JP2022550670A - 炎症性疾患のためのddx17及びnlrc4標的化 - Google Patents

炎症性疾患のためのddx17及びnlrc4標的化 Download PDF

Info

Publication number
JP2022550670A
JP2022550670A JP2022512828A JP2022512828A JP2022550670A JP 2022550670 A JP2022550670 A JP 2022550670A JP 2022512828 A JP2022512828 A JP 2022512828A JP 2022512828 A JP2022512828 A JP 2022512828A JP 2022550670 A JP2022550670 A JP 2022550670A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
seq
nlrc4
human
transcripts
transcript
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Withdrawn
Application number
JP2022512828A
Other languages
English (en)
Other versions
JPWO2021041317A5 (ja
Inventor
アムバティ ジャヤクリシュナ
ワン シャオビン
アムバティ カメシュワリ
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
UVA Licensing and Ventures Group
Original Assignee
University of Virginia Patent Foundation
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by University of Virginia Patent Foundation filed Critical University of Virginia Patent Foundation
Publication of JP2022550670A publication Critical patent/JP2022550670A/ja
Publication of JPWO2021041317A5 publication Critical patent/JPWO2021041317A5/ja
Withdrawn legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • A61K31/52Purines, e.g. adenine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7076Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines containing purines, e.g. adenosine, adenylic acid
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D411/00Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having oxygen and sulfur atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D411/02Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having oxygen and sulfur atoms as the only ring hetero atoms containing two hetero rings
    • C07D411/04Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, at least one ring having oxygen and sulfur atoms as the only ring hetero atoms containing two hetero rings directly linked by a ring-member-to-ring-member bond
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/513Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim having oxo groups directly attached to the heterocyclic ring, e.g. cytosine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/33Heterocyclic compounds
    • A61K31/395Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins
    • A61K31/495Heterocyclic compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. guanethidine or rifamycins having six-membered rings with two or more nitrogen atoms as the only ring heteroatoms, e.g. piperazine or tetrazines
    • A61K31/505Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim
    • A61K31/519Pyrimidines; Hydrogenated pyrimidines, e.g. trimethoprim ortho- or peri-condensed with heterocyclic rings
    • A61K31/52Purines, e.g. adenine
    • A61K31/522Purines, e.g. adenine having oxo groups directly attached to the heterocyclic ring, e.g. hypoxanthine, guanine, acyclovir
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/66Phosphorus compounds
    • A61K31/675Phosphorus compounds having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. pyridoxal phosphate
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/66Phosphorus compounds
    • A61K31/683Diesters of a phosphorus acid with two hydroxy compounds, e.g. phosphatidylinositols
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/66Phosphorus compounds
    • A61K31/683Diesters of a phosphorus acid with two hydroxy compounds, e.g. phosphatidylinositols
    • A61K31/685Diesters of a phosphorus acid with two hydroxy compounds, e.g. phosphatidylinositols one of the hydroxy compounds having nitrogen atoms, e.g. phosphatidylserine, lecithin
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7068Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7068Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid
    • A61K31/7072Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid having two oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. uridine, uridylic acid, thymidine, zidovudine
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A61K31/7064Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
    • A61K31/7076Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines containing purines, e.g. adenosine, adenylic acid
    • A61K31/708Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines containing purines, e.g. adenosine, adenylic acid having oxo groups directly attached to the purine ring system, e.g. guanosine, guanylic acid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7088Compounds having three or more nucleosides or nucleotides
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K9/00Medicinal preparations characterised by special physical form
    • A61K9/0012Galenical forms characterised by the site of application
    • A61K9/0048Eye, e.g. artificial tears
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P27/00Drugs for disorders of the senses
    • A61P27/02Ophthalmic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2866Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against receptors for cytokines, lymphokines, interferons
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K16/00Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/40Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against enzymes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2300/00Mixtures or combinations of active ingredients, wherein at least one active ingredient is fully defined in groups A61K31/00 - A61K41/00

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Ophthalmology & Optometry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Abstract

NLRファミリーCARDドメイン含有4(NLRC4)インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害若しくは病状を処置及び/又は防止するための方法が提供される。いくつかの実施態様において、この方法は、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む組成物を、その必要がある対象に投与する段階を含む。また、細胞においてNLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化を阻害するための方法、NLRC4によって誘導されるIL-1βが細胞から放出されることを阻害するための方法、対象におけるAluによって誘導される網膜色素細胞(RPE)変性を阻害するための方法、及びここに開示されている方法に使用するための組成物も提供される。【選択図】 なし

Description

関連出願の相互参照
本発明は、2019年8月23日に出願された米国仮特許出願第62/891,124号の優先権を主張し、本明細書にはその全体が参照により組み込まれる。
本発明は、国立衛生研究所によって付与された助成金番号DP1GM114862及びR01EY029799の下での米国政府の支援によってなされた。そのため米国政府は本発明に一定の権利を有する。
本発明は、一般的には、NLRファミリーCARDドメイン含有4(NLRC4)インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状を処置及び/又は防止するための組成物及び方法に関する。いくつかの実施態様では、方法は、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る組成物をその必要がある対象に投与することを含み、投与することは、NLRC4インフラマソーム生物活性を減縮するために有効な経路及び量によってである。
ヌクレオチドオリゴマー化ドメイン(NOD)様受容体(NLR)は多様な刺激に対する自然免疫応答において重大な役割を演ずる。いくつかのNLRは抗細菌免疫に寄与する。例えば、NLRファミリーCARD含有4(NLRC4)インフラマソームは細胞質内の細菌フラジェリン及びT3SSコンポーネントによって活性化され、それによってプロカスパーゼ-1をその活性な形態へと切断して、パイロトーシス及び下流の炎症カスケードの引き金となる。NLRC4はこれらの細菌産物を直接的には認識しない。代わりに、それはNLRファミリーアポトーシス阻害剤蛋白質(NAIP)ファミリーの蛋白質を利用してフラジェリン及びT3SSを感知する。NAIPは細菌リガンドの直接的な受容体としての用をなし、それによって、下流の炎症カスケードにとってのアダプターとしてのNLRC4インフラマソームを可能化する。マウスでは、NAIP1~6は特異的な細菌リガンドに応答したNLRC4活性化を媒介することができる。しかしながら、ヒトはマウスで見られるNAIP遺伝子の重複を欠く。代わりに、単一のヒトNAIPが複数の細菌リガンドの認識を可能化する。無菌性の組織ダメージもまた虚血性脳卒中及び多発性硬化症のモデルにおいてNLRC4インフラマソームを活性化することが公知であるが、どの内在性の刺激がこれらの設定において細菌感染の不在下でNLRC4インフラマソームを活性化するのかは不明である。これらの多様な無菌性の活性化因子についてのNLRC4インフラマソームの感知スペクトルは未知であり、今日まで、公知のNLRC4インフラマソーム阻害剤はない。
短鎖散在核エレメント(SINE)は哺乳類ゲノムのおよそ10%を構成する非コードレトロトランスポゾンである。AluRNAはヒトにおける最も成功したレトロトランスポゾンSINEエレメントであり、B1、B2、ID、及びB4はマウスSINEである。SINEのゲノム挿入及び/又は転写過剰はインフラマソーム活性化を引き起こし得、嚢胞性線維症、血友病A、網膜色素変性症、加齢黄斑変性(AMD)、糖尿病、及び高コレステロール血症を包含する複数の疾患に関連する。しかしながら、SINE-RNAを認識するための上流のセンサーは依然として未知である。
この概要は本発明のいくつかの実施態様を列挙し、多くのケースでは本発明のこれらの実施態様の変形及び順列を列挙する。この概要は単に多数のかつ様々な実施態様の例示である。所与の実施態様の1つ以上の代表的特徴の言及は同様に例示的である。かかる実施態様は、典型的には、言及されている特徴(単数又は複数)あり又はなしで存在し得る。同様に、この概要に列挙されるか否かにかかわらず、それらの特徴は本発明の他の実施態様に適用され得る。過剰な繰り返しを避けるために、この概要はかかる特徴の全ての可能な組み合わせを列挙又は示唆しない。
いくつかの実施態様では、本発明は、NLRファミリーCARDドメイン含有4(NLRC4)インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害若しくは病状を処置及び/又は防止するための方法であって、該方法は、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれからなる、又はそれから成る組成物を、その必要がある対象に投与する段階を含む、本質的にそれからなる、又はそれから成り、該投与段階は、NLRC4インフラマソーム生物活性を減縮することに有効な経路及び量によって行われ、それにより、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状を処置及び/又は防止する、方法である。いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状は、網膜色素上皮(RPE)の疾患、任意に加齢黄斑変性(AMD)及び/又は地図状萎縮である。
いくつかの実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状は、移植片対宿主病、慢性疼痛、増殖性硝子体網膜症、緑内障、関節リウマチ、多発性硬化症、双極性障害、大うつ病性障害、腎線維症、腎炎、肺線維症、ハンチントン病、骨粗鬆症、慢性リンパ性白血病、不安障害、肺結核、閉経後の女性及び骨折患者における骨粗鬆症、全身性エリテマトーデス、慢性炎症性及び神経障害性疼痛、常染色体優性多発性嚢胞腎、脊髄損傷、アルツハイマー病、神経障害性疼痛、高血圧、静脈瘤、I型糖尿病、II型糖尿病、痛風、自己免疫性肝炎、グラフト血管損傷、動脈硬化、血栓症、メタボリックシンドローム、唾液腺炎症、外傷性脳損傷、虚血性心疾患、虚血性脳卒中、パーキンソン病、メラノーマ、神経芽腫、前立腺、乳、皮膚、及び甲状腺癌、早期管状腺胃癌、神経内分泌癌、ムコイド結腸癌、結腸癌;高異型度尿路上皮癌、淡明型腎細胞癌、未分化卵巣癌、乳頭嚢胞内乳癌、グラム陰性敗血症、感染性緑膿菌、ビブリオコレラ、レジオネラspp.、フランシセラspp.、リーシュマニアspp.、SARS-CoV、SARS-CoV-2、及びクラミジアspp.、クライオピリノパチー;角膜炎、尋常性ざ瘡、クローン病、潰瘍性大腸炎、過敏性腸症候群、インスリン抵抗性、肥満、溶血性尿毒症症候群、ポリオーマウイルス感染、免疫複合体型腎疾患、急性尿細管障害、ループス腎炎、家族性寒冷自己炎症性症候群、マックル・ウェルズ症候群及び小児多臓器系炎症性疾患、慢性乳児神経皮膚関節自己炎症性疾患、腎虚血灌流障害、糸球体腎炎、クリオグロブリン血症、全身性血管炎、IgA腎症、マラリア、寄生蠕虫、敗血症性ショック、アレルギー性喘息、枯草熱、慢性閉塞性肺疾患、薬剤性肺炎症、接触皮膚炎、らい病、バークホルデリア・セノセパシア感染、呼吸器合胞体ウイルス感染、乾癬、強皮症、反応性関節炎、嚢胞性線維症、梅毒、シェーグレン症候群、炎症性関節疾患、非アルコール性脂肪肝疾患、心臓手術(周術期/術後炎症)、急性及び慢性臓器移植拒絶、急性及び慢性骨髄移植拒絶、並びに腫瘍血管新生からなる群から選択される。
いくつかの実施態様では、本発明の方法は、更に、その必要がある対象にNLRC4インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤を投与することを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性の(the)少なくとも1つの追加の阻害剤は、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1(CAS-1)、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(CGAS)、カスパーゼ-4(CAS-4)、インターフェロン遺伝子刺激因子-1(STING1)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害剤は短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これはNLRC4、NLRP3、CAS-1、CGAS、CAS-4、STING、PPIF、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害剤は抗体又はその抗原結合断片であり、これはNLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する。
いくつかの実施態様では、本発明は、細胞においてNLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化を阻害するための方法であって、NLRC4遺伝子産物並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRファミリーパイリンドメイン含有3(NLRP3)遺伝子産物の複合体を、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させる段階を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成り、それによって、NLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化が細胞において阻害される、方法である。いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施態様では、細胞は、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在する。
いくつかの実施態様では、本発明の方法は、更に、NLRC4インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤をその必要がある対象に投与することを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤は、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1(CAS-1)、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(CGAS)、カスパーゼ-4(CAS-4)、インターフェロン遺伝子刺激因子-1(STING1)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害剤は短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これはNLRC4、NLRP3、CAS-1、CGAS、CAS-4、STING、PPIF、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害剤は抗体又はその抗原結合断片であり、これは、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する。
本発明は、いくつかの実施態様では、NLRC4によって誘導されるIL-1βが細胞から放出されることを阻害するための方法にもまた関する。いくつかの実施態様では、方法は、NLRC4遺伝子産物並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRファミリーパイリンドメイン含有3(NLRP3)遺伝子産物の複合体をヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させることを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、それによって、細胞からのNLRC4によって誘導されるIL-1β放出が阻害される。いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施態様では、細胞は、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在する。いくつかの実施態様では、NLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化及び/又はNLRC4によって誘導されるIL-1β放出は、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状に関連する。いくつかの実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状は、網膜色素上皮(RPE)の疾患、任意に加齢黄斑変性(AMD)及び/又は地図状萎縮である。
いくつかの実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状は、移植片対宿主病、慢性疼痛、増殖性硝子体網膜症、緑内障、関節リウマチ、多発性硬化症、双極性障害、大うつ病性障害、腎線維症、腎炎、肺線維症、ハンチントン病、骨粗鬆症、慢性リンパ性白血病、不安障害、肺結核、閉経後の女性及び骨折患者における骨粗鬆症、全身性エリテマトーデス、慢性炎症性及び神経障害性疼痛、常染色体優性多発性嚢胞腎、脊髄損傷、アルツハイマー病、神経障害性疼痛、高血圧、静脈瘤、I型糖尿病、II型糖尿病、痛風、自己免疫性肝炎、グラフト血管損傷、動脈硬化、血栓症、メタボリックシンドローム、唾液腺炎症、外傷性脳損傷、虚血性心疾患、虚血性脳卒中、パーキンソン病、メラノーマ、神経芽腫、前立腺、乳、皮膚、及び甲状腺癌、早期管状腺胃癌、神経内分泌癌、ムコイド結腸癌、結腸癌;高異型度尿路上皮癌、淡明型腎細胞癌、未分化卵巣癌、乳頭嚢胞内乳癌、グラム陰性敗血症、感染性緑膿菌、ビブリオコレラ、レジオネラspp.、フランシセラspp.、リーシュマニアspp、SARS-CoV、SARS-CoV-2、及びクラミジアspp.、クライオピリノパチー;角膜炎、尋常性ざ瘡、クローン病、潰瘍性大腸炎、過敏性腸症候群、インスリン抵抗性、肥満、溶血性尿毒症症候群、ポリオーマウイルス感染、免疫複合体型腎疾患、急性尿細管障害、ループス腎炎、家族性寒冷自己炎症性症候群、マックル・ウェルズ症候群及び小児多臓器系炎症性疾患、慢性乳児神経皮膚関節自己炎症性疾患、腎虚血灌流障害、糸球体腎炎、クリオグロブリン血症、全身性血管炎、IgA腎症、マラリア、寄生蠕虫、敗血症性ショック、アレルギー性喘息、枯草熱、慢性閉塞性肺疾患、薬剤性肺炎症、接触皮膚炎、らい病、バークホルデリア・セノセパシア感染、呼吸器合胞体ウイルス感染、乾癬、強皮症、反応性関節炎、嚢胞性線維症、梅毒、シェーグレン症候群、炎症性関節疾患、非アルコール性脂肪肝疾患、心臓手術(周術期/術後炎症)、急性及び慢性臓器移植拒絶、急性及び慢性骨髄移植拒絶、並びに腫瘍血管新生からなる群から選択される。
いくつかの実施態様では、本発明の方法は、更に、NLRC4インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤をその必要がある対象に投与することを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、少なくとも1つの追加の阻害剤は、アンチセンスオリゴヌクレオチド、短鎖干渉RNA(siRNA)、短鎖ヘアピンRNA(shRNA)、抗体、又はその抗原結合断片からなる群から選択される。いくつかの実施態様では、阻害剤は短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これは、NLRC4、NLRP3、CAS-1、CGAS、CAS-4、STING、PPIF、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。
いくつかの実施態様では、本発明は、対象におけるAluによって誘導される網膜色素細胞(RPE)変性を阻害するための方法に関する。いくつかの実施態様では、方法は、対象の細胞においてNLRC4遺伝子産物並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRファミリーパイリンドメイン含有3(NLRP3)遺伝子産物の複合体をヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させることを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、それによって、細胞からのNLRC4によって誘導されるIL-1β放出が阻害される。いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施態様では、細胞は、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在するRPE細胞である。
いくつかの実施態様では、本発明の方法は、更に、RPEを分解から保護するように設計された少なくとも1つの追加の処置を対象に施すことを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、少なくとも1つの追加の処置は、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(cGAS)、カスパーゼ-4、インターフェロン遺伝子刺激因子(STING)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施態様では、阻害剤は短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これはNLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害剤は抗体又はその抗原結合断片であり、これはNLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する。
本発明は、いくつかの実施態様では、また、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状を処置及び/又は防止することに使用するための組成物に関する。いくつかの実施態様では、この組成物はヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。
本発明は、いくつかの実施態様では、NLRC4によって誘導されるIL-1βが細胞から放出されることを阻害することに使用するための組成物にもまた関し、組成物は、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。
本発明は、いくつかの実施態様では、対象におけるAluによって誘導される網膜色素細胞(RPE)変性を阻害することに使用するための組成物にもまた関し、組成物は、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。
本発明の組成物のいくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施態様では、組成物は眼部送達のために製剤される。
いくつかの実施態様では、組成物は、更に、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(cGAS)、カスパーゼ-4、インターフェロン遺伝子刺激因子(STING)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害剤は短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これは、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害剤は抗体又はその抗原結合断片であり、これは、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する。
従って、NLRファミリーCARDドメイン含有4(NLRC4)インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状を処置及び/又は防止するための組成物及び方法を提供することが、本発明の目的である。
この及び他の目的は全体的に又は部分的に本発明によって達成される。更に、本発明の目的が上で申し立てられたが、本発明の他の目的及び利点は次の記載、図、及び実施例の研究の後に当業者には明らかになるであろう。加えて、本発明の種々の態様及び実施態様が下に更に詳細に記載される。
マウスマクロファージ(BMDM)におけるSINE-RNAによって誘導されるNLRC4リン酸化(部位S533)。マウス骨髄由来マクロファージ(BMDM)がSINE-RNA(それぞれ100pmolのAlu(配列番号86)、B1(配列番号87)、及びB2(配列番号88))、及びポリI:C(10μg/ml)によって処置された。リン酸化Nlrc4(p-Nlrc4)及びトータルNlrc4(t-Nlrc4)がウエスタンブロットによって検出された。アクチンはローディング対照として提供されている。p-NLRC4バンドは黒色矢印によって指示された。 蛋白質キナーゼCデルタによるSINE-RNAによって誘導されるNLRC4リン酸化(部位S533)。LRRK2キナーゼ阻害剤gsk2578215a(GSK;5-(2-フルオロ-4-ピリジニル)-2-(フェニルメトキシ)-N-3-ピリジニル-ベンズアミド;CAS番号1285515-21-0;シグマアルドリッチ、セントルイス、ミズーリ、米国)又はPKCデルタ阻害剤ロットレリン(CAS番号82-08-6;シグマアルドリッチ)によって2μM又は5μMで前処置され、AluRNA(配列番号86)トランスフェクション又はトランスフェクション試薬単独(モック)によって処置されたBMDM細胞。NLRC4リン酸化(P-NLRC4)及び上清カスパーゼ-1活性化がSDS-PAGEによって検出された。結果は、AluRNA(配列番号86)トランスフェクションがNLRC4リン酸化及びカスパーゼ-1前駆体(プロ)の切断を誘導するということを示した。これはカスパーゼ-1の活性形態(蛋白質サイズは~20kDaであり、p20と標識されている)を細胞培地(上清)に放出する。PKCデルタ阻害剤のロットレリンはAluRNAによって誘導されるNLRC4リン酸化及びカスパーゼ-1活性化をブロックした。p-NLRC4及びカスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示された。 SINE-RNAによって誘導されるASCオリゴマー化はNLRC4に依存する(BMDM)。図3A.Alu(配列番号86)もしくはB2(配列番号88)RNA又はトランスフェクション試薬のみ(モック)によってトランスフェクションされた後のBMDMにおける内在性のASCスペック及びNLRC4斑点の免疫蛍光画像。結果はSINE-RNA(Alu及びB2、それぞれ配列番号86及び88)がASCスペックの形成を誘導するということを示した。これはインフラマソーム活性化のホールマークである(矢印で指示されている)。その上、NLRC4蛋白質は斑点としてアセンブリし、ASCスペックと共存した。図3B.ASCオリゴマー化が架橋及びウエスタンブロットによって野生型及びNlrc4-/-BMDMにおいて評価された。結果は、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるASCオリゴマー化がNlrc4-/-BMDMにおいて損なわれるということを示した。オリゴマーASC蛋白質のバンドは黒色矢印によって指示された。 AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4蛋白質オリゴマー化。マウスBMDMがAluRNA(配列番号86;100pmol)によって指示されている時点において処置された。NLRC4オリゴマーがトリス-グリシンネイティブPAGEによって検出された。ローディング対照はアクチンによって示されている。結果は、AluRNA(配列番号86)トランスフェクションがNLRC4オリゴマーの形成を誘導するということを示した。これはAluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4インフラマソームのアセンブリ及び活性化を指示する。オリゴマーNLRC4蛋白質のバンドは黒色矢印によって指示された。 NLRC4欠損はAluRNA(配列番号86)によって誘導されるインフラマソームをブロックする(BMDM)。図5A.野生型及びNlrc4-/-BMDMがAluRNA(配列番号86)、B2RNA(配列番号88)、ポリ(I:C)、又はモックによってトランスフェクションされた。NLRC4、NLRP3、及びアクチンの発現が細胞ライセートのイムノブロットによって検出された。カスパーゼ-1前駆体(p45)の切断及びカスパーゼ-1の活性形態(p20)の放出は上清のイムノブロットによって測定された。結果は、SINE-RNA(Alu及びB2。それぞれ配列番号86及び88)によって誘導されるカスパーゼ-1切断がNlrc4-/-BMDMにおいて損なわれるということを示した。カスパーゼ-1(p20)のバンドは黒色矢印によって指示された、図5B.野生型及びNlrc4-/-BMDMがAlu(配列番号86)、B2RNA(配列番号88)、ポリ(I:C)、又はモックによってトランスフェクションされた。IL-1β放出がELISAによって測定された。結果は、SINE-RNAによって誘導されるIL-1β放出がNlrc4-/-BMDMにおいてブロックされたということを示している。データは平均±SEMとして示されている。**p<0.01;***p<0.001。 CLIP-質量分析はDdx5/Ddx17が可能性としてAluRNA(配列番号86)に結合するということを同定した。図6A.個々の同定されたAluRNA結合蛋白質についてのCLIP-LC-MS/MSの散布図。対応する-log10(P値)に対してプロットされたバックグラウンド(ビオチン)と比較したベイト特異的な蛋白質濃縮(ビオチン化AluRNA;配列番号86)の(メジアンlog(~倍の変化))について、定量分析がフィッシャーの正確確率検定によって行われた。横の点線はlog(~倍の変化)カットオフを表し、縦線はそのP値カットオフを表す。図6B.ビオチン-AluRNA(配列番号86)サンプルに濃縮されたトータルスペクトル数の定量。DDX5及びDDX17の濃縮されたピークは黒色矢印によって指示された。 蛍光染色はヒトRPE細胞におけるDdx17及びBtn-AluRNA(配列番号86)の共局在を示す。ヒトRPE細胞がビオチン標識AluRNA(btn-Alu;配列番号86)によって処置された。内在性のDdx17及びbtn-AluRNA(配列番号86)の二重染色はDdx17及びAluRNA(配列番号86)の間の共(co-co)共局在を示す。結果は、AluRNA(配列番号86)トランスフェクションがDDX17蛋白質の核から細胞質への移行を誘導し、DDX17がAluRNA(配列番号86)と共局在するということを示した。DDX17及びAluRNA(配列番号86)二重陽性シグナルは白色矢印によって指示された。 AluRNA(配列番号86)及びDdx17相互作用についてのCLIP(架橋免疫沈降)。ヒトHEK293細胞がbtn-AluRNA(配列番号86)によってトランスフェクションされ、紫外光によって架橋され、ビオチン-ストレプトアビジンによってプルダウンされた。Ddx17の結合がウエスタンブロットによって決定された。図8A.ビオチン又はmycタグによって媒介される免疫沈降にのためのCLIP(架橋免疫沈降)の概略図。図8B.ビオチン-AluRNA(配列番号86)のストレプトアビジンプルダウン(IP)の結果は、DDX17が細胞内で物理的にAluRNA(配列番号86)に結合するということを示している。WCLは全細胞ライセートである。AluRNA(配列番号86)によるプルダウンされたDDX17蛋白質のバンドは黒色矢印によって指示された。図8C.HEK293細胞がmycタグ付きDDX17及びビオチン-AluRNA(配列番号86)によってトランスフェクションされた。細胞が架橋され、ライセートは抗mycビーズによる免疫沈降のためであった。トータルRNAが抽出され、そして(and were)AluRNA(配列番号86)がノーザンブロットによって検出された。結果は、AluRNA(配列番号86)が細胞内でDDX17と相互作用するということを示した。myc-DDX17蛋白質によるプルダウンされたAluRNA(配列番号86)のバンドは黒色矢印によって指示された。 BMDM細胞におけるDDX17及びNLRC4のAluRNA(配列番号86)によって誘導される共局在。野生型BMDM細胞がAluRNA(配列番号86)によって処置された。内在性のDdx17及びNLRC4蛋白質の局在が蛍光染色によって検出された。結果は、AluRNA(配列番号86)処置がDDX17及びNLRC4の共局在を誘導するということを示した。これは、AluRNA(配列番号86)がDDX17-NLRC4アセンブリ及びNLRC4インフラマソーム活性化を誘導したということを暗示している。DDX17及びNLRC4二重陽性シグナルは白色矢印によって指示された。 共免疫沈降はAluRNA(配列番号86)処置後のDDX17及びNLRC4の相互作用を同定した。HEK293細胞がFlagタグ付きNLRC4プラスミド及びAluRNA(配列番号86)によってトランスフェクションされた。Flag免疫沈降が種々のライセートによって行われた。結果は、AluRNA(配列番号86)処置がNLRC4及びDDX17の間の相互作用を誘導するということを示した。免疫沈降されたDDX17及びNLRC4蛋白質は黒色矢印によって指示された。
そのマイクロプロセッサ機能に非依存的なAluRNA(配列番号86)によって誘導されるインフラマソームに関わるDdx17。DDX17はDDX5及びDroshaとのマイクロプロセッサ複合体のコンポーネントである。DDX17のマイクロプロセッサ機能がAluRNA(配列番号86)によって誘導されるインフラマソームのために要求されるかどうかを試験するために、我々はTHP細胞におけるカスパーゼ-1活性化をDDX5又はDroshaノックダウン(DDX5のsiRNA:GGAAAUUACAGUUAGAGGU;配列番号89);DroshaのsiRNA:GACAAGUUGAUAGGAUAUA;配列番号90)によって測定した。図11A.THP1細胞におけるDdx5ではなくsiRNAによって媒介されるDdx17ノックダウンは、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるカスパーゼ-1活性化をブロックした。図11B.siRNAによって媒介されるDroshaノックダウンは、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるカスパーゼ-1活性化に影響しなかった。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示された。 DDX17ノックダウンはAluRNA(配列番号86)によって誘導されるASCオリゴマー化及びIL-1β放出をブロックする。図12A.THP1細胞におけるDdx5(DDX5のsiRNA:GGAAAUUACAGUUAGAGGU;配列番号89)ではなくsiRNAによって媒介されるDDX17ノックダウン(DDX17のsiRNA:CCAAUCUGAUGUAUCAGGA;配列番号91)は、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるASCオリゴマー化をブロックした。ASCオリゴマーのバンドは黒色矢印によって指示された。図12B.THP1細胞におけるDdx5ではなくsiRNAによって媒介されるDDX17ノックダウンは、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるIL-1β放出をブロックした。 Ddx17欠損はAluRNA(配列番号86)によって誘導されるインフラマソームをBMDMにおいてブロックする。Ddx17-/-iBMDM細胞はAluRNA(配列番号86)によって誘導されるカスパーゼ-1活性化(図13A)及びIL-1β放出(図13B)をブロックした。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示された。 Ddx17ノックダウンはAluRNA(配列番号86)によって誘導されるIFNI応答及び炎症プライミングに影響しない。野生型BMDM細胞がDDX17上のsiRNA標的(CCAAUCUGAUGUAUCAGGA;配列番号91)によってトランスフェクションされ、それから、24時間後に、BMDM細胞がAluRNA(配列番号86;100pmol)によって処置された。トータルRNAがqPCRアッセイのために抽出された。結果は、Ddx17ノックダウンが、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるI型インターフェロン応答(CXCL10、IFNB;図14A)又は炎症プライミング(IL-1β(IL1b)、カスパーゼ-1(CASP1);図14B)に影響しないということを示した。 DDX17ノックダウンは古典的なNLRC4及びNLRP3インフラマソームに影響しない。THP1細胞がDDX17上のsiRNA標的(siRNA配列:CCAAUCUGAUGUAUCAGGA;配列番号91)によってトランスフェクションされ、それから、24時間後に、フラジェリン(3μg/ml)又はLPS(125ng/ml)プラスATP(50mM/30分)、DOTAPプラスLPSがTHP1細胞に追加された。上清がカスパーゼ-1検出のために収集された。結果は、配列番号91によるDDX17ノックダウンが古典的なNLRC4インフラマソーム及びNLRP3インフラマソームに影響しないということを示した。ローディング対照はアクチンによって示されている。カスパーゼ-1前駆体はp45、カスパーゼ-1の活性形態はp20と言われる。インフラマソームアセンブリのアダプター蛋白質のCARD含有アポトーシス関連スペック様蛋白質(ASC)がASCと標識されている。カスパーゼ-1p20)バンドは黒色矢印によって指示された。 DDX17に結合するAluRNA(配列番号86)はNLRC4及びNLRP3の二重リクルートを誘導する。AluRNA(配列番号86)によって処置された野生型及びDdx17-/-iBMDM細胞が12時間後に収集された。細胞ライセートがNLRP3抗体によって免疫沈降され、指示されている抗体によってイムノブロットされた。NLRP3-IPによる免疫沈降されたNLRC4蛋白質のバンドは黒色矢印によって指示された。 NLRC4欠損はAluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRP3-ASC相互作用をブロックする(BMDM)。図17A.AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRP3-ASC相互作用はNlrc4-/-BMDMではなくなった。ASC-IPによる免疫沈降されたNLRP3蛋白質のバンドは黒色矢印によって指示された。図17B.AluRNA(配列番号86)によって誘導されるASCオリゴマー化はNlrp3-/-BMDMではブロックされた。ASCオリゴマーのバンドは黒色矢印によって指示されている。 NLRP3欠損はSINE-RNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4インフラマソームをBMDMにおいてブロックする。AluRNA(配列番号86)によって誘導されるカスパーゼ-1活性化(図18A)及びILl-β放出(図18B)はNlrp3-/-BMDMにおいて損なわれた。***p<0.001。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示されている。 NAIPはAluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4インフラマソームに不可欠ではない(BMDM)。図19A.フラジェリンによって誘導されるカスパーゼ-1活性化及びIL-1β放出はNaip-/-BMDM(Naip1~6Δ/Δと言われる(referred as))において損なわれた。図19B.AluRNA(配列番号86)によって誘導されるカスパーゼ-1切断及びIL-1β放出はNaip-/-BMDMでは影響されなかった。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示されている。 DDX17-NLRC4-NLRP3はDicer1ノックダウンによって誘導されるインフラマソーム活性化に要求される。図20A.Dicer1ノックダウン(Dicer1のsiRNA:GCAGUUGUCCUAAACAGAU;配列番号92)はp-NLRC4の増大及びカスパーゼ-1活性化を引き起こす。これらはDdx17-/-iBMDMではブロックされた。図20B.Dicer1ノックダウンによって誘導されるカスパーゼ-1切断はNlrc4-/-及びNlrp3-/-BMDMにおいて損なわれた。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示されている。
ドライAMDのRPE組織におけるDdx17-Nlrc4シグナル伝達の発現レベル。図21A.ドライAMD患者からのRPE組織のライセートによるDdx17、Nlrc4、PKCDのイムノブロットは、ドライAMDサンプルにおける有意に上方制御されたDdx17蛋白質を示した。図21B:図21Aのイムノブロットのスキャンからの注記されている蛋白質の相対レベルの棒グラフ。DDX17バンドは黒色矢印によって指示されている。 DDX17はドライAMDのヒトドナー眼のRPEにおいてNLRC4と相互作用する。インサイチュのDDX17及びNLRC4の間の相互作用を捕捉するために、我々はドライAMD又は健康な対照のドナー眼のヒト組織切片によって近接ライゲーションアッセイ(PLA)を行った。結果は、DDX17がドライAMDのドナー眼のRPEにおいてNLRC4と相互作用したということを示している。これは、DDX17-NLRC4複合体のアセンブリがヒトドライAMDにおいて生起するということを指示した。DDX17-NLRC4複合体の陽性シグナルは黒色矢印によって指示されている。 NLRC4高活性型蛋白質の外因的発現はRPE変性を誘導する。RPEにおけるNLRC4活性化の帰結を試験するために、ヒトNLRC4蛋白質の野生型(pNLRC4WT)及び高活性型変異体(pNLRC4T337S)をコードする500ngのプラスミドがインビボのマウスRPE細胞に形質導入された。我々の結果はNLRC4活性化がRPE変性を引き起こすということを示した。図23A.眼底画像は高活性型NLRC4蛋白質によって誘導されるRPE変性を示した。RPE変性を原因とする高密度エリアは白色矢印によって指示されている。図23B.蛍光画像はNLRC4T337S発現細胞における遮断されたZO-1染色を示した。ZO-1無秩序化のRPEエリアは白色矢印によって指示されている。 ヒトRPE細胞におけるAluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4活性化。AluRNA(配列番号86)がヒトRPEにおけるNLRC4活性化を誘導するかどうかを試験するために、我々はヒトRPEをAluRNA(配列番号86、100pmol)によってトランスフェクションした。図24A.NLRC4の免疫蛍光染色は、AluRNA(配列番号86)がhRPE細胞におけるサイトゾルNLRC4斑点を誘導したということを示している。AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4集合体が白色矢印によって指示されている。図24B.AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4(p-NLRC4)リン酸化及びオリゴマー化。ローディング対照はアクチンによって示されている。NLRC4オリゴマーはトリス-グリシンネイティブPAGEによって検出された。データはAluRNA(配列番号86)がヒトRPEにおけるNLRC4活性化を誘導するということを実証した。NLRC4オリゴマーのバンドは黒色矢印によって指示されている。 NLRC4ノックダウンはAluRNA(配列番号86)によって誘導されるASCオリゴマー化及びRPE変性をブロックする。ヒトRPE細胞がNLRC4(NLRC4のスマートプールsiRNA:CAACUGGGCUCCUCUGUAA;配列番号93)及びNAIP(NAIPのスマートプールsiRNA:GUAAAGAGCUAUAUGGAUA;配列番号94)上のsiRNA標的によって処置され、24時間後に、AluRNA(配列番号86、100pmol)によって処置された。図25A.イムノブロットは、NAIPではなくNLRC4ノックダウンが、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるASCオリゴマー化を縮減したということを示している。ASCオリゴマーのバンドは黒色矢印によって指示された。図25B.眼底画像及びZO-1蛍光画像は、NLRC4ノックダウンが、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるRPE変性をブロックしたということを示している。眼底画像のRPE変性及びRPEシートのZO-1無秩序化を原因とする高密度エリアは白色矢印によって指示されている。 DDX17-NLRC4シグナル伝達に干渉すること(interfering)は、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるRPE変性をブロックする。C57/B6マウスの野生(wilde)型がDdx17上のsiRNA標的(Ddx17のsiRNA:GGCUAGAUGUGGAAGAUGU;配列番号95)を硝子体注射され、2日後に、Nlrc4-/-、Naipl-6-/-マウス、及びDdx17ノックダウンマウスがAluRNA(配列番号86)を網膜下注射された。眼底画像及びZO-1蛍光画像は、NaipではなくDdx17及びNlrc4に干渉することが、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるRPE変性をブロックするということを示した。眼底画像のRPE変性及びRPEシートのZO-1無秩序化を原因とする高密度エリアは白色矢印によって指示されている。 NRTIはフラジェリンによって誘導されるNLRC4インフラマソームをBMDMにおいてブロックする。野生型BMDM細胞が例示的なNRTI(D4T、3TC)によって100μMで1時間に渡って前処置され、それから、フラジェリントランスフェクション(3μg/ml)によって刺激された。上清及び細胞ライセートがカスパーゼ-1検出のために収集された。結果は、NRTI処置がフラジェリンによって誘導されるカスパーゼ-1活性化を縮減するということを示した。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示されている。 NRTI(3TC)はフラジェリンによって誘導されるNLRC4インフラマソームを用量依存的な様式でブロックする。野生型BMDM細胞が指示されているドーズのNRTI(3TC)によって1時間に渡って前処置され、それから、フラジェリントランスフェクション(3μg/ml)によって刺激された。上清がカスパーゼ-1検出のために収集された。結果は、NRTIがフラジェリンによって誘導されるカスパーゼ-1活性化を用量依存的な様式で阻害するということを示した。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示されている。 NRTI(3TC)はフラジェリンによって誘導されるNLRC4オリゴマー化を用量依存的な様式でブロックする。野生型BMDM細胞が指示されているドーズのNRTI(3TC)によって1時間に渡って前処置され、それから、フラジェリントランスフェクション(3μg/ml)によって刺激された。細胞ペレットがネイティブPage電気泳動によるNLRC4オリゴマー検出のために収集された。結果は、NRTI3TCがフラジェリンによって誘導されるNLRC4オリゴマー化を阻害するということを示した。NLRC4オリゴマーのバンドは黒色矢印によって指示されている。 NRTI(3TC)はフラジェリンによって誘導されるインターロイキン1ベータ産生をブロックする。野生型BMDM細胞が指示されているドーズのNRTI(3TC)によって1時間に渡って前処置され、それから、フラジェリントランスフェクション(3μg/ml)によって刺激された。上清が収集され、分泌IL-1βについてアッセイされた。結果は、フラジェリンがIL-1β前駆体(蛋白質サイズは30kDである;p30)の切断及び細胞培地(上清)中へのIL-1βの活性形態(蛋白質サイズは17kDである:p17)の放出を誘導するということを示した。NRTIはフラジェリンによって誘導されるIL-1β放出を阻害した。切断されたIL-1βのバンドは黒色矢印によって指示されている。
修飾NRTI(K8、K9)はBMDMにおけるフラジェリンによって誘導されるNLRC4インフラマソームをブロックする。野生型BMDM細胞が通常のNRTI(D4T、3TC)、修飾NRTIの3-メチル-3TC(K9)もしくは2-エチル-AZT(K8)、又はNLRP3阻害剤(MCC950、CY-09)によって1時間に渡って前処置され、それから、フラジェリントランスフェクション(3μg/ml)によって刺激された。上清が分泌カスパーゼ-1検出のために収集された。結果は、修飾NRTIがフラジェリンによって誘導されるカスパーゼ-1活性化を阻害するということを示した。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示されている。 NRTIはフラジェリンによって誘導されるNLRC4インフラマソームをNLRP3依存的な様式でブロックする。NLRP3ノックアウトBMDM細胞が通常のNRTI(D4T、3TC)又はNLRP3阻害剤(MMC950、CY-09)によって1時間に渡って前処置され、それから、フラジェリントランスフェクション(3μg/ml)によって刺激された。上清がカスパーゼ-1検出のために収集された。結果は、修飾NRTIがフラジェリンによって誘導されるカスパーゼ-1活性化をNLRP3ノックアウトBMDMでは阻害しないということを示した。カスパーゼ-1(p20)バンドは黒色矢印によって指示されている。 NRTIは再構成系において直接的にNLRP3/NLRC4複合体に結合する。HEK293細胞がNLRC4及びNLRP3によってトランスフェクションされた。ビオチン標識NRTI(D4T、AZT)がHEK細胞に4時間後に追加され、細胞ペレットがビオチンストレプトアビジンプルダウンのために収集された。NRTI及びNLRC4/NLRP3の間の結合がイムノブロットによって検出された。結果は、ビオチン標識NRTIが直接的にNLRC4及びNLRP3蛋白質に結合し得るということを示した。ビオチン化NRTIによってプルダウンされたNLRC4及びNLRP3のバンドは黒色矢印によって指示されている。 PKCδ及びNLRC4リン酸化(S533)はAluRNA(配列番号86)によって誘導されるインフラマソーム活性化に要求される。図35A及び35B.野生型、Prkcd-/+、及びPrkcd-/-BMDMがAluRNA(配列番号86、100pmol)によって12時間に渡ってトランスフェクションされた。カスパーゼ-1、IL-1β切断、及びIL-1β放出を測定するために、上清が収集された。細胞ライセートがp-NLRC4、NLRC4、PKCδ、及びアクチンブロッティングのために収集された。結果は、カスパーゼ-1、IL-1β切断、及びIL-1β放出がPrkcd-/-BMDMにおいて損なわれるということを示した。図35C.野生型及びNlrc4S533A/S533ABMDMがAluRNA(配列番号86、100pmol)によって12時間に渡ってトランスフェクションされた。ELISAによってIL-1β放出を測定するために、上清が収集された。結果は、IL-1β放出がNlrc4S533A/S533ABMDMにおいて損なわれるということを示した。p-NLRC4及びカスパーゼ-1(p20)のバンドが黒色矢印によって指示されている。 PKCδによって媒介されるNLRC4リン酸化はAluRNA(配列番号86)によって誘導されるRPE変性に要求される。野生型、Prkcd-/-、及びNlrc4S533A/S533AマウスがAluRNA(配列番号86)を網膜下注射された。眼底画像(図36A)及びZO-1(図36B)フラットマウント蛍光画像は、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるRPE変性がPrkcd-/-及びNlrc4S533A/S533Aマウスではブロックされるということを示した。眼底画像のRPE変性及びRPEシートのZO-1無秩序化を原因とする高密度エリアは白色矢印によって指示されている。 AluRNA(配列番号86)はヒト細胞におけるDDX17移行を誘導する。ヒト単球(THP-1)がAluRNA(配列番号86、100pmol)によってLIPOFECTAMINE(商標)3000ブランドトランスフェクション試薬(リポ;サーモフィッシャーサイエンティフィック)を用いてトランスフェクションされた。細胞ライセートが収集され、細胞分画に付された。DDX17及びヒストンH3のイムノブロットが用いられて、DDX17の細胞内分布を評価した。結果は、AluRNA(配列番号86)処置が核から細胞質へのDDX17移行を誘導し、DDX17がサイトゾルAluRNA(配列番号86)と共局在したということを示している。細胞核及び細胞質のDDX17のバンドは黒色矢印によって指示された。 AluRNA(配列番号86)はNLRC4及びNLRP3複合体のアセンブリを誘導する。ヒトRPE細胞がビオチン化AluRNA(配列番号86、100pmol)によってLIPOFECTAMINE(商標)3000ブランドトランスフェクション試薬(リポ;サーモフィッシャーサイエンティフィック)によってトランスフェクションされた。NLRC4及びNLRP3複合体のアセンブリが近接ライゲーションアッセイ(PLA)によって評価された。結果は、AluRNA(配列番号86)トランスフェクションがヒトRPE細胞におけるNLRC4及びNLRP3複合体のアセンブリを誘導するということを示した。NLRC4-NLRP3複合体のシグナルは白色矢印によって指示されている。 DDX17の発現はドライAMDのヒトドナー眼のRPEにおいて増大している。インサイチュのヒト眼におけるDDX17及びNLRC4発現を測定するために、我々は免疫組織化学によってドライAMDのヒトドナー眼又は健康な対照におけるDDX17蛋白質(図39A)及びNLRC4蛋白質(図39B)のレベルを検出した。結果は、DDX17の発現がドライAMDのヒトドナー眼のRPEにおいて増大しているということを指示した。DDX17及びNLRC4シグナルは黒色矢印によって指示されている。
配列表の簡単な説明
配列番号1は、ヒトNLRファミリーCARDドメイン含有4(NLRC4)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_021209.4に対応する。
配列番号2は配列番号1によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_067032.3に対応する。
配列番号3~6は、配列番号1のヌクレオチド配列及び他のヒトNLRC4遺伝子産物を標的化する例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号7はマウスNLRファミリーCARDドメイン含有4(Nlrc4)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_001033367.3に対応する。
配列番号8は配列番号7によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_001028539.1に対応する。
配列番号9~20は、配列番号7のヌクレオチド配列及び他のマウスNlrc4遺伝子産物を標的化する例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号21はヒトDEADボックスヘリカーゼ17(DDX17)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_006386.5に対応する。
配列番号22は配列番号21によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_006377.2に対応する。
配列番号23~27は、配列番号21のヌクレオチド配列及び他のヒトDDX17遺伝子産物を標的化する例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号28はマウスDEADボックスヘリカーゼ17(Ddx17)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_001040187.1に対応する。
配列番号29は配列番号28によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_001035277.1に対応する。
配列番号30~34は、配列番号28のヌクレオチド配列及び他のマウスDdx17遺伝子産物を標的化する例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号35はヒトNLRファミリーパイリンドメイン含有3(NLRP3)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_004895.5に対応する。
配列番号36は配列番号35によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_004886.3に対応する。
配列番号37はマウスNLRファミリーパイリンドメイン含有3(Nlrp3)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_001359638.1に対応する。
配列番号38は配列番号37によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_001346567.1に対応する。
配列番号39はヒトカスパーゼ-1(CASP1)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_033292.4に対応する。
配列番号40は配列番号39によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_150634.1に対応する。
配列番号41はマウスカスパーゼ-1(Casp1)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_009807.2に対応する。
配列番号42は配列番号41によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_033937.2に対応する。
配列番号43はヒトカスパーゼ-4(CASP4)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_001225.4に対応する。
配列番号44は配列番号43によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_001216.1に対応する。
配列番号45は、配列番号43のヌクレオチド配列及び他のヒトCASP4遺伝子産物を標的化する例示的なshRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号46~51は、配列番号43のヌクレオチド配列及び他のヒトCASP4遺伝子産物を標的化する例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号52はマウスカスパーゼ-4(Casp4)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_007609.3に対応する。
配列番号53は配列番号52によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_031635.2に対応する。
配列番号54はヒトサイクリックGMP-AMPシンターゼ(CGAS)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_138441.3に対応する。
配列番号55は配列番号54によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_612450.2に対応する。
配列番号56及び57は、配列番号54のヌクレオチド配列及び他のヒトCGAS遺伝子産物を標的化する例示的なshRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号58は、配列番号54のヌクレオチド配列及び他のヒトCGAS遺伝子産物を標的化する例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号59はマウスサイクリックGMP-AMPシンターゼ(Cgas)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_173386.5に対応する。
配列番号60は配列番号59によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_775562.2に対応する。
配列番号61はヒトインターフェロン応答cGAMP相互作用因子刺激因子1(STING1)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_198282.4に対応する。
配列番号62は配列番号61によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_938023.1に対応する。
配列番号63は、配列番号61のヌクレオチド配列及び他のヒトSTING1遺伝子産物を標的化する例示的なshRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号64はマウスインターフェロン応答cGAMP相互作用因子刺激因子1(Sting1)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_028261.1に対応する。
配列番号65は配列番号64によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_082537.1に対応する。
配列番号66はヒトペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_005729.4に対応する。
配列番号67は配列番号66によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_005720.1に対応する。
配列番号68は、配列番号66のヌクレオチド配列及び他のヒトPPIF遺伝子産物を標的化する例示的なshRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号69はマウスペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(Ppif)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_134084.1に対応する。
配列番号70は配列番号69によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_598845.1に対応する。
配列番号71はヒトガスダーミンD(GSDMD)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_024736.7に対応する。
配列番号72は配列番号71によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_079012.3に対応する。
配列番号73は、配列番号71のヌクレオチド配列及び他のヒトGSDMD遺伝子産物を標的化する例示的なshRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号74はマウスガスダーミンD(Gsdmd)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_026960.4に対応する。
配列番号75は配列番号74によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_081236.1に対応する。
配列番号76はヒトインターフェロン-ベータ(IFN-β)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_002176.4に対応する。
配列番号77は配列番号76によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_002167.1に対応する。
配列番号78は、配列番号76のヌクレオチド配列及び他のヒトIFN-β遺伝子産物を標的化する例示的なshRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号79はマウスインターフェロン-ベータ(Ifn-β)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_010510.1に対応する。
配列番号80は配列番号79によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_034640.1に対応する。
配列番号81はヒトインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_001384498.1に対応する。
配列番号82は配列番号81によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_001371427.1に対応する。
配列番号83は、配列番号81のヌクレオチド配列及び他のヒトIFNAR遺伝子産物を標的化する例示的なshRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号84はマウスインターフェロン-α/β受容体(Ifnar)遺伝子産物の例示的なヌクレオチド配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NM_010508.2に対応する。
配列番号85は配列番号84によってコードされるアミノ酸配列であり、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースのアクセッションNo.NP_034638.2に対応する。
配列番号86は例示的なAluRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号87は例示的なB1RNAのヌクレオチド配列である。
配列番号88は例示的なB2RNAのヌクレオチド配列である。
配列番号89は、DDX5遺伝子産物に標的化された例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号90は、Drosha遺伝子産物に標的化された例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号91は、DDX17遺伝子産物に標的化された例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号92は、Dicer1遺伝子産物に標的化された例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号93は、NLRC4遺伝子産物に標的化された例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号94は、NAIP遺伝子産物に標的化された例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
配列番号95は、Ddx17遺伝子産物に標的化された例示的なsiRNAのヌクレオチド配列である。
詳細な記載
I.定義
本発明を記載及び請求することには、次の術語が下で提出される定義に従って用いられるであろう。
冠詞「a」及び「an」は本明細書においては冠詞の文法的対象の1つ又は1つよりも多くを(すなわち少なくとも1つを)言うために用いられる。例として、「要素」は1つの要素又は1つよりも多くの要素を意味する。
本明細書において用いられる用語「約」は、およそ、~の領域、大体、又は前後を意味する。用語「約」が数的な範囲と共に用いられるときには、それは、提出される数値よりも上及び下に境界を拡大することによってその範囲を修飾する。例えば、いくつかの実施態様では、用語「約」は本明細書においては、申し立てられた値よりも10%のばらつきだけ上及び下に数値を修飾するために用いられる。よって、約50%は45%~55%の範囲内を意味する。エンドポイントによって本明細書に記載される数的な範囲は、その範囲内に含められる全ての数及び画分を包含する(例えば、1から5は1、1.5、2、2.75、3、3.90、4、及び5を包含する)。全ての数及びそれらの画分は用語「約」によって修飾されると考えられるということもまた理解されるであろう。
本明細書において用いられる言い回し「生体サンプル」は、対象から(例えば、生検、血液、血清など)又は対象からの細胞もしくは組織から(例えば、それから単離されたRNA及び/又はDNA及び/又は蛋白質もしくはポリペプチド)単離されたサンプルを言う。生体サンプルは、いずれかの生物からのいずれかの生体組織又は液又は細胞、並びにインビトロで培養された細胞、例えば細胞株及び組織培養細胞であり得る。頻繁に、サンプルは、対象(すなわち、診断手続き及び/又は処置を経過する対象)に由来するサンプルである「臨床サンプル」であろう。典型的な臨床サンプルは、脳脊髄液、血清、血漿、血液、唾液、皮膚、筋肉、嗅覚組織、涙液、滑液、爪組織、毛髪、大便、尿、組織又は細胞型、及びそれらの組み合わせ、組織又は針生検サンプル、及びそれらからの細胞を包含するが、これらに限定されない。生体サンプルは、組織の切片、例えば組織学目的で取られた凍結切片又はホルマリン固定切片をもまた包含し得る。
「包含する」、「含有する」、又は「特徴とする」と類義である本明細書において用いられる用語「含む」は、包含的又は開放的であり、追加の記載されていない要素及び/又は方法ステップを排除しない。「含む」はクレーム用語に用いられる専門用語であり、これは、名指しされている要素が存在するが、他の要素が追加され得、依然として本発明の範囲内の組成物又は方法を形成し得るということを意味する。限定ではなく例として、特定の活性な薬剤及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物は他のコンポーネントをもまた含有し得る。他の活性な薬剤、他の担体及び賦形剤、並びにいずれかの限定なしに医薬組成物中への包含に適当であり得るいずれかの他の分子を包含するが、これらに限定されない。
本明細書において用いられる言い回し「からなる」は、特に請求項に記載されないいずれかの要素、ステップ、又は成分を排除する。言い回し「からなる」がプリアンブルの直後よりもむしろクレームボディのクローズに現れるときには、それはそのクローズで提出されている要素のみを限定する;他の要素は全体的な請求項から排除されない。限定ではなく例として、活性な薬剤及び薬学的に許容される担体からなる医薬組成物は、その特定の活性な薬剤及び薬学的に許容される担体以外の他のコンポーネントを含有しない。しかるべき検出レベルよりも下であるいずれかの分子は不在であると見なされるということは理解される。
本明細書において用いられる言い回し「から本質的になる」は、規定されている材料又はステップ、プラス請求される主題の基本的なかつ新規の特質(単数又は複数)に実質的に影響しないものに請求項の範囲を限定する。限定ではなく例として、活性な薬剤及び薬学的に許容される担体から本質的になる医薬組成物は、活性な薬剤及び薬学的に許容される担体を含有するが、いずれかの追加の要素をもまた包含し得る。これは存在し得るが、これはインビトロ又はインビボの組成物の生物学的機能に実質的に影響しない。
用語「含む」、「から本質的になる」、及び「からなる」について、これらの3つの用語の1つが本明細書において用いられるところでは、本開示及び請求の主題は他の2つの用語のどちらかの使用を包摂する。例えば、「含む」は「から本質的になる」及び「からなる」両方よりも幅広い移行の用語であり、それゆえに、用語「含む」は「から本質的になる」及び「からなる」両方を暗黙的に包摂する。同様に、移行句「から本質的になる」は「からなる」よりも幅広く、それゆえに、言い回し「から本質的になる」は「からなる」を暗黙的に包摂する。
本明細書において用いられる用語「対象」はいずれかの無脊椎動物又は脊椎動物種のメンバーを言う。従って、用語「対象」は動物界のいずれかのメンバーを包摂することを意図され、脊索動物門(すなわち、硬骨魚(硬骨魚類)、両生(両生類)、爬虫(爬虫類)、鳥(鳥類)、及び哺乳(哺乳動物)綱のメンバー)、並びにそれらに包摂される全ての目及び科を包含するが、これらに限定されない。いくつかの実施態様では、対象はヒトである。
本明細書において開示される全ての遺伝子、遺伝子名、遺伝子産物、及び他の産物は、本明細書において開示される組成物及び方法が適用可能であるいずれかの種からのオーソログ又は他の類似の産物に対応することを意図されるということが注記される。それゆえに、用語はヒト及びマウスからの遺伝子及び遺伝子産物を包含するが、これらに限定されない。特定の種からの遺伝子又は遺伝子産物が開示されるときに、それが現れる文脈が明瞭に指示しない限り、本開示は例示的であることのみを意図され、限定として解釈されるべきではないということは理解される。それゆえに、例えば、本明細書において具体的に言及され、かつ種々の例示的な遺伝子産物のアクセッションNo.がGENBANK(登録商標)バイオ配列データベースに開示されているいずれかの遺伝子は、他の哺乳動物を包含するがこれらに限定されない他の動物及びヒトからの相同な及びバリアントの遺伝子及び遺伝子産物を包摂することを意図される。限定ではなく例として、GENBANK(登録商標)バイオ配列データベースは、中でもヒトNLRC4遺伝子産物のヌクレオチド配列に対応するアクセッションNo.NM_021209.4及びマウスNlrc4遺伝子産物のヌクレオチド配列に対応するNM_001033367.3、並びに中でもヒトDDX17遺伝子産物のヌクレオチド配列に対応するアクセッションNo.NM_006386.5及びマウスDdx17遺伝子産物のヌクレオチド配列に対応するNM_001040187.1を包含する。用語「Nlrc4」は他の動物からのNLRファミリーCARDドメイン含有4遺伝子及び遺伝子産物並びにそれらのバリアントを言い、用語「Ddx17」は他の動物からのDEADボックスヘリカーゼ17(Ddx17)遺伝子及び遺伝子産物並びにそれらのバリアントを言うということが理解される。
本発明の方法は温血脊椎動物にとって特に有用である。それゆえに、本発明は哺乳動物及び鳥類に関係する。より具体的には、哺乳動物、例えばヒト及び他の霊長類、並びにヒトにとって絶滅危惧であることを原因として重要な(例えばシベリアトラ)、経済的に重要な(ヒトによる消費のために農場で育てられる動物)、及び/又は社会的に重要な(ペットとして又は動物園で飼われている動物)哺乳動物、例えばヒト以外の肉食動物(例えばネコ及びイヌ)、ブタ(育成豚、成豚、及びイノシシ)、反芻動物(例えば畜牛、雄牛、ヒツジ、キリン、シカ、ヤギ、野牛、及びラクダ)、齧歯類(例えばマウス、ラット、及びウサギ)、有袋動物、及びウマからの幹細胞の単離、操作、及び使用が企図される。絶滅危惧である動物園で飼われている種類の鳥類、並びにそれらがヒトにとって経済的にもまた重要であるキジカモ類、より具体的には飼育キジカモ類、例えば家禽、例えばシチメンチョウ、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、ホロホロチョウ、及び同類を包含する鳥類への本発明の方法及び組成物の使用もまた提供される。それゆえに、養豚(育成豚及び成豚)、反芻動物、ウマ、家禽、及び同類を包含するがこれらに限定されない家畜からの幹細胞の単離、操作、及び使用もまた企図される。
本明細書において用いられる言い回し「実質的に」は、実体の集合体のコンポーネントのいくつかの実施態様では50%以下、いくつかの実施態様では40%以下、いくつかの実施態様では30%以下、いくつかの実施態様では25%以下、いくつかの実施態様では20%以下、いくつかの実施態様では15%以下、いくつかの実施態様では10%以下、いくつかの実施態様では9%以下、いくつかの実施態様では8%以下、いくつかの実施態様では7%以下、いくつかの実施態様では6%以下、いくつかの実施態様では5%以下、いくつかの実施態様では4%以下、いくつかの実施態様では3%以下、いくつかの実施態様では2%以下、いくつかの実施態様では1%以下、及びいくつかの実施態様では0%以下が所与の特質を有さない条件を言う。
本発明の文脈において用いられる用語「追加の治療活性化合物」又は「追加の治療薬剤」は、処置されようとする特定の傷害、疾患、又は障害への追加の治療使用のための化合物の使用又は投与を言う。例えば、かかる化合物は、無関係の疾患もしくは障害、又は処置されようとする傷害、疾患、もしくは障害の一次処置に対して応答性ではない疾患もしくは障害を処置するために用いられているものを包含し得る。追加の治療活性な薬剤によって処置されようとする疾患及び障害は、例えば高血圧及び糖尿病を包含する。追加の化合物は、疼痛及び炎症を包含するがこれらに限定されない傷害、疾患、又は障害に関連する症状を処置するためにもまた用いられ得る。
本明細書において用いられる用語「成体」はいずれかの非胎児の又は非未成年の対象を言うことを意味される。
本明細書において用いられる「アゴニスト」は、ヒトなどの哺乳動物に投与されるときに、対象における目当ての標的化合物又は分子のレベル又は存在に帰せられ得る生物活性を増強又は拡大する組成物である。
疾患、病状、もしくは障害の症状の重篤度、又はかかる症状が対象によって経験される頻度、あるいは両方が縮減される場合には、疾患あるいは障害は「緩和」される。
本明細書において用いられるアミノ酸は、表1に指示されている通り、その完全な名称、それに対応する3文字コード、又はそれに対応する1文字コードによって表される:
Figure 2022550670000002
本明細書において用いられる表現「アミノ酸」は、天然及び合成アミノ酸両方並びにD及びLアミノ酸両方を包含することを意図される。「標準アミノ酸」は、天然に生起するペプチドに普通に見出される20個の標準L-アミノ酸のいずれかを意味する。「非標準アミノ酸残基」は、それが合成的に調製されるか又は天然のソースに由来するかどうかにかかわらず、標準アミノ酸以外のいずれかのアミノ酸を意味する。本明細書において用いられる「合成アミノ酸」は化学修飾アミノ酸をもまた包摂し、塩、アミノ酸誘導体(例えばアミド)、及び置換を包含するが、これらに限定されない。本発明のペプチド上において、特にカルボキシ又はアミノ末端に含有されるアミノ酸はメチル化、アミド化、アセチル化、又は他の化学基による置換によって修飾され得、これらは、それらの活性に悪影響することなしにペプチドの循環半減期を変化させ得る。加えて、ジスルフィド連結部が本発明のペプチド上に存在し得るか又は不在であり得る。
用語「アミノ酸」は「アミノ酸残基」と交換可能に用いられ、遊離のアミノ酸又はペプチドのアミノ酸残基を言い得る。それが遊離のアミノ酸又はペプチドの残基を言うかどうかは、用語が用いられる文脈から明らかであろう。
アミノ酸は側鎖Rに基づいて7つの群に分類され得る:(1)脂肪族側鎖、(2)ヒドロキシル(OH)基を含有する側鎖、(3)硫黄原子を含有する側鎖、(4)酸性又はアミド基を含有する側鎖、(5)塩基性基を含有する側鎖、(6)芳香族環を含有する側鎖、及び(7)側鎖がアミノ基に融合しているイミノ酸のプロリンである。
本明細書において開示されるペプチド化合物を記載するために用いられる命名法は従来の慣行を踏襲し、アミノ基は各アミノ酸残基の左に、カルボキシ基は右に提示される。別様に規定されない限り、本発明の選択された具体的な実施態様を表す処方において、アミノ及びカルボキシ末端基は、具体的に示されてはいないが、それらが生理的pH値において採るであろう形態であると理解されるであろう。
本明細書において用いられる用語「塩基性」又は「正荷電」アミノ酸は、R基がpH7.0において正味の正電荷を有し、標準アミノ酸リジン、アルギニン、及びヒスチジンを包含するが、これらに限定されないアミノ酸を言う。
化学的な化合物の本明細書において用いられる「アナログ」は、例として、構造が別のものに似ているが必ずしも異性体ではない化合物である(例えば、5-フルオロウラシルはチミンのアナログである)。
「アンタゴニスト」は、ヒトなどの哺乳動物に投与されるときに、対象における目当ての化合物又は分子のレベル又は存在に帰せられ得る生物活性を阻害する組成物である。
本明細書において用いられる用語「アンチセンスオリゴヌクレオチド」又はアンチセンス核酸は、それの少なくとも部分が、正常細胞又は異常細胞に存在する核酸に対して相補的である核酸ポリマーを意味する。「アンチセンス」は、特に、蛋白質をコードする二本鎖DNA分子の非コード鎖の核酸配列、又は非コード鎖に対して実質的に相同である配列を言う。本明細書において定義されるアンチセンス配列は、蛋白質をコードする二本鎖DNA分子の配列に対して相補的である。アンチセンス配列がDNA分子のコード鎖のコード部分だけに対して相補的であるということは必要ではない。アンチセンス配列は、蛋白質をコードするDNA分子のコード鎖上に規定される制御配列に対して相補的であり得る。この制御配列はコード配列の発現をコントロールする。本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドはホスホロチオエートオリゴヌクレオチド及びオリゴヌクレオチドの他の修飾を包含するが、これらに限定されない。
本明細書において用いられる用語「自家」は、天然にかつ正常では体のある種の型の組織に又は特定の構造に生起する何かを言う。移植では、それは、ドナー及びレシピエントエリアが同じ個体にある移植片を、又はドナーが先に献血し、それから通常は手術の間に再度受け取る血液を言う。
本明細書において用いられる用語「生体適合性」は実質的な有害な応答をホストに誘発しない材料を言う。
本明細書において用いられる用語「生分解性の」は、生体によって分解されることができることを意味する。生分解性の材料が生体によって単位へと分解され得、これらが生体系から取り除かれ得るか及び/又は生体系に化学的に組み込まれ得るかどちらかであるという点で、生分解性の材料は非生分解性の材料とは異なる。
本明細書において用いられる用語「生体サンプル」は、生きている生物から得られるサンプルを言い、皮膚、毛髪、組織、血液、血漿、細胞、汗、及び尿を包含する。
本明細書において用いられる用語「生体吸収性」はインビボで吸収される材料の能力を言う。「完全な」吸収は、有意な細胞外断片が残らないということを意味する。吸収プロセスには、体液、酵素、又は細胞の作用による元のインプラント材料の消去が関わる。例えば、吸収された炭酸カルシウムは、骨塩としてもしくは体内で別様に再利用されることによって再定着し得るか、又は排泄され得る。用語が本明細書において用いられる「強く生体吸収性」は、インプラントされた材料のトータルの質量の少なくとも80%が1年以内に吸収されるということを意味する。
言い回し「細胞培養培地(cell culture medium)」、「培養培地(culture medium)」(各ケースにおいて複数は「培地(media)」)、及び「培地製剤」は、細胞を培養するための栄養溶液を言い、交換可能に用いられ得る。
「馴化培地」は、細胞又は組織の第1の集団を培地によって培養することと、それから培地を収穫することとによって調製されるものである。それから、馴化培地は(細胞によって培地中に分泌されるいずれかのものと併せて)、例えば対象の疾患もしくは障害を処置するために又は細胞の第2の集団の成長もしくは分化を支持するために、いずれかの所望のやり方で用いられ得る。
本明細書において用いられる用語「保存的アミノ酸置換」は、本明細書においては次の表2に要約されている5つの群の1つの中でのアミノ酸交換として定義される。
Figure 2022550670000003
「対照」細胞、組織、サンプル、又は対象は、試験細胞、組織、サンプル、又は対象と同じ型の細胞、組織、サンプル、又は対象である。対照は、例えば、試験細胞、組織、サンプル、又は対象が検査される正確に又はほぼ同じ時間に検査され得る。対照は、例えば、試験細胞、組織、サンプル、又は対象が検査される時間から離れた時間において検査され得、対照の検査の結果が記録され得、その結果、記録された結果が試験細胞、組織、サンプル、又は対象の検査によって得られる結果と比較され得る。試験が行われようとする疾患又は障害を有することが疑われる対象から試験サンプルが得られるところでは、対照は試験群又は試験対象以外の別のソース又は類似のソースからもまた得られ得る。
「試験」細胞、組織、サンプル、又は対象は、検査又は処置されようとするものである。
「病的指標」細胞、組織、又はサンプルは、存在するときには、細胞、組織、又はサンプルが所在する(又は組織が得られた)動物が疾患又は障害に冒されているという指標であるものである。例として、動物の肺組織における1つ以上の乳部細胞の存在は、動物が転移性の乳癌に冒されているという指標である。
細胞の1つ以上が疾患又は障害に冒されていない動物の組織に存在する場合には、組織は細胞を「正常に含む」。
本明細書において用いられる「化合物」は、本発明の薬物又は薬物としての使用のための候補、上の組み合わせ及び混合物、並びにポリペプチド及び抗体と普通に見なされるいずれかの型の物質又は薬剤を言う。
本明細書において用いられる「サイトカイン」は細胞間シグナル伝達分子を言い、これらの最も周知のものは哺乳類の体細胞の制御に関わる。それらの効果が成長促進性及び成長阻害性両方のサイトカインのいくつものファミリーがキャラクタリゼーションされており、例えばインターロイキン、インターフェロン、及びトランスフォーミング増殖因子を包含する。いくつもの他のサイトカインが当業者に公知である。これらのサイトカインのソース、特質、標的、及びエフェクター活性は記載されている。
本明細書において用いられる「ケモカイン」は、T細胞などの白血球の走化性に関わる細胞間シグナル伝達分子を言う。
用語「送達基剤」は、インビボで細胞を送達するために用いられ得るか又は動物に投与される細胞を含む組成物に追加され得るいずれかの種類のデバイス又は材料を言う。これは、インプラント可能なデバイス、細胞の集合体、マトリックス材料、ゲルなどを包含するが、これらに限定されない。
本明細書において用いられる化合物の「誘導体」は、アルキル、アシル、又はアミノ基によるHの置き換えのような1つ以上のステップによって類似の構造の別の化合物から産生され得る化学的な化合物を言う。
単語「検出する」及びその文法的バリアントの使用は、定量なしの種の測定を言うことを意味され、単語「決定する」又は「測定する」の使用は、それらの文法的バリアントと共に、定量ありの種の測定を言うことを意味される。用語「検出する」及び「同定する」は本明細書において交換可能に用いられる。
本明細書において用いられる「検出可能なマーカー」又は「レポーター分子」は、マーカーなしの類似の化合物の存在下においてマーカーを含む化合物の特異的検出を可能にする原子又は分子である。検出可能なマーカー又はレポーター分子は、例えば、放射性同位体、抗原性決定基、酵素、ハイブリダイゼーションに利用可能な核酸、クロモフォア、フルオロフォア、化学発光分子、電気化学的に検出可能な分子、及び変改された蛍光偏光又は変改された光散乱を可能にする分子を包含する。
「疾患」は、動物がホメオスタシスを維持し得ず、疾患が良くならない場合には動物の健康が悪化し続ける動物の健康状態である。
対照的に、動物の「障害」は、動物がホメオスタシスを維持することができるが、動物の健康状態が障害の不在下よりも良好ではない健康状態である。無処置のまま放置された障害は動物の健康状態のさらなる減少を必ずしも引き起こさない。
本明細書において用いられる「有効量」は、選択された効果を生ずるために十分な量を意味する。「治療上有効量」は、疾患又は障害を処置又は防止することに用いられようとする薬剤の有効量を意味する。
本明細書において用いられる用語「エピトープ」は、抗体を誘発しそれと反応し得る抗原分子上の小さい化学基として定義される。抗原は1つ以上のエピトープを有し得る。ほとんどの抗原は多くのエピトープを有する。すなわち、それらは多価である。一般的には、エピトープはサイズが大体5つのアミノ酸又は糖である。当業者は、一般的には、分子の具体的な線状の配列よりもむしろ総体的な3次元構造が抗原特異性の主な基準であるということを理解する。
「断片」又は「セグメント」は、少なくとも1つのアミノ酸を含むアミノ酸配列のある部分、又は少なくとも1つのヌクレオチドを含む核酸配列のある部分である。用語「断片」及び「セグメント」は本明細書においては交換可能に用いられる。
蛋白質又はペプチドに適用される本明細書において用いられる用語「断片」は、通例では、長さが少なくとも約3~15アミノ酸、少なくとも約15~25アミノ酸、長さが少なくとも約25~50アミノ酸、長さが少なくとも約50~75アミノ酸、長さが少なくとも約75~100アミノ酸、及び長さが100アミノ酸超であり得る。
核酸に適用される本明細書において用いられる用語「断片」は、通例では、長さが少なくとも約20ヌクレオチド、典型的には少なくとも約50ヌクレオチド、より典型的には約50から約100ヌクレオチド、いくつかの実施態様では少なくとも約100から約200ヌクレオチド、いくつかの実施態様では少なくとも約200ヌクレオチドから約300ヌクレオチド、尚いくつかの実施態様では少なくとも約300から約350、いくつかの実施態様では少なくとも約350ヌクレオチドから約500ヌクレオチド、尚いくつかの実施態様では少なくとも約500から約600、いくつかの実施態様では少なくとも約600ヌクレオチドから約620ヌクレオチド、尚いくつかの実施態様では少なくとも約620から約650であり得、最大ではいくつかの実施態様では、核酸断片は長さが約650ヌクレオチド超であろう。
本明細書において用いられる「機能的な」分子は、それが特徴とする特性又は活性を見せる形態の分子である。
本明細書において用いられる「機能的な生体分子」は、それが特徴とする特性を見せる形態の生体分子である。例えば、機能的な酵素は、酵素が特徴とする特徴的な触媒活性を見せるものである。
本明細書において用いられる用語「増殖因子」は、細胞又は組織の増殖を促進する生物活性分子を意味する。本発明に有用な増殖因子は、トランスフォーミング増殖因子-アルファ(TGF-α)、トランスフォーミング増殖因子-ベータ(TGF-β)、AA、AB、及びBBアイソフォームを包含する血小板由来増殖因子(PDGF)、FGF酸性アイソフォーム1及び2、FGF塩基性形態2、並びにFGF4、8、9、及び10を包含する線維芽細胞増殖因子(FGF)、NGF2.5s、NGF7.0s、及びベータNGF、並びにニューロトロフィンを包含する神経増殖因子(NGF)、脳由来神経栄養因子、軟骨由来因子、骨増殖因子(BGF)、塩基性線維芽細胞増殖因子、インスリン様増殖因子(IGF)、血管内皮増殖因子(VEGF)、EG-VEGF、VEGF関連蛋白質、Bv8、VEGF-E、顆粒球コロニー刺激因子(G-CSF)、インスリン様増殖因子(IGF)I及びII、肝細胞増殖因子、グリア神経栄養増殖因子、幹細胞因子(SCF)、ケラチノサイト増殖因子(KGF)、骨格増殖因子、骨基質由来増殖因子、及び骨由来増殖因子、並びにそれらの混合物を包含するが、これらに限定されない。いくつかの増殖因子は細胞又は組織の分化をもまた促進し得る。例えば、TGFは細胞又は組織の成長及び/又は分化を促進し得る。
本明細書において用いられる「相同な」は、2つのポリマー分子間の、例えば2つの核酸分子、例えば2つのDNA分子もしくは2つのRNA分子間の、又は2つのポリペプチド分子間のサブユニット配列類似性を言う。2つの分子の両方におけるあるサブユニット位置が同じ単量体サブユニットによって占められているときには、例えば、2つのDNA分子のそれぞれのある位置がアデニンによって占められている場合には、それらはその位置において相同である。2つの配列間の相同性は、マッチするか又は相同な位置の数の直接的な関数である。例えば、2つの化合物配列上の位置の半分(例えば、長さが10サブユニットのポリマー上の5つの位置)が相同である場合には、2つの配列は50%相同であり、位置の90%、例えば10のうち9がマッチしているか又は相同である場合には、2つの配列は90%の相同性を共有する。例として、DNA配列5'-ATTGCC-3'及び5'-TATGGC-3'は50%の相同性を共有する。
本明細書において用いられる「相同性」は「同一性」と類義的に用いられる。
2つのヌクレオチド又はアミノ酸配列間のパーセント同一性の決定は数学的アルゴリズムを用いて達成され得る。例えば、2つの配列を比較するために有用な数学的アルゴリズムは、カーリン(Karlin)&アルチュル(Altschul),1990年のアルゴリズムであり、カーリン(Karlin)&アルチュル(Altschul),1993年の通り改変される。このアルゴリズムはNBLAST及びXBLASTプログラムに組み込まれ(アルチュル(Altschul)ら,1990年a;アルチュル(Altschul)ら,1990年bを見よ)、例えば国立生物工学情報センター(NCBI)ワールドワイドウェブサイトにおいてアクセスされ得る。BLASTヌクレオチド検索は、NBLASTプログラム(NCBIウェブサイトでは「blastn」と指定される)によって次のパラメータを用いて行われ得る:本明細書に記載される核酸に対して相同なヌクレオチド配列を得るために、ギャップペナルティー=5;ギャップ延長ペナルティー=2;ミスマッチペナルティー=3;マッチリワード=1;期待値10.0;及びワードサイズ=11。BLAST蛋白質検索はXBLASTプログラム(NCBIウェブサイトでは「blastn」と指定される)又はNCBI「blastp」プログラムによって次のパラメータを用いて行われ得る:本明細書に記載される蛋白質分子に対して相同なアミノ酸配列を得るために、期待値10.0、BLOSUM62スコア行列。比較目的のためのギャップ付きアラインメントを得るためには、ギャップ付きBLASTがアルチュル(Altschul)ら,1997年に記載の通り利用され得る。代替的には、分子間の遠い関係性(アルチュル(Altschul)ら,1997年)及び共通のパターンを共有する分子間の関係性を検出する反復的検索を行うために、PSI-Blast又はPHI-Blastが用いられ得る。BLAST、ギャップ付きBLAST、PSI-Blast、及びPHI-Blastプログラムを利用するときには、それぞれのプログラム(例えば、XBLAST及びNBLAST)のデフォルトパラメータが用いられ得る。
2つの配列間のパーセント同一性は、ギャップを許すことあり又はなしに、上に記載されているものに類似の技術を用いて決定され得る。パーセント同一性を算出する際には、典型的には厳密なマッチがカウントされる。
本明細書において用いられる用語「ハイブリダイゼーション」は、相補的な核酸の対形成を参照して用いられる。ハイブリダイゼーション及びハイブリダイゼーションの強さ(すなわち、核酸間の結び付きの強さ)は、核酸間の相補性の度合い、関わる条件の厳しさ、形成されるハイブリッドの長さ、及び核酸上のG:C比などの因子によってインパクトを及ぼされる。
用語「成分」は、化学的又は生物学的起源かどうかにかかわらず、細胞の増殖、生残、又は分化を維持又は促進するための細胞培養培地に用いられ得るいずれかの化合物を言う。用語「コンポーネント」、「栄養素」、「サプリメント」、及び「成分」は交換可能に用いられ得、全てかかる化合物を言うことを意味される。細胞培養培地に用いられる典型的な限定しない成分は、アミノ酸、塩、金属、糖、脂質、核酸、ホルモン、ビタミン、脂肪酸、蛋白質、及び同類を包含する。エクシビボの細胞の培養を促進又は維持する他の成分は、特定の必要に従って当業者によって選択され得る。
本明細書において用いられる用語「阻害する」は、用語「阻害する」が用いられる文脈に基づいて、記載される機能、レベル、活性、速度などを縮減又は妨害する化合物、薬剤、又は方法の能力を言う。いくつかの実施態様では、阻害は少なくとも10%、いくつかの実施態様では少なくとも25%、いくつかの実施態様では少なくとも50%であり、いくつかの実施態様では、機能は少なくとも75%阻害される。用語「阻害する」は「縮減する」及び「ブロックする」と交換可能に用いられる。
本明細書において用いられる用語「阻害剤」は、その適用が分化及び活性を包含するがこれらに限定されない目当てのプロセス又は機能の阻害をもたらすいずれかの化合物又は薬剤を言う。目当ての活性又は機能の縮減がある場合には、阻害が推察され得る。
本明細書において用いられる言い回し「阻害性核酸」は、RNA干渉(RNAi)又は遺伝子サイレンシングを媒介することができるいずれかの核酸分子を言う。例えば、バス(Bass),2001年;エルバシール(Elbashir)ら,2001;並びにPCT国際公開No.WO99/07409;WO99/32619;WO00/01846;WO00/44895;WO00/44914;WO01/36646;及びWO01/29058を見よ。例示的な阻害性核酸は、低分子干渉RNA、短鎖干渉RNA、siRNA、及びmiRNAを包含する。いくつかの実施態様では、阻害性核酸は、相補的なセンス及びアンチセンス領域を含む二本鎖ポリヌクレオチド分子を含み、アンチセンス領域は標的核酸分子のある領域に対して相補的な配列を含む。例えば、いくつかの実施態様では、阻害性核酸は、NLRC4、NLRP3、DDX17、カスパーゼ-1、カスパーゼ-4、cGAS、STING1、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物のある領域に対して相補的なアンチセンス領域を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害性核酸は、自己相補的なセンス及びアンチセンス領域を有する一本鎖ポリヌクレオチドを含み、アンチセンス領域は標的核酸分子のある領域に対して相補的な配列を含む。いくつかの実施態様では、阻害性核酸は、1つ以上のループ構造と自己相補的なセンス及びアンチセンス領域を含むステムとを有する一本鎖ポリヌクレオチドを含み、アンチセンス領域は標的核酸分子のある領域に対して相補的な配列を含み、ポリヌクレオチドはインビボ又はインビトロどちらかでプロセシングされて、RNAiを媒介することができる活性な阻害性核酸を生成し得る。いくつかの実施態様では、阻害性核酸はsiRNAであり、これは、いくつかの実施態様では、配列番号3~6(hNLRC4siRNA)、9~20(mNlrc4siRNA)、23~27(hDDX17siRNA)、30~34(mDdx17siRNA)、46~51(hCAS-4siRNA)、及び58(hCGASsiRNA)のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害性核酸はshRNAであり、これは、いくつかの実施態様では、配列番号45(hCAS-4shRNA)、56(hCGASshRNA)、57(hCGASshRNA)、63(hSTING1shRNA)、68(hPPIFshRNA)、73(hGSDMDshRNA)、78(hIFN-βshRNA)、及び83(hIFNARshRNA)のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。
本明細書において用いられる阻害性核酸分子は、RNAのみを含有する分子に限定される必要はなく、更に化学修飾ヌクレオチド及び非ヌクレオチドを包摂する。
本明細書において用いられる「注射又は適用する」は、多数の経路及びアプローチによる本発明の化合物又は組成物の投与を包含し、外用、経口、バッカル、静脈内、腫瘍内、筋肉内、動脈内、髄内、髄腔内、心室内、経真皮、皮下、腹腔内、鼻腔内、経腸、外用、舌下、膣、眼、経肺、又は直腸経路を包含するが、これらに限定されない。いくつかの実施態様では、組成物は眼部送達のために製剤される。
本明細書において用いられる「傷害」は一般的にダメージ、危害、又は傷付けを言う。通常は、外力によって体に課されたダメージに適用される。
本明細書において用いられる「説明材料」は、本明細書に記載される種々の疾患又は障害の緩和を成就するためのキット中の本発明の組成物の有用性を伝達するために用いられ得る刊行物、録音、ダイアグラム、又はいずれかの他の表現媒体を包含する。任意に又は代替的に、説明材料は哺乳動物の細胞又は組織の疾患又は障害を緩和する1つ以上の方法を記載し得る。本発明のキットの説明材料は、例えば、本発明の同定された化合物を含有する容器に添付され得るか、又は同定された化合物を含有する容器と一緒に出荷され得る。代替的には、説明材料は、説明材料及び化合物がレシピエントによって協力的に用いられるという意図で、容器とは別個に出荷され得る。
用語「単離する」及び「セレクションする」は本明細書において交換可能に用いられる。
用語「単離する」、「単離される」、「単離すること」、及びそれらの文法的変形は、細胞を参照して用いられるときには、それが起源の培養又は組織において共に生起する他の細胞型又は他の細胞材料から少なくとも部分的に単離された目当ての単細胞又は目当ての細胞の集団を言う。それが目当ての細胞以外の細胞又は他の細胞材料をいくつかの実施態様では少なくとも60%、いくつかの実施態様では少なくとも75%、いくつかの実施態様では少なくとも90%、ある種のケースでは、いくつかの実施態様では少なくとも99%不含であるときに、サンプルは「実質的に純粋」である。純度は、例えば例において提示されるものだがこれらに限定されないいずれかの適当な方法によって測定され得る。
「単離された核酸」は、天然に生起する状態ではそれをフランキングする配列から分離された核酸セグメント又は断片、例えば正常では断片に隣接する配列、例えばそれが天然に生起するゲノム上の断片に隣接する配列から取り除かれたDNA断片を言う。用語は、天然では核酸に付随する他のコンポーネント、例えばRNAもしくはDNA、又は天然では細胞内においてそれに付随する蛋白質から実質的に精製された核酸にもまた適用される。よって、用語は、例えば、ベクター上に、自律複製プラスミドもしくはウイルス上に、又は原核生物もしくは真核生物のゲノムDNA上に組み込まれているか、あるいは他の配列から独立した別個の分子として(例えば、PCR又は制限酵素消化によって産生されるcDNA又はゲノムもしくはcDNA断片として)存在する組み換えDNAを包含する。それは、追加のポリペプチド配列をコードするハイブリッド遺伝子の一部である組み換えDNAをもまた包含する。
別様に規定されない限り、「アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」は、互いの縮重バージョンでありかつ同じアミノ酸配列をコードする全てのヌクレオチド配列を包含する。蛋白質をコードするヌクレオチド配列及びRNAはイントロンを包含し得る。
本明細書において用いられる「リガンド」は、標的化合物に特異的に結合する化合物である。混成の化合物のサンプル中の化合物の存在を決定する結合反応において、リガンドが機能するときには、リガンド(例えば抗体)は、化合物「に特異的に結合する」又は「と特異的に免疫反応性である」。それゆえに、指定されるアッセイ(例えば、イムノアッセイ)条件下では、リガンドは特定の化合物に選好的に結合し、サンプル中に存在する他の化合物には有意な程度に結合しない。例えば、イムノアッセイ条件下において、抗体はそれに対して抗体が育てられたエピトープを持つ抗原に特異的に結合する。特定の抗原と特異的に免疫反応性の抗体をセレクションするために、種々のイムノアッセイフォーマットが用いられ得る。例えば、固相ELISAイムノアッセイは、抗原と特異的に免疫反応性のモノクローナル抗体をセレクションするために慣例的に用いられる。特異的免疫反応性を決定するために用いられ得るイムノアッセイフォーマット及び条件の記載については、ハーロー(Harlow)&レーン(Lane),1988年を見よ。
「受容体」はリガンドに特異的に又は選択的に結合する化合物である。
本明細書において用いられる用語「連結部」は2つの基の間の接続を言う。接続は共有結合的又は非共有結合的どちらかであり得、イオン結合、水素結合、及び疎水性/親水性相互作用を包含するが、これらに限定されない。
本明細書において用いられる用語「リンカー」は、2つの他の分子を共有結合的に又は非共有結合的に、例えばイオンもしくは水素結合又はファンデルワールス相互作用によって繋ぐ分子又はそれに由来する二価基を言う。
本明細書において用いられる用語「発現のレベルを測定すること」又は「発現のレベルを決定すること」は、アッセイの結果を目当ての遺伝子又は蛋白質の発現のレベルと相関させるために用いられ得るいずれかの尺度又はアッセイを言う。かかるアッセイは、mRNAのレベル、蛋白質レベルなどを測定することを包含し、例えばノーザン及びウエスタンブロット分析、結合アッセイ、イムノブロットなどのアッセイによって行われ得る。発現のレベルは発現の速度を包含し得、存在するmRNA又は蛋白質の実際の量に換算して測定され得る。かかるアッセイは、情報を保存及びプロセシングするための、並びにレベル、シグナルなどを定量することを助けるための、並びにレベルを比較することへの使用のために情報をデジタイズするためのプロセス又は系とカップリングされる。
本明細書において用いられる用語「調節する」は、活性、機能、又はプロセスのレベルを変化させることを言う。用語「調節する」は、活性、機能、又はプロセスを阻害及び刺激すること両方を包摂する。用語「調節する」は本明細書においては用語「制御する」と交換可能に用いられる。
用語「核酸」は典型的には大きいポリヌクレオチドを言う。「核酸」によってはいずれかの核酸が意味され、デオキシリボヌクレオシド又はリボヌクレオシドから構成されるかどうかにかかわらず、ホスホジエステル連結部又は修飾連結部、例えばホスホトリエステル、ホスホロアミダート、シロキサン、カーボネート、カルボキシメチルエステル、アセトアミダート、カルバメート、チオエーテル、橋かけホスホロアミダート、橋かけメチレンホスホネート、橋かけホスホロアミダート、橋かけホスホロアミダート、橋かけメチレンホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、橋かけホスホロチオエート、もしくはスルホン連結部、及びかかる連結部の組み合わせから構成されるかどうかにかかわらない。用語核酸は、具体的には、5つの生体に生起する塩基(アデニン、グアニン、チミン、シトシン、及びウラシル)以外の塩基から構成される核酸をもまた包含する。
本明細書において用いられる用語「核酸」は、RNA並びに一本及び二本鎖DNA及びcDNAを包摂する。更にその上、用語「核酸」、「DNA」、「RNA」、及び類似の用語は、核酸アナログ、すなわちホスホジエステルバックボーン以外を有するアナログをもまた包含する。例えば、当分野で公知であり、ホスホジエステル結合の代わりにペプチド結合をバックボーンに有するいわゆる「ペプチド核酸」は、本発明の範囲内と見なされる。「核酸」によってはいずれかの核酸が意味され、デオキシリボヌクレオシド又はリボヌクレオシドから構成されるかどうかにかかわらず、ホスホジエステル連結部又は修飾連結部、例えばホスホトリエステル、ホスホロアミダート、シロキサン、カーボネート、カルボキシメチルエステル、アセトアミダート、カルバメート、チオエーテル、橋かけホスホロアミダート、橋かけメチレンホスホネート、橋かけホスホロアミダート、橋かけホスホロアミダート、橋かけメチレンホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、橋かけホスホロチオエート、又はスルホン連結部、及びかかる連結部の組み合わせから構成されるかどうかにかかわらない。用語核酸は、具体的には、5つの生体に生起する塩基(アデニン、グアニン、チミン、シトシン、及びウラシル)以外の塩基から構成される核酸をもまた包含する。ポリヌクレオチド配列を記載するためには、従来の表記法が本明細書において用いられる。一本鎖ポリヌクレオチド配列の左手の端は5'端であり、二本鎖ポリヌクレオチド配列の左手方向は5'方向と言われる。新生RNA転写物へのヌクレオチドの5'から3'の追加の方向は転写方向と言われる。mRNAと同じ配列を有するDNA鎖は「コード鎖」と言われる。DNA上の参照点の5'に所在するDNA鎖上の配列は「上流配列」と言われる。DNA上の参照点の3'であるDNA鎖上の配列は「下流配列」と言われる。
本明細書において用いられる用語「核酸コンストラクト」は、ゲノム的な又は合成的な方法によって得られるかどうかにかかわらず、所望の特定の遺伝子又は遺伝子断片をコードするDNA及びRNA配列を包摂する。
別様に規定されない限り、「アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」は、互いの縮重バージョンでありかつ同じアミノ酸配列をコードする全てのヌクレオチド配列を包含する。蛋白質をコードするヌクレオチド配列及びRNAはイントロンを包含し得る。
用語「オリゴヌクレオチド」は、典型的には、一般的には約50ヌクレオチドを超えない短いポリヌクレオチドを言う。ヌクレオチド配列がDNA配列(すなわちA、T、G、C)によって表されるときには、これは「U」が「T」を置き換えるRNA配列(すなわちA、U、G、C)をもまた包含するということは理解されるであろう。
2つのポリヌクレオチドを「作動可能に連結された」と記載することによって、一本鎖又は二本鎖核酸部分が、2つのポリヌクレオチドの少なくとも1つがそれが特徴とする生理学的効果を他方に対して行使することができるような様式で核酸部分の中に配置された2つのポリヌクレオチドを含むということが意味される。例として、遺伝子のコード領域に作動可能に連結されたプロモーターはコード領域の転写を促進することができる。
医薬組成物の本明細書において用いられる「非経口投与」は、対象の組織の物理的裂孔を特徴とする投与及び組織の裂孔部からの医薬組成物の投与のいずれかの経路を包含する。それゆえに、非経口投与は、組成物の注射、切開部からの組成物の適用、組織穿通非手術的創傷からの組成物の適用、及び同類による医薬組成物の投与を包含するが、これらに限定されない。具体的には、非経口投与は、皮下、腹腔内、筋肉内、胸骨内注射、腫瘍内、及び腎臓透析輸液技術を包含することを企図されるが、これらに限定されない。
用語「医薬組成物」は、少なくとも1つの活性成分を含む組成物を意味するものとし、それによって、組成物は、哺乳動物(例えば、限定なしにヒト)における規定された効能アウトカムの検討を受け入れる。当業者は、業者の必要に基づいて活性成分が所望の効能アウトカムを有するかどうかを決定するための適当な技術を理解及び了解するであろう。
本明細書において用いられる用語「薬学的に許容される担体」は、適当な化合物又は誘導体が組み合わせられ得、かつ組み合わせ後に適当な化合物を対象に投与するために用いられ得る化学組成物を意味する。
本明細書において用いられる用語「生理学的に許容される」エステル又は塩は、組成物が投与されるべき対象にとって有害性ではない、医薬組成物のいずれかの他の成分と適合性である活性成分のエステル又は塩形態を意味する。
「複数」は少なくとも2つを意味する。
「ポリヌクレオチド」は核酸の一本鎖又はパラレル及びアンチパラレル鎖を意味する。それゆえに、ポリヌクレオチドは一本鎖又は二本鎖核酸どちらかであり得る。
「ポリペプチド」は、ペプチド結合によって連結されたアミノ酸残基、関係する天然に生起する構造バリアント、及びそれらの合成の天然に生起しないアナログ、関係する天然に生起する構造バリアント、並びにそれらの合成の天然に生起しないアナログから構成されるポリマーを言う。
「合成ペプチド又はポリペプチド」は天然に生起しないペプチド又はポリペプチドを意味する。合成ペプチド又はポリペプチドは例えば自動ポリペプチド合成機を用いて合成され得る。種々の固相ペプチド合成方法が当業者に公知である。
本明細書において用いられる用語「防止する」は、何かが起こることを止めること、又は可能なもしくは蓋然的な何かが起こることに対して事前措置を取ることを意味する。医学の文脈では、「防止」は、一般的には、疾患又は病状を獲得する確率を減少させるために取られる行為を言う。
「プライマー」は、指定されるポリヌクレオチド鋳型に特異的にハイブリダイゼーションすること及び相補的なポリヌクレオチドの合成の開始点を提供することができるポリヌクレオチドを言う。かかる合成は、ポリヌクレオチドプライマーが、合成が誘導される条件下に、すなわちヌクレオチド、相補的なポリヌクレオチド鋳型、及びDNAポリメラーゼなどのポリマー化のための薬剤の存在下に置かれるときに生起する。プライマーは典型的には一本鎖であるが、二本鎖であり得る。プライマーは典型的にはデオキシリボ核酸であるが、広い種々の合成の及び天然に生起するプライマーが多くの適用に有用である。プライマーは、合成開始部位としての用をなすためのそれがハイブリダイゼーションするように設計されている鋳型に対して相補的であるが、鋳型の厳密な配列を反映する必要はない。かかるケースでは、鋳型に対するプライマーの特異的ハイブリダイゼーションはハイブリダイゼーション条件の厳しさに依存する。プライマーは例えばクロモゲン性、放射性、又は蛍光部分によって標識され、検出可能な部分として用いられ得る。
「予防」処置は、疾患又は傷害に関連する病理を発生するリスクを減少させる目的で、疾患もしくは傷害の徴候を見せないか又は疾患もしくは傷害の早期の徴候のみを見せる対象に投与される処置である。
本明細書において用いられる用語「プロモーター/制御配列」は、プロモーター/制御配列に作動可能に連結された遺伝子産物の発現に要求される核酸配列を意味する。いくつかの場合には、この配列はコアプロモーター配列であり得、他の場合には、この配列はエンハンサー配列及び遺伝子産物の発現に要求される他の制御エレメントをもまた包含し得る。プロモーター/制御配列は、例えば、組織特異的な様式で遺伝子産物を発現するものであり得る。
「恒常的」プロモーターは、それが作動可能に連結されている遺伝子の発現を細胞において一定した様式で駆動するプロモーターである。例として、細胞ハウスキーピング遺伝子の発現を駆動するプロモーターは恒常的プロモーターであると見なされる。
「誘導性」プロモーターは、遺伝子産物をコード又は規定するポリヌクレオチドと作動可能に連結されたときに、プロモーターに対応する誘導因子が実質的に細胞内に存在するときのみに、遺伝子産物が生細胞によって産生されることを引き起こすヌクレオチド配列である。
「組織特異的」プロモーターは、遺伝子産物をコード又は規定するポリヌクレオチドと作動可能に連結されたときに、実質的に細胞がプロモーターに対応する組織型の細胞である場合にのみ、遺伝子産物が生細胞によって産生されることを引き起こすヌクレオチド配列である。
末端アミノ基について本明細書において用いられる「保護基」はペプチドの末端アミノ基を言い、この末端アミノ基がペプチド合成に従来使用される種々のアミノ末端保護基のいずれかとカップリングされる。かかる保護基は、例えばアセチル保護基、例えばホルミル、アセチル、ベンゾイル、トリフルオロアセチル、スクシニル、及びメトキシスクシニル;芳香族ウレタン保護基、例えばベンジルオキシカルボニル;並びに脂肪族ウレタン保護基、例えばtert-ブトキシカルボニル又はアダマンチルオキシカルボニルを包含する。好適な保護基についてはグロス(Gross)&ミーンホーファー(Mienhofer),1981年を見よ。
末端カルボキシ基について本明細書において用いられる「保護基」はペプチドの末端カルボキシル基を言い、この末端カルボキシル基が種々のカルボキシル末端保護基のいずれかとカップリングされる。かかる保護基は、例えばtert-ブチル、ベンジル、又はエステルもしくはエーテル結合によって末端カルボキシル基に連結される他の許容される基を包含する。
用語「蛋白質」は典型的には大きいポリペプチドを言う。ポリペプチド配列を描写するためには、従来の表記法が本明細書においては用いられる。ポリペプチド配列の左手の端はアミノ末端である。ポリペプチド配列の右手の端はカルボキシル末端である。
本明細書において用いられる用語「蛋白質制御経路」は、蛋白質を制御する上流制御経路及び蛋白質が制御する下流事象両方を言う。かかる制御は、目当ての蛋白質の転写、翻訳、レベル、活性、翻訳後修飾、及び機能、並びに蛋白質が制御する下流事象を包含するが、これらに限定されない。
用語「蛋白質経路」及び「蛋白質制御経路」は本明細書においては交換可能に用いられる。
本明細書において用いられる用語「精製された」及び同類の用語は、正常ではネイティブな環境において分子又は化合物と結び付けられた他のコンポーネントに対して相対的な分子又は化合物の濃縮に関する。用語「精製された」は、特定の分子の完全な純度がプロセスの間に達成されたということを必ずしも指示しない。本明細書において用いられる「高度に精製された」化合物は、90%超純粋である化合物を言う。
「組み換えポリヌクレオチド」は、天然では一緒に繋がれていない配列を有するポリヌクレオチドを言う。増幅又はアセンブリされた組み換えポリヌクレオチドが好適なベクター上に包含され得、ベクターは好適なホスト細胞を形質転換するために用いられ得る。
組み換えポリヌクレオチドは、非コード機能(例えば、プロモーター、複製起点、リボソーム結合部位など)も供し得る。
組み換えポリヌクレオチドを含むホスト細胞は「組み換えホスト細胞」と言われる。遺伝子が組み換えポリヌクレオチドを含む組み換えホスト細胞によって発現される遺伝子は、「組み換えポリペプチド」を生ずる。
「組み換えポリペプチド」は、組み換えポリヌクレオチドの発現によって産生されるものである。
用語「制御する」は、目当ての機能又は活性を刺激又は阻害することどちらかを言う。
本明細書において用いられる用語「制御エレメント」は「制御配列」と交換可能に用いられ、プロモーター、エンハンサー、及び他の発現対照エレメント、又はかかるエレメントのいずれかの組み合わせを言う。
「可逆的にインプラント可能な」デバイスは、(例えば、外科的に、又は動物の天然の開口部への挿入によって)動物の体に挿入され、その後に動物の健康への多大な危害なしに取り除かれ得るものである。
本明細書において用いられる「サンプル」は、いくつかの実施態様では、対象からの生体サンプルを言い、正常組織サンプル、疾患組織サンプル、生検、血液、唾液、大便、精液、涙、及び尿を包含するが、これらに限定されない。サンプルは、目当ての細胞、組織、又は液を含有する対象から得られる材料のいずれかの他のソースでもまたあり得る。サンプルは細胞又は組織培養からもまた得られ得る。
「有意な検出可能なレベル」は、提示されるデータから可視であり、法医学的証拠の分析の間には議論/説明されることを必要とするであろうコンタミネートの量である。
用語「シグナル配列」によって、ポリペプチドが細胞内で取る進路を指令するペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が意味される。すなわち、それは、細胞からのポリペプチドの最終的な分泌を包含するがこれに限定されない細胞内のポリペプチドの細胞性のプロセシングを指令する。シグナル配列は、ポリペプチドの合成を小胞体へと標的化する専らではないが典型的にポリペプチドのアミノ末端に見出されるアミノ酸の配列である。いくつかの場合には、シグナルペプチドはポリペプチドから蛋白質加水分解的に取り除かれ、それゆえに成熟蛋白質には不在である。
「短鎖干渉RNA(siRNA)」によって、とりわけ、センス及びアンチセンス鎖両方から構成される単離されたdsRNA分子が意味される。いくつかの実施態様では、それは長さが10ヌクレオチド超である。siRNAは、標的遺伝子からのセンス及び相補的なアンチセンス配列両方、例えばヘアピンを有する単一の転写物をもまた言う。siRNAは、更に、天然に生起するRNAとは1つ以上のヌクレオチドの追加、欠失、置換、及び/又は変改が異なる変改されたRNA、並びにdsRNAのいずれかの形態(より大きいdsRNAの蛋白質加水分解的に切断される産物、部分精製RNA、本質的に純粋なRNA、合成RNA、組み換え産生RNA)を包含する。
用語「固体支持体」、「表面」、及び「基材」は交換可能に用いられ、いずれかのサイズの構造単位を言い、前記の構造単位又は基材は分子構造の固定化又は前記構造の修飾にとって好適な表面を有し、前記基材は金属、金属箔、ガラス、溶融シリカ、合成ポリマー、及び膜などだがこれらに限定されない材料から作られる。
本明細書において用いられる用語「特異的に結合する」によって、特定の分子を認識及び結合するが、サンプル中の他の分子を実質的に認識又は結合しない分子が意味される。又は、それは、細胞の制御プロセスの一部のような2つ以上の分子間の結合を意味し、ここでは、前記分子はサンプル中の他の分子を実質的に認識又は結合しない。
本明細書において用いられる用語「標準」は比較のために用いられる何かを言う。例えば、それは、試験化合物を投与するときに投与され、結果を比較するために用いられる公知の標準的な薬剤又は化合物であり得る。又は、それは、パラメータ又は機能に対する薬剤又は化合物の効果を測定するときに対照値を得るために測定される標準的なパラメータ又は機能であり得る。「標準」は「内部標準」をもまた言い得る。例えば、既知の量でサンプルに追加され、かつ目当てのマーカーが測定される前にサンプルがプロセシングされるか又は精製もしくは抽出手続きに付されるときに精製又は回収率などの事を決定することに有用である薬剤又は化合物である。常にではないが多くの場合に、内部標準は例えば放射性同位体によって標識された目当ての精製されたマーカーに限定され、それがサンプル中の内在性の物質から見分けられることを許す。
本明細書において用いられる用語「刺激する」は、それが対照値に対して相対的に高いようにして、活性又は機能レベルを誘導又は増大させることを意味する。刺激は直接的な又は間接的なメカニズムによってであり得る。いくつかの実施態様では、活性又は機能は対照値と比較して少なくとも10%、いくつかの実施態様では少なくとも25%、いくつかの実施態様では少なくとも50%刺激される。本明細書において用いられる用語「刺激因子」は、その適用が目当てのプロセス又は機能の刺激をもたらすいずれかの組成物、化合物、又は薬剤を言う。
診断又は処置の「対象」はヒトを包含する動物である。それはペット及び家畜をもまた包含する。
本明細書において用いられる「その必要がある対象」は、本発明の方法又は組成物によって益されるであろう患者、動物、哺乳動物、又はヒトである。
本明細書において用いられる「実質的に相同なアミノ酸配列」は、少なくとも約95%の相同性、いくつかの実施態様では少なくとも約96%の相同性、更にいくつかの実施態様では少なくとも約97%の相同性、いくつかの実施態様では少なくとも約98%の相同性、最大ではいくつかの実施態様では少なくとも約99%以上の相同性を参照配列のアミノ酸配列に対して有するアミノ酸配列を包含する。アミノ酸配列の類似性又は同一性は、BLAST(基本的局所アラインメント検索ツール)2.0.14アルゴリズムを使用するBLASTP及びTBLASTNプログラムを用いることによって計算され得る。これらのプログラムに用いられるデフォルトの設定は、本発明の目的で実質的に類似のアミノ酸配列を同定することに好適である。
「実質的に相同な核酸配列」は、対応する配列が、参照核酸配列によってコードされるペプチドと実質的に同じ構造及び機能を有するペプチドをコードする、参照核酸配列に対応する核酸配列を意味する。例えば、ここでは、ペプチド機能に有意に影響しないアミノ酸の変化のみが生起する。いくつかの実施態様では、実質的に同一の核酸配列は、参照核酸配列によってコードされるペプチドをコードする。実質的に類似の核酸配列及び参照核酸配列の間の同一性のパーセンテージは少なくとも約50%、65%、75%、85%、95%、99%、又はより多くである。核酸配列の実質的同一性は、例えば物理的/化学的方法(すなわちハイブリダイゼーション)によって又はコンピュータアルゴリズムによる配列アラインメントによって、2つの配列の配列同一性を比較することによって決定され得る。ヌクレオチド配列が参照ヌクレオチド配列に実質的に類似であるかどうかを決定するための好適な核酸ハイブリダイゼーション条件は:50℃で7%ドデシル硫酸ナトリウムSDS、0.5MのNaPO、1mMのEDTA、50℃で2×標準クエン酸含有生理食塩水(SSC)、0.1%SDSによる洗浄;いくつかの実施態様では、50℃で7%(SDS)、0.5MのNaPO、1mMのEDTA、50℃で1×SSC、0.1%SDSによる洗浄;いくつかの実施態様では、50℃で7%SDS、0.5MのNaPO、1mMのEDTA、50℃で0.5×SSC、0.1%SDSによる洗浄;更にいくつかの実施態様では、50℃で7%SDS、0.5MのNaPO、1mのEDTA65℃で0.1×SSC、0.1%SDSによる洗浄である。2つの核酸配列間の実質的類似性を決定するための好適なコンピュータアルゴリズムは、GCSプログラムパッケージ及びBLASTN又はFASTAプログラムを包含する(アルチュル(Altschul)ら,1990年a;アルチュル(Altschul)ら,1990年b;アルチュル(Altschul)ら,1997年)。これらのプログラムで提供されるデフォルトの設定は、本発明の目的で核酸配列間の実質的類似性を決定することに好適である。
用語「実質的に純粋」は、天然にそれに付随するコンポーネントから分離された化合物、分子、又は同類を記載している。典型的には、サンプル中のトータルの材料の少なくとも10%、更にいくつかの実施態様では少なくとも20%、更にいくつかの実施態様では少なくとも50%、更にいくつかの実施態様では少なくとも60%、更にいくつかの実施態様では少なくとも75%、更にいくつかの実施態様では少なくとも90%、最大ではいくつかの実施態様では少なくとも99%(体積、湿潤もしくは乾燥重量、又はモルパーセントもしくはモル分率による)が目当ての化合物であるときに、化合物は実質的に純粋である。純度は、いずれかの適当な方法、例えば例において開示されるものによって、又はポリペプチドのケースではカラムクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、もしくはHPLC分析によって測定され得る。化合物、例えば蛋白質は、それが天然に結び付いたコンポーネントを本質的に不含であるときに又はそれがその天然の状態においてそれに付随するネイティブなコンタミナントから分離されているときにもまた実質的に精製されている。
「表面活性剤」又は「界面活性剤」は、材料の表面張力を縮減及び材料内への又は中の浸透を可能化する能力を有する物質である。
本明細書において用いられる用語「症状」は、患者によって経験されるかつ疾患の指標である構造、機能、又は感覚のいずれかの病的現象又は正常からの逸脱を言う。対照的に、「徴候」は疾患の客観的証拠である。例えば、鼻血は徴候である。それは患者、医師、看護師、及び他の観察者にとって明白である。
「治療」処置は、それらの徴候を逓減又は消去する目的で、病理の兆候を見せる対象に投与される処置である。
化合物の「治療上有効量」は、化合物が投与される対象に有益な効果を提供するために十分である化合物の量である。
「組織」は、(1)特定の機能を果たす統合された類似の細胞の群;(2)類似の構造及び機能を有する細胞の集合体からなる生物の一部;又は(3)類似にそれらの構造及び機能を特徴とする細胞の群分け、例えば筋肉もしくは神経組織を意味する。
本明細書において用いられる用語「外用適用」は皮膚などの表面への投与を言う。この用語は皮膚のケースでは「皮膚塗布」と交換可能に用いられる。「外用適用」は「直接適用」である。
「経真皮」送達によって、皮膚又は粘膜組織を通して血流中への薬物の通過による送達が意味される。経真皮は、それへの薬物又は化合物の外用適用による薬物又は化合物の投与のための入口としての皮膚をもまた言う。「経真皮」は「経皮」と交換可能に用いられる。
用語「トランスフェクション」は用語「遺伝子移入」、「形質転換」、及び「形質導入」と交換可能に用いられ、ポリヌクレオチドの細胞内導入を意味する。「トランスフェクション効率」は、トランスフェクションに付された細胞によって取り込まれるトランスジーンの相対量を言う。実際的には、トランスフェクション効率はトランスフェクション手続き後に発現されるレポーター遺伝子産物の量によって見積もられる。
本明細書において用いられる用語「トランスジーン」は、アミノ酸配列をコードする核酸に作動可能に連結されたプロモーター/制御配列をコードする核酸を含む外因的な核酸配列を意味し、この外因的核酸はトランスジェニック哺乳動物によってコードされる。
本明細書において用いられる用語「処置すること」は、特定の傷害、疾患、障害、もしくは病状の予防、又は特定の傷害、疾患、障害、もしくは病状に関連する症状の緩和、及び/又は前記症状を防止もしくは消去することを包含し得る。「予防」処置は、疾患に関連する病理を発生するリスクを減少させる目的で、疾患の徴候を見せないか又は疾患の早期の徴候のみを見せる対象に投与される処置である。「処置すること」は本明細書において「処置」と交換可能に用いられる。
「ベクター」は、単離された核酸を含み、かつ単離された核酸を細胞の内部に送達するために用いられ得る組成物である。多数のベクターが当分野で公知であり、線状ポリヌクレオチド、イオン性又は両親媒性化合物と結び付けられたポリヌクレオチド、プラスミド、及びウイルスを包含するが、これらに限定されない。それゆえに、用語「ベクター」は自律複製プラスミド又はウイルスを包含する。用語は、例えばポリリジン化合物、リポソーム、及び同類などの、細胞への核酸の移入又は送達を容易化する非プラスミド及び非ウイルス化合物をもまた包含すると解釈されるべきである。ウイルスベクターの例は、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクター、レトロウイルスベクター、組み換えウイルスベクター、及び同類を包含するが、これらに限定されない。非ウイルスベクターの例は、リポソーム、DNAのポリアミン誘導体、及び同類を包含するが、これらに限定されない。
「発現ベクター」は、発現されるべきヌクレオチド配列に作動的に連結された発現対照配列を含む組み換えポリヌクレオチドを含むベクターを言う。発現ベクターは発現のための十分なシス作用エレメントを含む。発現のための他のエレメントはホスト細胞によって又はインビトロ発現系によって供給され得る。発現ベクターは、当分野で公知の全てのもの、例えばコスミド、プラスミド(例えば、裸の又はリポソームに含有された)、及びウイルスを包含し、これらが組み換えポリヌクレオチドを組み込む。
本明細書において用いられる術語は特定のバージョン又は実施態様を記載する目的のためのみであり、本発明の範囲を限定することは意図されない。本明細書において言及される全ての刊行物はそれらの全体が参照によって組み込まれる。
II.組成物
いくつかの実施態様では、本発明は、本明細書において開示される方法に使用するための組成物に関する。NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状を処置及び/又は防止するための、細胞のNLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化を阻害するための、NLRC4によって誘導されるIL-1βが細胞から放出されることを阻害するための、並びに対象のAluによって誘導される網膜色素細胞(RPE)変性を阻害するための方法を包含するが、これらに限定されない。
従って、いくつかの実施態様では、本発明は、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状を処置及び/又は防止することに使用するための組成物を提供する。
いくつかの実施態様では、本発明は、NLRC4によって誘導されるIL-1βが細胞から放出されることを阻害することに使用するための組成物を提供する。
いくつかの実施態様では、本発明は、対象のAluによって誘導される網膜色素細胞(RPE)変性を阻害することに使用するための組成物を提供する。
いくつかの実施態様では、本発明の組成物は、1つ以上のヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。数々のNRTIが公知であり、次を包含するが、これらに限定されない:アバカビル((1S,4R)-4-[2-アミノ-6-(シクロプロピルアミノ)-9H-プリン-9-イル]シクロペンタ-2-エン-1-イル}メタノール;ABC;U.S.特許No.8,183,370)、アデホビル({[2-(6-アミノ-9H-プリン-9-イル)エトキシ]メチル}ホスホン酸;ビスPOM-PMEA;U.S.特許No.5,663,159)、アムドキソビル([(2R,4R)-4-(2,6-ジアミノプリン-9-イル)-1,3-ジオキソラン-2-イル]メタノール;マーフィー(Murphy)ら,2010年)、アプリシタビン(4-アミノ-1-[(2R,4R)-2-(ヒドロキシメチル)-1,3-オキサチオラン-4-イル]ピリミジン-2(1H)-オン;AVX754;PCT国際特許出願公開No.WO2014/183147)、センサブジン(1-[(2R,5R)-5-エチニル-5-(ヒドロキシメチル)-2H-フラン-2-イル]-5-メチルピリミジン-2,4-ジオン;U.S.特許No.7,589,078;8,193,165;9,126,971)、ジダノシン(9-((2R,5S)-5-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロフラン-2-イル)-3H-プリン-6(9H)-オン;DDI;U.S.特許No.7,589,078;8,193,165;9,126,971)、エルブシタビン(4-アミノ-5-フルオロ-1-[(2S,5R)-5-(ヒドロキシメチル)-2,5-ジヒドロフラン-2-イル]ピリミジン-2-オン;U.S.特許出願公開No.2011/0150997)、エムトリシタビン(2',3'-ジデオキシ-5-フルオロ-3'-チアシチジン4-アミノ-5-フルオロ-1-[(2R,5S)-2-(ヒドロキシメチル)-1,3-オキサチオラン-5-イル]-1,2-ジヒドロピリミジン-2-オン;FTC;PCT国際特許出願公開No.WO2014/176532)、エンテカビル(2-アミノ-9-[(1S,3R,4S)-4-ヒドロキシ-3-(ヒドロキシメチル)-2-メチリデンシクロペンチル]-1H-プリン-6-オン;ETV;U.S.特許No.6,627,224)、ラミブジン(2',3'-ジデオキシ-3'-チアシチジン-4-アミノ-1-[(2R,5S)-2-(ヒドロキシメチル)-1,3-オキサチオラン-5-イル]-1,2-ジヒドロピリミジン-2-オン;3TC;U.S.特許No.8,481,554)、ラシビル(4-アミノ-5-フルオロ-1-[(2S,5R)-2-(ヒドロキシメチル)-1,3-オキサチオラン-5-イル]-1,2-ジヒドロピリミジン-2-オン;オットー(Otto),2004年、スタンピジン(メチルN-((4-ブロモフェノキシ){[(2S,5R)-5-(5-メチル-2,4-ジオキソ-3,4-ジヒドロピリミジン-1(2H)-イル)-2,5-ジヒドロフラン-2-イル]メトキシ}ホスホリル)-D-アラニネート;U.S.特許No.6,350,736)、スタブジン(1-[(2R,5S)-5-(ヒドロキシメチル)-2,5-ジヒドロフラン-2-イル]-5-メチル-1,2,3,4-テトラヒドロピリミジン-2,4-ジオン;d4T;U.S.特許No.8,026,356)、テノホビルジソプロキシル(ビス{[(イソプロポキシカルボニル)オキシ]メチル}({[(2R)-1-(6-アミノ-9H-プリン-9-イル)-2-プロパニル]オキシ}メチル)ホスホネート;TDF;PCT国際特許出願公開No.WO2008/007382)、テノホビルアラフェナミド(イソプロピル(2S)-2-[[[(1R)-2-(6-アミノプリン-9-イル)-1-メチル-エトキシ]メチル-フェノキシ-ホスホリル]アミノ]プロパノエート;GS-7340;U.S.特許No.9,296,769)、ザルシタビン(4-アミノ-1-((2R,5S)-5-(ヒドロキシメチル)テトラヒドロフラン-2-イル)ピリミジン-2(1H)-オン;ddC;シェルトン(Shelton)ら,1993年)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(3'-デオキシ-3'-アジド-チミジン1-[(2R,4S,5S)-4-アジド-5-(ヒドロキシメチル)オキソラン-2-イル]-5-メチルピリミジン-2,4-ジオン;AZT;U.S.特許No.5,905,082;6,294,540;6,417,191)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC(カムブジン-9及びK-9としてもまた公知)、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせ。U.S.特許出願公開No.2019/0022115、2019/0055273、2019/0177326、2019/0185508をもまた見よ。これらのU.S.特許、U.S.特許出願公開、及びPCT国際特許出願公開のそれぞれは、その全体が参照によって組み込まれる。それゆえに、いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施態様では、本発明の組成物は医薬組成物として調製される。本化合物を含む医薬組成物はその必要がある個体に多数の経路によって投与され、外用、経口、静脈内、筋肉内、動脈内、髄内、髄腔内、心室内、経真皮、皮下、腹腔内、鼻腔内、経腸、外用、舌下、又は直腸経路を包含するが、これらに限定されない。
本発明は、本発明の組成物を含む医薬組成物をもまた対象とする。より具体的には、かかる化合物は、当業者に公知の標準的な薬学的に許容される担体、フィラー、可溶化剤、及び安定化剤を用いて医薬組成物として製剤され得る。
本発明は、本明細書において開示される方法を実施するための適当な化合物、そのホモログ、断片、アナログ、又は誘導体の医薬組成物の使用をもまた包摂し、組成物は、少なくとも1つの適当な化合物、そのホモログ、断片、アナログ、又は誘導体及び薬学的に許容される担体を含む。
本発明を実施するために有用な医薬組成物は、1ng/kg/日及び100mg/kg/日の間のドーズを送達するように投与され得る。本発明の方法に有用である医薬組成物は、経口固体製剤、眼、坐剤、エアロゾル、外用、又は他の類似の製剤によって全身投与され得る。適当な化合物に加えて、かかる医薬組成物は、薬学的に許容される担体及び薬物投与を増強及び容易化することが公知の他の成分を含有し得る。他の可能な製剤、例えばナノ粒子、リポソーム、リシール赤血球、及び免疫学系の系もまた、本発明の方法に従って適当な化合物を投与するために用いられ得る。
本発明は、活性成分として本明細書において開示される病状、障害、及び疾患の処置に有用な化合物を含む医薬組成物の調製及び使用をもまた包摂する。かかる医薬組成物は対象への投与に好適な形態の活性成分単独からなり得るか、又は医薬組成物は活性成分並びに1つ以上の薬学的に許容される担体、1つ以上の追加の成分、又はこれらの何らかの組み合わせを含み得る。当分野で周知である通り、活性成分は、生理学的に許容されるエステル又は塩の形態で、例えば生理学的に許容されるカチオン又はアニオンとの組み合わせで医薬組成物中に存在し得る。
本明細書において用いられる用語「生理学的に許容される」エステル又は塩は、組成物が投与されるべき対象にとって有害性ではない、医薬組成物のいずれかの他の成分と適合性である活性成分のエステル又は塩形態を意味する。
本明細書に記載される医薬組成物の製剤は、薬理学の分野で公知の又は今後開発されるいずれかの方法によって調製され得る。一般的には、かかる調製方法は、活性成分を担体又は1つ以上の他の補助的な成分と結び付け、それから、必要な又は望ましい場合には、産物を所望のシングル又はマルチドーズユニットへと成形又はパッケージングするステップを包含する。
本明細書において提供される医薬組成物の記載は主としてヒトへの医療投与に好適である医薬組成物を対象とするが、かかる組成物は全ての種類の動物への投与に一般的に好適であるということは当業者によって理解されるであろう。組成物を種々の動物への投与に好適にするためのヒトへの投与に好適な医薬組成物の改変は良く理解されており、通例の技能の獣医学薬理学者はかかる改変をせいぜい単に通例の実験作業によって設計し得、行い得る。
本発明の医薬組成物の投与が企図される対象は、ヒト及び他の霊長類、並びに商業的に大事な哺乳動物を包含する哺乳動物、例えば畜牛、育成豚、ウマ、ヒツジ、ネコ、及びイヌを包含するが、これらに限定されない。
本発明の方法に有用である医薬組成物は、経口、直腸、膣、非経口、外用、経肺、鼻腔内、バッカル、眼、髄腔内、又は別の投与経路に好適な製剤として調製、パッケージング、又は販売され得る。いくつかの実施態様では、組成物は眼部送達のために製剤される。他の企図される製剤は、有突起ナノ粒子、リポソーム調製物、活性成分を含有するリシール赤血球、及び免疫学系製剤を包含する。
本発明の医薬組成物は、バルクで、シングルユニットドーズとして、又は複数のシングルユニットドーズとして調製、パッケージング、又は販売され得る。本明細書において用いられる「ユニットドーズ」は、所定の量の活性成分を含む医薬組成物の個別的な量である。活性成分の量は、一般的には、対象に投与されるであろう活性成分の用量、又はかかる用量の便利な画分、例えばかかる用量の二分の一又は三分の一に等しい。
本発明の医薬組成物中の活性成分(単数又は複数)、薬学的に許容される担体(単数又は複数)、及びいずれかの追加の成分の相対量は、処置される対象のアイデンティティー、サイズ、及び状態に依存して、更に、組成物が投与されるべき経路に依存して変動するであろう。例として、組成物は0.1%及び100%(w/w)の間の活性成分を含み得る。
活性成分に加えて、本発明の医薬組成物は更に1つ以上の追加の薬学的に活性な薬剤を含み得る。特に企図される追加の薬剤は、制吐薬及びスカベンジャー、例えばシアニド及びシアネートスカベンジャーを包含する。
本発明の医薬組成物の制御放出又は徐放製剤が従来のテクノロジーを用いて作られ得る。経口投与に好適な本発明の医薬組成物の製剤は、個別的な固体投薬単位の形態で調製、パッケージング、又は販売され得、それぞれが所定の量の活性成分を含有する錠剤、ハードもしくはソフトカプセル、カシェ、トローチ、又はロゼンジを包含するが、これらに限定されない。経口投与に好適な他の製剤は、粉末状もしくは顆粒状製剤、水系もしくは油系懸濁液、水系もしくは油系溶液、又はエマルションを包含するが、これらに限定されない。
本明細書において用いられる「油系」液体は、炭素含有液体分子を含み、かつ水よりも極性でない性質を見せるものである。
経口投与に好適である本発明の医薬組成物の液体製剤は、液体形態で、又は使用に先立つ水もしくは別の好適な基剤による水戻しを意図される乾燥産物の形態でどちらかで、調製、パッケージング、及び販売され得る。
液体の懸濁液は、水系又は油系基剤による活性成分の懸濁を達成するための従来の方法を用いて調製され得る。水系基剤は例えば水及び等張生理食塩水を包含する。油系基剤は、例えばアーモンド油、油系エステル、エチルアルコール、野菜油、例えば落花生、オリーブ、胡麻、又はココナッツ油、分画野菜油、及び鉱油、例えば液体パラフィンを包含する。液体の懸濁液は1つ以上の追加の成分を更に含み得、懸濁剤、分散又は濡れ剤、乳化剤、粘滑薬、保存料、緩衝剤、塩、香味剤、着色料、及び甘味料を包含するが、これらに限定されない。油系懸濁液は更に増粘剤を含み得る。公知の懸濁剤は、ソルビトールシロップ、水素添加食用脂、アルギン酸ナトリウム、ポリビニルピロリドン、トラガカントガム、アカシアガム、及びセルロース誘導体、例えばカルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロースを包含するが、これらに限定されない。
公知の分散又は濡れ剤は、天然に生起するホスファチド、例えばレシチン、脂肪酸との、長鎖脂肪族アルコールとの、脂肪酸及びヘキシトールに由来する部分エステルとの、又は脂肪酸及び無水ヘキシトールに由来する部分エステルとのアルキレンオキシドの縮合産物(例えば、それぞれ、ステアリン酸ポリオキシエチレン、ヘプタデカエチレンオキシセタノール、ポリオキシエチレンソルビトールモノオレエート、及びポリオキシエチレンソルビタンモノオレエート)を包含するが、これらに限定されない。
公知の乳化剤はレシチン及びアカシアを包含するが、これらに限定されない。公知の保存料は、パラヒドロキシ安息香酸メチル、エチル、又はn-プロピル、アスコルビン酸、及びソルビン酸を包含するが、これらに限定されない。公知の甘味料は、例えばグリセロール、プロピレングリコール、ソルビトール、スクロース、及びサッカリンを包含する。油系懸濁液のための公知の増粘剤は例えば蜜蝋、固形パラフィン、及びセチルアルコールを包含する。
水系又は油系溶媒中の活性成分の液体の溶液は液体の懸濁液と実質的に同じ様式で調製され得る。一次的な違いは、活性成分が溶媒中に懸濁されるよりもむしろ溶解されるということである。本発明の医薬組成物の液体の溶液は、液体の懸濁液について記載されているコンポーネントのそれぞれを含み得る。懸濁剤は必ずしも溶媒中の活性成分の溶解を補助しないであろうということは理解される。水系溶媒は例えば水及び等張生理食塩水を包含する。油系溶媒は、例えばアーモンド油、油系エステル、エチルアルコール、野菜油、例えば落花生、オリーブ、胡麻、又はココナッツ油、分画野菜油、及び鉱油、例えば液体パラフィンを包含する。
本発明の医薬調製物の粉末状及び顆粒状製剤は公知の方法を用いて調製され得る。かかる製剤は対象に直接的に投与され得、例えば、錠剤を形成するために、カプセルを充填するために、又はそれへの水系もしくは油系基剤の追加によって水系もしくは油系懸濁液もしくは溶液を調製するために用いられる。これらの製剤のそれぞれは、更に、分散又は濡れ剤、懸濁剤、及び保存料の1つ以上を含み得る。追加の賦形剤、例えばフィラー及び甘味料、香味剤、又は着色料もまたこれらの製剤に包含され得る。
本発明の医薬組成物は、水中油型エマルション又は油中水型エマルションの形態でもまた調製、パッケージング、又は販売され得る。油相は、野菜油、例えばオリーブ又は落花生油、鉱油、例えば液体パラフィン、又はこれらの組み合わせであり得る。かかる組成物は、1つ以上の乳化剤、例えば天然に生起するガム、例えばアカシアガム又はトラガカントガム、天然に生起するホスファチド、例えば大豆又はレシチンホスファチド、ソルビタンモノオレエートなどの脂肪酸及び無水ヘキシトールの組み合わせに由来するエステル又は部分エステル、並びにエチレンオキシドとのかかる部分エステルの縮合産物、例えばポリオキシエチレンソルビタンモノオレエートを更に含み得る。これらのエマルションは、例えば甘味料又は香味剤を包含する追加の成分をもまた含有し得る。
本発明の医薬組成物は、直腸投与、膣投与、非経口投与に好適な製剤としてもまた調製、パッケージング、又は販売され得る。
医薬組成物は、無菌注射用水系又は油系懸濁液又は溶液の形態で調製、パッケージング、又は販売され得る。この懸濁液又は溶液は公知技術に従って製剤され得、活性成分に加えて、追加の成分、例えば本明細書に記載される分散剤、濡れ剤、又は懸濁剤を含み得る。かかる無菌注射用製剤は、非毒性の非経口的に許容される希釈剤又は溶媒、例えば水又は例えば1,3ブタンジオールを用いて調製され得る。
他の許容される希釈剤及び溶媒は、リンゲル液、等張塩化ナトリウム溶液、及び不揮発性油、例えば合成のモノ又はジグリセリドを包含するが、これらに限定されない。有用である他の非経口投与可能な製剤は、活性成分を微結晶形態で、リポソーム調製物として、又は生分解性のポリマー系のコンポーネントとして含むものを包含する。徐放又はインプラントのための組成物は、薬学的に許容されるポリマー又は疎水性材料、例えばエマルション、イオン交換樹脂、難溶性ポリマー、又は難溶性塩を含み得る。
経口及び/又は経鼻投与にとって好適な製剤は、例えば約0.1%(w/w)ほども少しから100%(w/w)ほども多くまでの活性成分を含み得、更に、本明細書に記載される追加の成分の1つ以上を含み得る。
本発明の医薬組成物は、バッカル投与に好適な製剤として調製、パッケージング、又は販売され得る。かかる製剤は、例えば従来の方法を用いて作られる錠剤又はロゼンジの形態であり得、例えば0.1から20%(w/w)の活性成分であり得、残部は経口的に溶解可能な又は分解可能な組成物と任意に本明細書に記載される追加の成分の1つ以上とを含む。その代わりに、バッカル投与に好適な製剤は、活性成分を含む粉末又はエアロゾル化もしくは噴霧された溶液もしくは懸濁液を含み得る。かかる粉末状の、エアロゾル化された、又はエアロゾル化された製剤は、分散されるときには、好ましくは約0.1から約200ナノメートルの範囲の平均粒径又は液滴径を有し、本明細書に記載される追加の成分の1つ以上を更に含み得る。
本明細書において用いられる「追加の成分」は次の1つ以上を包含するが、これらに限定されない:賦形剤;表面活性剤;分散剤;不活性な希釈剤;造粒及び崩壊剤;結合剤;潤滑剤;甘味料;香味剤;着色料;保存料;生理学的に分解可能な組成物、例えばゼラチン;水系基剤及び溶媒;油系基剤及び溶媒;懸濁剤;分散又は濡れ剤;乳化剤、粘滑薬;緩衝剤;塩;増粘剤;フィラー;乳化剤;抗酸化剤;抗生物質;抗真菌剤;安定化剤;及び薬学的に許容されるポリマー又は疎水性材料。本発明の医薬組成物に包含され得る他の「追加の成分」は当分野において公知であり、例えばレミントンの薬科学Remington's Pharmaceutical Sciences),ジェンナーロ(Genaro)(編)(1985年)マック出版社,イーストン,ペンシルベニア,米国に記載されている。これはその全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
典型的には、動物、好ましくはヒトに投与され得る本発明の化合物の用量は、対象の体重のキログラム当たり1μgから約100gの量の範囲であるが、投与される正確な用量は、処置されようとする動物の型及び疾患状態の型、動物の年齢、並びに投与経路を包含するがこれらに限定されない多数の因子に依存して変動するであろう。1つの実施態様では、化合物の用量は動物の体重のキログラム当たり約10μgから約10gまで変動するであろう。別の実施態様では、用量は対象の体重のキログラム当たり約10mgから約1gまで変動するであろう。
化合物は毎日数回ほども頻繁に対象に投与され得る。又は、それは、より頻繁でなく、例えば1日に1回、1週に1回、2週に1回、1ヶ月に1回、又は更にはより頻繁でなく、例えば数ヶ月に1回又は更には1年に1回、又はより少なく投与され得る。投薬の頻度は当業者には難なく明らかであり、例えば処置されようとする疾患の型及び重篤度、対象の型及び年齢などだがこれらに限定されない多数の因子に依存するであろう。
いくつかの実施態様では、本発明の組成物は追加の治療薬剤を包含する。これらは、いくつかの実施態様では、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(cGAS)、カスパーゼ-4、インターフェロン遺伝子刺激因子(STING)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、阻害剤は短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これは、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1(CAS-1)、cGAS、カスパーゼ-4(CAS-4)、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化する。いくつかの実施態様では、阻害剤は抗体又はその抗原結合断片であり、これは、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する。NLRC4、NLRP3、CAS-1、サイクリックCGAS、CAS-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARの核酸及び抗体に基づく阻害剤は例えばPCT国際特許出願公開No.WO2019/074884に開示され、これはその全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
III.使用及び処置の方法
本明細書において開示される通り、インフラマソームを活性化するSINE-RNAを認識する細胞センサーはDdx17として同定された。意外にも、SINE-RNAとの結合によって、Ddx17は、NLRC4、NLRP3蛋白質、及びCARD含有アポトーシス関連スペック様蛋白質(ASC)蛋白質の二重リクルート、次に下流の炎症カスケードを引き起こす。その上、SINEはNAIPとは独立してNLRC4インフラマソームを活性化した。これは細菌感染の際の古典的NLRC4インフラマソームに要求される。我々のデータは、Ddx17-NLRC4-NLRP3シグナル伝達がAMDの進行した形態の地図状萎縮の臨床的及び病理学的ホールマークのRPE変性に寄与するということを示唆する。まとめると、我々の研究は、NAIPとは独立のSINEによって活性化される無菌性の非古典的NLRC4インフラマソーム経路の第1の報告への新規の洞察を提供し、AMDの病理におけるNLRC4インフラマソームの意外な役割をもまた記載する。
従って、本発明のいくつかの実施態様では、例えば黄斑変性、アルツハイマー病、ループスなどだがこれらに限定されない複数の疾患に関連付けられているSINE-RNAが、NLFC4インフラマソームを先には未知の様式で活性化するということが見出された。より具体的には、SINE-RNAはDDX17によって認識され、これはNLRC4と相互作用し、先にはNLRC4活性化に要求されると考えられていたNAIPとは独立のNLRC4の活性化を提供する。本明細書に更に記載される通り、DDX17又はNLRC4を標的化するsiRNAは網膜変性を包含する細胞性炎症及び細胞死をブロックする。NRTI又はアルキル化NRTIもまたNLRC4活性化をブロックし、それゆえに、NLRC4の第1の低分子阻害剤かつ複数の疾患の薬物候補を表す。
よって、いくつかの実施態様では、本発明は、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状を処置及び/又は防止するための方法に関する。本明細書において用いられる言い回し「NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状」は、その少なくとも1つの症状が直接的に又は間接的にどちらかでNLRC5生物活性からもたらされ、かつ細胞及び/又は対象におけるその改善が本発明の組成物及び方法による細胞及び/又は対象の処置からもたらされ得るいずれかの疾患、障害、及び/又は病状を言う。NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する例示的な疾患、障害、及び/又は病状は、移植片対宿主病、慢性疼痛、増殖性硝子体網膜症、緑内障、関節リウマチ、多発性硬化症、双極性障害、大うつ病性障害、腎線維症、腎炎、肺線維症、ハンチントン病、骨粗鬆症、慢性リンパ性白血病、不安障害、肺結核、閉経後の女性及び骨折患者における骨粗鬆症、全身性エリテマトーデス、慢性炎症性及び神経障害性疼痛、常染色体優性多発性嚢胞腎、脊髄損傷、アルツハイマー病、神経障害性疼痛、高血圧、静脈瘤、I型糖尿病、II型糖尿病、痛風、自己免疫性肝炎、グラフト血管損傷、動脈硬化、血栓症、メタボリックシンドローム、唾液腺炎症、外傷性脳損傷、虚血性心疾患、虚血性脳卒中、パーキンソン病、メラノーマ、神経芽腫、前立腺、乳、皮膚、及び甲状腺癌、早期管状腺胃癌、神経内分泌癌、ムコイド結腸癌、結腸癌;高異型度尿路上皮癌、淡明型腎細胞癌、未分化卵巣癌、乳頭嚢胞内乳癌、グラム陰性敗血症、感染性緑膿菌、ビブリオコレラ、レジオネラspp.、フランシセラspp.、リーシュマニアspp、SARS-CoV、SARS-CoV-2、及びクラミジアspp.、クライオピリノパチー;角膜炎、尋常性ざ瘡、クローン病、潰瘍性大腸炎、過敏性腸症候群、インスリン抵抗性、肥満、溶血性尿毒症症候群、ポリオーマウイルス感染、免疫複合体型腎疾患、急性腎障害、ループス腎炎、家族性寒冷自己炎症性症候群、マックル・ウェルズ症候群及び小児多臓器系炎症性疾患、慢性乳児神経皮膚関節自己炎症性疾患、腎虚血灌流障害、糸球体腎炎、クリオグロブリン血症、全身性血管炎、IgA腎症、マラリア、寄生蠕虫、敗血症性ショック、アレルギー性喘息、枯草熱、慢性閉塞性肺疾患、薬剤性肺炎症、接触皮膚炎、らい病、バークホルデリア・セノセパシア感染、呼吸器合胞体ウイルス感染、乾癬、強皮症、反応性関節炎、嚢胞性線維症、梅毒、シェーグレン症候群、炎症性関節疾患、非アルコール性脂肪肝疾患、心臓手術(周術期/術後炎症)、急性及び慢性臓器移植拒絶、急性及び慢性骨髄移植拒絶、並びに腫瘍血管新生を包含するが、これらに限定されない。NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する特定の疾患、障害、及び/又は病状は、加齢黄斑変性(AMD)及び/又は地図状萎縮である。
本発明のいくつかの実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状を処置及び/又は防止するための方法は、NRTIを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る組成物をその必要がある対象に投与することを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。投与することは、NLRC4インフラマソーム生物活性を減縮するための有効な量及び経路によってであり、それによって、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状を処置及び/又は防止する。いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
本発明の特定の実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状は網膜色素上皮(RPE)の疾患であり、これはいくつかの実施態様では加齢黄斑変性(AMD)及び/又は地図状萎縮を包含し得る。
類似に、いくつかの実施態様では、本発明は、細胞のNLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化を阻害するための方法に関する。いくつかの実施態様では、方法は、NLRC4遺伝子産物並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRP3遺伝子産物の複合体をNRTIを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させることを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。それによって、NLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化が細胞において阻害される。いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
本発明の方法のいくつかの実施態様では、細胞は、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在する。
加えて、いくつかの実施態様では、本発明はNLRC4によって誘導されるIL-1βが細胞から放出されることを阻害するための方法に関する。これらは、いくつかの実施態様では、NLRC4遺伝子産物並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRP3遺伝子産物の複合体をヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させることを含み得るか、本質的にそれからなり得るか、又はそれからなり得る。それによって、細胞からのNLRC4によって誘導されるIL-1β放出が阻害される。いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
本発明の方法のいくつかの実施態様では、細胞は、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在する。
いくつかの実施態様では、NLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化及び/又はNLRC4によって誘導されるIL-1β放出は、NLRファミリーCARDドメイン含有4(NLRC4)インフラマソーム生物活性と関連する疾患、障害、及び/又は病状と関連する。いくつかの実施態様では、NLRC4インフラマソーム生物活性と関連する疾患、障害、及び/又は病状は、網膜色素上皮(RPE)の疾患、任意に加齢黄斑変性(AMD)及び/又は地図状萎縮である。
加えて、いくつかの実施態様では、本発明は、対象におけるAluによって誘導される網膜色素細胞(RPE)変性を阻害するための方法に関する。これらは、いくつかの実施態様では、対象の細胞のNLRC4遺伝子産物並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRP3遺伝子産物の複合体をヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させることを含み得るか、本質的にそれからなり得るか、又はそれからなり得る。それによって、細胞からのNLRC4によって誘導されるIL-1β放出が阻害される。いくつかの実施態様では、NRTIは、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施態様では、細胞はRPE細胞であり、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在する(that present)。いくつかの実施態様では、本発明の方法は、更に、RPEを分解から保護するように設計された少なくとも1つの追加の処置を対象に施すことを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。
それゆえに、かつ当業者によって理解されるであろう通り、いくつかの実施態様では、本発明の組成物及び方法は組み合わせ治療の一部であり、処置されるべき疾患、障害、及び/又は病状に依存して、NRTI処置以外の適当な治療が使用される。限定ではなく例として、いくつかの実施態様では、本発明の方法は、更に、その必要がある対象にNLRC4インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤を投与することを含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。いくつかの実施態様では、少なくとも1つの追加の阻害剤は、アンチセンスオリゴヌクレオチド、短鎖干渉RNA(siRNA)、短鎖ヘアピンRNA(shRNA)、及び抗体又はその抗原結合断片からなる群から選択される。本発明の組成物及び方法に使用され得るsiRNA及びshRNAが本明細書において上で開示され、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1(CAS-1)、CGAS、カスパーゼ-4(CAS-4)、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化する核酸を包含し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。
いくつかの実施態様では、少なくとも1つの追加の処置は、NLRC4、NLRP3、CAS-1、CGAS、CAS-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を対象に投与することを含む。いくつかの実施態様では、阻害剤は短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これは、NLRC4、NLRP3、CAS-l、cGAS、CAS-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る。
いくつかの実施態様では、阻害剤は抗体又はその抗原結合断片であり、これは、NLRC4、NLRP3、CAS-1、cGAS、CAS-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する。NLRC4、NLRP3、CAS-1、cGAS、CAS-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNAR遺伝子産物に結合する抗体及びそれらの断片は、当分野で公知の方法を用いて容易に産生され得る(例えば、ハーラン(Harlan)&レーン(Lane),1988年を見よ)。代替的に又は加えて、これらの遺伝子産物に結合する抗体及びそれらの抗原結合断片は、Abcam(ケンブリッジ、英国)、サンタクルーズバイオテクノロジー社(サンタクルーズ、カリフォルニア、米国)、シグマアルドリッチ(セントルイス、ミズーリ、米国)、及び他を包含するがこれらに限定されないソースから商業的に利用可能である。
ここで、本発明の代表的な実施態様が示される付随する例を参照して、本発明が以降でより詳しく記載される。しかしながら、本発明は異なる形態で実施され得、本明細書において提出される実施態様に限定されると解釈されるべきではない。むしろ、これらの実施態様は、本開示が徹底的かつ完全であり、本発明の範囲を当業者に詳しく伝えるようにして提供される。
実施例1
SINE-RNAはNLRC4インフラマソーム活性化を誘導する
先の研究は、サルモネラ暴露に応答したNLRC4インフラマソーム活性化が、その活性化のための2つのステップ、NLRC4のSer533残基のリン酸化とNLRC4のNAIPによって媒介されるオリゴマー化とを要求するということを示している。イムノブロットは、ヒトAluRNA(配列番号86)並びにマウスB1(配列番号87)及びB2(配列番号88)RNAがBMDMにおいてS533のNLRC4リン酸化を誘導するということを明らかにした。注記すべきことに、長鎖dsRNAミメティックポリ(I:C)はNLRC4リン酸化を誘導しなかった(図1)。その上、SINE-RNAによる処置はインフラマソーム活性化の指標のカスパーゼ-1p20切断を誘導した(図2)。この研究における爾後の実験には、我々はAluRNA(配列番号86)をNLRC4インフラマソームを活性化するための刺激として用いた。今日まで、2つのキナーゼがNLRC4をS533でリン酸化することが報告されている:蛋白質キナーゼCデルタ(PKCδ)及びロイシンリッチリピート含有キナーゼ-2(LRRK2)である。AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4リン酸化におけるこれらのキナーゼの役割を探求するために、我々はBMDMをそれぞれLRRK2(GSK2578215A、GSK)及びPKCδ(ロットレリン、Rot)の薬理学的阻害剤によって前処置した。GSKではなくロットレリンは、NLRC4のAluRNA(配列番号86)によって誘導されるリン酸化とカスパーゼ-1活性化とをBMDMにおいて阻害し(図2)、LRRK2ではなくPKCδがこのプロセスに関わるということを示唆した。
活性化したNLRC4インフラマソームは、高分子質量マルチ蛋白質複合体へとアセンブリすることによってオリゴマー化を経過する。我々は、BMDMのSINE-RNA処置に応答したNLRC4及びアポトーシススペック(ASC)様蛋白質複合体のインサイチュのアセンブリを第1に検討した。免疫蛍光研究は、モック処置された細胞と比較して、SINE-RNAによって処置されたBMDMにおける増大したNLRC4及びASCスペックを示す(図3A)。NLRC4インフラマソームアセンブリを評価するために、WT及びNLRC4KOのBMDM細胞をAluRNA(配列番号86)によって処置した。スベリン酸ジスクシンイミジル(DSS)によって架橋されたライセートを変性SDS-PAGEを用いて分析してASCオリゴマーを検出し、細胞ライセートをネイティブポリアクリルアミドゲル電気泳動(ネイティブ-PAGE)を用いて分析してNLRC4オリゴマー化を検出した。イムノブロットは、AluRNA(配列番号86)がASCオリゴマーの形成をNLRC4に依存的に誘導し(図3B)、典型的な大きいオリゴマーNLRC4複合体がSINE-RNAによって誘導される(図4)ということを明らかにした。NLRC4/ASCオリゴマー化はプロカスパーゼ-1からその活性形態p20への切断及びIL-1β放出に必須である。有意に、SINE-RNAによって誘導されるカスパーゼ-1の活性化及びIL-1β放出は、NLRC4BMDMにおいて損なわれた(図5A及び5B)。総体的に、これらのデータは、リン酸化、オリゴマー化、及びELISAアッセイによってモニタリングされる通り、SINE-RNAがマウスBMDMにおけるNLRC4インフラマソーム活性化を誘導するということを実証し、PKCδがNLRC4リン酸化を担うキナーゼであるということを示唆する。
実施例2
DDX17はSINE-RNAによって誘導されるNLRC4インフラマソーム活性化に要求される
次に、我々は、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4インフラマソーム活性化を担うセンサーを同定することを求めた。我々は架橋免疫沈降(CLIP)-質量分析を使用してAluRNA(配列番号86)の蛋白質相互作用パートナーを明らかにした。爾後に、DDX5及びDDX17を可能性としてのAluRNA相互作用パートナーとして同定した(図6A及び6B)。免疫局在研究は、WTマウスBMDMにおけるビオチン標識AluRNA(配列番号86)及びDDX17の重ね合わせを示している(図7)。次に、我々は、DDX17がAluRNA(配列番号86)と相互作用するかどうかをCLIPアッセイを用いて検討した。我々はMycタグ付きDDX17をHEK293細胞にトランスフェクションし、爾後にそれらをビオチン標識AluRNA(配列番号86)によって処置し、それらをUV架橋に付した(図8A)。ノーザンブロッティングによって検出される通り、抗ストレプトアビジン(図8B)又はMyc抗体(図8C)による細胞ライセートの免疫沈降はビオチン標識AluRNA(配列番号86)をプルダウンした。mycのイムノブロット及びAluRNA(配列番号86)のノーザンブロッティングは、AluRNA(配列番号86)がDDX17と相互作用するということを示した(図8C)。次に、我々はDDX17がNLRC4と相互作用するという仮説を試験した。AluRNA(配列番号86)によって処置されたマウスBMDMでは、免疫蛍光研究はDDX17及びNLRC4の共局在を明らかにした(図9)。DDX17及びNLRC4の間の物理的相互作用が、AluRNA(配列番号86)によって処置されたHEK293細胞において、FLAG-NLRC4発現系及び免疫沈降を用いて同定された(図10)。
次に、我々は、DDX5又はDDX17が、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4インフラマソーム活性化のセンサーであるかどうかを検査した。DDX5及びDDX17の配列の類似性の高い度合いを原因として、我々はDDX5単独、DDX17単独、又はDDX5及びDDX17両方を標的化する3つのsiRNAを設計し、それらの標的効率をTHP1細胞において確認した(図11A)。DDX5/17siRNA及びDDX17siRNA両方は、AluRNA(配列番号86)によって処置された細胞におけるカスパーゼ-1切断を縮減したが、DDX5siRNAはそうしなかった(図11A)。最近の証拠は、DDX5及びDDX17がコアRNA特異的エンドリボヌクレアーゼDroshaと併せてmiRNAマイクロプロセシングに関わるということを示唆している。よって、我々はDroshaもまたSINE-RNA-DDX17-NLRC4軸に関わるかどうかを試験した。そこで、我々はsiDrosha又はsiDDX17又はsi対照をモック又はAluRNA(配列番号86)によって処置されたTHP1細胞においてトランスフェクションし、カスパーゼ-1活性化をイムノブロットによって検査した。siDDX17はカスパーゼ-1のレベルを阻害したが(図11B)、siDroshaはしなかった。これらの観察は、DDX17によって媒介されるSINE-RNAによって誘導されるNLRC4インフラマソームがマイクロプロセッサ機能に非依存的であるということを関連付けている。
それから、我々は、siDDX17がTHP1細胞におけるASCオリゴマー化及びIL-1β放出をもまた阻害し得るかどうかを検査した。イムノブロットは、si対照及びsiDDX5と比較して、siDDX17のみがASCオリゴマーの形成を防止するということを明らかにした(図12A)。ELISA読み出しは、siDDx5/対照と比較して、IL-βがsiDDX17及びsiDDX5/17では有意に縮減されたということを示している(図12B)。全てのこれらのデータは、DDX17がSINE-RNAによって誘導されるNLRC4インフラマソーム活性化のセンサーであるということを示唆する。DDX17がNLRC4のセンサーであるということを更に確認するために、我々は、それぞれAluRNA(配列番号86)又はモック処置されたTHP1細胞及びDDX17KOのBMDMにおいて、イムノブロットによるカスパーゼ-1切断及びELISAによるIL-1β分泌を検討した。AluRNA(配列番号86)によって処置されたWT細胞と比較して、カスパーゼ-1はDDX17KOのBMDMでは有意に縮減された;図13A)。更にその上、IL-1βのレベルはDDX17KOのBMDM及びsiDDX17、siDDX5/17トランスフェクションTHP1細胞では有意に阻害され、NLRC4のセンサーとしてのDDX17の根拠を更に提供した(図13B)。
我々は、AluRNA(配列番号86)がI型インターフェロン(IFN)応答及び炎症プライミングをBMDMにおいて誘導するということを先に報告した。DDX17はAluRNA(配列番号86)によって誘導されるインフラマソーム活性化に必須であるので、我々はDDX17ノックダウンがI型IFN応答などのインフラマソームカスケードの下流事象に影響し得るかどうかを試験した。カスパーゼ-1、CXCL10、IFNβ、IL-18、及びIL-1β遺伝子の発現は、カスパーゼ-1を例外としてAluRNA(配列番号86)による処置に応答して上方制御された。DDX17siRNAはこれらの遺伝子の発現レベルに影響しなかった(図14A及び14B)。
最後に、我々は、DDX17がNAIPを要求するフラジェリンによる従来のNLRC4活性化とLPS+ATP依存的なNLRP3インフラマソーム活性化とに役割を有するかどうかを検査した。我々はマウスBMDMをフラジェリン又はLPS+ATPによって処置し、siDDX17によってトランスフェクションし、NLRC4又はNLRP3依存的なカスパーゼ-1切断を検査した。イムノブロットは、無変化のカスパーゼ-1レベルによって指示される通り、DDX17ノックダウンが、それぞれフラジェリン及びLPS+ATPによって誘導されるNLRC4及びNLRP3インフラマソームに影響しないということを示している(図15)。これらのデータは、DDX17が、フラジェリンによって誘導されるNLRC4及びLPS+ATPのNLP3インフラマソームには関わっていないという考えを支持する。
実施例3
NAIPではなくNLRP3がAluRNAによって誘導されるDDX17-NLRC4活性化に要求される
次に、我々は、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるDDX17が可能性としてNLRC4以外のNLRと相互作用し得るかどうかを検討した。免疫沈降タンデム質量分析は、モック処置されたDDX17と比較して、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるDDX17がNLRP3ペプチドともまた相互作用するということを同定した(表3及び4を見よ)。そこで、我々は、DDX17とのAluRNA(配列番号86)の相互作用がNLRC4及びNLRP3インフラマソーム両方をリクルートし得るかどうかを試験した。我々はWT及びDDX17KOのBMDMをAluRNA(配列番号86)によって処置し、NLRP3を免疫沈降してNLRC4発現について検査した。イムノブロットは、NLRC4がDDX17KOではなくWTのBMDMのみで発現されるということを明らかにし、AluRNA(配列番号86)及びDDX17複合体がNLRP3及びNLRC4インフラマソームをリクルートするということを示唆した(図16)。次に、我々は、NLRC4活性がNLRP3-ASC相互作用にとって機能的に大事かどうかを問うた。我々はAluRNA(配列番号86)によって処置されたWT及びNLRC4KOのBMDMにおいてASCを免疫沈降し、NLRP3発現を検査した。イムノブロットは、NLRP3発現がNLRC4KOのBMDMでは完全に阻害されるということを明らかにし、NLRP3-ASC相互作用がNLRC4の不在下において阻害されるということを示唆した(図17A)。更にその上、ASC単量体及び二量体は、NLRP3又はASCKOのBMDMではなくAluRNA(配列番号86)によって処置されたWTのBMDMでのみ現れた(図17B)。次に、我々はSINE-RNAによって誘導されるインフラマソームにおけるNLRP3の機能的な役割を評価した。WT及びNLRP3KOのBMDMをモック又はAluRNA(配列番号86)処置に付して、NLRC4、カスパーゼ-1、及びIL-1βレベルを検査した。イムノブロットの結果は、SINE-RNAによって誘導されるインフラマソームが、NLRC4発現に影響することなしにNLRP3KOのBMDMにおいてブロックされるということを示している(図18A)。類似に、IL-1βレベルはWTのBMDMと比較してNLRP3KOでは有意に阻害された(図18B)。これらのデータは、NLRP3がSINE-RNAによって誘導されるNLRC4インフラマソームに要求されるが、必須ではないということを示唆する。
Figure 2022550670000004
Figure 2022550670000005
蛋白質のNAIPファミリーは、専用の病原体センサーとして作用することによってNLRC4インフラマソーム活性化を促すように機能する。先の研究は、マウスNAIPがNLRC4及び細菌リガンドとの複合体を形成してインフラマソームを活性化するということを示した。例えば、NAIP5及びNAIP2はNLRC4及びそれぞれサルモネラ種のフラジェリン又はT3SSコンポーネントとの複合体を形成する。後の研究は、NAIP5に類似に、NAIP6もまたフラジェリンを認識し得るが、NAIP1はT3SS蛋白質PrgIに応答してNLRC4を活性化するということを明らかにした。しかしながら、ヒトでは、1コピーのNAIPのみが存在し、これによってNLRC4が活性化される。それゆえに、NAIPはマウス及びヒトにおけるNLRC4インフラマソーム活性化に必須である。ゆえに、我々は、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4活性化がNAIP依存的であるかどうかを決定することを求めた。第1に、我々は、NAIP1~6KOマウス細胞を用いて、NAIPを要求するフラジェリンによるNLRC4によって媒介されるカスパーゼ-1活性化を検査した。先の研究と整合して、NAIP1~6KOマウスから単離されたBMDMは、切断されたカスパーゼ-1産物(p20サブユニット;図19A)の有意な阻害によって証明される通り、フラジェリンによって刺激されたときにNLRC4インフラマソームを活性化することに失敗した。文献で報告されている知見に類似に、ELISAによって見積もられるIL-1βレベルもまたNAIP1~6KO細胞では有意に縮減された(図19A)。
それから、我々は、WT及びNAIP1~6KOマウスから収穫されたBMDMにおいて、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4リン酸化の違いがあるかどうかを検査した。イムノブロットはNLRC4リン酸化がNAIP1~6KOマウスでは阻害されないということを明らかにし、NAIPがAluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4活性化には関わらずにあり得るということを指示した(図19B)。次に、我々はC57BL/6JのWT、NLRC4KO、及びNAIP1~6KOのBMDMをAluRNA(配列番号86)によって処置し、カスパーゼ-1活性化をウエスタンブロッティングによってモニタリングした。興味深いことに、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるカスパーゼ-1切断はNAIP1~6KOのBMDMではブロックされず(図19B)、AluRNAによって誘導されるNLRC4インフラマソーム活性化がNAIP非依存的であるということを示唆する。AluRNAによって誘導されるNLRC4活性化がNAIP非依存的であるということを更に確認するために、我々はWT及びNAIP1~6KOのBMDMをSINE-RNAによって処置し、ELISAを用いてIL-1β分泌を検査した。IL-1β分泌はSINE-RNA処置に応答して阻害されなかった(図19B)。まとめると、我々の結果は、AluRNAを新規のNAIP非依存的な非古典的NLRC4インフラマソーム経路の引き金として導入する。
我々は、DICER欠損によって媒介されるAluRNAの蓄積がNLRP3インフラマソーム活性化を誘導するということを先に示した。そこで、我々はDICERノックダウンがDDX17-NLRC4-NLRP3シグナル伝達をもまた誘導し得るかどうかを検査した。WT及びDDX17KOのBMDMをsiDICERによってトランスフェクションして、NLRC4リン酸化及びカスパーゼ-1を検査した。イムノブロットデータは、dicer欠損がWTにおいてはNLRC4のリン酸化及びカスパーゼ-1活性化を誘導し、これがDDX17KOのBMDMではブロックされるということを示している(図20A)。それから、我々は、NLRC4のリン酸化及びカスパーゼ-1活性化をWT、NLRC4KO、及びNLRP3KOのBMDMにおいてsiDICER又はsi対照によるトランスフェクション後に決定した。NLRC4のリン酸化はWT又はNLPR3KOのBMDMではなくNLRC4KOのみでブロックされる(図20B)。更にその上、siDICERは、WTのBMDMにおけるカスパーゼ-1の活性化を誘導した。これはNLRC4及びNLRP3KOのBMDMではブロックされる(図20B)。全てのこれらのデータは、DDX17-NLRC4-NLRP3シグナル伝達がDICERノックダウンによって誘導されるインフラマソーム活性化に要求されるという見解を支持する。
実施例4
加齢黄斑変性の治療標的としてのDDX17によって媒介される非古典的NLRC4-NLRP3インフラマソーム
次に、我々はGAのヒト眼がDDX17及びNLRC4を発現するかどうかを試験した。イムノブロットは、対照の眼と比較して、GAの眼のRPE/脈絡膜におけるDDX17及びNLRC4の豊富さを明らかにした(図21A及び21B)。DDX17はNLRC4とインビトロで相互作用したので、我々はこれがAMDの患者にもまた当てはまるかどうかを検討した。PLAアッセイをヒトAMD組織に用いて、我々は、健康な対照と比較して、NLRC4がDDX17と相互作用するということを発見した(図22)。まとめると、これらのデータは、BMDM及びTHP1細胞培養研究における機能的データを映して、ヒトGAへのNAIP及びNLRC4の関わりの証拠を提供する。
我々は、DICER1喪失を原因とするAluRNA(配列番号86)の蓄積がマウス及びヒトにおいてNLRP3インフラマソームを活性化し、カスパーゼ-1依存的な様式でRPE変性を引き起こすということを先に確立した。AluRNA(配列番号86)はマウスBMDMにおいてNLRC4を活性化するので、我々は、次に、NLRC4インフラマソーム活性化がマウスにおけるRPE変性を誘導し得るかどうかを検査するためのインビボ実験を行なった。我々は、恒常的に活性なNLRC4の強制発現がマウスにおいてRPE変性を誘導し得るかどうかを試験した。pNLRC4WT-IRES-GFPではなく、恒常的に活性であるpNLRC4T3375-IRES-GFPの網膜下注射は、WTマウスにおいてRPE変性を誘導した(図23A及び23B)。
次に、我々は、AluRNA(配列番号86)がヒトRPE細胞におけるNLRC4インフラマソーム活性化の引き金ともまたなるかどうかを問うた。我々は免疫蛍光染色実験を行なって、AluRNA(配列番号86)がヒトRPE細胞におけるNLRC4スペック形成を誘導し得るかどうかを検査した。我々は、AluRNA(配列番号86)処置に応答したヒトRPE細胞におけるNLRC4のスペックに似ている斑点構造に気づいた(図24A)。更にその上、モックトランスフェクション細胞と比較して、AluRNA(配列番号86)によってトランスフェクションされたヒトRPE細胞はNLRC4オリゴマーの形成を誘導した(図24B)。まとめると、これらのデータは、AluRNA(配列番号86)によって活性化されるRPE細胞におけるNLRC4シグナル伝達経路の存在を実証している。我々は、更に、カスパーゼ-1切断に関わる決定的ステップのNLRC4によって誘導されるASCオリゴマー化を研究することによって、NLRC4インフラマソーム活性化の下流事象を検討した。NLRC4siRNAは、AluRNA(配列番号86)と併用投与されたときに、インビトロのASCオリゴマー化(図25A)及びインビボのRPE変性(図25B)をブロックした。
最後に、我々は、NLRC4インフラマソームに干渉することが、SINE-RNAによって誘導されるRPE変性をブロックするかどうかを検討することを求めた。我々は、AluRNA(配列番号86)又はAluRNA(配列番号86)+siDDX17をWT又はNLRC4KO又はNAIP1~6KOマウスにおいて網膜下送達し、先に記載された通り眼底写真及びZO-1染色を用いてRPE変性について検査した。AluRNA(配列番号86)はRPE変性をWT及びNAIP1~6KOマウスにおいてのみ誘導し、NLRC4KO及びsiDDX17注射マウスはこの表現型からレスキューされた。NLRC4インフラマソームシグナル伝達に干渉することが、SINE-RNAによって誘導されるRPE変性をブロックするということを示唆している(図26)。
実施例5
NRTIはNLRC4インフラマソームによって誘導されるRPE変性をブロックする
ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)はレトロウイルス複製を阻害するHIV治療薬である。我々は、NRTIが、内在性のレトロエレメントAluRNA(配列番号86)によるP2X7によって媒介されるNLRP3インフラマソーム活性化を阻害するということを先に示した。AluRNA(配列番号86)によるNLRP3インフラマソームの活性化はAMDの重篤な形態の地図状萎縮における網膜色素上皮(RPE)の死を引き起こす。我々は、NRTI(D4T及びAZT)の腹腔内投与が、マウスにおけるAluRNA(配列番号86)によって誘導されるRPE変性を防止するということを先に報告した。現行では、複数のNLRP3インフラマソーム阻害剤、例えばMCC950、CY09が利用可能である。しかしながら、NLRC4の阻害剤はない。そこで、NLRC4によって駆動される疾患を研究するためのNLRC4インフラマソームの阻害剤を開発する必要が存在する。ここで、我々は、NRTIがフラジェリンによって誘導されるNLRC4インフラマソームをブロックするということを初めて示す。我々はフラジェリントランスフェクションされたBMDMをDT4及び3TCによって前処置して、カスパーゼ-1活性化を検査した。イムノブロット研究は、対照と比較して、D4T及び3TCがフラジェリンによって誘導されるカスパーゼ-1活性化をブロックするということを示している(図27)。その上、我々は3TCによって処置されたときのカスパーゼ-1活性化の用量依存的阻害を見た(図28)。一緒になって、全てのこれらのデータはNRTIがNLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化をブロックするということを示唆する。
NLRC4オリゴマー化は、高分子質量のNLRC4蛋白質複合体がアセンブリされるインフラマソーム活性化の別のホールマークである。そこで、我々は次に3TCがフラジェリンによって誘導されるNLRC4オリゴマー化をもまたブロックし得るかどうかを検査した。3TCによって前処置されたBMDMをフラジェリンによってトランスフェクションし、細胞ライセートをネイティブポリアクリルアミドゲル電気泳動(ネイティブPAGE)を用いて分析して、NLRC4オリゴマー化を検出した。イムノブロットは、フラジェリンが対照ではNLRC4オリゴマーを誘導し、これが3TCによって用量依存的に阻害されるということを明らかにし、NRTIがフラジェリンによって誘導されるNLRC4インフラマソームをブロックするということを示唆した(図29)。更にその上、活性化したNLRC4インフラマソームはIL-1βサイトカインの産生を誘導する。そこで、我々は、3TCがフラジェリンによって誘導されるNLRC4依存的なIL-1β産生をもまたブロックし得るかどうかを検査した。イムノブロットデータは、IL-1β産生がフラジェリントランスフェクションBMDMでは用量依存的な様式で3TCによって阻害されるということを示している(図30)。次に、我々はAZT及び3TCを修飾して2-エチルAZT(K8)及び3-メチル3TC(K9)を生成し、フラジェリンによって誘導されるNLRC4依存的なカスパーゼ-1活性化をブロックするそれらの能力を試験した。イムノブロットの結果は、対照と比較して、K8及びK9がフラジェリンによって誘導されるカスパーゼ-1活性化をブロックしたということを示している(図31)。まとめると、全てのこれらのデータは、NRTI及び修飾NRTIがNLRC4インフラマソームの活性化を阻害するということを示唆する。
最後に、我々はNRTIがNLRC4インフラマソームを阻害するメカニズムを検討することを求め、これがNLRP3依存的であるかどうかを問うた。我々はWT及びNLRP3KOのBMDMをフラジェリンによってトランスフェクションして、イムノブロットを用いてカスパーゼ-1活性化を検査した。フラジェリンによって誘導されるカスパーゼ-1活性化はNLRP3欠損BMDMではブロックされ、NLRC4活性化がNLRP3依存的であるということを示唆する(図32)。NRTIの作用機序を更に確認するために、我々は、それらが直接的にNLRP3/NLRC4複合体に結合するかどうかを再構成系において検討した。我々は、フラジェリントランスフェクションBMDMを遊離及びビオチン標識D4T及びAZTによって処置し、ビオチンをプルダウンした。イムノブロットは、D4T及びAZTがNLRP3及びNLRC4と相互作用するということを明らかにし、それらの作用機序を更に確認した(図33)。要約すると、全てのこれらのデータは、NRTIが、NLRP3/NLRC4複合体に直接的に結合することによってフラジェリンによって誘導されるNLRC4活性化を阻害するということを示唆する。
実施例6
PKCδ阻害はNLRC4リン酸化及びAluRNAによって誘導されるカスパーゼ-1活性化をブロックする
野生型BMDMを、指示されているドーズのPKCδ阻害剤ロットレリン(シグマアルドリッチ社、セントルイス、ミズーリ、米国)及びLRRK2阻害剤GSK2578215A(シグマアルドリッチ)によって1時間に渡って前処置し、それから、AluRNA(配列番号86)トランスフェクション(100pmol)によって刺激した。上清及び細胞ライセートをカスパーゼ-1切断及びp-NLRC4ブロットのために収集した。結果は、PKCδ阻害剤がAluRNA(配列番号86)によって誘導されるNLRC4リン酸化及びカスパーゼ-1活性化を阻害するということを指示した。
実施例7
PKCδ及びNLRC4リン酸化(S533)はAluRNAによって誘導されるインフラマソーム活性化に要求される
野生型、Prkcd-/+、及びPrkcd-/-BMDMをAluRNA(配列番号86、100pmol)によって12時間に渡ってトランスフェクションした。カスパーゼ-1、IL-1β切断、及びIL-1β放出を測定するために、上清を収集した。細胞ライセートをp-Nlrc4、Nlrc4、PKCδ、及びアクチンブロットのために収集した。図34A及び34Bに提示されている結果は、カスパーゼ-1、IL-1β切断、及びIL-1β放出がPrkcd-/-BMDMにおいて損なわれるということを示した。
野生型及びNlrc4S533A/S533ABMDMをAluRNA(配列番号86、100pmol)によって12時間に渡ってトランスフェクションした。ELISAによってIL-1β放出を測定するために、上清を収集した。図34Cに示されている結果は、IL-1β放出がNlrc4S533A/S533ABMDMにおいて損なわれるということを指示した。
実施例8
PKCδによって媒介されるNLRC4リン酸化は、AluRNAによって誘導されるRPE変性に要求される
野生型、Prkcd-/-、及びNlre4S533A/S533AマウスにAluRNA(配列番号86)を網膜下注射した。眼底画像及びZO-1蛍光画像が図35A及び35Bに提示されている。示されている通り、AluRNA(配列番号86)によって誘導されるRPE変性はPrkcd-/-及びNlrc4S533A/S533Aマウスではブロックされた。
実施例9
AluRNAはヒト細胞におけるDDX17移行を誘導する
ヒト単球(THP-1)をAluRNA(配列番号86、100pmol)によって処置した。細胞ライセートを収集し、細胞分画に付した。DDX17及びヒストンH3のイムノブロットを用いてDDX17の細胞内分布を評価した。図36に示されている通り、AluRNA(配列番号86)処置は核から細胞質へのDDX17移行を誘導し、DDX17はサイトゾルAluRNA(配列番号86)と共局在した。
実施例10
AluRNAはNLRC4及びNLRP3複合体のアセンブリを誘導する
ヒトRPE細胞をビオチン化AluRNA(配列番号86、100pmol)によって処置した。NLRC4及びNLRP3複合体のアセンブリを近接ライゲーションアッセイ(PLA)によって評価した。結果は図37に提示されている。これは、AluRNA(配列番号86)トランスフェクションがヒトRPE細胞におけるNLRC4及びNLRP3複合体のアセンブリを誘導するということを示した。
実施例11
DDX17の発現はドライAMDのヒトドナー眼のRPEにおいて増大している
DDX17及びNLRC4蛋白質の発現を免疫組織化学によってドライAMDのヒトドナー眼において測定した。結果は図38A及び38Bに提示されている。そこに示されている通り、DDX17の発現はドライAMDのヒトドナー眼のRPEでは増大していた。
実施例の考察
NLRファミリーCARDドメイン含有(NLRC)4は上皮及び自然免疫細胞によって発現されるサイトゾル蛋白質である。NLRC4蛋白質はアポトーシススペック様蛋白質及びカスパーゼ-1と共にインフラマソーム複合体をアセンブリして、炎症促進性サイトカインのインターロイキン(IL)-1β、IL-18、及びガスダーミンD(Gsdmd)の成熟を促進し、それによって、パイロトーシスとして公知の細胞死の炎症性の形態を誘導する。NLRC4インフラマソームは、NLRファミリーアポトーシス阻害性蛋白質(NAIP)として公知の病原体感知蛋白質の助けによって、細菌フラジェリン及びIII型分泌系(T3SS)を間接的に感知することによって抗細菌免疫を制御することから最も周知である。ここでは、我々は、非細菌性分子の短鎖散在核エレメント(SINE)転写物もまたマウス及びヒトマクロファージ並びに網膜色素上皮(RPE)細胞におけるNLRC4インフラマソーム活性化を誘導し得るということを示している。NAIPに依存的であるフラジェリンによって誘導されるNLRC4活性化とは対照的に、我々は、全てのNAIP遺伝子を欠損したマウスが、SINE-RNAによって誘導されるNLRC4活性化に対して感受性のままに残るということを示す。不偏的な様式によって、我々は、RNAヘリカーゼのDEADボックスファミリーのメンバーDDX17をSINE-RNAによって誘導されるNLRC4インフラマソーム活性化のセンサーとして同定した。我々は、SINE-RNAとの結合によって、Ddx17がNLRC4及びNLRP3の二重リクルートを誘導し、かつASC分子はカスパーゼ-1活性化及びIL-1β放出をもたらすということを機構的に見出した。Ddx17-Nlrc4-NLRP3シグナル伝達の治療操作は、加齢黄斑変性(AMD)の動物モデルにおいてSINE-RNAによって誘導されるRPE変性から保護する。最後に、我々は、現行でHIV治療薬として用いられているヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)が、NLRC4インフラマソームに対する阻害活性を所有するということを示す。まとめると、これらのデータは、可逆的中枢性失明の最も普通の原因のAMDに関連性を有する無菌性のNAIP非依存的な非古典的NLRC4インフラマソーム経路の発見と、NRTIがこのNLRC4インフラマソーム経路を阻害するように機能するということとをハイライトとしている。
我々のデータは、インビボ及びヒト細胞培養研究両方において、SINE-RNAによって活性化される新規のNAIP非依存的な非古典的NLRC4インフラマソーム経路を同定した。更にその上、我々は、DDX17をSINE-RNAによって媒介されるNLRC4インフラマソームの新規のセンサーとして同定した。興味深いことに、我々は、NLRC4インフラマソームコンポーネントがヒトAMDの眼において脱制御しているということを見出した。NLRC4インフラマソーム経路シグナル伝達に干渉することは、SINE-RNAによって誘導されるRPE変性を逆行させた。更にその上、我々は、NRTI及び修飾NRTIがNLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化を有効にブロックするということを示す。これらのデータはNLRC4インフラマソームをAMDの発病機序におけるキープレーヤーとして関連付けている。
今日まで、3つのモデルがNLRC4インフラマソームの活性化を最も良く説明する。第1に、フラジェリン及びT3SS蛋白質などの細菌産物を包含する病原体関連分子パターン(PAMP)は、NAIPを介してNLRC4インフラマソームを活性化する。このメカニズムは腸病原体に対する防御にとって不可欠である。第2に、NLRC4の遺伝性変異は小児における重篤な自己炎症性疾患をもたらす。最後に、いくつかの研究は、脳損傷、加齢性ヌクレオチド代謝、又はリゾホスファチジルコリンを包含する内在性の刺激もまたNLRC4依存的なインフラマソーム活性化を誘導し得るということを報告している。
この無菌性のNLRC4インフラマソーム活性化を支配する分子メカニズムは大きくは未知である。AMDをモデルとして用いて、我々の知見は、内在性のSINE-RNA種によって誘導されるNAIP非依存的な非古典的NLRC4インフラマソームを初めて明らかにした。Ddx17によるSINE-RNA認識によって、NLRC4はPKCδによってリン酸化されて、Ddx17及びNLRC4の間の相互作用を促進し、NLRC4のオリゴマー化、ASCスペック形成、カスパーゼ-1活性化、及びIL-18放出をもたらす。これらの知見はAMDの病理に関連性を有する。
イムノブロット研究を用いて、我々は、NLRC4インフラマソーム活性化がNLRP3依存的であるということと、NRTIがNLRP3-NLRC4複合体に直接的に結合してその活性化を阻害し得るということとを発見した。これらの知見は、NLRC4インフラマソームによって駆動される疾患を処置及び/又は防止する並びにNLRC4阻害剤として作用するNRTI並びに修飾NRTIの能力を支持している。
引用文献
全ての特許、特許出願及びそれらの公開、科学雑誌記事、及びデータベースエントリー(例えばGENBANK(登録商標)バイオ配列データベースエントリー及びその中の利用可能な全てのアノテーション)を包含するが、これらに限定されない下で列挙される全ての参照及び本開示に引用される全ての参照は、それらが本明細書において使用される方法論、技術、及び/又は組成物を補足するか、説明するか、そのバックグラウンドを提供するか、又は教示する程度まで、それらの全体が参照によって本明細書に組み込まれる。
- Altschul et al. (1990a) Basic local alignment search tool. J Mol Biol 215:403-410.
- Altschul et al. (1990b) Protein database searches for multiple alignments. Proc Natl Acad Sci U S A 87:14:5509-5513.
- Altschul et al. (1997) Gapped BLAST and PSI- BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res 25:3389-3402.
- Bass (2001) The short answer. Nature 411:428-429.
- Elbashir et al. (2001) Duplexes of 21-nucleotide RNAs mediate RNA interference in cultured mammalian cells. Nature 411:494-498.
- GENBANK(r) Accession Nos. NM_001033367.3; NM_001040187.1; NM_006386.5; NM_021209.4; NP_001028539.1; NP_001035277.1; NP_006377.2; NP_067032.3.
- Gross & Mienhofer (eds.) (1981) The Peptides, Volume 3, Academic Press, New York, New York, United States of America.
- Harlow & Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, United States of America.
- Karlin & Altschul (1990) Methods for assessing the statistical significance of molecular sequence features by using general scoring schemes. Proc Natl Acad Sci U S A 87:2264-2268.
- Karlin & Altschul (1993) Applications and statistics for multiple high-scoring segments in molecular sequences. Proc Natl Acad Sci U S A 90:5873-5877.
- Murphy et al. (2010) Antiviral activity and tolerability of amdoxovir with zidovudine in a randomized double-blind placebo-controlled study in HIV-1-infected individuals. Antivir Ther 15(2):185-192.
- Otto (2004) New nucleoside reverse transcriptase inhibitors for the treatment of HIV infections. Curr Opin Pharmacol 4(5):431-436.
- PCT International Publication Nos. WO 99/07409; WO 99/32619; WO 2000/001846; WO 2000/044895; WO 2000/044914; WO 2001/036646; WO 2001/029058; WO 2008/007382; WO 2014/176532; WO 2014/183147; WO 2019/074884.
- Shelton et al. (1993) Zalcitabine. Ann Pharmacother 27(4):480-489.
- U.S. Patent Application Publication Nos. 2011/0150997; 2019/0022115; 2019/0055273; 2019/0177326; 2019/0185508.
U.S. Patent Nos. 5,663,159; 5,905,082; 6,294,540; 6,350,736; 6,417,191; 6,627,224; 7,589,078; 8,026,356; 8,183,370; 8,193,165; 9,126,971; 9,296,769.
本発明を具体的な実施態様を参照して開示したが、本発明の真の趣旨及び範囲から逸脱することなしに、本発明の他の実施態様及び変形が他の当業者によって考案され得るということは明らかである。

Claims (37)

  1. NLRファミリーCARDドメイン含有4(NLRC4)インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害若しくは病状を処置及び/又は防止するための方法であって、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれからなる、又はそれから成る組成物を、その必要がある対象に投与する段階を含む、本質的にそれからなる、又はそれから成り、該投与段階は、NLRC4インフラマソーム生物活性を減縮することに有効な経路及び量によって行われ、それにより、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状を処置及び/又は防止する、方法。
  2. 前記NRTIが、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項1に記載の方法。
  3. 前記NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害又は病状が、網膜色素上皮(RPE)の疾患、任意に加齢黄斑変性(AMD)及び/又は地図状萎縮である、請求項1又は2に記載の方法。
  4. 更に、その必要がある対象にNLRC4インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤を投与する段階を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項1~3のいずれか一項に記載の方法。
  5. 前記NLRC4インフラマソーム生物活性の(the)少なくとも1つの追加の阻害剤が、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1(CAS-1)、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(CGAS)、カスパーゼ-4(CAS-4)、インターフェロン遺伝子刺激因子-1(STING1)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項4に記載の方法。
  6. 前記阻害剤が、短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これはNLRC4、NLRP3、CAS-1、CGAS、CAS-4、STING、PPIF、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項5に記載の方法。
  7. 前記阻害剤が、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する、抗体又はその抗原結合断片である、請求項5に記載の方法。
  8. 細胞においてNLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化を阻害するための方法であって、NLRC4遺伝子産物並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRファミリーパイリンドメイン含有3(NLRP3)遺伝子産物の複合体を、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させる段階を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成り、それによって、NLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化が細胞において阻害される、方法。
  9. 該NRTIが、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項8に記載の方法。
  10. いくつかの実施態様では、前記細胞が、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在する、請求項8又は9に記載の方法。
  11. 更に、その必要がある対象に、インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤を投与する段階を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項8~10のいずれか一項に記載の方法。
  12. 前記NLRC4インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤が、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1(CAS-1)、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(CGAS)、カスパーゼ-4(CAS-4)、インターフェロン遺伝子刺激因子-1(STING1)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項11に記載の方法。
  13. 前記阻害剤が、短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これはNLRC4、NLRP3、CAS-1、CGAS、CAS-4、STING、PPIF、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項11に記載の方法。
  14. 前記阻害剤が、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する、抗体又はその抗原結合断片である、請求項11に記載の方法。
  15. NLRC4によって誘導されるIL-1βが細胞から放出されることを阻害するための方法であって、NLRC4遺伝子産物、並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRファミリーパイリンドメイン含有3(NLRP3)遺伝子産物の複合体を、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させる段階を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成り、それによって、細胞からNLRC4によって誘導されるIL-1βが放出されることが阻害される、方法。
  16. 前記NRTIが、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項15に記載の方法。
  17. 前記細胞が、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在する、請求項15又は16に記載の方法。
  18. 前記NLRC4によって誘導されるカスパーゼ-1活性化及び/又はNLRC4によって誘導されるIL-1β放出が、NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状に関連する、請求項8~17のいずれか一項に記載の方法
  19. 前記NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、又は病状が、網膜色素上皮(RPE)の疾患、任意に加齢黄斑変性(AMD)及び/又は地図状萎縮である、請求項18に記載の方法。
  20. 更に、NLRC4インフラマソーム生物活性の少なくとも1つの追加の阻害剤を、その必要がある対象に投与する段階を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項18又は19に記載の方法。
  21. 前記少なくとも1つの追加の阻害剤が、アンチセンスオリゴヌクレオチド、短鎖干渉RNA(siRNA)、短鎖ヘアピンRNA(shRNA)、抗体、又はその抗原結合断片からなる群から選択される、請求項20に記載の方法。
  22. 前記阻害剤が、短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これは、NLRC4、NLRP3、CAS-1、CGAS、CAS-4、STING、PPIF、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項21に記載の方法。
  23. 対象におけるAluによって誘導される網膜色素細胞(RPE)変性を阻害するための方法であって、対象の細胞においてNLRC4遺伝子産物並びに/又はNLRC4遺伝子産物及びNLRファミリーパイリンドメイン含有3(NLRP3)遺伝子産物の複合体を、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る有効量の組成物と接触させる段階を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成り、それによって、細胞からのNLRC4によって誘導されるIL-1β放出が阻害される、方法。
  24. 前記NRTIが、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項23に記載の方法。
  25. 前記細胞が、対象、任意に哺乳類対象、更に任意にヒト対象に存在するRPE細胞である、請求項23又は24に記載の方法。
  26. 更に、前記RPEを分解から保護するように設計された少なくとも1つの追加の処置を対象に施す段階を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項23~25のいずれか一項に記載の方法
  27. 前記少なくとも1つの追加の処置が、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(cGAS)、カスパーゼ-4、インターフェロン遺伝子刺激因子(STING)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を対象に投与する段階を含む、請求項26に記載の方法。
  28. 前記阻害剤が、短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これはNLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項27に記載の方法。
  29. 前記阻害剤が、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する、抗体又はその抗原結合断片である、請求項27に記載の方法。
  30. NLRC4インフラマソーム生物活性に関連する疾患、障害、及び/又は病状を処置及び/又は防止することに使用するための組成物であって、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、組成物。
  31. NLRC4によって誘導されるIL-1βが細胞から放出されることを阻害することに使用するための組成物であって、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、組成物。
  32. 対象におけるAluによって誘導される網膜色素細胞(RPE)変性を阻害することに使用するための組成物であって、ヌクレオシド逆転写酵素阻害剤(NRTI)を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、組成物。
  33. 前記NRTIが、アバカビル(ABC)、アデホビル(ビスPOM-PMEA)、アムドキソビル、アプリシタビン(AVX754)、センサブジン、ジダノシン(DDI)、エルブシタビン、エムトリシタビン(FTC)、エンテカビル(ETV)、ラミブジン(3TC)、ラシビル、スタンピジン、スタブジン(d4T)、テノホビルジソプロキシル(TDF)、テノホビルアラフェナミド(GS-7340)、ザルシタビン(ddC)、ジドブジン(ZDV)/アジドチミジン(AZT)、それらの誘導体、任意にそれらのアルキル化誘導体、更に任意にトリメトキシ3TC、それらの薬学的に許容される塩、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項30~32のいずれか一項に記載の組成物。
  34. 眼部送達のために製剤される、請求項30~33のいずれか一項に記載の組成物。
  35. 前記組成物が、更に、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、サイクリックGMP-AMPシンターゼ(cGAS)、カスパーゼ-4、インターフェロン遺伝子刺激因子(STING)、ペプチジル-プロリルシス-トランスイソメラーゼF(PPIF)、ミトコンドリア膜透過性遷移孔(MPTP)、ガスダーミンD(GSDMD)、インターフェロン-ベータ(IFN-β)、及びインターフェロン-α/β受容体(IFNAR)からなる群から選択される少なくとも1つの分子又は複合体の生物活性の阻害剤を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項30~34のいずれか一項に記載の組成物。
  36. 前記阻害剤が、短鎖干渉RNA(siRNA)又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)であり、これは、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の転写産物を標的化し、任意に、転写産物は、配列番号1、7、21、28、35、37、39、41、43、52、54、59、61、64、66、69、71、74、76、79、81、及び84のいずれかで提出されるヌクレオチド配列アミノ酸を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、更に任意に、siRNA又はshRNAは、ヒトNLRC4転写産物を標的化する配列番号3~6、マウスNlrc4転写産物を標的化する配列番号9~20、ヒトDDX17転写産物を標的化する配列番号23~27、マウスDdx17転写産物を標的化する配列番号30~34、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号45、ヒトCAS-4転写産物を標的化する配列番号46~51、ヒトCGAS転写産物を標的化する配列番号56~58、ヒトSTING1転写産物を標的化する配列番号63、ヒトPPIF転写産物を標的化する配列番号68、ヒトGSDMD転写産物を標的化する配列番号73、ヒトIFN-β転写産物を標的化する配列番号78、及びヒトIFNAR転写産物を標的化する配列番号83のいずれかで提出されるヌクレオチド配列を含む、本質的にそれから成る、又はそれから成る、請求項35に記載の組成物。
  37. 前記阻害剤が、NLRC4、NLRP3、カスパーゼ-1、cGAS、カスパーゼ-4、STING、PPIF、MPTP、GSDMD、IFN-β、及びIFNARからなる群から選択される遺伝子の翻訳産物に結合する、抗体又はその抗原結合断片である、請求項35に記載の組成物。
JP2022512828A 2019-08-23 2020-08-24 炎症性疾患のためのddx17及びnlrc4標的化 Withdrawn JP2022550670A (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201962891124P 2019-08-23 2019-08-23
US62/891,124 2019-08-23
PCT/US2020/047640 WO2021041317A1 (en) 2019-08-23 2020-08-24 Ddx17 and nlrc4 targeting for inflammatory diseases

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2022550670A true JP2022550670A (ja) 2022-12-05
JPWO2021041317A5 JPWO2021041317A5 (ja) 2023-09-06

Family

ID=74685756

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2022512828A Withdrawn JP2022550670A (ja) 2019-08-23 2020-08-24 炎症性疾患のためのddx17及びnlrc4標的化

Country Status (8)

Country Link
US (1) US20220280543A1 (ja)
EP (1) EP4017503A4 (ja)
JP (1) JP2022550670A (ja)
KR (1) KR20220066071A (ja)
CN (1) CN114599373A (ja)
AU (1) AU2020340298A1 (ja)
CA (1) CA3149147A1 (ja)
WO (1) WO2021041317A1 (ja)

Families Citing this family (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA3125991A1 (en) 2019-01-25 2020-07-30 Brown University Compositions and methods for treating, preventing or reversing age-associated inflammation and disorders
CN112608923B (zh) * 2021-01-17 2023-05-12 上海捷瑞生物工程有限公司 一种抑制ddx17相关rna表达产物的核苷酸及其应用
KR102673132B1 (ko) * 2021-04-20 2024-06-12 아주대학교산학협력단 염증성 질환 치료를 위한 nlrp3 인플라마좀 억제 펩타이드
WO2022271868A1 (en) * 2021-06-23 2022-12-29 University Of Kentucky Research Foundation Treatment for aortopathy
CN114106140A (zh) * 2021-11-23 2022-03-01 哈尔滨医科大学附属肿瘤医院 一种表达特定sting异构体、细胞系、制备方法、用途
WO2023164472A1 (en) * 2022-02-22 2023-08-31 Rome Therapeutics, Inc. Methods of treating medical conditions using censavudine or a related compound
KR20240002134A (ko) * 2022-06-28 2024-01-04 가톨릭대학교 산학협력단 테노포비르 알라페나미드를 포함하는 비알콜성 지방간염 예방, 개선 또는 치료용 조성물

Family Cites Families (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2013148316A1 (en) * 2012-03-29 2013-10-03 Biogen Idec Ma Inc. Biomarkers for use in integrin therapy applications
US9326983B2 (en) * 2013-08-01 2016-05-03 University Of Kentucky Research Foundation Compositions and methods for treating retinal degradation
EP3858826A1 (en) * 2015-02-26 2021-08-04 University of Kentucky Research Foundation Compositions and methods for treating retinal degradation
CN105012305A (zh) * 2015-07-24 2015-11-04 福建广生堂药业股份有限公司 拉米夫定及其药用盐治疗老年性黄斑部病变的用途
GB201616557D0 (en) * 2016-09-29 2016-11-16 Secretary Of State For Health The Assay for distinguishing between sepsis and systemic inflammatory response syndrome
WO2018162271A1 (en) * 2017-03-05 2018-09-13 Rita Dobmeyer Nanoparticles for the treatment of macular degeneration

Also Published As

Publication number Publication date
CA3149147A1 (en) 2021-03-04
AU2020340298A1 (en) 2022-03-24
US20220280543A1 (en) 2022-09-08
WO2021041317A1 (en) 2021-03-04
EP4017503A1 (en) 2022-06-29
CN114599373A (zh) 2022-06-07
EP4017503A4 (en) 2024-03-20
KR20220066071A (ko) 2022-05-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2022550670A (ja) 炎症性疾患のためのddx17及びnlrc4標的化
JP7503558B2 (ja) 加齢関連炎症および障害を治療する、予防するまたは逆転させるための組成物および方法
US8853177B2 (en) Use of inhibitors of toll-like receptors in the prevention and treatment of hypercholesterolemia and hyperlipidemia and diseases related thereto
ES2838814T3 (es) FAM19A5 para uso en el diagnóstico y tratamiento de daños en el SNC
US20220160710A1 (en) Compositions and methods for treating or preventing alzheimer's disease
WO2009045397A1 (en) Methods for treating polycystic kidney desease (pkd) or other cyst forming diseases
US20200087662A1 (en) Inhibition of poly(a) binding protein and the treatment of pain
JPWO2003099339A1 (ja) 炎症性疾患を処置および予防するためのデコイ組成物
US20230172962A1 (en) Nrtis, nrti metabolites, and nrti analogs for macular degeneration and viral infections
EP2904009B1 (en) Compounds for treating the remyelination blockade in diseases associated with the expression of herv-w envelope protein
JP7402225B2 (ja) ヌクレオシド系逆転写酵素阻害剤を用いて関節障害を処置するための組成物および方法
JP2016538289A (ja) マクロファージ活性化の主要制御因子としてのparp9およびparp14
EP2305258A2 (en) Inhibition of neuronal damage
US20120231015A1 (en) Fragile x mental retardation protein (fmrp), compositions, and methods related thereto
JPWO2009069668A1 (ja) 悪性黒色腫抗原の発現上昇剤及びその用途
US9993522B2 (en) Treatment of pain by inhibition of USP5 de-ubiquitinase
US11413324B2 (en) Compositions and methods for treating peripheral nerve disease, disorders, and injuries
JP6590284B2 (ja) 疼痛抑制物質のスクリーニング方法および疼痛の予防または治療用医薬組成物
US20160106767A9 (en) Use of pkc-iota inhibitors for the treatment of breast cancer
WO2017126655A1 (ja) 疼痛の予防または治療用医薬組成物およびRobo4を用いる疼痛抑制物質のスクリーニング方法
US20220023291A1 (en) Compositions and methods for regulating inflammation
KR101121987B1 (ko) 파골세포 골흡수 억제 siRNA 발현 벡터 및 이를 이용한 유전자 치료제
US20230270881A1 (en) Oncogenic trim37 is a targetable epigenetic driver of metastasis and links chemoresistance and metastatic fate in triple-negative breast cancer
WO2023183822A1 (en) Hematopoietic loss of y chromosome leads to cardiac fibrosis and dysfunction and is associated with death due to heart failure
Hu et al. Protein Phosphatase PP1 Negatively Regulates IRF3 in Response to GCRV Infection in Grass Carp

Legal Events

Date Code Title Description
RD02 Notification of acceptance of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7422

Effective date: 20230227

RD04 Notification of resignation of power of attorney

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A7424

Effective date: 20230302

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20230823

A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20230823

A761 Written withdrawal of application

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A761

Effective date: 20240314