JP2022546537A - T細胞療法のためのt細胞の調製方法 - Google Patents

T細胞療法のためのt細胞の調製方法 Download PDF

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Abstract

本明細書では、所定の細胞密度で、細胞集団をある濃度の抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させ、細胞を培養し、それにより少なくとも一つのT細胞サブタイプの割合の増加を含むT細胞集団を産生することを含む、T細胞療法のためのT細胞を調製する方法が提供される。一部の実施形態では、方法は、幹メモリーT細胞の割合を増加させる。【選択図】図1

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2019年9月3日に出願された米国仮特許出願第62/895,381号の優先権の利益を主張するものであり、その内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
[技術分野]
本開示は、T細胞療法のために一つ以上のT細胞を調製する方法に関する。特に、本開示は、所定の細胞密度を有する細胞集団を、T細胞サブタイプの割合を増加させるように選択される、ある濃度の抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させることによって、細胞集団における少なくとも一つのT細胞サブタイプの割合を増加させる方法に関する。
ヒト癌は、その性質により、遺伝的または後成的変換を受けて異常な癌細胞となった正常な細胞から構成される。そうすることで、癌細胞は、正常な細胞によって発現されるものとは別個のタンパク質および他の抗原を発現し始める。これらの異常腫瘍抗原は、身体の自然免疫系が癌細胞を特異的に標的にし、死滅させるために使用され得る。しかしながら、癌細胞は様々な機序を利用して、Tリンパ球およびBリンパ球などの免疫細胞が癌細胞を首尾よく標的にすることを妨げる。
ヒトT細胞療法は、エクスビボで濃縮または改変されたヒトT細胞に依存して、対象、例えば患者において、癌細胞を標的にし、死滅させる。腫瘍抗原を標的化することができる天然起源のT細胞、または既知の癌抗原を特異的に標的化する遺伝子改変T細胞の濃度を高くする様々な技術が開発されてきた。これらの療法は、腫瘍サイズおよび患者の生存に対して有望な効果を有することが実証されている。
T細胞の混合集団の移植は、T細胞療法が能力を最大限に発揮することを妨げ得る要因の一つである。従来的なT細胞療法では、ドナーT細胞が収集され、任意に改変されて特定の抗原(例えば、腫瘍細胞)を標的とするか、または抗腫瘍特性(例えば、腫瘍浸潤リンパ球)のために選択され、インビトロで増殖され、それを必要とする対象に投与される。典型的には、結果として得られるT細胞は、多分に成熟した細胞の混合集団を含み、その多くが高分化している。結果として、これらの細胞の予想されるインビボでの持続性は限定され得、最初に観察されたプラス効果は、移植されたT細胞の非存在下で腫瘍がリバウンドするにつれて経時的に取り消され得る。したがって、T細胞療法で使用するために、T細胞のインビボでの持続性を増加させる必要性が依然として存在する。
本開示は、1)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始細胞集団と接触させることであって、開始細胞集団が少なくとも約0.2x106細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度であり、および体積比は、体積17.4以下の開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、ならびに2)培養培地中で細胞集団を培養することであって、結果として得られるT細胞集団は、第2のT細胞集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の第2の開始細胞集団を、体積17.5以上の第2の開始細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比率で、抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させる、培養すること、を含む、細胞集団における幹メモリーT細胞の割合を増加する方法を提供する。
本開示は、1)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始細胞集団と接触させることであって、開始細胞集団が少なくとも約0.2x106細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度であり、および体積比は、体積17.4以下の開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、ならびに2)培養培地中で細胞集団を培養することであって、結果として得られるT細胞集団は、第2のT細胞集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の第2の開始細胞集団を、体積17.5以上の第2の開始細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比率で、抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させる、培養すること、を含む、細胞集団における幹メモリーT細胞の割合を増加する方法であって、開始細胞集団を抗CD3/CD28ナノマトリックスで培養する前、培養する間、または培養した後に、開始細胞集団を形質導入および/またはトランスフェクトすることをさらに含む、細胞集団における幹メモリーT細胞の割合を増加する方法を提供する。
本開示は、1)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始PBMC集団と接触させることであって、開始PBMC集団が少なくとも約0.50x106細胞/ml~約2.00x106細胞/mlの細胞密度であり、および体積比は、体積5または10の開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、ならびに2)培養培地中で14~18日間、PBMC集団を培養することであって、結果として得られるPBMC集団は、第2のPBMC集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の第2の開始PBMC集団を、体積20または40の第2の開始PBMC集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比率で、抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させて、同じ日数の間培養する、培養すること、を含む、PBMC集団における幹メモリーT細胞の割合を増加する方法を提供する。
本開示は、1)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始精製されたT細胞集団と接触させることであって、開始T細胞集団が少なくとも約0.80x106細胞/ml~約1.60x106細胞/mlの細胞密度であり、および体積比は、体積10または15の開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、ならびに2)培養培地中で11~18日間、精製されたT細胞集団を培養することであって、結果として得られる精製されたT細胞集団は、第2の精製されたT細胞集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の第2の開始精製されたT細胞集団を、体積20、25または50の第2の開始T細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比率で、抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させて、同じ日数の間培養する、培養すること、を含む、精製されたT細胞集団における幹メモリーT細胞の割合を増加する方法を提供する。
本開示はさらに、治療有効量の結果として得られるTscm濃縮T細胞集団を、それを必要とする対象に投与することを含む、治療方法を提供する。
図1は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、1日目~18日目の全体的な実際の細胞収率を示す棒グラフである。
図2は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、G-Rex(登録商標)における細胞培養の前の1日目~8日目の実際の細胞収率を示す棒グラフである。
図3は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、G-Rex(登録商標)における8日目~18日目の実際の細胞収率を示す棒グラフである。
図4は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、総細胞増殖倍率(total cell expansion folds)を示す、プロセス中の日数に対する細胞増殖倍率をプロットしたグラフである。
図5は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、0日目~1日目、1日目~4日目、4日目~6日目、6日目~8日目、および8日目~18日目の増殖倍率を示す棒グラフおよび表である。
図6は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、G-Rex(登録商標)における増殖前0日目~1日目、1日目~4日目、4日目~6日目、6日目~8日目の増殖倍率を示す棒グラフである。
図7は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、プロセスの18日目のPBMC細胞サブセットの割合を示す棒グラフである。
図8は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、プロセスの18日目の(CD45ROおよびCD62Lマーカーを有する)CD5+T細胞メモリーサブセットの比率を示す棒グラフである。
図9は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、プロセスの18日目のCD4+およびCD8+細胞サブセットの割合を示す棒グラフである。
図10Aは、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、プロセスの18日目のCD45RAおよびCD62Lマーカーを使用した総CD5+T細胞サブセットのサブセットの割合を示す棒グラフである。
図10B~10Hは、垂直軸上にCD62L、水平軸上にCD45RAを有する等高線プロットであり、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、CD5+T細胞サブセットの割合を示す。
図11Aは、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、プロセスの18日目のCD45ROおよびCD62Lマーカーを使用した総CD5+T細胞サブセットのサブセットの割合を示す棒グラフである。
図11B~11Hは、垂直軸上にCD62L、水平軸上にCD45RAを有する等高線プロットであり、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、CD5+T細胞サブセットの割合を示す。
図12は、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、18日目のCAR+細胞およびTCRα/β-細胞の割合を示す棒グラフである。
図13Aは、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、プロセスにおける日に対する細胞生存率割合をプロットしたグラフである。
図13Bは、細胞培養体積比に対して示されたTransact(商標)と関連する対照とで活性化された細胞について、プロセスにおける日に対する細胞直径をプロットしたグラフである。
図14Aおよび14Bは、1:10および1:15のTransAct(商標)希釈で達成された最適なT細胞増殖をプロットしたグラフである。二つの異なるドナーからのFMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 T細胞、およびUT対照T細胞を、T細胞活性化/増殖キットビーズ(Miltenyi Biotec)、またはT細胞TransAct(商標)ポリマーナノマトリックス(Miltenyi Biotec)のいずれかを、それぞれ示されたビーズ:細胞または体積:体積比で用いて、刺激した。活性化(0日目)後9日目および14日目に総T細胞数を数え、倍増殖を計算した。561=ドナー数;658=ドナー数;UT=非形質導入T細胞;M=T細胞活性化/増殖キット;T=TransAct(商標);FMC=FMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 CAR T細胞;D9=9日目;D14=14日目。
図15Aおよび15Bは、製造プロセスの終了時に、TransAct(商標)希釈がCAR+T細胞の割合を変化させないことを示す棒グラフである。 二つの異なるドナーからのFMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 T細胞を、T細胞活性化/増殖キットビーズ(Miltenyi Biotec)、またはT細胞TransAct(商標)ポリマーナノマトリックス(Miltenyi Biotec)のいずれかを、それぞれ示されたビーズ:細胞または体積:体積比で用いて、刺激した。14日目のCAR+T細胞の割合を、フローサイトメトリーにより決定した。561=ドナー数;658=ドナー数;Miltenyi=T細胞活性化/増殖キット;T=TransAct(商標);D14=14日目;CAR=キメラ抗原受容体。
図16Aおよび16Bは、低い濃度のTransAct(商標)が、最終産生物中のCD4+CAR T細胞の割合を増加させることを示す棒グラフである。二つの異なるドナーからのFMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 T細胞、およびUT対照T細胞を、T細胞活性化/増殖キットビーズ(Miltenyi Biotec)、またはT細胞TransAct(商標)ポリマーナノマトリックス(Miltenyi Biotec)のいずれかを、それぞれ示されたビーズ:細胞または体積:体積比で用いて、刺激した。14日目のCD4+およびCD8+T細胞の割合を、フローサイトメトリーによって決定した。561=ドナー数;658=ドナー数;UT=非形質導入T細胞;M=T細胞活性化/増殖キット;T=TransAct(商標);FMC=FMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 CAR T細胞;D14=14日目。
図17A~17Dは、1:10および1:15のTransAct(商標)希釈が、最終産生物中のCD25+CAR T細胞の割合の低下をもたらすことを示す棒グラフである。二つの異なるドナーからのFMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 T細胞、およびUT対照T細胞を、T細胞活性化/増殖キットビーズ(Miltenyi Biotec)、またはT細胞TransAct(商標)ポリマーナノマトリックス(Miltenyi Biotec)のいずれかを、それぞれ示されたビーズ:細胞または体積:体積比で用いて、刺激した。14日目のCD25+および4-1BB+T細胞の割合を、フローサイトメトリーによって決定した。561=ドナー数;658=ドナー数;UT=非形質導入T細胞;M=T細胞活性化/増殖キット;T=TransAct(商標);FMC=FMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 CAR T細胞;D14=14日目。
図18A~18Dは、1:10および1:15のTransAct(商標)希釈が、CD4+およびCD8+ CAR T細胞の両方においてTSCM 細胞を、ならびにCD8+ CAR T細胞においてTCM細胞を保存することを示す棒グラフである。二つの異なるドナーからのFMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 T細胞、およびUT対照T細胞を、T細胞活性化/増殖キットビーズ(Miltenyi Biotec)、またはT細胞TransAct(商標)ポリマーナノマトリックス(Miltenyi Biotec)のいずれかを、それぞれ示されたビーズ:細胞または体積:体積比で用いて、刺激した。14日目のTSCMおよびTCM細胞の割合を、フローサイトメトリーによって決定した。561=ドナー数;658=ドナー数;UT=非形質導入T細胞;M=T細胞活性化/増殖キット;T=TransAct(商標);FMC=FMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 CAR T細胞;D14=14日目;TEFF=エフェクターT細胞;TEM=エフェクターメモリーT細胞;TCM=中央メモリーT細胞;TSCM=幹細胞メモリーT細胞。
本開示は、T細胞療法で使用するためのT細胞を調製する方法に関する。特に、本開示は、T細胞集団における未成熟でより分化程度の低いT細胞(例えば、幹メモリーT細胞(以下、「TSCM」))を含む特定のT細胞サブタイプの割合を高めることに関する。未成熟でより分化程度の低いT細胞のために濃縮することによって、いったん対象、例えば患者に投与されるとT細胞の潜在的な持続性は増加し得る。結果として、未成熟T細胞の濃縮された集団は、分化の混合段階でのT細胞の集団よりも持続的な抗腫瘍効果を生じる可能性が高い。
定義
本開示がより容易に理解され得るように、特定の用語がまず定義される。本出願で使用される場合、本明細書に別途明示的に定められている場合を除き、以下の各用語は、以下に記載する意味を有するものとする。追加的な定義は、本開示全体を通して記載される。
別段の定義がない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本開示が関係する当業者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有する。例えば、Concise Dictionary of Biomedicine and Molecular Biology, Juo, Pei-Show, 2nd ed.,2002,CRC Press;The Dictionary of Cell and Molecular Biology, 3rd ed., 1999, Academic Press;およびOxford Dictionary of Biochemistry And Molecular Biology, Revised,2000,Oxford University Pressは、本開示で使用される用語の多くに関する一般的な辞書を当業者に提供する。
単位、接頭辞、および記号は、国際単位系(Systeme International de Unites)(SI)が認めた様式で示されている。数値範囲は、範囲を定義する数値を含む。本明細書に提供される見出しは、本明細書全体を参照することによって得ることができる本開示の様々な態様を限定するものではない。したがって、以下に定義される用語は、その全体が本明細書を参照することによってより完全に定義される。
本明細書で使用される場合、不定冠詞「a」または「an」は、任意の列挙されたまたは数え上げられた構成要素の「一つ以上」を指すと理解されるべきである。
用語「約」または「本質的に含む」は、当業者によって決定される特定の値または組成物に対する許容可能な誤差範囲内の値または組成物を指し、これは、値または組成物がどのように測定または決定されるか、すなわち測定システムの限界に、いくぶんか依存する。例えば、当分野の慣行によると、「約」または「本質的に含む」とは、1、または1を超える標準偏差以内を意味することができる。あるいは、「約」または「本質的に含む」は、最大10%の範囲(すなわち、+/-10%)を意味することができる。例えば、「約3mg」は、2.7mg~3.3mgの間の任意の数を含み得る(10%について)。さらに、特に生物学的システムまたはプロセスに関して、当該用語は、値の最大1桁または最大5倍まで意味することができる。特定の値または組成物が本出願および特許請求の範囲に提供される場合、別段の記載がない限り、「約」または「本質的に含む」の意味は、その特定の値または組成物について許容可能な誤差範囲内であると想定されるべきである。
本明細書に記載されるように、別段の示唆がない限り、任意の濃度範囲、割合範囲、比の範囲、または整数範囲は、列挙された範囲内の任意の整数の値、および適切な場合、その分数(整数の10分の1および100分の1など)を含むと理解されるべきである。
本明細書で使用される場合、用語「および/または」は、他方を伴うまたは伴わない、二つの指定された特徴または構成要素各々の、具体的な開示として受け取られるべきである。したがって、本明細書の「Aおよび/またはB」などの語句で使用される用語「および/または」は、「AおよびB」、「AまたはB」、「A」(単独)、ならびに「B」(単独)を含むことが意図される。同様に、「A、B、および/またはC」などの語句で使用される用語「および/または」は、以下の態様の各々を包含することが意図されている。A、B、およびC;A、B、またはC;AまたはC;AまたはB;BまたはC;AおよびC;AおよびB;BおよびC;A(単独);B(単独);ならびにC(単独)。
本明細書に「含む」という用語で記載される態様がどこにあっても、「からなる」および/または「本質的にからなる」という観点から記載されるその他の点で類似した態様もまた提供されることが理解される。
用語「活性化」または「活性化された」は、検出可能な細胞増殖を誘導するために十分に刺激された免疫細胞、例えば、T細胞の状態を指す。活性化はまた、誘導されたサイトカイン産生および検出可能なエフェクター機能と関連し得る。「活性化されたT細胞」という用語は、とりわけ、細胞分裂をしているT細胞を指す。T細胞活性化は、限定されるものではないが、CD57、PD1、CD107a、CD25、CD137、CD69、および/またはCD71を含む、一つ以上のバイオマーカーのT細胞発現の増加によって特徴付けられ得る。
「投与する」とは、当業者に公知の様々な方法および送達システムのいずれかを使用して、対象に薬剤を物理的に導入することを指す。本明細書に開示される方法によって調製されるT細胞についての例示的な投与経路は、例えば注射もしくは点滴による、静脈内、筋肉内、皮下、腹腔内、脊椎、または、その他の非経口投与経路を含む。本明細書で使用される場合、「非経口投与」という語句は、通常は注射による、腸内および局所投与以外の投与様式を意味し、限定するものではないが、静脈内、筋肉内、動脈内、髄腔内、リンパ管内、病巣内、関節包内、眼窩内、心臓内、皮内、腹腔内、経気管、皮下、表皮下、関節内、被膜下、クモ膜下、脊髄内、硬膜外、および胸骨内注射および注入、ならびにインビボエレクトロポレーションを含む。投与はまた、例えば、1回、複数回、および/または一つ以上の長期間にわたって実施することができる。
「抗体」(Ab)という用語は、限定されないが、抗原に特異的に結合する免疫グロブリンを含む。概して、抗体は、ジスルフィド結合によって相互接続された少なくとも二つの重(H)鎖および二つの軽(L)鎖を含み得る。各H鎖は、重鎖可変領域(本明細書ではVHと省略される)および重鎖定常領域を含む。重鎖定常領域は、三つまたは四つの定常ドメイン、CH1、CH2 CH3、および/またはCH4を含むことができる。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細書ではVLと省略される)および軽鎖定常領域を含む。軽鎖定常領域は、一つの定常ドメイン、CLを含み得る。VH領域およびVL領域は、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる、より保存された領域が散在する相補性決定領域(CDR)と呼ばれる、超可変性の領域にさらに細分され得る。各VHおよびVLは、三つのCDRおよび四つのFRを含み、アミノ末端からカルボキシ末端へ以下の順序で配置される:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鎖および軽鎖の可変領域は、抗原と相互作用する結合ドメインを含有する。
免疫グロブリンは、IgA、分泌型IgA、IgG、およびIgMを含むがこれに限定されない、一般的に知られているアイソタイプのいずれかに由来することができる。IgGサブクラスは、当該技術分野で公知であり、ヒトIgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4を含むがこれに限定されない。「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされるAbクラスまたはサブクラス(例えば、IgMまたはIgG1)を指す。「抗体」という用語は、例として、天然起源の、および天然起源でないAbの両方、モノクローナルおよびポリクローナルAb、キメラおよびヒト化Ab、ヒトまたは非ヒトAb、完全合成Ab、ならびに一本鎖Abを含み、ラクダ抗体を含む。非ヒトAbは、ヒトにおけるその免疫原性を減少させるための組換え方法によってヒト化することができる。明示的に記載されていない場合、また文脈が別段の示唆を示さない限り、用語「抗体」はまた、前述の免疫グロブリンのいずれかの抗原結合断片または抗原結合部分を含み、一価および二価の断片または部分、ならびに一本鎖Abを含む。
「抗原結合分子」または「抗体断片」は、抗体の全体未満である任意の部分を指す。抗原結合分子は、抗原性相補性決定領域(CDR)を含み得る。抗体断片の例としては、限定されるものではないが、Fab、Fab’、F(ab’)2、およびFv断片、dAb、線形抗体、scFv抗体、ならびに抗原結合分子から形成される多重特異性抗体が挙げられる。
用語「自己」は、後で再導入されるのと同じ個体に由来する任意の材料を指す。例えば、操作された自己細胞療法(eACT(商標))は、ドナー、例えば患者からのリンパ球の収集を伴い、次いで、それらは、例えばCAR構築物を発現するように操作され、その後、同じドナー、例えば患者へ再び投与される。
用語「同種異系型」は、後に同じ種の別の個体に導入される、ある個体に由来する任意の材料を指す、例えば同種異系T細胞移植または療法。
用語「抗CD3/28ナノマトリックス」は、例えばMiltenyi Biotec社(カリフォルニア州オーバーン)からTransAct TM T細胞試薬として提供される、CD3およびCD28に結合する抗体および/またはその断片を含むナノメートルスケールマトリックスを指す(例えば、カタログ番号200-076-202 MACS GMP T Cell Transact-CRR、カタログ番号170-076-156 MACS GMP T Cell Transact for Research useを参照)。
「癌」は、体内における異常な細胞の制御不能な増殖によって特徴付けられる様々な疾患の広範な群を指す。未制御の細胞分裂および増殖は、隣接する組織に侵入し、さらにリンパ系または血流を介して身体の遠隔部分に転移する可能性もある悪性腫瘍の形成をもたらす。「癌」または「癌組織」は、様々なステージの腫瘍を含み得る。ある特定の実施形態では、癌または腫瘍はステージ0であり、例えば、癌または腫瘍が発生の非常に早期であり、転移していない。一部の実施形態では、癌または腫瘍はステージIであり、例えば、癌または腫瘍が比較的小さなサイズであり、近くの組織に広がっておらず、転移していない。他の実施形態では、癌または腫瘍はステージII、またはステージIIIであり、例えば、癌または腫瘍がステージ0またはステージIよりも大きく、隣接する組織へと増殖したが、リンパ節に転移している可能性を除いて、転移していない。他の実施形態では、癌または腫瘍はステージIVであり、例えば、癌または腫瘍が転移している。ステージIVは、進行癌または転移癌とも呼ばれ得る。
本明細書で使用される場合、「抗腫瘍効果」は、腫瘍体積の減少、腫瘍成長の阻害、腫瘍細胞数の減少、腫瘍細胞増殖の減少、転移数の減少、全生存期間または無増悪生存期間の増加、平均余命の増加、または腫瘍に関連する様々な生理学的症状の改善として現れ得る生物学的効果を指す。抗腫瘍効果はまた、腫瘍の発生の予防、例えばワクチンを指すこともできる。
本明細書で使用される場合、PFSと省略され得る「無増悪生存期間」という用語は、治療日から、悪性リンパ腫に対するIWG応答基準の改訂版(the revised IWG Response Criteria for Malignant Lymphoma)による疾患進行の、または任意の原因の死亡の日付までの時間を指す。
「疾患進行」は、放射線写真上の悪性病変の測定または他の方法によって評価される。
本明細書で使用される場合、DORと省略され得る「奏効期間」は、対象の最初の客観的奏効から、悪性リンパ腫に対するIWG応答基準の改定版により疾患進行が確認された日、または死亡日までを指す。
OSと省略され得る用語「全生存期間」は、治療日から死亡日までの時間として定義される。
本明細書で使用される場合、「サイトカイン」は、免疫反応を伝達するために、マクロファージ、B細胞、T細胞、および肥満細胞を含む免疫細胞によって放出され得る、非抗体タンパク質を指す。一部の実施形態では、一つ以上のサイトカインが、T細胞療法に応答して放出される。ある特定の実施形態では、T細胞療法に応答して分泌されるそれらのサイトカインは、有効なT細胞療法の徴候であり得る。
本明細書で使用される場合、「治療有効量」、または「治療有効用量」は、本方法によって産生される、ならびに、単独でまたは別の治療剤と組み合わせて使用された場合、対象を疾患の発症から保護する、あるいは、疾患症状の重症度の減少、疾患の無症状期間の頻度および継続期間の増加、または疾患の罹患に起因する欠陥もしくは障害の予防によって証明される、疾患退縮を促進する、T細胞またはDC細胞の量を指す。疾患退縮を促進するT細胞またはDC細胞の能力は、例えば、臨床試験中のヒト対象において、ヒトにおける有効性を予測する動物モデル系において、またはインビトロアッセイにおける薬剤の活性をアッセイすることによって、熟練した施術者に公知の様々な方法を用いて評価することができる。
本明細書で使用される場合、用語「リンパ球」は、ナチュラルキラー(NK)細胞、T細胞、またはB細胞を含み得る。NK細胞は、固有の免疫系の主要構成要素を表す細胞傷害性(細胞毒性)リンパ球の一種である。NK細胞は、腫瘍およびウイルスに感染した細胞を拒絶する。それはアポトーシスまたはプログラム細胞死のプロセスを通して作用する。細胞を死滅させるために活性化を必要としないため、それらは「ナチュラルキラー」と呼ばれた。T細胞は、細胞性免疫(抗体の関与なし)において主要な役割を果たす。そのT細胞受容体(TCR)は、他のリンパ球型から自身を差別化する。免疫系の専門器官である胸腺は、T細胞の成熟に対して主に関与する。
T細胞にはいくつかのタイプがあり、すなわち、ヘルパーT細胞(例えば、CD4+細胞、エフェクターTEFF細胞)、細胞傷害性T細胞(TC、細胞傷害性Tリンパ球、CTL、Tキラー細胞、細胞溶解性T細胞、CD8+T細胞、またはキラーT細胞としても知られる)、メモリーT細胞((i)幹メモリーTSCM細胞は、ナイーブ細胞のように、CD45RO-、CCR7+、CD45RA+、CD62L+(L-セレクチン)、CD27+、CD28+、およびIL-7Rα+であるが、それらはまた大量のCD95、IL-2Rβ、CXCR3、およびLFA-1も発現し、メモリー細胞に特有の多数の機能的特性を示す);(ii)中央メモリーTCM細胞は、L-セレクチンを発現し、CCR7+およびCD45RO+であり、それらはIL-2を分泌するが、IFNβもIL-4も分泌しない、ならびに(iii)エフェクターメモリーTEM細胞はしかしながら、L-セレクチンもCCR7も発現しないが、CD45ROは発現し、IFNγおよびIL-4のようなエフェクターサイトカインを産生する)、制御性T細胞(Treg、サプレッサーT細胞、またはCD4+CD25+制御性T細胞)、ナチュラルキラーT細胞(NKT)、およびガンマデルタT細胞である。腫瘍内に見出されるT細胞は、「腫瘍浸潤リンパ球」または「TIL」と呼ばれる。
「ナイーブ」T細胞は、免疫学的に未分化のままである成熟T細胞を指す。胸腺における正および負選択に続いて、T細胞は、CD4+またはCD8+ナイーブT細胞のいずれかとして現れる。それらのナイーブ状態では、T細胞はL-セレクチン(CD62L+)、IL-7受容体-α(IL-7R-α)、およびCD132を発現するが、CD25、CD44、CD69、およびCD45ROは発現しない。本明細書で使用される場合、「未成熟」も、ナイーブT細胞または未成熟T細胞のいずれかの表現型特性を示すT細胞、例えばTSCM細胞またはTCM細胞を指し得る。例えば、未成熟T細胞は、L-セレクチン(CD62L+)、IL-7R-α、CD132、CCR7、CD45RA、CD45RO、CD27、CD28、CD95、CXCR3、およびLFA-1のうちの一つ以上を発現することができる。ナイーブまたは未成熟T細胞は、TEM細胞およびTEFF細胞などの、末端分化エフェクターT細胞と対比することができる。
本明細書で言及される場合、「T細胞機能」は、健康なT細胞の正常な特性を指す。一部の実施形態では、T細胞機能は、T細胞増殖を含む。一部の実施形態では、T細胞機能は、T細胞活性を含む。一部の実施形態では、T細胞機能は、細胞溶解活性を含む。
本明細書で使用される場合、「細胞増殖」は、T細胞の、細胞分裂を介して数において成長する能力を指す。増殖は、例えば、カルボキシフルオレセインスクシンイミジルエステル(CFSE)で細胞を染色することによって測定することができる。細胞増殖は、インビトロで、例えばT細胞培養中、またはインビボで、例えばT細胞療法の投与後に、起こり得る。
本明細書で使用される場合、「T細胞活性」は、健康なT細胞に共通する任意の活性を指す。一部の実施形態では、T細胞機能は、サイトカイン産生を含む。ある特定の実施形態では、T細胞活性は、インターフェロンガンマ(IFNγ)、組織壊死因子アルファ(TNFα)、および両方から選択される一つ以上のサイトカインの産生を含む。
本明細書で使用される場合、「細胞溶解活性」または「細胞毒性」は、標的細胞を破壊するT細胞の能力を指す。一部の実施形態では、標的細胞は癌細胞、例えば腫瘍細胞である。一部の実施形態では、T細胞は、キメラ抗原受容体(CAR)またはT細胞受容体(TCR)を発現し、標的細胞は、標的抗原を発現する。
用語「遺伝子操作された」、「遺伝子編集する」、または「操作された」は、限定されないが、コード領域もしくは非コード領域、またはその一部を欠失させること、あるいはコード領域またはその一部を挿入することを含む、細胞のゲノムを改変する方法を指す。一部の実施形態では、改変される細胞は、リンパ球、例えばT細胞であり、これは患者またはドナーのいずれかから取得することができる。細胞は、細胞のゲノムに組み込まれる外因性構築物、例えばキメラ抗原受容体(CAR)またはT細胞受容体(TCR)などを発現するように改変され得る。
「免疫反応」は、侵入病原体、病原体に感染した細胞もしくは組織、癌性もしくは他の異常細胞、または自己免疫もしくは病的炎症の場合における、正常なヒト細胞もしくは組織を、選択的に標的化すること、それらに結合すること、それらを損傷すること、それらを破壊すること、および/または脊椎動物の身体からそれらを排除することをもたらす、免疫系の細胞(例えば、Tリンパ球、Bリンパ球、ナチュラルキラー(NK)細胞、マクロファージ、好酸球、肥満細胞、樹状細胞および好中球)、ならびにこれらの細胞または肝臓のいずれかによって産生される可溶性高分子(Ab、サイトカイン、および補体を含む)の作用を指す。
用語「免疫療法」は、免疫反応を誘導、強化、抑制、または他の方法で改変することを含む方法による、疾患に罹患しているか、または罹患するもしくは再発するリスクがある対象の治療を指す。免疫療法の例としては、限定されるものではないが、T細胞療法が挙げられる。T細胞療法には、養子T細胞療法、腫瘍浸潤性リンパ球(TIL)免疫療法、自己細胞療法、操作された自己細胞療法(eACT(商標))、操作された同種異系細胞療法、および同種異系T細胞移植が含まれ得る。しかしながら、当業者は、本明細書に開示されるT細胞を調製する方法が、任意の移植されたT細胞療法の有効性を強化するであろうことを認識するであろう。T細胞療法の例は、米国特許公開第2014/0154228号および第2002/0006409号、ならびに国際公開第WO2008/081035号に記載されている。
免疫療法のT細胞は、当該技術分野で公知の任意の供給源から得ることができる。例えば、T細胞は、造血幹細胞集団からインビトロで分化することができ、またはT細胞はドナーから取得することができる。ドナーは、対象、例えば抗癌治療を必要とする対象、または健康なドナーとすることができる。T細胞は、例えば、末梢血単核細胞、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位からの組織、腹水、胸水、脾臓組織、および腫瘍から取得することができる。加えて、T細胞は、当該技術分野で利用可能な一つ以上のT細胞株に由来し得る。T細胞はまた、FICOLL(商標)分離および/またはアフェレーシスなどの、当業者に公知の任意の数の技術を使用して、対象から採取された血液単位から取得することができる。T細胞はまた、ヒト胸腺環境を複製して一次および再プログラムされた多能性幹細胞からの効率的なT細胞のエクスビボ分化を支持する、人工胸腺オルガノイド(ATO)細胞培養系から取得することができる。T細胞療法のためのT細胞を単離する追加の方法は、米国特許公開第2013/0287748号に開示されており、これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
養子細胞移植としても知られ、「eACT(商標)」と省略され得る「操作された自己細胞療法」という用語は、患者自身のT細胞を収集し、その後遺伝子改変して、一つ以上の特定の腫瘍細胞または悪性腫瘍の細胞表面上に発現された一つ以上の抗原を認識し、標的にするプロセスである。T細胞は、例えば、一つ以上のキメラ抗原受容体(CAR)、または一つ以上のT細胞受容体(TCR)、およびそれらの組み合わせを発現するように操作され得る。CAR陽性(+)T細胞は、共刺激ドメインおよび活性化ドメインを含む細胞内シグナル伝達部分に連結された、特定の腫瘍抗原に対する特異性を有する、細胞外単鎖可変断片(scFv)を発現するように操作される。共刺激ドメインは、例えば、CD28、CTLA4、CD16、OX-40、4-1BB/CD137、CD2、CD7、CD27、CD30、CD40、プログラム死-1(PD-1)、プログラム死リガンド-1 (PD-L1)、誘導性T細胞共刺激体(ICOS)、ICOS-L、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1 (CD11a/CD18)、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD3イプシロン、CD247、CD276(B7-H3)、LIGHT(腫瘍壊死因子スーパーファミリーメンバー14; TNFSF14)、NKG2C、Igアルファ(CD79a)、DAP-10、Fcガンマ受容体、MHCクラス1分子、TNF受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ球活性化分子(SLAMタンパク質)、活性化NK細胞受容体、BTLA、トールリガンド受容体、ICAM-1、B7-H3、CDS、ICAM-1、GITR、BAFFR、LIGHT、HVEM(LIGHTR)、KIRDS2、SLAMF7、NKp80(KLRF1)、NKp44、NKp30、NKp46、CD19、CD4、CD8アルファ、CD8ベータ、IL2Rベータ、IL2Rガンマ、IL7Rアルファ、ITGA4、VLA1、CD49a、ITGA4、IA4、CD49D、ITGA6、VLA-6、CD49f、ITGAD、CD11d、ITGAE、CD103、ITGAL、CD11a、LFA-1、ITGAM、CD11b、ITGAX、CD11c、ITGB1、CD29、ITGB2、CD18、LFA-1、ITGB7、NKG2D、TNFR2、TRANCE/RANKL、DNAM1 (CD226)、SLAMF4(CD244、2B4)、CD84、CD96(Tactile)、CEACAM1、CRT AM、Ly9(CD229)、CD160(BY55)、PSGL1、CD100(SEMA4D)、CD69、SLAMF6(NTB-A、Ly108)、SLAM(SLAMF1、CD150、IPO-3)、BLAME(SLAMF8)、SELPLG(CD162)、LTBR、LAT、GADS、SLP-76、PAG/Cbp、CD19a、CD83と特異的に結合するリガンド、またはそれらの任意の組み合わせに由来し得る;活性化ドメインは、例えば、CD3ゼータ、イプシロン、デルタ、ガンマなどのCD3に由来し得る。ある特定の実施形態では、CARは、二つ、三つ、四つ、またはそれ以上の共刺激ドメインを有するように設計される。CAR scFvは、例えば、NHL、CLL、および非T細胞ALLを含むがこれに限定されない、全ての正常なB細胞、およびB細胞悪性腫瘍(B cell malignances)を含む、B細胞系統の細胞によって発現される膜貫通タンパク質である、CD19を標的とするように設計され得る。CAR+T細胞療法および構築物の例は、米国特許出願公開第2013/0287748号、2014/0227237号、2014/0099309号、および2014/0050708号に記載されており、これらの参照文献は、その全体が参照により組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「患者」は、癌(例えば、リンパ腫または白血病)を含む疾患に罹患している任意のヒトを含む。用語「対象」および「患者」は、本明細書では互換的に使用される。用語「ドナー対象」は、本明細書において、その細胞がさらなるインビトロ操作のために取得されている対象を指す。ドナー対象は、本明細書に記載される方法によって作製された細胞の集団で治療されるがん患者であってもよく(すなわち、自己ドナー)、または本明細書に記載される方法によって作製された細胞の集団の作製時に、異なる個人または癌患者を治療するために使用されるであろうリンパ球サンプルを提供する個人であってもよい(すなわち、同種異系ドナー)。本方法によって調製された細胞を受ける対象を、「レシピエント対象」と呼んでもよい。
本明細書で使用される場合、「刺激」は、刺激分子とその同族リガンドとの結合によって誘発される一次応答を指し、結合はシグナル伝達イベントを媒介する。「刺激分子」は、抗原提示細胞(antigen present cell)上に存在する同族刺激リガンドと特異的に結合する、T細胞上の分子、例えば、T細胞受容体(TCR)/CD3複合体である。「刺激リガンド」は、抗原提示細胞(例えば、人工抗原提示細胞(aAPC)、樹状細胞、B細胞など)上に存在するとき、T細胞上の刺激分子と特異的に結合し、それによって、限定されるものではないが、活性化、免疫反応の開始、増殖などを含む、T細胞による一次応答を媒介し得るリガンドである。刺激リガンドには、ペプチドを負荷したMHCクラスI分子、抗CD3抗体、スーパーアゴニスト抗CD28抗体、およびスーパーアゴニスト抗CD2抗体が含まれるが、これらに限定されない。本明細書で使用される場合、「活性化された」または「活性」は、刺激されたT細胞を指す。活性T細胞は、CD137、CD25、CD71、CD26、CD27、CD28、CD30、CD154、CD40L、およびCD134からなる群から選択される一つ以上のマーカーの発現によって特徴付けられ得る。
用語「外因性」は、外部供給源に由来する任意の物質を指す。
本明細書で使用される場合、用語「持続性」は、例えば、対象に投与された一つ以上の移植されたT細胞またはその後代(例えば、分化または成熟したT細胞)が、ある期間にわたって、検出可能なレベルで対象に残留する能力を指す。本明細書で使用される場合、一つ以上の移植されたT細胞またはその後代(例えば、分化または成熟したT細胞)の持続性を増加させることは、投与後の対象において移植されたT細胞が検出可能な時間を増加させることを指す。例えば 一つ以上の移植されたT細胞のインビボでの持続性は、少なくとも約1日、少なくとも約2日、少なくとも約3日、少なくとも約4日、少なくとも約5日、少なくとも約6日、少なくとも約7日、少なくとも約8日、少なくとも約9日、少なくとも約10日、少なくとも約11日、少なくとも約12日、少なくとも約13日、少なくとも約14日、少なくとも約3週間、少なくとも約4週間、少なくとも約1か月、少なくとも約2か月、少なくとも約3か月、少なくとも約4か月、少なくとも約5か月、または少なくとも約6カ月増加され得る。また、一つ以上の移植されたT細胞のインビボでの持続性は、本明細書に開示される本方法によって調製されなかった一つ以上の移植されたT細胞と比較して、少なくとも約1.5倍、少なくとも約2倍、少なくとも約2.5倍、少なくとも約3倍、少なくとも約3.5倍、少なくとも約4倍、少なくとも約4.5倍、少なくとも約5倍、少なくとも約6倍、少なくとも約7倍、少なくとも約8倍、少なくとも約9倍、または少なくとも約10倍増加され得る。
用語「低減する」および「減少する」は、本明細書では互換的に使用され、元の値よりも小さくなる任意の変化を示す。「低減する」および「減少する」は相対的な用語であり、測定前と測定後の比較を必要とする。「低減する」および「減少する」は、完全な枯渇を含む。一部の実施形態では、用語「低減する」および「減少する」は、本開示の方法(例えば、強力な活性化)によって調製されたT細胞 と、この調製を伴わないT細胞との間のT細胞効果の比較を含む。
本明細書で使用される場合、T細胞の成熟を「調節する」という用語は、本明細書に記載される任意の介入を使用して、一つ以上のT細胞の成熟、例えば分化、に影響を与えることを指す。一部の実施形態では、「調節する」は、T細胞の成熟を遅らせるか、または阻害することを指す。他の実施形態では、「調節する」とは、T細胞の成熟を加速または促進することを指す。特に、本明細書で使用される場合、「T細胞の成熟を遅らせるまたは阻害する」とは、一つ以上のT細胞を未成熟または未分化状態で維持することを指す。例えば、「T細胞の成熟を遅らせるまたは阻害する」とは、T EMまたはTEFF状態に進行するのとは対照的に、T細胞をナイーブまたはTCM状態に維持することを指し得る。また、「T細胞の成熟を遅らせるまたは阻害する」とは、T細胞の混合集団内で未成熟または未分化T細胞(例えば、ナイーブT細胞および/またはT CM細胞)の全体的な割合を増加または濃縮することも指し得る。T細胞の状態(例えば、成熟または未成熟)は、例えば、様々な遺伝子の発現およびT細胞の表面上に発現される様々なタンパク質の存在をスクリーニングすることによって決定することができる。例えば、L-セレクチン(CD62L+)、IL-7R-a、CD132、CR7、CD45RA、CD45RO、CD27、CD28、CD95、IL-2Rβ、CXCR3、LFA-1、およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される一つ以上のマーカーの存在は、成熟度の低い未分化T細胞を示すことができる。
対象の治療」、または対象を「治療する」とは、疾患に関連する症状、合併症、もしくは状態、または生化学的徴候の発症、進行、発達、重症度、または再発を、逆転、緩和、改善、阻害、遅延、または予防する目的で、実施される任意のタイプの介入またはプロセス、あるいは本開示を使用して調製された一つ以上のT細胞の投与を指す。一実施形態では、「治療」または「治療する」は部分寛解を含む。別の実施形態では、「治療」または「治療する」は完全寛解を含む。
本開示の様々な態様が、以下のサブセクションにおいてさらに詳細に記載される。
免疫細胞の調製方法
本開示は、細胞療法で使用するための免疫細胞(例えば、リンパ球または樹状細胞)を調製する方法に関する。特定のインビトロで操作された細胞(例えば、CAR T細胞、T細胞、または樹状細胞)は、インビトロ操作後に患者に投与した場合、有効と言うほどでもない場合があることが見出される。いかなる特定の理論にも拘束されることを意図しないが、一つの理由は、患者に投与される前に、リンパ球がインビトロで時期尚早に分化され得ることであることに留意されたい。本開示は、ある特定の実施形態では、強力な活性化条件を使用することによって、T細胞集団における未成熟でより分化程度の低い細胞の数を増やす方法を明らかにするものである。
一実施形態では、本開示は、収集されたT細胞の集団における未成熟で、より分化程度の低い細胞(例えば、幹細胞メモリーT細胞;TSCM)の割合を増加させる方法に関する。したがって、本明細書に記載の方法は、細胞療法(例えば、T細胞療法)において、移植されたT細胞またはDC細胞またはそれらの後代のインビボでの持続性を増加させるために使用することができる。さらに、一部の実施形態では、本発明は、得られたT細胞がインビトロで増加した増殖を呈することを提供する。さらに、一部の実施形態では、本発明は、得られたT細胞がCD8+T細胞の増加した割合を呈することを提供する。
別の実施形態では、本発明は、一つ以上の細胞を、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させることによって、T細胞集団の未成熟でより分化程度の低い細胞の割合を高める方法を含み、ここで、T細胞集団は、約0.2x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む。T細胞のさらなる調製は、本明細書の他の場所で記述される。
本開示は、インビトロで一つ以上のT細胞を含む細胞集団を、より高い濃度の抗CD3/28ナノマトリックスと接触させることが、サンプル中の未成熟でより分化程度の低いT細胞、例えばT SCM 細胞の濃度を、より高分化したT細胞の濃度と比較して増加させ得ることを示す。したがって、別の実施形態では、本発明は、1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)対17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団の比率を含む培地中で一つ以上のT細胞を培養することを含む、幹細胞様CD4+T細胞またはCD8+T細胞を作製するための方法を提供し、ここで、T細胞集団は、約0.2x106細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む。他の実施形態では、本開示は、(a)一つ以上のT細胞を、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させることであって、ここで、T細胞集団は、約0.2x106細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む、接触させることと、(c)一つ以上のT細胞を増殖させることと、を含む、サンプル中のCD8+CD45RA+/CD62L+T細胞および/またはCD8+CD45RO-/CD62L+T細胞の集団を濃縮する方法を提供する。増加した濃度の未成熟および未分化T細胞またはDC細胞を作製することは、細胞療法(例えば、T細胞療法またはDC細胞療法)を必要とする対象への移植時の、細胞のインビボでの持続性を増加させることができる。したがって、別の実施形態では、本開示は、一つ以上のT細胞を、(i)対象に投与する前に、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させることであって、ここで、T細胞集団は、約0.2x106細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む、接触させることを含む、養子細胞療法において一つ以上のT細胞のインビボでの持続性を延長するための方法を提供し;ここで、インビボでの持続性は、15体積超(例えば、16、16.5、17、17.5、18、18.5、19、19.5、20、25、30、または40体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触される、一つ以上の移植されたT細胞と比較して、延長される。
本明細書に開示される方法は、インビトロで未成熟でより分化程度の低い細胞についてT細胞集団を調節する、例えば濃縮することを含む。一つ以上のT細胞またはDC細胞の成熟または分化の遅延または阻害は、当技術分野で公知の任意の方法によって測定することができる。例えば、未成熟で、より分化程度の低いT細胞またはDC細胞に対する細胞集団の濃縮は、一つ以上のバイオマーカーの存在を検出することによって測定することができる。一つ以上のバイオマーカーの存在は、免疫組織化学的検査および/または蛍光標識細胞分取(FACS)を含むがこれらに限定されない、当技術分野で公知の任意の方法によって検出することができる。一部の実施形態では、一つ以上のバイオマーカーは、L-セレクチン(CD62L+)、IL-7Rα、CD132、CCR7、CD45RA、CD45RO、CD27、CD28、CD95、IL-2Rβ、CXCR3、LFA-1、またはそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される。ある特定の実施形態では、未成熟でより分化程度の低いT細胞に対する細胞集団の濃縮は、L-セレクチン(CD62L+)、CD45RA、およびCD45ROのうちの一つ以上の存在を検出することによって測定することができる。本方法は、収集された細胞の集団において未成熟および未分化T細胞またはDC細胞の相対的比率を増加させることができるが、一部の成熟および分化細胞が依然として存在し得ることを、当業者であれば理解するであろう。その結果、未成熟でより分化程度の低いT細胞に対する細胞集団の濃縮は、一つ以上の細胞を、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させることであって、ここで、T細胞集団は、約0.2x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む、接触させることの前、および接触させることの後に、細胞集団中の未成熟および未分化細胞の総割合を計算することによって、測定することができる。本明細書に開示される方法は、T細胞集団における未成熟および未分化T細胞の割合を増加させる。ある特定の実施形態では、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた一つ以上のT細胞は、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または約100%の未成熟または未分化T細胞を含む。他の実施形態では、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団であって、ここでT細胞集団は約0.2x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む、T細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた一つ以上のT細胞は、少なくとも約10%~少なくとも約90%、少なくとも約20%~少なくとも約80%、少なくとも約30%~少なくとも約70%、少なくとも約40%~少なくとも約60%、少なくとも約10%~少なくとも約50%、少なくとも約20%、少なくとも約40%、少なくとも約35%~少なくとも約45%、少なくとも約20%~少なくとも約60%、または少なくとも約50%~少なくとも約90%の未成熟または未分化T細胞を含む。ある特定の実施形態では、未成熟または未分化T細胞は、ナイーブT細胞および/または中心メモリーTSCM細胞である。
別の実施形態では、未成熟で、より分化程度の低いT細胞またはDC細胞に対する細胞集団の濃縮は、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団であって、ここでT細胞集団は約0.2x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む、T細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた細胞集団中の未成熟および未分化細胞の総割合を計算することによって、および17体積超のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた参照細胞集団中の未成熟で、より分化程度の低いT細胞またはDC細胞の割合と比較することであって、ここで参照T細胞集団は約0.2x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む、比較することによって、測定することができる。ある特定の実施形態では、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた一つ以上のT細胞は、参照T細胞集団よりも、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、または少なくとも約100%のより未成熟または未分化のT細胞、例えばTscm細胞を含む。ある特定の実施形態では、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた一つ以上のT細胞は、参照T細胞集団の、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍または10倍より未熟または非未分化のT細胞、例えばTSCM細胞を含む。
本開示は、一つ以上のT細胞を、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させることによって、T細胞集団の未成熟でより分化程度の低い細胞の割合を高める方法を提供し、ここで、T細胞集団は、約0.2 x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む。 一つ以上のT細胞またはDC細胞は、当技術分野で公知の任意の手段を介して抗CD3/28ナノマトリックスと接触させることができる。例えば、抗CD3/28ナノマトリックスを、一つ以上のT細胞またはDC細胞を培養するために使用される培養培地に添加することができる。
本開示の一つ以上のT細胞は、T細胞療法で使用するために、対象に投与することができる。したがって、一つ以上のT細胞は、T細胞療法を必要とする対象から、またはドナーから収集され得る。一旦収集されると、一つ以上のT細胞は、対象に投与される前に、任意の好適な期間にわたって処理され得る。この時間中、ドナーからのT細胞収集と対象への投与との間の任意の期間にわたり、一つ以上のT細胞は、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させることができ、ここで、T細胞集団は、約0.2 x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度を含む。例えば、一つ以上のT細胞が、少なくとも約1日間、少なくとも約2日間、少なくとも約3日間、少なくとも約4日間、少なくとも約5日間、少なくとも約6日間、少なくとも約7日間、少なくとも約8日間、少なくとも約9日間、少なくとも約10日間、少なくとも約11日間、少なくとも約12日間、少なくとも約13日間、少なくとも約14日間、少なくとも約15日間、少なくとも約16日間、少なくとも約17日間、少なくとも約18日間、少なくとも約19日間、または少なくとも約20日間、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)に接触、例えばその存在下で培養され得る。一部の実施形態では、一つ以上のT細胞が、約1日~約18日間、約1日~約14日間、約1日~約10日間、約1日~約7日間、約1日~約6日間、約1日~約5日間、約1日~約4日間、約1日~約3日間、約1日~約2日間、約2日~約3日間、約2日~約4日間、約2日~約5日間、または約2日~約6日間、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)に、接触(例えばその存在下で培養)される。ある特定の一実施形態では、一つ以上のT細胞は、T細胞が収集される日(例えば、0日目)からT細胞が対象に投与される日まで、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)に、接触、例えばその存在下で培養される。別の実施形態では、T細胞は、0日目から投与まで、1日目から投与まで、2日目から投与まで、3日目から投与まで、4日目から投与まで、5日目から投与まで、6日目から投与まで、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)に、接触、例えばその存在下で培養される。一部の実施形態では、一つ以上のT細胞は、投与前に洗浄されて抗CD3/28ナノマトリックスを除去する。
本明細書に記載される方法は、ドナーから得られたリンパ球の集団を濃縮することをさらに含むことができる。リンパ球の集団、例えば、一つ以上のT細胞の濃縮は、以下に限定されないが、分離媒体(例えば、FICOLL(登録商標)PAQUE、ROSETTESEP(商標)HLA総リンパ球濃縮カクテル、リンパ球分離培地(LSA)(MP Biomedical Cat. 番号0850494X)、または類似のもの)の使用、濾過もしくは溶出による細胞サイズ、形状、または密度分離、免疫磁気分離(例えば、磁気活性化細胞選別システム、MACS)、蛍光分離(例えば、蛍光活性化細胞選別システム、FACS)、あるいはビーズベースのカラム分離を含む、任意の好適な分離方法によって達成され得る。さらに、汎Tアイソレーションキット、ヒト(Miltenyi Biotec社、カリフォルニア州オーバーン、#130-096-535)、CD4/CD8選択キット(Miltenyi Biotec社、カリフォルニア州オーバーン、#130-122-352 StraightFrom(登録商標)Leukopak(登録商標)CD4/CD8 マイクロビーズキット、#130-030-401 CliniMACS CD4 マイクロビーズ、および#130-030-801 CliniMACS CD8 マイクロビーズおよびCD3 マイクロビーズキット)を使用して、T細胞の集団の濃縮を達成することができる。
本明細書に記載される方法は、リンパ球の集団を一つ以上のT細胞刺激剤で刺激して、好適な条件下で活性化されたT細胞の集団を産生することをさらに含み得る。リンパ球、例えば、T細胞またはPBMCは、新鮮または凍結であってもよく、それらは例えば、末梢血または臍帯血に由来し得る。一つ以上の好適なT細胞刺激剤の任意の組み合わせを使用して、以下に限定されるものではないが、T細胞刺激分子または共刺激分子を標的とする抗体またはその機能的断片(例えば、抗CD2抗体、抗CD3抗体、抗CD28抗体、またはその機能的断片)、または任意の他の好適なマイトジェン(例えば、テトラデカノイルホルボールアセテート(TPA)、フィトヘマグルチニン(PHA)、コンカナバリンA(conA)、リポ多糖(LPS)、ポークウィードマイトジェン(PWM))、またはT細胞刺激分子もしくは共刺激分子に対する天然リガンド、または抗CD3/28ナノマトリックス、例えば、TransAct (商標) T細胞試薬(Miltenyi Biotec社、カリフォルニア州オーバーン)を含む、活性化されたT細胞の集団を産生し得る。
本明細書に記載されるリンパ球の集団を刺激するための好適な条件は、ある温度、ある長さの時間、および/またはCO2のあるレベルの存在下であることを含み得る。ある特定の実施形態では、刺激のための温度は、約34°C、約35°C、約36°C、約37°C、または約38°Cである。ある特定の実施形態では、刺激のための温度は、約34~38°Cである。ある特定の実施形態では、刺激のための温度は、約35~37°Cである。ある特定の実施形態では、刺激のための温度は、約36~38°Cである。ある特定の実施形態では、刺激のための温度は、約36~37°Cまたは約37°Cである。
本明細書に記載されるリンパ球の集団を刺激するための別の条件は、刺激のための時間を含み得る。一部の実施形態では、刺激のための時間は、約0~72時間である。一部の実施形態では、刺激のための時間は、約0~24時間、約24~72時間、約24~36時間、約30~42時間、約36~48時間、約40~52時間、約42~54時間、約44~56時間、約46~58時間、約48~60時間、約54~66時間、または約60~72時間である。特定の一実施形態では、刺激のための時間は、約48時間または少なくとも約48時間である。他の実施形態では、刺激のための時間は、約44~52時間である。ある特定の実施形態では、刺激のための時間は、約40~44時間、約40~48時間、約40~52時間、または約40~56時間である。一実施形態では、刺激のための時間は、約0~24時間であり、リンパ球の集団は新鮮である。
本明細書に記載されるリンパ球の集団を刺激するための他の条件は、あるCO2 レベルを含み得る。一部の実施形態では、刺激のためのCO2のレベルは、約1.0~10%のCO2である。 一部の実施形態では、刺激のためのCO2のレベルは、約1.0%、約2.0%、約3.0%、約4.0%、約5.0%、約6.0%、約7.0%、約8.0%、約9.0%、または約10.0%のCO2である。一実施形態では、刺激のためのCO2 のレベルは、約3~7%のCO2である。 他の実施形態では、刺激のためのCO2 のレベルは、約4~6%のCO2である。さらに他の実施形態では、刺激のためのCO2 のレベルは、約4.5~5.5%のCO2である。特定の一実施形態では、刺激のためのCO2 のレベルは、約5%のCO2である。
リンパ球の集団を刺激するための条件は、任意の組み合わせで、ある温度、刺激のためのある長さの時間、および/またはCO2のあるレベルの存在下であることを含み得る。例えば、リンパ球の集団を刺激する工程は、約36~38°Cの温度で、約44~52時間の間、約4.5~5.5%CO2のCO2のレベルの存在下で、一つ以上のT細胞刺激剤でリンパ球の集団を刺激することを含み得る。
本明細書の方法に有用なリンパ球の濃度は、約0.5~10.0×106細胞/mLであり得る。ある特定の実施形態では、リンパ球の濃度は、約1.0~2.0×106細胞/mL、約1.0~3.0×106細胞/mL、約1.0~4.0×106細胞/mL、約1.0~5.0×106細胞/mL、約1.0~6.0×106細胞/mL、約1.0~7.0×106細胞/mL、約1.0~8.0×106細胞/mL、1.0~9.0x106 細胞/mL、または約1.0~10.0×106 細胞/mLである。ある特定の実施形態では、リンパ球の濃度は、約1.0~2.0×106細胞/mLまたは2.0~3.0x106 細胞/mLである。ある特定の実施形態では、リンパ球の濃度は、約1.0~1.2×106細胞/mL、約1.0~1.4×106細胞/mL、約1.0~1.6×106細胞/mL、約1.0~1.8×106細胞/mL、または約1.0~2.0×106細胞/mLである。ある特定の実施形態では、リンパ球の濃度は、約2.1~3.0x106 細胞/mL、約2.1~3.0x106 細胞/mL、約2.1~3.0x106 細胞/mL、約2.4~3x106 細胞/mL、約2.5~3.0x106 細胞/mL、約2.6~3.0x106 細胞/mL、約2.7~3.0x106 細胞/mL、2.8~3.0x106 細胞/mL、または2.8~3.0x106 細胞/mLである。ある特定の実施形態では、リンパ球の濃度は、少なくとも約0.2×106細胞/mL、0.3×106細胞/mL、0.4×106細胞/mL、0.5×106 細胞/mL、0.6×106 細胞/mL、0.7×106 細胞/mL、0.8×106細胞/mL、0.9×106細胞/mL、1.0×106細胞/mL、少なくとも約1.1×106 細胞/mL、少なくとも約1.2×106 細胞/mL、少なくとも約1.3×106 細胞/mL、少なくとも約1.4×106 細胞/mL、少なくとも約1.5×106 細胞/mL、少なくとも約1.6。×106細胞/mL、少なくとも約1.7.×106細胞/mL、少なくとも約1.8×106細胞/mL、少なくとも約1.9.×106細胞/mL、少なくとも約2.0.×106細胞/mL、少なくとも約4.0×106細胞/mL、少なくとも約6.0×106細胞/mL、少なくとも約8.0×106、または少なくとも約10.0×106細胞/mLである。
抗CD3抗体(またはその機能的断片)、抗CD28抗体(またはその機能的断片)、または抗CD3抗体と抗CD28抗体の組み合わせを、リンパ球の集団を刺激する工程に従って使用することができる。任意の可溶性または固定化抗CD2、抗CD3、および/または抗CD28抗体、またはその機能的断片を使用することができる(例えば、クローンOKT3(抗CD3)、クローン145-2C11(抗CD3)、クローンUCHT1(抗CD3)、クローンL293(抗CD28)、クローン15E8(抗CD28))。一部の態様では、抗体は、限定されるものではないが、Miltenyi Biotec(例えば、TransAct (商標)T細胞試薬 ラージスケール、#130-109-104)、BD Biosciences(例えば、MACS GMP CD3 pure 1 mg/mL、Part No. 170-076-116)、およびeBioscience, Inc.を含む、当該技術分野で公知のベンダーから、商業的に購入することができる。さらに、当業者であれば、標準的な方法によって抗CD3および/または抗CD28抗体を産生する方法を理解するであろう。一部の実施形態では、リンパ球の集団を刺激する工程に従って使用される一つ以上のT細胞刺激剤は、T細胞サイトカインの存在下でT細胞刺激または共刺激分子を標的とする抗体またはその機能的断片を含む。一態様では、一つ以上のT細胞刺激剤は、抗CD3抗体およびIL-2を含む。ある特定の実施形態では、T細胞刺激剤は、約20ng/mL~100ng/mLの濃度の抗CD3抗体を含む。ある特定の実施形態では、抗CD3抗体の濃度は、約20ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、または約100ng/mLである。特定の一実施形態では、抗CD3抗体の濃度は約50ng/mLである。
本明細書に記載される方法は、形質導入されたT細胞の集団を産生するための単一サイクル形質導入を使用して、対象のタンパク質(例えば、CAR)をコードする核酸分子を含むウイルスベクターで、活性化されたT細胞の集団を形質導入することをさらに含み得る。いくつかの組換えウイルスが、遺伝物質を細胞に送達するためのウイルスベクターとして使用されている。形質導入工程に従って使用され得るウイルスベクターは、以下に限定されないが、組換えレトロウイルスベクター、組換えレンチウイルスベクター、組換えアデノウイルスベクター、および組換えアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターを含む、任意のエコトロピックまたはアンホトロピックウイルスベクターであり得る。一部の実施形態では、方法は、一つ以上のT細胞をレトロウイルスで形質導入することをさらに含む。一実施形態では、活性化されたT細胞の集団を形質導入するために使用されるウイルスベクターは、MSGV1ガンマレトロウイルスベクターである。この実施形態の一態様によれば、ウイルスベクターは、本明細書で「ウイルスベクター接種材料」と呼ばれる、ウイルスベクター製造に特異的な培地中の懸濁培養液中で成長させる。ウイルスベクターを成長させるための任意の好適な成長培地および/またはサプリメントを、本明細書に提供される方法に従ってウイルスベクター接種材料に使用することができる。一部の態様によれば、ウイルスベクター接種材料は、形質導入工程中に培養培地に添加される。
一部の実施形態では、一つ以上のT細胞は、レンチウイルスで形質導入することができる。一実施形態では、レンチウイルスは、対象のタンパク質をコードする異種遺伝子を含む。特定の一実施形態では、対象のタンパク質は、標的細胞の表面、例えば腫瘍細胞の表面上に抗原を結合することができ、CARとすることができる。
本明細書に記載される活性化されたT細胞の集団を形質導入するための条件は、特定の温度で、および/または特定のレベルのCO2の存在下で、特定の時間を含み得る。ある特定の実施形態では、形質導入のための温度は約34°C、約35°C、約36 C、約37°C、または約38°Cである。一実施形態では、形質導入のための温度は、約34~38°Cである。別の実施形態では、形質導入のための温度は、約35~37°Cである。別の実施形態では、形質導入のための温度は、約36~38°Cである。さらに別の実施形態では、形質導入のための温度は、約36~37°Cである。特定の一実施形態では、形質導入のための温度は、約37°Cである。
ある特定の実施形態では、形質導入のための時間は、活性化後約0~36時間である。一部の実施形態では、形質導入のための時間は、約12~16時間、約12~20時間、約12~24時間、約12~28時間、または約12~32時間である。他の実施形態では、形質導入のための時間は、約20時間または少なくとも約20時間である。一実施形態では、形質導入のための時間は、約16~24時間である。他の実施形態では、形質導入のための時間は、少なくとも約14時間、少なくとも約16時間、少なくとも約18時間、少なくとも約20時間、少なくとも約22時間、少なくとも約24時間、または少なくとも約26時間である。
ある特定の実施形態では、形質導入のための CO2のレベルは、約1.0~10%のCO2である。他の実施形態では、形質導入のためのCO2のレベルは、約1.0%、約2.0%、約3.0%、約4.0%、約5.0%、約6.0%、約7.0%、約8.0%、約9.0%、または約10.0%のCO2である。一実施形態では、形質導入のためのCO2のレベルは、約3~7%のCO2である。別の実施形態では、形質導入のためのCO2のレベルは、約4~6%のCO2である。別の実施形態では、形質導入のためのCO2のレベルは、約4.5~5.5%のCO2である。特定の一実施形態では、形質導入のためのCO2のレベルは、約5%のCO2である。
一部の実施形態では、本明細書に記載される活性化されたT細胞の集団を形質導入することは、任意の組み合わせで、特定の時間、特定の温度で、および/または特定のレベルのCO2の存在下で:約36~38°Cの温度で、約16~24時間の間、および約4.5~5.5%のCO2のレベルのCO2 の存在下で、実施することができる。
本明細書に提供される方法は、操作されたT細胞の集団を産生するために、一つ以上の形質導入されたT細胞の集団を特定の時間にわたって増殖させることを含むことができる。所定の増殖時間は、(i)患者に投与するための少なくとも一つの用量のための、操作されたT細胞の集団における十分な数の細胞、(ii)典型的なより長いプロセスと比較して、幼若細胞の好ましい比率を有する操作されたT細胞の集団、または(iii)(i)および(ii)の両方、の産生を可能にする任意の好適な時間であり得る。この時間は、T細胞によって発現される対象のタンパク質、使用されるベクター、治療効果を有するために必要な用量、および他の変数に依存するであろう。したがって、一部の実施形態では、増殖のための所定の時間は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、15日、16日、17日、18日、19日、20日、21日、または21日超とすることができる。一部の態様では、増殖のための時間は、当技術分野で公知の増殖方法よりも短い。例えば、増殖のための所定の時間は、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%短く、または75%超短くすることができる。一態様では、増殖のための時間は約3日であり、リンパ球の集団の濃縮から操作されたT細胞を産生するまでの時間は約6日である。
形質導入されたT細胞の集団を増殖するための条件は、温度、および/またはあるレベルのCO2の存在下であることを含み得る。ある特定の実施形態では、温度は約34°C、約35°C、約36°C、約37°C、または約38°Cである。一実施形態では、温度は、約34~38°Cである。別の実施形態では、温度は、約35~37°Cである。別の実施形態では、温度は、約36~38°Cである。さらに別の実施形態では、温度は、約36~37°Cである。特定の一実施形態では、温度は、約37°Cである。ある特定の実施形態では、CO2のレベルは1.0~10%のCO2である。他の実施形態では、CO2 のレベルは、約1.0%、約2.0%、約3.0%、約4.0%、約5.0%、約6.0%、約7.0%、約8.0%、約9.0%、または約10.0%のCO2 である。 一実施形態では、CO2 のレベルは、約4.5~5.5%のCO2である。別の実施形態では、CO2のレベルは、約5%のCO2である。他の実施形態では、CO2のレベルは、約3.5%、約4.0%、約4.5%、約5.0%、約5.5%、または約6.5%のCO2である。一部の実施形態では、形質導入されたT細胞の集団を増殖するための条件は、任意の組み合わせで、温度、および/またはあるレベルのCO2の存在下であることを含み得る。例えば、形質導入されたT細胞の集団を増殖するための条件は、約36~38°Cの温度、および約4.5~5.5%のCO2のレベルのCO2の存在下であることを含む。
本明細書に提供される方法の各工程は、半閉鎖系または閉鎖系において実施することができる。ある特定の実施形態では、閉鎖系は、任意の好適な細胞培養バッグ(例えば、Miltenyi Biotec MACS(登録商標)GMP細胞分化バッグ、Origen Biomedical PermaLife細胞培養バッグ)を含む、閉鎖バッグ培養系である。一部の実施形態では、閉鎖バッグ培養系で使用される細胞培養バッグは、形質導入工程中に組換えヒトフィブロネクチン断片で被覆される。組換えヒトフィブロネクチン断片は、三つの機能ドメイン:中央細胞結合ドメイン、ヘパリン結合ドメインII、およびCS1配列を含み得る。組換えヒトフィブロネクチン断片を使用して、標的細胞およびウイルスベクターの共局在化を助けることによって、免疫細胞のレトロウイルス形質導入の遺伝子効率を増加させることができる。ある特定の実施形態では、組換えヒトフィブロネクチン断片は、RETRONECTIN(登録商標)(タカラバイオ、日本)である。ある特定の実施形態では、細胞培養バッグは、約1~60μg/mLまたは約1~40μg/mLの濃度の組換えヒトフィブロネクチン断片で被覆される。他の実施形態では、細胞培養バッグは、約1~20μg/mL、20~40μg/mL、または40~60μg/mLの濃度の組換えヒトフィブロネクチン断片で被覆される。一部の実施形態では、細胞培養バッグは、約1μg/mL、約2μg/mL、約3μg/mL、約4μg/mL、約5μg/mL、約6μg/mL、約7μg/mL、約8μg/mL、約9μg/mL、約10μg/mL、約11μg/mL、約12μg/mL、約13μg/mL、約14μg/mL、約15μg/mL、約16μg/mL、約17μg/mL、約18μg/mL、約19μg/mL、または約20μg/mLの組換えヒトフィブロネクチン断片で被覆される。他の実施形態では、細胞培養バッグは、約2~5μg/mL、約2~10μg/mL、約2~20μg/mL、約2~25μg/mL、約2~30μg/mL、約2~35μg/mL、約2~40μg/mL、約2~50μg/mL、または約2~60μg/mLの組換えヒトフィブロネクチン断片で被覆される。ある特定の実施形態では、細胞培養バッグは、少なくとも約2μg/mL、少なくとも約5μg/mL、少なくとも約10μg/mL、少なくとも約15μg/mL、少なくとも約20μg/mL、少なくとも約25μg/mL、少なくとも約30μg/mL、少なくとも約40μg/mL、少なくとも約50μg/mL、または少なくとも約60μg/mLの組換えヒトフィブロネクチン断片で被覆される。特定の一実施形態では、細胞培養バッグは、少なくとも約10μg/mLの組換えヒトフィブロネクチン断片で被覆される。閉鎖バッグ培養系で使用される細胞培養バッグは、任意選択で、形質導入工程中にヒトアルブミン血清(HSA)で遮断することができる。代替的な実施形態では、細胞培養バッグは、形質導入工程中にHSAで遮断されない。
他の態様では、ヒト血清を伴うまたは伴わない、T細胞培養培地を使用して、a)一つ以上のT細胞を、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させること、(b)活性化されたT細胞の集団を形質導入すること、および(c)形質導入されたT細胞の集団を増殖させること、のうちの少なくとも一つを実施する。一部の態様では、(a)~(c)の各々は、血清を添加しないT細胞培養培地を使用して実施される。本明細書で言及されるように、用語「無血清培地」または「無血清培養培地」は、使用される成長培地が血清(例えば、ヒト血清またはウシ血清)で補充されないことを意味する。したがって、一部の実施形態では、培養細胞の生存率、活性化、および成長を支持する目的で、個別に分かれた別個の成分として培養培地に血清を添加しない。任意の好適な培養培地T細胞増殖培地を、本明細書に記載される方法に従って懸濁液中で細胞を培養するために使用することができる。例えば、T細胞増殖培地は、限定されるものではないが、好適な量の緩衝剤、マグネシウム、カルシウム、ピルビン酸ナトリウム、および重炭酸ナトリウムを含む滅菌低グルコース溶液を含み得る。一実施形態では、T細胞増殖培地は、OPTMIZER(商標)(Life Technologies)である。操作されたT細胞を産生するための典型的な方法とは対照的に、本明細書に記載の方法は、血清(例えば、ヒトまたはウシ)で補充されていない培養培地を使用することができる。
抗CD3/28ナノマトリックス
本開示の抗CD3/28ナノマトリックスは、CD3およびCD28を結合する抗体および/またはその断片を含むナノメートルスケールマトリックスであり、TransAct (商標)T細胞試薬(以下、「TransAct(商標))として、Miltenyi Biotec社(カリフォルニア州オーバーン)によって提供される。TransAct(商標)試薬は、全直径約100nmの生体適合性多糖マトリックスに埋め込まれたナノスケールの鉄酸化物結晶からなるコロイド試薬である。CD3(クローンOKT3)およびCD28(クローン15E8)に対する抗体は、マトリックスに共有結合される。例えば、Casati et al.,Cancer Immunol Immunother 2013年10月;62(10):1563-73、Casati et al.,MACS & more,Vol 15,2013年2月、およびUS2014/0087462を参照のこと。
T細胞
本明細書に記載される一つ以上のT細胞は、例えばヒトドナーを含む、任意の供給源から取得することができる。ドナーは、抗癌治療、例えば、本明細書に記載される方法によって作製された一つ以上のT細胞での治療、を必要とする対象であってもよく(すなわち、自己ドナー)、または本明細書に記載される方法によって作製された細胞の集団の作製時に、異なる個人または癌患者を治療するために使用されるであろうリンパ球サンプルを提供する個人であってもよい(すなわち、同種異系ドナー)。リンパ球の集団は、当技術分野で使用される任意の好適な方法によってドナーから取得することができる。
本明細書に記載の方法は、一つ以上の細胞を、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させることによって、T細胞集団において、より分化程度の低い未成熟な細胞(例えば、TSCM細胞)の割合を増加させるために使用することができる。本明細書に記載されるように、驚くべきことに、一つ以上のT細胞の、抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)による強力な活性化は、インビトロでナイーブおよび未成熟T細胞の割合を増加させることが見出された。特に、活性化後、一つ以上のT細胞は、未分化または未成熟T細胞を示す一つ以上の遺伝子を発現することができる。未分化または未成熟T細胞を示す一つ以上の遺伝子は、群CD8、CD45RA、CCR7、CD45RO、CD62L、CD28、CD95、IL-7Rα、CXCR4、TCF7、FOXO1、ID3、BCL6、およびそれらの任意の組み合わせから選択することができる。例えば、一つ以上のT細胞を、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させることにより、CD62L、CD45RA、CD45RO、およびそれらの任意の組み合わせから選択される未分化または未成熟T細胞を示す、一つ以上の遺伝子を発現する細胞の割合が増加する。
他の実施形態では、一つ以上のT細胞を、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた後に、一つ以上のT細胞は、CD62L、CD45RA、および/またはCD45ROを発現する 特定の一実施形態では、抗CD3/28ナノマトリックスと接触させた後は、接触させる前と比較して、より大きな割合の一つ以上のT細胞が、CD62L、CD45RA、および/またはCD45ROを発現する。特定の一実施形態では、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた一つ以上のT細胞のより大きな割合が、17体積以上(例えば、17.5、20、30、または40体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させたT細胞の集団よりも、CD62L、CD45RA、および/またはCD45ROを発現する。
T細胞療法
本開示は、17体積以上(例えば、17.5、20、30、または40体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)の比で接触させたT細胞の集団と比較して、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)の比で一つ以上のT細胞を接触させることにより、集団中の未成熟で、より分化程度の低いT細胞の割合を増加させるための方法を提供する。一部の実施形態では、方法は、本明細書に提供される方法を使用して調製された一つ以上のT細胞を、それを必要とする対象に投与することをさらに含む。当業者であれば、本明細書に提供される方法によって産生される一つ以上のT細胞が、患者に一つ以上のT細胞を投与することを含む、患者の治療の任意の方法において使用され得ることを理解するであろう。
例えば、限定されるものではないが、本明細書に記載される方法は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)免疫療法、自己細胞療法、操作された自己細胞療法(eACT(商標))、同種異系T細胞移植、操作された同種異系T細胞療法、非T細胞移植、およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される養子T細胞療法であり得る、T細胞療法の有効性を強化することができる。養子T細胞療法は、腫瘍細胞を認識し、かつ腫瘍細胞を結合する能力を有する自己または同種異系T細胞を、選択すること、インビトロで濃縮すること、および患者へ投与することの任意の方法を広く含む。TIL免疫療法は、腫瘍組織に浸潤することができるリンパ球が単離され、インビトロで濃縮され、患者に投与される、養子T細胞療法の一種である。TIL細胞は、自己、または同種異系であり得る。自己細胞療法は、腫瘍細胞を標的化することができるT細胞を患者から単離し、インビトロでT細胞を濃縮し、同じ患者にT細胞を再び投与することを含む養子T細胞療法である。同種異系T細胞移植には、エクスビボで増殖された天然起源のT細胞、または遺伝子操作されたT細胞の移植が含まれ得る。非T細胞移植には、限定されないがナチュラルキラー(NK)細胞などの、非T細胞を用いた自己または同種異系療法が含まれ得る。
特定の一実施形態では、本開示のT細胞療法は、操作された同種異系T細胞療法である。この実施形態によると、方法は、ドナーから血液細胞を収集することを含み得る。次いで、単離された血液細胞(例えば、T細胞)は、少なくとも約0.2x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度で、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)を接触させた、一つ以上の天然起源タンパク質(例えば、内因性TCR)の発現を低減するように遺伝子操作され得る。T細胞は、キメラ抗原受容体(「操作されたCAR T細胞」)またはT細胞受容体(「操作されたTCR T細胞」)を発現するように操作され得る。特定の一実施形態では、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させた、操作された同種異系CAR T細胞または操作されたTCR T細胞は、その後、対象に投与される。一部の実施形態では、操作されたT細胞は、対象中の固形または液状の腫瘍に向けられる。
一実施形態では、一つ以上のT細胞は、キメラ抗原受容体を発現するように操作され得る。キメラ抗原受容体は、腫瘍抗原への結合分子を含み得る。結合分子は、抗体またはその抗原結合分子であってもよい。例えば、抗原結合分子は、scFv、Fab、Fab’、Fv、F(ab’)2、ラクダ類およびdAb、ならびに任意の断片またはそれらの組み合わせから選択することができる。
キメラ抗原受容体は、特定の腫瘍抗原を標的とするように操作され得る。一部の実施形態では、腫瘍抗原が、BCMA、EGFRvIII、Flt-3、WT-1、CD20、CD23、CD30、CD38、CD70、CD33、CD133、MHC-WT1、TSPAN10、MHC-PRAME、Liv1、ADAM10、CHRNA2、LeY、NKG2D、CS1、CD44v6、ROR1、CD19、クローディン(Claudin)18.2(クローディン18A2またはクローディン18アイソフォーム2)、DLL3(デルタ様タンパク質3、ドロソフィラデルタ相同体3、デルタ3)、Muc17(ムチン17、Muc3、Muc3)、FAPアルファ(線維芽細胞活性化タンパク質アルファ)、Ly6G6D(リンパ球抗原6複合体座位タンパク質G6d、c6orf23、G6D、MEGT1、NG25)、RNF43(E3ユビキチン-タンパク質リガーゼRNF43、RINGフィンガータンパク質43)、ErbB2(HER2/neu)、癌胎児性抗原(CEA)、上皮細胞接着分子(EpCAM)、上皮増殖因子受容体(EGFR)、CD40、ジシアロガングリオシドGD2、GD3、C型レクチン様分子-1(CLL-1)、管上皮ムチン、gp36、TAG-72、グリコスフィンゴ脂質、神経膠腫関連抗原、βヒト絨毛性ゴナドトロピン、アルファフェトタンパク質(AFP)、レクチン反応性AFP、チログロブリン、RAGE-1、MN-CA IX、ヒトテロメラーゼ逆転写酵素、RU1、RU2(AS)、腸内カルボキシルエステラーゼ、mut hsp70-2、M-CSF、プロスターゼ、プロスターゼ特異的抗原(PSA)、PAP、NY-ESO-1、LAGA-la、p53、プロステイン、PSMA、サバイビンおよびテロメラーゼ、前立腺癌腫瘍抗原-1(PCTA-1)、MAGE、ELF2M、好中球エラスターゼ、エフリンB2、CD22、インスリン成長因子(IGFl)-l、IGF-II、IGFI受容体、メソテリン、腫瘍特異的ペプチドエピトープを提示する主要組織適合性複合体(MHC)分子、5T4、O 1、Nkp30、腫瘍間質抗原、フィブロネクチンのエクストラドメインA(EDA)およびエクストラドメインB(EDB)およびテネイシンCのAIドメイン(TnC AI)および線維芽細胞関連タンパク質(fap)、LRP6、黒色腫関連コンドロイチン硫酸プロテオグリカン(MCSP)、MARTI、MUC1、LMP2、イディオタイプ(Idiotype)、NY-ESO-1、Ras変異体、gp100、プロテイナーゼ3、bcr-abl、チロシナーゼ、hTERT、EphA2、ML-TAP、ERG、NA17、PAX3、ALK、アンドロゲン受容体、系統特異的または組織特異的抗原、例えば、CD3、CD4、CD8、CD24、CD25、CD34、CD79、CD116、CD117、CD135、CD123、CD138、CTLA-4、B7-1(CD80)、B7-2(CD86)、エンドグリン、主要組織適合性複合体(MHC)分子、MUC16、PSCA、Trop2、CD171(L1CAM)、CA9、STEAP1、VEGFR2、およびそれらの任意の組み合わせから選択される。
本明細書に提供される方法は、一つ以上のT細胞の患者への移植を含むT細胞療法を含むことができる。T細胞は、治療有効量で投与することができる。T細胞、例えば操作されたCAR+T細胞または操作されたTCR+T細胞の治療有効量は、例えば、少なくとも約104細胞、少なくとも約10細胞、少なくとも約106細胞、少なくとも約107細胞、少なくとも約108細胞、少なくとも約109、または少なくとも約1010であってもよい。別の実施形態では、T細胞、例えば、操作されたCAR+T細胞または操作されたTCR+T細胞の治療有効量は、約104細胞、約105細胞、約106細胞、約107細胞、または約108細胞である。特定の一実施形態では、T細胞、例えば操作されたCAR+T細胞または操作されたTCR+T細胞の治療有効量は、約2×106細胞/kg、約3×106細胞/kg、約4×106細胞/kg、約5×106細胞/kg、約6×106細胞/kg、約7×106細胞/kg、約8×106細胞/kg、約9×106細胞/kg、約1×107細胞/kg、約2×107細胞/kg、約3×107細胞/kg、約4×107細胞/kg、約5×107細胞/kg、約6×107細胞/kg、約7×107細胞/kg、約8×107細胞/kg、または約9×107細胞/kgである。
一部の実施形態では、患者は、T細胞療法の投与前に事前調整される。患者は、一つ以上の化学療法剤および/または放射線療法を用いた治療を含むがこれに限定されない、当技術分野で公知の任意の方法に従って、事前調整され得る。一部の実施形態では、事前調整は、T細胞療法の前に、内因性リンパ球の数を低減する、サイトカインシンクを除去する、一つ以上の恒常性サイトカインまたは炎症促進因子の血清レベルを増加させる、調整後に投与されるT細胞のエフェクター機能を強化する、抗原提示細胞活性化および/または利用可能性を強化する、またはそれらの任意の組み合わせの、任意の治療を含むことができる。
癌治療
本開示の方法は、対象における癌を治療する、腫瘍のサイズを縮小する、腫瘍細胞を死滅させる、腫瘍細胞増殖を防止する、腫瘍の成長を防止する、患者から腫瘍を除去する、腫瘍の再発を防止する、腫瘍転移を防止する、患者における寛解を誘導する、またはそれらの任意の組み合わせ、に使用することができる。ある特定の実施形態では、方法は、完全奏効を誘導する。他の実施形態では、方法は部分奏効を誘導する。
一実施形態、本開示は、対象に一つ以上のT細胞を投与することを含むT細胞療法を必要とする対象において、腫瘍を治療する方法に向けられており、ここで一つ以上のT細胞は、少なくとも約0.2x106細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度で、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させてある。別の実施形態では、本開示は、対象に一つ以上のT細胞を投与することを含むT細胞療法を必要とする対象において、腫瘍のサイズを低減する、もしくは減少させる、または腫瘍の成長を抑制する方法に向けられており、ここで一つ以上のT細胞は、少なくとも約0.2x106細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度で、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させてある。
治療され得る癌としては、血管形成されていない腫瘍、まだ実質的に血管形成されていない腫瘍、または血管形成されている腫瘍を含み得る。癌はまた、固形腫瘍または非固形腫瘍を含み得る。ある特定の実施形態では、癌は、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、腺様嚢胞癌、副腎皮質、癌、AIDS関連癌、肛門癌、虫垂癌、星状細胞腫、非定型奇形様/ラブドイド腫瘍、中枢神経系、B細胞白血病、リンパ腫またはNHLなどの他のB細胞悪性腫瘍、基底細胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨癌、骨肉腫および悪性線維性組織球腫、脳幹神経膠腫、脳腫瘍、乳癌、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、中枢神経系癌、子宮頸癌、脊索腫、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、慢性骨髄増殖性疾患、結腸癌、大腸癌(結腸直腸癌)、頭蓋咽頭腫、皮膚t細胞リンパ腫、胚芽腫、中枢神経系、子宮内膜癌、上衣芽腫、上衣腫、食道癌、鼻腔神経芽細胞腫、腫瘍のユーイング肉腫ファミリー、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、肝外胆管がん、眼癌骨の線維性組織球腫、悪性、および骨肉腫、胆嚢癌、胃(胃)癌、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、軟部組織肉腫、生殖細胞腫瘍、妊娠性絨毛腫瘍、グリオーマ、ヘアリー細胞白血病、頭頸部癌、心臓癌、肝細胞(肝臓)癌、組織球症、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、眼内黒色腫、膵島細胞腫瘍(膵内分泌部)、カポシ肉腫、腎臓癌、ランゲルハンス細胞組織球症、喉頭癌、白血病、口唇および口腔癌、肝癌(原発性)、上皮内小葉癌(LCIS)、肺癌、リンパ腫、マクログロブリン血症、男性乳がん、骨の悪性線維性組織球腫および骨肉腫、髄芽腫、髄上皮腫、黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、NUT遺伝子に関与する潜在性原発正中線路癌を有する転移性扁平上皮頸部癌(metastatic squamous neck cancer with occult primary midline tract carcinoma involving NUT gene)、口癌(mouth cancer)、多発性内分泌腫瘍症候群、多発性骨髄腫/形質細胞腫瘍、菌状息肉症、骨髄異形成症候群、骨髄異形成/骨髄増殖性腫瘍、骨髄性白血病、慢性(CML)、骨髄性白血病、急性(AML)、骨髄腫、複数、骨髄増殖性疾患、鼻腔および副鼻腔癌、上咽頭癌、神経芽腫、非ホジキンリンパ腫、非小細胞肺癌、口腔癌(oral cancer)、口腔癌(oral cavity cancer)、中咽頭癌、骨肉腫および骨の悪性線維性組織球腫、卵巣癌、膵癌、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔癌および鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、中間型松果体実質腫瘍、松果体芽腫およびテント上原始神経外胚葉腫瘍、下垂体腫瘍、形質細胞腫瘍/多発性骨髄腫、胸膜肺芽腫、妊娠と乳癌、原発性中枢神経系(CNS)リンパ腫、前立腺がん、直腸癌、腎細胞(腎臓)癌、腎盂および尿管、移行上皮がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、肉腫、セザリー症候群、小細胞肺癌、小腸癌、軟部組織肉腫、扁平上皮癌、頸部扁平上皮癌、胃(胃)癌、テント上原始神経外胚葉性腫瘍、t細胞リンパ腫、皮膚、精巣癌、咽頭癌、胸腺腫および胸腺癌、甲状腺癌、腎盂と尿管の移行上皮癌、栄養膜腫瘍、尿管および腎盂癌、尿道癌、子宮癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症、腎芽細胞腫、に由来する腫瘍から選択されてもよい。
一実施形態では、方法は、腫瘍を治療するために使用することができ、腫瘍はリンパ腫または白血病である。リンパ腫および白血病は、特にリンパ球に影響を及ぼす血液の癌である。血液中のすべての白血球は、骨髄中に存在する単一のタイプの多能性造血幹細胞に由来する。この幹細胞は、骨髄前駆細胞とリンパ球前駆細胞の両方を産生し、これが体内で見られる様々な種類の白血球を産生する。骨髄前駆細胞から生じる白血球には、Tリンパ球(T細胞)、Bリンパ球(B細胞)、ナチュラルキラー細胞、および形質細胞が含まれる。リンパ球前駆細胞から生じる白血球には、巨核球、肥満細胞、好塩基球、好中球、好酸球、単球、およびマクロファージが含まれる。リンパ腫および白血病は、患者におけるこれらの細胞タイプの一つ以上に影響を及ぼす可能性がある。
したがって、一部の実施形態では、方法は、リンパ腫または白血病を治療するために使用することができ、リンパ腫または白血病は、B細胞悪性腫瘍である。B細胞悪性腫瘍の例としては、以下に限定されないが、非ホジキンリンパ腫(NHL)、小リンパ球性リンパ腫(SLL/CLL)、マントル細胞リンパ腫(MCL)、FL、辺縁帯リンパ腫(MZL)、節外性(MALTリンパ腫)、節性(単球様B細胞リンパ腫)、脾臓の、びまん性大細胞型リンパ腫、B細胞慢性リンパ性白血病/リンパ腫、バーキットリンパ腫、およびリンパ芽球性リンパ腫が挙げられる。一部の実施形態では、リンパ腫または白血病は、B細胞慢性リンパ性白血病/小細胞性リンパ腫、B細胞前リンパ球性白血病、リンパ形質細胞性リンパ腫(例えば、ヴァルデンストレームマクログロブリン血症)、脾臓辺縁帯リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、形質細胞腫瘍(例えば、形質細胞性骨髄腫(すなわち、多発性骨髄腫)、または形質細胞腫)、節外性辺縁帯B細胞リンパ腫(例えば、MALTリンパ腫)、節性辺縁帯B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫(FL)、形質転換濾胞性リンパ腫(TFL)、原発性皮膚濾胞中心リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、エプスタイン-バーウイルス陽性DLBCL、リンパ腫様肉芽腫症、縦隔(胸腺)原発大細胞型B細胞リンパ腫(PMBCL)、血管内大細胞型B細胞リンパ腫、ALK+大細胞型B細胞リンパ腫、形質芽細胞リンパ腫、原発性滲出性リンパ腫、HHV8関連多中心性キャッスルマン病で生じる大細胞型B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫/白血病、T細胞性前リンパ球性白血病、T細胞大顆粒リンパ球性白血病、侵攻性NK細胞白血病、成人T細胞白血病/リンパ腫、節外性NK/T細胞リンパ腫、腸管症関連T細胞リンパ腫、肝脾T細胞リンパ腫、芽球性NK細胞リンパ腫、菌状息肉症/セザリー症候群、原発性皮膚未分化大細胞リンパ腫、リンパ腫様丘疹症、末梢性T細胞リンパ腫、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、未分化大細胞型リンパ腫、Bリンパ芽球性白血病/リンパ腫、再発性遺伝子異常を伴うB型リンパ芽球性白血病/リンパ腫、Tリンパ芽球性白血病/リンパ腫、およびホジキンリンパ腫から選択される。一部の実施形態では、癌は、一つ以上の前治療に対して難治性であり、および/または癌は、一つ以上の前治療後に再発している。
ある特定の実施形態では、癌は、濾胞性リンパ腫、形質転換濾胞性リンパ腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、および縦隔(胸腺)原発大細胞型B細胞リンパ腫から選択される。特定の一実施形態では、癌はびまん性大細胞型B細胞リンパ腫である。
一部の実施形態では、癌は、化学療法、放射線療法、免疫療法(T細胞療法および/または抗体もしくは抗体-薬剤コンジュゲートを用いた治療を含む)、自己幹細胞移植、またはそれらの任意の組み合わせのうちの一つ以上に対して耐性を有するか、またはそれらの後に再発している。特定の一実施形態では、癌は難治性のびまん性大細胞型B細胞リンパ腫である。
一部の実施形態では、癌は、対象に一つ以上のT細胞を投与することによって治療され、ここで一つ以上のT細胞は、少なくとも約0.2x106細胞/ml~約5.8x106 細胞/mlの細胞密度で、17体積以下(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、15または16体積)のT細胞集団に対する1体積の抗CD3/28ナノマトリックス、例えばT細胞Transact(商標)と接触させてある。一部の実施形態では、一つ以上のT細胞は、操作されたCAR細胞または操作されたTCR細胞を含む。一実施形態では、操作されたCAR細胞または操作されたT細胞は、対象の腫瘍を治療する。
本発明は、さらなる限定として解釈されるべきではない以下の実施例によってさらに説明される。本出願全体を通して引用される全ての参考文献の内容は、参照により本明細書に明示的に組み込まれる。
以下の実施例は、本開示の様々な実施形態を説明することを意図している。したがって、論じた特定の実施形態は、本開示の範囲に対する限定として解釈されるべきではない。例えば、以下の実施例は、抗CD19キメラ抗原受容体(CAR)で形質導入されたT細胞を対象とするが、当業者であれば、本明細書に記載される方法は、任意のCARで形質導入されたT細胞に適用できることを理解するであろう。当業者には、様々な等価物、変更、および修正が、本開示の範囲から逸脱することなく行うことができることが明白であり、そのような同等の実施形態が本明細書に含まれることが理解される。さらに、本開示で引用されるすべての参考文献は、本明細書に完全に記載されているかのように、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
実施形態
E1. 1)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始細胞集団と接触させることであって、開始細胞集団が少なくとも約0.2x106 細胞/ml~約5.8x106細胞/mlの細胞密度であり、および体積比は、体積17.4以下の開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、ならびに2)培養培地中で細胞集団を培養することであって、結果として得られるT細胞集団は、第2のT細胞集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の第2の開始細胞集団を、体積17.5以上の第2の開始細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比率で、抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させる、培養すること、を含む、細胞集団における幹メモリーT細胞の割合を増加する方法。
E2. ナノマトリックスが、Macs(登録商標)GMP T細胞 Transact(商標)ナノマトリックスである、E1に記載の方法。
E3. 開始細胞集団が、末梢血、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位からの組織、腹水、胸水脾臓組織、腫瘍、間葉組織、T細胞株、または人工胸腺オルガノイド(ATO)細胞培養系から取得される、実施形態1および2のいずれかに記載の方法。
E4. 開始細胞集団が、Tリンパ球、Bリンパ球、ヘルパーT細胞、腫瘍浸潤性リンパ球、メモリーT細胞、細胞傷害性T細胞、ナチュラルキラーT細胞、末梢血リンパ球、腫瘍浸潤性白血球、末梢血単核細胞、樹状細胞、臍帯血幹細胞、多能性幹細胞、および間葉系幹細胞からなる群から選択される、実施形態1~3のいずれかに記載の方法。
E5. 開始細胞集団が、末梢血単核細胞、正に選択されたCD3、CD4、またはCD8 T細胞、あるいは負に選択されたCD3、CD4、またはCD8 T細胞である、実施形態1~4のいずれかに記載の方法。
E6. 開始細胞集団が、末梢血単核細胞である、実施形態1~5のいずれかに記載の方法。
E7. 開始細胞集団が、精製されたT細胞集団である、実施形態1~4のいずれかに記載の方法。
E8. 開始細胞密度が、少なくとも約0.50x106~約6.00x106、約0.56x106~約5.72x106、約0.80x106~約4.0x106、約1.00x106 ~約3.0x106、約2.00x106~約3.5x106、または約2.50x6~約3.5x106である、実施形態1~7のいずれかに記載の方法。
E9. 細胞密度が、約2.86×106細胞/mLである、実施形態1~8のいずれかに記載の方法。
E10. 開始細胞密度が、約3.00×106細胞/mLである、実施形態1~9のいずれかに記載の方法。
E11. 開始細胞密度が、少なくとも約0.28x106~約2.86x106、0.25x106~約2.00x106、約0.5x106~約2x106、約1.00x106~約2.00x106、約0.80x106~約1.5x106、または約1.20x106 ~約1.5x106細胞/mlである、実施形態1~9のいずれかに記載の方法。
E12. 細胞密度が、約1.43x106細胞/mLである、実施形態1~8、または11のいずれかに記載の方法。
E13. 開始細胞密度が、約1.00x106細胞/mLである、実施形態1~8、または11のいずれかに記載の方法。
E14. 抗CD3/28ナノマトリックスの体積対開始細胞集団の体積の体積比が、約1:5、1:6、1:7、1:8、1:9、1:10、1:11、1.12、1:13、1:14、1:15、1:16、または1:17である、実施形態1~13のいずれかに記載の方法。
E15. 抗CD3/CD28ナノマトリックスで開始細胞集団を培養する前、培養中、または培養後に、開始細胞集団を形質導入することをさらに含む、実施形態1~14のいずれかに記載の方法。
E16. 開始細胞集団が、レンチウイルスベクター、レトロウイルスベクター、および/またはアデノウイルス関連ベクターで形質導入される、実施形態15のいずれかに記載の方法。
E17. 抗CD3/CD28ナノマトリックスで開始細胞集団を培養する前、培養中、または培養後に、開始細胞集団をトランスフェクトすることをさらに含む、実施形態1~16のいずれかに記載の方法。
E18. トランスフェクト工程が、TALEN(登録商標)mRNAエレクトロポレーション(EP)および/またはCRISPER Cas9エレクトロポレーションを含む、実施形態17に記載の方法。
E19. トランスフェクト工程が、TCRαβ遺伝子および/またはβ2M遺伝子を破壊することを含む、実施形態18に記載の方法。
E20. 開始細胞集団が、約8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20日間培養される、実施形態1~19のいずれかに記載の方法。
E21. 結果として得られるT細胞集団が、未分化または未成熟T細胞を示す一つ以上のマーカーを発現する、実施形態1~20のいずれか一つに記載の方法。
E22. 未分化または未成熟T細胞を示す一つ以上のマーカーが、CD62L、CD45RA、CD45RO、およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される、実施形態21に記載の方法。
E23. 結果として得られるT細胞集団が、第2の結果として得られるT細胞集団よりも、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約100%多い幹メモリーT細胞を含む、実施形態1~22のいずれかに記載の方法。
E24. 開始細胞集団体積比が1:5であり、第2の開始細胞集団体積比が1:20、1:25、または1:50である、実施形態1~23のいずれかに記載の方法。
E25. 開始細胞集団体積比が1:10であり、第2の開始細胞集団体積比が1:20、1:25、または1:50である、実施形態1~24のいずれかに記載の方法。
E26. 開始細胞集団体積比が1:15であり、第2の開始細胞集団体積比が1:20、1:25、または1:50である、実施形態1~24のいずれかに記載の方法。
E27. レンチウイルスが、細胞表面受容体をコードする異種遺伝子を含む、実施形態16~26のいずれかに記載の方法。
E28. 細胞表面受容体が、標的細胞の表面上の抗原を結合することができる、実施形態27に記載の方法。
E29. 標的細胞が、腫瘍細胞である、実施形態28に記載の方法。
E30. 細胞表面受容体が、T細胞受容体(TCR)またはキメラ抗原受容体(CAR)である、28、または29に記載の方法。
E31. TCRまたはCARが、707-AP(707アラニンプロリン)、AFP(アルファ(a)-フェトタンパク質)、ART-4(T4細胞によって認識される腺癌抗原)、BAGE(B抗原;b-カテニン/m、b-カテニン/変異)、BCMA(B細胞成熟抗原)、Bcr-abl(ブレークポイントクラスター領域-アベルソン)、CAIX(炭酸脱水酵素IX)、CD19(分化19のクラスター)、CD20(分化20のクラスター)、CD22(分化22のクラスター)、CD30(分化30のクラスター)、CD33(分化33のクラスター)、CD44v7/8(分化44のクラスター、エクソン7/8)、CAMEL(メラノーマのCTL認識抗原)、CAP-1(癌胎児性抗原ペプチド-1)、CASP-8(カスパーゼ-8)、CDC27m(細胞分裂サイクル27変異)、CDK4/m(サイクリン依存性キナーゼ4変異)、CEA(癌胎児性抗原)、CT(癌/精巣(抗原))、Cyp-B(シクロフィリンB)、DAM(分化抗原メラノーマ)、EGFR(上皮増殖因子受容体)、EGFRvIII(上皮増殖因子受容体、バリアントIII)、EGP-2(上皮糖タンパク質2)、EGP-40(上皮糖タンパク質40)、Erbb2、3、4(赤芽球性白血病ウイルス癌遺伝子ホモログ-2、-3、4)、ELF2M(伸長因子2変異)、ETV6-AML1(Etsバリアント遺伝子6/急性骨髄性白血病1遺伝子ETS)、FBP(葉酸結合タンパク質)、fAchR(胎児型アセチルコリン受容体)、G250(糖タンパク質250)、GAGE(G抗原)、GD2(ジシアロガングリオシド2)、GD3(ジシアロガングリオシド3)、GnT-V(N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼV)、Gp100(糖タンパク質100kD)、HAGE(ヘリカーゼ抗原)、HER-2/neu(ヒト表皮受容体-2/神経学; EGFR2としても知られる)、HLA-A(ヒト白血球抗原-A)HPV(ヒトパピローマウイルス)、HSP70-2M(ヒートショックタンパク質70-2変異)、HST-2(ヒトシグネット環腫瘍-2)、hTERTまたはhTRT(ヒトテロメラーゼ逆転写酵素)、iCE(腸内カルボキシルエステラーゼ)、IL-13R-a2(インターロイキン-13受容体サブユニットアルファ-2)、KIAA0205、KDR(キナーゼ挿入ドメイン受容体)、。カッパ軽鎖、LAGE(L抗原)、LDLR/FUT(低密度脂質受容体/GDP-L-フコース: b-D-ガラクトシダーゼ2-a-Lフコシルトランフエェラーゼ)、LeY(ルイス-Y抗体)、L1CAM(L1細胞接着分子)、MAGE(メラノーマ抗原)、MAGE-A1(メラノーマ関連抗原1)、MAGE-A3、MAGE-A6、メソテリン、マウスCMV感染細胞、MART-1/Melan-A(T細胞-1によって認識されるメラノーマ抗原/メラノーマ抗原A)、MC1R(メラノコルチン1受容体)、ミオシン/m(ミオシン変異)、MUC1(ムチン1)、MUM-1、-2、-3(黒色腫遍在性突然変異1、2、3)、NA88-A(患者M88のNA cDNAクローン)、NKG2D(ナチュラルキラーグループ2、メンバーD)リガンド、NY-BR-1(ニューヨーク乳房分化抗原1)、NY-ESO-1(ニューヨーク食道扁平上皮癌-1)、腫瘍胎児抗原(h5T4)、P15(タンパク質15)、p190 minor bcr-abl(190KD bcr-ablのタンパク質)、Pml/RARa(前骨髄球性白血病/レチノイン酸受容体a)、PRAME(メラノーマの優先的に発現される抗原)、PSA(前立腺特異的抗原)、PSCA(前立腺幹細胞抗原)、PSMA(前立腺特異的膜抗原)、RAGE(腎抗原)、RU1またはRU2(腎ユビキタス1または2)、SAGE(肉腫抗原)、SART-1またはSART-3(腫瘍1または3を拒絶する扁平上皮抗原)、SSX1、-2、-3、4(滑膜肉腫X1、-2、-3、-4)、TAA(腫瘍関連抗原)、TAG-72(腫瘍関連糖タンパク質72)、TEL/AML1(転座性Ets-ファミリー白血病/急性骨髄性白血病1)、TPI/m(トリオースホスフェートイソメラーゼ変異型)、TRP-1(チロシナーゼ関連タンパク質1、またはgp75)、TRP-2(チロシナーゼ関連タンパク質2)、TRP-2/INT2(TRP-2/イントロン2)、VEGF-R2(血管内皮成長因子受容体2)、WT1(ウィルムス腫瘍遺伝子)、CD70、FLT3、DLL3およびそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される抗原を結合する能力を有する、実施形態30に記載の方法。
E33. 治療有効量の結果として得られるT細胞を、それを必要とする対象に投与することをさらに含む、実施形態1~32のいずれかに記載の方法。
E34. T細胞療法を必要とする対象において腫瘍を治療する方法であって、実施形態実施形態1~33のいずれかに記載される、結果として得られるT細胞のうちの一つ以上を対象に投与することを含む、方法。
E35. T細胞療法を必要とする対象において、腫瘍のサイズを低減する、もしくは減少させる、または腫瘍の増殖を抑制する方法であって、実施形態1~34のいずれかに記載される、結果として得られるT細胞のうちの一つ以上を対象に投与することを含む、方法。
E36. 腫瘍が、骨癌、膵臓癌、皮膚癌、頭や首の癌、皮膚または眼内悪性メラノーマ、子宮癌、卵巣癌、直腸癌、肛門部の癌、胃癌、精巣癌、子宮癌、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頸管癌、膣癌、外陰部癌、ホジキン病、非ホジキンリンパ腫(NHL)、縦隔原発大細胞型B細胞リンパ腫(PMBC)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、濾胞性リンパ腫(FL)、形質転換濾胞性リンパ腫、多発性骨髄腫、脾臓辺縁帯リンパ腫(SMZL)、食道癌、小腸癌、内分泌系の癌、甲状腺の癌、副甲状腺の癌、副腎の癌、軟部組織肉腫、尿道の癌、陰茎の癌、慢性または急性白血病、急性骨髄性白血病、慢性骨髄性白血病、急性リンパ芽球性白血病(ALL)(非T細胞ALLを含む)、慢性リンパ性白血病(CLL)、小児の固形腫瘍、リンパ球性リンパ腫、膀胱癌、腎臓または尿管の癌、腎盂癌、中枢神経系(CNS)の腫瘍、原発性CNSリンパ腫、腫瘍血管新生、脊髄軸腫瘍、脳幹神経膠腫、下垂体腺腫、カポジ肉腫、類表皮癌、扁平上皮癌、T細胞リンパ腫、アスベストによって誘発された癌を含む、環境的に誘発された癌、他のB細胞悪性腫瘍、およびそれらの任意の組み合わせから選択される癌である、実施形態29~35のいずれかに記載の方法。
E37. 1)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始PBMC集団と接触させることであって、開始PBMC集団が少なくとも約0.5x106 細胞/ml~約2.0x106 細胞/mlの細胞密度であり、および体積比は、体積5または10の開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、ならびに2)培養培地中で14~18日間、PBMC集団を培養することであって、結果として得られるPBMC集団は、第2のPBMC集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の第2の開始PBMC集団を、体積20の第2の開始PBMC集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比率で、抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させて、同じ日数の間培養する、培養すること、を含む、PBMC集団における幹メモリーT細胞の割合を増加する方法。
E38. 1)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始精製されたT細胞集団と接触させることであって、開始T細胞集団が少なくとも約0.80x106 細胞/ml~約1.60x106 細胞/mlの細胞密度であり、および体積比は、体積10または15の開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、ならびに2)培養培地中で11~18日間、PBMC集団を培養することであって、結果として得られる精製されたT細胞集団は、第2の精製されたT細胞集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の第2の開始精製されたT細胞集団を、体積20、25または50の第2の開始T細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比率で、抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させて、同じ日数の間培養する、培養すること、を含む、精製されたT細胞集団における幹メモリーT細胞の割合を増加する方法。
E39. 1)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始T細胞集団と接触させることであって、開始T細胞集団が少なくとも約0.80x106 細胞/ml~約1.60x106 細胞/mlの細胞密度であり、および体積比は、体積10または15の開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、ならびに2)培養培地中で11~18日間、T細胞集団を培養することであって、結果として得られるT細胞集団は、第2のT細胞集団と比較してT細胞の数の増加を含み、同じ細胞密度の第2の開始T細胞集団を、体積20、25または50の第2の開始T細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比率で、抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させて、同じ日数の間培養する、培養すること、を含む、T細胞集団におけるT細胞の総数を増加する方法。
実施例1
PBMC集団からのエクスビボ活性化された同種異系T細胞の調製
ドナー血液を収集し、アフェレーシスによりその成分部分に分離した。次いで、PBMCを、Ficoll(登録商標)-hypaqueステップ勾配で濃縮し、凍結保存した。0日目に、Ficoll(登録商標)で単離され凍結されたヒトPBMCを解凍し、10%ヒト血清を含む培養培地で1回洗浄した。次いで細胞を5%ヒト血清で培地中で培養し、37°Cおよび5% CO2で一晩インキュベートした。1日目に、得られたPBMCは、約3×106細胞/mL以下の細胞密度であり、試験画分に分割され、1.5×106細胞/mLで以下のように活性化された:
Figure 2022546537000001
対照、試験グループ1~2、については、細胞をmTransActの存在下で培養された、それは、mTransAct CD3/CD28キット(カタログ番号130-020-008、Miltenyi Biotec社、カリフォルニア州オーバーン)において提供され、mTransAct CD3/CD28キットでは、抗CD3抗体および抗CD28抗体はそれぞれ、CD3およびCD28に対するマウスモノクローナル抗体である。
試験グループ3から5については、細胞をTransact(商標)(Miltenyi Biotec社、カリフォルニア州オーバーン)の存在下で培養した、ここでナノマトリックスを、指示された体積比で、ヒト化抗CD3および抗CD28抗体(以下、「h TransAct(商標)」 )とコンジュゲートさせる。
すべての試験グループについて、表1に示されるように、細胞を、Transact(商標)によって細胞培養体積比に活性化した。細胞を活性化した培養培地は、X-vivo15(Lonza)、および100IU/mlの5%ヒト血清(Gemini)+IL-2から構成される(Miltenyi Biotec社)。
4日目に、表1に示されるように、活性化培養培地を新鮮な培養培地で希釈したか、または遠心分離により完全に除去した。試験グループ1および5については、細胞を、少なくとも1体積の新鮮な培養培地で、1体積の活性化培養培地に希釈した。残りの試験グループについては、540gで、室温で5分間遠心分離を実施した。次いで細胞を培養培地で1回洗浄した。
さらに4日目に、当技術分野で公知の方法により、CARの導入のためのレンチウイルスベクター形質導入により、活性化された細胞を遺伝子改変することができる。簡潔に述べると、試験グループ1および5では、活性化培養培地の新鮮な細胞培養培地での希釈で、レンチウイルスベクター(LVV #1831P、Lentigen Technology社、メリーランド州ゲイザースバーグ)を培養培地に加え、細胞を製造業者の指示に従って形質導入した。残りの試験グループについては、細胞を製造業者の指示に従って形質導入した。簡潔に述べると、細胞を採取し、1回洗浄し、レンチウイルスベクター(Lentigen Technology社、メリーランド州ゲイザースバーグ)を1~10%v/vのレンチウイルスベクターで細胞培養に添加された培養培地に再懸濁した。両方の方法で、形質導入の細胞密度は1×106細胞/mLであった。
細胞を、4日目から6日目までTフラスコ中で増殖させた。6日目に、TALEN(登録商標)mRNAエレクトロポレーション(EP)によって、さらに細胞の遺伝子編集をして、TCRαβ遺伝子を破壊し、その遺伝子発現をノックアウトした。製造業者の指示に従って、TALEN(登録商標)mRNAエレクトロポレーションを、AgilePulse(登録商標)エレクトロポレーションシステム(ハーバード・バイオサイエンス社、マサチューセッツ州ホリストン、の一部門であるBTX(登録商標)から入手可能)を使用して実施した。
遺伝子改変された同種異系CAR-T細胞を含む同種異系T細胞は、製造業者の指示に従って、8日目から18日目の間にG-Rex(登録商標)10(Wilson Wolf社、ミネソタ州セントポール)で増殖された。
細胞増殖および収率
実際の細胞収率を、自動細胞カウンターNucleoCounter NC-200(Chemometec、Allerod、デンマーク)を使用して、1、4、6、8および18日目に測定した。1日目から18日目までの結果を図1に示す。G-Rex(登録商標)における細胞増殖前の1、4、6、および8日目の結果を図2に示し、8日目から18日目までのG-Rex(登録商標)における増殖の結果を図3に示す。
総細胞増殖倍率を決定し、図4に1日目~18日目の結果を示す。図5は、各試験グループについて、各プロセス工程における増殖倍率を示し、試験グループ3~5が、8日目から18日目まで、試験グループ6および7よりも高い増殖倍率を有する。図6は、0日目から6日目までの各試験グループについて、各プロセス工程における増殖倍率の結果を示す。
細胞表現型
細胞表現型は、1日目および18日目に分析される。細胞は、製造業者の指示に従って、関連する標的に対する蛍光抗体で標識される。
次いで、蛍光標識された細胞を、製造業者の指示に従ってLSRFortessa(商標)サイトメーター(BD Biosciences、ニュージャージー州フランクリンレイクス)により分析し、FlowJoソフトウェアバージョン10(FlowJo社、オレゴン州アシュランド)を使用してデータを分析した。
PBMC細胞サブセットを、CD5(BD Horizon)、CD14(Biolegend)、CD56(BD Biosciences)、およびCD19(Biolegend)に対する市販の抗体を使用して、1日目に試験グループおよび関連する対照の各々について決定した。
CD8 T細胞サブセットを、CD8 (BD Biosciences)、CD45RA (Biolegend)、およびCD62L (BD Biosciences)に対する市販の抗体を使用して、1日目に試験グループおよび関連する対照の各々について決定した
CD4:CD8細胞比を、CD4(BD Biosciences)、およびCD8 (BD Biosciences)に対する市販の抗体を使用して、1日目に試験グループおよび関連する対照の各々について決定した。
CD45RA+、CD62L+である総CD5+細胞サブセットを、CD5(BD Horizon)、CD45RA (Biolegend)、およびCD62L (BD Biosciences)に対する市販の抗体を使用して、18日目に試験グループおよび関連する対照の各々について決定した。
CD45RO+、CD62L+である総CD5+細胞サブセットを、CD5(BD Horizon)、CD45RO (Biolegend)、およびCD62L (BD Biosciences)に対する市販の抗体を使用して、18日目に試験グループおよび関連する対照の各々について決定した。
試験グループおよび関連する対照の各々について、CAR+%、およびTCRαβ-%細胞の割合を、蛍光色素にコンジュゲートされたCAR抗イディオタイプ抗体およびTCRαβ (Biolegend)に対する市販の抗体を使用して、18日目に決定する。
製造業者の指示に従って、NucleoCounter(登録商標) NC-200(商標)(Chemometec、デンマーク、アレロド(Allerod))を使用して、試験グループおよび関連する対照の各々について0日目から18日目まで細胞生存率を監視した。
製造業者の指示に従って、NucleoCounter(登録商標) NC-200(商標)(Chemometec、デンマーク、アレロド)を使用して、試験グループおよび関連する対照の各々について0日目から18日目まで細胞直径を監視した。
実施例2
精製されたT細胞集団からのエクスビボ活性化された同種異系T細胞の調製
ヒト末梢血単核細胞(PBMC)は、STEMCELL Technologiesが供給するプロトコルに従って、Ficoll(登録商標)-Paque PLUS(GE Healthcare Life Sciences)およびSepMate(商標)-50チューブ(STEMCELL Technologies)を使用して、匿名の血液ドナーからのバフィーコートから単離された。次いで、汎T細胞を、Miltenyi Biotecによって供給されたプロトコルに従って、汎T細胞アイソレーションキット(Miltenyi Biotec)を使用して、新たに調製されたPBMCから単離した。汎T細胞を、使用準備ができるまで液体窒素中に保存した。
初代ヒト汎T細胞(10~30×106)を、0日目に解凍し、T細胞形質導入培地-X-Vivo(商標)15(Lonza)+10% HyCloneウシ胎児血清(GE Healthcare Life Sciences)-中で約2×106細胞/mLで再懸濁し、加湿インキュベーター中で37°C、5% CO2で30分間インキュベートした。30分間のインキュベーション後、T細胞を計数し、T細胞形質導入培地を使用して細胞密度を調整した。次いで、T細胞を、1:1のビーズ対T細胞比でのT細胞活性化/増殖キット(Miltenyi Biotec)からのビーズか、または1:10、1:15、1:20、1:25、1:50の体積希釈でのT細胞TransAct(商標)ポリマーナノマトリックス(Miltenyi Biotec)からのビーズのいずれかと混合した。組換えヒトIL-2(Miltenyi Biotec)を、最終濃度100U/mLとなるまで加えた。次いで、T細胞を37°Cのインキュベーターに戻した。
2日後(2日目)、T細胞を計数し、5×105細胞/mLでT細胞形質導入培地中に再懸濁し、新鮮なIL-2を添加した。次いで、T細胞を、FMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 CARをコードするレンチウイルスベクターで形質導入し、37°Cのインキュベーターに戻した。非形質導入(UT)対照を並行して作製した。5日目に、形質導入効率をフローサイトメトリーにより確認し、FMC63-41BB-CD3ζ 抗CD19 CAR T細胞、およびUT対照T細胞をG-Rex(登録商標)6ウェルプレート(Wilson Wolf)に移した。T細胞培養培地-X-Vivo(商標)15(Lonza)+5%ヒト血清AB(クロットオフ)(Gemini BioProducts)および100 IU/mLの組換えヒトIL-2(Miltenyi Biotec)-を、最大35mLまで添加した。
LSRFortessa(商標)X-20 Cell Analyzer(BD Biosciences社)を使用してフローサイトメトリーにより免疫表現型解析を行い、FlowJo(登録商標)v10(FlowJo社)ソフトウェアを使用してデータを分析した。以下の抗体を使用した:Alexa Fluor(AF)700抗ヒトCD25抗体(BioLegend #302622);BUV395抗ヒトCD62L抗体(BD Bioscience #565219);BV605抗ヒトCD8a抗体(BioLegend #301040);BV786抗ヒトCD4抗体(BD Bioscience #563914);PE抗ヒトCD137(4-1BB)抗体(BioLegend #309804);ペリジニンクロロフィル(PerCP)/Cy5.5抗ヒトCD45RO抗体(BioLegend #304222)。

Claims (23)

  1. 細胞集団における幹メモリーT細胞の割合を増加させる方法であって、前記方法が、
    a)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始細胞集団と接触させることであって、
    i)前記開始細胞集団が、少なくとも約0.2×106細胞/ml~約5.8×106細胞/mlの細胞密度であり、
    ii)前記体積比が、体積17.4以下の前記開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、および、
    b)前記細胞集団を培養培地中で培養すること、を含み、
    ここで、結果として得られるT細胞集団が、第2のT細胞集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の前記第2の開始細胞集団を、体積17.5以上の前記第2の開始細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比で、前記抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させる、方法。
  2. 前記開始細胞集団が、末梢血、骨髄、リンパ節組織、臍帯血、胸腺組織、感染部位からの組織、腹水、胸水脾臓組織、腫瘍、間葉組織、T細胞株、誘導多能性幹細胞(induced pluriopotent stem cell)、または人工胸腺オルガノイド(ATO)細胞培養系から取得される、請求項1に記載の方法。
  3. 前記開始細胞集団が、Tリンパ球、Bリンパ球、ヘルパーT細胞、腫瘍浸潤性リンパ球、メモリーT細胞、細胞傷害性T細胞、ナチュラルキラーT細胞、末梢血リンパ球、腫瘍浸潤性白血球、末梢血単核細胞、樹状細胞、臍帯血幹細胞、多能性幹細胞、および間葉系幹細胞からなる群から選択される、請求項1および2のいずれかに記載の方法。
  4. 前記開始細胞集団が、末梢血単核細胞(PBMC)、正に選択されたCD3、CD4、もしくはCD8 T細胞、または負に選択されたCD3、CD4、もしくはCD8 T細胞、あるいはそれらの組み合わせである、請求項1~3のいずれかに記載の方法。
  5. 前記開始細胞集団が、末梢血単核細胞である、請求項1~4のいずれかに記載の方法。
  6. 前記開始細胞集団が、CD4+および/またはCD8+T細胞を含む精製されたT細胞集団である、請求項1~4のいずれかに記載の方法。
  7. 前記開始細胞密度が、少なくとも約0.50x106~約6.00x106、約0.56x106~約5.72x106、約0.80x106~約4.0x106、約1.00x106~約3.0x106、約2.00x106~約3.5x106、または約2.50x106~約3.5x106である、請求項1~6のいずれかに記載の方法。
  8. 前記細胞密度が、約2.86×106細胞/mLである、請求項1~7のいずれかに記載の方法。
  9. 前記開始細胞密度が、約1.50×106細胞/mLである、請求項1~8のいずれかに記載の方法。
  10. 前記開始細胞密度が、少なくとも約0.28x106~約2.86x106、0.25x106~約2.00x106、約0.5x106~約2.00x106、約1.00x106~約2.00x106、約0.80x106~約1.5x106、または約1.20x6~約1.5x106細胞/mlである、請求項1~8のいずれかに記載の方法。
  11. 前記細胞密度が、約1.43x106細胞/mLである、請求項1~7、または10のいずれかに記載の方法。
  12. 前記開始細胞密度が、約1.00x106細胞/mLである、請求項1~7、または10のいずれかに記載の方法。
  13. 抗CD3/28ナノマトリックスの体積対開始細胞集団の体積の体積比が、約1:5、1:6、1:7、1:8、1:9、1:10、1:11、1.12、1:13、1:14、1:15、1:16、または1:17である、請求項1~12のいずれかに記載の方法。
  14. 前記開始細胞集団が、約8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20日間培養される、請求項1~13のいずれかに記載の方法。
  15. 15.前記結果として得られるT細胞集団が、未分化または未成熟T細胞を示す一つ以上のマーカーを発現する、請求項1~14のいずれか一項に記載の方法。
  16. 前記未分化または未成熟T細胞を示す一つ以上のマーカーが、CD62L、CD45RA、CD45RO、またはそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される、請求項15に記載の方法。
  17. 前記結果として得られるT細胞集団が、前記第2の結果として得られるT細胞集団よりも、少なくとも約5%、少なくとも約10%、少なくとも約15%、少なくとも約20%、少なくとも約25%、少なくとも約30%、少なくとも約35%、少なくとも約40%、少なくとも約45%、少なくとも約50%、少なくとも約55%、少なくとも約60%、少なくとも約65%、少なくとも約70%、少なくとも約75%、少なくとも約80%、少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約100%多い幹メモリーT細胞を含む、請求項1~16のいずれかに記載の方法。
  18. 開始細胞集団体積比が1:5であり、第2の開始細胞集団体積比が1:20、1:25、または1:50である、請求項1~17のいずれかに記載の方法。
  19. 前記開始細胞集団体積比が1:10であり、前記第2の開始細胞集団体積比が1:20、1:25、または1:50である、請求項1~18のいずれかに記載の方法。
  20. 前記開始細胞集団体積比が1:15であり、前記第2の開始細胞集団体積比が1:20、1:25、または1:50である、請求項1~19のいずれかに記載の方法。
  21. PBMC集団における幹メモリーT細胞の割合を増加させる方法であって、前記方法が、
    a)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始PBMC集団と接触させることであって、
    i)前記開始PBMC集団が、少なくとも約0.50×106細胞/ml~約2.00×106細胞/mlの細胞密度であり、
    ii)前記体積比が、体積5または10の前記開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、および、
    b)前記PBMC集団を、培養培地中で14~18日間培養すること、を含み、
    ここで、結果として得られるPBMC集団が、第2のPBMC集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の前記第2の開始PBMC集団を、体積20の前記第2の開始PBMC集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比で、前記抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させ、同じ日数の間培養する、方法。
  22. 精製されたT細胞集団における幹メモリーT細胞の割合を増加させる方法であって、前記方法が、
    a)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始精製されたT細胞集団と接触させることであって、
    i)前記開始T細胞集団が、少なくとも約0.80×106細胞/ml~約1.60×106細胞/mlの細胞密度であり、
    ii)前記体積比が、体積10または15の前記開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、および、
    b)前記開始精製されたT細胞集団を、培養培地中で11~18日間培養すること、を含み、
    ここで、結果として得られる精製されたT細胞集団が、第2の精製されたT細胞集団と比較して幹メモリーT細胞の割合の増加を含み、同じ細胞密度の前記第2の開始精製されたT細胞集団を、体積20、25、または50の前記第2の開始T細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比で、前記抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させ、同じ日数の間培養する、方法。
  23. T細胞集団におけるT細胞の総数を増加させる方法であって、前記方法が、
    a)ある体積比で、ある体積の抗CD3/CD28ナノマトリックスを、ある体積の開始T細胞集団と接触させることであって、
    i.前記開始T細胞集団が、少なくとも約0.80×106細胞/ml~約1.60×106細胞/mlの細胞密度であり、
    ii.前記体積比が、体積10または15の前記開始細胞集団に対して体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスである、接触させること、および、
    b)前記T細胞集団を、培養培地中で11~18日間培養すること、を含み、
    ここで、結果として得られるT細胞集団が、第2のT細胞集団と比較してT細胞の数の増加を含み、同じ細胞密度の前記第2の開始T細胞集団を、体積20、25、または50の前記第2の開始T細胞集団に対する体積1の抗CD3/CD28ナノマトリックスの比で、前記抗CD3/CD28ナノマトリックスと接触させ、同じ日数の間培養する、方法。
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