JP2023553205A - Strep-TagIIタグに特異的に結合する抗体およびその使用 - Google Patents
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Abstract
Strep-TagIIタグに特異的に結合する抗体が開示され、さらに、本発明の抗体のアミノ酸配列、クローニングまたは発現ベクター、ホスト細胞、および抗体を発現または分離するための方法が開示され、本発明の抗体を含む組成物もまた開示される。本発明の抗体を用いるという手段によって、Strep-TagIIタグを発現する生物サンプルを検出または精製するための方法もまた開示される。【選択図】図1
Description
本発明は、Strep-TagIIタグに特異的に結合する抗体に関し、抗体のアミノ酸配列、クローニングまたは発現ベクター、ホスト細胞、抗体を産生するための方法、およびStrep-TagIIタグを発現する生物サンプルを精製または検出するために抗体を用いる方法を開示する。
腫瘍免疫療法の開発によって、CAR-T(キメラ抗原受容体T細胞)およびTCR-T(T細胞受容体T細胞、操作されたT細胞受容体T細胞)ならびに他の免疫細胞療法戦略が多大な注目を受けている。インビボにおけるCAR-TまたはTCR-Tの増殖レベルはその有効性の重要な指標である。よって、細胞の迅速かつ正確な検出のための試薬または方法の開発は、インビトロおよびインビボにおけるその増殖効率を有効にモニタリングすることを助けるであろう。
現行では、CAR-TまたはTCR-T細胞を検出するための2つの方法があり、定量的リアルタイムPCR(qPCR)を用いて、T細胞におけるCARまたはTCRの遺伝子発現を検出すること、およびT細胞におけるCAR蛋白質またはTCR蛋白質発現を検出すること、である。T細胞におけるCAR蛋白質発現の検出のためには、T細胞が、フローサイトメトリーによって、普通にはCAR蛋白質上のscFv(一本鎖可変断片)断片に特異的に結合する抗体、またはFab断片に結合する抗体、またはプロテインL、および同様によって検出される。T細胞におけるTCR蛋白質発現の検出のためには、特にそのTCRを特異的に標的化するペプチドおよびHLAの複合体がT細胞のフローサイトメトリーアッセイのために普通に用いられる。しかしながら、上の検出法は明らかな限定を有する。遺伝子コピー数のqPCR検出はCAR発現T細胞を正確には反映し得ない。なぜなら、CAR遺伝子をインテグレーションする細胞は通常はCAR蛋白質を発現し得ず、qPCR検出法において偽陽性を引き起こすからである。CAR蛋白質陽性のT細胞の検出法では、Fab抗体の検出バックグラウンド値は高く、容易に偽陽性を引き起こすもので、プロテインLはscFv上にκ軽鎖を有するCARの検出にのみ好適である。その上、CAR蛋白質上のscFv断片を標的化する抗体では、ならびにTCRを標的化するHLAおよびポリペプチドの複合体では、異なるCAR蛋白質またはTCRについて、異なる抗体または複合体をスクリーニングし、妥当な検出法を確立することが必要とされる、これらは時間消費的、非効率的、かつコスト高である。CAR-Tの正確な、高感度の、かつ普遍的な抗体検出が開発され得る場合には、それは遺伝子形質導入細胞療法薬の検出効率を多大に改善し、検出コストを縮減するであろう。
本発明は、重鎖可変領域(以下、VHと略される)と軽鎖可変領域(以下、VLと略される)とを含むStrep-TagIIタグに特異的に結合する単離された抗体を開示し、VHは、配列番号1のアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2のアミノ酸配列を含むVH-CDR2、および配列番号3または配列番号4のアミノ酸配列を含むVH-CDR3を含み、VLは、配列番号5または配列番号6のアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号7または配列番号8のアミノ酸配列を含むVL-CDR2、および配列番号9または配列番号10のアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。
いくつかの実施形態において、VHは、配列番号1で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR1、配列番号2で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR2、および配列番号3または配列番号4で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR3を含み、VLは、配列番号5または配列番号6で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR1、配列番号7または配列番号8で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR2、および配列番号9または配列番号10で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR3を含む。
いくつかの実施形態において、VHは、配列番号1のアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2のアミノ酸配列を含むVH-CDR2、および配列番号3のアミノ酸配列を含むVH-CDR3を含む。
いくつかの実施形態において、VHは、配列番号1のアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2のアミノ酸配列を含むVH-CDR2、および配列番号4のアミノ酸配列を含むVH-CDR3を含む。
いくつかの実施形態において、VLは、配列番号5のアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号7のアミノ酸配列を含むVL-CDR2、および配列番号9のアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。
いくつかの実施形態において、VLは、配列番号6のアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号8のアミノ酸配列を含むVL-CDR2、および配列番号10のアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。
いくつかの実施形態において、抗体はVHおよびVLを含み、VHは、配列番号1のアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2のアミノ酸配列を含むVH-CDR2、および配列番号3のアミノ酸配列を含むVH-CDR3を含み、VLは、配列番号5のアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号7のアミノ酸配列を含むVL-CDR2、および配列番号9のアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。
いくつかの実施形態において、抗体はVHおよびVLを含み、VHは、配列番号1のアミノ酸配列を含むVH-CDR1、配列番号2のアミノ酸配列を含むVH-CDR2、および配列番号4のアミノ酸配列を含むVH-CDR3を含み、VLは、配列番号6のアミノ酸配列を含むVL-CDR1、配列番号8のアミノ酸配列を含むVL-CDR2、および配列番号10のアミノ酸配列を含むVL-CDR3を含む。
いくつかの実施形態において、抗体はVHおよびVLを含み、VHは、配列番号1で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR1、配列番号2で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR2、および配列番号3で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR3を含み、VLは、配列番号5で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR1、配列番号7で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR2、および配列番号9で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR3を含むか、または
VHは、配列番号1で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR1、配列番号2で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR2、および配列番号4で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR3を含み、VLは、配列番号6で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR1、配列番号8で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR2、および配列番号10で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR3を含む。
VHは、配列番号1で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR1、配列番号2で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR2、および配列番号4で提示されるアミノ酸配列からなるVH-CDR3を含み、VLは、配列番号6で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR1、配列番号8で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR2、および配列番号10で提示されるアミノ酸配列からなるVL-CDR3を含む。
本発明において、VHおよびVL上の各CDRはカバット付番システムによって同定される。
いくつかの実施形態において、VHは配列番号23もしくは24のアミノ酸配列を含むか、もしくは本質的にそれからなるか、もしくはそれからなるか、またはVHは85%以上の、好ましくは90%以上の、より好ましくは95%以上の、もしくはさらに好ましくは99%以上の同一性を配列番号23もしくは24に対して有するアミノ酸配列を含むか、もしくは本質的にそれからなるか、もしくはそれからなる。
いくつかの実施形態において、VLは配列番号25もしくは26のアミノ酸配列を含むか、もしくは本質的にそれからなるか、もしくはそれからなるか、またはVLは85%以上の、好ましくは90%以上の、より好ましくは95%以上の、もしくはさらにはより好ましくは99%以上の同一性を配列番号25もしくは26に対して有するアミノ酸配列を含むか、もしくは本質的にそれからなるか、もしくはそれからなる。
いくつかの実施形態において、抗体のVHまたはVLはさらに1つ以上のフレームワーク領域(単数または複数)(以下、FWRと略される)を含む。
いくつかの実施形態において、VHは1つ、2つ、3つ、または4つのFWRを含み、各FWRは、配列番号11、12、13、14、15、および16で提示される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列、少なくとも90%、好ましくは少なくとも95%、より好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列(アミノ酸配列は、配列番号11、12、13、14、15、および16のいずれか1つのアミノ酸配列と比較して1つ以上のアミノ酸置換、挿入、または欠失を有する)を含む。いくつかの具体的な実施形態において、前述のVHは4つのFWRを含み、FWR1は配列番号11で提示されるアミノ酸配列を含み、FWR2は配列番号12または配列番号13で提示されるアミノ酸配列を含み、FWR3は配列番号14または配列番号15で提示されるアミノ酸配列を含み、FWR4は配列番号16で提示されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、VLは1つ、2つ、3つ、または4つのFWRを含み、各FWRは、配列番号17、18、19、20、21、および22で提示される配列からなる群から選択されるアミノ酸配列、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列(アミノ酸配列は、配列番号17、18、19、20、21、および22のいずれか1つのアミノ酸配列と比較して1つ以上のアミノ酸置換、挿入、または欠失を有する)を含む。いくつかの具体的な実施形態において、前述のVLは4つのFWRを含み、FWR1は配列番号17または配列番号18で提示されるアミノ酸配列を含み、FWR2は配列番号19で提示されるアミノ酸配列を含み、FWR3は配列番号20または配列番号21で提示されるアミノ酸配列を含み、FWR4は配列番号22で提示されるアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態において、VHは配列番号23のアミノ酸配列を含むか、または本質的にそれからなるか、またはそれからなり、VLは配列番号25のアミノ酸配列を含むか、または本質的にそれからなるか、またはそれからなる。
いくつかの実施形態において、VHは配列番号24のアミノ酸配列を含むか、または本質的にそれからなるか、またはそれからなり、VLは配列番号26のアミノ酸配列を含むか、または本質的にそれからなるか、またはそれからなる。
いくつかの実施形態において、抗体の重鎖は、配列番号27もしくは29のアミノ酸配列を含むか、もしくは本質的にそれからなるか、もしくはそれからなるか、または抗体の重鎖は、少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、もしくはさらに好ましくは少なくとも99%の同一性を配列番号27もしくは29に対して有するアミノ酸配列を含むか、もしくは本質的にそれからなるか、もしくはそれからなる。
いくつかの実施形態において、抗体の軽鎖は、配列番号28もしくは30のアミノ酸配列を含むか、もしくは本質的にそれからなるか、もしくはそれからなるか、または抗体の軽鎖は、少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、もしくはさらに好ましくは少なくとも99%の同一性を配列番号28もしくは30に対して有するアミノ酸配列を含むか、もしくは本質的にそれからなるか、もしくはそれからなる。
いくつかの実施形態において、抗体の重鎖は配列番号27のアミノ酸配列を含むか、または本質的にそれからなるか、またはそれからなり、抗体の軽鎖は配列番号28のアミノ酸配列を含むか、または本質的にそれからなるか、またはそれからなる。
いくつかの実施形態において、抗体の重鎖は配列番号29のアミノ酸配列を含むか、または本質的にそれからなるか、またはそれからなり、抗体の軽鎖は配列番号30のアミノ酸配列を含むか、または本質的にそれからなるか、またはそれからなる。
いくつかの実施形態において、前述の抗体は、さらに、重鎖定常領域および軽鎖定常領域の少なくとも1つを含む。重鎖定常領域はマウスIgG1、マウスIgG2a、マウスIgG2b、またはマウスIgG3から選択され、軽鎖定常領域はκ鎖またはλ鎖から選択される。好ましくは、重鎖定常領域はマウスIgG1であり、軽鎖定常領域はマウス抗体のκ鎖である。
いくつかの実施形態において、前述の抗体は全長抗体、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv、scFv、モノクローナル抗体、二重特異性抗体、または多重特異性抗体である。
例示的な抗体の配列は表1および配列表で提示される通りである。
例示的な抗体のCDR配列およびFWR配列は表2および3で提示される通りである。
本発明は、前述の抗体をコードする単離された核酸分子をもまた開示する。
本発明はクローニングベクターまたは発現ベクターをもまた開示し、発現ベクターは前述の核酸分子を含む。
本発明は、前述のクローニングベクターまたは発現ベクターの1つ以上を含むホスト細胞をもまた開示する。
本発明は、前述の抗体を産生するための方法をもまた開示し、前述のホスト細胞を培養することと抗体を単離することとを含む。
本発明は、前述の抗体と1つ以上の薬学的に許容される賦形剤、希釈剤、または担体とを含む組成物またはキットをもまた開示する。
本発明は、検出可能な標識に連結された前述の抗体を含むコンジュゲートをもまた開示する。当業者は、いずれかの検出可能な標識が本発明のコンジュゲートを構築するために用いられ得るということを了解するであろう。例示的な検出可能な標識は蛍光標識、酵素基質標識、放射性同位体、ジゴキシゲニン、ビオチン、もしくはアビジン、DNA分子、または検出のための金を包含するが、これらに限定されない。ここで、蛍光標識はフルオレセイン、ローダミン、ダンシル、フィコエリスリン、またはテキサスレッドを包含するが、これらに限定されない。酵素基質標識は西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、糖オキシダーゼ、またはβ-D-ガラクトシダーゼを包含するが、これらに限定されない。放射性同位体は123I、124I、125I、131I、35S、3H、111In、112In、14C、64Cu、67Cu、86Y、88Y、90Y、177Lu、211At、186Re、188Re、153Sm、212Bi、32P、他のランタニドを包含するが、これらに限定されない。標識はルミネセンス標識またはクロモフォアでもまたあり得る。
本発明は、前述のコンジュゲートと1つ以上の薬学的に許容される賦形剤、希釈剤、または担体とを含む組成物またはキットをもまた開示する。
本発明は、サンプル中のStrep-TagIIタグを含有する融合ポリペプチドを検出するための試薬またはキットの調製における前述の抗体の使用をもまた開示する。
本発明は、サンプル中のStrep-TagIIタグを含有する融合ポリペプチドを検出するための方法をもまた開示し、(i)融合ポリペプチドを含有するサンプルを、本発明の単離された抗体とインビトロで、抗体および融合ポリペプチドの間の相互作用を許す条件下において接触させることと、(ii)抗体および融合ポリペプチドの間の複合体の形成を検出することとを含む。ここで、複合体を検出する方法はフローサイトメトリー、ウエスタンブロット、免疫組織化学、および免疫蛍光の少なくとも1つを包含するが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、Strep-TagIIタグを含有するサンプルはStrep-TagIIタグを含有するCAR-T細胞である。
本発明は、サンプル中のStrep-TagIIタグを含有する融合ポリペプチドを精製するための方法をもまた開示し、(i)融合ポリペプチドを含有するサンプルを、インビトロで、本発明の単離された抗体と、抗体および融合ポリペプチドの間の相互作用を許す条件下において接触させることと、(ii)抗体および融合ポリペプチドの間で形成された複合体を精製することとを含む。ここで、精製する方法は、アフィニティークロマトグラフィー、免疫沈降、および同類を包含するが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態において、サンプルは、血液、尿、唾液、リンパ、脳脊髄液、骨髄、組織および臓器、細胞の少なくとも1つを含む生物サンプルである。
具体的な実施形態において、血液は血清、血漿、および全血の少なくとも1つを含む。
いくつかの実施形態において、サンプルはキメラ抗原受容体細胞または操作された細胞受容体細胞を含む。
いくつかの実施形態において、サンプルはキメラ抗原受容体細胞または操作された細胞受容体細胞である。
本発明の抗体はより強い親和性を有し、これはキメラ抗原受容体細胞または操作された細胞受容体細胞のStrep-TagIIタグにより特異的に結合し得、キメラ抗原受容体細胞または操作された細胞受容体細胞のインビトロおよびインビボの増幅効率を有効にモニタリングし得る。
本発明は具体的な実施形態によって下でさらに記載される。別様に定義されない限り、本明細書において用いられる用語は、当業者に普通に理解される同じ意味を有する。
本明細書において用いられる用語「抗原」は、抗体産生または特異的な免疫担当細胞の活性化が関わり得る免疫応答を誘起する分子を言う。当業者は、全ての蛋白質またはペプチドを包含するいずれかの高分子が抗原として用いられ得るということを理解するであろう。例えば、本発明における免疫化抗原は、NWSHPQFEKのアミノ酸配列を有するStrep-TagIIであり得るか、またはキーホールリンペットヘモシアニン(KLH)にコンジュゲート化されたStrep-TagII(NWSHPQFEK-KLH)であり得る。抗原は、生成、合成され得るか、または組織サンプル、腫瘍サンプル、細胞、もしくは生体液を包含するがこれらに限定されない生物サンプルに由来し得る。本明細書において用いられる用語「検出抗原」は、抗体力価を決定するために用いられる抗原、例えばオボアルブミン(OVA)にコンジュゲート化されたStrep-TagII(NWSHPQFEK-OVA)を言うが、当業者は、抗原はNWSHPQFEK-OVAには限定されず、NWSHPQFEKまたはその一部を含有する抗原もまた検出抗原として用いられ得るということを理解し得る。そのため、特定の検出抗原の使用は抗体の調製方法に対する限定として解釈されるべきではない。
本明細書において用いられる用語「ペプチド」および「ポリペプチド」は、ペプチド結合によって共有結合的に連結されたアミノ酸残基からなる化合物を言う。本明細書において用いられる「融合ポリペプチド」は、Strep-TagIIタグが取り付けられているポリペプチドを言う。例えば、Strep-TagIIタグはキメラ抗原受容体の細胞外ドメインscFv上の重鎖可変領域または軽鎖可変領域のN末端またはC末端の端に取り付けられている。ポリペプチドは天然のペプチド、組み換えペプチド、合成ペプチド、またはそれらの組み合わせを含む。
本明細書において用いられる用語「抗体」は最も幅広い意味で用いられ、種々の抗体構造を包摂し、それらが所望の抗原結合活性を見せる限り、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば二重特異性抗体)、全長抗体、および抗体断片(または抗原結合断片、または抗原結合部分)を包含するが、これらに限定されない。抗体は、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv、scFv、di-scFv、tri-scFv、Fd、および抗原結合機能を保持する他の抗体断片を含むが、これらに限定されず、それは二量体構造(ダイアボディ)または三量体構造(トライアボディ)でもまたあり得る。抗原結合断片は典型的には抗体軽鎖可変領域(VL)および抗体重鎖可変領域(VH)を含み、これらは、相補性決定領域(CDR)と呼ばれる超可変領域と、フレームワーク領域(FWR)と呼ばれるより保存された領域とにさらに細分され得る。これは散在している。本発明において開示される抗体および抗原結合断片のCDRはカバット付番によって定義または同定される。
全長抗体は、ジスルフィド結合によって相互接続された少なくとも2つの重鎖および2つの軽鎖を含む蛋白質を言う。各重鎖は重鎖可変領域および重鎖定常領域からなり、各軽鎖は軽鎖可変領域および軽鎖定常領域からなる。本発明の具体的な実施形態において、重鎖定常領域はマウス由来IgG1、IgG2a、IgG2b、またはIgG3から選択され得、軽鎖定常領域はκ鎖またはλ鎖から選択される。
本明細書において用いられる用語「キメラ抗原受容体」または「CAR」は、免疫エフェクター細胞上に発現されるように操作されたかつ抗原に特異的に結合することができる人工の受容体を言う。「キメラ抗原受容体細胞」は、細胞上の抗原に特異的に結合し得る人工の受容体を発現する免疫細胞を言い、免疫細胞はリンパ球、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、単球/マクロファージ、顆粒球、マスト細胞などを含み、養子細胞移入を用いる治療に用いられ得る。操作されたT細胞受容体としてもまた公知の本発明において用いられる用語「操作された細胞受容体」または「TCR」は、MHCによって送達される腫瘍細胞内抗原ペプチドのより有効な認識を可能化し、それによって腫瘍を死滅・処置するようにインビトロで遺伝子操作されたTCRのペプチド鎖から組成されるヘテロ二量体である。本発明における融合ポリペプチドはStrep-TagIIタグと融合したCARまたはTCRを含む。
本明細書において用いられる「単離された」は、天然の状態から変調されたか、または取り出されたことを意味する。例えば、生きている動物に天然に存在する核酸またはペプチドは「単離されて」いないが、その天然の状態における共存する材料から部分的にまたは完全に分離されている同じ核酸またはペプチドは「単離されて」いる。単離された核酸または蛋白質は、実質的に精製された形態で存在し得るか、またはホスト細胞などの非天然環境に存在し得る。「単離された」抗体は、その天然の環境の構成成分から同定ならびに分離および/または回収されたものである。いくつかの実施形態において、抗体は、電気泳動(例えばSDS-PAGE、等電点電気泳動IEF、キャピラリー電気泳動)またはクロマトグラフィー(例えばイオン交換または逆相HPLC)によって決定される95%または99%よりも多大な純度で精製される。本明細書において用いられるホスト細胞は、クローニングベクターまたは発現ベクターを含有するいずれかの原核または真核細胞であり得、ホスト細胞の染色体またはゲノム上にクローニングされた遺伝子を含有するように遺伝子操作された原核または真核細胞を包含する。改変された免疫系を有する特別なトランスジェニック動物もまた抗体を作るために用いられ得る。
本明細書において申し立てられる数的な限度または範囲は端点を包含し、数的な限度または範囲内の全ての値および部分範囲を具体的に包含する。
別様に規定されない限り、次の例における実験法は従来の方法である。
例1.抗原、マウス免疫化、およびハイブリドーマ調製
1.抗原
免疫化抗原はキーホールリンペットヘモシアニン(KLH)にコンジュゲート化されたStrep-TagII(NWSHPQFEK-KLH)であり、検出抗原はオボアルブミン(OVA)にコンジュゲート化されたStrep-TagII(NWSHPQFEK-OVA)である。全てはチャイニーズペプチド(Chinese Peptide)社から購入した。
1.抗原
免疫化抗原はキーホールリンペットヘモシアニン(KLH)にコンジュゲート化されたStrep-TagII(NWSHPQFEK-KLH)であり、検出抗原はオボアルブミン(OVA)にコンジュゲート化されたStrep-TagII(NWSHPQFEK-OVA)である。全てはチャイニーズペプチド(Chinese Peptide)社から購入した。
2.免疫化
免疫化抗原蛋白質(KLHにコンジュゲート化されたStrep-TagIIポリペプチド(NWSHPQFEK-KLH))を生理食塩水中に0.5mg/mLの濃度で溶解した。100μLの上述の抗原蛋白質溶液を等体積の完全フロイントアジュバント(シグマ;Cat#:1001646446)と混合し、免疫応答を産生するための皮下腹部多点注射によってBalb/cマウス(雌、6~8週、北京維通利華実験動物技術有限公司(Beijing Vital River Laboratory Animal Technology Co., Ltd.)から購入)を免疫化した。それから、上の抗原蛋白質溶液を生食によって0.25mg/mLの濃度に希釈し、100uLの希釈された抗原蛋白質溶液およびフックス不完全アジュバント(シグマ;Cat#:1002036152)をそれぞれ第15、29、および43日に体積で1:1混合し、ブースター免疫化のための皮下腹部多点注射によってBalb/cマウスを免疫化した。合計で4回の抗原免疫化のために、各マウスには注射あたり200μLの体積を注射した。血清力価をそれぞれ第22、36、および50日に断尾血液によって決定した。マウス血清力価はNWSHPQFEK-OVAポリペプチドを用いる酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)によって検出し、方法は次の通りであった:1μg/mLのOVAコンジュゲート化Strep-TagII(NWSHPQFEK-OVA)を4℃の96ウェルプレート(コーニングから購入)に追加し、一晩置き、ELISAプレートを洗浄し、それから、0.05%Tween-20を含有するリン酸緩衝生理食塩水(PBST)によって5回洗浄した。プレートを1%ウシ血清アルブミンによって2時間の間室温でブロッキングし、PBSTによって5回洗浄した。それから、マウス血清を1:1000から1:102400まで4回希釈し、ELISAプレートに追加し、室温で1時間の間インキュベーションし、PBSTによって5回洗浄した。100μL/ウェルのHRP標識ヤギ抗マウス二次抗体(インビトロジェン、Cat#:31430)を追加し、洗浄後に室温で1時間の間インキュベーションした。それから、50μL/ウェルの3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)をプレートに追加し、室温で15分間インキュベーションし、それから反応を止め、結果を読み取った。
免疫化抗原蛋白質(KLHにコンジュゲート化されたStrep-TagIIポリペプチド(NWSHPQFEK-KLH))を生理食塩水中に0.5mg/mLの濃度で溶解した。100μLの上述の抗原蛋白質溶液を等体積の完全フロイントアジュバント(シグマ;Cat#:1001646446)と混合し、免疫応答を産生するための皮下腹部多点注射によってBalb/cマウス(雌、6~8週、北京維通利華実験動物技術有限公司(Beijing Vital River Laboratory Animal Technology Co., Ltd.)から購入)を免疫化した。それから、上の抗原蛋白質溶液を生食によって0.25mg/mLの濃度に希釈し、100uLの希釈された抗原蛋白質溶液およびフックス不完全アジュバント(シグマ;Cat#:1002036152)をそれぞれ第15、29、および43日に体積で1:1混合し、ブースター免疫化のための皮下腹部多点注射によってBalb/cマウスを免疫化した。合計で4回の抗原免疫化のために、各マウスには注射あたり200μLの体積を注射した。血清力価をそれぞれ第22、36、および50日に断尾血液によって決定した。マウス血清力価はNWSHPQFEK-OVAポリペプチドを用いる酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)によって検出し、方法は次の通りであった:1μg/mLのOVAコンジュゲート化Strep-TagII(NWSHPQFEK-OVA)を4℃の96ウェルプレート(コーニングから購入)に追加し、一晩置き、ELISAプレートを洗浄し、それから、0.05%Tween-20を含有するリン酸緩衝生理食塩水(PBST)によって5回洗浄した。プレートを1%ウシ血清アルブミンによって2時間の間室温でブロッキングし、PBSTによって5回洗浄した。それから、マウス血清を1:1000から1:102400まで4回希釈し、ELISAプレートに追加し、室温で1時間の間インキュベーションし、PBSTによって5回洗浄した。100μL/ウェルのHRP標識ヤギ抗マウス二次抗体(インビトロジェン、Cat#:31430)を追加し、洗浄後に室温で1時間の間インキュベーションした。それから、50μL/ウェルの3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)をプレートに追加し、室温で15分間インキュベーションし、それから反応を止め、結果を読み取った。
免疫化されたマウスの血清力価の検出結果に従って、5匹のマウスの力価結果が示され(図1)、No.#4マウスの力価は他のマウスのものよりも高かった。マウス#4をハイブリドーマ融合のために選択し、融合の3日前に、マウスにショックのために50μgの免疫化抗原を腹腔内注射した。
3.融合
ポリエチレングリコール融合法によって、マウス#4の脾臓を摘出し、すり潰し、ダルベッコリン酸緩衝生理食塩水(DPBS)に再懸濁してマウス脾臓B細胞の単細胞を摘出し、500gで5分間遠心し、ペレットをDPBSに再懸濁し、それから、細胞を5分の500gの遠心によって洗浄し、脾細胞をマウスミエローマ細胞株sp2/0(ノルディック・バイオサイエンス(北京)社から購入)と3:1の比(細胞数の比)で混合し、1mLポリエチレングリコール(ロシュ;Cat#:10783641001)を追加し、融合した細胞をHAT培地(ギブコ;Cat#:21060-017)に再懸濁し、96ウェル細胞培養プレートにプレーティングし、二酸化炭素インキュベータにおける37℃での7日の培養後に、ハイブリドーマの一次スクリーニングをELISAおよびフローサイトメトリーによって行った。選択されたハイブリドーマ細胞を二酸化炭素インキュベータにおいて37℃で一晩培養し、それから、融合した細胞を限界希釈によって96ウェルプレートに播種した。
ポリエチレングリコール融合法によって、マウス#4の脾臓を摘出し、すり潰し、ダルベッコリン酸緩衝生理食塩水(DPBS)に再懸濁してマウス脾臓B細胞の単細胞を摘出し、500gで5分間遠心し、ペレットをDPBSに再懸濁し、それから、細胞を5分の500gの遠心によって洗浄し、脾細胞をマウスミエローマ細胞株sp2/0(ノルディック・バイオサイエンス(北京)社から購入)と3:1の比(細胞数の比)で混合し、1mLポリエチレングリコール(ロシュ;Cat#:10783641001)を追加し、融合した細胞をHAT培地(ギブコ;Cat#:21060-017)に再懸濁し、96ウェル細胞培養プレートにプレーティングし、二酸化炭素インキュベータにおける37℃での7日の培養後に、ハイブリドーマの一次スクリーニングをELISAおよびフローサイトメトリーによって行った。選択されたハイブリドーマ細胞を二酸化炭素インキュベータにおいて37℃で一晩培養し、それから、融合した細胞を限界希釈によって96ウェルプレートに播種した。
例2.陽性ハイブリドーマ細胞のスクリーニング
ハイブリドーマの培養上清中の抗Strep-TagII抗体の存在をELISA試験およびフローサイトメトリーによって検出し、無限増殖および抗体を分泌し得るハイブリドーマ細胞を最後にスクリーニングした。詳細は次の通りである。
ハイブリドーマの培養上清中の抗Strep-TagII抗体の存在をELISA試験およびフローサイトメトリーによって検出し、無限増殖および抗体を分泌し得るハイブリドーマ細胞を最後にスクリーニングした。詳細は次の通りである。
1.ELISAスクリーニング
1μg/mLのOVAコンジュゲート化Strep-TagII(NWSHPQFEK-OVA)を96ウェルプレート(コーニングから購入)に4℃で一晩追加し、それから、上清を捨てた後に、プレートをリン酸緩衝液中の0.05%Tween-20(PBST)によって5回洗浄した。プレートを1%ウシ血清アルブミンによって2時間の間室温でブロッキングし、PBSTによって5回洗浄した。100μL/ウェルのハイブリドーマ上清を追加し、1時間の間室温でインキュベーションし、それからPBSTによって5回洗浄した。洗浄後に、100μL/ウェルのHRP標識ヤギ抗マウス二次抗体(インビトロジェン、Cat#:31430)を追加し、1時間の間室温でインキュベーションした。それから、50μL/ウェルの3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)をプレートに追加し、室温で15分間インキュベーションし、それから反応を止め、結果を読み取った。陽性のハイブリドーマをELISAスクリーニングによって選択し、拡大培養のために96ウェル培養プレートから24ウェル培養プレートに移入し、24ウェル培養プレートの上清を5日後に再スクリーニングし、再スクリーニングをフローサイトメトリー(FACS)によって分析した。
1μg/mLのOVAコンジュゲート化Strep-TagII(NWSHPQFEK-OVA)を96ウェルプレート(コーニングから購入)に4℃で一晩追加し、それから、上清を捨てた後に、プレートをリン酸緩衝液中の0.05%Tween-20(PBST)によって5回洗浄した。プレートを1%ウシ血清アルブミンによって2時間の間室温でブロッキングし、PBSTによって5回洗浄した。100μL/ウェルのハイブリドーマ上清を追加し、1時間の間室温でインキュベーションし、それからPBSTによって5回洗浄した。洗浄後に、100μL/ウェルのHRP標識ヤギ抗マウス二次抗体(インビトロジェン、Cat#:31430)を追加し、1時間の間室温でインキュベーションした。それから、50μL/ウェルの3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)をプレートに追加し、室温で15分間インキュベーションし、それから反応を止め、結果を読み取った。陽性のハイブリドーマをELISAスクリーニングによって選択し、拡大培養のために96ウェル培養プレートから24ウェル培養プレートに移入し、24ウェル培養プレートの上清を5日後に再スクリーニングし、再スクリーニングをフローサイトメトリー(FACS)によって分析した。
2.フローサイトメトリースクリーニング
CD19を標的化するCARをコードするレンチウイルス移入プラスミドの構築およびレンチウイルスベクターの調製:1)Strep-TagIIとCD19を標的化するscFvとをコードするキメラ遺伝子を、遺伝子合成法(北京バイオメッド・ジーン・テクノロジー(Beijing Biomed Gene Technology)社)によって合成した。2)CD19を標的化するCARの既存のプラスミドを鋳型として用いて(CD19を標的化するCARのヌクレオチド配列は、特許CN105177031Bの配列番号13参照)、PCRを用いて、CD8αヒンジ領域、CD8α膜貫通領域、4-1BBの細胞内領域(NP_001552.2に対応)、およびCD3ζの細胞内領域(NP_000725.1に対応)を含有するCAR分子の核酸断片をクローニングした。3)ステップ1)で得られたキメラ遺伝子とステップ2)で得られた核酸断片とを鋳型として用いて、Strep-TagIIとCD19を標的化するCARとをコードする完全な核酸断片をPCRによってクローニングした。4)ステップ3)で得られた完全な核酸断片をレンチウイルスベクターpLenti6.3/V5(サーモフィッシャー、ウォルサム、MA、USA)上に制限酵素消化およびライゲーションの方法によって挿入して、Strep-TagIIとCD19を標的化するCARとの遺伝子を持つレンチウイルス移入プラスミドを得た。5)レンチウイルスパッケージングプラスミドpLP/VSVG、pLP1/MDK、pLP2/RSK(サーモフィッシャー、ウォルサム、MA、USA)、およびステップ4)で得られた移入プラスミドをHEK293T細胞にLipofectamine3000(サーモフィッシャー、ウォルサム、MA、USA)を用いてトランスフェクションし、培養培地を48時間後に収集し、300gで遠心して細胞デブリを取り除き、25,000rpmで3時間の間超遠心によって遠心した。沈殿を1mLの生理食塩水に溶解して、所望のレンチウイルスベクターを得た。
CD19を標的化するCARをコードするレンチウイルス移入プラスミドの構築およびレンチウイルスベクターの調製:1)Strep-TagIIとCD19を標的化するscFvとをコードするキメラ遺伝子を、遺伝子合成法(北京バイオメッド・ジーン・テクノロジー(Beijing Biomed Gene Technology)社)によって合成した。2)CD19を標的化するCARの既存のプラスミドを鋳型として用いて(CD19を標的化するCARのヌクレオチド配列は、特許CN105177031Bの配列番号13参照)、PCRを用いて、CD8αヒンジ領域、CD8α膜貫通領域、4-1BBの細胞内領域(NP_001552.2に対応)、およびCD3ζの細胞内領域(NP_000725.1に対応)を含有するCAR分子の核酸断片をクローニングした。3)ステップ1)で得られたキメラ遺伝子とステップ2)で得られた核酸断片とを鋳型として用いて、Strep-TagIIとCD19を標的化するCARとをコードする完全な核酸断片をPCRによってクローニングした。4)ステップ3)で得られた完全な核酸断片をレンチウイルスベクターpLenti6.3/V5(サーモフィッシャー、ウォルサム、MA、USA)上に制限酵素消化およびライゲーションの方法によって挿入して、Strep-TagIIとCD19を標的化するCARとの遺伝子を持つレンチウイルス移入プラスミドを得た。5)レンチウイルスパッケージングプラスミドpLP/VSVG、pLP1/MDK、pLP2/RSK(サーモフィッシャー、ウォルサム、MA、USA)、およびステップ4)で得られた移入プラスミドをHEK293T細胞にLipofectamine3000(サーモフィッシャー、ウォルサム、MA、USA)を用いてトランスフェクションし、培養培地を48時間後に収集し、300gで遠心して細胞デブリを取り除き、25,000rpmで3時間の間超遠心によって遠心した。沈殿を1mLの生理食塩水に溶解して、所望のレンチウイルスベクターを得た。
Strep-TagIIタグを含有するCAR-T細胞の調製:T細胞を健康なボランティアの末梢血単核細胞(妙通(上海)生物科技有限公司(Miao Tong (Shanghai) Biological Science & Technology Co., Ltd.)、中国)からCD3/CD28ダイナビーズ(サーモフィッシャー)を用いて単離し、単離されたT細胞(この時点のT細胞はCD3/CD28ダイナビーズと連結されている)をIL-2(500IU/mL)を含有する新鮮なX-VIVO15培養系によって48時間の間培養し、上のレンチウイルスベクターを用いてT細胞を感染させた。細胞のウイルス感染の24時間後に、細胞を遠心して培地を交換し、培養を上述の培養系によって続けた。4日の細胞培養後に、培養系のすべての細胞を収集し、培養系のダイナビーズを磁石スタンドによって取り出し、T細胞を遠心およびカウントし、CAR-T細胞含量をフローサイトメータ(NovoCyte2060R、ACEAバイオサイエンシズ、サンディエゴ、CA、USA)によって検出した。
Strep-TagIIタグを含有する上のCAR-T細胞を収集し、DPBSによって洗浄し、カウントし、細胞をチューブあたりおよそ3×105細胞でEPチューブに分注した。上清を遠心によって収集した後に、100μL/ウェルのハイブリドーマ上清を追加し、室温で15分間インキュベーションした。2回の洗浄後に、5μLのPE標識ラット抗マウスIgG(BD、Cat#:550083)を各チューブに追加し、15分間室温でインキュベーションし、それから、細胞をDPBSによって2回洗浄し、フローサイトメトリーFACS法によって分析した。
3.陽性サブクローン
陽性のハイブリドーマクローンを限界希釈法によって96ウェルプレートにサブクローニングし、陽性の単クローンをFACSスクリーニング法(上と同じ)によって同定および選択した。RNAを得られたモノクローナル細胞から抽出し、DNAへの逆転写後に、PCRを抗体の重鎖および軽鎖遺伝子に特異的に結合するプライマーによって行い、PCR産物をシーケンシングした。
陽性のハイブリドーマクローンを限界希釈法によって96ウェルプレートにサブクローニングし、陽性の単クローンをFACSスクリーニング法(上と同じ)によって同定および選択した。RNAを得られたモノクローナル細胞から抽出し、DNAへの逆転写後に、PCRを抗体の重鎖および軽鎖遺伝子に特異的に結合するプライマーによって行い、PCR産物をシーケンシングした。
例3.シーケンシング
陽性の単クローンを選択し、トータルRNAをTRIZOL法によって抽出した。cDNAをRT-PCRによって生成し、それから、重および軽鎖をそれぞれPCRによって増幅した(RT-PCRキットをTransGenから購入、Cat#:AE311-03。GXLハイフィデリティDNAポリメラーゼをPCRに用い、タカラから購入、Cat#:R050A。具体的な作業は製品マニュアル参照)。それから、PCR産物をクリーニングキット(AXYGEN、Cat#:155。具体的な作業は製品マニュアル参照)によってクリーニングし、次にシーケンシングをし、シーケンシングは北京睿博興科生物技術有限公司(Beijing Ruibiotech Co., Ltd.)に任せた。軽鎖可変領域および重鎖可変領域のアミノ酸配列は表1および2ならびに配列表で提示される通りである。スクリーニングされた抗体クローン番号はそれぞれ8A882および8F8D1である。
陽性の単クローンを選択し、トータルRNAをTRIZOL法によって抽出した。cDNAをRT-PCRによって生成し、それから、重および軽鎖をそれぞれPCRによって増幅した(RT-PCRキットをTransGenから購入、Cat#:AE311-03。GXLハイフィデリティDNAポリメラーゼをPCRに用い、タカラから購入、Cat#:R050A。具体的な作業は製品マニュアル参照)。それから、PCR産物をクリーニングキット(AXYGEN、Cat#:155。具体的な作業は製品マニュアル参照)によってクリーニングし、次にシーケンシングをし、シーケンシングは北京睿博興科生物技術有限公司(Beijing Ruibiotech Co., Ltd.)に任せた。軽鎖可変領域および重鎖可変領域のアミノ酸配列は表1および2ならびに配列表で提示される通りである。スクリーニングされた抗体クローン番号はそれぞれ8A882および8F8D1である。
例4.腹水調製および抗体精製
1.腹水調製
6から8週齢の5匹のBalb/cマウスを注文し、1週の給餌後に1mLのパラフィンワックス(江西省益普生製薬有限公司(Jiangxi Yipusheng Pharmaceutical Co., Ltd.)から購入)を注射し、次週に、各マウスに1×106のモノクローナルハイブリドーマ細胞を注射した。1週後に、マウスは明らかな腹部膨満を有することが観察され、マウスは48時間毎に穿刺およびアスピレーションされた。3~4mLの腹水を各マウスから収集し、合計で20mLの腹水を収集した。
1.腹水調製
6から8週齢の5匹のBalb/cマウスを注文し、1週の給餌後に1mLのパラフィンワックス(江西省益普生製薬有限公司(Jiangxi Yipusheng Pharmaceutical Co., Ltd.)から購入)を注射し、次週に、各マウスに1×106のモノクローナルハイブリドーマ細胞を注射した。1週後に、マウスは明らかな腹部膨満を有することが観察され、マウスは48時間毎に穿刺およびアスピレーションされた。3~4mLの腹水を各マウスから収集し、合計で20mLの腹水を収集した。
2.抗体精製
抗体はアフィニティー精製法によって精製し、自然流下式カラムを結合緩衝液(pH7.0)によって平衡化し、カラム体積の2~5倍で洗浄した。濾過された腹水をカラム(プロテインA/Gカラム、サーモフィッシャーに注文、Cat#:89930)に通した;カラムをカラム体積の5~10倍の結合緩衝液によって洗浄し、標的蛋白質をpH3.5の0.1Mグリシンによって溶出し、次に、pH9.0のTris-HClによる中性への調整をした。最後に、BCAキット(サーモ;Cat#:23227、具体的な作業は製品マニュアル参照)を用いて抗体濃度を決定した。抗体の純度はSDS-PAGEによって同定され、図2は抗体が高い純度を有するということを示す。
抗体はアフィニティー精製法によって精製し、自然流下式カラムを結合緩衝液(pH7.0)によって平衡化し、カラム体積の2~5倍で洗浄した。濾過された腹水をカラム(プロテインA/Gカラム、サーモフィッシャーに注文、Cat#:89930)に通した;カラムをカラム体積の5~10倍の結合緩衝液によって洗浄し、標的蛋白質をpH3.5の0.1Mグリシンによって溶出し、次に、pH9.0のTris-HClによる中性への調整をした。最後に、BCAキット(サーモ;Cat#:23227、具体的な作業は製品マニュアル参照)を用いて抗体濃度を決定した。抗体の純度はSDS-PAGEによって同定され、図2は抗体が高い純度を有するということを示す。
例5.抗体の検証および親和性の検出
1.フローサイトメトリー検証
精製された高純度抗体をFACSによって同定した。例2.2で調製されたStrep-TagIIタグを含有するCAR-T細胞(当社製造)を収集し、FACS緩衝液によって洗浄し、カウントした。細胞をチューブあたりおよそ3×105細胞でEPチューブに分注した。上清を取り除くための遠心後に、8A882抗体もしくは8F8D1抗体または正の対照抗体を1μg/mLの終濃度で追加し、チューブを室温で15分間インキュベーションした。2回の洗浄後に、5μLのPE標識ラット抗マウスIgGを各チューブに追加し、室温で15分間インキュベーションした。それから、細胞を2回洗浄し、FACS分析を行った。実験結果は、同じ量の検出細胞(CAR-T)の条件下では、本発明の8F8D1および8A882抗体による処置後に、Strep-TagIIタグを含有するCAR-T細胞の発現率はそれぞれ48.07%および36.41%であるということを示している。これらは正の対照抗体処置の発現率27.63%よりもかなり高い。上の結果は、本発明の抗体が短いStrep-TagIIペプチドを特異的に認識し得、本発明の抗体が短いStrep-TagIIペプチドに対して市販の正の対照抗体よりも高い親和性を有するということを証明している(図3)。負の対照は追加されないStrep-TagIIタグ抗体追加であり、負の対照IgGのみが追加され、正の対照は市販の抗Strep-TagIIタグ抗体(Abcam;Cat#:ab184224)であった。
1.フローサイトメトリー検証
精製された高純度抗体をFACSによって同定した。例2.2で調製されたStrep-TagIIタグを含有するCAR-T細胞(当社製造)を収集し、FACS緩衝液によって洗浄し、カウントした。細胞をチューブあたりおよそ3×105細胞でEPチューブに分注した。上清を取り除くための遠心後に、8A882抗体もしくは8F8D1抗体または正の対照抗体を1μg/mLの終濃度で追加し、チューブを室温で15分間インキュベーションした。2回の洗浄後に、5μLのPE標識ラット抗マウスIgGを各チューブに追加し、室温で15分間インキュベーションした。それから、細胞を2回洗浄し、FACS分析を行った。実験結果は、同じ量の検出細胞(CAR-T)の条件下では、本発明の8F8D1および8A882抗体による処置後に、Strep-TagIIタグを含有するCAR-T細胞の発現率はそれぞれ48.07%および36.41%であるということを示している。これらは正の対照抗体処置の発現率27.63%よりもかなり高い。上の結果は、本発明の抗体が短いStrep-TagIIペプチドを特異的に認識し得、本発明の抗体が短いStrep-TagIIペプチドに対して市販の正の対照抗体よりも高い親和性を有するということを証明している(図3)。負の対照は追加されないStrep-TagIIタグ抗体追加であり、負の対照IgGのみが追加され、正の対照は市販の抗Strep-TagIIタグ抗体(Abcam;Cat#:ab184224)であった。
2.抗体の蛍光標識
本発明の抗体は、マルチサイト検出および分析の目的でそれぞれFITCおよびPEの2つの異なる蛍光によって標識される。抗体蛍光標識は北京4Aバイオテック社がした。
本発明の抗体は、マルチサイト検出および分析の目的でそれぞれFITCおよびPEの2つの異なる蛍光によって標識される。抗体蛍光標識は北京4Aバイオテック社がした。
3.蛍光標識抗体アフィニティー検出
本発明の抗体アフィニティー検出は動的平衡アッセイ法(飽和濃度法)を採用する。少量の抗原の存在下において、抗体を勾配希釈に付して抗原-抗体複合体の濃度を検出する。抗原-抗体複合体の濃度が合計の抗原濃度の半分を占めるときには、抗体の対応する濃度値(EC50)は抗原に対する抗体のKD値である。
本発明の抗体アフィニティー検出は動的平衡アッセイ法(飽和濃度法)を採用する。少量の抗原の存在下において、抗体を勾配希釈に付して抗原-抗体複合体の濃度を検出する。抗原-抗体複合体の濃度が合計の抗原濃度の半分を占めるときには、抗体の対応する濃度値(EC50)は抗原に対する抗体のKD値である。
Strep-TagIIタグを含有するCAR-T細胞を収集し、DPBSによって洗浄し、カウントした。細胞をチューブあたりおよび3×105細胞でいくつかのEPチューブに分注した。上清を取り除くための遠心後に、10個の濃度に連続勾配で希釈された8A882抗体または8F8D1抗体および正の対照抗体(市販のStrep-TagII抗体、Abcam;Cat#:ab184224)を追加し、室温で15分間インキュベーションした。細胞をDPBSによって2回洗浄した後に、PE標識ラット抗マウスIgGを追加し、室温で15分間インキュベーションした。細胞を2回洗浄した後に、FACS分析およびグラフパッドプリズムソフトウェアを用いてEC50値を計算した。ソフトウェア分析によって得られた8A882および8F8D1ならびに正の対照抗体のEC50値は、それぞれ0.4nM、0.2nM、および0.55nMであった(図4)。正の対照抗体と比較して、本発明の2系統の抗体は高い親和性を有する。
例6.抗体を用いる腫瘍を持つマウスの末梢血中のCAR-T細胞の検出
合計で6匹の6~8週齢NCGマウス(江蘇省GemPharmatech社、中国)に1.0×106のNalm-6-LAE細胞(ATCC、USA)を各マウスの尾静脈から注射し、5日後に、マウスをルシフェラーゼインビボイメージング(Lumina-II小動物インビボイメージングシステム、パーキンエルマー、USA)によって分析して、マウス白血病モデルが首尾良く調製されたということを確認し、それから、各マウスにCD19CAR-T細胞を尾静脈から注射した(例2.2の方法を参照して当社が調製、マウスあたり2×106細胞)。100μLの末梢血を、CAR-T検出のためにCAR-T細胞注射後の第2、4、8、12、21、および28日にマウスの眼窩から収集した。具体的には、末梢血を各50μLの2つのアリコートに分け、3μLのPE標識8F8D1抗体を各アリコートに追加し、混合し、室温で20分間インキュベーションし遮光した。そして、溶血液をサンプルに追加し、室温で15分間インキュベーションし遮光し、DPBSによって2回洗浄し、それからそれぞれ100μLのDPBSに再懸濁し、CAR-T比をFACSによって分析し、100μLの末梢血あたりのCAR-T細胞数を計算し、各マウスにおけるCAR-Tの代謝プロファイルをプロットした(図5)。
合計で6匹の6~8週齢NCGマウス(江蘇省GemPharmatech社、中国)に1.0×106のNalm-6-LAE細胞(ATCC、USA)を各マウスの尾静脈から注射し、5日後に、マウスをルシフェラーゼインビボイメージング(Lumina-II小動物インビボイメージングシステム、パーキンエルマー、USA)によって分析して、マウス白血病モデルが首尾良く調製されたということを確認し、それから、各マウスにCD19CAR-T細胞を尾静脈から注射した(例2.2の方法を参照して当社が調製、マウスあたり2×106細胞)。100μLの末梢血を、CAR-T検出のためにCAR-T細胞注射後の第2、4、8、12、21、および28日にマウスの眼窩から収集した。具体的には、末梢血を各50μLの2つのアリコートに分け、3μLのPE標識8F8D1抗体を各アリコートに追加し、混合し、室温で20分間インキュベーションし遮光した。そして、溶血液をサンプルに追加し、室温で15分間インキュベーションし遮光し、DPBSによって2回洗浄し、それからそれぞれ100μLのDPBSに再懸濁し、CAR-T比をFACSによって分析し、100μLの末梢血あたりのCAR-T細胞数を計算し、各マウスにおけるCAR-Tの代謝プロファイルをプロットした(図5)。
データは、マウスにおけるCAR-T細胞の分布がPE標識8F8D1抗体を用いて
有効に検出され得るということを示している。
有効に検出され得るということを示している。
Claims (15)
- 重鎖可変領域(VH)と軽鎖可変領域(VL)とを含む、Strep-TagIIタグに特異的に結合する単離された抗体であって、
前記VHは、配列番号1を含むVH-CDR1、配列番号2を含むVH-CDR2、配列番号3または配列番号4を含むVH-CDR3を含み、前記VLは、配列番号5または配列番号6を含むVL-CDR1、配列番号7または配列番号8を含むVL-CDR2、配列番号9または配列番号10を含むVL-CDR3を含む、抗体。 - 前記VHは、配列番号1を含むVH-CDR1、配列番号2を含むVH-CDR2、配列番号3を含むVH-CDR3を含み、前記VLは、配列番号5を含むVL-CDR1、配列番号7を含むVL-CDR2、配列番号9を含むVL-CDR3を含むか、または
前記VHは、配列番号1を含むVH-CDR1、配列番号2を含むVH-CDR2、配列番号4を含むVH-CDR3を含み、前記VLは、配列番号6を含むVL-CDR1、配列番号8を含むVL-CDR2、配列番号10を含むVL-CDR3を含む、
請求項1に記載の抗体。 - 前記VHは、配列番号23もしくは24のアミノ酸配列を含むか、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、もしくはさらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号25もしくは26のアミノ酸配列を含むか、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、もしくはさらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含む、
請求項1に記載の抗体。 - 前記VHは、1つ以上のフレームワーク領域(単数または複数)を含み、前記フレームワーク領域のそれぞれがアミノ酸配列を含み、前記アミノ酸配列は、配列番号11、12、13、14、15、および16で提示される配列、または少なくとも90%、好ましくは少なくとも95%、より好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列であり、
前記VLは、1つ以上のフレームワーク領域(単数または複数)を含み、前記フレームワーク領域のそれぞれがアミノ酸配列を含み、前記アミノ酸配列は、配列番号17、18、19、20、21、および22で提示される配列、または少なくとも90%、好ましくは少なくとも95%、より好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列である、
請求項1に記載の抗体。 - 前記VHは、配列番号23のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号25のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含むか、あるいは
前記VHは、配列番号24のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含み、前記VLは、配列番号26のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含む、
請求項1に記載の抗体。 - 抗体重鎖が、配列番号27もしくは29のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含み、抗体軽鎖が、配列番号28もしくは30のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含む、
請求項1に記載の抗体。 - 抗体重鎖が、配列番号27のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸を含み、抗体軽鎖が、配列番号28のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含むか、あるいは
抗体重鎖が、配列番号29のアミノ酸配列、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含み、抗体軽鎖が、配列番号30、または少なくとも85%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%、さらに好ましくは少なくとも99%の同一性をそれに対して有するアミノ酸配列を含む、
請求項1に記載の抗体。 - 請求項1~7のいずれか1項に記載の抗体をコードする単離された核酸。
- 請求項8に記載の核酸分子を含むクローニングまたは発現ベクター。
- 請求項8に記載の核酸分子を含むホスト細胞。
- 標識が蛍光標識、酵素基質標識、放射性同位体、ジゴキシゲニン、ビオチン、もしくはアビジン、DNA分子、または検出のための金から選択され、好ましくは、前記蛍光標識は、フルオレセイン、ローダミン、ダンシル、フィコエリスリン、またはテキサスレッドから選択され、好ましくは、前記酵素基質標識は、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、糖オキシダーゼ、またはβ-D-ガラクトシダーゼから選択され、好ましくは、前記放射性同位体は、123I、124I、125I、131I、35S、3H、111In、112In、14C、64Cu、67Cu、86Y、88Y、90Y、177Lu、211At、186Re、188Re、153Sm、212Bi、32P、他のランタニドから選択され、好ましくは、前記標識は、ルミネセンス標識またはクロモフォアから選択される、前記標識に連結された請求項1~7のいずれか1項に記載の抗体を含む抗体コンジュゲート。
- 請求項1~7のいずれか1項に記載の抗体または請求項11に記載の抗体コンジュゲートと、1つ以上の薬学的に許容される賦形剤、希釈剤、または担体とを含む組成物またはキット。
- サンプル中のStrep-TagIIタグを含有する融合ポリペプチドを検出する方法であって、
(i)前記融合ポリペプチドを含有する前記サンプルを、請求項1~7のいずれか1項に記載の単離された抗体とインビトロで、前記抗体および前記融合ポリペプチドの間の相互作用を許す条件下において接触させることと、(ii)前記抗体および前記サンプルの間の複合体の形成を検出することとを含み、
好ましくは、前記複合体を検出する方法はフローサイトメトリー、ウエスタンブロット、免疫組織化学、および免疫蛍光の少なくとも1つを含む、
方法。 - サンプル中のStrep-TagIIタグを含有する融合ポリペプチドを精製する方法であって、
(i)前記サンプルを、請求項1~7のいずれか1項に記載の単離された抗体とインビトロで、前記抗体および前記融合ポリペプチドの間の相互作用を許す条件下において接触させることと、(ii)前記抗体および前記サンプルの間で形成された複合体を精製することとを含み、
好ましくは、前記精製する方法はアフィニティークロマトグラフィーおよび免疫沈降を含む、
方法。 - 前記サンプルは、血液、尿、唾液、リンパ、脳脊髄液、骨髄、組織および臓器、細胞の少なくとも1つを含む生物サンプルであり、好ましくは、前記血液は、血清、血漿、および全血の少なくとも1つを含み、好ましくは、前記サンプルは、キメラ抗原受容体細胞または操作された細胞受容体細胞を含有する、請求項13または14に記載の方法。
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