JP2022527373A - Retを結合するヒト抗体およびその使用方法 - Google Patents
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Abstract
Description
配列表の公式コピーは、ファイル名10582WO01_SeqList_ST25.TXT、作成日2020年4月9日、およびサイズ約168キロバイトのASCIIフォーマット配列表として、本明細書と同時にEFS-Webを介して電子提出されている。このASCIIフォーマット文書に含有される配列表は、本明細書の一部であり、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
しかし、RETが腫瘍細胞の成長および増殖において果たす役割を考慮すると、およびこの分子を標的とするために承認された薬剤がほとんどないという事実を考慮すると、RETの阻害剤、例えば非常に強力で、臨床での使用の承認を妨げる有害効果を生じないRETに特異的に結合するヒト抗体が依然として必要である。
(a)完全ヒト抗体であること;
(b)表面プラズモン共鳴によって測定した場合に約1.0×10-7M~約1.0×10-12Mの範囲のKDを示すこと;
(c)RETの、その対応する共受容体(それぞれGFRα1、GFRα2、GFRα3、およびGFRα4)と複合体を形成した1つまたは複数のGDNFファミリーメンバーリガンド(GDNF、ニュールツリン、アルテミン、およびパーセフィン)との結合または相互作用を阻害または遮断すること;
(d)GDNF、ニュールツリン、アルテミン、およびパーセフィンから選択される1つまたは複数のGDNFファミリーメンバーリガンドによって媒介されるRETシグナル伝達を阻害すること;
(e)RET受容体に対する抗体の結合後のRET内部移行/分解を増強すること;
(f)配列番号2、18、34、50、66、82、98、114、130、146、162、178、194、210、226、242、258、274、および290からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域(HCVR)を含むこと;または
(g)配列番号10、26、42、58、74、90、106、122、138、154、170、186、202、218、234、250、266、282、および298からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域(LCVR)を含むこと
のうちの1つまたは複数を有する、単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
(a)配列番号4、20、36、52、68、84、100、116、132、148、164、180、196、212、228、244、260、276、および292からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するHCDR1ドメイン;
(b)配列番号6、22、38、54、70、86、102、118、134、150、166、182、198、214、230、246、262、278、および294からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するHCDR2ドメイン;
(c)配列番号8、24、40、56、72、88、104、120、136、152、168、184、200、216、232、248、264、280、および296からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するHCDR3ドメイン;
(d)配列番号12、28、44、60、76、92、108、124、140、156、172、188、204、220、236、252、268、284、および300からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するLCDR1ドメイン;
(e)配列番号14、30、46、62、78、94、110、126、142、158、174、190、206、222、238、254、270、286、および302からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するLCDR2ドメイン;ならびに
(f)配列番号16、32、48、64、80、96、112、128、144、160、176、192、208、224、240、256、272、288、および304からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するLCDR3ドメイン
を含む。
「トランスフェクション中の再配列」は、「RET」とも呼ばれ、末梢および中枢神経系ならびに腎臓を含む多様な組織において発生の間に発現される受容体チロシンキナーゼである。RETがん遺伝子は、1985年にTakahashiらによって同定され、彼らはヒトリンパ腫DNAをトランスフェクトしたNIH/3T3細胞においてトランスフォーム活性を有する新規遺伝子再配列を報告した(Takahashi, M., et al., (1985) Cell, 42:581-588を参照されたい)。RETは後に、がん遺伝子であることが確認され、甲状腺乳頭癌(PTC)患者のDNAにおいて体細胞再配列されており、後にRET/PTCと呼ばれた(Fusco, A. et al., (1987), Nature, 328:170-172; Grieco, M. et al., (1990), Cell, 60:557-63)。RETタンパク質は、3つのドメイン:細胞外リガンド結合ドメイン、疎水性膜貫通ドメイン、およびチロシンキナーゼドメインが27アミノ酸の挿入によって分割されている細胞質部分で構成される(図1を参照されたい)。選択的スプライシングによって生成されたRETの2つの主なアイソフォームが存在する。短いおよび長いRETアイソフォームは、9個および51個の無関係なC末端アミノ酸によって異なり、それぞれRET9およびRET51と呼ばれる。それらは広範囲の種にわたって高度に保存されている(Carter, MT, et al. (2001), Cytogenet Cell Genet, 95:169-76)。いずれのアイソフォームもフォーカス形成アッセイによってトランスフォーム活性を示す(Rossel, M. et al. (1997), Oncogene, 14:265-75)。
「トランスフェクション中の再配列」は、「RET」とも呼ばれ、末梢および中枢神経系ならびに腎臓を含む多様な組織において発生の間に発現される受容体チロシンキナーゼである(Arighi, E. et al. (2005), Cytokine Growth Factor Rev 16:441-67; Borrello, MG, et al., (2013), Expert Opin. Ther. Targets, 17(4): 403-419)。RETがん遺伝子は、1985年にTakahashiらによって同定され、彼らはヒトリンパ腫DNAをトランスフェクトしたNIH/3T3細胞においてトランスフォーム活性を有する新規遺伝子再配列を報告した(Takahashi, M., et al., (1985) Cell, 42:581-588を参照されたい)。RETは後に、がん遺伝子であることが確認され、甲状腺乳頭癌(PTC)患者のDNAにおいて体細胞再配列されており、後にRET/PTCと呼ばれた(Fusco, A. et al., (1987), Nature, 328:170-172; Grieco, M. et al., (1990), Cell, 60:557-63)。RETタンパク質は、3つのドメイン:細胞外リガンド結合ドメイン、疎水性膜貫通ドメイン、およびチロシンキナーゼドメインが27アミノ酸の挿入によって分割されている細胞質部分で構成される(図1を参照されたい)。選択的スプライシングによって生成されたRETの2つの主なアイソフォームが存在する。短いおよび長いRETアイソフォームは、9個および51個の無関係なC末端アミノ酸によって異なり、それぞれRET9およびRET51と呼ばれる。それらは広範囲の種にわたって高度に保存されている(Carter, MT, et al. (2001), Cytogenet Cell Genet, 95:169-76)。いずれのアイソフォームもフォーカス形成アッセイによってトランスフォーム活性を示す(Rossel, M. et al. (1997), Oncogene, 14:265-75)。
特にそれ以外であると示していない限り、用語「抗体」は、本明細書で使用される場合、2つの免疫グロブリン重鎖および2つの免疫グロブリン軽鎖を含む抗体分子(すなわち、「完全な抗体分子」)ならびにその抗原結合性断片を包含すると理解されるものとする。用語、抗体の「抗原結合性部分」、抗体の「抗原結合性断片」等は、本明細書で使用される場合、特異的に抗原に結合して複合体を形成する任意の天然に存在する、酵素により得ることができる、合成の、または遺伝子操作されたポリペプチドまたは糖タンパク質を含む。用語、抗体の「抗原結合性部分」または「抗体断片」は、本明細書で使用される場合、RETに特異的に結合する能力を保持する抗体の1つまたは複数の断片を指す。抗体断片は、Fab断片、F(ab’)2断片、Fv断片、dAb断片、CDRを含有する断片、または単離されたCDRを含み得る。抗体の抗原結合性断片は、例えば任意の適した標準的な技術、例えばタンパク質分解消化、または抗体可変および(必要に応じて)定常ドメインをコードするDNAの操作および発現を伴う組換え遺伝子操作技術を使用して完全な抗体分子から導出され得る。そのようなDNAは公知であるかおよび/または例えば商業的供給源、DNAライブラリー(例えば、ファージ抗体ライブラリーを含む)から容易に入手可能であるか、または合成することができる。DNAを、化学的にまたは分子生物学技術を使用することによってシーケンシングおよび操作して、例えば1つもしくは複数の可変および/もしくは定常ドメインを適した構成に配置すること、またはコドンを導入し、システイン残基を創出し、アミノ酸を改変、付加、もしくは欠失すること等ができる。
トランスジェニックマウスにおいてヒト抗体を生成するための方法は当技術分野で公知である。任意のそのような公知の方法を、本発明の状況において使用して、RETに特異的に結合するヒト抗体を作製することができる。
本発明の抗RET抗体および抗体断片は、記載の抗体の配列とは異なるがRETを結合する能力を保持するアミノ酸配列を有するタンパク質を包含する。そのようなバリアント抗体および抗体断片は、親配列と比較した場合にアミノ酸の1つまたは複数の付加、欠失、または置換を含むが、記載の抗体のそれと本質的に同等である生物活性を示す。同様に、本発明の抗体コードDNA配列は、本開示の配列と比較した場合にヌクレオチドの1つまたは複数の付加、欠失、または置換を含むが、本発明の抗体または抗体断片と本質的に生物学的に同等である抗体または抗体断片をコードする配列を包含する。
本発明のある特定の実施形態によれば、例えば中性pHと比較して酸性pHでFcRn受容体に対する抗体の結合を増強または減少させる1つまたは複数の変異を含むFcドメインを含む抗RET抗体が提供される。例えば、本発明は、FcドメインのCH2またはCH3領域で変異を含む抗RET抗体であって、変異が、酸性環境(例えば、pHが約5.5~約6.0の範囲であるエンドソームにおいて)においてFcRnに対するFcドメインの親和性を増加させる、抗RET抗体を含む。そのような変異は、動物に投与した場合に抗体の血清中半減期の増加をもたらし得る。そのようなFc改変の非制限的な例としては、例えば、250位(例えば、EまたはQ);250および428位(例えば、LまたはF);252位(例えば、L/Y/F/WまたはT)、254位(例えば、SまたはT)、および256位(例えば、S/R/Q/E/DまたはT)での改変;または428および/もしくは433位(例えば、H/L/R/S/P/QまたはK)、および/もしくは434位(例えば、H/FまたはY)での改変;または250および/もしくは428位での改変;または307もしくは308位(例えば、308F、V308F)、および434位での改変が挙げられる。一実施形態では、改変は、428L(例えば、M428L)および434S(例えば、N434S)改変;428L、259I(例えば、V259I)、および308F(例えば、V308F)改変;433K(例えば、H433K)および434(例えば、434Y)改変;252、254、および256(例えば、252Y、254T、および256E)改変;250Qおよび428L改変(例えば、T250QおよびM428L);ならびに307および/または308改変(例えば、308Fまたは308P)を含む。
一般的に、本発明の抗体は、RETに結合する、ならびにそうすることでRET活性化および/またはシグナル伝達を遮断または防止するように作用することによって機能し得る。本発明の抗体はまた、RETに結合する、およびそうすることでRETの、その対応する共受容体と複合体を形成した1つまたは複数のGDNFファミリーメンバー、例えばGDNF/GFRα1、ニュールツリン/GFRα2、アルテミン/GFRα3、またはパーセフィン/GFRα4との相互作用または結合を妨害または防止することによって機能し得る。RETの腫瘍形成能がヒトにおいて確立されているという事実に基づき、RETに特異的に結合するアンタゴニスト抗体は、がん性状態に罹患している患者における腫瘍細胞成長を阻害することにおいて有益な効果を有することが証明され得る。
(a)完全ヒト抗体であること;
(b)表面プラズモン共鳴によって測定した場合に約1.0×10-7M~約1.0×10-12Mの範囲のKDを示すこと;
(c)RETの、その対応する共受容体(それぞれGFRα1、GFRα2、GFRα3、およびGFRα4)と複合体を形成した1つまたは複数のGDNFファミリーメンバーリガンド(GDNF、ニュールツリン、アルテミン、およびパーセフィン)との結合または相互作用を阻害または遮断すること;
(d)GDNF、ニュールツリン、アルテミン、およびパーセフィンから選択される1つまたは複数のGDNFファミリーメンバーリガンドによって媒介されるRETシグナル伝達を阻害すること;
(e)RET受容体に対する抗体の結合後のRET内部移行/分解を増強すること;
(f)配列番号2、18、34、50、66、82、98、114、130、146、162、178、194、210、226、242、258、274、および290からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域(HCVR)を含むこと;または
(g)配列番号10、26、42、58、74、90、106、122、138、154、170、186、202、218、234、250、266、282、および298からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域(LCVR)を含むこと
のうちの1つまたは複数を示す完全ヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片を提供する。
当業者に公知の様々な技術を使用して、抗体がポリペプチドまたはタンパク質内の「1つまたは複数のアミノ酸と相互作用する」か否かを決定することができる。例示的な技術としては、例えばAntibodies, Harlow and Lane (Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harb., NY)に記載されるアッセイなどのルーチンの交差遮断アッセイが挙げられ、実行することができる。他の方法としては、アラニンスキャン変異分析、ペプチドブロット分析(Reineke (2004) Methods Mol Biol 248:443-63)、ペプチド切断分析結晶学的研究、およびNMR分析が挙げられる。加えて、抗原のエピトープ切除、エピトープ抽出、および化学改変などの方法を用いることができる(Tomer (2000) Protein Science 9: 487-496)。抗体が相互作用するポリペプチド内のアミノ酸を同定するために使用することができる別の方法は、質量分析法によって検出される水素/重水素交換である。一般的に、水素/重水素交換法は、目的のタンパク質の重水素標識化、その後抗体の重水素標識タンパク質への結合を伴う。次に、タンパク質/抗体複合体を水に移すと、抗体複合体によって保護されたアミノ酸内の交換可能なプロトンは、界面の一部ではないアミノ酸内の交換可能なプロトンよりも遅い速度で重水素から水素への逆交換を受ける。その結果、タンパク質/抗体界面の一部を形成するアミノ酸は重水素を保持し、したがって界面に含まれないアミノ酸と比較して相対的に大きい質量を示し得る。抗体の解離後、標的タンパク質をプロテアーゼ切断および質量分析法による分析に供し、それによって抗体が相互作用する特異的アミノ酸に対応する重水素標識残基を明らかにする。例えばEhring (1999) Analytical Biochemistry 267(2):252-259; Engen and Smith (2001) Anal. Chem. 73:256A-265Aを参照されたい。
本発明は、腫瘍細胞の増殖を阻害することが可能なまたはがん性状態などのRET関連状態に関連する少なくとも1つの症状を改善するための薬剤などの治療部分にコンジュゲートされたヒトRETモノクローナル抗体(「イムノコンジュゲート」)を包含する。そのような薬剤は、RETに対する第2の異なる抗体もしくは抗腫瘍化学療法剤であり得るか、またはRETを発現する腫瘍細胞に標的化した場合に、腫瘍細胞を殺滅するように作用する放射性核種であり得る。抗RET抗体にコンジュゲートされ得る治療部分のタイプは、処置される状態および達成される所望の治療効果を考慮に入れる。あるいは、所望の治療効果が、ある特定の組織によるRETの発現に関連する続発症もしくは症状、またはRET発現に起因する他の任意の状態、例えば、これに限定されないががんを処置することである場合、状態の続発症もしくは症状を処置するために、または本発明の抗体の任意の副作用を軽減するために適切な薬剤をコンジュゲートすることが有利であり得る。イムノコンジュゲートを形成するために適した薬剤の例は、当技術分野で公知であり、例えばWO05/103081号を参照されたい。
本発明の抗体は、単特異性、二特異性、または多特異性であり得る。多特異性抗体は、1つの標的ポリペプチドの異なるエピトープに対して特異的であり得るか、または1つより多くの標的ポリペプチドに特異的な抗原結合ドメインを含有し得る。例えば、Tutt et al., 1991, J. Immunol. 147:60-69; Kufer et al., 2004, Trends Biotechnol. 22:238-244を参照されたい。本発明の抗体は、別の機能的分子、例えば別のペプチドまたはタンパク質に連結させるかまたはそれと同時発現させることができる。例えば、抗体またはその断片を、1つまたは複数の他の分子実体、例えば別の抗体または抗体断片に機能的に連結させて(例えば、化学カップリング、遺伝子融合、非共有結合による会合またはその他の方法)、第2の結合特異性を有する二特異性または多特異性抗体を産生することができる。
本発明は、本発明の抗RET抗体またはその抗原結合性断片を含む治療組成物を提供する。本発明に従う治療組成物の投与は、適した担体、賦形剤、および製剤に取り込まれて移入、送達、認容性の改善等を提供する他の薬剤と共に投与される。数多くの適切な製剤が、全ての薬剤師に公知の処方集で見出され得る:Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Company, Easton, PA。これらの製剤は、例えば粉末、パスタ、軟膏、ゼリー、ろう、油、脂質、脂質(カチオン性またはアニオン性)含有小胞(例えば、LIPOFECTIN(商標))、DNAコンジュゲート、無水吸収性パスタ、水中油型および油中水型乳剤、乳剤カーボワックス(様々な分子量のポリエチレングリコール)、半固体ゲル、およびカーボワックスを含有する半固体混合物が挙げられる。同様にPowell et al. "Compendium of excipients for parenteral formulations" PDA (1998) J Pharm Sci Technol 52:238-311も参照されたい。
本発明のある特定の実施形態によれば、RETに対する抗体の複数回用量を、決められた時間経過にわたって対象に投与してもよい。本発明のこの態様による方法は、RETに対する抗体の複数回用量を対象に逐次的に投与することを含む。本明細書で使用される場合、「逐次的に投与すること」は、RETに対する抗体の各用量が異なる時点で、例えば既定の間隔(例えば、数時間、数日、数週間、または数ヶ月)を隔てて異なる日に対象に投与されることを意味する。本発明は、RETに対する抗体の単一の初回用量の後、RETに対する抗体の1つまたは複数の二次用量および必要に応じてRETに対する抗体の1つまたは複数の三次用量を患者に逐次的に投与することを含む方法を含む。
ある特定の細胞および組織において発現されるRETタンパク質との結合/相互作用により、本抗体は、RETタンパク質の、1つまたは複数のリガンド/共受容体複合体、例えばGDNF/GFRα1、アルテミン/GFRα3、ニュールツリン/GFRα2、またはパーセフィン/GFRα4との相互作用を防止するために有用である。本発明の抗RET抗体がこの相互作用を防止または阻害する能力を考慮すると、本発明のアンタゴニスト抗体は、腫瘍細胞の成長がRETシグナル伝達に依存する場合に腫瘍細胞成長の阻害にとって有用であることを証明し得るか、またはがん性状態に関連する疼痛ならびにRET活性化もしくはシグナル伝達が役割を果たす他の疾患もしくは障害に関連する疼痛を阻害するために有用であることを証明し得る。本発明の抗体は、単独でもしくは別の抗腫瘍剤もしくは治療レジメンと併せて、または状態に関連する疼痛をさらに改善するために使用される1つもしくは複数の薬剤と共に投与される場合、RET発現腫瘍を有する対象における腫瘍の成長および/もしくは転移を遅らせるために、またはがん性状態に関連する疼痛を処置するために使用され得る。あるいは、本発明の抗体は、がん性状態に関連する少なくとも1つの症状を改善するために有用であり得る。
上記のように、本発明の方法は、ある特定の実施形態によれば、RETに対する抗体と組み合わせて1つまたは複数の追加の治療剤を対象に投与することを含む。本明細書で使用される場合、表現「と組み合わせて」は、追加の治療剤が、抗RET抗体を含む医薬組成物の前、後、または同時に投与されることを意味する。用語「と組み合わせて」はまた、抗RET抗体と第2の治療剤の逐次的なまたは同時の投与も含む。
また本発明の抗RET抗体を使用して、例えば診断目的のために試料中のRETを検出および/または測定してもよい。RETに関連すると考えられる疾患または状態の確認は、例えばRETシグナル伝達を通しての成長に依存する腫瘍からの生検試料(すなわち、腫瘍細胞)中のRETの存在を測定することによって行われ得ると想定される。例示的なRETの診断アッセイは、例えば患者から得た試料を本発明の抗RET抗体と接触させることを含み得、抗RET抗体は検出可能な標識もしくはレポーター分子によって標識されるか、または患者試料からRETタンパク質を発現する細胞を選択的に単離するための捕捉リガンドとして使用される。あるいは、標識されていない抗RET抗体を、それ自体検出可能に標識される二次抗体と組み合わせて診断適用に使用することができる。検出可能な標識またはレポーター分子は、3H、14C、32P、35S、もしくは125Iなどの放射性同位体;フルオレセインイソチオシアネートもしくはローダミンなどの蛍光もしくは化学発光部分;またはアルカリホスファターゼ、β-ガラクトシダーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、もしくはルシフェラーゼなどの酵素であり得る。試料中のFタンパク質を含有するRETを検出または測定するために使用することができる具体的な例示的なアッセイとしては、酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)、ラジオイムノアッセイ(RIA)、および蛍光活性化細胞選別法(FACS)が挙げられる。
以下のいずれか1つを含む免疫原を使用してRETに対する抗体を生成することができる。ある特定の実施形態では、本発明の抗体は、全長のRETタンパク質などの一次免疫原によって免疫したマウスから得られる(例えば、いずれも残基番号1~28からのシグナル配列を有する、ヒトRET51アイソフォームに関して、ATCC受託番号NP_066124.1においても見出される配列番号310;およびヒトRET9アイソフォームに関して、ATCC受託番号NP_065681.1においても見出される配列番号312を参照されたい)。マウスに、同じ分子を含有する1つもしくは複数の追加免疫注射を行ってもよく、またはその免疫原性断片、例えばアミノ酸残基1~28の範囲のシグナル配列を有する、ATCC受託番号NP_066124.1においても見出される配列番号313のアミノ酸1~635の範囲のヒトRET細胞外ドメインを追加免疫してもよい。ある特定の実施形態では、マウスに全長のRETタンパク質を注射した後、配列番号305、306、307、および313として示される構築物のいずれかまたは組み換えによって調製した分子を追加免疫する。
表1は、RETタンパク質に特異的な選択された抗体の重鎖および軽鎖可変領域アミノ酸配列対およびその対応する抗体識別子を記載する。抗体は典型的には、本明細書において以下の命名法に従って呼ばれる:Fc接頭辞(例えば、「H4H」、「H1M」、「H2M」)の後に続く数値識別子(例えば、表1に示すように「7086」)、その後に続く「P」または「N」接尾辞。このように、この命名法によれば、抗体は、例えば「H2M7086N」と呼ばれ得る。本明細書で使用される抗体の名称におけるH4H、H1M、およびH2M接頭辞は、抗体の特定のFc領域を示す。例えば、「H2M」抗体はマウスIgG2 Fcを有するが、「H4H」抗体はヒトIgG4 Fcを有する。当業者によって認識されるように、H1MまたはH2M抗体をH4H抗体に変換することができ、その逆も同じであるが、いずれにせよ表1に示す数値識別子によって示される可変ドメイン(CDRを含む)は同じままである。同じ数値での抗体名称を有するが接尾辞の文字N、B、またはPが異なる抗体は、同一のCDR配列を有するが、CDR配列に入らない領域(すなわち、フレームワーク領域)に配列バリエーションを有する重鎖および軽鎖を有する抗体を指す。このように、特定の抗体のN、B、およびPバリアントは、その重鎖および軽鎖可変領域内に同一のCDR配列を有するが、そのフレームワーク領域内が互いに異なる。
ヒト抗RET抗体の結合親和性および速度定数を表面プラズモン共鳴(Biacore T200)によって25℃および37℃で決定した(表2~3)。ヒトIgG4 Fc(すなわち、「H4H」名称)として発現させた抗体を抗ヒトFcセンサー表面(mAb-捕捉フォーマット)上で捕捉し、可溶性単量体の(hRET.mmh;配列番号305、macaca fascicularis(mf)RET.mmh;配列番号306)または二量体の(hRET.mFc;配列番号307)RETタンパク質をセンサー表面上に注入した。結合平衡解離定数(KD)、および解離半減期(t1/2)を運動速度定数から:KD[M]=kd/ka;およびt1/2(分)=(ln2/(60*kd)として計算した。計算は、BiacoreT200評価ソフトウェアv1.0を使用して実施した。
抗RET抗体が予め複合体を形成したプレート結合GDNF:GFRα1に対するヒトRETの結合を遮断する能力を、競合サンドイッチELISAを使用して評価した。RET抗体の大部分は、プレート結合GDNF/GFRα1共複合体に対するRETの結合を強力に遮断した(表4)。IC50値は、5.2nM~アッセイの理論最低値(250pM)より下の値の範囲であり、最大の遮断は72~96%の範囲であった。
組換えヒト二量体GDNF(R&D systems)、およびヒトGFRα1.mFc(配列番号308)を、PBS中で1:1のモル比で混合して、約2.0μg/mlの最終共複合体濃度を得た。GDNF-GFRα1共複合体を室温(RT)で1時間インキュベートした後、96ウェルマイクロタイタープレートを4℃で一晩コーティングした。非特異的結合部位をBSAによって遮断した。
この実施例では、RETシグナル伝達および内部移行に対する抗RET抗体の効果を、MCF7およびhRET操作レポーター細胞株を使用して調べた。
MCF7/SRE-ルシフェラーゼ安定細胞株の生成
MCF7細胞は、RETおよびGFRα1を天然に発現する。MCF7/SRELuc細胞の産生は、Cignal Lenti SREレポーターキット(SABiosciences)によるMCF7の形質導入およびピューロマイシンでの2週間の選択を介して生成された安定に組み込まれたSRE-ルシフェラーゼを利用した。レンチウイルスは、最小CMVプロモーターおよび血清応答エレメント(SRE)のタンデムリピートの制御下でホタルルシフェラーゼ遺伝子を発現する。
ヒトGFRα(1または3)およびhRETを、リポフェクタミン2000媒介トランスフェクションの逐次ラウンドを介してHEK293細胞に安定に導入し、500μg/ml G418(hGFRa1または3)および100μg/mlハイグロマイシンB(hRET)中で少なくとも2週間選択した。次いで、hGFRa1/hRETまたはhGFRa3/hRETを発現するHEK293二重安定株を、上記のようにCignal Lenti SREレポーターキットによって形質導入して、HEK293/hGFRa1/hRET/SRE-Luc細胞株およびアルテミン応答性HEK293/GFRa3/hRET/SRE-Luc細胞株を生成した。
MCF7-SRE-luc細胞20000個をPDLコーティング96ウェルプレートにOptimem+0.5%FBS中で播種し、37℃、5%CO2で一晩成長させた。阻害曲線のために、細胞を、1.6pM~1μMの範囲の連続希釈した抗hRET mAbと共に1時間インキュベートした。次いで、一定用量のヒトGDNF(4~10pM)を添加し、細胞をさらに6時間インキュベートした。
HEK293/hGFRa3/hRET/SRE-Luc細胞株におけるアルテミン刺激ルシフェラーゼ活性の阻害を、MCF7/SRE-Luc細胞に関して記載した方法を介して抗RET抗体を使用して評価した。阻害曲線を生成するために、細胞を、1.6pM~1μMの範囲の連続希釈した抗hRET抗体と共に1時間インキュベートした。次いで、細胞を一定用量のhアルテミン(100pM)によって6時間刺激した。アルテミンの用量反応曲線は、連続希釈したhアルテミン(0.17pM~10nM)を、抗体を添加せずに細胞に37℃で6時間添加することによって生成した。ルシフェラーゼ活性測定およびカーブフィッティングを、GDNF刺激ルシフェラーゼ活性に関して記載したとおりに実施した。
EC50/IC50値を、GraphPad Prismを使用して12ポイント応答曲線に対して4パラメーターロジスティック方程式から決定した。遮断パーセントは、最高の抗体用量に関して報告し、データを平均値±標準偏差(SD)として報告する。
抗hRET mAbを内部移行に関して試験するために、HEK293/hGFRa1/hRET/SRE-Luc細胞を、抗体(10μg/ml)と共に氷上で30分間インキュベートした後、1回洗浄した。次いで細胞を、alexa488コンジュゲート抗hFc Fab二次抗体と共に30分間インキュベートした後、2回目の洗浄を行った。抗体を37℃で4時間内部移行させたか、または内部移行を防止するために4℃で維持した。細胞を4%ホルムアルデヒド中で固定し、細胞表面のalexa488を、抗alexa488クエンチ抗体との4℃で1時間のインキュベーションによってクエンチした。核をヘキスト染料によって染色し、画像をImageXpress micro XL(Molecular Devices)において獲得した。
様々な二特異性抗体を、本発明の方法の実践における使用のために生成する。例えば、RET特異的抗体を、RETタンパク質の別個のドメインに結合する可変領域が単一の結合分子内で二重のドメイン特異性を付与するように共に連結される二特異的フォーマット(「二特異性抗体(bi-specific)」)で生成する。適切に設計された二特異性抗体は、特異性および結合アビディティの両方を増加させることを通して全体的なRET中和有効性を増強し得る。個々のドメインに関して特異性を有する可変領域を、構造的足場上で対を形成させ、それによって各領域を別個のエピトープまたは1つのドメイン内の異なる領域に同時に結合させる。二特異性抗体の一例では、1つのドメインに関して特異性を有する結合剤からの重鎖可変領域(VH)を、第2のドメインに対して特異性を有する一連の結合剤からの軽鎖可変領域(VL)と組み換えて、そのVHに対する元の特異性に支障をきたすことなく、元のVHと対を形成することができる非同族のVLパートナーを同定する。このようにして、単一のVLセグメント(例えば、VL1)を2つの異なるVHドメイン(例えば、VH1およびVH2)と組み合わせて、2つの結合「アーム」(VH1-VL1、およびVH2-VL1)で構成される二特異性抗体を生成することができる。単一のVLセグメントの使用は、システムの複雑度を低減させ、それによって二特異性抗体を生成するために使用されるクローニング、発現、および精製プロセスを単純化し、その効率を増加させる(例えば、USSN13/022759およびUS2010/0331527を参照されたい)。
Claims (40)
- RET(トランスフェクション中の再配列)受容体チロシンキナーゼに特異的に結合する単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片であって、前記抗体が、以下の特徴:
(a)完全ヒト抗体であること;
(b)表面プラズモン共鳴によって測定した場合に約1.0×10-7M~約1.0×10-12Mの範囲のKDを示すこと;
(c)RETの、その対応する共受容体(それぞれGFRα1、GFRα2、GFRα3、およびGFRα4)と複合体を形成した1つまたは複数のGDNFファミリーメンバーリガンド(GDNF、ニュールツリン、アルテミン、およびパーセフィン)との結合または相互作用を阻害または遮断すること;
(d)GDNF、ニュールツリン、アルテミン、およびパーセフィンから選択される1つまたは複数のGDNFファミリーメンバーリガンドによって媒介されるRETシグナル伝達を阻害すること;
(e)前記RET受容体に対する前記抗体の結合後のRET内部移行/分解を増強すること;
(f)配列番号2、18、34、50、66、82、98、114、130、146、162、178、194、210、226、242、258、274、および290からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する重鎖可変領域(HCVR)を含むこと;または
(g)配列番号10、26、42、58、74、90、106、122、138、154、170、186、202、218、234、250、266、282、および298からなる群より選択されるアミノ酸配列を有する軽鎖可変領域(LCVR)を含むこと
のうちの1つまたは複数を有する、単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。 - 前記抗体が、GDNF:GFRα1共複合体に対するヒトRETの結合を約100pM~約7.0nMの範囲のIC50値で遮断する、請求項1に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記抗体が、前記GDNF:GFRα1共複合体に対するヒトRETの結合を約250pM~約5.2nMの範囲のIC50値で遮断する、請求項2に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記GDNF:GFRα1共複合体に対するヒトRETの遮断パーセントが、約40%~100%の範囲である、請求項3に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 前記GDNF:GFRα1共複合体に対するヒトRETの遮断パーセントが、約57%~約97%の範囲である、請求項4に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- GDNF媒介RETシグナル伝達が、約50pM~100nMより大きい値の範囲のIC50値で阻害される、請求項1に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- GDNF媒介RETシグナル伝達が、約143pM~100nMより大きい値の範囲のIC50値で阻害される、請求項6に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- GDNF媒介RETシグナル伝達が、約40%~約100%阻害される、請求項6に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- GDNF媒介RETシグナル伝達が、約60%~約100%阻害される、請求項7に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- アルテミン媒介RETシグナル伝達が、約100pM~約500nMの範囲のIC50値で阻害される、請求項1に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- アルテミン媒介RETシグナル伝達が、約250pM~約341nMの範囲のIC50値で阻害される、請求項10に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- アルテミン媒介RETシグナル伝達が、約57%~約100%阻害される、請求項11に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- 配列番号2/10、18/26、34/42、50/58、66/74、82/90、98/106、114/122、130/138、146/154、162/170、178/186、194/202、210/218、226/234、242/250、258/266、274/282、および290/298からなる群より選択されるHCVR/LCVRアミノ酸配列対を含む、請求項1に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- RETに特異的に結合する単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片であって、前記抗体が、配列番号2、18、34、50、66、82、98、114、130、146、162、178、194、210、226、242、258、274、および290からなる群より選択されるHCVRアミノ酸配列内に含有される3つの重鎖CDR(HCDR1、HCDR2、およびHCDR3)を含むHCVR;ならびに配列番号10、26、42、58、74、90、106、122、138、154、170、186、202、218、234、250、266、282、および298からなる群より選択されるLCVRアミノ酸配列内に含有される3つの軽鎖CDR(LCDR1、LCDR2、およびLCDR3)を含むLCVRを含む、単離されたヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合性断片。
- (a)配列番号4、20、36、52、68、84、100、116、132、148、164、180、196、212、228、244、260、276、および292からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するHCDR1ドメイン;
(b)配列番号6、22、38、54、70、86、102、118、134、150、166、182、198、214、230、246、262、278、および294からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するHCDR2ドメイン;
(c)配列番号8、24、40、56、72、88、104、120、136、152、168、184、200、216、232、248、264、280、および296からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するHCDR3ドメイン;
(d)配列番号12、28、44、60、76、92、108、124、140、156、172、188、204、220、236、252、268、284、および300からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するLCDR1ドメイン;
(e)配列番号14、30、46、62、78、94、110、126、142、158、174、190、206、222、238、254、270、286、および302からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するLCDR2ドメイン;ならびに
(f)配列番号16、32、48、64、80、96、112、128、144、160、176、192、208、224、240、256、272、288、および304からなる群より選択されるアミノ酸配列を有するLCDR3ドメイン
を含む、請求項14に記載の単離されたヒトモノクローナル抗体または抗原結合性断片。 - 配列番号2/10、18/26、34/42、50/58、66/74、82/90、98/106、114/122、130/138、146/154、162/170、178/186、194/202、210/218、226/234、242/250、258/266、274/282、および290/298からなる群より選択される重鎖および軽鎖配列対を含む抗体または抗原結合性断片と、RETに対する特異的結合に関して競合する、単離された抗体またはその抗原結合性断片。
- 配列番号2/10、18/26、34/42、50/58、66/74、82/90、98/106、114/122、130/138、146/154、162/170、178/186、194/202、210/218、226/234、242/250、258/266、274/282、および290/298からなる群より選択される重鎖および軽鎖配列対を含む抗体によって認識されるRET上の同じエピトープを結合する単離された抗体またはその抗原結合性断片。
- 請求項1~17のいずれかに記載の抗体または抗原結合性断片をコードする単離された核酸分子。
- 請求項18に記載の核酸分子を含む発現ベクター。
- 請求項1~17のいずれかに記載のRETを特異的に結合する抗体またはその抗原結合性断片のいずれか1つまたは複数、および薬学的に許容される担体または希釈剤を含む医薬組成物。
- RET受容体チロシンキナーゼ遺伝子またはその再配列された形態の発現、活性化、またはシグナル伝達に関連する障害もしくは状態、または前記障害もしくは状態に関連する疼痛を処置する方法であって、それを必要とする患者に、請求項1~17のいずれかに記載の1つもしくは複数の抗体もしくはその抗原結合性断片、または請求項1~17のいずれかに記載の1つもしくは複数の抗体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法。
- RET受容体チロシンキナーゼ遺伝子またはその再配列された形態の発現、活性化、またはシグナル伝達に関連する前記障害または状態ががんであり、前記がんが甲状腺がん、肺がん、膵臓がん、皮膚がん、乳がん、および血液由来のがんからなる群より選択される、請求項21に記載の方法。
- RET受容体チロシンキナーゼ遺伝子またはその再配列された形態の発現、活性化、またはシグナル伝達に関連する前記障害または状態が、急性疼痛、慢性疼痛、神経障害性疼痛、炎症性疼痛、関節炎、変形性関節症、片頭痛、群発性頭痛、三叉神経痛、ヘルペス性神経痛、全身性神経痛、神経変性障害、神経内分泌障害、内臓痛、急性痛風、ヘルペス後神経痛、糖尿病性ニューロパチー、坐骨神経痛、背部痛、頭頸部痛、重度または難治性疼痛、突出痛、術後痛、歯痛、鼻炎、がん疼痛、または膀胱障害からなる群より選択される、請求項21に記載の方法。
- 腫瘍の成長または腫瘍細胞の増殖を阻害するための方法であって、前記腫瘍または腫瘍細胞がRETまたはその再配列された形態を発現し、前記方法がそれを必要とする患者に請求項1~17のいずれかに記載の1つもしくは複数の抗体もしくはその抗原結合性断片、または請求項1~17のいずれかに記載の1つもしくは複数の抗体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法。
- 前記腫瘍が固形腫瘍または血液由来の腫瘍である、請求項24に記載の方法。
- 前記固形腫瘍が、甲状腺腫瘍、肺腫瘍、膵臓腫瘍、皮膚腫瘍、および乳房腫瘍からなる群より選択される、請求項25に記載の方法。
- 前記甲状腺腫瘍が、甲状腺乳頭癌(PTC)または甲状腺髄様癌(MTC)である、請求項26に記載の方法。
- 前記甲状腺髄様癌が、多発性内分泌腫瘍症2型または3型(MEN2A、MEN2B)、および家族性甲状腺髄様癌(FMTC)症候群からなる群より選択される遺伝性MTCであるか、または前記甲状腺髄様癌が散発性MTCである、請求項27に記載の方法。
- 前記肺腫瘍が肺腺癌である、請求項26に記載の方法。
- 前記肺腫瘍が非小細胞肺がん(NSCLC)である、請求項26に記載の方法。
- 前記皮膚腫瘍が黒色腫である、請求項26に記載の方法。
- 前記血液由来の腫瘍が白血病である、請求項25に記載の方法。
- 前記白血病が慢性骨髄単球性白血病である、請求項32に記載の方法。
- RET発現および/または機能を下方調節する方法であって、それを必要とする患者に、請求項1~17のいずれかに記載の1つもしくは複数の抗体もしくはその抗原結合性断片、または請求項1~17のいずれかに記載の1つもしくは複数の抗体を含む医薬組成物を投与することを含む、方法。
- 前記RET発現および/または機能を下方調節することが、RAS/RAF経路およびPI3K経路からなる群より選択される下流のシグナル伝達経路の下方調節をもたらす、請求項34に記載の方法。
- 前記抗体または抗原結合性断片が、第2の治療剤と組み合わせて前記患者に投与される、請求項21~35のいずれかに記載の方法。
- 前記第2の治療剤が、低分子チロシンキナーゼ阻害剤、抗腫瘍剤、RETに特異的なsiRNA、RETに特異的な第2の抗体、および鎮痛剤からなる群より選択される、請求項36に記載の方法。
- 前記低分子チロシンキナーゼ阻害剤が、バンデタニブ、セディラニブ、(AZD2171)、ゲフィチニブ、エルロチニブ、SU14813、バタラニブ、ソラフェニブ、ソラフェニブ(BAY43-9006)、スニチニブ、カボザンチニブ、モテサニブ、XL-647、XL-999、AG-013736、BIBF1120、TSU68、GW786034、AEE788、CP-547632、KRN951、CHIR258、CEP-7055、OSI-930、ABT-869、E7080、ZK-304709、BAY57-9352、L-21649、BMS582664、XL-880、XL-184、XL-820、RPI-1、PP-1、およびNVP-AST478からなる群より選択される、請求項37に記載の方法。
- 前記抗腫瘍剤が、化学療法剤、放射性核種、および抗体-薬物コンジュゲートからなる群より選択される、請求項37に記載の方法。
- 前記鎮痛剤が、神経成長因子(NGF)阻害剤(例えば、低分子NGFアンタゴニストもしくは抗NGF抗体)、アスピリンもしくは別のNSAID、モルヒネ、ステロイド(例えば、プレドニゾン)、抗Nav1.7抗体もしくはNav1.7の低分子阻害剤、Nav1.8アンタゴニスト(例えば、抗Nav1.8抗体もしくはNav1.8の低分子阻害剤)、Nav1.9アンタゴニスト(例えば、抗Nav1.9抗体もしくはNav1.9の低分子阻害剤)、サイトカイン阻害剤(例えば、インターロイキン-1(IL-1)阻害剤(例えば、リロナセプト(「IL-1 trap」);Regeneron)もしくはアナキンラ(KINERET(登録商標)、Amgen)、低分子IL-1アンタゴニストもしくは抗IL-1抗体;IL-18阻害剤(例えば、低分子IL-18アンタゴニストもしくは抗IL-18抗体);IL-6もしくはIL-6R阻害剤(例えば、低分子IL-6アンタゴニスト、抗IL-6抗体、もしくは抗IL-6受容体抗体)、カスパーゼ-1の阻害剤、p38、IKK1/2、CTLA-4Ig、またはオピオイドからなる群より選択される、請求項37に記載の方法。
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