JP2023078127A - 結晶性生体分子を対象にする方法 - Google Patents

Abstract

【課題】結晶性生体分子、例えば結晶性抗体、を含む組成物を調製する方法を提供すること。【解決手段】代表的な実施形態において、本方法は、例えば、緩衝液を交換するため、及び／又は溶液中で結晶性生体分子を濃縮するために、例えば向流遠心分離を使用して、結晶性生体分子の動床を形成させることを含む。また、試料中で結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子を検出する方法も提供される。代表的な実施形態において、結晶性生体分子を含む組成物を調製する方法は、注入口及び排出口を含む回転チャンバーにおいて結晶性生体分子の流動床を形成させることを含む。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本願は、各出願の内容が参照により本明細書中に組み込まれる、２０１７年３月１４日に提出された米国特許仮出願第６２／４７１，３５８号明細書及び２０１７年３月２４日に提出された米国特許仮出願第６２／４７６，３５９号明細書に対する優先権を主張する。

抗体は、細胞、細菌、ウイルス又は毒素上の別個の抗原を特異的に標的とする能力ゆえに副作用が限定的であることを特徴とする強力な治療剤の一角をなす。１９８６年に、最初の治療用モノクローナル抗体、Ｏｒｔｈｏｃｌｏｎｅ ＯＫＴ３が市場に導入された。それ以来、このクラスの生物製剤が顕著に増加してきた。２０１４年後半、４７種類のモノクローナル抗体製品が、癌及び炎症、心血管系、呼吸器及び感染性疾患を含む様々な疾患の処置について米国又は欧州で承認を受けた。１年に約４種類の製品という現在の承認速度を考えると、２０２０年までにおよそ７０種類のモノクローナル抗体製品が市販されるであろうと推測される。（非特許文献１）を参照。

米国での抗体市場の見積もりは＄１００億超まで増加すると予想されることが報告されているものの、このような治療薬の生産に制限がないわけではない。治療用抗体の１つの欠点は、要求される高純度レベルを達成するための下流の処理のコストである。プロテインＡクロマトグラフィーを介して９０％を超える純度レベルを達成し得る一方で、吸着媒体のコストは大きな欠点である。治療用抗体の別の制限要素は、送達及び保管中に遭遇する化学的及び物理的変性に対する抗体構造の感受性である。研究者らは抗体製剤の安定性を改善するためのアプローチを開発してきたものの、これらの方法のうち一部は、タンパク質活性の喪失及び／又はタンパク質安定化担体もしくは処方物のさらなる支出によるコスト上昇につながる。

タンパク質結晶化は、原理上、タンパク質精製の効果的で拡張可能な方法として認識されている。結晶性タンパク質は、それらのタンパク質溶液対応物と比較して安定性がより高くなり、したがって有効期間がより長くなる。結晶化を通じたタンパク質精製は、オボアルブミン及びリパーゼを含め、試験タンパク質産物によって実行可能であることが示されている。インスリンは、工業規模で結晶化される唯一の治療用タンパク質である。抗体の結晶化は、それらの相挙動での複雑性ゆえに、まだ日常的なものではない。沈殿、相分離及びゲル様相の形成が起こり得、「平衡には程遠い系を動力学的に捕捉し、その結果、結晶性タンパク質の収率を低下させるか又は結晶形成を完全に阻害する」。（非特許文献２）を参照。接線流及び交液流（ａｌｔｅｒｎａｔｉｎｇ ｆｌｏｗ）ろ過などの従来の精製技術は、膜ファウリング（すなわちフィルター媒体の孔への結晶の目詰まり）ゆえに、タンパク質結晶化精製には適切ではない。また、フィルターを通じて流れを維持するのに必要な高い圧力は、結晶の過剰なせん断、破壊及び圧縮につながり得る。タンパク質が抗体である場合、このようなタンパク質の結晶は粘着性で脆いため、これらの問題は悪化する。

したがって、結晶性抗体を含む組成物を調製する有効な方法が当技術分野で必要とされている。

Ｅｃｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，ＭＡｂｓ ７（１）：９－１４（２０１５） Ｚａｎｇ ｅｔ ａｌ．，ＰＬＯＳ Ｏｎｅ ６（９）：ｅ２５２８２（２０１１）

抗体又は免疫グロブリン、その抗原結合断片などを含むが限定されない、結晶性生体分子、例えば抗原結合生体分子を含む組成物を調製する方法が本明細書中で開示される。代表的な実施形態において、本方法は、結晶性生体分子が存在する溶液（例えば緩衝液）を交換するために、及び／又は結晶性生体分子を含む溶液（例えば緩衝液）を濃縮するために、向流勾配遠心分離（ＣＦＧＣ）を使用することを含む。開示される方法は、この段階が低せん断、密閉系及び無菌的処理条件下で行われるため、有利である。多段階を同じ装置で行い、それによって異なる装置への移動時の生成物の損失が阻止される。本明細書中に記載の方法全体を通して低せん断環境が維持されるので、結晶性生体分子は互いから分離されたままであり、それにより凝集体の形成が最小限に抑えられる。開示される方法は、充填などの下流処理の操作に容易に送り込まれ得る均一な結晶スラリーの獲得につながる。

代表的な実施形態において、結晶性生体分子を含む組成物を調製する方法は、注入口及び排出口を含む回転チャンバーにおいて結晶性生体分子の流動床を形成させることを含む。特定の理論に縛られるものではないが、そのチャンバーにおいて遠心力（Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}）を生成させるために実質的に水平な軸の周囲でチャンバーを回転させ、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向とは逆の方向に、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を相殺する力（Ｆ_ＦＲ１）を有する第１の流速（ＦＲ１）で、注入口を通じて第１の溶液の第１の流れを流動させ、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながらチャンバーから第１の溶液を回収することによって、流動床が生成されると考えられる。

代表的な実施形態において、本方法は、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら、第１の溶液の第１の流れを第２の溶液の第２の流れで置き換えることも含む。代表的な態様において、本方法は、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら、第１の溶液の第１の流れを置き換えるために第２の溶液の第２の流れを流動させることを含む。代表的な態様において、本方法は、第２の流れの力がＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を相殺するように、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向とは逆方向に、Ｆ_ＦＲ１と等しい力（Ｆ）を有するＦＲ１と同等の流速（ＦＲ）で、注入口を通じて第２の溶液の第２の流れを流動させ、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら、チャンバーから第２の溶液を回収することを含む。

代表的な実施形態において、本方法は、あるいは又はさらに、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}未満である力（Ｆ_ＦＲ２）を有する第２の流速（ＦＲ２）までＦＲ１を変化させることによって、又はＦ_ＦＲ１を超えるレベルまでＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を上昇させるためにチャンバーの回転速度を上昇させることによって、チャンバーの領域内で結晶化生体分子を濃縮することを含む。

代表的な態様において、本方法は、例えばＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向と平行である方向に、排出口を通じてチャンバーに第２の流れを流動させることによって、チャンバーから結晶性生体分子を除去することを含む。

試料中の結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子を検出する方法も本明細書中で開示される。代表的な実施形態において、本方法は、試料の複数の^１Ｈ ＮＭＲ Ｃａｒｒ－Ｐｕｒｃｅｌｌ－Ｍｅｉｂｏｏｍ－Ｇｉｌｌ（ＣＰＭＧ）スペクトルを得ること及び試料の^１３Ｃ ＮＭＲ交差分極（ＣＰ）スペクトルを得ることを含む。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
結晶性生体分子を含む組成物を調製する方法であって、
ａ）注入口及び排出口を含む回転チャンバーにおいて結晶性生体分子の流動床を形成させ、実質的に水平な軸の周囲で前記チャンバーを回転させて、前記チャンバー中で遠心力（Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}）を生成させることによって前記流動床が生成され、前記Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向とは逆方向に、及びＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を相殺する力（Ｆ_ＦＲ１）を有する第１の流速（ＦＲ１）で、前記注入口を通じて第１の溶液の第１の流れを流動させ、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら前記チャンバーから前記第１の溶液を回収することと；
ｂ）段階（ｉ）、（ｉｉ）又は（ｉｉｉ）：
ｉ．結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら前記第１の溶液の第１の流れを置き換えるために第２の溶液の第２の流れを流動させること；
ｉｉ．Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}未満である力（Ｆ_ＦＲ２）を有する第２の流速（ＦＲ２）にＦＲ１を変化させることによって、又はＦ_ＦＲ１よりも大きいレベルまでＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を上昇させるために前記チャンバーの回転速度を上昇させることによって、前記チャンバーの領域内で前記結晶化生体分子を濃縮すること；
ｉｉｉ．段階（ｉ）及び段階（ｉｉ）の組み合わせ
を実施することと；
ｃ）前記チャンバーから前記結晶性生体分子を除去するためにＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向に対して平行である方向に、前記排出口を通じて前記チャンバーに第２の流れを流動させることと、
を含む、方法。
（項目２）
少なくとも段階（ｉ）中でＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}が１０００ｇである、項目１に記載の方法。
（項目３）
段階（ｉ）中、前記第２の溶液の前記第２の流れの供給体積が約５０～約５００ｍＬである、項目１又は２に記載の方法。
（項目４）
前記第２の溶液の前記第２の流れの供給体積が約１００～約３００ｍＬである、項目３に記載の方法。
（項目５）
チャンバーあたりの前記第１の溶液の体積の数が段階（ｉ）中で２以上である、項目１～４の何れか１項に記載の方法。
（項目６）
ＦＲ１が段階（ｉ）中に約５０ｍＬ／ｍｉｎ～約１５０ｍＬ／ｍｉｎである、項目１～５の何れか１項に記載の方法。
（項目７）
ＦＲ１が約７０ｍＬ／ｍｉｎ～約１２０ｍＬ／ｍｉｎである、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記第１の溶液が高浸透圧性結晶化緩衝液である、項目１～７の何れか１項に記載の方法。
（項目９）
前記第２の溶液が等張性処方緩衝液である、項目１～８の何れか１項に記載の方法。
（項目１０）
前記Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}が段階（ｉｉ）中に１０００ｇである、項目１～９の何れか１項に記載の方法。
（項目１１）
前記第２の溶液の第２の流れの供給体積が段階（ｉｉ）中に約１００～約５００ｍＬである、項目１～１０の何れか１項に記載の方法。
（項目１２）
前記第２の溶液の前記第２の流れの供給体積が約１５０～約３５０ｍＬである、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
チャンバーあたりの前記第１の溶液の体積の数が段階（ｉｉ）中に１又は２である、項目１～１２の何れか１項に記載の方法。
（項目１４）
ＦＲ２が段階（ｉｉ）中に約１０ｍＬ／ｍｉｎ～約５０ｍＬ／ｍｉｎである、項目１～１３の何れか１項に記載の方法。
（項目１５）
ＦＲ２が約２０ｍＬ／ｍｉｎ～約４０ｍＬ／ｍｉｎである、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記結晶性生体分子の濃度が少なくとも２倍上昇する、項目１～１５の何れか１項に記載の方法。
（項目１７）
前記結晶性生体分子の濃度が少なくとも３倍上昇する、項目１６に記載の方法。
（項目１８）
前記結晶性生体分子の濃度が少なくとも４倍上昇する、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
約５ｇ及び約２０ｇのレベルまでＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を低下させることを含む、項目１～１８の何れか１項に記載の方法。
（項目２０）
１０ｇを下回るまでＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を低下させる、項目１９に記載の方法。（項目２１）
ＦＲ１が第１のポンプにより調節され、前記第１のポンプが段階（ｂ）の後に約１０ｍＬ／ｍｉｎ～約１００ｍＬ／ｍｉｎに設定される、項目１～２０の何れか１項に記載の方法。
（項目２２）
前記第１のポンプが約１５ｍＬ／ｍｉｎ～約６５ｍＬ／ｍｉｎに設定される、項目２１に記載の方法。
（項目２３）
前記回転チャンバーがチャンバー蠕動ポンプに連結される、項目１～２２の何れか１項に記載の方法。
（項目２４）
前記チャンバー蠕動ポンプが、前記第１のポンプ及びＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}と同じ方向に送り込むように設定される、項目２３に記載の方法。
（項目２５）
前記チャンバー蠕動ポンプが段階（ｂ）の後に約５０ｍＬ／ｍｉｎ～約１００ｍＬ／ｍｉｎに設定される、項目２４に記載の方法。
（項目２６）
前記チャンバー蠕動ポンプが約７５ｍＬ／ｍｉｎに設定される、項目２５に記載の方法。
（項目２７）
前記チャンバー蠕動ポンプが約７５ｍＬ／ｍｉｎに設定され、前記第１のポンプが約５０ｍＬ／ｍｉｎに設定され、１０ｇを下回るまでＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を低下させる、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記方法が複数の回転チャンバーを含む装置中で行われる、項目１～２７の何れか１項に記載の方法。
（項目２９）
前記装置が、少なくとも２個、少なくとも４個又は少なくとも６個の回転チャンバーを含む、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
前記装置が、４個又は６個のチャンバーを含む、項目２９に記載の方法。
（項目３１）
段階（ａ）～（ｃ）が複数のチャンバー中で行われる、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
結晶性生体分子が前記装置の別のチャンバーから除去されるときとは別個の時間に、結晶性生体分子が前記装置のチャンバーから除去される、項目３１に記載の方法。
（項目３３）
前記結晶性生体分子がタンパク質であるか又は１つ以上のポリペプチド鎖を含む、項目１～３２の何れか１項に記載の方法。
（項目３４）
前記結晶性タンパク質が免疫グロブリン又はそれらの抗原結合断片である、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
試料中で結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子を検出する方法であって、
ａ）前記試料の複数の^１Ｈ ＮＭＲ Ｃａｒｒ－Ｐｕｒｃｅｌｌ－Ｍｅｉｂｏｏｍ－Ｇｉｌｌ（ＣＰＭＧ）スペクトルを得ることと、
ｂ）前記試料の^１３Ｃ ＮＭＲ交差分極（ＣＰ）スペクトルを得ることと、
を含む、方法。
（項目３６）
前記方法の段階（ａ）中に約２５０～約１０００ＭＨｚの^１Ｈ共振周波数を操作することを含む、項目３５に記載の方法。
（項目３７）
約２５０～約３５０Ｋで温度を維持することを含む、項目３５又は３６に記載の方法。（項目３８）
マジック角回転（ＭＡＳ）プローブを操作することを含む、項目３５～３７の何れか１項に記載の方法。
（項目３９）
前記ＭＡＳプローブが少なくとも２個のＲＦチャネルを含む、項目３８に記載の方法。（項目４０）
前記ＭＡＳプローブが^１Ｈ及び^１３Ｃに対して調整される、項目３９に記載の方法。
（項目４１）
前記ＭＡＳプローブが約２ｋＨｚ～約８ｋＨｚの回転周波数で操作される、項目３８～４０の何れか１項に記載の方法。
（項目４２）
９０°パルスを使用することを含む、項目３５～４１の何れか１項に記載の方法。
（項目４３）
約２．５μｓの^１Ｈ ９０°パルスを使用することを含む、項目４２に記載の方法。
（項目４４）
前記^１Ｈ ＣＰＭＧスペクトルが、約２μｓ～約２０μｓ長の約５～約１００パイパルスで得られた、項目３５～４３の何れか１項に記載の方法。
（項目４５）
前記２０パイパルスのそれぞれが約１０μｓ～約１ｍｓ離された、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
ＣＰＭＧパルスの全時間が約５００μｓ～約５０ｍｓである、項目４５に記載の方法。（項目４７）
１４ｋＨｚまでの周波数で回転させながら複数の^１Ｈ ＣＰＭＧスペクトルを得ることを含む、項目３５～４６の何れか１項に記載の方法。
（項目４８）
測定中の前記^１３Ｃ ＣＰの接触時間が約１００μｓ～約１０ｍｓである、項目３５～４７の何れか１項に記載の方法。
（項目４９）
前記測定が、約２０ｋＨｚ～約１００ｋＨｚの^１３ＣでのＲＦスピンロックパルスを含む、項目４８に記載の方法。
（項目５０）
^１Ｈでのランプパルスが一致する、項目４９に記載の方法。
（項目５１）
前記試料中の生体分子の含量を定量することを含む、項目３５～５０の何れか１項に記載の方法。
（項目５２）
前記結晶性生体分子が、非晶質生体分子とは異なる分光学的特徴を示す、項目３５～５１の何れか１項に記載の方法。
（項目５３）
前記結晶性生体分子が、非晶質生体分子よりも高い分子運動性の分光学的特徴を示す、項目３５～５２の何れか１項に記載の方法。
（項目５４）
前記結晶性生体分子がバイ－レフリガント（ｂｉ－ｒｅｆｒｉｎｇａｎｔ）である、項目３５～５３の何れか１項に記載の方法。
（項目５５）
前記結晶性生体分子が回折しない、項目３５～５４の何れか１項に記載の方法。
（項目５６）
前記生体分子が、タンパク質を含むか又は１つ以上のポリペプチド鎖を含む、項目３５～５５の何れか１項に記載の方法。
（項目５７）
前記タンパク質が抗体又はその断片である、項目５６に記載の方法。
（項目５８）
前記試料中の前記生体分子が１つ以上のグリカンを含む、項目３５～５７の何れか１項に記載の方法。

図１は、ｋＳｅｐ（登録商標）及び従来からの遠心分離に対する排出口ｐＨプロファイルのグラフである。 図２は、ｋＳｅｐ（登録商標）装置を用いたタンパク質結晶化工程の流れ図である。 図３は、ｋＳｅｐ（登録商標）Ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｅ－Ｗａｓｈ－Ｈａｒｖｅｓｔ（ＣＷＨ）グラフィカルユーザーインターフェースの像である。 図４は、回収評価のためのｋＳｅｐ（登録商標）系パイプ及び計装図／図面である。 図５は、結晶性（赤）対非晶質（青）材料の^１Ｈ ＮＭＲ ＣＰＭＧスペクトルである。 図６は、定量化の可能性を示す、１００％～０％の結晶性材料の様々な調製の^１Ｈ ＮＭＲ ＣＰＭＧスペクトルである。調製物Ａ、Ｂ及びＣが含有する結晶量は減少している。「５％非晶質」は、５％非晶質材料とともに結晶を含有する調製物であり、「５％結晶」は、５％結晶とともに非晶質材料を含有する調製物である。 図７は、^１Ｈ ＮＭＲ ＣＰＭＧスペクトル対温度であり、ピークの強度が、運動性上昇を示す温度とともに上昇することが示される。

結晶性生体分子を対象とする方法が本明細書中で開示される。結晶性生体分子を含む組成物を調製するための方法が提供される。代表的な実施形態において、本方法は、注入口及び排出口を含む回転チャンバーにおいて結晶性生体分子の流動床を形成させることを含み、この流動床は、そのチャンバーにおいて遠心力（Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}）を生成させるために実質的に水平な軸周辺でチャンバーを回転させ、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向と逆方向に、及びＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を相殺する力（Ｆ_ＦＲ１）を有する第１の流速（ＦＲ１）で、注入口を通じて第１の溶液の第１の流れを流動させ、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながらチャンバーから第１の溶液を回収することによって生成される。

代表的な実施形態において、本方法は、緩衝液交換段階、濃縮段階又は緩衝液交換段階及び濃縮段階の両方を含む。各段階のさらなる記載は以下で提供する。

緩衝液交換段階
代表的な実施形態において、本方法は緩衝液交換段階を含み、代表的な態様において、このような段階は、結晶性生体分子の流動床を維持しながら行われる。代表的な態様において、本方法は、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら、第１の溶液の第１の流れを第２の溶液の第２の流れで置き換えることを含む。代表的な態様において、本方法は、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら、第１の溶液の第１の流れを置き換えるために第２の溶液の第２の流れを流動させることを含む。

代表的な態様において、本方法は、第２の流れの力がＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を相殺するように、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向とは逆方向に、及びＦ_ＦＲ１と等しい力（Ｆ）を有するＦＲ１と同等の流速（ＦＲ）で、注入口を通じて第２の流れ又は第２の溶液を流動させ、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながらチャンバーから第２の溶液を回収することを含む。代表的な態様において、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}は、流動床において結晶性生体分子を維持するのに適切である。ある一定の態様において、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}は約５００ｇ～約３０００ｇの範囲である。ある一定の態様において、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}は約７５０ｇ～約１２５０ｇの範囲である。ある一定の態様において、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}はこの段階中、約１０００ｇ（±１００ｇ）である。

第２の溶液の第２の流れの供給体積は、流動床において結晶性生体分子を維持するのに十分である。代表的な態様において、第２の溶液の第２の流れの供給体積は約５０～５００ｍＬである。代表的な態様において、第２の溶液の第２の流れの供給体積は、約１００～３００ｍＬである。代表的な態様において、チャンバーあたりの第１の溶液の体積の数は２以上である。代表的な態様において、ＦＲ１は、流動床において結晶性分子を維持するのに十分である。代表的な態様において、ＦＲ１は約５０ｍＬ／ｍｉｎ～約１５０ｍＬ／ｍｉｎである。代表的な態様において、ＦＲ１は約７０ｍＬ／ｍｉｎ～約１２０ｍＬ／ｍｉｎである。

有利に、本方法は特定のタイプの緩衝液に限定されないが、ただし、緩衝液は結晶性生体分子の完全性に負の影響を与えず、例えば緩衝液は結晶性生体分子のサイズ、形状及び／又は生成物の品質に負の影響を与えないものとする。この点において、第１の溶液及び第２の溶液のそれぞれは、何れかのｐＨを特徴とする緩衝液又は溶液の何れかのタイプであり得る。代表的な態様において、溶液のｐＨは、生理的ｐＨ、例えば６．５～７．５である。代表的な態様において、溶液のｐＨは、少なくとも５、少なくとも５．５、少なくとも６、少なくとも６．５、少なくとも７、少なくとも７．５、少なくとも８、少なくとも８．５、少なくとも９、少なくとも９．５、少なくとも１０又は少なくとも１０．５、ｐＨ１１以下であり得る。代表的な態様において、第１の溶液及び第２の溶液の一方又は両方が、独立に緩衝剤を含む。代表的な態様において、緩衝剤は、リン酸緩衝液（例えばＰＢＳ）、トリエタノールアミン、Ｔｒｉｓ、ビシン、ＴＡＰＳ、トリシン、ＨＥＰＥＳ、ＴＥＳ、ＭＯＰＳ、ＰＩＰＥＳ、カコジル酸、ＭＥＳ、酢酸、クエン酸、コハク酸、ヒスチジン又は他の薬学的に許容可能な緩衝液からなる群から選択される。

代表的な態様において、第１の溶液は高浸透圧性タンパク質結晶化緩衝液である。代表的な態様において、第２の溶液は、哺乳動物、例えばヒトへの投与に安全である処方緩衝液である。代表的な態様において、第２の溶液は、生理的ｐＨを有し、無菌である。

濃縮段階
さらなる又は代替的な実施形態において、本方法は、チャンバーの領域内で結晶化生体分子を濃縮することを含む。代表的な態様において、本方法は、例えば本明細書中に記載の段階の何れかなど、緩衝液交換段階後に結晶化生体分子を濃縮することを含む。代表的な態様において、濃縮段階は、（ｉ）ＦＲ１をＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}よりも弱い力（Ｆ_ＦＲ２）を有する第２の流速（ＦＲ２）に変化させるか、又は（ｉｉ）Ｆ_ＦＲ１よりも高いレベルにＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を上昇させるためにチャンバーの回転速度を上昇させるか又は（ｉｉｉ）（ｉ）及び（ｉｉ）の両方を行うかの何れかによって行い得る。代表的な態様において、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}は少なくともこの段階中、１０００ｇである。代表的な態様において、第２の溶液の第２の流れの供給体積は約１００～５００ｍＬである。代表的な態様において、第２の溶液の第２の流れの供給体積は約１５０ｍＬ～約３５０ｍＬ、例えば約１５０ｍＬ、約２００ｍＬ、約２５０ｍＬ、約３００ｍＬ又は約３５０ｍＬである。代表的な態様において、チャンバーあたりの第１の溶液の体積の数は１である。代表的な態様において、ＦＲ２は約１０ｍＬ／ｍｉｎ～約５０ｍＬ／ｍｉｎである。代表的な態様において、ＦＲ２は約６０ｍＬ／ｍｉｎ未満である。代表的な態様において、ＦＲ２は約１０ｍＬ／ｍｉｎ～約５０ｍＬ／ｍｉｎである。代表的な態様において、ＦＲ２は約２０ｍＬ／ｍｉｎ～約４０ｍＬ／ｍｉｎである。代表的な態様において、ＦＲ２は約２０ｍＬ／ｍｉｎ、約２５ｍＬ／ｍｉｎ、約３０ｍＬ／ｍｉｎ、約３５ｍＬ／ｍｉｎ又は約４０ｍＬ／ｍｉｎである。

代表的な態様において、濃縮段階後、結晶性生体分子の濃度は少なくとも２倍、少なくとも３倍又は少なくとも４倍上昇する。

回収段階
代表的な態様において、本方法は、結晶性生体分子をチャンバーから除去することを含む。代表的な態様において、本方法は、チャンバーの領域内で結晶性生体分子を濃縮した後に結晶性生体分子をチャンバーから除去することを含む。代表的な態様において、本方法は、充填結晶懸濁液を破壊することなく、及び／又は充填結晶懸濁液内で空洞形成を生じさせることなく、結晶性生体分子の濃縮懸濁液をチャンバーからゆっくりと除去することを含む。充填結晶懸濁液内での空洞形成は、濃度プロファイルを破壊し、濃縮結晶懸濁液を横切る非均一濃度勾配を生じさせるので、望ましくない。

代表的な態様において、本方法は、チャンバーから結晶性生体分子を除去するためにＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向と平行である方向に排出口を通じてチャンバーに第２の流れを流動させることを含む。

代表的な態様において、本方法は、約５ｇ～約２０ｇのレベルに、又は約５ｇ～約１５ｇのレベルにＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を低下させることを含む。代表的な態様において、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を約１０ｇ未満、例えば約８ｇに低下させる。

代表的な態様において、第１のポンプによってＦＲ１を調節し、緩衝液交換及び／又は濃縮段階後に第１のポンプを約１０ｍＬ／ｍｉｎ～約１００ｍＬ／ｍｉｎに設定する。代表的な態様において、ＦＲ１を第１のポンプによって調節し、第１のポンプを約７５ｍＬ／ｍｉｎ未満に設定する。代表的な態様において、第１のポンプによってＦＲ１を調節し、緩衝液交換及び／又は濃縮段階後に第１のポンプを約１５ｍＬ／ｍｉｎ～約６５ｍＬ／ｍｉｎに設定する。代表的な態様において、第１のポンプを約４５ｍＬ／ｍｉｎ～約６５ｍＬ／ｍｉｎ、任意選択により約５０ｍＬ／ｍｉｎに設定する。

代表的な態様において、回転チャンバーをチャンバー蠕動ポンプに接続する。代表的な例において、チャンバー蠕動ポンプは、第１のポンプ及びＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}と同じ方向に送り込む。特定の理論に縛られるものではないが、第１のポンプは、チャンバーから材料を吸引する「引く」機構として作用し、一方でチャンバー蠕動ポンプは、生体分子の空洞形成がないことを確実にするための「押す」機構として作用する。代表的な態様において、緩衝液交換及び／又は濃縮段階後にチャンバー蠕動ポンプを約５０ｍＬ／ｍｉｎ～約１５０ｍＬ／ｍｉｎに設定する。代表的な態様において、チャンバー蠕動ポンプを１００ｍＬ／ｍｉｎ未満に設定する。いくつかの実施形態において、チャンバー蠕動ポンプを約６０ｍＬ／ｍｉｎ～約９０ｍＬ／ｍｉｎに設定する。代表的な例において、チャンバー蠕動ポンプを約７５ｍＬ／ｍｉｎに設定し、第１のポンプを約５０ｍＬ／ｍｉｎに設定し、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を１０ｇ未満、任意選択により８ｇに低下させる。

ＣＦＧＣ装置
代表的な態様において、開示される方法は、向流勾配遠心分離（ＣＦＧＣ）系で行われる。代表的な態様において、装置は複数の回転チャンバーを含む。代表的な態様において、装置は、少なくとも２個、少なくとも４個又は少なくとも６個の回転チャンバーを含む。代表的な態様において、装置は、４個又は６個のチャンバーを含む。代表的な実施形態において、本方法は、複数の回転チャンバーを含む装置において行われ、各チャンバーを装置の他のチャンバーとともに同時に操作してもよいし、又はそれのみで操作してもよい。代表的な態様において、開示される方法の段階は複数のチャンバーにおいて行われる。代表的な態様において、開示される方法の段階は、２個、３個又は４個のチャンバー中で行われる。代表的な態様において、開示される方法の段階は、５個又は６個のチャンバー中で行われる。代表的な態様において、開示される方法の段階は、約６個を超える、約１０個を超える、約２０個を超えるチャンバー中で行われる。

代表的な態様において、装置はｋＳｅｐ（登録商標）システムである。代表的な態様において、装置はｋＳｅｐ（登録商標）４００であり、これは４個の個別のチャンバーを有し、チャンバーはそれぞれ限度容量が１００ｍＬである。代表的な態様において、装置はｋＳｅｐ（登録商標）６０００Ｓであり、これは６個の個別のチャンバーを有し、チャンバーはそれぞれ限度容量が１０００ｍＬである。ｋＳｅｐ（登録商標）６０００Ｓの最大流速は７２０Ｌ／ｈｒである。

代表的な態様において、開示される方法が本装置の複数のチャンバー中で行われる場合、一度に１個ずつチャンバーから結晶性生体分子が除去される。例えば結晶性生体分子が逐次的に各チャンバーから除去される。このように、この装置の１個のチャンバーからの結晶性生体分子の除去は、結晶性生体分子がこの装置の別のチャンバーから除去されるときとは別の時間に行われる。特定の理論に縛られるものではないが、一度に１個のチャンバーから結晶性生体分子を除去することによって、結晶性生体分子の空洞形成の機会が減少すると考えられる。

代表的な実施形態
代表的な態様において、結晶性生体分子を含む組成物を調製する方法は、（ａ）注入口及び排出口を含む回転チャンバーにおいて結晶性生体分子の流動床を形成させ、このチャンバー中で遠心力（Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}）を生じさせるために実質的に水平な軸の周囲でチャンバーを回転させ、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向とは逆の方向に、及びＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を相殺する力（Ｆ_ＦＲ１）を有する第１の流速（ＦＲ１）で、注入口を通じて第１の溶液の第１の流れを流動させ、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら、チャンバーから第１の溶液を回収することによってこの流動床が生成されること、（ｂ）段階（ｉ）、段階（ｉｉ）又は段階（ｉｉｉ）を行い、段階（ｉ）が、結晶化生体分子の流動床の形成を実質的に維持しながら第１の溶液の第１の流れを置き換えるために第２の溶液の第２の流れを流動させることであり、段階（ｉｉ）が、Ｆ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}未満である力（Ｆ_ＦＲ２）を有する第２の流速（ＦＲ２）にＦＲ１を変化させることによって、又はＦ_ＦＲ１より高いレベルにＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}を上昇させるためにチャンバーの回転速度を上昇させることによって、チャンバーの領域内で結晶化生体分子を濃縮することであり、段階（ｉｉｉ）は、段階（ｉ）及び段階（ｉｉ）の組み合わせであること、及び（ｃ）結晶性生体分子をチャンバーから除去することを含む。代表的な態様において、チャンバーから結晶性生体分子を除去するためにＦ_{ｃｅｎｔｒｉｆｕｇａｌ}の方向と平行である方向に排出口を通じてチャンバーに第２の流れを流動させることによって結晶性生体分子をチャンバーから除去する。

さらなる段階
本明細書中で開示される方法は、さらなる段階を含み得る。例えば、本方法は、組み換えタンパク質を産生し、精製し、処方することに関与する１つ以上の上流段階又は下流段階を含み得る。代表的な実施形態において、本方法は、組み換えタンパク質（例えば組み換え抗体）を発現する宿主細胞を作製するための段階を含む。宿主細胞は、原核宿主細胞、例えばＥ．コリ（Ｅ．ｃｏｌｉ）又はバチルス・サブチリス（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ）であり得るか、又は宿主細胞は、真核、例えば酵母細胞、糸状菌細胞、原生動物細胞、昆虫細胞又は哺乳動物細胞（例えばＣＨＯ細胞）であり得る。このような宿主細胞は当技術分野で記載されている。例えばＦｒｅｎｚｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｆｒｏｎｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ ４：２１７（２０１３）を参照。例えば、本方法は、一部の例において、組み換えタンパク質又はそのポリペプチド鎖をコードするヌクレオチド配列を含む核酸を含むベクターを宿主細胞に導入することを含む。

代表的な実施形態において、本方法は、組み換えタンパク質（例えば組み換え抗体）を発現する宿主細胞を培養するための段階を含む。このような段階は当技術分野で公知である。例えばＬｉ ｅｔ ａｌ．，ＭＡｂｓ ２（５）：４６６－４７７（２０１０）を参照。

代表的な実施形態において、本方法は、培養物から組み換えタンパク質（例えば組み換え抗体）を精製するための段階を含む。代表的な態様において、本方法は、１つ以上のクロマトグラフィー段階、例えばアフィニティークロマトグラフィー（例えばプロテインＡアフィニティークロマトグラフィー）、イオン交換クロマトグラフィー及び／又は疎水性相互作用クロマトグラフィーを含む。代表的な態様において、本方法は、組み換えタンパク質を含む溶液から結晶性生体分子を生成させるための段階を含む。代表的な態様において、本方法は、その全体において参照により組み込まれる国際公開第２０１６０１０９２７号パンフレット、題名「ＣＲＹＳＴＡＬＬＩＮＥ ＡＮＴＩＢＯＤＹ ＦＯＲＭＵＬＡＴＩＯＮＳ」に記載のものを含め、結晶性物質を調製するための段階を含む。本方法は、いくつかの態様において、溶液状態又は結晶化に影響を与える要因、例えば溶媒、有機溶媒又は添加物の蒸発速度、適切な共溶質及び緩衝液の存在、ｐＨ及び温度を調節することを含み得る。タンパク質の結晶化に影響を与える様々な要因の包括的な概説は、ＭｃＰｈｅｒｓｏｎ（１９８５，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ １１４：１１２－１２０）により公開されている。指針として、結晶化されているポリペプチドの包括的なリストを含むＭｃＰｈｅｒｓｏｎ及びＧｉｌｌｉｌａｎｄ（１９８８，Ｊ Ｃｒｙｓｔａｌ Ｇｒｏｗｔｈ，９０：５１－５９）の教示ならびにそれらが結晶化された条件が利用可能である。さらに、結晶及び結晶化レシピの一覧ならびに溶解タンパク質構造の座標のリポジトリは、Ｂｒｏｏｋｈａｖｅｎ Ｎａｔｉｏｎａｌ ＬａｂｏｒａｔｏｒｙのＰｒｏｔｅｉｎ
Ｄａｔａ Ｂａｎｋ（ｗｗｗ．ｒｃｓｂ．ｏｒｇ／ｐｄｂ／；Ｂｅｒｎｓｔｅｉｎ ｅｔ ａｌ．，１９７７，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ １１２：５３５－５４２）により維持されている。一般に、適切な水性溶媒又は塩もしくは有機溶媒もしくは添加物などの適切な結晶化剤を含有する水性溶媒（まとめて「結晶化試薬」と呼ぶ）と結晶化させようとするポリペプチド（すなわち抗体）を組み合わせることにより結晶を生成させる。溶媒をポリペプチドと合わせ、結晶化の誘導に適切であり、ポリペプチド活性及び安定性の維持にとって許容可能であることが実験的に決定された温度で撹拌し得る。結晶化のための実験室規模の方法としては、ハンギングドロップ蒸気拡散、シッティングドロップ蒸気拡散、微小透析、マイクロバッチ、オイル下（ｕｎｄｅｒ ｏｉｌ）、ゲル中（ｉｎ ｇｅｌ）及びサンドイッチドロップ法が挙げられる。溶媒は、任意選択により、共結晶化添加物、例えば沈殿剤、脂肪酸、還元剤、グリセロール、スルホベタイン、界面活性物質、ポリオール、二価陽イオン、補助因子又はカオトロープ及びアミノ酸ならびにｐＨを調節するための緩衝物種が挙げられ得る。「共結晶化添加物」としては、ポリペプチドの結晶化を促進する化合物及び／又はタンパク質を安定化させ、変性から保護する化合物が挙げられる。共溶質の例としては、酢酸アンモニウム、塩化アンモニウム、フッ化アンモニウム、ギ酸アンモニウム、硝酸アンモニウム、リン酸アンモニウム、硫酸アンモニウム、塩化カドミウム、硫酸カドミウム、酢酸カルシウム、塩化カルシウム、塩化セシウム、塩化コバルト、ＣＨ_３（ＣＨ_２）_１５Ｎ（ＣＨ_３）_３Ｂｒ．－（ＣＴＡＢ）、クエン酸二アンモニウム、リン酸水素二アンモニウム、リン酸二アンモニウム、酒石酸二アンモニウム、リン酸二カリウム、リン酸二ナトリウム、酒石酸二ナトリウム、ＤＬ－リンゴ酸、塩化第二鉄、Ｌ－プロリン、酢酸リチウム、塩化リチウム、硝酸リチウム、硫酸リチウム、酢酸マグネシウム、塩化マグネシウム、ギ酸マグネシウム、硝酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ニッケル、酢酸カリウム、臭化カリウム、塩化カリウム、クエン酸カリウム、フッ化カリウム、ギ酸カリウム、硝酸カリウム、リン酸カリウム、酒石酸カリウムナトリウム、硫酸カリウム、チオシアン酸カリウム、酢酸ナトリウム、臭化ナトリウム、塩化ナトリウム、クエン酸ナトリウム、フッ化ナトリウム、ギ酸ナトリウム、マロン酸ナトリウム、硝酸ナトリウム、リン酸ナトリウム、硫酸ナトリウム、チオシアン酸ナトリウム、コハク酸、タクシメート（ｔａｃｓｉｍａｔｅ）、クエン酸三アンモニウム、クエン酸三リチウム、トリメチルアミンＮ－オキシド、クエン酸三カリウム、クエン酸三ナトリウム、酢酸亜鉛、硫酸亜鉛及び共溶質を供給するように機能する他の化合物が挙げられる。「結晶化」は、ポリペプチドの結晶化を促進するために所望の範囲で溶液のｐＨを維持する化合物を含む。例としては、ＡＣＥＳ（Ｎ－（２－アセトアミド）－２－アミノエタンスルホン酸）、ＢＥＳ（Ｎ，Ｎ－ビス（２－ヒドロキシエチル）－２－アミノエタンスルホン酸）、ビシン（Ｎ，Ｎ－ビス（２－ヒドロキシエチル）グリシン）、ビス－ＴＲＩＳ（２，２－ビス－（ヒドロキシメチル）－２，２’，２’’－ニトリロトリエタノール）、ホウ酸、ＣＡＰＳ（３－［シクロヘキシルアミノ］－１－プロパンスルホン酸）、クエン酸、ＥＰＰＳ（ＨＥＰＰＳ、４－（２－ヒドロキシエチル）ピペラジン－１－プロパンスルホン酸）、Ｇｌｙ－Ｇｌｙ（ＮＨ．ｓｕｂ．２ＣＨ．ｓｕｂ．２ＣＯＮＨＣＨ．ｓｕｂ．２ＣＯＯＨ、グリシル－グリシン）、ＨＥＰＥＳ（４－（２－ヒドロキシエチル）ピペラジン－１－エタンスルホン酸）、イミダゾール、ＭＥＳ（２－モルホリノエタンスルホン酸）、ＭＯＰＳ（３－（Ｎ－モルホリノ）－プロパンスルホン酸）、ＰＩＰＥＳ（ピペラジン－１，４－ビス（２－エタンスルホン酸））、塩化カリウム、酢酸ナトリウム、重炭酸ナトリウム、リン酸一ナトリウム（リン酸二水素ナトリウム）、二塩基性リン酸ナトリウム、ＴＡＰＳ（Ｎ－［ｔｒｉｓ－（ヒドロキシメチル）メチル］－３－アミノプロパンスルホン酸）、ＴＡＰＳＯ（Ｎ－［ｔｒｉｓ（ヒドロキシメチル）メチル］－３－アミノ－２－ヒドロキシプロパンスルホン酸）、ＴＥＳ（Ｎ－［ｔｒｉｓ（ヒドロキシメチル）メチル］－２－アミノエタンスルホン酸）、トリシン（Ｎ－［ｔｒｉｓ（ヒドロキシメチル）メチル］グリシン）、Ｔｒｉｓ－ＨＣｌ、ＴＲＩＺＭＡ（２－アミノ－２－（ヒドロキシメチル）－１，３－プロパンジオール）及び溶液を指定のｐＨ又はその付近に維持するように機能する他の化合物が挙げられる。

沈殿剤の選択は、結晶化に影響を与える１つの要因である。例えばＰＥＧ製品、例えば分子量２００～２０，０００ｋＤのものを使用し得る。ＰＥＧ３３５０は、体積排除効果により働く長いポリマー沈殿剤又は脱水剤である。リオトロピック塩、例えば硫酸アンモニウムなどは、カプリル酸などの短鎖脂肪酸と同じように、沈殿工程を促進する。多イオン種も有用な沈殿剤である。

皮下注射のための処方物中での使用のための抗体は、例えば、好ましくは生理的ｐＨ範囲で、及び等張性の浸透圧をもたらす結晶化試薬中で沈殿させる。結晶化を促進するために、添加物、共溶質、緩衝液など及びそれらの濃縮物が必要であることは実験的に決定される。

工業規模の工程において、結晶化につながる沈殿の調節は、ポリペプチド、沈殿剤、共溶質及び任意選択によりバッチ工程における緩衝液の単純な組み合わせにより最良に行われ得る。別の選択肢として、出発材料（「シード」）としてポリペプチド沈殿を使用することによって、ポリペプチドを結晶化し得る。この場合、ポリペプチド沈殿物を結晶化溶液に添加し、結晶が形成されるまで温置する。

透析又は蒸気拡散などの代替的な実験室での結晶化法も適応させ得る。ＭｃＰｈｅｒｓｏｎ、上出及びＧｉｌｌｉｌａｎｄ、上出は、結晶化文献の概説において適切な条件の包括的リストを含む。時折、結晶化ポリペプチドが架橋されるべき場合、意図する架橋剤と結晶化媒体との間の不適合により、結晶をより適切な溶媒系に交換することが必要になり得る。

いくつかの実施形態によれば、次の工程によってポリペプチド結晶、結晶処方物及び組成物を調製する：最初に、ポリペプチドを結晶化する。次に、本明細書中で記載のような賦形剤又は成分を母液に直接添加する。あるいは、母液を除去した後、最短で１時間～最長２４時間にわたり、賦形剤又は他の処方成分の溶液中で結晶を懸濁する。賦形剤濃度は、一般的には約０．０１～３０％ｗ／ｗであり、それぞれ９９．９９～７０％ｗ／ｗのポリペプチド結晶濃度に対応する。一実施形態において、賦形剤濃度は、約０．１～１０％であり、それぞれ９９．９～９０％ｗ／ｗの結晶濃度に対応する。母液は、ろ過、緩衝液交換によるか、又は遠心分離によるかの何れかにより、結晶スラリーから除去し得る。

続いて、室温又は－２０℃～２５℃の温度の何れかで、ビヒクルが結晶を溶解させない限りあらゆる等張性の注射可能ビヒクルで、任意選択により例えばエタノール、メタノール、イソプロパノール又は酢酸エチル又はポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などの１つ以上の有機溶媒又は添加物の５０～１００％の溶液で結晶を洗浄する。さらに、結晶を洗浄するために水を使用し得る。結晶は、窒素、空気又は不活性ガスの気流を結晶上に通過させることの何れかによって乾燥させる。最終的に、必要に応じて結晶の微粒子化を行い得る。ポリペプチド結晶の乾燥は、Ｎ_２、空気又は不活性ガスでの乾燥；真空オーブン乾燥；凍結乾燥；揮発性有機溶媒もしくは添加物での洗浄とそれに続く溶媒の蒸発；又はドラフト中での蒸発を含む手段による、水、有機溶媒又は添加物又は液体ポリマーの除去である。一般的には、結晶が自由流動性粉末になるときに乾燥が達成される。湿潤結晶上にガス流を通過させることによって乾燥を行い得る。ガスは、窒素、アルゴン、ヘリウム、二酸化炭素、空気又はそれらの組み合わせからなる群から選択され得る。達成される粒子の直径は、０．１～１００マイクロメーターの範囲又は０．２～１０マイクロメーターの範囲又は１０～５０マイクロメーターの範囲又は０．５～２マイクロメーターの範囲であり得る。吸入により投与しようとする処方物に対して、一実施形態において、ポリペプチド結晶から形成される粒子は０．５～１マイクロメーターの範囲である。

いくつかの実施形態によれば、タンパク質結晶を調製する場合、タンパク質結晶処方物又は組成物、エンハンサー、例えば界面活性物質などを結晶化中に添加しない。いくつかの他の実施形態によれば、タンパク質結晶を調製する場合、タンパク質結晶処方物又は組成物、エンハンサー、例えば界面活性物質などを結晶化中に添加する。結晶化後、約１～１０％ｗ／ｗの濃度、あるいは約０．１～２５％ｗ／ｗの濃度、あるいは約０．１～５０％ｗ／ｗの濃度で、賦形剤又は成分を母液に添加する。これらの濃度は、それぞれ９９～９０％ｗ／ｗ、９９．９～７５％ｗ／ｗ及び９９．９～５０％ｗ／ｗの結晶濃度に対応する。賦形剤又は成分を約０．１～３時間にわたり母液中で結晶とともに温置するか、あるいは０．１～１２時間にわたり温置を行うか、あるいは０．１～２４時間にわたり温置を行う。

いくつか又は何れかの実施形態において、成分又は賦形剤を母液以外の溶液中で溶解させ、タンパク質結晶を母液から取り出し、賦形剤又は成分溶液中で懸濁する。いくつかの実施形態において、賦形剤又は成分溶液（又は懸濁ビヒクル）は、等張性であり、注射可能である賦形剤又は成分又は界面活性物質の混合物である。いくつかの実施形態において、賦形剤又は成分溶液（又は再懸濁ビヒクル）は、等張性であり、注射可能である賦形剤又は成分又は界面活性物質の混合物ではない。成分又は賦形剤濃度及び温置時間は、上記のものと同じである。

代表的な実施形態において、本方法は、精製生体分子（例えば抗体）を処方するための段階を含む。代表的な段階は、Ｆｏｒｍｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｒｏｃｅｓｓ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ ｆｏｒ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ，ｅｄｓ．Ｊａｍｅｅｌ ａｎｄ Ｈｅｒｓｈｅｎｓｏｎ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．（Ｈｏｂｏｋｅｎ，ＮＪ），２０１０に記載される。

代表的な実施形態において、本方法は、生体分子の結晶性形態と非晶質形態とについて試料を分析することを含む。代表的な態様において、本方法は、試料の定量分析を含む。

生体分子
本明細書中で使用される場合、「生体分子」又は「生物学的分子」という用語は、生きている生物中に存在するか、又は生きている生物により産生されるかもしくは代謝され得るか、又は生きている生物中に存在するか、それらにより産生されるかもしくは代謝され得る分子に構造的に基づく大きな巨大分子を指す。生体分子としては、ポリペプチド、タンパク質、多糖類、脂質（例えば糖脂質、リン脂質、ステロール）及びポリヌクレオチド又は核酸（例えばＤＮＡ又はＲＮＡ）であることが挙げられるが限定されない。

本明細書中で開示される方法は、生体分子が結晶形態を想定し得る限り、何らかの特定のタイプの生体分子に限定されない。代表的な態様において、結晶性生体分子は、１つ以上のポリペプチド鎖を含むタンパク質である。代表的な態様において、結晶性タンパク質は、ホルモン、増殖因子、サイトカイン、細胞表面受容体又は何らかの他の天然もしくは非天然リガンドであり、これらは細胞表面受容体（例えば上皮増殖因子受容体（ＥＧＦＲ）、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）、Ｂ細胞受容体（ＢＣＲ）、ＣＤ２８、血小板由来増殖因子受容体（ＰＤＧＦ）、ニコチン性アセチルコリン受容体（ｎＡＣｈＲ）など）に結合する。

代表的な例において、生体分子は、抗体もしくは免疫グロブリン又はそれらの断片、例えば抗原結合抗体断片である。本明細書中で使用される場合、「抗体」という用語は、重及び軽鎖を含む、及び可変及び定常領域を含む、従来の免疫グロブリン形式を有するタンパク質を指す。例えば、抗体は、ポリペプチド鎖の２つの同一のペアの「Ｙ型」構造であるＩｇＧであり得、各ペアは、１本の「軽」（一般的には分子量が約２５ｋＤａ）及び１本の「重」鎖（一般的には分子量が約５０～７０ｋＤａ）を有する。抗体は可変領域及び定常領域を有する。ＩｇＧ形式で、可変領域は一般に約１００～１１０以上のアミノ酸であり、３個の相補性決定領域（ＣＤＲ）を含み、抗原認識に主に関与し、異なる抗原に結合する他の抗体間で実質的に変動する。定常領域は、抗体に免疫系の細胞及び分子を動員させる。可変領域は各軽鎖及び重鎖のＮ末端領域から構成され、一方で定常領域は重鎖及び軽鎖のそれぞれのＣ末端部分から構成される。（Ｊａｎｅｗａｙ ｅｔ ａｌ．，”Ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ｔｈｅ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｍｏｌｅｃｕｌｅ ａｎｄ ｔｈｅ Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ Ｇｅｎｅｓ”，Ｉｍｍｕｎｏｂｉｏｌｏｇｙ：Ｔｈｅ Ｉｍｍｕｎｅ Ｓｙｓｔｅｍ ｉｎ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｄｉｓｅａｓｅ，４^ｔｈ ｅｄ．Ｅｌｓｅｖｉｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｌｔｄ．／Ｇａｒｌａｎｄ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，（１９９９））。

抗体のＣＤＲの一般的な構造及び特性は当技術分野で記載されている。簡潔に述べると、抗体骨格において、ＣＤＲは、重及び軽鎖可変領域におけるフレームワーク内に埋め込まれ、それらは抗原結合及び認識に大きく関与する領域を構成する。可変領域は典型的に、フレームワーク領域内（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，１９９１によりフレームワーク領域１－４、ＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３及びＦＲ４と呼ばれる；Ｃｈｏｔｈｉａ ａｎｄ Ｌｅｓｋ，１９８７，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１－９１７も参照）に、少なくとも３個の重鎖又は軽鎖ＣＤＲ（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，１９９１，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ Ｎ．Ｉ．Ｈ．，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．；Ｃｈｏｔｈｉａ ａｎｄ Ｌｅｓｋ，１９８７，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．１９６：９０１－９１７；Ｃｈｏｔｈｉａ ｅｔ ａｌ．，１９８９，Ｎａｔｕｒｅ ３４２：８７７－８８３も参照）を含む。

抗体は、当技術分野で公知の何らかの定常領域を含み得る。ヒト軽鎖はカッパ及びラムダ軽鎖として分類される。重鎖は、ミュー、デルタ、ガンマ、アルファ又はイプシロンとして分類され、それぞれＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＧ、ＩｇＡ及びＩｇＥとして抗体のアイソタイプを定める。ＩｇＧは、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３及びＩｇＧ４を含むが限定されないいくつかのサブクラスを有する。ＩｇＭは、ＩｇＭ１及びＩｇＭ２を含むが限定されないサブクラスを有する。本発明の実施形態は、抗体の全てのこのようなクラス又はアイソタイプを含む。軽鎖定常領域は、例えばカッパ又はラムダ型軽鎖定常領域、例えばヒトカッパ又はラムダ型軽鎖定常領域であり得る。重鎖定常領域は、例えばアルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ又はミュー型重鎖定常領域、例えばヒトアルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ又はミュー型重鎖定常領域であり得る。したがって、代表的な実施形態において、本抗体は、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３又はＩｇＧ４の何れか１つを含む、アイソタイプＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ又はＩｇＭの抗体である。

本抗体は、モノクローナル抗体又はポリクローナル抗体であり得る。いくつかの実施形態において、本抗体は、哺乳動物、例えば、マウス、ウサギ、ヤギ、ウマ、ニワトリ、ハムスター、ヒトなどにより産生される天然抗体と実質的に同様である配列を含む。この点において、本抗体は、哺乳動物抗体、例えばマウス抗体、ウサギ抗体、ヤギ抗体、ウマ抗体、ニワトリ抗体、ハムスター抗体、ヒト抗体などとみなされ得る。ある一定の態様において、本組み換えタンパク質はヒト抗体である。ある一定の態様において、生体分子は、ヒト抗体などの抗体である。ある一定の態様において、生体分子は、キメラ抗体又はヒト化抗体である。「キメラ抗体」という用語は、２つ以上の異なる抗体からのドメインを含有する抗体を指す。キメラ抗体は、例えば１種由来の定常ドメイン及び第２の種由来の可変ドメインを含有し得、又はより一般的には、少なくとも２種由来のアミノ酸配列の一続きを含有し得る。キメラ抗体は、同じ種内の２つ以上の異なる抗体のドメインも含有し得る。「ヒト化」という用語は、抗体に関して使用される場合、元の起源の抗体よりも真のヒト抗体と類似している構造及び免疫学的機能を有するように操作されている非ヒト起源由来の少なくともＣＤＲ領域を有する抗体を指す。例えば、ヒト化は、非ヒト抗体、例えばマウス抗体など由来のＣＤＲをヒト抗体に移植することを含み得る。ヒト化は、非ヒト配列をヒト配列に類似するようにするためのアミノ酸置換の選択も含み得る。

例えばパパイン及びペプシンなどの酵素によって、抗体が断片に切断され得る。パパインは、抗体を切断して２個のＦａｂ断片及び１個のＦｃ断片を生成させる。ペプシンは、抗体を切断してＦ（ａｂ’）_２断片及びｐＦｃ’断片を生成させる。代表的な態様において、生体分子は、少なくとも１個のグリコシル化部位を保持する抗体断片、例えばＦａｂ、Ｆｃ、Ｆ（ａｂ’）_２又はｐＦｃ’であってもよい。

少なくとも約１２～１５０ｋＤａの分子量範囲及び単量体（ｎ＝１）から二量体（ｎ＝２）及び三量体（ｎ＝３）から四量体（ｎ＝４）及びより高い可能性がある結合価（ｎ）範囲に広がる代替的な抗体形式の範囲拡大を生じさせるために抗体の構造が利用されており；このような代替的な抗体形式は、本明細書中で「抗体タンパク質生成物」と呼ばれる。

抗体タンパク質生成物としては、完全な抗原結合能を保持する、抗体断片に基づくもの、例えばｓｃＦｖ、Ｆａｂ及びＶＨＨ／ＶＨが挙げられる（以下に記載）。その完全な抗原結合部位を保持する最小の抗原結合断片はＦｖ断片（断片、抗原結合）であり、これは完全に可変（Ｖ）領域からなる。分子の安定性のためにｓｃＦｖ（１本鎖断片可変）断片にＶ領域を連結するために、可溶性の柔軟性のあるアミノ酸ペプチドリンカーを使用するか、又は定常（Ｃ）ドメインをＶ領域に付加してＦａｂ断片を生成させる。ｓｃＦｖ及びＦａｂの両方は、宿主細胞、例えば、原核宿主細胞において容易に作製され得る広く使用される断片である。他の抗体タンパク質生成物としては、オリゴマー化ドメインに連結されるｓｃＦｖからなる異なる形式を含むジア、トリア及びテトラボディ又はミニボディ（ミニＡｂｓ）のようなジスルフィド結合で安定化されるｓｃＦｖ（ｄｓ－ｓｃＦｖ）、１本鎖Ｆａｂ（ｓｃＦａｂ）ならびに二量体及び多量体抗体形式が挙げられる。最小断片は、ラクダ科動物重鎖Ａｂならびに単ドメインＡｂ（ｓｄＡｂ）のＶＨＨ／ＶＨである。新規抗体形式を作製するために最も頻繁に使用される基本単位は１本鎖可変（Ｖ）ドメイン抗体断片（ｓｃＦｖ）であり、これは、～１５アミノ酸残基のペプチドリンカーにより連結される重及び軽鎖由来のＶドメイン（ＶＨ及びＶＬドメイン）を含む。ペプチボディ又はペプチド－Ｆｃ融合は、また別の抗体タンパク質生成物である。ペプチボディの構造は、Ｆｃドメイン上に移植された生物学的に活性のあるペプチドからなる。ペプチボディは、当技術分野で詳細に記載されている。例えばＳｈｉｍａｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．，ｍＡｂｓ ４（５）：５８６－５９１（２０１２）を参照。

他の抗体タンパク質生成物としては、１本鎖抗体（ＳＣＡ）；ダイアボディ；トリアボディ；テトラボディ；二重特異性又は三重特異性抗体などが挙げられる。二重特異性抗体は、５つの主要なクラス：ＢｓＩｇＧ、付加ＩｇＧ、ＢｓＡｂ断片、二重特異性融合タンパク質及びＢｓＡｂコンジュゲートに分けられ得る。例えばＳｐｉｅｓｓ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ６７（２）Ｐａｒｔ Ａ：９７－１０６（２０１５）を参照。

代表的な態様において、生体分子は、これらの抗体タンパク質生成物の何れか１つを含む。代表的な態様において、生体分子は、ｓｃＦｖ、Ｆａｂ ＶＨＨ／ＶＨ、Ｆｖ断片、ｄｓ－ｓｃＦｖ、ｓｃＦａｂ、二量体抗体、多量体抗体（例えばダイアボディ、トリアボディ、テトラボディ）、ミニＡｂ、ラクダ科動物の重鎖抗体のペプチボディＶＨＨ／ＶＨ、ｓｄＡｂ、ダイアボディ；トリアボディ；テトラボディ；二重特異性又は三重特異性抗体、ＢｓＩｇＧ、付加ＩｇＧ、ＢｓＡｂ断片、二重特異性融合タンパク質及びＢｓＡｂコンジュゲートの何れか１つである。

生体分子は、単量体形態又は多量体、オリゴマー又は多量体形態の抗体タンパク質生成物であり得る。抗体が２つ以上の個別の抗原結合領域断片を含むある一定の実施形態において、抗体は、抗体により認識され、結合される個別のエピトープの数に依存して、二重特異性、三重特異性もしくは多重特異性又は二価、三価もしくは多価とみなされる。

結晶性及び非晶質生体分子を検出する方法
ロバストで安全な処方を確実にするために、様々な処理段階（例えば、バルク材料の規模拡大、処方開発、製造）中に、及び製剤の有効期間を通じて、結晶化度又は乱れの度合いを任意選択で監視する。製剤及び生体系におけるそれらの下流の結果とともに医薬製剤原料の非晶質形態が詳細に記述されている。例えばＳｈａｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｐｈａｒｍ Ｓｃｉ ９５（８）：１６４１（２００６）を参照。非晶質固体は通常、結晶性固体に関連して定義され、一般的には結晶性構造の特徴である長距離並進方向の対称性を欠く。非晶質相は、粒子全体にわたり、又は粒子の表面などの粒子の一部で生じ得る。乱れが小さすぎて容易に検出し得ない場合、固体の非晶質形態の検出は非常に困難であり得る。乱れが十分に大きいと、製品性能に変化が生じ得、例えば圧縮後の硬度、溶解速度の促進、化学的安定性の低下及び保管中の湿気により誘導される再結晶化に影響し得る。Ｓｈａｈ ｅｔ ａｌ．，２００６上出を参照。（結晶性固体に対して）固形物の非晶質形態を検出するための様々な定量技術が存在し、例えば粉末Ｘ線回折Ｘ（ＰＸＲＤ）、示差走査熱量測定（ＤＳＣ）、等温マイクロカロリメトリー（ＩＭＣ）、溶液カロリメトリー（ＳＣ）、赤外分光法（ＩＲＲ、フーリエ変換（ＦＴ）ラマン分光法及び固体ＮＭＲ（ｓｓＮＭＲ）が挙げられる。しかし、それぞれが１つ以上の短所を有する。

結晶性生体分子を含む組成物を調製する方法に加えて、試料中の結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子を検出するための効率的で手軽な方法が本明細書中で提供される。

代表的な実施形態において、試料中の結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子を検出する方法は、試料において高分解能ｓｓＮＭＲ（固相核磁気共鳴）分析を行うことを含む。代表的な実施形態において、本方法は、プロトン脱共役及びマジック角回転（ＭＡＳ）を使用して、高分解能^１３Ｃ ｓｓＮＭＲスペクトルを得ることを含み、交差分極（ＣＰ）によって感度の増強が達成される。代表的な態様において、試料中の結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子を検出する方法は、試料の複数の^１Ｈ Ｃａｒｒ－Ｐｕｒｃｅｌｌ－Ｍｅｉｂｏｏｍ－Ｇｉｌｌ（ＣＰＭＧ）スペクトルを得ること及び試料の^１３Ｃ交差分極（ＣＰ）スペクトルを得ることを含む。代表的な態様において、本方法は、約２５０～約１０００ＭＨｚ（任意選択により約５００ＭＨｚ、約７００ＭＨｚ、約８００ＭＨｚ、約９００ＭＨｚ）の^１Ｈ共振周波数を操作することを含む。代表的な態様において、本方法は、約２５０～３５０Ｋ、例えば約２５０Ｋ、約２７５Ｋ、約３００Ｋ、約３２５Ｋ又は約３５０Ｋで温度を維持することを含む。代表的な態様において、本方法は、マジック角回転（ＭＡＳ）プローブを操作することを含む。代表的な例において、本方法は、少なくとも２つの高周波（ｒｆ）チャネルを含むＭＡＳプローブを操作することを含む。代表的な態様において、ＭＡＳプローブは、^１Ｈ及び^１３Ｃに対して調整される。ある一定の態様において、約２ｋＨｚ～約８ｋＨｚ又は約３ｋＨｚ～約５ｋＨｚ、例えば約４ｋＨｚの回転周波数でＭＡＳプローブが操作される。いくつかの態様において、本方法は、９０度パルス、例えば^１Ｈ９０度パルス約２．５μｓを使用することを含む。いくつかの態様において、約２μｓ～約２０μｓ（例えば、約５μｓ、約１０μｓ、約１５μｓ、約２０μｓ）長の約５～約１００パイパルス（例えば約１０～約９０、約２０～約８０パイパルス）で^１Ｈ ＣＰＭＧスペクトルを得る。例えばパイパルスのそれぞれが５００μｓ離され得、任意選択によりＣＰＭＧパルスの総時間は１０ｍｓである。代表的な態様において、本方法は、５ｋＨｚ以下、８ｋＨｚ超又は約１４ｋＨｚの周波数で回転しながら複数の^１Ｈ ＣＰＭＧスペクトルを得ることを含む。いくつかの態様において、測定中の^１３Ｃ ＣＰの接触時間は、約１００μｓ～約１０ｍｓ、例えば約２５０μｓ、約５００μｓ、約７５０μｓ、約１ｍｓ、約２ｍｓ、約３ｍｓ、約４ｍｓ、約５ｍｓ、約６ｍｓ、約７ｍｓ、約８ｍｓ、約９ｍｓ、約１０ｍｓ）である。代表的な態様において、測定は、約２０ｋＨｚ～約１００ｋＨｚ、例えば約５０ｋＨｚの^１３ＣでのＲＦスピンロックパルスを含んだ。代表的な態様において、^１Ｈでのランプパルスを一致させる。

いくつかの態様における代表的な実施形態において検出する方法は、試料中の結晶性生体分子の含量を定量することを含む。代表的な例において、結晶性生体分子は、非晶質生体分子とは異なる分光学的特徴を呈する。代表的な例において、結晶性生体分子は、非晶質生体分子よりも高い分子運動性の分光学的特徴を呈する。

したがって、試料中の結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子の含量を定量する方法が本明細書中で提供される。代表的な態様において、本方法は、（Ａ）試料の複数の^１Ｈ
ＮＭＲ Ｃａｒｒ－Ｐｕｒｃｅｌｌ－Ｍｅｉｂｏｏｍ－Ｇｉｌｌ（ＣＰＭＧ）スペクトルを得ること及び（Ｂ）試料の^１３Ｃ ＮＭＲ交差分極（ＣＰ）スペクトルを得ることを含む。試料中の結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子を検出する方法を参照する教示に従い、本明細書中で開示される含量を定量する方法が行われ得る。

検出又は定量の方法の代表的な態様において、結晶性生体分子はバイ－レフリンガント（ｂｉ－ｒｅｆｒｉｎｇａｎｔ）であり、任意選択により回折しない。代表的な態様において、結晶性生体分子は約１Å～約２Åで、回折しないか又は回折しにくい。本明細書中に記載の検出方法に関しては、生体分子は、例えばポリペプチド、タンパク質、多糖類、脂質（例えば糖脂質、リン脂質、ステロール）、ポリヌクレオチド又は核酸（例えばＤＮＡ又はＲＮＡ）を含む本明細書中に記載の何れかの生体分子であり得る。代表的な実施形態において、生体分子は、１つ以上のポリペプチド鎖を含むタンパク質である。代表的な例において、生体分子は、抗体もしくは免疫グロブリン又はそれらの抗原結合抗体断片であり、「生体分子」の題名のセクション下で本明細書中に記載のものの何れかを含む。代表的な例において、タンパク質は１つ以上のグリカンを含み、すなわちグリカン付加（ｇｌｙｃａｎａｔｅｄ）生体分子である。代表的な実施形態において、生体分子はグリカン付加（ｇｌｙｃａｎａｔｅｄ）抗体である。

次の実施例は本発明を単に例示するために与えるものであり、その範囲を制限するものではない。

実施例１：結晶性モノクローナル抗体の緩衝液交換
ｋＳｅｐ（登録商標）システム（Ｓａｒｔｏｒｉｕｓ Ｓｔｅｄｉｍ Ｎｏｒｔｈ Ａｍｅｒｉｃａ，Ｉｎｃ．，Ｂｏｈｅｍｉａ，ＮＹ）は、製造中に、生成物として細胞を回収するか、又は細胞を廃棄し、生成物として上清を回収するための生物学的処理のために設計される向流勾配遠心分離系である。この系は、Ｋｅｌｌｙ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．Ｐｒｏｇ．３２（６）：１５２０－１５３０（２０１６）及び米国特許出願公開第２０１１／０２０７２２２号明細書に記載されている。ｋＳｅｐ（登録商標）システムは、流体（例えば培地、緩衝液）の連続流の相反する力と遠心力が釣り合っている従来からの遠心分離系とは異なっており、装置内で細胞又は粒子の流動床系を生じさせる。Ｄｅｃｈｓｉｒｉ，Ｃ．（２００４）．Ｐａｒｔｉｃｌｅ ｔｒａｎｓｐｏｒｔ ｉｎ
ｆｌｕｉｄｉｚｅｄ ｂｅｄｓ：ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔｓ ａｎｄ ｓｔｏｃｈａｓｔｉｃ ｍｏｄｅｌｓ Ｇｒｏｎｉｎｇｅｎ：ｓ．ｎ．を参照。従来からの遠心分離ユニットにおいて、充填床系が達成される。ｋＳｅｐ（登録商標）システムは、クリーニングの必要を最小化する使い切り構成要素も利用しており、無菌的な溶接連結を通じて無菌的処理に寄与する。ｋＳｅｐ（登録商標）系は、研究室又は製造規模の系として利用可能である。ｋＳｅｐ（登録商標）４００システムは、１１４Ｌ／ｈｒの最大流速で４００ｍＬ／サイクルを処理する能力を有する実験室規模の系である。ｋＳｅｐ（登録商標）４００システムは、４つの個々の１００ｍＬチャンバーを有し、各チャンバーをそれだけで、又は他のチャンバーと同時に稼働させ得る。ｋＳｅｐ（登録商標）６０００Ｓシステムは、７２０Ｌ／ｈｒの最大流速で６０００ｍＬ／サイクルを処理する能力を有する製造規模の系（図１参照）である。ｋＳｅｐ（登録商標）６０００Ｓシステムは、６個の個々の１０００ｍＬチャンバーを有し、各チャンバーをそれだけで、又は他のチャンバーと同時に稼働させ得る。

ｋＳｅｐ（登録商標）システムがタンパク質結晶化でのその使用について評価されている一方で（ＭｃＰｈｅｒｓｏｎ，Ｍｅｔｈｏｄｓ ３４（３）：２５４－２６５（２００４）、さらなる下流の処理に対しては使用されていない。ここで、タンパク質結晶化ユニット操作後、高浸透圧性結晶化緩衝液を患者投与に適切な等張性処方緩衝液で置き換えるためにｋＳｅｐ（登録商標）システムを使用する（例えば図２参照）。タンパク質結晶化懸濁液を患者投与に適している濃度に濃縮する際にもｋＳｅｐ（登録商標）システムを使用する。

ｋＳｅｐ（登録商標）システムを使用した場合、結晶性完全ヒトモノクローナル抗体を含むタンパク質結晶懸濁液は、１緩衝液交換体積で９０％の効率を超えて、及び２緩衝液交換体積で９９％の効率を超えて交換された緩衝液であった。ｋＳｅｐ（登録商標）システム内で遠心力及び流体流動力（ｆｌｕｉｄ ｆｌｏｗ ｆｏｒｃｅ）バランスを変化させることによって、ｋＳｅｐ（登録商標）ユニットから分注する前にモノクローナル抗体タンパク質結晶懸濁液を濃縮した。本ユニットに搭載される結晶量及び遠心力に対する流体流動力（ｆｌｕｉｄ ｆｌｏｗ ｆｏｒｃｅ）に基づき、６３ｍｇ／ｍＬから、２１５～３００ｍｇ／ｍＬの範囲でタンパク質結晶懸濁液を濃縮し得る。したがって、ｋＳｅｐ（登録商標）システムを介した向流勾配遠心分離は、結晶化緩衝液を処方緩衝液に緩衝液交換し、患者投与に適している濃度にタンパク質結晶を濃縮するための有効な手段である。

材料及び方法
機器：タンパク質結晶懸濁液緩衝液交換及び濃縮操作のためにｋＳｅｐ（登録商標）４００ユニットを使用した。実験室規模のｋＳｅｐ（登録商標）ユニットによって、大量の材料を消費することなくこれらの操作を評価するためのプラットフォームが得られた。評価のための材料使用量を減少させるために、体積使用を１００～３００ｍＬに減少させるため、２つ又は１つの何れかのｋＳｅｐ（登録商標）システムチャンバーに対して最小４００ｍＬで使用する標準的な４個のｋＳｅｐ（登録商標）システムチャンバーから、チャンバーの使用を減少させた。立体配置が緩衝液交換及び濃縮ユニット操作後にタンパク質結晶を回収するための適正な筋道をもたらしたので、濃縮－洗浄－回収、ＣＷＨ、使い捨てチューブセットをこの評価のために使用した。

材料：この評価のために、完全ヒト化モノクローナル抗体を使用した。結晶化開始時に、抗体の処方物は、１４０ｍｇ／ｍＬの濃度で、ｐＨ５．０の、２０ｍＭ酢酸ナトリウム、２２０ｍＭプロリン及び０．０１％ポリソルベート８０を含有した。この系に添加した結晶化緩衝液は、ｐＨ８．４で、１６ｍＭリン酸ナトリウム、２０％ＰＥＧ３３５０を含有した。結晶化ユニット操作の最後の最終タンパク質結晶懸濁液は、ｐＨ６．２で、およそ９ｍＭ酢酸ナトリウム、９８ｍＭプロリン、０．００４％ポリソルベート８０、７ｍＭリン酸ナトリウム、８．９％ＰＥＧ３３５０から構成された。結晶濃度は６２．２ｍｇ／ｍＬであった。

緩衝液交換緩衝液：緩衝液交換及び濃縮のために使用した緩衝液は、次の構成要素：ｐＨ５．２で、２７ｍＭコハク酸、１５％ＰＥＧ３３５０、０．１％ＰＳ８０からなる等張性緩衝液であった。

結果及び観察
緩衝液交換
ｋＳｅｐ（登録商標）システムの濃縮－洗浄－回収の予めプログラムしたアプリケーションタイプを使用して、緩衝液交換操作を行った（例えば図３を参照）。全体的な緩衝液交換に影響を与えた重大なパラメーターは、洗浄流速及びチャンバーあたりの体積数（ダイアボリューム（ｄｉａｖｏｌｕｍｅ）と同等）であった。洗浄流速パラメーターは、処理時間及び緩衝液交換効率の両方に影響を与えた。洗浄流速が速いほど、処理時間が短くなるが、緩衝液交換効率が低くなる。逆に、洗浄流速が遅いほど、処理時間が長くなるが、緩衝液交換効率は高くなる。チャンバーあたりの体積数に対して、体積は、ｋＳｅｐ（登録商標）システムの推奨プロトコールで指定されるようなバイオリアクター体積によって定められた。緩衝液交換効率を定量するために、排出口の流れのｐＨを測定して、緩衝液交換緩衝液ｐＨでの排出口ｐＨの収束を観察した。注入口供給物質ｐＨは６．２で始まり、緩衝液交換緩衝液ｐＨが５．２であったので、排出口ｐＨが緩衝液交換緩衝液のｐＨに到達したら、緩衝液交換は完了したとみなした。

緩衝液交換実験の結果を表１でまとめる。チャンバーあたりの体積数が増加すると、実験１からの排出口ｐＨが５．３４であり、実験４からの排出口ｐＨが５．２２であったので、緩衝液交換効率が改善した。洗浄流速及び供給体積などの他の可変要素も最終排出口ｐＨに影響したが、チャンバーあたりの体積数と同程度ではなかった。

図２で示されるように、従来からの卓上遠心分離器と比較した場合、ｋＳｅｐ（登録商標）システムは緩衝液交換効率に関してより良好に機能した。卓上遠心分離に対する単スピン及びデカント操作（ｋＳｅｐ（登録商標）システムにおけるチャンバーあたりの１体積数と同等）の後、従来からの遠心分離器に対する排出口ｐＨは５．７であったのに対して、ｋＳｅｐ（登録商標）システムではおよそ５．３であった。１００～３００ｍＬの供給体積、７０～１２０ｍＬ／ｍｉｎの洗浄１流速及び１～２の緩衝液交換体積を評価し、完全な緩衝液交換が起こった程度を決定した。

濃縮
緩衝液交換操作後、遠心分離力と流体流速との間のバランスを変化させることによって、タンパク質結晶懸濁液を濃縮した。遠心分離力を流体流速力より大きくすることによって、タンパク質結晶がｋＳｅｐ（登録商標）システムチャンバーの一方の末端に対して移動し、チャンバー内で効果的に濃縮された。この結果を達成するための方法は、流体の流速定数を維持しながら遠心分離力を上昇させること、遠心分離力定数を維持しながら流体の流速を低下させること又は前の２つの組み合わせを含んだ。排出口濃度変数に影響を及ぼした２つの入力変数：洗浄流速／遠心分離力及び供給体積があった。ｋＳｅｐ（登録商標）システムの濃縮洗浄回収プログラム（例えば図３参照）とともに洗浄２流速関数を使用して、１５０～３００ｍＬの供給体積及び２０～３５ｍＬ／ｍｉｎの洗浄２流速を評価した。これらの入力変数に基づいて、表２で示されるように、ｋＳｅｐ（登録商標）を使用して、１６８～３０３ｍｇ／ｍＬの範囲の濃度が達成された。

前の実験は、２６０～５００ｍＬの供給体積を変更し、洗浄２流速を３０ｍＬ／ｍｉｎで維持することによって、１２２～２２９ｍｇ／ｍＬの範囲の排出口濃縮にタンパク質結晶懸濁液を濃縮した。２００ｍｇ／ｍＬを超える排出口濃度が観察されたにもかかわらず、異なる緩衝液交換緩衝液（１０ｍＭ ＮａＰＯ４ ｐＨ６．２、１０％ＰＥＧ３３５０、１２０ｍＭリジン、０．１％Ｐｓ８０緩衝液（リジン））の使用ゆえに、複屈折能がある顕微鏡を介してタンパク質結晶凝集及び結晶性の劣化も観察された。最初の失敗実験からの結果を表３で示す。

回収
タンパク質結晶懸濁液を所望の濃度に濃縮した後、ｋＳｅｐ（登録商標）ユニットから懸濁液を分注（回収）しなければならない。一般的には、ｋＳｅｐ（登録商標）システムからの物質を除去するために、本ユニットを逆に作動させ、ｋＳｅｐ（登録商標）チャンバーの注入口を通じて物質を押し出す。注入口及び排出口からの大きな圧力差を防ぐために緩衝液中で緩衝液がパルスを送り出しながら、個別のチャンバー蠕動ポンプは、物質を除去するために逆に押し出す。ｋＳｅｐ（登録商標）濃縮－洗浄－回収適用での予めプログラムされた回収操作は、本ユニットから非濃縮懸濁液を回収するために設計され、その結果、多くの初期実験が失敗であったが、それは、本ユニットの使い捨てチューブに詰まった物質又は充填された結晶懸濁液の何れかがパルス緩衝液ポンプ又は個々のチャンバー蠕動ポンプにより破壊されたからであった。

初期実験は、６０ｇの遠心分離速度での予めプログラムされた回収操作及び５０ｍＬ／ｍｉｎの回収（すなわちチャンバー蠕動ポンプ）流速を使用した。予めプログラムされた操作を使用した結果、チャンバーから物質が回収できなかったという多くの失敗が起こった。予めプログラムされたレシピを使用した際に多くの試みが失敗に終わった後、リアルタイムベースで流速及びバルブの位置調整を操作するために、回収操作を手動での制御に切り替えた。遠心分離速度を低下させ、評価するための条件の数を減少させるために一定値で維持し、緩衝液をパルス化せずに緩衝液ポンプを維持した。緩衝液の流速からの圧力が一定に上昇するように緩衝液ポンプを維持した。個々のチャンバー蠕動ポンプは結晶から物質をゆっくりと引き出し、充填結晶懸濁液の空洞形成を防ぎながら、圧力を上昇させることによって徐々に充填結晶懸濁液をチャンバーから押し出す。充填結晶懸濁液の劣化は、最終結晶濃度に負の影響を与える。表４は、ｋＳｅｐ（登録商標）システムから充填（濃縮）結晶懸濁液を回収することに関係する実験をまとめる。表４は、回収実験及び実験中に気づいた観察の一部を明らかにする。充填結晶懸濁液は、現在設定されたように、予めプログラムされた回収自動化では回収され得なかった。回収操作は、自動制御に依存するのではなく、実験者がリアルタイムベースで設定を調整し得る手動操作に切り替える必要があった。「ａ」及び「ｂ」と呼ばれる実験は、回収を試みて失敗した後に条件が調整された同じ実験の一部である。

考慮すべき別の要因は個々のチャンバーポンプであり；個々のチャンバーポンプは、充填結晶懸濁液内で空洞形成を全く引き起こさずにチャンバーから物質を引き出す必要がある。空洞形成は、濃度プロファイルを破壊し、表４実験４及び５で示されるように、濃縮結晶懸濁液にわたり非均一濃度勾配を生じさせる。濃縮結晶懸濁液を回収するために、一度に１個のチャンバーを回収した。一度に複数のチャンバーを回収することによって空洞形成の可能性が上昇した。遠心分離力を８ｇで維持し、緩衝液ポンプを２５～５０ｍＬ／ｍｉｎに設定し、個別のチャンバーポンプを７５ｍＬ／ｍｉｎに設定した（図４）。遠心分離力及び緩衝液ポンプは、チャンバーから物質を押し出すための推進力を生じさせ、一方で、空洞形成が制限されることを確実にするために、個別のチャンバーポンプが引っ張り機序として作用する。

実施例２：識別
処方緩衝液中での試料の洗浄：基本的に、その全体において参照により組み込まれる題名「ＣＲＹＳＴＡＬＬＩＮＥ ＡＮＴＩＢＯＤＹ ＦＯＲＭＵＬＡＴＩＯＮＳ」である国際公開第２０１６０１０９２７号パンフレットに記載のようにバッチ法で結晶性物質の試料を調製した。

２７ｍＭコハク酸及び１５％ＰＥＧ３３５０及び０．１％Ｔｗ－８０、ｐＨ＝５．５の処方緩衝液中で全ての試料を洗浄した。結晶又は非晶質物質の１ｍＬをエッペンドルフチューブ中で１ｍＬの処方緩衝液と合わせ、穏やかな転倒撹拌により混合した。次に、２０００ＲＰＭ＝３７６ｒｃｆで５分間、混合物を遠心分離し、上清を除去した。さらなる１ｍＬの処方緩衝液を添加し、ペレットを再懸濁し、穏やかに混合して、続いて遠心分離した。これを１回反復した。

試料充填：全ての試料を４．０ｍｍ Ｂｒｕｋｅｒローターに充填した。１ｍＬピペットチップを切って、ローターへの漏斗とし、２．０ｍＬ Ｅｐｐｅｎｄｏｒｆチューブの内側にローター及び漏斗がフィットするようにサイズを調整した。１００μＬの懸濁液を漏斗に添加することによって試料を充填し、次いで１０ｋ ｒｃｆで２分間遠心分離した。ローターに固体試料が十分に充填されるまで、これを４～８回反復した。

ＳＳＮＭＲ：５００ＭＨｚの^１Ｈ 共振周波数で作動するＢｒｕｋｅｒ Ａｓｃｅｎｄ
Ａｖａｎｃｅ ＩＩＩワイドボア分光光度計を分析のために使用した。別段の記載がある場合を除き、全ての実験に対して、４ｋＨｚの回転周波数で作動する４ｍｍ Ｈ／Ｆ／Ｘ ＭＡＳプローブを使用した。温度実験を行う場合を除き、温度を３００Ｋに調節するために、ＢＣＵ ＩＩ－８０／６０温度ユニットを使用した。９０度パルスに対して^１Ｈ２．５ｕｓ ｐｉ／２＝１６０Ｗを使用した。固体物質からのシグナルを抑制する全部で１０ｍｓのＣＰＭＧパルスに対して、５００μｓ離れた５μｓの２０パイパルスで、^１Ｈ
ＣＰＭＧスペクトルを回収した。ＣＰＭＧスペクトルを測定した後、ローターにおいて総固体物質を較正し、試料とローターとの間の充填における相違を説明するための手段として、試料を１４ｋＨｚ以下で回転させ、１３Ｃ交差分極（ＣＰ）を測定した。ＣＰスペクトルは１３Ｃおいて、２ｍｓ接触時間及び５０ｋＨｚ ＲＦスピンロックパルスを使用し、^１Ｈにおいてランプパルスと適切に一致した。

観察
固相にあり、移動相にない試料の部分から生じるプロトンシグナルを抑制するために、ＣＰＭＧスペクトルを使用した。ｍＡｂ結晶及び非晶質生成物のＣＰＭＧスペクトルにおいて、結晶性物質で出現し、非晶質物質で出現しなかった、いくつかのシグナルがあった（図５参照）。５％結晶性又は５％非晶質ｍＡｂの何れかを添加した試料からのスペクトルで示されるように、結晶性含量の量を定量するために、これらのシグナルを使用し得た（図６）。結晶性スペクトルにおけるシグナルも温度上昇とともに増加し、このことから、分子のこれらの部分がより移動性になっていたことが示される（図７）。

本明細書中で引用される、刊行物、特許出願及び特許を含む参考文献は全て、各参考文献が、参照により組み込まれ、本明細書中でその全体において示された場合と同程度まで、参照により本明細書によって組み込まれる。

「ａ」及び「ａｎ」及び「ｔｈｅ」という用語の使用及び本開示を記載する内容における類似の言及（特に、次の特許請求の範囲の内容において）は、本明細書中で別段の断りがない限り、又は内容と明らかに矛盾しない限り、単数及び複数の両方を包含するものと解釈されたい。「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「有する（ｈａｖｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」及び「含有する（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」という用語は、別段の記載がない限り、制約のない用語として解釈されたい（すなわち「含むが限定されない」を意味する）。

本明細書中の値の範囲の引用は、単に、本明細書中で別段の断りがない限り、範囲及び各エンドポイント内に入る各個別の値を個々に指す省略法となるものであり、各個別の値及びエンドポイントは、それが個々に本明細書中で引用されるかのように、本明細書中に組み込まれる。

本明細書中に記載の方法は全て、本明細書中で別段の指示がない限り、又は内容と明らかに矛盾しない限り、何らかの適切な順序で行われ得る。本明細書中で提供されるあらゆる例又は代表的な語（例えば「など（ｓｕｃｈ ａｓ）」）の使用は、本開示を単により詳細に明らかにするものであり、別段の主張がない限り、本開示の範囲における制限を提起しない。本願の言語のうち、本開示の実施に必須なものとして何らかの非主張要素を示すものとして解釈されるべきものはない。

本開示の好ましい実施形態は、本開示を実施するための発明者らにとって公知の最良の形態を含め、本明細書中に記載される。前述の記載を読めば、これらの好ましい実施形態の変種が当業者に明らかになり得る。発明者らは、当業者が、必要に応じてこのような変種を使用することを予期し、発明者らは、本開示が、具体的に本明細書中に記載のもの以外にまた使用されるはずであることを意図する。したがって、この開示は、適用可能な法律により許容される場合、本明細書に添付される特許請求の範囲で示される主題の全ての変更物及び同等物を含む。さらに、本明細書中で別段の指示がない限り、又は内容と明らかに矛盾しない限り、その全ての可能な変形物の上記の要素の何らかの組み合わせが本開示により包含される。

Claims (24)

1. 試料中で結晶性生体分子及び／又は非晶質生体分子を検出する方法であって、
   ａ）前記試料の複数の ^１ Ｈ ＮＭＲ Ｃａｒｒ－Ｐｕｒｃｅｌｌ－Ｍｅｉｂｏｏｍ－Ｇｉｌｌ（ＣＰＭＧ）スペクトルを得ることと、
   ｂ）前記試料の ^１３ Ｃ ＮＭＲ交差分極（ＣＰ）スペクトルを得ることと、
   を含む、方法。
2. 前記方法の段階（ａ）中に２５０～１０００ＭＨｚの ^１ Ｈ共振周波数を操作することを含む、請求項１に記載の方法。
3. ２５０～３５０Ｋで温度を維持することを含む、請求項１又は２に記載の方法。
4. マジック角回転（ＭＡＳ）プローブを操作することを含む、請求項１～３の何れか１項に記載の方法。
5. 前記ＭＡＳプローブが少なくとも２個のＲＦチャネルを含む、請求項４に記載の方法。
6. 前記ＭＡＳプローブが ^１ Ｈ及び ^１３ Ｃに対して調整される、請求項５に記載の方法。
7. 前記ＭＡＳプローブが２ｋＨｚ～８ｋＨｚの回転周波数で操作される、請求項４～６の何れか１項に記載の方法。
8. ９０°パルスを使用することを含む、請求項１～７の何れか１項に記載の方法。
9. ２．５μｓの ^１ Ｈ ９０°パルスを使用することを含む、請求項８に記載の方法。
10. 前記 ^１ Ｈ ＣＰＭＧスペクトルが、２μｓ～２０μｓ長の５～１００パイパルスで得られた、請求項１～９の何れか１項に記載の方法。
11. 前記２０パイパルスのそれぞれが１０μｓ～１ｍｓ離された、請求項１０に記載の方法。
12. ＣＰＭＧパルスの全時間が５００μｓ～５０ｍｓである、請求項１１に記載の方法。
13. １４ｋＨｚまでの周波数で回転させながら複数の ^１ Ｈ ＣＰＭＧスペクトルを得ることを含む、請求項１～１２の何れか１項に記載の方法。
14. 測定中の前記 ^１３ Ｃ ＣＰの接触時間が１００μｓ～１０ｍｓである、請求項１～１３の何れか１項に記載の方法。
15. 前記測定が、２０ｋＨｚ～１００ｋＨｚの ^１３ ＣでのＲＦスピンロックパルスを含む、請求項１４に記載の方法。
16. ^１ Ｈでのランプパルスが一致する、請求項１５に記載の方法。
17. 前記試料中の生体分子の含量を定量することを含む、請求項１～１６の何れか１項に記載の方法。
18. 前記結晶性生体分子が、非晶質生体分子とは異なる分光学的特徴を示す、請求項１～１７の何れか１項に記載の方法。
19. 前記結晶性生体分子が、非晶質生体分子よりも高い分子運動性の分光学的特徴を示す、請求項１～１８の何れか１項に記載の方法。
20. 前記結晶性生体分子がバイ－レフリガント（ｂｉ－ｒｅｆｒｉｎｇａｎｔ）である、請求項１～１９の何れか１項に記載の方法。
21. 前記結晶性生体分子が回折しない、請求項１～２０の何れか１項に記載の方法。
22. 前記生体分子が、タンパク質を含むか又は１つ以上のポリペプチド鎖を含む、請求項１～２１の何れか１項に記載の方法。
23. 前記タンパク質が抗体又はその断片である、請求項２２に記載の方法。
24. 前記試料中の前記生体分子が１つ以上のグリカンを含む、請求項１～２３の何れか１項に記載の方法。

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