JP2021506765A - Dux4の発現に関連する疾患の治療のための化合物 - Google Patents

Dux4の発現に関連する疾患の治療のための化合物 Download PDF

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Abstract

本発明は筋ジストロフィー等のDUX4の発現に関連する疾患の治療のための化合物に関する。本発明はまた、該化合物の使用、又は該化合物の使用の方法に関する。【選択図】 なし

Description

本発明は筋ジストロフィー等のDUX4の発現に関連する疾患の治療のための化合物に関する。本発明はまた、該化合物の使用、又は該化合物の使用方法に関する。
セリン/スレオニンキナーゼ(EC2.7.11.1)は低分子阻害剤の期待される薬剤ターゲットであるタンパク質キナーゼの1つのクラスである。これは真核細胞のシグナル伝達経路に関与しているので、セリン/スレオニンキナーゼの阻害はがん、糖尿病、及び種々の炎症性障害等の疾患の治療に妥当性を有すると考えられる。
カゼインキナーゼ1(CK1、CSNK1としても知られている)はセリン/スレオニンキナーゼファミリーに属している。CK1のアイソフォームはWntシグナル伝達、サーカディアンリズム、転写因子の核−細胞質シャトリング、DNAの修復、及びDNAの転写に関与している(Eide EJ、Virshup DM (2001)doi:10.1081/CBI-100103963)。哺乳類では、この酵素は全てが同様のキナーゼドメインを有する7つのアイソフォーム、α、β、γ1、γ2、γ3、δ、及びεとして存在している。種々の基質タンパク質のリン酸化を通して、これらのアイソフォームはこれらの基質タンパク質の機能を活性化し、安定化し、不活性化し、又は不安定化し、それによりそれらの機能を制御することができる。たとえば、いずれも異常な細胞増殖を制御する重要なタンパク質である腫瘍抑制因子p53及び腫瘍遺伝子mdm2は、CK1の基質である。
カゼインキナーゼ1γ、カゼインキナーゼ1δ、及びカゼインキナーゼ1ε等の哺乳類のカゼインキナーゼは、種々の細胞増殖並びにWntシグナル伝達、サーカディアンリズム、及びDNAの修復等の生存プロセスの重要な制御因子である。これらは他のアイソフォームのドメインと同様のキナーゼドメインを有している。しかし、これらのN末端及びC末端ドメインは他のアイソフォームのドメインとは異なる。C末端ドメインは複数の自己リン酸化部位を有しており、自己酵素活性の制御に関与していると考えられている。カゼインキナーゼ1δ又はカゼインキナーゼ1ε等のカゼインキナーゼによるp53のリン酸化は、p53とmdm2との相互作用に変化をもたらす。カゼインキナーゼ1δ及びカゼインキナーゼ1εが細胞分裂の間に中心体としてのスピンドルの形成に伴う制御タンパク質として関与していること、並びにカゼインキナーゼ1δ及びカゼインキナーゼ1εがTRAIL(腫瘍壊死因子関連アポトーシス誘導因子)及びFasが媒介するアポトーシスに関与していることも知られている。非選択的CK1阻害化合物IC261によるカゼインキナーゼ1δ又はカゼインキナーゼ1εの阻害が、インビボ及びインビトロで膵臓腫瘍細胞の増殖を低減させることも報告されている(Brockschmidtら、2008、DOI: 10.1136/gut.2007.123695)。したがって、CK1阻害剤は種々の重要な表現型及び治療効果について開発され検討されてきた。
国際公開第2011/051858号には、中枢神経系に関連する疾患及び障害の治療及び/又は予防に有用なCK1阻害剤(δ及びεの両方)が開示されている。これらの阻害剤は、一連の置換されたイミダゾール化合物、より詳細には一連の4−アリール−5−ヘテロアリール−1−ヘテロシクロアルキル−イミダゾール類及び関連する類似体を形成する。CK1δ及びCK1εの合成及びIC50値の両方が報告されており、IC50は一般にナノモル範囲に入っている。CK1阻害剤の密接に関連するファミリーが国際公開第2012/085721号に開示されている。
国際公開第2015/119579号には、アゾールコアも特徴とするファミリー、即ちCK1阻害剤としての使用のための、2,4,5−トリ置換アゾール化合物のファミリーが開示されている。阻害剤は、CK1の阻害を介する多能性幹細胞の心筋細胞への分化を誘導し又は促進するために用いられる。阻害剤を得るための合成経路が開示されており、阻害剤は一般にCK1δ及びCK1ε阻害剤としてナノモル範囲のIC50値を有することが示されている。
EP2949651には、CK1阻害剤として作用する置換ベンゾチアゾール類の誘導体のファミリーが開示されており、それらの使用はCK1が媒介する疾患、特に炎症、神経、精神、神経変性、及び/又は眼科疾患、並びにある種の再生プロセスの治療及び/又は予防と関連している。合成方法が提供されており、阻害剤はCK1δ及びCK1εに対してナノモルの阻害活性を有することが示されている。
国際公開第2009/016286号には、タンパク質キナーゼ阻害剤として、特にCK1δ及びCK1εの阻害剤として有用な6−シクロアミノ−3−(ピリド−4−イル)イミダゾ[l,2−b]ピリダジン誘導体が開示されている。それらの合成が詳細に記載されており、カゼインキナーゼ1δ及びカゼインキナーゼ1εによるカゼインのリン酸化を阻害するCK1阻害剤の能力が米国特許出願公開第2005/0131012号に記載された手順で評価され、IC50値がナノモル範囲であることが明らかになった。
国際公開第2015/195880号には、同様のコアを有するファミリー、即ちタンパク質キナーゼ阻害剤として有用な置換ビシクロピラゾール類が開示されている。阻害剤を得るための合成戦略が記載されており、得られるCK1阻害剤はCK1δ及びCK1εに効果があることが示された。特にがんの治療への妥当性が示されている。
顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー(FSHD)は、最もよく見られる遺伝性の筋ジストロフィーである。症状は20歳前に始まり、眼及び口、肩、上腕、並びに下肢の付近の筋肉の衰弱及び萎縮を伴う。衰弱はその後、腹筋、及び時には腰の筋肉に広がることがあり、患者の約20%は結局車いすに縛られることになる。患者は現在のところ、鎮痛剤の使用、認知療法、及び時には患者の可動性を維持するために用いられる医用デバイスで補助する身体的な運動を含む、疼痛及び疲労等の症状に対する療法に頼っている。さらに、肩甲骨の手術処置によって肩甲骨機能の増大が得られることもある。これらの介入はせいぜい本質的に対症的なものにとどまり、疾患の進行に影響せず、疾患の進行を改変することができる療法へのニーズがあることを示している。
近年、FSHDの分子的基礎の理解において顕著な進歩があった。その結果、FSHDの原因となる基礎的な遺伝子病変の特定及び特性解析が得られ、筋肉細胞におけるダブルホメオボックス4(DUX4)レトロジーンのエピジェネティックな抑制解除が、疾患の主な特徴である筋委縮、炎症、及び酸化ストレスを引き起こす転写規制解除カスケードを開始することによって病因の引き金となるという、新たな病因モデルが生まれた。DUX4は転写因子との類似性を共有しており、通常、ヒト精巣の生殖細胞中に豊富に発現されるが、体細胞組織中ではエピジェネティックに抑制されている。筋肉細胞におけるDUX4遺伝子の機能獲得がFSHDの病因論の基礎になっているという病因モデルは幅広く支持されている(Lemmersら、2010、DOI:10.1126/science.1189044;Sharmaら、2016、DOI:10.4172/2157-7412.1000303;Sniderら、2010、DOI:10.1371/journal.pgen.1001181;Tawilら、2014、DOI: 10.1186/2044-5040-4-12)。
FSHDは2つのサブタイプ、即ちFSHD1とFSHD2に分けられることがある。FSHD1は染色体4q35のサブテロメア領域に位置するDNAタンデムアレイ(D4Z4)の中の大きな欠失を伴っている。D4Z4リピートのそれぞれはDUX4遺伝子のコピーを含んでおり、これは健常な個体の体細胞組織では通常、サイレンシングされている。健常で遺伝的変化がない個体は4qの両方の染色体アームに10〜100個のD4Z4繰り返し単位を有していると定義されるが、FSHD1に罹患した個体は1つの4q染色体アームに1〜10個のD4Z4繰り返し単位を有している。FSHDの特徴であるD4Z4リピートの欠失によって、数百個のヒストン及びCpGに富む多量のDNAを含む制御クロマチンのかなりの部分がこの領域から除去されている。これらの要素はDNAのメチル化及びヘテロクロマチンの成立に重要であり、これらの喪失はD4Z4アレイのエピジェネティック状況を顕著に変化させる。D4Z4の短縮それ自体は病原的ではない。末梢のDUX4のトランスクリプトのポリアデニル化に影響し得る多型を含む疾患許容状態の4qA対立遺伝子においてD4Z4の短縮が起こる場合にのみ、エピジェネティック状況の変化に、FSHD1患者の骨格筋における選択的スプライシング及びDUX4の発現の増大が伴う。より稀な形態であるFSHD2においては、SMCHD1又はDNMT3B等のエピジェネティック因子の変異形が原因である。この形態においても、D4Z4領域は低メチル化状態にあり、筋肉細胞はDUX4タンパク質が抑制解除されているという特徴を有する。両方の形態のFSHDはDUX4の過度の発現に集約される。したがって、FSHD1及びFSHD2は別々のものではなく、連続的系列上にあることが示唆されている(Van den Boogaardら、2016、DOI: 10.1016/j.ajhg.2016.03.013)。
DUX4はその発現によって転写カスケードが開始され、筋肉細胞の機能不全の進行及び死、ついには明らかな病変がもたらされる転写因子として作用する(Kowaljowら、2007、DOI:10.1016/j.nmd.2007.04.002;Vanderplanckら、2011、doi: 10.1371/journal.pone.0026820 ;Gengら、2012、DOI:10.1016/j.devcel.2011.11.013 ; Yaoら、2014、DOI: 10.1093/hmg/ddu251 ; Wallaceら、2011、DOI: 10.1002/ana.22275)。健常な個体では、DUX4は生殖細胞系列で発現するが、体細胞組織ではエピジェネティックにサイレンシングされている。FSHDの患者では、筋肉線維のほんの小さな割合におけるバースト様のDUX4の発現が筋肉細胞の死を引き起こし、ついには筋肉の衰弱及び消耗をもたらす(Lemmersら、2010)。最も単純化した用語では、DUX4の過発現がFSHDの根本的な一次的病因であり、その抑制はFSHDに対する有望な治療的アプローチである。これを支持するものとして、短いリピートサイズは一般に重度なFSHDの表現型を伴っている。中程度のリピート短縮では、臨床的重篤度はより温和で、より変化しやすい。FSHDの極めて稀なサブタイプであるFSHD2にはリピート短縮が中程度であるという特徴があり(10を超えるリピートが残存している)、SMCHD1遺伝子又はDNMT3B遺伝子の変異を伴っている。FSHD2でもD4Z4領域は低メチル化状態にあり、筋肉細胞はDUX4タンパク質が抑制解除されているという特徴を有する。SMCHD1の変異も有する10個未満のD4Z4繰り返し単位を有する患者は極めて重度な臨床的表現型を有し、いずれもDUX4の抑制解除に寄与する繰り返しサイズとエピジェネティック修飾因子の活性の組み合わせが、FSHDにおける最終的な疾患重篤度を決定していることが分かる。
Campbellら(2017、DOI 10.1186/s13395-017-0134-x)は、既知のエピジェネティック活性を有する化学化合物、並びに臨床試験に到達した化合物からなるPharmakon1600ライブラリーから選択したものをスクリーニングし、不死化したFSHD骨格筋肉細胞培養におけるDUX4ターゲット遺伝子mRNAの発現レベルによってモニターしたDUX4発現を低減する分子を特定した。彼らはタンパク質のブロモドメイン及びエクストラ−ターミナル(BET)ファミリーの阻害剤及びβ−2アドレナリン作動性受容体のアゴニストを含むいくつかのクラスの分子を特定した。彼らの研究は、これら2つのクラスの化合物が、それぞれブロモドメイン含有タンパク質4(BRD4)の活性をブロッキングし、又は環状アデノシンモノホスフェート(cAMP)のレベルを増大することによって、DUX4の発現を抑制していることを示唆している。
DUX4はFSHDの原因としての役割を有しているので、DUX4を抑制することは疾患の進行を中断させる主要な治療アプローチである。このアプローチは、急性リンパ球性白血病(Yasudaら、2016、doi:10.1038/ng.3535)及び肉腫(Oyamaら、2017DOI: 10.1038/s41598-017-04967-0 ; Bergeratら、2017、DOI: 10.1016/j.prp.2016.11.015)等を含むがん等の他の疾患の治療にも有用である可能性がある。しかし、DUX4の発現の機序の理解は十分でなく、対応する薬剤ターゲットも十分に特定されていない。結果として、現在のところFSHDの治療は存在せず、DUX4の発現を抑制するために用いることができる化合物及び組成物へのニーズが存在する。
第1の態様では、本発明はDUX4の発現を伴う疾患又は病態の治療における使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ1阻害剤はDUX4の発現を低減する。好ましくは、DUX4の発現を伴う疾患又は病態は筋ジストロフィー又はがんであり、好ましくはDUX4の発現を伴う前記疾患又は病態は筋ジストロフィーであり、最も好ましくは顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー(FSHD)である。好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は1日あたり4、3、2、若しくは1回又はそれ未満、好ましくは1日に1回、対象に投与されるという特徴を有する。好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は少なくともカゼインキナーゼ1δを阻害し、任意選択でカゼインキナーゼ1δに対して特異的である。好ましくは、CK1阻害剤は0.1〜1500mg/日、好ましくは0.1〜400mg/日、より好ましくは0.25〜150mg/日の範囲の量で対象に投与されるという特徴を有する。好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は経口、舌下、血管内、静脈内、皮下、又は経皮で、好ましくは経口で、投与されるという特徴を有する。好ましくは、DUX4の発現は少なくとも20%、40%、60%、80%、又はそれ以上、低減される。好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は筋肉細胞、免疫細胞、又はがん細胞中におけるDUX4の発現を低減する。好ましくは、DUX4の発現の低減はPCR又は免疫染色を用いて決定される。好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤はアゾールコアを含むクラスからのものである。好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は化合物A、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L、M、N、O、PF−670462、及びPF−5006739からなる群から選択される。
第2の態様では、本発明は第1の実施形態で定義した使用のための、第1の実施形態で定義した少なくとも1つのカゼインキナーゼ1阻害剤及び薬学的に許容できる賦形剤を含む組成物を提供する。好ましくは、使用のための組成物は経口、舌下、非経口、血管内、静脈内、皮下、又は経皮投与、好ましくは経口投与のために製剤化される。
第3の態様では、本発明はDUX4の発現を低減するためのインビボ、インビトロ、又はエクスビボの方法を提供し、本方法は細胞を第1の態様で定義したカゼインキナーゼ1阻害剤又は第2の態様で定義した組成物と接触させるステップを含む。第4の態様では、本発明はそれを必要とする対象におけるDUX4の発現を低減する方法を提供し、本方法は第1の態様で定義したカゼインキナーゼ1阻害剤又は第2の態様で定義した組成物の有効量を投与するステップを含む。
(A):2名の異なったドナーからの分化3日後のFSHDミオチューブにおけるDUX4の免疫細胞化学染色の説明図である。DUX4陽性の核のクラスターが明瞭に染色されているが、DUX4陰性の核は染色されていない。ヒストグラムはDUX4と二次抗体(上)又は二次抗体のみ(下)で染色した後の免疫蛍光シグナルの強度を示す(X軸上で強度が増大)。上の矢印はバックグラウンドのシグナル(左向き矢印)又は特異的DUX4シグナル(右向き矢印)を示す。(B):分化3日後のDUX4で染色したFSHDミオチューブの説明図である。点状のパターンは、二次抗体の対照からバックグラウンドを除去するために加えたフィルターの設定に起因する。閾値の設定により、センチネル核からより離れた核では弱いDUX4のシグナルの検出が妨げられていることに注目されたい。 スクリプトに基づく画像解析には、核の特定、ミオチューブの特定、ミオチューブの境界の内側又は外側における核の検出(融合インデックスを計算するために用いる)、DUX4陽性の核及びクラスター、ミオチューブの面積、ミオチューブの幅、及びミオチューブの骨格長が含まれることを示す図である。 384ウェルフォーマットにおける一次スクリーニングアッセイフォーマットのバリデーションである。3つの独立した実験を示し、分化培地中、3日後の分化している初代ミオチューブ中のDUX4を発現している核の数のスクリプトに基づく定量を用いて得られたアッセイウィンドウを説明する。アッセイウィンドウはDUX4のシグナルと二次抗体のバックグラウンドシグナル(DUX4が全く存在しない場合のシグナルを表す)とによって定義される。 スクリーニングアッセイプロトコルの概略図である。−1日目に筋芽細胞を播種し、0日目に培地を分化培地に変更した。細胞を3日間、分化させた。化合物は固定の15時間前に添加した。 DUX4の発現についての2つの異なる読み取り(DUX4陽性の核の数及びDUX4の強度)及び毒性の可能性をモニターするための2つの異なる読み取り(融合インデックス、核カウント)を用いる、注釈付き化合物ライブラリーの一次スクリーニングから得られた2組の結果の相関を示す図である。ヒットコーリング閾値(厳密度が高い)を点線で示し、右上の象限は異なる読み取りについてヒットした化合物を含む。散布図の軸は対称である。 図5A〜図5Gは種々のCK1阻害剤についての異なる読み取りの濃度−応答曲線である。化合物に曝露して15時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを測定した。図5A:PF−670462の結果、図5B:PF−5006739の結果、図5C:化合物Cの結果、図5D:化合物Dの結果、図5E:化合物Eの結果、図5F:化合物Fの結果、図5G:化合物Gの結果。構造式は実施例5に示している。 図5A〜図5Gは種々のCK1阻害剤についての異なる読み取りの濃度−応答曲線である。化合物に曝露して15時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを測定した。図5A:PF−670462の結果、図5B:PF−5006739の結果、図5C:化合物Cの結果、図5D:化合物Dの結果、図5E:化合物Eの結果、図5F:化合物Fの結果、図5G:化合物Gの結果。構造式は実施例5に示している。 図5A〜図5Gは種々のCK1阻害剤についての異なる読み取りの濃度−応答曲線である。化合物に曝露して15時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを測定した。図5A:PF−670462の結果、図5B:PF−5006739の結果、図5C:化合物Cの結果、図5D:化合物Dの結果、図5E:化合物Eの結果、図5F:化合物Fの結果、図5G:化合物Gの結果。構造式は実施例5に示している。 図5A〜図5Gは種々のCK1阻害剤についての異なる読み取りの濃度−応答曲線である。化合物に曝露して15時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを測定した。図5A:PF−670462の結果、図5B:PF−5006739の結果、図5C:化合物Cの結果、図5D:化合物Dの結果、図5E:化合物Eの結果、図5F:化合物Fの結果、図5G:化合物Gの結果。構造式は実施例5に示している。 図5A〜図5Gは種々のCK1阻害剤についての異なる読み取りの濃度−応答曲線である。化合物に曝露して15時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを測定した。図5A:PF−670462の結果、図5B:PF−5006739の結果、図5C:化合物Cの結果、図5D:化合物Dの結果、図5E:化合物Eの結果、図5F:化合物Fの結果、図5G:化合物Gの結果。構造式は実施例5に示している。 図5A〜図5Gは種々のCK1阻害剤についての異なる読み取りの濃度−応答曲線である。化合物に曝露して15時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを測定した。図5A:PF−670462の結果、図5B:PF−5006739の結果、図5C:化合物Cの結果、図5D:化合物Dの結果、図5E:化合物Eの結果、図5F:化合物Fの結果、図5G:化合物Gの結果。構造式は実施例5に示している。 図5A〜図5Gは種々のCK1阻害剤についての異なる読み取りの濃度−応答曲線である。化合物に曝露して15時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを測定した。図5A:PF−670462の結果、図5B:PF−5006739の結果、図5C:化合物Cの結果、図5D:化合物Dの結果、図5E:化合物Eの結果、図5F:化合物Fの結果、図5G:化合物Gの結果。構造式は実施例5に示している。 アッセイプロトコルの概略図である。−1日目に筋芽細胞を播種し、0日目に培地を分化培地に変更した。細胞を3日間、分化させた。固定の15時間前又は72時間前に化合物を添加した。15時間の処置については、分化が既に顕著に進行したときに化合物を添加する。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。 72時間の処置の場合には、分化フェイズ全体の間に化合物をインキュベートした。他のパネルはBET阻害剤(図6B1、図6B2)、又はβ2アドレノ受容体アゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2、図6F)についての異なる読み取りの濃度−応答曲線を示す。処置の15時間又は72時間後のDUX4核カウント、DUX4の強度、融合インデックス、及び全核カウントを評価した。(図6B1、図6B2):(+)JQ1、(図6C1、図6C2):フォルモテロール、(図6D1、図6D2):サルブタモール、(図6E1、図6E2):サルメテロール、(図6F):分化培地中でβ2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)に72時間曝露した後のミオチューブの顕微鏡写真、(図6G1、図6G2):CK1阻害剤(PF−670462)に15時間及び72時間曝露した両方の結果。
FSHDについて合意された疾患仮説においてDUX4が中心的な役割を担うことを受けて、疾患を改変する可能性のある治療的アプローチはDUX4の阻害に依拠することが予想される。本発明者らは驚くべきことに、筋肉細胞におけるDUX4の抑制を実現するための新規な薬剤ターゲットとしてカゼインキナーゼ1(CK1)を特定した。本発明はFSHD患者由来の初代筋肉細胞を用いて行なわれた。FSHDの遺伝子座には霊長類特異性があること、及び内因性のDUX4制御機序を研究するためには組み換え、不死化、又は腫瘍原性の細胞又は動物モデルでは妥当性に疑問があることから、初代の患者由来筋肉細胞が使用可能で最も妥当性のある疾患モデルである。不死化細胞に基づくアッセイはエピゲノムが変化している危険があり、そのためDUX4の発現の内因性制御の研究における妥当性には限界がある。特に、D4Z4がサブテロメア位置にあること及びDUX4抑制の安定性においてD4Z4エピゲノムが重要であること(Stadlerら、2013、DOI:10.1038/nsmb.2571)によって、DUX4の発現を制御する生理学的に妥当な薬剤ターゲットを発見するために初代筋肉細胞を用いる必要性が強調される。
DUX4は歴史的にFSHDの筋肉で検出することは困難であると考えられてきた。FSHDの患者からの初代筋芽細胞におけるDUX4の発現は確率論的に起きることが示されてきた。増殖型FSHD筋芽細胞では1000個中1個、筋芽細胞の分化の間では200個中1個の核のみがDUX4陽性であることが研究によって報告されている。この特に低いDUX4の存在量のため、DUX4タンパク質の検出は技術的に困難であることが報告されてきた。FSHDに関する文献で初代FSHD筋肉細胞が広く用いられているが、いずれの報告もベンチスケールレベルを超えて適用可能とは思われない。初代細胞を用いることによってもたらされる限界及び低レベルの内因性DUX4を検出することの複雑さの理解によって、初代FSHD筋肉細胞を高スループットのフォーマットに適用することに伴う困難さが説明される。増殖型FSHD筋芽細胞の多核ミオチューブへのインビトロ分化に際してDUX4の発現は増大するが、そのレベルは低いままであり、確固とした大スケールのスクリーニングアプローチのためには動的な変動が極めて困難な課題であることが広く受け入れられている(Campbellら、2017)。
使用のための化合物
第1の態様では、本発明はDUX4の(過度の)発現を伴う疾患又は病態の治療における使用のためのカゼインキナーゼ1(CK1)阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ1阻害剤はDUX4の発現を低減する。該CK1阻害剤は本明細書において本発明による使用のためのCK1阻害剤と称する。CK1阻害剤は当技術で既知であり、本明細書で後により詳細に説明する。
本明細書に記載した医学用途は、記述した(1つ又は複数の)病態の治療(たとえば有効量の化合物の投与による)のための医薬としての使用のための本明細書に定義した化合物として策定されるが、同様にi)有効量の化合物を対象に投与するステップを含む、本明細書に定義した化合物を用いる記述した(1つ又は複数の)病態を治療する方法、ii)記述した(1つ又は複数の)病態を治療するための医薬の製造における使用のための、本明細書に定義した化合物であって、好ましくは有効量で投与される化合物、及びiii)好ましくは有効量を投与することによる、記述した(1つ又は複数の)病態を治療するための、本明細書に定義した化合物の使用として策定される。そのような医学的使用は全て、本発明によって想定されている。好ましい対象は治療を必要とする対象である。治療は好ましくは疾患又は病態の遅延、改善、緩和、安定化、治癒、又は予防をもたらす。換言すれば、本発明による使用のための化合物は、記述した疾患又は病態の治療、遅延、改善、緩和、安定化、治癒、又は予防のための化合物であってもよい。
本発明による使用のためのCK1阻害剤はDUX4の発現を低減する。このDUX4の発現は、好ましくは治療される対象の全体のDUX4の発現である。DUX4の発現は当技術で既知の方法を用いて決定することができ、又は実施例で例示される。たとえば、DUX4の発現はRT−PCR等のPCR手法を用いて、又は免疫染色、マススペクトル、若しくはELISAを用いて、たとえば細胞又は細胞抽出物を含む試料、好ましくは対象から得た試料について決定することができる。これに関して、低減は好ましくは所定の値又は参照値と比較した低減である。好ましい参照値は細胞又は細胞抽出物を含む未処理の試料中のDUX4の発現を決定することによって得られた参照値である。この未処理試料は同じ対象から得たもの、又は異なった健常な対象から得たものでよく、より好ましくは同じ方法で得られた試料であり、したがって同じ種類の細胞を含む。試験試料と参照試料の両方が、得られた単一のより大きな試料の一部であることが便利である。或いは、試験試料は治療を開始する前に対象から得られたものである。極めて好ましい参照値は、本発明によるカゼインキナーゼ1阻害剤の最初の投与の前に対象から得られた試料のDUX4の発現レベルである。別の好ましい参照値は、DUX4の発現がない場合を表す固定値である。
DUX4の発現の低減は、好ましくは発現が少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、又は100%低減されることを意味する。DUX4の発現がたとえば100%低減されれば、DUX4の発現はもはや検出されないということがあり得る。低減はタンパク質レベル、たとえば免疫染色、ELISA、又はマススペクトルで評価することができ、又はmRNAレベル、たとえばRT−PCR等のPCR手法によって評価することができる。好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、DUX4の発現の低減はPCR又は免疫染色を用いて決定され、好ましいPCR手法はRT−PCRである。好ましい実施形態では本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、DUX4の発現は少なくとも20%、40%、60%、80%、又はそれ以上、より好ましくは少なくとも30%、40%、60%、80%、又はそれ以上、低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも10%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも20%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも30%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも40%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも50%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも60%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも70%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも80%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも90%低減される。さらに好ましい実施形態では、DUX4の発現は少なくとも95%低減される。最も好ましい実施形態では、DUX4の発現は約100%、好ましくは100%低減される。
好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ1阻害剤は筋肉細胞、免疫細胞、又はがん細胞、好ましくは筋肉細胞又は免疫細胞、最も好ましくは筋肉細胞におけるDUX4の発現を低減する。好ましい筋肉細胞は筋芽細胞、衛星細胞、ミオチューブ、及び筋肉線維である。好ましい免疫細胞はB細胞、T細胞、樹状細胞、好中球、ナチュラルキラー細胞、顆粒球、先天性リンパ球様細胞、巨核球、骨髄由来サプレッサー細胞、単球/マクロファージ、及び胸腺細胞、並びに任意選択で肥満細胞である。その他の好ましい細胞は血小板及び赤血球である。他の実施形態では、DUX4の発現はがん細胞において低減される。
好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのCK1阻害剤を提供し、DUX4の発現を伴う前記疾患又は病態は筋ジストロフィー又はがんであり、好ましくはDUX4の発現を伴う前記疾患又は病態は筋ジストロフィーであり、最も好ましくは顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー(FSHD)である。
これに関して、好ましい筋ジストロフィーはFSHDであり、好ましいがんは前立腺がん(国際公開第2014/081923号)、多発性骨髄腫(米国特許出願公開第2014/0221313号)、肺がん(Langら、2014、DOI:10.14205/2310-8703.2014.02.01.1)、結腸がん(Pazら、2003、DOI: 10.1093/hmg/ddg226)、肉腫、又は白血病であり、好ましい肉腫は小円形細胞肉腫(Oyamaら、2017 DOI: 10.1038/s41598-017-04967-0; Bergeratら、2017、DOI:10.1016/j.prp.2016.11.015 ; Chebib及びJo、2016、DOI: 10.1002/cncy.21685)であり、好ましい白血病は急性リンパ球性白血病(ALL)、より詳細にはB細胞前駆体ALL(Yasudaら、2016、doi:10.1038/ng.3535 ; Lilljebjorn及びFioretos、2017、DOI: 10.1182/blood-2017-05-742643 ;Zhang ら、2017、DOI:10.1038/ng.3691)である。
したがって、好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのCK1阻害剤を提供し、DUX4の発現を伴う前記疾患又は病態は筋ジストロフィー又はがんであり、好ましくはDUX4の発現を伴う前記疾患又は病態はFSHD、前立腺がん、多発性骨髄腫、肺がん、結腸がん(好ましくは結腸直腸癌腫)、肉腫(好ましくは小円形細胞肉腫)、白血病(好ましくは急性リンパ球性白血病、より好ましくはB細胞前駆体急性リンパ球性白血病)であり、好ましくはDUX4の発現を伴う前記疾患又は病態はFSHDである。より好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのCK1阻害剤を提供し、DUX4の発現を伴う前記疾患又は病態は筋ジストロフィー又はがんであり、好ましくはDUX4の発現を伴う前記疾患又は病態はFSHD又はがんであり、がんは好ましくは前立腺がん、多発性骨髄腫、肺がん、結腸がん(好ましくは結腸直腸癌腫)、肉腫(好ましくは小円形細胞肉腫)、白血病(好ましくは急性リンパ球性白血病、より好ましくはB細胞前駆体急性リンパ球性白血病)であり、がんはより好ましくは肉腫、最も好ましくは小円形細胞肉腫である。
好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのCK1阻害剤を提供し、DUX4の発現を伴う前記疾患又は病態はがんであり、がんは好ましくは前立腺がん、多発性骨髄腫、肺がん、結腸がん(好ましくは結腸直腸癌腫)、肉腫(好ましくは小円形細胞肉腫)、白血病(好ましくは急性リンパ球性白血病、より好ましくはB細胞前駆体急性リンパ球性白血病)であり、がんはさらに好ましくは肉腫、最も好ましくは小円形細胞肉腫である。
その他のDUX4ターゲットは、通常は精巣のみで発現するが、いくつかのがんでは抑制解除されて免疫応答を誘発する遺伝子である「がん精巣抗原」(CTA)として知られている。これらの観察は、がんにおけるDUX4の抑制解除がHSATII、CTA、及び/又はTHE1Bプロモーターの活性化を媒介することを暗示している(Youngら、2013、doi:10.1371/journal.pgen.1003947)。これと一致して、Dmitrievら(2014、DOI:10.1111/jcmm.12182)はFSHDとがん細胞の発現プロファイルの類似性を実証し、これらの疾患の病因における共通のステップを示唆している。
カゼインキナーゼ1阻害剤
カゼインキナーゼ1阻害剤は当技術で既知である。好ましくは、本発明に関連して、本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤は一般構造式(1a)、(1b)、(2a)、(2b)、又は(3)

(式中、X及びYは独立に=N−、−NR−、CR、又は−S−であるが、ただしX及びYの少なくとも1つはCRであり、
環Aは存在しない(したがって事実上これは2個のHである)か、4〜7員のシクロアルキル若しくはヘテロシクロアルキル、又は5〜6員のヘテロアリールであり、2個までの炭素原子が=N−、−NR−、−O−、−S−から選択されるヘテロ原子で置換され、残りの任意の炭素原子が価数が許す範囲でRによって置換されていてもよく、好ましくは環Aは4〜7員のシクロアルキル若しくはヘテロシクロアルキル、又は5〜6員のヘテロアリールであり、2個までの炭素原子が=N−、−NR−、−O−、−S−から選択されるヘテロ原子で置換され、残りの任意の炭素原子が価数が許す範囲でRによって置換されていてもよく、
それぞれのRは独立にH、C1−4アルキル、C3−6シクロアルキル、−CF、−(CH1−3CF、4〜10員のアリール、4〜10員のヘテロアリール、4〜10員のヘテロシクロアルキルであり、前記アリール、ヘテロアリール、又はヘテロシクロアルキルはハロゲン、OH、オキソ、シアノ、−SOCH、任意選択でメタノール若しくはエタノールでエステル化されたカルボン酸、カルボキサミド、ニトロ、C1−6アルコキシ、C1−6アルキル、又はC1−6アルキル−O−C1−6アルキルから独立に選択される1つ、2つ、又は3つの置換基で置換されていてもよく、好ましくはそれぞれのRは独立にH、C1−4アルキル、C3−6シクロアルキル、−CF、−(CH1−3−CF、4〜10員のヘテロシクロアルキルであり、前記ヘテロシクロアルキルはハロゲン、OH、オキソ、シアノ、C1−6アルキル、又はC1−6アルキル−O−C1−6アルキルから独立に選択される2つまでの置換基で置換されていてもよく、
それぞれのRは独立にH、C1−6アルキル、C4−10−ビシクロアルキル、−(CH−CN、−SO−C1−6アルキル、−SO(CH3−6シクロアルキル、−C1−6アルキル−O−C1−6アルキル、−C1−6アルキル−C(O)O−C1−6アルキル、−C3−6シクロアルキル−C(O)O−C1−6アルキル、−C(O)−(O)−C1−6アルキル、−C(O)−C1−6アルキル−O−C1−6アルキル、−C(O)−(O)−(CH−(C6−10アリール)、−(CH−(C6−10アリール)、−C(O)−(O)−(CH−(5〜10員のヘテロアリール)、−(CH−C(O)−NR、−(CH−(5〜10員のヘテロアリール)、−C(O)−(O)−(CH−(3〜10員のヘテロシクロアルキル)、−(CH−(4〜10員のヘテロシクロアルキル)、−C(O)−(O)−(CH−(3〜10員のシクロアルキル)、又は−(CH−(3〜10員のシクロアルキル)であり、
前記Rのアリール、ヘテロアリール、シクロアルキル、及びヘテロシクロアルキルはハロゲン、OH、シアノ、C1−6アルキル、又はC1−6アルキル−O−C1−6アルキルから独立に選択される2つまでの置換基で置換されていてもよく、
のうち任意のアルキル、シクロアルキル、及びヘテロシクロアルキルは価数が許す範囲でオキソによってさらに置換されていてもよく、
それぞれのRは独立に、存在しないか、C1−3アルキル、ハロゲン、オキソ、−NR、又は−ORであり、
それぞれのRは独立にハロゲン、−CF、C1−3アルキル、−(CH−C3−4シクロアルキル、−(CH−O−C1−3アルキル、−(CH−シアノ、又は−(CH−ヒドロキシであり、ハロゲンは好ましくはFであり好ましくはX及びYを含む5員環に対してパラ位であり、C1−3アルキルは好ましくはメチルであり好ましくはX及びYを含む5員環に対してメタ位であり、好ましくはそれぞれのRは独立にハロゲン、−CF、C1−3アルキル、−(CH−C3−4シクロアルキル、−(CH−O−C1−3アルキル、−(CH−シアノ、又は−(CH−ヒドロキシであり、
それぞれのRは独立にH又はC1−6アルキルであり、
それぞれのRは独立にH又はC1−6アルキルであり、
はH、ハロゲン、又はC1−3アルキルであり、
nは0、1、又は2であり、
それぞれのtは独立に0、1、又は2であり、
それぞれのuは独立に0又は1であり、
A’は4〜7員のシクロアルキル、窒素を含む4〜7員のヘテロシクロアルキルであるか、或いはA’はこれがR’を通じて連結されている環に直接融合していてもよく、好ましくはA’は窒素を含む4〜7員のヘテロシクロアルキルであるか、或いはA’はこれがR’を通じて連結されている環に直接融合していてもよく、
LはC1−3アルキルであり、
R’は水素、C1−3アルキル、又はC3−4シクロアルキルであり、
それぞれのR’は独立にC1−3アルキル、フッ素、ヒドロキシル、C1−3アルコキシ、又はシアノであり、
R’は水素、C1−3アルキル、又はC3−4シクロアルキルであり、
R’は任意選択で1〜3個のR置換基で置換された、1〜3個のヘテロ原子を有する5〜10員のヘテロアリールであり、
R’は水素又は−N(Rであり、
ZはN又は−CRであり、
それぞれのRは独立に水素又はC1−3アルキルであり、
は水素、C1−3アルキル、又はハロゲンであり、
mは0、1、又は2であり、
qは1、2、又は3であり、
R”は任意選択でハロゲン、C1−6アルキル、C1−6アルキルオキシ、C1−6アルキルチオ、C1−6フルオロアルキル、C1−6フルオロアルキルオキシ、及びCNから選択される1つ又は複数の置換基で置換されていてもよいアリール基を表し、
R”はH、C1−3アルキル、−NR”R”、ヒドロキシル、又はC1−4アルキルオキシを表し、
A”は任意選択で1つ又は2つのRで置換されたC1−7−アルキレンを表し、
Bは任意選択でRで置換されたC1−7−アルキレンを表し、
L”はR若しくはRで置換されたN、又はRe1及びR若しくは2つの基Re2で置換されたCを表し、
A”及びBの炭素原子は任意選択で、1つ又は互いに同一であっても異なっていてもよい複数の基Rで置換されており、
、R、及びR
2つの基Rが一緒にC1−6アルキレンを形成することができ、
及びRが一緒に結合又はC1−6アルキレンを形成することができ、
及びRが一緒に結合又はC1−6アルキレンを形成することができ、
及びRが一緒に結合又はC1−6アルキレンを形成することができるように定義され、
はH、C1−6アルキル、C3−7シクロアルキル、C3−7シクロアルキル−C1−6アルキル、C1−6アルキルチオ−C1−6アルキル、C1−6アルキルオキシ−C1−6アルキル、C1−6フルオロアルキル、ベンジル、C1−6アシル、及びヒドロキシ−C1−6アルキルから選択される基を表し、
e1は−NR”R”、又は任意選択で酸素原子を含む環状モノアミンであって、任意選択でF、C1−6アルキル、C1−6アルキルオキシ、及びヒドロキシルから選択される1つ又は複数の置換基で置換された環状モノアミンを表し、
2つの基Re2は、それらを有する炭素原子とともに、任意選択で酸素原子を含む環状モノアミンを形成し、該環状モノアミンは任意選択で1つ又は互いに同一であっても異なっていてもよい複数のRで置換されており、
はC1−6アルキル、C3−7シクロアルキル、C3−7シクロアルキル C1−6アルキル、C1−6アルキルオキシ−C1−6アルキル、ヒドロキシ−C1−6アルキル、C1−6フルオロアルキル、又はベンジルを表し、
R”及びR”はそれぞれ独立にH、C1−4アルキル、C3−7シクロアルキル、又はC3−7シクロアルキル−C1−6アルキルを表し、
はO及びNQから選択されるが、ただしXがNQの場合にはQ及びQは窒素原子及びこれらがそれぞれ結合している隣接する炭素原子とともに、炭素原子及びN、NQ、O、Sから選択される0〜3個の追加のヘテロ原子を含み1〜5個のQ10で置換されたヘテロ環を形成し、
は任意選択でハロゲン、OH、CN、及びNQで置換されたC1−4アルキルであるか、又はQは0〜5個のQ11で置換された−(CQ−カルボシクリル、並びに炭素原子及びN、NQ、O、Sから選択される1〜4個のヘテロ原子を含み0〜5個のQ11で置換された−(CQ−ヘテロシクリルであり、
はH、C1−4アルキル、ハロゲン、CN、アリール、及びヘテロアリールから選択され、
はH及びC1−4アルキルから選択され、
はH、C1−4アルキル、ハロゲン、及びCNから選択され、
はH、0〜4個のQで置換されたC1−4アルキル、0〜4個のQで置換された−(CH−C3−6カルボシクリル、並びに炭素原子及びN、O、Sから選択される1〜3個のヘテロ原子を含み0〜4個のQで置換された−(CH−ヘテロシクリルであり、
は0〜3個のQで置換されたアリールであり、
はH、0〜3個のQで置換されたC1−4アルキル、−(CHCN、−(CHOQ、−(CHS(O)、−(CHC(=O)Q、−(CHNQ、−(CHC(=O)NQ、0〜3個のQで置換された−(CHC(=O)−C1−4アルキル、−(CHNQC(=O)Q、−(CHNQC(=O)OQ、−(CHOC(=O)NQ、−(CHNQC(=O)NQ、−(CHC(=O)OQ、−(CHS(O)NQ、−(CHNQS(O)NQ、−(CHNQS(O)、0〜3個のQeで置換された−(CH−カルボシクリル、及び0〜3個のQで置換された−(CH−ヘテロシクリルから選択され、
はH、−C(=O)Q、0〜5個のQで置換されたC1−6アルキル、0〜5個のQeで置換された−(CH−C3−6カルボシクリル、及び0〜5個のQで置換された−(CH−ヘテロシクリルから選択され、
10はH、0〜3個のQで置換されたC1−6アルキル、−(CHNQ、−(CHC(=O)Q、−(CHC(=O)OQ、−(CHC(=O)NQ、−S(O)、0〜3個のQで置換された−(CH)C3−6カルボシクリル、及び0〜3個のQで置換された−(CH−ヘテロシクリルから選択され、
それぞれのQ11は独立にH、ハロゲン、=O、CN、NO、−OQ、−S(O)、−C(=O)Q、−(CQNQ、−(CQC(=O)NQ、−NQC(=O)Q、−NQC(=O)OQ、−OC(=O)NQ、−NQC(=O)NQ、−(CQC(=O)OQ、−S(O)NQ、−NQS(O)NQ、−NQS(O)、0〜5個のQで置換されたC1−6アルキル、0〜5個のQで置換された−(CQ−C3−6カルボシクリル、及び0〜5個のQで置換された−(CQ−ヘテロシクリルから選択され、
それぞれのQは独立にH、CN、0〜5個のQで置換されたC1−6アルキル、0〜5個のQで置換されたC2−6アルケニル、0〜5個のQで置換されたC2−6アルキニル、0〜5個のQで置換された−(CH−C3−10カルボシクリル、及び0〜5個のQで置換された−(CH−ヘテロシクリルから選択され、又はQが2個の場合にはこれらが両方とも結合している窒素原子とともに0〜5個のQで置換されたヘテロ環を形成し、
それぞれのQは独立にH、0〜5個のQで置換されたC1−6アルキル、0〜5個のQで置換されたC2−6アルケニル、0〜5個のQで置換されたC2−6アルキニル、0〜5個のQで置換された−(CH−C3−10カルボシクリル、及び0〜5個のQで置換された−(CH−ヘテロシクリルから選択され、
それぞれのQは独立に0〜5個のQで置換されたC1−6アルキル、0〜5個のQで置換されたC2−6アルケニル、0〜5個のQで置換されたC2−6アルキニル、0〜5個のQで置換されたC3−6カルボシクリル、及び0〜5個のQで置換されたヘテロシクリルから選択され、
それぞれのQは独立にH及び0〜5個のQで置換されたC1−4アルキルから選択され、
それぞれのQは独立に0〜5個のQで置換されたC1−6アルキル、C2−6アルケニル、C2−6アルキニル、−(CH−C3−6シクロアルキル、ハロゲン、CN、NO、=O、COH、−(CHOQ、SQ、及び−(CHNQから選択され、
それぞれのQは独立にH、F、C1−5アルキル、C3−6シクロアルキル、及びフェニルから選択され、又はQが2個の場合にはこれらが両方とも結合している窒素原子とともに任意選択でC1−4アルキルで置換されたヘテロ環を形成し、
それぞれのpは独立に0、1、又は2であり、
それぞれのrは独立に0、1、2、3、又は4であり、
は−NH−、−CH−、−CH(Ph)−、−CHCH−、−CHCH(Ph)−、−CH=CH−、−CHOCH−、−CHNHC(O)−、−CHNHC(O)CH(Ph)−、及び−CHNHC(O)CH−から選択され、
Q’はQ’、ハロゲン、−CF、−OCF、−OQ’、−COQ’、−SON(Q’、及び−NOから選択され、
Q’、Q’、Q’、及びQ’は独立にH、ハロゲン、C1−6アルコキシ、−NH、−NHQ’、−CN、−NO、−OCF3、及び−COQ’から選択され、
Q’はH及びC1−6アルキルから選択され、Xが−CH(Ph)−、−CHCH(Ph)−、又は−CHNHC(O)CH(Ph)−の場合にはQ’、Q’、Q’、及びQ’はHである)
を有しているか、又はそのアイソマー若しくは薬学的に許容できる塩である。
本発明による使用のためのCK1阻害剤はSR−3029であってもよい。
好ましい実施形態では、本発明による使用のためのCK1阻害剤は一般式(la)若しくは(lb)、又はそのアイソマー若しくは薬学的に許容できる塩であり、X、Y、A、R、R、R、R、R、R、R、n、t、u、A’、L、R’、R’、R’、R’、R’、Z、R、R、m、及びqは上で定義した通りである。さらに好ましい実施形態では、CK1阻害剤は一般式(la)、又はそのアイソマー若しくはその薬学的に許容できる塩であり、X、Y、A、R、R、R、R、R、R、R、n、t、u、A’、L、R’、R’、R’、R’、R’、Z、R、R、m、及びqは上で定義した通りである。さらに好ましい実施形態では、CK1阻害剤は一般式(lb)、又はそのアイソマー若しくは薬学的に許容できる塩であり、X、Y、A、R、R、R、R、R、R、R、n、t、u、A’、L、R’、R’、R’、R’、R’、Z、R、R、m、及びqは上で定義した通りである。このクラスのCK1阻害剤はそれ自体、当技術で既知であり、それらのより詳細な構造及び合成は、たとえば国際公開第2011/051858号、国際公開第2012/085721号、及び国際公開第2015/119579号に記載されている。
このクラスのCK1阻害剤はアゾールコアを含んでいる。本態様の好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ1阻害剤はアゾールコアを含むクラスのものである。より好ましくは、使用のためのこれらのCK1阻害剤は4−アリール−5−ヘテロアリール−1−ヘテロシクロアルキル−イミダゾール部分を含む。好ましくは、これらの阻害剤について、アゾールコアのパラ位に単一のRが存在し、より好ましくはこのRはFである。したがって、さらにより好ましい実施形態では、本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤は4−ハロフェニル部分、好ましくは4−フルオロフェニル部分に連結されたアゾールコアを含む。アゾールコアを含む極めて好ましい化合物は表3に示す化合物D、E、F、及びGであり、化合物Dがさらにより好ましい。
好ましい実施形態では、本発明による使用のためのCK1阻害剤は一般式(2a)若しくは(2b)、又はそのアイソマー若しくは薬学的に許容できる塩であり、R、R、R”、R”、A”、B、L”、R、R、R、R、Re1、Re2、R、R”、R”、X、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q10、Q11、Q、Q、Q、Q、Q、Q、r、及びPは上で定義した通りである。さらに好ましい実施形態では、CK1阻害剤は一般式(2a)、又はそのアイソマー若しくは薬学的に許容できる塩であり、R、R、R”、R”、A”、B、L”、R、R、R、R、Re1、Re2、R、R”、R”、X、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q10、Q11、Q、Q、Q、Q、Q、Q、P、及びrは上で定義した通りである。さらに好ましい実施形態では、CK1阻害剤は一般式(2b)、又はそのアイソマー若しくは薬学的に許容できる塩であり、R、R、R”、R”、A”、B、L”、R、R、R、R、Re1、Re2、R、R”、R”、X、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q10、Q11、Q、Q、Q、Q、Q、Q、P、及びrは上で定義した通りである。このクラスのCK1阻害剤はそれ自体、当技術で既知であり、それらのより詳細な構造及び合成は、たとえば国際公開第2009/016286号及び国際公開第2015/195880号に記載されている。
このクラスのCK1阻害剤はシクロ−3−(ピリド−4−イル)イミダゾ[l,2−b]ピリダジンコアを含んでいる。本態様の好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ1阻害剤はシクロ−3−(ピリド−4−イル)イミダゾ[l,2−b]ピリダジンコアを含むクラスのものである。さらに好ましい実施形態では、本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤はアゾールコアを含むか、又はシクロ−3−(ピリド−4−イル)イミダゾ[l,2−b]ピリダジンコアを含む。さらに好ましい実施形態では、本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤は一般式(1a)、(1b)、(2a)、又は(2b)のものであり、X、Y、A、R、R、R、R、R、R、R、n、t、u、A’、L、R’、R’、R’、R’、R’、Z、R、R、m、q、R”、R”、A”、B、L”、R、R、R、R、Re1、Re2、R、R”、R”、X、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q、Q10、Q11、Q、Q、Q、Q、Q、Q、r、及びPは上で定義した通りである。
好ましい実施形態では、本発明による使用のためのCK1阻害剤は一般式(3)、又はそのアイソマー若しくは薬学的に許容できる塩であり、X、Q’、Q’、Q’、Q’、Q’、及びQ’は上で定義した通りである。このクラスのCK1阻害剤はそれ自体、当技術で既知であり、それらのより詳細な構造及び合成は、たとえばEP2949651に記載されている。Csk1阻害剤が一般式(3)のものである場合には、Xは好ましくは−CH−、−CHCH−、−CH(Ph)−、又は−NH−、最も好ましくは−CH−であり、Q’は好ましくは−CF、ハロゲン、又はC1−6アルキル、より好ましくは−CFであり、Q’、Q’、Q’、及びQ’は好ましくは独立にH、ハロゲン、及びC1−5アルコキシから選択される。より好ましくは、CK1阻害剤が一般式(3)のものである場合には、Xは−CH−であり、Q’は−CFである。
例示的なCK1阻害剤の構造を表3に示す。さらに好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのCK1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ1阻害剤は化合物A、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L、M、N、O、SR−3029、PF−670462、及びPF−5006739からなる群から選択される。化合物OはTA−01としても知られている。より好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は化合物A、B、C、D、E、F、G、H、O、SR−3029、PF−670462、及びPF−5006739からなる群から選択される。さらにより好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は化合物A、D、F、G、H、O、SR−3029、PF−670462、及びPF−5006739からなる群から選択される。さらにより好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は化合物A、D、F、G、H、SR−3029、PF−670462、及びPF−5006739からなる群から選択される。最も好ましくは、カゼインキナーゼ1阻害剤は化合物A、D、F、G、H、SR−3029、及びPF−5006739からなる群から選択される。カゼインキナーゼ1阻害剤は化合物Dであることも極めて好ましい。カゼインキナーゼ1阻害剤が化合物A、B、及びHからなる群から選択されることも極めて好ましく、より好ましくはこれは化合物Hである。
他の実施形態では、本発明による使用のためのCK1阻害剤は阻害抗体、アンチセンスオリゴヌクレオチド、又はCK1の発現を防止するオリゴヌクレオチドである。
カゼインキナーゼ1の種々のアイソフォームは異なった機能を有していることが知られている。既知のアイソフォームの組の中で、CK1δ及びCK1εが本発明によるCK1阻害剤の好ましいターゲットである。これら2つのアイソフォームは互いに緊密に関連していることが知られている。たとえば、CK1δ及びCK1εはサーカディアンサイクル長とタンパク質の安定性において一般に冗長であると考えられていたが、僅かに異なった機能を有していることが後に明らかになった(Etchegaray JPら、2009、DOI:10.1128/MCB.00338-09)。それらの生理学的重要性、及び本発明における使用のためのCK1阻害剤の既知の有効性から、本発明の好ましい実施形態は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ阻害剤は少なくともカゼインキナーゼ1δ又はカゼインキナーゼ1εを阻害する。任意選択で、カゼインキナーゼ阻害剤はカゼインキナーゼ1δ又はカゼインキナーゼ1εに特異的である。さらに、より好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ阻害剤は少なくともカゼインキナーゼ1δを阻害し、任意選択でカゼインキナーゼ1δに特異的である。他のより好ましい実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ阻害剤は少なくともカゼインキナーゼ1εを阻害し、任意選択でカゼインキナーゼ1εに特異的である。他の実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ阻害剤は少なくともカゼインキナーゼ1αを阻害し、任意選択でカゼインキナーゼ1αに特異的である。他の実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ阻害剤は少なくともカゼインキナーゼ1βを阻害し、任意選択でカゼインキナーゼ1βに特異的である。他の実施形態では、本発明は本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤を提供し、カゼインキナーゼ阻害剤は少なくともカゼインキナーゼ1γ1、1γ2、及び/又は1γ3を阻害し、任意選択でカゼインキナーゼ1γ1、1γ2、及び/又は1γ3に特異的である。これに関して、CK1阻害剤が特定のアイソフォームを少なくとも部分的に阻害する場合には、CK1阻害剤はその特定のアイソフォームに対して特異的であることを理解されたい。好ましくは、そのCK1阻害剤は他のアイソフォームより効率的にその特定のアイソフォームを阻害する。
本発明における使用のために好適なCK1阻害剤はカゼインキナーゼに対して好ましくは多くとも650nM、好ましくは多くとも500nM、より好ましくは多くとも400nM、さらにより好ましくは多くとも300nM、さらにより好ましくは多くとも250nM、さらにより好ましくは多くとも200nM、最も好ましくは多くとも100nMのIC50を有する。好ましい実施形態では、CK1阻害剤は少なくともカゼインキナーゼ1δ又はカゼインキナーゼ1εに対して多くとも450nM、より好ましくは多くとも400nM、さらにより好ましくは多くとも350nM、さらにより好ましくは多くとも200nM、さらにより好ましくは多くとも100nM、最も好ましくは多くとも50nMのIC50を有する。最も好ましい実施形態では、CK1阻害剤はカゼインキナーゼ1δに対して多くとも350nM、好ましくは多くとも100nM、より好ましくは多くとも35nM、最も好ましくは多くとも25nMのIC50を有する。CK1に対するIC50値は当技術で既知の任意の方法、たとえば国際公開第2011/051858号、国際公開第2015/119579号、EP2949651、又は米国特許出願公開第2005/0131012号に記載されている方法を用いて決定することができる。好適なアッセイでは、たとえばKinase−Gloアッセイ(Promega、part # V672A)を用いるペプチド基質及び読み取り法を用いることができる。
組成物
さらなる態様では、本発明は本発明による使用のための少なくとも1つのCK1阻害剤及び薬学的に許容できる賦形剤を含む組成物を提供する。該組成物は本明細書において本発明による使用のための組成物と称する。本発明による使用のための好ましい組成物は薬学的組成物である。好ましい実施形態では、本発明による使用のための組成物は経口、舌下、非経口、血管内、静脈内、皮下、又は経皮投与、任意選択で吸入による投与のため、好ましくは経口投与のために製剤化される。投与方法のさらなる特徴及び定義は製剤及び投与の部で提供する。
製剤及び投与
上述の化合物を含む組成物は、医療用又は化粧用の調製物、又は病人食及び栄養補助食品を含むヒト又は動物の食料等の他の種々の媒体として調製することができる。「病人食」は、そのために特別の栄養的要求が存在する疾患又は病態を特別に食事管理することを意図した製品である。例として、限定はしないが、病人食には栄養チューブを通して供給される(腸内投与と称される)ビタミン及びミネラル製剤が含まれてもよい。「栄養補助食品」は、ヒトの食事を補助することを意図し、典型的にはピル、カプセル、錠剤、又は同様の製剤の形態で提供される製品を意味する。例として、限定はしないが、栄養補助食品には以下の成分、即ちビタミン、ミネラル、ハーブ、植物、アミノ酸、全体の食事摂取を増大することによって食事を補助することを意図した食事物質、並びに上記のいずれかの濃縮物、代謝物、成分、抽出物、又は組み合わせのうちの1つ又は複数が含まれてもよい。栄養補助食品は、フードバー、飲料、粉末、シリアル、調理済み食品、食品添加物、及びキャンディ、又は健康を増進し、又はDUX4の発現若しくは活性を伴う変性疾患の進行を防止し若しくは停止させるために設計されたその他の機能性食品を含むがこれらに限定されない食品に組み込んでもよい。
主題の組成物はしたがって、食物を含むがこれに限定されない経口摂取できるその他の生理学的に許容できる材料と混ぜ合わせることができる。さらに又は或いは、本明細書に記載した使用のための組成物は食物の投与と組み合わせて(別々に)経口投与してもよい。
組成物は単独で、又は他の薬学的若しくは化粧品用の薬剤と組み合わせて投与してもよく、その生理学的に許容できる担体と組み合わせることができる。特に、本明細書に記載した化合物は、薬学的若しくは生理学的に許容できる賦形剤、担体、及びビヒクル等の添加物とともに製剤化することによって、薬学的又は化粧品用組成物として製剤化することができる。好適な薬学的若しくは生理学的に許容できる賦形剤、担体、及びビヒクルには、たとえばリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、タルク、単糖類、二糖類、デンプン、ゼラチン、セルロース、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム、デキストロース、ヒドロキシプロピル−P−シクロデキストリン、ポリビニルピロリジノン、低融点ワックス、イオン交換樹脂、その他、並びにこれらの任意の2つ以上の組み合わせ等の加工剤並びに薬剤送達の改変剤及び促進剤が含まれる。その他の好適な薬学的に許容できる賦形剤は、参照により本明細書に組み込まれる「Remington's Pharmaceutical Sciences」、MackPub. Co.、New Jersey (1991)、及び「Remington:The Science and Practice of Pharmacy」、LippincottWilliams & Wilkins、Philadelphia、20版(2003)、21版(2005)及び22版(2012)に記載されている。
CK1を阻害する多くの分子がp38をも阻害できることが知られている。p38マイトゲン活性化タンパク質キナーゼはサイトカイン、紫外線照射、ヒートショック、及び浸透圧ショック等のストレス刺激に応答するマイトゲン活性化タンパク質キナーゼ(MAPK)の1クラスであり、細胞の分化、サイトカインの分泌、アポトーシス、及びオートファジーに関与している。加齢による筋肉衛星細胞(筋肉幹細胞)におけるp38 MAPK経路の持続的な活性化が筋肉の再生を障害することが知られている。好ましい実施形態では、CK1阻害剤はp38阻害剤でもある。
p38とCK1の相同性によって、本発明はDUX4の発現を伴う疾患又は病態の治療における使用のためのp38阻害剤をも提供し、p38阻害剤はDUX4の発現を低減する。これはこれ以降、本発明による使用のためのp38阻害剤と称する。p38阻害剤は当技術で既知である。正確な分子構造を除いて、本発明による使用の用語及び特徴は本発明による使用のためのCK1阻害剤について定義した通りである。
好適なp38阻害剤の例としては、ARRY−797(CHEMBL1088750,CAS:1036404−17−7)、LOSMAPIMOD(CHEMBL1088752,CAS:585543−15−3)、AZD−7624(CHEMBL9960,CAS:1095004−78−6)、DORAMAPIMOD(CHEMBL103667)、NEFLAMAPIMOD(CHEMBL119385,CAS:209410−46−8)、TAK−715(CHEMBL363648,CAS:303162−79−0)、TALMAPIMOD(CHEMBL514201,CAS:309913−83−5)、PAMAPIMOD(CHEMBL1090089,CAS:449811−01−2)、VX−702(CHEMBL1090090,CAS:745833−23−2)、PH−797804(CHEMBL1088751,CAS:586379−66−0)、BMS−582949(CHEMBL1230065,CAS:623152−17−0)、PF−03715455(CHEMBL1938400,CAS:1056164−52−3)、DILMAPIMOD(CHEMBL2103838,CAS:444606−18−2)、SEMAPIMOD(CHEMBL2107779,CAS:352513−83−8)、RALIMETINIB(CHEMBL2364626,CAS:862505−00−8)、FX−005(CHEMBL3545216,CAS:2016822−86−7)、ACUMAPIMOD(CHEMBL3545226,CAS:836683−15−9)、KC−706(CHEMBL3545282,CAS:896462−15−0)、PG−760564(CHEMBL3545398)、RWJ−67657(CHEMBL190333,CAS:215303−72−3)、RO−3201195(CHEMBL203567,CAS:249937−52−8)、AMG−548(CHEMBL585902,CAS:864249−60−5)、SD−0006(CHEMBL1090173)、SCIO−323(CHEMBL1614702,CAS:309913−51−7)、R−1487(CHEMBL1766582,CAS:449808−64−4)、AZD−6703(CHEMBL2031465,CAS:1083381−65−0)、SC−80036(CHEMBL3544930)、GSK−610677(CHEMBL3544968,CAS:2016840−17−6)、LY−3007113(CHEMBL3544998)、LEO−15520(CHEMBL3545074)、AVE−9940(CHEMBL3545117,CAS:1201685−00−8)、PS−516895(CHEMBL3545139)、TA−5493(CHEMBL3545201,CAS:1073666−93−9)、PEXMETINIB(ARRY614)(CHEMBL3545297,CAS:945614−12−0)、SB−85635(CHEMBL3545384)、及びCK1阻害剤が挙げられる。
本発明による使用のための組成物は当技術で公知のプロセスによって、たとえば従来の混合、溶解、顆粒化、糖衣錠製造、湿式粉砕、乳化、カプセル化、包括、又は凍結乾燥プロセスによって製造することができ、それにより、リポソーム製剤、コアセルベート、水中油エマルジョン、ナノ粒子/ミクロ粒子粉末、又は任意の他の形状若しくは形態が得られ得る。したがって、本発明による使用のための組成物は、活性化合物を薬学的に使用可能な調製物に加工することを助ける賦形剤及び補助剤を含む1つ又は複数の生理学的に許容できる担体を用いて従来の方法で製剤化することができる。適当な製剤は選択した投与経路による。
注射用としては、本発明による使用のためのCK1阻害剤及び組成物は水溶液、好ましくはハンクス液、リンゲル液、又は生理学的食塩緩衝液等の生理学的に親和性のある緩衝液の中で製剤化され得る。経粘膜投与用としては、透過すべきバリアに適切な浸透剤が製剤中で用いられる。そのような浸透剤は当技術で一般に既知である。
使用のためのCK1阻害剤及び組成物が当技術で公知の薬学的に許容できる担体と組み合わせることによって、又は食品添加物として用いることによって製剤化される場合には、経口及び非経口投与が用いられ得る。そのような戦略によって、本発明による使用のためのCK1阻害剤及び組成物は、治療される対象が経口摂取するための錠剤、ピル、糖衣錠、カプセル、液体、ゲル、シロップ、スラリー、懸濁液、その他として製剤化されることが可能になる。経口使用のための調製物又は薬理学的調製物は、固形賦形剤を用いて、錠剤又は糖衣錠のコアを得るために所望であれば好適な補助剤を添加した後で、得られる混合物を任意選択で摩砕し、顆粒の混合物を処理することによって作製することができる。好適な賦形剤は特に、充填剤、たとえばラクトース、スクロース、マンニトール、若しくはソルビトールを含む糖類、セルロース調製物、たとえばトウモロコシデンプン、コムギデンプン、コメデンプン、ジャガイモデンプン、ゼラチン、トラガカントガム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム、及び/又はポリビニルピロリドン(PVP)である。所望であれば、架橋ポリビニルピロリドン、寒天、又はアルギン酸若しくはアルギン酸ナトリウム等のアルギン酸塩等の崩壊剤を添加してもよい。さらに、当技術で既知の取り込み促進剤と共製剤化してもよい。
糖衣錠コアには好適なコーティングが提供される。この目的のために濃縮砂糖溶液を用いることができ、これは任意選択でアラビアゴム、タルク、PVP、カルボポールゲル、ポリエチレングリコール、及び/又は二酸化チタン、ラッカー溶液、及び好適な有機溶媒又は溶媒混合物を含んでもよい。ポリメタクリレートを用いてpH応答性放出プロファイルを提供し、それにより胃を通過させるようにしてもよい。識別のため、又は異なった組み合わせの活性CK1阻害剤の用量を特徴付けるために、錠剤又は糖衣錠コーティングに染料又は顔料を添加してもよい。
経口投与できるCK1阻害剤及び組成物には、ゼラチンから作られた押し込み式カプセル、並びにゼラチンとグリセロール若しくはソルビトール等の可塑剤とから作られたシールされたソフトカプセルが含まれる。押し込み式カプセルはラクトース等の充填剤、デンプン等のバインダー、及び/又はタルク若しくはステアリン酸マグネシウム等の滑沢剤、並びに任意選択で安定剤と混合して活性成分を含んでもよい。ソフトカプセルでは、活性化合物は脂肪油、液体パラフィン、又は液状ポリエチレングリコール等の好適な液体中に溶解又は懸濁してもよい。さらに、安定剤を添加してもよい。経口投与のための全ての製剤はそのような投与に好適な用量とすべきである。
頬への投与のためには、本発明による使用のためのCK1阻害剤及び組成物は、従来の方式で製剤化された錠剤又はトローチの形態で投与されてもよい。
本発明による使用のためのCK1阻害剤及び組成物は注射、たとえば急速静脈注射又は連続注入による非経口投与のために製剤化されてもよい。このようにして、特定の器官、組織、腫瘍部位、炎症部位、その他をターゲットとすることも可能である。感染のための製剤は単位用量形態、たとえばアンプル又は多用量容器に、添加した保存剤とともに提供されてもよい。組成物は懸濁液、溶液、又は油性若しくは水性ビヒクルの中のエマルジョンの形態としてもよく、懸濁剤、安定剤、及び/又は分散剤等の調合用薬剤を含んでもよい。この製剤は筋肉組織への特異的ターゲティングを可能にするので好ましい。
非経口投与のための組成物には水溶性の形態の組成物の水溶液が含まれる。さらに、懸濁液は適切な油性注射用懸濁液として調製してもよい。好適な親油性溶媒又はビヒクルには、ゴマ油等の脂肪油、又はオレイン酸エチル若しくはトリグリセリド等の合成脂肪酸エステル、又はリポソームが含まれる。水性注射用懸濁液はカルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトール、又はデキストラン等の懸濁液の粘度を上昇させる物質を含んでもよい。任意選択で、懸濁液は高濃度の溶液の調製を可能にするために組成物の溶解度を上昇させる好適な安定剤又は薬剤を含んでもよい。
或いは、組成物の1つ又は複数の成分は、使用前に好適なビヒクル、たとえば無菌パイロジェンフリー水と構成するための粉末状であってもよい。
本発明による使用のための組成物は、たとえばココアバター又は他のグリセリド等の従来の坐剤用基剤を含む坐剤又は浣腸剤等の直腸用組成物として製剤化してもよい。
先に述べた製剤に加えて、本発明による使用のためのCK1阻害剤及び組成物はデポ調製物として製剤化してもよい。そのような長期作用型製剤は埋め込み(たとえば皮下又は筋肉内)又は筋肉内注射によって投与してもよい。したがって、これらはたとえば好適なポリマー性若しくは疎水性材料とともに(たとえば許容できる油の中のエマルジョンとして)、又は体内で自己分解し、若しくは自己分解しない固体又は半固体のインプラントの一部として、又はイオン交換樹脂として製剤化してもよく、或いは組成物の1つ若しくは複数の成分は難溶性誘導体、たとえば難溶性塩として製剤化することができる。好適なポリマー性材料の例は当業者には既知であり、PLGA及びポリカプロン酸等のポリラクトンが含まれる。
本発明による使用のための組成物は好適な固体又はゲル相の担体又は賦形剤を含んでもよい。そのような担体又は賦形剤の例には、それだけに限らないが、炭酸カルシウム、リン酸カルシウム、種々の糖類、デンプン、セルロース誘導体、ゼラチン、及びポリエチレングリコール等のポリマーが含まれる。
本発明による使用のための組成物は、経皮パッチの中に含まれてもよい。本発明による使用のための好ましい経皮パッチは、単層の薬剤含有接着剤パッチ、又は多層の薬剤含有接着剤パッチ、又はリザーバーパッチ、又はマトリックスパッチ、又は蒸気パッチから選択される。
本発明による使用のための組成物はCK1阻害剤及び組成物を含み、活性成分はその意図された目的を達成するために有効な量で含まれる。より詳細には、治療有効量は疾患の原因又は症状を防止し、安定化し、緩和し、回復させ、若しくは改善するため、又は治療される対象の生存、可動性、若しくは自立を延長するために有効な化合物の量を意味する。治療有効量の決定は、特に本明細書で提供する詳細な開示に照らせば、当業者の能力の範囲内である。本発明で用いるいずれのCK1阻害剤及び組成物についても、治療有効量又は用量は、たとえば本明細書で例示するように、最初に細胞培養アッセイから推定することができる。用量は採用する用量形態及び利用する投与経路に応じてこの範囲の中で変動し得る。正確な製剤、投与経路、及び用量は、個別の臨床医が患者の病態を考慮して選択することができる(たとえばFinglら、1975、「ThePharmacological Basis of Therapeutics」第1章、1頁を参照されたい)。投与されるCK1阻害剤及び組成物の量は、もちろん治療される対象、対象の体重、苦痛の重篤度、投与の方法、及び処方する臨床医の判断によることになる。
本発明による使用のための組成物は、本発明による使用のためのCK1阻害剤及び本明細書で定義する他の成分の1つ又は複数が同じ容器の中で、溶液中、懸濁液中、又は粉末状であるように供給してもよい。本発明による使用のための組成物は、全ての成分を互いに別々に提供し、たとえば投与の前に互いに混合されるように、又は別々に若しくは連続して投与されるように、提供してもよい。とりわけ投与の経路及び機序に応じて種々の包装オプションが可能であり、当業者には既知である。上述の投与方法に照らして、本発明は経口、舌下、血管内、静脈内、皮下、経皮、又は任意選択で吸入によって、好ましくは経口によって投与されることを特徴とする、本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤、又は本発明による使用のための組成物を提供する。
CK1阻害剤又は組成物の「有効量」は、対象に投与したときに、疾患の1つ又は複数の症状を低減し若しくは排除し、又は疾患の1つ又は複数の症状の進行を遅延させ、又は疾患の1つ又は複数の症状の重篤度を低減し、又は疾患の発症を抑制し、又は疾患の有害症状の発症を抑制するために十分な量である。有効量は1回又は複数の投与で得ることができる。
単一用量形態を生成するために担体材料と組み合わせることができる「有効量」は、活性成分が投与される宿主及び特定の投与モードに応じて変動することになる。選択される単位用量は通常、血液中の化合物の所望の最終濃度が得られるように製造され、投与される。
有効量(即ち、有効全日用量)は、好ましくは成人に対して、全日用量約0.01〜2000mg、又は約0.01〜1000mg、又は約0.01〜500mg、又は約5〜1000mg、又は約20〜800mg、又は約30〜800mg、又は約30〜700mg、又は約20〜700mg、又は約20〜600mg、又は約30〜600mg、又は約30〜500mg、又は約30〜450mg、又は約30〜400mg、又は約30〜350mg、又は約30〜300mg、又は約50〜600mg、又は約50〜500mg、又は約50〜450mg、又は約50〜400mg、又は約50〜300mg、又は約50〜250mg、又は約100〜250mg、又は約150〜250mgとして本明細書で定義される。最も好ましい実施形態では、有効量は約200mgである。好ましい実施形態では、本発明は0.1〜1500mg/日、好ましくは0.1〜1000mg/日、より好ましくは0.1〜400mg/日、さらにより好ましくは0.25〜150mg/日、たとえば約100mg/日の範囲の量で対象に投与されることを特徴とする、本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤又は本発明による使用のための組成物を提供する。
或いは、有効量の化合物は、好ましくは成人に対して、好ましくは体重1kgあたりで投与される。したがって、全日用量は、好ましくは成人に対して、約0.05〜約40mg/kg、約0.1〜約20mg/kg、約0.2mg/kg〜約15mg/kg、又は約0.3mg/kg〜約15mg/kg、又は約0.4mg/kg〜約15mg/kg、又は約0.5mg/kg〜約14mg/kg、又は約0.3mg/kg〜約14mg/kg、又は約0.3mg/kg〜約13mg/kg、又は約0.5mg/kg〜約13mg/kg、又は約0.5mg/kg〜約11mg/kgである。
小児に対する全日用量は好ましくは多くとも200mgである。より好ましくは全日用量は約0.1〜200mg、約1〜200mg、約5〜200mg、約20〜200mg、約40〜200mg、又は約50〜200mgである。好ましくは、小児に対する全日用量は約0.1〜150mg、約1〜150mg、約5〜150mg、約10〜150mg、約40〜150mg、又は約50〜150mgである。より好ましくは、全日用量は約5〜100mg、約10〜100mg、約20〜100mg、約30〜100mg、約40〜100mg、又は約50〜100mgである。さらにより好ましくは、全日用量は約5〜75mg、約10〜75mg、約20〜75mg、約30〜75mg、約40〜75mg、又は約50〜75mgである。
用いることができる用量の代替例は、約0.1μg/kg〜約300mg/kg、又は約1.0μg/kg〜約40mg/kg体重、又は約1.0μg/kg〜約20mg/kg体重、又は約1.0μg/kg〜約10mg/kg体重、又は約10.0μg/kg〜約10mg/kg体重、又は約100μg/kg〜約10mg/kg体重、又は約1.0mg/kg〜約10mg/kg体重、又は約10mg/kg〜約100mg/kg体重、又は約50mg/kg〜約150mg/kg体重、又は約100mg/kg〜約200mg/kg体重、又は約150mg/kg〜約250mg/kg体重、又は約200mg/kg〜約300mg/kg体重、又は約250mg/kg〜約300mg/kg体重、の用量範囲内の本発明による使用のための化合物の有効量である。用いることができる他の用量は、約0.01mg/kg体重、約0.1mg/kg体重、約1mg/kg体重、約10mg/kg体重、約20mg/kg体重、約30mg/kg体重、約40mg/kg体重、約50mg/kg体重、約75mg/kg体重、約100mg/kg体重、約125mg/kg体重、約150mg/kg体重、約175mg/kg体重、約200mg/kg体重、約225mg/kg体重、約250mg/kg体重、約275mg/kg体重、又は約300mg/kg体重である。
本発明による使用のための化合物又は組成物は、単一の日用量で投与してもよく、又は全日用量を1日2回、3回、又は4回の分割用量で投与してもよい。
本発明の好ましい実施形態では、「対象」、「個体」、又は「患者」は、個別の生命体、好ましくは脊椎動物、より好ましくは哺乳類、さらにより好ましくは霊長類、最も好ましくはヒトであると理解される。
本発明のさらに好ましい実施形態では、ヒトは成人、たとえば18歳以上の人である。さらに、成人の平均体重は62kgであることが本明細書で理解される。ただし平均体重は国によって変動することが知られている。したがって本発明の別の実施形態では成人の平均体重は約50〜90kgの間である。本明細書で定義した有効用量は平均体重を有する対象に限られないことが本明細書で理解される。好ましくは、対象は18.0〜40.0kg/mのBMI(肥満度指数)、より好ましくは18.0〜30.0kg/mのBMIを有する。
或いは、治療される対象は小児、たとえば17歳以下の人である。さらに、治療され対象は誕生と思春期との間、又は思春期と成人期との間の人であってもよい。思春期は女性では10〜11歳、男性では11〜12歳で始まることが本明細書で理解される。さらに、治療される対象は新生児(生後最初の28日間)、乳児(0〜1歳)、幼児(1〜3歳)、学齢前(3〜5歳)、学齢期小児(5〜12歳)、又は青年(13〜18歳)であってもよい。
治療の間の効果的な範囲を維持するため、CK1阻害剤又は組成物は1日1回、又は2日、3日、4日、若しくは5日に1回、投与してもよい。しかし好ましくは、化合物は少なくとも1日1回投与してもよい。したがって好ましい実施形態では、本発明は1日あたり4回、3回、2回、1回又はそれ未満、好ましくは1日1回、対象に投与されることを特徴とする、本発明による使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤、又は本発明による使用のための組成物に関する。全日用量は単一の日用量として投与してもよい。或いは、化合物は少なくとも1日2回投与される。したがって、本明細書で定義した化合物は1日に1回、2回、3回、4回、又は5回投与してもよい。したがって、全日用量をいくつかの用量(単位)に分割して本明細書で定義した全日用量が投与されるようにしてもよい。好ましい実施形態では、化合物は1日2回投与される。用語「1日2回」、「bid」、及び「bis in die」は本明細書において相互交換可能に用いられることがさらに理解される。
好ましい実施形態では、全日用量は1日あたりいくつかの用量に分割される。これらの別々の用量の量は異なってもよい。たとえばそれぞれの全日用量について、最初の用量は2回目の用量よりも化合物の量が多くてもよく、逆でもよい。しかし好ましくは、化合物は同様又は同一の用量で投与される。したがって最も好ましい実施形態では、化合物は1日2回、2つの同様の又は同一の用量で投与される。
本発明のさらに好ましい実施形態では、本明細書で上に定義した化合物の全日用量は少なくとも2つの別々の用量で投与される。少なくとも2つの別々の用量の投与の間隔は少なくとも約0.5、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、又は12時間であり、好ましくは少なくとも2つの別々の用量の間隔は少なくとも約4、5、6、7、8、9、10、11、又は12時間であり、より好ましくは少なくとも2つの別々の用量の間隔は少なくとも約8、9、10、11、又は12時間である。
使用
本発明の一態様では、本発明によるCK1阻害剤又は本発明による組成物の使用が提供される。前記使用はそれを必要とする対象のDUX4の発現を伴う疾患又は病態の治療のためのものであり、本発明によるCK1阻害剤又は組成物の有効用量の対象への投与を含み、CK1阻害剤又は組成物は本明細書で既に定義した通りである。
本態様の一実施形態では、本発明によるCK1阻害剤又は本発明による組成物の使用が提供される。前記使用はそれを必要とする対象における筋ジストロフィー又はがんの治療のためのものであり、本発明によるCK1阻害剤又は組成物の有効用量の対象への投与を含み、CK1阻害剤又は組成物は本明細書で既に定義した通りである。さらなる特徴及び定義は、特に治療すべき疾患又は病態について好ましくは本明細書の別の箇所で定義した通りである。
方法
本発明の一態様はDUX4の発現を低減するためのインビボ、インビトロ、又はエクスビボの方法を提供し、本方法は細胞を本明細書で既に定義したCK1阻害剤又は本明細書で既に定義した組成物と接触させるステップを含む。好ましくは、前記方法はDUX4の発現を伴う筋ジストロフィー又はがん等の疾患又は病態を治療するためのものあり、最も好ましくは前記疾患又は病態は顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー(FSHD)である。本方法は好ましくは本明細書で既に定義した使用を含む。好ましい方法は細胞を本明細書で既に定義したCK1阻害剤と接触させるステップを含む。本発明に関連して、細胞をCK1阻害剤又は組成物と接触させるステップは、そのCK1阻害剤又は組成物を、細胞を培養している培地に添加するステップを含んでもよい。細胞をCK1阻害剤又は組成物と接触させるステップは、そのCK1阻害剤又は組成物を、その中に細胞が懸濁し、若しくは細胞を覆っている培地、緩衝液、又は溶液に添加するステップを含んでもよい。細胞を接触させる他の好ましい方法は、細胞にCK1阻害剤又は組成物を注入するステップ、又は細胞を本発明によるCK1阻害剤又は組成物を含む材料に曝露するステップを含む。投与のためのさらなる方法は、本明細書の別の箇所で定義している。好ましい細胞はDUX4を発現していることが知られている細胞、DUX4を発現している疑いがある細胞、又は本明細書で既に定義した疾患又は病態によって影響を受けていることが知られている細胞である。
本態様の一実施形態では、本方法はインビトロ法である。本態様のさらなる実施形態では、本方法はエクスビボ法である。本態様のさらなる実施形態では、本方法はインビボ法である。本態様の好ましい実施形態では、本方法はインビトロ法又はエクスビボ法である。
本態様の実施形態の中では、細胞は対象から得られた試料からの細胞であってもよい。そのような試料は以前に対象から得られた試料であってもよい。本態様の実施形態の中では、試料は以前にヒト対象から得られたものであってもよい。本態様の実施形態の中では、試料は非ヒト対象から得られたものであってもよい。本態様の好ましい実施形態では、試料を得るステップは本発明による方法の一部ではない。
好ましい実施形態では、本発明による方法は、それを必要とする対象におけるDUX4の発現を低減する方法であり、本方法は本明細書で既に定義したCK1阻害剤又は本明細書で既に定義した組成物の有効量を投与するステップを含む。より好ましい実施形態では、本方法はDUX4の発現を伴う疾患又は病態、好ましくは筋ジストロフィー又はがんの治療のためのものであり、最も好ましくは前記疾患又は病態は顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー(FSHD)である。さらなる特徴及び定義は、好ましくは本明細書の別の箇所で定義した通りである。
一般的定義
本書類及びその特許請求の範囲において、動詞「含む」及びその活用形は、その非限定的意味で、その単語に続く項目は含まれるが、特に言及していない項目は除外していないことを意味するよう使用される。さらに、動詞「からなる」は、「から基本的になる」で置き換えてもよく、本明細書で定義する組み合わせ又は組成物は具体的に特定されたもの以外の(1つ又は複数の)追加の成分を含んでもよく、前記(1つ又は複数の)追加の成分は本発明の独特の特徴を変化させないことを意味する。さらに、不定冠詞「a」又は「an」による要素への言及は、文脈からただ1つの要素のみが存在することが明確に要求されない限り、1つ以上の要素が存在する可能性を除外しない。したがって不定冠詞「a」又は「an」は通常、「少なくとも1つ」を意味する。
構造式又は化学名がキラル中心を有していることが当業者に理解されるが、キラリティが表示されていない場合には、3通り全て、つまりそれぞれのキラル中心についてラセミ混合物、純粋なR鏡像体、及び純粋なS鏡像体のいずれもが個別に言及されていることになる。
本発明に関して物質のパラメーターを論じる際にはいつも、他に特定しない限り、パラメーターは生理学的条件下で決定され、測定され、明示されることを前提とする。生理学的条件は当業者には既知であり、水性溶媒系、大気圧、6〜8の間のpH値、室温〜約37℃(約20℃〜約40℃)の範囲の温度、及び緩衝塩又はその他の成分の好適な濃度を含む。
本書類に記載した医薬としての物質の使用は、医薬の製造における前記物質の使用として解釈することもできる。同様に、物質が治療のため又は医薬として用いられる場合にはいつも、これは治療のための医薬の製造のために用いることもできる。本明細書に記載した医薬としての使用のための製品は治療の方法において用いることができ、そのような治療の方法は使用のための製品の投与を含む。本発明によるCK1阻害剤又は組成物は、好ましくは本発明による方法又は使用における使用のためである。
本出願を通して、発現は遺伝子の機能性mRNAへの転写であると考えられ、それにより酵素若しくは転写因子等のポリペプチド、又はたとえばDUX4ポリペプチドが生成する。ポリペプチドは効果を発揮し、又は活性を有することができる。これに関して、ポリペプチドの発現の増大若しくは低減は、前記ポリペプチドをコードするmRNAのレベルの増大若しくは低減、ポリペプチド分子のレベル若しくは量の増大若しくは低減、又は前記ポリペプチド分子の全活性の増大若しくは低減であると考えることができる。好ましくは、ポリペプチドの発現の増大若しくは低減は、それぞれ前記ポリペプチドの活性の増大若しくは低減をもたらし、これはポリペプチド分子のレベル若しくは量の増大若しくは低減によって引き起こされ得る。より好ましくは、DUX4の発現の低減はDUX4遺伝子の転写の低減、DUX4 mRNAの不安定化若しくは分解、DUX4ポリペプチド分子の量の低減、DUX4ポリペプチド分子の活性の低減、DUX4ポリペプチドの不安定化若しくは分解、又はそれらの組み合わせである。mRNAの不安定化によってそれがコードするポリペプチドの発現が低減し、おそらくその発現をもたらすことができない。分解したmRNAは破壊され、それがコードするポリペプチドを発現することができない。不安定化されたポリペプチドはその効果の発揮が少なく、又は不安定化されなかった同じポリペプチドよりも活性が低く、おそらく効果を発揮せず、又は活性を有しない。不安定化されたポリペプチドは変性し、又は異常な折り畳みとなることがある。分解したポリペプチドは破壊され、効果を発揮せず、又は活性を有しない。
本発明に関連して、評価すべきパラメーターの低減又は増大は、そのパラメーターに対応する値の少なくとも5%の変化を意味する。より好ましくは、値の低減又は増大は少なくとも10%、さらにより好ましくは少なくとも20%、少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも70%、少なくとも90%、又は100%の変化を意味する。この後の場合には、そのパラメーターに関連して検出できる値がもはや存在しない場合があり得る。
単語「約」又は「ほぼ」は、数値(たとえば約10)に伴って用いる場合、好ましくはその値が所与の値(10)のプラスマイナス1%以内でもよいことを意味している。
本明細書で特定されるそれぞれの実施形態は、他に指示しない限り、互いに組み合わせることができる。いくつかの実施形態を参照して本発明を上で説明した。当業者であれば実施形態のいくつかの要素について小さな変形を想像することができよう。これらは、添付した特許請求の範囲で定義される保護の範囲に含まれる。引用した全ての特許及び参考文献は、全体が参照により本明細書に組み込まれる。
実施例1 − 初代FSHD筋肉細胞は筋核の小さな割合でDUX4を発現する。
本発明者らは初代ミオチューブにおける高感度のDUX4の検出法の確立に成功し、これを用いて内因性DUX4発現の定量的評価のための高含量アッセイを構築した。本方法は内因性DUX4発現の検出及び定量の自動化のためのバリデートされた表現型スクリーニングプラットフォームへと発展された。DUX4の抑制の基礎となる機序には相互作用する多くのタンパク質が関与していることがあり、上記の表現型アプローチに有利である。さらに、これは経路/ターゲットに依存せず(したがって仮説に捉われない)、細胞毒性又は筋肉分化への干渉に関する追加的な情報を提供する。
様々なドナーから得られた細胞の間でDUX4の発現のレベルに顕著な相違があることが報告されている。したがって、様々なドナーに由来する筋肉細胞株が十分に解析され、一次スクリーニングのために最適な細胞株が選択された。筋芽細胞のMyoD染色により、全ての細胞株に確かな筋原性があることが確認された(Rudnickiら、1993; cell 75(7):1351-9)。パラメーターを最適化した後で、スクリーニングアッセイに適用可能なDUX4の検出手順が確立され、FSHD細胞においては予想されたDUX4のパターンが得られたが、健常ドナーのミオチューブでは得られなかった。図1に示すように、またRickardら(2015, DOI: 10.1093/hmg/ddv315)によっても記載されているように、この中には、陽性細胞数が僅かにすぎない核DUX4の局在化及びDUX4陽性核クラスターにおける強度勾配が含まれていた。
実施例2 − DUX4の抑制を特定するためのスクリーニングアッセイ
スクリプトに基づく画像解析に基づいて、定量的アッセイの読み取りを開発した。実施例1に従い、筋核を検出するDAPI及びミオチューブの形成を可視化するミオシン重鎖(MHC)に対する抗体も用いて、細胞を染色した。画像を解析するために自動化スクリプトを開発して、核、ミオチューブの境界、及びDUX4シグナルの検出を可能にし、このスクリプトを用いてアーチファクトを検出し、偽陽性シグナルを低減させた。このスクリプトによって、DUX4陽性核及び核クラスターの数、融合インデックス、ミオチューブの面積、ミオチューブの幅、及びミオチューブの骨格長を含む多重のバリデートされた読み取りが可能になった(図2を参照されたい)。さらに、細胞の喪失又は化合物の毒性の尺度として全核カウントも含めた。初代ミオチューブにおける内因性DUX4の発現を評価することによって、スクリプトをバリデートし、結果は文献値と一致し、DUX4を発現する核の数は0.5%未満であった。
アッセイをさらに成熟させてスクリーニングの目的に適するようにした。アッセイの品質はドナー細胞株に依存した。DUX4陽性の核の数はそれぞれのドナー細胞株に特徴的であり、実験の間で一貫していた。アッセイを384ウェルのフォーマットに小型化するため、DUX4を発現する核の数、再現性、及びZ因子に関して最良性能の細胞株を選択し、化合物の大きなライブラリーの自動化スクリーニングを可能にした。2個のD4Z4リピートを有する細胞株を一次スクリーニングのために選択し、6個のD4Z4リピートを有する細胞株を後のバリデーションのために選択した。一次スクリーニングアッセイのZ因子は0.6であり、これは優れたアッセイであることを表している(Zhang ら、1999、doi:10.1177/108705719900400206、図3を参照されたい)。
約5000個の注釈付き化合物を含む化合物ライブラリーを高含量アッセイでスクリーニングした。この目的のため、384ウェルプレートに初代筋芽細胞を播種し、その後、増殖培地を分化培地に置き換えた。分化の3日後、細胞をライブラリー化合物で(異なったスクリーニングプレート上でデュプリケートとして)15時間処理し、その後、固定して、DUX4に対する抗体、ミオシン重鎖(MHC)に対する抗体、及びDAPI(4’,6−ジアミジノ−2−フェニルインドール)で染色した。スクリプトに基づく解析によって、DUX4の発現(DUX4陽性の核のカウント、又はDUX4の強度)及び毒性の可能性(融合インデックス及び核のカウント)についての読み取りを得た。結果を図4に示す。同じアッセイを5回繰り返す実験によって、約200ヒットの大多数が確認された。さらなる濃度−応答プロファイリングのためにこれらの化合物を選択した。
これらヒットした化合物の半分をRT−PCRを用いてバリデートした。DUX4のmRNA発現及び下流ターゲット遺伝子Trim43及びZScan4に基づき、参照としてハウスキーピング遺伝子hGUSB、GAPDH、hRPL27を用いて、免疫細胞化学アッセイ(タンパク質レベル)とRT−PCRアッセイ(mRNAレベル)との間でDUX4の抑制に極めて良好な相関が観察された。このことは、ヒットしたものの大多数が上流の作用モードを有していること、即ちこれらは(DUX4の分解を加速することとは逆に)DUX4の発現を阻害することによって作用していることを示唆している。
RT−PCRはおそらくアッセイキット(hGAPDH(app)についてはアッセイID Hs02758991_g1、hTRIM43(app)についてはアッセイID Hs00299174_m1、hMYH2_tv1−2(app)についてはアッセイID Hs00430042_m1)の一部としてApplied Biosystems社(Foster City、USA)に発注したオリゴヌクレオチドを用いて、Lemmersら(2010、DOI:10.1126/science.1189044)に記載されたように実施した。他のオリゴヌクレオチドは表1に示す。
実施例3 − CK1阻害剤はDUX4のリプレッサーとして作用する。
DUX4の抑制の新規な作用機序を特定するため、バリデートされたアッセイを用いて、約5000種類の化合物を含む注釈付き化合物ライブラリーをスクリーニングした。このライブラリーには、化合物の一次的薬理のみでなく、潜在的な既知の多重薬理をも伴う注釈付き薬理を有する化合物が含まれていた。一次スクリーニングによって複数のヒットが得られ、DUX4陽性の核の数を低減する化合物が特定された。濃度−応答曲線を確立することにより、ヒットした化合物をさらにプロファイリングした。スクリーニング及びプロファイリングしたデータの組に生物情報学的アプローチを適用することによって、本発明者らは驚くべきことに、表現型に関して活性な化合物の集団の中で、即ちDUX4の抑制を誘導する化合物の群の中で、CK1の注釈を有する化合物が顕著に富化されていることを発見した。興味あることに、CK1の注釈を有する元の化合物のいずれも、その一次的な薬理ターゲットとしてCK1を有しておらず、それぞれは他のタンパク質ファミリーの他の高い潜在性を有するターゲットを有していた。したがって、生物情報学的解析はCK1とDUX4の抑制との関連を特定するために重要であった。
プロファイリングした化合物は、DUX4に対して濃度依存的効果(阻害又は活性化)を示す場合に、表現型に関して活性であると注釈した。これらの中で、融合インデックス又は核の全数の10%を超える阻害を示した化合物は、これらの読み取りに対する効果がDUX4に対する効果の5分の1以下でなければ、除外した。したがって、4790種類の特定の化合物の中で、188種類の化合物が表現型に関して活性であると分類され、そのうち162種類がDUX4阻害剤であった。
表現型に関して活性な化合物については、元のターゲット注釈を、公開されていて利用可能な追加の情報(文献、特許出願、販売者のデータベース等)で補完した。全てのヒトタンパク質、及びヒトプロテオームへのマッピングを確立することができる非ヒト相同分子種を考慮した。次いでこれらのターゲット注釈に対して4790種の化合物のそれぞれを評価し、ターゲットを所与の化合物について活性又は非活性と分類した。表現型に関して活性な化合物については、ターゲットに対する化合物の能力が表現型に関する能力の10倍以下であれば、注釈したターゲットは活性であると分類し、そうでなければターゲットは不活性であると分類した。この解析によって、約201種類のターゲットが表現型に関する活性に関連しており、偽発見率が0.05であることが明らかになった。表現型に関して活性な化合物の群の中に、CK1阻害剤として注釈される化合物の富化が検出された。
実施例4 − CK1のアイソフォームがFSHD初代筋肉細胞の中で発現する。
健常な筋肉細胞とFSHDの筋肉細胞の両方でターゲットの発現を確認するため、4名の異なったFSHDドナー及び4名の異なった健常ドナーからの初代ミオチューブにおける異なったCK1アイソフォームの発現を決定するRNAシーケンシングアプローチを行なった。その結果、FSHDの筋肉細胞と健常な筋肉細胞の両方で全てのCK1アイソフォームの発現が示される。CK1α、CK1δ、及びCK1εにおいて最大の発現がある(表2を参照されたい)。
実施例5 − CK1の阻害はDUX4を抑制する。
図4Aに示す実施例2のプロトコルに従って、CK1阻害剤によるDUX4の抑制をアッセイした。図5A〜5Gで用いたCK1阻害剤の構造を表3に示す。図4Aの矢印で示すように、化合物を初代FSHD細胞と15時間インキュベートした。結果を図5A〜5Gに示し、50%効果濃度(EC50)を表3に示す。表3はCK1α、CK1δ、CK1ε、及びp38αに対して決定されたIC50値もnM単位で示し、それぞれCK1a、d、e、及びp38aと注釈している。



選択したリード化合物も異種移植したマウスモデルでインビボで試験した。この目的のため、ヒト初代FSHD筋芽細胞をマウスの前脛骨筋に注射した。次いでこれらのヒト細胞はミオチューブに分化し、その間にDUX4は抑制解除される。上記のインビトロで観察されたEC50を超える曝露を保証する良好な薬物動態特性を有する選択された化合物は、RT−PCR及び組織学的検査によって立証されたように、この異種移植動物モデルにおけるDUX4のmRNAの発現の抑制を惹起した。
実施例6 − CK1阻害剤はミオチューブの融合を阻害しない。
増殖型FSHDの筋芽細胞の多核ミオチューブへのインビトロ分化に際してDUX4の発現が増大する(Balogら、2015 Epigenetics. 2015;10(12):1133-42)ので、分化の阻害がDUX4の抑制に対して偽陽性効果をもたらす可能性がある。
非選択的阻害剤(+)JQ1又はBRD4選択的阻害剤RVX−208等のブロモ−及びエクストラ−ターミナルドメイン(BET)阻害剤は、分化し不死化したミオチューブ培養におけるDUX4の発現を阻害する可能性がある(米国特許出願公開第2015/087636号を参照されたい)。そこでは分化しているミオチューブが分化プロセスの開始時に、即ち増殖培地を分化培地に変更した瞬間から、(+)JQ1に曝露されると、ミオシン重鎖(MYH2、分化のマーカー)の発現が低減することが示され、阻害剤が分化プロセスにも影響していることが示唆された。本出願に記載した表現型アッセイにおいて(+)JQ1とRVX−208の両方を評価した。分化しているミオチューブでは、β2アドレノ受容体のアゴニストもDUX4の発現を阻害していることが報告されている(Campbellら、2017)。本発明者らは、融合プロセスに対するBET阻害剤とβ2アドレノ受容体アゴニストの両方の影響を評価し、CK1阻害剤の効果と比較した。
図6Aに実施例2の実験設定を示す。元のスクリーニングプロトコルと類似させて固定の15時間前、又は固定の72時間前に化合物を添加した(灰色の矢印)。後の場合には、分化プロセス全体の間に化合物が存在する。本発明者らは、BET阻害剤(+)JQ1(図6B1、図6B2)及びβ2アドレノ受容体のアゴニスト(図6C1、図6C2、図6D1、図6D2、図6E1、図6E2)の早期の添加によって融合プロセス及び筋芽細胞のミオチューブへの分化が阻害されることを見出した。図6Fは、β2アドレノ受容体アゴニスト(フォルモテロール)による処置の後ではミオチューブの形成が観察できないことを示している。そのため、DUX4のシグナルを評価する際に偽陽性の読み取りが生じる。BET阻害剤RVX−208は、処理時間に関わらずDUX4の発現に影響を示さなかった(図示せず)。15時間の時点で融合インデックスは影響されないようであるが、この処理時間でも、後期の分化マーカーであるミオシン重鎖(Myh、図示せず、プライマーは上記のhMYH2キットのものである)の発現の阻害を示すRT−PCRによって決定されるように、ミオチューブの融合プロセスはこれらの化合物によって影響された。
実施例5で説明したように、CK1の阻害はDUX4を阻害する。この効果は、化合物による処理の15時間後でも72時間後でも、ミオチューブの融合を阻害することなしに起こる(図6G1、図6G2)。
実施例7 − CK1阻害剤の阻害プロファイル。
化合物PF−670462、PF−5006739、化合物E、化合物F、化合物D、化合物H、化合物A、及びSR3029の、CK1α、CK1δ、CK1ε、及びp38の阻害、並びにDUX4の同時抑制についてアッセイした。表4に阻害の結果を示す。
文献
Balog et al., 2015 Epigenetics. 2015;10(12):1133-42; Bergerat et al., 2017, DOI: 10.1016/j.prp.2016.11.015; Van denBoogaard et al., 2016, DOI: 10.1016/j.ajhg.2016.03.013; Brockschmidt et al.,2008, DOI: 10.1136/gut.2007.123695; Campbell et al., 2017, DOI:10.1186/s13395-017-0134-x; Chebib and Jo, 2016, DOI: 10.1002/cncy.21685; EideEJ, Virshup DM, 2001, DOI:10.1081/CBI-100103963; Etchegaray JP et al., 2009,DOI:10.1128/MCB.00338-09; Geng et al., 2012, DOI: 10.1016/j.devcel.2011.11.013;Kowaljow et al., 2007, DOI: 10.1016/j.nmd.2007.04.002; Lang et al., 2014, DOI:10.14205/2310-8703.2014.02.01.1; Lemmers et al., 2010, DOI:10.1126/science.1189044; Lilljebjorn & Fioretos, 2017, DOI:10.1182/blood-2017-05-742643; Oyama et al., 2017 DOI:10.1038/s41598-017-04967-0; Paz et al., 2003, DOI: 10.1093/hmg/ddg226; Rickardet al., 2015, DOI: 10.1093/hmg/ddv315; Rudnicki et al., 1993; cell75(7):1351-9; Sharma et al., 2016, DOI:10.4172/2157-7412.1000303; Snider etal., 2010, DOI: 10.1371/journal.pgen.1001181; Stadler et al., 2013, DOI:10.1038/nsmb.2571; Tawil et al., 2014, DOI: 10.1186/2044-5040-4-12;Vanderplanck et al., 2011, doi: 10.1371/journal.pone.0026820; Wallace et al.,2011, DOI: 10.1002/ana.22275; Yao et al., 2014, DOI: 10.1093/hmg/ddu251; Yasudaet al., 2016, doi: 10.1038/ng.3535; Young et al., 2013, doi:10.1371/journal.pgen.1003947;Zhang et al., 1999, doi:10.1177/108705719900400206; Zhang et al., 2017,DOI:10.1038/ng.3691
WO2011051858 / WO2012085721 / WO2015119579/ EP2949651 / WO2009016286 / US2005/0131012 / WO2015195880 / WO2014081923 / US20140221313/ US2015087636A1

Claims (15)

  1. DUX4の発現を伴う疾患又は病態の治療における使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤であって、DUX4の発現を低減するカゼインキナーゼ1阻害剤。
  2. DUX4の発現を伴う前記疾患又は病態が筋ジストロフィー又はがんであり、好ましくはDUX4の発現を伴う前記疾患又は病態が筋ジストロフィーであり、最も好ましくは顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー(FSHD)である、請求項1に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  3. 1日あたり4、3、2、若しくは1回又はそれ未満、好ましくは1日に1回、対象に投与されることを特徴とする、請求項1又は2に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  4. 少なくともカゼインキナーゼ1δを阻害する、請求項1〜3のいずれか一項に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  5. 0.1〜1500mg/日、好ましくは0.1〜400mg/日、より好ましくは0.25〜150mg/日の範囲の量で対象に投与されることを特徴とする、請求項1〜4のいずれか一項に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  6. 経口、舌下、血管内、静脈内、皮下、又は経皮で、好ましくは経口で、投与されることを特徴とする、請求項1〜5のいずれか一項に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  7. DUX4の発現が少なくとも20%、40%、60%、80%、又はそれ以上、低減される、請求項1〜6のいずれか一項に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  8. 筋肉細胞、免疫細胞、又はがん細胞中におけるDUX4の発現を低減する、請求項1〜7のいずれか一項に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  9. DUX4の発現の前記低減がPCR又は免疫染色を用いて決定される、請求項1〜8のいずれか一項に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  10. アゾールコアを含むクラスからのものである、請求項1〜9のいずれか一項に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  11. 化合物A、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L、M、N、O、SR−3029、PF−670462、及びPF−5006739からなる群から選択される、請求項1〜10のいずれか一項に記載の使用のためのカゼインキナーゼ1阻害剤。
  12. 請求項1〜11のいずれか一項に定義される使用のための、
    請求項1〜11のいずれか一項に定義される少なくとも1つのカゼインキナーゼ1阻害剤、及び
    薬学的に許容できる賦形剤
    を含む組成物。
  13. 経口、舌下、非経口、血管内、静脈内、皮下、又は経皮投与、好ましくは経口投与のために製剤化された、請求項12に記載の使用のための組成物。
  14. DUX4の発現を低減するためのインビボ、インビトロ、又はエクスビボの方法であって、細胞を、請求項1〜11のいずれか一項に定義されるカゼインキナーゼ1阻害剤又は請求項12若しくは13に定義される組成物と接触させるステップを含む方法。
  15. それを必要とする対象におけるDUX4の発現を低減する方法であって、請求項1〜11のいずれか一項に定義されるカゼインキナーゼ1阻害剤又は請求項12若しくは13に定義される組成物の有効量を投与するステップを含む方法。
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