JP2023053029A - 微生物培養装置 - Google Patents
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Abstract
Description
(a)培養環境が閉鎖的であるために、微生物からの過剰な生成物質を系外へ排出できない。その結果、微生物の代謝産物や環境成分が、蓄積して、微生物の増殖を阻害する。
(b)固形培地において、目的微生物の成育に要求される栄養素濃度を維持するのが困難である。
表面に、第1凹部と、前記第1凹部の内部に設けられ、前記第1凹部よりも深い、第2凹部と、を有する、ケースと、
前記第2凹部よりも上流側の前記第1凹部内へ流体を流入させるための流入路と、
前記第2凹部よりも下流側の前記第1凹部内から流体を流出させるための流出路と、
を備えており、
前記第2凹部が多孔板で塞がれており、
前記第2凹部より上流側の前記第1凹部に設けられた、上流側の整流リブと、
前記第2凹部より下流側の前記第1凹部に設けられた、下流側の整流リブと、
を更に備えており、
前記第2凹部に、環境成分含有材料又は栄養素含有材料が収容されており、
前記多孔板の貫通孔に、微生物含有培地が充填されており、
栄養素含有液体又は環境成分含有液体が前記流入路から流入されて前記流出路から流出されるようになっている、
ことを特徴としている。
微生物を培養する層状の培養部と、
前記培養部の第1表面と前記第1表面の反対側の第2表面とに配置された、前記培養部に栄養素を供給する層状の栄養素供給部及び前記培養部に環境成分を供給する層状の環境成分供給部の、少なくとも一方と、
を有する三層積層構造体を、含むことを特徴としている。
栄養素供給部に流通させる栄養素含有気体又は栄養素含有液体の、種類及び濃度の少なくとも一方を、変更する、栄養素変更工程、及び、環境成分供給部に流通させる環境成分含有気体又は環境成分含有液体の、種類及び濃度の少なくとも一方を、変更する、環境成分変更工程の、少なくとも一方を、含んでいる。
栄養素供給部を、別の栄養素供給部と交換し又は環境成分供給部と交換する、栄養素交換工程、及び、環境成分供給部を、別の環境成分供給部と交換し又は栄養素供給部と交換する、環境成分交換工程の、少なくとも一方を、含んでいる。
培養部の培養状態をセンサーによって検知してモニターするモニター工程を、含んでおり、モニター結果に基づいて、栄養素供給部に流通させる栄養素含有気体又は栄養素含有液体の、種類及び濃度の少なくとも一方を、変更する、栄養素変更工程、及び、環境成分供給部に流通させる環境成分含有気体又は環境成分含有液体の、種類及び濃度の少なくとも一方を、変更する、環境成分変更工程の、少なくとも一方を、更に含んでいる。
培養部の培養状態をセンサーによって検知してモニターするモニター工程を、含んでおり、モニター結果に基づいて、栄養素供給部を、別の栄養素供給部と交換し又は環境成分供給部と交換する、栄養素交換工程、及び、環境成分供給部を、別の環境成分供給部と交換し又は栄養素供給部と交換する、環境成分交換工程の、少なくとも一方を、更に含んでいる。
<微生物培養装置>
本発明の微生物培養装置は、三層積層構造体を含むことを特徴としている。
図1~図3に示されるように、三層積層構造体は、次の3種類の構成を含んでいる。
培養部は、微生物を培養するようになっており、微生物が播種された培地すなわち微生物含有培地を有している。培地としては、例えば、寒天などを使用できる。
栄養素供給部は、培養部に栄養素を供給するようになっている。栄養素とは、微生物の生育に必要な栄養などの基質(生育因子)である。栄養素は、固体又は液体又は気体の状態で、すなわち、栄養素含有材料又は栄養素含有液体又は栄養素含有気体として、供給される。
環境成分供給部は、培養部に環境成分を供給するようになっている。環境成分とは、微生物を自然環境に近い状態で生育させるための環境因子である。環境成分は、固体又は液体又は気体の状態で、すなわち、環境成分含有材料又は環境成分含有液体又は環境成分含有気体として、供給される。環境成分含有材料としては、例えば土壌をそのまま使用できる。環境成分含有液体としては、例えば海水をそのまま使用できる。
本発明の微生物培養装置によれば、次のような作用効果を発揮できる。
(a)培養部1に、栄養素供給部2から栄養素を供給でき、及び/又は、環境成分供給部3から環境成分を供給できるので、培養部1において微生物を培養できる。
微生物培養装置としては、例えば、以下に示される4種類の型を採用できるが、これらに限定されるものではない。
三層一体型装置は、例えば断面略図である図6に示されるように、三層積層構造体10が1個のケース51内に収容されている構成を、有している。これによれば、非常にコンパクトな装置を実現できる。なお、三層積層構造体10の平面視形状は、円形、三角形、四角形、又は、その他の多角形などを採用できる。
ジャケット型装置では、断面略図である図7に示されるように、三層積層構造体10を構成する、培養部1、栄養素供給部2、及び環境成分供給部3が、それぞれ、内部空間を囲む枠本体を備えた枠体によって、構成されている。なお、三層積層構造体10の平面視形状は、円形、三角形、四角形、又は、その他の多角形を採用できる。
印刷型装置では、断面略図である図8に示されるように、三層積層構造体10を構成する、培養部1、栄養素供給部2、及び環境成分供給部3が、それぞれ、印刷によって構成されている。なお、三層積層構造体10の平面視形状は、円形、三角形、四角形、又は、その他の多角形を採用できる。
薄膜体型装置は、印刷型装置に比して、印刷層に代えて薄膜体を備えている点が異なっており、その他は同じである。すなわち、第1薄膜体16、第2薄膜体26、及び第3薄膜体36を備えている。第1薄膜体26は、ドクターブレード法によって微生物含有培地が薄膜化されて構成されており、第2薄膜体26は、ドクターブレード法によって栄養素含有材料が薄膜化されて構成されており、第3薄膜体36は、ドクターブレード法によって環境成分含有材料が薄膜化されて構成されている。なお、各薄膜体の間には、メンブレンフィルター40が配置されていることが、好ましい。
本発明の微生物培養方法は、上述した微生物培養装置を用いた微生物の培養において、多様な培養条件を実現できる。
図9は、本発明の第1実施形態の微生物培養装置を示す斜視図である。この微生物培養装置100Aは、1個のケース51内に1個の三層積層構造体10を収容した構成を、有しており、すなわち「三層一体型装置」である。
(a)多孔板52の貫通孔522内の微生物に、下側から環境成分を供給でき、上側から栄養素を供給できるので、貫通孔522内で微生物を培養できる。
第1実施形態の微生物培養装置100Aは、次のような変形例を任意に採用できる。
図14は、本発明の第2実施形態の微生物培養装置を示す斜視図である。この微生物培養装置100Bは、「ジャケット型装置」である。図15は、図14のXV矢視図である。図16は、図15のXVI矢視図(平面図)である。図17は、図16のXVII-XVII断面図である。図18は、図17に示される断面の斜視図である。
(a)ジャケット61に環境成分含有液体を流通させることにより、ジャケット62~64内の微生物に、下側から環境成分を供給でき、上側から栄養素を供給できるので、ジャケット62~64内で微生物を培養できる。また、ジャケット67に栄養素含有液体を流通させることにより、ジャケット66内の微生物に、下側からも上側からも栄養素を供給できるので、ジャケット66内で微生物を培養できる。
第2実施形態の微生物培養装置100Bは、次のような変形例を任意に採用できる。
図37は、本発明の第3実施形態の微生物培養装置を示す断面略図である。この微生物培養装置100Cは、「印刷層型装置」である。
(a)第2印刷層72及び第3印刷層73の微生物に、下側から環境成分を供給でき、上側から栄養素を供給できるので、第2印刷層72及び第3印刷層73で微生物を培養できる。また、第5印刷層75に、下側からも上側からも栄養素を供給できるので、第5印刷層75で微生物を培養できる。
第3実施形態の微生物培養装置100Cは、次のような変形例を任意に採用できる。
(2-1)スクリーン印刷法。
(2-2)印刷材料を、PETフィルム上にコーターを用いて塗工して、所望の大きさに金型で打ち抜いて、積層体を形成する。
本発明の第4実施形態の微生物培養装置は、「薄膜体型装置」である。この微生物培養装置100Dは、図37に示される第3実施形態の「印刷層型装置」と同じ構成を有しているが、印刷層に代えて薄膜体を備えている。
第1実施形態の微生物培養装置100A(図9)を使用した。
・栄養素供給部
・R2A培地(日本製薬株式会社製) 3.2g/L
・R2A培地(日本製薬株式会社製) 3.2g/L
カンテン末(ナカライテスク株式会社製) 15g/L
・上記のカンテン水溶液を、オートクレーブ(121℃/20分間)処理し、60℃付近になったら土壌抽出希釈液を添加し、攪拌後に培養部の各貫通孔522に充填した。なお、土壌抽出希釈液は、土壌5gに純水15mLを加えて攪拌し、1時間放置後の上澄を逐次希釈し、DAPI染色を行ない、顕微鏡観察にて微生物の数を数え、培養部の各貫通孔522に1個の微生物が入るような濃度に、調整した。
・カンテン末(ナカライテスク株式会社製) 15g/L
・上記のカンテン水溶液95mLを、オートクレーブ(121℃/20分間)処理し、60℃付近になったら土壌抽出液5mLを添加し、攪拌後に第2凹部57に注入する。なお、土壌抽出液は、土壌5gに純水15mLを加えて、攪拌し、1時間放置後の上澄を5mL分取した。
栄養素供給部においてR2A培地を連続的に1週間流通させて、培養を行った。
培養後に、培養部に生成されたコロニーを、回収し、テクノスルガ・ラボ株式会社において、遺伝子解析を行った。16SrDNAのV1~V4領域の約600塩基に関して、相同性解析を実施し、簡易分子系統樹を作成し、種の同定を行った。相同率は塩基配列の一致度を示し、相同率が98%よりも低い場合に、新種と判断した。
・DNA抽出 アクロモペプチダーゼ(富士フィルム和光純薬株式会社製)
・PCR増幅 PrimeSTAR HS DNA Polymerase(タカラバイオ株式会社製)
・サイクルシーケンス BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit(Applied Biosystems製)
・塩基配列決定 ChromasPro1.7(Technelysium製)
・データベース DB-BA12.0(テクノスルガ・ラボ株式会社製)
国際塩基配列データベース
検索日:2018年3月15日
寒天平板表面塗抹法によってコロニーを生成し、同様の遺伝子解析を実施した。
図40は、遺伝子解析の結果を示す。図40において、Aは既知種100~98%を示し、Bは新種98~94%を示し、Cは新属・新科94~91%を示し、Dは新目91%未満を示している。本実施例によれば、獲得できた微生物の約45%が新種相当であり、新目及び新属レベルの新しい微生物も獲得できた。よって、難培養微生物の獲得に非常に有効であることを、確認できた。
第2実施形態の微生物培養装置100Bを使用した。但し、図41に示されるように、ジャケット65は、ジャケット67と同じ構成を有している。
・栄養素供給部(ジャケット67)
・基質A液
・R2A培地(日本製薬株式会社製) 0.32g/100mL
純水 100mL
・基質B液
・R2A培地(日本製薬株式会社製) 0.032g/100mL
純水 100mL
・土壌抽出液
・土壌5gに対して純水15gの割合で作製した。
・カンテン末(ナカライテスク株式会社製) 1.5g/100mL
純水 95mL
・上記のカンテン水溶液を、オートクレーブ(121℃/20分間)処理し、60℃付近になったら土壌抽出希釈液5mLを添加し、攪拌後に培養部であるジャケットの内部空間に充填した。なお、土壌抽出希釈液は、土壌5gに純水15mLを加えて攪拌し、1時間放置後の上澄を、逐次希釈で10000倍に希釈して、作製した。
・各部の間には、メンブレンフィルターVCWP(メルクミリポア株式会社製 0.1μm)を配置した。
栄養素供給部(ジャケット67)に基質A液を、栄養素供給部(ジャケット65)に基質B液を、及び環境成分供給部(ジャケット61)に土壌抽出液を、連続的に1週間流通させて、培養を行った。
培養後に、培養部に生成したコロニーを、回収し、テクノスルガ・ラボ株式会社において、遺伝子解析を行った。16SrDNAのV1~V4領域の約600塩基に関して、相同性解析を実施し、簡易分子系統樹を作成し、種の同定を行った。相同率は塩基配列の一致度を示し、相同率が98%よりも低い場合に、新種と判断した。
・DNA抽出 アクロモペプチダーゼ(富士フィルム和光純薬株式会社製)
・PCR増幅 PrimeSTAR HS DNA Polymerase(タカラバイオ株式会社製)
・サイクルシーケンス BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit(Applied Biosystems製)
・塩基配列決定 ChromasPro1.7(Technelysium製)
・データベース DB-BA12.0(テクノスルガ・ラボ株式会社製)
国際塩基配列データベース
検索日:2018年3月15日
寒天平板表面塗抹法によってコロニーを生成し、同様の遺伝子解析を実施した。
図42は、遺伝子解析の結果を示す。図42において、Aは既知種100~98%を示し、Bは新種98~94%を示し、Cは新属94~91%を示し、Dは新目91%未満を示している。本実施例によれば、獲得できた微生物の約40%が新種相当であり、新目及び新属レベルの新しい微生物も獲得できた。よって、難培養微生物の獲得に非常に有効であることを、確認できた。
第3実施形態の微生物培養装置100C(図37)を使用した。
・栄養素供給部(第6印刷層76)
・基質A層
・R2A培地(日本製薬株式会社製) 0.32g/100mL
カンテン末(ナカライテスク株式会社製) 1.5g/100mL
純水 100mL
・オートクレーブ(121℃/20分間)処理して、基質ペーストを得た。
・基質B層
・R2A培地(日本製薬株式会社製) 0.032g/100mL
カンテン末(ナカライテスク株式会社製) 1.5g/100mL
純水 100mL
・オートクレーブ(121℃/20分間)処理して、基質ペーストを得た。
・カンテン末(ナカライテスク株式会社製) 1.5g/100mL
純水 95mL
・上記のカンテン水溶液を、オートクレーブ(121℃/20分間)処理し、60℃付近になったら土壌抽出液5mLを添加し、攪拌して、土壌ペーストを得た。なお、土壌抽出液は、土壌5gに純水15mLを加えて攪拌し、1時間放置後に上澄を5mL分取した。
・カンテン末(ナカライテスク株式会社製) 1.5g/100mL
純水 95mL
・上記のカンテン水溶液を、オートクレーブ(121℃/20分間)処理し、60℃付近になったら土壌抽出希釈液5mLを添加して攪拌し、培養ペーストを得た。なお、土壌抽出希釈液は、土壌5gに純水15mLを加えて攪拌し、1時間放置後の上澄を、逐次希釈で10000倍に希釈して、作製した。
・各層は、スクリュー式ディスペンサーQuspa Ms(株式会社進和製)を用いて形成した。ニードルとしては、以下のマルチニードルを用いた。ニードル先端及びシリンジは、ヒーターで60℃に加温することにより、各ペーストを溶融状態で保持した。ギャップ1.2mmで約1mm厚でペーストを塗布した。室温で放置すると、固化した。
・21G(内径0.51mm)×8本 ピッチ0.93mm
・各層の間には、メンブレンフィルターVCWP(メルクミリポア株式会社製 0.1μm)を配置した。
印刷層からなる積層体を形成した後、滅菌済みのシャーレに入れて、1週間培養を行った。
10A~F 三層積層構造体
1 培養部
11 第1表面
12 第2表面
13 第1内部空間
14 第1枠本体
15 第1印刷層
16 第1薄膜体
2 栄養素供給部
23 第2内部空間
24 第2枠本体
25 第2印刷層
26 第2薄膜体
27 流入路
28 流出路
3 環境成分供給部
33 第3内部空間
34 第3枠本体
35 第3印刷層
36 第3薄膜体
37 流入路
38 流出路
41 温度センサー
42 pHセンサー
43 超音波発振器(超音波振動部)
51 ケース
Claims (4)
- 表面に、第1凹部と、前記第1凹部の内部に設けられ、前記第1凹部よりも深い、第2凹部と、を有する、ケースと、
前記第2凹部よりも上流側の前記第1凹部内へ流体を流入させるための流入路と、
前記第2凹部よりも下流側の前記第1凹部内から流体を流出させるための流出路と、
を備えており、
前記第2凹部が多孔板で塞がれており、
前記第2凹部より上流側の前記第1凹部に設けられた、上流側の整流リブと、
前記第2凹部より下流側の前記第1凹部に設けられた、下流側の整流リブと、
を更に備えており、
前記第2凹部に、環境成分含有材料又は栄養素含有材料が収容されており、
前記多孔板の貫通孔に、微生物含有培地が充填されており、
栄養素含有液体又は環境成分含有液体が前記流入路から流入されて前記流出路から流出されるようになっている、
ことを特徴とする、微生物培養装置。 - 前記上流側の整流リブと前記下流側の整流リブとは、構成が異なっている、
請求項1記載の微生物培養装置。 - 前記上流側の整流リブは、前記流入路から流入してきた流体を幅方向に均等に分流させるように設けられた前段リブと、幅方向に分流された流体を長さ方向に沿うように整流する後段リブと、を含んでおり、
前記長さ方向は、前記流入路から前記流出路へ至る方向であり、
前記幅方向は、前記長さ方向に対して直交する方向である、
請求項1又は2に記載の微生物培養装置。 - 前記多孔板は、前記第2凹部に対して取り外し可能である、
請求項1又は2に記載の微生物培養装置。
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