JP2023078288A5

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Publication number: JP2023078288A5
Application number: JP2023040749A
Authority: JP
Filing date: 2023-03-15
Publication date: 2023-09-08

Claims

改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む植物であって、該遺伝子ホモログが、その対応する野生型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログと比べて改変を含み、植物における該改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログの存在が、改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含まない植物と比較して損傷誘発性表面変色の低減をもたらす、植物。
野生型Ｆ５Ｈ遺伝子配列が、配列番号５８から１１４のいずれかで表される配列である、請求項１に記載の植物。
ジャガイモ（Solanum tuberosum）、タマネギ（Allium cepa）、レタス（Lactuca sativa）、アーティチョーク（Cynara cardunculus var. Scolymus）、イネ（Oryza sativa）、トウモロコシ（Zea mays）、モモ（Prunus persica）、ナス（Solanum melongen）、チコリー（Cichorium intybus）、エンダイブ（Cichorium endivia）、セロリ（Apium graveolens）、リンゴ（Malus domestica）、バナナ（Musa acuminate）、大豆（Glycine max）、ナシ（Pyrus x bretschneideri）、小麦（Triticum aestivum）、ラディッシュ（Raphanus sativus）およびキャベツ／カリフラワー（Brassica oleracea）からなる群より選択される植物であって、それらの野生型Ｆ５Ｈ遺伝子配列の配列番号が表２に記載されている、請求項１および２のいずれか一項に記載の植物。
２つの改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む、請求項１および２のいずれか一項に記載の植物。
レタス（Lactuca sativa）、アーティチョーク（Cynara cardunculus var. Scolymus）、イネ（Oryza sativa Japonica）、トウモロコシ（Zea mays）、モモ（Prunus persica）、ナス（Solanum melongen）、チコリー（Cichorium intybus）、エンダイブ（Cichorium endivia）、セロリ（Apium graveolens）、リンゴ（Malus domestica）、バナナ（Musa acuminate）、大豆（Glycine max）、ナシ（Pyrus x bretschneideri）、小麦（Triticum aestivum）、ラディッシュ（Raphanus sativus）およびキャベツ／カリフラワー（Brassica oleracea）からなる群より選択される植物であって、それらの野生型Ｆ５Ｈ遺伝子配列の配列番号が表２に記載されている、請求項４に記載の植物。
３つの改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む、請求項１および２のいずれか一項に記載の植物。
チコリー（Cichorium intybus）、エンダイブ（Cichorium endivia）、セロリ（Apium graveolens）、リンゴ（Malus domestica）、バナナ（Musa acuminate）、大豆（Glycine max）、ナシ（Pyrus x bretschneideri）、小麦（Triticum aestivum）、ラディッシュ（Raphanus sativus）およびキャベツ／カリフラワー（Brassica oleracea）からなる群より選択される植物であって、それらの野生型Ｆ５Ｈ遺伝子配列の配列番号が表２に記載されている、請求項６に記載の植物。
４つの改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む、請求項１および２のいずれか一項に記載の植物。
バナナ（Musa acuminate）、大豆（Glycine max）、ナシ（Pyrus x bretschneideri）、小麦（Triticum aestivum）、ラディッシュ（Raphanus sativus）およびキャベツ／カリフラワー（Brassica oleracea）からなる群より選択される植物であって、それらの野生型Ｆ５Ｈ遺伝子配列の配列番号が表２に記載されている、請求項８に記載の植物。
５つ以上の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む、請求項１および２のいずれか一項に記載の植物。
大豆（Glycine max）、ナシ（Pyrus x bretschneideri）、小麦（Triticum aestivum）、ラディッシュ（Raphanus sativus）およびキャベツ／カリフラワー（Brassica oleracea）からなる群より選択される植物であって、それらの野生型Ｆ５Ｈ遺伝子配列の配列番号が表２に記載されている、請求項１０に記載の植物。
改変が、対応する野生型Ｆ５Ｈ１遺伝子ホモログにより産生されるタンパク質の発現と比較して、Ｆ５Ｈ１タンパク質ホモログのタンパク質発現が低下または欠失している、請求項１から１１のいずれか一項に記載の植物。
改変が、対応する野生型Ｆ５Ｈ１遺伝子ホモログにより産生されるタンパク質の活性と比較して、Ｆ５Ｈ１タンパク質ホモログのタンパク質活性が低下または欠失している、請求項１から１２のいずれか一項に記載の植物。
改変が未成熟終止コドンをもたらす、請求項１から１３のいずれか一項に記載の植物。
レタス（Lactuca sativa）植物であって、野生型が配列番号１１５の配列を有するＦ５Ｈ１と呼ばれる第１の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログと、要すれば、野生型が配列番号１１６の配列を有するＦ５Ｈ２と呼ばれる第２の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む、請求項１から５および１２から１４のいずれか一項に記載の植物。
改変型Ｆ５Ｈ１遺伝子ホモログがホモ接合体であり、改変型Ｆ５Ｈ２遺伝子ホモログが、ヘテロ接合体またはホモ接合体のいずれかである、請求項１５に記載の植物。
改変型Ｆ５Ｈ１遺伝子が未成熟終止コドンを含む、請求項１５または１６に記載の植物。
レタス（Lactuca sativa）植物であって、未成熟終止コドンが配列番号１１５の位置３７０の変異Ｃ→Ｔによりもたらされる、請求項１７に記載の植物。
図４に記載の別の植物であって、未成熟終止コドンがレタス（Lactuca sativa）において配列番号１１５の位置３７０に対応する位置での変異によりもたらされる、請求項１７に記載の植物。
改変型Ｆ５Ｈ２遺伝子が、１以上のアミノ酸置換を有するタンパク質をコードする、請求項１５から１９のいずれか一項に記載の植物。
レタス（Lactuca sativa）植物であって、改変型Ｆ５Ｈ２遺伝子が、配列番号２のコードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置１５４のスレオニンからイソロイシンへのアミノ酸置換、および／または配列番号２のコードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置１６５のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換、および／または配列番号２のコードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置３０８のセリンからフェニルアラニンへのアミノ酸置換、および／または配列番号２のコードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置４３４のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換、および／または配列番号２のコードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置４３６のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換によりもたらされる変異を含む、請求項１５から２０のいずれか一項に記載の植物。
コードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置１５４のスレオニンからイソロイシンへのアミノ酸置換が、配列番号１１６の位置４６１のＣ→Ｔへのヌクレオチド変化の結果であり、コードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置１６５のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換が、配列番号１１６の位置４９４のＧ→Ａへのヌクレオチド変化の結果であり、コードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置３０８のセリンからフェニルアラニンへのアミノ酸置換が、配列番号１１６の位置９２３のＣ→Ｔへのヌクレオチド変化の結果であり、コードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置４３４のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換が、配列番号１１６の位置１３０１のＧ→Ａへのヌクレオチド変化の結果であり、そしてコードされたＦ５Ｈ２タンパク質の位置４３６のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換が、配列番号１１６の位置１３０７のＧ→Ａへのヌクレオチド変化の結果である、請求項２１に記載の植物。
図４に記載の別の植物であって、アミノ酸置換が、レタス（Lactuca sativa）における位置に対応する位置にある、請求項２０または２２に記載の植物。
請求項１から２３のいずれか一項に記載の植物の一部分であって、該部分が、葉、植物の葉球（whole head）、果実、花部、種子、カード（curd）、茎、塊茎、球根または根であり、またはそれらの処理された形態である、植物の一部分。
請求項２４に記載の植物の一部分を含む、食品。
請求項１から２３のいずれか一項に記載の植物を発育させることができる、種子。
請求項１から２３のいずれか一項に記載の植物の種子であって、そのゲノム中に改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む、種子。
請求項１から２３のいずれか一項に記載の植物を発育させることができる、および／またはその植物に由来する種苗であって、小胞子、花粉、子房、胚珠、胚、胚嚢、卵細胞、不定根（cutting）、根、根冠、胚軸、子葉、茎、葉、花、葯、種子、分裂組織細胞、プロトプラストおよび細胞、またはそれらの組織培養物からなる群より選択される、種苗。
植物における損傷誘発性表面変色の低減をもたらす、請求項１から２３のいずれか一項に記載の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログ。
低減された損傷誘発性表面変色を示す植物の開発のための、請求項１から２３のいずれか一項に記載の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログの使用。
Ｆ５Ｈ１タンパク質の内生量の低下が、表２に記載の野生型Ｆ５Ｈ配列における未成熟終止コドンに起因する、請求項１から２３のいずれか一項に記載の植物。
植物におけるＦ５Ｈ１タンパク質の内生量を低下させることを含む、低減された損傷誘発性表面変色を示す植物を作出する方法。
植物におけるＦ５Ｈ１タンパク質の内生量を、野生型Ｆ５Ｈ１遺伝子ホモログを変異させることにより低下させる、請求項３２に記載の方法。
変異誘発を、ＣＲＩＳＰＲ、化学試薬、放射線、またはそれらの組合せにより行う、請求項３２または３３に記載の方法。
植物におけるＦ５Ｈ１タンパク質の内生量の低下が、遺伝子サイレンシングまたはＲＮＡｉにより、植物のＦ５Ｈ１遺伝子ホモログの発現を低下させることにより達成される、請求項３２に記載の方法。
１つまたは複数の野生型Ｆ５Ｈ１遺伝子ホモログが、表２に記載の配列番号のヌクレオチド配列および対応するアミノ酸配列を有する、請求項３２から３５のいずれか一項に記載の方法。
低下が、請求項３２から３６のいずれか一項に記載の方法により行われる、低下したＦ５Ｈ１発現を含む植物。
低減された損傷誘発性表面変色を示す植物を選択する方法であって、請求項１から２３のいずれか一項に記載の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログの存在について１つの植物または植物の集団をスクリーニングすること、および場合により、低減された損傷誘発性表面変色を示す植物を識別するための表現型テストを適用すること、および低減された損傷誘発性表面変色を示す植物を選択することを含む、方法。
植物またはその一部分における低減された損傷誘発性表面変色の変異の原因を該植物のゲノムにおいて検出するための分子マーカーであって、該マーカーが、表２に示される野生型配列の配列番号のＦ５Ｈ野生型配列のいずれかにおける変異である、分子マーカー。
変異が、配列番号１１５の位置３７０のＣ→Ｔへのヌクレオチド変化である、請求項３９に記載の分子マーカー。
変異が、配列番号１１６の位置４６１のＣ→Ｔの変異によりもたらされるコードされたタンパク質の位置１５４のスレオニンからイソロイシンへのアミノ酸置換、および／または配列番号１１６の位置４９４のＧ→Ａの変異によりもたらされるコードされたタンパク質の位置１６５のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換、および／または配列番号１１６の位置９２３のＣ→Ｔの変異によりもたらされるコードされたタンパク質の位置３０８のセリンからフェニルアラニンへのアミノ酸置換、および／または配列番号１１６の位置１３０１のＧ→Ａの変異によりもたらされるコードされたタンパク質の位置４３４のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換、および／または配列番号１１６の位置１３０７のＧ→Ａの変異によりもたらされるコードされたタンパク質の位置４３６のグリシンからグルタミン酸へのアミノ酸置換である、請求項３９に記載の分子マーカー。
低減された損傷誘発性表面変色を示す植物を識別もしくは作出するため、または請求項１から２３のいずれか一項に記載の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログに関連する他のマーカーを開発するための、請求項３９から４１のいずれか一項に記載の分子マーカーの使用。
植物の低減された損傷誘発性表面変色に関連する分子マーカーを識別するための方法であって、
ａ)植物から、および該植物の一方または両方の親から、ＤＮＡを単離すること；
ｂ）配列番号１７５、１７６、１７７、１７８または１７９に対応する配列で、またはその近くで、該ＤＮＡの領域において分子マーカーをスクリーニングすること；
ｃ）該植物の一方または両方の親から、低減された損傷誘発性表面変色表現型を有する該マーカーの共遺伝を決定すること
を含む、方法。
低減された損傷誘発性表面変色を示す植物を作出する方法であって、
（ａ）請求項１に記載の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む植物を、別の植物と交配すること；
（ｂ）場合により、１または複数回の自家交配および／または他家交配を行うこと；および
（ｃ）場合により、該低減された損傷誘発性表面変色を含む植物を、自家交配または他家交配の各回後に選別すること
を含む、方法。
該植物が、表現型により選別される、および／または分子マーカーの使用により選別される、請求項４４に記載の方法。
第１の親植物と第２の親植物を交配させて、得られた植物の種子を採取することを含む、ハイブリッド植物の種子を生産する方法であって、該第１の親植物および／または第２の親植物が、請求項１に記載の改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む、方法。
請求項１に記載の植物における改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログの存在を決定する方法であって、該植物由来の核酸サンプルを得る工程、該核酸を野生型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログを含む対照植物から得られた核酸サンプルと比較する工程、および該２つの核酸サンプル間の多型を検出する工程を含み、ここで、該検出された多型が、改変型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログの存在の指標である、方法。
野生型Ｆ５Ｈ遺伝子ホモログが、表２に記載の配列番号の配列のいずれかである、請求項４７に記載の方法。