JP2018537690A - コヒーレントラマンイメージング用生検装置 - Google Patents

Abstract

生体サンプルを分析する装置及びシステムが提供される。装置には、第１端部から第２端部に延在する中空体が含まれる。この本体は、サンプル収集部を画定する。この本体の第１端部の第１開口部は、陰圧源を収容するよう構成され、該本体の第２端部の第２開口部は、生体サンプルを収容するよう構成されている。この本体には、サンプル収集部に対応する領域に配置された光透過性領域がさらに含まれる。この光透過性領域は、サンプル収集部に配置された場合に生体サンプルのイメージングを実行可能なイメージング装置からの電磁波を透過するよう構成されている。

Description

〔政府の支援〕
本発明は、国立衛生研究所により与えられたＥＢ０１７２５４の下での米国政府支援によりなされた。米国政府は本発明において一定の権利を有する。

〔関連出願の相互参照〕
本出願は、２０１５年９月２５日に出願された米国特許出願第６２／２３２，６３３号の利益及び優先権を主張するものである。その全開示が参照により本明細書に組み込まれる。

本開示は、被検者から生体組織サンプルや生検を取得し分析を行う装置及び方法に関するものである。

この節は、本開示に関係する背景情報を提供するものであり、それは必ずしも従来技術ではない。

外科的切除術は、大半の腫瘍に対する治療の基本である。腫瘍の多くは切除キャビティ内又は近くで再発することから、切除範囲（ＥＯＲ）や手術中に除去された腫瘍の割合は、重要な予後因子である。低グレード脳腫瘍では、ＥＯＲが少なくとも９０％の患者は、８年間の全生存率が９１％であったのに対し、ＥＯＲが９０％未満の患者は、８年間の全生存率が６０％であったのことが最近の研究で分かっている。より広範囲に外科切除は、高グレード神経膠腫では長寿と関連しているという証拠も山のように存在する。残念ながら、切除範囲を安全に最大化すること、すなわち、健康な脳組織に危害を加えずにがん領域を除去することは、一つには腫瘍と正常な脳組織を区別することが困難であることから、いまだ課題である。従って、脳腫瘍患者にとっては、次善の手術結果が一般的である。安全に切除可能な腫瘍を持つ患者の中でも、Ｘ線写真上完全な切除が行われたのはたった２３．５％の患者にすぎないことが臨床研究で分かっている。乳がんでは、手術後に残存腫瘍が特定されるので、二次手術も非常に高い率（病院によっては１０から４５％の率）で生じる。皮膚がんでは、その率は約１０％である。よって、ＥＯＲを向上させる装置及び方法が望ましい。

この節は、本開示の概要を提供するものであり、その全範囲あるいは特徴の全てを包括的に開示するものではない。

本技術によれば、生体サンプルを分析する生検装置が提供される。この装置には、第１端部から第２端部まで延在する中空体が含まれる。この本体は、サンプル収集部を画定する。この本体の第１端部の第１開口部は、陰圧源を収容するよう構成され、該本体の第２端部の第２開口部は、生体サンプルを収容するよう構成されている。この本体には、サンプル収集部に対応する領域に配置された光透過性領域がさらに含まれる。この光透過性領域は、サンプル収集部に配置された場合に生体サンプルのイメージングを実行可能なイメージング装置からの電磁波を透過するよう構成されている。

また、本技術によれば、生体装置と、その生体装置に配置された場合に生体サンプルのイメージングを行うイメージング装置とを備えたイメージングシステムも提供される。この生検装置には、第１端部から第２端部まで延在する本体が含まれる。この本体は、サンプル収集部を画定する。この本体の第１端部の第１開口部は、陰圧源を収容するよう構成され、該本体の第２端部の第２開口部は、生体サンプルを収容するよう構成されている。この本体には、サンプル収集部に対応する領域に配置された光透過性領域がさらに含まれる。この光透過性領域は、サンプル収集部に配置された場合に生体サンプルのイメージングを実行可能なイメージング装置からの電磁波を透過するよう構成されている。このイメージング装置は、誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）装置、コヒーレント反ストークスラマン散乱（ＣＡＲＳ）装置、共焦点ラマン装置、共焦点反射装置、共焦点蛍光装置、光コヒーレンストモグラフィー（ＯＣＴ）装置、２光子励起蛍光（ＴＰＥＦ）装置、第２高調波発生（ＳＨＧ）装置、第３高調波発生（ＴＨＧ）装置であればよい。

さらに、本技術によれば、被検者から組織を採取する方法が提供される。この方法には、生検装置により被検者から生体サンプルを採取する工程が含まれる。この生検装置には、第１端部から第２端部まで延在する本体が含まれる。この本体は、サンプル収集部を画定する。この本体の第１端部の第１開口部は、陰圧源を収容するよう構成され、該本体の第２端部の第２開口部は、生体サンプルを収容するよう構成されている。この本体には、サンプル収集部に対応する領域に配置された光透過性領域がさらに含まれる。この光透過性領域は、サンプル収集部に配置された場合に生体サンプルのイメージングを実行可能なイメージング装置からの電磁波を透過するよう構成されている。従って、生体サンプルは、生検装置のサンプル収集部に収集される。また、この方法には、生検装置のサンプル収集部に生体サンプルを保持しながら生体サンプルのイメージングを行って、生体サンプルの光学画像を取得する工程と、その光学画像を画面に表示する工程とがさらに含まれる。

さらに、本技術によれば、少なくとも一つの使い捨て生検装置を含むキットが提供される。この少なくとも一つの生検装置には、第１端部から第２端部まで延在する本体が含まれる。この本体は、サンプル収集部を画定する。この本体の第１端部の第１開口部は、陰圧源を収容するよう構成され、該本体の第２端部の第２開口部は、生体サンプルを収容するよう構成されている。この本体には、サンプル収集部に対応する領域に配置された光透過性領域がさらに含まれる。この光透過性領域は、サンプル収集部に配置された場合に生体サンプルのイメージングを実行可能なイメージング装置からの電磁波を透過するよう構成されている。この少なくとも一つの生検装置は、滅菌状態で包装されている。

本明細書に提示された説明から、さらなる適用可能分野が明らかになるであろう。この概要における説明及び特定の例は、単に例示することを意図され、本開示の範囲を限定することを意図されたものではない。

本明細書で説明される図面は、選択された実施形態を例示することのみを目的とし、すべての可能な実施例ではなく、本開示の範囲を限定することを意図されていない。

対応する符号は、図面のいくつかの図全体にわたって対応する構成要素を示している。

脳腫瘍の手術前ＭＲＩスキャンを示す図である。 腫瘍のある脳の全体像を示す図である。 さまざまな多光子顕微鏡法（ＭＰＭ）及び分光法を示すエネルギー図である。 例示的なコヒーレントラマン散乱（ＣＲＳ）顕微鏡システムを示す模式図である。 例示的なファイバレーザーベースのコヒーレントラマン散乱（ＣＲＳ）顕微鏡を示す図である。 ファイバレーザーベースの誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）システムによって得られた脳組織のＳＲＳイメージを示す図である。 ラマンスペクトルのグラフを示す図である。 青と緑で表示された誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）画像を示す図である。 ピンクと紫で表示された誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）画像を示す図である。 広範囲のステッチＳＲＳ画像を示す図である。 マウス脳の誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）画像とヘマトキシリン及びエオジン（Ｈ＆Ｅ）画像を示す図である。 正常又はわずかに過形成の大脳皮質組織のＳＲＳ及びＨ＆Ｅ画像を示す図である。 浸潤性神経膠腫のＳＲＳ及びＨ＆Ｅ画像を示す図である。 高密度神経膠腫のＳＲＳ及びＨ＆Ｅ画像を示す図である。 膠芽腫の磁気共鳴イメージング（ＭＲＩ）画像を示す図である。 誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）とヘマトキシリン及びエオジン（Ｈ＆Ｅ）顕微鏡法の両方における生存腫瘍の過形成と核異型を示す図である。 血管複合体のＳＲＳ及びＨ＆Ｅ画像を示す図である。 有糸分裂像のＳＲＳ及びＨ＆Ｅ画像を示す図である。 乏突起膠腫のＭＲＩを示す図である。 乏突起膠腫内の過形成組織のＳＲＳ及びＨ＆Ｅ画像を示す図である。 血管のＳＲＳ及びＨ＆Ｅ画像を示す図である。 神経周囲浸潤のＳＲＳ及びＨ＆Ｅ画像を示す図である。 生検装置を示す図である。 外科吸引装置に取り付けられた生検チップを示す図である。 吸引装置に取り付けられた生検チップの写真を示す図である。 生検チップとして構成された生検装置を示す図である。 図１２Ａの生検装置の１２Ｂ線に沿った断面図である。 図１２Ａの生検装置の１２Ｃ線に沿った断面図である。 図１２Ａの生検装置の１２Ｃ線に沿った断面図である。 図１２Ａの生検装置の１２Ｅ線に沿った断面図である。 チャネル高さ２００μｍ、チャネル幅４ｍｍ、壁厚２００μｍの長方形のガラス毛管で取得した２色誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）画像を示す図である。 チャネルに位置する脳腫瘍の誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）画像を示す図である。 本技術のいくつかの態様に係る生検装置を示す斜視図である。 図１４Ａの生検装置の分解図である。 図１４Ａの生検装置の上面図である。 図１４Ｃの生検装置の１４Ｄ線に沿った断面図である。 図１４Ａの生検装置の下部を示す斜視図である。 図１４Ｅの生検装置の部分上面図である。 図１４Ｅの生検装置の１４Ｇ線に沿った断面図である。 本技術のさまざまな態様に係る生検装置を示す図である。 図１５Ａの生検装置の上断面図である。 図１５Ａの生検装置の１５Ｃ線に沿った断面図である。 本技術のいくつかの態様に係る生検装置を示す図である。 図１６Ａの生検装置の上断面図である。 図１６Ａの生検装置の１６Ｃ線に沿った側断面図である。 本技術のいくつかの態様に係る生検装置の一部のサンプル導入部を示す上断面図である。 図１７Ａのサンプル導入部の１７Ｂ線に沿った側断面図である。 本技術のいくつかの態様に係る生検装置の一部のサンプル導入部を示す上断面図である。 図１８Ａのサンプル導入部の１８Ｂ線に沿った側断面図である。 本技術のいくつかの態様に係る外部キャリアバイアルに挿入された生検装置を示す図である。 図１９Ａの外部キャリアバイアルに挿入された生検装置の側面斜視図である。 生検サンプルを分析するシステムを示す図である。 本技術のいくつかの態様に係る第１複合装置を示す図である。 本技術のいくつかの態様に係る第２複合装置を示す図である。 本技術に係る生検装置とイメージャの使用についての例示的なワークフローを示す図である。 生体外リアルタイム組織学による例示的なワークフローを示すブロック図である。 磁気共鳴イメージング（ＭＲＩ）データと誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）データとに同時に基づくナビゲーションを可能にする生体内リアルタイム組織学の例示的な臨床ワークフローを示す図である。 術中の磁気共鳴イメージング（ＭＲＩ）及び誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）ワークフローの比較を示す図である。 ナビゲーションデータとＳＲＳデータの結合例を示す図である。 複数の生検を採取する走査パターンを示す図である。 腫瘍浸潤の度合いを算出するための誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）画像の分類を示す図である。 高濃度腫瘍（上）、浸潤性腫瘍（中）、正常組織において検出された核の誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）顕微鏡視野（ＦＯＶ）の分割を示す図である。 高濃度腫瘍（上）、浸潤性腫瘍（中）、正常組織において検出された軸索のＳＲＳ ＦＯＶの分割を示す図である。 手動で画像分割により検出されたＦＯＶ当たりの平均核数を示すグラフである。 手動で画像分割により評価された軸索密度を示すグラフである。 誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）顕微鏡法によりイメージングが行われた正常組織の定量分析を示す図である。 さまざまな遷移における組織画像を示す図である。

例示的な実施例について、添付の図面を参照してより十分に説明する

本明細書で使用される専門用語は、特定の例示的な実施形態を説明する目的のみのためであり、限定を意図するものではない。本明細書で使用される単数形「１つの（ａ、ａｎ、ｔｈｅ）」は、別途状況が明白に示されない限り、複数形もまた含むことが意図され得る。「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」、「備える（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、及び「有する（ｈａｖｉｎｇ）」の用語は、提示された特徴、要素、組成物、ステップ、整数、動作、及び／又は構成要素の存在を含み、ひいては指定するが、１つ又は複数の他の特徴、整数、ステップ、動作、要素、構成要素、及び／又はそれらの群の存在又は追加を排除しない。オープンエンドの用語「備える」は、本明細書に記載された様々な実施形態を説明かつ特許請求するために使用する、非制限的な用語として理解されるべきだが、ある態様ではこの用語は、「からなる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｏｆ）」又は「から本質的になる（ｃｏｎｓｉｓｔｉｎｇ ｅｓｓｅｎｔｉａｌｌｙ ｏｆ）などの、より限定的かつ制限的なものに代わるものと、代替的に理解され得る。したがって、任意の実施例が列挙する任意の組成物、材料、構成要素、要素、特徴、整数、動作、及び／又は処理ステップについて、本開示もまた、列挙された組成物、材料、構成要素、要素、特徴、整数、動作、及び／又は処理ステップなどからなる、又は本質的になる実施形態を具体的に含む。「からなる」の場合、代替の実施例は任意の追加の組成物、材料、構成要素、要素、特徴、整数、動作、及び／又は処理ステップを除外する。一方「から本質的になる」の場合、基本的特性及び新規の特性に物質的に影響を与える任意の追加の組成物、材料、構成要素、要素、特徴、整数、動作、及び／又は処理ステップは、そのような実施形態から除外されるが、基本的特性及び新規の特性に実質的に影響を与えない任意の追加の組成物、材料、構成要素、要素、特徴、整数、動作、及び／又は処理ステップは、実施例に含むことができる。

本明細書では、さまざまなステップ、要素、コンポーネント、領域、層及び／又は区画を説明するのに第１、第２、第３などの用語を使用することがあるが、これらのステップ、要素、コンポーネント、領域、層及び／又は区画はこれらの用語によって限定されてはならない。これらの用語は、１つのステップ、要素、コンポーネント、領域、層又は区画を別のステップ、要素、コンポーネント、領域、層又は区画と区別するために使用しているにすぎない。本明細書で使用する「第１」、「第２」などの用語及びその他の数字を示す用語は、文脈により明確に明記しない限り、序列又は順序を暗示するものではない。そのため、以下に記載する第１のステップ、要素、コンポーネント、領域、層又は区画は、実施例の教示を逸脱することなく、第２のステップ、要素、コンポーネント、領域、層又は区画と称することができる。

本明細書全体で、数値は、近似的な測定値、又は所与の値及び言及されたおよその値を有する実施形態ならびに言及された正確な値を有する実施形態からのわずかな逸脱を包含する範囲の限定を表わす。添付の特許請求の範囲を含む本明細書におけるパラメータ（例えば、量又は条件）のすべての数値は、数値の前に「約（ａｂｏｕｔ）」が実際に現われるか否かに関わらず、すべての場合に「約」という用語によって修正されることを理解されたい。「約」は、提示された数値があるわずかな曖昧さを許容することを示す（値の正確さへのある近似、値へのおおよそ又は妥当な接近、ほとんど）。「約」によってもたらされる曖昧さがこの通常の意味として当技術分野で理解されない場合、本明細書で使用される「約」は、少なくともこのようなパラメータを測定及び使用する通常の方法から生じ得る変形を示す。

本明細書で参照するとき、範囲は、別段の定めがない限り、終点を含み、すべての個別の値及び全範囲をさらに分割した範囲も含む。従って、例えば、「ＡからＢ」又は「約Ａから約Ｂ」の範囲は、Ａ及びＢを含む。具体的なパラメータ（温度、分子量、重量パーセンテージなど）についての値の開示及び値の範囲は、本明細書で有用な他の値及び値の範囲を排除するものではない。所与のパラメータに対する２つ以上の例示された具体的な値は、パラメータに対して主張される可能性がある一連の値の範囲の終点を定義する場合があることも想定される。例えば、パラメータＸが本明細書において値Ａを有すると例示され、また値Ｚを有するとも例示されている場合には、パラメータＸは約Ａから約Ｚの値の範囲を有する可能性があると想定される。同様に、パラメータについて２つ以上の値の範囲（範囲は、入れ子関係であっても、重複していても、別個であってもよい）の開示は、開示された範囲の終点を使用して主張される可能性がある値のすべての可能な組み合わせの範囲を含むことが想定される。例えば、本明細書においてパラメータＸが１から１０、２から９又は３から８の範囲の値を有すると例示される場合、パラメータＸは、１から９、１から８、１から３、１から２、２から１０、２から８、２から３、３から１０及び３から９を含む他の範囲の値を有する場合があることも想定される。

腫瘍と非浸潤組織の全体的な違いは知覚できないことが多いが、腫瘍浸潤脳の細胞構築学的な特徴は顕著である。しかしながら、よくある組織学的技術によりこれらの違いを検出するには、組織を薄く切断し、染色することが求められる。凍結切片組織学は、現在、生検収集から診断まで通常少なくとも約３０分かかる病理組織学的データを得る最速の方法であるが、その診断精度は、永久切片組織学よりも低い。永久切片組織学は、一つにはアーチファクトを凍結させることから、生検収集から診断まで通常２、３日かかる。凍結切片組織学は、術前生検が行われなかった場合の診断用手術に用いられるが、処理時間が長いので、外科手術中に切除の完全性を誘導するのに実用的ではない。

組織を物理的に切開せずに組織のイメージングを行うのに、複数の光学イメージングモダリティが開発されている。例えば、内因性、外因性、蛍光反射又はラマン活性種に基づく共焦点顕微鏡法は、共焦点ピンホールを用いて焦点外信号を抑制する。臨床的には、５−アミノレブリン酸（５−ＡＬＡ）の蛍光イメージングは、ある程度の感度を示して、腫瘍を特定するため重要である。共焦点イメージングを行うことで、特に腫瘍の境界において、感度や特異性がさらに向上する場合がある。２光子励起蛍光（ＴＰＥＦ）、第２高調波発生（ＳＨＧ）、第３高調波発生（ＴＨＧ）、及び、コヒーレント反ストークスラマン散乱（ＣＡＲＳ）や誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）を含むコヒーレントラマン散乱（ＣＲＳ）などの多光子技術は、非線形励起プロファイルに起因して内因性光学切片を利用する。光コヒーレンストモグラフィー（ＯＣＴ）は、コヒーレント検出を利用して、深さに依存する信号を測定する。光音響検出は、異なる深さからの信号の時間遅延を利用する。従って、イメージングは、内因性分光コントラストに基づくモダリティにより行うことができる。

これらのイメージングモダリティの多くは、信号の生成に、色素や他の造影剤ではなく、サンプルの内因性種、要素又は因子を利用する。これらの内因性種、要素又は因子はすべて、顕微鏡レベルでサンプルの分子構成を分析するのに使用可能な高速非破壊分析技術である。自発ラマン散乱と同様、ＣＲＳ顕微鏡法は、脂質、タンパク質、ＤＮＡなど、分子の内因性振動特性を利用して、画像のコントラストを生成する。このＳＲＳ顕微鏡法における信号生成のコヒーレントな性質により、自発ラマンに対して最大１００，０００倍の増幅を与え、周囲照明条件下（例えば、手術室内）で最大でビデオ速度（毎秒３０フレーム）のイメージング速度と高感度検出を可能にする。

これらの新規技術を導入することにより臨床業務を変えることで、既存の臨床ワークフローへの影響を最小限に抑えつつ、臨床転帰を改善する。従って、いくつかの態様において、組織イメージングを行う生検装置、システム及び方法は、臨床ワークフローへの影響を最小限に抑えつつ、臨床業務の改善を図ることができる。

術中磁気共鳴イメージング（ＭＲＩ）と同様に、外科医が主要の境界に近づいていることを認識して、腫瘍コアのデバルキングを行った後に術中光学イメージングを行ってもよい。光学イメージングは、潜伏残存腫瘍の特定に役立ち、切除が必要かつ安全と判断されると継続される。そのため、光学イメージングのイメージング深さが制限されていたとしても、切除とイメージングを併用することで、ほぼ制限のないイメージング深さを実現する。また、術前ＭＲＩでは、衛星病巣が知られていることもある。そのような病巣の除去にも、切除とイメージングの併用が有効である。

本開示のいくつかの態様に係る手持ち式の光学イメージングシステムは、そのような手持ち式による色素染色や切開を行うのに患者から組織を採取する必要がないため、その場イメージングが可能となる。従来の手持ち式に関連する画質は、質が落ちる場合がある。また、外科医や病理学者にとって画質が最も重要である場合、リアルタイムで外科キャビティの一箇所又は複数の箇所から採取された生検サンプルに対して光学イメージングを生体外で行うことも可能である。生体外イメージングがその場イメージングよりも有利な点は、生体内での使用に安全なレーザー出力が制限されているため、信号強度が向上し、後方散乱信号や動きアーチファクトが減少するため、収集効率が向上することである。小さい外科キャビティにおいて術中に使用するイメージングレンズのサイズを縮小することによっても、その場イメージングの画質が制限されることがある。生検装置が腫瘍のデバルキングの終わり頃に使用された場合、必ずしもさらなる組織の生検を行わなくてもよく、生体外イメージングを問題なく実行するようにしてもよい。

いくつかの態様では、本開示は、組織生検などの生体サンプルを取得し、そのイメージングを行う装置及び方法を検討する。方法は、例えば、生検装置により組織生検サンプルを取得する工程と、その生検装置を生体外イメージング用のイメージャに挿入する工程とを備えていてもよい。変形例では、この生検装置とイメージャを、その場で使用し得る単体の器具として一体化する。従来のその場イメージング方法及び装置とは違い、本開示の方法及び装置は、イメージングの前に、生検装置のサンプル収集部に組織を吸引する。この吸引によってイメージング光学素子に対して移動しない領域を設けることで、動きアーチファクトが軽減される。また、いくつかの態様では、組織を生体外試料として扱う従来の方法及び装置と比較して、イメージングに対して大きなレーザー出力を使用可能にする薄いサンプルを調製することで、透過イメージングが可能となる。このように、その場イメージングと生体外イメージングの利点が組み合わされる。他の変形例では、生検装置及びイメージャ／イメージング装置を、生体外で使用し得る単体の器具として一体化する。ここでは、従来の器具により組織生検を取得し、イメージャのサンプル収集部に吸引によりロードすることができる。

他の態様では、本開示は、生検装置を検討する。この生検装置は、第１端部と第２端部を有する中空体を備えている。この中空体は、細長い本体がほぼまっすぐで対称であることを意味する主縦軸を画定する。しかしながら、いくつかの実施例では、例えば、生検装置が特定の方向及び／又は配向でイメージング装置に受け取られる場合など、中空体は対称ではないものとする。この中空体は、サンプル収集部を形成する。細長い本体の第１端部の第１開口部は、陰圧源を収容するよう構成され、細長い本体の第２端部の第２開口部は、生体サンプルを収容するよう構成されている。また、この細長い本体は、サンプル収集部に対応する領域に配置された光透過性領域をさらに有する。この光透過性領域は、サンプル収集部に配置された場合に、生体サンプルのイメージングを実行可能なイメージング装置からの電磁波を透過するよう構成されている。さらに他の態様では、本開示は、上記生検装置を備え、さらにイメージング装置を備えるイメージングシステムを検討する。このイメージングシステムは、透過モード又は反射モードで生体サンプルから収集される光信号を提供する。このイメージング装置は、生検装置に含まれる生体サンプルに関する組成及び／又は構造情報を有する画像を提供可能である。従って、医師は、正常組織と異常組織、すなわち、悪性がん細胞を含む組織を見分けることができ、外科手術中に生体サンプルが採取された領域からさらに組織を除去するかどうかを判断することができる。この生検装置により一つ又は複数の生体サンプルが採取され、イメージング装置で分析されると、医師は、腫瘍の境界を決定することができる。医師は、この決定により、正常組織を保存しつつ、除去する必要がある組織だけを除去することができる。このイメージング装置は、必要に応じて、画像の座標及び／又は方向を記録する外科ナビゲーションシステムに登録してもよい。ディスプレイには、生体サンプルに関するナビゲーション情報と組織学的情報の両方を示してもよい。

従って、いくつかの態様では、本技術は、生体外光学イメージャと、消耗生検チップを使用する装置、システム及び方法を提供する。この生検チップは、固定陰圧又は真空源から供給された陰圧（例えば、真空）を手動で制御することにより、装置のイメージング部に対応する狭い組織サンプル収集領域に組織が引き込まれるようにする外科吸引装置（例えば、脳神経外科吸引装置）の端部でスライドする。このような固定陰圧源は、ビルの真空システムであってもよく、ビルの部屋の壁からアクセスすることができる。このビルとしては、例えば、病院、診療所、オフィスビルであってもよい。生検を被検者から取得すると、生検装置を生体外光学イメージャに直接ロードしてもよい。サンプル処理は必要なく、組織学的データが、例として、いくつかの態様では、約５分以下、他の態様では、必要に応じて、約１分以下という短い期間内に出現する。この生検装置のユーザ、例えば、外科医は、各生検ごとに新しいチップを使用して、組織キャビティから複数の生検を採取することができる。このサンプル収集イメージング部のサイズは、生検量を最小限に抑えるよう、最小限にとどめることができる。

本開示の生検装置は、イメージングシステムと関連していてもよい。このイメージングシステムは、一つ又は複数のイメージング装置と、ハードウェア及びソフトウェアを含む関連処理ユニットを備えていてもよい。このイメージング装置により一つ又は複数の画像を取得して、採取され生検装置内に保持された生体サンプルの画像を生成してもよい。本技術によれば、外科医は、組織学的画像において腫瘍の存在を検出することができる。しかしながら、外科医の中には、画像を解釈するのに病理学者に相談することを選ぶ者もいる。画像はデジタルなので、システムは、ビルのテレパソロジーインフラストラクチャと一体化することが可能である。また、データ分析には画像解釈アルゴリズムを用いることもできる。

また、本技術によれば、顕微鏡イメージングと巨視的イメージングの間のギャップをブリッジし、生検又はイメージング装置を外科ナビゲーションシステムに登録し、各生検又は画像の座標及び／又は方向を記録することにより複数の画像を追跡するシステム及び方法が提供される。例えば、画像を取得すると、それらはナビゲーションシステムにロードされてもよく、ナビゲーション情報と組織学的データの両方を分割画面に表示することができる。

また、顕微鏡画像に対して生検の方向を追跡することによっても、除去又は保存する組織領域の特定を行うことができる。例えば、線維路は、（例えば、ＣＲＳ画像では線や円として現れる軸索を取り囲むミエリンに基づく）光学画像で見られる。この光学画像を巨視的画像の特定の方向に配置することにより、保存し得る線維路をハイライトすることができる。他の実施例では、腫瘍境界が光学画像に出現することがある。この方向は、より多くの腫瘍組織を安全に除去可能な領域に外科医を誘導するのに用いることができる。

組織イメージング技術
図１Ａは、脳腫瘍のある患者の手術前ＭＲＩスキャン１００を示す図である。図１Ｂは、同じ患者の頭蓋骨を開頭後のその患者の露出した脳１０２の全体像を示す図である。図１Ｂに示すように、正常な脳組織と脳腫瘍を視覚的に見分けるのは困難である。腫瘍を除去する際に最適な手術結果を得る上での制限要因は、癌性脳組織と非癌性脳組織は肉眼では見分けがつかない場合があるため、相当な腫瘍がすべていつ除去されたかを把握することである。従って、切除をガイドするための高度な画像診断技術を用いることが望ましい。

ラマン散乱では、分子振動を励起しながら分子によって励起光子を散乱させる。各分子結合タイプは、比剛性（例えば、Ｃ＝Ｃ結合はＣ−Ｃ結合より強い）と関連する質量（例えば、Ｃ−ＣはＣ−Ｈより重い）、ひいては特定の振動周波数を有する。分散したラマン散乱スペクトルは、サンプルの分子振動によって測定され、そのサンプルの化学組成から算出される。

脳神経外科の現場における腫瘍浸潤の検出には、自発ラマン分光法をうまく適用することができる。自発ラマン分光法は、積分時間が長いことから点取得に限られることが多く、また、コヒーレントラマン散乱イメージングの空間分解能を欠いていることも多く、診断にはスペクトル解析に頼ることになる。例えば、ＭＲＩにおける基本的な分光法である核磁気共鳴（ＮＭＲ）は、研究用途において広く用いられているが、その臨床的使用は限られている。いずれの場合も、組織構造に関する重要な診断情報が提供されるが、医師は、医学的な意思決定を行うにあたって点スペクトルよりも画像の方を選ぶ。

コヒーレント反ストークスラマン散乱（ＣＡＲＳ）及び誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）を含むコヒーレントラマン散乱（ＣＲＳ）によれば、自発ラマン信号の増幅が可能となる。図２は、ＣＡＲＳプロセス２１４とＳＲＳプロセス２１８のエネルギー図を示す。ＣＡＲＳ２１４とＳＲＳ２１８のどちらの場合も、サンプルがポンプで励起され、差周波数が分子振動の周波数と一致するようストークスビームが構成される。ＳＲＳ２１８では、分子群が仮想状態を通ることにより基底状態２００から振動励起状態２０２に励起される。その結果、ポンプ光子が生成され、ストークス光子が吸収される。ＣＡＲＳ２１４では、第２ポンプ光子が散乱して、反ストークス周波数で新しい光子が生成される。

ＳＲＳ２１８は、ＣＡＲＳ２１４と同じ照明条件で励起されるが、検出が異なる。ＣＡＲＳ２１４は、発光が励起ビームの波長とは異なる波長で検出されるという点で蛍光と似ている。ＳＲＳ２１８は、一つの励起ビーム（例えば、誘導ラマン損失）の吸収が第２ビームの存在下で測定されるという点で吸収と似ている。ＳＲＳ２１８は高感度であるが、その検出には、高周波位相敏感検波スキーム（例えば、ロックイン検出）により、レーザー背景から比較的小さい信号を抽出することが含まれてもよい。ＳＲＳ２１８は、励起スペクトルが自発ラマンと同一であるので、化学的特異性に対して固有の機能を発揮する。ＳＲＳ２１８のもう一つの利点は、特別な光学的遮蔽なしに周囲光条件下で機能するということである。

ＣＡＲＳ２１４は、サンプルの透過又は反射モダリティ（いわゆるｅｐｉ検出）において検出可能である。ＳＲＳ２１８は、励起ビームの損失又は利得であるので、透過で検出されることが多い。しかしながら、サンプルの厚みが大きい場合、前方へ伝播するＳＲＳ２１８信号は、後方散乱し、反射モードで検出可能である。とはいえ、通常、最高の信号強度と画質は、サンプルの厚みが散乱の平均自由行程に対して小さい場合に得られる。

また、図２には、他の多光子顕微鏡法（ＭＰＭ）及び分光法も示す。２光子励起蛍光（ＴＰＥＦ）２０６では、２つの励起光子を同時に吸収して、基底状態２００から電子的に励起された状態２０４に分子群を励起し、そこから、ＴＰＥＦ顕微鏡法で検出された信号である蛍光発光の下で弛緩する。２色２光子励起蛍光（ＴＣＴＰＥＦ）２０８による励起では、異なる波長の２つの光子が同時に吸収される。その吸収２１６又は蛍光発光２０８が顕微鏡法における信号として測定される。ＴＰＥＦ２０６及びＴＣＴＰＥＦ２０８は、固有の組織種、要素又は因子から生じることもあれば、フルオロフォアの外色素から生じることもある。通常、ＴＰＥＦ２０６及びＴＣＴＰＥＦ２０８は、サンプルの発光が等方性を有しているので、反射モードで検出される。蛍光信号についても、一光子励起手段で励起可能である。そして、焦点外の光は、共焦点ピンホールによりカットされる。第２高調波発生（ＳＨＧ）２１０及び第３高調波発生（ＴＨＧ）２１２では、信号の放出が励起波長のちょうど２倍又は３倍である。ＳＨＧ２１０は、例えば、コラーゲンのイメージングにおいて周知である。ＴＨＧ２１２は、非線形屈折率を測定し、脳組織において腫瘍浸潤を特徴付けるのに用いることができる。ＴＨＧ２１２の画像は、ＣＲＳの画像と似ているところもあるが、核特異的コントラストを欠いている。従って、さまざまな面で、現在の技術には、これらの分光法を行う装置が含まれる。さまざまな実施例では、ＳＲＳ装置、ＣＡＲＳ装置、共焦点ラマン装置、共焦点反射装置、共焦点蛍光装置、ＯＣＴ装置、ＴＰＥＦ装置、ＳＨＧ装置、ＴＨＧ装置から成る群からイメージング装置が選択される。

図３は、例示的なＣＲＳ顕微鏡システム３００を示す模式図である。このシステム３００では、ポンプ３０２とストークスビーム３０４がダイクロイックミラー３０６で重畳して、共線ビームを生成する。励起は、通常、中程度の平均出力で高ピーク出力を有するパルスレーザーにより行われ、サンプルにダメージを与えずに非線形ＣＲＳ信号を励起する。従って、このシステム３００では、サンプルにおいてパルスを時間的に重ね合わせるように、２つのパルス列の相対的な遅延を調整する遅延線３０８がビーム路のうちの少なくとも一つに含まれる。共線ビームは、対物レンズ３１２によって、サンプル３１０に集光させる。ガルバノ走査ミラー３１４によれば、決定論的方法により（通常、コンピュータ又は電子制御下で）サンプル３１０において共通焦点体積がスキャンされる。ＳＲＳの場合、透過時に集光レンズ３１６により信号が収集され、光学フィルタ３１８により光学的にフィルタ処理され、検出器３２０で検出されて、画素として信号が生成される。走査パターンを生成したコンピュータや電子機器は、その画素を画像に再配置するのに用いられる。通常、４００μｍの視野（ＦＯＶ）を有する高開口数（ＮＡ）対物レンズを用いることにより、良好な画質が得られる。ビーム走査型画像取得と電動状態を合わせることにより、より広範囲の画像を取得することができる。例えば、モザイクイメージングによれば、複数のＸＹ画像を一つの大きな画像に縫い合わせることができる。例えば、各個別の視野は、１Ｍ個の画素（すなわち、１０００×１０００個の画素）を有する４００μｍ×４００μｍの領域であってもよく、５×５のモザイクを縫い合わせることにより、２５Ｍ個の画素を有する２ｍｍ×２ｍｍの領域がカバーされることになる。また別の方法として、ガルバノ走査ミラー３１４ではたった一つの軸に沿ってしかデータ取得が行われず、他の軸は電動ステージによるものである場合に、ストリップタイリングを用いることもできる。この例では、４００μｍ×２ｍｍのストリップを一回の取得動作で走査することができる。

歴史的に見て、ＳＲＳは、２つの正確に同期した調節可能な超短（ピコ秒）レーザーパルス列を必要とするため、その臨床現場における実施や操作は困難で費用がかかるものと考えられてきた。ここでは、いくつかの変形例において、本技術は、ファイバコアによる導光のためにロバストで、電気通信業界の規模の経済のために比較的安価なカスタム２波長ファイバレーザー光源を採用してもよい。カスタム２波長ファイバレーザー光源を有するプロトタイプシステムは、例えば、手術室に設置して、顕微鏡法に関する広範囲の訓練を受けていないユーザによって操作が可能である。

ＣＲＳの励起ビームを得るには、異なるレーザー光源を用いてもよい。大学の研究室の多くでは、固体光パラメトリック発振器（ＯＰＯ）ベースのシステムを用いて、同期した２つのパルス列３０２、３０４を生成する。他の方法には、キャビティ長に関するフィードバック又はパルスオンデマンドの解決策により、２つの独立したレーザーの電子同期を行うことが含まれる。ＣＲＳ顕微鏡のファイバレーザーベースの実装では、ＯＰＯシステムと同様の非常にロバストな光同期を採用することができる。レーザー光源は、２つの主要なファイバ利得媒体、エルビウム（Ｅｒ）及びイッテルビウム（Ｙｂ）の周波数差がラマンスペクトルの高波数領域と重なることに基づいている。つまり、パルス列３２４がエルビウム（Ｅｒ）添加発振器３２２によって生成され、その後、光学スプリッタ３２６によって分割される。一つのアームがエルビウム添加ファイバ増幅器３２８で増幅されて、第１パルス列３０２を生成する。このファイバ増幅器３２８の後に第２高調波発生ユニットをさらに備え、増幅器３２８の出力の周波数を２倍にして第１パルス列３０２を得ることが可能である。第２アームは、例えば、スーパーコンティニウムや調節可能な狭帯域フィルタにより、周波数シフトユニット３３０で周波数シフトされる。その後、周波数シフトされた出力は、イッテルビウム（Ｙｂ）添加増幅器３３２で増幅されて、第２パルス列３０４が得られる。

さまざまな実施例では、システム３００は、（１）約１０ＭＨｚから約１００ＭＨｚの繰り返し率で０．５から１０ｐｓのパルス幅を有する約６００ｎｍから約１０００ｎｍのポンプビームについて、約５０から約５００ｍＷの平均出力と、（２）約９００ｎｍから約１１００ｎｍの調節可能なストークスビームについて、約５０ｍＷから約１０００ｍＷの平均出力と、（３）約１００ｆｓ以下のタイミングジッタが得られるよう構成されている。このシステム３００は、約５秒以下、約２秒以下、又は、約１秒以下で画像を生成することが可能である。多色取得の波長同調は、通常、フレームとフレームの間に行われる。そして、広範囲のモザイク画像は、約５分以内、約４分以内、約３分以内、約２分以内、又は、約１分以内に取得可能である。一実施例では、システム３００は、（１）２ｐｓのパルス幅と８０ＭＨｚの繰り返し率を有する７９０ｎｍに固定波長のポンプビームについて、３００ｍＷの平均出力と、（２）１０１０ｎｍから１０４５ｎｍの調節可能なストークスビームについて、約５００ｍＷの平均出力と、（３）約５０ｆｓ以下のタイミングジッタが得られるよう構成されている。このシステム３００は、２８００ｃｍ^−１から３１００ｃｍ^−１のラマン範囲に対応している。このようなシステム３００によれば、１分足らずで、０．６ｎｍ解像度の新鮮な外科標本から、２ｍｍ×２ｍｍ領域の２５Ｍ画素の２色ＳＲＳ画像を生成することが可能である。

ファイバレーザーベースのマルチモーダルＳＲＳ顕微鏡４００の一例を図４に示す。この顕微鏡４００は、オリンパス顕微鏡本体４０２と、ファイバデリバリ技術によりシームレスにレーザー光源４０６を結合するビーム走査ユニット４０４から構成されている。レーザーと顕微鏡４００は、コンピュータ４１２により制御電子機器４０８（レーザー）、４１０（顕微鏡）を介して制御されている。イメージングデータは、画面４１４に表示される。一実施例では、イメージングソフトウェアは、オープンソースの顕微鏡プラットフォーム、μマネージャに基づいている。それにより、イメージング、レーザー、ステージパラメータを完全に制御することが可能となり、多色モザイクイメージングのアルゴリズムが得られる。すべての構成要素（４００乃至４１４）を移動式のカート４１６に搭載して、完全一体型のマルチモーダルＳＲＳ顕微鏡を構成することができる。

図５は、側頭葉切除を受けたてんかん患者５００、低グレードの乏突起膠腫を持つ患者５０４、高グレードの神経膠腫を持つ患者５０８からファイバレーザーベースのＳＲＳプロトタイプシステムにより得られたＳＲＳ画像を示す。対応するＳＲＳ画像は、まばらな細胞質と多くの軸索で特徴付けられた正常なヒトの大脳皮質５０２、円形の核と豊富な細胞質を持つ特徴的な腫瘍細胞を有する低グレードの乏突起膠腫を持つ人間の脳５０６、偽柵状配列パターンに細胞が密集した高グレードの神経膠腫を持つ人間の脳５１０を示す。重要な点は、正常脳と腫瘍浸潤脳では顕微鏡で見た形状に違いがあるということである。

ＳＲＳ顕微鏡法では、神経病理学で最もよく使用される染色であるヘマトキシリン及びエオジン（Ｈ＆Ｅ）として類似した形態学的特徴をハイライトした画像が生成される。図６Ａは、組織内の脂質６００、タンパク質６０２、ＤＮＡ６０４などの共通分子のラマンスペクトルを示す。複数のラマンシフト（例えば、２８５０ｃｍ^−１及び２９３０ｃｍ^−１又は２８５０ｃｍ^−１、２９３０ｃｍ^−１及び２９６０ｃｍ^−１など）において組織のイメージングを行い、スペクトル非混合技術を用いることにより、例えば、Ｈ＆Ｅ染色を模倣して図６Ｂの６０６に青と緑で又は図６Ｃの６０８にピンクと紫で示すように、異なる疑似色で表示可能な多色ＳＲＳ画像を生成することができる。ＣＨ_２振動（２８４５ｃｍ^−１）のＳＲＳ画像は、有髄軸索や細胞外基質６１０など、脂質の多い構造を示す。ＣＨ_３振動（２９３０ｃｍ^−１）のＳＲＳ画像は、核やコラーゲン繊維６１２など、プロテインやＤＮＡを豊富に含む構造を示す。図６Ｄは、低グレードの神経膠腫の１．５ｍｍ×１．５ｍｍ領域のステッチ画像を示す。

ＳＲＳ顕微鏡法は、脳腫瘍における腫瘍境界の描出に有効である。図７Ａ乃至図７Ｄは、ヒト神経膠腫異種移植マウスモデルにおけるＳＲＳ画像とＨ＆Ｅ組織構造画像の比較を示す。まずは、ＳＲＳにより薄い凍結した部分のイメージングが行われ、その後、Ｈ＆Ｅで染色されることにより、同一の組織に関して方法の比較を行うことができる。図７Ａは、マウス脳の全断面図を示す。図７Ｂは、正常又はわずかな過形成皮質組織（２５％未満の腫瘍浸潤）の高倍率図を示す。図７Ｃは、正常な白質束（星印）、腫瘍浸潤束（矢印）、高密度腫瘍細胞（矢）を有する浸潤性神経膠腫（２５％から７５％の腫瘍浸潤）を示す。図７Ｄは、高密度な神経膠腫（７５％以上の腫瘍浸潤）を示す。これらの画像は、ウェブ上の調査に入力して、ＳＲＳとＨ＆Ｅ顕微鏡法を定量的に比較するのに用いられる。腫瘍浸潤度を特徴付けるＳＲＳと標準Ｈ＆Ｅ染色間の方法間の一致は優良（ｋ＝０．９８）である。

また、ＳＲＳは、２２人の神経外科患者から得られた新鮮な未処理の外科標本６０にも有効である。ＳＲＳは、標準のＨ＆Ｅ光学顕微鏡法とほぼ完璧な一致で腫瘍浸潤を検出した。ＳＲＳ顕微鏡法に特有の化学的コントラストは、組織の細胞性、軸索密度、腫瘍浸潤組織のタンパク質：脂質比における定量化可能な変化を明らかにすることにより腫瘍の検出を可能にする。

図８Ａ乃至図８Ｈは、ヒトの外科標本におけるＳＲＳ画像とＨ＆Ｅ組織構造画像の比較を示す。図８Ａは、ＳＲＳとＨ＆Ｅでイメージングが行われたリング状造影を示す膠芽腫（ＧＢＭ；矢）のＭＲＩ画像を示す。図８Ｂは、ＳＲＳ（左）とＨ＆Ｅ（右）顕微鏡法の両方に生存腫瘍の過形成と核異型が見られることを示す。図８Ｃでは、微小血管増殖により、ＳＲＳ顕微鏡法（左、矢）ではっきりと認められ、過ヨウ素酸シッフ染色（右、矢）でハイライトされた蛇行性血管複合体が生成される。図８Ｄに示すように、ＳＲＳ顕微鏡法（左）とＨ＆Ｅ染色（右）により、有糸分裂像も見られる（矢）。非造影の低グレード乏突起膠腫のＭＲＩ画像を図８Ｅに示す。図８Ｆに示すように、乏突起膠腫は、ニューロフィラメント免疫染色（右）により確認されるように、ＳＲＳイメージング（左）に最小限の軸索破壊を引き起こす「目玉焼き」状の形態（矢）の巣を有する過形成組織からなる。図８Ｇでは、ＳＲＳ（左）とＨ＆Ｅ（右）顕微鏡法により、「金網」血管（矢）のイメージングが行われる。図８Ｈでは、ＳＲＳ（左）とＨ＆Ｅ（右）顕微鏡法の両方に神経周囲浸潤が見られる。

生検装置及びイメージング
腫瘍浸潤度や切除を継続するか否かに時間遅延なくアクセスするための露出した外科的キャビティの表面から、できるだけ小さいが（神経障害のリスクを最小限に抑えるのに）診断上適切な量の組織生検を取ることを可能にする生検装置と併用して、ＳＲＳや他の光学イメージング又は分光法技術を使用することが望ましい。図５の画像の取得については、切断機構を用いた標準の脳神経外科生検鉗子（例えば、Ｂ．Ｂｒａｕｎ、ペンシルバニア州ベツレヘム）により行われた。２４０μｍスペーサ（Ｇｒａｃｅ Ｂｉｏｌａｂｓ社、オレゴン州ベンド）を用いて圧縮状態の保持した顕微鏡スライドと１．５番カバースリップとの間に小さい組織片を載置した。この変形例では、画質が優良ではあるが、サンプル処理がやや煩雑なため、神経外科ワークフローに組み込むにはやや不向きである。

鉗子などの脳神経外科用手術器具にイメージング用光学窓を含むよう適合させるのは、可動部品が多く、薄く平らなサンプルを得るための懸念や、生検される組織量を最小限に抑える必要性があることから、非常に難しく、費用がかかる場合がある。

針生検（ＣＮＢ）や微細針吸引生検（ＦＮＡ）用の器具が開発されている。これらの針ベースの装置は、生検標本を得るために、所望の組織やサンプルに向かって患者の体内に切り込んでいったり繋ぎ合わせたりするよう設計されている。光学イメージングや分光法の動機は、誤った生検率を減らすことや、分子技術に関する診断用腫瘍量を増やすことにある。針は、一般的に、金属製であり、サンプルを切断したり皮膚や他の組織を貫通するのに鋭い刃を有している。針は、通常、鋭い刃に関わるリスクが存在するため、開腹手術には用いられない。

患者へのリスクを最小限に抑えつつ、組織表面から生検を得る方法は、タッチプレップやスカッシュプレップとして知られている。この方法により細胞学的検査が可能となるが、組織構造が保存されないことが多く、それによって技術の診断精度が大幅に制限されてしまう場合がある。

脳神経外科で使用される器具は、通常、陰圧、すなわち、吸引力を利用し、密集した組織を解体する超音波（例えば、キャビトロン超音波外科用吸引装置；ＣＵＳＡ）と併用されることが多い。ここでの目標は、効果的に組織を除去することである。ある態様では、生検標本の抽出に、切断や圧縮ではなく、吸引力を利用する生検装置を用いることが望ましい。そのようなシステムによれば、生検装置と既存の外科ワークフローの一体化を可能にしつつ、迅速な組織学的分析のために被検者から摘出された生体サンプルの細胞構築や完全性の保存がより良好に行われる。また、光学イメージングを行うのに十分なくらい収集チャネルを薄くし、大きな変形や診断上関連する組織構造の損失を引き起こし得る神経障害を回避できるほどサンプリング量を抑えることが望ましい。

開腹手術中に生検標本の採取及びイメージングを行うための器具の使用や方法を改善する必要性に対処するため、本技術は、組織変形を軽減し、同時に、組織に関する組成及び／又は構造情報が得られるリアルタイムの品質画像を提供するための生検チップ、装置及び方法を提供する。

従って、さまざまなチャネル高さ及び幅を有する長方形のガラス毛管（ＶｉｔｒｏＣｏｍから市販されている）を吸引装置に接続して生検装置が構成された。この生検装置は、ビルの壁内を循環するビルの真空システム、真空ポンプ、自律的に吸引力を発生させる独立システム（非限定の例として、Ｓｔｒｙｋｅｒ（登録商標）Ｓｕｒｇｉｃａｌから市販されているネプチューン（登録商標）（ＮＥＰＴＵＮＥ）２ウェイストマネジメントシステムなど）によって与えられる吸引力など、当技術分野で使用される陰圧、すなわち、吸引力の固定式又は移動式の供給源で駆動する。このような装置は、脳組織を吸い上げるのに用いられる。チャネルが約２００μｍ以上の高さを有する場合に組織の吸引が効率的に行われるが、ビルにより供給された吸引力は、超音波吸引なしに１００μｍのチャネルに組織を吸い上げたり吸引したりできるほど強力な吸引力である。

組織サンプルは、生検装置で取得された後、図４に示すファイバレーザーベースのＳＲＳ顕微鏡４００で分析が行われ、透過型ＳＲＳでイメージングが行われた。チャネルの高さが約５００μｍ以下、約４００μｍ以下、約３００μｍ以下、約２００μｍ以下、約１００μｍ以下の場合に、十分な画質が得られる。図１３Ａは、チャネル高さが２００μｍ、チャネル幅が４ｍｍ、壁厚が２００μｍの長方形のガラス毛管で得られた２色ＳＲＳ画像を示す。意外にも、図５の画像を得るのに使用するカバースリップ、カバースライド、両面テープを用いたより煩雑なサンプル調製と比べて、画質の明らかな損失や、組織変形又は血液による干渉の兆候はなかった。また、屈折率のマッチングには、追加の液体が必要とされなかった。画像は、非重複色チャネルを生じさせるサンプルドリフト、ステージヒステリシス、揺動又は非直線運動を示していない。

図９は、生体サンプル９５０を収容する生検装置９００を示す図である。この装置９００は、第１開口部９０４と第２開口部９０６を有する本体９０２と、少なくとも部分的に光透過性を有する壁９０８の少なくとも一部とから構成されている。本体９０２は、組織などの生体サンプル９５０を収容するチャネル９１０を画定する。陰圧９１２の供給源が第１開口部９０４に印加されて、生体サンプル９５０が第２開口部９０６からチャネル９１０内へと引き込まれる。この生体サンプル９５０の画像は、少なくとも部分的に光透過性を有する壁９０８の一部を介して得られる。いくつかの実施例では、この生検装置９００は、任意のバックストップ又は有孔壁９１４をさらに備えている。このバックストップ又は壁は、陰圧がバックストップ又は有孔壁９１４を横断できるように複数の穴又はポアを有している。バックストップ又は壁９１４は、組織が生検装置９００から飛び出すのを防ぎ、組織を装置９００のイメージングに適した領域に保持する。

一実施例では、上記装置は、少なくとも部分的に長方形の断面形状を有する領域を有している。この形状により、装置の異なる領域のフォーカシングを行うオートフォーカスを繰り返し行わずに、組織のイメージングが単純化され、及び／又は、光学収差が軽減される。一方で、生検中に除去する組織量を最小限に抑え、チャネルを狭く保つことが有利である。他方で、診断精度を向上させるのに可能な限り大量の組織量を得ることが有利である。このトレードオフは応用特有のものである。例えば、装置においてサンプルのイメージングが行われる領域は、イメージングが行われる軸と、圧力が印加される軸の両方に直交する寸法（「ｘ寸法」）が、約１００μｍから約１５ｍｍ、約５００μｍから約１０ｍｍ、又は、約１ｍｍから約５ｍｍの範囲である。さまざまな実施例では、このｘ寸法は、約１００μｍ、約２００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１１ｍｍ、約１２ｍｍ、約１３ｍｍ、約１４ｍｍ、又は、約１５ｍｍである。この装置においてサンプルのイメージングが行われる領域は、イメージングが行われる軸に沿った寸法（「ｙ寸法」）が、約５０μｍから約１０００μｍの範囲である。さまざまな実施例では、このｙ寸法は、約１０００μｍ以下、約５００μｍ以下、約４００μｍ以下、約３００μｍ以下、約２００μｍ以下、又は、約１００μｍ以下である。いくつかの実施例では、ｙ寸法は、約１０μｍから約１０００μｍ、約５０μｍから約４００μｍ、約１００μｍから約３００μｍ、又は、約１５０μｍから約２５０μｍである。従って、さまざまな実施例では、イメージングが行われる軸に沿った装置の寸法は、約５００μｍ、約４５０μｍ、約４００μｍ、約３５０μｍ、約３００μｍ、約３５０μｍ、約３００μｍ、約２５０μｍ、約２００μｍ、約１５０μｍ、又は、約１００μｍである。この装置においてサンプルのイメージングが行われる領域は、イメージングが行われる軸と、圧力が印加される軸に直交する寸法（「ｚ寸法」）が、約１００μｍから約３０ｍｍ、約１ｍｍから約２０ｍｍ、約１ｍｍから約１５ｍｍ、又は、約５ｍｍから約１０ｍｍの範囲である。さまざまな実施例では、このｚ寸法は、約１００μｍ、約２００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１５ｍｍ、約２０ｍｍ、約２５ｍｍ、又は、約３０ｍｍである。従って、さまざまな実施例では、この装置は、ｘ：ｙ：ｚ寸法が約１００μｍ：５０μｍ：１００μｍから約１５ｍｍ：１０００μｍ：３０ｍｍ、又は、約１ｍｍ：１００μｍ：１ｍｍから約１０ｍｍ：２５０μｍ：１５ｍｍの領域を有する。一実施例では、この装置は、ｘ：ｙ：ｚ寸法が約１０ｍｍ：２００μｍ：１５ｍｍの領域を有する。

さまざまな実施例では、陰圧の供給源は、部屋の壁からアクセス可能なビルの真空システム、自律的に吸引力を発生させる独立システム、又は、ポンプである。他の実施例では、上記装置は、図１０に示すように外科吸引装置９２２と結合する生検チップ９２０として構成される。この吸引装置９２２は、剛性を有していても柔軟性を有していてもよい縦本体９２３を備えている。この生検チップ９２０は、ビルの真空システム又はポンプへのアクセスを与える壁など、吸引力又は陰圧９２４の供給源に接続された外科吸引装置９２２に取り付け可能である。この吸引装置９２２は、外科医の手９２６に保持される。図１０に示すように、いくつかの実施例では、吸引装置９２２は、吸引力源９２４から周囲環境への低抵抗パスを形成する開口部又は開口９２８を有する。この開口部を、例えば、外科医の親指９３０で、部分的又は完全に覆うことにより、生検チップ９２０の開口部に印加される吸引量の微調整が可能である。この吸引装置９２２及び生検チップ９２０は、例えば、外科クランプ９３６で皮膚を保持しながら、露出した脳組織９３４の外科キャビティ９３２から生検を採取するのに使用可能である。この吸引装置９２２は、以下にさらに説明するように、吸引装置９２２及び／又は生検チップ９２０のナビゲーション追跡を行う受動又は能動マーカ９３８をさらに備えていてもよい。また、ナビゲーション追跡（例えば、光学的又は電磁的）用の受動又は能動マーカは、各生検チップの一部として備えられていてもよい。マーカのさまざまな機能は、さまざまな生検チップのエンコードを行うのに用いられてもよい。

イメージングは、アセンブリ全体（吸引装置９２２及び生検チップ９２０）のイメージングを行うことにより、又は、吸引装置９２２から生検チップ９２０を取り外して、生検チップ９２０だけを別個にイメージャに装着することにより実行することができる。前者の場合は、イメージングシステムは滅菌状態であることが好ましい。後者の場合は、外科医がもう一つの生検チップを装着して、さらに複数のサンプルを迅速に採取してもよい。他の実施例では、吸引装置９２２に接続した生検チップ９２０により外科的切除を行なってもよい。組織病理の決定が必要なポイントに外科医が達すると、その外科医が吸い上げた最後の組織片がイメージングを行うサンプルとして用いられてもよい。

図１１は、標準的な（Ｖ．Ｍｕｅｌｌｅｒ；カリフォルニア州サンディエゴ）脳神経外科用吸引装置９６２に取り付けられた例示的な生検チップ９６０の写真を示す。この吸引装置９６２は、剛性又は柔軟性を有する縦本体９６３を備えている。この吸引装置９６２は、パイプやチューブ９６４によって、病院の真空システムなどの固定式の陰圧源に取り付けられている。吸引は、真空システムに関連するバルブや圧力調整器によって調節されてもよく、手術の現場でも、外科医が吸引装置９６２の開口又は開口部９６６を自身の親指９６８で閉じることにより局所的に調節されてもよい。

さまざまな実施例では、生検チップ全体が、少なくとも部分的に光透過性を有する材料でできており、この生検チップの反射モード又は透過モード時にサンプルから画像を得ることができる。他の実施例では、この生検チップのほんの一部だけが少なくとも部分的に光透過性であり、反射モードでイメージングが実行される。さらに他の実施例では、サンプルの対向する両側における生検チップの部分が少なくとも部分的に光透過性であるのに対し、生検チップの他の部分は非透過性であり、反射モード又は透過モードのいずれかでイメージングを実行することができる。

さまざまな実施例では、７９０ｎｍ及び１０１０から１０５０ｎｍのスペクトル領域の波長を有するビームによりイメージングが行われ、「光透過性」とは、これらの波長に対して透過性を有するものとしてとらえる。他の実施例では、励起ビームの波長は、約０．４μｍから約１０μｍ、約０．７μｍから約１０μｍ、約０．７μｍから約２．１μｍ、約０．７μｍから約１．６μｍ、約０．４μｍから約１．１μｍ、約０．５μｍから約１．１μｍの範囲であってもよく、「光透過性」とは、これらの波長に対して少なくとも部分的に光透過性を有するものとしてとらえる。「部分的に光透過性」とは、約１０％以上、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、約９５％以上、約９８％以上、又は、約９９％以上の光透過性を有する材料を指す。反射防止膜を用いて、反射防止膜なしの場合に比べて透過性を向上させることができる。

上記生検装置は、イメージングに適した光学特性を有することを特徴とする材料でできている。この材料は、分化の可能性が低く、光学収差を生じさせず、複屈折性はなく、励起レーザー出力に耐えることができ、イメージングが行われる領域ではラマン活性ではなく、イメージングが行われるスペクトル領域ではラマン活性である。本明細書で用いられるように、「ラマン活性」とは、約２８００ｃｍ^−１から約３１００ｃｍ^−１などの特定のスペクトル領域でラマンシフト（ストークス又は反ストークス）を発生させる材料を指す。この材料からの信号は、組織画像に対して好ましくない背景信号を生じさせる場合があり、そのような場合には、スペクトル領域においてラマン活性ではない材料を使用することが好ましい。他の実施例では、上記材料からのラマン信号は、焦点がずれていて、材料がラマン活性であってもよいため、組織イメージングに干渉しない。この場合、イメージングシステムは、その材料内又はその付近でもイメージングを行って、スペクトル較正及び／又はフィールド平坦化を行うよう構成することができる。さまざまな実施例では、非限定の例として、イメージング用材料としては、上記光学特性を示すよう構成される場合に、ガラス、石英、プラスチック、ポリシロキサン、ポリジメチルシロキサン（ＰＤＭＳ）、ポリシロキサン−尿素／ウレタンコポリマー、ポリウレタン、ポリ尿素、ポリエーテル、ポリエステル、ポリアクリレート、ポリメタクリレート（ポリ（メタクリル酸メチル（ＰＭＭＡ）、ポリ（メタクリル酸エチル（ＰＥＭＡ）又は（ポリ）メタクリル酸ブチルーコーメタクリル酸メチル（ＰＢＭＭＡ）を含む）、ポリカーボネート、ポリスチレン、ポリアミド、ポリビニルエステル、又は、ポリオレフィン、例えば、ポリエチレン、ポリブタジエン、エチレン−オレフィンコポリマー、スチレン−ブタジエンコポリマー、Ｔｏｐａｓ Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｐｏｌｙｍｅｒｓから市販されているＴＯＰＡＳ（登録商標）ＣＯＣなどの環状オレフィンコポリマー（ＣＯＣ）、Ｈｏｎｅｙｗｅｌｌから市販されているＡＣＬＡＲ（登録商標）ＰＣＴＦＥなどのポリクロロトリフルオロエチレン（ＰＣＴＦＥ）、ポリエチレンテレフタレートが挙げられる。これらを組み合わせたものが所望の光学特性を示す場合に、適した材料の混合物や誘導体も使用可能である。

サンプルを載置する生検チップがプラスチック製である場合に、ＣＲＳイメージングを行うことができる。図１３Ｂは、２００μｍの透明なプラスチックチャネルを有するヒトの脳組織の２色ＳＲＳ画像を示す。プラスチックからの焦点外ＳＲＳ信号が存在するものの、容易に除去され、図５の画像を得るのに使用するカバースリップ、カバースライド、両面テープを用いた、又は、図１３Ａの画像を生成するのに使用する長方形のガラス毛管を用いたより煩雑なサンプル調製方法と同等の画質が得られる。従って、上記生検装置は、ガラス、プラスチック又は本明細書に記載の任意の適した材料でできていてもよい。

本明細書に記載の臨床的に関連するＣＲＳイメージングのすべての例が行われたラマンスペクトルの高波数領域におけるラマン信号は、通常、Ｃ−Ｈ振動から生じるものである。一実施例では、生検装置は、水素原子の一部が重水素原子に置き換えられて、対象スペクトル領域ではラマン活性が低い材料として生成される材料からできていてもよい。

他の実施例では、対象スペクトル領域外でのラマン活動は、信号をイメージングシステムのスペクトル較正、イメージベースのオートフォーカス及び／又はフィールド平坦化に使用し得るため、歓迎される副作用にもなり得る。

図１２Ａ乃至図１２Ｅは、例示的な生検装置１２００を詳細に示す３Ｄ図である。図１２Ｂは、図１２Ａの生検装置１２００の１２Ｂ線に沿った断面図である。図１２Ｃは、図１２Ａの生検装置１２００の１２Ｃ線に沿った断面図である。図１２Ｄは、図１２Ａの生検装置１２００の１２Ｄ線に沿った斜視図である。図１２Ｅは、図１２Ａの生検装置１２００の１２Ｅ線に沿った斜視図である。

生検チップとして構成された生検装置１２００は、第１端部１２０４から、反対側の第２端部１２０６などの第２端部１２０６まで延在する「本体」とも呼ばれる中空体１２０２を備えている。いくつかの実施例では、この中空体１２０２は、中心縦軸１２０８を画定する。他の実施例では、中空体１２０２は、湾曲又は偏心している。この本体１２０２は、第１端部１２０４の第１開口部１２１２から第２端部１２０６の第２開口部１２１４まで延在する中心穴又は中空内部１２１０を有している。また、本体１２０２には、第２端部１２０６に又はその近傍にサンプル収集部１２１６が形成されている。いくつかの実施例では、本体１２０２には、サンプル収集部１２１６を有するテーパー領域が形成されている。本明細書で用いられるように、「サンプル収集部」とは、イメージング時に生体サンプルが位置する装置１２００の一部である。言い換えれば、使用時、生体サンプルは、生体装置１２００内へと引き込まれ、サンプル収集部１２１６に保持される。従って、この「サンプル収集部」は、「サンプルイメージング部」とも呼ばれる。図１２Ａ乃至図１２Ｃに示すように、サンプル収集部１２１６は、第２端部１２０６に又はその近傍に位置している。しかしながら、他の実施例では、サンプル収集部は、中央領域又は生検装置１２００の第１端部１２０４の近くに位置している。このように、サンプル収集部又はサンプルイメージング部１２１６の配置や位置は限定されていない。

本体１２０２の第１端部１２０４から第２端部１２０６までの長さは、約１ｃｍから約２０ｃｍ、約２ｃｍから約１５ｃｍ、又は、約３ｃｍから約１０ｃｍであればよい。いくつかの実施例では、本体１２０２は、約１ｃｍ、約２ｃｍ、約３ｃｍ、約４ｃｍ、約５ｃｍ、約６ｃｍ、約７ｃｍ、約８ｃｍ、約９ｃｍ、約１０ｃｍ、約１２ｃｍ、約１４ｃｍ、約１６ｃｍ、約１８ｃｍ、約２０ｃｍの長さを有する。この本体１２０２の第１及び第２端部１２０４、１２０６に直交する第１面から第１及び第２端部１２０４、１２０６に直交する第２面までの幅は、約２ｍｍから約３０ｍｍ、約３ｍｍから約２０ｍｍ、又は、約５ｍｍから約１０ｍｍであればよい。いくつかの実施例では、本体１２０２は、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１２ｍｍ、約１４ｍｍ、約１６ｍｍ、約１８ｍｍ、約２０ｍｍの幅を有する。従って、さまざまな実施例では、生検装置１２０２は、ほぼ等しい長さと幅を有する。他の実施例では、本体１２０２の長さが幅よりも長く、細長い中空体１２０２が得られる。また、生検装置１２００の本体１２０２は、対称であっても非対称であってもよい。例えば、この装置１２００を特定の方向でイメージング装置に挿入しなければいけないいくつかの実施例では、非対称な本体１２０２が用いられる。

第１開口部１２１２は、陰圧源を収容するよう構成されている。例えば、適した陰圧源としては、固定式の真空源（例えば、ビルの真空システム）やポンプであっても良く、ビルの壁やポンプから延在するパイプやチューブによって生検装置１２００まで延在している。いくつかの実施例では、この陰圧を供給するパイプやチューブは、外科吸引装置（例えば、図１０の吸引装置９２２や図１１の吸引装置９６２など）の一端に接続され、生検装置１２００は、その外科吸引装置の反対側の一端に取り外し可能に接続されている。生検装置１２００は、例えば、締まり嵌めや圧入、ルアー嵌め、バヨネットスロット、ねじ切りを含む、従来知られている任意の手段でチューブや外科吸引装置に取り外し可能に接続される。生検装置１２００が締まり嵌めや圧入によりチューブや吸引装置に接続される実施例では、図１２Ａ乃至図１２Ｃに示すように、本体１２０２は、第１端部１２０６から外側へ広がって接続をしやすくすることができる。

第２開口部１２１４は、患者から得られた生体サンプルを収容するよう構成されている。この患者は、人間であってもよいし、例えば、馬、犬、猫などの人間以外の哺乳類であってもよい。しかしながら、患者は、医療処置を受けている動物であるものとする。生体サンプルは、陰圧や吸引力を併用して、装置１２００の第２開口部１２１４からサンプル収集部１２１６へと吸い込まれる又は引き込まれる組織又は生体片である。さまざまな実施例では、組織は、例えば、脳、乳房、肝臓、肺、前立腺、結腸、胃、膵臓など、被検者の臓器サンプルである。しかしながら、この組織は、医師によって採取された組成及び／又は構造分析が必要な任意の組織であるものとする。本明細書に記載のように、さまざまな実施例では、組織は、ある程度腫瘍や悪性がん細胞が浸潤している可能性のある脳のサンプルである。サンプル収集部１２１６は、いくつかの実施例では、第２端部１２０６の近くに位置しているが、本体１２０２の第２端部１２１６は、イメージング用生体サンプルを収容するために、組織へとまとめる、切り込む又は突き刺すよう構成されていない。その代わり、外科キャビティの表面から組織を吸い上げる又は取り込むよう構成されている。

生検装置１２００は、上記サンプル収集部１２１６に対応する領域に配置、位置決め又は位置付けられた光透過性領域１２１８をさらに有する。この光透過性領域１２１８は、励起ビームに対して、かつ、生体サンプルによって励起ビームとの相互作用後に生成された光信号に対して（上述のように）少なくとも部分的に光透過性を有する。この光透過性領域１２１８は、イメージング装置が該光透過性領域１２１８を介してサンプル収集部１２１６の生体サンプルの画像をキャプチャすることができるよう配置されている。従って、光透過性領域１２１８は、サンプル収集部１２１６に配置された場合に、生体サンプルのイメージングを行うことができるイメージング装置からの電磁波を透過する又はできるよう構成されている。いくつかの実施例では、生検装置１２００全体が上記光透過性領域１２１８を有する。つまり、これらの実施例では、装置本体１２０２全体が光透過性を有する。他の実施例では、サンプル収集部１２１６に隣接する部分など、本体１２０２の一部だけが光透過性を有する。この光透過性領域１２１８は、上述のように、光透過性ガラスやプラスチックなど、従来知られている光透過性を有する任意の材料でできている。また、光透過性領域１２１８は、ユーザの好みに応じて、所定の領域においてラマン活性であってもそうでなくてもよい。

中心穴１２１０は、サンプル収集部１２１６で収集チャネル１２２０を画定する。この収集チャネル１２２０は、ほぼ平面状であり、断面形状を有している。サンプル収集及びイメージングを可能にする任意の断面形状を用いればよい。この断面形状は、非限定の例として、かつ、図１２Ａ乃至図１２Ｅに示すように、長方形であってもよい。従って、生検装置１２００の断面形状は、サンプル収集部１２１６における形状と、生検装置１２００の残りの部分における形状とが異なっていてもよい。図１２Ｄに示すように、収集チャネル１２２０は、高さＨと幅Ｗを有し、図１２Ｃに示すように、深さＤを有する。他の実施例では、収集チャネル１２２０は、ほぼ平面状の上面又は天井と、反対側のほぼ平面状の底面又は床を有する。一方、それらの上面及び底面と直交する壁は、凹状又は凸状であってもよい。また一方、そのような実施例では、高さＨ、幅Ｗ、深さＤに関する同様の制約が適用される。多くの実施例では、高さＨの設定は、生体サンプルを収集チャネル１２２０に吸引するのに十分な量又はレベルの陰圧又は吸引力を供給するよう、かつ、その生体サンプルの画像を十分な画質及び解像度でキャプチャできるよう行われる。陰圧又は吸引力の強さは、主に、印加される陰圧の程度によって決定される。圧力は、通常、環境大気圧以上又は以下のゲージ圧によって測定される。この普通の圧力計ではゼロを示す大気圧は、７６０ｍｍＨｇであり、これは海抜ゼロでの標準大気圧である。従って、陰圧は、大気圧未満の圧力、又は、圧力計でゼロ未満の圧力（大気）に定義される。いくつかの実施例では、陰圧又は吸引力は、約１０ｍｍＨｇから約５５０ｍｍＨｇ、約１０ｍｍＨｇから約５０ｍｍＨｇ、約５０ｍｍＨｇから約１００ｍｍＨｇ、約１００ｍｍＨｇから約１５０ｍｍＨｇ、約１５０ｍｍＨｇから約２００ｍｍＨｇ、約２００ｍｍＨｇから約２５０ｍｍＨｇ、約２５０ｍｍＨｇから約３００ｍｍＨｇ、約３００ｍｍＨｇから約３５０ｍｍＨｇ、約３５０ｍｍＨｇから約４００ｍｍＨｇ、約４００ｍｍＨｇから約４５０ｍｍＨｇ、約４５０ｍｍＨｇから約５００ｍｍＨｇ、又は、約５００ｍｍＨｇから約５５０ｍｍＨｇである。いくつかの実施例では、陰圧又は吸引力は、５５０ｍｍＨｇ以上である。従って、圧力又は吸引力のレベルは、さまざまな実施例では、約１０ｍｍＨｇ、約２５ｍｍＨｇ、約５０ｍｍＨｇ、約７５ｍｍＨｇ、約１００ｍｍＨｇ、約１５０ｍｍＨｇ、約２００ｍｍＨｇ、約２５０ｍｍＨｇ、約３００ｍｍＨｇ、約３５０ｍｍＨｇ、約４００ｍｍＨｇ、約４５０ｍｍＨｇ、約５００ｍｍＨｇ、約５５０Ｈｇ以上である。いくつかの実施例では、圧力レベルは約１８０ｍｍＨｇであり、病院の壁にあるポートを介してアクセスできる病院の固定真空システムによって供給された陰圧又は吸引力のレベルとほぼ同じであり、これは、ポンプによっても行える。

画像は、外科医や他の医師が画像を分析して画像の対応するサンプルの組成を判定することができる場合に十分な画質及び解像度を有する。つまり、画像は、組織サンプルにがん細胞が浸潤しているかどうかを外科医や他の医師が容易に、すなわち、手術中に判定することができる場合に十分な画質及び解像度を有する。上述のように、高さＨは、約５００μｍ以下、約４００μｍ以下、約３００μｍ以下、約２００μｍ以下、又は、約１００μｍ以下である。いくつかの実施例では、高さＨは、約１０μｍから約５００μｍ、約５０μｍから約４００μｍ、約１００μｍから約３００μｍ、又は、約１５０μｍから約２５０μｍの範囲である。従って、さまざまな実施例では、高さＨは、約５００μｍ、約４５０μｍ、約４００μｍ、約３５０μｍ、約３００μｍ、約３５０μｍ、約３００μｍ、約２５０μｍ、約２００μｍ、約１５０μｍ、又は、約１００μｍである。幅Ｗは、約１００μｍから約１５ｍｍ、約５００μｍから約１０ｍｍ、又は、約１ｍｍから約５ｍｍの範囲である。さまざまな実施例では、幅Ｗは、約１０μｍ、約２００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１１ｍｍ、約１２ｍｍ、約１３ｍｍ、約１４ｍｍ、又は、約１５ｍｍである。しかしながら、図１２Ｃに示すように、この幅Ｗは、収集チャネル１２２４が装置１２００の第２端部１２００８からその第１端部１２０６に延在するにつれて若干縮小してもよい。深さＤは、約１００μｍから約３０ｍｍ、約１ｍｍから約２０ｍｍ、約５ｍｍから約１５ｍｍ、又は、約５ｍｍから約１０ｍｍの範囲である。さまざまな実施例では、深さＤは、約１００μｍ、約２００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１５ｍｍ、約２０ｍｍ、約２５ｍｍ、又は、約３０ｍｍである。例えば、幅Ｗと深さＤがいずれも４ｍｍである場合、最大４ｍｍ×４ｍｍの面積で画像を展開することができる。装置１２００によれば、イメージングが行われる軸に沿ったサンプル収集部１２１６の各寸法より高い距離分解能が可能となる。

いくつかの実施例では、装置１２００のサンプル収集部１２１６は、必要に応じて、バックストップ又は有孔壁１２２２をさらに備えている。このバックストップ又は壁１２２２は、陰圧がバックストップ又は壁１２２２を横断できるように複数の穴又はポアを有している。バックストップ又は壁１２２２は、生体サンプルが生検装置１２００から飛び出すのを防ぎ、その生体サンプルをイメージングを行うために装置１２００のサンプル収集部１２１６内に保持する。この任意のバックストップ又は有孔壁１２２２は、装置１２００の第２端部１２０６から収集チャネル１２２０の深さＤと等しい距離に又はその近傍で、本体１２０２の中心穴１２１０内に配置されている。

生検装置１２００のサンプル収集部１２１６には、装置本体１２０２の収集チャネル１２２０と光透過性領域１２１８が含まれる。図１２Ａ乃至図１２Ｄに示すように、サンプル収集部１２１６は、ほぼ平面状であり、チャネル高さＨに応じたサイズの比較的短い端部１２２４、１２２６を有する。このサンプル収集部１２１６は、ほぼ平面状の第１面１２２８と、ほぼ平面状の第２面１２３０も有し、これらの面は端部１２２４、１２２６とほぼ直交している。第１平面１２２８と第２平面１２３０の少なくとも一方は、装置本体１２０２の光透過性領域１２１８を有して構成されている。収集チャネル１２２０に位置する生体サンプルのイメージングが透過モードで行われる実施例では、光透過性領域１２１８を画定する光透過性材料が、第１面１２２８と第２面１２３０の両方に含まれる。収集チャネル１２２０に位置する生体サンプルのイメージングが反射モードで行われる実施例では、光透過性領域１２１８を画定する光透過性材料が、第１面１２２８又は第２面１２３０の少なくとも一方に含まれる。つまり、光透過性領域１２１８を画定する光透過性材料が、第１面１２２８と第２面１２３０の両方に含まれる場合、収集チャネル１２２０内の生体サンプルのイメージングを透過モード又は反射モードで行うことができる。一方、光透過性領域１２１８を画定する光透過性材料が、第１面１２２８又は第２面１２３０のいずれか一方だけに含まれる場合、収集チャネル１２２０内の生体サンプルのイメージングは反射モードでしか行えない。第１面１２２８と第２面１２３０における本体１２０２の厚さは、励起ビームが収集チャネル１２２０に位置する生体サンプルに集光し、それと相互作用できるよう設定されている。さまざまな実施例では、第１面１２２８の厚さは、顕微鏡スライドの厚さとほぼ等しく、第２面１２３０の厚さは、１．５番カバースリップの厚さとほぼ等しい。従って、サンプル収集部１２１６における装置１２００の本体１２０２には、励起光路と収集光路が含まれる。さまざまな実施例では、これらの励起光路及び収集光路における生検装置１２００の本体１２０２はそれぞれ、約５０μｍから約２ｍｍ、約７５μｍから約１．５ｍｍ、約１００μｍから約１ｍｍ、約１５０μｍから約５００μｍ、約２００μｍから約１５０μｍである。

いくつかの実施例では、生検装置１２００は、この生検装置１２００によって供給される陰圧の量やレベルを制御する調整器又は圧力調整器をさらに備えている。この調整器は、外面と生検装置１２００の中心穴１２１０又は内部との間の流体連結を可能にする、細長い本体１２０２に配置された開口部又はバルブであってもよい。例えば、開口部を指や親指で部分的に覆うことで、中心穴１２１０内の陰圧量を制御するようにしてもよい。もしくは、バルブを中心穴１２１０内の陰圧量を制御するよう操作してもよい。いくつかの実施例では、上記調整器は、生検装置が取り付けられる外科吸引装置の一つの部材である。他の実施例では、中心穴１２１０内の陰圧量は、生検装置１２００が取り外し可能に接続される吸引装置に配置された圧力制御調整器によって制御される。非限定の例として、吸引装置は、上述のように、図１０の吸引装置９２２であっても、図１１の吸引装置９６２であってもよい。この吸引装置にある圧力制御調整器は、上述のように、開口部であってもバルブであってもよい。

以下にさらに説明するように、生検装置１２００などの生検装置は、生体サンプルや生検の座標を記録するナビゲーション機器と併用して、その生体サンプルや生検の採取場所に対応する記録された座標を提供することができる。術前又は術中の巨視的イメージングデータを記録された座標に表示することにより、外科医や他の医師は、その生体サンプルが採取された領域に悪性がん細胞が浸潤しているかどうか判断することができる。この処理を繰り返すことで、外科医や医師は、正常で健康な組織が除去されることを極力抑えつつ、腫瘍や腫瘍細胞を含む組織を安全に除去することができるよう、その腫瘍の境界線を決定することができる。

上記装置１２００全体が、透明なプラスチックやガラスなど、少なくとも部分的に光透過性を有する材料でできている実施例では、射出成形、押出又は３次元印刷により単一段階での製造が可能である。他の実施例では、装置１２００は、射出成形、押出又は３次元印刷と、圧縮、溶融、熱結合、及び／又は、接着などの二次過程とからなる二段階の手順で製造可能である。従って、生検装置１２００は、単一の一体構造であればよい。また、生検装置１２００は、接着剤で機械的に、及び／又は、熱アニーリングにより組み合わされる２つ以上の部品から組み立てることもできる。例えば、収集チャネル１２２０の底部や床を射出成形して第１ユニットを形成し、第２ユニットをその第１ユニットに対して熱アニーリングして、収集チャネル１２２０の上部や天井を形成することができる。この方法は、射出成形では所望のアスペクト比が得られない場合に有利となることがある。

さまざまな実施例では、生検装置１２００は、ポンプや真空システムによって供給された陰圧を該装置１２００を介して伝送する外科吸引装置に取り外し可能に接続されるよう構成されている。従って、この生検装置１２００は、サンプル収集部１２１６の収集チャネル１２２０に生体サンプルを収容し、イメージング装置において直接分析を行って、そのサンプルに関する組成及び／又は構造情報並びに、必要に応じて、ナビゲーション情報を数秒又は数分以内に、例えば、約２０分以内、約１５分以内、約１０分以内、約５分以内、約４分以内、約３分以内、約２分以内、又は、約１分以内に得ることができる。この情報は、いくつかの実施例では、直ちに、又は、約１０秒から約２０分、約１０秒から約１５分、約１０秒から約１０分、約１０秒から約５分、又は、約１０秒から約２分の範囲内に得られる。従って、上記方法は、約１０秒、約２０秒、約３０秒、約４０秒、約５０秒、約１分、約１．５分、約２分、約２．５分、約３分、約３．５分、約４分、約４．５分、約５分、約６分、約７分、約８分、約９分、約１０分、約１２分、約１５分、約１８分、又は、約２０分で得ることができる。

第２のモジュール式生検装置１２５０を図１４Ａ乃至図１４Ｇに示す。この生検装置１２５０は、第１端部１２５４から、反対側の第２端部１２５６まで延在する本体１２５２を備えている。この本体１２５２には、第１端部１２５４に又はその近傍に吸引接続部１２５８が形成され、第２端部１２５６に又はその近傍にサンプル収集部１２６０が形成されている。この吸引接続部１２５８は、第１端部１２５４の第１開口部１２６４からサンプル収集部１２６０まで延在する中心穴１２６２を画定する。この吸引接続部１２５８は、第１開口部１２６４により陰圧源を収容するよう構成されている。

上記サンプル収集部１２６０は、表面１２６６と、その表面１２６６と直交する壁１２６８を有している。裏面１２７０は、サンプル収集部１２６０の壁１２６８に配置されている。この裏面１２７０は、平面状又はほぼ平面状であり、少なくとも部分的に光透過性を有する。ほぼ平面状であるとは、裏面１２７０は平面状であることからそれる、すなわち、凹状又は凸状であってもよいことを意味する。いくつかの実施例では、この裏面１２７０は、顕微鏡スライドである。裏面１２７０は、非限定の例として、クランプ、接着剤、溝封止など、従来知られている任意の手段で壁１２６８に接続することができる。裏面１２７０が壁１２６８に配置されている場合、サンプル収集部１２６０では、第２端部１２５６における第２開口部１２７４から吸引接続部１２５８まで延在する収集チャネル１２７２が形成される。この収集チャネル１２７２は、陰圧（上述の陰圧など）が第１開口部１２６４に印加されると、空気と生体物質などの物質が第２開口部１２７４と収集チャネル１２７２から吸引されるよう、中心穴１２６２と流体連結している。さまざまな実施例では、収集チャネル１２７２は、中空の中間部１２７６によって中心穴１２６２に接続している。以下にさらに説明するように、本体１２５２は、必要に応じて、少なくとも部分的に光透過性を有する裏面１２７０と検出窓とを位置合わせするのに用いられる位置決め面１２７８をさらに備えている。また、生検装置１２５０は、生体物質が中心穴１２６２から飛び出すのを防ぐバックストップ又は有孔壁を収集チャネル１２７２に備えていてもよい。このバックストップ又は有孔壁は、収集チャネル１２７２に恒久的に配置されていてもよいし、例えば、壁１２６８や表面１２６６をスライドすることなどにより、必要に応じて収集チャネル１２７２に挿入されたりそこから取り出されたりしてもよい。生体サンプルが生検装置１２５０のサンプル収集部１２６０の収集チャネル１２７２に吸引されると、光が裏面１２７０を通過して、その生体サンプルと相互作用する場合がある。

この生検装置１２５０により生体物質の吸引を十分に行うために、サンプル収集部１２６０は、生体組織が収集チャネル１２７２を自由に、すなわち、凝集や閉塞することなく流れるようにするよう構成されたじょうご状のサンプル導入部１２８０を備えている。このサンプル導入部１２８０は、生体物質を収集チャネル１２７２に導く面を有する。従って、サンプル導入部１２８０は、第２開口部１２７４を備え、この第２開口部１２７４は、サンプル導入部１２８０内で第２幅へと徐々に小さくなる第１幅を有する。また、第２開口部１２７４は、サンプル導入部１２８０内で小さい第２高さへと徐々に小さくなる第１高さを有する。図１４Ｆに示すように、壁１２６８は、収集チャネル１２７２が第２開口部１２７４において、第２端部１２５６から第１端部１２５４に向かう方向において長さＬ_１分だけ第２幅Ｗ_２まで小さくなる第１幅Ｗ_１を有するよう、生検装置１２５０の第２端部１２５６から収集チャネル１２７２の中間部１２８２まで内側に傾斜している。さまざまな実施例では、第１幅Ｗ_１は、約１００μｍから約１０ｍｍの範囲であり、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍなどの幅である。そして、第２幅Ｗ_２は、約５０μｍから約８ｍｍの範囲であり、例えば、約５０μｍ、約１００μｍ、約２５０μｍ、約５００ｍｍ、約７５０μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、又は、約８ｍｍなどである。長さＬ_１は、約１００μｍから約２０ｍｍの範囲であり、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１５ｍｍ、又は、約２０ｍｍなどの長さであってもよい。図１４Ｇに示すように、表面１２６６は、収集チャネル１２７２が第２開口部１２７４において、第２端部１２５６から第１端部１２５４に向かう方向において長さＬ_１分だけ第２高さＨ_２まで小さくなる第１高さＨ_１を有するよう、第１端部１２５４に向かう生検装置１２５０の第２端部１２５６から裏面１２７０に向かって傾斜している。さまざまな実施例では、この第１高さＨ_１は、約１０μｍから約５ｍｍの範囲であり、例えば、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍなどの高さである。そして、第２高さＨ_２は、約５μｍから約２ｍｍの範囲であり、例えば、約５μｍ、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、又は、約２ｍｍなどである。

図１５Ａ乃至図１５Ｃは、図１４Ａ乃至図１４Ｇの生検装置２５０と類似した生検装置２５０ｂを示す。しかしながら、この生検装置２５０ｂは、上記サンプル導入部１２８０とは異なるサンプル導入部１２８０ｂを有する。図１５Ｂに示すように、壁１２６８は、収集チャネル１２７２が、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、又は、約１０ｍｍの幅など、約１００μｍから約１０ｍｍの範囲の単一の幅Ｗ_３を有するよう、ほぼまっすぐである。図１５Ｃに示すように、表面１２６６は、収集チャネル１２７２が第２開口部１２７４において、第２端部１２５６から第１端部１２５４に向かう方向において長さＬ_２分だけ第２高さＨ_４まで小さくなる第１高さＨ_３を有するよう、第１端部１２５４に向かう生検装置１２５０の第２端部１２５６から裏面１２７０に向かって傾斜している。さまざまな実施例では、この第１高さＨ_３は、約１０μｍから約５ｍｍの範囲であり、例えば、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍなどの高さである。そして、第２高さＨ_４は、約５μｍから約２ｍｍの範囲であり、例えば、約５μｍ、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、又は、約２ｍｍなどである。長さＬ_２は、約１００μｍから約２０ｍｍの範囲であり、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１５ｍｍ、又は、約２０ｍｍなどの長さであってもよい。

図１６Ａ乃至図１６Ｃは、図１４Ａ乃至図１４Ｇの生検装置２５０と類似した生検装置１２５０ｃを示す。しかしながら、この生検装置１２５０ｃは、上記サンプル導入部１２８０とは異なるサンプル導入部１２８０ｃを有する。図１６Ｂに示すように、壁１２６８は、収集チャネル１２７２が、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、又は、約１０ｍｍの幅など、約１００μｍから約１０ｍｍの範囲の単一の幅Ｗ_４を有するよう、ほぼまっすぐである。図１６Ｃに示すように、収集チャネル１２７２は、長さＬ_３分だけ第１端部１２５４に向かって延在する第２開口部１２７４からの高さＨ_５を有する。この収集チャネル１２７２の高さは、長さＬ_３の後、高さＨ_６まで急に減少する。さまざまな実施例では、この高さＨ_５は、約１０μｍから約５ｍｍの範囲であり、例えば、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍなどの高さである。そして、第２高さＨ_６は、約５μｍから約２ｍｍの範囲であり、例えば、約５μｍ、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、又は、約２ｍｍなどである。長さＬ_３は、約１００μｍから約２０ｍｍの範囲であり、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１５ｍｍ、又は、約２０ｍｍなどの長さであってもよい。

上記サンプル導入部の形状は限定されないものとする。図１７Ａ及び図１７Ｂ、図１８Ａ及び図１８Ｂは、サンプル導入部のさらなる非限定例を示す。すなわち、図１７Ａ及び図１７Ｂは、生検装置１２５０ｄのサンプル導入部１２８０ｄを示す。図１７Ａに示すように、壁１２６８は、収集チャネル１２７２が、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、又は、約１０ｍｍの幅など、約１００μｍから約１０ｍｍの範囲の単一の幅Ｗ_５を有するよう、ほぼまっすぐである。図１７Ｂに示すように、収集チャネル１２７２は、長さＬ_４分だけ第２端部に向かって延在する第２開口部からの高さＨ_７を有する。表面１２６６は、長さＬ_４の後、長さＬ_５にわたって高さＨ_８まで裏面１２７０に向かって傾斜する。さまざまな実施例では、この高さＨ_７は、約１０μｍから約５ｍｍの範囲であり、例えば、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、又は、約５ｍｍなどの高さである。そして、高さＨ_８は、約５μｍから約２ｍｍの範囲であり、例えば、約５μｍ、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、又は、約２ｍｍなどである。長さＬ_４、Ｌ_５は、それぞれ、約１００μｍから約２０ｍｍの範囲であり、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１５ｍｍ、又は、約２０ｍｍなどの長さであってもよい。

図１８Ａ及び図１８Ｂは、生検装置１２５０ｅのサンプル導入部１２８０ｅを示す。図１８Ａに示すように、壁１２６８は、第２開口部１２７４から第１端部１２５４に向かって延在する長さＬ_６にわたってほぼまっすぐである。収集チャネル１２７２は、この長さＬ_６にわたって第１幅Ｗ_６を有する。この壁１２６８は、長さＬ_６の後、内側に突き出て第２幅Ｗ_７を画定する。さまざまな実施例では、第１幅Ｗ_６は、約１００μｍから約１０ｍｍの範囲であり、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍなどの幅である。そして、第２幅Ｗ_７は、約５０μｍから約８ｍｍの範囲であり、例えば、約５０μｍ、約１００μｍ、約２５０μｍ、約５００ｍｍ、約７５０μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、又は、約８ｍｍなどである。長さＬ_６は、約１００μｍから約２０ｍｍの範囲であり、例えば、約１００μｍ、約５００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍ、約６ｍｍ、約７ｍｍ、約８ｍｍ、約９ｍｍ、約１０ｍｍ、約１５ｍｍ、又は、約２０ｍｍなどの長さであってもよい。図１８Ｂに示すように、収集チャネル１２７２は、長さＬ_６分だけ第１端部１２５４に向かって延在する第２開口部１２７４からの高さＨ_９を有する。この収集チャネル１２７２の高さは、長さＬ_６の後、高さＨ_１０まで急に減少する。さまざまな実施例では、この高さＨ_９は、約１０μｍから約５ｍｍの範囲であり、例えば、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、約２ｍｍ、約３ｍｍ、約４ｍｍ、約５ｍｍなどの高さである。そして、高さＨ_１０は、約５μｍから約２ｍｍの範囲であり、例えば、約５μｍ、約１０μｍ、約５０μｍ、約１００μｍ、約２００μｍ、約３００μｍ、約４００μｍ、約５００μｍ、約６００μｍ、約７００μｍ、約８００μｍ、約９００μｍ、約１ｍｍ、又は、約２ｍｍなどである。

上記生検装置１２５０乃至１２５０ｅの使用時に考えられる課題の一つとしては、対応するイメージングシステムの光学素子が体液や生体組織（例えば、血液）で汚染される可能性があり、それにより画質の低下が生じる。このような画質の低下は、イメージング装置への挿入前に生検装置１２５０乃至１２５０ｅを洗浄することにより回避することができる。また、生検装置１２５０乃至１２５０ｅは、第２開口部１２７４と外部環境とを物理的に分離するが、生検装置１２５０乃至１２５０ｅ内部の吸引された組織のイメージングを可能にする光透過性領域を有する外部キャリアバイアルに挿入されるよう構成することができる。

このような外部キャリアバイアル１３００を、そこに挿入された図１６Ａ乃至図１６Ｇの生検装置１２５０と共に、図１９Ａ及び図１９Ｂに示す。しかしながら、本明細書に記載の生検装置はいずれも、この外部キャリアバイアル１３００やその対応する実施例に収容されてもよいものとする。この外部キャリアバイアル１３００は、必要に応じて、機械加工可能であり、例えば、高分子材料を成形することによって作製されてもよい。外部キャリアバイアル１３００は、第１端部１３０４から反対側の第２端部１３０６まで延在する細長い本体１３０２を備えている。この細長い本体１３０２には、第１端部１３０４の開口部１３１０から第２端部１３０６に向かって延在するが、第２開口部を形成するよう第２端部１３０６を貫通しては延在しない中空の内部コンパートメント１３０８が形成されている。

この中空の内部コンパートメント１３０８は、取付部１３１２とイメージング部１３１４を有する。生検装置１２５０は位置決め面１２７８を有するのに対し、取付部１３１２は対向位置決め面１３１６を有する。イメージング部１３１４は、少なくとも部分的に光透過性を有する検出窓１３１８を有する。さまざまな実施例では、このイメージング部は、サンプル収集部１２６０についてのスペース１３２０が形成されるよう、生検装置１２５０のサンプル収集部１２６０の少なくとも一部を収容するには十分すぎるスペースを有している。従って、外部キャリアバイアル１３００は、生検装置１２５０を外部キャリアバイアル１３００の中空の内部コンパートメント１３０８に挿入後、水又は油でそのスペース１３２０が満たされるよう、挿入前に、その少なくとも一部にイメージング用の水又は油が充填されてもよい。この水又は油、すなわち、浸漬液は、生体サンプルに汚染される可能性があるが、イメージング及び／又は検出装置はクリーンなままである。

生検装置１２５０が外部キャリアバイアル１３００の中空の内部コンパートメント１３０８に挿入されると、この生検装置１２５０の位置決め面１２７８が、取付部１３１２の対向位置決め面１３１６と係合する。位置決め面１２７８が対向位置決め面１３１６と係合すると、外部キャリアバイアルの検出窓１３１８と、生検装置１２５０の少なくとも部分的に光透過性を有する裏面１２７０とが位置合わせされる。このように、イメージングや検出を目的として、検出又はイメージング装置からの光が、外部キャリアバイアル１３１０の検出窓１３１８を通り、生検装置１２５０の少なくとも部分的に光透過性を有する裏面１２７０を通って、収集チャネル１２７２内に位置する生体サンプルと相互作用する場合がある。生検装置１２５０のサンプル収集部１２６０に対するスペース１３２０は、浸漬液で充填されていてもよい。さらに又はその代わりに、浸漬液は、生体サンプルの分析及び／又はイメージングが行われるよう、外部キャリアバイアル１３１０の検出窓１３１８に配置されていてもよい。

さまざまな実施例では、本技術に係る生検チップとして構成された生検装置などの生検装置は、使い捨てで滅菌包装されており、標準の外科吸引装置に取り外し可能に接続されるよう構成されている。このように、生検チップは交換可能である。従って、本技術によれば、滅菌状態で個別に又はまとめて包装された生検装置を少なくとも一つ含むキットが提供される。さまざまな実施例では、このキットには、収集チャネルと光透過性領域の寸法が同じである収集チャネルをそれぞれ有する生検装置が含まれる。他の実施例では、このキットには、さまざまなサイズの収集チャネル及び／又は光透過性領域を有する生検装置が含まれる。このキットに含まれる生検装置は、外科吸引装置に取り外し可能に接続され、患者から組織サンプルを採取し、イメージング装置において直接分析を行って、該サンプル組織に関する組成及び／又は構造情報、並びに、必要に応じて、ナビゲーション情報を取得するよう構成されている。また、キットの中には、上記ラマンスペクトル領域で活性である光透過性部分を有する生検装置、及び／又は、上記ラマンスペクトル領域で非活性である光透過性部分を有する生検装置を含むものがある。従って、キットには、本技術で提供される生検装置の変形例が含まれていても良く、このキットに含まれる生検装置はすべて同じであっても異なっていてもよい。このキットには、上述のようなイメージング目的で生検チップと併用する少なくとも一つの外部キャリアバイアルがさらに含まれていてもよい。また、このキットには、浸漬液の容器及び／又は固有のラベルがさらに含まれていてもよい。

他の実施例では、上記生検チップは、滅菌処理可能であり、再利用可能である。さらに他の実施例では、上記生検チップは、該生検チップによって伝送される陰圧を制御する調整器を備えていてもよい。

イメージングシステム
本明細書に記載の生検装置はいずれも、生体外イメージングシステムと併用して利用可能である。

図２０は、生体外イメージャ１４０２と、上記生検装置などの生検装置１４０４を備えたシステム１４００を示す。この生検装置１４０４の一方の端部には、組織サンプル１４０６が含まれている。この端部は、イメージング装置１４０２の開口部又はスロット１４０８に挿入される。さまざまな実施例では、図２０に示すように、生検装置１０４は、１次元、２次元又は３次元ステージ１４１０により所定の位置に固定され、焦点調節及び／又は広範囲の走査イメージングを可能にする。ステージのモータドライバは、波長同調、イメージング、起動停止トリガなどの他の制御要素と同期するよう構成することができる。励起光１４１２は、対物レンズなどの励起集束光学素子１４１４により、生検装置１４０４の少なくとも部分的に透過性を有する壁の一部を通ってサンプル１４０６に集光される。このサンプル１４０６からの信号は、集光レンズなどの発光光学素子１４１６により透過時に収集されてもよく、励起集束光学素子１４１４により反射時に収集されてもよい。このシステム１４００は、生検装置１４０４が挿入されることにより起動すると、自動的に取得動作を開始するスイッチ又はボタン１４１８をさらに備えていてもよい。このスイッチ又はボタン４１６は、機械式又は光ベースのスイッチ又はボタンであってもよい。イメージャ１４０２は、浸漬液（例えば、水）を収容する密閉キャビティ１４２０をさらに備えていてもよい。いくつかの実施例では、システム１４００は、浸漬液用の輸液交換システムを備えている。さらに他の実施例では、システム１４００は、浸漬液やイメージング光学素子をクリーンに保つためなど、生検装置１４０４の外表面の（例えば、血液からの）洗浄、清掃及び／又は払拭を行う手段をさらに備えていてもよい。いくつかの実施例では、洗浄手段は、生検装置１４０４が挿入される開口部１４０８に配置されたブラシである。他の実施例では、この洗浄手段は、別個の洗浄チャンバであり、超音波洗浄剤を収容していてもよい。さらに他の実施例では、洗浄手段は、生検装置１４０４の表面を手動で拭くための布やティッシュペーパーである。この生検装置１４０４とイメージャ１４０２を併用することにより、サンプル処理工程をなくし、（例えば、ＳＲＳ又はＣＡＲＳによる）光学イメージングの臨床ワークフローへのシームレスな一体化が可能となる。

医師などのユーザは、グラフィカル・ユーザ・インタフェース（ＧＵＩ）上で本技術によって展開された画像を閲覧する。実際には、画像取得は、生体サンプルを含んだ生検装置の一端をイメージャに挿入することにより、又は、ユーザによりトリガされる。アルゴリズムによって、オートフォーカス、多色タイリング、フィールド平坦化、色チャネル重複、ステッチング、Ｈ＆Ｅ疑似着色処理を自動的に行ってもよい。いくつかの実施例では、上記ＧＵＩは、ズーム、パン及び画像回転機能を有するディスプレイとしてのみ機能してもよい（すなわち、タブレット装置上でも動作可能である）。イメージングチップの材料から得られたＳＲＳ信号は、オートフォーカス用ガイド信号として、すなわち、サンプルに依存せず、また、フィールド平坦性補正や固有のスペクトル較正用ガイド信号として機能してもよい。

また他の例では、生体外イメージャは、複数の生検装置をロードするための複数の開口部又はスロットを備えていてもよい。医師は、患者から生体サンプルを採取すると、その生体サンプルをそれぞれ含む生検装置を、例えば、所定の順番でロードすることができる。そして、イメージャは、各サンプルを一つ一つ連続して自動的にロードし、それらのイメージングを個別に連続して行う。他の実施例では、生検装置は、例えば、複数の生体サンプルを単一の生検装置に次々とロードすることにより、又は、別々にロード可能な複数の生検装置を設けることにより、複数の生体サンプルを生検装置にロードできるよう構成されている。そして、この生体外イメージャは、複数の生検サンプルのイメージングを自動的に行うよう構成されている。

また他の例では、上記生体外イメージャは、生検装置にプリントされたラベルを読み取るよう構成されていてもよい。非限定の例として、このようなラベルは、バーコード、ＱＲコード（登録商標）、数字（例えば、「１」、「２」など）、文字（例えば、「Ａ」、「Ｂ」など）、固有のシリアル番号、又は、その組み合わせ（例えば、「生検１」、「生検２」など）であってもよい。一実施例では、このラベルの読み取りは、生検装置がイメージャの第１位置にロードされた際にバーコードやＱＲコード（登録商標）を読み取り、生検装置がイメージャの第２位置にロードされた際にサンプルのイメージングを行うことができるバーコードスキャナやＱＲコードスキャナを備えることにより実施することができる。他の実施例では、ラベルの読み取りは、生検装置が第１位置にロードされた際に生検装置上のラベルを読み取り、生検装置が第２位置にロードされた際にサンプルのイメージングを行うことができる白色光チャンバをイメージャに備えることにより実施することができる。また他の実施例では、生体外イメージャのイメージング光学素子は、ラベル、ＱＲコード（登録商標）又はバーコードのイメージングを（例えば、透過又は反射イメージングにより）行うよう構成することができる。生検装置に固有のラベルを付与することの利点の一つは、複数の生検を追跡することができるということである。例えば、画像メタデータにラベルを付与して、データセットがアーカイブに保管されたり、結合されたりした際に、同一の機器又は他の機器（例えば、外科ナビゲーションシステム）により識別するようにしてもよい。

他の実施例では、イメージングシステムは、上述のような生検装置に含まれる組織サンプルのイメージングを行うよう構成することができ、かつ、その組織サンプルの従来の白色光イメージングを行うよう構成することもできる。例えば、白色光イメージングの組織サンプルは、Ｈ＆Ｅ又は生体内色素で染色された組織切片やタッチ／スカッシュ製剤であってもよい。このような二重機能性により、有用性が拡大する。この白色光イメージングは、同じ画像形成機構（例えば、ビーム走査イメージング）又は２つの別々の機構（例えば、生検装置のイメージング用にビーム走査イメージング、白色光イメージング用にカメラベースのイメージング）によって実施することができる。他の実施例では、イメージングシステムは、組織サンプルの巨視的イメージングを行うための白色光カメラと、組織サンプルの顕微鏡イメージングを行うための第２イメージングシステムとを備えて構成することができる。例えば、巨視的イメージングシステムは、組織サンプルの輪郭を決定し、これら二つのモダリティ間における画像登録手段による顕微鏡イメージングの走査領域を決定するのに用いることができる。これにより、組織サンプルの周辺を高解像度で走査することができる。

他の実施例では、上記生検装置及びイメージングシステムを一体化した装置として用いることができる。一般的原則としては、装置のサンプル収集部への組織の吸引を陰圧源により行うということである。このような複合装置は、小型イメージャを用いた光学イメージングによりその場で、又は、従来の生検器具を用いて患者から組織サンプルを採取し、それを陰圧によりイメージャにロードすることにより生体外で使用することができる。

図２１及び図２２は、イメージャと生検装置を組み合わせて得られた装置の例を示し、これらを本明細書では「複合装置」と呼ぶ。すなわち、図２１は第１複合装置１４５０を示し、図２２は第２複合装置１４５２を示す。この第１複合装置１４５０と第２複合装置１４５２はいずれも、透過イメージングが可能である。この複合装置１４５０、１４５２は、一般的に、収集チャネル１４５６を形成する本体１４５４を備え、この収集チャネル１４５６は、その本体１４５４の第１端部１４６０にある第１開口部１４５８から、本体１４５４の反対側の第２端部１４６４にある第２開口部１４６２まで延在している。第１複合装置１４５０の収集チャネル１４５６は、第２端部１４６４付近で、例えば、約９０°に曲がっているのに対し、第２複合装置１４５２の収集チャネル１４５６はほぼまっすぐである。両複合装置１２５０、１４５２では、レンズ１４６８と検出器１４７０が本体１４５４に一体化されている。生体サンプル１４７２が陰圧１４８０により第１複合装置１４５０の収集チャネル１４５６に吸引されると、走査機構１４７４はレンズ１４６８を介して光１４７６を放出し、そのレンズが生体サンプル１４７２を通ってほぼ一直線に検出器１４７０へと光を集光する。生体サンプル１４７２が陰圧１４８０により第２複合装置１４５２の収集チャネル１４５６に吸引されると、走査機構１４７４はレンズ１４６８を介して光１４７６を放出し、そのレンズが生体サンプル１４７２を通って検出器１４７０へと光を反射し、集光する。両複合装置１４５０、１４５２では、検出器１４７０は、サンプルの透過側に配置されている。しかしながら、複合装置１４５０、１４５２は例示的なものであり、さらなる構成が適用されてもよいものとする。例えば、収集チャネル１４５６は、前向きの光学素子と吸引を備えるよう構成されていてもよく、信号は反射時に収集されてもよい。これらの例では、イメージング用の小型ＧＲＩＮレンズの使用を示しているが、他の光学素子を用いてもよい。また、上記例では、イメージングを行う機構としてファイバスキャナの使用を示しているが、ガルバノ又はＭＥＭＳ走査ミラーなどの他の機構を使用することもできる。

上記複合装置１４５０、１４５２は、ユーザに組織学的情報を提供するようその場で使用可能であり、その組織学的情報が得られた後、生体サンプル１４７２を回収して、遺伝分析などの生体外分析に使用してもよい。言い換えれば、この複合装置１４５０、１４５２によって得られた生体サンプルに対して少なくとも２つのテストを行ってもよい。

顕微鏡及び巨視的イメージングデータの統合
生体内又は生体外イメージングの共通の課題は、目で識別できる特徴と比べて、イメージング情報が顕微鏡スケールであるということである。顕微鏡的及び巨視的データの両方を便利な方法で提示する必要がある。巨視的イメージングモダリティの例としては、肉眼、外科用顕微鏡、超音波システム、ＭＲＩ、ＣＴがある。本技術によれば、組織キャビティの複数の画像を迅速に取得することができる。従って、画像がどこから取得されたかを追跡する技術が必要である。本技術では、これらのニーズに対応する。

図２３は、本明細書に記載の特定の変形例に係る生検装置と生体外イメージャの使用についての臨床ワークフロー１５００の例を示す。このワークフローには、（Ａ）登録された生検の収集、（Ｂ）画像取得及び共同登録、（Ｃ）ＳＲＳ強化ナビゲーション誘導を行う工程が含まれる。サンプルは、ナビゲーションシステムにより追跡可能な機器により収集され、生検現場（赤色丸印）で位置座標が記録される。切除された組織サンプルは、生体外イメージャによりイメージングが行われ、ＭＲＩ／ＣＴベースのナビゲーションデータセットに共同登録される。最終的に、ＭＲＩ及びＳＲＳ情報と統合されたデータセットにより、ＭＲＩに基づく構造データと顕微鏡イメージングに基づく組織学的データの両方に基づいて、手術野内でのナビゲーションを行うことができる。例えば、同じＭＲＩ／ＣＴベースのナビゲーションデータセットのコンテキストに、複数の生検を表示してもよい。このワークフローによれば、組織が採取された同じ位置に外科医や他の医師が戻り、必要に応じて切除を継続して行うことが可能となる。

図２４は、生体外リアルタイム組織学による例示的なワークフロー１６００のブロック図を示す。医師は、追跡した生検装置を対象領域の上に配置する。組織を（例えば、吸引、圧縮又は切断により）切除することで、その組織が採取された座標の取得がトリガされる。この処理は、自動で（例えば、生検装置内のスイッチにより、又は、ナビゲーションシステムが認識可能な追跡マーカの構造変化によりトリガされて）行われてもよいし、医師により手動で（例えば、フットパドルにより）行われてもよい。そして、システム１６００は、術前の巨視的画像を生検座標にロードして表示してもよい。一方、組織サンプルを含む生検装置は、例えば、血液などを洗い流してもよく、その後、イメージングキャビティに挿入され、顕微鏡画像データの取得がトリガされる。この顕微鏡画像データは、取得されると、巨視的画像データと並んで表示される。顕微鏡画像データは、巨視的データ内に保存されたままとなり、さらなる生検が取得されると追加される。

図２５は、ＭＲＩ及びＳＲＳデータに基づくナビゲーションを同時に可能にする生体内リアルタイム組織学の例示的な臨床ワークフロー１７００を示す。ナビゲーションシステムによって追跡された手持ち式プローブは、ＭＲＩベースのナビゲーションデータセットにリアルタイムで共同登録される組織学的画像を収集する。ＭＲＩ及びＳＲＳ情報と統合されたデータセットにより、ＭＲＩに基づく構造データとＳＲＳイメージングに基づく組織学的データの両方に基づいて、手術野内でのナビゲーションを行うことができる。この手持ち式プローブは、腫瘍浸潤の疑いがある領域内のキャビティを走査するのに用いられ、高密度に浸潤した組織を除去して、非浸潤領域を保存するようにする。

いくつかの変形例では、神経膠腫手術に通常用いられるナビゲーションシステムに手持ち式ＳＲＳプローブを登録する。ＳＲＳ画像は、その登録された定位空間における座標と共に、取得時に自動的に保存される。走査の最後に、ナビゲーションシステムは、直近に取得したＳＲＳ画像の組織学的情報をナビゲーションモデルの位置と共に表示することができる。そして、外科医は、腫瘍が残存する領域を特定し、さらなる切除を安全に行えるかどうか判断してもよい。

ＳＲＳ組織学は、診断細胞及び組織レベルの特徴を解像するのに高い倍率を必要とするため、視野が制限される（ＦＯＶ＝暫定的結果において３５０μｍ）。手持ち式ＳＲＳ内視鏡によれば、画像取得及び登録は、キャビティ面を３ｍｍ間隔で走査することで行われる。２×２ｃｍ^２の切除キャビティは、２．５分で（画像取得に０．５秒、再配置に２．５秒を含む、ＦＯＶにつき３秒で５０枚の画像を想定した場合）走査可能である。この時間は、複数の２×２ｃｍ^２の面を走査して、より広範囲の領域にわたって腫瘍検出を行ったとしても、ｉＭＲＩ取得に必要な追加時間（平均１．６時間）と比べて大幅に短い。この３ｍｍ間隔は、脳腫瘍と大きさが似ている腫瘍摘出手術検体のサンプリングに用いられる方法に基づいたものである。この方法は、再手術率を２６％から９％に軽減することが証明されている。また、３ｍｍは、プローブの手動での配置精度にも関係している。図２６Ａは、神経膠腫手術におけるＳＲＳイメージングの別の例示的なワークフロー１８００を示す。具体的には、図２６Ｂは、術中ＭＲＩ及びＳＲＳワークフローの比較を示す。このワークフローはいずれも、全体的な切除、画像取得、フレームレス定位ナビゲーションシステムを利用して、残存腫瘍の登録と位置特定を行うものである。主な違いは、ＳＲＳでは、画像取得に対して患者や手術環境の準備を整える作業がないということである。図２６Ｂは、ナビゲーションデータとＳＲＳデータの結合例を示す。ＳＲＳデータ及び位置データがＳＲＳ内視鏡により収集されると、外科医は、外科キャビティ内の任意の位置にナビゲートして、局所的な組織学的パターンを観察することができる。任意の位置における組織学的データは、最も近いＦＯＶから収集されたデータに基づくものである。このデータは、従来ナビゲーションに用いられる三面図における位置情報と共に、ナビゲーションモニタに表示される。図２６Ｃは、原寸に比例して描かれた複数の生検を採取するための走査パターンを示す。２ｃｍ×２ｃｍの腫瘍キャビティは、３ｍｍ間隔で３６０μｍのＦＯＶにより約２５分でマッピングすることができる。このパターンには、緑色のボックスが腫瘍のないＦＯＶを示し、赤色のボックスが腫瘍浸潤の兆候が見られるＦＯＶを示す仮定走査データセットがマッピングされる。ピンク色の領域は、「赤色」ＦＯＶの濃度で、残存腫瘍を高リスクでシミュレーションした領域である。

生体外及び生体内のいずれの場合も、顕微鏡的画像と巨視的画像との配向を維持するなど、生検又はイメージング装置の方向をさらに追跡することが有利なことが多い。これは、例えば、顕微鏡イメージングでしか見えない腫瘍の境界線や神経線維の方向を明確にするのに有用な場合がある。白質線維路方向の特定は、機能的重要性を持つことが多い。例えば、皮質脊髄路、弓状束、上縦束及び下縦束、視覚路などの主要な線維束は、その方向に基づいて特定可能である。これらの線維路は、神経系が正常に機能するのに極めて重要であり、手術中に保存ができれば患者にとっても有利である。従って、さまざまな実施例では、イメージング方法には、生検装置の座標及び／又は方向の追跡と記録を行って、生体サンプルの採取時にその位置及び／又は方向に対応する座標及び／又は方向情報を記録する工程と、術前及び／又は術中の巨視的イメージングデータを記録された座標及び／又は方向に表示する工程とが含まれる。さまざまな実施例では、顕微鏡画像は、それらが取得された記録された座標及び／又は方向において巨視的画像のコンテキストに表示される。いくつかの実施例では、生検装置は、外科吸引装置に取り外し可能に接続され、外科吸引装置に位置するナビゲーション信号から既知の距離及び方向に配置されている。外科ナビゲーションシステムは、このナビゲーション信号に対する生検装置の方向と位置を算出する。他の実施例では、生検装置には、ナビゲーションシステムとの通信を行うため、少なくとも一つのナビゲーション信号が位置する。さらに他の実施例では、生検装置に取り外し可能に接続された外科吸引装置と生検装置の両方が、ナビゲーションシステムとの通信を行うため、それぞれに位置するナビゲーション信号を有している。

ＳＲＳ画像の自動画像分割
組織病理学的所見の解釈は、主観的要素を有し、時間集約的であったり、病理学者の専門的知識を必要とする場合がある。イメージングデータは、腫瘍浸潤の自動検出手段による手術ワークフローに組み込まれてもよい。分類体系により、ロバストな定量化されたＳＲＳ画像属性（過形成、軸索密度、タンパク質：脂質比）を、浸潤検出を行うための単一の測定基準に統合する場合がある。図２７は、腫瘍浸潤の度合いを算出するためのＳＲＳ画像の分類を示す。この図は、ＳＲＳ画像における定量化された核密度、軸索密度、タンパク質：脂質比の３次元散布図を示す。測定値は、１８人の患者（３人のてんかん患者、８人の特異的な組織学的サブタイプを含む１５人の脳及び脊椎腫瘍患者）から得られた５１個の新鮮な組織生検からの１４７７の３００×３００μｍ^２のＦＯＶから得られたものである。この散布図上の各ポイントは、各生検の平均値を示す。生検は、Ｈ＆Ｅ染色に基づき、有資格の神経病理学者によって、主に正常からわずかに過形成（ｎ＝２１）、浸潤性の腫瘍（ｎ＝１４）、高密度腫瘍（ｎ＝１６）に分類された。マーカ色は、各生検の平均分類値を示し、０（正常な可能性が高い）がシアン（四角）で、１（腫瘍の可能性が高い）が赤色（丸及び三角）で示されている。正常な大脳皮質、正常な白質、低グレード神経膠、高グレード神経膠腫の代表的なＦＯＶが示されている。

各ＦＯＶにおける核の数、軸索密度、タンパク質：脂質比の定量化を自動で行うことが可能なプログラムを用いることができる（図２８Ａ）。この自動細胞計数及び軸索定量化プログラムは、核コントラストが弱い又は不明瞭な場合に発生する細胞数の相違から、正常な脳と浸潤性及び高密度な神経膠腫とを手動で区別する方法とよく相関する。画像定量化法は、グレーと白の接合部（図２９）や乏突起膠腫の辺縁など、検体の主要な遷移において隣接するＦＯＶを評価することにより検証された。細胞性やタンパク質：脂質比は、大脳皮質から白質に移動する軸索密度の増加に伴って減少した。腫瘍内から隣接する脳内へと移動する同様のパターンが見られたが、細胞性の差は、ほぼ１桁大きかった。

図２８Ａ乃至図２８Ｄは、ＳＲＳ画像分割の検証を示す。図２８Ａは、高密度腫瘍（上）、浸潤性腫瘍（中）、正常組織（下）で検出された核（右）を示すＳＲＳ顕微鏡法ＦＯＶの分割（左）を示す。検出された核の数は、同じＦＯＶの手集計と比較する。図２８Ｂは、高密度腫瘍（上）、浸潤性腫瘍（中）、正常組織（下）で検出された軸索（右）を示すＳＲＳのＦＯＶ画像の分割（左）を示す。軸索の周長は、完全なＳＲＳ画像ライブラリに基づき、手動での１０ポイントスケール評価（０＝軸索なし、１０＝最大軸索密度）と比較して、１０ポイントスケールに再正規化される。図２８Ｃは、手集計と、代表的な正常脳（ｎ＝２）、浸潤性腫瘍（ｎ＝２）、高密度腫瘍（ｎ＝２）生検の画像分割とにより検出されたＦＯＶ当たりの核の平均数を示す。図２８Ｄは、代表的な正常脳（ｎ＝２）、浸潤性腫瘍（ｎ＝２）、高密度腫瘍（ｎ＝２）生検について上述のように手動評価及び分割を行ったＦＯＶの軸索密度を示す。

図２９は、顕微鏡法でイメージングを行った正常組織サンプルの定量分析を示す。この画像は、ＳＲＳ顕微鏡法脂質チャネル２１００、ＳＲＳ顕微鏡法タンパク質チャネル２１０２、ＳＲＳ顕微鏡法脂質及びタンパク質画像のオーバーレイ２１０４、全ＦＯＶについて算出した軸索密度（任意の単位）のヒートマップ２１０６、ＦＯＶ当たりの核のヒートマップ（２１０８、）、全ＦＯＶについて算出したタンパク質：脂質比のヒートマップ２１１０、全ＦＯＶについての分類値２１１２を示す。差し込み図は、高い（赤）、平均（黄）、低い（青）分類値を有するＦＯＶを示す。なお、平均分類値は大脳皮質で大きい値（生検のトップ）となるが、全ＦＯＶは、０．５の切り捨てをはるかに下回る分類値を有する。

１８人の患者（３人のてんかん患者、８人の特異的な組織学的サブタイプを含む１５人の脳及び脊椎腫瘍患者）から得られた５１個の新鮮な組織生検からの１４７７の３００×３００μｍ^２のＦＯＶについて、細胞性、軸索密度、タンパク質：脂質比の定量化とプロッティングを行う。５１個の生検のそれぞれについての平均値の３次元プロット（図２７）は、分析された組織間における各属性の変動を示した。１４７７のＦＯＶのぞれぞれのプロットは、正常組織と高密度に腫瘍浸潤した組織とを区別するパラメータの勾配を示した。

個別の組織属性は、さまざまな程度の感度と特異度により腫瘍浸潤を示した。しかしながら、各組織属性を含む腫瘍浸潤を予測するロバストな分類子を作成するため、一般化加法モデル（ＧＡＭ）による疑似尤度法が用いられる。３人の側頭葉てんかんを持つ患者と、１５人の脳腫瘍患者から得られた１４７７のＦＯＶから分類子が構築された。このＦＯＶの半分（ｎ＝７３８）を用いて分類子が作成され、それがもう半分（ｎ＝７３９）に対してテストされた。分類値は０から１の範囲で、０が腫瘍浸潤の可能性が最も低く、１が浸潤の可能性が最も高い。この分類子は、９７．５％の平均感度と９８．５％の特異度（ＡＵＣ０．９９５）で腫瘍浸潤脳と非腫瘍浸潤脳とを区別した。また、分類子は、グレードや組織学的サブタイプとは関係なく、腫瘍浸潤の種類（正常、わずかに過形成、浸潤性の神経膠腫、高密度神経膠腫）間の区別も高精度に行なった。この分類子は、病理学者による腫瘍浸潤の判定とほぼ一致した。

上記分類子は、広く一般化できるよう、中枢神経系内又はその近くに出現した一連の腫瘍から作成された。しかしながら、神経膠腫は浸潤性が高く、非神経膠腫と比べて境界が不明瞭であるため、神経膠腫浸潤と非浸潤脳を見分けることは最大の課題となる。従って、神経膠腫と対照しか含まない別個の疑似尤度ＧＡＭが生成される。神経膠腫のみのＧＡＭは、９７．０％の感度と９８．７％の特異度で腫瘍浸潤脳と非浸潤脳を区別する。

疑似尤度ＧＡＭ分類子は、被検者内相関を説明し、この分類子の構築には訓練セットは含まれていないが、テストセットデータの一部は、訓練セットデータの一部と相関する（例えば、同じ被検者に由来する）。この依存から脱却するため、主に神経膠腫（及び対照としてのてんかん患者）からなるデータセットに対して、リーブワンアウト相互検証法を用いた。このリーブワンアウト相互検証法によれば、疑似尤度ＧＡＭほど正確ではないが、８７．３％の感度と８７．５％の特異度が得られる。

データは、個々の生検からの複数のＦＯＶから得られる。従って、このデータは相関性があり、データが独立したものであるとする標準統計モデルは当てはまらない。しかしながら、疑似尤度法には、被検者内での相関によって生じるデータの過分散や過小分散を説明する分散パラメータが含まれるので、クラスタデータに対する有効な統計法である（例えば、個別内のＦＯＶ）。１より大きい分散パラメータは、過分散を示し、１未満の分散パラメータは、過小分散を示す。分類子を構築する疑似尤度法、具体的には、疑似二項分布法が適用される。分類子では、共変量を、直線的に入力するのではなく、ＧＡＭ法により疑似尤度に入力する。これにより、グループ間の決定境界のモデル化をより柔軟に行うことができる。疑似尤度ＧＡＭ法では、共変量を三次スプライン関数として入力する。対象の共変量としては、軸索密度、核密度、タンパク質：脂質比、これらの共変量間のすべての交互作用がある。

１）正常対浸潤性及び高密度腫瘍、２）正常対浸潤性腫瘍、３）正常対高密度腫瘍の４つの別個の疑似尤度ＧＡＭ分類子が構築される。段階的回帰により、これら３つの場合のそれぞれに最も適合するものを判定する。交互作用は、ＧＡＭを三次スプライン関数に適合する前に行われる。段階的回帰では、各モデルに対して以下の共変量を選択する：１）３つの主作用、軸索密度と核密度との交互作用、軸索密度、タンパク質：脂質比、２）３つの主作用とすべての３つの交互作用、３）３つの主作用と、軸索密度と核密度の相互作用、４）３つの主作用、軸索密度と核密度の相互作用、核密度とタンパク質：脂質比の相互作用。

段階的回帰によって決定したモデルにより、データが２つの等しい部分にランダムに分割され、訓練セットとテストセットが生成される。そして、上記疑似尤度ＧＡＭがこの訓練セットに再適合され、テストセットから予測が行われる。テストセットにより行われた予測に対して、０．５の判別確率閾値により、受信者動作特性曲線、感度、特異度、精度が得られる。上記分析が１０００回行われ、その１０００回にわたる統計値の平均と９５％信頼区間を報告した。

疑似尤度法内で考え得るデータ相関を排除するため、Ｐｉｃａｒｄ他による相互検証法を利用した。この方法では、被検者が訓練セットから外される。上記モデルを訓練データに適合後、このモデルにより、外された被検者のデータを予測する。毎回違う被検者を外しながら相互検証法により上記４つの分析が行われる。このリーブワンアウト相互検証は、非神経膠腫を持つ患者を排除したデータセットに対して行われる。

ＳＲＳ顕微鏡画像の分割と分析は、ＭＡＴＬＡＢ画像処理ツールボックス（ＭａｔｈＷｏｒｋｓ社、ミシガン州ノバイ）で開発されたカスタムソフトウェアにより行われる。この分割プログラムは３つのモジュールを有する。１つ目のモジュールは、ヒストグラム切断、血管及びアーチファクトの除去、３００×３００μｍ^２のＦＯＶへの各画像の分割、各ＦＯＶの同形フィルタリングにより、画像のインポートと前処理を行う。２つ目のモジュールは、以下のように２８４５ｃｍ^−１のチャネルから軸索を分割する。まず、各ＦＯＶを、そのＦＯＶの平均強度から得られた閾値により、２値画像に変換する。画像開放によりこの画像のノイズ除去を行って、残りのオブジェクトを拡張させ、候補オブジェクトの「大まかなマスク」を作成する。同時に、大津の方法により定められた閾値により、ＦＯＶもシャープにして、２値に変換する。画像開放を行って、その結果をソーベルエッジカーネルとコンボリューションし、大津の閾値化により２値に変換し、再び開放する。そして、すべての残りのオブジェクトを偏心度（境界楕円の長軸及び短軸の長さ比として定義される）と面積によってソートする。０．８５未満の偏心度と、６００画素未満の大きさのものを除外する。このマスクと大まかな強度マスクの両方に含まれる画素は、軸索としてカウントされる。結果として得られたオブジェクトに属する周辺画素数を合計して軸索長とする。

３つ目のモジュールでは、２９３０ｃｍ^−１のチャネルから２８４５ｃｍ^−１のチャネルを取り去り、ＦＯＶ平均未満の強度を有するすべての画素と１．５標準偏差をゼロに設定することにより核分割を開始する。そして、５×５四方のマスクにより画像開放を実行し、その画像を大津の閾値化により２値に変換する。ユーザが選択した「最小核」の大きさの半分未満のすべてのオブジェクトを除外する。そして、流域アルゴリズムにより、複数の極大値を含む隣接オブジェクトを分離する。その後、接続性を維持しつつ、オブジェクトを肥厚化させ、オブジェクト内の穴を充填する。

組織サンプルの分析方法
本技術によれば、組織サンプルの分析方法も提供される。この方法には、本明細書に記載の生検装置により患者から組織サンプル、すなわち、生検を取り出す工程と、その組織サンプルの光学イメージングを行う工程とが含まれる。組織サンプルのイメージングは、光学切片を行うモダリティ及び／又は固有分光法コントラストに基づくモダリティによって行うことができる。そのようなモダリティとしては、誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）、コヒーレント反ストークスラマン散乱（ＣＡＲＳ）、共焦点ラマン、共焦点反射、共焦点蛍光、光コヒーレンストモグラフィー（ＯＣＴ）、２光子励起蛍光（ＴＰＥＦ）、第２高調波発生（ＳＨＧ）、第３高調波発生（ＴＨＧ）を含むがこれらに限定されるものではない。

いくつかの実施例では、上記方法には、同じ生検サンプルの二次分析を行う工程がさらに含まれる。この二次分析としては、ＤＮＡ塩基配列決定法、ＲＮＡ塩基配列決定法、転写優先、マイクロアレイ分析、抗体、蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、クロマチン免疫沈降（ＣｈＩＰ）、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）又は質量分析などの分子生物学技術を含むがこれに限定されるものではない。従って、組織サンプルの組織学的分析と分子解析の両方が行われても良い。この組織サンプルは、従来の生検装置により取得し、イメージングを行うために凍結切片、スカッシュ又はタッチ調製により調製して、二次分析のために取り出されてもよい。また、生検装置からの組織サンプルの取り出しは、第１開口部から陽圧を印加する、又は、生検装置の一部を取り除くことにより行うことができる。例えば、組織サンプルは、イメージング完了後、固定容器に自動的に分けることができる。

前述した実施形態の記載は、例示及び説明を目的として提供したものである。この記載は排他的なものでも本発明を限定するものでもない。特定の実施形態の個々の要素又は特徴は、全体を通してその特定の実施形態に限定されるものではなく、特に図示したり説明したりしていなくとも必要に応じて相互に入れ替え可能であり、選択した実施形態で使用可能なものである。また、特定の実施形態の個々の要素又は特徴は、様々に変化させてもよい。このような変形例を本発明から逸脱したものとみなしてはならず、このような修正はすべて本発明の範囲内に含まれるものとする。

Claims (51)

1. 第１端部から第２端部まで延在し、サンプル収集部を有する中空体と、
   陰圧源を収容するよう構成された、前記中空体の第１端部にある第１開口部と、
   生体サンプルを収容するよう構成された、前記中空体の第２端部にある第２開口部と、
   前記サンプル収集部に対応する領域に配置された前記中空体の光透過性領域であって、前記サンプル収集部に配置された場合に前記生体サンプルのイメージングを実行可能なイメージング装置からの電磁波を透過するよう構成された光透過性領域と、
   を具備することを特徴とする生検装置。
2. 前記生体サンプルは、脳組織であることを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
3. 前記陰圧源は、固定真空システムに関連するパイプであることを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
4. 前記陰圧源は、ポンプに関連するパイプであることを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
5. 前記陰圧源は、固定真空システム又はポンプに関連する外科吸引装置であることを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
6. 前記外科吸引装置は、前記陰圧のレベルを制御する圧力制御調整器を備えていることを特徴とする請求項５に記載の生検装置。
7. 前記中空体内の陰圧レベルを制御する圧力制御調整器
   をさらに具備することを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
8. 前記圧力制御調整器は、前記生検装置の外面と内部間の流体連結を可能にする、前記中空体に配置された開口部であり、
   前記中空体の陰圧レベルは、前記開口部を前記生検装置のユーザの指で部分的に又は完全に覆うことで制御可能である、
   ことを特徴とする請求項７に記載の生検装置。
9. 前記サンプル収集部内の前記中空体により、いずれもほぼ平面である上面と底面を有する収集チャネルが形成されることを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
10. 前記収集チャネルは、約５００μｍ以下の高さを有することを特徴とする請求項９に記載の生検装置。
11. 前記収集チャネルは、約２０μｍ以下の高さを有することを特徴とする請求項９に記載の生検装置。
12. 前記収集チャネルは、約１００μｍ以下の高さを有することを特徴とする請求項９に記載の生検装置。
13. 前記サンプル収集部の高さは、
    ａ．前記第２端部に十分な陰圧量を生じさせて前記生体サンプルをキャプチャし、
    ｂ．前記生体サンプルに関する構造情報を提供する前記生体サンプルの画像をキャプチャすることができる、
    ように設定されていることを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
14. 前記中空体は、完全に光透過性を有することを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
15. 前記光透過性領域は、約０．５μｍから約１．１μｍの波長域に対して光透過性を有することを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
16. 前記光透過性領域は、約２８００ｃｍ^−１から約３１００ｃｍ^−１のスペクトル領域においてラマン活性であることを特徴とする請求項１５に記載の生検装置。
17. 前記光透過性領域は、約２８００ｃｍ^−１から約３１００ｃｍ^−１のスペクトル領域においてラマン活性でないことを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
18. 前記中空体の少なくとも前記光透過性領域がプラスチックを含むことを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
19. 前記光透過性領域は、電磁波に対して少なくとも部分的に透過性を有することを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
20. 前記中空体の第２端部は、前記生体サンプルを収容するために、組織へとまとめる、切り込む又は突き刺すよう構成されていないことを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
21. 前記サンプル収集部は、サンプル導入部を有することを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
22. 前記サンプル導入部は、第２開口部を有し、前記第２開口部は、前記サンプル導入部内で第２幅まで徐々に小さくなる第１幅を有することを特徴とする請求項２１に記載の生検装置。
23. 前記第２開口部は、前記サンプル導入部内で小さい第２高さまで徐々に小さくなる第１高さを前記第２開口部に有することを特徴とする請求項２２に記載の生検装置。
24. 前記生検装置は、前記生検装置の中空体の前記光透過性領域と位置合わせされた少なくとも一つの光透過性検出窓を有する外部キャリアバイアルの中空内部コンパートメントに挿入されることを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
25. 前記外部キャリアバイアルは、浸漬液を収容していることを特徴とする請求項２４に記載の生検装置。
26. ラベルをさらに具備することを特徴とする請求項１に記載の生検装置。
27. 前記ラベルは、バーコード又はＱＲコードであることを特徴とする請求項２６に記載の生検装置。
28. 前記ラベルは、数字又は文字であることを特徴とする請求項２６に記載の生検装置。
29. 請求項１に記載の生検装置を具備する光学イメージングシステムであって、
    前記生検装置の前記サンプル収集部に配置された場合に、前記生体サンプルのイメージングを行うイメージング装置、
    をさらに具備することを特徴とする光学イメージングシステム。
30. イメージングが行われる軸に沿った前記生体装置の前記サンプル収集部の寸法より大きな距離分解能を有することを特徴とする請求項２９に記載の光学イメージングシステム。
31. 前記イメージング装置は、誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）装置、コヒーレント反ストークスラマン散乱（ＣＡＲＳ）装置、共焦点ラマン装置、共焦点反射装置、共焦点蛍光装置、光コヒーレンストモグラフィー（ＯＣＴ）装置、２光子励起蛍光（ＴＰＥＦ）装置、第２高調波発生（ＳＨＧ）装置、第３高調波発生（ＴＨＧ）装置から成る群から選択されることを特徴とする請求項２９に記載の光学イメージングシステム。
32. 前記光学イメージングシステムの前記イメージング装置は、前記生体サンプルからの透過時に光信号を収集することを特徴とする請求項２９に記載の光学イメージングシステム。
33. 前記光学イメージングシステムの前記イメージング装置は、前記生体サンプルからの反射時に光信号を収集する
    ことを特徴とする請求項２９に記載の光学イメージングシステム。
34. 前記サンプル収集部に対応する領域における前記中空体には、励起及び収集光路が含まれることを特徴とする請求項２９に記載の光学イメージングシステム。
35. 前記イメージング装置は、前記生検装置における前記生体サンプルから収集された光信号を反射により生成することを特徴とする請求項２９に記載の光学イメージングシステム。
36. 前記生検装置の外面を洗浄する洗浄機能をさらに具備することを特徴とする請求項２９に記載の光学イメージングシステム。
37. 被検者から組織を採取する方法であって、
    請求項１に記載の生検装置の前記サンプル収集部に収集された生体サンプルを該生検装置により前記被検者から採取する工程と、
    前記生検装置の前記サンプル収集部に前記生体サンプルを保持しながら前記生体サンプルのイメージングを行って、前記生体サンプルの光学画像を取得する工程と、
    前記光学画像を画面に表示する工程と、
    を具備することを特徴とする方法。
38. 前記生体サンプルのイメージングは、光学切片を行うモダリティによって行われることを特徴とする請求項３７に記載の方法。
39. イメージングは、内因性分光コントラストに基づくモダリティによって行われることを特徴とする請求項３７に記載の方法。
40. 前記生体サンプルのイメージングには、誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）、コヒーレント反ストークスラマン散乱（ＣＡＲＳ）、共焦点ラマン、共焦点反射、共焦点蛍光、光コヒーレンストモグラフィー（ＯＣＴ）、２光子励起蛍光（ＴＰＥＦ）、第２高調波発生（ＳＨＧ）、又は、第３高調波発生（ＴＨＧ）により前記生体サンプルの画像を生成する工程が含まれることを特徴とする請求項３７に記載の方法。
41. 前記生検装置の座標及び／又は方向を追跡及び記録し、前記生体サンプルが収集されると、その位置及び／又は方向に対応する記録された座標及び／又は方向を提供する工程と、
    術前又は術中巨視的イメージングデータを前記記録された座標及び／又は方向に表示する工程と、
    をさらに具備することを特徴とする請求項３７に記載の方法。
42. 請求項１に記載の生検装置を少なくとも一つ具備し、
    前記少なくとも一つの生検装置が滅菌状態で包装されていることを特徴とするキット。
43. 前記キットは、まとめて又は個別に包装された複数の生検チップを含むことを特徴とする請求項４２に記載のキット。
44. 前記キットは、前記少なくとも一つの生検装置の一つを収容するよう構成された少なくとも一つの外部キャリアバイアルをさらに含むことを特徴とする請求項４２に記載のキット。
45. 前記キットは、浸漬液の容器をさらに含むことを特徴とする請求項４４に記載のキット。
46. 前記少なくとも一つの生検装置は、固有のラベルを有することを特徴とする請求項４２に記載のキット。
47. 被検者から得られた組織を分析する方法であって、
    生検装置により被検者から組織サンプルを採取する工程と、
    前記組織サンプルの光学的イメージングを行う工程と、
    前記組織サンプルに対して二次分析を行う工程と、
    を具備することを特徴とする方法。
48. 前記組織サンプルの光学的イメージングは、誘導ラマン散乱（ＳＲＳ）、コヒーレント反ストークスラマン散乱（ＣＡＲＳ）、共焦点ラマン、共焦点反射、共焦点蛍光、光コヒーレンストモグラフィー（ＯＣＴ）、２光子励起蛍光（ＴＰＥＦ）、第２高調波発生（ＳＨＧ）、第３高調波発生（ＴＨＧ）の少なくともいずれか一つにより行われ、
    前記二次分析は、ＤＮＡ塩基配列決定法、ＲＮＡ塩基配列決定法、転写優先、マイクロアレイ分析、抗体、蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）、クロマチン免疫沈降（ＣｈＩＰ）、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、質量分析から成る群から選択される少なくとも一つの分子生物学技術により行われる、
    ことを特徴とする請求項４７に記載の方法。
49. 前記生検装置は、
    第１端部から第２端部まで延在し、サンプル収集部を有する中空体と、
    陰圧源を収容するよう構成された、前記中空体の第１端部にある第１開口部と、
    生体サンプルを収容するよう構成された、前記中空体の第２端部にある第２開口部と、
    前記サンプル収集部に対応する領域に配置された前記中空体の光透過性領域であって、前記サンプル収集部に配置された場合に前記生体サンプルのイメージングを実行可能なイメージング装置からの電磁波を透過するよう構成された光透過性領域と、
    を備えていることを特徴とする請求項４７に記載の方法。
50. 前記組織サンプルは、前記生検装置の開口部から陽圧を印加することにより前記装置から除去されることを特徴とする請求項４７に記載の方法。
51. 前記組織サンプルは、前記生検装置の一部を取り外すことにより前記生検装置から除去されることを特徴とする請求項５０に記載の方法。