JP6728153B2 - キュウリ植物における収量qtl - Google Patents
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Description
不定冠詞「a」または「an」は、1つであり唯一の要素しか存在しないことがその文脈において明確に要求されない限り、複数の要素が存在する可能性を排除しない。したがって、不定冠詞「a」または「an」は、通常、「少なくとも1つ」を意味する。
る)である場合に、「実質的な配列同一性」を有する。
本発明は、野生キュウリまたはキュウリの近縁野生種から移入された1つまたは2つの収量QTLを含む、栽培されたCucumis sativus var. sativus植物に関する。特に、収量の増大は、栽培キュウリの第2および/または第6染色体上の遺伝子移入断片によって付与され、前記遺伝子移入断片は、Cucumis sativus var. sativus種の野生植物またはキュウリの近縁野生種に由来する。
一つの態様において、第2染色体上の遺伝子移入断片は、
a)配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型、
b)配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型、
c)配列番号3の一塩基多型マーカーSNP_03のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号4の一塩基多型マーカーSNP_04のGTまたはGG遺伝子型、
e)配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、
f)配列番号6の一塩基多型マーカーSNP_06のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、
h)配列番号8の一塩基多型マーカーSNP_08のCTまたはTT遺伝子型、
i)配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型、
j)配列番号10の一塩基多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型、
k)配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型、
l)マーカーSNP_01とSNP_11との間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー
からなる群から選択される、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つもしくは3つ、または少なくとも4、5、6、7、8、9、10、11個のマーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
a)配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型、
b)配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型、
c)配列番号3の一塩基多型マーカーSNP_03のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号4の一塩基多型マーカーSNP_04のGTまたはGG遺伝子型、
e)配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、
f)配列番号6の一塩基多型マーカーSNP_06のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、
h)配列番号8の一塩基多型マーカーSNP_08のCTまたはTT遺伝子型、
i)配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型、
j)配列番号10の一塩基多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型、
k)配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型、
からなる群から選択される、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2もしくは3つ、または少なくとも4、5、6、7、8、9、10もしくは11個全部のマーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
a)配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型、
b)配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型、
c)配列番号3の一塩基多型マーカーSNP_03のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号4の一塩基多型マーカーSNP_04のGTまたはGG遺伝子型、
e)配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、
f)配列番号6の一塩基多型マーカーSNP_06のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、
h)配列番号8の一塩基多型マーカーSNP_08のCTまたはTT遺伝子型、
i)配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型、
j)配列番号10の一塩基多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型、
k)配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型、
からなる群から選択される、少なくとも2、3または4つ(または少なくとも5、6、7、8、9、10または11個)の連続するマーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
a)配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型、
b)配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、
c)配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型、および
e)配列番号10の一塩基多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型
からなる群から選択される、少なくとも一部のSNPマーカー、すなわち少なくとも1、2、3、4または5つすべてのマーカーを含む遺伝子移入断片を含む。
−配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、および/または
−配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、および任意に
−SNP_05とSNP_07の間の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー。
一つの態様において、第6染色体上の遺伝子移入断片(および遺伝子移入断片を含む栽培キュウリ植物または植物部分)は、
a)配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
b)配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
c)配列番号14の一塩基多型マーカーSNP_14のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号15の一塩基多型マーカーSNP_15のCTまたはTT遺伝子型、
e)配列番号16の一塩基多型マーカーSNP_16のAGまたはAA遺伝子型、
f)配列番号17の一塩基多型マーカーSNP_17のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
h)配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型、
i)配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型、
j)配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型、
k)配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型、
l)配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型、
m)配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型、
n)配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型、
o)配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型、
p)配列番号27の一塩基多型マーカーSNP_27のAGまたはAA遺伝子型、
q)配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
r)配列番号29の一塩基多型マーカーSNP_29のCTまたはCC遺伝子型、
s)配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型、
t)マーカーSNP_12とSNP_30との間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー
からなる群から選択される、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2または3つ、または少なくとも4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18または19個のマーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
a)配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
b)配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
c)配列番号14の一塩基多型マーカーSNP_14のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号15の一塩基多型マーカーSNP_15のCTまたはTT遺伝子型、
e)配列番号16の一塩基多型マーカーSNP_16のAGまたはAA遺伝子型、
f)配列番号17の一塩基多型マーカーSNP_17のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
h)配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型、
i)配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型、
j)配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型、
k)配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型、
l)配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型、
m)配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型、
n)配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型、
o)配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型、
p)配列番号27の一塩基多型マーカーSNP_27のAGまたはAA遺伝子型、
q)配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
r)配列番号29の一塩基多型マーカーSNP_29のCTまたはCC遺伝子型、
s)配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型、
からなる群から選択される、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2もしくは3つ、または少なくとも4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18または19個全部のマーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
a)配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
b)配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
c)配列番号14の一塩基多型マーカーSNP_14のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号15の一塩基多型マーカーSNP_15のCTまたはTT遺伝子型、
e)配列番号16の一塩基多型マーカーSNP_16のAGまたはAA遺伝子型、
f)配列番号17の一塩基多型マーカーSNP_17のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
h)配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型、
i)配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型、
j)配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型、
k)配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型、
l)配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型、
m)配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型、
n)配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型、
o)配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型、
p)配列番号27の一塩基多型マーカーSNP_27のAGまたはAA遺伝子型、
q)配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
r)配列番号29の一塩基多型マーカーSNP_29のCTまたはCC遺伝子型、および
s)配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型
からなる群から選択される、少なくとも2、3または4つ(または少なくとも5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18もしくは19個)の連続するマーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
−配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
−配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
−配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型、
−配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型、
−配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型、
−配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型、
−配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型、
−配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型、
からなる群から選択される、少なくとも一部のSNPマーカー、すなわち少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12または13個すべてのマーカーを含む遺伝子移入断片を含む。
−配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
−配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、および、任意に、
−マーカーSNP_13とSNP_18との間および/またはマーカーSNP_18とSNP_28との間の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的なマーカー
からなる群から選択される少なくとも1、2または3つのマーカーを含む。
a)配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型、
b)配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型、
c)配列番号3の一塩基多型マーカーSNP_03のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号4の一塩基多型マーカーSNP_04のGTまたはGG遺伝子型、
e)配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、
f)配列番号6の一塩基多型マーカーSNP_06のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、
h)配列番号8の一塩基多型マーカーSNP_08のCTまたはTT遺伝子型、
i)配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型、
j)配列番号10の単一ヌクレオチド多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型、
k)配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型。
からなる群から選択される、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10個またはそれ以上(または11個すべて)の一塩基多型(SNP)マーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である。
a)配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
b)配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
c)配列番号14の一塩基多型マーカーSNP_14のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号15の一塩基多型マーカーSNP_15のCTまたはTT遺伝子型、
e)配列番号16の一塩基多型マーカーSNP_16のAGまたはAA遺伝子型、
f)配列番号17の一塩基多型マーカーSNP_17のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
h)配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型、
i)配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型、
j)配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型、
k)配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型、
l)配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型、
m)配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型、
n)配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型、
o)配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型、
p)配列番号27の一塩基多型マーカーSNP_27のAGまたはAA遺伝子型、
q)配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
r)配列番号29の一塩基多型マーカーSNP_29のCTまたはCC遺伝子型、
s)配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型、
からなる群から選択される、少なくとも1、好ましくは少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18個またはそれ以上(または19個すべて)の一塩基多型(SNP)マーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
a)配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型、
b)配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型、
c)マーカーSNP_01とSNP_11との間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー、
d)マーカーSNP_01またはSNP_11の7cM、5cM、3cMまたはそれ未満の範囲内に遺伝的に連鎖した任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー、および
e)マーカーSNP_01またはSNP_11の5Mb、3Mb、2Mb、1Mb、0.5Mbまたは0.2Mb以内の範囲内に物理的に連鎖した任意の野生型キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー
からなる群から選択される少なくとも一つのマーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
a)配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
b)配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型、
c)マーカーSNP_12とSNP_30との間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー、
d)マーカーSNP_12またはSNP_30の7cM、5cM、3cMまたはそれ未満の範囲内に遺伝的に連鎖した任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー、および
e)マーカーSNP_12またはSNP_30の5Mb、3Mb、2Mb、1Mb、0.5Mbまたは0.2Mb以内の範囲内に物理的に連鎖した任意の野生型キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー
からなる群から選択される少なくとも一つのマーカーを検出する分子マーカーアッセイによって検出可能である。
a)栽培されたC. sativus var. sativus植物の群を準備し、
b)
i)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_01〜SNP_11、および/または
ii)第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_12〜SNP_30
からなる群から選択される少なくとも1つのSNPマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いて前記群をスクリーニングし、
c)
iii)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_01〜SNP_11のSNPマーカーの少なくとも1つ、および/または第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_12〜SNP_30のSNPマーカーの少なくとも1つ、または
iv)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_1〜SNP_11から選択される少なくとも2、3または4つの連続するマーカー、および/または第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_12〜SNP_30から選択される少なくとも2、3または4つの連続するマーカー、または
v)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_2、SNP_5、SNP_7、SNP_9およびSNP10からなる群から選択される少なくとも1、2または3つのマーカー、および/または第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_12、SNP_13、SNP_18〜SNP_26、SNP_28およびSNP_30からなる群から選択される少なくとも1、2または3つのマーカー、または
vi)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するための、少なくともマーカーSNP_06、任意にマーカーSNP_05および/またはSNP_07、および/または第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_13、SNP_18およびSNP_28から選択される少なくとも1、2または3つのマーカー
を含む植物を同定および/または選択する
ことを含む方法が提供される。
a)収量の増加を付与する対立遺伝子を含む遺伝子移入断片を有する組換え第2染色体および/または組換え第6染色体をホモ接合型で含む第1近交系キュウリ植物であって、前記遺伝子移入断片がNCIMB42262中に存在するものであるかまたはそれより小さい断片である、植物を提供し、
b)第2近交系キュウリ植物を提供し、
c)a)の前記キュウリ植物をb)の前記キュウリ植物と交配させ、
d)前記交配種からF1交配種種子を採取する
ことを含む方法が提供される。
a)受託番号NCIMB42262として寄託された種子から植物を生育し、
b)前記植物を1回以上同系交配させるか、または前記植物を他のキュウリ植物と1回以上交配させて後代の種子を産生し、
c)前記種子または前記種子もしくは植物の一部から生育した前記後代の種子または植物を、
i)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_01〜SNP_11、および/または
ii)第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_12〜SNP_30
からなる群から選択される少なくとも1つのSNPマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いてスクリーニングし、
d)
iii)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_01〜SNP_11のSNPマーカーの少なくとも1つ、および/または第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_12〜SNP_30のSNPマーカーの少なくとも1つ、または
iv)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_1〜SNP_11から選択される少なくとも2、3または4つの連続するマーカー;および/または第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_12〜SNP_30から選択される少なくとも2、3または4つの連続するマーカー、または
v)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_2、SNP_5、SNP_7、SNP_9およびSNP10からなる群から選択される少なくとも1、2または3つのマーカー、および/または第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_12、SNP_13、SNP_18〜SNP_26、SNP_28およびSNP_30からなる群から選択される少なくとも1、2または3つのマーカー、または
vi)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するための、少なくともマーカーSNP_06、任意にマーカーSNP_05および/またはSNP_07、および/または第6染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_13、SNP_18およびSNP_28から選択される少なくとも1、2または3つのマーカー
を含む後代植物を同定および/または選択する
ことを含む方法が提供される。
さらなる実施形態において、本発明は、記載されているように、第2および/または第6染色体上の遺伝子移入断片をホモ接合型またはヘテロ接合型で含む(収量の増加を付与する)新規の栽培キュウリ植物を生産する方法を提供する。この方法は、本発明の植物またはその後代植物を、オスまたはメスの親いずれかとして、第2のキュウリ植物(またはキュウリの近縁野生種)と1回以上交配すること、および/または本発明のキュウリ植物またはその後代植物を1回以上同系交配すること、および/または前記交配および/または同系交配から得られた後代を選択すること含む。
a)果実収量の増加を付与する対立遺伝子をホモ接合型で含む遺伝子移入断片を有する組換え第2および/または第6染色体を含む第1の栽培キュウリ植物を提供し、
b)第2の栽培キュウリ植物、特に野生型(非組換え)第2および/または第6染色体を有する植物を提供する工程、
c)a)の前記キュウリ植物をb)の前記キュウリ植物と交配させる工程、
d)前記交配種からF1交配種種子を採取する工程、
e)F1交配種種子から生育した植物と任意に同系交配してF2種子またはさらなる同系交配世代を産生し、組換え第2および/または第6染色体を有するF2種子または更なる同系交配世代種子を任意に選択する工程、および
f)前記F1またはF2またはさらなる同系交配世代種子から生育した植物とさらに交配して、良好な農業特性を有し、遺伝子移入断片の一方または両方をホモ接合型またはヘテロ接合型で含むキュウリ植物を産生する工程
を含む。
a)QTL2.1またはその変異型およびQTL6.1またはその変異型から選択される収量QTLを含む遺伝子移入断片を含む、少なくとも1つの組換え第2染色体および/または少なくとも1つの組換え第6染色体を含む第1の近交系キュウリ植物を提供し、
b)QTL2.1またはその変異型およびQTL6.1またはその変異型から選択される収量QTLを含む遺伝子移入断片を含む、少なくとも1つの組換え第2染色体および/または少なくとも1つの組換え第6染色体を含む第2の近交系キュウリ植物を提供し、
c)a)の前記キュウリ植物をb)の前記キュウリ植物と交配させ、
d)前記交配種からF1交配種種子を採取する
ことを含む方法も提供される。
a)第1の栽培キュウリ植物を提供する工程、
b)QTL2.1(またはその変異型)および/またはQTL6.1(またはその変異型)を、本明細書に記載されている1つ以上のSNPマーカーの存在によって決定可能なものとして含む、第2の野生キュウリ植物またはキュウリの近縁野生種を提供する工程、
c)a)の前記キュウリ植物をb)の前記キュウリ植物と交配させる工程、
d)前記交配種からF1種子を採取し、F1植物をa)のキュウリ植物に戻し交配させて戻し交配(BC1)群を産生するか、またはF1植物を1回以上同系交配させてF2またはF3またはそれ以上の世代の同系交配群を産生する工程、
e)任意にd)の植物を1回以上a)のキュウリ植物に戻し交配させて、より高い世代の戻し交配群を産生する工程、および
f)QTL2.1(またはその変異型)および/またはQTL6(またはその変異型)を含む第2および/または第6染色体上の遺伝子移入を含む、F2、F3もしくはそれ以上の世代の同系交配植物、またはBC1もしくそれ以上の世代の戻し交配植物を同定する工程
を含む。
a)第1の栽培キュウリ植物を提供する工程、
b)本明細書で提供される1つ以上のSNPマーカーを含む、第2の野生キュウリ植物またはキュウリの近縁野生種を提供する工程、
c)前記a)の植物を前記b)の植物と交配させる工程、
d)前記交配種からF1種子を採取し、F1植物をa)のキュウリ植物に戻し交配させて戻し交配(BC1)群を産生するか、またはF1植物を1回以上同系交配させてF2またはF3群を産生する工程、
e)任意に戻し交配群を同系交配させて、例えば、BC1S1またはBC1S2群を産生する工程、
f)(1つ以上の)SNPマーカーおよび/またはSNPマーカー間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーもしくはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカーを含むF2、F3、BC1、BC1S1またはBC1S2植物を同定する工程
を含む。
a)1つ以上の受託された野生キュウリまたはキュウリの近縁野生種を提供し、
b)SNP_01〜SNP_11および/またはSNP_12〜SNP_30からなる群から選択される少なくとも1つ(または少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上)のSNPマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いて前記受託物を同定および/または選択し、
c)少なくとも1つ以上の下記マーカーを含むb)の受託物を同定および/または選択し、
a)配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型および/または
b)配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型および/または
c)配列番号3の一塩基多型マーカーSNP_03のAGまたはGG遺伝子型および/または
d)配列番号4の一塩基多型マーカーSNP_04のGTまたはGG遺伝子型および/または
e)配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型および/または
f)配列番号6の一塩基多型マーカーSNP_06のCTまたはTT遺伝子型および/または
g)配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型および/または
h)配列番号8の一塩基多型マーカーSNP_08のCTまたはTT遺伝子型および/または
i)配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型および/または
j)配列番号10の一塩基多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型および/または
k)配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型および/または
l)マーカーSNP_01とSNP_11との間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカーおよび/または
d)少なくとも1つ以上の下記マーカーを含むb)の受託物を同定および/または選択し、
a)配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型および/または
b)配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型および/または
c)配列番号14の一塩基多型マーカーSNP_14のAGまたはGG遺伝子型および/または
d)配列番号15の一塩基多型マーカーSNP_15のCTまたはTT遺伝子型および/または
e)配列番号16の一塩基多型マーカーSNP_16のAGまたはAA遺伝子型および/または
f)配列番号17の一塩基多型マーカーSNP_17のCTまたはTT遺伝子型および/または
g)配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型および/または
h)配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型および/または
i)配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型および/または
j)配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型および/または
k)配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型および/または
l)配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型および/または
m)配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型および/または
n)配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型および/または
o)配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型および/または
p)配列番号27の一塩基多型マーカーSNP_27のAGまたはAA遺伝子型および/または
q)配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型および/または
r)配列番号29の一塩基多型マーカーSNP_29のCTまたはCC遺伝子型および/または
s)配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型および/または
t)マーカーSNP_12とSNP_30との間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーまたはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー
または任意に前記野生受託物由来のQTLを栽培キュウリに(例えば戻し交配によって)遺伝子移入する
ことを含む。
a)栽培キュウリ植物または植物部分を提供し、
b)
i)SNP_01〜SNP_11および/またはマーカーSNP_01とSNP_11との間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーもしくはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー、および/または
ii)SNP_12〜SNP_30および/またはマーカーSNP_12とSNP_30との間の任意の野生キュウリゲノム特異的マーカーもしくはキュウリの近縁野生種ゲノム特異的マーカー
からなる群から選択される少なくとも1つ(好ましくは少なくとも2、3、4、5つまたはそれ以上)のSNPマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いて前記植物または前記植物部分(または前記植物または植物部分から得られたDNA)をスクリーニングする
ことを含む方法が提供される。
a)QTL2.1およびQTL6.1を含む遺伝子移入断片を欠く第1の栽培キュウリ植物を提供し、
b)受託番号NCIMB42262として寄託された種子またはその後代から生育された植物から選択される第2の栽培キュウリ植物を提供し、
c)前記a)の植物を前記b)の植物と交配させ、
d)前記交配種からF1種子を採取し、F1植物を1回以上任意に同系交配させて、F2もしくはF3またはさらなる同系交配群を作出し、
e)任意にF1植物またはF2もしくはF3もしくはさらなる同系交配植物をa)の植物に戻し交配させて戻し交配群を産生し、
f)戻し交配群を1回以上任意に同系交配させ、
g)第2染色体上の遺伝子移入断片を示すSNPマーカーおよび/または第6染色体上の遺伝子移入断片を示すSNPマーカーの遺伝子型の1つ以上またはすべてを含む、F1、F2、F3、さらなる同系交配植物または戻し交配植物を同定する
ことを含む方法もまた本明細書に包含される。
a)QTL2.1および/またはQTL6.1を含む遺伝子移入断片を有し、前記遺伝子移入断片がNCIMB42262に見出される断片であるか、またはその遺伝子移入断片のより短い断片である、少なくとも1つの組換え第2および/または第6染色体を含む第1の近交系キュウリ植物を提供し、
b)組換え第2および/または第6染色体を有するかまたは有さない第2の近交系キュウリ植物を提供し、
c)前記a)の植物を前記b)の植物と交配させ、
d)前記交配種からF1交配種種子を採取する
ことを含む。
a)受託番号NCIMB42262として寄託された種子から植物を生育させ、
b)前記植物を1回以上同系交配させるか、または前記植物を他の栽培キュウリ植物と1回以上交配させて後代の種子を産生し、
c)本明細書に開示される少なくとも1つのSNPマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いて、前記種子または種子もしくは植物の部分から生育させた後代の種子または植物をスクリーニングし、
d)(本明細書の他の箇所に記載されているように)QTL2.1および/またはQTL6.1を含む遺伝子移入断片を示す少なくとも1、2、3またはそれ以上のSNPマーカーを含む後代植物を同定および/または選択し、
e)任意に前記後代植物の果実収量の増加を確認する
ことを含む方法が提供される
一つの態様において、本明細書の全体を通して記載されるように、野生キュウリまたはキュウリの近縁野生種の遺伝子移入断片を含む、改変された(組換え)栽培キュウリの第2および/または第6染色体が本明細書において提供される。一つの態様において、組換え染色体は、その自然環境から単離される。別の態様において、組換え染色体は、植物細胞、特にキュウリ細胞、特に栽培キュウリ細胞中に存在する。また、QTLを含む組換え染色体の単離された部分も本明細書において提供される。
QTL2.1およびQTL6.1をヘテロ接合型で含む、CUXYLDで指定されるピックル型の交配種Cucumis sativus var. sativusの種子の代表的なサンプル、および2つのQTLを欠く、CUXGCで指定される遺伝的対照は、2014年7月2日にExpert Solution (EPC2000 規則32(1))に基づきブダペスト条約に従って、Nunhems B.V.によってNCIMB Ltd. (Ferguson Building, Craibstone Estate, Bucksburn Aberdeen, 英国スコットランドAB21 9YA)に寄託された。種子には、以下の寄託番号NCIMB42262(CUXYLD)およびNCIMB42261(CUXGC)が付与された。
集団の作製
米国から得られた野生キュウリ受託物を、特許ピックルキュウリ交配種系統HMO1125と交配した。HMO1125は、一度の機械収穫のためのピックルキュウリプログラムの選抜系統である。
収量実験の目的は、1回のピックルキュウリの収量を測定することであった。245個の試験交配種を泥炭鉢に手で播種した。1ポット当たり3つの種子を播種し、1種の交配種当たり80ポットを播種した。泥炭鉢への播種は温室で行った。泥炭鉢を、少なくとも24℃の温度で48時間維持した。播種の4日後、泥炭鉢を野外に植えた。プランテーションの約3週間後、泥炭鉢ごとに2つの最もよく生育した植物を維持した。最終植物密度は10植物/m2であった。各土地から、110〜120の果実を収穫した。土地当たりの植物の正確な数を記録した。収量を2つの異なる方法で測定した。土地当たりの果実の総数を数え、その土地の植物の数で割った。この結果、植物当たりの果実の平均数(FrPP)で表される収量が得られる。第2の測定は、土地当たりの果実重量を計算し、これを植物の数で割って、植物当たりの平均収量(GrPP)を得ることであった。1.5cmより大きい径を有する果実のみを測定した。
第2染色体上の遺伝子移入を欠く試験交配種に対する、第2染色体上の遺伝子移入(QTL2.1)を含む試験交配種の果実収量。収量データは、オランダ(NL)の2件の試験と米国(USA)の2件の試験に基づいている。収量は、(上記のように)植物当たりの平均グラム数(GrPP)および植物当たりの平均果実数(FrPP)で表される。
第6染色体上の遺伝子移入を欠く試験交配種に対する、第6染色体上の遺伝子移入(QTL6.1)を含む試験交配種の果実収量。収量データは、オランダ(NL)の2件の試験と米国(USA)の2件の試験に基づいている。収量は、(上記のように)植物当たりの平均グラム数(GrPP)および植物当たりの平均果実数(FrPP)で表される。
QTL検出試験の結果に基づいて、1つの特定のBC2S3系統を選択し、別の特許選抜系統(VDS826)と交配し、新たな試験交配種である交配種CUXYLDを作出した。CUXYLDの種子はNCIMB42262の番号で寄託された。CUXYLDは、第2染色体(QTL2.1を含む)および第6染色体(QTL6.1を含む)に野生型ドナーからの遺伝子移入をヘテロ接合型で有する。
遺伝的対照CUXGCおよびCUXYLDの試験当たり3回の試験および2回の反復についての2012年の収量測定。収量は、植物当たりの平均果実(FrPP)で表される。
遺伝的対照CUXGCおよびCUXYLDの試験当たり3回の試験および2回の反復についての2013年の収量測定。収量は、植物当たりの平均果実(FrPP)で表される。
一塩基多型マーカー(SNP)を、野生遺伝子移入断片にわたって同定し、物理的なC. sativusマップ上のそれらの位置を決定した。
Claims (30)
- 野生キュウリまたはキュウリの近縁野生種の遺伝子移入断片を、第2染色体上にホモ接合もしくはヘテロ接合形態で含む栽培キュウリ(Cucumis sativus var. sativus)植物であって、前記遺伝子移入断片がキュウリの果実収量を増加させ、食用収穫時に果実に苦味がなく、前記遺伝子移入断片が、NCIMB42262として寄託された種子から栽培された植物と栽培キュウリ植物とを交配させることによって得られ、前記第2染色体上の遺伝子移入断片が、
a)配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型、
b)配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型、
c)配列番号3の一塩基多型マーカーSNP_03のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号4の一塩基多型マーカーSNP_04のGTまたはGG遺伝子型、
e)配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、
f)配列番号6の一塩基多型マーカーSNP_06のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、
h)配列番号8の一塩基多型マーカーSNP_08のCTまたはTT遺伝子型、
i)配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型、
j)配列番号10の一塩基多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型、
k)配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型
の全てのマーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である、栽培キュウリ植物。 - 前記キュウリの果実収量の増加が、同一環境下で生育した場合に、遺伝子移入断片を含む植物系統の植物当たりの平均果実数(FrPP)が、遺伝子移入断片を含まない遺伝的対照系統と比較して有意に高いこと、および/または、同一環境下で生育した場合に、遺伝子移入断片を含む植物系統の植物当たりの平均果実重量(GrPP)が、遺伝子移入断片を含まない遺伝的対照系統と比較して有意に高いことにより、表現型的に表現される、請求項1記載の植物。
- 第6染色体上にホモ接合またはヘテロ接合形態で遺伝子移入断片をさらに含み、前記遺伝子移入断片がキュウリ果実収量を増加させ、かつ、前記第6染色体上の遺伝子移入断片が、
a)配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
b)配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
c)配列番号14の一塩基多型マーカーSNP_14のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号15の一塩基多型マーカーSNP_15のCTまたはTT遺伝子型、
e)配列番号16の一塩基多型マーカーSNP_16のAGまたはAA遺伝子型、
f)配列番号17の一塩基多型マーカーSNP_17のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
h)配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型、
i)配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型、
j)配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型、
k)配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型、
l)配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型、
m)配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型、
n)配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型、
o)配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型、
p)配列番号27の一塩基多型マーカーSNP_27のAGまたはAA遺伝子型、
q)配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
r)配列番号29の一塩基多型マーカーSNP_29のCTまたはCC遺伝子型、
s)配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型からなる群から選択される、少なくとも1つ、好ましくは少なくとも2つまたは3つのマーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である、請求項1または2に記載の植物。 - 前記第6染色体上の遺伝子移入断片が、
a)配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
b)配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
c)配列番号14の一塩基多型マーカーSNP_14のAGまたはGG遺伝子型、
d)配列番号15の一塩基多型マーカーSNP_15のCTまたはTT遺伝子型、
e)配列番号16の一塩基多型マーカーSNP_16のAGまたはAA遺伝子型、
f)配列番号17の一塩基多型マーカーSNP_17のCTまたはTT遺伝子型、
g)配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
h)配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型、
i)配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型、
j)配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型、
k)配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型、
l)配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型、
m)配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型、
n)配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型、
o)配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型、
p)配列番号27の一塩基多型マーカーSNP_27のAGまたはAA遺伝子型、
q)配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
r)配列番号29の一塩基多型マーカーSNP_29のCTまたはCC遺伝子型、および
s)配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型
からなる群から選択される、少なくとも2、3または4つの連続するマーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である、請求項3に記載の植物。 - 少なくとも1、2または3つのマーカーが、
−配列番号12の一塩基多型マーカーSNP_12のAGまたはAA遺伝子型、
−配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
−配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号19の一塩基多型マーカーSNP_19のACまたはAA遺伝子型、
−配列番号20の一塩基多型マーカーSNP_20のACまたはAA遺伝子型、
−配列番号21の一塩基多型マーカーSNP_21のAGまたはGG遺伝子型、
−配列番号22の一塩基多型マーカーSNP_22のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号23の一塩基多型マーカーSNP_23のAGまたはAA遺伝子型、
−配列番号24の一塩基多型マーカーSNP_24のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号25の一塩基多型マーカーSNP_25のAGまたはGG遺伝子型、
−配列番号26の一塩基多型マーカーSNP_26のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号30の一塩基多型マーカーSNP_30のGTまたはTT遺伝子型
からなる群から選択されて検出される、請求項3または4に記載の植物。 - 少なくとも1、2または3つのマーカーが、
−配列番号13の一塩基多型マーカーSNP_13のAGまたはAA遺伝子型、
−配列番号18の一塩基多型マーカーSNP_18のCTまたはCC遺伝子型、
−配列番号28の一塩基多型マーカーSNP_28のCTまたはCC遺伝子型、
からなる群から選択される、請求項3〜5のいずれか一項に記載の植物。 - 前記植物が、以下の型のキュウリ:ピックルキュウリ(pickling cucumbers)、スライスキュウリ(slicing cucumbers)、長キュウリ(long cucumbers)、短キュウリ(short cucuber)、ヨーロッパ温室キュウリ(European greenhouse cucumber)、ベイト−アルファ型キュウリ、オリエンタルトレリス型キュウリ(oriental trellis type cucumbers)、アジアキュウリのうちの1つである、請求項1〜6のいずれか一項に記載の植物。
- 前記植物が、単交配F1交配種または近交系である、請求項1〜7のいずれか一項に記載の植物。
- 前記植物が、一度の(once-over)機械収穫に適している、請求項1〜8のいずれか一項に記載の植物。
- 前記植物が野生キュウリ植物および在来種ではないか、または前記植物がユーラシアキュウリ群、東アジアキュウリ群または西双版納キュウリ群の栽培キュウリである、請求項1〜9のいずれか一項に記載の植物。
- 前記植物が受粉しない無核果実を産生する、請求項1〜9のいずれか一項に記載の植物。
- 前記植物が、主としてまたは完全に雌性である、請求項1〜11のいずれか一項に記載の植物。
- 前記植物が、前記植物により産生される果実の形態学的特性に関して均一である、請求項1〜12のいずれか一項に記載の植物。
- 前記植物が、食用成熟時に、少なくとも10cmの平均果実長および/または2以上の果実直径に対する果実長比を有する果実を産生する、請求項1〜13のいずれか一項に記載の植物。
- 前記第2染色体上の遺伝子移入断片が、受託番号NCIMB42262で寄託された種子中の第2染色体上に見出される断片である、請求項1〜14のいずれか一項に記載の植物。
- 前記第2染色体上の遺伝子移入断片が、10Mb以下のサイズ、好ましくは8Mb以下のサイズ、より好ましくは3Mb以下のサイズである、請求項1〜15のいずれか一項に記載の植物。
- 前記遺伝子移入断片が、少なくとも0.5Mbまたは少なくとも1Mbのサイズである、請求項16に記載の植物。
- 前記植物が無限成長(indeterminate)のキュウリである、請求項1〜17のいずれか一項に記載の植物。
- 請求項1〜18のいずれか一項に記載の植物を生育させる種子。
- 請求項1〜19のいずれか一項に記載の植物から採取したキュウリ果実。
- 食用収穫時に果実に苦味がない、請求項20に記載の果実。
- 前記果実が食用収穫時に薄い皮を有する、請求項20または21に記載の果実。
- 少なくとも1つの組換え第2染色体を含み、前記組換え第2染色体が野生キュウリ植物またはキュウリの近縁野生種の遺伝子移入断片を含み、前記遺伝子移入断片が果実収量の向上をもたらすQTLを含む、請求項1〜22のいずれか一項に記載の植物または種子の細胞、組織または植物部分。
- 果実収量が向上したキュウリ品種を栽培するための、野生キュウリ植物またはキュウリの近縁野生種の遺伝子移入断片を含む組換え第2染色体の使用であって、前記遺伝子移入断片が果実収量の向上をもたらす対立遺伝子を含み、前記組換え第2染色体が受託番号NCIMB42262として寄託された種子中に存在する組換え第2染色体である、使用。
- 受託番号NCIMB42262として寄託された種子またはその後代中に存在する第2染色体の、遺伝子移入断片を前記第2染色体上に含む栽培されたキュウリ植物を産生するための使用であって、前記遺伝子移入断片が、前記遺伝子移入断片を含まない遺伝的対照キュウリ植物と比較して果実収量の向上をもたらす、使用。
- 受託番号NCIMB42262として寄託された種子またはその後代から栽培された植物の、果実収量が向上した栽培されたキュウリ植物を産生するための使用であって、前記果実収量の向上が前記植物またはその後代の第2染色体から得られる遺伝子移入断片によりもたらされる、使用。
- 第2染色体上に遺伝子移入断片を含む栽培されたC. sativus var. sativus植物を同定する方法であって、前記遺伝子移入断片が、NCIMB42262に存在するものであって、
a)栽培されたC. sativus var. sativus植物の個体群を準備し、
b)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_01〜SNP_11であって、それぞれ配列番号1〜配列番号11の第75ヌクレオチドであるSNP_01〜SNP_11の全てのSNPマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いて前記個体群をスクリーニングし、
c)i)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するための、SNP_01〜SNP_11の全てのSNPマーカー
を含む植物を同定および/または選択する
ことを含み、
前記工程c)のSNP遺伝子型は、
配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型、
配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型、
配列番号3の一塩基多型マーカーSNP_03のAGまたはGG遺伝子型、
配列番号4の一塩基多型マーカーSNP_04のGTまたはGG遺伝子型、
配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、
配列番号6の一塩基多型マーカーSNP_06のCTまたはTT遺伝子型、
配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、
配列番号8の一塩基多型マーカーSNP_08のCTまたはTT遺伝子型、
配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型、
配列番号10の一塩基多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型、
配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型
である、方法。 - 果実収量の向上をもたらす遺伝子移入断片を含むC. sativusF1交配植物の製造方法であって、
a)収量の向上をもたらす対立遺伝子を含む遺伝子移入断片を有する組換え第2染色体をホモ接合形態で含む第1近交系キュウリ植物であって、前記遺伝子移入断片がNCIMB42262に存在するものである、キュウリ植物を準備し、
b)第2近交系キュウリ植物を準備し、
c)前記a)のキュウリ植物と前記b)のキュウリ植物とを交配させ、
d)前記交配種からF1交配種子を回収する
ことを含む、方法。 - NCIMB42262の後代を製造するための方法であって、
a)受託番号NCIMB42262として寄託された種子から植物を栽培し、
b)前記植物を1回または複数回同系交配させるか、または前記植物を1回または複数回他のキュウリ植物と交配させて後代の種子を産生し、
c)前記種子または前記種子もしく植物の一部から栽培された前記後代の種子または植物を、第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_01〜SNP_11の全てのSNPマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いてスクリーニングし、
d)i)第2染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのSNP_01〜SNP_11の全てのSNPマーカー
を含む後代植物を同定および/または選択する
ことを含み、
前記工程d)のSNP遺伝子型は、
配列番号1の一塩基多型マーカーSNP_01のAGまたはGG遺伝子型、
配列番号2の一塩基多型マーカーSNP_02のAGまたはGG遺伝子型、
配列番号3の一塩基多型マーカーSNP_03のAGまたはGG遺伝子型、
配列番号4の一塩基多型マーカーSNP_04のGTまたはGG遺伝子型、
配列番号5の一塩基多型マーカーSNP_05のACまたはCC遺伝子型、
配列番号6の一塩基多型マーカーSNP_06のCTまたはTT遺伝子型、
配列番号7の一塩基多型マーカーSNP_07のAGまたはGG遺伝子型、
配列番号8の一塩基多型マーカーSNP_08のCTまたはTT遺伝子型、
配列番号9の一塩基多型マーカーSNP_09のCTまたはCC遺伝子型、
配列番号10の一塩基多型マーカーSNP_10のGTまたはGG遺伝子型、
配列番号11の一塩基多型マーカーSNP_11のAGまたはAA遺伝子型
である、前記方法。 - 請求項29に記載の方法により産生された後代植物。
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