゼ(OGT)、又はCREB結合タンパク質(CBP)と結合する部分を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質結合部分は、O結合型β-N-アセチルグルコサミントランスフェラーゼ(OGT)、又はCREB結合タンパク質(CBP)と結合する分子の残基である。
いくつかの実施形態では、制御分子は、ポリコーム群(PcG)タンパク質である。特定の実施形態では、制御分子は、ポリコーム抑制複合体(PRC)である。いくつかの実施形態では、制御分子は、それぞれポリコーム抑制複合体1又はポリコーム抑制複合体2、PRC1及びPRC2である。いくつかの実施形態では、制御分子は、CBX2、CBX4。CBX6、CBX7、及びCBX8から選択されるポリコームパラログである。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、p300/CBP HAT(ヒストンアセチルトランスフェラーゼ)と結合する部分を含む。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、ブロモドメイン阻害剤、BPTF阻害剤、メチルシトシンジオキシゲナーゼ阻害剤、DNAデメチラーゼ阻害剤、ヘリカーゼ阻害剤、アセチルトランスフェラーゼ阻害剤、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤、CDK-9阻害剤、陽性転写伸長因子阻害剤、及びポリコーム抑制複合体阻害剤から選択される。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、CDK9阻害剤である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、CDK9i、CDK7i、CDK12/13i、汎-CDKi、L3MBTL3リクルータ、CBXリクルータ、又はEEDリクルータから選択される。いくつかの実施形態では、第2の末端は、CDK9iである。いくつかの実施形態では、第2の末端は、CDK7iである。いくつかの実施形態では、第2の末端は、CDK12/13iである。いくつかの実施形態では、第2の末端は、汎-CDKiである。いくつかの実施形態では、第2の末端は、L3MBTL3リクルータである。いくつかの実施形態では、第2の末端は、CBXリクルータである。いくつかの実施形態では、第2の末端は、EEDリクルータである。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、1つ以上の任意に置換されるC6-10アリール、任意に置換されるC4-10炭素環式、任意に置換される4~10員複素環式、又は任意に置換される5~10員ヘテロアリールを含む。いくつかの実施形態では、第2の末端は、ジアジン又はジアゼピン環を含み、ジアジン又はジアゼピン環は、S、N、及びOから選択される1個以上のヘテロ原子を含むC6-10アリール又は5~10員ヘテロアリール環と縮合される。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、任意に置換される二環式又は三環式構造を含む。いくつかの実施形態では、任意に置換される二環式又は三環式構造は、チオフェン環と縮合したジアゼピン環を含む。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、制御タンパク質と結合することができる部分を含み、部分は、制御タンパク質と結合することができる化合物に由来する。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(C)
式中、
環Aは、5~10員のヘテロアリール又は5~10員複素環であり、
A1及びA2は、各々独立して、CH又はNであり、
B1及びB2は、各々独立して、O、S、又はNR5であり、
Z1は、O、S、又はNR5であり、
R3及びR4は、各々独立して、水素、ハロゲン、又はC1-C6アルキルであり、
R5は、水素又はC1-C6アルキルである。
いくつかの実施形態では、環Aは、5、6、7、又は8員ヘテロアリールである。
いくつかの実施形態では、環Aは、5、6、7、又は8員複素環である。いくつかの実施形態では、環Aは、5員複素環である。いくつかの実施形態では、環Aは、6員複素環である。いくつかの実施形態では、環Aは、7員複素環である。いくつかの実施形態では、環Aは、ピペリジン又はピリジンである。
いくつかの実施形態では、A1は、Nであり、A2は、Nである。いくつかの実施形態では、A1は、Nであり、A2は、CHである。いくつかの実施形態では、A1は、CHであり、A2は、Nである。
いくつかの実施形態では、B1及びB2は、各々独立して、O又はSである。いくつかの実施形態では、B1は、Sである。いくつかの実施形態では、B2は、Oである。
いくつかの実施形態では、Z1は、Oである。いくつかの実施形態では、Z1は、Sである。
いくつかの実施形態では、R3及びR4は、各々独立して、C1-C6アルキルである。いくつかの実施形態では、R3及びR4は、各々独立して、水素である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(C-1)の化合物、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物を含む。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(D)
式中、
環Bは、フェニル又は5~6員シクロアルキレンであり、
L3は、任意に置換されるアルキレン又はヘテロアルケレンであり、
R6、R7、R8、及びR9は、各々独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
R10Aは、水素、C1-C6アルキル、又はSO2-R10Cであり、
R10Bは、水素又はC1-C6アルキルであり、
R10Cは、C1-C6アルキル又はフェニルである。
いくつかの実施形態では、環Bは、フェニルである。いくつかの実施形態において、環Bは、5~6員シクロアルキレン(例えば、5~6員シクロアルキル環)である。いくつかの実施形態では、環Bは、5員シクロアルキレンである。いくつかの実施形態では、環Bは、6員シクロアルキレンである。
いくつかの実施形態では、L3は、任意に置換されるアルキレンである。いくつかの実施形態では、L3は、C3-C6アルキレンである。いくつかの実施形態では、L3は、-CHCH-アルキレンである。
いくつかの実施形態では、R6、R7、R8、及びR9は、各々独立して、ハロゲンである。R6、R7、R8、及びR9は、各々独立して、水素である。
いくつかの実施形態では、R10Aは、C1-C6アルキルである。いくつかの実施形態では、R10Aは、SO2-R10Cである。いくつかの実施形態では、R10Aは、SO2-フェニルである。いくつかの実施形態では、R10Aは、水素である。
いくつかの実施形態では、R10Bは、C1-C6アルキルである。いくつかの実施形態では、R10Bは、メチル、エチル、又はt-ブチルである。いくつかの実施形態では、R10Bは、水素である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(D-1)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(D-2)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(D-3)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(D-4)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(E)
式中、
q2及びq3は、各々独立して、1、2、3、又は4であり、
R11は、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
各R12及びR13は、独立して、任意に置換される5~8員ヘテロシクロアルキルである。
いくつかの実施形態では、R11は、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルである。いくつかの実施形態では、R11は、ハロゲンである。いくつかの実施形態では、R11は、水素である。
いくつかの実施形態では、各R12及びR13は、独立して任意に置換される5員ヘテロシクロアルキル環である。いくつかの実施形態では、各R12及びR13は、独立して任意に置換される6員ヘテロシクロアルキル環である。いくつかの実施形態では、各R12及びR13は、独立して任意に置換される6員ヘテロシクロアルキル環である。いくつかの実施形態では、各R12及びR13は、独立して任意に置換される7員ヘテロシクロアルキル環である。
いくつかの実施形態では、q2及びq3は、各々独立して、1、2、又は3である。いくつかの実施形態では、q2及びq3は、各々独立して、1である。いくつかの実施形態では、q2及びq3は、各々独立して、2である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(E-1)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(F)
式中、
R14及びR17は、各々独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-20アルキル、C1-20ヘテロアルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
R15は、独立して、置換される5員ヘテロアリールであり、
R16は、水素又はC1-C6アルキルである。
いくつかの実施形態では、R14は、任意に置換されるC1-20アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルである。いくつかの実施形態では、R14は、C1-20ヘテロアルキルである。いくつかの実施形態では、ヘテロアルキルは、PEGである。いくつかの実施形態では、PEGは、1~20のPEGユニットを含む。いくつかの実施形態では、R14は、ハロゲンである。いくつかの実施形態では、R17は、水素である。
いくつかの実施形態では、R15は、任意に、1、2、又は3個の窒素原子を含む5員ヘテロアリールである。
いくつかの実施形態では、R17は、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルである。いくつかの実施形態では、R17は、ハロゲンである。いくつかの実施形態では、R17は、水素である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(F-1)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(G)
式中、
rは、0、1、又は2であり、
R18及びR19は、各々独立して、水素、任意に置換されるC1-20アルキル、C1-20ヘテロアルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
各R20は、独立して、水素、ハロゲン、又はC1-C6アルキルであり、
各R21は、独立して、水素又はC1-C6アルキルである。
いくつかの実施形態では、R18は、任意に置換されるC1-20アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルである。いくつかの実施形態では、R18は、任意に置換されるC1-6アルキルである。いくつかの実施形態では、R18は、任意に置換されるC1-20ヘテロアルキルである。いくつかの実施形態では、ヘテロアルキルは、PEGである。いくつかの実施形態では、PEGは、1~20のPEGユニットを含む。
いくつかの実施形態では、R19は、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルである。いくつかの実施形態では、R19は、ハロゲンである。いくつかの実施形態では、R19は、水素である。いくつかの実施形態では、R18は、任意に置換されるC1-20ヘテロアルキルである。いくつかの実施形態では、ヘテロアルキルは、PEGである。いくつかの実施形態では、PEGは、1~20のPEGユニットを含む。
いくつかの実施形態では、各R20は、独立して、C1-C6アルキルである。いくつかの実施形態では、各R20は、独立して、ハロゲンである。
いくつかの実施形態では、rは、1又は2である。いくつかの実施形態では、rは、0である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(G-1)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(H-1)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(H-2)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J)
式中、
R23は、-NR23AR23B又は-NR23A(R23B)2であり、
R23A及びR23Bは、各々独立して、任意に置換されるC1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、アリール、若しくはヘテロアリールであるか、又は
R23A及びR23Bは、それらが結合している窒素と一緒に結合して、複素環を形成し、
R24は、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6アルコキシであり、
R25は、水素又はC1-3アルキルであり、
R30、R32、及びR33は、各々独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6アルコキシ、又はC3-C6シクロアルキル環であり、
R31は、C1-6アルキル又はC3-10シクロアルキルであり、
j1は、0又は1であり、
j2は、0、1、2、又は3である。
いくつかの実施形態では、j1は、0である。いくつかの実施形態では、j1は、1である。
いくつかの実施形態では、j2は、0であり、いくつかの実施形態では、j2は、1である。いくつかの実施形態では、j2は、2である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J-1)
式中、
R23は、-NR23AR23B又は-NR23A(R23B)2であり、
R23A及びR23Bは、各々独立して、任意に置換されるC1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、アリール、若しくはヘテロアリールであるか、又は
R23A及びR23Bは、それらが結合している窒素と一緒に結合して、複素環を形成し、
R24は、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6アルコキシであり、
R25は、水素又はC1-3アルキルであり、
R30は、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、又はC1-6アルコキシであり、
R31は、C1-6アルキル又はC3-10シクロアルキルである。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J-2)
式中、
R23は、-NR23AR23B又は-NR23A(R23B)2であり、
R23A及びR23Bは、各々独立して、任意に置換されるC1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、アリール、若しくはヘテロアリールであるか、又は
R23A及びR23Bは、それらが結合している窒素と一緒に結合して、複素環を形成し、
R24は、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6アルコキシであり、
R25は、水素又はC1-3アルキルである。
いくつかの実施形態では、R23A及びR23Bは、独立して、任意に置換されるC1-6アルキルである。いくつかの実施形態では、アルキルは、-CH3、-CH2CH3、-CH2CH2CH3、又は-CH(CH3)2である。いくつかの実施形態では、R23A及びR23Bは、独立して、任意に置換されるC3-C10シクロアルキルである。いくつかの実施形態では、シクロアルキルは、単環式又は二環式シクロアルキルである。いくつかの実施形態では、シクロアルキルは、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、又はアダマンチルである。いくつかの実施形態では、R23A及びR23Bは、独立して、任意に置換されるアリールである。いくつかの実施形態では、アリールは、フェニルである。
いくつかの実施形態では、-NR23AR23Bは、
いくつかの実施形態では、R24は、C1-6アルキルである。いくつかの実施形態では、R24は、-CH3、-CH2CH3、-CH(CH3)2、又は-C(CH3)3である。いくつかの実施形態では、R24は、ハロゲンである。いくつかの実施形態では、R24は、-Br、-Cl、-F、又は-Iである。いくつかの実施形態では、R24は、-CF3又は-OCH3である。いくつかの実施形態では、R24は、水素である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J-3)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J-4)
いくつかの実施形態では、R30、R32、及びR33は、各々独立して、水素である。いくつかの実施形態では、R30、R32、及びR33は、各々独立して、ハロゲンである。いくつかの実施形態では、R30、R32、及びR33は、各々独立して、水素、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6アルコキシ、又はC3-6シクロアルキル環である。いくつかの実施形態では、R30、R32、及びR33は、各々独立して、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、sec-ブチル、イソブチル、又はtert-ブチルである。いくつかの実施形態では、R30、R32、及びR33は、各々独立して、シクロブチル、シクロペンチル、又はシクロヘキシル環である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J-5)
式中、
環Cは、任意に置換される5~6員ヘテロシクリル環であり、
R23は、-NR23AR23B又は-NR23A(R23B)2であり、
R23A及びR23Bは、各々独立して、任意に置換されるC1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、アリール、若しくはヘテロアリールであるか、又は
R23A及びR23Bは、それらが結合している窒素と一緒に結合して、複素環を形成し、
R24が、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6アルコキシであり、
R25は、水素又はC1-3アルキルであり、
R30、R32、及びR33は、各々独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6アルコキシ、又はC3-6シクロアルキル環である。
いくつかの実施形態では、環Cは、5員ヘテロシクリル環である。いくつかの実施形態では、環Cは、N、S、及びOから選択される1~3個のヘテロ原子を含む5員ヘテロシクリル環である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J-6)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J-7)
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(J-8)
式中、
Lは、非存在、又は任意に置換されるC1-20アルキレン若しくはC1-20ヘテロアルキレンリンカーであり、
R23は、-NR23AR23B又は-NR23A(R23B)2であり、
R23A及びR23Bは、各々独立して、任意に置換されるC1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、アリール、若しくはヘテロアリールであるか、又は
R23A及びR23Bは、それらが結合している窒素と一緒に結合して、複素環を形成し、
R33は、各々独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6アルコキシ、又はC3-6シクロアルキル環であり、
R36は、水素、-C(O)R37、又は-NR38C(O)R37であり、
R37は、任意に置換されるアリール、C1-6アルキル、又はC3-C6シクロアルキル環であり、
R38は、水素又はC1-6アルキルであり、
j1は、0又は1である。
いくつかの実施形態では、Lは、非存在である。いくつかの実施形態では、Lは、任意に置換されるC1-20アルキレンリンカーである。いくつかの実施形態では、Lは、C1-20ヘテロアルキレンリンカーである。いくつかの実施形態では、ヘテロアルキレンリンカーは、PEGリンカーである。いくつかの実施形態では、PEGは、1~20のPEGユニットを有する。
いくつかの実施形態において、R36は、水素である。いくつかの実施形態では、R36は、-C(O)R37又は-NR38C(O)R37である。いくつかの実施形態では、R37は、任意に置換されるアリールである。いくつかの実施形態では、R37は、1、2、又は3個のハロゲン、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6アルコキシで任意に置換される、任意に置換されるフェニルである。いくつかの実施形態では、R37は、C1-6アルキルで任意に置換されるフェニルである。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(K)
式中、
X8は、CH又はNであり、
Y8は、-C(O)-、又は-S(O)2-であり、
R27は、C1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、又は5~10員ヘテロアリールの任意に置換されるカチオンであり、
R28は、水素、ハロゲン、又はC1-6アルキルであり、
R29は、水素又はC1-3アルキルである。
いくつかの実施形態では、Y8は、-C(O)-である。いくつかの実施形態では、Y8は、-S(O)2-である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(K-1)若しくは(K-2)
いくつかの実施形態では、X8は、CHである。いくつかの実施形態では、X8は、Nである。
いくつかの実施形態では、R27は、
いくつかの実施形態では、R28は、ハロゲンである。いくつかの実施形態では、R28は、-Br、-Cl、-F、又は-Iである。いくつかの実施形態では、R28は、水素である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、
いくつかの実施形態では、第2の末端は、式(L)
式中、
R33は、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
R35は、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C C1-6アミノアルキル3-C10シクロアルキル、又は5~10員ヘテロアリールであり、
s1及びs2は、各々独立して、1、2、3、又は4である。
いくつかの実施形態では、第2の末端は、
いくつかの実施形態では、第2の末端は、
いくつかの実施形態では、第2の末端は、
いくつかの実施形態では、第2の末端は、
いくつかの実施形態では、第2の末端は、JQ1、iBET762、OTX015、RVX208、又はAU1を含まない。いくつかの実施形態では、第2の末端は、JQ1を含まない。いくつかの実施形態では、第2の末端は、ブロモドメインタンパク質と結合する部分を含まない。いくつかの実施形態では、第2の末端は、JQ1、JQ-1、OTX015、RVX208酸、又はRVX208ヒドロキシルを含まない。
特定の実施形態では、制御分子は、BRD2、BRD3、BRD4、及びBRDTから選択されるブロモドメイン含有タンパク質ではない。特定の実施形態では、制御分子は、BRD2、BRD3、BRD4、又はBRDTではない。
いくつかの実施形態では、タンパク質結合部分は、
タンパク質結合部分は、制御タンパク質と結合する化合物の残基を含み得る。
特定の実施形態では、制御分子は、転写因子である。
特定の実施形態では、制御分子は、RNAポリメラーゼである。
特定の実施形態では、制御分子は、RNAポリメラーゼの活性を制御する部分である。
特定の実施形態では、制御分子は、TATA結合タンパク質と相互作用する。
特定の実施形態では、制御分子は、転写因子II Dと相互作用する。
特定の実施形態では、制御分子は、CDK9サブユニットを含む。
特定の実施形態では、制御分子は、P-TEFbである。
特定の実施形態では、リクルート部分は、制御分子と結合するが、制御分子の活性を阻害しない。特定の実施形態では、リクルート部分は、制御分子と結合し、制御分子の活性を阻害する。特定の実施形態では、リクルート部分は、制御分子と結合し、制御分子の活性を増加させる。
特定の実施形態では、リクルート部分は、制御分子の活性部位と結合する。特定の実施形態では、リクルート部分は、制御分子の制御部位と結合する。
オリゴマー骨格リンカー
オリゴマー骨格は、第1の末端及び第2の末端を接続するリンカーを含んでおり、制御分子を標的遺伝子に近づけて遺伝子発現を調節する。
オリゴマー骨格は、第1の末端及び第2の末端を接続するリンカーを含んでおり、制御分子を標的遺伝子に近づけて遺伝子発現を調節する。
リンカーの長さは、制御タンパク質の種類及び標的遺伝子にも依存する。いくつかの実施形態では、リンカーは、約50オングストローム未満の長さを有する。いくつかの実施形態では、リンカーは、約20~30オングストロームの長さを有する。
いくつかの実施形態では、リンカーは、5~50個の鎖原子を含む。
いくつかの実施形態では、リンカーは、2~50個のスペーシング部分を有する多量体を含み、
スペーシング部分は、独立して、-((CR3aR3b)x-O)y-、-((CR3aR3b)x-NR4a)y-、-((CR3aR3b)x-CH=CH-(CR3aR3b)x-O)y-、任意に置換される-C1-12アルキル、任意に置換されるC2-10アルケニル、任意に置換されるC2-10アルキニル、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレン、アミノ酸残基、-O-、-C(O)NR4a-、-NR4aC(O)-、-C(O)-、-NR1-、-C(O)O-、-O-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-SO2NR4a-、-NR4aSO2-、及び-P(O)OH-、並びにそれらの任意の組み合わせからなる群から選択され、
各xは、独立して、2~4であり、
各yは、独立して、1~10であり、
各R3a及びR3bは、独立して、水素、任意に置換されるアルキル、任意に置換されるアルケニル、任意に置換されるアルキニル、任意に置換されるアルコキシ、任意に置換されるアミノ、カルボキシル、カルボキシルエステル、アシル、アシルオキシ、アシルアミノ、アミノアシル、任意に置換されるアルキルアミド、スルホニル、任意に置換されるチオアルコキシ、任意に置換されるアリール、任意に置換されるヘテロアリール、任意に置換されるシクロアルキル、及び任意に置換されるヘテロシクリルから選択され、
各R4aは、独立して、水素又は任意に置換されるC1-6アルキルである。
スペーシング部分は、独立して、-((CR3aR3b)x-O)y-、-((CR3aR3b)x-NR4a)y-、-((CR3aR3b)x-CH=CH-(CR3aR3b)x-O)y-、任意に置換される-C1-12アルキル、任意に置換されるC2-10アルケニル、任意に置換されるC2-10アルキニル、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレン、アミノ酸残基、-O-、-C(O)NR4a-、-NR4aC(O)-、-C(O)-、-NR1-、-C(O)O-、-O-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-SO2NR4a-、-NR4aSO2-、及び-P(O)OH-、並びにそれらの任意の組み合わせからなる群から選択され、
各xは、独立して、2~4であり、
各yは、独立して、1~10であり、
各R3a及びR3bは、独立して、水素、任意に置換されるアルキル、任意に置換されるアルケニル、任意に置換されるアルキニル、任意に置換されるアルコキシ、任意に置換されるアミノ、カルボキシル、カルボキシルエステル、アシル、アシルオキシ、アシルアミノ、アミノアシル、任意に置換されるアルキルアミド、スルホニル、任意に置換されるチオアルコキシ、任意に置換されるアリール、任意に置換されるヘテロアリール、任意に置換されるシクロアルキル、及び任意に置換されるヘテロシクリルから選択され、
各R4aは、独立して、水素又は任意に置換されるC1-6アルキルである。
いくつかの実施形態では、オリゴマー骨格は、-(T1-V1)a-(T2-V2)b-(T3-V3)c-(T4-V4)d-(T5-V5)e-を含み、
式中、a、b、c、d、及びeは、各々独立して、0又は1であり、a、b、c、d、及びeの合計は、1~5であり、
T1、T2、T3、T4、及びT5は、各々独立して、任意に置換される(C1-C12)アルキレン、任意に置換されるアルケニレン、任意に置換されるアルキニレン、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(修飾PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、任意に置換される(C6-C10)アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレン、アセタール基、ジスルフィド、ヒドラジン、炭水化物、ベータ-ラクタム、及びエステルから選択され、
(a)wは、1~20の整数であり、
(b)mは、1~20の整数であり、
(c)nは、1~30の整数であり、
(d)pは、1~20の整数であり、
(e)hが、1~12の整数であり、
(f)EAは、以下の構造を有し、
式中、a、b、c、d、及びeは、各々独立して、0又は1であり、a、b、c、d、及びeの合計は、1~5であり、
T1、T2、T3、T4、及びT5は、各々独立して、任意に置換される(C1-C12)アルキレン、任意に置換されるアルケニレン、任意に置換されるアルキニレン、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(修飾PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、任意に置換される(C6-C10)アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレン、アセタール基、ジスルフィド、ヒドラジン、炭水化物、ベータ-ラクタム、及びエステルから選択され、
(a)wは、1~20の整数であり、
(b)mは、1~20の整数であり、
(c)nは、1~30の整数であり、
(d)pは、1~20の整数であり、
(e)hが、1~12の整数であり、
(f)EAは、以下の構造を有し、
(h)(PEG)nは、-(CR2aR2b-CR2aR2b-O)n-CR2aR2b-の構造を有し、
(i)(修飾PEG)nは、(PEG)nの少なくとも1つの-(CR2aR2b-CR2aR2b-O)-を-(CH2-CR2a=CR2a-CH2-O)-又は-(CR2aR2b-CR2aR2b-S)-に置き換えた構造を有し、
(j)AAは、アミノ酸残基であり、
(k)V1、V2、V3、V4、及びV5は、各々独立して、結合、-CO-、-NR1a-、-CONR1a-、-NR1aCO-、-CONR1aC1-4アルキル-、-NR1aCO-C1-4アルキル-、-C(O)O-、-OC(O)-、-O-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-SO2NR1a-、-NR1aSO2-、及び-P(O)OH-からなる群から選択され、
(l)各R1aは、独立して、水素又は及び任意に置換されるC1-6アルキルであり、
各R2a及びR2bは、独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、ハロゲン、アルコキシ、置換アルコキシ、アミノ、置換アミノ、カルボキシル、カルボキシルエステル、アシル、アシルオキシ、アシルアミノ、アミノアシル、アルキルアミド、置換アルキルアミド、スルホニル、チオアルコキシ、置換チオアルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、シクロアルキル、置換シクロアルキル、ヘテロシクリル、及び置換ヘテロシクリルから選択される。
いくつかの実施形態では、a、b、c、d、及びeは、各々独立して、0又は1であり、a、b、c、d、及びeの合計は、1である。いくつかの実施形態では、a、b、c、d、及びeは、各々独立して、0又は1であり、a、b、c、d、及びeの合計は、2である。いくつかの実施形態では、a、b、c、d、及びeは、各々独立して、0又は1であり、a、b、c、d、及びeの合計は、3である。いくつかの実施形態では、a、b、c、d、及びeは、各々独立して、0又は1であり、a、b、c、d、及びeの合計は、4である。いくつかの実施形態では、a、b、c、d、及びeは、各々独立して、0又は1であり、a、b、c、d、及びeの合計は、5である。
いくつかの実施形態では、nは、3~9である。いくつかの実施形態では、nは、4~8である。いくつかの実施形態では、nは、5又は6である。
いくつかの実施形態では、T1、T2、T3、及びT4、及びT5は、各々独立して、(C1-C12)アルキル、置換(C1-C12)アルキル、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(修飾PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、フェニル、置換フェニル、ピペリジン-4-アミノ(P4A)、パラ-アミノ-ベンジルオキシカルボニル(PABC)、メタ-アミノ-ベンジルオキシカルボニル(MABC)、パラ-アミノ-ベンジルオキシ(PABO)、メタ-アミノ-ベンジルオキシ(MABO)、パラ-アミノベンジル、アセタール基、ジスルフィド、ヒドラジン、炭水化物、ベータ-ラクタム、エステル、(AA)p-MABC-(AA)p、(AA)p-MABO-(AA)p、(AA)p-PABO-(AA)p、及び(AA)p-PABC-(AA)pから選択され、いくつかの実施形態では、ピペリジン-4-アミノ(P4A)は、
いくつかの実施形態では、T1、T2、T3、T4、及びT5は、各々独立して、(C1-C12)アルキル、置換(C1-C12)アルキル、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(修飾PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、任意に置換される(C6-C10)アリーレン、4~10員ヘテロシクロアルケン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレンから選択される。いくつかの実施形態では、EAは、以下の構造を有し、
いくつかの実施形態では、EA及びEDAについて、xは2~3であり、qは1~3である。いくつかの実施形態では、R1aは、H又はC1-6アルキルである。
いくつかの実施形態では、T4又はT5は、任意に置換される(C6-C10)アリーレンである。
いくつかの実施形態では、T4又はT5は、フェニレン又は置換フェニレンである。いくつかの実施形態では、T4又はT5は、フェニレン、又は-C1-6アルキル、ハロゲン、OH、若しくはアミンから選択される1~3個の置換基で置換されるフェニレンである。いくつかの実施形態では、T4又はT5は、5~10員ヘテロアリーレン又は置換ヘテロアリーレンである。いくつかの実施形態では、T4又はT5は、4~10員ヘテロシレン又は置換ヘテロシクリレンである。いくつかの実施形態では、T4又はT5は、-C1-6アルキル、ハロゲン、OH、若しくはアミンから選択される1~3個の置換基で任意に置換されるヘテロアリーレン又はヘテロシレンである。
いくつかの実施形態では、T1、T2、T3、T4、及びT5、並びにV1、V2、V3、V4、及びV5は、以下の表2から選択される。
いくつかの実施形態では、リンカーは、N(R1a)(CH2)xN(R1b)(CH2)xN-を含み、式中、R1a及びR1bが、各々独立して、水素又は任意に置換されるC1-C6アルキルから選択され、各xが、独立して、1~6の範囲の整数である。
いくつかの実施形態では、リンカーは、-(CH2-C(O)N(R’’)-(CH2)q-N(R’)-(CH2)q-N(R’’)C(O)-(CH2)x-C(O)N(R’’)-A-、-(CH2)x-C(O)N(R’’)-(CH2 CH2O)y(CH2)x-C(O)N(R’’)-A-、-C(O)N(R’’)-(CH2)q-N(R’)-(CH2)q-N(R’’)C(O)-(CH2)x-A-、-(CH2)x-O-(CH2 CH2O)y-(CH2)x-N(R’’)C(O)-(CH2)x-A-、又は-N(R’’)C(O)-(CH2)-C(O)N(R’’)-(CH2)x-O(CH2CH2O)y(CH2)x-A-を含み、式中、R’が、メチルであり、R’’が、水素であり、各x及びyが、独立して、1~10の整数であり、各qが、独立して、2~10の整数であり、各Aが、独立して、結合、任意に置換されるC1-12アルキル、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、及び任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレンから選択される。
いくつかの実施形態では、リンカーは、-(CH2CH2-O)x1-又は-(CH2CH2-O)x2-A-(CH2CH2-O)x3-を含み、式中、Aが、任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレン又はスピロシクレンであり、各x1、x2、及びx3が、独立して、1~15の整数である。
いくつかの実施形態では、リンカーは、ポリエチレングリコール(PEG)を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、1~20個のPEGユニットを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20個のPEGユニットを含む。
いくつかの実施形態では、Aは、
いくつかの実施形態では、リンカーは、-CO-、-NR1a-、-CONR1a-、-NR1aCO-、-CONR1aC1-4アルキル-、-NR1aCO-C1-4アルキル-、-C(O)O-、-OC(O)-、-O-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-SO2NR1a-、-NR1SO2-、-P(O)OH-、-((CH2)x-O)-、-((CH2)y-NR1a)-、任意に置換される-C1-12アルキレン、任意に置換されるC2-10アルケニレン、任意に置換されるC2-10アルキニレン、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、及び任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレンから選択される基で第1の末端と結合され、各xが、独立して、1~4であり、各yが、独立して、1~4であり、各R1aが、独立して、水素又は任意に置換されるC1-6アルキルである。
いくつかの実施形態では、リンカーは、-CO-、-NR1a-、C1-12アルキル、-CONR1a-、及び-NR1aCO-から選択される基で第1の末端と結合される。
いくつかの実施形態では、リンカーは、-CO-、-NR1a-、-CONR1a-、-NR1aCO-、-CONR1aC1-4アルキル-、-NR1aCO-C1-4アルキル-、-C(O)O-、-OC(O)-、-O-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-SO2NR1a-、-NR1SO2-、-P(O)OH-、-((CH2)x-O)-、-((CH2)y-NR1a)-、任意に置換される-C1-12アルキレン、任意に置換されるC2-10アルケニレン、任意に置換されるC2-10アルキニレン、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、及び任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレンから選択される基で第2の末端と結合され、各xが、独立して、1~4であり、各yが、独立して、1~4であり、各R1aが、独立して、水素又は任意に置換されるC1-6アルキルである。
いくつかの実施形態では、リンカーは、-CO-、-NR1a-、-CONR1a-、-NR1aCO-、-((CH2)x-O)-、-((CH2)y-NR1a)-、-O-、任意に置換される-C1-12アルキル、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、及び任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレンから選択される基で第2の末端と結合され、各xが、独立して、1~4であり、各yが、独立して、1~4であり、各R1が、独立して、水素又は任意に置換されるC1-6アルキルである。
いくつかの実施形態では、リンカーは、式(C-1)
式中、
環Bは、非存在、アリーレン、又はヘテロシクロアルキレンであり、
L5が、非存在、任意に置換されるアルキレン、又はアルケニレンであり、
各Y8及びY9は、独立して、CH又はNであり、
s1は、0~3であり、
**は、第2の末端との結合を示す。
いくつかの実施形態では、環Bは、非存在である。いくつかの実施形態では、環Bは、C4-C7ヘテロシクロアルキレンである。
いくつかの実施形態では、Y8は、Nである。いくつかの実施形態では、Y8は、CHである。
いくつかの実施形態では、Y9は、Nである。いくつかの実施形態では、Y9は、CHである。
いくつかの実施形態では、L5は、非存在である。
いくつかの実施形態では、L5は、アルキレン又はアルケネレンである。
いくつかの実施形態では、L5は、-(CR1GR1G)x-(アルキレン)2-(CR1GR1G)y-であり、式中、x及びyが、各々独立して、0又は1であり、各R1Gが、水素又はC1-C3アルキルである。
いくつかの実施形態では、リンカーは、式(C-2)
式中、
各Y10及びY11は、独立して、N又はCHである。
いくつかの実施形態では、Y8及びY9の各々は、独立して、N又はCHであり、Y9は、Nである。
いくつかの実施形態では、L5は、C1-C3アルキレン又はC1-C3アルケレンである。
いくつかの実施形態では、L5は、-CH2-、-CH2CH2-、-C≡C-、又は-C≡C-C≡C-である。いくつかの実施形態では、L5は、-CH2-又は-CH2CH2-である。いくつかの実施形態では、L5は、-C≡C-である。いくつかの実施形態では、L5は、-C≡C-C≡C-である。
いくつかの実施形態では、リンカーは、式(C-3)
式中、
s1は、0~3であり、
s2は、1~3であり、
R26は、任意に置換されるC1-20アルキレン又はヘテロアルキレンであり、
各R1Gは、独立して、水素又はC1-C3アルキルであり、
**は、第2の末端との結合を示す。
いくつかの実施形態では、R26は、任意に置換されるC1-20ヘテロアルキレンである。いくつかの実施形態では、R26は、PEGである。
いくつかの実施形態では、各R1Gは、独立して、水素である。いくつかの実施形態では、各R1Gは、独立して、C1-C3アルキルである。いくつかの実施形態では、C1-C3アルキルは、メチル、エチル、又はプロピルである。いくつかの実施形態では、各R1Gは、独立して、メチルである。
いくつかの実施形態では、s1は、0、1、又は2である。いくつかの実施形態では、s1は、0である。いくつかの実施形態では、s1は、1である。いくつかの実施形態では、s1は、2である。
いくつかの実施形態では、s2は、1又は2である。いくつかの実施形態では、s2は、1である。いくつかの実施形態では、s2は、2である。
いくつかの実施形態では、リンカーは、
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の転写モジュレータ化合物の非限定的な例を以下の表3に示す。
使用方法
本開示はまた、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の転写を調節する方法にも関し、方法は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1を本明細書に記載の分子と接触させるステップを含む。
本開示はまた、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の転写を調節する方法にも関し、方法は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1を本明細書に記載の分子と接触させるステップを含む。
細胞表現型、細胞増殖、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1の転写、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1の転写からのmRNAの産生、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1の翻訳、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1によってコードされるタンパク質によって生成される生化学的出力の変化、又はdmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、若しくはatn1によってコードされるタンパク質と天然の結合パートナーとの非共有結合が、モニタリングされ得る。かかる方法は、疾患の治療様式、生物学的アッセイ、細胞アッセイ、生化学的アッセイなどであり得る。いくつかの実施形態では、遺伝子は、dmpkである。いくつかの実施形態では、遺伝子は、atxn1である。
いくつかの実施形態では、遺伝子は、atxn2である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、atxn3である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、cacna1aである。いくつかの実施形態では、遺伝子は、atxn7である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、ppp2r2である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、tbpである。いくつかの実施形態では、遺伝子は、httである。いくつかの実施形態では、遺伝子は、jph3である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、arである。いくつかの実施形態では、遺伝子は、atn1である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、atxn8である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、atxn80sである。いくつかの実施形態では、遺伝子は、ttbk2である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、tcf4である。いくつかの実施形態では、遺伝子は、httである。
また、本明細書では、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の転写によって媒介される疾患の治療方法も提供され、治療有効量の本明細書に開示される分子又はその塩を、それを必要とする患者に投与することを含む。
特定の実施形態では、疾患は、DM1、脊髄小脳失調症、ハンチントン病、ハンチントン病様症候群、球脊髄性筋萎縮症、及び歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症から選択される。
特定の実施形態では、疾患は、DM1から選択される。
特定の実施形態では、疾患は、脊髄小脳失調症である。特定の実施形態では、脊髄小脳失調症は、SCA1、SCA2、SCA3、SCA6、SCA7、SCA12、及びSCA17から選択される。特定の実施形態では、脊髄小脳失調症は、SCA1、SCA2、SCA3、SCA6、SCA7、及びSCA17から選択される。
特定の実施形態では、疾患は、ハンチントン病及びハンチントン病様症候群から選択される。特定の実施形態では、疾患は、ハンチントン病及びハンチントン病様2症候群から選択される。
特定の実施形態では、疾患は、球脊髄性筋萎縮症である。
特定の実施形態では、疾患は、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症である。
特定の実施形態では、疾患は、フックス角膜内皮ジストロフィー(FECD)である。
また、本明細書では、薬剤として使用するための本明細書に開示の分子も提供される。
また、本明細書で提供されるのは、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の転写によって媒介される疾患の治療のための薬剤として使用するための、本明細書に開示される分子である。
また、本明細書に開示される分子の薬剤としての使用も提供される。
また、提供されるのは、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の転写によって媒介される疾患の治療のための薬剤としての、本明細書に開示される分子の使用である。
また、提供されるのは、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の転写によって媒介される疾患の治療のための薬剤の製造に使用するための、本明細書に開示される分子である。
また、提供されるのは、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の転写によって媒介される疾患の治療のための、本明細書に開示される分子の使用である。
また、本明細書で提供されるのは、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1を本明細書に開示される分子又はその塩と接触させることを含む、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の転写を調節する方法である。
また、本明細書で提供されるのは、患者に治療有効量の本明細書に開示される分子又はその塩を患者に投与することを含む、患者において効果を達成するための方法であり、効果は、筋萎縮、運動失調、線維束性形成、認知症、構音障害、及び嚥下障害から選択される。
また、本明細書で提供されるのは、TCF4の転写によって媒介される、又はそれと関連する、疾患若しくは状態の予防又は治療のための方法である。
TCF4の発現を調節する方法は、TCF4を本明細書に記載の分子と接触させることを含む。
TCF4の転写によって引き起こされる疾患の治療方法は、治療有効量の本明細書に記載の分子を、それを必要とする患者に投与することを含む。
いくつかの実施形態は、治療有効量の本明細書に記載の分子、及び別の治療剤を投与することを含む、TCF4の転写によって引き起こされる疾患の治療方法に関する。
本明細書で提供されるのは、治療有効量の本明細書に開示される分子又はその塩を患者に投与することを含む、患者において効果を達成するための方法であり、効果は、グレア、霧視、疼痛、又は角膜上のザラザラ感から選択される。
本開示の特定の分子は、その遺伝子型がCAG又はCTGの3以上の反復を有する対象の治療に有効であり得る。本開示の特定の分子は、その遺伝子型がCAG又はCTGの5以上の反復を有する対象の治療に有効であり得る。本開示の特定の分子は、その遺伝子型がCAG又はCTGの10以上の反復を有する対象の治療に有効であり得る。本開示の特定の分子は、その遺伝子型がCAG又はCTGの20以上の反復を有する対象の治療に有効であり得る。本開示の特定の分子は、その遺伝子型がCAG又はCTGの50以上の反復を有する対象の治療に有効であり得る。本開示の特定の分子は、その遺伝子型がCAG又はCTGの100以上の反復を有する対象の治療に有効であり得る。本開示の特定の分子は、その遺伝子型がCAG又はCTGの200以上の反復を有する対象の治療に有効であり得る。本開示の特定の化合物又は分子は、その遺伝子型がCAG又はCTGの500以上の反復を有する対象の治療に有効であり得る。
また、治療有効量の本明細書に開示される化合物を投与することを含む、対象におけるdmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1媒介機能の調節方法も提供される。
また、本明細書に開示される化合物を、薬学的に許容され得る担体と一緒に含む、薬学的組成物も提供される。
特定の実施形態では、薬学的組成物は、経口投与用に製剤化される。
特定の実施形態では、薬学的組成物は、静脈内注射及び/又は点滴用に製剤化される。
特定の実施形態では、経口薬学的組成物は、錠剤及びカプセルから選択される。
特定の実施形態では、エクスビボ治療方法が提供される。エクスビボ法は、典型的には、対象から除去された細胞、臓器、及び/又は組織を含む。細胞、臓器、及び/又は組織は、例えば、適切な条件下で薬剤とともにインキュベートされ得る。接触した細胞、臓器、及び/又は組織は、典型的には、ドナーに戻されるか、レシピエントに配置されるか、又は将来の使用のために保管される。したがって、化合物は、典型的には、薬学的に許容され得る担体中に存在する。
特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、治療の6時間以内に標的遺伝子の発現を調節する。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、治療の24時間以内に、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現を調節する。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、治療の72時間以内に、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現を調節する。
特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の2倍の増加を引き起こす。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の5倍の増加を引き起こす。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の10倍の増加を引き起こす。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の20倍の増加を引き起こす。
特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の20%の減少を引き起こす。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の50%の減少を引き起こす。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の80%の減少を引き起こす。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の90%の減少を引き起こす。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の95%の減少を引き起こす。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現の99%の減少を引き起こす。
特定の実施形態では、薬学的組成物の投与により、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現が健康な個体で観察される発現レベルの25%以内に低下する。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与により、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現が健康な個体で観察される発現レベルの50%以内に低下する。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与により、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現が健康な個体で観察される発現レベルの75%以内に低下する。特定の実施形態では、薬学的組成物の投与により、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn80s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1の発現が健康な個体で観察される発現レベルの90%以内に低下する。
薬学的組成物及び投与
また、治療有効量の本明細書に開示される化合物又は分子を投与することを含む、対象におけるdmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn0s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1媒介機能の調節方法も提供される。
また、治療有効量の本明細書に開示される化合物又は分子を投与することを含む、対象におけるdmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、atxn8、atxn0s、ttbk2、tcf4、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、又はatn1媒介機能の調節方法も提供される。
また、本明細書に開示される化合物を、薬学的に許容され得る担体と一緒に含む、薬学的組成物も提供される。
特定の実施形態では、薬学的組成物は、経口投与用に製剤化される。
特定の実施形態では、薬学的組成物は、静脈内注射又は点滴用に製剤化される。
特定の実施形態では、経口薬学的組成物は、錠剤及びカプセルから選択される。
特定の実施形態では、エクスビボ治療方法が提供される。エクスビボ法は、典型的には、対象から除去された細胞、臓器、又は組織を含む。細胞、臓器、又は組織は、例えば、適切な条件下で薬剤とともにインキュベートされ得る。接触した細胞、臓器、又は組織は、典型的には、ドナーに戻されるか、レシピエントに配置されるか、又は将来の使用のために保管される。したがって、化合物は、典型的には、薬学的に許容され得る担体中に存在する。
略称及び定義
本明細書で使用される場合、以下の用語は示された意味を有する。
本明細書で使用される場合、以下の用語は示された意味を有する。
特定のラジカル命名規則が、文脈に応じて、モノラジカル又はジラジカルのいずれかを含むことができることを理解されたい。例えば、置換基が分子の残りの部分との2つの結合点を必要とする場合、置換基はジラジカルであることが理解される。例えば、2つの結合点を必要とするアルキルとして識別される置換基には、-CH2-、-CH2CH2-、-CH2CH(CH3)CH2-などのジラジカルが含まれる。他のラジカル命名規則は、ラジカルが「アルキレン」、「アルケニレン」、「アリーレン」、「ヘテロアリーレン」などのジラジカルであることを明確に示している。
2つのR基が、「それらが結合する原子と一緒に」環(例えば、カルボシクリル、ヘテロシクリル、アリール、又はヘテロアリール環)を形成すると言われる場合、それは、原子及び2つのR基の集合単位が、列挙された環であることを意味する。そうでなければ、環は、個別にとらえられる場合、各R基の定義によって制限されない。例えば、以下の部分構造が存在する場合、
同様に、2つの「隣接する」R基が「それらが結合する原子と一緒に」環を形成すると言われる場合、原子、介在する結合、及び2つのR基の集合単位が列挙された環であることを意味する。例えば、以下の部分構造が存在する場合、
置換基がジラジカルとして示される場合(すなわち、分子の残りの部分との2つの結合点を有する場合)、別段の指示がない限り、置換基が任意の方向配置で結合され得ることを理解されたい。したがって、例えば、-AE-、又は
値の範囲が開示され、「n1…~n2」又は「n1…~n2の間」という表記が使用される場合、n1及びn2は数字であり、特に指定されない限り、この表記は、数字自体及びそれらの間の範囲を含むことが意図される。この範囲は、整数又は間の連続的なものであり得、最終値を含み得る。例として、炭素は整数単位であるため、「2~6個の炭素」の範囲は、2個、3個、4個、5個、及び6個の炭素を含むことが意図されている。例としてたとえれば、「1~3μM(マイクロモル)」の範囲は、1μM、3μM、及びその間の全てから任意の有効数字まで(例えば、1.255μM、2.1μM、2.9999μMなど)を含むことを意図する。
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、それが修正する数値を修飾することを意図し、そのような値を誤差の範囲内で変数として表す。チャート又はデータの表に与えられる平均値への標準偏差などの特定の誤差が列挙されていない場合、「約」という用語は、列挙された値を包含する範囲、及び有意な数値を考慮してその数値に切り上げ又は切り下げることによっても含まれる範囲を意味すると理解されるべきである。
「ポリアミド」という用語は、アミド(すなわち、CONH)結合によって化学的に結合された結合可能単位のポリマーを指し、任意選択的に、ポリアミドは、それと結合した化学プローブを含む。ポリアミドは、当該技術分野で既知の方法を使用して、カルボン酸(COOH)とアミン(RR’NH)との段階的縮合により合成され得る。代替的には、ポリアミドは、インビトロでの酵素反応を使用するか、又は微生物による発酵を使用することによって形成することもできる。
「結合可能な単位」という用語は、メチルイミダゾール、メチルピロール、及び任意に窒素置換基を含む直鎖並びに分枝鎖の脂肪族官能基(例えば、メチレン、エチレン、プロピレン、ブチレンなど)、並びにそれらの化学誘導体を指す。結合可能な単位の脂肪族官能基は、例えば、当技術分野で周知の方法によるポリアミドの合成中のB-アラニン又はジメチルアミノプロピルアミンの縮合によって提供することができる。
「リンカー」という用語は、少なくとも10個の連続する原子の鎖を指す。特定の実施形態では、リンカーは、20個以下の非水素原子を含む。特定の実施形態では、リンカーは、40個以下の非水素原子を含む。特定の実施形態では、リンカーは、60個以下の非水素原子を含む。特定の実施形態では、リンカーは、C、H、N、O、及びSから選択される原子を含む。特定の実施形態では、全ての非水素原子は、リンカー内の2つの隣接する原子、又はリンカー内の1個の隣接する原子、及びリンカーの末端のいずれかと化学的に結合する。特定の実施形態では、リンカーは、それが結合している2つの他の基のうちの少なくとも1つとアミド結合を形成する。特定の実施形態では、リンカーは、それが結合している2つの他の基のうちの少なくとも1つとエステル又はエーテル結合を形成する。特定の実施形態では、リンカーは、それが結合している2つの他の基のうちの少なくとも1つとチオエステル又はチオエーテル結合を形成する。特定の実施形態では、リンカーは、それが結合している2つの他の基のうちの少なくとも1つと直接炭素-炭素結合を形成する。特定の実施形態では、リンカーは、それが結合している2つの他の基のうちの少なくとも1つとアミン又はアミド結合を形成する。特定の実施形態では、リンカーは、-(CH2OCH2)-単位を含む。特定の実施形態では、リンカーは、-(CH(CH3)OCH2)-単位を含む。特定の実施形態では、リンカーは、RN=C1-4アルキルに対して-(CH2NRNCH2)単位を含む。特定の実施形態では、リンカーは、アリーレン、シクロアルキレン、又はヘテロシクロアルキレン部分を含む。
「スペーサー」という用語は、少なくとも5個の連続する原子の鎖を指す。特定の実施形態では、スペーサーは、10個以下の非水素原子を含む。特定の実施形態では、スペーサーは、C、H、N、O、及びSから選択される原子を含む。特定の実施形態では、スペーサーは、それが結合している2つの他の基とアミド結合を形成する。特定の実施形態では、スペーサーは、-(CH2OCH2)-単位を含む。特定の実施形態では、スペーサーは、RN=C1-4アルキルに対して-(CH2NRNCH2)単位を含む。特定の実施形態では、スペーサーは、生理学的pHにおいて少なくとも1つの正電荷を含む。
「カーブ構成要素」という用語は、約4~10個の連続する原子の鎖を指す。特定の実施形態では、カーブ構成要素は、C、H、N、O、及びSから選択される原子を含む。特定の実施形態では、カーブ構成要素は、それが結合している2つの他の基とアミド結合を形成する。特定の実施形態では、カーブ構成要素は、生理学的pHにおいて少なくとも1つの正電荷を含む。
「核酸」及び「ヌクレオチド」という用語は、当該技術分野で周知のリボヌクレオチド及びデオキシリボヌクレオチド、並びにそれらの類似体を指す。
「オリゴヌクレオチド配列」という用語は、定義された配列及び長さ(例えば、2、3、4、5、6、又はそれ以上のヌクレオチド)を有する複数の核酸を指す。「オリゴヌクレオチド反復配列」という用語は、オリゴヌクレオチド配列の連続する拡張を指す。
「転写」という用語は、当該技術分野で周知であり、DNA指向性RNAポリメラーゼによるRNA(すなわち、リボ核酸)の合成を指す。「転写を調節する」という用語は、当該技術分野で周知の方法、例えば、転写産物であるmRNAのアッセイによって測定され得る転写レベルの変化を指す。特定の実施形態では、調節は、転写の増加である。他の実施形態では、調節は、転写の減少である。
本明細書で使用される場合、「アシル」という用語は、単独又は組み合わせて、アルケニル、アルキル、アリール、シクロアルキル、ヘテロアリール、複素環、又はカルボニルに結合している原子が炭素である他の任意の部分と結合しているカルボニルを指す。「アセチル」基は、-C(O)CH3基を指す。「アルキルカルボニル」又は「アルカノイル」基は、カルボニル基を介して親分子部分と結合したアルキル基を指す。かかる基の例としては、メチルカルボニル及びエチルカルボニルが含まれる。アシル基の例としては、ホルミル、アルカノイル、及びアロイルが含まれる。
本明細書で使用される場合、「アルケニル」という用語は、単独又は組み合わせて、1つ以上の二重結合を有し、2~20個の炭素原子を含む、直鎖又は分枝鎖の炭化水素ラジカルを指す。特定の実施形態では、当該アルケニルは、2~6個の炭素原子を含むであろう。「アルケニレン」という用語は、エテニレン[(-CH=CH-)、(-C::C-)]などの2つ以上の位置で結合した炭素-炭素二重結合系を指す。好適なアルケニルラジカルの例としては、エテニル、プロペニル、2-メチルプロペニル、1,4-ブタジエニルなどが含まれる。特に明記しない限り、「アルケニル」という用語は、「アルケニレン」基を含み得る。
本明細書で使用される場合、「アルコキシ」という用語は、単独又は組み合わせて、アルキルエーテルラジカルを指し、アルキルという用語は以下に定義されるとおりである。好適なアルキルエーテルラジカルの例としては、メトキシ、エトキシ、n-プロポキシ、イソプロポキシ、n-ブトキシ、イソ-ブトキシ、sec-ブトキシ、tert-ブトキシなどが含まれる。
本明細書で使用される場合、「アルキル」という用語は、単独又は組み合わせて、1~20個の炭素原子を含む直鎖又は分枝鎖のアルキルラジカルを指す。特定の実施形態では、当該アルキルは、1~10個の炭素原子を含むであろう。更なる実施形態では、当該アルキルは、1~8個の炭素原子を含むであろう。アルキル基は、本明細書で定義されるように任意に置換され得る。アルキルラジカルの例としては、メチル、エチル、n-プロピル、イソプロピル、n-ブチル、イソブチル、sec-ブチル、tert-ブチル、ペンチル、イソ-アミル、ヘキシル、オクチル、ノイルなどが含まれる。本明細書で使用される場合、「アルキレン」という用語は、単独又は組み合わせて、メチレン(-CH2-)などの、2つ以上の位置で結合した直鎖又は分枝鎖の飽和炭化水素に由来する飽和脂肪族基を指す。特に明記しない限り、「アルキル」という用語は、「アルキレン」基を含み得る。
本明細書で使用される場合、「アルキルアミノ」という用語は、単独又は組み合わせて、アミノ基を介して親分子部分と結合したアルキル基を指す。好適なアルキルアミノ基は、モノ又はジアルキル化されて、例えば、N-メチルアミノ、N-エチルアミノ、N,N-ジメチルアミノ、N,N-エチルメチルアミノなどの基を形成することができる。
本明細書で使用される場合、「アルキリデン」という用語は、単独又は組み合わせて、炭素-炭素二重結合の1個の炭素原子がアルケニル基が結合する部分に属するアルケニル基を指す。
本明細書で使用される場合、「アルキルチオ」という用語は、単独又は組み合わせて、アルキルチオエーテル(R-S-)ラジカルを指し、アルキルという用語は上で定義したとおりであり、硫黄は単一又は二重に酸化され得る。好適なアルキルチオエーテルラジカルの例としては、メチルチオ、エチルチオ、n-プロピルチオ、イソプロピルチオ、n-ブチルチオ、イソ-ブチルチオ、sec-ブチルチオ、tert-ブチルチオ、メタンスルホニル、エタンスルフィニルなどが含まれる。
本明細書で使用される場合、「アルキニル」という用語は、単独又は組み合わせて、1つ以上の三重結合を有し、2~20個の炭素原子を含む、直鎖又は分枝鎖の炭化水素ラジカルを指す。特定の実施形態では、当該アルキニルは、2~6個の炭素原子を含む。更なる実施形態では、当該アルキニルは、2~4個の炭素原子を含む。「アルキニレン」という用語は、エチニレン(-C:::C-、-C≡C-)などの2つの位置で結合した炭素-炭素三重結合を指す。アルキニルラジカルの例としては、エチニル、プロピニル、ヒドロキシプロピニル、ブチン-1-イル、ブチン-2-イル、ペンチン-1-イル、3-メチルブチン-1-イル、ヘキシン-2-イルなどが含まれる。特に明記しない限り、「アルキニル」という用語は、「アルキニレン」基を含み得る。
本明細書で使用される場合、「アミド」及び「カルバモイル」という用語は、単独又は組み合わせて、カルボニル基を介して親分子部分と結合した以下に記載のアミノ基、又はその逆を指す。本明細書で使用される場合、「C-アミド」という用語は、単独又は組み合わせて、-C(O)N(RR’)基を指し、R及びR’は本明細書で定義されるとおりであるか、又は指定された具体的に列挙された「R」基によって定義されるとおりである。本明細書で使用される場合、「N-アミド」という用語は、単独又は組み合わせて、RC(O)N(R’)-基を指し、R及びR’は本明細書で定義されるとおりであるか、又は指定された具体的に列挙された「R」基によって定義されるとおりである。本明細書で使用される場合、「アシルアミノ」という用語は、単独又は組み合わせて、アミノ基を介して親部分と結合したアシル基を包含する。「アシルアミノ」基の例は、アセチルアミノ(CH3C(O)NH-)である。
本明細書で使用される場合、「アミド」という用語は、単独で組み合わせて、-C(O)NRR’を指し、式中、R及びR’は、独立して、水素、アルキル、アシル、ヘテロアルキル、アリール、シクロアルキル、ヘテロアリール、及びヘテロシクロアルキルから選択され、それらのいずれも、それ自体が、任意に置換され得る。追加的に、R及びR’は合わせてヘテロシクロアルキルを形成し得、これらのいずれも任意に置換され得る。アミドは、カルボン酸をアミンで直接縮合させることによって、又は酸塩化物を使用することによって形成され得る。加えて、カップリング試薬は、DCC及びEDCIなどのカルボジイミド系化合物を含む、当該技術分野で既知である。
本明細書で使用される場合、「アミノ」という用語は、単独又は組み合わせて、-NRR’を指し、式中、R及びR’は、独立して、水素、アルキル、アシル、ヘテロアルキル、アリール、シクロアルキル、ヘテロアリール、及びヘテロシクロアルキルから選択され、それらのいずれも、それ自体が、任意に置換され得る。追加的に、R及びR’は合わせてヘテロシクロアルキルを形成し得、これらのいずれも任意に置換され得る。
本明細書で使用される場合、「アリール」という用語は、単独又は組み合わせて、1、2、又は3個の環を含む炭素環式芳香族系を意味し、多環式環系が互いに縮合している。「アリール」という用語は、フェニル、ナフチル、アントラセニル、及びフェナントリルなどの芳香族基を包含する。「アリーレン」という用語は、フェニレン、ナフチレン、アントラセニレン、及びフェナントリレンなどの芳香族基を包含する。
本明細書で使用される場合、「アリールアルケニル」又は「アラルケニル」という用語は、単独又は組み合わせて、アルケニル基を介して親分子部分と結合したアリール基を指す。
本明細書で使用される場合、「アリールアルコキシ」又は「アラルコキシ」という用語は、単独又は組み合わせて、アルコキシ基を介して親分子部分と結合したアリール基を指す。
本明細書で使用される場合、「アリールアルキル」又は「アラルキル」という用語は、単独又は組み合わせて、アルキル基を介して親分子部分と結合したアリール基を指す。
本明細書で使用される場合、「アリールアルキニル」又は「アラルキニル」という用語は、単独又は組み合わせて、アルキニル基を介して親分子部分と結合したアリール基を指す。
本明細書で使用される場合、「アリールアルカノイル」又は「アラルカノイル」又は「アロイル」という用語は、単独又は組み合わせて、アリール置換アルカンカルボン酸、例えば、ベンゾイル、ナフトイル、フェニルアセチル、3-フェニルプロピオニル(ヒドロシンナモイル)、4-フェニルブチリル、(2-ナフチル)アセチル、4-クロロヒドロシンナモイルなどに由来するアシルラジカルを指す。
本明細書で使用される場合、アリールオキシという用語は、単独又は組み合わせて、オキシを介して親分子部分と結合したアリール基を指す。
本明細書で使用される場合、「ベンゾ」及び「ベンズ」という用語は、単独又は組み合わせて、ベンゼンに由来する二価ラジカルC6H4=を指す。例としては、ベンゾチオフェン及びベンズイミダゾールが含まれる。
本明細書で使用される場合、「カルバメート」という用語は、単独又は組み合わせて、窒素又は酸末端のいずれかから親分子部分と結合され得、本明細書で定義されるように任意に置換され得る、カルバミン酸(-NHCOO-)のエステルを指す。
本明細書で使用される場合、「O-カルバミル」という用語は、単独又は組み合わせて、-OC(O)NRR’基を指し、R及びR’は本明細書で定義されるとおりである。
本明細書で使用される場合、「N-カルバミル」という用語は、単独又は組み合わせて、ROC(O)NR’-基を指し、R及びR’は本明細書で定義されるとおりである。
本明細書で使用される場合、「カルボニル」という用語は、単独の場合にはホルミル[-C(O)H]を含み、組み合わせた場合には-C(O)-基である。
本明細書で使用される場合、「カルボキシル」又は「カルボキシ」という用語は、-C(O)OH、又はカルボン酸塩中のような対応する「カルボン酸」アニオンを指す。「O-カルボキシ」基は、RC(O)O-基を指し、式中、Rは本明細書で定義されるとおりである。「C-カルボキシ」基は、-C(O)OR基を指し、式中、Rは本明細書で定義されるとおりである。
本明細書で使用される場合、「シアノ」という用語は、単独又は組み合わせて、-CNを指す。
本明細書で使用される場合、「シクロアルキル」、又は代替的に、「炭素環」は、単独又は組み合わせて、飽和又は部分的に飽和した単環式、二環式、又は三環式アルキル基を指し、各環状部分は、3~12個の炭素原子環員を含み、任意選択で、本明細書で定義されるように任意に置換されるベンゾ縮合環系であり得る。特定の実施形態では、当該シクロアルキルは、5~7個の炭素原子を含むであろう。かかるシクロアルキル基の例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロヘキシル、シクロヘプチル、テトラヒドロナフチル、インダニル、オクタヒドロナフチル、2,3-ジヒドロ-1H-インデニル、アダマンチルなどが含まれる。本明細書で使用される場合、「二環式」及び「三環式」は、縮合環系、例えば、デカヒドロナフタレン、オクタヒドロナフタレン、並びに多環式(多中心)飽和型又は部分的不飽和型の両方を含むことが意図される。後者のタイプの異性体は、一般に、ビシクロ[1,1,1]ペンタン、カンファー、アダマンタン、及びビシクロ[3,2,1]オクタンによって例示される。
本明細書で使用される場合、「エステル」という用語は、単独又は組み合わせて、炭素原子で連結された2つの部分を架橋するカルボキシ基を指す。
本明細書で使用される場合、「エーテル」という用語は、単独又は組み合わせて、炭素原子で連結された2つの部分を架橋するオキシ基を指す。
本明細書で使用される場合、「ハロ」又は「ハロゲン」という用語は、単独又は組み合わせて、フッ素、塩素、臭素、又はヨウ素を指す。
本明細書で使用される場合、「ハロアルコキシ」という用語は、単独又は組み合わせて、酸素原子を介して親分子部分と結合したハロアルキル基を指す。
本明細書で使用される場合、「ハロアルキル」という用語は、単独又は組み合わせて、上で定義した意味を有するアルキルラジカルを指し、1つ以上の水素はハロゲンで置き換えられる。具体的には、モノハロアルキル、ジハロアルキル、及びポリハロアルキルラジカルが包含される。モノハロアルキルラジカルは、例えば、ラジカル内にヨード、ブロモ、クロロ、又はフルオロ原子を有し得る。ジハロ及びポリハロアルキルラジカルは、2個以上の同じハロ原子、又は異なるハロラジカルの組み合わせを有し得る。ハロアルキルラジカルの例としては、フルオロメチル、ジフルオロメチル、トリフルオロメチル、クロロメチル、ジクロロメチル、トリクロロメチル、ペンタフルオロエチル、ヘプタフルオロプロピル、ジフルオロクロロメチル、ジクロロフルオロメチル、ジフルオロエチル、ジフルオロプロピル、ジクロロエチル、及びジクロロプロピルが含まれる。「ハロアルキレン」は、2つ以上の位置で結合したハロアルキル基を指す。例えば、フルオロメチレン(-CFH-)、ジフルオロメチレン(-CF2-)、クロロメチレン(-CHCl-)などが含まれる。
本明細書で使用される場合、「ヘテロアルキル」という用語は、単独又は組み合わせて、指定された数の炭素原子、並びにN、O、及びSから選択される1~3個のヘテロ原子からなる、完全に飽和した、又は1~3度の不飽和を含む、安定した直鎖若しくは分枝鎖、又はそれらの組み合わせを指し、N原子及びS原子は、任意選択で酸化され得、Nヘテロ原子は、任意選択で四級化され得る。ヘテロ原子は、ヘテロアルキル基の任意の内部位置に配置され得る。最大2個のヘテロ原子は、例えば、-CH2-NH-OCH3のように連続していてもよい。
本明細書で使用される場合、「ヘテロアリール」という用語は、単独又は組み合わせて、3~15員不飽和ヘテロモノ環、又は縮合環のうちの少なくとも1つが芳香族であり、N、O、及びSから選択される少なくとも1つの原子を含む縮合単環式、二環式、又は三環式環系を指す。特定の実施形態では、当該ヘテロアリールは、環員として1~4個のヘテロ原子を含むであろう。更なる実施形態では、当該ヘテロアリールは、環員として1~2個のヘテロ原子を含むであろう。特定の実施形態では、当該ヘテロアリールは、5~7個の原子を含むであろう。この用語はまた、縮合多環式基を包含し、複素環はアリール環と縮合され、ヘテロアリール環は他のヘテロアリール環と縮合され、ヘテロアリール環はヘテロシクロアルキル環と縮合されるか、又はヘテロアリール環はシクロアルキル環と縮合される。ヘテロアリール基の例としては、ピロリル、ピロリニル、イミダゾリル、ピラゾリル、ピリジル、ピリミジニル、ピラジニル、ピリダジニル、トリアゾリル、ピラニル、フリル、チエニル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、オキサジアゾリル、チアゾリル、チアジアゾリル、イソチアゾリル、インドリル、イソインドリル、インドリジニル、ベンズイミダゾリル、キノリル、イソキノリル、キノキサリニル、キナゾリニル、インダゾリル、ベンゾトリアゾリル、ベンゾジオキソリル、ベンゾピラニル、ベンゾオキサゾリル、ベンゾオキサジアゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾチアジアゾリル、ベンゾフリル、ベンゾチエニル、クロモニル、クマリニル、ベンゾピラニル、テトラヒドロキノリニル、テトラゾロピリダジニル、テトラヒドロイソキノリニル、チエノピリジニル、フロピリジニル、ピロロピリジニルなどが含まれる。例示的な三環式複素環基としては、カルバゾリル、ベンジドリル、フェナントロリニル、ジベンゾフラニル、アクリジニル、フェナントリジニル、キサンテニルなどが含まれる。
本明細書で使用される場合、「ヘテロシクロアルキル」、及び互換的に「複素環」という用語は、単独又は組み合わせて、それぞれ、環員として少なくとも1つのヘテロ原子を含む、飽和、部分不飽和、若しくは完全不飽和(ただし非芳香族)の単環式、二環式、又は三環式複素環基を指し、各当該ヘテロ原子は、独立して、窒素、酸素、及び硫黄から選択され得る。特定の実施形態では、当該ヘテロシクロアルキルは、環員として1~4個のヘテロ原子を含むであろう。更なる実施形態では、当該ヘテロシクロアルキルは、環員として1~2個のヘテロ原子を含むであろう。特定の実施形態では、当該ヘテロシクロアルキルは、各環に3~8個の環員を含むであろう。更なる実施形態では、当該ヘテロシクロアルキルは、各環に3~7個の環員を含むであろう。なお更なる実施形態では、当該ヘテロシクロアルキルは、各環に5~6個の環員を含むであろう。「ヘテロシクロアルキル」及び「複素環」は、スルホン、スルホキシド、三級窒素環員のN-酸化物、並びに縮合炭素環系及びベンゾ縮合環系を含むことが意図され、追加的に、両方の用語は、複素環が、本明細書で定義されるアリール基、又は追加の複素環基に縮合される系も含む。複素環基の例としては、テトラヒドロイソキノリン、アジリジニル、アゼチジニル、1,3-ベンゾジオキソリル、ジヒドロイソインドリル、ジヒドロイソキノリニル、ジヒドロシンノリニル、ジヒドロベンゾジオキシニル、ジヒドロ[1,3]オキサゾロ[4,5-b]ピリジニル、ベンゾチアゾリル、ジヒドロインドリル、ジヒドロピリジニル、1,3-ジオキサニル、1,4-ジオキサニル、1,3-ジオキソラニル、イソインドリニル、モルホリニル、ピペラジニル、ピロリジニル、テトラヒドロピリジニル、ピペリジニル、チオモルホリニルなどが含まれる。複素環基は、特に禁止されない限り、任意に置換され得る。
本明細書で使用される場合、「ヒドラジニル」という用語は、単独又は組み合わせて、単結合で結合した2つのアミノ基、すなわち、-N-N-を指す。
本明細書で使用される場合、「ヒドロキシ」という用語は、単独又は組み合わせて、-OHを指す。
本明細書で使用される場合、「ヒドロキシアルキル」という用語は、単独又は組み合わせて、アルキル基を介して親分子部分と結合されるヒドロキシ基を指す。
本明細書で使用される場合、「イミノ」という用語は、単独又は組み合わせて、=N-を指す。
本明細書で使用される場合、「イミノヒドロキシ」という用語は、単独又は組み合わせて、=N(OH)及び=N-O-を指す。
「主鎖内」という語句は、本明細書に開示される式のいずれか1つの化合物又は分子との基の結合点から始まる炭素原子の最も長い連続する又は隣接する鎖を指す。
「イソシアナト」という用語は、-NCO基を指す。
「イソチオシアナト」という用語は、-NCS基を指す。
「原子の直鎖」という語句は、独立して、炭素、窒素、酸素、及び硫黄から選択される原子の最も長い直鎖を指す。
本明細書で使用される場合、「低級」という用語は、単独又は組み合わせて、特に定義されない限り、1~6個の炭素原子を含む(すなわち、C1-C6アルキル)ことを意味する。
本明細書で使用される場合、「低級アリール」という用語は、単独又は組み合わせて、フェニル又はナフチルを意味し、これらのいずれも、提供される場合、任意に置換されてもよい。
本明細書で使用される「低級ヘテロアリール」という用語は、単独又は組み合わせて、1)5又は6個の環員を含み、そのうち1~4個の当該環員がN、O、及びSから選択されるヘテロ原子であり得る単環式ヘテロアリール、又は2)縮合環の各々が、5若しくは6個の環員を含み、それらの間にN、O、及びSから選択される1~4個のヘテロ原子を含む、二環式ヘテロアリールのいずれかを意味する。
本明細書で使用される場合、「低級シクロアルキル」は、単独又は組み合わせて、3~6個の環員を有する単環式シクロアルキル(すなわち、C3-C6シクロアルキル)を意味する。低級シクロアルキルは、不飽和であり得る。低級シクロアルキルの例としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、及びシクロヘキシルが含まれる。
本明細書で使用される場合、「低級ヘテロシクロアルキル」という用語は、単独又は組み合わせて、3~6個の環員を有する単環式ヘテロシクロアルキルを意味し、そのうちの1~4個は、N、O、及びS(すなわち、C3-C6ヘテロシクロアルキル)から選択されるヘテロ原子であり得る。低級ヘテロシクロアルキルの例としては、ピロリジニル、イミダゾリジニル、ピラゾリジニル、ピペリジニル、ピペラジニル、及びモルホリニルが含まれる。低級複素環アルキルは、不飽和であり得る。
本明細書で使用される場合、「低級アミノ」という用語は、単独又は組み合わせて、-NRR’を指し、式中、R及びR’は、独立して、水素及び低級アルキルから選択され、それらのいずれも任意に置換され得る。
本明細書で使用される場合、「メルカプチル」という用語は、単独又は組み合わせて、RS-基を指し、式中、Rは、本明細書で定義されるとおりである。
本明細書で使用される場合、「ニトロ」という用語は、単独又は組み合わせて、-NO2を指す。
本明細書で使用される場合、「オキシ」又は「オキサ」という用語は、単独又は組み合わせて、-O-を指す。
本明細書で使用される場合、「オキソ」という用語は、単独又は組み合わせて、=Oを指す。
「ペルハロアルコキシ」という用語は、全ての水素原子がハロゲン原子で置換されたアルコキシ基を指す。
本明細書で使用される場合、「パーハロアルキル」という用語は、単独又は組み合わせて、全ての水素原子がハロゲン原子で置換されたアルキル基を指す。
本明細書で使用される場合、「スルホネート(sulfonate)」、「スルホン酸(sulfonic acid)」、及び「スルホン酸(sulfonic)」という用語は、単独又は組み合わせて、スルホン酸が塩形成に使用されるときの、-SO3H基及びそのアニオンを指す。
本明細書で使用される場合、「スルファニル」という用語は、単独又は組み合わせて、-S-を指す。
本明細書で使用される場合、「スルフィニル」という用語は、単独又は組み合わせて、-S(O)-を指す。
本明細書で使用される場合、「スルホニル」という用語は、単独又は組み合わせて、-S(O)2-を指す。
「N-スルホンアミド」という用語は、RS(=O)2NR’-基を指し、R及びR’は本明細書で定義されるとおりである。
「S-スルホンアミド」という用語は、-S(=O)2NRR’基を指し、R及びR’は本明細書で定義されるとおりである。
本明細書で使用される場合、「チア」及び「チオ」という用語は、単独又は組み合わせて、酸素が硫黄で置換された-S-基又はエーテルを指す。チオ基の酸化誘導体、すなわちスルフィニル及びスルホニルは、チア及びチオの定義に含まれる。
本明細書で使用される場合、「チオール」という用語は、単独又は組み合わせて、-SH基を指す。
本明細書で使用される場合、「チオカルボニル」という用語は、単独の場合にはチオホルミル-C(S)Hを含み、組み合わせた場合には-C(S)-基である。
「N-チオカルバミル」という用語は、ROC(S)NR’-基を指し、R及びR’は本明細書で定義されるとおりである。
「O-チオカルバミル」という用語は、-OC(S)NRR’基を指し、R及びR’は本明細書で定義されるとおりである。
「「チオシアナト」という用語は、-CNS基を指す。
「トリハロメタンスルホンアミド」という用語は、X3CS(O)2NR-基を指し、Xはハロゲンであり、Rは本明細書で定義されるとおりである。
「トリハロメタンスルホニル」という用語は、X3CS(O)2-基を指し、Xはハロゲンである。
「トリハロメトキシ」という用語は、X3CO-基を指し、Xはハロゲンである。
本明細書で使用される場合、「三置換シリル」という用語は、単独又は組み合わせて、置換アミノの定義下で本明細書に列挙される基により、その3つの自由原子価で置換されたシリコーン基を指す。例としては、トリメチルシリル、tert-ブチルジメチルシリル、トリフェニルシリルなどが含まれる。
本明細書における任意の定義は、複合構造基を説明するための任意の他の定義と組み合わせて使用され得る。慣例により、そのような定義の後に続く要素は、親部分に結合するものである。例えば、複合基アルキルアミドは、アミド基を介して親分子と結合したアルキル基を表し、アルコキシアルキルという用語は、アルキル基を介して親分子と結合したアルコキシ基を表す。
基が「ヌル」であると定義されている場合、当該基が存在しないことを意味する。
「任意に置換される」という用語は、先行する基が置換されていても置換されていなくてもよいことを意味する。置換される場合、「任意に置換される」基の置換基には、以下の基又は特定の指定された基のセットから独立して選択される1つ以上の置換基が、単独又は組み合わせて含まれ得るが、これらに限定されない:低級アルキル、低級アルケニル、低級アルキニル、低級アルカノイル、低級ヘテロアルキル、低級ヘテロシクロアルキル、低級ハロアルキル、低級ハロアルケニル、低級ハロアルキニル、低級パーハロアルキル、低級パーハロアルコキシ、低級シクロアルキル、フェニル、アリール、アリールオキシ、低級アルコキシ、低級ハロアルコキシ、オキソ、低級アシルオキシ、カルボニル、カルボキシル、低級アルキルカルボニル、低級カルボキシエステル、低級カルボキサミド、シアノ、水素、ハロゲン、ヒドロキシ、アミノ、低級アルキルアミノ、アリールアミノ、アミド、ニトロ、チオール、低級アルキルチオ、低級ハロアルキルチオ、低級ペルハロアルキルチオ、アリールチオ、スルホネート、スルホン酸、三置換シリル、N3、SH、SCH3、C(O)CH3、CO2CH3、CO2H、ピリジニル、チオフェン、フラニル、低級カルバメート、及び低級ウレア。構造的に実現可能な場合、2つの置換基を一緒に連結して、0~3個のヘテロ原子からなる縮合5員、6員、若しくは7員の炭素環式又は複素環式環を形成してもよく、例えば、メチレンジオキシ又はエチレンジオキシを形成してもよい。任意に置換される基は、非置換(例えば、-CH2CH3)、完全置換(例えば、-CF2CF3)、一置換(例えば、-CH2CH2F)、又は完全置換と一置換との間のレベルで置換(例えば、-CH2CF3)であり得る。置換基が置換に関して限定されることなく列挙される場合、置換形態及び非置換形態の両方が包含される。置換基が「置換」として修飾される場合、置換形態は具体的に意図される。追加的に、特定の部分に対する任意の置換基の異なるセットは、必要に応じて定義されてもよく、これらの場合、任意の置換は、多くの場合、「で任意に置換された」というフレーズの直後に定義されたとおりである。
本明細書で使用される場合、置換基は、1つ以上の水素原子が別の原子又は基と交換されている非置換親基に由来する。別途示されない限り、基が「置換される」とみなされる場合、基は、独立して、C1-C6アルキル、C1-C6アルケニル、C1-C6アルキニル、C1-C6ヘテロアルキル、C3-C7カルボシクリル(ハロ、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシ、C1-C6ハロアルキル、及びC1-C6ハロアルコキシで任意に置換される)、C3-C7-カルボシクリル-C1-C6-アルキル(ハロ、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシ、C1-C6ハロアルキル、及びC1-C6ハロアルコキシで任意に置換される)、3~10員ヘテロシクリル(ハロ、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシ、C1-C6ハロアルキル、及びC1-C6ハロアルコキシで任意に置換される)、3~10員ヘテロシクリル-C1-C6-アルキル(ハロ、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシ、C1-C6ハロアルキル、及びC1-C6ハロアルコキシで任意に置換される)、アリール(ハロ、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシ、C1-C6ハロアルキル、及びC1-C6ハロアルコキシで任意に置換される)、アリール(C1-C6)アルキル(ハロ、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシ、C1-C6ハロアルキル、及びC1-C6ハロアルコキシで任意に置換される)、5~10員ヘテロアリール(ハロ、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシ、C1-C6ハロアルキル、及びC1-C6ハロアルコキシで任意に置換される)、5~10員ヘテロアリール(C1-C6)アルキル(ハロ、C1-C6アルキル、C1-C6アルコキシ、C1-C6ハロアルキル、及びC1-C6ハロアルコキシで任意に置換される)、ハロ、シアノ、ヒドロキシ、C1-C6アルコキシ、C1-C6アルコキシ(C1-C6)アルキル(すなわち、エーテル)、アリールオキシ、スルフヒドリル(メルカプト)、ハロ(C1-C6)アルキル(例えば、-CF3)、ハロ(C1-C6)アルコキシ(例えば、-OCF3)、C1-C6アルキルチオ、アリールチオ、アミノ、アミノ(C1-C6)アルキル、ニトロ、O-カルバミル、N-カルバミル、O-チオカルバミル、N-チオカルバミル、C-アミド、N-アミド、S-スルホンアミド、N-スルホンアミド、C-カルボキシ、O-カルボキシ、アシル、シアナト、イソシアナト、チオシアナト、イソチオシアナト、スルフィニル、スルホニル、及びオキソ(=O)から選択される1つ以上の置換基で置換されることを意味する。基が「任意に置換される」と記載される場合は常に、その基は上記の置換基で置換され得る。
Rという用語又はR’という用語は、特に定義しない限り、単独で、番号指定なしで出現し、水素、アルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、アリール、ヘテロアリール、及びヘテロシクロアルキルから選択される部分を指し、それらのいずれも任意に置換され得る。かかるR及びR’基は、本明細書で定義されるように任意に置換され得る。R基が数の指定を有するか否かにかかわらず、R、R’、及びRnを含む全てのR基、式中、n=(1、2、3、…n)、全ての置換基、及び全ての用語は、基からの選択の観点から、他の全てのものから独立していると理解されるべきである。任意の変数、置換基、又は用語(例えば、アリール、複素環、Rなど)が、式又は一般構造内で複数回出現する場合、各出現時のその定義は、他の全て出現時の定義とは独立である。当業者は、特定の基が親分子と結合してもよく、又は書かれているようにいずれかの端から要素の鎖内の位置を占めてもよいことを更に認識するであろう。例えば、-C(O)N(R)-などの非対称な基は、炭素又は窒素のいずれかで親部分と結合され得る。
非対称中心は、本明細書に開示される化合物又は分子に存在する。これらの中心は、キラル炭素原子の周りの置換基の配置に応じて、記号「R」又は「S」によって指定される。本開示が、ジアステレオマー、エナンチオマー、及びエピマー形態、並びにd-異性体及びl-異性体、並びにそれらの混合物を含む全ての立体化学異性体形態を包含することを理解されたい。化合物又は分子の個々の立体異性体は、キラル中心を含む市販の出発材料から、又はエナンチオマー生成物の混合物の調製、続いてジアステレオマーの混合物への変換、続いて分離若しくは再結晶化、クロマトグラフィー技術、キラルクロマトグラフィーカラムでのエナンチオマーの直接分離、又は当該技術分野で既知の任意の他の適切な方法により、合成的に調製され得る。特定の立体化学の出発化合物又は分子は、市販されているか、又は当該技術分野で既知の技術によって作製及び分解され得る。追加的に、本明細書に開示される化合物又は分子は、幾何異性体として存在し得る。本開示には、全てのシス、トランス、シン、アンチ、エントゲゲン(entgegen)(E)、及びズサンメン(zusammen)(Z)異性体、並びにそれらの適切な混合物が含まれる。追加的に、化合物又は分子は、互変異性体として存在し得、全ての互変異性異性体は、本開示によって提供される。追加的に、本明細書に開示される化合物又は分子は、非溶媒和形態でも、水、エタノールなどの薬学的に許容され得る溶媒との溶媒和形態でも存在し得る。一般に、溶媒和形態は、非溶媒和形態と同等とみなされる。
「結合」という用語は、2個の原子間の共有結合、又は結合によって連結された原子がより大きな下部構造の一部であると考えられる場合の2つの部分を指す。別段の定めがない限り、結合は、単結合、二重結合、又は三重結合であり得る。分子の図面における2つの原子間の破線は、追加の結合がその位置に存在し得るか、又は存在し得ないことを示す。
本明細書で使用される場合、「疾患」という用語は、概して、「障害」、「症候群」、及び「状態」(医学的状態の場合のように)という用語と同義であることが意図され、互換的に使用され、全てが、正常な機能を損なうヒト及び動物の身体、又はその一部の異常な状態を反映しており、典型的には、特徴的な兆候や症状によって明らかにされ、ヒト又は動物の生活の期間又は質を低下させる。
「併用療法」という用語は、本開示に記載されている治療状態又は障害を治療するための2つ以上の治療剤の投与を意味する。かかる投与は、活性成分の固定比率を有する単一のカプセル内、又は活性成分ごとに複数の別個のカプセル内など、実質的に同時の様式でのこれらの治療剤の同時投与を包含する。加えて、かかる投与はまた、各タイプの治療剤を連続的な様式で使用することも含まれる。いずれの場合も、治療レジメンは、本明細書に記載の状態又は障害の治療において薬物併用の有益な効果を提供するであろう。
「治療有効」という語句は、疾患若しくは障害の治療において、又は臨床エンドポイントの影響に対して使用される有効成分の量を限定することを意図している。
「治療上許容され得る」という用語は、それらの化合物又は分子(又は塩、プロドラッグ、互変異性体、両性イオン形態など)を指し、これらは、過度の毒性、刺激、及びアレルギー反応を起こすことなく、患者の組織と接触して使用するのに好適であり、合理的な利益/リスク比に見合ったものであり、意図された用途に有効である。
本明細書で使用される場合、患者の「治療」への言及は、予防を含むことが意図される。治療はまた、本質的に先制的であってもよく、すなわち、疾患の予防を含んでもよい。疾患の予防は、例えば、病原体による感染の予防の場合のように、疾患からの完全な保護を含み得るか、又は疾患の進行の予防を含み得る。例えば、疾患の予防は、任意のレベルで疾患と関連する影響を完全に排除することを意味するのではなく、代わりに、臨床的に有意又は検出可能なレベルまで疾患の症状を予防することを意味し得る。疾患の予防はまた、疾患の後期段階への疾患の進行の予防を意味し得る。
「患者」という用語は、概して、「対象」という用語と同義であり、ヒトを含む全ての哺乳動物を含む。患者の例としては、ヒト、ウシ、ヤギ、ヒツジ、ブタ、及びウサギなどの家畜、並びにイヌ、ネコ、ウサギ、及びウサギなどのコンパニオン動物が含まれる。好ましくは、患者は、ヒトである。
「プロドラッグ」という用語は、インビボでより活性化される化合物又は分子を指す。本明細書に開示される特定の化合物又は分子は、Hydrolysis in Drug and Prodrug Metabolism:Chemistry,Biochemistry,and Enzymology(Testa,Bernard and Mayer,Joachim M.Wiley-VHCA,Zurich,Switzerland 2003)に記載されているように、プロドラッグとしても存在し得る。本明細書に記載される化合物のプロドラッグは、生理学的条件下で化学変化を容易に受けて化合物を提供する化合物の構造的に修飾された形態である。追加的に、プロドラッグは、エクスビボ環境で化学的又は生化学的方法によって化合物に変換することができる。例えば、プロドラッグは、好適な酵素又は化学試薬とともに経皮パッチリザーバに配置されたときに、化合物にゆっくりと変換することができる。プロドラッグは、場合によっては、化合物又は親薬物よりも投与しやすい場合があるため、しばしば有用である。これらは、例えば、経口投与によって生体利用可能であり得るが、親薬物は生体利用可能ではない。プロドラッグはまた、医薬組成物中で、親薬物を上回る改善された溶解性を有する場合もある。プロドラッグの加水分解的切断又は酸化的活性化に依存するものなど、多種多様なプロドラッグ誘導体が当該技術分野で既知である。プロドラッグの例としては、限定されないが、エステル(「プロドラッグ」)として投与されるが、その後代謝的に加水分解されて活性物質であるカルボン酸となる化合物である。追加の例としては、化合物のペプチジル誘導体が含まれる。
「接触する」という用語は、化合物(例えば、本開示の転写分子的分子)を所望の標的遺伝子に近接させることを指す。接触することは、標的部分との結合をもたらし得るか、又は標的部分の立体配座変化をもたらし得る。
本明細書に開示される化合物又は分子は、治療的に許容され得る塩として存在することができる。本開示は、酸付加塩を含む、塩の形態で上記に列挙される化合物又は分子を含む。好適な塩としては、有機酸及び無機酸の両方で形成されたものが含まれる。かかる酸付加塩は、通常、薬学的に許容され得る。しかしながら、薬学的に許容されない塩の塩も、問題の化合物又は分子の調製及び精製に有用であり得る。塩基性付加塩も形成され、薬学的に許容され得る。塩の調製及び選択に関するより完全な討論については、Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use(Stahl,P.Heinrich.Wiley-VCHA,Zurich,Switzerland,2002)を参照されたい。
塩基性付加塩は、化合物又は分子の最終的な単離及び精製中に、カルボキシ基を好適な塩基、例えば、金属カチオンの水酸化物、炭酸塩、重炭酸塩と、又はアンモニアと、又は有機一級、二級、若しくは三級アミンと反応させることによって調製することができる。治療上許容され得る塩のカチオンには、リチウム、ナトリウム、カリウム、カルシウム、マグネシウム、及びアルミニウム、並びに非毒性四級アミンカチオン、例えば、アンモニウム、テトラメチルアンモニウム、テトラエチルアンモニウム、メチルアミン、ジメチルアミン、トリメチルアミン、トリエチルアミン、ジエチルアミン、エチルアミン、トリブチルアミン、ピリジン、N,N-ジメチルアニリン、N-メチルピペリジン、N-メチルモルホリン、ジシクロヘキシルアミン、プロカイン、ジベンジルアミン、N,N-ジベンジルフェネチルアミン、1-エフェナミン、及びN,N’-ジベンジルエチレンジアミンが含まれる。塩基付加塩の形成に有用な他の代表的な有機アミンとしては、エチレンジアミン、エタノールアミン、ジエタノールアミン、ピペリジン、及びピペラジンが含まれる。
薬学的分野において既知の他の担体材料及び投与様式も使用され得る。本開示の薬学的組成物は、効果的な製剤及び投与手順などの薬学の周知の技術のいずれかによって調製され得る。好ましい単位用量製剤は、本明細書において以下に列挙するような有効用量、又はその適切な部分の活性成分を含有するものである。
特に上記で言及した成分に加えて、上記の製剤は、問題の製剤の種類を考慮して当該技術分野の従来の他の薬剤を含み得ること、例えば、経口投与に好適なものが香味剤を含み得ることを理解されたい。
単回投与形態を製造するために担体材料と組み合わせることができる有効成分の量は、治療される宿主、及び特定の投与方法によって変化する。
化合物又は分子は、様々な様式で、例えば、経口的に、局所的に、又は注射により投与され得る。患者に投与される化合物の正確な量は、主治医の責任となる。任意の特定の患者のための特定の用量レベルは、使用される特定の化合物の活性、年齢、体重、一般的な健康、性別、食事、投与時間、投与経路、排泄速度、薬物の組み合わせ、治療される正確な疾患、及び治療される適応症又は状態の重症度を含む、様々な要因に依存するであろう。加えて、投与経路は、症状及びその重症度に応じて変化し得る。効果的な製剤及び投与手順に関する上記の考慮事項は、当該技術分野で周知であり、標準的な教科書に記載されている。
組み合わせ及び併用療法
特定の事例では、本明細書に記載の化合物又は分子(又はその薬学的に許容され得る塩)のうちの少なくとも1つを、別の治療剤と組み合わせて投与することが適切であり得る。ほんの一例として、本明細書の化合物のうちの1つを受けたときに患者が経験する副作用のうちの1つが高血圧である場合、最初の治療剤と組み合わせて抗高血圧薬を投与することが適切であり得る。又は、ほんの一例として、本明細書に記載される化合物のうちの1つの治療有効性は、アジュバントの投与によって増強され得る(すなわち、アジュバント自体は、最小限の治療上の利益しか有し得ないが、別の治療剤と組み合わせて、患者への全体的な治療上の利益が増強される)。又は、ほんの一例として、患者が経験する利益は、本明細書に記載される化合物のうちの1つを、治療的利益を有する別の治療剤(治療レジメンも含む)とともに投与することによって増加され得る。ほんの一例として、本明細書に記載される化合物のうちの1つの投与を伴う糖尿病の治療において、患者に別の糖尿病治療薬を提供することによって、治療上の利益の増加がもたらされ得る。いずれの場合でも、治療される疾患、障害、又は状態にかかわらず、患者が経験する全体的な利益は、単に2つの治療剤の加算であってもよく、又は患者は、相乗的利益を経験してもよい。
特定の事例では、本明細書に記載の化合物又は分子(又はその薬学的に許容され得る塩)のうちの少なくとも1つを、別の治療剤と組み合わせて投与することが適切であり得る。ほんの一例として、本明細書の化合物のうちの1つを受けたときに患者が経験する副作用のうちの1つが高血圧である場合、最初の治療剤と組み合わせて抗高血圧薬を投与することが適切であり得る。又は、ほんの一例として、本明細書に記載される化合物のうちの1つの治療有効性は、アジュバントの投与によって増強され得る(すなわち、アジュバント自体は、最小限の治療上の利益しか有し得ないが、別の治療剤と組み合わせて、患者への全体的な治療上の利益が増強される)。又は、ほんの一例として、患者が経験する利益は、本明細書に記載される化合物のうちの1つを、治療的利益を有する別の治療剤(治療レジメンも含む)とともに投与することによって増加され得る。ほんの一例として、本明細書に記載される化合物のうちの1つの投与を伴う糖尿病の治療において、患者に別の糖尿病治療薬を提供することによって、治療上の利益の増加がもたらされ得る。いずれの場合でも、治療される疾患、障害、又は状態にかかわらず、患者が経験する全体的な利益は、単に2つの治療剤の加算であってもよく、又は患者は、相乗的利益を経験してもよい。
いずれの場合も、複数の治療剤(そのうちの少なくとも1つは、本明細書に開示される化合物である)は、任意の順序で、又は同時に投与されてもよい。同時である場合、複数の治療剤は、単一の統合された形態で、又は複数の形態(単なる例として、単一の丸剤として、又は2つの別個の丸剤として)で提供され得る。治療薬のうちの1つは、複数用量で投与されてもよく、又は両方が複数用量として投与されてもよい。同時でない場合、複数回投与の間のタイミングは、数分から4週間の範囲の任意の期間であってもよい。
したがって、別の態様では、特定の実施形態は、かかる治療を必要とするヒト又は動物の対象において本明細書に記載される障害を治療するための方法であって、対象における当該障害を軽減又は予防するのに有効な量の本明細書に開示される化合物を、当技術分野で公知の当該障害の治療のための少なくとも1つの追加の薬剤と組み合わせて、当該対象に投与することを含む、方法を提供する。関連する態様では、特定の実施形態は、本明細書に開示される少なくとも1つの化合物を、障害を治療するための1つ以上の追加の薬剤と組み合わせた治療組成物を提供する。障害は、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、atn、及びTCF4をコードする遺伝子などの欠損遺伝子の発現と関連付けられ得る。
ヒト治療に有用であることに加えて、本明細書に開示される特定の化合物及び製剤は、哺乳動物、げっ歯類などを含む、コンパニオン動物、外来動物、及び家畜の獣医学的治療にも有用であり得る。より好ましい動物としては、ウマ、イヌ、及びネコが含まれる。
化合物の合成
本開示の化合物は、以下に詳述する一般的な合成スキーム及び実験手順に例示される方法を使用して調製することができる。一般的な合成スキーム及び実験手順は例示的なものであり、限定することは意図していない。本開示の化合物を調製するために使用される出発物質は市販されているか、又は当技術分野で即知であるルーチンな方法を使用して調製することができる。
本開示の化合物は、以下に詳述する一般的な合成スキーム及び実験手順に例示される方法を使用して調製することができる。一般的な合成スキーム及び実験手順は例示的なものであり、限定することは意図していない。本開示の化合物を調製するために使用される出発物質は市販されているか、又は当技術分野で即知であるルーチンな方法を使用して調製することができる。
略称のリスト
Ac2O=無水酢酸;AcCl=塩化アセチル;AcOH=酢酸;AIBN=アゾビスイソブチロニトリル;aq.=水性;Bu3SnH=水素化トリブチルスズ;CD3OD=重水素化メタノール;CDCl3=重水素化クロロホルム;CDI=1,1′-カルボニルジイミダゾール;DBU=1,8-ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ-7-エン;DCM=ジクロロメタン;DEAD=ジエチルアゾジカルボキシレート;DIBAL-H=ジ-イソブチルアルミニウムヒドリド;DIEA=DIPEA=N,N-ジイソプロピルエチルアミン;DMAP=4-ジメチルアミノピリジン;DMF=N,N-ジメチルホルムアミド;DMSO-d6=重水素化ジメチルスルホキシド;DMSO=ジメチルスルホキシド;DPPA=ジフェニルホスホリルアジド;EDC.HCl=EDCI.HCl=1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミドハイドロクロライド;Et2O=ジエチルエーテル;EtOAc=酢酸エチル;EtOH=エタノール;h=時間;HATU=2-(1H-7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェートメタナミン;HMDS=ヘキサメチルジシラザン;HOBT=1-ヒドロキシベンゾトリアゾール;i-PrOH=イソプロパノール;LAH=水素化アルミニウムリチウム;LiHMDS=リチウムビス(トリメチルシリル)アミド;MeCN=アセトニトリル;MeOH=メタノール;MP-カーボネート樹脂=マクロ多孔質トリエチルアンモニウムメチルポリスチレンカーボネート樹脂;MsCl=塩化メシル;MTBE=メチル三級ブチルエーテル;MW=マイクロ波照射;n-BuLi=n-ブチルリチウム;NaHMDS=ナトリウムビス(トリメチルシリル)アミド;NaOMe=ナトリウムメトキシド;NaOtBu=ナトリウムt-ブトキシド;NBS=N-ブロモスクシンイミド;NCS=N-クロロスクシンイミド;NMP=N-メチル-2-ピロリドン;Pd(Ph3)4=テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0);Pd2(dba)3=トリス(ジベンジリデンアセトン)-ジパラジウム(0);PdCl2(PPh3)2=ビス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(II)ジクロリド;PG=保護基;分取-HPLC=分取高速液体クロマトグラフィー;PyBop=(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)-トリピロリジノホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート;Pyr=ピリジン;RT=室温;RuPhos=2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル;sat.=飽和;ss=飽和溶液;t-BuOH=tert-ブタノール;T3P=プロピルホスホン酸無水物;TBS=TBDMS=tert-ブチルジメチルシリル;TBSCl=TBDMSCl=tert-ブチルジメチルクロロシラン;TEA=Et3N=トリエチルアミン;TFA=トリフルオロ酢酸;TFAA=トリフルオロ酢酸無水物;THF=テトラヒドロフラン;Tol=トルエン;TsCl=塩化トシル;XPhos=2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,4’,6’-トリイソプロピルビフェニル。
Ac2O=無水酢酸;AcCl=塩化アセチル;AcOH=酢酸;AIBN=アゾビスイソブチロニトリル;aq.=水性;Bu3SnH=水素化トリブチルスズ;CD3OD=重水素化メタノール;CDCl3=重水素化クロロホルム;CDI=1,1′-カルボニルジイミダゾール;DBU=1,8-ジアザビシクロ[5.4.0]ウンデカ-7-エン;DCM=ジクロロメタン;DEAD=ジエチルアゾジカルボキシレート;DIBAL-H=ジ-イソブチルアルミニウムヒドリド;DIEA=DIPEA=N,N-ジイソプロピルエチルアミン;DMAP=4-ジメチルアミノピリジン;DMF=N,N-ジメチルホルムアミド;DMSO-d6=重水素化ジメチルスルホキシド;DMSO=ジメチルスルホキシド;DPPA=ジフェニルホスホリルアジド;EDC.HCl=EDCI.HCl=1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミドハイドロクロライド;Et2O=ジエチルエーテル;EtOAc=酢酸エチル;EtOH=エタノール;h=時間;HATU=2-(1H-7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-1,1,3,3-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェートメタナミン;HMDS=ヘキサメチルジシラザン;HOBT=1-ヒドロキシベンゾトリアゾール;i-PrOH=イソプロパノール;LAH=水素化アルミニウムリチウム;LiHMDS=リチウムビス(トリメチルシリル)アミド;MeCN=アセトニトリル;MeOH=メタノール;MP-カーボネート樹脂=マクロ多孔質トリエチルアンモニウムメチルポリスチレンカーボネート樹脂;MsCl=塩化メシル;MTBE=メチル三級ブチルエーテル;MW=マイクロ波照射;n-BuLi=n-ブチルリチウム;NaHMDS=ナトリウムビス(トリメチルシリル)アミド;NaOMe=ナトリウムメトキシド;NaOtBu=ナトリウムt-ブトキシド;NBS=N-ブロモスクシンイミド;NCS=N-クロロスクシンイミド;NMP=N-メチル-2-ピロリドン;Pd(Ph3)4=テトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0);Pd2(dba)3=トリス(ジベンジリデンアセトン)-ジパラジウム(0);PdCl2(PPh3)2=ビス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(II)ジクロリド;PG=保護基;分取-HPLC=分取高速液体クロマトグラフィー;PyBop=(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)-トリピロリジノホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート;Pyr=ピリジン;RT=室温;RuPhos=2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,6’-ジイソプロポキシビフェニル;sat.=飽和;ss=飽和溶液;t-BuOH=tert-ブタノール;T3P=プロピルホスホン酸無水物;TBS=TBDMS=tert-ブチルジメチルシリル;TBSCl=TBDMSCl=tert-ブチルジメチルクロロシラン;TEA=Et3N=トリエチルアミン;TFA=トリフルオロ酢酸;TFAA=トリフルオロ酢酸無水物;THF=テトラヒドロフラン;Tol=トルエン;TsCl=塩化トシル;XPhos=2-ジシクロヘキシルホスフィノ-2’,4’,6’-トリイソプロピルビフェニル。
化合物を調製するための一般的な合成方法
一般に、本開示のポリアミドは、Boc保護された直鎖脂肪族及び複素芳香族アミノ酸、並びにそれらのアルキル化誘導体などの化合物を使用して、固体支持合成方法によって合成され得、これらは、当技術分野で周知のように、アミノ分解によって支持体から切断され、脱保護され(例えば、チオフェノキシドナトリウムで)、逆相HPLCによって精製される。ポリアミドの同一性及び純度は、1H-NMR、分析用HPLC、又は質量分析などの当業者が利用できる様々な分析技術のうちのいずれかを使用して検証することができる。
一般に、本開示のポリアミドは、Boc保護された直鎖脂肪族及び複素芳香族アミノ酸、並びにそれらのアルキル化誘導体などの化合物を使用して、固体支持合成方法によって合成され得、これらは、当技術分野で周知のように、アミノ分解によって支持体から切断され、脱保護され(例えば、チオフェノキシドナトリウムで)、逆相HPLCによって精製される。ポリアミドの同一性及び純度は、1H-NMR、分析用HPLC、又は質量分析などの当業者が利用できる様々な分析技術のうちのいずれかを使用して検証することができる。
以下のスキームを使用して、本開示を実施することができる:
スキームA.ポリアミドの合成
スキームA.ポリアミドの合成
本明細書に開示される化合物は、スキームAを使用して合成することができる。明瞭さ及び簡潔さのために、スキームは、サブユニット「C」及び「D」を含むジアミドの合成を示し、これらの両方は、アミノ及びカルボキシ部分を有する不特定の5員環として表される。サブユニット「D」のアミノ基は、Boc又はCBzカルバメートなどの保護基「PG」で保護され、101が得られる。次いで、遊離)カルボン酸を、EDCなどのカップリング試薬を使用して固体支持体と反応させて、支持された化合物103が得られる。酸性条件下でのPGの除去により、遊離アミン104が得られ、窒素保護カルボン酸105と結合して、アミド106が得られる。酸性条件下でのPGの除去により、遊離アミン107が得られる。この例では、遊離アミンを酢酸無水物と反応させて、アセトアミドを形成する(図示せず。次いで、分子が塩基性条件下で固体支持体から切断されて、カルボン酸108が得られる。リンカーL及びリクルート部位Xの結合ための方法を以下に開示する。
当業者は、上記のスキームの多くのバリエーションが、広範囲の化合物を提供するために利用可能であることを理解するであろう:
1)配列104-106-107は、より長いポリアミン配列を形成するために、所望の頻度で繰り返すことができる。
2)様々なアミノ複素環カルボン酸を使用して、異なるサブユニットを形成することができる。表4は、制限することを意図するものではないが、本開示の化合物の合成のために企図されるいくつかの複素環アミノ酸を提供する。カルバメート保護基PGは、当該技術分野で十分に確立されている技術を使用して組み込むことができる。
1)配列104-106-107は、より長いポリアミン配列を形成するために、所望の頻度で繰り返すことができる。
2)様々なアミノ複素環カルボン酸を使用して、異なるサブユニットを形成することができる。表4は、制限することを意図するものではないが、本開示の化合物の合成のために企図されるいくつかの複素環アミノ酸を提供する。カルバメート保護基PGは、当該技術分野で十分に確立されている技術を使用して組み込むことができる。
3)ヒドロキシ含有複素環式アミノ酸は、それらのTBSエーテルとしてスキームBに組み込まれ得る。限定することを意図するものではないが、スキームBは、本開示における分子の合成のために企図されるTBSで保護された複素環式アミノ酸の合成を提供する。
スキームB.TBS保護された複素環式アミノ酸の合成
4)脂肪族アミノ酸は、DNAヌクレオチドの認識のためのスペーサー単位「W」及びサブユニットの形成のために上記の合成に使用され得る。表5は、限定することを意図するものではないが、本開示における分子の合成のために企図されるいくつかの脂肪族アミノ酸を提供する。
スキームC.ポリアミド/リクルート因子/リンカーコンジュゲートの合成。
リンカーL及びリクルート部位Xの結合は、リンカーLにトリエチレングリコール部位を使用するスキームIIIに開示される方法で達成することができる。トリエチレングリコール301のモノTBSエーテルは、光延条件下でブロモ化合物302に変換される。リクルート部位Xは、ヒドロキシル部位による臭素の置換によって結合され、エーテル303が得られる。次いで、TBS基をフッ化物で処理することによって除去して、ポリアミド部分とのカップリングに好適であり得るアルコール304が得られる。プロピレングリコール又はポリアミンリンカーを含むが、これらに限定されない代替リンカーL、又はアミン及びチオールの使用を含むが、これらに限定されないリクルート部分Xの代替結合点を包含するための他の方法は、当業者には明らかであろう。
スキームD.ポリアミド/リクルート因子/リンカーコンジュゲートの合成。
X-L-Y分子の合成は、スキームDに示される方法で完了することができる。カルボン酸108は、酸塩化物401に変換される。塩基性条件下での301のアルコール官能性との反応により、結合生成物402が得られる。カルボジイミド試薬の使用を含むがこれに限定されない、カップリング手順を実施するための他の方法は当業者には明らかであろう。例えば、アミドカップリング試薬としては、ジシクロヘキシルカルボジイミド(DCC)、ジイソプロピルカルボジイミド(DIC)、エチル-(N’,N’-ジメチルアミノ)プロピルカルボジイミドハイドロクロライド(EDC)などのカルボジイミドを、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)、4-(N,N-ジメチルアミノ)ピリジン(DMAP)、及びジイソプロピルエチルアミン(DIEA)などの試薬と組み合わせて使用することができるが、これらに限定されない。他の試薬は、実際のカップリング反応に応じて、(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリス(ジメチルアミノ)ホスホニウムヘキサフルオロホスフェート(BOP)、(ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリピロリジノホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート(PyBOP)、(7-アザベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロホスフェート(PyAOP)、ブロモトリピロリジノホスホニウム ヘキサフルオロホスフェート(PyBrOP)、ビス(2-オキソ-3-オキサゾリジニル)ホスフィン酸クロリド(BOP-Cl)、O-(ベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HBTU)、O-(ベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TBTU)、O-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HATU)、O-(7-アザベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウムテトラフルオロボレート(TATU)、O-(6-クロロベンゾトリアゾール-1-イル)-N,N,N’,N’-テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(HCTU)、カルボニルジイミダゾール(CDI)、及びN,N,N′,N′-テトラメチルクロロホルムアミジニウムヘキサフルオロホスフェート(TCFH)も多くの場合に使用される。
タンパク質結合分子をオリゴマー骨格と結合する
一般に、オリゴマー骨格は、オリゴマーをタンパク質結合部分内の結合位置に連結するために実行できる、化学反応の種類に適合するように官能化される。反応の種類としては、アミドカップリング反応、エーテル形成反応(O-アルキル化反応)、アミン形成反応(N-アルキル化反応)、及び場合によっては炭素-炭素カップリング反応が好適であるが、これらに限定されない。オリゴマー及びタンパク質結合因子を連結するために使用される一般的な反応を以下に示す。表2に示される化合物及び構造は、化合物と制御タンパク質との間の水素結合に干渉しないが、化学的に実行可能な任意の位置で、本明細書に記載のオリゴマー骨格と結合することができる。
一般に、オリゴマー骨格は、オリゴマーをタンパク質結合部分内の結合位置に連結するために実行できる、化学反応の種類に適合するように官能化される。反応の種類としては、アミドカップリング反応、エーテル形成反応(O-アルキル化反応)、アミン形成反応(N-アルキル化反応)、及び場合によっては炭素-炭素カップリング反応が好適であるが、これらに限定されない。オリゴマー及びタンパク質結合因子を連結するために使用される一般的な反応を以下に示す。表2に示される化合物及び構造は、化合物と制御タンパク質との間の水素結合に干渉しないが、化学的に実行可能な任意の位置で、本明細書に記載のオリゴマー骨格と結合することができる。
スキームE.アミドカップリング。
一態様では、本開示の分子は、細胞透過性リガンド部分を含む。細胞透過性リガンド部分は、細胞膜を通過する化合物の輸送を促進する役割を果たす。特定の実施形態では、細胞透過性リガンド部分は、ポリペプチドである。いくつかのペプチド配列は、ポリRなどのポリカチオン配列、(RXR)n(X=6-アミノヘキサン酸)及び(RXRRBR)n(B=ベータアラニン)などのスペーサーを散在させたアルギニンが豊富な配列、ペネトラチンペプチド由来の配列、並びにPNA/PMO内在化ペプチド(Pip)由来の配列を含む、細胞への通過を容易にすることができる。Pip5シリーズは、配列ILFQYを特徴とする。
特定の実施形態では、細胞透過性ポリペプチドは、N末端カチオン性配列H2N-(R)n-CO-を含み、包括的にn=5~10である。特定の実施形態では、N末端カチオン配列は、独立して、β-アラニン及び6-アミノヘキサン酸から選択されるアミノ酸残基に対するRの1、2、又は3個の置換を含む。
特定の実施形態では、細胞透過性ポリペプチドは、ILFQY配列を含む。特定の実施形態では、細胞透過性ポリペプチドは、QFLY配列を含む。特定の実施形態では、細胞透過性ポリペプチドは、QFL配列を含む。
特定の実施形態では、細胞透過性ポリペプチドは、C末端カチオン配列-HN-(R)n-COOHを含み、包括的にn=5~10である。特定の実施形態では、C末端カチオン配列は、独立して、ベータ-アラニン及び6-アミノヘキサン酸から選択されるアミノ酸残基に対するRの1、2、又は3個の置換を含む。特定の実施形態では、C末端カチオン性配列は、ひとつおきの位置で、独立して、ベータ-アラニン及び6-アミノヘキサン酸から選択されるアミノ酸残基で置換される。特定の実施形態では、C末端カチオン配列は、-HN-RXRBRXRB-COOHである。
以下の実施例は、本発明の様々な実施形態を説明する目的で示されるものであり、いかなる形でも本発明を限定することを意図するものではない。本実施例は、本明細書に記載の方法とともに、現在、好ましい実施形態を代表するものであり、例示的であり、本発明の範囲を限定するものではない。特許請求の範囲によって定義される本発明の趣旨の範囲内に含まれる変更及び他の使用は、当業者であれば想到するであろう。
本発明の好ましい実施形態が本明細書に示され、記載されているが、そのような実施形態が例としてのみ提供されることは、当業者には明白であろう。本発明から逸脱することなく、多数の変形、変更、及び置換がここで当業者に想起されるであろう。本明細書に記載される実施形態に対する様々な代替案が用いられ得ることは理解されるべきである。以下の特許請求の範囲は、本発明の範囲を定義し、これらの特許請求の範囲及びそれらの等価物の範囲内の方法及び構造が、それらによって包含されることが意図される。
以下の実施例は、開示された実施形態を説明することを目的とするものであり、限定するものではない。
スキームAは、ポリアミドを調製し、ポリアミドをオリゴマー骨格と結合させ、次いでリガンドをオリゴマー骨格のもう一方の末端と結合させるためのステップを説明する。以下の表3に列挙されるような転写モジュレータ分子は、合成を使用して調製することができる。
スキームAは、ポリアミドを調製し、ポリアミドをオリゴマー骨格と結合させ、次いでリガンドをオリゴマー骨格のもう一方の末端と結合させるためのステップを説明する。以下の表3に列挙されるような転写モジュレータ分子は、合成を使用して調製することができる。
代表的なリガンドの合成
実施例1.N-(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)-4-[(2E)-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エンアミド]ベンズアミド(INT-10)の合成
実施例1.N-(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)-4-[(2E)-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エンアミド]ベンズアミド(INT-10)の合成
ステップ:メチル(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エノエートの合成
三口250mLフラスコを-15~-25℃に冷却した。添加漏斗にTHF(25.00mL)中のメチル(2E)-4-ブロモブタ-2-エノエート(5.00g、27.93mmol、1.00当量)を負荷した。第2の添加漏斗にメチルアミン(THF中2M)(13.79mL、2.50当量)を負荷した。ポット温度を-30℃に保ちながら、両溶液を30分かけて同時に滴下した。混合物を室温に温め、3.0時間保持した。次いで、反応混合物を-60~-65℃に冷却した。TEA(14.13g、139.66mmol、5.00当量)を加え、THF(50.00mL)中の(Boc)2O(24.38g、111.73mmol、4.00当量)の溶液を1.0時間かけて滴下して加えた。混合物を2.0時間保持し、それを室温まで温める。TLC(9:1ヘプタン:EtOAc)により反応が完了していることを確認する。沈殿物を濾去し、混合物を濃縮して油を得た。油をCH2Cl2(50mL)に再溶解し、水(25mL)、1N HCl(25mL)、及び水(2×25mL)で連続的に洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム(10g)で10分間乾燥させた。混合物を濾過し、濃縮した。メチル(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エノエート(6.00g、92.75%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C11H19NO4に対する質量計算値:229.13、実測値:247.15[M+H2O]+。
三口250mLフラスコを-15~-25℃に冷却した。添加漏斗にTHF(25.00mL)中のメチル(2E)-4-ブロモブタ-2-エノエート(5.00g、27.93mmol、1.00当量)を負荷した。第2の添加漏斗にメチルアミン(THF中2M)(13.79mL、2.50当量)を負荷した。ポット温度を-30℃に保ちながら、両溶液を30分かけて同時に滴下した。混合物を室温に温め、3.0時間保持した。次いで、反応混合物を-60~-65℃に冷却した。TEA(14.13g、139.66mmol、5.00当量)を加え、THF(50.00mL)中の(Boc)2O(24.38g、111.73mmol、4.00当量)の溶液を1.0時間かけて滴下して加えた。混合物を2.0時間保持し、それを室温まで温める。TLC(9:1ヘプタン:EtOAc)により反応が完了していることを確認する。沈殿物を濾去し、混合物を濃縮して油を得た。油をCH2Cl2(50mL)に再溶解し、水(25mL)、1N HCl(25mL)、及び水(2×25mL)で連続的に洗浄した。有機層を硫酸ナトリウム(10g)で10分間乾燥させた。混合物を濾過し、濃縮した。メチル(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エノエート(6.00g、92.75%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C11H19NO4に対する質量計算値:229.13、実測値:247.15[M+H2O]+。
ステップ2:(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エン酸の合成
THF(40.00mL)及びH2O(40.00mL)中のメチル(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エノエート(6.00g、26.17mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、KOH(5.87g、104.62mmol、4.00当量)を0℃で加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(20mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH4~5に酸性化した。得られた混合物をEA(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をNaCl(40mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エン酸(4.50g、79.89%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C10H17NO4に対する質量計算値:215.12、実測値:238.10[M+Na]+。
THF(40.00mL)及びH2O(40.00mL)中のメチル(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エノエート(6.00g、26.17mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、KOH(5.87g、104.62mmol、4.00当量)を0℃で加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(20mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH4~5に酸性化した。得られた混合物をEA(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をNaCl(40mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エン酸(4.50g、79.89%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C10H17NO4に対する質量計算値:215.12、実測値:238.10[M+Na]+。
ステップ3:メチル4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]ベンゾエートの合成
DMF(60.00mL)中の(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブト-2-エン酸(4.50g、20.91mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、HATU(9.54g、25.09mmol、1.20当量)、DIEA(8.11g、62.72mmol、3.00当量)、及びメチル4-アミノベンゾエート(3.16g、20.91mmol、1.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。反応物を0℃の水/氷(150mL)でクエンチした。得られた混合物をEA(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をNaCl(80mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(3:1)で溶出して、メチル4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]ベンゾエート(2.00g、27.46%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C18H24N2O5に対する質量計算値:348.17、実測値:371.05[M+Na]+。
DMF(60.00mL)中の(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブト-2-エン酸(4.50g、20.91mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、HATU(9.54g、25.09mmol、1.20当量)、DIEA(8.11g、62.72mmol、3.00当量)、及びメチル4-アミノベンゾエート(3.16g、20.91mmol、1.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。反応物を0℃の水/氷(150mL)でクエンチした。得られた混合物をEA(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をNaCl(80mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(3:1)で溶出して、メチル4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]ベンゾエート(2.00g、27.46%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C18H24N2O5に対する質量計算値:348.17、実測値:371.05[M+Na]+。
ステップ4:4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エナミド]安息香酸の合成
THF(10.00mL)及びH2O(5.00mL)中のメチル4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]ベンゾエート(1.00g、2.87mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、LiOH.H2O(361.34mg、8.61mmol、3.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。次いで、残留物を水(4mL)に溶解した。混合物を2N HClでpH7に中和した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]安息香酸(670.00mg、63.87%収率)を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C17H22N2O5に対する質量計算値:334.15、実測値:335.15[M+H]+。
THF(10.00mL)及びH2O(5.00mL)中のメチル4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]ベンゾエート(1.00g、2.87mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、LiOH.H2O(361.34mg、8.61mmol、3.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。次いで、残留物を水(4mL)に溶解した。混合物を2N HClでpH7に中和した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]安息香酸(670.00mg、63.87%収率)を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C17H22N2O5に対する質量計算値:334.15、実測値:335.15[M+H]+。
ステップ5:3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)-1H-インドールの合成
メチルマグネシウムブロミド(2-メチルテトラヒドロフラン中3.2M、9.84mL、85.41mmol、2.00当量)を、THF(200.00mL)中のインドール(10.00g、117.15mmol、2.75当量)の溶液に0℃で10分間かけて滴下して加えた。溶液を0~2℃で30分間撹拌した。2,4,5-トリクロロピリミジン(7.83g、42.68mmol、1.00当量)を滴下して加えた。氷浴から取り出し、溶液を周囲温度で1.0時間撹拌した。温度を60℃に上昇させ、混合物を60℃で1.5時間撹拌した。混合物を25℃に冷却し、酢酸(4.94mL、86.4mmol、2.00当量)を滴下して加えた。水(80mL)及びTHF(16mL)を加え、混合物を60℃で20分間撹拌し、二相溶液を得た。層を分配し、ヘプタン(80mL)を有機溶液に加えて、固体の結晶化をもたらした。固体を濾過により収集し、ヘプタン(16mL)で洗浄して、真空オーブンで乾燥させて、3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)-1H-インドールを黄色の固体として得た(5.10g、21.45%収集)。LC/MS:C12H7Cl2N3に対する質量計算値:263.00、実測値:264.05[M+H]+。
メチルマグネシウムブロミド(2-メチルテトラヒドロフラン中3.2M、9.84mL、85.41mmol、2.00当量)を、THF(200.00mL)中のインドール(10.00g、117.15mmol、2.75当量)の溶液に0℃で10分間かけて滴下して加えた。溶液を0~2℃で30分間撹拌した。2,4,5-トリクロロピリミジン(7.83g、42.68mmol、1.00当量)を滴下して加えた。氷浴から取り出し、溶液を周囲温度で1.0時間撹拌した。温度を60℃に上昇させ、混合物を60℃で1.5時間撹拌した。混合物を25℃に冷却し、酢酸(4.94mL、86.4mmol、2.00当量)を滴下して加えた。水(80mL)及びTHF(16mL)を加え、混合物を60℃で20分間撹拌し、二相溶液を得た。層を分配し、ヘプタン(80mL)を有機溶液に加えて、固体の結晶化をもたらした。固体を濾過により収集し、ヘプタン(16mL)で洗浄して、真空オーブンで乾燥させて、3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)-1H-インドールを黄色の固体として得た(5.10g、21.45%収集)。LC/MS:C12H7Cl2N3に対する質量計算値:263.00、実測値:264.05[M+H]+。
ステップ6:5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミンの合成
250mLの丸底フラスコに、3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)-1H-インドール(5.10g、19.31mmol、1.00当量)、p-トルエンスルホン酸(6.65g、38.62mmol、2.00当量)、及び3-ニトロアニリン(2.67g、19.33mmol、1.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を窒素雰囲気下、120℃で24.0時間撹拌した。反応混合物を蒸発して乾燥させ、DCM(100mL)及びMeOH(10mL)に再溶解し、飽和NaHCO3(50mL)、水(50mL)、及び飽和ブライン(50mL)で順次洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濾液を蒸発させて粗生成物を得た。得られた固体をDCM/MeOH(9:1)で粉砕し、濾過して、DCMで洗浄し、5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミンを淡黄の色固体として得た(4.90g、96.00%収率)。LC/MS:C18H12ClN5O2に対する質量計算値:365.07、実測値:366.15[M+H]+。
250mLの丸底フラスコに、3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)-1H-インドール(5.10g、19.31mmol、1.00当量)、p-トルエンスルホン酸(6.65g、38.62mmol、2.00当量)、及び3-ニトロアニリン(2.67g、19.33mmol、1.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を窒素雰囲気下、120℃で24.0時間撹拌した。反応混合物を蒸発して乾燥させ、DCM(100mL)及びMeOH(10mL)に再溶解し、飽和NaHCO3(50mL)、水(50mL)、及び飽和ブライン(50mL)で順次洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濾液を蒸発させて粗生成物を得た。得られた固体をDCM/MeOH(9:1)で粉砕し、濾過して、DCMで洗浄し、5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミンを淡黄の色固体として得た(4.90g、96.00%収率)。LC/MS:C18H12ClN5O2に対する質量計算値:365.07、実測値:366.15[M+H]+。
ステップ7:N1-[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミンの合成
40.00mLのTHF及び40.00mLのH2O中の5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミン(4.90g、13.40mmol、1.00当量)の溶液に、Fe(11.22g、200.94mmol、15.00当量)及びNH4Cl(17.91g、334.90mmol、25.00当量)を250mL丸底フラスコ中で窒素雰囲気下で加えた。混合物を80℃で17.0時間撹拌し、次いで反応混合物をセライトパッドを通して濾過した。有機相を分離し、水(50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させ、蒸発させて、4.40gの粗製のN1-[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミンを淡黄色の固体として得た。LC/MS:C18H14ClN5に対する質量計算値:335.09、実測値:336.10[M+H]+。
40.00mLのTHF及び40.00mLのH2O中の5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミン(4.90g、13.40mmol、1.00当量)の溶液に、Fe(11.22g、200.94mmol、15.00当量)及びNH4Cl(17.91g、334.90mmol、25.00当量)を250mL丸底フラスコ中で窒素雰囲気下で加えた。混合物を80℃で17.0時間撹拌し、次いで反応混合物をセライトパッドを通して濾過した。有機相を分離し、水(50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させ、蒸発させて、4.40gの粗製のN1-[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミンを淡黄色の固体として得た。LC/MS:C18H14ClN5に対する質量計算値:335.09、実測値:336.10[M+H]+。
ステップ8:tert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメートの合成
DMF(8.00mL)中の4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]安息香酸(262.88mg、0.79mmol、1.10当量)の撹拌溶液に、HATU(326.11mg、0.86mmol、1.20当量)、DIEA(277.11mg、2.14mmol、3.00当量)、及びN1-[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミン(240.00mg、0.72mmol、1.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。反応物を0℃の水/氷(20mL)でクエンチした。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。Tert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメート(500.00mg、85.82%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C35H34ClN7O4に対する質量計算値:651.24、実測値:652.35[M+H]+。
DMF(8.00mL)中の4-[(2E)-4-[(tert-ブトキシカルボニル)(メチル)アミノ]ブタ-2-エンアミド]安息香酸(262.88mg、0.79mmol、1.10当量)の撹拌溶液に、HATU(326.11mg、0.86mmol、1.20当量)、DIEA(277.11mg、2.14mmol、3.00当量)、及びN1-[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミン(240.00mg、0.72mmol、1.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。反応物を0℃の水/氷(20mL)でクエンチした。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。Tert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメート(500.00mg、85.82%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C35H34ClN7O4に対する質量計算値:651.24、実測値:652.35[M+H]+。
ステップ9:N-(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)-4-[(2E)-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エナミド]ベンズアミドの合成
DCM(16.00mL)中のtert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメート(500.00mg、0.77mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、TFA(4.00mL)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、15分間で30%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。N-(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)-4-[(2E)-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エナミド]ベンズアミド(330.00mg、72.48%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C30H26ClN7O2に対する質量計算値:551.18、実測値:552.30[M+H]+。
DCM(16.00mL)中のtert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメート(500.00mg、0.77mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、TFA(4.00mL)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、15分間で30%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。N-(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)-4-[(2E)-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エナミド]ベンズアミド(330.00mg、72.48%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C30H26ClN7O2に対する質量計算値:551.18、実測値:552.30[M+H]+。
実施例2.N-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]-4-[(2E)-4-ブロモブト-2-エンアミド]ベンズアミド(INT-11-Br)の合成
ステップ1:(2E)-4-ブロモブト-2-エノイルクロリドの合成
DCM(20.00mL)中の4-ブロモ-トランス-クロトン酸(1.50g、9.09mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、(COCl)2(6.92g、54.52mmol、6.00当量)及びDMF(0.50mL)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。(2E)-4-ブロモブト-2-エノイルクロリド(1.50g、89.94%収率)を、黄色の油として得た。
DCM(20.00mL)中の4-ブロモ-トランス-クロトン酸(1.50g、9.09mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、(COCl)2(6.92g、54.52mmol、6.00当量)及びDMF(0.50mL)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。(2E)-4-ブロモブト-2-エノイルクロリド(1.50g、89.94%収率)を、黄色の油として得た。
ステップ2:1-(ベンゼンスルホニル)-3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)インドールの合成
アセトニトリル(20.00mL)及びH2O(10.00mL)中の1(ベンゼンスルホニル)インドリルボロン酸(2.00g、6.64mmol、1.00当量)及び2,4,5-トリクロロピリミジン(1.22g、6.64mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、Na2CO3(1.41g、13.28mmol、2.00当量)及びPd(PPh3)4(0.38g、0.33mmol、0.05当量)を加えた。N2を3回交換した。反応混合物を窒素雰囲気下、85℃で2.0時間撹拌した。次いで、それを濾過し、濾過ケーキを水(3×5mL)、n-ヘキサン(2×5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、1-(ベンゼンスルホニル)-3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)インドール(2.60g、87.15%)を白色の固体として得た。LC/MS:C18H11Cl2N3O2Sに対する質量計算値:402.99、実測値:403.95[M+H]+。
アセトニトリル(20.00mL)及びH2O(10.00mL)中の1(ベンゼンスルホニル)インドリルボロン酸(2.00g、6.64mmol、1.00当量)及び2,4,5-トリクロロピリミジン(1.22g、6.64mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、Na2CO3(1.41g、13.28mmol、2.00当量)及びPd(PPh3)4(0.38g、0.33mmol、0.05当量)を加えた。N2を3回交換した。反応混合物を窒素雰囲気下、85℃で2.0時間撹拌した。次いで、それを濾過し、濾過ケーキを水(3×5mL)、n-ヘキサン(2×5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、1-(ベンゼンスルホニル)-3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)インドール(2.60g、87.15%)を白色の固体として得た。LC/MS:C18H11Cl2N3O2Sに対する質量計算値:402.99、実測値:403.95[M+H]+。
ステップ3:4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロ-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミンの合成
ペンタン-2-オール(50.00mL)中の1-(ベンゼンスルホニル)-3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)インドール(2.00g、4.95mmol、1.00当量)及び3-ニトロアニリン(683.34mg、4.95mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、p-トルエンスルホン酸(1.70g、9.89mmol、2.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を120℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をDCM(100mL)及びMeOH(10mL)に溶解し、飽和NaHCO3(1×50mL)、H2O(1×50mL)、及びブライン(1×50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロ-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミン(2.20g、58.16%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C24H16ClN5O4Sに対する質量計算値:505.06、実測値:506.15[M+H]+。
ペンタン-2-オール(50.00mL)中の1-(ベンゼンスルホニル)-3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)インドール(2.00g、4.95mmol、1.00当量)及び3-ニトロアニリン(683.34mg、4.95mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、p-トルエンスルホン酸(1.70g、9.89mmol、2.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を120℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をDCM(100mL)及びMeOH(10mL)に溶解し、飽和NaHCO3(1×50mL)、H2O(1×50mL)、及びブライン(1×50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロ-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミン(2.20g、58.16%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C24H16ClN5O4Sに対する質量計算値:505.06、実測値:506.15[M+H]+。
ステップ4:N1-[4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミンの合成
EtOH(30.00mL)及びH2O(10.00mL)中の4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロ-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミン(2.20g、4.35mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、Fe(2.43g、43.51mmol、10.01当量)及びNH4Cl(3.49g、65.23mmol、15.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を80℃で17.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEA(3x10mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(30mL)に溶解し、EA(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。粗N1-[4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミン(2.00g、78.48%収率)を赤色の油として得た。LC/MS:C24H18ClN5O2Sに対する質量計算値:475.09、実測値:476.15[M+H]+。
EtOH(30.00mL)及びH2O(10.00mL)中の4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロ-N-(3-ニトロフェニル)ピリミジン-2-アミン(2.20g、4.35mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、Fe(2.43g、43.51mmol、10.01当量)及びNH4Cl(3.49g、65.23mmol、15.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を80℃で17.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEA(3x10mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(30mL)に溶解し、EA(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(30mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。粗N1-[4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミン(2.00g、78.48%収率)を赤色の油として得た。LC/MS:C24H18ClN5O2Sに対する質量計算値:475.09、実測値:476.15[M+H]+。
ステップ5:tert-ブチルN-(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバメートの合成
DMF(25.00mL)中の4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]安息香酸(1.00g、4.20mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、HATU(2.40g、6.30mmol、1.50当量)、DIEA(1.63g、12.61mmol、3.00当量)、及びN1-[4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミン(2.00g、4.20mmol、1.00当量)を0℃で加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。反応物を0℃の水/氷(75mL)でクエンチした。得られた混合物をEA(3x100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3x100mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムにより精製し、PE/EA(3:2)で溶出して、tert-ブチルN-(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバメート(2.00g、61.16%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C36H31ClN6O5Sに対する質量計算値:694.18、実測値:695.10[M+H]+。
DMF(25.00mL)中の4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]安息香酸(1.00g、4.20mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、HATU(2.40g、6.30mmol、1.50当量)、DIEA(1.63g、12.61mmol、3.00当量)、及びN1-[4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]ベンゼン-1,3-ジアミン(2.00g、4.20mmol、1.00当量)を0℃で加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。反応物を0℃の水/氷(75mL)でクエンチした。得られた混合物をEA(3x100mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3x100mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムにより精製し、PE/EA(3:2)で溶出して、tert-ブチルN-(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバメート(2.00g、61.16%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C36H31ClN6O5Sに対する質量計算値:694.18、実測値:695.10[M+H]+。
ステップ6:4-アミノ-N-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]ベンズアミドの合成
1,4-ジオキサン中のHCl(4M、20.00mL)中のtert-ブチルN-(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバメート(2.00g、2.88mmol、1.00当量)の溶液を、室温で1.5時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。4-アミノ-N-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]ベンズアミド(2.00g、粗製)を黄色の固体として得た。LC/MS:C31H23ClN6O3Sに対する質量計算値:594.12、実測値:595.25[M+H]+。
1,4-ジオキサン中のHCl(4M、20.00mL)中のtert-ブチルN-(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバメート(2.00g、2.88mmol、1.00当量)の溶液を、室温で1.5時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。4-アミノ-N-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]ベンズアミド(2.00g、粗製)を黄色の固体として得た。LC/MS:C31H23ClN6O3Sに対する質量計算値:594.12、実測値:595.25[M+H]+。
ステップ7:N-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]-4-[(2E)-4-ブロモブト-2-エンアミド]ベンズアミドの合成
THF(20.00mL)中の4-アミノ-N-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]ベンズアミド(1.90g、3.19mmol、1.00当量)の溶液に、DIEA(1.24g、9.58mmol、3.00当量)及びTHF(10.00mL)中の(2E)-4-ブロモブト-2-エノイルクロリド(0.59g、3.22mmol、1.01当量)の溶液を0℃で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(1:4)で溶出して、N-[3-[4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]-4-[(2E)-4-ブロモブト-2-エンアミド]ベンズアミド(1.60g、64.21%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C35H26BrClN6O4Sに対する質量計算値:740.06、742.06、実測値:741.00、743.00[M+H、M+2+H]+。
THF(20.00mL)中の4-アミノ-N-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]ベンズアミド(1.90g、3.19mmol、1.00当量)の溶液に、DIEA(1.24g、9.58mmol、3.00当量)及びTHF(10.00mL)中の(2E)-4-ブロモブト-2-エノイルクロリド(0.59g、3.22mmol、1.01当量)の溶液を0℃で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(1:4)で溶出して、N-[3-[4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]-4-[(2E)-4-ブロモブト-2-エンアミド]ベンズアミド(1.60g、64.21%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C35H26BrClN6O4Sに対する質量計算値:740.06、742.06、実測値:741.00、743.00[M+H、M+2+H]+。
実施例3.(2E)-N-[4-[(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エンアミド(INT-12)の合成
ステップ1:tert-ブチル(3R)-3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)ピペリジン-1-カルボキシレートの合成
NMP(50.00mL)中の1-(ベンゼンスルホニル)-3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)インドール(4.00g、9.89mmol、1.00当量)及びtert-ブチル(3R)-3-アミノピペリジン-1-カルボキシレート(3.21g、16.03mmol、1.62当量)の撹拌混合物に、DIEA(1.91g、14.84mmol、15.00当量)を加えた。反応混合物を140℃で17.0時間撹拌した。反応を0℃の水(200mL)でクエンチした。得られた混合物をEtOAc(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(2x50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EtOAc(1:1)で溶出して、tert-ブチル(3R)-3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)ピペリジン-1-カルボキシレート(5.00g、66.63%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C28H30ClN5O4Sに対する質量計算値:567.17、実測値:568.20[M+H]+。
NMP(50.00mL)中の1-(ベンゼンスルホニル)-3-(2,5-ジクロロピリミジン-4-イル)インドール(4.00g、9.89mmol、1.00当量)及びtert-ブチル(3R)-3-アミノピペリジン-1-カルボキシレート(3.21g、16.03mmol、1.62当量)の撹拌混合物に、DIEA(1.91g、14.84mmol、15.00当量)を加えた。反応混合物を140℃で17.0時間撹拌した。反応を0℃の水(200mL)でクエンチした。得られた混合物をEtOAc(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(2x50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EtOAc(1:1)で溶出して、tert-ブチル(3R)-3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)ピペリジン-1-カルボキシレート(5.00g、66.63%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C28H30ClN5O4Sに対する質量計算値:567.17、実測値:568.20[M+H]+。
ステップ2:tert-ブチル(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレートの合成
MeOH(50.00mL)中のtert-ブチル(3R)-3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)ピペリジン-1-カルボキシレート(4.00g、7.04mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、H2O(25.00mL)中のKOH(1.58g、28.16mmol、4.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で4.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(2:1)で溶出して、tert-ブチル(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(2.00g、63.53%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C22H26ClN5O2に対する質量計算値:427.18、実測値:428.10[M+H]+。
MeOH(50.00mL)中のtert-ブチル(3R)-3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)ピペリジン-1-カルボキシレート(4.00g、7.04mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、H2O(25.00mL)中のKOH(1.58g、28.16mmol、4.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で4.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(2:1)で溶出して、tert-ブチル(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(2.00g、63.53%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C22H26ClN5O2に対する質量計算値:427.18、実測値:428.10[M+H]+。
ステップ3:5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-[(3R)-ピペリジン-3-イル]ピリミジン-2-アミンの合成
MeOH(5.00mL)中のtert-ブチル(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(500.00mg、1.17mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、1,4-ジオキサン中のHCl(気体)(4M、15.00mL)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-[(3R)-ピペリジン-3-イル]ピリミジン-2-アミン(500.00mg、粗製)を黄色の固体として得た。LC/MS:C17H18ClN5に対する質量計算値:327.13、実測値:328.15[M+H]+。
MeOH(5.00mL)中のtert-ブチル(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(500.00mg、1.17mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、1,4-ジオキサン中のHCl(気体)(4M、15.00mL)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-[(3R)-ピペリジン-3-イル]ピリミジン-2-アミン(500.00mg、粗製)を黄色の固体として得た。LC/MS:C17H18ClN5に対する質量計算値:327.13、実測値:328.15[M+H]+。
ステップ4:tert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメートの合成
手順は、tert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメート(INT-10.8)と同じであった。500.00mgの5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-[(3R)-ピペリジン-3-イル]ピリミジン-2-アミンを使用して、900.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(69.14%収率)。LC/MS:C34H38ClN7O4に対する質量計算値:643.27、実測値:644.35[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメート(INT-10.8)と同じであった。500.00mgの5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)-N-[(3R)-ピペリジン-3-イル]ピリミジン-2-アミンを使用して、900.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(69.14%収率)。LC/MS:C34H38ClN7O4に対する質量計算値:643.27、実測値:644.35[M+H]+。
ステップ5:(2E)-N-[4-[(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エンアミドの合成
手順は、N-(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)-4-[(2E)-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エンアミド]ベンズアミド(INT-10)と同じであった。900.00mgのtert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメートを使用して、450.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(59.20%収率)。LC/MS:C29H30ClN7O2に対する質量計算値:543.21、実測値:544.15[M+H]+。
手順は、N-(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)-4-[(2E)-4-(メチルアミノ)ブタ-2-エンアミド]ベンズアミド(INT-10)と同じであった。900.00mgのtert-ブチルN-[(2E)-3-([4-[(3R)-3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]カルバモイル)プロパ-2-エン-1-イル]-N-メチルカルバメートを使用して、450.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(59.20%収率)。LC/MS:C29H30ClN7O2に対する質量計算値:543.21、実測値:544.15[M+H]+。
実施例4.(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-14)の合成
ステップ1:メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエートの合成
1000mlのフラスコに、4-tert-ブチル安息香酸(10.00g、56.11mmol、1.00当量)及びDMF(250.00mL)を加え、溶液を0℃で10分間撹拌し、メチル L-フェニルアラニネート(12.07g、67.33mmol、1.20当量)、TBTU(23.42g、72.94mmol、1.30当量)、DIEA(18.13g、140.27mmol、2.50当量)を加え、反応物を0℃で1.0時間撹拌した。反応物を氷水(800mL)に注ぎ、沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×100mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(20.00g、粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C21H25NO3に対する質量計算値:339.18、実測値:340.20[M+H]+。
1000mlのフラスコに、4-tert-ブチル安息香酸(10.00g、56.11mmol、1.00当量)及びDMF(250.00mL)を加え、溶液を0℃で10分間撹拌し、メチル L-フェニルアラニネート(12.07g、67.33mmol、1.20当量)、TBTU(23.42g、72.94mmol、1.30当量)、DIEA(18.13g、140.27mmol、2.50当量)を加え、反応物を0℃で1.0時間撹拌した。反応物を氷水(800mL)に注ぎ、沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×100mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(20.00g、粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C21H25NO3に対する質量計算値:339.18、実測値:340.20[M+H]+。
ステップ2:(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸の合成
1000mlのフラスコに、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(19.00g、55.98mmol、1.00当量)、MeOH(160.00mL)、LiOH.H2O(2M、83.96mL、167.93mmol、3.00当量)、THF(80.00mL)を加え、反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応物を濃縮し、残留物を水(200mL)に溶解し、0℃に冷却し、2M塩酸でpH=5に調整した。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(19.00g、粗製)を白色の固体として得た。LCMS:C20H23NO3に対する質量計算値:325.17、実測値:326.15[M+H]+。
1000mlのフラスコに、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(19.00g、55.98mmol、1.00当量)、MeOH(160.00mL)、LiOH.H2O(2M、83.96mL、167.93mmol、3.00当量)、THF(80.00mL)を加え、反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応物を濃縮し、残留物を水(200mL)に溶解し、0℃に冷却し、2M塩酸でpH=5に調整した。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(19.00g、粗製)を白色の固体として得た。LCMS:C20H23NO3に対する質量計算値:325.17、実測値:326.15[M+H]+。
ステップ3:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT14.1)と同じであったが、反応温度は室温であった。10.00gの(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸を使用して、13.00gの粗製のメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパノエートをオフホワイト色の固体として得た。LC/MS:C25H32N2O4に対する質量計算値:424.24、実測値:425.25[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT14.1)と同じであったが、反応温度は室温であった。10.00gの(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸を使用して、13.00gの粗製のメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパノエートをオフホワイト色の固体として得た。LC/MS:C25H32N2O4に対する質量計算値:424.24、実測値:425.25[M+H]+。
ステップ4:(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパン酸の合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.2)と同じであった。13.00gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパノエートを使用して、12.00gの(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパン酸を、オフホワイト色の固体として得た(95.68%収率)。LC/MS:C23H28N2O4に対する質量計算値:396.20、実測値:397.25[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.2)と同じであった。13.00gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパノエートを使用して、12.00gの(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパン酸を、オフホワイト色の固体として得た(95.68%収率)。LC/MS:C23H28N2O4に対する質量計算値:396.20、実測値:397.25[M+H]+。
ステップ5:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであったが、反応温度は室温であった。10.00gの(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサン酸を使用して、12.00gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た(94.99%収率)。LC/MS:C30H39N3O8に対する質量計算値:569.27、実測値:592.45[M+Na]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであったが、反応温度は室温であった。10.00gの(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサン酸を使用して、12.00gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た(94.99%収率)。LC/MS:C30H39N3O8に対する質量計算値:569.27、実測値:592.45[M+Na]+。
ステップ6:メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
DCM(100.00mL)中の1,4-ジオキサン(50.00mL、4M)中のメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(13.00g、22.82mmol、1.00当量)の溶液及びHCl(気体)を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。得られた固体をEt2O(2×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(12.00g、粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C25H31N3O6に対する質量計算値:469.22、実測値:470.40[M+H]+。
DCM(100.00mL)中の1,4-ジオキサン(50.00mL、4M)中のメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(13.00g、22.82mmol、1.00当量)の溶液及びHCl(気体)を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。得られた固体をEt2O(2×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(12.00g、粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C25H31N3O6に対する質量計算値:469.22、実測値:470.40[M+H]+。
ステップ7:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は2.0時間であった。9.00gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、8.50gの所望の生成物を、白色の固体として得た(64.99%収率)。LC/MS:C36H50N4O9に対する質量計算値:682.36、実測値:683.55[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は2.0時間であった。9.00gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、8.50gの所望の生成物を、白色の固体として得た(64.99%収率)。LC/MS:C36H50N4O9に対する質量計算値:682.36、実測値:683.55[M+H]+。
ステップ8:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであった。8.50gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、8.40gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C31H42N4O7に対する質量計算値:582.31、実測値:583.50[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであった。8.50gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、8.40gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C31H42N4O7に対する質量計算値:582.31、実測値:583.50[M+H]+。
ステップ9:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであったが、反応温度は室温であった。次いで、得られた固体を、PREP_ACHIRAL_SFC、カラム:GreenSep Basic、3*15cm、5μm;移動相A:CO2、移動相B:MeOH(0.5% 2M NH3-MeOH)--HPLC;流速:75mL/分;勾配:均一濃度30% B;カラム温度(℃):35;背圧(bar):100;波長:254nm;RT1(分):4.82;試料溶媒:MeOH--HPLCにより精製した。8.00gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、4.80gの所望の生成物を、黄色の固体として得た(40.23%収率)。LC/MS:C54H68N6O10に対する質量計算値:960.50、実測値:961.95[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであったが、反応温度は室温であった。次いで、得られた固体を、PREP_ACHIRAL_SFC、カラム:GreenSep Basic、3*15cm、5μm;移動相A:CO2、移動相B:MeOH(0.5% 2M NH3-MeOH)--HPLC;流速:75mL/分;勾配:均一濃度30% B;カラム温度(℃):35;背圧(bar):100;波長:254nm;RT1(分):4.82;試料溶媒:MeOH--HPLCにより精製した。8.00gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、4.80gの所望の生成物を、黄色の固体として得た(40.23%収率)。LC/MS:C54H68N6O10に対する質量計算値:960.50、実測値:961.95[M+H]+。
ステップ10:メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
DMF(8.00mL)中のメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(2.60g、2.71mmol、1.00当量)及びジエチルアミン(2.00mL)の溶液を、室温で20分間撹拌した。得られた溶液を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、30分間で5%~38%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて、蒸発させ、メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(2.00g、85.05%)を黄色の固体として得た。LC/MS:C39H58N6O8に対する質量計算値:738.43、実測値:739.65[M+H]+。
DMF(8.00mL)中のメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(2.60g、2.71mmol、1.00当量)及びジエチルアミン(2.00mL)の溶液を、室温で20分間撹拌した。得られた溶液を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、30分間で5%~38%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて、蒸発させ、メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(2.00g、85.05%)を黄色の固体として得た。LC/MS:C39H58N6O8に対する質量計算値:738.43、実測値:739.65[M+H]+。
ステップ11:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート
MeOH(10.00mL)中のメチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(1.80g、2.44mmol、1.00当量)及びアセトアルデヒド(428.00mg、9.72mmol、3.99当量)の撹拌溶液に、NaBH3CN(459.00mg、7.30mmol、3.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。得られた混合物を水(150mL)で希釈した。得られた混合物をCH2Cl2(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(2x50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(1.75g、90.50%収率)を黄色の油として得た。HRMS:C43H66N6O8に対する質量計算値:794.4942、実測値:795.5154[M+H]+。
MeOH(10.00mL)中のメチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(1.80g、2.44mmol、1.00当量)及びアセトアルデヒド(428.00mg、9.72mmol、3.99当量)の撹拌溶液に、NaBH3CN(459.00mg、7.30mmol、3.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。得られた混合物を水(150mL)で希釈した。得られた混合物をCH2Cl2(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(2x50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(1.75g、90.50%収率)を黄色の油として得た。HRMS:C43H66N6O8に対する質量計算値:794.4942、実測値:795.5154[M+H]+。
ステップ12:(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸の合成
手順は、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(INT-14.2)と同じであったが、溶媒は、MeOH/H2Oであり、反応温度は30℃であり、反応時間は2.0時間であった。1.60gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、1.70gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C42H64N6O8に対する質量計算値:780.48、実測値:781.45[M+H]+。
手順は、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(INT-14.2)と同じであったが、溶媒は、MeOH/H2Oであり、反応温度は30℃であり、反応時間は2.0時間であった。1.60gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、1.70gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C42H64N6O8に対する質量計算値:780.48、実測値:781.45[M+H]+。
実施例5.4-([2,5-ビス[4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]アミノ)安息香酸(INT-18)の合成
ステップ1:1-[3-ブロモ-4-[4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン-1-カルボニル]ベンゾイル]-4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジンの合成
DMF(25.00mL)中の2-ブロモベンゼン-1,4-ジカルボン酸(1.00g、4.08mmol、1.00当量)の溶液に、TBTU(3.12g、12.24mmol、3.00当量)、及びトリエチルアミン(1.23g、12.20mmol、2.99当量)を加えた。次いで、4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン(1.26g、8.16mmol、2.00当量)を加えた。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を50mLの氷水に注ぎ、EA抽出した(3×50mL)。有機相を合わせて、H2O(2×50mL)及びブライン(50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濃縮した。残留物を、DCM/MeOH=5:1でシリカゲルカラムにより精製した。1.00gの所望の生成物を、褐色の固体として得た(46.00%収率)。LC/MS:C26H37BrN4O2に対する質量計算値:516.21、実測値:517.05、519.05[M+H、M+2+H]+。
DMF(25.00mL)中の2-ブロモベンゼン-1,4-ジカルボン酸(1.00g、4.08mmol、1.00当量)の溶液に、TBTU(3.12g、12.24mmol、3.00当量)、及びトリエチルアミン(1.23g、12.20mmol、2.99当量)を加えた。次いで、4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン(1.26g、8.16mmol、2.00当量)を加えた。混合物を室温で一晩撹拌した。混合物を50mLの氷水に注ぎ、EA抽出した(3×50mL)。有機相を合わせて、H2O(2×50mL)及びブライン(50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濃縮した。残留物を、DCM/MeOH=5:1でシリカゲルカラムにより精製した。1.00gの所望の生成物を、褐色の固体として得た(46.00%収率)。LC/MS:C26H37BrN4O2に対する質量計算値:516.21、実測値:517.05、519.05[M+H、M+2+H]+。
ステップ2:tert-ブチル4-([2,5-ビス[4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]アミノ)ベンゾエートの合成:
Tol(25.00mL)中の1-[3-ブロモ-4-[4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン-1-カルボニル]ベンゾイル]-4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン(1.00g、1.93mmol、1.00当量)の溶液に、tert-ブチル4-アミノベンゾエート(373.41mg、1.93mmol、1.00当量)、カリウムtert-ブトキシド(433.66mg、3.865mmol、2.0当量)、X-Phos(184.23mg、0.39mmol、0.20当量)、及びPd2(dba)3.CHCl3(200.01mg、0.19mmol、0.10当量)を加えた。N2を3回交換した。混合物を120℃で12.0時間撹拌した。溶媒を除去し、残留物を、MeOH/DCM=1:5でシリカゲルカラムにより精製した。950.00mgの所望の生成物を、褐色の固体として得た(58.00%収率)。LC/MS:C37H51N5O4に対する質量計算値:629.39、実測値:630.50[M+H]+。
Tol(25.00mL)中の1-[3-ブロモ-4-[4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン-1-カルボニル]ベンゾイル]-4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン(1.00g、1.93mmol、1.00当量)の溶液に、tert-ブチル4-アミノベンゾエート(373.41mg、1.93mmol、1.00当量)、カリウムtert-ブトキシド(433.66mg、3.865mmol、2.0当量)、X-Phos(184.23mg、0.39mmol、0.20当量)、及びPd2(dba)3.CHCl3(200.01mg、0.19mmol、0.10当量)を加えた。N2を3回交換した。混合物を120℃で12.0時間撹拌した。溶媒を除去し、残留物を、MeOH/DCM=1:5でシリカゲルカラムにより精製した。950.00mgの所望の生成物を、褐色の固体として得た(58.00%収率)。LC/MS:C37H51N5O4に対する質量計算値:629.39、実測値:630.50[M+H]+。
ステップ3:4-([2,5-ビス[4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]
アミノ)安息香酸の合成
100mLフラスコに、tert-ブチル4-([2,5-ビス[4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]アミノ)ベンゾエート(950.00mg、1.51mmol、1.00当量)、及びジオキサン溶液(20.00mL)中の4M HClを加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。溶媒を除去し、残留物をEt2O(2×10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、850mgの所望の生成物を、淡褐色の固体として得た(90.00%収率)。LC/MS:C33H43N5O4に対する質量計算値:573.33、実測値:574.50[M+H]+。
アミノ)安息香酸の合成
100mLフラスコに、tert-ブチル4-([2,5-ビス[4-(ピロリジン-1-イル)ピペリジン-1-カルボニル]フェニル]アミノ)ベンゾエート(950.00mg、1.51mmol、1.00当量)、及びジオキサン溶液(20.00mL)中の4M HClを加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。溶媒を除去し、残留物をEt2O(2×10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、850mgの所望の生成物を、淡褐色の固体として得た(90.00%収率)。LC/MS:C33H43N5O4に対する質量計算値:573.33、実測値:574.50[M+H]+。
実施例6.tert-ブチル3-[[4-([[4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレート(INT-22-Boc)の合成
ステップ1:4-メトキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリルの合成
DMF(80.00mL)中の2-ブロモ-4-メトキシベンゾニトリル(4.50g、21.22mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ピラゾール(7.22g、106.05mmol、5.00当量)、Cs2CO3(13.83g、42.44mmol、2.00当量)、及びCuBr(6.09g、42.44mmol、2.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物をN2雰囲気下、120℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾液をH2O(150mL)で希釈した。得られた混合物をEA(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムにより精製し、PA/EA(3:1)で溶出して、4-メトキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.70g、39.44%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C11H9N3Oに対する質量計算値:199.07、実測値:200.05[M+H]+。
DMF(80.00mL)中の2-ブロモ-4-メトキシベンゾニトリル(4.50g、21.22mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ピラゾール(7.22g、106.05mmol、5.00当量)、Cs2CO3(13.83g、42.44mmol、2.00当量)、及びCuBr(6.09g、42.44mmol、2.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物をN2雰囲気下、120℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾液をH2O(150mL)で希釈した。得られた混合物をEA(3×200mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムにより精製し、PA/EA(3:1)で溶出して、4-メトキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.70g、39.44%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C11H9N3Oに対する質量計算値:199.07、実測値:200.05[M+H]+。
ステップ2:4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリルの合成
DCM(20.00mL)中の4-メトキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.30g、6.53mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、三臭化ホウ素(32.70g、0.13mmol、20.00当量)を-78℃で滴下して加えた。得られた混合物を室温で2日間撹拌した。反応物を0℃の水/氷(20mL)でクエンチした。得られた混合物をDCM(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1x50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.20g、84.72%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C10H7N3Oに対する質量計算値:185.06、実測値:186.10[M+H]+。
DCM(20.00mL)中の4-メトキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.30g、6.53mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、三臭化ホウ素(32.70g、0.13mmol、20.00当量)を-78℃で滴下して加えた。得られた混合物を室温で2日間撹拌した。反応物を0℃の水/氷(20mL)でクエンチした。得られた混合物をDCM(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1x50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.20g、84.72%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C10H7N3Oに対する質量計算値:185.06、実測値:186.10[M+H]+。
ステップ3:4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリルの合成
CH3CN(20.00mL)中の4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.10g、5.94mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、BnBr(1.52g、5.89mmol、1.50当量)及びK2CO3(2.46g、17.82mmol、3.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を60℃で3.0時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(4:1)で溶出して、4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.20g、73.07%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C17H13N3Oに対する質量計算値:275.11、実測値:276.10[M+H]+。
CH3CN(20.00mL)中の4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.10g、5.94mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、BnBr(1.52g、5.89mmol、1.50当量)及びK2CO3(2.46g、17.82mmol、3.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を60℃で3.0時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(4:1)で溶出して、4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.20g、73.07%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C17H13N3Oに対する質量計算値:275.11、実測値:276.10[M+H]+。
ステップ4:1-[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メタンアミンの合成
MeOH(20.00mL)中の4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.20g、4.36mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ラネーNi(373.43mg、4.36mmol、1.00当量)、及びNH3.H2O(76.38mg、2.18mmol、0.50当量)を室温で少量ずつ加えた。次いで、H2を3回交換した。得られた混合物を、H2雰囲気下、室温で3.0時間撹拌した。固体を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3x10mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。1-[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メタンアミン(1.20g、86.69%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C17H17N3Oに対する質量計算値:279.14、実測値:280.15[M+H]+。
MeOH(20.00mL)中の4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)ベンゾニトリル(1.20g、4.36mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ラネーNi(373.43mg、4.36mmol、1.00当量)、及びNH3.H2O(76.38mg、2.18mmol、0.50当量)を室温で少量ずつ加えた。次いで、H2を3回交換した。得られた混合物を、H2雰囲気下、室温で3.0時間撹拌した。固体を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3x10mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。1-[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メタンアミン(1.20g、86.69%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C17H17N3Oに対する質量計算値:279.14、実測値:280.15[M+H]+。
ステップ5:8-イソプロピル-2-スルファニリデン-1H,3H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オンの合成
DCM(40.00mL)中の4-イソプロピル-1H-ピラゾール-3-アミン(2.50g、19.97mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DCM(20.00mL)中のエチルN-カルボチオイルカルバメート(2.62g、19.98mmol、1.00当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、DCM(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。
DCM(40.00mL)中の4-イソプロピル-1H-ピラゾール-3-アミン(2.50g、19.97mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DCM(20.00mL)中のエチルN-カルボチオイルカルバメート(2.62g、19.98mmol、1.00当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、DCM(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。
残留物をCH3CN(45.00mL)に溶解した。上記混合物に、K2CO3(8.28g、59.92mmol、3.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を80℃で更に3.0時間撹拌した。混合物をAcOHでpH3~5に酸性化した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をH2O(50mL)に懸濁した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。8-イソプロピル-2-スルファニリデン-1H,3H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オン(3.00g、66.64%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C8H10N4OSに対する質量計算値:210.06、実測値:211.00[M+H]+。
ステップ6:8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)-1H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オンの合成
H2O(12.00mL)中のEtOH(35.00mL)及び2M NaOH中の8-イソプロピル-2-スルファニリデン-1H,3H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オン(2.50g、11.89mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ヨウ化メチル(1.86g、13.10mmol、1.10当量)を0℃で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。混合物を6M HClでpH3~5に酸性化した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(20mL)に懸濁した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)-1H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オン(1.10g、41.25%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C9H12N4OSに対する質量計算値:224.07、実測値:225.10[M+H]+。
H2O(12.00mL)中のEtOH(35.00mL)及び2M NaOH中の8-イソプロピル-2-スルファニリデン-1H,3H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オン(2.50g、11.89mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ヨウ化メチル(1.86g、13.10mmol、1.10当量)を0℃で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。混合物を6M HClでpH3~5に酸性化した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を水(20mL)に懸濁した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)-1H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オン(1.10g、41.25%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C9H12N4OSに対する質量計算値:224.07、実測値:225.10[M+H]+。
ステップ7:4-クロロ-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジンの合成
POCl3(10.00mL)中の8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)-1H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オン(1.00g、4.46mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、N,N-ジエチルアニリン(2.00g、13.40mmol、3.01当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を90℃で3.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。4-クロロ-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン(1.17g、粗製)を赤色の油として得た。LC/MS:C9H11ClN4Sに対する質量計算値:242.04、実測値:243.05[M+H]+。
POCl3(10.00mL)中の8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)-1H-ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-オン(1.00g、4.46mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、N,N-ジエチルアニリン(2.00g、13.40mmol、3.01当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を90℃で3.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。4-クロロ-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン(1.17g、粗製)を赤色の油として得た。LC/MS:C9H11ClN4Sに対する質量計算値:242.04、実測値:243.05[M+H]+。
ステップ8:N-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン
CH3CN(15.00mL)中の4-クロロ-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン(1.00g、4.12mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、1-[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メタンアミン(1.15g、4.12mmol、1.00当量)及びDIEA(2.66g、20.60mmol、5.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を50℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をEA(50mL)に溶解した。得られた混合物を、飽和水性NaHCO3(1×30mL)及びブライン(1×20mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(4:1)で溶出して、N-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン(1.10g、53.44%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C26H27N7OSに対する質量計算値:485.20、実測値:486.30[M+H]+。
CH3CN(15.00mL)中の4-クロロ-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン(1.00g、4.12mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、1-[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メタンアミン(1.15g、4.12mmol、1.00当量)及びDIEA(2.66g、20.60mmol、5.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を50℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をEA(50mL)に溶解した。得られた混合物を、飽和水性NaHCO3(1×30mL)及びブライン(1×20mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(4:1)で溶出して、N-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン(1.10g、53.44%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C26H27N7OSに対する質量計算値:485.20、実測値:486.30[M+H]+。
ステップ9:N-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-メタンスルホニルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミンの合成
DCM(15.00mL)中のN-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン(1.00g、2.06mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、m-CPBA(1.07g、6.20mmol、3.01当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。得られた混合物を、飽和水性NaHCO3(1×10mL)及びブライン(1×5mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(3:2)で溶出して、N-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-メタンスルホニルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン(1.00g、58.05%収率)を無色の油として得た。LC/MS:C26H27N7O3Sに対する質量計算値:517.19、実測値:540.30[M+Na]+。
DCM(15.00mL)中のN-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-(メチルスルファニル)ピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン(1.00g、2.06mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、m-CPBA(1.07g、6.20mmol、3.01当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。得られた混合物を、飽和水性NaHCO3(1×10mL)及びブライン(1×5mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(3:2)で溶出して、N-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-メタンスルホニルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン(1.00g、58.05%収率)を無色の油として得た。LC/MS:C26H27N7O3Sに対する質量計算値:517.19、実測値:540.30[M+Na]+。
ステップ10:tert-ブチル3-[[4-([[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレートの合成
DMF(10.00mL)中のtert-ブチル3-ヒドロキシピペリジン-1-カルボキシレート(1.17g、5.81mmol、3.01当量)の撹拌溶液に、THF(5.80mL)中の1M KHMDSを室温で滴下して加えた。得られた混合物を室温で10分間撹拌した。上記混合物に、DMF(5.00mL)中のN-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-メタンスルホニルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン(1.00g、1.93mmol、1.00当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を70℃で更に2.0時間撹拌した。得られた混合物をEA(60mL)で希釈した。混合物を、飽和水性NaHCO3(1×30mL)及びブライン(3×30ML)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(3:1)で溶出して、tert-ブチル3-[[4-([[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレート(900.00mg、72.93%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C35H42N8O4に対する質量計算値:638.33、実測値:639.45[M+H]+。
DMF(10.00mL)中のtert-ブチル3-ヒドロキシピペリジン-1-カルボキシレート(1.17g、5.81mmol、3.01当量)の撹拌溶液に、THF(5.80mL)中の1M KHMDSを室温で滴下して加えた。得られた混合物を室温で10分間撹拌した。上記混合物に、DMF(5.00mL)中のN-[[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]-8-イソプロピル-2-メタンスルホニルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-4-アミン(1.00g、1.93mmol、1.00当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を70℃で更に2.0時間撹拌した。得られた混合物をEA(60mL)で希釈した。混合物を、飽和水性NaHCO3(1×30mL)及びブライン(3×30ML)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(3:1)で溶出して、tert-ブチル3-[[4-([[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレート(900.00mg、72.93%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C35H42N8O4に対する質量計算値:638.33、実測値:639.45[M+H]+。
ステップ11:Tert-ブチル3-[[4-([[4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレート
MeOH(20.00mL)中のtert-ブチル3-[[4-([[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレート(900.00mg、1.41mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、Pd/C(149.94mg)を室温で少量ずつ加えた。次いで、H2を3回交換した。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEA(3x10mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。tert-ブチル3-[[4-([[4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレート(720.00mg、91.90%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C28H36N8O4に対する質量計算値:548.29、実測値:549.40[M+H]+。
MeOH(20.00mL)中のtert-ブチル3-[[4-([[4-(ベンジルオキシ)-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレート(900.00mg、1.41mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、Pd/C(149.94mg)を室温で少量ずつ加えた。次いで、H2を3回交換した。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEA(3x10mL)で洗浄した。濾液を真空下で濃縮した。tert-ブチル3-[[4-([[4-ヒドロキシ-2-(ピラゾール-1-イル)フェニル]メチル]アミノ)-8-イソプロピルピラゾロ[1,5-a][1,3,5]トリアジン-2-イル]オキシ]ピペリジン-1-カルボキシレート(720.00mg、91.90%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C28H36N8O4に対する質量計算値:548.29、実測値:549.40[M+H]+。
実施例7.2-[([3-エチル-5-[(2S)-2-[2-(オキサン-2-イルオキシ)エチル]ピペリジン-1-イル]ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-イル]アミノ)メチル]-3-(オキサン-2-イル)-1,3-ベンゾジアゾール-5-オール(INT-23-THP)の合成
ステップ1:4-(ベンジルオキシ)-2-ニトロアニリンの合成
DMF(30.00mL)中の4-アミノ-3-ニトロフェノール(4.00g、25.95mmol、1.00当量)の溶液に、THF(7.00mL)中のt-BuOK(3.20g、28.25mmol、1.10当量)を0℃で10分間かけて加えた。混合物を0℃で20分間撹拌した後、DMF(5.00mL)中の臭化ベンジル(4.88g、28.25mmol、1.10当量)の溶液を滴下して加えた。反応混合物を0℃で2.0時間撹拌した。次いで、100mLのNH4Clを滴下して加え、反応をクエンチした。生成物を濾過し、濾液が無色になるまで水で洗浄した。濾過ケーキを、真空下で乾燥させた。6.29gの所望の生成物を、赤色の固体として得た(99.33%収率)。LC/MS:C13H12N2O3に対する質量計算値:244.08、実測値:245.20[M+H]+。
DMF(30.00mL)中の4-アミノ-3-ニトロフェノール(4.00g、25.95mmol、1.00当量)の溶液に、THF(7.00mL)中のt-BuOK(3.20g、28.25mmol、1.10当量)を0℃で10分間かけて加えた。混合物を0℃で20分間撹拌した後、DMF(5.00mL)中の臭化ベンジル(4.88g、28.25mmol、1.10当量)の溶液を滴下して加えた。反応混合物を0℃で2.0時間撹拌した。次いで、100mLのNH4Clを滴下して加え、反応をクエンチした。生成物を濾過し、濾液が無色になるまで水で洗浄した。濾過ケーキを、真空下で乾燥させた。6.29gの所望の生成物を、赤色の固体として得た(99.33%収率)。LC/MS:C13H12N2O3に対する質量計算値:244.08、実測値:245.20[M+H]+。
ステップ2:tert-ブチルN-[[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]カルバメートの合成
密封管に、4-(ベンジルオキシ)-2-ニトロアニリン(2.80g、11.46mmol、1.00当量)、tert-ブチルN-(2-オキソエチル)カルバメート(2.19g、13.76mmol、1.20当量)、Na2S2O4(5.99g、34.39mmol、3.00当量)、EtOH(20.00mL)、及びDMSO(40.00mL)を加えた。混合物を80℃で17.0時間撹拌した。次いで、混合物を50mLの氷水に注ぎ、EA(3×50mL)で抽出した。有機相を合わせ、水(50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、次いで、無水Na2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラム(PE/EA=1:1)により精製した。1.71gの所望の生成物を暗黄色の固体として得た。(38.00%収率)。LC/MS:C20H23N3O3に対する質量計算値:353.17、実測値:354.25[M+H]+。
密封管に、4-(ベンジルオキシ)-2-ニトロアニリン(2.80g、11.46mmol、1.00当量)、tert-ブチルN-(2-オキソエチル)カルバメート(2.19g、13.76mmol、1.20当量)、Na2S2O4(5.99g、34.39mmol、3.00当量)、EtOH(20.00mL)、及びDMSO(40.00mL)を加えた。混合物を80℃で17.0時間撹拌した。次いで、混合物を50mLの氷水に注ぎ、EA(3×50mL)で抽出した。有機相を合わせ、水(50mL)、ブライン(50mL)で洗浄し、次いで、無水Na2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラム(PE/EA=1:1)により精製した。1.71gの所望の生成物を暗黄色の固体として得た。(38.00%収率)。LC/MS:C20H23N3O3に対する質量計算値:353.17、実測値:354.25[M+H]+。
ステップ3:1-[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メタンアミントリフルオロ酢酸塩の合成
DCM(25.00mL)中のtert-ブチルN-[[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]カルバメート(1.71g、4.84mmol、1.00当量)の溶液に、TFA(5.00mL)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。次いで、溶媒を除去し、残留物を次のステップに直接使用した。1.71gの粗生成物をTFA塩として得て、それは暗黄色の固体であった。LC/MS:C15H15N3Oに対する質量計算値:253.12、実測値:254.15[M+H]+。
DCM(25.00mL)中のtert-ブチルN-[[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]カルバメート(1.71g、4.84mmol、1.00当量)の溶液に、TFA(5.00mL)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。次いで、溶媒を除去し、残留物を次のステップに直接使用した。1.71gの粗生成物をTFA塩として得て、それは暗黄色の固体であった。LC/MS:C15H15N3Oに対する質量計算値:253.12、実測値:254.15[M+H]+。
ステップ4:N-[[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]-5-クロロ-3-エチルピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-アミン
マイクロ波管に、1-[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メタンアミントリフルオロ酢酸塩(1.71g、4.66mmol、1.00当量)、5,7-ジクロロ-3-エチルピラゾロ[1,5-a]ピリミジン(1.01g、4.66mmol、1.00当量)、i-PrOH(20.00mL)、及びCH3CN(5.00mL)を加えた。最後にDIEA(3.01g、23.29mmol、5.00当量)を加えた。溶液をマイクロ波条件下で100℃に加熱し、2.0時間撹拌した。溶媒を除去し、残留物を100%EAでシリカゲルカラムにより精製した。2.00gの所望の生成物を、暗黄色の固体として得た(89.00%収率)。LC/MS:C23H21ClN6Oに対する質量計算値:432.15、実測値:433.20[M+H]+。
マイクロ波管に、1-[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メタンアミントリフルオロ酢酸塩(1.71g、4.66mmol、1.00当量)、5,7-ジクロロ-3-エチルピラゾロ[1,5-a]ピリミジン(1.01g、4.66mmol、1.00当量)、i-PrOH(20.00mL)、及びCH3CN(5.00mL)を加えた。最後にDIEA(3.01g、23.29mmol、5.00当量)を加えた。溶液をマイクロ波条件下で100℃に加熱し、2.0時間撹拌した。溶媒を除去し、残留物を100%EAでシリカゲルカラムにより精製した。2.00gの所望の生成物を、暗黄色の固体として得た(89.00%収率)。LC/MS:C23H21ClN6Oに対する質量計算値:432.15、実測値:433.20[M+H]+。
ステップ5:2-[(2S)-1-[7-([[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]アミノ)-3-エチルピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-5-イル]ピペリジン-2-イル]エタノールの合成
マイクロ波管に、N-[[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]-5-クロロ-3-エチルピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-アミン(2.00g、4.62mmol、1.00当量)、2-[(2S)-ピペリジン-2-イル]エタノール(1.79mol、13.86mmol、3.00当量)、NMP(28.00mL)、及びDIEA(2985.45mg、23.10mmol、5.00当量)を加えた。混合物をマイクロ波条件下、230℃で14.0時間撹拌した。次いで、混合物を100mLの氷水に注ぎ、EA(3×70mL)で抽出した。有機相を合わせ、水(3×50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濃縮した。残留物を、DCM/MeOH=12:1でシリカゲルカラムにより精製した。1.01gの所望の生成物を暗黄色の固体として得た(37.00%収率)。LC/MS:C30H35N7O2に対する質量計算値:525.29、実測値:526.40[M+H]+。
マイクロ波管に、N-[[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]-5-クロロ-3-エチルピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-アミン(2.00g、4.62mmol、1.00当量)、2-[(2S)-ピペリジン-2-イル]エタノール(1.79mol、13.86mmol、3.00当量)、NMP(28.00mL)、及びDIEA(2985.45mg、23.10mmol、5.00当量)を加えた。混合物をマイクロ波条件下、230℃で14.0時間撹拌した。次いで、混合物を100mLの氷水に注ぎ、EA(3×70mL)で抽出した。有機相を合わせ、水(3×50mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濃縮した。残留物を、DCM/MeOH=12:1でシリカゲルカラムにより精製した。1.01gの所望の生成物を暗黄色の固体として得た(37.00%収率)。LC/MS:C30H35N7O2に対する質量計算値:525.29、実測値:526.40[M+H]+。
ステップ6:N-[[6-(ベンジルオキシ)-1-(オキサン-2-イル)-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]-3-エチル-5-[(2S)-2-[2-(オキサン-2-イルオキシ)エチル]ピペリジン-1-イル]ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-アミンの合成
THF(10.00mL)中の2-[(2S)-1-[7-([[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]アミノ)-3-エチルピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-5-イル]ピペリジン-2-イル]エタノール(1.01g、1.92mmol、1.00当量)の溶液に、DHP(3.22g、38.35mmol、20.00当量)及びp-TsOH(66.04mg、0.384mmol、0.20当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、75℃で36.0時間撹拌した。次いで、溶媒を除去し、残留物を、H2O(0.05% NH4HCO3)/CH3CN、100分間で20%~90%を形成する条件下で逆相カラムにより精製した。600.00mgの所望の生成物を、淡褐色の固体として得た(42.39%収率)。LC/MS:C40H51N7O4に対する質量計算値:693.40、実測値:694.55[M+H]+。
THF(10.00mL)中の2-[(2S)-1-[7-([[5-(ベンジルオキシ)-3H-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]アミノ)-3-エチルピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-5-イル]ピペリジン-2-イル]エタノール(1.01g、1.92mmol、1.00当量)の溶液に、DHP(3.22g、38.35mmol、20.00当量)及びp-TsOH(66.04mg、0.384mmol、0.20当量)を加えた。混合物をN2雰囲気下、75℃で36.0時間撹拌した。次いで、溶媒を除去し、残留物を、H2O(0.05% NH4HCO3)/CH3CN、100分間で20%~90%を形成する条件下で逆相カラムにより精製した。600.00mgの所望の生成物を、淡褐色の固体として得た(42.39%収率)。LC/MS:C40H51N7O4に対する質量計算値:693.40、実測値:694.55[M+H]+。
ステップ7:2-[([3-エチル-5-[(2S)-2-[2-(オキサン-2-イルオキシ)エチル]ピペリジン-1-イル]ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-イル]アミノ)メチル]-3-(オキサン-2-イル)-1,3-ベンゾジアゾール-5-オールの合成
EA(3.00mL)及びMeOH(3.00mL)中のN-[[6-(ベンジルオキシ)-1-(オキサン-2-イル)-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]-3-エチル-5-[(2S)-2-[2-(オキサン-2-イルオキシ)エチル]ピペリジン-1-イル]ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-アミン(500.00mg、0.72mmol、1.00当量)の溶液を、室温で一晩撹拌した。混合物を濾過し、濃縮して、2-[([3-エチル-5-[(2S)-2-[2-(オキサン-2-イルオキシ)エチル]ピペリジン-1-イル]ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-イル]アミノ)メチル]-3-(オキサン-2-イル)-1,3-ベンゾジアゾール-5-オール(400.00mg、91.94%収率)を得た。LCMS:C33H45N7O4に対する質量計算値:603.35、実測値:604.50[M+H]+。
EA(3.00mL)及びMeOH(3.00mL)中のN-[[6-(ベンジルオキシ)-1-(オキサン-2-イル)-1,3-ベンゾジアゾール-2-イル]メチル]-3-エチル-5-[(2S)-2-[2-(オキサン-2-イルオキシ)エチル]ピペリジン-1-イル]ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-アミン(500.00mg、0.72mmol、1.00当量)の溶液を、室温で一晩撹拌した。混合物を濾過し、濃縮して、2-[([3-エチル-5-[(2S)-2-[2-(オキサン-2-イルオキシ)エチル]ピペリジン-1-イル]ピラゾロ[1,5-a]ピリミジン-7-イル]アミノ)メチル]-3-(オキサン-2-イル)-1,3-ベンゾジアゾール-5-オール(400.00mg、91.94%収率)を得た。LCMS:C33H45N7O4に対する質量計算値:603.35、実測値:604.50[M+H]+。
実施例8.(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-024-OH)の合成
ステップ1:ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。10.00gの(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサン酸を使用して、13.00gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを、白色の固体として得た(94.33%収率)。LC/MS:C36H43N3O8に対する質量計算値:645.31、実測値:646.50[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。10.00gの(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサン酸を使用して、13.00gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを、白色の固体として得た(94.33%収率)。LC/MS:C36H43N3O8に対する質量計算値:645.31、実測値:646.50[M+H]+。
ステップ2:ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであった。9.00gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、7.60gの粗製の所望の生成物を白色の固体として得た。LC/MS:C31H35N3O6に対する質量計算値:545.25、実測値:546.40[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであった。9.00gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、7.60gの粗製の所望の生成物を白色の固体として得た。LC/MS:C31H35N3O6に対する質量計算値:545.25、実測値:546.40[M+H]+。
ステップ3:ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。7.60gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、10.04gの所望の生成物を白色の固体として得た(94.98%収率)。LC/MS:C42H54N4O9に対する質量計算値:758.38、実測値:759.60[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。7.60gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、10.04gの所望の生成物を白色の固体として得た(94.98%収率)。LC/MS:C42H54N4O9に対する質量計算値:758.38、実測値:759.60[M+H]+。
ステップ4:ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであった。4.32gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、3.75gの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C37H46N4O7に対する質量計算値:658.34、実測値:659.40[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであった。4.32gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、3.75gの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C37H46N4O7に対する質量計算値:658.34、実測値:659.40[M+H]+。
ステップ5:ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
DMF(150.00mL)中の(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパン酸(4.32g、10.90mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、TBTU(5.25g、16.34mmol、1.50当量)、DIEA(4.22g、32.69mmol、3.00当量)、及びベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(7.90g、11.99mmol、1.10当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。反応物を氷水(450mL)に注いだ。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x150mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。次いで、沈殿した固体を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で35%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(3.20g、28.31%収率)を白色の固体として得た。次いで、1.50gのそれを以下の条件下で、Achiral-Prep-HPLCにより精製した:カラム:GreenSep Basic、3*15cm、5μm;移動相A:CO2、移動相B:MeOH(0.5% 2M NH3-MeOH)--HPLC;流速:75mL/分;勾配:均一濃度37% B;カラム温度(℃):35;背圧(bar):100;波長:254nm;RT1(分):2.95;RT2(分):4.05;試料溶媒:DCM--HPLC;注入量:1mL;実行数:30。画分を合わせて濃縮し、700.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C60H72N6O10に対する質量計算値:1036.53、実測値:1037.95[M+H]+。
DMF(150.00mL)中の(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパン酸(4.32g、10.90mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、TBTU(5.25g、16.34mmol、1.50当量)、DIEA(4.22g、32.69mmol、3.00当量)、及びベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(7.90g、11.99mmol、1.10当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で3.0時間撹拌した。反応物を氷水(450mL)に注いだ。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x150mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。次いで、沈殿した固体を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で35%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(3.20g、28.31%収率)を白色の固体として得た。次いで、1.50gのそれを以下の条件下で、Achiral-Prep-HPLCにより精製した:カラム:GreenSep Basic、3*15cm、5μm;移動相A:CO2、移動相B:MeOH(0.5% 2M NH3-MeOH)--HPLC;流速:75mL/分;勾配:均一濃度37% B;カラム温度(℃):35;背圧(bar):100;波長:254nm;RT1(分):2.95;RT2(分):4.05;試料溶媒:DCM--HPLC;注入量:1mL;実行数:30。画分を合わせて濃縮し、700.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C60H72N6O10に対する質量計算値:1036.53、実測値:1037.95[M+H]+。
ステップ6:ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.11)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。2.30gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、1.20gの所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C45H62N6O8に対する質量計算値:814.46、実測値:815.75[M+H]+。
手順は、(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.11)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。2.30gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、1.20gの所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C45H62N6O8に対する質量計算値:814.46、実測値:815.75[M+H]+。
ステップ7:ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イルアミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
ClCH2CH2Cl(10.00mL)中のベンジル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(500.00mg、0.61mmol、1.00当量)の溶液に、NaBH3CN(308.42mg、4.90mmol、8.00当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を50℃で17.0時間撹拌した。反応混合物をNH4Cl(5mL)で希釈し、濃縮して、残留物をDMF(5.0mL)に溶解し、以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で30%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イルアミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(280.00mg、50.20%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C52H72N6O8に対する質量計算値:908.54、実測値:455.45[1/2M+H]+。
ClCH2CH2Cl(10.00mL)中のベンジル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(500.00mg、0.61mmol、1.00当量)の溶液に、NaBH3CN(308.42mg、4.90mmol、8.00当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を50℃で17.0時間撹拌した。反応混合物をNH4Cl(5mL)で希釈し、濃縮して、残留物をDMF(5.0mL)に溶解し、以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で30%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イルアミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(280.00mg、50.20%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C52H72N6O8に対する質量計算値:908.54、実測値:455.45[1/2M+H]+。
ステップ8:ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
MeOH(6mL)中のベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イルアミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(200.00mg、0.220mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaBH3CN(110.59mg、1.76mmol、8.00当量)及び(HCHO)n(329.97mg、1.10mmol、5.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。反応混合物をNH4Cl(20.00mL)で希釈し、次いで、得られた混合物を真空下で濃縮した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で30%~35%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(200.00mg、98.48%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C53H74N6O8に対する質量計算値:922.56、実測値:923.60[M+H]+。
MeOH(6mL)中のベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イルアミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(200.00mg、0.220mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaBH3CN(110.59mg、1.76mmol、8.00当量)及び(HCHO)n(329.97mg、1.10mmol、5.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。反応混合物をNH4Cl(20.00mL)で希釈し、次いで、得られた混合物を真空下で濃縮した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で30%~35%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(200.00mg、98.48%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C53H74N6O8に対する質量計算値:922.56、実測値:923.60[M+H]+。
ステップ9:(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸の合成
CHCl3(5.00mL)中のベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(450.00mg、0.49mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、CH3SO3H(1.00mL)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、15分間で25%~30%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(220.00mg、54.18%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C46H68N6O8に対する質量計算値:832.51、実測値:833.40[M+H]+
CHCl3(5.00mL)中のベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(450.00mg、0.49mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、CH3SO3H(1.00mL)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、15分間で25%~30%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(220.00mg、54.18%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C46H68N6O8に対する質量計算値:832.51、実測値:833.40[M+H]+
実施例9.4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}安息香酸(INT-25)の合成
ステップ1:5-ブロモ-4-ヒドラジニル-2-(メチルスルファニル)ピリミジンの合成
250mlのフラスコに、5-ブロモ-4-クロロ-2-(メチルスルファニル)ピリミジン(9.00g、37.58mmol、1.00当量)、EtOH(100.00mL)、NH2NH2.H2O(3.78g、75.53mmol、2.01当量)を加え、反応物を室温で17.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、ヘキサン(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、5-ブロモ-4-ヒドラジニル-2-(メチルスルファニル)ピリミジン(10.00g、粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C5H7BrN4Sに対する質量計算値:233.96、実測値:235.00、237.00[M+H、M+2+H]+。
250mlのフラスコに、5-ブロモ-4-クロロ-2-(メチルスルファニル)ピリミジン(9.00g、37.58mmol、1.00当量)、EtOH(100.00mL)、NH2NH2.H2O(3.78g、75.53mmol、2.01当量)を加え、反応物を室温で17.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、ヘキサン(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、5-ブロモ-4-ヒドラジニル-2-(メチルスルファニル)ピリミジン(10.00g、粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C5H7BrN4Sに対する質量計算値:233.96、実測値:235.00、237.00[M+H、M+2+H]+。
ステップ2:8-ブロモ-5-(メチルスルファニル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジンの合成
100mLフラスコに、5-ブロモ-4-ヒドラジニル-2-(メチルスルファニル)ピリミジン(5.00g、0.02mmol、1.00当量)及びCH(OMe)3(40.00mL)を加えた。混合物を90℃で3.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により回収し、エタノール(3×50mL)で洗浄した。これにより、8-ブロモ-5-(メチルスルファニル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン(4.20g、81.00%収率)をオレンジ色の固体として得た。LC/MS:C6H5BrN4Sに対する質量計算値:243.94、実測値:244.95、246.95[M+H、M+H+2]+。
100mLフラスコに、5-ブロモ-4-ヒドラジニル-2-(メチルスルファニル)ピリミジン(5.00g、0.02mmol、1.00当量)及びCH(OMe)3(40.00mL)を加えた。混合物を90℃で3.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により回収し、エタノール(3×50mL)で洗浄した。これにより、8-ブロモ-5-(メチルスルファニル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン(4.20g、81.00%収率)をオレンジ色の固体として得た。LC/MS:C6H5BrN4Sに対する質量計算値:243.94、実測値:244.95、246.95[M+H、M+H+2]+。
ステップ3:8-ブロモ-N-(フラン-2-イルメチル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン
25mLのフラスコに、8-ブロモ-5-(メチルスルファニル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン(500.00mg、2.05mmol、1.00当量)及びフリルアミン(5.00mL)を加えた。反応物を室温で1.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により回収し、エタノール(3×50mL)で洗浄した。これにより、8-ブロモ-N-(フラン-2-イルメチル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン(435.00mg、73.00%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C10H8BrN5Oに対する質量計算値:292.99、実測値:293.85、295.85[M+H、M+2+H]+。
25mLのフラスコに、8-ブロモ-5-(メチルスルファニル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン(500.00mg、2.05mmol、1.00当量)及びフリルアミン(5.00mL)を加えた。反応物を室温で1.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により回収し、エタノール(3×50mL)で洗浄した。これにより、8-ブロモ-N-(フラン-2-イルメチル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン(435.00mg、73.00%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C10H8BrN5Oに対する質量計算値:292.99、実測値:293.85、295.85[M+H、M+2+H]+。
ステップ4:メチル4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}ベンゾエート
100mLフラスコに、ジオキサン(20.00mL)中の8-ブロモ-N-(フラン-2-イルメチル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン(500.00mg、1.70mmol、1.00当量)、及びH2O(2.00mL)を加えた。次いで、K3PO4(1.08g、5.10mmol、3.00当量)及びPd(DtBPF)Cl2(554.00mg、0.85mmol、0.50当量)を上記混合物に加えた。混合物をN2下で一晩90℃に加熱した。得られた混合物を室温に冷却し、20mLのH2Oを混合物に加え、EtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(9:1)で溶出して、メチル4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}ベンゾエート(600.00mg、96.91%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C18H115N5O3に対する質量計算値:349.12、実測値:350.15[M+H]+。
100mLフラスコに、ジオキサン(20.00mL)中の8-ブロモ-N-(フラン-2-イルメチル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン(500.00mg、1.70mmol、1.00当量)、及びH2O(2.00mL)を加えた。次いで、K3PO4(1.08g、5.10mmol、3.00当量)及びPd(DtBPF)Cl2(554.00mg、0.85mmol、0.50当量)を上記混合物に加えた。混合物をN2下で一晩90℃に加熱した。得られた混合物を室温に冷却し、20mLのH2Oを混合物に加え、EtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を無水Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(9:1)で溶出して、メチル4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}ベンゾエート(600.00mg、96.91%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C18H115N5O3に対する質量計算値:349.12、実測値:350.15[M+H]+。
ステップ5:4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}安息香酸の合成
MeOH(10.00mL)及びTHF(10.00mL)中のメチル4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}ベンゾエート(600.00mg、1.72mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、LiOH溶液(2M、8.60mL、17.19mmol、10.00当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を50℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(5mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}安息香酸(450.00mg、78.00%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C17H13N5O3に対する質量計算値:335.10、実測値:336.10[M+H]+。
MeOH(10.00mL)及びTHF(10.00mL)中のメチル4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}ベンゾエート(600.00mg、1.72mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、LiOH溶液(2M、8.60mL、17.19mmol、10.00当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を50℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(5mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。4-{5-[(フラン-2-イルメチル)アミノ]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル}安息香酸(450.00mg、78.00%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C17H13N5O3に対する質量計算値:335.10、実測値:336.10[M+H]+。
実施例10.3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパン酸(SM-040)の合成
ステップ1:エチル(2E)-3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパ-2-エノエート
100mLのフラスコに、トルエン(40.00mL)中の5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-カルバルデヒド(1.00g、5.02mmol、1.00当量)及びエチル2-(トリフェニル-ラムダ5-ホスファニリデン)アセテート(2.62g、7.53mmol、1.50当量)を加えた。混合物を90℃で17.0時間撹拌した。反応物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(25/75)で溶出して、エチル(2E)-3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパ-2-エノエート(1.20g、88.90%収率)を淡黄色の結晶として得た。LC/MS:C11H12BrNO2に対する質量計算値:269.01、実測値:269.85、271.85[M+H、M+2+H]+。
100mLのフラスコに、トルエン(40.00mL)中の5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-カルバルデヒド(1.00g、5.02mmol、1.00当量)及びエチル2-(トリフェニル-ラムダ5-ホスファニリデン)アセテート(2.62g、7.53mmol、1.50当量)を加えた。混合物を90℃で17.0時間撹拌した。反応物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(25/75)で溶出して、エチル(2E)-3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパ-2-エノエート(1.20g、88.90%収率)を淡黄色の結晶として得た。LC/MS:C11H12BrNO2に対する質量計算値:269.01、実測値:269.85、271.85[M+H、M+2+H]+。
ステップ2:エチル3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパノエート
100mLのフラスコに、DME(24.00mL)及び水(6.00mL)中のエチル(2E)-3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパ-2-エノエート(1.20g、4.46mmol、1.00当量)、TsNHNH2(4.14g,22.21mmol、5.00当量)、AcONa(1.09g、13.33mmol、3.00当量)を加えた。混合物を100℃で17.0時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、残留物をシリカゲルクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(9:1)で溶出して、エチル3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパノエート(1.14g、95%)を無色の液体として得た。LC/MS:C11H14BrNO2に対する質量計算値:271.02、実測値:271.85、273.85[M+H、M+2+H]+。
100mLのフラスコに、DME(24.00mL)及び水(6.00mL)中のエチル(2E)-3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパ-2-エノエート(1.20g、4.46mmol、1.00当量)、TsNHNH2(4.14g,22.21mmol、5.00当量)、AcONa(1.09g、13.33mmol、3.00当量)を加えた。混合物を100℃で17.0時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮し、残留物をシリカゲルクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(9:1)で溶出して、エチル3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパノエート(1.14g、95%)を無色の液体として得た。LC/MS:C11H14BrNO2に対する質量計算値:271.02、実測値:271.85、273.85[M+H、M+2+H]+。
ステップ3:エチル3-[6-メチル-5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン-2-イル]プロパノエートの合成
25mLのフラスコに、エチル3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパノエート(900.00mg、3.31mmol、1.00当量)、ビス(ピナコラト)ジボロン(2.52g、9.92mmol、3.00当量)、AcOK(973.70mg、9.92mmol、3.00当量)、Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(538.81mg、0.66mmol、0.20当量)、及び1,4-ジオキサン(10.00mL)を室温で加えた。反応物をN2雰囲気下、90℃で17.0時間撹拌した。混合物をEA(3×30mL)で抽出し、有機相を合わせて、無水Na2SO4で乾燥させることによって洗浄した。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。この粗生成物(粗生成物2.12g)を、更に精製せずに次のステップで直接使用した。LC/MS:C17H26BNO4に対する質量計算値:319.20、実測値:320.20[M+H]+。
25mLのフラスコに、エチル3-(5-ブロモ-6-メチルピリジン-2-イル)プロパノエート(900.00mg、3.31mmol、1.00当量)、ビス(ピナコラト)ジボロン(2.52g、9.92mmol、3.00当量)、AcOK(973.70mg、9.92mmol、3.00当量)、Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(538.81mg、0.66mmol、0.20当量)、及び1,4-ジオキサン(10.00mL)を室温で加えた。反応物をN2雰囲気下、90℃で17.0時間撹拌した。混合物をEA(3×30mL)で抽出し、有機相を合わせて、無水Na2SO4で乾燥させることによって洗浄した。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。この粗生成物(粗生成物2.12g)を、更に精製せずに次のステップで直接使用した。LC/MS:C17H26BNO4に対する質量計算値:319.20、実測値:320.20[M+H]+。
ステップ4:1-(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メタンアミンの合成
100mLのフラスコに、MeOH(2.00mL)及びMeCN(20.00mL)中の1-(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メタンアミンハイドロクロライド(1.00g、4.93mmol、1.00当量)、及びK2CO3(3.39g、24.50mmol、5.00当量)を加えた。混合物を60℃で3.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH(9/1)で溶出した。画分を合わせ、濃縮して、1-(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メタンアミン(513.00mg、62.50%収率)をオレンジ色の固体として得た。LC/MS:C9H10FNOに対する質量計算値:167.07、実測値:168.05[M+H]+。
100mLのフラスコに、MeOH(2.00mL)及びMeCN(20.00mL)中の1-(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メタンアミンハイドロクロライド(1.00g、4.93mmol、1.00当量)、及びK2CO3(3.39g、24.50mmol、5.00当量)を加えた。混合物を60℃で3.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH(9/1)で溶出した。画分を合わせ、濃縮して、1-(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メタンアミン(513.00mg、62.50%収率)をオレンジ色の固体として得た。LC/MS:C9H10FNOに対する質量計算値:167.07、実測値:168.05[M+H]+。
ステップ5:8-ブロモ-N-[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミンの合成
25mLのフラスコに、8-ブロモ-5-(メチルスルファニル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン(372.00mg、1.52mmol、1.00当量)及び1-(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メタンアミン(507.48mg、3.04mmol、2.00当量)を加えた。混合物を40℃で17.0時間撹拌した。反応物をEtOAcで希釈した。沈殿した固体を濾過により収集し、EtOAc(3×10mL)で洗浄した。これにより、8-ブロモ-N-[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン(430.00mg、72.27%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C14H11BrFN5Oに対する質量計算値:363.01、実測値:364.00、366.00[M+H、M+2+H]+。
25mLのフラスコに、8-ブロモ-5-(メチルスルファニル)-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン(372.00mg、1.52mmol、1.00当量)及び1-(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メタンアミン(507.48mg、3.04mmol、2.00当量)を加えた。混合物を40℃で17.0時間撹拌した。反応物をEtOAcで希釈した。沈殿した固体を濾過により収集し、EtOAc(3×10mL)で洗浄した。これにより、8-ブロモ-N-[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン(430.00mg、72.27%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C14H11BrFN5Oに対する質量計算値:363.01、実測値:364.00、366.00[M+H、M+2+H]+。
ステップ6:エチル3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパノエートの合成
8-ブロモ-N-[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン(677.80mg、1.81mmol、1.80当量)、エチル3-[6-メチル-5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン-2-イル]プロパノエート(330.00mg、1.03mmol、1.00当量)、K3PO4(658.46mg、3.10mmol、3.00当量)、Pd(DtBPF)Cl2(134.78mg、0.21mmol、0.20当量)、ジオキサン(10.00mL)、及びH2O(2.00mL)を、マイクロ波管に加えた。次いで、N2を3回交換した。混合物をマイクロ波下で0.5時間120℃に加熱した。10mLの水を加え、得られた混合物をEtOAc(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をEtOAc(3×30mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆相フラッシュにより精製した(C18カラム;移動相、水中のACN(0.05%NH4HCO3)、10分間で10%~50%勾配;検出器、UV254nm)。画分を合わせて濃縮した。エチル3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパノエート(120.00mg、24.3%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C25H25FN6O3に対する質量計算値:476.20、実測値:477.20[M+H]+。
8-ブロモ-N-[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-5-アミン(677.80mg、1.81mmol、1.80当量)、エチル3-[6-メチル-5-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)ピリジン-2-イル]プロパノエート(330.00mg、1.03mmol、1.00当量)、K3PO4(658.46mg、3.10mmol、3.00当量)、Pd(DtBPF)Cl2(134.78mg、0.21mmol、0.20当量)、ジオキサン(10.00mL)、及びH2O(2.00mL)を、マイクロ波管に加えた。次いで、N2を3回交換した。混合物をマイクロ波下で0.5時間120℃に加熱した。10mLの水を加え、得られた混合物をEtOAc(3×10mL)で抽出した。合わせた有機層をEtOAc(3×30mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆相フラッシュにより精製した(C18カラム;移動相、水中のACN(0.05%NH4HCO3)、10分間で10%~50%勾配;検出器、UV254nm)。画分を合わせて濃縮した。エチル3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパノエート(120.00mg、24.3%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C25H25FN6O3に対する質量計算値:476.20、実測値:477.20[M+H]+。
ステップ7:3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパン酸
50mLのフラスコに、エチル3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパノエート(120.00mg、0.25mmol、1.00当量)、MeOH(2.00mL)、及びTHF(2.00mL)を加えた。次いで、LiOH溶液(2M、1.26mL、2.52mmol、10.00当量)を上記の混合物に少量ずつ加えた。反応物を50℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(30mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x3mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパン酸(100.00mg、86.54%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C23H21FN6O3に対する質量計算値:448.17、実測値:449.15[M+H]+
50mLのフラスコに、エチル3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパノエート(120.00mg、0.25mmol、1.00当量)、MeOH(2.00mL)、及びTHF(2.00mL)を加えた。次いで、LiOH溶液(2M、1.26mL、2.52mmol、10.00当量)を上記の混合物に少量ずつ加えた。反応物を50℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(30mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x3mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、3-[5-(5-{[(5-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1-ベンゾフラン-4-イル)メチル]アミノ}-[1,2,4]トリアゾロ[4,3-c]ピリミジン-8-イル)-6-メチルピリジン-2-イル]プロパン酸(100.00mg、86.54%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C23H21FN6O3に対する質量計算値:448.17、実測値:449.15[M+H]+
実施例11:(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-29-PEG2-C(O)-PTBPh)の合成
ステップ1:tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテートの合成:
100mLフラスコに、4-tert-ブチル安息香酸(1.63g、9.12mmol、1.00当量)及びDMF(20.00mL)を加えた。混合物を0℃に冷却し、次いで、PyBOP(7.12g、13.68mmol、1.50当量)及びtert-ブチル2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]アセテート(2.00g、9.12mmol、1.00当量)を加え、続いてDIEA(4.77mL、27.36mmol、3.00当量)を加えた。反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応混合物を水(60mL)に注いだ。反応混合物をEA(3x60mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x60mL)及びNaCl(1x60mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EtOAc(40:60)で溶出して、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(1.18g、32.05%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C21H33NO5に対する質量計算値:379.24、実測値:380.25[M+H]+。
100mLフラスコに、4-tert-ブチル安息香酸(1.63g、9.12mmol、1.00当量)及びDMF(20.00mL)を加えた。混合物を0℃に冷却し、次いで、PyBOP(7.12g、13.68mmol、1.50当量)及びtert-ブチル2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]アセテート(2.00g、9.12mmol、1.00当量)を加え、続いてDIEA(4.77mL、27.36mmol、3.00当量)を加えた。反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応混合物を水(60mL)に注いだ。反応混合物をEA(3x60mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x60mL)及びNaCl(1x60mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EtOAc(40:60)で溶出して、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(1.18g、32.05%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C21H33NO5に対する質量計算値:379.24、実測値:380.25[M+H]+。
ステップ2:(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)酢酸の合成
50mLのフラスコに、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(1.18g、3.11mmol、1.00当量)、DCM(10.00mL)、及びTFA(5.00mL)を加えた。混合物を室温で1.0時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、これにより、(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)酢酸(1.92g粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C17H25NO5に対する質量計算値:323.17、実測値:324.10[M+H]+。
50mLのフラスコに、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(1.18g、3.11mmol、1.00当量)、DCM(10.00mL)、及びTFA(5.00mL)を加えた。混合物を室温で1.0時間撹拌した。混合物を真空下で濃縮して、これにより、(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)酢酸(1.92g粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C17H25NO5に対する質量計算値:323.17、実測値:324.10[M+H]+。
ステップ3:ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]-6-{[(9H-[フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。1.36gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、1.97gの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た。LC/MS:C48H58N4O10に対する質量計算値:850.42、実測値:851.40[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。1.36gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、1.97gの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た。LC/MS:C48H58N4O10に対する質量計算値:850.42、実測値:851.40[M+H]+。
ステップ4:ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.11)と同じであったが、Et2NH及びDMFの比は1:1であった。1.97gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、1.24gの所望の生成物を褐色の油として得た(79.40%収率)。LC/MS:C33H48N4O8に対する質量計算値:628.35、実測値:629.35[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.11)と同じであったが、Et2NH及びDMFの比は1:1であった。1.97gのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、1.24gの所望の生成物を褐色の油として得た(79.40%収率)。LC/MS:C33H48N4O8に対する質量計算値:628.35、実測値:629.35[M+H]+。
ステップ5:ベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートトリフルオロ酢酸の合成
手順は、ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-024-OBn)と同じであった。500.00mgのベンジル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、523.00mgの所望の生成物を褐色の固体として得た(79.56%収率)。LC/MS:C37H56N4O8に対する質量計算値:684.41、実測値:685.40[M+H]+。
手順は、ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-024-OBn)と同じであった。500.00mgのベンジル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、523.00mgの所望の生成物を褐色の固体として得た(79.56%収率)。LC/MS:C37H56N4O8に対する質量計算値:684.41、実測値:685.40[M+H]+。
ステップ6:(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸の合成
手順は、(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-024-OH)と同じであった。200.00mgのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、130.00mgの所望の生成物を黄褐色の油として得た。LC/MS:C30H50N4O8に対する質量計算値:594.36、実測値:595.40[M+H]+。
手順は、(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-024-OH)と同じであった。200.00mgのベンジル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用して、130.00mgの所望の生成物を黄褐色の油として得た。LC/MS:C30H50N4O8に対する質量計算値:594.36、実測値:595.40[M+H]+。
実施例12:(2S)-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサン酸(INT-36-UAZ-IMTB)の合成
ステップ1:tert-ブチル3-(2-ブロモアセチル)アゼチジン-1-カルボキシレートの合成
250mlのフラスコに、tert-ブチル3-アセチルアゼチジン-1-カルボキシレート(2.00g、10.04mmol、1.00当量)、THF(30.00mL)を加え、混合物をN2雰囲気下で-78℃に冷却した。LDA(2M THF中)(6.02mL、12.05mmol、1.20当量)を、上記溶液に滴下して加え、混合物を-78℃で40分間撹拌し、次いで、TMSCl(1.97g、18.17mmol、1.81当量)を滴下して加え、更に1.0時間撹拌した。NaHCO3溶液(50mL)を加え、EA(3×50mL)で抽出し、NaCl溶液(50mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し(濾過)、有機相を濃縮した。粗生成物をTHF(30.00mL)に溶解し、0℃に冷却し、次いで、NaHCO3(1.10g、13.05mmol、1.30当量)、NBS(1.61g、9.03mmol、0.90当量)を加え、反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応物を室温でNaHCO3溶液(20mL)を加えることによりクエンチした。得られた混合物をEtOAc(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をNaHCO3溶液(30mL)、NaCl溶液(30mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。これにより、tert-ブチル3-(2-ブロモアセチル)アゼチジン-1-カルボキシレート(4.00g、粗製)を油として得た。LC/MS:C10H16BrNO3に対する質量計算値:277.03、実測値:221.95、223.95[M-t-Bu+1+H]+。
250mlのフラスコに、tert-ブチル3-アセチルアゼチジン-1-カルボキシレート(2.00g、10.04mmol、1.00当量)、THF(30.00mL)を加え、混合物をN2雰囲気下で-78℃に冷却した。LDA(2M THF中)(6.02mL、12.05mmol、1.20当量)を、上記溶液に滴下して加え、混合物を-78℃で40分間撹拌し、次いで、TMSCl(1.97g、18.17mmol、1.81当量)を滴下して加え、更に1.0時間撹拌した。NaHCO3溶液(50mL)を加え、EA(3×50mL)で抽出し、NaCl溶液(50mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥し(濾過)、有機相を濃縮した。粗生成物をTHF(30.00mL)に溶解し、0℃に冷却し、次いで、NaHCO3(1.10g、13.05mmol、1.30当量)、NBS(1.61g、9.03mmol、0.90当量)を加え、反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応物を室温でNaHCO3溶液(20mL)を加えることによりクエンチした。得られた混合物をEtOAc(3×50mL)で抽出した。合わせた有機層をNaHCO3溶液(30mL)、NaCl溶液(30mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。これにより、tert-ブチル3-(2-ブロモアセチル)アゼチジン-1-カルボキシレート(4.00g、粗製)を油として得た。LC/MS:C10H16BrNO3に対する質量計算値:277.03、実測値:221.95、223.95[M-t-Bu+1+H]+。
ステップ2:tert-ブチル3-[2-({[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}メチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレートの合成
DMF(8.00mL)中のtert-ブチル3-(2-ブロモアセチル)アゼチジン-1-カルボキシレート(2.60g、9.35mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ベンジルN-(カルバムイミドイルメチル)カルバメート(581.14mg、2.80mmol、0.30当量)、及びK2CO3(1.68g、12.15mmol、1.30当量)を加え、得られた混合物を50℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをCH3OH(3x3mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮し、残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%NH4HCO3)、40分間で5%~45%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせ、濃縮して、tert-ブチル3-[2-({[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}メチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(350.00mg、9.69%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C20H26N4O4に対する質量計算値:386.19、実測値:387.20[M+H]+。
DMF(8.00mL)中のtert-ブチル3-(2-ブロモアセチル)アゼチジン-1-カルボキシレート(2.60g、9.35mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ベンジルN-(カルバムイミドイルメチル)カルバメート(581.14mg、2.80mmol、0.30当量)、及びK2CO3(1.68g、12.15mmol、1.30当量)を加え、得られた混合物を50℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをCH3OH(3x3mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮し、残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%NH4HCO3)、40分間で5%~45%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせ、濃縮して、tert-ブチル3-[2-({[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}メチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(350.00mg、9.69%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C20H26N4O4に対する質量計算値:386.19、実測値:387.20[M+H]+。
ステップ3:tert-ブチル3-[2-(アミノメチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレートの合成
DMF(2.00mL)中のtert-ブチル3-[2-({[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}メチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(330.00mg、0.85mmol、1.00当量)の溶液に、Pd/C(99.00mg、30%w/w)を加え、反応物をH2雰囲気下、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(2x1mL)で洗浄した。粗製物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%NH4HCO3)、30分間で5%~30%勾配;検出器、UV254nm。濾液を減圧下で濃縮して、tert-ブチル3-[2-(アミノメチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(90.00mg、41.77%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C12H20N4O2に対する質量計算値:252.15、実測値:253.30[M+H]+。
DMF(2.00mL)中のtert-ブチル3-[2-({[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}メチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(330.00mg、0.85mmol、1.00当量)の溶液に、Pd/C(99.00mg、30%w/w)を加え、反応物をH2雰囲気下、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(2x1mL)で洗浄した。粗製物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%NH4HCO3)、30分間で5%~30%勾配;検出器、UV254nm。濾液を減圧下で濃縮して、tert-ブチル3-[2-(アミノメチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレート(90.00mg、41.77%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C12H20N4O2に対する質量計算値:252.15、実測値:253.30[M+H]+。
ステップ4:tert-ブチル3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボキシレートの合成:
手順は、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(INT-29-300)と同じであったが、反応温度は50℃、反応時間は3.0時間であった。最終生成物をTLCプレートにより精製した。80.00mgのtert-ブチル3-[2-(アミノメチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレートを使用して、120.00mgの所望の生成物を褐色の油として得た(91.97%収率)。
手順は、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(INT-29-300)と同じであったが、反応温度は50℃、反応時間は3.0時間であった。最終生成物をTLCプレートにより精製した。80.00mgのtert-ブチル3-[2-(アミノメチル)-3H-イミダゾール-4-イル]アゼチジン-1-カルボキシレートを使用して、120.00mgの所望の生成物を褐色の油として得た(91.97%収率)。
ステップ5:N-{[4-(アゼチジン-3-イル)-3H-イミダゾール-2-イル]メチル}-4-tert-ブチルベンズアミドの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-5-(モルホリン-4-イル)ペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-50-6)と同じであった。100.00mgのtert-ブチル3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボキシレートを使用して、100.00mgの粗製の所望の生成物を得た。LC/MS:C18H24N4Oに対する質量計算値:312.19、実測値:313.55[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-5-(モルホリン-4-イル)ペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-50-6)と同じであった。100.00mgのtert-ブチル3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボキシレートを使用して、100.00mgの粗製の所望の生成物を得た。LC/MS:C18H24N4Oに対する質量計算値:312.19、実測値:313.55[M+H]+。
ステップ6:tert-ブチル(2S)-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-2-(イミダゾール-1-カルボニルアミノ)ヘキサノエートの合成
THF(2.00mL)中のtert-ブチル(2S)-2-アミノ-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ヘキサノエート(300.00mg、0.99mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DIEA(384.63mg、2.98mmol、3.00当量)及びCDI(804.27mg、4.96mmol、5.00当量)を加え、得られた混合物を室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を水(50mL)に注ぎ、DCM(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×150mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-2-(イミダゾール-1-カルボニルアミノ)ヘキサノエート(350.00mg、88.99%収率)を無色の油として得た。LC/MS:C19H32N4O5に対する質量計算値:396.23、実測値:397.15[M+H]+。
THF(2.00mL)中のtert-ブチル(2S)-2-アミノ-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ヘキサノエート(300.00mg、0.99mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DIEA(384.63mg、2.98mmol、3.00当量)及びCDI(804.27mg、4.96mmol、5.00当量)を加え、得られた混合物を室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を水(50mL)に注ぎ、DCM(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×150mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮して、tert-ブチル(2S)-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-2-(イミダゾール-1-カルボニルアミノ)ヘキサノエート(350.00mg、88.99%収率)を無色の油として得た。LC/MS:C19H32N4O5に対する質量計算値:396.23、実測値:397.15[M+H]+。
ステップ7:tert-ブチル(2S)-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]ヘキサノエートの合成
THF(3.00mL)中のN-{[4-(アゼチジン-3-イル)-3H-イミダゾール-2-イル]メチル}-4-tert-ブチルベンズアミド(80.00mg、0.26mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DIEA(99.29mg、0.77mmol、3.00当量)及びN-{[4-(アゼチジン-3-イル)-3H-イミダゾール-2-イル]メチル}-4-tert-ブチルベンズアミド(80.00mg、0.26mmol、1.00当量)を加え、得られた混合物を室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮し、分取TLC(DCM:MeOH=18:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]ヘキサノエート(85.00mg、51.80%収率)を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C34H52N6O6に対する質量計算値:640.39、実測値:641.70[M+H]+。
THF(3.00mL)中のN-{[4-(アゼチジン-3-イル)-3H-イミダゾール-2-イル]メチル}-4-tert-ブチルベンズアミド(80.00mg、0.26mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DIEA(99.29mg、0.77mmol、3.00当量)及びN-{[4-(アゼチジン-3-イル)-3H-イミダゾール-2-イル]メチル}-4-tert-ブチルベンズアミド(80.00mg、0.26mmol、1.00当量)を加え、得られた混合物を室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮し、分取TLC(DCM:MeOH=18:1)により精製して、tert-ブチル(2S)-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]ヘキサノエート(85.00mg、51.80%収率)を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C34H52N6O6に対する質量計算値:640.39、実測値:641.70[M+H]+。
ステップ8:(2S)-6-アミノ-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]ヘキサン酸の合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-5-(モルホリン-4-イル)ペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-50-6)と同じであった。80.00mgのtert-ブチル(2S)-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]ヘキサノエートを使用して、80.00mgの粗製の所望の生成物を褐色の油として得た。LC/MS:C25H36N6O4に対する質量計算値:484.27、実測値:485.45[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-5-(モルホリン-4-イル)ペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-50-6)と同じであった。80.00mgのtert-ブチル(2S)-6-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]ヘキサノエートを使用して、80.00mgの粗製の所望の生成物を褐色の油として得た。LC/MS:C25H36N6O4に対する質量計算値:484.27、実測値:485.45[M+H]+。
ステップ9:(2S)-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサン酸の合成
手順は、ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-024-OBn)と同じであった。60.00mgの(2S)-6-アミノ-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]ヘキサン酸を使用して、60.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(89.62%収率)。LC/MS:C29H44N6O4に対する質量計算値:540.34、実測値:541.55[M+H]+。
手順は、ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-024-OBn)と同じであった。60.00mgの(2S)-6-アミノ-2-[3-(2-{[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]メチル}-3H-イミダゾール-4-イル)アゼチジン-1-カルボニルアミノ]ヘキサン酸を使用して、60.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(89.62%収率)。LC/MS:C29H44N6O4に対する質量計算値:540.34、実測値:541.55[M+H]+。
実施例13:2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(INT-37)の合成
ステップ1:メチル3-[(tert-ブチルジメチルシリル)オキシ]-2-ヒドロキシベンゾエートの合成
DMF(300.00mL)中のメチル2,3-ジヒドロキシベンゾエート(10.00g、59.47mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DIEA(10.76g、83.26mmol、1.40当量)及びt-ブチルジメチルクロロシラン(9.86g、65.42mmol、1.10当量)を窒素雰囲気下、0℃で滴下して加えた。混合物を0℃で1.0時間撹拌した。混合物に水(300mL)を加え、EA(3×200mL)で抽出した。有機層を水(300mL)及びブライン(150mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させた。混合物をセライトパッドを通して濾過し、減圧下で濃縮した。それをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE/EA=10:1)により精製した。16.90gの所望の生成物を黄色の油として得た(99.00%収率)。LC/MS:C14H22O4Siに対する質量計算値:282.13、実測値:283.00[M+H]+。
DMF(300.00mL)中のメチル2,3-ジヒドロキシベンゾエート(10.00g、59.47mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DIEA(10.76g、83.26mmol、1.40当量)及びt-ブチルジメチルクロロシラン(9.86g、65.42mmol、1.10当量)を窒素雰囲気下、0℃で滴下して加えた。混合物を0℃で1.0時間撹拌した。混合物に水(300mL)を加え、EA(3×200mL)で抽出した。有機層を水(300mL)及びブライン(150mL)で洗浄した。有機層をNa2SO4で乾燥させた。混合物をセライトパッドを通して濾過し、減圧下で濃縮した。それをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(PE/EA=10:1)により精製した。16.90gの所望の生成物を黄色の油として得た(99.00%収率)。LC/MS:C14H22O4Siに対する質量計算値:282.13、実測値:283.00[M+H]+。
ステップ2:メチル3-[(tert-ブチルジメチルシリル)オキシ]-2-メトキシベンゾエートの合成
DMF(200.00mL)中のメチル3-[(tert-[ブチルジメチルシリル)オキシ]-2-ヒドロキシベンゾエート(11.40g、40.37mmol、1.00当量)及びK2CO3(10.04g、72.66mmol、1.80当量)の撹拌混合物に、CH3I(10.31g、72.66mmol、1.80当量)を室温で加えた。混合物を16.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEA(200mL)で洗浄した。有機層をブライン(3×100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。溶媒を減圧下で濃縮した。12.00gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(99%収率)。LC/MS:C15H24O4Siに対する質量計算値:296.14、実測値:297.15[M+H]+。
DMF(200.00mL)中のメチル3-[(tert-[ブチルジメチルシリル)オキシ]-2-ヒドロキシベンゾエート(11.40g、40.37mmol、1.00当量)及びK2CO3(10.04g、72.66mmol、1.80当量)の撹拌混合物に、CH3I(10.31g、72.66mmol、1.80当量)を室温で加えた。混合物を16.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEA(200mL)で洗浄した。有機層をブライン(3×100mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。溶媒を減圧下で濃縮した。12.00gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(99%収率)。LC/MS:C15H24O4Siに対する質量計算値:296.14、実測値:297.15[M+H]+。
ステップ3:3-ヒドロキシ-2-メトキシ安息香酸の合成
H2O(40.00mL)及びTHF(80.00mL)中のメチル3-[(tert-ブチルジメチルシリル)オキシ]-2-メトキシベンゾエート(12.00g、40.48mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、LiOH(14.54g、607.22mmol、15.00当量)を室温で加えた。混合物を室温で4.0時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮した。混合物に水を加え、EAで洗浄した。水層を3M HClでpH=1に酸性化した。混合物をEAで抽出し、有機層をNa2SO4で乾燥させた。溶媒を減圧下で濃縮した。5.60gの所望の生成物を黄色の油として得た(82.27%収率)。LC/MS:C8H8O4に対する質量計算値:168.04、実測値:169.05[M+H]+。
H2O(40.00mL)及びTHF(80.00mL)中のメチル3-[(tert-ブチルジメチルシリル)オキシ]-2-メトキシベンゾエート(12.00g、40.48mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、LiOH(14.54g、607.22mmol、15.00当量)を室温で加えた。混合物を室温で4.0時間撹拌した。混合物を減圧下で濃縮した。混合物に水を加え、EAで洗浄した。水層を3M HClでpH=1に酸性化した。混合物をEAで抽出し、有機層をNa2SO4で乾燥させた。溶媒を減圧下で濃縮した。5.60gの所望の生成物を黄色の油として得た(82.27%収率)。LC/MS:C8H8O4に対する質量計算値:168.04、実測値:169.05[M+H]+。
ステップ4:tert-ブチル4-(2-ブロモアセチル)ピペラジン-1-カルボキシレートの合成
Na2CO3(10.00mL、238.70mmol、11.20当量)中のtert-ブチルピペラジン-1-カルボキシレート(5.60g、30.06mmol、1.41当量)の溶液を、DCM(100.00mL)で処理した。混合物に臭化ブロモアセチル(4.30g、21.30mmol、1.00当量)を0℃で40分間かけて少量ずつ加えた。次いで、得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。反応を水でクエンチし、EtOAc(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層を5%NaHCO3(3×30mL)及び水性クエン酸(3×30mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。7.40gの所望の生成物を、白色の固体として得た(97.25%収率)。C11H19BrN2O3に対する質量計算値:306.06、308.06、実測値:251.00、253.00[M-Boc+H+H]+。
Na2CO3(10.00mL、238.70mmol、11.20当量)中のtert-ブチルピペラジン-1-カルボキシレート(5.60g、30.06mmol、1.41当量)の溶液を、DCM(100.00mL)で処理した。混合物に臭化ブロモアセチル(4.30g、21.30mmol、1.00当量)を0℃で40分間かけて少量ずつ加えた。次いで、得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。反応を水でクエンチし、EtOAc(3×30mL)で抽出した。合わせた有機層を5%NaHCO3(3×30mL)及び水性クエン酸(3×30mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。7.40gの所望の生成物を、白色の固体として得た(97.25%収率)。C11H19BrN2O3に対する質量計算値:306.06、308.06、実測値:251.00、253.00[M-Boc+H+H]+。
ステップ5:tert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレートの合成
CH3CN(20.00mL)中のtert-ブチル4-(2-ブロモアセチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、3.26mmol、1.00当量)、3,5-ジメチルフェノール(0.60g、4.88mmol、1.50当量)、及びK2CO3(1.35g、9.77mmol、3.00当量)の混合物を、室温で14.0時間撹拌した。反応物を水でクエンチし、EA(3×200mL)で抽出した。有機層を組み合わせ、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EA/PE=1:3)により精製した。画分を合わせて濃縮した。1.00gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(88.16%収率)。LC/MS:C19H28N2O4に対する質量計算値:348.44、実測値:349.20[M+H]+。
CH3CN(20.00mL)中のtert-ブチル4-(2-ブロモアセチル)ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、3.26mmol、1.00当量)、3,5-ジメチルフェノール(0.60g、4.88mmol、1.50当量)、及びK2CO3(1.35g、9.77mmol、3.00当量)の混合物を、室温で14.0時間撹拌した。反応物を水でクエンチし、EA(3×200mL)で抽出した。有機層を組み合わせ、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EA/PE=1:3)により精製した。画分を合わせて濃縮した。1.00gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(88.16%収率)。LC/MS:C19H28N2O4に対する質量計算値:348.44、実測値:349.20[M+H]+。
ステップ6:2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-(ピペラジン-1-イル)エタノンの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応後、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。1.00gのtert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用した。0.70gの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(98.22%収率)。LC/MS:C14H20N2O2に対する質量計算値:248.33、実測値:249.20[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応後、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。1.00gのtert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用した。0.70gの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(98.22%収率)。LC/MS:C14H20N2O2に対する質量計算値:248.33、実測値:249.20[M+H]+。
ステップ7:2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノンの合成
DMF(5.00mL)中の2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-(ピペラジン-1-イル)エタノン(324.90mg、1.31mmol、1.10当量)、EDCI(342.02mg、1.78mmol、1.50当量)、HOBT(241.07mg、1.78mmol、1.50当量)、及びDIEA(384.30mg、2.97mmol、2.50当量)の混合物を、室温で2.0時間撹拌した。混合物にH2O(5mL)を加え、EtOAc(3×10mL)で抽出した。有機層を合わせ、飽和水性クエン酸(2×30mL)、及び飽和水性NaHCO3(2×30mL)、及びブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EA/PE=1:1)により精製した。画分を合わせて濃縮した。0.28gの所望の生成物を、白色の固体として得た(57.10%収率)。LC/MS:C22H26N2O5に対する質量計算値:398.46、実測値:399.20[M+H]+。
DMF(5.00mL)中の2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-(ピペラジン-1-イル)エタノン(324.90mg、1.31mmol、1.10当量)、EDCI(342.02mg、1.78mmol、1.50当量)、HOBT(241.07mg、1.78mmol、1.50当量)、及びDIEA(384.30mg、2.97mmol、2.50当量)の混合物を、室温で2.0時間撹拌した。混合物にH2O(5mL)を加え、EtOAc(3×10mL)で抽出した。有機層を合わせ、飽和水性クエン酸(2×30mL)、及び飽和水性NaHCO3(2×30mL)、及びブライン(30mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(EA/PE=1:1)により精製した。画分を合わせて濃縮した。0.28gの所望の生成物を、白色の固体として得た(57.10%収率)。LC/MS:C22H26N2O5に対する質量計算値:398.46、実測値:399.20[M+H]+。
実施例14:4-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}-2-メチルフェニルウレア(SM-045(OMe)-pUA)の合成
ステップ1:tert-ブチル4-[2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレートの合成:
手順は、tert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(INT-37-5)と同じであった。1.00gのtert-ブチル4-(2-ブロモアセチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用した。1.20gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(97.16%収率)。LC/MS:C18H25N3O6に対する質量計算値:379.17、実測値:379.97[M+H]+。
手順は、tert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(INT-37-5)と同じであった。1.00gのtert-ブチル4-(2-ブロモアセチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用した。1.20gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(97.16%収率)。LC/MS:C18H25N3O6に対する質量計算値:379.17、実測値:379.97[M+H]+。
ステップ2:2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)-1-(ピペラジン-1-イル)エタノンの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応時間は16.0時間であり、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。1.20gのtert-ブチル4-[2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用した。1.00gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C13H17N3O4に対する質量計算値:279.12、実測値:279.90[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応時間は16.0時間であり、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。1.20gのtert-ブチル4-[2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用した。1.00gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C13H17N3O4に対する質量計算値:279.12、実測値:279.90[M+H]+。
ステップ3:1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)エタノンの合成
手順は、2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(INT-037)と同じであった。0.59gの2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)-1-(ピペラジン-1-イル)エタノンを使用した。0.36gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(46.99%収率)。LC/MS:C21H23N3O7に対する質量計算値:429.15、実測値:429.95[M+H]+。
手順は、2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(INT-037)と同じであった。0.59gの2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)-1-(ピペラジン-1-イル)エタノンを使用した。0.36gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(46.99%収率)。LC/MS:C21H23N3O7に対する質量計算値:429.15、実測値:429.95[M+H]+。
ステップ4:2-(4-アミノ-3-メチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノンの合成
手順は、2-(4-アミノ-3,5-ジメチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(INT-38-pNH2)と同じであったが、反応時間は16.00時間であった。0.36gの1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)エタノンを使用した。0.35gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(94.07%収率)。LC/MS:C21H25N3O5に対する質量計算値:399.18、実測値:399.90[M+H]+。
手順は、2-(4-アミノ-3,5-ジメチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(INT-38-pNH2)と同じであったが、反応時間は16.00時間であった。0.36gの1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-メチル-4-ニトロフェノキシ)エタノンを使用した。0.35gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(94.07%収率)。LC/MS:C21H25N3O5に対する質量計算値:399.18、実測値:399.90[M+H]+。
ステップ5:4-{2-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}-2-メチルフェニルウレアの合成
手順は、4-{2-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}-2,6-ジメチルフェニルウレア(INT-38-pUA)と同じであった。0.30gの2-(4-アミノ-3-メチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノンを使用した。0.13gの所望の生成物を白色の固体として得た(38.98%収率)。LC/MS:C23H28N4O6に対する質量計算値:456.20、実測値:457.20[M+H]+。
手順は、4-{2-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}-2,6-ジメチルフェニルウレア(INT-38-pUA)と同じであった。0.30gの2-(4-アミノ-3-メチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノンを使用した。0.13gの所望の生成物を白色の固体として得た(38.98%収率)。LC/MS:C23H28N4O6に対する質量計算値:456.20、実測値:457.20[M+H]+。
ステップ6:4-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}-2-メチルフェニルウレアの合成
DMF(1.00mL)中の4-{2-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}-2-メチルフェニルウイレア(15.00mg、0.03mmol、1.00当量)、及びK2CO3(8.43mg、0.06mmol、1.80当量)の撹拌混合物に、CH3I(8.66mg、0.06mmol、1.8当量)を室温で加えた。得られた混合物を50℃で2時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾液を以下の条件で分取HPLCにより精製した:カラム:XBridge Prep Phenyl OBDカラム、19*250mm、5μm;移動相A:水(10mmol/L NH4HCO3+0.1%NH3.H2O)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:10分間で22%B~24%B、24%B;波長:254nm;RT1(分):8.92;実行数:5。画分を合わせて濃縮した。2.00mgの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(12.92%収率)。LC/MS:C23H28N4O6に対する質量計算値:456.20、実測値:457.20[M+H]+。
DMF(1.00mL)中の4-{2-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}-2-メチルフェニルウイレア(15.00mg、0.03mmol、1.00当量)、及びK2CO3(8.43mg、0.06mmol、1.80当量)の撹拌混合物に、CH3I(8.66mg、0.06mmol、1.8当量)を室温で加えた。得られた混合物を50℃で2時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾液を以下の条件で分取HPLCにより精製した:カラム:XBridge Prep Phenyl OBDカラム、19*250mm、5μm;移動相A:水(10mmol/L NH4HCO3+0.1%NH3.H2O)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:10分間で22%B~24%B、24%B;波長:254nm;RT1(分):8.92;実行数:5。画分を合わせて濃縮した。2.00mgの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(12.92%収率)。LC/MS:C23H28N4O6に対する質量計算値:456.20、実測値:457.20[M+H]+。
実施例15.2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-N-[2-(3-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}フェノキシ)エチル]アセトアミド(INT-041)の合成
ステップ1:tert-ブチル4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-カルボキシレートの合成
手順は、2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(INT-037)と同じであったが、反応時間は4.0時間であった。2.00gの2,3-ジメトキシ安息香酸を使用した。4.20gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C18H26N2O5に対する質量計算値:350.18、実測値:351.10[M+H]+。
手順は、2-(3,5-ジメチルフェノキシ)-1-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(INT-037)と同じであったが、反応時間は4.0時間であった。2.00gの2,3-ジメトキシ安息香酸を使用した。4.20gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C18H26N2O5に対する質量計算値:350.18、実測値:351.10[M+H]+。
ステップ2:1-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジンの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応は4.0時間であり、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。4.20gのtert-ブチル4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用した。2.90gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C13H18N2O3に対する質量計算値:250.13、実測値:251.05[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応は4.0時間であり、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。4.20gのtert-ブチル4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用した。2.90gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C13H18N2O3に対する質量計算値:250.13、実測値:251.05[M+H]+。
ステップ3:2-ブロモ-1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノンの合成
CH2Cl2(50.00mL)中の1-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン(2.60g、10.39mmol、1.00当量)、及び水性Na2CO3(5%、50mL)の撹拌溶液に、臭化ブロモアセチル(2.31g、11.43mmol、1.10当量)を0℃で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物をDCM(10mL)で希釈した。得られた混合物を2×10mLの5%HClで洗浄した。合わせた有機層をブライン、H2Oで洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。3.50gの所望の生成物を黄色の固体として得た(90.76%収率)。LC/MS:C15H19BrN2O4に対する質量計算値:370.05、372.05、実測値:371.00、373.00[M+H]+。
CH2Cl2(50.00mL)中の1-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン(2.60g、10.39mmol、1.00当量)、及び水性Na2CO3(5%、50mL)の撹拌溶液に、臭化ブロモアセチル(2.31g、11.43mmol、1.10当量)を0℃で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物をDCM(10mL)で希釈した。得られた混合物を2×10mLの5%HClで洗浄した。合わせた有機層をブライン、H2Oで洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。3.50gの所望の生成物を黄色の固体として得た(90.76%収率)。LC/MS:C15H19BrN2O4に対する質量計算値:370.05、372.05、実測値:371.00、373.00[M+H]+。
ステップ4:1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-ヒドロキシフェノキシ)エタノンの合成
手順は、tert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(INT-37-5)と同じであったが、反応温度は60℃であり、反応時間は2.0時間であった。3.20gの2-ブロモ-1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノンを使用した。2.4gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(69.53%収率)。LC/MS:C21H24N2O6に対する質量計算値:400.16、実測値:401.25[M+H]+。
手順は、tert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(INT-37-5)と同じであったが、反応温度は60℃であり、反応時間は2.0時間であった。3.20gの2-ブロモ-1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノンを使用した。2.4gの所望の生成物を淡黄色の油として得た(69.53%収率)。LC/MS:C21H24N2O6に対する質量計算値:400.16、実測値:401.25[M+H]+。
ステップ5:tert-ブチルN-[2-(3-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}フェノキシ)エチル]カルバメートの合成
手順は、tert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(INT-37-5)と同じであったが、反応温度は80℃、反応時間は2.0時間であった。0.20gの1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-ヒドロキシフェノキシ)エタノンを使用した。0.25gの所望の生成物を黄色の固体として得た(92.08%収率)。LC/MS:C28H37N3O8に対する質量計算値:543.26、実測値:544.30[M+H]+。
手順は、tert-ブチル4-[2-(3,5-ジメチルフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(INT-37-5)と同じであったが、反応温度は80℃、反応時間は2.0時間であった。0.20gの1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-(3-ヒドロキシフェノキシ)エタノンを使用した。0.25gの所望の生成物を黄色の固体として得た(92.08%収率)。LC/MS:C28H37N3O8に対する質量計算値:543.26、実測値:544.30[M+H]+。
ステップ6:2-[3-(2-アミノエトキシ)フェノキシ]-1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノンの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応は3.0時間であり、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。0.33gのtert-ブチルN-[2-(3-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}フェノキシ)エチル]カルバメートを使用した。0.24gの所望の生成物の粗生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C23H29N3O6に対する質量計算値:443.21、実測値:444.15[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応は3.0時間であり、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。0.33gのtert-ブチルN-[2-(3-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}フェノキシ)エチル]カルバメートを使用した。0.24gの所望の生成物の粗生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C23H29N3O6に対する質量計算値:443.21、実測値:444.15[M+H]+。
ステップ7:エチル2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセテートの合成
DMF(10.00mL)中の4-tert-ブチル安息香酸(500.00mg、2.81mmol、1.00当量)、及びアミノ酢酸エチルエステル(347.15mg、3.37mmol、1.20当量)の撹拌溶液に、HATU(1.60g、4.21mmol、1.50当量)、及びEt3N(567.75mg、5.61mmol、2.00当量)を加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を水(20mL)で希釈した。得られた混合物をEtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×10mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(5:1)で溶出して、エチル2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセテート(700.00mg、94.75%)を白色の固体として得た。LC/MS:C15H21NO3に対する質量計算値:263.15、実測値:264.10[M+H]+。
DMF(10.00mL)中の4-tert-ブチル安息香酸(500.00mg、2.81mmol、1.00当量)、及びアミノ酢酸エチルエステル(347.15mg、3.37mmol、1.20当量)の撹拌溶液に、HATU(1.60g、4.21mmol、1.50当量)、及びEt3N(567.75mg、5.61mmol、2.00当量)を加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を水(20mL)で希釈した。得られた混合物をEtOAc(3×20mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×10mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(5:1)で溶出して、エチル2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセテート(700.00mg、94.75%)を白色の固体として得た。LC/MS:C15H21NO3に対する質量計算値:263.15、実測値:264.10[M+H]+。
ステップ8:[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]酢酸の合成
手順は、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(INT-14.2)と同じであったが、反応時間は16.0時間であった。0.70gのエチル2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセテートを使用した。0.50gの所望の生成物を、白色の固体として得た(79.95%収率)。LC/MS:C13H17NO3に対する質量計算値:235.12、実測値:236.10[M+H]+。
手順は、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(INT-14.2)と同じであったが、反応時間は16.0時間であった。0.70gのエチル2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセテートを使用した。0.50gの所望の生成物を、白色の固体として得た(79.95%収率)。LC/MS:C13H17NO3に対する質量計算値:235.12、実測値:236.10[M+H]+。
ステップ9:2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-N-[2-(3-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}フェノキシ)エチル]アセトアミドの合成
手順は、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(INT-29-300)と同じであった。反応後、反応混合物をHPLCにより精製した。0.10gの(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]酢酸を使用した。39.80mgの所望の生成物を、白色の固体として得た(14.14%収率)。LC/MS:C36H44N4O8に対する質量計算値:660.32、実測値:661.25[M+H]+。
手順は、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(INT-29-300)と同じであった。反応後、反応混合物をHPLCにより精製した。0.10gの(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]酢酸を使用した。39.80mgの所望の生成物を、白色の固体として得た(14.14%収率)。LC/MS:C36H44N4O8に対する質量計算値:660.32、実測値:661.25[M+H]+。
実施例16.メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-イル]ホルムアミド}プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-042)の合成
ステップ1:エチル1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-カルボキシレートの合成
エチルアルコール(120.00mL)中の[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]ヒドラジン(3.71g、20.82mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、エチル2-ホルミル-3-プロパノエート(3.00g、20.82mmol、1.00当量)を空気雰囲気下0℃で滴下して加えた。混合物を25℃で6.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮して、エチル1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-カルボキシレート(2.00g、35.28%)を褐色の固体として得た。LC/MS:C16H20N2O2に対する質量計算値:272.15、実測値:273.15[M+H]+。
エチルアルコール(120.00mL)中の[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]ヒドラジン(3.71g、20.82mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、エチル2-ホルミル-3-プロパノエート(3.00g、20.82mmol、1.00当量)を空気雰囲気下0℃で滴下して加えた。混合物を25℃で6.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮して、エチル1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-カルボキシレート(2.00g、35.28%)を褐色の固体として得た。LC/MS:C16H20N2O2に対する質量計算値:272.15、実測値:273.15[M+H]+。
ステップ2:1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-カルボン酸の合成
手順は、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(INT-14.2)と同じであったが、反応時間は5.0時間であった。1.00gのエチル1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-カルボキシレートを使用した。0.64gの所望の生成物を、白色の固体として得た(71.19%収率)。LC/MS:C14H16N2O2に対する質量計算値:244.29、実測値:246.10[M+H]+。
手順は、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(INT-14.2)と同じであったが、反応時間は5.0時間であった。1.00gのエチル1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-カルボキシレートを使用した。0.64gの所望の生成物を、白色の固体として得た(71.19%収率)。LC/MS:C14H16N2O2に対する質量計算値:244.29、実測値:246.10[M+H]+。
ステップ3:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-イル]ホルムアミド}プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチル
フェニル)ホルムアミド]アセトアミド}アセトアミド)アセトアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-32-102)と同じであった。0.26gの1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-カルボン酸を使用した。0.80gの所望の生成物を黄色の固体として得た(85.41%収率)。LC/MS:C48H61N7O9に対する質量計算値:879.45、実測値:880.40[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチル
フェニル)ホルムアミド]アセトアミド}アセトアミド)アセトアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-32-102)と同じであった。0.26gの1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-カルボン酸を使用した。0.80gの所望の生成物を黄色の固体として得た(85.41%収率)。LC/MS:C48H61N7O9に対する質量計算値:879.45、実測値:880.40[M+H]+。
ステップ4:メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-イル]ホルムアミド}プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.11)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。1.0gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[1-(4-[tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-イル]ホルムアミド}プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用した。1.0gの所望の生成物の粗生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C33H51N7O7に対する質量計算値:657.81、実測値:658.60[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.11)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。1.0gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[1-(4-[tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-イル]ホルムアミド}プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用した。1.0gの所望の生成物の粗生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C33H51N7O7に対する質量計算値:657.81、実測値:658.60[M+H]+。
ステップ5:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-イル]ホルムアミド}プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14-OMe)と同じであったが、反応時間は4.0時間であった。1.0gのメチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-イル]ホルムアミド}プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用した。0.40gの所望の生成物を黄色の固体として得た(36.86%収率)。LC/MS:C37H59N7O7に対する質量計算値:713.92、実測値:714.45[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14-OMe)と同じであったが、反応時間は4.0時間であった。1.0gのメチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[1-(4-tert-ブチルフェニル)ピラゾール-4-イル]ホルムアミド}プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエートを使用した。0.40gの所望の生成物を黄色の固体として得た(36.86%収率)。LC/MS:C37H59N7O7に対する質量計算値:713.92、実測値:714.45[M+H]+。
実施例17.(6-{[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]カルバモイル}-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)酢酸(INT-043)の合成
DMF(10.00mL)中のエチル シアノアセテート(2.71g、23.93mmol、1.50当量)、及び5-ブロモピリジン-2,3-ジアミン(3.00g、15.96mmol、1.00当量)の混合物を、マイクロ波条件下、160℃で1.0時間撹拌した。反応物を室温で水(20mL)でクエンチした。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×20mL)で洗浄した。得られた固体を真空下で乾燥させ、2-{6-ブロモ-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル}アセトニトリル(2.40g、63.45%収率)を褐色の固体として得た。LC/MS:C8H5BrN4に対する質量計算値:235.96、実測値:237.00、239.00[M+H、M+2+H]+。
ステップ2:メチル2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボキシレートの合成
MeOH(20.00mL)中の2-{6-ブロモ-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル}アセトニトリル(1.80g、7.59mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(1.24g、1.52mmol、0.20当量)、及びEt3N(2.31g、22.78mmol、3.00当量)を加えた。得られた混合物を5バールのCO雰囲気下、100℃で16.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN(0.05%TFA)、30分間で10%~30%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせ、濃縮して、メチル2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボキシレート(510.00mg、31.07%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C10H8N4O2に対する質量計算値:216.06、実測値:217.10[M+H]+。
MeOH(20.00mL)中の2-{6-ブロモ-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル}アセトニトリル(1.80g、7.59mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(1.24g、1.52mmol、0.20当量)、及びEt3N(2.31g、22.78mmol、3.00当量)を加えた。得られた混合物を5バールのCO雰囲気下、100℃で16.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN(0.05%TFA)、30分間で10%~30%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせ、濃縮して、メチル2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボキシレート(510.00mg、31.07%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C10H8N4O2に対する質量計算値:216.06、実測値:217.10[M+H]+。
ステップ3:2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボン酸の合成
手順は、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(INT-14.2)と同じであったが、溶媒はMeOHであり、反応温度は45℃であった。490.00mgのメチル2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボキシレートを使用して、410.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(89.48%収率)。LC/MS:C9H6N4O2に対する質量計算値:202.04、実測値:203.00[M+H]+。
手順は、(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパン酸(INT-14.2)と同じであったが、溶媒はMeOHであり、反応温度は45℃であった。490.00mgのメチル2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボキシレートを使用して、410.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(89.48%収率)。LC/MS:C9H6N4O2に対する質量計算値:202.04、実測値:203.00[M+H]+。
ステップ4:N-[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]-2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボキサミドの合成
手順は、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(INT-29-300)と同じであった。390.00mgの2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボン酸を使用して、660.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(98.48%収率)。LC/MS:C20H21N5Oに対する質量計算値:347.17、実測値:348.25[M+H]+。
手順は、tert-ブチル2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセテート(INT-29-300)と同じであった。390.00mgの2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボン酸を使用して、660.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(98.48%収率)。LC/MS:C20H21N5Oに対する質量計算値:347.17、実測値:348.25[M+H]+。
ステップ5:エチル2-(6-{[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]カルバモイル}-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)アセテートの合成
塩酸(エタノール中)(30%、15.00mL)中のN-[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]-2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボキサミド(660.00mg、1.90mmol、1.00当量)の溶液を、0℃で16.0時間保持した。得られた混合物を濃縮して、エチル2-(6-{[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]カルバモイル}-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)アセテート(740.00mg粗製)を黄色の固体として得た。LC/MS:C22H26N4O3に対する質量計算値:394.20、実測値:395.25[M+H]+。
塩酸(エタノール中)(30%、15.00mL)中のN-[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]-2-(シアノメチル)-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-6-カルボキサミド(660.00mg、1.90mmol、1.00当量)の溶液を、0℃で16.0時間保持した。得られた混合物を濃縮して、エチル2-(6-{[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]カルバモイル}-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)アセテート(740.00mg粗製)を黄色の固体として得た。LC/MS:C22H26N4O3に対する質量計算値:394.20、実測値:395.25[M+H]+。
ステップ6:(6-{[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]カルバモイル}-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)酢酸の合成
手順は、(2S)-2-[(2S)-6-(ジエチルアミノ)-2-アセトアミドヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-27-Ac)と同じであった。200.00mgのエチル2-(6-{[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]カルバモイル}-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)アセテートを使用して、185.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C20H22N4O3に対する質量計算値:366.16、実測値:367.35[M+H]+。
手順は、(2S)-2-[(2S)-6-(ジエチルアミノ)-2-アセトアミドヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-27-Ac)と同じであった。200.00mgのエチル2-(6-{[(4-tert-ブチルフェニル)メチル]カルバモイル}-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)アセテートを使用して、185.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C20H22N4O3に対する質量計算値:366.16、実測値:367.35[M+H]+。
実施例18.tert-ブチルN-[2-(4-アミノベンズアミド)フェニル]カルバメート(INT-44断片)の合成
ステップ44-1:ベンジルN-[4-({2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]フェニル}カルバモイル)フェニル]カルバメートの合成
DMF(5.00mL)中のtert-ブチルN-(2-アミノフェニル)カルバメート(765.00mg、3.67mmol、1.00当量)、及び4-{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}安息香酸(1.00g、3.69mmol、1.00当量)、TCFH(1.30g、4.63mmol、1.26当量)、NMI(1.80g、21.92mmol、5.95当量)の溶液を、室温で1.0時間撹拌した。反応物を氷水(50mL)に注ぎ、混合物を15分間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、ベンジルN-[4-({2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]フェニル}カルバモイル)フェニル]カルバメート(1.40g、79.82%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C26H27N3O5に対する質量計算値:461.20、実測値:484.30[M+Na]+。
DMF(5.00mL)中のtert-ブチルN-(2-アミノフェニル)カルバメート(765.00mg、3.67mmol、1.00当量)、及び4-{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}安息香酸(1.00g、3.69mmol、1.00当量)、TCFH(1.30g、4.63mmol、1.26当量)、NMI(1.80g、21.92mmol、5.95当量)の溶液を、室温で1.0時間撹拌した。反応物を氷水(50mL)に注ぎ、混合物を15分間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、ベンジルN-[4-({2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]フェニル}カルバモイル)フェニル]カルバメート(1.40g、79.82%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C26H27N3O5に対する質量計算値:461.20、実測値:484.30[M+Na]+。
ステップ44-2:tert-ブチルN-[2-(4-アミノベンズアミド)フェニル]カルバメートの合成
MeOH(20.00mL)中のベンジルN-[4-({2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]フェニル}カルバモイル)フェニル]カルバメート(1.40g、3.03mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、Pd/C(280.00mg、20%w/w)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を水素雰囲気下、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3x10mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。これにより、tert-ブチルN-[2-(4-アミノベンズアミド)フェニル]カルバメート(950.00mg、粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C18H21N3O3に対する質量計算値:327.16、実測値:350.20[M+Na]+。
MeOH(20.00mL)中のベンジルN-[4-({2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]フェニル}カルバモイル)フェニル]カルバメート(1.40g、3.03mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、Pd/C(280.00mg、20%w/w)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を水素雰囲気下、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3x10mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。これにより、tert-ブチルN-[2-(4-アミノベンズアミド)フェニル]カルバメート(950.00mg、粗製)を白色の固体として得た。LC/MS:C18H21N3O3に対する質量計算値:327.16、実測値:350.20[M+Na]+。
実施例19.メチル4-{[ブチル({[4-(プロプ-2-イン-1-イルオキシ)フェニル]カルバモイル})アミノ]メチル}ベンゾエート(INT-046-AR-断片)
ステップ1:メチル4-[(ブチルアミノ)メチル]ベンゾエート
手順は、ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{bicycle[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-024-OBn)と同じであったが、反応溶媒はDCMであり、反応後、混合物を濃縮し、逆相により直接精製した。1.00gのメチル4-ホルミルベンゾエートを使用して、400.00mgの所望の生成物を淡黄色の油として得た。LC/MS:C13H19NO2に対する質量計算値:221.14、実測値:222.15[M+H]+。
手順は、ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{bicycle[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-024-OBn)と同じであったが、反応溶媒はDCMであり、反応後、混合物を濃縮し、逆相により直接精製した。1.00gのメチル4-ホルミルベンゾエートを使用して、400.00mgの所望の生成物を淡黄色の油として得た。LC/MS:C13H19NO2に対する質量計算値:221.14、実測値:222.15[M+H]+。
ステップ2:メチル4-[({[4-(ベンジルオキシ)フェニル]カルバモイル}(ブチル)アミノ)メチル]ベンゾエートの合成
メチル4-[(ブチルアミノ)メチル]ベンゾエート(380.00mg、1.72mmol、1.00当量)、及び1-(ベンジルオキシ)-4-イソシアナトベンゼン(425.46mg、1.90mmol、1.10当量)をDCM(3.00mL)に溶解した。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、PE及びEA(PE:EA=2:1)で溶出した。画分を合わせて濃縮して、メチル4-[({[4-(ベンジルオキシ)フェニル]カルバモイル}(ブチル)アミノ)メチル]ベンゾエート(560.00mg、73.03%収率)を淡褐色の油として得た。LC/MS:C27H30N2O4に対する質量計算値:446.22、実測値:447.30[M+H]+。
メチル4-[(ブチルアミノ)メチル]ベンゾエート(380.00mg、1.72mmol、1.00当量)、及び1-(ベンジルオキシ)-4-イソシアナトベンゼン(425.46mg、1.90mmol、1.10当量)をDCM(3.00mL)に溶解した。得られた混合物を、室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、PE及びEA(PE:EA=2:1)で溶出した。画分を合わせて濃縮して、メチル4-[({[4-(ベンジルオキシ)フェニル]カルバモイル}(ブチル)アミノ)メチル]ベンゾエート(560.00mg、73.03%収率)を淡褐色の油として得た。LC/MS:C27H30N2O4に対する質量計算値:446.22、実測値:447.30[M+H]+。
ステップ3:メチル4-({ブチル[(4-ヒドロキシフェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)ベンゾエートの合成
メチル4-[({[4-(ベンジルオキシ)フェニル]カルバモイル}(ブチル)アミノ)メチル]ベンゾエート(500.00mg、1.12mmol、1.00当量)をトリフルオロアセトアルデヒド(3.00mL)に溶解し、得られた混合物を70℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮して、メチル4-({ブチル[(4-ヒドロキシフェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)ベンゾエート(500.00mg、粗製)を褐色の油として得た。LC/MS:C20H24N2O4に対する質量計算値:356.17、実測値:357.20[M+H]+。
メチル4-[({[4-(ベンジルオキシ)フェニル]カルバモイル}(ブチル)アミノ)メチル]ベンゾエート(500.00mg、1.12mmol、1.00当量)をトリフルオロアセトアルデヒド(3.00mL)に溶解し、得られた混合物を70℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮して、メチル4-({ブチル[(4-ヒドロキシフェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)ベンゾエート(500.00mg、粗製)を褐色の油として得た。LC/MS:C20H24N2O4に対する質量計算値:356.17、実測値:357.20[M+H]+。
ステップ4:メチル4-{[ブチル({[4-(プロプ-2-イン-1-イルオキシ)フェニル]カルバモイル})アミノ]メチル}ベンゾエートの合成
ACN(3.00mL)中のメチル4-({ブチル[(4-ヒドロキシフェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)ベンゾエート(400.00mg、1.12mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、臭化プロパルギル(200.26mg、1.68mmol、1.50当量)、及びK2cCO3(930.62mg、6.73mmol、6.00当量)を加え、得られた溶液を70℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをACN(3x2mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮し、以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中の0.5%NH4HCO3及びCH3CN、20分間で25%~35%勾配;検出器、UV254nm~220nm。画分を合わせ、濃縮して、メチル4-{[ブチル({[4-(プロプ-2-イン-1-イルオキシ)フェニル]カルバモイル})アミノ]メチル}ベンゾエート(180.00mg、40.66%収率)を淡褐色の油として得た。LC/MS:C23H26N2O4に対する質量計算値:394.18、実測値:395.15[M+H]+。
ACN(3.00mL)中のメチル4-({ブチル[(4-ヒドロキシフェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)ベンゾエート(400.00mg、1.12mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、臭化プロパルギル(200.26mg、1.68mmol、1.50当量)、及びK2cCO3(930.62mg、6.73mmol、6.00当量)を加え、得られた溶液を70℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをACN(3x2mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮し、以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中の0.5%NH4HCO3及びCH3CN、20分間で25%~35%勾配;検出器、UV254nm~220nm。画分を合わせ、濃縮して、メチル4-{[ブチル({[4-(プロプ-2-イン-1-イルオキシ)フェニル]カルバモイル})アミノ]メチル}ベンゾエート(180.00mg、40.66%収率)を淡褐色の油として得た。LC/MS:C23H26N2O4に対する質量計算値:394.18、実測値:395.15[M+H]+。
実施例20:(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[(2S,3aS,7aS)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-オクタヒドロインドール-2-イル]ホルムアミド}-6-[イソプロピル(メチル)アミノ]ヘキサンアミド]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタン酸(INT-047)の合成
ステップ1:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。5.00のロイシンメチルエステルを使用して、8.20gの所望の生成物を白色の固体として得た(60.67%収率)。LC/MS:C21H32N2O5に対する質量計算値:392.23、実測値:393.25[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。5.00のロイシンメチルエステルを使用して、8.20gの所望の生成物を白色の固体として得た(60.67%収率)。LC/MS:C21H32N2O5に対する質量計算値:392.23、実測値:393.25[M+H]+。
ステップ2:メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応後、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。8.10gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[([tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートを使用して、8.10gの粗製の所望の生成物を褐色の油として得た。LC/MS:C16H24N2O3に対する質量計算値:292.18、実測値:293.15[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応後、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。8.10gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[([tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートを使用して、8.10gの粗製の所望の生成物を褐色の油として得た。LC/MS:C16H24N2O3に対する質量計算値:292.18、実測値:293.15[M+H]+。
ステップ3:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。10.40gの(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサン酸を使用して、14.00gの所望の生成物を白色の固体として得た(78.11%収率)。LC/MS:C42H54N4O8に対する質量計算値:742.39、実測値:765.65[M+Na]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。10.40gの(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサン酸を使用して、14.00gの所望の生成物を白色の固体として得た(78.11%収率)。LC/MS:C42H54N4O8に対する質量計算値:742.39、実測値:765.65[M+Na]+。
ステップ4:メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応後、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。4.00gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートを使用して、4.00gの粗製の所望の生成物を褐色の油として得た。LC/MS:C37H46N4O6に対する質量計算値:642.34、実測値:643.35[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イル)メトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.6)と同じであったが、反応後、混合物を濃縮した。粗生成物を次のステップに直接使用した。4.00gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートを使用して、4.00gの粗製の所望の生成物を褐色の油として得た。LC/MS:C37H46N4O6に対する質量計算値:642.34、実測値:643.35[M+H]+。
ステップ5:tert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。3.46gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートを使用して、3.70gの所望の生成物をピンク色の固体として得た。LC/MS:C51H67N5O9に対する質量計算値:893.49、実測値:894.55[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパノエート(INT-14.1)と同じであった。3.46gのメチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタノエートを使用して、3.70gの所望の生成物をピンク色の固体として得た。LC/MS:C51H67N5O9に対する質量計算値:893.49、実測値:894.55[M+H]+。
ステップ6:tert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-アミノ-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.11)と同じであった。3.65gのtert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートを使用して、1.30gの所望の生成物を白色の固体として得た(42.66%収率)。LC/MS:C36H57N5O7に対する質量計算値:671.43、実測値:672.70[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-6-アミノ-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-14.11)と同じであった。3.65gのtert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートを使用して、1.30gの所望の生成物を白色の固体として得た(42.66%収率)。LC/MS:C36H57N5O7に対する質量計算値:671.43、実測値:672.70[M+H]+。
ステップ7:tert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-[イソプロピル(メチル)アミノ]-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}アセトアミド)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート及び(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}アセトアミド)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-33-2)と同じであった。900.00mgのtert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-アミノ-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートを使用して、310.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C40H65N5O7に対する質量計算値:727.49、実測値:728.75[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}アセトアミド)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート及び(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}アセトアミド)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-33-2)と同じであった。900.00mgのtert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-アミノ-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートを使用して、310.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C40H65N5O7に対する質量計算値:727.49、実測値:728.75[M+H]+。
ステップ8:(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-{[(2S,3aS,7aS)-1-(tert-ブトキシカルボニル)-オクタヒドロインドール-2-イル]ホルムアミド}-6-[イソプロピル(メチル)アミノ]ヘキサンアミド]-3-フェニルプロパンアミド]-4-メチルペンタン酸の合成
手順は、(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(2-メチルプロピル)アミノ}-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-34-PEG2-C(O)-PTBPh-NIB)と同じであった。しかし、反応温度は50℃であり、反応時間は3.0時間であった。170.00mgのtert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-[イソプロピル(メチル)アミノ]-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートを使用して、100.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(60.98%収率)。LC/MS:C39H63N5O7に対する質量計算値:713.47、実測値:714.75[M+H]+。
手順は、(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクロ[2.2.1]ヘプタン-2-イル(2-メチルプロピル)アミノ}-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)アセトアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸(INT-34-PEG2-C(O)-PTBPh-NIB)と同じであった。しかし、反応温度は50℃であり、反応時間は3.0時間であった。170.00mgのtert-ブチル(2S,3aS,7aS)-2-{[(1S)-5-[イソプロピル(メチル)アミノ]-1-{[(1S)-1-{[(2S)-1-メトキシ-4-メチル-1-オキソペンタン-2-イル]カルバモイル}-2-フェニルエチル]カルバモイル}ペンチル]カルバモイル}-オクタヒドロインドール-1-カルボキシレートを使用して、100.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(60.98%収率)。LC/MS:C39H63N5O7に対する質量計算値:713.47、実測値:714.75[M+H]+。
実施例21.tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(INT-048A-Boc)の合成
ステップ1:(3S,4R)-1-ベンジル-3-(4-ブロモフェニル)-4-ニトロピロリジンの合成
DCM(50.00mL)中の1-ブロモ-4-[(E)-2-ニトロエテニル]ベンゼン(5.00g、21.93mmol、1.00当量)、及びTFA(5.00mL)の撹拌溶液に、DCM(10.00mL)中のベンジル(メトキシメチル)[(トリメチルシリル)メチル]アミン(6.25g、26.33mmol、1.20当量)を0℃で滴下して加えた。得られた混合物を0℃で1.0時間撹拌した。得られた混合物を室温まで温め、室温で1.5時間撹拌した。反応物を0℃で飽和NaHCO3(水性)(200mL)を加えてクエンチした。得られた混合物をCH2Cl2(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×100mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(5:1)で溶出して、(3S,4R)-1-ベンジル-3-(4-ブロモフェニル)-4-ニトロピロリジン(7.20g、87.27%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C17H17BrN2O2に対する質量計算値:360.05、実測値:361.10、363.10[M+H、M+2+H]+。
DCM(50.00mL)中の1-ブロモ-4-[(E)-2-ニトロエテニル]ベンゼン(5.00g、21.93mmol、1.00当量)、及びTFA(5.00mL)の撹拌溶液に、DCM(10.00mL)中のベンジル(メトキシメチル)[(トリメチルシリル)メチル]アミン(6.25g、26.33mmol、1.20当量)を0℃で滴下して加えた。得られた混合物を0℃で1.0時間撹拌した。得られた混合物を室温まで温め、室温で1.5時間撹拌した。反応物を0℃で飽和NaHCO3(水性)(200mL)を加えてクエンチした。得られた混合物をCH2Cl2(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×100mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(5:1)で溶出して、(3S,4R)-1-ベンジル-3-(4-ブロモフェニル)-4-ニトロピロリジン(7.20g、87.27%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C17H17BrN2O2に対する質量計算値:360.05、実測値:361.10、363.10[M+H、M+2+H]+。
ステップ2:(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)ピロリジン-3-アミンの合成
H2O(20.00mL)及びEtOH(80.00mL)中の(3S,4R)-1-ベンジル-3-(4-ブロモフェニル)-4-ニトロピロリジン(3.50g、9.69mmol、1.00当量)、及びFe粉末(9.00g、161.16mmol、16.63当量)、NH4Cl(9.00g、168.25mmol、17.37当量)の混合物を、50℃で3.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOH(3×30mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を水(100mL)で希釈した。得られた混合物をCH2Cl2(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(2x100mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。これにより、(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)ピロリジン-3-アミン(2.90g、粗製)を黄色の固体として得た。LCMS:C17H19BrN2に対する質量計算値:330.07、実測値:331.10、333.10[M+H、M+2+H]+。
H2O(20.00mL)及びEtOH(80.00mL)中の(3S,4R)-1-ベンジル-3-(4-ブロモフェニル)-4-ニトロピロリジン(3.50g、9.69mmol、1.00当量)、及びFe粉末(9.00g、161.16mmol、16.63当量)、NH4Cl(9.00g、168.25mmol、17.37当量)の混合物を、50℃で3.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOH(3×30mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を水(100mL)で希釈した。得られた混合物をCH2Cl2(3×150mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(2x100mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。これにより、(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)ピロリジン-3-アミン(2.90g、粗製)を黄色の固体として得た。LCMS:C17H19BrN2に対する質量計算値:330.07、実測値:331.10、333.10[M+H、M+2+H]+。
ステップ3:(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミンの合成
手順は、ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-024-OBn)と同じであったが、反応温度は35℃であり、反応時間は17.0時間であった。2.50gの(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)ピロリジン-3-アミンを使用して、1.30gの所望の生成物を白色の油として得た(47.94%収率)。LC/MS:C19H23BrN2に対する質量計算値:358.10、実測値:359.20、361.20[M+H、M+2+H]+。
手順は、ベンジル(2S)-2-[(2S)-6-{ビシクリル[2.2.1]ヘプタン-2-イル(メチル)アミノ}-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-024-OBn)と同じであったが、反応温度は35℃であり、反応時間は17.0時間であった。2.50gの(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)ピロリジン-3-アミンを使用して、1.30gの所望の生成物を白色の油として得た(47.94%収率)。LC/MS:C19H23BrN2に対する質量計算値:358.10、実測値:359.20、361.20[M+H、M+2+H]+。
ステップ4:(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン及び(3S,4R)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミンの合成
ラセミ体混合生成物(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(1.30g、3.62mmol、1.00当量)を以下の条件でSFCにより分離した:カラム:CHIRAL ART Amylose-C NEO、5*25cm、10μm;移動相A:CO2、移動相B:MEOH(0.1% 2M NH3-MEOH);流速:200mL/分;勾配:均一濃度20%B;カラム温度(℃):35;背圧(bar):100;波長:220nm;RT1(分):6.29;RT2(分):8.54;試料溶媒:MeOH-----分取;注入量:1mL;実行数:35。画分を合わせ、蒸発させて、(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(450.00mg、34.62%収率)を白色の油として、(3S,4R)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(430.00mg、33.08%収率)を白色の油として得た。4A:LC/MS:C19H23BrN2に対する質量計算値:358.10、実測値:359.15、361.15[M+H、M+2+H]+。4B:LC/MS:C19H23BrN2に対する質量計算値:358.10、実測値:359.15、361.15[M+H+2]+。
ラセミ体混合生成物(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(1.30g、3.62mmol、1.00当量)を以下の条件でSFCにより分離した:カラム:CHIRAL ART Amylose-C NEO、5*25cm、10μm;移動相A:CO2、移動相B:MEOH(0.1% 2M NH3-MEOH);流速:200mL/分;勾配:均一濃度20%B;カラム温度(℃):35;背圧(bar):100;波長:220nm;RT1(分):6.29;RT2(分):8.54;試料溶媒:MeOH-----分取;注入量:1mL;実行数:35。画分を合わせ、蒸発させて、(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(450.00mg、34.62%収率)を白色の油として、(3S,4R)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(430.00mg、33.08%収率)を白色の油として得た。4A:LC/MS:C19H23BrN2に対する質量計算値:358.10、実測値:359.15、361.15[M+H、M+2+H]+。4B:LC/MS:C19H23BrN2に対する質量計算値:358.10、実測値:359.15、361.15[M+H+2]+。
ステップ5:tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-1-ベンジル-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレートの合成
ジオキサン(10.00mL)中の(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(400.00mg、1.11mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルピペラジン-1-カルボキシレート(414.00mg、2.22mmol、2.00当量)、Pd2(dba)3(103.00mg、0.11mmol、0.10当量)、XPhos(106.00mg、0.22mmol、0.20当量)、ナトリウム t-ブトキシド(290.00mg、3.02mmol、2.71当量)の混合物を、窒素雰囲気下、110℃で2.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキを1,4-ジオキサン(2×5mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-1-ベンジル-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(430.00mg、83.13%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C28H40N4O2に対する質量計算値:464.32、実測値:465.30[M+H]+。
ジオキサン(10.00mL)中の(3R,4S)-1-ベンジル-4-(4-ブロモフェニル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(400.00mg、1.11mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルピペラジン-1-カルボキシレート(414.00mg、2.22mmol、2.00当量)、Pd2(dba)3(103.00mg、0.11mmol、0.10当量)、XPhos(106.00mg、0.22mmol、0.20当量)、ナトリウム t-ブトキシド(290.00mg、3.02mmol、2.71当量)の混合物を、窒素雰囲気下、110℃で2.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキを1,4-ジオキサン(2×5mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-1-ベンジル-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(430.00mg、83.13%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C28H40N4O2に対する質量計算値:464.32、実測値:465.30[M+H]+。
ステップ6:tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレートの合成
CF3CH2OH(6.00mL)中のtert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-1-ベンジル-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(420.00mg、0.90mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、Pd(OH)2/C(84.00mg、20%w/w)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を水素雰囲気下、室温で36.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをCF3CH2OH(2×5mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。これにより、tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(370.00mg、粗製)を褐色の油として得た。LC/MS:C21H34N4O2に対する質量計算値:374.27、実測値:375.30[M+H]+。
CF3CH2OH(6.00mL)中のtert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-1-ベンジル-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(420.00mg、0.90mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、Pd(OH)2/C(84.00mg、20%w/w)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を水素雰囲気下、室温で36.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをCF3CH2OH(2×5mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。これにより、tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(370.00mg、粗製)を褐色の油として得た。LC/MS:C21H34N4O2に対する質量計算値:374.27、実測値:375.30[M+H]+。
ステップ7:tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレートの合成
MeOH(4.00mL)中のtert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(350.00mg、0.94mmol、1.00当量)、及び7-フルオロ-2,3-ジヒドロインデン-1-オン(210.00mg、1.40mmol、1.50当量)の撹拌混合物に、NaBH3CN(180.00mg、7.83mmol、8.38当量)、塩化亜鉛(ジエチルエーテル中1M、4mL)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を50℃で24.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3x5mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(20:1)で溶出して、tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(390.00mg、79.10%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C30H41FN4O2に対する質量計算値:508.32、実測値:509.30[M+H]+。
MeOH(4.00mL)中のtert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(350.00mg、0.94mmol、1.00当量)、及び7-フルオロ-2,3-ジヒドロインデン-1-オン(210.00mg、1.40mmol、1.50当量)の撹拌混合物に、NaBH3CN(180.00mg、7.83mmol、8.38当量)、塩化亜鉛(ジエチルエーテル中1M、4mL)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を50℃で24.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOH(3x5mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(20:1)で溶出して、tert-ブチル4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-カルボキシレート(390.00mg、79.10%収率)を褐色の油として得た。LC/MS:C30H41FN4O2に対する質量計算値:508.32、実測値:509.30[M+H]+。
実施例22.N-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-5-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4-メチル-4’-(ピペラジン-1-イルメチル)-[1,1’-ビフェニル]-3-カルボキサミド(INT-052)の合成
ステップ1:メチル5-ブロモ-2-メチル-3-(オキサン-4-イルアミノ)ベンゾエートの合成
MeOH(50.00mL)中のメチル3-アミノ-5-ブロモ-2-メチルベンゾエート(5.00g、20.48mmol、1.00当量)の溶液に、テトラヒドロ-4H-ピラン-4-オン(4.10g、40.97mmol、2.00当量)、AcOH(2.46g、40.97mmol、2.00当量)、NaBH3CN(3.86g、61.452mmol、3.00当量)を加えた。得られた混合物を35℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~20%酢酸エチル/石油エーテル)により精製して、メチル5-ブロモ-2-メチル-3-(オキサン-4-イルアミノ)ベンゾエート(4.45g、66.19%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C14H18BrNO3に対する質量計算値:327.04、実測値:328.05、330.05[M+H、M+2+H]+。
MeOH(50.00mL)中のメチル3-アミノ-5-ブロモ-2-メチルベンゾエート(5.00g、20.48mmol、1.00当量)の溶液に、テトラヒドロ-4H-ピラン-4-オン(4.10g、40.97mmol、2.00当量)、AcOH(2.46g、40.97mmol、2.00当量)、NaBH3CN(3.86g、61.452mmol、3.00当量)を加えた。得られた混合物を35℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~20%酢酸エチル/石油エーテル)により精製して、メチル5-ブロモ-2-メチル-3-(オキサン-4-イルアミノ)ベンゾエート(4.45g、66.19%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C14H18BrNO3に対する質量計算値:327.04、実測値:328.05、330.05[M+H、M+2+H]+。
ステップ2:メチル5-ブロモ-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチルベンゾエートの合成
手順は、メチル5-ブロモ-2-メチル-3-(オキサン-4-イルアミノ)ベンゾエートと同じであったが、反応時間は48.0時間であった。4.45gのメチル5-ブロモ-2-メチル-3-(オキサン-4-イルアミノ)ベンゾエートを使用して、3.40gの所望の生成物を黄色の固体として得た(70.39%収率)。LC/MS:C16H22BrNO3に対する質量計算値:355.07、実測値:356.25、358.25[M+H、M+2+H]+。
手順は、メチル5-ブロモ-2-メチル-3-(オキサン-4-イルアミノ)ベンゾエートと同じであったが、反応時間は48.0時間であった。4.45gのメチル5-ブロモ-2-メチル-3-(オキサン-4-イルアミノ)ベンゾエートを使用して、3.40gの所望の生成物を黄色の固体として得た(70.39%収率)。LC/MS:C16H22BrNO3に対する質量計算値:355.07、実測値:356.25、358.25[M+H、M+2+H]+。
ステップ3:5-ブロモ-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチル安息香酸の合成
EtOH(40.00mL)中のメチル5-ブロモ-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチルベンゾエート(3.40g、9.54mmol、1.00当量)の溶液に、10%NaOH水性(19.09mL、38.18mmol、4.00当量)を加えた。得られた混合物を80℃で1.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(40mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化し、反応混合物をEA(3x40mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x20mL)及びNaCl(1x20mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。5-ブロモ-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチル安息香酸(3.20g、97.98%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C15H20BrNO3対する質量計算値:341.06、実測値:342.25、344.25[M+H、M+2+H]+。
EtOH(40.00mL)中のメチル5-ブロモ-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチルベンゾエート(3.40g、9.54mmol、1.00当量)の溶液に、10%NaOH水性(19.09mL、38.18mmol、4.00当量)を加えた。得られた混合物を80℃で1.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(40mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化し、反応混合物をEA(3x40mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x20mL)及びNaCl(1x20mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。5-ブロモ-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチル安息香酸(3.20g、97.98%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C15H20BrNO3対する質量計算値:341.06、実測値:342.25、344.25[M+H、M+2+H]+。
ステップ4:5-ブロモ-N-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチルベンズアミドの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}アセトアミド)アセトアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-32-102)と同じであった。3.00gの5-ブロモ-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチル安息香酸を使用して、4.00gの所望の生成物を白色の固体として得た(95.78%収率)。LC/MS:C23H30BrN3O3対する質量計算値:475.14、実測値:476.30、478.30[M+H、M+2+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[2-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}アセトアミド)アセトアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-32-102)と同じであった。3.00gの5-ブロモ-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチル安息香酸を使用して、4.00gの所望の生成物を白色の固体として得た(95.78%収率)。LC/MS:C23H30BrN3O3対する質量計算値:475.14、実測値:476.30、478.30[M+H、M+2+H]+。
ステップ5:tert-ブチル4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-カルボキシレートの合成
1,4-ジオキサン(32.00mL)及びH2O(8.00mL)中の5-ブロモ-N-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチルベンズアミド(3.80g、7.98mmol、1.00当量)の溶液に、tert-ブチル4-{[4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェニル]メチル}ピペラジン-1-カルボキシレート(3.21g、7.98mmol、1.00当量)、Na2CO3(2.54g、23.93mmol、3.00当量)、Pd(PPh3)4(0.92g、0.80mmol、0.10当量)を得た。次いで、反応物をN2雰囲気下、100℃で2.0時間撹拌した。反応物を水(40mL)でクエンチした。得られた混合物を酢酸エチル(3x40)で抽出した。有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~20%DCM/MeOH)により精製して、tert-ブチル4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-カルボキシラート(5.20g、97.03%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C39H53N5O5に対する質量計算値:671.40、実測値:672.45[M+H]+。
1,4-ジオキサン(32.00mL)及びH2O(8.00mL)中の5-ブロモ-N-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-3-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-2-メチルベンズアミド(3.80g、7.98mmol、1.00当量)の溶液に、tert-ブチル4-{[4-(4,4,5,5-テトラメチル-1,3,2-ジオキサボロラン-2-イル)フェニル]メチル}ピペラジン-1-カルボキシレート(3.21g、7.98mmol、1.00当量)、Na2CO3(2.54g、23.93mmol、3.00当量)、Pd(PPh3)4(0.92g、0.80mmol、0.10当量)を得た。次いで、反応物をN2雰囲気下、100℃で2.0時間撹拌した。反応物を水(40mL)でクエンチした。得られた混合物を酢酸エチル(3x40)で抽出した。有機層を合わせ、無水硫酸ナトリウムで乾燥させ、濾過し、濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~20%DCM/MeOH)により精製して、tert-ブチル4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-カルボキシラート(5.20g、97.03%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C39H53N5O5に対する質量計算値:671.40、実測値:672.45[M+H]+。
ステップ6:N-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-5-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4-メチル-4’-(ピペラジン-1-イルメチル)-[1,1’-ビフェニル]-3-カルボキサミドの合成
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-5-(モルホリン-4-イル)ペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-50-6)と同じであった。300.00mgのtert-ブチル4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、250.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C34H45N5O3に対する質量計算値:571.35、実測値:572.65[M+H]+。
手順は、メチル(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-アミノ-5-(モルホリン-4-イル)ペンタンアミド]-6-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパノエート(INT-50-6)と同じであった。300.00mgのtert-ブチル4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、250.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C34H45N5O3に対する質量計算値:571.35、実測値:572.65[M+H]+。
実施例23.1-[7-ヒドロキシ-1-(2-メタンスルホニルフェニル)インドリジン-3-イル]エタノン(INT-053)の合成
ステップ1:4-メトキシ-1-(2-オキソプロピル)ピリジン-1-イウムクロリドの合成
4-メトキシピリジン(1.20g、11.00mmol、1.00当量)、及びトナイト(5.09g、54.98mmol、5.00当量)をEA(20.00mL)に溶解した。得られた混合物を80℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮して、4-メトキシ-1-(2-オキソプロピル)ピリジン-1-イウムクロリド(2.20g、粗製)を褐色の油として得た。LC/MS:C9H12ClNO2に対する質量計算値:201.05、実測値:166.10[M-Cl]+。
4-メトキシピリジン(1.20g、11.00mmol、1.00当量)、及びトナイト(5.09g、54.98mmol、5.00当量)をEA(20.00mL)に溶解した。得られた混合物を80℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮して、4-メトキシ-1-(2-オキソプロピル)ピリジン-1-イウムクロリド(2.20g、粗製)を褐色の油として得た。LC/MS:C9H12ClNO2に対する質量計算値:201.05、実測値:166.10[M-Cl]+。
ステップ2:メチル3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボキシレートの合成
トルエン(30.00mL)中の4-メトキシ-1-(2-オキソプロピル)ピリジン-1-イウムクロリド(2.80g、13.89mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、メチルアクリレート(11.95g、138.85mmol、10.00当量)、Et3N(2.11g、20.83mmol、1.50当量)、及びMnO2(9.66g、111.08mmol、8.00当量)を加え、得られた混合物を90℃で1.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEA(3x8mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、PE及びEA(PE:EA=4:1)で溶出した。画分を合わせ、濃縮して、メチル3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボキシレート(2.00g、52.43%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C13H13NO4に対する質量計算値:247.08、実測値:248.10[M+H]+。
トルエン(30.00mL)中の4-メトキシ-1-(2-オキソプロピル)ピリジン-1-イウムクロリド(2.80g、13.89mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、メチルアクリレート(11.95g、138.85mmol、10.00当量)、Et3N(2.11g、20.83mmol、1.50当量)、及びMnO2(9.66g、111.08mmol、8.00当量)を加え、得られた混合物を90℃で1.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEA(3x8mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮し、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製して、PE及びEA(PE:EA=4:1)で溶出した。画分を合わせ、濃縮して、メチル3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボキシレート(2.00g、52.43%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C13H13NO4に対する質量計算値:247.08、実測値:248.10[M+H]+。
ステップ3:3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボン酸の合成
MeOH(20.00mL)及びTHF(20.00mL)中のメチル3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボキシレート(1.90g、7.69mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaOH(2M、38.42mL、10.00当量)を加えた。得られた混合物を80℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(15mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~4に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させ、3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボン酸(1.00g、52.45%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C12H11NO4に対する質量計算値:233.06、実測値:234.25[M+H]+。
MeOH(20.00mL)及びTHF(20.00mL)中のメチル3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボキシレート(1.90g、7.69mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaOH(2M、38.42mL、10.00当量)を加えた。得られた混合物を80℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(15mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~4に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x10mL)で洗浄し、真空下で乾燥させ、3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボン酸(1.00g、52.45%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C12H11NO4に対する質量計算値:233.06、実測値:234.25[M+H]+。
ステップ4:1-(1-ブロモ-7-メトキシインドリジン-3-イル)エタノンの合成
ジメチルホルムアミド(8.00mL)中の3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボン酸(1.00g、4.29mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaHCO3(1.08g、12.86mmol、3.00当量)、及びNBS(0.84g、4.72mmol、1.10当量)を0℃で加え、得られた混合物を室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を水(200mL)に注ぎ、EA(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をH2O(3×150mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮して、1-(1-ブロモ-7-メトキシインドリジン-3-イル)エタノン(950.00mg、78.51%収率)を暗緑色の固体として得た。LC/MS:C11H10BrNO2に対する質量計算値:266.98、実測値:268.00、27.00[M+H、M+2+H]+。
ジメチルホルムアミド(8.00mL)中の3-アセチル-7-メトキシインドリジン-1-カルボン酸(1.00g、4.29mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaHCO3(1.08g、12.86mmol、3.00当量)、及びNBS(0.84g、4.72mmol、1.10当量)を0℃で加え、得られた混合物を室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を水(200mL)に注ぎ、EA(3×100mL)で抽出した。合わせた有機層をH2O(3×150mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮して、1-(1-ブロモ-7-メトキシインドリジン-3-イル)エタノン(950.00mg、78.51%収率)を暗緑色の固体として得た。LC/MS:C11H10BrNO2に対する質量計算値:266.98、実測値:268.00、27.00[M+H、M+2+H]+。
ステップ5:1-[1-(2-メタンスルホニルフェニル)-7-メトキシインドリジン-3-イル]エタノンの合成
窒素ガスを、ジオキサン(8.00mL)及びH2O(1.00mL)(ジオキサン及びH2Oの体積比=8:1)中の1-(1-ブロモ-7-メトキシインドリジン-3-イル)エタノン(900.00mg、3.36mmol、1.00当量)、2-メタンスルホニルフェニルボロン酸(1342.87mg、6.71mmol、2.00当量)、1,1’-ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン-パラジウム(II)ジクロリド ジクロロメタン錯体(191.42mg、0.24mmol、0.07当量)、及びK2CO3(1391.80mg、10.07mmol、3.00当量)の混合物を通してバブリングした。得られた混合物を密封管中でマイクロ波条件下で加熱した(120℃、30分間)。得られた混合物をEA(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層をH2O(3×15mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE及びEA(PE:EA=2:1)で溶出した。画分を合わせ、濃縮して、1-[1-(2-メタンスルホニルフェニル)-7-メトキシインドリジン-3-イル]エタノン(540.00mg、42.16%収率)を褐色の固体として得た。LC/MS:C18H17NO4Sに対する質量計算値:343.08、実測値:343.95[M+H]+。
窒素ガスを、ジオキサン(8.00mL)及びH2O(1.00mL)(ジオキサン及びH2Oの体積比=8:1)中の1-(1-ブロモ-7-メトキシインドリジン-3-イル)エタノン(900.00mg、3.36mmol、1.00当量)、2-メタンスルホニルフェニルボロン酸(1342.87mg、6.71mmol、2.00当量)、1,1’-ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン-パラジウム(II)ジクロリド ジクロロメタン錯体(191.42mg、0.24mmol、0.07当量)、及びK2CO3(1391.80mg、10.07mmol、3.00当量)の混合物を通してバブリングした。得られた混合物を密封管中でマイクロ波条件下で加熱した(120℃、30分間)。得られた混合物をEA(2×10mL)で抽出した。合わせた有機層をH2O(3×15mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。粗生成物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE及びEA(PE:EA=2:1)で溶出した。画分を合わせ、濃縮して、1-[1-(2-メタンスルホニルフェニル)-7-メトキシインドリジン-3-イル]エタノン(540.00mg、42.16%収率)を褐色の固体として得た。LC/MS:C18H17NO4Sに対する質量計算値:343.08、実測値:343.95[M+H]+。
ステップ6:1-[7-ヒドロキシ-1-(2-メタンスルホニルフェニル)インドリジン-3-イル]エタノンの合成
DMF(3.00mL)中の1-[1-(2-メタンスルホニルフェニル)-7-メトキシインドリジン-3-イル]エタノン(200.00mg、0.58mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ヨードシクロヘキサン(1223.39mg、5.82mmol、10.00当量)を加えて、得られた混合物にマイクロ波を180℃で5.0時間照射した。得られた混合物を水(100mL)に注ぎ、EA(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×150mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮して、1-[7-ヒドロキシ-1-(2-メタンスルホニルフェニル)インドリジン-3-イル]エタノン(200.00mg、粗製)を暗緑色の油として得た。LC/MS:C17H15NO4Sに対する質量計算値:329.07、実測値:330.10[M+H]+。
DMF(3.00mL)中の1-[1-(2-メタンスルホニルフェニル)-7-メトキシインドリジン-3-イル]エタノン(200.00mg、0.58mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ヨードシクロヘキサン(1223.39mg、5.82mmol、10.00当量)を加えて、得られた混合物にマイクロ波を180℃で5.0時間照射した。得られた混合物を水(100mL)に注ぎ、EA(2×100mL)で抽出した。合わせた有機層を水(3×150mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮して、1-[7-ヒドロキシ-1-(2-メタンスルホニルフェニル)インドリジン-3-イル]エタノン(200.00mg、粗製)を暗緑色の油として得た。LC/MS:C17H15NO4Sに対する質量計算値:329.07、実測値:330.10[M+H]+。
実施例24.4-[2-ホルミル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(INT-054)の合成
ステップ1:1-メチル-4-(トリブチルスタンニル)ピラゾールの合成
THF(200.00mL)中の4-ブロモ-1-メチルピラゾール(5.00g、31.06mmol、1.00当量)の溶液に、ヘキサン中のn-BuLi(2.5M、12.50mL、132.70mmol、4.27当量)を-20℃で滴下して加え、混合物を-20℃~-10℃で0.5時間撹拌し、続いてスズ-Sn(8087.10mg、24.85mmol、0.80当量)を滴下して加えた。0.5時間後、反応混合物を飽和NH4Cl(水性)でクエンチし、残留物をEA(3×300mL)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH=10:1で溶出して、1-メチル-4-(トリブチルスタンニル)ピラゾール(1.20g、10.41%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C16H32N2Snに対する質量計算値:372.16、実測値:373.20[M+H]+。
THF(200.00mL)中の4-ブロモ-1-メチルピラゾール(5.00g、31.06mmol、1.00当量)の溶液に、ヘキサン中のn-BuLi(2.5M、12.50mL、132.70mmol、4.27当量)を-20℃で滴下して加え、混合物を-20℃~-10℃で0.5時間撹拌し、続いてスズ-Sn(8087.10mg、24.85mmol、0.80当量)を滴下して加えた。0.5時間後、反応混合物を飽和NH4Cl(水性)でクエンチし、残留物をEA(3×300mL)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH=10:1で溶出して、1-メチル-4-(トリブチルスタンニル)ピラゾール(1.20g、10.41%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C16H32N2Snに対する質量計算値:372.16、実測値:373.20[M+H]+。
ステップ2:4-[(1E)-{[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミノ}メチル]ベンゾニトリルの合成
EtOH(50.00mL)中の4-ホルミルベンゾニトリル(3.20g、24.40mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エタンアミン(3.05g、24.40mmol、1.00当量)、及びAcOH(4.19mL、73.12mmol、3.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を80℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。4-[(1E)-{[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミノ}メチル]ベンゾニトリル(5.80g、粗製)を黄色の油として得た。LC/MS:C14H14N4に対する質量計算値:238.12、実測値:239.15[M+H]+。
EtOH(50.00mL)中の4-ホルミルベンゾニトリル(3.20g、24.40mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エタンアミン(3.05g、24.40mmol、1.00当量)、及びAcOH(4.19mL、73.12mmol、3.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を80℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。4-[(1E)-{[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミノ}メチル]ベンゾニトリル(5.80g、粗製)を黄色の油として得た。LC/MS:C14H14N4に対する質量計算値:238.12、実測値:239.15[M+H]+。
ステップ3:4-{3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリルの合成
DMF(200.00mL)中の4-[(1E)-{[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミノ}メチル]ベンゾニトリル(5.80g、24.34mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、K2CO3(6.73g、48.68mmol、2.00当量)、及び{[(4-メチルベンゼンスルホニル)メチル]イミノ}メタニド(7.13g、36.51mmol、1.50当量)を室温で加えた。得られた混合物を95℃で17.0時間撹拌した。室温まで冷却した後、反応混合物を水(600mL)に注いだ。反応混合物をEA(3x200mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x200mL)及びNaCl(1x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~10%メタノール/ジクロロメタン)により精製して、4-{3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリル(6.10g、90.37%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C16H15N5に対する質量計算値:277.13、実測値:278.30[M+H]+。
DMF(200.00mL)中の4-[(1E)-{[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミノ}メチル]ベンゾニトリル(5.80g、24.34mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、K2CO3(6.73g、48.68mmol、2.00当量)、及び{[(4-メチルベンゼンスルホニル)メチル]イミノ}メタニド(7.13g、36.51mmol、1.50当量)を室温で加えた。得られた混合物を95℃で17.0時間撹拌した。室温まで冷却した後、反応混合物を水(600mL)に注いだ。反応混合物をEA(3x200mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x200mL)及びNaCl(1x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~10%メタノール/ジクロロメタン)により精製して、4-{3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリル(6.10g、90.37%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C16H15N5に対する質量計算値:277.13、実測値:278.30[M+H]+。
ステップ4:4-{5-ブロモ-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリルの合成
DMF(100.00mL)中4-{3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリル(6.10g、22.00mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、1,3-ジブロモ-5,5-ジメチルイミダゾリジン-2,4-ジオン(3.14g、11.00mmol、0.50当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を0℃で3.0時間撹拌した。反応混合物を水(300mL)に注いだ。反応混合物をEA(3x200mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x200mL)及びNaCl(1x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~10%メタノール/ジクロロメタン)により精製して、4-{5-ブロモ-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリル(4.30g、54.88%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C16H14BrN5に対する質量計算値:355.04、実測値:356.20、358.20[M+H、M+2+H]+。
DMF(100.00mL)中4-{3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリル(6.10g、22.00mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、1,3-ジブロモ-5,5-ジメチルイミダゾリジン-2,4-ジオン(3.14g、11.00mmol、0.50当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を0℃で3.0時間撹拌した。反応混合物を水(300mL)に注いだ。反応混合物をEA(3x200mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x200mL)及びNaCl(1x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~10%メタノール/ジクロロメタン)により精製して、4-{5-ブロモ-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリル(4.30g、54.88%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C16H14BrN5に対する質量計算値:355.04、実測値:356.20、358.20[M+H、M+2+H]+。
ステップ5:4-[5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリルの合成
ジオキサン(8.00mL)中の4-{5-ブロモ-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリル(500.00mg、1.40mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、1-メチル-4-(トリブチルスタンニル)ピラゾール(781.43mg、2.11mmol、1.50当量)、Pd(PPh3)4(162.19mg、0.14mmol、0.10当量)を室温で少量ずつ加えた。最終反応混合物に、N2雰囲気下、150℃で1.5時間マイクロ波を照射した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH(10:1)で溶出して、4-[5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(270.00mg、53.82%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C20H19N7に対する質量計算値:357.17、実測値:358.20[M+H]+。
ジオキサン(8.00mL)中の4-{5-ブロモ-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル}ベンゾニトリル(500.00mg、1.40mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、1-メチル-4-(トリブチルスタンニル)ピラゾール(781.43mg、2.11mmol、1.50当量)、Pd(PPh3)4(162.19mg、0.14mmol、0.10当量)を室温で少量ずつ加えた。最終反応混合物に、N2雰囲気下、150℃で1.5時間マイクロ波を照射した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH(10:1)で溶出して、4-[5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(270.00mg、53.82%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C20H19N7に対する質量計算値:357.17、実測値:358.20[M+H]+。
ステップ6:4-[2-ブロモ-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリルの合成
CH3CN(10.00mL)中の4-[5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(270.00mg、0.76mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NBS(201.68mg、1.13mmol、1.50当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。室温まで冷却した後、反応物を減圧下で除去した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~10%メタノール/ジクロロメタン)により精製して、4-[2-ブロモ-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(210.00mg、63.71%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C20H18BrN7に対する質量計算値:435.08、実測値:436.20、438.20[M+H、M+2+H]+。
CH3CN(10.00mL)中の4-[5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(270.00mg、0.76mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NBS(201.68mg、1.13mmol、1.50当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。室温まで冷却した後、反応物を減圧下で除去した。得られた残留物をシリカゲルクロマトグラフィー(0~10%メタノール/ジクロロメタン)により精製して、4-[2-ブロモ-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(210.00mg、63.71%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C20H18BrN7に対する質量計算値:435.08、実測値:436.20、438.20[M+H、M+2+H]+。
ステップ7:4-[2-エテニル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリルの合成
DMF/H2O(7mL:1mL)中の4-[2-ブロモ-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(210.00mg、0.48mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、トリブチル(エテニル)スタンナン(228.93mg、0.72mmol、1.50当量)、Na2CO3(153.04mg、1.44mmol、3.00当量)、及びPd(PPh3)4(55.62mg、0.045mmol、0.10当量)を室温で少量ずつ加えた。最終反応混合物をN2雰囲気下、120℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH(10:1)で溶出して、4-[2-エテニル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(180.00mg、97.53%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C22H21N7に対する質量計算値:383.19、実測値:384.35[M+H]+。
DMF/H2O(7mL:1mL)中の4-[2-ブロモ-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(210.00mg、0.48mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、トリブチル(エテニル)スタンナン(228.93mg、0.72mmol、1.50当量)、Na2CO3(153.04mg、1.44mmol、3.00当量)、及びPd(PPh3)4(55.62mg、0.045mmol、0.10当量)を室温で少量ずつ加えた。最終反応混合物をN2雰囲気下、120℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH(10:1)で溶出して、4-[2-エテニル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(180.00mg、97.53%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C22H21N7に対する質量計算値:383.19、実測値:384.35[M+H]+。
ステップ8:4-[2-ホルミル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリルの合成
ジオキサン/H2O(2mL:2mL)中の4-[2-エテニル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(330.00mg、0.86mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、OsO4(21.88mg、0.09mmol、0.10当量)、2,6-ジメチルピリジン(184.43mg、1.72mmol、2.00当量)、及びNaIO4(368.14mg、1.72mmol、2.00当量)を室温で少量ずつ加えた。最終反応混合物を室温で2.0時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2SO3(水性)でクエンチし、残留物をEA(3×50mL)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH=10:1で溶出して、4-[2-ホルミル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(310.00mg、93.46%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C21H19N7Oに対する質量計算値:385.17、実測値:386.35[M+H]+。
ジオキサン/H2O(2mL:2mL)中の4-[2-エテニル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(330.00mg、0.86mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、OsO4(21.88mg、0.09mmol、0.10当量)、2,6-ジメチルピリジン(184.43mg、1.72mmol、2.00当量)、及びNaIO4(368.14mg、1.72mmol、2.00当量)を室温で少量ずつ加えた。最終反応混合物を室温で2.0時間撹拌した。反応混合物を飽和Na2SO3(水性)でクエンチし、残留物をEA(3×50mL)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、DCM/MeOH=10:1で溶出して、4-[2-ホルミル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(310.00mg、93.46%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C21H19N7Oに対する質量計算値:385.17、実測値:386.35[M+H]+。
代表的なポリアミドの合成
実施例25.PA-003の合成
実施例25.PA-003の合成
ステップ1:エチル4-アミノ-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT60-022-100)の合成
EtOH(120.00mL)及びEA(120.00mL)中のエチル1-メチル-4-ニトロイミダゾール-2-カルボキシレート(30.00g、150.63mmol、1.00当量)の溶液に、Pd/C(8.01g、27%w/w)を加えた。次いで、反応物をH2雰囲気下、室温で17.0時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を濃縮して、エチル4-アミノ-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(22.30g、75.20%)を黄色の固体として得た。LC/MS:C7H11N3O2に対する質量計算値:169.09、実測値:170.10[M+H]+。
EtOH(120.00mL)及びEA(120.00mL)中のエチル1-メチル-4-ニトロイミダゾール-2-カルボキシレート(30.00g、150.63mmol、1.00当量)の溶液に、Pd/C(8.01g、27%w/w)を加えた。次いで、反応物をH2雰囲気下、室温で17.0時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を濃縮して、エチル4-アミノ-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(22.30g、75.20%)を黄色の固体として得た。LC/MS:C7H11N3O2に対する質量計算値:169.09、実測値:170.10[M+H]+。
ステップ2:エチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT60-017-10)の合成
500mLフラスコに、3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパン酸(22.45g、118.65mmol、0.90当量)、DMF(180.00mL)を加えた。混合物を0℃に冷却し、次いでHATU(75.18g、197.71mmol、1.50当量)及びDIEA(51.11g、395.43mmol、3.00当量)を加え、混合物を10分間撹拌し、次いでエチル4-アミノ-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(22.30g、131.81mmol、1.00当量)を少量ずつ加えた。反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応を氷水(600mL)でクエンチし、溶液を15分間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、エチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(34.50g、76.90%)を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C15H24N4O5に対する質量計算値:340.17、実測値:341.20[M+H]+。
500mLフラスコに、3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパン酸(22.45g、118.65mmol、0.90当量)、DMF(180.00mL)を加えた。混合物を0℃に冷却し、次いでHATU(75.18g、197.71mmol、1.50当量)及びDIEA(51.11g、395.43mmol、3.00当量)を加え、混合物を10分間撹拌し、次いでエチル4-アミノ-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(22.30g、131.81mmol、1.00当量)を少量ずつ加えた。反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応を氷水(600mL)でクエンチし、溶液を15分間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、エチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(34.50g、76.90%)を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C15H24N4O5に対する質量計算値:340.17、実測値:341.20[M+H]+。
ステップ3:4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)の合成
MeOH(200.00mL)中のエチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]1メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(34.50g、101.36mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、LiOH溶液(2M、202mL、4.00当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を45℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(50mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x30mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(30.00g、94.77%)を白色の固体として得た。LC/MS:C13H20N4O5に対する質量計算値:312.14、実測値:313.15[M+H]+。
MeOH(200.00mL)中のエチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]1メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(34.50g、101.36mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、LiOH溶液(2M、202mL、4.00当量)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を45℃で2.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(50mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x30mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(30.00g、94.77%)を白色の固体として得た。LC/MS:C13H20N4O5に対する質量計算値:312.14、実測値:313.15[M+H]+。
ステップ4:メチル4-(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(INT60-022-200)の合成
CH3CN(150.00mL)中の4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(16.00g、51.23mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、TCFH(21.56g、76.84mmol、1.50当量)、NMI(12.62g、153.69mmol、3.00当量)、及びメチル4-アミノ-1-メチルピロール-2-カルボキシレートハイドロクロライド(10.74g、56.34mmol、1.10当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を室温で2.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、CH3CN(3x20mL)により洗浄し、真空下で乾燥させた。メチル4-(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(19.00g、82.70%)を白色の固体として得た。LC/MS:C20H28N6O6に対する質量計算値:448.21、実測値:449.25[M+H]+。
CH3CN(150.00mL)中の4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(16.00g、51.23mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、TCFH(21.56g、76.84mmol、1.50当量)、NMI(12.62g、153.69mmol、3.00当量)、及びメチル4-アミノ-1-メチルピロール-2-カルボキシレートハイドロクロライド(10.74g、56.34mmol、1.10当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を室温で2.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、CH3CN(3x20mL)により洗浄し、真空下で乾燥させた。メチル4-(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(19.00g、82.70%)を白色の固体として得た。LC/MS:C20H28N6O6に対する質量計算値:448.21、実測値:449.25[M+H]+。
ステップ5:メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボキシレートハイドロクロライド(INT60-022-201)の合成
HCl/1,4-ジオキサン(4M、200.00mL)中のメチル4-(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(19.00g、42.37mmol、1.00当量)の溶液を室温で2時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボンハイドロクロライド(19.00g粗製)を黄色の固体として得た。LC/MS:C15H21ClN6O4に対する質量計算値:348.15、実測値:349.05[M+H]+。
HCl/1,4-ジオキサン(4M、200.00mL)中のメチル4-(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(19.00g、42.37mmol、1.00当量)の溶液を室温で2時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボンハイドロクロライド(19.00g粗製)を黄色の固体として得た。LC/MS:C15H21ClN6O4に対する質量計算値:348.15、実測値:349.05[M+H]+。
ステップ6:エチル4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチル-1H-イミダゾール-2-カルボキシレート(INT60-017-11)の合成
手順は、メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボンハイドロクロライド(INT60-017-11)と同じであった。2.00gのエチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、2.00gの粗製の所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た。LC/MS:C10H16N4O3に対する質量計算値:240.12、実測値:241.10[M+H]+。
手順は、メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボンハイドロクロライド(INT60-017-11)と同じであった。2.00gのエチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、2.00gの粗製の所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た。LC/MS:C10H16N4O3に対する質量計算値:240.12、実測値:241.10[M+H]+。
ステップ7:メチル1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボキシレート(INT60-022-202)の合成
CH3CN(20.00mL)中の1-メチルピロール-2-カルボン酸(600.00mg、4.80mmol、1.00当量)の溶液に、NMI(1.22g、14.87mmol、3.10当量)、TCFH(1.48g、5.28mmol、1.10当量)、及びメチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(2004.53mg、5.75mmol、1.20当量)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。溶媒を除去し、残留物を以下の条件下で逆相カラムにより精製した:カラム、C18カラム、MeCN/水(0.05%TFA)、100分間で5%~50%勾配;検出器、254nm。画分を合わせて濃縮した。1.30gの所望の生成物を白色の固体として得た(56%収率)。LC/MS:C21H25N7O5に対する質量計算値:455.19、実測値:456.30[M+H]+。
CH3CN(20.00mL)中の1-メチルピロール-2-カルボン酸(600.00mg、4.80mmol、1.00当量)の溶液に、NMI(1.22g、14.87mmol、3.10当量)、TCFH(1.48g、5.28mmol、1.10当量)、及びメチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(2004.53mg、5.75mmol、1.20当量)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。溶媒を除去し、残留物を以下の条件下で逆相カラムにより精製した:カラム、C18カラム、MeCN/水(0.05%TFA)、100分間で5%~50%勾配;検出器、254nm。画分を合わせて濃縮した。1.30gの所望の生成物を白色の固体として得た(56%収率)。LC/MS:C21H25N7O5に対する質量計算値:455.19、実測値:456.30[M+H]+。
ステップ8:1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボン酸(INT60-022-203)の合成
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。2.00gのメチル1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボキシレートを使用して、1.90gの所望の生成物を白色の固体として得た(92.00%収率)。LC/MS:C20H23N7O5に対する質量計算値:441.18、実測値:442.25[M+H]+。
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。2.00gのメチル1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボキシレートを使用して、1.90gの所望の生成物を白色の固体として得た(92.00%収率)。LC/MS:C20H23N7O5に対する質量計算値:441.18、実測値:442.25[M+H]+。
ステップ9:メチル1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボキシレート(INT60-022-204)の合成
手順は、メチル4-(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(INT60-022-200)と同じであったが、濾液を濃縮し、逆相カラムにより精製した。1.90gの1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボン酸を使用して、2.70gの所望の生成物を白色の固体として得た(71.00%収率)。LC/MS:C35H41N13O8に対する質量計算値:771.32、実測値:772.35[M+H]+。
手順は、メチル4-(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(INT60-022-200)と同じであったが、濾液を濃縮し、逆相カラムにより精製した。1.90gの1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボン酸を使用して、2.70gの所望の生成物を白色の固体として得た(71.00%収率)。LC/MS:C35H41N13O8に対する質量計算値:771.32、実測値:772.35[M+H]+。
ステップ10:1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-1-メチル-4-[1-methyl-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボン酸(INT60-022-205)の合成
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。2.70gのメチル1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボキシレートを使用して、2.80gの所望の生成物を白色の固体として得た。(78.00%収率)。LC/MS:C34H39N13O8に対する質量計算値:757.30、実測値:758.50[M+H]+。
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。2.70gのメチル1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボキシレートを使用して、2.80gの所望の生成物を白色の固体として得た。(78.00%収率)。LC/MS:C34H39N13O8に対する質量計算値:757.30、実測値:758.50[M+H]+。
ステップ11:エチル1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT60-022-206)の合成
DMF(25.00mL)中の1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボン酸(2.90g、3.83mmol、1.00当量)の溶液に、NMI(3.20g、39.04mmol、10.20当量)、TCFH(1.18g、4.21mmol、1.10当量)、及びエチル4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(1.16g、4.21mmol、1.10当量)を加えた。次いで、反応物を室温で3.0時間撹拌した。混合物を氷水に注ぎ、固体を濾過し、次いでそれをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH=10:1)により精製した。2.5gの所望の生成物を、白色の固体として得た(66.00%収率)。LC/MS:C44H53N17O10に対する質量計算値:979.42、実測値:980.80[M+H]+。
DMF(25.00mL)中の1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボン酸(2.90g、3.83mmol、1.00当量)の溶液に、NMI(3.20g、39.04mmol、10.20当量)、TCFH(1.18g、4.21mmol、1.10当量)、及びエチル4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(1.16g、4.21mmol、1.10当量)を加えた。次いで、反応物を室温で3.0時間撹拌した。混合物を氷水に注ぎ、固体を濾過し、次いでそれをシリカゲルカラムクロマトグラフィー(DCM/MeOH=10:1)により精製した。2.5gの所望の生成物を、白色の固体として得た(66.00%収率)。LC/MS:C44H53N17O10に対する質量計算値:979.42、実測値:980.80[M+H]+。
ステップ12:1-メチル-4-(3-(1-メチル-4-(1-メチル-4-(3-(1-メチル-4-(1-メチル-4-(3-(1-メチル-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボキサミド)-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボキサミド)-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボン酸(PA-003)の合成
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであったが、反応温度は40℃であり、反応時間は4.0時間であった。2.50gのエチル1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、1.90gの所望の生成物を白色の固体として観察した(78.00%収率)。LC/MS:C42H49N17O10に対する質量計算値:951.38、実測値:952.65[M+H]+。
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであったが、反応温度は40℃であり、反応時間は4.0時間であった。2.50gのエチル1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、1.90gの所望の生成物を白色の固体として観察した(78.00%収率)。LC/MS:C42H49N17O10に対する質量計算値:951.38、実測値:952.65[M+H]+。
実施例26.PA-004の合成
ステップ1:メチル3-[(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエート(INT61-025-30)の合成
1000mlのフラスコに、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(11.00g、35.22mmol、1.00当量)、DMF(300.00mL)を加え、混合物を0℃に冷却し、次いで、HATU(20.09g、52.83mmol、1.50当量)、DIEA(18.21g、140.88mmol、4.00当量)を滴下して加え、混合物を10分間撹拌し、メチル3-アミノプロパノエート(3.63g、35.22mmol、1.00当量)を少量ずつ加えた。反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応混合物を水/氷(600mL)に注ぎ、固体を濾過し、真空下で乾燥させた。水相をEA(3x200mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x200mL)及びNaCl(1x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムにより精製し、純粋なEAで溶出した。画分を合わせて濃縮した。メチル3-[(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエート(13.00g、87.95%)を黄色の固体として得た。LC/MS:C17H27N5O6に対する質量計算値:397.20、実測値:398.20[M+H]+。
1000mlのフラスコに、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(11.00g、35.22mmol、1.00当量)、DMF(300.00mL)を加え、混合物を0℃に冷却し、次いで、HATU(20.09g、52.83mmol、1.50当量)、DIEA(18.21g、140.88mmol、4.00当量)を滴下して加え、混合物を10分間撹拌し、メチル3-アミノプロパノエート(3.63g、35.22mmol、1.00当量)を少量ずつ加えた。反応物を室温で1.0時間撹拌した。反応混合物を水/氷(600mL)に注ぎ、固体を濾過し、真空下で乾燥させた。水相をEA(3x200mL)で抽出し、有機相を合わせて、H2O(1x200mL)及びNaCl(1x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムにより精製し、純粋なEAで溶出した。画分を合わせて濃縮した。メチル3-[(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエート(13.00g、87.95%)を黄色の固体として得た。LC/MS:C17H27N5O6に対する質量計算値:397.20、実測値:398.20[M+H]+。
ステップ2:メチル3-[[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-イル]ホルムアミド]プロパノエートハイドロクロライドの合成
手順は、メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボキシレートハイドロクロライド(INT60-017-11)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。11.00gのメチル3-[(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエートを使用して、11.00gの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C12H19N5O4に対する質量計算値:297.14、実測値:298.20[M+H]+。
手順は、メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボキシレートハイドロクロライド(INT60-017-11)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。11.00gのメチル3-[(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエートを使用して、11.00gの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C12H19N5O4に対する質量計算値:297.14、実測値:298.20[M+H]+。
ステップ3:メチル1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボキシレート(INT61-001-100)の合成
DMF(150.00mL)中の1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(10.00g、79.29mmol、7.00当量)の撹拌溶液に、TBTU(38.19g、118.94mmol、1.50当量)、メチル4-アミノ-1-メチルピロール-2-カルボキシレートハイドロクロライド(16.63g、87.24mmol、1.10当量)、及びDIEA(30.74g、237.88mmol、3.00当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を室温で17.0時間撹拌した。反応物を水/氷(450mL)に注いだ。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。メチル1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボキシレート(16.5g、78.37%)を白色の固体として得た。LC/MS:C12H14N4O3に対する質量計算値:262.11、実測値:263.15[M+H]+。
DMF(150.00mL)中の1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(10.00g、79.29mmol、7.00当量)の撹拌溶液に、TBTU(38.19g、118.94mmol、1.50当量)、メチル4-アミノ-1-メチルピロール-2-カルボキシレートハイドロクロライド(16.63g、87.24mmol、1.10当量)、及びDIEA(30.74g、237.88mmol、3.00当量)を0℃で少量ずつ加えた。得られた混合物を室温で17.0時間撹拌した。反応物を水/氷(450mL)に注いだ。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。メチル1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボキシレート(16.5g、78.37%)を白色の固体として得た。LC/MS:C12H14N4O3に対する質量計算値:262.11、実測値:263.15[M+H]+。
ステップ4:1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボン酸(INT61-001-101)の合成
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。16.50gのメチル1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボキシレートを使用して、12.00gの1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボン酸(76.84%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C11H12N4O3に対する質量計算値:248.09、実測値:249.10[M+H]+。
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。16.50gのメチル1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボキシレートを使用して、12.00gの1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボン酸(76.84%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C11H12N4O3に対する質量計算値:248.09、実測値:249.10[M+H]+。
ステップ5:メチル1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボキシレート(INT61-001-102)の合成
手順は、エチル3-[(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエート(INT60-017-10)と同じであった。9.00gの1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボン酸を使用して、14.00gの所望の生成物(63.54%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C26H30N10O6に対する質量計算値:578.23、実測値:579.10[M+H]+。
手順は、エチル3-[(4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエート(INT60-017-10)と同じであった。9.00gの1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-カルボン酸を使用して、14.00gの所望の生成物(63.54%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C26H30N10O6に対する質量計算値:578.23、実測値:579.10[M+H]+。
ステップ6:1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アフォルダミド]ピロール-2-カルボン酸(INT61-001-103)の合成
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。14.00gのメチル1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミドカルボキシレートを使用して、12.00gの所望の生成物(81.49%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C25H28N10O6に対する質量計算値:564.22、実測値:565.15[M+H]+。
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。14.00gのメチル1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミドカルボキシレートを使用して、12.00gの所望の生成物(81.49%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C25H28N10O6に対する質量計算値:564.22、実測値:565.15[M+H]+。
ステップ7:エチル4-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ブタンアミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-10)の合成
手順は、エチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT60-017-10)と同じであった。7.80gの4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ブタン酸を得て、11.00gの所望の生成物を小さなピンク色の固体として得た(80.70%収率)。LC/MS:C16H26N4O5に対する質量計算値:354.19、実測値:355.15[M+H]+。
手順は、エチル4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT60-017-10)と同じであった。7.80gの4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ブタン酸を得て、11.00gの所望の生成物を小さなピンク色の固体として得た(80.70%収率)。LC/MS:C16H26N4O5に対する質量計算値:354.19、実測値:355.15[M+H]+。
ステップ8:エチル4-(4-アミノブタンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-11)の合成
手順は、メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボンハイドロクロライド(INT60-017-11)と同じであった。9.40gのエチル4-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ブタンアミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、6.20gの所望の生成物を白色の固体として得た(90.89%収率)。LCMS:C11H18N4O3に対する質量計算値:254.14、実測値:255.15[M+H]+.
手順は、メチル4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボンハイドロクロライド(INT60-017-11)と同じであった。9.40gのエチル4-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ブタンアミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、6.20gの所望の生成物を白色の固体として得た(90.89%収率)。LCMS:C11H18N4O3に対する質量計算値:254.14、実測値:255.15[M+H]+.
ステップ9:エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)の合成
DMF(250.00mL)中の1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボン酸(18.20g、32.24mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DIEA(12.50g、96.71mmol、3.00当量)、エチル4-(4-アミノブタンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(9.02g、35.46mmol、1.10当量)、及びPyBOP(20.13g、38.68mmol、1.20当量)を0℃で加えた。得られた混合物を室温で1.0時間撹拌した。反応物を氷/水(800mL)に注いだ。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x200mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。24.70gのエチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレートを黄色の固体として得た(95.74%収率)。LC/MS:C36H44N14O8に対する質量計算値:800.35、実測値:801.30[M+H]+。
DMF(250.00mL)中の1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-カルボン酸(18.20g、32.24mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DIEA(12.50g、96.71mmol、3.00当量)、エチル4-(4-アミノブタンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(9.02g、35.46mmol、1.10当量)、及びPyBOP(20.13g、38.68mmol、1.20当量)を0℃で加えた。得られた混合物を室温で1.0時間撹拌した。反応物を氷/水(800mL)に注いだ。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x200mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。24.70gのエチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレートを黄色の固体として得た(95.74%収率)。LC/MS:C36H44N14O8に対する質量計算値:800.35、実測値:801.30[M+H]+。
ステップ10:1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボン酸(INT61-04-OH-13)の合成
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。24.00gのエチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、23.10gの所望の生成物を黄色の固体として得た(99.36%収率)。LC/MS:C34H40N14O8に対する質量計算値:772.32、実測値:773.30[M+H]+。
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。24.00gのエチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、23.10gの所望の生成物を黄色の固体として得た(99.36%収率)。LC/MS:C34H40N14O8に対する質量計算値:772.32、実測値:773.30[M+H]+。
ステップ11:エチル4-[4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-025-20)の合成
DMF(200.00mL)中の4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-1-メチルピロール-2-カルボン酸(11.50g、47.87mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、EDCI(22.94g、119.66mmol、2.50当量)、エチル4-アミノ-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(8.10g、47.87mmol、1.00当量)、及びDMAP(14.62g、119.66mmol、2.50当量)を0℃で加えた。得られた混合物を35℃で17.0時間撹拌した。反応後、反応物を500mLの氷/水に注いだ。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、エチル4-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(16.00g、85.48%収率)を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C18H25N5O5に対する質量計算値:391.19、実測値:392.30[M+H]+。
DMF(200.00mL)中の4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-1-メチルピロール-2-カルボン酸(11.50g、47.87mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、EDCI(22.94g、119.66mmol、2.50当量)、エチル4-アミノ-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(8.10g、47.87mmol、1.00当量)、及びDMAP(14.62g、119.66mmol、2.50当量)を0℃で加えた。得られた混合物を35℃で17.0時間撹拌した。反応後、反応物を500mLの氷/水に注いだ。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×50mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。これにより、エチル4-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(16.00g、85.48%収率)を淡黄色の固体として得た。LC/MS:C18H25N5O5に対する質量計算値:391.19、実測値:392.30[M+H]+。
ステップ12:エチル4-(4-アミノ-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-20)の合成
DCM(135.00mL)中のエチル4-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(16.00g、40.88mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、TFA(45.00mL)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物の褐色の油をEt2O(200mL)で希釈した。沈殿した固体を濾過により回収し、Et2O(2x100mL)で洗浄した。得られた固体を真空下で乾燥させた。これにより、エチル4-(4-アミノ-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(16.00g、粗製)を褐色の固体として得た。LC/MS:C13H17N5O3に対する質量計算値:291.13、実測値:292.15[M+H]+。
DCM(135.00mL)中のエチル4-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(16.00g、40.88mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、TFA(45.00mL)を室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物の褐色の油をEt2O(200mL)で希釈した。沈殿した固体を濾過により回収し、Et2O(2x100mL)で洗浄した。得られた固体を真空下で乾燥させた。これにより、エチル4-(4-アミノ-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(16.00g、粗製)を褐色の固体として得た。LC/MS:C13H17N5O3に対する質量計算値:291.13、実測値:292.15[M+H]+。
ステップ13:エチル4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-21)の合成
DMF(120.00mL)中のエチル4-(4-アミノ-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(12.00g、41.19mmol、1.00当量)、及び3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパン酸(7.50g、39.64mmol、0.96当量)、PyBOP(22.00g、42.28mmol、1.03当量)、DIEA(45.00g、348.18mmol、8.45当量)の溶液を、室温で1.0時間撹拌した。反応物を氷水(400mL)に注ぎ、混合物を15分間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×150mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。水相をEA(3×150mL)で抽出し、合わせた有機相を合わせ、H2O(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(1:8)で溶出した。合計17.00gのエチル4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを黄色の固体として得た(89.28%収率)。LC/MS:C21H30N6O6に対する質量計算値:462.22、実測値:463.35[M+H]+。
DMF(120.00mL)中のエチル4-(4-アミノ-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(12.00g、41.19mmol、1.00当量)、及び3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパン酸(7.50g、39.64mmol、0.96当量)、PyBOP(22.00g、42.28mmol、1.03当量)、DIEA(45.00g、348.18mmol、8.45当量)の溶液を、室温で1.0時間撹拌した。反応物を氷水(400mL)に注ぎ、混合物を15分間撹拌した。沈殿した固体を濾過により収集し、水(3×150mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。水相をEA(3×150mL)で抽出し、合わせた有機相を合わせ、H2O(200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。固体を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(1:8)で溶出した。合計17.00gのエチル4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを黄色の固体として得た(89.28%収率)。LC/MS:C21H30N6O6に対する質量計算値:462.22、実測値:463.35[M+H]+。
ステップ14:4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT61-04-OH-22)の合成
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。12.00gのエチル4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、10.00gの所望の生成物を白色の固体として得た(88.81%収率)。LC/MS:C19H26N6O6に対する質量計算値:434.19、実測値:435.25[M+H]+。
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。12.00gのエチル4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、10.00gの所望の生成物を白色の固体として得た(88.81%収率)。LC/MS:C19H26N6O6に対する質量計算値:434.19、実測値:435.25[M+H]+。
ステップ15:エチル3-{[4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-イル]ホルムアミド}プロパノエート(INT61-04-OH-23)の合成
DMF(120.00mL)中の4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(10.00g、23.02mmol、1.00当量)、及びβ-アラニンエチルエステルハイドロクロライド(4.90g、31.90mmol、1.39当量)、PyBOP(12.50g、24.02mmol、1.04当量)、DIEA(9.00g、69.64mmol、3.03当量)の溶液を、室温で1.0時間撹拌した。反応物を室温で水(500mL)を加えてクエンチした。得られた混合物をEtOAc(3×400mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(1:8)で溶出して、エチル3-{[4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-イル]ホルムアミド}プロパノエート(12.00g、93.80%)を黄色の固体として得た。LC/MS:C24H35N7O7に対する質量計算値:533.26、実測値:534.30[M+H]+。
DMF(120.00mL)中の4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(10.00g、23.02mmol、1.00当量)、及びβ-アラニンエチルエステルハイドロクロライド(4.90g、31.90mmol、1.39当量)、PyBOP(12.50g、24.02mmol、1.04当量)、DIEA(9.00g、69.64mmol、3.03当量)の溶液を、室温で1.0時間撹拌した。反応物を室温で水(500mL)を加えてクエンチした。得られた混合物をEtOAc(3×400mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(3x200mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(1:8)で溶出して、エチル3-{[4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-イル]ホルムアミド}プロパノエート(12.00g、93.80%)を黄色の固体として得た。LC/MS:C24H35N7O7に対する質量計算値:533.26、実測値:534.30[M+H]+。
ステップ16:エチル3-({4-[4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルイミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパノエート(INT61-04-OH-24)の合成
手順は、エチル4-(4-アミノ-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-20)と同じであった。12.00gのエチル3-{[4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-イル]ホルムアミド}プロパノエートを使用して、12.00gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C19H27N7O5に対する質量計算値:433.21、実測値:434.25[M+H]+。
手順は、エチル4-(4-アミノ-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-20)と同じであった。12.00gのエチル3-{[4-(4-{3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド}-1-メチルピロール-2-アミド)-1-メチルイミダゾール-2-イル]ホルムアミド}プロパノエートを使用して、12.00gの粗製の所望の生成物を、白色の固体として得た。LC/MS:C19H27N7O5に対する質量計算値:433.21、実測値:434.25[M+H]+。
ステップ17:エチル3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエート(INT61-004-OEt)の合成
手順は、エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)と同じであった。10.00gの1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボン酸を使用して、13.60gの所望の生成物を黄色の固体として得た(88.61%収率)。分取HPLCによる精製後、一部の純粋な生成物を淡黄色の固体として得た。HRMS:C53H65N21O12に対する質量計算値:1187.5122、実測値:1188.5153[M+H]+。
手順は、エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)と同じであった。10.00gの1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボン酸を使用して、13.60gの所望の生成物を黄色の固体として得た(88.61%収率)。分取HPLCによる精製後、一部の純粋な生成物を淡黄色の固体として得た。HRMS:C53H65N21O12に対する質量計算値:1187.5122、実測値:1188.5153[M+H]+。
ステップ18:3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸(PA-004-OH)の合成
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであったが、反応温度は35℃であった。10.60gのエチル3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエートを使用して、10.00gの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C51H61N21O12に対する質量計算値:1159.48、実測値:581.25[M/2+H]+。
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであったが、反応温度は35℃であった。10.60gのエチル3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパノエートを使用して、10.00gの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C51H61N21O12に対する質量計算値:1159.48、実測値:581.25[M/2+H]+。
実施例27.PA-023の合成
ステップ1:エチル1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキシレート(INT81-023-4)の合成
手順は、エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。1.50gのエチル4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、2.00gの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(68.09%収率)。LC/MS:C21H26N8O5に対する質量計算値:470.20、実測値:471.40[M+H]+。
手順は、エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。1.50gのエチル4-(3-アミノプロパンアミド)-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、2.00gの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(68.09%収率)。LC/MS:C21H26N8O5に対する質量計算値:470.20、実測値:471.40[M+H]+。
ステップ2:1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボン酸(INT81-023-5)の合成
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000))と同じであったが、反応温度は室温(r.t.)であり、反応時間は2.0時間であった。2.00gのエチル1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、1.80gの1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボン酸をオフホワイトの固体として得た(95.71%収率)。LC/MS:C19H22N8O5に対する質量計算値:442.17、実測値:443.10[M+H]+。
手順は、4-[3-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000))と同じであったが、反応温度は室温(r.t.)であり、反応時間は2.0時間であった。2.00gのエチル1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、1.80gの1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボン酸をオフホワイトの固体として得た(95.71%収率)。LC/MS:C19H22N8O5に対する質量計算値:442.17、実測値:443.10[M+H]+。
ステップ3:エチル4-{4-[(2S)-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(INT81-023-6)の合成
手順は、エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。1.60gのエチル4-{4-[(2S)-4-アミノ-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、1.90gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(70.20%収率)。LC/MS:C51H55N15O10に対する質量計算値:1037.43、実測値:1038.45[M+H]+。
手順は、エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。1.60gのエチル4-{4-[(2S)-4-アミノ-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレートを使用して、1.90gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(70.20%収率)。LC/MS:C51H55N15O10に対する質量計算値:1037.43、実測値:1038.45[M+H]+。
ステップ4:4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボン酸(INT81-023-7)の合成
MeOH(5.00mL)、THF(15.00mL)、及びH2O(18.30mL)中のエチル4-{4-[(2S)-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(1.90g、1.83mmol、1.00当量)、及びLiOH(0.22g、9.15mmol、5.00当量)の混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を更に精製することなく次のステップで直接使用した。LC/MS:C34H41N15O8に対する質量計算値:787.33、実測値:788.40[M+H]+。
MeOH(5.00mL)、THF(15.00mL)、及びH2O(18.30mL)中のエチル4-{4-[(2S)-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキシレート(1.90g、1.83mmol、1.00当量)、及びLiOH(0.22g、9.15mmol、5.00当量)の混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を更に精製することなく次のステップで直接使用した。LC/MS:C34H41N15O8に対する質量計算値:787.33、実測値:788.40[M+H]+。
ステップ5:4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT81-023-8)の合成
MeOH/THF/H2O(5.00mL/15.00mL/18.30mL)中の4-{4-[(2S)-2-アミノ-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(1.40g、1.78mmol、1.00当量)の混合物に、ジ-tert-ブチルジカーボネート(0.78g、3.55mmol、2.00当量)、及びDMAP(0.02g、0.18mmol、0.10当量)を加えた。反応物を室温で3.0時間撹拌した。混合物にH2O(30mL)を加えた。混合物をセライトパッドを通して濾過し、固体を酢酸エチル(3x30mL)で洗浄して、4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(1.20g、76.05%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C39H49N15O10に対する質量計算値:887.38、実測値:888.45[M+H]+。
MeOH/THF/H2O(5.00mL/15.00mL/18.30mL)中の4-{4-[(2S)-2-アミノ-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(1.40g、1.78mmol、1.00当量)の混合物に、ジ-tert-ブチルジカーボネート(0.78g、3.55mmol、2.00当量)、及びDMAP(0.02g、0.18mmol、0.10当量)を加えた。反応物を室温で3.0時間撹拌した。混合物にH2O(30mL)を加えた。混合物をセライトパッドを通して濾過し、固体を酢酸エチル(3x30mL)で洗浄して、4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(1.20g、76.05%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C39H49N15O10に対する質量計算値:887.38、実測値:888.45[M+H]+。
ステップ6:メチル4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボキシレート(INT81-023-9)の合成
手順は、エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。1.20gの4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸を使用して、1.10gの所望の生成物を黄色の固体として得た(71.01%収率)。LC/MS:C52H63N19O12に対する質量計算値:1145.49、実測値:1146.50[M+H]+。
手順は、エチル1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-カルボキシレート(INT61-04-OH-12)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。1.20gの4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸を使用して、1.10gの所望の生成物を黄色の固体として得た(71.01%収率)。LC/MS:C52H63N19O12に対する質量計算値:1145.49、実測値:1146.50[M+H]+。
ステップ7:4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボン酸(PA-023)の合成
手順は、4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-アミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボン酸(INT60-022-0)と同じであった。1.00gのメチル4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]formamido}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボキシレートを使用して、400.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(39.16%収率)。LC/MS:C51H61N19O12に対する質量計算値:1131.47、実測値:1132.65[M+H]+
手順は、4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-アミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボン酸(INT60-022-0)と同じであった。1.00gのメチル4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]formamido}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボキシレートを使用して、400.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(39.16%収率)。LC/MS:C51H61N19O12に対する質量計算値:1131.47、実測値:1132.65[M+H]+
代表的な化合物の合成
実施例28.化合物1の合成
実施例28.化合物1の合成
ステップ1:tert-ブチルN-(17-[4-[(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(INT91-010-50)の合成
DMF(1.50mL)中tert-ブチルN-(17-ブロモ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(100.00mg、0.22mmol、1.00当量)の溶液に、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(89.92mg、0.24mmol、1.05当量)、及びK2CO3(93.31mmol、0.68mmol、3.00当量)を加えた。次いで、反応物を室温で3.0日間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を以下の条件下で逆相カラムで精製した:カラム、C18カラム;移動相、水中MeCN、40分間で5%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせ、真空下で濃縮した。130mgの所望の生成物を無色の油として得た(77.00%収率)。LC/MS:C34H57N5O9S2に対する質量計算値:743.36、実測値:744.55[M+H]+。
DMF(1.50mL)中tert-ブチルN-(17-ブロモ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(100.00mg、0.22mmol、1.00当量)の溶液に、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(89.92mg、0.24mmol、1.05当量)、及びK2CO3(93.31mmol、0.68mmol、3.00当量)を加えた。次いで、反応物を室温で3.0日間撹拌した。反応混合物を濾過し、濾液を以下の条件下で逆相カラムで精製した:カラム、C18カラム;移動相、水中MeCN、40分間で5%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせ、真空下で濃縮した。130mgの所望の生成物を無色の油として得た(77.00%収率)。LC/MS:C34H57N5O9S2に対する質量計算値:743.36、実測値:744.55[M+H]+。
ステップ2:1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)の合成
1,4-ジオキサン(1.00mL)中の4M HCl中のtert-ブチルN-(17-[4-[(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(30.00mg)の溶液を、室温で2.0時間撹拌した。混合物を濃縮して、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(30.00mg、粗製)を油として得た。LC/MS:C29H49N5O7S2に対する質量計算値:643.31、実測値:644.45[M+H]+。
1,4-ジオキサン(1.00mL)中の4M HCl中のtert-ブチルN-(17-[4-[(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(30.00mg)の溶液を、室温で2.0時間撹拌した。混合物を濃縮して、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(30.00mg、粗製)を油として得た。LC/MS:C29H49N5O7S2に対する質量計算値:643.31、実測値:644.45[M+H]+。
ステップ3:N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)の合成
DMF(2.00mL)中の1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(21.00mg、0.033mmol、1.05当量)の溶液に、NMI(21.00mg、0.26mmol、8.10当量)、TCFH(10mg、0.07mmol、2.19当量)、及び1-メチル-4-(3-(1-メチル-4-(1-メチル-4-(3-(1-メチル-4-(1-メチル-4-(3-(1-メチル-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボキサミド)-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボキサミド)-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボン酸(30.00mg、0.032mmol、1.00当量)を加えた。次いで、反応物を室温で2.0時間撹拌した。DMF(2.0mL)中の粗混合物を、以下の条件で分取HPLCにより精製し(カラム:XSelect CSH Prep C18 OBDカラム、5um,19*150mm;移動相A:水(10mmol/L NH4HCO3)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:20分間で20B~40B;220nm;RT1:19.35;RT2:;注入量:2ml;実行数:5)、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(21.20mg、41.00%収率)を白色の固体として得た。HRMS:C71H96N22O16S2に対する質量計算値:1576.6816、実測値:1577.6870[M+H]+。
DMF(2.00mL)中の1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(21.00mg、0.033mmol、1.05当量)の溶液に、NMI(21.00mg、0.26mmol、8.10当量)、TCFH(10mg、0.07mmol、2.19当量)、及び1-メチル-4-(3-(1-メチル-4-(1-メチル-4-(3-(1-メチル-4-(1-メチル-4-(3-(1-メチル-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボキサミド)-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボキサミド)-1H-ピロール-2-カルボキサミド)プロパンアミド)-1H-イミダゾール-2-カルボン酸(30.00mg、0.032mmol、1.00当量)を加えた。次いで、反応物を室温で2.0時間撹拌した。DMF(2.0mL)中の粗混合物を、以下の条件で分取HPLCにより精製し(カラム:XSelect CSH Prep C18 OBDカラム、5um,19*150mm;移動相A:水(10mmol/L NH4HCO3)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:20分間で20B~40B;220nm;RT1:19.35;RT2:;注入量:2ml;実行数:5)、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(21.20mg、41.00%収率)を白色の固体として得た。HRMS:C71H96N22O16S2に対する質量計算値:1576.6816、実測値:1577.6870[M+H]+。
実施例29.化合物004の合成
ステップ1:tert-ブチルN-[(20E)-21-[(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバモイル]-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメート(INT92-013-1)の合成
DMF(4.00mL)中のN-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]-4-[(2E)-4-ブロモブタ-2-エンアミド]ベンズアミド(150.00mg、0.20mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、tert-ブチルN-(5,8,11,14,17-ペンタオキサ-2-アザノナデカン-19-イル)カルバメート(79.75mg、0.20mmol、1.00当量)、K2CO3(83.81mg、0.60mmol、3.00当量)、及びNaI(60.60mg、0.40mmol、2.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で35%~55%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。Tert-ブチルN-[(20E)-21-[(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバモイル]-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメート(200.00mg、88.40%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C53H63ClN8O11Sに対する質量計算値:1054.40、実測値:1055.65[M+H]+。
DMF(4.00mL)中のN-[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]-4-[(2E)-4-ブロモブタ-2-エンアミド]ベンズアミド(150.00mg、0.20mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、tert-ブチルN-(5,8,11,14,17-ペンタオキサ-2-アザノナデカン-19-イル)カルバメート(79.75mg、0.20mmol、1.00当量)、K2CO3(83.81mg、0.60mmol、3.00当量)、及びNaI(60.60mg、0.40mmol、2.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。固体を濾過し、濾液を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で35%~55%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。Tert-ブチルN-[(20E)-21-[(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバモイル]-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメート(200.00mg、88.40%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C53H63ClN8O11Sに対する質量計算値:1054.40、実測値:1055.65[M+H]+。
ステップ2:tert-ブチルN-[(20E)-21-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメート(INT92-013-2)の合成
ジオキサン(3.00mL)中のtert-ブチルN-[(20E)-21-[(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバモイル]-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメート(190.00mg、0.18mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、H2O(3.0mL)中の1M KOHを室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で30%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。Tert-ブチルN-[(20E)-21-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメート(100.00mg、43.48%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C47H59ClN8O9に対する質量計算値:914.41、実測値:915.65[M+H]+。
ジオキサン(3.00mL)中のtert-ブチルN-[(20E)-21-[(4-[[3-([4-[1-(ベンゼンスルホニル)インドール-3-イル]-5-クロロピリミジン-2-イル]アミノ)フェニル]カルバモイル]フェニル)カルバモイル]-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメート(190.00mg、0.18mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、H2O(3.0mL)中の1M KOHを室温で滴下して加えた。得られた混合物を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で30%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。Tert-ブチルN-[(20E)-21-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメート(100.00mg、43.48%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C47H59ClN8O9に対する質量計算値:914.41、実測値:915.65[M+H]+。
ステップ3:(20E)-1-アミノ-N-[4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザドコス-20-エン-22-アミド(INT92-013-3)の合成
手順は、(INT90-050-6)と同じであった。100.00mgのtert-ブチルN-[(20E)-21-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメートを使用して、100.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C42H51ClN8O7に対する質量計算値:814.36、実測値:815.55[M+H]+。
手順は、(INT90-050-6)と同じであった。100.00mgのtert-ブチルN-[(20E)-21-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバメートを使用して、100.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C42H51ClN8O7に対する質量計算値:814.36、実測値:815.55[M+H]+。
ステップ4:N-[5-([2-[(2-[[5-([2-[(2-[[(20E)-21-([4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]カルバモイル)-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザヘニコス-20-エン-1-イル]カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]エチル]カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]エチル]カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物004)の合成
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであった。45.00mgの(20E)-1-アミノ-N-[4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザドコス-20-エン-22-アミドを使用して、8.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(8.54%収率)。HRMS:C84H98ClN25O16に対する質量計算値:1747.7312、実測値:1748.7334[M+H]+。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであった。45.00mgの(20E)-1-アミノ-N-[4-[(3-[[5-クロロ-4-(1H-インドール-3-イル)ピリミジン-2-イル]アミノ]フェニル)カルバモイル]フェニル]-18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザドコス-20-エン-22-アミドを使用して、8.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(8.54%収率)。HRMS:C84H98ClN25O16に対する質量計算値:1747.7312、実測値:1748.7334[M+H]+。
実施例30.化合物010の合成の合成
ステップ1:tert-ブチルN-[17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメート(INT93-019-101)の合成
手順は、(INT60-017-10)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。100.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(34.15%収率)。LC/MS:C59H98N8O14に対する質量計算値:1142.72、実測値:522.70[1/2(M-Boc)+H]+。
手順は、(INT60-017-10)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。100.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(34.15%収率)。LC/MS:C59H98N8O14に対する質量計算値:1142.72、実測値:522.70[1/2(M-Boc)+H]+。
ステップ2:(2S)-N-[(1S)-1-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバモイル]-2-ヒドロキシエチル]-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド(INT93-019-102)の合成
手順は、(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)酢酸(INT-29-110)の合成と同じであり、50.00mgのtert-ブチルN-[17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメートを使用して、50.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C54H90N8O12に対する質量計算値:1042.66、実測値:1043.90[M+H]+。
手順は、(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]エトキシ}エトキシ)酢酸(INT-29-110)の合成と同じであり、50.00mgのtert-ブチルN-[17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメートを使用して、50.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C54H90N8O12に対する質量計算値:1042.66、実測値:1043.90[M+H]+。
ステップ3:N-[5-[(2-[[2-([5-[(2-[[2-([17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル]エチル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル]エチル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物010)の合成。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。28.00mgの1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-カルボン酸を使用して、10.70mgの所望の生成物を白色の固体として得た(18.10%収率)。HRMS:C96H137N25O21に対する質量計算値:1976.0421、実測値:1977.0458[M+H]+。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。28.00mgの1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-カルボン酸を使用して、10.70mgの所望の生成物を白色の固体として得た(18.10%収率)。HRMS:C96H137N25O21に対する質量計算値:1976.0421、実測値:1977.0458[M+H]+。
実施例31.化合物096の合成
ステップ1:tert-ブチルN-[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]カルバメート(INT-94-139-1000)の合成
THF(20.00mL)中のCuI(56.90mg、0.30mmol、0.05当量)、及びNiCl2.6H2O(71.01mg、0.30mmol、0.05当量)の撹拌溶液に、TMEDA(138.87mg、1.20mmol、0.20当量)を空気雰囲気下、室温で滴下して加えた。得られた混合物を空気雰囲気下、室温で5分間撹拌した。上記混合物に、THF(10.00mL)中の4-エチニルアニリン(700.00mg、5.98mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルN-(プロプ-2-イン-1-イル)カルバメート(463.67mg、2.99mmol、0.50当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を室温で更に17.0時間撹拌した。反応物を室温でH2O(50mL)を加えることによりクエンチした。得られた混合物をEA(3×80mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1x50mL)で洗浄し、無水Ns2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(3:1)で溶出して、tert-ブチルN-[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]カルバメート(600.00mg、37.15%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C16H18N2O2に対する質量計算値:270.14、実測値:215.05[M-tBu+1+H]+。
THF(20.00mL)中のCuI(56.90mg、0.30mmol、0.05当量)、及びNiCl2.6H2O(71.01mg、0.30mmol、0.05当量)の撹拌溶液に、TMEDA(138.87mg、1.20mmol、0.20当量)を空気雰囲気下、室温で滴下して加えた。得られた混合物を空気雰囲気下、室温で5分間撹拌した。上記混合物に、THF(10.00mL)中の4-エチニルアニリン(700.00mg、5.98mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルN-(プロプ-2-イン-1-イル)カルバメート(463.67mg、2.99mmol、0.50当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を室温で更に17.0時間撹拌した。反応物を室温でH2O(50mL)を加えることによりクエンチした。得られた混合物をEA(3×80mL)で抽出した。合わせた有機層をブライン(1x50mL)で洗浄し、無水Ns2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(3:1)で溶出して、tert-ブチルN-[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]カルバメート(600.00mg、37.15%収率)を黄色の固体として得た。LC/MS:C16H18N2O2に対する質量計算値:270.14、実測値:215.05[M-tBu+1+H]+。
ステップ2:(2R)-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}プロパン酸(INT94-417-10)の合成
DMF(25.00mL)中の(2R)-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-3-ヒドロキシプロパン酸(2.00g、6.11mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DMAP(0.07g、0.61mmol、0.10当量)、イミダゾール(0.83g、12.22mmol、2.00当量)、及びTBDPSCl(3.36g、12.22mmol、2.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を30℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、(2R)-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}プロパン酸(1.70g、49.24%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C34H35NO5Siに対する質量計算値:565.23、実測値:566.45[M+H]+。
DMF(25.00mL)中の(2R)-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}-3-ヒドロキシプロパン酸(2.00g、6.11mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、DMAP(0.07g、0.61mmol、0.10当量)、イミダゾール(0.83g、12.22mmol、2.00当量)、及びTBDPSCl(3.36g、12.22mmol、2.00当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を30℃で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、(2R)-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}プロパン酸(1.70g、49.24%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C34H35NO5Siに対する質量計算値:565.23、実測値:566.45[M+H]+。
ステップ3:9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[(4-{5-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ペンタ-1,3-ジイン-1-イル}フェニル)カルバモイル]-2-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]エチル]カルバメート(INT94-417-11)の合成
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。520.00mgの(2S)-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}プロパン酸を使用した。反応後、反応混合物を氷水に注ぎ、得られた固体をシリカゲルクロマトグラフィーにより精製した。350.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(46.55%収率)。LC/MS:C50H51N3O6Siに対する質量計算値:817.35、実測値:818.70[M+H]+。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。520.00mgの(2S)-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]-2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}プロパン酸を使用した。反応後、反応混合物を氷水に注ぎ、得られた固体をシリカゲルクロマトグラフィーにより精製した。350.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(46.55%収率)。LC/MS:C50H51N3O6Siに対する質量計算値:817.35、実測値:818.70[M+H]+。
ステップ4:Tert-ブチルN-(5-{4-[(2S)-2-アミノ-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]プロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバメート(INT94-417-12)の合成
DMF(5.00mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[(4-{5-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ペンタ-1,3-ジイン-1-イル}フェニル)カルバモイル]-2-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]エチル]カルバメート(330.00mg、0.40mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ピペリジン(0.50mL)を室温で加えた。得られた混合物を室温で20分間撹拌した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で35%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。Tert-ブチルN-(5-{4-[(2S)-2-アミノ-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]プロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバメート(160.00mg、66.57%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C35H41N3O4Siに対する質量計算値:595.29、実測値:596.25[M+H]+。
DMF(5.00mL)中の9H-フルオレン-9-イルメチルN-[(1S)-1-[(4-{5-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]ペンタ-1,3-ジイン-1-イル}フェニル)カルバモイル]-2-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]エチル]カルバメート(330.00mg、0.40mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、ピペリジン(0.50mL)を室温で加えた。得られた混合物を室温で20分間撹拌した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で35%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。Tert-ブチルN-(5-{4-[(2S)-2-アミノ-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]プロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバメート(160.00mg、66.57%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C35H41N3O4Siに対する質量計算値:595.29、実測値:596.25[M+H]+。
ステップ5:tert-ブチルN-(5-{4-[(2S)-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]プロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバメート(INT94-417-13)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。45.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサン酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(60.63%収率)。LC/MS:C74H98N8O9Siに対する質量計算値:1270.72、実測値:1272.00[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。45.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサン酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(60.63%収率)。LC/MS:C74H98N8O9Siに対する質量計算値:1270.72、実測値:1272.00[M+H]+。
ステップ6:(2S)-N-[(1S)-1-{[4-(5-アミノペンタ-1,3-ジイン-1-イル)フェニル]カルバモイル}-2-ヒドロキシエチル]-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド(INT94-417-15)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。45.00mgのtert-ブチルN-(5-{4-[(2S)-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]プロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバメートを使用して、45.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C53H72N8O7に対する質量計算値:932.55、実測値:933.95[M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。45.00mgのtert-ブチルN-(5-{4-[(2S)-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]プロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバメートを使用して、45.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の固体として得た。LC/MS:C53H72N8O7に対する質量計算値:932.55、実測値:933.95[M+H]+。
ステップ7:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(5-{4-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物096)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。40.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、3.50mgの所望の生成物を白色の固体として得た(4.53%収率)。HRMS:C104H131N29O18に対する質量計算値:2074.0227、実測値:2075.0222[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。40.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、3.50mgの所望の生成物を白色の固体として得た(4.53%収率)。HRMS:C104H131N29O18に対する質量計算値:2074.0227、実測値:2075.0222[M+H]+。
実施例32.化合物098の合成
ステップ1:tert-ブチルN-{2-[2-(プロプ-2-イン-1-イルアミノ)エトキシ]エチル}カルバメート(INT95-419-201)の合成
ACN(10.00mL)中のtert-ブチルN-[2-(2-ブロモエトキシ)エチル]カルバメート(1.00g、3.73mmol、1.00当量)の溶液に、Et3N(1.13g、11.187mmol、3.00当量)、及び2-プロピニルアミン(2.05g、37.29mmol、10.00当量)を加えた。次いで、反応物を50℃で17.0時間撹拌した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%NH4HCO3)、60分間で5%~40%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせ、濃縮して、tert-ブチルN-{2-[2-(プロプ-2-イン-1-イルアミノ)エトキシ]エチル}カルバメート(600.00mg、66.40%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C12H22N2O3に対する質量計算値:242.16、実測値:243.20[M+H]+。
ACN(10.00mL)中のtert-ブチルN-[2-(2-ブロモエトキシ)エチル]カルバメート(1.00g、3.73mmol、1.00当量)の溶液に、Et3N(1.13g、11.187mmol、3.00当量)、及び2-プロピニルアミン(2.05g、37.29mmol、10.00当量)を加えた。次いで、反応物を50℃で17.0時間撹拌した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%NH4HCO3)、60分間で5%~40%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせ、濃縮して、tert-ブチルN-{2-[2-(プロプ-2-イン-1-イルアミノ)エトキシ]エチル}カルバメート(600.00mg、66.40%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C12H22N2O3に対する質量計算値:242.16、実測値:243.20[M+H]+。
ステップ2:tert-ブチルN-[2-(2-{[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT95-419-101)の合成
手順は、tert-ブチルN-[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]カルバメート(INT94-139-1000)と同じであったが、生成物を逆相カラムによって精製した。300.00mgのtert-ブチルN-{2-[2-(プロプ-2-イン-1-イルアミノ)エトキシ]エチル}カルバメートを使用して、250.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(56.49%収率)。LC/MS:C20H27N3O3に対する質量計算値:357.21、実測値:358.20[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]カルバメート(INT94-139-1000)と同じであったが、生成物を逆相カラムによって精製した。300.00mgのtert-ブチルN-{2-[2-(プロプ-2-イン-1-イルアミノ)エトキシ]エチル}カルバメートを使用して、250.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(56.49%収率)。LC/MS:C20H27N3O3に対する質量計算値:357.21、実測値:358.20[M+H]+。
ステップ3:tert-ブチルN-[2-(2-{[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル][(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT95-419-102)の合成
THF(3.00mL)中のtert-ブチルN-[2-(2-{[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメートアミン(100.00mg、0.27mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル 9H-フルオレン-9-イルメチルカーボネート(136.00mg、0.40mmol、1.50当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をTLCプレートにより精製し、DCM/MeOH(10:1)で溶出して、tert-ブチルN-[2-(2-{[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル][(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメート(100.00mg、64.60%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C35H37N3O5に対する質量計算値:579.27、実測値:602.50[M+Na]+。
THF(3.00mL)中のtert-ブチルN-[2-(2-{[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメートアミン(100.00mg、0.27mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、2,5-ジオキソピロリジン-1-イル 9H-フルオレン-9-イルメチルカーボネート(136.00mg、0.40mmol、1.50当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を、室温で17.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をTLCプレートにより精製し、DCM/MeOH(10:1)で溶出して、tert-ブチルN-[2-(2-{[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル][(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメート(100.00mg、64.60%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C35H37N3O5に対する質量計算値:579.27、実測値:602.50[M+Na]+。
ステップ4:tert-ブチルN-[2-(2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル][5-(4-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}フェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT95-419-103)の合成
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであったが、反応混合物を逆相カラムにより精製した。120.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(28.07%収率)。LC/MS:C86H96N24O16に対する質量計算値:1720.74、実測値:861.90[M/2+H]+。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであったが、反応混合物を逆相カラムにより精製した。120.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(28.07%収率)。LC/MS:C86H96N24O16に対する質量計算値:1720.74、実測値:861.90[M/2+H]+。
ステップ5:9H-フルオレン-9-イルメチル N-[2-(2-アミノエトキシ)エチル]-N-[5-(4-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}フェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]カルバメート(INT95-419-104)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。40.00mgのtert-ブチルN-[2-(2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル][5-(4-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}フェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメートを使用して、40.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C81H88N24O14に対する質量計算値:1620.69、実測値:811.85[M/2+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。40.00mgのtert-ブチルN-[2-(2-{[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル][5-(4-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}フェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメートを使用して、40.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C81H88N24O14に対する質量計算値:1620.69、実測値:811.85[M/2+H]+。
ステップ6:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(4-{5-[(2-{2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]エトキシ}エチル)アミノ]ペンタ-1,3-ジイン-1-イル}フェニル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物098)の合成。
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であった。15.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、4.10mgの所望の生成物を白色の固体として得た(10.15%収率)。HRMS:C108H140N30O19に対する質量計算値:2161.0911、実測値:2162.1060[M+H]+。
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であった。15.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、4.10mgの所望の生成物を白色の固体として得た(10.15%収率)。HRMS:C108H140N30O19に対する質量計算値:2161.0911、実測値:2162.1060[M+H]+。
実施例33.化合物071の合成
ステップ1:tert-ブチルN-[3-({3-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]プロピル}(メチル)アミノ)プロピル]カルバメート(INT96-385-1)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。40.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を淡黄色の油として得た(96.82%収率)。LC/MS:C54H89N9O9に対する質量計算値:1007.69、実測値:505.30[M/2+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。40.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を淡黄色の油として得た(96.82%収率)。LC/MS:C54H89N9O9に対する質量計算値:1007.69、実測値:505.30[M/2+H]+。
ステップ2:(2S)-N-[(1S)-1-({3-[(3-アミノプロピル)(メチル)アミノ]プロピル}カルバモイル)-2-ヒドロキシエチル]-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド(INT96-385-2)の合成
手順は、(INT91-010-51)と同じであった。50.00mgのtert-ブチルN-[3-({3-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]プロピル}(メチル)アミノ)プロピル]カルバメートを使用して、50.00mgの粗製の所望の生成物を無色の油として得た。LC/MS:C49H81N9O7に対する質量計算値:907.63、実測値:908.90[M+H]+。
手順は、(INT91-010-51)と同じであった。50.00mgのtert-ブチルN-[3-({3-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]プロピル}(メチル)アミノ)プロピル]カルバメートを使用して、50.00mgの粗製の所望の生成物を無色の油として得た。LC/MS:C49H81N9O7に対する質量計算値:907.63、実測値:908.90[M+H]+。
ステップ3:N-(5-{[3-({2-[(2-{[5-({2-[(2-{[3-({3-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]プロピル}(メチル)アミノ)プロピル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)プロピル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物071)の合成。
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は1.0時間であった。54.00mgの1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-カルボン酸を使用して、8.80mgの所望の生成物を白色の固体として得た(8.29%収率)。HRMS:C100H140N30O18に対する質量計算値:2049.0962、実測値:2050.1128[M+H]+。
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は1.0時間であった。54.00mgの1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-カルボン酸を使用して、8.80mgの所望の生成物を白色の固体として得た(8.29%収率)。HRMS:C100H140N30O18に対する質量計算値:2049.0962、実測値:2050.1128[M+H]+。
実施例34.化合物109の合成の合成
ステップ1:(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-2-({17-[(4-{3-[(4-{4-[(2R)-2-アセトアミド-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド}-1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)エチルアセテート(INT97-430-1)の合成
DCM(1.50mL)中の4-[(2R)-2-アミノ-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-N-{5-[(2-{[2-({17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキサミド(20.00mg、0.01mmol、1.00当量)の溶液に、Ac2O(6.95mg、0.07mmol、7.00当量)、TEA(6.89mg、0.07mmol、7.00当量)を加えた。得られた混合物を室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-2-({17-[(4-{3-[(4-{4-[(2R)-2-アセトアミド-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド}-1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)エチルアセテート(20.00mg 粗製)を黄色の油として得た。LC/MS:C104H145N27O23に対する質量計算値:2140.10、実測値:1071.95[M/2+H]+。
DCM(1.50mL)中の4-[(2R)-2-アミノ-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-N-{5-[(2-{[2-({17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチルイミダゾール-2-カルボキサミド(20.00mg、0.01mmol、1.00当量)の溶液に、Ac2O(6.95mg、0.07mmol、7.00当量)、TEA(6.89mg、0.07mmol、7.00当量)を加えた。得られた混合物を室温で1.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-2-({17-[(4-{3-[(4-{4-[(2R)-2-アセトアミド-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド}-1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)エチルアセテート(20.00mg 粗製)を黄色の油として得た。LC/MS:C104H145N27O23に対する質量計算値:2140.10、実測値:1071.95[M/2+H]+。
ステップ2:N-{5-[(2-{[2-({17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-4-[(2R)-2-アセトアミド-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール)-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキサミド(化合物109)の合成
MeOH(1.50mL)中の(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-2-({17-[(4-{3-[(4-{4-[(2R)-2-アセトアミド-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド}-1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)エチルアセテート(25.00mg、0.01mmol、1.00当量)の溶液に、2 M LiOH(0.02mL、3.33当量)を加えた。得られた混合物を45℃で1.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(5mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。固体をDMF(1.0mL)に溶解し、得られた混合物を濾過し、DMF(1.0mL)中の濾液を分取HPLCにより精製した:カラム:XBridge Prep Phenyl OBDカラム、19*150mm、5μm 13nm;移動相A:水(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:15分間で40%B~65%B、65%B;波長:254nm;RT1(分):9.35。画分を合わせて直接凍結乾燥させた。N-{5-[(2-{[2-({17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-4-[(2R)-2-アセトアミド-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキサミド(3.70mg、14.83%収率)を淡黄色の固体として得た。HRMS:C102H143N27O22に対する質量計算値:2098.0900、実測値:2099.0925[M+H]+。
MeOH(1.50mL)中の(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-2-({17-[(4-{3-[(4-{4-[(2R)-2-アセトアミド-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-アミド}-1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-1-メチルイミダゾール-2-イル)ホルムアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)エチルアセテート(25.00mg、0.01mmol、1.00当量)の溶液に、2 M LiOH(0.02mL、3.33当量)を加えた。得られた混合物を45℃で1.0時間撹拌した。得られた混合物を減圧下で濃縮した。残留物をH2O(5mL)に溶解した。混合物を2M HClでpH3~5に酸性化した。沈殿した固体を濾過により収集し、H2O(3x5mL)で洗浄し、真空下で乾燥させた。固体をDMF(1.0mL)に溶解し、得られた混合物を濾過し、DMF(1.0mL)中の濾液を分取HPLCにより精製した:カラム:XBridge Prep Phenyl OBDカラム、19*150mm、5μm 13nm;移動相A:水(0.05%TFA)、移動相B:ACN;流速:25mL/分;勾配:15分間で40%B~65%B、65%B;波長:254nm;RT1(分):9.35。画分を合わせて直接凍結乾燥させた。N-{5-[(2-{[2-({17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-4-[(2R)-2-アセトアミド-4-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[1-メチル-4-(1-メチルピロール-2-アミド)ピロール-2-アミド]イミダゾール-2-アミド}ピロール-2-イル)ホルムアミド]ブタンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボキサミド(3.70mg、14.83%収率)を淡黄色の固体として得た。HRMS:C102H143N27O22に対する質量計算値:2098.0900、実測値:2099.0925[M+H]+。
実施例35.化合物120の合成
ステップ1:tert-ブチルN-[(1S)-1-({5-[(2-{[5-({5-[(17-{4-[(5-{[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル}-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)-3-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}プロピル]カルバメート(INT98-441-3)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。41.20mgの4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボン酸を使用して、35.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(49.20%収率)。LC/MS:C80H108N24O18S2に対する質量計算値:1756.77、実測値:880.05[M/2+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。41.20mgの4-[4-(4-{4-[(2S)-2-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-カルボン酸を使用して、35.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(49.20%収率)。LC/MS:C80H108N24O18S2に対する質量計算値:1756.77、実測値:880.05[M/2+H]+。
ステップ2:1-[17-({4-[4-(4-{4-[(2S)-2-アミノ-4-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}ブタンアミド]-1-メチルピロール-2-アミド}-1-メチルイミダゾール-2-アミド)-1-メチルピロール-2-アミド]-1-メチルピロール-2-イル}ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]-N-(5-{[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル}-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物120)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであり、粗生成物を分取HPLCにより精製した。30.00mgのtert-ブチルN-[(1S)-1-({5-[(2-{[5-({5-[(17-{4-[(5-{[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル}-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)-3-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}プロピル]カルバメートを使用して、9.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(32.93%収率)。HRMS:C75H100N24O16S2に対する質量計算値:1656.7191、実測値:1657.7342[M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであり、粗生成物を分取HPLCにより精製した。30.00mgのtert-ブチルN-[(1S)-1-({5-[(2-{[5-({5-[(17-{4-[(5-{[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル}-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)-3-{[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-イル]ホルムアミド}プロピル]カルバメートを使用して、9.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(32.93%収率)。HRMS:C75H100N24O16S2に対する質量計算値:1656.7191、実測値:1657.7342[M+H]+。
実施例36.化合物123の合成
ステップ1:N-[5-({3-[(2-{[2-({5-[(2-{[2-({2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エチル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]プロピル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(INT99-461-4)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。200.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、220.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(87.25%収率)。LC/MS:C57H73N25O13に対する質量計算値:1315.58、実測値:659.35[1/2 M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。200.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、220.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(87.25%収率)。LC/MS:C57H73N25O13に対する質量計算値:1315.58、実測値:659.35[1/2 M+H]+。
ステップ2:メチル2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセテート(INT99-461-5)の合成
DMSO(2.00mL)中のCuSO4.5H2O(4.36mg、0.02mmol、0.10当量)、ナトリウムアスコルベート(17.39mg、0.09mmol、0.50当量)、THPTA(379.59mg、0.88mmol、5.00当量)の溶液に、N-[5-({3-[(2-{[2-({5-[(2-{[2-({2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エチル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]プロピル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(230.00mg、0.18mmol、1.00当量)、メチルブタ-3-イノエート(17.14mg、0.18mmol、1.00当量)を加えた。得られた混合物を室温で1.0時間撹拌した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で35%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。メチル2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセテート(150.00mg、60.69%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C62H79N25O15に対する質量計算値:1413.61、実測値:708.35[1/2 M+H]+。
DMSO(2.00mL)中のCuSO4.5H2O(4.36mg、0.02mmol、0.10当量)、ナトリウムアスコルベート(17.39mg、0.09mmol、0.50当量)、THPTA(379.59mg、0.88mmol、5.00当量)の溶液に、N-[5-({3-[(2-{[2-({5-[(2-{[2-({2-[2-(2-アジドエトキシ)エトキシ]エチル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]プロピル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(230.00mg、0.18mmol、1.00当量)、メチルブタ-3-イノエート(17.14mg、0.18mmol、1.00当量)を加えた。得られた混合物を室温で1.0時間撹拌した。反応混合物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のACN(0.05%TFA)、20分間で35%~50%勾配;検出器、UV254nm。画分を合わせて濃縮した。メチル2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセテート(150.00mg、60.69%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C62H79N25O15に対する質量計算値:1413.61、実測値:708.35[1/2 M+H]+。
ステップ3:(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)酢酸(INT99-461-6)の合成
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。140.00mgのメチル2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセテートを使用して、90.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(64.93%収率)。LC/MS:C61H77N25O15に対する質量計算値:1399.60、実測値:701.35[1/2M+H]+。
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。140.00mgのメチル2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセテートを使用して、90.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(64.93%収率)。LC/MS:C61H77N25O15に対する質量計算値:1399.60、実測値:701.35[1/2M+H]+。
ステップ99-4:tert-ブチルN-(2-{4-[2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセトアミド]ベンズアミド}フェニル)カルバメート(INT99-461-7)の合成
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。反応後、反応混合物を逆相カラムにより精製した。70.00mgの(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)酢酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(58.50%収率)。LC/MS:C79H96N28O17に対する質量計算値:1708.75、実測値:856.05[1/2M+H]+。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。反応後、反応混合物を逆相カラムにより精製した。70.00mgの(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)酢酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(58.50%収率)。LC/MS:C79H96N28O17に対する質量計算値:1708.75、実測値:856.05[1/2M+H]+。
ステップ5:N-[5-({3-[(2-{[2-({5-[(2-{[2-({2-[2-(2-{4-[({4-[(2-アミノフェニル)カルバモイル]フェニル}カルバモイル)メチル]-1,2,3-トリアゾール-1-イル}エトキシ)エトキシ]エチル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]プロピル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物123)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであったが、粗製物を分取HPLCにより精製した。46.00mgのtert-ブチルN-(2-{4-[2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセトアミド]ベンズアミド}フェニル)カルバメートを使用して、1.10mgの所望の生成物を白色の固体として得た(2.35%収率)。HRMS:C74H88N28O15に対する質量計算値:1608.6983、実測値:1631.6928[M+Na]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであったが、粗製物を分取HPLCにより精製した。46.00mgのtert-ブチルN-(2-{4-[2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセトアミド]ベンズアミド}フェニル)カルバメートを使用して、1.10mgの所望の生成物を白色の固体として得た(2.35%収率)。HRMS:C74H88N28O15に対する質量計算値:1608.6983、実測値:1631.6928[M+Na]+。
実施例37.化合物124の合成
ステップ1:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(20-アジド-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(INT100-462-1)の合成
手順は、N(INT61-04-OH-21)と同じであった。反応後、反応混合物を氷水に注ぎ、得られた固体を次のステップに直接使用することができた。300.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、340.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(88.09%収率)。LC/MS:C65H89N25O17に対する質量計算値:1491.68、実測値:747.45[M/2+H]+。
手順は、N(INT61-04-OH-21)と同じであった。反応後、反応混合物を氷水に注ぎ、得られた固体を次のステップに直接使用することができた。300.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、340.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(88.09%収率)。LC/MS:C65H89N25O17に対する質量計算値:1491.68、実測値:747.45[M/2+H]+。
ステップ2:メチル2-[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]アセテート(INT100-462-2)の合成
手順は、(INT99-461-5)と同じであった。300.00mgのN-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(20-アジド-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミドを使用して、300.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(93.83%収率)。LC/MS:C70H95N25O19に対する質量計算値:1589.72、実測値:796.50[M/2+H]+。
手順は、(INT99-461-5)と同じであった。300.00mgのN-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(20-アジド-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミドを使用して、300.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(93.83%収率)。LC/MS:C70H95N25O19に対する質量計算値:1589.72、実測値:796.50[M/2+H]+。
ステップ3:[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]酢酸(INT100-462-3)の合成
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。300.00mgのメチル2-[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]アセテートを使用して、160.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(53.80%収率)。LC/MS:C69H93N25O19に対する質量計算値:1575.70、実測値:789.50[M/2+H]+。
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。300.00mgのメチル2-[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]アセテートを使用して、160.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(53.80%収率)。LC/MS:C69H93N25O19に対する質量計算値:1575.70、実測値:789.50[M/2+H]+。
ステップ4:tert-ブチルN-[2-(4-{2-[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]アセトアミド}ベンズアミド)フェニル]カルバメート(INT100-462-4)の合成
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は1.0時間であった。反応後、反応混合物を逆相カラムにより精製した。110.00mgの[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]酢酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(38.00%収率)。LC/MS:C87H112N28O21に対する質量計算値:1884.85、実測値:944.20[M/2+H]+。
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は1.0時間であった。反応後、反応混合物を逆相カラムにより精製した。110.00mgの[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]酢酸を使用して、50.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(38.00%収率)。LC/MS:C87H112N28O21に対する質量計算値:1884.85、実測値:944.20[M/2+H]+。
ステップ5:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(20-{4-[({4-[(2-アミノフェニル)カルバモイル]フェニル}カルバモイル)メチル]-1,2,3-トリアゾール-1-イル}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物124)の合成。
手順は、(INT-29-110)と同じであったが、粗生成物を分取HPLCにより精製した。41.00mgのtert-ブチルN-[2-(4-{2-[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]アセトアミド}ベンズアミド)フェニル]カルバメートを使用して、6.40mgの所望の生成物を白色の固体として得た(16.13%収率)。HRMS:C82H104N28O19に対する質量計算値:1784.8032、実測値:1785.8050[M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであったが、粗生成物を分取HPLCにより精製した。41.00mgのtert-ブチルN-[2-(4-{2-[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]アセトアミド}ベンズアミド)フェニル]カルバメートを使用して、6.40mgの所望の生成物を白色の固体として得た(16.13%収率)。HRMS:C82H104N28O19に対する質量計算値:1784.8032、実測値:1785.8050[M+H]+。
実施例38.化合物128の合成の合成
ステップ1:メチル4-({ブチル[(4-{[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]メトキシ}フェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)ベンゾエート(INT101-466-10)の合成
手順は、メチル2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセテート(INT99-461-5)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。115.00mgのN-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(20-アジド-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミドを使用して、110.00mgの所望の生成物を淡褐色の固体として得た(75.66%収率)。LC/MS:C88H115N27O21に対する質量計算値:1885.87、実測値:944.30[M/2+H]+。
手順は、メチル2-(1-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}-1,2,3-トリアゾール-4-イル)アセテート(INT99-461-5)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。115.00mgのN-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(20-アジド-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミドを使用して、110.00mgの所望の生成物を淡褐色の固体として得た(75.66%収率)。LC/MS:C88H115N27O21に対する質量計算値:1885.87、実測値:944.30[M/2+H]+。
ステップ2:4-({ブチル[(4-{[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]メトキシ}フェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)安息香酸(INT101-466-11)の合成
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであったが、溶媒はTHF/MeOHであった。110.00mgのメチル4-({ブチル[(4-{[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]メトキシ}フェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)ベンゾエートを使用して、84.00mgの所望の生成物を暗緑色の固体として得た(76.94%収率)。LC/MS:C87H113N27O21に対する質量計算値:1871.86、実測値:937.75[M/2+H]+。
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであったが、溶媒はTHF/MeOHであった。110.00mgのメチル4-({ブチル[(4-{[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]メトキシ}フェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)ベンゾエートを使用して、84.00mgの所望の生成物を暗緑色の固体として得た(76.94%収率)。LC/MS:C87H113N27O21に対する質量計算値:1871.86、実測値:937.75[M/2+H]+。
ステップ3:N-[5-({3-[(2-{[2-({5-[(2-{[2-({20-[4-(4-{[ブチル({[4-(ヒドロキシカルバモイル)フェニル]メチル})カルバモイル]アミノ}フェノキシメチル)-1,2,3-トリアゾール-1-イル]-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]プロピル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物128)の合成。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであった。75.00mgの4-({ブチル[(4-{[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]メトキシ}フェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)安息香酸を使用して、2.80mgの所望の生成物を白色の固体として得た(3.53%収率)。HRMS:C87H114N28O21に対する質量計算値:1886.8713、実測値:1887.8745[M+H]+。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであった。75.00mgの4-({ブチル[(4-{[1-(20-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15,18-ヘキサオキサイコサン-1-イル)-1,2,3-トリアゾール-4-イル]メトキシ}フェニル)カルバモイル]アミノ}メチル)安息香酸を使用して、2.80mgの所望の生成物を白色の固体として得た(3.53%収率)。HRMS:C87H114N28O21に対する質量計算値:1886.8713、実測値:1887.8745[M+H]+。
実施例39.化合物074の合成
ステップ1:tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)の合成
ACN(10.00mL)中のtert-ブチルN-{2-[2-(2-ブロモエトキシ)エトキシ]エチル}カルバメート(1.00g、3.203mmol、1.00当量)の溶液に、K2CO3(1.33g、9.609mmol、3.00当量)、及びN-メチルベンジルアミン(0.78g、6.406mmol、2.00当量)を加えた。次いで、反応物を70℃で一晩撹拌した。懸濁液を濾過し、濾液をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(15:01)で溶出して、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(1.00g、88.57%)を淡黄色の油として得た。LC/MS:C19H32N2O4に対する質量計算値:352.24、実測値:353.15[M+H]+。
ACN(10.00mL)中のtert-ブチルN-{2-[2-(2-ブロモエトキシ)エトキシ]エチル}カルバメート(1.00g、3.203mmol、1.00当量)の溶液に、K2CO3(1.33g、9.609mmol、3.00当量)、及びN-メチルベンジルアミン(0.78g、6.406mmol、2.00当量)を加えた。次いで、反応物を70℃で一晩撹拌した。懸濁液を濾過し、濾液をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(15:01)で溶出して、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(1.00g、88.57%)を淡黄色の油として得た。LC/MS:C19H32N2O4に対する質量計算値:352.24、実測値:353.15[M+H]+。
ステップ2:tert-ブチルN-(2-{2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメート(INT102-388-2)の合成
MeOH(3.00mL)中のtert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(160.00mg、0.45mmol、1.00当量)の溶液に、Pd(OH)2/C(40.00mg、25%w/w)を加えた。次いで、反応物をH2雰囲気下、室温で17.0時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を濃縮して、tert-ブチルN-(2-{2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメート(100.00mg、粗製)を淡黄色の油として得た。LC/MS:C12H26N2O4に対する質量計算値:262.19、実測値:263.20[M+H]+。
MeOH(3.00mL)中のtert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(160.00mg、0.45mmol、1.00当量)の溶液に、Pd(OH)2/C(40.00mg、25%w/w)を加えた。次いで、反応物をH2雰囲気下、室温で17.0時間撹拌した。混合物を濾過し、濾液を濃縮して、tert-ブチルN-(2-{2-[2-(メチルアミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメート(100.00mg、粗製)を淡黄色の油として得た。LC/MS:C12H26N2O4に対する質量計算値:262.19、実測値:263.20[M+H]+。
ステップ3:tert-ブチルN-{2-[2-(2-{N-メチル-3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}カルバメート(INT102-388-3)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。79.60mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、60.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(56.04%収率)。LC/MS:C63H85N23O15に対する質量計算値:1403.66、実測値:703.35[M/2+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。79.60mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、60.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(56.04%収率)。LC/MS:C63H85N23O15に対する質量計算値:1403.66、実測値:703.35[M/2+H]+。
ステップ4:N-[5-({3-[(2-{[2-({5-[(2-{[2-({2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エチル}(メチル)カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]プロピル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(INT102-388-4)
手順は、(INT-29-110)と同じであった。50.00mgのtert-ブチルN-{2-[2-(2-{N-メチル-3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}カルバメートを使用して、50.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C58H77N23O13に対する質量計算値:1303.61、実測値:1304.80[M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。50.00mgのtert-ブチルN-{2-[2-(2-{N-メチル-3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}カルバメートを使用して、50.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C58H77N23O13に対する質量計算値:1303.61、実測値:1304.80[M+H]+。
ステップ5:N-(5-{[3-({2-[(2-{[5-({2-[(2-{[2-(2-{2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]エトキシ}エトキシ)エチル](メチル)カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)プロピル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物074)の合成。
手順は、(INT61-06-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。30.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、10.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(11.92%収率)。HRMS:C100H139N29O20に対する質量計算値:2066.0751、実測値:2067.0925[M+H]+。
手順は、(INT61-06-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。30.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、10.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(11.92%収率)。HRMS:C100H139N29O20に対する質量計算値:2066.0751、実測値:2067.0925[M+H]+。
実施例40化合物129の合成
ステップ1:ベンジルN-(17-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]フェノキシ}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(INT103-467-1)の合成
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)と同じであった。1.00mgのtert-ブチルN-(4-ヒドロキシフェニル)カルバメートを使用して、150.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(68.98%収率)。LC/MS:C31H46N2O10に対する質量計算値:606.32、実測値:607.60[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)と同じであった。1.00mgのtert-ブチルN-(4-ヒドロキシフェニル)カルバメートを使用して、150.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(68.98%収率)。LC/MS:C31H46N2O10に対する質量計算値:606.32、実測値:607.60[M+H]+。
ステップ2:ベンジルN-[17-(4-アミノフェノキシ)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメート(INT103-467-2)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。140.00mgのベンジルN-(17-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]フェノキシ}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメートを使用して、140.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C26H38N2O8に対する質量計算値:506.26、実測値:507.30[M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。140.00mgのベンジルN-(17-{4-[(tert-ブトキシカルボニル)アミノ]フェノキシ}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメートを使用して、140.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C26H38N2O8に対する質量計算値:506.26、実測値:507.30[M+H]+。
ステップ3:tert-ブチル7-({4-[(17-{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエート(INT103-467-3)の合成
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT61-04-OH-21)と同じであった。64.00mgの8-(tert-ブトキシ)-8-オキソオクタン酸を使用して、110.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(55.37%収率)。LC/MS:C38H58N2O11に対する質量計算値:718.40、実測値:719.45[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT61-04-OH-21)と同じであった。64.00mgの8-(tert-ブトキシ)-8-オキソオクタン酸を使用して、110.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(55.37%収率)。LC/MS:C38H58N2O11に対する質量計算値:718.40、実測値:719.45[M+H]+。
ステップ4:tert-ブチル7-({4-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエート(INT103-467-40)の合成
DMF(2.00mL)中のtert-ブチル7-({4-[(17-{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエート(85.00mg、0.12mmol、1.00当量)の溶液に、Pd/C(17.00mg、20%w/w)を加えた。次いで、H2を3回交換した。混合物を、室温で2.0時間撹拌した。Pd/Cを濾過し、MeOHで洗浄し、濾液を濃縮して、凍結乾燥した。Tert-ブチル7-({4-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエート(70.00mg、粗製)を黄色の油として得た。LC/MS:C30H52N2O9に対する質量計算値:584.37、実測値:585.40[M+H]+。
DMF(2.00mL)中のtert-ブチル7-({4-[(17-{[(ベンジルオキシ)カルボニル]アミノ}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエート(85.00mg、0.12mmol、1.00当量)の溶液に、Pd/C(17.00mg、20%w/w)を加えた。次いで、H2を3回交換した。混合物を、室温で2.0時間撹拌した。Pd/Cを濾過し、MeOHで洗浄し、濾液を濃縮して、凍結乾燥した。Tert-ブチル7-({4-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエート(70.00mg、粗製)を黄色の油として得た。LC/MS:C30H52N2O9に対する質量計算値:584.37、実測値:585.40[M+H]+。
ステップ5:tert-ブチル7-({4-[(17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエート(INT103-467-41)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。117.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、140.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(72.93%収率)。LC/MS:C81H111N23O20に対する質量計算値:1725.84、実測値:864.50[M/2+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。117.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、140.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(72.93%収率)。LC/MS:C81H111N23O20に対する質量計算値:1725.84、実測値:864.50[M/2+H]+。
ステップ6:7-({4-[(17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタン酸(INT103-467-42)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。50.00mgのtert-ブチル7-({4-[(17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエートを使用して、50.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C77H103N23O20に対する質量計算値:1669.77、実測値:836.45[M/2+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。50.00mgのtert-ブチル7-({4-[(17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタノエートを使用して、50.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C77H103N23O20に対する質量計算値:1669.77、実測値:836.45[M/2+H]+。
ステップ7:N-ヒドロキシ-N’-{4-[(17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}オクタンジアミド(化合物129)の合成。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであったが、反応時間は17.0時間であった。50.00mgの7-({4-[(17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタン酸を使用して、8.50mgの所望の生成物を白色の固体として得た(16.69%収率)。HRMS:C77H104N24O20に対する質量計算値:1684.7859、実測値:1685.7944[M+H]+。
手順は、N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)-1-[17-([1-メチル-4-[3-([1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-[[1-メチル-4-(1-メチル-4-[3-[(1-メチルピロール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]イミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド]プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル]ホルムアミド)プロパンアミド]イミダゾール-2-イル]ホルムアミド)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]ピペリジン-4-カルボキサミド(化合物001)と同じであったが、反応時間は17.0時間であった。50.00mgの7-({4-[(17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]フェニル}カルバモイル)ヘプタン酸を使用して、8.50mgの所望の生成物を白色の固体として得た(16.69%収率)。HRMS:C77H104N24O20に対する質量計算値:1684.7859、実測値:1685.7944[M+H]+。
実施例41.化合物142の合成
ステップ1:tert-ブチル4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-カルボキシレート(INT104-484-1)の合成
DMF(20.00mL、258.44mmol、23.54当量)中の2,3-ジメトキシ安息香酸(2.00g、10.98mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルピペラジン-1-カルボキシレート(2.25g、12.08mmol、1.10当量)の混合物に、EDCI(3.16g、16.47mmol、1.50当量)、HOBT(2.23g、16.47mmol、1.50当量)、及びDIEA(3.55g、27.45mmol、2.50当量)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。混合物にH2O(20mL)を加え、EtOAc(30mL×3)で抽出した。有機層を合わせ、飽和水性クエン酸(50mL×2)、飽和水性NaHCO3(50mL×2)、ブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。3.50gの所望の生成物を、白色の固体として得た(90.98%収率)。LC/MS:C18H26N2O5に対する質量計算値:350.18、実測値:351.10[M+H]+。
DMF(20.00mL、258.44mmol、23.54当量)中の2,3-ジメトキシ安息香酸(2.00g、10.98mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルピペラジン-1-カルボキシレート(2.25g、12.08mmol、1.10当量)の混合物に、EDCI(3.16g、16.47mmol、1.50当量)、HOBT(2.23g、16.47mmol、1.50当量)、及びDIEA(3.55g、27.45mmol、2.50当量)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。混合物にH2O(20mL)を加え、EtOAc(30mL×3)で抽出した。有機層を合わせ、飽和水性クエン酸(50mL×2)、飽和水性NaHCO3(50mL×2)、ブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。3.50gの所望の生成物を、白色の固体として得た(90.98%収率)。LC/MS:C18H26N2O5に対する質量計算値:350.18、実測値:351.10[M+H]+。
ステップ2:1-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン(INT104-484-2)の合成
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。4.00gのtert-ブチル4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、2.80gの所望の生成物を白色の固体として得た(98.00%収率)。LC/MS:C13H18N2O3に対する質量計算値:250.13、実測値:251.10[M+H]+。
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。4.00gのtert-ブチル4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、2.80gの所望の生成物を白色の固体として得た(98.00%収率)。LC/MS:C13H18N2O3に対する質量計算値:250.13、実測値:251.10[M+H]+。
ステップ3:2-ブロモ-1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エテノン(INT104-484-3)の合成
CH2Cl2(40.00mL、629.27mmol、56.25当量)中の1-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン(2.80g、11.19mmol、1.00当量)、及び臭化ブロモアセチル(2.48g、12.31mmol、1.10当量)の混合物に、H2O(40.00mL、2220.40mmol、198.48当量)中のNa2CO3(3.56g、33.56mmol、3.00当量)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。有機層を5%HCl(50mL×2)、H2O(50mL×2)、ブライン(50mL×2)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。粗生成物をフラッシュクロマトグラフィー(DCM:MeOH=10:1)により精製した。3.00gの所望の生成物を、白色の固体として得た(72.24%収率)。LC/MS:C15H19BrN2O4に対する質量計算値:370.05、実測値:371.00[M+H]+。
CH2Cl2(40.00mL、629.27mmol、56.25当量)中の1-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン(2.80g、11.19mmol、1.00当量)、及び臭化ブロモアセチル(2.48g、12.31mmol、1.10当量)の混合物に、H2O(40.00mL、2220.40mmol、198.48当量)中のNa2CO3(3.56g、33.56mmol、3.00当量)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。有機層を5%HCl(50mL×2)、H2O(50mL×2)、ブライン(50mL×2)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。粗生成物をフラッシュクロマトグラフィー(DCM:MeOH=10:1)により精製した。3.00gの所望の生成物を、白色の固体として得た(72.24%収率)。LC/MS:C15H19BrN2O4に対する質量計算値:370.05、実測値:371.00[M+H]+。
ステップ4:tert-ブチルN-{17-[(3-メチルフェニル)アミノ]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメート(INT104-484-4)の合成
DMF(3.00mL、38.77mmol、83.08当量)中のM-トルイジン(50.00mg、0.47mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルN-(17-ブロモ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(207.34mg、0.47mmol、1.00当量)の混合物に、NaI(69.94mg、0.47mmol、1.00当量)、及びCs2CO3(456.09mg、1.40mmol、3.00当量)を加えた。混合物を80℃で16.0時間撹拌した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN(0.05%TFA)、20分間で10%~60%勾配;検出器、UV254nm。70.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(31.88%収率)。LC/MS:C24H42N2O7に対する質量計算値:470.30、実測値:471.25[M+H]+。
DMF(3.00mL、38.77mmol、83.08当量)中のM-トルイジン(50.00mg、0.47mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルN-(17-ブロモ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(207.34mg、0.47mmol、1.00当量)の混合物に、NaI(69.94mg、0.47mmol、1.00当量)、及びCs2CO3(456.09mg、1.40mmol、3.00当量)を加えた。混合物を80℃で16.0時間撹拌した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN(0.05%TFA)、20分間で10%~60%勾配;検出器、UV254nm。70.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(31.88%収率)。LC/MS:C24H42N2O7に対する質量計算値:470.30、実測値:471.25[M+H]+。
ステップ5:tert-ブチルN-{20-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-18-(3-メチルフェニル)-20-オキソ-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-1-イル}カルバメート(INT104-484-5)の合成
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)と同じであった。反応後、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を分取TLCで精製した。70.00mgのN-{17-[(3-メチルフェニル)アミノ]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメートを使用して、80.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(70.68%収率)。LC/MS:C39H60N4O11に対する質量計算値:760.43、実測値:761.40[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)と同じであった。反応後、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を分取TLCで精製した。70.00mgのN-{17-[(3-メチルフェニル)アミノ]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメートを使用して、80.00mgの所望の生成物を白色の固体として得た(70.68%収率)。LC/MS:C39H60N4O11に対する質量計算値:760.43、実測値:761.40[M+H]+。
ステップ6:1-アミノ-20-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-18-(3-メチルフェニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-オン(INT104-484-6)の合成
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。ただし反応時間は1時間であった。90.00mgのtert-ブチルN-{20-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-18-(3-メチルフェニル)-20-オキソ-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-1-イル}カルバメートを使用して、70.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(89.56%収率)。LC/MS:C34H52N4O9に対する質量計算値:660.37、実測値:661.35[M+H]+。
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。ただし反応時間は1時間であった。90.00mgのtert-ブチルN-{20-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-18-(3-メチルフェニル)-20-オキソ-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-1-イル}カルバメートを使用して、70.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(89.56%収率)。LC/MS:C34H52N4O9に対する質量計算値:660.37、実測値:661.35[M+H]+。
ステップ7:N-[5-({3-[(2-{[2-({5-[(2-{[2-({20-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-18-(3-メチルフェニル)-20-オキソ-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-1-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]プロピル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物142)の合成。
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は16時間であった。30.00mgの1-アミノ-20-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-18-(3-メチルフェニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-オンを使用して、11.50mgの所望の生成物を白色の固体として得た(13.50%収率)。LC/MS:C85H111N25O20に対する質量計算値:1801.8437、実測値:1824.8310[M+Na]+。
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は16時間であった。30.00mgの1-アミノ-20-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-18-(3-メチルフェニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-オンを使用して、11.50mgの所望の生成物を白色の固体として得た(13.50%収率)。LC/MS:C85H111N25O20に対する質量計算値:1801.8437、実測値:1824.8310[M+Na]+。
実施例42.化合物143の合成
ステップ1:2-メチル-4-ニトロフェニルウレア(INT105-485-1)の合成
CH3COOH(20.00mL)中の4-ニトロ-2-トルイジン(2.00g、13.15mmol、1.00当量)の混合物に、H2O(15.00mL)中のナトリウムシアネート(1.79g、27.61mmol、2.10当量)を加えた。混合物を室温で16.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により回収し、Et2O(3x10mL)で洗浄した。700.00mgの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た。LC/MS:C8H9N3O3に対する質量計算値:195.06、実測値:196.10[M+H]+。
CH3COOH(20.00mL)中の4-ニトロ-2-トルイジン(2.00g、13.15mmol、1.00当量)の混合物に、H2O(15.00mL)中のナトリウムシアネート(1.79g、27.61mmol、2.10当量)を加えた。混合物を室温で16.0時間撹拌した。沈殿した固体を濾過により回収し、Et2O(3x10mL)で洗浄した。700.00mgの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た。LC/MS:C8H9N3O3に対する質量計算値:195.06、実測値:196.10[M+H]+。
ステップ2:4-アミノ-2-メチルフェニルウレア(INT105-485-2)の合成
EtOH(15.00mL)及びH2O(10.00mL)中の2-メチル-4-ニトロフェニルウレア(700.00mg、3.59mmol、1.00当量)、及びNH4Cl(1918.44mg、35.86mmol、10.00当量)の混合物に、Fe(2002.86mg、35.86mmol、10.00当量)を80℃でゆっくりと加えた。混合物を同じ温度で30分間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAcで洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物をEtOAc(30mL)に溶解した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAcで洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。200.00mgの所望の生成物を黄褐色の固体として得た(33.76%収率)。LC/MS:C8H11N3Oに対する質量計算値:165.09、実測値:166.00[M+H]+。
EtOH(15.00mL)及びH2O(10.00mL)中の2-メチル-4-ニトロフェニルウレア(700.00mg、3.59mmol、1.00当量)、及びNH4Cl(1918.44mg、35.86mmol、10.00当量)の混合物に、Fe(2002.86mg、35.86mmol、10.00当量)を80℃でゆっくりと加えた。混合物を同じ温度で30分間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAcで洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物をEtOAc(30mL)に溶解した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをEtOAcで洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。200.00mgの所望の生成物を黄褐色の固体として得た(33.76%収率)。LC/MS:C8H11N3Oに対する質量計算値:165.09、実測値:166.00[M+H]+。
ステップ3:4-({2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエチル}アミノ)-2-メチルフェニルウレア(INT105-485-3)の合成
DMF(20.00mL)中の4-アミノ-2-メチルフェニルウレア(1.00g、6.05mmol、1.00当量)、及び2-ブロモ-1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(2.36g、6.36mmol、1.05当量)の混合物に、NaHCO3(1.02g、12.11mmol、2当量)、及びNaI(1.00g、6.66mmol、1.1当量)を加えた。混合物を60℃で16.0時間撹拌した。混合物にH2O(20mL)を加え、DCM(20mLx3)で抽出した。有機層を合わせ、H2O(50mL)及びブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のMeOH、20分間で10%~50%勾配;検出器、UV254nm。740.00mgの所望の生成物を黒色の固体として得た(26.84%収率)。LC/MS:C23H29N5O5に対する質量計算値:455.22、実測値:456.15[M+H]+。
DMF(20.00mL)中の4-アミノ-2-メチルフェニルウレア(1.00g、6.05mmol、1.00当量)、及び2-ブロモ-1-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]エタノン(2.36g、6.36mmol、1.05当量)の混合物に、NaHCO3(1.02g、12.11mmol、2当量)、及びNaI(1.00g、6.66mmol、1.1当量)を加えた。混合物を60℃で16.0時間撹拌した。混合物にH2O(20mL)を加え、DCM(20mLx3)で抽出した。有機層を合わせ、H2O(50mL)及びブライン(50mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のMeOH、20分間で10%~50%勾配;検出器、UV254nm。740.00mgの所望の生成物を黒色の固体として得た(26.84%収率)。LC/MS:C23H29N5O5に対する質量計算値:455.22、実測値:456.15[M+H]+。
ステップ4:tert-ブチルN-(1-{[4-(カルバモイルアミノ)-3-メチルフェニル]({2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエチル})カルバモイル}-2,5,8,11,14-ペンタオキサヘキサデカン-16-イル)カルバメート(INT105-485-4)の合成
手順は、(化合物001)と同じであった。ただし反応物を逆相カラムにより精製した。100.00mgの4-({2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)-1-イル]-2-オキソエチル}アミノ)-2-メチルフェニルウレアを使用して、60.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(32.81%収率)。LC/MS:C40H60N6O13に対する質量計算値:832.42、実測値:855.40[M+Na]+。
手順は、(化合物001)と同じであった。ただし反応物を逆相カラムにより精製した。100.00mgの4-({2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)-1-イル]-2-オキソエチル}アミノ)-2-メチルフェニルウレアを使用して、60.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(32.81%収率)。LC/MS:C40H60N6O13に対する質量計算値:832.42、実測値:855.40[M+Na]+。
ステップ5:17-アミノ-N-[4-(カルバモイルアミノ)-3-メチルフェニル]-N-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエチル}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカナミド(INT105-485-5)の合成
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。ただし反応時間は1.0時間であった。60.00mgのtert-ブチルN-(1-{[4-(カルバモイルアミノ)-3-メチルフェニル]({2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエチル})カルバモイル}-2,5,8,11,14-ペンタオキサヘキサデカン-16-イル)カルバメートを使用して、40.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(75.77%収率)。LC/MS:C35H52N6O11に対する質量計算値:732.37、実測値:733.35[M+H]+。
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。ただし反応時間は1.0時間であった。60.00mgのtert-ブチルN-(1-{[4-(カルバモイルアミノ)-3-メチルフェニル]({2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエチル})カルバモイル}-2,5,8,11,14-ペンタオキサヘキサデカン-16-イル)カルバメートを使用して、40.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(75.77%収率)。LC/MS:C35H52N6O11に対する質量計算値:732.37、実測値:733.35[M+H]+。
ステップ6:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(1-{[4-(カルバモイルアミノ)-3-メチルフェニル]({2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエチル})カルバモイル}-2,5,8,11,14-ペンタオキサヘキサデカン-16-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物143)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。35.00mgの17-アミノ-N-[4-(カルバモイルアミノ)-3-メチルフェニル]-N-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエチル}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカナミドを使用して、4.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(4.62%収率)。HRMS:C86H111N27O22に対する質量計算値:1873.8379、実測値:1874.8405[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。35.00mgの17-アミノ-N-[4-(カルバモイルアミノ)-3-メチルフェニル]-N-{2-[4-(2,3-ジメトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエチル}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカナミドを使用して、4.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(4.62%収率)。HRMS:C86H111N27O22に対する質量計算値:1873.8379、実測値:1874.8405[M+H]+。
実施例43.化合物146の合成
ステップ1:tert-ブチル17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカノエート(INT106-488-50)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。250.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、260.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(80.78%収率)。LC/MS:C67H92N22O18に対する質量計算値:1492.70、実測値:747.56[M/2+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。250.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、260.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(80.78%収率)。LC/MS:C67H92N22O18に対する質量計算値:1492.70、実測値:747.56[M/2+H]+。
ステップ2:17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン酸(INT106-488-51)の合成
DCM(5mL)中のtert-ブチル17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカノエート(260.00mg、0.17mmol、1.00当量)、及びTFA(1mL)の溶液を、室温で1時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。これにより、17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン酸(300mg、粗製)を黄色の油として得た。LC/MS:C63H84N22O18に対する質量計算値:1436.63、実測値:1437.80[M+H]+。
DCM(5mL)中のtert-ブチル17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカノエート(260.00mg、0.17mmol、1.00当量)、及びTFA(1mL)の溶液を、室温で1時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。これにより、17-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン酸(300mg、粗製)を黄色の油として得た。LC/MS:C63H84N22O18に対する質量計算値:1436.63、実測値:1437.80[M+H]+。
ステップ3:N-(5-{[3-({2-[(2-{[5-({2-[(2-{[17-(4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-イル)-17-オキソ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)プロピル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物146)の合成。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。25.00mgの(3R,4S)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-[4-(ピペラジン-1-イル)フェニル]ピロリジン-3-アミンを使用して、11.40mgの所望の生成物を白色の固体として得た(9.53%収率)。HRMS:C88H115FN26O17に対する質量計算値:1826.8918、実測値:1827.8891[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。25.00mgの(3R,4S)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-[4-(ピペラジン-1-イル)フェニル]ピロリジン-3-アミンを使用して、11.40mgの所望の生成物を白色の固体として得た(9.53%収率)。HRMS:C88H115FN26O17に対する質量計算値:1826.8918、実測値:1827.8891[M+H]+。
実施例44.化合物147の合成の合成
ステップ1:(3R,4S)-4-{4-[4-(エテンスルホニル)ピペラジン-1-イル]フェニル}-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(INT107-489-1)の合成
DCM(5.00mL)中の(3R,4S)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-[4-(ピペラジン-1-イル)フェニル]ピロリジン-3-アミン(200.00mg、0.49mmol、1.00当量)、及び2-クロロエタンスルホニルクロリド(190.00mg、1.17mmol、2.38当量)、TEA(158.00mg、1.56mmol、3.19当量)の溶液を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、(3R,4S)-4-{4-[4-(エテンスルホニル)ピペラジン-1-イル]フェニル}-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(70.00mg、28.68%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C27H35FN4O2Sに対する質量計算値:498.25、実測値:499.20[M+H]+.
DCM(5.00mL)中の(3R,4S)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチル-4-[4-(ピペラジン-1-イル)フェニル]ピロリジン-3-アミン(200.00mg、0.49mmol、1.00当量)、及び2-クロロエタンスルホニルクロリド(190.00mg、1.17mmol、2.38当量)、TEA(158.00mg、1.56mmol、3.19当量)の溶液を、室温で2.0時間撹拌した。得られた混合物を真空下で濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、(3R,4S)-4-{4-[4-(エテンスルホニル)ピペラジン-1-イル]フェニル}-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(70.00mg、28.68%収率)を白色の固体として得た。LC/MS:C27H35FN4O2Sに対する質量計算値:498.25、実測値:499.20[M+H]+.
ステップ2:tert-ブチルN-[17-(4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-イルスルホニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメート(INT107-489-2)の合成
ACN(3.00mL)中の(3R,4S)-4-{4-[4-(エテンスルホニル)ピペラジン-1-イル]フェニル}-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(60.00mg、0.12mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルN-(14-ヒドロキシ-3,6,9,12-テトラオキサテトラデカン-1-イル)カルバメート(41.00mg、0.12mmol、1.01当量)、Cs2CO3(117.00mg、0.36mmol、2.98当量)の混合物を、50℃で24.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをACN(3x3mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を分取TLC(CH2Cl2/MeOH 10:1)により精製して、tert-ブチルN-[17-(4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-イルスルホニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメート(65.00mg、64.61%)を白色の油として得た。LC/MS:C42H66FN5O9Sに対する質量計算値:835.46、実測値:858.40[M+Na]+。
ACN(3.00mL)中の(3R,4S)-4-{4-[4-(エテンスルホニル)ピペラジン-1-イル]フェニル}-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(60.00mg、0.12mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルN-(14-ヒドロキシ-3,6,9,12-テトラオキサテトラデカン-1-イル)カルバメート(41.00mg、0.12mmol、1.01当量)、Cs2CO3(117.00mg、0.36mmol、2.98当量)の混合物を、50℃で24.0時間撹拌した。混合物を室温まで冷却した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをACN(3x3mL)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を分取TLC(CH2Cl2/MeOH 10:1)により精製して、tert-ブチルN-[17-(4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-イルスルホニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメート(65.00mg、64.61%)を白色の油として得た。LC/MS:C42H66FN5O9Sに対する質量計算値:835.46、実測値:858.40[M+Na]+。
ステップ3:(3R,4S)-4-{4-[4-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-スルホニル)ピペラジン-1-イル]フェニル}-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)-N,N-ジメチルピロリジン-3-アミン(INT107-489-3)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。30.00mgのtert-ブチルN-[17-(4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-イルスルホニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメートを使用して、30.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LCMS:C37H58FN5O7Sに対する質量計算値:735.40、実測値:758.70[M+Na]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。30.00mgのtert-ブチルN-[17-(4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-イルスルホニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメートを使用して、30.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LCMS:C37H58FN5O7Sに対する質量計算値:735.40、実測値:758.70[M+Na]+。
ステップ4:N-(5-{[3-({2-[(2-{[5-({2-[(2-{[17-(4-{4-[(3S,4R)-4-(ジメチルアミノ)-1-(7-フルオロ-2,3-ジヒドロ-1H-インデン-1-イル)ピロリジン-3-イル]フェニル}ピペラジン-1-イルスルホニル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)プロピル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物147)の合成
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は4.0時間であった。45.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、11.10mgの所望の生成物を白色の固体として得た(14.36%収率)。HRMS:C88H117FN26O18Sに対する質量計算値:1876.8744、実測値:1877.8772[M+H]+。
手順は、(INT61-025-20)と同じであったが、反応温度は室温であり、反応時間は4.0時間であった。45.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、11.10mgの所望の生成物を白色の固体として得た(14.36%収率)。HRMS:C88H117FN26O18Sに対する質量計算値:1876.8744、実測値:1877.8772[M+H]+。
実施例45.化合物159の合成
ステップ1:tert-ブチル4-[2-(3-ヒドロキシフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレート(INT108-507-1)の合成
手順は、(INT102-388-1)と同じであった。ただし溶媒はMeCNであった。2.00gのtert-ブチル4-(2-ブロモアセチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、1.20gの所望の生成物を白色の固体として得た(54.79%収率)。LC/MS:C17H24N2O5に対する質量計算値:336.17、実測値:281.10[M+H-tBu]+。
手順は、(INT102-388-1)と同じであった。ただし溶媒はMeCNであった。2.00gのtert-ブチル4-(2-ブロモアセチル)ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、1.20gの所望の生成物を白色の固体として得た(54.79%収率)。LC/MS:C17H24N2O5に対する質量計算値:336.17、実測値:281.10[M+H-tBu]+。
ステップ2:tert-ブチル4-{2-[3-(シアノメトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボキシレート(INT108-507-2)の合成
手順は、(INT102-388-1)と同じであった。ただし溶媒はMeCNであった。1.20gのtert-ブチル4-[2-(3-ヒドロキシフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、1.10gの所望の生成物を黄色の固体として得た(82.14%収率)。LC/MS:C19H25N3O5に対する質量計算値:375.18、実測値:320.05[M+H-tBu]+。
手順は、(INT102-388-1)と同じであった。ただし溶媒はMeCNであった。1.20gのtert-ブチル4-[2-(3-ヒドロキシフェノキシ)アセチル]ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、1.10gの所望の生成物を黄色の固体として得た(82.14%収率)。LC/MS:C19H25N3O5に対する質量計算値:375.18、実測値:320.05[M+H-tBu]+。
ステップ3:tert-ブチル4-{2-[3-(2-アミノエトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボキシレート(INT108-507-3)の合成
NH3H2O(10.00mL、256.81mmol、96.41当量)、及びMeOH(15.00mL、370.48mmol、139.09当量)中のtert-ブチル4-{2-[3-(シアノメトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、2.66mmol、1.00当量)の混合物に、ラネーNi(22.82g、26.64mmol、10.00当量)を加えた。混合物をH2雰囲気下、室温で4.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOHで洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のMeOH(0.05%TFA)、20分間で10%~50%勾配;検出器、UV254nm。250.00mgの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(24.73%収率)。LC/MS:C19H29N3O5に対する質量計算値:379.21、実測値:323.10[M+H-tBu]+。
NH3H2O(10.00mL、256.81mmol、96.41当量)、及びMeOH(15.00mL、370.48mmol、139.09当量)中のtert-ブチル4-{2-[3-(シアノメトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボキシレート(1.00g、2.66mmol、1.00当量)の混合物に、ラネーNi(22.82g、26.64mmol、10.00当量)を加えた。混合物をH2雰囲気下、室温で4.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをMeOHで洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件で逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製した:カラム、C18シリカゲル;移動相、水中のMeOH(0.05%TFA)、20分間で10%~50%勾配;検出器、UV254nm。250.00mgの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(24.73%収率)。LC/MS:C19H29N3O5に対する質量計算値:379.21、実測値:323.10[M+H-tBu]+。
ステップ4:エチル2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセテート(INT108-507-4)の合成
DMF(20.00mL、258.44mmol、23.03当量)中の4-tert-ブチル安息香酸(2.00g、11.22mmol、1.00当量)、及びアミノ酢酸エチルエステル(1.16g、11.22mmol、1.00当量)の混合物に、HATU(6.40g、16.83mmol、1.50当量)、及びTEA(2.84g、28.05mmol、2.50当量)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。混合物にH2O(30mL)を加え、EtAOc(30mLx3)で抽出した。有機層を合わせ、H2O(50mL)及びブライン(50mLx2)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(1:1)で溶出した。2.50gの所望の生成物を、白色の固体として得た(84.60%収率)。LC/MS:C15H21NO3に対する質量計算値:263.15、実測値:264.15[M+H]+。
DMF(20.00mL、258.44mmol、23.03当量)中の4-tert-ブチル安息香酸(2.00g、11.22mmol、1.00当量)、及びアミノ酢酸エチルエステル(1.16g、11.22mmol、1.00当量)の混合物に、HATU(6.40g、16.83mmol、1.50当量)、及びTEA(2.84g、28.05mmol、2.50当量)を加えた。混合物を室温で2.0時間撹拌した。混合物にH2O(30mL)を加え、EtAOc(30mLx3)で抽出した。有機層を合わせ、H2O(50mL)及びブライン(50mLx2)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EA(1:1)で溶出した。2.50gの所望の生成物を、白色の固体として得た(84.60%収率)。LC/MS:C15H21NO3に対する質量計算値:263.15、実測値:264.15[M+H]+。
ステップ5:[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]酢酸(INT108-507-5)の合成
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。2.40gの2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセテートを使用して、2.00gの所望の生成物を白色の固体として得た(93.27%収率)。LC/MS:C13H17NO3に対する質量計算値:235.12、実測値:236.15[M+H]+。
手順は、4-[3-[(Tert-ブトキシカルボニル)アミノ]プロパンアミド]-1-メチルイミダゾール-2-カルボン酸(INT60-022-2000)と同じであった。2.40gの2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセテートを使用して、2.00gの所望の生成物を白色の固体として得た(93.27%収率)。LC/MS:C13H17NO3に対する質量計算値:235.12、実測値:236.15[M+H]+。
ステップ6:tert-ブチル4-{2-[3-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}エトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボキシレート(INT108-507-6)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。ただし反応時間は2.0時間であった。160.00mgの[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]酢酸を使用して、130.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(32.04%収率)。LC/MS:C32H44N4O7に対する質量計算値:596.32、実測値:619.30[M+Na]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。ただし反応時間は2.0時間であった。160.00mgの[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]酢酸を使用して、130.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(32.04%収率)。LC/MS:C32H44N4O7に対する質量計算値:596.32、実測値:619.30[M+Na]+。
ステップ7:2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-N-(2-{3-[2-オキソ-2-(ピペラジン-1-イル)エトキシ]フェノキシ}エチル)アセトアミド(INT108-507-7)の合成
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。130.00mgのtert-ブチル4-{2-[3-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}エトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、100.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(92.43%収率)。LC/MS:C27H36N4O5に対する質量計算値:496.27、実測値:497.25[M+H]+。
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。130.00mgのtert-ブチル4-{2-[3-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}エトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボキシレートを使用して、100.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(92.43%収率)。LC/MS:C27H36N4O5に対する質量計算値:496.27、実測値:497.25[M+H]+。
ステップ8:2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-N-[2-(3-{2-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}フェノキシ)エチル]アセトアミド(INT108-507-80)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。ただし反応時間は2.0時間であった。130.00mgの2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-N-(2-{3-[2-オキソ-2-(ピペラジン-1-イル)エトキシ]フェノキシ}エチル)アセトアミドを使用した。90.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(53.16%収率)。LC/MS:C35H42N4O8に対する質量計算値:646.30、実測値:647.20[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。ただし反応時間は2.0時間であった。130.00mgの2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-N-(2-{3-[2-オキソ-2-(ピペラジン-1-イル)エトキシ]フェノキシ}エチル)アセトアミドを使用した。90.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(53.16%収率)。LC/MS:C35H42N4O8に対する質量計算値:646.30、実測値:647.20[M+H]+。
ステップ9:tert-ブチルN-{17-[3-(4-{2-[3-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}エトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボニル)-2-メトキシフェノキシ]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメート(INT108-507-9)の合成
手順は、(INT102-388-1)と同じであった。ただし反応時間は2.0時間であり、溶媒はMeCNであった。80.00mgの2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-N-[2-(3-{2-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}フェノキシ)エチル]アセトアミドを使用して、60.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(48.02%収率)。LC/MS:C52H75N5O15に対する質量計算値:1009.53、実測値:1010.50[M+H]+。
手順は、(INT102-388-1)と同じであった。ただし反応時間は2.0時間であり、溶媒はMeCNであった。80.00mgの2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-N-[2-(3-{2-[4-(3-ヒドロキシ-2-メトキシベンゾイル)ピペラジン-1-イル]-2-オキソエトキシ}フェノキシ)エチル]アセトアミドを使用して、60.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(48.02%収率)。LC/MS:C52H75N5O15に対する質量計算値:1009.53、実測値:1010.50[M+H]+。
ステップ10:N-(2-{3-[2-(4-{3-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]-2-メトキシベンゾイル}ピペラジン-1-イル)-2-オキソエトキシ]フェノキシ}エチル)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド(INT108-507-10)の合成
手順は、(INT91-010-51)と同じであった。ただし反応時間は1.0時間であった。50.00mgのtert-ブチルN-{17-[3-(4-{2-[3-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}エトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボニル)-2-メトキシフェノキシ]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメートを使用して、40.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(88.80%収率)。LC/MS:C47H67N5O13に対する質量計算値:909.47、実測値:910.60[M+H]+。
手順は、(INT91-010-51)と同じであった。ただし反応時間は1.0時間であった。50.00mgのtert-ブチルN-{17-[3-(4-{2-[3-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}エトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボニル)-2-メトキシフェノキシ]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメートを使用して、40.00mgの所望の生成物を無色の油として得た(88.80%収率)。LC/MS:C47H67N5O13に対する質量計算値:909.47、実測値:910.60[M+H]+。
ステップ11:N-[5-({3-[(2-{[2-({5-[(2-{[2-({17-[3-(4-{2-[3-(2-{2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミド}エトキシ)フェノキシ]アセチル}ピペラジン-1-カルボニル)-2-メトキシフェノキシ]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}カルバモイル)エチル]カルバモイル}-1-メチルイミダゾール-4-イル)カルバモイル]プロピル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物159)の合成。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応時間は2.0時間であり、反応混合物を分取HPLCにより精製した。30.00mgのN-(2-{3-[2-(4-{3-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]-2-メトキシベンゾイル}ピペラジン-1-イル)-2-オキソエトキシ]フェノキシ}エチル)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミドを使用して、6.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(9.51%収率)。HRMS:C98H126N26O24に対する質量計算値:2050.9438、実測値:2051.9442[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応時間は2.0時間であり、反応混合物を分取HPLCにより精製した。30.00mgのN-(2-{3-[2-(4-{3-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)オキシ]-2-メトキシベンゾイル}ピペラジン-1-イル)-2-オキソエトキシ]フェノキシ}エチル)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]アセトアミドを使用して、6.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(9.51%収率)。HRMS:C98H126N26O24に対する質量計算値:2050.9438、実測値:2051.9442[M+H]+。
実施例46.化合物163の合成
ステップ1:{[(4-シアノピリジン-2-イル)メチル]アミノ}酢酸(INT109-511-1)の合成
MeOH(5.00mL)中の2-ホルミルピリジン-4-カルボニトリル(300.00mg、2.27mmol、1.00当量)、及びグリシン(170.45mg、2.27mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、NaBH3CN(285.38mg、4.54mmol、2.00当量)を室温で加えた。反応物を16.0時間撹拌した。反応混合物をセライトパッドを通して濾過した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN(0.05%TFA)、10分間で1%~10%勾配;検出器、UV254nmで逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製し、{[(4-シアノピリジン-2-イル)メチル]アミノ}酢酸(310.00mg、71.41%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C9H9N3O2に対する質量計算値:191.07、実測値:192.10[M+H]+。
MeOH(5.00mL)中の2-ホルミルピリジン-4-カルボニトリル(300.00mg、2.27mmol、1.00当量)、及びグリシン(170.45mg、2.27mmol、1.00当量)の撹拌混合物に、NaBH3CN(285.38mg、4.54mmol、2.00当量)を室温で加えた。反応物を16.0時間撹拌した。反応混合物をセライトパッドを通して濾過した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN(0.05%TFA)、10分間で1%~10%勾配;検出器、UV254nmで逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製し、{[(4-シアノピリジン-2-イル)メチル]アミノ}酢酸(310.00mg、71.41%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C9H9N3O2に対する質量計算値:191.07、実測値:192.10[M+H]+。
ステップ2:((4-カルバモイルピリジン-2-イル)メチル)グリシン(INT109-511-2)の合成
{[(4-シアノピリジン-2-イル)メチル]アミノ}酢酸(310.00mg、1.62mmol、1.00当量)、及びH2SO4(1.00mL、18.76mmol、11.57当量)、TFA(4.00mL、53.85mmol、33.21当量)の混合物を、室温で一晩撹拌した。所望の生成物をLCMSにより検出できた。混合物をNaHCO3でpH=10に塩基性化した。LC/MS:C9H11N3O3に対する質量計算値:209.08、実測値:210.10[M+H]+。混合物にジ-tert-ブチルジカーボネート(1.00mL)を加えた。反応物を室温で2.0時間撹拌した。反応物をLCMSに従って実行した。混合物を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN、20分間で10%~60%勾配;検出器、UV254nmで逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製し、[(tert-ブトキシカルボニル)[(4-カルバモイルピリジン-2-イル)メチル]アミノ]酢酸(60.00mg、11.96%収率)を淡黄色の油として得た。LC/MS:C14H19N3O5に対する質量計算値:309.13、実測値:310.30[M+H]+。
{[(4-シアノピリジン-2-イル)メチル]アミノ}酢酸(310.00mg、1.62mmol、1.00当量)、及びH2SO4(1.00mL、18.76mmol、11.57当量)、TFA(4.00mL、53.85mmol、33.21当量)の混合物を、室温で一晩撹拌した。所望の生成物をLCMSにより検出できた。混合物をNaHCO3でpH=10に塩基性化した。LC/MS:C9H11N3O3に対する質量計算値:209.08、実測値:210.10[M+H]+。混合物にジ-tert-ブチルジカーボネート(1.00mL)を加えた。反応物を室温で2.0時間撹拌した。反応物をLCMSに従って実行した。混合物を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN、20分間で10%~60%勾配;検出器、UV254nmで逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製し、[(tert-ブトキシカルボニル)[(4-カルバモイルピリジン-2-イル)メチル]アミノ]酢酸(60.00mg、11.96%収率)を淡黄色の油として得た。LC/MS:C14H19N3O5に対する質量計算値:309.13、実測値:310.30[M+H]+。
ステップ3:イル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバメート(INT-109-511-3)の合成
MeOH(5.00mL)中のN-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(140.00mg、0.10mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルN-エチル-N-(2-オキソエチル)カルバメート(36.85mg、0.20mmol、2.00当量)の撹拌混合物に、NaBH3CN(24.74mg、0.39mmol、4.00当量)を室温で加えた。反応物を一晩撹拌した。反応混合物を更に精製することなく次のステップで直接使用した。LC/MS:C72H104N24O18に対する質量計算値:1592.80、実測値:797.80[1/2M+H]+。得られた混合物に、ホルムアルデヒド(50.00mg、1.67mmol、14.74当量)及びNaBH3CN(14.19mg、0.23mmol、2.00当量)を室温で加えた。反応物を1.0時間撹拌した。所望の生成物をLCMSにより検出できた。反応混合物を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN(0.05%TFA)、20分間で10%~50%勾配;検出器、UV254nmで逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製し、tert-ブチルN-エチル-N-(18-メチル-1-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバメート(180.00mg、99.13%収率)を無色の油として得た。LC/MS:C73H106N24O18に対する質量計算値:1606.81、実測値:804.75[1/2M+H]+。
MeOH(5.00mL)中のN-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(140.00mg、0.10mmol、1.00当量)、及びtert-ブチルN-エチル-N-(2-オキソエチル)カルバメート(36.85mg、0.20mmol、2.00当量)の撹拌混合物に、NaBH3CN(24.74mg、0.39mmol、4.00当量)を室温で加えた。反応物を一晩撹拌した。反応混合物を更に精製することなく次のステップで直接使用した。LC/MS:C72H104N24O18に対する質量計算値:1592.80、実測値:797.80[1/2M+H]+。得られた混合物に、ホルムアルデヒド(50.00mg、1.67mmol、14.74当量)及びNaBH3CN(14.19mg、0.23mmol、2.00当量)を室温で加えた。反応物を1.0時間撹拌した。所望の生成物をLCMSにより検出できた。反応混合物を減圧下で濃縮した。残留物を以下の条件:カラム、シリカゲル;移動相、水中のMeCN(0.05%TFA)、20分間で10%~50%勾配;検出器、UV254nmで逆フラッシュクロマトグラフィーにより精製し、tert-ブチルN-エチル-N-(18-メチル-1-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバメート(180.00mg、99.13%収率)を無色の油として得た。LC/MS:C73H106N24O18に対する質量計算値:1606.81、実測値:804.75[1/2M+H]+。
ステップ4:1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)-N-{1-メチル-5-[(3-{[1-メチル-2-({2-[(1-メチル-5-{[1-メチル-2-({2-[(18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18,21-ジアザトリコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)イミダゾール-4-イル]カルバモイル}ピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)イミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]ピロール-3-イル}イミダゾール-2-カルボキサミド(INT109-511-4)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。反応後、反応混合物を分取HPLCにより精製した。180.00mgのtert-ブチルN-エチル-N-(18-メチル-1-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバメートを使用した。20.00mgの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(11.85%収率)。LC/MS:C68H98N24O16に対する質量計算値:1506.76、実測値:754.65[1/2M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。反応後、反応混合物を分取HPLCにより精製した。180.00mgのtert-ブチルN-エチル-N-(18-メチル-1-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバメートを使用した。20.00mgの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(11.85%収率)。LC/MS:C68H98N24O16に対する質量計算値:1506.76、実測値:754.65[1/2M+H]+。
ステップ5:tert-ブチルN-[(4-カルバモイルピリジン-2-イル)メチル]-N-{[エチル(18-メチル-1-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバモイル]メチル}カルバメート(INT109-511-5)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。40.00mgの1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)-N-{1-メチル-5-[(3-{[1-メチル-2-({2-[(1-メチル-5-{[1-メチル-2-({2-[(18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18,21-ジアザトリコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)イミダゾール-4-イル]カルバモイル}ピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)イミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]ピロール-3-イル}イミダゾール-2-カルボキサミドを使用した。20.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(41.90%収率)。LC/MS:C82H115N27O20に対する質量計算値:1797.88、実測値:900.60[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応時間は2.0時間であった。40.00mgの1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)-N-{1-メチル-5-[(3-{[1-メチル-2-({2-[(1-メチル-5-{[1-メチル-2-({2-[(18-メチル-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18,21-ジアザトリコサン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)イミダゾール-4-イル]カルバモイル}ピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)イミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]ピロール-3-イル}イミダゾール-2-カルボキサミドを使用した。20.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(41.90%収率)。LC/MS:C82H115N27O20に対する質量計算値:1797.88、実測値:900.60[M+H]+。
ステップ6:2-[({[エチル(18-メチル-1-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバモイル]メチル}アミノ)メチル]ピリジン-4-カルボキサミド(化合物163)の合成。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。反応後、反応混合物を分取HPLCにより精製した。20.00mgのtert-ブチルN-[(4-カルバモイルピリジン-2-イル)メチル]-N-{[エチル(18-メチル-1-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバモイル]メチル}カルバメートを使用した。3.40mgの所望の生成物を褐色の油として得た(14.49%収率)。HRMS:C77H107N27O18に対する質量計算値:1697.8287、実測値:1698.8281[M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。反応後、反応混合物を分取HPLCにより精製した。20.00mgのtert-ブチルN-[(4-カルバモイルピリジン-2-イル)メチル]-N-{[エチル(18-メチル-1-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザイコサン-20-イル)カルバモイル]メチル}カルバメートを使用した。3.40mgの所望の生成物を褐色の油として得た(14.49%収率)。HRMS:C77H107N27O18に対する質量計算値:1697.8287、実測値:1698.8281[M+H]+。
実施例47.化合物164の合成
ステップ1:tert-ブチルN-(7-{4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-イル}ヘプチル)カルバメート(INT110-512-1)の合成
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)と同じであった。反応後、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を逆相カラムにより精製した。50.00mgのN-[(4,6--2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-5-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4-メチル-4’-(ピペラジン-1-イルメチル)-[1,1’-ビフェニル]-3-カルボキサミドを使用して、28.90mgの所望の生成物を白色の固体として得た(40.41%収率)。LC/MS:C46H68N6O5に対する質量計算値:784.53、実測値:785.80[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)と同じであった。反応後、反応混合物を濾過し、濾液を濃縮した。残留物を逆相カラムにより精製した。50.00mgのN-[(4,6--2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-5-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4-メチル-4’-(ピペラジン-1-イルメチル)-[1,1’-ビフェニル]-3-カルボキサミドを使用して、28.90mgの所望の生成物を白色の固体として得た(40.41%収率)。LC/MS:C46H68N6O5に対する質量計算値:784.53、実測値:785.80[M+H]+。
ステップ2:4’-{[4-(7-アミノヘプチル)ピペラジン-1-イル]メチル}-N-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-5-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-カルボキサミド(INT110-512-2)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。23.00mgのtert-ブチルN-(7-{4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-イル}ヘプチル)カルバメートを使用して、22.00mgの所望の生成物の粗生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C41H60N6O3に対する質量計算値:684.47、実測値:685.75[M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。23.00mgのtert-ブチルN-(7-{4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-イル}ヘプチル)カルバメートを使用して、22.00mgの所望の生成物の粗生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C41H60N6O3に対する質量計算値:684.47、実測値:685.75[M+H]+。
ステップ3:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(7-{4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-イル}ヘプチル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物164)の合成。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。33.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、10.70mgの所望の生成物を白色の固体として得た(20.21%収率)。HRMS:C92H119N27O14に対する質量計算値:1825.9430、実測値:1826.9410[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。33.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、10.70mgの所望の生成物を白色の固体として得た(20.21%収率)。HRMS:C92H119N27O14に対する質量計算値:1825.9430、実測値:1826.9410[M+H]+。
実施例48.化合物167の合成の合成
ステップ1:tert-ブチルN-(32-{4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-イル}-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30-デカオキサドトリアコンタン-1-イル)カルバメート(INT111-515-1)の合成
手順はtert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)と同じであったが、反応混合物をPLC-プレートにより精製した。30.00mgのN-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-5-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4-メチル-4’-(ピペラジン-1-イルメチル)-[1,1’-ビフェニル]-3-カルボキサミドを使用して、44.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(73.56%収率)。LC/MS:C61H98N6O15に対する質量計算値:1154.70、実測値:578.85[1/2M+H]+。
手順はtert-ブチルN-[2-(2-{2-[ベンジル(メチル)アミノ]エトキシ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT102-388-1)と同じであったが、反応混合物をPLC-プレートにより精製した。30.00mgのN-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-5-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4-メチル-4’-(ピペラジン-1-イルメチル)-[1,1’-ビフェニル]-3-カルボキサミドを使用して、44.60mgの所望の生成物を白色の固体として得た(73.56%収率)。LC/MS:C61H98N6O15に対する質量計算値:1154.70、実測値:578.85[1/2M+H]+。
ステップ2:4’-{[4-(32-アミノ-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30-デカオキサドトリアコンタン-1-イル)ピペラジン-1-イル]メチル}-N-[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]-5-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4-メチル-[1,1’-ビフェニル]-3-カルボキサミド(INT111-515-2)の合成
手順は、(INT-29-110))と同じであった。35.00mgのtert-ブチルN-(32-{4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-イル}-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30-デカオキサドトリアコンタン-1-イル)カルバメートを使用して、31.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C56H90N6O13に対する質量計算値:1054.65、実測値:1055.95[M+H]+。
手順は、(INT-29-110))と同じであった。35.00mgのtert-ブチルN-(32-{4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-イル}-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30-デカオキサドトリアコンタン-1-イル)カルバメートを使用して、31.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C56H90N6O13に対する質量計算値:1054.65、実測値:1055.95[M+H]+。
ステップ3:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(32-{4-[(3’-{[(4,6-ジメチル-2-オキソ-1H-ピリジン-3-イル)メチル]カルバモイル}-5’-[エチル(オキサン-4-イル)アミノ]-4’-メチル-[1,1’-ビフェニル]-4-イル)メチル]ピペラジン-1-イル}-3,6,9,12,15,18,21,24,27,30-デカオキサドトリアコンタン-1-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物167)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。32.98mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、5.90mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(9.18%収率)。HRMS:C107H149N27O24に対する質量計算値:2196.1268、実測値:2197.1299[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。32.98mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、5.90mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(9.18%収率)。HRMS:C107H149N27O24に対する質量計算値:2196.1268、実測値:2197.1299[M+H]+。
実施例49.化合物171の合成
ステップ1:tert-ブチルN-(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメート(INT112-519-1)の合成
THF(5.00mL)中の4-[2-ホルミル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(100.00mg、0.26mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaBH(OAc)3(164.96mg、0.78mmol、3.00当量)、及びtert-ブチルN-{2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エチル}カルバメート(77.31mg、0.31mmol、1.20当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を50℃で17.0時間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Cl(水性)でクエンチし、残留物をEA(3×10mL)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、tert-ブチルN-(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメート(80.00mg、49.91%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C32H43N9O4に対する質量計算値:617.34、実測値:618.45[M+H]+.
THF(5.00mL)中の4-[2-ホルミル-5-(1-メチルピラゾール-4-イル)-3-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-4-イル]ベンゾニトリル(100.00mg、0.26mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaBH(OAc)3(164.96mg、0.78mmol、3.00当量)、及びtert-ブチルN-{2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エチル}カルバメート(77.31mg、0.31mmol、1.20当量)を室温で少量ずつ加えた。得られた混合物を50℃で17.0時間撹拌した。反応混合物を飽和NH4Cl(水性)でクエンチし、残留物をEA(3×10mL)で抽出し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、濃縮した。残留物をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、CH2Cl2/MeOH(10:1)で溶出して、tert-ブチルN-(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメート(80.00mg、49.91%収率)を黄色の油として得た。LC/MS:C32H43N9O4に対する質量計算値:617.34、実測値:618.45[M+H]+.
ステップ2:tert-ブチルN-(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメート(INT112-519-2)の合成
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル][(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT95-419-102)と同じであった。70.00mgのtert-ブチルN-(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメートを使用して、120.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(126.07%収率)。LC/MS:C47H53N9O6に対する質量計算値:839.41、実測値:840.40[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-[2-(2-{[5-(4-アミノフェニル)ペンタ-2,4-ジイン-1-イル][(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ}エトキシ)エチル]カルバメート(INT95-419-102)と同じであった。70.00mgのtert-ブチルN-(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメートを使用して、120.00mgの所望の生成物を黄色の固体として得た(126.07%収率)。LC/MS:C47H53N9O6に対する質量計算値:839.41、実測値:840.40[M+H]+。
ステップ3:9H-フルオレン-9-イルメチルN-{2-[2-(2-アミノエトキシ)エトキシ]エチル}-N-{[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}カルバメート(INT112-519-3)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。60.00mgのtert-ブチルN-(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメートを使用して、60.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C42H45N9O4に対する質量計算値:739.36、実測値:370.95[1/2M+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。60.00mgのtert-ブチルN-(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}[(9H-フルオレン-9-イルメトキシ)カルボニル]アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバメートを使用して、60.00mgの粗製の所望の生成物を黄色の油として得た。LC/MS:C42H45N9O4に対する質量計算値:739.36、実測値:370.95[1/2M+H]+。
ステップ4:9H-フルオレン-9-イルメチル N-{[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}-N-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}カルバメート(INT112-519-4)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。70.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、55.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(48.44%収率)。LC/MS:C93H104N30O15に対する質量計算値:1880.83、実測値:942.15[M//2+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであった。70.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、55.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(48.44%収率)。LC/MS:C93H104N30O15に対する質量計算値:1880.83、実測値:942.15[M//2+H]+。
ステップ5:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(2-{2-[2-({[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}アミノ)エトキシ]エトキシ}エチル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物171)の合成
手順は、tert-ブチルN-(5-{4-[(2S)-2-アミノ-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]プロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバメート(INT94-417-12)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。55.00mgの9H-フルオレン-9-イルメチル N-{[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}-N-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}カルバメートを使用して、15.50mgの所望の生成物を白色の固体として得た(31.25%収率)。HRMS:C78H94N30O13に対する質量計算値:1658.7617、実測値:1659.7675[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-(5-{4-[(2S)-2-アミノ-3-[(tert-ブチルジフェニルシリル)オキシ]プロパンアミド]フェニル}ペンタ-2,4-ジイン-1-イル)カルバメート(INT94-417-12)と同じであったが、反応混合物を分取HPLCにより精製した。55.00mgの9H-フルオレン-9-イルメチル N-{[5-(4-シアノフェニル)-4-(1-メチルピラゾール-4-イル)-1-[2-(1-メチルピラゾール-4-イル)エチル]イミダゾール-2-イル]メチル}-N-{2-[2-(2-{3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド}エトキシ)エトキシ]エチル}カルバメートを使用して、15.50mgの所望の生成物を白色の固体として得た(31.25%収率)。HRMS:C78H94N30O13に対する質量計算値:1658.7617、実測値:1659.7675[M+H]+。
実施例50.化合物189の合成
ステップ1:4-アジドブタナールの合成(INT113-546-1)
DCM(10.00mL)中の(COCl)2(0.67mL、7.82mmol、3.00当量)の撹拌溶液を-78℃に冷却して、DCM(10.00mL)中のDMSO(1.11mL、15.636mmol、6当量)を2分間かけて滴下して加えた。反応混合物を-78℃で20分間撹拌し、次いで、DCM(5.00mL)中の4-アジドブタン-1-オール(300.00mg、2.61mmol、1.00当量)の溶液を滴下して加えた。反応混合物を-78℃で更に30分間撹拌し、その後、NEt3(2.90mL、20.85mmol、8.00当量)を滴下して加えた。反応混合物を0℃まで温め、5分間撹拌した。飽和NaHCO3水溶液(10mL)を加えて反応物をクエンチした。有機層を分離し、水層をDCM(3×20mL)で抽出した。合わせた有機抽出物をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。これにより、4-アジドブタナール(300.00mg、粗製)を淡黄色の油として得た。粗生成物を、更に精製することなく次のステップで直接使用した。1H NMR(300 MHz,CDCl3)δ:9.80(s,1H),3.63(t,J=6.6 Hz,2H),2.58(t,J=6.0 Hz,2H),1.81-1.96(m,2H).
DCM(10.00mL)中の(COCl)2(0.67mL、7.82mmol、3.00当量)の撹拌溶液を-78℃に冷却して、DCM(10.00mL)中のDMSO(1.11mL、15.636mmol、6当量)を2分間かけて滴下して加えた。反応混合物を-78℃で20分間撹拌し、次いで、DCM(5.00mL)中の4-アジドブタン-1-オール(300.00mg、2.61mmol、1.00当量)の溶液を滴下して加えた。反応混合物を-78℃で更に30分間撹拌し、その後、NEt3(2.90mL、20.85mmol、8.00当量)を滴下して加えた。反応混合物を0℃まで温め、5分間撹拌した。飽和NaHCO3水溶液(10mL)を加えて反応物をクエンチした。有機層を分離し、水層をDCM(3×20mL)で抽出した。合わせた有機抽出物をブライン(20mL)で洗浄し、Na2SO4で乾燥させ、濾過し、真空中で濃縮した。これにより、4-アジドブタナール(300.00mg、粗製)を淡黄色の油として得た。粗生成物を、更に精製することなく次のステップで直接使用した。1H NMR(300 MHz,CDCl3)δ:9.80(s,1H),3.63(t,J=6.6 Hz,2H),2.58(t,J=6.0 Hz,2H),1.81-1.96(m,2H).
ステップ2:tert-ブチルN-(22-アジド-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザドコサン-1-イル)カルバメート(INT113-546-2)の合成
MeOH(5.00mL)中の4-アジドブタナール(300.00mg、2.65mmol、4.04当量)、及びtert-ブチルN-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(250.00mg、0.66mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaBH3CN(123.87mg、1.97mmol、3.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で一晩撹拌した。反応後、反応物を飽和NH4Cl(水性)(10mL)を0℃で加えることによりクエンチした。得られた混合物を真空下で濃縮した。得られた混合物をEtOAc(3x10mL)で抽出した。合わせた有機層を水(2x10mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を分取TLC(CH2Cl2/MeOH=12:1)により精製して、tert-ブチルN-(22-アジド-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザドコサン-1-イル)カルバメート(150.00mg、47.80%収率)を淡黄色の油として得た。LC/MS:C21H43N5O7に対する質量計算値:477.32、実測値:478.20[M+H]+。
MeOH(5.00mL)中の4-アジドブタナール(300.00mg、2.65mmol、4.04当量)、及びtert-ブチルN-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(250.00mg、0.66mmol、1.00当量)の撹拌溶液に、NaBH3CN(123.87mg、1.97mmol、3.00当量)を室温で加えた。得られた混合物を、室温で一晩撹拌した。反応後、反応物を飽和NH4Cl(水性)(10mL)を0℃で加えることによりクエンチした。得られた混合物を真空下で濃縮した。得られた混合物をEtOAc(3x10mL)で抽出した。合わせた有機層を水(2x10mL)で洗浄し、無水Na2SO4で乾燥させた。濾過後、濾液を減圧下で濃縮した。残留物を分取TLC(CH2Cl2/MeOH=12:1)により精製して、tert-ブチルN-(22-アジド-3,6,9,12,15-ペンタオキサ-18-アザドコサン-1-イル)カルバメート(150.00mg、47.80%収率)を淡黄色の油として得た。LC/MS:C21H43N5O7に対する質量計算値:477.32、実測値:478.20[M+H]+。
ステップ3:tert-ブチルN-{17-[N-(4-アジドブチル)-3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメート(INT113-546-3)の合成
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、溶媒はDMAであった。170.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、130.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(53.54%収率)。LC/MS:C72H102N26O18に対する質量計算値:1618.79、実測値:1619.85[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、溶媒はDMAであった。170.00mgの3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパン酸を使用して、130.00mgの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(53.54%収率)。LC/MS:C72H102N26O18に対する質量計算値:1618.79、実測値:1619.85[M+H]+。
ステップ4:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)(4-アジドブチル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(INT113-546-4)の合成
手順は、(INT-29-110)と同じであった。160.00mgのtert-ブチルN-{17-[N-(4-アジドブチル)-3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメートを使用して、160.00mgの粗製の所望の生成物を淡黄色の油として得た。LC/MS:C67H94N26O16に対する質量計算値:1518.73、実測値:761.10[M/2+H]+。
手順は、(INT-29-110)と同じであった。160.00mgのtert-ブチルN-{17-[N-(4-アジドブチル)-3-[(1-メチル-4-{1-メチル-4-[3-({1-メチル-4-[4-({1-メチル-4-[1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-アミド]ピロール-2-イル}ホルムアミド)ブタンアミド]イミダゾール-2-イル}ホルムアミド)プロパンアミド]ピロール-2-アミド}イミダゾール-2-イル)ホルムアミド]プロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル}カルバメートを使用して、160.00mgの粗製の所望の生成物を淡黄色の油として得た。LC/MS:C67H94N26O16に対する質量計算値:1518.73、実測値:761.10[M/2+H]+。
ステップ4:N-{5-[(3-{[2-({2-[(5-{[2-({2-[(4-アジドブチル)({17-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパンアミド]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル})カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)カルバモイル]エチル}カルバモイル)-1-メチルイミダゾール-4-イル]カルバモイル}プロピル)カルバモイル]-1-メチルピロール-3-イル}-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物181)の合成。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、溶媒はDMAであり、固体を分取HPLCにより精製した。70.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、97.30mgの所望の生成物を白色の固体として得た(47.40%収率)。HRMS:C109H156N32O23に対する質量計算値:2281.2021、実測値:2304.1859[M+Na]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、溶媒はDMAであり、固体を分取HPLCにより精製した。70.00mgの(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(2S)-2-[(4-tert-ブチルフェニル)ホルムアミド]-3-フェニルプロパンアミド]プロパンアミド]-4-メチルペンタンアミド]-6-(ジエチルアミノ)ヘキサンアミド]-3-ヒドロキシプロパン酸を使用して、97.30mgの所望の生成物を白色の固体として得た(47.40%収率)。HRMS:C109H156N32O23に対する質量計算値:2281.2021、実測値:2304.1859[M+Na]+。
実施例51.化合物190の合成
ステップ1:tert-ブチル4-[(2-クロロ-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル)アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(INT114-547-1)の合成
THF(50mL、617.15mmol、53.30当量)中の2,4-ジクロロ-6,7-ジメトキシキナゾリン(3.00g、11.58mmol、1当量)の撹拌混合物に、tert-ブチル4-アミノピペリジン-1-カルボキシレート(5.10g、25.47mmol、2.2当量)、及びDIEA(1.80g、13.89mmol、1.2当量)を室温で加えた。得られた混合物を室温で12.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをTHF(50mLx2)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EAで溶出した。5.00gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(91.90%収率)。LC/MS:C20H27ClN4O4に対する質量計算値:422.17、実測値:423.19[M+H]+。
THF(50mL、617.15mmol、53.30当量)中の2,4-ジクロロ-6,7-ジメトキシキナゾリン(3.00g、11.58mmol、1当量)の撹拌混合物に、tert-ブチル4-アミノピペリジン-1-カルボキシレート(5.10g、25.47mmol、2.2当量)、及びDIEA(1.80g、13.89mmol、1.2当量)を室温で加えた。得られた混合物を室温で12.0時間撹拌した。得られた混合物を濾過し、濾過ケーキをTHF(50mLx2)で洗浄した。濾液を減圧下で濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EAで溶出した。5.00gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(91.90%収率)。LC/MS:C20H27ClN4O4に対する質量計算値:422.17、実測値:423.19[M+H]+。
ステップ2:tert-ブチル4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-カルボキシレート(INT114-547-2)の合成
t-BuOH(7mL、73.663mmol、44.50当量)中のtert-ブチル4-[(2-クロロ-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル)アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(700mg、1.655mmol、1当量)の撹拌混合物に、ヘキシルアミン(1674.95mg、16.550mmol、10当量)を室温で加えた。得られた混合物を130℃で4.0時間撹拌した。得られた混合物(EB2104506-100P1及びEB2104506-101P1と合わせた)を減圧下で濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EAで溶出した。2.10gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(86.72%収率)。LC/MS:C26H41N5O4に対する質量計算値:487.32、実測値:488.30[M+H]+。
t-BuOH(7mL、73.663mmol、44.50当量)中のtert-ブチル4-[(2-クロロ-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル)アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレート(700mg、1.655mmol、1当量)の撹拌混合物に、ヘキシルアミン(1674.95mg、16.550mmol、10当量)を室温で加えた。得られた混合物を130℃で4.0時間撹拌した。得られた混合物(EB2104506-100P1及びEB2104506-101P1と合わせた)を減圧下で濃縮した。残留物を、シリカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、PE/EAで溶出した。2.10gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(86.72%収率)。LC/MS:C26H41N5O4に対する質量計算値:487.32、実測値:488.30[M+H]+。
ステップ3:N2-ヘキシル-6,7-ジメトキシ-N4-(ピペリジン-4-イル)キナゾリン-2,4-ジアミン(INT114-547-3)の合成
手順は、(INT91-010-51)と同じであった。1.90gのtert-ブチル4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-カルボキシレートを使用して、1.70gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(101.33%収率)。LC/MS:C21H33N5O2に対する質量計算値:387.53、実測値:388.20[M+H]+。
手順は、(INT91-010-51)と同じであった。1.90gのtert-ブチル4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-カルボキシレートを使用して、1.70gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(101.33%収率)。LC/MS:C21H33N5O2に対する質量計算値:387.53、実測値:388.20[M+H]+。
ステップ4:tert-ブチルN-[17-(4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメート(INT114-547-4)の合成
手順は、tert-ブチルN-(17-[4-[(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(INT91-010-50)と同じであったが、反応塩基はCs2CO3であり、反応時間は4.0時間であった。300.00mgのN2-ヘキシル-6,7-ジメトキシ-N4-(ピペリジン-4-イル)キナゾリン-2,4-ジアミンを使用して、330.00mgの所望の生成物を淡黄色の油として得た(56.76%収率)。LC/MS:C38H66N6O9に対する質量計算値:750.49、実測値:751.35[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-(17-[4-[(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(INT91-010-50)と同じであったが、反応塩基はCs2CO3であり、反応時間は4.0時間であった。300.00mgのN2-ヘキシル-6,7-ジメトキシ-N4-(ピペリジン-4-イル)キナゾリン-2,4-ジアミンを使用して、330.00mgの所望の生成物を淡黄色の油として得た(56.76%収率)。LC/MS:C38H66N6O9に対する質量計算値:750.49、実測値:751.35[M+H]+。
ステップ5:N4-[1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)ピペリジン-4-イル]-N2-ヘキシル-6,7-ジメトキシキナゾリン-2,4-ジアミン(INT114-547-5)の合成
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであったが、反応時間は4.0時間であった。320.00mgのtert-ブチルN-[17-(4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメートを使用して、274.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(98.80%収率)。LC/MS:C32H56N6O7に対する質量計算値:650.44、実測値:651.35[M+H]+。
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであったが、反応時間は4.0時間であった。320.00mgのtert-ブチルN-[17-(4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメートを使用して、274.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(98.80%収率)。LC/MS:C32H56N6O7に対する質量計算値:650.44、実測値:651.35[M+H]+。
ステップ6:N-(5-{[3-({2-[(2-{[5-({2-[(2-{[17-(4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)プロピル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物190)の合成
手順は、(INT61-025-20)と同じであった。36.46mgのN4-[1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)ピペリジン-4-イル]-N2-ヘキシル-6,7-ジメトキシキナゾリン-2,4-ジアミンを使用して、3.10mgの所望の生成物を白色の固体として得た(4.01%収率)。HRMS:C84H117N27O18に対する質量計算値:1791.91、実測値:1792.91[M+H]+。
手順は、(INT61-025-20)と同じであった。36.46mgのN4-[1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)ピペリジン-4-イル]-N2-ヘキシル-6,7-ジメトキシキナゾリン-2,4-ジアミンを使用して、3.10mgの所望の生成物を白色の固体として得た(4.01%収率)。HRMS:C84H117N27O18に対する質量計算値:1791.91、実測値:1792.91[M+H]+。
実施例52.化合物192の合成
ステップ1:tert-ブチル4-{[6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-カルボキシレート(INT115-549-1)の合成
手順は、tert-ブチル4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-カルボキシレート。(INT114-547-2)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。700.00mgのtert-ブチル4-[(2-クロロ-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル)アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレートを使用して、1.50gの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(64.05%収率)。LC/MS:C25H37N5O4に対する質量計算値:471.28、実測値:472.20[M+H]+。
手順は、tert-ブチル4-{[2-(ヘキシルアミノ)-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-カルボキシレート。(INT114-547-2)と同じであったが、反応時間は1.0時間であった。700.00mgのtert-ブチル4-[(2-クロロ-6,7-ジメトキシキナゾリン-4-イル)アミノ]ピペリジン-1-カルボキシレートを使用して、1.50gの所望の生成物をオフホワイト色の固体として得た(64.05%収率)。LC/MS:C25H37N5O4に対する質量計算値:471.28、実測値:472.20[M+H]+。
ステップ2:6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)-N-(ピペリジン-4-イル)キナゾリン-4-アミン(INT115-549-2)の合成
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。1.40gのtert-ブチル4-{[6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-カルボキシレートを使用して、1.60gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(130.58%収率)。LC/MS:C20H29N5O2に対する質量計算値:371.23、実測値:372.15[M+H]+。
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであった。1.40gのtert-ブチル4-{[6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-カルボキシレートを使用して、1.60gの所望の生成物を淡黄色の固体として得た(130.58%収率)。LC/MS:C20H29N5O2に対する質量計算値:371.23、実測値:372.15[M+H]+。
ステップ3:tert-ブチルN-[17-(4-{[6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメート(INT115-549-3)の合成
手順は、tert-ブチルN-(17-[4-[(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(INT91-010-50)と同じであったが、反応塩基はCs2CO3であり、反応時間は4.0時間であった。300.00mgの6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)-N-(ピペリジン-4-イル)キナゾリン-4-アミンを使用して、440.00mgの所望の生成物を淡黄色の油として得た(74.13%収率)。LC/MS:C37H62N6O9に対する質量計算値:734.46、実測値:735.35[M+H]+。
手順は、tert-ブチルN-(17-[4-[(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)カルバモイル]ピペリジン-1-イル]-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)カルバメート(INT91-010-50)と同じであったが、反応塩基はCs2CO3であり、反応時間は4.0時間であった。300.00mgの6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)-N-(ピペリジン-4-イル)キナゾリン-4-アミンを使用して、440.00mgの所望の生成物を淡黄色の油として得た(74.13%収率)。LC/MS:C37H62N6O9に対する質量計算値:734.46、実測値:735.35[M+H]+。
ステップ4:N-[1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)ピペリジン-4-イル]-6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-アミン(INT115-549-4)の合成
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであったが、反応時間は4.0時間であった。430.00mgのtert-ブチルN-[17-(4-{[6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメートを使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(13.46%収率)。LC/MS:C32H54N6O7に対する質量計算値:634.41、実測値:635.30[M+H]+。
手順は、1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)-N-(5-[[(5-tert-ブチル-1,3-オキサゾール-2-イル)メチル]スルファニル]-1,3-チアゾール-2-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド(INT91-010-51)と同じであったが、反応時間は4.0時間であった。430.00mgのtert-ブチルN-[17-(4-{[6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバメートを使用して、50.00mgの所望の生成物を黄色の油として得た(13.46%収率)。LC/MS:C32H54N6O7に対する質量計算値:634.41、実測値:635.30[M+H]+。
ステップ5:N-(5-{[3-({2-[(2-{[5-({2-[(2-{[17-(4-{[6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-イル]アミノ}ピペリジン-1-イル)-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)-1-メチルピロール-3-イル]カルバモイル}エチル)カルバモイル]-1-メチルイミダゾール-4-イル}カルバモイル)プロピル]カルバモイル}-1-メチルピロール-3-イル)-1-メチル-4-(3-{[1-メチル-4-(1-メチルイミダゾール-2-アミド)ピロール-2-イル]ホルムアミド}プロパンアミド)イミダゾール-2-カルボキサミド(化合物192)の合成。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応時間は4.0時間であり、反応混合物を分取HPLCにより精製した。32.83mgのN-[1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)ピペリジン-4-イル]-6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-アミンを使用して、1.70mgの所望の生成物を白色の固体として得た(2.22%収率)。LC/MS:C83H113N27O18に対する質量計算値:1775.88、実測値:1776.87[M+H]+。
手順は、(INT61-04-OH-21)と同じであったが、反応時間は4.0時間であり、反応混合物を分取HPLCにより精製した。32.83mgのN-[1-(17-アミノ-3,6,9,12,15-ペンタオキサヘプタデカン-1-イル)ピペリジン-4-イル]-6,7-ジメトキシ-2-(ピペリジン-1-イル)キナゾリン-4-アミンを使用して、1.70mgの所望の生成物を白色の固体として得た(2.22%収率)。LC/MS:C83H113N27O18に対する質量計算値:1775.88、実測値:1776.87[M+H]+。
実施例53.本開示の追加化合物の合成
本出願の化合物を、実施例1~52と同様の方法によって作製した。分析データの概要を表7に示す。
本出願の化合物を、実施例1~52と同様の方法によって作製した。分析データの概要を表7に示す。
生物学的実施例
実施例B1.生物学的アッセイ
以下に記載される方法を使用して、開示される分子の結合及び治療における有効性を実証する。概して、アッセイは、CAG又はCTG反復(例えば、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、atn、及びTCF4をコードする遺伝子を含む標的遺伝子の発現レベルに対する、開示された分子の効果を評価することを目的とする。
実施例B1.生物学的アッセイ
以下に記載される方法を使用して、開示される分子の結合及び治療における有効性を実証する。概して、アッセイは、CAG又はCTG反復(例えば、dmpk、atxnl、atxn2、atxn3、cacna1a、atxn7、ppp2r2b、tbp、htt、jph3、ar、atn、及びTCF4をコードする遺伝子を含む標的遺伝子の発現レベルに対する、開示された分子の効果を評価することを目的とする。
遺伝子発現
CAG又はCTG反復を含む標的遺伝子の発現を、当該分野で既知の技術によってアッセイした。これらのアッセイは、定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)、マイクロアレイ、又は多重RNAシークエンシング(RNA-seq)を含むが、これらに限定されず、選択されたアッセイは、標的遺伝子の総発現、又は対立遺伝子特異的発現のいずれかを測定する。例示的なアッセイは、Freeman WM et al.,“Quantitative RT-PCR:pitfalls and potential”,BioTechniques 1999,26,112-125、Dudley AM et al,“Measuring absolute expression with microarrays with a calibrated reference sample and an extended signal intensity range”,PNAS USA 2002,99(11),7554-7559、Wang Z et al.,“RNA-Seq:a revolutionary tool for transcriptomics” Nature Rev.Genetics 2009,10,57-63に見出される。
CAG又はCTG反復を含む標的遺伝子の発現を、当該分野で既知の技術によってアッセイした。これらのアッセイは、定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)、マイクロアレイ、又は多重RNAシークエンシング(RNA-seq)を含むが、これらに限定されず、選択されたアッセイは、標的遺伝子の総発現、又は対立遺伝子特異的発現のいずれかを測定する。例示的なアッセイは、Freeman WM et al.,“Quantitative RT-PCR:pitfalls and potential”,BioTechniques 1999,26,112-125、Dudley AM et al,“Measuring absolute expression with microarrays with a calibrated reference sample and an extended signal intensity range”,PNAS USA 2002,99(11),7554-7559、Wang Z et al.,“RNA-Seq:a revolutionary tool for transcriptomics” Nature Rev.Genetics 2009,10,57-63に見出される。
標的遺伝子の翻訳産物の産生を、当該分野で既知の技術によってアッセイした。これらのアッセイは、ウエスタンブロットアッセイを含むが、これらに限定されず、選択されたアッセイは、標的遺伝子の総タンパク質発現、又は対立遺伝子特異的発現のいずれかを測定する。
アッセイでの使用のために、2つの組織モデル及び2つの動物モデルが企図される。
疾患モデルI:ヒト細胞培養
このモデルは、線維芽細胞、人工多能性幹細胞、及び幹細胞から分化した細胞を含む患者由来細胞で構成される。特に、疾患の影響を示す細胞型、例えば、神経細胞型に注意が払われる。
このモデルは、線維芽細胞、人工多能性幹細胞、及び幹細胞から分化した細胞を含む患者由来細胞で構成される。特に、疾患の影響を示す細胞型、例えば、神経細胞型に注意が払われる。
疾患モデルII:マウス細胞培養
このモデルは、線維芽細胞、人工多能性幹細胞、幹細胞から分化した細胞、及び疾患の影響を示す初代細胞、例えば、神経細胞型を含む、疾患症状に特に関与する組織からのマウスからの細胞培養物で構成される。
このモデルは、線維芽細胞、人工多能性幹細胞、幹細胞から分化した細胞、及び疾患の影響を示す初代細胞、例えば、神経細胞型を含む、疾患症状に特に関与する組織からのマウスからの細胞培養物で構成される。
疾患モデルIII:マウス
このモデルは、その遺伝子型が疾患表現型の関連する反復数を含むマウスで構成され、これらのモデルは、予想される改変した遺伝子発現(例えば、標的遺伝子の発現の調節)を示すべきである。
このモデルは、その遺伝子型が疾患表現型の関連する反復数を含むマウスで構成され、これらのモデルは、予想される改変した遺伝子発現(例えば、標的遺伝子の発現の調節)を示すべきである。
疾患モデルIV:マウス
このモデルは、その遺伝子型が、疾患患者からのヒト遺伝子座のノックインを含むマウスで構成され、これらのモデルは、これらのモデルは、予想される改変した遺伝子発現(例えば、標的遺伝子の発現の調節)を示すべきである。
このモデルは、その遺伝子型が、疾患患者からのヒト遺伝子座のノックインを含むマウスで構成され、これらのモデルは、これらのモデルは、予想される改変した遺伝子発現(例えば、標的遺伝子の発現の調節)を示すべきである。
本出願で引用されている米国又は外国の全ての参考文献、特許又は出願は、それらの全体が本明細書に記載されているかのように、参照により本明細書に組み込まれる。何らかの矛盾が生じる場合、本明細書に文字通り開示される内容が優先される。
実施例B2.EC50アッセイ
DM1病巣低減アッセイ法:筋強直性ジストロフィー1罹患患者線維芽細胞(Coriell GM04602;1600 CTG反復)及び野生型線維芽細胞(Coriell GM07492;対照株)を、10%FBS及び1×ペニシリン/ストレプトマイシンを補充したGibco DMEM(1×)+4.5g/L D-グルコース+L-グルタミン+110mg/Lピルビン酸ナトリウムで別々に培養した。細胞を48~72時間ごとに培地を新鮮なものにして、37℃、5%CO2のインキュベーター内で維持した。
DM1病巣低減アッセイ法:筋強直性ジストロフィー1罹患患者線維芽細胞(Coriell GM04602;1600 CTG反復)及び野生型線維芽細胞(Coriell GM07492;対照株)を、10%FBS及び1×ペニシリン/ストレプトマイシンを補充したGibco DMEM(1×)+4.5g/L D-グルコース+L-グルタミン+110mg/Lピルビン酸ナトリウムで別々に培養した。細胞を48~72時間ごとに培地を新鮮なものにして、37℃、5%CO2のインキュベーター内で維持した。
90~95%の培養密度で、両方の細胞株をTrypl-Eを使用して採取し、次いで500xgで5分間ペレット化し、培地中に再懸濁した。DM1線維芽細胞を、200μL培地中5,000細胞/ウェルの密度でAgilent 96ウェル黒色プレートに播種し、8つのウェルを対照線維芽細胞用に確保した。プレートを戻し、37℃、5%CO2で24時間インキュベートした。
化合物を10mMストックからDMSO中で1mMに希釈し、次いで培地中でもう一度6μM(2x濃度)に希釈した。培地を全てのプレートから除去し、細胞に100μLの培地を補充した。細胞を、細胞を含む100μL培地に100μLの6μM(2x濃度)化合物を加えることにより、8点用量反応、1:3倍希釈、3μM最高用量で処理した。プレートを戻し、37℃及び5% CO2で48時間の経時実験のためにインキュベートした。
処理後、化合物を除去し、プレートをPBSで洗浄し、次いで細胞を75μLの4%PFA溶液中で室温で20分間固定した。プレートをPBSで2回、冷70%エタノールで2回洗浄した後、250μLの冷70%エタノールで24~72時間、-20℃で透過処理した。
透過化後、プレートを30%ホルムアミド及び2× SSC緩衝液で1回洗浄し、その緩衝液中で室温で15分間再水和した。細胞を、30%ホルムアミド、2× SSC、25mg/mLデキストラン硫酸、2.5mg/mL BSA、0.2μg/mL ニシン精子DNA、2mMバナジル-リボヌクレオシド複合体、及び5nM CAG10-Cy3プローブを含む、75μLのハイブリダイゼーション溶液中で37℃で一晩インキュベートした。
プレートを、2×SSC緩衝液中の30%ホルムアミドで1回洗浄し、次いで、インキュベーティングプレートシェーカー中、37℃、300RPMで30分間、緩衝液で2回洗浄した。細胞を、室温で5分間、PBS中の2.5μg/mL DAPI 75μLで染色した。次いで、プレートをPBSで2回洗浄し、250μLのPBS中に保存した。プレートを接着箔で密封し、70%エタノールで拭いた。
細胞は、各ウェルの4つの領域から20x対物サンプリングを使用してCytation5で画像化した。核をDAPIチャネル下で捕捉し、病巣をRFPチャネル下で捕捉した。プレートを、ウェルごと、核ごとの平均病巣に基づいて分析した。活性化合物は、用量応答性の様式で、陰性対照細胞から核当たりの病巣の有意な減少を示した化合物として定義した。
FECDにおける病巣の縮小:F35T細胞を、8%FBS、20μg/mLアスコルビン酸、200mg/mL CaCl2、0.08%コンドロイチン硫酸、1Xペニシリン/ストレプトマイシン、100μg/mLウシ下垂体抽出物、5ng/mL上皮成長因子、及び20ng/mL神経成長因子を補充したOpti-MEM(ThermoFisher)を含む培地で培養した。培養中、細胞を37℃、5%CO2のインキュベーター内で維持した。培地を48時間ごとに新鮮なものに交換した。細胞が適切な培養密度に達したら、それらを採取し、補充された200μLのOpti-MEM培地中でウェル当たり5000細胞の密度で96ウェルプレートに播種した。細胞をインキュベーターに戻し、37℃、5% CO2で24時間放置した。次いで、細胞を化合物又は陰性対照で8点用量応答で処理し、37℃、5%CO2で48時間インキュベートした。処理後、細胞を室温で4%PFAで20分間固定し、続いて70%のエタノールで透過処理した。細胞を-20℃で最小1時間、最大72時間インキュベートした後、エタノールを除去し、細胞をPBSで洗浄した。細胞を30%ホルムアミド及び2XSSC緩衝液で10分間室温で再水和した。次いで、細胞を、30%ホルムアミド、2XSSC、55mg/mLデキストラン硫酸、2.75mg/mLウシ血清アルブミン、0.2μg/mLニシン精子DNA、1%バナジル-リボヌクレオシド複合体、及び0.05% 10μM CAG10-Cy3プローブを含むハイブリダイゼーション溶液中で37℃で一晩インキュベートした。細胞を、2XSSC中の30%ホルムアミドで2回洗浄し、2回目の洗浄では37℃、200rpmで60分間振盪しながら細胞をインキュベートした。細胞をPBS中の5mg/mL DAPI 1:1000で染色し、室温で5分間インキュベートした。次いで、細胞をPBSで洗浄し、各ウェルに最終体積150μLのPBSを入れて接着箔で密封した。細胞をCytation 5で画像化し、核ごとの病巣に基づいて分析した。活性化合物は、用量応答性の様式で、陰性対照細胞から核当たりの病巣の有意な減少を示した化合物として定義した。
代表的なインビトロ生化学データを表8に提示する。A<100nM;Bは100nM~500nMであり;C>500nM。
実施例B3.病巣縮小
図1は、本開示の代表的な化合物で48時間処理した後のDM1線維芽細胞(1000反復)処理結果と、ディナシクリブ又は未処理(NT)との対比を示す。図2は、本開示の代表的な化合物で6日間処理した後の線維芽細胞を示す。
図1は、本開示の代表的な化合物で48時間処理した後のDM1線維芽細胞(1000反復)処理結果と、ディナシクリブ又は未処理(NT)との対比を示す。図2は、本開示の代表的な化合物で6日間処理した後の線維芽細胞を示す。
本発明の好ましい実施形態が本明細書に示され、記載されているが、そのような実施形態が例としてのみ提供されることは、当業者には明白であろう。本発明から逸脱することなく、多数の変形、変更、及び置換がここで当業者に想起されるであろう。本明細書に記載される本発明の実施形態に対する様々な代替案が、本発明の実施において用いられ得ることは理解されるべきである。以下の特許請求の範囲は、本発明の範囲を定義し、これらの特許請求の範囲及びそれらの等価物の範囲内の方法及び構造が、それによって包含されることが意図される。
Claims (67)
- 第1の末端、第2の末端、及びリンカー部分を有する転写モジュレータ分子であって、
a)前記第1の末端が、ヌクレオチド反復配列CTG又はCAGと非共有結合することができるDNA結合部分を含み、
b)前記第2の末端が、前記ヌクレオチド反復配列CTG又はCAGを含む遺伝子の発現を調節する制御分子と結合することができるタンパク質結合部分を含み、
c)前記リンカー部分が、前記第1の末端及び前記第2の末端を接続し、
前記第1が、式(A-2’)の構造、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物を含み、
各X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7が、独立して、O、S、又はNR1Dであり、
各Y1、Y2、Y3、Y4、Y5、Y6、及びY7が、独立して、CH又はNであり、
W1が、水素、任意に置換される5~10員ヘテロアリール、C1-C6アルキル、-C(O)-NR1ER1F、-NR1E-C(O)-NR1ER1Fであり
W2が、任意に置換される5~10員ヘテロアリール、C1-C6アルキル、又は-C(O)-NR1ER1Fであり、
m1が、0、1、2、又は3であり、
n1が、0、1、2、又は3であり、
p1が、1、2、3、又は4であり、
各R1D及びR1Eが、独立して、水素、又は任意に置換されるC1-C6アルキルであり、
R1Fが、水素、任意に置換されるC1-C10アルキル、C1-C10ヘテロアルキル、PEG1-20、又は1つ以上のAAであり、AAが、β-アラニン、リジン、及びアルギニンから選択される1つ以上のアミノ酸であり、
R1Hが、水素、アミノ、シアノ、又は任意にC1-C10アルキル、C2-C10ヘテロアルキルである、転写モジュレータ分子。 - 前記第1の末端が、直鎖状ポリアミドを含む、請求項1に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記ポリアミドが、500nM未満の親和性で前記DNAと結合することができる、請求項1又は2に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- W2が、-C(O)-NR1ER1Fである、請求項1~3のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- W2が、-C(O)-(β-アラニン)である、請求項1~4のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記第1の末端が、式(A-2)の構造、又はその薬学的に許容され得る塩、溶媒和物、若しくは水和物を含み、
各X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7が、独立して、O、S、又はNR1Dであり、
各Y1、Y2、Y3、Y4、Y5、Y6、及びY7が、独立して、CH又はNであり、
W1が、水素、任意に置換される5~10員ヘテロアリール、C1-C6アルキル、-C(O)-NR1ER1F、又は-NR1E-C(O)-NR1ER1Fであり
m1が、0、1、2、又は3であり、
n1が、0、1、2、又は3であり、
p1が、1、2、3、又は4であり、
各R1D及びR1Eが、独立して、水素又はC1-C6アルキルであり、
R1Fが、水素、任意に置換されるC1-C10アルキル、C2-C10ヘテロアルキル、PEG1-20、又は1つ以上のAAであり、AAが、β-アラニン、リジン、及びアルギニンから選択される1つ以上のアミノ酸である、請求項1~5のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。 - 各X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7が、独立して、-NR1Dであり、R1Dが、C1-C6アルキルである、請求項1又は6に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 各X1、X2、X3、X4、X5、X6、及びX7が、独立して、-NCH3である、請求項1、6、又は7のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- m1が、0又は1であり、n1が、0又は1である、請求項1~8のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- p1が、2又は3である、請求項1~9のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- W1が、水素、又は任意に置換される5~10員ヘテロアリールである、請求項1~10のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記5~10員ヘテロアリールが、ピロール又はイミダゾールである、請求項11に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- W1が、水素である、請求項1~11のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記第1の末端が、式(A-3)
- 前記第1の末端が、式(A-4)
- 前記第1の末端が、式(A-5)
- 前記第1の末端が、以下の構造
- 前記リンカーが、約50オングストローム未満の長さを有する、請求項1~17のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記リンカーが、約10~60オングストロームの長さを有する、請求項1~17のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記リンカーが、約20~40オングストロームの長さを有する、請求項1~17のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記リンカーが、2~50個のスペーシング部分を有する多量体を含み、前記スペーシング部分が、独立して、-((CR3aR3b)x-O)y-、-((CR3aR3b)x-NR4a)y-、-((CR3aR3b)x-CH=CH-(CR3aR3b)x-O)y-、任意に置換される-C1-12アルキル、任意に置換されるC2-10アルケニル、任意に置換されるC2-10アルキニル、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレン、アミノ酸残基、-O-、-C(O)NR4a-、-NR4aC(O)-、-C(O)-、-NR4a-、-C(O)O-、-O-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-SO2NR4a-、-NR4aSO2-、及び-P(O)OH-、並びにそれらの任意の組み合わせからなる群から選択され、
各xが、独立して、2~4であり、
各yが、独立して、1~10であり、
各R3a及びR3bが、独立して、水素、任意に置換されるアルキル、任意に置換されるアルケニル、任意に置換されるアルキニル、任意に置換されるアルコキシ、任意に置換されるアミノ、カルボキシル、カルボキシルエステル、アシル、アシルオキシ、アシルアミノ、アミノアシル、任意に置換されるアルキルアミド、スルホニル、任意に置換されるチオアルコキシ、任意に置換されるアリール、任意に置換されるヘテロアリール、任意に置換されるシクロアルキル、及び任意に置換されるヘテロシクリルから選択され、
各R4aが、独立して、水素又は任意に置換されるC1-6アルキルである、請求項1~20のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。 - オリゴマー骨格が、-(T1-V1)a-(T2-V2)b-(T3-V3)c-(T4-V4)d-(T5-V5)e-を含み、
式中、a、b、c、d、及びeが、各々独立して、0又は1であり、a、b、c、d、及びeの合計が、1~5であり、
T1、T2、T3、T4、及びT5が、各々独立して、任意に置換される(C1-C12)アルキレン、任意に置換されるアルケニレン、任意に置換されるアルキニレン、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(修飾PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、任意に置換される(C6-C10)アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレン、ジスルフィド、ヒドラジン、炭水化物、ベータ-ラクタム、及びエステルから選択され、
各m、p、及びwが、独立して、1~20の整数であり、
nが、1~30の整数であり、
hが、1~12の整数であり、
EAが、以下の構造を有し、
各xが、独立して、2~4の整数であり、
各rが、独立して、0又は1であり、
(PEG)nが、-(CR2aR2b-CR2aR2b-O)n-CR2aR2b-の構造を有し、
(修飾PEG)nが、(PEG)nの少なくとも1つの-(CR2aR2b-CR2aR2b-O)-を-(CH2-CR2a=CR2a-CH2-O)-又は-(CR2aR2b-CR2aR2b-S)-に置き換えた構造を有し、
AAが、アミノ酸残基であり、
V1、V2、V3、V4、及びV5が、各々独立して、結合、-CO-、-NR1a-、-CONR1a-、-NR1aCO-、-CONR1aC1-4アルキル-、-NR1aCO-C1-4アルキル-、-C(O)O-、-OC(O)-、-O-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-SO2NR1a-、-NR1aSO2-、及び-P(O)OH-からなる群から選択され、
各R1aが、独立して、水素、又は及び任意に置換されるC1-6アルキルであり、各R2a及びR2bが、独立して、水素、アルキル、置換アルキル、アルケニル、置換アルケニル、アルキニル、置換アルキニル、ハロゲン、アルコキシ、置換アルコキシ、アミノ、置換アミノ、カルボキシル、カルボキシルエステル、アシル、アシルオキシ、アシルアミノ、アミノアシル、アルキルアミド、置換アルキルアミド、スルホニル、チオアルコキシ、置換チオアルコキシ、アリール、置換アリール、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、シクロアルキル、置換シクロアルキル、ヘテロシクリル、及び置換ヘテロシクリルから選択される、請求項1~20のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - T1、T2、T3、T4、及びT5が、各々独立して、(C1-C12)アルキル、置換(C1-C12)アルキル、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(修飾PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、任意に置換されるフェニル、ピペリジン-4-アミノ(P4A)、ピペリジン-3-アミノ、ピペラジン、ピロリジン-3-アミノ、アゼチジン-3-アミノ、パラ-アミノ-ベンジルオキシカルボニル(PABC)、メタ-アミノ-ベンジルオキシカルボニル(MABC)、パラ-アミノ-ベンジルオキシ(PABO)、メタ-アミノ-ベンジルオキシ(MABO)、パラアミノベンジル、アセタール基、ジスルフィド、ヒドラジン、炭水化物、ベータ-ラクタム、エステル、(AA)p-MABC-(AA)p、(AA)p-MABO-(AA)p、(AA)p-PABO-(AA)p、及び(AA)p-PABC-(AA)pから選択される、請求項22に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- ピペリジン-4-アミノ(P4A)が、
- T1、T2、T3、T4、及びT5が、各々独立して、(C1-C12)アルキル、置換(C1-C12)アルキル、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(修飾PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、任意に置換される(C6-C10)アリーレン、4~10員ヘテロシクロアルケン、及び任意に置換される5~10員ヘテロアリーレンから選択される、請求項22に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記リンカーが、-N(R1a)(CH2)xN(R1b)(CH2)xN-を含み、式中、R1a及びR1bが、各々独立して、水素又は任意に置換されるC1-C6アルキルから選択され、各xが、独立して、1~6の範囲の整数である、請求項1~25のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記リンカーが、-(CH2-C(O)N(R’’)-(CH2)q-N(R’)-(CH2)q-N(R’’)C(O)-(CH2)x-C(O)N(R’’)-A-、-(CH2)x-C(O)N(R’’)-(CH2CH2O)y(CH2)x-C(O)N(R’’)-A-、-C(O)N(R’’)-(CH2)q-N(R’)-(CH2)q-N(R’’)C(O)-(CH2)x-A-、-(CH2)x-O-(CH2CH2O)y-(CH2)x-N(R’’)C(O)-(CH2)x-A-、又は-N(R’’)C(O)-(CH2)-C(O)N(R’’)-(CH2)x-O(CH2CH2O)y(CH2)x-A-を含み、式中、R’が、メチルであり、R’’が、水素であり、各x及びyが、独立して、1~10の整数であり、各qが、独立して、2~10の整数であり、各Aが、独立して、結合、任意に置換されるC1-12アルキル、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、及び任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレンから選択される、請求項1~25のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記リンカーが、式(C-1)
式中、
環Bが、非存在、アリーレン、又はヘテロシクロアクリレンであり、
L5が、非存在、任意に置換されるアルキレン、又はアルケニレンであり、
各Y8及びY9が、独立して、CH又はNであり、
s1が、0~3であり、
**が、前記第2の末端との結合を示す、請求項1~27のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。 - 前記リンカーが、式(C-2)
式中、各Y10及びY11が、独立して、N又はCHである、請求項28に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。 - 前記リンカーが、式(C-3)
式中、
s1が、0~3であり、
s2が、1~3であり、
R26が、任意に置換されるC1-20アルキレン又はヘテロアルキレンであり、
各R1Gが、独立して、水素又はC1-C3アルキルであり、
**が、前記第2の末端との結合を示す、請求項28に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。 - 前記リンカーが、-CO-、-NR1a-、-CONR1a-、-NR1aCO-、-CONR1aC1-4アルキル-、-NR1aCO-C1-4アルキル-、-C(O)O-、-OC(O)-、-O-、-S-、-S(O)-、-SO2-、-SO2NR1a-、-NR1aSO2-、-P(O)OH-、-((CH2)x-O)-、-((CH2)y-NR1a)-、任意に置換される-C1-12アルキレン、任意に置換されるC2-10アルケニレン、任意に置換されるC2-10アルキニレン、任意に置換されるC6-10アリーレン、任意に置換されるC3-7シクロアルキレン、任意に置換される5~10員ヘテロアリーレン、及び任意に置換される4~10員ヘテロシクロアルキレンから選択される基で前記第1の末端と結合され、各x及びyが、独立して、1~4であり、各R1aが、独立して、水素又は任意に置換されるC1-6アルキルである、請求項1~30のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記リンカーが、-CO-、-NR1a-、C1-12アルキル、-CONR1a-、及び-NR1aCO-から選択される基で前記第1の末端と結合され、各R1aが、独立して、水素又は任意に置換されるC1-6アルキルである、請求項1~31のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記第2の末端が、制御タンパク質と結合することができる部分を含み、前記部分が、前記制御タンパク質と結合することができる化合物に由来する、請求項1~32のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記第2の末端が、ブロモドメイン阻害剤、BPTF阻害剤、メチルシトシンジオキシゲナーゼ阻害剤、DNAデメチラーゼ阻害剤、ヘリカーゼ阻害剤、アセチルトランスフェラーゼ阻害剤、ヒストン脱アセチル化酵素阻害剤、CDK-9阻害剤、陽性転写伸長因子阻害剤、及びポリコーム抑制複合体阻害剤から選択される、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記第2の末端が、CDK9阻害剤である、請求項34に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物
- 前記第2の末端が、CDK9i、CDK7i、CDK12/13i、汎-CDKi、L3MBTL3リクルータ、CBXリクルータ、又はEEDリクルータから選択される、請求項34に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記第2の末端が、PRC1又はPRC2のリクルータである、請求項34に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記第2の末端が、Brd4結合部分ではない、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物。
- 前記第2の末端が、式(C)
式中、
環Aが、5~10員ヘテロアリール又はヘテロシクロアルキルであり、
A1及びA2が、各々独立して、CH又はNであり、
B1及びB2が、各々独立して、O、S、又はNR5であり、
Z1が、O、S、又はNR5であり、
各R3及びR4が、独立して、水素、ハロゲン、又はC1-C6アルキルであり、
R5が、水素又はC1-C6アルキルである、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - 前記第2の末端が、式(C-1)
- 前記第2の末端が、式(D)
式中、
L3が、任意に置換されるアルキレン又はヘテロアルキレンであり、
各R6、R7、R8、及びR9が、独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
R10Aが、水素、C1-C6アルキル、又はSO2-R10Cであり、
R10Bが、独立して、水素又はC1-C6アルキルであり、
R10Cが、C1-C6アルキル又はアリールである、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - 前記第2の末端が、式(D-1)
- 前記第2の末端が、式(D-2)
- 前記第2の末端が、式(E)
式中、
各q2及びq3が、独立して、1、2、3、又は4であり、
R11が、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
各R12及びR13が、独立して、任意に置換される5~8員ヘテロシクロアルキルである、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - 前記第2の末端が、式(E-1)
- 前記第2の末端が、式(F)
式中、
各R14及びR17が、独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
R15が、独立して、置換5員ヘテロアリールであり、
R16が、水素又はC1-C6アルキルである、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - 前記第2の末端が、式(F-1)
- 前記第2の末端が、式(G)
式中、
rが、0、1、又は2であり、
R18が、水素、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6ヒドロキシアルキルであり、
R19が、水素、ハロゲン、又は任意に置換されるC1-6アルキルであり。
各R20が、独立して、水素、ハロゲン、又はC1-C6アルキルであり、
各R21が、独立して、水素又はC1-C6アルキルである、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - 前記第2の末端が、式(G-1)
- 前記第2の末端が、式(H-1)
- 前記第2の末端が、式(H-2)
- 前記第2の末端が、式(J)
式中、
R23が、-NR23AR23B又は-NR23A(R23B)2であり、
R23A及びR23Bが、各々独立して、任意に置換されるC1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、アリール、若しくはヘテロアリールであるか、又は
R23A及びR23Bが、それらが結合している窒素と一緒に結合して、複素環を形成し、
R24が、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6アルコキシであり、
R25が、水素又はC1-3アルキルであり、
R30、R32、及びR33が、各々独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6アルコキシ、又はC3-6シクロアルキルであり、
R31が、C1-6アルキル又はC3-10シクロアルキルであり、
j1が、0又は1であり、
j2が、0、1、2、又は3である、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - 前記第2の末端が、式(J-1)
- 前記第2の末端が、式(J-2)
- 前記第2の末端が、式(J-3)
- 前記第2の末端が、式(J-4)
- 前記第2の末端が、式(J-5)
式中、
環Cが、任意に置換される5~6員ヘテロシクリル環であり、
R23が、-NR23AR23B又は-NR23A(R23B)2であり、
R23A及びR23Bが、各々独立して、任意に置換されるC1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、アリール、若しくはヘテロアリールであるか、又は
R23A及びR23Bが、それらが結合している窒素と一緒に結合して、複素環を形成し、
R24が、水素、ハロゲン、C1-6アルキル、C1-6ハロアルキル、又はC1-6アルコキシであり、
R25が、水素又はC1-3アルキルであり、
R30、R32、及びR33が、各々独立して、水素、ハロゲン、任意に置換されるC1-6アルキル、C1-6アルコキシ、又はC3-C6シクロアルキル環である、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - 前記第2の末端が、式(J-6)
- 前記第2の末端が、式(J-7)
- 前記第2の末端が、式(K)
式中、
X8が、CH又はNであり、
Y8が、-C(O)-、又は-S(O)2-であり、
R27が、C1-6アルキル、C3-C10シクロアルキル、又は5~10員ヘテロアリールの任意に置換されるカチオンであり、
R28が、水素、ハロゲン、又はC1-6アルキルであり、
R29が、水素又はC1-3アルキルである、請求項1~33のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子。 - 前記第2の末端が、
- 請求項1~61のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物と、薬学的に許容され得る担体と、を含む、薬学的組成物。
- dmpkの発現を調節する方法であって、前記dmpkを、請求項1~61のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物、あるいは請求項62に記載の薬学的組成物と接触させることを含む、方法。
- dmpkの過剰発現によって引き起こされる疾患又は状態の治療を必要とする対象においてその治療を実施する方法であって、治療有効量の請求項1~61のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物、あるいは請求項62に記載の薬学的に許容され得る組成物を前記対象に投与することを含む、方法。
- 前記疾患又は状態が、筋強直性ジストロフィー1型(DM1)である、請求項64に記載の方法。
- フックス角膜内皮ジストロフィー(FECD)を治療することを必要とする対象においてその治療を実施する方法であって、治療有効量の請求項1~61のいずれか一項に記載の転写モジュレータ分子、又はその薬学的に許容され得る塩若しくは溶媒和物、あるいは請求項62に記載の薬学的組成物を前記対象に投与することを含む、方法。
- 追加の治療剤を投与することを含む、請求項63~66のいずれか一項に記載の方法。
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