JP2019534321A5 - - Google Patents

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一部の実施形態では、前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、小分子、アンチセンス核酸、干渉ＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｐｉｗｉＲＮＡ、アプタマー、リボザイム、ゲノム編集、ドミナントネガティブタンパク質結合パートナー、およびこれらの組合せからなる群から選択される阻害剤である。なお別の実施形態では、前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、小分子である。別の実施形態では、前記小分子が、図１〜２２および表８に列挙されている小分子からなる群から選択される。さらに別の実施形態では、前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ハイスループットスクリーニングにおいて同定される。なお別の実施形態では、前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ＵＳＰ７の活性または発現レベルも阻害する。別の実施形態では、前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ｐ５３の活性または発現レベルを阻害しない。さらに別の実施形態では、前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、２、３、４、５、６、７、８、９、１０種またはそれよりも多いＵＳＰ１０バイオマーカーである。なお別の実施形態では、前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ＵＳＰ１０の少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルをモジュレートする。別の実施形態では、ＵＳＰ１０の前記少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルが減少する。さらに別の実施形態では、ＵＳＰ１０の前記少なくとも１種の下流標的が、ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログである。なお別の実施形態では、前記ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログが、表２に列挙されているバイオマーカーからなる群から選択される少なくとも１種のヒトＦＬＴ３である。別の実施形態では、前記ＡＭＬが、成人ＡＭＬまたは小児ＡＭＬである。さらに別の実施形態では、前記対象が、哺乳動物（例えば、ＡＭＬの動物モデルまたはヒト）である。
特定の実施形態では、例えば、以下が提供される：
（項目１）
急性骨髄芽球性白血病（ＡＭＬ）に罹患した対象を処置する方法であって、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を阻害する薬剤を該対象に投与し、これにより、該ＡＭＬに罹患した該対象を処置するステップを含み、必要に応じて、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、方法。
（項目２）
前記薬剤が、薬学的に許容される製剤で投与される、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記薬剤が、前記少なくとも１種のバイオマーカーに直接的に結合し、必要に応じて、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、項目１または２に記載の方法。
（項目４）
前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、ヒトＵＳＰ１０またはそのオーソログである、項目１から３のいずれか一項に記載の方法。
（項目５）
少なくとも１種のさらなる抗がん剤を投与するステップをさらに含み、必要に応じて、該少なくとも１種のさらなる抗がん剤が、表２に列挙されている少なくとも１種のバイオマーカーのコピー数、量および／または活性を阻害する、項目１から４のいずれか一項に記載の方法。
（項目６）
ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する方法であって、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を阻害する薬剤と該ＡＭＬ細胞を接触させ、これにより、該ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害するステップを含み、必要に応じて、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、方法。
（項目７）
前記接触させるステップを、ｉｎ ｖｉｖｏ、ｅｘ ｖｉｖｏまたはｉｎ ｖｉｔｒｏで行い、必要に応じて、前記ＡＭＬ細胞が死滅する、項目６に記載の方法。
（項目８）
前記薬剤が、薬学的に許容される製剤で投与される、項目６または７に記載の方法。
（項目９）
前記薬剤が、前記少なくとも１種のバイオマーカーに直接的に結合し、必要に応じて、前記ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、項目６から８のいずれか一項に記載の方法。
（項目１０）
前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、ヒトＵＳＰ１０またはそのオーソログである、項目６から９のいずれか一項に記載の方法。
（項目１１）
少なくとも１種のさらなる抗がん剤を投与するステップをさらに含み、必要に応じて、該少なくとも１種のさらなる抗がん剤が、表２に列挙されている少なくとも１種のバイオマーカーのコピー数、量および／または活性を阻害する、項目６から１０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
ＡＭＬに罹患したまたはＡＭＬを発症する危険性がある対象が、ＵＳＰ１０阻害剤療法から利益を得るかどうかを決定する方法であって、
ａ）該対象から生体試料を得るステップと、
ｂ）対象試料における少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を決定するステップであって、必要に応じて、該少なくとも１種のＵＳＰ１
０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーからなる群から選択される、ステップと、
ｃ）対照における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を決定するステップと、
ｄ）ステップｂ）およびｃ）において検出された該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を比較するステップと
を含み、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの該対照コピー数、量および／または活性と比べた、該対象試料における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性の存在または有意な増加が、該ＡＭＬに罹患したまたは該ＡＭＬを発症する危険性がある該対象が、ＵＳＰ１０阻害剤療法から利益を得ることを示す、方法。
（項目１３）
前記ＡＭＬが、ＵＳＰ１０阻害剤療法から利益を得ると決定される場合、ＵＳＰ１０阻害剤療法を推奨するか、処方するか、または施行するステップをさらに含む、項目１２に記載の方法。
（項目１４）
前記ＡＭＬが、ＵＳＰ１０阻害剤療法から利益を得ないと決定される場合、ＵＳＰ１０阻害剤療法以外の抗ＡＭＬ療法を推奨するか、処方するか、または施行するステップをさらに含む、項目１２に記載の方法。
（項目１５）
前記抗ＡＭＬ療法が、標的化療法、化学療法、放射線療法および／またはホルモン療法からなる群から選択される、項目１４に記載の方法。
（項目１６）
前記対照試料が、前記患者または該患者が属する同じ種のメンバーのいずれかに由来するがん性または非がん性試料から決定される、項目１２から１５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１７）
前記対照試料が、細胞を含む、項目１２から１６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１８）
臨床的有用率、死亡までの生存期間、病理学的完全奏効、病理的応答の半定量的尺度、臨床的完全寛解、臨床的部分寛解、臨床的安定疾患、無再発生存期間、無転移生存期間、無病生存期間、循環腫瘍細胞減少、循環マーカー応答およびＲＥＣＩＳＴ基準からなる群から選択される少なくとも１種の基準によって測定される、ＵＳＰ１０阻害剤療法に対する応答性を決定するステップをさらに含む、項目１２から１７のいずれか一項に記載の方法。
（項目１９）
対象におけるＡＭＬを処置するための薬剤の有効性を評価する方法であって、
ａ）第１の対象試料において、該薬剤の存在下で維持された、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量または活性を検出するステップであって、必要に応じて、該ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、ステップと、
ｂ）第２の対象試料において、該被験化合物の非存在下で維持された、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を検出するステップと、ｃ）ステップａ）およびｂ）由来の該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を比較するステップであって、該第２の対象試料と比べた、該第１の対象試料における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの有意に増加したコピー数、量および／または活性が、該薬剤が、該対象における該ＡＭＬを処置することを示す、ステップと
を含む方法。
（項目２０）
対象におけるＡＭＬの進行をモニタリングする方法であって、
ａ）対象試料において、第１の時点において、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を検出するステップであって、必要に応じて、該ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、ステップと、
ｂ）治療剤の投与後の少なくとも１つのその後の時点において、ステップａ）を反復するステップと、
ｃ）ステップａ）およびｂ）において検出されたコピー数、量および／または活性を比較するステップであって、少なくとも１種のその後の対象試料と比べた、該第１の対象試料における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの有意に増加したコピー数、量および／または活性が、該薬剤が、該対象における該ＡＭＬを処置することを示す、ステップと
を含む方法。
（項目２１）
前記第１の時点と前記その後の時点との間に、前記対象が、処置を受けている、処置を完了している、および／または前記ＡＭＬが寛解している、項目２０に記載の方法。
（項目２２）
前記第１の時点と前記その後の時点との間に、前記対象が、ＵＳＰ１０阻害剤療法を受けている、項目２０または２１に記載の方法。
（項目２３）
前記第１のおよび／または少なくとも１種のその後の試料が、ｅｘ ｖｉｖｏ試料およびｉｎ ｖｉｖｏ試料からなる群から選択される、項目２０から２２のいずれか一項に記載の方法。
（項目２４）
前記第１のおよび／または少なくとも１種のその後の試料が、ＡＭＬの動物モデルから得られる、項目２０から２３のいずれか一項に記載の方法。
（項目２５）
前記第１のおよび／または少なくとも１種のその後の試料が、前記対象から得られる単一の試料またはプールされた試料の部分である、項目２０から２４のいずれか一項に記載の方法。
（項目２６）
ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長および／またはＡＭＬ細胞死をモジュレートする薬剤を同定するための細胞に基づく方法であって、
ａ）被験薬剤と、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーを発現する細胞を接触させるステップであって、必要に応じて、該ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、ステップと
ｂ）該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、発現レベルまたは活性レベルに対する該被験薬剤の効果を決定して、これにより、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長および／またはＡＭＬ細胞死をモジュレートする薬剤を同定するステップと
を含む方法。
（項目２７）
前記細胞が、ＡＭＬの動物モデルから単離される、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
前記細胞が、ＡＭＬに罹患した対象に由来する、項目２６または２７に記載の方法。
（項目２９）
前記細胞が、ＵＳＰ１０阻害剤療法に対して非応答性である、項目２６から２８のいずれか一項に記載の方法。
（項目３０）
前記接触させるステップを、ｉｎ ｖｉｖｏ、ｅｘ ｖｉｖｏまたはｉｎ ｖｉｔｒｏで行い、必要に応じて、前記薬剤が、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／
またはＡＭＬ細胞死を促進する、項目２６から２９のいずれか一項に記載の方法。
（項目３１）
前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、発現レベルまたは活性レベルに対する前記被験薬剤の効果を決定する前または後に、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーに結合する該被験薬剤の能力を決定するステップをさらに含み、必要に応じて、該薬剤が、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／またはＡＭＬ細胞死を促進する、項目２６から３０のいずれか一項に記載の方法。
（項目３２）
前記試料が、前記対象から得られる細胞、細胞系、組織学的スライド、パラフィン包埋組織、新鮮凍結組織、新鮮組織、生検、血液、血漿、血清、口腔内切屑、唾液、脳脊髄液、尿、糞便、粘液または骨髄を含む、項目１２から３１のいずれか一項に記載の方法。
（項目３３）
ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／またはＡＭＬ細胞死を促進する薬剤を同定するための無細胞の方法であって、
ａ）被験薬剤と接触した、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量または活性に対する被験薬剤の効果を決定するステップであって、必要に応じて、該ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、ステップと、
ｂ）該被験薬剤の非存在下で維持された該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量または活性を決定するステップと、
ｃ）ステップａ）およびｂ）由来の該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量および／または活性を比較するステップであって、ステップｂ）と比べた、ステップａ）における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの有意に減少した量および／または活性が、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／またはＡＭＬ細胞死を促進する薬剤として該被験薬剤を同定する、ステップと
を含む方法。
（項目３４）
前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量または活性に対する前記被験薬剤の効果を決定する前または後に、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーに結合する該被験薬剤の能力を決定するステップをさらに含む、項目３３に記載の方法。
（項目３５）
前記被験薬剤と、前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーを発現するＡＭＬ細胞を接触させて、接触するステップを含む、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／またはＡＭＬ細胞死を促進する該被験薬剤の能力を確認するステップをさらに含む、項目３３または３４に記載の方法。
（項目３６）
前記コピー数が、マイクロアレイ、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）、ハイスループットシークエンシング、比較ゲノムハイブリダイゼーション（ＣＧＨ）または蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）によって評価される、項目１２から３５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３７）
前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量が、前記試料における、該バイオマーカーをコードするポリヌクレオチド分子または該ポリヌクレオチド分子の部分の存在を検出することにより評価される、項目１２から３５のいずれか一項に記載の方法。
（項目３８）
前記ポリヌクレオチド分子が、ｍＲＮＡ、ｃＤＮＡまたはその機能的改変体もしくは断片である、項目３７に記載の方法。
（項目３９）
前記検出するステップが、前記ポリヌクレオチド分子を増幅するステップをさらに含む、項目３７に記載の方法。
（項目４０）
前記少なくとも１種のバイオマーカーの量が、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、該１種もしくは複数種のバイオマーカーをコードする前記ポリヌクレオチドまたは該ポリヌクレオチド分子の部分の前記試料と核酸プローブをアニールすることにより評価される、項目１２から３９のいずれか一項に記載の方法。
（項目４１）
前記少なくとも１種のバイオマーカーの量が、前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのポリペプチドの存在を検出することにより評価される、項目１２から３９のいずれか一項に記載の方法。
（項目４２）
前記ポリペプチドの存在が、該ポリペプチドと特異的に結合する試薬を使用して検出される、項目４１に記載の方法。
（項目４３）
前記試薬が、抗体、抗体誘導体および抗体断片からなる群から選択される、項目４２に記載の方法。
（項目４４）
前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの活性が、前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルのモジュレーションの大きさを決定することにより評価される、項目１２から３９のいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの前記少なくとも１種の下流標的が、ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログである、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
前記ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログが、表２に列挙されているバイオマーカーからなる群から選択される少なくとも１種のヒトＦＬＴ３である、項目４５に記載の方法。
（項目４７）
前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、小分子、抗ＵＳＰ１０イントラボディまたはその抗原結合性断片、アンチセンス核酸、干渉ＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｐｉｗｉＲＮＡ、アプタマー、リボザイム、ゲノム編集、ドミナントネガティブタンパク質結合パートナー、およびこれらの組合せからなる群から選択される阻害剤である、項目１から４６のいずれか一項に記載の方法。
（項目４８）
前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、小分子である、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
前記小分子が、図１〜２２および表８に列挙されている小分子からなる群から選択される、項目４８に記載の方法。
（項目５０）
前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ハイスループットスクリーニングにおいて同定される、項目１から４９のいずれか一項に記載の方法。
（項目５１）
前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ＵＳＰ７の活性または発現レベルも阻害する、項目１から５０のいずれか一項に記載の方法。
（項目５２）
前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ｐ５３の活性または発現レベルを阻害しない、項目１から５１のいずれか一項に記載の方法。
（項目５３）
前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、２、３、４、５、６、７、８、９、１０種またはそれよりも多いＵＳＰ１０バイオマーカーである、項目１から５２のい
ずれか一項に記載の方法。
（項目５４）
前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ＵＳＰ１０の少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルをモジュレートする、項目１から５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目５５）
ＵＳＰ１０の前記少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルが減少する、項目５４に記載の方法。
（項目５６）
ＵＳＰ１０の前記少なくとも１種の下流標的が、ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログである、項目５４または５５に記載の方法。
（項目５７）
前記ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログが、表２に列挙されているバイオマーカーからなる群から選択される少なくとも１種のヒトＦＬＴ３である、項目５６に記載の方法。
（項目５８）
前記ＡＭＬが、成人ＡＭＬまたは小児ＡＭＬである、項目１から５７のいずれか一項に記載の方法。
（項目５９）
前記対象が、哺乳動物である、項目１から５８のいずれか一項に記載の方法。
（項目６０）
前記哺乳動物が、ＡＭＬの動物モデルである、項目５９に記載の方法。
（項目６１）
前記哺乳動物が、ヒトである、項目５９に記載の方法。

Claims (76)

  1. 急性骨髄芽球性白血病（ＡＭＬ）に罹患した対象を処置する方法において使用するための組成物であって、該組成物は、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を阻害する薬剤を含み、該方法は、該組成物を該対象に投与するステップを含み、必要に応じて、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、組成物。
  2. 前記組成物が、薬学的に許容される製剤である、請求項１に記載の組成物。
  3. 前記薬剤が、前記少なくとも１種のバイオマーカーに直接的に結合し、必要に応じて、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、請求項１または２に記載の組成物。
  4. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、ヒトＵＳＰ１０またはそのオーソログである、請求項１から３のいずれか一項に記載の組成物。
  5. 前記方法は、少なくとも１種のさらなる抗がん剤を投与するステップをさらに含み、必要に応じて、該少なくとも１種のさらなる抗がん剤が、表２に列挙されている少なくとも１種のバイオマーカーのコピー数、量および／または活性を阻害する、請求項１から４のいずれか一項に記載の組成物。
  6. ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する方法において使用するための組成物であって、該組成物は、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を阻害する薬剤を含み、該方法は、該薬剤と該ＡＭＬ細胞を接触させるステップを含み、必要に応じて、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、組成物。
  7. 前記接触させるステップを、ｉｎ ｖｉｖｏ、ｅｘ ｖｉｖｏまたはｉｎ ｖｉｔｒｏで行い、必要に応じて、前記ＡＭＬ細胞が死滅する、請求項６に記載の組成物。
  8. 前記組成物が、薬学的に許容される製剤である、請求項６または７に記載の組成物。
  9. 前記薬剤が、前記少なくとも１種のバイオマーカーに直接的に結合し、必要に応じて、前記ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、請求項６から８のいずれか一項に記載の組成物。
  10. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、ヒトＵＳＰ１０またはそのオーソログである、請求項６から９のいずれか一項に記載の組成物。
  11. 前記方法が、少なくとも１種のさらなる抗がん剤を投与するステップをさらに含み、必要に応じて、該少なくとも１種のさらなる抗がん剤が、表２に列挙されている少なくとも１種のバイオマーカーのコピー数、量および／または活性を阻害する、請求項６から１０のいずれか一項に記載の組成物。
  12. 少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの対照コピー数、量および／または活性と比べた、対象試料における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性の存在または有意な増加を、ＡＭＬに罹患したまたはＡＭＬを発症する危険性がある対象が、ＵＳＰ１０阻害剤療法から利益を得るかどうかを決定するための指標とする方法であって、
    ａ）該対象から得られた生体試料における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を決定するステップであって、必要に応じて、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーからなる群から選択される、ステップと、
    ｂ）対照における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を決定するステップと、
    ｃ）ステップａ）およびｂ）において検出された該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を比較するステップと
    を含み、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの該対照コピー数、量および／または活性と比べた、該対象試料における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性の存在または有意な増加が、該ＡＭＬに罹患したまたは該ＡＭＬを発症する危険性がある該対象が、ＵＳＰ１０阻害剤療法から利益を得ることを示す、方法。
  13. 前記ＡＭＬが、ＵＳＰ１０阻害剤療法から利益を得ると決定される場合、ＵＳＰ１０阻害剤療法を推奨するか、処方するか、または施行するステップをさらに含む、請求項１２に記載の方法。
  14. 前記ＡＭＬが、ＵＳＰ１０阻害剤療法から利益を得ないと決定される場合、ＵＳＰ１０阻害剤療法以外の抗ＡＭＬ療法を推奨するか、処方するか、または施行するステップをさらに含む、請求項１２に記載の方法。
  15. 前記抗ＡＭＬ療法が、標的化療法、化学療法、放射線療法および／またはホルモン療法からなる群から選択される、請求項１４に記載の方法。
  16. 前記対照試料が、前記患者または該患者が属する同じ種のメンバーのいずれかに由来するがん性または非がん性試料から決定される、請求項１２から１５のいずれか一項に記載の方法。
  17. 前記対照試料が、細胞を含む、請求項１２から１６のいずれか一項に記載の方法。
  18. 臨床的有用率、死亡までの生存期間、病理学的完全奏効、病理的応答の半定量的尺度、臨床的完全寛解、臨床的部分寛解、臨床的安定疾患、無再発生存期間、無転移生存期間、無病生存期間、循環腫瘍細胞減少、循環マーカー応答およびＲＥＣＩＳＴ基準からなる群から選択される少なくとも１種の基準によって測定される、ＵＳＰ１０阻害剤療法に対する応答性を決定するステップをさらに含む、請求項１２から１７のいずれか一項に記載の方法。
  19. 第２の対象試料と比べた、第１の対象試料における少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの有意に増加したコピー数、量および／または活性を、対象におけるＡＭＬを処置するための薬剤の有効性の評価の指標とする方法であって、
    ａ）該第１の対象試料において、該薬剤の存在下で維持された、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量または活性を検出するステップであって、必要に応じて、該ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、ステップと、
    ｂ）該第２の対象試料において、該被験化合物の非存在下で維持された、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を検出するステップと、ｃ）ステップａ）およびｂ）由来の該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を比較するステップであって、該第２の対象試料と比べた、該第１の対象試料における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの有意に増加したコピー数、量および／または活性が、該薬剤が、該対象における該ＡＭＬを処置することを示す、ステップと
    を含む方法。
  20. 少なくとも１種のその後の対象試料と比べた、第１の時点の対象試料における少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの有意に増加したコピー数、量および／または活性を、対象におけるＡＭＬの進行のモニタリングの指標とする方法であって、
    ａ）該第１の対象試料において、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、量および／または活性を検出するステップであって、必要に応じて、該ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、ステップと、
    ｂ）治療剤の投与後の少なくとも１つのその後の時点において、ステップａ）を反復するステップと、
    ｃ）ステップａ）およびｂ）において検出されたコピー数、量および／または活性を比較するステップであって、少なくとも１種のその後の対象試料と比べた、該第１の対象試料における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの有意に増加したコピー数、量および／または活性が、該薬剤が、該対象における該ＡＭＬを処置することを示す、ステップと
    を含む方法。
  21. 前記第１の時点と前記その後の時点との間に、前記対象が、処置を受けている、処置を完了している、および／または前記ＡＭＬが寛解している、請求項２０に記載の方法。
  22. 前記第１の時点と前記その後の時点との間に、前記対象が、ＵＳＰ１０阻害剤療法を受けている、請求項２０または２１に記載の方法。
  23. 前記第１のおよび／または少なくとも１種のその後の試料が、ｅｘ ｖｉｖｏ試料およびｉｎ ｖｉｖｏ試料からなる群から選択される、請求項２０から２２のいずれか一項に記載の方法。
  24. 前記第１のおよび／または少なくとも１種のその後の試料が、ＡＭＬの動物モデルから得られる、請求項２０から２３のいずれか一項に記載の方法。
  25. 前記第１のおよび／または少なくとも１種のその後の試料が、前記対象から得られる単一の試料またはプールされた試料の部分である、請求項２０から２４のいずれか一項に記載の方法。
  26. ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長および／またはＡＭＬ細胞死をモジュレートする薬剤を同定するための細胞に基づく方法であって、
    ａ）被験薬剤と、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーを発現する細胞を接触させるステップであって、必要に応じて、該ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、ステップと
    ｂ）該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、発現レベルまたは活性レベルに対する該被験薬剤の効果を決定して、これにより、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長および／またはＡＭＬ細胞死をモジュレートする薬剤を同定するステップと
    を含む方法。
  27. 前記細胞が、ＡＭＬの動物モデルから単離される、請求項２６に記載の方法。
  28. 前記細胞が、ＡＭＬに罹患した対象に由来する、請求項２６または２７に記載の方法。
  29. 前記細胞が、ＵＳＰ１０阻害剤療法に対して非応答性である、請求項２６から２８のいずれか一項に記載の方法。
  30. 前記接触させるステップを、ｉｎ ｖｉｖｏ、ｅｘ ｖｉｖｏまたはｉｎ ｖｉｔｒｏで行い、必要に応じて、前記薬剤が、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／
    またはＡＭＬ細胞死を促進する、請求項２６から２９のいずれか一項に記載の方法。
  31. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのコピー数、発現レベルまたは活性レベルに対する前記被験薬剤の効果を決定する前または後に、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーに結合する該被験薬剤の能力を決定するステップをさらに含み、必要に応じて、該薬剤が、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／またはＡＭＬ細胞死を促進する、請求項２６から３０のいずれか一項に記載の方法。
  32. 前記試料が、前記対象から得られる細胞、細胞系、組織学的スライド、パラフィン包埋組織、新鮮凍結組織、新鮮組織、生検、血液、血漿、血清、口腔内切屑、唾液、脳脊髄液、尿、糞便、粘液または骨髄を含む、請求項１２から３１のいずれか一項に記載の方法。
  33. ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／またはＡＭＬ細胞死を促進する薬剤を同定するための無細胞の方法であって、
    ａ）被験薬剤と接触した、少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量または活性に対する被験薬剤の効果を決定するステップであって、必要に応じて、該ＵＳＰ１０バイオマーカーが、表１に列挙されているＵＳＰ１０バイオマーカーの群から選択される、ステップと、
    ｂ）該被験薬剤の非存在下で維持された該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量または活性を決定するステップと、
    ｃ）ステップａ）およびｂ）由来の該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量および／または活性を比較するステップであって、ステップｂ）と比べた、ステップａ）における該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの有意に減少した量および／または活性が、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／またはＡＭＬ細胞死を促進する薬剤として該被験薬剤を同定する、ステップと
    を含む方法。
  34. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量または活性に対する前記被験薬剤の効果を決定する前または後に、該少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーに結合する該被験薬剤の能力を決定するステップをさらに含む、請求項３３に記載の方法。
  35. 前記被験薬剤と、前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーを発現するＡＭＬ細胞を接触させて、接触するステップを含む、ＡＭＬ細胞の過剰増殖性成長を阻害する、および／またはＡＭＬ細胞死を促進する該被験薬剤の能力を確認するステップをさらに含む、請求項３３または３４に記載の方法。
  36. 前記コピー数が、マイクロアレイ、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）、ハイスループットシークエンシング、比較ゲノムハイブリダイゼーション（ＣＧＨ）または蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）によって評価される、請求項１２から３５のいずれか一項に記載の方法。
  37. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの量が、前記試料における、該バイオマーカーをコードするポリヌクレオチド分子または該ポリヌクレオチド分子の部分の存在を検出することにより評価される、請求項１２から３５のいずれか一項に記載の方法。
  38. 前記ポリヌクレオチド分子が、ｍＲＮＡ、ｃＤＮＡまたはその機能的改変体もしくは断片である、請求項３７に記載の方法。
  39. 前記検出するステップが、前記ポリヌクレオチド分子を増幅するステップをさらに含む、請求項３７に記載の方法。
  40. 前記少なくとも１種のバイオマーカーの量が、ストリンジェントなハイブリダイゼーション条件下で、該１種もしくは複数種のバイオマーカーをコードする前記ポリヌクレオチドまたは該ポリヌクレオチド分子の部分の前記試料と核酸プローブをアニールすることにより評価される、請求項１２から３９のいずれか一項に記載の方法。
  41. 前記少なくとも１種のバイオマーカーの量が、前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーのポリペプチドの存在を検出することにより評価される、請求項１２から３９のいずれか一項に記載の方法。
  42. 前記ポリペプチドの存在が、該ポリペプチドと特異的に結合する試薬を使用して検出される、請求項４１に記載の方法。
  43. 前記試薬が、抗体、抗体誘導体および抗体断片からなる群から選択される、請求項４２に記載の方法。
  44. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの活性が、前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルのモジュレーションの大きさを決定することにより評価される、請求項１２から３９のいずれか一項に記載の方法。
  45. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーの前記少なくとも１種の下流標的が、ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログである、請求項４４に記載の方法。
  46. 前記ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログが、表２に列挙されているバイオマーカーからなる群から選択される少なくとも１種のヒトＦＬＴ３である、請求項４５に記載の方法。
  47. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、小分子、抗ＵＳＰ１０イントラボディまたはその抗原結合性断片、アンチセンス核酸、干渉ＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｐｉｗｉＲＮＡ、アプタマー、リボザイム、ゲノム編集、ドミナントネガティブタンパク質結合パートナー、およびこれらの組合せからなる群から選択される阻害剤である、請求項１から１１のいずれか一項に記載の組成物。
  48. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、小分子である、請求項４７に記載の組成物。
  49. 前記小分子が、図１〜２２および表８に列挙されている小分子からなる群から選択される、請求項４８に記載の組成物。
  50. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ハイスループットスクリーニングにおいて同定される、請求項１から１１および４７から４９のいずれか一項に記載の組成物。
  51. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ＵＳＰ７の活性または発現レベルも阻害する、請求項１から１１および４７から５０のいずれか一項に記載の組成物。
  52. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ｐ５３の活性または発現レベルを阻害しない、請求項１から１１および４７から５１のいずれか一項に記載の組成物。
  53. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、２、３、４、５、６、７、８、９、１０種またはそれよりも多いＵＳＰ１０バイオマーカーである、請求項１から１１および４７から５２のいずれか一項に記載の組成物。
  54. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ＵＳＰ１０の少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルをモジュレートする、請求項１から１１および４７から５３のいずれか一項に記載の組成物。
  55. ＵＳＰ１０の前記少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルが減少する、請求項５４に記載の組成物。
  56. ＵＳＰ１０の前記少なくとも１種の下流標的が、ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログである、請求項５４または５５に記載の組成物。
  57. 前記ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログが、表２に列挙されているバイオマーカーからなる群から選択される少なくとも１種のヒトＦＬＴ３である、請求項５６に記載の組成物。
  58. 前記ＡＭＬが、成人ＡＭＬまたは小児ＡＭＬである、請求項１から１１および４７から５７のいずれか一項に記載の組成物。
  59. 前記対象が、哺乳動物である、請求項１から１１および４７から５８のいずれか一項に記載の組成物。
  60. 前記哺乳動物が、ＡＭＬの動物モデルである、請求項５９に記載の組成物。
  61. 前記哺乳動物が、ヒトである、請求項５９に記載の組成物。
  62. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、小分子、抗ＵＳＰ１０イントラボディまたはその抗原結合性断片、アンチセンス核酸、干渉ＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、ｐｉｗｉＲＮＡ、アプタマー、リボザイム、ゲノム編集、ドミナントネガティブタンパク質結合パートナー、およびこれらの組合せからなる群から選択される阻害剤である、請求項１２から４６のいずれか一項に記載の方法。
  63. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、小分子である、請求項６２に記載の方法。
  64. 前記小分子が、図１〜２２および表８に列挙されている小分子からなる群から選択される、請求項６３に記載の方法。
  65. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ハイスループットスクリーニングにおいて同定される、請求項１２から４６および６２から６４のいずれか一項に記載の方法。
  66. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ＵＳＰ７の活性または発現レベルも阻害する、請求項１２から４６および６２から６５のいずれか一項に記載の方法。
  67. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ｐ５３の活性または発現レベルを阻害しない、請求項１２から４６および６２から６６のいずれか一項に記載の方法。
  68. 前記少なくとも１種のＵＳＰ１０バイオマーカーが、２、３、４、５、６、７、８、９、１０種またはそれよりも多いＵＳＰ１０バイオマーカーである、請求項１２から４６および６２から６７のいずれか一項に記載の方法。
  69. 前記ＵＳＰ１０阻害剤療法または被験薬剤が、ＵＳＰ１０の少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルをモジュレートする、請求項１２から４６および６２から６８のいずれか一項に記載の方法。
  70. ＵＳＰ１０の前記少なくとも１種の下流標的の活性または発現レベルが減少する、請求項６９に記載の方法。
  71. ＵＳＰ１０の前記少なくとも１種の下流標的が、ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログである、請求項６９または７０に記載の方法。
  72. 前記ヒトＦＬＴ３またはそのオーソログが、表２に列挙されているバイオマーカーからなる群から選択される少なくとも１種のヒトＦＬＴ３である、請求項７１に記載の方法。
  73. 前記ＡＭＬが、成人ＡＭＬまたは小児ＡＭＬである、請求項１２から４６および６２から７２のいずれか一項に記載の方法。
  74. 前記対象が、哺乳動物である、請求項１２から４６および６２から７３のいずれか一項に記載の方法。
  75. 前記哺乳動物が、ＡＭＬの動物モデルである、請求項７４に記載の方法。
  76. 前記哺乳動物が、ヒトである、請求項７４に記載の方法。
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