JP2022095666A - 感染症を治療するステープル化細胞内ターゲティング抗微生物ペプチド - Google Patents

感染症を治療するステープル化細胞内ターゲティング抗微生物ペプチド Download PDF

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Abstract

【課題】微生物細胞膜を介して微生物細胞の内部に移行して生物学的活性を発揮する能力を有する、構造的に安定化されたペプチド、および微生物によって引き起こされる感染症の処置方法を提供する。【解決手段】式：JPEG2022095666000054.jpg4691［式中、Ｒ１およびＲ２は、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキルであり；Ｒ３は、アルキレン、アルケニレンまたはアルキニレンであり；各ｘは１から１０であり；各ｗおよびｙは１から２０であり；ｚは１から１０であり；各Ｘａａはアミノ酸である］を有する化合物による。【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本願は、２０１６年２月２９日も出願された米国仮出願第６２／３０１,４２６号の利益を主張する（その記載内容は、出典明示によりその全体として本明細書の一部を構成する）。
技術の分野
本開示は、細胞内ターゲティング抗微生物ペプチドの構造安定化、ならびに細菌性および他の病原性感染症を治療するために該ペプチドを使用する方法に関する。
抗生物質スーパー耐性菌の増加は、世界中の医療システムにとって大きな脅威である。米国単独で、疾病管理予防センター（Centers for Disease Control and Prevention）（ＣＤＣ）は、抗生物質耐性感染症に起因する医療費が年間２００億ドルになると推定している[1]（非特許文献１）。ここ１０年間にわたって抗生物質のパイプラインは枯渇しており、耐性感染症に対処するために我々の抗生物質の在庫を補充する薬物候補はごくわずかである[2～4]（非特許文献２～非特許文献４）。加えて、規制ハードル、ならびに製薬およびバイオテクノロジー企業が抗生物質の研究に投資することに対する低い奨励金に起因して、抗生物質発見の負担は、学術研究センターおよび病院にかかってきている[5～6]（非特許文献５、非特許文献６）。これらの出来事は、新規薬剤を開発する会社への多額の奨励金を導入し、有望な抗生物質候補の医薬品承認プロセスの処理速度を上げる、米国抗生物質開発奨励法（U.S. Generating Antibiotic Incentives Act）および革新的医薬品イニシアティブ・悪玉耐性菌に対する新薬（Innovative Medicines Initiative New Drugs for Bad Bugs）などの新たな政府の取り組みにつながっている[2]（非特許文献２）。さらにまた、オバマ政権は、近年、抗生物質耐性激増に対する監視の強化および抗生物質創薬への投資に１２億ドルを割り当てた。
このような構想は正しい方向への重要なステップであるが、抗生物質創薬技術における革新の必要性は、薬物パイプラインに新しい候補を補充するために非常に重要である。伝統的な創薬技術は、これまで非常に我々の役に立ってきた；しかしながら、細菌耐性は経時的に進化してきているので、これらの技術は、次第に時代遅れとなってきている。現在、バクテリオファージ療法およびワクチン接種のような代替治療オプションが大いに探究されており、抗生物質耐性の負担の軽減に役立つ可能性があり、その有病率の低下にさえ役立つ可能性がある[7～10]（非特許文献７～非特許文献１０）。それにもかかわらず、新規抗生物質を緊急に必要としている患者のベッドサイドにこのような治療法が届くまでには多くの研究開発が必要である。他の治療オプションも研究されていて進んでいるが、微生物感染症に使用できる最も有効で信頼性のある治療手法は抗生物質である。かくして、それらの継続的な開発は極めて重要なものであり、候補を開発することができる天然化合物の新しいリザーバーの必要性も極めて重要である。１つの有効なリザーバーは、抗微生物ペプチド（ＡＭＰ）と称される化合物群である。
ＡＭＰは、微生物侵入に対して（特に、体液性免疫応答の重要な要素として）不可欠な防衛線を形成する、進化的に保存されたクラスのタンパク質である[2]（非特許文献２）。これらのペプチドは、多くの異種生物によって生産され、細菌、真菌類および原生動物に対して、ならびにウイルスに対してさえも、広範囲の活性を呈することが見出されている。
ＡＭＰは、４つの主な構造群に分けることができる：４つのうち２つのジスルフィド架橋を有する安定化βシートペプチド；１つのジスルフィド架橋を有するループペプチド；αヘリックスペプチド；ならびにアルギニン、グリシン、プロリン、トリプトファンおよびヒスチジンにおいて豊富な拡張構造[2～4]（非特許文献２～非特許文献４）。典型的には１２～５０アミノ酸長であるこれらのペプチドは、通常、両親媒性特性を有するカチオンである。これらの生物物理学的特性により、それらが細菌膜と相互作用して、膜の完全性もしくは移行の破壊、および細胞内プロセスの破壊を生じる[3～5]（非特許文献３～非特許文献５）。ＡＭＰの他の特性としては、サイトカイン産生の増加、免疫細胞の活性化、および創傷治癒の促進などの種々のメカニズムを介する免疫系調節が挙げられる[6、7]（非特許文献６、非特許文献７）。
ある種のαヘリックスＡＭＰの膜溶解特性ならびに利用可能な膨大な量の構造的およびメカニズム的データに起因して、該αヘリックスＡＭＰに多くの焦点が課せられてきたが、他のファミリーのＡＭＰは、研究も特徴付けもされないままである。これらのあまり特徴付けられていないＡＭＰとしては、細胞内ターゲティング抗微生物ペプチド（Ｉ－ＴＡＭＰ）として知られている一群のＡＭＰが挙げられる。それらの膜を横切って移行する能力に起因して、このクラスのＡＭＰは、ＤＮＡ合成、タンパク質合成、シャペロン支援タンパク質（chaperone-assisted protein）フォールディング、酵素活性、および／または細胞壁合成の阻害を包含する、微生物細胞内部の種々の微生物プロセスを標的とすることができる[3、8]（非特許文献３、非特許文献８）。Ｉ－ＴＡＭＰは、魚類、軟体動物、昆虫、両生動物および哺乳動物において発見されている[3、9]（非特許文献３、非特許文献９）。しかしながら、高濃度ではほとんどのＡＭＰは溶解性となり、現行のモデル膜系はあまりに単純すぎるので、これらのＡＭＰを適切に特徴付けるのは困難であった[8]（非特許文献８）。
それにもかかわらず、ある種の細胞内ターゲティング抗微生物ペプチドは十分に研究されており、それらの作用モードに関してコンセンサスが得られている。このようなペプチドンの１つは、アジアヒキガエル（Asian toad）（Bufo bufo garagriozans）の胃組織から単離されたヒストン由来ＡＭＰ（Ｈ－ＤＡＭＰ）であるブフォリンＩＩである[13]（非特許文献１１）。マガイニンＩＩのような他の両生動物ＡＭＰとは異なって、ブフォリンＩＩは細菌膜の完全性を破壊しない。その代わり、ブフォリンＩＩは、細菌サイトゾルに移行し、ＤＮＡと結合し、転写を阻害することができる[10]（非特許文献１０）。それにもかかわらず、ブフォリンＩＩを包含するＩ－ＴＡＭＰの一般的に乏しい安定性および低い効力は、有効な医薬品としてのブフォリンＩＩおよび／または他のＩ－ＴＡＭＰの開発への関心を低下させ、それらを研究試薬としての使用に降格させた。
J.R.E.C.L.R.T.C.H.R.P.G.D.A.P.D.M.C. R Monina Klevens, Estimating Health Care-Associated Infections and Deaths in U.S. Hospitals, 2002, Public Health Reports. 122 (2007) 160. M. Zasloff, Antimicrobial peptides of multicellular organisms, Nature. 415 (2002) 389-395. doi:10.1038/415389a. K.A. Brogden, Antimicrobial peptides: pore formers or metabolic inhibitors in bacteria? Nat. Rev. Microbiol. 3 (2005) 238-250. doi:10.1038/nrmicro1098. C.D. Fjell, J.A. Hiss, R.E.W. Hancock, G. Schneider, Designing antimicrobial peptides: form follows function, Nat Rev Drug Discov. 11 (2011) 37-51. doi:10.1038/nrd3591. Y.J. Gordon, E.G. Romanowski, A.M. McDermott, A Review of Antimicrobial Peptides and Their Therapeutic Potential as Anti-Infective Drugs, Curr Eye Res. 30 (2005) 505-515. doi:10.1080/02713680590968637. S.C. Mansour, O.M. Pena, R.E.W. Hancock, Host defense peptides: front-line immunomodulators, Trends Immunol. 35 (2014) 443-450. doi:10.1016/j.it.2014.07.004. H.D. Thaker, A. Som, F. Ayaz, D. Lui, W. Pan, R.W. Scott, et al., Synthetic Mimics of Antimicrobial Peptides with Immunomodulatory Responses, J. Am. Chem. Soc. 134 (2012) 11088-11091. doi:10.1021/ja303304j. P. Shah, F.S.H. Hsiao, Y.H. Ho, C.S. Chen, The proteome targets of intracellular targeting antimicrobial peptides, Proteomics. (2015). doi:10.1002/pmic.201500380. P. Nicolas, Multifunctional host defense peptides: intracellular‐targeting antimicrobial peptides, FEBS Journal. 276 (2009) 6483-6496. doi:10.1111/j.1742-4658.2009.07359.x. G.S. Yi, C.B. Park, S.C. Kim, C. Cheong, Solution structure of an antimicrobial peptide buforin II, FEBS Letters. 398 (1996) 87-90. C.B. Park, K.S. Yi, K. Matsuzaki, M.S. Kim, S.C. Kim, Structure-activity analysis of buforin II, a histone H2A-derived antimicrobial peptide: The proline hinge is responsible for the cell-penetrating ability of buforin II, Proceedings of the National Academy of Sciences. 97 (2000) 8245-8250. doi:10.1073/pnas.150518097.
概要
本書は、全炭化水素ステープル（staple(s)）のＩ－ＴＡＭＰ配列への設置、それにより、増強された抗微生物活性を有していて、しかも、対象外の毒性が皆無かそれに近い化合物を生じることを記載している。ペプチドの炭化水素ステープリング（stapling）は、Ｉ－ＴＡＭＰの重要なサブコンポーネントのαヘリックス二次構造を反復し、それにより、それらの細菌内への移入を増強し、その結果として、細菌細胞の内部でのそれらの生物活性を増強する[14、15]。炭化水素ステープリングは、改善されたαヘリックス安定化に加えて、タンパク質分解抵抗性を増強し、それにより、しばしばインビボで急速分解の影響を受けやすい天然ペプチドと比べて改善された薬物動態特性を与える[16]。さらにまた、いくつかの実施態様において、本書のステープル化Ｉ－ＴＡＭＰは、溶解活性が全くないかもしくは最小であるか、または標的微生物細胞に対する細胞増殖阻害活性を有し得る。本開示は、炭化水素ステープリングをＩ－ＴＡＭＰ内の別々の配列に適用することにより、構造安定化、抗微生物活性の増強、および溶血活性の有意な低下をもたらすことを示している。
さらに詳しくは、本書は、式（Ｉ）
Figure 2022095666000001
 ［式中、
各Ｘａａは、独立して、アミノ酸であり；
各Ｒ1およびＲ2は、独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
各Ｒ3は、独立して、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
各Ｒ4は、独立して、－ＮＨ3または－ＯＨであり、ここで、各－ＮＨ3は、別の化学的要素（chemical entity）とカップリングしていてもよく；
各ｘは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
各ｗおよびｙは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０であり；
ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である］
を有する内部架橋（ＩＣＬ）微生物内細胞ターゲティング抗微生物ペプチド（intra-microbial cell targeting anti-microbial peptide）（Ｉ－ＴＡＭＰ）（ここで、該ペプチドは、少なくとも１つの微生物に対して細胞内抗微生物効果を示す）またはその薬学的に許容される塩を提供する。
いくつかの実施態様において、
各Ｒ1およびＲ2は、独立して、ＨまたはＣ1～Ｃ10アルキル、アルケニル、アルキニルであるか、または
各Ｒ3は、１～６個のＲ4で置換された、アルキレン、アルケニレンまたはアルキニレン（例えば、Ｃ8またはＣ11アルケニレン）であり；
各Ｒ4は、独立して、－ＮＨ3または－ＯＨであり、ここで、各－ＮＨ3は、ベンジル酸誘導体、酵素阻害剤、炭水化物基、ヒドロキシル基、ホスフェート基、ファルネシル基、イソファルネシル基、脂肪酸基、またはコンジュゲーション（conjugation）もしくは官能基化（functionalization）のためのリンカーなどの化学的要素とカップリングしていてもよく；
ｘは、２、３または６であり、Ｒ3は、対応する親非内部架橋ＡＭＰと比べて、少なくとも一対のアミノ酸の側鎖と置き換わり；
ｗおよびｙは、独立して、０～２０の整数であり；
ｚは、１～１０の整数（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０）であり）；
各Ｘａａは、独立して、アミノ酸（例えば、２０種類の天然アミノ酸または非天然アミノ酸のうちの１つ）であり、
ただし、ｘが２である場合、Ｒ3はＣ8アルキレン、アルケニレンまたはアルキニレンであり；ｘが３である場合、Ｒ3はＣ8アルキレン、アルケニレンまたはアルキニレンであり；ｘが６である場合、Ｒ3はＣ11アルキレン、アルケニレンまたはアルキニレンであり、ただし、ｘ、ｗおよびｙの合計は少なくとも１０であり、
したがって、該ＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰは、配列番号１～１３のうちいずれか１つの配列の少なくとも１０個の連続するアミノ酸、または１、２、３、４もしくは５個のアミノ酸置換を有するその変異体、または（ａ）対応する親非内部架橋ＡＭＰと比べて、この１０個の連続するアミノ酸内で、２、３または６アミノ酸離れている少なくとも一対（例えば、一対または二対）のアミノ酸の側鎖が、式Ｉに記載されている該アミノ酸対のα炭素を結合する連結基Ｒ3に置き換わっていること；および（ｂ）該アミノ酸対の第１のα炭素が式Ｉに記載されているようにＲ1で置換されており、該アミノ酸対の第２のα炭素が式Ｉに記載されているようにＲ2で置換されていることを除いては本書に記載の別のポリペプチド配列を含有する。Ｒ3は２個のＲ4で置換され得、該Ｒ4は－ＯＨであり得る。別法として、Ｒ3は、置換されていてもよい－ＮＨ3であり得、他方は－ＯＨである。
さらにまた、本書は、さらに、アミノ酸を含有する内部架橋（ＩＣＬ）微生物内細胞ターゲティング抗微生物ペプチド（Ｉ－ＴＡＭＰ）であって、２、３または６アミノ酸離れている少なくとも一対（例えば、一対または二対）のアミノ酸の側鎖が、対応する親非内部架橋ＡＭＰと比べて、
各Ｒ3が、独立して、１～６個のＲ4によって置換されていてもよい、アルキレン、アルケニレンまたはアルキニレン（例えば、Ｃ6、Ｃ7またはＣ11アルケニレン）であり；
各Ｒ4が、独立して、－ＮＨ3または－ＯＨであり、ここで、各－ＮＨ3が置換されていてもよく；各Ｒ1およびＲ2が、独立して、置換または非置換の、Ｃ1～Ｃ10アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキルまたはヘテロシクリルアルキルである
ような、一対のアミノ酸のα炭素を結合する連結基Ｒ3に置き換わっている、内部架橋（ＩＣＬ）微生物内細胞ターゲティング抗微生物ペプチド（Ｉ－ＴＡＭＰ）を提供する。
いくつかの実施態様において、該ＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰは、配列番号１～１３の少なくとも１０個の連続するアミノ酸、または１、２、３、４または５個のアミノ酸置換を有するその変異体、または（ａ）対応する親非内部架橋ＡＭＰと比べて、この１０個の連続するアミノ酸内で、２、３または６アミノ酸離れている少なくとも一対（例えば、一対または二対）のアミノ酸の側鎖が、該アミノ酸対のα炭素を結合する連結基Ｒ3に置き換わっていること、および連結基Ｒ3に置き換わった側鎖を有する各アミノ酸対のα炭素のＨが、独立して、Ｃ1～Ｃ10アルキル、アルケニルまたはアルキニルによって置き換わっていてもよいことを除いては本書に記載の別のポリペプチド配列を含有する。このペプチドは、配列番号７の少なくとも１０個の連続するアミノ酸を含有する。
上記のＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰのどちらかは、配列番号１４～６０のうちいずれか１つの配列を含有することができる。それらは、例えば、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)２、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)３、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)４、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)６、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)７、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)８、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)１１、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)１、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)２、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)３、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)４、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)５、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)６、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)７、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)８、またはＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)９の配列を含有することができる。ある場合には、上記のＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰは、配列番号４３、４７または５５のうちいずれか１つの配列を含有することができる。
本書は、また、微生物感染の治療または予防方法であって、微生物性生物（microbial organism）が感染している対象体または微生物性生物が感染するリスクを有する対象体に、上記のＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰのいずれかの有効量を投与することを含む方法を特徴とする。該対象体は、動物または植物であり得る。該動物は、哺乳動物、例えば、ヒトであり得る。該微生物性生物は、細菌性生物（bacterial organism）、例えば、グラム陽性細菌性生物またはグラム陰性細菌性生物であり得る。該方法は、さらに、少なくとも１種類の抗生物質の有効量を投与することを含むことができる。該抗生物質は、ＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰと相乗的に作用して微生物性生物の感染を阻害または予防することができる。ＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰおよび抗生物質は相乗的に作用して抗生物質に対する耐性を克服または予防することができる。
本書の別の態様は、上記のＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰのいずれかの１つ以上を含有する組成物である。該組成物は、さらに、医療または衛生デバイスを含有することができる。この１つ以上のＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰは、医療または衛生デバイスを被覆すること、または該機器に含浸させることができる。該組成物は、また、１種類以上の抗生物質を含有することができる。
上記のＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰＳのいずれかの１つ以上と接触させることを含む、微生物性生物の増殖を阻害するかまたは微生物性生物を死滅させる方法もまた本書によって提供される。該微生物性生物は、細胞外微生物性生物または細胞内微生物性生物であり得る。この接触は、該微生物性生物を含む対象体において起こり得る。別法として、該方法は、インビトロ法であり得る。該方法は、本書に記載の特徴（例えば、微生物感染の治療または予防方法について上記したもの）のいずれかを用いて実行され得ると解される。
本書の別の特徴は、上記のＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰのいずれかの製造方法であって、ＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰが第１の表面疎水性パッチを含むαヘリックス領域を含み、連結基との置き換えが、対応する親非内部架橋Ｉ－ＴＡＭＰと比べて、内部架橋ペプチド上の該第１の疎水性パッチと１つ以上のさらなる表面疎水性パッチとの間の不連続性を維持するかまたは引き起こすようなＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰを合成することを含む方法である。この方法は、また、該連結基に加水分解修飾（hydrolyzing modification）、例えば、ジヒドロキシル化を付加することを包含し得る。
本書のさらに別の特徴は、上記のＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰのいずれかを設計する方法であって、
－ ＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰの１つ以上のパネルを作成すること（各パネルは、（ａ）２、３または６アミノ酸離れている少なくとも一対のアミノ酸の側鎖が、該アミノ酸対のα炭素を結合する連結基Ｒ3によって置き換えられており；（ｂ）各パネルの各メンバーにおいて、該アミノ酸対が、関連するパネルの他のメンバーと比べて異なる位置にある、複数のパネルメンバーＩＣＬ Ｉ－ＴＡＭＰを含有する）；および
－ （ｉ）関連するメンバーのαヘリックス領域における第１の表面疎水性パッチと、該メンバーのαヘリックス領域における１つ以上のさらなる表面疎水性パッチとの間の不連続性の存在について；および（ｉｉ）能力についての各パネルの各メンバーが微生物細胞中に移動する能力および哺乳動物細胞を溶解するかまたはその増殖を阻害する能力について、全てのパネルの各メンバーを試験すること
を含む方法である。該方法は、また、微生物細胞中に移動する能力が比較的高く、および／または哺乳動物細胞を溶解するかまたはその増殖を阻害する能力が比較的低い、全てのパネルの１つまたは複数のメンバーを製造することを含み得る。
本書で用いる場合、用語「約」および「およそ」とは、所定の値または状態の±１０％以内、好ましくは該値または状態の±５％以内であると定義される。
他に特記しない限り、本書で用いる技術用語及び科学用語はすべて、本発明が属する技術分野における当業者によって一般的に理解される意味と同じ意味を有する。方法および物質は、本発明において用いるために本書に記載される；当該技術分野で知られている他の好適な方法および物質を用いることもできる。物質、方法および実施例は、例示的であって、限定を意図するものではない。本書に記載の刊行物、特許出願、特許、配列、データベースエントリーおよび他の文献はすべて、出典明示によりその全体として本書の一部を構成する。矛盾する場合、定義を含む本明細書が支配する。
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明および図面、ならびに特許請求の範囲から明らかである。
図１は、ブフォリンＩＩおよび例示的ステープル化アナログの配列を示すチャートである。ステープル化誘導体の配列とともに整列したブフォリンＩＩ配列は、Ｘ,Ｘ対によって表されるｉ,ｉ＋４ステープルの位置、および８,Ｘ対によって表されるｉ,ｉ＋７ステープルの位置を示す。変異した他の残基は囲まれる。一番上から下まで挙げられた配列は、配列番号３７～６０および７に対応する。「８」は、(Ｒ)－２－(７'－オクテニル)アラニンである；「Ｘ」は、(Ｓ)－２－(４'－ペンテニル)アラニンである。 図２は、トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）の不在下および存在下におけるブフォリンＩＩおよびｉ,ｉ＋４ステープル化アナログの円偏光二色性（ＣＤ）スペクトルを示す。図２のパネルＡは、緩衝溶液中のブフォリンＩＩ（Ｆ１０Ｗ）およびｉ,ｉ＋４ステープル化アナログのＣＤスペクトルのグラフである。図２のパネルＢは、ＴＦＥ：緩衝液（１：１）混合物中のブフォリンＩＩ（Ｆ１０Ｗ）およびｉ,ｉ＋４ステープル化アナログのＣＤスペクトルのグラフである。 図３は、トリフルオロエタノール（ＴＦＥ）の不在下および存在下におけるブフォリンＩＩおよびｉ,ｉ＋７ステープル化アナログの円偏光二色性スペクトルを示す。図３のパネルＡは、緩衝溶液中のブフォリンＩＩ（Ｆ１０Ｗ）およびｉ,ｉ＋７ステープル化アナログのＣＤスペクトルのグラフである。図３のパネルＢは、ＴＦＥ：緩衝液（１：１）混合物中のブフォリンＩＩ（Ｆ１０Ｗ）およびｉ,ｉ＋７ステープル化アナログのＣＤスペクトルのグラフである。 図４のパネルＡは、さまざまな種類のステープルを作成するために使用した非天然アミノ酸の化学構造を示す。図４のパネルＢは、さまざまな長さのステープルを有するペプチドを例示する。図４のパネルＣは、ペプチド配列に沿ったステープルウォークを例示する。 図５は、例示的ステープルウォークとともに、さまざまな種類の二重および三重ステープリングストラテジーの表示を示す概略図である。 図６は、さまざまな長さの分岐した二重ステープル部分を用いて例示的ステープルウォークを示す概略図である。 図７は、ステープル化抗微生物ペプチド誘導体を作成するために用いた例示的化学的変化を示す概略図である。 図８は、ステープル化ブフォリンＩＩアナログの溶血性を示すグラフである。ステープル化ブフォリンＩＩアナログをリン酸緩衝液中にて１％ｖ／ｖヒト赤血球（ＲＢＣ）と一緒に３７℃で１時間インキュベートし、次いで、上清を回収し、５７０ｎｍのＵＶ吸光度を用いてヘモグロビン放出を測定した。ステープル化溶解性対照ペプチド（lytic control peptide）とは対照的に、ブフォリンＩＩアナログは、５０μｇ／ｍＬまでの全ての試験濃度で５％未満の溶血レベルを示した。
詳細な説明
Ｉ－ＴＡＭＰ配列は、微生物細胞内で抗微生物活性を達成する微生物細胞移動の独特な性質を有する。この開示は、治療法の開発のために抗微生物効力およびタンパク質分解安定性を最適化／最大化する構造的に安定化されたＩ－ＴＡＭＰの開発を報告する。このような構造安定化Ｉ－ＴＡＭＰは、溶解活性が全くないかもしくは最小限でなければならないか、またはターゲット微生物細胞に対して細胞増殖阻害活性を有しなければならないことが理解されるであろう。このようなドラッグ・リパーパシング（drug repurposing）は、メトトレキサートのようなＦＤＡ承認薬剤を選択的な抗微生物剤に変換するための別の非常に重要な道である。かくして、本発明は、Ｉ－ＴＡＭＰ構造を化学的に安定化すること、および治療カーゴ（therapeutic cargo）の細菌送達にそれらを適合させることによって、Ｉ－ＴＡＭＰを抗微生物剤として開発する際の従前の制限に取り組むものである。
概念実証として、本発明者らは、ブフォリンＩＩの配列に炭化水素ステープリングを適用した。ブフォリンＩＩ配列内の特定の位置で炭化水素ステープルをインストールすることによって、本発明者らは、例えば非修飾（親）ブフォリンＩＩ配列と比べて抗微生物活性の２００倍増大を包含する、効力の劇的な増大を達成した。これらの効力増強は、円偏光二色性分光法によって決定される構造安定化によって行われた。さらにまた、これらの活性増大は、必ずしも、ヒト赤血球に対する非特異的溶血活性の増大を伴うものではなかった。例えば、特定の例では、溶血活性は、細菌処理のための最小阻止濃度（ＭＩＣ）よりも１０倍高い濃度でのみ同定され、有意で広い治療域に光を当てる。
重要なことに、細菌膜通過を含むブフォリンＩＩの作用機序は、その他の点ではグラム陰性細菌の内部にアクセスすることができない抗生物質にブフォリンＩＩをリンクするキメラ化合物の開発を可能にする。さらにまた、Ｉ－ＴＡＭＰについて発見された特定のステープリングストラテジーは、このＡＭＰの細菌取り込み能力とインビボ適用のためのペプチドの安定性との両方を強化する。
本発明は、さらに、細胞内ＡＭＰが治療抵抗を克服するための新しい治療薬を可能にする可能性を利用する新規な機械を提供する。ブフォリンＩＩのようなＩ－ＴＡＭＰは、細菌の膜を横切って移動することによって細菌細胞内ターゲットに対して作用するので、ステープル化Ｉ－ＴＡＭＰは、細菌膜不浸透に起因して以前は有効ではなかった抗生物質のリパーパシングを可能にする、細菌の選択的ターゲティングのための新しい送達プラットフォームを提供する。例示的クラスのカーゴは、その他の点ではグラム陰性細菌の外膜によってブロックされるグラム陽性抗微生物剤、例えばβラクタム系薬剤である。さらなるクラスのカーゴとしては、例えば、その他の点ではヒト使用に有毒であるが選択的に細菌をターゲットとすることができる抗生物質、および細菌クロスターゲット（bacterial cross-target）を有する癌治療剤、例えば、メトトレキサートが挙げられる[19]。
魚由来のＩ－ＴＡＭＰ
本発明の原理および方法は、魚において抗微生物剤として機能する全てのＩ－ＴＡＭＰ（例えば、皮および／または腸分泌物におけるものを包含する）およびそのステープル化アナログに適用される。本願の例として、以下の配列および例示的ステープル化アナログを以下に記載する。以下に記載されたこれらの配列および他のすべてにおいて、「Ｘ」は、ステープルの位置を示す。該配列のうちいくつかは、Ｃ末端に「－ＮＨ2」を含有する；これは、Ｃ末端残基のアミド化を示す。

リューロシジン（Pleurocidin）（ヒラメ（winter flounder）由来）
Figure 2022095666000002


ヒポシン（Hipposin）（タイセイヨウオヒョウ（Atlantic halibut）由来）
Figure 2022095666000003


ヒマンチュリン（Himanturin）（Round Whip Ray, H. pastinacoides由来）
Figure 2022095666000004


ニジマスＨ２Ａ（Rainbow Trout H2A）（ニジマス（Oncorhynchus mykiss）由来）
Figure 2022095666000005
軟体動物由来のＩ－ＴＡＭＰ
本発明の原理および方法は、軟体動物において抗微生物剤として機能する全てのＩ－ＴＡＭＰ（例えば、皮および／または腸分泌物におけるものを包含する）およびそのステープル化アナログに適用される。本願の例として、以下の配列および例示的ステープル化アナログを以下に記載する。

アブヒシン（Abhisin）（アワビ（Haliotis discus）由来）
Figure 2022095666000006


ホタテガイＡＭＰ（Scallop AMP）（アズマニシキ（Chlamys farreri）由来）
Figure 2022095666000007
両生類由来のＩ－ＴＡＭＰ
本発明の原理および方法は、両生類において抗微生物剤として機能する全てのＩ－ＴＡＭＰ（例えば、分泌物におけるものを包含する）およびそのステープル化アナログに適用される。本願の例として、以下の配列および例示的ステープル化アナログを以下に記載する。

ブフォリン（アジアヒキガエル（Asian Toad Bufo garagrizans）由来の胃分泌物 － 以下の例はブフォリンＩＩである）
Figure 2022095666000008
哺乳動物由来のＩ－ＴＡＭＰ
本発明の原理および方法は、哺乳動物において抗微生物剤として機能する全てのＩ－ＴＡＭＰ（例えば、分泌物におけるものを包含する）およびそのステープル化アナログに適用される。本願の例として、以下の配列および例示的ステープル化アナログを以下に記載する。

ヒトヒストンＨ１切断型アナログ
Figure 2022095666000009


ヒスタチン５（Histatin 5）（ヒト由来）
Figure 2022095666000010
昆虫由来のＩ－ＴＡＭＰ
本発明の原理および方法は、昆虫において抗微生物剤として機能する全てのＩ－ＴＡＭＰ（例えば、皮および／または腸分泌物におけるものを包含する）およびそのステープル化アナログに適用される。本願の例として、以下の配列および例示的ステープル化アナログを以下に記載する。

ドロソシン（ショウジョウバエ由来）
Figure 2022095666000011


アピデシンＩＢ（ミツバチ由来）
Figure 2022095666000012
本開示は、内部（分子内）架橋（またはステープル）によって結合された少なくとも２つの修飾アミノ酸を含む（ここで、この少なくとも２つのアミノ酸は、２、３または６アミノ酸離れている）、抗細菌ペプチド（ＡＭＰ）に関連する構造的に安定化されたペプチド（ＡＭＰの安定化されたαヘリックスまたは安定化ＡＭＰもしくはＳＴＡＭＰと称される場合がある）を提供する。本書における安定化ペプチドとしては、２つのステープルを有するペプチドおよび／またはステッチ化（stitched）ペプチドを包含するステープル化ペプチドが挙げられる。本開示のこの構造安定化ペプチドは、一般的にＩ－ＴＡＭＰから誘導される。
例えば、いくつかの実施態様において、該化合物は、対応する非架橋ペプチドと比べて、円偏光二色性によって決定されるαヘリックス度が少なくとも１.２５倍、１.５倍、１.７５倍または２倍の増加を示す。いくつかの実施態様において、該化合物は、約１０％、約１５％、約２０％、約２５％、約３０％、約３５％、約４０％、約４５％、約５０％、約５５％、約６０％、約６５％、約７０％、約７５％、約８０％、約８５％、約９０％、約９５％または約１００％のヘリックス度を示す。
アミノ酸は、本書において当該ペプチドの基本単位である。用語「アミノ酸」とは、アミノ基およびカルボキシル基の両方ならびに側鎖を含有する分子をいう。本書に記載のペプチドへの組み込みに適したアミノ酸としては、天然αアミノ酸、例えばペプチドに見られる２０種類の一般的な天然αアミノ酸（例えば、Ａｌａ（Ａ）、Ａｒｇ（Ｒ）、Ａｓｎ（Ｎ）、Ｃｙｓ（Ｃ）、Ａｓｐ（Ｄ）、Ｇｌｎ（Ｑ）、Ｇｌｕ（Ｅ）、Ｇｌｙ（Ｇ）、Ｈｉｓ（Ｈ）、Ｉｌｅ（Ｉ）、Ｌｅｕ（Ｌ）、Ｌｙｓ（Ｋ）、Ｍｅｔ（Ｍ）、Ｐｈｅ（Ｆ）、Ｐｒｏ（Ｐ）、Ｓｅｒ（Ｓ）、Ｔｈｒ（Ｔ）、Ｔｒｐ（Ｗ）、Ｔｙｒ（Ｙ）、およびＶａｌ（Ｖ））のＤ異性体およびＬ異性体、非天然αアミノ酸（α,α－二置換およびＮ－アルキル化アミノ酸が挙げられるが、これらに限定されない）、天然βアミノ酸（例えば、βアラニン）、ならびに非天然βアミノ酸が挙げられるが、これらに限定されない。本発明のペプチドの構築に用いられるアミノ酸は、有機合成によって調製されることができるか、または、天然原料の分解もしくは天然原料からの単離のような他の経路によって得られることができる。
多くの公知の非天然アミノ酸が存在し、そのいずれも本発明のペプチドに含まれ得る。非天然アミノ酸のいくつかの非限定的な例は、４－ヒドロキシプロリン、デスモシン、γアミノ酪酸、βシアノアラニン、ノルバリン、４－(Ｅ)－ブテニル－４(Ｒ)－メチル－Ｎ－メチル－Ｌ－トレオニン、Ｎ－メチル－Ｌ－ロイシン、１－アミノ－シクロプロパンカルボン酸、１－アミノ－２－フェニル－シクロプロパンカルボン酸、１－アミノ－シクロブタンカルボン酸、４－アミノ－シクロペンテンカルボン酸、３－アミノ－シクロヘキサンカルボン酸、４－ピペリジル酢酸、４－アミノ－l－メチルピロール－２－カルボン酸、２,４－ジアミノ酪酸、２,３－ジアミノプロピオン酸、２,４－ジアミノ酪酸、２－アミノヘプタン二酸、４－(アミノメチル)安息香酸、４－アミノ安息香酸、オルト置換、メタ置換および／またはパラ置換フェニルアラニン（例えば、－Ｃ(＝Ｏ)Ｃ6Ｈ5；－ＣＦ3；－ＣＮ；－ハロ；－ＮＯ2；ＣＨ3で置換された）、二置換フェニルアラニン、置換チロシン（例えば、さらに、－Ｃ(＝Ｏ)Ｃ6Ｈ5；－ＣＦ3；－ＣＮ；－ハロ；－ＮＯ2；ＣＨ3で置換された）、ならびにスタチンである。加えて、アミノ酸は、数例を挙げると、ヒドロキシル化、リン酸化、スルホン化、アシル化およびグリコシル化されているアミノ酸残基を包含するように誘導体化され得る。
「ペプチド」または「ポリペプチド」は、ペプチド（アミド）結合によって一緒に結合されたアミノ酸残基のポリマーを含む。これらの用語は、本書で用いる場合、あらゆるサイズ、構造または機能を有するタンパク質、ポリペプチドおよびペプチドをいう。典型的には、ペプチドまたはポリペプチドは、少なくとも３アミノ酸長である。ペプチドまたはポリペプチドは、個々のタンパク質、またはタンパク質の集合をいうことができる。いくつかの場合において、ペプチドは、天然アミノ酸だけを包含することができるが、当該技術分野で知られている非天然アミノ酸（すなわち、自然界には存在しないがポリペプチド鎖に組み込むことができる化合物）および／またはアミノ酸アナログを代替使用することができる。また、ペプチドまたはポリペプチド中の１つ以上のアミノ酸は、例えば、炭水化物基、ヒドロキシル基、ホスフェート基、ファルネシル基、イソファルネシル基、脂肪酸基、コンジュゲーション（conjugation）または官能基化（functionalization）または他の修飾のためのリンカーなどの化学的要素の付加によって、修飾され得る。ペプチドまたはポリペプチドは、また、単一分子であってもよいか、またはタンパク質のような多分子複合体であってよい。ペプチドまたはポリペプチドは、天然タンパク質またはペプチドの単なる断片であってよい。ペプチドまたはポリペプチドは、天然、組換えもしくは合成またはそれらのあらゆる組合せであってよい。「ジペプチド」とは、共有結合した２つのアミノ酸をいう。
いくつかの場合において、ペプチドは、αヘリックス二次構造を有しているかまたは有するように誘導され得る。
いくつかの場合において、ペプチドは、１、２、３、４または５個のアミノ酸置換を含む（例えば、１、２、３、４もしくは５個のアミノ酸がＡに置き換えられているか、または１、２、３、４もしくは５個のアミノ酸が保存的に置換されている）修飾ペプチドである。
いくつかの場合において、安定化ペプチドは、配列番号１～１３のうちの１つに対して少なくとも８０％（例えば、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％、９９％、９９.５％または１００％）の同一性を有するＩ－ＴＡＭＰ、または１つ以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、好ましくは１～２、１～３、１～４、または１～５個）の保存的アミノ酸置換を有する配列番号１～１３のうちの１つを含むＩ－ＴＡＭＰから生成され得る。いくつかの場合において、安定化ペプチドは、配列番号１４～３６のうちの１つに対して少なくとも８０％（例えば、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％、９９％、９９.５％または１００％）の同一性を有することができるか、または１つ以上（例えば、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、例えば、１～２、１～３、１～４、または１～５）の保存的アミノ酸置換を有する配列番号１～１３のうちの１つを含むことができる。いくつかの場合において、安定化ペプチドは、１つまたは２つのステープル（例えば、２または３（または６）アミノ酸離れている２つのアミノ酸の間に１つのステープル、または２または３（または６）アミノ酸離れている２つのアミノ酸の間にそれぞれ２つのステープル）を有する配列番号１～１３のうちの１つの配列を有する。加えて、この安定化ペプチドにおけるアミノ酸のうち１、２、３、４または５個（その側鎖はステープルと置き換えられていない）は、保存的置換によって置き換えられ得るか、またはＡによって置き換えられ得る。いくつかの場合において、安定化ペプチドは、配列番号３７～６０のうちの１つの配列を有する。別の場合において、安定化ペプチドは、配列番号４３、４７または５５のうちの１つの配列を有する。
いくつかの場合において、「保存的アミノ酸置換」は、１つのアミノ酸残基が類似の側鎖を有する別のアミノ酸残基と置き換えられる置換を包含することができる。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当該技術分野で定義されている。これらのファミリーは、塩基性側鎖を有するアミノ酸（例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン）、酸性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、非荷電極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン）、非極性側鎖を有するアミノ酸（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン）、β分枝側鎖を有するアミノ酸（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）および芳香族側鎖を有するアミノ酸（例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン）を包含する。
アミノ酸配列間のパーセント同一性を決定する方法は、当該技術分野で知られている。例えば、該配列は、最適な比較を目的として整列される（例えば、最適な整列のために第１のアミノ酸および第２のアミノ酸のうちの１つもしくは両方または核酸配列にギャップを導入することができ、比較の目的で非相同配列を廃棄することができる）。比較の目的で整列させた参照配列の長さは、該参照配列の長さの少なくとも３０％、少なくとも４０％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、または少なくとも７０％、８０％、９０％もしくは１００％であり得る。次に、対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置におけるアミノ酸残基またはヌクレオチドを比較する。第１の配列における位置が、第２の配列における対応する位置と同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占領されている場合、該分子は、その位置で同一である。２つのアミノ酸の間のパーセント同一性の決定は、例えばＢＬＡＳＴ ２.０プログラムを用いて行うことができる。配列比較は、非ギャップ整列を用い、デフォルトパラメータ（Ｂｌｏｓｓｏｍ ６２マトリックス、ギャップ存在コスト（gap existence cost）１１、残基当たりギャップコスト（per residue gapped cost）１、およびλ比０.８５）を用いて、行われる。ＢＬＡＳＴプログラムに用いられる数学的アルゴリズムは、Altschul et al.（Nucleic Acids Res. 25:3389-3402, 1997)に記載されている。
上記のとおり、本書におけるペプチドは、一緒になって内部（分子内）架橋（またはステープル）を形成する少なくとも２つの修飾アミノ酸（ここで、この少なくとも２つの修飾アミノ酸は、（Ａ）２アミノ酸離れている（すなわち、ｉ,ｉ＋３）か、（Ｂ）３アミノ酸離れている（すなわち、ｉ,ｉ＋４）か、または（Ｃ）６アミノ酸離れている（すなわち、ｉ,ｉ＋７））を含む。
ｉとｉ＋３との間の架橋の場合、該架橋は、例えば、Ｃ7アルキレンまたはアルケニレンであり得る。ｉとｉ＋４との間の架橋の場合、該架橋は、例えば、Ｃ8アルキレンまたはアルケニレンであり得る。ｉとｉ＋７との間の架橋の場合、該架橋は、例えば、Ｃ11、Ｃ12、またはＣ13アルキレンまたはアルケニレンであり得る。架橋がアルケニレンである場合、１つ以上の二重結合が存在することができる。
ｉとｉ＋３との間の架橋の場合、該架橋は、例えば、Ｃ6、Ｃ7、またはＣ8アルキレンまたはアルケニレン（例えば、１つの二重結合を有するＣ6アルケニレン）であり得る。ｉとｉ＋４との間の架橋の場合、該架橋は、例えば、Ｃ8アルキレンまたはアルケニレンであり得る。ｉとｉ＋７との間の架橋の場合、該架橋は、例えば、Ｃ11、Ｃ12、またはＣ13アルキレンまたはアルケニレン（例えば、１つの二重結合を有するＣ11アルケニレン）であり得る。該架橋がアルケニレンである場合、１つ以上の二重結合が存在することができる。該架橋は、－ＯＨおよび－ＮＨ3から選択される１～５個の置換基で置換されていてもよい。
「ペプチドステープリング」とは、架橋環を形成するために閉環メタセシス（ＲＣＭ）反応を用いてポリペプチド鎖に存在する２つのオレフィン含有側鎖（例えば、架橋可能な側鎖）が共有結合される（例えば、「一緒にステープル化される」）合成方法に由来する造語である（Blackwell et al., J. Org. Chem., 66: 5291-5302, 2001；Angew et al., Chem. Int. Ed. 37:3281, 1994）。本書で用いる場合、用語「ペプチドステープリング」とは、単独で「ステープル化」されたポリペプチドを提供するために、反応を促進させるためにいくつもの反応条件および／または触媒を用いて、ポリペプチド鎖中に存在し得る２つ（例えば、少なくとも一対）の二重結合含有側鎖、三重結合含有側鎖、または二重結合および三重結合含有側鎖を結合することを包含する。用語「多重にステープル化」されたポリペプチドとは、２つ以上の個別のステープルを含有するこれらのポリペプチドをいい、種々のスペーシングおよび組成の２つ、３つまたはそれ以上の独立したステープルを含有し得る。加えて、本書で用いる場合、用語「ペプチドステッチング」とは、２つのステープルが例えば共通の残基に連結されている「ステッチ化」された（例えば、タンデムにまたは多重にステープル化された）ポリペプチドを提供するための単一のポリペプチド鎖における複数の直列の「ステープリング」事象をいう。ペプチドステッチングは、例えば、国際公開第２００８／１２１７６７号および国際公開第２０１０／０６８６８４号に記載されている（どちらも出典明示によりその全体として本明細書の一部を構成する）。いくつかの場合、本書で用いる場合、ステープルは、不飽和結合を保持することができるか、または還元され得る（例えば、下記のステッチングのパラグラフの記載に記載されるとおり）。
多くのペプチドステープルは全炭化水素架橋を有するが、他のタイプの架橋またはステープルを用いることができる。例えば、トリアゾール含有（例えば、１,４－トリアゾールまたは１,５－トリアゾール）架橋を用いることができる（例えば、Kawamoto et al. 2012 Journal of Medicinal Chemistry 55:1137；国際公開第２０１０／０６０１１２号を参照）。
全炭化水素架橋を用いるペプチドのステープリングは、特に生理学的に関連する条件下で、天然の立体構造および／または二次構造を維持するのに役立つことが示されている（例えば、Schafmiester et al., J. Am. Chem. Soc., 122:5891-5892, 2000; Walensky et al., Science, 305:1466-1470, 2004を参照）。
αヘリックス二次構造を有する傾向にある全炭化水素架橋による本書におけるペプチドのステープリングは、安定性および種々の薬物動態学的特性を向上させることができる。
本書における安定化ペプチドは、少なくとも２つの内部架橋またはステープル化アミノ酸を包含し、ここで、この少なくとも２つのアミノ酸は、例えば、２アミノ酸離れている（すなわち、ｉ,ｉ＋３）か、３アミノ酸離れている（すなわち、ｉ,ｉ＋４）か、または６アミノ酸離れている（すなわち、ｉ,ｉ＋７）。内部架橋（例えば、ステープル）を支持するために少なくとも２つのアミノ酸が必要であるが、例えばさらなる内部架橋（例えば、ステープル）を支持するために、ペプチド中にさらなる内部架橋アミノ酸対を含むことができる。例えば、ペプチドは、１つ、２つ、３つ、４つ、５つまたはそれ以上のステープルを含むことができる。
図４のパネルＡは、さまざまな架橋化合物を作成するために使用することができる非天然アミノ酸の化学構造例を示す。図４のパネルＢは、ｉ残基とｉ＋３残基との間、ｉ残基とｉ＋４残基との間、およびｉ残基とｉ＋７残基との間に炭化水素架橋を有するペプチドを例示する。図４のパネルＣは、ペプチド配列に沿ったステープルウォークを例示する。図５は、二重および三重のステープリングストラテジーを有するさまざまなペプチド配列、ならびに例示的ステープルウォークを例示する。
別法としてまたは加えて、ペプチドは、例えば共通起源から生じる２つのステープルを生じる、３つの内部架橋またはステッチ化アミノ酸を含むことができる。ペプチドステッチは、少なくとも３つの内部架橋アミノ酸を含み、ここで、３つのアミノ酸の中央（本書においてコアまたは中央アミノ酸と称される）は、この２つの隣接修飾アミノ酸の各々と（α炭素間で）内部架橋を形成する。該コアアミノ酸のα炭素は、飽和されていても飽和されていなくてもよい、該ペプチドにおける他のアミノ酸のα炭素との内部架橋である側鎖を有する。該コアアミノ酸と架橋されたアミノ酸は、該コアアミノ酸からいずれかの方向に２、３または６アミノ酸離れていることができる（例えば、ｉ,ｉ－３、ｉ,ｉ－４、ｉ,ｉ－７、ｉ,ｉ＋３、ｉ,ｉ＋４、ｉ,ｉ＋７（ここで、「ｉ」はコアアミノ酸である）。該コアのいずれかの側のアミノ酸の数（例えば、コアアミノ酸と該コアに架橋したアミノ酸との間）は、同じであっても異なってもよい。
いくつかの態様において、本書におけるペプチドは、少なくとも１つ（例えば、１つ、２つ、３つ、４つまたは５つ）のステープルおよび少なくとも１つ（例えば、１つ、２つ、３つ、４つまたは５つ）のステッチの組み合わせを含むことができる。図６は、さまざまな長さの分岐したステッチ化部分を用いてステープルウォーク例を例示する。
修飾（例えば、内部架橋を支持するため）のためのアミノ酸の選択は、また、ステープルスキャンによって促進され得る。用語「ステープルスキャン」とは、ステープル化ペプチドのライブラリーの合成をいい、これにより、ｉとｉ＋３；ｉとｉ＋４；およびｉとｉ＋７の単一および複数のステープルまたはステッチの位置は、ステープル化またはステッチ化構築物について所望の、有効な、好適な、または最適な特性および活性を同定するために全ての可能な位置をサンプリングしてペプチド配列の長さに沿って連続して配置される。ステープルスキャン方法の例は図面に例示される。好適なテザー（tether）は、本書、ならびに例えば米国特許出願公開第２００５／０２５０６８０号、ＰＣＴ出願ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０５８５７５、国際公開第２００９／１０８２６１号および国際公開第２０１０／１４８３３５号に記載されている。
本書に記載のペプチドにおける使用に適切なアミノ酸側鎖は当該技術分野において知られている。例えば、好適なアミノ酸側鎖としては、メチル（アラニンのαアミノ酸側鎖がメチルであるので）、４－ヒドロキシフェニルメチル（チロシンのαアミノ酸側鎖が４－ヒドロキシフェニルメチルであるので）およびチオメチル（システインのαアミノ酸側鎖がチオメチルであるので）などが挙げられる。「末端不飽和アミノ酸側鎖（terminally unsaturated amino acid side chain）」とは、ポリペプチド鎖における他の末端不飽和部分（terminal unsaturated moiety）との架橋反応に関与する末端不飽和部分、例えば置換もしくは非置換の二重結合（例えば、オレフィン系）または三重結合（例えば、アセチレン系）を有するアミノ酸側鎖をいう。特定の態様において、「末端不飽和アミノ酸側鎖」は、末端オレフィン系アミノ酸側鎖（terminal olefinic amino acid side chain）である。特定の態様において、「末端不飽和アミノ酸側鎖」は、末端アセチレン系アミノ酸側鎖（terminal acetylenic amino acid side chain）である。特定の態様において、「末端不飽和アミノ酸側鎖」の末端部分は、それ以上置換されていない。
上記のとおり、内部テザーまたは架橋は、１ヘリカルターンの長さにわたって（すなわち、約３.４アミノ酸（すなわち、ｉ,ｉ＋３、またはｉ,ｉ＋４））または２ヘリカルターンの長さにわたって（すなわち、約７アミノ酸（すなわち、ｉ,ｉ＋７））伸びることができる。したがって、ｉとｉ＋３；ｉとｉ＋４；またはｉとｉ＋７に位置するアミノ酸は、化学修飾および架橋の理想的な候補である。かくして、例えば、ペプチドが配列...Ｘａａ1、Ｘａａ2、Ｘａａ3、Ｘａａ4、Ｘａａ5、Ｘａａ6、Ｘａａ7、Ｘａａ8、Ｘａａ9...（ここで、「...」は、さらなるアミノ酸の任意の存在を示す）を有する場合、Ｘａａ1とＸａａ4との間、またはＸａａ1とＸａａ5との間、またはＸａａ1とＸａａ8との間の架橋は、Ｘａａ2とＸａａ5との間、またはＸａａ2とＸａａ6との間、またはＸａａ2とＸａａ9との間などの架橋と同様に有用である。
ポリペプチドは、さらに配列を安定化するため、または、より長いポリペプチドストレッチの安定化を促進するために、ポリペプチド配列内に２つ以上の架橋を含むことができる。該ポリペプチドが１つの部分で容易に合成するには長すぎる場合、別々に合成した架橋ペプチドをネイティブ化学ライゲーション（native chemical ligation）と称される技術によって結合することができる（例えば、Bang, et al., J. Am. Chem. Soc. 126:1377）。別法として、大きいペプチドは、フゼオン（Fuzeon）の工業的合成におけるように、収束的手法を用いてルーチン的に合成され、これにより、完全に保護された断片は、特異的かつ連続的に反応し、最後に脱保護した後に、所望の全長生成物を形成する。図７は、ステープル化抗微生物ペプチド誘導体を作成するために用いられる化学的変化の例を示す概略図である。
化合物
本発明は、式（Ｉ）：
Figure 2022095666000013
 ［式中、
各Ｘａａは、独立して、アミノ酸であり；
各Ｒ1およびＲ2は、独立して、Ｈ、またはＣ1～Ｃ10アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり；
各Ｒ3は、独立して、１～６個のＲ4で置換されている、アルキレン、アルケニレンまたはアルキニレン（例えば、Ｃ6、Ｃ7、Ｃ11アルケニレン）であり；
各Ｒ4は、独立して、－ＮＨ3または－ＯＨであり、ここで、各－ＮＨ3は、置換されていてもよく；
ここで、各Ｒ3は、対応する親（すなわち、非修飾）非内部架橋ＡＭＰと比べて、２、３または６アミノ酸離れている（すなわち、ｘ＝２、３または６）少なくとも一対（例えば、一対または二対）のアミノ酸の側鎖と置き換わる］
で示される修飾ポリペプチドまたはその薬学的に許容される塩を特徴とする。
上記および本書の他の記載箇所で用いる場合、「対応する親（すなわち、非修飾）非内部架橋ＡＭＰ」は、野生型ＡＭＰ、または本書に記載の内部架橋を含まないことを除けば本書に記載の野生型ＡＭＰの変種のいずれかであり得る。
式Ｉの場合、記載された態様のなかに以下の態様がある。
ｘ＝２（すなわち、ｉ＋３リンケージ）の場合、Ｒ3は、例えば、Ｃ7アルキレンまたはアルケニレンであり得る。それがアルケニレンである場合、１つ以上の二重結合が存在し得る。ｘ＝６（すなわち、ｉ＋４リンケージ）の場合、Ｒ3は、例えば、Ｃ11、Ｃ12またはＣ13アルキレンまたはアルケニレンであり得る。それがアルケニレンである場合、１つ以上の二重結合が存在し得る。ｘ＝３（すなわち、ｉ＋４リンケージ）の場合、Ｒ3は、例えば、Ｃ8アルキレンまたはアルケニレンであり得る。それがアルケニレンである場合、１つ以上の二重結合が存在し得る。
特定の場合、２つのα,α二置換立体中心（α炭素）は、ともにＲ配置またはＳ配置であるか（例えば、ｉ,ｉ＋４架橋）、または１つの立体中心がＲであり、残りの立体中心がＳである（例えば、ｉ,ｉ＋７架橋）。かくして、式Ｉが
Figure 2022095666000014
 として示される場合、例えばｘが３である場合、Ｃ'およびＣ''二置換立体中心は、ともにＲ配置であり得るか、またはそれらはともにＳ配置であり得る。ｘが６である場合、Ｃ'二置換立体中心がＲ配置であり、Ｃ''二置換立体中心がＳ配置であるか、または、Ｃ'二置換立体中心がＳ配置であり、Ｃ''二置換立体中心がＲ配置である。Ｒ3二重結合は、ＥまたはＺ立体化学配置であり得る。類似の配置は、すぐ上に示した式におけるＣ'およびＣ''に対応する式ＩＩにおける炭素についても可能である。
いくつかの場合において、ポリペプチドは、架橋に置き換えられる該アミノ酸側鎖に加えて配列番号１～１３のいずれかにおける１個、２個、３個、４個、５個、６個、７個、８個、９個、１０個、１１個または１２個のアミノ酸交換（例えば、保存的アミノ酸交換）を有するアミノ酸配列を包含する。
いくつかの実施態様において、化合物は、式（ＩＩ）:
Figure 2022095666000015
 ［式中、
－ 各Ａ、Ｃ、ＤおよびＥは、独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
－ 各Ｂは、独立して、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
Figure 2022095666000016
 、[－ＮＨ－Ｌ4－ＣＯ－]、[－ＮＨ－Ｌ4－ＳＯ2－]、または[－ＮＨ－Ｌ4－]であり；
－ 各Ｒ1は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキル、またはヘテロシクロアルキルであるか（これらのいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＲ1ならびに、Ｒ1およびＬの両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ2は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキルであるか（これらのいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＲ2ならびに、Ｒ2およびＬの両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ3は、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、アリールまたはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｌは、独立して、大環状分子（macrocycle）形成リンカーであり；
－ 各Ｌ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、ヘテロアリーレンまたは[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｒ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3qであり（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒ1またはＲ2の結合点である）；
－ 各ｎは、独立して、１、２、３、４または５であり；
－ 各Ｒ7は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＤ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ8は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＥ残基との環状構造の一部であり；
－ 各ｖおよびｗは、独立して、０～１０００、１～１０００、または３～１０００の整数であり；
－ 各ｘ、ｙおよびｚは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ ｕは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である］
を有する。
いくつかの実施態様において、各ｖおよびｗは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０である。いくつかの実施態様において、各ｗは、独立して、３～１０００、例えば、３～５００、３～２００、３～１００、３～５０、３～３０、３～２０、または３～１０の整数である。いくつかの実施態様において、ｗは、３～１０、例えば、３～６、３～８、６～８、または６～１０の整数である。いくつかの実施態様において、ｗは、３である。他の実施態様において、ｗは６である。いくつかの実施態様において、各ｖは、独立して、１～１０００、例えば、１～５００、１～２００、１～１００、１～５０、１～３０、１～２０、または１～１０の整数である。いくつかの実施態様において、ｖは２である。
一例において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方は、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。別の例において、Ｒ1およびＲ2はともに、独立して、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。いくつかの態様において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方はメチルである。他の態様において、Ｒ1およびＲ2はメチルである。
いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは少なくとも２または少なくとも３である。他の実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である。いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は３または６である。いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は３である。他の実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は６である。
大環状分子または大環状分子前駆体におけるＡ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの各出現は独立して選択される。例えば、式[Ａ]xによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一ではない実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ａｓｐ－Ａｌａ）、およびアミノ酸が同一である実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ｇｌｎ－Ｇｌｎ）を包含する。これは、所定の範囲のｘ、ｙまたはｚの値について当てはまる。同様に、ｕが１よりも大きい場合、各化合物は、同一または異なる化合物を包含し得る。例えば、化合物は、異なるリンカー長または化学組成を含む化合物を含み得る。
いくつかの実施態様において、該化合物は、ヘリックス内水素結合を可能にさせる、Ｒ8が－Ｈであるαヘリックスである二次構造を含む。いくつかの実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つはα,α－二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α,α－二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、２－アミノイソ酪酸である。他の実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは
Figure 2022095666000017
 である。
他の実施態様において、１番目のＣαから２番目のＣαまで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、１番目のＣαと２番目のＣαの間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるαヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
いくつかの態様において、式（ＩＩ）で示される化合物は、式（ＩＩａ）：
Figure 2022095666000018
 ［式中、
－ 各Ａ、Ｃ、ＤおよびＥは、独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
－ 各Ｂは、独立して、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
Figure 2022095666000019
 、[－ＮＨ－Ｌ4－ＣＯ－]、[－ＮＨ－Ｌ4－ＳＯ2－]、または[－ＮＨ－Ｌ4－]であり；
－ 各Ｌは、独立して、大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｌ'は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンもしくはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、または結合であるか、またはＲ1ならびに、Ｒ1およびＬ'の両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｌ''は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンもしくはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、または結合であるか、またはＲ2ならびに、Ｒ2およびＬ''の両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ1は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＬ'ならびに、Ｒ1およびＬ'の両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ2は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＬ''ならびに、Ｒ2およびＬ''の両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ Ｒ3は、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、アリールまたはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｌ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、ヘテロアリーレン、または[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｒ4は、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3qであり（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒ1またはＲ2への結合点である）；
－ 各ｎは、独立して、１、２、３、４または５であり；
－ 各Ｒ7は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＤ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ8は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＥ残基との環状構造の一部であり；
－ 各ｖおよびｗは、独立して、０～１０００、１～１０００、または３～１０００の整数であり；
－ 各ｘ、ｙおよびｚは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ ｕは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である］
を有する。
いくつかの実施態様において、Ｌは、式－Ｌ1－Ｌ2－で示される大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、Ｌ1およびＬ2は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、ヘテロアリーレンまたは[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）である。
一例において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方は、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。別の例において、Ｒ1およびＲ2はともに、独立して、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。いくつかの態様において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方はメチルである。他の実施態様において、Ｒ1およびＲ2はメチルである。
いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは少なくとも２または少なくとも３である。他の実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である。大環状分子または大環状分子前駆体におけるＡ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの各出現は独立して選択される。例えば、式[Ａ]xによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一ではない実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ａｓｐ－Ａｌａ）、およびアミノ酸が同一である実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ｇｌｎ－Ｇｌｎ）を包含する。これは、所定の範囲のｘ、ｙまたはｚの値について当てはまる。同様に、ｕが１よりも大きい場合、各化合物は、同一または異なる部分を包含し得る。例えば、化合物は、異なるリンカー長または化学組成を含む部分を含み得る。
いくつかの実施態様において、該化合物は、ヘリックス内水素結合を可能にさせる、Ｒ8が－Ｈであるヘリックスである二次構造を含む。いくつかの実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つはα,α－二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α,α－二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、２－アミノイソ酪酸である。他の実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、
Figure 2022095666000020
 である。
他の実施態様において、１番目のＣαから２番目のＣαまで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、１番目のＣαと２番目のＣαの間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
いくつかの実施態様において、式（ＩＩ）で示される化合物は、式（ＩＩｂ）：
Figure 2022095666000021
 ［式中、
－ 各Ａ、Ｃ、ＤおよびＥは、独立して、アミノ酸であり（ここで、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤおよびＥは、大環状分子形成リンカーＬおよびＬ'によって連結された架橋アミノ酸と一緒になってターゲットペプチドのアミノ酸配列を形成する）；
－ 各Ｂは、独立して、アミノ酸、
Figure 2022095666000022
 、[－ＮＨ－Ｌ4－ＣＯ－]、[－ＮＨ－Ｌ4－ＳＯ2－]、または[－ＮＨ－Ｌ4－]であり；
－ Ｌは、式－Ｌ1－Ｌ2－で示される大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｒ1は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＬならびに、Ｒ1およびＬの両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ2は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、または、Ｌならびに、Ｒ2およびＬの両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ Ｒ3は、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、アリールまたはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ Ｌ'は、式－Ｌ1'－Ｌ2'－で示される大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｒ1'は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＬ'ならびに、Ｒ1'およびＬ'の両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ2'は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＬ'ならびに、Ｒ2'およびＬ'の両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ2'は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＬ'ならびに、Ｒ2'およびＬ'の両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ4は、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3qであり（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒ1、Ｒ2、Ｒ1'、またはＲ2'への結合点である）；
－ 各ｎは、独立して、１、２、３、４または５であり；
－ 各Ｒ7は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＤ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ8は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＥ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ7'は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＤ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ8'は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＥ残基との環状構造の一部であり；
－ 各ｘ、ｙおよびｚは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ 各ｘ'、ｙ'およびｚ'は、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ 各ｖおよびｗは、独立して、０～１０００、１～１０００、または３～１０００の整数であり；
－ 各ｖ'およびｗ'は、独立して、０～１０００、１～１０００、または３～１０００の整数であり；
－ 各ｎは、１、２、３、４または５である］
を有する。
いくつかの実施態様において、ｘ'＋ｙ'＋ｚ'の合計は、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり、例えば３または６であり、少なくとも２、または少なくとも３である。
いくつかの実施態様において、該化合物は、式（ＩＩｃ）：
Figure 2022095666000023
 ［式中、
－ 各Ａ、Ｃ、ＤおよびＥは、独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
－ 各Ｂは、独立して、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
Figure 2022095666000024
 、[－ＮＨ－Ｌ4－ＣＯ－]、[－ＮＨ－Ｌ4－ＳＯ2－]、または[－ＮＨ－Ｌ4－]であり；
－ 各Ｒ1は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＲ1ならびに、Ｒ1およびＬの両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ2は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＲ2ならびに、Ｒ2およびＬの両方が結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ3は、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、アリールまたはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｌは、独立して、式
Figure 2022095666000025
 で示される大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｌ1、Ｌ2およびＬ3は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、ヘテロアリーレンまたは[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｒ4は、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3qであり（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒ1またはＲ2への結合点である）；
－ 各Ｒ7は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＤ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ8は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＥ残基との環状構造の一部であり；
－ 各ｖおよびｗは、独立して、０～１０００、１～１０００、または３～１０００の整数であり；
－ 各ｘ、ｙおよびｚは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ ｕは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ 各ｎは、１、２、３、４または５である］
を有する。
一例において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方は、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。別の例において、Ｒ1およびＲ2はともに、独立して、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。いくつかの態様において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方はメチルである。他の態様において、Ｒ1およびＲ2はメチルである。
いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは少なくとも２または少なくとも３である。他の実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である。大環状分子または大環状分子前駆体におけるＡ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの各出現は独立して選択される。例えば、式[Ａ]ｘによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一ではない実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ａｓｐ－Ａｌａ）、およびアミノ酸が同一である実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ｇｌｎ－Ｇｌｎ）を包含する。これは、所定の範囲のｘ、ｙまたはｚの値について当てはまる。
いくつかの実施態様において、Ｅによって表される最初の２つのアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される最初の３つのアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される最初の４つのアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅに関するｉ＋１、ｉ＋２、ｉ＋３、ｉ＋４、ｉ＋５、および／またはｉ＋６であるアミノ酸の１つ以上または各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。
いくつかの実施態様において、Ｅによって表される１番目のＣ末端アミノ酸および／または２番目のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される１番目のＣ末端アミノ酸および／または２番目のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖、例えば小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される１番目のＣ末端アミノ酸、２番目のＣ末端アミノ酸および／または３番目のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される１番目のＣ末端アミノ酸、２番目のＣ末端アミノ酸および／または３番目のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖、例えば小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅに関してｉ＋１、ｉ＋２、ｉ＋３、ｉ＋４、ｉ＋５、および／またはｉ＋６であるアミノ酸の１つ以上または各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。
いくつかの実施態様において、各ｗは、独立して、１～１０００の整数である。例えば、Ｅによって表される１番目のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、２～１０００である。例えば、Ｅによって表される２番目のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、３～１０００である。例えば、Ｅによって表される３番目のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される３番目のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、４～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、５～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、６～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、７～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、８～１０００である。
いくつかの実施態様において、該化合物は、ヘリックス内水素結合を可能にさせる、Ｒ8が－Ｈであるヘリックスである二次構造を含む。いくつかの実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つはα,α－二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α,α－二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、２－アミノイソ酪酸である。他の実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、
Figure 2022095666000026
 である。
他の実施態様において、１番目のＣαから２番目のＣαまで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、１番目のＣαと２番目のＣαの間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
いくつかの態様において、Ｌは、式
Figure 2022095666000027
 で示される大環状分子形成リンカーである。
いくつかの態様において、Ｌは、式
Figure 2022095666000028
 で示される大環状分子形成リンカーまたはその互変異性体である。
大環状分子形成リンカーＬの典型的な態様は、以下に示される。
Figure 2022095666000029
Figure 2022095666000030
トリアゾール架橋基（crosslinker）の形成に用いられるアミノ酸は、下記の説明に従って表される。各アミノ酸のα位の立体化学は、他に特記しない限り、Ｓである。アジドアミノ酸については、示された炭素原子の数は、α炭素と末端のアジドとの間にあるメチレン単位の数をいう。アルキンアミノ酸については、示された炭素原子の数は、α位とトリアゾール部分との間にあるメチレン単位の数に、アルキンに由来するトリアゾール基内の２つの炭素原子を足した数をいう。
＄５ａ５ α－Ｍｅ アルキン １,５ トリアゾール（５炭素）
＄５ｎ３ α－Ｍｅ アジド １,５ トリアゾール（３炭素）
＄４ｒｎ６ α－Ｍｅ Ｒ－アジド １,４ トリアゾール（６炭素）
＄４ａ５ α－Ｍｅ アルキン １,４ トリアゾール（５炭素）
大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、該リンケージは、およそ４個の原子～１２個の原子、およそ６個の原子～１０個の原子、またはおよそ８個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ２ターンにまたがる場合、該リンケージは、およそ７個の原子～１５個の原子、およそ９個の原子～１３個の原子、またはおよそ１１個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ３ターンにまたがる場合、該リンケージは、およそ１３個の原子～２１個の原子、およそ１５個の原子～１９個の原子、またはおよそ１７個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ４ターンにまたがる場合、該リンケージは、およそ１９個の原子～２７個の原子、およそ２１個の原子～２５個の原子、またはおよそ２３個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ５ターンにまたがる場合、該リンケージは、およそ２５個の原子～３３個の原子、およそ２７個の原子～３１個の原子、またはおよそ２９個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ１７個の構成員～２５個の構成員、およそ１９個の構成員～２３個の構成員、またはおよそ２１個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ１７個の構成員～２５個の構成員、およそ１９個の構成員～２３個の構成員、またはおよそ２１個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ３ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ４４個の構成員～５２個の構成員、およそ４６個の構成員～５０個の構成員、またはおよそ４８個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ４ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ５９個の構成員～６７個の構成員、およそ６１個の構成員～６５個の構成員、またはおよそ６３個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがαヘリックスのおよそ５ターンに及ぶ場合、得られた大環状分子は、およそ７４個の構成員～８２個の構成員、およそ７６個の構成員～８０個の構成員、またはおよそ７８個の構成員を含有する環を形成する。
本書におけるいずれの実施態様においても、各ｖ、ｗ、ｖ'およびｗ'は、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９または５０であり得る。本書におけるいずれの実施態様においても、各ｖ、ｗ、ｖ'およびｗ'は、独立して、０～１０００、０～５００、０～４００、０～３００、０～２００、０～１００、０～５０、０～４０、０～３０、０～２５、０～２０、０～１５、０～１０、０～８、０～６、０～５、１～１０００、１～５００、１～４００、１～３００、１～２００、１～１００、１～５０、１～４０、１～３０、１～２５、１～２０、１～１５、１～１０、１～８、１～６、１～５、３～１０００、３～５００、３～４００、３～３００、３～２００、３～１００、３～５０、３～４０、３～３０、３～２５、３～２０、３～１５、３～１０、３～８、３～６または３～５であり得る。
ある実施態様において、式（ＩＩ）で示される化合物は、
Figure 2022095666000031
 ［式中、各Ｒ1およびＲ2は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）である］
である。
関連する実施態様において、該化合物は、
Figure 2022095666000032
 である式（ＩＩ）の構造を含む。
いくつかの実施態様において、式（ＩＩ）で示される化合物は、
Figure 2022095666000033
 ［式中、各Ｒ1およびＲ2は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（非置換であるかまたはハロ－で置換された）である］
である。
関連する実施態様において、式（ＩＩ）で示される化合物は、
Figure 2022095666000034
 ［式中、各Ｒ1'およびＲ2'は、独立して、アミノ酸側鎖である］
である。
他の実施態様において、式（ＩＩ）で示される化合物は、以下に示される式のいずれかによって示される化合物である：
Figure 2022095666000035
Figure 2022095666000036
Figure 2022095666000037
 式中、「ＡＡ」は、いずれかの天然または非天然アミノ酸側鎖を表し、
Figure 2022095666000038
 は、上記で定義した[Ｄ]vまたは[Ｅ]wであり、ｎは、０～２０、５０、１００、２００、３００、４００または５００の整数である。いくつかの実施態様において、前のパラグラフで示される置換基「ｎ」は０である。他の実施態様において、前のパラグラフで示される置換基「ｎ」は５０未満、４０、３０、２０、１０または５である。
大環状分子形成リンカーＬの典型的な実施態様は、以下に示される。
Figure 2022095666000039
他の実施態様において、式（ＩＩ）で示される化合物における[Ｄ]および／または[Ｅ]は、細胞取り込みを促進するためにさらに修飾される。いくつかの実施態様において、化合物の脂質付加またはＰＥＧ化は、細胞取り込みを促進し、バイオアベイラビリティを上昇させ、血液循環を増加させ、薬物動態を変化させ、免疫原性を低下させ、および／または、必要投与回数を減少させる。
他の実施態様において、式（ＩＩ）で示される化合物における[Ｄ]および[Ｅ]の少なくとも１つは、化合物が少なくとも２つの大環状分子形成リンカーを含むようにさらなる大環状分子形成リンカーを含む部分を表す。特定の実施態様において、化合物は２つの大環状分子形成リンカーを含む。ある実施態様において、ｕは２である。
いくつかの実施態様において、Ｌは、式－Ｌ1－Ｌ2－で示される大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、Ｌ1およびＬ2は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、ヘテロアリーレン、または[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；各Ｒ4は、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；各Ｋは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3qであり（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒ1またはＲ2への結合点である）；各ｎは、独立して、１、２、３、４または５である。
本書に記載の式のいずれかの実施態様において、Ｌ1およびＬ2は、単独でまたは組み合わせて、トリアゾールまたはチオエーテルを形成する。
本書に記載の式のいずれかの実施態様において、Ｌ1およびＬ2は、単独でまたは組み合わせて、トリアゾールまたはチオエーテルを形成しない。
他の実施態様において、１番目のα炭素から２番目のα炭素まで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、１番目のα炭素と２番目のα炭素の間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
一例において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方は、非置換であるかまたはハロ－で置換されているアルキルである。別の例において、Ｒ1およびＲ2はともに、独立して、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。いくつかの実施態様において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方はメチルである。他の実施態様において、Ｒ1およびＲ2はメチルである。
いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは少なくとも２または少なくとも３である。他の実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である。大環状分子または大環状分子前駆体におけるＡ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの各出現は独立して選択される。例えば、式[Ａ]ｘによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一ではない実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ａｓｐ－Ａｌａ）、およびアミノ酸が同一である実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ｇｌｎ－Ｇｌｎ）を包含する。これは、所定の範囲のｘ、ｙまたはｚの値について当てはまる。同様に、ｕが１よりも大きい場合、各化合物は、同一または異なる化合物を包含し得る。例えば、化合物は、異なるリンカー長または化学組成を含む化合物を含み得る。
いくつかの実施態様において、該化合物は、ヘリックス内水素結合を可能にさせる、Ｒ8が－Ｈであるヘリックスである二次構造を含む。いくつかの実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つはα,α－二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α,α－二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、２－アミノイソ酪酸である。他の実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは
Figure 2022095666000040
 である。
いくつかの実施態様において、ｗは、１～１０００である。例えば、Ｅによって表される１番目のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、２～１０００である。例えば、Ｅによって表される２番目のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、３～１０００である。例えば、Ｅによって表される３番目のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含むことができる。例えば、Ｅによって表される３番目のアミノ酸は小さい疎水性側鎖を含むことができる。いくつかの実施態様において、ｗは、４～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは５～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは６～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは７～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは８～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、３～１０、例えば３～６、３～８、６～８、または６～１０の整数である。いくつかの実施態様において、ｗは３である。他の実施態様において、ｗは、６である。いくつかの実施態様において、ｖは、１～１０、例えば、２～５の整数である。いくつかの実施態様において、ｖは２である。いくつかの実施態様において、ｖは３である。
いくつかの実施態様において、Ｅによって表される１番目の２個のアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される１番目の３個のアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される１番目の４個のアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。
いくつかの実施態様において、Ｅによって表される１番目のＣ末端アミノ酸および／または２番目のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される１番目のＣ末端アミノ酸および／または２番目のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖、例えば小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される１番目のＣ末端アミノ酸、２番目のＣ末端アミノ酸、および／または３番目のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される１番目のＣ末端アミノ酸、２番目のＣ末端アミノ酸、および／または３番目のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖、例えば小さい疎水性側鎖を含む。
いくつかの実施態様において、１番目のＥに関してｉ＋１、ｉ＋２、ｉ＋３、ｉ＋４、ｉ＋５、および／またはｉ＋６であるアミノ酸の１つ以上または各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、各Ｅは、独立して、Ａｌａ（アラニン）、Ｄ－Ａｌａ（Ｄ－アラニン）、Ａｉｂ（α－アミノイソ酪酸）、Ｓａｒ（Ｎ－メチルグリシン）およびＳｅｒ（セリン）からなる群から選択されるアミノ酸である。
他の実施態様において、式Ｉ、Ｉａ、ＩｂまたはＩｃで示される化合物における[Ｄ]および／または[Ｅ]は、細胞取り込みを促進するためにさらに修飾される。いくつかの実施態様において、化合物の脂質付加またはＰＥＧ化は、細胞取り込みを促進し、バイオアベイラビリティを上昇させ、血液循環を増加させ、薬物動態を変化させ、免疫原性を低下させ、および／または、必要投与回数を減少させる。
他の実施態様において、式Ｉ、Ｉａ、ＩｂまたはＩｃで示される化合物における[Ｄ]および[Ｅ]の少なくとも１つは、化合物が少なくとも２つの大環状分子形成リンカーを含むようにさらなる大環状分子形成リンカーを含む部分を表す。特定の実施態様において、化合物は２つの大環状分子形成リンカーを含む。ある実施態様において、ｕは２である。
他の実施態様において、本発明は、式（ＩＩＩ）：
Figure 2022095666000041
 ［式中、
－ 各Ａ、Ｃ、ＤおよびＥは、独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
－ 各Ｂは、独立して、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
Figure 2022095666000042
 、[－ＮＨ－Ｌ4－ＣＯ－]、[－ＮＨ－Ｌ4－ＳＯ2－]、または[－ＮＨ－Ｌ4－]であり；
－ 各Ｒ1は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＲ1ならびに、Ｒ1およびＬが結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ2は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であるか、またはＲ2ならびに、Ｒ2およびＬが結合している原子と一緒になって環を形成し；
－ 各Ｒ3は、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、アリールまたはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｌ1、Ｌ2、Ｌ3、およびＬ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、ヘテロアリーレンまたは[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3qであり（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒ1またはＲ2への結合点である）；
－ 各Ｒ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｒ7は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＤ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ8は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールもしくはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＥ残基との環状構造の一部であり；
－ 各ｖおよびｗは、独立して、０～１０００、１～１０００、または３～１０００の整数であり；
－ 各ｘ、ｙおよびｚは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ ｕは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ 各ｎは、独立して、１、２、３、４または５である］
で示される化合物を提供する。
いくつかの実施態様において、１番目のα炭素から２番目のα炭素まで測定した大環状分子形成リンカー[－Ｌ1－Ｓ－Ｌ2－Ｓ－Ｌ3－]の長さは、１番目のα炭素と２番目のα炭素の間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるヘリックス（３10ヘリックスまたはαヘリックスが挙げられるがこれらに限定されない）のような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。いくつかの実施態様において、チオール部分は、アミノ酸残基であるＬ－システイン、Ｄ－システイン、α－メチル－Ｌ－システイン、α－メチル－Ｄ－システイン、Ｌ－ホモシステイン、Ｄ－ホモシステイン、α－メチル－Ｌ－ホモシステイン、またはα－メチル－Ｄ－ホモシステインの側鎖である。ビスアルキル化試薬は、一般式Ｘ－Ｌ2－Ｙ（式中、Ｌ2はリンカー部分であり、ＸおよびＹは、Ｌ2と結合を形成するために－ＳＨ部分に置き換えられる脱離基である）で示されるものである。いくつかの実施態様において、ＸおよびＹはハロゲン、例えば、Ｉ、ＢｒまたはＣｌである。
他の実施態様において、本発明は、式（ＩＶ）または（ＩＶａ）：
Figure 2022095666000043
 ［式中、
－ 各Ａ、Ｃ、ＤおよびＥは、独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
－ 各Ｂは、独立して、天然もしくは非天然アミノ酸、アミノ酸アナログ、
Figure 2022095666000044
 、[－ＮＨ－Ｌ4－ＣＯ－]、[－ＮＨ－Ｌ4－ＳＯ2－]、または[－ＮＨ－Ｌ4－]であり；
－ 各Ｒ1は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＥ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ2は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルまたはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＥ残基との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒ3は、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、アリールまたはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｌは、独立して、式－Ｌ1－Ｌ2－で示される大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｌ1、Ｌ2、およびＬ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレン、ヘテロアリーレン、または[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｒ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3qであり（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒ1またはＲ2への結合点である）；
－ 各Ｒ7は、独立して、－Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、アリールまたはヘテロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各ｖおよびｗは、独立して、０～１０００、１～１０００、または３～１０００の整数であり；
－ 各ｘ、ｙおよびｚは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ ｕは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ 各ｎは、独立して、１、２、３、４、５である］
で示される化合物を提供する。
一例において、Ｌ1およびＬ2は、単独でまたは組み合わせて、トリアゾールまたはチオエーテルを形成しない。
一例において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方は、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。別の例において、Ｒ1およびＲ2はともに、独立して、非置換であるかまたはハロ－で置換されたアルキルである。いくつかの実施態様において、Ｒ1およびＲ2の少なくとも一方はメチルである。他の実施態様において、Ｒ1およびＲ2はメチルである。
いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは少なくとも１である。他の実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは少なくとも２である。他の実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚは１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０である。大環状分子または大環状分子前駆体におけるＡ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの各出現は独立して選択される。例えば、式[Ａ]ｘによって表される配列は、ｘが３である場合、アミノ酸が同一ではない実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ａｓｐ－Ａｌａ）、およびアミノ酸が同一である実施態様（例えば、Ｇｌｎ－Ｇｌｎ－Ｇｌｎ）を包含する。これは、所定の範囲のｘ、ｙまたはｚの値について当てはまる。
いくつかの実施態様において、該化合物は、ヘリックス内水素結合を可能にさせる、Ｒ8が－Ｈであるαヘリックスである二次構造を含む。いくつかの実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、α,α－二置換アミノ酸である。一例において、Ｂは、α,α－二置換アミノ酸である。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは、２－アミノイソ酪酸である。他の実施態様において、Ａ、Ｂ、Ｃ、ＤまたはＥの少なくとも１つは
Figure 2022095666000045
 である。
他の実施態様において、１番目のＣαから２番目のＣαまで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、１番目のＣαと２番目のＣαの間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるαヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、式（Ｖ）または式（Ｖａ）：
Figure 2022095666000046
 ［式中、
－ 各Ａa、Ｃa、Ｄa、Ｅa、Ａb、ＣbおよびＤbは、独立して、天然または非天然アミノ酸であり；
－ 各ＢaおよびＢbは、独立して、天然もしくは非天然アミノ酸、
Figure 2022095666000047
 、[－ＮＨ－Ｌ4－ＣＯ－]、[－ＮＨ－Ｌ4－ＳＯ2－]、または[－ＮＨ－Ｌ4－]であり；
－ 各Ｒa1は、独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）；またはＨであるか；またはＲa1は、ＤaまたはＥaアミノ酸のうち１つのアミノ酸のα位に連結する大環状分子形成リンカーＬ'を形成するか；またはＬaと一緒になって、非置換であるかまたは置換されている環を形成し；
－ 各Ｒa2は、独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）；またはＨであるか；またはＲa2は、ＤaまたはＥaアミノ酸のうち１つのアミノ酸のα位に連結する大環状分子形成リンカーＬ'を形成するか；またはＬaと一緒になって、非置換であるかまたは置換されている環を形成し；
－ 各Ｒb1は、独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアルキルもしくはヘテロシクロアルキル（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）；またはＨであるか；またはＲb1は、Ｄbアミノ酸のうちの１つのアミノ酸のα位に連結する大環状分子形成リンカーＬ'を形成するか；またはＬbと一緒になって、非置換であるかまたは置換されている環を形成し；
－ 各Ｒ3は、独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアルキルアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）、またはＨであり；
－ 各Ｌaは、独立して、大環状分子形成リンカーであり、非置換であるかまたは置換されているＲa1またはＲa2との環を形成してもよく；
－ 各Ｌbは、独立して、大環状分子形成リンカーであり、非置換であるかまたは置換されているＲb1との環を形成してもよく；
－ 各Ｌ'は、独立して、大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｌ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｒ4は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＯＣＯ2、ＮＲ3、ＣＯＮＲ3、ＯＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3q（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒa1、Ｒa2またはＲb1への結合点である）であり；
－ 各Ｒa7は、独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）；またはＨ；またはＤaアミノ酸との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒb7は、独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）；またはＨ；またはＤbアミノ酸との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒa8は、独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）；またはＨ；またはＥaアミノ酸との環状構造の一部であり；
－ 各Ｒb8は、独立して、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキル、ヘテロアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロシクロアルキル、シクロアリールもしくはヘテロシクロアリール（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）；またはＨ；または１～１０００アミノ酸残基のアミノ酸配列であり；
－ 各ｖａおよびｖｂは、独立して、０～１０００の整数であり；
－ 各ｗａおよびｗｂは、独立して、０～１０００の整数であり；
－ 各ｕａおよびｕｂは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり、ここで、ｕａ＋ｕｂは少なくとも１であり；
－ 各ｘａおよびｘｂは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ 各ｙａおよびｙｂは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ 各ｚａおよびｚｂは、独立して、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
－ 各ｎは、独立して、１、２、３、４または５である］
を有する化合物またはその薬学的に許容される塩である。
いくつかの態様において、本発明の化合物は、
－ 各Ｌaが、独立して、式－Ｌ1－Ｌ2－で示される大環状分子形成リンカーであり、非置換であるかまたは置換されているＲa1またはＲa2との環を形成してもよく；
－ 各Ｌbが、独立して、式－Ｌ1－Ｌ2－で示される大環状分子形成リンカーであり、非置換であるかまたは置換されているＲb1との環を形成してもよく；
－ 各Ｌ'が、独立して、式－Ｌ1－Ｌ2－で示される大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｌ1およびＬ2が、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｒ4が、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋが、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＯＣＯ2、ＮＲ3、ＣＯＮＲ3、ＯＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3q（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒa1、Ｒa2、またはＲb1への結合点である、
上記で定義した式で示される化合物またはその薬学的に許容される塩である。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、各ＬaおよびＬbが、独立して、トリアゾール含有大環状分子形成リンカーである、上記で定義した式を有する。いくつかの実施態様において、当該化合物は、
－ 各ＬaおよびＬbが、独立して、式：
Figure 2022095666000048
 で示される大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｌ1、Ｌ2、およびＬ3が、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレン、または[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｒ4が、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋが、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＯＣＯ2、ＮＲ3、ＣＯＮＲ3、ＯＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3q（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒa1、Ｒa2またはＲb1への結合点である）であり；
－ 各ｎが、独立して、１、２、３、４または５である、
上記で定義した式で示される化合物またはその薬学的に許容される塩である。
いくつかの態様において、当該化合物は、
－ 各ＬaおよびＬbが、独立して、式－Ｌ1－ＳＲ9Ｒ10－Ｌ2－ＳＲ11Ｒ12－Ｌ3－（式中、各Ｌ1、Ｌ2、およびＬ3は、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、シクロアリーレン、ヘテロシクロアリーレンまたは[－Ｒ4－Ｋ－Ｒ4－]n（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；各Ｒ9、Ｒ10、Ｒ11、およびＲ12は、独立して、存在しないかまたはＯである）で示される大環状分子形成リンカーであり；
－ 各Ｒ4が、独立して、アルキレン、アルケニレン、アルキニレン、ヘテロアルキレン、シクロアルキレン、ヘテロシクロアルキレン、アリーレンまたはヘテロアリーレン（これらはいずれも非置換であるかまたは置換されている）であり；
－ 各Ｋが、独立して、Ｏ、Ｓ、ＳＯ、ＳＯ2、ＣＯ、ＣＯ2、ＯＣＯ2、ＮＲ3、ＣＯＮＲ3、ＯＣＯＮＲ3、ＯＳＯ2ＮＲ3、ＮＲ3q、ＣＯＮＲ3q、ＯＣＯＮＲ3q、またはＯＳＯ2ＮＲ3q（ここで、各Ｒ3qは、独立して、Ｒa1、Ｒa2またはＲb1への結合点である）であり；
－ 各ｎが、独立して、１、２、３、４または５である、
上記で定義した式で示される化合物またはその薬学的に許容される塩である。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、ＬaおよびＬbのうち１つまたは両方が、独立して、ビスチオエーテル含有大環状分子形成リンカーである、上記で定義した式を有する。いくつかの実施態様において、各ＬaおよびＬbは、独立して、式－Ｌ1－Ｓ－Ｌ2－Ｓ－Ｌ3－で示される大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、ＬaおよびＬbのうち１つまたは両方が、独立して、ビススルホン含有大環状分子形成リンカーである、上記で定義した式を有する。いくつかの実施態様において、各ＬaおよびＬbは、独立して、式－Ｌ1－ＳＯ2－Ｌ2－ＳＯ2－Ｌ3－で示される大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、ＬaおよびＬbのうち１つまたは両方が、独立して、ビススルホキシド含有大環状分子形成リンカーである、上記で定義した式を有する。いくつかの実施態様において、各ＬaおよびＬbは、独立して、式－Ｌ1－Ｓ(Ｏ)－Ｌ2－Ｓ(Ｏ)－Ｌ3－で示される大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、１つ以上の二次構造を含む。いくつかの実施態様において、当該化合物は、αヘリックスである二次構造を含む。いくつかの態様において、当該化合物は、βヘアピンターンである二次構造を含む。
いくつかの実施態様において、ｕaは０である。いくつかの態様において、ｕaは０であり、Ｌbは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは０であり、Ｌbは、αヘリックス二次構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕbは０である。いくつかの態様において、ｕbは０であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕbは０であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、αヘリックス二次構造だけを含む。
他の実施態様において、当該化合物は、αヘリックス構造およびβヘアピン構造である二次構造の組み合わせを含む。いくつかの実施態様において、ＬaおよびＬbは、炭化水素含有大環状分子形成リンカー、トリアゾール含有大環状分子形成リンカー、または硫黄含有大環状分子形成リンカーの組み合わせである。いくつかの実施態様において、当該化合物は、ＬaおよびＬb（ここで、Ｌaは、βヘアピン構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである）を含む。いくつかの実施態様において、当該化合物は、ＬaおよびＬb（ここで、Ｌaは、αヘリックス構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、βヘアピン構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである）を含む。いくつかの実施態様において、当該化合物は、ＬaおよびＬb（ここで、Ｌaは、αヘリックス構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、βヘアピン構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである）を含む。いくつかの実施態様において、当該化合物は、ＬaおよびＬb（ここで、Ｌaは、βヘアピン構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである）を含む。
いくつかの実施態様において、ｕa＋ｕbは少なくとも１である。いくつかの実施態様において、ｕa＋ｕb＝２である。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１である。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、βヘアピン二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、βヘアピン二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、βヘアピン構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、βヘアピン二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、βヘアピン二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、βヘアピン二次構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造を架橋するトリアゾール含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、硫黄含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、硫黄含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス二次構造とのトリアゾール含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス二次構造との炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、硫黄含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、硫黄含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス二次構造との炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、硫黄含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、硫黄含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、αヘリックス構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、βヘアピン構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。いくつかの実施態様において、ｕaは１であり、ｕbは１であり、Ｌaは、βヘアピン構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーであり、Ｌbは、αヘリックス構造を架橋する炭化水素含有大環状分子形成リンカーである。
いくつかの実施態様において、Ｒb1はＨである。
いくつかの実施態様において、各ｖおよびｗは、０、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０である。いくつかの実施態様において、ｗは、３～１０００、例えば３～５００、３～２００、３～１００、３～５０、３～３０、３～２０、または３～１０の整数である。いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は３または６である。いくつかの実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は３である。他の実施態様において、ｘ＋ｙ＋ｚの合計は６である。
他に特記しない限り、いずれの化合物（化合物、大環状分子前駆体、および他の組成物を包含する）も、１個以上の同位体濃縮原子の存在だけが異なる化合物を包含することを意味する。例えば、水素の重水素またはトリチウムとの置き換え、または炭素の13Ｃ濃縮または14Ｃ濃縮炭素との置き換えを除けば記載された構造を有する化合物は本開示の範囲内である。
いくつかの実施態様において、本書に記載の化合物は、かかる化合物を構成する原子の１個以上において非天然の割合の原子同位体を含有することができる。例えば、該化合物は、放射性同位体、例えばトリチウム（3Ｈ）、ヨウ素－１２５（125Ｉ）または炭素－１４（14Ｃ）などで放射標識され得る。他の実施態様において、１個以上の炭素原子は、ケイ素原子に置き換えられる。本書に記載の化合物の全ての同位体変化は、放射性であってもなくても、本書において意図される。
本書に記載の化合物は、化学的に、光学的に、異性体的に、エナンチオマー的に、またはジアステレオマー的に、少なくとも純度１％、少なくとも純度２％、少なくとも純度３％、少なくとも純度４％、少なくとも純度５％、少なくとも純度６％、少なくとも純度７％、少なくとも純度８％、少なくとも純度９％、少なくとも純度１０％、少なくとも純度１１％、少なくとも純度１２％、少なくとも純度１３％、少なくとも純度１４％、少なくとも純度１５％、少なくとも純度１６％、少なくとも純度１７％、少なくとも純度１８％、少なくとも純度１９％、少なくとも純度２０％、少なくとも純度２１％、少なくとも純度２２％、少なくとも純度２３％、少なくとも純度２４％、少なくとも純度２５％、少なくとも純度２６％、少なくとも純度２７％、少なくとも純度２８％、少なくとも純度２９％、少なくとも純度３０％、少なくとも純度３１％、少なくとも純度３２％、少なくとも純度３３％、少なくとも純度３４％、少なくとも純度３５％、少なくとも純度３６％、少なくとも純度３７％、少なくとも純度３８％、少なくとも純度３９％、少なくとも純度４０％、少なくとも純度４１％、少なくとも純度４２％、少なくとも純度４３％、少なくとも純度４４％、少なくとも純度４５％、少なくとも純度４６％、少なくとも純度４７％、少なくとも純度４８％、少なくとも純度４９％、少なくとも純度５０％、少なくとも純度５１％、少なくとも純度５２％、少なくとも純度５３％、少なくとも純度５４％、少なくとも純度５５％、少なくとも純度５６％、少なくとも純度５７％、少なくとも純度５８％、少なくとも純度５９％、少なくとも純度６０％、少なくとも純度６１％、少なくとも純度６２％、少なくとも純度６３％、少なくとも純度６４％、少なくとも純度６５％、少なくとも純度６６％、少なくとも純度６７％、少なくとも純度６８％、少なくとも純度６９％、少なくとも純度７０％、少なくとも純度７１％、少なくとも純度７２％、少なくとも純度７３％、少なくとも純度７４％、少なくとも純度７５％、少なくとも純度７６％、少なくとも純度７７％、少なくとも純度７８％、少なくとも純度７９％、少なくとも純度８０％、少なくとも純度８１％、少なくとも純度８２％、少なくとも純度８３％、少なくとも純度８４％、少なくとも純度８５％、少なくとも純度８６％、少なくとも純度８７％、少なくとも純度８８％、少なくとも純度８９％、少なくとも純度９０％、少なくとも純度９１％、少なくとも純度９２％、少なくとも純度９３％、少なくとも純度９４％、少なくとも純度９５％、少なくとも純度９６％、少なくとも純度９７％、少なくとも純度９８％、少なくとも純度９９％、少なくとも純度９９.１％、少なくとも純度９９.２％、少なくとも純度９９.３％、少なくとも純度９９.４％、少なくとも純度９９.５％、少なくとも純度９９.６％、少なくとも純度９９.７％、少なくとも純度９９.８％、または少なくとも純度９９.９％であり得る。純度は、例えば、ＨＰＬＣ、ＭＳ、ＬＣ／ＭＳ、融点、またはＮＭＲによって、評価することができる。
２つ以上のペプチドは、ある程度の相同性を共有することができる。一対のペプチドは、例えば、約２０％までのペアワイズ相同性、約２５％までのペアワイズ相同性、約３０％までのペアワイズ相同性、約３５％までのペアワイズ相同性、約４０％までのペアワイズ相同性、約４５％までのペアワイズ相同性、約５０％までのペアワイズ相同性、約５５％までのペアワイズ相同性、約６０％までのペアワイズ相同性、約６５％までのペアワイズ相同性、約７０％までのペアワイズ相同性、約７５％までのペアワイズ相同性、約８０％までのペアワイズ相同性、約８５％までのペアワイズ相同性、約９０％までのペアワイズ相同性、約９５％までのペアワイズ相同性、約９６％までのペアワイズ相同性、約９７％までのペアワイズ相同性、約９８％までのペアワイズ相同性、約９９％までのペアワイズ相同性、約９９.５％までのペアワイズ相同性、または約９９.９％までのペアワイズ相同性を有することができる。一対のペプチドは、例えば、少なくとも約２０％のペアワイズ相同性、少なくとも約２５％のペアワイズ相同性、少なくとも約３０％のペアワイズ相同性、少なくとも約３５％のペアワイズ相同性、少なくとも約４０％のペアワイズ相同性、少なくとも約４５％のペアワイズ相同性、少なくとも約５０％のペアワイズ相同性、少なくとも約５５％のペアワイズ相同性、少なくとも約６０％のペアワイズ相同性、少なくとも約６５％のペアワイズ相同性、少なくとも約７０％のペアワイズ相同性、少なくとも約７５％のペアワイズ相同性、少なくとも約８０％のペアワイズ相同性、少なくとも約８５％のペアワイズ相同性、少なくとも約９０％のペアワイズ相同性、少なくとも約９５％のペアワイズ相同性、少なくとも約９６％のペアワイズ相同性、少なくとも約９７％のペアワイズ相同性、少なくとも約９８％のペアワイズ相同性、少なくとも約９９％のペアワイズ相同性、少なくとも約９９.５％のペアワイズ相同性、少なくとも約９９.９％のペアワイズ相同性を有することができる。
２つ以上のペプチド間の相同性を決定するために、ＮＣＢＩ ＢＬＡＳＴ、Ｃｌｕｓｔａｌ Ｗ、ＭＡＦＦＴ、Ｃｌｕｓｔａｌ Ｏｍｅｇａ、ＡｌｉｇｎＭｅ、Ｐｒａｌｉｎｅ、または他の好適な方法またはアルゴリズムなどの様々な方法およびソフトウエアプログラムを用いることができる。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、３10またはαヘリックスモチーフなどの少なくとも１つのヘリックスモチーフを含む。例えば、式Ｉ、ＩＩまたはＩＩＩで示される化合物におけるＡ、Ｂ、および／またはＣは、１つ以上のヘリックスを含む。一般的な事柄として、ヘリックスは、１ターンあたり３～４個のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施態様において、該化合物のヘリックスは、１～５ターンを含み、したがって、３～２０個のアミノ酸残基を含む。特定の実施態様において、ヘリックスは、１ターン、２ターン、３ターン、４ターン、または５ターンを含む。いくつかの実施態様において、大環状分子形成リンカーは、化合物内に含まれるヘリックスモチーフを安定化する。かくして、いくつかの実施態様において、１番目のα炭素から２番目のα炭素までの大環状分子形成リンカーＬの長さは、ヘリックスの安定性を増大させるように選択される。いくつかの実施態様において、大環状分子形成リンカーは、ヘリックスの１ターン～５ターンにまたがる。いくつかの実施態様において、大環状分子形成リンカーは、ヘリックスのおよそ１ターン、２ターン、３ターン、４ターン、または５ターンにまたがる。いくつかの実施態様において、大環状分子形成リンカーの長さは、ヘリックスの１ターンあたりおよそ５Å～９Å、またはヘリックスの１ターンあたりおよそ６Å～８Åである。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、長さは、およそ５個の炭素－炭素結合～１３個の炭素－炭素結合、およそ７個の炭素－炭素結合～１１個の炭素－炭素結合、またはおよそ９個の炭素－炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ２ターンにまたがる場合、長さは、およそ８個の炭素－炭素結合～１６個の炭素－炭素結合、およそ１０個の炭素－炭素結合～１４個の炭素－炭素結合、またはおよそ１２個の炭素－炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ３ターンにまたがる場合、長さは、およそ１４個の炭素－炭素結合～２２個の炭素－炭素結合、およそ１６個の炭素－炭素結合～２０個の炭素－炭素結合、またはおよそ１８個の炭素－炭素結合に等しい大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ４ターンにまたがる場合、長さは、およそ２０個の炭素－炭素結合～２８個の炭素－炭素結合、およそ２２個の炭素－炭素結合～２６個の炭素－炭素結合、またはおよそ２４個の炭素－炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ５ターンにまたがる場合、長さは、およそ２６個の炭素－炭素結合～３４個の炭素－炭素結合、およそ２８個の炭素－炭素結合～３２個の炭素－炭素結合、またはおよそ３０個の炭素－炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ４個の原子～１２個の原子、およそ６個の原子～１０個の原子、またはおよそ８個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ２ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ７個の原子～１５個の原子、およそ９個の原子～１３個の原子、またはおよそ１１個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ３ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ１３個の原子～２１個の原子、およそ１５個の原子～１９個の原子、またはおよそ１７個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ４ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ１９個の原子～２７個の原子、およそ２１個の原子～２５個の原子、またはおよそ２３個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ５ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ２５個の原子～３３個の原子、およそ２７個の原子～３１個の原子、またはおよそ２９個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ１７個の構成員～２５個の構成員、およそ１９個の構成員～２３個の構成員、またはおよそ２１個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ２ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ２９個の構成員～３７個の構成員、およそ３１個の構成員～３５個の構成員、またはおよそ３３個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ３ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ４４個の構成員～５２個の構成員、およそ４６個の構成員～５０個の構成員、またはおよそ４８個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ４ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ５９個の構成員～６７個の構成員、およそ６１個の構成員～６５個の構成員、またはおよそ６３個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ５ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ７４個の構成員～８２個の構成員、およそ７６個の構成員～８０個の構成員、またはおよそ７８個の構成員を含有する環を形成する。
いくつかの実施態様において、安定化ペプチドは、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０個のアミノ酸を有する。ペプチドは、１つ以上の不斉中心を含有することができ、かくして、ラセミ化合物およびラセミ混合物、単一のエナンチオマー、個々のジアステレオマーおよびジアステレオマー混合物、ならびに存在するオレフィンの幾何異性体（例えば、Ｚまたはcis、およびＥまたはtrans）として生じることができる。例えば、本書に記載のペプチドは、例えば、cis－およびtrans－異性体、Ｒ－およびＳ－エナンチオマー、ジアステレオマー、(Ｄ)－異性体、(Ｌ)－異性体、そのラセミ混合物、ならびに他のその混合物を包含する特定の幾何異性体または立体異性体形態で存在することができる。エナンチオマーは、それらの対応するエナンチオマーを含まなくてもよく（例えば、実質的に含まなくてもよく）、および／または光学的に濃縮されていてもよい。本書で用いる場合、「光学的に濃縮されている」とは、化合物が有意に大きい割合の１つのエナンチオマーで構成されていることを意味する。特定の実施態様において、実質的に含まないとは、組成物が少なくとも約９０重量％の好ましいエナンチオマーを含有することを意味する。他の実施態様において、化合物は、少なくとも約９５重量％、９８重量％、または９９重量％の好ましいエナンチオマーから構成される。好ましいエナンチオマーは、例えばキラル高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）ならびにキラル塩の形成および結晶化が挙げられるがこれらに限定されない当該技術分野において知られている技術を用いて、ラセミ混合物から単離することができるか、または、不斉合成によって製造することができる（例えば、Jacques, et al, Enantiomers, Racemates and Resolutions (Wiley Interscience, New York, 1981)；Wilen, S. H., et al., Tetrahedron 33:2725 (1977)；Eliel, EX. Stereochemistry of Carbon Compounds (McGraw- Hill, NY, 1962)；Wilen, S.H. Tables of Resolving Agents and Optical Resolutions p. 268 (EX. Eliel, Ed., Univ. of Notre Dame Press, Notre Dame, IN 1972を参照）。これらの化合物のかかる異性体形態は全て、本発明に明示的に包含される。
ペプチドは、また、複数の互変異性体形態で表すこともでき、このような場合、本発明は、本書に記載の化合物の全ての互変異性体形態（例えば、複数の部位でのアルキル化が位置異性体を生じ得る場合、平衡状態の異性体（例えば、ケト－エノール））、位置異性体、および本書に記載の化合物の酸化生成物を自明的に包含する（本発明は、このような反応生成物を全て自明的に包含する）。このような化合物のかかる異性体形態は全て、全ての結晶形態と同様に包含される。
用語「ハロ」とは、フッ素、塩素、臭素またはヨウ素のラジカルをいう。用語「アルキル」とは、示された数の炭素原子を含有する直鎖であっても分枝鎖であってもよい炭化水素鎖をいう。例えば、Ｃ1～Ｃ10は、基が１～１０個（境界も含む）の炭素原子を有し得ることを示す。数字表示がない場合、「アルキル」は、１～２０個（境界も含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分枝鎖）である。用語「アルキレン」とは、二価のアルキル（すなわち、－Ｒ－）をいう。
用語「アルケニル」とは、ＺまたはＥいずれかの幾何学的配置の炭素－炭素二重結合を１つ以上有する直鎖であっても分枝鎖あってもよい炭化水素鎖をいう。アルケニル部分は、所定の数の炭素原子を含有する。例えば、Ｃ2～Ｃ10は、基が２個～１０個（境界も含む）の炭素原子を有し得ることを示す。用語「低級アルケニル」とは、Ｃ2～Ｃ8アルケニル鎖をいう。数字表示がない場合、「アルケニル」は、２～２０個（境界も含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分枝鎖）である。
用語「アルキニル」とは、炭素－炭素三重結合を１つ以上有する直鎖であっても分枝鎖であってもよい炭化水素鎖をいう。アルキニル部分は、示された数の炭素原子を含有する。例えば、Ｃ2～Ｃ10は、基が２～１０個（境界も含む）の炭素原子を有し得ることを示す。用語「低級アルキニル」とは、Ｃ2～Ｃ8アルキニル鎖をいう。数字表示がない場合、「アルキニル」は、２～２０個（境界も含む）の炭素原子を有する鎖（直鎖または分枝鎖）である。
用語「アリール」とは、各環の０個、１個、２個、３個、４個または５個の原子が置換基によって置換され得る、６炭素単環式または１０炭素二環式芳香族環系をいう。アリール基の例としては、フェニル、ナフチルなどが挙げられる。用語「アリールアルキル」または用語「アラルキル」とは、アリールで置換されたアルキルをいう。用語「アリールアルコキシ」とは、アリールで置換されたアルコキシをいう。
本書で用いる場合、用語「シクロアルキル」は、３～１２個の炭素、好ましくは３～８個の炭素、より好ましくは３～６個の炭素を有する飽和または部分不飽和環状炭化水素基を包含し、ここで、該シクロアルキル基は、さらに、置換されていてもよい。好ましいシクロアルキル基としては、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、シクロペンテニル、シクロヘキシル、シクロヘキセニル、シクロヘキサジエニル、シクロヘプチル、シクロヘプタジエニル、シクロヘプタトリエニル、シクロオクチル、シクロオクテニル、シクロオクタジエニル、シクロオクタトリエニル、およびシクロオクチニルが挙げられるが、これらに限定されない。
用語「ヘテロアリール」とは、単環式の場合には１～３個のヘテロ原子、二環式の場合には１個～６個のヘテロ原子、または三環式の場合には１～９個のヘテロ原子を有し（ここで、該ヘテロ原子は、Ｏ、ＮまたはＳから選択される）（例えば、単環式、二環式または三環式の場合にそれぞれ炭素原子および１～３個、１～６個、または１～９個のＮ、ＯまたはＳのヘテロ原子）、各環の０個、１個、２個、３個または４個の原子が置換基によって置換され得る、芳香族５～８員単環式環系、芳香族８～１２員二環式環系、または芳香族１１～１４員三環式環系をいう。ヘテロアリール基の例としては、ピロリル、ピリジル、フリルまたはフラニル、イミダゾリル、１,２,３－トリアゾリル、１,２,４－トリアゾリル、ベンゾイミダゾリル、ピリダジル、ピリミジル、チオフェニル、キノリニル、インドリル、チアゾリル、オキサゾリル、イソオキサゾリルなどが挙げられる。用語「ヘテロアリールアルキル」または用語「ヘテロアラルキル」とは、ヘテロアリールで置換されたアルキルをいう。用語「ヘテロアリールアルコキシ」とは、ヘテロアリールで置換されたアルコキシをいう。
用語「ヘテロシクリル」とは、単環式の場合には１～３個のヘテロ原子、二環式の場合には１～６個のヘテロ原子、または三環式の場合には１～９個のヘテロ原子を有し（ここで、該ヘテロ原子は、Ｏ、ＮまたはＳから選択される）（例えば、単環式、二環式または三環式の場合にそれぞれ炭素原子および１～３個、１～６個、または１～９個のＮ、ＯまたはＳのヘテロ原子）、各環の０個、１個、２個または３個の原子が置換基によって置換され得る、非芳香族５～８員単環式環系、非芳香族８～１２員二環式環系または非芳香族１１～１４員三環式環系をいう。ヘテロシクリル基の例としては、ピペラジニル、ピロリジニル、ジオキサニル、アジリジニル、オキシリル、チイリル（thiiryl）、モルホリニル、テトラヒドロフラニルなどが挙げられる。
用語「置換基」とは、アルキル基、シクロアルキル基、アリール基、ヘテロシクリル基またはヘテロアリール基においてその基のいずれかの原子において「置換される」基をいう。好適な置換基としては、ハロ基、ヒドロキシ基、メルカプト基、オキソ基、ニトロ基、ハロアルキル基、アルキル基、アルカリール（alkaryl）基、アリール基、アラルキル基、アルコキシ基、チオアルコキシ基、アリールオキシ基、アミノ基、アルコキシカルボニル基、アミド基、カルボキシ基、アルカンスルホニル基、アルキルカルボニル基、アジド基およびシアノ基が挙げられるが、これらに限定されない。
炭化水素テザーが記載されているが、他のテザーも想定される。例えば、テザーは、エーテル部分、チオエーテル部分、エステル部分、アミン部分またはアミド部分のうちの１つ以上を含むことができる。いくつかの場合、天然アミノ酸側鎖をテザーに組み込むことができる。例えば、テザーは、セリン中のヒドロキシル、システイン中のチオール、リジン中の第一アミン、アスパルテートまたはグルタメート中の酸、またはアスパラギンもしくはグルタミン中のアミドなどの官能基とカップリングすることができる。したがって、２つの非天然アミノ酸をカップリングすることによって製造されるテザーを用いるのではなく天然アミノ酸を用いてテザーを作成することが可能である。また、単一の非天然アミノ酸を天然アミノ酸と一緒に用いることも可能である。
さらに、テザーの長さは変えることができることも想定される。例えば、二次αヘリックス構造に比較的高度な拘束を与えることが望ましい場合には、より短いテザーを用いることができるが、一方、二次αヘリックス構造にあまり拘束を与えないことが望ましい場合があり、したがって、より長いテザーが望ましい場合がある。
加えて、主にαヘリックスの単一面上にあるテザーを提供するために、アミノ酸ｉからｉ＋３に、ｉからｉ＋４に；およびｉからｉ＋７にまたがるテザーの例が記載されているが、該テザーは、多数のアミノ酸のあらゆる組み合わせにもまたがるように合成することができる。
いくつかの場合、α二置換アミノ酸は、ポリペプチドにおいて、αヘリックス二次構造の安定性を向上させるために使用される。しかしながら、α二置換アミノ酸は必要ではなく、モノα置換基を用いる場合（例えば、テザー化アミノ酸において）も想定される。
ステープル化ポリペプチドは、薬物（例えば、抗生物質；以下を参照）、トキシン、ポリエチレングリコールの誘導体；第２のポリペプチド；炭水化物などを含むことができる。ポリマーまたは他の薬剤がステープル化ポリペプチドに結合する場合、組成物が実質的に均一であることが望ましい場合がある。
ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）部分の付加は、ポリペプチドの薬物動態学的および薬力学的特性を向上させることができる。例えば、ＰＥＧ化は、腎クリアランスを低下させ、より安定な血漿濃度をもたらすことができる。ＰＥＧは、水溶性ポリマーであり、ポリペプチドと連結するように、式：
ＸＯ－－(ＣＨ2ＣＨ2Ｏ)n－－ＣＨ2ＣＨ2－－Ｙ
［式中、ｎは２～１０,０００であり、ＸはＨまたは末端修飾、例えば、Ｃ1-4アルキルであり；Ｙは、ポリペプチドのアミン基（リジンのεアミン、またはＮ末端が挙げられるがこれらに限定されるものではない）への、アミドリンケージ、カルバメートリンケージまたは尿素リンケージである］
として表すことができる。Ｙは、チオール基（システインのチオール基が挙げられるが、これに限定されるものではない）へのマレイミドリンケージであってもよい。ＰＥＧをポリペプチドへ直接または間接的に連結するための他の方法は、当該技術分野の当業者に知られている。ＰＥＧは、直鎖であっても分枝鎖であってもよい。種々の官能性誘導体を包含する種々の形態のＰＥＧが市販されている。
骨格に分解性リンケージを有するＰＥＧを使用することができる。例えば、ＰＥＧは、加水分解を受けるエステルリンケージを用いて製造することができる。分解性ＰＥＧリンケージを有するコンジュゲート体は、例えば、国際公開第９９／３４８３３号、国際公開第９９／１４２５９号および米国特許第６,３４８,５５８号に記載されている。
特定の実施態様において、高分子ポリマー（例えば、ＰＥＧ）は、中間リンカーを介して本書に記載の薬剤に結合する。特定の実施態様において、該リンカーは、ペプチド結合によって連結される１～２０個のアミノ酸から構成され、ここで、該アミノ酸は、２０個の天然アミノ酸から選択される。これらのアミノ酸のいくつかは、当業者によって十分に理解されるように、グリコシル化され得る。他の実施態様において、この１～２０個のアミノ酸は、グリシン、アラニン、プロリン、アスパラギン、グルタミンおよびリジンから選択される。他の実施態様において、リンカーは、グリシンおよびアラニンのような立体障害のない大多数のアミノ酸から構成される。非ペプチドリンカーもまた可能である。例えば、－ＮＨ(ＣＨ2)nＣ(Ｏ)－（ここで、ｎ＝２～２０である）のようなアルキルリンカーを使用することができる。これらのアルキルリンカーは、さらに、低級アルキル（例えば、Ｃ1～Ｃ6）、低級アシル、ハロゲン（例えば、Ｃｌ、Ｂｒ）、ＣＮ、ＮＨ2、フェニルなどの立体障害のない基によって置換され得る。米国特許第５,４４６,０９０号には、二官能性ＰＥＧリンカー、およびＰＥＧリンカー末端の各々にペプチドを有するコンジュゲート体の形成におけるその使用が記載されている。
本書に記載の化合物の合成方法は、当該技術分野において知られている。それにもかかわらず、以下に例示する方法を用いることができる。所望の化合物を得るために種々の工程を別のシーケンスまたは順序で行うことができることが理解される。本書に記載の所望の化合物の合成に有用な合成化学変換および保護基方法（保護および脱保護）は当該技術分野において知られており、例えば、R. Larock, Comprehensive Organic Transformations, VCH Publishers (1989)；T.W. Greene and P.G.M. Wuts, Protective Groups in Organic Synthesis, 3d. Ed., John Wiley and Sons (1999)；L. Fieser and M. Fieser, Fieser and Fieser's Reagents for Organic Synthesis, John Wiley and Sons (1994)；およびL. Paquette, ed., Encyclopedia of Reagents for Organic Synthesis, John Wiley and Sons (1995)、ならびにそれらの続版に記載されるようなものが挙げられる。
本発明のペプチドは、当業者に周知の化学合成方法によって作成することができる。例えば、Fields et al., Chapter 3 in Synthetic Peptides: A User's Guide, ed. Grant, W. H. Freeman & Co., New York, N.Y., 1992, p. 77。故に、ペプチドは、例えばＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ Ｐｅｐｔｉｄｅ ＳｙｎｔｈｅｓｉｚｅｒＴＭ Ｍｏｄｅｌ ４３０Ａまたは４３１にて、側鎖保護アミノ酸を用いて、ｔ－ＢｏｃまたはＦｍｏｃ化学によって保護されたα－ＮＨ2を用いる固相合成法の自動Ｍｅｒｒｉｆｉｅｌｄ技術を用いて合成することができる。
本書に記載のペプチドを作成する１つの方法は、固相ペプチド合成法（ＳＰＰＳ）を用いることである。Ｃ末端アミノ酸は、リンカー分子との酸不安定性結合を介して架橋ポリスチレン樹脂に結合する。この樹脂は、比較的簡単かつ迅速に過剰の試薬および副生成物を洗浄する、合成に使用される溶媒に不溶である。Ｎ末端は、酸において安定であるが塩基によって除去可能であるＦｍｏｃ基で保護される。側鎖官能基は、塩基安定で酸不安定な基によって保護される。
長いペプチドは、ネイティブ・ケミカル・ライゲーションを用いて個々の合成ペプチドを結合することによって作成され得る。別法として、この長い合成ペプチドは、周知の組換えＤＮＡ技術によって合成することができる。かかる技術は、周知の標準マニュアルにて詳細なプロトコールとともに提供されている。本発明のペプチドをコードする遺伝子を構築するために、好ましくは該遺伝子が発現される生物に最適なコドンを用いて、該アミノ酸配列を逆翻訳して、アミノ酸配列をコードする核酸配列を得る。次に、必要に応じて、典型的にはペプチドおよびあらゆる調節エレメントをコードするオリゴヌクレオチドを合成することによって合成遺伝子を作成する。該合成遺伝子を好適なクローニングベクターに挿入し、宿主細胞内に導入する。次いで、該ペプチドを、選択した発現系および宿主にとって適切な好適な条件下で発現させる。標準的な方法によって該ペプチドの精製および特徴付けを行う。
該ペプチドは、ハイスループットコンビナトリアル法で、例えばAdvanced Chemtechから入手可能なハイスループット多重チャネルコンビナトリアルシンセサイザーを用いて、作成することができる。
ペプチド結合を、例えばペプチドの生理学的安定性を増大させるために、レトロインベルソ結合（Ｃ(Ｏ)－ＮＨ）；還元アミド結合（ＮＨ－ＣＨ2）；チオメチレン結合（Ｓ－ＣＨ2またはＣＨ2－Ｓ）；オキソメチレン結合（Ｏ－ＣＨ2またはＣＨ2－Ｏ）；エチレン結合（ＣＨ2－ＣＨ2）；チオアミド結合（Ｃ(Ｓ)－ＮＨ）；trans－オレフィン結合（ＣＨ＝ＣＨ）；フルオロ置換trans－オレフィン結合（ＣＦ＝ＣＨ）；ケトメチレン結合（Ｃ(Ｏ)－ＣＨＲ）またはＣＨＲ－Ｃ(Ｏ）（ここで、ＲはＨまたはＣＨ3である）；およびフルオロ－ケトメチレン結合（Ｃ(Ｏ)－ＣＦＲまたはＣＦＲ－Ｃ(Ｏ）（ここで、ＲはＨまたはＦまたはＣＨ3である）に置き換えることができる。
さらに、アセチル化、アミド化、ビオチニル化、シンナモイル化、ファルネシル化、フルオレセイン化、ホルミル化、ミリストイル化、パルミトイル化、リン酸化（Ｓｅｒ、ＴｙｒまたはＴｈｒ）、ステアロイル化、スクシニル化およびスルフリル化によって、ポリペプチドを修飾することができる。上記したように、ペプチドを、例えば、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）；アルキル基（例えば、Ｃ1～Ｃ20直鎖または分枝鎖アルキル基）；脂肪酸ラジカル；およびそれらの組み合わせとコンジュゲートすることができる。
さまざまな長さのオレフィン系側鎖を含有するα,α－二置換非天然アミノ酸は、公知の方法によって合成することができる（Williams et al. J. Am. Chem. Soc., 113:9276, 1991; Schafmeister et al., J. Am. Chem Soc., 122:5891, 2000；およびBird et al., Methods Enzymol., 446:369, 2008; Bird et al, Current Protocols in Chemical Biology, 2011）。ペプチドについて、ｉとｉ＋７を連結するステープル（i linked to i+7 staple）を用いる場合（安定化されたヘリックスの２ターン）、ａ）１個のＳ5アミノ酸および１個のＲ8が使用されるか、またはｂ）１個のＳ8アミノ酸および１個のＲ5アミノ酸が使用される。Ｒ8は、出発キラル補助基がＲ－アルキル－立体異性体を与えることを除けば同じ経路を用いて合成される。また、５－ヨードペンテンに代えて８－ヨードオクテンを用いる。阻害剤は、ＭＢＨＡ樹脂において固相ペプチド合成法（ＳＰＰＳ）を用いて固体支持体上で合成される（例えば、国際公開第２０１０／１４８３３５号を参照）。
Ｆｍｏｃ保護α－アミノ酸（オレフィン系アミノ酸Ｆｍｏｃ－Ｓ5－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｒ8－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｒ8－ＯＨ、Ｆｍｏｃ－Ｓ8－ＯＨおよびＦｍｏｃ－Ｒ5－ＯＨ以外）、２－(６－クロロ－１－Ｈ－ベンゾトリアゾール－１－イル)－１,１,３,３－テトラメチルアミニウム・ヘキサフルオロホスフェート（ＨＣＴＵ）、およびＲｉｎｋ Ａｍｉｄｅ ＭＢＨＡは、例えば、Novabiochem（San Diego, CA）から市販されている。ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）、Ｎ－メチル－２－ピロリジノン（ＮＭＰ）、Ｎ,Ｎ－ジイソプロピルエチルアミン（ＤＩＥＡ）、トリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）、１,２－ジクロロエタン（ＤＣＥ）、フルオロセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、およびピペリジンは、例えば、Sigma-Aldrichから市販されている。オレフィン系アミノ酸合成は、当該技術分野において報告されている（例えば、Williams et al., Org. Synth., 80:31, 2003を参照）。
本発明の化合物は、選択的生物学的特性（例えば、疎水性、および／または、疎水性パッチの位置／出現率（occurrence）を包含する）を増強するために適切な官能性を付加することによって修飾され得る。このような修飾は、当該技術分野で知られており、所定の生物学的コンパートメント（例えば、血液、リンパ系、中枢神経系）への生物学的浸透を増大させるもの、経口アベイラビリティを増大させるもの、注射による投与を可能にする溶解性を増大させるもの、代謝を改変するもの、および排泄率を改変するものを包含する。
微生物の膜対哺乳動物の膜に対して選択的である安定化抗微生物ペプチド（すなわち、微生物を死滅させることまたはその増殖を阻害することができるが、哺乳動物細胞を溶解するかまたはその増殖を阻害する能力は比較的低いペプチド）は、１種以上の微生物に対して、例えば、同一の１種以上の微生物に対する対応する親（すなわち、非修飾）非内部架橋ペプチドのＭＩＣよりも約１.５倍以上低い、約２倍以上低い、約２.５倍以上低い、約３倍以上低い、約４倍以上低い、約５倍以上低い、約６倍以上低い、約７倍以上低い、約８倍以上低い、約９倍以上低い、約１０倍以上低い、約１５倍以上低いまたは約２０倍以上低いＭＩＣを有し得る。微生物の膜対哺乳動物の膜に対して選択的である抗微生物ペプチドは、例えば、約１μｇ／ｍｌ、約２μｇ／ｍｌ、約３μｇ／ｍｌ、約４μｇ／ｍｌ、約５μｇ／ｍｌ、約６μｇ／ｍｌ、約７μｇ／ｍｌ、約８μｇ／ｍｌ、約９μｇ／ｍｌ、約１０μｇ／ｍｌ、約１２μｇ／ｍｌ、約１４μｇ／ｍｌ、約１６μｇ／ｍｌ、約１８μｇ／ｍｌ、約２０μｇ／ｍｌ、約２２μｇ／ｍｌ、約２４μｇ／ｍｌ、約２６μｇ／ｍｌ、約２８μｇ／ｍｌまたは約３０μｇ／ｍｌのＭＩＣを有することができる。
加えて、微生物の膜対哺乳動物の膜に対して選択的である抗微生物ペプチドは、ＲＢＣ溶血活性アッセイにおいて、１種以上の微生物に対するＭＩＣで投与された場合、例えば、約５０％未満、約４０％未満、約３０％未満、約２５％未満、約２０％未満、約１５％未満、約１０％未満、約５％未満、約２.５％未満、約２％未満または約１％未満の赤血球（ＲＢＣ）を溶解し得る。微生物の膜対哺乳動物の膜に対して選択的である抗微生物ペプチドは、例えば、１種以上の微生物に対するＭＩＣの１.５倍、２倍、２.５倍、３倍、４倍、５倍、６倍、７倍、８倍、９倍または１０倍よりも高いかまたはおよそ等しい濃度で投与された場合、ＲＢＣ溶血活性アッセイにおいて、約５０％未満、約４０％未満、約３０％未満、約２５％未満、約２０％未満、約１５％未満、約１０％未満、約５％未満、約２.５％未満、約２％未満または約１％未満の赤血球（ＲＢＣ）を溶解し得る。微生物の膜対哺乳動物の膜に対して選択的である抗微生物ペプチドのＲＢＣ溶血活性は、対応する親（すなわち、非修飾）非内部架橋ペプチドのＲＢＣ溶血活性よりも低いか、または該ＲＢＣ溶血活性とおよそ等しいか、または該ＲＢＣ溶血活性よりも１.５倍未満大きいか、２倍未満大きいか、２.５倍未満大きいか、３倍未満大きいか、４倍未満大きいか、５倍未満大きいか、６倍未満大きいか、７倍未満大きいか、８倍未満大きいか、９倍未満大きいか、もしくは１０倍未満大きい。
ペプチドまたはタンパク質内の疎水性パッチは、ペプチドまたはタンパク質の構造の、例えば、コンピューターによる予測／シミュレーション（例えば、ＥｘＰＡＳｙ ＰｒｏｔＳｃａｌｅ、Ｓｃｏｏｂｙドメイン予測、ＰＳＩＰＲＥＤ、疎水性クラスター分析、Ｋｙｔｅ Ｄｏｏｌｉｔｔｌｅプロッティング、および／またはＳＰＬＩＴを用いる）および／または実験的決定（例えば、分光法、電子顕微鏡、ホモロジーモデリング、Ｘ線および／またはニュートロン小角散乱（ＳＡＸＳ／ＳＡＮＳ）、および／またはＸ線結晶解析を含む技術を用いる）を包含する、当該技術分野において一般的に知られている技術を用いて同定することができる。
本発明の化合物の薬学的に許容される塩としては、薬学的に許容される無機および有機の酸および塩基から誘導されるものが挙げられる。好適な酸塩の例としては、include酢酸塩、アジピン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、酪酸塩、クエン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グリコール酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、乳酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、２－ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、パルモ酸塩（palmoate）、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、サリチル酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸、トシル酸塩、トリフルオロメチルスルホン酸塩、およびウンデカン酸塩が挙げられる。適切な塩基から誘導される塩としては、アルカリ金属（例えば、ナトリウム）塩、アルカリ土類金属（例えば、マグネシウム）塩、アンモニウム塩およびＮ－(アルキル)４＋塩が挙げられる。本発明は、また、本書に記載の化合物の塩基性窒素含有基の４級化を想定する。水溶性もしくは油溶性または水分散性もしくは油分散性生成物は、このような４級化によって得ることができる。
本書に記載のペプチドを得る（例えば、合成する）、ステープリングする、および精製するのに好適な方法も当該技術分野において知られており（例えば、Bird et. al., Methods in Enzymol., 446:369-386 (2008); Bird et al, Current Protocols in Chemical Biology, 2011; Walensky et al., Science, 305:1466-1470 (2004); Schafmeister et al., J. Am. Chem. Soc., 122:5891-5892 (2000)；２０１０年３月１８日に出願された米国特許出願第１２／５２５,１２３号；および２０１０年５月２５日に発行された米国特許第７,７２３,４６８号（各々、出典明示によりその全体として本明細書の一部を構成する）を参照）、本書に記載されている。
いくつかの実施態様において、ペプチドは、非ステープル化ペプチド夾雑物を実質的に含まないか、または単離される。ペプチドの精製方法は、例えば、固相支持体上でペプチドを合成することを含む。環化後、固相支持体を単離し、ＤＭＳＯ、ＤＭＳＯ／ジクロロメタン混合物、またはＤＭＳＯ／ＮＭＰ混合物などの溶媒の溶液に懸濁することができる。ＤＭＳＯ／ジクロロメタン混合物またはＤＭＳＯ／ＮＭＰ混合物は、ＤＭＳＯを約３０％、４０％、５０％、または６０％含むことができる。特定の実施態様において、５０％／５０％のＤＭＳＯ／ＮＭＰ溶液が使用される。該溶液は、１、６、１２または２４時間インキュベートすることができ、その後、該樹脂を、例えばジクロロメタンまたはＮＭＰで、洗浄することができる。ある実施態様において、該樹脂はＮＭＰで洗浄される。振盪し、該溶液に不活性ガスを通気することができる。
本発明の架橋ポリペプチドの特性は、例えば下記の方法を用いて、アッセイすることができる。
αヘリックス度を決定するアッセイ： 化合物を水性溶液（例えば、ｐＨ７の５ｍＭリン酸カリウム溶液、または蒸留水、２５～５０μＭの濃度まで）に溶解する。分光偏光計（例えば、Ｊａｓｃｏ Ｊ－７１０、Aviv）において標準的な測定パラメータ（例えば、温度、２０℃；波長、１９０～２６０ｎｍ；ステップ解像度（step resolution）、０.５ｎｍ；速度、２０ｎｍ／秒；蓄積、１０；応答、１秒；帯域幅、１ｎｍ；光路長、０.１ｃｍ）を用いて円偏光二色性（ＣＤ）スペクトルを得る。平均残基楕円率をモデルヘリックスデカペプチドについて報告されている値（Yang et al., Methods Enzymol. 130:208 (1986)）で割ることによって、各ペプチドのαヘリックス含有量を算出する。
融解温度（Ｔｍ）を決定するアッセイ： 架橋または非修飾テンプレートペプチドを蒸留水または他の緩衝液もしくは溶媒に溶解し（例えば、５０μＭの最終濃度で）、分光偏光計（例えば、Ｊａｓｃｏ Ｊ－７１０、Aviv）において標準的なパラメータ（例えば、波長２２２ｎｍ；ステップ解像度、０.５ｎｍ；速度、２０ｎｍ／秒；蓄積、１０；応答、１秒；帯域幅、１ｎｍ；温度上昇率：１℃／分；光路長、０.１ｃｍ）を用いて、ある温度範囲（例えば、４～９５℃）にわたって楕円率の変化を測定することによってＴｍを決定する。
インビトロプロテアーゼ耐性アッセイ： ペプチド骨格のアミド結合は、プロテアーゼによる加水分解を受けやすく、それによって、ペプチド系化合物はインビボで急速に分解しやすくなる。しかしながら、ペプチドヘリックス形成は、典型的にはアミド骨格を埋没させ、および／またはひずませ、および／または保護し、したがって、タンパク質分解的切断を予防するかまたは実質的に遅らせることができる。本発明のペプチド模倣大環状分子をインビトロ酵素タンパク質分解（例えば、トリプシン、キモトリプシン、ペプシン）させて、対応する非架橋または別にステープル化されたポリペプチドと比べた分解速度の変化について評価することができる。例えば、該ペプチド模倣大環状分子および対応する非架橋ポリペプチドを、トリプシンアガロースと一緒にインキュベートし、該反応物を遠心分離によって様々な時点で反応をクエンチし、その後ＨＰＬＣ注入して２８０ｎｍでの紫外線吸収により残存基質を定量する。簡潔に述べると、該ペプチド模倣大環状分子およびペプチド模倣体前駆体（５ｍｃｇ）を、トリプシンアガロース（Pierce）（Ｓ／Ｅ約１２５）と一緒に０、１０、２０、９０、および１８０分間インキュベートする。高速での卓上遠心分離によって反応をクエンチし；単離した上清中に残存している基質を２８０ｎｍでのＨＰＬＣによるピーク検出によって定量する。タンパク質分解反応は一次速度則を示し、ｌｎ［Ｓ］対時間のプロットから速度定数、ｋを決定する。
模倣大環状分子および／または対応する非架橋ポリペプチドを、各々、マウス、ラットおよび／またはヒトの新鮮な血清（例えば、１～２ｍＬ）と一緒に、３７℃で、例えば、０、１、２、４、８および２４時間インキュベートすることができる。大環状分子濃度が異なる試料を血清による段階希釈によって調製することができる。インタクトな化合物のレベルを決定するために、以下の手順を用いることができる：例えば、血清１００μｌを２ｍｌ遠心管に移し、その後、５０％ギ酸１０μＬおよびアセトニトリル５００μＬを添加し、４±２℃で１０分間、１４,０００ＲＰＭで遠心分離することにより、試料を抽出する。次いで上清を新しい２ｍｌチューブに移し、ＴｕｒｂｏｖａｐにおいてＮ2＜１０ｐｓｉ下にて３７℃で蒸発させる。試料をアセトニトリル：水（５０：５０）１００μＬで再構成し、ＬＣ－ＭＳ／ＭＳ分析を行った。エクスビボ安定性を試験するための同等または同様の手順は知られており、血清における大環状分子の安定性を決定するために使用することができる。
インビボプロテアーゼ耐性アッセイ： ペプチドステープリングの重要な利益は、インビトロプロテアーゼ耐性の、顕著に向上したインビボでの薬物動態への変換である。強力で選択的な抗微生物活性を有する構造的に安定化したＩ－ＴＡＭＰを、例えば従前に公開された方法（例えば、Bird et al, PNAS, 2010を参照）を用いて、インビボでのプロテアーゼ安定性についてスクリーニングする。
医薬組成物
医薬組成物としての使用または医薬組成物における使用のために、本書に記載の安定化ペプチドの１種以上（例えば、配列番号１４～３６を含む、配列番号１～１３のうちの１種以上を有するＩ－ＴＡＭＰ由来のもの）を製剤化することができる。かかる組成物は、あらゆる経路、例えば、食品医薬品局（Food and Drug Administration）（ＦＤＡ）によって承認されたあらゆる経路による対象体への投与のために製剤化または適合させることができる。例示的な方法は、ＦＤＡデータ標準マニュアル（Data Standards Manual）（ＤＳＭ）に記載されている。
本発明の医薬組成物は、例えば、経口的に、非経口的に、吸入スプレーもしくはネブライザーによって、局所に、直腸に、鼻腔に、頬側に、膣に、植え込みリザーバーによって、注射によって（例えば、静脈内に、動脈内に、真皮下に（subdermally）、腹腔内に、筋肉内に、および／または皮下に（subcutaneously））、眼科用製剤で、または経粘膜投与によって、投与され得る。好適な投与量は、約０.００１～約１００ｍｇ／ｋｇ体重の範囲であり得るか、または特定の薬物の要求に応じた範囲であり得る。本発明の医薬組成物は、慣用の非毒性の薬学的に許容される担体、補助剤またはビヒクルを含有し得る。いくつかの場合において、該製剤のｐＨは、薬学的に許容される酸、塩基または緩衝剤で調整して、製剤化された化合物もしくはその送達形態の安定性を増大させることができる。本書で用いる場合、非経口という用語は、皮下、皮内、静脈内、筋肉内、関節内、動脈内、滑膜内、胸骨内、髄腔内、病巣内および頭蓋内の注射または注入技術を包含する。別法として、または、加えて、本発明は、ＦＤＡ ＤＳＭに記載されるような方法のいずれかに従って投与することができる。
本書で用いる場合、本書に記載の式で示される化合物を包含する本発明の化合物は、その薬学的に許容される誘導体またはプロドラグを包含するように定義される。「薬学的に許容される誘導体またはプロドラッグ」とは、レシピエントへの投与後に本発明の化合物を（直接または間接的に）提供する能力を有する、本書に記載の化合物または薬剤のいずれもの薬学的に許容される塩、エステル、エステルの塩、または他の誘導体を意味する。特に望ましい誘導体およびプロドラッグは、本発明の化合物を哺乳動物に投与した場合に（例えば、経口投与した化合物を血中にさらに容易に吸収させることによって）本発明の化合物のバイオアベイラビリティを増大させるものまたは、生物学的コンパートメント（例えば、脳またはリンパ系）への親化合物の送達を親種と比べて増強するものである。好ましいプロドラッグとしては、水溶解度または腸膜を介する能動輸送を増強する基が本書に記載の式の構造に付加されている誘導体を含む。
いくつかの場合において、医薬組成物は、１種以上の安定化ペプチドの有効量を含むことができる。本書で用いる場合、用語「有効量」および「処置に有効な」とは、所定の効果または生理学的結果（例えば、感染症の処置）をもたらすためのその投与の状況内で有効な一定期間（急性または慢性投与および定期的または継続投与を包含する）用いられる、本書に記載の１種以上の化合物または医薬組成物の量または濃度をいう。
本書における方法は、化合物または化合物の組成物の、所望の効果または記載の効果を達成するために有効な量の投与を企図する。典型的には、本発明の医薬組成物は、１日に約１～約６回投与される、または、別法として、持続注入として投与される。かかる投与は、慢性または急性治療として用いることができる。単一剤形を調製するために担体材料と合わせることができる有効成分の量は処置される宿主および特定の投与様式に依存して変わる。典型的な製剤は、約５％～約９５％（ｗ／ｗ）の活性化合物を含有する。別法として、かかる製剤は、約２０％～約８０％の活性化合物を含有する。
投薬は種々の技術を用いて決定することができる。選択された投与量レベルは、例えば、用いられる特定化合物の活性、投与経路、投与時間、用いられている特定化合物の排泄または代謝の速度、処置期間、用いられる特定化合物と合わせて用いられる他の薬物、化合物および／または物質、処置を受ける患者の年齢、性別、体重、状態、総体的な健康、および治療歴、および医療分野で周知の同様の要因を含む種々の要因に依存し得る。投与量の値は、また、軽減すべき状態の重篤度によっても変わり得る。特定の対象体について、個々の必要性および組成物の投与を管理または監督する人の専門的な判断に従って、特定の投与計画を経時的に調整することができる。
いくつかの実施態様において、本開示の化合物の好適な日用量は、治療効果を生じるのに有効な最低用量である化合物の量であり得る。このような有効量は、一般的に、上記の要因に依存する。所与の患者において最も効果的な処置をもたらす特定の化合物の正確な投与時間および量は、特定化合物の活性、薬物動態およびバイオアベイラビリティ、患者の生理的状態（年齢、性別、病気のタイプおよびステージ、全身健康状態、所与の投薬量および投薬形態への応答性を包含する）、ならびに投与経路などに依存する。
医師または獣医師は、必要とされる医薬組成物の有効量を処方することができる。例えば、医師または獣医師は、所望の治療効果を達成するために必要なレベルより低いレベルで医薬組成物に用いられる本開示の化合物の投薬を開始し、所望の効果が達成されるまで徐々に用量を増やすことができる。
本書に記載の医薬組成物は、正確な用量の単回投与に適した単位投与剤形であり得る。単位投与剤形では、処方物は、１種以上の化合物の適切な量を含む単位投与量に分割される。単位投与量は、製剤の個別の量を含有するパッケージの形態であり得る。非限定的な例は、バイアルまたはアンプルに入れた液剤である。水性懸濁組成物は、再密閉不能な単回投与用容器に包装することができる。例えば保存剤と組み合わせて、再密閉可能な複数回投与用容器を使用することができる。非経口注射用製剤は、単位投与剤形で、例えば、アンプル、または保存剤を含む複数回投与用容器で提供することができる。
本書に記載の化合物は、約１ｍｇ～約２０００ｍｇ；約１００ｍｇ～約２０００ｍｇ；約１０ｍｇ～約２０００ｍｇ；約５ｍｇ～約１０００ｍｇ、約１０ｍｇ～約５００ｍｇ、約５０ｍｇ～約２５０ｍｇ、約１００ｍｇ～約２００ｍｇ、約１ｍｇ～約５０ｍｇ、約５０ｍｇ～約１００ｍｇ、約１００ｍｇ～約１５０ｍｇ、約１５０ｍｇ～約２００ｍｇ、約２００ｍｇ～約２５０ｍｇ、約２５０ｍｇ～約３００ｍｇ、約３００ｍｇ～約３５０ｍｇ、約３５０ｍｇ～約４００ｍｇ、約４００ｍｇ～約４５０ｍｇ、約４５０ｍｇ～約５００ｍｇ、約５００ｍｇ～約５５０ｍｇ、約５５０ｍｇ～約６００ｍｇ、約６００ｍｇ～約６５０ｍｇ、約６５０ｍｇ～約７００ｍｇ、約７００ｍｇ～約７５０ｍｇ、約７５０ｍｇ～約８００ｍｇ、約８００ｍｇ～約８５０ｍｇ、約８５０ｍｇ～約９００ｍｇ、約９００ｍｇ～約９５０ｍｇ、または約９５０ｍｇ～約１０００ｍｇの範囲内で組成物中に存在することができる。
本書に記載の化合物は、約１ｍｇ、約２ｍｇ、約３ｍｇ、約４ｍｇ、約５ｍｇ、約１０ｍｇ、約１５ｍｇ、約２０ｍｇ、約２５ｍｇ、約３０ｍｇ、約３５ｍｇ、約４０ｍｇ、約４５ｍｇ、約５０ｍｇ、約５５ｍｇ、約６０ｍｇ、約６５ｍｇ、約７０ｍｇ、約７５ｍｇ、約８０ｍｇ、約８５ｍｇ、約９０ｍｇ、約９５ｍｇ、約１００ｍｇ、約１２５ｍｇ、約１５０ｍｇ、約１７５ｍｇ、約２００ｍｇ、約２５０ｍｇ、約３００ｍｇ、約３５０ｍｇ、約４００ｍｇ、約４５０ｍｇ、約５００ｍｇ、約５５０ｍｇ、約６００ｍｇ、約６５０ｍｇ、約７００ｍｇ、約７５０ｍｇ、約８００ｍｇ、約８５０ｍｇ、約９００ｍｇ、約９５０ｍｇ、約１０００ｍｇ、約１０５０ｍｇ、約１１００ｍｇ、約１１５０ｍｇ、約１２００ｍｇ、約１２５０ｍｇ、約１３００ｍｇ、約１３５０ｍｇ、約１４００ｍｇ、約１４５０ｍｇ、約１５００ｍｇ、約１５５０ｍｇ、約１６００ｍｇ、約１６５０ｍｇ、約１７００ｍｇ、約１７５０ｍｇ、約１８００ｍｇ、約１８５０ｍｇ、約１９００ｍｇ、約１９５０ｍｇ、または約２０００ｍｇの量で組成物中に存在することができる。
いくつかの実施態様において、投与量は、薬物の量を対象体の質量で割ったもの、例えば、対象体の体重１キログラムあたりの薬物のミリグラムで表すことができる。いくつかの実施態様において、化合物は、約５ｍｇ／ｋｇ～約５０ｍｇ／ｋｇ、２５０ｍｇ／ｋｇ～約２０００ｍｇ／ｋｇ、約１０ｍｇ／ｋｇ～約８００ｍｇ／ｋｇ、約５０ｍｇ／ｋｇ～約４００ｍｇ／ｋｇ、約１００ｍｇ／ｋｇ～約３００ｍｇ／ｋｇ、または約１５０ｍｇ／ｋｇ～約２００ｍｇ／ｋｇの範囲の量で投与される。
投与量は、患者の体重１ｋｇあたりの化合物の量に基づくことができる。別法として、本開示の投与量は、化合物の血漿濃度を参照することによって決定することができる。例えば、最大血漿濃度（Ｃmax）および時間０から無限大までの血漿濃度－時間曲線下面積（ＡＵＣ）を用いることができる。
いくつかの実施態様において、対象体は、ヒト対象体であり、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり０.０１～１００ｍｇである。例えば、種々の例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり、約.０１－５０ｍｇ／ｋｇ、約０.０１～２０ｍｇ／ｋｇ、約０.０１～１０ｍｇ／ｋｇ、約０.１～１００ｍｇ／ｋｇ、約０.１～５０ｍｇ／ｋｇ、約０.１～２０ｍｇ／ｋｇ、約０.１～１０ｍｇ／ｋｇ、約０.５～／ｋｇ、約０.５～５０ｍｇ／ｋｇ、約０.５～２０ｍｇ／ｋｇ、約０.５～１０ｍｇ／ｋｇ、約１～１００ｍｇ／ｋｇ、約１～５０ｍｇ／ｋｇ、約１～２０ｍｇ／ｋｇ、約１～１０ｍｇ／ｋｇである。ある実施態様において、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり、約０.５ｍｇ～１０ｍｇの化合物が投与される。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり、約０.１６ｍｇ、約０.３２ｍｇ、約０.６４ｍｇ、約１.２８ｍｇ、約３.５６ｍｇ、約７.１２ｍｇ、約１４.２４ｍｇ、または約２０ｍｇである。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり、約０.１６ｍｇ、約０.３２ｍｇ、約０.６４ｍｇ、約１.２８ｍｇ、約３.５６ｍｇ、約７.１２ｍｇ、または約１４.２４ｍｇである。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約０.１６ｍｇである。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約０.３２ｍｇである。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約０.６４ｍｇである。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約１.２８ｍｇである。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約３.５６ｍｇである。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約７.１２ｍｇである。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約１４.２４ｍｇである。
いくつかの実施態様において、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約０.５～約２０ｍｇまたは約０.５～約１０ｍｇの化合物が１週間に２回投与される。例えば、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約０.５～約１ｍｇ、約０.５～約５ｍｇ、約０.５～約１０ｍｇ、約０.５～約１５ｍｇ、約１～約５ｍｇ、約１～約１０ｍｇ、約１～約１５ｍｇ、約１～約２０ｍｇ、約５～約１０ｍｇ、約１～約１５ｍｇ、約５～約２０ｍｇ、約１０～約１５ｍｇ、約１０～約２０ｍｇ、または約１５～約２０ｍｇの化合物が１週間に約２回投与される。いくつかの例において、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約１ｍｇ、約１.５ｍｇ、約２ｍｇ、約２.５ｍｇ、約３ｍｇ、約３.５ｍｇ、約４ｍｇ、約４.５ｍｇ、約５ｍｇ、約５.５ｍｇ、約６ｍｇ、約６.５ｍｇ、約７ｍｇ、約７.５ｍｇ、約８ｍｇ、約８.５ｍｇ、約９ｍｇ、約９.５ｍｇ、約１０ｍｇ、約１０.５ｍｇ、約１１ｍｇ、約１１.５ｍｇ、約１２ｍｇ、約１２.５ｍｇ、約１３ｍｇ、約１３.５ｍｇ、約１４ｍｇ、約１４.５ｍｇ、約１５ｍｇ、約１５.５ｍｇ、約１６ｍｇ、約１６.５ｍｇ、約１７ｍｇ、約１７.５ｍｇ、約１８ｍｇ、約１８.５ｍｇ、約１９ｍｇ、約１９.５ｍｇ、または約２０ｍｇの化合物が１週間に２回投与される。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約１.２５ｍｇ、約２.５ｍｇ、約５ｍｇ、約１０ｍｇ、または約２０ｍｇの化合物が１週間に２回投与される。いくつかの例において、投与される化合物の量は、ヒト対象体の体重１ｋｇあたり約１.２５ｍｇ、約２.５ｍｇ、約５ｍｇまたは約１０ｍｇである。当該化合物は、１週間に１回、１週間に２回、１週間に３回、４回、５回、６回、または７回投与することができる。当該化合物は、３週間に１回投与することができる。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、一定時間にわたって徐々に投与される。所望の量の化合物が、例えば、約０.１時間～２４時間にわたって徐々に投与され得る。いくつかの場合において、所望の量の化合物が、０.１時間、０.５時間、１時間、１.５時間、２時間、２.５時間、３時間、３.５時間、４時間、４.５時間、５時間、６時間、７時間、８時間、９時間、１０時間、１１時間、１２時間、１３時間、１４時間、１５時間、１６時間、１７時間、１８時間、１９時間、２０時間、２１時間、２２時間、２３時間、または２４時間にわたって徐々に投与される。いくつかの例において、所望の量の化合物が、０.２５～１２時間にわたって、例えば、０.２５～１時間、０.２５～２時間、０.２５～３時間、０.２５～４時間、０.２５～６時間、０.２５～８時間、または０.２５～１０時間にわたって徐々に投与される。いくつかの例において、所望の量の化合物が、０.２５～２時間にわたって徐々に投与される。いくつかの例において、所望の量の化合物が、０.２５～１時間にわたって徐々に投与される。いくつかの例において、所望の量の化合物が、０.２５時間、０.３時間、０.４時間、０.５時間、０.６時間、０.７時間、０.８時間、０.９時間、１.０時間、１.１時間、１.２時間、１.３時間、１.４時間、１.５時間、１.６時間、１.７時間、１.８時間、１.９時間、または２.０時間にわたって徐々に投与される。いくつかの例において、所望の量の化合物が、１時間にわたって徐々に投与される。いくつかの例において、所望の量の化合物が、２時間にわたって徐々に投与される。
当該化合物の投与は、必要な限り継続することができる。いくつかの実施態様において、本開示の１種以上の化合物は、１日以上、１週間以上、１か月以上、２か月以上、３か月以上、４か月以上、５か月以上、６か月以上、７か月以上、８か月以上、９か月以上、１０か月以上、１１か月以上、１２か月以上、１３か月以上、１４か月以上、１５か月以上、１６か月以上、１７か月以上、１８か月以上、１９か月以上、２０か月以上、２１か月以上、２２か月以上、２３か月以上、または２４か月以上投与される。いくつかの実施態様において、本開示の１種以上の化合物は、１週間未満、１か月未満、２か月未満、３か月未満、４か月未満、５か月未満、６か月未満、７か月未満、８か月未満、９か月未満、１０か月未満、１１か月未満、１２か月未満、１３か月未満、１４か月未満、１５か月未満、１６か月未満、１７か月未満、１８か月未満、１９か月未満、２０か月未満、２１か月未満、２２か月未満、２３か月未満、または２４か月未満投与される。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目、および２８日目に投与される。いくつかの実施態様において、当該化合物は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目、および２８日目に投与され、投与は、２サイクルの間継続される。いくつかの実施態様において、当該化合物は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目、および２８日目に投与され、投与は、３サイクルの間継続される。いくつかの実施態様において、当該化合物は、２８日サイクルの１日目、８日目、１５日目、および２８日目に投与され、投与は、４サイクル、５サイクル、６サイクル、７サイクル、８サイクル、９サイクル、１０サイクル、またはそれ以上のサイクルの間継続される。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目、および２１日目に投与される。いくつかの実施態様において、当該化合物は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目、および２１日目に投与され、投与は、２サイクルの間継続される。いくつかの実施態様において、当該化合物は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目、および２１日目に投与され、投与は、３サイクルの間継続される。いくつかの実施態様において、当該化合物は、２１日サイクルの１日目、８日目、１１日目、および２１日目に投与され、投与は、４サイクル、５サイクル、６サイクル、７サイクル、８サイクル、９サイクル、１０サイクル、またはそれ以上のサイクルの間継続される。
いくつかの実施態様において、本開示の１種以上の化合物は、継続的に慢性的に投与される。いくつかの実施態様において、本開示の１種以上の化合物の投与は、疾患の進行、許容されない毒性、または投与を中止するという患者もしくは医師の判断が文書化されるまで継続される。いくつかの実施態様において、ステープル化ＡＭＰの有効用量としては、例えば、以下のものを挙げることができるが、それらに限定されない：約、０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～１００００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～５０００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～２５００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～１０００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～９００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～８００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～７００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～６００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～５００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～４００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～３００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～２００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～１００；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～９０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～８０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～７０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～６０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～５０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～４０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～３０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～２０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～３０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１～１５、０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～３０；０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１～１０、０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１または１０～３０；または０.００００１、０.０００１、０.００１、０.０１、０.１、１～５ｍｇ／ｋｇ／日。
本発明の医薬組成物は、１種以上のペプチドおよび薬学的に許容される担体および／またはビヒクルを含むことができる。いくつかの場合において、医薬は、さらに、疾患または疾患症状の調節の達成に有効な量で１種以上のさらなる治療剤を含むことができる。適切な治療剤を本書の安定化Ｉ－ＴＡＭＰと化学的に（共有的または非共有的に）結合して投与することもできる。このようなさらなる治療剤としては、当該技術分野で公知の抗微生物剤（例えば、抗生物質）を挙げることができる。共投与される場合、本発明のステープル化ＡＭＰは、抗微生物剤と組み合わせて作用して、機構的に相加的または相乗的な抗微生物効果を生じる。
本書に記載のステープル化ペプチド（別々の実体として、または（共有的にまたは非共有的に）化学的に結合された）との共投与に適切な抗生物質（別々の薬剤として、または該ステープル化ペプチドと化学的に結合した）の例としては、以下のものが挙げられるが、これらに限定されない：キノロン（例えば、レボフロキサシン、ノルフロキサシン、オフロキサシン、シプロフロキサシン、ペルフロキサシン、ロメフロキサシン、フレロキサシン、スパルフロキサシン、グレパフロキサシン、トロバフロキサシン、クリナフロキサシン、ゲミフロキサシン、エノキサシン、シタフロキサシン、ナジフロキサシン、トスルフロキサン（tosulfloxacin）、シンノキサシン（cinnoxacin）、ロソクサシン、ミロキサシン、モキシフロキサシン、ガチフロキサシン、シンノキサシン（cinnoxacin）、エノキサシン、フレロキサシン、ロマフロキサシン（lomafloxacin）、ロメフロキサシン、ミロキサシン、ナリジクス酸、ナジフロキサシン、オキソリニン酸、ペフロキサシン、ピリミド酸（pirimidic acid）、ピペミド酸、ロソクサシン、ルフロキサシン、テマフロキサシン、トスフロキサシン、トロバフロキサシン、ベシフロキサシン）；以下のものを包含するβラクタム：セファロスポリン（例えば、セファセトリル、セフィキシム、セファドロキシル、セファログリシン、セファロニウム、セファロリジン、セファロチン、セファピリン、セフカペン、セフダルオキシム、セフジニル、セフジトレン、セファトリジン、セフェタメト、セファザフル、セファゼドン、セファゾリン、セファラジン、セフロキサジン、セフテゾール、セフテラム、セフチブテン、セフチオフル、セフチオレン、セフチゾキシム、セファクロル、セフプロジル、セフロキシム、セフゾナム、セフメノキシム、セフォジジム、セフォタキシム、セフォベシン、セフピミゾール、セフピロム、セフキノム、セフトビプロール、セフポドキシム、セフタジジム、セフタロリン、セフクリジン、セフェピム、セフルプレナム、セフォセリス、セフォゾプラン、セファレキシン、セファロリジン、セファマンドール、セフスロジン、セフォニシド、セフォペラジン、セフォペラゾン、セフォプロジル（cefoprozil）、セフトリアキソン）、ペニシリンおよびペニシリン誘導体（例えば、ペニシリンＧ、ペニシリンＶ、プロカインペニシリン、ベンザチンペニシリン、ベンザチンベンジルペニシリン、アンピシリン、エピシリン、アモキシシリン、ベンジルペニシリン、クロメトシリン、フェノキシメチルペニシリン、オキサシリン、メチシリン、ジクロキサシリン、フルクロキサシリン、テモシリン、アズロシリン、カルベニシリン、リカルシリン（ricarcillin）、メズロシリン、ピペラシリン、アパルシリン、ヘタシリン、バカンピシリン、スルベニシリン、メシシラム（mecicilam）、ペブメシリナム（pevmecillinam）、シクラシリン、タラピシリン（talapicillin）、アスポキシシリン、アジドシリン、クロキサシリン、ナフシリン、ピバンピシリン、ペナメシリン、メシリナム、プロピシリン、フェネチシリン、チカルシリン、テモシリン）、カルバペネム（例えば、チエナマイシン、トモペネム、レナペネム、テビペネム、ラズペネム、イミペネム、メロペネム、エルタペネム、ドリペネム、パニペネム（ベタミプロン）、ビアペネム）、カルバセフェム（例えば、ロラカルベフ）、ペネム（例えば、ファロペネム）、セファマイシン（例えば、セフブペラゾン、セフメタゾール、セフミノクス、セフォテタン、セフォキシチン）、モノバクタム（例えば、アズトレオナム、ノカルディシンＡ、タブトキシン、チゲモナム（tigemonam））、およびオキサセフェム（例えば、フロモキセフ、ラタモキセフ）；リポペプチド抗生物質（例えば、アムフォマイシン（amphomycin）、アスパルトシン、ブレビスチン（brevistin）、セレキシンＡ、セレキシンＢ、グルママイシン、ラスパルトマイシン、ツシマイシン、ザオマイシン（zaomycin）、ダプトマイシン）；ポリミキシン抗生物質（例えば、ポリミキシンＢ、コリスチン（ポリミキシンＥ）、ポリミキシンＭ）；アミノグリコシド（例えば、ゲンタマイシン、アミカシン、トブラマイシン、デベカシン、カナマイシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、パロモマイシン、シソマイシン、スペクチノマイシン、ステレプトマイシン）；グリコペプチド（例えば、バンコマイシン、テイコプラニン、テラバンシン、ラモプラニン、ダプトマイシン、デカプラニン、ブレオマイシン）；マクロライド（例えば、アジスロマイシン、クラリスロマイシン、エリスロマイシン、フィダキソマイシン、テリスロマイシン、カルボマイシンＡ、ジョサマイシン、キタサマイシン、ミデカマイシン／酢酸ミデカマイシン、オレアンドマイシン、ソリスロマイシン、スピラマイシン、トロレアンドマイシン、タイロシン、ロキシスロマイシン、ジリスロマイシン、トロレアンドマイシン、スペクチノマイシン、メチマイシン、ネオメチマイシン、エリスロノリド、メガロマイシン、ピクロマイシン、ナルボマイシン、オレアンドマイシン、トリアセチル－オレアンドマイシン、ラウカマイシン（laukamycin）、クジマイシンＡ、アルボサイクリン、シネロマイシンＢ）；アンサマイシン（例えば、ストレプトバリシン、ゲルダナマイシン、ハービマイシン、リファマイシン、リファンピン、リファブチン、リファペンチン、リファミキシン）；リネゾリド；プリスチナマイシン；およびスルホンアミド（例えば、スルファニルアミド、スルファセタルニド（sulfacetarnide）、スルファピリジン、スルファチアゾール、スルファジアジン、スルファメラジン、スルファジミジン、スルファソミジン、スルファサラジン、マフェニド、スルファメトキサゾール、スルファメトキシピリダジン、スルファジメトキシン、スルファシマジン、スルファドキシン、スルファメトピラジン、スルファグアニジン、スクシニルスルファチアゾール、フタリルスルファチアゾール）。
本発明の組成物が本書に記載の式で示される化合物および１種以上のさらなる治療剤または予防剤の組合せを含む場合、当該化合物およびさらなる薬剤は、ともに、単独療法計画で通常投与される用量の約１％～約１００％、または約５％～約９５％の用量レベルで存在する。さらなる薬剤は、複数回投与計画の一部として、本発明の化合物とは別に投与することができる。別法として、これらの薬剤は、単一組成物中で本発明の化合物と一緒に混合された単一剤形の一部であってもよい。
用語「薬学的に許容される担体または補助剤」とは、本発明の化合物と一緒に患者に投与することができ、その薬理学的活性を破壊せず、治療量の化合物を送達するのに十分な用量で投与される場合に非毒性である、担体または補助剤をいう。
本発明の医薬組成物に使用することができる薬学的に許容される担体、補助剤およびビヒクルとしては、イオン交換体、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、自己乳化型薬物送達システム（ＳＥＤＤＳ）、例えば、ｄ－α－トコフェロールポリエチレングリコール１０００サクシネート、薬学的投与剤形に使用される界面活性剤、例えば、ツイーンまたは他の類似のポリマー系送達マトリックス、血清タンパク質、例えば、ヒト血清アルブミン、緩衝物質、例えば、ホスフェート、グリシン、ソルビン酸、ソルビン酸カリウム、飽和植物脂肪酸の部分グリセリド混合物、水、塩または電解質、例えば、硫酸プロタミン、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、セルロース系物質、ポリエチレングリコール、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリレート、ワックス、ポリエチレン－ポリオキシプロピレン－ブロックポリマー、ポリエチレングリコールおよび羊毛脂が挙げられるが、これらに限定されない。シクロデキストリン、例えば、α－、β－、およびγ－シクロデキストリンもまた、本書に記載の式によって示される化合物の送達を増強するために有利に使用することができる。
本発明の医薬組成物は、慣用の非毒性の薬学的に許容される担体、補助剤、またはビヒクルを含有することができる。いくつかの場合において、該製剤のｐＨを、薬学的に許容される酸、塩基または緩衝剤で調整して、処方された化合物またはその送達形態の安定性を高めることができる。本書で用いる場合、非経口という用語は、非経口、硬膜外、皮下、皮内、静脈内、筋肉内、関節内、動脈内、滑膜内、胸骨内、髄腔内、病巣内および頭蓋内の注射または注入技術を包含する。
本開示の化合物の有効量は、許容される投与様式のいずれかによって単回または複数回投与することができる。選択された投与経路にかかわらず、本開示の化合物および／または本開示の医薬組成物は、薬学的に許容される投与剤形に製剤化される。本開示による化合物は、他の医薬品と同様に、ヒト医学または獣医学における使用のための好都合な方法での投与のために製剤化することができる。
ある態様において、本開示は、１種以上の薬学的に許容される担体（添加剤）および／または希釈剤と一緒に処方された、１種以上の上記化合物の治療有効量を含む医薬製剤を提供する。ある実施態様において、本書に記載の１種以上の化合物は、非経口投与のための非経口投与のために製剤化され、本書に記載の１種以上の化合物は、水性または非水性の液剤、分散液剤、懸濁剤、または乳剤、または使用直前に滅菌注射液または分散液に再構成することができる滅菌散剤として製剤化することができる。このような製剤は、糖、アルコール、抗酸化剤、緩衝剤、静菌剤、製剤を意図されたレシピエントの血液と等張にする溶質、または懸濁化剤もしくは増粘剤を含むことができる。これらの組成物はまた、保存剤、湿潤剤、乳化剤および分散剤のような補助剤を含むこともできる。対象化合物に対する微生物の作用の防止は、種々の抗細菌剤および抗真菌剤、例えばパラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸などを含めることによって確実にすることができる。等張剤（例えば、糖、塩化ナトリウムなど）を組成物に含めることも望ましい場合もある。さらに、注射用医薬形態の長期吸収は、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンのような吸収を遅延させる薬剤を含めることによってもたらされ得る。必要に応じて、製剤は、使用前に、例えば、等張生理食塩水またはデキストロース溶液で希釈することができる。いくつかの例において、当該化合物は水溶液として処方され、静脈内投与される。
医薬組成物は、注射用の溶液または粉末の形態とすることができる。かかる組成物は、好適な分散剤または湿潤剤（例えば、Ｔｗｅｅｎ ８０）および懸濁化剤を用いて当該技術分野で公知の技術に従って製剤化することができる。滅菌注射用製剤はまた、例えば１,３－ブタンジオール中溶液として、非毒性の非経口上許容される希釈剤または溶媒中の滅菌注射用溶液または懸濁液であってもよい。用いることができる許容されるビヒクルおよび溶媒には、マンニトール、水、リンゲル溶液、および等張性塩化ナトリウム溶液がある。加えて、滅菌固定油（sterile, fixed oil）は、慣用的に溶媒または懸濁媒体として用いることができる。この目的で、合成モノグリセリドまたは合成ジグリセリドを包含する無菌性固定油（bland fixed oil）を用いることができる。脂肪酸、例えば、オレイン酸およびそのグリセリド誘導体は、特にそれらのポリオキシエチル化バージョンで、オリーブ油またはヒマシ油のような天然の薬学的に許容される油と同様に、注射剤の製剤に有用である。これらの油性液剤または懸濁剤は、長鎖アルコール希釈剤もしくは分散剤、またはカルボキシメチルセルロース、または乳剤および／または懸濁剤のような薬学的に許容される投与剤形の製剤化に一般的に使用される類似の分散剤を含有することもできる。ＴｗｅｅｎまたはＳｐａｎのような一般的に使用される他の界面活性剤、および／または、薬学的に許容される固体、液体または他の投与剤形の製造に一般的に使用される他の類似の乳化剤またはバイオアベイラビリティ増強剤も製剤化の目的で使用することができる。
医薬組成物は、カプセル剤、錠剤、乳剤、および水性懸濁剤、分散製剤および液剤が挙げられるがこれらに限定されない経口的に許容される投与剤形で経口投与され得る。経口用の錠剤の場合、一般的に使用される担体としては、ラクトースおよびコーンスターチが挙げられる。ステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤もまた典型的に添加される。カプセル形態での経口投与について、有用な希釈剤としては、ラクトースおよび乾燥コーンスターチが挙げられる。水性懸濁剤および／または乳剤を経口投与する場合、有効成分は、乳化剤および／または懸濁化剤と合わせて、油相に懸濁または溶解することができる。必要に応じて、ある種の甘味剤および／または矯味矯臭剤および／または着色剤を添加することができる。
本発明の医薬組成物は、また、直腸投与用坐剤の形態で投与することもできる。これらの組成物は、本発明の化合物を、室温では固体であるが直腸温度では液体となって腸内で融解して有効成分を放出する好適な非刺激性賦形剤と混合することによって調製することができる。このような材料としては、カカオ脂、ミツロウおよびポリエチレングリコールが挙げられるがこれらに限定されない。
別法として、または、加えて、医薬組成物は、鼻エアゾールまたは吸入によって投与することができる。このような組成物は、医薬製剤の技術分野で周知の技術に従って調製され、ベンジルアルコールまたは他の適切な保存剤、バイオアベイラビリティを高める吸収促進剤、フッ化炭素、および／または当該技術分野で知られている他の可溶化剤もしくは分散剤を用いて生理食塩水で液剤として調製することができる。
いくつかの場合において、本書に記載の１種以上のペプチドは、例えば担体タンパク質と、コンジュゲート体を形成することができる。このようなコンジュゲート組成物は、一価または多価であり得る。例えば、コンジュゲート組成物は、本書に記載の１つのペプチドが担体タンパク質とコンジュゲートしたものを含むことができる。別法として、コンジュゲート組成物は、本書に記載の２種以上のペプチドが担体とコンジュゲートしたものを含むことができる。
本書で用いる場合、２つのものが互いに「コンジュゲートし」た場合、それらは、直接的または間接的な共有または非共有相互作用によって連結される。特定の実施態様において、該会合は共有である。他の実施態様において、該会合は、非共有である。非共有相互作用としては、水素結合、ファンデルワールス相互作用、疎水性相互作用、磁気相互作用、静電相互作用などが挙げられる。間接的共有相互作用は、２つのものが共有連結している場合には、リンカー基を介していてもよい。
担体タンパク質としては、対象体における免疫原性を増大または増強させるタンパク質を挙げることができる。例示的な担体タンパク質は、当該技術分野において記載されている（例えば、Fattom et al., Infect. Immun., 58:2309-2312, 1990；Devi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:7175-7179, 1991；Li et al., Infect. Immun. 57:3823-3827, 1989；Szu et al., Infect. Immun. 59:4555-4561,1991；Szu et al., J. Exp. Med. 166:1510-1524, 1987；およびSzu et al., Infect. Immun. 62:4440-4444, 1994を参照）。ポリマー担体は、１種以上の第一および／もしくは第二アミノ基、アジド基、またはカルボキシル基を含有する天然または合成材料であり得る。担体は水溶性であり得る。
処置方法
本開示は、感染症の予防および／または処置のために本書におけるペプチドを使用する方法を包含する。本書で用いる場合、用語「処置する」、「処置すること」または「処置」とは、対象体が罹患している疾患または状態を、部分的または完全に、軽減（alleviating）、阻害、寛解（ameliorating）、および／または緩和（relieving）することをいう。これは、疾患または障害（例えば、癌）の症状のうち１種以上が寛解するかまたは有益に改変される様式を意味する。本書で用いる場合、特定の障害（例えば、感染症）の症状の寛解とは、永久的または一時的にかかわらず、本発明の組成物および方法に起因または関連することができる持続的または一過性の緩和（lessening）をいう。いくつかの実施態様において、処置は、例えば、処置前の微生物細胞または生物体の数に対する（例えば、対象体中の）微生物細胞または生物体の数の減少；処置前の（例えば、対象体中の）微生物細胞または生物体の生存率（例えば、平均生存率）に対する（例えば、対象体中の）微生物細胞または生物体の生存率（例えば、平均生存率）の減少；および／または処置前の対象体の症状に対する該対象体における１種以上の感染症に関連する１種以上の症状の軽減を促進することができるかまたはもたらすことができる。
内部架橋ＡＭＰが有効な細菌の例としては、以下のものが挙げられるが、これらに限定されない：ブドウ球菌（Staphylococci）（例えば、スタフィロコッカス・アウレウス（S. aureus）、スタフィロコッカス・インターメディウス（S. intermedius）、スタフィロコッカス・エピデルミデス（S. epidermidis）、および他のコアグラーゼ陰性ブドウ球菌）、ナイセリア（例えば、ナイセリア・ゴノレア（N. gonorrheae）およびナイセリア・メニンギティディス（N. meningitidis））、連鎖球菌（Streptococci）（例えば、Ａ群連鎖球菌（Group A Streptococcus）（例えば、ストレプトコッカス・ピオゲネス（S. pyogenes））、Ｂ群連鎖球菌（Group B Streptococcus）（例えば、ストレプトコッカス・アガラクチア（S. agalactiae））、Ｃ群連鎖球菌（Group C Streptococcus）、Ｇ群連鎖球菌（Group G Streptococcus）、ストレプトコッカス・ニューモニエ（S. pneumoniae）、およびビリダンス連鎖球菌（viridans Streptococci））、クラミジア・トラコマチス（Chlamydia trachomatis）、トレポネーマ（Treponemae）（例えば、トレポネーマ・パリダム（T. pallidum）、トレポネーマ・ペルテヌエ（T. pertenue）、およびトレポネーマ・セラテウム（T. cerateum））、ヘモフィルス（Haemophilus）菌（例えば、ヘモフィルス・デュクレイ（H. ducreyi）、ヘモフィルス・インフルエンザエ（H. influenzae）、およびヘモフィルス・エジプチウス（H. aegyptius））、ボルデテラ（Bordetellae）（例えば、ボルデテラ・パータシス（B. pertussis）、ボルデテラ・パラパータシス（B. parapertussis）、およびボルデテラ・ブロンキセプチカ（B. bronchiseptica））、ガードネレラ・バギナリス（Gardnerella vaginalis）、バチルス（Bacillus）（例えば、バチルス・アントラシス（B. anthracis）およびバチルス・セレウス（B. cereus））、マイコバクテリア（Mycobacteria）（例えば、マイコバクテリウム・ツベルクローシス（M. tuberculosis）およびマイコプラズマ・レプラエ（M. leprae））、リステリア・モノサイトゲネス（Listeria monocytogenes）、ボレリア・ブルグドルフェリ（Borrelia burgdorferi）、アクチノバチルス・プルロニューモニア（Actinobacillus pleuropneumoniae）、ヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter pylori）、クロストリジウム（Clostridium）（例えば、クロストリジウム・パーフリンジェンス（C. perfringens）、クロストリジウム・セプティカム（C. septicum）、クロストリジウム・ノビー（C. novyi）、およびクロストリジウム・テタニ（C. tetani））、エシェリキア・コリ（Escherichia coli）、ポルフィロモナス・ジンジバリス（Porphyromonas gingivalis）、ビブリオ・コレラエ（Vibrio cholerae）、サルモネラ（Salmonella）菌（例えば、サルモネラ・エンテリティディス（S. enteriditis）、サルモネラ・チフィリウム（S. typhimurium）、およびサルモネラ・チフィ（S. typhi））、シゲラ（Shigella）菌、フランシセラ（Francisella）菌、エルシニア（Yersinia）菌（例えば、エルシニア・ペスチス（Y. pestis）およびエルシニア・エンテロコリチカ（Y. enterocolitica））、バークホルデリア（Burkholderia）菌、シュードモナス（Pseudomonas）菌、およびブルセラ（Brucella）菌。ＡＭＰが有効なマイコプラズマ生物体（Mycoplasmal organism）としては、例えば、マイコプラズマ・ニューモニエ（M. pneumoniae）、マイコプラズマ・ファーメンタンス（M. fermentans）、マイコプラズマ・ホミニス（M. hominis）、およびマイコプラズマ・ペネトランス（M. penetrans）が挙げられる。
内部架橋ＡＭＰが有効な真菌類（酵母を含む）生物体の例としては、カンジダ・アルビカンス（Candida albicans）、他のカンジダ種、クリプトコッカス・ネオフォルマンス（Cryptococcus neoformans）、ヒストプラズマ・カプスラーツム（Histoplasma capsulatum）、およびニューモシスチス・カリニ（Pneumocystis carinii）が挙げられるが、これらに限定されない。
内部架橋ＡＭＰが有効な寄生原虫としては、トリコモナス・バギナリス（Trichomonas vaginalis）、プラスモディウム・ファルシパルム（Plasmodium falciparum）、プラスモディウム・ビバックス（P. vivax）、プラスモディウム・オバル（P. ovale）、プラスモディウム・マラリアエ（P. malariae）、エントアメーバ・ヒストリチカ（Entamoeba histolytica）、トキソプラズマ・ブルセイ（Toxoplasma brucei）、トキソプラズマ・ゴンディ（Toxoplasma gondii）およびリーシュマニア・メジャー（Leishmania major）が挙げられるが、これらに限定されない。
内部架橋ＡＭＰを用いることができるウイルスの例としては、ヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）１型および２型、ヒトリンパ球向性ウイルス（ＨＴＬＶ）、麻疹ウイルス、狂犬病ウイルス、Ａ型、Ｂ型およびＣ型肝炎ウイルス、ロタウイルス、ライノウイルス、インフルエンザウイルス、パラインフルエンザウイルス、呼吸器多核体ウイルス、アデノウイルス、パルボウイルス（例えば、パルボウイルスＢ１９）、ロジオラウイルス、エンテロウイルス、パピローマウイルス、レトロウイルス、ヘルペスウイルス（例えば、単純ヘルペスウイルス、水痘帯状疱疹ウイルス、エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、ヒトサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、ヒトヘルペスウイルス６型、７型および８型）、ポックスウイルス（例えば、大痘瘡および小痘瘡、ワクシニア、およびサル痘ウイルス）、ネコ白血病ウイルス、ネコ免疫不全ウイルス、およびサル免疫不全ウイルスが挙げられるが、これらに限定されない。構造的に安定化されたＩ－ＴＡＭＰは、微生物細胞内に移行し、該微生物細胞内でそれらの生物学的活性を発揮するが、関連する哺乳動物細胞内に移行する能力を有するが該哺乳動物細胞の有意な溶解を引き起こさない適切な哺乳動物内細胞活性（intra-mammalian cell activities）（例えば、抗細胞内ウイルスまたは他の哺乳動物内細胞抗微生物活性（intra-mammalian cell anti-microbial activity））を有する構造的に安定化されたＡＭＰを開発することができることが想定される。
本書に記載の組成物、製剤および／または方法によって処置することができる障害としては、感染性疾患が挙げられるが、これらに限定されない。感染性疾患は、細菌、ウイルス、真菌類または寄生虫などの病原体によって引き起こされ得る。いくつかの実施態様において、感染性疾患は、ヒトからヒトへうつることができる。いくつかの実施態様において、感染性疾患は、昆虫または動物から咬傷によってうつることがある。いくつかの実施態様において、感染性疾患は、汚染されている食物もしくは水の摂取、または環境中の生物への暴露によって獲得され得る。いくつかの感染性疾患はワクチンによって予防することができる。
特定の実施態様において、本書に記載の組成物、製剤および／または方法によって処置することができる疾患としては、以下のものが挙げられるが、これらに限定されない：アシネトバクター感染症、放線菌症、アフリカ睡眠病（アフリカトリパノソーマ症)、ＡＩＤＳ（後天性免疫不全症候群）、アメーバ症、アナプラズマ症、住血線虫症、アニサキス症、炭疽、溶血性アルカノバクテリア感染症、アルゼンチン出血熱、回虫症、アスペルギルス症、アストロウイルス感染症、バベシア症、バチルス・セレウス感染症、細菌性肺炎、細菌性膣症、バクテロイデス感染症、バランチジウム症、バルトネラ症、バイリサスカリス感染症（Baylisascaris infecton）、ＢＫウイルス感染症、黒色砂毛症（Black piedra）、ブラストシストシス（Blastocystosis）、ブラストミセス症、ボリビア出血熱、ボツリヌス中毒（および乳児ボツリヌス中毒)、ブラジル出血熱、ブルセラ症、腺ペスト、バークホルデリア感染症、ブルーリ潰瘍、カリシウイルス感染症（ノロウイルスおよびサポウイルス）、カンピロバクター症、カンジダ症（モニリア症；鵞口瘡）、毛細虫症、カリオン病、ネコひっかき病、蜂巣炎、シャガス病（アメリカトリパノソーマ症）、軟性下疳、水痘、チクングニア、クラミジア、肺炎クラミジア感染症（台湾急性呼吸器因子またはＴＷＡＲ）、コレラ、黒色分芽菌症、ツボカビ症、肝吸虫症、クロストリジウム・ディフィシル大腸炎、コクシジオイデス症、コロラドダニ熱（ＣＴＦ）、感冒（急性ウイルス性鼻咽喉炎；急性コリーザ）、クロイツフェルト・ヤコブ病（ＣＪＤ）、クリミア・コンゴ出血熱（ＣＣＨＦ）、クリプトコッカス症、クリプトスポリジウム症、皮膚幼虫移行症（ＣＬＭ）、シクロスポラ症、嚢虫症、サイトメガロウイルス感染症、デング熱、デスモデスムス感染症、二核アメーバ症、ジフテリア、裂頭条虫症、メジナ虫症、エボラ出血熱、エキノコックス症、エーリキア症、腸蟯虫症（蟯虫感染症）、エンテロコッカス感染症、エンテロウイルス感染症、発疹チフス、伝染性紅斑（第五病）、急性発疹症（第六病）、肝蛭症（Fasciolasis）、肥大吸虫症、致死性家族性不眠症（ＦＦＩ）、フィラリア症、ウェルシュ菌食中毒、自由生息アメーバ感染症、フソバクテリウム感染症、ガス壊疽（クロストリジウム性筋壊死）、ゲオトリクム症、ゲルストマン・シュトロイスラー・シャインカー症候群（ＧＳＳ）、ジアルジア症、鼻疽、顎口虫症、淋病、鼠径肉芽腫（鼠径リンパ肉芽腫症）、Ａ群連鎖球菌感染症、Ｂ群連鎖球菌感染症、インフルエンザ菌感染症、手足口病（ＨＦＭＤ）、ハンタウイルス肺症候群（ＨＰＳ）、ハートランドウイルス病、ヘリコバクター・ピロリ感染症、溶血性尿毒症症候群（ＨＵＳ）、腎症候性出血熱（ＨＦＲＳ）、Ａ型肝炎、Ｂ型肝炎、Ｃ型肝炎、Ｄ型肝炎、Ｅ型肝炎、単純ヘルペス、ヒストプラスマ症、鉤虫感染症、ヒトボカウイルス感染症、ヒト・エウィンギー・エーリキア症（Human ewingii ehrlichiosis）、ヒト顆粒球性アナプラズマ症（ＨＧＡ）、ヒトメタニューモウイルス感染症、ヒト単球性エーリキア症、ヒトパピローマウイルス（ＨＰＶ）感染症、ヒトパラインフルエンザウイルス感染症、条虫症、エプスタイン・バーウイルス伝染性単核症（Mono）、インフルエンザ（flu）、イソスポーラ症、川崎病、角膜炎、キンゲラ・キンゲ感染症、クールー病、ラッサ熱、レジオネラ症（レジオネラ症）、レジオネラ症（ポンティアック熱）、リーシュマニア症、ハンセン病、レプトスピラ症、リステリア症、ライム病（ライムボレリア症）、リンパ管フィラリア症（象皮症）、リンパ球性脈絡髄膜炎、マラリア、マールブルグ出血熱（ＭＨＦ）、麻疹、中東呼吸器症候群（ＭＥＲＳ）、類鼻疽（ホイットモア病）、髄膜炎、髄膜炎菌性病、横川吸虫症、微胞子虫症、伝染性軟属腫（ＭＣ）、サル痘、ムンプス、発疹熱（地方病性チフス（Endemic typhus））、マイコプラズマ肺炎、菌腫（曖昧性除去（disambiguation）、ハエ幼虫症、新生児結膜炎（Neonatal conjunctivitis）（新生児眼炎）、異型クロイツフェルト・ヤコブ病（ｖＣＪＤ、ｎｖＣＪＤ）、ノカルジア症、オンコセルカ症（河川盲目症）、オピストルキス症、パラコクシジオイデス症（南アメリカブラストミセス症）、肺吸虫症、パスツレラ症、頭部シラミ症（Pediculosis capitis）（アタマジラミ）、体部シラミ症（Pediculosis corporis）（コロモジラミ）、ケジラミ症（陰部のシラミ、ケジラミ）、骨盤内炎症性疾患（ＰＩＤ）、百日咳、ペスト、肺炎球菌性感染症、ニューモシスチス肺炎（ＰＣＰ）、肺炎、灰白髄炎、プレボテラ感染症、原発性アメーバ性髄膜脳炎（ＰＡＭ）、進行性多巣性白質脳症、オウム病、Ｑ熱、狂犬病、回帰熱、呼吸器多核体ウイルス感染症、リノスポリジウム症、ライノウイルス感染症、リケッチア感染症、リケッチア痘症、リフトバレー熱（ＲＶＦ）、ロッキー山紅斑熱(RMSF)、ロタウイルス感染症、風疹、サルモネラ症、ＳＡＲＳ（重症急性呼吸器症候群）、疥癬、住血吸虫症、敗血症、赤痢菌感染症（細菌性赤痢）、帯状疱疹、天然痘（痘瘡）、スポロトリクム症、ブドウ球菌性食中毒、黄色ブドウ球菌感染症、糞線虫症、亜急性硬化性全脳炎、梅毒、条虫症、破傷風（開口障害）、白癬性毛瘡（かみそり負け（Barber's itch））、頭部白癬、体部白癬、股部白癬、手白癬、黒癬、足白癬、爪白癬（爪真菌症）、癜風、トキソカラ症（眼幼虫移行症（ＯＬＭ））、トキソカラ症（内臓幼虫移行症（ＶＬＭ））、トラコーマ、トキソプラスマ症、旋毛虫症、トリコモナス症、鞭虫症（鞭虫感染症）、結核、野兎病、腸チフス熱、発疹チフス熱（Typhus fever）、ウレアプラズマ・ウレアリチカム感染症、渓谷熱（Valley fever）、ベネズエラウマ脳炎、ベネズエラ出血熱、ビブリオ・バルニフィカス感染症、腸炎ビブリオ性腸炎、ウイルス性肺炎、西ナイル熱、白砂毛症（White piedra）（Tinea blanca)、偽結核菌感染症、エルシニア症、黄熱、および接合菌症。
本書に記載の組成物、製剤および／または方法は、病原を処置するために使用することができる。いくつかの実施態様において、該病原は、ウイルス、細菌、プリオン、真菌類または寄生虫であり得る。特定の実施態様において、本書に記載の病原としては、以下のものが挙げられるが、これらに限定されない：アシネトバクター・バウマンニ（Acinetobacter baumannii）、アクチノミセス・イスラエリィ（Actinomyces israelii）、アクチノミセス・ゲエンセリアエ（Actinomyces gerencseriae）およびプロピオバクテリウム・プロピオニクス（Propionibacterium propionicus）、トリパノソーマ・ブルセイ（Trypanosoma brucei）、ＨＩＶ（ヒト免疫不全ウイルス）、エントアメーバ・ヒストリチカ（Entamoeba histolytica）、アナプラズマ種（Anaplasma species）、アンギオストロンギルス属（Angiostrongylus）、アニサキス、バチルス・アントラシス（Bacillus anthracis）、溶血性アルカノバクテリア（Arcanobacterium haemolyticum）、フニンウイルス、ヒト回虫、アスペルギルス種（Aspergillus species）、アストロウイルス科（Astroviridae family）、バベシア種（Babesia species）、バチルス・セレウス（Bacillus cereus）、細菌性腟症細菌叢（bacterial vaginosis microbiota）、バクテロイデス種（Bacteroides species）、バランチジウム・コリ（Balantidium coli）、バルトネラ（Bartonella）、バイリサスカリス種（Baylisascaris species）、ＢＫウイルス、ピエドライア・ホルタエ（Piedraia hortae）、ブラストシスチス種（Blastocystis species）、ブラストミセス・デルマチチジス（Blastomyces dermatitidis）、マチュポウイルス、クロストリジウム・ボツリヌム（Clostridium botulinum）、サビア（Sabia）、ブルセラ種（Brucella species）、腸内細菌科（Enterobacteriaceae）、バークホルデリア・セパシア（Burkholderia cepacia）および他のバークホルデリア種（Burkholderia species）、マイコバクテリウム・ウルセランス（Mycobacterium ulcerans）、カリシウイルス科（Caliciviridae family）、カンピロバクター種（Campylobacter species）、カンジダ・アルビカンス（Candida albicans）および他のカンジダ種（Candida species）、キャピラリア・フィリピネシス（Capillaria philippinensis）、キャピラリア・ヘパチカ（Capillaria hepatica）、キャピラリア・エロフィラ（Capillaria aerophila）、バルトネラ・バシリホルミス（Bartonella bacilliformis）、バルトネラ・ヘンセラ（Bartonella henselae）、Ａ群連鎖球菌およびブドウ球菌（Group A Streptococcus and Staphylococcus）、トリパノソーマ・クルージ（Trypanosoma cruzi）、ヘモフィルス・デュクレイ（Haemophilus ducreyi）、水痘帯状疱疹ウイルス（Varicella zoster virus ）（ＶＺＶ）、アルファウイルス（Alphavirus）、クラミジア・トラコマチス（Chlamydia trachomatis）、クラミドフィラ・ニューモニエ（Chlamydophila pneumoniae）、ビブリオ・コレラエ（Vibrio cholera）、フォンセカエア・ペドロソイ（Fonsecaea pedrosoi）、バトラコキトリウム・デンドラバチディス（Batrachochytrium dendrabatidis）、肝吸虫（Clonorchis sinensis）、クロストリジウム・ディフィシル（Clostridium difficile）、コクシジオイデス・イミチス（Coccidioides immitis）およびコクシジオイデス・ポサダシ（Coccidioides posadasii）、コロラドダニ熱ウイルス（Colorado tick fever virus）（ＣＴＦＶ）、ライノウイルス（rhinoviruses）およびコロナウイルス（coronaviruses）、ＰＲＮＰ、クリミア・コンゴ出血熱ウイルス、クリプトコッカス・ネオフォルマンス（Cryptococcus neoformans）、クリプトスポリジウム種（Cryptosporidium species）、ブラジル鉤虫（Ancylostoma braziliense）；複数の他の寄生虫、シクロスポラ・カイエタネンシス（Cyclospora cayetanensis）、有鉤条虫（Taenia solium）、サイトメガロウイルス、デングウイルス（ＤＥＮ－１、ＤＥＮ－２、ＤＥＮ－３およびＤＥＮ－４）－フラビウイルス（Flaviviruses）、緑藻類（Green algae）、デスモデスムス・アルマツス（Desmodesmus armatus）、二核アメーバ（Dientamoeba fragilis）、コリネバクテリウム・ジフテリエ（Corynebacterium diphtheria）、裂頭条虫（Diphyllobothrium）、メジナ虫（Dracunculus medinensis）、エエボラウイルス（ＥＢＯＶ）、エキノコックス種（Echinococcus species）、エシェリキア種（Ehrlichia species）、エンテロビウス・ベルミクラリス（Enterobius vermicularis）、エンテロコッカス種（Enterococcus species）、エンテロウイルス種（Enterovirus species）、発疹チフスリケッチア（Rickettsia prowazekii）、パルボウイルス（Parvovirus）Ｂ１９、ヒトヘルペスウイルス（Human herpesvirus）６（ＨＨＶ－６）およびヒトヘルペスウイルス（Human herpesvirus）７（ＨＨＶ－７）、ファスキオラ・ヘパチカ（Fasciola hepatica）およびファスキオラ・ギガンチカ（Fasciola gigantica）、ファシオロプシス・ブスキ（Fasciolopsis buski）、ＰＲＮＰ、フィラリア上科（Filarioidea superfamily）、クロストリジウム・パーフリンジェンス（Clostridium perfringens）、フソバクテリウム種（Fusobacterium species）、クロストリジウム・パーフリンジェンス（Clostridium perfringens）、他のクロストリジウム種（Clostridium species）、ゲオトリクム・カンジダム（Geotrichum candidum）、ジアルジア・ラムブリア（Giardia lamblia）、バークホルデリア・マレイ（Burkholderia mallei）、グナソストーマ・スピニゲルム（Gnathostoma spinigerum）およびグナソストーマ・ヒスピダム（Gnathostoma hispidum）、ナイセリア・ゴノレア（Neisseria gonorrhoeae）、クレブシエラ・グラニュロマチス（Klebsiella granulomatis）、ストレプトコッカス・ピオゲネス（Streptococcus pyogenes）、ストレプトコッカス・アガラクチア（Streptococcus agalactiae）、ヘモフィルス・インフルエンザエ（Haemophilus influenza）、エンテロウイルス（Enteroviruses）、主にコクサッキーＡウイルス（Coxsackie A virus）およびエンテロウイルス（Enterovirus）７１（ＥＶ７１）、シンノンブルウイルス（Sin Nombre virus）、ハートランドウイルス（Heartland virus）、ヘリコバクター・ピロリ（Helicobacter pylori）、エシェリキア・コリ（Escherichia coli）Ｏ１５７：Ｈ７、Ｏ１１１およびＯ１０４：Ｈ４、ブニヤウイルス科（Bunyaviridae family）、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、Ｅ型肝炎ウイルス、単純ヘルペスウイルス（Herpes simplex virus）１型および２型（ＨＳＶ－１およびＨＳＶ－２）、ヒストプラズマ・カプスラーツム（Histoplasma capsulatum）、ズビニ鉤虫（Ancylostoma duodenale）およびアメリカ鉤虫（Necator americanus）、ヒトボカウイルス（Human bocavirus）（ＨＢｏＶ）、エシェリキア・エウィンギー（Ehrlichia ewingii）、アナプラズマ・ファゴサイトフィルム（Anaplasma phagocytophilum）、ヒトメタニューモウイルス（Human metapneumovirus）（ｈＭＰＶ）、エーリキア・シャフェンシス（Ehrlichia chaffeensis）、ヒトパピローマウイルス（Human papillomavirus）（ＨＰＶ）、ヒトパラインフルエンザウイルス（Human parainfluenza viruses）（ＨＰＩＶ）、小型条虫（Hymenolepis nana）および縮小条虫（Hymenolepis diminuta）、エプスタイン・バーウイルス（Epstein-Barr Virus）（ＥＢＶ）、オルトミクソウイルス科（Orthomyxoviridae family）、イソスポーラ・ベリ（Isospora belli）、キンゲラ・キンゲ（Kingella kingae）、ラッサウイルス（Lassa virus）、レジオネラ・ニューモフィラ（Legionella pneumophila）、リーシュマニア種（Leishmania species）、ライ菌（Mycobacterium leprae）、マイコバクテリウム・レプロマトシス（Mycobacterium lepromatosis）、レプトスピラ種（Leptospira species）、リステリア・モノサイトゲネス（Listeria monocytogenes）、ボレリア・ブルグドルフェリ（Borrelia burgdorferi）、ボレリア・ガリニ（Borrelia garinii）、ボレリア・アフゼリ（Borrelia afzelii）、バンクロフト糸状虫（Wuchereria bancrofti）、マレー糸状虫（Brugia malayi）、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス（Lymphocytic choriomeningitis virus）（ＬＣＭＶ）、プラスモジウム種（Plasmodium species）、マールブルグウイルス（Marburg virus）、麻疹ウイルス（Measles virus）、中東呼吸器症候群コロナウイルス（Middle East respiratory syndrome coronavirus）、バークホルデリア・シュードマレイ（Burkholderia pseudomallei）、ナイセリア・メニンギティディス（Neisseria meningitides）、横川吸虫（Metagonimus yokagawai）、マイクロスポリジア・フィルム（Microsporidia phylum）、伝染性軟属腫ウイルス（Molluscum contagiosum virus）（ＭＣＶ）、サル痘ウイルス（Monkeypox virus）、ムンプスウイルス（Mumps virus）、リケッチア・チフィ（Rickettsia typhi）、マイコプラズマ・ニューモニエ（Mycoplasma pneumoniae）、アクチノマウセトーマ（Actinomycetoma）、ユーマイセトーマ（Eumycetoma）、寄生虫性双翅目ハエ幼虫（parasitic dipterous fly larvae）、クラミジア・トラコマチス（Chlamydia trachomatis）、ナイセリア・ゴノレア（Neisseria gonorrhoeae）、ノカルジア・アステロイドス（Nocardia asteroids）、ノカルジア種（Nocardia species）、回旋糸状虫（Onchocerca volvulus）、タイ肝吸虫（Opisthorchis viverrini）およびネコ肝吸虫（Opisthorchis felineus）、南アメリカ分芽菌（Paracoccidioides brasiliensis）、ペディクルス・ヒューマヌス・カピチス（Pediculus humanus capitis）、フィチルス・プビス（Phthirus pubis）、ボルデテラ・パータシス（Bordetella pertussis）、エルシニア・ペスチス（Yersinia pestis）、ストレプトコッカス・ニューモニエ（Streptococcus pneumoniae）、ニューモシスチス・ジロベシ（Pneumocystis jirovecii）、ポリオウイルス（Poliovirus）、プレボテラ種（Prevotella species）、ネグレリア・フォーレリ（Naegleria fowleri）、ＪＣウイルス、クラミドフィラ・シタッシ（Chlamydophila psittaci）、コクシエラ・ブルネッティ（Coxiella burnetii）、狂犬病ウイルス、ボレリア・ヘルムシイ（Borrelia hermsii）、ボレリア・レクルレンチス（Borrelia recurrentis）、ボレリア種（Borrelia species）、呼吸器多核体ウイルス（Respiratory syncytial virus）（ＲＳＶ）、リノスポリジウム・セーベリ（Rhinosporidium seeberi）、ライノウイルス（Rhinovirus）、リケッチア種（Rickettsia species）、リケッチア・アカリ（Rickettsia akari）、リフトバレー熱ウイルス（Rift Valley fever virus）、リケッチア・リケッチア（Rickettsia rickettsia）、ロタウイルス（Rotavirus）、風疹ウイルス（Rubella virus）、サルモネラ種（Salmonella species）、ＳＡＲＳコロナウイルス（SARS coronavirus）、ヒゼンダニ（Sarcoptes scabiei）、シストソーマ種（Schistosoma species）、シゲラ種（Shigella species）、水痘帯状疱疹ウイルス（Varicella zoster virus）（ＶＺＶ）、大痘瘡（Variola major）、小痘瘡（Variola minor）、スポロトリクス・シェンクッキイ（Sporothrix schenckii）、スタフィロコッカス種（Staphylococcus species）、糞線虫（Strongyloides stercoralis）、麻疹ウイルス（Measles virus）、梅毒トレポネーマ（Treponema pallidum）、テニア種（Taenia species）、クロストリジウム・テタニ（Clostridium tetani）、トリコフィトン種（Trichophyton species）、トリコフィトン・トンズランス（Trichophyton tonsurans）、エピデルモフィトン・フロコスム（Epidermophyton floccosum）、トリコフィトン・ルブルム（Trichophyton rubrum）、トリコフィトン・メンタグロフィテス（Trichophyton mentagrophytes）、トリコフィトン・ルブルム（Trichophyton rubrum）、ホルタエア・ウエルネクキイ（Hortaea werneckii）、トリコフィトン種（Trichophyton species）、トリコフィトン種
（Trichophyton species）、マラセチア種（Malassezia species）、イヌ回虫（Toxocara canis）、ネコ回虫（Toxocara cati）、クラミジア・トラコマチス（Chlamydia trachomatis）、トキソプラズマ・ゴンディ（Toxoplasma gondii）、旋毛虫（Trichinella spiralis）、腟トリコモナス（Trichomonas vaginalis）、鞭虫（Trichuris trichiura）、マイコバクテリウム・ツベルクローシス（Mycobacterium tuberculosis）、フランシセラ・ツラレンシス（Francisella tularensis）、サルモネラ・エンテリカ亜種エンテリカ（Salmonella enterica subsp. enterica）、血清型チフス（serovar typhi）、リケッチア（Rickettsia）、ウレアプラズマ・ウレアリチカム（Ureaplasma urealyticum）、コクシジオイデス・イミチス（Coccidioides immitis）、コクシジオイデス・ポサダシ（Coccidioides posadasii）、ベネズエラウマ脳炎ウイルス（Venezuelan equine encephalitis virus）、グアナリトウイルス（Guanarito virus）、ビブリオ・バルニフィカス（Vibrio vulnificus）、ビブリオ・パラヘモリチカス（Vibrio parahaemolyticus）、複数のウイルス（multiple viruses）、ウエストナイルウイルス（West Nile virus）、トリコスポロン・ベイゲリイ（Trichosporon beigelii）、エルシニア・シュードツベルクロシス（Yersinia pseudotuberculosis）、エルシニア・エンテロコリチカ（Yersinia enterocolitica）、黄熱ウイルス（Yellow fever virus）、ケカビ目（Mucorales order）（ムコール症）、およびハエカビ目（Entomophthorales order）（エントモフトラ症）。
本書に記載の全ての処置および予防方法は、上記の微生物性生物の少なくともいずれかまたは全てに適用することができる。
いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、１種の微生物に対して有毒であり得る。いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、２種の微生物に対して有毒であり得る。いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、３種の微生物に対して有毒であり得る。いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、４種の微生物に対して有毒であり得る。いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、５種の微生物に対して有毒であり得る。
いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、宿主対象体にダメージを与えることなく微生物を処置するために用いることができる。いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、宿主対象体にダメージを与えることなく２種の微生物を処置するために用いることができる。いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、宿主対象体にダメージを与えることなく３種の微生物を処置するために用いることができる。いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、宿主対象体にダメージを与えることなく４種の微生物を処置するために用いることができる。いくつかの実施態様において、本発明の化合物は、宿主対象体にダメージを与えることなく５種の微生物を処置するために用いることができる。
一般的に、方法は、対象体を選択すること、および、例えば医薬組成物においてまたは医薬組成物として、本書におけるペプチドのうち１種以上の有効量を対象体に投与することを含み、また、微生物感染症の予防または処置に必要な場合には投与を繰り返すことを含んでもよく、また、例えば経口、静脈内または局所投与することができる。
特定の患者のための特定の投与量および処置計画は、使用される特定の化合物の活性、年齢、体重、総体的な健康状態、性別、食事、投与時間、排泄速度、薬物組み合わせ（drug combination）、疾患、状態または症状の重篤度および経過、疾患、状態または症状に対する患者の素質、ならびに処置を行う医師の判断を含む種々の要因に依存する。
１回以上の投与、適用または投薬で、有効量を投与することができる。治療化合物の治療有効量（すなわち、有効な投与量）は、選択された治療化合物に依存する。当該組成物は、１日１回以上～１週間に１回以上（１日おきに１回を包含する）投与することができる。当業者は、疾患または障害の重篤度、以前の処置、対象体の総体的な健康および／または年齢、ならびに存在する他の疾患が挙げられるがこれらに限定されない特定の要因が対象体を有効に処置するために必要とされる投与量およびタイミングに影響を及ぼし得ると解する。
さらにまた、本書に記載の治療化合物の治療有効量による対象体の処置は、単回の処置または一連の処置を含み得る。例えば、少なくとも１回、有効量を投与することができる。患者の状態が改善されると、必要に応じて、本発明の化合物、組成物または組み合わせの維持用量を投与することができる。その後、投与量もしくは投与頻度、またはその両方を、症状の関数として、改善された状態が維持されるレベルまで低下させることができる。しかしながら、患者は、疾患症状の再発時に長期間断続的治療を必要とすることがある。
いくつかの場合、本書におけるペプチドは、さらに、疾患または疾患症状の調節を行うのに有用な量で１種以上のさらなる治療剤と共投与することができる。かかるさらなる治療剤としては、当該技術分野で知られている慣用の抗微生物剤（例えば、抗生物質）を挙げることができる。共投与される場合、本発明のステープル化ＡＭＰは、慣用の抗微生物剤と組み合わせて、機構的に相加的または相乗的な抗微生物効果を生じるように機能する。特定の作用機序に限定されずに、特定の微生物性生物（例えば、グラム陰性細菌を包含する）の膜に「細孔」を生じる能力を有する特定の内部架橋（例えば、ステープル化）ＡＭＰは、適切な慣用の抗微生物剤の、関連する微生物細胞の内部への通過を促進および／または増強するように作用することができる。同じ目的で、内部架橋ＡＭＰは、適切な抗微生物剤と（共有的または非共有的に）コンジュゲートすることができ、得られたコンジュゲート体は、適切な対象体へ投与される。
内部架橋および細胞内ターゲティングＡＭＰが微生物性生物の膜に一過性の「細孔」をも生じる能力は、それらのための別の有用性の基礎をもたらす。かくして、例えば、関連する微生物性生物（例えば、本書に記載のもののいずれか）を、対象体内またはインビトロで、該微生物性生物の「細孔」または溶解を生じる能力を有する内部架橋ＡＭＰと接触させることができる。この活性の結果として、核酸（例えば、ＤＮＡおよび／またはＲＮＡ）が、微生物性生物からそれらの周囲へ放出される。この現象は、微生物性生物の正確で迅速で安価な同定の基礎として用いることができる。接触が対象体内で生じる場合、種々の体液（例えば、血液、リンパ液、尿、糞便、粘液、または涙）のいずれかまたは体洗浄を試験することができる。接触がインビトロで生じる場合、培養培地を試験することができる。
医療または衛生デバイスへの応用
本発明の抗微生物ペプチドは、様々な医療および／または衛生デバイス（例えば、コーティングとして、またはデバイスが脊椎動物対象体の体管（bodily canal）に挿入された後、脊椎動物対象体の体腔に挿入された後または脊椎動物の組織もしくは器官に適用された後に分解または溶解した場合の暴露または放出のために生分解性デバイス内に含浸される）に応用または組み込むことができて、微生物（例えば、細菌またはバイオフィルム）の増殖を防止または阻害することができる。本書に記載のステープル化ペプチドとともに用いるのに好適な医療または衛生デバイスとしては、下記の目的で脊椎動物対象体の体管に挿入されるか、脊椎動物対象体の体腔に挿入されるか、または脊椎動物の組織もしくは器官に適用されるデバイスが挙げられるがこれらに限定されない：（ａ）傷の保護；（ｂ）脊椎動物対象体の体からの、体液、分泌液または排泄物（例えば、血液、月経、尿、リンパ液、脳脊髄液、精液、唾液、膣分泌物、粘液、または糞便）の望ましくない放出の防止または軽減、または制限された放出の解消；（ｃ）対象体への薬物またはいくつかの他の治療剤もしくは予防剤の送達；（ｄ）不在の臓器機能の置換または欠損した臓器機能の補完；または（ｅ）体管（例えば、血管）の開存性の維持。医療または衛生デバイスの具体的な例としては、以下のものが挙げられるがこれらに限定されない：直腸デバイス、例えば、坐剤、浣腸、およびカテーテル；鼻送達、器官送達、または食道送達デバイス；膣用デバイス、例えば、膣用タンポンおよび避妊デバイス（例えば、ペッサリーまたは子宮内デバイス（ＩＵＤ））；静脈用、動脈用、頭蓋内用および他のためのニードル、カテーテルおよびステント；腎透析用アクセス；外科用の絆創膏、縫合または包帯；オストミーデバイス；天然および合成の埋め込み型組織マトリックス（例えば、米国特許第５,８８５,８２９号を参照（出典明示によりその全体として本明細書の一部を構成する））；ペースメーカー、ならびにペースメーカーワイヤおよびリード；合成および自然のプロテーゼ、例えば、臀部および膝用プロテーゼ、ならびに心臓弁；体腔（例えば、腹腔）に埋め込まれ、薬物またはいくつかの他の治療もしくは予防剤のゆっくりとした送達を提供する浸透圧ポンプ（例えば、ミニ浸透圧ポンプ）。
さらなる適用
処置に好適な動物の例は、当該技術分野において一般的に知られており、以下のものが挙げられる（しかし、これらに限定されない）：例えば、家禽類および他のトリ（ニワトリ、シメンチョウ、アヒル、ダチョウ、エミュー、ウズラを包含する）、反芻動物（ヤギ、ヒツジ、およびウシを包含する）、サカナ、ブタ、ウサギ、マウス、ラット、ウマ、ロバ、サル、類人猿、ネコ科動物（ネコを包含する）、ハムスター、フェレット、モルモットおよびイヌ科動物（イヌを包含する）。処置に好適な植物の例は、当該技術分野において一般的に知られており、以下のものが挙げられる（しかし、これらに限定されない）：例えば、アーモンド、リンゴ、アマランス、チョウセンアザミ、アスパラガス、アボカド、バナナおよびプランテン、オオムギ、ビート、ベリー類（ブルーベリー、ブラックベリー、ストロベリー、およびラズベリー）、パンノキおよびジャックフルーツ、芽キャベツ、キャベツ、ニンジン、キャッサバ、カリフラワーおよびブロッコリー、セロリ、ハヤトウリ、チェリー、ココナツ、コラードおよびケール、コーン（トウモロコシ）、キュウリおよびズッキーニ、タンポポ、ナスビ、エンダイブおよびチコリ、ニンニク、コールラビ、ブドウ、マメ科植物、レタス、メロン類（ハネデュー、カンタロープおよびスイカ）、カラシナ、オート麦、オカ（oca）、オリーブ、オクラ、タマネギ、オレンジおよびグレープフルーツ、オイスタープラント、西洋ナシ、モモ、ペミカン、ペッパー、ジャガイモおよび他の塊茎、キノア、ラディッシュ、コメ、ダイオウ、ライムギ、サゴ、ソルガム、ダイズ、ホウレンソウ、カボチャ（pumpkin）および他のカボチャ（squash）、キクイモ、タロイモ、テフ、トマト、カブ、ウルーコ（ulluco）、バニラ、クレソン、コムギ、ヤム、およびヤウティア。処置に好適な食品の例は、当該技術分野において一般的に知られており、以下のものが挙げられる（しかし、これらに限定されない）：例えば、上記のような、藻類、キノコ類、および動物由来の食品（例えば、ビーフ、バター、タマゴ、（アイス）クリーム、グレイビー、ミルク、ポーク、ヴィール、ヨーグルト）および／または植物由来の食品（例えば、ビール、パン、シリアル、チョコレート、コーヒー、ケチャップ、マスタードソース、オートミール、ジュース、グルタミン酸ナトリウム、サラダ、ソーダ、ソフトドリンク、豆乳、醤油、茶、豆腐、揚げ物、酢、ワイン）。
本書におけるペプチドは、また、微生物（例えば、細菌）汚染のリスクを低減または排除するために、パーソナルケアおよび／または消費者製品の状況において（例えば、滅菌プロセスにおける健康製品または美容製品に）適用することもできる。処置に好適な製品の例は、当該技術分野において一般的に知られており、以下のものが挙げられる（しかし、これらに限定されない）：例えば、ブラシ、コンディショナー、クリップ、クリッパー、カールアイロン、シャンプー、ソープ、ローション、局所アクネ軟膏、オイル、着色料、染料、香料、ピン、フレグランス、カミソリ、ヒゲソリ用デバイス、デオドラント、化粧料、キッチン用および／またはダイニング用デバイス（例えば、まな板、ラック、容器、ポット、平鍋、器具（utensil））、および清掃デバイス（例えば、ホウキ、モップ、ちりとり、掃除機）および清浄液。
実施例１：ステープル化Ｉ－ＴＡＭＰアナログの合成
どのステープル挿入位置が最適な生物学的および薬理学的特性を有するＩ－ＴＡＭＰアナログを生成するかを同定するために、ステープル化ブフォリンＩＩペプチドの完全なｉ,ｉ＋４およびｉ,ｉ＋７ステープルスキャンパネルを合成した（図１）。いくつかの組成物において、二次構造におけるブレークポイントとしてのプロリンの潜在的な役割を考慮して、中心のプロリン残基の置き換えを回避した。また、いくつかのパネルにおいて、ＵＶ分光法によるペプチド濃度の容易な決定のために、該プロリンに隣接するフェニルアラニンをトリプトファンに置き換えた。これらの例示的なパネルの生成は、親Ｉ－ＴＡＭＰの種々のセグメントの構造安定化の、その抗微生物および溶血活性に対する効果を調べることを可能にした。
実施例２：ステープル化Ｉ－ＴＡＭＰアナログのαヘリックス特徴付け
当該ステープル化Ｉ－ＴＡＭＰアナログパネル内の各ペプチドについてαヘリックス含量を決定するために、α－ヘリックス促進溶媒であるトリフルオロエタノール（ＴＦＥ；５０％ｖ／ｖ）の存在下および不在下でＣＤ分光法を用い、１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ７.４）に溶解したペプチドを研究した。ＴＦＥの不在下では、ｉ,ｉ＋４ステープル化アナログは、完全に無秩序であった非ステープル化親Ｉ－ＴＡＭＰであるブフォリンＩＩ（Ｆ１０Ｗ）と比べて多少改善されたαヘリックス構造を示した（図２のパネルＡ）。ＴＦＥを添加すると、αヘリックス含量は、αヘリックスＡＭＰについて前に観察されたほど劇的ではないが、ステープル化アナログのいくつかおよび親Ｉ－ＴＡＭＰ（Ｆ１０Ｗ）では増加し（図２のパネルＢ）、ブフォリンＩＩ配列内のヘリックス破壊プロリンの取り込みと一致する。ｉ,ｉ＋７ステープル化アナログは、ＴＦＥの存在下および不在下の両方で、それらのｉ,ｉ＋４カウンターパートと比べて高いレベルのαヘリックス度を示した（図３）。
実施例３：ステープル化Ｉ－ＴＡＭＰペプチドの溶血活性
敗血症などの全身性感染症におけるＡＭＰの使用を長く妨害してきた主な障害の１つは、それらの、赤血球（ＲＢＣ）などのヒト細胞を溶解する傾向である。かくして、治療域を達成するために可能な限り溶血活性を最小化することが重要である。リン酸緩衝液中１％ＲＢＣ懸濁液においてＩ－ＴＡＭＰブフォリンＩＩのステープル化アナログを試験した場合、ほとんどのｉ,ｉ＋４アナログは低い溶血活性を示したが、いくつかの場合、溶血が５倍増加した（表１）。一般に、ｉ,ｉ＋７アナログは、おそらくより長い炭化水素ステープルのより大きな疎水性に起因して、より高い溶血活性を有した（表１）。注目すべきことに、炭化水素ステープルが疎水性の増大に起因して溶血活性を増大させるこれらの状況下では、アルケン部分を、例えばジヒドロキシル化によって、修飾して、親水性残基を導入し、溶血を潜在的に軽減することができる。
ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)７およびＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)１１は低い溶血活性を維持しながら抗微生物活性の最大の上昇を示したので、抗微生物効力と溶血活性抑制のバランスを取って、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)７およびＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)１１をさらなる開発のための特定の例示的な候補として同定した。
図８は、ステープル化ブフォリンＩＩアナログの溶血を示すグラフである。ステープル化ブフォリンＩＩアナログをリン酸緩衝液中１％ｖ／ｖヒト赤血球（ＲＢＣ）と一緒に３７℃で１時間インキュベートし、次いで、上清を回収し、５７０ｎｍでＵＶ吸光度を使用してヘモグロビン放出を測定した。ステープル化溶解性対照ペプチドとは対照的に、ブフォリンＩＩアナログは、５０μｇ／ｍＬまでの全ての試験濃度で５％未満の溶血レベルを示した。
Figure 2022095666000049
実施例４：ステープル化Ｉ－ＴＡＭＰペプチドの抗微生物活性
非ステープル化配列と比べたステープル化ブフォリンＩＩアナログの抗微生物活性を決定するために、一般的なグラム陰性病原体、エシェリキア・コリ（Escherichia coli）（E. coli）に対するＭＩＣを決定した。ほとんどの研究はブフォリンＩＩ活性を研究するために放射状拡散アッセイ（radial diffusion assay）（ＲＤＡ）を用いるが、マイクロブロス希釈アッセイ（microbroth dilution assay）は抗生物質の分野で用いられる標準技術であるので、このより広く適用される技術を採用した。非ステープル化ブフォリンＩＩ（Ｆ１０Ｗ）およびブフォリンＩＩの活性と比べて、全てのステープル化アナログは、適度な構造安定化に起因して予想されるものを超えて、より高いレベルの活性を示した（表１および２）。顕著には、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)７およびＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)４などの特定の場合において、非修飾ブフォリンＩＩと比べて観察された活性の増加は２００倍を超えていた。注目すべきことに、Ｎ末端領域のステープリングが、以前にブフォリンＩＩのＣ末端αヘリックス領域であったＣ末端領域にステープルを導入するよりも優れた化合物を生じることは特に予想されなかった。これらの結果は、ステープル挿入部位が以前の構造的および生物学的データに基づいて明白（apparent）ではないかまたは明白（obvious）ではなかったので、最適な構築物を発見するために包括的なステープルスキャンの重要性を再確認する。
Figure 2022095666000050
実施例で用いた方法
固相ペプチド合成法：Ｆｍｏｃベースの固相ペプチド合成法を使用して、抗微生物ペプチドおよびそれらのステープル化誘導体を合成した。様々なステープル長を達成するために、α－メチル、α－アルケニルアミノ酸を２個、３個、または６個の残基に隣接して使用した。例として、Ｒ5残基またはＲ3残基は位置ｉで組み込むことができ、Ｓ5は位置ｉ＋３で組み込まむことができ、一方、２個のＳ5残基はｉおよびｉ＋４の位置で使用することができ、Ｒ8は位置ｉで、Ｓ5は位置ｉ＋７で（または、Ｓ8は位置ｉで、Ｒ5はｉ＋７で）使用することができる[20]。ステープリング反応のために、ジクロロエタンに溶解したＧｒｕｂｂｓの第一世代ルテニウム触媒を樹脂上にあるペプチドに加えた。最大変換を確実にするために、ステープリングを３～５ラウンド行った。一旦ステープル化した後、トリフルオロ酢酸を用いて該ペプチドを樹脂から切断し、次いで、ヘキサン：エーテル（１：１）混合物を用いて沈殿させ、次いで、風乾し、ＬＣ－ＭＳを用いて精製した。ＵＶ分光法を用いて、２８０ｎｍにおけるトリプトファン吸光係数ε＝５６９０Ｍ-1ｃｍ-1に基づいて精製されたペプチドの量を測定した。アミノ酸分析も用いた。
円偏光二色性分光法：ヘリックス構造の特徴付けのため、Ａｖｉｖ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ分光計による円偏光二色性（ＣＤ）分光法を用いて、各ペプチドの平均モル楕円率を決定した。１０ｍＭリン酸緩衝液（ｐＨ７.４）中、および緩衝液：２,２,２－トリフルオロエタノール（１：１ｖ／ｖ）の混合物中のペプチドストック溶液（１００μＭ）を１ｍｍの溶融石英セルに充填し、それらの楕円率を１９５ｎｍから２６０ｎｍまでスキャンした。
抗微生物活性アッセイ：以下のマイクロブロス希釈プロトコールを、各ペプチドのＭＩＣを決定するために適合させた。最初に、Ｍｕｅｌｌｅｒ－Ｈｉｎｔｏｎブロス（ＭＨＢ）をアニオン交換カラムに通してポリアニオン種を除去し、精製ＭＨＢを得た。この精製ブロスをハンコック（Hancock）らが考案した９６ウェルプレート用の標準的なマイクロブロス希釈プロトコールに使用した[21]。注：ＢＳＡは、最初の研究でペプチド活性を妨げる可能性があることが判明したので、本書に記載の適応プロトコールには使用しなかった。簡潔には、細菌細胞を精製ＭＨＢ中にて３７℃で一夜増殖させ、次いで、希釈し、再び数時間増殖させた。透明な丸底ポリプロピレン９６ウェルプレートを用いて、水（１０μｌ）によるペプチドストックの段階希釈物を調製した。次いで、精製ＭＨＢ中の細菌９０μｌを添加して、５×１０5ＣＦＵ／ｍｌの最終接種物を得た。次いで、プレートを多孔性テープで覆って蒸発を減少させ、３７℃で２０～２４時間インキュベートした。ＭＩＣは、目に見える成長が観察されなかった最小のペプチド濃度を評価することによって決定した。
溶血活性アッセイ：溶血活性の決定のために、以下のプロトコールを適用した：ヒト血液サンプルを遠心分離して赤血球（ＲＢＣ）を単離し、次いで、これを洗浄し、リン酸緩衝生理食塩水に懸濁させて１％（ｖ／ｖ）懸濁液を得た。次いで、この懸濁液を透明丸底ポリプロピレン９６－ウェルプレート中の水によるペプチドストックの段階希釈物に加え、プレートを３７℃で１時間インキュベートした。インキュベーション後、プレートを遠心分離し、上清を単離して、放出されたヘモグロビンの量を、分光光度計（５７０ｎｍ）を用いて決定した。最小溶血濃度（ＭＨＣ）は、ヘモグロビン放出が１％未満であったペプチド濃度を評価することによって決定した。
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他の実施態様において、第１のＣαから第２のＣαまで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、第１のＣαと第２のＣαの間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるαヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
他の実施態様において、第１のＣαから第２のＣαまで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、第１のＣαと第２のＣαの間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
いくつかの実施態様において、Ｅによって表される第１のＣ末端アミノ酸および／または第２のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される第１のＣ末端アミノ酸および／または第２のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖、例えば小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される第１のＣ末端アミノ酸、第２のＣ末端アミノ酸および／または第３のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される第１のＣ末端アミノ酸、第２のＣ末端アミノ酸および／または第３のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖、例えば小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅに関してｉ＋１、ｉ＋２、ｉ＋３、ｉ＋４、ｉ＋５、および／またはｉ＋６であるアミノ酸の１つ以上または各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。
いくつかの実施態様において、各ｗは、独立して、１～１０００の整数である。例えば、Ｅによって表される第１のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、２～１０００である。例えば、Ｅによって表される第２のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、３～１０００である。例えば、Ｅによって表される第３のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される第３のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、４～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、５～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、６～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、７～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、８～１０００である。
他の実施態様において、第１のＣαから第２のＣαまで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、第１のＣαと第２のＣαの間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
他の実施態様において、第１のα炭素から第２のα炭素まで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、第１のα炭素と第２のα炭素の間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
いくつかの実施態様において、ｗは、１～１０００である。例えば、Ｅによって表される第１のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、２～１０００である。例えば、Ｅによって表される第２のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、ｗは、３～１０００である。例えば、Ｅによって表される第３のアミノ酸は、小さい疎水性側鎖を含むことができる。例えば、Ｅによって表される第３のアミノ酸は小さい疎水性側鎖を含むことができる。いくつかの実施態様において、ｗは、４～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは５～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは６～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは７～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは８～１０００である。いくつかの実施態様において、ｗは、３～１０、例えば３～６、３～８、６～８、または６～１０の整数である。いくつかの実施態様において、ｗは３である。他の実施態様において、ｗは、６である。いくつかの実施態様において、ｖは、１～１０、例えば、２～５の整数である。いくつかの実施態様において、ｖは２である。いくつかの実施態様において、ｖは３である。
いくつかの実施態様において、Ｅによって表される第１の２個のアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される第１の３個のアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される第１の４個のアミノ酸の各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。
いくつかの実施態様において、Ｅによって表される第１のＣ末端アミノ酸および／または第２のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される第１のＣ末端アミノ酸および／または第２のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖、例えば小さい疎水性側鎖を含む。いくつかの実施態様において、Ｅによって表される第１のＣ末端アミノ酸、第２のＣ末端アミノ酸、および／または第３のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖を含む。例えば、Ｅによって表される第１のＣ末端アミノ酸、第２のＣ末端アミノ酸、および／または第３のＣ末端アミノ酸は、疎水性側鎖、例えば小さい疎水性側鎖を含む。
いくつかの実施態様において、第１のＥに関してｉ＋１、ｉ＋２、ｉ＋３、ｉ＋４、ｉ＋５、および／またはｉ＋６であるアミノ酸の１つ以上または各々は、非荷電側鎖または負荷電側鎖を含む。いくつかの実施態様において、各Ｅは、独立して、Ａｌａ（アラニン）、Ｄ－Ａｌａ（Ｄ－アラニン）、Ａｉｂ（α－アミノイソ酪酸）、Ｓａｒ（Ｎ－メチルグリシン）およびＳｅｒ（セリン）からなる群から選択されるアミノ酸である。
いくつかの実施態様において、第１のα炭素から第２のα炭素まで測定した大環状分子形成リンカー[－Ｌ1－Ｓ－Ｌ2－Ｓ－Ｌ3－]の長さは、第１のα炭素と第２のα炭素の間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるヘリックス（３10ヘリックスまたはαヘリックスが挙げられるがこれらに限定されない）のような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。いくつかの実施態様において、チオール部分は、アミノ酸残基であるＬ－システイン、Ｄ－システイン、α－メチル－Ｌ－システイン、α－メチル－Ｄ－システイン、Ｌ－ホモシステイン、Ｄ－ホモシステイン、α－メチル－Ｌ－ホモシステイン、またはα－メチル－Ｄ－ホモシステインの側鎖である。ビスアルキル化試薬は、一般式Ｘ－Ｌ2－Ｙ（式中、Ｌ2はリンカー部分であり、ＸおよびＹは、Ｌ2と結合を形成するために－ＳＨ部分に置き換えられる脱離基である）で示されるものである。いくつかの実施態様において、ＸおよびＹはハロゲン、例えば、Ｉ、ＢｒまたはＣｌである。
他の実施態様において、第１のＣαから第２のＣαまで測定した大環状分子形成リンカーＬの長さは、第１のＣαと第２のＣαの間のものを包含するが必ずしもこれに限定されるわけではない該化合物の残基によって形成されるαヘリックスのような所望の二次ペプチド構造を安定化させるように選択される。
いくつかの実施態様において、当該化合物は、３10またはαヘリックスモチーフなどの少なくとも１つのヘリックスモチーフを含む。例えば、式Ｉ、ＩＩまたはＩＩＩで示される化合物におけるＡ、Ｂ、および／またはＣは、１つ以上のヘリックスを含む。一般的な事柄として、ヘリックスは、１ターンあたり３～４個のアミノ酸残基を含む。いくつかの実施態様において、該化合物のヘリックスは、１～５ターンを含み、したがって、３～２０個のアミノ酸残基を含む。特定の実施態様において、ヘリックスは、１ターン、２ターン、３ターン、４ターン、または５ターンを含む。いくつかの実施態様において、大環状分子形成リンカーは、化合物内に含まれるヘリックスモチーフを安定化する。かくして、いくつかの実施態様において、第１のα炭素から第２のα炭素までの大環状分子形成リンカーＬの長さは、ヘリックスの安定性を増大させるように選択される。いくつかの実施態様において、大環状分子形成リンカーは、ヘリックスの１ターン～５ターンにまたがる。いくつかの実施態様において、大環状分子形成リンカーは、ヘリックスのおよそ１ターン、２ターン、３ターン、４ターン、または５ターンにまたがる。いくつかの実施態様において、大環状分子形成リンカーの長さは、ヘリックスの１ターンあたりおよそ５Å～９Å、またはヘリックスの１ターンあたりおよそ６Å～８Åである。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、長さは、およそ５個の炭素－炭素結合～１３個の炭素－炭素結合、およそ７個の炭素－炭素結合～１１個の炭素－炭素結合、またはおよそ９個の炭素－炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ２ターンにまたがる場合、長さは、およそ８個の炭素－炭素結合～１６個の炭素－炭素結合、およそ１０個の炭素－炭素結合～１４個の炭素－炭素結合、またはおよそ１２個の炭素－炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ３ターンにまたがる場合、長さは、およそ１４個の炭素－炭素結合～２２個の炭素－炭素結合、およそ１６個の炭素－炭素結合～２０個の炭素－炭素結合、またはおよそ１８個の炭素－炭素結合に等しい大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ４ターンにまたがる場合、長さは、およそ２０個の炭素－炭素結合～２８個の炭素－炭素結合、およそ２２個の炭素－炭素結合～２６個の炭素－炭素結合、またはおよそ２４個の炭素－炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ５ターンにまたがる場合、長さは、およそ２６個の炭素－炭素結合～３４個の炭素－炭素結合、およそ２８個の炭素－炭素結合～３２個の炭素－炭素結合、またはおよそ３０個の炭素－炭素結合に等しい。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ４個の原子～１２個の原子、およそ６個の原子～１０個の原子、またはおよそ８個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ２ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ７個の原子～１５個の原子、およそ９個の原子～１３個の原子、またはおよそ１１個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ３ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ１３個の原子～２１個の原子、およそ１５個の原子～１９個の原子、またはおよそ１７個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ４ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ１９個の原子～２７個の原子、およそ２１個の原子～２５個の原子、またはおよそ２３個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ５ターンにまたがる場合、リンケージは、およそ２５個の原子～３３個の原子、およそ２７個の原子～３１個の原子、またはおよそ２９個の原子を含有する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ１ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ１７個の構成員～２５個の構成員、およそ１９個の構成員～２３個の構成員、またはおよそ２１個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ２ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ２９個の構成員～３７個の構成員、およそ３１個の構成員～３５個の構成員、またはおよそ３３個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ３ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ４４個の構成員～５２個の構成員、およそ４６個の構成員～５０個の構成員、またはおよそ４８個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ４ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ５９個の構成員～６７個の構成員、およそ６１個の構成員～６５個の構成員、またはおよそ６３個の構成員を含有する環を形成する。大環状分子形成リンカーがヘリックスのおよそ５ターンにまたがる場合、得られた大環状分子は、およそ７４個の構成員～８２個の構成員、およそ７６個の構成員～８０個の構成員、またはおよそ７８個の構成員を含有する環を形成する。
本願は以下の態様も包含する。
［態様１］
式：
Figure 2022095666000063
 ［式中、
各Ｒ 1 およびＲ 2 は、独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
各Ｒ 3 は、独立して、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
各ｘは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
各ｗおよびｙは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０であり；
ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０であり；
各Ｘａａは、独立して、アミノ酸である］
を有する化合物（ここで、該化合物は、少なくとも１種類の微生物に対して細胞内抗微生物効果を示す）またはその薬学的に許容される塩。
［態様２］
ｘが２、３または６である、態様１記載の化合物。
［態様３］
ｘが２であり；Ｒ 3 がＣ 8 アルキレン、Ｃ 8 アルケニレン、またはＣ 8 アルキニレンであり；ｘ、ｗおよびｙの合計が少なくとも１０である、態様２記載の化合物。
［態様４］
ｘが３であり；Ｒ 3 がＣ 8 アルキレン、Ｃ 8 アルケニレン、またはＣ 8 アルキニレンであり；ｘ、ｗおよびｙの合計が少なくとも１０である、態様１記載の化合物。
［態様５］
Ｒ 3 が１個、２個、３個、４個、５個または６個のＲ 4 で置換されており、各Ｒ 4 が、独立して、－ＮＨ 3 または－ＯＨであり、ここで、各－ＮＨ 3 が別の化学的要素とカップリングしていてもよい、態様１記載の化合物。
［態様６］
Ｒ 3 が２個のＲ 4 で置換されており、どちらのＲ 4 も－ＯＨである、態様５記載の化合物。
［態様７］
Ｒ 3 が２個のＲ 4 で置換されており、１個のＲ 4 が置換されていてもよい－ＮＨ 3 であり、残りのＲ 4 が－ＯＨである、態様５記載の化合物。
［態様８］
少なくとも１つのＸａａが、非天然アミノ酸であるアミノ酸である、態様１記載の化合物。
［態様９］
化合物がヘリックスを含む、態様１記載の化合物。
［態様１０］
ヘリックスがα－ヘリックスである、態様９記載の化合物。
［態様１１］
Ｒ 3 がα－ヘリックスの１～２ターンにまたがっている、態様１記載の化合物。
［態様１２］
化合物が、配列番号１～６０からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む、態様１記載の化合物。
［態様１３］
化合物が、配列番号１～６０からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を含む、態様１記載の化合物。
［態様１４］
化合物が、配列番号１～６０からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも ８０％同一であるアミノ酸配列を含む、態様１記載の化合物。
［態様１５］
化合物が、配列番号１～６０からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、態様１記載の化合物。
［態様１６］
化合物が、配列番号１～６０のいずれか１つであるアミノ酸配列を含む、態様１記載の化合物。
［態様１７］
化合物が、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)２、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)３、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)４、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)６、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)７、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)８、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)１１、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)１、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)２、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)３、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)４、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)５、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)６、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)７、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)８、またはＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)９を含む、態様１記載の化合物。
［態様１８］
化合物が、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)７、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)１１、またはＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)６の配列を含む、態様１記載の化合物。
［態様１９］
抗微生物効果が、約０.１μＭ～約５０μＭの最小阻止濃度である、態様１記載の化合物。
［態様２０］
抗微生物効果が、約０.５μＭ～約２０μＭの最小阻止濃度である、態様１記載の化合物。
［態様２１］
微生物が細菌性生物である、態様１記載の化合物。
［態様２２］
細菌性生物がグラム陽性である、態様２１記載の化合物。
［態様２３］
細菌性生物がグラム陰性である、態様２１記載の化合物。
［態様２４］
細菌性生物がマイコバクテリウム・ツベルクローシス（Mycobacterium tuberculosis）である、態様２１記載の化合物。
［態様２５］
微生物によって引き起こされる感染症の処置方法であって、該微生物によって引き起こされる感染症に罹患しているかまたは罹患するリスクを有する対象体に、式：
Figure 2022095666000064
 ［式中、
各Ｒ 1 およびＲ 2 は、独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
各Ｒ 3 は、独立して、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
各ｘは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
各ｗおよびｙは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０であり；
ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
各Ｘａａは、独立して、アミノ酸である］
を有する化合物（ここで、該化合物は、少なくとも１種類の微生物に対して細胞内抗微生物効果を示す）またはその薬学的に許容される塩の治療有効量を投与することを含む、方法。
［態様２６］
対象体が動物である、態様２５記載の方法。
［態様２７］
動物が哺乳動物である、態様２６記載の方法。
［態様２８］
動物がヒトである、態様２６記載の方法。
［態様２９］
対象体が植物である、態様２５記載の方法。
［態様３０］
微生物が細菌性生物である、態様２５記載の方法。
［態様３１］
細菌性生物がグラム陽性である、態様３０記載の方法。
［態様３２］
細菌性生物がグラム陰性である、態様３０記載の方法。
［態様３３］
さらに、該対象体に抗生物質の治療有効量を投与することを含む、態様２５記載の方法。
［態様３４］
化合物および抗生物質が該感染症を治療するために相乗的に作用する、態様３３記載の方法。
［態様３５］
化合物および抗生物質が該抗生物質に対する感染の抵抗性を克服するために相乗的に作用する、態様３３記載の方法。
［態様３６］
式：
Figure 2022095666000065
 ［式中、
各Ｒ 1 およびＲ 2 は、独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
各Ｒ 3 は、独立して、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
各ｘは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０であり；
各ｗおよびｙは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０であり；
ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０であり；
各Ｘａａは、独立して、アミノ酸である］
を有する化合物（ここで、該化合物は、少なくとも１種類の微生物に対する細胞内抗微生物効果を示す）またはその薬学的に許容される塩を含む、医薬組成物。
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Claims (36)

  1. 式：
    Figure 2022095666000051
     ［式中、
    各Ｒ1およびＲ2は、独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
    各Ｒ3は、独立して、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
    各ｘは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
    各ｗおよびｙは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０であり；
    ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０であり；
    各Ｘａａは、独立して、アミノ酸である］
    を有する化合物（ここで、該化合物は、少なくとも１種類の微生物に対して細胞内抗微生物効果を示す）またはその薬学的に許容される塩。
  2. ｘが２、３または６である、請求項１記載の化合物。
  3. ｘが２であり；Ｒ3がＣ8アルキレン、Ｃ8アルケニレン、またはＣ8アルキニレンであり；ｘ、ｗおよびｙの合計が少なくとも１０である、請求項２記載の化合物。
  4. ｘが３であり；Ｒ3がＣ8アルキレン、Ｃ8アルケニレン、またはＣ8アルキニレンであり；ｘ、ｗおよびｙの合計が少なくとも１０である、請求項１記載の化合物。
  5. Ｒ3が１個、２個、３個、４個、５個または６個のＲ4で置換されており、各Ｒ4が、独立して、－ＮＨ3または－ＯＨであり、ここで、各－ＮＨ3が別の化学的要素とカップリングしていてもよい、請求項１記載の化合物。
  6. Ｒ3が２個のＲ4で置換されており、どちらのＲ4も－ＯＨである、請求項５記載の化合物。
  7. Ｒ3が２個のＲ4で置換されており、１個のＲ4が置換されていてもよい－ＮＨ3であり、残りのＲ4が－ＯＨである、請求項５記載の化合物。
  8. 少なくとも１つのＸａａが、非天然アミノ酸であるアミノ酸である、請求項１記載の化合物。
  9. 化合物がヘリックスを含む、請求項１記載の化合物。
  10. ヘリックスがα－ヘリックスである、請求項９記載の化合物。
  11. Ｒ3がα－ヘリックスの１～２ターンにまたがっている、請求項１記載の化合物。
  12. 化合物が、配列番号１～６０からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも６０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１記載の化合物。
  13. 化合物が、配列番号１～６０からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも７０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１記載の化合物。
  14. 化合物が、配列番号１～６０からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも ８０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１記載の化合物。
  15. 化合物が、配列番号１～６０からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも９０％同一であるアミノ酸配列を含む、請求項１記載の化合物。
  16. 化合物が、配列番号１～６０のいずれか１つであるアミノ酸配列を含む、請求項１記載の化合物。
  17. 化合物が、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)２、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)３、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)４、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)６、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)７、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)８、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)１１、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)１、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)２、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)３、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)４、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)５、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)６、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)７、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)８、またはＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)９を含む、請求項１記載の化合物。
  18. 化合物が、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)７、ＢＦＳｔａｐ(ｉ＋４)１１、またはＢＦＳｔａｐ(ｉ＋７)６の配列を含む、請求項１記載の化合物。
  19. 抗微生物効果が、約０.１μＭ～約５０μＭの最小阻止濃度である、請求項１記載の化合物。
  20. 抗微生物効果が、約０.５μＭ～約２０μＭの最小阻止濃度である、請求項１記載の化合物。
  21. 微生物が細菌性生物である、請求項１記載の化合物。
  22. 細菌性生物がグラム陽性である、請求項２１記載の化合物。
  23. 細菌性生物がグラム陰性である、請求項２１記載の化合物。
  24. 細菌性生物がマイコバクテリウム・ツベルクローシス（Mycobacterium tuberculosis）である、請求項２１記載の化合物。
  25. 微生物によって引き起こされる感染症の処置方法であって、該微生物によって引き起こされる感染症に罹患しているかまたは罹患するリスクを有する対象体に、式：
    Figure 2022095666000052
     ［式中、
    各Ｒ1およびＲ2は、独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
    各Ｒ3は、独立して、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
    各ｘは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
    各ｗおよびｙは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０であり；
    ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０であり；
    各Ｘａａは、独立して、アミノ酸である］
    を有する化合物（ここで、該化合物は、少なくとも１種類の微生物に対して細胞内抗微生物効果を示す）またはその薬学的に許容される塩の治療有効量を投与することを含む、方法。
  26. 対象体が動物である、請求項２５記載の方法。
  27. 動物が哺乳動物である、請求項２６記載の方法。
  28. 動物がヒトである、請求項２６記載の方法。
  29. 対象体が植物である、請求項２５記載の方法。
  30. 微生物が細菌性生物である、請求項２５記載の方法。
  31. 細菌性生物がグラム陽性である、請求項３０記載の方法。
  32. 細菌性生物がグラム陰性である、請求項３０記載の方法。
  33. さらに、該対象体に抗生物質の治療有効量を投与することを含む、請求項２５記載の方法。
  34. 化合物および抗生物質が該感染症を治療するために相乗的に作用する、請求項３３記載の方法。
  35. 化合物および抗生物質が該抗生物質に対する感染の抵抗性を克服するために相乗的に作用する、請求項３３記載の方法。
  36. 式：
    Figure 2022095666000053
     ［式中、
    各Ｒ1およびＲ2は、独立して、Ｈ、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリールアルキル、シクロアルキルアルキル、ヘテロアリールアルキル、またはヘテロシクリルアルキルであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
    各Ｒ3は、独立して、アルキレン、アルケニレン、またはアルキニレンであり、これらはいずれも置換または非置換であり；
    各ｘは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０であり；
    各ｗおよびｙは、独立して、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０であり；
    ｚは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０であり；
    各Ｘａａは、独立して、アミノ酸である］
    を有する化合物（ここで、該化合物は、少なくとも１種類の微生物に対する細胞内抗微生物効果を示す）またはその薬学的に許容される塩を含む、医薬組成物。
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