JP2017530719A5

JP2017530719A5 -

Info

Publication number: JP2017530719A5
Application number: JP2017520477A
Authority: JP
Filing date: 2015-10-14
Publication date: 2018-11-29
Anticipated expiration: 2035-10-14

Claims

野生キュウリまたはキュウリの近縁野生種の遺伝子移入断片を、第２染色体上にホモ接合もしくはヘテロ接合形態で含む栽培キュウリ（Cucumis sativus var. sativus）植物であって、前記遺伝子移入断片がキュウリの果実収量を増加させ、食用収穫時に果実に苦味がなく、前記遺伝子移入断片が、ＮＣＩＭＢ４２２６２として寄託された種子から栽培された植物と栽培キュウリ植物とを交配させることによって得られ、前記第２染色体上の遺伝子移入断片が、
ａ）配列番号１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０１のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｂ）配列番号２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０２のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｃ）配列番号３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０３のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｄ）配列番号４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０４のＧＴまたはＧＧ遺伝子型、
ｅ）配列番号５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０５のＡＣまたはＣＣ遺伝子型、
ｆ）配列番号６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０６のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｇ）配列番号７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０７のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｈ）配列番号８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０８のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｉ）配列番号９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０９のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｊ）配列番号１０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１０のＧＴまたはＧＧ遺伝子型、
ｋ）配列番号１１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１１のＡＧまたはＡＡ遺伝子型
からなる群から選択される、少なくとも１つ、好ましくは少なくとも２つまたは３つのマーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である、栽培キュウリ植物。
前記キュウリの果実収量の増加が、同一環境下で生育した場合に、遺伝子移入断片を含む植物系統の植物当たりの平均果実数（ＦｒＰＰ）が、遺伝子移入断片を含まない遺伝的対照系統と比較して有意に高いこと、および／または、同一環境下で生育した場合に、遺伝子移入断片を含む植物系統の植物当たりの平均果実重量（ＧｒＰＰ）が、遺伝子移入断片を含まない遺伝的対照系統と比較して有意に高いことにより、表現型的に表現される、請求項１記載の植物。
前記第２染色体上の遺伝子移入断片が、
ａ）配列番号１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０１のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｂ）配列番号２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０２のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｃ）配列番号３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０３のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｄ）配列番号４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０４のＧＴまたはＧＧ遺伝子型、
ｅ）配列番号５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０５のＡＣまたはＣＣ遺伝子型、
ｆ）配列番号６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０６のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｇ）配列番号７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０７のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｈ）配列番号８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０８のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｉ）配列番号９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０９のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｊ）配列番号１０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１０のＧＴまたはＧＧ遺伝子型、
ｋ）配列番号１１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１１のＡＧまたはＡＡ遺伝子型
からなる群から選択される、少なくとも３つのマーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である、請求項１または２に記載の植物。
第６染色体上にホモ接合またはヘテロ接合形態で遺伝子移入断片をさらに含み、前記遺伝子移入断片がキュウリ果実収量を増加させ、かつ、前記第６染色体上の遺伝子移入断片が、
ａ）配列番号１２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１２のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｂ）配列番号１３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１３のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｃ）配列番号１４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１４のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｄ）配列番号１５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１５のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｅ）配列番号１６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１６のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｆ）配列番号１７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１７のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｇ）配列番号１８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１８のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｈ）配列番号１９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１９のＡＣまたはＡＡ遺伝子型、
ｉ）配列番号２０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２０のＡＣまたはＡＡ遺伝子型、
ｊ）配列番号２１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２１のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｋ）配列番号２２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２２のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｌ）配列番号２３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２３のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｍ）配列番号２４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２４のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｎ）配列番号２５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２５のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｏ）配列番号２６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２６のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｐ）配列番号２７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２７のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｑ）配列番号２８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２８のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｒ）配列番号２９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２９のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｓ）配列番号３０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿３０のＧＴまたはＴＴ遺伝子型
からなる群から選択される、少なくとも１つ、好ましくは少なくとも２つまたは３つのマーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である、請求項１〜３のいずれか一項に記載の植物。
前記第２染色体上の遺伝子移入断片が、
ａ）配列番号１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０１のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｂ）配列番号２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０２のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｃ）配列番号３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０３のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｄ）配列番号４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０４のＧＴまたはＧＧ遺伝子型、
ｅ）配列番号５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０５のＡＣまたはＣＣ遺伝子型、
ｆ）配列番号６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０６のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｇ）配列番号７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０７のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｈ）配列番号８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０８のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｉ）配列番号９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０９のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｊ）配列番号１０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１０のＧＴまたはＧＧ遺伝子型、
ｋ）配列番号１１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１１のＡＧまたはＡＡ遺伝子型
からなる群から選択される、少なくとも２、３または４つの連続するマーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である、請求項１〜４のいずれか一項に記載の植物。
前記第６染色体上の遺伝子移入断片が、
ａ）配列番号１２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１２のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｂ）配列番号１３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１３のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｃ）配列番号１４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１４のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｄ）配列番号１５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１５のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｅ）配列番号１６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１６のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｆ）配列番号１７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１７のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
ｇ）配列番号１８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１８のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｈ）配列番号１９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１９のＡＣまたはＡＡ遺伝子型、
ｉ）配列番号２０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２０のＡＣまたはＡＡ遺伝子型、
ｊ）配列番号２１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２１のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｋ）配列番号２２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２２のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｌ）配列番号２３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２３のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｍ）配列番号２４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２４のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｎ）配列番号２５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２５のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｏ）配列番号２６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２６のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｐ）配列番号２７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２７のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
ｑ）配列番号２８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２８のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
ｒ）配列番号２９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２９のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、および
ｓ）配列番号３０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿３０のＧＴまたはＴＴ遺伝子型
からなる群から選択される、少なくとも２、３または４つの連続するマーカーを検出する分子マーカーアッセイにより検出可能である、請求項４または５に記載の植物。
少なくとも１、２または３つのマーカーが、
ａ）配列番号２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０２のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｂ）配列番号５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０５のＡＣまたはＣＣ遺伝子型、
ｃ）配列番号７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０７のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
ｄ）配列番号９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０９のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、および
ｅ）配列番号１０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１０のＧＴまたはＧＧ遺伝子型
からなる群から選択されて検出される、請求項１〜６のいずれか一項に記載の植物。
少なくとも以下のマーカーが検出される、請求項１〜７のいずれか一項に記載の植物：
−配列番号６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０６のＣＴまたはＴＴ遺伝子型。
以下のマーカーの少なくとも１つがさらに検出される、請求項８に記載の植物：
−配列番号５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０５のＡＣまたはＣＣ遺伝子型、
−配列番号７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０７のＡＧまたはＧＧ遺伝子型。
少なくとも１、２または３つのマーカーが、
−配列番号１２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１２のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
−配列番号１３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１３のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
−配列番号１８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１８のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
−配列番号１９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１９のＡＣまたはＡＡ遺伝子型、
−配列番号２０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２０のＡＣまたはＡＡ遺伝子型、
−配列番号２１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２１のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
−配列番号２２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２２のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
−配列番号２３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２３のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
−配列番号２４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２４のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
−配列番号２５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２５のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
−配列番号２６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２６のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
−配列番号２８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２８のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
−配列番号３０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿３０のＧＴまたはＴＴ遺伝子型
からなる群から選択されて検出される、請求項４〜９のいずれか一項に記載の植物。
少なくとも１、２または３つのマーカーが、
−配列番号１３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１３のＡＧまたはＡＡ遺伝子型、
−配列番号１８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１８のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
−配列番号２８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿２８のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
からなる群から選択される、請求項４〜１０のいずれか一項に記載の植物。
前記植物が、以下の型のキュウリ：ピックルキュウリ（pickling cucumbers）、スライスキュウリ（slicing cucumbers）、長キュウリ（long cucumbers）、短キュウリ（short cucuber）、ヨーロッパ温室キュウリ（European greenhouse cucumber）、ベイト−アルファ型キュウリ、オリエンタルトレリス型キュウリ（oriental trellis type cucumbers）、アジアキュウリのうちの１つである、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の植物。
前記植物が、単交配Ｆ１交配種または近交系である、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の植物。
前記植物が、一度の（once-over）機械収穫に適している、請求項１〜１３のいずれか一項に記載の植物。
前記植物が野生キュウリ植物および在来種ではないか、または前記植物がユーラシアキュウリ群、東アジアキュウリ群または西双版納キュウリ群の栽培キュウリである、請求項１〜１５のいずれか一項に記載の植物。
前記植物が受粉しない無核果実を産生する、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の植物。
前記植物が、主としてまたは完全に雌性である、請求項１〜１６のいずれか一項に記載の植物。
前記植物が、前記植物により産生される果実の形態学的特性に関して均一である、請求項１〜１７のいずれか一項に記載の植物。
前記植物が、食用成熟時に、少なくとも１０ｃｍの平均果実長および／または２以上の果実直径に対する果実長比を有する果実を産生する、請求項１〜１８のいずれか一項に記載の植物。
前記第２染色体上の遺伝子移入断片が、受託番号ＮＣＩＭＢ４２２６２で寄託された種子中の第２染色体上に見出される断片、またはより小さい断片である、請求項１〜１９のいずれか一項に記載の植物。
前記第２染色体上の遺伝子移入断片が、１０Ｍｂ以下のサイズ、好ましくは８Ｍｂ以下のサイズ、より好ましくは３Ｍｂ以下のサイズである、請求項１〜２０のいずれか一項に記載の植物。
前記遺伝子移入断片が、少なくとも０．５Ｍｂまたは少なくとも１Ｍｂのサイズである、請求項２１に記載の植物。
前記植物が無限成長（indeterminate）のキュウリである、請求項１〜２２のいずれか一項に記載の植物。
請求項１〜２３のいずれか一項に記載の植物を生育させる種子。
請求項１〜２４のいずれか一項に記載の植物から採取したキュウリ果実。
食用収穫時に果実に苦味がない、請求項２５に記載の果実。
前記果実が食用収穫時に薄い皮を有する、請求項２５または２６に記載の果実。
少なくとも１つの組換え第２染色体を含み、前記組換え第２染色体が野生キュウリ植物またはキュウリの近縁野生種の遺伝子移入断片を含み、前記遺伝子移入断片が果実収量の向上をもたらすＱＴＬを含む、請求項１〜２７のいずれか一項に記載の植物または種子の細胞、組織または植物部分。
果実収量が向上したキュウリ品種を栽培するための、野生キュウリ植物またはキュウリの近縁野生種の遺伝子移入断片を含む組換え第２染色体の使用であって、前記遺伝子移入断片が果実収量の向上をもたらす対立遺伝子を含み、前記組換え第２染色体が受託番号ＮＣＩＭＢ４２２６２として寄託された種子中に存在する組換え第２染色体であるか、または当該組換え第２染色体に由来する、使用。
受託番号ＮＣＩＭＢ４２２６２として寄託された種子またはその後代中に存在する第２染色体の、遺伝子移入断片を前記第２染色体上に含む栽培されたキュウリ植物を産生するための使用であって、前記遺伝子移入断片が、前記遺伝子移入断片を含まない遺伝的対照キュウリ植物と比較して果実収量の向上をもたらす、使用。
受託番号ＮＣＩＭＢ４２２６２として寄託された種子またはその後代から栽培された植物の、果実収量が向上した栽培されたキュウリ植物を産生するための使用であって、前記果実収量の向上が前記植物またはその後代の第２染色体から得られる遺伝子移入断片によりもたらされる、使用。
第２染色体上に遺伝子移入断片を含む栽培されたC. sativus var. sativus植物を同定する方法であって、前記遺伝子移入断片が、ＮＣＩＭＢ４２２６２に存在するものであるか、またはそれに由来するより小さい断片であって、
ａ）栽培されたC. sativus var. sativus植物の個体群を準備し、
ｂ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのＳＮＰ＿０１〜ＳＮＰ＿１１であって、それぞれ配列番号１〜配列番号１１の第７５ヌクレオチドであるＳＮＰ＿０１〜ＳＮＰ＿１１からなる群から選択される少なくとも１つのＳＮＰマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いて前記個体群をスクリーニングし、
ｃ）ｉ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するための、ＳＮＰ＿０１〜ＳＮＰ＿１１の少なくとも１つのＳＮＰマーカー、または
ｉｉ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するための、ＳＮＰ＿１〜ＳＮＰ＿１１から選択される少なくとも２、３または４つの連続するマーカー、または
ｉｉｉ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するための、ＳＮＰ＿２、ＳＮＰ＿５、ＳＮＰ＿７、ＳＮＰ＿９およびＳＮＰ＿１０からなる群から選択される少なくとも１、２または３つのマーカー、または
ｉｖ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するための、少なくともマーカーＳＮＰ＿０６ならびに任意にマーカーＳＮＰ＿０５および／またはＳＮＰ＿０７
を含む植物を同定および／または選択する
ことを含み、
前記工程ｃ）のＳＮＰ遺伝子型は、
配列番号１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０１のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
配列番号２の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０２のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
配列番号３の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０３のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
配列番号４の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０４のＧＴまたはＧＧ遺伝子型、
配列番号５の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０５のＡＣまたはＣＣ遺伝子型、
配列番号６の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０６のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
配列番号７の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０７のＡＧまたはＧＧ遺伝子型、
配列番号８の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０８のＣＴまたはＴＴ遺伝子型、
配列番号９の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿０９のＣＴまたはＣＣ遺伝子型、
配列番号１０の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１０のＧＴまたはＧＧ遺伝子型、
配列番号１１の一塩基多型マーカーＳＮＰ＿１１のＡＧまたはＡＡ遺伝子型
からなる群から選択される、方法。
果実収量の向上をもたらす遺伝子移入断片を含むC. sativusＦ１交配植物の製造方法であって、
ａ）収量の向上をもたらす対立遺伝子を含む遺伝子移入断片を有する組換え第２染色体をホモ接合形態で含む第１近交系キュウリ植物であって、前記遺伝子移入断片がＮＣＩＭＢ４２２６２に存在するものであるか、またはより小さい断片である、キュウリ植物を準備し、
ｂ）第２近交系キュウリ植物を準備し、
ｃ）前記ａ）のキュウリ植物と前記ｂ）のキュウリ植物とを交配させ、
ｄ）前記交配種からＦ１交配種子を回収する
ことを含む、方法。
ＮＣＩＭＢ４２２６２の後代を製造するための方法であって、
ａ）受託番号ＮＣＩＭＢ４２２６２として寄託された種子から植物を栽培し、
ｂ）前記植物を１回または複数回同系交配させるか、または前記植物を１回または複数回他のキュウリ植物と交配させて後代の種子を産生し、
ｃ）前記種子または前記種子もしく植物の一部から栽培された前記後代の種子または植物を、
第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのＳＮＰ＿０１〜ＳＮＰ＿１１、
からなる群から選択される少なくとも１つのＳＮＰマーカーを検出する分子マーカーアッセイを用いてスクリーニングし、
ｄ）ｉ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのＳＮＰ＿０１〜ＳＮＰ＿１１の少なくとも１つのＳＮＰマーカー、または
ｉｉ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのＳＮＰ＿１〜ＳＮＰ＿１１から選択される少なくとも２、３または４つの連続するマーカー、または
ｉｉｉ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するためのＳＮＰ＿２、ＳＮＰ＿５、ＳＮＰ＿７、ＳＮＰ＿９およびＳＮＰ＿１０からなる群から選択される少なくとも１、２または３つのマーカー、または
ｉｖ）第２染色体上の遺伝子移入断片を検出するための、少なくともマーカーＳＮＰ＿０６ならびに任意にマーカーＳＮＰ＿０５および／またはＳＮＰ＿０７
を含む後代植物を同定および／または選択する
ことを含む、方法。
請求項３４に記載の方法により産生された後代植物。