JP2022516006A - 修飾オルソポックスウイルスベクター - Google Patents
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Abstract
本開示は、修飾オルソポックスウイルスベクター、ならびに様々ながんの治療のためにそれを使用する方法に関する。本開示は、増強された腫瘍溶解活性、感染の拡散、免疫回避、腫瘍残留性、外因性DNA配列の取り込み能力、大規模製造のための快適性、及び安全性を含む、様々な有益な治療活性を示す修飾オルソポックスウイルスベクターを提供する。【選択図】なし
Description
関連出願の相互参照
本出願は、2019年11月4日に出願された米国仮特許出願第62/930,524号、2019年7月10日に出願された米国仮特許出願第62/872,699号、及び2018年12月21日に出願された米国仮特許出願第62/784,372号の優先権の利益を主張し、これらの各々の開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本出願は、2019年11月4日に出願された米国仮特許出願第62/930,524号、2019年7月10日に出願された米国仮特許出願第62/872,699号、及び2018年12月21日に出願された米国仮特許出願第62/784,372号の優先権の利益を主張し、これらの各々の開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
配列表
本出願は、2019年12月18日に作成された、1,252,729バイトのサイズを有する、14596-051-228_SL.txtと題されるASCIIテキストファイルとして本出願と共に提出された配列表を参照により組み込む。
本出願は、2019年12月18日に作成された、1,252,729バイトのサイズを有する、14596-051-228_SL.txtと題されるASCIIテキストファイルとして本出願と共に提出された配列表を参照により組み込む。
1.分野
本発明は、例えば、がんなどの細胞増殖障害の治療のための免疫療法の分野に関する。特に、本発明は、遺伝子修飾オルソポックスウイルス、ならびにそれらの作製及び使用方法に関する。
本発明は、例えば、がんなどの細胞増殖障害の治療のための免疫療法の分野に関する。特に、本発明は、遺伝子修飾オルソポックスウイルス、ならびにそれらの作製及び使用方法に関する。
2.背景
免疫系は、腫瘍細胞を特定し、それらを破壊の標的とするために刺激され得る。腫瘍溶解性オルソポックスウイルスを利用する免疫療法は、がん研究において急速に進化している分野である。効率及び安全性を最大化するために、腫瘍溶解性ウイルスに対する腫瘍選択性を操作及び/または増強するために新しいアプローチが必要である。この選択性は、潜在的に毒性のある治療剤または遺伝子がウイルスに追加される場合に、特に重要である。
免疫系は、腫瘍細胞を特定し、それらを破壊の標的とするために刺激され得る。腫瘍溶解性オルソポックスウイルスを利用する免疫療法は、がん研究において急速に進化している分野である。効率及び安全性を最大化するために、腫瘍溶解性ウイルスに対する腫瘍選択性を操作及び/または増強するために新しいアプローチが必要である。この選択性は、潜在的に毒性のある治療剤または遺伝子がウイルスに追加される場合に、特に重要である。
臨床腫瘍溶解ベクターとしてのオルソポックスウイルスの使用は、がん治療に有望なパラダイムであるが、患者における水痘病変などの毒性、及び免疫抑制性副作用のために、現在の大部分の臨床候補は、中程度の臨床的成功のみが示されている。より強固なウイルス複製、がん細胞殺傷、及び感染の観点からの拡散を示すオルソポックスウイルスを操作する方法の必要性が存在する。本発明は、この必要性に対応し、修飾オルソポックスウイルスを利用することにより、選択性及び安全性の制限に対する解決策を提供する。
3.概要
本開示は、がんの治療のためのオルソポックスウイルスの使用を記載する。特に、本開示は、部分的には、オルソポックスウイルスが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子のうちの1つ以上または全てにおいて欠失を含むように遺伝子修飾された場合に生じる増強された腫瘍溶解活性、感染の拡散、及び安全性の結果に基づく。これらの遺伝子のうちの1つ以上または全てに変異を示す、遺伝子修飾オルソポックスウイルス、例えば、ワクシニアウイルス(例えば、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1ウイルス)は、改善された腫瘍溶解能力、腫瘍における複製、感染性、免疫回避、腫瘍残留性、外因性DNA配列の組み込み能力、及び/または大規模製造のための快適性などの一連の有益な機能を示し得る。本開示は、B8R遺伝子において欠失を含むようにさらに遺伝子修飾されたオルソポックスウイルスを記載する。様々な実施形態において、修飾オルソポックスウイルスは、3つの導入遺伝子:膜貫通ドメイン(IL-12-TM)を含むインターロイキン12、FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3-L)、及び抗細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)抗体のうちの少なくとも1つを発現する。
本開示は、がんの治療のためのオルソポックスウイルスの使用を記載する。特に、本開示は、部分的には、オルソポックスウイルスが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子のうちの1つ以上または全てにおいて欠失を含むように遺伝子修飾された場合に生じる増強された腫瘍溶解活性、感染の拡散、及び安全性の結果に基づく。これらの遺伝子のうちの1つ以上または全てに変異を示す、遺伝子修飾オルソポックスウイルス、例えば、ワクシニアウイルス(例えば、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1ウイルス)は、改善された腫瘍溶解能力、腫瘍における複製、感染性、免疫回避、腫瘍残留性、外因性DNA配列の組み込み能力、及び/または大規模製造のための快適性などの一連の有益な機能を示し得る。本開示は、B8R遺伝子において欠失を含むようにさらに遺伝子修飾されたオルソポックスウイルスを記載する。様々な実施形態において、修飾オルソポックスウイルスは、3つの導入遺伝子:膜貫通ドメイン(IL-12-TM)を含むインターロイキン12、FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3-L)、及び抗細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)抗体のうちの少なくとも1つを発現する。
一態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′逆位末端配列(ITR)におけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列と、を含み、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターであり、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(d)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列と、を含み、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターであり、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。
特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、(d)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列と、を含み、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターであり、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
特定の実施形態では、核酸は、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、ヌクレオチド配列、及び/または(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
特定の実施形態では、核酸は、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、ヌクレオチド配列、及び/または(ii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、核酸は、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び/または(ii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
特定の実施形態では、核酸は、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、核酸は、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列において、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び/または(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され(すなわち、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に存在する)、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)。さらなる特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の上流にある。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも50%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも60%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも70%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも80%の欠失である。特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の約75%の欠失である。別の特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の約80%の欠失である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、Copenhagen株ワクシニアウイルスのゲノムに由来する。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、配列番号210のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、残存するB14Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の上流にある。特定の実施形態において、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の下流にある。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にあり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子のうちのいずれか1つ、2つ、または3つは、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子のうちのいずれか1つ、2つ、または3つは、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子のうちのいずれか1つ、2つ、または3つは、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される(すなわち、B8R遺伝子の遺伝子座に存在する)。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子のうちのいずれか1つ、2つ、または3つは、部分B13RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分B13RとB29R遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子のうちのいずれか1つ、2つ、または3つは、残存するB13Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子の間に挿入され(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、残存するB14Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子の間に挿入され(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第2の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、残存するB14Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子の間に挿入され(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、残存するB14Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、残存するB14Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。
特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、残存するB14Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B13RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分B13RとB29R遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、残存するB13Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分B13RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入され(すなわち、部分B13RとB29R遺伝子との間に存在する)、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される(すなわち、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に存在する)。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、残存するB13Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分C2LとF3L遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、残存するC2Lワクシニア遺伝子の部分と、残存するF3Lワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される(すなわち、B8R遺伝子の遺伝子座に存在する)。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される(すなわち、部分B14RとB29R遺伝子との間に存在する)。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、残存するB14Rワクシニア遺伝子の部分と、残存するB29Rワクシニア遺伝子の部分との間に挿入される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にあり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にあり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書に提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、第1の導入遺伝子と、(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、第2の導入遺伝子と、(d)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、第3の導入遺伝子と、を含む、核酸である。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。
特定の実施形態では、核酸は、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。
特定の実施形態では、核酸は、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、核酸は、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書に提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の上流にある。特定の実施形態において、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の下流にある。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、pSのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、pSのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、pSのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、pSのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、pSプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、pSプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、pSプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、pSプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様では、核酸は、配列番号210のヌクレオチド配列を含み、部分C2L及びF3Lワクシニア遺伝子は、配列番号210における部分C2L及びF3Lワクシニア遺伝子である。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様では、核酸は、配列番号210のヌクレオチド配列を含み、部分B14R及びB29Rワクシニア遺伝子は、配列番号210の部分B14R及びB29Rワクシニア遺伝子である。
一態様では、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載の核酸を含むウイルスである。
一態様では、提供されるのは、本明細書に開示される核酸またはウイルスを含むパッケージング細胞株である。
一態様では、本明細書に提供されるのは、本明細書に開示されるウイルスと、生理学的に許容される担体と、を含む薬学的組成物である。
一態様では、提供されるのは、哺乳動物患者におけるがんを治療する方法であり、該方法は、治療有効量の本明細書に開示されるようなウイルスを該患者に投与することを含む。別の態様では、提供されるのは、哺乳動物患者におけるがんを治療する方法であり、該方法は、治療有効量の本明細書に開示されるような薬学的組成物を該患者に投与することを含む。いくつかの実施形態では、哺乳動物患者は、ヒト患者である。
いくつかの実施形態では、ウイルスは、プライム:ブースト治療において刺激として使用される。いくつかの実施形態では、ウイルスは、プライム:ブースト治療における追加免疫として使用される。
いくつかの実施形態では、哺乳動物患者は、がんを有する。例えば、いくつかの実施形態では、がんは、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、ならびに喉癌からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、がんは、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、副腎皮質癌、AIDS関連リンパ腫、原発性CNSリンパ腫、肛門癌、虫垂癌、星状細胞腫、異型奇形/ラブドイド腫瘍、基底細胞癌、胆管癌、肝外癌、ユーイング肉腫ファミリー、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、中枢神経系胚性腫瘍、中枢神経系胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣腫、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、原発性リンパ腫、脊索腫、慢性骨髄増殖性腫瘍、結腸癌、肝外胆管癌、非浸潤性乳管癌(DCIS)、子宮内膜癌、上衣腫、食道癌、嗅神経芽細胞腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、卵管癌、骨の線維性組織球腫、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、精巣胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛性疾患、神経膠腫、小児脳幹神経膠腫、有毛細胞白血病、肝細胞癌、ランゲルハンス細胞組織球症、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、膵島細胞腫瘍、膵臓神経内分泌腫瘍、ウィルムス腫瘍及び他の小児腎臓腫瘍、ランゲルハンス細胞組織球症、小細胞肺癌、皮膚T細胞リンパ腫、眼内黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性頸部扁平上皮癌、正中線管癌、多発性内分泌腺腫症候群、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、鼻腔及び副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫(NHL)、非小細胞肺癌(NSCLC)、上皮性卵巣癌、胚細胞卵巣癌、低悪性度卵巣癌、膵臓神経内分泌腫瘍、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔及び鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、胸膜肺芽腫、原発性腹膜癌、直腸癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、カポジ肉腫、横紋筋肉腫、セザリー症候群、小腸癌、軟部肉腫、喉癌、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、腎盂及び尿管の移行上皮癌、尿道癌、子宮内膜癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ならびにワルデンストレームマクログロブリン血症からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、提供される方法は、該患者に免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む。いくつかの実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1もしくは抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である。
いくつかの実施形態では、提供される方法は、該患者にインターロイキンを投与することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、該インターロイキンは、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、インターロイキンは、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、インターロイキンは、膜結合である。
いくつかの実施形態では、方法は、該患者にインターフェロンを投与することをさらに含む。いくつかの実施形態では、インターフェロンは、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、提供される方法は、該患者にサイトカインを投与することをさらに含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である。いくつかの実施形態では、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質は、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、サイトカインは、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びcKitからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、サイトカインは、Flt3リガンドである。
一態様では、本明細書に開示される核酸またはウイルスと、宿主細胞において該核酸または該ウイルスを発現するように該キットの使用者に指示する添付文書と、を含むキットが提供される。
一態様では、本明細書に開示されるウイルスと、がんを有する哺乳動物患者に治療有効量の該ウイルスを投与し、それによって該がんを治療するように使用者に指示する添付文書と、を含むキットが提供される。いくつかの実施形態では、哺乳動物患者は、ヒト患者である。
3.1.定義
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、記載される値を10%上回らないまたは下回らない値を指す。例えば、「約5nM」という用語は、4.5nM~5.5nMの範囲を示す。
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、記載される値を10%上回らないまたは下回らない値を指す。例えば、「約5nM」という用語は、4.5nM~5.5nMの範囲を示す。
本明細書で使用される場合、「抗体」(Ab)という用語は、特定の抗原と特異的に結合するか、または特定の抗原と免疫学的に反応する免疫グロブリン分子を指し、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヘテロ複合抗体(例えば、二重、三重、及び四重特異的抗体、ダイアボディ、トリアボディ、及びテトラボディ)、ならびに例えば、Fab’、F(ab’)2、Fab、Fv、rIgG、及びscFv断片を含む抗体の抗原結合断片を含むがこれらに限定されない、ポリクローナル、モノクローナル、遺伝子操作及びその他の方法で修飾された形態の抗体を含む。さらに、別段の指示がない限り、「モノクローナル抗体」(mAb)という用語は、無傷分子、ならびに標的タンパク質と特異的に結合することができる抗体断片(例えば、Fab及びF(ab’)2断片など)の両方を含むことを意図する。Fab及びF(ab’)2断片は、無傷抗体のFc断片を欠き、動物の循環からより迅速に除去され、無傷抗体よりも少ない非特異的組織結合を有し得る(Wahl et al.,J.Nucl.Med.24:31 6,1 983を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書で使用される「抗原結合断片」という用語は、標的抗原と特異的に結合する能力を保持する抗体の1つ以上の断片を指す。抗体の抗原結合機能は、全長抗体の断片によって実行され得る。抗体断片は、Fab、F(ab’)2、scFv、SMIP、ダイアボディ、トリアボディ、アフィボディ、ナノボディ、アプタマー、またはドメイン抗体であり得る。抗体の「抗原結合断片」という用語に包含される結合断片の例には、これらに限定されないが、(i)Fab断片、VL、VH、CL、及びCH1ドメインからなる一価断片、(ii)F(ab’)2断片、ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって連結された2つのFab断片を含む二価断片、(iii)VH及びCH1ドメインからなるFd断片、(iv)抗体の単一アームのVL及びVHドメインからなるFv断片、(v)VH及びVLドメインを含むdAb、(vi)VHドメインからなるdAb断片(Ward et al.,Nature 341:544-546,1 989)、(vii)VHまたはVLドメインからなるdAb、(viii)単離された相補性決定領域(CDR)、及び(ix)任意に合成リンカーによって連結され得る2つ以上の単離されたCDRの組み合わせが含まれる。さらに、Fv断片の2つのドメイン、VL及びVHは、別個の遺伝子によってコードされるが、組換え方法を使用して、それらを、VL及びVH領域が対合して一価の分子を形成する単一のタンパク質鎖として作製することを可能にするリンカーによって連結することができる(単鎖Fv(scFv)として知られている;例えば、Bird et al.,Science 242:423-426,1988、及びHuston et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883,1988を参照されたい)。これらの抗体断片は、当業者に知られている従来の技法を使用して得ることができ、断片は、無傷抗体と同様の方法で有用性についてスクリーニングすることができる。抗原結合断片は、組換えDNA技法、無傷免疫グロブリンの酵素的もしくは化学的切断、またはいくつかの実施形態では、当該技術分野で既知の化学ペプチド合成手順によって産生され得る。
本明細書で使用される場合、「二重特異性抗体」という用語は、少なくとも2つの異なる抗原に対する結合特異性を有するモノクローナル、しばしばヒトまたはヒト化抗体を指す。
本明細書で使用される場合、「細胞」、「細胞株」、及び「細胞培養」という用語は、互換的に使用され得る。これらの用語の全てはまた、あらゆる後世であるそれらの子孫も含む。すべての子孫は、意図的または不用意な変異に起因して同一ではない可能性があることを理解されたい。
本明細書で使用される場合、「キメラ」抗体という用語は、ラットまたはマウスなどの1つの供給源生物の免疫グロブリンに由来する可変配列、及び異なる生物(例えば、ヒト)の免疫グロブリンに由来する定常領域を有する抗体を指す。キメラ抗体を産生する方法は、当該技術分野で既知である。例えば、Morrison,1985,Science 229(4719):1202-7、Oi et al.,1986,BioTechniques 4:214-221、Gillies et al.,1985,J.Immunol.Methods 125:191-202、米国特許第5,807,715号、同第4,816,567号、及び同第4,816,397号を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「相補性決定領域」(CDR)という用語は、軽鎖及び重鎖可変ドメインの両方に見られる超可変領域を指す。可変ドメインのより高度に保存された部分は、フレームワーク領域(FR)と称される。当該技術分野で理解されるように、抗体の超可変領域を画定するアミノ酸位置は、文脈及び当該技術分野で既知の様々な定義に応じて変化することができる。可変ドメイン内のいくつかの位置は、ハイブリッド超可変位置とみなされてもよく、その点、これらの位置は、1つの基準セットの下で超可変領域内にあるとみなされ得る一方で、異なる基準セットの下で超可変領域の外にあるとみなされ得る。これらの位置のうちの1つ以上は、伸長超可変領域において見出すこともできる。天然重鎖及び軽鎖の可変ドメインはそれぞれ、主にβシート構成を採用し、3つのCDRによって接続され、βシート構造を接続し、場合によってはその一部を形成するループを形成する4つのフレームワーク領域を含む。各鎖におけるCDRは、FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4の順序でFR領域によって近接して一緒に保持され、他の抗体鎖由来のCDRと共に、抗体の標的結合部位の形成に寄与する(Kabat et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest(National Institute of Health,Bethesda,Md.1987、参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書で使用される場合、免疫グロブリンアミノ酸残基の番号付けは、別途示されない限り、Kabatらの免疫グロブリンアミノ酸残基番号付けシステムに従って行われる。
本明細書で使用される場合、「保存的変異」、「保存的置換」、または「保存的アミノ酸置換」という用語は、極性、静電荷、及び立体体積などの類似の物理化学的特性を示す1つ以上の異なるアミノ酸に対する1つ以上のアミノ酸の置換を指す。これらの特性を、以下の表1の20個の天然アミノ酸の各々について要約した。この表から、保存的アミノ酸ファミリーには、(i)G、A、V、L、及びI;(ii)D及びE;(iii)C、S、及びT;(iv)H、K、及びR;(v)N及びQ;ならびに(vi)F、Y、及びWが含まれることが理解される。したがって、保存的変異または置換は、同じアミノ酸ファミリーのメンバーに対して1つのアミノ酸を置換するものである(例えば、Thrに対するSerまたはArgに対するLysの置換)。
本明細書で使用される場合、「欠失する」、「欠失」などの用語は、遺伝子もしくはそれに関連する、またはそれに作動可能に連結されて遺伝子(例えば、プロモーターまたはエンハンサー要素などの転写因子結合部位)を除去するか、さもなければ遺伝子を機能しないようにする調節要素への修飾を指す。本明細書に記載の例示的な欠失には、標的遺伝子の開始コドンから終止コドンまでの、目的の遺伝子をコードする核酸全体の除去が含まれる。本明細書に記載の欠失の他の例には、部分的に欠失した標的遺伝子の発現時に、生成物(例えば、RNA転写産物、タンパク質産物、または制御性RNA)が機能しないか、または標的遺伝子の野生型形態よりも機能しにくいように、標的遺伝子をコードする核酸の一部(例えば、1つ以上のコドン、またはその一部、例えば、単一のヌクレオチド欠失)の除去することが含まれる。本明細書に記載の例示的な欠失には、対象遺伝子に関連する制御性要素(複数可)の全てまたは一部、例えば標的遺伝子の発現を制御するプロモーター及び/またはエンハンサー核酸の全てまたは一部の除去が含まれる。
特定の実施形態では、本開示に記載される組換えワクシニアウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、B21R(3’ITRにおける)、B22R(3’ITRにおける)、B23R(3’ITRにおける)、B24R(3’ITRにおける)、B25R(3’ITRにおける)、B26R(3’ITRにおける)、B27R(3’ITRにおける)、B28R(3’ITRにおける)、及びB29R(3’ITRにおける)の遺伝子のうちの1つ以上における欠失を含む。特定の実施形態では、本開示に記載される組換えワクシニアウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、を含む。特定の実施形態では、本開示に記載される組換えワクシニアウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、B20R、B21R(3’ITRにおける)、B22R(3’ITRにおける)、B23R(3’ITRにおける)、B24R(3’ITRにおける)、B25R(3’ITRにおける)、B26R(3’ITRにおける)、B27R(3’ITRにおける)、B28R(3’ITRにおける)、及びB29R(3’ITRにおける)の遺伝子のうちの1つ以上における欠失を含み、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子欠失は、遺伝子の配列全体を除去する。他の実施形態において、遺伝子欠失は、部分欠失、すなわち、遺伝子の配列の一部を除去するものである。一実施形態では、遺伝子欠失は、遺伝子の配列の少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、または少なくとも95%を除去する部分欠失である。一実施形態では、遺伝子欠失は、遺伝子のタンパク質コード配列の少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、または少なくとも90%を除去する部分欠失である。他の実施形態では、遺伝子欠失は、遺伝子の配列の100%を除去する。さらに他の実施形態では、遺伝子欠失は、遺伝子のタンパク質コード配列の100%を除去する。一実施形態では、遺伝子欠失は、遺伝子の配列の少なくとも50、少なくとも100、少なくとも200、少なくとも300、少なくとも400、少なくとも500、少なくとも600、少なくとも700、少なくとも800、少なくとも900、または少なくとも1000ヌクレオチドを除去する。別の実施形態では、遺伝子欠失は、遺伝子の配列の少なくとも50、少なくとも100、少なくとも200、少なくとも300、少なくとも400、少なくとも500、少なくとも600、少なくとも700、少なくとも800、少なくとも900、または少なくとも1000ヌクレオチドを除去する部分欠失である。特定の実施形態では、遺伝子における部分欠失は、部分遺伝子をもたらす。
本明細書で使用される場合、「誘導体化抗体」という用語は、単離された抗体に天然ではない残基を切断または化学部分を付加するように化学反応によって修飾される抗体を指す。誘導体化抗体は、グリコシル化、アセチル化、ペグ化、リン酸化、アミド化、既知の化学的保護/遮断基の付加による誘導体化、タンパク質分解切断、細胞リガンドまたは他のタンパク質との結合によって得ることができる。様々な化学修飾のうちのいずれかは、限定されないが、確立された手順を使用して、特定の化学切断、アセチル化、ホルミル化、ツニカマイシンの代謝合成などを含む、既知の技術によって実行することができる。加えて、誘導体は、例えば、アンバー抑制技術を使用して、1つ以上の非天然アミノ酸を含有することができる(例えば、米国特許第6,964,859号を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書で使用される場合、「ダイアボディ」という用語は、2つのポリペプチド鎖を含む二価抗体を指し、各ポリペプチド鎖は、同じペプチド鎖上のVH及びVLドメインの分子内会合を可能にするには短すぎるリンカー(例えば、5つのアミノ酸からなるリンカー)によって連結されたVH及びVLドメインを含む。この構成は、ホモ二量体構造を形成するために、各ドメインを別のポリペプチド鎖上の相補的ドメインと対合させる。したがって、「トリアボディ」という用語は、3つのペプチド鎖を含む三価抗体を指し、これらの各々は、同じペプチド鎖内のVHドメイン及びVLドメインの分子内会合を可能にするために極めて短いリンカー(例えば、1~2アミノ酸からなるリンカー)によって連結された1つのVHドメイン及び1つのVLドメインを含む。それらの天然構造に折り畳むために、このように構成されるペプチドは典型的には、適切な折り畳みを可能にするために隣接するペプチド鎖のVH及びVLドメインを互いに空間的に近位に配置するように三量体化する(Holliger et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 90:6444-48,1993を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書で使用される場合、「二重可変ドメイン免疫グロブリン」(「DVD-Ig」)は、リンカーを介して2つのモノクローナル抗体の標的結合可変ドメインを組み合わせて、四価の二重標的化単剤を作製する抗体を指す。(Gu et al.,Meth.Enzymol.,502:25-41,2012、参照により本明細書に組み込まれる)。
本明細書で使用される場合、「内因性」という用語は、特定の生物(例えば、ヒト)または生物内の特定の位置(例えば、器官、組織、またはヒト細胞などの細胞)に天然に見出される分子(例えば、ポリペプチド、核酸、または補因子)を記載する。
本明細書で使用される場合、「外因性」という用語は、特定の生物(例えば、ヒト)または生物内の特定の位置(例えば、器官、組織、またはヒト細胞などの細胞)に天然に見出されない分子(例えば、ポリペプチド、核酸、または補因子)を記載する。外因性物質には、外部供給源から生物に、またはそこから抽出された培養物質に提供されるものが含まれる。
本明細書で使用される場合、「フレームワーク領域」または「FW領域」という用語は、CDRと隣接するアミノ酸残基を含む。FW領域残基は、とりわけ、例えば、ヒト抗体、げっ歯類由来抗体(例えば、マウス抗体)、ヒト化抗体、霊長類化抗体、キメラ抗体、抗体断片(例えば、Fab断片)、一本鎖抗体断片(例えば、scFv断片)、抗体ドメイン、及び二重特異性抗体に存在し得る。
本明細書で使用される場合、「ヘテロ特異性抗体」という用語は、少なくとも2つの異なる抗原に対する結合特異性を有するモノクローナル、好ましくはヒトまたはヒト化抗体を指す。従来、ヘテロ特異性抗体の組換え産生は、2つの免疫グロブリン重鎖-軽鎖対の共発現に基づき、2つの重鎖は異なる特異性を有する(Milstein et al.,Nature 305:537,1 983)。同様の手順が、例えば、WO93/08829、米国特許第6,210,668号、同第6,193,967号、同第6,132,992号、同第6,106,833号、同第6,060,285号、同第6,037,453号、同第6,010,902号、同第5,989,530号、同第5,959,084号、同第5,959,083号、同第5,932,448号、同第5,833,985号、同第5,821,333号、同第5,807,706号、同第5,643,759号、同第5,601,819号、同第5,582,996号、同第5,496,549号、同第4,676,980号、WO91/00360、WO92/00373、EP03089、Traunecker et al.,EMBO J.10:3655(1991)、Suresh et al.,Methods in Enzymology 121:210(1986)に開示され、参照により本明細書に組み込まれる。異種特異性抗体は、Klein et al.,mAbs 4(6):653-663,2012に記載されるように、多重特異性抗体における正しい鎖会合を強制するFc変異が含まれ得、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「ヒト抗体」という用語は、タンパク質の実質的に全ての部分(例えば、CDR、フレームワーク、CL、CHドメイン(例えば、CH1、CH2、CH3)、ヒンジ、(VL、VH))は、わずかな配列変化または変動のみを有するヒトにおいて実質的に非免疫原性である抗体を指す。ヒト抗体は、ヒト細胞において(例えば、組換え発現によって)、または機能的に再配列されたヒト免疫グロブリン(例えば、重鎖及び/または軽鎖)遺伝子を発現することができる非ヒト動物もしくは原核もしくは真核細胞によって産生され得る。さらに、ヒト抗体が一本鎖抗体である場合、それは天然ヒト抗体には見られないリンカーペプチドを含むことができる。例えば、Fvは、重鎖の可変領域と軽鎖の可変領域とを接続する、2~約8個のグリシンまたは他のアミノ酸残基などのリンカーペプチドを含むことができる。かかるリンカーペプチドは、ヒト起源であると見なされる。ヒト抗体は、ヒト免疫グロブリン配列に由来する抗体ライブラリを使用するファージディスプレイ方法を含む、当該技術分野で既知の様々な方法によって作製することができる。米国特許第4,444,887号及び同第4,716,111号、ならびにPCT公開第WO1998/46645号、同第WO1998/50433号、同第WO1998/24893号、同第WO1998/16654号、同第WO1996/34096号、同第WO1996/33735号、及び同第WO1991/10741号を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる。ヒト抗体は、機能的な内因性免疫グロブリンを発現することができないが、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現することができるトランスジェニックマウスを使用して産生することもできる。例えば、PCT公開第WO98/24893号、同第WO92/01047号、同第WO96/34096号、同第WO96/33735号、米国特許第5,413,923号、同第5,625,126号、同第5,633,425号、同第5,569,825号、同第5,661,016号、同第5,545,806号、同第5,814,318号、同第5,885,793号、同第5,916,771号、及び同第5,939,598号を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「ヒト化」抗体という用語は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小配列を含む、キメラ免疫グロブリン、免疫グロブリン鎖またはその断片(例えば、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2、または抗体の他の標的結合サブドメイン)である非ヒト(例えば、マウス)抗体の形態を指す。一般に、ヒト化抗体は、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的に全てを含み、CDR領域の全てまたは実質的に全てが、非ヒト免疫グロブリンの領域に対応するであろう。FR領域の全てまたは実質的に全てはまた、ヒト免疫グロブリン配列のものであり得る。ヒト化抗体はまた、免疫グロブリン定常領域(Fc)の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンコンセンサス配列の一部を含み得る。抗体ヒト化の方法は、当該技術分野で既知である。例えば、Riechmann et al.,Nature 332:323-7,1988、米国特許第5,530,101号、同第5,585,089号、同第5,693,761号、同第5,693,762号、及び同第6,180,370号、Queen et al、EP239400、PCT公開第WO91/09967号、米国特許第5,225,539号、EP592106、ならびにEP519596を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「モノクローナル抗体」という用語は、それが産生される方法ではなく、任意の真核、原核、またはファージクローンを含む単一のクローンに由来する抗体を指す。
本明細書で使用される場合、「多重特異性抗体」という用語は、2つ以上の標的抗原に対する親和性を示す抗体を指す。多重特異性抗体は、完全免疫グロブリン分子と同様の構造を有し得、Fc領域、例えばIgG Fc領域を含む。かかる構造は、これらに限定されないが、IgG-Fv、IgG-(scFv)2、DVD-Ig、(scFv)2-(scFv)2-Fc、及び(scFv)2-Fc-(scFv)2を含むことができる。IgG-(scFv)2の事例では、scFvは、重鎖または軽鎖のいずれかのN末端またはC末端のいずれかと結合することができる。例示的な多重特異性分子は、Kontermann,2012,mAbs 4(2):182-197、Yazaki et al.,2013,Protein Engineering,Design & Selection 26(3):1 87-1 93、及びGrote et al.,2012, in Proetzel & Ebersbach(eds.),Antibody Methods and Protocols,Methods in Molecular Biology vol.901,chapter 16:247-263により概説されており、参照により本明細書に組み込まれる。Fc領域を欠き、抗体または抗体断片を組み込むことができる例示的な多重特異性分子には、scFv二量体(ダイアボディ)、三量体(トリアボディ)、及び四量体(テトラボディ)、Fab二量体(接着ポリペプチドまたはタンパク質ドメインによる複合体)、ならびにFab三量体(化学的に複合される)が含まれ、Hudson and Souriau,2003,Nature Medicine 9:129-134に記載され、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「パーセント(%)配列同一性」という用語は、配列を整列させ、必要に応じてギャップを導入して最大パーセント配列同一性を達成した後の参照配列のアミノ酸(または核酸)残基と同一である候補配列のアミノ酸(または核酸)残基のパーセンテージを指す(例えば、ギャップは、最適な整列のために候補配列及び参照配列の一方または両方に導入され得、非相同配列は比較目的のために無視され得る)。パーセント配列同一性を決定する目的での整列は、例えば、BLAST、ALIGN、またはMegalign(ONASTAR)ソフトウェアなどの公的に利用可能なコンピュータソフトウェアを使用して、当技術分野の技術の範囲内である様々な方法で達成することができる。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大整列を達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、整列を測定するための適切なパラメータを決定することができる。例えば、候補配列と比較するために整列された参照配列は、候補配列が候補配列の全長または候補配列の連続するアミノ酸(または核酸)残基の選択部分にわたって50%~100%の配列同一性を示すことを示し得る。比較目的のために整列された候補配列の長さは、例えば、参照配列の長さの少なくとも30%、(例えば、30%、40、50%、60%、70%、80%、90%、または100%)であり得る。候補配列内の位置が、参照配列内の対応する位置と同じアミノ酸残基によって占有される場合、次いで、分子は、その位置で同一である。
本明細書で使用される場合、「霊長類化抗体」という用語は、霊長類由来抗体、ならびに非霊長類供給源の抗体からのCDR及び定常領域などの他の領域からのフレームワーク領域を含む抗体を指す。霊長類化抗体を産生する方法は、当該技術分野で既知である。例えば、米国特許第5,658,570号、同第5,681,722号、及び同第5,693,780号を参照されたく、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、ポリヌクレオチド断片との関連で「作動可能に連結された」という用語は、2つのポリヌクレオチド断片が連結され、2つのポリヌクレオチド断片によってコードされるアミノ酸配列がフレーム内に残存することを意味することが意図される。
本明細書で使用される場合、「制御性要素」などの用語は、抗体鎖遺伝子の転写または翻訳を制御するプロモーター、エンハンサー、及び他の発現制御要素(例えば、ポリアデニル化シグナル)を指す。かかる制御性配列は、例えば、Goeddel,Gene Expression Technology:Methods in Enzymology 185(Academic Press,San Diego,CA ,1990)に記載され、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「対象」及び「患者」という用語は、本明細書に記載の特定の疾患または状態(がんまたは感染症など)の治療を受ける生物を指す。対象及び患者の例としては、疾患または状態、例えば、がんなどの細胞増殖障害の治療を受けるヒトなどの哺乳動物が含まれる。
本明細書で使用される場合、「scFv」という用語は、抗体由来の重鎖及び軽鎖の可変ドメインが連結されて1つの鎖を形成した一本鎖Fv抗体を指す。scFv断片は、リンカーによって分離された抗体軽鎖(VL)(例えば、CDR-L1、CDR-L2、及び/またはCDR-L3)の可変領域及び抗体重鎖(VH)(例えば、CDR-H1、CDR-H2、及び/またはCDR-H3)の可変領域を含む単一のポリペプチド鎖を含む。ScFv断片のVL及びVH領域を連結するリンカーは、タンパク質生成アミノ酸からなるペプチドリンカーであり得る。代替的なリンカーは、scFv断片のタンパク質分解に対する耐性を増大させるために(例えば、D-アミノ酸を含むリンカー)、scFv断片の溶解性を増強するために(例えば、ポリエチレングリコール含有リンカーまたは反復グリシン及びセリン残基を含有するポリペプチドなどの親水性リンカー)、分子(例えば、分子内もしくは分子間ジスルフィド結合を形成するシステイン残基を含むリンカー)の生体物理的安定性を改善するために、またはscFv断片(例えば、グリコシル化部位を含有するリンカー)の免疫原性を減衰させるために使用することができる。scFv分子は、当該技術分野において既知であり、例えば、米国特許第5,892,019号、Flo et al.,(Gene 77:51,1989)、Bird et al.,(Science 242:423,1988)、Pantoliano et al.,(Biochemistry 30:10117,1991)、Milenic et al.,(Cancer Research 51:6363, 1991)、及びTakkinen et al.,(Protein Engineering 4:837,1991)に記載される。scFv分子のVL及びVHドメインは、1つ以上の抗体分子に由来し得る。また、本発明のscFv分子の可変領域は、それらが由来する抗体分子からのアミノ酸配列が異なるように修飾され得ることも、当業者には理解されよう。例えば、いくつかの実施形態では、アミノ酸残基における保存的置換または変化をもたらすヌクレオチドまたはアミノ酸置換が行われ得る(例えば、CDR及び/またはフレームワーク残基において)。代替的にまたは追加的に、CDRアミノ酸残基に変異を行い、当該技術分野で認識される技術を使用して抗原結合を最適化する。scFv断片は、例えば、WO2011/084714に記載され、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される場合、「特異的に結合する」という語句は、例えば、抗体またはその抗原結合断片によって特異的に認識されるタンパク質及び他の生物学的分子の異種集団における抗原の存在を決定する結合反応を指す。抗原と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片は、100nM未満のKDで抗原と結合し得る。例えば、抗原と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片は、最大100nM(例えば、1pM~100nM)のKDで抗原と結合し得る。特定の抗原もしくはそのエピトープとの特異的結合を示さない抗体またはその抗原結合断片は、その特定の抗原またはそのエピトープに対して100nM超(例えば、500nm、1μM、100μM、500μM、または1mM超)のKDを示し得る。特定のタンパク質または炭水化物と特異的に免疫反応性の抗体を選択するために、様々な免疫アッセイ形式が使用され得る。例えば、固相ELISAイムノアッセイは、タンパク質または炭水化物と特異的に免疫反応性の抗体を選択するために日常的に使用される。特定の免疫反応性を決定するために使用することができる免疫アッセイ形式及び条件の記載については、Harlow & Lane,Antibodies,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,New York(1988)、及びHarlow & Lane,Using Antibodies,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,New York(1999)を参照されたい。
本明細書で使用される場合、「トランスフェクション」という用語は、原核生物または真核生物の宿主細胞への外因性DNAの導入に一般的に使用される多種多様な技術、例えば、エレクトロポレーション、リポフェクション、リン酸カルシウム沈殿、DEAE-デキストラントランスフェクションなどのいずれかを指す。
本明細書で使用される場合、「治療する」または「治療」という用語は、がんなどの細胞増殖性障害の進行等の望ましくない生理学的変化または障害を予防または減速(軽減)させることが目的である療法的治療を指す。有益なまたは所望の臨床結果としては、限定されないが、症状の軽減、疾患の程度の減少、疾患の安定化(すなわち、悪化しない)状態、疾患進行の遅延または緩徐、疾患状態の改善または緩和、ならびに検出可能であるか検出不可能であるかにかかわらず、寛解(部分的または完全であるかにかかわらず)が含まれる。治療を必要としているものには、既にその状態もしくは障害を患っているもの、及びその状態もしくは障害を患いやすいもの、またはその状態もしくは障害が防止されるべきであるべきものが含まれる。
本明細書で使用される場合、「ベクター」という用語は、核酸ベクター、例えば、プラスミドなどのDNAベクター、RNAベクター、ウイルス、または他の好適なレプリコン(例えば、ウイルスベクター)を指す。外因性タンパク質をコードするポリヌクレオチドを原核細胞または真核細胞に送達するための様々なベクターが開発されている。かかる発現ベクターの例は、例えば、WO1994/1 1026に開示され、参照により本明細書に組み込まれる。本発明の発現ベクターは、タンパク質の発現及び/または哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)などの宿主細胞のゲノムへのこれらのポリヌクレオチド配列の組み込みに使用される1つ以上の追加の配列要素を含み得る。本明細書に記載の抗体及び抗体断片の発現に使用することができる例示的なベクターには、遺伝子転写を指示するプロモーター領域及びエンハンサー領域などの制御性配列を含むプラスミドが含まれる。ベクターは、標的遺伝子の翻訳速度を調節するか、または遺伝子転写から生じるmRNAの安定性もしくは核輸送を改善する核酸を含み得る。これらの配列要素は、発現ベクター上に担持される遺伝子の効率的な転写を誘導するために、例えば、5’及び3’非翻訳領域、内部リボソーム侵入部位(IRES)、ならびにポリアデニル化シグナル部位を含み得る。本明細書に記載のベクターはまた、かかるベクターを含む細胞を選択するためのマーカーをコードするポリヌクレオチドを含み得る。好適なマーカーの例には、アンピシリン、クロラムフェニコール、カナマイシン、またはノルセオトリシン(nourseothricin)等の抗生物質に対する耐性をコードする遺伝子が含まれる。
本明細書で使用される場合、「VH」という用語は、Fv、scFv、またはFabの重鎖を含む、抗体の免疫グロブリン重鎖の可変領域を指す。「VL」への言及は、Fv、scFv、dsFv、またはFabの軽鎖を含む免疫グロブリン軽鎖の可変領域を指す。抗体(Ab)及び免疫グロブリン(Ig)は、同じ構造特性を有する糖タンパク質である。抗体は、特定の標的に対する結合特異性を示すが、免疫グロブリンは、標的特異性を欠く抗体及び他の抗体様分子の両方を含む。天然抗体及び免疫グロブリンは、通常、2つの同一の軽(L)鎖及び2つの同一の重(H)鎖からなる、約150,000ダルトンのヘテロ四量体糖タンパク質である。天然抗体の各重鎖は、アミノ末端に可変ドメイン(VH)、続いていくつかの定常ドメインを有する。天然抗体の各軽鎖は、アミノ末端(VL)に可変ドメイン、及びカルボキシ末端に定常ドメインを有する。
3.2.遺伝子定義
本明細書で使用される場合、「B8R」は、ガンマインターフェロン(IFN-γ)受容体と相同性を有する分泌タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB8R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の非限定的な例は、UniProtKBデータベースエントリP21004に与えられ、以下に再現される:MRYIIILAVLFINSIHAKITSYKFESVNFDSKIEWTGDGLYNISLKNYGIKTWQTMYTNVPEGTYDISAFPKNDFVSFWVKFEQGDYKVEEYCTGLCVEVKIGPPTVTLTEYDDHINLYIEHPYATRGSKKIPIYKRGDMCDIYLLYTANFTFGDSEEPVTYDIDDYDCTSTGCSIDFATTEKVCVTAQGATEGFLEKITPWSSEVCLTPKKNVYTCAIRSKEDVPNFKDKMARVIKRKFNKQSQSYLTKFLGSTSNDVTTFLSMLNLTKYS(配列番号1)。
本明細書で使用される場合、「B8R」は、ガンマインターフェロン(IFN-γ)受容体と相同性を有する分泌タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB8R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の非限定的な例は、UniProtKBデータベースエントリP21004に与えられ、以下に再現される:MRYIIILAVLFINSIHAKITSYKFESVNFDSKIEWTGDGLYNISLKNYGIKTWQTMYTNVPEGTYDISAFPKNDFVSFWVKFEQGDYKVEEYCTGLCVEVKIGPPTVTLTEYDDHINLYIEHPYATRGSKKIPIYKRGDMCDIYLLYTANFTFGDSEEPVTYDIDDYDCTSTGCSIDFATTEKVCVTAQGATEGFLEKITPWSSEVCLTPKKNVYTCAIRSKEDVPNFKDKMARVIKRKFNKQSQSYLTKFLGSTSNDVTTFLSMLNLTKYS(配列番号1)。
「B8R」という用語は、上記に列挙されるタンパク質の断片もしくはバリアント、または別のワクシニアウイルス株由来の相同遺伝子の断片もしくはバリアントも含み得る。バリアントには、本明細書に開示される配列との85%以上の同一性を有するこれらの配列が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用される場合、「B14R」は、オルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB14R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP20842に与えられ、以下に再現される:
MNHCLLAISAVYFKAKWLTPFEKEFTSDYPFYVSPTEMVDVSMMSMYGELFNHASVKESFGNFSIIELPYVGDTSMMVILPDKIDGLESIEQNLTDTNFKKWCNSLDAMFIDVHIPKFKVTGSYNLVDTLVKSGLTEVFGSTGDYSNMCNLDVSVDAMIHKTYIDVNEEYTEAAAATCALVSDCASTITNEFCVDHPFIYVIRHVDGKILFVGRYCSPTTNC(配列番号2)。
MNHCLLAISAVYFKAKWLTPFEKEFTSDYPFYVSPTEMVDVSMMSMYGELFNHASVKESFGNFSIIELPYVGDTSMMVILPDKIDGLESIEQNLTDTNFKKWCNSLDAMFIDVHIPKFKVTGSYNLVDTLVKSGLTEVFGSTGDYSNMCNLDVSVDAMIHKTYIDVNEEYTEAAAATCALVSDCASTITNEFCVDHPFIYVIRHVDGKILFVGRYCSPTTNC(配列番号2)。
本明細書で使用される場合、「B15R」は、オルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB15R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21089に与えられ、以下に再現される:
MTANFSTHVFSPQHCGCDRLTSIDDVKQCLTEYIYWSSYAYRNRQCAGQLYSTLLSFRDDAELVFIDIRELVKNMPWDDVKDCTEIIRCYIPDEQKTIREISAIIGLCAYAATYWGGEDHPTSNSLNALFVMLEMLNYVDYNIIFRRMN(配列番号3)。
MTANFSTHVFSPQHCGCDRLTSIDDVKQCLTEYIYWSSYAYRNRQCAGQLYSTLLSFRDDAELVFIDIRELVKNMPWDDVKDCTEIIRCYIPDEQKTIREISAIIGLCAYAATYWGGEDHPTSNSLNALFVMLEMLNYVDYNIIFRRMN(配列番号3)。
本明細書で使用される場合、「B16R」は、IL-1-ベータ阻害剤をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB16R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21116に与えられ、以下に再現される:
MSILPVIFLP IFFYSSFVQT FNASECIDKG(配列番号4)。
MSILPVIFLP IFFYSSFVQT FNASECIDKG(配列番号4)。
本明細書で使用される場合、「B17L」は、オルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB17L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21075に与えられ、以下に再現される:
MSRKFMQVYEYDREQYLDEFIEDRYNDSFITSPEYYSAEKYMCRYTTLNHNCVNVRRCALDSKLLHDIITNCKIYNNIELVRATKFVYYLDLIKCNWVSKVGDSVLYPVIFITHTSTRNLDKVSVKTYKGVKVKKLNRCADHAIVINPFVKFKLTLPNKTSHAKVLVTFCKLRTDITPVEAPLPGNVLVYTFPDINKRIPGYIHVNIEGCIDGMIYINSSKFACVLKLHRSMYRIPPFPIDICSCCSQYTNDDIEIPIHDLIKDVAIFKNKETVYYLKLNNKTIARFTYFNNIDTAITQEHEYVKIALGIVCKLMINNMHSIVGVNHSNTFVNCLLEDNV(配列番号5)。
MSRKFMQVYEYDREQYLDEFIEDRYNDSFITSPEYYSAEKYMCRYTTLNHNCVNVRRCALDSKLLHDIITNCKIYNNIELVRATKFVYYLDLIKCNWVSKVGDSVLYPVIFITHTSTRNLDKVSVKTYKGVKVKKLNRCADHAIVINPFVKFKLTLPNKTSHAKVLVTFCKLRTDITPVEAPLPGNVLVYTFPDINKRIPGYIHVNIEGCIDGMIYINSSKFACVLKLHRSMYRIPPFPIDICSCCSQYTNDDIEIPIHDLIKDVAIFKNKETVYYLKLNNKTIARFTYFNNIDTAITQEHEYVKIALGIVCKLMINNMHSIVGVNHSNTFVNCLLEDNV(配列番号5)。
本明細書で使用される場合、「B18R」は、アンキリン反復タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB18R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21076に与えられ、以下に再現される:
MSRRLIYVLNINRKSTHKIQENEIYTYFSHCNIDHTSTELDFVVKNYDLNRRQHVTGYTALHCYLYNNYFTNDVLKILLNHDVNVTMKTSSGRMPVYILLTRCCNISHDVVIDMIDKDKNHLSHRDYSNLLLEYIKSRYMLLKEEDIDENIVSTLLDKGIDPNFKQDGYTALHYYYLCLAHVYKPGECRKPITIKKAKRIISLFIQHGANLNALDNCGNTPFHLYLSIEMCNNIHMTKMLLTFNPNFKICNNHGLTPILCYITSDYIQHDILVMLIHHYETNVGEMPIDERRMIVFEFIKTYSTRPADSITYLMNRFKNINIYTRYEGKTLLHVACEYNNTQVIDYLIRINGDINALTDNNKHATQLIIDNKENSPYTINCLLYILRYIVDKNVIRSLVDQLPSLPIFDIKSFEKFISYCILLDDTFYDRHVKNRDSKTYRYAFSKYMSFDKYDGIITKCHDETMLLKLSTVLDTTLYAVLRCHNSRKLRRYLTELKKYNNDKSFKIYSNIMNERYLNVYYKDMYVSKVYDKLFPVFTDKNCLLTLLPSEIIYEILYMLTINDLYNISYPPTKV(配列番号6)。
MSRRLIYVLNINRKSTHKIQENEIYTYFSHCNIDHTSTELDFVVKNYDLNRRQHVTGYTALHCYLYNNYFTNDVLKILLNHDVNVTMKTSSGRMPVYILLTRCCNISHDVVIDMIDKDKNHLSHRDYSNLLLEYIKSRYMLLKEEDIDENIVSTLLDKGIDPNFKQDGYTALHYYYLCLAHVYKPGECRKPITIKKAKRIISLFIQHGANLNALDNCGNTPFHLYLSIEMCNNIHMTKMLLTFNPNFKICNNHGLTPILCYITSDYIQHDILVMLIHHYETNVGEMPIDERRMIVFEFIKTYSTRPADSITYLMNRFKNINIYTRYEGKTLLHVACEYNNTQVIDYLIRINGDINALTDNNKHATQLIIDNKENSPYTINCLLYILRYIVDKNVIRSLVDQLPSLPIFDIKSFEKFISYCILLDDTFYDRHVKNRDSKTYRYAFSKYMSFDKYDGIITKCHDETMLLKLSTVLDTTLYAVLRCHNSRKLRRYLTELKKYNNDKSFKIYSNIMNERYLNVYYKDMYVSKVYDKLFPVFTDKNCLLTLLPSEIIYEILYMLTINDLYNISYPPTKV(配列番号6)。
本明細書で使用される場合、「B19R」は、IFN-アルファ-ベータ受容体様分泌糖タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB19R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21077に与えられ、以下に再現される:
MTMKMMVHIYFVSLSLLLLLFHSYAIDIENEITEFFNKMRDTLPAKDSKWLNPACMFGGTMNDMATLGEPFSAKCPPIEDSLLSHRYKDYVVKWERLEKNRRRQVSNKRVKHGDLWIANYTSKFSNRRYLCTVTTKNGDCVQGIVRSHIKKPPSCIPKTYELGTHDKYGIDLYCGILYAKHYNNITWYKDNKEINIDDIKYSQTGKELIIHNPELEDSGRYDCYVHYDDVRIKNDIVVSRCKILTVIPSQDHRFKLILDPKINVTIGEPANITCTAVSTSLLIDDVLIEWENPSGWLIGFDFDVYSVLTSRGGITEATLYFENVTEEYIGNTYKCRGHNYYFEKTLTTTVVLE(配列番号7)。
MTMKMMVHIYFVSLSLLLLLFHSYAIDIENEITEFFNKMRDTLPAKDSKWLNPACMFGGTMNDMATLGEPFSAKCPPIEDSLLSHRYKDYVVKWERLEKNRRRQVSNKRVKHGDLWIANYTSKFSNRRYLCTVTTKNGDCVQGIVRSHIKKPPSCIPKTYELGTHDKYGIDLYCGILYAKHYNNITWYKDNKEINIDDIKYSQTGKELIIHNPELEDSGRYDCYVHYDDVRIKNDIVVSRCKILTVIPSQDHRFKLILDPKINVTIGEPANITCTAVSTSLLIDDVLIEWENPSGWLIGFDFDVYSVLTSRGGITEATLYFENVTEEYIGNTYKCRGHNYYFEKTLTTTVVLE(配列番号7)。
本明細書で使用される場合、「B20R」は、アンキリン反復タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なB20R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21078に与えられ、以下に再現される:MDEDTRLSRYLYLTDREHINVDSIKQLCKISDPNACYRCGCTALHEYFYNYRSVNGKYKYRYNGYYQYYSSSDYENYNEYYYDDYDRTGMNSESDSESDNISIKTEYENEYEFYDETQDQSTQHNDL(配列番号8)。
本明細書で使用される場合、「C1L」は、オルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なC1L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21036に与えられ、以下に再現される:
MVKNNKISNSCRMIMSTNPNNILMRHLKNLTDDEFKCIIHRSSDFLYLSDSDYTSITKET
LVSEIVEEYPDDCNKILAIIFLVLDKDIDVDIETKLKPKPAVRFAILDKMTEDIKLTDLV
RHYFRYIEQDIPLGPLFKKIDSYRTRAINKYSKELGLATEYFNKYGHLMFYTLPIPYNRF
FCRNSIGFLAVLSPTIGHVKAFYKFIEYVSIDDRRKFKKELMSK(配列番号9)。
MVKNNKISNSCRMIMSTNPNNILMRHLKNLTDDEFKCIIHRSSDFLYLSDSDYTSITKET
LVSEIVEEYPDDCNKILAIIFLVLDKDIDVDIETKLKPKPAVRFAILDKMTEDIKLTDLV
RHYFRYIEQDIPLGPLFKKIDSYRTRAINKYSKELGLATEYFNKYGHLMFYTLPIPYNRF
FCRNSIGFLAVLSPTIGHVKAFYKFIEYVSIDDRRKFKKELMSK(配列番号9)。
本明細書で使用される場合、「C2L」は、細胞外マトリックスへのカルシウム非依存性接着に影響を与えるケルチ様タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なC2L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21037に与えられ、以下に再現される:
MESVIFSINGEIIQVNKEIITASPYNFFKRIQDHHLKDEAIILNGINYHAFESLLDYMRWKKINITINNVEMILVAAVIIDVPPVVDLCVKTMIHNINSTNCIRMFNFSKRYGIKKLYNASMSEIINNITAVTSDPEFGKLSKDELTTILSHEDVNVNHEDVTAMILLKWIHKNPNDVDIINILHPKFMTNTMRNAISLLGLTISKSTKPVTRNGIKHNIVVIKNSDYISTITHYSPRTEYWTIVGNTDRQFYNANVLHNCLYIIGGMINNRHVYSVSRVDLETKKWKTVTNMSSLKSEVSTCVNDGKLYVIGGLEFSISTGVAEYLKHGTSKWIRLPNLITPRYSGASVFVNDDIYVMGGVYTTYEKYVVLNDVECFTKNRWIKKSPMPRHHSIVYAVEYDGDIYVITGITHETRNYLYKYIVKEDKWIELYMYFNHVGKMFVCSCGDYILIIADAKYEYYPKSNTWNLFDMSTRNIEYYDMFTKDETPKCNVTHKSLPSFLSNCEKQFLQ(配列番号10)。
MESVIFSINGEIIQVNKEIITASPYNFFKRIQDHHLKDEAIILNGINYHAFESLLDYMRWKKINITINNVEMILVAAVIIDVPPVVDLCVKTMIHNINSTNCIRMFNFSKRYGIKKLYNASMSEIINNITAVTSDPEFGKLSKDELTTILSHEDVNVNHEDVTAMILLKWIHKNPNDVDIINILHPKFMTNTMRNAISLLGLTISKSTKPVTRNGIKHNIVVIKNSDYISTITHYSPRTEYWTIVGNTDRQFYNANVLHNCLYIIGGMINNRHVYSVSRVDLETKKWKTVTNMSSLKSEVSTCVNDGKLYVIGGLEFSISTGVAEYLKHGTSKWIRLPNLITPRYSGASVFVNDDIYVMGGVYTTYEKYVVLNDVECFTKNRWIKKSPMPRHHSIVYAVEYDGDIYVITGITHETRNYLYKYIVKEDKWIELYMYFNHVGKMFVCSCGDYILIIADAKYEYYPKSNTWNLFDMSTRNIEYYDMFTKDETPKCNVTHKSLPSFLSNCEKQFLQ(配列番号10)。
本明細書で使用される場合、「F1L」は、カスパーゼ-9阻害剤をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なF1L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP68450に与えられ、以下に再現される:
MLSMFMCNNIVDYVDDIDNGIVQDIEDEASNNVDHDYVYPLPENMVYRFDKSTNILDYLSTERDHVMMAVRYYMSKQRLDDLYRQLPTKTRSYIDIINIYCDKVSNDYNRDMNIMYDMASTKSFTVYDINNEVNTILMDNKGLGVRLATISFITELGRRCMNPVKTIKMFTLLSHTICDDCFVDYITDISPPDNTIPNTSTREYLKLIGITAIMFATYKTLKYMIG(配列番号11)。
MLSMFMCNNIVDYVDDIDNGIVQDIEDEASNNVDHDYVYPLPENMVYRFDKSTNILDYLSTERDHVMMAVRYYMSKQRLDDLYRQLPTKTRSYIDIINIYCDKVSNDYNRDMNIMYDMASTKSFTVYDINNEVNTILMDNKGLGVRLATISFITELGRRCMNPVKTIKMFTLLSHTICDDCFVDYITDISPPDNTIPNTSTREYLKLIGITAIMFATYKTLKYMIG(配列番号11)。
本明細書で使用される場合、「F2L」は、デオキシウリジントリホスファターゼ(dUTPase)をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なF2L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP68634に与えられ、以下に再現される:
MFNMNINSPVRFVKETNRAKSPTRQSPGAAGYDLYSAYDYTIPPGERQLIKTDISMSMPKICYGRIAPRSGLSLKGIDIGGGVIDEDYRGNIGVILINNGKCTFNVNTGDRIAQLIYQRIYYPELEEVQSLDSTNRGDQGFGSTGLR(配列番号12)。
MFNMNINSPVRFVKETNRAKSPTRQSPGAAGYDLYSAYDYTIPPGERQLIKTDISMSMPKICYGRIAPRSGLSLKGIDIGGGVIDEDYRGNIGVILINNGKCTFNVNTGDRIAQLIYQRIYYPELEEVQSLDSTNRGDQGFGSTGLR(配列番号12)。
本明細書で使用される場合、「F3L」は、自然免疫応答修飾因子及び病原性因子であるケルチ様タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なF3L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21013に与えられ、以下に再現される:
MPIFVNTVYCKNILALSMTKKFKTIIDAIGGNIIVNSTILKKLSPYFRTHLRQKYTKNKDPVTRVCLDLDIHSLTSIVIYSYTGKVYIDSHNVVNLLRASILTSVEFIIYTCINFILRDFRKEYCVECYMMGIEYGLSNLLCHTKNFIAKHFLELEDDIIDNFDYLSMKLILESDELNVPDEDYVVDFVIKWYIKRRNKLGNLLLLIKNVIRSNYLSPRGINNVKWILDCTKIFHCDKQPRKSYKYPFIEYPMNMDQIIDIFHMCTSTHVGEVVYLIGGWMNNEIHNNAIAVNYISNNWIPIPPMNSPRLYATGIPANNKLYVVGGLPNPTSVERWFHGDAAWVNMPSLLKPRCNPAVASINNVIYVMGGHSETDTTTEYLLPNHDQWQFGPSTYYPHYKSCALVFGRRLFLVGRNAEFYCESSNTWTLIDDPIYPRDNPELIIVDNKLLLIGGFYRGSYIDTIEVYNHHTYSWNIWDGK(配列番号13)。
MPIFVNTVYCKNILALSMTKKFKTIIDAIGGNIIVNSTILKKLSPYFRTHLRQKYTKNKDPVTRVCLDLDIHSLTSIVIYSYTGKVYIDSHNVVNLLRASILTSVEFIIYTCINFILRDFRKEYCVECYMMGIEYGLSNLLCHTKNFIAKHFLELEDDIIDNFDYLSMKLILESDELNVPDEDYVVDFVIKWYIKRRNKLGNLLLLIKNVIRSNYLSPRGINNVKWILDCTKIFHCDKQPRKSYKYPFIEYPMNMDQIIDIFHMCTSTHVGEVVYLIGGWMNNEIHNNAIAVNYISNNWIPIPPMNSPRLYATGIPANNKLYVVGGLPNPTSVERWFHGDAAWVNMPSLLKPRCNPAVASINNVIYVMGGHSETDTTTEYLLPNHDQWQFGPSTYYPHYKSCALVFGRRLFLVGRNAEFYCESSNTWTLIDDPIYPRDNPELIIVDNKLLLIGGFYRGSYIDTIEVYNHHTYSWNIWDGK(配列番号13)。
本明細書で使用される場合、「K1L」は、NF-κB阻害剤をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なK1L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP20632に与えられ、以下に再現される:
MDLSRINTWKSKQLKSFLSSKDTFKADVHGHSALYYAIADNNVRLVCTLLNAGALKNLLENEFPLHQAATLEDTKIVKILLFSGMDDSQFDDKGNTALYYAVDSGNMQTVKLFVKKNWRLMFYGKTGWKTSFYHAVMLNDVSIVSYFLSEIPSTFDLAILLSCIHTTIKNGHVDMMILLLDYMTSTNTNNSLLFIPDIKLAIDNKDIEMLQALFKYDINIYSVNLENVLLDDAEITKMIIEKHVEYKSDSYTKDLDIVKNNKLDEIISKNKELRLMYVNCVKKN(配列番号14)。
MDLSRINTWKSKQLKSFLSSKDTFKADVHGHSALYYAIADNNVRLVCTLLNAGALKNLLENEFPLHQAATLEDTKIVKILLFSGMDDSQFDDKGNTALYYAVDSGNMQTVKLFVKKNWRLMFYGKTGWKTSFYHAVMLNDVSIVSYFLSEIPSTFDLAILLSCIHTTIKNGHVDMMILLLDYMTSTNTNNSLLFIPDIKLAIDNKDIEMLQALFKYDINIYSVNLENVLLDDAEITKMIIEKHVEYKSDSYTKDLDIVKNNKLDEIISKNKELRLMYVNCVKKN(配列番号14)。
本明細書で使用される場合、「K2L」は、細胞融合を防止するセリンプロテアーゼ阻害剤をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なK2L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP20532に与えられ、以下に再現される:
MIALLILSLTCSVSTYRLQGFTNAGIVAYKNIQDDNIVFSPFGYSFSMFMSLLPASGNTRIELLKTMDLRKRDLGPAFTELISGLAKLKTSKYTYTDLTYQSFVDNTVCIKPLYYQQYHRFGLYRLNFRRDAVNKINSIVERRSGMSNVVDSNMLDNNTLWAIINTIYFKGTWQYPFDITKTRNASFTNKYGTKTVPMMNVVTKLQGNTITIDDEEYDMVRLPYKDANISMYLAIGDNMTHFTDSITAAKLDYWSFQLGNKVYNLKLPKFSIENKRDIKSIAEMMAPSMFNPDNASFKHMTRDPLYIYKMFQNAKIDVDEQGTVAEASTIMVATARSSPEKLEFNTPFVFIIRHDITGFILFMGKVESP(配列番号15)。
MIALLILSLTCSVSTYRLQGFTNAGIVAYKNIQDDNIVFSPFGYSFSMFMSLLPASGNTRIELLKTMDLRKRDLGPAFTELISGLAKLKTSKYTYTDLTYQSFVDNTVCIKPLYYQQYHRFGLYRLNFRRDAVNKINSIVERRSGMSNVVDSNMLDNNTLWAIINTIYFKGTWQYPFDITKTRNASFTNKYGTKTVPMMNVVTKLQGNTITIDDEEYDMVRLPYKDANISMYLAIGDNMTHFTDSITAAKLDYWSFQLGNKVYNLKLPKFSIENKRDIKSIAEMMAPSMFNPDNASFKHMTRDPLYIYKMFQNAKIDVDEQGTVAEASTIMVATARSSPEKLEFNTPFVFIIRHDITGFILFMGKVESP(配列番号15)。
本明細書で使用される場合、「K3L」は、PKR阻害剤をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なK3L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP20639に与えられ、以下に再現される:
MLAFCYSLPNAGDVIKGRVYEKDYALYIYLFDYPHSEAILAESVKMHMDRYVEYRDKLVGKTVKVKVIRVDYTKGYIDVNYKRMCRHQ(配列番号16)。
MLAFCYSLPNAGDVIKGRVYEKDYALYIYLFDYPHSEAILAESVKMHMDRYVEYRDKLVGKTVKVKVIRVDYTKGYIDVNYKRMCRHQ(配列番号16)。
本明細書で使用される場合、「K4L」は、DNA修飾ヌクレアーゼ(例えば、DNAニッキング酵素)をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なK4L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP20537に与えられ、以下に再現される:
MNPDNTIAVITETIPIGMQFDKVYLSTFNMWREILSNTTKTLDISSFYWSLSDEVGTNFGTIILNEIVQLPKRGVRVRVAVNKSNKPLKDVERLQMAGVEVRYIDITNILGGVLHTKFWISDNTHIYLGSANMDWRSLTQVKELGIAIFNNRNLAADLTQIFEVYWYLGVNNLPYNWKNFYPSYYNTDHPLSINVSGVPHSVFIASAPQQLCTMERTNDLTALLSCIRNASKFVYVSVMNFIPIIYSKAGKILFWPYIEDELRRSAIDRQVSVKLLISCWQRSSFIMRNFLRSIAMLKSKNIDIEVKLFIVPDADPPIPYSRVNHAKYMVTDKTAYIGTSNWTGNYFTDTCGASINITPDDGLGLRQQLEDIFMRDWNSKYSYELYDTSPTKRCKLLKNMKQCTNDIYCDEIQPEKEIPEYSLE(配列番号17)。
MNPDNTIAVITETIPIGMQFDKVYLSTFNMWREILSNTTKTLDISSFYWSLSDEVGTNFGTIILNEIVQLPKRGVRVRVAVNKSNKPLKDVERLQMAGVEVRYIDITNILGGVLHTKFWISDNTHIYLGSANMDWRSLTQVKELGIAIFNNRNLAADLTQIFEVYWYLGVNNLPYNWKNFYPSYYNTDHPLSINVSGVPHSVFIASAPQQLCTMERTNDLTALLSCIRNASKFVYVSVMNFIPIIYSKAGKILFWPYIEDELRRSAIDRQVSVKLLISCWQRSSFIMRNFLRSIAMLKSKNIDIEVKLFIVPDADPPIPYSRVNHAKYMVTDKTAYIGTSNWTGNYFTDTCGASINITPDDGLGLRQQLEDIFMRDWNSKYSYELYDTSPTKRCKLLKNMKQCTNDIYCDEIQPEKEIPEYSLE(配列番号17)。
本明細書で使用される場合、「K5L」は、推定モノグリセリドリパーゼをコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なK5L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21084に与えられ、以下に再現される:
MGATISILASYDNPNLFTAMILMSPLVNADAVSRLNLLAAKLMGTITPNAPVGKLCPESVSRDMDKVYKYQYDPLINHEKIKAGFASQVLKATNKVRKIISKINTPRLSYSREQTMRLVMFQVHIISCNMQIVIEK(配列番号18)。
MGATISILASYDNPNLFTAMILMSPLVNADAVSRLNLLAAKLMGTITPNAPVGKLCPESVSRDMDKVYKYQYDPLINHEKIKAGFASQVLKATNKVRKIISKINTPRLSYSREQTMRLVMFQVHIISCNMQIVIEK(配列番号18)。
本明細書で使用される場合、「K6L」は、推定モノグリセリドリパーゼをコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なK6L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP68465に与えられ、以下に再現される:
MSANCMFNLDNDYIYWKPITYPKALVFISHGAGKHSGRYDELAENISSLGILVFSHDHIGHGRSNGEKMMIDDFGTARGNY(配列番号19)。
MSANCMFNLDNDYIYWKPITYPKALVFISHGAGKHSGRYDELAENISSLGILVFSHDHIGHGRSNGEKMMIDDFGTARGNY(配列番号19)。
本明細書で使用される場合、「K7R」は、NF-κB及びIRF3の阻害剤をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なK7R遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP68467に与えられ、以下に再現される:
MATKLDYEDAVFYFVDDDKICSRDSIIDLIDEYITWRNHVIVFNKDITSCGRLYKELMKFDDVAIRYYGIDKINEIVEAMSEGDHYINFTKVHDQESLFATIGICAKITEHWGYKKISESRFQSLGNITDLMTDDNINILILFLEKKLN(配列番号20)。
MATKLDYEDAVFYFVDDDKICSRDSIIDLIDEYITWRNHVIVFNKDITSCGRLYKELMKFDDVAIRYYGIDKINEIVEAMSEGDHYINFTKVHDQESLFATIGICAKITEHWGYKKISESRFQSLGNITDLMTDDNINILILFLEKKLN(配列番号20)。
本明細書で使用される場合、「M1L」は、アンキリン反復タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なM1L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP20640に与えられ、以下に再現される:
MIFVIESKLLQIYRNRNRNINFYTTMDNIMSAEYYLSLYAKYNSKNLDVFRNMLQAIEPSGNNYHILHAYCGIKGLDERFVEELLHRGYSPNETDDDGNYPLHIASKINNNRIVAMLLTHGADPNACDKHNKTPLYYLSGTDDEVIERINLLVQYGAKINNSVDEEGCGPLLACTDPSERVFKKIMSIGFEARIVDKFGKNHIHRHLMSDNPKASTISWMMKLGISPSKPDHDGNTPLHIVCSKTVKNVDIIDLLLPSTDVNKQNKFGDSPLTLLIKTLSPAHLINKLLSTSNVITDQTVNICIFYDRDDVLEIINDKGKQYDSTDFKMAVEVGSIRCVKYLLDNDIICEDAMYYAVLSEYETMVDYLLFNHFSVDSVVNGHTCMSECVRLNNPVILSKLMLHNPTSETMYLTMKAIEKDKLDKSIIIPFIAYFVLMHPDFCKNRRYFTSYKRFVTDYVHEGVSYEVFDDYF(配列番号21)。
MIFVIESKLLQIYRNRNRNINFYTTMDNIMSAEYYLSLYAKYNSKNLDVFRNMLQAIEPSGNNYHILHAYCGIKGLDERFVEELLHRGYSPNETDDDGNYPLHIASKINNNRIVAMLLTHGADPNACDKHNKTPLYYLSGTDDEVIERINLLVQYGAKINNSVDEEGCGPLLACTDPSERVFKKIMSIGFEARIVDKFGKNHIHRHLMSDNPKASTISWMMKLGISPSKPDHDGNTPLHIVCSKTVKNVDIIDLLLPSTDVNKQNKFGDSPLTLLIKTLSPAHLINKLLSTSNVITDQTVNICIFYDRDDVLEIINDKGKQYDSTDFKMAVEVGSIRCVKYLLDNDIICEDAMYYAVLSEYETMVDYLLFNHFSVDSVVNGHTCMSECVRLNNPVILSKLMLHNPTSETMYLTMKAIEKDKLDKSIIIPFIAYFVLMHPDFCKNRRYFTSYKRFVTDYVHEGVSYEVFDDYF(配列番号21)。
本明細書で使用される場合、「M2L」は、NF-κB及びアポトーシスの阻害剤をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なM2L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリQ1PJ18に与えられ、以下に再現される:
MVYKLVLLFCIASLGYSVEYKNTICPPRQDYRYWYFAAELTIGVNYDINSTIIGECHMSESYIDRNANIVLTGYGLEINMTIMDTDQRFVAAAEGVGKDNKLSVLLFTTQRLDKVHHNISVTITCMEMNCGTTKYDSDLPESIHKSSSCDITINGSCVTCVNLETDPTKINPHYLHPKDKYLYHNSEYGMRGSYGVTFIDELNQCLLDIKELSYDICYRE(配列番号22)。
MVYKLVLLFCIASLGYSVEYKNTICPPRQDYRYWYFAAELTIGVNYDINSTIIGECHMSESYIDRNANIVLTGYGLEINMTIMDTDQRFVAAAEGVGKDNKLSVLLFTTQRLDKVHHNISVTITCMEMNCGTTKYDSDLPESIHKSSSCDITINGSCVTCVNLETDPTKINPHYLHPKDKYLYHNSEYGMRGSYGVTFIDELNQCLLDIKELSYDICYRE(配列番号22)。
本明細書で使用される場合、「N1L」は、NF-κB及びアポトーシスを阻害するBCL-2様タンパク質をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なN1L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP21054に与えられ、以下に再現される:
MRTLLIRYILWRNDNDQTYYNDDFKKLMLLDELVDDGDVCTLIKNMRMTLSDGPLLDRLNQPVNNIEDAKRMIAISAKVARDIGERSEIRWEESFTILFRMIETYFDDLMIDLYGEK(配列番号23)。
MRTLLIRYILWRNDNDQTYYNDDFKKLMLLDELVDDGDVCTLIKNMRMTLSDGPLLDRLNQPVNNIEDAKRMIAISAKVARDIGERSEIRWEESFTILFRMIETYFDDLMIDLYGEK(配列番号23)。
本明細書で使用される場合、「N2L」は、IRF3の阻害剤をコードする遺伝子などのオルソポックスウイルス(例えば、ワクシニア、例えば、Copenhagen)遺伝子を指す。ワクシニアウイルスのCopenhagen株における例示的なN2L遺伝子によってコードされるタンパク質配列の例は、UniProtKBデータベースエントリP20641に与えられ、以下に再現される:
MTSSAMDNNEPKVLEMVYDATILPEGSSMDPNIMDCINRHINMCIQRTYSSSIIAILNRFLTMNKDELNNTQCHIIKEFMTYEQMAIDHYGEYVNAILYQIRKRPNQHHTIDLFKKIKRTPYDTFKVDPVEFVKKVIGFVSILNKYKPVYSYVLYENVLYDEFKCFINYVETKYF(配列番号26)。
MTSSAMDNNEPKVLEMVYDATILPEGSSMDPNIMDCINRHINMCIQRTYSSSIIAILNRFLTMNKDELNNTQCHIIKEFMTYEQMAIDHYGEYVNAILYQIRKRPNQHHTIDLFKKIKRTPYDTFKVDPVEFVKKVIGFVSILNKYKPVYSYVLYENVLYDEFKCFINYVETKYF(配列番号26)。
本明細書に記載の遺伝子のコード配列(CDS)の例示的なCopenhagen株ヌクレオチド配列は、以下の表42に提供される。例示的な野生型Copenhagen株ワクシニアウイルスゲノムのヌクレオチド配列も、以下の表42に提供される。別の例示的な野生型Copenhagen株ワクシニアウイルスゲノムは、配列番号590(表42に提供される)であるが、表46に特定される1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、またはすべてのヌクレオチド多型を伴う。特定の実施形態では、本明細書に記載の遺伝子のCDSは、表46に特定される1、2、3以上のヌクレオチド多型を除いて、表42に提供されるヌクレオチド配列と同一のヌクレオチド配列を有する。
4.図面の簡単な説明
オルソポックスウイルスウイルス株を含む59個のポックスウイルス株の系統発生分析を示す。
異なる腫瘍型における5個のワクチンウイルスを継代した後の異なるウイルス株の存在量を示す。
様々な異なる患者腫瘍コアにおいて複製するワクシニア野生型株の能力を示す。
異なるワクシニア野生型株のプラークサイズ測定値を示す。
5p欠失(CopMD5p)及び3p欠失(CopMD3p)のゲノム構造を示す。CopMD5p及びCopMD3pの両方を交差させてCopMD5p3pを生成した。
様々な用量でのCopenhagenまたはCopMD5p3pのいずれかによる感染後のがん細胞死を示すヒートマップを示す。
4つの異なるがん細胞株におけるCopenhagen及びCopMD5p3p複製の成長曲線を示す。
Copenhagen及びCopMD5p3pが、力価測定によって示されるように、患者のエクスビボ試料で複製する能力を示す。
修飾CopMD5p3pウイルスが、親ウイルスとは異なるプラークを形成することを示す。CopMD5p3pプラークは中央ではるかに鮮明であり、目に見えるシンシチウム(細胞融合)を伴う。
CopMD5p3pが786-O細胞においてシンシチウム(細胞融合)を誘導することを示す。
CopMD5p3pが、Copenhagen野生型と同様に腫瘍成長を制御することができるが、体重減少を引き起こさないことを示す。
チミジンキナーゼの腫瘍溶解性ノックアウトを保有する他の2つのワクシニア株(Copenhagen及びWyeth)と比較した場合、CopMD5p3pがポックス病変形成を引き起こさないことを示す。
ヌードCD-1マウスにおける全身投与後のワクシニアのIVIS生物分布を示す。CopMD5p3p(TK KO)をコードするルシフェラーゼは、腫瘍特異的であり、標的外の組織において複製しない。
全身投与後のワクシニアの生体分布を示す。CopMD5p3pは、腫瘍内の他の腫瘍溶解性ワクチンと同様に複製されるが、標的外組織/器官からの複製は少ない。
ヒトPBMCにおけるワクシニアの免疫原性を示す。ヒト自然免疫細胞活性化を誘導するCopMD5p3pの能力は、野生型Copenhagenの能力よりも強力である。
マウス脾細胞におけるワクシニアの免疫原性を示す。マウス自然免疫細胞活性化を誘導するCopMD5p3pの能力は、Copenhagenの能力よりも強力である。
ヒト細胞におけるワクシニアの免疫原性を示す。NF-kB免疫転写因子を活性化するCopMD5p3pの能力は、CopenhagenまたはVVddよりも強力であるが、MG-1と同様である。
侵襲性黒色腫モデル(C57BL6マウスにおけるB16-F10同系黒色腫モデル)において、免疫チェックポイント阻害剤抗CTLA-4抗体との相乗効果を示す。インビボでの有効性は、ワクシニア及び免疫チェックポイント阻害剤抗CTLA-4抗体で処置した免疫適格マウスモデルにおける生存によって測定した。
免疫チェックポイント阻害剤抗CTLA-4抗体との相乗効果を示す。インビボ有効性は、ワクシニア及び免疫チェックポイント阻害剤抗CTLA-4抗体で処置した免疫適格マウスモデルにおける腫瘍成長(上段)及び生存(下段)によって測定した。CopMD5p3p(左列)を腫瘍溶解性のCopenhagen TK KO(右列)と比較した。
免疫チェックポイント阻害剤抗PD1抗体との相乗効果を示す。インビボ有効性は、ワクシニア及び免疫チェックポイント阻害剤抗PD1抗体で処置した免疫適格マウスモデルにおける腫瘍成長(上段)及び生存(下段)によって測定した。CopMD5p3p(左列)を腫瘍溶解性のCopenhagen TK KO(右列)と比較した。
免疫チェックポイント阻害剤抗PD1抗体及び抗CTLA-4抗体との相乗効果を示す。インビボ有効性は、ワクシニア及び免疫チェックポイント阻害剤抗PD1抗体及び抗CTLA-4抗体で処置した免疫適格マウスモデルにおける腫瘍成長(上段)及び生存(下段)によって測定した。CopMD5p3p(左列)を腫瘍溶解性のCopenhagen TK KO(右列)と比較した。
5’(「5p」)主要欠失遺伝子座(左)及び3’(「3p」)主要欠失遺伝子座(右)を有する修飾ポックスウイルスベクター(例えば、修飾ワクシニアウイルスベクター、例えば、修飾Copenhagenワクシニアウイルスベクター)の産生のためのスキームを示す。5p標的構築物は、C2Lに対する1kb相同領域、続いてeGFP発現導入遺伝子、及びF3Lに対する1kb相同領域からなる。3p標的構築物は、B14Rに対する729bp相同領域、続いてmCherry発現導入遺伝子、及びB29Rに対する415bp相同領域からなる。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアウイルスが様々な細胞株において増殖する能力を示す。
クリスタルバイオレット(上パネル)及びアラマーブルーアッセイ(下パネル)によって評価したように、野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアビリオンの様々な細胞株上での細胞傷害性効果を示す。下パネルに示されるチャートのx軸に沿って各細胞株について列挙される株の順序は、左から右へ、CopMD5p、CopMD5p3p、CopMD3p、及びCopWT(野生型Copenhagenワクシニア株)である。
マウスへの投与時の野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアビリオンの分布を示す。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアビリオンが、ナチュラルキラー(NK)細胞を活性化し、抗腫瘍免疫を促進する能力を示す。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアビリオンが、HT29細胞に対するNK細胞媒介性脱顆粒を増強する能力、NK細胞活性及び抗腫瘍免疫の尺度を示す。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾CopenhagenワクシニアビリオンがT細胞をプライミングして抗腫瘍免疫応答を開始する能力を示す。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアウイルスが、初期感染点から遠隔位置に拡散する能力を示す。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアビリオンが、ウイルス増殖の尺度であるプラークを形成する能力を示す。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアビリオンが、U2OS細胞においてプラークを形成する能力を示す。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアビリオンが、786-O細胞においてプラークを形成する能力を示す。
様々なポックスウイルスゲノムにおけるCopMD5p3pにおける欠失遺伝子のパーセンテージを示す。
SKV-B8R+ウイルスの正常細胞株対がん細胞株の感染を示す。
SKV-B8R+が、インターフェロンシグナル伝達を損なわないことを示す。
FLt3-LG及びIL-12-TM導入遺伝子についてのB8R組換え標的化戦略を示す。
SKV(CopMD5p3p-B8R-)は、SKV-B8R+と比較して、腫瘍対照において同様の有効性を有する。
塩基性野生型Copenhagenワクシニアウイルスゲノムと比較したSKV-123v2腫瘍溶解プラットフォームのゲノム組織を示す線形模式概略図を示す。FRTはフリップパーゼ酵素の認識部位である。
2つの免疫療法導入遺伝子及び抗体を発現するように操作されたSKVを示す。
2つの免疫療法導入遺伝子及び抗体を発現するように操作されたSKVを示す。
導入遺伝子を発現する様々なSKVウイルスについて定量化されたhIL-12産生を示す。
SKV-123、SKV-3、及び対照SKV-eGFPウイルス(MOI 0.1、感染24時間後)に感染した生Vero細胞でのIL-12 p35(IL-12)細胞表面免疫染色を示す。
結合したマウスIL-12 p35膜を発現するSKVは、マウス腫瘍の制御においてより大きな有効性を有する。
様々なワクシニア株で操作された主要な二重欠失が、インビトロでのがん細胞殺傷を増強することを示す。
様々なワクシニア株に感染したHeLa細胞の表現型の特徴付けを示す。
5p3pワクシニア株が、野生型株と比較して体重減少を誘導しないことを示す。マウスの体重測定値を示す。CD-1ヌードマウスを尾静脈内注入を介して1x107pfu(粒子形成単位)で処置し、示される時点で測定した。
5p3pワクシニア株が、野生型株と比較してポックス病変を誘導しないことを示す。ポックス病変の存在の評価を示した。CD-1ヌードマウスを、尾静脈内注入を介して、示されるワクシニアウイルス株で、1×107pfuで処置した。マウスを、注入後6日のポックス病変について検査した。
0.05mlのSKV(ワクシニアウイルス)(用量:1e7pfu)で処置した8匹の異種移植マウスモデルにおける経時的な腫瘍体積及び生存曲線であって、MiaPaca-2異種移植片マウスモデルからの結果を示す。
0.05mlのSKV(ワクシニアウイルス)(用量:1e7pfu)で処置した8匹の異種移植マウスモデルにおける経時的な腫瘍体積及び生存曲線であって、PC-3異種移植片マウスモデルからの結果を示す。
0.05mlのSKV(ワクシニアウイルス)(用量:1e7pfu)で処置した8匹の異種移植マウスモデルにおける経時的な腫瘍体積及び生存曲線であって、U87MG異種移植片モデルからの結果を示す。
0.05mlのSKV(ワクシニアウイルス)(用量:1e7pfu)で処置した8匹の異種移植マウスモデルにおける経時的な腫瘍体積及び生存曲線であって、UACC-62異種移植片モデルからの結果を示す。
0.05mlのSKV(ワクシニアウイルス)(用量:1e7pfu)で処置した8匹の異種移植マウスモデルにおける経時的な腫瘍体積及び生存曲線であって、UM-UC-3異種移植片マウスモデルからの結果を示す。
0.05mlのSKV(ワクシニアウイルス)(用量:1e7pfu)で処置した8匹の異種移植マウスモデルにおける経時的な腫瘍体積及び生存曲線であって、COLO-205異種移植片マウスモデルからの結果を示す。
0.05mlのSKV(ワクシニアウイルス)(用量:1e7pfu)で処置した8匹の異種移植マウスモデルにおける経時的な腫瘍体積及び生存曲線であって、NCI-H460異種移植片マウスモデルからの結果を示す。
0.05mlのSKV(ワクシニアウイルス)(用量:1e7pfu)で処置した8匹の異種移植マウスモデルにおける経時的な腫瘍体積及び生存曲線であって、HT29異種移植片モデルからの結果を示す。
活性導入遺伝子をコードするSKVで処置されたMC-38腫瘍を有する、ヒトCTLA-4を発現するトランスジェニックC57/BL6マウスモデルにおける経時的な平均腫瘍体積及び生存曲線を示す。次いで、動物を5つの処置群に無作為化し、次いでPBS、PBS+イピリムマブ、SKV、抗PD-1抗体、SKV-12m3v2-eGFP、またはSKV-12m3v2-eGFP+抗PD-1抗体で処置した。SKV-12m3v2-eGFPは、ヒト抗CTLA-4抗体、ヒトFlt3リガンド、及びマウスIL-12 TMp35を発現するSKVである。
図49に示した実験の個々の腫瘍体積を示す。
膜結合マウスIL-12 p35または膜結合マウスIL-12 p70のいずれかで処置されたMC-38マウスモデルにおける経時的な平均腫瘍体積を示す。
ウイルス(SKVB8R+TK-コード化OVA抗原)を使用した異種プライム:ブースト腫瘍溶解性ワクチンレジメンの結果を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるFLT3-L及び抗CTLA-4抗体の生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるFLT3-L及び抗CTLA-4抗体の生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるFLT3-L及び抗CTLA-4抗体の生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるFLT3-L及び抗CTLA-4抗体の生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるFLT3-L及び抗CTLA-4抗体の生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるFLT3-L及び抗CTLA-4抗体の生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるIL-12-TMの生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるIL-12-TMの生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるIL-12-TMの生体内分布を示す。
CT26腫瘍細胞を移植し、ITまたはIVのいずれかでSKV-123v2を投与したBALB/cマウスの血清及び組織におけるIL-12-TMの生体内分布を示す。
未処置またはSKV-123v2で処置されたNGSマウスにおける腫瘍体積を示す。
SKV-123v2ウイルス感染がん細胞(上パネル)及び正常細胞(下パネル)のアラマーブルー生存動態を示す。
SKV-123v2ウイルス感染がん細胞(786-O、HeLa)及び正常細胞(PBMC、PrEC)におけるウイルス複製成長曲線を示す。
SKV-123v2ウイルス感染がん細胞(786-O、HeLa)及び正常細胞(PBMC、PrEC)における抗CTLA-4抗体発現レベルを示す。
SKV-123v2ウイルス感染がん細胞(786-O、HeLa)及び正常細胞(PBMC、PrEC)におけるFLT3L発現レベルを示す。
ワクシニアウイルスゲノムにおいて導入遺伝子を挿入するための標的構築物の設計を示す。構築物は、増幅のPCR産物または細菌プラスミドの一部のいずれかであり得る。導入遺伝子の数及びそれらの方向は柔軟である。導入遺伝子及び蛍光マーカーの順序は柔軟である。
5.詳細な説明
本発明は、ワクシニアウイルス(例えば、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16m8、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1ウイルス)などの遺伝子修飾オルソポックスウイルス、ならびに様々ながんの治療のためのそれらの使用を特徴とする。本発明は、部分的には、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16m8、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1ウイルスなどのオルソポックスウイルスが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、K ORF A、K ORF B、B ORF E、B ORF F、及びB ORF G遺伝子、ならびにB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R ITRのコピーのうちの1つ以上または全ての遺伝子の欠失を含むように操作された場合に、著しく改善された腫瘍溶解活性、腫瘍における複製、感染性、免疫回避、腫瘍残留性、外因性DNA配列の取り込み能力、及び大規模製造の快適性を示すという発見に基づく。本発明の様々な実施形態では、修飾オルソポックスウイルスは、B8R遺伝子の欠失を含む。マウスにおいては不活性であるが、B8R遺伝子は、ヒトIFN-γの抗ウイルス活性を中和する。様々な実施形態では、少なくとも1つの導入遺伝子は、その後、相同組換え標的化戦略を通じてB8R遺伝子(現在は欠失している)の遺伝子座に挿入される。様々な実施形態において、修飾オルソポックスウイルスは、3つの導入遺伝子:IL-12-TM、FLT3-L、及び抗CLTA4抗体のうちの少なくとも1つを発現する。本明細書で使用される場合、FLT3L、Flt-3リガンド、FLT3LG、FLT3-LG、FLT3-Lは同義語であり、全てFMS様チロシンキナーゼ3リガンドを指す。
本発明は、ワクシニアウイルス(例えば、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16m8、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1ウイルス)などの遺伝子修飾オルソポックスウイルス、ならびに様々ながんの治療のためのそれらの使用を特徴とする。本発明は、部分的には、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16m8、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1ウイルスなどのオルソポックスウイルスが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、K ORF A、K ORF B、B ORF E、B ORF F、及びB ORF G遺伝子、ならびにB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R ITRのコピーのうちの1つ以上または全ての遺伝子の欠失を含むように操作された場合に、著しく改善された腫瘍溶解活性、腫瘍における複製、感染性、免疫回避、腫瘍残留性、外因性DNA配列の取り込み能力、及び大規模製造の快適性を示すという発見に基づく。本発明の様々な実施形態では、修飾オルソポックスウイルスは、B8R遺伝子の欠失を含む。マウスにおいては不活性であるが、B8R遺伝子は、ヒトIFN-γの抗ウイルス活性を中和する。様々な実施形態では、少なくとも1つの導入遺伝子は、その後、相同組換え標的化戦略を通じてB8R遺伝子(現在は欠失している)の遺伝子座に挿入される。様々な実施形態において、修飾オルソポックスウイルスは、3つの導入遺伝子:IL-12-TM、FLT3-L、及び抗CLTA4抗体のうちの少なくとも1つを発現する。本明細書で使用される場合、FLT3L、Flt-3リガンド、FLT3LG、FLT3-LG、FLT3-Lは同義語であり、全てFMS様チロシンキナーゼ3リガンドを指す。
本明細書に記載のオルソポックスウイルスは、哺乳類患者(例えば、ヒト患者)などの患者に投与して、広範囲のがんを含む様々な細胞増殖障害を治療することができる。以下の節は、オルソポックスウイルス及びその遺伝子修飾、ならびに遺伝子修飾オルソポックスウイルスの産生及び増殖方法、ならびにそれを患者に投与するための技術を記載する。
5.1.ポックスウイルス
一般に、ポックスウイルス粒子は、楕円形またはレンガ状であり、長さは約200~400nmである。外面は平行な列で隆起しており、時には螺旋状に配置される。かかる粒子は非常に複雑であり、100を超える異なるタンパク質が含まれる。細胞外形態は、2つの膜(EEV:細胞外エンベロープビリオン)を含むが、細胞内粒子は、内部膜(IMV:細胞内成熟ビリオン)のみを有する。外側表面は、しっかりと圧縮された核酸タンパク質からなるコアを取り囲む脂質及びタンパク質からなる。抗原的には、ポックスウイルスもまた非常に複雑であり、特異的抗体及び交差反応抗体の両方を誘導する。粒子内に少なくとも10個の酵素が存在し、主に核酸代謝/ゲノム複製に関する。
一般に、ポックスウイルス粒子は、楕円形またはレンガ状であり、長さは約200~400nmである。外面は平行な列で隆起しており、時には螺旋状に配置される。かかる粒子は非常に複雑であり、100を超える異なるタンパク質が含まれる。細胞外形態は、2つの膜(EEV:細胞外エンベロープビリオン)を含むが、細胞内粒子は、内部膜(IMV:細胞内成熟ビリオン)のみを有する。外側表面は、しっかりと圧縮された核酸タンパク質からなるコアを取り囲む脂質及びタンパク質からなる。抗原的には、ポックスウイルスもまた非常に複雑であり、特異的抗体及び交差反応抗体の両方を誘導する。粒子内に少なくとも10個の酵素が存在し、主に核酸代謝/ゲノム複製に関する。
野生型ポックスウイルスのゲノムは、130~300Kbpの直鎖状二本鎖DNAである。ゲノムの末端は、いくつかのタンデムリピート配列を有する末端ヘアピンループを有する。いくつかのポックスウイルスゲノムが配列決定されており、必須遺伝子の大部分はゲノムの中央部分に位置し、非必須遺伝子は末端に位置する。ポックスウイルスゲノムには約250個の遺伝子が存在する。複製は、ウイルスがゲノム複製に必要なすべての機能を獲得するのに十分に複雑であるため、細胞質内で行われる。細胞による寄与はあるが、この寄与の性質は不明である。しかしながら、ポックスウイルス遺伝子発現及びゲノム複製は、除核された細胞において生じるが、成熟は遮断され、細胞によってある程度の役割を示す。
細胞質に入ると、遺伝子発現は、コアに関連するウイルス酵素によって実行される。発現は、ゲノム複製の前に発現される約50%のゲノムを表す初期遺伝子と、ゲノム複製後に発現される後期遺伝子との2つの相に分割される。発現の時間的制御は、活性についてDNA複製に依存する後期プロモーターによって提供される。ゲノム複製は、自己プライミングを伴うと考えられ、これは、その後、ウイルスゲノムを作製するために切断及び修復される高分子量コンカテーマーの形成につながる。ウイルス組立は、細胞骨格において生じ、おそらく細胞骨格タンパク質(例えば、アクチン結合タンパク質)との相互作用を伴う。細胞質に封入体が形成され、成熟してウイルス粒子となる。細胞間の拡散は、感染の拡散のための代替機構を提供し得る。全体的に、この大きく複雑なウイルスの複製はかなり迅速で、平均してわずか12時間である。少なくとも9つの異なるポックスウイルスがヒトに疾患を引き起こすが、痘瘡ウイルス及びワクシニアが最も知られている。痘瘡株は、主要な痘瘡株(死亡率25~30%)及び少数の痘瘡株(同じ症状だが死亡率は1%未満)に分類される。両方のウイルスによる感染は、呼吸経路によって自然に生じ、全身的であり、様々な症状を生じさせるが、最も顕著には、痘瘡に特徴的な膿疱及び皮膚の瘢痕を伴う。
5.2.オルソポックスウイルス
5.2.1.ワクシニアウイルス
ワクチンウイルスは、ポックスウイルスまたはポックスウイルス科、コードポックスウイルス亜科、及びオルソポックスウイルス属のメンバーである。オルソポックスウイルスは、コードポックスウイルス亜科の他のメンバーよりも比較的均質であり、ワクシニアウイルス、バリオラウイルス(天然痘の原因物質)、ウシポックスウイルス、バッファロポックスウイルス、サルポックスウイルス、マウスポックスウイルス、ウマポックスウイルス種など、11の異なるが密接に関連する種が含まれる(Moss,1996を参照されたい)。
5.2.1.ワクシニアウイルス
ワクチンウイルスは、ポックスウイルスまたはポックスウイルス科、コードポックスウイルス亜科、及びオルソポックスウイルス属のメンバーである。オルソポックスウイルスは、コードポックスウイルス亜科の他のメンバーよりも比較的均質であり、ワクシニアウイルス、バリオラウイルス(天然痘の原因物質)、ウシポックスウイルス、バッファロポックスウイルス、サルポックスウイルス、マウスポックスウイルス、ウマポックスウイルス種など、11の異なるが密接に関連する種が含まれる(Moss,1996を参照されたい)。
ワクシニアウイルスは、約190kbの直鎖状二本鎖DNAゲノムを有し、約250個の遺伝子をコードする大型複合体封入ウイルスである。ワクチンは、天然痘を根絶するワクチンとしての役割でよく知られている。天然痘の根絶後、科学者は、生物学的組織に遺伝子を送達するためのツールとしてのワクシニアの使用を探求してきた(遺伝子療法及び遺伝子工学)。ワクシニアウイルスは、宿主細胞の細胞質にのみ複製されるため、DNAウイルス間でも固有である。したがって、ウイルスDNA複製に必要な様々な酵素及びタンパク質をコードするためには、大きなゲノムが必要である。複製中、ワクシニアは、細胞内成熟ビリオン(IMV)、細胞内エンベロープビリオン(IEV)、細胞関連エンベロープビリオン(CEV)、及び細胞外エンベロープビリオン(EEV)の、外膜が異なるいくつかの感染形態を産生する。IMVは最も豊富な感染性形態であり、宿主間の拡散の原因であると考えられる。他方では、CEVは細胞間の拡散において役割を果たすと考えられ、EEVは宿主生物内の長距離拡散にとって重要であると考えられる。
ワクシニアウイルスは、ウシポックスを引き起こすウイルスと密接に関連している。ワクシニアの正確な起源は不明であるが、最も一般的な見解は、ワクシニアウイルス、ウシポックスウイルス、及び痘瘡ウイルス(天然痘の原因物質)が全て共通の先祖ウイルスに由来していたことである。また、ワクシニアウイルスはもともとウマから単離されたものであったという推測もある。ワクシニアウイルス感染症は、健康な個体においては軽度であり、典型的には無症状であるが、軽度の発疹及び発熱を引き起こし得、死亡率が極めて低い。ワクシニアウイルス感染に対して生成される免疫応答は、致命的な天然痘感染からその人を保護する。このため、ワクシニアウイルスを天然痘に対する生ウイルスワクチンとして使用される。ワクシニアウイルスワクチンは天然痘ウイルスを含まないため安全であるが、特にワクチンが免疫障害を受けている場合、時折特定の合併症及び/またはワクチンの副作用が生じる場合がある。
ワクシニアウイルスの例示的な株には、これらに限定されないが、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16m8、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1が含まれる。
5.2.2.チミジンキナーゼ変異体及びヘマグルチニン変異体
腫瘍溶解性ウイルスとしてワクシニアウイルスを試験するいくつかの現在の臨床研究は、ウイルス性チミジンキナーゼ(TK)遺伝子において欠失を保有する。この欠失はウイルスを減衰させ、DNA複製、したがってウイルス増殖のための細胞チミジンキナーゼの活性にウイルスを依存させる。細胞チミジンキナーゼは、ほとんどの正常組織において低いレベルで、及び多くのがん細胞において上昇したレベルで発現される。代謝標的化を通じて、TK-ウイルスは、高い代謝速度を有する細胞(例えば、健康な細胞または腫瘍細胞)において増殖することができ、低レベルのチミジンキナーゼを有する細胞においてあまり増殖しない。静止腫瘍細胞(例えば、がん幹細胞)が存在するため、TKウイルスは、化学療法がほとんど効果がないように、このがん細胞集団を殺傷能力が損なわれる可能性が高い。いくつかの実施形態では、本開示において記載される修飾ウイルスベクターは、ウイルス合成機構(TKを含む)を保持し、静止がん細胞において増殖し得る。かかる実施形態において、本開示のウイルス修飾は、TKまたは他のDNA代謝酵素(例えば、リボヌクレオチドレダクターゼ)を欠失させることなく、ウイルスが高度に選択的であることを可能にし得、低い代謝速度を有する腫瘍においてより効果的であり得る。いくつかの実施形態では、本開示において記載される修飾ウイルスベクターは、機能的TK遺伝子(例えば、野生型TK遺伝子)を含む。他の実施形態では、本開示に記載される修飾ウイルスベクターは、TK遺伝子における欠失(複数可)または機能喪失変異(複数可)を含む。
腫瘍溶解性ウイルスとしてワクシニアウイルスを試験するいくつかの現在の臨床研究は、ウイルス性チミジンキナーゼ(TK)遺伝子において欠失を保有する。この欠失はウイルスを減衰させ、DNA複製、したがってウイルス増殖のための細胞チミジンキナーゼの活性にウイルスを依存させる。細胞チミジンキナーゼは、ほとんどの正常組織において低いレベルで、及び多くのがん細胞において上昇したレベルで発現される。代謝標的化を通じて、TK-ウイルスは、高い代謝速度を有する細胞(例えば、健康な細胞または腫瘍細胞)において増殖することができ、低レベルのチミジンキナーゼを有する細胞においてあまり増殖しない。静止腫瘍細胞(例えば、がん幹細胞)が存在するため、TKウイルスは、化学療法がほとんど効果がないように、このがん細胞集団を殺傷能力が損なわれる可能性が高い。いくつかの実施形態では、本開示において記載される修飾ウイルスベクターは、ウイルス合成機構(TKを含む)を保持し、静止がん細胞において増殖し得る。かかる実施形態において、本開示のウイルス修飾は、TKまたは他のDNA代謝酵素(例えば、リボヌクレオチドレダクターゼ)を欠失させることなく、ウイルスが高度に選択的であることを可能にし得、低い代謝速度を有する腫瘍においてより効果的であり得る。いくつかの実施形態では、本開示において記載される修飾ウイルスベクターは、機能的TK遺伝子(例えば、野生型TK遺伝子)を含む。他の実施形態では、本開示に記載される修飾ウイルスベクターは、TK遺伝子における欠失(複数可)または機能喪失変異(複数可)を含む。
同様に、ワクシニアウイルスのヘマグルチニン(HA)遺伝子の不活性化は、ウイルスの減衰をもたらし得る。いくつかの実施形態では、本開示において記載される修飾ウイルスベクターは、機能的HA遺伝子(例えば、野生型HA遺伝子)を含む。他の実施形態では、本開示に記載される修飾ウイルスベクターは、HA遺伝子における欠失(複数可)または機能喪失変異(複数可)を含む。
特定の実施形態では、本開示に記載される修飾ウイルスベクターは、機能的TK遺伝子(例えば、野生型TK遺伝子)及び機能的HA遺伝子(例えば、野生型HA遺伝子)を含む。別の特定の実施形態では、本開示に記載される修飾ウイルスベクターは、機能的TK遺伝子(例えば、野生型TK遺伝子)及びHA遺伝子における欠失(複数可)または機能喪失変異(複数可)を含む。別の特定の実施形態では、本開示に記載される修飾ウイルスベクターは、TK遺伝子及び機能的HA遺伝子(例えば、野生型HA遺伝子)における欠失(複数可)または機能喪失変異(複数可)を含む。別の特定の実施形態では、本開示に記載される修飾ウイルスベクターは、TK遺伝子における欠失(複数可)または機能喪失変異(複数可)、及びHA遺伝子における欠失(複数可)または機能喪失変異(複数可)を含む。
5.2.3.組換えオルソポックスウイルスゲノム
一態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′逆位末端配列(ITR)におけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
一態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′逆位末端配列(ITR)におけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
いくつかの実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
好ましい実施形態では、本開示におけるヌクレオチド配列と隣接する内因性遺伝子(すなわち、ヌクレオチド配列の隣接する内因性遺伝子)は、ヌクレオチド配列に最も近い2つの内因性遺伝子である(ヌクレオチド配列の一方が上流及び他方が下流)。内因性遺伝子は、部分遺伝子または全長遺伝子であり得る。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、イピリムマブの6つの相補性決定領域(CDR)を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列と、を含み、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターであり、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
いくつかの実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、イピリムマブの6つの相補性決定領域(CDR)を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、IL-12 p40(例えば、ヒトIL-12 p40)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合であり、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3Lの膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(d)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列と、を含み、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターであり、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。
特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、IL-12 p40(例えば、ヒトIL-12 p40)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合であり、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3Lの膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、(d)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列と、を含み、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターであり、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
特定の実施形態では、核酸は、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、イピリムマブの6つの相補性決定領域(CDR)を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、IL-12 p40(例えば、ヒトIL-12 p40)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合であり、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3Lの膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、ヌクレオチド配列、及び/または(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、イピリムマブの6つの相補性決定領域(CDR)を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、IL-12 p40(例えば、ヒトIL-12 p40)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合であり、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3Lの膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
特定の実施形態では、核酸は、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、イピリムマブの6つの相補性決定領域(CDR)を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、ヌクレオチド配列、及び/または(ii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、イピリムマブの6つの相補性決定領域(CDR)を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、核酸は、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、IL-12 p40(例えば、ヒトIL-12 p40)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合であり、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3Lの膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び/または(ii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、IL-12 p40(例えば、ヒトIL-12 p40)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合であり、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3Lの膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である。
特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
特定の実施形態では、核酸は、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、核酸は、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、イピリムマブの6つの相補性決定領域(CDR)を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、IL-12 p40(例えば、ヒトIL-12 p40)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合であり、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3Lの膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び/または(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。
特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、イピリムマブの6つの相補性決定領域(CDR)を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載される。
特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、IL-12 p40(例えば、ヒトIL-12 p40)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、膜結合であり、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、またはIL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)0、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3Lの膜貫通ドメイン及び細胞質ドメイン)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載される。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。さらなる特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の上流にある。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも30%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも40%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも50%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも60%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも70%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の少なくとも80%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の30%~90%、30%~85%、40%~90%、40%~85%、50%~90%、50%~85%、60%~90%、60%~85%、70%~90%、70%~85%、75%~90%、75%~85%、または80%~85%の欠失である。特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の約75%の欠失である。別の特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の約80%の欠失である。別の特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B8R遺伝子配列の約82%の欠失である。
例えば、いくつかの実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の少なくとも30%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の少なくとも40%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の少なくとも50%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の少なくとも60%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の少なくとも70%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の少なくとも80%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の30%~90%、30%~85%、40%~90%、40%~85%、50%~90%、50%~85%、60%~90%、60%~85%、70%~90%、70%~85%、75%~90%、75%~85%、または80%~85%の欠失である。特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の約75%の欠失である。別の特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の約80%の欠失である。別の特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号591のヌクレオチド配列の約82%の欠失である。
別の例では、いくつかの実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、ACAACACCATGAGATATATTATA ATTCTCGCAGTTTTGTTCATTAATAGTATACACGCTAAAATAACTAGTTATAAGTTTGAATCCGTCAATTTTGATTCCAAAATTGAATGGACTGGGGATGGTCTATACAATATATCCCTTAAAAATTATGGCATCAAGACGTGGCAAACAATGTATACAAATGTACCAGAAGGAACATACGACATATCCGCATTTCCAAAGAATGATTTCGTATCTTTCTGGGTTAAATTTGAACAAGGCGATTATAAAGTGGAAGAGTATTGTACGGGACTATGCGTCGAAGTAAAAATTGGACCACCGACTGTAACATTGACTGAATACGACGACCATATCAATTTGTACATCGAGCATCCGTATGCTACTAGAGGTAGCAAAAAGATTCCTATTTACAAACGCGGTGACATGTGTGATATCTACTTGTTGTATACGGCTAACTTCACATTCGGAGATTCTGAAGAACCAGTAACATATGATATCGATGACTACGATTGCACGTCTACAGGTTGCAGCATAGACTTTGCCACAACAGAAAAAGTGTGCGTGACAGCACAGGGAGCCACAGAAGGGTTTCTCGAAAAAATTACTCCATGGAGTTCGGAAGTATGTCTGACACCTAAAAAGAATGTATATACATGTGCAATTAGATCCAAAGAAGATGTTCCCAATTTCAAGGACAAAATGGCCAGAGTTATCAAGAGAAAATTTAATAAACAGTCTCAATCTTATTTAACTAAATTTCTCGGTAGCACATCAAATGATGTTACCACTTTTCTTAGCATGCTTAACTTGACTAAATATTCATAA(配列番号550)のヌクレオチド配列の少なくとも30%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の少なくとも40%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の少なくとも50%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の少なくとも60%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の少なくとも70%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の少なくとも80%の欠失である。他の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の30%~90%、30%~85%、40%~90%、40%~85%、50%~90%、50%~85%、60%~90%、60%~85%、70%~90%、70%~85%、75%~90%、75%~85%、または80%~85%の欠失である。特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の約75%の欠失である。別の特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の約80%の欠失である。別の特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、配列番号550のヌクレオチド配列の約82%の欠失である。
特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、ワクシニアゲノムのB9R遺伝子の機能を妨害しない。特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B9R遺伝子の発現を妨害しない。特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B9R遺伝子のプロモーター(複数可)を除去しない。特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、B9R遺伝子の転写制御性配列を除去しない。特定の実施形態では、欠失後に残存するB8R遺伝子の唯一の配列は、適切なB9R機能及び/または発現に必要な配列である。特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失はAAAATTTAATAAACA(配列番号551)を含むヌクレオチド配列を除去しない。別の特定の実施形態では、B8R遺伝子における欠失は、ヌクレオチド配列AAAATTTAATAAACA(配列番号551)を除去しない。特定の実施形態では、残存するB8R遺伝子の唯一の配列は、GATGTTCCCAATTTCAAGGACAAAATGGCCAGAGTTATCAAGAGAAAATTTAATAAACAGTCTCAATCTTATTTAACTAAATTTCTCGGTAGCACATCAAATGATGTTACCACTTTTCTTAGCATGCTTAACTTGACTAAATATTCATAA(配列番号552)のヌクレオチド配列である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、Copenhagen株ワクシニアウイルスのゲノムに由来する。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)に由来する。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)を含む。
本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個の表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書で提供される実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1~3、1~5、2~4、2~5、1~9、2~8、4~8、6~8、1~9、2~9、4~9、6~9、7~9、1~10、2~10、5~10、または8~10個の表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書で提供される実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、11~20、12~15、15~20、または18~20個の表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書で提供される実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1~20、1~15、5~20、または10~20個の表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書で提供されるいくつかの実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、全ての表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。特定のかかる実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。いくつかのかかる実施形態では、組換えウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。特定のかかる実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、または32個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。かかる実施形態のいくつかでは、組換えウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、ならびび3′逆位末端配列(ITR)におけるB19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入と、を含むように操作され得る。
本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1、2、3、または4個の同義バリアントである表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書で提供される実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1、2、3、4、5、6、または7個のタンパク質コード領域内でない表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1、2、3、4、5、6、または7個のアミノ酸配列内の変化をもたらす表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書で提供される実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1または2個のフレームシフトをもたらす表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。特定のかかる実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。いくつかのかかる実施形態では、組換えウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。特定のかかる実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、または32個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。かかる実施形態のいくつかでは、組換えウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、ならびび3′逆位末端配列(ITR)におけるB19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入と、を含むように操作され得る。
本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1、2、3、4、5、6、または7個の表46に特定される遺伝子において見出されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書に提供されるいくつかの実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、8、9、10、11、12、または13個の表46に特定される遺伝子において見出されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、全ての表46に特定される遺伝子において見出されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1~5、5~10、1~13、5~13、または10~13個の表46に特定される遺伝子において見出されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。特定のかかる実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。いくつかのかかる実施形態では、組換えウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。特定のかかる実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、または32個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。かかる実施形態のいくつかでは、組換えウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、ならびび3′逆位末端配列(ITR)におけるB19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入と、を含むように操作され得る。
本明細書で提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、ワクシニア遺伝子C14L、C2L、C1L、N2L、F3L、F13L、F16L、G7L、L3L、J3R、D6R、A41L、またはA46Rについて表46に特定されるヌクレオチド多型(複数可)を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書で提供されるいくつかの実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、ワクシニア遺伝子C14L、C2L、C1L、N2L、F3L、F13L、F16L、G7L、L3L、J3R、D6R、A41L、及びA46Rについて表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、1、2、3、4、5、6、または7個のワクシニア遺伝子C14L、C2L、C1L、N2L、F3L、F13L、F16L、G7L、L3L、J3R、D6R、A41L、及びA46Rについて表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。本明細書に提供される特定の実施形態及び態様では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、ヌクレオチド配列が、8、9、10、11、12、または13個のワクシニア遺伝子C14L、C2L、C1L、N2L、F3L、F13L、F16L、G7L、L3L、J3R、D6R、A41L、及びA46Rについて表46に特定されるヌクレオチド多型を含むことを除き、GenBank受託番号M35027.1のヌクレオチド配列(配列番号590)と同一のヌクレオチド配列を含む。特定のかかる実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。いくつかのかかる実施形態では、組換えウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。特定のかかる実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、本明細書で特定されるワクシニアウイルス遺伝子における21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、または32個の欠失(例えば、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R)、ならびに本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入を含むように操作され得る。かかる実施形態のいくつかでは、組換えウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、ならびび3′逆位末端配列(ITR)におけるB19R、及びB20R、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)のうちの1、2、または3個の挿入と、を含むように操作され得る。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、配列番号210のヌクレオチド配列を含む。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、1、2、3、4、5、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の表46に特定されるヌクレオチド多型を除き、配列番号210のヌクレオチド配列と同一であるヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列、ならびに(b)(i)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子(例えば、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載されるヌクレオチド配列を含む)、(ii)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子(例えば、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載されるヌクレオチド配列を含む)、及び(iii)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子(例えば、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載されるヌクレオチド配列を含む)のうちの1、2、または3個を含む、核酸である。
特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列、ならびに(b)(i)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子(例えば、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載されるヌクレオチド配列を含む)、(ii)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子(例えば、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載されるヌクレオチド配列を含む)、及び(iii)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子(例えば、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載されるヌクレオチド配列を含む)のうちの2または3個を含む、核酸である。
特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)(i)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子(例えば、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載されるヌクレオチド配列を含む)、(ii)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子(例えば、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載されるヌクレオチド配列を含む)、及び(iii)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子(例えば、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載されるヌクレオチド配列を含む)と、を含む、核酸である。
上記の特定の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子を含み、核酸は、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結されたH5Rプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子を含み、核酸は、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された後期プロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含み、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、核酸は、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結されたB8Rプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、核酸は、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結されたB19Rプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、核酸は、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結されたB8Rプロモーター及びB19Rプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。上記の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、同じ方向を有し、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。上記の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、同じ方向を有し、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。上記の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、同じ方向を有し、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。上記の特定の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、配列番号624のヌクレオチド配列を含む。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、1、2、3、4、5、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の表46に特定されるヌクレオチド多型を除き、配列番号624のヌクレオチド配列と同一であるヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)配列番号624のワクシニアウイルスヌクレオチド配列、ならびに(b)(i)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子(例えば、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載されるヌクレオチド配列を含む)、(ii)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子(例えば、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載されるヌクレオチド配列を含む)、及び(iii)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子(例えば、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載されるヌクレオチド配列を含む)のうちの1、2、または3個を含む、核酸である。特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、または第3のプロモーターと作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーターをさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、及び第3のプロモーターと作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーターをさらに含む。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び/または第3の導入遺伝子は、本明細書に記載の遺伝子座または複数の遺伝子座に挿入される。
特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)配列番号624のワクシニアウイルスヌクレオチド配列、ならびに(b)(i)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子(例えば、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載されるヌクレオチド配列を含む)、(ii)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子(例えば、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載されるヌクレオチド配列を含む)、及び(iii)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子(例えば、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載されるヌクレオチド配列を含む)のうちの2または3個を含む、核酸である。特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、または第3のプロモーターと作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーターをさらに含む。特定の実施形態では、2または3個の導入遺伝子は、本明細書に記載の遺伝子座または複数の遺伝子座に挿入される。
特定の実施形態では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)配列番号624のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)(i)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子(例えば、第1のヌクレオチド配列は、配列番号214に記載されるヌクレオチド配列を含む)、(ii)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子(例えば、第2のヌクレオチド配列は、配列番号215に記載されるヌクレオチド配列を含む)、及び(iii)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子(例えば、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載されるヌクレオチド配列を含む)と、を含む、核酸である。特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、または第3のプロモーターと作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーターをさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーター、及び第3のプロモーターと作動可能に連結された本明細書に記載のプロモーターをさらに含む。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、本明細書に記載の遺伝子座または複数の遺伝子座に挿入される。
上記の特定の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子を含み、核酸は、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結されたH5Rプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子を含み、核酸は、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された後期プロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含み、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、核酸は、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結されたB8Rプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、核酸は、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結されたB19Rプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、核酸は、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結されたB8Rプロモーター及びB19Rプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。上記の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、同じ方向を有し、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。上記の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、同じ方向を有し、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。上記の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、同じ方向を有し、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失をさらに含む。上記の特定の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失をさらに含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の上流にある。特定の実施形態において、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の下流にある。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にあり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にあり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であり、(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、(c)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にあり、核酸は、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列、及び(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、核酸は、B8R遺伝子における欠失を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書に提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、第1の導入遺伝子と、(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、第2の導入遺伝子と、(d)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、第3の導入遺伝子と、を含む、核酸である。
いくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第1のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第2のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。いくつかの実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が同じ方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と比較して逆方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの5’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。他の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子が反対方向を有する場合、第3のヌクレオチド配列は、組換えワクシニアウイルスゲノムの3’末端に近い隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C2L及びF3L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、C3L及びF4L遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B14R及びB29R遺伝子である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列の隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子は、B13R及びB29R遺伝子である。さらに別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子は、B13R遺伝子である。特定の実施形態では、核酸は、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである。別の特定の実施形態では、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーター(例えば、初期H5Rプロモーター、後期H5Rプロモーター、または初期H5Rプロモーター及び後期H5Rプロモーター)である。
特定の実施形態では、核酸は、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。さらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む。別のさらなる特定の実施形態では、後期プロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を含む。別の実施形態では、F17Rプロモーターは、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。さらに別の実施形態では、D13Lプロモーターは、配列番号562のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、核酸は、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、及び/またはB2Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。別の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターは、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F11Lプロモーターは、配列番号568のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B2Rプロモーターは、配列番号569のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書に提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2のヌクレオチド配列は、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3のヌクレオチド配列は、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子は、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。特定の実施形態では、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の上流にある。特定の実施形態において、第3の導入遺伝子は、第2の導入遺伝子の下流にある。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、pSのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、pSのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、pSのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、pSのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである。特定の実施形態では、H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、pSプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、pSプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、pSプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、(b)CTLA-4(例えば、ヒトCTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第1の導入遺伝子が、配列番号210における部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される、第1の導入遺伝子と、(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、第2のヌクレオチド配列が、第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される、第2の導入遺伝子と、(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、第2の導入遺伝子の下流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、核酸が、(i)第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(ii)第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、(iii)第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、核酸である。特定の実施形態では、pSプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、F17Rプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号563のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、E3Lプロモーターのヌクレオチド配列は、配列番号567のヌクレオチド配列を含む。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第2の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態において、第1の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態において、第2の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態において、第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、ワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3
の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第3の導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子が、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子及び第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第1の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入される。特定の実施形態では、B14RからB29R遺伝子が欠失し、第2の導入遺伝子及び第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第1の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第2の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第3の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第1の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第2の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、核酸は、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、及び第3の導入遺伝子を含み、第3の導入遺伝子は、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に挿入される。別の実施形態では、第3の導入遺伝子は、部分ワクシニアC2L遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアF3L遺伝子と隣接して挿入されるか、またはワクシニア遺伝子C3LとF4Lとの間に挿入され、第2の導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入され、第1の導入遺伝子は、部分ワクシニアB14R遺伝子と隣接して挿入されるか、部分ワクシニアB29R遺伝子と隣接して挿入されるか、またはB14RからB29R遺伝子が欠失する場合、B13R遺伝子と隣接して挿入される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様では、核酸は、配列番号210のヌクレオチド配列を含み、部分C2L及びF3Lワクシニア遺伝子は、配列番号210における部分C2L及びF3Lワクシニア遺伝子である。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様では、核酸は、配列番号210のヌクレオチド配列を含み、部分B14R及びB29Rワクシニア遺伝子は、配列番号210における部分B14R及びB29Rワクシニア遺伝子である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様では、核酸は、配列番号624のヌクレオチド配列を含み、部分C2L及びF3Lワクシニア遺伝子は、配列番号624における部分C2L及びF3Lワクシニア遺伝子である。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様では、核酸は、配列番号624のヌクレオチド配列を含み、部分B14R及びB29Rワクシニア遺伝子は、配列番号624における部分B14R及びB29Rワクシニア遺伝子である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、部分C2L及びF3Lワクシニア遺伝子への挿入は、組換えワクシニアウイルスゲノムに存在する5p欠失の境界内への挿入である。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間の挿入は、組換えワクシニアウイルスゲノムに存在する3p欠失の境界内への挿入である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、完全長抗体(例えば、完全長ヒト抗体、完全長ヒト化抗体、または完全長マウス抗体)である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、切断ペプチド、例えば、2A自己切断ペプチド(例えば、T2Aペプチド)などの自己切断ペプチドによって連結されたイピリムマブの重鎖及び軽鎖を含むポリペプチドをコードする。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列は、切断ペプチド、例えば、2A自己切断ペプチド(例えば、T2Aペプチド)などの自己切断ペプチドによって連結されたイピリムマブの重鎖シグナルペプチド及び重鎖、ならびに軽鎖シグナルペプチド及び軽鎖を含むポリペプチドをコードする。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の他の実施形態では、第1のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片は、一本鎖抗体(例えば、一本鎖ヒト抗体、一本鎖ヒト化抗体、または一本鎖マウス抗体、例えば、9D9)である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の別の特定の実施形態では、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様のいくつかの実施形態では、第2のヌクレオチド配列によってコードされるIL-12ペプチドは、サイトカインの膜結合バージョンである。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)及び膜貫通ドメインを含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)及び膜貫通ドメイン(IL12-TMp35)からなる。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、膜貫通ドメイン、及び細胞質ドメインを含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、膜貫通ドメイン、及び細胞質ドメインからなる。膜貫通ドメインは、任意の膜結合タンパク質(例えば、B7-1、膜結合TNFα、または膜結合FLT3L)に由来し得る。細胞質ドメインは、細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3L)を含む任意のタンパク質に由来し得る。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、ならびに哺乳動物表面ディスプレイに一般的に使用される要素であるB7-1抗原からのB7細胞質及び膜ドメインを含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p35(例えば、ヒトIL-12 p35)、ならびにB7-1抗原からのB7細胞質及び膜ドメインからなる。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含み、これは、p40サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p40)及びp35サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p35)、ならびに膜貫通ドメインを含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)からなり、これは、p40サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p40)及びp35サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p35)、ならびに膜貫通ドメイン(IL12-TMp70、またはp40-p35-TM)を含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含み、これは、p40サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p40)及びp35サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p35)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインを含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含み、これは、p40サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p40)及びp35サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p35)、ならびに膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインを含む。膜貫通ドメインは、任意の膜結合タンパク質(例えば、B7-1、膜結合TNFα、または膜結合FLT3L)に由来し得る。細胞質ドメインは、細胞質ドメイン(例えば、B7-1、TNFα、またはFLT3L)を含む任意のタンパク質に由来し得る。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)を含み、これは、p40サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p40)及びp35サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p35)、ならびにB7-1抗原からのB7細胞質及び膜ドメインを含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、IL-12 p70(例えば、ヒトIL-12 p70)からなり、これは、p40サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p40)及びp35サブユニット(例えば、ヒトIL-12 p35)、ならびにB7-1抗原からのB7細胞質及び膜ドメインを含む。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、ヒトIL-12ポリペプチド(例えば、ヒトIL12-TMp35またはヒトIL12-TMp70)である。特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドは、マウスIL-12ポリペプチド(例えば、マウスIL12-TMp35またはマウスIL12-TMp70)である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を有する後期プロモーターである。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、配列番号561のヌクレオチド配列を有する後期プロモーター及びB8Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、可溶性形態のヒトFLT3Lである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、GenBank受託番号U03858.1に記載される可溶性形態のヒトFLT3Lである。例えば、特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通全体(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)を欠く。他の例では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン(例えば、GenBank受託番号U03858.1に記載されるヒトFLT3Lの膜貫通ドメイン)の少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。一実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメイン全体を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及び1、2、3、または4個のFLT3L細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞質ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメイン全体、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、細胞質ドメインの少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメイン全体、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸を欠く。別の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、FLT3L膜貫通ドメインの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、12、13、14、または15個の細胞質ドメインのN末端アミノ酸残基、及びFLT3L細胞外ドメインのカルボキシ末端から1~5、1~10、5~10、10~20、15~20、1~20、5~20、または10~20個のアミノ酸を欠く。いくつかの実施形態及び態様では、膜貫通ドメイン、細胞質ドメイン、及び細胞外ドメインは、GenBank受託番号U03858.1に記載されるFLT3L配列のものである。
特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列によってコードされるFLT3Lは、X7アイソフォームであり、第3のヌクレオチド配列は、Lyman et al.,1994,Blood 83:2795-2801に記載されるような179個のヌクレオチド配列を欠く。特定の実施形態では、FLT3Lは、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される配列を含む。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列は、配列番号216に記載される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーターである。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーターである。本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである。特定の実施形態では、B8Rプロモーターは、配列番号564のヌクレオチド配列を含む。特定の実施形態では、B19Rプロモーターは、配列番号565のヌクレオチド配列を含む。
本発明はまた、検出可能なマーカー、例えば、蛍光マーカー(例えば、増強されたGFP(eGFP)などの緑色蛍光タンパク質(GFP))をコードする第4のヌクレオチド配列を含む第4の導入遺伝子をさらに含む、本明細書に記載の核酸を企図する。特定の実施形態では、核酸は、蛍光マーカーをコードする第4のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む。特定の実施形態では、蛍光マーカーをコードする第4のヌクレオチド配列は、第1、第2、及び第3のヌクレオチド配列のうちの1つと連結され、その下流にある。
特定の実施形態では、蛍光マーカーをコードする第4のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、E3Lプロモーターである。別の特定の実施形態では、蛍光マーカーをコードする第4のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、p7.5プロモーターである。
特定の実施形態では、本明細書に提供されるのは、表45で特定され、表45で特定された遺伝子座(複数の遺伝子座)に挿入され、表45で特定されたプロモーター(複数可)と作動可能に連結された導入遺伝子(複数可)を有する、配列番号210または配列番号624のヌクレオチド配列を含むベクターである。特定の実施形態では、本明細書に提供されるのは、表45に記載されるようなベクターである。
第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、第3の導入遺伝子、及び/または第4の導入遺伝子がTK遺伝子座に挿入され得ることも企図される。他の導入遺伝子(存在する場合)は、他の遺伝子座、例えば、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間、及び/またはHA遺伝子座に挿入することができる。いくつかの実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、TK遺伝子における欠失を含む。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、第3の導入遺伝子、及び/または第4の導入遺伝子がTK遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。他の実施形態では、TK遺伝子は欠失しないが、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、第3の導入遺伝子、及び/または第4の導入遺伝子がTK遺伝子に挿入され、TK遺伝子の機能を破壊する。
他の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、機能的、例えば、野生型TK遺伝子を含み、導入遺伝子(複数可)のいずれもTK遺伝子座に挿入されない。野生型TK遺伝子は、ワクシニアウイルスゲノムにおいて天然に見られるTK遺伝子を含む。
第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、第3の導入遺伝子、及び/または第4の導入遺伝子がHA遺伝子座に挿入され得ることも企図される。他の導入遺伝子(存在する場合)は、他の遺伝子座、例えば、部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間、B8R遺伝子における欠失の遺伝子座、部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間、及び/またはTK遺伝子座に挿入することができる。いくつかの実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、HA遺伝子における欠失を含む。特定の実施形態では、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、第3の導入遺伝子、及び/または第4の導入遺伝子がHA遺伝子における欠失の遺伝子座に挿入される。他の実施形態では、HA遺伝子は欠失しないが、第1の導入遺伝子、第2の導入遺伝子、第3の導入遺伝子、及び/または第4の導入遺伝子がHA遺伝子に挿入され、HA遺伝子の機能を破壊する。
他の実施形態では、組換えワクシニアウイルスゲノムは、機能的、例えば、野生型HA遺伝子を含み、導入遺伝子(複数可)のいずれもHA遺伝子座に挿入されない。野生型HA遺伝子は、ワクシニアウイルスゲノムにおいて天然に見られるHA遺伝子を含む。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、少なくとも1つのプロモーターは、第1のヌクレオチド配列、第2のヌクレオチド配列、及び/または第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結され、少なくとも1つのプロモーターは、初期プロモーター、後期プロモーター、または初期/後期プロモーターである。特定の実施形態では、少なくとも1つのプロモーターは、初期プロモーター及び後期プロモーターである。特定の実施形態では、後期プロモーターは、TAAATヌクレオチド配列(配列番号631)を含み得る。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、抗CTLA-4抗体をコードする第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、初期プロモーター、後期プロモーター、または初期/後期プロモーターである。特定の実施形態では、少なくとも1つのプロモーターは、初期プロモーター及び後期プロモーターである。特定の実施形態では、後期プロモーターは、TAAATヌクレオチド配列(配列番号631)を含み得る。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5R初期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、AAAAATGAAAATAAA(配列番号630)またはTAAAAAATGAAAATAAATACAAAGGTTCTT(配列番号553)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5R後期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、TAAAT(配列番号631)、TCTTGAGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号632)、またはAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号554)のヌクレオチド配列を含む)である。特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、H5R初期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、AAAAATGAAAATAAA(配列番号630)またはTAAAAAATGAAAATAAATACAAAGGTTCTT(配列番号553)のヌクレオチド配列を含む)、及びH5R後期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、TAAAT(配列番号631)、TCTTGAGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号632)、またはAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号554)のヌクレオチド配列を含む)である。H5R後期プロモーターがTAAATのヌクレオチド配列(配列番号631)を含む場合、一実施形態では、核酸は、TAAATとATG翻訳開始コドンとの間の介在配列(例えば、長さが約10、20、30、または40ヌクレオチドである介在配列)を含み、別の実施形態では、TAAATとATG翻訳開始コドンとの間に介在配列が存在しない(例えば、TAAATの最後の2つのヌクレオチドが、ATG翻訳開始コドンの最初の2つのヌクレオチドである)。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、pS初期プロモーター(例えば、AAAATTGAAATTTTA(配列番号555)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、pS後期プロモーター(例えば、TTTTATTTTTTTTTTTTGGAATATAAATA(配列番号556)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、pS初期/後期プロモーター(例えば、AAAATTGAAATTTTATTTTTTTTTTTTGGAATATAAATA(配列番号557)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、LEO初期プロモーター(例えば、TTTTATTTTTTTTTTTTGGAATATAAATA(配列番号556)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、LEO後期プロモーター(例えば、AAAATTGAAAAAATA(配列番号558)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、LEO初期/後期プロモーター(例えば、TTTTATTTTTTTTTTTTGGAATATAAATATCCGGTAAAATTGAAAAAATA(配列番号559)のヌクレオチド配列を含む)である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、後期プロモーターである。特定の実施形態では、後期プロモーターは、TTNTTTTTTNTTTTTTTNNNNTATAAAT(配列番号560、Nが任意のヌクレオチドである)のヌクレオチド配列を含む。別の特定の実施形態では、後期プロモーターは、TTGTATTTTCTTTTGTTGGCATATAAAT(配列番号561)のヌクレオチド配列を含む。別の特定の実施形態では、後期プロモーターは、D13Lプロモーター(例えば、TTTATTGTAAGCTTTTTCCATTTTAAAT(配列番号562)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、後期プロモーターは、F17Rプロモーター(例えば、TCATTTTGTTTTTTTCTATGCTATAAAT(配列番号563)のヌクレオチド配列を含む)である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、初期プロモーター、後期プロモーター、または初期/後期プロモーターである。特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B8Rプロモーター(例えば、TAAAAATTTAAAATATATTATCACTTCAGT(配列番号564)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B19Rプロモーター(例えば、AAAAAACTGATATTATATAAATATTTTAGT(配列番号565)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、NNAAAANTGAAAANATANNNNNNNNNNNNN(配列番号566、Nが任意のヌクレオチドである)のヌクレオチド配列を含む。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、E3Lプロモーター(例えば、AAAAAAATGATAAAGTAGGTTCAGTTTTAT(配列番号567)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、F11Lプロモーター(例えば、TAAAAAGTGAAAAACAATATTATTTTTATC(配列番号568)のヌクレオチド配列を含む)である。別の特定の実施形態では、第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターは、B2Rプロモーター(例えば、AAAATTAAAAAATAACTTAATTTATTATTG(配列番号569)のヌクレオチド配列を含む)である。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約100ヌクレオチドと重複するか、またはその内にある。特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約80ヌクレオチド内である。特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約70ヌクレオチド内である。特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約60ヌクレオチド内である。特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約50ヌクレオチド内である。別の特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約40ヌクレオチド内である。別の特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約30ヌクレオチド内である。別の特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約20ヌクレオチド内である。別の特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約10ヌクレオチド内である。別の特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの約5ヌクレオチド内である。別の特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンの2ヌクレオチド内である。別の特定の実施形態では、プロモーター配列は、プロモーターが作動可能に連結された導入遺伝子の翻訳開始コドンと重複する。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、核酸は、ヌクレオチド配列を含む導入遺伝子を含み、核酸が、ヌクレオチド配列と作動可能に連結された非翻訳領域(UTR)、例えば、H5R UTRまたはその一部、例えば、H5R UTRの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%を含むヌクレオチド配列をさらに含み得る。特定の実施形態では、H5R UTRまたはその一部は、H5R初期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、AAAAATGAAAATAAA(配列番号630)またはTAAAAAATGAAAATAAATACAAAGGTTCTT(配列番号553)のヌクレオチド配列を含む)を含む。別の特定の実施形態では、H5R UTRまたはその一部は、H5R後期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、TAAAT(配列番号631)、TCTTGAGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号632)、またはAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号554)のヌクレオチド配列を含む)を含む。別の特定の実施形態では、H5R UTRまたはその一部は、H5R初期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、AAAAATGAAAATAAA(配列番号630)またはTAAAAAATGAAAATAAATACAAAGGTTCTT(配列番号553)のヌクレオチド配列を含む)、及びH5R後期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、TAAAT(配列番号631)、TCTTGAGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号632)、またはAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号554)のヌクレオチド配列を含む)を含む。別の特定の実施形態では、H5R UTRは、TTAAAGTTACAAACAACTAGGAAATTGGTTTATGATGTATAATTTTTTTAGTTTTTATAGATTCTTTATTCTATACTTAAAAAATGAAAATAAATACAAAGGTTCTTGAGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAATTATTTCATTATCGCGATATCCGTTAAGTTTGTATCGTA(配列番号626)のヌクレオチド配列を含む。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、核酸は、CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子を含み、核酸は、非翻訳領域(UTR)をコードするヌクレオチド配列をさらに含み得る。例えば、UTRは、第1のヌクレオチド配列に作動可能に連結されたH5R UTRまたはその一部(例えば、H5R UTRの少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%)を含むことができる。特定の実施形態では、H5R UTRは、H5R初期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、AAAAATGAAAATAAA(配列番号630)またはTAAAAAATGAAAATAAATACAAAGGTTCTT(配列番号553)のヌクレオチド配列を含む)を含む。別の特定の実施形態では、H5R UTRは、H5R後期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、TAAAT(配列番号631)、TCTTGAGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号632)、またはAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号554)のヌクレオチド配列を含む)を含む。別の特定の実施形態では、H5R UTRは、H5R初期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、AAAAATGAAAATAAA(配列番号630)またはTAAAAAATGAAAATAAATACAAAGGTTCTT(配列番号553)のヌクレオチド配列を含む)、及びH5R後期プロモーター(例えば、任意で配列の上流及び/または下流に1つ、2つ、3つ、4つ、5つ以上のヌクレオチドを有する、TAAAT(配列番号631)、TCTTGAGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号632)、またはAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAAT(配列番号554)のヌクレオチド配列を含む)を含む。別の特定の実施形態では、H5R UTRは、TTAAAGTTACAAACAACTAGGAAATTGGTTTATGATGTATAATTTTTTTAGTTTTTATAGATTCTTTATTCTATACTTAAAAAATGAAAATAAATACAAAGGTTCTTGAGGGTTGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATAATCATAAATTATTTCATTATCGCGATATCCGTTAAGTTTGTATCGTA(配列番号626)のヌクレオチド配列を含む。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、以下の遺伝子のうちの少なくとも1つ、2つ、3つ、4つ、5つ、6つ、7つ、8つ、9つ、10個、20個、30個、40個、50個、60個、70個、80個、90個、もしくは100個、または全てが組換えワクシニアウイルスゲノムから欠失されない:C3L、C4L、C5L、C6L、C7L、C8L、C9L、C10L、C11R、C12L、C13L、C14L、C15L(5’ITRにおける)、C16L(5’ITRにおける)、C17L(5’ITRにおける)、C18L(5’ITRにおける)、C19L(5’ITRにおける)、C20L(5’ITRにおける)、C21L(5’ITRにおける)、C22L(5’ITRにおける)、C23L(5’ITRにおける)、F4L、F5L、F6L、F7L、F8L、F9L、F10L、F11L、F12L、F13L、F14L、F15L、F16L、F17R、E1L、E2L、E3L、E4L、E5R、E6R、E7R、E8R、E9L、E10R、E11L、O1L、O2L、I1L、I2L、I3L、I4L、I5L、I6L、I7L、I8R、G1L、G2R、G3L、G4L、G5R、G6R、G7L、G8R、G9R、L1R、L2R、L3L、L4R、L5R、J1R、J2R、J3R、J4R、J5L、J6R、H1L、H2R、H3L、H4L、H5R、H6R、H7R、D1R、D2L、D3R、D4R、D5R、D6R、D7R、D8L、D9R、D10R、D11L、D12L、D13L、A1L、A2L、A3L、A4L、A5R、A6L、A7L、A8R、A9L、A10L、A11R、A12L、A13L、A14L、A15L、A16L、A17L、A18R、A19L、A20R、A21L、A22R、A23R、A24R、A25L、A26L、A27L、A28L、A29L、A30L、A31R、A32L、A33R、A34R、A35R、A36R、A37R、A38L、A39R、A40R、A41L、A42R、A43R、A44L、A45R、A46R、A47L、A48R、A49R、A50R、A51R、A52R、A53R、A54L、A55R、A56R、A57R、B1R、B2R、B3R、B4R、B5R、B6R、B7R、B8R、B9R、B10R、B11R、B12R、及びB13R(例えば、遺伝子の記載についてGoebel et al.,1990,Virology 179(1):247-266を参照されたく、かかる記載について参照により本明細書に組み込まれる)。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、表43に記載の核酸配列を含む核酸である。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、セクション6の実施例に記載されている核酸である。
一態様では、提供されるのは、組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であり、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも7つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも8つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも9つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも10個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも11個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも12個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも13個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも14個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも15個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも16個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも17個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも18個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも19個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも20個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも21個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも22個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失を含む。
一態様では、提供されるのは組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であり、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失を含む。
一態様では、提供されるのは、組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であり、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも7つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも8つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも9つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも10個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも11個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも12個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも13個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも14個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、少なくとも15個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子は、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子の各々の欠失を含む。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、宿主相互作用に関与するタンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む。例えば、いくつかの実施形態では、該タンパク質は、細胞外マトリックスへのカルシウム非依存性接着に影響を及ぼす。いくつかの実施形態では、該タンパク質は、NF-κB阻害剤、例えば、C2L、N1L、M2L、K1L、及びK7R遺伝子からなる群から選択される遺伝子によってコードされるNF-κB阻害剤である。いくつかの実施形態では、該タンパク質は、アポトーシス阻害剤、例えば、カスパーゼ-9阻害剤(F1L遺伝子によってコードされるものなど)、BCL-2様タンパク質(N1Lによってコードされるものなど)である。いくつかの実施形態では、該タンパク質は、インターフェロン制御性因子3(IRF3)阻害剤(N2LまたはK7Rによってコードされるものなど)、セリンプロテアーゼ阻害剤、細胞融合を防止するタンパク質(K2Lによってコードされるものなど)、RNA活性化タンパク質キナーゼ(PKR)阻害剤(K1LまたはK3Lによってコードされるものなど)、病原性因子(F3Lによってコードされるものなど)、IL-1-ベータ阻害剤(B16Rによってコードされるものなど)、または分泌型IFNα隔離剤(B19Rによってコードされるものなど)である。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、DNA複製に関与するタンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む。例えば、いくつかの実施形態では、該タンパク質は、DNA修飾ヌクレアーゼ(例えば、K4Lによってコードされるタンパク質)またはデオキシウリジントリホスファターゼ(dUTPase)(例えば、F2Lによってコードされるタンパク質)である。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの欠失遺伝子のヌクレオチド配列全体が欠失する。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの欠失遺伝子は、部分的にのみ欠失しており、部分欠失は、宿主細胞への導入時に該部分的に欠失した遺伝子を機能しないようにするのに十分である。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、逆位末端配列(ITR)の少なくとも2つのコピーを含む。
いくつかの実施形態において、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、ITRの任意のコピーを欠く。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、B21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRからなる群から選択されるITRの少なくとも1つのコピーにおける欠失を含む。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRのコピーの少なくとも全てにおける欠失を含む。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、B8R遺伝子における欠失を含む。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、無傷B8R遺伝子を含む。
一態様では、提供されるのは、組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であり、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、(ii)ITR:B21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含む。
一態様では、提供されるのは、組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であり、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失と、(ii)ITR:B21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含み、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、無傷B8R遺伝子を含む。
いくつかの実施形態では、提供される核酸は、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの導入遺伝子をさらに含む。いくつかの実施形態では、提供される核酸は、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの導入遺伝子をさらに含む。いくつかの実施形態では、提供される核酸は、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子をさらに含む。
例えば、いくつかの実施形態では、提供される核酸は、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、該免疫チェックポイント阻害剤は、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、該免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD-L1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、該免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である。いくつかの実施形態では、該免疫チェックポイント阻害剤は、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である。
例えば、いくつかの実施形態では、提供される核酸は、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、該インターロイキンは、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、該インターロイキンは、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、該インターロイキンは、膜結合である。いくつかの実施形態では、該インターロイキンは、膜結合IL-12 p70である。いくつかの実施形態では、該インターロイキンは、膜結合IL-12 p35である。
例えば、いくつかの実施形態では、提供される核酸は、サイトカインをコードする導入遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、該サイトカインは、インターフェロン(IFN)である。いくつかの実施形態では、インターフェロンは、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、サイトカインは、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である。いくつかの実施形態では、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質は、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、サイトカインは、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びc-kitからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、サイトカインは、Flt3リガンドである。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、B8R遺伝子における欠失を含み、少なくとも1つの導入遺伝子が、B8R遺伝子における欠失に挿入される。いくつかの実施形態において、少なくとも2つの導入遺伝子が、B8R遺伝子の欠失に挿入される。いくつかの実施形態において、少なくとも3つの導入遺伝子が、B8R遺伝子の欠失に挿入される。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの導入遺伝子は、B8R遺伝子における欠失がない遺伝子座、例えば、オルソポックスウイルスゲノムの5’末端での欠失の境界にある遺伝子座、またはオルソポックスウイルスゲノムの3’末端での欠失の境界にある遺伝子座に挿入される。
一態様では、提供されるのは、組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であり、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、(ii)ITR:B21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、(iii)B8R遺伝子における欠失に挿入されるIL-12-TM導入遺伝子と、(iv)B8R遺伝子における欠失に挿入されるFlt3リガンド導入遺伝子と、(v)(a)一本鎖抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片をコードする導入遺伝子、または(b)(i)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の重鎖をコードする導入遺伝子及び(ii)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の軽鎖をコードする導入遺伝子のいずれかと、を含み、パート(v)における導入遺伝子(複数可)が、組換えオルソポックスウイルスゲノムに存在する5p欠失の境界内に挿入され、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片が、CTLA-4と結合することが可能である。
いくつかの実施形態では、オルソポックスウイルスゲノムは、配列番号210の配列に由来し、(a)該由来配列は、B8R遺伝子の欠失、IL-12-TM導入遺伝子、Flt3リガンド導入遺伝子、及び一本または二本鎖抗CTLA-4抗体をコードする導入遺伝子(複数可)を含み、(b)IL-12-TM導入遺伝子は、配列番号212のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、(c)Flt3リガンド導入遺伝子は、配列番号213のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、(d)抗CTLA-4抗体は、配列番号211のアミノ酸配列を含む。
提供される核酸のいくつかの実施形態では、核酸は、腫瘍関連抗原、例えば、表3~30のいずれか1つに列挙される腫瘍関連抗原をコードする導入遺伝子をさらに含む。いくつかの実施形態では、腫瘍関連抗原は、CD19、CD33、EpCAM、CEA、PSMA、EGFRvIII、CD133、EGFR、CDH19、ENPP3、DLL3、MSLN、ROR1、HER2、HLAA2、EpHA2、EpHA3、MCSP、CSPG4、NG2、RON、FLT3、BCMA、CD20、FAPα、FRα、CA-9、PDGFRα、PDGFRβ、FSP1、S100A4、ADAM12m、RET、MET、FGFR、INSR、及びNTRKからなる群から選択される腫瘍関連抗原である。
いくつかの実施形態において、腫瘍関連抗原は、MAGE-A3またはその1つ以上の断片を含む。
いくつかの実施形態において、腫瘍関連抗原は、NY-ESO-1またはその1つ以上の断片を含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍関連抗原は、1つ以上のヒトパピローマウイルス(HPV)タンパク質またはその断片を含む。いくつかの実施形態では、HPVタンパク質またはその断片は、(i)HPV16のE6及びE7タンパク質またはその断片、ならびに(ii)HPV18のE6及びE7タンパク質またはその断片のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、該HPVタンパク質または断片の配列は、国際特許公開第WO/2014/127478号に開示され、その内容が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、腫瘍関連抗原は、ブラキュリまたはその1つ以上の断片を含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍関連抗原は、前立腺酸ホスファターゼまたはその1つ以上の断片を含む。
本明細書に記載の2つ以上の導入遺伝子が組換えオルソポックスウイルスゲノム(例えば、組換えワクシニアウイルスゲノム)に挿入される場合、導入遺伝子は、1つの遺伝子座または複数の遺伝子座(例えば、2つの遺伝子座または3つの遺伝子座)に挿入され得る。上述の2つ以上の導入遺伝子が同じ遺伝子座に挿入される場合、導入遺伝子は、隣接する内因性オルソポックスウイルス遺伝子(例えば、ワクシニアウイルス遺伝子)の一方または両方に対して、及び互いに同じ方向または異なる方向で挿入され得る。また、2つ以上の導入遺伝子が同じ遺伝子座に挿入される場合、組換えオルソポックスウイルスゲノム(例えば、組換えワクシニアウイルスゲノム)の同じ遺伝子座に挿入される導入遺伝子の順序が異なり得ることも企図される。
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様の特定の実施形態では、CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードするヌクレオチド配列は、切断ペプチド、例えば、自己切断ペプチド、例えば、2A自己切断ペプチドによって分離される抗CTLA-4抗体(例えば、イピリムマブ)の重鎖及び軽鎖をコードする。特定の実施形態では、2A自己切断ペプチドは、T2Aペプチドである。特定の実施形態では、T2Aペプチドは、GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP(配列番号570)のアミノ酸配列を含む。特定の実施形態では、T2Aペプチドは、PRGSGEGRGSLLTCGDVEENPGP(配列番号571)のアミノ酸配列を含む。別の特定の実施形態では、T2Aペプチドは、EGRGSLLTCGDVEENPGP(配列番号572)のアミノ酸配列を含む。別の特定の実施形態では、2A自己切断ペプチドは、P2Aペプチドである。特定の実施形態では、P2Aペプチドは、GSGATNFSLLKQAGDVEENPGP(配列番号573)のアミノ酸配列を含む。別の特定の実施形態では、P2Aペプチドは、ATNFSLLKQAGDVEENPGP(配列番号574)のアミノ酸配列を含む。別の特定の実施形態では、2A自己切断ペプチドは、E2Aペプチドである。特定の実施形態では、E2Aペプチドは、GSGQCTNYALLKLAGDVESNPGP(配列番号575)のアミノ酸配列を含む。別の特定の実施形態では、E2Aペプチドは、QCTNYALLKLAGDVESNPGP(配列番号576)のアミノ酸配列を含む。別の特定の実施形態では、2A自己切断ペプチドは、F2Aペプチドである。特定の実施形態では、F2Aペプチドは、GSGVKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP(配列番号577)のアミノ酸配列を含む。別の特定の実施形態では、F2Aペプチドは、VKQTLNFDLLKLAGDVESNPGP(配列番号578)のアミノ酸配列を含む。2A自己切断ペプチドによる抗体の重鎖及び軽鎖の連結により、抗体導入遺伝子を1つのオープンリーディングフレーム内で翻訳することが可能となり、自己切断が共翻訳的に生じ、同等量の共発現重鎖及び軽鎖がもたらされる。特定の実施形態では、本明細書に記載のヌクレオチド配列によってコードされる抗CTLA-4抗体は、配列番号211のアミノ酸配列を含む。
様々な実施形態では、本明細書に提供される核酸は、組換え核酸である。
5.2.4.修飾オルソポックスウイルス
一態様では、本明細書で提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸を含むウイルスである。特定の実施形態では、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸を含むウイルスであり、核酸は、膜結合IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。
一態様では、本明細書で提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸を含むウイルスである。特定の実施形態では、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸を含むウイルスであり、核酸は、膜結合IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子を含む組換えワクシニアウイルスゲノムを含む。
別の態様では、本明細書に提供されるのは、セクション6の実施例に記載のウイルスである。
別の態様では、提供されるのは、本明細書に記載の組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸を含むウイルスである。いくつかの実施形態では、a)組換えオルソポックスウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、b)該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含み、またはc)該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む。
いくつかの実施形態では、該ウイルスは、ワクシニアウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、該ワクシニアウイルスは、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1からなる群から選択される株に由来する。いくつかの実施形態では、該ワクシニアウイルスは、Copenhagen、Western Reserve、Tian Tan、Wyeth、及びListerからなる群から選択される株に由来する。いくつかの実施形態では、該ワクシニアウイルスは、Copenhagen株ワクシニアウイルスに由来する。
いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、チミジンキナーゼ(TK)遺伝子をさらに含む。いくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスゲノムは、リボヌクレオチドレダクターゼ遺伝子をさらに含む。
提供されるウイルスのいくつかの実施形態では、細胞(例えば、哺乳動物細胞)の集団を該ウイルスと接触させると、該欠失を含まないウイルスの形態と接触した同じ型の細胞(例えば、哺乳動物細胞)の集団と比較して、細胞(例えば、哺乳動物細胞)の集団が増加した合成細胞形成を示す。
提供されるウイルスのいくつかの実施形態では、細胞(例えば、哺乳動物細胞)の集団を該ウイルスと接触させると、該欠失を含まないウイルスの形態と接触した同じ型の細胞(例えば、哺乳動物細胞)の集団と比較して、細胞(例えば、哺乳動物細胞)の集団がウイルスの増加した拡散を示す。
提供されるウイルスのいくつかの実施形態では、該組換えオルソポックスウイルスベクターは、該欠失を含まないウイルスの形態と比較して、細胞(例えば、哺乳類細胞)の集団に増加した細胞障害性効果を発揮する。
いくつかの実施形態では、該哺乳動物細胞は、ヒト細胞である。
いくつかの実施形態では、該ヒト細胞は、がん細胞である。
いくつかの実施形態では、該哺乳動物細胞は、U2OS、293、293T、Vero、HeLa、A549、BHK、BSC40、CHO、OVCAR-8、786-0、NCI-H23、U251、SF-295、T-47D、SKMEL2、BT-549、SK-MEL-28、MDA-MB-231、SK-OV-3、MCF7、M14、SF-268、CAKI-1、HPAV、OVCAR-4、HCT15、K-562、及びHCT-116からなる群から選択される細胞株由来である。
提供されるウイルスのいくつかの実施形態では、ウイルスは、腫瘍関連抗原、例えば、表3~30のいずれか1つに列挙される腫瘍関連抗原をコードする導入遺伝子をさらに含む。いくつかの実施形態では、腫瘍関連抗原は、CD19、CD33、EpCAM、CEA、PSMA、EGFRvIII、CD133、EGFR、CDH19、ENPP3、DLL3、MSLN、ROR1、HER2、HLAA2、EpHA2、EpHA3、MCSP、CSPG4、NG2、RON、FLT3、BCMA、CD20、FAPα、FRα、CA-9、PDGFRα、PDGFRβ、FSP1、S100A4、ADAM12m、RET、MET、FGFR、INSR、及びNTRKからなる群から選択される腫瘍関連抗原である。
いくつかの実施形態において、腫瘍関連抗原は、MAGE-A3またはその1つ以上の断片を含む。
いくつかの実施形態において、腫瘍関連抗原は、NY-ESO-1またはその1つ以上の断片を含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍関連抗原は、1つ以上のヒトパピローマウイルス(HPV)タンパク質またはその断片を含む。いくつかの実施形態では、HPVタンパク質またはその断片は、(i)HPV16のE6及びE7タンパク質またはその断片、ならびに(ii)HPV18のE6及びE7タンパク質またはその断片のうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、該HPVタンパク質または断片の配列は、国際特許公開第WO/2014/127478号に開示され、その内容が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、腫瘍関連抗原は、ブラキュリまたはその1つ以上の断片を含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍関連抗原は、前立腺酸ホスファターゼまたはその1つ以上の断片を含む。
特定の実施形態では、本明細書に提供されるウイルスは、単離される。特定の実施形態では、本明細書に提供されるウイルスは、精製される。
様々な実施形態では、本明細書に提供されるウイルスは、組換えウイルスである。
特定の実施形態では、本明細書に提供されるウイルスは、患者(例えば、哺乳動物患者)に投与された場合にポックス病変形成を引き起こさない。特定の実施形態では、本明細書で提供されるウイルスは、インビトロで、及び/または患者(例えば、哺乳動物患者)に投与された場合に複製することが可能である。特定の実施形態では、本明細書で提供されるウイルスは、インビトロで、及び/または患者(例えば、哺乳動物患者)に投与された場合に、本明細書に記載の導入遺伝子(複数可)を発現することができる。特定の実施形態では、本明細書で提供されるウイルスは、インビトロで、及び/または患者(例えば、哺乳動物患者)に投与された場合に、標的腫瘍細胞を殺傷することが可能である(例えば、がん細胞障害性を示す)。ポックス病変の形成、複製、導入遺伝子発現、または標的腫瘍細胞の殺傷(例えば、がん細胞障害性)を決定するために使用され得る例示的なアッセイについては、セクション6の実施例を参照されたい。
5.2.5.ウイルス特性を測定するためのアッセイ
特定の実施形態では、本明細書に記載のウイルスは、当該技術分野で知られる方法を使用して、それらの複製/拡散能力、生存率、導入遺伝子発現、及び/または標的腫瘍細胞を殺傷させる能力(例えば、がん細胞傷害性)について試験された。複製/拡散、生存率、導入遺伝子の発現、または標的腫瘍細胞の殺傷(例えば、がん細胞障害性)を決定するために使用され得る例示的なアッセイについて、セクション6の実施例を参照されたい。
特定の実施形態では、本明細書に記載のウイルスは、当該技術分野で知られる方法を使用して、それらの複製/拡散能力、生存率、導入遺伝子発現、及び/または標的腫瘍細胞を殺傷させる能力(例えば、がん細胞傷害性)について試験された。複製/拡散、生存率、導入遺伝子の発現、または標的腫瘍細胞の殺傷(例えば、がん細胞障害性)を決定するために使用され得る例示的なアッセイについて、セクション6の実施例を参照されたい。
ウイルスの腫瘍拡散及び毒性を測定するための当該技術分野で既知のアッセイには、これらに限定されないが、プラークサイズ、シンシチウム形成、及び/またはコメットアッセイ(EEV)を測定することが含まれる。ウイルスの免疫刺激活性を測定するための当該技術分野で既知のアッセイには、これらに限定されないが、NK活性化(CD69発現%で測定)、NK脱顆粒(CD107aの増加倍率で測定)、及び/またはT細胞プライミングアッセイが含まれる。ウイルスの選択性を測定するための当該技術分野で既知のアッセイには、これらに限定されないが、尾のポックス病変、生体分布、及び/または体重測定が含まれる。
5.2.6.細胞、細胞株、及びパッケージング細胞株
一態様では、本明細書で提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸を含む細胞である。別の態様では、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.4に記載のウイルスを含む細胞である。特定の実施形態では、本明細書に提供される細胞は、哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)である。特定の実施形態では、本明細書に提供される細胞は、宿主細胞(例えば、セクション5.4に記載の宿主細胞)である。
一態様では、本明細書で提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸を含む細胞である。別の態様では、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.4に記載のウイルスを含む細胞である。特定の実施形態では、本明細書に提供される細胞は、哺乳動物細胞(例えば、ヒト細胞)である。特定の実施形態では、本明細書に提供される細胞は、宿主細胞(例えば、セクション5.4に記載の宿主細胞)である。
一態様では、本明細書で提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸を含む細胞株である。別の態様では、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.4に記載のウイルスを含む細胞株である。特定の実施形態では、本明細書に提供される細胞株は、哺乳動物細胞株(例えば、ヒト細胞株)である。
一態様では、本明細書で提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸を含むパッケージング細胞株である。別の態様では、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.4に記載のウイルスを含むパッケージング細胞株である。パッケージング細胞株は、オルソポックスウイルスウイルス(例えば、ワクシニアウイルス)をパッケージングするのに好適な任意の細胞株であり得る。特定の実施形態では、本明細書に提供されるパッケージング細胞株は、哺乳動物パッケージング細胞株(例えば、ヒトパッケージング細胞株)である。
本明細書に記載のウイルスを培養するために使用され得る例示的な細胞には、例えば、HeLa細胞、U2OS細胞、293T細胞、NIH3T3細胞、Jurkat細胞、293細胞、COS細胞、CHO細胞、Saos細胞、PC12細胞、及びニワトリ胚線維芽細胞(CEF)が含まれる。本明細書に記載のウイルスをパッケージするために使用され得る例示的なパッケージング細胞株には、例えば、HeLa細胞株、U2-OS細胞株、HEK293T細胞株、786-O細胞株、A549細胞株、または付着性ヒトがん細胞株が含まれる。特定の実施形態では、細胞はまた、ワクシニアウイルスの複製及び/またはパッケージングに必要な1つ以上の因子を発現するか、または発現するように操作される。
特定の実施形態では、本明細書で提供される細胞、細胞株、またはパッケージング細胞株は、セクション6の実施例に記載の細胞、細胞株、またはパッケージング細胞株である。
5.2.7.オルソポックスウイルス遺伝子によってコードされるタンパク質の例
本開示に記載のオルソポックスウイルス遺伝子によってコードされる例示的なタンパク質は、以下の表31~40に再現される。以下で使用される場合、「位置」という用語は、本明細書に記載の例示的なオルソポックスウイルスベクターにおける欠失核酸に対する遺伝子の位置を指す。様々な遺伝子について、アミノ酸配列情報及びタンパク質受託ID番号が提供される。
本開示に記載のオルソポックスウイルス遺伝子によってコードされる例示的なタンパク質は、以下の表31~40に再現される。以下で使用される場合、「位置」という用語は、本明細書に記載の例示的なオルソポックスウイルスベクターにおける欠失核酸に対する遺伝子の位置を指す。様々な遺伝子について、アミノ酸配列情報及びタンパク質受託ID番号が提供される。
5.3.遺伝子修飾の方法
標的ゲノムからの核酸の挿入または欠失のための方法は、本明細書に記載され、当該技術分野で既知であるものを含む。本発明の組成物の発現をもたらすための核酸送達の方法は、本明細書に記載のように、または当業者に既知であるように、核酸(例えば、ウイルスベクター及び非ウイルスベクターを含むDNA)を細胞小器官、細胞、組織、または生物に導入することができる実質的に任意の方法を含むと考えられる。かかる方法には、これらに限定されないが、マイクロインジェクション(Harland and Weintraub,1985、米国特許第5,789,215号、参照により本明細書に組み込まれる)を含む注入による(米国特許第5,994,624号、同第5,981,274号、同第5,945,100号、同第5,780,448号、同第5,736,524号、同第5,702,932号、同第5,656,610号、同第5,589,466号、及び第5,580,859号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、エレクトロポレーションによる(米国特許第5,384,253号、参照により本明細書に組み込まれる)、リン酸カルシウム沈殿による(Graham and Van Der Eb,1973、Chen and Okayama,1987、Rippe et al.,1990)、DEAE-デキストランに続いてポリエチレングリコールを使用することによる(Gopal,1985)、直接音波負荷による(Fechheimer et al.,1987)、リポソームを介したトランスフェクションによる(Nicolau and Sene,1982、Fraley et al.,1979、Nicolau et al.,1987、Wong et al.,1980、Kaneda et al.,1989、Kato et al.,1991)、微粒子銃による(PCT出願第WO94/09699号及び同第95/06128号、米国特許第5,610,042号、同第5,322,783号、同第5,563,055号、同第5,550,318号、同第5,538,877号、及び同第5,538,880号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、炭化ケイ素繊維との攪拌による(Kaeppler et al.,1990、米国特許第5,302,523号及び同第5,464,765号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、アグロバクテリウムを介した形質転換による(米国特許第5,591,616号及び同第5,563,055号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、またはプロトプラストのPEGを介した形質転換による(Omirulleh et al.,1993、米国特許第4,684,611号及び同第4,952,500号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、乾燥/阻害を介したDNA取り込みによる(Potrykus et al.,1985)などのDNAの直接的な送達が含まれる。これらのような技術の適用を通じて、細胞小器官(複数可)、細胞(複数可)、組織(複数可)、または生物(複数可)は、安定的または一時的に形質転換され得る。
標的ゲノムからの核酸の挿入または欠失のための方法は、本明細書に記載され、当該技術分野で既知であるものを含む。本発明の組成物の発現をもたらすための核酸送達の方法は、本明細書に記載のように、または当業者に既知であるように、核酸(例えば、ウイルスベクター及び非ウイルスベクターを含むDNA)を細胞小器官、細胞、組織、または生物に導入することができる実質的に任意の方法を含むと考えられる。かかる方法には、これらに限定されないが、マイクロインジェクション(Harland and Weintraub,1985、米国特許第5,789,215号、参照により本明細書に組み込まれる)を含む注入による(米国特許第5,994,624号、同第5,981,274号、同第5,945,100号、同第5,780,448号、同第5,736,524号、同第5,702,932号、同第5,656,610号、同第5,589,466号、及び第5,580,859号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、エレクトロポレーションによる(米国特許第5,384,253号、参照により本明細書に組み込まれる)、リン酸カルシウム沈殿による(Graham and Van Der Eb,1973、Chen and Okayama,1987、Rippe et al.,1990)、DEAE-デキストランに続いてポリエチレングリコールを使用することによる(Gopal,1985)、直接音波負荷による(Fechheimer et al.,1987)、リポソームを介したトランスフェクションによる(Nicolau and Sene,1982、Fraley et al.,1979、Nicolau et al.,1987、Wong et al.,1980、Kaneda et al.,1989、Kato et al.,1991)、微粒子銃による(PCT出願第WO94/09699号及び同第95/06128号、米国特許第5,610,042号、同第5,322,783号、同第5,563,055号、同第5,550,318号、同第5,538,877号、及び同第5,538,880号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、炭化ケイ素繊維との攪拌による(Kaeppler et al.,1990、米国特許第5,302,523号及び同第5,464,765号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、アグロバクテリウムを介した形質転換による(米国特許第5,591,616号及び同第5,563,055号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、またはプロトプラストのPEGを介した形質転換による(Omirulleh et al.,1993、米国特許第4,684,611号及び同第4,952,500号、各々が参照により本明細書に組み込まれる)、乾燥/阻害を介したDNA取り込みによる(Potrykus et al.,1985)などのDNAの直接的な送達が含まれる。これらのような技術の適用を通じて、細胞小器官(複数可)、細胞(複数可)、組織(複数可)、または生物(複数可)は、安定的または一時的に形質転換され得る。
以下示すのは、CopMD5p、CopMD3p、及びCopMD5p3pウイルスにおける欠失遺伝子のクラスター及びそれらの機能である。ITR遺伝子(「ITR」及び「*」によって表2で指定される)は、ゲノムの右側のITRである1つのコピーで欠失される。しかしながら、これらの遺伝子は、左側のITRにおいて第2のコピーを有し、これは、これらのウイルスにおいて無傷のままである。欠失は、全ゲノム配列決定により確認した。欠失した遺伝子の大部分は、ウイルス感染に対する宿主応答の遮断に関与するか、または未知の機能を有するかのいずれかである。
様々な実施形態では、オルソポックスウイルスは、B8R遺伝子において欠失を含むようにさらに遺伝子修飾される。ワクシニアウイルスB8R遺伝子は、ガンマインターフェロン受容体(IFN-γ)と相同性を有する分泌タンパク質をコードする。インビトロにおいて、B8Rタンパク質は、ヒト及びラットガンマインターフェロンを含むいくつかの種のガンマインターフェロンと結合し、抗ウイルス活性を中和するが、マウスIFN-γとは有意に結合しない。B8R遺伝子を欠失させることは、ヒトにおけるIFN-γの障害を防止する。様々な実施形態では、1つ、2つ、または3つの導入遺伝子が、欠失したB8R遺伝子の遺伝子座に挿入される。いくつかの株において、B8R欠失の部位に存在する導入遺伝子(複数可)に加えて、株はまた、欠失したB8R遺伝子の遺伝子座ではないオルソポックスウイルス上の追加の遺伝子座に挿入される少なくとも1つの導入遺伝子を有する。様々な実施形態では、少なくとも1つの導入遺伝子が5p欠失の境界に挿入され、少なくとも1つの導入遺伝子が3p欠失の境界に挿入され、またはその両方に挿入される。様々な実施形態では、少なくとも3つ、4つ、5つ以上の導入遺伝子が、修飾オルソポックスウイルスゲノムに挿入される。
様々な実施形態では、修飾オルソポックスウイルスベクターの配列は、以下の表43において、配列番号210として示される配列である。いくつかの実施形態において、修飾オルソポックスウイルスベクターの配列は、配列番号210の誘導体である。例えば、本明細書に記載のように、修飾オルソポックスウイルスベクターは、本明細書で考察されるように、1つ以上の導入遺伝子を発現するように修飾され得る。
様々な実施形態では、修飾オルソポックスウイルスベクターの配列は、以下の表43において、配列番号624として示される配列である。いくつかの実施形態において、修飾オルソポックスウイルスベクターの配列は、配列番号624の誘導体である。例えば、本明細書に記載のように、修飾オルソポックスウイルスベクターは、本明細書で考察されるように、B8R配列の欠失を含み得、及び/または1つ以上の導入遺伝子を発現するように修飾され得る。
様々な実施形態において、修飾オルソポックスウイルスは、3つの導入遺伝子:IL-12-TM、FLT3-L、及び抗CLTA4抗体のうちの少なくとも1つを発現する。これらの導入遺伝子の配列及び/またはそれらによってコードされるアミノ酸配列の非限定的な例を以下に記載する:
本明細書に記載の組換えワクシニアウイルスを生成する例示的な方法については、セクション6.32の実施例32を参照されたい。
5.4.ウイルス増殖
本発明は、組み換えオルソポックスウイルスを特徴とし、野生型と比較して1つ以上の遺伝子欠失を用いて構築されたものが含まれ、これにより、ウイルスは、非がん細胞に対して毒性が低いまたは非毒性である一方で、がん細胞に対して使用するための所望の特性を示す。このセクションは、例えば、組換えDNA技術の使用を介して変異ウイルスを生成する方法など、本明細書に記載の組換えオルソポックスウイルスを産生するための様々なプロトコルを要約する。
本発明は、組み換えオルソポックスウイルスを特徴とし、野生型と比較して1つ以上の遺伝子欠失を用いて構築されたものが含まれ、これにより、ウイルスは、非がん細胞に対して毒性が低いまたは非毒性である一方で、がん細胞に対して使用するための所望の特性を示す。このセクションは、例えば、組換えDNA技術の使用を介して変異ウイルスを生成する方法など、本明細書に記載の組換えオルソポックスウイルスを産生するための様々なプロトコルを要約する。
例えば、オルソポックスウイルスゲノムにおける変異を生成するために、天然及び修飾ポリペプチドは、ベクターに含まれる核酸分子によってコードされ得る。ベクターは、例えば、プラスミド、コスミド、ウイルス(バクテリオファージ、動物ウイルス、及び植物ウイルス)、及び人工染色体(例えば、YAC)を含み得る。当業者は、Sambrook et al.,(1989)及びAusubel et al.,1994に記載される標準的な組換え技法を通じてベクターを構築するのに十分に備わっており、これらの両方は参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。修飾ポリペプチドをコードすることに加えて、ベクターは、タグまたは標的分子などの非修飾ポリペプチド配列をコードし得る。
宿主細胞内でベクターを増殖させるために、それは、複製が開始される特定の核酸配列である複製部位の1つ以上の起源(多くの場合、「オリ」と称される)を含み得る。代替的に、宿主細胞が酵母である場合、自律複製配列(ARS)を用いることができる。
異種核酸配列を発現する文脈において、「宿主細胞」は、原核細胞または真核細胞を指し、ベクターを複製することができ、及び/またはベクターによってコードされる異種遺伝子を発現することができる任意の形質転換可能な生物を含む。宿主細胞は、ベクターまたはウイルス(それらが外因性ポリペプチドを発現する場合、ベクターとして適格である)のレシピエントとして使用することができ、これまでに使用されている。宿主細胞は、「トランスフェクト」または「形質転換」され得、これは、修飾されたタンパク質をコードする配列などの外因性核酸が宿主細胞に移入または導入されるプロセスを指す。形質転換細胞は、初代対象細胞及びその子孫を含む。宿主細胞は、所望の結果がベクターの複製であるか、またはベクターコード核酸配列の一部もしくは全ての発現であるかに応じて、酵母細胞、昆虫細胞、及び哺乳動物細胞を含む原核生物または真核生物に由来し得る。宿主細胞として使用するために多数の細胞株及び培養物が利用可能であり、それらは、生体培養及び遺伝子物質のアーカイブとして機能する組織であるAmerican Type Culture Collection(ATCC)を通じて得ることができる(www.atcc.org)。適切な宿主は、ベクター骨格及び所望の結果に基づいて、当業者によって決定することができる。プラスミドまたはコスミドは、例えば、多くのベクターの複製のために原核生物宿主細胞に導入され得る。ベクター複製及び/または発現のための宿主細胞として使用される細菌細胞には、DH5α、JM109、及びKCB、ならびにSURE(登録商標)Competent Cells、及びSOLOPACK(商標)Gold Cells(STRATAGENE(登録商標)、La Jolla、Calif.)などの市販の多数の細菌宿主が含まれる。代替的に、E.coli LE392などの細菌細胞が、ファージウイルスの宿主細胞として使用することができる。適切な酵母細胞には、Saccharomyces cerevisiae、Saccharomyces pombe、及びPichia pastorisが含まれる。ベクター複製及び/または発現のための真核生物宿主細胞の例には、HeLa、NIH3T3、Jurkat、293、COS、CHO、Saos、及びPC12が含まれる。様々な細胞型及び生物由来の多くの宿主細胞が入手可能であり、当該技術分野の技能者には既知であろう。同様に、ウイルスベクターは、真核宿主細胞または原核宿主細胞、特にベクターの複製または発現を許容する宿主細胞と併せて使用することができる。いくつかのベクターは、それが原核細胞及び真核細胞の両方において複製及び/または発現されることを可能にする制御配列を用いることができる。当業者は、上記の宿主細胞を全てインキュベートしてそれらを維持し、ベクターの複製を可能にする条件をさらに理解するであろう。ベクターの大規模な産生、ならびにベクター及びそれらの同族ポリペプチド、タンパク質、またはペプチドによってコードされる核酸の産生を可能にする技術及び条件も理解され、既知である。
また、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.6及び5.4に記載の細胞、細胞株、またはパッケージング細胞株を使用して、セクション5.2.4に記載のウイルスを増殖させる方法である。一態様では、本明細書に提供されるのは、本明細書に記載のウイルスに感染した細胞、細胞株、またはパッケージング細胞株を培養することを含む、ウイルスを増殖させる方法である。いくつかの実施形態では、ウイルスは、増殖後に単離または精製される。ウイルスを増殖させるための例示的な方法及び技法については、セクション6の例を参照されたい。
5.5.治療方法
5.5.1.薬学的組成物、投与、及び用量
また、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.4に記載のウイルス及び生理学的に許容される担体を含む薬学的組成物である。特定の実施形態では、本明細書で提供される薬学的組成物は、治療有効量のウイルスを含む。特定の実施形態では、本明細書に提供される薬学的組成物は、本明細書に記載の治療方法において使用される。
5.5.1.薬学的組成物、投与、及び用量
また、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.4に記載のウイルス及び生理学的に許容される担体を含む薬学的組成物である。特定の実施形態では、本明細書で提供される薬学的組成物は、治療有効量のウイルスを含む。特定の実施形態では、本明細書に提供される薬学的組成物は、本明細書に記載の治療方法において使用される。
本発明の組換えオルソポックスウイルスベクターを含む治療組成物は、当該技術分野で既知の方法を使用して調製することができる。例えば、かかる組成物は、例えば、生理学的に許容される担体、賦形剤、または安定剤(Remington’s Pharmaceutical Sciences 16th edition,Osol,A.Ed.(1980)、参照により本明細書に組み込まれる)を使用して、所望の形態、例えば、凍結乾燥製剤または水溶液の形態で調製することができる。
本発明の方法及び組成物を使用して、腫瘍溶解を誘導し、細胞を殺傷させ、成長を阻害し、転移を阻害し、腫瘍サイズを減少させ、さもなければ腫瘍細胞の悪性表現型を逆転または減少させるために、例えば、本明細書に記載の投与経路のうちの1つ以上を介して、がんを有する患者にオルソポックスウイルスを投与することによって、腫瘍を修飾オルソポックスウイルスと接触させ得る。投与経路は、がんの位置及び性質に応じて変化し得、例えば、皮内、経皮、非経口、静脈内、筋肉内、鼻腔内、皮下、局所的(例えば、腫瘍の近く、特に腫瘍の血管系または隣接する血管系を伴う)、経皮的、気管内、腹腔内、動脈内、膀胱内、腫瘍内、吸入、灌流、洗浄、及び経口投与ならびに製剤を含み得る。特定の実施形態では、本明細書において提供される薬学的組成物は、使用される投与経路に適するように製剤化される。
「血管内」という用語は、患者の血管系への送達を指し、患者の血管もしくは複数の血管への(into)、その内(within)またはその内(in)への送達を意味すると理解される。特定の実施形態では、投与は静脈(静脈内)と見なされる血管内へのものであり、他の実施形態では、投与は動脈と見なされる血管内へのものである。静脈には、これらに限定されないが、内頸静脈、末梢静脈、冠状静脈、肝静脈、門脈、大伏在静脈、肺静脈、上大静脈、下大静脈、胃静脈、脾静脈、下腸間膜静脈、上腸間膜静脈、橈側皮静脈、及び/または大腿静脈が含まれる。動脈には、これらに限定されないが、冠状動脈、肺動脈、上腕動脈、内頸動脈、大動脈弓、大腿動脈、末梢動脈、及び/または繊毛動脈が含まれる。送達は、細動脈または毛細血管を通して、またはそれに送達され得ることが企図される。
腫瘍内注入、または腫瘍血管系への直接的な注入は、離散した、固体の、アクセス可能な腫瘍に対して特に企図される。局所的、領域的、または全身投与もまた、適切であり得る。ウイルス粒子は、例えば、約1cm間隔で、腫瘍に複数回の注入を投与することによって有利に接触させることができる。外科的介入の場合、本発明は、手術不能な腫瘍を切除の対象にするためなどに、手術前に使用し得る。連続投与はまた、必要に応じて、例えば、カテーテルを腫瘍または腫瘍血管系に移植することによって適用され得る。かかる連続灌流は、例えば、治療開始後、約1~2時間、約2~6時間、約6~12時間、または約12~24時間の期間にわたって行われ得る。一般に、連続灌流を介した治療用組成物の用量は、灌流が発生する期間にわたって調整された単一または複数の注射によって与えられる用量と同等であり得る。特に黒色腫及び肉腫の治療には、四肢灌流を使用して本発明の治療組成物を投与することがさらに企図される。
治療レジメンは様々であり得、多く場合、腫瘍型、腫瘍位置、疾患進行、ならびに患者の健康及び年齢に依存する。特定の型の腫瘍は、より積極的な治療を必要とするが、同時に、特定の患者は、より負担となるプロトコルを許容できない。臨床医は、治療製剤の既知の有効性及び毒性(存在する場合)に基づいてかかる決定を行うのに最も好適である。特定の実施形態では、治療される腫瘍は、少なくとも最初は切除可能ではない場合がある。本開示の治療剤を用いた治療は、周辺部位での収縮または特定の特に侵襲的な部分の除去によって腫瘍の切除可能性を増加させ得る。治療後、切除が可能であり得る。切除後の追加の治療は、腫瘍部位における顕微鏡的な残存疾患を排除する役割を果たす。
治療は、様々な「単位用量」を含み得る。単位用量は、所定量の治療用組成物を含有するものとして定義される。投与される量、ならびに特定の経路及び製剤は、臨床分野の技術の範囲内である。単位用量は、単一の注入として投与する必要はないが、設定された期間にわたる連続注入を含み得る。本発明の単位用量は、ウイルス構築物のプラーク形成単位(pfu)の観点から好都合に記載され得る。単位用量は、103、104、105、106、107、108、109、1010、1011、1012、~1013pfu以上の範囲であり得る。追加的にまたは代替的に、達成可能なウイルスの種類及び力価に応じて、1~100、10~50、100~1000、または最大約もしくは少なくとも約1×104、1×105、1×106、1×107、1×108、1×109、1×1010、1×1011、1×1012、1×1013、1×1014、もしくは1×1015以上の感染性ウイルス粒子(vp)が、その間の全ての値及び範囲を含めて、腫瘍または腫瘍部位に送達され得る。
本明細書に開示される組み換えオルソポックスウイルスゲノムのがんまたは腫瘍細胞への送達の別の方法は、腫瘍内注入を介し得る。しかしながら、本明細書に開示される薬学的組成物は、代替的に、米国特許第5,543,158号、米国特許第5,641,515号、及び米国特許第5,399,363号(各々が参照によりその全体が本明細書に詳細に組み込まれる)に記載されるように、非経口的に、静脈内に、皮内に、筋肉内に、経皮的に、またはさらには腹腔内に投与され得る。核酸構築物の注入は、発現構築物が注入に必要とされる特定の針の規格を通過することができる限り、シリンジまたは溶液の注射に使用される任意の他の方法によって送達され得る。本明細書に記載の組換えオルソポックスウイルスの投与のために使用され得る例示的な針なし注入システムは、米国特許第5,846,233号に例示される。このシステムは、溶液を保持するためのアンプルチャンバを規定するノズル、及び溶液をノズルから送達部位に押し出すためのエネルギーデバイスを特徴とする。別の例示的なシリンジシステムは、任意の深さで正確に所定量の溶液を複数回注入することを可能にするものである(米国特許第5,846,225号)。
本明細書に記載のウイルス粒子または核酸の混合物は、1つ以上の賦形剤、担体、または希釈剤と好適に混合した水中で調製することができる。分散液は、グリセロール、液体ポリエチレングリコール、及びそれらの混合物中、ならびに油中で調製することもできる。通常の保存及び使用条件下では、これらの調製物は、微生物の成長を防止するための防腐剤を含有し得る。注射可能な使用に好適な薬学的形態には、滅菌水溶液、または滅菌注入液もしくは分散液を即時調製するための分散液及び滅菌粉末を含む(具体的には、米国特許第5,466,468号、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。すべての事例において、形態は滅菌であり得、容易な注射可能性が存在する程度まで流体であり得る。これは、製造及び保存条件下で安定であり、細菌及び真菌などの微生物の汚染作用から保護される必要がある。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、及び液体ポリエチレングリコールなど)、それらの好適な混合物、及び/または植物油を含有する溶媒または分散媒であり得る。適切な流動性は、例えば、レシチンなどのコーティングの使用によって、分散の場合に必要な粒子サイズの維持によって、及び界面活性剤の使用によって維持され得る。微生物作用の予防は、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸、チメロサールなどの様々な抗菌剤及び抗真菌剤によってもたらすことができる。多くの事例において、等張剤、例えば、糖または塩化ナトリウムを含むことが好ましい。注射可能な組成物の持続的吸収は、吸収を遅延させる薬剤、例えば、モノステアリン酸アルミニウム及びゼラチンの組成物における使用によってもたらすことができる。
例えば、水溶液中の非経口投与の場合、溶液は、必要に応じて適切に緩衝され得、液体希釈剤は、最初に十分な生理食塩水またはグルコースで等張性をもたらし得る。これらの特定の水溶液は、静脈内、筋肉内、皮下、腫瘍内、及び腹腔内投与に特に好適である。これに関連して、使用することができる滅菌水性媒体は、本開示に照らして当業者に知られているであろう。例えば、1回の投薬量は、1mlの等張NaCl溶液に溶解され、1000mlの皮下溶解液に追加されるか、または提案された注入部位に注射され得る。治療される対象の状態に応じて、投与量にいくらかの変動が必然的に生じる。投与の責任者は、いずれにしても、個々の対象に適切な用量を決定する。さらに、ヒト投与のために、調製物は、FDA Office of Biologics基準によって要求される滅菌性、発熱性、一般的な安全性、及び純度基準を満たす必要がある。
本明細書で使用される場合、「担体」は、任意及び全ての溶媒、分散媒体、ビヒクル、コーティング、希釈剤、抗菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤、緩衝液、担体溶液、懸濁液、コロイドなどを含む。薬学的活性物質のためのかかる媒体及び薬剤の使用は、当該技術分野で周知である。任意の従来の媒体または薬剤が活性成分と互換性がない限り、治療組成物中でのその使用が企図される。補助的な活性成分も組成物に組み入れることもできる。「薬学的に許容される」または「薬理学的に許容される」という句は、ヒトに投与された場合にアレルギーまたは同様の有害な反応を生じない分子実体及び組成物を指す。活性成分としてタンパク質を含有する水性組成物の調製は、当該技術分野で十分に理解されている。典型的には、かかる組成物は、液体溶液または懸濁液のいずれかとして注射用として調製され、注入前の液体中への溶解または懸濁に好適な固体形態も調製することができる。
5.5.2.治療方法
さらに本明細書で提供されるのは、患者(例えば、ヒト患者などの哺乳類患者)におけるがんなどの細胞増殖障害を治療する方法である。
さらに本明細書で提供されるのは、患者(例えば、ヒト患者などの哺乳類患者)におけるがんなどの細胞増殖障害を治療する方法である。
一態様では、本明細書で提供されるのは、患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)におけるがんなどの細胞増殖障害を治療する方法であり、方法は、セクション5.2.4に記載の治療有効量のウイルスを患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)に投与することを含む。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)におけるがんなどの細胞増殖障害を治療する方法であり、方法は、セクション5.5.1に記載の治療有効量の薬学的組成物を患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)に投与することを含む。
本明細書に記載の治療方法の特定の実施形態では、哺乳動物患者は、ヒト患者である。
本明細書に記載の治療方法の特定の実施形態では、がんは、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、ならびに喉癌からなる群から選択される。
本明細書に記載の治療方法の特定の実施形態では、がんは、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、副腎皮質癌、AIDS関連リンパ腫、原発性CNSリンパ腫、肛門癌、虫垂癌、星状細胞腫、異型奇形/ラブドイド腫瘍、基底細胞癌、胆管癌、肝外癌、ユーイング肉腫ファミリー、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、中枢神経系胚性腫瘍、中枢神経系胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣腫、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、原発性リンパ腫、脊索腫、慢性骨髄増殖性腫瘍、結腸癌、肝外胆管癌、非浸潤性乳管癌(DCIS)、子宮内膜癌、上衣腫、食道癌、嗅神経芽細胞腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、卵管癌、骨の線維性組織球腫、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、精巣胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛性疾患、神経膠腫、小児脳幹神経膠腫、有毛細胞白血病、肝細胞癌、ランゲルハンス細胞組織球症、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、膵島細胞腫瘍、膵臓神経内分泌腫瘍、ウィルムス腫瘍及び他の小児腎臓腫瘍、ランゲルハンス細胞組織球症、小細胞肺癌、皮膚T細胞リンパ腫、眼内黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性頸部扁平上皮癌、正中線管癌、多発性内分泌腺腫症候群、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、鼻腔及び副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫(NHL)、非小細胞肺癌(NSCLC)、上皮性卵巣癌、胚細胞卵巣癌、低悪性度卵巣癌、膵臓神経内分泌腫瘍、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔及び鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、胸膜肺芽腫、原発性腹膜癌、直腸癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、カポジ肉腫、横紋筋肉腫、セザリー症候群、小腸癌、軟部肉腫、喉癌、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、腎盂及び尿管の移行上皮癌、尿道癌、子宮内膜癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ならびにワルデンストレームマクログロブリン血症からなる群から選択される。
本明細書に記載の治療方法のいくつかの実施形態では、ウイルス及び薬学的組成物は、細胞増殖障害(がんなど)を治療するための別の薬剤と組み合わせて投与されない。
本明細書に記載の治療方法の他の実施形態では、ウイルスまたは薬学的組成物は、細胞増殖障害(がんなど)を治療するための1つ以上の追加の薬剤、例えば、セクション5.5.3に記載の1つ以上の追加の薬剤と組み合わせて投与される。
本明細書に開示される組換えオルソポックスウイルス及び薬学的組成物は、例えば、腫瘍溶解によってがん細胞を直接的に殺傷させるため、及び/または標的がん細胞に対する適応免疫応答の有効性を増強するために、がんなどの細胞増殖障害に罹患している対象、例えば、ヒトなどの哺乳類対象に投与することができる。いくつかの実施形態では、細胞増殖障害は、がん、例えば、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、または喉癌である。特定の事例では、細胞増殖障害は、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、副腎皮質癌、AIDS関連リンパ腫、原発性CNSリンパ腫、肛門癌、虫垂癌、星状細胞腫、異型奇形/ラブドイド腫瘍、基底細胞癌、胆管癌、肝外癌、ユーイング肉腫ファミリー、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、中枢神経系胚性腫瘍、中枢神経系胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣腫、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、原発性リンパ腫、脊索腫、慢性骨髄増殖性腫瘍、結腸癌、肝外胆管癌、非浸潤性乳管癌(DCIS)、子宮内膜癌、上衣腫、食道癌、嗅神経芽細胞腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、卵管癌、骨の線維性組織球腫、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、精巣胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛性疾患、神経膠腫、小児脳幹神経膠腫、有毛細胞白血病、肝細胞癌、ランゲルハンス細胞組織球症、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、膵島細胞腫瘍、膵臓神経内分泌腫瘍、ウィルムス腫瘍及び他の小児腎臓腫瘍、ランゲルハンス細胞組織球症、小細胞肺癌、皮膚T細胞リンパ腫、眼内黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性頸部扁平上皮癌、正中線管癌、多発性内分泌腺腫症候群、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、鼻腔及び副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫(NHL)、非小細胞肺癌(NSCLC)、上皮性卵巣癌、胚細胞卵巣癌、低悪性度卵巣癌、膵臓神経内分泌腫瘍、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔及び鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、胸膜肺芽腫、原発性腹膜癌、直腸癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、カポジ肉腫、横紋筋肉腫、セザリー症候群、小腸癌、軟部肉腫、喉癌、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、腎盂及び尿管の移行上皮癌、尿道癌、子宮内膜癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ならびにワルデンストレームマクログロブリン血症からなる群から選択されるがんであり得る。
当業者は、対象、例えば、それを必要とする哺乳動物対象(例えば、ヒト)への投与のための組換えオルソポックスウイルスベクターの有効量を容易に決定することができる。例えば、医師は、所望の治療効果を達成し、所望の効果が達成されるまで徐々に用量を増加させるために必要なレベルよりも低いレベルで組換えオルソポックスウイルスベクターの処方を開始し得る。代替的に、医師は、ある用量の組換えオルソポックスウイルスベクターを投与することによって治療レジメンを開始し、その後、治療効果が達成されるまで徐々により低い用量を投与し得る(例えば、1つ以上の腫瘍の体積の減少)。概して、本発明の組換えオルソポックスウイルスベクターの好適な1日用量は、治療効果をもたらすのに有効な最低用量である組換えオルソポックスウイルスベクターの量であろう。本発明の組換えオルソポックスウイルスベクターの治療組成物の1日用量は、単回用量として、または1日、1週間、1ヶ月、または1年を通じて適切な間隔で別々に投与される2回、3回、4回、5回、6回以上の用量として、任意選択で単位剤形で投与され得る。本発明の組換えオルソポックスウイルスベクターが単独で投与されることが可能であるが、それはまた、薬学的製剤として、賦形剤、担体、及び任意に追加の治療剤と組み合わせて投与され得る。
本発明の組換えオルソポックスウイルスベクターは、当該技術分野で既知の様々な方法のいずれかによって、がんなどの細胞増殖疾患の進行を減衰させるそれらの能力についてモニタリングすることができる。例えば、医師は、患者における1つ以上の腫瘍の体積を分析することによって、本発明の組換えオルソポックスウイルスベクターによる治療に対する対象、例えば、哺乳類対象(例えば、ヒト)の応答をモニタリングし得る。代替的に、医師は、特定の対象のリンパ液中のT-reg細胞集団を分析することによって、本発明の組換えオルソポックスウイルスベクターによる治療に対する対象(例えば、ヒト)の応答性をモニタリングすることができる。例えば、医師は、対象、例えば、哺乳動物対象(例えば、ヒト)からサンプルを採取し、蛍光活性化セルソーティングなどの確立された手順を使用して、がん細胞の量または密度を決定することができる。試料中のがん細胞の量が、組換えオルソポックスウイルスの投与前に対象から得られた試料中のがん細胞の量と比較して減少した(例えば、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、96%、97%、98%、99%以上)という発見は、オルソポックスウイルス投与ががんを効果的に治療していることを示すものであり得る。
5.5.3.併用療法
本明細書に記載の組換えオルソポックスウイルスベクターは、免疫チェックポイント阻害剤などの1つ以上の追加の薬剤と共に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、免疫チェックポイント阻害剤と同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的な免疫チェックポイント阻害剤には、これらに限定されないが、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片が含まれる。追加的にまたは代替的に、本発明のベクターは、インターロイキン(IL)と同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、インターロイキンと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的なインターロイキンには、これらに限定されないが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23が含まれる。追加的にまたは代替的に、本発明のベクターは、インターフェロンと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、インターフェロンと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的なインターフェロンには、これらに限定されないが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマが含まれる。追加的にまたは代替的に、本発明のベクターは、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質と同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質と同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的なTNFスーパーファミリーメンバータンパク質には、これらに限定されないが、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドが含まれる。追加的にまたは代替的に、本発明のベクターは、サイトカインと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、サイトカインと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的なサイトカインには、これらに限定されないが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、抗TGF-ベータ、抗VEGF-R2、及びcGAS(グアニルアデニル酸シクラーゼ)が含まれる。
本明細書に記載の組換えオルソポックスウイルスベクターは、免疫チェックポイント阻害剤などの1つ以上の追加の薬剤と共に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、免疫チェックポイント阻害剤と同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的な免疫チェックポイント阻害剤には、これらに限定されないが、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片が含まれる。追加的にまたは代替的に、本発明のベクターは、インターロイキン(IL)と同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、インターロイキンと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的なインターロイキンには、これらに限定されないが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23が含まれる。追加的にまたは代替的に、本発明のベクターは、インターフェロンと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、インターフェロンと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的なインターフェロンには、これらに限定されないが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマが含まれる。追加的にまたは代替的に、本発明のベクターは、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質と同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質と同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的なTNFスーパーファミリーメンバータンパク質には、これらに限定されないが、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドが含まれる。追加的にまたは代替的に、本発明のベクターは、サイトカインと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、サイトカインと同時に投与するか、混合するか、または別々に投与することができる。本発明の組成物及び方法と組み合わせて使用するための例示的なサイトカインには、これらに限定されないが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、抗TGF-ベータ、抗VEGF-R2、及びcGAS(グアニルアデニル酸シクラーゼ)が含まれる。
追加的にまたは代替的に、免疫チェックポイント阻害剤は、オルソポックスウイルス自体において発現され得る。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子を含むことができる。本発明の組成物及び方法のオルソポックスウイルスによる発現のための例示的な免疫チェックポイント阻害剤には、これらに限定されないが、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片が含まれる。追加的にまたは代替的に、インターロイキンは、オルソポックスウイルス自体において発現され得る。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、インターロイキンをコードする導入遺伝子を含むことができる。本発明の組成物及び方法のオルソポックスウイルスによる発現のための例示的な免疫チェックポイント阻害剤には、これらに限定されないが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23が含まれる。追加的にまたは代替的に、インターフェロンは、オルソポックスウイルス自体において発現され得る。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、インターフェロンをコードする導入遺伝子を含むことができる。本発明の組成物及び方法のオルソポックスウイルスによる発現のための例示的なインターフェロンには、これらに限定されないが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマが含まれる。追加的にまたは代替的に、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質は、オルソポックスウイルス自体において発現され得る。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質をコードする導入遺伝子を含むことができる。本発明の組成物及び方法のオルソポックスウイルスによる発現のための例示的なTNFスーパーファミリーメンバータンパク質には、これらに限定されないが、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドが含まれる。追加的にまたは代替的に、サイトカインは、オルソポックスウイルス自体において発現され得る。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、サイトカインをコードする導入遺伝子を含むことができる。本発明の組成物及び方法のオルソポックスウイルスによる発現のための例示的なサイトカインには、これらに限定されないが、GM-CSF、fms関連チロシンキナーゼ3(Flt3)リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びc-KITが含まれる。
追加的にまたは代替的に、腫瘍関連抗原は、オルソポックスウイルス自体において発現され得る。例えば、組換えオルソポックスウイルスベクターは、腫瘍関連抗原をコードする導入遺伝子を含むことができる。本発明の組成物及び方法のオルソポックスウイルスによる発現のための例示的な腫瘍関連抗原には、これらに限定されないが、CD19、CD33、EpCAM、CEA、PSMA、EGFRvIII、CD133、EGFR、CDH19、ENPP3、DLL3、MSLN、ROR1、HER2、HLAA2、EpHA2、EpHA3、MCSP、CSPG4、NG2、RON、FLT3、BCMA、CD20、FAPα、FRα、CA-9、PDGFRα、PDGFRβ、FSP1、S100A4、ADAM12m、RET、MET、FGFR、INSR、NTRK、MAGE-A3、NY-ESO-1、1つ以上のヒトパピローマウイルス(HPV)タンパク質、HPV16のE6及びE7タンパク質、HPV18のE6及びE7タンパク質、ブラキュリ、もしくは前立腺酸性ホスファターゼ、またはその1つ以上の断片が含まれる。本明細書に記載の組成物及び方法と組み合わせて使用するための腫瘍関連抗原の追加の例には、これらに限定されないが、表3~30に記載されているものが含まれる。
本明細書に記載の治療方法の特定の実施形態では、方法は、患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)に免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む。特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される。特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片である。特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、イピリムマブである。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、トレメリムマブである。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、ニボルマブである。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、ペムブロリズマブである。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、セミプリマブである。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、アテゾリズマブである。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、アベルマブである。別の特定の実施形態では、免疫チェックポイント阻害剤は、デュルバルマブである。
本明細書に記載の治療方法の特定の実施形態では、方法は、患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)にインターロイキンを投与することをさらに含む。特定の実施形態では、インターロイキンは、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される。特定の実施形態では、インターロイキンは、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される。特定の実施形態では、インターロイキンは、膜結合である。
本明細書に記載の治療方法の特定の実施形態では、方法は、患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)にインターフェロンを投与することをさらに含む。特定の実施形態では、インターフェロンは、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される。
本明細書に記載の治療方法の特定の実施形態では、方法は、患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)にサイトカインを投与することをさらに含む。特定の実施形態では、サイトカインは、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である。特定の実施形態では、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質は、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される。特定の実施形態では、サイトカインは、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びcKitからなる群から選択される。特定の実施形態では、サイトカインは、Flt3リガンドである。
5.6.キット
さらに本明細書で提供されるのは、本発明に従って使用することができるキットである。
さらに本明細書で提供されるのは、本発明に従って使用することができるキットである。
一態様では、本明細書で提供されるのは、セクション5.2.3に記載の核酸と、宿主細胞において核酸を発現するようにキットの使用者に指示する添付文書と、を含むキットである。
別の態様では、本明細書に提供されるのは、セクション5.2.4に記載のウイルスと、ウイルスを宿主細胞において発現するようにキットの使用者に指示する添付文書と、を含むキットである。
別の態様では、本明細書で提供されるのは、セクション5.2.4に記載のウイルスと、がんを有する患者(例えば、ヒト患者などの哺乳動物患者)に治療有効量のウイルスを投与し、それによってがんを治療するように使用者に指示する添付文書と、を含むキットである。特定の実施形態では、哺乳動物患者は、ヒト患者である。治療されるがんは、セクション5.5に記載されるがんであり得る。
好ましい実施形態では、核酸またはウイルスは、核酸またはウイルスを保管するのに好適な1つ以上の容器に保管される。特定の実施形態では、本明細書に提供されるキットは、それらの意図される使用に好適な対照をさらに含む。
5.7.例示的な実施形態
5.7.1.セット1
1.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、前記核酸。
5.7.1.セット1
1.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、前記核酸。
2.前記欠失が、少なくとも3つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態1に記載の核酸。
3.前記欠失が、少なくとも4つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態2に記載の核酸。
4.前記欠失が、少なくとも5つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態3に記載の核酸。
5.前記欠失が、少なくとも6つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態4に記載の核酸。
6.前記欠失が、少なくとも7つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態5に記載の核酸。
7.前記欠失が、少なくとも8つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態6に記載の核酸。
8.前記欠失が、少なくとも9つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態7に記載の核酸。
9.前記欠失が、少なくとも10個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態8に記載の核酸。
10.前記欠失が、少なくとも11個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態9に記載の核酸。
11.前記欠失が、少なくとも12個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態10に記載の核酸。
12.前記欠失が、少なくとも13個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態11に記載の核酸。
13.前記欠失が、少なくとも14個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態12に記載の核酸。
14.前記欠失が、少なくとも15個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態13に記載の核酸。
15.前記欠失が、少なくとも16個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態14に記載の核酸。
16.前記欠失が、少なくとも17個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態15に記載の核酸。
17.前記欠失が、少なくとも18個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態16に記載の核酸。
18.前記欠失が、少なくとも19個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態17に記載の核酸。
19.前記欠失が、少なくとも20個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態18に記載の核酸。
20.前記欠失が、少なくとも21個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態19に記載の核酸。
21.前記欠失が、前記F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20R遺伝子の各々を含む、実施形態20に記載の核酸。
22.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
23.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~22のいずれか1つに記載の核酸。
24.前記欠失が、少なくとも2つの遺伝子を含み、各々が独立して、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態23に記載の核酸。
25.前記欠失が、少なくとも3つの遺伝子を含み、各々が独立して、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態24に記載の核酸。
26.前記欠失が、少なくとも4つの遺伝子を含み、各々が独立して、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態25に記載の核酸。
27.前記欠失が、少なくとも5つの遺伝子を含み、各々が独立して、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態26に記載の核酸。
28.前記欠失が、前記B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々を含む、実施形態27に記載の核酸。
29.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
30.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~29のいずれか1つに記載の核酸。
31.前記欠失が、少なくとも2つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態30に記載の核酸。
32.前記欠失が、少なくとも3つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態31に記載の核酸。
33.前記欠失が、少なくとも4つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態32に記載の核酸。
34.前記欠失が、少なくとも5つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態33に記載の核酸。
35.前記欠失が、少なくとも6つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態34に記載の核酸。
36.前記欠失が、少なくとも7つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態35に記載の核酸。
37.前記欠失が、少なくとも8つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態36に記載の核酸。
38.前記欠失が、少なくとも9つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態37に記載の核酸。
39.前記欠失が、少なくとも10個の遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態38に記載の核酸。
40.前記欠失が、前記C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2L遺伝子の各々を含む、実施形態39に記載の核酸。
41.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、カスパーゼ-9阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
42.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、カスパーゼ-9阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~41のいずれか1つに記載の核酸。
43.前記カスパーゼ-9阻害剤をコードする遺伝子が、F1Lである、実施形態41または42に記載の核酸。
44.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、BCL-2阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
45.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、BCL-2阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~44のいずれか1つに記載の核酸。
46.前記BCL-2阻害剤をコードする遺伝子が、N1Lである、実施形態44または45に記載の核酸。
47.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、dUTPaseをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
48.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、dUTPaseをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~47のいずれか1つに記載の核酸。
49.前記dUTPaseをコードする遺伝子が、F2Lである、実施形態46または47に記載の核酸。
50.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、IFN-アルファ/ベータ受容体様分泌型糖タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
51.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、IFN-アルファ/ベータ受容体様分泌型糖タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~50のいずれか1つに記載の核酸。
52.前記IFN-アルファ/ベータ受容体様分泌型糖タンパク質をコードする遺伝子が、B19Rである、実施形態50または51に記載の核酸。
53.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、IL-1-ベータ阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
54.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、IL-1-ベータ阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~53のいずれか1つに記載の核酸。
55.前記IL-1-ベータ阻害剤をコードする遺伝子が、B16Rである、実施形態53または54に記載の核酸。
56.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ホスホリパーゼ-Dをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
57.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ホスホリパーゼ-Dをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~56のいずれか1つに記載の核酸。
58.前記ホスホリパーゼ-Dをコードする遺伝子が、K4Lである、実施形態56または57に記載の核酸。
59.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、PKR阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
60.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、PKR阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~59のいずれか1つに記載の核酸。
61.前記PKR阻害剤をコードする遺伝子が、K3Lである、実施形態59または60に記載の核酸。
61.前記PKR阻害剤をコードする遺伝子が、K3Lである、実施形態59または60に記載の核酸。
62.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、セリンプロテアーゼ阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
63.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、セリンプロテアーゼ阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~62のいずれか1つに記載の核酸。
64.前記セリンプロテアーゼ阻害剤をコードする遺伝子が、K2Lである、実施形態62または63に記載の核酸。
65.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、TLRシグナル伝達阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
66.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、TLRシグナル伝達阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~65のいずれか1つに記載の核酸。
67.前記TLRシグナル伝達阻害剤をコードする遺伝子が、N2Lである、実施形態65または66に記載の核酸。
68.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ケルチ様タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
69.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ケルチ様タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~68のいずれか1つに記載の核酸。
70.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ケルチ様タンパク質を各々コードする少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、実施形態69に記載の核酸。
71.前記ケルチ様タンパク質をコードする遺伝子が独立して、F3L及びC2Lからなる群から選択される、実施形態68~70のいずれか1つに記載の核酸。
72.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、モノグリセリドリパーゼをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
73.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、モノグリセリドリパーゼをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~72のいずれか1つに記載の核酸。
74.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、モノグリセリドリパーゼを各々コードする少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、実施形態73に記載の核酸。
75.前記モノグリセリドリパーゼをコードする遺伝子が独立して、K5L及びK6Lからなる群から選択される、実施形態72~74のいずれか1つに記載の核酸。
76.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、NF-κB阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
77.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、NF-κB阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~76のいずれか1つに記載の核酸。
78.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、NF-κB阻害剤を各々コードする少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、実施形態77に記載の核酸。
79.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、NF-κB阻害剤を各々コードする少なくとも3つの遺伝子の欠失を含む、実施形態78に記載の核酸。
80.前記NF-κB阻害剤をコードする遺伝子が独立して、K7R、K1L、及びM2Lからなる群から選択される、実施形態76~79のいずれか1つに記載の核酸。
81.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、アンキリン反復タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
82.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、アンキリン反復タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~81のいずれか1つに記載の核酸。
83.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、アンキリン反復タンパク質を各々コードする少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、実施形態82に記載の核酸。
84.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、アンキリン反復タンパク質を各々コードする少なくとも3つの遺伝子の欠失を含む、実施形態83に記載の核酸。
85.前記アンキリン反復タンパク質をコードする遺伝子が独立して、B18R、B20R、及びM1Lからなる群から選択される、実施形態81~84のいずれか1つに記載の核酸。
86.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B15R、B17R、及びB14Rからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
87.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B15R、B17R、及びB14Rからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~86のいずれか1つに記載の核酸。
88.前記欠失が、少なくとも2つの遺伝子を含み、各々が独立して、B15R、B17R、及びB14Rからなる群から選択される、実施形態87に記載の核酸。
89.前記欠失が、前記B15R、B17R、及びB14R遺伝子の各々を含む、実施形態88に記載の核酸。
90.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~89のいずれか1つに記載の核酸。
91.前記欠失が、少なくとも2つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態90に記載の核酸。
92.前記欠失が、少なくとも3つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態91に記載の核酸。
93.前記欠失が、少なくとも4つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態92に記載の核酸。
94.前記欠失が、少なくとも5つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態93に記載の核酸。
95.前記欠失が、少なくとも6つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態94に記載の核酸。
96.前記欠失が、少なくとも7つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態95に記載の核酸。
97.前記欠失が、少なくとも8つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態96に記載の核酸。
98.前記欠失が、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29R遺伝子の各々を含む、実施形態97に記載の核酸。
99.
100.
102.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16m8、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1からなる群から選択される株である、実施形態101に記載の核酸。
103.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen、Western Reserve、Tian Tan、Wyeth、及びListerからなる群から選択される株である、実施形態101に記載の核酸。
104.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen株ワクシニアウイルスである、実施形態101に記載の核酸。
105.前記欠失の各々が、対応する遺伝子をコードするポリヌクレオチド全体の欠失である、実施形態1~104のいずれか1つに記載の核酸。
106.前記欠失の各々が、対応する遺伝子をコードするポリヌクレオチドの一部の欠失であり、前記欠失が、宿主細胞への導入時に前記遺伝子を機能しないようにするのに十分である、実施形態1~104のいずれか1つに記載の核酸。
107.前記核酸が、腫瘍関連抗原をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~106のいずれか1つに記載の核酸。
108.前記腫瘍関連抗原が、表3~30のいずれか1つに列挙される腫瘍関連抗原である、実施形態107に記載の核酸。
109.前記腫瘍関連抗原が、CD19、CD33、EpCAM、CEA、PSMA、EGFRvIII、CD133、EGFR、CDH19、ENPP3、DLL3、MSLN、ROR1、HER2、HLAA2、EpHA2、EpHA3、MCSP、CSPG4、NG2、RON、FLT3、BCMA、CD20、FAPα、FRα、CA-9、PDGFRα、PDGFRβ、FSP1、S100A4、ADAM12m、RET、MET、FGFR、INSR、及びNTRKからなる群から選択される腫瘍関連抗原である、実施形態107に記載の核酸。
110.前記腫瘍関連抗原が、MAGE-A3またはその1つ以上の断片を含む、実施形態107に記載の核酸。
111.前記腫瘍関連抗原が、NY-ESO-1またはその1つ以上の断片を含む、実施形態107に記載の核酸。
112.前記腫瘍関連抗原が、1つ以上のヒトパピローマウイルス(HPV)タンパク質またはその断片を含む、実施形態107に記載の核酸。
113.前記腫瘍関連抗原が、(i)HPV16のE6及びE7タンパク質またはその断片、ならびに(ii)HPV18のE6及びE7タンパク質またはその断片を含む、実施形態107に記載の核酸。
114.前記腫瘍関連抗原が、ブラキュリまたはその1つ以上の断片を含む、実施形態107に記載の核酸。
115.前記腫瘍関連抗原が、前立腺酸性ホスファターゼまたはその1つ以上の断片を含む、実施形態107に記載の核酸。
116.実施形態107~115のいずれか1つに記載の核酸を産生する方法であって、
a.実施形態1~106のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記腫瘍関連抗原をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
a.実施形態1~106のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記腫瘍関連抗原をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
117.前記核酸が、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~115のいずれか1つに記載の核酸。
118.前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、実施形態117に記載の核酸。
119.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-L1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、実施形態117に記載の核酸。
120.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態117に記載の核酸。
121.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、実施形態117に記載の核酸。
122.実施形態117~121のいずれか1つに記載の核酸を産生する方法であって、
a.実施形態1~116のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記免疫チェックポイント阻害剤をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
a.実施形態1~116のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記免疫チェックポイント阻害剤をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
123.前記核酸が、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~115及び117~121のいずれか1つに記載の核酸。
124.前記インターロイキンが、
IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態123に記載の核酸。
IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態123に記載の核酸。
125.前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、実施形態123に記載の核酸。
126.前記インターロイキンが、膜結合である、実施形態125に記載の核酸。
127.実施形態123~126の1つに記載の核酸を産生する方法であって、
a.実施形態1~115及び117~121のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記インターロイキンをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
a.実施形態1~115及び117~121のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記インターロイキンをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
128.前記核酸が、インターフェロン(IFN)をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~115、117~121、及び123~126のいずれか1つに記載の核酸。
129.前記インターフェロンが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態128に記載の核酸。
130.実施形態128または129に記載の核酸を産生する方法であって、
a.実施形態1~115、117~121、及び123~126のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記インターフェロンをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
a.実施形態1~115、117~121、及び123~126のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記インターフェロンをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
131.前記核酸が、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~115、117~121、123~126、128、及び129のいずれか1つに記載の核酸。
132.前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、実施形態131に記載の核酸。
133.実施形態131または132に記載の核酸を産生する方法であって、
a.実施形態1~115、117~121、123~126、128、及び129のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
a.実施形態1~115、117~121、123~126、128、及び129のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
134.前記核酸が、サイトカインをコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、及び132のいずれか1つに記載の核酸。
135.前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、抗TGF-ベータ、抗VEGF-R2、及びcGAS(グアニルアデニル酸シクラーゼ)からなる群から選択される、実施形態134に記載の核酸。
136.前記サイトカインが、Flt3リガンドである、実施形態134に記載の核酸。
137.実施形態135または136に記載の核酸を産生する方法であって、
a.実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、及び132のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記サイトカインをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
a.実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、及び132のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記サイトカインをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
138.前記核酸が、マイクロRNA(miRNA)をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、及び134~136のいずれか1つに記載の核酸。
139.前記miRNAが、mir-6である、実施形態138に記載の核酸。
140.実施形態138または139に記載の核酸を産生する方法であって、
a.実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、及び134~136のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記miRNAをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
a.実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、及び134~136のいずれか1つに記載の核酸にトランスポゾン挿入部位を導入することと、
b.(a)で形成された核酸を、前記miRNAをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記核酸に導入することと、
c.(b)で形成された核酸を回収することと、を含む、前記方法。
141.少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、組換えオルソポックスウイルスベクター。
142.前記欠失が、少なくとも3つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態141に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
143.前記欠失が、少なくとも4つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態142に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
144.前記欠失が、少なくとも5つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態143に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
145.前記欠失が、少なくとも6つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態144に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
146.前記欠失が、少なくとも7つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態145に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
147.前記欠失が、少なくとも8つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態146に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
148.前記欠失が、少なくとも9つの遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態147に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
149.前記欠失が、少なくとも10個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態148に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
150.前記欠失が、少なくとも11個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態149に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
151.前記欠失が、少なくとも12個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態150に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
152.前記欠失が、少なくとも13個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態151に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
153.前記欠失が、少なくとも14個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態152に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
154.前記欠失が、少なくとも15個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態153に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
155.前記欠失が、少なくとも16個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態154に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
156.前記欠失が、少なくとも17個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態155に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
157.前記欠失が、少なくとも18個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態156に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
158.前記欠失が、少なくとも19個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態157に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
159.前記欠失が、少なくとも20個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態158に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
160.前記欠失が、少なくとも21個の遺伝子を含み、各々が独立して、F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態159に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
161.前記欠失が、前記F1L、N1L、B14R、M2L、K1L、K7R、C2L、N2L、M1L、K2L、K3L、F3L、B16R、B19R、K4L、K5L、K6L、F2L、B15R、B17L、B18R、及びB20R遺伝子の各々を含む、実施形態160に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
162.B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、組換えオルソポックスウイルスベクター。
163.前記ベクターが、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~162のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
164.前記欠失が、少なくとも2つの遺伝子を含み、各々が独立して、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態163に記載のベクター。
165.前記欠失が、少なくとも3つの遺伝子を含み、各々が独立して、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態164に記載のベクター。
166.前記欠失が、少なくとも4つの遺伝子を含み、各々が独立して、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態165に記載のベクター。
167.前記欠失が、少なくとも5つの遺伝子を含み、各々が独立して、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rからなる群から選択される、実施形態166に記載のベクター。
168.前記欠失が、B14R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの各々を含む、実施形態167に記載のベクター。
169.C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、組換えオルソポックスウイルスベクター。
170.前記ベクターが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~169のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
171.前記欠失が、少なくとも2つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態170に記載のベクター。
172.前記欠失が、少なくとも3つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態171に記載のベクター。
173.前記欠失が、少なくとも4つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態172に記載のベクター。
174.前記欠失が、少なくとも5つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態173に記載のベクター。
175.前記欠失が、少なくとも6つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態174に記載のベクター。
176.前記欠失が、少なくとも7つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態175に記載のベクター。
177.前記欠失が、少なくとも8つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態176に記載のベクター。
178.前記欠失が、少なくとも9つの遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態177に記載のベクター。
179.前記欠失が、少なくとも10個の遺伝子を含み、各々が独立して、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lからなる群から選択される、実施形態178に記載のベクター。
180.前記欠失が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、K1L、K2L、K3L、K4L、K7R、及びF2Lの各々を含む、実施形態179に記載のベクター。
181.カスパーゼ-9阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、組換えオルソポックスウイルスベクター。
182.前記ベクターが、カスパーゼ-9阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~181のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
183.前記カスパーゼ-9阻害剤をコードする遺伝子が、F1Lである、実施形態181または182に記載のベクター。
184.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、BCL-2阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
185.前記ベクターが、BCL-2阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~184のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
186.前記BCL-2阻害剤をコードする遺伝子が、N1Lである、実施形態184または185に記載のベクター。
187.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、dUTPaseをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
188.前記ベクターが、dUTPaseをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~187のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
189.前記dUTPaseをコードする遺伝子が、F2Lである、実施形態187または188に記載のベクター。
190.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、IFN-アルファ/ベータ受容体様分泌型糖タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
191.前記ベクターが、IFN-アルファ/ベータ受容体様分泌型糖タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~190のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
192.前記IFN-アルファ/ベータ受容体様分泌糖タンパク質をコードする遺伝子が、B19Rである、実施形態190または191に記載のベクター。
193.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、IL-1-ベータ阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
194.前記ベクターが、IL-1-ベータ阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~193のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
195.前記IL-1-ベータ阻害剤をコードする遺伝子が、B16Rである、実施形態193または194に記載のベクター。
196.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、ホスホリパーゼ-Dをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
197.前記ベクターが、ホスホリパーゼ-Dをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~196のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
198.前記ホスホリパーゼ-Dをコードする遺伝子が、K4Lである、実施形態196または197に記載のベクター。
199.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、PKR阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
200.前記ベクターが、PKR阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~199のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
201.前記PKR阻害剤をコードする遺伝子が、K3Lである、実施形態199または200に記載のベクター。
202.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、セリンプロテアーゼ阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
203.前記ベクターが、セリンプロテアーゼ阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~202のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
204.前記セリンプロテアーゼ阻害剤をコードする遺伝子が、K2Lである、実施形態202または203に記載のベクター。
205.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、TLRシグナル伝達阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
206.前記ベクターが、TLRシグナル伝達阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~205のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
207.前記TLRシグナル伝達阻害剤をコードする遺伝子が、N2Lである、実施形態205または206に記載のベクター。
208.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、ケルチ様タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
209.前記ベクターが、ケルチ様タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~208のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
210.前記ベクターが、ケルチ様タンパク質を各々コードする少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、実施形態209に記載のベクター。
211.前記ケルチ様タンパク質をコードする遺伝子が独立して、F3L及びC2Lからなる群から選択される、実施形態208~210のいずれか1つに記載のベクター。
212.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、モノグリセリドリパーゼをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
213.前記ベクターが、モノグリセリドリパーゼをコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~212のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
214.前記ベクターが、モノグリセリドリパーゼを各々コードする少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、実施形態213に記載のベクター。
215.前記モノグリセリドリパーゼをコードする遺伝子が独立して、K5L及びK6Lからなる群から選択される、実施形態212~214のいずれか1つに記載のベクター。
216.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、NF-κB阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
217.前記ベクターが、NF-κB阻害剤をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~216のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
218.前記欠失が、NF-κB阻害剤をそれぞれコードする少なくとも2つの遺伝子を含む、実施形態217に記載のベクター。
219.前記欠失が、NF-κB阻害剤をそれぞれコードする少なくとも3つの遺伝子を含む、実施形態218に記載のベクター。
220.前記NF-κB阻害剤をコードする遺伝子が独立して、K7R、K1L、及びM2Lからなる群から選択される、実施形態216~219のいずれか1つに記載のベクター。
221.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、アンキリン反復タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
222.前記ベクターが、アンキリン反復タンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~221のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
223.前記欠失が、アンキリン反復タンパク質をそれぞれコードする少なくとも2つの遺伝子を含む、実施形態222に記載のベクター。
224.前記欠失が、アンキリン反復タンパク質をそれぞれコードする少なくとも3つの遺伝子を含む、実施形態223に記載のベクター。
225.前記アンキリン反復タンパク質をコードする遺伝子が独立して、B18R、B20R、及びM1Lからなる群から選択される、実施形態221~224のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
226.組換えオルソポックスウイルスベクターであって、前記ベクターが、B15R、B17R、及びB14Rからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記組換えオルソポックスウイルスベクター。
227.前記ベクターが、B15R、B17R、及びB14Rからなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~226のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
228.前記欠失が、少なくとも2つの遺伝子を含み、各々が独立して、B15R、B17R、及びB14Rからなる群から選択される、実施形態227に記載のベクター。
229.前記欠失が、前記B15R、B17R、及びB14R遺伝子の各々を含む、実施形態228に記載のベクター。
230.前記ベクターが、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態141~229のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
231.前記欠失が、少なくとも2つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態230に記載のベクター。
232.前記欠失が、少なくとも3つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態231に記載のベクター。
233.前記欠失が、少なくとも4つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態232に記載のベクター。
234.前記欠失が、少なくとも5つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態233に記載のベクター。
235.前記欠失が、少なくとも6つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態234に記載のベクター。
236.前記欠失が、少なくとも7つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態235に記載のベクター。
237.前記欠失が、少なくとも8つの遺伝子を含み、各々が独立して、前記B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29RからなるITR遺伝子の群から選択される、実施形態236に記載のベクター。
238.前記欠失が、B21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの各々を含む、実施形態237に記載のベクター。
239.
242.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16m8、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1からなる群から選択される株である、実施形態241に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
243.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen、Western Reserve、Tian Tan、Wyeth、及びListerからなる群から選択される株である、実施形態241に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
244.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen株ワクシニアウイルスである、実施形態241に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
245.前記欠失が、対応する遺伝子をコードするポリヌクレオチド全体の欠失である、実施形態141~244のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
246.前記欠失の各々が、対応する遺伝子をコードするポリヌクレオチドの一部の欠失であり、前記欠失が、宿主細胞への導入時に前記遺伝子を機能しないようにするのに十分である、実施形態141~244のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
247.前記ベクターが、腫瘍関連抗原をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態14141~246のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
248.前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、腫瘍関連抗原をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態141~247のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
249.前記腫瘍関連抗原が、表3~30のいずれか1つに列挙される腫瘍関連抗原である、実施形態248に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
250.前記腫瘍関連抗原が、CD19、CD33、EpCAM、CEA、PSMA、EGFRvIII、CD274、EGFR、CDH19、ENPP3、DLL3、MSLN、ROR1、HER2、HLAA2、EpHA2、EpHA3、MCSP、CSPG4、NG2、RON、FLT3、BCMA、CD20、FAPα、FRα、CA-9、PDGFRα、PDGFRβ、FSP1、S100A4、ADAM12m、RET、MET、FGFR、INSR、及びNTRKからなる群から選択される腫瘍関連抗原である、実施形態248に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
251.前記腫瘍関連抗原が、MAGE-A3またはその1つ以上の断片を含む、実施形態248に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
252.前記腫瘍関連抗原が、NY-ESO-1またはその1つ以上の断片を含む、実施形態248に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
253.前記腫瘍関連抗原が、1つ以上のヒトパピローマウイルス(HPV)タンパク質またはその断片を含む、実施形態248に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
254.前記腫瘍関連抗原が、(i)HPV16のE6及びE7タンパク質またはその断片、ならびに(ii)HPV18のE6及びE7タンパク質またはその断片を含む、実施形態248に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
255.前記腫瘍関連抗原が、ブラキュリまたはその1つ以上の断片を含む、実施形態248に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
256.前記腫瘍関連抗原が、前立腺酸性ホスファターゼまたはその1つ以上の断片を含む、実施形態248に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
257.実施形態248~256のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを産生する方法であって、
d.実施形態141~247のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記腫瘍関連抗原をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
d.実施形態141~247のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記腫瘍関連抗原をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
258.前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態141~256のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
259.前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、実施形態258に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
260.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-L1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、実施形態258に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
261.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態258に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
262.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、実施形態258に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
263.実施形態258~262のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを産生する方法であって、
d.実施形態141~257のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記免疫チェックポイント阻害剤をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
d.実施形態141~257のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記免疫チェックポイント阻害剤をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
264.前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態141~256及び258~262のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
265.前記インターロイキンが、
IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態264に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態264に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
266.前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、実施形態264に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
267.前記インターロイキンが、膜結合である、実施形態266に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
268.実施形態264~267の1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを産生する方法であって、
d.実施形態141~256及び258~262のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記インターロイキンをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
d.実施形態141~256及び258~262のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記インターロイキンをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
269.前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、インターフェロン(IFN)をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態141~256、258~262、及び264~267のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
270.前記インターフェロンが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態269に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
271.実施形態269または270に記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを産生する方法であって、
d.実施形態141~256、258~262、及び264~267のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記インターフェロンをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
d.実施形態141~256、258~262、及び264~267のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記インターフェロンをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
272.前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態141~256、258~262、264~267、269、及び270のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
273.前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、実施形態272に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
274.実施形態272または273に記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを産生する方法であって、
d.実施形態141~256、258~262、264~267、269、及び270のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
d.実施形態141~256、258~262、264~267、269、及び270のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質をコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
275.前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、サイトカインをコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、及び273のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
276.前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、抗TGF-ベータ、抗VEGF-R2、及びcGAS(グアニルアデニル酸シクラーゼ)からなる群から選択される、実施形態275に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
277.前記サイトカインが、Flt3リガンドである、実施形態275に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
278.実施形態276または277に記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを産生する方法であって、
d.実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、及び273のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記サイトカインをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
d.実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、及び273のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記サイトカインをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
279.前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、マイクロRNA(miRNA)をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、及び275~277のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
280.前記miRNAが、mir-6である、実施形態279に記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
281.実施形態279または280に記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを産生する方法であって、
d.実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、及び275~277のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記miRNAをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
d.実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、及び275~277のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターにトランスポゾン挿入部位を導入することと、
e.(a)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを、前記miRNAをコードする遺伝子を含む転位因子と接触させ、それによって前記遺伝子を前記組換えオルソポックスウイルスベクターに導入することと、
f.(b)で形成された組換えオルソポックスウイルスベクターを回収することと、を含む、前記方法。
282.前記核酸または前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、チミジンキナーゼ(TK)遺伝子を含む、実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、及び139のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、及び280のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
283.前記核酸または前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、リボヌクレオチドレダクターゼ遺伝子を含む、実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、139、及び282のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、280、及び282のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
284.哺乳動物細胞の集団を前記核酸または前記組換えオルソポックスウイルスベクターと接触させると、前記細胞が、前記欠失を含まないオルソポックスウイルスベクターの形態と接触した同じ種類の哺乳動物細胞の集団と比較して、増加したシンシチウム形成を示す、実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、139、282、及び283のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、280、282、及び283のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
285.哺乳動物細胞の集団を前記核酸または前記組換えオルソポックスウイルスベクターと接触させると、前記細胞が、前記欠失を含まないオルソポックスウイルスベクターの形態と接触した同じ種類の哺乳動物細胞の集団と比較して、前記オルソポックスウイルスベクターの増加した拡散を示す、実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、139、及び282~284のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、280、及び282~284のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
286.前記核酸または前記組換えオルソポックスウイルスベクターが、前記欠失を含まないオルソポックスウイルスベクターの形態と比較して、哺乳動物細胞の集団に対して増加した細胞傷害性効果を発揮する、実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、139、及び282~285のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、280、及び282~285のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクター。
287.前記哺乳動物細胞が、ヒト細胞である、実施形態284~286のいずれか1つに記載の核酸または組換えオルソポックスウイルスベクター。
288.前記ヒト細胞が、がん細胞である、実施形態287に記載の核酸または組換えオルソポックスウイルスベクター。
289.前記哺乳動物細胞が、U2OS、293、293T、Vero、HeLa、A549、BHK、BSC40、CHO、OVCAR-8、786-0、NCI-H23、U251、SF-295、T-47D、SKMEL2、BT-549、SK-MEL-28、MDA-MB-231、SK-OV-3、MCF7、M14、SF-268、CAKI-1、HPAV、OVCAR-4、HCT15、K-562、及びHCT-116からなる群から選択される細胞株由来である、実施形態284~286のいずれか1つに記載の核酸または組換えオルソポックスウイルスベクター。
290.実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、139、及び282~289のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、280、及び282~289のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを含む、パッケージング細胞株。
291.哺乳類患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、139、及び282~289のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、280、及び282~289のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを前記患者に投与することを含む、前記方法。
292.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態291に記載の方法。
293.前記がんが、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、ならびに喉癌からなる群から選択される、実施形態291または292に記載の方法。
294.前記がんが、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、副腎皮質癌、AIDS関連リンパ腫、原発性CNSリンパ腫、肛門癌、虫垂癌、星状細胞腫、異型奇形/ラブドイド腫瘍、基底細胞癌、胆管癌、肝外癌、ユーイング肉腫ファミリー、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、中枢神経系胚性腫瘍、中枢神経系胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣腫、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、原発性リンパ腫、脊索腫、慢性骨髄増殖性腫瘍、結腸癌、肝外胆管癌、非浸潤性乳管癌(DCIS)、子宮内膜癌、上衣腫、食道癌、嗅神経芽細胞腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、卵管癌、骨の線維性組織球腫、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、精巣胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛性疾患、神経膠腫、小児脳幹神経膠腫、有毛細胞白血病、肝細胞癌、ランゲルハンス細胞組織球症、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、膵島細胞腫瘍、膵臓神経内分泌腫瘍、ウィルムス腫瘍及び他の小児腎臓腫瘍、ランゲルハンス細胞組織球症、小細胞肺癌、皮膚T細胞リンパ腫、眼内黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性頸部扁平上皮癌、正中線管癌、多発性内分泌腺腫症候群、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、鼻腔及び副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫(NHL)、非小細胞肺癌(NSCLC)、上皮性卵巣癌、胚細胞卵巣癌、低悪性度卵巣癌、膵臓神経内分泌腫瘍、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔及び鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、胸膜肺芽腫、原発性腹膜癌、直腸癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、カポジ肉腫、横紋筋肉腫、セザリー症候群、小腸癌、軟部肉腫、喉癌、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、腎盂及び尿管の移行上皮癌、尿道癌、子宮内膜癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ならびにワルデンストレームマクログロブリン血症からなる群から選択される、実施形態291または292に記載の方法。
295.前記方法が、前記患者に免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、実施形態291~294のいずれか1つに記載の方法。
296.前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、実施形態295に記載の方法。
297.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、実施形態295に記載の方法。
298.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態295に記載の方法。
299.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、実施形態295に記載の方法。
300.前記方法が、前記患者にインターロイキンを投与することをさらに含む、実施形態291~299のいずれか1つに記載の方法。
301.前記インターロイキンが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態300に記載の方法。
302.前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、実施形態300に記載の方法。
303.前記インターロイキンが、膜結合である、実施形態301または302に記載の方法。
304.前記方法が、前記患者にインターフェロンを投与することをさらに含む、実施形態291~303のいずれか1つに記載の方法。
305.前記インターフェロンが、
IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態304に記載の方法。
IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態304に記載の方法。
306.前記方法が、前記患者にTNFスーパーファミリーメンバータンパク質を投与することをさらに含む、実施形態291~305のいずれか1つに記載の方法。
307.前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、実施形態306に記載の方法。
308.前記方法が、前記患者にサイトカインを投与することをさらに含む、実施形態291~307のいずれか1つに記載の方法。
309.前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、抗TGF-ベータ、抗VEGF-R2、及びcGAS(グアニルアデニル酸シクラーゼ)からなる群から選択される、実施形態308に記載の方法。
310.前記サイトカインが、Flt3リガンドである、実施形態308に記載の方法。
311.前記方法が、前記患者にmiRNAを投与することをさらに含む、実施形態291~310のいずれか1つに記載の方法。
312.前記miRNAが、mir-6である、実施形態311に記載の方法。
313.キットであって、実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、139、及び282~289のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、280、及び282~289のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターと、宿主細胞において前記核酸または前記ベクターを発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
314.実施形態1~115、117~121、123~126、128、129、131、132、134~136、138、139、及び282~289のいずれか1つに記載の核酸、または実施形態141~256、258~262、264~267、269、270、272、273、275~277、279、280、及び282~289のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスベクターと、がんを有する哺乳動物患者に治療有効量の前記核酸または組換えオルソポックスウイルスベクターを投与し、それによって前記がんを治療するように使用者に指示する添付文書と、を含むキット。
315.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態314に記載のキット。
316.B8R遺伝子が欠失する、先行する実施形態のいずれかに記載のオルソポックスウイルス。
317.少なくとも1つの導入遺伝子が、前記欠失したB8R遺伝子の遺伝子座に挿入される、実施形態316に記載のオルソポックスウイルス。
318.少なくとも2つの導入遺伝子が、前記欠失したB8R遺伝子の遺伝子座に挿入される、実施形態317に記載のオルソポックスウイルス。
319.少なくとも3つの導入遺伝子が、前記欠失したB8R遺伝子の遺伝子座に挿入される、実施形態318に記載のオルソポックスウイルス。
320.少なくとも1つの追加の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子の遺伝子座ではない遺伝子座に挿入される、実施形態316~319のいずれか1つに記載のオルソポックスウイルス。
321.前記遺伝子座が、5p欠失の境界である、実施形態320に記載のオルソポックスウイルス。
322.前記遺伝子座が、3p欠失の境界である、実施形態321に記載のオルソポックスウイルス。
323.IL-12TM、FLT3-L、抗CLTA-4抗体のうちの少なくとも1つが挿入される、実施形態316~322に記載のオルソポックスウイルス。
324.前記IL-12-TM及びFLT3-L遺伝子が、前記欠失したB8R遺伝子の遺伝子座に挿入されている、実施形態323に記載のオルソポックスウイルス。
325.前記抗CLTA-4抗体が、前記5p欠失の境界内に挿入される、実施形態323~324のいずれか1つに記載のオルソポックスウイルス。
326.前記ウイルスが、配列番号210の配列を含む、実施形態323~325に記載のいずれか1つに記載のオルソポックスウイルス。
326.前記抗CLTA抗体が、配列番号211である、実施形態323~325のいずれか1つに記載のオルソポックスウイルス。
327.前記IL-12-TMが、配列番号212である、実施形態323~326のいずれか1つに記載のオルソポックスウイルス。
328.前記FLT3-Lが、配列番号213である、実施形態323~327のいずれか1つに記載のオルソポックスウイルス。
329.核酸配列を含むオルソポックスウイルスであって、前記核酸配列が、配列番号210の誘導体であり、
前記誘導体が、配列番号210のB8R遺伝子の欠失を含み、
IL-12-TM及びFLT3-L導入遺伝子が、前記欠失したB8R遺伝子の遺伝子座に挿入され、
抗CLTA-4抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子が、配列番号210に存在する5p欠失の境界内に挿入され、
前記IL-12-TMが、配列番号212であり
前記FLT3-Lが、配列番号213であり、
前記抗CLTA4抗体が、配列番号211によってコードされる、前記オルソポックスウイルス。
前記誘導体が、配列番号210のB8R遺伝子の欠失を含み、
IL-12-TM及びFLT3-L導入遺伝子が、前記欠失したB8R遺伝子の遺伝子座に挿入され、
抗CLTA-4抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子が、配列番号210に存在する5p欠失の境界内に挿入され、
前記IL-12-TMが、配列番号212であり
前記FLT3-Lが、配列番号213であり、
前記抗CLTA4抗体が、配列番号211によってコードされる、前記オルソポックスウイルス。
5.7.2.セット2
1.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
1.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
2.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態1に記載の核酸。
3.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態2に記載の核酸。
4.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態3に記載の核酸。
5.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態4に記載の核酸。
6.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも7つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態5に記載の核酸。
7.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも8つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態6に記載の核酸。
8.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも9つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態7に記載の核酸。
9.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも10個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態8に記載の核酸。
10.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも11個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態9に記載の核酸。
11.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも12個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態10に記載の核酸。
12.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも13個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態11に記載の核酸。
13.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも14個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態12に記載の核酸。
14.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも15個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態13に記載の核酸。
15.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも16個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態14に記載の核酸。
16.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも17個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態15に記載の核酸。
17.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも18個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態16に記載の核酸。
18.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも19個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態17に記載の核酸。
19.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも20個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態18に記載の核酸。
20.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも21個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態19に記載の核酸。
21.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも22個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態20に記載の核酸。
22.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失を含む、実施形態21に記載の核酸。
23.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
24.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態23に記載の核酸。
25.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態24に記載の核酸。
26.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態25に記載の核酸。
27.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態26に記載の核酸。
28.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態27に記載の核酸。
29.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失を含む、実施形態28に記載の核酸。
30.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
31.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態30に記載の核酸。
32.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態31に記載の核酸。
33.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態32に記載の核酸。
34.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態33に記載の核酸。
35.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態34に記載の核酸。
36.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも7つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態35に記載の核酸。
37.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも8つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態36に記載の核酸。
38.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも9つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態37に記載の核酸。
39.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも10個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態38に記載の核酸。
40.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも11個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態39に記載の核酸。
41.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも12個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態40に記載の核酸。
42.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも13個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態41に記載の核酸。
43.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも14個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態42に記載の核酸。
44.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも15個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態43に記載の核酸。
45.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子の各々の欠失を含む、実施形態44に記載の核酸。
46.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、宿主相互作用に関与するタンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~45のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸。
47.前記タンパク質が、細胞外マトリックスへのカルシウム非依存性接着に影響を及ぼす、実施形態46に記載の核酸。
48.前記タンパク質が、NF-κB阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
49.前記タンパク質が、C2L、N1L、M2L、K1L、及びK7R遺伝子からなる群から選択される遺伝子によってコードされる、実施形態48に記載の核酸。
50.前記タンパク質が、アポトーシス阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
51.前記アポトーシス阻害剤が、カスパーゼ-9阻害剤である、実施形態47に記載の核酸。
52.前記カスパーゼ-9阻害剤が、前記F1L遺伝子によってコードされる、実施形態51に記載の核酸。
53.前記アポトーシス阻害剤が、BCL-2様タンパク質である、実施形態50に記載の核酸。
54.前記BCL-2様タンパク質が、N1Lによってコードされる、実施形態53に記載の核酸。
55.前記タンパク質が、インターフェロン制御性因子3(IRF3)阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
56.前記IRF3阻害剤が、N2LまたはK7Rによってコードされる、実施形態55に記載の核酸。
57.前記タンパク質が、セリンプロテアーゼ阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
58.前記タンパク質が、細胞融合を防止する、実施形態46に記載の核酸。
59.前記タンパク質が、K2Lによってコードされる、実施形態58に記載の核酸。
60.前記タンパク質が、RNA活性化タンパク質キナーゼ(PKR)阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
61.前記タンパク質が、K1LまたはK3Lによってコードされる、実施形態60に記載の核酸。
62.前記タンパク質が、病原性因子である、実施形態46に記載の核酸。
63.前記タンパク質が、F3Lによってコードされる、実施形態63に記載の核酸。
64.前記タンパク質が、IL-1-ベータ阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
65.前記タンパク質が、B16Rによってコードされる、実施形態64に記載の核酸。
66.前記タンパク質が、分泌型IFNα隔離剤である、実施形態46に記載の核酸。
67.前記タンパク質が、B19Rによってコードされる、実施形態67に記載の核酸。
68.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、DNA複製に関与するタンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~67のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸。
69.前記タンパク質が、DNA修飾ヌクレアーゼである、実施形態68に記載の核酸。
70.前記タンパク質が、K4Lによってコードされる、実施形態69に記載の核酸。
71.前記タンパク質が、デオキシウリジントリホスファターゼ(dUTPase)である、実施形態70に記載の核酸。
72.前記dUTPaseが、F2Lによってコードされる、実施形態71に記載の核酸。
73.少なくとも1つの欠失遺伝子のヌクレオチド配列全体が欠失する、実施形態1~72のいずれか1つに記載の核酸。
74.少なくとも1つの欠失遺伝子が、部分的にのみ欠失しており、前記部分的欠失が、宿主細胞への導入時に前記部分的に欠失した遺伝子を機能しないようにするのに十分である、実施形態1~72のいずれか1つに記載の核酸。
75.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、逆位末端配列(ITR)の少なくとも2つのコピーを含む、実施形態1~74のいずれか1つに記載の核酸。
76.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ITRの任意のコピーを欠く、実施形態1~74のいずれか1つに記載の核酸。
77.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRからなる群から選択されるITRの少なくとも1つのコピーにおける欠失を含む、実施形態1~74のいずれか1つに記載の核酸。
78.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRのコピーの少なくとも全てにおける欠失を含む、実施形態1~74のいずれか1つに記載の核酸。
79.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B8R遺伝子における欠失を含む、実施形態1~78のいずれか1つに記載の核酸。
80.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、無傷B8R遺伝子を含む、実施形態1~78のいずれか1つに記載の核酸。
81.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含む、前記核酸。
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含む、前記核酸。
82.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含み、
前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、無傷B8R遺伝子を含む、前記核酸。
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含み、
前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、無傷B8R遺伝子を含む、前記核酸。
83.免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~82のいずれか1つに記載の核酸。
84.前記核酸が、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの導入遺伝子を含む、実施形態83に記載の核酸。
85.前記核酸が、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子を含む、実施形態84に記載の核酸。
86.前記核酸が、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子を含む、実施形態83または84のいずれか1つに記載の核酸。
87.前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、実施形態85または86に記載の核酸。
88.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-L1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、実施形態87に記載の核酸。
89.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態88に記載の核酸。
90.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、実施形態88に記載の核酸。
91.前記核酸が、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子を含む、実施形態83または84に記載の核酸。
92.前記インターロイキンが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態85または91に記載の核酸。
93.前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、実施形態92に記載の核酸。
94.前記インターロイキンが、膜結合である、実施形態93に記載の核酸。
95.前記インターロイキンが、膜結合IL-12 p70である、実施形態94に記載の核酸。
96.前記核酸が、サイトカインをコードする導入遺伝子を含む、実施形態83または84に記載の核酸。
97.前記サイトカインが、インターフェロン(IFN)である、実施形態96に記載の核酸。
98.前記インターフェロンが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態97に記載の核酸。
99.前記サイトカインが、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である、実施形態96に記載の核酸。
100.前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、実施形態99に記載の核酸。
101.前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びc-kitからなる群から選択される、実施形態96に記載の核酸。
102.前記サイトカインが、Flt3リガンドである、実施形態101に記載の核酸。
103.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムは、前記B8R遺伝子における前記欠失を含み、少なくとも1つの導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入される、実施形態83~102に記載の核酸。
104.少なくとも2つの導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入される、実施形態103に記載の核酸。
105.少なくとも3つの導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入される、実施形態104に記載の核酸。
106.少なくとも1つの導入遺伝子が、前記B8R遺伝子の欠失ではない遺伝子座に挿入される、実施形態103~105のいずれか1つに記載の核酸。
107.前記遺伝子座が、前記オルソポックスウイルスゲノムの5’末端における欠失の境界にある、実施形態106に記載の核酸。
108.前記遺伝子座が、前記オルソポックスウイルスゲノムの3’末端における欠失の境界にある、実施形態106に記載の核酸。
109.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、
(iii)前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入されたIL-12-TM導入遺伝子と、
(iv)前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入されたFlt3リガンド導入遺伝子と、
(v)
(a)一本鎖抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片をコードする導入遺伝子、
または
(b)(i)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の重鎖をコードする導入遺伝子、及び
(ii)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の軽鎖をコードする導入遺伝子のいずれかと、を含み、
パート(v)における導入遺伝子(複数可)が、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムに存在する5p欠失の境界内に挿入され、
前記抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片が、CTLA-4と結合することが可能である、前記核酸。
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、
(iii)前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入されたIL-12-TM導入遺伝子と、
(iv)前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入されたFlt3リガンド導入遺伝子と、
(v)
(a)一本鎖抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片をコードする導入遺伝子、
または
(b)(i)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の重鎖をコードする導入遺伝子、及び
(ii)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の軽鎖をコードする導入遺伝子のいずれかと、を含み、
パート(v)における導入遺伝子(複数可)が、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムに存在する5p欠失の境界内に挿入され、
前記抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片が、CTLA-4と結合することが可能である、前記核酸。
110.前記オルソポックスウイルスゲノムが、配列番号210の配列に由来し、
(a)前記由来配列が、B8R遺伝子の欠失、ならびに前記IL-12-TM導入遺伝子、前記Flt3リガンド導入遺伝子、及び前記一本鎖または二本鎖抗CTLA-4抗体をコードする導入遺伝子(複数可)を含み、
(b)前記IL-12-TM導入遺伝子が、配列番号212のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、
(c)前記Flt3リガンド導入遺伝子が、配列番号213のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、
(d)前記抗CTLA-4抗体が、配列番号211のアミノ酸配列を含む、実施形態109に記載の核酸。
(a)前記由来配列が、B8R遺伝子の欠失、ならびに前記IL-12-TM導入遺伝子、前記Flt3リガンド導入遺伝子、及び前記一本鎖または二本鎖抗CTLA-4抗体をコードする導入遺伝子(複数可)を含み、
(b)前記IL-12-TM導入遺伝子が、配列番号212のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、
(c)前記Flt3リガンド導入遺伝子が、配列番号213のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、
(d)前記抗CTLA-4抗体が、配列番号211のアミノ酸配列を含む、実施形態109に記載の核酸。
111.実施形態1~110のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸を含む、ウイルス。
112.
a)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含むか、
b)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含むか、または
C)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態111に記載のウイルス。
a)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含むか、
b)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含むか、または
C)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態111に記載のウイルス。
113.前記ウイルスが、ワクシニアウイルスに由来する、実施形態111または112に記載のウイルス。
114.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1からなる群から選択される株に由来する、実施形態113に記載のウイルス。
115.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen、Western Reserve、Tian Tan、Wyeth、及びListerからなる群から選択される株に由来する、実施形態114に記載のウイルス。
116.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen株ワクシニアウイルスに由来する、実施形態115に記載のウイルス。
117.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、チミジンキナーゼ(TK)遺伝子をさらに含む、実施形態111~116のいずれか1つに記載のウイルス。
118.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、リボヌクレオチドレダクターゼ遺伝子をさらに含む、実施形態111~117のいずれか1つに記載のウイルス。
119.哺乳動物細胞の集団を前記ウイルスと接触させると、前記欠失を含まないウイルスの形態と接触した同じ型の哺乳動物細胞の集団と比較して、哺乳動物細胞の集団が、増加したシンシチウム形成を示す、実施形態111~118のいずれか1つに記載のウイルス。
120.哺乳動物細胞の集団を前記ウイルスと接触させると、前記欠失を含まないウイルスの形態と接触した同じ型の哺乳動物細胞の集団と比較して、哺乳動物細胞の集団が、ウイルスの増加した拡散を示す、実施形態111~119のいずれか1つに記載のウイルス。
121.前記ウイルスが、前記欠失を含まないウイルスの形態と比較して、哺乳類細胞集団に増加した細胞傷害性効果を発揮する、実施形態111~120のいずれか1つに記載のウイルス。
122.前記哺乳類細胞が、ヒト細胞である、実施形態119~121のいずれか1つに記載のウイルス。
123.前記ヒト細胞が、がん細胞である、実施形態122に記載のウイルス。
124.前記哺乳動物細胞が、U2OS、293、293T、Vero、HeLa、A549、BHK、BSC40、CHO、OVCAR-8、786-0、NCI-H23、U251、SF-295、T-47D、SKMEL2、BT-549、SK-MEL-28、MDA-MB-231、SK-OV-3、MCF7、M14、SF-268、CAKI-1、HPAV、OVCAR-4、HCT15、K-562、及びHCT-116からなる群から選択される細胞株由来である、実施形態119~121のいずれか1つに記載のウイルス。
125.前記核酸または前記ウイルスが、腫瘍関連抗原をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~110のいずれか1つに記載の核酸または実施形態111~124のいずれか1つに記載のウイルス。
126.前記腫瘍関連抗原が、表3~30のいずれか1つに列挙される腫瘍関連抗原である、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
127.前記腫瘍関連抗原が、CD19、CD33、EpCAM、CEA、PSMA、EGFRvIII、CD133、EGFR、CDH19、ENPP3、DLL3、MSLN、ROR1、HER2、HLAA2、EpHA2、EpHA3、MCSP、CSPG4、NG2、RON、FLT3、BCMA、CD20、FAPα、FRα、CA-9、PDGFRα、PDGFRβ、FSP1、S100A4、ADAM12m、RET、MET、FGFR、INSR、及びNTRKからなる群から選択される腫瘍関連抗原である、実施形態126に記載の核酸またはウイルス。
128.前記腫瘍関連抗原が、MAGE-A3またはその1つ以上の断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
129.前記腫瘍関連抗原が、NY-ESO-1またはその1つ以上の断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
130.前記腫瘍関連抗原が、1つ以上のヒトパピローマウイルス(HPV)タンパク質またはその断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
131.前記HPVタンパク質またはその断片が、(i)HPV16のE6及びE7タンパク質またはその断片、ならびに(ii)HPV18のE6及びE7タンパク質またはその断片のうちの1つ以上を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
132.前記HPVタンパク質または断片の配列は、国際特許公開第WO/2014/127478号に開示され、その内容が参照により本明細書に組み込まれる、実施形態131に記載の核酸またはウイルス。
133.前記腫瘍関連抗原が、ブラキュリまたはその1つ以上の断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
134.前記腫瘍関連抗原が、前立腺酸性ホスファターゼまたはその1つ以上の断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
135.実施形態1~110のいずれか1つに記載の核酸または実施形態111~124のいずれか1つに記載のウイルスを含む、パッケージング細胞株。
136.哺乳類患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の実施形態111~134のいずれか1つに記載のウイルスを前記患者に投与することを含む、前記方法。
137.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態136に記載の方法。
138.前記ウイルスが、プライム:ブースト治療において刺激として使用される、実施形態136または137に記載の方法。
139.前記ウイルスが、プライム:ブースト治療における追加免疫として使用される、実施形態136または137に記載の方法。
140.前記哺乳動物患者が、がんを有する、実施形態136~139のいずれか1つに記載の方法。
141.前記がんが、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、ならびに喉癌からなる群から選択される、実施形態140に記載の方法。
142.前記がんが、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、副腎皮質癌、AIDS関連リンパ腫、原発性CNSリンパ腫、肛門癌、虫垂癌、星状細胞腫、異型奇形/ラブドイド腫瘍、基底細胞癌、胆管癌、肝外癌、ユーイング肉腫ファミリー、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、中枢神経系胚性腫瘍、中枢神経系胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣腫、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、原発性リンパ腫、脊索腫、慢性骨髄増殖性腫瘍、結腸癌、肝外胆管癌、非浸潤性乳管癌(DCIS)、子宮内膜癌、上衣腫、食道癌、嗅神経芽細胞腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、卵管癌、骨の線維性組織球腫、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、精巣胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛性疾患、神経膠腫、小児脳幹神経膠腫、有毛細胞白血病、肝細胞癌、ランゲルハンス細胞組織球症、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、膵島細胞腫瘍、膵臓神経内分泌腫瘍、ウィルムス腫瘍及び他の小児腎臓腫瘍、ランゲルハンス細胞組織球症、小細胞肺癌、皮膚T細胞リンパ腫、眼内黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性頸部扁平上皮癌、正中線管癌、多発性内分泌腺腫症候群、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、鼻腔及び副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫(NHL)、非小細胞肺癌(NSCLC)、上皮性卵巣癌、胚細胞卵巣癌、低悪性度卵巣癌、膵臓神経内分泌腫瘍、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔及び鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、胸膜肺芽腫、原発性腹膜癌、直腸癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、カポジ肉腫、横紋筋肉腫、セザリー症候群、小腸癌、軟部肉腫、喉癌、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、腎盂及び尿管の移行上皮癌、尿道癌、子宮内膜癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ならびにワルデンストレームマクログロブリン血症からなる群から選択される、実施形態140に記載の方法。
143.前記方法が、前記患者に免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、実施形態136~142のいずれか1つに記載の方法。
144.前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、実施形態143に記載の方法。
145.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、実施形態144に記載の方法。
146.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態145に記載の方法。
147.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、実施形態145に記載の方法。
148.前記方法が、前記患者にインターロイキンを投与することをさらに含む、実施形態136~147のいずれか1つに記載の方法。
149.前記インターロイキンが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態148に記載の方法。
150.前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、実施形態149に記載の方法。
151.前記インターロイキンが、膜結合である、実施形態149または150に記載の方法。
152.前記方法が、前記患者にインターフェロンを投与することをさらに含む、実施形態136~151のいずれか1つに記載の方法。
153.前記インターフェロンが、
IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態152に記載の方法。
IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態152に記載の方法。
154.前記方法が、前記患者にサイトカインを投与することをさらに含む、実施形態136~153のいずれか1つに記載の方法。
155.前記サイトカインが、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である、実施形態154に記載の方法。
156.前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、実施形態155に記載の方法。
157.前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びcKitからなる群から選択される、実施形態154に記載の方法。
158.前記サイトカインが、Flt3リガンドである、実施形態157に記載の方法。
159.キットであって、実施形態1~110のいずれか1つに記載の核酸または実施形態111~134のいずれか1つに記載のウイルスと、宿主細胞において前記核酸または前記ウイルスを発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
160.キットであって、実施形態111~134のいずれか1つに記載のウイルスと、がんを有する哺乳動物患者に治療有効量の前記ウイルスを投与し、それによって前記がんを治療するように使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
161.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態160に記載のキット。
162.前記インターロイキンが、膜結合IL-12 p35である、実施形態94に記載の核酸。
5.7.3.セット3
1.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
1.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
2.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態1に記載の核酸。
3.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態2に記載の核酸。
4.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態3に記載の核酸。
5.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態4に記載の核酸。
6.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも7つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態5に記載の核酸。
7.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも8つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態6に記載の核酸。
8.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも9つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態7に記載の核酸。
9.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも10個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態8に記載の核酸。
10.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも11個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態9に記載の核酸。
11.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも12個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態10に記載の核酸。
12.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも13個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態11に記載の核酸。
13.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも14個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態12に記載の核酸。
14.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも15個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態13に記載の核酸。
15.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも16個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態14に記載の核酸。
16.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも17個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態15に記載の核酸。
17.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも18個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態16に記載の核酸。
18.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも19個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態17に記載の核酸。
19.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも20個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態18に記載の核酸。
20.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも21個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態19に記載の核酸。
21.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも22個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態20に記載の核酸。
22.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失を含む、実施形態21に記載の核酸。
23.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
24.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態23に記載の核酸。
25.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態24に記載の核酸。
26.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態25に記載の核酸。
27.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態26に記載の核酸。
28.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される、実施形態27に記載の核酸。
29.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失を含む、実施形態28に記載の核酸。
30.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、前記核酸。
31.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも2つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態30に記載の核酸。
32.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも3つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態31に記載の核酸。
33.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも4つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態32に記載の核酸。
34.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも5つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態33に記載の核酸。
35.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも6つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態34に記載の核酸。
36.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも7つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態35に記載の核酸。
37.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも8つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態36に記載の核酸。
38.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも9つの遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態37に記載の核酸。
39.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも10個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態38に記載の核酸。
40.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも11個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態39に記載の核酸。
41.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも12個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態40に記載の核酸。
42.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも13個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態41に記載の核酸。
43.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも14個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態42に記載の核酸。
44.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、少なくとも15個の遺伝子の欠失を含み、各遺伝子が、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される、実施形態43に記載の核酸。
45.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子の各々の欠失を含む、実施形態44に記載の核酸。
46.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、宿主相互作用に関与するタンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~45のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸。
47.前記タンパク質が、細胞外マトリックスへのカルシウム非依存性接着に影響を及ぼす、実施形態46に記載の核酸。
48.前記タンパク質が、NF-κB阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
49.前記タンパク質が、C2L、N1L、M2L、K1L、及びK7R遺伝子からなる群から選択される遺伝子によってコードされる、実施形態48に記載の核酸。
50.前記タンパク質が、アポトーシス阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
51.前記アポトーシス阻害剤が、カスパーゼ-9阻害剤である、実施形態47に記載の核酸。
52.前記カスパーゼ-9阻害剤が、F1L遺伝子によってコードされる、実施形態51に記載の核酸。
53.前記アポトーシス阻害剤が、BCL-2様タンパク質である、実施形態50に記載の核酸。
54.前記BCL-2様タンパク質が、N1Lによってコードされる、実施形態53に記載の核酸。
55.前記タンパク質が、インターフェロン制御性因子3(IRF3)阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
56.前記IRF3阻害剤が、N2LまたはK7Rによってコードされる、実施形態55に記載の核酸。
57.前記タンパク質が、セリンプロテアーゼ阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
58.前記タンパク質が、細胞融合を防止する、実施形態46に記載の核酸。
59.前記タンパク質が、K2Lによってコードされる、実施形態58に記載の核酸。
60.前記タンパク質が、RNA活性化タンパク質キナーゼ(PKR)阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
61.前記タンパク質が、K1LまたはK3Lによってコードされる、実施形態60に記載の核酸。
62.前記タンパク質が、病原性因子である、実施形態46に記載の核酸。
63.前記タンパク質が、F3Lによってコードされる、実施形態63に記載の核酸。
64.前記タンパク質が、IL-1-ベータ阻害剤である、実施形態46に記載の核酸。
65.前記タンパク質が、B16Rによってコードされる、実施形態64に記載の核酸。
66.前記タンパク質が、分泌型IFNα隔離剤である、実施形態46に記載の核酸。
67.前記タンパク質が、B19Rによってコードされる、実施形態67に記載の核酸。
68.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、DNA複製に関与するタンパク質をコードする少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態1~67のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸。
69.前記タンパク質が、DNA修飾ヌクレアーゼである、実施形態68に記載の核酸。
70.前記タンパク質が、K4Lによってコードされる、実施形態69に記載の核酸。
71.前記タンパク質が、デオキシウリジントリホスファターゼ(dUTPase)である、実施形態70に記載の核酸。
72.前記dUTPaseが、F2Lによってコードされる、実施形態71に記載の核酸。
73.少なくとも1つの欠失遺伝子のヌクレオチド配列全体が欠失する、実施形態1~72のいずれか1つに記載の核酸。
74.少なくとも1つの欠失遺伝子が、部分的にのみ欠失しており、前記部分的欠失が、宿主細胞への導入時に前記部分的に欠失した遺伝子を機能しないようにするのに十分である、実施形態1~72のいずれか1つに記載の核酸。
75.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、逆位末端配列(ITR)の少なくとも2つのコピーを含む、実施形態1~74のいずれか1つに記載の核酸。
76.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ITRの任意のコピーを欠く、実施形態1~74のいずれか1つに記載の核酸。
77.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRからなる群から選択されるITRの少なくとも1つのコピーにおける欠失を含む、実施形態1~74のいずれか1つに記載の核酸。
78.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRのコピーの少なくとも全てにおける欠失を含む、実施形態1~74のいずれか1つに記載の核酸。
79.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B8R遺伝子における欠失を含む、実施形態1~78のいずれか1つに記載の核酸。
80.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、無傷B8R遺伝子を含む、実施形態1~78のいずれか1つに記載の核酸。
81.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含む、前記核酸。
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含む、前記核酸。
82.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含み、
前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、無傷B8R遺伝子を含む、前記核酸。
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、を含み、
前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、無傷B8R遺伝子を含む、前記核酸。
83.免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~82のいずれか1つに記載の核酸。
84.前記核酸が、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの導入遺伝子を含む、実施形態83に記載の核酸。
85.前記核酸が、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子、及びサイトカインをコードする導入遺伝子を含む、実施形態84に記載の核酸。
86.前記核酸が、免疫チェックポイント阻害剤をコードする導入遺伝子を含む、実施形態83または84のいずれか1つに記載の核酸。
87.前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、実施形態85または86に記載の核酸。
88.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-L1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、実施形態87に記載の核酸。
89.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態88に記載の核酸。
90.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、実施形態88に記載の核酸。
91.前記核酸が、インターロイキン(IL)をコードする導入遺伝子を含む、実施形態83または84に記載の核酸。
92.前記インターロイキンが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態85または91に記載の核酸。
93.前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、実施形態92に記載の核酸。
94.前記インターロイキンが、膜結合である、実施形態93に記載の核酸。
95.前記インターロイキンが、膜結合IL-12 p70である、実施形態94に記載の核酸。
96.前記核酸が、サイトカインをコードする導入遺伝子を含む、実施形態83または84に記載の核酸。
97.前記サイトカインが、インターフェロン(IFN)である、実施形態96に記載の核酸。
98.前記インターフェロンが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態97に記載の核酸。
99.前記サイトカインが、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である、実施形態96に記載の核酸。
100.前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、実施形態99に記載の核酸。
101.前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びc-kitからなる群から選択される、実施形態96に記載の核酸。
102.前記サイトカインが、Flt3リガンドである、実施形態101に記載の核酸。
103.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムは、前記B8R遺伝子における前記欠失を含み、少なくとも1つの導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入される、実施形態83~102に記載の核酸。
104.少なくとも2つの導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入される、実施形態103に記載の核酸。
105.少なくとも3つの導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入される、実施形態104に記載の核酸。
106.少なくとも1つの導入遺伝子が、前記B8R遺伝子の欠失ではない遺伝子座に挿入される、実施形態103~105のいずれか1つに記載の核酸。
107.前記遺伝子座が、前記オルソポックスウイルスゲノムの5’末端における欠失の境界にある、実施形態106に記載の核酸。
108.前記遺伝子座が、前記オルソポックスウイルスゲノムの3’末端における欠失の境界にある、実施形態106に記載の核酸。
109.組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸であって、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、
(iii)前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入されたIL-12-TM導入遺伝子と、
(iv)前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入されたFlt3リガンド導入遺伝子と、
(v)
(a)一本鎖抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片をコードする導入遺伝子、
または
(b)(i)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の重鎖をコードする導入遺伝子、及び
(ii)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の軽鎖をコードする導入遺伝子のいずれかと、を含み、
パート(v)における導入遺伝子(複数可)が、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムに存在する5p欠失の境界内に挿入され、
前記抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片が、CTLA-4と結合することが可能である、前記核酸。
(i)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、B20R、及びB8R遺伝子の各々の欠失と、
(ii)ITRのB21R-ITR、B22R-ITR、B23R-ITR、B24R-ITR、B25R-ITR、B26R-ITR、B27R-ITR、B28R-ITR、及びB29R-ITRの各コピーにおける欠失と、
(iii)前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入されたIL-12-TM導入遺伝子と、
(iv)前記B8R遺伝子における前記欠失に挿入されたFlt3リガンド導入遺伝子と、
(v)
(a)一本鎖抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片をコードする導入遺伝子、
または
(b)(i)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の重鎖をコードする導入遺伝子、及び
(ii)抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片の軽鎖をコードする導入遺伝子のいずれかと、を含み、
パート(v)における導入遺伝子(複数可)が、前記組換えオルソポックスウイルスゲノムに存在する5p欠失の境界内に挿入され、
前記抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片が、CTLA-4と結合することが可能である、前記核酸。
110.前記オルソポックスウイルスゲノムが、配列番号210の配列に由来し、
(a)前記由来配列が、前記B8R遺伝子の欠失、ならびに前記IL-12-TM導入遺伝子、前記Flt3リガンド導入遺伝子、及び前記一本鎖または二本鎖抗CTLA-4抗体をコードする導入遺伝子(複数可)を含み、
(b)前記IL-12-TM導入遺伝子が、配列番号212のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、
(c)前記Flt3リガンド導入遺伝子が、配列番号213のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、
(d)前記抗CTLA-4抗体が、配列番号211のアミノ酸配列を含む、実施形態109に記載の核酸。
(a)前記由来配列が、前記B8R遺伝子の欠失、ならびに前記IL-12-TM導入遺伝子、前記Flt3リガンド導入遺伝子、及び前記一本鎖または二本鎖抗CTLA-4抗体をコードする導入遺伝子(複数可)を含み、
(b)前記IL-12-TM導入遺伝子が、配列番号212のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、
(c)前記Flt3リガンド導入遺伝子が、配列番号213のアミノ酸配列を含むタンパク質をコードし、
(d)前記抗CTLA-4抗体が、配列番号211のアミノ酸配列を含む、実施形態109に記載の核酸。
111.実施形態1~110のいずれか1つに記載の組換えオルソポックスウイルスゲノムを含む核酸を含む、ウイルス。
112.
a)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含むか、
b)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含むか、または
C)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態111に記載のウイルス。
a)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも2つの遺伝子の欠失を含むか、
b)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含むか、または
C)前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子の欠失を含む、実施形態111に記載のウイルス。
113.前記ウイルスが、ワクシニアウイルスに由来する、実施形態111または112に記載のウイルス。
114.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、EM63、ACAM2000、LC16m8、CV-1、修飾ワクシニアアンカラ(MVA)、Dairen I、GLV-1h68、IHD-J、L-IVP、LC16mO、Tashkent、Tian Tan、及びWAU86/88-1からなる群から選択される株に由来する、実施形態113に記載のウイルス。
115.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen、Western Reserve、Tian Tan、Wyeth、及びListerからなる群から選択される株に由来する、実施形態114に記載のウイルス。
116.前記ワクシニアウイルスが、Copenhagen株ワクシニアウイルスに由来する、実施形態115に記載のウイルス。
117.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、チミジンキナーゼ(TK)遺伝子をさらに含む、実施形態111~116のいずれか1つに記載のウイルス。
118.前記組換えオルソポックスウイルスゲノムが、リボヌクレオチドレダクターゼ遺伝子をさらに含む、実施形態111~117のいずれか1つに記載のウイルス。
119.哺乳動物細胞の集団を前記ウイルスと接触させると、前記欠失を含まないウイルスの形態と接触した同じ型の哺乳動物細胞の集団と比較して、哺乳動物細胞の集団が、増加したシンシチウム形成を示す、実施形態111~118のいずれか1つに記載のウイルス。
120.哺乳動物細胞の集団を前記ウイルスと接触させると、前記欠失を含まないウイルスの形態と接触した同じ型の哺乳動物細胞の集団と比較して、哺乳動物細胞の集団が、ウイルスの増加した拡散を示す、実施形態111~119のいずれか1つに記載のウイルス。
121.前記ウイルスが、前記欠失を含まないウイルスの形態と比較して、哺乳類細胞集団に増加した細胞傷害性効果を発揮する、実施形態111~120のいずれか1つに記載のウイルス。
122.前記哺乳類細胞が、ヒト細胞である、実施形態119~121のいずれか1つに記載のウイルス。
123.前記ヒト細胞が、がん細胞である、実施形態122に記載のウイルス。
124.前記哺乳動物細胞が、U2OS、293、293T、Vero、HeLa、A549、BHK、BSC40、CHO、OVCAR-8、786-0、NCI-H23、U251、SF-295、T-47D、SKMEL2、BT-549、SK-MEL-28、MDA-MB-231、SK-OV-3、MCF7、M14、SF-268、CAKI-1、HPAV、OVCAR-4、HCT15、K-562、及びHCT-116からなる群から選択される細胞株由来である、実施形態119~121のいずれか1つに記載のウイルス。
125.前記核酸または前記ウイルスが、腫瘍関連抗原をコードする導入遺伝子をさらに含む、実施形態1~110のいずれか1つに記載の核酸または実施形態111~124のいずれか1つに記載のウイルス。
126.前記腫瘍関連抗原が、表3~30のいずれか1つに列挙される腫瘍関連抗原である、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
127.前記腫瘍関連抗原が、CD19、CD33、EpCAM、CEA、PSMA、EGFRvIII、CD133、EGFR、CDH19、ENPP3、DLL3、MSLN、ROR1、HER2、HLAA2、EpHA2、EpHA3、MCSP、CSPG4、NG2、RON、FLT3、BCMA、CD20、FAPα、FRα、CA-9、PDGFRα、PDGFRβ、FSP1、S100A4、ADAM12m、RET、MET、FGFR、INSR、及びNTRKからなる群から選択される腫瘍関連抗原である、実施形態126に記載の核酸またはウイルス。
128.前記腫瘍関連抗原が、MAGE-A3またはその1つ以上の断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
129.前記腫瘍関連抗原が、NY-ESO-1またはその1つ以上の断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
130.前記腫瘍関連抗原が、1つ以上のヒトパピローマウイルス(HPV)タンパク質またはその断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
131.前記HPVタンパク質またはその断片が、(i)HPV16のE6及びE7タンパク質またはその断片、ならびに(ii)HPV18のE6及びE7タンパク質またはその断片のうちの1つ以上を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
132.前記HPVタンパク質または断片の配列は、国際特許公開第WO/2014/127478号に開示され、その内容が参照により本明細書に組み込まれる、実施形態131に記載の核酸またはウイルス。
133.前記腫瘍関連抗原が、ブラキュリまたはその1つ以上の断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
134.前記腫瘍関連抗原が、前立腺酸性ホスファターゼまたはその1つ以上の断片を含む、実施形態125に記載の核酸またはウイルス。
135.実施形態1~110のいずれか1つに記載の核酸または実施形態111~124のいずれか1つに記載のウイルスを含む、パッケージング細胞株。
136.哺乳類患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の実施形態111~134のいずれか1つに記載のウイルスを前記患者に投与することを含む、前記方法。
137.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態136に記載の方法。
138.前記ウイルスが、プライム:ブースト治療において刺激として使用される、実施形態136または137に記載の方法。
139.前記ウイルスが、プライム:ブースト治療における追加免疫として使用される、実施形態136または137に記載の方法。
140.前記哺乳動物患者が、がんを有する、実施形態136~139のいずれか1つに記載の方法。
141.前記がんが、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、ならびに喉癌からなる群から選択される、実施形態140に記載の方法。
142.前記がんが、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性リンパ性白血病(CLL)、慢性骨髄性白血病(CML)、副腎皮質癌、AIDS関連リンパ腫、原発性CNSリンパ腫、肛門癌、虫垂癌、星状細胞腫、異型奇形/ラブドイド腫瘍、基底細胞癌、胆管癌、肝外癌、ユーイング肉腫ファミリー、骨肉腫及び悪性線維性組織球腫、中枢神経系胚性腫瘍、中枢神経系胚細胞腫瘍、頭蓋咽頭腫、上衣腫、気管支腫瘍、バーキットリンパ腫、カルチノイド腫瘍、原発性リンパ腫、脊索腫、慢性骨髄増殖性腫瘍、結腸癌、肝外胆管癌、非浸潤性乳管癌(DCIS)、子宮内膜癌、上衣腫、食道癌、嗅神経芽細胞腫、頭蓋外胚細胞腫瘍、性腺外胚細胞腫瘍、卵管癌、骨の線維性組織球腫、消化管カルチノイド腫瘍、消化管間質腫瘍(GIST)、精巣胚細胞腫瘍、妊娠性絨毛性疾患、神経膠腫、小児脳幹神経膠腫、有毛細胞白血病、肝細胞癌、ランゲルハンス細胞組織球症、ホジキンリンパ腫、下咽頭癌、膵島細胞腫瘍、膵臓神経内分泌腫瘍、ウィルムス腫瘍及び他の小児腎臓腫瘍、ランゲルハンス細胞組織球症、小細胞肺癌、皮膚T細胞リンパ腫、眼内黒色腫、メルケル細胞癌、中皮腫、転移性頸部扁平上皮癌、正中線管癌、多発性内分泌腺腫症候群、多発性骨髄腫/形質細胞新生物、骨髄異形成症候群、鼻腔及び副鼻腔癌、鼻咽頭癌、神経芽細胞腫、非ホジキンリンパ腫(NHL)、非小細胞肺癌(NSCLC)、上皮性卵巣癌、胚細胞卵巣癌、低悪性度卵巣癌、膵臓神経内分泌腫瘍、乳頭腫症、傍神経節腫、副鼻腔及び鼻腔癌、副甲状腺癌、陰茎癌、咽頭癌、褐色細胞腫、下垂体腫瘍、胸膜肺芽腫、原発性腹膜癌、直腸癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、唾液腺癌、カポジ肉腫、横紋筋肉腫、セザリー症候群、小腸癌、軟部肉腫、喉癌、胸腺腫及び胸腺癌、甲状腺癌、腎盂及び尿管の移行上皮癌、尿道癌、子宮内膜癌、子宮肉腫、膣癌、外陰癌、ならびにワルデンストレームマクログロブリン血症からなる群から選択される、実施形態140に記載の方法。
143.前記方法が、前記患者に免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、実施形態136~142のいずれか1つに記載の方法。
144.前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、実施形態143に記載の方法。
145.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、実施形態144に記載の方法。
146.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態145に記載の方法。
147.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、実施形態145に記載の方法。
148.前記方法が、前記患者にインターロイキンを投与することをさらに含む、実施形態136~147のいずれか1つに記載の方法。
149.前記インターロイキンが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態148に記載の方法。
150.前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、実施形態149に記載の方法。
151.前記インターロイキンが、膜結合である、実施形態149または150に記載の方法。
152.前記方法が、前記患者にインターフェロンを投与することをさらに含む、実施形態136~151のいずれか1つに記載の方法。
153.前記インターフェロンが、
IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態152に記載の方法。
IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態152に記載の方法。
154.前記方法が、前記患者にサイトカインを投与することをさらに含む、実施形態136~153のいずれか1つに記載の方法。
155.前記サイトカインが、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である、実施形態154に記載の方法。
156.前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、実施形態155に記載の方法。
157.前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びcKitからなる群から選択される、実施形態154に記載の方法。
158.前記サイトカインが、Flt3リガンドである、実施形態157に記載の方法。
159.キットであって、実施形態1~110のいずれか1つに記載の核酸または実施形態111~134のいずれか1つに記載のウイルスと、宿主細胞において前記核酸または前記ウイルスを発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
160.キットであって、実施形態111~134のいずれか1つに記載のウイルスと、がんを有する哺乳動物患者に治療有効量の前記ウイルスを投与し、それによって前記がんを治療するように使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
161.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態160に記載のキット。
162.前記インターロイキンが、膜結合IL-12 p35である、実施形態94に記載の核酸。
5.7.4.セット4
1.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、前記第1の導入遺伝子と、
(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、前記第3の導入遺伝子と、を含む、前記核酸。
1.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、前記第1の導入遺伝子と、
(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、前記第3の導入遺伝子と、を含む、前記核酸。
2.前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態1に記載の核酸。
3.前記抗CTLA-4抗体をコードする前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態1または2に記載の核酸。
4.前記抗CTLA-4抗体をコードする前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、実施形態3に記載の核酸。
5.前記抗CTLA-4抗体をコードする前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態3に記載の核酸。
6.前記IL-12ポリペプチドをコードする前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態1~5のいずれか1つに記載の核酸。
7.前記IL-12ポリペプチドをコードする前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、実施形態6に記載の核酸。
8.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態7に記載の核酸。
9.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態7に記載の核酸。
10.FLT3Lをコードする前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態1~9のいずれか1つに記載の核酸。
11.FLT3Lをコードする前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、実施形態10に記載の核酸。
12.FLT3Lをコードする前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態10に記載の核酸。
13.FLT3Lをコードする前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態10に記載の核酸。
14.FLT3Lをコードする前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態10に記載の核酸。
15.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
16.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
17.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
18.前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
19.前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
20.前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
21.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
22.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
23.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
24.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
25.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
26.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
27.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
28.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
29.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
30.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
31.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
32.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
33.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
34.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
35.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
36.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
37.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
38.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
39.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
40.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
41.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
42.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
43.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
44.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
45.前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
46.前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
47.前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
48.前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
49.前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
50.前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
51.前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
52.前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
53.前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
54.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
55.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
56.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
57.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
58.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
59.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
60.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
61.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
62.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
63.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
64.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
65.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
66.前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
67.前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
68.前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
69.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
70.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
71.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
72.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
73.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
74.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
75.前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
76.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
77.前記第3の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~14のいずれか1つに記載の核酸。
78.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
79.前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態78に記載の核酸。
80.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態78または79に記載の核酸。
81.前記第1の導入遺伝子が、配列番号210における前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態78または79に記載の核酸。
82.前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、実施形態80または81に記載の核酸。
83.前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、実施形態80または81に記載の核酸。
84.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
85.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態84に記載の核酸。
86.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態85に記載の核酸。
87.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態84~86のいずれか1つに記載の核酸。
88.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態87に記載の核酸。
89.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態88に記載の核酸。
90.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
91.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態90に記載の核酸。
92.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態91に記載の核酸。
93.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態90~92のいずれか1つに記載の核酸。
94.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態93に記載の核酸。
95.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態94に記載の核酸。
96.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
97.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態96に記載の核酸。
98.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態97に記載の核酸。
99.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態96~98のいずれか1つに記載の核酸。
100.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態99に記載の核酸。
101.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態100に記載の核酸。
102.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
103.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態102に記載の核酸。
104.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態103に記載の核酸。
105.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態102~104のいずれか1つに記載の核酸。
106.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態105に記載の核酸。
107.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態106に記載の核酸。
108.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
109.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態108に記載の核酸。
110.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態109に記載の核酸。
111.前記pSのヌクレオチド配列が、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む、実施形態108~110のいずれか1つに記載の核酸。
112.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
113.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態112に記載の核酸。
114.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態113に記載の核酸。
115.前記pSのヌクレオチド配列が、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む、実施形態112~114のいずれか1つに記載の核酸。
116.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列のB8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列のB8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列のB8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列のB8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
117.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態116に記載の核酸。
118.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態117に記載の核酸。
119.前記pSのヌクレオチド配列が、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む、実施形態116~118のいずれか1つに記載の核酸。
120.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む前記第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む前記第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
121.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態120に記載の核酸。
122.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態121に記載の核酸。
123.前記pSのヌクレオチド配列が、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む、実施形態120~122のいずれか1つに記載の核酸。
124.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列のB8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列のB8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
125.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態124に記載の核酸。
126.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態125に記載の核酸。
127.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態124~126のいずれか1つに記載の核酸。
128.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態127に記載の核酸。
129.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態128に記載の核酸。
130.前記F17Rプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号563のヌクレオチド配列を含む、実施形態124~129のいずれか1つに記載の核酸。
131.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
132.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態131に記載の核酸。
133.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態132に記載の核酸。
134.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態131~133のいずれか1つに記載の核酸。
135.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態134に記載の核酸。
136.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態135に記載の核酸。
137.前記F17Rプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号563のヌクレオチド配列を含む、実施形態131~136のいずれか1つに記載の核酸。
138.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8RプロモーターまたはB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
139.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態138に記載の核酸。
140.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態139に記載の核酸。
141.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態138~140のいずれか1つに記載の核酸。
142.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態141に記載の核酸。
143.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態142に記載の核酸。
144.前記F17Rプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号563のヌクレオチド配列を含む、実施形態138~143のいずれか1つに記載の核酸。
145.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
146.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態145に記載の核酸。
147.前記B8Rプロモーターが、配列番号564のヌクレオチド配列を含み、前記B19Rプロモーターが、配列番号565のヌクレオチド配列を含む、実施形態146に記載の核酸。
148.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態145~147のいずれか1つに記載の核酸。
149.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態148に記載の核酸。
150.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態149に記載の核酸。
151.前記F17Rプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号563のヌクレオチド配列を含む、実施形態145~150のいずれか1つに記載の核酸。
152.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
153.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態152に記載の核酸。
154.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態153に記載の核酸。
155.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態154に記載の核酸。
156.前記E3Lプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号567のヌクレオチド配列を含む、実施形態152~155のいずれか1つに記載の核酸。
157.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
158.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態157に記載の核酸。
159.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態158に記載の核酸。
160.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態159に記載の核酸。
161.前記E3Lプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号567のヌクレオチド配列を含む、実施形態157~160のいずれか1つに記載の核酸。
162.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列のB8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列のB8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
163.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態162に記載の核酸。
164.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態163に記載の核酸。
165.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態164に記載の核酸。
166.前記E3Lプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号567のヌクレオチド配列を含む、実施形態162~165のいずれか1つに記載の核酸。
167.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
168.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーターまたはH5R後期プロモーターである、実施形態167に記載の核酸。
169.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5R初期プロモーター及びH5R後期プロモーターである、実施形態168に記載の核酸。
170.前記H5R初期プロモーターが、配列番号553のヌクレオチド配列を含み、前記H5R後期プロモーターが、配列番号554のヌクレオチド配列を含む、実施形態169に記載の核酸。
171.前記E3Lプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号567のヌクレオチド配列を含む、実施形態167~170のいずれか1つに記載の核酸。
172.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
173.前記pSプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む、実施形態172に記載の核酸。
174.前記F17Rプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号563のヌクレオチド配列を含む、実施形態172または173に記載の核酸。
175.前記E3Lプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号567のヌクレオチド配列を含む、実施形態172~174のいずれか1つに記載の核酸。
176.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
177.前記pSプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む、実施形態176に記載の核酸。
178.前記F17Rプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号563のヌクレオチド配列を含む、実施形態176または177に記載の核酸。
179.前記E3Lプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号567のヌクレオチド配列を含む、実施形態176~178のいずれか1つに記載の核酸。
180.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
181.前記pSプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む、実施形態180に記載の核酸。
182.前記F17Rプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号563のヌクレオチド配列を含む、実施形態170または181に記載の核酸。
183.前記E3Lプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号567のヌクレオチド配列を含む、実施形態180~182のいずれか1つに記載の核酸。
184.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)部分C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子を含み、B8R遺伝子における欠失を含む、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列と、
(b)CTLA-4と特異的に結合する抗体をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載され、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載され、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載され、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列の前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、pSプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、F17Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、E3Lプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
185.前記pSプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号555、配列番号556、または配列番号557のヌクレオチド配列を含む、実施形態184に記載の核酸。
186.前記F17Rプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号563のヌクレオチド配列を含む、実施形態174または185に記載の核酸。
187.前記E3Lプロモーターのヌクレオチド配列が、配列番号567のヌクレオチド配列を含む、実施形態184~186のいずれか1つに記載の核酸。
188.実施形態1~187のいずれか1つに記載の組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸を含む、ウイルス。
189.実施形態1~187のいずれか1つに記載の核酸を含む、パッケージング細胞株。
190.実施形態188に記載のウイルスを含む、パッケージング細胞株。
191.実施形態188に記載のウイルスと、生理学的に許容される担体と、を含む、薬学的組成物。
192.キットであって、実施形態1~187のいずれか1つに記載の核酸と、宿主細胞において前記核酸を発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
193.キットであって、実施形態188に記載のウイルスと、前記ウイルスを宿主細胞において発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
194.キットであって、実施形態188に記載のウイルスと、がんを有する哺乳動物患者に治療有効量のウイルスを投与し、それによって前記がんを治療するように使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
195.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態194に記載のキット。
196.哺乳動物患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の実施形態188に記載のウイルスを前記哺乳動物患者に投与することを含む、前記方法。
197.哺乳動物患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の実施形態191に記載の薬学的組成物を前記哺乳動物患者に投与することを含む、前記方法。
198.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態196または197に記載の方法。
199.前記がんが、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、結腸直腸癌、精巣癌、ならびに喉癌からなる群から選択される、実施形態196~198のいずれか1つに記載の方法。
200.前記方法が、前記哺乳動物患者に抗PD1抗体または抗PD-L1抗体を投与することをさらに含む、実施形態199に記載の方法。
5.7.5.セット5
1.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′逆位末端配列(ITR)におけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
1.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′逆位末端配列(ITR)におけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
2.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態1に記載の核酸。
3.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、実施形態2に記載の核酸。
4.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態2に記載の核酸。
5.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
6.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態5に記載の核酸。
7.前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態1~6のいずれか1つに記載の核酸。
8.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする、実施形態1~7のいずれか1つに記載の核酸。
9.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される配列を含む、実施形態1~8のいずれか1つに記載の核酸。
10.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、実施形態1~8のいずれか1つに記載の核酸。
11.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
12.前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形11に記載の核酸。
13.前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、実施形態12に記載の核酸。
14.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態13に記載の核酸。
15.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態13に記載の核酸。
16.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
17.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態16に記載の核酸。
18.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態16に記載の核酸。
19.前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態11~18のいずれか1つに記載の核酸。
20.前記IL-12ポリペプチドが、膜結合である、実施形態11~19のいずれか1つに記載の核酸。
21.前記IL-12ポリペプチドが、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む、実施形態11~20のいずれか1つに記載の核酸。
22.前記IL-12ポリペプチドが、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む、実施形態11~21のいずれか1つに記載の核酸。
23.前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される配列を含む、実施形態11~22のいずれか1つに記載の核酸。
24.前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、実施形態11~22のいずれか1つに記載の核酸。
25.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
26.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形25に記載の核酸。
27.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、実施形態26に記載の核酸。
28.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態26に記載の核酸。
29.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態26に記載の核酸。
30.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態26に記載の核酸。
31.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、
(d)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、
(d)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
32.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態31に記載の核酸。
33.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態31に記載の核酸。
34.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態31に記載の核酸。
35.前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態25~34のいずれか1つに記載の核酸。
36.前記FLT3Lが、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む、実施形態25~35のいずれか1つに記載の核酸。
37.前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される配列を含む、実施形態25~36のいずれか1つに記載の核酸。
38.前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、実施形態25~36のいずれか1つに記載の核酸。
39.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
40.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態39に記載の核酸。
41.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、実施形態40に記載の核酸。
42.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態40に記載の核酸。
43.前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態39~42のいずれか1つに記載の核酸。
44.前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、実施形態43に記載の核酸。
45.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態44に記載の核酸。
46.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態44に記載の核酸。
47.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列、をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列、をさらに含む、前記核酸。
48.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態47を含む核酸。
49.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態47または48を含む核酸。
50.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態47または48に記載の核酸。
51.第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態39~50のいずれか1つに記載の核酸。
52.前記IL-12ポリペプチドが、膜結合である、実施形態39~51のいずれか1つに記載の核酸。
53.前記IL-12ポリペプチドが、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む、実施形態39~52のいずれか1つに記載の核酸。
54.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする、実施形態39~53のいずれか1つに記載の核酸。
55.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される配列を含む、実施形態39~54のいずれか1つに記載の核酸。
56.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、実施形態39~54のいずれか1つに記載の核酸。
57.前記IL-12ポリペプチドが、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む、実施形態39~56のいずれか1つに記載の核酸。
58.前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される配列を含む、実施形態39~57のいずれか1つに記載の核酸。
59.前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、実施形態39~57のいずれか1つに記載の核酸。
60.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
61.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態60に記載の核酸。
62.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、実施形態61に記載の核酸。
63.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態61に記載の核酸。
64.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態60~63のいずれか1つに記載の核酸。
65.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、実施形態64に記載の核酸。
66.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態64に記載の核酸。
67.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態64に記載の核酸。
68.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態64に記載の核酸。
69.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。
70.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態69に記載の核酸。
71.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態69または70に記載の核酸。
72.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態69または70に記載の核酸。
73.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態69または70に記載の核酸。
74.前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態60~73のいずれか1つに記載の核酸。
75.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする、実施形態60~74のいずれか1つに記載の核酸。
76.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される配列を含む、実施形態60~75のいずれか1つに記載の核酸。
77.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、実施形態60~75のいずれか1つに記載の核酸。
78.前記FLT3Lが、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む、実施形態60~77のいずれか1つに記載の核酸。
79.前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される配列を含む、実施形態60~78のいずれか1つに記載の核酸。
80.前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、実施形態60~78のいずれか1つに記載の核酸。
81.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
82.前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形81に記載の核酸。
83.前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、実施形態82に記載の核酸。
84.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態83に記載の核酸。
85.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態83に記載の核酸。
86.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態81~85のいずれか1つに記載の核酸。
87.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、実施形態86に記載の核酸。
88.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態86に記載の核酸。
89.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態86に記載の核酸。
90.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態86に記載の核酸。
91.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。
92.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態91に記載の核酸。
93.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態91に記載の核酸。
94.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態91~93のいずれか1つに記載の核酸。
95.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態91~93のいずれか1つに記載の核酸。
96.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態91~93のいずれか1つに記載の核酸。
97.前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある、実施形態81~96のいずれか1つに記載の核酸。
98.前記IL-12ポリペプチドが、膜結合である、実施形態81~97のいずれか1つに記載の核酸。
99.前記IL-12ポリペプチドが、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む、実施形態81~98のいずれか1つに記載の核酸。
100.前記IL-12ポリペプチドが、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む、実施形態81~99のいずれか1つに記載の核酸。
101.前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される配列を含む、実施形態81~100のいずれか1つに記載の核酸。
102.前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、実施形態81~100のいずれか1つに記載の核酸。
103.前記FLT3Lが、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む、実施形態81~102のいずれか1つに記載の核酸。
104.前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される配列を含む、実施形態81~103のいずれか1つに記載の核酸。
105.前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、実施形態81~103のいずれか1つに記載の核酸。
106.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失である、前記核酸。
107.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態106に記載の核酸。
108.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、実施形態107に記載の核酸。
109.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態107に記載の核酸。
110.前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態106~109のいずれか1つに記載の核酸。
111.前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、実施形態110に記載の核酸。
112.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態111に記載の核酸。
113.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態111に記載の核酸。
114.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、実施形態106~113のいずれか1つに記載の核酸。
115.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、実施形態114に記載の核酸。
116.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態114に記載の核酸。
117.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態114に記載の核酸。
118.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態114に記載の核酸。
119.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。
120.前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、実施形態119に記載の核酸。
121.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、実施形態119または120に記載の核酸。
122.前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、実施形態119または120に記載の核酸。
123.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、実施形態119~122のいずれか1つに記載の核酸。
124.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、実施形態119~122のいずれか1つに記載の核酸。
125.前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、実施形態119~122のいずれか1つに記載の核酸。
126.前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態106~125のいずれか1つに記載の核酸。
127.前記IL-12ポリペプチドが、膜結合である、実施形態106~126のいずれか1つに記載の核酸。
128.前記IL-12ポリペプチドが、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む、実施形態106~127のいずれか1つに記載の核酸。
129.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする、実施形態106~128のいずれか1つに記載の核酸。
130.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される配列を含む、実施形態106~129のいずれか1つに記載の核酸。
131.前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、実施形態106~129のいずれか1つに記載の核酸。
132.前記IL-12ポリペプチドが、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む、実施形態106~131のいずれか1つに記載の核酸。
133.前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される配列を含む、実施形態106~132のいずれか1つに記載の核酸。
134.前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、実施形態106~132のいずれか1つに記載の核酸。
135.前記FLT3Lが、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む、実施形態106~134のいずれか1つに記載の核酸。
136.前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される配列を含む、実施形態106~135のいずれか1つに記載の核酸。
137.前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、実施形態106~135のいずれか1つに記載の核酸。
138.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
139.前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、実施形態138に記載の核酸。
140.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~10、39~80、及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
141.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態11~24、39~59、及び81~137のいずれか1つに記載の核酸。
142.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態25~38及び60~137のいずれか1つに記載の核酸。
143.前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態1~10、39~80、及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
144.前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態11~24、39~59、及び81~137のいずれか1つに記載の核酸。
145.前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態25~38及び60~137のいずれか1つに記載の核酸。
146.前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態1~10、39~80、及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
147.前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態11~24、39~59、及び81~137のいずれか1つに記載の核酸。
148.前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態25~38及び60~137のいずれか1つに記載の核酸。
149.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
150.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
151.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
152.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
153.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
154.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
155.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
156.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
157.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
158.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
159.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
160.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
161.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
162.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
163.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
164.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
165.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
166.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
167.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
168.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
169.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
170.前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
171.前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態39~59及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
172.前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
173.前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態60~80及び106~137のいずれか1つに記載の核酸。
174.前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
175.前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態81~137のいずれか1つに記載の核酸。
176.前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
177.前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
178.前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
179.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
180.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
181.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
182.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
183.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
184.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
185.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
186.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
187.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
188.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
189.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
190.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
191.前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
192.前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
193.前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
194.前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
195.前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
196.前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
197.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
198.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
199.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
200.前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
201.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
202.前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、実施形態106~137のいずれか1つに記載の核酸。
203.前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の少なくとも50%の欠失である、実施形態1~202のいずれか1つに記載の核酸。
204.前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の少なくとも60%の欠失である、実施形態1~202のいずれか1つに記載の核酸。
205.前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の少なくとも70%の欠失である、実施形態1~202のいずれか1つに記載の核酸。
206.前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の少なくとも80%の欠失である、実施形態1~202のいずれか1つに記載の核酸。
207.前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の約75%の欠失である、実施形態1~202のいずれか1つに記載の核酸。
208.前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の約80%の欠失である、実施形態1~202のいずれか1つに記載の核酸。
209.前記組換えワクシニアウイルスゲノムが、Copenhagen株ワクシニアウイルスのゲノムに由来する、実施形態1~208のいずれか1つに記載の核酸。
210.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
211.前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、実施形態210に記載の核酸。
212.前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態210または211に記載の核酸。
213.前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、実施形態210または211に記載の核酸。
214.前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、実施形態212または213に記載の核酸。
215.前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、実施形態212または213に記載の核酸。
216.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
217.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
218.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
219.組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座内に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。
220.前記組換えワクシニアウイルスゲノムが、配列番号624のワクシニアウイルスヌクレオチド配列を含む、実施形態1~219のいずれか1つに記載の核酸。
221.前記組換えワクシニアウイルスゲノムが、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列を含む、実施形態1~105のいずれか1つに記載の核酸。
222.実施形態1~221のいずれか1つに記載の組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸を含む、ウイルス。
223.実施形態1~221のいずれか1つに記載の核酸を含む、パッケージング細胞株。
224.実施形態222に記載のウイルスを含む、パッケージング細胞株。
225.実施形態222に記載のウイルスと、生理学的に許容される担体と、を含む、薬学的組成物。
226.キットであって、実施形態1~221のいずれか1つに記載の核酸と、宿主細胞において前記核酸を発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
227.キットであって、実施形態222に記載のウイルスと、前記ウイルスを宿主細胞において発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
228.キットであって、実施形態222に記載のウイルスと、がんを有する哺乳動物患者に治療有効量の前記ウイルスを投与し、それによって前記がんを治療するように使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
229.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態228に記載のキット。
230.哺乳動物患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の実施形態222に記載のウイルスを前記哺乳動物患者に投与することを含む、前記方法。
231.哺乳動物患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の実施形態225に記載の薬学的組成物を前記哺乳動物患者に投与することを含む、前記方法。
232.前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、実施形態230または231に記載の方法。
233.前記がんが、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、結腸直腸癌、精巣癌、ならびに喉癌からなる群から選択される、実施形態230~232のいずれか1つに記載の方法。
234.前記方法が、前記哺乳動物患者に免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、実施形態230~233のいずれか1つに記載の方法。
235.前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、実施形態234に記載の方法。
236.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、実施形態234に記載の方法。
237.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態234に記載の方法。
238.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、実施形態234に記載の方法。
239.前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片である、実施形態234に記載の方法。
240.前記方法が、前記哺乳動物患者にインターロイキンを投与することをさらに含む、実施形態219~228のいずれか1つに記載の方法。
241.前記インターロイキンが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、実施形態240に記載の方法。
242.前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、実施形態240に記載の方法。
243.前記インターロイキンが、膜結合である、実施形態240~242のいずれか1つに記載の方法。
244.前記方法が、前記哺乳動物患者にインターフェロンを投与することをさらに含む、実施形態230~243のいずれか1つに記載の方法。
245.前記インターフェロンが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、実施形態244に記載の方法。
246.前記方法が、前記哺乳動物患者にサイトカインを投与することをさらに含む、実施形態230~245のいずれか1つに記載の方法。
247.前記サイトカインが、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である、実施形態246に記載の方法。
248.前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、実施形態247に記載の方法。
249.前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びcKitからなる群から選択される、実施形態246に記載の方法。
250.前記サイトカインが、Flt3リガンドである、実施形態246に記載の方法。
表41.遺伝子整列
選択されたオルソポックスウイルス遺伝子の例示的なアライメントを以下に示す。5個のワクシニアウイルス株、Copenhagen(「cop」)、Western Reserver(「WR」)、Tian Tan(「Tian」)、Wyeth、及びListerの様々な遺伝子は、以下のようにアライメントする:
選択されたオルソポックスウイルス遺伝子の例示的なアライメントを以下に示す。5個のワクシニアウイルス株、Copenhagen(「cop」)、Western Reserver(「WR」)、Tian Tan(「Tian」)、Wyeth、及びListerの様々な遺伝子は、以下のようにアライメントする:
6.実施例
以下の実施例は、当業者に本出願で特許請求される組成物及び方法がどのように実施、作製、及び評価されるかの説明を提供するために示されるのであって、本発明の純粋な例示であるものであり、本発明者らが本明細書の発明とみなすものの範囲を限定するものではない。
以下の実施例は、当業者に本出願で特許請求される組成物及び方法がどのように実施、作製、及び評価されるかの説明を提供するために示されるのであって、本発明の純粋な例示であるものであり、本発明者らが本明細書の発明とみなすものの範囲を限定するものではない。
6.1.実施例1-OncoVacの発見
59個のポックスウイルス株からのオープンリーディングフレーム(ORF)をオルソログにクラスター化し、アミノ酸レベルで整列した(系統分析については、図1を参照されたい)。ベイジアン分析を行って、全ての株の相関性を決定した。ポックスウイルスは、遺伝子含有量及び宿主範囲において非常に多様である。いくつかの天然に存在するワクシニア野生型株があり、これらは互いに異なる。
59個のポックスウイルス株からのオープンリーディングフレーム(ORF)をオルソログにクラスター化し、アミノ酸レベルで整列した(系統分析については、図1を参照されたい)。ベイジアン分析を行って、全ての株の相関性を決定した。ポックスウイルスは、遺伝子含有量及び宿主範囲において非常に多様である。いくつかの天然に存在するワクシニア野生型株があり、これらは互いに異なる。
図33は、様々なポックスウイルスゲノムにおけるCopMD5p3p(表2)における欠失遺伝子のパーセンテージを示す。グラフ上の各点は、1つのポックスウイルスゲノムを表す。相同性検索を使用して、Copenhagenゲノム由来の表2の遺伝子のアミノ酸配列を有する他の系統群からのポックスウイルスを照会した。他のポックスウイルスに存在する欠失遺伝子の量は、それらの増大する発散と共に減少する。
ワクシニア野生型株を等しいプラーク形成単位数で混合し、NGS(インプットプール)で配列決定した。得られた混合物を異なるがん細胞株で3回継代した。最終集団をIllumina NGS配列決定で配列決定した。読み取り(短いDNA断片)を配列同一性に基づいて様々な株に割り当て、最終集団における各株のパーセントを計算するために使用した。異なる腫瘍型における5個のワクシニアウイルスを継代した後の異なるウイルス株の存在量を図2に示す。Copenhagen株は、他の株よりも成長することができるため、より速く複製する。
異なるワクシニア野生型株も、様々な患者の腫瘍コアで低いPFU(1×104)で感染するために使用した。平均4回感染した各株は、各々3つの2x2mmの腫瘍コアを含む複製物である。複製をウイルス滴定によって評価し、図3に示すようにプラーク形成単位(PFU)として表した。Copenhagen株は、他の株よりも高い力価に成長し、したがって患者のエクスビボ試料においてより速く複製する。患者のエクスビボコアは、患者の3D腫瘍を良好に模倣する。
次に、ワクシニア野生型株を、3%CMCオーバーレイを使用したU2-OS細胞でのプラークアッセイに供した。感染から2日後、各株について20~30個のプラークをそれらのサイズについて測定した。Copenhagen、Western Reserve、Wyeth、Lister、及びTian Tanのプラークサイズ測定値を図4に示す。プラーク形成は、ウイルスが複製、拡散、及び殺傷する能力によって影響される。Copenhagen株について観察されるより大きなプラークサイズは、この株が腫瘍溶解性ウイルスの発生に重要なこれらの能力において優れていることを示唆する。
最後に、図1からの全ての59個のポックスウイルスゲノムを使用して、ORFを見つけ、オルソロガス群にクラスター化した。Copenhagen遺伝子を含む群は、Copenhagenゲノムにおける遺伝子の位置(x軸)及び群のサイズ(y軸)に基づいてプロットした。59種全てが同じ遺伝子を共有する場合、保存は100%であると見なされる。主要な欠失の一部である遺伝子CopMD5p及びCopMD3pは、それらの欠失が適合性に影響を及ぼさないため、ウイルス複製のためにあまり重要ではないことを見出した。
以前に特徴付けられていないA47L遺伝子を欠失させることによって、新規の表現型を発見した。A47Lを欠失させると、Copenhagenウイルスがより大きなプラークを作製するように誘導される。
Illumina NGSディープ配列決定は、プラーク精製プロセス中の主要な欠失の存在を明らかにした。CopMD5p及びCopMD3pは、プラーク精製され、主要なゲノム欠失を有することが見出されたクローンを表す。これらの2つのクローンを使用して、HeLa細胞の単層を高いMOI(MOI10)で共感染させ、組換えを誘導した。無作為なプラークピッキング及びPCRは、両方のゲノム欠失を含む二重欠失CopMD5p3pの存在を明らかにした(図5を参照されたい)。したがって、野生型Copenhagen集団において2つの天然に存在する欠失を発見した。これら2つの欠失を組み合わせ、精製して、本明細書で「CopMD5p3p」と称される複製ウイルスを得、これは、C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子における欠失、ならびにITRのB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rコピーの各々における欠失を示す。本明細書で使用される場合、「CopWT」は、野生型Copenhagenワクシニアウイルスを指し、「CopMD5p」は、代表的な5’遺伝子(C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L)における欠失を保有するCopenhagenワクシニアウイルスを指し、「CopMD3p」は、代表的な3’遺伝子(B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R)における欠失、ならびにITRのB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rコピーの各々における欠失を保有するCopenhagenワクシニアウイルスを指す。
6.2.実施例2-がん細胞死
がん細胞を、4回の複製で24ウェルプレートにおいてMOI(1~0.01)の範囲でCopMD5p3pで感染させた。ウイルスに感染してから2日後に、プレートをクリスタルバイオレットで染色した。クリスタルバイオレット染色をSDSに溶解させ、分光光度法により読み取った。データを、非感染細胞の吸光度パーセントとして表した(図6を参照されたい)。このデータは、CopMD5p3pウイルスに曝露すると、がん細胞株の大部分がより速く死滅することを示す。
がん細胞を、4回の複製で24ウェルプレートにおいてMOI(1~0.01)の範囲でCopMD5p3pで感染させた。ウイルスに感染してから2日後に、プレートをクリスタルバイオレットで染色した。クリスタルバイオレット染色をSDSに溶解させ、分光光度法により読み取った。データを、非感染細胞の吸光度パーセントとして表した(図6を参照されたい)。このデータは、CopMD5p3pウイルスに曝露すると、がん細胞株の大部分がより速く死滅することを示す。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾コCopenhagenワクシニアビリオンが抗腫瘍免疫応答を誘導し、様々ながん細胞株において増殖する能力も、図23、24、及び26~32に示す。
6.3.実施例3-がん細胞における成長
4つのがん細胞株を、24ウェルプレートで、低MOI(0.001)で3重にCopMD5p3pで感染させ、異なる時点で、ウイルスを収集し、滴定した。0時間はインプットを表す。HeLa、786-O、HT-29、及びMCF7の成長曲線を図7に示す。このデータは、修飾CopMD5p3pウイルスがインビトロで成長するその能力を損なわないことを示す。これは、インターフェロン応答の存在下であっても、ウイルスが複製能があることを意味する。哺乳動物細胞株において複製する能力は、別の重要な利点を提供する。かかるウイルスは、増強した速度及び効率で製造され得る。
4つのがん細胞株を、24ウェルプレートで、低MOI(0.001)で3重にCopMD5p3pで感染させ、異なる時点で、ウイルスを収集し、滴定した。0時間はインプットを表す。HeLa、786-O、HT-29、及びMCF7の成長曲線を図7に示す。このデータは、修飾CopMD5p3pウイルスがインビトロで成長するその能力を損なわないことを示す。これは、インターフェロン応答の存在下であっても、ウイルスが複製能があることを意味する。哺乳動物細胞株において複製する能力は、別の重要な利点を提供する。かかるウイルスは、増強した速度及び効率で製造され得る。
6.4.実施例4-患者腫瘍試料における成長
患者腫瘍試料を手術直後に採取し、2mmx2mmコアに切断した。3つのコアを、野生型CopenhagenまたはCopMD5p3pのいずれかの少量のウイルス(1x104PFU)に感染させた。72時間後、ウイルスアウトプットをプラークアッセイによって評価し、最終ウイルス力価をPFUとして表した(図8を参照されたい)。このデータは、修飾CopMD5p3pウイルスが新鮮な患者腫瘍試料において複製することができることを示す。患者腫瘍試料における複製は、患者3D腫瘍における複製の良好なモデルである。
患者腫瘍試料を手術直後に採取し、2mmx2mmコアに切断した。3つのコアを、野生型CopenhagenまたはCopMD5p3pのいずれかの少量のウイルス(1x104PFU)に感染させた。72時間後、ウイルスアウトプットをプラークアッセイによって評価し、最終ウイルス力価をPFUとして表した(図8を参照されたい)。このデータは、修飾CopMD5p3pウイルスが新鮮な患者腫瘍試料において複製することができることを示す。患者腫瘍試料における複製は、患者3D腫瘍における複製の良好なモデルである。
6.5.実施例5-U2-OS細胞におけるシンシチウム
U2-OS細胞の単層を、Copenhagen野生型またはCopMD5p3pウイルスのいずれかに感染させた。2時間後、プラークアッセイの場合と同様に、培地をオーバーレイ培地と交換した。感染後48時間で、プラーク表現型を評価するためにEVOSを用いて写真を撮影した(図9参照されたい)。シンシチウムとしても知られる細胞融合は、感染していない細胞が感染した細胞と結合するため、ウイルスの拡散を助けると考えられている。さらに、融合細胞は免疫原性であり、がん細胞の場合、抗腫瘍免疫応答を開始するのに役立ち得ることが示されている。
U2-OS細胞の単層を、Copenhagen野生型またはCopMD5p3pウイルスのいずれかに感染させた。2時間後、プラークアッセイの場合と同様に、培地をオーバーレイ培地と交換した。感染後48時間で、プラーク表現型を評価するためにEVOSを用いて写真を撮影した(図9参照されたい)。シンシチウムとしても知られる細胞融合は、感染していない細胞が感染した細胞と結合するため、ウイルスの拡散を助けると考えられている。さらに、融合細胞は免疫原性であり、がん細胞の場合、抗腫瘍免疫応答を開始するのに役立ち得ることが示されている。
6.6.実施例6-786-O細胞におけるシンシチウム
786-O細胞の単層を、Copenhagen野生型またはCopMD5p3pウイルスのいずれかに感染させた。24時間後、10倍の倍率でEVOS用いて写真を撮影した(図10を参照されたい)。これは、シンシチウムの発生の追加の証拠である。図9に、プラークの表現型を示す。現在の実験では、細胞の単層をオーバーレイなしで感染した。CopMD5p3pウイルスによって感染したほとんどの細胞が融合している。
786-O細胞の単層を、Copenhagen野生型またはCopMD5p3pウイルスのいずれかに感染させた。24時間後、10倍の倍率でEVOS用いて写真を撮影した(図10を参照されたい)。これは、シンシチウムの発生の追加の証拠である。図9に、プラークの表現型を示す。現在の実験では、細胞の単層をオーバーレイなしで感染した。CopMD5p3pウイルスによって感染したほとんどの細胞が融合している。
6.7.実施例7-マウスモデルにおける腫瘍制御及び体重減少
ヌードCD-1マウスに、HT-29ヒト結腸癌異種移植片を播種した。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、マウスを24時間間隔で3回(破線)、1x107PFUのいずれかのワクシニアウイルスで静脈内投与した。腫瘍サイズ及び体重減少について、マウスを約隔日で測定した(図11を参照されたい)。この実験は、CopMD5p3pが免疫不全ヌードマウスにおいてあらゆる体重減少または病気の他の徴候を引き起こさないため、はるかに安全なウイルスであることを示す。この実験はまた、CopMD5p3pが、親Copenhagen野生型ウイルスと同様に腫瘍増殖を制御することができることを示す。
ヌードCD-1マウスに、HT-29ヒト結腸癌異種移植片を播種した。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、マウスを24時間間隔で3回(破線)、1x107PFUのいずれかのワクシニアウイルスで静脈内投与した。腫瘍サイズ及び体重減少について、マウスを約隔日で測定した(図11を参照されたい)。この実験は、CopMD5p3pが免疫不全ヌードマウスにおいてあらゆる体重減少または病気の他の徴候を引き起こさないため、はるかに安全なウイルスであることを示す。この実験はまた、CopMD5p3pが、親Copenhagen野生型ウイルスと同様に腫瘍増殖を制御することができることを示す。
6.8.実施例8-ポックス病変形成
ヌードCD-1マウスを、1x107PFUのいずれかのワクシニアウイルスで1回、群あたり6匹のマウスに静脈内投与した。治療の2週間後に、マウスを犠牲にし、尾の写真を撮影した。尾のポックス病変を、全てのマウス尾で手動で数えた。代表的な写真を図12に示す。この実験は、CopMD5p3pが免疫不全ヌードマウスにおいてあらゆるポックス病変を引き起こさないため、はるかに安全なウイルスであることを示す。これは、以前の腫瘍溶解性ワクシニアの臨床データが、治療時にポックス病変を発症する患者を示しているため、重要である。チミジンキナーゼ(TK)のノックアウトは、OV(腫瘍溶解性ウイルス)の安全性を増加させる一般的な方法であり、現在、第III相腫瘍溶解性ワクシニア及びFDA承認された腫瘍溶解性T-Vecに存在する。データは、TKを欠失させることは、このアッセイにおいて重要な役割を果たさず、マウスは、TK欠失ウイルスで負荷されるとポックス病変を発症するが、無傷TKを有するCopMD5p3pでポックス病変を発症しないことを示す。
ヌードCD-1マウスを、1x107PFUのいずれかのワクシニアウイルスで1回、群あたり6匹のマウスに静脈内投与した。治療の2週間後に、マウスを犠牲にし、尾の写真を撮影した。尾のポックス病変を、全てのマウス尾で手動で数えた。代表的な写真を図12に示す。この実験は、CopMD5p3pが免疫不全ヌードマウスにおいてあらゆるポックス病変を引き起こさないため、はるかに安全なウイルスであることを示す。これは、以前の腫瘍溶解性ワクシニアの臨床データが、治療時にポックス病変を発症する患者を示しているため、重要である。チミジンキナーゼ(TK)のノックアウトは、OV(腫瘍溶解性ウイルス)の安全性を増加させる一般的な方法であり、現在、第III相腫瘍溶解性ワクシニア及びFDA承認された腫瘍溶解性T-Vecに存在する。データは、TKを欠失させることは、このアッセイにおいて重要な役割を果たさず、マウスは、TK欠失ウイルスで負荷されるとポックス病変を発症するが、無傷TKを有するCopMD5p3pでポックス病変を発症しないことを示す。
6.9.実施例9-全身投与後のワクシニアのIVIS生体内分布
ワクシニアウイルス野生型Wyeth、野生型Copenhagen、及びCopMD5p3pを、TKをFlucに置き換えるpSEM1プラスミドによる感染細胞のトランスフェクションを通じて、ホタルルシフェラーゼ(Fluc)を発現するように操作した。ウイルスをプラーク精製し、拡張した。全てのウイルスはTKノックアウトであり、TK遺伝子座に機能的Flucをコードする。
ワクシニアウイルス野生型Wyeth、野生型Copenhagen、及びCopMD5p3pを、TKをFlucに置き換えるpSEM1プラスミドによる感染細胞のトランスフェクションを通じて、ホタルルシフェラーゼ(Fluc)を発現するように操作した。ウイルスをプラーク精製し、拡張した。全てのウイルスはTKノックアウトであり、TK遺伝子座に機能的Flucをコードする。
次いで、ヌードCD-1マウスに、HT-29ヒト結腸癌異種移植片を播種した。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、マウスを1e7PFUのいずれかのワクシニアFlucをコードするウイルスで、群あたり4匹のマウスに静脈内投与した。治療の4日後、マウスにルシフェリンをi.p.(腹腔内)注入し、ウイルスの存在についてIVISで画像化した(図13を参照されたい)。この実験は、CopMD5p3pが腫瘍に対してより特異的であるため、はるかに安全なウイルスであることを示す。他のウイルスは、尾、筋肉、足、及び鼻腔内の標的外の複製を示す。CopMD5p3pは、腫瘍においてのみ局在する。前の図12及び13に示すように、尾には、他の株と比較して検出可能なCopMD5p3pが少ない。図14は、CopMD5p3pが他の腫瘍溶解性ワクシニアと比較した場合、他の器官においてもより低い力価を有することを示す。CopMD5p3pは、腫瘍における他のウイルスと同じレベルで複製するが、標的外組織では少ないため、CopMD5p3pは、腫瘍溶解性ウイルスのプロファイルにより適合する。
野生型Copenhagenワクシニアウイルス及びいくつかの修飾Copenhagenワクシニアビリオンを含む、様々なワクシニアウイルスベクターの生体内分布の追加の実施例を図25に示す。
6.10.実施例10-ヒトPBMCにおけるワクシニアの免疫原性
PBMCを、健康なヒトドナー(n=2)の血液から単離した。PBMCを、いずれかのワクシニアと共に24時間インキュベートし、フローサイトメトリを使用して初期活性化マーカーを確認した(図15を参照されたい)。この実験は、CopMD5p3pがより免疫原性であり、より容易に免疫細胞によって検出可能であることを示す。腫瘍組織において複製するOVは、抗腫瘍免疫応答を成功させるために免疫細胞を活性化する必要があるため、これは望ましい特性であると考える。
PBMCを、健康なヒトドナー(n=2)の血液から単離した。PBMCを、いずれかのワクシニアと共に24時間インキュベートし、フローサイトメトリを使用して初期活性化マーカーを確認した(図15を参照されたい)。この実験は、CopMD5p3pがより免疫原性であり、より容易に免疫細胞によって検出可能であることを示す。腫瘍組織において複製するOVは、抗腫瘍免疫応答を成功させるために免疫細胞を活性化する必要があるため、これは望ましい特性であると考える。
6.11.実施例11-マウス脾細胞におけるワクシニアの免疫原性
免疫能のあるBalb/Cマウスに、1e7ワクシニアPFUワクシニアウイルスを静脈内注入した。1日または2日後に、マウスを犠牲にし、脾臓を採取して、フローサイトメトリを使用して免疫活性化について分析した(図16を参照されたい)。この実験は、CopMD5p3pがより免疫原性であり、より容易にマウス免疫細胞によって検出可能であることを示す。このデータは、ほとんどのインビボ実験がマウスにおいて行われるため、前の図15を良好に補完する。
免疫能のあるBalb/Cマウスに、1e7ワクシニアPFUワクシニアウイルスを静脈内注入した。1日または2日後に、マウスを犠牲にし、脾臓を採取して、フローサイトメトリを使用して免疫活性化について分析した(図16を参照されたい)。この実験は、CopMD5p3pがより免疫原性であり、より容易にマウス免疫細胞によって検出可能であることを示す。このデータは、ほとんどのインビボ実験がマウスにおいて行われるため、前の図15を良好に補完する。
6.12.実施例12-ヒト細胞におけるワクシニアの免疫原性
ヒト癌細胞786-Oを、0.01のMOIで、いずれかのウイルスで感染させた。翌日、細胞を採取し、細胞分画によって核及び細胞質を分離した。タンパク質を各画分から抽出し、NF-kBサブユニットp65及びp50をブロットした(図17を参照されたい)。NF-kB免疫転写因子は、そのサブユニットp65及びp50が核に移行すると、免疫応答を開始する。いくつかのウイルスは、免疫抑制性であり、この転座を遮断し、免疫応答を防止する。NF-kB機能を抑制することは、免疫療法アプローチと組み合わせて腫瘍溶解性ウイルスを使用するという目標に対して反直感的である。したがって、CopMD5p3pは、MG-1と同様に動作するため、より有利なウイルスである。
ヒト癌細胞786-Oを、0.01のMOIで、いずれかのウイルスで感染させた。翌日、細胞を採取し、細胞分画によって核及び細胞質を分離した。タンパク質を各画分から抽出し、NF-kBサブユニットp65及びp50をブロットした(図17を参照されたい)。NF-kB免疫転写因子は、そのサブユニットp65及びp50が核に移行すると、免疫応答を開始する。いくつかのウイルスは、免疫抑制性であり、この転座を遮断し、免疫応答を防止する。NF-kB機能を抑制することは、免疫療法アプローチと組み合わせて腫瘍溶解性ウイルスを使用するという目標に対して反直感的である。したがって、CopMD5p3pは、MG-1と同様に動作するため、より有利なウイルスである。
6.13.実施例13-侵襲性黒色腫モデルにおける免疫チェックポイント阻害剤抗CTLA-4抗体との相乗効果
免疫能のあるC57BL/6マウスに、B16-F10黒色腫腫瘍を皮下に播種した(5×105細胞)。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、治療を開始した。CopMD5p3pウイルスで治療したマウスは、1日間隔で3回の1e7PFU用量を腫瘍(腫瘍内)に受けた。抗CTLA-4で治療したマウスは、1日間隔で5回の100ug用量の抗体を腹腔内に受けた。治療開始後、生存を1日おきに記録した(図18参照されたい)。この実験では、CopMD5p3pウイルスの腫瘍溶解効果が、非常に侵襲性黒色腫マウスモデルにおいて周知のチェックポイント阻害剤CTLA-4と相乗作用することができるかを試験した。ウイルス及びチェックポイントで治療したマウスの生存中央値は、他の任意の群よりも高かった。これは、CopMD5p3pがチェックポイント遮断免疫療法と相乗作用するいくつかの刺激特性を有することを示唆する。
免疫能のあるC57BL/6マウスに、B16-F10黒色腫腫瘍を皮下に播種した(5×105細胞)。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、治療を開始した。CopMD5p3pウイルスで治療したマウスは、1日間隔で3回の1e7PFU用量を腫瘍(腫瘍内)に受けた。抗CTLA-4で治療したマウスは、1日間隔で5回の100ug用量の抗体を腹腔内に受けた。治療開始後、生存を1日おきに記録した(図18参照されたい)。この実験では、CopMD5p3pウイルスの腫瘍溶解効果が、非常に侵襲性黒色腫マウスモデルにおいて周知のチェックポイント阻害剤CTLA-4と相乗作用することができるかを試験した。ウイルス及びチェックポイントで治療したマウスの生存中央値は、他の任意の群よりも高かった。これは、CopMD5p3pがチェックポイント遮断免疫療法と相乗作用するいくつかの刺激特性を有することを示唆する。
6.14.実施例14-免疫チェックポイント阻害剤抗CTLA-4抗体との相乗効果
免疫能のあるBalb/Cマウスに、CT26-LacZ腫瘍を皮下に播種した(5×105細胞)。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、治療を開始した。ワクシニアウイルスで治療したマウスは、腫瘍(腫瘍内)に3回(24時間間隔、最初の3つの破線)の1e7PFU用量を受けた。抗CTLA-4で治療したマウスは、5回(24時間間隔、破線)の100ug用量の抗体を腹腔内に受けた。治療開始後、腫瘍サイズ及び生存を1日おきに記録した(図19を参照されたい)。データは、TKノックアウトワクシニアウイルスが、CopMD5p3pと同様に抗CTLA-4と良好に機能しないことを示す。これは、CopMD5p3pがより免疫原性であり、抗腫瘍免疫応答を生成することがより可能であることを示唆する。
免疫能のあるBalb/Cマウスに、CT26-LacZ腫瘍を皮下に播種した(5×105細胞)。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、治療を開始した。ワクシニアウイルスで治療したマウスは、腫瘍(腫瘍内)に3回(24時間間隔、最初の3つの破線)の1e7PFU用量を受けた。抗CTLA-4で治療したマウスは、5回(24時間間隔、破線)の100ug用量の抗体を腹腔内に受けた。治療開始後、腫瘍サイズ及び生存を1日おきに記録した(図19を参照されたい)。データは、TKノックアウトワクシニアウイルスが、CopMD5p3pと同様に抗CTLA-4と良好に機能しないことを示す。これは、CopMD5p3pがより免疫原性であり、抗腫瘍免疫応答を生成することがより可能であることを示唆する。
6.15.実施例15-免疫チェックポイント阻害剤抗PD1抗体との相乗効果
免疫能のあるBalb/Cマウスに、CT26-LacZ腫瘍を皮下に播種した(5×105細胞)。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、治療を開始した。ワクシニアウイルスで治療したマウスは、腫瘍(腫瘍内)に3回(24時間間隔、最初の3つの破線)の1e7PFU用量を受けた。抗PD1で治療したマウスは、ワクシニアウイルスの最後の投与の24時間後に、5回(24時間間隔、最後の5つの破線)の100ug用量の抗体を腹腔内に受けた。治療開始後、腫瘍サイズ及び生存を1日おきに記録した(図20を参照されたい)。データは、TKノックアウトワクシニアウイルスが、CopMD5p3pと同様に抗PD1と良好に機能しないことを示す。これは、CopMD5p3pがより免疫原性であり、抗腫瘍免疫応答を生成することがより可能であることを示唆する。
免疫能のあるBalb/Cマウスに、CT26-LacZ腫瘍を皮下に播種した(5×105細胞)。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、治療を開始した。ワクシニアウイルスで治療したマウスは、腫瘍(腫瘍内)に3回(24時間間隔、最初の3つの破線)の1e7PFU用量を受けた。抗PD1で治療したマウスは、ワクシニアウイルスの最後の投与の24時間後に、5回(24時間間隔、最後の5つの破線)の100ug用量の抗体を腹腔内に受けた。治療開始後、腫瘍サイズ及び生存を1日おきに記録した(図20を参照されたい)。データは、TKノックアウトワクシニアウイルスが、CopMD5p3pと同様に抗PD1と良好に機能しないことを示す。これは、CopMD5p3pがより免疫原性であり、抗腫瘍免疫応答を生成することがより可能であることを示唆する。
6.16.実施例16-免疫チェックポイント阻害剤抗PD1抗体及び抗CTLA-4抗体との相乗効果
免疫能のあるBalb/Cマウスに、CT26-LacZ腫瘍を皮下に播種した(5×105細胞)。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、治療を開始した。ワクシニアウイルスで治療したマウスは、腫瘍(腫瘍内)に3回(24時間間隔、最初の3つの破線)の1e7PFU用量を受けた。抗CTLA-4で治療したマウスは、5回(24時間間隔、最初の5つの破線)の100ug用量の抗体を腹腔内に受けた。抗PD1で治療したマウスは、ワクシニアウイルスの最後の投与の24時間後に、5回(24時間間隔、最後の5つの破線)の100μg用量の抗体を腹腔内に受けた。治療開始後、腫瘍サイズ及び生存を1日おきに記録した(図21を参照されたい)。この実験では、両方のチェックポイントを同時に遮断した場合に、低用量(100μgではなく25μg)のチェックポイント阻害剤抗体が機能するかを試験した。CopMD5p3pは依然として、このマウスモデルにおいて、より低い用量(合計50μg)のチェックポイントで治療を達成することができた。チェックポイント阻害剤は用量依存性毒性を有するため、非常に少量のチェックポイント遮断剤が依然として観察可能な表現型を達成することができることが有利である。他の実験と同様に、CopMD5p3pウイルスは、確立された腫瘍を治癒させ、この効果は、対応するCopMD5p3pの欠失を欠く野生型ウイルスでは観察されない。
免疫能のあるBalb/Cマウスに、CT26-LacZ腫瘍を皮下に播種した(5×105細胞)。皮下腫瘍が約5mmx5mmのサイズを確立したら、治療を開始した。ワクシニアウイルスで治療したマウスは、腫瘍(腫瘍内)に3回(24時間間隔、最初の3つの破線)の1e7PFU用量を受けた。抗CTLA-4で治療したマウスは、5回(24時間間隔、最初の5つの破線)の100ug用量の抗体を腹腔内に受けた。抗PD1で治療したマウスは、ワクシニアウイルスの最後の投与の24時間後に、5回(24時間間隔、最後の5つの破線)の100μg用量の抗体を腹腔内に受けた。治療開始後、腫瘍サイズ及び生存を1日おきに記録した(図21を参照されたい)。この実験では、両方のチェックポイントを同時に遮断した場合に、低用量(100μgではなく25μg)のチェックポイント阻害剤抗体が機能するかを試験した。CopMD5p3pは依然として、このマウスモデルにおいて、より低い用量(合計50μg)のチェックポイントで治療を達成することができた。チェックポイント阻害剤は用量依存性毒性を有するため、非常に少量のチェックポイント遮断剤が依然として観察可能な表現型を達成することができることが有利である。他の実験と同様に、CopMD5p3pウイルスは、確立された腫瘍を治癒させ、この効果は、対応するCopMD5p3pの欠失を欠く野生型ウイルスでは観察されない。
6.17.実施例17-対象の治療のための投与
本明細書に記載の方法を使用して、当技術分野の臨床医は、がんまたは腫瘍細胞を治療するために、本明細書に記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを含む薬学的組成物を対象(例えば、患者)に投与することができる。がんは、とりわけ例えば、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、または喉癌であり得る。
本明細書に記載の方法を使用して、当技術分野の臨床医は、がんまたは腫瘍細胞を治療するために、本明細書に記載の組換えオルソポックスウイルスベクターを含む薬学的組成物を対象(例えば、患者)に投与することができる。がんは、とりわけ例えば、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、または喉癌であり得る。
例えば、当技術分野の臨床医は、患者ががんまたは腫瘍に罹患すると評価することができ、本明細書に開示される組換えオルソポックスウイルスベクターを含む薬学的組成物の治療有効量(例えば、腫瘍のサイズを減少させるのに十分な量)を患者に投与することができる。薬学的組成物は、対象に、指定された時間間隔(例えば、毎週、毎日、または毎時)ごとに1回以上の用量(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25回以上)で投与され得る。患者は、治療の有効性をモニタリングし、患者の応答に基づいて用量を増加または減少させるために、用量間で評価され得る。薬学的組成物は、患者に経口、非経口(例えば、局所)、静脈内、筋肉内、皮下、または鼻腔内に投与され得る。治療は、薬学的組成物の単回投与を伴い得る。治療は、薬学的組成物の継続的な投与(例えば、日、週、月、または年)を伴い得る。治療は、別の治療剤(例えば、免疫チェックポイント阻害剤、例えば、他の薬剤の中でも、抗PD-1もしくは抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、IL-12、またはFlt3リガンド)の使用をさらに伴い得る。
6.18.実施例18-いくつかのワクシニア株におけるCopMD5p及びCopMD3pの標的欠失
修飾ワクシニアウイルスベクターを産生するための以下のプロトコルは、例えば、Rintoul et al.PLoS One.6(9):e24643(2011)に記載される技法を利用し、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
修飾ワクシニアウイルスベクターを産生するための以下のプロトコルは、例えば、Rintoul et al.PLoS One.6(9):e24643(2011)に記載される技法を利用し、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
簡潔には、組換え構築物を標的とするCopMD5p(5’遺伝子において欠失を保有するCopenhagenワクシニアウイルス:(C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、及びF3L遺伝子)及びCopMd3p(3’遺伝子において欠失を保有するCopenhagenワクシニアウイルス:B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20R遺伝子)は、g-Block技術(IDT,Coralville Iowa)によって合成した。U2OS細胞を、無血清DMEMで0.01のMOIで1.5時間野生型ワクシニアウイルス(Wyeth、Western Reserve、Tian Tan、Lister)に感染させた。ウイルス上清を吸引し、OptiMEM(Gibco)のLipofectamine 2000(Invitrogen)により、g-Blockを標的とするPCR増幅CopMD5pまたはCopMD3pをU2OS細胞にトランスフェクトした。10%FBSを補充したDMEMを、トランスフェクションの30分後に細胞に添加し、一晩放置した。翌日、トランスフェクション培地を吸引し、新鮮なDMEM 10% FBS培地を細胞に添加した。感染トランスフェクションの48時間後、U2OS細胞を採取し、単一の凍結解凍サイクルによって溶解した。段階的に希釈した溶解物をU2OS細胞のコンフルエントな単層に播種し、eGFP陽性(CopMD5p標的化)またはmCherry陽性(CopMD3p標的化)プラークを単離し、5ラウンドのプラーク精製を通して精製した。
二重主要欠失ワクシニアウイルスは、U2OS細胞における各ウイルスについて5のMOIでCopMD5p及びCopMD3p欠失ワクシニアウイルスの共感染によって生成した。細胞を翌日採取し、1ラウンドの凍結解凍によって溶解した。溶解物を段階的に希釈し、U2OS細胞のコンフルエントな単層に播種し、二重陽性プラーク(eGFP+mCherry)のために選択した。プラークを、5ラウンドのプラーク精製によって精製した。
本開示の修飾オルソポックスウイルスベクター(例えば、修飾ワクシニアウイルスベクター、例えば、修飾Copenhagenワクシニアウイルスベクター)の産生のための例示的なスキームを図22に示す。
6.19.実施例19-SKV(CopMD5p3p-B8R-)が、SKV-B8R+と比較して、腫瘍対照において同様の有効性を有する
ワクシニアウイルス(VV)B8R遺伝子は、ガンマインターフェロン受容体(IFN-γ)と相同性を有する分泌タンパク質をコードする。インビトロにおいて、B8Rタンパク質は、ヒト及びラットガンマインターフェロンを含むいくつかの種のガンマインターフェロンと結合し、抗ウイルス活性を中和するが、マウスIFN-γとは有意に結合しない。ここでは、B8R遺伝子を欠く組換えVVの構築及び特徴付けを説明する。標的構築物とB8R遺伝子座との間の相同組換えにより、2つのloxP部位(SKV-GFP)に隣接するeGFP導入遺伝子でB8R遺伝子の75%を置き換えた。
ワクシニアウイルス(VV)B8R遺伝子は、ガンマインターフェロン受容体(IFN-γ)と相同性を有する分泌タンパク質をコードする。インビトロにおいて、B8Rタンパク質は、ヒト及びラットガンマインターフェロンを含むいくつかの種のガンマインターフェロンと結合し、抗ウイルス活性を中和するが、マウスIFN-γとは有意に結合しない。ここでは、B8R遺伝子を欠く組換えVVの構築及び特徴付けを説明する。標的構築物とB8R遺伝子座との間の相同組換えにより、2つのloxP部位(SKV-GFP)に隣接するeGFP導入遺伝子でB8R遺伝子の75%を置き換えた。
B8R-ウイルスは、B8R+ウイルスと同様の有効性を示した。図37は、SKVまたはSKV-GFPのいずれかで治療したマウスの生存を評価した。5×105のCT26-LacZ細胞を0日目に皮下に播種した。14日目、16日目及び18日目に、SKVまたはSKV-GFPのいずれかの腫瘍内注入で107pfuの用量で腫瘍を治療した。注入されたウイルスがB8R遺伝子座の欠失を有する場合、有効性の有意な減少は見られなかった。
6.20.実施例20-SKV-B8R+ウイルスの正常細胞株対がん細胞株の感染
原発的な健常細胞の生存率をがん細胞のものと比較した。コンフルエントな正常細胞またはがん細胞を48時時間のMOI(pfu/細胞)の範囲で感染させ、その後、生存率を定量した。図34に示されるように、SKV-B8R+ウイルスは、優先的にがん細胞に感染する。
原発的な健常細胞の生存率をがん細胞のものと比較した。コンフルエントな正常細胞またはがん細胞を48時時間のMOI(pfu/細胞)の範囲で感染させ、その後、生存率を定量した。図34に示されるように、SKV-B8R+ウイルスは、優先的にがん細胞に感染する。
6.21.実施例21-SKV-B8R+が、インターフェロンシグナル伝達を損なわない。
インターフェロンシグナル伝達は、様々な正常細胞株及び1つのがん細胞株(786-O)において上方制御(誘導発現)または下方制御(抑制発現)されるインターフェロン経路における遺伝子の数を決定することによって評価した。図35は、100万個の細胞のコンフルエントな単層を、3のMOI(3e6 PFU)で18時間、SKV-B8R+(CopMD5p3p)またはTK遺伝子が無効となっている親Copenhagenウイルスに感染させた。RNA-seqを使用してRNAを配列決定し、インターフェロン遺伝子の遺伝子発現を、読み取りマッピング及び発現正規化後に決定した。SKV-B8R+(CopMD5p3p)ウイルスは、主にインターフェロン経路における遺伝子を誘導するが、親Copenhagenは遺伝子を抑制する。これは、SKV-B8R+(CopMD5p3p)が、正常細胞のウイルス排除において重要であるI型インターフェロンシグナル伝達を誘導することができることを示唆する。
インターフェロンシグナル伝達は、様々な正常細胞株及び1つのがん細胞株(786-O)において上方制御(誘導発現)または下方制御(抑制発現)されるインターフェロン経路における遺伝子の数を決定することによって評価した。図35は、100万個の細胞のコンフルエントな単層を、3のMOI(3e6 PFU)で18時間、SKV-B8R+(CopMD5p3p)またはTK遺伝子が無効となっている親Copenhagenウイルスに感染させた。RNA-seqを使用してRNAを配列決定し、インターフェロン遺伝子の遺伝子発現を、読み取りマッピング及び発現正規化後に決定した。SKV-B8R+(CopMD5p3p)ウイルスは、主にインターフェロン経路における遺伝子を誘導するが、親Copenhagenは遺伝子を抑制する。これは、SKV-B8R+(CopMD5p3p)が、正常細胞のウイルス排除において重要であるI型インターフェロンシグナル伝達を誘導することができることを示唆する。
6.22.実施例22-Flt3L、IL-12 TM、及び抗hCTLA-4を発現するように操作されたB8R陰性ワクシニアウイルス
上記のように、CopMD5p3p及びB8R欠失の両方を含む修飾ワクシニアウイルスを、図38に示すように、免疫療法導入遺伝子、Flt3L及びIL-12-TM、ならびにhCTLA-4に対する抗体を発現するようにさらに操作した。Flt3L、IL-12 TM、及びeGFP導入遺伝子を、CopenhagenワクシニアウイルスゲノムのB8R遺伝子座に挿入した。図36を参照されたい。標的構築物とB8R遺伝子座との間の相同組換えにより、Flt3-LG、IL-12-TM、及びeGFP導入遺伝子(SKV-23)でB8R遺伝子の75%を置き換えた。この戦略は、B8Rの代わりに導入遺伝子を挿入しながら、B8Rノックアウトウイルスの作製を可能にした。抗CTLA-4IgGを、5p欠失の境界を標的にして、T2Aプロテオミクスモチーフによって分離されたヒト抗CTLA-4抗体の重鎖及び軽鎖を挿入することにより、SKV-23骨格に挿入した(SKV-123v2、図38を参照されたい)。
上記のように、CopMD5p3p及びB8R欠失の両方を含む修飾ワクシニアウイルスを、図38に示すように、免疫療法導入遺伝子、Flt3L及びIL-12-TM、ならびにhCTLA-4に対する抗体を発現するようにさらに操作した。Flt3L、IL-12 TM、及びeGFP導入遺伝子を、CopenhagenワクシニアウイルスゲノムのB8R遺伝子座に挿入した。図36を参照されたい。標的構築物とB8R遺伝子座との間の相同組換えにより、Flt3-LG、IL-12-TM、及びeGFP導入遺伝子(SKV-23)でB8R遺伝子の75%を置き換えた。この戦略は、B8Rの代わりに導入遺伝子を挿入しながら、B8Rノックアウトウイルスの作製を可能にした。抗CTLA-4IgGを、5p欠失の境界を標的にして、T2Aプロテオミクスモチーフによって分離されたヒト抗CTLA-4抗体の重鎖及び軽鎖を挿入することにより、SKV-23骨格に挿入した(SKV-123v2、図38を参照されたい)。
膜結合IL-12導入遺伝子を発現するこれらの操作されたウイルスの能力を評価した。細胞は、SKV-1sc23、SKV-3、またはSKV-GFPで操作されたワクシニア遺伝子に感染させた。図42に示されるように、Vero細胞をIL-12 p35特異的抗体で染色した。Vero細胞を、細胞膜特異的染色パターンを視覚化するための対比染色として、小麦胚芽凝集素(WGA)結合フルオロフォアで共標識した。hIL-12産生を、ウエスタンブロット定量化を通じて導入遺伝子を発現する様々なSKVウイルスについてさらに定量化した。図41を参照されたい。1x106のHeLa細胞の単層を、MOI 0.1(1x105pfu)で、3つの導入遺伝子(抗hCTLA-4、FTL3L、IL-12)の異なる組み合わせを発現する様々なワクシニアSKVに感染させた。感染の48時間後、上清及び溶解物を収集し、IL-12 p35サブユニットについて発現を調査した。膜貫通ドメインを有するIL-12 p35サブユニットを発現するように設計されたウイルスであるSKV-123及びSKV-3は、溶解物画分にのみタンパク質を発現し、IL-12が上清に分泌されないことを示唆している。
抗hCTLA-4及びhFLT3Lの発現レベルを、ELISAプロトコルを使用して測定した。1e6 HeLa細胞の単層を、MOI 0.1(1x105pfu)で、3つ全ての導入遺伝子を発現するSKV-123に感染させた。感染の48時間後、上清を収集し、ELISAを介して、ヒト抗CTLA-4抗体及びFlt3リガンドの発現についてアッセイした。図40に示されるように、SKV-123ウイルスは、Flt3リガンド可溶性タンパク質よりもCTLA-4に対してより多くの抗体を産生することができた。
3つ全ての導入遺伝子を発現するSKV-123ウイルスを、経時的な導入遺伝子発現動態の観点から評価した(図39)。786-Oヒト腺癌細胞株のコンフルエントな単層を、3のMOI(3×106pfu)でSKV-123ウイルスに感染させた。RNA-seqを使用してRNAを配列決定し、挿入された導入遺伝子の遺伝子発現を、読み取りマッピング及び発現正規化後に決定した。データは、導入遺伝子発現が、細胞感染が発生した後3~4時間でピークであることを示唆する。
別の実験では、SKV-123v2ウイルス由来の3つの導入遺伝子の発現を、他の3つのがん細胞株:HeLaヒト子宮頸癌細胞(American Type Culture Collection(ATCC)カタログ番号:CCL-2)、HT-29ヒト大腸癌細胞(ATCCカタログ番号:HTB-38)、及びCT26.WTマウス大腸癌細胞(ATCCカタログ番号:CRL-2638)でさらに評価した。0.1または1.0のMOIでのSKV-123ウイルス感染は、HeLa、HT-29、及びCT26.WTがん細胞のそれぞれでCTLA-4抗体、FLT3L、及びIL-12導入遺伝子産物の産生をもたらした(図56~59)。
6.23.実施例23 結合したマウスIL-12 p35膜を発現するSKVは、マウス腫瘍の制御においてより大きな有効性を有する。
SKVまたはSKV-3ウイルス(マウス膜結合p35IL-12を発現する)のいずれかで治療したマウスの生存を評価した。5e6のCT26-LacZ細胞を0日目に皮下に播種した。14日目、16日目及び18日目に、SKVまたはSKV-3のいずれかの腫瘍内注入で1e7の用量で腫瘍を治療した。SKVウイルスは、CT26結腸腫瘍を有するマウスの生存を延長したが、IL-12のSKV-3発現は、持続的な治癒につながる寛解を誘導することが可能である。図43を参照されたい。
SKVまたはSKV-3ウイルス(マウス膜結合p35IL-12を発現する)のいずれかで治療したマウスの生存を評価した。5e6のCT26-LacZ細胞を0日目に皮下に播種した。14日目、16日目及び18日目に、SKVまたはSKV-3のいずれかの腫瘍内注入で1e7の用量で腫瘍を治療した。SKVウイルスは、CT26結腸腫瘍を有するマウスの生存を延長したが、IL-12のSKV-3発現は、持続的な治癒につながる寛解を誘導することが可能である。図43を参照されたい。
6.24.実施例24-様々なワクシニア株で操作された主要な二重欠失が、インビトロでのがん細胞殺傷を増強する
Hela細胞を、以下の遺伝子操作ワクシニアウイルスの株で0.1のMOIで感染させた:(1)親野生型ウイルス(WT)、(2)5プライム主要欠失(5p)、(3)3プライム主要欠失(3p)、及び(4)組み換え5プライム及び3プライム主要二重欠失(5p3p)。細胞生存率を、感染の72時間後にアラマーブルーアッセイによって定量化した。5p及び5p3pの両方の主要な二重欠失ワクシニア株は、親野生型及び3pの主要欠失株と比較して、HeLa細胞においてより細胞傷害性である。図44~47を参照されたい。
Hela細胞を、以下の遺伝子操作ワクシニアウイルスの株で0.1のMOIで感染させた:(1)親野生型ウイルス(WT)、(2)5プライム主要欠失(5p)、(3)3プライム主要欠失(3p)、及び(4)組み換え5プライム及び3プライム主要二重欠失(5p3p)。細胞生存率を、感染の72時間後にアラマーブルーアッセイによって定量化した。5p及び5p3pの両方の主要な二重欠失ワクシニア株は、親野生型及び3pの主要欠失株と比較して、HeLa細胞においてより細胞傷害性である。図44~47を参照されたい。
6.25.実施例25-8つの異なる異種移植マウスモデルにおける腫瘍体積及び生存利益に対するSKVの有効性
これらの有効性研究の目的は、Mia PaCa-2ヒト膵臓腫瘍細胞、PC-3ヒト前立腺腫瘍細胞、U87MGヒト神経膠腫細胞、UACC-62ヒト黒色腫細胞、UM-UC-3ヒト膀胱腫瘍細胞、COLO-205ヒト大腸細胞、NCI-H460ヒト肺腫瘍細胞、またはHT29ヒト結腸腺癌細胞のいずれかを皮下(SC)移植した無胸腺ヌードマウスにおいて静脈内(IV)及び/または腫瘍内(IT)に注入されるCopMD5p3p及びB8R欠失(SKV)の両方を含む修飾ワクシニアウイルスの抗がん活性を決定することであった。
これらの有効性研究の目的は、Mia PaCa-2ヒト膵臓腫瘍細胞、PC-3ヒト前立腺腫瘍細胞、U87MGヒト神経膠腫細胞、UACC-62ヒト黒色腫細胞、UM-UC-3ヒト膀胱腫瘍細胞、COLO-205ヒト大腸細胞、NCI-H460ヒト肺腫瘍細胞、またはHT29ヒト結腸腺癌細胞のいずれかを皮下(SC)移植した無胸腺ヌードマウスにおいて静脈内(IV)及び/または腫瘍内(IT)に注入されるCopMD5p3p及びB8R欠失(SKV)の両方を含む修飾ワクシニアウイルスの抗がん活性を決定することであった。
細胞を培養し、必要な数の細胞を得たとき、合計45匹の雌6~8週齢の無胸腺ヌードマウスに腫瘍細胞を接種した(0日目)。各マウスの側腹部に、0.2mLの1:1 Matrigel(商標)中の1,000万個の細胞(1x107個の細胞)をSCで注入した。25匹のマウスが約100~200mgの腫瘍(標的群の平均腫瘍重量約200mg)を有した場合、ワクシニアウイルスによる治療を開始した。
マウスに、0.05mlのSKV(用量1e7pfu)をIT(10匹のマウス)及び/またはIV(10匹のマウス)のいずれかで投与した。対照(5匹のマウス)に0.05mlのPBSを投与した。IT注入の場合、滅菌シリンジに取り付けられた31G 1/2”の針を使用して各腫瘍を注入した。腫瘍が大きいまたは不規則な形状をしている場合、腫瘍を注入の各日で異なる領域に注入した。マウスの死亡及び瀕死については、1日2回観察した。腫瘍を治療の初日から週2回測定した。腫瘍体積(mm3)を、楕円球(lxw2)/2=mm3の式を使用して計算し、式中、l及びwは、各測定で収集されたより大きい及びより小さい寸法を指す。
腫瘍移植後60日目以前に、任意の死体動物、過度の体重減少(治療の初日から体重の>30%)を有する任意の動物、または総腫瘍負荷が4,000mgに達した任意の動物、潰瘍化した、もしくは脱落した任意の動物を研究から除外した。
これらの有効性試験は、図48A~48Eに示されるように、1e7pfu SKVの用量をIVまたはITで投与した場合のMia PaCa-2、PC-3、U87MG、UACC-62、及びUM-UC-3異種移植片モデルにおいて、ならびに図48F~48Hに示されるように、1e7pfu SKVの用量をITで投与した場合のCOLO-205、H460、及びHT29異種移植片モデルにおいて、測定可能な腫瘍体積の減少を示した。これらの有効性研究はまた、図48A~48Hに示されるように、PBSのみで治療した対照マウスと比較して、SKVをIV及び/またはITで投与した場合、8つ全ての異種移植モデルにおいて生存率の有意な増加(p<0.0001)を示した。
6.26.実施例26-同系マウスモデルにおける腫瘍体積及び生存利益に対する様々なSKVベクターの有効性
いくつかのSKVベクターを生成した(上記の表44及び45を参照されたい)。この研究の目的は、すべてのコード化された導入遺伝子が活性であった同系マウスモデルにおけるSKV-12m3v2-eGFP、イピリムマブ、及びSKVの有効性を比較することであった。100μlのMatrigel及び無血清DMEM培地の1:1混合物中に再懸濁したMC38大腸癌細胞(5x105)を、ヒトCTLA-4を発現するトランスジェニックC57BL/6マウスの右側腹部にSC注入した。次いで、動物を5つの治療群に無作為化し、次いでPBS、PBS+イピリムマブ、SKV、抗PD-1抗体、SKV-12m3v2-eGFP、またはSKV-12m3v2-eGFP+抗PD-1抗体で治療した。SKV-12m3v2-eGFPは、ヒト抗CTLA-4抗体、ヒトFlt3リガンド、及びマウスIL-12 TMp35を発現するSKVである。ウイルスをPBSで希釈して、50μlで1x108PFU/マウスを送達し、次いで腫瘍の中心に総体積を注入して、単一の針跡を作製した。抗体(100μl中のイピリムマブ20μg及び100μl中の抗PD-1抗体250μg)を滅菌PBSで適切な用量に希釈し、ip注入によって送達した。SC MC38腫瘍を保有するマウスを、a)1mg/kgのイピリムマブ、b)1x108PFUのSKV、またはc)1x108PFUのSKV-12m3v2-eGFPのいずれかの3用量で治療した。腫瘍を測定し、体積を記録し、治療前及びその後の研究期間にわたって(21日間)に基本的な健康状態を評価した。研究の結果を図49(平均腫瘍体積及び生存曲線)及び図50(個々の腫瘍体積)に示す。イピリムマブ単独では、腫瘍成長の遅延及び1治癒(10%)をもたらし、SKV単独では、有効性及び2治癒(20%)を示し、3つの導入遺伝子を発現するSKVは、腫瘍制御を有意に改善し、生存率を増加させ、3治癒(30%)をもたらし、PD-1抗体の追加は、治癒速度を倍増させ(30~60%)、PD-1抗体単独では、効果を有さなかった(データは示さず)。
いくつかのSKVベクターを生成した(上記の表44及び45を参照されたい)。この研究の目的は、すべてのコード化された導入遺伝子が活性であった同系マウスモデルにおけるSKV-12m3v2-eGFP、イピリムマブ、及びSKVの有効性を比較することであった。100μlのMatrigel及び無血清DMEM培地の1:1混合物中に再懸濁したMC38大腸癌細胞(5x105)を、ヒトCTLA-4を発現するトランスジェニックC57BL/6マウスの右側腹部にSC注入した。次いで、動物を5つの治療群に無作為化し、次いでPBS、PBS+イピリムマブ、SKV、抗PD-1抗体、SKV-12m3v2-eGFP、またはSKV-12m3v2-eGFP+抗PD-1抗体で治療した。SKV-12m3v2-eGFPは、ヒト抗CTLA-4抗体、ヒトFlt3リガンド、及びマウスIL-12 TMp35を発現するSKVである。ウイルスをPBSで希釈して、50μlで1x108PFU/マウスを送達し、次いで腫瘍の中心に総体積を注入して、単一の針跡を作製した。抗体(100μl中のイピリムマブ20μg及び100μl中の抗PD-1抗体250μg)を滅菌PBSで適切な用量に希釈し、ip注入によって送達した。SC MC38腫瘍を保有するマウスを、a)1mg/kgのイピリムマブ、b)1x108PFUのSKV、またはc)1x108PFUのSKV-12m3v2-eGFPのいずれかの3用量で治療した。腫瘍を測定し、体積を記録し、治療前及びその後の研究期間にわたって(21日間)に基本的な健康状態を評価した。研究の結果を図49(平均腫瘍体積及び生存曲線)及び図50(個々の腫瘍体積)に示す。イピリムマブ単独では、腫瘍成長の遅延及び1治癒(10%)をもたらし、SKV単独では、有効性及び2治癒(20%)を示し、3つの導入遺伝子を発現するSKVは、腫瘍制御を有意に改善し、生存率を増加させ、3治癒(30%)をもたらし、PD-1抗体の追加は、治癒速度を倍増させ(30~60%)、PD-1抗体単独では、効果を有さなかった(データは示さず)。
研究での最初のヒトエンドポイント時のPBS治療群と比較して、腫瘍対照は、イピリムマブ(P<0.05)、SKV(P<0.05)、SKV-12m3v2-eGFP(P<0.05)、及びSKV-12m3v2-eGFP+抗PD-1抗体(P<0.05)による治療に応答して観察された。異なるウイルス間または抗PD-1抗体の追加による腫瘍制御に、統計的に有意な差はなかった。全ての統計的試験は、GraphPad Prism8.2を用いた複数のt検定を使用して行った。
PBS治療群(生存期間中央値19日)と比較した増加した生存期間を、SKV(P<0.005、生存中央値20=5日、イピリムマブ(P<0.001、生存中央値30日)、SKV-12m3v2-eGFP(P<0.001、生存中央値33日)、及びSKV-12m3v2-eGFP+抗PD-1抗体(P<0.001)による治療で観察した。完全な腫瘍退縮を、イピリムマブ(n=1)、SKV(n=2)、SKV-12m3v2-eGFP(n=3)、及びSKV-12m3v2-eGFP(n=6)の治療群において観察した。SKV-12m3v2-eGFP+抗PD-1抗体での治療は、SKV単独での治療と比較して生存利益の増加を示した(P<0.05)が、SKV-12m3v2-eGFP+抗PD-1抗体をSKV-12m3v2-eGFP単独と比較した場合、生存に統計的に有意な差はなかった。全ての統計的試験は、GraphPad Prism 8.2を用いたログランク(Mantel-Cox)試験を使用して行った。
SKV-12m3v2-eGFP +抗PD-1抗体群における初期腫瘍が完全に退縮した6匹のマウスを、反対側の側腹部に5×105個のMC38細胞を再負荷したところ、2匹のマウスが腫瘍成長を示し、4匹のマウスが腫瘍成長に対して耐性を維持した。
6.27.実施例27-腫瘍体積MC-38マウスモデルにおけるSKV発現膜結合IL-12p35-TMサブユニット対IL12p70-TMサブユニットの有効性の比較
この研究の目的は、MC38腫瘍モデルにおけるSKV-mIL12p35対SKV-mIL12p70及びSKVの有効性を比較して、2つのIL12サブユニットの免疫刺激能に関連する腫瘍制御及び生存に差があるかを評価することであった。100μlのMatrigel及び無血清DMEM培地の1:1混合物中に再懸濁したMC38大腸癌細胞(5x105)を、C57BL/6マウスの右側腹部にSC注入した。腫瘍を約3×3mmになるまで7日間成長させた。次いで、動物を4つの治療群に無作為化し、次いでPBS、SKV、SKV-mIL12p35、またはSKV-mIL12p70で治療した。ウイルスをPBSで希釈して、100μlで1x107PFU/マウスを送達し、次いで腫瘍の中心に総体積を注入して、単一の針跡を作製した。結果を図51に示す。SKV、SKV-mIL12p35、及びSKV-mIL12p70で治療したマウスは全て、対照PBSで治療したマウスと比較して腫瘍体積の減少を示した。SKV-mIL12p35及びSKV-mIL12p70治療はいずれも、SKV治療単独よりも効果的であった。SKV-mIL12p35及びSKV-mIL12p70治療マウスは、腫瘍体積の同等の減少を示した。
この研究の目的は、MC38腫瘍モデルにおけるSKV-mIL12p35対SKV-mIL12p70及びSKVの有効性を比較して、2つのIL12サブユニットの免疫刺激能に関連する腫瘍制御及び生存に差があるかを評価することであった。100μlのMatrigel及び無血清DMEM培地の1:1混合物中に再懸濁したMC38大腸癌細胞(5x105)を、C57BL/6マウスの右側腹部にSC注入した。腫瘍を約3×3mmになるまで7日間成長させた。次いで、動物を4つの治療群に無作為化し、次いでPBS、SKV、SKV-mIL12p35、またはSKV-mIL12p70で治療した。ウイルスをPBSで希釈して、100μlで1x107PFU/マウスを送達し、次いで腫瘍の中心に総体積を注入して、単一の針跡を作製した。結果を図51に示す。SKV、SKV-mIL12p35、及びSKV-mIL12p70で治療したマウスは全て、対照PBSで治療したマウスと比較して腫瘍体積の減少を示した。SKV-mIL12p35及びSKV-mIL12p70治療はいずれも、SKV治療単独よりも効果的であった。SKV-mIL12p35及びSKV-mIL12p70治療マウスは、腫瘍体積の同等の減少を示した。
6.28.実施例28-異種プライムブースト腫瘍溶解性ワクチンレジメンにおけるSKV
予備的な結果は、SKVを使用して、異種ワクチンにおける免疫応答を刺激または増強することができることを示した。オバルブミン(OVA)を異種プライムブーストの組み合わせで外来抗原として使用した。動物を1日目に刺激し、8~10日目に評価し、次いで14日目に追加免疫し、21~24日目に追加免疫後に再度評価した。健康なC57黒色マウスを、PBS(対照)、OVAを発現するアデノウイルス、OVAを発現する野生型Copenhagen株ワクシニアウイルス、または刺激もしくは追加免疫としてOVAを発現するCopMD5p3p(SKV骨格)で治療した。21日目にOVA特異的応答を評価する四量体分析を実施した。マウスを10日時点で評価し、図52に示されるように、1日目に刺激を施し、次いで14日目に免疫を追加免疫したC57BL/6マウスにおいて、Copenhagenウイルスではなく、CopMD5p3pまたはSKV骨格が刺激及び追加免疫設定の両方で免疫応答を誘導したことを示した。CopMD5p3p(SKV骨格)は刺激することができ、刺激応答は、Maraba MG1腫瘍溶解性ラブドウイルスによって増強することができる。CopMD5p3p(SKV骨格)は、アデノウイルス刺激応答を促進することができる。CopMD5p3p(SKV骨格)は、外来抗原に対する免疫応答の刺激及び追加免疫の両方で、親Copenhagenウイルスを上回った。
予備的な結果は、SKVを使用して、異種ワクチンにおける免疫応答を刺激または増強することができることを示した。オバルブミン(OVA)を異種プライムブーストの組み合わせで外来抗原として使用した。動物を1日目に刺激し、8~10日目に評価し、次いで14日目に追加免疫し、21~24日目に追加免疫後に再度評価した。健康なC57黒色マウスを、PBS(対照)、OVAを発現するアデノウイルス、OVAを発現する野生型Copenhagen株ワクシニアウイルス、または刺激もしくは追加免疫としてOVAを発現するCopMD5p3p(SKV骨格)で治療した。21日目にOVA特異的応答を評価する四量体分析を実施した。マウスを10日時点で評価し、図52に示されるように、1日目に刺激を施し、次いで14日目に免疫を追加免疫したC57BL/6マウスにおいて、Copenhagenウイルスではなく、CopMD5p3pまたはSKV骨格が刺激及び追加免疫設定の両方で免疫応答を誘導したことを示した。CopMD5p3p(SKV骨格)は刺激することができ、刺激応答は、Maraba MG1腫瘍溶解性ラブドウイルスによって増強することができる。CopMD5p3p(SKV骨格)は、アデノウイルス刺激応答を促進することができる。CopMD5p3p(SKV骨格)は、外来抗原に対する免疫応答の刺激及び追加免疫の両方で、親Copenhagenウイルスを上回った。
6.29.実施例29-IT対IV投与によるSKV-123導入遺伝子の生体内分布
SKV-123での治療の結果として発現された導入遺伝子(抗CTLA-4抗体、FLT3L、及びIL-12-TM)の生体内分布に対する異なる投与経路(IV対IT)の影響を研究した。雌のBALB/cマウスに、CT26-LacZ腫瘍細胞(3×105個の細胞)を移植し、その後、2週間後(用量1×108個のPFU)に、研究1日目、3日目、及び5日目のIV注入、または研究1日目及び3日目のIT注入のいずれかによってSKV-123を与えた。腫瘍を保有する群について、2日目、4日目、6日目、8日目、及び22日目に血液及び組織を採取した。腫瘍を保有しない群について28日目及び43日目に脾臓を採取した。血清を血液試料から単離し(心臓穿刺から収集)、FLT3LのELISA及び抗CTLA-4抗体発現について組織を均質化した。ELISAは、PCRによってウイルスゲノムが陽性であることを試験した試料に対してのみ実行した。IL-12-TMの生体内分布については、2日目、4日目、8日目、22日目、28日目、及び43日目に組織を採取した。組織を、IL-12-TM導入遺伝子発現のウエスタンブロット分析のために均質化した。ウエスタンブロットは、PCRによってウイルスゲノムが陽性であることを試験した試料に対してのみ実行した。抗チューブリンを負荷対照として使用した。脾臓及び尾の試料でチューブリンを検出することはできなかったが、転写後のブロットのポンソー染色でタンパク質の存在を確認した。1日目及び3日目にIV注入によって与えられたSKV-123は、血清中で検出可能なレベルの抗CTLA-4抗体及びFLT3Lを(図53A、53B)、2日目にマウスの腫瘍においてより低い濃度で(図53C、53D)もたらした。FLT3Lはまた、脾臓及び尾において2日目に、なおIV治療後4日目に検出することができた(図53C、53D)。抗CTLA-4抗体は、IVまたはIT治療にかかわらず、4日目に血清中で検出可能なままであった(図53A)。SKV-123のIT治療は4日目に腫瘍のFLT3L濃度をもたらし(図53F)、一方で、抗CTLA-4抗体濃度は、低いが検出可能であった(図53E)。腫瘍選択的導入遺伝子発現は、全身循環で検出される任意の検出可能な導入遺伝子産物なしで、腫瘍内で治療用ペイロード濃度(例えば、>7.5ng/mlのFLT3L)が達成されたマウス腫瘍モデルにおいて実証された。
SKV-123での治療の結果として発現された導入遺伝子(抗CTLA-4抗体、FLT3L、及びIL-12-TM)の生体内分布に対する異なる投与経路(IV対IT)の影響を研究した。雌のBALB/cマウスに、CT26-LacZ腫瘍細胞(3×105個の細胞)を移植し、その後、2週間後(用量1×108個のPFU)に、研究1日目、3日目、及び5日目のIV注入、または研究1日目及び3日目のIT注入のいずれかによってSKV-123を与えた。腫瘍を保有する群について、2日目、4日目、6日目、8日目、及び22日目に血液及び組織を採取した。腫瘍を保有しない群について28日目及び43日目に脾臓を採取した。血清を血液試料から単離し(心臓穿刺から収集)、FLT3LのELISA及び抗CTLA-4抗体発現について組織を均質化した。ELISAは、PCRによってウイルスゲノムが陽性であることを試験した試料に対してのみ実行した。IL-12-TMの生体内分布については、2日目、4日目、8日目、22日目、28日目、及び43日目に組織を採取した。組織を、IL-12-TM導入遺伝子発現のウエスタンブロット分析のために均質化した。ウエスタンブロットは、PCRによってウイルスゲノムが陽性であることを試験した試料に対してのみ実行した。抗チューブリンを負荷対照として使用した。脾臓及び尾の試料でチューブリンを検出することはできなかったが、転写後のブロットのポンソー染色でタンパク質の存在を確認した。1日目及び3日目にIV注入によって与えられたSKV-123は、血清中で検出可能なレベルの抗CTLA-4抗体及びFLT3Lを(図53A、53B)、2日目にマウスの腫瘍においてより低い濃度で(図53C、53D)もたらした。FLT3Lはまた、脾臓及び尾において2日目に、なおIV治療後4日目に検出することができた(図53C、53D)。抗CTLA-4抗体は、IVまたはIT治療にかかわらず、4日目に血清中で検出可能なままであった(図53A)。SKV-123のIT治療は4日目に腫瘍のFLT3L濃度をもたらし(図53F)、一方で、抗CTLA-4抗体濃度は、低いが検出可能であった(図53E)。腫瘍選択的導入遺伝子発現は、全身循環で検出される任意の検出可能な導入遺伝子産物なしで、腫瘍内で治療用ペイロード濃度(例えば、>7.5ng/mlのFLT3L)が達成されたマウス腫瘍モデルにおいて実証された。
IL-12-TMのウエスタンブロットは、肝臓において非特異的バンドのみを示し(図54A)、一方で、動物の腫瘍、脾臓、肺、または尾においてIL-12-TMは検出されなかった(図54A~54D)。免疫能を有する腫瘍を有するマウスにおけるSKV-123の生体内分布は、IT治療動物における腫瘍、ならびにIV治療後の最初の数日間において、腫瘍及び限られた数の他の組織に非常に低いレベルで制限された。
ウイルスゲノムは、評価された時点のいずれにおいても、脳、心臓、腎臓、卵巣、鼠径部リンパ節、骨髄、または血清中で検出されなかった。ウイルスゲノムは、9日目の時点での1つの試料を除いて、4日目の時点で腫瘍試料においてのみ検出可能であった。ゲノムは、主に2日目及び4日目の時点で、いくつかの尾部、肺、脾臓、及び肝臓試料で検出可能であった。23日目の採取群からのいかなる試料においてもゲノムは検出されなかった。
SKV-123ウイルスのウイルス力価は、IV注入による治療後2日目の尾において最も高く、脾臓、肺、及び肝臓において検出可能な低レベルであった。4日目に、力価は、IV注入群について尾でのみ検出された。ウイルス力価を両方の投与経路で腫瘍において検出し、IV注入と比較してIT注入後に高い力価が見られた。ウイルスはまた、肺において、両方の投与経路において同等のレベルで検出された。
この研究で検査した環境排出試料(血清、尿、唾液)のいずれも、検出可能なウイルスゲノムまたは複製ウイルスを含有しなかった。
6.30.実施例30-ヒト化マウスモデルにおける腫瘍体積に対するSKV-123v2の有効性
ヒト化マウスモデルにおける腫瘍の成長に対するSKV-123v2の有効性を研究した。NOD scidガンマ(NSG)マウスは、ヒトPBMCで治療することができ、その結果、ヒト様免疫系を発達させる免疫不全実験マウスのブランドである。雌のNSGマウスにヒトPBMCを移植し、2週間後に1x107個のUM-UC-3異種移植ヒト膀胱腫瘍細胞を皮下移植した。腫瘍体積(mm3)を、楕円球(lxw2)/2=mm3の式を使用して計算し、式中、l及びwは、各測定で収集されたより大きい及びより小さい寸法を指す。腫瘍が最小100mm3である場合、マウスを1×108PFUでSKV-123v2または生理食塩水対照で2日ごとにIV注入によって3週間治療した。研究の経過にわたって基本的なマウスの健康状態を評価し、腫瘍体積を測定した。腫瘍は、移植の4日目から開始して治療の初日から週に2回測定した。21日目にSKV-123v2で治療した動物は、ビヒクル治療対照と比較して-8.4%の差に対応する164mm3の平均腫瘍体積を有し、最大効果は、対照と比較して-53.2%の差で32日目に観察した(図55)。
ヒト化マウスモデルにおける腫瘍の成長に対するSKV-123v2の有効性を研究した。NOD scidガンマ(NSG)マウスは、ヒトPBMCで治療することができ、その結果、ヒト様免疫系を発達させる免疫不全実験マウスのブランドである。雌のNSGマウスにヒトPBMCを移植し、2週間後に1x107個のUM-UC-3異種移植ヒト膀胱腫瘍細胞を皮下移植した。腫瘍体積(mm3)を、楕円球(lxw2)/2=mm3の式を使用して計算し、式中、l及びwは、各測定で収集されたより大きい及びより小さい寸法を指す。腫瘍が最小100mm3である場合、マウスを1×108PFUでSKV-123v2または生理食塩水対照で2日ごとにIV注入によって3週間治療した。研究の経過にわたって基本的なマウスの健康状態を評価し、腫瘍体積を測定した。腫瘍は、移植の4日目から開始して治療の初日から週に2回測定した。21日目にSKV-123v2で治療した動物は、ビヒクル治療対照と比較して-8.4%の差に対応する164mm3の平均腫瘍体積を有し、最大効果は、対照と比較して-53.2%の差で32日目に観察した(図55)。
6.31.実施例31-腫瘍及び正常細胞におけるSKV-123v2のインビトロ感染性比較
ヒト正常(PBMC、PrEC)及びがん(786-O、HeLa)細胞のSKV-123v2ウイルス感染後のウイルス複製、細胞傷害性、導入遺伝子発現、ならびにサイトカイン産生をインビトロで特徴付けた。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)は、Lonza(カタログ番号:CC-2702)から購入した。ヒト前立腺上皮細胞(PrEC)は、Lonza(カタログ番号:CC-2555)から購入した。786-Oヒト腎腺癌細胞は、ATCC(カタログ番号:CRL-1932)から購入した。HeLaヒト子宮頸癌細胞は、ATCC(カタログ番号:CCL-2)から購入した。
ヒト正常(PBMC、PrEC)及びがん(786-O、HeLa)細胞のSKV-123v2ウイルス感染後のウイルス複製、細胞傷害性、導入遺伝子発現、ならびにサイトカイン産生をインビトロで特徴付けた。ヒト末梢血単核細胞(PBMC)は、Lonza(カタログ番号:CC-2702)から購入した。ヒト前立腺上皮細胞(PrEC)は、Lonza(カタログ番号:CC-2555)から購入した。786-Oヒト腎腺癌細胞は、ATCC(カタログ番号:CRL-1932)から購入した。HeLaヒト子宮頸癌細胞は、ATCC(カタログ番号:CCL-2)から購入した。
細胞を24ウェルプレートに播種した。細胞生存率及びサイトカイン発現を、感染後6時間、24時間、48時間、及び72時間の4つの時点で評価した。生存細胞数/mL及び各細胞懸濁液の生存率を決定するために、細胞懸濁液を各々0.6mLのViCellカップに入れ、試料を計器に記録した。希釈液を調製した。単層が>80%コンフルエント(細胞播種の24時間後)であった場合、細胞を感染させた。感染の当日、ウイルスを以下の表47に概説されるように適切な用量に希釈した。感染は、24ウェルプレートで実施した。
サイトカインプロファイリングを示される時点で実施した。感染した細胞上清を等分し、-20℃で保存して、IL-18を含むHuman Cytokine Array/Chemokine Array 42-Plex(HD42)を使用した分析のためにEve Technologiesに送った。FLT3L及びイピリムマブ発現を、ELISAアッセイを使用して評価した。細胞生存率を、アラマーブルーを使用して各採取時点で実施し、Fluoroskanで読み出して、未治療の対照ウェルと比較した治療ウェルの生存率%を決定した。ウイルス力価を決定して、異なる細胞株間の複製動態を評価した。
正常な細胞を、感染時の細胞生存率を最大化するために、血清成長因子の存在下で、接触阻害の欠如下で培養した。試験した条件下で、SKV-123v2感染実験に使用した同等の細胞密度で、PrEC(前立腺上皮細胞)は、HeLa癌細胞とほぼ同じ高い増殖速度を示した。これらの条件下で培養した場合の試験した正常細胞株の表現型をより良く定義するために、コンパニオン研究において、PrEC細胞及びPBMCに対してBrdU取り込みを測定する増殖アッセイを行った。がん細胞株及びPBMCと比較したPrECにおけるSKV-123v2の中間複製は、インビトロ感染条件下で観察したこの正常細胞株の相対増殖速度と相関した。
結果は、用量依存的及び時間依存的様式での細胞生存率の低下によって証明されるように、786-O及びHeLaがん細胞株がSKV-123v2ウイルス感染に対して感受性であったことを示す(図56)。786-O細胞生存率は、試験した全てのMOIで経時的に減少した一方で、HeLa細胞生存率は、1及び0.1のMOIでのSKV-123v2ウイルス感染時に減少した。正常なヒトPBMCは、1、0.1、及び0.01のMOIでのSKV-123v2ウイルス感染後の高細胞生存率によって証明されるように、感染に対して耐性であった(図56)。正常なヒトPrECは、がん細胞株と比較して、SKV-123v2ウイルス感染に対する感受性が低かった。感染後48時間までに、いなかるMOI(1、0.1、0.01)でも細胞生存率の低下は観察されなかった。感染後72時間までに、1及び0.1のMOIでSKV-123v2ウイルス感染時に、細胞生存率の低下が認められた(図56)。
SKV-123v2ウイルスは、正常なヒトPrECと比較した場合、がん細胞株に感染し、より高い割合で複製された(図57)。それらは、正常なヒトPrECと比較した場合、10倍を超えるレベルで786-O及びHeLaがん細胞株において感染及び複製された。SKV-123v2ウイルスは、1、0.1、及び0.01のMOIで正常なヒトPBMCにおいて複製しなかった(図59)。
抗CTLA-4抗体及びFLT3L(SKV-123v2ウイルス感染細胞によって産生された2つの導入遺伝子産物)の産生を、各MOI及び時点で細胞上清でモニタリングした。SKV-123v2ウイルス感染は、正常細胞(PrEC細胞またはPBMC)と比較した場合、がん細胞において抗CTLA-4抗体及びFLT3Lのより多くの産生をもたらした(図58及び59)。抗CTLA-4抗体またはFLT3Lは、PBMC細胞上清中で検出されなかった。FLT3L及び抗CTLA-4抗体導入遺伝子産物の濃度は、SKV-123v2感染に対する細胞の感受性と相関した。
サイトカインプロファイリング実験では、SKV-123v2ウイルスに感染したがん細胞で正常細胞よりも高いレベルの細胞傷害性を観察した。
細胞株PrECは、ウイルス感染に対して特に応答性であり、状況に応じてEGF、G-CSF、IL-1a、IL-1RA、IL-4、及びIL-18を産生し、これらのサイトカインの低濃度または無視可能な濃度のみがHeLa、786-0、及びPBMCから検出可能であった。PrEC及び786-0が、感染に応答してIL-8、TGF-α、及びTNFαを産生した唯一の細胞株であり、一方でPrEC及びPBMCのみがIP-10を生産した。PrECは、EGFの用量依存的産生を示し、ウイルス感染のより高いMOIでの産生が増加した。EGF濃度は、ウイルスのMOI 1に感染した細胞については、72時間でわずかな増加を伴い、24~72時間の間、同じ投与群内で一貫したままであった。PrEC細胞において、IL-1a産生は、感染後48時間ほとんどベースラインと一貫したままであり、次いで72時間で増加し、最も高い濃度をMOI 1で観察した。同様に、PrECによるIL-1RA及びIL-18産生は、感染後72時間で濃度の劇的な増加を示し、この時点より前は低い(より高いMOI 0.1及び1の感染において24時間でわずかなIL-1RA増加)または無視可能であった。IL-1RAの産生は72時間で用量依存的に見えたが、ウイルスのMOI 1は、MOI 0.1と比較してIL-18産生の減少をもたらした。PrECは、未治療対照と比較して、全ての投与群において感染後6時間で低減したIL-4を産生した。しかしながら、このIL-4産生は、ベースラインを24時間上回って増加し、感染後72時間まで高いままであった。
代替的に、PrECを除く全ての細胞株がMCP-1を産生した。HeLa及び786-0細胞において、高濃度のMCP-1がベースラインで産生され、ウイルス感染の影響を受けなかった。PBMCにおいて、MCP-1は、高用量のウイルス:感染後24時間でのMOI 1のウイルス、ならびに72時間でのMOI 0.1及び1のウイルスによってベースラインを超えて誘導された。
いくつかのサイトカインは、ベースラインを超えて、感染後24時間及び72時間で増加したが、48時間(またはわずかに)増加しなかった。HeLa細胞において、これらは、FGF-2(MOI 1では、より低い投与量は72時間でのみ産生を誘導することができた)及びIL-6(MOI 0.01及び0.1のみ;MOI 1濃度は経時的に一貫していた)である。PrEC細胞において、これらは、G-CSF(MOI 0.01及び0.1のみ;MOI 1濃度は経時的に一貫していた)、TGF-α(MOI 0.01及び0.1のみ;MOI 1濃度は経時的に一貫していた)、TNFα(MOI 0.01及び0.1のみ;MOI 1は経時的に増加した)、及びIP-10(MOI 0.1及び0.1のみ;MOI 1は低濃度を産生した)である。786-0細胞において、これらは、FGF-2(MOI 0.1及び1のみ;最低用量MOI 0.01のみが72時間で産生を誘導した)、IL-8(MOI 0.01及び0.1のみ;MOI 1濃度は経時的に一貫していた)、及びTGF-α(MOI 0.01及び0.1のみ)、TNFα(MOI 0.01及び0.1のみ;MOI濃度は経時的にベースラインであった)である。PBMCにおいて、サイトカインは、IP-10(MOI 1のみ)である。
HeLa及び786-0細胞でのIFNα2産生は感染後24時間でピークに達し、その後時間経過と共に低下したが、PrEC細胞ではIFNα2産生は72時間で最も高かった。3つ全ての細胞株において、MOI 0.1または1でのより高い投与は、投与群の中で最も低いサイトカイン産生を示した。
IFNγ産生は全ての細胞株において低く、786-0は24時間でピーク産生を示し、次いで経時的に減少した。
6.32.実施例32-組換えワクシニアウイルスの生成
この実施例に記載の方法及び技術を使用して、表45に記載のベクターを生成した。表45に要約されているように、ベクターの各々は、複製能があり、ベクターに含まれる導入遺伝子(複数可)を発現し、示されているようにがん細胞株で細胞傷害性を示すことが実証されている。以下に記載のアッセイを使用して、表45に要約されたデータを生成した。
この実施例に記載の方法及び技術を使用して、表45に記載のベクターを生成した。表45に要約されているように、ベクターの各々は、複製能があり、ベクターに含まれる導入遺伝子(複数可)を発現し、示されているようにがん細胞株で細胞傷害性を示すことが実証されている。以下に記載のアッセイを使用して、表45に要約されたデータを生成した。
組換え
ほぼコンフルエント(80~90%)のU2OS細胞の単層を、最初に2時間ワクシニアウイルス(例えば、SKVウイルス)に感染させて修飾する。感染後、標的DNA(図60)を感染細胞にトランスフェクトする。翌日(トランスフェクションの12~18時間後)、トランスフェクション培地を除去し、新鮮な培地を細胞に添加する。2日目(トランスフェクション後約48時間)に、細胞を凍結し、プラーク精製のために解凍する。
プラーク精製及び増幅
組換えワクシニアウイルスを特定するために、プラークを蛍光マーカーを使用してスクリーニングする。前のステップからの感染/トランスフェクション混合物の段階希釈(1:10)をU2OS細胞のコンフルエントな単層に2時間添加し、その後、培地をオーバーレイ培地に置き換えてプラーク形成を可能にする。2日後、蛍光プラークを採取し、段階希釈し、U2OS細胞の新鮮な単層に添加し、続いてオーバーレイ培地を添加する。このプラーク精製のプロセスは、全てのプラークが蛍光するまで繰り返される。蛍光マーカーを除去するために、適切なリコンビナーゼを、上記のステップ(すなわち、組み換え)で概説される蛍光ウイルスでトランスフェクトする。次に、プラーク精製のプロセスを継続して、非蛍光プラークを選択する。
次いで、純粋な組換えウイルスのプラークを使用して、増殖のために別の細胞株(例えば、HeLa細胞)の単層に感染させ、このステップではオーバーレイは添加されない。感染した細胞に目に見える細胞変性効果が見られると、細胞溶解物が収集され、組換えウイルス濃度がウイルス滴定によって決定される。
導入遺伝子発現
組み換えウイルスを使用して、様々な濃度(例えば、MOI 0.01、0.1、または1)で様々ながん細胞(例えば、HeLa、U2OS、786-Oなど)に、様々な時間(例えば、感染後6時間、24時間、48時間、及び72時間)で感染させる。細胞溶解物(ウエスタンブロット用)及び細胞上清(ELISA用)を凍結し、導入遺伝子産生に関するアッセイのために-80℃で保管する。可溶性タンパク質(例えば、FLT3L、抗CTLA-4抗体)をコードする導入遺伝子については、ELISAキットを用いて導入遺伝子産生を定量化する。細胞制限(例えば、細胞または膜結合内)タンパク質産物(例えば、膜結合IL-12)をコードする導入遺伝子については、細胞溶解物のウエスタンブロットを使用して、導入遺伝子産生を定量化する。
がん細胞株細胞傷害性
がん細胞株の細胞傷害性は、感染細胞に対する光学顕微鏡法によって見られる可視的な細胞変性効果によって決定する。細胞溶解物を収集し、組換えウイルス濃度をウイルス力価測定によって決定することができる。
いくつかの実施形態
本明細書で言及されている全ての刊行物、特許、及び特許出願は、各独立した刊行物または特許出願が参照により組み込まれることが詳細にかつ個別に示された場合と同じ程度に、参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で言及されている全ての刊行物、特許、及び特許出願は、各独立した刊行物または特許出願が参照により組み込まれることが詳細にかつ個別に示された場合と同じ程度に、参照により本明細書に組み込まれる。
本発明は、その特定の実施形態に関連して記載されているが、さらなる修正が可能であり、本出願は、一般的に、本発明の原理に従った本発明の任意の変形、使用、または適応を網羅することが意図され、本発明が関連する技術分野内の既知のまたは慣習的な実践の範囲内にあり、前述の本質的な特徴に適用され得、特許請求の範囲に従う本発明からのかかる逸脱を含むことが理解されるであろう。
いくつかの実施形態は、特許請求の範囲内にある。
Claims (250)
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′逆位末端配列(ITR)におけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)細胞傷害性Tリンパ球関連タンパク質4(CTLA-4)と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項1に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、請求項2に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、請求項2に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、請求項5に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、請求項1~6のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする、請求項1~7のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される配列を含む、請求項1~8のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、請求項1~8のいずれか1項に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)インターロイキン12(IL-12)ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項11に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、請求項12に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、請求項13に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、請求項13に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、請求項16に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、請求項16に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、請求項11~18のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、膜結合である、請求項11~19のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む、請求項11~20のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項11~21のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される配列を含む、請求項11~22のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、請求項11~22のいずれか1項に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)FMS様チロシンキナーゼ3リガンド(FLT3L)をコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項25に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、請求項26に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、請求項26に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、請求項26に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、請求項26に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、
(d)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、請求項31に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、請求項31に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、請求項31に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、請求項25~34のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記FLT3Lが、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項25~35のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される配列を含む、請求項25~36のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、請求項25~36のいずれか1項に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項39に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、請求項40に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、請求項40に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項39~42のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、請求項43に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、請求項44に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、請求項44に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、請求項47を含む核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、請求項47または48を含む核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、請求項47または48に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、請求項39~50のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、膜結合である、請求項39~51のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む、請求項39~52のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする、請求項39~53のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される配列を含む、請求項39~54のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、請求項39~54のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項39~56のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される配列を含む、請求項39~57のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、請求項39~57のいずれか1項に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項60に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、請求項61に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、請求項61に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項60~63のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、請求項64に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、請求項64に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、請求項64に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、請求項64に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、請求項69に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、請求項69または70に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、請求項69または70に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、請求項69または70に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、請求項60~73のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする、請求項60~74のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される配列を含む、請求項60~75のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、請求項60~75のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記FLT3Lが、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項60~77のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される配列を含む、請求項60~78のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、請求項60~78のいずれか1項に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項81に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、請求項82に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、請求項83に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、請求項83に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項81~85のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、請求項86に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、請求項86に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、請求項86に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、請求項86に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(d)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(ii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。 - 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、請求項91に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、請求項91に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、請求項91~93のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、請求項91~93のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、請求項91~93のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニア遺伝子と同じ方向にある、請求項81~96のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、膜結合である、請求項81~97のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む、請求項81~98のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項81~99のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される配列を含む、請求項81~100のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、請求項81~100のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記FLT3Lが、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項81~102のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される配列を含む、請求項81~103のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、請求項81~103のいずれか1項に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B8R、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失である、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項106に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、請求項107に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、請求項107に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項106~109のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、請求項110に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、請求項111に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、請求項111に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列をさらに含む、請求項106~113のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、請求項114に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、請求項114に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、請求項114に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、請求項114に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーター、pSプロモーター、またはLEOプロモーターである、前記ヌクレオチド配列、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列、及び/または
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター、B19Rプロモーター、E3Lプロモーター、F11Lプロモーター、またはB2Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列をさらに含む、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、請求項119に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列、F17Rプロモーター、またはD13Lプロモーターを含む、請求項119または120に記載の核酸。
- 前記後期プロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む、請求項119または120に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーターである、請求項119~122のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B19Rプロモーターである、請求項119~122のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、請求項119~122のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、請求項106~125のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、膜結合である、請求項106~126のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、IL-12 p35またはIL-12 p70を含む、請求項106~127のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号211に記載されるアミノ酸配列を含むアミノ酸配列をコードする、請求項106~128のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される配列を含む、請求項106~129のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1のヌクレオチド配列が、配列番号214に記載される、請求項106~129のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記IL-12ポリペプチドが、配列番号212に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項106~131のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される配列を含む、請求項106~132のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2のヌクレオチド配列が、配列番号215に記載される、請求項106~132のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記FLT3Lが、配列番号213に記載されるアミノ酸配列を含む、請求項106~134のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される配列を含む、請求項106~135のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3のヌクレオチド配列が、配列番号216に記載される、請求項106~135のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、請求項138に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項1~10、39~80、及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項11~24、39~59、及び81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項25~38及び60~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項1~10、39~80、及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項11~24、39~59、及び81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項25~38及び60~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項1~10、39~80、及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項11~24、39~59、及び81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項25~38及び60~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項39~59及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項60~80及び106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項81~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子、前記第2の導入遺伝子、及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第2の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、請求項106~137のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の少なくとも50%の欠失である、請求項1~202のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の少なくとも60%の欠失である、請求項1~202のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の少なくとも70%の欠失である、請求項1~202のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の少なくとも80%の欠失である、請求項1~202のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の約75%の欠失である、請求項1~202のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記B8R遺伝子における前記欠失が、前記B8R遺伝子配列の約80%の欠失である、請求項1~202のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記組換えワクシニアウイルスゲノムが、Copenhagen株ワクシニアウイルスのゲノムに由来する、請求項1~208のいずれか1項に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。 - 前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にある、請求項210に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項210または211に記載の核酸。
- 前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在し、前記第2の導入遺伝子及び前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、請求項210または211に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、請求項212または213に記載の核酸。
- 前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にある、請求項212または213に記載の核酸。
- 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子であって、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にある、前記第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が部分欠失であり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。 - 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分C2LとF3Lワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。 - 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の上流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。 - 組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸であって、
(a)C2L、C1L、N1L、N2L、M1L、M2L、K1L、K2L、K3L、K4L、K5L、K6L、K7R、F1L、F2L、F3L、B14R、B15R、B16R、B17L、B18R、B19R、及びB20Rの遺伝子における欠失、ならびに任意でB8R遺伝子における欠失と、
(b)3′ITRにおけるB21R、B22R、B23R、B24R、B25R、B26R、B27R、B28R、及びB29Rの遺伝子における欠失と、
(c)CTLA-4と特異的に結合する抗体またはその抗原結合断片をコードする第1のヌクレオチド配列を含む第1の導入遺伝子であって、前記第1のヌクレオチド配列が、前記第1のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第1の導入遺伝子が、前記部分B14RとB29Rワクシニア遺伝子との間に存在する、前記第1の導入遺伝子と、
(d)IL-12ポリペプチドをコードする第2のヌクレオチド配列を含む第2の導入遺伝子であって、前記第2のヌクレオチド配列が、前記第2のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第2の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在する、前記第2の導入遺伝子と、
(e)FLT3Lをコードする第3のヌクレオチド配列を含む第3の導入遺伝子と、を含み、
前記C2L、F3L、B14R、及びB29Rワクシニア遺伝子における前記欠失が、部分欠失であり、前記第3のヌクレオチド配列が、前記第3のヌクレオチド配列と隣接する内因性ワクシニアウイルス遺伝子と同じ方向にあり、前記第3の導入遺伝子が、前記B8R遺伝子における前記欠失の遺伝子座に存在し、前記第3の導入遺伝子が、前記第2の導入遺伝子の下流にあり、
前記核酸が、
(i)前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第1のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、H5Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(ii)前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第2のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、配列番号561のヌクレオチド配列を含む後期プロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、
(iii)前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された少なくとも1つのプロモーターを含むヌクレオチド配列であって、前記第3のヌクレオチド配列と作動可能に連結された前記少なくとも1つのプロモーターが、B8Rプロモーター及びB19Rプロモーターである、前記ヌクレオチド配列と、をさらに含む、前記核酸。 - 前記組換えワクシニアウイルスゲノムが、配列番号624のワクシニアウイルスヌクレオチド配列を含む、請求項1~219のいずれか1項に記載の核酸。
- 前記組換えワクシニアウイルスゲノムが、配列番号210のワクシニアウイルスヌクレオチド配列を含む、請求項1~105のいずれか1項に記載の核酸。
- 請求項1~221のいずれか1項に記載の組換えワクシニアウイルスゲノムを含む核酸を含む、ウイルス。
- 請求項1~221のいずれか1項に記載の核酸を含む、パッケージング細胞株。
- 請求項222に記載のウイルスを含む、パッケージング細胞株。
- 請求項222に記載のウイルスと、生理学的に許容される担体と、を含む、薬学的組成物。
- キットであって、請求項1~221のいずれか1項に記載の核酸と、宿主細胞において前記核酸を発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
- キットであって、請求項222に記載のウイルスと、宿主細胞において前記ウイルスを発現するように前記キットの使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
- キットであって、請求項222に記載のウイルスと、がんを有する哺乳動物患者に治療有効量の前記ウイルスを投与し、それによって前記がんを治療するように使用者に指示する添付文書と、を含む、前記キット。
- 前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、請求項228に記載のキット。
- 哺乳動物患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の請求項222に記載のウイルスを前記哺乳動物患者に投与することを含む、前記方法。
- 哺乳動物患者においてがんを治療する方法であって、治療有効量の請求項225に記載の薬学的組成物を前記哺乳動物患者に投与することを含む、前記方法。
- 前記哺乳動物患者が、ヒト患者である、請求項230または231に記載の方法。
- 前記がんが、白血病、リンパ腫、肝臓癌、骨癌、肺癌、脳癌、膀胱癌、胃腸癌、乳癌、心臓癌、子宮頸癌、子宮癌、頭頸部癌、胆嚢癌、喉頭癌、口唇及び口腔癌、眼癌、黒色腫、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、精巣癌、ならびに喉癌からなる群から選択される、請求項230~232のいずれか1項に記載の方法。
- 前記方法が、前記哺乳動物患者に免疫チェックポイント阻害剤を投与することをさらに含む、請求項230~233のいずれか1項に記載の方法。
- 前記免疫チェックポイント阻害剤が、OX40リガンド、ICOSリガンド、抗CD47抗体またはその抗原結合断片、抗CD40/CD40L抗体またはその抗原結合断片、抗Lag3抗体またはその抗原結合断片、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片、抗PD1抗体またはその抗原結合断片、及び抗Tim-3抗体またはその抗原結合断片からなる群から選択される、請求項234に記載の方法。
- 前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体もしくはその抗原結合断片、または抗CTLA-4抗体もしくはその抗原結合断片である、請求項234に記載の方法。
- 前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD1抗体またはその抗原結合断片である、請求項234に記載の方法。
- 前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗CTLA-4抗体またはその抗原結合断片である、請求項234に記載の方法。
- 前記免疫チェックポイント阻害剤が、抗PD-L1抗体またはその抗原結合断片である、請求項234に記載の方法。
- 前記方法が、前記哺乳動物患者にインターロイキンを投与することをさらに含む、請求項219~228のいずれか1項に記載の方法。
- 前記インターロイキンが、IL-1アルファ、IL-1ベータ、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-12 p35、IL-12 p40、IL-12 p70、IL-15、IL-18、IL-21、及びIL-23からなる群から選択される、請求項240に記載の方法。
- 前記インターロイキンが、IL-12 p35、IL-12 p40、及びIL-12 p70からなる群から選択される、請求項240に記載の方法。
- 前記インターロイキンが、膜結合である、請求項240~242のいずれか1項に記載の方法。
- 前記方法が、前記哺乳動物患者にインターフェロンを投与することをさらに含む、請求項230~243のいずれか1項に記載の方法。
- 前記インターフェロンが、IFN-アルファ、IFN-ベータ、IFN-デルタ、IFN-イプシロン、IFN-タウ、IFN-オメガ、IFN-ゼータ、及びIFN-ガンマからなる群から選択される、請求項244に記載の方法。
- 前記方法が、前記哺乳動物患者にサイトカインを投与することをさらに含む、請求項230~245のいずれか1項に記載の方法。
- 前記サイトカインが、TNFスーパーファミリーメンバータンパク質である、請求項246に記載の方法。
- 前記TNFスーパーファミリーメンバータンパク質が、TRAIL、Fasリガンド、LIGHT(TNFSF-14)、TNF-アルファ、及び4-1BBリガンドからなる群から選択される、請求項247に記載の方法。
- 前記サイトカインが、GM-CSF、Flt3リガンド、CD40リガンド、TGF-ベータ、VEGF-R2、及びcKitからなる群から選択される、請求項246に記載の方法。
- 前記サイトカインが、Flt3リガンドである、請求項246に記載の方法。
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