JP2020536508A - トランスアミナーゼ突然変異体及びその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
触媒活性:単位時間あたり単位容量(又は質量)の触媒が原料反応物を転化する量である。本発明においては、トランスアミナーゼの触媒活性の大きさは、本発明の前記反応原料の転化率と正相関を示す。
ΔA:反応プロセス中の吸光光度値の変化量、
V1:反応系の総体積、
6.22:消光係数、
t:ΔAの検出時間、
V2:加える酵素液の体積。
上記の一次スクリーニングによる酵素の活性が野生型トランスアミナーゼより高い突然変異体を100μg/mlのアンピシリンを含む500mlのLB液体培地に接種し、37℃でOD600=0.6になるまで振とう培養し、最終濃度が0.2mMになるまでIPTGを加え、25℃で誘導発現を行う。16h誘導した後に、6000gを10min遠心して菌体を収集する。菌体に対して超音波破砕機(JY92−2D、寧波新芝生物科技株式会社製)で細胞を破砕し、4℃で、10000gを20min遠心して上清液を取得して、活性検出に用いる。
Quik Change Primer Designウェブページで設計された36対の部位特異的突然変異プライマー及び表1に示される9つの飽和突然変異プライマーを用い、全プラスミドPCRによって完全な線形フラグメントを取得し、上記のPCR産物をDpnIで消化して出発遺伝子の母本のテンプレートを除去した後に、大腸菌BL21(DE3)に形質転化し、形質転化したものを50μg/mlのアンピシリンを含有するLBシャーレにコーティングし、37℃で一晩培養した。飽和突然変異をハイスループットスクリーニングした。具体的には、上記突然変異体に対して以下の方法によりハイスループットスクリーニングを行った。
酵素活性が野生型トランスアミナーゼより高い上記突然変異体を100μg/mlのアンピシリンを含む500mlのLB液体培地に接種し、37℃でOD600=0.6になるまで振とう培養し、最終濃度が0.2mMになるまでIPTGを加え、25℃で誘導発現を行った。16h誘導した後に、6000gのものを10min遠心して菌体を収集した。菌体に対して超音波破砕機(JY92−2D、寧波新芝生物科技株式会社製)で細胞を破砕し、4℃で、10000gを20min遠心して上清液を取得して、活性検出に用いた。
番号1〜21、33〜43及び54の突然変異体で誘導発現した33個のトランスアミナーゼを(S)−1−ベンジルオキシカルボニル−3−アミノピペリジンの合成反応のスクリーニングに用い、N−BOC−ピペリジノン基質0.2gをDMSO 0.3mlに溶解して均一に混合し、4.3Mのイソプロピルアミンの塩酸塩698ul、PLP 2mg、組換え粗酵素0.5〜3wtを加え、pH7.0の100mMのリン酸塩緩衝液を用いて反応系を10〜16Vに補完し、pHを7.0に調整し、30℃で、200rpmで一晩反応させる様な反応系を用いた。反応をスクリーニングした結果活性が高い菌種の反応結果は、表7に示される。表7を除いた21個のトランスアミナーゼ突然変異体の触媒活性は、野生型トランスアミナーゼの活性に比べて増加していなかった。
0.5wtのトランスアミナーゼの粗酵素を30℃、pH9.5で、50%のDMSOで1h処理した後、以下の反応に用いた。N−Cbz−3−ピペリジノン基質0.2gをDMSO 0.3mlに溶解して均一に混合し、4.3Mのイソプロピルアミンの塩酸塩698ul、0.01g/mlのPLP 0.2mlを加え、100mMのNaHCO3で反応系を11Vに補完し、pHを9.5に調整し、30℃の恒温でシェーカーにおいて200rpmで一晩反応させた。16h後に、体系200μLを取り、メタノール400μLを加えて均一に混合し、12000rpmで3分間遠心して、HPLCにより上清液について転化率を検出した。具体的な結果は表8に示される。
4つの0.5wtのトランスアミナーゼの粗酵素を30℃、pH9.5で、50%〜60%のDMSOで1h処理した後、以下の反応に用いた。N−Cbz−3−ピペリジノン基質0.2gをDMSO 0.3mlに溶解して均一に混合し、4.3Mのイソプロピルアミンの塩酸塩698ul、0.01g/mlのPLP 0.2mlを加え、100mMのNaHCO3で反応系を2mlに補完し、pHを9.5に調整し、30℃の恒温でシェーカーにおいて200rpmで一晩反応させた。16h後に、体系200μLを取り、メタノール400μLを加えて均一に混合し、12000rpmで3分間遠心して、HPLCにより上清液について転化率を検出し、結果は表9に示される。
その反応方程式は、以下の通りである。
その反応方程式は、以下の通りであった。
Claims (10)
- トランスアミナーゼ突然変異体であって、
アミノ酸配列は、配列番号1に示される配列が突然変異したアミノ酸配列であり、前記突然変異したアミノ酸部位は、F89、K193、P243、V234、I262、Q280、V379、R416、A417及びC418からなる群から選択される1つ又は複数である、
ことを特徴とするトランスアミナーゼ突然変異体。 - 前記突然変異したアミノ酸部位における突然変異は、P243E、F89Y/W、K193E、V234I、I262V、Q280K、V379L/M/T、R416A/C/H/Q/T/S、A417S及びC418A/Q/Sのうちのいずれか1種又は複数種を含み、ここでは、「/」は「又は」を示す、
ことを特徴とする請求項1に記載のトランスアミナーゼ突然変異体。 - 前記突然変異は、V379L/M/T+F89Y/W、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S、V379L/M/T+A417S、V379L/M/T+C418A/Q/S、V379L/M/T+P243E、V379L/M/T+K193E、V379L/M/T+V234I、V379L/M/T+I262V、V379L/M/T+Q280K、R416A/C/H/Q/T/S+A417S、R416A/C/H/Q/T/S+C418A/Q/S、R416A/C/H/Q/T/S+F89Y/W、R416A/C/H/Q/T/S+A417S+F89Y/W、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+F89Y/W、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+A417S、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+C418A/Q/S、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+K193E、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+V234I、V379L/M/T+C418A/Q/S+F89Y/W、V379L/M/T+C418A/Q/S+P243E、V379L/M/T+C418A/Q/S+I262V、V379L/M/T+A417S+Q280K、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+C418A/Q/S+F89Y/W、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+C418A/Q/S+Q280K、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+C418A/Q/S+F89Y/W+Q280K、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+C418A/Q/S+F89Y/W+Q280K+I262V、V379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+C418A/Q/S+F89Y/W+Q280K+A417S及びV379L/M/T+R416A/C/H/Q/T/S+C418A/Q/S+F89Y/W+Q280K+I262V+V234Iの組み合わせのうちのいずれか1つを含む、
ことを特徴とする請求項1又は2に記載のトランスアミナーゼ突然変異体。 - DNA分子であって、
請求項1〜3のいずれか1項に記載のトランスアミナーゼ突然変異体をコードする、
ことを特徴とするDNA分子。 - 組換えプラスミドであって、
請求項4に記載のDNA分子が接続されている、
ことを特徴とする組換えプラスミド。 - 前記組換えプラスミドは、pET−21b(+)、pET−22b(+)、pET−3a(+)、pET−3d(+)、pET−11a(+)、pET−12a(+)、pET−14b(+)、pET−15b(+)、pET−16b(+)、pET−17b(+)、pET−19b(+)、pET−20b(+)、pET−21a(+)、pET−23a(+)、pET−23b(+)、pET−24a(+)、pET−25b(+)、pET−26b(+)、pET−27b(+)、pET−28a(+)、pET−29a(+)、pET−30a(+)、pET−31b(+)、pET−32a(+)、pET−35b(+)、pET−38b(+)、pET−39b(+)、pET−40b(+)、pET−41a(+)、pET−41b(+)、pET−42a(+)、pET−43a(+)、pET−43b(+)、pET−44a(+)、pET−49b(+)、pQE2、pQE9、pQE30、pQE31、pQE32、pQE40、pQE70、pQE80、pRSET−A、pRSET−B、pRSET−C、pGEX−5X−1、pGEX−6p−1、pBV220、pBV221、pBV222、pTrc99A、pTwin1、pEZZ18、pKK232−18、pUC−18又はpUC−19である、
ことを特徴とする請求項5に記載の組換えプラスミド。 - 前記宿主細胞であって、
請求項5又は6に記載の組換えプラスミドを含有する、
ことを特徴とする宿主細胞。 - 前記宿主細胞は、原核細胞又は真核細胞であり、
好ましくは、前記真核細胞は、酵母細胞であり、
好ましくは、前記宿主細胞は、形質転換受容性細胞であり、さらに好ましくは、前記形質転換受容性細胞は、大腸菌BL21細胞又は大腸菌W3110である、
ことを特徴とする請求項7に記載の宿主細胞。 - トランスアミナーゼを用いてケトン系化合物及びアミノドナーのアミノ基転移反応を触媒するステップを含むキラルアミンの生産方法であって、
前記トランスアミナーゼは、請求項1〜3のいずれか1項に記載のトランスアミナーゼ突然変異体である、
ことを特徴とするキラルアミンの生産方法。 - 前記ケトン系化合物は、
ことを特徴とする請求項9に記載の方法。
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