JP2022166146A - フリードライヒ運動失調症の治療用のベクター - Google Patents
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Abstract
Description
とが多い。電気生理学的研究では40m/sを超える伝導速度が示され、知覚神経活動電位の欠如又は低下、及びH反射の欠如が見られる。神経病理学的レベルでは、脊髄、後根、時には小脳の顕著な萎縮、及び心肥大が観察される。神経変性が末梢感覚神経で確認され、大型後根神経節感覚ニューロンの進行性消失、後柱変性、クラーク柱(Clarke's spine)のニューロン、及び脊髄小脳線維、錐体路の経シナプス変性、並びに薄束核及び楔状核の萎縮が見られる。二次病変としては、大型グルタミン酸作動性ニューロンに影響する小脳の歯状核の萎縮、並びにベッツ細胞及び皮質脊髄路の萎縮を挙げることができる。
位置するFXN遺伝子の分子の欠陥であることが特定された。この突然変異は、FXN遺伝子の第一イントロンのALU配列内に位置するGAAトリプレットの異常なホモ接合伸長(homozygous expansion)からなる。FRDAの患者の約98%が、各々のGAA反復の数が201~1700(より頻繁には600~900)である2本の染色体を有する。しかしながら、FRDAの患者の2%~5%がFXN遺伝子中のGAA伸長及び点突然変異を複合ヘテロ接合(composite heterozygosis)で呈する(表1)。これまで、FXN
遺伝子中の17種を超える異なる突然変異がFRDAを誘発することが可能であることが記載されている。FRDAにおけるGAA伸長は、減数分裂時に非常に不安定であり、FXN遺伝子の転写を妨げ、異常に低レベルのフラタキシンmRNAをもたらす。GAA伸長は、FXN遺伝子の転写をサイレンシングし、三重DNA構造若しくはDNA-RNAハイブリッド、又はその両方の形成によりフラタキシン発現を無効にする。更に最近では、GAA伸長がGAA過剰伸長(hyperexpansion)の近くでのヘテロクロマチン様構造の形成により転写の開始から伸長への移行を妨げることが提唱されている。GAA伸長がFXN遺伝子の5’上流領域に位置するCpGサイトのエピジェネティックメチル化をもたらし、それらのサイレンシングを引き起こすことも提唱されている。このため、FXN遺伝子中のGAA突然変異の結果として、FRDAにおいてフラタキシンタンパク質の欠乏が生じる。
ことに加えて、細胞の鉄の取込み及び利用を調節するタンパク質アコニターゼ1(ACO1)のDNA結合能も調整する。
本出願で使用される「治療」及び「療法」という用語は、疾患及び/又は症状を治癒及び/又は緩和する目的と共に健康上の問題の改善を目標として使用される一連の衛生的手段、薬理学的手段、外科的手段及び/又は物理的手段を指す。「治療」及び「療法」という用語には、予防法及び治癒法が含まれる。それというのも、両者とも個体又は動物の健康の維持及び/又は回復に向けられるからである。症状、疾患及び廃疾の原因にかかわらず、健康上の問題を軽減及び/又は治癒するために適した医薬の投与は、本出願の文脈内の治療又は療法の形として解釈されるべきである。
えば、イノシトール)、ポリエチレングリコール等の有機糖類又は糖アルコール、尿素、グルタチオン、チオクト酸、チオグリコール酸ナトリウム、チオグリセロール、α-モノチオグリセロール及びチオ硫酸ナトリウム等の硫黄含有還元剤、ヒト血清アルブミン、ウシ血清アルブミン、ゼラチン又は他の免疫グロブリン等の低分子量タンパク質、並びにポリビニルピロリドン等の親水性ポリマーが挙げられる。
第1の態様において、本発明は、核酸を含むアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターであって、該核酸が、
(i)フラタキシンをコードする核酸配列と、
(ii)ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)プロモーターと、
(iii)ウッドチャック肝炎ウイルス転写後調節エレメント(WPRE)と、
を含み、(ii)及び(iii)が(i)に作動可能に連結し、(i)の発現を調節する、ベクターを提供する。
gaattccggggttggggttgcgccttttccaaggcagccctgggtctgcgcagggacgcggctgctctgggcgtggttccgggaaacgcagcggcgccgaccctgggtctcgcacattcttcacgtccgttcgcagcgtcacccggatcttcgccgctacccttgtgggccccccggcgacgcttcctgctccgcccctaagtcgggaaggttccttgcggttcgcggcgtgccggacgtgacaaacggaagccgcacgtctcactagtaccctcgcagacggacagcgccagggagcaatggcagcgcgccgaccgcgatgggctgtggccaatagcggctgctcagcagggcgcgccgagagcagcggccgggaaggggcggtgcgggaggcggggtgtggggcggtagtgtgggccctgttcctgcccgcgcggtgttccgcattctgcaagcctccggagcgcacgtcggcagtcggctccctcgttgaccgaatcaccgacctctctccccag
配列同一性は、BLASTを用いて決定する。
TCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG
ATGTGGACTCTCGGGCGCCGCGCAGTAGCCGGCCTCCTGGCGTCACCCAGCCCGGCCCAGGCCCAGACCCTCACCCGGGTCCCGCGGCCGGCAGAGTTGGCCCCACTCTGCGGCCGCCGTGGCCTGCGCACCGACATCGATGCGACCTGCACGCCCCGCCGCGCAAGTTCGAACCAGAGAGGTCTCAACCAGATTTGGAATGTCAAAAAGCAGAGTGTCTATTTGATGAATTTGAGGAAATCTGGAACTTTGGGCCACCCAGGCTCTCTAGATGAGACCACCTATGAAAGACTAGCAGAGGAAACGCTGGACTCTTTAGCAGAGTTTTTTGAAGACCTTGCAGACAAGCCATACACGTTTGAGGACTATGATGTCTCCTTTGGGAGTGGTGTCTTAACTGTCAAACTGGGTGGAGATCTAGGAACCTATGTGATCAACAAGCAGACGCCAAACAAGCAAATCTGGCTATCTTCTCCATCCAGTGGACCTAAGCGTTATGACTGGACTGGGAAAAACTGGGTGTACTCCCACGACGGCGTGTCCCTCCATGAGCTGCTGGCCGCAGAGCTCACTAAAGCCTTAAAAACCAAACTGGACTTGTCTTCCTTGGCCTATTCCGGAAAAGATGCTT
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GAATTCCGGGGTTGGGGTTGCGCCTTTTCCAAGGCAGCCCTGGGTCTGCGCAGGGACGCGGCTGCTCTGGGCGTGGTTCCGGGAAACGCAGCGGCGCCGACCCTGGGTCTCGCACATTCTTCACGTCCGTTCGCAGCGTCACCCGGATCTTCGCCGCTACCCTTGTGGGCCCCCCGGCGACGCTTCCTGCTCCGCCCCTAAGTCGGGAAGGTTCCTTGCGGTTCGCGGCGTGCCGGACGTGACAAACGGAAGCCGCACGTCTCACTAGTACCCTCGCAGACGGACAGCGCCAGGGAGCAATGGCAGCGCGCCGACCGCGATGGGCTGTGGCCAATAGCGGCTGCTCAGCAGGGCGCGCCGAGAGCAGCGGCCGGGAAGGGGCGGTGCGGGAGGCGGGGTGTGGGGCGGTAGTGTGGGCCCTGTTCCTGCCCGCGCGGTGTTCCGCATTCTGCAAGCCTCCGGAGCGCACGTCGGCAGTCGGCTCCCTCGTTGACCGAATCACCGACCTCTCTCCCCAGTGGCTAACTAGAGAACCCACTGCTTACTGGCTTATCGAAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCCAAGCTGGCTAGCGTTTAAACTTAAGCTTGGCCGCCACCATGTGGACTCTCGGGCGCCGCGCAGTAGCCGGCCTCCTGGCGTCACCCAGCCCGGCCCAGGCCCAGACCCTCACCCGGGTCCCGCGGCCGGCAGAGTTGGCCCCACTCTGCGGCCGCCGTGGCCTGCGCACCGACATCGATGCGACCTGCACGCCCCGCCGCGCAAGTTCGAACCAGAGAGGTCTCAACCAGATTTGGAATGTCAAAAAGCAGAGTGTCTATTTGATGAATTTGAGGAAATCTGGAACTTTGGGCCACCCAGGCTCTCTAGATGAGACCACCTATGAAAGACTAGCAGAGGAAACGCTGGACTCTTTAGCAGAGTTTTTTGAAGACCTTGCAGACAAGCCATACACGTTTGAGGACTATGATGTCTCCTTTGGGAGTGGTGTCTTAACTGTCAAACTGGGTGGAGATCTAGGAACCTATGTGATCAACAAGCAGACGCCAAACAAGCAAATCTGGCTATCTTCTCCATCCAGTGGACCTAAGCGTTATGACTGGACTGGGAAAAACTGGGTGTACTCCCACGACGGCGTGTCCCTCCATGAGCTGCTGGCCGCAGAGCTCACTAAAGCCTTAAAAACCAAACTGGACTTGTCTTCCTTGGCCTATTCCGGAAAAGATGCTTTGCCCACCTAGGGATCGGATCCCCGGGTACCGAGCTCGAATTCTGCAGATATCCAGCACACTTTGCCTTTCTCTCCACAGGTGTCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG
CTGGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCTGAATTCCGGGGTTGGGGTTGCGCCTTTTCCAAGGCAGCCCTGGGTCTGCGCAGGGACGCGGCTGCTCTGGGCGTGGTTCCGGGAAACGCAGCGGCGCCGACCCTGGGTCTCGCACATTCTTCACGTCCGTTCGCAGCGTCACCCGGATCTTCGCCGCTACCCTTGTGGGCCCCCCGGCGACGCTTCCTGCTCCGCCCCTAAGTCGGGAAGGTTCCTTGCGGTTCGCGGCGTGCCGGACGTGACAAACGGAAGCCGCACGTCTCACTAGTACCCTCGCAGACGGACAGCGCCAGGGAGCAATGGCAGCGCGCCGACCGCGATGGGCTGTGGCCAATAGCGGCTGCTCAGC
AGGGCGCGCCGAGAGCAGCGGCCGGGAAGGGGCGGTGCGGGAGGCGGGGTGTGGGGCGGTAGTGTGGGCCCTGTTCCTGCCCGCGCGGTGTTCCGCATTCTGCAAGCCTCCGGAGCGCACGTCGGCAGTCGGCTCCCTCGTTGACCGAATCACCGACCTCTCTCCCCAGTGGCTAACTAGAGAACCCACTGCTTACTGGCTTATCGAAATTAATACGACTCACTATAGGGAGACCCAAGCTGGCTAGCGTTTAAACTTAAGCTTGGCCGCCACCATGTGGACTCTCGGGCGCCGCGCAGTAGCCGGCCTCCTGGCGTCACCCAGCCCGGCCCAGGCCCAGACCCTCACCCGGGTCCCGCGGCCGGCAGAGTTGGCCCCACTCTGCGGCCGCCGTGGCCTGCGCACCGACATCGATGCGACCTGCACGCCCCGCCGCGCAAGTTCGAACCAGAGAGGTCTCAACCAGATTTGGAATGTCAAAAAGCAGAGTGTCTATTTGATGAATTTGAGGAAATCTGGAACTTTGGGCCACCCAGGCTCTCTAGATGAGACCACCTATGAAAGACTAGCAGAGGAAACGCTGGACTCTTTAGCAGAGTTTTTTGAAGACCTTGCAGACAAGCCATACACGTTTGAGGACTATGATGTCTCCTTTGGGAGTGGTGTCTTAACTGTCAAACTGGGTGGAGATCTAGGAACCTATGTGATCAACAAGCAGACGCCAAACAAGCAAATCTGGCTATCTTCTCCATCCAGTGGACCTAAGCGTTATGACTGGACTGGGAAAAACTGGGTGTACTCCCACGACGGCGTGTCCCTCCATGAGCTGCTGGCCGCAGAGCTCACTAAAGCCTTAAAAACCAAACTGGACTTGTCTTCCTTGGCCTATTCCGGAAAAGATGCTTTGCCCACCTAGGGATCGGATCCCCGGGTACCGAGCTCGAATTCTGCAGATATCCAGCACACTTTGCCTTTCTCTCCACAGGTGTCGACAATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTGGAATTCGAGCTCGGTACGATCAGCTGATCAGCCTCGACTGTGCCTTCTAGTTGCCAGCCATCTGTTGTTTGCCCCTCCCCCGTGCCTTCCTTGACCCTGGAAGGTGCCACTCCCACTGTCCTTTCCTAATAAAATGAGGAAATTGCATCGCATTGTCTGAGTAGGTGTCATTCTATTCTGGGGGGTGGGGTGGGGCAGGACAGCAAGGGGGAGGATTGGGAAGACAATAGCAGGCATGCTGGGGATGCGGTGGGCTCTATGGCTGGCGCGCTCGCTCGCTCACTGAGGCCGCCCGGGCAAAGCCCGGGCGTCGGGCGACCTTTGGTCGCCCGGCCTCAGTGAGCGAGCGAGCGCGCAGAGAGGGAGTGGCCAACTCCATCACTAGGGGTTCCT
第2の態様では、本発明は、(i)フラタキシンをコードする核酸配列と、(ii)PGKプロモーターと、(iii)WPREとを含む核酸であって、(ii)及び(iii)が(i)に作動可能に連結し、(i)の発現を調節する、核酸を提供する。
第3の態様では、本発明は、上述の実施形態のいずれか1つによる核酸と、細菌細胞におけるクローニングベクターの複製を促進する付加的な核酸エレメントとを含むクローニングベクターを提供する。
、及び選択可能なマーカーの存在を伴う、クローニングに適した任意のベクターを指す。
第4の態様では、本発明は、上述の実施形態のいずれか1つによる核酸と、AAVベクター、好ましくはAAV-9ベクターへのトランスファーベクターの組込み又は転位を促進する付加的な核酸エレメントとを含むトランスファーベクターを提供する。
第5の態様では、本発明は、上述の実施形態のいずれか1つによるAAVベクターの作製への本発明の核酸、本発明のクローニングベクター又は本発明のトランスファーベクターの使用を提供する。
第6の態様では、本発明は、本発明のAAVベクター又は本発明の核酸と薬学的に許容可能な担体又は希釈剤とを含む医薬組成物を提供する。
ール、ソルビトール及びマンニトール等のポリオール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、プルロニック(登録商標)類及びそれらの組み合わせが挙げられる。医薬組成物に添加される凍結乾燥保護剤の量は一般に、医薬組成物が凍結乾燥されたときに、許容することができない株の分解をもたらさない量である。
れるようなその他の薬学的に許容可能な担体、賦形剤又は安定剤が本明細書に記載される医薬組成物中に含まれていてもよいが、但し、それらは医薬組成物の所望の特性に悪影響を及ぼさないものとする。本明細書で使用される場合に、「薬学的に許容可能な担体」は、医薬品投与と適合可能な任意の全ての溶剤、分散媒、コーティング剤、抗細菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤を意味する。医薬品作用物質用のそのような媒体及び作用物質の使用は、当該技術分野でよく知られている。許容可能な担体、賦形剤又は安定剤は、使用される投与量及び濃度で、レシピエントに対して非毒性であり、追加の緩衝剤、保存剤、共溶媒、アスコルビン酸及びメチオニンを含む酸化防止剤、EDTA等のキレート化剤、金属複合体(例えば、Zn-タンパク質複合体)、ポリエステル類等の生分解性ポリマー、ナトリウム、多価糖アルコール等の塩形成対イオン、アラニン、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、リジン、オルニチン、ロイシン、2-フェニルアラニン、グルタミン酸及びトレオニン等のアミノ酸、ラクチトール、スタキオース、マンノース、ソルボース、キシロース、リボース、リビトール、ミオイニシトース、ミオイニシトール、ガラクトース、ガラクチトール、グリセロール、シクリトール(例えば、イノシトール)、ポリエチレングリコール等の有機糖類又は糖アルコール、尿素、グルタチオン、チオクト酸、チオグリコール酸ナトリウム、チオグリセロール、α-モノチオグリセロール及びチオ硫酸ナトリウム等の硫黄含有還元剤、ヒト血清アルブミン、ウシ血清アルブミン、ゼラチン又は他の免疫グロブリン等の低分子量タンパク質並びにポリビニルピロリドン等の親水性ポリマーを含む。
止剤、安定剤及び薬学的に許容可能な担体を更に含んでいてもよい。エアロゾル投与については、医薬組成物は概して、界面活性剤及び噴射剤と共に微粉化形態で供給される。界面活性剤は、当然ながら非毒性でなくてはならず、概して噴射剤に可溶である。かかる作用物質の代表的なものは、カプロン酸、オクタン酸、ラウリン酸、パルミチン酸、ステアリン酸、リノール酸、リノレン酸、オレステリン(olesteric)酸及びオレイン酸等の6
個~22個の炭素原子を含有する脂肪酸と脂肪族多価アルコール又はその環状無水物とのエステル又は部分エステルである。混合又は天然グリセリド等の混合エステルを用いることができる。例えば鼻腔内送達用のレシチンのように、担体が必要に応じて含まれていてもよい。坐剤については、従来の結合剤及び担体は、例えばポリアルカレン(polyalkalene)グリコール又はトリグリセリドを含み得る。
第7の態様では、本発明は、薬剤として使用される本発明のAAVベクター、本発明の核酸又は本発明の医薬組成物を提供する。第8の態様では、本発明は、フリードライヒ運動失調症の治療に使用される本発明のAAVベクター、本発明の核酸又は本発明の医薬組成物を提供する。
ヒトフラタキシン(hFXN)のアイソフォーム1のコード配列をヘマグルチニンタグ(HA)と融合させ、In-Fusion(商標) HD Cloning Kit(Clontech)を用いてpcDNA3.1発現ベクターにクローニングした。この融合系を全てのクローニング工程に使用した。CMV、又はシナプシン(phSYN)、ニューロン特異的エノラーゼ(phNSE)、1255bpのFXNプロモーター(phFXN1255)若しくはヒトホスホグリセリン酸キナーゼアイソフォーム1(phPGK1)のヒト(h)プロモーター(p)のいずれかとFXN遺伝子のコード領域とを融合させることで幾つかの構築物を生成した。3’末端のウッドチャック肝炎ウイルス応答エレメント(responsive element)(WPRE)配列に加えて、CMVエンハンサー及びコザック配列等の更なる調節エレメントを5’末端に付加した。これら全ての発現ベクターにより生成する構築物を表2に挙げる。
C)に置き換えることによってルシフェラーゼ発現を駆動するように生成した。これらのプラスミドを表3に挙げる。
pcDNA3.1-phPGK-kFXN-HA-WPRE及びpcDNA3.1-phPGK-kLUC-HA-WPREプラスミドの発現カセットを、組み換えAAV9ベクターのSnaBI-MfeI部位にクローニングした(rAAV9-phPGK1-F
XN-HA-WPREベクター及びrAAV9-phPGK-LUC-WPREベクター)。加えて、FXNコード配列を欠く対照nullベクターを生成した(AAV2/9-null)。3つ全ての構築物及びウイルス粒子は、Center of Animal Biotechnology and Gene Therapy(バルセロナ自治大学)のVector Production Unitで生成された。得ら
れる最終力価は、AAV9-phPGK-FXN-HA-WPREについては1.4×1013vg/ml、AAV9-phPGK-LUC-WPREについては9.8×1012vg/ml、AAV2/9-nullについては6×1012vg/mlであった。
1. 細胞培養、in vitro発現及びルシフェラーゼレポーターアッセイ
マウス神経芽細胞腫細胞(N2a)、ヒト神経芽細胞腫細胞(SH-SY5Y)及びヒト胎児腎臓(HEK 293)細胞を、10cm培養皿において10%ウシ胎仔血清(Sigma)、2mM グルタミン、50μg/mlペニシリン/ストレプトマイシン(Life technologies)を含有するダルベッコ変法イーグル培地(DMEM)中にて70%コンフルエンスで培養した。トランスフェクションを、N2a及びSH-SY5Y細胞についてはlipofectamine 2000(Life technologies)、HEK 293につい
てはリン酸カルシウムを用い、0.25μgのEGFPに加えて4μgのプラスミドDNA単独を用いて行った。トランスフェクション後に、培地をHEK細胞については新鮮DMEM培養培地、N2a及びSH-SY5Y細胞についてはNeurobasal、B27サプリメント、10μMレチノイン酸、2mMグルタミン、50μg/mlペニシリン/ストレプトマイシンに置き換えた。細胞培養培地交換の48時間後に、表2に挙げる発現プラスミドがトランスフェクトされた細胞を採取し、更に使用するまで-80℃で保管した。ルシフェラーゼレポーターアッセイについては、表3に挙げるプラスミドを上述のようにトランスフェクトし、細胞を384ウェルプレートに再プレーティングし、ルシフェラーゼ活性を、デュアルルシフェラーゼレポーターアッセイキットを製造業者(Promega)の使用説明書の通りに使用して決定した。
タンパク質をRIPA溶解バッファー:10mM Tris-HCl(pH7.4)、140mM NaCl、0.1%デオキシコール酸ナトリウム、1%Triton X-100、1%SDS、2mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)、25mMフッ化ナトリウム(NaF)、2.5mM NaVO3及びタンパク質阻害剤カクテル(Roche)中
でのホモジナイズにより培養細胞から抽出した。タンパク質濃度を、DC-BioRadプロテインアッセイ(BioRad)を用いて決定した。全タンパク質抽出物を、1mM DTTを含有する4X Protein Sample Loading Buffer(Li-Cor Biosciences)と混合し、一定の20mAにて15%アクリルアミドゲル上での電気泳動によって分離した後、PVDF膜に転写した。使用した一次抗体は、抗FXN PAC 2518(Grazia Isaya博士(Mayo Clinic、ミネソタ州ロチェスター)の厚意によ
る寄贈)、抗FXN(1G2、Merck Millipore)、抗HAタグ(クローン16B12、
MMS-101P、Covance)及び抗βアクチン(AC15、Sigma)であった。赤外色素コンジュゲート二次抗体は、抗マウスIRDye-800CW及び抗ウサギIRDye 700CW(Li-Cor Biosciences)であり、免疫反応性を、Odyssey分析ソフトウェアv2.1(Li-Cor Biosciences)を用いて検出した。
図1~図5、並びに表2及び表3に見ることができるように、hPGK1プロモーター、リンカー配列(長さ及び含量)及びWPREを含む構築物の供給により、細胞におけるフラタキシンの発現が可能であった。ヒトPGK1プロモーターは、生理学的に適切な組織において発現される、代謝的に調節されるプロモーターであるため、フラタキシンのプロモーターとして有力な候補である。しかしながら、フラタキシンコード配列を発現する
ことを可能にするために使用される調節エレメント又はリンカーの配列/長さは、不明であった。エレメント及び配列の種々の組合せを試みることで、本発明者らの結果から、約105ntの長さを有する構築物がFXN発現を可能にするが、35nt前後のリンカー長では、WPRE RNA安定化配列(stabilizer sequence)を付加したとしてもFX
N発現が可能でないことから、ヒトフラタキシンコード配列からのタンパク質発現が、hPGK1プロモーターとFXNコード配列との間に操作上機能的なリンカーを組み入れることを必要とすることが示される。興味深いことに、このリンカーの要求は、試験した他のプロモーター(すなわち、hSYN)ではなく、hPGK1プロモーターを使用した場合にのみ顕著であった。さらに、このベクターからのフラタキシンタンパク質のレベルは、WPRE配列の非存在下であっても、CMV又はCAGプロモーター駆動性ベクターから得られたものよりもはるかに低く、内因性レベルにより匹敵する。以前のアプローチの制限の1つは、フラタキシン発現を得ることを可能にするために、CAG又はCMVプロモーター等の高駆動プロモーターが使用されており、細胞ストレスを引き起こし、予防効果の一部を無効にする可能性がある、非常に高レベルのタンパク質発現をもたらすことである。本明細書に提示されるベクターは、関連する神経系及び末梢組織において生理学的に機能的な範囲内の量でフラタキシンタンパク質の発現を駆動することが可能である。
1. 動物
本研究に使用した、Pookらによって開発されたフリードライヒ運動失調症マウスモデルYG8R(Pook et al. 2001. Neurogenetics. 3(4):185-93、Virmouni et al., 2014. PLoS ONE. 9(9):e107416)は、Jackson Laboratoriesのリポジトリから入手した(ストッ
ク番号012253)。このヒトFXNトランスジェニックマウスモデルは、内因性マウスフラタキシン遺伝子のノックアウト(Fxn-/-)であり、ファウンダーYG8(およそ82個及び190個のGAAトリヌクレオチド配列反復を有するヒトFXN遺伝子の2つのタンデムコピーを保有する)に由来するヒトFXN YAC導入遺伝子を有する。マウスをNexGen Mouse IVCケージ(Allentown、ニュージャージー州)
内で12時間の明暗サイクルを用い、陰圧、温度及び湿度を制御し、水及び照射齧歯類固形飼料Teklad global 18% protein(Envigo)を自由に与えながらSPF様条件で飼育した。YG8Rマウスコロニーは、The Institute for Health Science Research Germans Trias i Pujol(IGTP)で作り出された。雌性及び雄性ヘ
ミ接合YG8R(Tg/-)、並びにWT C57Bl/6マウスを全実験に使用した。
導入遺伝子コピー数を、SYBR Premix Ex Taq II(Tli RNase H Plus)(タカラバイオ株式会社)、及びヒトフラタキシン導入遺伝子用の以下のプライマー:hFXN_Tg_FW:5’-GAAC-TTCAAATTAGTTCCCCTTTCTTC-3’(配列番号7)、hFXN_Tg_RV:5’-CACAGCCAT-TCTTTGGGTTTC-3’(配列番号8)、及び内部対照アポリポタンパク質B-100アイソフォームX1:IC_FW:5’-CACGTGGGCTCCAGCATT-3’(配列番号9)、IC_RV:TCACCAGTCATTTCTGCCTTTG(配列番号10)を使用するLightCycler(商標) 480 Instrument(Roche)での定量リアルタイムPCR(qPCR)を用いて決定した
。アッセイを95℃で5分間、95℃で20秒間及び60℃で30秒間、72℃で30秒間の40サイクル、最後に72℃で2分間の1サイクルの熱サイクル条件を用いて行った。サンプルを関心の各遺伝子について三連でアッセイし、導入遺伝子のレベルをCt(ΔΔCt)法によって決定した。導入遺伝子コピー数を、既知のコピー数を有する対照サンプルのCtデータと比較して推定した。GAA反復長をLA taq(Invitrogen)、並びに以下のプライマー:GAA-F:5’-GGGATTGGTT-GCCAGTGCTT-AAAAGTTAG-3’(配列番号11)及びGAA-R:5’-GATCTAAGGACCATCATGG-CCACACTTGCC-3’(配列番号12)を使用するGAA PCR増幅PCRによって決定した。PCR産物を100Vで3時間の電気泳動
によって1.5%アガロースゲル中で分離し、バンドサイズを分析した。次いで、GAA反復の数をPCR産物のサイズから451bp(隣接する非反復DNA)を差し引き、残りの塩基対反復サイズを3で割ることによって決定した。
YG8Rヘミ接合及びWT 10週齢マウスをケタミン(10mg/kg(体重);Imalgene 500;Rhone-Merieux、フランス、リヨン)及びキシラジン(1mg
/kg(体重);Rompun;Bayer)の腹腔内注射によって麻酔した。AAV9-p
hPGK-FXN-HA-WPRE、AAV9-phPGK-LUC-WPRE又はAAV2/9-nullの髄腔内投与を腰部に行った。傍脊椎筋の切開による脊椎側面の露出後に、ウイルスベクターを33ゲージ針及びハミルトンシリンジにより腰椎L3及びL4の間でCSF中にゆっくりと注射した。髄腔への適切なアクセスは、動物の尾部の動きによって確認された。その後、筋肉及び皮膚を縫合した。各マウスへの種々のウイルスベクターの投与量は、4.6×10-12vg/kg(マウス体重)であった。
AAV9-phPGK-LUC-WPREベクターの生体内分布のin vivo評価のために、10週齢(2.5ヶ月齢)で、また150mg/kg(マウス体重)のD-ルシフェリン基質溶液の単回腹腔内注射を行った3.5ヶ月後にマウスにベクターを髄腔内投与した。マウスを基質投与の15分後に吸入麻酔(導入には4%、維持には2%のイソフルラン)によって麻酔した。麻酔マウスをPerkin Elmer Ivis Lumina II(Caliper Life Sciences、ドイツ)の暗チャンバー内に維持し、光子放
出を記録した。画像を1分間の積分時間、12.5cmの視野を用いてLivingイメージングソフトウェア(Xenogen Corporation、米国、カリフォルニア州)で分析した。
ex vivo評価のために、マウスの組織及び器官を基質投与の15分後に摘出した。組織及び器官を透明皿に入れ、上記のようなLivingイメージングソフトウェア(Xenogen Corporation、米国、カリフォルニア州)を用いて画像を取り込んだ。結果は図6
に見ることができる。
RNAを30mgの新鮮凍結マウス組織からRNeasy Mini Kit(Qiagen)を用いて抽出した。RNAのRIN及び定量化をAgilent 2200 TapeStation(Agilent)で得た。RNAを37℃で15分間、85℃で5秒間の温度
条件でPrimeScript(商標) RT reagent Kit(タカラバイオ株式会社)を用いてcDNA(25ng/μl)に逆転写した(retrotranscribed)。qRT-PCRをマウス組織に由来するcDNAを用いて行い、フラタキシン発現のレベルをマルチウェルプレートフォーマットでLightCycler480機器(Roche Diagnostics)を用いて試験した。反応混合物は0.1mMの各プライマー、10ngのcD
NA及び5μlのTaqMan Universal Master Mix II、UNGなし(Thermofisher Scientific)からなる10μlの総量を有していた。ヒトフラ
タキシン検出のためのプライマー-プローブは、Bio-radによって設計済みであり(dH
saCPE5031641、Bio-rad)、マウスサンプル用のβ-2ミクログロブリン(
B2m)ハウスキーピング遺伝子のプライマーは、IDTによって設計済みであった(Mm
.PT.39a.22214835;IDT)。アッセイは50℃で2分間、95℃で10
分間、95℃で15秒間及び60℃で1分間の40サイクルの熱サイクル条件で行った。サンプを関心の各遺伝子について三連でアッセイし、レベルをCt(ΔΔCt)法によって決定した。結果は図7に見ることができる。
タンパク質をRIPA溶解バッファー:10mM Tris-HCl(pH7.4)、140mM NaCl、0.1%デオキシコール酸ナトリウム、1%Triton X-100、1%SDS、2mMエチレンジアミン四酢酸(EDTA)、25mMフッ化ナトリウム(NaF)、2.5mM NaVO3及びタンパク質阻害剤カクテル(Roche)中
でのホモジナイズによりマウス組織から抽出した。タンパク質濃度を、DC-BioRadプロテインアッセイ(BioRad)を用いて決定した。全タンパク質抽出物を、1mM DTTを含有する4X Protein Sample Loading Buffer(Li-Cor Biosciences)と混合し、一定の20mAにて15%アクリルアミドゲル上での電気泳動によって分離した後、PVDF膜に転写した。使用した一次抗体は、抗FXN PAC 2518(Grazia Isaya博士(Mayo Clinic,Rochester MN)の厚意による寄贈)
、抗FXN(1G2、Merck Millipore)、抗HAタグ(クローン16B12、MMS-
101P、Covance)及び抗βアクチン(AC15、Sigma)であった。赤外色素コンジュゲート二次抗体は、抗マウスIRDye-800CW及び抗ウサギIRDye 700CW(Li-Cor Biosciences)であり、免疫反応性を、Odyssey分析ソフトウェアv2.1(Li-Cor Biosciences)を用いて検出した。結果は図8に見ることができる。
後肢の組みは、多数の神経変性マウスモデルにおいて疾患進行のマーカーであることが示されている。各マウスを、尾を持って周囲のあらゆる物体から離して持ち上げた。後肢の位置を10秒間観察し、以下のようにスコアリングした。後肢が常に腹部から離れて外向きに開いていた場合、スコア0を割り当てる。ぶら下げた時間の50%を超えて一方の後肢が腹部に向かって引っ込められていた場合、スコア1が付けられる。ぶら下げた時間の50%を超えて両方の後肢が腹部に向かって部分的に引っ込められていた場合、スコア2が付けられる。ぶら下げた時間の50%を超えて後肢が完全に引っ込められ、腹部に触れていた場合、スコア3が付けられる。マウスにおける足組み反射を4ヶ月齢から2ヶ月に一度評定した。結果は図9に見ることができる。
マウス尾部の尾神経における振幅(μV)及び神経伝導速度(m/s)を測定した。吸入麻酔(イソフルラン2%)下の動物について、刺激電極針を4つの異なる刺激点(尾端から1cm、2cm、3cm、4cm)で皮下に位置付け、登録針点を尾端から6cmに固定した。値をMedelec Synergy装置(Viasys、米国)の2つのチャンネルを用いてEMG/PE N-EPで記録した。電気生理学的試験中に、動物の皮膚温は32℃超に維持した。マウスを4ヶ月齢から2ヶ月に一度評定した。結果は図10に見ることができる。
本発明者らは、提示のAAV処理が、生理学的に適切な組織において生理学的に適切なレベルで発現され、内因性タンパク質と同様のプロセシングを示し、FRDAのマウスモデル(YG8R)において罹患ニューロンの電気生理学的性質、及び神経症状を大幅に改善し得ることから、FRDAの治療として効果的であることを提唱する。AAV9-hPGK1-FXNベクター中のFXNと同じ調節エレメント下のAAV9ベクター中のルシフェラーゼ遺伝子が髄腔内注射した場合に脊髄、脳全体、更には末梢組織において発現されることが図6に示される。また、同じベクター及び調節エレメント下のルシフェラーゼの発現は、注射後少なくとも7ヶ月前後にわたって一貫したままである(データは示さない)。フラタキシンレベルの低下が全てではないにしても殆どのFRDAの症状の根底にあり、25%以上のフラタキシンレベルを発現する突然変異を保有する個体がFRDAの症状を示さないことから、FXN発現の僅かな増加によりFRDA患者における症状を阻
止するか又は大幅に改善することが可能であるはずである。しかしながら、非常に高レベルのFXN発現又は任意の他のタンパク質は、細胞効果を誘導し、最終的に阻止効果を弱め、又は更には症状を悪化させる可能性がある。したがって、内因性FXNタンパク質と可能な限り同様のレベルをもたらすFXN発現ベクターを開発することに関心が寄せられる。したがって、本発明者らは、代謝的に調節されるプロモーター下で生理学的に適切なレベルでのFXNの発現を可能にするベクター(AAV9-hPGK1-FXNベクター)を開発し、10週齢のYG8Rヘミ接合マウス(Tg/-)の髄腔内に送達した。非注射マウスと比較してより高レベルのFXN mRNAが、YG8Rヘミ接合マウス(Tg/-)において肝臓と脊髄の胸部との両方でAAV9-PGK1-FXNベクターの髄腔内注射の3.5ヶ月後に検出された(それぞれ0.5倍及び2倍;図7)。これらは、ヘミ接合YG8Rマウスと比較して、脊髄でそれぞれ0.5倍及び3倍を示したホモ接合YG8Rマウスにおいて同じか又はより低かった。これにより、L3-L4髄腔内領域に注射したこのFXNコードベクターが取り込まれ、逆行性輸送によって又は髄液を介して拡散することで胸髄ニューロンにおいて発現されることが示される。本発明者らは、髄腔内投与したAAV9ベクターが血液脳関門を通過し、肝臓、心臓等の末梢組織に到達することも可能であり(図6)、注射したベクターからhFXN mRNAを発現することが可能である(図7)ことにも注目した。
(1cm~4cm)で、4ヶ月齢(処理の1.5ヶ月後)ではnullベクターで処理したWT、又はnull及びAAV-FXNで処理したYG8Rヘミ接合マウスの間に有意差が認められなかったことが図10に示される。しかしながら、6ヶ月齢からは、AAV9-null処理YG8R(Tg/-)マウスが振幅の有意な減少を示した一方で、AAV9-FXN処理マウスは、13ヶ月齢(処理の9.5ヶ月後)になってもWTマウスによりよく似ていた。速度の変化は認められなかった(データは示さない)。これらのデータから、AAV-hPGK1-FXNベクターでの処理が、おそらくは罹患ニューロンからの軸索の喪失を防ぐことによって、YG8Rマウスにおいて尾神経の機能を保持することができたことが示される。
Claims (15)
- 核酸を含むアデノ随伴ウイルス(AAV)ベクターであって、該核酸が、
(i)フラタキシンをコードする核酸配列と、
(ii)ホスホグリセリン酸キナーゼ(PGK)プロモーターと、
(iii)ウッドチャック肝炎ウイルス転写後調節エレメント(WPRE)と、
を含み、(ii)及び(iii)が(i)に作動可能に連結し、(i)の発現を調節し、(i)と(ii)との間に操作上機能的なリンカーが存在し、該リンカーが配列番号6、又は配列番号6と少なくとも95%同一の配列からなる、ベクター。 - 前記リンカーが配列番号6からなる、請求項1に記載のベクター。
- 前記PGKプロモーターが配列番号1を含む、請求項1又は2に記載のベクター。
- 前記WPREが配列番号2を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載のベクター。
- 前記フラタキシンをコードする核酸配列が配列番号3、又は配列番号3と少なくとも90%同一であり、フラタキシンの機能的変異体である配列を含む、請求項1~4のいずれか一項に記載のベクター。
- (i)、(ii)、(iii)及び前記リンカーを含む前記核酸の配列が配列番号4、又は配列番号4と少なくとも98%同一の配列からなる、請求項1に記載のベクター。
- 前記AAVベクターがAAV血清型9ベクターである、請求項1~6のいずれか一項に記載のベクター。
- (i)、(ii)、(iii)及び前記リンカーを含む前記核酸の配列が配列番号4からなり、前記AAVベクターがAAV血清型9ベクターである、請求項1に記載のベクター。
- (i)フラタキシンをコードする核酸配列と、
(ii)PGKプロモーターと、
(iii)WPREと、
を含む核酸であって、(ii)及び(iii)が(i)に作動可能に連結し、(i)の発現を調節し、(i)と(ii)との間に操作上機能的なリンカーが存在し、該リンカーが配列番号6、又は配列番号6と少なくとも95%同一の配列からなる、核酸。 - (i)、(ii)、(iii)及び前記リンカーを含む前記核酸の配列が配列番号4、又は配列番号4と少なくとも98%同一の配列である、請求項9に記載の核酸。
- 請求項9又は10に記載の核酸と、AAVベクター、好ましくはAAV-9ベクターへのトランスファーベクターの組込み又は転位を促進する付加的な核酸エレメントとを含むトランスファーベクター。
- 請求項1~8のいずれか一項に記載のAAVベクターの作製のための請求項9又は10に記載の核酸、請求項11に記載のトランスファーベクターの使用。
- 請求項1~8のいずれか一項に記載のAAVベクターと、薬学的に許容可能な担体又は希釈剤とを含む医薬組成物。
- 医薬として用いられる、請求項1~8のいずれか一項に記載のAAVベクター。
- フリードライヒ運動失調症の治療のために用いられる、請求項1~8のいずれか一項に記載のAAVベクター。
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