JP2020023520A - コイルドコイルの免疫グロブリン融合タンパク質およびその組成物 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2013年7月11日に出願の、米国仮特許出願第61/845,280号;2013年7月11日に出願の、米国仮特許出願第61/845,287号;2014年1月10日に出願の、米国仮特許出願第61/925,904号;および2014年6月26日に出願の、米国仮特許出願第62/017,713号の利益を主張し、そのすべては、それら全体が引用によって本明細書に組み込まれる。
図面には以下の図が含まれる。
本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、1つ以上の免疫グロブリンドメインを含み得る。免疫グロブリンドメインは、免疫グロブリンA、免疫グロブリンD、免疫グロブリンE、免疫グロブリンG、または免疫グロブリンMであり得る。免疫グロブリンドメインは、免疫グロブリン重鎖領域またはその断片であり得る。免疫グロブリンドメインは、哺乳動物の抗体からのものであり得る。代替的に、免疫グロブリンドメインは、キメラ抗体からのものであり得る。免疫グロブリンドメインは、操作された抗体または組み換え抗体からのものであり得る。免疫グロブリンドメインは、ヒト化抗体、ヒト操作した抗体、または完全ヒト抗体からのものであり得る。哺乳動物の抗体は、ウシ抗体であり得る。哺乳動物の抗体は、ヒト抗体であり得る。哺乳動物の抗体は、ネズミ抗体であり得る。哺乳動物の抗体は、ヒト以外の霊長類抗体であり得る。
2つ以上の抗体領域は、同じであり得る。代替的に、またはさらに、2つ以上の抗体領域は、異なる。
本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、1つ以上の抗体領域を含む。抗体領域は、免疫グロブリンまたはそのフラグメントを含み得る。抗体領域は、免疫グロブリン重鎖、免疫グロブリン軽鎖、またはその組み合わせの少なくとも一部分を含み得る。抗体領域は、2つ以上の免疫グロブリン連鎖またはその部分を含み得る。抗体領域は、3つ以上の免疫グロブリン連鎖またはその部分を含み得る。抗体領域は、4つ以上の免疫グロブリン連鎖またはその部分を含み得る。抗体領域は、5つ以上の免疫グロブリン連鎖またはその部分を含み得る。抗体領域は、2つの免疫グロブリン重鎖および2つの免疫グロブリン軽鎖を含み得る。
アミノ酸は連続し得る。アミノ酸は連続しないかもしれない。
本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、1つ以上の非抗体領域を含み得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、2つ以上の非抗体領域を含み得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上の非抗体領域を含み得る。
本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、1つ以上の伸長融合領域を含み得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、2つ以上の伸長融合領域を含み得る。免疫グロブリン融合タンパク質は、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上の伸長融合領域を含み得る。
本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、1つ以上の伸長ペプチドを含み得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、2つ以上の伸長ペプチドを含み得る。1つ以上の伸長ペプチドは、治療剤のN末端、C末端、またはN末端およびC末端に付けられ得る。1つ以上の伸長ペプチドは、治療剤の各末端に付けられ得る。1つ以上の伸長ペプチドは、治療剤の異なる末端に付けられ得る。
Nは、約1乃至約3であり得る。
本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、1つ以上の治療剤を含み得る。治療剤は、ペプチドであり得る。治療剤は、小分子であり得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、2つ以上の治療剤を含み得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、3、4、5、6またはそれ以上の治療剤を含み得る。2つ以上の治療剤は、同じであり得る。2つ以上の治療剤は、異なり得る。
幾つかの実施形態では、治療剤の2、3、4、5またはそれ以上の領域は、疼痛を処置するように構成される。
免疫グロブリン融合タンパク質、抗体領域、非抗体領域、及び/又は伸長融合領域は、1つ以上のリンカーをさらに含み得る。免疫グロブリン融合タンパク質、抗体領域、非抗体領域、及び/又は伸長融合領域は、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のリンカーをさらに含み得る。伸長融合領域は、1つ以上のリンカーをさらに含み得る。伸長融合領域は、2、3、4、5、6、7、8、9、10またはそれ以上のリンカーをさらに含み得る。
本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、1つ以上のタンパク質分解性切断部位をさらに含み得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、2つ以上のタンパク質分解性切断部位をさらに含み得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、3つ以上のタンパク質分解性切断部位をさらに含み得る。本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質は、4、5、6、7またはそれ以上のタンパク質分解性切断部位をさらに含み得る。本明細書に開示される治療剤は、1つ以上のタンパク質分解性切断部位をさらに含み得る。
免疫グロブリン融合タンパク質は、本明細書に開示されるように、組み換え法によって発現され得る。一般に、免疫グロブリン融合タンパク質をコード化する核酸は、さらなるクローニング(DNAの増幅)または発現のために、単離されて、複製可能なベクターに挿入され得る。免疫グロブリン融合タンパク質をコード化するDNAは、PCR増幅によって調製され得、従来の手順を使用して(例えば、免疫グロブリン融合タンパク質をコード化するヌクレオチドに特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって)配列決定され得る。典型的な実施形態では、免疫グロブリン融合タンパク質をコード化する核酸は、PCR増幅され、制限酵素で消化され、およびゲル精製される。消化された核酸は、複製可能なベクターへと挿入され得る。消化された免疫グロブリン融合タンパク質の挿入を包含している複製可能なベクターは、さらなるクローニング(DNAの増幅)または発現のために、宿主細胞へと形質転換または形質導入され得る。宿主細胞は、原核細胞または真核細胞であり得る。
本明細書には、免疫グロブリン融合タンパク質及び/又は本明細書に開示される免疫グロブリン融合タンパク質の成分を含む組成物が開示される。組成物は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、またはそれ以上の免疫グロブリン融合タンパク質を含み得る。免疫グロブリン融合タンパク質は、異なり得る。代替的に、免疫グロブリン融合タンパク質は、同じあり得るか又は類似し得る。免疫グロブリン融合タンパク質は、異なる抗体領域、伸長融合領域、伸長ペプチド、治療剤またはそれらの組み合わせを含み得る。
本明細書にはさらに、1つ以上の免疫グロブリン融合タンパク質またはその成分を含むキットが開示される。免疫グロブリン融合タンパク質は、本開示の方法を実施するための使用を促進する方法でパッケージ化され得る。例えば、キットは、容器に添付されたラベルまたは該方法の実施の際の免疫グロブリン融合タンパク質の用途を記載する添付文書とともに、容器内にパッケージ化された本明細書に記載される免疫グロブリン融合タンパク質を含む。適切な容器は、例えば、ボトル、バイアル、シリンジなどを含む。容器は、ガラスまたはプラスチックなどの様々な材料から形成され得る。容器は、滅菌した点検口を有し得る(例えば、容器は、皮下注射針で貫通可能なストッパーを有する静脈注射用の溶液バッグまたはバイアルであり得る)。キットは、容器を含み得、その中に免疫グロブリン融合タンパク質が包含される。キットは、(a)免疫グロブリン融合タンパク質の抗体領域;(b)免疫グロブリン融合タンパク質の伸長融合領域;(c)伸長融合領域の伸長ペプチド;(d)伸長融合領域の治療剤;または(e)(a)−(d)の組み合わせ、を有する容器を含み得る。キットは、特定の疾病を処置するために使用され得る第1および第2の組成物を示す添付文書をさらに含み得る。代替的に、またはさらに、キットは、薬学的に許容可能なバッファー(例えば、注射用静菌水(BWFI)、リン酸緩衝食塩水、リンゲル液およびデキストロース溶液)を含む、第2(または第3)容器をさらに含み得る。キットは、限定されないが、他のバッファー、希釈剤、フィルター、針、およびシリンジを含む、商用およびユーザーの見地から望ましい他の材料をさらに含み得る。免疫グロブリン融合タンパク質は、ユニット剤形でパッケージ化され得る。キットは、投与の特定経路に従って免疫グロブリン融合タンパク質を投与するのに、またはスクリーニングアッセイを実施するのに適したデバイスをさらに含み得る。キットは、免疫グロブリン融合タンパク質の組成物の用途を記載するラベルを包含し得る。
本明細書にはさらに、1つ以上の疾患及び/又は疾病を処置、軽減、阻害及び/又は予防するための免疫グロブリン融合タンパク質およびその方法が開示される。該方法は、本明細書に開示される1つ以上の免疫グロブリン融合タンパク質を含む組成物を、それを必要としている被験体に投与する工程を含み得る。免疫グロブリン融合タンパク質は、非抗体領域に付けられた抗体領域を含み得る。幾つかの例では、免疫グロブリン融合タンパク質は、伸長融合領域に付けられた抗体領域を含む。非抗体領域は、1つ以上の治療剤を含む。伸長融合領域は、1つ以上の治療剤を含む。幾つかの実施形態では、非免疫グロブリン領域は、1つ以上の伸長ペプチドを含む。幾つかの実施形態では、伸長融合領域は、1つ以上の伸長ペプチドを含む。一実施形態では、伸長ペプチドは、アルファヘリックスの二次構造を有するアミノ酸配列を含む。一実施形態では、伸長ペプチドは、ベータストランドの二次構造を有するアミノ酸配列を含まない。幾つかの実施形態では、非免疫グロブリン領域は、1つ以上のリンカーペプチドを含む。幾つかの実施形態では、伸長融合領域は、1つ以上のリンカーペプチドを含む。一実施形態では、リンカーペプチドは、アルファヘリックスまたはベータストランドの二次構造を有するアミノ酸配列を含まない。
代替的に、またはさらに、治療剤は、インターロイキン8(IL−8)、IL−21、ジコノチド、ソマトスタチン、クロロトキシン、SDF1アルファまたはその誘導体または変異体である。抗体領域は、1つ以上の免疫グロブリンドメインを含み得る。免疫グロブリンドメインは、免疫グロブリンA、免疫グロブリンD、免疫グロブリンE、免疫グロブリンG、または免疫グロブリンMであり得る。免疫グロブリンドメインは、免疫グロブリン重鎖領域またはその断片であり得る。幾つかの例では、免疫グロブリンドメインは、哺乳動物の抗体からのものである。代替的に、免疫グロブリンドメインは、キメラ抗体からのものであり得る。免疫グロブリンドメインは、操作した抗体または組み換えの抗体からのものであり得る。免疫グロブリンドメインは、ヒト化抗体、ヒト操作した抗体、または完全ヒト抗体からのものであり得る。哺乳動物の抗体は、ウシ抗体であり得る。哺乳動物の抗体は、ヒト抗体であり得る。他の例では、哺乳動物の抗体は、ネズミ抗体であり得る。免疫グロブリン融合タンパク質、抗体領域及び/又は伸長融合領域は、1つ以上のリンカーをさらに含み得る。リンカーは、伸長ペプチドに治療剤を付け得る。リンカーは、抗体領域に伸長融合領域を付け得る。リンカーは、抗体領域、伸長融合領域、伸長ペプチド、または治療剤に、タンパク質分解性切断部位を付け得る。疾患または疾病は、自己免疫性疾患、異種免疫性疾患または疾病、炎症性疾患、病原性感染、血栓塞栓障害、呼吸器疾患または疾病、代謝疾患、中枢神経系(CNS)障害、骨疾患または癌であり得る。他の例では、疾患または疾病は、血液疾患である。幾つかの例では、疾患または疾病は、肥満症、糖尿病、骨粗鬆症、貧血症、または疼痛である。治療剤は、hGCSFであり得、疾患または疾病は、好中球減少症であり得る。治療剤は、hLeptinであり得、疾患または疾病は、糖尿病であり得る。治療剤は、hGHであり得、疾患または疾病は、成長障害であり得る。治療剤は、IFN−アルファであり得、疾患または疾病は、ウイルス感染であり得る。治療剤は、Mamba1であり得、疾患または疾病は、疼痛であり得る。治療剤は、エラフィンであり得、疾患または疾病は、炎症であり得る。治療剤は、IFN−アルファでよびエラスターゼ阻害剤ペプチドであり得、疾患または疾病は、慢性閉塞性肺疾患(COPD)であり得る。
炎症性疾患は、肝炎であり得る。
代替的に、被験体は、ウシであり得る。被験体は、鳥類、爬虫類または両生類であり得る。
本明細書にはさらに、疾患または疾病の処置のための薬剤の製造における免疫グロブリン融合タンパク質(IFP)の使用が開示される。IFPは、本明細書に開示されるIFPのいずれかであり得る。本明細書には、疾患または疾病の処置のための薬剤の製造における免疫グロブリン融合タンパク質の使用が開示され、該免疫グロブリン融合タンパク質は、非抗体領域に付けられた抗体領域を含む。本明細書にはさらに、疾患または疾病の処置のための薬剤の製造における免疫グロブリン融合タンパク質の使用が開示され、IFPは、伸長融合領域に付けられた抗体領域を含み、ここで、該伸長融合領域は治療剤を含む。非抗体領域は、伸長ペプチドを含み得る。非抗体領域は、リンカーペプチドを含み得る。非抗体領域は、タンパク質分解性切断部位を含み得る。伸長融合領域は、伸長ペプチドを含み得る。伸長融合領域は、リンカーペプチドを含み得る。伸長融合領域は、タンパク質分解性切断部位を含み得る。伸長融合領域は、抗体領域内に挿入され得る。伸長融合領域は、抗体領域の免疫グロブリン重鎖内に挿入され得る。伸長融合領域は、抗体領域の免疫グロブリン軽鎖内に挿入され得る。伸長融合領域は、抗体領域に結合され得る。伸長融合領域は、抗体領域内の位置に結合され得る。非抗体領域は、抗体領域内に挿入され得る。非抗体領域は、抗体領域の免疫グロブリン重鎖内に挿入され得る。非抗体領域は、抗体領域の免疫グロブリン軽鎖内に挿入され得る。非抗体領域は、抗体領域に結合され得る。非抗体領域は、抗体領域内の位置に結合され得る。抗体領域は、1つ以上の免疫グロブリンドメインを含み得る。免疫グロブリンドメインは、免疫グロブリンA、免疫グロブリンD、免疫グロブリンE、免疫グロブリンG、または免疫グロブリンMであり得る。免疫グロブリンドメインは、免疫グロブリン重鎖領域またはその断片であり得る。幾つかの例では、免疫グロブリンドメインは、哺乳動物の抗体からのものである。代替的に、免疫グロブリンドメインは、キメラ抗体からのものであり得る。免疫グロブリンドメインは、操作した抗体または組み換えの抗体からのものであり得る。免疫グロブリンドメインは、ヒト化抗体、ヒト操作した抗体、または完全ヒト抗体からのものであり得る。哺乳動物の抗体は、ウシ抗体であり得る。哺乳動物の抗体は、ヒト抗体であり得る。他の例では、哺乳動物の抗体は、ネズミ抗体であり得る。リンカーは、伸長ペプチドに治療剤を付け得る。リンカーは、抗体領域に伸長融合領域を付け得る。リンカーは、抗体領域、伸長融合領域、伸長ペプチド、または治療剤に、タンパク質分解性切断部位を付け得る。治療剤は、ペプチドまたはその誘導体または変異体であり得る。代替的に、治療剤は小分子である。治療剤は、GCSFを含み得る。GCSFは、ヒトGCSFであり得る。治療剤は、Moka1であり得る。治療剤は、VM24であり得る。治療剤は、エキセンディン−4であり得る。治療剤は、エリスロポエチンであり得る。エリトロポイエチンは、ヒトエリスロポエチンであり得る。治療剤は、hLeptinであり得る。治療剤は、成長ホルモン(GH)であり得る。成長ホルモンは、ヒト成長ホルモン(hGH)であり得る。治療剤は、インターフェロン−アルファであり得る。治療剤は、インターフェロン−ベータであり得る。治療剤は、GLP−1であり得る。治療剤は、好中球エラスターゼ阻害剤であり得る。治療剤は、リラキシンであり得る。治療剤は、Mamba1であり得る。治療剤は、エラフィンであり得る。治療剤は、ベータトロフィンであり得る。治療剤は、GDF11であり得る。治療剤は、GMCSFであり得る。疾患または疾病は、自己免疫性疾患、異種免疫性疾患または疾病、炎症性疾患、病原性感染、血栓塞栓障害、呼吸器疾患または疾病、代謝疾患、中枢神経系(CNS)障害、骨疾患または癌であり得る。他の例では、疾患または疾病は、血液疾患である。幾つかの例では、疾患または疾病は、肥満症、糖尿病、骨粗鬆症、貧血症、または疼痛である。疾患または疾病は、成長障害であり得る。
本明細書にはさらに、治療剤の1つ以上の薬理学的性質を改善する方法が開示される。該方法は、本明細書に記載される免疫グロブリン融合タンパク質を生成する工程を含み得る。薬理学的性質の例は、限定されないが、半減期、安定性、溶解性、免疫原性、毒性、バイオアベイラビリティ、吸収、遊離、分配、代謝および分泌を含み得る。遊離は、医薬製剤から治療剤を放出するプロセスを指し得る。吸収は、血液循環に入る物質のプロセスを指し得る。分配は、身体の流体および組織にわたる物質の分散または散布を指し得る。代謝(または生体内変化、あるいは不活性化)は、異物が存在することの生体による認識、および娘の(daughter)代謝物質への親化合物の不可逆変化を指し得る。
分泌は、身体からの物質の除去を指し得る。
ウシGCSF(bGCSF)をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:186)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。免疫グロブリン融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、bGCSFフラグメントの両端上に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、bGCSF−リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、伸長ペプチドおよびリンカーを用いてbGCSF遺伝子をコード化するPCRはフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブのhIgG1 CH1−CH3定常領域を、三重の突然変異体(S228P、F234AおよびL235A)を包含しているhIgG4 CH1−CH3定常領域と交換するように、トラスツズマブ−コイルベースのbGCSF融合タンパク質を修飾して、トラスツズマブ−コイルbGCSF HC(SEQ ID NO:38)を生成した。トラスツズマブ−コイルベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーション(in−frame ligation)によって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
ウシGCSF(bGCSF)をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:186)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。免疫グロブリン融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、bGCSFフラグメントの両端上に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、bGCSF−リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、伸長ペプチドおよびリンカーを用いてbGCSF遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってウシIgG抗体(BLV1H12)の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、ウシ−コイルbGCSF HC(SEQ ID NO:39)を生成した。ウシ−コイルベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、ウシIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:18)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイル−bGCSFベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイル−bGCSF融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:38)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:1)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。ウシ−コイル−bGCSFベースの融合タンパク質を、ウシ−コイル−bGCSF融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:39)およびウシ軽鎖(SEQ ID NO:18)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析した。図4で示されるように、レーン1はタンパク質ラダーを示し、レーン2はウシ−コイルIgGを示し、レーン3はDTTで処置したウシ−コイルIgGを示し、レーン4はウシ−コイル−bGCSF IgGを示し、レーン5はDTTで処置したウシ−コイル−bGCSF IgGを示し、レーン6はトラスツズマブ−コイル−bGCSF IgGを示し、レーン7はDTTで処置したトラスツズマブ−コイル−bGCSF IgGを示し、レーン8はトラスツズマブIgGを示し、およびレーン9はDTTで処置したトラスツズマブIgGを示す。
マウスNFS−60細胞を、米国培養菌保存施設(ATCC),VAから得て、10%のウシ胎児血清(FBS)、0.05mMの2−メルカプトエタノールおよび62ng/mlのヒトマクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)を補足したRPMI−1640培地中で培養した。増殖アッセイのために、マウスNFS−60細胞を、RPMI−1640培地で3回洗浄し、1.5×105細胞/mlの密度で10%のFBSおよび0.05mMの2−メルカプトエタノールを有するRPMI−1640培地中で再懸濁した。96ウェルのプレートにおいて、100μlの細胞懸濁液を各ウェルに加え、その後、様々な濃度のトラスツズマブIgG(SEQ ID NO:22および19)、トラスツズマブ−コイル−bGCSF IgG(SEQ ID NO:69および19)、ウシ−コイルIgG(SEQ ID NO:36および271)、ウシ−コイル−bGCSF IgG(SEQ ID NO:70および36)、およびbGCSF(SEQ ID NO:227)を加えた。プレートを、72時間5%のCO2インキュベーターにおいて37℃でインキュベートした。その後、細胞を、37℃で4時間AlamarBlue(Invitrogen)(細胞懸濁液の1/10容量)で処置した。細胞の生存率を示すために各ウェルに対する595nmの蛍光を読み取り、表13に示す。図6は、データのグラフ表示を示す。トラスツズマブ−コイル−bGCSF IgGのEC50は、2.49±0.26ng/mLであった。ウシ−コイル−bGCSF IgGのEC50は、2.55±0.38ng/mLであった。bGCSFのEC50は、4.87±0.29ng/mLであった。
Her2受容体へのトラスツズマブ−コイル−bGCSF融合タンパク質の結合親和性を、ELISAによって検査した。ヒトHer2−Fcキメラ(5ug/mL)(R&D Systems)を、4℃で一晩、96ウェルのELISAプレート上にコーティングし、その後、37℃で2時間、PBS(pH7.4)において1%のBSAで遮断した。PBS(pH7.4)中の0.05%のTween−20での洗浄後、様々な濃度のトラスツズマブIgG(SEQ ID NO:22および19)およびトラスツズマブ−コイル−bGCSF(SEQ ID NO:69および19)の融合タンパク質を、各ウェルに加え、37℃で2時間インキュベートした。続いて、HRP抱合体(Sigma)を有するヤギのポリクローナル抗ヒトκ軽鎖抗体を加え、37℃で2時間インキュベートした。続いて、ウェルを洗浄し、各ウェルに蛍光発生のペルオキシダーゼ基質を加えることによって、結合親和性を、425nmの蛍光強度に基づいて検査した。以下の表は、トラスツズマブIgGおよびトラスツズマブ−コイル−bGCSF IgGの425nmでの蛍光強度を示す。図7は、表14のデータのグラフ表示を示す。図7に示されるように、ライン1はトラスツズマブIgGを表わし、ライン2はトラスツズマブ−コイル−bGCSF IgGを表わす。トラスツズマブIgGのEC50は、110±14pMであった。
ベータトロフィンをコード化する遺伝子(SEQ ID NO:198)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、ベータトロフィンフラグメントの両端上に加えた。続いて、対象の遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、生成するべき重複伸長PCRの利用によってウシIgG抗体(BLV1H12)の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植して、BLV1H12−直接ベータトロフィン融合(SEQ ID NO:118)を生成する。BLV1H12−コイルベータトロフィンベースの融合タンパク質を生成するために、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、ベータトロフィン−リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加える。続いて、ベータトロフィン、リンカー、および伸長ペプチドを含むPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってBLV1H12抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植して、トラスツズマブ−コイルベータトロフィン(CDRH3)HC(SEQ ID NO:66)を生成する。BLV1H12−ベータトロフィンにベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、BLV1H12抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:18)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
BLV1H12−直接ベータトロフィン融合タンパク質を、BLV1H12−直接ベータトロフィン融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:140)およびBLV1H12軽鎖(SEQ ID NO:36)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。BLV1H12−コイルベータトロフィン融合タンパク質を、BLV1H12−コイルベータトロフィン融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:97)およびBLV1H12軽鎖(SEQ ID NO:36)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析した(図8)。図8に示されるように、レーン1はタンパク質ラダーを包含し;レーン2はDTTで処置したBLV1H12−コイルベータトロフィン融合タンパク質(SEQ ID NO:97および36)を包含し;およびレーン3はBLV1H12−コイルベータトロフィン融合タンパク質(SEQ ID NO:97および36)を包含している。
bGCSFをコード化する遺伝子(SEQ ID NO:186)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、bGCSFフラグメントの両端上に加えた。続いて、対象の遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植して、トラスツズマブ−直接bGCSF融合(SEQ ID NO:101)を生成する。トラスツズマブ−bGCSFベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブ抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−接bGCSF融合タンパク質を、トラスツズマブ−直接bGCSF融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:123)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析した(図10)。図10に示されるように、レーン1はタンパク質ラダーを包含し;レーン2はトラスツズマブ−直接bGCSF融合タンパク質(SEQ ID NO:123および19)を包含し;およびレーン3はDTTで処置したトラスツズマブ−直接bGCSF融合タンパク質(SEQ ID NO:123および19)を包含している。
マウスNFS−60細胞を、米国培養菌保存施設(ATCC),VAから得て、RPMI−1640培地で3回洗浄し、1.5×105細胞/mLの密度で10%のウシ胎児血清(FBS)および0.05mMの2−メルカプトエタノールを補足したRPMI−1640培地中で再懸濁した。96ウェルのプレートにおいて、100μlの細胞懸濁液を各ウェルに加え、その後、様々な濃度のトラスツズマブ−直接bGCSF IgG(SEQ ID NO:123および19)およびbGCSF(SEQ ID NO:227)を加えた。プレートを、72時間5%のCO2インキュベーターにおいて37℃でインキュベートした。その後、細胞を、37℃で4時間AlamarBlue(Invitrogen)(細胞懸濁液の1/10容量)で処置した。細胞の生存率を示すために各ウェルに対する595nmの蛍光を読み取った。図11は、データのグラフ表示を描写する。トラスツズマブ直接的な−bGCSF IgGのEC50は1.8±0.4ng/mLであった。bGCSFのEC50は1.3±0.2ng/mLであった。
エキセンディン−4(Ex−4)をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:188)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。因子Xa(SEQ ID NO:182)の切断部位を、Ex−4のN末端の前に置いた。融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を増加させるために、因子Xaプロテアーゼ切断部位およびGGGGSCリンカー(SEQ ID NO:178)が、Ex−4遺伝子断片のC末端の端部に加えられる直前に、可動性CGGGGSリンカー(SEQ ID NO:177)を加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、エキセンディン−4リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、対象の遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4ベースの融合タンパク質を、7つの変異(E233P、L234V、L235A、ΔG236、A327G、A330S、およびP331S)を包含しているヒトhIgG1 CH1−CH3定常領域で修飾し、トラスツズマブ−コイル−Ex4 HC融合(SEQ ID NO:40)を生成した。トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4ベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:71)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析した。トラスツズマブ−コイルベースのEx−4融合タンパク質を、製造業者のプロトコルに従って、因子Xaプロテアーゼ(GE Healthcare)でさらに処置し、融合ペプチドのN末端を放出した。処置後、融合タンパク質を、プロテインA/Gアフィニティーカラムによって再精製して、プロテアーゼを除去し、図12に示されるようにSDS−PAGEゲルによって分析した。レーン1はタンパク質マーカーである。レーン2は、トラスツズマブ−コイル−Ex−4 IgG(SEQ ID NO:71および19)である。レーン3は、DTTで処置したトラスツズマブ−コイル−Ex−4 IgG(SEQ ID NO:71および19)である。レーン4はタンパク質マーカーである。レーン5は、因子Xaでの切断後のトラスツズマブ−コイル−Ex−4 IgG(SEQ ID NO:71および19)であり、これは、Ex−4ペプチドのN末端を放出して、トラスツズマブ−コイル−Ex−4 RN IgGを生成する(ここで、RNは放出されたN末端に対する略語である)。レーン6は、DTTで処置したトラスツズマブ−コイル−Ex−4 RN IgGである。
PBS(pH7.4)中の、10μgの精製したトラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4重鎖(HC)融合(SEQ ID NO:71および19)を、1μL(500ユニット)のペプチド−N−グリコシダーゼ(NEB)により37℃で一晩処置し、その後、50mMのDTTを加えた。融合タンパク質を、Agilent Technologyからの6520 Q−TOF LC/MSを使用して、ESI−MSによって分析した。クロマトグラフを図13に示す。トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4 HCに対する予想される分子量は、56,880Daである。トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4 HCに対する観察された分子量は、56,748Daであった。観察された分子量は、第1アミノ酸グルタミン酸(E)なしの予想される分子量に相互に関連している。
PBS(pH7.4)中の10μgの精製した因子Xa切断したトラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4重鎖(HC)融合(SEQ ID NO:71および19)を、1μL(500ユニット)のペプチド−N−グリコシダーゼ(NEB)により37℃で一晩処置し、その後、50mMのDTTを加えた。切断した融合タンパク質フラグメントを、Agilent Technologyからの6520 Q−TOF LC/MSを使用して、ESI−MSによって分析した。N末端フラグメントのクロマトグラフを、図14Aに示し、C末端フラグメントのクロマトグラフを、図14Bに示す。トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4 HC RN N末端フラグメントに対する予想される分子量は、13,309Daである。トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4 HC RN N末端フラグメントに対する観察された分子量は、13,307Daであった。トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4 HC RN C末端フラグメントに対する予想される分子量は、43,589Daである。トラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4 HC RN C末端フラグメントに対する観察された分子量は、43,458Daであった。
表面GLP−1RおよびcAMP応答性ルシフェラーゼレポーター遺伝子を過剰発現するHEK293細胞を、1ウェル当たり5,000個の細胞の密度で384ウェルのプレートに播種した。5%のCO2による37℃での24時間のインキュベーション後、細胞を、様々な濃度のエキセンディン−4ペプチド(SEQ ID NO:228)、トラスツズマブ(SEQ ID NO:19および22)、トラスツズマブ−コイルエキセンディン−4(SEQ ID NO:71および19)、およびトラスツズマブ−コイルエキセンディン−4(SEQ ID NO:71および19)RNで処置し、さらに24時間インキュベートした。続いて、ルシフェラーゼアッセイを、製造業者の指示(Promega)に従って、One−Gloルシフェラーゼ試薬を使用して行った。図15は、データのグラフ表示を示す。エキセンディン−4のEC50は、0.03±0.004nMであった。トラスツズマブ−コイルエキセンディン−4のEC50は、3.8±0.2nMであった。トラスツズマブ−コイルエキセンディン−4 RNのEC50は、0.01±0.001nMであった。
グルカゴン受容体(GCGR)およびCRE−Lucレポーターを過剰発現するHEK293細胞を、5%のCO2により37℃で10%のFBSを用いてDMEM中で成長させた。細胞を、1ウェル当たり5,000個の細胞の密度で384ウェルのプレートに播種し、5%のCO2により37℃で24時間、様々な濃度のグルカゴン、エキセンディン−4ペプチド(SEQ ID NO:228)、トラスツズマブ(SEQ ID NO:19および22)、トラスツズマブ−コイルエキセンディン−4(SEQ ID NO:71および19)、およびトラスツズマブ−コイルエキセンディン−4(SEQ ID NO:71および19)RNの融合タンパク質で処置した。その後、発光強度を、製造業者の指示に従って、One−Glo(Promega,WI)ルシフェラーゼ試薬を使用して測定した。図16は、データのグラフ表示を示す。
Ex−4(SEQ ID NO:228)(1.6mg/kg)およびトラスツズマブ−コイル−Ex−4(SEQ ID NO:71および19)RN融合タンパク質(2.8mg/kg)を、静脈内(i.v.)または皮下(S.C.)の注入によってCD1マウス(N=3)に投与した。血液サンプルを、Ex−4ペプチド用に0日目から8日目に、およびトラスツズマブ−コイル−Ex−4 RN融合タンパク質用に0日目から14日目に収集した。残存活性を、HEK293−GLP−1R−CRE−Luc細胞を使用して分析した。データを、静脈注射のために第1時間点(30分)で最高濃度をとることによって正規化した。データを、皮下注射のために第2時間点(1日)で最高濃度をとることによって正規化した。最高濃度のパーセンテージを、血液サンプル収集の時間点に対して図示し、データを一次反応式(=A0e−kt)に適合されることによって、半減期を測定し、式中、A0は初期濃度であり、tは時間であり、およびkは一次反応定数である。図17Aおよび図17Bは、データのグラフ表示を示す。図17Aは、静脈内注射を示す。図17Bは、皮下注射を示す。エキセンディン−4(i.v.)のt1/2は、1.5±0.2時間であった。トラスツズマブ−コイルエキセンディン−4 RN(i.v.)のt1/2は、2.4±0.1日であった。トラスツズマブ−コイルエキセンディン−4 RN(S.C.)のt1/2は、3.9±1.2日であった。
Ex−4(SEQ ID NO:228)(20μg/kg)、トラスツズマブ(SEQ ID NO:19および22)(8mg/kg)、および様々な濃度のトラスツズマブ−コイル−Ex−4 RN(SEQ ID NO:71および19)の融合タンパク質の単回投与量を、皮下(S.C.)注射によってCD1マウス(N=5)に投与した。グルコース(3g/kg、経口投与(p.o.))を、単回投与処置の30分、24、48、72、96、120、144、168、および216時間後に与え、その後、グルコース負荷の直前およびその15、30、45、60、および120分後に、血中グルコース測定を行った。図18A−Rは、単回投与処置の30分、24、48、72、96、120、144、168、および216時間後のデータのグラフ表示を示す。
Ex−4(SEQ ID NO:228)(20μg/kg)、トラスツズマブ(SEQ ID NO:19および22)(8mg/kg)、および様々な濃度のトラスツズマブ−コイル−Ex−4(SEQ ID NO:71および19)の融合タンパク質の単回投与量を、皮下(S.C.)注射によってCD1マウス(N=5)に投与した。グルコース(3g/kg、p.o.)を、単回投与処置の2、24、48、72、96、120、および144時間後に与え、その後、グルコース負荷の直前およびその15、30、45、60、および120分後に血中グルコース測定を行った。図19A−Nは、単回投与処置の2、24、48、72、144、168、および216時間後のデータのグラフ表示を示す。
Her2受容体へのトラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4融合タンパク質の結合親和性を、ELISAによって検査する。ヒトHer2−Fcキメラ(5ug/mL)(R&D Systems)、4℃で一晩、96ウェルのELISAプレート上にコーティングし、その後、37℃で2時間、PBS(pH7.4)において1%のBSAで遮断した。PBS(pH7.4)中の0.05%のTween−20での洗浄後、様々な濃度のトラスツズマブIgG(SEQ ID NO:19および22)およびトラスツズマブ−コイル−エキセンディン−4(SEQ ID NO:71および19)の融合タンパク質を加えて、37℃で2時間インキュベートした。続いて、HRP抱合体(Sigma)を有するヤギのポリクローナル抗ヒトκ軽鎖抗体を加え、37℃で2時間インキュベートする。続いて、ウェルを洗浄し、蛍光発生のペルオキシダーゼ基質を各ウェルに加えることによって、結合親和性を、425nmの蛍光強度に基づいて検査する。
HER2を過剰発現するSKBR3細胞を、10%のFBSと1%のペニシリンおよびストレプトマイシンを有するDMEM中で成長させる。細胞を、冷たいPBSで3回洗浄し、PBS中で2%のBSAで遮断し、軽く混合しながら4℃で2時間、10または100nMのトラスツズマブ(SEQ ID NO:19および22)およびトラスツズマブ−CDR融合タンパク質(SEQ ID NO:71および19)でインキュベートする。非結合抗体を、PBS中で2%のBSAによって洗浄することによって除去する。その後、細胞を、軽く混合しながら4℃で1時間、FITC抗ヒトIgG Fc(KPL, Inc., M)で染色し、その後、PBSで洗浄して、フローサイトメトリーによる解析を行う。
Mokaをコード化する遺伝子(SEQ ID NO:189)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、Mokaフラグメントの両端上に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、MokaリンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、伸長ペプチドおよびリンカーを用いてMoka遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブのhIgG1 CH1−CH3定常領域を、三重の突然変異体(S228P、F234AおよびL235A)を包含しているhIgG4 CH1−CH3定常領域と交換するように、トラスツズマブ−コイル−Mokaベースの融合タンパク質をさらに修飾して、トラスツズマブ−コイル−Moka IgG(SEQ ID NO:41)を生成した。トラスツズマブ−コイル−Mokaベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイル−Mokaベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイル−Moka融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:72)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させる。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取する。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、図20に示されるようにSDS−PAGEゲルによって分析する。レーン1はタンパク質分子量マーカーを示す。レーン2は精製したトラスツズマブ−コイル−Moka IgGを示す。レーン3は、DTTで処置された精製したトラスツズマブ−コイル−Moka IgGを示す。
VM24をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:190)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、VM24フラグメントの両端上に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、VM24リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、対象の遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブのhIgG1 CH1−CH3定常領域を、三重の突然変異体(S228P、F234AおよびL235A)を包含しているhIgG4 CH1−CH3定常領域と交換するように、トラスツズマブ−コイル−VM24ベースの融合タンパク質をさらに修飾して、SEQ ID NO:42を生成した。トラスツズマブ−コイル−VM24ベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイル−VM24ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイル−VM24融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:73)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させる。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取する。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、図20に示されるようにSDS−PAGEゲルによって分析する。レーン1はタンパク質分子量マーカーを示す。レーン4は、精製したトラスツズマブ−コイル−Vm24 IgGを示す。レーン5は、DTTで処置された精製したトラスツズマブ−コイル−Vm24 IgGを示す。
ヒトPBMCを、フィコール勾配遠心分離によって健康なドナーの新鮮な静脈血から単離し、その後、10%のFBSによるRPMI1640培地中で再懸濁し、1×106細胞/mLの密度で96ウェルのプレートに蒔いた。ヒトT細胞を、T細胞富化キットを使用して、単離したPBMCから精製した。精製したPBMCおよびT細胞を、様々な濃度の精製したトラスツズマブ−コイルMoka(SEQ ID NO:72および19)およびトラスツズマブ−コイルVm24(SEQ ID NO:73および19)の融合タンパク質とともに5%のCO2により37℃で1時間、前処理し、その後、抗CD3およびCD28抗体によって活性化した。24時間の処置後、分泌されたTNF−αのレベルの測定のためにELISAキットを使用して、上清を収集した。図21は、T細胞活性化データに関するインビトロ阻害のグラフ表示を示す。トラスツズマブ−コイルMoka IgG(SEQ ID NO:72および19)のEC50は、269±46nMであった。トラスツズマブ−コイルVm24 IgG(SEQ ID NO:73および19)のEC50は、178±104nMであった。
ヒトGCSF(hGCSF)をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:187)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、hGCSFフラグメントの両端上に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、hGCSF−リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。CDRH3融合を生成するために、対象の遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDRH3)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。CDRH2融合を生成するために、対象の遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDRH2)の相補性決定領域2へと移植し、Thr54−Asn55を交換した。CDRL3融合を生成するために、対象の遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の軽鎖(CDRL3)の相補性決定領域3へと移植し、Thr93−Pro95を交換した。トラスツズマブ−コイル−hGCSFベースの融合タンパク質を、7つの変異(E233P、L234V、L235A、ΔG236、A327G、A330SおよびP331S)を包含しているヒトhIgG1 CH1−CH3定常領域で修飾した。トラスツズマブ−コイル−hGCSFベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイル−hGCSFベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイル−hGCSF融合タンパク質(CDRH3)重鎖(SEQ ID NO:74)とトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:9)、トラスツズマブ−コイル−hGCSF融合タンパク質(CDRH2)重鎖とトラスツズマブ軽鎖、およびトラスツズマブ−コイル−hGCSF融合タンパク質(CDRL3)軽鎖とトラスツズマブ重鎖をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させる。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取する。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析する。図22は、精製したトラスツズマブ−コイル−hGCSFベースの融合タンパク質を示す。レーン1は、精製したトラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRH2)IgGを示す。レーン2は、DTTで処置された精製したトラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRH2)IgGを示す。レーン3はタンパク質分子量マーカーを示す。レーン4は、精製したトラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRL3)IgGを示す。レーン5は、DTTで処置された精製したトラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRL3)IgGを示す。
PBS(pH7.4)中の、10μgの精製したトラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRH2)を、1μL(500ユニット)のペプチド−N−グリコシダーゼ(NEB)により37℃で一晩処置し、その後、50mMのDTTを加えた。融合タンパク質を、Agilent Technologyからの6520 Q−TOF LC/MSを使用して、ESI−MSによって分析した。クロマトグラフは図23Aに示される。トラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRH2)HCに対する予想される分子量は、71,472Daである。トラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRH2)HCに対する観察された分子量は、72,300Daであった。観察された分子量は、hGCSF上のO−グリコシル化に相互に関連する。PBS(pH7.4)中の、10μgの精製したトラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRL3)を、1μL(500ユニット)のペプチド−N−グリコシダーゼ(NEB)により37℃で一晩処置し、その後、50mMのDTTを加えた。融合タンパク質を、Agilent Technologyからの6520 Q−TOF LC/MSを使用して、ESI−MSによって分析した。クロマトグラフは図23Bに示される。トラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRL3)LCに対する予想される分子量は、45,746Daである。トラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRL3)LCに対する観察された分子量は、46,692Daであった。観察された分子量は、hGCSF上のO−グリコシル化に相互に関連する。
HER2を過剰発現するSKBR3細胞を、10%のFBSおよび1%のペニシリンとストレプトマイシンを有するDMEM中で成長させた。細胞を、冷たいPBSで3回洗浄し、PBS中で2%のBSAにより遮断し、軽く混合しながら4℃で2時間、10または100nMのトラスツズマブおよびトラスツズマブ−CDR融合タンパク質、トラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRH2)およびトラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRL3)でインキュベートした。非結合抗体を、PBS中で2%のBSAによって洗浄することによって除去した。その後、細胞を、軽く混合しながら4℃で1時間、FITC抗ヒトIgG Fc(KPL, Inc., M)で染色し、その後、PBSで洗浄して、フローサイトメトリーによる解析を行った。図24はフローサイトメトリーヒストグラムを示す。
マウスNFS−60細胞を、10%のFBS、0.05mMの2−メルカプトエタノールおよび62ng/mlのヒトマクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)を補足したRPMI−1640培地中で培養した。トラスツズマブ−hGCSF融合タンパク質の増殖活性を検査するために、細胞を、10%のFBSを有するRPMI−1640培地で3回洗浄し、1.5×105細胞/mlの密度で10%のFBSおよび0.05mMの2−メルカプトエタノールを有するRPMI−1640培地中で再懸濁し、様々な濃度のhGCSF、トラスツズマブ、トラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRH2)、およびトラスツズマブ−コイル−hGCSF(CDRL3)とともに96ウェルのプレート(1ウェル当たり1.5×104細胞)に蒔き、および5%のCO2により37℃で72時間インキュベートした。その後、細胞を、37℃で4時間、AlamarBlue(Life Technologies, CA)で処置した。595nmで測定された蛍光強度は、細胞生存率に比例する。図25は、データのグラフ表示を示す。hGCSFのEC50は、1.7±0.3ng/mLであった。トラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRH2)のEC50は、0.4±0.1ng/mLであった。トラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRL3)のEC50は、0.9±0.1ng/mLであった。
hEPOをコード化する遺伝子(SEQ ID NO:192)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。免疫グロブリン融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、hEPOフラグメントの両端上に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、hEPO−リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、伸長ペプチドおよびリンカーを用いてhEPO遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブ−コイルhEPO(CDRH3)重鎖のCH1−CH3定常領域を、三重の変異(S228P、F234AおよびL235A)を包含しているヒトIgG4 CH1−CH3定常領域と交換して、トラスツズマブ−コイルhEPO(CDRH3)HCを生成した。トラスツズマブ−コイルベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイル−hEPOベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイル−hEPO融合タンパク質重鎖およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:1)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析した。図26で示されるように、レーン1はタンパク質ラダーを示し、レーン2は精製したトラスツズマブ−コイル−hEPO(CDRH3)およびトラスツズマブLCを示し、およびレーン3はDTTで処置したトラスツズマブ−コイル−hEPO(CDRH3)およびトラスツズマブLCを示す。
PBS(pH7.4)中の、10μgの精製したトラスツズマブ−コイル−hEPO(CDRH3)を、1μL(500ユニット)のペプチド−N−グリコシダーゼ(NEB)により37℃で一晩処置し、その後、50mMのDTTを加えた。融合タンパク質を、Agilent Technologyからの6520 Q−TOF LC/MSを使用して、ESI−MSによって分析した。クロマトグラフを図27に示す。トラスツズマブ−コイル−hEPO(CDRH3)HCに対する予想される分子量は、70,307Daである。トラスツズマブ−コイル−hEPO(CDRH3)HCに対する観察された分子量は、70,177Daであった。観察された分子量は、hEPO上のOグリコシル化および第1アミノ酸グルタミン酸(E)の欠如に相互に関連する。
HER2を過剰発現するSKBR3細胞を、10%のFBSおよび1%のペニシリンとストレプトマイシンを有するDMEM中で成長させた。細胞を、冷たいPBSで3回洗浄し、PBS中で2%のBSAにより遮断し、軽く混合しながら4℃で2時間、10または100nMのトラスツズマブおよびトラスツズマブ−コイル−hEPO(CDRL3)でインキュベートした。非結合抗体を、PBS中で2%のBSAによって洗浄することによって除去した。その後、細胞を、軽く混合しながら4℃で1時間、FITC抗ヒトIgG Fc(KPL, Inc., M)で染色し、その後、PBSで洗浄して、フローサイトメトリーによる解析を行った。図28はフローサイトメトリーヒストグラムを示す。
ヒトTF−1細胞を、10%のウシ胎児血清(FBS)、ペニシリンおよびストレプトマイシン(50U/mL)、および2ng/mlのヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)を包含しているRPMI−1640培地中で5%のCO2により37℃で培養した。トラスツズマブ−hEPO融合タンパク質の増殖活性を検査するために、細胞を、10%のFBSを有するRPMI−1640培地で3回洗浄し、1.5×105細胞/mlの密度で10%のFBSを有するRPMI−1640培地中で再懸濁し、様々な濃度のhEPO、トラスツズマブ、およびトラスツズマブ−コイルhEPO(CDRH3)の融合タンパク質とともに96ウェルのプレート(1ウェル当たり1.5×104細胞)に蒔き、および5%のCO2により37℃で72時間インキュベートした。その後、細胞を、37℃で4時間、AlamarBlue(Life Technologies, CA)で処置した。595nmで測定された蛍光強度は、細胞生存率に比例する。EC50値を、データをロジスティックシグモイド関数:y=A2+(A1−A2)/(1+(x/x0)p)に適合させることによって測定し、式中、A1は初期値であり、A2は最終値であり、x0は曲線の変曲点であり、およびpはパワーである。図29は、データのグラフ表示を示す。hEPOのEC50は、0.1±0.02nMであった。トラスツズマブ−コイルhEPO(CDRH3)のEC50は、0.1±0.01nMであった。
hEPOをコード化する遺伝子(SEQ ID NO:192)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。免疫グロブリン融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、hEPOフラグメントの両端上に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、hEPO−リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、伸長ペプチドおよびリンカーを用いてhEPO遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブ−コイルhEPO(CDRH3)重鎖のCH1−CH3定常領域を、三重の変異(S228P、F234AおよびL235A)を包含しているヒトIgG4 CH1−CH3定常領域と交換して、トラスツズマブ−コイルhEPO(CDRH3)HC(SEQ ID NO:62)を生成した。
トラスツズマブ−コイル−hGCSF/EPO二重融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルhEPO(CDRH3)HC(SEQ ID NO:62)およびトラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRL3)LC(SEQ ID NO:63)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された二重融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析した。図30に示されるように、レーン1はタンパク質ラダーを示し、レーン2はトラスツズマブ−コイル−hGCSF/EPO二重融合タンパク質を示し、およびレーン3はDTTで処置したトラスツズマブ−コイル−hGCSF/EPO二重融合タンパク質を示す。
PBS(pH7.4)中の、10μgの精製したトラスツズマブ−コイル−hGCSF/EPO二重融合タンパク質(SEQ ID NO:62、63)を、1μL(500ユニット)のペプチド−N−グリコシダーゼ(NEB)により37℃で一晩処置し、その後、50mMのDTTを加えた。融合タンパク質を、Agilent Technologyからの6520 Q−TOF LC/MSを使用して、ESI−MSによって分析した。
クロマトグラフを図31Aに示す。トラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRL3)LCに対する予想される分子量は、45,746Daである。トラスツズマブ−コイルhGCSF(CDRL3)LCに対する観察された分子量は、46,690Daであった。観察された分子量は、hGCSF上のOグリコシル化に相互に関連する。
HER2を過剰発現するSKBR3細胞を、10%のFBSおよび1%のペニシリンとストレプトマイシンを有するDMEM中で成長させた。細胞を、冷たいPBSで3回洗浄し、PBS中で2%のBSAにより遮断し、軽く混合しながら4℃で2時間、10または100nMのトラスツズマブおよびトラスツズマブ−コイル−hGCSF/EPO二重融合タンパク質(SEQ ID NO:62、63)でインキュベートした。非結合抗体を、PBS中で2%のBSAによって洗浄することによって除去した。その後、細胞を、軽く混合しながら4℃で1時間、FITC抗ヒトIgG Fc(KPL, Inc., M)で染色し、その後、PBSで洗浄して、フローサイトメトリーによる解析を行った。図32はフローサイトメトリーヒストグラムを示す。
ヒトTF−1細胞を、10%のウシ胎児血清(FBS)、ペニシリンおよびストレプトマイシン(50U/mL)、および2ng/mlのヒト顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)を包含しているRPMI−1640培地中で5%のCO2により37℃で培養した。トラスツズマブhGCSF/hEPO融合タンパク質の増殖活性を検査するために、細胞を、10%のFBSを有するRPMI−1640培地で3回洗浄し、1.5×105細胞/mlの密度で10%のFBSを有するRPMI−1640培地中で再懸濁し、様々な濃度のhEPO、トラスツズマブ、およびトラスツズマブhGCSF/hEPO(CDRH3)融合タンパク質(SEQ ID NO:62、63)とともに96ウェルのプレート(1ウェル当たり1.5×104細胞)に蒔き、および5%のCO2により37℃で72時間インキュベートした。その後、細胞を、37℃で4時間、AlamarBlue(Life Technologies, CA)で処置した。595nmで測定された蛍光強度は、細胞生存率に比例する。図33は、データのグラフ表示を示す。hEPOのEC50は、0.1±0.02nMであった。トラスツズマブ−コイルhGCSF/hEPOのEC50は、0.2±0.03nMであった。
マウスNFS−60細胞を、10%のFBS、0.05mMの2−メルカプトエタノールおよび62ng/mlのヒトマクロファージコロニー刺激因子(M−CSF)を補足したRPMI−1640培地中で培養した。トラスツズマブhGCSF/hEPO融合タンパク質の増殖活性を検査するために、細胞を、10%のFBSを有するRPMI−1640培地で3回洗浄し、1.5×105細胞/mlの密度で10%のFBSおよび0.05mMの2−メルカプトエタノールを有するRPMI−1640培地中で再懸濁し、様々な濃度のhGCSF、トラスツズマブ、およびトラスツズマブhGCSF/hEPO(CDRH3)の融合タンパク質(SEQ ID NO:62、63)とともに96ウェルのプレート(1ウェル当たり1.5×104細胞)に蒔き、および5%のCO2により37℃で72時間インキュベートした。その後、細胞を、37℃で4時間、AlamarBlue(Life Technologies, CA)で処置した。595nmで測定された蛍光強度は、細胞生存率に比例する。図34は、データのグラフ表示を示す。hGCSFのEC50は、1.7±0.3nMであった。トラスツズマブ−コイルhGCSF/hEPOのEC50は、3.1±0.1nMであった。
hGHをコード化する遺伝子(SEQ ID NO:201)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。免疫グロブリン融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、hGHフラグメントの両端上に加えられた。ハーセプチン−コイルhGH融合タンパク質を生成するために、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、hGH−リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。トラスツズマブ−直接hGH(CDRH2)融合タンパク質(SEQ ID NO:128)を生成するために、リンカーを用いてhGH遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってハーセプチンIgG抗体の重鎖(CDRH2)の相補性決定領域2へと移植した。トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)融合タンパク質(SEQ ID NO:75)を生成するために、伸長ペプチドおよびリンカーを用いてhGH遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってハーセプチンIgG抗体の重鎖(CDRH3)の相補性決定領域3へと移植した。トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH2)融合タンパク質(SEQ ID NO:76)を生成するために、伸長ペプチドおよびリンカーを用いてhGH遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってハーセプチンIgG抗体の重鎖(CDRH2)の相補性決定領域2へと移植した。トラスツズマブhGHベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−直接hGHベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−直接hGH(CDRH2)HC(SEQ ID NO:128)、およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)HC(SEQ ID NO:75)、およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH2)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH2)HC(SEQ ID NO:76)、およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析した。図35で示されるように、レーン1はタンパク質ラダーを示し、レーン2はトラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)(SEQ ID NO:75、19)を示し、レーン3はDTで処置したトラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)(SEQ ID NO:75、19)を示し、レーン4はタンパク質ラダーを示し、レーン5はトラスツズマブ−直接hGH(CDRH2)(SEQ ID NO:128および19)を示し、レーン6はDTTで処置したトラスツズマブ−直接hGH(CDRH2)(SEQ ID NO:128および19)を示し、レーン7はトラスツズマブ−コイルhGH(CDRH2)(SEQ ID NO:76および19)を示し、およびレーン8はDTTで処置したトラスツズマブ−コイルhGH(CDRH2)(SEQ ID NO:76および19)を示す。
hGHR−Ba/F3増殖アッセイ:ネズミBa/F3細胞株を、EF1αプロモーター下でhGH受容体(hGHR)で安定して形質導入した。クローン的に選択されたhGHR−Ba/F3を、10%のFBS、RPMI1640、および50ng/mLのhGHで維持した。増殖アッセイを、1ウェル当たり200μLのアッセイ培地(RPMI1640中に10%のFBS)中に20,000個の細胞を含む96ウェルの培養プレートで行った。増加する濃度のhGH、トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)、トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH2)、およびトラスツズマブ−直接(CDRH2)を、72時間細胞でインキュベートした。インキュベーション期間の終わりに、20μlのPrestoblueを各ウェルに加え、蛍光シグナルを、550nmの励起とともに590nmでSpectramax蛍光プレートリーダーに記録した。hGHおよびトラスツズマブhGH融合に対するEC50値を表15に示す。
ヒトIM9細胞(ATCC)を、RPMI1640中の10%のFBS中で維持した。リン酸化アッセイの前夜に、2x10e5 IM9細胞を、200μLのアッセイ培地(RPMI中に1%のチャコールを除去したFBS)中でV底の96ウェルのプレートへと播種し、培地をし、一晩飢餓にした。リン酸化実験の日に、飢餓細胞を、37℃で10分間の様々な濃度で、hGH、トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)、トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH2)、およびトラスツズマブ−直接(CDRH2)で刺激した。刺激後、細胞を、10分間37℃で4%のホルムアルデヒドによって固定し、その後、90%のメタノールで透過処理した。その後、細胞を、10分間室温で5%のBSAで遮断し、製造業者の示されたプロトコルに従って、Alexa Fluor(登録商標)488共役の抗pStat5(Tyr694)(C71E5)ウサギmAb(Cell Signaling Technology, Inc.)で染色した。細胞を、PBSで洗浄し、フローサイトメーターによって分析した。hGHおよびトラスツズマブhGH融合に対するEC50値を表15に示す。
ND=測定されず。
トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)およびジェノトロピンを、1処置当たり3匹のラットでSD雌ラットへとPBS中の2mg/kgで2つの別々の実験群に静脈内(i.v.)または皮下(S.C.)に注射した。血漿サンプルを、以下の時間点に収集した:30分、1時間、2時間、4時間、6時間、24時間、48時間、3日、4日、7日、10日、および14日。ジェノトロピンの量を、hGH Human Direct ELISA Kit (Life Technologies)によって定量化した。トラスツズマブ−コイルhGHン(CDRH3)を、サンドイッチELISAアッセイを使用して定量化した。簡潔に、マキシソープ(maxisorb)ELISAプレートを、37℃で1時間、ヤギ抗ヒトIgG Fc(Abcam,ab98616)でコーティングし、その後、5%のBSAで遮断した。血漿の適切な希釈液を、遮断したウェルに加え、ウェルを、室温で1時間インキュベートした。ウェルを洗浄した後、ビオチン化したポリクローナル抗hGH抗体(R&D Systems,BAF1067)を、1時間ウェルに適用した。プレートを、洗浄し、室温で1時間、高感度のストレプトアビジン−HRP抱合体(Pierce,21130)でインキュベートした。QuantaBluの蛍光発生ELISA基質を、広範囲な洗浄後に適用し、シグナルを、Spectramax蛍光プレートリーダーによって得た。標準曲線の線形領域(シグナル対濃度)へとシグナルを外挿する(extrapolating)ことによって、血漿サンプル中のトラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)融合の量を定量化した。各収集時間点でのジェノトロピンおよびトラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)の濃度を、図示し、図36A−Bに示した。図36Aは、静脈注射による薬物動態を示す。図36Bは、皮下注射による薬物動態を示す。
トラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)融合の薬力学性能を、標準的な下垂体切除したラットアッセイにおいて評価した。下垂体切除した雄ラットを、Harlanから購入し、手術/移動後の体重の正常化をモニタリングするために、研究前の数日間予めスクリーニングした。最初の重量によって一致したラットを、以下の幾つかの治療のうちの1つで処置した:14日間のジェノトロピンの毎日の皮下注射(0.1mg/kg);またはジェノトロピン(0.3mg/kg)またはトラスツズマブ−コイルhGH(CDRH3)(1.0mg/kg)の週2回の投与。動物を毎日計量した。処置期間の終わりに、動物を屠殺し、骨端の厚さを測定した。1日目からの体重のパーセント変化を、1日当たりで図示し、図37に示す。
hLeptinをコード化する遺伝子(SEQ ID NO:197)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。免疫グロブリン融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を最適化するために、GGGGS(SEQ ID NO:179、n=1)の可動性リンカーを、hLeptinフラグメントの両端上に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、hLeptin−リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。伸長ペプチドおよびリンカーを用いてhLeptin遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDRH3)の相補性決定領域3へと移植した。トラスツズマブの定常領域を、7つの変異(E233P、L234V、L235A、ΔG236、A327G、A330SおよびP331S)を包含しているヒトIgG1 CH1−CH3定常領域で修飾して、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)HC(SEQ ID NO:78)を生成した。CDRL3融合を生成するために、伸長ペプチドおよびリンカーを用いてhLeptin遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の軽鎖(CDRL3)の相補性決定領域3へと移植して、Thr93−Pro95を交換し、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRL3)(SEQ ID NO:49)を生成した。伸長ペプチドおよびリンカーを用いてhLeptin遺伝子をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によって、トラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDRH2)の相補性決定領域2へと移植し、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)HC(SEQ ID NO:79)を生成した。トラスツズマブ−コイルhLeptinベースの融合タンパク質の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)HC(SEQ ID NO:78)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)HC(SEQ ID NO:79)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRL3)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRL3)LC(SEQ ID NO:49)およびトラスツズマブ重鎖(SEQ ID NO:4)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、SDS−PAGEゲルによって分析した。図38で示されるように、レーン1はトラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)(SEQ ID NO:79、19)を示し、レーン2はDTTで処置したトラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)(SEQ ID NO:79、19)を示し、レーン3、4および7はタンパク質分子量マーカーを示し、レーン5はトラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)(SEQ ID NO:78、19)を示し、レーン6はDTTで処置したトラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)(SEQ ID NO:78、19)を示し、レーン8はトラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRL3)(SEQ ID NO:49、4)を示し、およびレーン9はDTTで処置したトラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRL3)(SEQ ID NO:49、4)を示す。
ヒトレプチン受容体(LepR)を過剰発現するBaf3の安定した細胞を、96ウェルのプレートに播種し、72時間、異なる量のhLeptin(SEQ ID NO:238)、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)(SEQ ID NO:79、19)、およびトラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)(SEQ ID NO:78、19)で処置した。AlamarBlue試薬を、1/10容量で加え、2時間インキュベートし、蛍光を、560nmの励起下で590nmで測定した。データを、GraphPad Prism6を使用して分析した。図39Aおよび図39Bは、データのグラフ表示を示す。hLeptinのEC50は、129.4±46.09ρMであった(図39A)。トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)のEC50は、55.38±14.04ρMであった。トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)のEC50は、99.41±18.91ρMであった。hLeptinのEC50は、58.19±10.88ρMであった(図39B)。トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRL3)のEC50は、665.1±62.70ρMであった。
SKBR3細胞を、10%のFBSおよび1%のペニシリンとストレプトマイシンを有するDMEM中で成長させた。細胞を、冷たいPBSで3回洗浄し、PBS中で2%のBSAにより遮断し、軽く混合しながら4℃で2時間、10または100nMのトラスツズマブ、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)(SEQ ID NO:79、19)、およびトラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)(SEQ ID NO:78、19)でインキュベートした。非結合抗体を、PBS中で2%のBSAによって洗浄することによって除去した。その後、細胞を、軽く混合しながら4℃で1時間、FITC抗ヒトIgG Fc(KPL, Inc., M)で染色し、その後、PBSで洗浄して、フローサイトメトリーによる解析を行った。図40Aは、トラスツズマブのフローサイトメトリーヒストグラムを示す。図40Bは、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH2)のフローサイトメトリーヒストグラムを示す。図40Cは、トラスツズマブ−コイルhLeptin(CDRH3)のフローサイトメトリーヒストグラムを示す。
エラフィンをコード化する遺伝子(SEQ ID NO:217)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。可動性GGGGSリンカー(SEQ ID NO:179)を、エラフィン遺伝子断片のN末端およびC末端に加え、融合タンパク質のフォールディングおよび安定性を増加させた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、エラフィンリンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、リンカーおよび伸長フラグメントを用いてエラフィンをコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブ−コイル−エラフィンベースの融合タンパク質を、7つの変異(E233P、L234V、L235A、ΔG236、A327G、A330S、およびP331S)を包含しているヒトhIgG1 CH1−CH3定常領域で修飾し、トラスツズマブ−コイル−エラフィンHC融合(SEQ ID NO:54)を生成した。トラスツズマブ−コイル−エラフィン(CDRH3)の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイル−エラフィン(CDRH3)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルエラフィン融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:54)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、図41に示されるようにSDS−PAGEゲルによって分析した。レーン1はタンパク質マーカーである。レーン2は、トラスツズマブ−コイル−エラフィン(CDRH3)IgG(SEQ ID NO:85および19)である。レーン3は、DTTで処置したトラスツズマブ−コイル−エラフィン(CDRH3)IgG(SEQ ID NO:85および19)である。
ヒトエラスターゼを、Elastin Products Company, Inc.から購入した。増加する濃度のエラフィン(SEQ ID NO:258)およびトラスツズマブ−コイルエラフィン(CDRH3)IgG(SEQ ID NO:85および19)を、室温でエラスターゼによりインキュベートし、エラスターゼの残存活性を、蛍光発生のエラスターゼ基質MeOSuc−AAPV−AMC(EMD Millipore)の付加によって分析した。Spectramax蛍光プレートリーダー上で325nmの励起による420nmの波長でモニタリングすることによって、反応の勾配(slope)を得た。各データポイントを3回繰り返し(triplicated)、方程式へtriplicatedされ適合させられた:
Q=(Ki*(1+(S/Km)))。Y=Vo*(1−((((Et+X+Q)−(((Et+X+Q)^2)−4*Et*X)^0.5))/(2*Et)))。
図42Aは、エラフィンによるエラスターゼの阻害を示す。図42Bは、トラスツズマブ−コイルエラフィン(CDRH3)IgGによるエラスターゼの阻害を示す。
GLP2をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:222)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。可動性CGGGGSリンカー(SEQ ID NO:177)を、GLP2のN末端に加え、可動性GGGGSC(SEQ ID NO:178)を、GLP2のC末端に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、GLP2リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、リンカーおよび伸長フラグメントを用いてGLP2をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブ−コイルGLP2ベースの融合タンパク質を、7つの変異(E233P、L234V、L235A、ΔG236、A327G、A330S、およびP331S)を包含しているヒトhIgG1 CH1−CH3定常領域で修飾し、トラスツズマブ−コイルGLP2(CDRH3)HC融合(SEQ ID NO:65)を生成した。トラスツズマブ−コイルGLP2(CDRH3)の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイルGLP2(CDRH3)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルGLP2融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:65)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:19)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、図43に示されるようにSDS−PAGEゲルによって分析した。レーン1はタンパク質マーカーである。レーン2は、トラスツズマブ−コイルGLP2(CDRH3)IgG(SEQ ID NO:96および19)である。レーン3は、DTTで処置したトラスツズマブ−コイルGLP2(CDRH3)IgG(SEQ ID NO:96および19)である。
リラキシン(インスリンcペプチド)をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:225)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。可動性のGGGGSリンカー(SEQ ID NO:179)を、リラキシンのN末端に加え、可動性のGGGGS(SEQ ID NO:179)を、リラキシンのC末端に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、リラキシンリンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、リンカーおよび伸長フラグメントを用いてリラキシン(インスリンc−ペプチド)をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブ−コイルリラキシン(インスリンc−ペプチド)ベースの融合タンパク質を、7つの変異(E233P、L234V、L235A、ΔG236、A327G、A330S、およびP331S)を包含しているヒトhIgG1 CH1−CH3定常領域で修飾し、トラスツズマブ−コイルリラキシン(インスリンc−ペプチド)(CDRH3)HC融合を生成した。トラスツズマブ−コイルリラキシン(インスリンc−ペプチド)(CDRH3)の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイルリラキシン(インスリンc−ペプチド)(CDRH3)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルリラキシン(インスリンc−ペプチド)融合タンパク質重鎖およびトラスツズマブ軽鎖をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、図44に示されるようにSDS−PAGEゲルによって分析した。レーン1は、DTTで処置したトラスツズマブ−コイルリラキシン(インスリンc−ペプチド)(CDRH3)IgGである。レーン2は、トラスツズマブ−コイルリラキシン(インスリンc−ペプチド)(CDRH3)IgGである。レーン3はタンパク質マーカーである。
因子XaおよびPC2(IEGRKKR)に対する内部プロテアーゼ切断部位を含むリラキシンをコード化する遺伝子を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。可動性GGGGSリンカー(SEQ ID NO:179)を、リラキシンのN末端に加え、可動性GGGGS(SEQ ID NO:179)を、リラキシンのC末端に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、リラキシンリンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、プロテアーゼ切断部位、リンカーおよび伸長フラグメントを用いてリラキシンをコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブ−コイルリラキシンベースの融合タンパク質を、7つの変異(E233P、L234V、L235A、ΔG236、A327G、A330S、およびP331S)を包含しているヒトhIgG1 CH1−CH3定常領域で修飾し、トラスツズマブ−コイルリラキシン(CDRH3)HC融合を生成した。トラスツズマブ−コイルリラキシン(CDRH3)の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイルリラキシン(CDRH3)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルリラキシン融合タンパク質重鎖(SEQ ID NO:90)およびトラスツズマブ軽鎖(SEQ ID NO:18)をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、図45に示されるようにSDS−PAGEゲルによって分析した。レーン1はタンパク質マーカーである。レーン2は、トラスツズマブ−コイルリラキシン(CDRH3)IgGである。レーン3は、DTTで処置したトラスツズマブ−コイル型リラキシン(CDRH3)IgGである。レーン4は、プロテアーゼPC2と同時発現されたトラスツズマブ−コイルリラキシン(CDRH3)IgGである。レーン5は、PC2同時発現され、DTTで処置したトラスツズマブ−コイルリラキシン(CDRH3)IgGである。
PC2(RKKR)に対する内部6xHISおよびプロテアーゼ切断部位を含むリラキシン(XTEN35)をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:224)を、GenscriptまたはIDTによって合成し、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によって増幅した。可動性GGGGSリンカー(SEQ ID NO:179)を、リラキシン(XTEN35)のN末端に加え、可動性GGGGS(SEQ ID NO:179)を、リラキシン(XTEN35)のC末端に加えた。その後、逆平行コイルドコイルを形成する、伸長ペプチドGGSGAKLAALKAKLAALK(SEQ ID NO:151)およびELAALEAELAALEAGGSG(SEQ ID NO:161)をコード化する配列を、リラキシン(XTEN35)リンカーフラグメントのN末端およびC末端の端部に加えた。続いて、リンカーおよび伸長フラグメントを用いてリラキシン(XTEN35)をコード化するPCRフラグメントを、重複伸長PCRの利用によってトラスツズマブIgG抗体の重鎖(CDR3H)の相補性決定領域3へと移植し、Trp99−Met107ループを交換した。トラスツズマブ−コイルリラキシン(XTEN35)ベースの融合タンパク質を、7つの変異(E233P、L234V、L235A、ΔG236、A327G、A330S、およびP331S)を包含しているヒトhIgG1 CH1−CH3定常領域で修飾し、トラスツズマブ−コイルリラキシン(CDRH3)HC融合を生成した。トラスツズマブ−コイルリラキシン(CDRH3)の発現ベクターを、pFuseバックボーンベクター(InvivoGen,CA)に対する増幅した融合遺伝子のインフレームでのライゲーションによって生成した。同様に、トラスツズマブIgG抗体の軽鎖をコード化する遺伝子(SEQ ID NO:1)を、pFuseバックボーンベクターへとクローニングした。得られた発現ベクターは、DNA塩基配列決定によって確証された。
トラスツズマブ−コイルリラキシン(XTEN35)(CDRH3)ベースの融合タンパク質を、トラスツズマブ−コイルリラキシン(XTEN35)融合タンパク質重鎖およびトラスツズマブ軽鎖をコード化するベクターでの浮遊性HEK293細胞の一過性のトランスフェクションによって発現させた。発現された融合タンパク質を、培養培地へと分泌し、トランスフェクションの48時間および96時間後に採取した。融合タンパク質を、プロテインA/Gクロマトグラフィー(Thermo Fisher Scientific, IL)によって精製し、プロテアーゼPC2で切断し、図46に示されるようにSDS−PAGEゲルによって分析した。レーン1は、DTTで処置したトラスツズマブ−コイルリラキシン(XTEN35)(CDRH3)IgGである。レーン2は、トラスツズマブ−コイルリラキシン(XTEN35)(CDRH3)IgGである。レーン3は、PC2と同時発現され、DTTで処置したトラスツズマブ−コイルリラキシン(XTEN35)(CDRH3)IgGである。レーン4は、PC2と同時発現されたトラスツズマブ−コイルリラキシン(XTEN35)(CDRH3)IgGである。レーン5はタンパク質分子量マーカーである。
Her2受容体へのトラスツズマブ−コイル−hGCSF融合タンパク質の結合親和性を、ELISAによって検査する。ヒトHer2−Fcキメラ(5μg/mL)(R&D Systems)を、4℃で一晩、96ウェルのELISAプレート上にコーティングし、その後、37℃で2時間、PBS(pH7.4)中で1%のBSAにより遮断する。PBS(pH7.4)中で0.05%のTween−20により洗浄した後に、様々な濃度のトラスツズマブIgGおよびトラスツズマブ−コイル−hGCSF融合タンパク質を、37℃での2時間のインキュベーションのためにプレートに加える。続いて、HRP抱合体(Sigma)を有するヤギのポリクローナル抗ヒトκ軽鎖抗体をプレートに加え、プレートを、37℃で2時間インキュベートする。続いて、ウェルを洗浄し、蛍光発生のペルオキシダーゼ基質を各ウェルに加えることによって、結合親和性を、425nmの蛍光強度に基づいて検査する。
Her2受容体へのトラスツズマブ−コイル−VM24融合タンパク質の結合親和性を、ELISAによって検査する。ヒトHer2−Fcキメラ(5μg/mL)(R&D Systems)を、4℃で一晩、96ウェルのELISAプレート上にコーティングし、その後、37℃で2時間、PBS(pH7.4)中で1%のBSAにより遮断する。PBS(pH7.4)中で0.05%のTween−20により洗浄した後に、様々な濃度のトラスツズマブIgGおよびトラスツズマブ−コイル−VM24融合タンパク質を、37℃で2時間プレートに加える。続いて、HRP抱合体(Sigma)を有するヤギのポリクローナル抗ヒトκ軽鎖抗体をプレートに加え、プレートを、37℃で2時間インキュベートする。続いて、ウェルを洗浄し、蛍光発生のペルオキシダーゼ基質を各ウェルに加えることによって、結合親和性を、425nmの蛍光強度に基づいて検査する。
レプチンおよびエキセンディン−4を、操作したコイルドコイルのストーク(stalk)を有するトラスツズマブバックボーンにおけるCDR−3HおよびCDR−3Lの領域に融合する。生成したヒト化の生物学的に活性な融合タンパク質は、関連する疾患の処置のための薬理学的性質を改善し得る。さらに、hLeptinおよびEx−4の組み合わせは、相乗効果を有し得る。トラスツズマブ−コイルhLeptin/Ex4融合は、融合したhLeptinおよびEx−4のフラグメントの各末端のGGGGSリンカーおよび抗体の塩基にコイルドコイルを連結するためのGGSGリンカーを包含している。
Her2受容体へのトラスツズマブ−コイル−Moka融合タンパク質の結合を、ELISAによって検査する。ヒトHer2−Fcキメラ(5μg/mL)(R&D Systems)を、4℃で一晩、96ウェルのELISAプレート上にコーティングし、その後、37℃で2時間、PBS(pH7.4)中で1%のBSAにより遮断する。PBS(pH7.4)中で0.05%のTween−20により洗浄した後に、様々な濃度のトラスツズマブIgGおよびトラスツズマブ−コイル−Moka融合タンパク質を、各ウェルに加え、プレートを37℃で2時間インキュベートする。続いて、HRP抱合体(Sigma)を有するヤギのポリクローナル抗ヒトκ軽鎖抗体をプレートに加え、プレートを、37℃で2時間インキュベートする。続いて、ウェルを洗浄し、蛍光発生のペルオキシダーゼ基質を各ウェルに加えることによって、結合親和性を、425nmの蛍光強度に基づいて検査する。
Claims (101)
- 免疫グロブリン融合タンパク質であって、
a.一次抗体領域、
b.第1治療剤、および
c.連結ペプチドを含み、
ここで、第1治療剤が、連結ペプチドによって一次抗体領域に付けられ、
連結ペプチドが、ベータストランドの二次構造を有する領域を含まない、免疫グロブリン融合タンパク質。 - 連結ペプチドが、第1伸長ペプチドを含むことを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1伸長ペプチドが、アルファヘリックスの二次構造を有する1つ以上の領域を含むことを特徴とする、請求項2に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1伸長ペプチドが、ウシ超長CDR3アミノ酸配列に基づく又は由来する7つを超える連続するアミノ酸を含まないことを特徴とする、請求項2または3に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 連結ペプチドが、第1結合ペプチドを含むことを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1結合ペプチドが、アルファヘリックスまたはベータストランドの二次構造を含まないことを特徴とする、請求項5に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、一次抗体領域のCDRに付けられていることを特徴とする、請求項2乃至6のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療剤が、一次抗体領域の1つ以上の領域に取って代わることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、一次抗体領域の1つ以上の領域に取って代わることを特徴とする、請求項1または8に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドをさらに含むことを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、第2伸長ペプチドを含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2伸長ペプチドが、アルファヘリックスの二次構造を有する1つ以上の領域を含むことを特徴とする、請求項11に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、第2結合ペプチドを含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2結合ペプチドが、アルファヘリックスまたはベータストランドの二次構造を含まないことを特徴とする、請求項13に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2治療剤をさらに含むことを特徴とする、請求項1乃至14のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、SEQ ID NO:19−36および271−273のいずれか1つに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至15のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、SEQ ID NO:19−36および271−273のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至15のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、トラスツズマブ免疫グロブリンに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至15のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、トラスツズマブ免疫グロブリンのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至15のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、パリビズマブ免疫グロブリンに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至15のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、パリビズマブ免疫グロブリンのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至15のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 二次抗体領域をさらに含むことを特徴とする、請求項1乃至21のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、抗体軽鎖の領域を含み、二次抗体領域が、抗体重鎖の領域を含むことを特徴とする、請求項22に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、抗体重鎖の領域を含み、二次抗体領域が、抗体軽鎖の領域を含むことを特徴とする、請求項22に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、抗体軽鎖の第1領域を含み、二次抗体領域が、抗体軽鎖の第2領域を含むことを特徴とする、請求項22に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 一次抗体領域が、抗体重鎖の第1領域を含み、二次抗体領域が、抗体重鎖の第2領域を含むことを特徴とする、請求項22に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 二次抗体領域が、SEQ ID NO:19−36および271−273のいずれか1つに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項22乃至26のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 二次抗体領域が、SEQ ID NO:19−36および271−273のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項22乃至26のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 二次抗体領域が、トラスツズマブ免疫グロブリンに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項22乃至26のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 二次抗体領域が、トラスツズマブ免疫グロブリンのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項22乃至26のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 二次抗体領域が、パリビズマブ免疫グロブリンに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項22乃至26のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 二次抗体領域が、パリビズマブ免疫グロブリンのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項22乃至26のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、SEQ ID NO:144−185のいずれか1つに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至32のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、SEQ ID NO:144−185のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至32のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、SEQ ID NO:144−185のいずれか1つに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、SEQ ID NO:144−185のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、プロテアーゼ切断部位を含むことを特徴とする、請求項1乃至36のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、プロテアーゼ切断部位を含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療剤が、プロテアーゼによる認識のために構成されたアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至38のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2治療剤が、プロテアーゼによる認識のために構成されたアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項15に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、1つ以上の伸長ペプチドおよび1つ以上のリンカーペプチドを含むことを特徴とする、請求項1乃至40のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、1つ以上の伸長ペプチド、1つ以上のリンカーペプチド、および1つ以上のプロテアーゼ切断部位を含むことを特徴とする、請求項1乃至40のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、1つ以上の伸長ペプチドおよび1つ以上のプロテアーゼ切断部位を含むことを特徴とする、請求項1乃至40のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1連結ペプチドが、1つ以上のリンカーペプチドおよび1つ以上のプロテアーゼ切断部位を含むことを特徴とする、請求項1乃至40のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、1つ以上の伸長ペプチドおよび1つ以上のリンカーペプチドを含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、1つ以上の伸長ペプチド、1つ以上のリンカーペプチド、および1つ以上のプロテアーゼ切断部位を含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、1つ以上の伸長ペプチドおよび1つ以上のプロテアーゼ切断部位を含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第2連結ペプチドが、1つ以上のリンカーペプチドおよび1つ以上のプロテアーゼ切断部位を含むことを特徴とする、請求項10に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療剤が、SEQ ID NO:227−267のいずれか1つに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至48のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療剤が、SEQ ID NO:227−267のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至48のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療剤が、SEQ ID NO:227−267のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約80%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項1乃至48のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療剤が、SEQ ID NO:227−267のいずれか1つに相同である約5乃至約350のアミノ酸を含む約5乃至約1,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項1乃至48のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療剤が、SEQ ID NO:227−267のいずれか1つに対する少なくとも50%の相同性を有している約5乃至約350のアミノ酸を含む約5乃至約1,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項1乃至48のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療剤が、SEQ ID NO:227−267のいずれか1つに対する少なくとも80%の相同性を有している約5乃至約350のアミノ酸を含む約5乃至約1,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項1乃至48のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:68−99のいずれか1つに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項2乃至4のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:68−99のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項2乃至4のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:68−99のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約80%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項2乃至4のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:68−99のいずれか1つに相同である約50乃至約700のアミノ酸を含む約5乃至約3,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項2乃至4のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:68−99のいずれか1つに対する少なくとも50%の相同性を有している約50乃至約700のアミノ酸を含む約5乃至約3,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項2乃至4のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:68−99のいずれか1つに対する少なくとも80%の相同性を有している約50乃至約700のアミノ酸を含む約5乃至約3,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項2乃至4のいずれかに記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 請求項55乃至60のいずれか1つの免疫グロブリン融合タンパク質をコード化する核酸を含む、第1遺伝子構築物。
- 請求項61の遺伝子構築物を含む、第1発現ベクター。
- 請求項62の第1発現ベクターを含む、哺乳動物の発現宿主。
- 免疫グロブリン融合タンパク質を生成する方法であって、
a)哺乳動物の細胞培養物中で請求項62の発現ベクターを一時的にトランスフェクトする工程、
b)制御された温度およびCO2パーセンテージで発現培地中の細胞培養物を成長させる工程、および
c)分泌された免疫グロブリン融合タンパク質を採取する工程を含む、方法。 - 免疫グロブリン融合タンパク質を精製する工程をさらに含むことを特徴とする、請求項64に記載の方法。
- 必要としている被験体において疾患または疾病を処置する方法であって、該方法が、請求項55乃至60のいずれかの治療上有効な量の免疫グロブリン融合タンパク質を被験体に投与する工程を含む、方法。
- 請求項55乃至60のいずれかの免疫グロブリン融合タンパク質を含む、医薬組成物。
- 薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含むことを特徴とする、請求項67に記載の医薬組成物。
- 免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:122−143のいずれか1つに基づく又は由来するアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項5または6に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:122−143のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約50%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項5または6に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:122−143のいずれか1つのアミノ酸配列に少なくとも約80%相同であるアミノ酸配列を含むことを特徴とする、請求項5または6に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:122−143のいずれか1つに相同である約50乃至約700のアミノ酸を含む約5乃至約3,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項5または6に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:122−143のいずれか1つに対する少なくとも約50%の相同性を有している約50乃至約700のアミノ酸を含む約5乃至約3,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項5または6に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1免疫グロブリン融合タンパク質が、SEQ ID NO:122−143のいずれか1つに対する少なくとも約80%の相同性を有している約50乃至約700のアミノ酸を含む約5乃至約3,000のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項5または6に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 請求項69乃至74のいずれか1つの免疫グロブリン融合タンパク質をコード化する核酸を含む、第1遺伝子構築物。
- 請求項75の遺伝子構築物を含む、第1発現ベクター。
- 請求項76の第1発現ベクターを含む、哺乳動物の発現宿主。
- 免疫グロブリン融合タンパク質を生成する方法であって、
d)哺乳動物の細胞培養物中で請求項76の発現ベクターを一時的にトランスフェクトする工程、
e)制御された温度およびCO2パーセンテージで発現培地中の細胞培養物を成長させる工程、および
c)分泌された免疫グロブリン融合タンパク質を採取する工程を含む、方法。 - 免疫グロブリン融合タンパク質を精製する工程をさらに含むことを特徴とする、請求項78に記載の方法。
- 必要としている被験体において疾患または疾病を処置する方法であって、該方法が、請求項69乃至74のいずれかの治療上有効な量の免疫グロブリン融合タンパク質を被験体に投与する工程を含む、方法。
- 請求項69乃至74のいずれかの免疫グロブリン融合タンパク質を含む、医薬組成物。
- 薬学的に許容可能な賦形剤をさらに含むことを特徴とする、請求項81に記載の医薬組成物。
- 第1治療用ペプチドが、好中球減少症及び/又は好中球減少症に関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、糖尿病及び/又は糖尿病に関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、肥満症及び/又は肥満症に関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、自己免疫性疾患及び/又は自己免疫性に関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、貧血症及び/又は貧血症に関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、成長ホルモン欠損症及び/又は成長ホルモンに関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、慢性閉塞性肺疾患(COPD)及び/又はCOPDに関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、疼痛を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、過敏性腸症候群(IBS)及び/又はIBSに関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、クローン病及び/又はクローン病に関連する病気を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、好中球減少症及び/又は好中球減少症に関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、代謝障害及び/又は前記代謝障害から結果として生じる疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 代謝障害が、リポジストロフィー、糖尿病、および高トリグリセリド血症を含むことを特徴とする、請求項94に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、短腸症候群及び/又は短腸症候群に関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、心不全の患者を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、線維症及び/又は線維症に関連する疾患を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 第1治療用ペプチドが、肺高血圧症、未熟な肺の人工呼吸器誘発性の損傷及び/又は肺移植拒絶反応を処置するように構成されることを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 結合ペプチドが、約0乃至約50のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項5に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
- 連結ペプチドが、約0乃至約50のアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項1に記載の免疫グロブリン融合タンパク質。
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