JP2022549854A - 抗il-27抗体及びその使用 - Google Patents
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Abstract
本開示は、抗IL-27抗体及びその抗原結合部分に関する。本開示は、抗体またはその抗原結合部分の投与によって、がん等の疾患の1つまたは複数の症状を治療または改善する方法にも関する。本開示は、例えば対象またはサンプル中のIL-27を検出する方法にも関する。本開示は、概してIL-27シグナリングを調節するための組成物及び方法に関する。より詳細には、本開示は、IL-27へ結合し、IL-27シグナリングを調節する、免疫原性組成物(例えば抗体、抗体断片、及び同種のもの)に関する。【選択図】なし
Description
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本出願と共に提出されたASCIIテキストファイル(名称:4416_009PC02_Seqlisting_ST25.txt;サイズ:156,863バイト;及び作成日:2020年9月25日)中の、電子提出された配列表の内容は、参照することによってその全体が本明細書に援用される。
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関連出願の相互参照
本PCT出願は、2019年9月25日に出願された米国仮出願第62/906,008号、及び2020年9月22日に出願された同第63/081,705号の優先権の利益を主張するものであり、その各々は、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される。
本PCT出願は、2019年9月25日に出願された米国仮出願第62/906,008号、及び2020年9月22日に出願された同第63/081,705号の優先権の利益を主張するものであり、その各々は、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される。
本開示は、概してIL-27シグナリングを調節するための組成物及び方法に関する。より詳細には、本開示は、IL-27へ結合し、IL-27シグナリングを調節する、免疫原性組成物(例えば抗体、抗体断片、及び同種のもの)に関する。
近年、ますます多くの証拠は、免疫系が、腫瘍の形成及び進行に対する重要な障壁として作動することを示唆している。抗腫瘍の能力または活性を備えた天然に存在するT細胞が、がんの患者において存在するという原理は、腫瘍学における免疫療法アプローチの開発を合理的なものとした。免疫細胞(T細胞、マクロファージ、及びナチュラルキラー細胞等)は、抗腫瘍活性を呈し、悪性腫瘍の出現及び増殖を効果的に制御し得る。腫瘍特異的抗原または腫瘍関連抗原は、悪性腫瘍を認識し消失させるように免疫細胞を誘導し得る(Chen & Mellman,(2013)Immunity 39(1):1-10)。腫瘍特異的免疫応答が存在するにもかかわらず、悪性腫瘍は、多くの場合様々な免疫調節メカニズムを介して免疫攻撃を回避するかまたは避け、腫瘍の出現及び進行の制御の失敗をもたらす(Motz & Coukos,(2013)Immunity 39(1):61-730)。実際は、がんの新たな特徴は、これらの免疫調節メカニズムの利己的利用及び抗腫瘍免疫応答の無効化であり、免疫学的殺傷からの腫瘍の回避及び回避をもたらす(Hanahan and Weinberg(2011)Cell 144(5):646-674)。
IL-27は、2つのサブユニット(EBI3及びIL-27p28)から構成されるヘテロ二量体のサイトカインである。IL-27は、IL-12サイトカインファミリー及びIL-6サイトカインファミリーの両方に構造的に関連する。IL-27は、IL-27Rα(WSX1)及びgp130鎖からなるヘテロ二量体受容体へ結合し、当該受容体を介してシグナリングを媒介し、それらは、優先的にSTAT1及びSTAT3を介するシグナリングを媒介する。初期の報告は、CD4+T細胞の分裂増殖、Tヘルパー(Th)1細胞の分化、及びIFN-γの産生を支持し、多くの場合IL-12と協力して作用する、免疫促進サイトカインとして、IL-27を特徴づけた。後続の研究から、IL-27が複雑な免疫調節機能を提示し、使用されている生物学的コンテキスト及び実験モデルに依存して、炎症誘発効果または抗炎症効果のいずれかをもたらすことが示された。IL-27は、ヒトがん細胞において異なる免疫調節性分子の発現を駆動し、それはインビボでの免疫応答の局所的攪乱を支持し得る(Fabbi et al.,(2017)Mediators Inflamm 3958069。2017年2月1日にオンライン出版された。doi:10.1155/2017/3958069、及びその中の含有される参照文献)。
がんの治療及び管理において見られている有意な進歩にもかかわらず、がんの治療及び管理のための新規で有効な治療法についての継続的な必要性が依然としてある。
がんの治療及び管理において見られている有意な進歩にもかかわらず、がんの治療及び管理のための新規で有効な治療法についての継続的な必要性が依然としてある。
Chen & Mellman,(2013)Immunity 39(1):1-10
Motz & Coukos,(2013)Immunity 39(1):61-730
Hanahan and Weinberg(2011)Cell 144(5):646-674
Fabbi et al.,(2017)Mediators Inflamm 3958069。2017年2月1日にオンライン出版された。doi:10.1155/2017/3958069
IL-27をアンタゴナイズし、(i)配列番号2(IL-27p28)に対応するアミノ酸37~56、(ii)配列番号2(IL-27p28)に対応するアミノ酸142~164、または(iii)(i)及び(ii)の両方、のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する抗体またはその抗原結合部分が本明細書において開示される。いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、またはGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のAsp146、Arg149、及び/またはPhe153を含むエピトープへ特異的に結合する。いくつかの態様において、エピトープは、配列番号2(IL-27p28)のHis150及び/またはLeu156をさらに含む。いくつかの態様において、エピトープは、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Leu142、及び/またはGlu164をさらに含む。いくつかの態様において、エピトープは、配列番号2(IL-27p28)のGlu46、Val49、Ser50、及び/またはLeu162をさらに含む。いくつかの態様において、エピトープは、配列番号2(IL-27p28)のLeu53、Lys56、Asp143、Arg145、Leu147、Arg152、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、またはPro163のうちの1つまたは複数のアミノ酸をさらに含む。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164からなるかまたは本質的になるエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164からなるかまたは本質的になるエピトープへ特異的に結合する。
他の態様において、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する抗体またはその抗原結合部分は、(i)配列番号9、10、及び11でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号18及び19でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;(ii)配列番号31、32、及び33でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号39、40、及び41でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;(iii)配列番号53、54、及び55でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号61、62、及び63でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;(iv)配列番号75、76、及び77でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号83、84、及び85でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;(v)配列番号97、98、及び99でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号105、106、及び107でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または(vi)配列番号119、120、及び121でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない。
他の態様において、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する抗体またはその抗原結合部分は、(i)配列番号12、13、及び14でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号20、21、及び22でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;(ii)配列番号34、35、及び36でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号42、43、及び44でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;(iii)配列番号56、57、及び58でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号64、65、及び66でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;(iv)配列番号78、79、及び80でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号86、87、及び88でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;(v)配列番号100、101、及び102でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号108、109、及び110でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または(vi)配列番号122、123、及び124でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない。
いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分の重鎖CDR1は、N-GFTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]-C(配列番号144)からならない、及び/または、重鎖CDR2は、N-ISSS[S/G][S/A]YI-C(配列番号146)からならない。いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分の重鎖CDR1は、N-FTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]MN-C(配列番号148)からならない、及び/または、重鎖CDR2は、N-[G/S]ISSS[S/G][S/A]YI[L/Y]YADSVKG-C(配列番号149)からならない。
他の態様において、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する抗体またはその抗原結合部分は、(i)N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)からなる重鎖CDR2、及び配列番号121で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または(ii)N-FTFXXXXMN-C(配列番号150)からなる重鎖CDR1、N-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)からなる重鎖CDR2、及び配列番号124で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、を含まない。
いくつかの態様において、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する抗体またはその抗原結合部分は、N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-IXXXXXXX-C(配列番号152)からなる重鎖CDR2、及びN-AR[X]n=6-15DX-C(配列番号153)からなる重鎖CDR3配列;ならびにN-QS[X]n=1-3SS[X]n=0-4Y-C(配列番号154)からなる軽鎖CDR1、N-XXS-C(配列番号155)からなる軽鎖CDR2、及びN-QQXXXXP[X]n=0-1T-C(配列番号156)からなる軽鎖CDR3配列を、それぞれ含まない。
以下の特性:(i)15nM以下の平衡解離定数(KD)でヒトIL-27へ結合する;(ii)IL-27受容体へのIL-27の結合をブロックする;(iii)細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する;(iv)細胞におけるCD161発現のIL-27媒介性阻害を阻害または低減する;(v)細胞におけるIL-27媒介性のPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する;ならびに(vi)1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する、のうちの少なくとも1つまたは複数を呈する抗体またはその抗原結合部分が、本明細書において開示される。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、15nM以下の平衡解離定数(KD)でヒトIL-27へ結合する。
他の態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する。いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、免疫細胞またはがん細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を低減する。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する。いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、免疫細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する。
他の態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する。いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、免疫細胞またはがん細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する。いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、がん細胞におけるPD-L1の発現を阻害または低減する。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD1媒介性分泌を誘導または促進する。いくつかの態様において、1つまたは複数のサイトカインは、IFNg(IFNγ)、IL-17、TNFa(TNFα)、またはIL-6である。いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、IgG1抗体、IgG2抗体、IgG3抗体、IgG4抗体、IgM抗体、IgA1抗体、IgA2抗体、IgD抗体、及びIgE抗体からなる群から選択される。他の態様において、抗体またはその抗原結合部分は、IgG1抗体またはIgG4抗体である。いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、少なくとも1つの突然変異を含むFcドメインを含む。記載される単離された抗体またはその抗原結合部分及び薬学的に許容される担体のうちの任意の1つを含む医薬組成物も、本明細書において開示される。単離された抗体またはその抗原結合部分の軽鎖、重鎖、または軽鎖及び重鎖の両方をコードするヌクレオチド配列を含む核酸も開示する。核酸を含む発現ベクターが、本明細書において開示される。発現ベクターにより形質転換された細胞も、開示される。
本開示は、抗体またはその抗原結合部分の発現を可能にする条件下で発現ベクターにより形質転換された細胞を維持することを含む、ヒトIL-27を特異的に結合する抗体またはその抗原結合部分を産生するための方法も提供する。いくつかの態様において、方法は、抗体またはその抗原結合部分を得ることをさらに含む。
細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する方法であって、細胞を抗体またはその抗原結合部分と接触させることを含み、抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する、前記方法が本明細書において開示される。
細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する方法であって、細胞を抗体またはその抗原結合部分と接触させることを含み、抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する、前記方法がさらに開示される。
細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する方法であって、細胞を抗体またはその抗原結合部分と接触させることを含み、抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害する、前記方法も開示される。
1つまたは複数のサイトカインの細胞からの分泌を誘導するか促進する方法であって、細胞を抗体またはその抗原結合部分と接触させることを含み、抗体またはその抗原結合部分が、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する、前記方法も開示される。
有効量の開示される単離された抗体もしくは抗原結合断片または開示される医薬組成物を対象へ投与することを含む、対象において免疫応答を刺激する方法が、さらに開示される。
有効量の開示される単離された抗体もしくは抗原結合断片または開示される医薬組成物を対象へ投与することを含む、対象においてがんを治療する方法が、さらに開示される。
対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法が、本明細書において開示される。方法は、有効量の開示される単離された抗体もしくはその抗原結合部分または開示される医薬組成物を対象へ投与し、抗体、その抗原結合部分、または医薬組成物が、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減し、それによって免疫応答を刺激するかまたはがんを治療することを含む。
対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法が、さらに開示される。方法は、有効量の開示される単離された抗体もしくはその抗原結合部分または開示される医薬組成物を対象へ投与し、抗体、その抗原結合部分、または医薬組成物が、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減し、それによって免疫応答を刺激するかまたはがんを治療することを含む。
対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法が、さらに開示される。方法は、有効量の開示される単離された抗体もしくはその抗原結合部分または開示される医薬組成物を対象へ投与し、抗体、その抗原結合部分、または医薬組成物が、細胞のPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減し、それによって免疫応答を刺激するかまたはがんを治療することを含む。
対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法が、さらに開示される。方法は、有効量の開示される単離された抗体もしくはその抗原結合部分または開示される医薬組成物を対象へ投与し、抗体、その抗原結合部分、または医薬組成物が、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進し、それによって免疫応答を刺激するかまたはがんを治療することを含む。
いくつかの態様において、方法によって治療されたがんは、肺癌(例えば非小細胞肺癌)、肉腫、精巣癌、卵巣癌、膵臓癌、乳癌(例えばトリプルネガティブ乳癌)、黒色腫、頭頸部癌(例えば頭頸部扁平上皮癌)、結腸直腸癌、膀胱癌、子宮内膜癌、前立腺癌、甲状腺癌、肝細胞癌、胃癌、脳腫瘍、リンパ腫(例えばDL-BCL)、白血病(例えばAML)、または腎臓癌(例えば腎細胞癌、例えば腎明細胞癌)から選ばれる。
抗PD-1抗体の1つまたは複数の活性を促進する(例えばPD-1媒介性サイトカイン分泌を促進する;抗PD-1媒介性TNFα分泌を促進する;抗PD-1抗体へ曝露された細胞からの抗PD-1媒介性IL-6分泌を促進する)方法が、本明細書において開示される。方法は、抗PD-1抗体と同時にまたはそれへ逐次的に、開示される抗体またはその抗原結合部分へ細胞を曝露し、それによって抗PD1抗体の1つまたは複数の活性を促進することを含む。
抗PD-1抗体、開示される抗体、またはそれらの抗原結合部分、及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物が、さらに開示される。
同時投与または逐次投与のための、抗PD-1抗体及び開示される抗体またはその抗原結合部分、ならびにその使用のための指示書を含むキットも、開示される。
開示される単離された抗体またはその抗原結合部分が、1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用して投与される、免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する開示される方法のうちの任意の1つが、本明細書において開示される。第2の治療剤または手順は、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬物、細胞傷害剤、免疫ベース療法、サイトカイン、外科的手順、放射線による手順、共刺激分子の活性化物質、阻害分子の阻害物質、ワクチン、もしくは細胞免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、PD-1アンタゴニスト、PD-L1阻害物質、TIM-3阻害物質、LAG-3阻害物質、TIGIT阻害物質、CD112R阻害物質、TAM阻害物質、STINGアゴニスト、4-1BBアゴニスト、チロシンキナーゼ阻害物質、アデノシン軸を標的化する薬剤(例えばCD39アンタゴニスト、CD73アンタゴニスト、またはA2ARアンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、もしくはデュアルA2AR/A2BRアンタゴニスト)、CCR8アンタゴニスト、CTLA4アンタゴニスト、VEG-F阻害物質、またはそれらの組み合わせである。他の態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、PD-1アンタゴニストである。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PDR001、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ピジリズマブ、MEDI0680、REGN2810、TSR-042、PF-06801591、及びAMP-224からなる群から選択される。いくつかの態様において、PD-L1阻害物質は、FAZ053、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、及びBMS-936559からなる群から選択される。他の態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、スニチニブ(SUTENT(登録商標))、カボザンチニブ(CABOMETYX(登録商標))、アキシチニブ(INLYTA(登録商標))、レンバチニブ(LENVIMA(登録商標))、エベロリムス(AFINITOR(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、エパカドスタット、NKTR-214(CD-122バイアスアゴニスト)、チボザニブ(FOTIVDA(登録商標))、アベキシノスタット、イピリムマブ(YERVOY(登録商標))、トレメリムマブ、パゾパニブ(VOTRIENT(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、テムシロリムス(TORISEL(登録商標))、ラムシルマブ(CYRAMZA(登録商標))、ニラパリブ、サボリチニブ、vorolanib(X-82)、レゴラフェニブ(STIVARGO(登録商標))、ドナフェニブ(マルチキナーゼ阻害物質)、カムレリズマブ(SHR-1210)、ペキサスチモジン・デバシレプベク(JX-594)、ラムシルマブ(Cyramza(登録商標))、アパチニブ(YN968D1)、カプセル化ドキソルビシン(THERMODOX(登録商標))、チバンチニブ(ARQ197)、ADI-PEG 20、ビニメチニブ、メシル酸アパチニブ、ニンテダニブ、リリルマブ、ニボルマブ(OPDIVO(登録商標))、ペムブロリズマブ(KEYTRUDA(登録商標))、アテゾリズマブ(TECENTRIQ(登録商標))、アベルマブ(BAVENCIO(登録商標))、デュルバルマブ(IMFIMZI(登録商標))、セミプリマブ-rwlc(LIBTAYO(登録商標))、チスレリズマブ、及びスパルタリズマブからなる群から選択される。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、TIM-3阻害物質であり、任意選択で、TIM-3阻害物質は、MGB453またはTSR-022である。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、LAG-3阻害物質であり、任意選択で、LAG-3阻害物質は、LAG525、BMS-986016、及びTSR-033からなる群から選択される。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、TIGIT阻害物質である。他の態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、CD112R阻害物質である。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、TAM(Axl、Mer、Tyro)阻害物質である。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、4-1BBアゴニストである。他の態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、チロシンキナーゼ阻害物質(TKI)である。いくつかの態様において、TKIは、イマチニブ、ダサチニブ、ニロチニブ、ボスチニブ、またはポナチニブから選択される。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の薬剤は、アデノシン軸を標的化する薬剤である。いくつかの態様において、アデノシン軸を標的化する薬剤は、CD39アンタゴニスト、CD73アンタゴニスト、A2AR アンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、またはデュアルA2AR/A2BRアンタゴニストから選択される。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、CD39アンタゴニストである。CD39アンタゴニストの例としては、参照することによって本明細書に援用されるUS2019/0284295(Surface Oncology,Inc.)中で記載されるものが挙げられる。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、CD73アンタゴニストである。CD73アンタゴニストの例としては、小分子CD73阻害物質(AB421(Arcus)等)、CD73へ結合するCD73抗体またはその抗原結合部分(MEDI9447(Medimmune)等)、BMS-986179(Bristol Meyers Squibb)、または参照することによってその全体が本明細書に援用されるUS2018/0009899(Corvus)中で記載されるもの等が挙げられる。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、A2ARアンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、またはデュアルA2AR/A2BRアンタゴニストである。A2ARアンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、及びデュアルA2AR/A2BRアンタゴニストの例としては、Hodgson et al.,(2009)J Pharmacol Exp Ther 330(1):294-303(参照することによってその全体が本明細書に援用される)中で記載される、Preladenant/SCH 420814(Merck/Schering、CAS登録番号:377727-87-2);米国特許第9,133,197号(参照することによってその全体が本明細書に援用される)中で記載される、ST-4206(Leadiant Biosciences);LeWitt et al.,(2008)Ann Neurol 63(3):295-302(参照することによってその全体が本明細書に援用される)中で記載される、KW-6356(Kyowa Hakko Kogyo)、Tozadenant/SYN-115(Acorda)、イストラデフィリン/KW-6002(Kyowa Hakko Kogyo、CAS登録番号:155270-99-8);テオフィリン(CAS登録番号:58-55-9)、NIR178(Novartis);WO2011/095625(参照することによってその全体が本明細書に援用される)中で記載される、AB928(Arcus Biosciences)、GBV-2034(Globavir)、ビパデナント(Redox/Juno)、AZD4635/HTL-1071(AstraZeneca/Heptares);WO2009/156737(参照することによってその全体が本明細書に援用される)中で記載される、CPI-444/V81444(Corvus/Genentech);US8,796,284及びWO2017/025918(参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される)中で記載される、PBF509(Palobiofarma/Novartis);US8114845、US9029393、US20170015758、またはUS20160129108(それらのすべてが、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される)中で記載される、A2ARアンタゴニスト;ならびにATL-444、MSX-3、SCH-58261、SCH-412,348、SCH-442,416、VER-6623、VER-6947、VER-7835、CGS-15943、またはZM-241,385が挙げられる。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、CCR8アンタゴニストである。いくつかの態様において、CCR8アンタゴニストは、小分子及び抗体から選択される。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、CTLA4アンタゴニストである。いくつかの態様において、CTLA4アンタゴニストは、Yervoy(登録商標)(PCT公開WO01/14424中で記載される、イピリムマブまたは抗体10D1)、トレメリムマブ(以前はチシリムマブ、CP-675,206)、モノクローナル抗体または抗CTLA-4抗体(以下の出版物:WO98/42752;WO00/37504;米国特許第6,207,156号;Hurwitz et al.(1998)Pro.Natl.Acad.Sci.USA95(17):10067-10071;Camacho et al.(2004)J.Clin.Oncology 22(145):抗体トラクト番号2505(抗体CP-675206);及びMokyr et al.(1998)Cancer Res.58:5301-5304のうちの任意のもの中で記載される)からなる群から選択される。WO2013/173223中で開示される抗CTLA-4抗体のうちの任意のものがさらに使用され得る。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、VEG-F阻害物質である。いくつかの態様において、VEG-F阻害物質は、カボザンチニブ、パオパニブ(paopanib)、ベバシズマブ、スニチニブ、アキシチニブ、レンバンチニブ(lenvantinib)、ソラフェニブ、レゴラフェニブ、ポナチニブ、カボザンチニブ、バンデタニブ、ラムシルマブ、またはベバシズマブから選択される。
対象において免疫応答を刺激するための、または対象においてがんを治療するための、任意選択で、1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用する使用のための、開示される抗体もしくはその抗原結合部分または開示される医薬組成物の使用が、本明細書において開示される。
開示される抗体もしくはその抗原結合部分または開示される医薬組成物、及び対象における免疫応答の刺激または対象におけるがんの治療における使用のための指示書を、任意選択で、1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用する使用のための指示書と共に含むキットが、さらに開示される。
開示される抗体またはその抗原結合部分、及び対象からのサンプル中のIL-27の検出における使用のための指示書を、任意選択で、対象においてIL-27関連がんを検出するための使用のための指示書と共に含むキットもまた、開示される。
定義
本特許請求の範囲及び明細書において使用される用語は、別段の定めのない限り、以下で示されるように定義される。
本特許請求の範囲及び明細書において使用される用語は、別段の定めのない限り、以下で示されるように定義される。
本明細書及び添付の特許請求の範囲において使用される時、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」、及び「その(the)」は、文脈が別段明確に指示しない限り、複数の参照物を包含することに注目すべきである。
本明細書において使用される時、「約」は、当業者によって理解され、それが使用された文脈に依存してある程度に変動するだろう。当業者に明らかでない用語の使用があるならば、それが使用された文脈を考慮して、「約」は、特定の値のプラスまたはマイナス10%までを意味するだろう。
本明細書において使用される時、「アゴニスト」という用語は、本明細書において開示されるネイティブなポリペプチドの生物学的な活性を部分的にまたは十分に増進、誘導、増加、及び/または活性化する、任意の分子を指す。好適なアゴニスト分子としては、具体的には、アゴニスト抗体または抗体断片、ネイティブなポリペプチド、ペプチド、またはタンパク質の断片またはアミノ酸配列バリアントが挙げられる。いくつかの態様において、アゴニストの存在下における活性化は、用量依存的方式で観察される。いくつかの態様において、測定されたシグナル(例えば生物学的な活性)は、匹敵する条件下で陰性の対照により測定されたシグナルよりも、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または少なくとも約100%高い。本開示の方法における使用に好適なアゴニストを同定する方法も、本明細書において開示される。例えば、これらの方法としては、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、FORTE BIO(登録商標)系、及び放射免疫アッセイ(RIA)等の結合アッセイが挙げられるがこれらに限定されない。これらのアッセイは、アゴニストが関心のポリペプチド(例えば受容体またはリガンド)へ結合する能力を決定し、したがってアゴニストがポリペプチドの活性を増進、増加、または活性化する能力を示す。アゴニストの有効性は、機能性アッセイ(アゴニストがポリペプチドの機能を活性化または増進する能力等)を使用しても決定され得る。例えば、機能性アッセイは、ポリペプチドを候補アゴニスト分子と接触させること、及びポリペプチドに通常関連する1つまたは複数の生物学的活性における検出可能な変化を測定することを含み得る。アゴニストの効力は、通常そのEC50値(アゴニスト応答の50%を活性化するのに要求される濃度)によって定義される。EC50値が低いほどアゴニストの効力は大きくなり、最大の生物学的応答を活性化するのに要求される濃度は低くなる。
本明細書において使用される時、「アラニンスキャニング」という用語は、所与のタンパク質またはポリペプチドの安定性または機能(複数可)(例えば結合親和性)への特異的な野生型残基の寄与を決定するために使用される技法を指す。当該技法は、ポリペプチド中の野生型残基をアラニン残基で置換し、続いて、アラニンで置換された誘導体または突然変異体のポリペプチドの安定性または機能(複数可)(例えば結合親和性)を査定すること、及び野生型ポリペプチドに比較することを含む。ポリペプチド中の野生型残基をアラニンで置換する技法は、当技術分野において公知である。
「改善」という用語は、疾患状態(例えばがん)の治療における任意の治療的に有益な結果を指し、その予防、重症度もしくは進行の軽減、寛解、または治癒が挙げられる。
本明細書において使用される時、「アミノ酸」という用語は、天然に存在するアミノ酸及び合成アミノ酸、そして天然に存在するアミノ酸に類似する方式で機能するアミノ酸類似体及びアミノ酸模倣体を指す。天然に存在するアミノ酸は、遺伝コードによってコードされるもの、そして後に修飾されたそれらのアミノ酸(例えばヒドロキシプロリン、γ-カルボキシグルタミン酸、及びO-ホスホセリン)である。アミノ酸類似体は、天然に存在するアミノ酸と同じ基本的化学構造(すなわち水素、カルボキシル基、アミノ基、及びR基へ結合されたa炭素)を有する化合物(例えばホモセリン、ノルロイシン、メチオニンスルホキシド、メチオニンメチルスルホニウム)を指す。かかる類似体は、修飾されたR基(例えばノルロイシン)または修飾されたペプチド骨格を有するが、天然に存在するアミノ酸と同じ基本的化学構造を保持する。アミノ酸模倣体は、アミノ酸の一般的な化学構造とは異なる構造を有するが、天然に存在するアミノ酸に類似する様式で機能する化学化合物を指す。
アミノ酸は、それらの一般的に公知である3文字記号、またはIUPAC-IUB Biochemical Nomenclature Commissionによって推奨される1文字記号のいずれかによって本明細書において参照され得る。ヌクレオチドも同様に、それらの一般的に認められる1文字コードによって参照され得る。
本明細書において使用される時、「アミノ酸置換」は、第2の異なる「置き換え」のアミノ酸残基により所定のアミノ酸配列(出発のポリペプチドのアミノ酸配列)中の少なくとも1つの既存のアミノ酸残基を置き換えることを指す。「アミノ酸挿入」は、所定のアミノ酸配列への少なくとも1つの追加のアミノ酸の取り込みを指す。挿入は通常1または2のアミノ酸残基の挿入からなり得るが、より大きな「ペプチド挿入」も行うことができる(例えば約3~約5、または場合によっては約10、15、もしくは20アミノ酸残基までの挿入)。挿入された残基(複数可)は、上で開示されるように天然に存在し得るかまたは天然に存在し得ない。「アミノ酸欠失」は、所定のアミノ酸配列からの少なくとも1つのアミノ酸残基の除去を指す。
本明細書において使用される時、「量」または「レベル」という用語は、最も幅広い意味で使用され、物質(例えば代謝物質、小分子、タンパク質、mRNA、マーカー)の量、濃度、または存在量を指す。代謝物質または小分子(例えば薬物)を指す場合に、「量」、「レベル」、及び「濃度」という用語は、概して互換的に使用され、概して生物学的サンプル中の検出可能な量を指す。「上昇したレベル」または「増加したレベル」は、対照サンプル(疾患もしくは障害(例えばがん)に罹患していない個体(複数可)からのもの、または内部対照等)に比べた、サンプル内の物質の量、濃度、または存在量の増加を指す。いくつかの態様において、サンプル中の物質(例えば薬物)の上昇したレベルは、当技術分野において公知の技法(例えばHPLC)によって決定されるような、対照サンプル中の物質の量に比べて、約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の物質の量の増加を指す。「低減したレベル」は、対照(疾患もしくは障害(例えばがん)に罹患していない個体(複数可)からのもの、または内部対照等)に比べた、個体における物質(例えば薬物)の量、濃度、または存在量の減少を指す。いくつかの態様において、低減したレベルは、検出可能な量、濃度、または存在量がほとんどまたはまったくない。いくつかの態様において、サンプル中の物質(例えば薬物)の低減したレベルは、当技術分野において公知の技法(例えばHPLC)によって決定されるような、対照サンプル中の物質の量に比べて、約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の物質の量の減少を指す。
タンパク質、mRNA、またはマーカー(本明細書において記載されるもの等)を参照する場合に、「発現のレベル」または「発現レベル」という用語は、概して互換的に使用され、概して生物学的サンプル中のタンパク質、mRNA、またはマーカーの検出可能な量を指す。いくつかの態様において、タンパク質、mRNA、またはマーカーの検出可能な量または検出可能なレベルは、薬剤(本明細書において記載されるもの等)への応答の尤度に関連する。「発現」は、概して遺伝子内に含有される情報が、細胞中に存在し作動する構造(例えばPD-L1等のタンパク質マーカー)へと変換されるプロセスを指す。したがって本明細書において使用される時、「発現」は、ポリヌクレオチドへの転写、ポリペプチドへの翻訳、あるいは場合によってはポリヌクレオチド及び/またはポリペプチドの修飾(例えばポリペプチドの翻訳後修飾)指し得る。転写されたポリヌクレオチド、翻訳されたポリペプチド、あるいはポリヌクレオチド及び/またはポリペプチドの修飾(例えばポリペプチドの翻訳後修飾)の断片も、それらが、オルタナティブスプライシングによって生成された転写物もしくは分解された転写物から、または例えばタンパク質分解によるポリペプチドの翻訳後プロセシングから生じるかどうかにかかわらず、発現されたとして見なされるだろう。「発現された遺伝子」としては、mRNAとしてポリヌクレオチドへと転写され、次いでポリペプチドへと翻訳されるもの、及びさらにRNAへと転写されるが、ポリペプチドへと翻訳されないもの(例えばトランスファー及びリボソームRNA)が挙げられる。「上昇した発現」、「上昇した発現レベル」、または「上昇したレベル」は、対照サンプル(疾患もしくは障害(例えばがん)に罹患していない個体(複数可)、または内部対照等)に比べた、サンプル内の物質の発現の増加またはレベルの増加を指す。いくつかの態様において、サンプル中の物質(例えばPD-L1等のタンパク質マーカー)の上昇した発現は、当技術分野において公知の技法(例えばFACS)によって決定されるような、対照サンプル中の物質の量に比べて、約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の物質の量の増加を指す。「低減した発現」、「低減した発現レベル」、または「低減したレベル」は、対照(疾患もしくは障害(例えばがん)に罹患していない個体(複数可)、または内部対照等)に比べた、個体における物質(例えばタンパク質マーカー)の発現の減少またはレベルの減少を指す。いくつかの態様において、低減した発現は、発現がほとんどまたはまったくない。いくつかの態様において、サンプル中の物質(例えばタンパク質マーカー)の低減した発現は、当技術分野において公知の技法(例えばFACS)によって決定されるような、対照サンプル中の物質の量に比べて、約5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の物質の量の減少を指す。
本明細書において使用される時、「血管形成」または「血管新生」という用語は、新しい血管が既存の血管から発生するプロセスを指す(Varner et al.,(1999)Angiogen.3:53-60;Mousa et al.,(2000)Angiogen.Stim.Inhib.35:42-44;Kim et al.,(2000)Amer.J.Path.156:1345-1362;Kim et al.,(2000)J.Biol.Chem.275:33920-33928;Kumar et al.(2000)Angiogenesis:From Molecular to Integrative Pharm.169-180)。既存の血管からまたは循環内皮幹細胞からの内皮細胞(Takahashi et al.,(1995)Nat.Med.5:434-438;Isner et al.,(1999)J.Clin.Invest.103:1231-1236)は、増殖因子もしくはホルモンによるキュー、または低酸素もしくは虚血性の条件に応答して、移動し、分裂増殖し、管腔を備えた構造へと分化して、新しい血管を形成するように活性化されるようになる。虚血(がんにおいて起こる等)の間に、酸素供給及び栄養物質の送達を増加させる必要性は、影響を受けた組織による血管形成因子の分泌を明らかに誘導し、これらの因子は新しい血管形成を刺激する。複数の追加の用語は血管形成に関する。
「アンタゴニスト」という用語は、本明細書において使用される時、標的分子の阻害物質を指し、「阻害物質」という用語と同義的に本明細書において使用され得る。本明細書において使用される時、「アンタゴニスト」という用語は、本明細書において開示されるネイティブなポリペプチドの生物学的活性を部分的にまたは十分にブロック、阻害、または中和する任意の分子を指す。好適なアンタゴニスト分子としては、具体的には、アンタゴニスト抗体または抗体断片、ネイティブなポリペプチド、ペプチド、またはタンパク質の断片またはアミノ酸配列バリアントが挙げられる。いくつかの態様において、アンタゴニストの存在下における阻害は、用量依存的方式で観察される。いくつかの態様において、測定されたシグナル(例えば生物学的な活性)は、匹敵する条件下で陰性の対照により測定されたシグナルよりも、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または少なくとも約100%低い。本開示の方法における使用に好適なアンタゴニストを同定する方法も、本明細書において開示される。例えば、これらの方法としては、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、ForteBio(登録商標)系、放射免疫アッセイ(RIA)、Meso Scale Discoveryアッセイ(例えばMeso Scale Discovery Electrochemiluminescence(MSD-ECL))、及びビーズベースのLuminex(登録商標)アッセイ等の結合アッセイが挙げられるがこれらに限定されない。これらのアッセイは、アンタゴニストが関心のポリペプチド(例えば受容体またはリガンド)へ結合する能力を決定し、したがってアンタゴニストがポリペプチドの活性を阻害、中和、またはブロックする能力を示す。アンタゴニストの有効性は、機能性アッセイ(アンタゴニストがポリペプチドの機能を阻害する能力等)を使用しても決定され得る。例えば、機能性アッセイは、ポリペプチドを候補アンタゴニスト分子と接触させること、及びポリペプチドに通常関連する1つまたは複数の生物学的活性における検出可能な変化を測定することを含み得る。アンタゴニストの効力は、通常そのIC50値(アゴニスト応答の50%を阻害するのに要求される濃度)によって定義される。IC50値が低いほどアンタゴニストの効力は大きくなり、最大の生物学的応答を阻害するのに要求される濃度は低くなる。
本明細書において使用される時、「ヒトIL-27をアンタゴナイズする抗体またはその抗原結合部分」という語句は、ヒトIL-27の少なくとも1つの当技術分野で認められている活性(例えばIL-27生物学的活性及び/またはIL-27シグナリングによって媒介される下流経路(複数可)、あるいは他のIL-27媒介性機能)をアンタゴナイズし、例えば少なくとも5%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、またはそれ以上のヒトIL-27活性の減少(または低減)に関する抗体を指す。IL-27生物学的活性及び/またはIL-27シグナリングによって媒介される下流経路(複数可)、あるいは他のIL-27媒介性機能の追加の例は、以下及び本明細書の他の箇所での追加で詳細に記載される。
本明細書において使用される時、「抗IL-27アンタゴニスト抗体」という用語(互換的に称された「抗IL-27抗体」)は、IL-27へ特異的に結合し、IL-27生物学的活性及び/またはIL-27シグナリングによって媒介される下流経路(複数可)、あるいは他のIL-27媒介性機能を阻害する抗体を指す。抗IL-27アンタゴニスト抗体は、IL-27シグナリングまたは機能(IL-27またはその代謝物質への受容体結合及び/またはそれらへの細胞応答の惹起等)によって媒介される下流経路を包含する、IL-27の生物学的活性(例えばリガンド結合、酵素活性)を、ブロック、アンタゴナイズ、抑制、阻害、または低減する抗体を網羅する。いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27アンタゴニスト抗体は、ヒトIL-27へ結合し、その同族もしくは正常な受容体(例えばIL-27受容体)、または1つもしくは複数の受容体サブユニット(例えばgp130及び/またはIL-27Rα(WSX1/TCCRとしても公知である))へのヒトIL-27の結合を防止、ブロック、または阻害する。いくつかの態様において、抗IL-27アンタゴニスト抗体は、gp130へのヒトIL-27の結合を、防止、ブロック、または阻害する。いくつかの態様において、抗IL-27アンタゴニスト抗体は、IL-27RαへのヒトIL-27の結合を、防止、ブロック、または阻害する。いくつかの態様において、抗IL-27アンタゴニスト抗体は、IL-27単量体の二量体化を、防止、ブロック、または阻害する。いくつかの態様において、抗IL-27抗体は、EBI3単量体へ特異的に結合しない。いくつかの態様において、抗IL-27抗体は、IL-27p28単量体へ特異的に結合する。いくつかの実施形態において、抗IL-27抗体は、P28を含む非連続のエピトープへ特異的に結合するが、EBI3単量体へ結合しない。いくつかの態様において、抗IL-27抗体は、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する。いくつかの態様において、抗IL-27抗体は、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する(例えば細胞におけるCD161発現のIL-27媒介性阻害を改善または軽減する)。いくつかの態様において、抗IL-27抗体は、細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する。いくつかの態様において、抗IL-27は、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1-媒介性分泌を誘導または促進する。いくつかの態様において、抗IL-27アンタゴニスト抗体は、ヒトIL-27へ結合し、抗腫瘍応答を刺激または促進する。いくつかの態様において、抗IL-27アンタゴニスト抗体は、15nM以下の親和性でヒトIL-27へ結合する。いくつかの態様において、抗IL-27アンタゴニスト抗体は、ヒトIL-27へ結合し、野生型もしくは突然変異体のIgG1重鎖定常領域、または野生型もしくは突然変異体のIgG4重鎖定常領域を含む。抗IL-27アンタゴニスト抗体の例は、本明細書において提供される。
本明細書において使用される時、「抗体」という用語は、2つの軽鎖ポリペプチド及び2つの重鎖ポリペプチドを含む完全な抗体を指す。完全な抗体としては、IgM抗体、IgG抗体、IgA抗体、IgD抗体、及びIgE抗体を包含する異なる抗体アイソタイプが挙げられる。「抗体」という用語は、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体、キメラ化抗体またはキメラ抗体、ヒト化抗体、霊長動物化抗体、脱免疫化抗体、及び完全ヒト抗体を包含する。抗体は、様々な種(例えばヒト、非ヒト霊長動物(例えばオランウータン、ヒヒ、またはチンパンジー)、ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコ、ウサギ、モルモット、アレチネズミ、ハムスター、ラット、及びマウス等の哺乳動物)のうちの任意のものにおいて作製され得るか、またはそれらに由来し得る。抗体は、精製抗体または組み換え抗体であり得る。本明細書において使用される時、「抗体断片」、「抗原結合断片」という用語、または類似する用語は、標的抗原(例えばIL-27)へ結合し、標的抗原の活性を阻害する能力を保持する、抗体の断片を指す。かかる断片としては、例えば一本鎖抗体、一本鎖Fv断片(scFv)、Fd断片、Fab断片、Fab’フラグメント、またはF(ab’)2断片が挙げられる。scFv断片は、scFvが由来する抗体の重鎖及び軽鎖の両方の可変領域を含む単一ポリペプチド鎖である。加えて、イントラボディ、ミニボディ、トリアボディ、及びダイアボディも抗体の定義中に包含され、本明細書において記載される方法における使用に適合性がある。例えばTodorovska et al.,(2001)J.Immunol.Methods 248(1):47-66;Hudson and Kortt,(1999)J.Immunol.Methods 231(1):177-189;Poljak,(1994)Structure 2(12):1121-1123;Rondon and Marasco,(1997)Annu.Rev.Microbiol.51:257-283(それらの各々の開示は、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される)を参照されたい。
本明細書において使用される時、「抗体断片」という用語は、例えば単一ドメイン抗体(ラクダ化単一ドメイン抗体等)も包含する。例えばMuyldermans et al.,(2001)Trends Biochem.Sci.26:230-235;Nuttall et al.,(2000)Curr.Pharm.Biotech.1:253-263;Reichmann et al.,(1999)J.Immunol.Meth.231:25-38;PCT出願公開番号WO94/04678及び同WO94/25591;及び米国特許第6,005,079号(それらのすべては、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される)を参照されたい。いくつかの態様において、本開示は、単一ドメイン抗体が形成されるように、修飾の有る2つのVHドメインを含む単一ドメイン抗体を提供する。
いくつかの態様において、抗原結合断片は、重鎖ポリペプチドの可変領域及び軽鎖ポリペプチドの可変領域を含む。いくつかの態様において、本明細書において記載される抗原結合断片は、抗体の軽鎖及び重鎖のCDRのポリペプチドを含む。
「抗原提示細胞」または「APC」という用語は、MHCと複合体化される外来の抗原をその表面上に提示する細胞である。T細胞は、T細胞受容体(TCR)を使用してこの複合体を認識する。APCの例としては、B細胞、樹状細胞(DC)、末梢血単核細胞(PBMC)、単球(THP-1等)、Bリンパ芽球様細胞(C1R.A2、1518 B-LCL等)、及び単球由来樹状細胞(DC)が挙げられるがこれらに限定されない。いくつかのAPCは、食細胞運動によって、または受容体媒介性エンドサイトーシスによって抗原を内部移行させる。
「抗原提示」という用語は、APCが抗原を捕捉し、例えばMHC-I及び/またはMHC-IIコンジュゲートの構成要素としての、T細胞によるそれらの認識を可能にするプロセスを指す。
本明細書において使用される時、「アポトーシス」という用語は、多細胞生物(例えばヒト)における起こるプログラム細胞死のプロセスを指す。アポトーシスをもたらす高度に調節される生化学的及び分子的な事象は、膜ブレブ形成、細胞体積縮小、染色体DNAの凝縮及び断片化、ならびにmRNAの崩壊を包含する、観察可能で特徴的な細胞への形態学的変化に導き得る。アポトーシスを起こしているT細胞を含む細胞を同定する一般的な方法は、フルオロフォアコンジュゲートタンパク質(アネキシンV)へ細胞を曝露することである。アネキシンVは、原形質膜の外側の小葉上のホスファチジルセリンへ結合する能力(それは細胞がアポトーシスのプロセスを起こしている初期指標である)によってアポトーシス性細胞を検出するのに、一般的に使用される。
本明細書において使用される時、「B細胞」(代替的に「Bリンパ球」)という用語は、リンパ球サブタイプの白血球のタイプを指す。B細胞は、抗体を分泌することにより、適応免疫系の液性免疫構成要素において機能する。B細胞はまた、抗原を提示し、サイトカインを分泌する。B細胞は、他の2つのクラスのリンパ球(T細胞及びナチュラルキラー細胞)とは異なり、それらの細胞膜上にB細胞受容体(BCR)を発現する。BCRはB細胞が特異的抗原へ結合することを可能にし、それに対して抗体応答を開始するだろう。
本明細書において使用される時、「固定化されたIL-27へ結合する」という用語は、例えば細胞の表面上に発現されるかまたは固体支持体へ付着される、IL-27へ結合する本開示の抗体の能力を指す。
本明細書において使用される時、「二重特異性抗体」または「二重機能性抗体」という用語は、2つの異なる重鎖/軽鎖ペア及び2つの異なる結合部位を有する人工ハイブリッド抗体を指す。二重特異性抗体は、ハイブリドーマの融合またはFab’フラグメントの連結を包含する様々な方法によって産生され得る。例えばSongsivilai & Lachmann,(1990)Clin.Exp.Immunol.79:315-321;Kostelny et al.,(1992)J.Immunol.148:1547-1553を参照されたい。
従来、二重特異性抗体の組み換え産生は、2つの免疫グロブリン重鎖/軽鎖ペアの共発現に基づき、2つの重鎖/軽鎖ペアは異なる特異性を有する(Milstein and Cuello,(1983)Nature 305:537-539)。所望の結合する特異性を備えた抗体可変ドメイン(抗体-抗原結合部位)は、免疫グロブリン定常ドメイン配列へ融合され得る。重鎖可変領域の融合は、好ましくはヒンジ領域、CH2領域、及びCH3領域のうちの少なくとも一部分を含む免疫グロブリン重鎖定常ドメインとのものである。二重特異性抗体を生成する例示的な現在公知の方法のさらなる詳細については、例えばSuresh et al.,(1986)Methods Enzymol.121:210;PCT公開番号WO96/27011;Brennan et al.,(1985)Science 229:81;Shalaby et al.,J.Exp.Med.(1992)175:217-225;Kostelny et al.,(1992)J.Immunol.148(5):1547-1553;Hollinger et al.,(1993)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-6448;Gruber et al.,(1994)J.Immunol.152:5368;及びTutt et al.,(1991)J.Immunol.147:60を参照されたい。二重特異性抗体としては。架橋抗体またはヘテロコンジュゲート抗体も挙げられる。ヘテロコンジュゲート抗体は、任意の好都合な架橋方法を使用して作製され得る。好適な架橋剤は当技術分野において周知であり、多数の架橋技法と共に米国特許第4,676,980号中で開示される。
二重特異性抗体断片を組み換え細胞培養物から直接作製し単離するための様々な技法も記載されている。例えば、二重特異性抗体はロイシンジッパーを使用して産生された。例えばKostelny et al.(1992)J Immunol 148(5):1547-1553を参照されたい。Fos及びJunのタンパク質からのロイシンジッパーペプチドは、遺伝子融合によって2つの異なる抗体のFab’部分へ連結され得る。抗体ホモ二量体はヒンジ領域で還元されて単量体を形成し、次いで再酸化されて抗体ヘテロ二量体を形成し得る。この方法は、抗体ホモ二量体の産生のためにも利用され得る。Hollinger et al.(1993)Proc Natl Acad Sci USA 90:6444-6448によって記載される「ダイアボディ」技術は、二重特異性抗体断片を作製するための代替メカニズムを提供した。断片は、同じ鎖上の2つのドメイン間のペアリングを可能にするには短すぎるリンカーによって軽鎖可変ドメイン(VL)へ接続された重鎖可変ドメイン(VH)を含む。したがって、1つの断片のVH及びVLのドメインは、別の断片の相補的なVL及びVHドメインとペアリングさせられ、それによって2つの抗原結合部位を形成する。一本鎖Fv(scFv)二量体の使用によって、二重特異性抗体断片を作製するための別の戦略も報告されている。例えばGruber et al.(1994)J Immunol 152:5368を参照されたい。代替的に、抗体は、例えばZapata et al.(1995)Protein Eng.8(10):1057-1062中で記載されるような「線状抗体」であり得る。簡潔には、これらの抗体は、1ペアの抗原結合領域を形成する1ペアのタンデムなFdセグメント(VH-CH1-VH-CH1)を含む。線状抗体は、二重特異性または単一特異性であり得る。
2を超える価数(例えば三重特異性抗体)による抗体が企図され、例えばTutt et al.(1991)J Immunol 147:60中で記載される。
本開示は、多重特異性抗体のバリアント形態(Wu et al.(2007)Nat Biotechnol 25(11):1290-1297中で記載されるデュアル可変ドメイン免疫グロブリン(DVD-Ig)分子等)も包含する。DVD-Ig分子は、2つの異なる親抗体からの2つの異なる軽鎖可変ドメイン(VL)は、組み換えDNA技法によって、直接または短いリンカーを経由してタンデムに、続いて軽鎖定常ドメインに連結されるようにデザインされる。同様に、重鎖は、タンデムに連結される2つの異なる重鎖可変ドメイン(VH)、続いて定常ドメインCH1及びFc領域を含む。2つの親抗体からDVD-Ig分子を作製するための方法は、例えばPCT公開番号WO08/024188及び同WO07/024715中でさらに記載される。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、Fab・イン・タンデム(Fabs-in-Tandem)免疫グロブリンであり、当該免疫グロブリンにおいて、第2の特異性を備えた軽鎖可変領域は、完全な抗体の重鎖可変領域へ融合される。かかる抗体は、例えば国際特許出願公開番号WO2015/103072中で記載される。
本明細書において使用される時、「がん抗原」または「腫瘍抗原」は、(i)腫瘍特異的抗原、(ii)腫瘍関連抗原、(iii)腫瘍特異的抗原を発現する細胞、(iv)腫瘍関連抗原を発現する細胞、(v)腫瘍上の胎児抗原、(vi)自己腫瘍細胞、(vii)腫瘍特異的膜抗原、(viii)腫瘍関連膜抗原、(ix)増殖因子受容体、(x)増殖因子リガンド、及び(xi)他のタイプの抗原または抗原提示細胞またはがんに関連する材料を指す。
本明細書において使用される時、「がん特異的免疫応答」という用語は、腫瘍、がん細胞、またはがん抗原の存在によって誘導された免疫応答を指す。ある特定の態様において、応答としては、がん抗原特異的リンパ球の分裂増殖が挙げられる。ある特定の態様において、応答としては、抗体及びT細胞受容体の発現及びアップレギュレーション、ならびにリンホカイン、ケモカイン、及びサイトカインの形成及び放出が挙げられる。先天性免疫系及び後天性免疫系の両方が相互作用して、腫瘍、がん細胞、またはがん抗原に対する抗原性応答を開始する。ある特定の態様において、がん特異的免疫応答は、T細胞応答である。
「癌腫」という用語は当技術分野で認められており、呼吸器系癌、胃腸系癌、泌尿生殖系癌、精巣癌、乳癌、前立腺癌、内分泌系、癌及び黒色腫を包含する、上皮組織または内分泌組織の悪性腫瘍を指す。本明細書において記載される抗IL-27抗体は、任意のタイプのがん(腎癌または黒色腫が挙げられる)または任意のウイルス性疾患を有する患者、それらを有する疑いのある患者、または発症の高いリスクがあり得る患者の治療に使用され得る。例示的な癌としては、子宮頸部、肺、前立腺、乳房、頭頸部、大腸、及び卵巣の組織から形成されるものが挙げられる。当該用語は癌肉腫も包含し、癌肉腫は癌性組織及び肉腫組織から構成される悪性腫瘍を含む。「腺癌」は、腺組織に由来する癌腫、または腫瘍細胞が認識可能な腺構造を形成する癌腫を指す。
本明細書において使用される時、「CD112R」という用語は、ポリオウイルス受容体様タンパク質のメンバーを指し、ヒトT細胞のための共阻害性受容体である。CD112Rは、主としてT細胞及びNK細胞によって発現される阻害性受容体であり、CD112結合について活性化受容体CD226と競合する。CD112のCD112Rとの相互作用は、CD226とのものよりも高い親和性であり、それによってCD226媒介性細胞活性化を効果的に調節する。CD112との相互作用をブロックする抗CD112Rのアンタゴニストは、CD112Rのすぐ下流の阻害性シグナリングを限定する一方で、同時に、CD112とのCD226相互作用を増加させることによって免疫細胞活性化をより増進する。本明細書において使用される時、「CD112R阻害物質」という用語は、CD112Rの生物学的な機能または活性を、混乱、ブロック、または阻害する薬剤を指す。
本明細書において使用される時、「CD137」(代替的に「4-1BB」)という用語は、腫瘍壊死因子(TNF)受容体スーパーファミリーのメンバーを指す。4-1BBは、主として活性化T細胞についての共刺激免疫チェックポイント分子である。CD137の架橋は、T細胞の分裂増殖、IL-2分泌、生存、及び細胞溶解活性を促進する。本明細書において使用される時、「4-1BBアゴニスト」という用語は、4-1BBの1つまたは複数の機能を、刺激、誘導、または増加する薬剤を指す。例示的な4-1BBアゴニストは、ウトミルマブ(PF-05082566)であり、ウトミルマブは、この4-1BBを標的化してT細胞を刺激する完全ヒトIgG2モノクローナル抗体である。
本明細書において使用される時、「CD161」(代替的にキラー細胞レクチン様受容体サブファミリーB、メンバー1(KLRB1);NK1.1、またはNKR-P1Aとして公知)という用語は、C型レクチンスーパーファミリーのメンバーを指す。CD161はT細胞のマーカーであり、CD161の発現は、多数の異なるがんタイプについての腫瘍微小環境へのT細胞の浸潤に関連していた。CD161は、Fergusson et al.,(2014)Cell Reports 9(3):1075-1088(それは、参照することによってその全体が本明細書に援用される)中でさらに記載される。
本明細書において使用される時、「IL-27」または「インターロイキン27」という用語は、IL-27サイトカインを指す。IL-27はIL-6/IL-12サイトカインファミリーに関連し、エプスタイン-バーウイルス誘導遺伝子3として公知(EBI3;IL-27サブユニットβ及びIL-27Bとしても公知)の第1のサブユニット、及びIL-27p28として公知(IL30及びIL-27サブユニットα及びIL-27Aとしても公知)の第2のサブユニットを含む、ヘテロ二量体サイトカインである。IL-27は、単球、内皮細胞、及び樹状細胞を包含する活性化された抗原提示細胞によって優先的に合成される(Jankowski et al.(2010)Arch Immunol.Ther.Exp.58:417-425,Diakowski et al.(2013)Adv.Clin.Exp.Med.(2013)22(5):683-691)。IL-27は炎症誘発効果を有し得るが、多くの研究から免疫抑制剤としてのIL-27の重要な役割が示唆される(Shimizu et al.(2006)J.Immunol.176:7317-7324,Hisada et al.(2004)Cancer Res.64:1152-1156,Diakowski(2013)前掲)。IL-27はTh1応答の開始を増進する因子として最初に記載されたが、IL-27は、Th1応答を限定すること、Th2細胞及びTh17細胞の分化を阻害すること、ならびにTr1細胞集団及び他のT調節性細胞集団の発生を調節することによって、主要なT細胞抑制機能を行うことが後に見出された(Dietrich et al.(2014)J.Immunol.192:5382-5389)。免疫制御物質としてその役割に加えて、IL-27は、血管形成、造血、及び破骨細胞形成も調節する(同上)。
IL-27は、WSX1として公知(IL-27受容体サブユニットα、IL-27RA、T細胞サイトカイン受容体タイプ1(TCCR)、及びサイトカイン受容体様1(CRL1)としても公知)の第1のサブユニット、及びgp130として公知(インターロイキン-6シグナル伝達因子(IL6ST)、インターロイキン-6受容体サブユニットβ(IL-6RB)、及びオンコスタチンM受容体としても公知)の第2のサブユニットを含む、ヘテロ二量体タイプIサイトカイン受容体(IL-27受容体またはIL-27R)を介してシグナリングする。gp130は、IL-6ファミリーサイトカインについての受容体サブユニットでもある(Liu et al.(2008)Scan.J.Immunol.68:22-299,Diakowski(2013)前掲)。IL-27Rを介するIL-27シグナリングは、JAK-STAT及びp38 MAPK経路を包含する複数のシグナリングカスケードを活性化する。
EBI3は、p28またはIL-27ヘテロ二量体に非依存性の生物学的機能も有すると考えられる。例えば、EBI3はp35とも相互作用してヘテロ二量体サイトカインIL-35を形成し(Yoshida et al.(2015)Annu.Rev Immunol.33:417-43)、p28またはIL-27の対応する増加無しに、ある特定の細胞タイプにおいて選択的に過剰発現されることが示された(Larousserie et al.(2005)Am.J.Pathol.166(4):1217-28)。
例示的なヒトEBI3タンパク質のアミノ酸配列は、配列番号1(NCBI参照配列:NP_005746.2;N-mtpqlllalvlwascppcsgrkgppaaltlprvqcrasrypiavdcswtlppapnstspvsfiatyrlgmaarghswpclqqtptstsctitdvqlfsmapyvlnvtavhpwgssssfvpfitehiikpdppegvrlsplaerqlqvqweppgswpfpeifslkywirykrqgaarfhrvgpieatsfilravrpraryyvqvaaqdltdygelsdwslpatatmslgk-C)中で提供される。例示的なヒトp28タンパク質のアミノ酸配列は、配列番号2(NCBI参照配列:NP_663634.2;N-mgqtagdlgwrlsllllplllvqagvwgfprppgrpqlslqelrreftvslhlarkllsevrgqahrfaeshlpgvnlyllplgeqlpdvsltfqawrrlsdperlcfisttlqpfhallgglgtqgrwtnmermqlwamrldlrdlqrhlrfqvlaagfnlpeeeeeeeeeeeeerkgllpgalgsalqgpaqvswpqllstyrllhslelvlsravrellllskaghsvwplgfptlspqp-C)中で提供される。例示的なヒトWSX1タンパク質のアミノ酸配列は、配列番号3(NCBI参照配列:NP_004834.1;N-mrggrgapfwlwplpklallpllwvlfqrtrpqgsagplqcygvgplgdlncsweplgdlgapselhlqsqkyrsnktqtvavaagrswvaipreqltmsdkllvwgtkagqplwppvfvnletqmkpnaprlgpdvdfseddpleatvhwapptwpshkvlicqfhyrrcqeaawtllepelktipltpveiqdlelatgykvygrcrmekeedlwgewspilsfqtppsapkdvwvsgnlcgtpggeeplllwkapgpcvqvsykvwfwvggrelspegitcccslipsgaewarvsavnatswepltnlslvcldsasaprsvavssiagstellvtwqpgpgeplehvvdwardgdpleklnwvrlppgnlsallpgnftvgvpyritvtavsasglasassvwgfreelaplvgptlwrlqdappgtpaiawgevprhqlrghlthytlcaqsgtspsvcmnvsgntqsvtlpdlpwgpcelwvtastiagqgppgpilrlhlpdntlrwkvlpgilflwglfllgcglslatsgrcyhlrhkvlprwvwekvpdpansssgqphmeqvpeaqplgdlpileveemepppvmessqpaqatapldsgyekhflptpeelgllgpprpqvla-C)中で提供される。例示的なヒトgp130タンパク質のアミノ酸配列は、配列番号4(NCBI参照配列:NP_002175.2;N-mltlqtwlvqalfiflttestgelldpcgyispespvvqlhsnftavcvlkekcmdyfhvnanyivwktnhftipkeqytiinrtassvtftdiaslniqltcniltfgqleqnvygitiisglppekpknlscivnegkkmrcewdggrethletnftlksewathkfadckakrdtptsctvdystvyfvnievwveaenalgkvtsdhinfdpvykvkpnpphnlsvinseelssilkltwtnpsiksviilkyniqyrtkdastwsqippedtastrssftvqdlkpfteyvfrircmkedgkgywsdwseeasgityedrpskapsfwykidpshtqgyrtvqlvwktlppfeangkildyevtltrwkshlqnytvnatkltvnltndrylatltvrnlvgksdaavltipacdfqathpvmdlkafpkdnmlwvewttpresvkkyilewcvlsdkapcitdwqqedgtvhrtylrgnlaeskcylitvtpvyadgpgspesikaylkqappskgptvrtkkvgkneavlewdqlpvdvqngfirnytifyrtiignetavnvdsshteytlssltsdtlymvrmaaytdeggkdgpeftfttpkfaqgeieaivvpvclafllttllgvlfcfnkrdlikkhiwpnvpdpskshiaqwsphtpprhnfnskdqmysdgnftdvsvveieandkkpfpedlksldlfkkekinteghssgiggsscmsssrpsisssdenessqntsstvqystvvhsgyrhqvpsvqvfsrsestqplldseerpedlqlvdhvdggdgilprqqyfkqncsqhesspdishferskqvssvneedfvrlkqqisdhisqscgsgqmkmfqevsaadafgpgtegqverfetvgmeaatdegmpksylpqtvrqggympq-C)中で提供される。
本明細書において使用される時、「競合する」という用語は、同じエピトープへ結合することについて競合する抗原結合タンパク質(例えば免疫グロブリン、抗体、またはそれらの抗原結合断片)の文脈において使用される場合に、アッセイ(例えば競合結合アッセイ;交差ブロッキングアッセイ)によって決定される抗原結合タンパク質間の相互作用を指し、そこで、試験抗原結合タンパク質(例えば試験抗体)は、参照抗原結合タンパク質(例えば参照抗体)の共通抗原(例えばIL-27またはその断片)への特異的結合を阻害する(例えば低減またはブロックする)。
指定されたポリペプチドまたはタンパク質「に由来する」ポリペプチド配列またはアミノ酸配列は、ポリペプチドの起源を指す。好ましくは、特定の配列に由来するポリペプチド配列またはアミノ酸配列は、その配列またはその部分に本質的に同一のアミノ酸配列を有し、そこで、当該部分は、少なくとも10~20のアミノ酸、好ましくは少なくとも20~30のアミノ酸、より好ましくは少なくとも30~50のアミノ酸からなるか、またはそうでなければ、配列中にその起源を有するとして当業者に同定可能である。別のペプチドに由来するポリペプチドは、出発ポリペプチドに比べて1つまたは複数の突然変異(例えば別のアミノ酸残基により置換されたか、または1つもしくは複数のアミノ酸残基挿入もしくは欠失を有する、1つまたは複数のアミノ酸残基)を有し得る。
ポリペプチドは、天然に存在しないアミノ酸配列を含み得る。かかるバリアントは、必然的に、出発分子と、100%未満の配列同一性または類似性を有する。ある特定の態様において、バリアントは、例えばバリアント分子の長さにわたって、出発ポリペプチドのアミノ酸配列と、約75%~100%未満、より好ましくは約80%~100%未満、より好ましくは約85%~100%未満、より好ましくは約90%~100%未満(例えば91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%)、及び最も好ましくは約95%~100%未満のアミノ酸配列同一性または類似性のアミノ酸配列を有するだろう。
ある特定の態様において、本開示の抗体は、ヌクレオチド配列によってコードされる。本発明のヌクレオチド配列は、クローニング、遺伝子療法、タンパク質発現及び精製、突然変異導入、それを必要とする宿主のDNAワクチン接種、例えば受動免疫のための抗体生成、PCR、プライマー及びプローブの生成、ならびに同種のものを包含する多数の適用に有用であり得る。
本明細書において開示される方法における使用に好適な抗体は、ネイティブな配列の所望される活性を保持しながら、それらが由来する天然に存在するかまたはネイティブな配列とは配列で変動するように変更され得ることも、当業者によって理解されるだろう。例えば、「必須でない」アミノ酸残基での保存的な置換または変化へ導くヌクレオチドまたはアミノ酸の置換がなされ得る。突然変異は、標準的技法(部位特異的突然変異誘発及びPCR媒介性突然変異誘発等)によって導入され得る。
本明細書において開示される方法における使用に好適な抗体は、1つまたは複数のアミノ酸残基での(例えば必須のアミノ酸残基または必須でないアミノ酸残基での)保存的なアミノ酸置換を含み得る。「保存的なアミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が、類似する側鎖を有するアミノ酸残基により置き換えられるものである。類似する側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当技術分野において定義されており、類似する側鎖としては、塩基性側鎖(例えばリジン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えばアスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖(例えばグリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えばアラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、β分岐側鎖(例えばスレオニン、バリン、イソロイシン)、及び芳香族側鎖(例えばチロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)が挙げられる。したがって、結合ポリペプチド中の必須でないアミノ酸残基は、同じ側鎖ファミリーからの別のアミノ酸残基により好ましくは置き換えられる。ある特定の態様において、アミノ酸のストリングは、側鎖ファミリーメンバーの順序及び/または組成が異なる、構造的に類似するストリングにより置き換えられ得る。代替的にある特定の態様において、突然変異は、コーディング配列のすべてまたは一部分に沿って飽和突然変異誘発等によってランダムに導入され、もたらされた突然変異体は、本発明の結合ポリペプチドの中へ取り込まれ、所望の標的へ結合するそれらの能力についてスクリーニングされ得る。
本明細書において使用される時、抗原の「交差提示」という用語は、APC上のMHCクラスI分子及びMHCクラスII分子を介する、外来性タンパク質抗原のT細胞への提示を指す。
本明細書において使用される時、「交差反応する」という用語は、本開示の抗体が異なる種からのIL-27へ結合する能力を指す。例えば、ヒトIL-27に結合する本開示の抗体は、別の種のIL-27にも結合し得る。本明細書において使用される時、交差反応性は、結合アッセイ(例えばSPR、ELISA)における精製抗原との特異的反応性、またはIL-27を生理的に発現する細胞への結合もしくはそうでなければそれらとの機能的相互作用を検出することによって測定される。交差反応性を決定するための方法としては、本明細書において記載される標準的結合アッセイ、例えばBiacore(商標)2000 SPR instrument(Biacore AB及びUppsala、Sweden)を使用するBiacore(商標)表面プラズモン共鳴(SPR)分析、またはフローサイトメトリー技法が挙げられる。
本明細書において使用される時、「細胞傷害性Tリンパ球(CTL)応答」という用語は、細胞傷害性T細胞によって誘導される免疫応答を指す。CTL応答は、主としてCD8+T細胞によって媒介される。
本明細書において使用される時、「樹状細胞」または「DC」という用語は、骨髄(BM)由来白血球であり、最も強力なタイプの抗原提示細胞である、抗原提示細胞のタイプを指す。DCは、抗原を捕捉及び加工し、タンパク質を、T細胞によって認識される主要組織適合性複合体(MHC)分子上に提示されるペプチドへ変換する。DCは不均一である(例えば骨髄性DC及び形質細胞様DC)。すべてのDCは、抗原の取り込み、加工、及びナイーブT細胞への提示が可能であるが、DCのサブタイプは別個のマーカーを有し、所在位置、移動経路、詳細な免疫学的機能、及びそれらの生成のための感染または炎症性刺激への依存性において異なる。適応免疫応答の発達の間に、DCの表現型及び機能は、耐性の開始、記憶、ならびに極性化されたT-ヘルパー1(Th1)、Th2、及びTh17の分化における役割を果たす。
本明細書において使用される時、「樹状細胞活性化」という用語は、未成熟樹状細胞から成熟樹状細胞への移行を指し、活性化された樹状細胞は、成熟樹状細胞及び移行のプロセス中の樹状細胞を網羅し、共刺激シグナルを誘導するCD80及びCD86の発現は、活性化刺激によって上昇される。成熟ヒト樹状細胞は、CD40、CD80、CD86、及びHLAクラスII(例えばHLA-DR)の発現について陽性の細胞である。未成熟樹状細胞は、例えばCD80及びCD86からなる群から選択されるマーカーに基づいて、成熟樹状細胞と区別され得る。未成熟樹状細胞は、これらのマーカーについて弱く陽性、好ましくは陰性であり、その一方で成熟樹状細胞は陽性である。成熟樹状細胞の弁別は、当業者によってルーチンに遂行され、上で記載されるそれぞれのマーカー及びそれらの発現を測定するための方法も当業者に周知である。
本明細書において使用される時、「EC50」という用語は、最大応答の50%(すなわち最大応答とベースラインとの間の中間)である応答を、インビトロアッセイまたはインビボアッセイのいずれかにおいて、誘導する抗体またはその抗原結合部分の濃度を指す。
本明細書において使用される時、「有効用量」または「有効投薬量」という用語は、所望の効果を達成するか部分的に達成するのに十分な量として定義される。「治療有効用量」という用語は、既に疾患に罹患する患者における疾患及びその合併症を治癒させるか、または少なくとも部分的に停止するのに十分な量として定義される。この使用のために有効な量は、治療されている障害の重症度、及び患者自身の免疫系の一般的な状態に依存するだろう。
本明細書において使用される時、「エピトープ」または「抗原決定基」という用語は、免疫グロブリンまたは抗体が特異的に結合する抗原上の部位を指す。「エピトープマッピング」という用語は、その標的タンパク質抗原上の、抗体またはその抗原結合断片の結合部位またはエピトープを同定するプロセスまたは方法を指す。エピトープマッピングの方法及び技法は、本明細書において提供される。エピトープは、連続したアミノ酸、またはタンパク質の三次の折りたたみによって並列した非連続のアミノ酸の両方から形成され得る。連続したアミノ酸から形成されたエピトープは、典型的には、変性溶媒への曝露で保持されるが、三次の折りたたみによって形成されたエピトープは、典型的には、変性溶媒による処理で失われる。エピトープは、典型的には、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、または15のアミノ酸を、固有の空間的立体配座で含む。どのエピトープが所与の抗体によって結合されるかを決定するための方法(すなわちエピトープマッピング)は、当技術分野において周知であり、例えば免疫ブロット及び免疫沈降アッセイが挙げられ、そこで、IL-27からのオーバーラップペプチドまたは連続したペプチドは、所与の抗IL-27抗体との反応性について試験される。エピトープの空間的立体配座を決定する方法としては、当技術分野における技法及び本明細書において記載されるもの(例えばX線結晶学及び2次元核磁気共鳴)が挙げられる(例えばEpitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology,Vol.66,G.E.Morris,Ed.(1996)を参照)。
本明細書において記載される特定の抗体によって認識されるエピトープのすべてまたは部分(例えば同じ領域もしくはオーバーラップする領域、または領域間のもしくは領域にわたる領域)を含むIL-27上のエピトープへ結合する抗体も、本開示によって網羅される。
同じエピトープに結合する抗体、及び/または本明細書において記載される抗体とヒトIL-27へ結合することについて競合する抗体も本開示によって網羅される。同じエピトープを認識する抗体または結合について競合する抗体は、ルーチンの技法を使用して同定され得る。かかる技法としては、例えばある抗体が別の抗体の標的抗原への結合をブロックする能力を示す免疫アッセイ(すなわち競合結合アッセイ)が挙げられる。競合的結合は、試験中の免疫グロブリンが共通の抗原(IL-27等)への参照抗体の特異的結合を阻害するアッセイにおいて決定される。多数のタイプの競合結合アッセイは公知であり、例えば固相直接放射免疫アッセイ(RIA)または固相間接放射免疫アッセイ、固相直接酵素免疫アッセイ(EIA)または固相間接酵素免疫アッセイ、サンドイッチ競合アッセイ(Stahli et al.,Methods in Enzymology 9:242(1983)を参照);固相直接ビオチン-アビジンEIA(Kirkland et al.,J.Immunol.137:3614(1986)を参照);固相直接標識アッセイ、固相直接標識サンドイッチアッセイ(Harlow and Lane,Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press(1988)を参照);I-125標識を使用する固相直接標識RIA(Morel et al.,Mol.Immunol.25(1):7(1988)を参照);固相直接ビオチン-アビジンEIA(Cheung et al.,Virology 176:546(1990));及び直接標識RIA(Moldenhauer et al.,Scand.J.Immunol.32:77(1990))である。典型的には、かかるアッセイは、固体表面へ結合された精製抗原またはこれらのいずれかを持つ細胞、標識されない試験免疫グロブリン、及び標識された参照免疫グロブリンの使用を含む。競合的阻害は、試験免疫グロブリンの存在下における固体表面または細胞へ結合された標識の量の決定によって測定される。通常、試験免疫グロブリンは過剰に存在する。通常、競合抗体が過剰に存在する場合に、当該競合抗体は、参照抗体の共通抗原への特異的結合を、少なくとも50~55%、55~60%、60~65%、65~70%、70~75%またはそれ以上阻害するだろう。
他の技法としては、例えば抗原:抗体複合体の結晶のX線分析(それはエピトープの原子分解能を提供する)及び水素/重水素(H/D)交換と組み合わせた質量分析(それは抗原:抗体相互作用の立体配座及びダイナミクスを研究する)等のエピトープマッピング法が挙げられる。他の方法は、抗原フラグメントまたは抗原の変異バリアントへの抗体の結合をモニタリングし、そこで抗原配列内のアミノ酸残基の修飾に起因する結合の喪失は、エピトープ構成要素の指標と多くの場合判断される。加えて、エピトープマッピングのためのコンピューターによるコンビナトリアル方法も使用され得る。これらの方法は、コンビナトリアルファージディスプレイペプチドライブラリーから特異的な短いペプチドを親和性単離する、関心の抗体の能力に依存する。次いでペプチドは、ペプチドライブラリーのスクリーニングに使用される抗体に対応するエピトープの定義のためのリードと見なされる。エピトープマッピングのために、立体配座的に不連続なエピトープをマッピングすることが示された計算アルゴリズムも開発されている。
本明細書において使用される時、「Fc媒介性エフェクター機能」または「Fcエフェクター機能」という用語は、抗体の主要な機能及び目的以外の抗体の生物学的活性を指す。例えば、治療法に依存しない(therapeutic agnostic)抗体のエフェクター機能は、標的のタンパク質または経路の活性化以外の生物学的活性である。抗体効果機能の例としては、C1q結合及び補体依存性細胞傷害;Fc受容体結合;抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC);ファゴサイトーシス;細胞表面受容体(例えばB細胞受容体)のダウンレギュレーション;Fc受容体を発現する血小板の活性化の欠如;及びB細胞活性化が挙げられる。多くのエフェクター機能は、Fcγ受容体へのFc結合により開始する。いくつかの態様において、腫瘍抗原標的化抗体は、エフェクター機能(例えばADCC活性)を有する。いくつかの態様において、本明細書において記載される腫瘍抗原標的化抗体は、定常領域の非修飾形態に比べて、エフェクター機能の増加(例えばADCCを媒介する能力の増加)を有するバリアント定常領域を含む。
本明細書において使用される時、「Fc受容体」という用語は、免疫エフェクター細胞の表面上で見出され、抗体のFc領域によって結合される、ポリペプチドを指す。いくつかの態様において、Fc受容体は、Fcγ受容体である。Fcγ受容体、FcγRI(CD64)、FcγRII(CD32)、及びFγcRIII(CD16)の3つのサブクラスがある。すべての4つのIgGアイソタイプ(IgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4)は、Fc受容体FcγRI、FcγRIIA、及びFcγRIIIAに結合し活性化する。FcγRIIBは阻害性受容体であり、したがってこの受容体への抗体結合は補体及び細胞応答を活性化しない。FcγRIは、単量体形態でIgGへ結合する高親和性受容体であるが、FcγRIIA及びFcγRIIAは、多量体形態でのみIgGを結合し、わずかにより低い親和性を有する低親和性受容体である。Fc受容体及び/またはC1qへの抗体の結合は、Fc領域内の特異的な残基またはドメインによって支配される。結合は、ヒンジ領域内及び抗体のCH2部分内に所在する残基にも依存する。いくつかの態様において、本明細書において記載される抗体のアゴニスト活性及び/または治療活性は、Fc受容体(例えばFcγR)へのFc領域の結合に依存する。いくつかの態様において、本明細書において記載される抗体のアゴニスト活性及び/または治療活性は、Fc受容体(例えばFcγR)へのFc領域の結合によって促進される。
本開示において用いられる特定のFc受容体配列のリストは、表13として以下で示される。
本明細書において使用される時、「糖鎖付加パターン」という用語は、タンパク質へ、より具体的には免疫グロブリンタンパク質へ共有結合で付加された炭水化物単位のパターンとして定義される。当業者が、異種抗体の糖鎖付加パターンを、導入遺伝子のCH遺伝子が由来する種よりも、非ヒト遺伝子導入動物の種における糖鎖付加のパターンにより類似すると認識する場合に、異種抗体の糖鎖付加パターンは、非ヒト遺伝子導入動物の種によって産生される抗体上に天然に存在する前記糖鎖付加パターンに実質的に類似すると特徴づけられ得る。
本明細書において使用される時、「ヒト抗体」という用語は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列の可変領域及び定常領域(存在するならば)を有する抗体を包含する。本開示のヒト抗体は、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基(例えばインビトロのランダム突然変異誘発もしくは部位特異的突然変異誘発によって、またはインビボの体細胞突然変異によって導入された突然変異)を含み得る(例えばLonberg et al.,(1994)Nature 368(6474):856-859);Lonberg,(1994)Handbook of Experimental Pharmacology 113:49-101;Lonberg & Huszar,(1995)Intern.Rev.Immunol.13:65-93、及びHarding & Lonberg,(1995)Ann.N.Y.Acad.Sci.764:536-546を参照)。しかしながら、「ヒト抗体」という用語は、別の哺乳類種(マウス等)の生殖細胞系列に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列にグラフトされた抗体(すなわちヒト化抗体)を包含しない。
本明細書において使用される時、「異種抗体」という用語は、かかる抗体を産生する遺伝子導入非ヒト生物体に関連して定義される。この用語は、遺伝子導入非ヒト動物を構成しない生物体において見出され、概して遺伝子導入非ヒト動物種以外の種からのものに対応する、アミノ酸配列またはコード核酸配列を有する抗体を指す。
「免疫応答を誘導する」及び「免疫応答を促進する」という用語は、互換的に使用され、特定の抗原への免疫応答(すなわち受動的または適応的のいずれか)の刺激を指す。「誘導する」という用語は、CDCまたはADCCの誘導に関して使用される時、特定の直接的細胞殺傷メカニズムの刺激を指す。
本明細書において使用される時、「免疫原性細胞死」(代替的に「免疫原性アポトーシス」として公知である)という用語は、腫瘍細胞からのダメージ関連分子パターン(DAMP)分子(例えばアデノシン三リン酸、ATP)の死の前の発現及び放出を誘導し、腫瘍細胞の免疫原性の増加、及び免疫原性様式(例えばファゴサイトーシスによる)での腫瘍細胞の死をもたらす、1つまたは複数のシグナリング経路の活性化に関連する細胞死様式を指す。本明細書において使用される時、「免疫原性細胞死誘導剤」という用語は、免疫原性細胞死のプロセス、経路、または様式を誘導する化学的薬剤、生物学的薬剤、または薬理学的薬剤を指す。
本明細書において使用される時、「阻害する」、「低減する」、または「ブロックする」という用語(例えば細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のヒトIL-27媒介性リン酸化の阻害または低減を指す)は、互換的に使用され、部分的及び完全な阻害/ブロックの両方を網羅する。IL-27の阻害/ブロックは、阻害またはブロック無しに起こる活性の正常なレベルまたはタイプを低減または変更する。阻害及びブロックは、抗IL-27抗体と接触させないIL-27に比較して、抗L-27抗体と接触させた場合のIL-27の結合親和性における任意の測定可能な減少、例えばIL-27の結合の、少なくとも約10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%の阻害も包含するように意図される。
本明細書において使用される時、「血管形成を阻害する」、「血管形成を減退する」、及び「血管形成を低減する」という用語は、組織中の血管形成のレベルを、対応する対照組織中の量よりも、少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、またはそれ未満である量、及び最も好ましくは対照組織において観察されるのと同じレベルへ低減することを指す。
本明細書において使用される時、「増殖を阻害する」という用語(例えば細胞を指す)は、細胞の増殖における任意の測定可能な減少、例えば細胞の増殖の、少なくとも約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、99%、または100%の阻害を包含するように意図される。
本明細書において使用される時、「予防を必要とする対象」、「治療を必要とする対象」、または「それを必要とする対象」は、適切な医療従事者(例えばヒトの事例において医師、看護師、または診療看護師;非ヒト哺乳動物の事例において獣医師)の判断によって、所与の治療(抗IL-27抗体を含む組成による治療等)から合理的に利益を得るであろう対象を指す。
「インビボ」という用語は、生物体において起こるプロセスを指す。
本明細書において使用される時、「単離された抗体」という用語は、異なる抗原特異性を有する他の抗体が実質的に無い抗体を指すように意図される(例えばヒトIL-27へ特異的に結合する単離された抗体は、IL-27以外の抗原を特異的に結合する抗体が実質的に無い)。しかしながら、エピトープへ特異的に結合する単離された抗体は、異なる種からの他のIL-27タンパク質への交差反応性を有し得る。しかしながら、抗体は、本明細書において記載される特異的結合アッセイにおいて、ヒトIL-27への特異的な結合を示し続ける。加えて、単離された抗体は、典型的には、他の細胞材料及び/または化学物質が実質的に無い。いくつかの態様において、異なるIL-27特異性を有する「単離された」抗体の組み合わせは、十分に定義された組成で組み合わせられる。
本明細書において使用される時、「単離された核酸分子」という用語は、IL-27へ結合する抗体または抗体部分(例えばVH、VL、CDR3)をコードする核酸を指し、抗体または抗体部分をコードするヌクレオチド配列が、IL-27以外の抗原を結合する抗体または抗体部分をコードする他のヌクレオチド配列は無く、他の配列が、ヒトゲノムDNA中の核酸に天然に隣接し得る、核酸分子を指すように意図される。例えば、表12中で示される配列から選択される配列は、本明細書において記載される抗IL-27抗体のモノクローナル抗体の重鎖(VH)及び軽鎖(VL)可変領域を含むヌクレオチド配列に対応する。
本明細書において使用される時、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされる抗体クラス(例えばIgMまたはIgG1)を指す。いくつかの態様において、本開示のヒトモノクローナル抗体は、IgG1アイソタイプのものである。いくつかの態様において、本開示のヒトモノクローナル抗体は、IgG2アイソタイプのものである。いくつかの態様において、本開示のヒトモノクローナル抗体は、IgG3アイソタイプのものである。いくつかの態様において、本開示のヒトモノクローナル抗体は、IgG4アイソタイプのものである。当業者に明らかであるように、抗体アイソタイプ(例えばIgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgD、及びIgE)の同定は、当技術分野においてルーチンであり、一般的には公知の抗体、出版されたFcバリアント配列、及び保存配列との配列アライメントの組み合わせを含む。
本明細書において使用される時、「アイソタイプスイッチ」という用語は、抗体のクラスまたはアイソタイプが、あるIgクラスから他のIgクラスのものへ変化する現象を指す。
本明細書において使用される時、「KD」または「KD」という用語は、抗体と抗原との間の結合反応の平衡解離定数を指す。KDの値は、抗体オフレート定数(kd)対抗体オンレート定数(ka)の比の数値表現である。KDの値は、抗体の抗原への結合親和性に反比例する。KD値が小さいほど、その抗原についての抗体の親和性は高い。親和性は、単一分子のそのリガンドへの結合の強度であり、典型的には平衡解離定数(KD)(それは二分子相互作用の桁の強度を評価及びランク付けするに使用される)によって測定及び報告される。
本明細書において使用される時、「kd」または「kd」(代替的に「koff」または「koff」)という用語は、抗体の抗体/抗原複合体からの解離についてのオフレート定数を指すように意図される。kdの値は、毎秒崩壊または解離する複合体の割合の数値表現であり、単位は秒-1で発現される。
本明細書において使用される時、「ka」または「ka」(代替的に「kon」または「kon」)という用語は、抗体の抗原との会合についてのオンレート定数を指すように意図される。kaの値は、抗体及び抗原の1モル(1M)溶液中で毎秒形成される抗体/抗原複合体の数の数値表現であり、単位はM-1秒-1で表現される。
本明細書において使用される時、「白血球」という用語は、感染性微生物及び外来性物質に対して身体を防御することに関与する白血球のタイプを指す。白血球は、骨髄において産生される。白血球には5つの主なタイプがあり、2つの主な群に細分され、それらは、多形核白血球(好中球、好酸球、好塩基性細胞)及び単核性白血球(単球及びリンパ球)である。
本明細書において使用される時、「リンパ球」という用語は、身体の免疫防御に関与するタイプの白血球(leukocyte)または白血球(white blood cell)を指す。リンパ球2つの主なタイプがあり、B細胞及びT細胞である。
本明細書において使用される時、「連結される」、「融合される」、または「融合」という用語は、互換的に使用される。これらの用語は、化学的コンジュゲーションまたは組み換え手段を包含するすべての手段によって、2つ以上のエレメントまたは構成要素またはドメインを一緒に繋ぐことを指す。化学的コンジュゲーションの方法(例えばヘテロ二官能性架橋剤を使用する)は、当技術分野において公知である。
本明細書において使用される時、「局所投与(local administration)」または「局所送達」は、その意図された標的組織または部位への組成物または薬剤の血管系を介する輸送に依存しない送達を指す。例えば、組成物は、組成物もしくは薬剤の注射または植え込みによって、または組成物もしくは薬剤を含有するデバイスの注射または植え込みによって、送達され得る。標的の組織または部位の近くにおける局所投与に続いて、組成物もしくは薬剤、または1つまたは複数のその構成要素は、意図された標的の組織または部位へ拡散し得る。
本明細書において使用される時、「MHC分子」は、2つのタイプの分子(MHCクラスI及びMHCクラスII)を指す。MHCクラスI分子は、特異的なCD8+T細胞へ抗原を提示し、MHCクラスII分子は、特異的なCD4+T細胞へ抗原を提示する。APCへ外来的に送達された抗原は、主としてMHCクラスIIとの会合のために加工され得る。これとは対照的に、APCへ内因的に送達された抗原は、主としてMHCクラスIとの会合のために加工される。
本明細書において使用される時、「モノクローナル抗体」という用語は、特定のエピトープについての単一の結合特異性及び親和性を示す抗体を指す。したがって、「ヒトモノクローナル抗体」という用語は、単一の結合特異性を示し、ヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列に由来する可変領域及び任意選択の定常領域を有する抗体を指す。いくつかの態様において、ヒトモノクローナル抗体は、不死化細胞へ融合された、ヒトの重鎖導入遺伝子及び軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有する遺伝子導入非ヒト動物(例えば遺伝子導入マウス)から得られたB細胞を含む、ハイブリドーマによって産生される。
本明細書において使用される時、「単球」という用語は、白血球のタイプを指し、マクロファージ及び樹状細胞へと分化して免疫応答を達成し得る。
本明細書において使用される時、「ナチュラルキラー(NK)細胞」という用語は、細胞傷害性リンパ球のタイプを指す。これらは大きな、通常、顆粒性の非T非Bのリンパ球であり、それらはある特定の腫瘍細胞を殺傷し、ウイルス及び他の細胞内病原体に対する先天性免疫、そして抗体依存性細胞媒介性細胞傷害(ADCC)における重要な役割を果たす。
本明細書において使用される時、「天然に存在する」という用語は、ある目的物へ適用される時、ある目的物を天然で見出すことができるという事実を指す。例えば、天然の供給源から単離され得、且つ研究室において人間によって意図的に修飾されない生物体(ウイルスが挙げられる)中に存在するポリペプチドまたはポリヌクレオチドの配列は、天然に存在する。
本明細書において使用される時、「スイッチされない(nonswitched)アイソタイプ」という用語は、アイソタイプスイッチングが起こっていない場合に、産生されるアイソタイプクラスの重鎖を指し、スイッチされないアイソタイプをコードするCH遺伝子は、典型的には、機能的に再構成されたVDJ遺伝子からすぐ下流の最初のCH遺伝子である。アイソタイプスイッチングは、古典的または非古典的なアイソタイプスイッチングとして分類されている。古典的アイソタイプスイッチングは、導入遺伝子中の少なくとも1つのスイッチ配列領域が関与する組み換え事象によって起こる。非古典的アイソタイプスイッチングは、例えばヒトσμとヒトΣμとの間での相同組み換えによって起こり得る(δ関連欠失)。代替の非古典的スイッチング機序(とりわけ導入遺伝子間及び/または染色体間の組み換え等)が、起こり、アイソタイプスイッチングを有効にし得る。
本明細書において使用される時、「核酸」という用語は、一本鎖形態または二本鎖形態のいずれかでのデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド及びそのポリマーを指す。具体的に限定されない限り、当該用語は、参照核酸と類似する結合特性を有し、天然に存在するヌクレオチドに類似する様式で代謝される、天然ヌクレオチドの既知のアナログを含有する核酸を網羅する。別段の指示のない限り、特定の核酸配列は、明示的に示された配列に加えて、保存的に修飾されたそのバリアント(例えば縮重コドン置換)及び相補的配列も暗黙的に網羅する。具体的には、縮重コドン置換は、1つまたは複数の選択された(またはすべての)コドンの第3の位置が、混合塩基及び/またはデオキシイノシン残基により置換された配列を生成することによって達成され得る(Batzer et al.,Nucleic Acid Res.19:5081,1991;Ohtsuka et al.,Biol.Chem.260:2605-2608,1985;及びCassol et al,1992;Rossolini et al,Mol.Cell.Probes 8:91-98,1994)。アルギニン及びロイシンについては、第2の塩基での修飾も保存的であり得る。核酸という用語は、遺伝子、cDNA、及び遺伝子によってコードされたmRNAと互換的に使用される。
本明細書において使用されるポリヌクレオチドは、任意のポリリボヌクレオチドまたはポリデオクスリボヌクレオチド(polydeoxribonucleotide)から構成され得、それらは非修飾RNAもしくはDNA、または修飾RNAもしくはDNAであり得る。例えば、ポリヌクレオチドは、一本鎖及び二本鎖のDNA、一本鎖及び二本鎖の領域の混合物であるDNA、一本鎖及び二本鎖のRNA、ならびに一本鎖及び二本鎖の領域の混合物であるRNA、一本鎖領域もしくはより典型的には二本鎖領域または一本鎖及び二本鎖の混合領域であり得るDNA及びRNAを含むハイブリッド分子から構成され得る。加えて、ポリヌクレオチドは、RNAもしくはDNA、またはRNA及びDNAの両方を含む三本鎖領域から構成され得る。ポリヌクレオチドは、安定性または他の理由のために修飾された、1つまたは複数の修飾された塩基またはDNAもしくはRNAの骨格も含有し得る。「修飾」塩基としては、例えばトリチル化塩基及びまれな塩基(イノシン等)が挙げられる。様々な修飾がDNA及びRNAへ行われ得る。したがって、「ポリヌクレオチド」は、化学的に、酵素により、または代謝的に修飾された形態を包含する。
核酸は、それが別の核酸配列と機能的な関係性へと配置される場合に「作動可能に連結されている」。例えば、プロモーターまたはエンハンサーが配列の転写に影響するならば、コード配列へ作動可能に連結されている。転写調節配列に関して、作動可能に連結されるとは、連結されるDNA配列が連続すること、及び2つのタンパク質コード領域を繋ぐことが必要な場合は、リーディングフレームで連続することを意味する。スイッチ配列については、作動可能に連結された配列は、スイッチ組み換えの達成が可能であることを示す。
本明細書において使用される時、「非経口投与」、「非経口投与される」、及び他の文法上同等の語句は、経腸投与及び局所投与(topical administration)以外の投与モードを指し、通常注射によるものであり、静脈内、鼻腔内、眼内、筋肉内、動脈内、髄腔内、被膜内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、脊髄内、硬膜外、大脳内、頭蓋内、頸動脈内、及び胸骨内の注射及び点滴が限定されずに挙げられる。
本明細書において使用される時、「患者」という用語は、予防的処置または治療処置のいずれかを受けるヒト及び他の哺乳動物対象を包含する。
本明細書において使用される時、「PD-1アンタゴニスト」という用語は、PD-1シグナリング経路を阻害するか、またはそうでなければ細胞(例えば免疫細胞)におけるPD-1機能を阻害する、任意の化学化合物または生物学的分子を指す。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-L1がPD-1へ結合すること及び/またはPD-L2がPD-1へ結合することをブロックする。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1に特異的に結合する。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-L1に特異的に結合する。
「パーセント同一性」という用語は、2つ以上の核酸配列またはポリペプチド配列の文脈において、以下で記載された配列比較アルゴリズム(例えばBLASTP及びBLASTN、または当業者に利用可能な他のアルゴリズム)のうちの1つを使用して、または視覚的検査によって測定されるように、最大の対応について比較しアライメントさせた場合に、同じであるヌクレオチドまたはアミノ酸残基の規定のパーセンテージを有する、2つ以上の配列またはサブ配列を指す。適用に依存して、「パーセント同一性」は、比較されている配列の領域にわたって、例えば機能的ドメインにわたって存在し得るか、または代替的には比較される2つの配列の全長にわたって存在し得る。配列比較のために、典型的には、1つの配列が参照配列として働き、それへ試験配列が比較される。配列比較アルゴリズムを使用する場合に、試験配列及び参照配列はコンピューターへと入力され、必要であるならばサブ配列座標が指定され、配列アルゴリズムプログラムパラメーターが指定される。次いで、配列比較アルゴリズムにより、指定されたプログラムパラメーターに基づいて、参照配列に比べた試験配列(複数可)についてのパーセント配列同一性を計算する。
比較のための配列の最適なアライメントは、例えばSmith & Waterman,Adv.Appl.Math.2:482(1981)の局所相同性アルゴリズムによって、Needleman & Wunsch,J.Mol.Biol.48:443(1970)の相同性アライメントアルゴリズムによって、Pearson & Lipman,Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA 85:2444(1988)の類似性についての探索方法によって、これらのアルゴリズムのコンピューター化実装(Wisconsin Genetics Software Package(Genetics Computer Group,575 Science Dr.,Madison,Wis.)中のGAP、BESTFIT、FASTA、及びTFASTA)、または視覚的検査(概してAusubel et al.、下記を参照)によって遂行され得る。
パーセント配列同一性及び配列類似性の決定のために好適なアルゴリズムの1つの例は、BLASTアルゴリズムであり、それはAltschul et al.,J.Mol.Biol.215:403-410(1990)中で記載される。BLAST分析の遂行のためのソフトウェアは、National Center for Biotechnology Informationのウェブサイトを介して公的に利用可能である。
概して本明細書において使用される時、「薬学的に許容される」は、妥当な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、炎症、アレルギー反応、または他の問題もしくは合併症無しに、合理的なベネフィット/リスク比と釣り合った、ヒト及び動物の組織、器官、及び/または体液と接触させる使用に好適な、化合物、材料、組成物及び/または投薬形態を指す。
本明細書において使用される時、「薬学的に許容される担体」は、任意の及びすべての溶媒、分散媒、コーティング、抗菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤、ならびに生理学的に適合性がある同種のものを指し、それらを包含する。組成物としては、薬学的に許容される塩(例えば酸付加塩または塩基付加塩)が挙げられ得る(例えばBerge et al.(1977)J Pharm Sci 66:1-19を参照)。
本明細書において使用される時、「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という用語は、互換的に使用されて、アミノ酸残基のポリマーを指す。これらの用語は、1つまたは複数のアミノ酸残基が対応する天然に存在するアミノ酸の人工的な化学的模倣体であるアミノ酸ポリマー、そして天然に存在するアミノ酸ポリマー、及び天然に存在しないアミノ酸ポリマーへ適用される。
本明細書において使用される時、「予防すること」という用語は、病態に関連して使用される場合に、組成物を受け取らない対象に比べて、対象において医学的条件の症状の頻度を低減するか、またはその開始を遅延させる組成物の投与を指す。
本明細書において使用される時、「精製された」または「単離された」という用語は、本明細書において記載されるタンパク質(抗体または断片)のうちの任意のものへ適用される時、構成要素(例えばタンパク質、または他の天然に存在する生物学的分子もしくは有機分子)から分離または精製されたポリペプチドを指し、当該構成要素は当該ポリペプチドに天然に付随する(例えばタンパク質を発現する原核生物中の他のタンパク質、脂質、及び核酸)。典型的には、サンプル中の全タンパク質の少なくとも60(例えば少なくとも65、70、75、80、85、90、92、95、97、または99)%を重量で構成する場合に、ポリペプチドは精製されている。
本明細書において使用される時、「プログラム細胞死タンパク質1」または「PD-1」という用語は、CD28ファミリーに属する免疫阻害性受容体であるプログラム細胞死タンパク質1ポリペプチドを指し、ヒトにおいてPDCD1遺伝子によってコードされる。PD-1についての代替名称または同義語としては、PDCD1、PD1、CD279、及びSLEB2が挙げられる。PD-1は、あらかじめ活性化されたT細胞、B細胞、及び骨髄性細胞でインビボで優先的に発現され、2つのリガンド(PD-L1及びPD-L2)へ結合する。「PD-1」という用語は、本明細書において使用される時、ヒトPD-1(hPD-1)、hPD-1のバリアント、アイソフォーム、及び種ホモログ、ならびにhPD-1と少なくとも1つの共通のエピトープを有する類似体を包含する。完全なhPD-1配列は、GenBankアクセッション番号AAC51773下で見出され得る。
本明細書において使用される時、「プログラム死リガンド-1」または「PD-L1」という用語は、PD-1についての2つの細胞表面糖タンパク質リガンドのうちの1つ(他のものはPD-L2)でありそれは、PD-1への結合に際して、T細胞活性化及びサイトカイン分泌をダウンレギュレートする。PD-L1についての代替名称及び同義語としては、PDCD1L1、PDL1、B7H1、B7-4、CD274、及びB7-Hが挙げられる。「PD-L1」という用語は、本明細書において使用される時、ヒトPD-L1(hPD-L1)、hPD-L1のバリアント、アイソフォーム、及び種ホモログ、ならびにhPD-L1と少なくとも1つの共通のエピトープを有する類似体を包含する。完全なhPD-L1配列は、GenBankアクセッション番号Q9NZQ7下で見出され得る。
PD-1は、TCRシグナルを負に調節する免疫阻害性タンパク質として公知である(Ishida,Y.et al.(1992)EMBO J.11:3887-3895;Blank,C.et al.(Epub 2006 Dec.29)Immunol.Immunother.56(5):739-745)。PD-1とPD-L1との間の相互作用は、免疫チェックポイントとして作用することができ、それはT細胞受容体媒介性分裂増殖の減少を導き得る(Dong et al.(2003)J.Mol.Med.81:281-7;Blank et al.(2005)Cancer Immunol.Immunother.54:307-314;Konishi et al.(2004)Clin.CancerRes.10:5094-100)。免疫抑制は、PD-L1またはPD-L2とのPD-1の局所的相互作用の阻害によって回復され得、PD-L2とPD-1の相互作用が同様にブロックされる場合に、効果は相加的である(Iwai et al.(2002)Proc.Nat’l.Acad.Sci.USA 99:12293-7;Brown et al.(2003)J.Immunol.170:1257-66)。
複数のがんについては、腫瘍の生存及び分裂増殖は、腫瘍媒介性免疫チェックポイント調節によって持続される。この調節は、抗がん免疫系機能の混乱をもたらし得る。例えば、最近の研究から、腫瘍細胞による免疫チェックポイント受容体リガンド(PD-L1またはPD-L2等)の発現が、特にT細胞の抑制によって、腫瘍微小環境において免疫系活性をダウンレギュレートし、がん免疫回避を増進し得ることが示されている。PD-L1は、様々なヒトがんによって多量に発現される(Dong et al.,(2002)Nat Med 8:787-789)。PD-L1についての受容体(PD-1)は、リンパ球(例えば活性化されたT細胞)上で発現され、特にT細胞の抑制によって、通常は免疫系をダウンレギュレートし、自己寛容の増進に関与する。しかしながら、T細胞上で発現されたPD-1受容体が、腫瘍細胞上の同族のPD-L1リガンドへ結合する場合に、もたらされるT細胞の抑制は、腫瘍に対する免疫応答の悪化に寄与する(例えば腫瘍浸潤リンパ球の減少、またはがん細胞による免疫回避の確立)。
例えば卵巣癌、腎臓癌、結腸直腸癌、膵臓癌、肝臓癌、及び黒色腫の大量のサンプルのセットにおいて、PD-L1発現は、後続の治療にかかわらず、予後不良及び全生存率の低減と相関することが示された(例えばDong et al.,(2002)Nat Med 8(8):793-800;Yang et al.,(2008)Invest Ophthalmol Vis Sci 49(6):2518-2525;Ghebeh et al.,(2006)Neoplasia 8:190-198;Hamanishi et al.,(2007)Proc Nat Acad Sci USA 104:3360-3365;Thompson et al.,(2006)Clin Genitourin Cancer 5:206-211;Nomi et al.,(2005)Clin Cancer Res 11:2947-2953;Inman et al.,(2007)Cancer 109:1499-1505;Shimauchi et al.,(2007)Int J Cancer 121:2585-2590;Gao et al.,(2009)Clin Cancer Res 15:971-979;Nakanishi et al.,(2007)Cancer Immunol Immunother 56:1173-1182;Hino et al.,(2010)Cancer 116(7):1757-1766を参照)。同様に、腫瘍リンパ球上のPD-1発現は、乳癌(Kitano et al.,(2017)ESMO Open 2(2):e000150)及び黒色腫(Kleffel et al.,(2015)Cell 162(6):1242-1256)における機能障害のT細胞をマークすることが明らかにされた。PD-1アンタゴニスト(例えばPD-1/PD-L1/PD-L2シグナリング軸の機能に影響するもの、及び/またはPD-1及びPD-L1及び/またはPD-L2間の相互作用を混乱させるもの等)が、開発されており、それは、免疫細胞-腫瘍細胞相互作用の調節を介して機能する新規クラスの抗腫瘍阻害物質を表わす。
本明細書において使用される時、「再構成された」という用語は、Vセグメントが、完全なVHドメインまたはVLを本質的にコードする立体配座で、それぞれD-JセグメントまたはJセグメントにすぐ隣接して配置される、重鎖または軽鎖の免疫グロブリン遺伝子座の立体配置を指す。再構成された免疫グロブリン遺伝子の遺伝子座は、生殖細胞系列DNAへの比較によって同定され得、再構成された遺伝子座は、少なくとも1つの組み換えられたヘプタマー/ノナマーの相同エレメントを有するだろう。
本明細書において使用される時、「組み換え宿主細胞」(または単純に「宿主細胞」)という用語は、組み換え発現ベクターが導入された細胞を指すように意図される。かかる用語が特定の対象細胞だけでなく、かかる細胞の子孫も指すように意図されることを理解するべきである。特定の修飾が、突然変異または環境の影響のいずれかに起因して次世代において起こり得るので、かかる子孫は実際は親細胞に同一ではないが、本明細書において使用される時、それでも「宿主細胞」という用語の範囲内に包含される。
本明細書において使用される時、「組み換えヒト抗体」という用語は、(a)ヒト免疫グロブリン遺伝子についての遺伝子導入動物もしくは染色体導入動物(例えばマウス)またはそれらから調製されたハイブリドーマから単離された抗体、(b)抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から(例えばトランスフェクトーマから)単離された抗体、(c)組み換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体、及び(d)ヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のDNA配列へのスプライシングに関与する任意の他の手段によって調製、発現、生成、または単離された抗体等の、組み換え手段によって調製、発現、生成、または単離された抗体を包含する。かかる組み換えヒト抗体は、特定のヒト生殖細胞系列免疫グロブリン配列を利用する可変領域及び定常領域を含む生殖細胞系列遺伝子によってコードされるが、例えば抗体成熟の間に起こる後続の再構成及び突然変異を含む。当技術分野において公知であるように(例えばLonberg(2005)Nature Biotech.23(9):1117-1125を参照)、可変領域は抗原結合ドメインを含有し、これは再構成して外来の抗原に特異的な抗体を形成する様々な遺伝子によってコードされる。再構成に加えて、可変領域は、複数の単一アミノ酸変化(体細胞突然変異または超変異と称された)によってさらに修飾されて、外来の抗原への抗体の親和性を増加させることができる。定常領域は、抗原へさらに応答して変化するだろう(すなわちアイソタイプスイッチ)。したがって、軽鎖免疫グロブリン及び重鎖免疫グロブリンのポリペプチドをコードする、抗原に応答して再構成され体細胞突然変異した核酸分子は、元の核酸分子と配列同一性を有していなくてもよいが、その代りに、実質的に同一であるか、または類似するだろう(すなわち少なくとも80%の同一性を有する)。
本明細書において使用される時、「参照抗体」(「参照mAb」と互換的に使用される)または「参照抗原結合タンパク質」という用語は、IL-27上の特異的エピトープへ結合する抗体またはその抗原結合断片を指し、参照抗体自体と1つまたは複数の別個の抗体との間の関係性を確立するために使用され、当該関係性は、参照抗体及び1つまたは複数の別個の抗体のIL-27上の同じエピトープへの結合である。本明細書において使用される時、当該用語は、本明細書において記載されるもの等の試験またはアッセイ(例えば競合結合アッセイ)において競合物質として有用な抗IL-27抗体を暗示し、当該アッセイは、同じエピトープへ結合する1つまたは複数の別個の抗体の探索、同定、または開発に有用である。
本明細書において使用される時、「特異的結合」、「選択的結合」、「選択的に結合する」、及び「特異的に結合する」という用語は、所定の抗原上のエピトープへの抗体の結合を指す。典型的には、抗体は、分析物として組み換えヒトIL-27を使用し、リガンドとして抗体を使用して、BIACORE 2000機器において表面プラズモン共鳴(SPR)技術によって決定された場合に、およそ10-6M未満(およそ10-7、10-8M、10-9M、もしくは10-10M未満、または場合によってはより低い等)の平衡解離定数(KD)で結合し、所定の抗原または非常によく関連する抗原以外の非特異的抗原(例えばBSA、カゼイン)への結合についての親和性よりも、少なくとも2倍高い親和性で、所定の抗原へ結合する。ある特定の態様において、IL-27へ特異的に結合する抗体は、分析物として組み換えヒトIL-27を使用し、リガンドとして抗体を使用して、BIACORE 2000機器において表面プラズモン共鳴(SPR)技術によって決定された場合に、およそ100nM(10-7M)未満、任意選択でおよそ50nM(5×10-8M)未満、任意選択でおよそ15nM(1.5×10-8M)未満、任意選択でおよそ10nM(10-8M)未満、任意選択でおよそ5nM(5×10-9M)未満、任意選択でおよそ1nM(10-9M)未満、任意選択でおよそ0.1nM(10-10M)未満、任意選択でおよそ0.01nM(10-11M)未満、または場合によってはより低い平衡解離定数(KD)で結合し、所定の抗原への結合は、所定の抗原または非常によく関連する抗原以外の非特異的抗原(例えばBSA、カゼイン)への結合についての抗体の親和性よりも、少なくとも2倍高い親和性で起こる。「抗原を認識する抗体」及び「抗原について特異的な抗体」という語句は、本明細書において、「抗原へ特異的に結合する抗体」という用語と互換的に使用される。
本明細書において使用される時、「STAT1リン酸化」という用語は、シグナル伝達兼転写活性化因子1(STAT1)ポリペプチド(ヒトにおいてSTAT1遺伝子によってコードされる転写因子)のリン酸化を指す。STAT分子は、受容体関連キナーゼによってリン酸化され、それが、ホモ二量体またはヘテロ二量体を形成することによって活性化及び二量体化を引き起こし、それらは核へ移動して転写因子として働く。STAT1は、複数のリガンド(IL-27が挙げられる)を介するシグナリングに応答して、活性化(すなわちリン酸化)され得る。IL-27Rを介するIL-27シグナリングは、STAT1のリン酸化(pSTAT1)をもたらす。STAT1は、細胞の生存、生存度、または病原体応答に関与する遺伝子発現において重要な役割を有する。IL-27シグナリングの結果としてのSTAT1リン酸化を決定する方法としては、リン酸化STAT1を特異的に認識する抗体により標識された細胞のフローサイトメトリーによる分析が挙げられるがこれらに限定されない(例えばTochizawa et al.,(2006)J Immunol Methods 313(1-2):29-37を参照)。
本明細書において使用される時、「STAT3リン酸化」という用語は、シグナル伝達兼転写活性化因子3(STAT3)ポリペプチド(ヒトにおいてSTAT3遺伝子によってコードされる転写因子)のリン酸化を指す。STAT3は、細胞刺激に応答して様々な遺伝子の発現を媒介し、したがって多くの細胞プロセス(細胞増殖及びアポトーシス等)において重要な役割を果たす。IL-27シグナリングの結果としてのSTAT3リン酸化を決定する方法としては、リン酸化STAT3を特異的に認識する抗体により標識された細胞または細胞抽出物の分析が挙げられるがこれらに限定されない(例えばFursov et al.,(2011)Assay Drug Dev Technol 9(4):420-429を参照)。
本明細書において使用される時、「スイッチ配列」という用語は、スイッチ組み換えを担うDNA配列を指す。「スイッチドナー」配列(典型的にはμスイッチ部位)は、スイッチ組み換えの間に欠失するコンストラクト領域の5’(すなわち上流)にあるだろう。「スイッチアクセプター」領域は、欠失することになるコンストラクト領域と置き換えられる定常領域(例えばγ、εなど)との間にあるだろう。組み換えが常に起こる特異的な部位がないので、最終的な遺伝子配列は、典型的には、コンストラクトから予測可能ではないだろう。
本明細書において使用される時、「対象」という用語は、任意のヒトまたは非ヒト動物を包含する。例えば、本発明の方法及び組成物は、免疫障害の有る対象の治療に使用され得る。「非ヒト動物」という用語は、すべての脊椎動物、例えば哺乳動物及び非哺乳動物(非ヒト霊長動物、ヒツジ、イヌ、ウシ、ニワトリ、両生動物、爬虫類動物等)を包含する。
核酸については、「実質的な相同性」という用語は、2つの核酸またはその指定の配列が、最適にアライメントされて比較された場合に、ヌクレオチドのうちの少なくとも約80%、ヌクレオチドのうちの通常少なくとも約90%~95%及びより好ましくは少なくとも約98%~99.5%で、適切なヌクレオチド挿入または欠失を伴って、同一であることを示す。代替的に、セグメントが、選択的ハイブリダイゼーション条件下でストランドの相補物へハイブリダイズする場合に、実質的な相同性は存在する。
2つの配列間のパーセント同一性は、2つの配列の最適なアライメントのために導入される必要のあるギャップの数及び各々のギャップの長さを考慮に入れて、配列によって共有される同一である位置の数の関数(すなわち%相同性=同一である位置の数/位置の総数×100)である。非限定的例において以下で記載されるように、配列の比較及び2つの配列間のパーセント同一性の決定は数学的アルゴリズムを使用して達成され得る。
2つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで利用可能)中のGAPのプログラムを使用して、NWSgapdna.CMPマトリックス、ならびに40、50、60、70、または80のギャップの重み付け、及び1、2、3、4、5、または6の長さの重み付けを使用して、決定され得る。2つのヌクレオチド配列またはアミノ酸配列間のパーセント同一性は、ALIGNプログラム(バージョン2.0)の中へ組込まれたE.Meyers and W.Miller(CABIOS,(1989))のアルゴリズムを使用して、PAM120重み付け残基表、12のギャップ長ペナルティ、及び4のギャップペナルティを使用しても、決定され得る。加えて、2つのアミノ酸配列間のパーセント同一性は、GCGソフトウェアパッケージ(http://www.gcg.comで入手可能)中のGAPプログラムの中へ組込まれたNeedleman and Wunsch(J.Mol.Biol.48:444-453(1970))アルゴリズムを使用して、Blossum 62マトリックスまたはPAM250マトリックスのいずれか、ならびに16、14、12、10、8、6、または4のギャップの重み付け、及び1、2、3、4、5、または6の長さの重み付けを使用して、決定され得る。
本開示の核酸及びタンパク質配列は、例えば関連配列を同定するために、公開データベースに対する検索を遂行するための「クエリ配列」としてさらに使用され得る。かかる検索は、Altschul,et al.(1990)J.Mol.Biol.215:403-10のNBLASTプログラム及びXBLASTプログラム(バージョン2.0)を使用して遂行され得る。BLASTヌクレオチド検索は、NBLASTプログラム、スコア=100、ワード長=12により遂行されて、本発明の核酸分子に相同なヌクレオチド配列を得ることができる。BLASTタンパク質検索は、XBLASTプログラム、スコア=50、ワード長=3により遂行されて、本発明のタンパク質分子に相同なアミノ酸配列を得ることができる。比較の目的のためのギャップを入れたアライメントを得るために、Gapped BLASTは、Altschul et al.,(1997)Nucleic Acids Res.25(17):3389-3402中で記載されるように利用され得る。BLASTプログラム及びGapped BLASTプログラムを利用する場合に、それぞれのプログラム(例えばXBLAST及びNBLAST)のデフォルトパラメーターが使用され得る。http://www.ncbi.nlm.nih.govを参照されたい。
核酸は、全細胞中に、細胞溶解物中に、または部分的に精製された形態もしくは実質的に純粋な形態で存在し得る。標準的技法(アルカリ/SDS処理、CsClバンディング、カラムクロマトグラフィー、アガロースゲル電気泳動、及び当技術分野において周知の他のものが挙げられる)によって、他の細胞構成要素または他の混入物質(例えば他の細胞核酸またはタンパク質)から精製される場合に、核酸は「単離されている」または「実質的に純粋である」。F.Ausubel,et al.,ed.Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing and Wiley Interscience,New York(1987)を参照されたい。
本開示の核酸組成物は、多くの場合ネイティブな配列(修飾された制限部位及び同種のものを除いて)であるが、遺伝子配列を提供する標準的技法に従って、cDNA、ゲノム、またはそれらの混合物のいずれかから突然変異し得る。コーディング配列については、これらの突然変異は、所望に応じてアミノ酸配列に影響し得る。特に、ネイティブなV、D、J、定常、スイッチ、及び本明細書において記載される他のかかる配列に実質的に相同であるか、またはそれらに由来する、DNA配列が企図される(ここで、「由来する」とは、ある配列が別の配列と同一であるかまたはそれから修飾されていることを示す)。
本明細書において使用される時、「STING」(代替的にTMEM173)という用語は、インターフェロン遺伝子の刺激因子(直接的な細胞質DNAセンサー及びアダプタータンパク質の両方として機能するタンパク質)を指す。ヒトにおいて、STINGは、TMEM173遺伝子によってコードされる。STINGは、先天性免疫において重要な役割を果たす。細胞が細胞内病原体(ウイルス、マイコバクテリア、及び細胞内寄生生物等)により感染される場合に、STINGは、タイプIインターフェロンの産生を誘導する。STINGによって媒介されたタイプIインターフェロンは、それを分泌する同じ細胞及び近傍の細胞へ結合することによって、感染した細胞及び近傍の細胞を局所感染から保護する。STINGについての例示的なアミノ酸配列は、アクセッション番号NP_001288667下でNCBI Genbankデータベースによって提供される。
「T細胞」という用語は、細胞表面上のT細胞受容体の存在によって他の白血球と区別され得るタイプの白血球を指す。T細胞には複数のサブセットがあり、当該サブセットとしては、Tヘルパー細胞(別名TH細胞またはCD4+T細胞)及びサブタイプ(TH1細胞、TH2細胞、TH3細胞、TH17細胞、TH9細胞、及びTFH細胞を包含する)、細胞傷害性T細胞(別名TC細胞、CD8+T細胞、細胞傷害性Tリンパ球、Tキラー細胞、キラーT細胞)、メモリーT細胞及びサブタイプ(セントラルメモリーT細胞(TCM細胞)及びエフェクターメモリーT細胞(TEM細胞及びTEMRA細胞)、及びレジデントメモリーT細胞(TRM細胞)を包含する)、調節性T細胞(別名Treg細胞またはサプレッサーT細胞)及びサブタイプ(CD4+FOXP3+Treg細胞、CD4+FOXP3-Treg細胞、Tr1細胞、Th3細胞、及びTreg17細胞を包含する)、ナチュラルキラーT細胞(別名NKT細胞)、粘膜関連インバリアントT細胞(MAIT)、ならびにVガンマデルタT細胞(γδT細胞)(γ9/Vδ2 T細胞を包含する)が挙げられるがこれらに限定されない。前述されないかまたは言及されないT細胞のうちの任意の1つまたは複数は、本発明の使用法のための標的細胞タイプであり得る。
本明細書において使用される時、「T細胞媒介性応答」という用語は、エフェクターT細胞(例えばCD8+細胞)及びヘルパーT細胞(例えばCD4+細胞)が挙げられるがこれらに限定されない、T細胞によって媒介される任意の応答を指す。T細胞媒介性応答としては、例えばT細胞の細胞傷害性及び分裂増殖が挙げられる。
本明細書において使用される時、「治療有効量」もしくは「治療有効用量」という用語、または本明細書において使用される類似する用語は、所望の生物学的応答または医学的応答(例えばがんの1つまたは複数の症状の改善)を惹起する薬剤(例えば抗IL-27抗体またはその抗原結合断片)の量を意味するように意図される。
本明細書において使用される時、「TAM受容体」という用語は、TAM受容体タンパク質チロシンキナーゼ(TYRO3、AXL、及びMER)を指す。TAM受容体は、免疫系恒常性の調節に関与する。がんの状況において、TAM受容体は、二重調節性の役割(腫瘍発生の開始及び進行の制御、ならびに同時に多様な免疫細胞の関連する抗腫瘍応答の制御)を有する。TAM受容体のさらなる記載は、Paolino and Penninger(2016)Cancers 8(97):doi:10.3390/cancers8100097)中で見出される。本明細書において使用される時、「TAM受容体阻害物質」または「TAM阻害物質」という用語は、TAM受容体の機能または活性を阻害、ブロック、または低減する薬剤を指す。
本明細書において使用される時、「TIGIT」または「Ig及びITIMドメインを持つT細胞免疫受容体」という用語は、別段の指示のない限り、霊長動物(例えばヒト)及び齧歯動物(例えばマウス及びラット)等の哺乳動物を包含する、任意の脊椎動物供給源からの任意のネイティブなTIGITを指す。TIGITは、DKFZp667A205、FLJ39873、Vセット・免疫グロブリンドメイン含有タンパク質9、Vセット・膜貫通ドメイン含有タンパク質3、VSIG9、VSTM3、及びWUCAMとしても当技術分野において公知である。当該用語は、TIGITの天然に存在するバリアント(例えばスプライスバリアントまたは対立遺伝子バリアント)も網羅する。例示的なヒトTIGITのアミノ酸配列は、UniProtアクセッション番号Q495A1下で見出され得る。
「治療する」「治療すること」、及び「治療」という用語は、本明細書において使用される時、本明細書において記載される治療的処置または予防的処置を指す。「治療」の方法は、障害もしくは再発性の障害の1つもしくは複数の症状を予防、治癒、遅延、当該症状の重症度を低減、もしくは当該症状を改善するために、またはかかる治療の非存在下において予想されたものを超えて対象の生存を延長するために、かかる治療を必要とする対象(例えば特定の抗原に対する免疫応答の促進を必要とする対象、または最終的にかかる障害を取得し得る対象)へ、本開示のヒト抗体を投与することを採用する。
本明細書において使用される時、「腫瘍微小環境」(代替的に「がん微小環境」;短縮でTME)という用語は、腫瘍または新生物が存在する、周囲の血管そして非がん性細胞(免疫細胞、線維芽細胞、骨髄由来炎症細胞、及びリンパ球が挙げられるがこれらに限定されない)を含む細胞の環境(environment)または環境(milieu)を指す。シグナリング分子及び細胞外マトリックスも、TMEを構成する。腫瘍及び周囲の微小環境は密接に関係し、常時相互作用する。腫瘍は、細胞外シグナルを放出し、腫瘍血管形成を増進し、末梢性免疫寛容を誘導することによって、微小環境に影響を及ぼし得る一方で、微小環境中の免疫細胞は、腫瘍細胞の増殖及び発達に影響し得る。
本明細書において使用される時、「再構成されていない」または「生殖細胞系列での立体配置」という用語は、VセグメントがDまたはJセグメントにすぐ隣接するようは組み換えられていない立体配置を指す。
本明細書において使用される時、「ベクター」という用語は、それが連結された別の核酸を輸送することが可能な核酸分子を指すように意図される。1つのタイプのベクターは「プラスミド」であり、これは、追加のDNAセグメントがライゲーションされ得る環状二本鎖DNAループを指す。別のタイプのベクターはウイルスベクターであり、追加のDNAセグメントはウイルスゲノムの中へライゲーションされ得る。ある特定のベクターは、それらが導入される宿主細胞中で自律的複製が可能である(例えば細菌性複製起点を有する細菌ベクター及びエピソーム性哺乳動物ベクター)。他のベクター(例えば非エピソーム性哺乳類ベクター)は、宿主細胞の中への導入に際して宿主細胞のゲノムの中へ組み込まれ得て、それによって宿主ゲノムと一緒に複製される。さらに、ある特定のベクターは、それらが作動するように連結された遺伝子の発現を指令することができる。かかるベクターは、「組み換え発現ベクター」または単純に「発現ベクター」と本明細書において称される。概して、組み換えDNA技法において有用な発現ベクターは、多くの場合プラスミドの形態である。本明細書において、プラスミドがベクターの最も一般に使用される形態であるので、「プラスミド」及び「ベクター」は互換的に使用され得る。しかしながら、本発明は、ウイルスベクター等の同等の機能を供する他の形態の発現ベクター(例えば複製欠損レトロウイルス、アデノウイルス、及びアデノ随伴ウイルス)を包含することが意図される。
別段定義されない限り、本明細書において使用されるすべての技術用語及び科学用語は、本開示が属する技術分野の当業者によって共通して理解されるものと同じ意味を有する。好ましい方法及び材料が以下に記載されるが、本明細書において記載されるものに類似または同等の方法及び材料も、本明細書において開示される方法及び組成物の実践または試験において使用され得る。本明細書において言及されるすべての出版物、特許出願、特許、及び他の参照文献は、参照することによってそれらの全体が援用される。
本開示は、少なくとも部分的に、高親和性且つ特異性を備えたヒトIL-27p28上の特異的なエピトープへ結合する抗体分子を提供する。「IL-27」及び「IL27」という用語は、本明細書において使用される時、2つの異なる遺伝子(Epstein-Barr誘導遺伝子3(EBI3)、及びIL-27p28)によってコードされる、2つの別個のサブユニットからなる、ヘテロ二量体サイトカインIL-27を互換的に指す。IL-27は、炎症促進性及び抗炎症性の両方の特性を有し、造血細胞及び非造血細胞に対する多様な効果がある。
したがって、一態様において、本開示は、単離されたヒトIL-27へ特異的に結合しアンタゴナイズする、抗体またはその抗原結合部分であって、本明細書において開示されるエピトープへ特異的に結合し、以下の特性:
(i)15nM以下の平衡解離定数(KD)でヒトIL-27へ結合する;
(ii)IL-27受容体へのIL-27の結合をブロックする;
(iii)細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する;
(iv)細胞におけるCD161発現のIL-27媒介性阻害を阻害または低減する;
(v)細胞におけるIL-27媒介性のPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する;
(vi)1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する;ならびに
(vii)(i)~(vi)の組み合わせ、
のうちの少なくとも1つまたは複数を呈する、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)15nM以下の平衡解離定数(KD)でヒトIL-27へ結合する;
(ii)IL-27受容体へのIL-27の結合をブロックする;
(iii)細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する;
(iv)細胞におけるCD161発現のIL-27媒介性阻害を阻害または低減する;
(v)細胞におけるIL-27媒介性のPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する;
(vi)1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する;ならびに
(vii)(i)~(vi)の組み合わせ、
のうちの少なくとも1つまたは複数を呈する、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
本発明の追加の態様は、抗体分子をコードする核酸分子、発現ベクター、宿主細胞、及び抗体分子の作製のための方法を含む。免疫コンジュゲート、多重特異性または二重特異性の分子、及び抗体分子を含む医薬組成物も提供される。本明細書において開示される抗IL-27抗体分子は、がん性または悪性の障害、例えば固形腫瘍及び液性腫瘍(例えば白血病、例えばリンパ腫、例えばAML)、肺癌(例えば非小細胞肺癌)、膵臓癌、乳癌(例えばトリプルネガティブ乳癌)、黒色腫、精巣癌、肉腫、頭頸部癌(例えば頭頸部扁平上皮癌)、肝臓癌(例えば肝細胞癌(HCC))、結腸直腸癌、卵巣癌、脳腫瘍(例えば多形性グリオブラストーマ)、または腎臓癌(例えば腎細胞癌、例えば腎明細胞癌)の治療、予防、及び/または診断に使用され得る。
抗IL-27抗体及びその抗原結合断片
本開示は、IL-27p28へ特異的に結合し、IL-27(特にヒトIL-27)をアンタゴナイズする抗体及びその抗原結合部分を提供する。
本開示は、IL-27p28へ特異的に結合し、IL-27(特にヒトIL-27)をアンタゴナイズする抗体及びその抗原結合部分を提供する。
本開示は、ヒトIL-27をアンタゴナイズする、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、(i)配列番号2(IL-27p28)に対応するアミノ酸37~56、(ii)配列番号2(IL-27p28)に対応するアミノ酸142~164、または(iii)(i)及び(ii)の両方、のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、前記抗体またはその抗原結合部分に関する。いくつかの態様において、ヒトIL-27をアンタゴナイズする本開示の単離された抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、またはGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のAsp146、Arg149、及び/またはPhe153を含むエピトープへ特異的に結合する。いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のAsp146、Arg149、及びPhe153を含むエピトープへ特異的に結合する。いくつかの態様において、エピトープは、配列番号2(IL-27p28)のAsp146、Arg149、His150、及びPhe153を含む。いくつかの態様において、エピトープは、配列番号2(IL-27p28)のAsp146、Arg149、Phe153、及びLeu156を含む。いくつかの態様において、エピトープは、配列番号2(IL-27p28)のAsp146、Arg149、His150、Phe153、及びLeu156を含む。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のLeu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、及びGlu164を含むエピトープへ特異的に結合する。いくつかの態様において、エピトープは、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Asp146、Arg149、His150、Phe153、及びLeu156を含む。いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、及びGlu164を含むエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のLeu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164を含むエピトープへ特異的に結合する。いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGlu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、及びGlu164を含むエピトープへ特異的に結合する。いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164を含むエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164からなるかまたは本質的になるエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164、ならびに配列番号2(IL-27p28)のLeu53、Lys56、Asp143、Leu147、Arg152、Ala157、Gly159、Phe160、またはAsn161からなる群から選択される少なくとも1つの残基を含むエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164、ならびに配列番号2(IL-27p28)のLeu53、Lys56、Asp143、Arg145、Leu147、Arg152、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、またはPro163からなる群から選択される少なくとも1つの残基を含むエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、及びGlu164からなるかまたは本質的になるエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示の抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164からなるかまたは本質的になるエピトープへ特異的に結合する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合し、ヒトIL-27をアンタゴナイズする、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、以下の特性:(i)15nM以下の平衡解離定数(KD)でヒトIL-27へ結合する;(ii)IL-27受容体へのIL-27の結合をブロックする;(iii)細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する;(iv)細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する;(v)細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する;(vi)1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する;ならびに(vii)(i)~(vi)の組み合わせ、のうちの少なくとも1つまたは複数を呈する、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、配列番号2(ヒトIL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸のエピトープへ15nM以下の平衡解離定数(KD)で結合する。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、組み換えヒトIL-27p28へ、またはマウスIL-27p28へ結合する。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する。いくつかの態様において、細胞は、免疫細胞である。いくつかの態様において、細胞は、がん細胞である。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する(例えば、細胞におけるCD161発現の阻害を改善または軽減する)。いくつかの態様において、細胞は、免疫細胞である。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する。いくつかの態様において、PD-L1発現は、阻害または低減される。いくつかの態様において、TIM-3発現は、阻害または低減される。いくつかの態様において、PD-L1発現及びTIM-3の両方の発現は、低減される。いくつかの態様において、細胞は、免疫細胞である。いくつかの態様において、抗体は、モノクローナル抗体である。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する。いくつかの態様において、1つまたは複数のサイトカインは、TNFαである。いくつかの態様において、1つまたは複数のサイトカインは、IL-6である。いくつかの態様において、1つまたは複数のサイトカインは、TNFα及びIL-6である。いくつかの態様において、細胞は、免疫細胞である。
いくつかの態様において、単離された抗体またはその抗原結合部分は、IgG1抗体、IgG2抗体、IgG3抗体、IgG4抗体、IgM抗体、IgA1抗体、IgA2抗体、IgD抗体、及びIgE抗体からなる群から選択される。いくつかの態様において、抗体は、IgG1抗体またはIgG4抗体である。いくつかの態様において、抗体は、野生型IgG1重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、抗体は、野生型IgG4重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、抗体は、少なくとも1つの突然変異を含むFcドメインを含む。いくつかの態様において、抗体は、突然変異IgG1重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、抗体は、突然変異IgG4重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、突然変異IgG4重鎖定常領域は、EUナンバリングに従って、置換S228P、L235E、L235A、またはそれらの組み合わせのうちの任意の1つを含む。
いくつかの態様において、本開示は、前述の態様のうちの任意の1つに記載の抗体またはその抗原結合部分と実質的に同じIL-27上のエピトープへ結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、前述の態様のうちの任意の1つに記載の抗体またはその抗原結合部分によって結合される、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164からなる群から選択されるアミノ酸残基から少なくとも1つへ結合する単離された抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分によって結合される、エピトープ(配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164)の突然変異が、抗体またはその抗原結合部分への結合、及び前述の態様のうちの任意の1つに記載の抗体またはその抗原結合部分への結合の両方を阻害、低減、またはブロックする、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、軽鎖CDR1は、N-XXXXXXLFSSNXKXYXX-Cからなる。いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、軽鎖CDR3は、N-XXXASAXXX-Cからなる。いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR2は、N-XXSSSXSYXYXXXXXXX-Cからなる。いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR3は、N-XXXXGRTSYTATXHNXXXX-Cからなり、配列中、Xは、任意のアミノ酸である。
いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、軽鎖CDR1は、N-XXXXXXLFSSNXKXYXX-Cからなり、軽鎖CDR3は、N-XXXASAXXX-Cからなる。いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR2は、N-XXSSSXSYXYXXXXXXX-Cからなり、重鎖CDR3は、N-XXXXGRTSYTATXHNXXXX-Cからなり、配列中、Xは、任意のアミノ酸である。
いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合部分は、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、軽鎖CDR1は、N-XXXXXXLFSSNXKXYXX-Cからなり、軽鎖CDR3は、N-XXXASAXXX-Cからなり、重鎖CDR2は、N-XXSSSXSYXYXXXXXXX-Cからなり、重鎖CDR3は、N-XXXXGRTSYTATXHNXXXX-Cからなり、配列中、Xは、任意のアミノ酸である。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)配列番号9、10、及び11でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号17、18、及び19でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号31、32、及び33でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号39、40、及び41でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号53、54、及び55でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号61、62、及び63でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号75、76、及び77でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号83、84、及び85でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号97、98、及び99でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号105、106、及び107でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号119、120、及び121でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)配列番号9、10、及び11でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号17、18、及び19でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号31、32、及び33でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号39、40、及び41でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号53、54、及び55でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号61、62、及び63でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号75、76、及び77でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号83、84、及び85でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号97、98、及び99でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号105、106、及び107でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号119、120、及び121でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164を含むかまたはそれらなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)配列番号9、10、及び11でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号17、18、及び19でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号31、32、及び33でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号39、40、及び41でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号53、54、及び55でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号61、62、及び63でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号75、76、及び77でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号83、84、及び85でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号97、98、及び99でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号105、106、及び107でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号119、120、及び121でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)配列番号9、10、及び11でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号17、18、及び19でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号31、32、及び33でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号39、40、及び41でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号53、54、及び55でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号61、62、及び63でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号75、76、及び77でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号83、84、及び85でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号97、98、及び99でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号105、106、及び107でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号119、120、及び121でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164を含むかまたはそれらからなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)配列番号9、10、及び11でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号17、18、及び19でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号31、32、及び33でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号39、40、及び41でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号53、54、及び55でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号61、62、及び63でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号75、76、及び77でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号83、84、及び85でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号97、98、及び99でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号105、106、及び107でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号119、120、及び121でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)配列番号9、10、及び11でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号17、18、及び19でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号31、32、及び33でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号39、40、及び41でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号53、54、及び55でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号61、62、及び63でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号75、76、及び77でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号83、84、及び85でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号97、98、及び99でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号105、106、及び107でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号119、120、及び121でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)配列番号12、13、及び14でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号20、21、及び22でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号34、35、及び36でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号42、43、及び44でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号56、57、及び58でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号64、65、及び66でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号78、79、及び80でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号86、88、及び89でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号100、101、及び102でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号108、109、及び110でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号122、123、及び124でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)配列番号12、13、及び14でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号20、21、及び22でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号34、35、及び36でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号42、43、及び44でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号56、57、及び58でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号64、65、及び66でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号78、79、及び80でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号86、88、及び89でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号100、101、及び102でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号108、109、及び110でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号122、123、及び124でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164を含むかまたはそれらなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)配列番号12、13、及び14でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号20、21、及び22でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号34、35、及び36でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号42、43、及び44でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号56、57、及び58でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号64、65、及び66でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号78、79、及び80でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号86、88、及び89でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号100、101、及び102でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号108、109、及び110でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号122、123、及び124でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)配列番号12、13、及び14でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号20、21、及び22でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号34、35、及び36でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号42、43、及び44でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号56、57、及び58でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号64、65、及び66でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号78、79、及び80でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号86、88、及び89でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号100、101、及び102でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号108、109、及び110でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号122、123、及び124でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164を含むかまたはそれらからなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)配列番号12、13、及び14でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号20、21、及び22でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号34、35、及び36でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号42、43、及び44でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号56、57、及び58でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号64、65、及び66でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号78、79、及び80でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号86、88、及び89でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号100、101、及び102でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号108、109、及び110でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号122、123、及び124でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)配列番号12、13、及び14でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号20、21、及び22でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号34、35、及び36でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号42、43、及び44でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号56、57、及び58でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号64、65、及び66でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号78、79、及び80でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号86、88、及び89でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号100、101、及び102でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号108、109、及び110でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号122、123、及び124でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR1が、N-GFTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]-C(配列番号144)からならない、及び/または、重鎖CDR2が、N-ISSS[S/G][S/A]YI-C(配列番号146)からならない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164を含むかまたはそれらなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR1が、N-GFTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]-C(配列番号144)からならない、及び/または、重鎖CDR2が、N-ISSS[S/G][S/A]YI-C(配列番号146)からならない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164を含むかまたはそれらからなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR1が、N-GFTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]-C(配列番号144)からならない、及び/または、重鎖CDR2が、N-ISSS[S/G][S/A]YI-C(配列番号146)からならない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR1が、N-FTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]MN-C(配列番号148)を含まない、及び/または、重鎖CDR2が、N-[G/S]ISSS[S/G][S/A]YI[L/Y]YADSVKG-C(配列番号149)を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164を含むかまたはそれらなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR1が、N-FTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]MN-C(配列番号148)を含まない、及び/または、重鎖CDR2が、N-[G/S]ISSS[S/G][S/A]YI[L/Y]YADSVKG-C(配列番号149)を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164を含むかまたはそれらからなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、重鎖CDR1が、N-FTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]MN-C(配列番号148)を含まない、及び/または、重鎖CDR2が、N-[G/S]ISSS[S/G][S/A]YI[L/Y]YADSVKG-C(配列番号149)を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)からなる重鎖CDR2、及び配列番号121で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(ii)N-FTFXXXXMN-C(配列番号150)からなる重鎖CDR1、N-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)からなる重鎖CDR2、及び配列番号124で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)からなる重鎖CDR2、及び配列番号121で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(ii)N-FTFXXXXMN-C(配列番号150)からなる重鎖CDR1、N-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)からなる重鎖CDR2、及び配列番号124で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164を含むかまたはそれらなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)からなる重鎖CDR2、及び配列番号121で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(ii)N-FTFXXXXMN-C(配列番号150)からなる重鎖CDR1、N-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)からなる重鎖CDR2、及び配列番号124で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)からなる重鎖CDR2、及び配列番号121で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(ii)N-FTFXXXXMN-C(配列番号150)からなる重鎖CDR1、N-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)からなる重鎖CDR2、及び配列番号124で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164を含むかまたはそれらからなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、
(i)N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)からなる重鎖CDR2、及び配列番号121で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(ii)N-FTFXXXXMN-C(配列番号150)からなる重鎖CDR1、N-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)からなる重鎖CDR2、及び配列番号124で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)からなる重鎖CDR2、及び配列番号121で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(ii)N-FTFXXXXMN-C(配列番号150)からなる重鎖CDR1、N-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)からなる重鎖CDR2、及び配列番号124で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-IXXXXXXX-C(配列番号152)からなる重鎖CDR2、及びN-AR[X]n=6-15DX-C(配列番号153)からなる重鎖CDR3配列;ならびにN-QS[X]n=1-3SS[X]n=0-4Y-C(配列番号154)からなる軽鎖CDR1、N-XXS-C(配列番号155)からなる軽鎖CDR2、及びN-QQXXXXP[X]n=0-1T-C(配列番号156)からなる軽鎖CDR3配列を、それぞれ含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164を含むかまたはそれらなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-IXXXXXXX-C(配列番号152)からなる重鎖CDR2、及びN-AR[X]n=6-15DX-C(配列番号153)からなる重鎖CDR3配列;ならびにN-QS[X]n=1-3SS[X]n=0-4Y-C(配列番号154)からなる軽鎖CDR1、N-XXS-C(配列番号155)からなる軽鎖CDR2、及びN-QQXXXXP[X]n=0-1T-C(配列番号156)からなる軽鎖CDR3配列を、それぞれ含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164を含むかまたはそれらからなるエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-IXXXXXXX-C(配列番号152)からなる重鎖CDR2、及びN-AR[X]n=6-15DX-C(配列番号153)からなる重鎖CDR3配列;ならびにN-QS[X]n=1-3SS[X]n=0-4Y-C(配列番号154)からなる軽鎖CDR1、N-XXS-C(配列番号155)からなる軽鎖CDR2、及びN-QQXXXXP[X]n=0-1T-C(配列番号156)からなる軽鎖CDR3配列を、それぞれ含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、重鎖可変領域が、配列番号15、37、59、81、103、及び125からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まず;軽鎖可変領域が、配列番号23、45、67、89、111、及び133からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域が、
(i)それぞれ配列番号15及び65;
(ii)それぞれ配列番号37及び45;
(iii)それぞれ配列番号59及び67;
(iv)それぞれ配列番号81及び89;
(v)それぞれ配列番号103及び111;及び
(vi)それぞれ配列番号125及び133、
からなる群から選択されるアミノ酸配列ではない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)それぞれ配列番号15及び65;
(ii)それぞれ配列番号37及び45;
(iii)それぞれ配列番号59及び67;
(iv)それぞれ配列番号81及び89;
(v)それぞれ配列番号103及び111;及び
(vi)それぞれ配列番号125及び133、
からなる群から選択されるアミノ酸配列ではない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、重鎖可変領域が、配列番号15、37、59、81、103、及び125からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まず;軽鎖可変領域が、配列番号23、45、67、89、111、及び133からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域を含み、重鎖可変領域及び軽鎖可変領域が、
(i)それぞれ配列番号15及び65;
(ii)それぞれ配列番号37及び45;
(iii)それぞれ配列番号59及び67;
(iv)それぞれ配列番号81及び89;
(v)それぞれ配列番号103及び111;及び
(vi)それぞれ配列番号125及び133、
からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)それぞれ配列番号15及び65;
(ii)それぞれ配列番号37及び45;
(iii)それぞれ配列番号59及び67;
(iv)それぞれ配列番号81及び89;
(v)それぞれ配列番号103及び111;及び
(vi)それぞれ配列番号125及び133、
からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖が、配列番号25、47、69、91、113、及び135からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まず;軽鎖が、配列番号20、42、71、93、及び1115からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖が、配列番号25、47、69、91、113、及び135からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まず;軽鎖が、配列番号20、42、71、93、及び115からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖が、配列番号29、51、73、95、117、及び139からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まず;軽鎖が、配列番号71、49、71、93、115、及び137からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖が、配列番号29、51、73、95、117、及び139からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まず;軽鎖が、配列番号71、49、71、93、115、及び137からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖及び軽鎖が、
(i)それぞれ配列番号25及び27;
(ii)それぞれ配列番号47及び49;
(iii)それぞれ配列番号69及び71;
(iv)それぞれ配列番号91及び93;
(v)それぞれ配列番号113及び115;及び
(vi)それぞれ配列番号135及び137、
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)それぞれ配列番号25及び27;
(ii)それぞれ配列番号47及び49;
(iii)それぞれ配列番号69及び71;
(iv)それぞれ配列番号91及び93;
(v)それぞれ配列番号113及び115;及び
(vi)それぞれ配列番号135及び137、
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖及び軽鎖が、
(i)それぞれ配列番号25及び27;
(ii)それぞれ配列番号47及び49;
(iii)それぞれ配列番号69及び71;
(iv)それぞれ配列番号91及び93;
(v)それぞれ配列番号113及び115;及び
(vi)それぞれ配列番号135及び137、
からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)それぞれ配列番号25及び27;
(ii)それぞれ配列番号47及び49;
(iii)それぞれ配列番号69及び71;
(iv)それぞれ配列番号91及び93;
(v)それぞれ配列番号113及び115;及び
(vi)それぞれ配列番号135及び137、
からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖及び軽鎖が、
(i)それぞれ配列番号29及び27;
(ii)それぞれ配列番号51及び49;
(iii)それぞれ配列番号73及び72;
(iv)それぞれ配列番号95及び93;
(v)それぞれ配列番号117及び115;及び
(vi)それぞれ配列番号139及び137、
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)それぞれ配列番号29及び27;
(ii)それぞれ配列番号51及び49;
(iii)それぞれ配列番号73及び72;
(iv)それぞれ配列番号95及び93;
(v)それぞれ配列番号117及び115;及び
(vi)それぞれ配列番号139及び137、
からなる群から選択されるアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、IL-27をアンタゴナイズし、配列番号2(IL27-p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、抗体またはその抗原結合部分が、重鎖及び軽鎖を含み、重鎖及び軽鎖が、
(i)それぞれ配列番号29及び27;
(ii)それぞれ配列番号51及び49;
(iii)それぞれ配列番号73及び72;
(iv)それぞれ配列番号95及び93;
(v)それぞれ配列番号117及び115;及び
(vi)それぞれ配列番号139及び137、
からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
(i)それぞれ配列番号29及び27;
(ii)それぞれ配列番号51及び49;
(iii)それぞれ配列番号73及び72;
(iv)それぞれ配列番号95及び93;
(v)それぞれ配列番号117及び115;及び
(vi)それぞれ配列番号139及び137、
からなる群から選択されるアミノ酸配列に少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含まない、前記抗体またはその抗原結合部分を提供する。
抗IL-27抗体及びその抗原結合断片を産生するための方法
本開示は、本明細書において記載される抗IL-27抗体またはその抗原結合断片の任意のものを産生するための方法も特色とする。いくつかの態様において、本明細書において記載される抗体を調製するための方法は、適切な免疫原により対象(例えば非ヒト哺乳動物)を免疫することを含み得る。本明細書において記載される抗体のうちの任意のものを生成するために好適な免疫原は本明細書において説明される。例えば、IL-27p28へ結合する抗体を生成するために、当業者は、IL-27により好適な対象(例えばラット、マウス、アレチネズミ、ハムスター、イヌ、ネコ、ブタ、ヤギ、ウマ、または非ヒト霊長動物等の非ヒト哺乳動物)を免疫することができる。いくつかの態様において、配列番号2で示されるアミノ酸配列を含む全長ヒトIL-27p28単量体ポリペプチドは、免疫原として使用される。
本開示は、本明細書において記載される抗IL-27抗体またはその抗原結合断片の任意のものを産生するための方法も特色とする。いくつかの態様において、本明細書において記載される抗体を調製するための方法は、適切な免疫原により対象(例えば非ヒト哺乳動物)を免疫することを含み得る。本明細書において記載される抗体のうちの任意のものを生成するために好適な免疫原は本明細書において説明される。例えば、IL-27p28へ結合する抗体を生成するために、当業者は、IL-27により好適な対象(例えばラット、マウス、アレチネズミ、ハムスター、イヌ、ネコ、ブタ、ヤギ、ウマ、または非ヒト霊長動物等の非ヒト哺乳動物)を免疫することができる。いくつかの態様において、配列番号2で示されるアミノ酸配列を含む全長ヒトIL-27p28単量体ポリペプチドは、免疫原として使用される。
好適な対象(例えば非ヒト哺乳動物)は、哺乳動物による抗体の産生を惹起するのに十分な回数で、後続の追加免疫を伴って、適切な抗原により免疫され得る。免疫原は、アジュバントと共に対象(例えば非ヒト哺乳動物)へ投与され得る。対象における抗体の産生において有用なアジュバントとしては、タンパク質アジュバント;細菌アジュバント、例えば全細菌(BCG、Corynebacterium parvumまたはSalmonella minnesota)及び細菌構成要素(細胞壁骨格、トレハロースジミコレート、モノホスホリルリピドA、結核菌のメタノール抽出残渣(MER)、完全フロイントアジュバントまたは不完全フロイントアジュバントが挙げられる);ウイルスアジュバント;化学的アジュバント(例えば水酸化アルミニウム、ならびにヨード酢酸及びヘミコハク酸コレステリル)が挙げられるがこれらに限定されない。免疫応答を誘導するための方法に使用され得る他のアジュバントとしては、例えばコレラ毒素及びパラポックスのタンパク質が挙げられる。Bieg et al.(1999)Autoimmunity 31(1):15-24も参照されたい。例えばLodmell et al.(2000)Vaccine 18:1059-1066;Johnson et al.(1999)J Med Chem 42:4640-4649;Baldridge et al.(1999)Methods 19:103-107;及びGupta et al.(1995)Vaccine 13(14):1263-1276も参照されたい。
いくつかの態様において、方法は、免疫原へ結合するモノクローナル抗体を分泌するハイブリドーマ細胞株を調製することを含む。例えば、好適な哺乳動物(研究用マウス等)は、IL-27ポリペプチドにより上で記載されるように免疫される。免疫された哺乳動物の抗体産生細胞(例えば脾臓のB細胞)は、免疫原の少なくとも1回の追加免疫の2~4日後に単離され、次いで短時間培養させてから、好適な骨髄腫細胞株の細胞と融合され得る。細胞は、融合促進因子(例えばワクシニアウイルスまたはポリエチレングリコール等)の存在下において融合され得る。融合で得られたハイブリッド細胞はクローン化され、所望の抗体を分泌する細胞クローンが選択される。例えば、好適な免疫原により免疫されたBalb/c研究用マウスの脾臓細胞は、骨髄腫細胞株PAI細胞または骨髄腫細胞株Sp2/0-Ag14細胞と融合され得る。融合後に、正常な骨髄腫細胞が所望のハイブリドーマ細胞を超えて増殖することを防止するために、細胞は、選択培地(例えばHAT培養液)を一定間隔で補足する好適な培養培地中で増幅される。次いで得られたハイブリッド細胞は、所望の抗体(例えばヒトIL-27へ結合する抗体)の分泌についてスクリーニングされ、いくつかの態様において、当業者は、例えば米国特許第6,300,064号(Knappik et al.;Morphosys AG)及びSchoonbroodt et al.(2005)Nucleic Acids Res 33(9):e81中で記載されるように、非免疫バイアスライブラリーから抗IL-27抗体を同定し得る。
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法は、例えばファージディスプレイ技術、細菌ディスプレイ、酵母表面ディスプレイ、真核生物のウイルスディスプレイ、哺乳動物細胞ディスプレイ、及び無細胞(例えばリボソームディスプレイ)抗体スクリーニング技法を含み得るか、またはそれらと共に使用され得る(例えばEtz et al.(2001)J Bacteriol 183:6924-6935;Cornelis(2000)Curr Opin Biotechnol 11:450-454;Klemm et al.(2000)Microbiology 146:3025-3032;Kieke et al.(1997)Protein Eng 10:1303-1310;Yeung et al.(2002)Biotechnol Prog 18:212-220;Boder et al.(2000)Methods Enzymology 328:430-444;Grabherr et al.(2001)Comb Chem High Throughput Screen 4:185-192;Michael et al.(1995)Gene Ther 2:660-668;Pereboev et al.(2001)J Virol 75:7107-7113;Schaffitzel et al.(1999)J Immunol Methods 231:119-135;及びHanes et al.(2000)Nat Biotechnol 18:1287-1292を参照)。
様々なファージディスプレイ方法を使用して抗体を同定するための方法は、当技術分野において公知である。ファージディスプレイ方法において、機能的抗体ドメインは、それらをコードするポリヌクレオチド配列を運搬するファージ粒子の表面上で提示される。かかるファージは、レパートリーライブラリーまたはコンビナトリアル抗体ライブラリー(例えばヒトまたはマウスの)から発現された抗体(Fab、Fv、またはジスルフィド結合安定化Fv抗体断片等)の抗原結合ドメインの提示に利用され得る。これらの方法において使用されるファージは、典型的には線状ファージ(fd及びM13等)である。抗原結合ドメインは、ファージコートタンパク質pIII、pVIII、またはpIXのうちの任意のものへ組み換えにより融合されたタンパク質として発現される。例えばShi et al.(2010)JMB 397:385-396を参照されたい。本明細書において記載される免疫グロブリンまたはその断片の作製に使用され得るファージディスプレイ方法の例としては、Brinkman et al.(1995)J Immunol Methods 182:41-50;Ames et al.(1995)J Immunol Methods 184:177-186;Kettleborough et al.(1994)Eur J Immunol 24:952-958;Persic et al.(1997)Gene 187:9-18;Burton et al.(1994)Advances in Immunology 57:191-280;ならびにPCT公開番号WO90/02809、同WO91/10737、同WO92/01047、同WO92/18619、同WO93/11236、同WO95/15982、及び同WO95/20401中で開示されるものが挙げられる。好適な方法は、例えば米国特許第5,698,426号;同第5,223,409号;同第5,403,484号;同第5,580,717号;同第5,427,908号;同第5,750,753号;同第5,821,047号;同第5,571,698号;同第5,427,908号;同第5,516,637号;同第5,780,225号;同第5,658,727号;同第5,733,743号及び同第5,969,108号中でも記載される。
いくつかの態様において、ファージディスプレイ抗体ライブラリーは、免疫された哺乳動物からのB細胞から収集されたmRNAを使用して生成され得る。例えば、B細胞を含む脾細胞サンプルは、IL-27ポリペプチドにより上で記載されるように免疫された研究用マウスから単離され得る。mRNAは細胞から単離され、標準的分子生物学技法を使用してcDNAへ変換され得る。例えばSambrook et al.(1989)“Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2nd Edition,”Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.;Harlow and Lane(1988)、前掲;Benny K.C.Lo(2004)、前掲;及びBorrebaek(1995)、前掲を参照されたい。免疫グロブリンの重鎖及び軽鎖の可変領域ポリペプチドについてのcDNAコーディングは、ファージディスプレイライブラリーの構築に使用される。かかるライブラリーを生成するための方法は、例えばMerz et al.(1995)J Neurosci Methods 62(1-2):213-9;Di Niro et al.(2005)Biochem J 388(Pt 3):889-894;及びEngberg et al.(1995)Methods Mol Biol 51:355-376中で記載される。
いくつかの態様において、選択及びスクリーニングの組み合わせは、例えばハイブリドーマ由来抗体の集団またはファージディスプレイ抗体ライブラリーからの関心の抗体の同定に利用され得る。好適な方法は当技術分野において公知であり、例えばHoogenboom(1997)Trends in Biotechnology 15:62-70;Brinkman et al.(1995)、前掲;Ames et al.(1995)、前掲;Kettleborough et al.(1994)、前掲;Persic et al.(1997)、前掲;及びBurton et al.(1994)、前掲中で記載される。例えば、複数のファージミドベクター(各々は、バクテリオファージコートタンパク質(例えばM13ファージのpIII、pVIII、またはpIX)及び異なる抗原を組み合わせた領域の融合タンパク質をコードする)は、標準的分子生物学技法を使用して産生され、次いで細菌(例えばE.coli)の集団の中へ導入される。細菌におけるバクテリオファージの発現は、いくつかの態様において、ヘルパーファージの使用を要求し得る。いくつかの態様において、ヘルパーファージは要求されない(例えばChasteen et al.,(2006)Nucleic Acids Res 34(21):e145を参照)。細菌から産生されたファージは回収され、次いで例えば固体支持体へ結合された(固定化された)標的抗原へ接触させる。ファージは溶液中の抗原へも接触され得、後続して複合体は固体支持体へ結合される。
上記の方法を使用してスクリーニングされた抗体のサブ集団は、当技術分野において公知の任意の免疫学ベースまたは生化学ベースの方法を使用して、特定の抗原(例えばヒトIL-27p28)についてのそれらの特異性及び結合親和性が特徴づけられ得る。例えば、IL-27p28への抗体の特異的結合は、例えば免疫学的ベースまたは生化学的ベースの方法(上で記載されるELISAアッセイ、SPRアッセイ、免疫沈降アッセイ、親和性クロマトグラフィー、及び平衡透析法等であるがこれらに限定されない)を使用して決定され得る。抗体の免疫特異的結合及び交差反応性の分析に使用され得る免疫アッセイとしては、ウエスタンブロット、RIA、ELISA(酵素結合免疫吸着アッセイ)、「サンドイッチ」免疫アッセイ、免疫沈降アッセイ、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、補体固定アッセイ、免疫放射定量分析、蛍光免疫アッセイ、及びプロテインA免疫アッセイ等の技法を使用する、競合アッセイ系及び非競合アッセイ系が挙げられるがこれらに限定されない。かかるアッセイは、当技術分野においてルーチン且つ周知である。
選択されるCDRアミノ酸配列が短い配列(例えば10~15未満の長さのアミノ酸)である態様において、CDRをコードする核酸は、例えばShiraishi et al.(2007)Nucleic Acids Symposium Series 51(1):129-130及び米国特許第6,995,259号中で記載されるように化学的に合成され得る。アクセプター抗体をコードする所与の核酸配列のために、CDRをコードする核酸配列の領域は、標準的分子生物学技法を使用して、化学的に合成された核酸により置き換えられ得る。化学的に合成された核酸の5’末端及び3’末端は、核酸をドナー抗体の可変領域をコードする核酸の中へクローニングする際の使用のための付着末端制限酵素部位を含むように合成され得る。
いくつかの態様において、本明細書において記載される抗IL-27抗体は、その対応する変更がない定常領域に比べて、低減されたエフェクター機能を有している(またはエフェクター機能を有していない)変更された重鎖定常領域を含む。抗IL-27抗体の定常領域が関与するエフェクター機能は、定常領域またはFc領域の特性の変更によって調節され得る。変更されるエフェクター機能としては、例えば以下の活性:抗体依存性細胞性細胞傷害(ADCC)、補体依存性細胞傷害(CDC)、アポトーシス、1つまたは複数のFc受容体への結合、及び炎症促進性応答のうちの1つまたは複数における調節が挙げられる。調節は、定常領域の変更がない形態の活性に比較して、変更された定常領域を含有する対象抗体によって示されるエフェクター機能活性の増加、減少、または消失を指す。特定の態様において、調節は、活性が消失されるかまたは完全に非存在である状況を包含する。
一態様において、本明細書において記載される抗IL-27抗体は、IgG4重鎖定常領域を含む。一態様において、IgG4重鎖定常領域は、野生型IgG4重鎖定常領域である。別の態様において、IgG4定常領域は、突然変異、例えばEUのナンバリング(Kabat,E.A.,et al.、前掲)に従って、例えばS228P、及びL235EまたはL235Aの1つまたは両方を含む。一態様において、本明細書において記載される抗IL-27抗体は、IgG1定常領域を含む。一態様において、IgG1重鎖定常領域は、野生型IgG1重鎖定常領域である。別の態様において、IgG1重鎖定常領域は、突然変異を含む。
変更されたFcR結合親和性及び/またはADCC活性及び/または変更されたCDC活性を備えた変更された定常領域は、定常領域の変更がない形態に比較して、促進または減退したFcR結合活性及び/またはADCC活性及び/またはCDC活性のいずれかを有するポリペプチドである。FcRへの増加した結合を提示する変更された定常領域は、変更がないポリペプチドよりも高い親和性で、少なくとも1つのFcRに結合する。FcRへの減少した結合を提示する変更された定常領域は、変更がない形態の定常領域よりも低い親和性で、少なくとも1つのFcRに結合する。FcRへの減少した結合を提示するかかるバリアントは、FcRへの感知できる結合をほとんどまたはまったく保持しなくてもよく、例えばネイティブな配列の免疫グロブリン定常領域またはFc領域のFcRへの結合のレベルに比較して、0~50%(例えば50、49、48、47、46、45、44、43、42、41、40、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1%未満)のFcRへの結合であり得る。同様に、調節されたADCC活性及び/またはCDC活性を提示する変更された定常領域は、変更がない定常領域に比較して、増加または低減したADCC活性及び/またはCDC活性を呈し得る。例えばいくつかの態様において、変更された定常領域を含む抗IL-27抗体は、定常領域の変更がない形態のおよそ0~50%(例えば50、49、48、47、46、45、44、43、42、41、40、39、38、37、36、35、34、33、32、31、30、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2、または1%未満)のADCC及び/またはCDC活性を呈し得る。低減したADCC及び/またはCDCを提示する変更された定常領域を含む本明細書において記載される抗IL-27抗体は、低減したADCC活性及び/またはCDC活性を呈し得るか、またはまったく呈さなくてもよい。
いくつかの態様において、本明細書において記載される抗IL-27抗体は、低減しエフェクター機能を呈するか、またはまったく呈さない。いくつかの態様において、抗IL-27抗体は、ハイブリッド定常領域またはその部分(G2/G4ハイブリッド定常領域等)を含む(例えばBurton et al.(1992)Adv Immun 51:1-18;Canfield et al.(1991)J Exp Med 173:1483-1491;及びMueller et al.(1997)Mol Immunol 34(6):441-452を参照)。上記を参照されたい。
いくつかの態様において、抗IL-27抗体は、促進または低減した補体依存性細胞傷害(CDC)を呈する変更された定常領域を含有し得る。調節されたCDC活性は、抗体のFc領域において1つまたは複数のアミノ酸の置換、挿入、または欠失を導入することによって達成され得る。例えば米国特許第6,194,551号を参照されたい。代替的にまたは追加で、システイン残基(複数可)はFc領域中に導入され、それによって、この領域における鎖間のジスルフィド結合形成を可能にし得る。このように生成されたホモ二量体抗体は、改良もしくは低減した内在化能力、及び/または増加もしくは減少した補体媒介性細胞殺傷を有し得る。例えばCaron et al.(1992)J Exp Med 176:1191-1195及びShopes(1992)Immunol 148:2918-2922;PCT公開番号WO99/51642及び同WO94/29351;Duncan and Winter(1988)Nature 322:738-40;ならびに米国特許第5,648,260号及び同第5,624,821号を参照されたい。
組み換え抗体の発現及び精製
本明細書において記載される抗体またはその抗原結合断片は、分子生物学及びタンパク質化学の技術分野において公知の様々な技法を使用して産生され得る。例えば、抗体の重鎖ポリペプチド及び軽鎖ポリペプチドの1つまたは両方をコードする核酸は、転写及び翻訳の調節配列を含有する発現ベクターの中へ挿入され得、当該調節配列としては、例えばプロモーター配列、リボソーム結合部位、転写開始及び停止配列、翻訳開始及び停止配列、転写ターミネーターシグナル、ポリアデニル化シグナル、ならびにエンハンサー配列またはアクチベーター配列が挙げられる。調節配列としては、プロモーター配列ならびに転写開始及び停止配列が挙げられる。加えて、発現ベクターは、2つの異なる生物体において(例えば発現のための哺乳動物細胞または昆虫細胞、ならびにクローニング及び増幅のための原核生物の宿主において)維持され得るように、2つ以上の複製系を含み得る。
本明細書において記載される抗体またはその抗原結合断片は、分子生物学及びタンパク質化学の技術分野において公知の様々な技法を使用して産生され得る。例えば、抗体の重鎖ポリペプチド及び軽鎖ポリペプチドの1つまたは両方をコードする核酸は、転写及び翻訳の調節配列を含有する発現ベクターの中へ挿入され得、当該調節配列としては、例えばプロモーター配列、リボソーム結合部位、転写開始及び停止配列、翻訳開始及び停止配列、転写ターミネーターシグナル、ポリアデニル化シグナル、ならびにエンハンサー配列またはアクチベーター配列が挙げられる。調節配列としては、プロモーター配列ならびに転写開始及び停止配列が挙げられる。加えて、発現ベクターは、2つの異なる生物体において(例えば発現のための哺乳動物細胞または昆虫細胞、ならびにクローニング及び増幅のための原核生物の宿主において)維持され得るように、2つ以上の複製系を含み得る。
哺乳動物細胞における、核酸からのクローン化された重鎖ポリペプチド及び軽鎖ポリペプチドの発現のために、複数の可能なベクター系が利用可能である。ベクターの1つのクラスは、所望の遺伝子配列の宿主細胞ゲノムの中への組込みに依存する。安定的にDNAを組み込んだ細胞は、薬物抵抗性遺伝子(E.coli gpt(Mulligan and Berg(1981)Proc Natl Acad Sci USA 78:2072)またはTn5 neo(Southern and Berg(1982)Mol Appl Genet 1:327)等)を同時に導入することによって選択され得る。選択可能マーカー遺伝子は、発現されるDNA遺伝子配列へ連結され得るか、または共トランスフェクションによって同じ細胞の中へ導入され得る、のいずれかである(Wigler et al.(1979)Cell 16:77)。第2のクラスのベクターは、染色体外プラスミドへ自主的に複製する能力を付与するDNAエレメントを利用する。これらのベクターは、ウシパピローマウイルス(Sarver et al.(1982)Proc Natl Acad Sci USA,79:7147)、サイトメガロウイルス、ポリオーマウイルス(Deans et al.(1984)Proc Natl Acad Sci USA 81:1292)、またはSV40ウイルス(Lusky and Botchan(1981)Nature 293:79)等の動物ウイルスに由来し得る。
発現ベクターは、その後の核酸の発現に好適な方式で細胞の中へ導入され得る。導入の方法は、以下で検討される標的化細胞タイプによって大部分は定められる。例示的な方法としては、CaPO4沈殿、リポソーム融合、カチオン性リポソーム、エレクトロポレーション、ウイルス感染、デキストラン媒介性トランスフェクション、ポリブレン媒介性トランスフェクション、プロトプラスト融合、及び直接的顕微注射が挙げられる。
抗体またはその抗原結合断片の発現に適切な宿主細胞としては、酵母、細菌、昆虫、植物、及び哺乳動物の細胞が挙げられる。その中でも特定に関心が持たれるのは、細菌(E.coli等)、真菌(Saccharomyces cerevisiae及びPichia pastoris等)、昆虫細胞(SF9等)、哺乳動物細胞株(例えばヒト細胞株)、そして初代細胞株である。
いくつかの態様において、抗体またはその断片は、遺伝子導入動物(例えば遺伝子導入哺乳動物)において発現され、それらから精製され得る。例えば、抗体は、例えばHoudebine(2002)Curr Opin Biotechnol 13(6):625-629;van Kuik-Romeijn et al.(2000)Transgenic Res 9(2):155-159;及びPollock et al.(1999)J Immunol Methods 231(1-2):147-157中で記載されるように、遺伝子導入非ヒト哺乳動物(例えば齧歯動物)において産生され、乳汁から単離され得る。
抗体及びその断片は、抗体または断片をコードする核酸を含有する発現ベクターにより形質転換された宿主細胞を、タンパク質の発現を可能にするのに条件下及び時間量で、十分な培養することによって、細胞から産生され得る。タンパク質発現のためのかかる条件は、発現ベクター及び宿主細胞の選択により変動し、ルーチンの実験を介して当業者によって容易に確認されるだろう。例えば、E.coli中で発現された抗体は、封入体から再び折りたたまれ得る(例えばHou et al.(1998)Cytokine 10:319-30を参照)。細菌発現系及びそれらの使用のための方法は、当技術分野において周知である(Current Protocols in Molecular Biology,Wiley & Sons,and Molecular Cloning-A Laboratory Manual -3rd Ed.,Cold Spring Harbor Laboratory Press,New York(2001)を参照)。コドンの選択、好適な発現ベクター、及び好適な宿主細胞は、複数の因子に依存して、変動し、必要に応じて容易に最適化され得る。本明細書において記載される抗体(またはその断片)は、哺乳動物細胞において、または他の発現系(酵母、バキュロウイルス、及びインビトロの発現系が挙げられるがこれらに限定されない)において発現され得る(例えばKaszubska et al.(2000)Protein Expression and Purification 18:213-220を参照)。
発現に続いて、抗体及びその断片は単離され得る。抗体またはその断片は、他のどの構成要素がサンプル中にあるかに依存して、当業者に公知の様々な手法で単離または精製され得る。標準的精製方法としては、電気泳動技法、分子的技法、免疫学的技法、及びクロマトグラフィー技法(イオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー、親和性クロマトグラフィー、及び逆相HPLCクロマトグラフィーを包含する)が挙げられる。例えば、抗体は、標準的抗抗体カラム(例えばプロテインAカラムまたはプロテインGカラム)を使用して、精製され得る。限外濾過技法及びダイアフィルトレーション技法も、タンパク質濃縮と併用して、有益である。例えばScopes(1994)“Protein Purification,3rd edition,”Springer-Verlag,New York City,New Yorkを参照されたい。精製の必要度は、所望の使用に依存して変動するだろう。いくつかの実例において、発現された抗体またはその断片の精製は、必要ではないだろう。
精製された抗体またはその断片の収率または純度を決定する方法は、当技術分野において公知であり、当該方法としては、例えばBradfordアッセイ、紫外分光法、ビウレットタンパク質アッセイ、Lowryのタンパク質アッセイ、アミドブラックタンパク質アッセイ、高圧液体クロマトグラフィー(HPLC)、質量分析(MS)、及びゲル電気泳動方法(例えばクマシーブルー染色またはコロイダル銀染色等おタンパク質染色を使用して)が挙げられる。
抗体またはその抗原結合断片の修飾
抗体またはその抗原結合断片は、それらの発現及び精製に続いて修飾され得る。修飾は、共有結合性修飾または非共有結合性修飾であり得る。かかる修飾は、例えば選択された側鎖または末端残基と反応することが可能である有機誘導体化剤とポリペプチドの標的アミノ酸残基を反応させることによって、抗体または断片の中へ導入され得る。修飾に好適な部位は、様々な基準(例えば抗体または断片の構造分析またはアミノ酸配列分析が挙げられる)の任意のものを使用して選ばれ得る。
抗体またはその抗原結合断片は、それらの発現及び精製に続いて修飾され得る。修飾は、共有結合性修飾または非共有結合性修飾であり得る。かかる修飾は、例えば選択された側鎖または末端残基と反応することが可能である有機誘導体化剤とポリペプチドの標的アミノ酸残基を反応させることによって、抗体または断片の中へ導入され得る。修飾に好適な部位は、様々な基準(例えば抗体または断片の構造分析またはアミノ酸配列分析が挙げられる)の任意のものを使用して選ばれ得る。
いくつかの態様において、抗体またはその抗原結合断片は、異種部分へコンジュゲートされ得る。異種部分は、例えば異種ポリペプチド、治療剤(例えば毒素または薬物)、または検出可能な標識(放射性標識、酵素標識、蛍光標識、重金属標識、発光標識、またはビオチンもしくはストレプトアビジン等の親和性タグ等であるがこれらに限定されない)であり得る。好適な異種ポリペプチドとしては、例えば抗体または断片の精製における使用のための抗原性タグ(FLAG(DYKDDDDK(配列番号141))、ポリヒスチジン(6-His;HHHHHH(配列番号142))、赤血球凝集素(HA;YPYDVPDYA(配列番号143))、グルタチオンSトランスフェラーゼ(GST)、またはマルトース結合タンパク質(MBP))が挙げられる。異種ポリペプチドとしては、診断用マーカーまたは検出可能なマーカーとして有益なポリペプチド(例えば酵素)、例えばルシフェラーゼ、蛍光タンパク質(例えば緑色蛍光タンパク質(GFP))、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ(CAT)も挙げられる。好適な放射性標識としては、例えば32P、33P、14C、125I、131I、35S、及び3Hが挙げられる。好適な蛍光標識としては、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート(FITC)、緑色蛍光タンパク質(GFP)、DyLight(商標)488、フィコエリトリン(PE)、ヨウ化プロピディウム(PI)、PerCP、PE-Alexa Fluor(登録商標)700、Cy5、アロフィコシアニン、及びCy7が限定されずに挙げられる。発光標識としては、例えば任意の様々な発光ランタニド(例えばユウロピウムまたはテルビウム)キレートが挙げられる。例えば、好適なユウロピウムキレートとしては、ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA)またはテトラアザシクロドデカン-1,4,7,10-四酢酸(DOTA)のキレートユウロピウムが挙げられる。酵素的な標識としては、例えばアルカリホスファターゼ、CAT、ルシフェラーゼ、及びホースラディシュペルオキシダーゼが挙げられる。
2つのタンパク質(例えば抗体及び異種部分)は、複数の公知の化学架橋物質の任意のものを使用して架橋され得る。かかる架橋物質の例は、「ヒンダード」ジスルフィド結合を含むリンケージを介して2つのアミノ酸残基を連結するものである。これらのリンケージにおいて、架橋単位内のジスルフィド結合は、例えば還元グルタチオンまたは酵素ジスルフィド還元酵素の作用によって還元から保護される(ジスルフィド結合のいずれか側上の基の妨害によって)。ある好適な試薬(4-スクシンイミジルオキシカルボニル-α-メチル-α(2-ピリジルジチオ)トルエン(SMPT))は、タンパク質のうちの1つ上の末端リジン及び他のもの上の末端システインを利用して、2つのタンパク質間のかかるリンケージを形成する。各々のタンパク質上の異なるカップリング部分によって架橋するヘテロ二官能性試薬も、使用され得る。他の有益な架橋物質としては、2つのアミノ基を連結する試薬(例えばN-5-アジド-2-ニトロベンゾイルオキシスクシンイミド)、2つのスルフヒドリル基を連結する試薬(例えば1,4-ビス-マレイミドブタン)、アミノ基及びスルフヒドリル基を連結する試薬(例えばm-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル)、アミノ基及びカルボキシル基を連結する試薬(例えば4-[p-アジドサリチルアミド]ブチルアミン)、ならびにアミノ基及びアルギニンの側鎖中に存在するグアニジウム基を連結する試薬(例えばp-アジドフェニルグリオキサール一水和物)が限定されずに挙げられる。
いくつかの態様において、放射性標識は、抗体のアミノ酸骨格へ直接コンジュゲートされ得る。代替的に、放射性標識は、より大きな分子の一部分として(例えばメタ-[125I]ヨードフェニル-N-ヒドロキシスクシンイミド([125I]mIPNHS)中の125Iであり、[125I]mIPNHSは、遊離アミノ基へ結合して、関連するタンパク質のメタヨードフェニル(mIP)誘導体を形成する(例えばRogers et al.(1997)J Nucl Med 38:1221-1229を参照))、または次にタンパク質骨格へ結合されるキレートの一部分として(例えばDOTAまたはDTPAへ)含まれ得る。放射性標識またはそれらを含有するより大きな分子/キレートを、本明細書において記載される抗体または抗原結合断片へコンジュゲートする方法は、当技術分野において公知である。かかる方法は、タンパク質へ放射性標識またはキレートの結合を容易にする条件(例えばpH、塩濃度、及び/または温度)下で、放射性標識によりタンパク質をインキュベーションすることを含む(例えば米国特許第6,001,329号を参照)。
蛍光標識(時には「フルオロフォア」と称される)をタンパク質(例えば抗体)へコンジュゲートする方法は、タンパク質化学の技術分野において公知である。例えば、フルオロフォアは、フルオロフォアへ付加されたスクシンイミジル(NHS)エステルまたはテトラフルオロフェニル(TFP)エステル部分を使用して、タンパク質の遊離アミノ基(例えばリジン)またはスルフヒドリル基(例えばシステイン)へコンジュゲートされ得る。いくつかの態様において、フルオロフォアは、ヘテロ二官能性架橋物質部分(スルホ-SMCC等)へコンジュゲートされ得る。好適なコンジュゲーション法は、フルオロフォアのタンパク質への結合を容易にする条件下でフルオロフォアにより抗体タンパク質またはその断片をインキュベーションすることを含む。例えばWelch and Redvanly(2003)“Handbook of Radiopharmaceuticals:Radiochemistry and Applications,”John Wiley and Sons(ISBN 0471495603)を参照されたい。
いくつかの態様において、抗体または断片は、例えば血液、血清、または他の組織において、例えば循環中の抗体の安定化及び/または保持を改善する部分により修飾され得る。例えば、抗体または断片は、例えばLee et al.(1999)Bioconjug Chem10(6):973-8;Kinstler et al.(2002)Advanced Drug Deliveries Reviews 54:477-485及びRoberts et al.(2002)Advanced Drug Delivery Reviews 54:459-476中で記載されているようにPEG化、またはHES化(HESylated)され得る(Fresenius Kabi,Germany;例えばPavisic et al.(2010)Int J Pharm 387(1-2):110-119を参照)。安定化部分は、抗体または断片の安定性または保持を、少なくとも1.5(例えば少なくとも2、5、10、15、20、25、30、40、または50以上)倍改善し得る。
いくつかの態様において、本明細書において記載される抗体またはその抗原結合断片は、糖鎖付加され得る。いくつかの態様において、本明細書において記載される抗体またはその抗原結合断片は、抗体または断片が低減した糖鎖付加を有するかまたは糖鎖付加が非存在であるように、酵素処理もしくは化学処理を受けるか、または細胞から産生され得る。低減した糖鎖付加を備えた抗体を産生する方法は、当技術分野において公知であり、例えば米国特許第6,933,368号;Wright et al.(1991)EMBO J 10(10):2717-2723;及びCo et al.(1993)Mol Immunol 30:1361中で記載される。
医薬組成物及び製剤
ある特定の態様において、本発明は、抗IL-27抗体を、薬学的に許容される希釈物質、担体、可溶化物質、乳化物質、防腐物質及び/またはアジュバントと共に含む医薬組成物を提供する。
ある特定の態様において、本発明は、抗IL-27抗体を、薬学的に許容される希釈物質、担体、可溶化物質、乳化物質、防腐物質及び/またはアジュバントと共に含む医薬組成物を提供する。
ある特定の態様において、許容される製剤材料は、好ましくは利用される投薬量及び濃度で、レシピエントへ非毒性である。ある特定の態様において、製剤材料(複数可)は、皮下投与及び/または静脈内投与のためのものである。ある特定の態様において、医薬組成物は、例えば組成物のpH、浸透圧、粘度、透明度、色、等張性、芳香、滅菌性、安定性、溶出もしくは放出の速度、吸着、または透過を、修飾、維持、または保存するための製剤材料を含有し得る。ある特定の態様において、好適な製剤材料は、アミノ酸(グリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、またはリジン等);抗微生物物質;抗酸化物質(アスコルビン酸、亜硫酸ナトリウム、または亜硫酸水素ナトリウム等);バッファー(ホウ酸塩、重炭酸塩、トリスHCl、クエン酸塩、リン酸塩、または他の有機酸等);増量剤(マンニトールまたはグリシン等);キレート剤(エチレンジアミン四酢酸(EDTA)等);錯化剤(カフェイン、ポリビニルピロリドン、β-シクロデキストリン、またはヒドロキシプロピル-β-シクロデキストリン等);充填物質;単糖;二糖;及び他の炭水化物(グルコース、マンノース、またはデキストリン等);タンパク質(血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリン等);着色剤、香味剤、及び希釈剤;乳化剤;親水性ポリマー(ポリビニルピロリドン等);低分子量ポリペプチド;塩形成カウンターイオン(ナトリウム等);防腐物質(塩化ベンザルコニウム、安息香酸、サリチル酸、チメロサール、フェネチルアルコール、メチルパラベン、プロピルパラベン、クロルヘキシジン、ソルビン酸、または過酸化水素等);溶媒(グリセリン、プロピレングリコール、またはポリエチレングリコール等);糖アルコール(マンニトールまたはソルビトール等);懸濁化剤;界面活性物質または湿潤剤(プルロニック(登録商標)、PEG、ソルビタンエステル、ポリソルベート(ポリソルベート20、ポリソルベート80等)、トリトン、トロメタミン、レシチン、コレステロール、チロキサパル(tyloxapal)等);安定性促進剤(スクロースまたはソルビトール等);等張性促進剤(アルカリ金属ハロゲン化物、好ましくは塩化ナトリウムまたは塩化カリウム、マンニトールソルビトール等);送達ビヒクル;希釈物質;賦形剤及び/または薬学的アジュバントが挙げられるがこれらに限定されない(Remington’s Pharmaceutical Sciences,18th Edition,A.R.Gennaro,ed.,Mack Publishing Company(1995))。ある特定の態様において、製剤は、PBS;20mMのNaOAC(pH5.2)、50mMのNaCl;及び/または10mMのNAOAC(pH5.2)、9%のスクロースを含む。ある特定の態様において、最適な医薬組成物は、例えば意図される投与経路、送達フォーマット、及び所望の投薬量に依存して、当業者によって決定されるだろう。例えばRemington’s Pharmaceutical Sciences、前掲を参照されたい。ある特定の態様において、かかる組成物は、抗IL-27抗体の物理的状態、安定性、インビボの放出速度、及び/またはインビボのクリアランス速度に影響を及ぼし得る。
ある特定の態様において、医薬組成物中の主要なビヒクルまたは担体は、本質的に水性または非水性のいずれかであり得る。例えばある特定の態様において、好適なビヒクルまたは担体は、注射用水、生理食塩液、または人工脳脊髄液であり得、場合によっては、非経口投与のための組成物で一般的な他の材料が補足される。ある特定の態様において、食塩水は、等張のリン酸緩衝食塩水を含む。ある特定の態様において、中性に緩衝された食塩水または血清アルブミンと混合された食塩水は、さらなる例示的なビヒクルである。ある特定の態様において、医薬組成物は、約pH7.0~8.5のトリスバッファー、または約pH4.0~5.5の酢酸バッファーを含み、それらはソルビトールまたはその好適な代替物をさらに含み得る。ある特定の態様において、抗IL-27抗体を含む組成物は、純度の所望の程度を有する選択された組成物を、凍結乾燥ケーキまたは水溶液の形態の任意選択の製剤薬剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences、前掲)と混合することによって、貯蔵用に調製され得る。さらにある特定の態様において、抗IL-27抗体を含む組成物は、適切な賦形剤(スクロース等)を使用して、凍結乾燥物として製剤化され得る。
ある特定の態様において、医薬組成物は、非経口送達のために選択され得る。ある特定の態様において、組成物は、吸入のために、または消化管を介する送達(経口的に等)のために選択され得る。かかる薬学的に許容される組成物の調製は、当業者の能力内である。
ある特定の態様において、製剤構成要素は、投与の部位に対して許容される濃度で存在する。ある特定の態様において、バッファーを使用して、組成物を生理的なpHまたはわずかに低いpH、典型的には約5~約8のpH範囲内で維持する。
ある特定の態様において、非経口投与が企図される場合に、治療組成物は、薬学的に許容されるビヒクル中に、抗IL-27抗体を含む、パイロジェンフリーで非経口的に許容される水溶液の形態であり得る。ある特定の態様において、非経口注射用のビヒクルは、抗IL-27抗体が滅菌等張溶液として製剤化され、適切に保存される、滅菌蒸留水である。ある特定の態様において、調製は、その後にデポー注射を介して送達できる産物の制御放出または持続放出を提供できる薬剤(注射可能マイクロスフェア、生体侵食性粒子、ポリマー化合物(ポリ乳酸またはポリグリコール酸等)、ビーズ、またはリポソーム等)との、所望の分子の製剤を含み得る。ある特定の態様において、ヒアルロン酸も使用され得、循環中の持続的継続期間を増進する効果を有し得る。ある特定の態様において、植え込み可能な薬物送達デバイスは、所望の分子の導入に使用され得る。
ある特定の態様において、医薬組成物は、吸入のために製剤化され得る。ある特定の態様において、抗IL-27抗体は、吸入のための乾燥粉末として製剤化され得る。ある特定の態様において、抗IL-27抗体を含む吸入溶液は、エアロゾル送達のための噴射剤により製剤化され得る。ある特定の態様において、溶液は、霧化され得る。経肺投与は、化学的に修飾されたタンパク質の肺送達を記載するPCT出願番号PCT/US94/001875中でさらに記載される。
ある特定の態様において、製剤は、経口投与され得ることが企図される。ある特定の態様において、この様式で投与される抗IL-27抗体は、固体投薬形態(錠剤及びカプセル等)の調合において慣習的に使用される担体有りまたは無しで、製剤化され得る。ある特定の態様において、カプセルは、生物学的利用能が最大化され、全身にいきわたる前の(pre-systemic)分解が最小限にされる時に、胃腸管中の場所で製剤の有効成分を放出するようにデザインされ得る。ある特定の態様において、抗IL-27抗体の吸収を容易にするために、少なくとも1つの追加の薬剤が含まれ得る。ある特定の態様において、希釈物質、香味料、低融点ワックス、植物油、滑沢物質、懸濁化剤、錠剤崩壊剤、及び結合物質も利用され得る。
ある特定の態様において、医薬組成物は、錠剤の製造に好適な非毒性賦形剤との混合物中に有効量の抗IL-27抗体を含み得る。ある特定の態様において、溶液は、滅菌水または別の適切なビヒクル中で錠剤を溶解することによって、単位用量形態で調製され得る。ある特定の態様において、好適な賦形剤としては、不活性希釈物質(炭酸カルシウム、炭酸ナトリウムもしくは重炭酸ナトリウム、ラクトース、またはリン酸カルシウム等);または結合剤(デンプン、ゼラチン、またはアカシア等);または滑沢剤(ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸、またはタルク等)が挙げられるがこれらに限定されない。
持続送達製剤または制御送達製剤中に抗IL-27抗体を含む製剤を含む追加の医薬組成物が、当業者に明らかであろう。ある特定の態様において、様々な他の持続送達手段または制御送達手段(リポソーム担体、生体侵食性マイクロ粒子または多孔質ビーズ、及びデポー注射等)の製剤化のための技法も、当業者に公知である。例えば医薬組成物の送達のための多孔質ポリマーマイクロ粒子の制御放出を記載するPCT出願番号PCT/US93/00829を参照されたい。ある特定の態様において、持続放出調製物は、半透性ポリマーマトリクスを、造形品(例えばフィルムまたはマイクロカプセル)の形態で含み得る。持続放出マトリックスとしては、ポリエステル、ハイドロゲル、ポリラクチド(米国特許第3,773,919号及びEP058,481)、L-グルタミン酸及びγエチル-L-グルタメートのコポリマー(Sidman et al.,Biopolymers,22:547-556(1983))、ポリ(2-ヒドロキシエチル-メタクリレート)(Langer et al.,J.Biomed.Mater.Res.,15:167-277(1981)及びLanger,Chem.Tech.,12:98-105(1982))、エチレン酢酸ビニル(Langer et al.、前掲)、またはポリ-D(-)-3-ヒドロキシ酪酸(EP133,988)が挙げられ得る。ある特定の態様において、持続放出組成物は、さらに当技術分野において公知の任意の複数の方法によって調製され得るリポソームを含み得る。例えばEppstein et al,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,82:3688-3692(1985);EP036,676;EP088,046、及びEP143,949を参照されたい。
インビボの投与のために使用される医薬組成物は、典型的には滅菌される。ある特定の態様において、これは、滅菌濾過膜を介する濾過によって達成され得る。組成物が凍結乾燥される特定の態様において、この方法を使用する滅菌は、凍結乾燥及び再構成の前または後のいずれかで遂行され得る。ある特定の態様において、非経口投与のための組成物は、凍結乾燥形態でまたは溶液で保存され得る。ある特定の態様において、非経口組成物は、概して滅菌アクセスポートを有する容器(例えば皮下注射針によって穿刺可能な栓を有する静注液バッグまたはバイアル)の中へ配置される。
ある特定の態様において、一旦、医薬組成物が製剤化されたならば、それは、溶液、懸濁物、ゲル、エマルション、固体、または脱水もしくは凍結乾燥された粉末として、滅菌バイアル中に保存され得る。ある特定の態様において、かかる製剤は、即時使用可能な形態、または投与前に再構成される形態(例えば凍結乾燥)のいずれかで保存され得る。
ある特定の態様において、キットは、単回用量投与単位の産生のために提供される。ある特定の態様において、キットは、乾燥タンパク質を有する第1の容器及び水性製剤を有する第2の容器の両方を含有し得る。ある特定の態様において、単一チャンバー及びマルチチャンバーの充填済みシリンジ(例えば液体シリンジ及びリオシリンジ(lyosyringe))を含有するキットが含まれる。
ある特定の態様において、治療的に利用される抗IL-27抗体を含む医薬組成物の有効量は、例えば治療情況及び目的に依存するだろう。当業者は、ある特定の態様によれば、治療に適切な投薬量レベルが、送達される分子、抗IL-27抗体が使用されている適応症、投与経路、ならびに患者のサイズ(体重、体表面積、または器官サイズ)及び/または条件(年齢及び全身の健康)に部分的に依存して、それにより変動するだろうことを認識するだろう。ある特定の態様において、臨床医は、投薬量を力価測定し、最適な治療効果を得るように投与経路を修飾することができる。
ある特定の態様において、投薬頻度は、使用される製剤中の抗IL-27抗体の薬物動態パラメーターを考慮するだろう。ある特定の態様において、臨床医は、所望の効果を達成する投薬量に到達するまで組成物を投与するだろう。ある特定の態様において、組成物はしたがって、単回用量としてもしくは2回以上の用量として(それは所望の分子の同じ量を含有しても含有しなくてもよい)経時的に、または植え込みデバイスもしくはカテーテルを経由する連続点滴として、投与され得る。適切な投薬量のさらなる微調整は、当業者によってルーチンに行われ、当業者によってルーチンに遂行される作業の範囲内である。ある特定の態様において、適切な投薬量は、適切な用量-応答データの使用を介して確かめられ得る。
ある特定の態様において、医薬組成物の投与経路は公知の方法と合致し、例えば経口的なもの、注射を介する、静脈内、腹腔内、脳内(実質内)、脳室内、筋肉内、眼内、皮下、動脈内、門脈内、もしくは病巣内の経路;持続放出系によるもの、または植え込みデバイスによるものである。ある特定の態様において、組成物は、ボーラス注射によって、継続的な点滴によって、または植え込みデバイスによって投与され得る。ある特定の態様において、併用療法の個別の要素は、異なる経路によって投与され得る。
ある特定の態様において、組成物は、所望の分子が吸収またはカプセル化された膜、スポンジ、または別の適切な材料の植え込みを介して局所的に投与され得る。植え込みデバイスが使用される特定の態様において、デバイスは、任意の好適な組織または器官の中へ植え込まれ、所望の分子の送達は、拡散、徐放性ボーラス、または連続投与を介し得る。ある特定の態様において、抗IL-27抗体を含む医薬組成物をエクスビボの様式で使用することが所望され得る。かかる実例において、患者から取り出された細胞、組織、及び/または器官は、抗IL-27抗体を含む医薬組成物へ曝露され、その後に細胞、組織、及び/または器官は、後続して患者の中へ戻して植え込まれる。
ある特定の態様において、抗IL-27抗体は、本明細書において記載されるもの等の方法を使用してポリペプチドを発現及び分泌するように遺伝子操作された特定の細胞を植え込むことによって、送達され得る。ある特定の態様において、かかる細胞は、動物またはヒト細胞であり得、自己由来、異種(heterologous)、異なる種(xenogeneic)であり得る。ある特定の態様において、細胞は、不死化され得る。ある特定の態様において、免疫学的応答の機会を減少させるために、細胞は、周囲の組織の浸潤を避けるようにカプセル化され得る。ある特定の態様において、カプセル化材料は、典型的には、タンパク質産物(複数可)の放出を可能にするが、患者の免疫系によるまたは周囲の組織からの他の有害な因子による細胞の破壊を防止する、生体適合性の半透過性ポリマーの囲いまたは膜である。
適用
本明細書において記載される組成物は、多数の診断適用及び治療適用において使用され得る。例えば、検出可能に標識された抗原結合分子は、サンプル(例えば生物学的サンプル)中の標的抗原の存在または量を検出するアッセイにおいて使用され得る。組成物は、標的抗原機能の阻害の研究のためのインビトロのアッセイにおいて使用され得る。例えば組成物が補体タンパク質へ結合し阻害するいくつかの態様において、組成物は、補体活性を阻害するかまたはさもなければ補体関連障害の治療に有用である追加の新規化合物を同定するようにデザインされたアッセイにおいて、陽性対照として使用され得る。例えば、IL-27阻害組成物は、IL-27産生を低減または無効にする追加の化合物(例えば小分子、アプタマー、または抗体)を同定するアッセイにおいて、陽性対照として使用され得る。組成物は、以下で詳述するような治療方法においても使用され得る。
本明細書において記載される組成物は、多数の診断適用及び治療適用において使用され得る。例えば、検出可能に標識された抗原結合分子は、サンプル(例えば生物学的サンプル)中の標的抗原の存在または量を検出するアッセイにおいて使用され得る。組成物は、標的抗原機能の阻害の研究のためのインビトロのアッセイにおいて使用され得る。例えば組成物が補体タンパク質へ結合し阻害するいくつかの態様において、組成物は、補体活性を阻害するかまたはさもなければ補体関連障害の治療に有用である追加の新規化合物を同定するようにデザインされたアッセイにおいて、陽性対照として使用され得る。例えば、IL-27阻害組成物は、IL-27産生を低減または無効にする追加の化合物(例えば小分子、アプタマー、または抗体)を同定するアッセイにおいて、陽性対照として使用され得る。組成物は、以下で詳述するような治療方法においても使用され得る。
いくつかの態様において、本開示は、生物学的サンプル中のまたは対象中のIL-27を検出する方法であって、(i)サンプルまたは対象(任意選択で参照サンプルまたは対象)を、抗体分子及びIL-27の相互作用が起こることを可能にする条件下で、本明細書において記載される任意の抗体と接触させること、ならびに(ii)抗体分子とサンプルまたは対象(任意選択で参照サンプルまたは対象)との間での複合体の形成を検出すること、を含む、前記方法を提供する。
キット
キットは、本明細書において開示される抗IL-27抗体及び使用のための指示書を含み得る。キットは、好適な容器中に、抗IL-27抗体、1つまたは複数の対照、及び当技術分野において周知の様々なバッファー、試薬、酵素、及び他の標準的成分を含み得る。いくつかの態様において、本開示は、本明細書において開示される抗IL-27抗体または抗原結合部分、及び対象における免疫応答の刺激または対象におけるがんの治療における使用のための指示書を、任意選択で、本明細書において開示される1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用する使用のための指示書と共に含むキットを提供する。
キットは、本明細書において開示される抗IL-27抗体及び使用のための指示書を含み得る。キットは、好適な容器中に、抗IL-27抗体、1つまたは複数の対照、及び当技術分野において周知の様々なバッファー、試薬、酵素、及び他の標準的成分を含み得る。いくつかの態様において、本開示は、本明細書において開示される抗IL-27抗体または抗原結合部分、及び対象における免疫応答の刺激または対象におけるがんの治療における使用のための指示書を、任意選択で、本明細書において開示される1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用する使用のための指示書と共に含むキットを提供する。
容器としては、少なくとも1つのバイアル、ウェル、試験管、フラスコ、ボトル、シリンジ、または他の容器手段が挙げられ、抗IL-27抗体はその中へ配置され、いくつかの実例において、好適に小分けされ得る。追加の構成要素が提供される場合に、キットは、この構成要素が配置され得る追加の容器を含有し得る。キットは、商業的販売のために密閉で、抗IL-27抗体及び他の試薬容器も含有するための手段も含み得る。かかる容器は、所望のバイアルが保持される、射出成形またはブローモールド成形のプラスティック容器を含み得る。容器及び/またはキットは、使用のための指示書及び/または警告によるラベルを含み得る。
使用方法
本発明の組成物は、IL-27、及び/またはIL-27機能のアンタゴナイズ作用の検出及び/または定量を包含する、多数のインビトロ及びインビボの有用性を有する。
本発明の組成物は、IL-27、及び/またはIL-27機能のアンタゴナイズ作用の検出及び/または定量を包含する、多数のインビトロ及びインビボの有用性を有する。
いくつかの態様において、本開示は、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する方法であって、細胞を本開示によって提供される単離された抗体または抗原結合断片と接触させることを含み、抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する方法であって、細胞を本開示によって提供される単離された抗体または抗原結合断片と接触させることを含み、抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する方法であって、細胞を本開示によって提供される単離された抗体または抗原結合断片と接触させることを含み、抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害する、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、細胞からの1つまたは複数のサイトカインの分泌を誘導または促進する方法であって、細胞を本開示によって提供される単離された抗体または抗原結合断片と接触させることを含み、抗体またはその抗原結合部分が、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において免疫応答を刺激する方法であって、IL-27へ特異的に結合しアンタゴナイズする、有効量の本開示によって提供される単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を、対象へ投与することを含む、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象においてがんを治療する方法であって、IL-27へ特異的に結合しアンタゴナイズする、有効量の本開示によって提供される単離された抗体もしくはその抗原結合部分、または抗体もしくはその抗原結合部分及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を、対象へ投与することを含む、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法であって、有効量の本開示によって提供される単離された抗体もしくは抗原結合断片、または抗体もしくはその抗原結合部分及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を、対象へ投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分または医薬組成物が、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減し、それによって免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法であって、有効量の本開示によって提供される単離された抗体もしくは抗原結合断片、または抗体もしくはその抗原結合部分及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を、対象へ投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分または医薬組成物が、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減し、それによって免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法であって、有効量の本開示によって提供される単離された抗体もしくは抗原結合断片、または抗体もしくはその抗原結合部分及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を、対象へ投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分または医薬組成物が、細胞のPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減し、それによって免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、本開示は、対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法であって、有効量の本開示によって提供される単離された抗体もしくは抗原結合断片、または抗体もしくはその抗原結合部分及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物を、対象へ投与することを含み、抗体もしくはその抗原結合部分または医薬組成物が、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進し、それによって免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、がんは、肺癌(例えば非小細胞肺癌)、肉腫、精巣癌、卵巣癌、膵臓癌、乳癌(例えばトリプルネガティブ乳癌)、黒色腫、頭頸部癌(例えば頭頸部扁平上皮癌)、結腸直腸癌、膀胱癌、子宮内膜癌、前立腺癌、甲状腺癌、肝細胞癌、胃癌、脳腫瘍、リンパ腫(例えばDL-BCL)、白血病(例えばAML)、または腎臓癌(例えば腎細胞癌、例えば腎明細胞癌)から選ばれる。
上で記載される組成物は、とりわけ対象において様々ながんを治療または予防する方法において有用である。組成物は、投与経路に部分的に依存する様々な方法を使用して、対象(例えばヒト対象)へ投与され得る。経路は、例えば静脈注射もしくは静脈点滴(IV)、皮下注射(SC)、腹腔内(IP)注射、筋肉内注射(IM)、または髄腔内注射(IT)であり得る。注射は、ボーラスまたは連続点滴であり得る。
投与は、例えば局所的な点滴、注射、または植え込み手段によって達成され得る。植え込み物は、多孔質、非多孔質、またはゼラチン状の材料であり得、膜(サイラスティック膜等)または繊維が挙げられる。植え込み物は、対象への組成物の持続的または周期的な放出のために構成され得る。例えば米国特許出願公開第20080241223号;米国特許第5,501,856号;同第4,863,457号;及び同第3,710,795号;EP488401;及びEP430539(それらの各々の開示は、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される)を参照されたい。組成物は、例えば拡散システム、侵食システム、または対流システムに基づく植え込み可能なデバイス(例えば浸透圧ポンプ、生物分解性植え込み物、電気拡散システム、電気浸透システム、蒸気圧ポンプ、電解ポンプ、起泡ポンプ、圧電ポンプ、侵食ベースシステム、または電子機械システム)の手法によって対象へ送達され得る。
いくつかの態様において、抗IL-27抗体またはその抗原結合断片は、局所投与の手法によって対象へ治療的に送達される。
本明細書において記載される抗体またはその断片の好適な用量は、対象においてがんを治療または予防することが可能である用量であり、様々な因子(例えば治療される対象の年齢、性別、及び重量、ならびに使用される特定の阻害物質化合物が挙げられる)に依存し得る。例えば、がんの有る対象を治療するには、同じ対象を治療するのに要求されるIL-27結合Fab’抗体断片の用量に比較して、異なる用量の完全な抗IL-27抗体が要求され得る。対象へ投与される用量に影響する他の因子としては、例えばがんのタイプまたは重症度が挙げられる。例えば、転移性黒色腫を有する対象は、神経膠芽腫の有る対象とは異なる投薬量の抗IL-27抗体の投与を要求し得る。他の因子としては、例えば同時または以前の対象に影響する他の医学的障害、対象の全身の健康、対象の遺伝学的素因、食餌、投与時間、排泄率、薬物併用、及び対象へ投与される任意の他の追加の治療物質が挙げられ得る。任意の特定の対象のための特異的な投薬量及び治療レジメンが、治療する医療従事者(例えば医師または看護師)の判断にも依存するだろうことも理解されるべきである。好適な投薬量は、本明細書において記載される。
医薬組成物は、治療有効量の本明細書において記載される抗IL-27抗体またはその抗原結合断片を含み得る。かかる有効量は、投与される抗体の効果、または2つ以上の薬剤が使用されるならば抗体及び1つもしくは複数の追加の活性剤の併用効果に部分的に基づいて、当業者によって容易に決定され得る。本明細書において記載される抗体またはその断片の治療有効量は、個体の疾患状態、年齢、性別、及び体重、ならびに抗体(及び1つまたは複数の追加の活性剤)が個体における所望の応答(例えば腫瘍増殖の低減)を惹起する能力等の因子に従っても変動し得る。例えば、抗IL-27抗体の治療有効量は、特定の障害、及び/または当技術分野において公知のもしくは本明細書において記載される特定の障害の症状のうちの任意の1つを阻害し得る(それらの重症度を軽減するか、またはそれらの発症を消失させる)及び/または予防し得る。治療有効量は、組成物の任意の毒性効果または有害効果を治療的に有益な効果が上回るものでもある。
本明細書において記載される抗体またはその断片のうちの任意ものの好適なヒト用量は、例えば第I相用量漸増研究においてさらに評価され得る。例えばvan Gurp et al.(2008)Am J Transplantation 8(8):1711-1718;Hanouska et al.(2007)Clin Cancer Res 13(2,part 1):523-531;及びHetherington et al.(2006)Antimicrobial Agents and Chemotherapy 50(10):3499-3500を参照されたい。
いくつかの態様において、組成物は、組成物が全体として治療的に有効であるように、本明細書において記載される抗体またはその抗原結合断片のうちの任意のもの、及び1つもしくは複数の(例えば2、3、4、5、6、7、8、9、10、または11以上の)追加の治療剤を含有する。例えば、組成物は、本明細書において記載される抗IL-27抗体及びアルキル化剤を含有することができ、抗体及び薬剤各々は、併用された場合に、対象においてがん(例えば黒色腫)を治療または予防するために治療的に有効な濃度である。
かかる組成物の毒性及び治療物質有効性は、細胞培養または実験動物(例えば本明細書において記載されるがんのうちの任意のものの動物モデル)において、公知の薬学的手順によって決定され得る。これらの手順は、例えばLD50(集団の50%に対する致死用量)及びED50(集団の50%における治療有効用量)を決定するために使用され得る。毒性効果と治療効果との間の用量比は治療指標であり、LD50/ED50の比として表現され得る。高い治療指数を呈する抗体またはその抗原結合断片が好ましい。毒性副作用を示す組成物が使用され得るが、かかる化合物を影響を受けた組織の部位へ標的化する送達システムをデザインし、正常細胞への潜在的な損傷を最小限にし、それによって副作用を低減させるように注意を払うべきである。
細胞培養アッセイ及び動物研究から得られたデータは、ヒトにおける使用のための投薬量範囲の処方において使用され得る。かかる抗体またはその抗原結合断片の投薬量は、概してほとんどまたはまったく毒性を伴わないED50を含む、抗体または断片の循環濃度の範囲内に収まる。投薬量は、用いられる投薬形態及び利用される投与経路に依存してこの範囲内で変動し得る。本明細書において記載される抗IL-27抗体について、治療有効用量は、最初に細胞培養アッセイから推定され得る。用量は、細胞培養において決定されるIC50(すなわち症状の最大阻害の50%を達成する抗体の濃度)を含む循環血漿濃度範囲を達成するように、動物モデルにおいて定められ得る。かかる情報は、ヒトにおける有用な用量のより正確な決定に使用され得る。血漿中のレベルは、例えば高速液体クロマトグラフィーによって測定され得る。例えば局所投与(例えば眼または関節への)が所望されるいくつかの態様において、細胞培養または動物モデルは、局所部位内の治療有効濃度の達成に要求される用量の決定に使用され得る。
いくつかの態様において、方法は、がんのために他の療法と併用して遂行され得る。例えば、組成物は、放射線、外科手術、標的化化学療法もしくは細胞傷害性化学療法、化学放射線療法、ホルモン療法、免疫療法、遺伝子療法、細胞移植療法、高精度医療、ゲノム編集療法、または他の薬物療法と同時に、それらの前に、またはそれらの後に、対象へ投与され得る。
上で記載されるように、本明細書において記載される組成物(例えば抗IL-27組成物)は、カポジ肉腫、白血病、急性リンパ球性白血病、急性骨髄性白血病、骨髄芽球前骨髄球骨髄単球性単球性の赤白血病(myeloblasts promyelocyte myelomonocytic monocytic erythroleukemia)、慢性白血病、慢性骨髄性(顆粒球性)白血病、慢性リンパ球性白血病、マントル細胞リンパ腫、原発性中枢神経系リンパ腫、Burkittリンパ腫及び辺縁帯B細胞リンパ腫、真性多血症リンパ腫、Hodgkin病、非Hodgkin病、多発性骨髄腫、Waldenstromマクログロブリン血症、重鎖病、固形腫瘍、肉腫及び癌腫、線維肉腫、粘液肉腫、脂肪肉腫、軟骨肉腫、骨原性肉腫、骨肉腫、脊索腫、血管肉腫、内皮肉腫、リンパ管肉腫、リンパ管内皮肉腫、滑膜腫、中皮腫、Ewing腫瘍、平滑筋肉腫、横紋筋肉腫、結腸肉腫、結腸直腸癌、膵臓癌、乳癌、卵巣癌、前立腺癌、扁平上皮細胞癌、基底細胞癌、腺癌、汗腺癌、脂腺癌、乳頭癌、乳頭腺癌、嚢胞腺癌、髄様癌、気管支原性癌、腎細胞癌、肝細胞癌(HCC)、肝細胞癌、胆管癌、絨毛腫、精上皮腫、胎児性癌、Wilm’s腫瘍、子宮頸癌、子宮癌、精巣腫瘍、肺癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、膀胱癌、上皮癌、神経膠腫、星細胞腫、髄芽腫、頭蓋咽頭腫、上衣腫、松果体腫、血管芽腫、聴神経腫、乏突起細胞腫、髄膜腫、黒色腫、神経芽腫、網膜芽腫、鼻咽頭癌、食道癌、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳及び中枢神経系(CNS)癌、子宮頸癌、絨毛腫、結腸直腸癌、結合組織癌、消化器系癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部癌、胃癌、上皮内新生物、腎臓癌、喉頭癌、肝臓癌、肺癌(小細胞、大細胞)、黒色腫、神経芽腫;口腔癌(例えば唇、舌、口、及び咽頭)、卵巣癌、膵臓癌、網膜芽腫、横紋筋肉腫、直腸癌;呼吸器系癌、肉腫、皮膚癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮癌、ならびに尿路系癌等であるがこれらに限定されない、様々ながんの治療に使用され得る。
併用療法
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、1つまたは複数の追加の治療物質または治療(例えばがんについての別の治療物質または治療)と併用され得る。例えば、抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、1つまたは複数の追加の治療物質と併用して対象(例えばヒト患者)へ投与され得、当該併用は、がんを有するかまたは発症するリスクがある対象へ治療利益を提供する。
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、1つまたは複数の追加の治療物質または治療(例えばがんについての別の治療物質または治療)と併用され得る。例えば、抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、1つまたは複数の追加の治療物質と併用して対象(例えばヒト患者)へ投与され得、当該併用は、がんを有するかまたは発症するリスクがある対象へ治療利益を提供する。
いくつかの態様において、抗IL-27抗体またはその抗原結合部分及び1つまたは複数の追加の治療物質は、同じ時間に(例えば同時に)投与される。他の態様において、抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は時間内で第一に投与され、1つまたは複数の追加の治療物質は時間内で第二に(例えば逐次的に)投与される。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療物質は時間内で第一に投与され、抗IL-27抗体は時間内で第二に投与される。
本明細書において記載される抗IL-27抗体またはその抗原結合断片は、以前または現在施されている治療法を補充または増大し得る。例えば抗IL-27抗体またはその抗原結合断片による治療に際して、1つまたは複数の追加の治療物質の投与は、停止または減退させることができ、例えばより低いレベルで投与され得る。いくつかの態様において、以前の療法の投与は維持され得る。いくつかの態様において、以前の治療法は、抗IL-27抗体のレベルが治療効果を提供するのに十分なレベルを到達するまで、維持されるだろう。
いくつかの態様において、本開示は、対象においてがんを治療する方法であって、IL-27へ特異的に結合しアンタゴナイズする、有効量の本開示によって提供される単離された抗体またはその抗原結合部分を、1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用して、対象へ投与することを含み、第2の治療剤または手順が、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬物、細胞傷害剤、免疫ベース療法、サイトカイン、外科的手順、放射線による手順、共刺激分子の活性化物質、阻害分子の阻害物質、ワクチン、もしくは細胞免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、PD-1アンタゴニスト、TIM-3阻害物質、LAG-3阻害物質、TIGIT阻害物質、CD112R阻害物質、TAM阻害物質、STINGアゴニスト、4-1BBアゴニスト、またはそれらの組み合わせである。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、CD39アンタゴニスト、CD73アンタゴニスト、CCR8アンタゴニスト、またはそれらの組み合わせである。いくつかの態様において、抗CD73は、例えば米国公開番号2019/0031766A1(それは、参照することによってその全体が本明細書に援用される)中で開示される任意の抗CD73抗体である。いくつかの態様において、抗CD39は、例えば国際公開番号WO2019/178269 A2(それは、参照することによってその全体が本明細書に援用される)中で開示される任意の抗CD39抗体である。
いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、PD-1アンタゴニストである。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PDR001、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ピジリズマブ、MEDI0680、REGN2810、TSR-042、PF-06801591、及びAMP-224からなる群から選択される。ある特定の態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、PD-L1阻害物質である。いくつかの態様において、PD-L1阻害物質は、FAZ053、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、及びBMS-936559からなる群から選択される。いくつかの態様において、本開示は、抗PD-1抗体の1つまたは複数の活性を促進する(例えばPD-1媒介性サイトカイン分泌を促進する;抗PD-1媒介性TNFα分泌を促進する;抗PD-1抗体へ曝露された細胞からの抗PD-1媒介性IL-6分泌を促進する)方法であって、抗PD-1抗体と同時にまたはそれへ逐次的に、本開示によって提供される抗体またはその抗原結合部分へ細胞を曝露し、それによって抗PD1抗体の1つまたは複数の活性を促進することを含む、前記方法を提供する。
いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、スニチニブ(Sutent(登録商標))、カボザンチニブ(CABOMETYX(登録商標))、アキシチニブ(INLYTA(登録商標))、レンバチニブ(LENVIMA(登録商標))、エベロリムス(AFINITOR(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、エパカドスタット、NKTR-214(CD-122バイアスアゴニスト)、チボザニブ(FOTIVDA(登録商標))、アベキシノスタット、イピリムマブ(YERVOY(登録商標))、トレメリムマブ、パゾパニブ(VOTRIENT(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、テムシロリムス(TORISEL(登録商標))、ラムシルマブ(CYRAMZA(登録商標))、ニラパリブ、サボリチニブ、ボロラニブ(X-82)、レゴラフェニブ(STIVARGO(登録商標))、ドナフェニブ(マルチキナーゼ阻害物質)、カムレリズマブ(SHR-1210)、ペキサスチモジン・デバシレプベク(JX-594)、ラムシルマブ(CYRAMZA(登録商標))、アパチニブ(YN968D1)、カプセル化ドキソルビシン(THERMODOX(登録商標))、チバンチニブ(ARQ197)、ADI-PEG 20、ビニメチニブ、メシル酸アパチニブ、ニンテダニブ、リリルマブ、ニボルマブ(OPDIVO(登録商標))、ペムブロリズマブ(KEYTRUDA(登録商標))、アテゾリズマブ(TECENTRIQ(登録商標))、アベルマブ(BAVENCIO(登録商標))、デュルバルマブ(IMFIMZI(登録商標))、セミプリマブ-rwlc(LIBTAYO(登録商標))、チスレリズマブ、及び/またはスパルタリズマブである。
いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、TIM-3阻害物質であり、任意選択で、TIM-3阻害物質は、MGB453またはTSR-022である。
いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、LAG-3阻害物質であり、任意選択で、LAG-3阻害物質は、LAG525、BMS-986016、及びTSR-033からなる群から選択される。
いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、TIGIT阻害物質である。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、CD112R阻害物質である。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、TAM(Axl、Mer、Tyro)阻害物質である。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、STINGアゴニストである。いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、4-1BBアゴニストである。
いくつかの態様において、1つまたは複数の追加の治療剤は、チロシンキナーゼ阻害物質、アデノシン軸を標的化する薬剤(例えばCD39アンタゴニスト、CD73アンタゴニスト、またはA2ARアンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、もしくはデュアルA2AR/A2BRアンタゴニスト)、CCR8アンタゴニスト、CTLA4アンタゴニスト、VEG-F阻害物質、またはそれらの組み合わせである。
化学療法剤との併用
本発明の組成物との併用及び/または共投与に好適な化学療法剤としては、例えば:タキソール、サイトカラシンB、グラミシジンD、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド(tenoposide)、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルチシン(colchicin)、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン(dihydroxyanthrancindione)、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンD、1-デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、及びピューロマイシン、ならびにそれらの類似体または同族体が挙げられる。さらなる薬剤としては、例えば抗代謝物質(例えばメトトレキサート、6-メルカプトプリン、6-チオグアニン、シタラビン、5-フルオロウラシルデカルバジン(decarbazine))、アルキル化剤(例えばメクロレタミン、thioTEPA、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン(BSNU)、ロムスチン(CCNU)、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンC、cis-ジクロルジアミン(dichlordiamine)白金(II)(DDP)、プロカルバジン、アルトレタミン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、サトラプラチン、または四硝酸トリプラチン)、アントラサイクリン(例えばダウノルビシン(以前はダウノマイシン)及びドキソルビシン)、抗生物質(例えばダクチノムシン(dactinomcin)(以前はアクチノマイシン)、ブレオマイシン、ミトラマイシン、及びアントラマイシン(AMC))、ならびに抗有糸分裂剤(例えばビンクリスチン及びビンブラスチン)及びテモゾロマイドが挙げられる。
本発明の組成物との併用及び/または共投与に好適な化学療法剤としては、例えば:タキソール、サイトカラシンB、グラミシジンD、臭化エチジウム、エメチン、マイトマイシン、エトポシド、テノポシド(tenoposide)、ビンクリスチン、ビンブラスチン、コルチシン(colchicin)、ドキソルビシン、ダウノルビシン、ジヒドロキシアントラシンジオン(dihydroxyanthrancindione)、ミトキサントロン、ミトラマイシン、アクチノマイシンD、1-デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、及びピューロマイシン、ならびにそれらの類似体または同族体が挙げられる。さらなる薬剤としては、例えば抗代謝物質(例えばメトトレキサート、6-メルカプトプリン、6-チオグアニン、シタラビン、5-フルオロウラシルデカルバジン(decarbazine))、アルキル化剤(例えばメクロレタミン、thioTEPA、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン(BSNU)、ロムスチン(CCNU)、シクロホスファミド、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンC、cis-ジクロルジアミン(dichlordiamine)白金(II)(DDP)、プロカルバジン、アルトレタミン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、サトラプラチン、または四硝酸トリプラチン)、アントラサイクリン(例えばダウノルビシン(以前はダウノマイシン)及びドキソルビシン)、抗生物質(例えばダクチノムシン(dactinomcin)(以前はアクチノマイシン)、ブレオマイシン、ミトラマイシン、及びアントラマイシン(AMC))、ならびに抗有糸分裂剤(例えばビンクリスチン及びビンブラスチン)及びテモゾロマイドが挙げられる。
PD-1/PD-L1アンタゴニストとの併用
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、ヒトPD-1またはPD-L1へ特異的に結合し、PD-1/PD-L1生物学的活性、及び/またはヒトPD-1/PD-L1シグナリングによって媒介される下流経路(複数可)及び/または細胞プロセス、あるいは他のヒトPD-1/PD-L1媒介される機能を阻害する、1つまたは複数のPD-1アンタゴニストと併用される(例えば併用で投与される)。
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、ヒトPD-1またはPD-L1へ特異的に結合し、PD-1/PD-L1生物学的活性、及び/またはヒトPD-1/PD-L1シグナリングによって媒介される下流経路(複数可)及び/または細胞プロセス、あるいは他のヒトPD-1/PD-L1媒介される機能を阻害する、1つまたは複数のPD-1アンタゴニストと併用される(例えば併用で投与される)。
したがって、PD-1/PD-L1生物学的活性(PD-1/PD-L1シグナリングによって媒介される下流経路及び/または細胞プロセス(PD-1/PD-L1への受容体結合及び/または細胞応答の惹起等)が挙げられる)を、直接またはアロステリックに、ブロック、アンタゴナイズ、抑制、阻害、または低減するPD-1アンタゴニストが、本明細書において提供される。細胞または対象によって産生されるヒトPD-1またはPD-L1の量(quantity)または量(amount)を低減するPD-1アンタゴニストも、本明細書において提供される。
いくつかの態様において、本開示は、ヒトPD-1を結合し、PD-1へのPD-L1結合を防止、阻害、または低減するPD-1アンタゴニストを提供する。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1またはPD-L1をコードするmRNAに結合し、翻訳を防止する。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1またはPD-L1をコードするmRNAに結合し、分解及び/またはターンオーバーを引き起こす。
いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1のシグナリングまたは機能を阻害する。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1が、PD-L1、PD-L2、またはPD-L1及びPD-L2の両方へ結合することをブロックする。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1がPD-L1へ結合することをブロックする。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1がPD-L2へ結合することをブロックする。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1がPD-L1及びPD-L2へ結合することをブロックする。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1に特異的に結合する。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-L1に特異的に結合する。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-L2に特異的に結合する。
いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1がその同族のリガンドへ結合することを阻害する。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1がPD-L1へ結合すること、PD-1がPD-L2へ結合すること、またはPD-1がPD-L1及びPD-L2の両方へ結合することを阻害する。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1がその同族のリガンドへ結合することを阻害しない。
いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、PD-1またはPD-L1へ特異的に結合する、単離された抗体(mAb)またはその抗原結合断片である。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、ヒトPD-1へ特異的に結合する、抗体またはその抗原結合断片である。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、ヒトPD-L1へ特異的に結合する、抗体またはその抗原結合断片である。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、ヒトPD-L1へ結合し、PD-L1のPD-1への結合を阻害する、抗体または抗原結合断片である。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、ヒトPD-1へ結合し、PD-L1のPD-1への結合を阻害する、抗体または抗原結合断片である。
PD-1と、そのリガンドであるPD-L1及びPD-L2のいずれか1つまたは両方との間の相互作用を阻害または混乱させる複数の免疫チェックポイントアンタゴニストは、臨床開発において、またはがんの治療のために臨床医に、現在利用可能である。
本開示によって提供される組成物、方法、及び使用のうちの任意のものにおいて、PD-1アンタゴニストを構成し得る抗ヒトPD-1抗体またはその抗原結合断片の例としては、KEYTRUDA(登録商標)(ペムブロリズマブ、MK-3475、h409A11;US8952136、US8354509、US8900587、及びEP2170959を参照、それらのすべては、参照することによってそれらの全体が本明細書に含まれる;Merck)、OPDIVO(登録商標)(ニボルマブ(BMS-936558、MDX-1106、ONO-4538);US7595048、US8728474、US9073994、US9067999、EP1537878、US8008449、US8779105、及びEP2161336を参照、それらのすべては、参照することによってそれらの全体が本明細書に含まれる;Bristol Myers Squibb)、MEDI0680(AMP-514)、BGB-A317及びBGB-108(BeiGene)、244C8及び388D4(WO2016106159を参照、それは、参照することによってその全体が本明細書に援用される;Enumeral Biomedical)、PDR001(Novartis)、ならびにREGN2810(Regeneron)が挙げられるがこれらに限定されない。したがっていくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、ペムブロリズマブである。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、ニボルマブである。
本開示によって提供される組成物、方法、及び使用のうちの任意のものにおいて、PD-1アンタゴニストを構成し得る抗ヒトPD-L1抗体またはその抗原結合断片の例としては、BAVENCIO(登録商標)(アベルマブ、MSB0010718C、WO2013/79174を参照、それは、参照することによってその全体が本明細書に援用される;Merck/Pfizer)、IMFINZI(登録商標)(デュルバルマブ、MEDI4736)、TECENTRIQ(登録商標)(アテゾリズマブ、MPDL3280A、RG7446;WO2010/077634を参照、それは、参照することによってその全体が本明細書に援用される;Roche)、MDX-1105(BMS-936559、12A4;US7943743及びWO2013/173223を参照、それらの両方は、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される;Medarex/BMS)、及びFAZ053(Novartis)が挙げられるがこれらに限定されない。したがっていくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、アベルマブである。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、デュルバルマブである。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、アテゾリズマブである。
いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、ヒトPD-1またはヒトPD-L1へ特異的に結合するイムノアドヘシン(例えば定常領域(免疫グロブリン分子のFc領域等)へ縮合されたPD-L1またはPD-L2の細胞外部分またはPD-1結合部分を含有する融合タンパク質)である。PD-1へ特異的に結合するイムノアドへシオン(immunoadhesion)分子の例は、WO2010/027827及びWO2011/066342(それらの両方は、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される)中で記載される。いくつかの態様において、PD-1アンタゴニストは、ヒトPD-1へ特異的に結合するPD-L2-FC融合タンパク質である、AMP-224(B7-DCIgとしても公知である)である。
PD-1またはPD-L1へ結合し、PD-1/PD-L1シグナリング経路を混乱させる任意のPD-1アンタゴニストが、本明細書において開示される組成物、方法、及び使用に好適であることは当業者によって理解されるだろう。
いくつかの態様において、PD-1/PD-L1アンタゴニストは、小分子、核酸、ペプチド、ペプチド模倣物、タンパク質、炭水化物、炭水化物誘導体、またはグリコポリマーである。例示的な小分子PD-1阻害物質は、Zhan et al.,(2016)Drug Discov Today 21(6):1027-1036中で記載される。
TIM-3阻害物質との併用
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、TIM-3阻害物質と併用される(例えば併用で投与される)。TIM-3阻害物質は、抗体、その抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドであり得る。いくつかの態様において、TIM-3阻害物質は、MGB453(Novartis)、TSR-022(Tesaro)、またはLY3321367(Eli Lilly)から選ばれる。いくつかの態様において、抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、MGB453と併用して投与される。いくつかの態様において、抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、TSR-022と併用して投与される。
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、TIM-3阻害物質と併用される(例えば併用で投与される)。TIM-3阻害物質は、抗体、その抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドであり得る。いくつかの態様において、TIM-3阻害物質は、MGB453(Novartis)、TSR-022(Tesaro)、またはLY3321367(Eli Lilly)から選ばれる。いくつかの態様において、抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、MGB453と併用して投与される。いくつかの態様において、抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、TSR-022と併用して投与される。
LAG-3阻害物質との併用
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、LAG-3阻害物質と併用される(例えば併用で投与される)。LAG-3阻害物質は、抗体、その抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドであり得る。いくつかの態様において、LAG-3阻害物質は、LAG525(Novartis)、BMS-986016(Bristol Myers Squibb)、TSR-033(Tesaro)、MK-4280(Merck及びCo)、またはREGN3767(Regeneron)から選ばれる。
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、LAG-3阻害物質と併用される(例えば併用で投与される)。LAG-3阻害物質は、抗体、その抗原結合断片、イムノアドヘシン、融合タンパク質、またはオリゴペプチドであり得る。いくつかの態様において、LAG-3阻害物質は、LAG525(Novartis)、BMS-986016(Bristol Myers Squibb)、TSR-033(Tesaro)、MK-4280(Merck及びCo)、またはREGN3767(Regeneron)から選ばれる。
その他の併用
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、TIGIT阻害物質、キナーゼ阻害物質(例えばチロシンキナーゼ阻害物質(TKI))、CD112R阻害物質、TAM受容体阻害物質、4-1BB STINGアゴニスト、及び/または、アゴニスト、あるいはそれらの組み合わせと併用される(例えば併用で投与される)。いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、チロシンキナーゼ阻害物質、アデノシン軸を標的化する薬剤(例えばCD39アンタゴニスト、CD73アンタゴニスト、またはA2ARアンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、もしくはデュアルA2AR/A2BRアンタゴニスト)、CCR8アンタゴニスト、CTLA4アンタゴニスト、VEG-F阻害物質、またはそれらの組み合わせと併用される(例えば併用で投与される)。
いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、TIGIT阻害物質、キナーゼ阻害物質(例えばチロシンキナーゼ阻害物質(TKI))、CD112R阻害物質、TAM受容体阻害物質、4-1BB STINGアゴニスト、及び/または、アゴニスト、あるいはそれらの組み合わせと併用される(例えば併用で投与される)。いくつかの態様において、本開示によって提供される抗IL-27抗体またはその抗原結合部分は、チロシンキナーゼ阻害物質、アデノシン軸を標的化する薬剤(例えばCD39アンタゴニスト、CD73アンタゴニスト、またはA2ARアンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、もしくはデュアルA2AR/A2BRアンタゴニスト)、CCR8アンタゴニスト、CTLA4アンタゴニスト、VEG-F阻害物質、またはそれらの組み合わせと併用される(例えば併用で投与される)。
検出方法
いくつかの実施形態において、本明細書において記載される抗IL-27抗体またはその抗原結合断片は、生物学的サンプル中のヒトIL-27の検出及び/または定量の方法において利用され得る。したがって、本明細書において記載される抗IL-27抗体またはその抗原結合断片は、患者における疾患(例えばがん)の診断、予後予測、及び/または進行の決定に有益である。
いくつかの実施形態において、本明細書において記載される抗IL-27抗体またはその抗原結合断片は、生物学的サンプル中のヒトIL-27の検出及び/または定量の方法において利用され得る。したがって、本明細書において記載される抗IL-27抗体またはその抗原結合断片は、患者における疾患(例えばがん)の診断、予後予測、及び/または進行の決定に有益である。
本明細書において定義されるように、がんの改善について対象(例えばヒト患者)をモニタリングすることは、疾患パラメーターの変化(例えば腫瘍増殖の低減)についての対象を評価することを意味する。いくつかの実施形態において、評価は、投与の、少なくとも1時間、例えば少なくとも2、4、6、8、12、24、もしくは48時間、または少なくとも1日、2日、4日、10日、13日、20日、もしくはそれ以上、または少なくとも1週、2週、4週、10週、13週、20週間、もしくはそれ以上後に遂行される。対象は、以下の期間:治療の開始前;治療の間;または治療の1つもしくは複数の要素が施された後、のうちの1つまたは複数で評価され得る。評価は、さらなる治療についての必要性を評価すること(例えば投薬量、投与の頻度、または治療の継続期間を改変するべきかどうかを評価すること)を含み得る。評価は、選択された治療法様式を追加または撤回する必要性を評価すること(例えば本明細書において記載されるがんについての治療のうちの任意ものを追加または撤回すること)も含み得る。
いくつかの実施形態において、本開示は、対象からのサンプル中のIL-27を検出する方法であって、(a)IL-27がサンプル中に存在するならば検出抗体が検出抗体-IL-27複合体を形成することを可能にする条件下で、対象からのサンプルを検出抗体と接触させ、検出抗体が、本開示によって提供される抗体またはその抗原結合断片であること;及び(b)ステップ(a)において産生された複合体があるならば、その存在を検出すること、を含む、前記方法を提供する。
いくつかの実施形態において、本開示は、対象におけるIL-27関連がんを検出する方法であって、(a)IL-27がサンプル中に存在するならば検出抗体が検出抗体-IL-27複合体を形成することを可能にする条件下で、IL-27関連がんを有する疑いのある対象からのサンプルを検出抗体と接触させ、検出抗体が、本開示によって提供される抗体またはその抗原結合部分であること;及び(b)ステップ(a)において産生された複合体があるならば、その存在を検出すること、を含む、前記方法を提供する。いくつかの実施形態において、検出抗体は、検出可能な標識へカップルされる。いくつかの実施形態において、方法は、サンプルを捕捉抗体と接触させて、IL-27がサンプル中に存在するならばIL-27及び捕捉抗体を含む複合体を産生し、捕捉抗体が、本開示によって提供される抗体またはその抗原結合部分であることをさらに含む。
いくつかの実施形態において、捕捉抗体は、固体支持体上に固定化される。いくつかの実施形態において、サンプルは、検出抗体の前に捕捉抗体と接触させられる。いくつかの実施形態において、サンプルは、体液サンプルである。いくつかの実施形態において、体液サンプルは、血液、血清、血漿、細胞溶解物、または組織溶解物である。
いくつかの実施形態において、がんは、腎細胞癌(RCC)、肝細胞癌、肺癌、胃食道癌、卵巣癌、子宮内膜癌、黒色腫、白血病、及びリンパ腫から選択される。いくつかの実施形態において、がんは、腎細胞癌(RCC)である。他の実施形態において、がんは、肝細胞癌(HCC)である。いくつかの実施形態において、がんは、白血病及びリンパ腫から選択される。いくつかの実施形態において、がんは、急性骨髄性白血病(AML)である。
本開示は、その具体的な態様を参照して記載されているが、本開示の真の趣旨及び範囲から逸脱せずに、当業者によって、様々な変化が行われ得ること及び均等物が置換され得ることを理解されたい。加えて、特定の状況、材料、物質の組成、プロセス、プロセスステップ(複数可)を、本開示の目的、趣旨、及び範囲へ適合させるように、多くの修飾が行われ得る。すべてのかかる修飾は、本開示の範囲内であるように意図される。
実施例1:ヒトIL-27のP28サブユニットに特異的に結合する抗IL-27抗体の酵母における生成
複数のエピトープビンを提示する抗IL-27抗体を、以下で記載される方法を使用して、8つのナイーブなヒト合成酵母ライブラリーから選択した。
複数のエピトープビンを提示する抗IL-27抗体を、以下で記載される方法を使用して、8つのナイーブなヒト合成酵母ライブラリーから選択した。
材料及び方法
約109の多様性の各々の8つのナイーブなヒト合成酵母ライブラリーを、以前に記載されるように、増殖させた(例えばXu et al.,(2013)Protein Eng Des Sel 26(10):663-670;WO2009036379;WO2010105256;及びWO2012009568を参照、それらのすべては、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される)。選択の最初の2ラウンドについては、Miltenyi MACSシステムを利用する磁気ビーズ選別技法を、以前に記載されるように遂行した(例えばSiegel et al.(2004)J Immunol Methods 286(1-2):141-153を参照、それは、参照することによってその全体が本明細書に援用される)。
約109の多様性の各々の8つのナイーブなヒト合成酵母ライブラリーを、以前に記載されるように、増殖させた(例えばXu et al.,(2013)Protein Eng Des Sel 26(10):663-670;WO2009036379;WO2010105256;及びWO2012009568を参照、それらのすべては、参照することによってそれらの全体が本明細書に援用される)。選択の最初の2ラウンドについては、Miltenyi MACSシステムを利用する磁気ビーズ選別技法を、以前に記載されるように遂行した(例えばSiegel et al.(2004)J Immunol Methods 286(1-2):141-153を参照、それは、参照することによってその全体が本明細書に援用される)。
簡潔には、酵母細胞(約1010細胞/ライブラリー)を、洗浄バッファー(リン酸緩衝食塩水(PBS)/0.1%のウシ血清アルブミン(BSA))中で、3mLの100nMのビオチン化抗原(組み換えヒトIL-27;R&D Systems)により30℃で30分間インキュベーションした。40mLの氷冷洗浄バッファーにより1回洗浄した後に、細胞ペレットを20mLの洗浄バッファー中で再懸濁し、ストレプトアビジンマイクロビーズ(500μL)を酵母へ添加し、4℃で15分間インキュベーションした。次に、酵母細胞をペレット化し、20mLの洗浄バッファー中で再懸濁し、Miltenyi LSカラムの上に装填した。20mLを装填した後に、カラムを3mLの洗浄バッファーにより3回洗浄した。次いでカラムを磁界から除去し、酵母細胞を5mLの増殖培地により溶出し、次いで一晩に増殖させた。続く選択のラウンドを、フローサイトメトリーを使用して遂行した。およそ2×107の酵母細胞をペレット化し、洗浄バッファーにより3回洗浄し、平衡条件下の漸減濃度のビオチン化抗原(100から1nM)、種交差反応性を得るために30nMの異なる種のビオチン化抗原、または選択から非特異的抗体を除去するために多特異性枯渇試薬(PSR)のいずれかにより30℃でインキュベーションした。PSR枯渇のために、ライブラリーを、1:10希釈のビオチン化PSR試薬によりインキュベーションした。
次いで酵母細胞を洗浄バッファーにより2回洗浄し、LC-FITC(1:100を希釈)、及びSA-633(1:500希釈)またはEAPE(1:50希釈)のいずれかの二次試薬により4℃で15分間染色した。洗浄バッファーにより2回洗浄した後に、細胞ペレットを0.3mLの洗浄バッファー中で再懸濁し、ストレーナーキャップ付き選別チューブへ移した。FACS ARIAソーター(BD Biosciences)を使用して選別を遂行し、所望される特徴を備えた抗体を選択するように選別ゲートを決定した。所望される特徴のすべてを備えた集団が得られるまで、選択ラウンドを反復した。選別の最終なラウンド後に、酵母細胞をプレーティングし、特徴評価のために個別のコロニーを拾い上げた。
軽鎖多様化
抗体のさらなる探索及び改善のために、軽鎖多様化プロトコルを一次探索相の間に使用した。
抗体のさらなる探索及び改善のために、軽鎖多様化プロトコルを一次探索相の間に使用した。
軽鎖バッチ多様化プロトコル:ナイーブ選択アウトプットからの重鎖プラスミドを、スマッシュ・アンド・グラブを介して酵母から抽出し、E.coli中で増殖させ、後続してそこから精製し、5×106の多様性で軽鎖ライブラリーの中へ形質転換した。ナイーブ探索と同じ条件を利用して、1ラウンドのMACS及び4ラウンドのFACSにより選択を遂行した。
抗体最適化
抗体の最適化を、以下に記載されるように重鎖可変領域及び軽鎖可変領域の中へ多様性を導入することによって遂行した。
抗体の最適化を、以下に記載されるように重鎖可変領域及び軽鎖可変領域の中へ多様性を導入することによって遂行した。
CDRH1及びCDRH2の選択:単一抗体のCDRH3を、1×108の多様性のCDRH1バリアント及びCDRH2バリアントを備えたあらかじめ作製したライブラリーの中へ組み換え、ナイーブ探索において記載されるように1ラウンドのMACS及び4ラウンドのFACSにより選択を遂行した。異なるFACSラウンドにおいて、ライブラリーを、PSR結合、種交差反応性、及びタイトレーションまたは親のFab前複合体形成による親和性圧力について調査し、所望される特徴を備えた集団を得るように選別を遂行した。
抗体の産生及び精製
酵母クローンを飽和まで増殖させ、次いで振盪しながら30℃で48時間誘導した。誘導後に、酵母細胞をペレット化し、上清を精製のために採取した。プロテインAカラムを使用してIgGを精製し、酢酸(pH2.0)により溶出した。Fab断片をパパイン消化によって生成し、KappaSelect(GE Healthcare LifeSciences)上で精製した。
酵母クローンを飽和まで増殖させ、次いで振盪しながら30℃で48時間誘導した。誘導後に、酵母細胞をペレット化し、上清を精製のために採取した。プロテインAカラムを使用してIgGを精製し、酢酸(pH2.0)により溶出した。Fab断片をパパイン消化によって生成し、KappaSelect(GE Healthcare LifeSciences)上で精製した。
ForteBio KD測定
ForteBio親和性測定を、概して以前に記載されるようにOctet RED384で遂行した(例えばEstep et al,High throughput solution-based measurement of antibody-antigen affinity and epitope binning.Mabs 5(2),270-278 (2013)を参照、参照することによってその全体が本明細書に援用される)。簡潔には、IgGをAHQセンサーの上へオンラインで装填することによって、ForteBio親和性測定を遂行した。センサーをアッセイバッファー中でオフラインで30分間平衡化し、次いでベースライン確立のためにオンラインで60秒間モニタリングした。IgGを装填したセンサーを100nMの抗原へ3分間曝露し、その後にオフレート測定のためにアッセイバッファーへ3分間移した。すべての動態を、1:1結合モデルを使用して分析した。組み換えヒトIL-27タンパク質(R&D Systems、カタログ:2526-IL)を、抗原として使用した。抗IL-27抗体についての親和性測定は図1中で示す。
ForteBio親和性測定を、概して以前に記載されるようにOctet RED384で遂行した(例えばEstep et al,High throughput solution-based measurement of antibody-antigen affinity and epitope binning.Mabs 5(2),270-278 (2013)を参照、参照することによってその全体が本明細書に援用される)。簡潔には、IgGをAHQセンサーの上へオンラインで装填することによって、ForteBio親和性測定を遂行した。センサーをアッセイバッファー中でオフラインで30分間平衡化し、次いでベースライン確立のためにオンラインで60秒間モニタリングした。IgGを装填したセンサーを100nMの抗原へ3分間曝露し、その後にオフレート測定のためにアッセイバッファーへ3分間移した。すべての動態を、1:1結合モデルを使用して分析した。組み換えヒトIL-27タンパク質(R&D Systems、カタログ:2526-IL)を、抗原として使用した。抗IL-27抗体についての親和性測定は図1中で示す。
ForteBioエピトープビニング/リガンドブロッキング
エピトープビニング/リガンドブロッキングを、標準的サンドイッチフォーマットの交差ブロッキングアッセイを使用して遂行した。対照の抗標的IgGを、AHQセンサーの上へ装填し、センサー上の占有されていないFc結合部位を関連性がないヒトIgG1抗体によりブロックした。次いでセンサーを100nMの標的抗原、続いて第2の抗標的抗体またはリガンドへ曝露した。抗原会合後の第2の抗体またはリガンドによる追加の結合は、占有されていないエピトープ(非競合物質)を示し、その一方で、結合無しは、エピトープブロッキング(競合物質またはリガンドブロッキング)を示さす。
エピトープビニング/リガンドブロッキングを、標準的サンドイッチフォーマットの交差ブロッキングアッセイを使用して遂行した。対照の抗標的IgGを、AHQセンサーの上へ装填し、センサー上の占有されていないFc結合部位を関連性がないヒトIgG1抗体によりブロックした。次いでセンサーを100nMの標的抗原、続いて第2の抗標的抗体またはリガンドへ曝露した。抗原会合後の第2の抗体またはリガンドによる追加の結合は、占有されていないエピトープ(非競合物質)を示し、その一方で、結合無しは、エピトープブロッキング(競合物質またはリガンドブロッキング)を示さす。
MSD-SET動態アッセイ
平衡親和性測定を以前に記載されるように遂行した(Estep et al.,2013)。溶解平衡タイトレーション(SET)を、抗原を10~100pMで一定に保持して、PBS+0.1%のIgG不含有BSA(PBSF)中で遂行し、5~100nMで開始する抗体の3~5倍連続希釈物によりインキュベーションした(実験条件はサンプルに依存性する)。抗体(PBS中で20nM)を、標準的結合MSD-ECLプレートの上に4℃で一晩または室温で30分間コーティングした。次いでプレートを700rpmで振盪しながら30分間ブロックし、続いて洗浄バッファー(PBSF+0.05%のTween(登録商標) 20)により3回洗浄した。SETサンプルをプレート上に適用し、700rpmで振盪しながら150秒間インキュベーションし、続いて1回洗浄した。プレート上に捕捉された抗原を、PBSF中の250ng/mLのスルホタグ(sulfotag)標識ストレプトアビジンによるプレートの3分間インキュベーションによって検出した。プレートを洗浄バッファーにより3回洗浄し、次いで界面活性物質を含む1×Read Buffer Tを使用して、MSD Sector Imager 2400機器で読み取った。パーセント遊離抗原を、タイトレーションされた抗体の関数としてPrismでプロットし、二次方程式へフィッティングさせてKDを得た。スループットを改善するために、SETサンプル調製を含むMSD-SET実験を通して、液体ハンドリングロボットを使用した。
平衡親和性測定を以前に記載されるように遂行した(Estep et al.,2013)。溶解平衡タイトレーション(SET)を、抗原を10~100pMで一定に保持して、PBS+0.1%のIgG不含有BSA(PBSF)中で遂行し、5~100nMで開始する抗体の3~5倍連続希釈物によりインキュベーションした(実験条件はサンプルに依存性する)。抗体(PBS中で20nM)を、標準的結合MSD-ECLプレートの上に4℃で一晩または室温で30分間コーティングした。次いでプレートを700rpmで振盪しながら30分間ブロックし、続いて洗浄バッファー(PBSF+0.05%のTween(登録商標) 20)により3回洗浄した。SETサンプルをプレート上に適用し、700rpmで振盪しながら150秒間インキュベーションし、続いて1回洗浄した。プレート上に捕捉された抗原を、PBSF中の250ng/mLのスルホタグ(sulfotag)標識ストレプトアビジンによるプレートの3分間インキュベーションによって検出した。プレートを洗浄バッファーにより3回洗浄し、次いで界面活性物質を含む1×Read Buffer Tを使用して、MSD Sector Imager 2400機器で読み取った。パーセント遊離抗原を、タイトレーションされた抗体の関数としてPrismでプロットし、二次方程式へフィッティングさせてKDを得た。スループットを改善するために、SETサンプル調製を含むMSD-SET実験を通して、液体ハンドリングロボットを使用した。
実施例2:抗IL-27抗体の組み換えヒトIL-27への結合
実施例1中で記載される抗IL-27抗体が組み換えヒトIL-27へ結合する能力を、ELISAによって査定した。簡潔には、Nunc MaxiSorp ELISA Plates(Affymetrix #44-2404-21)を、100μL/ウェルの組み換えヒトIL-27(R&D Systems #2526-IL/CF)(0.5μg/mLにPBS中で希釈した)によりコーティングし、シールし、4℃で一晩でインキュベーションした。プレートを、100μL/ウェルの洗浄バッファー(PBS+0.01%のTween(登録商標))により3回洗浄した。次いでプレートを、200μL/ウェルのブロッキングバッファー(PBS+0.1%のBSA+0.01%のTween(登録商標))により、振盪しながら室温(RT)で1時間ブロックした。ブロッキングバッファーをデカントし、1ウェルあたり100μLの希釈された対照抗体及び抗IL-27抗体を示されるように添加した。10ポイントの連続希釈物を、1μg/mLの最高の濃度から開始して、1:10の抗体の希釈によって各々の抗体について生成した。プレートを、振盪しながらRTで1~2時間インキュベーションした。プレートを、100μL/ウェルの洗浄バッファーにより3回洗浄した。100μL/ウェルの抗ヒトIgG二次抗体(SouthernBiotech;カタログ番号2014-05)を添加した(1:5000にブロッキングバッファー中で希釈した)。次いでプレートを、振盪しながらRTで1時間インキュベーションした。1時間のインキュベーション後に、プレートを、100μL/ウェルの洗浄バッファーにより3回洗浄した。プレートを顕色させるために、100μL/ウェルのTMB Buffer(Life Technologies #00-2023)を添加した。標準曲線のウェル中で青色の顕色が観察され、希釈された対照抗体の最高濃度が濃青色に到達してすぐに(5~10分間)、50μL/ウェルのSTOP Solution(Thermo Fisher #SS04)を添加した(色は黄色へ変化するだろう)。顕色させたプレートを、反応停止の30分間以内に450nm(波長補正のために570nmのものを引いた)で読み取った。
実施例1中で記載される抗IL-27抗体が組み換えヒトIL-27へ結合する能力を、ELISAによって査定した。簡潔には、Nunc MaxiSorp ELISA Plates(Affymetrix #44-2404-21)を、100μL/ウェルの組み換えヒトIL-27(R&D Systems #2526-IL/CF)(0.5μg/mLにPBS中で希釈した)によりコーティングし、シールし、4℃で一晩でインキュベーションした。プレートを、100μL/ウェルの洗浄バッファー(PBS+0.01%のTween(登録商標))により3回洗浄した。次いでプレートを、200μL/ウェルのブロッキングバッファー(PBS+0.1%のBSA+0.01%のTween(登録商標))により、振盪しながら室温(RT)で1時間ブロックした。ブロッキングバッファーをデカントし、1ウェルあたり100μLの希釈された対照抗体及び抗IL-27抗体を示されるように添加した。10ポイントの連続希釈物を、1μg/mLの最高の濃度から開始して、1:10の抗体の希釈によって各々の抗体について生成した。プレートを、振盪しながらRTで1~2時間インキュベーションした。プレートを、100μL/ウェルの洗浄バッファーにより3回洗浄した。100μL/ウェルの抗ヒトIgG二次抗体(SouthernBiotech;カタログ番号2014-05)を添加した(1:5000にブロッキングバッファー中で希釈した)。次いでプレートを、振盪しながらRTで1時間インキュベーションした。1時間のインキュベーション後に、プレートを、100μL/ウェルの洗浄バッファーにより3回洗浄した。プレートを顕色させるために、100μL/ウェルのTMB Buffer(Life Technologies #00-2023)を添加した。標準曲線のウェル中で青色の顕色が観察され、希釈された対照抗体の最高濃度が濃青色に到達してすぐに(5~10分間)、50μL/ウェルのSTOP Solution(Thermo Fisher #SS04)を添加した(色は黄色へ変化するだろう)。顕色させたプレートを、反応停止の30分間以内に450nm(波長補正のために570nmのものを引いた)で読み取った。
例えば、生化学的親和性及び特異性の研究から、抗IL-27抗体である抗IL-27 Ab1が、ヘテロ二量体サイトカインIL-27のp28サブユニット(しかしEBI3サブユニットではない)へ、結合すること示された。抗IL-27 Ab1は、ヒト、非ヒト霊長動物、及び齧歯動物の組み換えIL-27へ結合し、結合の程度は種間で異なっていた。抗IL 27 Ab1のIL-27への結合特異性は、約4500の細胞表面分子及び可溶性分子のパネルに対する試験によって確認され、オフターゲット結合は観察されなかった。IL-27のその受容体IL-27RA(WSX-1)についての結合特異性も確認され、他の細胞表面受容体はヒトIL 27に結合しなかった。抗IL-27 Ab1がヒトIL 27とIL-27RA(WSX-1)との間の相互作用をブロックする能力を、表面プラズモン共鳴によって確認した。
本明細書において開示される抗体の結合を、複数のモデルシステム中で査定した。ヒトIL-27がマウス細胞に対して生物学的に活性があるので、DNAミニサークル送達を使用するマウスにおけるヒトIL-27の全身的な過剰発現を利用して、全ゲノムのマイクロアレイ分析、フローサイトメトリー、及び血清サイトカイン分析によってインビボのIL-27媒介性効果を分析した。インビボのIL-27によって調節されるマーカーの多くは、ヒト細胞ベースのアッセイにおける知見と一致していた。抗IL-27 Ab3を、播種性B16腫瘍モデルにおいても評価した。その設定において、抗IL-27 Ab3による処理は、IL-27リガンド(IL-27p28、EBI3)または受容体(IL-27RA)の様々な構成要素を欠損するマウスにおいて観察される表現型と一致する結果を示した。
まとめると、これらの研究から、抗IL-27 Ab1(及びその同胞の抗IL-27 Ab3)がマウスにおけるIL 27欠損の表現型をコピーすることができ、IL-27へ高親和性で特異的に結合し、その免疫抑制効果を単独またはPD-L1ブロッキング剤との併用のいずれかで阻害することができることが実証される。
実施例3:抗IL27抗体はSTAT1のリン酸化をインビトロで阻害する
IL-27受容体(IL-27R)を介するIL-27シグナリングは、シグナル伝達兼転写活性化因子1(STAT1)ポリペプチド(pSTAT1)のリン酸化をもたらす。実施例1において記載される抗IL-27抗体を、ヒト全血液、ヒトPBMC、U937骨髄性細胞(組織球性リンパ腫細胞株)、及びHUT-78 T細胞リンパ腫細胞における、STAT1のIL-27媒介性リン酸化を阻害するそれらの能力について、フローサイトメトリーによって試験した。
IL-27受容体(IL-27R)を介するIL-27シグナリングは、シグナル伝達兼転写活性化因子1(STAT1)ポリペプチド(pSTAT1)のリン酸化をもたらす。実施例1において記載される抗IL-27抗体を、ヒト全血液、ヒトPBMC、U937骨髄性細胞(組織球性リンパ腫細胞株)、及びHUT-78 T細胞リンパ腫細胞における、STAT1のIL-27媒介性リン酸化を阻害するそれらの能力について、フローサイトメトリーによって試験した。
抗IL-27抗体を、ヒト全血液におけるSTAT1のIL-27媒介性リン酸化を阻害するそれらの能力について試験した。簡潔には、EDTAで血液凝固を阻止したヒト全血液(室温で保存した)を、このアッセイにおいて使用した。45μLの血液を、ディープウェルの丸底プレート(Phenix #850356)の各々のウェルの中へ分配し、プレート加熱装置(EchoTherm IC20)で、または37℃のインキュベーター中で37℃で30分間暖めた。抗IL-27抗体を、ポリプロピレンV底プレート(Corning #3363)中でエンドトキシン不含有PBS(Teknova #P0300)中で10×の最高濃度へ希釈した。抗IL-27抗体を、エンドトキシン不含有PBS中で所望に応じて連続的に希釈した。PBS単独を、非刺激対照及び刺激対照のためにウェルへ添加した。5μLの各々の希釈物を45μLの血液のウェルへ添加し、プレート振盪機(Eppendorf Mix Mate)上で1000RPMで15秒間振盪することによって混合した。プレートを、プレート加熱装置で、または37℃のインキュベーター中で37℃で60分間インキュベーションした。
10μgの組み換えヒトIL-27(R&D Systems #2526-IL)のバイアルに、100μLのPBS+0.1%のBSA(10%のBSA Sigma #A1595から作製した)を添加して、100μg/mLへ再構成した。組み換えhIL-27(rhIL-27)の作業ストックを、エンドトキシン不含有PBS中で200ng/mLへの希釈によって調製した。60分間のインキュベーション後に、5μLの200ng/mLのrhIL-27を刺激血液の各々のウェルへ添加した。5μLのPBSを非刺激対照ウェルへ添加した。プレートをプレート振盪機上で1000RPMで15秒間振盪した。プレートを37℃で30分間インキュベーションした。
30分間のインキュベーション後に、細胞を固定した。Lyse/Fix試薬(BD #558049)を滅菌水(Hyclone #SH3052902)中で1:5に希釈し、水浴中で37℃へ暖めた。500μLのLyse/Fix試薬をディープウェルプレートの各々のウェルへ添加し、プレートをプレート振盪機上で1000RPMで15秒間混合した。プレートを37℃で15分間インキュベーションした。
15分間のインキュベーション後に、プレートを室温で1500RPMで5分間遠心分離し(Eppendorf遠心分離機5810R)、上清をはたいて廃棄した。1ウェルあたり1mLのエンドトキシン不含有PBSを添加し、プレートを1000RPMで15秒間プレート振盪機上で振盪した。プレートを室温で1500RPMで5分間遠心分離し(Eppendorf遠心分離機5810R)、上清をはたいて廃棄した。細胞ペレットはプレート中に残った。
細胞ペレットを、50μLのFACSバッファー(PBS、Gibco #14190-144 /2%のFBS、Sigma #F8317/1mMのEDTA、Fisher #BP2482)中の1:200のCD14-Pacific Blue(Biolegend #325616)中で再懸濁し、U底の96ウェルのプレート(Costar #3799)へ移した。プレートをプレートシーラー(VWR #89134-432)によりシールし、室温で30分間暗所でインキュベーションした。
30分間のインキュベーション後に、150μLのFACSバッファーを各々のウェルへ添加し、プレートを1500RPMで室温で5分間遠心分離した。次いで細胞ペレットを、ピペッティングにより100μLのPerm III(-20℃で保存した)(BD #558050)中で再懸濁し、プレートをプレートシーラー及び蓋によりシールした。プレートを、-20℃で一晩または4℃で15分間インキュベーションした。
インキュベーション後に、150μLのPBSを添加し、プレートを1500RPMで室温で5分間遠心分離した。上清をはたくことによってプレートから廃棄し、プレートを、以下の表6中で記載されるように調製した50μLの染色混液中で再懸濁した。
プレートを、室温で1時間暗所でインキュベーションした。1時間のインキュベーション後に、100μLのFACSバッファーを添加し、プレートを1500RPMで室温で5分間遠心分離した。上清をはたくことによってプレートから廃棄し、プレートを、フローサイトメトリーによる分析のために100μLのFACSバッファー中で再懸濁した。
実施例1中で記載される抗IL-27抗体を、プールされたヒトPBMCにおけるSTAT1のIL-27媒介性リン酸化を阻害するそれらの能力について、フローサイトメトリーによって試験した。簡潔には、バフィーコートから得られたヒトPBMC(末梢血単核細胞)の凍結クリオバイアルを、液体窒素貯蔵所から取り出し、37℃の水浴中で迅速に融解した。各々のクリオバイアルの内容物をP1000ピペットにより取り出し、15mLのコニカルfalconチューブへ移した。2~3mLの完全RPMI-1640(Gibco、61870-036)を融解細胞へゆっくり添加し、細胞を穏やかに旋回するかまたははたいて、懸濁した。コニカルチューブに完全RPMI-1640を10mLまで補充し、チューブを転倒して混合した。コニカルチューブを、1400RPMで室温で8分間チューブの遠心分離をした。
PBMC細胞を、暖めた血清不含有RPMI-1640中で1mLあたり400万細胞の密度で再懸濁し、1ウェル(50μL)あたり200,000細胞の密度で丸底の96ウェルプレート(Costar、3799)中にプレーティングした。抗IL-27抗体を、96ウェルポリプロピレンプレートの第1の列中で、血清不含有RPMI-1640中で40μg/mLの最高濃度へ希釈した(最終的に10μg/mLであるだろう)。連続希釈物を、プレートの最初の10列の残り中で、所望に応じて(1:2、1:3など)作製した。50マイクロリットル(μL)の抗体ストック(4×)を、丸底プレート中のPBMC細胞のプレートの最初の10列へ添加した。列11及び12中に、50μLの血清不含有RPMI-1640細胞培地を添加した。次いでプレートを37℃で2時間インキュベーションした。
2時間のインキュベーション後に、100μの50ng/mlの血清不含有RPMI-1640細胞培地中で希釈された組み換えヒトIL-27(R&D Systems、2526-IL)を、25ng/mlの最終的な濃度で、各々のウェル(血清不含有培地単独または抗体単独を含む対照ウェルを除いて)へ添加した。100μLの血清不含有RPMI-1640細胞培地を、対照ウェルまたは抗体単独のウェルへ添加した。プレートを37℃で20分間インキュベーションした。
20分間のインキュベーション後に、DI水中の50μLの4%のPFA(Pierce、28906)を、各々のウェルへ直接添加し、プレートを37℃で5分間インキュベーションして細胞を固定した。プレートを2000RPMで5分間遠心分離した。培地をはたくことによって廃棄し、プレートを150μLのDPBSにより洗浄した。洗浄ステップをさらに2回反復した。H2O中で希釈された50μの90%の氷冷メタノール(MeOH)(Sigma、439193)を、12チャンネルピペットを使用して、各々のウェルへ迅速に添加した。MeOHを添加する時に、特別に注意して各々のウェルを混合した。プレートを20℃で少なくとも15分間インキュベーションした。100μLのDPBSを、90%のメタノールの上で各々のウェルへ添加し、プレートを2000RPMで5分間遠心分離した。プレート内容物をはたくことによって廃棄し、プレートを前に記載されるように3回洗浄した。最後の洗浄後に、細胞ペレットはプレートのウェル中に残った。
ペレット化したPBMCを、FACSバッファー(2%のFBS、DPBS中で2mMのEDTA)中の1:100のpSTAT1 PE(BD Phosflow、526069)により、室温で45分間暗所で染色した。染色物質を添加する時に、特別に注意して、各々のウェルを12チャンネルピペットにより混合した。45分間のインキュベーション後に、100μLのFACSバッファーを各々のウェルの中へ添加し、プレートを2000RPMで5分間遠心分離した。上清をはたくことによって廃棄し、プレートを前に記載されるように2回洗浄した。細胞を100μLのFACSバッファー中で再懸濁し、フローサイトメトリーによって分析した。
図2A中で示されるように、抗IL-27抗体は、ヒトのプールされたPBMC中のSTAT1のリン酸化を阻害した。抗IL-27抗体である抗IL-27 Ab3は、プールされたヒトPBMCにおいて、140.5ng/mL(n=2)の平均IC50で、STAT1のリン酸化を阻害した。抗IL-27抗体である抗IL-27 Ab1は、プールされたヒトPBMCにおいて、58.3ng/mL(n=3)の平均IC50で、STAT1のリン酸化を阻害した。
抗IL-27抗体を、U937細胞(Fc受容体を発現することが公知の細胞株)におけるSTAT1のIL-27媒介性リン酸化を阻害するそれらの能力について、本質的に図2Aで記載されるように、フローサイトメトリーによってさらに試験した。図2B中で示されるように、抗IL-27抗体は、示されるようにU-937細胞におけるSTAT1のリン酸化を阻害する。抗IL-27 Ab3は、U937細胞において、81ng/mL(n=2)の平均IC50で、STAT1のリン酸化を阻害した。抗体である抗IL-27 Ab1は、U937細胞において、96ng/mL(n=2)の平均IC50で、STAT1のリン酸化を阻害した。
抗IL-27抗体を、皮膚T細胞リンパ腫株HUT-78(それは細胞表面Fc受容体を発現しない)におけるSTAT1のIL-27媒介性リン酸化を阻害するそれらの能力について、本質的に図2Aで記載されるように、フローサイトメトリーによって試験した。図2C中で示されるように、抗IL-27抗体は、HUT-78細胞におけるSTAT1のリン酸化を阻害した。抗IL-27 Ab3は、HUT-78細胞において、80ng/mL(n=1)のIC50で、STAT1のリン酸化を阻害した。抗体である抗IL-27 Ab1は、HUT-78細胞において、95ng/mL(n=2)の平均IC50で、STAT1のリン酸化を阻害した。
本開示は、種にわたる抗IL-27 Ab1によるIL-27阻害も全血液アッセイにおいて査定した。種にわたる抗IL-27 Ab1活性を特徴評価するために、ヒト、カニクイザル、ラット、及びマウスからの組み換えIL-27を、これらの種から得られた全血液サンプルからのTリンパ球におけるpSTAT1シグナリングを刺激することにについて試験した(データ不掲載)。
簡潔には、全血液を37℃へ暖め、続いて抗IL-27 Ab1により60分間の前インキュベーションをし、20ng/mLのヒトIL-27を添加した。サンプルをさらに30分間インキュベーションした。白血球を固定し、赤血球を溶解した。洗浄後に、固定細胞を透過処理し、抗CD3及び抗リン酸化STAT1(Y701)により染色した。1時間のインキュベーション後に、サンプルを洗浄し、フローサイトメトリーのために再懸濁した。パーセント阻害を、刺激対照ウェル及び非刺激対照ウェルを使用して計算し、IC50値をGraphPad Prismを使用して計算した。
ヒトT細胞における抗IL-27 Ab1シグナリング阻害についての代表的なデータを、図3中で示す。異なる種への抗IL-27 Ab1の親和性について行われた観察と一致して、抗IL-27 Ab1によるIL-27シグナリング阻害の効力は、ヒトで最も強かった、続いてカニクイザル、ラット、及びマウスであった(例えば表7を参照)。
実施例4:抗IL-27抗体によるCD161のIL-27媒介性阻害の低減
C型レクチンCD161は、その発現がIL-27によって抑制されるT細胞のマーカーである。実施例1中で記載される抗IL-27抗体を、プールされたヒトPBMC細胞におけるCD161のIL-27媒介性阻害を回復させるそれらの能力について、フローサイトメトリーによって試験した。簡潔には、バフィーコートから得られたプールされたヒトPBMC(末梢血単核細胞)の凍結クリオバイアルを、液体窒素貯蔵所から取り出し、37℃の水浴中で迅速に融解した。各々のクリオバイアルの内容物をP1000ピペットにより取り出し、15mLのコニカルfalconチューブへ移した。2~3mLの完全RPMI-1640(Gibco、61870-036)を融解細胞へゆっくり添加し、細胞を穏やかに旋回するかまたははたいて、懸濁した。コニカルチューブに完全RPMI-1640を10mLまで補充し、チューブを転倒して混合した。コニカルチューブを、1400RPMで室温で8分間チューブの遠心分離をした。
C型レクチンCD161は、その発現がIL-27によって抑制されるT細胞のマーカーである。実施例1中で記載される抗IL-27抗体を、プールされたヒトPBMC細胞におけるCD161のIL-27媒介性阻害を回復させるそれらの能力について、フローサイトメトリーによって試験した。簡潔には、バフィーコートから得られたプールされたヒトPBMC(末梢血単核細胞)の凍結クリオバイアルを、液体窒素貯蔵所から取り出し、37℃の水浴中で迅速に融解した。各々のクリオバイアルの内容物をP1000ピペットにより取り出し、15mLのコニカルfalconチューブへ移した。2~3mLの完全RPMI-1640(Gibco、61870-036)を融解細胞へゆっくり添加し、細胞を穏やかに旋回するかまたははたいて、懸濁した。コニカルチューブに完全RPMI-1640を10mLまで補充し、チューブを転倒して混合した。コニカルチューブを、1400RPMで室温で8分間チューブの遠心分離をした。
5日間のアッセイの間の蒸発の効果を最小限にするために、外側の壁の使用を避けた。外側のウェルを、1ウェルあたり200μLのDPBS(Gibco、14190-144)により満たすべきである。PBMC細胞を、暖めた完全RPMI-1640中でmLあたり200万細胞の密度で再懸濁した。精製されたヒト抗CD3抗体(Biolegend、UCTH1、#300402)を0.5μg/mLの濃度で添加した(これは最終的な濃度の2×である)。1ウェルあたり100μLのこの細胞混合物(1ウェルあたり200,000細胞)を、丸底の96ウェルプレート(Costar、3799)中にプレーティングした。
抗IL-27抗体を、96ウェルポリプロピレンプレートの第1の列中で、完全RPMI-1640中で40μg/mLの最高濃度へ希釈した(最終的に10ug/mLであるだろう)。連続希釈物を、プレートの最初の10列の残り中で、所望に応じて(1:2、1:3など・・・)作製した。50マイクロリットル(μL)の抗体ストック(4×)を、丸底プレート中のPBMC細胞のプレートの最初の10列へ添加した。列11及び12中に、50μLの完全RPMI-1640を添加した。
抗IL-27抗体の添加後に、50μLの100ng/mlの完全RPMI-1640中で希釈された組み換えヒトIL-27(R&D Systems、#2526-IL)を、25ng/mlの最終的な濃度で、各々のウェル(血清不含有培地または抗体単独を含む対照ウェルを除いて)へ添加した。50μLの完全RPMI-1640を対照ウェルへ添加した。プレートを、干渉を最小限にして、組織培養インキュベーター中で37℃で5日間インキュベーションした。
5日間のインキュベーション後に、プレートをインキュベーターから取り出し、プレート振盪機上で600RPMで30秒間動かした。プレートを1800RPMで5分間遠心分離した。培地を取り出し、追加のアッセイのために取っておき、プレートを150μLのDPBS(Gibco、#14190-144)により洗浄した。洗浄ステップをさらに2回反復した。細胞ペレットを、以下の表8中で記載されるように1ウェルあたり50μLの染色混液により染色した。
プレートをプレート振盪機上で600RPMで30秒間動かし、プレートを室温で30分間暗所でインキュベーションした。
30分間のインキュベーション後に、プレートを遠心分離し、上清をはたくことによって廃棄した。プレートを、以前に記載されるように2回洗浄した。最後の洗浄後に、細胞ペレットを、DI水中の50μLの4%のPFA(Pierce、28906)を添加することによって室温で10分間固定した。100μLのFASCバッファーを各々のウェルへ添加し、プレートを1800RPMで5分間遠心分離した。細胞を100μLのFACSバッファー中で再懸濁し、フローサイトメトリーによって読み取った。
図4中で示されるように、抗IL-27抗体は、示されるようにCD161のIL-27媒介性阻害を低減する。
実施例5:抗IL-27抗体の追加のインビトロの特徴評価を含む、抗IL-27抗体によるTNFα、IL-6、及び他のサイトカインのPD-1媒介性分泌の促進
抗IL-27抗体を、がん患者からのヒトPBMC細胞におけるTNFα及びIL-6のPD-1媒介性分泌を促進するそれらの能力について試験した。本質的に実施例4中で記載されるように、がん患者からのヒトPBMC細胞を培養し、示されるように1μg/mLの抗PD-1抗体を与えるウェルも追加した。ヒトCBA Th1/Th2/Th17キット(BD、560484)を使用して、アッセイからの上清を、TNFα及びIL-6について分析した。図5A及び5B中で示されるように、抗IL-27抗体は、プールされたヒトPBMC細胞におけるTNFα及びIL-6のPD-1媒介性分泌を促進する。
抗IL-27抗体を、がん患者からのヒトPBMC細胞におけるTNFα及びIL-6のPD-1媒介性分泌を促進するそれらの能力について試験した。本質的に実施例4中で記載されるように、がん患者からのヒトPBMC細胞を培養し、示されるように1μg/mLの抗PD-1抗体を与えるウェルも追加した。ヒトCBA Th1/Th2/Th17キット(BD、560484)を使用して、アッセイからの上清を、TNFα及びIL-6について分析した。図5A及び5B中で示されるように、抗IL-27抗体は、プールされたヒトPBMC細胞におけるTNFα及びIL-6のPD-1媒介性分泌を促進する。
本明細書における技法は、ヒトPBMCにおける、抗IL-27 Ab1単剤療法及び抗PD-1との併用のサイトカイン誘導活性も示す。IL-27は、複数の炎症性サイトカインの発現を負に調節することが公知である。サイトカイン産生に対するIL-27遮断の効果を決定するために、健康なドナー、RCCの患者、及び卵巣癌の患者からのヒトPBMCを、抗IL-27 Ab1の存在または非存在化において抗CD3により数日間活性化し、分泌されたサイトカイン(IL-17、IFNγ(IFNg)、TNFα(TNFa)、及びIL-6が挙げられる)のレベルについて試験した。簡潔には、4名の健康なドナー、5名のRCCの患者、及び2名の卵巣癌の患者からの新鮮な全血液から単離されたPBMCを、抗IL-27 Ab1(1μg/mL)、抗PD 1(ペムブロリズマブ、1μg/mL)、または両方の抗体の非存在または存在下において、0.25μg/mLの抗CD3抗体によって活性化した。5日後に、上清を収集し、MSDまたはCBAによってTNFα(A)またはIFNγ(B)のレベルについて試験した。示されたデータは、抗CD3刺激単独に比較した、サイトカイン産生における倍変化を提示する。統計は対応のあるt検定によって計算された(*p<0.005)。
抗PD-1抗体をこれらのアッセイにおける対照として使用し、PD-1及びIL-27遮断の組み合わせも図5C中で示されるように調査した。抗IL-27 Ab1治療は、試験された11のPBMCサンプルのうちの6サンプルでTNFα産生の増加を導き(>2倍増加によって決定した)、4名の健康なドナーのうちの2名、5名のRCCの患者のうちの3名、2名の及び卵巣癌の患者のうちの1名を含んでいた。ドナーのサブセットにおいて試験した場合に、この活性は抗IL-27 Ab1用量依存性であった(データ不掲載)。抗PD-1(ペムブロリズマブ)治療は、試験された11名のドナーの2名において、TNFα(5名のRCCのうちの1名及び2名の卵巣癌のうちの1名)の増加を示したが、抗IL-27 Ab1及び抗PD-1の併用は11名のドナーのうちの10名において増加を導いた。併用治療条件において観察されたTNFαの増加は、10名の応答者のうちの8名で、相加的であると思われた。IFNγ産生についての相加効果は、抗IL-27 Ab1及び抗PD-1の治療後にこれらの培養において観察された(11名のドナーのうちの10名)が、抗PD-1治療単独への応答は、抗IL-27 Ab1(11名のドナーのうちの2名)に比較して、より頻繁に観察された(11名のドナーのうちの10名)。総合すると、これらのデータから、抗IL-27 Ab1は、健康なドナー及びがんの患者からの活性化されたPBMC培養におけるTNFαレベルを増加させること、ならびに抗IL-27 Ab1及び抗PD-1の治療の併用は、いずれかの治療単独に比較して、より高いレベルのTNFα及びIFNγを導くことが示唆される。
IL-27及びPD-1遮断の役割をさらに調査するために、同じ活性化されたPBMC培養系を使用して、IL-27が、PD-1遮断によって引き起こされたサイトカイン産生の増加の効果を直接打ち消すことができるかどうかを決定した。簡潔には、ヒト全血液からの新鮮分離PBMCを、0.25μg/mLの抗CD3抗体によって活性化した。細胞を、対照IgG1(1μg/mL)、αPD1抗体単独(ペムブロリズマブ、1μg/mL)、rhIL-27(25ng/mL)+αPD1、または抗IL-27 Ab1(1μg/mL)と共にrhIL-27 +αPD1のいずれかで、37℃で5日間処理した。上清を、CBA検出のために収集した。4名の健康なドナーからのサイトカイン例(IL-17A及びIFNγ)を、対照に対する倍変化として示した。平均及び標準偏差を図示した。統計は対応のあるt検定によって計算された(*p<0.05、**p<0.01)。類似する結果は、RCCの患者からのPBMCにおいても観察された。図5D中で示されるように、PD-1遮断はこれらの培養物においてIL-17及びIFNγの両方を増加させ、IL-27はこの活性を完全に阻害することができ、応答は抗IL-27 Ab1の存在下において回復した。これらのデータから、IL-27がサイトカイン産生に対する抗PD-1処理の効果を減弱し得ることが示される。
したがって、IL-27は、活性化されたヒトPBMCにおける抗PD-1媒介性炎症性サイトカイン産生を阻害し、これは、抗IL-27 Ab1によってブロックされた特性であることがと示された。さらに、PD-1遮断と併用する抗IL-27 Ab1は、健康なドナー及びRCCの患者からの活性化されたPBMCにおけるサイトカイン産生の増加を導いた。したがって、IL-27のブロックによって、抗IL-27 Ab1は、免疫調節性受容体発現を変更すること、及び炎症性サイトカイン産生を増加させることによって、免疫細胞活性化を促進する。
抗IL-27抗体(本明細書において抗IL-27 Ab1)、α-PD1抗体、または抗IL-27抗体及びα-PD1抗体の併用の存在下における、個別の抗IL-27抗体の追加の特徴評価で、サイトカインの誘導/分泌のさらなる特徴評価を遂行した(図5E~5H、具体的にはTNFα、IFNγ、IL-6、及びIL-17Aについて)。
実施例6:抗IL-27抗体によるPD-L1及びTIM3のIL-27媒介性発現の阻害
実施例1中で記載される抗IL-27抗体を、プールされたヒト単球におけるPD-L1及びTIM-3のIL-27媒介性発現を阻害するそれらの能力について、フローサイトメトリーによって試験した。
実施例1中で記載される抗IL-27抗体を、プールされたヒト単球におけるPD-L1及びTIM-3のIL-27媒介性発現を阻害するそれらの能力について、フローサイトメトリーによって試験した。
ROSETTESEP(商標)Human Monocyte Enrichment Cocktail(Stemcell #15068)を使用して、ヒトバフィーコートから新鮮な単球を単離した。
5日間のアッセイの間の蒸発の効果を最小限にするために、外側の壁の使用を避けた。外側のウェルを、1ウェルあたり200μLのDPBS(Gibco、14190-144)により満たすべきである。
単球を、暖めた完全RPMI-1640中でmLあたり200万細胞の密度で再懸濁した。1ウェルあたり100μLのこの細胞混合物(1ウェルあたり200,000細胞)を、丸底の96ウェルプレート(Costar、3799)中にプレーティングした。
抗IL-27抗体を、96ウェルポリプロピレンプレートの第1の列中で、完全RPMI-1640中で40μg/mLの最高濃度へ希釈した(10μg/mLの最終的な濃度)。連続希釈物を、プレートの最初の10列の残り中で、所望に応じて(1:2、1:3など・・・)作製した。50マイクロリットル(μL)の抗体ストック(4×)を、丸底プレート中のPBMC細胞のプレートの最初の10列へ添加した。列11及び12中に、1250μLの完全RPMI-1640を添加した。
抗IL-27抗体の添加後に、50μLの80ng/mlの完全RPMI-1640中で希釈された組み換えヒトIL-27(R&D Systems、2526-IL)を、20ng/mlの最終的な濃度で、各々のウェル(血清不含有培地または抗体単独を含む対照ウェルを除いて)へ添加した。100μLの血清不含有RPMI-1640を対照ウェルへ添加した。プレートを、干渉を最小限にして、37℃で3日間インキュベーションした。
3日間のインキュベーション後に、プレートをインキュベーターから取り出し、プレート振盪機上で600RPMで30秒間動かした。プレートを1800RPMで5分間遠心分離した。培地をはたくことによって廃棄し、プレートを150μLのDPBSにより洗浄した(Gibco、14190-144)。洗浄ステップを2回反復した。細胞ペレットを、以下の表9中で記載されるように1ウェルあたり50μLの染色混液により染色した。
プレートをプレート振盪機上で600RPMで30秒間動かし、プレートを4℃で30分間暗所でインキュベーションした。
30分間のインキュベーション後に、プレートを遠心分離し、上清をはたくことによって廃棄した。プレートを、以前に記載されるように2回洗浄した。最後の洗浄後に、細胞ペレットを、脱イオン(DI)水中の50μLの4%のPFA(Pierce、28906)を添加することによって室温で10分間固定した。100μLのFACSバッファーを各々のウェルへ添加し、プレートを1800RPMで5分間遠心分離した。細胞を100μLのFACSバッファー中で再懸濁し、フローサイトメトリーによって分析した。
図6A及び6B中で示されるように、抗IL-27抗体は、プールされたヒト単球におけるPD-L1及びTIM3のIL-27媒介性発現を強力に阻害する。
抗IL-27抗体を、休止T細胞(不活性化)におけるPD-L1のIL-27媒介性発現を阻害するそれらの能力について、本質的に図6A及び6Bで記載されるように、さらに試験した。ROSETTESEP(商標)Human T cell Enrichment Cocktail(Stemcell #15061)を使用して、ヒトバフィーコートから休止T細胞を単離した。
プレートをプレート振盪機上で600RPMで30秒間動かし、プレートを4℃で30分間暗所でインキュベーションした。
30分間のインキュベーション後に、プレートを遠心分離し、上清をはたくことによって廃棄した。プレートを、以前に記載されるように2回洗浄した。最後の洗浄後に、細胞ペレットを、DI水中の50μLの4%のPFA(Pierce、28906)を添加することによって室温で10分間固定した。100μLのFACSバッファーを各々のウェルへ添加し、プレートを1800RPMで5分間遠心分離した。細胞を100μLのFACSバッファー中で再懸濁し、フローサイトメトリーによって読み取った。図6C中で示されるように、抗IL-27抗体は、プールされたヒト休止T細胞におけるPD-L1のIL-27媒介性発現を強力に阻害する。
実施例7:黒色腫の播種性B16F10モデルにおける抗IL-27抗体のインビボ有効性
黒色腫肺転移のモデルを使用して、臨床候補の抗IL-27 Ab1を使用するIL-27遮断の抗腫瘍活性を査定した。播種性B16F10肺転移の増殖は、EBI3及びIl27ra(Wsx-1)欠損マウスにおいて有意に低減していることが知られている(Sauer et al.,J.Immunology 181:6148-6157)。肺結節サイズ及び増殖動態が、移されたB16F10細胞の数に依存し、変動して急速に進行し得るので、抗PD-1及び抗CTLA-4の併用を治療活性についてのベンチマークとして研究した。抗IL-27 Ab1の前処理は、全体的な腫瘍量の有意な低減をもたらした。
黒色腫肺転移のモデルを使用して、臨床候補の抗IL-27 Ab1を使用するIL-27遮断の抗腫瘍活性を査定した。播種性B16F10肺転移の増殖は、EBI3及びIl27ra(Wsx-1)欠損マウスにおいて有意に低減していることが知られている(Sauer et al.,J.Immunology 181:6148-6157)。肺結節サイズ及び増殖動態が、移されたB16F10細胞の数に依存し、変動して急速に進行し得るので、抗PD-1及び抗CTLA-4の併用を治療活性についてのベンチマークとして研究した。抗IL-27 Ab1の前処理は、全体的な腫瘍量の有意な低減をもたらした。
簡潔には、6~8週齢のメスC57BL/6マウス(n=10/群)に、200μLのリン酸緩衝食塩水(PBS)中の2.5×105B16F10細胞または1×105B16-Luc細胞のいずれかを、尾静脈を介して静脈内(i.v.)接種した。動物に、抗IL-27 Ab1(1mgの用量)(Wuxi;ロット2108SD170316K01X01I01)またはポリクローナルヒトIgGアイソタイプ対照(1mgの用量)(Bioxcell;BE0092;ロット658417D1)を腹腔内(i.p.)注射した。抗体を、腫瘍注射の7日前に開始し、合計で4用量(-7、0、7、及び14日目)で週1回投薬した。肺転移の視覚的な計数のために、B16F10担腫瘍マウスを腫瘍細胞注射の18日後にCO2窒息によって安楽死させ、肺を心臓穿刺を介するPBSにより潅流し、取り出し、10%の中性緩衝ホルマリン中で24時間固定した。次いで固定された肺を、70%のエタノールへ移し、肺表面の転移を視覚的にカウントした。免疫組織化学的分析のために、ホルマリン固定肺(n=5/群)をパラフィン包埋し、切片にし、各々の切片における全組織面積のパーセンテージとしての全腫瘍面積の定量のために、ヘマトキシリン-エオシンにより染色した。肺転移のインビボの腫瘍画像化のために、B16-Luc担腫瘍動物に、200μLのPBS(Promega)中の3mgのVivoGlo D-ルシフェリンを尾静脈を介して週2回i.v.注射した。ルシフェリン注射の5分後に、動物に麻酔をかけ、生物発光画像化をIVIS Lumina LT Series IIIイメージャーを使用して遂行した。画像をLiving Image(バージョン4.5.5)ソフトウェアを使用して分析し、全フラックス測定値として光子/秒で提示した。
図7A~7G中で示されるように、抗IL-27抗体である抗IL-27 Ab1によるB16F10担腫瘍マウスの処理は、肺表面の転移の全カウントによって測定されるような全体的な腫瘍量の有意な低減(肺結節数、図7A)、及び免疫組織化学(IHC)分析による肺組織切片における腫瘍面積の低減(図7C~7F及び図7G)の両方をもたらした。抗IL-27 Ab1によるp28の遮断は、アイソタイプ対照処理に比較して、肺のB16結節の数の42%の低減をもたらした。抗IL-27 Ab1処理は、アイソタイプ対照に比較して(それぞれ21.6±8.4vs 37.6±10.9の肺結節)、B16F10肺転移の増殖を有意に阻害した(p=0.0079)。抗IL-27 Ab1処理は、IHCによって測定されるように全体的な肺腫瘍転移面積の83%の低減をもたらした(アイソタイプ対照群において16.43±1.39%vs抗IL-27 Ab1治療群において2.83±1.45%)。同様に、生物発光画像化は、抗IL-27 Ab1治療がB16-Luc肺転移の増殖を有意に(p=0.0062)遅延させることを明らかにした(図7B)。肺表面の転移数及び全腫瘍面積の類似する低減が、図7G中で示されるように、IL-27RA(WSX-1)媒介性抗体遮断、及び抗PD-1+抗CTLA-4併用療法により観察された。これらのデータは、抗PD-1及び抗CTLA-4のベンチマークの組み合わせが抗腫瘍活性を実証した、2つの独立した実験からのものである。B16F10細胞(2.5×105)を、C57BL/6マウス(n=10/群)に静脈内注射した。マウスを、1mgの抗IL-27 Ab1、抗IL-27RA(WSX-1)、またはヒトIgGアイソタイプ対照抗体のいずれかによりIP処理した(-7、0、7、14日目)。何匹かの動物を、抗PD-1及び抗CTLA-4によりIP処理した(0、4、7、及び11日目)。肺をB16F10肺転移の有る動物(n=5/群)から収集し、上で記載されるように処理したものを切片にし、H&Eにより染色した。B16F10腫瘍組織を、処理された動物(図7A)からのH&E染色肺切片における正常肺組織から、描出した。腫瘍面積を、全肺面積のパーセンテージとして計算した(図7G)。統計はt検定によって計算された。まとめると、これらのデータは、抗IL-27 Ab1が腫瘍モデルにおけるIl27ra(WSX-1)及びEBI3欠損の表現型をコピーすることができ、PD-1及びCTLA-4の併用の遮断に類似する活性を示すことを指摘する。
これらのデータから、抗IL-27抗体(抗IL-27 Ab1)による治療が、IL-27を結合しないアイソタイプ対照抗体による処理よりも高い程度で、抗腫瘍効果、腫瘍の増殖及び転移の両方の低減をもたらすことが実証される。
実施例8:ヒトIL-27ミニサークルによりハイドロダイナミックトランスフェクションされたマウスからのマウス脾細胞の遺伝子発現プロファイリング
T細胞表現型に対するIL-27の効果をインビボで調査するために、IL-27をコードするDNAミニサークルを使用してマウスにおいてIL-27を過剰発現させ、T細胞応答をRNA-Seq及びフローサイトメトリーによって査定した。ヒトIL-27は交差反応性のある種であることが公知であり、インビトロのマウス脾細胞においてpSTAT1シグナリング及びPD L1を誘導し得る。この種交差反応性を使用して、抗IL-27 Ab1によるマウスにおけるヒトIL-27過剰発現の効果及びその阻害を研究した。これを行うために、ヒトIL-27をコードするDNAプラスミドミニサークル(グリシンセリンリンカーによってEBI3へつながれたp28)を、ハイドロダイナミックトランスフェクションによってマウスへ以下に記載されるように投与し、それは高い全身的レベルのIL-27をもたらした。
T細胞表現型に対するIL-27の効果をインビボで調査するために、IL-27をコードするDNAミニサークルを使用してマウスにおいてIL-27を過剰発現させ、T細胞応答をRNA-Seq及びフローサイトメトリーによって査定した。ヒトIL-27は交差反応性のある種であることが公知であり、インビトロのマウス脾細胞においてpSTAT1シグナリング及びPD L1を誘導し得る。この種交差反応性を使用して、抗IL-27 Ab1によるマウスにおけるヒトIL-27過剰発現の効果及びその阻害を研究した。これを行うために、ヒトIL-27をコードするDNAプラスミドミニサークル(グリシンセリンリンカーによってEBI3へつながれたp28)を、ハイドロダイナミックトランスフェクションによってマウスへ以下に記載されるように投与し、それは高い全身的レベルのIL-27をもたらした。
ヒトIL-27ミニサークルのハイドロダイナミックトランスフェクション
6週齢のメスBALB/cマウスに、2mLの0.9%の標準食塩水中の20μgの空ベクターまたは連結されたヒトIL-27ミニサークルDNA(System Biosciences、Palo Alto、CA)のいずれかを、5秒間にわたって尾静脈を介して注射した。注射した動物を加温パッドを備えた空のケージへ移して、5分間回復させた。全血液を、ミニサークル注射の24時間後に血漿分離のためにK2-EDTAチューブの中へ収集し、血漿IL-27レベルをELISAによって確認した。PBMC及び全脾細胞を、トランスフェクションの5日後に収集し、細胞を染色し、フローサイトメトリーによって分析した。示されるマーカーの発現を、CD4+T細胞及びCD8+T細胞上で分析した。FlowJoソフトウェアを使用して、分析を遂行した。
6週齢のメスBALB/cマウスに、2mLの0.9%の標準食塩水中の20μgの空ベクターまたは連結されたヒトIL-27ミニサークルDNA(System Biosciences、Palo Alto、CA)のいずれかを、5秒間にわたって尾静脈を介して注射した。注射した動物を加温パッドを備えた空のケージへ移して、5分間回復させた。全血液を、ミニサークル注射の24時間後に血漿分離のためにK2-EDTAチューブの中へ収集し、血漿IL-27レベルをELISAによって確認した。PBMC及び全脾細胞を、トランスフェクションの5日後に収集し、細胞を染色し、フローサイトメトリーによって分析した。示されるマーカーの発現を、CD4+T細胞及びCD8+T細胞上で分析した。FlowJoソフトウェアを使用して、分析を遂行した。
遺伝子発現プロファイリング
全脾臓の機械的解離、続いて赤血球のACK溶解によって、マウス脾細胞を調製した。全RNAを、RNEASY(登録商標)Mini Kit(Qiagen、カタログ番号:74104)により脾細胞から得て、ヌクレアーゼ不含有水(Qiagen、カタログ番号:19101)中で20ng/uLへ調整した。遺伝子発現プロファイリングを、Affymetrix GENECHIP(商標)Mouse Gene 2.0 ST Arrays(Applied Biosystems、カタログ番号:902118)上で遂行した。RNAサンプルの加工、ハイブリダイゼーション、及びアレイスキャニングを、Boston University Microarray and Sequencing Resource(BUMSR)の標準的Affymetrix GENECHIP(商標)プロトコルを使用して実行した。すべてのCELファイルをRobust Multi-array Average(RMA)(Irizarry et al.,2003)によって正規化し、発現されていないプローブを除去し、高い重複間の(inter-replicate)変動係数を備えた転写物を廃棄することよって、遺伝子発現データを前加工した。後続の分析(平均発現、倍変化、t検定)をR(バージョンR3.6.2)で遂行した。
全脾臓の機械的解離、続いて赤血球のACK溶解によって、マウス脾細胞を調製した。全RNAを、RNEASY(登録商標)Mini Kit(Qiagen、カタログ番号:74104)により脾細胞から得て、ヌクレアーゼ不含有水(Qiagen、カタログ番号:19101)中で20ng/uLへ調整した。遺伝子発現プロファイリングを、Affymetrix GENECHIP(商標)Mouse Gene 2.0 ST Arrays(Applied Biosystems、カタログ番号:902118)上で遂行した。RNAサンプルの加工、ハイブリダイゼーション、及びアレイスキャニングを、Boston University Microarray and Sequencing Resource(BUMSR)の標準的Affymetrix GENECHIP(商標)プロトコルを使用して実行した。すべてのCELファイルをRobust Multi-array Average(RMA)(Irizarry et al.,2003)によって正規化し、発現されていないプローブを除去し、高い重複間の(inter-replicate)変動係数を備えた転写物を廃棄することよって、遺伝子発現データを前加工した。後続の分析(平均発現、倍変化、t検定)をR(バージョンR3.6.2)で遂行した。
フローサイトメトリーによる分析
全血液及び脾臓を、ミニサークル注射の5日後にマウスから収集した。脾細胞を、トランスフェクションの5日後にILの27発現マウスから収集した。単一細胞の脾細胞懸濁物を、40μmのナイロンセルストレーナーを介する機械的解離、続いてACKバッファー中での赤血球溶解によって調製した。全血液細胞を直接染色し、続いて、製造者の指示(BD Biosciences、San Jose、CA)に従って、BD Phosflow Lyse/Fix Buffer中で赤血球溶解及び固定を行った。2%のFBS及び2mMのEDTA含有PBS中のラット抗マウスCD16/CD32 mAb(100万細胞あたり1μg;Biolegend、San Diego、CA)により細胞をプレインキュベーションすることによって、FcγRIII/IIをブロックした。マウスCD4(クローンGK1.5)、CD8(53-6.7)、PD-L1(10F.9G2)、TIM3(RMT3-23)、LAG3(C9B7W)、及びTIGIT(1G9)(Biolegend)に対する、APC、PE、Brilliant Violet 510、及びBrilliant Violet 711にコンジュゲートされたmAbにより、細胞を染色した。細胞に付随する蛍光をLSRFortessa X-20フローサイトメーター(BD Biosciences)を使用して測定し、分析をFlowJoソフトウェア(Tree Star、Ashland、OR)を使用して遂行した。
全血液及び脾臓を、ミニサークル注射の5日後にマウスから収集した。脾細胞を、トランスフェクションの5日後にILの27発現マウスから収集した。単一細胞の脾細胞懸濁物を、40μmのナイロンセルストレーナーを介する機械的解離、続いてACKバッファー中での赤血球溶解によって調製した。全血液細胞を直接染色し、続いて、製造者の指示(BD Biosciences、San Jose、CA)に従って、BD Phosflow Lyse/Fix Buffer中で赤血球溶解及び固定を行った。2%のFBS及び2mMのEDTA含有PBS中のラット抗マウスCD16/CD32 mAb(100万細胞あたり1μg;Biolegend、San Diego、CA)により細胞をプレインキュベーションすることによって、FcγRIII/IIをブロックした。マウスCD4(クローンGK1.5)、CD8(53-6.7)、PD-L1(10F.9G2)、TIM3(RMT3-23)、LAG3(C9B7W)、及びTIGIT(1G9)(Biolegend)に対する、APC、PE、Brilliant Violet 510、及びBrilliant Violet 711にコンジュゲートされたmAbにより、細胞を染色した。細胞に付随する蛍光をLSRFortessa X-20フローサイトメーター(BD Biosciences)を使用して測定し、分析をFlowJoソフトウェア(Tree Star、Ashland、OR)を使用して遂行した。
統計分析
統計的有意差を、示されるように、対応のある、対応のない、または比率Studentのt検定(ratio Student’s t test)を使用するGraphPad Prismソフトウェアを使用して決定した。比率t検定を使用した場合に、0でなくするために0値に0.1を加算した。0.05未満のP値は、有意であると判断された。
統計的有意差を、示されるように、対応のある、対応のない、または比率Studentのt検定(ratio Student’s t test)を使用するGraphPad Prismソフトウェアを使用して決定した。比率t検定を使用した場合に、0でなくするために0値に0.1を加算した。0.05未満のP値は、有意であると判断された。
IL-27はT細胞による阻害性受容体の発現をインビボで増進する
図8A中で示されるように、400を上回る遺伝子が、IL-27の投与に応答して≧Log2倍で変化した。これらの遺伝子のサブセットを表11A~11B中で示す。これらの遺伝子の中には、免疫応答において重要な役割を果たす免疫阻害性受容体をコードするものがあった。図8B中で示されるように、Ly6a(Sca-1をコードする)、Lag3、Tigit、及びIl10は、IL-27に応答して脾細胞上でアップレギュレートされた。Ctla4及びCd274(PD-L1をコードする)のIL-27媒介性アップレギュレーションは、1倍未満の誘導である傾向もあった(データ不掲載)。発現データを検証するために、フローサイトメトリーを利用して、これらのマウスからのT細胞上のPD-L1、LAG-3、TIGIT、及びTIM-3のタンパク質発現を査定した。IL-27ミニサークルの投与は、脾臓の(脾臓)及び末梢血(PBMC)CD4+T細胞において、PD-L1、LAG-3及びTIGITのアップレギュレーションを導いた。CD8+T細胞において、IL-27ミニサークルは、PD-L1、LAG-3、TIGIT、及びTIM-3をアップレギュレートした。図8C~8F中で示されるように、IL-27ミニサークルの投与は、脾臓及び末梢血CD4+T細胞において、PD-L1、Lag-3、及びTigitのアップレギュレーションを導いた。CD8+T細胞において、IL-27ミニサークルは、PD L1、Lag-3、Tigit、及びTim-3をアップレギュレートした。これらのデータから、IL 27が、免疫調節性受容体発現の駆動にインビボで重要な役割を果たし得ることが示唆される。
図8A中で示されるように、400を上回る遺伝子が、IL-27の投与に応答して≧Log2倍で変化した。これらの遺伝子のサブセットを表11A~11B中で示す。これらの遺伝子の中には、免疫応答において重要な役割を果たす免疫阻害性受容体をコードするものがあった。図8B中で示されるように、Ly6a(Sca-1をコードする)、Lag3、Tigit、及びIl10は、IL-27に応答して脾細胞上でアップレギュレートされた。Ctla4及びCd274(PD-L1をコードする)のIL-27媒介性アップレギュレーションは、1倍未満の誘導である傾向もあった(データ不掲載)。発現データを検証するために、フローサイトメトリーを利用して、これらのマウスからのT細胞上のPD-L1、LAG-3、TIGIT、及びTIM-3のタンパク質発現を査定した。IL-27ミニサークルの投与は、脾臓の(脾臓)及び末梢血(PBMC)CD4+T細胞において、PD-L1、LAG-3及びTIGITのアップレギュレーションを導いた。CD8+T細胞において、IL-27ミニサークルは、PD-L1、LAG-3、TIGIT、及びTIM-3をアップレギュレートした。図8C~8F中で示されるように、IL-27ミニサークルの投与は、脾臓及び末梢血CD4+T細胞において、PD-L1、Lag-3、及びTigitのアップレギュレーションを導いた。CD8+T細胞において、IL-27ミニサークルは、PD L1、Lag-3、Tigit、及びTim-3をアップレギュレートした。これらのデータから、IL 27が、免疫調節性受容体発現の駆動にインビボで重要な役割を果たし得ることが示唆される。
抗IL-27 Ab1がミニサークル由来ヒトIL-27をブロックする能力をインビボで調査するために、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)による標的係合及び脾細胞における免疫調節性受容体発現の両方を研究した。IL-27トランスフェクション及び抗IL-27 Ab1(50mg/kg)による処理の5日後に、血漿をマウスから収集して、IL-27ヘテロ二量体及びEBI3レベルをMeso Scale Discovery(MSD)によって分析した。IL-27ヘテロ二量体アッセイは、抗IL-27 Ab1及びヒト特異的EBI3検出抗体を交差ブロックするp28捕捉抗体を利用し、したがって抗IL-27 Ab1がIL-27へ結合するならば、そのときIL-27の検出はマスクされるだろう。EBI3アッセイは、ヒトEBI3の2つの別個のエピトープについて特異的な捕捉抗体及び検出抗体の両方を利用し、ミニサークル由来IL-27はつながれたヘテロ二量体であるので、このアッセイは、抗IL-27 Ab1に結合にかかわらず全IL 27の検出を可能にする。
簡潔には、6週齢のメスBalb/cマウスに、空ベクター(対照)またはヒトIL-27を注射した。マウスを、ミニサークルトランスフェクションの7日前及びその日(-7日目及び0日目)に、1mgの抗IL-27 Ab1または抗DNPのIgG1アイソタイプ対照抗体のいずれかにより処理した。全血液を収集し、血漿をMeso Scale DiscoveryによってIL-27について分析した(図8G)。図8Gは、抗IL-27 Ab1処理が血漿中のIL-27検出を完全に阻害することをMSDによって示す。25mg/kgの抗IL-27 Ab1の用量を試験した場合に、類似するデータが観察された。これらのデータから、25mg/kg以上の用量での抗IL-27 Ab1が、ミニサークル由来IL-27をインビボで完全に飽和させ得ることが示唆される。この完全な標的係合は、pSTAT1機能性アッセイにおいても確認された。
抗IL-27 Ab1がIL-27の活性をインビボでブロックする能力を査定するために、PD L1、Tim-3、Lag-3、及びTigitの発現を、マウスPBMC及び脾細胞においてフローサイトメトリーによって分析した。抗IL-27 Ab1は、IL 27に誘導されたPD-L1及びLag 3のCD4+ PBMCにおける発現、ならびにPD-L1、Tim-3、Lag-3、及びTIGITのCD8+ PBMCにおける発現を有意にブロックした。抗IL-27 Ab1処理は、IL 27に誘導されたPD-L1、Lag-3、及びTIGITのCD4+ 脾細胞における発現、ならびにPD-L1及びLag 3のCD8+ 脾細胞における発現もブロックした。これらのデータから、抗IL-27 Ab1が、インビボでヒトIL-27に係合し活性をブロックし得ることが示唆される。
これらの結果から、インビボのIL-27の異所的発現が、T細胞による複数の阻害性受容体のアップレギュレーション、及び脾細胞における免疫修飾活性を備えた他の複数の分子を導くことを実証される。これらのデータから、IL-27アンタゴナイズ作用(例えば抗IL-27抗体による処理によって)が、T細胞上の阻害性受容体の発現を減少させ、それによって免疫応答を増加させるだろうことが示唆される。
実施例9:抗IL-27 Ab1の結合特性及びIL-27受容体遮断
0~5.0μg/mLの範囲の濃度の組み換えヒトIL-27の1μg/mLの抗IL-27 Ab1濃度との会合及び解離を決定した。最終的な結合動態パラメーターを、データへフィッティングさせるモデルの長所を実証する結合モデルのフィットパラメーター(R2及びχ2)と共に、表14中で示す。
0~5.0μg/mLの範囲の濃度の組み換えヒトIL-27の1μg/mLの抗IL-27 Ab1濃度との会合及び解離を決定した。最終的な結合動態パラメーターを、データへフィッティングさせるモデルの長所を実証する結合モデルのフィットパラメーター(R2及びχ2)と共に、表14中で示す。
ヒトIL-27は、本研究中で試験されたすべての種のうちで、抗IL-27 Ab1について最も強い結合親和性を提示した(3.86pM)。ヒトタンパク質よりもやや弱いが、組み換えのラット及びカニクイザルのIL-27もそれぞれ80.9pM及び37.4pMの値で、抗IL-27 Ab1についての強い親和性を示した。組み換えマウスIL-27は、ヒトタンパク質と比較して、抗IL-27 Ab1について最も弱い親和性を有し、より遅い会合速度及びより迅速な解離速度によって示されるようにnM範囲(4.43nM)の値であった。
実施例10:CDR配列アライメント
本開示の抗IL-27抗体の複数のサブ選択は、それらのCDR領域にわたる配列相同性を共有し、機能性を保持するものとして検証された多様なバリアントCDR配列を提供する。以下のコンセンサスCDR配列は、本開示によって完全に支持され、したがって本開示の範囲内にあることが、本明細書において明確に企図される。
本開示の抗IL-27抗体の複数のサブ選択は、それらのCDR領域にわたる配列相同性を共有し、機能性を保持するものとして検証された多様なバリアントCDR配列を提供する。以下のコンセンサスCDR配列は、本開示によって完全に支持され、したがって本開示の範囲内にあることが、本明細書において明確に企図される。
抗IL-27 Ab1、抗IL-27 Ab3、抗IL-27 Ab4、抗IL-27 Ab5、抗IL-27 Ab6、及び抗IL-27 Ab7抗体について、これらの抗IL-27抗体の各々のCDR配列のアライメントから、可変残基によって中断される、広範囲な相同性が明らかにされた。特に、重鎖CDR1アライメントから、以下の可変残基が明らかにされた。
HCDR1(IMGT)
CLUSTALのO(1.2.4)マルチプル配列アライメント
1 GFTFRSYG 8 (配列番号119)
5 GFTFRSYG 8 (配列番号31)
4 GFTFASYG 8 (配列番号97)
2 GFTFSRTG 8 (配列番号53)
3 GFTFSRYG 8 (配列番号75)
6 GFTFSSYS 8 (配列番号9)
****
HCDR1(IMGT)
CLUSTALのO(1.2.4)マルチプル配列アライメント
1 GFTFRSYG 8 (配列番号119)
5 GFTFRSYG 8 (配列番号31)
4 GFTFASYG 8 (配列番号97)
2 GFTFSRTG 8 (配列番号53)
3 GFTFSRYG 8 (配列番号75)
6 GFTFSSYS 8 (配列番号9)
****
したがってこれらの相同抗体についてのコンセンサス重鎖CDR1(IMGT)配列は、N-GFTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]-C(配列番号144)であり、したがってコンセンサス重鎖CDR1(IMGT)配列として本明細書においてより一般的に企図されるものは、N-GFTFXXXX-C(配列番号145)である(配列中、Xは任意のアミノ酸残基である)。
抗IL-27 Ab1、抗IL-27 Ab3、抗IL-27 Ab4、抗IL-27 Ab5、抗IL-27 Ab6、及び抗IL-27 Ab7抗体の重鎖CDR2(IMGT)配列のアライメントから、以下のことが明らかにされた。
HCDR2(IMGT)
CLUSTALのO(1.2.4)マルチプル配列アライメント
10 ISSSGSYI 8 (配列番号120)
11 ISSSSSYI 8 (配列番号98)
7 ISSSSSYI 8 (配列番号32)
9 ISSSSSYI 8 (配列番号54)
8 ISSSSAYI 8 (配列番号76)
12 ISSSSSYI 8 (配列番号10)
****.:**
HCDR2(IMGT)
CLUSTALのO(1.2.4)マルチプル配列アライメント
10 ISSSGSYI 8 (配列番号120)
11 ISSSSSYI 8 (配列番号98)
7 ISSSSSYI 8 (配列番号32)
9 ISSSSSYI 8 (配列番号54)
8 ISSSSAYI 8 (配列番号76)
12 ISSSSSYI 8 (配列番号10)
****.:**
したがってこれらの相同抗体についてのコンセンサス重鎖CDR2(IMGT)配列は、N-ISSS[S/G][S/A]YI-C(配列番号146)であり、したがってコンセンサス重鎖CDR2(IMGT)配列として本明細書においてより一般的に企図されるものは、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)である(配列中、Xは任意のアミノ酸残基である)。
ヒトCDR1(NT)及びヒトCDR2(NT)配列のアライメントから、以下のことも明らかにされた。
HCDR1(NT)
CLUSTALのO(1.2.4)マルチプル配列アライメント
13 FTFRSYGMN 9 (配列番号34)
16 FTFRSYGMN 9 (配列番号122)
17 FTFASYGMN 9 (配列番号100)
14 FTFSRTGMN 9 (配列番号56)
15 FTFSRYGMN 9 (配列番号78)
18 FTFSSYSMN 9 (配列番号12)
*** ***
HCDR2(NT)
CLUSTALのO(1.2.4)マルチプル配列アライメント
23 GISSSGSYIYYADSVKG 17 (配列番号123)
19 SISSSSSYIYYADSVKG 17 (配列番号35)
20 SISSSSSYIYYADSVKG 17 (配列番号57)
22 SISSSSSYIYYADSVKG 17 (配列番号101)
21 SISSSSAYILYADSVKG 17 (配列番号79)
24 SISSSSSYIYYADSVKG 17 (配列番号13)
.****.:** *******
HCDR1(NT)
CLUSTALのO(1.2.4)マルチプル配列アライメント
13 FTFRSYGMN 9 (配列番号34)
16 FTFRSYGMN 9 (配列番号122)
17 FTFASYGMN 9 (配列番号100)
14 FTFSRTGMN 9 (配列番号56)
15 FTFSRYGMN 9 (配列番号78)
18 FTFSSYSMN 9 (配列番号12)
*** ***
HCDR2(NT)
CLUSTALのO(1.2.4)マルチプル配列アライメント
23 GISSSGSYIYYADSVKG 17 (配列番号123)
19 SISSSSSYIYYADSVKG 17 (配列番号35)
20 SISSSSSYIYYADSVKG 17 (配列番号57)
22 SISSSSSYIYYADSVKG 17 (配列番号101)
21 SISSSSAYILYADSVKG 17 (配列番号79)
24 SISSSSSYIYYADSVKG 17 (配列番号13)
.****.:** *******
したがってこれらの相同抗体についてのコンセンサス重鎖CDR1(NT)及びCDR2(NT)配列は、それぞれN-FTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]MN-C(配列番号148)及びN-[G/S]ISSS[S/G][S/A]YI[L/Y]YADSVKG-C(配列番号149)である。これらのコンセンサス配列を考慮して、本明細書においてより一般的に企図されるコンセンサス重鎖CDR1(NT)配列及びCDR2(NT)配列は、それぞれN-FTFXXXXMN-C(配列番号150)及びN-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)である(配列中、Xは任意のアミノ酸残基である)。
重鎖CDR3(IMGTまたはNT)、ならびに軽鎖CDR CDR1(IMGTまたはNT)、CDR2(IMGTまたはNT)及びCDR3(IMGTまたはNT)は、抗IL-27 Ab1と抗IL-27 Ab3と抗IL-27 Ab4と抗IL-27 Ab5と抗IL-27 Ab6と抗IL-27 Ab7との間で完全保存されていた。
実施例11:IL-27-抗IL-27 Ab1 Fab複合体の結晶化及びエピトープ決定
最初の結晶化の試みを、25mMのトリス(pH7.5)、およそ30mMの塩化ナトリウム、及び5%のグリセロール中の10.1mg/mlで、ヒトIL-27-抗IL-27 Ab1 Fab複合体によりセットアップした。予備的結晶化条件を、PACTスクリーニングを使用して同定した(Newman et al.,(2005)Acta Cryst.D 61:1426)。
最初の結晶化の試みを、25mMのトリス(pH7.5)、およそ30mMの塩化ナトリウム、及び5%のグリセロール中の10.1mg/mlで、ヒトIL-27-抗IL-27 Ab1 Fab複合体によりセットアップした。予備的結晶化条件を、PACTスクリーニングを使用して同定した(Newman et al.,(2005)Acta Cryst.D 61:1426)。
結晶を、PACT A2(0.1MのSPG(コハク酸、リン酸二水素ナトリウム、及びグリシン)pH5及び25%のPEG 1500)を含む、複数の条件下で得た。これらの結晶を使用して新しいシードストックを作製し、JCSG+スクリーニングを使用してマイクロマトリックスシーディング(MMS)実験をセットアップした(D’Arcy et al.,(2007)Acta Cryst.D Biol Cryst.63:550-54)。
データセットを、Eiger2 XE 16M検出器を装備したステーションI04(Diamond Light Source、Didcot、England)(λ=0.9795Å)で、100Kで収集した。データを、autoPROC(Kabash,(2010)Acta.Cryst.D.Biol.Cyrst.66:125-32;Vonrhein et al.,(2011)Acta Cryst.Biol.Cryst.67:292-302)を使用して加工し、Aimlessプログラム(Evans et al.,(2013)Acta Cryst.Biol.Cryst.69:1204-14)も含む、STARANISOソフトウェア(Tickle et al.,STRANISO.Cambridge,United Kingdon:Global Phasing Ltd.(2018))を使用して、異方性を切り捨てた(anisotropically truncated)。
構造を、分子置換ソフトウェアPhaser(McCoy et al.,(2007)J.Appl.Cyrst.40:658-74)及びMolrep(Vagin et al.,(1997)J.Appl.Cyrst.30:1022-25)を使用して決定した(図9)。図9中で示されるように、抗IL-27 Ab1 Fabは、IL-27のp28分子へ結合する。全体のエピトープ-パラトープ領域についての電子密度は、十分に定義されている。抗IL-27 Ab1とp28との間の相互作用を、表15中で示す。
実施例12:追加のエピトープマッピング研究
さらなるエピトープマッピング研究を、IL-27-抗IL-27 Ab1 Fab複合体結晶構造を使用して実行した。抗IL-27 Ab1 Fab分子とIL-27との間の相互作用領域を、CCP4パッケージ中のQt-PISAプログラム及びNCONTプログラムを使用して調査した(Winn,et al.,(2011)Acta Cryst.D Biol.Cryst.67:235-42)。Coot(Emsley,et al.,(2010)Acta Cryst.D Biol.Cyrst.66:486-501)を、データ分析のために使用した。
さらなるエピトープマッピング研究を、IL-27-抗IL-27 Ab1 Fab複合体結晶構造を使用して実行した。抗IL-27 Ab1 Fab分子とIL-27との間の相互作用領域を、CCP4パッケージ中のQt-PISAプログラム及びNCONTプログラムを使用して調査した(Winn,et al.,(2011)Acta Cryst.D Biol.Cryst.67:235-42)。Coot(Emsley,et al.,(2010)Acta Cryst.D Biol.Cyrst.66:486-501)を、データ分析のために使用した。
エピトープ残基を、Fab原子の4Å内に原子を有するIL-27アミノ酸として定義し、CCP4中のNCONTを使用して評価した。前に表15中で同定及びリストされた残基に加えて、これらの研究により、追加のエピトープ残基が見出された。4Å内のIL-27p28と抗IL-27 Ab1 Fabとの間のすべての相互作用を、表16A中で以下に示す。
結合研究及びブロック研究を、ヒトIL-27ヘテロ二量体に対してのWSX-1及びgp130の両方について、SPRによって遂行した。ヒトIL-27はWSX-1へ高親和性で結合し、抗IL-27 Ab1は結合を完全に阻害することが可能であった(図10A)。ヒトIL-27はgp130へより低い親和性で結合し、抗IL-27 Ab1はIL-27のgp130への結合を阻害しなかった(図10B)。
図12は、三次元空間中のp28及びIL6をアライメントのために使用する、IL27/抗IL-27 Ab1のIL23/IL23Rとの複合体のスーパーインポーズを示す。IL6上のgp130結合部位は、p28上の抗IL-27 Ab1結合部位とオーバーラップする。しかしながら、p19上のIL23R結合部位は、p28上の抗IL-27 Ab1結合部位とオーバーラップしない。
図13は、三次元空間中のp28及びIL6をアライメントのために使用する、IL27/抗IL-27 Ab1のIL6/IL6Ra/gp130との複合体のスーパーインポーズを示す。ここで、IL6上のgp130結合部位は、この場合もやはりp28上の抗IL-27 Ab1結合部位とオーバーラップする。加えて、IL6Raは、EBI-3とアライメントする。
様々な動物にわたる配列アライメントは、EBI3との特異的な相互作用に関与するp28残基が良好に保存されることを明らかにし、同じことがp28との特異的な相互作用に関与するEBI3残基について当てはまる(図14A~15B)。これは、矢印によってマークされる、複数の保存された塩架橋アミノ酸残基及び複数の保存された疎水性アミノ酸残基を含む。
IL-27ヘテロ二量体のIL6/IL6RAとの構造アライメントから、二次構造、ドメイン、及びα炭素骨格が、両方のヘテロ二量体について良好にアライメントすること(図16A~16D)、ならびに複数のp28のEBI3との相互作用が、IL6RAで保存される可能性があること(図16D)が示される。
ヒトIL-27についての結合親和性データから、p28がgp130またはWSX-1単独のいずれかへの弱い結合を有するかまたは結合がまったくなかったことが示される(図17)。EBI3は、gp130単独についての結合がなかったが、WSX-1について中等度の結合親和性を有していた。ヘテロ二量体が集合した場合にのみ、ヒトIL27についての高親和性結合が観察された。p28についてのEBI3の親和性は、5nMであった。
抗IL-27 Ab1結合相互作用に関するヒトp28におけるアミノ酸の多くは、マウス配列中で保存される(図18A)が、抗IL-27 Ab1は、ヒトp28のGln37及びLeu162の両方と相互作用し、Gln37はマウス配列中に存在せず、Leu162はマウス配列中のCysに対応する(図18B)。抗IL-27 Ab1 LCが結合する場合に、マウスp28における追加のジスルフィド結合も局所構造的エピトープを乱し得る。
αCヘリックス中のArg残基からのプラス荷電の大きな領域を含む、ポリグルタミン酸配列と共に、解像されていないCDループもあった(図19A~19B)。
実施例13:腎細胞癌中のIL-27発現の標的化
IL-27の発現は腎細胞癌(RCC)中で増加し、RCC腫瘍組織中のEBI3、IL-27p28、及びIL-27RAのレベルは、正常な腎臓組織中で各々の発現に比べて、増加した(図20A)。これらの転写物の各々の低発現に比較して、EBI3(図20B)、IL-27RA(図20C)、及びIL-27p28(図20D)の各々の高発現は、ヒト対象の生存確率減少と相関する。
IL-27の発現は腎細胞癌(RCC)中で増加し、RCC腫瘍組織中のEBI3、IL-27p28、及びIL-27RAのレベルは、正常な腎臓組織中で各々の発現に比べて、増加した(図20A)。これらの転写物の各々の低発現に比較して、EBI3(図20B)、IL-27RA(図20C)、及びIL-27p28(図20D)の各々の高発現は、ヒト対象の生存確率減少と相関する。
IL-27は、活性化されたヒトCD4+T細胞において再現性のある遺伝子発現シグネチャーを誘導する。個別のドナーからの末梢血単核細胞(PBMC)を、抗CD3±組み換えヒトIL-27(rhIL-27)により3日間活性化した。CD4+T細胞をFACS選別し、遺伝子発現をマイクロアレイによって分析した。多数の遺伝子は、CD3及びrhIL-27により活性化されたT細胞中でアップレギュレートまたはダウンレギュレートされることが観察され、増加した発現でアップレギュレートされるものとしては、PDCD1、HAVCR2、CD274、LGALS9及びGBP5、LAMP3、RGS1、IL12RB2、RSAD2、IFIT3、及びIFI44L、ならびにダウンレギュレートされるものとしては、GZMA及びCD200が挙げられる(図21A)。CD4+T細胞におけるIL-27シグネチャーにおける上位31の遺伝子を、図21B中でリストする。顕著なことには、31遺伝子のうちの15は転帰不良と関連し、すなわちAIM2、ALPK1、APOL1、GBP5、IFI44、IRF1、LAMP3、LOC400696、PARP3、RGS1、SAMD9L、SOCS1、STAT1、TNFSF13B、及びXAF1である。上位のシグネチャー遺伝子のうちの12(STAT1、GBP5、IFI44、XAF1、及びSOCS1を含む)は、RCCの転帰不良と関連した(図22A)が、これらの同じ遺伝子は乳癌(BRCA)の転帰不良と関連しなかった(図22B)。
さらに、RCC患者におけるEBI3の血漿レベルは転帰を予測し得る。血清サンプルを腎摘出手術の時にRCC患者から収集し、EBI3特異的抗体ペアを使用してEBI3レベルを測定した。平均EBI3レベルは、健康なドナーからの血清と比較して、RCCの患者からの血清中で上昇した(図23A)。妊娠ドナーからの血清が、陽性対照として含まれていた。EBI3レベルは、ステージ2またはステージ3に比べて、ステージ4のRCCの対象中で最も高く(図23B)、全生存率(図23C)及び無病生存率(図23D)は、低いEBI3血清レベルのRCC患者中で、より高かった。
RCCのマウスモデルにおいて抗IL-27 Ab1処理のインビボの有効性を試験するために、Renca細胞を、左腎臓の中へ同所性に植え込んだ。植え込みの3日後のマウスを、抗IL-27 Ab1またはヒトIgG1アイソタイプ対照(50mg/kg、週2回)を、2週間腹腔内処理した。21日後に、組織を収集し、両方の腎臓を秤量して正味の腫瘍重量を計算し、肺転移を視覚的にカウントした。平均腫瘍重量は大部分で一定のままであったが(図24A)、肺転移は、アイソタイプの対照処理マウスに比較して、抗IL-27 Ab1処理マウスにおいて有意に低減した(図24B)。
これらのデータから、RCCの患者からの腫瘍において、IL-27p28、EBI3、及びIL-27RAの転写レベルの増加は予後不良と関連することが示される。抗IL-27 Ab1は、インビボでのRCCの同所性モデルにおいて単剤活性を実証し、抗IL-27 Ab1によるIL-27の遮断は、高レベルの循環EBI3を有するRCCの患者のための有望な戦略を提示する。
実施例14:同所性Hepa1-6 HCCマウスモデルにおいてIL-27を使用する、抗IL-27 Ab1のインビボの標的化
肝臓癌モデルにおいて抗IL-27 Ab1抗体のインビボの有効性を研究するために、Hepa1-6-Luc腫瘍細胞をマウスの肝臓の中へ注射し、動物に、IP注射によって植え込みの5、8、12、及び15日後に、50mg/kgの抗IL-27 Ab1を投薬した(図25A)。全フラックスは、hIgG1アイソタイプ対照処理マウスに比較して、抗IL-27 Ab1処理マウスにおいて、ほぼベースラインまで低減した(図25B)。
肝臓癌モデルにおいて抗IL-27 Ab1抗体のインビボの有効性を研究するために、Hepa1-6-Luc腫瘍細胞をマウスの肝臓の中へ注射し、動物に、IP注射によって植え込みの5、8、12、及び15日後に、50mg/kgの抗IL-27 Ab1を投薬した(図25A)。全フラックスは、hIgG1アイソタイプ対照処理マウスに比較して、抗IL-27 Ab1処理マウスにおいて、ほぼベースラインまで低減した(図25B)。
マウスモデルにおける抗IL-27 Ab1への反応性は、用量依存的であった。マウスを、植え込みの5、8、12、及び15日後に、アイソタイプ対照、5mg/kgの抗IL-27 Ab1、25mg/kgの抗IL-27 Ab1、または50mg/kgの抗IL-27 Ab1により処理した(図26A)。腫瘍増殖は、25または50mg/kgの抗IL-27 Ab1により処理されたマウスにおいて最も低かった(ほぼベースライン)(図26B~26F)。
抗IL-27 Ab1によって誘導された遺伝子発現の以前に定義された前臨床変化が、本モデルにおいて意義があるかどうかを決定するために、多くのバイオマーカー遺伝子の発現を、抗IL-27 Ab1の投与後にアッセイした(図27A~27C)。上位200の抑制された遺伝子を表17A中で示し、上位200の誘導された遺伝子を表17B中で示す。アップレギュレートされた遺伝子及びダウンレギュレートされた遺伝子の全リストを、上の表11A~11B中で提示する。
顕著なことには、抗IL-27 Ab1は、PD-L1、TIGIT、及びAFP発現を含む複数の重要な抑制遺伝子をダウンレギュレートし(図28B~28D)、EBI3、IL-27、及びIL27RAの発現の有意な変化は起こさない(図28A)ことが見出された。TGFβ経路も抗IL-27 Ab1投与の後に抑制され、TNFRSF10B、TNFRSF1a、及びPDGFAの発現が減少することが見出された(図28C及び図28E)。
さらに、抗IL-27 Ab1を使用する処理は、腫瘍免疫細胞浸潤を変更した。抗IL-27 Ab1は、腫瘍微小環境(TME;図29A)においてマクロファージ及びNKの転写物存在量を増進する。特に、抗IL-27 Ab1は、重要なマクロファージ関連マーカーであるCD206及びCD163をエンリッチし(図29B)、抗IL-27 Ab1は特異的なNK関連受容体を調節することが見出された(図30)。NKマーカー調節における不均一性から、抗IL-27 Ab1が、HEPA1-6腫瘍において浸潤だけでなくNK機能に影響を及ぼすことが示唆される。加えて、様々な他の細胞表面マーカーは、抗IL-27 Ab1による処理後に調節された発現を示した(図31)。
実施例15:IL-27阻害のバイオマーカーとしてのTNFSF15
TL1A(TNF様リガンド1A)またはVEGFI(血管内皮増殖因子阻害因子)として公知のTNFSF15(腫瘍壊死因子可溶性因子15)は、血管形成を阻害するにおける役割を果たすことが知られている腫瘍壊死因子ファミリー内のサイトカインであり(参照文献:VEGI,a novel cytokine of the tumor necrosis factor family,is an angiogenesis inhibitor that suppresses the growth of colon carcinomas in vivo.FASEB J.1999 Human Genome Sciences,Inc.)、炎症性サイトカインの産生の誘導によってT細胞共刺激因子として機能し得る(Migone et al.,Immunity 16(3):479-92(March 2002);Jin et al.,Mucosal Immunology 6:886-99(December 19,2012)を参照)。TNFSF15は、IL-27阻害物質による処理に後続するIL-27のブロック後にアップレギュレートされることが示され、IL-27を阻害することを意図した治療投与後のIL-27阻害の有効性の査定における、バイオマーカーとしての有用性を確立した。
TL1A(TNF様リガンド1A)またはVEGFI(血管内皮増殖因子阻害因子)として公知のTNFSF15(腫瘍壊死因子可溶性因子15)は、血管形成を阻害するにおける役割を果たすことが知られている腫瘍壊死因子ファミリー内のサイトカインであり(参照文献:VEGI,a novel cytokine of the tumor necrosis factor family,is an angiogenesis inhibitor that suppresses the growth of colon carcinomas in vivo.FASEB J.1999 Human Genome Sciences,Inc.)、炎症性サイトカインの産生の誘導によってT細胞共刺激因子として機能し得る(Migone et al.,Immunity 16(3):479-92(March 2002);Jin et al.,Mucosal Immunology 6:886-99(December 19,2012)を参照)。TNFSF15は、IL-27阻害物質による処理に後続するIL-27のブロック後にアップレギュレートされることが示され、IL-27を阻害することを意図した治療投与後のIL-27阻害の有効性の査定における、バイオマーカーとしての有用性を確立した。
IL-27は、活性化されたPBMCにおけるサイトカインIL-17A、IFNγ(またはIFNg)、及びTNFα(またはTNFa)の産生を阻害した。3名のドナーからプールされたヒトPBMCを、IL-27(100ng/mL)の存在または非存在下において、抗CD3(0.25μg/mL)により3日間刺激した。上清を収集し、サイトメトリービーズアレイによってIL-17A、IFNγ、TNFα、及びIL-10に対する効果について試験した。IL-27は、IL-17A、IFNγ、及びTNFαの産生の減少をもたらし、IL-10の産生に対する効果はなかった(図32A~32D)。
逆に、活性化されたPBMCにおけるIL-27の抗IL-27 Ab1によるブロックは、サイトカイン産生の増加を導く。3~4名の個別のドナーからのPBMCを、抗IL-27 Ab1(1μg/mL)の存在または非存在下において、抗CD3(0.25μg/mL)により4日間刺激した。上清を収集し、サイトメトリービーズアレイによってIL-17A、IFNγ、TNFα、及びIL-10に対する効果について試験した。抗IL-27 Ab1は、IL-17A、IFNγ、及びTNFαの産生の増加をもたらした(図33A~33D)。
抗IL-27 Ab1活性の薬力学的またはバイオマーカーとして追跡され得る遺伝子発現における他の変化を決定するために、遺伝子発現プロファイリングを、活性化されたPBMCにおけるマイクロアレイ分析によって遂行した。3名の個別のドナーからのPBMCを、抗IL-27 Ab1(1μg/mL)有りまたは無しで、抗CD3(0.25μg/mL)により24時間刺激した。各々のサンプルからのRNAを、マイクロアレイによる遺伝子発現プロファイリング間の単離及び加工して、IL-27阻害の効果を決定した。表18中で示されるように、複数の遺伝子(MMP1、MMP10、及びTNFSF15を含む)は、アイソタイプ対照に比較して、抗IL-27 Ab1によるIL-27阻害に後続する火山型プロット分析によって、差異的に発現していた。図34は、対照に比較したIL-27阻害の後の遺伝子発現のlog2倍変化(X軸)vs対照に比較した抗IL-27 Ab1による処理後の遺伝子発現変化の有意性(p値)(Y軸)を表わす火山型プロットを示す。TNFSF15転写物は、IL-27遮断後に有意に増加する。TNFSF15は、図35中で示されるように、すべての3名の個別のドナーにおいて、抗IL-27 Ab1による処理後に、アイソタイプ対照による処理に比較して、遺伝子発現レベルの再現性のある増加を示した。
後続の実験において、プールされたヒトPBMCを、2つの異なるロットの抗IL-27 Ab1(1μg/mL)またはアイソタイプ対照の存在下において、抗CD3(0.25μg/ml)により24時間刺激したか、または刺激しないままであった。RNAを収集し、遺伝子特異的Taqmanプローブを使用してTNFSF15転写物を測定するqPCRによって、TNFSF15相対量(RQ)を決定した。図36A~36B中で示されるように、結果から、IL-27阻害後のTNFSF15発現の増加が確認され、TNFSF15発現が休止PBMCにおいて抗IL-27 Ab1による処理後に増加しなかったので、免疫細胞活性化に依存することが見出された。
単球をPBMC培養の中へ補給した場合に、TNFSF15転写物の相対的増加はさらに促進された。プールされたヒトPBMCは、休止したまま(休止PBMC)、PBMCからエンリッチされた単球を1:2の比率で補給したPBMC(休止PBMC+単球)、休止したままの単球単独(休止単球)、抗CD3(0.25μg/mL)により活性化されたPBMC(活性化PMBC)、または1:2の比率で単球を補給し、抗CD3(0.25μg/mL)により活性化されたPBMC(活性化PMBC+単球)のいずれかであった。細胞を24時間培養し、次いでRNAをqPCRによるTNFSF15レベルの決定のために単離した。図37中の値は、アイソタイプ対照に比較した、抗IL-27 Ab1によるIL-27阻害後のTNFSF15転写物における倍変化を提示する。
図38中で示されるように、TNFSF15転写を促進する効果はIL-27遮断に特異的であり、CD39またはCD112Rを標的化する他の抗体により観察されなかった。この場合、プールされたヒトPBMCに単球由来マクロファージを補給し、IgG1対照抗体、抗IL-27抗体(抗IL-27 Ab1、1μg/mL)、抗CD39 IgG4抗体(1μg/mL)、抗CD112R IgG1抗体(1μg/mL)、または抗CD112R IgG4抗体(1μg/mL)の存在下において、抗CD3(0.25μg/mL)により24時間刺激した。RNAを24時間で収集し、ヒトTL1A/TNFSF15 DuoSet ELISA(R&D Systems)を使用して、細胞培養上清中のTNFSF15転写物を測定した。
さらに図39A及び図39B中で示されるように、活性化されたPBMCにおける抗IL-27 Ab1によるIL-27のブロック後に、分泌されたTNFSF15タンパク質の増加も、転写物に比較して、遅延した動態で観察された(図39A~39B)。プールされたヒトPBMCに単球由来マクロファージを補給し、IgG1対照または抗IL-27抗体(抗IL-27 Ab1、1μg/mL)の存在下において、抗CD3(0.25μg/mL)により刺激した。RNAを1、2、及び5日目で収集し、TNFSF15転写物相対量(RQ)を各々のタイムポイントについてqPCRによって決定した。培養上清を異なる時間で収集し、サンドイッチELISAを使用してTNFSF15タンパク質を測定した。
Claims (80)
- ヒトIL-27をアンタゴナイズする、単離された抗体またはその抗原結合部分であって、(i)配列番号2(IL-27p28)に対応するアミノ酸37~56、(ii)配列番号2(IL-27p28)に対応するアミノ酸142~164、または(iii)(i)及び(ii)の両方、のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含むエピトープへ特異的に結合する、前記抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、またはGlu164のうちの1つまたは複数のアミノ酸を含む、請求項1に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のAsp146、Arg149、及び/またはPhe153を含む、請求項1または2に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のHis150及び/またはLeu156をさらに含む、請求項3に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Leu142、及び/またはGlu164をさらに含む、請求項3または4に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のGlu46、Val49、Ser50、及び/またはLeu162をさらに含む、請求項3~5のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu142、Asp146、Arg149、His150、Phe153、Leu156、Leu162、及びGlu164からなるかまたは本質的になる、請求項1~6のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のLeu53、Lys56、Asp143、Leu147、Arg152、Ala157、Gly159、Phe160、またはAsn161のうちの1つまたは複数のアミノ酸をさらに含む、請求項1~6のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のLeu53、Lys56、Asp143、Arg145、Leu147、Arg152、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、またはPro163のうちの1つまたは複数のアミノ酸をさらに含む、請求項1~6のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、及びGlu164からなるかまたは本質的になる、請求項1~6のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記エピトープが、配列番号2(IL-27p28)のGln37、Leu38、Glu42、Glu46、Val49、Ser50、Leu53、Lys56、Leu142、Asp143、Arg145、Asp146、Leu147、Arg149、His150、Arg152、Phe153、Leu156、Ala157、Gly159、Phe160、Asn161、Leu162、Pro163、及びGlu164からなるかまたは本質的になる、請求項1~6のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 重鎖CDR1、重鎖CDR2、重鎖CDR3、軽鎖CDR1、軽鎖CDR2、及び軽鎖CDR3を含み、(i)軽鎖CDR1が、N-XXXXXXLFSSNXKXYXX-Cからなり、軽鎖CDR3が、N-XXXASAXXX-Cからなり、重鎖CDR2が、N-XXSSSXSYXYXXXXXXX-Cからなり、重鎖CDR3が、N-XXXXGRTSYTATXHNXXXX-Cからなり、配列中、Xが、任意のアミノ酸である、請求項1~11のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体またはその抗原結合部分が、
(i)配列番号9、10、及び11でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号17、18、及び19でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号31、32、及び33でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号39、40、及び41でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号53、54、及び55でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号61、62、及び63でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号75、76、及び77でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号83、84、及び85でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号97、98、及び99でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号105、106、及び107でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号119、120、及び121でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、請求項1~12のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。 - 前記抗体またはその抗原結合部分が、
(i)配列番号12、13、及び14でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号20、21、及び22でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(ii)配列番号34、35、及び36でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号42、43、及び44でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iii)配列番号56、57、及び58でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号64、65、及び66でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(iv)配列番号78、79、及び80でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号86、87、及び88でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;
(v)配列番号100、101、及び102でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号108、109、及び110でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(vi)配列番号122、123、及び124でそれぞれ示される重鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
からなる群から選択される重鎖CDR及び軽鎖CDRを含まない、請求項1~12のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。 - 前記重鎖CDR1が、N-GFTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]-C(配列番号144)からならない、及び/または、前記重鎖CDR2が、N-ISSS[S/G][S/A]YI-C(配列番号146)からならない、請求項1~14のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記重鎖CDR1が、N-FTF[S/A/R][S/R][T/Y][G/S]MN-C(配列番号148)からならない、及び/または、前記重鎖CDR2が、N-[G/S]ISSS[S/G][S/A]YI[L/Y]YADSVKG-C(配列番号149)からならない、請求項1~15のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体またはその抗原結合部分が、
(i)N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-ISSSXXYI-C(配列番号147)からなる重鎖CDR2、及び配列番号121で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号127、128、及び129でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列;または
(ii)N-FTFXXXXMN-C(配列番号150)からなる重鎖CDR1、N-XISSSXXYIXYADSVKG-C(配列番号151)からなる重鎖CDR2、及び配列番号124で示される重鎖CDR3配列;ならびに配列番号130、131、及び132でそれぞれ示される軽鎖CDR1、CDR2、及びCDR3の配列、
を含まない、請求項1~16のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。 - 前記抗体またはその抗原結合部分が、N-GFTFXXXX-C(配列番号145)からなる重鎖CDR1、N-IXXXXXXX-C(配列番号152)からなる重鎖CDR2、及びN-AR[X]n=6-15DX-C(配列番号153)からなる重鎖CDR3配列;ならびにN-QS[X]n=1-3SS[X]n=0-4Y-C(配列番号154)からなる軽鎖CDR1、N-XXS-C(配列番号155)からなる軽鎖CDR2、及びN-QQXXXXP[X]n=0-1T-C(配列番号156)からなる軽鎖CDR3配列を、それぞれを含まない、請求項1~17のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体またはその抗原結合部分が、以下の特性:
(i)15nM以下の平衡解離定数(KD)でヒトIL-27へ結合する;
(ii)IL-27受容体へのIL-27の結合をブロックする;
(iii)細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する;
(iv)細胞におけるCD161発現のIL-27媒介性阻害を阻害または低減する;
(v)細胞におけるIL-27媒介性のPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する;ならびに
(vi)1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する、のうちの少なくとも1つまたは複数を呈する、請求項1~18のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分。 - 前記単離された抗体またはその抗原結合部分が、15nM以下の平衡解離定数(KD)でヒトIL-27へ結合する、請求項1~19のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する、請求項1~20のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記細胞が、免疫細胞またはがん細胞である、請求項21に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する、請求項1~22のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記細胞が、免疫細胞である、請求項23に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減する、請求項1~24のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記細胞が、免疫細胞である、請求項25に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記細胞が、がん細胞である、請求項26に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記細胞が、がん細胞であり、前記抗体またはその抗原結合部分が、がん細胞におけるPD-L1の発現を阻害または低減する、請求項27に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体またはその抗原結合部分が、1つまたは複数のサイトカインの細胞からの前記PD-1媒介性分泌を誘導または促進する、請求項1~28のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記1つまたは複数のサイトカインが、IFNg(またはIFNγ)、IL-17、TNFa(またはTNFα)、またはIL-6である、請求項29に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体が、IgG1抗体、IgG2抗体、IgG3抗体、IgG4抗体、IgM抗体、IgA1抗体、IgA2抗体、IgD抗体、及びIgE抗体からなる群から選択される、請求項1~30のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体が、IgG1抗体またはIgG4抗体である、請求項31に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 前記抗体が、少なくとも1つの突然変異を含むFcドメインを含む、請求項1~32のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分。
- 先行請求項のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分及び薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
- 請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体またはその抗原結合部分の前記軽鎖、重鎖、または軽鎖及び重鎖の両方をコードするヌクレオチド配列を含む、核酸。
- 請求項35に記載の核酸を含む、発現ベクター。
- 請求項36に記載の発現ベクターにより形質転換された、細胞。
- ヒトIL-27を特異的に結合する抗体またはその抗原結合部分を産生する方法であって、前記モノクローナル抗体またはその抗原結合部分の発現を可能にする条件下で請求項37に記載の細胞を維持することを含む、前記方法。
- 前記抗体またはその抗原結合部分を得ることをさらに含む、請求項38に記載の方法。
- 細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する方法であって、前記細胞を請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体または抗原結合断片と接触させることを含み、前記抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減する、前記方法。
- 細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する方法であって、前記細胞を請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体または抗原結合断片と接触させることを含み、前記抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減する、前記方法。
- 細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3発現を阻害または低減する方法であって、前記細胞を請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体または抗原結合断片と接触させることを含み、前記抗体またはその抗原結合部分が、細胞におけるPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害する、前記方法。
- 細胞からの1つまたは複数のサイトカインの分泌を誘導または促進する方法であって、前記細胞を請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体または抗原結合断片と接触させることを含み、前記抗体またはその抗原結合部分が、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進する、前記方法。
- 対象における免疫応答を刺激する方法であって、有効量の請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体または抗原結合断片、請求項34に記載の医薬組成物を前記対象へ投与することを含む、前記方法。
- 対象におけるがんを治療する方法であって、有効量の請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体もしくは抗原結合断片または請求項34に記載の医薬組成物を対象へ投与することを含む、前記方法。
- 対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法であって、有効量の請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体もしくは抗原結合断片または請求項34に記載の医薬組成物を前記対象へ投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分または前記医薬組成物が、細胞におけるSTAT1及び/またはSTAT3のリン酸化を阻害または低減し、それによって前記免疫応答を刺激するかまたは前記がんを治療する、前記方法。
- 対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法であって、有効量の請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体もしくは抗原結合断片または請求項34に記載の医薬組成物を前記対象へ投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分または前記医薬組成物が、細胞におけるCD161発現の阻害を阻害または低減し、それによって前記免疫応答を刺激するかまたは前記がんを治療する、前記方法。
- 対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法であって、有効量の請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体もしくは抗原結合断片または請求項34に記載の医薬組成物を前記対象へ投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分または前記医薬組成物が、細胞のPD-L1及び/またはTIM-3の発現を阻害または低減し、それによって前記免疫応答を刺激するかまたは前記がんを治療する、前記方法。
- 対象において免疫応答を刺激するかまたはがんを治療する方法であって、有効量の請求項1~33のいずれか1項に記載の単離された抗体もしくは抗原結合断片または請求項34に記載の医薬組成物を前記対象へ投与することを含み、前記抗体もしくはその抗原結合部分または前記医薬組成物が、1つまたは複数のサイトカインの細胞からのPD-1媒介性分泌を誘導または促進し、それによって前記免疫応答を刺激するかまたは前記がんを治療する、前記方法。
- 前記がんが、肺癌(例えば非小細胞肺癌)、肉腫、精巣癌、卵巣癌、膵臓癌、乳癌(例えばトリプルネガティブ乳癌)、黒色腫、頭頸部癌(例えば頭頸部扁平上皮癌)、結腸直腸癌、膀胱癌、子宮内膜癌、前立腺癌、甲状腺癌、肝細胞癌、胃癌、脳腫瘍、リンパ腫(例えばDL-BCL)、白血病(例えばAML)、または腎臓癌(例えば腎細胞癌、例えば腎明細胞癌)から選ばれる、請求項45~49のいずれか1項に記載の方法。
- 抗PD-1抗体の1つまたは複数の活性を促進する(例えばPD-1媒介性サイトカイン分泌を促進する;抗PD-1媒介性TNFα分泌を促進する;抗PD-1抗体へ曝露された細胞からの抗PD-1媒介性IL-6分泌を促進する)方法であって、抗PD-1抗体と同時にまたはそれへ逐次的に、請求項1~33のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分へ細胞を曝露し、それによって抗PD1抗体の1つまたは複数の活性を促進することを含む、前記方法。
- 抗PD-1抗体及び請求項1~33のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分、ならびに薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
- 同時投与または逐次投与のための、抗PD-1抗体及び請求項1~33のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合部分、ならびにその使用のための指示書を含むキット。
- 前記単離された抗体またはその抗原結合部分が、1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用して投与され、第2の治療剤または手順が、化学療法、標的化抗癌療法、腫瘍溶解性薬物、細胞傷害剤、免疫ベース療法、サイトカイン、外科的手順、放射線による手順、共刺激分子の活性化物質、阻害分子の阻害物質、ワクチン、もしくは細胞免疫療法、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項44~50のいずれか1項に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、PD-1アンタゴニスト、PD-L1阻害物質、TIM-3阻害物質、LAG-3阻害物質、TIGIT阻害物質、CD112R阻害物質、TAM阻害物質、STINGアゴニスト、4-1BBアゴニスト、またはそれらの組み合わせである、請求項54に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、PD-1アンタゴニストである、請求項55に記載の方法。
- 前記PD-1アンタゴニストが、PDR001、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、ピジリズマブ、MEDI0680、REGN2810、TSR-042、PF-06801591、及びAMP-224からなる群から選択される、請求項56に記載の方法。
- 前記PD-L1阻害物質が、FAZ053、アテゾリズマブ、アベルマブ、デュルバルマブ、及びBMS-936559からなる群から選択される、請求項55に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、スニチニブ(SUTENT(登録商標))、カボザンチニブ(CABOMETYX(登録商標))、アキシチニブ(INLYTA(登録商標))、レンバチニブ(LENVIMA(登録商標))、エベロリムス(AFINITOR(登録商標))、ベバシズマブ(AVASTIN(登録商標))、エパカドスタット、NKTR-214(CD-122バイアスアゴニスト)、チボザニブ(FOTIVDA(登録商標))、アベキシノスタット、イピリムマブ(YERVOY(登録商標))、トレメリムマブ、パゾパニブ(VOTRIENT(登録商標))、ソラフェニブ(NEXAVAR(登録商標))、テムシロリムス(TORISEL(登録商標))、ラムシルマブ(CYRAMZA(登録商標))、ニラパリブ、サボリチニブ、vorolanib(X-82)、レゴラフェニブ(STIVARGO(登録商標))、ドナフェニブ(マルチキナーゼ阻害物質)、カムレリズマブ(SHR-1210)、ペキサスチモジン・デバシレプベク(JX-594)、ラムシルマブ(Cyramza(登録商標))、アパチニブ(YN968D1)、カプセル化ドキソルビシン(THERMODOX(登録商標))、チバンチニブ(ARQ197)、ADI-PEG 20、ビニメチニブ、メシル酸アパチニブ、ニンテダニブ、リリルマブ、ニボルマブ(OPDIVO(登録商標))、ペムブロリズマブ(KEYTRUDA(登録商標))、アテゾリズマブ(TECENTRIQ(登録商標))、アベルマブ(BAVENCIO(登録商標))、デュルバルマブ(IMFIMZI(登録商標))、セミプリマブ-rwlc(LIBTAYO(登録商標))、チスレリズマブ、及びスパルタリズマブからなる群から選択される、請求項55に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、TIM-3阻害物質であり、任意選択で、TIM-3阻害物質は、MGB453またはTSR-022である、請求項55に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、LAG-3阻害物質であり、任意選択で、LAG-3阻害物質は、LAG525、BMS-986016、及びTSR-033からなる群から選択される、請求項55に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、TIGIT阻害物質である、請求項55に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、CD112R阻害物質である、請求項55に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、TAM(Axl、Mer、Tyro)阻害物質である、請求項55に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、4-1BBアゴニストである、請求項55に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、チロシンキナーゼ阻害物質(TKI)である、請求項55に記載の方法。
- 対象において免疫応答を刺激するための、または対象におけるがんを治療するための、任意選択で、1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用する使用のための、請求項1~33のいずれか1項に記載の単離されたモノクローナル抗体もしくはその抗原結合部分または請求項34に記載の医薬組成物の使用。
- 請求項1~33のいずれか1項の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分、または請求項34の医薬組成物、及び対象における免疫応答の刺激または対象におけるがんの治療における使用のための指示書を、任意選択で、1つまたは複数の追加の治療剤または手順と併用する使用のための指示書と共に含む、キット。
- 請求項1~33のいずれか1項に記載の単離されたモノクローナル抗体またはその抗原結合部分、及び対象からのサンプル中のIL-27の検出における使用のための指示書を、任意選択で、対象においてIL-27関連がんを検出するための使用のための指示書と共に含む、キット。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、チロシンキナーゼ阻害物質、CD39アンタゴニスト、CD73アンタゴニスト、A2ARアンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、デュアルA2AR/A2BRアンタゴニスト、CCR8アンタゴニスト、CTLA4アンタゴニスト、VEG-F阻害物質、またはそれらの組み合わせである、請求項54に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、PD-1アンタゴニスト、PD-L1阻害物質、TIM-3阻害物質、LAG-3阻害物質、TIGIT阻害物質、CD112R阻害物質、TAM阻害物質、STINGアゴニスト、4-1BBアゴニスト、チロシンキナーゼ阻害物質、CD39アンタゴニスト、CD73アンタゴニスト、A2ARアンタゴニスト、A2BRアンタゴニスト、デュアルA2AR/A2BRアンタゴニスト、CCR8アンタゴニスト、CTLA4アンタゴニスト、VEG-F阻害物質、またはそれらの組み合わせである、請求項54に記載の方法。
- 前記1つまたは複数の追加の治療剤が、PD-1アンタゴニスト、PD-L1阻害物質、VEG-F阻害物質、またはそれらの組み合わせである、請求項71に記載の方法。
- 前記投与後にTNFSF15の発現を測定することをさらに含む、請求項44~51、54~66、及び70~72のいずれか1項に記載の方法。
- 前記投与前にTNFSF15の発現を測定することをさらに含む、請求項73に記載の方法。
- 前記投与前のTNFSF15の発現に比較して、前記投与後のTNFSF15の発現の変化がないかまたは前記発現の減少を呈する前記対象へ追加用量を投与することを含む、請求項75に記載の方法。
- 前記投与前のTNFSF15の発現に比較して、前記投与後のTNFSF15の発現の増加を呈する前記対象へ追加用量を投与することを含む、請求項74に記載の方法。
- 対象から得られたサンプル中のTNFSF15の発現を測定し、ヒトIL-27をアンタゴナイズする薬剤を前記対象へ投与し、前記投与後の前記対象から得られたサンプル中のTNFSF15の発現を測定することを含む、ヒトIL-27をアンタゴナイズする前記薬剤の有効性を決定する方法。
- 細胞培養物中のTNFSF15の発現を測定し、前記細胞培養物の1つまたは複数の細胞を対象でヒトIL-27をアンタゴナイズする薬剤と接触させ、接触後に前記細胞培養物中のTNFSF15の発現を測定することを含む、ヒトIL-27をアンタゴナイズする前記薬剤の有効性を決定する方法。
- 前記TNFSF15の発現が、mRNAレベル、タンパク質レベル、またはそれらの任意の組み合わせの測定によって測定される、請求項73~78のいずれか1項に記載の方法。
- 前記TNFSF15の発現が、定量的PCR(「qPCR」)、インサイチューハイブリダイゼーション、免疫組織化学、またはそれらの任意の組み合わせによって測定される、請求項73~79のいずれか1項に記載の方法。
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