JP2021522862A - 7’−5’−アルファ−アノマー二環式糖ヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドコンジュゲート - Google Patents
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Abstract
Description
R1は、Hまたはヒドロキシル保護基であり、
R2は、リン部分であり、
Bxは、核酸塩基であり、好ましくは、Bxは、プリン塩基またはピリミジン塩基から選択され、さらに好ましくは、Bxは、ウラシル、チミン、シトシン、5−メチルシトシン、アデニンまたはグアニンから選択される。
(I)T3は、ヌクレオシド結合基であり、T4は、7’末端基、OR1、もしくはOR2であり、好ましくは、T4は、7’末端基もしくはOR1であり、または
(ii)T3は、5’末端基、OR1、もしくはOR2であり、好ましくは、T3は、5’末端基もしくはOR2であり、
T4は、ヌクレオシド結合基であり、または
(iii)T3およびT4は、互いに独立して、ヌクレオシド結合基であり、
R1は、Hまたはヒドロキシル保護基であり、
R2は、リン部分であり、
Bxは、核酸塩基であり、好ましくは、Bxは、プリン塩基またはピリミジン塩基から選択され、さらに好ましくは、Bxは、ウラシル、チミン、シトシン、5−メチルシトシン、アデニンまたはグアニンから選択される。
本明細書で使用する場合、「アルファアノマービシクロDNA(abc−DNA)ヌクレオシド」は、二環式糖部分を含み、以下に示される一般構造を有するヌクレオシド類似体を意味する。
アルファ二環式(「abc」)DNAは、例えば、エクソンスキッピングを引き起こすことによって疾患を処置するために、アンチセンスオリゴヌクレオチド(AON)において有用である二環式糖部分を含むヌクレオシド類似体である。abc−DNAヌクレオシドは、以下の一般的な構造を有する。
T1およびT2の他方は、OR1またはOR2であり、
R1は、Hまたはヒドロキシル保護基であり、
R2は、リン部分であり、
Bxは、核酸塩基である。
(i)T1は、OR1であり、T2は、OR1またはOR2であるか、あるいは
(II)T1は、OR1またはOR2であり、T2は、OR1であり、
T1は、OR1またはOR2であり、T2は、OR1である。
(i)T1は、OR1であり、T2は、OR1またはOR2であるか、あるいは
(II)T1は、OR1またはOR2であり、T2は、OR1であり、
T1は、OR1であり、T2は、OR1またはOR2である。
Wは、O、S、もしくはSeを表し、またはWは、電子対を表し、またはWは、BH2を表し、
R3およびR4は、互いに独立して、H、ハロゲン、OH、OR5、NR6R7、SH、SR8、C1−C6アルキル、C1−C6ハロアルキル、C1−C6アルコキシ、C1−C6ハロアルコキシ、C1−C6アミノアルキルであり、R5は、各々が互いに独立してシアノ、ニトロ、ハロゲン、−NHC(O)C1−C3アルキル、−NHC(O)C1−C3ハロアルキル、C1−C3アルキルスルホニルで任意選択により置換された、C1−C9アルキル、C1−C6アルコキシ;各々が互いに独立してシアノ、ニトロ、ハロゲン、C1−C4アルコキシ、C1−C4ハロアルキル、C1−C4ハロアルコキシ、NHC(O)C1−C3アルキル、NHC(O)C1−C3ハロアルキル、C1−C3アルキルスルホニルで任意選択により置換された、アリール、C1−C6アルキレンアリール、C1−C6アルキレンジアリール;アセチル;ヒドロキシル保護基であり、R6およびR7は、互いに独立して、水素、シアノ、ニトロ、ハロゲン、C2−C6アルケニル、C3−C6シクロアルキル、C1−C3アルコキシで任意選択により置換された、C1−C9アルキル;アミノ保護基であるか、またはそれらが結合している窒素原子と一緒に複素環を形成し、複素環は、ピロリジニル、ピペリジニル、モルホリニル、ピペラジニル、およびホモピペラジンから選択され、複素環は、C1−C3アルキルで任意選択により置換され、R8は、チオール保護基であり、波線は、OR2基の酸素への結合を示している。WがO、S、またはSeを表す場合、リン部分内のP原子はPV原子価状態である。Wが電子対を表す場合、リン部分内のP原子はPIII原子価である。式(VII)の部分には、任意の可能な立体異性体が含まれる。式(VII)の塩が、式(VII)によって表される部分にさらに含まれ、該塩は、無機塩基またはアミンでの処理時に形成することができ、(互いに独立して)R3およびR4であるOH基またはSH基との反応から誘導される塩であり得る。OH基またはSH基との塩形成をもたらす無機塩基またはアミンは、当該技術分野で周知であり、トリメチルアミン、ジエチルアミン、メチルアミン、または水酸化アンモニウムを含む。本発明に含まれるこれらのリン部分は、適切な場合、「O−HB+」とも略され、HB+は、形成された対カチオンを指す。
Yは、O、S、またはSeであり、Yは、OまたはSであり、
R5は、独立して各々の場合において、水素、各々が互いに独立してシアノ、ニトロ、ハロゲン、−NHC(O)C1−C3アルキル、−NHC(O)C1−C3ハロアルキル、C1−C3アルキルスルホニルで任意選択により置換された、C1−C9アルキル、C1−C6アルコキシ;各々が互いに独立してシアノ、ニトロ、ハロゲン、C1−C4アルコキシ、C1−C4ハロアルキル、C1−C4ハロアルコキシ、−NHC(O)C1−C3アルキル、NHC(O)C1−C3ハロアルキル、C1−C3アルキルスルホニルで任意選択により置換された、アリール、C1−C6アルキレンアリール、C1−C6アルキレンジアリール;ヒドロキシル保護基であり、
R6およびR7は、互いに独立して、水素、シアノ、ニトロ、ハロゲン、C2−C6アルケニル、C3−C6シクロアルキル、C1−C3アルコキシで任意選択により置換された、C1−C9アルキル;シアノ、ニトロ、ハロゲン、C1−C3アルキル、C1−C3アルコキシで任意選択により置換された、アリール、例えば、フェニル;アミノ保護基であるか、またはそれらが結合している窒素原子と一緒に複素環を形成し、複素環が、ピロリジニル、ピペリジニル、モルホリニル、ピペラジニル、およびホモピペラジンから選択され、複素環が、C1−C3アルキルで任意選択により置換された、波線は、OR2基の酸素への結合を示している。一実施形態では、式(IX)によって表されるリン部分R2は、本明細書では「ホスホルアミデート部分」または互換的に使用される「ホスホロアミデート部分」と称される。
R5は、水素、各々が互いに独立してシアノ、ニトロ、ハロゲン、−NHC(O)C1−C3アルキル、−NHC(O)C1−C3ハロアルキル、C1−C3アルキルスルホニルで任意選択により置換された、C1−C9アルキル、C1−C6アルコキシ;各々が互いに独立してシアノ、ニトロ、ハロゲン、C1−C4アルコキシ、C1−C4ハロアルキル、C1−C4ハロアルコキシ、−NHC(O)C1−C3アルキル、NHC(O)C1−C3ハロアルキル、C1−C3アルキルスルホニル、ヒドロキシル保護基で任意選択により置換された、アリール、C1−C6アルキレンアリール、C1−C6アルキレンジアリールであり、
R6およびR7は、互いに独立して、水素、シアノ、ニトロ、ハロゲン、C2−C6アルケニル、C3−C6シクロアルキル、C1−C3アルコキシで任意選択により置換された、C1−C9アルキル、シアノ、ニトロ、ハロゲン、C1−C3アルキル、C1−C3アルコキシで任意選択により置換された、アリール、例えば、フェニルであるか、またはそれらが結合している窒素原子と一緒に複素環を形成し、複素環が、ピロリジニル、ピペリジニル、モルホリニル、ピペラジニル、およびホモピペラジンから選択され、複素環が、C1−C3アルキルで任意選択により置換された、波線は、OR2基の酸素への結合を示している。典型的にはかつ上記において、式(X)によって表されるリン部分R2は、本明細書では「ホスホルアミダイト部分」または互換的に使用される「ホスホロアミダイト部分」と称される。
T3またはT4のうちの一方は、ヌクレオシド結合基であり、
T3およびT4は、OR1、OR2であり、5’末端基、7’末端基、またはヌクレオシド結合基であり、R1は、Hまたはヒドロキシル保護基であり、R2は、リン部分であり、Bxは、核酸塩基である。
(I)T3は、ヌクレオシド結合基であり、T4は、7’末端基またはOR1、またはOR2であり、好ましくは、T4は、7’末端基またはOR1であるか、あるいは
(ii)T3は、5’末端基、OR1、またはOR2であり、好ましくはT3は、5’末端基またはOR2であり、T4は、ヌクレオシド結合基であるか、あるいは
(iii)T3およびT4は、互いに独立して、ヌクレオシド結合基である。
(I)T3は、ヌクレオシド結合基であり、T4は、7’末端基、OR1、またはOR2であり、好ましくはT4は、7’末端基またはOR2であるか、あるいは
(ii)T3は、5’末端基、OR1、またはOR2であり、好ましくはT3は、5’末端基またはOR1であり、
T4は、ヌクレオシド結合基であるか、あるいは
(iii)T3およびT4は、互いに独立して、ヌクレオシド結合基である。
本発明のオリゴヌクレオチドは、主に、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含み、例えば、ヌクレオシド間結合基の50%以上、例えば、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%、および100%は、ホスホジエステル結合基である。
本発明は、リンカーを介して結合したabc−DNAヌクレオシドおよび脂質基を含む、オリゴヌクレオチドを提供する。脂質基がコンジュゲートしたオリゴヌクレオチドの構造は、脂質基、例えば脂肪酸の炭化水素鎖が露出し、それによって炭化水素鎖と、アルブミンおよび/または脂肪酸受容体または輸送体と、の相互作用を可能となり、それによってインビボでの長い半減期を有するオリゴヌクレオチドを提供するようなものである。脂質基は、リンカーを介して、オリゴヌクレオチドの5’末端または7’末端のヒドロキシル基にコンジュゲートされている。
本発明のオリゴヌクレオチドは、リンカーを介して脂質基に結合している。いくつかの実施形態では、リンカーは、アミド結合を介して脂質基に結合されている。炭化水素リンカーの場合、リンカーは、2〜20個の炭素、例えば2、3、4、5、6、7、8、9または10個の炭素を含む。ポリエチレングリコール(PEG)リンカーの場合、リンカーは、1〜20個のエチレングリコールサブユニット、例えば1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のエチレングリコール反復を含む。リンカーは、炭化水素リンカーまたはポリエチレングリコール(PEG)リンカーであり得る。abcDNAが、リンカーのリン部分に結合し、脂質基、例えば脂肪酸由来基が、Yに結合している、本発明によるリンカーは、例えば、以下に示す一般的な構造を有することができ、
Y=NHの場合、脂肪酸由来基は、アミド結合を介して結合され、
n=1の場合、R1は、例えば、CO2Hであり、R2は、例えば、Hであり得、
T’は、−CH2−CH2−Oであり得、mは、エチレングリコール反復の数であり、
Tは、ジスルフィド基などの生体切断可能な部分であり得、kは、1に等しく、特定の実施形態では、
Xは、酸素またはNHであり得、
Zは、OまたはSであり得、
WR5は、OHまたはSHであり得る。
アミノ−アルキル−ホスホロチオエートリンカー:
アルファ−カルボキシレート−アミノ−アルキル−ホスホロチオエートリンカー:
アミノ−PEG−ホスホロチオエートリンカー:
および
アルファ−カルボキシレート−アミノ−PEG−ホスホロチオエートリンカー:
(i)アミノ−アルキル−ホスホロチオエートリンカー;
(ii)アルファ−カルボキシレート−アミノ−アルキル−ホスホロチオエートリンカー;
(iii)アミノ−PEG−ホスホロチオエートリンカー、および
(iv)アルファ−カルボキシレート−アミノ−PEG−ホスホロチオエートリンカー
すべて、提供した式において上記で定義された通りである。
または以下の構造を有する:
当該技術分野で周知の合成方法を使用して、abc−DNAヌクレオシドおよびabc−DNAヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドを合成する。いくつかの実施形態では、5’末端で脂質基にコンジュゲートされたオリゴヌクレオチドについて、本発明のリンカーは、オリゴヌクレオチドの合成および付加の前に、固体支持体に付加される。特定の実施形態では、脂質基がオリゴヌクレオチドの7’末端にコンジュゲートしているオリゴヌクレオチドの場合、コンジュゲーションは、固相合成中に起こる。他の実施形態では、脂質基がオリゴヌクレオチドの7’末端にコンジュゲートしているオリゴヌクレオチドの場合、コンジュゲーションは、合成が完了した後に起こる。
すべての反応は、乾燥したガラス器具中およびアルゴンの不活性雰囲気下で行われる。反応のための無水溶媒は、活性アルミナを通して濾過するか、またはモレキュラーシーブ(4Å)で保存することにより得る。カラムクロマトグラフィー(CC)は、シリカゲル(Silia Flash P60、40〜63μm、60Å)で行う。CCに使用されるメタノールは、HPLCグレードであり、CCに使用される他のすべての溶媒は、テクニカルグレードであり、使用前に蒸留される。薄層クロマトグラフィーは、シリカゲルプレート(Macherey−Nagel、プレコートしたTLCプレートsilG−25UV254)上で行う。化合物は、UV光の下で、またはp−アニスアルデヒド染色溶液[p−アニスアルデヒド(3.7mL)、氷酢酸(3.7mL)、濃硫酸(5mL)、エタノール(135mL)]に浸し、続いてヒートガンで加熱することより、視覚化する。NMRスペクトルは、CDCl3またはCD3OD、CD3CN中、300または400MHz(1H)、75または101MHz(13C)、および122MHz(31P)で記録される。化学シフト(δ)は、未処理の溶媒ピーク[CDCl3:7.26ppm(1H),77.16ppm(13C);CD3OD:3.31ppm(1H),49.00ppm(13C)]に対して報告される。シグナルの帰属は、APTおよびDEPTならびに1H、1H、および1H、13C相関実験(COSYの、HSQC、HMBC)に基づく。高分解能質量データは、ポジティブモードでのエレクトロスプレーイオン化(イオントラップ、ESI+)によって得られる。
UV融解実験は、Varian Cary Bio 100UV/vis分光光度計で記録される。実験は、2μMの2つの濃度である10mM NaH2PO4、0M〜150mM NaCl(アルファアノマー)または0.05M〜1.00M NaCl(ベータアノマー)、および7.0に調整したpHで行う。メチルポリシロキサンのカバー層によって、試料を蒸発から保護する。吸光度を260nmでモニターする。すべての実験において、0.5℃/分の温度勾配で3回の冷却−加熱サイクルを行う。曲線一次導関数の最大値は、VarianWinUVソフトウェアで導き出され、Tm値は、6つのランプ(ramp)の平均として報告される。
CDスペクトルは、JascoPFO−350S温度コントローラーを備えたJascoJ−715分光偏光計で記録される。試料条件は、UV融解実験と同じである。スペクトルは50nm/分の速度で210〜320nmで記録され、温度は試料から直接測定される。各実験について、試料と同じ塩濃度を含むブランクが記録される。報告されたスペクトルは、3回のスキャンの平滑化された平均を取り、対応するブランクスペクトルを差し引くことによって得られる。
後のヌクレオシド合成のために企図される二環式足場7および10を前述の中間体1から構築する(Tarkoy,M.;BolliM.;Schweizer,B.;Leumann,C.Helv.Chim.Acta 1993,76,481)(スキーム1)。1におけるエポキシド環を−78℃においてLiHMDS媒介の分子内脱離によって効率的に開環し、不飽和エステル2が良好な収率で生成される。その後の2のニッケル触媒によるNaBH4還元が、二環式コア構造の凸側から立体特異的に進み、エステル3が唯一同定可能であるジアステレオ異性体としてもたらされる。3におけるヒドロキシル官能基をTBDPSで保護し、4を定量的収率で得る。その結果、中間体4が−78℃においてDIBALで還元され、アルデヒド5になる。次いで、5のアセトニド保護基を、触媒としてのIn(OTf)3を用いて(Golden,K.C.;Gregg,B.T.;Quinn,J.F.Tetrahedron Lett.2010,51,4010)、穏やかな条件下で、MeCNおよびH2Oの混合物中で加水分解し、溶媒を単にMeOHに変えることによって、得られた二環式ヘミアセタールをメチルグリコシド6に変換する。次いで、化合物6をアセチル化して、保護された前駆体7を生成し、これをVorbruggen化学による対応するプリンヌクレオシドの合成に使用する。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 6.07−5.98(m、1H、H−C(2))、5.59(d、J=6.0 Hz、1H、H−C(5’))、4.94−4.81(m、1H、H−C(1’))、4.65(t、J=5.6 Hz、1H、H−C(7’))、4.18(q、J=7.1 Hz、2H、CH3CH2)、2.67(br、1H、OH)、2.37(dd、J=13.5、7.5 Hz、1H、H−C(8’))、1.55−1.42(m、1H、H−C(8’))、1.40、1.33(2s、6H、(CH3)2C)、1.26(t、J=7.1 Hz、3H、CH2CH3).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 165.75(C(1))、161.61(C(6’))、116.53(C(2))、110.69(C(3’))、76.55(C(5’))、75.52(C(1’))、71.63(C(7’))、60.51(CH2CH3)、37.46(C(8’))、26.44、24.11((CH3)2C)、14.27(CH2CH3).
C12H19O5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値243.1227、実測値243.1231。
2bのデータ:Rf=0.52(EtoAc/ヘキサン1:1):
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 6.15−6.05(m、1H、H−C(2))、5.37−5.02(m、2H、H−C(5’)、OH)、4.87(d、J=3.4 Hz、1H、H−C(1’))、4.67(t、J=4.9 Hz、1H、H−C(7’))、4.20(qd、J=7.1、0.9 Hz、2H、CH3CH2)、2.55(dd、J=14.6、8.1 Hz、1H、H−C(8’))、1.94−1.77(m、1H、H−C(8’))、1.39−1.25(m、9H、(CH3)2C、CH2CH3).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 167.91(C(1))、167.43(C(6’))、120.13(C(2))、111.75(C(3’))、81.62(C(5’))、78.08(C(1’))、70.85(C(7’))、61.25(CH2CH3)、36.53(C(8’))、27.38、25.45((CH3)2C)、14.19(CH2CH3).
C12H19O5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値243.1227、実測値243.1227。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 4.65−4.52(m、2H、H−C(1’)、H−C(5’))、4.15(qd、J=7.1、1.4 Hz、2H、CH3CH2 )、4.05(ddd、J=10.0、9.99、6.2 Hz、1H、H−C(7’))、2.86(br、s、1H、OH)、2.65(qd、J=16.9、7.1 Hz、2H、H−C(2))、2.24(dd、J=13.7、6.2 Hz、1H、H−C(8’))、1.93(dt、J=12.7、7.1 Hz、1H.H−C(6’))、1.56(ddd、J=13.9、10.2、5.5 Hz、1H、H−C(8’))、1.38(s、3H、(CH3)2 C)、1.30〜1.21(m、6H、(CH3)2C、CH2CH3)。
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 174.38(C(1))、109.06(C(3’))、79.65(C(5’))、77.19(C(1’)、74.32(C(7’)、60.80(CH2CH3)、46.66(C(6’))、40.38(C(8’))、32.43(C(2))、26.00、23.69((CH3)2C)、14.17(CH2CH3).
C12H21O5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値245.1384、実測値245.1388。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 7.77−7.59(m、4H、H−arom)、7.51−7.32(m、6H、H−arom)、4.61(t、J=5.7 Hz、1H、H−C(5’))、4.49(t、J=5.7 Hz、1H、H−C(1’))、4.15(q、J=6.9 Hz、2H、CH3CH2)、3.96(dd、J=15.5、9.5 Hz、1H、H−C(7’))、2.64−2.32(m、2H、H−C(2))、2.15(tt、J=9.0、4.3 Hz、1H、H−C(6’))、1.83(dd、J=12.7、5.2 Hz、1H、H−C(8’))、1.61−1.45(m、1H、H−C(8’))、1.27(td、J=7.1、1.9 Hz、3H、CH2CH3)、1.18(s、6H、(CH3)2C)、1.09、1.08(2s、9H、(CH3)3−C−Si)
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 173.07(C(1))、135.87、135.85(CH−arom)、134.08、133.73(C−arom)、129.80、129.75、127.67、127.58(CH−arom)、108.82(C(3’))、77.92(C(5’))、76.96(C(1’))、74.93(C(7’))、60.24(CH2CH3)、47.27(C(6’))、40.27(C(8’))、31.10(C(2))、27.04(CH3)3−C−Si)、25.86((CH3)2C)、23.83((CH3)2C)、19.23(CH3)3−C−Si)、14.24(CH2−CH3).
C28H39O5Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値483.2561、実測値483.2562。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.72(s、1H、H−C(1))、7.65(td、J=8.0、1.6 Hz、4H、H−arom)、7.47−7.33(m、6H、H−arom)、4.57(t、J=5.7 Hz、1H、H−C(5’))、4.51(t、J=5.7 Hz、1H、H−C(1’))、3.99(td、J=10.0、5.9 Hz、1H、H−C(7’))、2.58−2.43(m、2H、H−C(2))、2.20−2.08(m、1H、H−C(6’))、1.87(dd、J=13.5、5.9 Hz、1H、H−C(8’))、1.53(ddd、J=13.5、10.1、5.5 Hz、1H、H−C(8’))、1.16(d、J=3.5 Hz、6H、((CH3)2C)、1.05(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 201.87(C(1))、135.93、135.90(CH−arom)、133.96、133.73(C−arom)、129.96、129.89、127.79、127.68(CH−arom)、108.89(C(3’))、77.76(C(5’))、77.17(C(1’))、74.96(C(7’)、45.44(C(6’))、41.31(C(2))、40.16(C(8’))、27.08(CH3)3−C−Si)、25.87((CH3)2C)、23.79((CH3)2C)、19.25(CH3)3−C−Si).
C26H35O4Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値439.2299、実測値439.2297。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 7.63(dd、J=7.1、0.6 Hz、4H、H−arom)、7.46−7.34(m、6H、H−arom)、4.98(d、J=4.8 Hz、0.8H、H−C(2))、4.91(dd、J=5.9、1.3 Hz、0.2 H、H−C(2))、4.63−4.54(m、1H、H−C(6a))、4.53−4.37(m、1H、H−C(6))、4.09(m、0.2 H、H−C(4))、3.92(br、0.8 H、H−C(4))、3.29、3.27(2s、3 H、MeO)、2.79(dd、J=17.0、8.2 Hz、0.8H、H−C(3a))、2.64−2.51(m、0.2 H、H−C(3a))、2.29(d、J=8.1 Hz、1H、OH)、2.10−1.80(m、2.4 H、H−C(3)、H−C(5))、1.65(ddd、J=13.2、9.1、4.4 Hz、0.8 H、H−C(5))、1.44−1.34(m、0.2 H、H−C(3))、1.22(ddd、J=13.2、8.1、4.9 Hz、0.8 H、H−C(3))、1.05(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 135.78、135.74(CH−arom)、133.96、133.84(C−arom)、129.78、127.72(CH−arom)、107.21、106.50(C(2))、85.37、81.76(C(6a))、78.11、77.19(C(4))、73.03、72.44(C(6))、55.30、54.46(MeO)、50.91、49.67(C(3a))、41.13、40.29(C(3))、38.16、37.98(C(5))、26.96、26.92(CH3)3−C−Si)、19.07(CH3)3−C−Si).
C26H35O4Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値435.1962、実測値435.1950。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 7.70−7.59(m、4H、H−arom)、7.48−7.34(m、6H、H−arom)、5.41(dt、J=11.0、5.6 Hz、0.8H、H−C(6))、5.28(ddd、J=11.7、6.6、5.2 Hz、0.2H、H−C(6))、4.99(d、J=4.8 Hz、0.8H、H−C(2))、4.89−4.81(m、0.4H、H−C(2)、H−C(6a))、4.76−4.69(m、0.8H、H−C(6a))、4.11(d、J=5.1 Hz、0.2H、H−C(4))、3.90(d、J=4.0 Hz、0.8H、H−C(4))、3.27、3.24(2s、3H、MeO)、2.81(dd、J=16.6、7.6 Hz、0.8H、H−C(3a))、2.60(dd、J=10.1、7.0 Hz、0.2H、H−C(3a))、2.30−2.18(m、0.2 H、H−C(5))、2.12、2.10(2s、J=4.7 Hz、3H、MeCO2)、2.07−1.82(m、2.8H、H−C(5)、H−C(3))、1.24(ddd、J=12.9、7.6、3.7 Hz、1H、H−C(3))、1.07(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 170.75、170.66(MeCO2)、135.77、135.73、135.72(CH−arom)、133.75、133.65(C−arom)、129.82、129.74、127.76、127.75、127.71(CH−arom)、106.19、106.15(C(2))、83.17、79.80(C(6a))、77.49、76.46(C(4))、75.64、74.41(C(6))、54.34、54.25(MeO)、51.48、50.17(C(3a))、38.05、37.98(C(3))、36.96、36.21(C(5))、26.95、26.90(CH3)3−C−Si)、21.09、21.04(MeCO2)、19.04(CH3)3−C−Si).
C26H34O5NaSi([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値477.2068、実測値477.2063。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 7.66(m、4H、H−arom)、7.42(m、6H、H−arom)、6.22(t、J=2.1 Hz、1H、H−C(2))、4.91(dd、J=8.2、5.3 Hz、1H、H−C(3))、4.70(dt、J=11.1、5.6 Hz、1H、H−C(6))、4.56(t、J=2.8 Hz、1H、H−C(6a))、3.97(d、J=4.0 Hz、1H、H−C(4))、3.24(d、J=8.2 Hz、1H、H−C(3a))、2.30(br、1H、OH)、2.03(dd、J=12.6、5.4 Hz、1H、H−C(5))、1.51(ddd、J=12.7、11.2、4.2 Hz、1H、H−C(5))、1.08(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 146.24(C(2))、135.72、135.69(CH−arom)、134.03、133.74(C−arom)、129.80、129.78、127.73(CH−arom)、101.84(C(3))、84.59(C(6a))、76.79(C(4))、74.10(C(6))、55.56(C(3a))、39.38(C(5))、26.93(CH3)3−C−Si)、19.08(CH3)3−C−Si).
C23H29O3Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値381.1880、実測値381.1893。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 7.76(d、J=7.4 Hz、2H、H−arom)、7.69−7.60(m、J=9.3、5.9、4.6 Hz、8H、H−arom)、7.56−7.39(m、8H、H−arom)、7.33(t、J=7.3 Hz、1H、H−arom)、7.00−6.93(m、4H、H−arom)、6.47−6.37(m、1H、H−C(2))、4.67−4.58(m、1H、H−C(6))、4.58−4.50(m、2H、H−C(3)、H−C(6a))、3.86、3.85(2s、6H、MeO )、3.82(d、J=4.0 Hz、1H、H−C(4))、3.08(d、J=8.1 Hz、1H、H−C(3a))、1.67(td、J=12.4、4.2 Hz、1H、H−C(5))、1.28(dd、J=12.7、5.4 Hz、1H、H−C(5))、1.11(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 158.67(MeO−C−arom)、147.61(C(2))、146.26、137.36、137.21(C−arom)、135.81、135.78(CH−arom)、134.17、134.04(C−arom)、130.48、129.83、129.81、128.37、127.98、127.76、127.73、126.79、113.32、113.28(CH−arom)、100.29(C(3))、86.96(C(Ph)3)、84.95(C(6a))、76.17(C(6))、76.07(C(4))、55.26(MeO−DMTr)、55.11(C(3a))、37.32(C(5))、27.04(CH3)3−C−Si)、19.21(CH3)3−C−Si).
C44H46O5NaSi([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値705.3007、実測値705.3021。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 7.53−7.46(m、2H、H−arom)、7.43−7.35(m、4H、H−arom)、7.21(dd、J=10.7、5.3 Hz、2 H、H−arom)、7.16−7.08(m、1H、H−arom)、6.80−6.71(m、4H、H−arom)、6.30(t、J=2.1 Hz、1H、H−C(2))、4.68(t、J=2.8 Hz、1H、H−C(3))、4.29−4.14(m、2H、H−C(6)、H−C(6a))、3.71(s、6H、MeO)、3.65(d、J=3.5 Hz、1H、H−C(4))、2.87(d、J=7.9 Hz、1H、H−C(3a))、1.59(ddd、J=13.2、11.6、4.3 Hz、1H、H−C(5))、1.05−0.95(m、2H、H−C(5)、OH).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 158.54(MeO−C−arom)、147.64(C(2))、145.82、137.12、137.08(C−arom)、130.26、128.29、127.81、126.71、113.13(CH−arom)、100.17(C(3))、86.75(C(Ph)3)、84.42 C(6a))、75.54(C(6))、74.59(C(4))、55.22(MeO−DMTr)、54.25(C(3a))、37.56(C(5)).
C30H27O5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値467.1853、実測値467.1844。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 9.37(br、1H、H−N(3))、7.83(d、J=1.1 Hz、1H、H−C(6))、7.58−7.52(m、2H、H−arom)、7.48−7.41(m、4H、H−arom)、7.28(t、J=7.7 Hz、2H、H−arom)、7.21(t、J=7.2 Hz、1H、H−arom)、6.84(dd、J=8.9、1.2 Hz、4H、H−arom)、5.91(dd、J=8.0、5.5 Hz、1H、H−C(1’))、4.25(dt、J=10.8、6.0 Hz、1H、H−C(5’))、4.13−4.08(m、1H、H−C(4’))、3.86(d、J=3.4 Hz、1H、H−C(7’)、3.79(s、6H、MeO)、2.70(ddd、J=12.8、10.2、5.5 Hz、1H、H−C(2’))、2.61(dd、J=16.9、8.2 Hz、1H、H−C(3’))、1.84(d、J=0.8 Hz、3H、Me−C(5))、1.80(br、1H、OH)、1.60(ddd、J=14.2、10.5、4.2 Hz、1H、H−C(6’))、1.33(dt、J=12.9、8.0 Hz、1H、H−C(2’))、1.14(dd、J=13.7、6.1 Hz、1H、H−C(6’)).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 164.17(C(4))、158.64(MeO−C−arom)、150.47(C(2))、145.65、136.85、136.71(C−arom)、135.52(C(6))、130.20、128.12、127.91、126.90、113.22、113.21(CH−arom)、110.69(C(5))、87.21(C(Ph)3)、86.57(C(1’))、82.02(C(4’))、74.19(C(5’))、74.13(C(7’))、55.25(MeO−DMTr)、49.40(C(3’))、38.51(C(6’))、37.64(C(2’))、12.58(Me−C(5)).
C33H34O7N2Na([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値593.2258、実測値593.2250。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.93(br、1H、H−N(3))、7.85(d、J=1.2 Hz、1H、H−C(6))、7.65−7.52(m、2H、H−arom)、7.52−7.40(m、4H、H−arom)、7.40−7.21(m、3H、H−arom)、6.96−6.81(m、4H、H−arom)、6.00、5.94(2dd、J=8.3、5.2 Hz、1H、H−C(1’))、4.29−4.17(m、1H、H−C(5’))、4.12−3.89(m、2H、H−C(4’)、H−C(7’))、3.85、3.84(2s、6H、MeO)、3.81−3.63(m、2H、OCH2CH2CN)、3.56−3.41(m、2H、(Me2CH)2N)、2.88−2.69(m、2H、H−C(3’)、H−C(2’))、2.61、2.56(dt、J=12、9 6.3 Hz、2H、OCH2CH2CN)、1.92、1.82(2d、J=0.8 Hz、3H、Me−C(5))、1.75−1.56(m、1H、H−C(6’))、1.52−1.36(m、2H、H−C(6’)、H−C(2’))、1.22−1.01(m、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 163.86(C(4))、158.66、158.64(MeO−C−arom)、150.29、150.27(C(2))、145.58、145.52、136.76、136.71、136.69、136.60(C−arom)、135.49、135.35(C(6))、130.21、130.16、128.17、128.13、127.88、126.91、126.89(CH−arom)、117.49(OCH2CH2CN)、113.18(CH−arom)、110.74(C(5))、87.27、87.25(C(Ph)3)、86.58、86.45(C(1’))、81.79、81.68(C(4’))、76.02、75.50(JC、P=16.5、15.7 Hz、C(7’))、74.22(C(5’))、58.26、58.06、57.87(OCH2CH2CN)、55.26、55.22(MeO−DMTr)、48.85、48.62(JC、P=2.6、5.0 Hz、C(3’))、43.10、43.04(JC、P=12.3、12.4 Hz(Me2CH)2N)、37.78(JC、P=5.3 Hz C(6’))、37.62、37.48(C(2’))、37.41(JC、P=3.6 Hz C(6’))、24.57、24.53、24.50、24.46、24.44、24.39、24.37(Me2CH)2N)、20.35、20.25(JC、P=7.1、7.0 Hz、OCH2CH2CN)、12.58、12.41(7s、Me−C(5)).
31P NMR(122 MHz、CDCl3)δ 147.32、146.98.
C42H52O8N4P([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値771.3517、実測値771.3512。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 13.39(br、1H、NH)、8.46−8.26(m、2H、H−arom)、8.13(d、J=0.5 Hz、1H、C(6))、7.61(d、J=7.3 Hz、2H、H−arom)、7.58−7.43(m、7H、H−arom)、7.34(t、J=7.4 Hz、2H、H−arom)、7.30−7.23(m、1H、H−arom)、6.89(d、J=8.8 Hz、4H、H−arom)、5.96(dd、J=7.5、5.8 Hz、1H、H−C(1’))、4.38−4.25(m、1H、H−C(5’))、4.22−4.12(m、1H、H−C(4’))、3.90(d、J=3.6 Hz、1H、H−C(7’))、3.83(s、6H、MeO)、2.82(ddd、J=13.3、10.2、5.7 Hz、1H、H−C(2’))、2.66(dd、J=17.0、8.1 Hz、1H、H−C(3’))、2.08(s、3H、Me−C(5))、1.77(br、1H、OH)、1.71−1.57(m、1H、H−C(6’))、1.49−1.36(m、1H、H−C(2’))、1.21(dd、J=13.7、6.2 Hz、1H、H−C(6’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 179.56(CONH)、160.01(C(4))、158.70(MeO−C−arom)、147.96(C(2))、145.65(C−arom)、137.26(C(6))、136.99、136.83、136.71(C−arom)、132.41、130.22、129.89、128.16、128.14、127.95、126.94、113.25(CH−arom)、111.57(C(5))、87.34(C(Ph)3)、87.32(C(1’))、82.57(C(4’))、74.30(C(5’))、74.16(C(7’))、55.27(MeO−DMTr)、49.56(C(3’))、38.52(C(6’))、38.00(C(2’))、13.63(Me−C(5)).
C40H40O7N3([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値674.2861、実測値674.2862。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 13.32(s、1H、NH)、8.41−8.28(m、2H、H−arom)、8.13−8.04(m、1H、C(6))、7.61−7.51(m、3H、H−arom)、7.51−7.40(m、6H、H−arom)、7.37−7.29(m、2H、H−arom)、7.29−7.20(m、1H、H−arom)、6.92−6.82(m、4H、H−arom)、6.07−5.87(m、1H、H−C(1’))、4.24(dq、J=11.7、5.8 Hz、1H、H−C(5’))、4.13−4.00(m、1H、H−C(4’))、3.94(ddd、J=14.5、10.5、2.8 Hz、1H、H−C(7’))、3.83、3.82(2s、6H、MeO)、3.69(m、2H、OCH2CH2CN)、3.53−3.40(m、2H、(Me2CH)2N)、2.91−2.70(m、2H、H−C(2’)、H−C(3’))、2.57、2.53(2t、J=6.3 Hz、2H、OCH2CH2CN)、2.08、1.99(2d、J=0.6 Hz、3H、Me−C(5))、1.72−1.56(m、1H、H−C(6’))、1.54−1.36(m、2H、H−C(2’)、H−C(6’))、1.10(m、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 179.54(CONH)、159.98(C(4))、158.69(MeO−C−arom)、147.90(C(2))、145.58、145.54(C−arom)、137.30、136.93(C(6))、136.81、136.80、136.73、136.70、136.67、136.60(C−arom)、132.37、132.35、130.22、130.17、129.89、128.17、128.15、128.11、127.93、126.94(CH−arom)、117.49(OCH2CH2CN)、113.23(CH−arom)、111.60(C(5))、87.36、87.35(C(Ph)3)、87.33、87.25(C(1’))、82.33、82.25(C(4’))、76.05、75.52(JC、P=16.4、15.6 Hz、C(7’))、74.32(C(5’))、58.18、57.98(JC、P=19.5 Hz OCH2CH2CN)、55.28、55.24(MeO−DMTr)、48.93、48.72(JC、P=2.7、4.9 Hz、C(3’))、43.11、43.05(JC、P=12.4 Hz(Me2CH)2N)、38.02、37.88(C(2’))、37.74、37.40(JC、P=5.3、3.4 Hz、C(6’))、24.58、24.54、24.50、24.47、24.40、24.38(6s、Me2CH)2N)、20.36、20.26(JC、P=7.1 Hz、OCH2CH2CN)、)、13.66、13.49(Me−C(5)).
31P NMR(122 MHz、CDCl3)δ 147.37、147.07.
C49H57O8N5P([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値874.3939、実測値874.3937。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 9.33(br、1H、NH)、8.68(d、J=5.4 Hz、0.8H、H−C(2))、8.64(d、J=5.6 Hz、0.2H、H−C(2))、8.10(d、J=1.5 Hz、0.2H.H−C(8))、7.99(dJ=7.3 Hz、2H、H−arom)、7.95(s、0.8H、H−C(8))、7.63(t、J=8.7 Hz、4H、H−arom)、7.55(dd、J=13.0、6.4 Hz、1H、H−arom)、7.50−7.34(m、8H、H−arom)、6.20(dd、J=6.3、2.5 Hz、0.8H、H−C(1’))、6.05(t、J=6.5 Hz、0.2H、H−C(1’))、5.43−5.32(m、1H、H−C(5’))、5.03−4.97(m、0.8H、H−C(4’))、4.83(t、J=6.0 Hz、0.2H、H−C(4’))、4.14(br、0.2H、H−C(7’))、4.08(d、J=3.7 Hz、0.8H、H−C(7’))、3.02(dd、J=16.1、6.6 Hz、0.8H、H−C(3’))、2.83(dd、J=16.9、7.7 Hz、0.2H、H−C(3’))、2.59−2.39(m、1H、H−C(2’))、2.18−2.11(m、1H、H−C(6’))、2.07(d、J=1.6 Hz、2.4H、MeCO2)、2.02(d、J=1.9 Hz、0.6H、MeCO2)、2.01−1.92(m、1H、H−C(6’))、1.91−1.80(m、1H、H−C(3’))、1.07(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 170.57、170.49(MeCO2)、164.82(CONH)、152.50(C(2))、151.27(C(4))、149.56(C(6))、141.37、141.06(C(8))、135.72、135.68、135.66(CH−arom)、133.67、133.57、133.24、133.22(C−arom)、132.73、130.03、129.98、128.80、128.78、127.92、127.86、127.85(CH−arom)、123.61(C(5))、87.19、86.17(C(1’))、83.22、80.96(C(4’)、76.50、76.04(C(7’))、74.38(C(5’))、51.07(C(3’))、37.29、37.15、36.80、36.60(C(2’)、C(6’))、26.89(CH3)3−C−Si)、20.97、20.90(MeCO2)、19.01(CH3)3−C−Si).
C37H40O5N5Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値662.2793、実測値662.2787。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.70(s、1H、H−C(2))、8.09−7.98(m、2H、H−arom)、7.97(s、1H、H−C(8))、7.63(ddd、J=7.4、5.7、1.5 Hz、4H、H−arom)、7.59−7.55(m、1H、H−arom)、7.51(m、2H、H−arom)、7.44−7.33(m、6H、H−arom)、6.02(dd、J=9.4、5.5 Hz、1H、H−C(1’))、4.57(dd、J=8.1、5.0 Hz、1H、H−C(4’))、4.43(dd、J=11.8、5.3 Hz、1H、H−C(5’))、4.26(br、1H、H−C(7’))、2.78(q、J=8.9 Hz、1H、H−C(3’))、2.32−1.80(m、5H、H−C(2’)、H−C(6’)、OH)、1.06(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 164.85(CONH)、152.56(C(2))、151.17(C(4))、149.86(C(6))、141.25(C(8))、135.68(CH−arom)、133.87、133.39(C−arom)、132.78、129.92、128.78、128.01、127.78(CH−arom)、123.51(C(5))、87.65(C(1’))、82.91(C(4’))、76.66(C(7’))、72.54(C(5’))、50.44(C(3’))、41.42(C(6’))、36.17(C(2’))、26.89(CH3)3−C−Si)、19.03(CH3)3−C−Si).
C35H38O4N5Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値620.2688、実測値620.2671。
1H NMR(300 MHz、MeOD)δ 8.64(s、1H、H−C(2))、8.61(s、1H、H−C(8))、8.08(d、J=7.2 Hz、2H、H−arom)、7.68−7.17(m、22H、H−arom)、6.86−6.75(m、4H、H−arom)、6.14(dd、J=7.4、6.3 Hz、1H、H−C(1’))、4.48−4.31(m、1H、H−C(5’))、4.28−4.15(m、1H、H−C(4’))、3.88(d、J=3.8 Hz、1H、H−C(7’))、3.75、3.74(2s、6H、MeO)、2.67(dd、J=16.6、6.7 Hz、1H、H−C(3’))、2.47(ddd、J=13.3、10.2、6.1 Hz、1H、H−C(2’))、2.15−1.94(m、1H、H−C(6’))、1.71(ddd、J=13.0、11.3、4.4 Hz、1H、H−C(2’))、1.11(dd、J=12.2、4.9 Hz、1H、H−C(6’))、0.95(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 164.69(CONH)、158.61、158.60(MeO−C−arom)、152.42(C(2))、151.27(C(4))、149.41(C(6))、145.81(C−arom)、141.25(C(8))、137.00、136.85(C−arom)、135.60、135.57(CH−arom)、133.80、133.69、133.43(C−arom)、132.70、130.28、130.25、129.85、129.81、128.84、128.18、127.89、127.71、127.65、126.78(CH−arom)、123.52(C(5))、113.22、113.19(CH−arom)、87.09(C(Ph)3)、86.41(C(1’))、83.52(C(4’))、76.05(C(7’))、74.78(C(5’))、55.20(MeO−DMTr)、50.43(C(3’))、38.10(C(2’)、C(6’))、26.84(CH3)3−C−Si)、19.00(CH3)3−C−Si).
C56H56O6N5Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値922.3994、実測値922.3953。
1H NMR(300 MHz、CD3CN)δ 9.35(br、1H、NH)、8.67(s、1H、C(2))、8.46(s、1H、C(8))、8.01(d、J=7.4 Hz、2H、H−arom)、7.54(m、5H、H−arom)、7.35(m、4H、H−arom)、7.30−7.17(m、3H、H−arom)、6.84(d、J=8.9 Hz、4H、H−arom)、6.09(dd、J=7.8、6.2 Hz、1H、H−C(1’))、4.12(dt、J=11.2、5.8 Hz、1H、C(5’))、3.87−3.79(m、2H、C(4’)、C(7’))、3.75(s、6H、MeO)、2.83−2.64(m、2H、C(2’)、OH)、2.58−2.46(m、1H、C(3’))、2.21(dd、J=13.9、7.1 Hz、1H、C(2’))、1.92−1.82(m、1H、C(6’))、1.29−1.17(m、1H、C(6’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 165.03(CONH)、158.57(MeO−C−arom)、152.40(C(2))、151.23(C(4))、149.52(C(6))、145.68(C−arom)、141.49(C(8))、136.86、136.84、133.77(C−arom)、132.77、130.22、128.81、128.16、128.02、127.89、126.84(CH−arom)、123.40(C(5))、113.19(CH−arom)、87.06(C(Ph)3)、86.74(C(1’))、83.58(C(4’))、74.62(C(5’))、74.38(C(8’))、55.25(MeO−DMTr)、49.77(C(3’))、38.55、38.32(C(6’)、C(2’)).
C40H38O6N5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値684.2817、実測値684.2830。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 9.05(br、1H、NH)、8.70、8.70(2s、1H、H−C(2))、8.47、8.46(2s、1H、H−C(8))、7.97(d、J=7.5 Hz、2H、H−arom)、7.57−7.50(m、1H、H−arom)、7.49−7.41(m、4H、H−arom)、7.39−7.31(m、4H、H−arom)、7.24−7.17(m、5.4 Hz、2H、H−arom)、7.13(dt、J=12.5、6.2 Hz、1H、H−arom)、6.83−6.70(m、4H、H−arom)、6.14−5.97(m、1H、H−C(1’))、4.14(ddd、J=11.1、7.8、3.4 Hz、1H、H−C(5’))、3.91−3.74(m、2H、H−(4’)、H−C(7’))、3.71、3.70(2s、6H、MeO)、3.65−3.50(m、2H、OCH2CH2CN)、3.37(ddq、J=13.9、10.2、6.8 Hz、2H、(Me2CH)2N)、2.90−2.76(m、1H、H−C(2’))、2.75−2.60(m、1H、H−C(3’))、2.47、2.42(2t、J=6.3 Hz、2H、OCH2CH2CN)、2.11(dt、J=12.7、6.1 Hz、1H、H−C(2’))、1.73(ddt、J=13.6、10.4、5.1 Hz、1H、H−C(6’))、1.39(ddd、J=50.2、13.4、6.2 Hz、1H、H−C(6’))、1.10−0.89(m、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 164.66(CONH)、158.57(MeO−C−arom)、152.46(C(2))、151.32、151.26(C(4))、149.45、149.43(C(6))、145.60、145.59(C−arom)、141.52、141.47(C(8))、136.88、136.83、136.81、133.78(C−arom)、132.75、132.73、130.22、130.21、130.19、130.17、128.87、128.17、127.87、126.82、126.80(CH−arom)、123.59(C(5))、117.53、117.50(OCH2CH2CN)、113.17(CH−arom)、87.10、87.07(C(Ph)3)、86.72、86.68(C(1’))、83.36、83.25(C(4’))、76.55、75.81(JC、P=16.9、15.7 Hz、C(7’))、74.63、74.60(C(5’))、58.24、57.86(JC、P=19.1、19.2 Hz OCH2CH2CN)、55.25、55.21(MeO−DMTr)、49.29、49.08(JC、P=2.6、4.7 Hz、C(3’))、43.12、43.00(JC、P=2.4、2.3 Hz(Me2CH)2N)、38.27、38.23(C(2’))、37.41、37.22(JC、P=5.3、3.5 Hz、C(6’))24.56、24.53、24.49、24.47、24.43、24.41、24.36、24.33(8s、Me2CH)2N)、20.36、20.25(JC、P=7.2、7.0 Hz、OCH2CH2CN).
31P NMR(122 MHz、CDCl3)δ 147.64、146.87.
C49H55O7N7([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値884.3895、実測値884.3898。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 7.86(s、0.3H、H−C(8))、7.69(s、0.7H、H−C(8))、7.68−7.60(m、4H、H−arom)、7.47−7.34(m、6H、H−arom)、6.04(dd、J=6.9、3.0 Hz、0.7H、H−C(1’))、5.87(dd、J=8.0、6.2 Hz、0.3H、H−C(1’))、5.37(dt、J=14.2、4.6 Hz、1H、H−C(5’))、5.16(br、2H、NH2)、4.91(dd、J=6.5、5.1 Hz、0.7H、H−C(4’))、4.79(dd、J=6.9、5.2 Hz、0.3H、H−C(4’))、4.13(br、0.3H、H−C(7’))、4.06(d、J=4.0 Hz、0.7H、H−C(7’))、2.95(dd、J=16.3、6.6 Hz、0.7H、H−C(3’))、2.81(dd、J=17.0、7.4 Hz、0.3H、H−C(3’))、2.49−2.30(m、1H、H−C(2’))、2.14(dd、J=13.1、6.7 Hz、1H、H−C(6’))、2.08(s、2.1H、MeCO2)、2.02(s、0.9H、MeCO2)、2.02−1.91(m、1H、H−C(6’))、1.80(td、J=13.4、6.8 Hz、1H、H−C(2’))、1.07、1.06(2s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 170.55、170.44(MeCO2)、158.98、158.91(C(2))、153.18、152.95(C(4))、151.40、151.34(C(6))、140.38、140.14(C(8))、135.73、135.70(CH−arom)、133.78、133.62、133.24、133.17(C−arom)、130.03、130.00、127.88、127.86(CH−arom)、125.65、125.57(C(5))、86.59、85.74(C(1’))、82.93、80.99(C(4’))、76.57、76.14(C(7’))、74.34、74.32(C(5’))、51.15、51.10(C(3’))、37.19、36.99(C(6’))、36.70、36.25(C(2’))、26.87(CH3)3−C−Si)、20.95、20.86(MeCO2)、19.00(CH3)3−C−Si).
C30H35O4N5ClSi([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値592.2141、実測値592.2158。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 7.71(s、1H、H−C(8))、7.68−7.60(m、4H、H−arom)、7.44−7.33(m、6H、H−arom)、5.85(dd、J=9.3、5.8 Hz、1H、H−C(1’))、5.33(br、2H、NH2)、4.62(dd、J=8.4、4.9 Hz、1H、H−C(4’))、4.44(dd、J=10.7、5.3 Hz、1H、H−C(5’))、4.40−4.15(m、2H、H−C(7’)、OH)、2.79(q、J=8.7 Hz、1H、H−C(3’))、2.22(dd、J=15.2、9.3 Hz、1H、H−C(6’))、2.11−2.02(m、1H、H−C(6’))、2.02−1.85(m、2H、H−C(2’))、1.06(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 158.73(C(2))、152.78(C(4))、151.94(C(6))、140.70(C(8))、135.70(CH−arom)、133.91、133.48(C−arom)、129.90、127.78(CH−arom)、125.97(C(5))、87.96(C(1’))、82.88(C(5’))、76.85(C(7’))、72.36(C(5’))、50.41(C(3’))、41.96(C(6’))、35.73(C(2’))、26.90(CH3)3−C−Si)、19.02(CH3)3−C−Si).
C28H33O3N5ClSi([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値550.2036、実測値550.2015。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.52(s、1H、NH)、8.46(s、1H、NCHN(CH3)2)、7.63(dd、J=7.7、1.5 Hz、4H、H−arom)、7.50(s、1H、H−C(8))、7.44−7.30(m、6H、H−arom)、5.83(dd、J=9.3、6.0 Hz、1H、H−C(1’))、4.61(dd、J=8.7、5.0 Hz、1H、H−C(4’))、4.43−4.32(m、1H、H−C(5’))、4.29(dd、J=7.0、4.8 Hz、1H、H−C(7’))、3.95(d、J=5.1 Hz、1H、OH)、2.98(s、6H、NCHN(CH3)2)、2.79(dd、J=18.0、7.0 Hz、1H、H−C(3’))、2.20(dt、J=12.8、5.4 Hz、1H、H−C(6’))、2.09−1.88(m、3H、H−C(6’)、H−C(2’))、1.05(s、9H、(CH3)3−C−Si)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 158.73(C(2))、157.79(C(6))、156.91(NCHN(CH3)2)、149.84(C(4))、137.00(C(8))、135.70、135.67(CH−arom)、133.78、133.60(C−arom)、129.93、129.86、127.78、127.72(CH−arom)、121.61(C(5))、88.04(C(1’))、82.21(C(4’))、77.49(C(7’))、71.94(C(5’))、50.13(C(3’))、42.23(C(6’))、41.20(NCHN(CH3)2)、35.50(C(2’))、34.97(NCHN(CH3)2)、26.87(CH3)3−C−Si)、19.02(CH3)3−C−Si).
C31H38O4N6Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値586.2718、実測値586.2703。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 9.49(s、1H、NH)、8.38(s、1H、NCHN(CH3)2)、7.80(s、1H、C(8))、7.50−7.43(m、2H、H−arom)、7.42−7.27(m、10H、H−arom)、7.26−7.15(m、6H、H−arom)、7.14−7.08(m、1H、H−arom)、6.77−6.68(m、4H、H−arom)、5.78(dd、J=8.2、5.9 Hz、1H、H−C(1’))、4.25(dt、J=11.0、5.6 Hz、1H、H−C(5’))、4.14−4.03(m、1H、H−C(4’))、3.70−3.64(m、7H、MeO、H−C(7’))、3.00(s、3H、NCHN(CH3)2)、2.97(s、3H、NCHN(CH3)2)、2.43(dd、J=16.7、7.5 Hz、1H、H−C(3’))、2.24(ddd、J=13.3、10.1、5.8 Hz、1H、H−C(2’))、1.62(td、J=13.1、4.3 Hz、1H、H−C(6’))、1.43(dt、J=13.5、8.0 Hz、1H、H−C(2’))、0.99(dd、J=13.3、6.2 Hz、1H)、0.86(s、9H、(CH3)3−C−Si)).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 158.51、158.49(MeO−C−arom)、158.04(C(2))、157.91(C(6))、156.60(NCHN(CH3)2)、149.76(C(4))、145.83、137.12、136.94(C−arom)、136.01(C(8))、135.60、135.59(CH−arom)、133.81、133.47(C−arom)、130.32、130.26、129.77、128.24、127.82、127.65、127.62、126.67(CH−arom)、120.65(C(5))、113.13、113.09(CH−arom)、86.82(C(Ph)3)、85.01(C(1’))、82.26(C(4’))、76.14(C(7’))、74.61(C(5’))、55.19(MeO−DMTr)、50.18(C(3’))、41.29(NCHN(CH3)2)、38.01(C(6’))、37.76(C(2’))、35.14(NCHN(CH3)2)26.81 87(CH3)3−C−Si)、19.01(CH3)3−C−Si).
C52H57O6N6Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値889.4103、実測値889.4128。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 9.55(s、1H、NH)、8.45(s、1H、NCHN(CH3)2)、8.00(s、1H、H−C(8))、7.60−7.50(m、2H、H−arom)、7.49−7.39(m、4H、H−arom)、7.31−7.23(m、2H、H−arom)、7.21−7.12(m、1H、H−arom)、6.81(d、J=8.5 Hz、4H、H−arom)、5.93(dd、J=7.5、6.1 Hz、1H、H−C(1’))、4.26(dt、J=11.1、5.8 Hz、1H、H−C(5’))、4.07−3.98(m、1H、H−C(4’))、3.91(d、J=4.3 Hz、1H、H−C(7’))、3.77(s、6H、MeO)、3.14(s、3H、NCHN(CH3)2)、3.04(s、3H、NCHN(CH3)2)、2.73(ddd、J=13.3、10.1、6.0 Hz、1H、H−C(2’))、2.63−2.48(m、1H、H−C(3’))、2.12(br、1H、OH)、1.95−1.82(m、2H、H−C(6’)、H−C(2’))、1.14(dd、J=13.4、6.1 Hz、1H、H−C(6’)).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 158.52(MeO−C−arom)、158.12(C(2))、157.88(C(6))、156.65(NCHN(CH3)2)、149.78(C(4))、145.69、137.02、136.99(C−arom)、136.07(C(8))、130.26、128.26、127.82、126.74(CH−arom)、120.53(C(5))、113.12(CH−arom)、86.81(C(Ph)3)、85.35(C(1’))、82.64(C(4’))、74.61(C(7’))、74.48(C(5’))、55.23(MeO−DMTr)、49.63(C(3’))、41.37(NCHN(CH3)2)、38.55(C(6’))、38.23(C(2’))、35.14(NCHN(CH3)2).
C36H39O6N6([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値651.2926、実測値651.2912。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.54、9.47(2s、1H、NH)、8.54、8.52(2s、1H、NCHN(CH3)2)、8.02.8.00(2s、1H、H−C(8))、7.58−7.49(m、2H、H−arom)、7.46−7.36(m、4H、H−arom)、7.25(dd、J=11.0、3.5 Hz、2H、H−arom)、7.21−7.13(m、1H、H−arom)、6.80(dd、J=8.8、2.2 Hz、4H、H−arom)、6.00−5.82(m、1H、H−C(1’))、4.16(dd、J=10.7、5.4 Hz、1H、H−C(5’))、4.00−3.82(m、2H、H−C(4’)、H−C(7’))、3.77、3.77(2s、6H、MeO)、3.62(dt、J=12.2、6.1 Hz、2H、OCH2CH2CN)、3.51−3.33(m、2H、(Me2CH)2N)、3.15、3.14(2s、3H、NCHN(CH3)2)、3.07(s、3H、NCHN(CH3)2)、2.85−2.61(m、2H、C(2’)、C(3’))、2.59−2.44(m、2H、OCH2CH2CN)、2.00−1.79(m、2H、H−(C2’)、H−C(6’))、1.53−1.26(m、1H、H−C(6’))、1.10、1.01(2t、J=6.4 Hz、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 158.50(MeO−C−arom)、158.04、158.00(C(2))、157.93(C(6))、156.61、156.60(NCHN(CH3)2)、149.73、149.72(C(4))、145.62、145.62、136.97、136.94(C−arom)、136.14(C(8))、130.27、130.24、130.22、128.26、127.81、126.73(CH−arom)、120.81、120.76(C(5))、117.67、117.56(OCH2CH2CN)、113.10(CH−arom)、86.88、86.85(C(Ph)3)、85.58、85.37(C(1’))、82.41、82.07(C(4’))、77.08、76.01(JC、P=37.0、15.1 Hz、C(7’))、74.52、74.46(C(5’))、58.19、57.74(JC、P=18.9、19.0 Hz OCH2CH2CN)、55.25、55.21(MeO−DMTr)、49.10、48.83(JC、P=2.2、4.8 Hz、C(3’))、43.12、43.00((Me2CH)2N)、41.34、41.33(NCHN(CH3)2)、38.48、38.41(C(2’))、37.23、36.92(JC、P=5.7、3.3 Hz C(6’))、35.17((Me2CH)2N)、24.56、24.53、24.48、24.47、24.43、25.36、24.35(7s、Me2CH)2N)、20.39、20.28(JC、P=7.1、6.9 Hz、OCH2CH2CN).
31P NMR(122 MHz、CDCl3)δ 147.69、146.37.
C45H56O7N8P([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値851.4004、実測値851.4018。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.95(br、1H、H−N(3))、7.69(d、J=6.4 Hz、4H、H−arom)、7.54−7.39(m、7H、H−C(6)、H−arom)、5.98(dd、J=9.3、5.6 Hz、1H、H−C(1’))、5.71(d、J=8.1 Hz、1H、H−C(5))、4.51(dd、J=13.7、6.3 Hz、2H、H−C(4’)、H−C(5’))、4.14(br、1H、H−C(7’))、3.25(br、1H、OH)、2.74(dd、J=17.1、8.7 Hz、1H、H−C(3’))、2.26−1.87(m、3H、H−C(2’)、H−C(6’))、1.49−1.19(m、1H、H−C(2’))、1.12(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 163.65(C(4))、150.46(C(2))、139.85(C(6))、135.69、135.66(CH−arom)、133.71、133.42(C−arom)、129.98、129.93、127.85、127.81(CH−arom)、102.84(C(5))、86.17(C(1’))、81.83(C(4’))、76.94(C(7’))、72.45(C(5’))、50.09(C(3’))、40.93(C(6’))、35.83(C(2’))、26.91(CH3)3−C−Si)、19.03(CH3)3−C−Si).
C27H32O5N2NaSi([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値515.1973、実測値515.1963。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.26(br、1H、H−N(3))、7.84(d、J=8.1 Hz、1H、H−C(6))、7.40−7.08(m、19H、H−arom)、6.69(dd、J=8.8、4.9 Hz、4H、H−arom)、5.70(dd、J=7.8、5.8 Hz、1H、H−C(1’))、5.49(dd、J=8.1、1.5 Hz、1H、H−C(5))、4.24−4.11(m、1H、H−C(5’))、4.05−3.95(m、1H、H−C(4’))、3.65(d、J=1.7 Hz、6H、MeO)、3.62(d、J=3.0 Hz、1H、H−C(7’))、2.41(dd、J=17.2、8.5 Hz、1H、H−C(3’))、2.24(ddd、J=13.5、10.2、5.7 Hz、1H、H−C(2’))、1.39−1.24(m、1H、H−C(6’))、1.04(dd、J=13.1、5.7 Hz、1H、H−C(6’))、0.89(dt、J=13.8、8.3 Hz、1H、H−C(2’))、0.81(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 163.58(C(4))、158.66(MeO−C−arom)、150.38(C(2))、145.61(C−arom)、139.92(C(6))、136.71、136.56(C−arom)、135.61、135.55(CH−arom)、133.55、133.41(C−arom)、130.30、129.92、129.84、128.16、127.90、127.74、127.67、126.90、113.19、113.15(CH−arom)、102.12(C(5))、87.41(C(Ph)3)、86.80(C(1’))、82.32(C4’))、75.54(C(7’))、74.41(C(5’))、55.23(MeO−DMTr)、50.05(C(3’))、38.49(C(6’))、37.53(C(2’))、26.81(CH3)3−C−Si)、18.99(CH3)3−C−Si).
C48H50O7N2NaSi([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値817.3279、実測値817.3286。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 7.96(d、J=7.4 Hz、1H、H−C(6))、7.45(d、J=7.4 Hz、2H、H−arom)、7.38−7.08(m、17H、H−arom)、6.73(dd、J=8.7、4.7 Hz、4H、H−arom)、5.73(t、J=8.6 Hz、2H、H−C(5)、H−C(1’))、4.32−4.16(m、1H、H−C(5’))、4.03(t、J=5.6 Hz、1H、H−C(4’))、3.66(d、J=0.9 Hz、6H、MeO)、3.61(d、J=2.9 Hz、1H、H−C(7’))、2.50−2.33(m、2H、H−C(2’)、H−C(3’))、1.47−1.28(m、1H、H−C(6’))、1.03(dd、J=12.9、5.6 Hz、1H、H−C(6’))、0.92−0.75(m、10H、H−C(2’)、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 165.78(C(4))、158.59(MeO−C−arom)、155.94(C(2))、145.88(C−arom)、140.68(C(6))、136.93、136.78(C−arom)、135.59、135.53(CH−arom)、133.60、133.54(C−arom)、130.31、129.86、129.77、128.15、127.88、127.71、127.64、126.79、113.18、113.14(CH−arom)、94.53(C(5))、87.55(C(Ph)3)、87.22(C(1’))、82.23(C(4’))、75.76(C(7’))、74.68(C(5’))、55.21(MeO−DMTr)、50.18(C(3’))、38.25(C(6’))、38.08(C(2’))、26.83(CH3)3−C−Si)、19.00(CH3)3−C−Si).
C48H52O6N3Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値794.3620、実測値794.3649。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.61(d、J=7.4 Hz、1H、H−C(6))、7.81(d、J=7.5 Hz、2H、H−arom)、7.49−7.13(m、24H、H−arom、H−C(5))、6.77(dd、J=8.5、4.4 Hz、4H、H−arom)、5.73(t、J=6.4 Hz、1H、H−C(1’))、4.39−4.20(m、1H、H−C(5’))、4.05(t、J=6.1 Hz、1H、H−C(4’))、3.70(s、6H、MeO)、3.63(d、J=2.3 Hz、1H、H−C(7’))、2.72−2.55(m、1H、H−C(2’))、2.48(dd、J=16.0、8.4 Hz、1H、H−C(3’))、1.42−1.29(m、1H、H−C(6’))、1.19−1.11(m、1H、H−C(6’))、1.07−0.96(m、1H、H−C(2’))、0.85(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 166.64(CONH)、162.25(C(4))、158.70(MeO−C−arom)、154.84(C(2))、145.71(C−arom)、144.84(C(6))、136.74、136.67(C−arom)、135.59、135.51(CH−arom)、133.52、133.42、133.24(C−arom)、133.11、130.30、129.92、129.85、129.02、128.12、127.97、127.76、127.68、127.61、126.94、113.25、113.22(CH−arom)、96.22(C(5))、89.07(C(Ph)3)、87.53(C(1’))、83.46(C(4’))、75.59(C(7’))、74.71(C(5’))、55.24(MeO−DMTr)、50.35(C(3’))、38.61(C(6’))、38.15(C(2’))、26.82(CH3)3−C−Si)、19.00(CH3)3−C−Si).
C55H56O7N3Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値898.3882、実測値898.3898。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.90(br、1H、NH)、8.73(d、J=7.5 Hz、1H、H−C(6))、7.82(d、J=7.3 Hz、2H、H−arom)、7.55−7.31(m、10H、H−arom、H−C(5))、7.28−7.09(m、3H、H−arom)、6.76(dd、J=8.8、1.7 Hz、4H、H−arom)、5.73(t、J=6.3 Hz、1H、H−C(1’))、4.28−4.13(m、1H、H−C(5’))、3.83(t、J=6.0 Hz、1H、H−C(4’))、3.75(d、J=3.6 Hz、1H、H−C(7’))、3.70(s、6H、MeO)、2.86(d、J=14.7 Hz、1H、H−C−(2’))、2.54(dd、J=17.4、7.4 Hz、1H、H−C(3’))、1.68−1.55(m、1H、H−C(6’))、1.45−1.13(m、3H、H−C(2’)、H−C(6’)、OH).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 166.63(CONH)、162.34(C(4))、158.65(MeO−C−arom)、155.00(C(2))、145.62(C−arom)、145.11(C(6))、136.72、136.64、133.16(C−arom)、130.25、129.02、128.12、127.93、127.61、126.95、113.20(CH−arom)、96.24(C(5))、89.20(C(Ph)3)、87.48(C(1’))、83.40(C(4’))、74.50、(C(5’))73.90(C(7’))、55.25(MeO−DMTr)、50.05(C(3’))、38.90(C(6’))、38.40(C(2’)).
C39H38O7N3([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値660.2704、実測値660.2707。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.88(s、1H、NH)、8.79(d、J=7.5 Hz、1H、H−C(6))、7.93(d、J=7.5 Hz、2H、H−arom)、7.67−7.40(m、10H、H−arom、H−C(5))、7.39−7.22(m、3H、H−arom)、6.93−6.79(m、4H、H−arom)、5.97−5.77(m、1H、H−C(1’))、4.22(dt、J=14.5、5.6 Hz、1H、H−(5’))、3.98−3.84(m、2H、H−C(4’)、H−C(7’))、3.82(s、6H、MeO)、3.66(ddd、J=16.8、13.5、6.7 Hz、2H、OCH2CH2CN)、3.53−3.37(m、2H、(Me2CH)2N)、3.14−2.93(m、1H、H−C(2’))、2.84−2.66(m、1H、H−C(3’))、2.53(dt、J=12.4、6.3 Hz、2H、OCH2CH2CN)、1.83−1.56(m、2H、H−C(6’))、1.46(td、J=14.1、7.0 Hz、1H、H−C(2’))、1.18−0.97(m、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 166.70(CONH)、162.32、162.28(C(4))、158.68(MeO−C−arom)、154.93(C(2))、145.53(C−arom)、144.95、144.89(C(6))、136.69、136.63、136.56、136.52、133.24(C−arom)、133.10、130.24、130.20、129.01、128.10、127.94、127.60、126.96(CH−arom)、117.53(OCH2CH2CN)、113.20(CH−arom)、96.24(C(5))、89.15、89.10(C(Ph)3)、87.55、87.54(C(1’))、83.11、83.04(C(4’))、75.93、75.37(JC、P=16.7、15.5 Hz、C(7’))、74.48(C(5’))、58.25、57.99(JC、P=17.9、18.1 Hz OCH2CH2CN)、55.27、55.24(MeO−DMTr)、49.27、49.03(JC、P=3.1、4.8 Hz、C(3’))、43.15、42.98((Me2CH)2N)、38.89、38.80(C(2’))、37.44、37.24(JC、P=5.2、3.2 Hz、C(6’))、24.58、24.54、24.48、24.45、24.35(5s、Me2CH)2N)、20.33、20.24(JC、P=5.8、5.7 Hz、OCH2CH2CN).
31P NMR(121 MHz、CDCl3)δ 147.19、146.94.
C48H55O8N5P([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値860.3783、実測値860.3791。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.26(t、J=7.3 Hz、3H、H−arom、HN(3))、8.00(d、J=8.9 Hz、2H、H−arom)、7.72(d、J=1.0 Hz、1H、H−C(6))、7.55(d、J=6.9 Hz、2H、H−arom)、7.44(dd、J=8.8、6.6 Hz、4H、H−arom)、7.35−7.18(m、3H、H−arom)、6.83(dd、J=9.0、2.6 Hz、4H、H−arom)、6.01(dd、J=8.2、5.2 Hz、1H、H−C(1’))、4.96(d、J=3.3 Hz、1H、H−C(7’))、4.33−4.24(m、1H、H−C(4’))、4.24−4.13(m、1H、H−C(5’))、3.78(d、J=0.9 Hz、6H、MeO)、2.92−2.72(m、2H、H−C(3’)、H−C(2’))、1.81(d、J=0.6 Hz、3H、Me−C(5))、1.79−1.62(m、2H、H−C(6’))、1.22(d、J=5.9 Hz、1H、H−C(2’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 164.05、163.84(C(4)、CO2R)、158.81(MeO−C−arom)、150.64、150.52(O2N−C−arom、C(2))、145.29、136.43、136.34(C−arom)、135.18(C(6))、130.62、130.20、130.17、128.16、128.01、127.15、123.58、113.30、113.27(C−arom)、111.17(C(5))、87.53(C(Ph)3)、86.29(C(1’))、81.59(C(4’))、78.65(C(7’))、74.16(C(5’))、55.26(MeO−DMTr)、47.07(C(3’))、37.35(C(2’))、35.71(C(6’))、12.51(Me−C(5)).
C40H37O10N3Na([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値742.2371、実測値742.2375
1H NMR(400 MHz、DMSO)δ 11.33(s、1H、H−N(3))、8.34(d、J=8.8 Hz、2H、H−arom)、8.27−8.13(m、2H、H−arom)、7.78(s、1H、H−C(6))、5.96(dd、J=9.3、5.6 Hz、1H、H−C(1’))、5.18(t、J=3.8 Hz、1H、H−C(7’))、5.12(d、J=6.0 Hz、1H、OH)、4.33(dd、J=7.3、4.7 Hz、1H、H−C(4’))、4.27(td、J=10.5、5.5 Hz、1H、H−C(5’))、2.90(dd、J=17.2、8.5 Hz、1H、H−C(3’))、2.58−2.46(m、1H、H−C(2’))、2.30(ddd、J=13.8、8.8、5.3 Hz、1H、H−C(6’))、2.03(dd、J=9.6、4.2 Hz、1H、H−C(6’))、1.92−1.76(m、4H、H−C(2’)、Me−C(5)).
13C NMR(101 MHz、DMSO)δ 164.33、164.23(C(4)、CO2R)、150.91、150.75(O2N−C−arom、C(2))、136.79(C−arom)、135.69(C(6))、131.20、124.32(CH−arom)、109.89(C(5))、85.31(C(1’))、81.48(C(4’))、80.07(C(7’))、71.72(C(5’))、47.18(C(3’))、37.77(C(6’))、35.48(C(2’))、12.66 12.58(Me−C(5)).
C19H20O8N3([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値418.1245、実測値418.1242。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.14(br、1H、H−N(3))、7.53(dd、J=7.7、1.6 Hz、4H、H−arom)、7.39−7.23(m、6H、H−arom)、7.09(d、J=1.0 Hz、0.15 H、H−C(6))、6.87(d、J=1.0 Hz、0.85 H、H−C(6))、5.83(t、J=6.2 Hz、0.85 H、H−C(1’))、5.80−5.70(m、0.15H、H−C(1’))、5.36−5.04(m、1H、H−C(5’))、4.89(dd、J=6.3、5.2 Hz、1H、H−C(4’))、4.62(dd、J=7.1、5.6 Hz、0.15H、H−C(4’))、4.01−3.85(m、1H、H−C(7’))、2.76−2.55(m、1H、H−C(3’))、2.09−1.91(m、4H、H−C(6’)、MeCO2)、1.90−1.58(m、6H、H−C(6’)、H−C(2’)、Me−C(5))、0.96(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 170.70(MeCO2)、163.87(C(4))、150.29(C(2))、135.69、135.67(CH−arom)、134.99(C(6))、133.58、133.18(C−arom)、130.03、127.87(CH−arom)、111.05(C(5))、87.56(C(1’))、82.85(C(4’))、76.50(C(7’))、74.76(C(5’))、50.72(C(3’))、37.79(C(6’))、36.94(C(2’))、26.88((CH3)3−C−Si)、20.95(MeCO2)、19.01((CH3)3−C−Si)、12.63(Me−C(5)).
C30H37O6N2Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値549.2415、実測値549.2401。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 9.66(br、0.15H、H−N(3))、9.63(br、0.85H、H−N(3))、7.27(d、J=1.0 Hz、0.15H、H−C(6))、7.06(d、J=1.0 Hz、0.85H、H−C(6))、6.00(t、J=6.1 Hz、0.85H、H−C(1’))、5.91(dd、J=8.8、5.5 Hz、0.15H、H−C(1’))、5.26−5.10(m、1H、H−C(5’))、4.92(dd、J=6.5、5.3 Hz、0.85H、H−C(4’))、4.65(dd、J=6.9、5.7 Hz、0.15H、H−C(4’))、4.19−4.03(m、1H、H−C(7’))、2.91−2.72(m、2H、H−C(3’)、OH)、2.64(ddd、J=13.3、9.8、5.5 Hz、0.15H、H−C(2’))、2.25−2.15(m、1.70H、H−C(2’))、2.05(s、0.45H、MeCO2)、2.04(s、2.55H、MeCO2)、2.03−1.89(m、2H、H−C(6’))、1.88(d、J=0.7 Hz、0.45H、Me−C(5))、1.85(d、J=0.6 Hz、2.55H、Me−C(5))、1.42−1.28(m、0.15H、H−C(2’)).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 170.87(MeCO2)、164.26(C(4))、150.66(C(2))、135.54(C(6))、111.22(C(5))、87.97(C(1’))、82.97(C(4’))、75.08(C(7’))、74.52(C(5’))、50.07(C(3’))、37.81(C(2’))、37.23(C(6’))、21.02(MeCO2)、12.67(Me−C(5)).
C14H19O6N2([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値311.1238、実測値311.1234。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.17(br、0.85H、H−N(3))、8.56(br、0.15H、H−N(3))、7.38−7.32(m、2H、H−arom)、7.29−7.15(m、7H、H−arom)、6.82(d、J=1.1 Hz、1H、H−C(6))、6.76(d、J=8.9 Hz、4H、H−arom)、5.86(t、J=6.0 Hz、0.85H、H−C(1’))、5.71(dd、J=8.9、5.4 Hz、0.15H、H−C(1’))、5.25(dd、J=10.2、5.6 Hz、0.15H、H−C(5’))、5.21−5.11(m、0.85H、H−(C5’))、4.78(dd、J=6.7、4.8 Hz、0.85H、H−C(4’))、4.49(dd、J=7.1、5.3 Hz、0.15H、H−C(4’))、3.84(br、1H、H−C(7’))、3、72、3.71(2s、6H、MeO)、2.34−2.23(m、1H、H−C(3’))、2.01、1.99(2s、3H、MeCO2)、1.82(d、J=0.5 Hz、Me−C(5))、1.80−1.56(m、4H、H−C(2’)、H−C(6’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 170.69(MeCO2)、163.91(C(4))、158.82(MeO−C−arom)、150.33(C(2))、145.34、136.64、136.58(C−arom)、135.00(C(6))、130.25、128.39、128.07、127.15、113.41(CH−arom)、111.04(C(5))、87.70(C(Ph)3)、87.31(C(1’))、83.15(C(4’))、77.16(C(7’))、74.96(C(5’))、55.37(MeO−DMTr)、49.12(C(3’))、37.55(C(2’))、36.82(C(6’))、21.07(MeCO2)、12.66(Me−C(5)).
C35H36O8N2([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値612.2466、実測値612.2453。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 9.37(br、s、1H、H−N(3))、7.39−7.31(m、2H、H−arom)、7.25(d、J=8.3 Hz、4H、H−arom)、7.20(t、J=7.7 Hz、2H、H−arom)、7.16−7.08(m、1H、H−arom)、6.78(d、J=1.1 Hz、1H、H−C(6))、6.74(d、J=8.8 Hz、4H、H−arom)、5.91(dd、J=6.5、4.9 Hz、1H、H−C(1’))、4.57(dd、J=7.2、4.4 Hz、1H、H−C(4’))、4.35−4.18(m、1H、H−C(5’))、3.86(d、J=4.7 Hz、1H、H−C(7’))、3.69(s、6H、MeO)、2.53(br、1H、OH)、2.22(dd、J=15.3、6.3 Hz、1H、H−C(3’))、1.85−1.69(m、5H、Me−C(5)、H−C(2’)、H−C(6’))、1.66−1.49(m、2H、H−C(2’)、H−C(6’)).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 163.98(C(4))、158.67(MeO−C−arom)、150.47(C(2))、145.48、136.80、136.75(C−arom)、134.94(C(6))、130.19、130.18、128.35、127.97、127.01、113.31(CH−arom)、111.04(C(5))、87.82(C(Ph)3)、87.05(C(1’))、85.74(C(4’))、78.26(C(7’))、73.33(C(5’))、55.31(MeO−DMTr)、48.81(C(3’))、40.21(C(6’))、37.68(C(2’))、12.65(Me−C(5)).
C33H35O7N2([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値571.2439、実測値571.2421。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.03(br、1H、H−N(3))、7.36(d、J=8.1 Hz、2H、H−arom)、7.30−7.07(m、7H、H−arom)、6.84(s、1H、H−C(6))、6.80−6.69(m、4H、H−arom)、5.95、5.88(2dd、J=6.6、4.8 Hz、1H、H−C(1’))、4.70、4.61(2dd、J=7.3、4.3 Hz、1H、H−C(4’))、4.41−4.20(m、1H、H−C(5’))、3.94−3.82(m、1H、H−C(7’))、3.81−3.62(m、8H、MeO、OCH2CH2CN)、3.59−3.40(m、2H、(Me2CH)2N)、2.61−2.46(m、2H、OCH2CH2CN)、2.28(ddd、J=14.1、13.2、7.3 Hz、1H、H−C(3’))、1.91−1.73(m、5H、Me−C(5)、H−C(6’)、H−C(2’))、1.72−1.46(m、2H、H−C(6’)、H−C(2’))、1.16−1.00(m、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 164.01、163.98(C(4))、158.70(MeO−C−arom)、150.39、150.17(C(2))、145.52、136.84、136.78(C−arom)、135.44、135.39(C(6))、130.21、128.36、128.32、128.00、127.03(CH−arom)、118.02、117.76(OCH2CH2CN)、113.32(CH−arom)、110.91、110.59(C(5))、88.31、88.06(C(Ph)3)、87.11、87.06(C(1’))、85.44、85.39(JC、P=4.6、3.1 Hz、C(4’))、78.25、78.13(C(7’))、74.70、74.34(JC、P=13.5、18.5 Hz、C(5’))、58.73、58.47(JC、P=18.9、20.1 Hz、(OCH2CH2CN))、55.35、55.32(MeO−DMTr)、48.80、48.64(C(3’))、43.22、43.06(JC、P=12.4、11.0 Hz(Me2CH)2N)、39.68、39.63(C(6’))、38.06、37.93(C(2’))、24.81、24.74、24.71、24.68、24.65、24.59(6s、Me2CH)2N)、20.37、20.35(JC、P=7.1、6.8 Hz、OCH2CH2CN)、12.66(Me−C(5)).
31P NMR(122 MHz、CDCl3)δ 148.18、147.80.
C42H52O8N4P([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値771.3517、実測値771.3517。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 13.11(br、1H、NH)、8.30−8.10(m、2H、H−arom)、7.47−7.29(m、5H、H−arom)、7.28−7.06(m、7H、H−arom)、7.00(d、J=0.8 Hz、1H、H−C(6))、6.74(d、J=8.6 Hz、4H、H−arom)、5.89(dd、J=6.3、4.6 Hz、1H、H−C(1’))、4.61(dd、J=7.2、4.5 Hz、1H、H−C(4’))、4.33−4.20(m、1H、H−C(5’))、3.87(br、1H、H−C(7’))、3.69(s、6H、MeO)、2.32−2.13(m、2H、H−C(3’)、OH)、1.99(s、3H、Me−C(5))、1.87−1.73(m、2H、H−C(2’)、H−C(6’))、1.66−1.47(m、2H、H−C(2’)、H−C(6’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 179.61(CONH)、159.76(C(4))、158.74(MeO−C−arom)、147.87(C(2))、145.47(C−arom)、137.17(C(6))、136.77、136.68、136.03(C−arom)、132.55、130.21、129.98、128.34、128.21、128.03、127.07、113.35(CH−arom)、111.81(C(5))、88.74(C(Ph)3)、87.13(C(1’))、86.12(C(4’))、78.17(C(7’))、73.31(C(5’))、55.35(MeO−DMTr)、48.63(C(3’))、40.35(C(6’))、38.06(C(2’))、13.78(Me−C(5)).
C40H40O7N3([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値674.2861、実測値674.2877。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 13.26(br、1H、NH)、8.32(d、J=7.2 Hz、2H、H−arom)、7.58−7.39(m、5H、H−arom)、7.38−7.14(m、8H、H−arom、H−C(6))、6.88−6.77(m、4H、H−arom)、6.01、5.96(2dd、J=6.3、4.6 Hz、1H、H−C(1’))、4.82、4.74(2dd、J=7.3、4.3 Hz、1H、H−C(4’))、4.42(td、J=10.6、6.0 Hz、1H、H−C(5’))、3.97(br、1H、H−C(7’))、3.91−3.68(m、8H、MeO、OCH2CH2CN)、3.59(dtd、J=16.7、6.7、3.4 Hz、2H、(Me2CH)2N))、2.62(dt、J=15.5、6.4 Hz、2H、OCH2CH2CN)、2.49−2.23(m、1H、H−C(3’))、2.11、2.09(2d、J=0.5 Hz、3H、Me−C(5))、2.00−1.82(m、2H、H−C(6’)、H−C(2’))、1.82−1.55(m、2H、H−C(6’)、H−C(2’))、1.17(dd、J=16.3、6.8 Hz、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 179.60(CONH)、159.97(C(4))、158.76(MeO−C−arom)、147.81、147.70(C(2))、145.54(C−arom)、137.34、136.83(C(6))、136.77、136.72、136.65、136.55(C−arom)、132.45、130.22、130.20、129.96、128.34、128.31、128.18、128.00、127.04(CH−arom)、117.89、117.71(OCH2CH2CN)、113.35(CH−arom)、111.60、111.36(C(5))、89.24、89.01(C(Ph)3)、87.16、87.12(C(1’))、85.78、85.62(JC、P=4.3、3.2 Hz、C(4’))、78.20、77.98(C(7’))、74.68、74.37(JC、P=13.4、18.2 Hz、C(5’))、58.70、58.44(JC、P=18.5、20.0 Hz、(OCH2CH2CN))、55.36、55.33(MeO−DMTr)、48.65、48.44(C(3’))、43.27、43.14(JC、P=12.4、12.3 Hz(Me2CH)2N)、39.87、39.64(JC、P=3.4、3.7 Hz(C(6’))、38.30、38.22(C(2’))、24.80、24.72、24.70、24.67、24.63(Me2CH)2N)、20.39、20.37(JC、P=7.2、6.8 Hz、OCH2CH2CN)、13.72(Me−C(5)).
31P NMR(121 MHz、CDCl3)δ 148.18、147.96.
C49H57O8N5P([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値874.3939、実測値874.3946。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.34(s、1H、NH)、8.71(s、1H、H−C(2))、8.02(d、J=7.4 Hz、2H、H−arom))、7.92(s、1H、H−C(8))、7.68−7.58(m、4H、H−arom)、7.58−7.31(m、9H、H−arom)、6.23(dd、J=6.7、2.4 Hz、1H、H−C(1’))、4.74(dd、J=6.6、4.9 Hz、1H、H−C(4’))、4.49(dt、J=12.5、6.3 Hz、1H、H−C(5’))、4.10(br、1H、H−C(7’))、3.07(d、J=6.7 Hz、1H、OH)、2.92(dd、J=15.4、7.3 Hz、1H、H−C(3’))、2.52−2.35(m、1H、H−C(2’))、2.10−1.97(m、1H、H−C(6’))、1.94−1.77(m、2H、H−C(2’)、H−C(6’))、1.06(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 164.98(CONH)、152.65(C(2))、151.31(C(4))、149.69(C(6))、140.93(C(8))、135.74(CH−arom)、133.82、133.68、133.39(C−arom)、132.77、130.02、129.98、128.76、128.06、127.87、127.85(CH−arom)、123.38(C(5))、87.16(C(1’))、85.35(C(4’))、77.40(C(7’))、72.79(C(5’))、50.63(C(3’))、40.86(C(6’))、37.25(C(2’))、26.94((CH3)3−C−Si)、19.05((CH3)3−C−Si).
C35H38O4N5Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値620.2688、実測値620.2671。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.99(br、1H、NH)、8.73(s、1H、H−C(2))、8.09−7.99(m、2H、H−arom)、7.98(s、1H、H−C(8))、7.70−7.58(m、5H、H−arom)、7.57−7.48(m、2H、H−arom)、7.47−7.34(m、6H、H−arom)、6.22(dd、J=6.8、3.2 Hz、1H、H−C(1’))、5.45−5.35(m、1H、H−C(5’))、5.01(dd、J=6.7、5.0 Hz、1H、H−C(4’))、4.09(d、J=4.1 Hz、1H、H−C(7’))、3.02(dt、J=9.5、6.5 Hz、1H、H−C(3’))、2.55(ddd、J=13.5、10.0、3.2 Hz、1H、H−C(2’))、2.15(dd、J=13.2、6.2 Hz、1H、H−C(6’))、2.09(s、3H、MeCO2)、2.01(dt、J=8.0、3.5 Hz、1H、H−C(2’))、1.88(dt、J=13.6、5.3 Hz、1H、H−C(6’))、1.08(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 170.61(MeCO2)、164.75(CONH)、152.67(C(2))、151.37(C(4))、149.64(C(6))、141.41(C(8))、135.85(CH−arom)、133.71、133.38(C−arom)、132.91、130.15、130.10、128.99、128.02、127.99、127.97(CH−arom)、123.64(C(5))、87.37(C(1’))、83.37(C(4’))、76.63(C(7’))、74.51(C(5’))、51.19(C(3’))、37.44(C(2’))、37.32(C(6’))、27.01((CH3)3−C−Si)、21.08(MeCO2)、19.14((CH3)3−C−Si).
C37H40O5N5Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値662.2793、実測値662.2787。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 9.60(br、1H、NH)、8.67(s、1H、H−C(2))、8.09(s、1H、H−C(8))、7.96(d、J=7.4 Hz、2H、H−arom)、7.51(t、J=7.4 Hz、1H、H−arom)、7.42(t、J=7.5 Hz、2H、H−arom)、6.33(dd、J=6.7、3.1 Hz、1H、H−C(1’))、5.25(ddd、J=9.7、6.4、5.3 Hz、1H、H−C(5’))、4.92(dd、J=6.4、5.4 Hz、1H、H−C(1’))、4.14(br、2H、H−C(7’)、OH)、3.06(dd、J=16.0、6.6 Hz、1H、H−C(3’))、2.87(ddd、J=13.2、9.9、3.0 Hz、1H、H−C(2’))、2.26−2.17(m、1H、H−C2’))、2.10−1.98(m、5H、H−C(6’)、MeCO2).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 170.64(MeCO2)、165.27(CONH)、152.49(C(2))、151.26(C(4))、149.58(C(6))、141.64(C(8))、133.60(C−arom)、132.82、128.76、128.06(CH−arom)、123.30(C(5))、87.30(C(1’))、83.17(C(4’))、74.67(C(7’))、74.20(C(5’))、50.41(C(3’))、37.43(C(2’))、36.92(C(6’))、20.96(MeCO2).
C21H22O5N5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値424.1615、実測値424.1623。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.42(d、J=14.6 Hz、1H、NH)、8.73(s、1H、H−C(2))、8.03(d、J=7.6 Hz、2H、H−arom)、7.93(s、1H、H−C(8))、7.66−7.55(m、1H、H−arom)、7.55−7.45(m、4H、H−arom)、7.45−7.22(m、7H、H−arom)、6.87(d、J=8.7 Hz、4H、H−arom)、6.25(dd、J=6.6、2.4 Hz、1H、H−C(1’))、5.47−5.33(m、1H、H−C(5’))、4.89(dd、J=6.7、4.9 Hz、1H、H−C(4’))、4.02(d、J=2.5 Hz、1H、H−C(7’))、3.79(s、6H、MeO)、2.58(dd、J=16.0、6.9 Hz、1H、H−C(3’))、2.38(ddd、J=12.7、10.0、2.4 Hz、1H、H−C(2’))、2.11(s、3H、MeCO2)、2.09−1.87(m、3H、H−C(2’)、H−C(6’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 170.40(MeCO2)、164.84(CONH)、158.66(MeO−C−arom)、152.45(C(2))、151.22(C(4))、149.51(C(6))、145.23(C−arom)、141.23(C(8))、136.51、133.65(C−arom)、132.68、130.12、128.75、128.33、127.95、127.90、127.03(CH−arom)、123.55(C(5))、113.27(CH−arom)、87.19(C(Ph)3)、87.12(C(1’))、83.25(C(4’))、77.16(C(7’))、74.41(C(5’))、55.23(MeO−DMTr)、49.23(C(3’))、37.61(C(2’))、36.22(C(6’))、20.98(MeCO2).
C42H40O7N5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値726.2922、実測値726.2905。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.39(s、1H、NH)、8.61(s、1H、H−C(2))、7.93(d、J=7.4 Hz、2H、H−arom)、7.75(s、1H、H−C(8))、7.46(t、J=7.3 Hz、1H、H−arom)、7.40−7.31(m、4H、H−arom)、7.29−7.16(m、6H、H−arom)、7.11(t、J=7.2 Hz、1H、H−arom)、6.73(d、J=8.7 Hz、4H、H−arom)、6.12(dd、J=6.5、1.9 Hz、1H、H−C(1’))、4.53(dd、J=7.5、4.5 Hz、1H、H−C(4’))、4.32(br、1H、H−C(5’))、3.90(t、J=4.5 Hz、1H、H−C(7’))、3.66、3.65(2s、6H、MeO)、3.31(br、1H、OH)、2.36(dd、J=16.5、8.1 Hz、1H、H−C(3’))、2.04(ddd、J=12.0、9.9、2.0 Hz、1H、H−C(2’))、1.92−1.69(m、3H、H−C(2’)、H−C(6’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 164.92(CONH)、158.64(MeO−C−arom)、152.60(C(2))、151.28(C(4))、149.61(C(6))、145.44(C−arom)、140.71(C(8))、136.77、133.65(C−arom)、132.72、130.15、130.12、128.73、128.39、128.04、127.96、127.02(CH−arom)、123.27(C(5))、113.28(CH−arom)、87.11(C(1’))、87.01(C(Ph)3)、85.60(C(4’))、78.16(C(7’))、72.72(C(5’))、55.28(MeO−DMTr)、48.89(C(3’))、39.93(C(6’))、37.55(C(2’)).
C40H38O6N5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値684.2817、実測値684.2800。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.98(br、1H、NH)、8.68、8.67(2s、1H、C(2))、7.94(d、J=7.6 Hz、2H、H−arom)、7.90、7.84(2s、1H、C(8))、7.56−7.49(m、1H、H−arom)、7.48−7.34(m、4H、H−arom)、7.30−7.10(m、7H、H−arom)、6.80−6.69(m、4H、Harom)、6.21、6.15(2dd、J=6.8、2.2 Hz、1H、H−C(1’))、4.69、4.59(2dd、J=7.3、4.5 Hz、1H、H−C(4’))、4.44(tt、J=12.3、6.3 Hz、1H、H−C(5’))、3.90(dd、J=9.0、3.8 Hz、1H、H−C(5’))、3.82−3.63(m、8H、MeO、OCH2CH2CN)、3.59−3.43(m、2H、(Me2CH)2N)、2.61−2.49(m、2H、OCH2CH2CN)、2.47−2.07(m、2H、H−C(3’)、H−C(2’))、1.98−1.66(m、3H、H−C(2’)、H−C(6’))、1.15−1.03(m、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 164.67(CONH)、158.77(MeO−C−arom)、152.58(C(2))、151.34、151.29(C(4))、149.46(C(6))、145.55、145.54(C−arom)、141.58、141.50(C(8))、136.87、136.85、136.84、133.85(C−arom)、132.85、130.26、130.23、130.20、128.97、128.47、128.43、128.02、127.96、127.08(CH−arom)、123.62、123.58(C(5))、117.91、117.70(OCH2CH2CN)、113.37(CH−arom)、87.80、87.67(C(1’))、87.20、87.14(C(Ph)3)、85.29、85.22((JC、P=4.2、3.1 Hz、C(4’))、78.16、77.96(C(7’))、74.28、73.98(JC、P=14.8、18.4 Hz、C(5’))、58.80、58.61(JC、P=16.2、17.3 Hz OCH2CH2CN)、55.37、55.35(MeO−DMTr)、49.02、48.91(C(3’))、43.29、43.16(JC、P=8.9、9.0 Hz、((Me2CH)2N)、39.09(C(6’))、37.99、37.95(C(2’))、24.82、24.77、24.74、24.70、24.64((Me2CH)2N)、20.43、20.42(JC、P=1.4、1.9 Hz、OCH2CH2CN).
31P NMR(121 MHz、CDCl3)δ 148.14、148.11.
C45H56O7N8P([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値884.3895、実測値884.3904。
1H NMR(400 MHz、CDCl3)δ 7.71−7.60(m、5H、H−arom、H−(C(8))、7.49−7.34(m、6H、H−arom)、6.08(dd、J=6.9、2.6 Hz、1H、H−C(1’))、5.26(s、2H、NH2)、4.70(dd、J=7.5、4.8 Hz、1H、H−C(4’))、4.47(dt、J=10.0、5.1 Hz、1H、H−C(5’))、4.11(t、J=3.3 Hz、1H、H−C(7’))、2.87(dd、J=16.5、7.7 Hz、1H、H−C(3’))、2.57(br、1H、OH)、2.27(ddd、J=14.0、9.9、2.6 Hz、1H、H−C(2’))、2.10−2.01(m、1H、H−C(6’))、1.92−1.76(m、2H、H−C(2’)、H−C(6’))、1.06(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 159.09(C(2))、153.05(C(4))、151.46(C(6))、139.91(C(8))、135.71(CH−arom)、133.96、133.27(C−arom)、130.00、129.96、127.86、127.83(CH−arom)、125.52(C(5))、86.46(C(1’))、84.92(C(4’))、77.40(C(7’))、72.63(C(5’))、50.55(C(3’))、40.92(C(6’))、36.78(C(2’))、26.88((CH3)3−C−Si)、19.01((CH3)3−C−Si).
C28H33O3N5ClSi([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値550.2036、実測値550.2019。
1H NMR(400 MHz、MeOD)δ 7.73−7.61(m、5H、H−arom、H−C(8))、7.53−7.32(m、6H、H−arom)、6.06(dd、J=6.9、3.7 Hz、1H、H−C(1’))、4.74(dd、J=7.0、4.6 Hz、1H、H−C(4’))、4.46−4.36(m、1H、H−C(5’))、4.11(br、1H、H−C(7’))、2.91(dd、J=16.2、6.6 Hz、1H、H−C(3’))、2.31(ddd、J=13.8、10.0、3.7 Hz、1H、H−C(2’))、1.98−1.78(m、3H、H−C(2’)、H−C(3’))、1.07(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(101 MHz、MeOD)δ 159.30(C(2))、155.14(C(6))、152.38(C(4))、137.28(C(8))、136.93、136.88(CH−arom)、135.13、134.78(C−arom)、131.07、131.06、128.91、128.89(CH−arom)、117.98(C(5))、87.72(C(1’))、86.25(C(4’))、79.21、(C(7’))73.87(C(5’))、52.13(C(3’))、41.44(C(6’))、38.35(C(2’))、27.42((CH3)3−C−Si)、19.82((CH3)3−C−Si)).
C28H34O4N5Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値532.2386、実測値532.2367。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 12.11(br、1H、NH−C(4))、9.94(br、1H、H−N(1))、7.62(d、J=6.7 Hz、5H、H−arom、H−C(8))、7.46−7.31(m、6H、H−arom)、6.03(dd、J=6.7、2.7 Hz、1H、H−C(1’))、5.31(dt、J=10.3、5.2 Hz、1H、H−(C5’))、4.99−4.81(m、1H、H−C(4’))、4.02(d、J=3.8 Hz、1H、H−C(7’))、2.88(dd、J=16.0、6.6 Hz、1H、H−C(3’))、2.44−2.20(m、4H、MeCONH、H−C(2’))、2.12−1.73(m、6H、MeCO2、H−C(6’)、H−C(2’))、1.04(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 172.73(MeCONH)、170.46(MeCO2)、155.87(C(6))、148.09(C(4))、147.47(C(2))、137.13(C(8))、135.74(CH−arom)、133.62、133.29(C−arom)、130.13、130.09、127.96、127.93(CH−arom)、121.54(C(5))、86.47(C(1’))、82.81(C(4’))、76.60(C(7’))、74.37(C(5’))、51.23(C(3’))、37.04、37.01、(C(2’)、C(6’))26.92((CH3)3−C−Si)、24.46(MeCONH)、21.00(MeCO2)、19.05((CH3)3−C−Si).
C32H38O6N5Si([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値616.2586、実測値616.2580。
1H NMR(300 MHz、MeOD)δ 8.03(s、1H、H−C(8))、6.28(dd、J=7.0、3.8 Hz、1H、H−C(1’))、5.21(ddd、J=9.2、6.8、5.1 Hz、1H、H−C(5’))、4.98(dd、J=6.7、5.0 Hz、1H、H−(4’))、4.13−4.05(m、1H、H−C(7’))、3.17−3.05(m、1H、H−C(3’))、2.86(ddd、J=13.8、10.0、3.8 Hz、1H、H−C(2’))、2.39−2.27(m、1H、H−C(2’))、2.24(s、3H、MeCONH)、2.16−2.00(m、5H、MeCO2、H−C(6’)).
13C NMR(101 MHz、MeOD)δ 174.95(MeCONH)、172.32(MeCO2)、157.50(C(6))、149.96(C(4))、149.38(C(2))、139.66(C(8))、121.76(C(5))、88.23(C(1’))、84.23(C(4’))、75.83(C(5’)、C(7’))、51.65(C(3’))、38.04、37.93(C(2’)、C(6’))、23.83(MeCONH)、20.71(MeCO2).
C16H20O6N5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値378.1408、実測値378.1419。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 12.05(br、1H、NH−C(4))、9.90(br、1H、H−N(1))、7.40(s、1H、H−C(8))、7.38−7.31(m、2H、H−arom)、7.28−7.08(m、7H、H−arom)、6.75(dd、J=9.0、2.7 Hz、4H、H−arom)、5.95−5.85(m、1H、H−C(1’))、5.30−5.10(m、1H、H−C(5’))、4.70−4.58(m、1H、H−C(4’))、3.81(br、1H、H−C(7’))、3.68、3.68(2s、6H、MeO)、2.25−2.07(m、5H、MeCONH、H−C(3’)、H−C(2’))、1.96−1.79(m、5H、MeCO2、H−C(2’)、H−C(6’))、1.74−1.59(m、1H、H−C(6’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 172.65(MeCONH)、170.42(MeCO2)、158.73、158.70(MeO−C−arom)、155.86(C(6))、147.96(C(4))、147.43(C(2))、145.31(C−arom)、137.17(C(8))、136.69、136.44(C−arom)、130.32、130.21、128.29、128.05、127.09(CH−arom)、121.53(C(5))、113.38、113.35(CH−arom)、87.25(C(Ph)3)、86.73(C(1’))、82.77(C(4’))、77.19(C(7’))、74.37(C(5’))、55.38(MeO−DMTr)、49.28(C(3’))、37.25(C(2’))、36.06(C(6’))、24.40(MeCONH)、21.01(MeCO2).
C37H38O8N5([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値680.2715、実測値680.2718。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.75(br、1H、H−N(1))、8.25(s、1H、NCHN(CH3)2)、7.37(d、J=7.3 Hz、2H、H−arom)、7.29−7.08(m、8H、H−arom、H−C(8))、6.74(d、J=8.1 Hz、4H、H−arom)、6.03(dd、J=6.7、2.8 Hz、1H、H−C(1’))、4.57(dd、J=7.5、4.6 Hz、1H、H−C(4’))、4.37−4.26(m、1H、H−C(5’))、3.89(t、J=3.9 Hz、1H、H−C(7’))、3.67、3.67(2s、6H、MeO)、3.24(br、1H、OH)、2.94(s、3H、NCHN(CH3)2)、2.87(s、3H、NCHN(CH3)2)、2.35(dd、J=15.9、7.6 Hz、1H、H−C(3’))、1.94−1.68(m、4H、H−C(2’)、H−C(6’)).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 158.61(MeO−C−arom)、158.28(C(2))、157.92(NCHN(CH3)2)、156.69(C(6))、149.90(C(4))、145.52、136.86、136.77(C−arom)、135.50(C(8))、130.15、128.32、127.92、126.95(CH−arom)、120.27(C(5))、113.24(CH−arom)、86.92(C(Ph)3)、85.57(C(1’))、85.12(C(4’))、78.31(C(7’))、72.69(C(5’))、55.28(MeO−DMTr)、49.28(C(3’))、41.38(NCHN(CH3)2)、39.77(C(6’))、37.58(C(2’))、35.04(NCHN(CH3)2).
C36H39O6N6([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値651.2926、実測値651.2921。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.35(br、1H、H−N(1))、8.51、8.49(2s、1H、NCHN(CH3)2)、7.41−7.10(m、10H、H−arom、H−C(8))、6.83−6.70(m、4H、H−arom)、6.15−6.00(m、1H、H−C(1’))、4.64−4.36(m、2H、H−C(4’)、H−C(5’))、3.90−3.82(m、1H、H−C(7’))、3.80−3.62(m、8H、MeO、OCH2CH2CN)、3.59−3.43(m、2H、(Me2CH)2N)、3.04、3.02(2s、6H、NCHN(CH3)2)、2.67−2.48(m、2H、OCH2CH2CN)、2.32(ddd、J=24.1、15.1、6.7 Hz、1H、H−C(3’))、2.02−1.63(m、4H、H−C(2’)、H−C(6’))、1.14−1.03(m、12H、(Me2CH)2N).
13C NMR(101 MHz、CDCl3)δ 158.76(MeO−C−arom)、158.17、158.12(C(2))、158.03(NCHN(CH3)2)、156.66、156.59(C(6))、149.85、149.79(C(4))、145.51、145.49、136.84、136.77、136.73、136.71(C−arom)、135.76、135.59(C(8))、130.24、130.20、128.41、128.33、128.02、127.10、127.08(CH−arom)、120.74、120.70(C(5))、117.98、117.72(OCH2CH2CN)、113.34(CH−arom)、87.16、87.10(C(Ph)3)、86.00、85.72(C(1’))、84.13、84.10(JC、P=3.6、2.5 Hz、C(4’))、78.02、77.67(C(7’))、74.15、73.74(JC、P=15.3、18.7 Hz、C(5’))、58.90、58.67(JC、P=18.7、19.7 Hz OCH2CH2CN)、55.38、55.36(MeO−DMTr)、49.20、49.09(C(3’))、43.20、43.15(JC、P=12.4、12.6 Hz、((Me2CH)2N)、41.42、41.38(NCHN(CH3)2)、38.68、38.65(C(6’))、37.97、37.84(C(2’))、35.25(NCHN(CH3)2)、24.83、24.75、24.68、24.60、24.53((Me2CH)2N)、20.35、20.28(OCH2CH2CN).
31P NMR(121 MHz、CDCl3)δ 148.21、148.01.
C45H56O7N8P([M+H]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値851.4004、実測値851.4013。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.33−8.17(m、4H、H−arom)、7.72−7.61(m、4H、H−arom)、7.51−7.32(m、6H、H−arom)、5.65−5.47(m、1H、H−C(6))、4.97(dd、J=9.2、5.6 Hz、1H、H−C(2))、4.87(t、J=5.8 Hz、1H、H−C(6a))、4.18(d、J=5.0 Hz、0.2H、H−C(4))、3.98(d、J=3.5 Hz、0.8H、H−C(4))、3.21(d、J=15.1 Hz、3H、MeO)、2.88(dd、J=16.6、7.9 Hz、0.8H、H−C(3a))、2.75−2.62(m、0.2H、H−C(3a))、2.49−2.34(m、0.2H、H−C(5))、2.24−1.83(m、2.8H、H−(5)、H−C(3))、1.28(ddd、J=13.0、7.9、4.9 Hz、1H、H−C(3))、1.09(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 164.46、164.41(CO2R)、150.63(O2N−C−arom)、135.87、135.82(CH−arom)、134.07、133.75、133.69(CH−arom)、130.98、130.89、129.98、129.96、129.91、127.89、127.87、127.85、123.59(CH−arom)、106.49、106.39(C(2))、83.21、79.87(C(6a))、76.54(C(4))、76.09(C(6))、54.55、54.47(MeO)、51.69、50.30(C(3a)、38.07(C(3))、37.17、36.65(C(5))、27.04、26.99 90((CH3)3−C−Si)、19.14((CH3)3−C−Si).
C31H35O7NaSi([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値584.2075、実測値584.2085。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 9.38(br、1H、(s、1H、H−N(3))、8.32−8.23(m、2H、H−arom)、8.22−8.11(m、2H、H−arom)、7.65(dd、J=7.7、1.5 Hz、4H、H−arom)、7.50−7.36(m、6H、H−arom)、6.95(d、J=0.9 Hz、1H、H−C(6))、5.96(t、J=6.3 Hz、1H、H−C(1’))、5.55(dt、J=9.9、6.0 Hz、1H、H−C(5’))、5.13(dd、J=6.4、5.4 Hz、1H、H−C(4’))、4.20−4.05(m、1H、H−C(7’))、2.94−2.78(m、1H、H−C(3’))、2.22(dd、J=13.3、6.4 Hz、1H、H−C(6’))、2.09−1.73(m、6H、H−C(6’)、H−C(2’)、Me−C(5))、1.09(s、9H、(CH3)3−C−Si).
13C NMR(75 MHz、CDCl3)δ 164.32、163.79(C(4)、CO2R)、150.65、150.39(O2N−C−arom、C(2))、135.70、135.68(CH−arom)、135.13(C−arom)、134.83(C(6))、133.46、133.10(C−arom)、130.91、130.73、130.11、127.93、123.60(CH−arom)、111.30(C(5))、87.26(C(1’))、82.44(C(4’))、76.40(C(7’))、76.07(C(5’))、50.76(C(3’))、37.94(C(6’))、36.68(C(2’))、26.89((CH3)3−C−Si)、19.03((CH3)3−C−Si)、12.62(Me−C(5)).
C35H37O8N3NaSi([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値678.2242、実測値678.2254。
1H NMR(300 MHz、CDCl3)δ 8.96(br、1H、H−N(3))、8.34−8.17(m、4H、H−arom)、7.07(d、J=1.1 Hz、1H、H−C(6))、6.11(t、J=6.3 Hz、1H、H−C(1’))、5.57−5.45(m、1H、H−C(5’))、5.15(dd、J=6.6、5.4 Hz、1H、H−C(4’))、4.38−4.23(m、1H、H−C(7’))、2.96(dd、J=13.5、6.9 Hz、1H、H−C(3’))、2.26(ddd、J=13.1、10.3、5.4 Hz、4H、H−C(2’)、H−C(6’))、1.91(d、J=0.9 Hz、3H、Me−C(5)).
C19H19O8N3Na([M+Na]+)についてのESI+−HRMS m/z 計算値440.1064、実測値440.1072。
ホスホジエステル結合によって結合された少なくとも2個のアルファアノマービシクロDNA(abc−DNA)残基を含むオリゴヌクレオチドは、当該技術分野で周知の方法に従い、以下に説明するように、合成装置、例えば、Pharmaci−Gene−Assembler−PlusDNA合成装置で合成することができる。本発明のabc−DNAオリゴヌクレオチドの合成の工程を以下に示す:
特定の実施形態では、本発明は、本発明のオリゴヌクレオチドを含む医薬組成物を提供する。オリゴヌクレオチド試料は、試料の十分な部分が細胞に入り、効果、例えば、エクソンスキッピングを誘発することを可能にする任意の手段によって、適切に製剤化され、細胞の環境に導入することができる。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、アルブミンに事前に装填され、オリゴヌクレオチド−アルブミン複合体として投与される。オリゴヌクレオチドの多くの製剤は、当該技術分野で既知であり、オリゴヌクレオチドが標的細胞に侵入して作用できる限り、使用することができる。例えば、本発明のオリゴヌクレオチド剤は、リン酸緩衝生理食塩水などの緩衝液、リポソーム、ミセル構造、およびキャプシド中で製剤化することができる。カチオン性脂質を含むオリゴヌクレオチド剤の製剤は、細胞へのオリゴヌクレオチド剤のトランスフェクションを促進するために使用することができる。例えば、リポフェクチン(米国特許第5,705,188号)などのカチオン性脂質、カチオン性グリセロール誘導体、およびポリリジン(公開されたPCT国際出願第WO97/30731号)などのポリカチオン性分子を使用することができる。好適な脂質には、オリゴフェクタミン、リポフェクタミン(Life Technologies)、NC388(Ribozyme Pharmaceuticals Inc.,コロラド州ボールダー)、またはFuGene 6(Roche)が含まれ、これらはすべて製造元の説明書に従って使用することができる。
本発明は、標的RNAの発現および/またはそのような標的RNAの存在によって全体的または部分的に引き起こされる疾患または障害のリスクがある(またはそれらにかかりやすい)対象を処置する、予防的および治療的方法の両方を提供する。
本発明のオリゴヌクレオチドは、異常なレベルのmRNAまたは非コードRNAに基づく疾患の処置または予防のために、転写、翻訳、スプライシング、および/もしくは分解を妨害することにより、ならびに/または非コードRNAの機能を阻害することにより、遺伝子発現を調節するのに有用である。本発明の細胞の投与後に1つ以上の疾患症状が減少または排除される場合、対象は、疾患について処置されると言われる。
本発明は、主にリン酸ヌクレオシド間結合、1つまたは2つのリンカー、および脂質基を有する任意のabc−DNAオリゴヌクレオチドを提供する。配列は、任意の標的に対して設計できる。本発明の例示的なabc−DNAオリゴヌクレオチドの配列を以下に提供する。
デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)は、新生児男児の3500人に1人に罹患し、ベッカー型筋ジストロフィー(BMD)は20,000人に1人に罹患する。DMDおよびBMDはどちらも、X染色体上に位置し、かつ、ジストロフィンをコードするDMD遺伝子の変異によって引き起こされる。DMD患者は、進行性の筋力低下を患い、13歳未満で車椅子に拘束され、しばしば30歳より前に死亡する。BMDは、一般的により軽度であり、患者は、DMD患者と比較して、40年超にわたって歩行可能であり、平均余命が長いことがよくある。
5’ CC AAA CTA GAA ATG CCA TCT TCC TTG ATG T 3’(配列番号402)。
5’GG TTT GAT CTT TAC GGT AGA AGG AAC TAC A 7’(配列番号403)および表3に提供されるオリゴヌクレオチド:
5’CAT GTT CTT GTG GAA GTC TTG GCC TCC GTT GTC AAC TTA CTT TAC AAT 7’(配列番号407)および表4に提供されているオリゴヌクレオチド。
5’CC ATAGAATGTC CTTGAGGTCC TACCGTAACC CGTCGCCGTT TGACA 7’(配列番号410)および表5に示されている配列のいずれか1つ。
相補的パラレルRNA(parallel RNA)に対するアルファアノマーオリゴヌクレオチドの親和性
相補的パラレルRNAに対する親和性を、UV融解実験により、いくつかのアルファアノマーオリゴヌクレオチドについて評価した(表1)。
酸性条件におけるアルファアノマーオリゴヌクレオチドの安定性
ON1を酢酸緩衝液(0.1M、pH=4.5)で10μMに希釈し、得られた溶液を37℃で24時間インキュベートすることによって、ON1の酸性安定性を評価した。未処理のON1を参照として使用した。ON1の完全性をLC−MSによって測定した。未処理ON1のクロマトグラムおよび断片化パターン(図1A、図1B)と、酸性条件で24時間処理したON1のクロマトグラムおよび断片化パターン(図1C、図1D)と、の間に違いは見られない。この実験は、例えば細胞のリソソーム区画で遭遇し得る酸性条件におけるアルファアノマーオリゴヌクレオチドの安定性を示している。
アルファアノマーオリゴヌクレオチドの熱安定性
ON1をPBS溶液(137mM NaCl、2.7mM KCl、10mM Na2HPO4、1.8mM KH2PO4、pH=7.4)で10μMに希釈し、得られた溶液を95℃で60分間インキュベートすることによって、ON1の熱安定性を評価した。未処理のON1を参照として使用した。ON1の完全性をLC−MSによって測定した。未処理ON1のクロマトグラムおよび断片化パターン(図2A、図2B)と、95℃で加熱したON1のクロマトグラムおよび断片化パターン(図2C、図2D)と、の間に違いは見られない。この実験は、水溶液中のアルファアノマーオリゴヌクレオチドの化学的安定性を示している。
アルファアノマーオリゴヌクレオチドの生体安定性
ON1およびその対応する天然オリゴヌクレオチドを、H2Oおよびマウス血清(Sigma)の1:1混合液で10μMに希釈した。反応は20μLスケールで行い、37℃でインキュベートした。H2O中の10μMのオリゴヌクレオチドを37℃で24時間インキュベートすることにより、対照反応を行った。ホルムアミド(20μL)の添加により、特定の時間(1時間、2時間、4時間、および24時間)に反応を停止させた。得られた混合物を−20℃で保存した後、90℃で5分間熱変性させ、次いで20%変性PAGEによって分析した(図3)。標準的なプロトコルに従い、ステインスオール(stains−all)溶液の染色により視覚化を行った。実験結果は、天然DNA鎖が4時間後にはすでに完全に消化され、ON1が24時間後でも完全に安定していることを示している。
脂質基にコンジュゲートしたアルファアノマーオリゴヌクレオチドの、アルブミンへの結合
ON1のアルブミンへの結合を移動度シフトアッセイによって評価した(図4)。0、0.1、0.2、0.3、0.5、0.7、1.0、および1.5アルブミン当量(マウス血清由来のアルブミン、凍結乾燥粉末、96%以上(Sigma−Aldrich))を含むPBS溶液(137mM NaCl、2.7mM KCl、10mM Na2HPO4、1.8mM KH2PO4、pH=7.4)中、40μMでON1を37℃で1時間、インキュベートすることによって、試験溶液を調製した。10μLの各試料を10%ネイティブPAGE(40V、170分、7℃で実行)で分析した。標準的なプロトコルに従い、すべての溶液の染色により視覚化を行った。下のバンドは複合体を形成していないON1の存在を示し、上のバンドはアルブミンと複合体を形成したON1の存在を示す。この実験は、ON1が0.3当量以上のアルブミン濃度でアルブミンに効率的に結合できることを示している。
凝集体の存在および溶解
凝集体の形成および溶解をZetasizer Nano ZSで分析した(図7)。ON1を、7.5mg/mLの濃度で、PBS溶液(137mM NaCl、2.7mM KCl、10mM Na2HPO4、1.8mM KH2PO4、pH=7.4)に溶解した。ナノ粒子の最初の存在を記録した(0分)。次いで、溶液を95℃に加熱し、10分、20分、および30分の加熱後にナノ粒子の存在を記録した。次いで、溶液を室温で24時間放置し、次いで、ナノ粒子の存在を再び記録した。最初は、約1000nmのサイズを有する粒子について強い信号を測定することができる。溶液を加熱することにより、シグナルが消える。実験結果は、親油性部分にコンジュゲートしたオリゴヌクレオチドが水溶液中で凝集体を形成することを示している。しかしながら、溶液を95℃で少なくとも20分間加熱することにより、確実に凝集体が分散する。室温で24時間放置した後、凝集体は再び出現しない。
エクソンスキッピング効率の決定
エクソンスキッピングは、1つ以上のエクソンを成熟mRNAから除去するために、アンチセンスオリゴヌクレオチドの使用を含む。エクソンスキッピングを使用することにより、1つ以上のエクソンを成熟mRNAから除去し、インフレームである成熟mRNAを得ることができる。エクソンのスキッピングは、スプライス部位の一方もしくは両方、または内部エクソン配列を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの結合によって誘導することができる。エクソンは、両方のスプライス部位がスプライセオソーム複合体によって認識される場合においてのみmRNAに含まれるため、スプライス部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドの明らかな標的である。
hDMDdel52/mdxマウスモデルでのエクソンスキッピング
エクソンスキッピングの有効性は、筋ジストロフィーのhDMDdel52/mdxマウスモデルで決定される。マウスは、配列番号418、対応するホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー(PMO)または生理食塩水を含む配列を有するabc−DNA脂質基コンジュゲートオリゴヌクレオチドの静脈内注射を受ける。マウスは、オリゴヌクレオチドの週12回の注射(50mg/kg/週)を受ける。処置後、次の組織が分離される:心臓、横隔膜、前脛骨筋、腓腹筋、大腿四頭筋、上腕三頭筋、脳、肝臓、腎臓、およびエクソンスキッピングが決定される。特定の実施形態では、マウスは、abc−DNA脂質基コンジュゲートオリゴヌクレオチドの代わりにエチプラーセンまたはドリサペルセンで処置される。エクソンスキッピングは、RT−PCR、ウエスタンブロット、免疫蛍光および/またはデジタルPCRによって決定される。
Claims (31)
- オリゴヌクレオチド−脂質基コンジュゲートであって、前記オリゴヌクレオチドが、ホスホジエステル結合によって結合された少なくとも2個のアルファアノマービシクロDNA(abc−DNA)残基を含み、前記脂質基が、前記オリゴヌクレオチドに共有結合している、オリゴヌクレオチド−脂質基コンジュゲート。
- 前記脂質基が、リンカーを介して前記オリゴヌクレオチドに共有結合している、請求項1に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドが、12〜24個の残基を含む、請求項1または2に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチド前記オリゴヌクレオチドが、14〜19個の残基を含む、請求項1〜3のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記残基のすべてが、abc−DNA残基である、請求項1〜5のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記少なくとも2個のabc−DNA残基が、ホスホジエステル結合を介して隣接する残基に結合している、請求項1〜6のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記残基のすべてが、abc−DNA残基であり、ホスホジエステル結合を介して結合している、請求項1〜7のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記脂質基が、前記オリゴヌクレオチドの末端残基に共有結合している、請求項1〜8のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドが、ホスホジエステル結合基、ホスホトリエステル結合基、ホスホロチオエート結合基、ホスホロジチオエート結合基、ホスホネート結合基、ホスホノチオエート結合基、ホスフィネート結合基、ホスホルチオアミデート結合、およびホスホルアミデート結合基からなる群から選択される、リン含有ヌクレオシド結合基を介して結合している残基を含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記リンカーが、炭化水素リンカーまたはポリエチレングリコール(PEG)リンカーである、請求項2〜10のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記リンカーが、アミノ−アルキル−ホスホロチオエートリンカー、アミノ−PEG−ホスホロチオエートリンカー、アルファ−カルボキシレート−アミノ−アルキルホスホロチオエートリンカー、およびアルファ−カルボキシレート−アミノ−PEG−ホスホロチオエートリンカーからなる群から選択される、請求項2〜11のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記リンカーが、切断可能な基を含む、請求項2〜12のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記脂質基が、脂肪酸由来基である、請求項1〜13のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記脂肪酸が、飽和または不飽和である、請求項14に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記脂肪酸が、4〜28個の炭素原子の長さを有する、請求項14または15に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記脂肪酸由来基が、カルボン酸基を含む、請求項14〜16のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記脂肪酸が、表1または表2に提示される脂肪酸から選択される、請求項14〜17のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記脂肪酸が、ヘキサデカン酸である、請求項14〜18のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記脂質基が、チオホスフェート基を介して前記オリゴヌクレオチドに結合している、請求項1〜19のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドコンジュゲートが、デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)遺伝子のエクソン51の一部に対応するプレmRNAに結合する、請求項1〜20のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドコンジュゲートが、配列番号4、5、22〜24、36〜39、51〜55、404、および414〜425からなる群から選択される配列を含む、請求項21に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドが、表3に提供される配列のうちのいずれか1つを含む、請求項1〜22のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドコンジュゲートが、DMD遺伝子のエクソン53の一部に対応するプレmRNAに結合する、請求項1〜23のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドコンジュゲートが、表4に提供される配列のうちのいずれか1つを含む、請求項24に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドコンジュゲートが、DMD遺伝子のエクソン45の一部に対応するプレmRNAに結合する、請求項1〜25のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 前記オリゴヌクレオチドコンジュゲートが、表5に提供される配列のうちのいずれか1つを含む、請求項26に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲート。
- 請求項1〜27のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチド−脂質基コンジュゲートを好適な担体と組み合わせて含む、医薬組成物。
- 遺伝子から発現されたRNAへの、請求項1〜27のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲートのハイブリダイゼーションを可能することにより、前記遺伝子の発現を変化させる方法であって、前記オリゴヌクレオチドは、前記RNAの一部に相補的な配列を含む、方法。
- デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)もしくはベッカー型筋ジストロフィー(BMD)を有する対象において、または前記対象に由来する細胞において、ヒトジストロフィンプレmRNAのエクソン51のスキッピングを誘導する方法であって、前記方法は、配列番号4、5、22〜24、36〜39、51〜55、404、および414〜425からなる群から選択される配列を含む、請求項1〜23のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲートを提供することを含み、前記オリゴヌクレオチドコンジュゲートは、前記対象または前記細胞において前記エクソンのスキッピングを誘導し、前記ジストロフィンプレmRNAのエクソン51のスキッピングから生成されたmRNAが、機能的ジストロフィンタンパク質またはベッカー対象のジストロフィンタンパク質をコードする、方法。
- ヒトジストロフィンプレmRNAのエクソン51のスキッピングを誘導することにより、対象においてまたは前記対象に由来する細胞において、デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)またはベッカー型筋ジストロフィー(BMD)を処置する方法であって、前記方法は、前記対象または前記細胞に、配列番号4、5、22〜24、36〜39、51〜55、404、および414〜425からなる群から選択される配列を含む、請求項1〜23のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドコンジュゲートを含む組成物を提供することを含み、前記オリゴヌクレオチドコンジュゲートは、前記対象または前記細胞において前記エクソンのスキッピングを誘導し、前記ジストロフィンプレmRNAのエクソン51のスキッピングから生成されたmRNAが、機能的ジストロフィンタンパク質またはベッカー対象のジストロフィンタンパク質をコードする、方法。
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