CN118695861A - 用于治疗弗里德希共济失调的化合物和方法 - Google Patents

用于治疗弗里德希共济失调的化合物和方法 Download PDF

Info

Publication number
CN118695861A
CN118695861A CN202380020304.1A CN202380020304A CN118695861A CN 118695861 A CN118695861 A CN 118695861A CN 202380020304 A CN202380020304 A CN 202380020304A CN 118695861 A CN118695861 A CN 118695861A
Authority
CN
China
Prior art keywords
optionally substituted
methyl
alkyl
compound
pharmaceutically acceptable
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN202380020304.1A
Other languages
English (en)
Inventor
阿西姆·安萨里
阿比吉特·巴特
肖恩·杰弗里斯
普拉蒂克·沙阿
张承智
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Design Treatment Co
Original Assignee
Design Treatment Co
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Design Treatment Co filed Critical Design Treatment Co
Publication of CN118695861A publication Critical patent/CN118695861A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Abstract

本公开涉及用于调节fxn的表达以及治疗fxn在其中起积极作用的疾病和病状的化合物和方法。所述化合物可以是具有第一末端、第二末端和寡聚物骨架的转录调节因子分子，其中：a)所述第一末端包括能够与三核苷酸重复序列GAA非共价结合的DNA结合部分；b)所述第二末端包括与调节分子结合的蛋白质结合部分，所述调节分子调节包括所述核苷酸重复序列GAA的基因的表达；并且c)所述寡聚物骨架包括位于所述第一末端与所述第二末端之间的接头。

Description

用于治疗弗里德希共济失调的化合物和方法
交叉引用
本申请要求于2022年1月6日提交的美国申请第63/297,090号和于2022年11月8日提交的美国申请第63/382,854号的权益，所述美国申请通过引用以其整体并入本文。
技术领域
本文公开了新的嵌合杂环聚酰胺化合物和组合物及其作为用于治疗疾病的药物的应用。还提供了调节人或动物受试者的fxn的表达的方法，用于治疗如弗里德希共济失调(Friedreich's ataxia)等疾病。
背景技术
本公开涉及以mRNA的过度产生或不足产生为特性的遗传性遗传疾病的治疗。
弗里德希共济失调(“FA”或“FRDA”)是由共济蛋白基因(“fxn”)的突变引起的常染色体隐性神经退行性病症，所述基因编码蛋白质共济蛋白(“FXN”)，所述共济蛋白是参与电子转运和代谢的铁结合线粒体蛋白。在大多数患有FA的受试者中，在fxn的第一内含子中包含GAA三核苷酸重复序列(约66至超过1000个三核苷酸)，并且这种过度扩增是观察到的病理学的原因。GAA重复序列的过度扩增使得FXN的表达减少。
弗里德希共济失调的特性在于神经系统，具体地感觉神经元的逐渐退化。另外，心肌细胞和胰腺β细胞易受共济蛋白耗竭的影响。症状通常在18岁时出现；然而，FA的后期诊断并不罕见。FA患者会出现大感觉神经元和脊髓小脑束的神经退行性变，以及心肌病和糖尿病。FA的临床症状包含共济失调、步态共济失调、肌肉无力、上半身力量丧失、平衡丧失、下肢和肌腱缺乏反射、感觉丧失，具体地对振动的感觉丧失、位置感受损、对温度、触觉和疼痛的感知受损、听力和视力受损，包含色觉扭曲和不自主的眼球运动、足部形态不规则，包含高弓足和内翻、听力受损、构音障碍、吞咽困难、呼吸受损、脊柱侧弯、糖尿病、对葡萄糖和碳水化合物不耐受、心脏功能障碍，包含肥厚型心肌病、心律失常、心肌纤维化和心力衰竭。目前还没有治愈FA的方法，医学治疗仅限于脊柱和心脏的手术干预，以及辅助平衡、协调、运动和言语的疗法。
发明内容
本公开利用存在于控制基因表达的细胞核中的调节分子。真核细胞提供若干种用于控制基因复制、转录和/或翻译的机制。通过细胞内各种生物化学机制产生的调节分子可以调节遗传信息向细胞组分转化中所涉及的各种过程。已知有若干种调节分子调节mRNA的产生，如果直接用于fxn，可以调节导致弗里德希共济失调的fxn mRNA的产生，并且因此逆转疾病的进展。
本公开提供了用于将调节分子募集到接近fxn的化合物和方法。本文所公开的化合物含有：(a)募集部分，所述募集部分将与调节分子结合；与(b)连接，DNA结合部分，所述DNA结合部分将与fxn选择性结合。化合物将以下列方式抵消缺陷型fxn的表达：
(1)DNA结合部分将与fxn的特性GAA三核苷酸重复序列选择性结合；
(2)与DNA结合部分连接的募集部分因此将保持接近fxn；
(3)现在接近fxn的募集部分将募集调节分子接近基因；以及
(4)调节分子将调节表达，并且因此通过与基因的直接相互作用来抵消缺陷型fxn的产生。
上述机制将为由缺陷型fxn基因的表达引起的弗里德希共济失调提供有效的治疗。因此，校正缺陷型fxn基因的表达代表用于治疗弗里德希共济失调的有前途的方法。
本公开提供了将与调节分子结合的募集部分。调节分子的小分子抑制剂用作募集部分的设计的模板，因为这些抑制剂通常通过与调节分子的非共价结合起作用。
本公开进一步提供了DNA结合部分，所述DNA结合部分将与作为缺陷型fxn基因的特性的GAA三核苷酸重复序列的一个或多个拷贝选择性结合。由于与缺陷型fxn基因相关的高GAA计数，DNA结合部分与fxn的选择性结合成为可能，将引导募集部分接近基因，并将调节分子募集到上调基因转录的位置。
DNA结合部分将包括将与靶GAA序列选择性结合的聚酰胺片段。Dervan(美国专利第9,630,950号和第8,524,899号)和其他人设计了能够与选定DNA序列选择性结合的聚酰胺。这些聚酰胺位于双螺旋DNA的小沟中，并且与沃森-克里克碱基对形成氢键合相互作用。与特定DNA序列选择性结合的聚酰胺可以根据既定的化学规则通过连接单酰胺构建块来设计。为每个DNA碱基对提供一个构建块，每个构建块与以下DNA碱基对中的一个非共价和选择性结合：A/T、T/A、G/C和C/G。根据这一指导方针，三核苷酸将与具有三个酰胺单元的分子，即三酰胺结合。通常，这些聚酰胺将定向于DNA序列的任一方向，因此fxn的5'-GAA-3'三核苷酸重复序列可以被对GAA或AAG具有选择性的聚酰胺靶向。此外，与互补序列结合的聚酰胺，在这种情况下为TTC或CTT，也将与fxn的三核苷酸重复序列结合并且也可以使用。
原则上，通过将大量的单酰胺构建块结合到较长的聚酰胺链中，可以以更高的特异性和/或更高的亲和力靶向较长的DNA序列。理想地，聚酰胺的结合亲和力将简单地等于每个单独的单酰胺/DNA碱基对相互作用的总和。然而，在实践中，由于相当刚性的聚酰胺与DNA结构之间的几何不匹配，较长的聚酰胺序列与较长的DNA序列的结合不如简单的加成作用所预期的那样紧密。较长的聚酰胺序列和较长的DNA序列之间的几何错配诱导了不利的几何应变，所述几何应变从原本预期的结合亲和力中减去。
因此，本公开提供了包括由柔性间隔子连接的三酰胺的DNA部分。间隔子减轻了几何应变，否则所述几何应变会降低较大聚酰胺序列的结合亲和力。
本文公开了包括聚酰胺的化合物，所述聚酰胺可以与三核苷酸重复序列GAA的一个或多个拷贝结合，并且可以调节缺陷型fxn基因的表达。用这些化合物治疗受试者可以抵消缺陷型fxn基因的表达，并且这可以减少与弗里德希共济失调相关的症状的发生、严重程度和/或频率。本文所公开的某些化合物可以提供比先前观察到的这类化合物的结合亲和力和/或选择性更高的结合亲和力和/或选择性。
一方面，本文公开了表3中列出的化合物或其药学上可接受的盐。
另一方面，本文公开了一种药物组合物，所述药物组合物包括本文所公开的化合物或其药学上可接受的盐；以及药学上可接受的赋形剂。
另一方面，本文公开了一种调节fxn的表达的方法，所述方法包括使fxn与所公开的化合物或其药学上可接受的盐接触。
另一方面，本文提供了一种治疗有需要的患者的由缺陷型fxn的表达引起的疾病或病状的方法，所述方法包括向所述患者施用治疗有效量的本文所公开的化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，所述疾病是FA。
本文所描述的化合物、方法和组合物的其它目的、特征和优点将从以下详细描述中变得显而易见。然而，应当理解，尽管详细描述和具体实例指示了具体的实施例，然而所述具体的实施例仅以说明的方式给出，因为根据此详细描述本公开的精神和范围内的各种变化和修改对于本领域的技术人员而言将变得显而易见。
通过引用并入
本说明书中所提到的所有公开、专利和专利申请均通过相同的程度引用并入本文，如同特定且单独地指示每个单独的公开、专利或专利申请是通过引用并入的。在通过引用并入的公开和专利或专利申请与本说明书中所包含的公开内容相矛盾的情况下，本说明书旨在替代和/或优先于任何此类矛盾材料。
具体实施方式
本文公开了含有DNA结合部分的化合物(即，转录调节因子分子)，所述DNA结合部分可以与作为缺陷型fxn基因的特性的GAA三核苷酸重复序列的一个或多个拷贝选择性结合。化合物还含有与调节蛋白结合的部分。靶基因的选择性结合可以使调节蛋白接近靶基因，并且因此下调靶基因的转录。本文所公开的化合物提供比先前观察到的这类化合物的结合亲和力和选择性更高的结合亲和力和选择性，并且可以更有效地治疗与缺陷型fxn基因相关的疾病。
本文所描述的化合物可以募集调节分子来调节缺陷型fxn基因的表达，并有效治疗和/或和缓解与如弗里德希共济失调等疾病相关的症状。
化合物
本文所公开的化合物具有用于调节具有一个或多个GAA重复序列的靶基因(例如，fxn)的转录的有用活性，并且可以用于治疗或预防其中靶基因(例如，fxn)起活性作用的疾病或病状。因此，在广义方面，某些实施例还提供了包括一种或多种本文所公开的化合物以及药学上可接受的载体的药物组合物，以及制备和使用所述化合物和组合物的方法。某些实施例提供了用于调节fxn的表达的方法。其它实施例提供了用于治疗需要此类治疗的患者的fxn介导的病症的方法，所述方法包括向所述患者施用治疗有效量的本公开的化合物或组合物。还提供了本文所公开的某些化合物在制备用于治疗通过调节fxn的表达而改善的疾病或病状的药物中的用途。
一些实施例涉及一种化合物，所述化合物具有第一末端、第二末端和寡聚物骨架，其中：a)第一末端包括能够与核苷酸重复序列GAA非共价结合的DNA结合部分；b)第二末端包括与调节分子结合的蛋白质结合部分，所述调节分子调节包括核苷酸重复序列GAA的基因的表达；并且c)寡聚物骨架包括位于第一末端与第二末端之间的接头。在一些实施例中，第二末端是Brd4结合部分。在一些实施例中，第二末端不是Brd4结合部分。
在某些实施例中，化合物具有式(I)的结构：
X-L-Y
式(I)，
或其盐，其中：
X包括募集部分，所述募集部分能够与细胞核内的调节部分结合；
Y包括DNA识别部分，所述DNA识别部分能够与三核苷酸重复序列GAA的一个或多个拷贝非共价结合；并且
L是接头。
在一些实施例中，募集部分能够与调节部分非共价或共价结合。在一些实施例中，募集部分能够与调节部分非共价结合。
在某些实施例中，调节分子选自含溴结构域的蛋白质。
在一些实施例中，第一末端是Y，并且第二末端是X，并且寡聚物骨架是L。
在某些实施例中，化合物具有式(II)的结构：
X-L-(Y1-Y2-Y3)n-Y0
式(II)，
或其盐，其中：
X包括募集部分，所述募集部分能够与细胞核内的调节分子结合；
L是接头；
Y1、Y2和Y3是内部亚基，所述内部亚基中的每个内部亚基包括选自杂环或杂芳基环或C1-C6直链脂肪族区段的部分，并且所述内部亚基中的每个内部亚基与其两个相邻亚基化学连接；
Y0是端部亚基，所述端部亚基包括选自杂环或杂芳基环或直链脂肪族区段的部分，所述直链脂肪族区段与其单个相邻直链脂肪族区段化学连接；
每个亚基可以与GAA重复序列中的单独核苷酸非共价结合；
n是介于1与200之间的整数，包括端值；并且
(Y1-Y2-Y3)n-Y0结合形成DNA识别部分，所述DNA识别部分能够与三核苷酸序列GAA的一个或多个拷贝非共价结合。
在一些实施例中，结构式(II)的化合物包括GAA重复序列中的每个单独核苷酸的亚基。
在一些实施例中，每个内部亚基具有氨基(-NH-)基团和羧基(-CO-)基团。
在一些实施例中，结构式(II)的化合物包括位于每对内部亚基之间酰胺(-NHCO-)键。
在一些实施例中，结构式(II)的化合物包括位于L与最左侧内部亚基之间的酰胺(-NHCO-)键。
在一些实施例中，结构式(II)的化合物包括位于最右侧内部亚基与端部亚基之间的酰胺键。
在一些实施例中，每个亚基包括独立地选自杂环和脂肪族链的部分。
在一些实施例中，脂肪族链是C1-C6直链脂肪族链。在某些实施例中，脂肪族链具有结构式-(CH2)m-，其中m选自1、2、3、4和5。在某些实施例中，脂肪族链是-CH2CH2-。
在一些实施例中，杂芳基是单环、双环或多环杂芳基。在一些实施例中，杂芳基是单环杂芳基。在一些实施例中，杂芳基是5元杂芳基。在一些实施例中，每个杂芳基含有独立地选自N、O或S的杂原子。在一些实施例中，每个杂芳基独立地选自吡咯、咪唑、噻唑、唑、噻吩和呋喃。
在一些实施例中，每个内部亚基独立地选自：
苯并吡嗪基-CO-、-NH-亚苯基-CO-、-NH-亚吡啶基-CO-、-NH-亚哌啶基-CO-、-NH-亚嘧啶基-CO-、-NH-蒽基-CO-、-NH-喹啉基-CO-和其中Z是H、NH2、C1-6烷基或C1-6烷基NH2。
在一些实施例中，n介于1与100之间，包括端值。在某些实施例中，n介于1与50之间，包括端值。在某些实施例中，n介于1与20之间，包括端值。在某些实施例中，n介于1与10之间，包括端值。在某些实施例中，n介于1与5之间，包括端值。在某些实施例中，n是介于1与3之间的整数，包括端值。在某些实施例中，n选自1和2。在某些实施例中，n是1。
在一些实施例中，n是介于1与5之间的整数，包括端值。
在一些实施例中，n是介于1与3之间的整数，包括端值。
在一些实施例中，n是介于1与2之间的整数，包括端值。
在一些实施例中，n是1。
在一些实施例中，L包括C1-C6直链脂肪族区段。
在一些实施例中，L包括(CH2OCH2)m；并且m是介于1至20之间的整数，包括端值。在一些另外的实施例中，m是介于1至10之间的整数，包括端值。在某些另外的实施例中，m是介于1至5之间的整数，包括端值。
在一些实施例中，化合物具有式(III)的结构：
X-L-(Y1-Y2-Y3)-(W-Y1-Y2-Y3)n-Y0
式(III)，
或其盐，其中：
X包括募集部分，所述募集部分能够与细胞核内的调节分子结合；
L是接头；
Y1、Y2和Y3是内部亚基，所述内部亚基中的每个内部亚基包括选自杂环或杂芳基环或C1-C6直链脂肪族区段的部分，并且所述内部亚基中的每个内部亚基与其两个相邻亚基化学连接；
Y0是端部亚基，所述端部亚基包括选自杂环或直链脂肪族区段的部分，所述直链脂肪族区段与其单个相邻直链脂肪族区段化学连接；
每个亚基可以与GAA重复序列中的单独核苷酸非共价结合；
W是间隔子；
n是介于1与200之间的整数，包括端值；并且
(Y1-Y2-Y3)-(W-Y1-Y2-Y3)n-Y0结合形成DNA识别部分，所述DNA识别部分能够与三核苷酸重复序列GAA的一个或多个拷贝非共价结合。
在一些实施例中，Y1-Y2-Y3是：
在某些实施例中，Y1-Y2-Y3是：
在一些实施例中，Y1-Y2-Y3是Im-Py-β。
在一些实施例中，Y1-Y2-Y3是Im-Im-β。
在一些实施例中，每个Y1-Y2-Y3独立地选自β-Py-Im和β-Im-Im。
在一些实施例中，至多一个Y1-Y2-Y3是β-Im-Im。
在结构式(III)的化合物的一些实施例中，n介于1与100之间，包括端值。在结构式(III)的化合物的某些实施例中，n介于1与50之间，包括端值。在结构式(III)的化合物的某些实施例中，n介于1与20之间，包括端值。在结构式(III)的化合物的某些实施例中，n介于1与10之间，包括端值。在结构式(III)的化合物的某些实施例中，n介于1与5之间，包括端值。在结构式(III)的化合物的某些实施例中，n选自1和2。在结构式(III)的化合物的某些实施例中，n是1。
在一些实施例中，化合物具有式(IV)的结构：
或其盐，其中：
X包括募集部分，所述募集部分能够与细胞核内的调节分子结合；
Y0是端部亚基，所述端部亚基包括选自杂环或直链脂肪族区段的部分，所述直链脂肪族区段与其单个相邻直链脂肪族区段化学连接；并且
n是介于1与200之间的整数，包括端值。
在结构式(IV)的化合物的一些实施例中，n介于1与10之间，包括端值。在结构式(IV)的化合物的某些实施例中，n介于1与5之间，包括端值。在结构式(IV)的化合物的某些实施例中，n选自1和2。在结构式(IV)的化合物的某些实施例中，n是1。
在一些实施例中，化合物具有式(V)的结构：
或其盐，其中：
X包括募集部分，所述募集部分能够与细胞核内的调节分子结合；并且
W是间隔子；
Y0是端部亚基，所述端部亚基包括选自杂环或直链脂肪族区段的部分，所述直链脂肪族区段与其单个相邻直链脂肪族区段化学连接；并且
n是介于1与200之间的整数，包括端值。
在结构式(V)的化合物的一些实施例中，n介于1与10之间，包括端值。在结构式(V)的化合物的某些实施例中，n介于1与5之间，包括端值。在结构式(V)的化合物的某些实施例中，n选自1和2。在结构式(V)的化合物的某些实施例中，n是1。
在结构式(V)的化合物的一些实施例中，其中：W是-NHCH2-(CH2OCH2)p-CH2CO-；并且p是介于1与4之间的整数，包括端值。
第一末端-DNA结合部分
第一末端与基因相互作用并结合，具体地与GAA序列的小沟结合。一方面，本公开的化合物提供了用于单个聚酰胺亚基与GAA重复序列中的每个碱基对相互作用的聚酰胺序列。一方面，本公开的化合物提供了转角组分(例如，脂肪族氨基酸部分)，以使化合物能够与GAA发夹结合，其中每个核苷酸对与聚酰胺的两个亚基相互作用。
一方面，由于大量与fxn相关的GAA重复序列，本公开的化合物更可能与fxn的重复的GAA结合，而不是与受试者的DNA中的其它地方的GAA结合。
一方面，本公开的化合物提供了用于与GAA非共价结合的聚酰胺序列的多于一个拷贝。一方面，本公开的化合物与fxn结合的亲和力大于与含有单一聚酰胺序列的对应的化合物结合的亲和力。
一方面，本公开的化合物提供了用于与GAA非共价结合的聚酰胺序列的多于一个拷贝，并且该化合物中的单独的聚酰胺序列通过间隔子W连接，如上文所定义的。间隔子W允许该化合物根据需要调整其几何结构，以减轻几何应变，否则所述几何应变会影响较长聚酰胺序列的非共价结合。
在某些实施例中，DNA识别或结合部分在DNA的小沟中结合。
在某些实施例中，DNA识别或结合部分包括单体的聚合序列，其中聚合物中的每个单体与某个DNA碱基对选择性结合。
在某些实施例中，DNA识别或结合部分包括聚酰胺部分。
在某些实施例中，DNA识别或结合部分包括聚酰胺部分，所述聚酰胺部分包括杂芳香族单体，其中每个杂芳香族单体与特定核苷酸非共价结合，并且每个杂芳香族单体通过酰胺键与其一个或多个相邻杂芳香族单体连接。
在某些实施例中，DNA识别部分与包括至少1000个三核苷酸重复序列的序列结合。在某些实施例中，DNA识别部分与包括至少500个三核苷酸重复序列的序列结合。在某些实施例中，DNA识别部分与包括至少200个三核苷酸重复序列的序列结合。在某些实施例中，DNA识别部分与包括至少100个三核苷酸重复序列的序列结合。在某些实施例中，DNA识别部分与包括至少50个三核苷酸重复序列的序列结合。在某些实施例中，DNA识别部分与包括至少20个三核苷酸重复序列的序列结合。
所选聚酰胺的形式可以基于靶基因而变化。第一末端可以包含选自由以下组成的组的聚酰胺：线性聚酰胺、发夹聚酰胺、H-pin聚酰胺、重叠聚酰胺、滑动聚酰胺、环状聚酰胺、串联聚酰胺和延伸聚酰胺。在一些实施例中，第一末端包括线性聚酰胺。在一些实施例中，第一末端包括发夹聚酰胺。
聚酰胺与靶基因之间的结合亲和力可以基于聚酰胺的组成进行调整。在一些实施例中，聚酰胺能够以小于约600nM、约500nM、约400nM、约300nM、约250nM、约200nM、约150nM、约100nM或约50nM的亲和力与DNA结合。在一些实施例中，聚酰胺能够以小于约300nM的亲和力与DNA结合。在一些实施例中，聚酰胺能够以小于约200nM的亲和力与DNA结合。在一些实施例中，聚酰胺能够以大于约200nM、约150nM、约100nM、约50nM、约10nM或约1nM的亲和力与DNA结合。在一些实施例中，聚酰胺能够以在约1-600nM、10-500nM、20-500nM、50-400nM或100-300nM的范围内的亲和力与DNA结合。
聚酰胺与靶DNA之间的结合亲和力可以使用定量足迹滴定实验来确定。实验涉及在24℃或37℃下测量靶序列的聚酰胺的解离常数Kd，并使用标准聚酰胺测定溶液条件或近似的细胞内溶液条件。
调节蛋白与第二末端上的配体之间的结合亲和力可以使用适合特定蛋白的测定来确定。实验涉及测量蛋白质的配体的解离常数Kd，并使用标准蛋白质测定溶液条件或近似的细胞内溶液条件。
在一些实施例中，第一末端包括-NH-Q-C(＝O)-，其中Q是任选取代的C6-10亚芳基、任选取代的4-10元杂环烯基、任选取代的5-10元亚杂芳基或任选取代的亚烷基。在一些实施例中，Q是任选取代的C6-10亚芳基或任选取代的5-10元亚杂芳基。在一些实施例中，Q是任选取代的5-10元亚杂芳基。在一些实施例中，5-10元亚杂芳基任选地被1-4个选自以下的取代基取代：H、OH、卤素、C1-10烷基、NO2、CN、NR'R”、C1-6卤代烷基、C1-6烷氧基、C1-6卤代烷氧基、(C1-C6烷氧基)C1-C6烷基、C2-C10烯基、C2-C10炔基、C3-C7碳环基、4-10元杂环基、C6-C10芳基、5-10元杂芳基、(C3-C7环碳基)C1-C6烷基、(4-10元杂环基)C1-C6烷基、(C6-C10芳基)C1-C6烷基、(C6-C10芳基)C1-C6烷氧基、(5-10元杂芳基)C1-C6烷基、(C3-C7碳环基)-胺、(4-10元杂环基)胺、(C6-C10芳基)胺、(5-10元杂芳基)胺、酰基、C-羧基、O-羧基、C-酰胺基、N-酰胺基、S-磺酰胺基、N-磺酰胺基、-SR'、C(＝O)OH或C(＝O)NR'R”；其中每个R'和R”独立地是H、C1-C10烷基、C1-C10卤代烷基、C1-C10烷氧基。
在一些实施例中，第一末端包括至少三个被选择与核苷酸重复序列GAA相对应的芳香族甲酰胺部分和至少一个选自由以下组成的组的脂肪族氨基酸残基：甘氨酸、β-丙氨酸、γ-氨基丁酸、2,4-二氨基丁酸和5-氨基戊酸。在一些实施例中，第一末端包括至少一个β-丙氨酸亚基。
在一些实施例中，单体元素独立地选自由以下组成的组：任选取代的吡咯甲酰胺单体、任选取代的咪唑甲酰胺单体、任选取代的C-C连接的杂单环/杂双环部分和β-丙氨酸。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-2)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
其中，
m1是1-4；
n1是0-2；
每个Y1、Y2、Y3和Y4独立地是CH或N；
每个Z1、Z2、Z3和Z4独立地是O、S或NR1D；
每个L3是任选取代的C1-C6亚烷基、任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的3至7元杂环烯基或任选取代的5至6元亚杂芳基；
每个R30是氢或C1-C6烷基；或者
每个R30和L3与其所连接的原子接合在一起以形成4至7元杂环；
W1是氢、任选取代的C1-C6烷基、-NR1E-C(＝O)-NR1ER1F、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1- 10；
W2是氢、任选取代的C1-C6烷基、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1-10；
每个R1D和R1E独立地是氢、氘、任选取代的C1-C50烷基、任选取代的C1-C50杂烷基或任选取代的(PEG)1-50；
R1F是氢、氘、任选取代的C1-C20烷基、C1-C20杂烷基、(PEG)1-20或一个或多个AA；并且
每个AA独立地是天然存在的氨基酸。
在一些实施例中，每个L3是任选取代的C1-C6亚烷基。在一些实施例中，L3是任选地被一个或多个氢、卤素、C1-C6烷基、C1-C6杂烷基、C1-C6卤代烷基、C1-C6羟烷基、C3-C6环烷基或4至7元杂环烷基环取代的C2、C3、C4或C5亚烷基。在一些实施例中，L3是任选地被一个或多个氢、卤素、C1-C6烷基、C1-C6杂烷基、C3-C6环烷基或4至7元杂环烷基环取代的C2或C3亚烷基。在一些实施例中，L3是任选地被一个或两个氢、C1-C6烷基、C1-C6杂烷基、C3-C6环烷基或4至7元杂环烷基环取代的C2亚烷基。
在一些实施例中，每个L3独立地是C3-C7亚环烷基。在一些实施例中，L3是亚环丁基、亚环戊基、亚环己基或亚环庚基环。在一些实施例中，L3是亚环丁基。在一些实施例中，L3是亚环戊基。在一些实施例中，L3是亚环己基。
在一些实施例中，每个L3是3至7元杂环烯基。在一些实施例中，L3是4元、5元或6元杂环烯基。
在一些实施例中，每个R30独立地是氢。在一些实施例中，每个R30独立地是C1-C6烷基。
在一些实施例中，L3和R30与其所连接的原子接合在一起以形成4至7元杂环。在一些实施例中，环是4元杂环。在一些实施例中，环是5元杂环。在一些实施例中，环是6元杂环。在一些实施例中，环是7元杂芳香族环。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-3)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
其中，
m1是1-4；
n1是0-2；
每个Y1、Y2、Y3和Y4独立地是CH或N；
每个Z1、Z2、Z3和Z4独立地是O、S或NR1D；
W1是氢、任选取代的C1-C6烷基、-NR1E-C(＝O)-NR1ER1F、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1- 10；
W2是氢、任选取代的C1-C6烷基、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1-10；
每个R1D和R1E独立地是氢、氘、任选取代的C1-C50烷基、任选取代的C1-C50杂烷基或任选取代的(PEG)1-50；
R1F是氢、氘、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基、任选取代的(PEG)1-20或一个或多个AA；并且
每个AA独立地是选自β-丙氨酸、赖氨酸和精氨酸的氨基酸残基。
在一些实施例中，每个L3是相同的。在一些实施例中，每个L3是不同的。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-4)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
其中，
n1是0-2；
每个Y1、Y2、Y3和Y4独立地是CH或N；
每个Z1、Z2、Z3和Z4独立地是O、S或NR1D；
每个L3是任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的3至7元杂环烯基或任选取代的5至6元亚杂芳基；
每个R30是氢或C1-C6烷基；或者
每个R30和L3与其所连接的原子接合在一起以形成4至7元杂环；
W1是氢、任选取代的C1-C6烷基、-NR1E-C(＝O)-NR1ER1F、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1-10；
W2是氢、任选取代的C1-C6烷基、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1-10；
每个R1D和R1E独立地是氢、氘、任选取代的C1-C50烷基、任选取代的C1-C50杂烷基或任选取代的(PEG)1-50；
R1F是氢、氘、任选取代的C1-C20烷基、C1-C20杂烷基、(PEG)1-20或一个或多个AA；并且
每个AA独立地是天然存在的氨基酸。
在一些实施例中，接头部分在W2处与DNA结合部分(即，聚酰胺)连接。在一些实施例中，W2是任选取代的C1-C6烷基、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1-10。在一些实施例中，W2是-C(＝O)-NR1ER1F。在一些实施例中，W2是-C(＝O)NHCH2CH2C(＝O)-。在一些实施例中，W2是氢。
在一些实施例中，W2是(AA)1-10。在一些实施例中，每个AA独立地是β-丙氨酸。在一些实施例中，AA包括一个β-丙氨酸。在一些实施例中，AA包括两个β-丙氨酸。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-5)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，每个R1D和R1E独立地是氢、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基或任选取代的(PEG)1-20。在一些实施例中，每个R1D和R1E独立地是氢、任选取代的C1-C10烷基、任选取代的C1-C10杂烷基或任选取代的(PEG)1-20。
在一些实施例中，每个R1D独立地是任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基或任选取代的(PEG)1-20，其中的每一个任选地被酰胺基、烷基、炔基、叠氮基、氨基、卤素、卤代烷基、羟基、硝基、氧代(＝O)、氢氧化磷或PEG取代。在一些实施例中，每个R1D独立地是任选地被-CN、-NH2、-N3、-OH、CF3、-OP(＝O)(OH)2、-OP(＝O)(OCH3)2、-OP(＝O)(OCH3)(OH)或-OP(＝O)2OH取代的任选取代的C1-C20。在一些实施例中，每个R1D独立地是(PEG)1-50。在一些实施例中，每个R1D独立地是-C(＝O)-NR2AR2B或-NR2AR2B，其中每个R2A和R2B独立地是氢、C1-C50烷基或(PEG)1-50。
在一些实施例中，每个Z1、Z2、Z3和Z4独立地是NR1D，其中R1D是任选取代的C1-C20烷基或任选取代的C1-C20杂烷基。
在一些实施例中，每个Z1、Z2、Z3和Z4独立地是NCH3。
在一些实施例中，每个Z1、Z2、Z3和Z4独立地是NH。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-6)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，每个Y1和Y3是N；并且每个Y2和Y4独立地是CH或N。在一些实施例中，每个Y2和Y4独立地是CH。在一些实施例中，每个Y2和Y4独立地是N。在一些实施例中，Y2是CH并且Y4是N。在一些实施例中，Y2是N并且Y4是CH。
在一些实施例中，每个单元m1和n1是不同的或相同的。在一些实施例中，每个单元m1是不同的。在一些实施例中，每个单元m1是相同的。在一些实施例中，每个单元n1是不同的。在一些实施例中，每个单元n1是相同的。
在一些实施例中，m1是2或3；并且n1是0或1。
在一些实施例中，m1是2。在一些实施例中，m1是1。
在一些实施例中，n1是0。在一些实施例中，n1是1。
在一些实施例中，接头部分通过W1与DNA结合部分连接。在一些实施例中，W1是任选取代的C1-C6烷基或-C(＝O)-NR1ER1F。在一些实施例中，W1是-C(＝O)-NR1ER1F，其中R1E是氢；并且R1F是氢、任选取代的C1-C10烷基或任选取代的(PEG)1-20。
在一些实施例中，W1是氢。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-7)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
其中，
m1是1-4；
n1是0-2；
每个Y1、Y2、Y3和Y4独立地是CH或N；
每个Z1、Z2、Z3和Z4独立地是O、S或NR1D；
W1是氢、任选取代的C1-C6烷基、-NR1E-C(＝O)-NR1ER1F、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1- 10；
W2是氢、任选取代的C1-C6烷基、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1-10；其中
每个R1D和R1E独立地是氢、氘、任选取代的C1-C50烷基、任选取代的C1-C50杂烷基或任选取代的(PEG)1-50；
R1F是氢、氘、任选取代的C1-C20烷基、C1-C20杂烷基、(PEG)1-20或一个或多个AA；
每个AA独立地是天然存在的氨基酸；并且
每个R1H、R1J、R1K和R1L独立地是氢、氘、卤素、C1-C6烷基、C1-C6杂烷基、C1-C6卤代烷基或C1-C6羟烷基；或者
R1H和R1J或R1L和R1K与其所连接的碳原子结合在一起以形成C3-C6环烷基或4至7元杂环烷基环。
在一些实施例中，每个R1H、R1J、R1K和R1L独立地是氢、卤素、C1-C6烷基、C1-C6杂烷基、C1-C6卤代烷基或C1-C6羟烷基。在一些实施例中，每个R1H、R1J、R1K和R1L独立地是氢、卤素或C1-C6烷基。在一些实施例中，每个R1H、R1J、R1K和R1L独立地是卤素。在一些实施例中，每个R1H、R1J、R1K和R1L独立地是C1-C6烷基。在一些实施例中，每个R1H、R1J、R1K和R1L独立地是氢。
在一些实施例中，R1H和R1J或R1L和R1K与其所连接的原子结合在一起以形成C3-C6环烷基或4至7元杂环烷基环。在一些实施例中，R1H和R1J或R1L和R1K与其所连接的原子结合在一起以形成C3-C6环烷基。在一些实施例中，R1H和R1J或R1L和R1K与其所连接的原子结合在一起以形成4至7元杂环烷基环。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-8)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
其中，
每个v1和v2独立地是1-3；
m1是1-4；
n1是0-2；
每个Y1、Y2、Y3和Y4独立地是CH或N；
每个Z1、Z2、Z3和Z4独立地是O、S或NR1D；
W1是氢、任选取代的C1-C6烷基、-NR1E-C(＝O)-NR1ER1F、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1- 10；
W2是氢、任选取代的C1-C6烷基、-C(＝O)-NR1ER1F或(AA)1-10；其中
每个R1D和R1E独立地是氢、氘、任选取代的C1-C50烷基、任选取代的C1-C50杂烷基或任选取代的(PEG)1-50；
R1F是氢、氘、任选取代的C1-C20烷基、C1-C20杂烷基、(PEG)1-20或一个或多个AA；并且
每个AA独立地是天然存在的氨基酸。
在一些实施例中，每个v1独立地是1。在一些实施例中，每个v1独立地是2。在一些实施例中，每个v1是独立的3。在一些实施例中，每个v2独立地是1。在一些实施例中，每个v2独立地是2。在一些实施例中，每个v2独立地是3。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-9)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-10)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-11)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
其中，每个v1和v2独立地是1-3；
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-12)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
其中，
每个R1H、R1J、R1K和R1L独立地是氢、卤素、C1-C6烷基、C1-C6杂烷基、C1-C6卤代烷基或C1-C6羟烷基；或者
R1H和R1J或R1L和R1K与其所连接的碳原子结合在一起以形成C3-C6环烷基或4至7元杂环烷基环。
在一些实施例中，第一末端包括具有式(A-13)的结构的聚酰胺或其药学上可接受的盐：
其中，每个v3和v4独立地是1-3。
DNA识别或结合部分可以包含一个或多个选自由以下组成的组的亚基：
-NH-苯并吡嗪基-CO-、-NH-亚苯基-CO-、-NH-亚吡啶基-CO-、-NH-亚哌啶基-CO-、-NH-亚嘧啶基-CO-、-NH-蒽基-CO-、-NH-喹啉基-CO-、任选取代的5-10环杂环、其中
每个Ra独立地是H、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基、任选取代的C1-C20卤代烷基或任选取代的C1-C20烷基氨基；并且
每个Rb独立地是H、卤素、-OH、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基、任选取代的C1-C20卤代烷基、任选取代的C1-C20羟烷基或任选取代的C1-C20烷基氨基。
DNA识别或结合部分可以包含一个或多个选自由以下组成的组的亚基：
苯并吡嗪基-CO-、-NH-亚苯基-CO-、-NH-亚吡啶基-CO-、-NH-亚哌啶基-CO-、-NH-亚嘧啶基-CO-、-NH-蒽基-CO-、-NH-喹啉基-CO-和其中Z是H、NH2、C1-6烷基或C1-6烷基NH2。
在一些实施例中，Py是Im是是Th是Pz是Nt是Tn是Nh是iNt是iIm是HpBi是ImBi是PyBi是Dp是-NH-苯并吡嗪基-CO-是-NH-亚苯基-CO-是-NH-亚吡啶基-CO-是-NH-亚哌啶基-CO-是-NH-吡嗪基-CO-是-NH-萘-CO-是并且-NH-喹啉基-CO-是
在一些实施例中，第一末端包括一个或多个选自由以下组成的组的亚基：任选取代的N-甲基吡咯、任选取代的N-甲基咪唑和β-丙氨酸。
本文所描述的化合物中的第一末端对具有GAA的多个重复序列的序列具有高结合亲和力，并且优先于其它核苷酸重复序列或核苷酸序列与靶核苷酸重复序列结合。在一些实施例中，第一末端对具有GAA的多个重复序列的序列的结合亲和力高于对具有CGG的重复序列的序列的结合亲和力。在一些实施例中，第一末端对具有GAA的多个重复序列的序列的结合亲和力高于对具有CCG的重复序列的序列的结合亲和力。在一些实施例中，第一末端对具有GAA的多个重复序列的序列的结合亲和力高于对具有CCTG的重复序列的序列的结合亲和力。在一些实施例中，第一末端对具有GAA的多个重复序列的序列的结合亲和力高于对具有TGGAA的重复序列的序列的结合亲和力。在一些实施例中，第一末端对具有GAA的多个重复序列的序列的结合亲和力高于对具有GGGGCC的重复序列的序列的结合亲和力。在一些实施例中，第一末端对具有GAA的多个重复序列的序列的结合亲和力高于对具有CAG的重复序列的序列的结合亲和力。在一些实施例中，第一末端对具有GAA的多个重复序列的序列的结合亲和力高于对具有CTG的重复序列的序列的结合亲和力。
由于第一末端与靶核苷酸重复序列之间的优先结合，本文所描述的转录调节分子变得定位在具有GAA的多个重复序列的区周围。在一些实施例中，本文所描述的分子的第一末端的局部浓度在具有GAA的多个重复序列的序列附近高于在具有CGG的重复序列的序列附近。在一些实施例中，本文所描述的分子的第一末端的局部浓度在具有GAA的多个重复序列的序列附近高于在具有CCG的重复序列的序列附近。在一些实施例中，本文所描述的分子的第一末端的局部浓度在具有GAA的多个重复序列的序列附近高于在具有CCTG的重复序列的序列附近。在一些实施例中，本文所描述的分子的第一末端的局部浓度在具有GAA的多个重复序列的序列附近高于在具有TGGAA的重复序列的序列附近。在一些实施例中，本文所描述的分子的第一末端的局部浓度在具有GAA的多个重复序列的序列附近高于在具有GGGGCC的重复序列的序列附近。在一些实施例中，本文所描述的分子的第一末端的局部浓度在具有GAA的多个重复序列的序列附近高于在具有CTG的重复序列的序列附近。在一些实施例中，本文所描述的分子的第一末端的局部浓度在具有GAA的多个重复序列的序列附近高于在具有CAG的重复序列的序列附近。
第一末端定位到具有GAA的多个重复序列的序列，并且优先于其它核苷酸重复序列与靶核苷酸重复序列结合。在一些实施例中，序列具有GAA的至少2、3、4、5、8、10、12、15、20、25、30、40、50、100、200、300、400或500个重复序列。在某些实施例中，序列包括GAA的至少1000个核苷酸重复序列。在某些实施例中，序列包括GAA的至少500个核苷酸重复序列。在某些实施例中，序列包括GAA的至少200个核苷酸重复序列。在某些实施例中，序列包括GAA的至少100个核苷酸重复序列。在某些实施例中，序列包括GAA的至少50个核苷酸重复序列。在某些实施例中，序列包括GAA的至少20个核苷酸重复序列。
一方面，本公开的化合物可以与fxn的重复的GAA结合，而不是与受试者的DNA中的其它地方的GAA结合。
由预先选择的亚基的组合组成的聚酰胺可以与小沟中的DNA选择性结合。在其发夹结构中，两个芳香族氨基酸的反平行并排对与DNA序列结合，其中聚酰胺环具体针对每个DNA碱基包装。N-甲基吡咯(Py)有利于T、A和C碱基，不包括G；N-甲基咪唑(Im)是G-读取器；并且3-羟基-N-甲基吡咯(Hp)对胸腺嘧啶碱基具有特异性。使用下表1A和1B中所示的配对原则，使用氨基酸亚基的不同配对可以识别核苷酸碱基对。例如，Im/Py配对通过对称性读取G C，Py/Im配对读取C G，Hp/Py配对可以将T A与A·T、G C和C G区分开，并且Py/Py配对非特异性地将A·T和T A两者与G C和C G区分开。
在一些实施例中，第一末端包括与核苷酸G相对应的Im；与核苷酸A相对应的Py或β；与核苷酸A相对应的Py，其中Im是N-烷基咪唑，Py是N-烷基吡咯，并且β是β-丙氨酸。在一些实施例中，第一末端包括与核苷酸对G/C相对应的Im/Py、与核苷酸对A/T相对应的Py/β或Py/Py，并且其中Im是N-烷基咪唑(例如，N-甲基咪唑)，Py是N-烷基吡咯(例如，N-甲基吡咯)，并且β是β-丙氨酸。
表1A.单个氨基酸亚基的碱基配对(有利(+)，不利(-))。
*亚基HpBi、ImBi和PyBi用作两个单体亚基的缀合物，并且与两个核苷酸结合。HpBi、ImBi和PyBi的结合性质分别与Hp-Py、Im-Py和Py-Py相对应。
表1B.发夹聚酰胺的碱基配对。
聚酰胺的单体亚基可以基于表1A和表1B所示的配对原则串在一起。聚酰胺的单体亚基可以基于表1C和表1D所示的配对原则串在一起。
表1C示出了可以与特定核苷酸结合的单体亚基的实例。第一末端可以包含所描述的具有若干个刺在一起的单体亚基的聚酰胺，其中单体亚基选自每行。例如，聚酰胺可以包含与GAA结合的Im-β-Py，其中Im选自第一G列，β选自A列，并且Py选自第二A列。聚酰胺可以是与GAA的亚基结合的任何组合，其中亚基选自表1C中的每列，其中亚基按照GAA顺序串在一起。
另外，聚酰胺还可以包含五个亚基的部分集合或多个集合，如三个亚基的1.5、2、2.5、3、3.5或4个集合。聚酰胺可以包含3、4、5、6、7、8、9、10、12、14和16个单体亚基。多个集合可以通过W接合在一起。除了五个亚基或十个亚基之外，聚酰胺还可以包含1-4个另外的亚基，所述另外的亚基可以连接五个亚基的多个集合。
聚酰胺可以包含与GAA的2、3、4或5个核苷酸结合的单体亚基。例如，聚酰胺可以与GA、AA、GAA、AAG、AGA、GAAG、AAGA、GAAGA或GAAGAA结合。聚酰胺可以包含与GAA重复序列的3、4、5、6、7、8、9或10个核苷酸结合的单体亚基。核苷酸可以通过W接合。
当定位为末端单元时，单体亚基在末端处不具有胺、羰基或羧酸基团。末端中的胺或羧酸基团被氢替代。例如，当用作末端单元时，Py被理解为具有的结构(例如，)；并且当定位为末端单元时，Im被理解为具有的结构(例如，)。另外，当Py或Im用作末端单元时，Py和Im可以分别被PyT(例如，)和ImT(例如，)替代。
线性聚酰胺可以具有非限制性实例，包含但不限于β-Py-Im、Im-Py-β-Im-Py-β-Im-Py、Im-Py-β-Im-Py-Py-Im-β、Im-Py-Py-Im-Py-β-Im-β和其任何组合。
表1C.与GAA结合的线性聚酰胺中的单体亚基的实例。
因为靶基因可以包含GAA的多个重复序列，亚基可以串在一起以与一个或多个GAA重复序列(例如，GAAGAAGAAGAA)中的至少两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个或十个核苷酸结合。例如，聚酰胺可以通过与如GA、AA、GAA、AAG、AGA、GAAG、AAGA、GAAGA或GAAGAA等GAA的部分拷贝、完整拷贝或多个重复序列结合而与GAA重复序列结合。例如，聚酰胺可以包含与双链DNA上的GAA和其互补核苷酸结合的Im-Py-β-W-Py-β-Py，其中Im/Py对与G C结合，Py/β对与A·T结合，并且β/Py对与G A结合。在另一个实例中，与双链DNA上的GAAG和其互补核苷酸结合的Im-Py-β-Im-W-β-Py-β-Py，其中Im/Py对与G C结合，Py/β对与A·T结合，β/Py对与G A结合，并且Im/β对与G C结合。在另一个实例中，Im-Py-β-Im-gAB-Im-Py与双链DNA上的互补核苷酸的一部分(ACG)结合，其中Im与G结合，Py与A结合，β/Py与A T结合，Im/Im与G C结合。
聚酰胺的一些另外的实例包含但不限于Im-Py-Py-Im-gAB-Py-Im-Im-Py；Im-Py-Py-Im-gAB-Py-Im-Im-PyT；Im-Py-Py-Im-gAB-Py-Im-Im-β；Im-Py-Py-Im-gAB-Py-Im-Im-β-G；Im-β-β-Py-Im-gAB-Py-Im-Im-β；Im-β-Py-Im-gAB-Py-Im-Im-β-G；Im-β-Py-Im-gAB-Py-Im-Im-Py；Im-β-Py-Im-gAB-Py-Im-Im-PyT；Py-Py-Im-β-gAB-Im-Py-Im-Im；Py-Py-Im-β-gAB-Im-Py-Im-ImT；Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Im-Im；Py-Py-Im-Py-gAB-Im-Py-Im-ImT；Py-Py-Im-β-gAB-Im-β-Im-Im；Py-Py-Im-β-gAB-Im-β-Im-ImT；Py-Py-Im-Py-gAB-Im-β-Im-Im；Py-Py-Im-Py-gAB-Im-β-Im-ImT；Im-β-Py-gAB-Im-Im-Py；Im-β-Py-gAB-Im-Im-PyT；Im-β-Py-gAB-Im-Im-β；Im-β-Py-gAB-Im-Im-β-G；Im-Py-Py-gAB-Im-Im-β；Im-Py-Py-gAB-Im-Im-β-G；Im-Py-Py-gAB-Im-Im-Py；Im-Py-Py-gAB-Im-Im-PyT；Im-p-Py-gAB-Im-Im-Py；以及Im-β-Py-gAB-Im-Im-PyT；其中G可以是氢、烷基、烯基、炔基或-C(＝O)-RB；并且RB可以是氢、C1-C6烷基、C1-C6烯基或C1-C6炔基。在一些实施例中，发夹聚酰胺具有Im-Py-β-Im-gAB-Im-Py；Im-Py-β-Im-gAB-Im-Py-β-Im；Py-β-Im-gAB-Im-Py-β-Im；或β-Im-gAB-Im-Py-β-Im的结构。
第二末端——调节结合部分
在一些实施例中，第二末端包括能够与调节分子结合的蛋白结合部分，所述调节分子调节包括三核苷酸重复序列GAA的一个或多个拷贝的基因的表达。
在一些实施例中，调节分子选自核小体重塑因子(“NURF”)、溴结构域PHD指转录因子(“BPTF”)、十-十一易位酶(“TET”)、甲基胞嘧啶双加氧酶(“TET1”)、DNA去甲基化酶、解旋酶、乙酰基转移酶、CREB结合蛋白(“CBP”)、P300、O-连接的β-N-乙酰葡糖胺转移酶(“OGT”)、P300-CBP相关因子(“PCAF”)、组蛋白甲基转移酶、组蛋白脱甲基酶、色结构域、细胞周期蛋白依赖性激酶-9(“CDK9”)、八聚体结合转录因子(“OCT1”)、组织蛋白乙酰转移酶(“HAT”)、宿主细胞因子-1(“HCF1”)和组蛋白脱乙酰酶(“HDAC”)。
在一些实施例中，蛋白质结合部分与选自由以下组成的组的调节分子结合：CBP、P300、OGT、CAF、CDK9、NURF、BPTF、TET、TET1、HAT、HDAC、HCF1、OCT1、P-TEFb、细胞周期蛋白-T1、PRC2、DNA-甲基化酶、解旋酶、乙酰转移酶、组蛋白-乙酰化酶和甲基化组蛋白赖氨酸蛋白。
在一些实施例中，第二末端包括与OGT或CBP结合的部分。在一些实施例中，蛋白质结合部分是与OGT或CBP结合的化合物的残基。
在一些实施例中，第二末端包括溴结构域结合部分。在一些实施例中，溴结构域结合部分是BRD2、BRD3、BRD4或BRDT结合部分。在一些实施例中，溴结构域结合部分是BRD4结合部分。
在一些实施例中，调节分子是选自BRD2、BRD3、BRD4和BRDT的含溴结构域的蛋白质。
在一些实施例中，调节分子是BRD4。在某些实施例中，募集部分是BRD4激活剂。
在一些实施例中，调节分子调节组蛋白的重排。
在一些实施例中，调节分子调节组蛋白的糖基化、磷酸化、烷基化或酰化。
在一些实施例中，调节分子是转录因子。
在一些实施例中，调节分子是RNA聚合酶。
在一些实施例中，调节分子是调节RNA聚合酶的活性的部分。
在一些实施例中，募集部分与调节分子结合，但不抑制调节分子的活性。在一些实施例中，募集部分与调节分子结合并抑制调节分子的活性。在一些实施例中，募集部分与调节分子结合并增加调节分子的活性。
在一些实施例中，募集部分与调节分子的活性位点结合。在某些实施例中，募集部分与调节分子的调节位点结合。
调节蛋白与第二末端之间的结合亲和力可以基于分子的组成或蛋白质的类型进行调整。在一些实施例中，第二末端以小于约600nM、约500nM、约400nM、约300nM、约250nM、约200nM、约150nM、约100nM或约50nM的亲和力与调节分子结合。在一些实施例中，第二末端以小于约300nM的亲和力与调节分子结合。在一些实施例中，第二末端以小于约200nM的亲和力与调节分子结合。在一些实施例中，第二末端能够以大于约200nM、约150nM、约100nM、约50nM、约10nM或约1nM的亲和力与调节分子结合。在一些实施例中，第二末端能够以在约1-600nM、10-500nM、20-500nM、50-400nM、100-300nM或50-200nM的范围内的亲和力与调节分子结合。
在一些实施例中，第二末端是配体。
在一些实施例中，第二末端包括吡咯并吡啶酮。在一些实施例中，吡咯并吡啶酮被任选取代的氧基二苯取代。在一些实施例中，第二末端包括任选取代的4-(2-苯氧基苯基)-6λ2-吡咯并[2,3-c]吡啶-7(1H)-酮。
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
其中，
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
R17是氢或C1-C6烷基；
R18和R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
或者R18是-NRARB；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
R34是氢、卤素、-OH、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
R35是氢、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的5-6元单环芳基或杂芳基；
每个RA和RB独立地是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；并且
y1是1-3；并且
其中与接头的连接在R18或R35处。
在一些实施例中，与接头的连接在R18处。在一些实施例中，与接头的连接在R35处。
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-1)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
其中，
环E不存在或是任选取代的5-6元单环芳基或杂芳基或任选取代的4-8元杂环；
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
R17是氢或C1-C6烷基；
R18和R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
或者R18是-NRARB；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
R34是氢、卤素、-OH、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
每个RA和RB独立地是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；并且
y1是1-3。
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-2)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
其中，
环E不存在或是任选取代的5-6元单环芳基或杂芳基或任选取代的4-8元杂环；
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
R17是氢或C1-C6烷基；
R18是卤素；
R19a是卤素、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
R19b是氢、卤素、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
R25a是氢或任选取代的C1-C6烷基；并且
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基。
在一些实施例中，环E是任选取代的5或6元单环芳基或杂芳基，其中每个芳基或杂芳基任选地被烷基、氨基、卤素、羟基、羟烷基或PEG取代。在一些实施例中，环E任选地被一个或多个R33取代，其中每个R33独立地选自氘、卤素、羟基、氨基、硝基、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基、任选取代的C1-C20卤代烷基、任选取代的C1-C6羟烷基或任选取代的(PEG)1-20。
在一些实施例中，环E是苯基。在一些实施例中，环E是6元杂芳基。在一些实施例中，环E是吡啶、吡嗪或三嗪。在一些实施例中，环E是吡啶。在一些实施例中，环E是吡嗪。在一些实施例中，环E是三嗪。在一些实施例中，环E是5元杂芳基。在一些实施例中，环E是吡唑。在一些实施例中，环E是三唑、吡咯、咪唑、噁唑、噁二唑、噻唑或噻二唑。在一些实施例中，环E是三唑。在一些实施例中，环E是咪唑或吡咯。在一些实施例中，噁唑或噁二唑。在一些实施例中，环E是噻唑或噻二唑。
在一些实施例中，环E是被一个或多个-OH、-(OCH2CH2)m-OH或–(OCH2CH2)m-O-(C1-C6烷基)取代的苯基。在一些实施例中，环E是被一个或多个-OH取代的苯基。在一些实施例中，环E是被-(OCH2CH2)m-OH取代的苯基。在一些实施例中，环E是被一个或多个–(OCH2CH2)m-O-(C1-C6烷基)取代的苯基。
在一些实施例中，m是1至10。在一些实施例中，m是2至10。在一些实施例中，m是3至10。在一些实施例中，m是4至10。在一些实施例中，m是5至10。在一些实施例中，m是6至10。在一些实施例中，m是7至10。在一些实施例中，m是8至10。在一些实施例中，m是9至10。
在一些实施例中，m是1至9。在一些实施例中，m是2至9。在一些实施例中，m是3至9。在一些实施例中，m是4至9。在一些实施例中，m是5至9。在一些实施例中，m是6至9。在一些实施例中，m是7至9。在一些实施例中，m是8至9。
在一些实施例中，m是1至8。在一些实施例中，m是2至8。在一些实施例中，m是3至8。在一些实施例中，m是4至8。在一些实施例中，m是5至8。在一些实施例中，m是6至8。在一些实施例中，m是7至8。
在一些实施例中，m是1至7。在一些实施例中，m是2至7。在一些实施例中，m是3至7。在一些实施例中，m是4至7。在一些实施例中，m是5至7。在一些实施例中，m是6至7。
在一些实施例中，m是1至6。在一些实施例中，m是2至6。在一些实施例中，m是3至6。在一些实施例中，m是4至6。在一些实施例中，m是5至6。
在一些实施例中，m是1。在一些实施例中，m是2。在一些实施例中，m是3。在一些实施例中，m是4。在一些实施例中，m是5。在一些实施例中，m是6。在一些实施例中，m是7。在一些实施例中，m是8。在一些实施例中，m是9。在一些实施例中，m是10。
在一些实施例中，环E不存在。
在一些实施例中，Y是-CH2NH-或-NH-。在一些实施例中，Y是-CH2NH-。在一些实施例中，Y是-NH-。在一些实施例中，Y是-O-。
在一些实施例中，R17是氢。在一些实施例中，R17是C1-C6烷基。在一些实施例中，R17是甲基、乙基、丙基。在一些实施例中，R17是甲基。在一些实施例中，R17是乙基。在一些实施例中，R17是丙基。
在一些实施例中，R18和R19各自独立地是氢、CN或NO2。在一些实施例中，R18和R19各自独立地是卤素或任选取代的C1-C6烷基。在一些实施例中，R18和R19各自独立地是溴、氯、氟、甲基或乙基。在一些实施例中，R18和R19各自独立地是氟或甲基。
在一些实施例中，R18是卤素。在一些实施例中，R18是氯、溴或氟。在一些实施例中，R18是氯。在一些实施例中，R18是溴。在一些实施例中，R18是氟。
在一些实施例中，R19a是卤素、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6卤代烷基。在一些实施例中，R19a是卤素或任选取代的C1-C6烷基。在一些实施例中，R19a是氯、溴、氟或甲基。在一些实施例中，R19a是氟或甲基。在一些实施例中，R19a是氯。在一些实施例中，R19a是溴。在一些实施例中，R19a是氟。在一些实施例中，R19a是甲基。
在一些实施例中，R19b是氢、卤素或任选取代的C1-C6烷基。在一些实施例中，R19b是氯、溴、氟或甲基。在一些实施例中，R19b是氯。在一些实施例中，R19b是溴。在一些实施例中，R19b是氟或甲基。在一些实施例中，R19b是氟。在一些实施例中，R19b是甲基。在一些实施例中，R19b是氢。
在一些实施例中，R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C2-C6烯基、任选取代的C2-C6炔基或任选取代的C1-C6羟烷基，其中的每一个任选地被酰胺基、烷基、炔基、叠氮基、氨基、卤素、卤代烷基、羟基、硝基、氧代(＝O)、氢氧化磷或PEG取代。
在一些实施例中，R25是任选取代的C1-6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基或任选取代的C1-C6羟烷基。在一些实施例中，R25是C1-C6烷基或C1-C6杂烷基，其中的每一个任选地被-CN、-NH2、-N3、-OH、CF3、-OP(＝O)(OH)2或-O(CH2)OP(＝O)(OH)2取代。
在一些实施例中，R25是-NHSO2RA，其中RA是C1-C6烷基。在一些实施例中，R25是-NHSO2Et。在一些实施例中，R25是-NHSO2Me。在一些实施例中，R25是-SO2RA，其中RA是C1-C6烷基。在一些实施例中，R25是-SO2Et。在一些实施例中，R25是-SO2Me。
在一些实施例中，R25是
在一些实施例中，R25a是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基或任选取代的C1-C6羟烷基。在一些实施例中，R25a是C1-C6烷基或C1-6杂烷基，其中的每一个任选地被-CN、-NH2、-N3、-OH、CF3、-OP(＝O)(OH)2、-C(＝O)(CH2)2P(＝O)(OH)2或-(CH2)OP(＝O)(OH)2取代。在一些实施例中，R25a是氢、甲基、乙基、-OP(＝O)(OH)2或-(CH2)OP(＝O)(OH)2。
在一些实施例中，R32是任选地被卤代烷基、氢氧化磷取代的C1-C6烷基。在一些实施例中，R32是被-OP(＝O)(OH)2取代的C1-C6烷基。在一些实施例中，R32是未经取代的C1-C6烷基。在一些实施例中，R32是甲基、乙基或叔丁基。在一些实施例中，R32是甲基。在一些实施例中，R32是乙基。在一些实施例中，R32是叔丁基。在一些实施例中，R32是氢。
在一些实施例中，y1是1。在一些实施例中，y1是2。在一些实施例中，y1是3。
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-3)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
其中，
R17是氢或C1-C6烷基；
R18和R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
或者R18是-NRARB；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
每个R33a、R33b和R33c独立地选自氢、氘、卤素、羟基、氨基、硝基、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基、任选取代的C1-C20卤代烷基、任选取代的C1-C6羟烷基或任选取代的(PEG)1-20；
每个RA和RB独立地是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；并且
y1是1-3。
在一些实施例中，R33a、R33b和R33c各自独立地是氢、卤素、羟基、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基或任选取代的(PEG)1-20。在一些实施例中，R33a、R33b和R33c各自独立地是氢、卤素或任选取代的(PEG)1-20。在一些实施例中，R33a、R33b和R33c各自是氢。
在一些实施例中，R33a是卤素、羟基、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基或任选取代的(PEG)1-20；并且R33b和R33c各自是氢。在一些实施例中，R33a是任选取代的(PEG)1-20；并且R33b和R33c各自是氢。
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-4)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-5)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-6)或(B-7)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-8)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-9)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-10)或(B-11)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-12)、(B-13)或(B-14)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-15)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
其中，
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
R17是氢或C1-C6烷基；
R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
R34是氢、卤素、-OH、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
R35是氢、任选取代的C1-C6烷基、或任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的5-6元单环芳基或杂芳基；
RA是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；并且
y1是1-3。
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-16)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
其中，
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
R17是氢或C1-C6烷基；
R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
R34是氢、卤素、-OH、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
R35是氢、任选取代的C1-C6烷基、或任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的5-6元单环芳基或杂芳基；
RA是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；并且
y1是1-3。
在一些实施例中，R34是氢、卤素或-OH。在一些实施例中，R34是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基。在一些实施例中，R34是氢。
在一些实施例中，R35是任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6卤代烷基。在一些实施例中，R35是任选取代的C1-C6烷基。在一些实施例中，R35是甲基、乙基或异丙基。在一些实施例中，R35是任选取代的5-6元单环芳基或杂芳基。
在一些实施例中，第二末端包括具有式(B-17)的结构的化合物或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，第二末端选自：
或其药学上可接受的盐。
接头——寡聚物骨架
寡聚物骨架含有与第一末端和第二末端连接的接头，并使调节分子接近靶基因以调节基因表达。
接头的长度取决于调节蛋白的类型并且还取决于靶基因。在一些实施例中，接头的长度小于约50埃。在一些实施例中，接头的长度为约20至30埃。
在一些实施例中，接头包括5至50个链原子。
在一些实施例中，接头包括具有2至50个间隔部分的多聚体，其中间隔部分独立地选自由以下组成的组：-((CR3aR3b)x-O)y-、-((CR3aR3b)x-NR4a)y-、-((CR3aR3b)x-CH＝CH-(CR3aR3b)x-O)y-、任选取代的C1-C12烷基、任选取代的C2-C10烯基、任选取代的C2-C10炔基、任选取代的C6-C10亚芳基、任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的5至10元亚杂芳基、任选取代的4至10元亚杂环烷基、氨基酸残基、-O-、-C(＝O)NR4a-、-NR4aC(＝O)-、-C(＝O)-、-NR1-、-C(＝O)O-、-O-、-S-、-S(＝O)-、-SO2-、-SO2NR4a-、-NR4aSO2-和-P(＝O)OH-以及其任何组合；其中
每个x独立地是2-4；
每个y独立地是1-10；
每个R3a和R3b独立地选自氢、任选取代的烷基、任选取代的烯基、任选取代的炔基、任选取代的烷氧基、任选取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、任选取代的烷基酰胺、磺酰基、任选取代的硫代烷氧基、任选取代的芳基、任选取代的杂芳基、任选取代的环烷基和任选取代的杂环基；并且
每个R4a独立地是氢或任选取代的C1-C6烷基。
在一些实施例中，寡聚物骨架包括-(T1-V1)a-(T2-V2)b-(T3-V3)c-(T4-V4)d-(T5-V5)e-，其中，
a、b、c、d和e各自独立地是0或1，并且其中a、b、c、d和e的总和是1至5；
T1、T2、T3、T4和T5各自独立地选自任选取代的C1-C12亚烷基、任选取代的亚烯基、任选取代的亚炔基、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(经修饰的PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、任选取代的C6-C10亚芳基、任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的5至10元亚杂芳基、任选取代的4至10元亚杂环烷基、缩醛基、二硫化物、肼、碳水化合物、β-内酰胺和酯，其中
w是1至20的整数；
m是1至20的整数；
n是1至30的整数；
p是1至20的整数；
h是1至12的整数；
EA具有以下结构：
EDA具有以下结构：
其中每个q独立地是1至6的整数；每个x独立地是1至4的整数；并且每个r独立地是0或1；
(PEG)n具有-(CR2aR2b-CR2aR2b-O)n-CR2aR2b-的结构；
(经修饰的PEG)n具有用-(CH2-CR2a＝CR2a-CH2-O)-或-(CR2aR2b-CR2aR2b-S)-替代(PEG)n中的至少一个-(CR2aR2b-CR2aR2b-O)-的结构；
AA是氨基酸残基；
V1、V2、V3、V4和V5各自独立地选自由以下组成的组：键、CO-、-NR1a-、-CONR1a-、-NR1aCO-、-CONR1aC1-4烷基-、-NR1aCO-C1-4烷基-、-C(＝O)O-、-OC(＝O)-、-O-、-S-、-S(＝O)-、-SO2-、-SO2NR1a-、-NR1aSO2-和-P(＝O)OH-；
每个R1a独立地是氢或任选取代的C1-6烷基；并且
每个R2a和R2b独立地选自氢、烷基、经取代的烷基、烯基、经取代的烯基、炔基、经取代的炔基、卤素、烷氧基、经取代的烷氧基、氨基、经取代的氨基、羧基、羧基酯、酰基、酰氧基、酰基氨基、氨基酰基、烷基酰胺、经取代的烷基酰胺、磺酰基、硫代烷氧基、经取代的硫代烷氧基、芳基、经取代的芳基、杂芳基、经取代的杂芳基、环烷基、经取代的环烷基、杂环基以及经取代的杂环基。
在一些实施例中，a、b、c、d和e各自独立地是0或1，其中a、b、c、d和e的总和是1。在一些实施例中，a、b、c、d和e各自独立地是0或1，其中a、b、c、d和e的总和是2。在一些实施例中，a、b、c、d和e各自独立地是0或1，其中a、b、c、d和e的总和是3。在一些实施例中，a、b、c、d和e各自独立地是0或1，其中a、b、c、d和e的总和是4。在一些实施例中，a、b、c、d和e各自独立地是0或1，其中a、b、c、d和e的总和是5。
在一些实施例中，n是3-9。在一些实施例中，n是4-8。在一些实施例中，n是5或6。
在一些实施例中，T1、T2、T3和T4和T5各自独立地选自(C1-C12)烷基、经取代的(C1-C12)烷基、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(经修饰的PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、苯基、经取代的苯基、哌啶-4-氨基(P4A)、对氨基-苄氧羰基(PABC)、间氨基-苄氧羰基(MABC)、对氨基-苄氧基(PABO)、间氨基-苄氧基(MABO)、对氨基苄基、缩醛基、二硫化物、肼、碳水化合物、β-内酰胺、酯、(AA)p-MABC-(AA)p、(AA)p-MABO-(AA)p、(AA)p-PABO-(AA)p和(AA)p-PABC-(AA)p。在一些实施例中，哌啶-4-氨基(P4A)是其中R1a是H或C1-C6烷基。
在一些实施例中，T1、T2、T3、T4和T5各自独立地选自C1-C12烷基、经取代的C1-C12烷基、(EA)w、(EDA)m、(PEG)n、(经修饰的PEG)n、(AA)p、-(CR2aOH)h-、任选取代的C6-C10亚芳基、4-10元杂环烯烃、任选取代的5-10元亚杂芳基。在一些实施例中，EA具有以下结构：并且EDA具有以下结构：
在一些实施例中，对于EA和EDA，x是2-3并且q是1-3。在一些实施例中，R1a是H或C1-C6烷基。
在一些实施例中，T4或T5是任选取代的C6-C10亚芳基。
在一些实施例中，T4或T5是亚苯基或经取代的亚苯基。在一些实施例中，T4或T5是亚苯基或被1-3个选自-C1-6烷基、卤素、OH或胺的取代基取代的亚苯基。在一些实施例中，T4或T5是5-10元亚杂芳基或经取代的亚杂芳基。在一些实施例中，T4或T5是4-10元杂环烯基或经取代的杂环烯基。在一些实施例中，T4或T5是任选地被1-3个选自C1-C6烷基、卤素、OH或胺的取代基取代的亚杂芳基或杂环烯基。
在一些实施例中，T1、T2、T3、T4和T5以及V1、V2、V3、V4和V5选自下表2。
表2.代表性接头。
在一些实施例中，接头包括或其任何组合，其中r是介于1与10之间，优选地介于3与7之间的整数；并且X是O、S或NR1a。在一些实施例中，X是O或NR1a。在一些实施例中，X是O。
在一些实施例中，接头包括或者其任何组合；其中至少一个-(CH2-CH2-O)-被-((CR1aR1b)x-CH＝CH-(CR1aR1b)x-O)-或其任何组合替代；W'不存在，是(CH2)1-5、(CH2)1-5-O、(CH2)1-5-C(＝O)NH-(CH2)1-5-O、(CH2)1-5-C(＝O)NH-(CH2)1-5、-(CH2)1-5-NHC(＝O)-(CH2)1-5-O或-(CH2)1-5-NHC(＝O)-(CH2)1-5-；E3是任选取代的C6-C10亚芳基、任选取代的4至10元亚杂环烷基或任选取代的5至10元亚杂芳基；X是O、S或NH；每个R1a和R1b独立地是H或C1-C6烷基；r是介于1与10之间的整数；并且x是介于1与15之间的整数。在一些实施例中，X是O。在一些实施例中，X是NH。在一些实施例中，E3是任选地被1-3个选自C1-C6烷基、卤素、OH或胺的取代基取代的C6-C10亚芳基。
在一些实施例中，E3是亚苯基或经取代的亚苯基。
在一些实施例中，接头包括
在一些实施例中，接头包括-X(CH2)m(CH2CH2O)n-，其中X是-O-、-NH-或-S-，其中m是0或更大并且n是至少1。
在一些实施例中，接头在第二末端之后包括其中Rc选自键、-N(R1a)-、-O-和-S-；Rd选自-N(R1a)-、-O-和-S-；并且Re独立地选自氢和任选取代的C1-C6烷基；并且其中R1a是H或C1-C6烷基。
在一些实施例中，接头包括一个或多个选自以下的结构：C1-C12烷基、亚芳基、亚环烷基、亚杂芳基、亚杂环烷基、-O-、-C(＝O)NR1a-、-C(＝O)-、-NR1a-、-(CH2CH2CH2O)y-和-(CH2CH2CH2NR1a)y-，其中每个d和y独立地是1-10，并且每个R1a独立地是氢或C1-C6烷基。在一些实施例中，d是4-8。
在一些实施例中，接头包括并且每个d独立地是3-7。在一些实施例中，d是4-6。在其它实施例中，d介于5-9之间。
在一些实施例中，接头包括-N(R1a)(CH2)xN(R1b)(CH2)xN-，其中R1a和R1b各自独立地选自氢或任选取代的C1-C6烷基；并且每个x独立地是在1-6的范围内的整数。
在一些实施例中，接头包括接头包括-(CH2-C(＝O)N(R”)-(CH2)q-N(R')-(CH2)q-N(R”)C(＝O)-(CH2)x-C(＝O)N(R”)-A2-、-(CH2)x-C(＝O)N(R”)-(CH2 CH2O)y(CH2)x-C(＝O)N(R”)-A2-、-C(＝O)N(R”)-(CH2)q-N(R')-(CH2)q-N(R”)C(＝O)-(CH2)x-A2-、-(CH2)x-O-(CH2CH2O)y-(CH2)x-N(R”)C(＝O)-(CH2)x-A2-或-N(R”)C(＝O)-(CH2)-C(＝O)N(R”)-(CH2)x-O(CH2CH2O)y(CH2)x-A2-；其中R'是甲基。R”是氢；每个x和y独立地是1至10的整数；每个q独立地是2至10的整数；并且每个A2独立地选自键、任选取代的C1-C12烷基、任选取代的C6-C12亚芳基、任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的5至10元亚杂芳基和任选取代的4至10元亚杂环烷基。
在一些实施例中，接头包括-(CH2CH2-O)x1-或-(CH2CH2-O)x2-A2-(CH2CH2-O)x3-，其中A2是任选取代的4至10元亚杂环烷基或螺环烯，并且每个x1、x2和x3各自独立地是1-15的整数。
在一些实施例中，A2选自 在一些实施例中，A2是在一些实施例中，A2是在一些实施例中，A2是
在一些实施例中，A2包括具有以下结构的部分：
其中，
X2不存在或是-C(＝O)-；并且
R26是任选取代的C1-C50烷基或任选取代的C1-C50杂烷基。
在一些实施例中，X2是-C(＝O)-。在一些实施例中，X2不存在。
在一些实施例中，R26是C1-C50烷基。在一些实施例中，R26是C1-C40烷基。在一些实施例中，R26是C1-C30烷基。在一些实施例中，R26是C1-C20烷基。在一些实施例中，R26是C1-C10烷基。在一些实施例中，R26是C1-C50杂烷基。在一些实施例中，R26是C1-C40杂烷基。在一些实施例中，R26是C1-C30杂烷基。在一些实施例中，R26是C1-C20杂烷基。在一些实施例中，R26是C1-C10杂烷基。在一些实施例中，杂烷基是聚乙二醇(PEG)。
在一些实施例中，接头用选自以下的基团与第一末端接合：–C(＝O)-、-NR1a-、C1-C12烷基、-C(＝O)NR1a-和-NR1aC(＝O)-；其中每个R1a独立地是氢或任选取代的C1-C12亚烷基、任选取代的C2-C10亚烯基、任选取代的C2-C10亚炔基、任选取代的C6-C10亚芳基、任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的5至10元亚杂芳基和任选取代的4至10元亚杂环烷基。
在一些实施例中，接头用选自以下的基团与第一末端接合：-C(＝O)-、-NR1a-、-C(＝O)NR1a-、-NR1aC(＝O)-、-C(＝O)NR1aC1-C4烷基-、-NR1aC(＝O)-C1-C4烷基-、-C(＝O)O-、-OC(＝O)-、-O-、-S-、-S(＝O)-、-SO2-、-SO2NR1a-、-NR1SO2-、-P(＝O)OH-、-((CH2)x-O)-、-((CH2)y-NR1a)-、任选取代的C1-C12亚烷基、任选取代的C2-C10亚烯基、任选取代的C2-C10亚炔基、任选取代的C6-C10亚芳基、任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的5至10元亚杂芳基和任选取代的4至10元亚杂环烷基，其中每个x独立地是1-4，每个y独立地是1-4a，并且每个R1a独立地是氢或任选取代的C1-C6烷基。
在一些实施例中，接头用选自以下的基团与第一末端接合：-C(＝O)-、-NR1a-、C1-12烷基、-C(＝O)NR1a-和-NR1aC(＝O)-。
在一些实施例中，接头用选自以下的基团与第二末端接合：-C(＝O)-、-NR1a-、-C(＝O)NR1a-、-NR1aC(＝O)-、-C(＝O)NR1aC1-C4烷基-、-NR1aC(＝O)-C1-C4烷基-、-C(＝O)O-、-OC(＝O)-、-O-、-S-、-S(＝O)-、-SO2-、-SO2NR1a-、-NR1SO2-、-P(＝O)OH-、-((CH2)x-O)-、-((CH2)y-NR1a)-、任选取代的C1-C12亚烷基、任选取代的C2-C10亚烯基、任选取代的C2-C10亚炔基、任选取代的C6-C10亚芳基、任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的5至10元亚杂芳基和任选取代的4至10元亚杂环烷基，其中每个x独立地是1-4，每个y独立地是1-4，并且每个R1a独立地是氢或任选取代的C1-C6烷基。
在一些实施例中，接头用选自以下的基团与第二末端接合：-C(＝O)-、-NR1a-、-C(＝O)NR1a-、-NR1aC(＝O)-、-((CH2)x-O)-、-((CH2)y-NR1a)-、-O-、任选取代的C1-C12烷基、任选取代的C6-C10亚芳基、任选取代的C3-C7亚环烷基、任选取代的5至10元亚杂芳基和任选取代的4至10元亚杂环烷基，其中每个x独立地是1-4，每个y独立地是1-4，并且R1独立地是氢或任选取代的C1-C6烷基。
在一些实施例中，接头用选自任选取代的4至10元亚杂环烷基的基团与第二末端接合。
在一些实施例中，接头用包括式(C-1)的结构的部分或其药学上可接受的盐与第二末端接合：
其中，
环D不存在或是任选取代的亚芳基或任选取代的亚杂环烷基；
L1不存在或是任选取代的亚烷基、任选取代的C2-C10亚烯基或任选取代的C2-C10亚炔基；
每个X3和X4独立地是CH或N；
p1和p2各自独立地是0-3；并且
**指示与第二末端的连接。
在一些实施例中，环D不存在。在一些实施例中，环D是C4-C7亚杂环烷基。
在一些实施例中，X3是N。在一些实施例中，X3是CH。
在一些实施例中，X4是N。在一些实施例中，X4是CH。
在一些实施例中，接头用包括式(C-2)的结构的部分或其药学上可接受的盐与第二末端接合：
其中
L1不存在或是任选取代的亚烷基、任选取代的C2-C10亚烯基或任选取代的C2-C10亚炔基；
X4独立地是CH或N；
每个X5和X6独立地是N或CH；并且
**指示与第二末端的连接。
在一些实施例中，X4和X5中的每一个独立地是N或CH，并且X6是N。
在一些实施例中，L1不存在。
在一些实施例中，L1是-(CR1GR1G)x-(亚烷基)2-(CR1GR1G)y-；其中x和y各自独立地是0或1；并且每个R1G是氢或C1-C3烷基。
在一些实施例中，L1是C1-C3亚烷基、C2-C4亚烯基或C2-C4亚炔基。
在一些实施例中，L1是-CH2-、-CH2CH2-、在一些实施例中，L1是-CH2-或-CH2CH2-。在一些实施例中，L1是在一些实施例中，L1是
在一些实施例中，接头用包括式(C-3)的结构的部分或其药学上可接受的盐与第二末端接合：
其中，
p1和p2各自独立地是0-3；
r1是1-3；
R27是任选取代的C1-C50烷基、任选取代的C1-C50杂烷基、-C(＝O)(C1-C50烷基)或-C(＝O)(C1-C50杂烷基)，其中每个烷基和杂烷基是任选取代的；
每个R1G独立地是氢或C1-C3烷基；并且
**指示与第二末端的连接。
在一些实施例中，R27是任选取代的C1-C50烷基或任选取代的C1-C50杂烷基。在一些实施例中，R27是-C(＝O)(C1-C50烷基)或-C(＝O)(C1-C50杂烷基)，其中每个烷基和杂烷基是任选取代的。
在一些实施例中，R27是C1-C50烷基。在一些实施例中，R27是C1-C40烷基。在一些实施例中，R27是C1-C30烷基。在一些实施例中，R27是C1-C20烷基。在一些实施例中，R27是C1-C10烷基。在一些实施例中，R27是C1-C50杂烷基。在一些实施例中，R27是C1-C40杂烷基。在一些实施例中，R27是C1-C30杂烷基。在一些实施例中，R27是C1-C20杂烷基。在一些实施例中，R27是C1-C10杂烷基。在一些实施例中，杂烷基是聚乙二醇(PEG)。
在一些实施例中，每个R1G独立地是氢。在一些实施例中，R1G独立地是C1-C3烷基。在一些实施例中，C1-C3烷基是甲基、乙基或丙基。在一些实施例中，每个R1G独立地是甲基。
在一些实施例中，p1是0、1或2。在一些实施例中，p1是0。在一些实施例中，p1是1。在一些实施例中，p1是2。
在一些实施例中，r1是1或2。在一些实施例中，r1是1。在一些实施例中，r1是2。
在一些实施例中，接头用选自以下的基团与第二末端接合：
其中**指示与第二末端的连接。
在一些实施例中，接头用选自以下的基团与第二末端接合：
其中**指示与第二末端的连接。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-1)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，
环E不存在或是任选取代的5-6元单环芳基或杂芳基或任选取代的4-8元杂环；
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
LA是任选取代的亚烷基、任选取代的亚杂烷基或任选取代的PEG；
LB不存在或是其中
环D不存在或是任选取代的亚芳基或任选取代的亚杂环烷基；
L1不存在或是任选取代的亚烷基、任选取代的C2-C10亚烯基或任选取代的C2-C10亚炔基；
每个X3和X4独立地是CH或N；
p1和p2各自独立地是0-3；并且
**指示与环E或Y连接的点；
每个X3和X4独立地是CH或N；
R17是氢或C1-C6烷基；
R18和R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
或者R18是-NRARB；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
R34是氢、卤素、-OH、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
每个RA和RB独立地是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；并且
y1是1-3；并且
*指示与第一末端的连接。
在一些实施例中，LB不存在。
在一些实施例中，LB是
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-2)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，
环D不存在或是任选取代的亚芳基或任选取代的亚杂环烷基；
环E不存在或是任选取代的5-6元单环芳基或杂芳基或任选取代的4-8元杂环；
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
LA是任选取代的亚烷基、任选取代的亚杂烷基或任选取代的PEG；
L1不存在或是任选取代的亚烷基、任选取代的C2-C10亚烯基或任选取代的C2-C10亚炔基；
每个X3和X4独立地是CH或N；
R17是氢或C1-C6烷基；
R18和R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
或者R18是-NRARB；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
R34是氢、卤素、-OH、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
每个RA和RB独立地是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；
p1和p2各自独立地是0-3；
y1是1-3；并且
*指示与第一末端的连接。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-3)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，
环D不存在或是任选取代的亚芳基或任选取代的亚杂环烷基；
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
LA是任选取代的亚烷基、任选取代的亚杂烷基或任选取代的PEG；
L1不存在或是任选取代的亚烷基、任选取代的C2-C10亚烯基或任选取代的C2-C10亚炔基；
每个X3和X4独立地是CH或N；
R17是氢或C1-C6烷基；
R18和R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
或者R18是-NRARB；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
每个R33独立地选自氢、氘、卤素、羟基、氨基、硝基、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基、任选取代的C1-C20卤代烷基、任选取代的C1-C6羟烷基或任选取代的(PEG)1-20；
R34是氢、卤素、-OH、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
每个RA和RB独立地是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；
p1和p2各自独立地是0-3；
y2是1-3；
y1是1-3；并且
*指示与第一末端的连接。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-4)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，
Y是-CH2NH-、CH2O-、-NH-或-O-；
LA是任选取代的亚烷基、任选取代的亚杂烷基或任选取代的PEG；
R17是氢或C1-C6烷基；
R18和R19各自独立地是氢、氘、卤素、-CN、-NO2、任选取代的-C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
或者R18是-NRARB；
R25是任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6杂烷基、任选取代的C1-C6烯基、任选取代的C1-C6炔基、任选取代的C1-C6羟烷基、-SO2RA或-NHSO2RA；
R32是氢或任选取代的C1-C6烷基；
每个R33独立地选自氢、氘、卤素、羟基、氨基、硝基、任选取代的C1-C20烷基、任选取代的C1-C20杂烷基、任选取代的C1-C20卤代烷基、任选取代的C1-C6羟烷基或任选取代的(PEG)1-20；
R34是氢、卤素、-OH、任选取代的C1-C6烷基、任选取代的C1-C6卤代烷基或任选取代的C1-C6羟烷基；
每个RA和RB独立地是氢、氘、任选取代的C1-C6烷基或任选取代的C1-C6杂烷基；
y2是1-3；
y1是1-3；并且
*指示与第一末端的连接。
在一些实施例中，LA是任选取代的C1-C20亚烷基或任选取代的C2-C20亚杂烷基、任选取代的C2-C4亚炔基或任选取代的PEG1-20，其中各自任选地被烷基、氨基、氰基、卤代烷基或氧代(＝O)取代。
在一些实施例中，LA是其中n3是7、8、9、10、11、12、13、14或15；*指示与第一末端的连接；并且**指示与苯基的连接点。在一些实施例中，LA是其中n3是9、10、11、12、13、14或15；*指示与第一末端的连接；并且**指示与苯基的连接点。在一些实施例中，n3是7。在一些实施例中，n3是8。在一些实施例中，n3是9。在一些实施例中，n3是10。在一些实施例中，n3是11。在一些实施例中，n3是12。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-5)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-6)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-7)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-8)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-9)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1-20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-10)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-11)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-12)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-13)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-14)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-15)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-16)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-17)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-18)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-19)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-20)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-21)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-22)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-23)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-24)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-25)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-26)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-27)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-28)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-29)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-30)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-31)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-32)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-33)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-34)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-35)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-36)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-37)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-38)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-39)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-40)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-41)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；并且m是1-20。在一些实施例中，化合物包括具有式(D-42)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-43)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-44)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-45)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-46)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-47)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-48)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-49)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-50)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-51)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；并且m是1至20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-52)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-53)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，RE是-OH、-(OCH2CH2)m-OH或-(OCH2CH2)m-O(C1-C6烷基)；m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，化合物包括具有式(D-54)的结构的部分或其药学上可接受的盐：
其中，m是1至20；并且n是1-20。
在一些实施例中，LA是任选取代的C2-C20亚杂烷基或任选取代的PEG1-20，其中各自任选地被烷基、氨基、氰基、卤代烷基或氧代(＝O)取代。在一些实施例中，LA是C2-C20亚杂烷基。在一些实施例中，LA是PEG1-20。在一些实施例中，LA是-NH(CH2CH2-O)n-或-(CH2CH2-O)n-，其中n是1-20。在一些实施例中，LA是C2-C20亚杂烷基。在一些实施例中，LA是PEG1-20。在一些实施例中，LA是-NH(CH2CH2-O)n-。在一些实施例中，LA是-(CH2CH2-O)n-。
在一些实施例中，n是1-15。在一些实施例中，n是7-15。在一些实施例中，n是8-15。在一些实施例中，n是9-15。在一些实施例中，n是7、8、9、10、11、12、13、14或15。
还提供了实施例，其中上述任何实施例可以与这些实施例中的任何一个或多个实施例组合，只要组合不是相互排斥的。
如本文所使用的，当一个实施例被定义为与另一个不同时，两个实施例是“相互排斥的”。例如，其中两个基团组合以形成环烷基的实施例与其中一个基团是乙基并且另一个基团是氢的实施例相互排斥。类似地，其中一个基团是CH2的实施例与其中同一基团是NH的实施例相互排斥。
在一些实施例中，式(I)的化合物是选自表3的化合物或其药学上可接受的盐。在一些实施例中，式(I)的化合物是选自表3的化合物。
在一些实施例中，表3(下页)中呈现了本文所描述的化合物的非限制性实例。
另外形式的化合物
在一些方面，本文所公开的化合物具有一或多个立体中心，并且每个立体中心以R构型或S构型独立地存在。本文所提出的化合物包含所有非对映异构形式、对映异构形式和差向异构形式以及其合适的混合物。本文所提供的化合物和方法包含所有顺式(cis)、反式(trans)、顺(syn)、反(anti)、异侧(entgegen，E)和同侧(zusammen，Z)异构体以及其合适的混合物。在某些实施例中，通过使化合物的外消旋混合物与光学活性拆分剂反应形成一对非对映异构体化合物/盐、分离非对映体并回收光学纯的对映异构体，将本文中所描述的化合物制备为其单独的立体异构体。在一些实施例中，对映体的拆分是使用本文中所描述的化合物的共价非对映体衍生物执行的。在另一个实施例中，基于溶解度的差异通过分离/拆分技术分离非对映异构体。在其它实施例中，通过色谱法或通过形成非对映体盐以及通过重结晶或色谱法或其任何组合进行分离来进行立体异构体的分离。Jean Jacques,AndreCollet,Samuel H.Wilen,“对映体、外消旋体和拆分(Enantiomers,Racemates andResolutions)”约翰·威利父子出版公司(John Wiley And Sons,Inc.),1981。一方面，通过立体选择性合成获得立体异构体。
本文所描述的化合物包含同位素标记的化合物，除了一个或多个原子被具有不同于通常在自然界中发现的原子质量或质量数的原子质量或质量数的原子替代的事实之外，所述同位素标记的化合物与本文所提出的不同式和结构相同。可以掺入到本发明化合物中的同位素的实例包含氢、碳、氮、氧、硫、氟、氯和碘的同位素，例如是2H、3H、13C、14C、15N、18O、17O、35S、18F、36Cl和125I。
如本文所使用的，术语“同位素变体”是指这样的化合物，所述化合物在构成此类化合物的原子中的一个或多个原子处含有的同位素的比例大于天然丰度。例如，可以对化合物的“同位素变体”进行放射性标记，即，化合物的同位素变体可以含有一种或多种放射性同位素或可以用非放射性同位素，例如氘(2H或D)、碳-13(13C)、氮-15(15N)等对其进行标记。应当理解，在进行了此类同位素取代的化合物中，如果存在的话，则以下原子可以发生变化，使得例如任何氢可以是氘，任何碳可以是13C或任何氮可以是15N，并且使得可以在本领域的技术内测定此类原子的存在和放置。
使用方法
本公开还涉及调节fxn的转录的方法，所述方法包括使fxn与如本文所描述的化合物接触的步骤。可以监测细胞表型、细胞增殖、fxn的转录、从fxn的转录产生mRNA、fxn的翻译、由fxn编码的蛋白质产生的生物化学输出的变化、或由fxn编码的蛋白质与天然结合配偶体的非共价结合。此类方法可以是疾病治疗方式、生物测定、细胞测定、生物化学测定等。
本文所描述的化合物可以募集调节分子来调节缺陷型fxn基因的表达，并有效治疗和/或和缓解与如弗里德希共济失调等疾病相关的症状。
本文还提供了治疗由fxn的转录介导的疾病的方法，所述方法包括向有需要的患者施用治疗有效量的如本文所公开的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些方面，本公开提供一种治疗或预防有需要的受试者的本文所公开的疾病或病症的方法，所述方法包括向受试者施用治疗有效量的本公开的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些方面，本公开提供一种治疗有需要的受试者的本文所公开的疾病或病症的方法，所述方法包括向受试者施用治疗有效量的本公开的化合物或其药学上可接受的盐或本公开的药物组合物。
在一些方面，本公开提供了一种治疗或预防有需要的受试者的本文所公开的疾病或病症的方法，所述方法包括向受试者施用本公开的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些方面，本公开提供一种治疗有需要的受试者的本文所公开的疾病或病症的方法，所述方法包括向受试者施用本公开的化合物或其药学上可接受的盐或本公开的药物组合物。
在一些方面，本公开提供了一种本公开的用于治疗或预防本文所公开的疾病或病症的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些方面，本公开提供了一种本公开的用于治疗本文所公开的疾病或病症的化合物或其药学上可接受的盐。
在一些方面，本公开提供了一种本公开的化合物或其药学上可接受的盐在制备用于治疗或预防本文所公开的疾病或病症的药物中的用途。
在一些方面，本公开提供了一种本公开的化合物或其药学上可接受的盐在制备用于治疗本文所公开的疾病或病症的药物中的用途。
在一些实施例中，疾病或病症与fxn的转录相关。
在一些实施例中，疾病是弗里德希共济失调。
还提供了如本文所公开的化合物用于治疗由fxn的转录介导的疾病的用途。
本文还提供了一种调节fxn的转录的方法，所述方法包括使fxn与如本文所公开的化合物或其药学上可接受的盐接触。
本文还提供了一种用于在患者中实现效果的方法，所述方法包括向患者施用治疗有效量的如本文所公开的化合物或其药学上可接受的盐，其中效果选自改进的神经感觉、改进的视觉、改进的平衡、改进的步态、降低的对葡萄糖的敏感性和降低的对碳水化合物的敏感性。
在一些实施例中，本文所描述的化合物可以介导和/或缓解肌肉萎缩、共济失调、肌束震颤或痴呆中的一种或多种。
在一些实施例中，疾病或病症是肌肉萎缩。
在一些实施例中，疾病或病症是共济失调。
在一些实施例中，疾病或病症是肌束震颤。
在一些实施例中，疾病或病症是痴呆。
本公开的某些化合物可以有效用于治疗其基因型具有GAA的5个或更多个重复序列的受试者。本公开的某些化合物可以有效用于治疗其基因型具有GAA的10个或更多个重复序列的受试者。本公开的某些化合物可以有效用于治疗其基因型具有GAA的20个或更多个重复序列的受试者。本公开的某些化合物可以有效用于治疗其基因型具有GAA的50个或更多个重复序列的受试者。本公开的某些化合物可以有效用于治疗其基因型具有GAA的100个或更多个重复序列的受试者。本公开的某些化合物可以有效用于治疗其基因型具有GAA的200个或更多个重复序列的受试者。本公开的某些化合物可以有效用于治疗其基因型具有GAA的500个或更多个重复序列的受试者。
还提供了一种调节受试者的fxn介导的功能的方法，所述方法包括施用治疗有效量的如本文所公开的化合物。
在某些实施例中，提供了离体治疗方法。离体方法典型地包含从受试者去除的细胞、器官和/或组织。细胞、器官和/或组织可以例如在适当条件下用药剂进行温育。所接触细胞、器官和/或组织典型地返回到供体、被置于受体中或储存以供将来使用。因此，化合物通常呈药学上可接受的载体形式。
在某些实施例中，施用药物组合物在治疗的6小时内调节fxn的表达。在某些实施例中，施用药物组合物在治疗的24小时内调节fxn的表达。在某些实施例中，施用药物组合物在治疗的72小时内调节fxn的表达。
在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达增加2倍。在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达增加5倍。在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达增加10倍。在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达增加20倍。
在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达减少20％。在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达减少50％。在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达减少80％。在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达减少90％。在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达减少95％。在某些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达减少99％。
在一些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达落在对健康个体观察到的表达水平的25％内。在一些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达落在对健康个体观察到的表达水平的50％内。在一些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达落在对健康个体观察到的表达水平的75％内。在一些实施例中，施用药物组合物使得fxn的表达落在对健康个体观察到的表达水平的90％内。
药物组合物和施用
还提供了一种调节受试者的fxn介导的功能的方法，所述方法包括施用治疗有效量的如本文所公开的化合物。
还提供了一种药物组合物，所述药物组合物包括如本文所公开的化合物以及药学上可接受的载体。
在某些实施例中，药物组合物被调配成用于口服施用。
在某些实施例中，药物组合物被调配成用于静脉内注射或输注。
在某些实施例中，口服药物组合物选自片剂和胶囊。
在某些实施例中，提供了离体治疗方法。离体方法典型地包含从受试者去除的细胞、器官或组织。细胞、器官或组织可以例如在适当条件下用药剂进行温育。所接触细胞、器官或组织典型地返回到供体、被置于受体中或储存以供将来使用。因此，化合物通常呈药学上可接受的载体形式。
在某些实施例中，化合物在小于约5μM的浓度下是有效的。在某些实施例中，化合物在小于约1μM的浓度下是有效的。在某些实施例中，化合物在小于约400nM的浓度下是有效的。在某些实施例中，化合物在小于约200nM的浓度下是有效的。在某些实施例中，化合物在小于约100nM的浓度下是有效的。在某些实施例中，化合物在小于约50nM的浓度下是有效的。在某些实施例中，化合物在小于约20nM的浓度下是有效的。在某些实施例中，化合物在小于约10nM的浓度下是有效的。
组合和组合治疗
在某些情况下，与另一种治疗剂组合施用本文所描述的化合物(或其药学上可接受的盐)中的至少一种可能是合适的。仅作为实例，如果患者在接受本文的化合物中的一种化合物时所经历的副作用之一是高血压，则可能适合将抗高血压剂与初始治疗剂组合施用。或者，仅作为实例，本文所描述的化合物中的一种的治疗效果可以通过施用佐剂而增强(即，佐剂本身可以仅具有最小的治疗益处，但是与另一种治疗剂组合，增强了对患者的总体治疗益处)。或者，仅作为实例，患者所经历的益处可以通过将本文所描述的化合物中的一种化合物与也具有治疗益处的另一种治疗剂(也包含治疗方案)一起施用增加。仅作为实例，在涉及施用本文所描述的化合物中的一种化合物的糖尿病的治疗中，还可以通过向患者提供另一种糖尿病的治疗剂来增加治疗益处。在任何情况下，不管所治疗的疾病、病症或病状如何，患者所经历的总体益处可能只是两种治疗剂的叠加，或者患者可能经历协同益处。
可能的组合疗法的具体、非限制性实例包含使用本公开的某些化合物和ACE抑制剂。
在任何情况下，多种治疗剂(其中至少一种是本文所公开的化合物)可以按任何顺序施用或甚至同时施用。如果同时施用，则多种治疗剂可以以单一、统一的形式提供，也可以以多种形式(仅作为实例，作为单一药丸或作为两个单独的药丸)提供。其中一种治疗剂可以多剂量给药，或者两种治疗剂可以多剂量给药。如果不是同时给药，多次给药之间的定时可以是范围为几分钟至四周的任何持续时间。
因此，另一方面，某些实施例提供了治疗需要此类治疗的人或动物受试者的fxn介导的病症的方法，所述方法包括向所述受试者施用一定量的本文所公开的有效减少或预防受试者的所述病症的化合物，与至少一种本领域已知的用于治疗所述病症的另外的药剂组合。在相关方面，某些实施例提供了治疗组合物，所述治疗组合物包括至少一种本文所公开的化合物与一种或多种用于治疗fxn介导的病症的另外的药剂组合。
除了可用于人类治疗之外，本文所公开的某些化合物和调配物还可以用于伴侣动物、外来动物和农场动物，包含哺乳动物、啮齿动物等的兽医治疗。更优选的动物包含马、狗和猫。
定义
如本文所使用的，以下术语具有指定的含义。
应当理解，根据上下文，某些基团命名惯例可以包括单基或二基。例如，当取代基需要两个与分子其余部分的连接点时，应当理解，该取代基为二基。例如，被识别为需要两个连接点的烷基的取代基包含如-CH2-、-CH2CH2-、-CH2CH(CH3)CH2-等二基。其它基团命名惯例清楚地指示该基团是如“亚烷基”或“亚烯基”、“亚芳基”、“亚杂芳基”等二基。
当两个R基团被称为“与其所连接的原子一起”形成环(例如，碳环基、杂环基、芳基或杂芳基环)时，这意味着原子和两个R基团的集合单元是所述的环。当单独使用时，环在其它方面不受每个R基团的定义的限制。例如，当存在以下子结构时：
并且R1和R2被限定为选自由氢和烷基组成的组，或者R1和R2与其所连接的氮一起形成杂环基，这意味着R1和R2可以选自氢或烷基，或者替代性地，子结构具有结构：
其中环A是含有所描绘的氮的杂芳基环。
类似地，当两个“相邻的”R基团被称为“与其所连接的原子一起”形成环时，这意味着原子、居间键和两个R基团的集合单元是所述的环。例如，当存在以下子结构时：
并且R1和R2被限定为选自由氢和烷基组成的组，或者R1和R2与其所连接的原子一起形成芳基或碳环基，这意味着R1和R2可以选自氢或烷基，或者替代性地，子结构具有结构：
其中A是含有所描绘的双键的芳基环或碳环基。
当取代基被描绘为二基(即，具有与分子的其余部分的两个连接点)时，应当理解，除非另外指明，否则取代基可以以任何定向构型连接。因此，例如，描绘为-AE-或的取代基包含被定向成使得A连接在分子的最左侧连接点处的取代基，以及其中A连接在该分子的最右侧连接点处的取代基。
当公开的值的范围并且使用“从n1…至n2”或者“介于n1…与n2之间”的符号时，其中n1和n2是数字，则除非另有说明，否则该符号旨在包含数字本身和数字之间的范围。该范围可以是介于端值之间并且包含端值的整数或连续值。举例来说，“2至6个碳”的范围旨在包含两个、三个、四个、五个和六个碳，因为碳是以整数单位存在的。例如，将旨在包含1μM、3μM以及其间的每个数字的“1μM至3μM(微摩尔)”与有效数字(例如，1.255μM、2.1μM、2.9999μM等)中的任何数字进行比较。
如本文所使用的，术语“约”旨在对其修饰的数值进行量化，从而表示此类值在误差裕度内是可变的。当未列举特定误差裕度，如与数据图表或表格中给出的平均值的标准偏差时，术语“约”应被理解为意指将涵盖所列举值的范围和通过四舍五入到所述数字的范围，从而将有效数字考虑在内。
术语“聚酰胺”是指由酰胺(即，CONH)键化学结合的可连接单元的聚合物；任选地，聚酰胺包含与其缀合的化学探针。聚酰胺可以使用本领域已知的方法通过羧酸(COOH)与胺(RR'NH)的逐步缩合来合成。可替代地，聚酰胺可以使用体外酶促反应或通过采用微生物发酵来形成。
术语“可连接单元”是指甲基咪唑、甲基吡咯和直链和支链脂肪族官能团(例如，亚甲基、亚乙基、亚丙基、亚丁基等)，其任选地含有氮取代基和其化学衍生物。可连接单元的脂肪族官能团可以例如通过本领域众所周知的方法在聚酰胺的合成期间β-丙氨酸或二甲基氨基丙胺的缩合来提供。
术语“接头”是指至少10个连续原子的链。在某些实施例中，接头含有不超过20个非氢原子。在某些实施例中，接头含有不超过40个非氢原子。在某些实施例中，接头含有不超过60个非氢原子。在某些实施例中，接头含有选自C、H、N、O和S的原子。在某些实施例中，每个非氢原子与接头中的2个相邻原子化学键合，或者与接头中的一个相邻原子和接头的末端化学键合。在某些实施例中，接头与其所连接的两个其它基团中的至少一个形成酰胺键。在某些实施例中，接头与其所连接的两个其它基团中的至少一个形成酯或醚键。在某些实施例中，接头与其所连接的两个其它基团中的至少一个形成硫酯或硫醚键。在某些实施例中，接头与其所连接的两个其它基团中的至少一个形成直接碳-碳键。在某些实施例中，接头与其所连接的两个其它基团中的至少一个形成胺或酰胺键。在某些实施例中，接头包括-(CH2OCH2)-单元。在某些实施例中，接头包括-(CH(CH3)OCH2)-单元。在某些实施例中，对于RN＝C1-4烷基，接头包括-(CH2NRNCH2)单元。在某些实施例中，接头包括亚芳基、亚环烷基或亚杂环烷基部分。
术语“间隔子”是指至少5个连续原子的链。在某些实施例中，间隔子含有不超过10个非氢原子。在某些实施例中，间隔子含有选自C、H、N、O和S的原子。在某些实施例中，间隔子与其所连接的另外两个基团形成酰胺键。在某些实施例中，间隔子包括-(CH2OCH2)-单元。在某些实施例中，对于RN＝C1-4烷基，间隔子包括-(CH2NRNCH2)单元。在某些实施例中，间隔子在生理pH下含有至少一个正电荷。
术语“转角组分”是指约4至10个连续原子的链。在某些实施例中，转角组分含有选自C、H、N、O和S的原子。在某些实施例中，转角组分与其所连接的另外两个基团形成酰胺键。在某些实施例中，转角组分在生理pH下含有至少一个正电荷。
术语“核酸”和“核苷酸”是指本领域众所周知的核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸和其类似物。
术语“寡核苷酸序列”是指具有定义序列和长度的多个核酸(例如，2个、3个、4个、5个、6个或甚至更多个核苷酸)。术语“寡核苷酸重复序列”是指寡核苷酸序列的连续扩增。
本领域众所周知的术语“转录”是指通过DNA导向的RNA聚合酶合成RNA(即，核糖核酸)。术语“调节转录”是指转录水平的变化，所述转录水平可以通过本领域众所周知的方法，例如转录产物mRNA的测定来测量。在某些实施例中，调节是转录的增加。在其它实施例中，调节是转录的减少。
术语“接触”是指使化合物(例如，本公开的转录分子分子)接近期望的靶基因。接触可以产生与靶部分的结合或使得靶部分产生构象变化。
如本文单独或组合使用的术语“酰基”是指与烯基、烷基、芳基、环烷基、杂芳基、杂环连接的羰基，或任何其它部分是与羰基连接的原子是碳。“乙酰基”基团是指-C(＝O)CH3基团。“烷基羰基”或“烷酰基”基团是指通过羰基与母体分子部分连接的烷基。此类基团的实例包含甲基羰基和乙基羰基。酰基的实例包含甲酰基、烷酰基和芳酰基。
如本文单独或组合使用的术语“烯基”是指具有一个或多个双键并含有2至20个碳原子的直链或支链烃基。在某些实施例中，所述烯基将包括2至6个碳原子。术语“亚烯基”是指在如亚乙烯基[(-CH＝CH-),(-C::C-)]等两个或更多个位置处连接的碳-碳双键系统。合适的烯基的实例包含乙烯基、丙烯基、2-甲基丙烯基、1,4-丁二烯基等。除非另有说明，否则术语“烯基”可以包含“亚烯基”基团。
如本文单独或组合使用的术语“烷氧基”是指烷基醚基团，其中术语烷基定义如下。合适的烷基醚基团的实例包含甲氧基、乙氧基、正丙氧基、异丙氧基、正丁氧基、异丁氧基、仲丁氧基、叔丁氧基等。
如本文单独或组合使用的术语“烷基”是指含有1至20个碳原子的直链或支链烷基。在某些实施例中，所述烷基将包括1至10个碳原子。在另外的实施例中，所述烷基将包括1至8个碳原子。烷基可以是任选取代的，如本文所定义的。烷基的实例包含甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、异丁基、仲丁基、叔丁基、戊基、异戊基、己基、辛基、壬基等。如本文单独或组合使用的术语“亚烷基”是指源自在两个或更多个位置处连接的直链或支链饱和烃的饱和脂肪族基团，如亚甲基(-CH2-)。除非另有说明，否则术语“烷基”可以包含“亚烷基”基团。
如本文单独或组合使用的术语“烷基氨基”是指通过氨基连接到母体分子部分的烷基。合适的烷基氨基可以是单烷基化或二烷基化的形成基团，例如N-甲基氨基、N-乙基氨基、N,N-二甲基氨基、N,N-乙基甲基氨基等。
如本文单独或组合使用的术语“亚烷基”是指烯基，其中碳-碳双键的一个碳原子属于烯基所连接的部分。
如本文单独或组合使用的术语“烷基硫代基”是指烷基硫醚(R-S-)基团，其中术语烷基如上文所定义的，并且其中硫可以被一次或二次氧化。合适的烷基硫醚基团的实例包含甲硫基、乙硫基、正丙硫基、异丙硫基、正丁硫基、异丁硫基、仲丁硫基、叔丁硫基、甲磺酰基、乙磺酰基等。
如本文单独或组合使用的术语“炔基”是指具有一个或多个三键并含有2至20个碳原子的直链或支链烃基。在某些实施例中，所述炔基包括2至6个碳原子。在另外的实施例中，所述炔基包括2至4个碳原子。术语“亚炔基”是指在两个位置处连接的碳-碳三键，如亚乙炔基(-C:::C-，-C≡C-)。炔基残基的实例包含乙炔基、丙炔基、羟基丙炔基、丁炔-1-基、丁炔-2-基、戊炔-1-基、3-甲基丁炔-1-基、己炔-2-基等。除非另有说明，否则术语“炔基”可以包含“亚炔基”基团。
如本文单独或组合使用的术语“酰胺基”和“氨基甲酰基”是指如下文所描述的通过羰基连接到母体分子部分的氨基，或反之亦然。如本文单独或组合使用的术语“C-酰胺基”是指-C(＝O)N(RR')基团，其中R和R'如本文所定义的或如由指定的具体列举的“R”基团所定义的。如本文单独或组合使用的术语“N-酰胺基”是指RC(＝O)N(R')-基团，其中R和R'如本文所定义的或如由指定的具体列举的“R”基团所定义的。如本文单独或组合使用的术语“酰基氨基”包括通过氨基连接到母体部分的酰基。“酰基氨基”基团的实例是乙酰氨基(CH3C(＝O)NH-)。
如本文单独组合使用的术语“酰胺”是指-C(＝O)NRR'，其中R和R'独立地选自氢、烷基、酰基、杂烷基、芳基、环烷基、杂芳基和杂环烷基，其中的任何一个本身可以是任选取代的。另外地，R和R'可以组合以形成杂环烷基，其中的任何一个可以是任选取代的。酰胺可以通过羧酸与胺的直接缩合或通过使用酰氯来形成。另外，偶联剂是本领域已知的，包含如DCC和EDCI等基于碳二亚胺的化合物。
如本文单独或组合使用的术语“氨基”是指-NRR'，其中R和R'独立地选自氢、烷基、酰基、杂烷基、芳基、环烷基、杂芳基和杂环烷基，其中的任何一个本身可以是任选取代的。另外地，R和R'可以组合以形成杂环烷基，其中的任何一个可以是任选取代的。
如本文单独或组合使用的术语“芳基”意指含有一个、两个或三个环的碳环芳香族系统，其中此类多环系统稠合在一起。术语“芳基”包括如苯基、萘基、蒽基和菲基等芳香族基团。术语“亚芳基”包括如亚苯基、亚萘基、亚蒽基和亚菲基等芳香族基团。
如本文单独或组合使用的术语“芳基烯基”或“芳烯基”是指通过烯基连接到母体分子部分的芳基。
如本文单独或组合使用的术语“芳基烷氧基”或“芳烷氧基”是指通过烷氧基连接到母体分子部分的芳基。
如本文单独或组合使用的术语“芳基烷基”或“芳烷基”是指通过烷基连接到母体分子部分的芳基。
如本文单独或组合使用的术语“芳基炔基”或“芳炔基”是指通过炔基连接到母体分子部分的芳基。
如本文单独或组合使用的术语“芳基烷酰基”或“芳烷酰基”或“芳酰基”是指源自芳基取代的烷烃羧酸的酰基，如苯甲酰基、萘甲酰基、苯乙酰基、3-苯基丙酰基(氢桂皮酰基)、4-苯基丁酰基、(2-萘基)乙酰基、4-氯氢桂皮酰基等。
如本文单独或组合使用的术语芳氧基是指通过氧基连接到母体分子部分的芳基。
如本文单独或组合使用的术语“苯并(benzo)”和“苯并(benz)”是指源自苯的二价基团C6H4＝。实例包含苯并噻吩和苯并咪唑。
如本文单独或组合使用的术语“氨基甲酸酯”是指氨基甲酸酯(-NHCOO-)，其可以从氮端或酸端与母体分子部分连接，并且可以是任选取代的，如本文所定义的。
如本文单独或组合使用的术语“O-氨基甲酰基”是指-OC(O)NRR'基团-，其中R和R'如本文所定义的。
如本文单独或组合使用的术语“N-氨基甲酰基”具有R和R'的ROC(O)NR'-基团，如本文所定义的。
如本文所使用的术语“羰基”在单独使用时包含甲酰基[-C(＝O)H]并且在组合使用时是-C(O)-基团。
如本文所使用的术语“羧基(carboxyl)”或“羧基(carboxy)”是指-C(＝O)OH或对应的“羧酸酯”阴离子，如在羧酸盐中。“O-羧基”基团是指RC(O)O-基团，其中R如本文所定义的。“C-羧基”基团是指-C(＝O)OR基团，其中R如本文所定义的。
如本文单独或组合使用的术语“氰基”是指-CN。
如本文单独或组合使用的术语“环烷基”或可替代地“碳环”是指饱和或部分饱和的单环、双环或三环烷基，其中每个环状部分含有3至12个碳原子环成员，并且其可以任选地是苯并稠合环系统，所述苯并稠合环系统是任选取代的，如本文所定义的。在某些实施例中，所述环烷基将包括5至7个碳原子。此类环烷基的实例包含环丙基、环丁基、环戊基、环己基、环庚基、四氢萘基、茚满基、八氢萘基，2,3-二氢-1H-茚基，金刚烷基等。如本文所使用的“双环”和“三环”旨在包含两种稠合环系统，如十氢萘、八氢萘以及多环(多中心)饱和或部分不饱和类型。后一类型的异构体通常以双环[1,1,1]戊烷、樟脑、金刚烷和双环[3,2,1]辛烷为例。
如本文单独或组合使用的术语“酯”是指桥接在碳原子处连接的两个部分的羧基。
如本文单独或组合使用的术语“醚”是指桥接在碳原子处连接的两个部分的氧基。
如本文单独或组合使用的术语“卤代”或“卤素”是指氟、氯、溴或碘。
如本文单独或组合使用的术语“卤代烷氧基”是指通过氧原子连接到母体分子部分的卤代烷基。
如本文单独或组合使用的术语“卤代烷基”是指具有如上文所定义的含义的烷基，其中一个或多个氢被卤素替代。具体包括单卤代烷基、二卤代烷基和多卤代烷基。例如，单卤代烷基可以在基团内具有碘、溴、氯或氟原子。二卤代和多卤代烷基可以具有两个或更多个相同的卤代原子或不同卤代基团的组合。卤代烷基的实例包含氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、氯甲基、二氯甲基、三氯甲基、五氟乙基、七氟丙基、二氟氯甲基、二氯氟甲基、二氟乙基、二氟丙基、二氯乙基和二氯丙基。“卤代烷基”是指在两个或更多个位置处连接的卤代烷基。实例包含氟亚甲基(-CFH-)、二氟亚甲基(-CF2-)、氯亚甲基(-CHCl-)等。
如本文单独或组合使用的术语“杂烷基”是指完全饱和或含有1至3个不饱和度的稳定的直链或支链或其组合，由所述数量的碳原子和一至三个选自N、O和S的杂原子组成，并且其中N和S原子可以任选地被氧化，并且N杂原子可以任选地被季铵化。杂原子可以放置在杂烷基的任何内部位置处。至多两个杂原子可以是连续的，例如-CH2-NH-OCH3。
如本文单独或组合使用的术语“杂芳基”是指3至15元不饱和杂单环或稠合单环、双环或三环系统，其中稠合环中的至少一个是芳香族的，所述稠合环含有至少一个选自N、O和S的原子。在某些实施例中，所述杂芳基将包括1至4个杂原子作为环成员。在另外的实施例中，所述杂芳基将包括1至2个杂原子作为环成员。在某些实施例中，所述杂芳基将包括5至7个原子。术语还包括稠合多环基团，其中杂环与芳基环稠合，其中杂芳基环与其它杂芳基环稠合，其中杂芳基环与杂环烷基环稠合，或者其中杂芳基环与环烷基环稠合。杂芳基的实例包含吡咯基、吡咯啉基、咪唑基、吡唑基、吡啶基、嘧啶基、吡嗪基、哒嗪基、三唑基、吡喃基、呋喃基、噻吩基、噁唑基、异噁唑基、噁二唑基、噻唑基、噻二唑基、异噻唑基、吲哚基、异吲哚基、中氮茚基、苯并咪唑基、喹啉基、异喹啉基、喹喔啉基、喹唑啉基、吲唑基、苯并三唑基、苯并二氧杂环戊烯基、苯并吡喃基、苯并噁唑基、苯并噁二唑、苯并噻唑基、苯并噻二唑基、苯并呋喃基、苯噻嗯基、色满基、香豆素基、苯并吡喃基、四氢喹啉基、四唑并哒嗪基、四氢异喹啉基、噻吩并吡啶基、呋喃吡啶基、吡咯并吡啶基等。示例性三环杂环基团包含咔唑基、苯并吲哚基、菲咯啉基、二苯并呋喃基、吖啶基、菲啶基、呫吨基等。
如本文单独或组合使用的术语“杂环烷基”和可互换的“杂环”各自是指含有至少一个杂原子作为环成员的饱和、部分不饱和或完全不饱和(但非芳香族)单环、双环或三环杂环基团，其中每个所述杂原子可以独立地选自氮、氧和硫。在某些实施例中，所述杂环烷基将包括1至4个杂原子作为环成员。在另外的实施例中，所述杂环烷基将包括1至2个杂原子作为环成员。在某些实施例中，所述杂环烷基在每个环中将包括3至8个环成员。在另外的实施例中，所述杂环烷基在每个环中将包括3至7个环成员。在又另外的实施例中，所述杂环烷基在每个环中将包括5至6个环成员。“杂环烷基”和“杂环”旨在包含砜、亚砜、叔氮环成员的N-氧化物以及碳环稠合和苯并稠合系统；另外地，这两个术语还包含其中杂环与如本文所定义的芳基或另外的杂环基团稠合的系统。杂环基团的实例包含四氢异喹啉、氮丙啶基、氮杂环丁烷基、1,3-苯并二氧杂环戊烯基、二氢异吲哚基、二氢异喹啉基、二氢噌啉基、二氢苯并二噁英基、二氢[1,3]噁唑并[4,5-b]吡啶基、苯并噻唑基、二氢吲哚基、二氢-吡啶基、1,3-二噁烷基、1,4-二噁烷基、1,3-二氧戊环基、异吲哚啉基、吗啉基、哌嗪基、吡咯烷基、四氢吡啶基、哌啶基、硫代吗啉基等。除非具体禁止，否则杂环基团可以是任选取代的。
如本文单独或组合使用的术语“肼基”是指通过单键接合的两个氨基，即-N-N-。
如本文单独或组合使用的术语“羟基”是指-OH。
如本文单独或组合使用的术语“羟烷基”是指通过烷基连接到母体分子部分的羟基。
如本文单独或组合使用的术语“亚氨基”是指＝N-。
如本文单独或组合使用的术语“亚氨基羟基”是指＝N(OH)和＝N-O-。
短语“在主链中”是指从基团与本文所公开的式中的任何一个式的化合物或分子的连接点开始的最长的连续或相邻的碳原子链。
术语“异氰酸基”是指-NCO基团。
术语“异硫氰基”是指-NCS基团。
短语“原子直链”是指独立地选自碳、氮、氧和硫的最长的原子直链。
除非另有具体定义，否则如本文单独或组合使用的术语“低级”意指含有1至6个碳原子并且包含6个碳原子(即，C1-C6烷基)。
如本文单独或组合使用的术语“低级芳基”意指苯基或萘基，其中的任一个可以根据需要是任选取代的。
如本文单独或组合使用的术语“低级杂芳基”意指：1)包括五或六个环成员的单环杂芳基，其中一至四个所述成员可以是选自N、O和S的杂原子；或者2)双环杂芳基，其中稠合环中的每一个包括五或六个环成员，在其之间包括一至四个选自N、O和S的杂原子。
如本文单独或组合使用的术语“低级环烷基”意指具有三至六个环成员的单环环烷基(即，C3-C6环烷基)。低级环烷基可以是不饱和的。低级环烷基的实例包含环丙基、环丁基、环戊基和环己基。
如本文单独或组合使用的术语“低级杂环烷基”意指具有三至六个环成员的单环杂环烷基，其中一至四个可以是选自N、O和S的杂原子(即，C3-C6杂环烷基)。低级杂环烷基的实例包含吡咯烷基、咪唑烷基、吡唑烷基、哌啶基、哌嗪基和吗啉基。低级杂环烷基可以是不饱和的。
如本文单独或组合使用的术语“低级氨基”是指-NRR'，其中R和R'独立地选自氢和低级烷基，其中的每一个可以是任选取代的。
如本文单独或组合使用的术语“巯基”是指RS-基团，其中R如本文所定义的。
如本文单独或组合使用的术语“硝基”是指-NO2。
如本文单独或组合使用的术语“氧基”或“氧杂”是指-O-。
如本文单独或组合使用的术语“氧代”是指＝O。
术语“全卤代烷氧基”是指其中氢原子中的所有被卤素原子替代的烷氧基。
如本文单独或组合使用的术语“全卤代烷基”是指其中氢原子中的所有被卤素原子替代的烷基。
如本文单独或组合使用的术语“磺酸盐(sulfonate)”、“磺酸(sulfonic acid)”和“磺酸(sulfonic)”是指磺酸用于盐形成时的-SO3H基团和其阴离子。
如本文单独或组合使用的术语“硫烷基”是指-S-。
如本文单独或组合使用的术语“亚磺酰基”是指-S(O)-。
如本文单独或组合使用的术语“磺酰基”是指-S(O)2-。
术语“N-磺酰胺基”是指RS(＝O)2NR'-基团，其中R和R'如本文所定义的。
术语“S-磺酰胺基”是指-S(＝O)2NRR'基团，其中R和R'如本文所定义的。
如本文单独或组合使用的术语“硫杂”和“硫代”是指-S-基团或其中氧被硫替代的醚。硫代基团的氧化衍生物，即亚磺酰基和磺酰基包含在硫杂和硫代的定义中。
如本文单独或组合使用的术语“硫醇”是指-SH基团。
如本文所使用的术语“硫代羰基”在单独使用时包含硫代甲酰基-C(S)H并且在组合使用时是-C(S)-基团。
术语“N-硫代氨基甲酰基”是指ROC(S)NR'基团，其中R和R'如本文所定义的。
术语“O-硫代氨基甲酰基”是指OC(S)NRR'基团，其中R和R'如本文所定义的。
术语“硫氰基”是指CNS基团。
术语“三卤代甲磺酰胺基”是指X3CS(O)2NR基团，其中X是卤素并且R如本文所定义的。
术语“三卤代甲磺酰基”是指X3CS(O)2基团，其中X是卤素。
术语“三卤代甲氧基”是指X3CO基团，其中X是卤素。
如本文单独或组合使用的术语“三取代的甲硅烷基”是指以其三个自由价被如本文在取代的氨基的定义下列出的基团取代的硅酮基团。实例包含三甲基甲硅烷基、叔丁基二甲基甲硅烷基、三苯基甲硅烷基等。
本文的任何定义可以与任何其它定义组合使用来描述复合结构基团。按照惯例，任何此类定义的尾部元素是与母体部分连接的元素。例如，复合基团烷基酰胺基将表示通过酰胺基与母体分子连接的烷基，并且术语烷氧基烷基将表示通过烷基与母体分子连接的烷氧基。
当基团被定义为“空”时，意思是所述基团不存在。
术语“任选取代的”意指前面的基团可以是经取代的或未经取代的。当取代时,“任选取代的”基团的取代基可以单独或组合包含但不限于一个或多个独立地选自下列基团或特定指定组的基团的取代基：低级烷基、低级烯基、低级炔基、低级烷酰基、低级杂烷基、低级杂环烷基、低级卤代烷基、低级卤代烯基、低级卤代炔基、低级全卤代烷基、低级全卤代烷氧基、低级环烷基、苯基、芳基、芳氧基、低级烷氧基、低级卤代烷醇基、氧代、低级酰氧基、羰基、羧基、低级烷基羰基、低级羧酯、低级羧酰胺基、氰基、氢、卤素、羟基、氨基、低级烷基氨基、芳氨基、酰胺基、硝基、硫醇、低级烷硫基、低级卤代烷硫基、低级全卤代烷硫基、芳硫基、磺酸盐、磺酸、三取代的甲硅烷基、N3、SH、SCH3、C(O)CH3、CO2CH3、CO2H、吡啶基、噻吩、呋喃基、低级氨基甲酸酯和低级尿素。在结构可行的情况下，两个取代基可以接合在一起以形成由零至三个杂原子组成的稠合五元、六元或七元碳环或杂环，例如形成亚甲基二氧基或亚乙基二氧基。任选取代的基团可以是未经取代的(例如，-CH2CH3)、完全取代的(例如，-CF2CF3)、单取代的(例如，-CH2CH2F)或以完全取代与单取代之间的任何水平取代的(例如，-CH2CF3)。在没有限定取代的情况下列举取代基时，涵盖经取代的和未经取代的形式两者。当取代基被限定为“经取代的”时，取代的形式是具体指定的。另外地，可以根据需要定义特定部分的不同组的任选取代基；在这些情况下，任选的取代将如所定义的，通常紧跟在短语“任选地被…取代”之后。
如本文所使用的，经取代的基团源自未经取代的母体基团，其中已经存在一个或多个氢原子与另一个原子或基团的交换。除非另外指明，否则当基团被认为是“经取代的”时，这意味着所述基团被一个或多个独立地选自以下的取代基取代：C1-C6烷基、C1-C6烯基、C1-C6炔基、C1-C6杂烷基、C3-C7碳环基(任选地被卤代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6卤代烷基和C1-C6卤代烷氧基取代)、C3-C7-碳环基-C1-C6-烷基(任选地被卤代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6卤代烷基和C1-C6卤代烷氧基取代)、3至10元杂环基(任选地被卤代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6卤代烷基和C1-C6卤代烷氧基取代)、3至10元杂环基-C1-C6-烷基(任选地被卤代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6卤代烷基和C1-C6卤代烷氧基取代)、芳基(任选地被卤代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6卤代烷基和C1-C6卤代烷氧基取代)、芳基(C1-C6)烷基(任选地被卤代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6卤代烷基和C1-C6卤代烷氧基取代)、5至10元杂芳基(任选地被卤代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6卤代烷基和C1-C6卤代烷氧基取代)、5至10元杂芳基(C1-C6)烷基(任选地被卤代、C1-C6烷基、C1-C6烷氧基、C1-C6卤代烷基和C1-C6卤代烷氧基取代)、卤代、氰基、羟基、C1-C6烷氧基、C1-C6烷氧基(C1-C6)烷基(即，醚)、芳氧基、硫氢基(巯基)、卤代(C1-C6)烷基(例如，-CF3)、卤代(C1-C6)烷基(例如，-OCF3)、C1-C6烷硫基、芳硫基、氨基、氨基(C1-C6)烷基、硝基、O-氨甲酰基、N-氨甲酰基、O-硫代氨甲酰基、N-硫代氨甲酰基、C-酰胺基、N-酰胺基、S-亚磺酰胺基、N-亚磺酰胺基、C-羧基、O-羧基、酰基、氰酸根、异氰酸根、硫氰酸根、异硫氰酸根、亚磺酰基、磺酰基和氧代(＝O)。在基团被描述为“任选取代的”的任何地方，该基团可以被上述取代基取代。
除非另有定义，本身出现且没有数字标记的否则术语R或术语R'是指选自氢、烷基、环烷基、杂烷基、芳基、杂芳基和杂环烷基的部分，其中的任何一个可以是任选取代的。此类R和R'基团应该被理解为是任选取代的，如本文所定义的。无论R基团是否具有数字标记，每个R基团，包含R、R'和Rn，其中n＝(1、2、3、…n)，每个取代基和每个术语应该被理解为在选自基团方面彼此独立。如果任何变量、取代基或术语(例如，芳基、杂环、R等)在式或通用结构中出现多次，则其在每次出现时的定义独立于其它每次出现时的定义。本领域技术人员将进一步认识到，某些基团可以与母体分子连接，或者可以占据元素链中从任一端开始的位置。例如，如-C(O)N(R)-等不对称基团可以在碳或氮处与母体部分连接。
不对称中心存在于本文所公开的化合物或分子中。这些中心可以由符号“R”或“S”指定，这取决于手性碳原子周围的取代基的构型。应当理解，本公开涵盖所有立体化学异构体形式，包含非对映异构体、对映异构体和差向异构体形式，以及d-异构体和1-异构体和其混合物。化合物或分子的单独立体异构体可以由含有手性中心的可商购起始材料合成制备，或者通过制备对映异构体产物的混合物，随后进行分离，如转化为非对映异构体的混合物，随后进行分离或重结晶、色谱技术、在手性色谱柱上直接分离对映异构体或者本领域已知的任何其它适当方法来制备。特定立体化学的起始化合物或分子是可商购的，或者可以通过本领域已知的技术制备和解析。另外地，本文所公开的化合物或分子可以作为几何异构体存在。本公开包含所有顺式、反式、顺、反、异侧(E)和同侧(Z)异构体以及其适当的混合物。另外地，化合物或分子可以作为互变异构体存在；本公开提供了所有互变异构体。另外地，本文所描述的化合物或分子可以以非溶剂化形式以及具有药学上可接受的如水、乙醇等溶剂的溶剂化形式存在。通常，溶剂化形式被视为等同于非溶剂化形式。
术语“键”是指两个原子之间的共价键，或当由键接合的原子被视为是更大的子结构的一部分时是指两个部分之间的共价键。除非另有说明，否则键可以是单键、双键或三键。分子的图中的两个原子之间的虚线指示该位置处可能存在或不存在另外的键。
如本文所使用的术语“疾病”旨在是通常同义的，并且与术语“病症”、“综合症”和“病状”(如医学病状)可互换使用，因为所有均反映人或动物身体或其部分之一的使正常功能受损，通常表现为明显的体征和症状，并且使人或动物的生命的持续时间或质量降低的异常状况。
术语“组合疗法”意指施用两种或更多种治疗剂以治疗本公开中所描述的治疗病状或病症。此类施用涵盖以基本上同时的方式，如在具有固定比率的活性成分的单个胶囊中或在针对每种活性成分的多个单独的胶囊中共同施用这些治疗剂。另外，此类施用还涵盖以顺序的方式使用每种类型的治疗剂。在任一情况下，治疗方案将提供药物组合在治疗本文中所描述的病状或病症中的有益效果。
短语“治疗有效”意在限定用于治疗疾病或病状或影响临床终点的活性成分的量。
术语“治疗可接受”是指适合与患者的组织接触使用而没有过度毒性、刺激和过敏应答、与合理的收益/风险比相称并对其预期用途有效的化合物或分子(或盐、前药、互变异构体、两性离子形式等)。
如本文所使用的，提及“治疗”患者旨在包含预防。治疗在本质上也可以是抢先的，即其可以包含疾病的预防。疾病的预防可能涉及完全防止疾病，例如在预防病原体感染的情况下，或者可能涉及疾病进展的预防。例如，疾病的预防可能不意味着在任何水平上完全排除与疾病相关的任何影响，而是可能意味着将疾病的症状预防到临床上显著的或可检测的水平。预防疾病也可以意指预防疾病进展到疾病的晚期。
术语“患者”通常与术语“受试者”同义并且包含包括人的所有哺乳动物。患者的实例包含人、如牛、山羊、绵羊、猪和兔等家畜，以及如狗、猫、兔和马等伴侣动物。优选地，患者是人。
术语“前药”是指在体内更有活性的化合物或分子。本文所公开的某些化合物或分子也可以作为前药存在，如在《药物和前药代谢中的水解：化学、生物化学和酶学(Hydrolysis in Drug and Prodrug Metabolism:Chemistry,Biochemistry,andEnzymology)》(Testa,Bernard和Mayer,Joachim M.瑞士苏黎世的威利出版社-VHCA(Wiley-VHCA,Zurich,Switzerland)2003)中所描述的。本文所描述的化合物的前药是易于在生理条件下经历化学变化从而提供化合物的化合物的结构修饰形式。另外地，前药可以在离体环境中通过化学或生物化学方法转化成化合物。例如，当将前药置于具有合适的酶或化学试剂的透皮贴剂贮器中时，可以将前药缓慢转化为化合物。因为在一些情况下前药可能比化合物或母体药物更易于施用，所以前药通常是有用的。例如，前药可以通过口服施用而成为生物可利用的，而母体药物却不行。前药还可以在药物组合物中具有改进的超过母体药物的溶解度。本领域已知有各种各样的前药衍生物，如依赖于前药的水解性切割或氧化活化的那些衍生物。前药的实例不限于将是作为酯(“前药”)施用，但然后被代谢水解成羧酸，即活性实体的化合物。另外的实例包含化合物的肽基衍生物。
本文所公开的化合物或分子可以作为治疗上可接受的盐存在。本公开包含盐形式的上述化合物或分子，包含酸加成盐。合适的盐包含用有机酸和无机酸两者形成的盐。此类酸加成盐将通常是药学上可接受的。然而，非药学上可接受的盐可以用于制备和纯化所讨论的化合物或分子。碱加成盐也可以形成并且是药学上可接受的。关于盐的制备和选择的更完整的讨论，参见《药用盐：性质、选择和使用(Pharmaceutical Salts:Properties,Selection,and Use)》(Stahl,P.Heinrich.瑞士苏黎世的威利出版社-VCHA(Wiley-VCHA,Zurich,Switzerland),2002)。
碱加成盐可以在化合物或分子的最终分离和纯化期间通过使羧基与如金属阳离子的氢氧化物等合适的碱、碳酸盐或碳酸氢盐或与氨或有机伯胺、仲胺或叔胺反应来制备。治疗上可接受的盐的阳离子包含锂、钠、钾、钙、镁和铝，以及无毒的季胺阳离子，如铵、四甲基铵、四乙基铵、甲胺、二甲胺、三甲胺、三乙胺、二乙胺、乙胺、三丁胺、吡啶、N,N-二甲基苯胺、N-甲基哌啶、N-甲基吗啉、二环己胺、普鲁卡因、二苄胺、N,N-二苄基苯乙胺、1-非那明和N,N'-二苄基乙二胺。可用于形成碱加成盐的其它代表性有机胺包含乙二胺、乙醇胺、二乙醇胺、哌啶和哌嗪。
还可以使用制药领域已知的其它载体材料和施用方式。本公开的药物组合物可以通过如有效的调配和施用程序等众所周知的药学技术中的任何药学技术制备。优选的单位剂量调配物是含有有效剂量的如下述活性成分或其适当部分的调配物。
应当理解，关于正在讨论的调配物类型，除以上特别提及的成分外，上文所描述的调配物可以包含本领域中的常规的其它试剂，例如，适合于口服施用的调配物可以包含调味剂。
可以与载体材料组合以产生单个剂型的活性成分的量将根据被治疗的主体和特定施用方式而变化。
化合物或分子可以以各种方式施用，例如口服、局部或注射。施用于患者的化合物的精确量将由主治医师负责。对任何特定患者的具体剂量水平将取决于各种各样的因素，包含所采用的具体化合物的活性、年龄、体重、健康状况、性别、饮食、施用时间、施用路径、排泄率、药物组合、所治疗的确切病症，以及所治疗的适应症或病状的严重程度。另外，施用途径可以根据病状和其严重程度而变化。关于有效调配物和施用程序的上述考虑是本领域众所周知的并且在标准教科书中有所描述。
实例
以下实例出于展示本公开的各个实施例的目的而给出并且不意味着以任何方式限制本公开。本实例以及本文所描述的方法目前代表为示例性的优选的实施例，并且不旨在限制本公开的范围。本领域技术人员将想到其中的变化和涵盖在由权利要求的范围所限定的本公开的精神内的其它用途。
虽然已经在本文示出并描述了本公开的优选实施例，但是对本领域的普通技术人员而言应当显而易见的是此类实施例仅以举例方式提供。在不背离本公开的情况下，本领域的技术人员现在将想到许多变化、改变和取代。应当理解，可以采用本文所描述的实施例的各种替代方案。下列权利要求旨在界定本公开的范围，并据此涵盖这些权利要求及其同等物范围内的方法和结构。
化合物合成
本公开的化合物可以使用以下详述的一般合成方案和实验程序中说明的方法来制备。通用合成方案和实验程序仅出于说明目的而呈现，并且不旨在是限制性的。用于制备本公开的化合物的起始材料是市售可得的或者可以使用本领域已知的常规方法来制备。
缩写列表
Ac2O＝乙酸酐；AcCl＝乙酰氯；AcOH＝乙酸；AIBN＝偶氮双异丁腈；aq.＝水溶液Bu3SnH＝三丁基氢化锡；CD3OD＝氘化甲醇；CDCl3＝氘化氯仿；CDI＝1,1'-羰基二咪唑；DBU＝1,8-二氮杂二环[5.4.0]十一碳-7-烯；DCM＝二氯甲烷；DEAD＝偶氮二甲酸二乙酯；DIBAL-H＝二异丁基氢化铝；DIEA＝DIPEA＝N,N-二异丙基乙胺；DMAP＝4-二甲氨基吡啶；DMF＝N,N-二甲基甲酰胺；DMSO-d6＝氘代二甲亚砜；DMSO＝二甲亚砜；DPPA＝二苯基磷酰基叠氮化物；EDC.HCl＝EDCI.HCl＝1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐；Et2O＝乙醚；EtOAc＝乙酸乙酯；EtOH＝乙醇；h＝小时；HATU＝2-(1H-7-氮杂苯并三唑-1-基)-1,1,3,3-四甲基溴铵六氟磷酸甲胺；HMDS＝六甲基二硅氮烷；HOBT＝1-羟基苯并三唑；i-PrOH＝异丙醇；LAH＝氢化铝锂；LiHMDS＝双(三甲基硅基)胺基锂；MeCN＝乙腈；MeOH＝甲醇；MP-碳酸酯树脂＝大孔三乙基铵-甲基聚苯乙烯碳酸酯树脂；MsCl＝甲磺酰氯；MTBE＝甲基叔丁基醚；MW＝微波辐射；n-BuLi＝正丁基锂；NaHMDS＝双(三甲基甲硅烷基)氨基钠；NaOMe＝甲醇钠；NaOtBu＝叔丁醇钠；NBS＝N-溴代琥珀酰亚胺；NCS＝N-氯代琥珀酰亚胺；NMP＝N-甲基-2-吡咯烷酮；Pd(Ph3)4＝四(三苯基膦)钯(0)；Pd2(dba)3＝三(二亚苄基丙酮)二钯(0)；PdCl2(PPh3)2＝双(三苯基膦)二氯化钯(II)；PG＝保护基团；prep-HPLC＝制备型高效液相色谱法；PyBop＝(苯并三唑-1-基氧基)六氟磷酸盐三吡咯烷磷鎓；Pyr＝吡啶；RT＝室温；RuPhos＝2-二环己基膦基-2',6'-二异丙氧基联苯；sat.＝饱和；ss＝饱和溶液；t-BuOH＝叔丁醇；T3P＝丙基磷酸酐；TBS＝TBDMS＝叔丁基二甲基甲硅烷基；TBSCl＝TBDMSCl＝叔丁基二甲基氯硅烷；TEA＝Et3N＝三乙胺；TFA＝三氟乙酸；TFAA＝三氟乙酸酐；THF＝四氢呋喃；Tol＝甲苯；TsCl＝甲苯磺酰氯；XPhos＝2-双环己基膦基-2',4',6'-三异丙基联苯。
代表性聚酰胺的合成
实例1.3-([1-甲基-4-[3-([1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑- 2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基]甲酰胺基)丙酰胺 基]咪唑-2-基]甲酰胺基)丙酸(PA01-OH)的合成
方案1.
步骤1：4-氨基-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯的合成
向1-甲基-4-硝基咪唑-2-甲酸乙酯(30.00g，150.63mmol，1.00当量)于EtOH(120.00mL)和EA(120.00mL)中的溶液中添加Pd/C(8.01g，27％w/w)。然后将反应物在室温下在H2气氛下搅拌17.0小时。将固体滤出并将滤液浓缩，以得到呈黄色固体的4-氨基-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(22.30g，75.20％)。LC/MS:C7H11N3O2的质量计算值：169.09，实验值：170.10[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:7.37(s,1H),4.29-4.34(m,2H),3.94(s,3H),1.31(t,J＝7.2Hz,3H)。
步骤2：4-[3-[(叔丁氧羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯的合成
向500mL烧瓶中添加3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酸(22.45g，118.65mmol，0.90当量)，DMF(180.00mL)。将混合物冷却至0℃，然后添加HATU(75.18g，197.71mmol，1.50当量)和DIEA(51.11g，395.43mmol，3.00当量)，将混合物搅拌10.0分钟，然后分批添加4-氨基-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(22.30g，131.81mmol，1.00当量)。将反应物在室温下搅拌1.0小时。将反应用冰水(600mL)淬灭，并将溶液搅拌15.0分钟。将沉淀的固体通过过滤收集并用水(3x 50mL)洗涤并在真空下干燥。这产生呈浅黄色固体的4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(34.50g，76.90％)。LC/MS:C15H24N4O5的质量计算值：340.17，实验值：341.20[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:10.63(s,1H),7.52(s,1H),6.80(t,J＝5.6Hz,1H),4.23-4.28(m,2H),3.90(s,3H),3.15-3.20(m,2H),2.42(t,J＝7.2Hz,2H),1.37(s,9H),1.29(t,J＝7.2Hz,3H)。
步骤3：4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸的合成
在室温下向4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(34.50g，101.36mmol，1.00当量)于MeOH(200.00mL)中的经搅拌的溶液中逐滴添加LiOH溶液(2M，202.00mL，4.00当量)。将所得混合物在45℃下搅拌2.0小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物溶解于H2O(50mL)中。将混合物用2M HCl酸化至pH 3～5。将沉淀的固体通过过滤收集并用H2O(3x 30mL)洗涤，在真空下干燥。获得呈白色固体的4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(30.00g，94.77％)。LC/MS:C13H20N4O5的质量计算值：312.14，实验值：313.15[M+H]+。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.53(s,1H),7.48(s,1H),6.79(t,J＝5.4Hz,1H),3.89(s,3H),3.15 -3.22(m,2H),2.43(t,J＝7.2Hz,2H),1.37(s,9H)。
步骤4：4-(4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯的合成
在0℃下，向4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(16.00g，51.23mmol，1.00当量)于CH3CN(150.00mL)中的经搅拌的溶液中分批添加TCFH(21.56g，76.84mmol，1.50当量)、NMI(12.62g，153.69mmol，3.00当量)和4-氨基-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯盐酸盐(10.74g，56.34mmol，1.10当量)。将所得混合物在室温下搅拌2.0小时。将沉淀的固体通过过滤收集并通过CH3CN(3x 20mL)洗涤，在真空下干燥。获得呈白色固体的4-(4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(19.00g，82.70％)。LC/MS:C20H28N6O6的质量计算值：448.21，实验值：449.25[M+H]+。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.24(s,1H),10.11(s,1H),7.52(s,1H),7.33(s,1H),6.99(s,1H),6.82(t,J＝5.1Hz,1H),3.94(s,3H),3.85(s,3H),3.74(s,3H),3.16-3.23(m,2H),2.47(t,J＝6.9Hz,2H),1.38(s,9H)。
步骤5：4-[4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯盐酸盐的合成
将4-(4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(19.00g，42.37mmol，1.00当量)于HCl/1,4-二噁烷(4M，200.00mL)中的溶液在室温下搅拌2.0小时。将所得混合物在真空下浓缩。获得呈黄色固体的4-[4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯盐酸盐(19.00g，粗产物)。LC/MS:C15H21ClN6O4的质量计算值：348.15，实验值：349.05[M+H]+。1H NMR(300MHz,CD3OD)δ:7.37(s,2H),6.91(s,1H),4.03(s,3H),3.88(s,3H),3.79(s,3H),3.09(t,J＝6.6Hz,2H),2.64(t,J＝6.6Hz,2H)。
步骤6：3-[(4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-基)甲酰胺基]丙酸甲酯的合成
向1000ml烧瓶中添加4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(11.00g，35.22mmol，1.00当量)、DMF(300.00mL)，将混合物冷却至0℃，然后逐滴添加HATU(20.09g，52.83mmol，1.50当量)、DIEA(18.21g，140.88mmol，4.00当量)，将混合物搅拌10分钟，分批添加3-氨基丙酸甲酯(3.63g，35.22mol，1.00当量)。将反应物在室温下搅拌1.0小时。将反应混合物倒入到水/冰(600mL)中，将固体滤出并在真空下干燥。将水相通过EA(3x 200mL)萃取，将有机相合并并通过H2O(1x 200mL)和NaCl(1x 200mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱纯化，用纯EA洗脱。将级分合并并浓缩。获得呈黄色固体的3-[(4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-基)甲酰胺基]丙酸甲酯(13.00g，87.95％)。LC/MS:C17H27N5O6的质量计算值：397.20，实验值：398.20[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:10.28(s,1H),7.92(t,J＝6.0Hz,1H),7.37(s,1H),6.77(t,J＝6.0Hz,1H),3.88(s,3H),3.59(s,3H),3.42-3.47(m,2H),3.13-3.18(m,2H),2.56(t,J＝6.0Hz,2H),2.42(t,J＝6.0Hz,2H),1.35(s,9H)。
步骤7：3-[[4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基咪唑-2-基]甲酰胺基]丙酸甲酯盐酸盐的合成
将3-[(4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-基)甲酰胺基]丙酸甲酯(11.00g，27.678mmol，1.00当量)于HCl/1,4-二噁烷(4M，110.00mL)中的溶液在室温下搅拌1.0小时。将所得混合物在真空下浓缩，以得到呈黄色油的3-[[4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基咪唑-2-基]甲酰胺基]丙酸甲酯盐酸盐(11.00g，粗产物)。LC/MS:C12H19N5O4的质量计算值：297.14，实验值：298.20[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:10.57(s,1H),7.92(t,J＝6.0Hz,1H),7.37(s,1H),3.89(s,3H),3.59(s,3H),3.43-3.47(m,2H),2.97-3.05(m,2H),2.57-2.71(m,2H),2.56(t,J＝6.0Hz,2H)。
步骤8：1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸甲酯的合成
在0℃下，向1-甲基咪唑-2-甲酸(10.00g，79.29mmol，7.00当量)于DMF(150.00mL)中的经搅拌的溶液中分批添加TBTU(38.19g，118.94mmol，1.50当量)、4-氨基-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯盐酸盐(16.63g，87.24mmol，1.10当量)和DIEA(30.74g，237.88mmol，3.00当量)。将所得混合物在室温下搅拌17.0小时。将反应物倒入到水/冰(450mL)中。将沉淀的固体通过过滤收集并用H2O(3x 50mL)洗涤，在真空下干燥。获得呈白色固体的1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸甲酯(16.50g，78.37％)。LC/MS:C12H14N4O3的质量计算值：262.11，实验值：263.15[M+H]+。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.54(s,1H),7.54(s,1H),7.40(s,1H),7.04(s,2H),3.99(s,3H),3.85(s,3H),3.74(s,3H)。
步骤9：1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸的合成
在室温下向1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸甲酯(16.50g，62.91mmol，1.00当量)于MeOH(100.00mL)中的经搅拌的溶液中逐滴添加LiOH溶液(2M，158.00mL，5.00当量)。将所得混合物在45℃下搅拌2.0小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物溶解于H2O(50mL)中。将混合物用2M HCl酸化至pH 3～5。将沉淀的固体通过过滤收集并用H2O(3x 30mL)洗涤，在真空下干燥。获得呈白色固体的1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸(12.00g，76.84％)。LC/MS:C11H12N4O3的质量计算值：248.09，实验值：249.10[M+H]+。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.52(s,1H),7.48(s,1H),7.41(s,1H),7.06(s,1H),6.99(s,1H),3.99(s,3H),3.82(s,3H)。
步骤10：1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-甲酸甲酯的合成
在0℃下，向1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸(9.00g，36.255mmol，1.00当量)于DMF(150.00mL)中的经搅拌的溶液中分批添加HATU(20.68g，54.38mmol，1.50当量)、DIEA(14.06g，108.77mmol，3.00当量)和4-[4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(13.89g，39.872mmol，1.10当量)。将所得混合物在室温下搅拌17.0小时。将反应物倒入到0℃的水/冰(450mL)中。将沉淀的固体通过过滤收集并用H2O(3x 50mL)洗涤，在真空下干燥。获得呈黄色固体的1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-甲酸甲酯(14.00g，63.54％)LC/MS:C26H30N10O6的质量计算值：578.23，实验值：579.10[M+H]+。1HNMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.53(s,1H),10.29(s,1H),10.11(s,1H),8.10(t,J＝5.4Hz,1H),7.52(s,1H),7.47(s,2H),7.25(s,1H),7.17(s,1H),6.99(s,1H),6.97(s,1H),3.99(s,3H),3.95(s,3H),3.84(s,3H),3.82(s,3H),3.69(s,3H),3.42-3.49(m,2H),2.60(t,J＝7.2Hz,2H)。
步骤11：1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺基]吡咯-2-甲酸的合成
向1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基]-甲酰胺甲酸甲酯(14.00g，24.20mmol，1.00当量)于MeOH(70.00mL)中的溶液中添加LiOH(2M，72.00mL，6.00当量)。将混合物在45℃下搅拌2.0小时。将所得混合物在减压下浓缩。将残余物溶解于H2O(50mL)中。将混合物用2MHCl酸化至pH 3～5。将沉淀的固体通过过滤收集并用H2O(3x 20mL)洗涤，在真空下干燥。获得呈黄色固体的1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺基]吡咯-2-甲酸(12.00g，81.49％)LC/MS:C25H28N10O6的质量计算值：564.22，实验值：565.15[M+H]+。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.72(s,1H),10.32(s,1H),10.08(s,1H),8.14(t,J＝6.0Hz,1H),7.51(s,1H),7.47(s,2H),7.27(s,1H),7.23(s,1H),6.98(s,1H),6.94(s,1H),4.00(s,3H),3.95(s,3H),3.82(s,6H),3.44-3.46(m,2H),2.60(t,J＝6.6Hz,2H)。
步骤12：3-([1-甲基-4-[3-([1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基]甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基]甲酰胺基)丙酸甲酯的合成
在0℃下，向1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-甲酸(12.00g，21.26mmol，1.00当量)于DMF(100.00mL)中的经搅拌的溶液中分批添加HATU(12.12g，31.88mmol，1.50当量)、DIEA(8.24g，63.77mmol，3.00当量)和3-[[4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基咪唑-2-基]甲酰胺基]丙酸甲酯(6.95g，23.38mmol，1.10当量)。将所得混合物在室温下搅拌2.0小时。将反应物倒入到0℃的水/冰(300mL)中。将沉淀的固体通过过滤收集并用H2O(3x 30mL)洗涤，在真空下干燥。获得呈黄色固体的3-([1-甲基-4-[3-([1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基]甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基]甲酰胺基)丙酸甲酯(13.00g，64.77％)。LC/MS:C37H45N15O9的质量计算值：843.35，实验值：844.55[M+H]+。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.41(s,1H),10.37(s,1H),10.32(s,1H),9.96(s,1H),8.08(s,2H),7.96(s,1H),7.46(s,1H),7.42(s,1H),7.38(s,1H),7.24(s,2H),7.03(s,1H),6.98(s,1H),6.93(s,1H),4.13(s,3H),3.98(s,3H),3.95(s,3H),3.81(s,9H),3.60(s,6H),2.57-2.69(m,6H)。
步骤13：3-([1-甲基-4-[3-([1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基]甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基]甲酰胺基)丙酸的合成
向3-([1-甲基-4-[3-([1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基]甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基]甲酰胺基)丙酸甲酯(10.00g，10.59mmol，1.00当量)于MeOH(60.00mL)中的溶液中添加2M LiOH(21.20mL，42.40mmol，4.00当量)，将所得混合物在45℃下搅拌2.0小时。将所得混合物在减压下浓缩。将所得混合物用水(60mL)稀释。将混合物用2M HCl酸化至pH 3～5。将沉淀的固体通过过滤收集并用水(3x 20mL)洗涤。将固体在真空下干燥。这产生呈棕色固体的3-([1-甲基-4-[3-([1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-[[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基]丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基]甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基]甲酰胺基)丙酸(8.70g，84.14％)。LC/MS:C36H43N15O9的质量计算值：829.34，实验值：830.25[M+H]+。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:10.46(s,1H),10.39(s,1H),10.31(s,1H),9.93(s,1H),8.05 -8.10(m,2H),7.87(t,J＝6.0Hz,1H),7.42-7.46(m,3H),7.20-7.23(m,2H),7.07(s,1H),6.90-6.95(m,2H),3.95(s,3H),3.92(s,3H),3.89(s,3H),3.79(s,3H),3.78(s,3H),3.38-3.41(m,6H),2.44-2.59(m,6H)。
实例2.1-甲基-4-(1-甲基-4-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡 咯-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸(PA-047)的合成
方案2.
步骤1：4-[4-[(叔丁氧羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯的合成
在0℃下，向4-[(叔丁氧羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-甲酸(11.50g，47.87mmol，1.00当量)于DMF(200.00mL)中的经搅拌的溶液中添加EDCI(22.94g，119.66mmol，2.50当量)、4-氨基-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(8.10g，47.87mmol，1.00当量)和DMAP(14.62g，119.66mmol，2.50当量)。将所得混合物在35℃下搅拌17.0小时。在反应之后，将反应物倒入到500mL冰/水中。将沉淀的固体通过过滤收集并用水(3x 50mL)洗涤，在真空下干燥。这产生呈浅黄色固体的4-{4-[(叔丁氧羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(16.00g，85.48％)。LC/MS:C18H25N5O5的质量计算值：391.19，实验值：392.30[M+H]+。
步骤2：4-[4-[(叔丁氧羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤3)相同，但反应温度是室温并且反应时间是1.0小时。使用970.00mg的4-[4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基]-1-甲咪唑-2-甲酸乙酯，获得638.00mg的呈黄色固体的4-[4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(64.36％产率)。LC/MS:C16H21N5O5的质量计算值：363.15，实验值：364.15[M+H]+。
步骤3：4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯的合成
将4-{4-[(叔丁氧羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-甲酸(6.00g,16.51mmol，1.00当量)溶解于DMF(60.00mL)中。在0℃下将PyBOP(8.59g，16.51mmol，1.00当量)、4-氨基-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(2.55g，16.51mmol，1.00当量)和DIEA(6.40g，49.536mmol，3.00当量)依次添加到溶液中。使混合物温热至室温并搅拌1.0小时。在反应完成之后，将混合物逐滴添加到冰水(150mL)中。生成固体，将其滤出，通过水(2x15mL)洗涤并在真空下干燥，以得到呈红棕色固体的4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(7.10g，86.08％)。LC/MS:C23H29N7O6的质量计算值：499.21，实验值：500.15[M+H]+。
步骤4：4-[4-(4-氨基-1-甲基吡咯-2-酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯的合成
在室温下，向4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(250.00mg，0.500mmol，1.00当量)于DCM(2.50mL)中的经搅拌的溶液中逐滴添加TFA(0.50mL)。将所得混合物在室温下搅拌1.0小时。将所得混合物在真空下浓缩。获得呈棕色-黄色油的4-[4-(4-氨基-1-甲基吡咯-2-酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(250.00mg，粗产物)。LC/MS:C18H21N7O4的质量计算值：399.17，实验值：400.35[M+H]+。
步骤5：1-甲基-4-(1-甲基-4-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸甲酯的合成
在0℃下，向1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸(156.62mg，0.63mmol，0.90当量)于DMF(2.00mL)中的经搅拌的溶液中分批添加PyBOP(361.16mg，0.69mmol，1.00当量)、4-[4-(4-氨基-1-甲基吡咯-2-酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(280.00mg，0.70mmol，1.00当量)和DIEA(453.02mg，3.51mmol，5.00当量)。将所得混合物在室温下搅拌1.0小时。将反应混合物通过反相柱直接在以下条件下纯化：柱，C18硅胶；流动相，含ACN的水(0.05％ TFA)，50分钟内5％至70％梯度；检测器，UV254nm。将级分合并并浓缩。获得呈白色固体的1-甲基-4-(1-甲基-4-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸甲酯(240.00mg，51.65％产率)。LC/MS:C29H31N11O6的质量计算值：629.25，实验值：630.25[M+H]+。
步骤6：1-甲基-4-(1-甲基-4-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤3)相同。使用240.00mg的1-甲基-4-(1-甲基-4-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸甲酯，获得178.00mg的呈白色固体的1-甲基-4-(1-甲基-4-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸(62.96％产率)。LC/MS:C28H29N11O6的质量计算值：615.23，实验值：616.25[M+H]+。
实例3.1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰 胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪 唑-2-甲酸(PA-048)的合成
方案3.
步骤1：2-(1-甲基咪唑-2-基)-3H-1,3-苯并二唑-5-甲酸的合成
程序与(实例1步骤7)相同，但反应时间是1.0小时。使用2.00g的4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯，获得2.00g粗产物的呈灰白色固体的4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基-1H-咪唑-2-甲酸乙酯。LC/MS:C10H16N4O3的质量计算值：240.12，实验值：241.10[M+H]+。
步骤2：1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-
甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯的合成
程序与4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例2步骤3)相同。使用270.00mg的1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-甲酸，获得460.00mg的呈灰白色固体的1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯(96.45％产率)。LC/MS:C35H42N14O8的质量计算值：786.33，实验值：809.60[M+Na]+。
步骤3：1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤3)相同。使用470.00mg的1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯，获得400.00mg的呈灰白色固体的1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸(74.41％产率)。LC/MS:C33H38N14O8的质量计算值：758.30，实验值：759.55[M+H]+。
实例4.1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯- 2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2- 甲酸的合成(PA-048-Des)
方案4.
步骤1：4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯的合成
程序与4-氨基-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(实例1，步骤1)相同，但反应时间是18.0小时。使用5.00g的4-硝基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯，获得4.00g的呈棕色固体的4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(95.56％产率)。LC/MS:C7H10N2O2的质量计算值：154.07，实验值：155.25[M+H]+。
步骤2：4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯的合成
向100mL烧瓶中添加1-甲基咪唑-2-甲酸(0.82g，6.49mmol，1.00当量)、DMF(20.00mL)、4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(1.00g，6.486mmol，1.00当量)、DIEA(3.36g，26.01mmol，4.01当量)，将混合物在室温下搅拌5.0分钟，然后添加PyBOP(4.39g，8.43mmol，1.30当量)，将反应物在室温下搅拌1.0小时。在0℃下将反应通过添加水(60mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2x 10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用(PE:EA＝1:1)洗脱，以得到呈浅绿色固体的4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(1.50g，88.17％)。LC/MS:C12H14N4O3的质量计算值：262.11，实验值：263.25[M+H]+。
步骤3：4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤9)相同，但反应温度是30℃并且反应溶剂是MeOH/THF(2:1)。使用2.00g的4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酸乙酯，获得2.00g的呈棕色固体的4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酸。LC/MS:C10H10N4O3的质量计算值：234.08，实验值：235.05[M+H]+。
步骤4：1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酸乙酯的合成
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同。使用1.60g的4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酸，获得1.10g的呈固体的1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酸乙酯(35.28％产率)。LC/MS:C20H24N8O5的质量计算值：456.19，实验值：457.30[M+H]+。
步骤5：1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤9)相同，但反应时间是1.0小时并且反应溶剂是MeOH/THF(1:1)。使用1.10g的1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酸乙酯，获得760.00mg的呈白色固体的1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酸(73.62％产率)。LC/MS:C18H20N8O5的质量计算值：428.16，实验值：429.15[M+H]+。
步骤6：4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-甲酸乙酯的合成
程序与4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例3步骤2)相同。使用760.00mg的1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酸，获得1.00g粗产物的呈棕色固体的4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-甲酸乙酯。LC/MS:C25H28N10O6的质量计算值：564.22，实验值：565.45[M+H]+。
步骤7：4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤3)相同，但反应温度是40℃并且反应时间是1.0小时。使用1.00g的4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-甲酸乙酯，获得930.00mg粗产物的呈棕色固体的4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-甲酸。LC/MS:C23H24N10O6的质量计算值：536.19，实验值：537.20[M+H]+。
步骤8：1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯的合成
向100mL烧瓶中添加4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-甲酸(650.00mg,1.21mmol，1.00当量)、DMF(10.00mL)、4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(292.00mg，1.22mmol，1.00当量)、EDCI(1161.00mg，6.06mmol，5.00当量)，将混合物在室温下搅拌5.0分钟，然后添加DMAP(740.00mg，6.06mmol，5.00当量)，将反应物在室温下搅拌17.0小时。将反应物倒入到冰水(30mL)中，将沉淀的固体通过过滤收集并用水(3x 10mL)洗涤，在真空下干燥，将粗产物通过反快速色谱法在以下条件下纯化：柱，C18硅胶；流动相，含MeCN的水(0.05％TFA)，50分钟内10％至50％梯度；检测器，UV 254nm。将级分合并并浓缩。这产生呈棕色固体的1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯(320.00mg，34.81％)。LC/MS:C33H38N14O8的质量计算值：758.30，实验值：759.55[M+H]+。
步骤9：1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸(PA-048-Des)的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤3)相同，但反应温度是室温。使用310.00mg的1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯，获得170.00mg粗产物的呈棕色固体的1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸。LC/MS:C31H34N14O8的质量计算值：730.27，实验值：731.55[M+H]+。
实例5.1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪 唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺 基]咪唑-2-甲酸(PA-048-P6CB)的合成
方案5.
步骤1：1-甲基-4-[(1r,3r)-3-[(叔丁氧基羰基)氨基]环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯的合成
程序与3-[(4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-基)甲酰胺基]丙酸甲酯相同。使用200.00mg的(1r,3r)-3-[(叔丁氧基羰基)氨基]环丁烷-1-甲酸，获得330.00mg的呈橙色固体的1-甲基-4-[(1r,3r)-3-[(叔丁氧基羰基)氨基]环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯(96.93％产率)。LC/MS:C17H26N4O5的质量计算值：366.19，实验值：367.25[M+H]+。
步骤2：1-甲基-4-[(1r,3r)-3-氨基环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯的合成
程序与4-[4-(4-氨基-1-甲基吡咯-2-酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例2步骤3)相同。使用145.00mg的1-甲基-4-[(1r,3r)-3-[(叔丁氧基羰基)氨基]环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯，获得145.00mg粗产物的呈黄色油的1-甲基-4-[(1r,3r)-3-氨基环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯。LC/MS:C12H18N4O3的质量计算值：266.14，实验值：267.10[M+H]+。
步骤3：1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯的合成
程序与4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例2步骤3)相同。使用105.00mg的1-甲基-4-[(1r,3r)-3-氨基环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯，获得250.00mg的呈浅黄色固体的1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯(78.15％产率)。LC/MS:C37H44N14O8的质量计算值：812.35，实验值：813.50[M+H]+。
步骤4：1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸(PA-048-P6CB)的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤3)相同。使用250.00mg的1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸乙酯，获得210.00mg的呈浅黄色固体的1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸(87.00％产率)。LC/MS:C35H40N14O8的质量计算值：784.32，实验值：785.40[M+H]+。
实例6.3-(3-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-1H- 咪唑-2-甲酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑2-甲酰胺基)-1H-吡咯-2-甲 酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酰胺基)丙酰胺基)丙酸(PA-001-b)的合成
方案6.
遵循与所报告的实例1类似的程序，3-(3-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-甲酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑2-甲酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酰胺基)丙酰胺基)丙酸(PA-01-b)。
代表性配体的合成
实例7.4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧 代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
方案7.
步骤1：4-溴-7-甲氧基-1-(4-甲基苯磺酰基)吡咯并[2,3-c]吡啶的合成
在0℃下向4-溴-7-甲氧基-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶(5.00g，22.12mmol，1.00当量)于DMF(20.00mL)中的溶液中分批添加NaH(60％，796.46mg，33.19mmol，1.50当量)。然后将反应物搅拌15.0分钟，随后在0℃下添加TsCl(6.30g，33.19mmol，1.50当量)。将所得混合物在室温下再搅拌2.0小时。将混合物倒入到冰和水(60mL)中。将固体滤出，用H2O(10mL)洗涤并干燥，以得到呈白色固体的4-溴-7-甲氧基-1-(4-甲基苯磺酰基)吡咯并[2,3-c]吡啶(7.50g，83.98％产率)。LCMS:C15H13BrN2O3S的质量计算值：379.98，实验值：380.95,382.95[M+H,M+2+H]+。
步骤2：4-溴-7-甲氧基-1-甲苯磺酰基-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
在-78℃下向4-溴-7-甲氧基-1-甲苯磺酰基-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶(6.30g，16.58mmol，1.00当量)于THF(80.00mL)中的溶液中逐滴添加LDA(2M于THF中，12.50mL，24.87mmol，1.50当量)，并将混合物在-78℃至-50℃下搅拌1.0小时，随后逐滴添加ClCOOEt(2.69g，24.87mol，1.50当量)。在2.0小时之后，将反应混合物用饱和NH4Cl(水溶液)淬灭，并将残余物用EA(3x 300mL)萃取。将有机相合并并经Na2SO4干燥、过滤并浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EA＝10:1洗脱，以得到呈白色固体的4-溴-7-甲氧基-1-甲苯磺酰基-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(7.00g，90.11％产率)。LCMS:C18H17BrN2O5S的质量计算值：452.00，实验值：453.00,455.00[M+H,M+2+H]+。
步骤3：4-溴-7-氧代-1-甲苯磺酰基-6,7-二氢-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
在室温下在N2气氛下，向4-溴-7-甲氧基-1-甲苯磺酰基-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(4.00g，8.850mmol，1.00当量)于CH3CN(80.00mL)中的经搅拌的溶液中分批添加TMSCl(1.45g，13.28mmol，1.50当量)和NaI(2.00g，13.28mmol，1.50当量)。将混合物在室温下搅拌1.0小时，然后在65℃下逐滴添加H2O(238.95mg，13.28mmol，1.50当量)。将混合物在65℃下搅拌2.0小时。将反应混合物冷却至室温。将沉淀物过滤，用水(50mL)洗涤，经真空干燥。获得呈棕色固体的4-溴-7-氧代-1-甲苯磺酰基-6,7-二氢-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(4.30g，粗产物)。LCMS:C17H15BrN2O5S的质量计算值：437.99，实验值：438.95,440.95[M+H,M+2+H]+。
步骤4：4-溴-6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
向4-溴-7-氧代-1-甲苯磺酰基-6,7-二氢-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(4.30g，9.82mmol，1.00当量)于DMF(20.00mL)中的溶液中添加Cs2CO3(3.83g，11.78mmol，1.20当量)，向该反应物中逐滴添加MeI(1.67g，11.78mol，1.20当量)。将反应混合物在室温下在N2气氛下搅拌17.0小时。将混合物倒入到冰水(60mL)中。将固体滤出，用H2O(10mL)洗涤并干燥，以得到呈棕色固体的4-溴-6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(4.30g，粗产物)。LCMS:C18H17BrN2O5S的质量计算值：452.00，实验值：453.15,455.15[M+H,M+2+H]+。
步骤5：6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
在室温下在N2气氛下，向4-溴-6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(1.00g，2.21mmol，1.00当量)于THF(30.00mL)中的溶液中添加双(频哪醇)二硼(1.12g，4.41mmol，2.00当量)、KOAc(650.00mg，6.62mmol，3.00当量)、X-Phos PdG2(175.00mg，0.22mmol，0.10当量)和X-Phos(106.00mg，0.22mmol，0.10当量)。将所得混合物在75℃下在N2气氛下搅拌17.0小时。将混合物浓缩，向残余物中添加40mL H2O，然后将混合物用EA(3x 40mL)萃取，将有机相合并并用NaCl溶液(40mL)洗涤，经Na2SO4干燥。将固体滤出并且将滤液浓缩。获得呈黄色固体的6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(2.20g，粗产物)。将粗产物直接用于下一步骤。LCMS:C21H25BN2O5S的质量计算值：500.18，实验值：501.10[M+H]+。
步骤6：2-(4-氟-2,6-二甲基苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷的合成
在-78℃下在N2气氛下，向2-溴-5-氟-1,3-二甲基苯(5.00g，24.62mmol，1.00当量)于THF(15.00mL)中的溶液中逐滴添加n-BuLi(2.5M，14.77mL，36.94mmol，1.50当量)。将混合物在-78℃下搅拌3.0小时，然后在-78℃下逐滴添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(6.87g，36.94mmol，1.50当量)。将所得混合物自然加热至室温并搅拌3.0小时。在反应之后，在0℃下将反应用水(20mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩，以得到呈浅黄色油的2-(4-氟-2,6-二甲基苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(6.70g，粗产物)。将粗产物在不进行进一步纯化的情况下直接用于下一步骤。LC/MS:C14H20BFO2的质量计算值：250.15，实验值：251.30[M+1]+。
步骤7：4-氟-2,6-二甲基苯酚的合成
在-10℃下在N2气氛下，向2-(4-氟-2,6-二甲基苯基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼杂环戊烷(6.70g，26.79mmol，1.00当量)于THF(20.00mL)中的经搅拌的溶液中逐滴添加NaOH(1.61g，40.25mmol，1.50当量)和H2O2(9.99mL，428.59mmol，16.00当量)。将所得混合物在室温下搅拌17.0小时。在反应之后，将混合物用HCl(2M水溶液)酸化至pH＝1。将所得混合物用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机层用饱和NaHCO3(水溶液)(1x 10mL)和饱和Na2S2O3(水溶液)(1x 10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用己烷/EtOAc(12:1)洗脱，以得到呈白色固体的4-氟-2,6-二甲基苯酚(2.70g，66.88％产率)。1HNMR(400MHz,DMSO)δ:8.12(s,1H),6.73(d,J＝9.3Hz,2H),2.16(s,6H)。
步骤8：3-溴-4-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯甲酸甲酯的合成
在室温下，向4-氟-2,6-二甲基苯酚(2.70g，19.26mmol，1.00当量)和3-溴-4-氟苯甲酸甲酯(4.94g，21.20mmol，1.10当量)于DMSO(20.00mL)中的经搅拌的溶液中添加Cs2CO3(9.41g，28.90mmol，1.50当量)。将所得混合物在80℃下搅拌2.0小时。在反应之后，在室温下将反应通过添加水(30mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机层合并并经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用己烷/EtOAc(12:1)洗脱，以得到呈白色固体的3-溴-4-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯甲酸甲酯(6.80g，94.95％产率)。LC/MS:C16H14BrFO3的质量计算值：352.01，实验值：353.15[M+H]+。
步骤9：2-[3-溴-4-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]丙-2-醇的合成
在0℃下在N2气氛下，向3-溴-4-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯甲酸甲酯(2.00g，5.66mmol，1.00当量)于THF(10.00mL)中的经搅拌的溶液中逐滴添加溴(甲基)镁(3.00M于2-Me-THF中，11.33mL，33.98mmol，6.00当量)。将所得混合物在0℃下在N2气氛下搅拌1.0小时。在反应之后，在0℃下将反应通过添加饱和NH4Cl(水溶液)(10mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3x 10mL)萃取。将合并的有机层合并并经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用己烷/EtOAc(10:1)洗脱，以得到呈白色固体2-[3-溴-4-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]丙-2-醇(1.80g，77.40％产率)。LC/MS:C17H18BrFO2的质量计算值：352.05，实验值：335.00[M-OH]+。
步骤10：4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
在室温下在N2气氛下，向2-[3-溴-4-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]丙-2-醇(500.00mg，1.42mmol，1.00当量)和6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(1.42g，2.83mmol，2.00当量)于二噁烷(16.00mL)和H2O(4.00mL)中的经搅拌的溶液中添加Pd2(dba)3.CHCl3(129.62mg，0.14mmol，0.10当量)、K3PO4(901.39mg，4.25mmol，3.00当量)和1,3,5,7-四甲基-2,4,8-三氧杂-6-苯基-6-磷金刚烷(82.00mg，0.28mmol，0.20当量)。将所得混合物在75℃下在N2气氛下搅拌1.0小时。在室温下，将反应用水淬灭。将所得混合物用EtOAc(3x20mL)萃取。将合并的有机层经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用己烷/EtOAc(1:1)洗脱，以得到呈白色固体的4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(620.00mg，48.76％产率)。LC/MS:C35H35FN2O7S的质量计算值：646.21，实验值：647.20[M+H]+。
步骤11：4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
在室温下，向4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(600.00mg，0.93mmol，1.00当量)于MeOH(15.00mL)中的经搅拌的溶液/混合物中添加KOH(2M，3.71mL，7.42mmol，8.00当量)。将所得混合物在40℃下搅拌4.0小时。在反应之后，将所得混合物在真空下浓缩。然后将残余物溶解于水(10mL)中并用HCl(2M水溶液)酸化至pH 3。将沉淀的固体通过过滤收集并用水(3x 10mL)洗涤。将固体在真空下浓缩，以得到呈白色固体的4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸(390.00mg，64.26％产率)。LC/MS:C26H25FN2O5的质量计算值：464.17，实验值：465.15[M+H]+。
实例8.1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲 基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
方案8.
步骤1：4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
在室温下，向4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-1-(4-甲基苯磺酰基)-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(3.40g，5.26mmol，1.00当量)于乙醇(50.00mL)中的经搅拌的溶液中添加乙醇钠(894.40mg，13.14mmol，2.50当量)。将所得混合物在室温下搅拌2.0小时。在反应之后，将反应物倒入到柠檬酸溶液(3.32g，3.00当量，125mL)中。然后将所得混合物用EtOAc(3x 150mL)萃取。将合并的有机层用水(2x 50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残余物用乙醚(3x 10mL)洗涤，以得到呈白色固体的4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(2.00g，71.78％产率)。LCMS:C28H29FN2O5的质量计算值：492.21，实验值：493.40[M+H]+。
步骤2：1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
程序与1-(5-溴戊基)-4-[(叔丁氧羰基)氨基]吡咯-2-甲酸乙酯相同，但反应时间是2.0小时。使用500.00mg的4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯，获得500.00mg的呈白色固体的1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(94.61％产率)。LC/MS:C30H33FN2O5的质量计算值：520.24，实验值：521.35[M+H]+。
步骤3：1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸相同，但反应溶剂是MeOH/THF(1:5)。使用500.00mg的1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯，获得514.00mg的呈浅黄色固体的1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸。LC/MS:C28H29FN2O5的质量计算值：492.21，实验值：493.15[M+H]+。
实例9.4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲基磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代- 1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
方案9.
步骤1：4-溴-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
向6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(10.00g，45.41mmol，1.00当量)于四氢呋喃(150.00mL)中的经搅拌的溶液中添加NBS(8.08g，45.41mmol，1.00当量)和p-TsOH(3.91g，22.70mmol，0.50当量)。将所得混合物在室温下搅拌1.0小时。将所得混合物在真空下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0-10％ MeOH/DCM)纯化，以得到呈黄色固体的4-溴-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(13.00g，95.71％产率)。LC/MS:C11H11BrN2O3的质量计算值：298.00，实验值：299.00,301.00[M+H,M+2+H]+。
步骤2：6-甲基-7-氧代-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
向4-溴-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(13.00g，43.46mmol，1.00当量)于二噁烷(150.00mL)中的经搅拌的溶液中添加双(频哪醇)二硼(22.07g，86.92mmol，2.00当量)、Pd2(dba)3.CHCl3(4.00g，4.36mmol，0.10当量)和AcOK(8.53g，86.92mmol，2.00当量)。将最终反应混合物在120℃下用微波辐射照射1.0小时。将反应在1.0g规模上进行并重复13次。然后将反应混合物合并并一起处理。添加150mL H2O，将所得混合物用EA(3x 150mL)萃取。将有机层合并，经无水硫酸钠干燥，过滤并浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(50-70％ EA/PE)纯化，以得到呈黄色固体的6-甲基-7-氧代-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(10.00g，66.47％产率)。LC/MS:C17H23BN2O5的质量计算值：346.17，实验值：347.20[M+H]+。
步骤3：5-氟-2-(4-甲磺酰基-2-硝基苯氧基)-1,3-二甲基苯的合成
程序与3-溴-4-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯甲酸甲酯相同，但反应温度是120℃并且反应时间是1.0小时。使用2.00g的4-氟-2,6-二甲基苯酚。获得4.60g的呈灰白色固体的期望的产物(94.05％产率)。1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ:8.60(s,1H),8.07(d,J＝9.0Hz,1H),7.16(d,J＝9.0Hz,2H),6.88(d,J＝9.0Hz,1H),3.31(s,3H),2.09(s,6H)。
步骤4：2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲基磺酰苯胺的合成
向1-(2,4-二氟苯氧基)-4-甲磺酰基-2-硝基苯(500.00mg，1.52mmol，1.00当量)于THF(10.00mL)中的经搅拌的溶液中添加Pd/C(100.00mg，20％w/w)。将混合物在H2气氛下使用氢气球在室温下氢化17.0小时。将所得混合物过滤，将滤饼用EA(3x 20mL)洗涤。将滤液在减压下浓缩，以得到呈浅黄色油的2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲基磺酰苯胺(450.00mg，粗产物)。将粗产物在不进行进一步纯化的情况下直接用于下一步骤。LC/MS:C15H16FNO3S的质量计算值：309.08，实验值：310.10[M+H]+。
步骤5：5-氟-2-(2-碘-4-甲磺酰基苯氧基)-1,3-二甲基苯的合成
在0℃下，向2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲磺酰苯胺(500.00mg，1.62mmol，1.00当量)于二噁烷(5.00mL)中的经搅拌的溶液中逐滴添加浓氯化氢(1.00mL)。将所得混合物在0℃下搅拌10.0分钟。在0℃下向上述混合物中添加亚硝酸钠(133.81mg，1.94mmol，1.20当量)。将所得混合物在0℃下再搅拌1.0小时。在0℃下向上述混合物中添加KI(536.60mg，3.23mmol，2.00当量)。将所得混合物在40℃下再搅拌17.0小时。在反应之后，在室温下将反应用水(5mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3x 10mL)萃取。将合并的有机层用水(1x 10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残留物通过Prep-TLC(PE/EA5:1)纯化，以得到呈浅黄色油的5-氟-2-(2-碘-4-甲磺酰基苯氧基)-1,3-二甲基苯(250.00mg，31.65％产率)。LC/MS:C15H14FIO3S的质量计算值：419.97，实验值：442.95[M+Na]+。
步骤6：4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲基磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
在室温下在N2气氛下，向5-氟-2-(2-碘-4-甲磺酰基苯氧基)-1,3-二甲基苯(380.00mg，0.90mmol，1.00当量)于甲苯(6.00mL)和水(1.50mL)中的经搅拌的溶液中添加6-甲基-7-氧代-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(469.56mg，1.36mmol，1.50当量)、K3PO4(383.88mg，1.81mmol，2.00当量)和Pd(dtbpf)Cl2(58.93mg，0.09mmol，0.10当量)。将所得混合物在70℃下在N2气氛下搅拌2.0小时。在反应之后，在室温下将反应用水(10mL)淬灭。将所得混合物用EtOAc(3x 10mL)萃取。将合并的有机层用水(1x 5mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EA(0～100％)洗脱，以得到呈深黄色固体的4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(250.00mg，52.86％产率)。LC/MS:C26H25FN2O6S的质量计算值：512.14，实验值：513.30[M+H]+。
步骤7：4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲基磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
在室温下，向4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲基磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(240.00mg，0.47mmol，1.00当量)于四氢呋喃(1.00mL)和水(5.00mL)中的经搅拌的溶液中添加苛性钠(74.91mg，1.87mmol，4.00当量)。将所得混合物在70℃下搅拌2.0小时。在反应之后，将所得混合物在减压下浓缩。将残余物溶解于水(5mL)中。将混合物用HCl(2M水溶液)酸化至pH 4。将沉淀的固体通过过滤收集并用水(3x 5mL)洗涤，在真空下干燥。这产生呈浅黄色固体的4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲基磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸(170.00mg，73.44％产率)。LC/MS:C24H21FN2O6S的质量计算值：484.11，实验值：485.10[M+H]+。
实例10.4-[5-(乙磺酰基)-2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]-6-甲基-7-氧代- 1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
方案10.
步骤1：2-溴-4-(乙磺酰基)-1-氟苯的合成
向氟苯乙砜(1.00g，5.31mmol，1.00当量)于H2SO4(6.00mL)中的经搅拌的溶液中添加NBS(1.04g，5.84mmol，1.10当量)。将所得混合物在室温下搅拌16.0小时。将所得混合物倒入到冰水(20mL)中。将沉淀的固体通过过滤收集，用PE(50mL)洗涤并干燥，以得到呈黄色固体的2-溴-4-(乙磺酰基)-1-氟苯(890.00mg，62.71％产率)。LC/MS:C8H8BrFO2S的质量计算值：265.94,267.05,268.95[M+H,M+H+2]。
步骤2：2-[2-溴-4-(乙磺酰基)苯氧基]-5-氟-1,3-二甲苯的合成
程序与3-溴-4-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯甲酸甲酯(实例9步骤2)相同，但反应温度是110℃，反应时间是1.0小时，并且粗产物在不进行纯化的情况下用于下一步骤。使用870.00mg的1,3-二溴-5-(乙磺酰基)-2-氟苯，获得950.00mg的呈黄色固体的2-[2-溴-4-(乙磺酰基)苯氧基]-5-氟-1,3-二甲基苯(97.56％产率)。LC/MS:C16H16BrFO3S的质量计算值：386.00，实验值：387.05,389.05[M+H,M+2+H]+。
步骤3：2-[2-溴-4-(乙磺酰基)苯氧基]-5-氟-1,3-二甲苯的合成
程序与4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(实例9步骤6)相同，但反应温度是75℃并且反应时间是1.0小时。使用950.00mg的2-[2-溴-4-(乙磺酰基)苯氧基]-5-氟-1,3-二甲基苯，获得870.00mg的呈黄色固体的4-[5-(乙磺酰基)-2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(67.35％产率)。LC/MS:C27H27FN2O6S的质量计算值：526.15，实验值：527.35[M+H]+。
步骤4：4-[5-(乙磺酰基)-2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸相同。使用860.00mg的4-[5-(乙磺酰基)-2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯，获得590.00mg的呈黄色固体的4-[5-(乙磺酰基)-2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸(72.46％产率)。LC/MS:C25H23FN2O6S的质量计算值：498.12，实验值：499.25[M+H]+。
实例11.4-[2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2, 3-c]吡啶-2-甲酸的合成
方案11.
步骤1：1-(2,4-二氟苯氧基)-4-甲磺酰基-2-硝基苯的合成
向2,4-二氟苯酚(1.78g，13.68mmol，1.00当量)于DMSO(50.00mL)中的经搅拌的溶液中添加1-氟-4-甲磺酰基-2-硝基苯(3.00g，13.682mmol，1.00当量)和K2CO3(1.89g，13.68mmol，1.00当量)。将所得混合物在120℃下搅拌1.0小时。将反应混合物倒入到冰水(120mL)中，用EA(3x 150mL)萃取。将有机相合并并用H2O(100mL)和NaCl(100mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。将固体滤出并将滤液浓缩，以得到呈黄色固体的1-(2,4-二氟苯氧基)-4-甲磺酰基-2-硝基苯(4.20g，88.56％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.61(s,1H),8.15(d,J＝8.8Hz,1H),7.55 -7.66(m,2H),7.24-7.30(m,2H),3.34(s,3H)。
步骤2：2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲基磺酰苯胺的合成
程序与2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲基磺酰苯胺相同，但反应时间是1.0小时。使用500.00mg的1-(2,4-二氟苯氧基)-4-甲磺酰基-2-硝基苯，获得420.00mg的呈无色油的2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲磺酰基苯胺。LC/MS:C13H11F2NO3S的质量计算值：299.04，实验值：300.05[M+H]+。
步骤3：1-(2,4-二氟苯氧基)-2-碘-4-甲磺酰基苯的合成
程序与5-氟-2-(2-碘-4-甲磺酰基苯氧基)-1,3-二甲基苯相同，但在添加KI之后的反应时间是1.0小时。使用420.00mg的5-氟-2-(2-碘-4-甲磺酰基苯氧基)-1,3-二甲基苯，获得440.00mg的呈黄色固体的1-(2,4-二氟苯氧基)-2-碘-4-甲磺酰基苯(78.57％产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ:8.38(s,1H),7.86d,J＝8.4Hz,1H),7.50-7.61(m,1H),7.41-7.49(m,1H),7.15-7.25(m,1H),6.90(d,J＝8.8Hz,1H),3.26(s,3H)。
步骤4：4-[2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
程序与4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(实例9步骤6)相同，但反应温度是75℃并且反应时间是1.0小时。使用420.00mg的1-(2,4-二氟苯氧基)-2-碘-4-甲磺酰基苯，获得340.00mg的呈白色固体的4-[2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(62.11％产率)。LC/MS:C24H20F2N2O6S的质量计算值：502.10，实验值：503.25[M+H]+。
步骤5：4-[2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
程序与4-[3-[(叔丁氧基羰基)氨基]丙酰胺基]-1-甲基咪唑-2-甲酸(实例1步骤3)相同，但反应时间是1.0小时。使用320.00mg的4-[2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯，获得290.00mg的呈白色固体的4-[2-(2,4-二氟苯氧基)-5-甲磺酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸(92.15％产率)。LC/MS:C22H16F2N2O6S的质量计算值：474.07，实验值：475.20[M+H]+。
实例12.4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-甲氧基丙-2-基)苯基]-6-甲基- 7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
方案12.
向25ml烧瓶中添加4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸(200.00mg，0.43mmol，1.00当量)、MeOH(4.00mL)和H2SO4(0.20mL)。将反应物在室温下搅拌0.5小时。将反应物通过NaHCO3溶液调节至pH＝7～8，将水层用EtOAc(4x 10mL)萃取。将合并的有机层用盐水(2x 10mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩。这产生呈白色固体的4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-甲氧基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸(220.00mg，粗产物)。LC/MS:C27H27FN2O5的质量计算值：478.19，实验值：479.35[M+H]+。
本公开的代表性化合物的合成
实例13.N-[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]- 6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧 杂二十六烷-1-基]-1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑- 2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺 基]咪唑-2-甲酰胺(化合物7)的合成
方案13.
步骤1：N-(4-{[26-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氧基}苯基)氨基甲酸苄酯的合成
程序与1-甲基-4-(1-甲基-4-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸甲酯相同。使用150.00mg的N-{4-[(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]苯基}氨基甲酸苄酯，获得325.00mg的呈白色固体的期望的产物(97.63％产率)。LC/MS:C65H86N16O18的质量计算值：1378.63，实验值：1379.65[M+H]+。
步骤2：N-[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]-1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与9H-芴-9-基N-[2-({2-[(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酸甲酯相同。使用380.00mg的N-(4-{[26-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氧基}苯基)氨基甲酸苄酯，获得350.00mg粗产物的呈棕色油的期望的产物。LC/MS:C57H80N16O16的质量计算值：1244.59，实验值：1245.70[M+H]+。
步骤3：化合物7的合成
程序与N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(实例20)相同。使用250.00mg的N-[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]-1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酰胺，获得29.90mg的呈白色固体的期望的产物(8.64％产率)。HRMS:C83H103FN18O20的质量计算值：1690.7580，实验值：1691.7722[M+H]+。
实例14.N-[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]- 6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧 杂二十六烷-1-基]-1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡 咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑- 2-甲酰胺(化合物9)的合成
方案14.
步骤1：N-(4-{[26-({1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氧基}苯基)氨基甲酸苄酯的合成
程序与4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例2步骤3)相同。使用160.00mg的1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酸，获得260.00mg粗产物的呈棕色固体的N-(4-{[26-({1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氧基}苯基)氨基甲酸苄酯。LC/MS:C63H82N16O18的质量计算值：1350.60，实验值：676.85[M/2+H]+。
步骤2：N-[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]-1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与9H-芴-9-基N-[2-({2-[(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酸甲酯相同，但反应时间是17.0小时。使用250.00mg的N-(4-{[26-({1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氧基}苯基)氨基甲酸苄酯，获得170.00mg粗产物的呈棕色固体的期望的产物。LC/MS:C55H76N16O16的质量计算值：1216.56，实验值：609.80[M/2+H]+。
步骤3：化合物9的合成
程序与N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺相同。使用160.00mg的N-[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]-1-甲基-4-[3-({4-[1-甲基-4-(3-{[4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1H-吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]-1H-吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-甲酰胺，获得30.30mg的呈白色固体的期望的产物(13.71％产率)。HRMS:C81H99FN18O20的质量计算值：1662.7267，实验值：1663.7394[M+H]+。
实例15.N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟 基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}-2-(2,5,8,11,14, 17-六氧杂十九烷-19-基氧基)苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨 基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基 吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙 酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(化合物4)的合成
方案15.
步骤1：2-(苄氧基)-5-硝基苯酚的合成
在-20℃下，在10.0分钟内向4-硝基邻苯二酚(1.00g，6.45mmol，1.00当量)于DMF(10.00mL)中的经搅拌的溶液中分批添加NaH(60％，0.15g，6.45mmol，1.00当量)。将所得混合物在室温下搅拌1.0小时。在-20℃下，在30.0分钟内向上述混合物中逐滴添加含苄基溴(0.77mL，4.51mmol，0.70当量)的DMF(10.00mL)。将所得混合物在室温下再搅拌17.0小时。将反应混合物通过水淬灭并且用DCM(3x 5mL)萃取。将合并的有机层合并，并且进行浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用DCM:MeOH(10:1)洗脱，以得到呈黄色油的2-(苄氧基)-5-硝基苯酚(0.75g，45.54％产率)。LC/MS:C13H11NO4的质量计算值：245.06，实验值：244.05[M-H]+。
步骤2：19-[2-(苄氧基)-5-硝基苯氧基]-2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷的合成
程序与(S)-2-(4-(4-(16-((2-(1H-吲哚-3-基)乙基)氨基)十六烷酰胺基)苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-f][1,2,4]三唑并[4,3-a][1,4]二氮杂卓-6-基)乙酸叔丁酯相同。使用400.00mg的2-(苄氧基)-5-硝基苯酚，获得670.00mg的呈浅黄色油的19-[2-(苄氧基)-5-硝基苯酚氧基]-2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷(78.45％产率)。LC/MS:C26H37NO10的质量计算值：523.24，实验值：541.20[M+H2O]+。
步骤3：2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯酚的合成
将19-[2-(苄氧基)-5-硝基苯酚氧基]-2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷(670.00mg，1.280mmol，1.00当量)溶解于TFA(2.00mL)中。将所得混合物在70℃下搅拌2.0小时。将所得混合物在减压下浓缩，以得到呈浅棕色油的2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯酚(670.00mg，粗产物)。LC/MS:C19H31NO10的质量计算值：433.19，实验值：456.25[M+Na]+。
步骤4：N-{26-[2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酸叔丁酯的合成
程序与(S)-2-(4-(4-(16-((2-(1H-吲哚-3-基)乙基)氨基)十六烷酰胺基)苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-f][1,2,4]三唑并[4,3-a][1,4]二氮杂卓-6-基)乙酸叔丁酯相同，但反应时间是40.0小时。使用550.00mg的2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯酚，获得700.00mg的呈浅黄色油的N-{26-[2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酸叔丁酯(59.38％产率)。LC/MS:C42H76N2O20的质量计算值：928.49，实验值：946.40[M+H2O]+。
步骤5：26-[2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-胺的合成
程序与4-[4-(4-氨基-1-甲基吡咯-2-酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例2步骤3)相同。使用410.00mg的N-{26-[2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酸叔丁酯，获得410.00mg粗产物的呈棕色油的26-[2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-胺。LC/MS:C37H68N2O18的质量计算值：828.44，实验值：829.75[M+H]+。
步骤6：N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[2-(2,5,8,11,14,17-八氧杂二十六烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例2步骤3)相同。使用360.00mg的26-[2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-胺，获得650.00mg的呈浅棕色固体的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[2-(2,5,8,11,14,17-八氧杂二十六烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(91.22％产率)。LC/MS:C73H109N17O26的质量计算值：1639.77，实验值：821.65[M/2+H]+。
步骤7：N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-氨基-2-(2,5,8,11,14,17-八氧杂二十六烷-19-基氧基)苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与9H-芴-9-基N-[2-({2-[(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酸甲酯相同，但反应溶剂是MeOH。使用720.00mg的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[2-(2,5,8,11,14,17-八氧杂二十六烷-19-基氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺，获得500.00mg的呈浅棕色固体的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-氨基-2-(2,5,8,11,14,17-八氧杂二十六烷-19-基氧基)苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(70.74％产率)。LC/MS:C73H111N17O24的质量计算值：1609.79，实验值：806.65[M/2+H]+。
步骤8：化合物4的合成
程序与N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(实例20)相同。使用300.00mg的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-氨基-2-(2,5,8,11,14,17-八氧杂二十六烷-19-基氧基)苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺，获得36.30mg的呈灰白色固体的N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}-2-(2,5,8,11,14,17-六氧杂十九烷-19-基氧基)苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(8.89％产率)。HRMS:C99H134FN19O28的质量计算值：2055.9629，实验值：2056.9525[M+H]+。
实例16.N-{5-[(2-{[2-({2-[(26-{4-[({4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2- 羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-基}甲酰胺基)甲基]-1,2, 3-三唑-1-基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲 酰基)-1-甲基咪唑-4-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基吡咯-3-基}-1-甲基-4- (3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺 (化合物5)的合成
方案16.
步骤1：N-{[1-(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)-1,2,3-三唑-4-基]甲基}氨基甲酸叔丁酯的合成
在0℃下，向N-(丙-2-炔-1-基)氨基甲酸叔丁酯(318.52mg，2.052mmol，3.00当量)于DMF(6.00mL)中的经搅拌的溶液中分批添加CuSO4.5H2O(85.41mg，0.342mmol，0.50当量)、抗坏血酸钠(68.11mg，0.342mmol，0.50当量)和26-叠氮基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-胺(300.00mg，0.684mmol，1.00当量)。将所得混合物在室温下搅拌1.0小时。将反应混合物通过反快速色谱法在以下条件下纯化：柱，C18硅胶；流动相，含ACN的水(0.05％TFA)，20分钟内35％至45％梯度；检测器，UV 254nm。将级分合并并浓缩。获得呈黄的油的N-{[1-(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)-1,2,3-三唑-4-基]甲基}氨基甲酸叔丁酯(190.00mg，46.78％)。LC/MS:C26H51N5O10的质量计算值：593.36，实验值：594.55[M+H]+。
步骤2：N-[(1-{26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}-1,2,3-三唑-4-基)甲基]氨基甲酸叔丁酯的合成
程序与1-甲基-4-(1-甲基-4-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-甲酸甲酯相同。使用240.00mg的3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酸，获得450.00mg的呈黄色油(粗产物)的N-[(1-{26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}-1,2,3-三唑-4-基)甲基]氨基甲酸叔丁酯。LC/MS:C62H92N20O18的质量计算值：1404.69，实验值：1406.00[M+H]+。
步骤3：N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-(氨基甲基)-1,2,3-三唑-1-基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与4-[4-(4-氨基-1-甲基吡咯-2-酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例2步骤4)相同。使用200.00mg的N-[(1-{26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}-1,2,3-三唑-4-基)甲基]氨基甲酸叔丁酯，获得200.00mg粗产物的呈黄色油的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-(氨基甲基)-1,2,3-三唑-1-基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺。LC/MS:C57H84N20O16的质量计算值：1304.64，实验值：1305.95[M+H]+。
步骤4：化合物5的合成
程序与N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(实例20)相同。使用180.00mg的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-(氨基甲基)-1,2,3-三唑-1-基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺，获得29.80mg的呈白色固体的N-{5-[(2-{[2-({2-[(26-{4-[({4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-基}甲酰胺基)甲基]-1,2,3-三唑-1-基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基咪唑-4-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基吡咯-3-基}-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(12.30％产率)。HRMS:C83H107FN22O20的质量计算值：1750.8016，实验值：1751.8142[M+H]+。
实例17.N-{5-[(2-{[2-({2-[(26-{4-[({4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2- 羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-基}甲酰胺基)甲基]苯氧 基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲 基咪唑-4-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基吡咯-3-基}-1-甲基-4-(3-{[1-甲 基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(化合物6) 的合成
方案17.
步骤1：N-[(4-羟基苯基)甲基]氨基甲酸苄酯的合成
向100mL烧瓶中添加4-(氨基甲基)苯酚(500.00mg，4.060mmol，1.00当量)、THF(8.00mL)和H2O(8.00mL)。将所得混合物冷却至0℃，添加NaHCO3(444.00mg，5.285mmol，1.30当量)，逐滴添加氯甲酸苄酯(693.00mg，4.062mmol，1.00当量)，在0℃下搅拌10.0分钟，然后将反应物在室温下搅拌1.0小时。将所得混合物用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机层用水(1x 10mL)、盐水(1x 10ml)洗涤，经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩，将残余物用庚烷研磨，以得到呈灰白色固体的N-[(4-羟基苯基)甲基]氨基甲酸苄酯(680mg，粗产物)。LC/MS:C15H15NO3的质量计算值：257.11，实验值：280.10[M+Na]+。
步骤2：N-{[4-({26-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基]甲基}氨基甲酸苄酯的合成
程序与(S)-2-(4-(4-(16-((2-(1H-吲哚-3-基)乙基)氨基)十六烷酰胺基)苯基)-2,3,9-三甲基-6H-噻吩并[3,2-f][1,2,4]三唑并[4,3-a][1,4]二氮杂卓-6-基)乙酸叔丁酯(实例15步骤2)相同。使用300.00mg的N-[(4-羟基苯基)甲基]氨基甲酸苄酯，获得720.00mg的呈黄色油的N-{[4-({26-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基]甲基}氨基甲酸苄酯(82.02％产率)。LC/MS:C38H60N2O13的质量计算值：752.41，实验值：753.70[M+H]+。
步骤3：N-({4-[(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]苯基}甲基)氨基甲酸苄酯的合成
程序与4-[4-(3-氨基丙酰胺基)-1-甲基咪唑-2-酰胺基]-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯盐酸盐相同，但反应溶剂是含4M HCl的二噁烷/DCM(1:1)并且反应时间是1.0小时。使用690.00mg的N-{[4-({26-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基]甲基}氨基甲酸苄酯，获得700.00mg粗产物的呈黄色油的N-({4-[(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]苯基}甲基)氨基甲酸苄酯。LC/MS:C33H52N2O11的质量计算值：652.36，实验值：653.55[M+H]+。
步骤4：N-{[4-({26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基]甲基}氨基甲酸苄酯的合成
程序与4-(4-{4-[(叔丁氧基羰基)氨基]-1-甲基吡咯-2-酰胺基}-1-甲基咪唑-2-酰胺基)-1-甲基吡咯-2-甲酸甲酯(实例2步骤3)相同。使用690.00mg的N-({4-[(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]苯基}甲基)氨基甲酸苄酯，获得1.30g粗产物的呈黄色固体的N-{[4-({26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基]甲基}氨基甲酸苄酯。LC/MS:C69H93N17O19的质量计算值：1463.68，实验值：733.45[M/2+H]+。
步骤5：N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-(氨基甲基)苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与9H-芴-9-基N-[2-({2-[(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酸甲酯相同，但反应温度是40℃并且反应时间是17.0小时。使用900.00mg的N-{[4-({26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基]甲基}氨基甲酸苄酯，获得800.00mg粗产物的呈黄色油的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-(氨基甲基)苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺。LC/MS:C61H87N17O17的质量计算值：1329.65，实验值：666.40[M/2+H]+。
步骤6：化合物6的合成
程序与N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{1-乙基-4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(实例20)相同。使用200.00mg的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[4-(氨基甲基)苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺，获得25.90mg的呈白色固体的N-{5-[(2-{[2-({2-[(26-{4-[({4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-基}甲酰胺基)甲基]苯氧基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基咪唑-4-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基吡咯-3-基}-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(9.39％产率)。HRMS:C87H110FN19O21的质量计算值：1775.8108，实验值：1776.8272[M+H+。
实例18.N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-甲 氧基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9, 12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4- 基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲 基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(化合物1)的合成
方案18.
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同，使用60.00mg的4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-甲氧基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸，获得47.40mg的呈白色固体的N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-甲氧基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(20.95％产率)。HRMS:C87H110FN19O21的质量计算值：1775.8108，实验值：1776.8225[M+H]+。
实例19.4-(2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-N- (4-((1-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-甲酰胺 基)-1H-吡咯-2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酰胺基)-1H-吡唑-2-甲酰胺基)丙酰 胺基)-1H-咪唑-2-基)-1,5-二氧代-9,12,15,18,21,24,27,30-八氧杂-2,6-二氮杂三十二 烷-32-基)氧基)苯基)-7-氧代-6,7-二氢-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酰胺(化合物15)的合 成
方案19.
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同。使用0.43g的4-(2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-6,7-二氢-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸，获得1g的呈白色固体的N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-甲氧基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(22.58％产率)。HRMS:C86H108FN19O21的质量计算值：1761.7951，实验值：1762.9204[M+H]+。
实例20.N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-甲磺 酰基苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15,18, 21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲 酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2- 酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(化合物2)的合成
方案20.
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同。使用150.00mg的N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺，获得50.50mg的呈白色固体的期望的产物(24.13％产率)。HRMS:C84H104FN19O22S的质量计算值：1781.7308，实验值：1782.7370[M+H]+。
实例21.N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[5-(乙磺酰基)-2-(4-氟-2,6-二甲基苯 氧基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧基)-3,6,9,12,15, 18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基 甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑- 2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(化合物3)的合成
方案21.
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例2步骤2)相同。使用70.00mg的4-[5-(乙磺酰基)-2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸，获得6.70mg的呈白色固体的期望的产物(2.48％产率)。HRMS:C85H106FN19O22S的质量计算值：1795.7464，实验值：1796.7515[M+H]+。
实例22.1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺 基}丙酰胺基)-N-(1-甲基-5-{[(1r,3r)-3-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧 基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}苯氧 基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基 甲酰基]环丁基]氨基甲酰基}吡咯-3-基)咪唑-2-甲酰胺(化合物8)的合成
方案22.
步骤1：N-(4-{[26-({1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氧基}苯基)氨基甲酸苄酯的合成
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同。使用140.00mg的1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺基]咪唑-2-甲酸，获得240.00mg的呈浅黄色固体的期望的产物(95.72％产率)。LC/MS:C67H88N16O18的质量计算值：1404.65，实验值：1405.95[M+H]+。
步骤2：1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)-N-(1-甲基-5-{[(1r,3r)-3-[(2-{[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]环丁基]氨基甲酰基}吡咯-3-基)咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与4-氨基-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(实例1步骤2)相同，但反应时间是2.0小时并且溶剂是DMF。使用240.00mg的N-(4-{[26-({1-甲基-4-[(1r,3r)-3-{1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-酰胺基}环丁酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氧基}苯基)氨基甲酸苄酯，获得220.00mg粗产物的呈黄色油的期望的产物。LC/MS:C59H82N16O16的质量计算值：1270.61，实验值：636.60[M/2+H]+。
步骤3：化合物8的合成
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同。使用120.00mg的1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)-N-(1-甲基-5-{[(1r,3r)-3-[(2-{[26-(4-氨基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]环丁基]氨基甲酰基}吡咯-3-基)咪唑-2-甲酰胺，获得54.80mg的呈白色固体的期望的产物(32.40％产率)。HRMS:C85H105FN18O20的质量计算值：1716.7737，实验值：1717.7781[M+H]+。
实例23.N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟 基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}-2-羟基苯氧基)-3, 6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪 唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4- (1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(化合物12)的合 成
方案23.
步骤1：2-(苄氧基)-1-氟-4-硝基苯的合成
向2-氟-5-硝基苯酚(1.00g，6.365mmol，1.00当量)于DMF(15.00mL)中的经搅拌的溶液中添加苄基溴(1.63g，9.547mmol，1.50当量)和K2CO3(2.64g，19.095mmol，3.00当量)。将所得混合物在50℃下搅拌1.0小时。将反应混合物倒入到冰水(50mL)中，用EA(3x 80mL)萃取。将有机相合并并用H2O(50mL)和NaCl(50mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥。将固体滤出并且将滤液浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(0-10％ EA/PE)纯化，以得到呈黄色固体的2-(苄氧基)-1-氟-4-硝基苯(1.50g，95.32％)。
步骤2：2-(苄氧基)-1-氟-4-硝基苯的合成
2-(苄氧基)-1-氟-4-硝基苯(INT-503-201)是使用含NaH(60％，1.00当量)的DMF作为0℃至室温的溶剂合成的并且反应时间是2.0小时。使用100.00mg的2-(苄氧基)-1-氟-4-硝基苯，获得290.00mg的呈黄色油的N-{26-[2-(苄氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酸叔丁酯(96.78％产率)。LC/MS:C36H56N2O14的质量计算值：740.37，实验值：741.50[M+H]+。
步骤3：26-[2-(苄氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-胺的合成
程序与实例2步骤4相同。使用240.00mg的N-{26-[2-(苄氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酸叔丁酯，获得240.00mg粗产物的呈黄色油的26-[2-(苄氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-胺。LC/MS:C31H48N2O12的质量计算值：640.32，实验值：641.55[M+H]+。
步骤4：N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[2-(苄氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与实例2步骤5相同。使用240.00mg的26-[2-(苄氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-胺，获得500.00mg的呈黄色固体的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[2-(苄氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(91.90％产率)。LC/MS:C67H89N17O20的质量计算值：1451.64，实验值：727.45[M/2+H]+。
步骤5：N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-氨基-2-羟基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺的合成
程序与4-氨基-1-甲基咪唑-2-甲酸乙酯(实例1步骤3)相同，但反应时间是2.0小时并且溶剂是DMF。使用250.00mg的N-[5-({2-[(2-{[2-({26-[2-(苄氧基)-4-硝基苯氧基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基咪唑-4-基)氨基甲酰基]乙基}氨基甲酰基)-1-甲基吡咯-3-基]-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺，获得250.00mg粗产物的呈棕色油的N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-氨基-2-羟基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺。LC/MS:C60H85N17O18的质量计算值：1331.62，实验值：667.30[M/2+H]+。
步骤6.5-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}-2-({26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸盐的合成
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同。使用130.00mg的N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-氨基-2-羟基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺，获得70.00mg的呈白色固体的5-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}-2-({26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸盐(32.24％产率)。LC/MS:C112H131F2N21O26的质量计算值：2223.95，实验值：1113.45[M/2+H]+。
步骤7：化合物12的合成
向5-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}-2-({26-[3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)苯基4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸盐(70.00mg，0.031mmol，1.00当量)于MeOH(2.00mL)和THF(2.00mL)中的经搅拌的溶液中添加LiOH(2M，0.09mL，6.00当量)并且将所得混合物在室温下搅拌2.0小时。将混合物在减压下浓缩，将残余物用5mL水溶解，冷却至0℃，通过2M HCl将PH调节至3-5。将沉淀的固体通过过滤收集并用水(2x 3mL)洗涤并在真空下浓缩。将粗产物溶解于DMF中，过滤并将滤液(2.00mL)通过Prep-HPLC在以下条件下纯化：柱：XBridge制备型苯基OBD柱，19*150mm，5μm；流动相A：水(10mmol/L NH4HCO3+0.1％NH3.H2O)，流动相B：ACN；流速：25毫升/分钟；梯度：15分钟内28％ B至53％ B，53％B；波长：254nm；RT1(分钟)：12.58；运行次数：0。将级分合并并直接冻干，以得到呈白色固体的N-(5-{[2-({2-[(2-{[26-(4-{4-[2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基]-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-酰胺基}-2-羟基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酰基}乙基)氨基甲酰基]-1-甲基咪唑-4-基}氨基甲酰基)乙基]氨基甲酰基}-1-甲基吡咯-3-基)-1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-甲酰胺(19.5mg，33.43％)。HRMS:C86H108FN19O22的质量计算值：1777.7900，实验值：1778.7906[M+H]+。
实例24.4-(2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-N- (4-((1-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-甲酰胺 基)-1H-吡咯-2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酰胺基)-1H-吡唑-2-甲酰胺基)丙酰 胺基)-1H-咪唑-2-基)-1,5,9-三氧代-13,16,19,22,25,28,31,34-八氧杂-2,6,10-三氮杂 三十六烷-36-基)氧基)苯基)-7-氧代-6,7-二氢-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酰胺(化合物 10)的合成
方案24.
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同。使用191.00mg的4-(2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-6,7-二氢-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸，获得600mg的呈白色固体的期望的产物。HRMS:C89H113FN20O22的质量计算值：1832.8322，实验值：1834.30[M+H]+。
实例25.4-((1-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基- 1H-咪唑-2-甲酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑-2-甲酰胺基)-1H-吡咯- 2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑-2-基)-1,5-二氧代-9,12,15,18,21-五氧杂-2,6-二氮杂 二十三烷-23-基)氧基)苯基4-(2-(4-氟-2,6-双甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)- 6-甲基-7-氧代-6,7-二氢-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸盐(化合物11)的合成
方案25.
程序与4-氨基-1H-吡咯-2-甲酸乙酯(实例4步骤2)相同。使用2.85g的4-(2-(4-氟-2,6-二甲基苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-6,7-二氢-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸DIEA盐，获得5.5g的呈白色固体的期望的产物。HRMS:C80H96FN19O18的质量计算值：1630.70，实验值：1631.10[M+H]+。
实例26.4-(2-(2,6-二甲基-4-((1-(1-甲基-4-(3-(1-甲基-4-(1-甲基-4-(3-(1- 甲基-4-(1-甲基-1H-咪唑-2-甲酰胺基)-1H-吡咯-2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑-2-甲 酰胺基)-1H-吡唑-2-甲酰胺基)丙酰胺基)-1H-咪唑-2-基)-1,5-二氧代-9,12,15,18,21, 24,27,30-八氧杂-2,6-二氮杂三十二烷-32-基)氧基)苯氧基)-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)- N-乙基-6-甲基-7-氧代-6,7-二氢-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酰胺(化合物17)的合成
方案26.
步骤1：3-溴-4-(2,6-二甲基-4-硝基苯氧基)苯甲酸甲酯的合成
向2-氟-1,3-二甲基-5-硝基苯(5.80g，34.29mmol，1.00当量)和3-溴-4-羟基苯甲酸甲酯(8.71g，37.717mmol，1.1当量)于DMSO(30.00mL)中的经搅拌的混合物中分批添加Cs2CO3(13.41g，41.15mmol，1.20当量)。将混合物在130℃下搅拌4天。将所得混合物倒入到100mL H2O中并用EtOAc(3x 100mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1x 100mL)洗涤，并经无水Na2SO4干燥。在过滤之后，将滤液在减压下浓缩并将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EA(5:1)洗脱，以得到呈橙色固体的3-溴-4-(2,6-二甲基-4-硝基苯氧基)苯甲酸甲酯(1.50g，10.36％)。1H NMR(400MHz,CDCl3)δ:8.38(s,1H),8.07(s,2H),7.85(d,J＝8.8Hz,1H),6.36(d,J＝8.4Hz,1H),3.93(s,3H),2.24(s,6H)。
步骤2：4-(4-氨基-2,6-二甲基苯氧基)-3-溴苯甲酸甲酯的合成
在室温下，向3-溴-4-(2,6-二甲基-4-硝基苯氧基)苯甲酸甲酯(1.50g，3.95mmol，1.00当量)于EtOH(20.00mL)中的经搅拌的混合物中添加NH4Cl(2.11g，39.45mmol，10.00当量)和H2O(10.00mL)。将反应物加热至70℃，并分批添加Fe(2.20g，39.45mmol，10.00当量)，并将所得混合物在70℃下搅拌1.0小时。将混合物过滤，将滤饼用乙醇(3x 15mL)洗涤，并将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EA(2:1)洗脱，以得到呈棕色固体的4-(4-氨基-2,6-二甲基苯氧基)-3-溴苯甲酸甲酯(1.30g，88.44％)。LC/MS:C16H16BrNO3的质量计算值：349.03，实验值：350.00,352.00[M+H,M+H+Na]+
步骤3：3-溴-4-(4-羟基-2,6-二甲基苯氧基)苯甲酸酯的合成
将4-(4-氨基-2,6-二甲基苯氧基)-3-溴苯甲酸甲酯(1.30g，3.71mmol，1.00当量)溶解于H2O(10.00mL)和2M H2SO4(5.00mL)的冷却溶液中，并添加NaNO2(0.26g，3.71mmol，1.00当量)。将混合物搅拌10分钟，并且然后分批添加Cu2O(0.27g，1.86mmol，0.50当量)，并将混合物在80℃下搅拌1.0小时。然后将混合物用EtOAc(3x 20mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1x 30mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并将滤液在减压下浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法纯化，用PE/EA(3:1)洗脱，以得到呈橙色固体的3-溴-4-(4-羟基-2,6-二甲基苯氧基)苯甲酸甲酯(0.60g，41.42％)。LC/MS:C16H15BrO4的质量计算值：350.02，实验值：349.00,351.00[M-H,M-H+2]-
步骤4：3-溴-4-[4-({26-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)-2,6-二甲基苯氧基]苯甲酸甲酯的合成
向3-溴-4-(4-羟基-2,6-二甲基苯氧基)苯甲酸甲酯(600.00mg，1.71mmol，1.00当量)和N-(26-溴-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氨基甲酸叔丁酯(984.96mg，1.71mmol，1.00当量)于ACN(10.00mL)中的混合物中分批添加K2CO3(708.35mg，5.12mmol，3.00当量)，并将所得混合物在70℃下搅拌16.0小时。然后将混合物过滤，将滤饼用MeCN(3x 10mL)洗涤，并将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反快速色谱法在以下条件下纯化：柱，C18硅胶；流动相，含MeCN的水(0.1％ TFA)，10分钟内10％至50％梯度；检测器，UV254nm。将级分合并并浓缩，以得到呈黄色油的3-溴-4-[4-({26-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)-2,6-二甲基苯氧基]苯甲酸甲酯(750.00mg，52.88％)。LC/MS:C39H60BrNO14的质量计算值：845.32，实验值：846.30,848.30[M+H,M+H+2]+
步骤5：4-{4-[(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-3-溴苯甲酸甲酯的合成
在室温下向3-溴-4-[4-({26-[(叔丁氧基羰基)氨基]-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基}氧基)-2,6-二甲基苯氧基]苯甲酸甲酯(750.00mg，0.89mmol，1.00当量)于DCM(10.00mL)中的溶液中添加TFA(2.00mL)，并将混合物搅拌1.0小时。将所得混合物在减压下浓缩，以得到呈黄色油的4-{4-[(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-3-溴苯甲酸甲酯(750.00mg，粗产物)。LC/MS:C34H52BrNO12的质量计算值：745.27，实验值：746.25,478.25[M+H,M+H+2]+。
步骤6：4-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-3-溴苯甲酸甲酯的合成
在0℃下，通过注射器将Cbz-Cl(319.85mg，1.87mmol，2.00当量)添加到4-{4-[(26-氨基-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-3-溴苯甲酸甲酯(750.00mg，0.94mmol，1.00当量)和Na2CO3(149.04mg，1.41mmol，1.50当量)于H2O(10.00mL)和THF(3.00mL)中的混合物中。将所得混合物在室温下搅拌18.0小时，并且然后用CH2Cl2(3x 30mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1x 30mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并将滤液在减压下浓缩，以得到呈黄色液体的4-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-3-溴苯甲酸甲酯(680.00mg，75.76％)。LC/MS:C42H58BrNO14的质量计算值：879.30，实验值：880.30,882.30[M+H,M+H+2]+。
步骤7：N-(26-{4-[2-溴-4-(2-羟基丙-2-基)苯氧基]-3,5-二甲基苯氧基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氨基甲酸苄酯的合成
在0℃下在氮气下，向4-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-3-溴苯甲酸甲酯(680.00mg，0.77mmol，1.00当量)于THF(10.00mL)中的经搅拌的溶液中逐滴添加MeMgBr(1.0M，7.72mL，7.72mmol，10.00当量)10分钟。然后使混合物温热至室温并搅拌16.0小时。在0℃下将所得混合物用水(10mL)稀释并用EA(3x 15mL)萃取。将合并的有机层用盐水(1x 20mL)洗涤，经无水Na2SO4干燥，并将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反快速色谱法在以下条件下纯化：柱，C18硅胶；流动相，含MeCN的水(10mmol/L NH4HCO3)，10分钟内10％至50％梯度；检测器，UV 254nm。将级分合并并浓缩，以得到呈黄色油的N-(26-{4-[2-溴-4-(2-羟基丙-2-基)苯氧基]-3,5-二甲基苯氧基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氨基甲酸苄酯(450.00mg，59.56％)。LC/MS:C43H62BrNO13的质量计算值：879.34，实验值：878.20,880.20[M-H,M-H+2]-。
步骤8：4-(2-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯的合成
在室温下向N-(26-{4-[2-溴-4-(2-羟基丙-2-基)苯氧基]-3,5-二甲基苯氧基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氨基甲酸苄酯(450.00mg，0.51mmol，1.00当量)、6-甲基-7-氧代-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)-6,7-二氢-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(230.00mg，0.66mmol，1.30当量)和Pd(dtbpf)Cl2(33.30mg，0.05mmol，0.10当量)于甲苯(10.00mL)中的经搅拌的混合物中逐滴添加含K3PO4(325.31mg，1.53mmol，3.00当量)的H2O(1.00mL)。将混合物在70℃下搅拌6.0小时。然后将所得混合物过滤，将滤饼用EtOAc(3x 10mL)洗涤，并将滤液在减压下浓缩。将残余物通过反快速色谱法在以下条件下纯化：柱，C18硅胶；流动相，含MeCN的水(10mmol/L NH4HCO3)，10分钟内10％至50％梯度；检测器，UV 254nm。将级分合并并浓缩，以得到呈黄色油的4-(2-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(200.00mg，34.54％)。LC/MS:C54H73N3O16的质量计算值：1019.50，实验值：1020.35[M+H]+。
步骤9：4-(2-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸的合成
向4-(2-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸乙酯(320.00mg，0.31mmol，1.00当量)于MeOH(10.00mL)中的经搅拌的溶液中添加含LiOH(37.56mg，1.57mmol，5.00当量)的水(3.00mL)。将混合物在45℃下搅拌1.0小时。然后将混合物用HCl(2M)酸化至pH 4。将沉淀的固体通过过滤收集并用无水醚(3x 10mL)洗涤，以得到呈黄色固体的4-(2-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸(150.00mg，65.55％)。LC/MS:C52H69N3O16的质量计算值：991.47，实验值：992.50[M+H]+。
步骤10：N-[26-(4-{2-[2-(乙基氨基甲酰基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-4-基]-4-(2-羟基丙-2-基)苯氧基}-3,5-二甲基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酸苄酯的合成
向4-(2-{4-[(26-{[(苄氧基)羰基]氨基}-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基)氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯并[2,3-c]吡啶-2-甲酸(150.00mg，0.15mmol，1.00当量)、乙胺(6.82mg，0.15mmol，1.00当量)和PyBOP(118.02mg，0.23mmol，1.50当量)于DMF(6.00mL)中的经搅拌的混合物中逐滴添加DIEA(48.85mg，0.38mmol，2.50当量)。将混合物在室温下搅拌16.0小时。将所得混合物过滤并通过反快速色谱法(柱，C18硅胶；流动相，含MeCN的水(0.1％TFA)，10分钟内10％至50％梯度；检测器，UV 254nm)纯化。将级分合并并浓缩，以得到呈黄色油的N-[26-(4-{2-[2-(乙基氨基甲酰基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-4-基]-4-(2-羟基丙-2-基)苯氧基}-3,5-二甲基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酸苄酯(100.00mg，59.06％)。LC/MS:C54H74N4O15的质量计算值：1018.52，实验值：1019.40[M+H]+。
步骤11：4-(2-{4-[2-(2-氨基乙氧基)乙氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-N-乙基-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酰胺的合成
在室温下向N-[26-(4-{2-[2-(乙基氨基甲酰基)-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-4-基]-4-(2-羟基丙-2-基)苯氧基}-3,5-二甲基苯氧基)-3,6,9,12,15,18,21,24-八氧杂二十六烷-1-基]氨基甲酸苄酯(100.00mg，0.10mmol，1.00当量)于DMF(10.00mL)中的经搅拌的混合物中分批添加Pd/C(20.00mg，20％w/w)。将混合物在H2下搅拌17.0小时。将所得混合物过滤，将滤饼用MeOH(3x 10mL)洗涤并浓度。将所得残余物冻干，以得到呈黄色固体的4-(2-{4-[2-(2-氨基乙氧基)乙氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-N-乙基-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酰胺(80.00mg，120.18％)。LC/MS:C46H68N4O13的质量计算值：884.48，实验值：885.40[M+H]+。
步骤12：化合物17的合成
向4-(2-{4-[2-(2-氨基乙氧基)乙氧基]-2,6-二甲基苯氧基}-5-(2-羟基丙-2-基)苯基)-N-乙基-6-甲基-7-氧代-1H-吡咯[2,3-c]吡啶-2-甲酰胺(80.00mg，0.14mmol，1.00当量)、3-({1-甲基-4-[3-({1-甲基-4-[1-甲基-4-(3-{[1-甲基-4-(1-甲基咪唑-2-酰胺基)吡咯-2-基]甲酰胺基}丙酰胺基)咪唑-2-酰胺基]吡咯-2-基}甲酰胺基)丙酰胺基]咪唑-2-基}甲酰胺基)甲酸(PA-01，实例1)(115.12mg，0.14mmol，1.00当量)和PyBOP(108.29mg，0.21mmol，1.50当量)于DMF(2.00mL)中的经搅拌的混合物中逐滴添加DIEA(44.82mg，0.35mmol，2.50当量)。将混合物在室温下搅拌16.0小时。然后将混合物过滤并通过Prep-HPLC(柱：XBridge Shield RP18 OBD柱，19*250mm，10μm；流动相A：水(10mmol/LNH4HCO3+0.1％NH3.H2O)，流动相B：ACN；流速：25毫升/分钟；梯度：15分钟内20％ B至45％B，45％ B；波长：254nm；RT1(分钟)：14)纯化。将级分合并并冻干，以得到呈白色固体的标题化合物(化合物17)(16.1mg，6.61％)。HRMS:C82H109N19O21的质量计算值：1695.8045，实验值：1696.8142[M+H]+。HPLC：96.625％纯度。
实例27.本公开的化合物的一般合成和纯化
本公开的化合物是通过与实例1-26类似的方法制备的。化合物随后通过HRMS方法A或B纯化。
方法A：仪器：Waters Acquity I级UPLC与Xevo G2-XSQ Tof HRMS；柱：ACQUITYUPLC BEH-C18，2.1x 50mm，2.7μm；流动相A：H2O(0.1％ HCOOH)，流动B，CAN(0.1％ HCOOH)；流速：0.4毫升/分钟；梯度：1.5分钟内10％ B至95％ B，保持95％持续另外0.5分钟，然后0.3分钟内降至10％ B，保持10％ B持续另外0.7分钟；检测器：254nm。
方法B：仪器：Waters Acquity I级UPLC与Xevo G2-XS Q Tof HRMS；柱：ACQUITYUPLC BEH-C18，2.1x 50mm，2.7μm；流动相A：H2O(0.1％ HCOOH)，流动B，CAN(0.1％ HCOOH)；流速：0.4毫升/分钟；梯度：2.0分钟内5％ B至40％ B，另外1.5分钟内至95％，保持95％持续1.5分钟，然后0.3分钟内降至5％ B，保持5％ B持续另外0.7分钟；检测器：254nm。
表4中提供了通过方法A纯化的本公开的化合物的实验数据。
表4.本公开的化合物的LCMS分析。
化合物编号 从TOF-HRMS观察到[M+H]+[m/z]
1 1776.8225
2 1782.7370
3 1796.7515
4 2056.9525
5 1751.8142
6 1776.8272
7 1691.7722
8 1717.7781
9 1663.7394
10 1834.30
11 1631.10
12 1778.7906
15 1762.8062
17 1696.8142
18 1898.7955
19 1958.8153
生物学实例
实例B1：EC50测定
细胞培养：将细胞在RPMI1640培养基+15％ FBS中培养。将细胞维持在介于2×106/mL与1×06/mL之间的密度。将细胞离心，重悬于新鲜培养基中，计数并以每孔150,000个细胞铺在无包被的平底组织培养板中的100μL中。
化合物处理：将FA GeneTAC的10mM储备溶液在DMSO中以1:10稀释，随后在生长培养基中以1:100稀释。然后将工作溶液进一步稀释至期望的最终浓度150nM的10倍。然后将化合物以1:3比率稀释到含有0.01％ DMSO的生长培养基中。生成5点、3倍剂量应答曲线。将11μL的10X化合物添加到含有GM15850的100μL细胞悬浮液的孔中。将含有0.01％ DMSO的11μL生长培养基添加到所有未用FA GeneTAC处理的孔中。在使用异硫氰酸胍溶液进行细胞裂解之前，将细胞温育48小时。
RNA分离：使用离液盐在384孔柱过滤板中分离和纯化总RNA。
qRT-PCR：使用6uL mastermix和4μL RNA，使用AgPath-ID试剂(赛默飞世尔公司(Thermo Fisher))组装qRT-PCR反应。针对人FXN(测定ID Hs01075496_m1)和人GAPDH(测定ID Hs00266705_g1)的qRT-PCR TaqMan引物探针组用于测量预期靶标。使用制造商推荐的循环条件在ThermoFisher QuantStudio 6PRO仪器上运行qRT-PCR。
数据分析：使用赛默飞世尔公司设计和分析软件分析qPCR数据。将数据导出到Excel，并将hFXN表达相对于hGAPDH表达归一化。
表5中呈现了代表性体外生物化学数据。A<100nM；B是100nM至500nM；C>500nM。
表5.体外效力数据。
虽然已经在本文示出并描述了本公开的优选实施例，但是对本领域的普通技术人员而言应当显而易见的是此类实施例仅以举例方式提供。在不背离本公开的情况下，本领域的技术人员现在将想到许多变化、改变和取代。应当理解，本文所描述的本公开的实施例的多种替代方案可以用于实践本公开。下列权利要求旨在界定本公开的范围，并据此涵盖这些权利要求及其同等物范围内的方法和结构。

Claims (26)

1.一种化合物，其选自：
或其药学上可接受的盐。
2.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
3.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
4.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
5.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
6.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
7.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
8.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
9.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
10.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
11.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
12.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
13.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
14.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
15.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
16.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是
或其药学上可接受的盐。
17.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
18.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
19.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
20.根据权利要求1所述的化合物，其中所述化合物是：
或其药学上可接受的盐。
21.一种药物组合物，其包括根据权利要求1至20中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐以及药学上可接受的赋形剂。
22.一种调节fxn的表达的方法，所述方法包括使fxn与根据权利要求1至20中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或根据权利要求21所述的药物组合物接触。
23.一种治疗有需要的患者的由缺陷型fxn的表达引起的疾病或病状的方法，所述方法包括向所述患者施用根据权利要求1至20中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或根据权利要求21所述的药物组合物。
24.根据权利要求23所述的方法，其中所述疾病是弗里德希共济失调(Friedreich'sataxia，FA)。
25.一种治疗有需要的患者的弗里德希共济失调(FA)的方法，所述方法包括向所述患者施用根据权利要求1至20中任一项所述的化合物或其药学上可接受的盐或根据权利要求21所述的药物组合物。
26.根据权利要求25所述的方法，其中所述方法包括缓解肌肉萎缩、共济失调、肌束震颤或痴呆中的一种或多种。
CN202380020304.1A 2022-01-06 2023-01-06 用于治疗弗里德希共济失调的化合物和方法 Pending CN118695861A (zh)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US63/297,090 2022-01-06
US63/382,854 2022-11-08

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN118695861A true CN118695861A (zh) 2024-09-24

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN110191878B (zh) 疾病治疗用双亮氨酸拉链（dlk）激酶的二环[1.1.1]戊烷抑制剂
CN112351780A (zh) Ptpn11的取代的杂环抑制剂
JP7200120B2 (ja) Ｍｋ２阻害剤として有用なヘテロアリール化合物
CN110114351B (zh) Mct4的杂环抑制剂
CN107921044B (zh) 用于治疗疾病的gls1抑制剂
KR20180128937A (ko) 질환을 치료하는데 유용한 fimh의 만노스-유래 길항제
US20240050576A1 (en) Methods and compounds for the treatment of genetic disease
US20240166693A1 (en) Methods and compounds for modulating myotonic dystropy 1
CN114980886B (zh) 用于治疗草酸盐相关疾病的化合物和方法
CN117241805A (zh) 用于治疗弗里德希氏共济失调的方法和化合物
CN118695861A (zh) 用于治疗弗里德希共济失调的化合物和方法
KR20240138079A (ko) 프리드라이히 운동실조를 치료하기 위한 화합물 및 방법
AU2023205889A1 (en) Compounds and methods for treating friedreich&#39;s ataxia
US20230285569A1 (en) Methods and compounds for the treatment of fragile x
US20240042046A1 (en) Methods and compounds for modulating huntington&#39;s disease
CN117136051A (zh) Adamts抑制剂的前药、其制备方法和医药用途
AU2021355480A1 (en) Imidazopiperazine inhibitors of transcription activating proteins
CN116348112A (zh) 转录激活蛋白的咪唑并哌嗪抑制剂

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication