JP2018533360A - ヒトｃｄ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体及び使用方法 - Google Patents

ヒトｃｄ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体及び使用方法 Download PDF

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Abstract

本発明は、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体、その抗体又は抗原結合フラグメントをコードしているポリヌクレオチド、並びに前述のものを製造及び使用する方法に関する。

Description

本発明は、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体、その抗体又は抗原結合フラグメントをコードしているポリヌクレオチド、並びに前述のものを製造及び使用する方法に関する。
細胞表面ＣＤ４０分子は、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリー（ＴＮＦＲ）のメンバーであり、自然免疫応答及び適応免疫応答の両方における主要な制御因子である。ＣＤ４０は、ヒト抗原提示細胞、特にＢ細胞、樹状細胞及びマクロファージで、並びに線維芽細胞、平滑筋細胞、内皮細胞及び上皮細胞で発現される。ＣＤ４０はまた、全てのＢリンパ腫、固形腫瘍の３０〜７０％、黒色腫及び癌腫を含む広範な腫瘍細胞でも発現される。
ＣＤ４０の天然リガンドは、ＣＤ１５４又はＣＤ４０Ｌと呼ばれ、活性化Ｔリンパ球及び血小板で主に発現される。Ｔ細胞においてＣＤ４０がＣＤ４０Ｌと相互作用すると、液性免疫応答及び細胞性免疫応答の両方が誘導される。ＣＤ４０は、このリガンド−受容体ペアを制御して、Ｂ細胞及び樹状細胞（ＤＣ）を含む他の抗原提示細胞（ＡＰＣ）を活性化し、Ｔ細胞活性化を促進する。例えば、Ｂ細胞上でのＣＤ４０の活性化は、Ｂ細胞増殖、体細胞高頻度変異、抗体分泌細胞への分化及び二次リンパ器官の胚中心におけるアイソタイプスイッチを誘導する。インビトロ研究により、サイトカイン産生（例えばＩＬ−６、ＩＬ−１０、ＩＬ−１２、ＴＮＦ−α）、接着分子及び共刺激受容体（例えばＩＣＡＭ、ＣＤ２３、ＣＤ８０及びＣＤ８６）の発現、並びにＢリンパ球によるＭＨＣクラスＩ、ＭＨＣクラスＩＩ、及びＴＡＰトランスポーターの発現増加に対する、ＣＤ４０活性化の直接的な作用が示されている。
ＣＤ４０抗体は、腫瘍特異的細胞毒性Ｔリンパ球及びナチュラルキラー細胞（ＮＫ細胞）の活性増加をもたらす抗原提示細胞の活性化、又はＣＤ４０陽性腫瘍の直接的な抗体介在性の腫瘍細胞アポトーシス若しくは細胞傷害を含む、様々な機序によってその抗腫瘍作用を誘発し得る。しかしながら、抗ＣＤ４０抗体の全身投与は、サイトカイン放出症候群などの有害な副作用とも関連している。
よって、がん治療及び免疫応答の増強のために、抗ＣＤ４０抗体の改善が必要である。
本発明は、配列番号７５のヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体を提供する。
本発明はまた、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体であって、抗体が、そのアゴニスト活性のために架橋を必要とする、抗体も提供する。
本発明はまた、本明細書に記載されているある特定のＶＨ、ＶＬ、ＨＣＤＲ、ＬＣＤＲ、重鎖又は軽鎖配列を含む、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体も提供する。
本発明はまた、本発明の抗体と、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物も提供する。
本発明はまた、本発明の抗体ＶＨ、抗体ＶＬ、抗体ＶＨ及び抗体ＶＬ、抗体重鎖、抗体軽鎖、又は抗体重鎖及び抗体軽鎖をコードするポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターも提供する。
本発明はまた、本発明のベクターを含む宿主細胞も提供する。
本発明はまた、本発明の抗体の製造方法であって、抗体が発現する条件で本発明の宿主細胞を培養するステップと、宿主細胞によって産生された抗体を回収するステップと、を含む方法も提供する。
本発明はまた、対象においてがんを処置する方法であって、治療有効量の本発明の単離された抗体又は本発明の医薬組成物を、がんを処置するのに十分な時間にわたって、それを必要とする対象に投与するステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、対象において免疫応答を増強する方法であって、治療有効量の本発明の単離された抗体又は本発明の医薬組成物を、免疫応答を増強するのに十分な時間にわたって、それを必要とする対象に投与するステップを含む、方法も提供する。
本発明はまた、本発明の抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明は、本発明の抗体を含むキットも提供する。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体が、架橋依存的にＢ細胞を活性化することを示す図である。Ｂ細胞活性化は、架橋剤の非存在下でのＣＤ２３表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、他も同様である。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体が、架橋依存的にＢ細胞を活性化することを示す図である。Ｂ細胞活性化は、架橋剤の存在下でのＣＤ２３表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、他も同様である。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体が、架橋依存的にＢ細胞を活性化することを示す図である。Ｂ細胞活性化は、架橋剤の非存在下でのＨＬＡ−ＤＲ表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、他も同様である。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体が、架橋依存的にＢ細胞を活性化することを示す図である。Ｂ細胞活性化は、架橋剤の存在下でのＨＬＡ−ＤＲ表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、他も同様である。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体が、架橋依存的に樹状細胞（ＤＣ）を活性化することを示す図である。ＤＣ細胞活性化は、架橋剤の非存在下でのＣＤ８３表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、他も同様である。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体が、架橋依存的に樹状細胞（ＤＣ）を活性化することを示す図である。ＤＣ細胞活性化は、架橋剤の存在下でのＣＤ８３表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、他も同様である。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体が、架橋依存的に樹状細胞（ＤＣ）を活性化することを示す図である。ＤＣ活性化は、架橋剤の非存在下でのＨＬＡ−ＤＲ表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、他も同様である。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体が、架橋依存的に樹状細胞（ＤＣ）を活性化することを示す図である。ＤＣ活性化は、架橋剤の存在下でのＨＬＡ−ＤＲ表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、他も同様である。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 Ｃ４０Ｍ９のＶＨ（Ｃ４０Ｈ４３；配列番号６０）及びヒト生殖系列ＩＧＨＶ４−３９*０１（配列番号７３；図中でＩＧＨＶ４−３９として示す）の残基１〜９８のアミノ酸アライメントである。ＨＣＤＲ１及びＨＣＤＲ２アミノ酸に下線を引いている。Ｃ４０Ｍ９及びＩＧＨＶ４−３９*０１フレームワークは３つのアミノ酸が異なっていた。 Ｃ４０Ｍ１８のＶＬ（Ｃ４０Ｌ６４；配列番号６６）及びヒト生殖系列ＩＧＬＶ３−１（配列番号８６）の残基１〜９４のアミノ酸アライメントである。ＬＣＤＲ１及びＬＣＤＲ２アミノ酸配列に下線を引いている。Ｃ４０Ｍ１８フレームワークは、ＩＧＬＶ３−１とは２つのアミノ酸が異なっている。 ＣＤ４０と複合体を形成したＣ４０Ｍ１２６の結晶構造を示す図である。 Ｃ４０Ｂ１２６エピトープ及びパラトープ残基のカートゥーン表示（cartoon）を示す図である。ＣＤ４０残基番号付けは、配列番号７５に従う。Ｃ４０Ｍ１２６ ＶＨ及びＶＬ残基番号付けは、それぞれ配列番号６２及び６９に従う。 Ｃ４０Ｍ１２６が、対照抗体ＣＰ−８７０，８９３と比較したときに、樹状細胞をより強力に活性化すること、及びＣ４０Ｍ９が有する架橋非依存的受容体活性化作用がわずかであることを示す図である。ＤＣ活性化は、架橋剤の非存在下でのＨＬＡ−ＤＲ表面発現の増加として測定した。Ｍ９は抗体Ｃ４０Ｍ９を指し、Ｍ１２６は抗体Ｃ４０Ｍ１２６を指す。対照：ＣＰ−８７０，８９３。 １０ｍｇ／ｍｌの対照抗体ＣＰ−８７０，８９３を投与した動物において血小板数が一時的に減少したが、一方、Ｃ４０Ｍ９又はＣ４０Ｍ１２６の投与では血小板数が減少しなかったことを示す図である。１つの群につき２個体の個別の動物による結果を示している。 Ｃ４０Ｍ９又はＣ４０Ｍ１２６を投与した動物と比較したときの、１０ｍｇ／ｍｌの対照抗体ＣＰ−８７０，８９３で処置した動物におけるＩＬ−６産生（ｐｇ／ｍｌ）の増加を示す図である。１つの群につき２個体の個別の動物による結果を示している。
本明細書に引用されている特許及び特許出願を含む（ただしそれらに限定されない）全ての刊行物は、参照によりそれらの全体が記載されているのと同様に、本明細書に援用される。
本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を記載する目的でのみ使用され、限定を意図するものではないと理解すべきである。特に断らない限り、本明細書において使用される全ての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野における当業者によって一般的に理解されているものと同じ意味を有する。
本明細書で使用される場合、文脈上そうでない旨が明らかに示されない限り、単数形「ａ」、「ａｎｄ」及び「ｔｈｅ」には、複数の指示対象が含まれる。
本明細書に記載されているものと同様又は同等の任意の方法及び材料を、本発明の試験を実施するために使用できるが、例示となる材料及び方法を本明細書に記載する。
「特異的結合」又は「特異的に結合する」又は「結合する」とは、関連のない抗原に対するものよりも高い親和性でヒトＣＤ４０に対して抗体が結合することを指す。典型的には、抗体は、１×１０-8Ｍ以下、例えば１×１０-9Ｍ以下、１×１０-10Ｍ以下、１×１０-11Ｍ以下、又は１×１０-12Ｍ以下の解離定数（ＫD）で、典型的には、関連のない抗原（例えば、ＢＳＡ、カゼイン）に対する結合でのＫDの少なくとも１００分の１のＫDで、ヒトＣＤ４０に結合する。解離定数は標準的手法を用いて測定することができる。しかしながら、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体は、他の関連抗原に対して、例えばヒト又はサル、例えばＭａｃａｃａ ｆａｓｃｉｃｕｌａｒｉｓ（カニクイザル（cynomolgus, cyno））、Ｐａｎ ｔｒｏｇｌｏｄｙｔｅｓ（チンパンジー（chimpanzee, chimp））又はＣａｌｌｉｔｈｒｉｘ ｊａｃｃｈｕｓ（コモンマーモセット、マーモセット）などの他の種由来の同じ抗原（ホモログ）に対して交差反応性を有し得る。単一特異性抗体は、１つの抗原又は１つのエピトープに特異的に結合するのに対し、二重特異性抗体は、２つの異なる抗体又は２つの異なるエピトープに特異的に結合する。
「抗体」は、広義の意味を有し、マウス、ヒト、ヒト化及びキメラモノクローナル抗体を含むモノクローナル抗体、抗原結合フラグメント、二重特異性又は多重特異性抗体、二量体、四量体又は多量体抗体、一本鎖抗体、ドメイン抗体及び必要とされる特異性の抗原結合部位を含む任意の他の免疫グロブリン分子の改変された形態を含む免疫グロブリン分子を含む。「完全長抗体」は、ジスルフィド結合によって相互に接続された２つの重（Ｈ）鎖及び２つの軽（Ｌ）鎖、並びにその多量体（例えばＩｇＭ）で構成される。各重鎖は、重鎖可変領域（ＶＨ）及び重鎖定常領域（ＣＨ１、ヒンジＣＨ２及びＣＨ３ドメインで構成される）で構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域（ＶＬ）及び軽鎖定常領域（ＣＬ）で構成される。ＶＨ領域及びＶＬ領域は、フレームワーク領域（ＦＲ）に散在している相補性決定領域（ＣＤＲ）と称される超可変領域に更に区分され得る。各ＶＨ及びＶＬは、アミノ末端からカルボキシ末端に向かってＦＲ１、ＣＤＲ１、ＦＲ２、ＣＤＲ２、ＦＲ３、ＣＤＲ３、及びＦＲ４という順序で配置された、３つのＣＤＲ及び４つのＦＲセグメントによって構成される。
「相補性決定領域（ＣＤＲ）」は、抗体の「抗原結合部位」である。ＣＤＲは、様々な用語を用いて定義され得る：（ｉ）相補性決定領域（ＣＤＲ）は、ＶＨ内に３つ（ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３）及びＶＬ内に３つ（ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２、ＬＣＤＲ３）存在し、配列可変性に基づく（Ｗｕ ａｎｄ Ｋａｂａｔ，Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ１３２：２１１〜５０，１９７０；Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ，５ｔｈ Ｅｄ．Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅｓ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍｄ．，１９９１）。（ｉｉ）「超可変領域」、「ＨＶＲ」、又は「ＨＶ」は、ＶＨ内に３つ（Ｈ１、Ｈ２、Ｈ３）及びＶＬ内に３つ（Ｌ１、Ｌ２、Ｌ３）存在し、Ｃｈｏｔｈｉａ及びＬｅｓｋによって定義されているとおり、構造が超可変性である抗体可変ドメインの領域を指す（Ｃｈｏｔｈｉａ ａｎｄ Ｌｅｓｋ，Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ １９６：９０１〜１７，１９８７）。Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ（ＩＭＧＴ）データベース（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ＿ｉｍｇｔ＿ｏｒｇ）は、抗原結合部位の標準化された番号付け及び定義を提供している。ＣＤＲ、ＨＶ、及びＩＭＧＴの表記間の対応関係については、Ｌｅｆｒａｎｃ ｅｔ ａｌ．，Ｄｅｖ Ｃｏｍｐａｒａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２７：５５〜７７，２００３に記載されている。本明細書で使用されている「ＣＤＲ」、「ＨＣＤＲ１」、「ＨＣＤＲ２」、「ＨＣＤＲ３」、「ＬＣＤＲ１」、「ＬＣＤＲ２」、及び「ＬＣＤＲ３」という用語は、本明細書において別途記載のない限り、上掲のＫａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ、又はＩＭＧＴにより記載されている方法のいずれかにより定義されるＣＤＲを含む。
免疫グロブリンは、重鎖定常ドメインアミノ酸配列に応じて、５つの主要なクラス、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ、及びＩｇＭに割り当てることができる。ＩｇＡ及びＩｇＧは、ＩｇＡ1、ＩｇＡ2、ＩｇＧ1、ＩｇＧ2、ＩｇＧ3、及びＩｇＧ4アイソタイプに更に下位分類される。任意の脊椎動物種の抗体軽鎖は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、２つの明確に異なるタイプ、即ちカッパ（κ）及びラムダ（λ）のうちの一方に割り当てることができる。
「抗原結合フラグメント」は、親完全長抗体の抗原結合性を保持している免疫グロブリン分子の一部を指す。例示的な抗原結合フラグメントは、重鎖相補性決定領域（ＨＣＤＲ）１、２及び／又は３、軽鎖相補性決定領域（ＬＣＤＲ）１、２及び／又は３、重鎖可変領域（ＶＨ）、又は軽鎖可変領域（ＶＬ）、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｄ及びＦｖフラグメント並びに１つのＶＨドメイン又は１つのＶＬドメインのいずれかからなるドメイン抗体（ｄＡｂ）である。ＶＨ及びＶＬドメインは、合成リンカーを介して一緒に連結して、様々なタイプの単鎖抗体ドメイン設計を行うことができ、この設計では、ＶＨ／ＶＬドメインが分子内で、又はＶＨ及びＶＬドメインが別個の鎖によって発現される場合には分子間で、ペアを形成して、一価の抗原結合部位、例えば単鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）又はダイアボディ（例えば、国際特許出願公開第１９９８／４４００１号、国際特許出願公開第１９８８／０１６４９号、国際特許出願公開第１９９４／１３８０４号、国際特許出願公開第１９９２／０１０４７号に記載されている）を形成する。
「モノクローナル抗体」は、抗体重鎖からのＣ末端リシンの除去などの起こり得るよく知られた変更を除いて、各重鎖及び各軽鎖において単一のアミノ酸組成を有する抗体集団を指す。モノクローナル抗体は、多重特異性モノクローナル抗体が２つ以上の異なる抗原又はエピトープに結合することを除いて、典型的には１つの抗原エピトープに結合する。二重特異性モノクローナル抗体は、２つの異なる抗原エピトープに結合する。モノクローナル抗体は、抗体集団中に不均一なグリコシル化を有し得る。モノクローナル抗体は、単一特異性若しくは多重特異性、又は一価、二価、若しくは多価であり得る。二重特異性抗体又は三重特異性抗体などの多重特異性抗体は、モノクローナル抗体という用語に含まれる。
「単離された抗体」は、異なる抗原特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体又はその抗原結合フラグメントを指す（例えば、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離された抗体は、ヒトＣＤ４０以外の抗原に特異的に結合する抗体を実質的に含まない）。二重特異性抗体の場合、二重特異性抗体は、対象とする２つの抗原に特異的に結合し、対象とする２つの抗原以外の抗原に特異的に結合する抗体を実質的に含まない。「単離された抗体」は、純度８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％の抗体など、高純度まで単離された抗体を包含する。
「ヒト化抗体」は、少なくとも１つのＣＤＲがヒト以外の種に由来し、可変領域フレームワークがヒト免疫グロブリン配列に由来する抗体を指す。ヒト化抗体は、フレームワーク領域中に意図的に導入された変異を含む可能性があり、そのため、フレームワークは、発現されたヒト免疫グロブリン又は生殖系列遺伝子配列の正確な複製物でないことがある。
「ヒト抗体」は、フレームワーク及び全ての６つのＣＤＲが両方ともヒト起源の配列に由来する重鎖及び軽鎖可変領域を有する抗体を指す。抗体が定常領域又は定常領域の一部を含む場合、定常領域もヒト起源の配列に由来する。
ヒト抗体の可変領域が、ヒト生殖系列免疫グロブリン又は再編成された免疫グロブリン遺伝子を使用する系から得られていれば、その抗体は、ヒト起源の配列に由来する重鎖又は軽鎖可変領域を含む。そのような系の代表的なものとしては、ファージ上に提示されたヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリー、及び本明細書に記載されているヒト免疫グロブリン遺伝子座を保有するマウス又はラットなどのヒト以外の遺伝子導入動物がある。ヒト抗体は、例えば自然発生する体細胞変異、フレームワーク又は抗原結合部位中への置換の意図的な導入、並びにヒト以外の動物でのクローニング及びＶＤＪ組み換え中に導入されるアミノ酸変異のために、典型的には、ヒト生殖系列又は再編成された免疫グロブリン配列と比較したときにアミノ酸の違いを含む。典型的には、ヒト抗体のアミノ酸配列は、ヒト生殖系列又は再編成された免疫グロブリン遺伝子によってコードされるアミノ酸配列と少なくとも約８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、又は１００％同一である。場合によっては、ヒト抗体は、例えばＫｎａｐｐｉｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２９６：５７〜８６，２０００に記載されている、ヒトフレームワーク配列分析から得られたコンセンサスフレームワーク配列、又は例えばＳｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ３９７：３８５〜９６，２０１０及び国際特許出願公開第２００９／０８５４６２号に記載されている、ファージ上に提示されたヒト免疫グロブリン遺伝子ライブラリーに組み込まれた合成ＨＣＤＲ３を含み得る。
「組み換え体」は、組み換え法によって調製、発現、作製又は単離された抗体及びその他のタンパク質を含む。
「エピトープ」は、抗体が特異的に結合する抗原の部分を指す。エピトープは典型的には、化学的に活性な（極性、非極性又は疎水性など）部分、例えばアミノ酸又は多糖側鎖などの表面集団からなり、特定の三次元構造特性並びに特定の電荷特性を有し得る。エピトープは、立体構造の立体単位を形成する連続的な及び／又は不連続なアミノ酸によって構成され得る。不連続なエピトープでは、抗原の直鎖配列の異なる部分のアミノ酸が、タンパク質分子の折り畳みにより三次元空間でごく近接するようになる。
「多重特異性」は、少なくとも２つの異なる抗原又は抗原中の２つの異なるエピトープ、例えば３つ、４つ又は５つの異なる抗原又はエピトープに特異的に結合する抗体を指す。
「二重特異性」は、２つの異なる抗原、又は同じ抗原中の２つの異なるエピトープと特異的に結合する抗体を指す。二重特異性抗体は、他の関連する抗原に対して交差反応性を有し得るか、又は２つ以上の異なる抗原間で共有されるエピトープに結合することができる。
「変異体（variant）」は、１つ以上の改変、例えば置換、挿入、又は欠失によって参照ポリペプチド又は参照ポリヌクレオチドと異なるポリペプチド又はポリヌクレオチドを指す。
「ベクター」は、生物系内で複製可能な、又はそのような系間を移動することができる、ポリヌクレオチドを指す。ベクターポリヌクレオチドは、典型的には、生物系内でこれらのポリヌクレオチドの複製又は維持を促進するように機能する、複製起点、ポリアデニル化シグナル又は選択マーカーなどの要素を含む。そのような生物系の例としては、細胞、ウイルス、動物、植物、及びベクターの複製が可能な生物学的構成要素を利用して再構成された生物系を挙げることができる。ベクターを構成するポリヌクレオチドは、ＤＮＡ若しくはＲＮＡ分子又はこれらのハイブリッドであってもよい。
「発現ベクター」は、発現ベクター中に存在するポリヌクレオチド配列によってコードされるポリペプチドの翻訳を指令するために、生物系又は再構成された生物系において利用できるベクターを指す。
「ポリヌクレオチド」は、糖−リン酸骨格又は他の同等の共有結合化学によって共有結合したヌクレオチド鎖を含む合成分子を指す。ｃＤＮＡは、ポリヌクレオチドの典型例である。
「ポリペプチド」又は「タンパク質」は、ペプチド結合によって連結された少なくとも２つのアミノ酸残基を含んでポリペプチドを形成している分子を指す。５０アミノ酸未満の低分子ポリペプチドは、「ペプチド」と称することもある。
「ＣＤ４０」又は「ｈｕＣＤ４０」は、ヒトＣＤ４０タンパク質を指す。ＣＤ４０はまた、腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー５（ＴＮＦＲＳＦ５）、ＣＤ４ＯＬ受容体、又はＣＤ１５４受容体としても知られている。完全長ヒトＣＤ４０のアミノ酸配列を、配列番号７５に示す。ヒト完全長ＣＤ４０タンパク質は、２７７アミノ酸を有するＩ型膜タンパク質である。配列番号７５の残基１〜２０はシグナル配列であり、残基２１〜１９３は細胞外ドメインであり、残基１９４〜２１５は膜貫通ドメインであり、残基２１６〜２７７は細胞質ドメインである。明細書の全体にわたって、ＣＤ４０の細胞外ドメイン「ＣＤ４０−ＥＣＤ」は、配列番号７５の残基２１〜１９３のＣＤ４０フラグメントを指す。
「アゴニスト」又は「アゴニストの」は、ＣＤ４０に結合するとＢ細胞及び／又は樹状細胞（ＤＣ）活性化を誘導する、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体を指す。Ｂ細胞及びＤＣ活性化は、Ｂ細胞増殖の増加を測定することによって、又はＢ細胞上の表面マーカーＣＤ２３、ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６及びＨＬＡ−ＤＲ、並びにＤＣ上のＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６及びＨＬＡ−ＤＲのうちのいずれかの上方制御を測定することによって、測定することができる。アゴニストは、抗体を含まない対照サンプルと比較したときに、統計学的に有意にＢ細胞及び／又はＤＣ活性化を誘導し得る。
「架橋」は、ＦｃγＲＩＩｂにシス又はトランス結合するヒトＣＤ４０に特異的に結合する抗体によって誘導され、ＣＤ４０アゴニスト活性を誘導する、細胞上でのＣＤ４０の高次元の多量体化を指す。架橋は、本明細書に記載の架橋剤として抗ヒトＦ（ａｂ’）２を使用することによってインビトロで評価することができる。
「アゴニスト活性のために架橋を必要とする」は、実施例１に記載されている方法を使用してフローサイトメトリーを用いて表面発現を測定する場合に、２０μｇ／ｍｌの架橋剤抗ヒトＦ（ａｂ’）２の存在下で、抗体がＢ細胞上でＣＤ２３発現を、及び樹状細胞上でＣＤ８３表面発現を用量依存的に誘導すること、及び架橋剤の非存在下では、抗体はＢ細胞上のＣＤ２３表面発現及び樹状細胞上のＣＤ８３表面発現に対して影響を及ぼさないこと、を意味する。影響を及ぼさないとは、ＣＤ２３及びＣＤ８３の表面発現の指標となる、フローサイトメトリーにおいて得られるシグナルが、１×１０-12Ｍ〜１×１０-6Ｍの範囲の抗体濃度で、抗体力価測定曲線の全体にわたって±１ＳＤ内であることを意味する。
「約」は、当業者によって決定される特定の値について許容される誤差範囲内であることを意味し、これは、その値が測定又は決定される方法、すなわち測定システムの制限事項にある程度依存する。特定のアッセイ、結果又は実施形態に関連して、実施例又は本明細書のその他の箇所に別途明示的に記載のない限り、「約」は、当該技術分野の実施に従う１つの標準偏差又は５％までの範囲のいずれか大きい方の範囲内であることを意味する。
「〜と組み合わせて」は、２つ以上の治療薬を、混合物の状態で一緒に、単剤として同時に又は単剤として任意の順序で順次、対象に投与することを意味する。
本明細書では、表１に示すように通常の１文字及び３文字のアミノ酸コードを使用する。
Figure 2018533360
ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体
本発明は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）及びＢ細胞を強力に活性化する、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体を提供する。抗体が示し得るアゴニスト活性は、架橋の非存在下では極めてわずかであるか又はないため、抗体は、がん適応のための臨床開発において他の抗ＣＤ４０抗体と比較したときに、有効性を維持しながら改善された安全性プロファイルを有し得る。
野生型ＩｇＧ２として開発されたＣＤ４０アゴニストＣＰ−８７０，８９３は、膵がん又は黒色腫を有する対象において臨床試験で以前に試験されている。ＣＰ−８７０，８９３は、架橋を必要とせずにＡＰＣを活性化することができ、樹状細胞よりも約２０倍強力にＢ細胞を活性化する。Ｂ細胞の優先的活性化とともに、二価の可溶性ｍＡｂとしてのこのスーパーアゴニスト活性は、Ｂ細胞が分泌するＩＬ−６に誘導されるサイトカイン放出症候群（ＣＲＳ）を引き起し得る。被験者臨床試験では、この抗体の最も多い副作用は、抗体を静脈内注入した日の寒気、発熱、悪寒及び他の症状によって特徴付けられる、中等度のＣＲＳであった。よって、Ｂ細胞に対するＣＰ−８７０，８９３の作用は、ＡＰＣを活性化するには不十分な処置用量で、用量制限毒性をもたらし得る。
そのアゴニスト活性のために架橋を必要とし、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する、本発明のアゴニスト抗体は、ＣＲＳに誘導される潜在的毒性を減少させ得る。特定の理論に拘束されるものではないが、かなり大きい高次元の多量体化がＦｃγＲ架橋によって生じるため、かつその後のＡＰＣ活性化をもたらすためには、抗体が組織に到達する必要があるため、末梢における循環ＡＰＣは、本発明のＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体によって活性化される可能性がより低いことが予想される。ＡＰＣ（例えば樹状細胞）の活性化は、Ｂ細胞活性化よりも重要な臨床的関連性を有し得る。がんのＣＤ４０アゴニスト療法は、Ｔ細胞活性化と強く関連しており（Ｆｒｅｎｃｈ ｅｔ ａｌ．，１９９９，Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，５４８〜５５３；ｖａｎ Ｋｏｏｔｅｎ ｅｔ ａｌ．，２０００，Ｊ Ｌｅｕｃｏｃ Ｂｉｏｌ，６７：２〜１７；Ｓｏｔｏｍａｙｏｒ ｅｔ ａｌ．，１９９９，Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，５：７８０〜７８７）、このＴ細胞活性化は、プロフェッショナル抗原提示細胞、特に樹状細胞の活性化に依存している（Ｍｅｌｉｅｆ ｅｔ ａｌ．，２０００，７５：２３５〜２８２）。
本発明は、配列番号７５のヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体を提供する。
本発明はまた、配列番号７５のヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体であって、抗体がそのアゴニスト活性のために架橋を必要とする、抗体も提供する。
ＣＤ４０は、腫瘍壊死因子受容体（ＴＮＦＲ）スーパーファミリーに属し、免疫系において中心的な役割を果たす、細胞表面に発現する糖タンパク質である。ＣＤ４０は、様々な免疫細胞、例えばＢ細胞、樹状細胞、単球、及びマクロファージなどにおいて発現され、こうした細胞は、ＣＤ４０を介したシグナル伝達が起こるときに活性化される（Ｔａｓｃｉ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｃｅｌｌ．Ｍｏｌ．Ｌｉｆｅ．Ｓｃｉ．，（５８），４〜４３によって概説されている）。
ＣＤ４０シグナル伝達によって介在される樹状細胞及びＢ細胞活性化は、免疫細胞活性化、増殖、並びにサイトカイン及びケモカインの産生を含むいくつかの生物学的事象を誘発する。ＣＤ４０と関連する樹状細胞及びＢ細胞活性化を決定するための方法は、当該技術分野において既知であり（Ｓｃｈｏｎｂｅｃｋ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｃｅｌｌ Ｍｏｌ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉ．，５８：４０〜４３；ｖａｎ Ｋｏｏｔｅｎ ｅｔ ａｌ．，２０００，Ｊ．Ｌｅｕｋ．，Ｂｉｏｌ．，６７：２〜１７）、本明細書において記載されている。例示的な方法は、細胞数測定などの標準的な方法を使用して、表面マーカーＣＤ２３、ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６及びＨＬＡ−ＤＲ、又はこれらの組み合わせの上方制御を評価することである。
アゴニスト活性のための架橋に対する依存性は、既知の方法を使用してインビトロで評価することができる。例えば、Ｂ細胞又はＤＣ活性化は、抗免疫グロブリン抗体などの架橋剤の非存在下及び存在下で、評価することができる。インビトロで、典型的には、架橋はＦｃ抗体とＦｃγＲとの相互作用を介して起こる。
そのアゴニスト活性のために架橋を必要とするヒトＣＤ４０に特異的に結合する例示的なアゴニスト抗体は、本明細書に記載されている抗体Ｃ４０Ｍ６７、Ｃ４０Ｍ６６、Ｃ４０Ｍ６３、Ｃ４０Ｍ６２、Ｃ４０Ｍ５９、Ｃ４０Ｍ５８、Ｃ４０Ｍ５６、Ｃ４０Ｍ５５、Ｃ４０Ｍ５１、Ｃ４０Ｍ１８、Ｃ４０Ｍ１７、Ｃ４０Ｍ１２、Ｃ４０Ｍ１０２、Ｃ４０Ｍ１０３、Ｃ４０Ｍ１０４、Ｃ４０Ｍ１０５及びＣ４０Ｍ１２１である。
架橋非依存的にＣＤ４０の受容体を活性化する、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する例示的なアゴニスト抗体は、抗体Ｃ４０Ｍ１２６である。Ｃ４０Ｍ１２６は、抗体を架橋非依存的アゴニストに変える、Ｆｃ領域中のＳ２６７Ｅ変異を有する。Ｃ４０Ｍ１２６及び架橋依存的アゴニストｍＡｂ Ｃ４０Ｍ１２１は、Ｓ２６７Ｅ変異を除いて同一の重鎖及び軽鎖アミノ酸配列を有する。
本発明はまた、ヒト樹状細胞においてフローサイトメトリーを使用して測定されるＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６及びＨＬＡ−ＤＲ発現を誘導する、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体も提供する。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体は、ヒトＢ細胞においてフローサイトメトリーを使用して測定されるＣＤ２３、ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６及びＨＬＡ−ＤＲ発現を誘導する。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体は、ヒト樹状細胞においてフローサイトメトリーを使用して測定されるＣＤ８３発現を誘導する。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体は、ヒトＢ細胞においてフローサイトメトリーを使用して測定されるＣＤ２３発現を誘導する。
本発明はまた、配列番号７５のヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体又はその抗原結合フラグメントであって、配列番号５の重鎖可変領域（ＨＣＤＲ）１、配列番号１０のＨＣＤＲ２、配列番号１８のＨＣＤＲ３、配列番号３２の軽鎖可変領域（ＬＣＤＲ）１、配列番号３４のＬＣＤＲ２、及び配列番号４７のＬＣＤＲ３を含む、抗体又はその抗原結合フラグメントも提供する。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号７５の残基４６〜６４及び７５〜７６の範囲内でヒトＣＤ４０に結合する。「範囲内」は、抗体が結合するエピトープ残基の８０％以上が、アミノ酸区間４６〜６４又は７５〜７６の範囲内に存在すること、及び抗体が結合するエピトープ残基の２０％以下が、前述したアミノ酸区間４６〜６４又は７５〜７６の外側に存在することを意味する。
抗体が結合するＣＤ４０エピトープは、例えば水素／重水素交換（Ｈ／Ｄ交換）を使用して、又はＣＤ４０と複合体を形成した抗体の結晶構造を分析することによって、解析することができる。エピトープ残基は、Ｈ／Ｄ交換で少なくとも５％の重水素化レベルの差で抗体によって保護される残基、又は抗体とＣＤ４０の複合体の結晶構造において抗体に結合すると決定された表面に露出したアミノ酸残基である。抗体とＣＤ４０の複合体の結晶構造では、エピトープ残基は、抗体ＣＤＲ残基のいずれかから４Å以下の距離の範囲内に存在する、ＣＤ４０残基である。
Ｈ／Ｄ交換アッセイでは、ＣＤ４０タンパク質を、重水中で抗体の存在下又は非存在下で所定の時間にわたってインキュベートし、抗体に保護されていない交換可能な水素原子において重水素の取り込みを生じさせ、その後タンパク質をプロテアーゼ消化し、ＬＣ−ＭＳを使用してペプチドフラグメントを分析する。例示的なアッセイでは、５μＬの試験抗体（１０μｇ）又は５μＬのＣＤ４０と試験抗体の複合体（それぞれ１０及び７．３５μｇ）を、１２０μＬの酸化重水素標識化緩衝液（５０ｍＭリン酸、１００ｍＭ塩化ナトリウム、ｐＨ７．４）とともに０秒間、６０秒間、３００秒間、１８００秒間、７２００秒間、及び１４４００秒間インキュベートする。６３μＬの５Ｍ塩酸グアニジンを添加することによって重水素交換をクエンチし、最終的なｐＨを２．５とする。クエンチしたサンプルを、オンカラムペプシン／プロテアーゼタイプＸＩＩＩ消化及びＬＣ−ＭＳ分析に供する。ペプシン／プロテアーゼタイプＸＩＩＩ消化のために、１２５μＬ対照緩衝液（５０ｍＭリン酸、１００ｍＭ塩化ナトリウム、ｐＨ７．４）中の５μｇのサンプルを、６３μＬの５Ｍ塩酸グアニジン（最終的なｐＨは２．５である）を添加し、混合物を３分間インキュベートすることによって変性させる。その後、混合物をオンカラムペプシン／プロテアーゼタイプＸＩＩＩ消化に供し、結果として生じるペプチドを、Ｑ Ｅｘａｃｔｉｖｅ（商標）Ｈｙｂｒｉｄ Ｑｕａｄｒｕｐｏｌｅ−Ｏｒｂｉｔｒａｐ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｅｒ（Ｔｈｅｒｍｏ）に連結したＷａｔｅｒｓ Ａｃｑｕｉｔｙ ＵＰＬＣで構成されるＵＰＬＣ−ＭＳシステムを使用して分析する。ＭＳ生データを、Ｈ／Ｄ交換ＭＳデータの分析用のソフトウェアであるＨＤＸ ＷｏｒｋＢｅｎｃｈを使用して処理する。重水素化ペプチドとその天然型（ｔ0）との間の平均質量差を使用して、重水素レベルを算出する。ペプチド同定は、Ｍａｓｃｏｔを用いてＣＤ４０配列に対してＭＳ／ＭＳデータを検索することによって行う。前駆体及び生成イオンの質量許容誤差は、それぞれ２０ｐｐｍ及び０．０５Ｄａである。
Ｘ線結晶構造解析では、ＣＤ４０及び試験抗体を発現させ、標準的なプロトコールを使用して精製する。ＣＤ４０／試験抗体複合体を、４℃で終夜インキュベートし、濃縮し、サイズ排除クロマトグラフィーを使用して複合体形成していない化学種から分離する。様々な既知の試験溶液、例えばＰＥＧ３３５０、クエン酸アンモニウム及び２−（Ｎ−モルホリノ）エタンスルホン酸（ＭＥＳ）を含有する溶液から、蒸気拡散法によって複合体を結晶化する。
配列番号７５のヒトＣＤ４０残基４６〜６４及び７５〜７６の範囲内で結合する抗体は、ファージディスプレイライブラリーを使用してＣＤ４０に結合する抗体を単離し、ＣＤ４０に対する結合について参照抗体Ｃ４０Ｍ１２６（配列番号６２のＶＨ及び配列番号６９のＶＬ）と１００％競合する抗体を選択し、作製した抗体のエピトープを、抗体／ＣＤ４０複合体の結晶構造を解析して確認することによって、作製することができる。あるいは、配列番号７５の残基４６〜６４及び７５〜７６を包含するペプチドを使用してマウス、ラット又はウサギを免疫してもよく、前述した領域の範囲内での結合に関して、作製した抗体を評価してもよい。
いくつかの実施形態では、抗体は、以下の特性のうちの少なくとも１つを有する：
０．０１％のポリソルベート２０（ＰＳ−２０）及び１００μｇ／ｍｌのウシ血清アルブミンを含有するダルベッコリン酸緩衝生理食塩水中で２５℃でＰｒｏｔｅＯｎ ＸＰＲ３６システムを使用して解離定数（ＫD）が測定される場合に、約５×１０-9Ｍ以下のＫDで配列番号７５のヒトＣＤ４０に結合すること、又は
Ｂ細胞及び樹状細胞（ＤＣ）に対するそのアゴニスト活性のために架橋を必要とし、ＣＤ２３及びＣＤ８３表面発現がフローサイトメトリーを使用して測定される場合に、２０μｇ／ｍｌの架橋剤抗ヒトＦ（ａｂ’）２の存在下で、Ｂ細胞に対するアゴニスト活性がＢ細胞ＣＤ２３表面発現によって測定され、ＤＣに対するアゴニスト活性がＤＣ ＣＤ８３表面発現によって測定されること。
ヒトＣＤ４０に対する抗体の親和性は、任意の好適な方法を使用して実験により決定することができる。例示的な方法は、ＰｒｏｔｅＯｎ ＸＰＲ３６、Ｂｉａｃｏｒｅ ３０００若しくはＫｉｎＥｘＡ装置、ＥＬＩＳＡ、又は当業者に既知の競合的結合アッセイを利用する。ＣＤ４０に対する特定の抗体の親和性測定値は、異なる条件（例えば、モル浸透圧濃度、ｐＨ）下で測定した場合に異なり得る。よって、親和性及び他の結合パラメータ（例えば、ＫD、Ｋon、及びＫｏｆｆ）の測定は、典型的には、標準化された条件及び標準化された緩衝液、例えば本明細書に記載の緩衝液などを用いて行う。例えばＢｉａｃｏｒｅ ３０００又はＰｒｏｔｅＯｎを使用した親和性測定での内部誤差（標準偏差（ＳＤ）として測定される）は、典型的には、典型的な検出限界範囲内の測定に関して、５〜３３％の範囲内であり得ることが当業者には分かるであろう。したがって、「約」という用語はＫD値を指す場合、アッセイにおける典型的な標準偏差を反映する。例えば、ＫDが１×１０-9Ｍの場合の典型的なＳＤは、±０．３３×１０-9Ｍ以下である。
Ｂ細胞活性化アッセイでは、製造者のプロトコールに従ってＢ細胞ネガティブアイソレーションキットを使用して（ＭＡＣＳ Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）、ヒトＢ細胞を新鮮な又は凍結したＰＢＭＣから単離し得る。
ＤＣ活性化アッセイでは、完全培地ＲＰＭＩ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中で１００ｎｇ／ｍｌのヒトＧＭ−ＣＳＦ及びヒトＩＬ−４（Ｐｅｐｒｏｔｅｃｈ）の存在下で２日ごとに培地を補充して５日間培養した、凍結／新鮮のいずれかのＰＢＭＣから、製造者のプロトコールに従ってＣＤ１４ネガティブアイソレーションキットを使用して（ＭＡＣＳ Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）、ヒト単球を単離し得る。試験ＣＤ４０抗体の力価測定は、９６ウェルＵ底プレートに播種して、Ｂ細胞又はＤＣのいずれかを添加し、混合物を室温で１５分間インキュベートし得る。培地又は一定濃度２０μｇ／ｍｌの架橋剤抗ヒトＦ（ａｂ’）２のいずれかを添加し、複合体を、ＤＣ活性化アッセイでは２４時間、Ｂ細胞活性化アッセイでは４８時間、３７℃でインキュベートし得る。終了時点で細胞を回収し、フローバッファー（flow buffer）で２回洗浄し、ヒトＦｃブロック（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）と一緒に室温で１５分間インキュベートし、その後１回洗浄し得る。次に、細胞を、活性化マーカーＣＤ２３又はＣＤ８３に関して３０分間氷上で染色し、その後２回洗浄し得る。ＢＤ Ｆｏｒｔｅｓｓａを使用して細胞を分析する。あるいは、活性化マーカーＣＤ８０、ＣＤ８６、ＨＬＡ−ＤＲの表面発現も評価してもよい。
いくつかの実施形態では、抗体重鎖フレームワークはヒトＩＧＨＶ４−３９*０１（配列番号７３）に由来し、抗体軽鎖フレームワークはヒトＩＧＬＶ２−８*０１（配列番号８７）に由来する。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６２又は６１の重鎖可変領域（ＶＨ）及び配列番号６９の軽鎖可変領域（ＶＬ）を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６２のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨは、配列番号１０３のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされており、ＶＬは、配列番号１１０のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６１のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨは、配列番号１０２のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされており、ＶＬは、配列番号１１０のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、ＩｇＧ１アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、抗体は、ＩｇＧ２アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、抗体は、ＩｇＧ３アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、抗体は、ＩｇＧ４アイソタイプである。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６２のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＩｇＧ１／λアイソタイプであり、場合により、野生型ＩｇＧ１と比較した場合のＳ２６７Ｅ変異を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６２のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＩｇＧ１／λアイソタイプであり、場合により、野生型ＩｇＧ１と比較した場合のＳ２６７Ｅ／Ｉ３３２Ｅ変異を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６２のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＩｇＧ１／λアイソタイプであり、場合により、野生型ＩｇＧ１と比較した場合のＳ２６７Ｅ／Ｌ３２８Ｆ変異を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６２のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＩｇＧ１／λアイソタイプであり、場合により、野生型ＩｇＧ１と比較した場合のＥ２３３Ｄ／Ｇ２３７Ｄ／Ｈ２６８Ｄ／Ｐ２７１Ｇ／Ａ３３０Ｒ／Ｐ２３８Ｄ変異を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６１のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＩｇＧ１／λアイソタイプであり、場合により、野生型ＩｇＧ１と比較した場合のＳ２６７Ｅ変異を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６１のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＩｇＧ１／λアイソタイプであり、場合により、野生型ＩｇＧ１と比較した場合のＳ２６７Ｅ／Ｉ３３２Ｅ変異を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６１のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＩｇＧ１／λアイソタイプであり、場合により、野生型ＩｇＧ１と比較した場合のＳ２６７Ｅ／Ｌ３２８Ｆ変異を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号６１のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＩｇＧ１／λアイソタイプであり、場合により、野生型ＩｇＧ１と比較した場合のＥ２３３Ｄ／Ｇ２３７Ｄ／Ｈ２６８Ｄ／Ｐ２７１Ｇ／Ａ３３０Ｒ／Ｐ２３８Ｄ変異を含む。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号１２９の重鎖（ＨＣ）及び配列番号１３６の軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＨＣは、配列番号１５５のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされており、ＬＣは、配列番号１６２のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号１２８の重鎖（ＨＣ）及び配列番号１３６の軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＨＣは、配列番号１５４のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされており、ＬＣは、配列番号１６２のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、配列番号１２７の重鎖（ＨＣ）及び配列番号１３６の軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＨＣは、配列番号１５３のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされており、ＬＣは、配列番号１６２のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、多重特異性抗体である。
いくつかの実施形態では、抗体は、二重特異性抗体である。
抗体は、治療、例えばがんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば固形腫瘍の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば黒色腫の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば肺がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば扁平上皮非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば非扁平上皮ＮＳＣＬＣの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば肺腺癌の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば腎細胞癌（ＲＣＣ）（例えば、腎明細胞癌又は腎乳頭状細胞癌）、又はその転移巣の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば中皮腫の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば上咽頭癌（ＮＰＣ）の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば結腸直腸がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば前立腺がん又は去勢抵抗性前立腺がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば胃がん（stomach cancer）の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば卵巣がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば胃がん（gastric cancer）の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば肝がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば膵がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば甲状腺がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば頭頚部扁平上皮癌の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば食道又は胃腸管の癌の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば乳がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば卵管がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば脳腫瘍（brain cancer）の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば尿道がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば子宮内膜症の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば子宮頚部がんの処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば前述のがんの転移巣の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば多発性骨髄腫の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えばリンパ腫の処置に使用するのに好適である。
抗体は、治療、例えば白血病の処置に使用するのに好適である。
本発明はまた、配列番号７５のヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体又はその抗原結合フラグメントであって、抗体が、以下の特性：
０．０１％のポリソルベート２０（ＰＳ−２０）及び１００μｇ／ｍｌのウシ血清アルブミンを含有するダルベッコリン酸緩衝生理食塩水中で２５℃でＰｒｏｔｅＯｎ ＸＰＲ３６システムを使用して解離定数（ＫD）が測定される場合に、約５×１０-9Ｍ以下のＫDで配列番号７５のヒトＣＤ４０に結合すること、又は
Ｂ細胞及び樹状細胞（ＤＣ）に対するそのアゴニスト活性のために架橋を必要とし、ＣＤ２３及びＣＤ８３表面発現がフローサイトメトリーを使用して測定される場合に、２０μｇ／ｍｌの架橋剤抗ヒトＦ（ａｂ’）２の存在下で、Ｂ細胞に対するアゴニスト活性がＢ細胞ＣＤ２３表面発現によって測定され、ＤＣに対するアゴニスト活性がＤＣ ＣＤ８３表面発現によって測定されること、
のうちの少なくとも１つを有する、抗体又はその抗原結合フラグメントも提供する。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号１、８、２２、２８、３８及び４２のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号４８及び６３のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１４及び１３０の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号８９及び１０４のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４０及び１５６のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号２、７、２５、２６、３９及び４４のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号４９及び６４のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１５及び１３１の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９０及び１０５のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４１及び１５７のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号２、７、２４、２６、３９及び４４のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５０及び６４のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１６及び１３１の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９１及び１０５のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４２及び１５７のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号２、７、２３、２６、３９及び４４のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５１及び６４のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１７及び１３１の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９２及び１０５のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４３及び１５７のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号３、１３、１７、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５２及び６５のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１８及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９３及び１０６のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４４及び１５８のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、６、１９、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５３及び６５のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１９及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９４及び１０６のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４５及び１５８のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、６、２０、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５４及び６５のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２０及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９５及び１０６のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４６及び１５８のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号２、７、１４、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５５及び６５のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２１及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９６及び１０６のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４７及び１５８のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、６、２１、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５６及び６５のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２２及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９７及び１０６のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４８及び１５８のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、９、１５、３０、３６及び４１のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５７及び６６のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２３及び１３３の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９８及び１０７のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４９及び１５９のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、１１、１６、２９、３７及び４０のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５８及び６７のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２４及び１３４の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９９及び１０８のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１５０及び１６０のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、１２、１５、３０、３５及び４６のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５９及び６８のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２５及び１３５の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号１００及び１０９のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１５１及び１６１のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、９、１５、３０、３６及び４１のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５７及び７０のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２３及び１３７の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９８及び１１１のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４９及び１６３のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、９、１５、３１、３６及び４１のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５７及び７１のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２３及び１３８の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９８及び１１２のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４９及び１６４のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、抗体は、それぞれ配列番号４、９、１５、３１、３６及び４１のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５７及び７２のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２３及び１３９の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）を含む。
いくつかの実施形態では、ＶＨ及びＶＬは、それぞれ配列番号９８及び１１３のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、ＨＣ及びＬＣは、それぞれ配列番号１４９及び１６５のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドにコードされている。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６１又は６２の重鎖可変領域（ＶＨ）の重鎖相補性決定領域（ＨＣＤＲ）１（ＨＣＤＲ１）、２（ＨＣＤＲ２）及び３（ＨＣＤＲ３）アミノ酸配列を含み、これらのＨＣＤＲはＫａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ又はＩＭＧＴによって定義される。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号６３、６４、６５、６６、６７、６８、７０、７１又は７２の軽鎖可変領域（ＶＬ）の軽鎖相補性決定領域（ＬＣＤＲ）１（ＬＣＤＲ１）、２（ＬＣＤＲ２）及び３（ＬＣＤＲ３）アミノ酸配列を含み、これらのＬＣＤＲは、Ｋａｂａｔ、Ｃｈｏｔｈｉａ又はＩＭＧＴによって定義される。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６１又は６２のＶＨを含む。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号６３、６４、６５、６６、６７、６８、７０、７１又は７２のＶＬを含む。
本発明の例示的な抗ＣＤ４０抗体のＨＣＤＲ及びＬＣＤＲ配列を、表２に示す。本発明の例示的な抗ＣＤ４０抗体のＶＨ、ＶＬ、ＨＣ及びＬＣタンパク質及びアミノ酸配列を、表３に示す。
Figure 2018533360
Figure 2018533360
本発明のＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体の変異体は、本発明の範囲内である。例えば、変異体は、抗体特性に不利な影響を及ぼさないＶＨ及び／又はＶＬ中の１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、又は１５個のアミノ酸置換を含み得る。いくつかの実施形態では、配列同一性は、本発明のＶＨ又はＶＬアミノ酸配列に対して、約９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％又は９９％であり得る。
２つの配列間の同一性パーセントは、２つの配列の最適なアライメントを行うために導入する必要があるギャップの数及び各ギャップの長さを考慮した、配列により共有される同一の位置の数の関数である（すなわち、同一性％＝同一の位置の数／位置の総数×１００）。
２つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、ＡＬＩＧＮプログラム（ｖｅｒｓｉｏｎ２．０）に組み込まれているＥ．Ｍｅｙｅｒｓ ａｎｄ Ｗ．Ｍｉｌｌｅｒ（Ｃｏｍｐｕｔ．Ａｐｐｌ．Ｂｉｏｓｃｉ．，４，１１〜１７（１９８８））のアルゴリズムを使用して、ＰＡＭ１２０重み付き残基表を使用してギャップ長ペナルティ１２及びギャップペナルティ４で、決定することができる。更に、２つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、ＧＣＧソフトウェアパッケージ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｇｃｇ＿ｃｏｍで入手可能）のＧＡＰプログラムに組み込まれているＮｅｅｄｌｅｍａｎ及びＷｕｎｓｃｈ（Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．４８：４４４〜４５３（１９７０））のアルゴリズムを使用して、Ｂｌｏｓｓｕｍ ６２行列又はＰＡＭ２５０行列のいずれかを用いて、ギャップ重み（gap weight）１６、１４、１２、１０、８、６、又は４、長さ重み（length weight）１、２、３、４、５、又は６で、決定することができる。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６１又は６２のＶＨと少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％同一であるＶＨを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号６３、６４、６５、６６、６７、６８、７０、７１又は７２のＶＬと少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％同一であるＶＬを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、配列番号４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６１又は６２のＶＨと少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％同一であるＶＨ、及び配列番号６３、６４、６５、６６、６７、６８、７０、７１又は７２のＶＬと少なくとも９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％又は１００％同一であるＶＬを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、配列番号４８のＶＨ及び配列番号６３のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、配列番号４９のＶＨ及び配列番号６４のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５０のＶＨ及び配列番号６４のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５１のＶＨ及び配列番号６４のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５２のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５３のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５４のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５５のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５６のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５７のＶＨ及び配列番号６６のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５８のＶＨ及び配列番号６７のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５９のＶＨ及び配列番号６８のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５７のＶＨ及び配列番号７０のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５７のＶＨ及び配列番号７１のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号５７のＶＨ及び配列番号７２のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号６１のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、配列番号６２のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含み、ＶＨ、ＶＬ又はＶＨ及びＶＬの両方は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４又は１５個のアミノ酸置換を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、ＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２及びＨＣＤＲ３配列を含む重鎖可変領域、並びにＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３配列を含む軽鎖可変領域を含み、ＣＤＲ配列の１つ以上は、本明細書に記載の抗体（例えば、表２に示す）に基づく特定のアミノ酸配列又はその保存的改変を含み、抗体は、本発明のＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体の所望の機能的特性を保持する。
ある特定のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３配列並びにその保存的改変を含むヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、以下の特性：
０．０１％のポリソルベート２０（ＰＳ−２０）及び１００μｇ／ｍｌのウシ血清アルブミンを含有するダルベッコリン酸緩衝生理食塩水中で２５℃でＰｒｏｔｅＯｎ ＸＰＲ３６システムを使用して解離定数（ＫD）が測定される場合に、約５×１０-9Ｍ以下のＫDで配列番号７５のヒトＣＤ４０に結合すること、又は
Ｂ細胞及び樹状細胞（ＤＣ）に対するそのアゴニスト活性のために架橋を必要し、ＣＤ２３及びＣＤ８３表面発現がフローサイトメトリーを使用して測定される場合に、２０μｇ／ｍｌの架橋剤抗ヒトＦ（ａｂ’）２の存在下で、Ｂ細胞に対するアゴニスト活性がＢ細胞ＣＤ２３表面発現によって測定され、ＤＣに対するアゴニスト活性がＤＣ ＣＤ８３表面発現によって測定されること、のうちの少なくとも１つを有する。
「保存的改変」は、そのアミノ酸配列を含む抗体の結合特性に有意な影響を及ぼさない、又はそれを変えない、アミノ酸改変を指す。保存的改変は、アミノ酸置換、付加、及び欠失を含む。保存的置換は、アミノ酸が、類似の側鎖を有するアミノ酸残基に置き換えられる置換である。類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、明確に定義されており、酸性側鎖（例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸）、塩基性側鎖（例えば、リシン、アルギニン、ヒスチジン）、非極性側鎖（例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン）、非荷電極性側鎖（例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、システイン、セリン、トレオニン、チロシン、トリプトファン）、芳香族側鎖（例えば、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン、チロシン）、脂肪族側鎖（例えば、グリシン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、セリン、トレオニン）、アミド（例えば、アスパラギン、グルタミン）、β分岐側鎖（例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン）、及び含硫黄側鎖（システイン、メチオニン）を有する、アミノ酸を含む。更に、アラニン・スキャニング変異誘発について以前に述べられているように（ＭａｃＬｅｎｎａｎ ｅｔ ａｌ．，Ａｃｔａ Ｐｈｙｓｉｏｌ．Ｓｃａｎｄ．Ｓｕｐｐｌ．６４３：５５〜６７，１９９８；Ｓａｓａｋｉ ｅｔ ａｌ．，Ａｄｖ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．３５：１〜２４，１９９８）、ポリペプチド内の任意の天然残基をアラニンで置換することもできる。本発明の抗体に対するアミノ酸置換は、例えばＰＣＲによる変異誘発によるもの（米国特許第４，６８３，１９５号）などの、よく知られている方法によって行われ得る。あるいは、変異体のライブラリーを、既知の方法を用いて、例えば、ランダムコドン（ＮＮＫ）又は非ランダムコドン、例えば１１個のアミノ酸（Ａｌａ、Ｃｙｓ、Ａｓｐ、Ｇｌｕ、Ｇｌｙ、Ｌｙｓ、Ａｓｎ、Ａｒｇ、Ｓｅｒ、Ｔｙｒ、Ｔｒｐ）をコードするＤＶＫコドンを用いて、作製することができる。結果として生じる抗体変異体は、それらの特性に関して、本明細書に記載のアッセイを用いて試験することができる。
実施例で説明する実施形態は、一方が重鎖に由来し、一方が軽鎖に由来する、可変領域のペアを有しているが、当業者であれば代替的な実施形態は、単独の重鎖又は軽鎖可変領域を有してもよいということを認識するであろう。単独の可変領域を使用して、例えばＣＤ４０に特異的に結合可能な２ドメイン特異的抗原結合フラグメントを形成できる可変ドメインをスクリーニングすることができる。スクリーニングは、例えば、国際公開第１９９２／０１０４７号に開示されている階層的二重コンビナトリアルアプローチ（hierarchical dual combinatorial approach）を用いたファージディスプレイスクリーニング法によって実現することができる。このアプローチでは、Ｈ鎖又はＬ鎖いずれか一方のクローンを含有する単一コロニーを使用して、他方の鎖（Ｌ又はＨ）をコードするクローンの完全ライブラリーを感染させ、得られる２鎖特異的抗原結合ドメインを、本明細書に記載されているファージディスプレイ技術に従って選択し、ＣＤ４０に対するその結合及びアゴニスト活性について試験する。
本発明の抗体は、様々な技術を用いて作製可能である。例えば、Ｋｏｈｌｅｒ ａｎｄ Ｍｉｌｓｔｅｉｎ，Ｎａｔｕｒｅ ２５６：４９５，１９７５のハイブリドーマ法を使用してモノクローナル抗体を作製することができる。ハイブリドーマ法では、マウス又は他の宿主動物、例えばハムスター、ラット、若しくはサルなどを、ＣＤ４０のヒト又はカニクイザルＣＤ４０フラグメント、例えばＣＤ４０の細胞外ドメインで免疫し、その後、標準的な方法を使用して、免疫した動物の脾臓細胞と骨髄腫細胞とを融合させてハイブリドーマ細胞を形成させる（Ｇｏｄｉｎｇ，Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ｐｒｉｎｃｉｐｌｅｓ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ，ｐｐ．５９〜１０３（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，１９８６））。１個の不死化したハイブリドーマ細胞から生じたコロニーを、結合特異性、交差反応性又はその欠如、及び抗原に対する親和性などの所望の特性を有する抗体の産生についてスクリーニングする。
様々な宿主動物を使用して、本発明のＣＤ４０抗体を製造することができる。例えば、Ｂａｌｂ／ｃマウスを使用して、マウス抗ヒトＣＤ４０抗体を製造することができる。Ｂａｌｂ／ｃマウス及び他のヒト以外の動物において作製された抗体を、様々な技術を用いてヒト化して、よりヒトに近い配列を作製することができる。ヒト受容体フレームワークの選択を含む例示的なヒト化技術は既知であり、ＣＤＲ移植（米国特許第５，２２５，５３９号）、ＳＤＲ移植（米国特許第６，８１８，７４９号）、リサーフェシング（resurfacing）（Ｐａｄｌａｎ，Ｍｏｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ ２８：４８９〜４９９，１９９１）、特異性決定残基リサーフェシング（米国特許公開第２０１００２６１６２０号）、ヒト適応（又はヒトフレームワーク適応）（米国特許公開第２００９／０１１８１２７号）、超ヒト化（superhumanization）（米国特許第７，７０９，２２６号）、及びガイデッドセレクション（guided selection）（（Ｏｓｂｏｕｒｎ ｅｔ ａｌ（２００５）Ｍｅｔｈｏｄｓ ３６：６１〜６８，２００５；米国特許第５，５６５，３３２号）を含む。これらの方法では、親抗体のＣＤＲが、フレームワークＣＤＲの長さ、相同性若しくはカノニカル構造の情報、又はこれらの組み合わせに基づいた、親フレームワークに対する総合的な相同性をもとに選択され得るヒトフレームワーク上に移される。
ヒト化抗体は、国際公開第９０／００７８６１号及び国際公開第９２／２２６５３号に記載されている開示物などの技術により、結合親和性を保存するよう改変したフレームワーク支持残基を組み込むことによって（復帰変異）、又は任意のＣＤＲに変異を導入して例えば抗体の親和性を向上させることによって、所望の抗原に対するそれらの選択性又は親和性を向上させるように更に最適化させることもできる。
ゲノムにヒト免疫グロブリン（Ｉｇ）遺伝子座を保有するトランスジェニックマウスを使用して、標的タンパク質に対するヒト抗体を作製することができ、例えば、国際公開第９０／０４０３６号、米国第６，１５０，５８４号、国際公開第９９／４５９６２号、国際公開第０２／０６６６３０号、国際公開第０２／４３４７８号、Ｌｏｎｂｅｒｇ ｅｔ ａｌ（１９９４）Ｎａｔｕｒｅ ３６８：８５６〜９；Ｇｒｅｅｎ ｅｔ ａｌ（１９９４）Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔ．７：１３〜２１；Ｇｒｅｅｎ ＆ Ｊａｋｏｂｏｖｉｔｓ（１９９８）Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８８：４８３〜９５；Ｌｏｎｂｅｒｇ ａｎｄ Ｈｕｓｚａｒ（１９９５）Ｉｎｔ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１３：６５〜９３；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ ｅｔ ａｌ（１９９１）Ｅｕｒ．Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２１：１３２３〜１３２６；Ｆｉｓｈｗｉｌｄ ｅｔ ａｌ（１９９６）Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．１４：８４５〜８５１；Ｍｅｎｄｅｚ ｅｔ ａｌ（１９９７）Ｎａｔ．Ｇｅｎｅｔ．１５：１４６〜１５６；Ｇｒｅｅｎ（１９９９）Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２３１：１１〜２３；Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ（１９９９）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５９：１２３６〜１２４３；Ｂｒｕｇｇｅｍａｎｎ ａｎｄ Ｔａｕｓｓｉｇ（１９９７）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．８：４５５〜４５８；国際公開第０２／０４３４７８号）に記載されている。そのようなマウスの内因性免疫グロブリン遺伝子座を、破壊又は欠失させ、導入染色体（transchromosome）を使用した、又はミニ遺伝子を使用した、相同又は非相同組み換えを用いて、少なくとも１つの完全な又は部分的なヒト免疫グロブリン遺伝子座をマウスゲノム内に挿入することができる。Ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｒｅｇｅｎｅｒｏｎ＿ｃｏｍ）、Ｈａｒｂｏｕｒ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｈａｒｂｏｕｒａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ＿ｃｏｍ）、Ｏｐｅｎ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．（ＯＭＴ）（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｏｍｔｉｎｃ＿ｎｅｔ）、ＫｙＭａｂ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ｋｙｍａｂ＿ｃｏｍ）、Ｔｒｉａｎｎｉ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ．ｔｒｉａｎｎｉ＿ｃｏｍ）、及びＡｂｌｅｘｉｓ（ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ＿ａｂｌｅｘｉｓ＿ｃｏｍ）などの企業は、上記の技術を用いて、選択抗原を標的としたヒト抗体を提供するべく取り組んでいる。
ヒト抗体は、ファージディスプレイライブラリーから選択することができ、かかるファージは、ヒト免疫グロブリンあるいはその一部、例えばＦａｂ、単鎖抗体（ｓｃＦｖ）、又はペアを形成していない若しくはペアを形成した抗体可変領域などを発現するよう改変されている（Ｋｎａｐｐｉｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２９６：５７〜８６，２０００；Ｋｒｅｂｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈ ２５４：６７〜８４，２００１；Ｖａｕｇｈａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ １４：３０９〜３１４，１９９６；Ｓｈｅｅｔｓ ｅｔ ａｌ．，ＰＩＴＡＳ（ＵＳＡ）９５：６１５７〜６１６２，１９９８；Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍ ａｎｄ Ｗｉｎｔｅｒ，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２２７：３８１，１９９１；Ｍａｒｋｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ２２２：５８１，１９９１）。本発明の抗体は、例えば、Ｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ３９７：３８５〜９６，２０１０及び国際公開第０９／０８５４６２号）に記載されているバクテリオファージｐＩＸ被覆タンパク質との融合タンパク質として抗体の重鎖及び軽鎖可変領域を発現するファージディスプレイライブラリーから、単離され得る。ライブラリーを、ヒト及び／又はカニクイザルＣＤ４０の結合についてスクリーニングし、得られた陽性クローンの特性評価を更に行い、Ｆａｂをクローン溶解物から単離し、完全長ＩｇＧとして発現させることができる。ヒト抗体を単離するためのこのようなファージディスプレイ法は、例えば、米国特許第５，２２３，４０９号、同第５，４０３，４８４号、及びＬａｄｎｅｒ ｅｔ ａｌ．の同第５，５７１，６９８号、Ｄｏｗｅｒｅｔ ａｌ．の米国特許第５，４２７，９０８号、及び同第５，５８０，７１７号、ＭｃＣａｆｆｅｒｔｙｅｔ ａｌ．の米国特許第５，９６９，１０８号及び同第６，１７２，１９７号、並びにＧｒｉｆｆｉｔｈｓｅｔ ａｌ．の米国特許第５，８８５，７９３号、同第６，５２１，４０４号、同第６，５４４，７３１号、同第６，５５５，３１３号、同第６，５８２，９１５号及び同第６，５９３，０８１号に記載されている。
免疫原性抗原の調製及びモノクローナル抗体の製造は、組み換えタンパク質製造などの任意の好適な技術を用いて実施することができる。免疫原性抗原は、精製タンパク質、又は細胞全体若しくは細胞若しくは組織抽出物を含むタンパク質混合物の形態で動物に投与されてもよく、又は抗原は、当該抗原又はその一部をコードする核酸から動物の体内で新規に（de novo）形成されてもよい。
本発明の抗体は、ヒト抗体又はヒト化抗体であってもよい。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ヒトＩＧＨＶ３−２３*０３（配列番号７９）、ＩＧＨＶ１−６９*０１（配列番号８０）、ＩＧＨＶ３−２３*０１（配列番号８１）、ＩＧＨＶ３−２３*０４（配列番号８２）又はＩＧＨＶ４−３９*０１（配列番号７３）に由来するＶＨフレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ヒトＩＧＫＶ３−２０*１（配列番号７４）、ＩＧＫＶ４−１*０１（配列番号８４）、ＩＧＫＶ１−３９*０１（配列番号８５）、ＩＧＬＶ３−１*０１（配列番号８６）又はＩＧＬＶ２−８*０１（配列番号８７）に由来するＶＬフレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ヒトＩＧＨＶ３−２３*０３（配列番号７９）に由来する重鎖フレームワーク及びヒトＩＧＫＶ３−２０*０１（配列番号７４）に由来する軽鎖フレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ヒトＩＧＨＶ１−６９*０１（配列番号８０）に由来する重鎖フレームワーク及びヒトＩＧＫＶ４−１*０１（配列番号８４）に由来する軽鎖フレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ヒトＩＧＨＶ１−６９*０１（配列番号８０）に由来する重鎖フレームワーク及びヒトＩＧＫＶ１−３９*０１（配列番号８５）に由来する軽鎖フレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ヒトＩＧＨＶ３−２３*０１（配列番号８１）に由来する重鎖フレームワーク及びヒトＩＧＫＶ１−３９*０１（配列番号８５）に由来する軽鎖フレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ヒトＩＧＨＶ３−２３*０４（配列番号８２）に由来する重鎖フレームワーク及びヒトＩＧＬＶ３−１*０１（配列番号８６）に由来する軽鎖フレームワークを含む。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ヒトＩＧＨＶ４−３９*０１（配列番号７３）に由来する重鎖フレームワーク及びヒトＩＧＬＶ２−８*０１（配列番号８７）に由来する軽鎖フレームワークを含む。
特定のフレームワーク又は生殖系列配列「に由来する」重鎖又は軽鎖可変領域を含む抗体は、ヒト生殖系列免疫グロブリン遺伝子を使用する系から、例えば、下記で述べるトランスジェニックマウス又はファージディスプレイライブラリーなどから、得られる抗体を指す。特定のフレームワーク又は生殖細胞系列配列「に由来する」抗体は、例えば自然発生する体細胞変異又は意図的な置換のために、その由来となった配列と比較したときにアミノ酸の違いを含み得る。
本発明の抗体は、ＩｇＡ、ＩｇＤ、ＩｇＥ、ＩｇＧ又はＩｇＭアイソタイプであってもよい。本発明の抗体は、ＩｇＧ１型、ＩｇＧ２型、ＩｇＧ３型、ＩｇＧ４型であってもよい。
本発明の抗体を更に改変して、親抗体と比較した場合に特性が類似している又は変更されている改変抗体を作製することができる。本発明の抗体では、ＶＨ、ＶＬ、ＶＨ及びＶＬ、定常領域、ＶＨフレームワーク、ＶＬフレームワーク、又は上記６つのＣＤＲのうちのいずれか若しくは全てが改変されていてもよい。
本発明の抗体は、ＣＤＲ移植により改変されてもよい。本発明の抗体の１つ以上のＣＤＲ配列を異なるフレームワーク配列に移植してもよい。ＣＤＲ移植は、本明細書に記載の方法を使用して行うことができる。本明細書に記載のいくつかの実施形態では、また、下記に列挙する番号付けした実施形態の全てのうちのいくつかの実施形態では、本発明の抗体は、配列番号１、２、３、４若しくは５のＨＤＣＲ１、配列番号６、７、８、９、１０、１１、１２若しくは１３のＨＣＤＲ２、配列番号１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４若しくは２５のＨＣＤＲ３を含むＶＨ、及び配列番号２６、２７、２８、２９、３０、３１若しくは３２のＬＣＤＲ１、配列番号３３、３４、３５、３６、３７、３８若しくは３９のＬＣＤＲ２及び／又は配列番号４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６若しくは４７のＬＣＤＲ３を含むｔｅｌｌ、ＶＨフレームワークは、ＩＧＨＶ３−２３*０３（配列番号７９）、ＩＧＨＶ１−６９*０１（配列番号８０）、ＩＧＨＶ３−２３*０１（配列番号８１）、ＩＧＨＶ３−２３*０４（配列番号８２）、又はＩＧＨＶ４−３９*０１（配列番号７３）のいずれにも由来しておらず、ＶＬフレームワークは、ＩＧＬＶ４−１*０１（配列番号８４）、ＩＧＫＶ１−３９*０１（配列番号８５）、ＩＧＬＶ３−１*０１（配列番号８６）又はＩＧＬＶ２−８*０１（配列番号８７）のいずれにも由来していない。
使用するフレームワーク配列は、生殖系列抗体遺伝子配列を含む公開ＤＮＡデータベース又は発表されている参考文献から得ることができる。例えば、ヒト重鎖及び軽鎖可変領域遺伝子に関する生殖系列ＤＮＡ及びコードタンパク質配列は、ＩＭＧＴ（登録商標）、国際ＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ情報システム（登録商標）ｈｔｔｐ：／／＿ｗｗｗ−ｉｍｇｔ＿ｏｒｇにおいて見出すことができる。本発明の抗体中に存在するフレームワーク配列を置き換えるために使用することができるフレームワーク配列は、親フレームワークに対して最も高い同一性を示すものである。
親抗体及び改変抗体のフレームワーク配列は、例えば米国特許第６，１８０，３７０号に記載されているように、復帰変異によって更に改変して、得られる抗体の抗原への結合を回復及び／又は向上させることができる。親抗体及び改変抗体のフレームワーク配列は、フレームワーク領域内の、又は更には１つ以上のＣＤＲ領域内の１つ以上の残基を変異させることによって更に改変して、Ｔ細胞エピトープを除去して、それにより抗体の潜在的な免疫原性を低減することもできる。このアプローチは「脱免疫」とも呼ばれ、米国特許公開第２００３０１５３０４３号に詳述されている。
本発明の抗体のＣＤＲ残基を変異させて、対象とする抗体の結合特性のうち１つ以上を向上させることもできる。部位特異的変異誘発又はＰＣＲによる変異誘発を実施して、変異を導入することができ、抗体結合、又は他の対象とする機能的特性に対する影響を、本明細書に記載され実施例において示されているとおり、インビトロ又はインビボアッセイで評価することができる。導入可能な代表的な置換は、上記で論じた保存的な改変である。更に、典型的には、ＣＤＲ領域内の１、２、３、４、又は５個以下の残基が改変される。
本発明の抗体に対してＦｃ領域中に変異をもたらし、抗体エフェクター機能及び薬物動態特性を調節することができる。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、抗体Ｆｃ中の少なくとも１つの置換を含む。
本発明の抗体に対してＦｃ変異をもたらして、抗体半減期を調節することもできる。例えば、Ｍ２５２Ｙ／Ｓ２５４Ｔ／Ｔ２５６Ｅ変異を導入して、得られる抗体の半減期を延長することができる（Ｄａｌｌ’Ａｃｑｕａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２８１：２３５１４〜２４０，２００６）。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、ＦｃｙＲＩＩｂに対する抗体の結合を強化する少なくとも１つの変異をＦｃ領域中に含む。
「ＦｃｙＲＩＩｂに対する結合の強化」は、変異を有さない同じ抗体と比較した場合に、Ｆｃ領域中の少なくとも１つの変異を含む本発明の抗体によるＦｃｙＲＩＩｂに対する結合が統計的に有意に増強していること（例えばＥＣ50値の減少）を指す。
ＦｃｙＲＩＩｂに対する抗体の結合は、ＦｃｙＲＩＩｂを発現するように改変された細胞において、フローサイトメトリーを用いて評価することができる。例示の結合アッセイでは、９６ウェルプレート中１ウェル当たり２×１０5個の細胞を播種し、ＢＳＡ Ｓｔａｉｎ Ｂｕｆｆｅｒ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｓａｎ Ｊｏｓｅ，ＵＳＡ）中で４℃で３０分間ブロックした。細胞を、氷上で４℃で１．５時間、試験抗体とともにインキュベートする。ＢＳＡ染色緩衝液で２回洗浄した後、細胞を、Ｒ−ＰＥ標識抗ヒトＩｇＧ二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ Ｉｍｍｕｎｏｒｅｓｅａｒｃｈ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ）とともに４℃で４５分間、インキュベートする。細胞を、染色緩衝液で２回洗浄し、その後、１：２００希釈したＤＲＡＱ７生／死細胞染色試薬（Ｃｅｌｌ Ｓｉｇｎａｌｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｄａｎｖｅｒｓ，ＵＳＡ）を含有する１５０μＬのＳｔａｉｎ Ｂｕｆｆｅｒ中に再懸濁する。染色された細胞のＰＥ及びＤＲＡＱ７シグナルを、Ｍｉｌｔｅｎｙｉ ＭＡＣＳＱｕａｎｔフローサイトメーター（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ Ｂｉｏｔｅｃ，Ａｕｂｕｒｎ，ＵＳＡ）によって、それぞれＢ２及びＢ４チャンネルを使用して検出する。生細胞をＤＲＡＱ７除外でゲートし、収集された少なくとも１０，０００生細胞イベントについて、幾何平均蛍光シグナルを決定する。解析にはＦｌｏｗＪｏソフトウェア（Ｔｒｅｅ Ｓｔａｒ）を使用する。データを、平均蛍光シグナルに対する抗体濃度の対数としてプロットする。ＧｒａｐｈＰａｄ Ｐｒｉｓｍ ６（ＧｒａｐｈＰａｄ Ｓｏｆｔｗａｒｅ，Ｉｎｃ．）によって非線形回帰分析を行い、ＥＣ５０値を算出する。
ＦｃγＲＩＩｂに対する、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体の結合の増強は、ＣＤ４０分子の架橋を強化し、本発明のアゴニスト抗体によるＣＤ４０活性化をより強力にし得る。ＦｃγＲＩＩｂが増加した抗体を生じる例示のＦｃ変異は、Ｓ２６７Ｅ変異、Ｓ２６７Ｄ変異、Ｓ２６７Ｅ／Ｉ３３２Ｅ変異、Ｓ２６７Ｅ／Ｌ３２８Ｆ変異、Ｇ２３６Ｄ／Ｓ２６７Ｅ変異及びＥ２３３Ｄ／Ｇ２３７Ｄ／Ｈ２６８Ｄ／Ｐ２７１Ｇ／Ａ３３０Ｒ／Ｐ２３８Ｄ変異であり、残基の番号付けはＥＵ Ｉｎｄｅｘに従う。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、Ｆｃ領域中のＳ２６７Ｅ変異を含み、残基の番号付けはＥＵ Ｉｎｄｅｘに従う。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、Ｆｃ領域中のＳ２６７Ｅ／Ｉ３３２Ｅ変異を含み、残基の番号付けはＥＵ Ｉｎｄｅｘに従う。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、Ｆ領域中のＳ２６７Ｅ／Ｌ３２８Ｆ変異を含み、残基の番号付けはＥＵ Ｉｎｄｅｘに従う。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、Ｆｃ領域中のＥ２３３Ｄ／Ｇ２３７Ｄ／Ｈ２６８Ｄ／Ｐ２７１Ｇ／Ａ３３０Ｒ／Ｐ２３８Ｄ変異を含み、残基の番号付けはＥＵ Ｉｎｄｅｘに従う。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、Ｆｃγ受容体（ＦｃγＲ）に対する抗体の結合を強化する、かつ／又はＣｌｑ結合、補体依存性細胞傷害（ＧＤＣ）、抗体依存性細胞介在性細胞傷害（ＡＤＣＣ）又は貪食作用（ＡＤＣＰ）などのＦｃエフェクター機能を強化する、Ｆｃ領域中の少なくとも１つの変異を含む。
活性化Ｆｅｙに対する抗体の結合を増強する、かつ／又は抗体エフェクター機能を強化するために変異させることができるＦｃ領域の位置は、例えば米国特許第６，７３７，０５６号、米国特許公開第２０１５／０２５９４３４号、Ｓｈｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ，（２００１）Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７６：６５９１〜６６０４，Ｌａｚａｒ ｅｔ ａｌ，（２００６）Ｐｒｏｃ Ｎａｔａｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ，１０３：４００５〜４０１０，Ｓｔａｖｅｎｈａｇｅｎ ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ６７：８８８２〜８８９０，Ｒｉｃｈａｒｄｓ ｅｔ ａｌ，（２００８）Ｍｏｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒ ７：２５１７〜２５２７，Ｄｉｅｂｏｌｄｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｓｃｉｅｎｃｅ；２０１４年３月１３日にインターネット上で発表；ｄｏｉ：１０．１１２６／ｓｃｉｅｎｃｅ．１２４８９４３に記載されているものであり、２３６、２３９、２４３、２５６、２９０、２９２、２９８、３００、３０５、３１２、３２６、３３０、３３２、３３３、３３４、３４５、３６０、３３９、３７８、３９６又は４３０位を含む（残基の番号付けはＥＵ ｉｎｄｅｘに従う）。単独で又は組み合わせて行うことができる例示の変異は、Ｇ２３６Ａ変異、Ｓ２３９Ｄ変異、Ｆ２４３Ｌ変異、Ｔ２５６Ａ変異、Ｋ２９０Ａ変異、Ｒ２９２Ｐ変異、Ｓ２９８Ａ変異、Ｙ３００Ｌ変異、Ｖ３０５Ｌ変異、Ｋ３２６Ａ変異、Ａ３３０Ｋ変異、Ｉ３３２Ｅ変異、Ｅ３３３Ａ変異、Ｋ３３４Ａ変異、Ａ３３９Ｔ変異及びＰ３９６Ｌ変異である。ＡＤＣＣ又はＡＤＣＰが増加した抗体を生じる例示の置換の組み合わせは、ＩｇＧ１上のＳ２３９Ｄ／Ｉ３３２Ｅ変異、Ｓ２９８Ａ／Ｅ３３３Ａ／Ｋ３３４Ａ変異、Ｆ２４３Ｌ／Ｒ２９２Ｐ／Ｙ３００Ｌ変異、Ｆ２４３Ｌ／Ｒ２９２Ｐ／Ｙ３００Ｌ／Ｐ３９６Ｌ変異、Ｆ２４３Ｌ／Ｒ２９２Ｐ／Ｙ３００Ｌ／Ｖ３０５Ｉ／Ｐ３９６Ｌ変異及びＧ２３６Ａ／Ｓ２３９Ｄ／Ｉ３３２Ｅ変異である。
抗体のＣＤＣを強化するために突然変異させることができるＦｃ領域の位置は、例えば国際公開第Ｗ０２０１４／１０８１９８号、Ｉｄｕｓｏｇｉｅ ｅｔ ａｌ，（２００１）Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １６６：２５７１〜２５７５及びＭｏｏｒｅ ｅｔ ａｌ，（２０１０）Ｍａｂｓ，２：１８１〜１８９に記載されているものであり、２６７、２６８、３２４、３２６、３３３、３４５及び４３０位を含む。単独で又は組み合わせて行うことができる例示の変異は、Ｓ２６７Ｅ変異、Ｆ１２６８Ｆ変異、Ｓ３２４Ｔ変異、Ｋ３２６Ａ変異、Ｋ３２６Ｗ変異、Ｅ３３３Ａ変異、Ｅ３４５Ｋ変異、Ｅ３４５Ｑ変異、Ｅ３４５Ｒ変異、Ｅ３４５Ｙ変異、Ｅ４３０Ｓ変異、Ｅ４３０Ｆ変異及びＥ４３０Ｔ変異である。ＣＤＣが増加した抗体を生じる例示の変異の組み合わせは、ＩｇＧ１上のＫ３２６Ａ／Ｅ３３３Ａ変異、Ｋ３２６Ｗ／Ｅ３３３Ａ変異、Ｈ２６８Ｆ／Ｓ３２４Ｔ変異、Ｓ２６７Ｅ／Ｈ２６８Ｆ変異、Ｓ２６７Ｅ／Ｓ３２４Ｔ変異及びＳ２６７Ｅ／Ｈ２６８Ｆ／Ｓ３２４Ｔ変異である。
モノクローナル抗体がＡＤＣＣを誘導する能力は、それらのオリゴ糖を改変することによっても強化することができる。ヒトＩｇＧ１又はＩｇＧ３は、Ａｓｎ２９７がＮ−グリコシル化されており、グリカンの大部分は、よく知られている二分岐Ｇ０、Ｇ０Ｆ、Ｇ１、Ｇ１Ｆ、Ｇ２、又はＧ２Ｆの形態である。改変されていないＣＨＯ細胞により産生される抗体は、典型的には、少なくとも約８５％のグリカンフコース含量を有する。Ｆｃ領域に結合した二分岐の複合体型オリゴ糖からコアフコースを除去することにより、抗原結合又はＣＤＣ活性を変えることなく、改善されたＦｃγＲＩＩＩａ結合を介して抗体のＡＤＣＣを強化する。このようなｍＡｂは、培養浸透圧の制御（Ｋｏｎｎｏ ｅｔ ａｌ．，Ｃｙｔｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ６４：２４９〜６５，２０１２）、変異体ＣＨＯ株Ｌｅｃ１３の宿主細胞株としての適用（Ｓｈｉｅｌｄｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７７：２６７３３〜２６７４０，２００２）、変異体ＣＨＯ株ＥＢ６６の宿主細胞株としての適用（Ｏｌｉｖｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，ＭＡｂｓ ２（４），２０１０、印刷に先立って電子公開、ＰＭＩＤ：２０５６２５８２）、ラットハイブリドーマ細胞株ＹＢ２／０の宿主細胞株としての適用（Ｓｈｉｎｋａｗａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２７８：３４６６〜３４７３，２００３）、α１，６−フコシルトランスフェラーゼ（ＦＵＴ８）遺伝子に対して特異的な低分子干渉ＲＮＡの導入（Ｍｏｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ Ｂｉｏｅｎｇ８８：９０１〜９０８，２００４）、又はβ−１，４−Ｎ−アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼＩＩＩとゴルジα−マンノシダーゼＩＩ若しくは強力なα−マンノシダーゼＩ阻害剤であるキフネンシンとの共発現（Ｆｅｒｒａｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ２８１：５０３２〜５０３６，２００６、Ｆｅｒｒａｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ Ｂｉｏｅｎｇ ９３：８５１〜８６１，２００６、Ｘｈｏｕ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ Ｂｉｏｅｎｇ ９９；６５２〜６５，２００８）などの、Ｆｃオリゴ糖の二分岐複合型を有する比較的高度に脱フコシル化された抗体の効果的な発現につながることが報告されている様々な方法を用いて得ることができる。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、フコース含量が約０％〜約１５％の間、例えば１５％、１４％、１３％、１２％、１１％１０％、９％、８％、７％、６％、５％、４％、３％、２％、１％又は０％である二分岐グリカン構造を有する。
いくつかの実施形態では、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、フコース含量が約５０％、４０％、４５％、４０％、３５％、３０％、２５％、２０％、１５％、１４％、１３％、１２％、１１％、１０％、９％、８％、７％、６％、５％、４％、３％、２％、１％又は０％である二分岐グリカン構造を有する。
「フコース含量」は、Ａｓｎ２９７における糖鎖中のフコース単糖の量を意味する。フコースの相対量は、全糖構造に対するフコース含有構造の割合である。これらの構造は、複数の方法、例えば、１）国際特許出願公開第２００８／０７７５４６号に記載されている、Ｎ−グリコシダーゼＦ処理サンプルのＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ（例えば、複合体、ハイブリッド、並びにオリゴ−及び高マンノース構造）の使用、２）Ａｓｎ２９７グリカンの酵素的放出、その後の誘導体化、及び蛍光検出を用いたＨＰＬＣ（ＵＰＬＣ）及び／又はＨＰＬＣ−ＭＳ（ＵＰＬＣ−ＭＳ）による検出／定量、３）Ｅｎｄｏ Ｓ、又は第１のＧｌｃＮＡｃ単糖と第２のＧｌｃＮＡｃ単糖との間を切断し、フコースを第１のＧｌｃＮＡｃに結合させる他の酵素によるＡｓｎ２９７のグリカンの処理を行う又は行わない、天然又は還元ｍＡｂのインタクトプロテイン分析、４）酵素消化（例えば、トリプシン又はエンドペプチダーゼＬｙｓ−Ｃ）による、ｍＡｂの構成ペプチドへの消化、並びにその後のＨＰＬＣ−ＭＳ（ＵＰＬＣ−ＭＳ）による分離、検出、及び定量化、又は５）Ａｓｎ ２９７でのＰＮＧａｓｅ Ｆを用いた酵素による特異的脱グリコシル化による、ｍＡｂタンパク質からのｍＡｂオリゴ糖の分離、により特性評価及び定量することができる。放出されるオリゴ糖は、フルオロフォアで標識して、実験的質量と理論的質量との比較によるマトリックス支援レーザ脱離イオン化（ＭＡＬＤＩ）質量分析によるグリカン構造の精密な特性評価、イオン交換ＨＰＬＣ（ＧｌｙｃｏＳｅｐ Ｃ）によるシアル化の程度の決定、順相ＨＰＬＣ（ＧｌｙｃｏＳｅｐ Ｎ）による親水性基準に従うオリゴ糖型の分離及び定量、並びに高性能キャピラリー電気泳動−レーザ誘起蛍光（ＨＰＣＥ−ＬＩＦ）によるオリゴ糖の分離及び定量、を可能にする様々な補足的技術によって分離及び特定することが可能である。
本出願で使用される「低フコース」又は「低フコース含量」は、抗体が約０％〜１５％のフコース含量を有することを指す。
本明細書で使用する場合、「標準的なフコース」又は「標準的なフコース含量」は、約５０％を超える、通常は約６０％、７０％、８０％を超える、又は８５％を超えるフコース含量を有する抗体を指す。
ＡＤＣＣ、ＡＤＣＰ及び／又はＣＤＣが強化された、本発明のＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、ＣＤ４０を発現する血液学的悪性疾患を処置するのに有用であり得る。
「抗体依存性細胞傷害」、「抗体依存性細胞介在性細胞傷害」又は「ＡＤＣＣ」は、抗体で被覆された標的細胞と、ナチュラルキラー細胞、単球、マクロファージ、及び好中球などの溶解活性を有するエフェクター細胞との、エフェクター細胞上に発現されるＦｃγ受容体（ＦｃγＲ）を介した相互作用に依存する、細胞死を誘導するための機序である。例えば、ＮＫ細胞はＦｃγＲＩＩＩａを発現し、一方、単球はＦｃγＲＩ、ＦｃγＲＩＩ及びＦｃγＲＩＩＩａを発現する。本発明の抗体のＡＤＣＣ活性を評価するために、抗体を免疫エフェクター細胞と組み合わせて標的細胞に添加することができ、免疫エフェクター細胞が抗原抗体複合体により活性化されることで、標的細胞の細胞溶解が生じ得る。細胞溶解は、通常、溶解した細胞からの標識（例えば、放射性基質、蛍光染料、又は天然の細胞内タンパク質）の放出によって検出される。そのようなアッセイ用のエフェクター細胞の例としては、末梢血単核球（ＰＢＭＣ）及びＮＫ細胞が挙げられる。標的細胞の例としては、ＣＤ４０を発現する細胞が挙げられる。
「抗体依存性細胞貪食作用」（「ＡＤＣＰ」）は、例えばマクロファージ又は樹状細胞などの貪食細胞による取り込みによって、抗体で被覆された標的細胞を排除する機序を指す。ＡＤＣＰは、単球由来マクロファージをエフェクター細胞として、ＧＰＰ又は他の標識分子を発現するように改変されたＣＤ４０発現細胞を標的細胞として使用して評価することができる。エフェクター：標的細胞比は例えば４：１とすることができる。エフェクター細胞を標的細胞とともに、試験ＣＤ４０抗体を添加して又は添加せずに、４時間インキュベートし得る。インキュベーション後、細胞は、アキュターゼを使用して剥離させてよい。マクロファージは、蛍光標識に結合した抗ＣＤ１１抗体及び抗ＣＤ１４抗体により識別することができ、貪食作用の割合（％）は、標準的な方法を用いて、ＣＤ１１+ＣＤ１４+マクロファージにおけるＧＦＰ蛍光の割合（％）に基づいて決定することができる。
「補体依存性細胞傷害」又は「ＣＤＣ」は、標的結合抗体のＦｃエフェクタードメインが、補体成分Ｃ１ｑに結合及び活性化し、この補体成分Ｃ１ｑが次に補体カスケードを活性化して標的細胞の細胞死を引き起こす、細胞死を誘導するための機序を指す。補体の活性化はまた、標的細胞表面に対する補体成分の沈着を生じさせて、白血球への補体受容体（例えば、ＣＲ３）の結合によって、ＡＤＣＣを促進し得る。ＣＤ４０発現細胞のＣＤＣは、例えばＣＤ４０を発現する細胞を適切な培地に播種して、混合物中に抗ＣＤ４抗体を添加し、その後、プールしたヒト血清を添加することによって測定することができる。インキュベート時間の後、溶解した細胞の割合（％）を、標準的な方法を使用したＦＡＣＳアッセイにおいてヨウ化プロピジウム染色細胞の割合（％）として検出することができる。
「ＡＤＣＣの強化」「ＣＤＣの強化」及び「ＡＤＣＰの強化」は、変異を有さない同じ抗体と比較した場合に、Ｆｃ領域中の少なくとも１つの変異を含む本発明の抗体によって介在されるＡＤＣＣ、ＣＤＣ及び／又はＡＤＣＰが、統計的に有意に強化されることを指す。ＡＤＣＣ、ＣＤＣ及び／又はＡＤＣＰ、例えば本明細書に記載のアッセイ及び米国特許第８，８７１，２０４号に記載のアッセイにおいて。
更に、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、グリコシル化、異性化、脱グリコシル化などのプロセスによって、又はポリエチレングリコール部分の付加（ＰＥＧ化）及び脂質化などの天然に存在しない共有結合修飾によって、翻訳後修飾されてもよい。こうした修飾はインビボ又はインビトロで行われ得る。例えば、本発明の抗体をポリエチレングリコールにコンジュゲート（ＰＥＧ化）して薬物動態プロファイルを向上させることができる。コンジュゲーションは当業者に既知の技術によって行われ得る。治療用抗体をＰＥＧとコンジュゲーションさせると、機能は干渉されずに薬物動態が強化されることが示されている（Ｋｎｉｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｐｌａｔｅｌｅｔｓ １５：４０９〜１８，２００４；Ｌｅｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｃｙｔｏｋｉｎｅ １６：１０６〜１９，２００１；Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．１６：７６１〜７０，２００３）。
安定性、選択性、交差反応性、親和性、免疫原性、又は他の望ましい生物学的若しくは生物物理学的特性を向上させるように改変された本発明の抗体又はその抗原結合フラグメントは、本発明の範囲内である。抗体の安定性は、分子内力及び分子間力の中でも特に（１）内因的な安定性に影響を及ぼす個々のドメインのコアパッキング、（２）ＨＣとＬＣとのペア形成に影響するタンパク質／タンパク質境界面相互作用、（３）極性及び荷電残基の埋没、（４）極性及び荷電残基の水素（Ｈ）結合ネットワーク、並びに（５）表面電荷及び極性残基の分布、などの多くの因子によって影響を受ける（Ｗｏｒｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ３０５：９８９〜１０１０，２００１）。ある場合においては、構造を不安定化させる可能性のある残基は、抗体の結晶構造に基づいて、又は場合によっては分子モデリングによって特定することが可能であり、また、抗体安定性に対するこれらの残基の作用は、特定された残基に変異を含む変異体を作製及び評価することにより試験することができる。抗体の安定性を高める方法の１つは、示差走査熱量測定法（ＤＳＣ）で測定される場合の熱転移中点温度（Ｔm）を高くすることである。一般に、タンパク質のＴmは、その安定性と相関し、溶液中でのアンフォールディングし易さ及び変性し易さ、並びにそのタンパク質のアンフォールディングし易さに応じた分解プロセスとは逆相関する（Ｒｅｍｍｅｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｐｈａｒｍ．，１３：３６〜４６，２０００）。多数の研究で、ＤＳＣで熱安定性として測定された配合物の物理的安定性のランク付けと他の方法で測定された物理的安定性との間に相関があることが判明している（Ｇｕｐｔａ ｅｔ ａｌ．，ＡＡＰＳ ＰｈａｒｍＳｃｉ ５Ｅ８，２００３；Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｐｈａｒｍ Ｓｃｉ ９３：３０７６〜８９，２００４；Ｍａａ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｊ Ｐｈａｒｍ １４０：１５５〜６８，１９９６；Ｂｅｄｕ−Ａｄｄｏ ｅｔ ａｌ．，Ｐｈａｒｍ Ｒｅｓ ２１：１３５３〜６１，２００４；Ｒｅｍｍｅｌｅ ｅｔ ａｌ．，Ｐｈａｒｍ Ｒｅｓ １５：２００〜８，１９９７）。配合物研究は、ＦａｂのＴmが、対応するｍＡｂの長期物理的安定性と密接な関係があることを示唆している。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、多重特異性抗体である。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、二重特異性抗体である。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、二重特異性抗体に改変することができ、これもまた本発明の範囲内に包含される。
完全長二重特異性抗体は、例えば、無細胞環境でインビトロで、又は共発現を使用して、異なる特異性を有する２つの抗体半分子のヘテロ二量体形成に有利になるように各半分子において重鎖ＣＨ３境界面で変異を導入することによって、２つの単一特異性二価抗体間でＦａｂアーム交換（例えば、重鎖−軽鎖ペアで交換する半分子交換）して、作製することができる。Ｆａｂアーム交換反応は、ジスルフィド結合異性化反応及びＣＨ３ドメインの解離−結合の結果である。親単一特異性抗体のヒンジ領域中の重鎖ジスルフィド結合は、還元される。親単一特異性抗体のうちの１つに生じる遊離システインは、第２の親単一特異性抗体分子のシステイン残基と重鎖間ジスルフィド結合を形成し、同時に、親抗体のＣＨ３ドメインは、解離−結合により開放され再形成する。ＦａｂアームのＣＨ３ドメインは、ホモ二量体化よりヘテロ二量体化に有利になるように改変され得る。得られる生成物は、それぞれが異なるエピトープに結合する、２つのＦａｂアームｒ半分子を有する二重特異性抗体である。一方の重鎖における変異Ｆ４０５Ｌ及び他方の重鎖におけるＫ４０９Ｒを使用し得る。二重特異性抗体を作製するために、第１の単一特異性二価抗体及び第２の単一特異性二価抗体を、Ｆｃ領域中のＦ４０５Ｌ又はＫ４０９Ｒ変異を有するように改変し、ヒンジ領域中のシステインがジスルフィド結合異性化を受けるために十分な還元条件下で抗体を一緒にインキュベートし、これにより、Ｆａｂアーム交換により二重特異性抗体が作製される。インキュベート条件は、最適には、非還元条件に戻されてもよい。使用され得る還元剤の例は、２−メルカプトエチルアミン（２−ＭＥＡ）、ジチオトレイトール（ＤＴＴ）、ジチオエリトリトール（ＤＴＥ）、グルタチオン、トリス（２カルボキシエチル）ホスフィン（ＴＣＥＰ）、Ｌ−システイン及びβ−メルカプトエタノールである。例えば、少なくとも２０℃の温度で、少なくとも２５ｍＭの２−ＭＥＡの存在下又は少なくとも０．５ｍＭのジチオトレイトールの存在下で、ｐＨ５〜８、例えば、ｐＨ７．０又はｐＨ７．４で、少なくとも９０分のインキュベートを用いることができる。
二重特異性抗体はまた、Ｋｎｏｂ−ｉｎ−Ｈｏｌｅ（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、ＣｒｏｓｓＭＡｂ（Ｒｏｃｈｅ）及び静電的適合（ｅｌｅｃｔｒｏｓｔａｔｉｃａｌｌｙ−ｍａｔｃｈｅｄ）（Ｃｈｕｇａｉ，Ａｍｇｅｎ，ＮｏｖｏＮｏｒｄｉｓｋ，Ｏｎｃｏｍｅｄ）、ＬＵＺ−Ｙ（Ｇｅｎｅｎｔｅｃｈ）、Ｓｔｒａｎｄ Ｅｘｃｈａｎｇｅ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ Ｄｏｍａｉｎ ｂｏｄｙ（ＳＥＥＤｂｏｄｙ）（ＥＭＤ Ｓｅｒｏｎｏ）、及びＢｉｃｌｏｎｉｃ（Ｍｅｒｕｓ）などのデザインを使用して作製することもできる。
「ノブ−イン−ホール（knob-in-hole）」法（例えば、国際公開第２００６／０２８９３６を参照）を使用して、本発明の完全長二重特異性抗体を作製することができる。簡潔に述べると、ヒトＩｇＧにおいてＣＨ３ドメインの境界面を形成する選択されたアミノ酸を、ＣＨ３ドメイン相互作用に影響を及ぼす位置で変異させて、ヘテロ二量体形成を促進することができる。小さな側鎖を有するアミノ酸（ホール）が、第１の抗原に特異的に結合する抗体の重鎖内に導入され、大きな側鎖を有するアミノ酸（ノブ）が、第２の抗原に特異的に結合する抗体の重鎖内に導入される。２つの抗体の共発現後に、「ホール」を有する重鎖と「ノブ」を有する重鎖との優先的な相互作用の結果として、ヘテロ二量体が形成される。ノブ及びホールを形成する例示のＣＨ３置換ペアは、Ｔ３６６Ｙ／Ｆ４０５Ａ、Ｔ３６６Ｗ／Ｆ４０５Ｗ、Ｆ４０５Ｗ／Ｙ４０７Ａ、Ｔ３９４Ｗ／Ｙ４０７Ｔ、Ｔ３９４Ｓ／Ｙ４０７Ａ、Ｔ３６６Ｗ／Ｔ３９４Ｓ、Ｆ４０５Ｗ／Ｔ３９４Ｓ、及びＴ３６６Ｗ／Ｔ３６６Ｓ＿Ｌ３６８Ａ＿Ｙ４０７Ｖである（第１の重鎖の第１のＣＨ３ドメインにおける改変位置／第２の重鎖の第２のＣＨ３ドメインにおける改変位置として表す）。
ＣｒｏｓｓＭＡｂ技術を使用して、本発明の完全長二重特異性抗体を作製することができる。Ｆａｂアーム交換を促進するために「ノブ−イン−ホール」法を利用することに加えて、ＣｒｏｓｓＭＡｂは、半分のアームのうちの一方においてＣＨ１及びＣＬドメインを交換して、結果として生じる二重特異性抗体が確実に正しい軽鎖ペアを形成するようにする（例えば米国特許第８，２４２，２４７号を参照）。
他の交差法を使用して、二重特異性抗体の重鎖と軽鎖の間又は重鎖内で、一方又は両方のアームにおいて、可変又は定常、又は両ドメインを交換することによって、本発明の完全長二重特異性抗体を作製してもよい。こうした交換としては、例えば、国際公開第２００９／０８０２５４号、同第２００９／０８０２５１号、同第２００９／０１８３８６号及び同第２００９／０８０２５２号に記載されているように、ＶＨ−ＣＨ１とＶＬ−ＣＬ、ＶＨとＶＬ、ＣＨ３とＣＬ及びＣＨ３とＣＨ１が挙げられる。
他の手法、例えば、米国特許出願公開第２０１０／００１５１３３号、米国特許出願公開第２００９／０１８２１２７号、米国特許出願公開第２０１０／０２８６３７号、又は米国特許出願公開第２０１１／０１２３５３２号に記載されているように、あるＣＨ３表面における正に荷電した残基及び第２のＣＨ３表面における負に荷電した残基を置換することによる静電的相互作用を使用した重鎖ヘテロ二量体化の促進が使用されてもよい。他の手法では、ヘテロ二量体化は、米国特許出願公開第２０１２／０１４９８７６号又は米国特許出願公開第２０１３／０１９５８４９号に記載されているように、以下の置換：Ｌ３５１Ｙ＿Ｆ４０５Ａ＿Ｙ４０７Ｖ／Ｔ３９４Ｗ、Ｔ３６６Ｉ＿Ｋ３９２Ｍ＿Ｔ３９４Ｗ／Ｆ４０５Ａ＿Ｙ４０７Ｖ、Ｔ３６６Ｌ＿Ｋ３９２Ｍ＿Ｔ３９４Ｗ／Ｆ４０５Ａ＿Ｙ４０７Ｖ、Ｌ３５１Ｙ＿Ｙ４０７Ａ／Ｔ３６６Ａ＿Ｋ４０９Ｆ、Ｌ３５１Ｙ＿Ｙ４０７Ａ／Ｔ３６６Ｖ＿Ｋ４０９Ｆ、Ｙ４０７Ａ／Ｔ３６６Ａ＿Ｋ４０９Ｆ、又はＴ３５０Ｖ＿Ｌ３５１Ｙ＿Ｆ４０５Ａ＿Ｙ４０７Ｖ／Ｔ３５０Ｖ＿Ｔ３６６Ｌ＿Ｋ３９２Ｌ＿Ｔ３９４Ｗ（第１の重鎖の第１のＣＨ３ドメインにおける改変位置／第２の重鎖の第２のＣＨ３ドメインにおける改変位置として表す）により促進することができる。
ＬＵＺ−Ｙ技術を利用して、本発明の二重特異性抗体を作製してもよい。この技術では、Ｗｒａｎｉｋ ｅｔ ａｌ．，（２０１２）Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ ２８７（５２）：４２２２１〜９に記載されているように、精製後に除去されるロイシンジッパーをＣＨ３ドメインのＣ末端に付加して、親ｍＡｂからのヘテロ二量体の集合を引き起こす。
ＳＥＥＤｂｏｄｙ技術を利用して、本発明の二重特異性抗体を作製してもよい。ＳＥＥＤｂｏｄｙは、米国特許第２００７０２８７１７０号に記載されているように、定常ドメインにおいて、選択ＩｇＧ残基をＩｇＡ残基で置換し、ヘテロ二量体化を促進する。
変異は、通常、標準的な方法を使用して、抗体の定常ドメインなどの分子に対してＤＮＡレベルで行われる。
本発明の抗体を、様々な周知の抗体フォーマットに改変してもよい。
いくつかの実施形態では、二重特異性抗体としては、分子の両側がそれぞれ、少なくとも２つの異なる抗体のＦａｂフラグメント又はＦａｂフラグメントの一部を含む、組み換えＩｇＧ様の二重標的化分子；完全長ＩｇＧ抗体が追加のＦａｂフラグメント又はＦａｂフラグメントの一部に融合されている、ＩｇＧ融合分子；単鎖Ｆｖ分子又は安定化されたダイアボディが重鎖定常ドメイン、Ｆｃ領域又はその一部に融合されている、Ｆｃ融合分子；異なるＦａｂフラグメントが一緒に融合されている、Ｆａｂ融合分子；異なる単鎖Ｆｖ分子又は異なるダイアボディ又は異なる重鎖抗体（例えばドメイン抗体、ナノボディ）が、互いに、又は別のタンパク質に、又は担体分子に融合されている、ｓｃＦｖベースの抗体、ダイアボディベースの抗体、及び重鎖抗体（例えば、ドメイン抗体、ナノボディ）が、挙げられる。
本発明はまた、ある特定のＶＨ及びＶＬ配列を有する、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体であって、ＶＨが第１のポリヌクレオチドにコードされており、ＶＬが第２のポリヌクレオチドにコードされている、抗体も提供する。ポリヌクレオチドは相補的デオキシ核酸（complementary deoxynucleic acid）（ｃＤＮＡ）であってよく、好適な宿主における発現のためにコドン最適化されていてもよい。コドン最適化はよく知られている技術である。
ポリヌクレオチド、ベクター、宿主細胞
本発明はまた、本発明の抗体のＶＨ、本発明の抗体のＶＬ、本発明の抗体の重鎖又は本発明の抗体の軽鎖をコードする、単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、配列番号４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６１又は６２のＶＨをコードする単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、配列番号６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１又は７２のＶＬをコードする単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、配列番号４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６１又は６２のＶＨ及び配列番号６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１又は７２のＶＬをコードする単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、配列番号８９、９０、９１、９２、９３、９４、９５、９６、９７、９８、９９、１００、１０２、１０３、１０４、１０５、１０６、１０７、１０８、１０９、１１０、１１１、１１２又は１１３のポリヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、配列番号１１４、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、１２２、１２３、１２４、１２５、１２７、１２８又は１２９の重鎖をコードする単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、配列番号１３０、１３１、１３２、１３３、１３４、１３５、１３６、１３７、１３８又は１３９の軽鎖をコードする単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、配列番号１１４、１１５、１１６、１１７、１１８、１１９、１２０、１２１、１２２、１２３、１２４、１２５、１２７、１２８又は１２９の重鎖及び配列番号１３０、１３１、１３２、１３３、１３４、１３５、１３６、１３７、１３８又は１３９の軽鎖をコードする単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明はまた、配列番号１４０、１４１、１４２、１４３、１４４、１４５、１４６、１４７、１４８、１４９、１５０、１５１、１５３、１５４、１５５、１５６、１５７、１５８、１５９、１６０、１６１、１６２、１６３、１６４又は１６５のポリヌクレオチド配列を含む単離されたポリヌクレオチドも提供する。
本発明の抗体のＶＨ若しくはＶＬ若しくはその抗原結合フラグメント、又は本発明の抗体の重鎖及び軽鎖をコードするポリヌクレオチド配列は、意図される宿主細胞におけるヌクレオチド配列の発現を可能にする、プロモーター又はエンハンサーなどの１つ以上の制御エレメントに作動可能に連結させることができる。ポリヌクレオチドはｃＤＮＡであってもよい。
本発明はまた、本発明のポリヌクレオチドを含むベクターも提供する。そのようなベクターは、プラスミドベクター、ウイルスベクター、バキュロウイルス発現用ベクター、トランスポゾンベースのベクター、又は任意の手段によって所与の生物又は遺伝子的バックグラウンドに本発明の合成ポリヌクレオチドを導入するのに適した任意の他のベクターであってよい。例えば、定常領域に連結されていてもよい本発明の抗体の軽鎖及び／又は重鎖可変領域をコードするポリヌクレオチドを、発現ベクターに挿入する。軽鎖及び／又は重鎖は、同じ又は異なる発現ベクターにおいてクローン化することができる。免疫グロブリン鎖をコードするＤＮＡセグメントは、免疫グロブリンポリペプチドの発現を確実にする発現ベクター中の調節配列に作動可能に連結することができる。そのような調節配列としては、シグナル配列、プロモーター（例えば、天然に付随する又は異種のプロモーター）、エンハンサーエレメント、及び転写終結配列が挙げられ、抗体を発現するように選択された宿主細胞と適合するように選択される。ベクターを適切な宿主に組み込んだら、組み込んだポリヌクレオチドがコードしているタンパク質を高レベルで発現させるのに適した条件下で宿主を維持する。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号８９のポリヌクレオチド及び配列番号１０４のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９０のポリヌクレオチド及び配列番号１０５のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９１のポリヌクレオチド及び配列番号１０５のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９２のポリヌクレオチド及び配列番号１０５のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９３のポリヌクレオチド及び配列番号１０６のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９４のポリヌクレオチド及び配列番号１０６のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９５のポリヌクレオチド及び配列番号１０６のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９６のポリヌクレオチド及び配列番号１０６のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９７のポリヌクレオチド及び配列番号１０６のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９８のポリヌクレオチド及び配列番号１０７のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９９のポリヌクレオチド及び配列番号１０８のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号１００のポリヌクレオチド及び配列番号１０９のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９８のポリヌクレオチド及び配列番号１１１のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９８のポリヌクレオチド及び配列番号１１２のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号９８のポリヌクレオチド及び配列番号１１３のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号１０２のポリヌクレオチド及び配列番号１１０のポリヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、ベクターは、配列番号１０３のポリヌクレオチド及び配列番号１１０のポリヌクレオチドを含む。
好適な発現ベクターは、典型的には、エピソームとして、又は宿主染色体ＤＮＡの不可欠な部分として、宿主生物において複製可能である。通常、発現ベクターは、所望のＤＮＡ配列で形質転換された細胞の検出を可能にするため、アンピシリン耐性、ヒグロマイシン耐性、テトラサイクリン耐性、カナマイシン耐性、又はネオマイシン耐性などの選択マーカーを含む。
好適なプロモーター及びエンハンサーエレメントは、当該技術分野において既知である。真核細胞での発現に関して、例示のプロモーターとしては、軽鎖及び／又は重鎖免疫グロブリン遺伝子プロモーター及びエンハンサーエレメント；サイトメガロウイルス最初期プロモーター；単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼプロモーター；ＳＶ４０初期及び後期プロモーター；レトロウイルス由来の長鎖末端反復配列に存在するプロモーター；マウスメタロチオネイン−Ｉプロモーター；並びに様々な既知の組織特異的プロモーターが挙げられる。適切なベクター及びプロモーターの選択は、当業者の技量の範囲内である。
使用され得る例示のベクターは、細菌：ｐＢｓ、ｐｈａｇｅｓｃｒｉｐｔ、ＰｓｉＸ１７４、ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔ ＳＫ、ｐＢｓ ＫＳ、ｐＮＨ８ａ、ｐＮＨ１６ａ、ｐＮＨ１８ａ、ｐＮＨ４６ａ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ，Ｌａ Ｊｏｌｌａ，Ｃａｌｉｆ．，ＵＳＡ）；ｐＴｒｃ９９Ａ、ｐＫＫ２２３−３、ｐＫＫ２３３−３、ｐＤＲ５４０、及びｐＲＩＴ５（Ｐｈａｒｍａｃｉａ，Ｕｐｐｓａｌａ，Ｓｗｅｄｅｎ）である。真核生物：ｐＷＬｎｅｏ、ｐＳＶ２ｃａｔ、ｐＯＧ４４、ＰＸＲ１、ｐＳＧ（Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ）ｐＳＶＫ３、ｐＢＰＶ、ｐＭＳＧ及びｐＳＶＬ（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）、ｐＥＥ６．４（Ｌｏｎｚａ）並びにｐＥＥ１２．４（Ｌｏｎｚａ）。
本発明はまた、本発明の１つ以上のベクターを含む宿主細胞も提供する。「宿主細胞」は、ベクターが導入された細胞を指す。「宿主細胞」という用語は、対象とする特定の細胞だけでなく、そのような細胞の子孫、また更に対象とする特定の細胞から作製された安定な細胞株も指すものと理解される。変異又は環境による影響のいずれかにより、後続世代においてある特定の改変が生じる可能性があるため、そのような子孫は親細胞と同一ではない可能性があるが、本明細書で使用される「宿主細胞」という用語の範囲内には依然として含まれる。そのような宿主細胞は、真核細胞、原核細胞、植物細胞、又は古細菌細胞であってよい。
原核宿主細胞の例は、大腸菌（Escherichia coli）、バチルス・スブチリス（Bacillus subtilis）などの桿菌、並びにサルモネラ属（Salmonella）、セラチア属（Serratia）、及び様々なシュードモナス属（Pseudomonas）の種などの他の腸内細菌科のものである。酵母などの他の微生物も発現に有用である。好適な酵母宿主細胞の例は、サッカロミセス属（Saccharomyces）（例えば、サッカロマイセス・セレビシエ（S. cerevisiae））及びピキア属（k）である。例示的な真核細胞は、哺乳動物、昆虫、鳥類又は他の動物起源のものであり得る。哺乳動物真核細胞としては、ハイブリドーマ又は骨髄腫細胞株などの不死化細胞株、例えばＳＰ２／０（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）、Ｍａｎａｓｓａｓ、ＶＡ、ＣＲＬ−１５８１）、ＮＳ０（Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅｓ（ＥＣＡＣＣ）、Ｓａｌｉｓｂｕｒｙ，Ｗｉｌｔｓｈｉｒｅ，ＵＫ、ＥＣＡＣＣ Ｎｏ．８５１１０５０３）、ＦＯ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１６４６）及びＡｇ６５３（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１５８０）マウス細胞株などが挙げられる。例示的なヒト骨髄腫細胞株は、Ｕ２６６（ＡＴＴＣ ＣＲＬ−ＴＩＢ−１９６）である。他の有用な細胞株としては、チャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞に由来するもの、例えばＣＨＯＫ１ＳＶ（Ｌｏｎｚａ Ｂｉｏｌｏｇｉｃｓ，Ｗａｌｋｅｒｓｖｉｌｌｅ，ＭＤ）、Ｐｏｔｅｌｌｉｇｅｎｔ（登録商標）ＣＨＯＫ２ＳＶ（Ｌｏｎｚａ）、ＣＨＯ−Ｋ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−６１）又はＤＧ４４などが挙げられる。
本発明はまた、本発明の抗体の製造方法であって、抗体が発現する条件下で本発明の宿主細胞を培養するステップと、宿主細胞によって産生された抗体を回収するステップと、を含む方法も提供する。抗体を製造して精製する方法は当該技術分野において周知である。合成されたら（化学的に又は組み換えによって）、全抗体、それらの二量体、個々の軽鎖及び／若しくは重鎖、又はＶＨ及び／若しくはＶＬなどの他の抗体フラグメントを、硫酸アンモニウム沈殿、親和性カラム、カラムクロマトグラフィー、高速液体クロマトグラフィー（ＨＰＬＣ）精製、ゲル電気泳動など（概して、Ｓｃｏｐｅｓ，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ（Ｓｐｒｉｎｇｅｒ−Ｖｅｒｌａｇ，Ｎ．Ｙ．，（１９８２）を参照されたい）の標準的な手順に従って精製することができる。対象抗体は、実質的に純粋、例えば、少なくとも純度約８０％〜８５％、少なくとも純度約８５％〜９０％、少なくとも純度約９０％〜９５％、又は少なくとも約９８％〜９９％、又はそれ以上の純度であり得、例えば、対象抗体以外の細胞残屑、巨大分子などの夾雑物を含まない。
本発明の別の実施形態は、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体の製造方法であって、
抗体のＶＨをコードしている第１のポリヌクレオチド及び抗体のＶＬをコードしている第２のポリヌクレオチドを発現ベクターに組み込むステップと、
宿主細胞を発現ベクターで形質転換させるステップと、
ＶＬ及びＶＨが発現し、抗体を生成する条件下で、培養培地中で宿主細胞を培養するステップと、
宿主細胞又は培養培地から抗体を回収するステップと、を含む方法である。
本発明のポリヌクレオチド配列は、標準的な分子生物学的方法を使用してベクターに組み込むことができる。宿主細胞の形質転換、培養、抗体発現、及び精製は、周知の方法を用いて行われる。
処置の方法
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、インビトロ及びインビボで、診断上の有用性、並びに治療及び予防上の有用性を有する。例えば、本発明の抗体を、培養中の細胞にインビトロ若しくはエクスビボで、又はがん及び感染性疾患などの様々な障害を処置、予防及び／若しくは診断する対象に、投与することができる。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体、例えば抗体Ｃ４０Ｍ６７、Ｃ４０Ｍ６６、Ｃ４０Ｍ６３、Ｃ４０Ｍ６２、Ｃ４０Ｍ５９、Ｃ４０Ｍ５８、Ｃ４０Ｍ５６、Ｃ４０Ｍ５５、Ｃ４０Ｍ５１、Ｃ４０Ｍ１８、Ｃ４０Ｍ１７、Ｃ４０Ｍ１２、Ｃ４０Ｍ１０２、Ｃ４０Ｍ１０３、Ｃ４０Ｍ１０４、Ｃ４０Ｍ１０５、Ｃ４０Ｍ１２１及びＣ４０Ｍ１２６を、ＣＤ４０シグナル伝達を強化することが治療上有効であり得、疾患の症状を低減し得る、任意の状態又は疾患を処置及び／又は予防するために使用することができる。
本発明の方法を用いて任意の動物分類に属する対象を処置することができる。処置され得る対象の例としては、ヒト、齧歯動物、イヌ、ネコ、及び家畜などの哺乳動物が挙げられる。
本発明の抗体はまた、このような処置のための薬剤を調製するのに有用であり得、薬剤は、本明細書に定められる投薬量で投与するために調製される。
本発明は、がんを処置する方法であって、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する治療有効量の本発明の単離されたアゴニスト抗体を、がんを処置するのに十分な時間にわたって、かかる抗体を必要とする対象に投与するステップを含む、方法を提供する。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体を用いて処置することができる対象は、脳腫瘍、肺がん、骨がん、膵がん、皮膚がん、頭頚部がん、皮膚若しくは眼球内黒色腫、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、肛門部がん、胃がん（stomach cancer、gastric cancer）、結腸直腸がん、結腸がん、婦人科腫瘍（例えば、子宮肉腫、卵管癌、子宮内膜癌、子宮頚部癌、膣癌又は外陰癌）、食道がん、小腸がん、内分泌系がん（例えば、甲状腺、副甲状腺又は副腎のがん）、軟部組織肉腫、白血病、骨髄腫、多発性骨髄腫、尿道がん、陰茎がん、前立腺がん、慢性若しくは急性白血病、小児固形腫瘍、リンパ球性リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、膀胱がん、肝がん、腎がん、腎臓若しくは尿管がん（例えば、腎細胞癌、腎盂癌）、又は中枢神経系新生物（例えば、原発性ＣＮＳリンパ腫、脊髄軸（spinal axis）腫瘍、脳幹神経膠腫又は下垂体腺腫）、神経膠腫又は線維肉腫を有すると診断されている対象である。
本発明はまた、固形腫瘍を処置する方法であって、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する治療有効量の本発明の単離されたアゴニスト抗体を、固形腫瘍を処置するのに十分な時間にわたって、かかる抗体を必要とする対象に投与するステップを含む、方法を提供する。
本発明はまた、血液学的悪性疾患を処置する方法であって、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する治療有効量の本発明の単離されたアゴニスト抗体を、血液学的悪性疾患を処置するのに十分な時間にわたって、かかる抗体を必要とする対象に投与するステップを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、前立腺がん、乳がん、結腸直腸がん、膵がん、卵巣がん、肺がん、子宮頚部がん、横紋筋肉腫、神経芽腫、黒色腫、膀胱がん、又は頭頚部がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、黒色腫である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、肺がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、扁平上皮非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、非扁平上皮ＮＳＣＬＣである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、肺腺癌である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、腎細胞癌（ＲＣＣ）（例えば、腎明細胞癌又は腎乳頭状細胞癌）、又はその転移巣である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、中皮腫である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、上咽頭癌（ＮＰＣ）である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、結腸直腸がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、前立腺がん又は去勢抵抗性前立腺がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、胃がん（stomach cancer）である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、卵巣がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、胃がん（gastric cancer）である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、肝がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、膵がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、甲状腺がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、頭頚部扁平上皮癌である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、食道又は胃腸管の癌である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、乳がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、卵管がんである。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、脳腫瘍である。
いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、尿道がんである。
本発明はまた、免疫応答を増強する方法であって、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する治療有効量の本発明の単離されたアゴニスト抗体を、免疫応答を増強するのに十分な時間にわたって、かかる抗体を必要とする対象に投与するステップを含む、方法を提供する。
「処置する」又は「処置」は、腫瘍若しくは腫瘍細胞の発生若しくは広がりなどの好ましくない生理学的変化又は疾患を遅らせる（減らす）こと、又は処置の間、有益な若しくは望ましい臨床転帰をもたらすことを目的とした、治療的処置を指す。有益な又は望ましい臨床転帰としては、感知可能であるか感知不可能であるかにかかわらず、症状の軽減、疾患の程度の減少、疾患状態の安定化（すなわち、悪化しないこと）、疾患進行を遅らせること若しくは鈍化させること、転移がないこと、疾患状態の改善若しくは緩和、及び寛解（部分寛解又は完全寛解のいずれであっても）が挙げられる。「処置」はまた、対象が処置を受けなかった場合に予想される生存期間と比較して、生存期間を延長させることを意味し得る。処置を必要とする対象としては、好ましくない生理学的変化又は疾患をすでに有する対象、並びに前述の生理学的変化又は疾患を有する傾向がある対象が挙げられる。
「増殖を阻害する」（例えば腫瘍細胞に関して）は、治療薬又は治療薬の組み合わせと接触させたときの、前述の治療薬の非存在下での同じ腫瘍細胞又は腫瘍組織の増殖と比較した場合の、インビトロ又はインビボでの腫瘍細胞増殖又は腫瘍組織の測定可能な減少を指す。インビトロ又はインビボでの腫瘍細胞又は腫瘍組織の増殖阻害は、少なくとも約１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、９９％、又は１００％であり得る。
「治療有効量」は、必要な投薬量及び期間で所望の治療結果を得るための有効量を指す。治療有効量は、個体の疾患状態、年齢、性別、及び体重、並びに治療薬又は治療薬の組み合わせがその個体において所望の応答を引き出す能力などの因子によって様々であり得る。有効な治療薬又は治療薬の組み合わせの指標の例としては、例えば、患者のウェルビーイング（well-being）の改善、腫瘍量の減少、腫瘍増殖の停止若しくは鈍化、及び／又は体内の他の場所へのがん細胞の転移がないことが挙げられる。
本発明はまた、対象において免疫応答を増強する方法であって、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する治療有効量のアゴニスト抗体を、免疫応答を増強するのに十分な時間にわたって、かかる抗体を必要とする対象に投与するステップを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、対象は、免疫不全状態である。
いくつかの実施形態では、対象は、免疫不全状態になるリスクがある。免疫不全状態の対象は、化学療法又は放射線療法を受けている途中であっても、又は過去に受けていてもよい。
いくつかの実施形態では、対象は、感染の結果として免疫不全状態であるか、又はそのリスクがある。
いくつかの実施形態では、対象は、ウイルス感染を有する。
本発明はまた、ウイルス感染を処置する方法であって、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する治療有効量の本発明の単離されたアゴニスト抗体を、ウイルス感染を処置するのに十分な時間にわたって、かかる抗体を必要とする対象に投与するステップを含む、方法を提供する。
投与／医薬組成物
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、抗体と薬学的に許容される担体とを含む好適な医薬組成物の状態で提供することができる。担体は、ＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体と一緒に投与される賦形剤、アジュバント、添加剤、又はビヒクルであり得る。そのようなビヒクルは、水、及び石油、動物、植物、又は合成物起源のものを含む油、例えば落花生油、大豆油、鉱物油、ゴマ油などの液体であってよい。例えば、０．４％生理食塩水及び０．３％グリシンを用いることができる。これらの溶液は滅菌されており、一般には粒子状物質を含まない。これらは、通常の周知の滅菌技術（例えば、濾過）によって滅菌することができる。組成物は、生理学的条件に近づけるために必要とされる薬学的に許容される補助物質、例えばｐＨ調製剤及び緩衝剤、安定化剤、増粘剤、滑剤並びに着色剤などを含有し得る。そのような医薬製剤中の本発明の分子又は抗体の濃度は、幅広く異なっていてもよく、すなわち、約０．５重量％未満から、通常は少なくとも約１重量％まで、最大で１５又は２０重量％、２５重量％、３０重量％、３５重量％、４０重量％、４５重量％、又は５０重量％までであってよく、選択される特定の投与方法に従って、必要とされる用量、流体体積、粘度などに主に基づいて選択される。好適なビヒクル及び製剤（他のヒトタンパク質、例えばヒト血清アルブミンを含む）は、例えば、Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ，２１st Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｔｒｏｙ，Ｄ．Ｂ．ｅｄ．，Ｌｉｐｉｎｃｏｔｔ Ｗｉｌｌｉａｍｓ ａｎｄ Ｗｉｌｋｉｎｓ，Ｐｈｉｌａｄｅｌｐｈｉａ，ＰＡ ２００６，Ｐａｒｔ ５，Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ ｐｐ ６９１〜１０９２に記載されており、特にｐｐ．９５８〜９８９を参照されたい。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体の投与方法は、非経口投与、例えば、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内若しくは皮下、経粘膜投与（経口、鼻腔内、膣内、直腸内）又は当該技術分野において知られている当業者に理解されている他の手段などの、任意の好適な経路であり得る。ＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、既知の方法を使用して、腫瘍内に局所送達するために、リンパ節流入部位に腫瘍内投与することができる。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、任意の好適な経路によって、例えば、静脈内（ｉ．ｖ．）注入若しくはボーラス注入によって非経口的に（parentally）、筋肉内若しくは皮下に、又は腹腔内に、患者に対して投与することができる。ｉ．ｖ．注入は、例えば１５、３０、６０、９０、１２０、１８０又は２４０分間にわたって、又は１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１又は１２時間以上、行うことができる。
患者に投与される用量は、処置している疾患を軽減するか又は少なくとも部分的に停止させるのに十分なもの（「治療有効量」）であり、場合によっては、０．００５ｍｇ〜約１００ｍｇ／ｋｇ、例えば約０．０５ｍｇ〜約３０ｍｇ／ｋｇ又は約５ｍｇ〜約２５ｍｇ／ｋｇ、又は約４ｍｇ／ｋｇ、約８ｍｇ／ｋｇ、約１６ｍｇ／ｋｇ又は約２４ｍｇ／ｋｇ、又は例えば約１、２、３、４、５、６、７、８、９又は１０ｍｇ／ｋｇであり得るが、更に多量、例えば約１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０又は１００ｍｇ／ｋｇであってもよい。
固定単位用量、例えば、５０、１００、２００、５００又は１０００ｍｇを投与してもよく、又は用量は、患者の体表面積に基づいて、例えば、５００、４００、３００、２５０、２００、又は１００ｍｇ／ｍ2であってもよい。通常、１〜８用量（例えば、１、２、３、４、５、６、７、又は８）を投与してＡＬを処置するが、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０用量、又はそれ以上を投与してもよい。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体の投与は、１日、２日、３日、４日、５日、６日、１週間、２週間、３週間、１か月、５週間、６週間、７週間、２か月、３か月、４か月、５か月、６か月又はそれ以上後に反復することができる。治療クールの反復も可能であり、長期投与も同様に可能である。反復投与は、同一用量であってもよく、又は異なる用量であってもよい。例えば、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、静脈内注入により、８週間にわたって１週間ごとに８ｍｇ／ｋｇ又は１６ｍｇ／ｋｇで投与し、その後、更に１６週間にわたって２週間ごとに８ｍｇ／ｋｇ又は１６ｍｇ／ｋｇで投与し、その後、４週間ごとに８ｍｇ／ｋｇ又は１６ｍｇ／ｋｇで投与することができる。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体は、維持療法によって、例えば、１週間に１回、６か月以上にわたって、投与されてもよい。
例えば、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、１日当たり約０．１〜１００ｍｇ／ｋｇ、例えば０．５、０．９、１．０、１．１、１．５、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、４０、４５、５０、６０、７０、８０、９０又は１００ｍｇ／ｋｇの量の１日投薬量として、処置の開始後１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、又は４０日目のうちの少なくとも１日に、又は代替として、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９又は２０週目のうちの少なくとも１週に、又はこれらの任意の組み合わせで、２４、１２、８、６、４、又は２時間ごとの単一用量又は分割用量を使用して、又はこれらの任意の組み合わせで、提供され得る。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体はまた、がんの発症リスクを低減するため、がん進行におけるイベント発生の開始を遅らせるため、かつ／又はがんが寛解状態にある場合に再発リスクを低減するために、予防的に投与することもできる。これは、他の生物学的要因のために、存在することが分かっている腫瘍の位置を特定することが難しい患者において特に有用であり得る。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体は、保管のために凍結乾燥し、使用前に好適な担体で再構成することができる。この技術は、通常のタンパク質調製物に関して有効であることが示されており、周知の凍結乾燥及び再構成技術を用いることができる。
併用療法
本発明は、がんを有する対象を処置する方法であって、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する治療有効量の本発明のアゴニスト抗体を、第２の治療剤と組み合わせて投与するステップを含む、方法を提供する。
第２の治療剤は、阻害剤などの免疫チェックポイントモジュレーター、例えばＰＤ−１、ＰＤ−Ｌ１、ＣＴＬＡ−４、ＬＡＧ−３又はＴＩＭ−３に特異的に結合する抗アゴニスト抗体などであり得る。
第２の治療剤はまた、Ｔ細胞活性化分子のアゴニスト、例えば４−ＩＢＢ、ＣＤ２７、ＩＣＯＳ、又は０Ｘ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体であり得る。
第２の治療剤はまた、インドールアミン２，３−ジオキシゲナーゼ酵素の阻害剤であり得る。
使用され得る例示の抗ＰＤ−１抗体は、ＯＰＶＩＤＯ（登録商標）（ニボルマブ）及びＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標）（ペムブロリズマブ）である。ＫＥＹＴＲＵＤＡ（登録商標）（ペムブロリズマブ）は、例えば米国特許第８，３５４，５０９号に記載されており、配列番号１６６のＶＨ及び配列番号１６７のＶＬを含む。ＯＰＶＩＤＯ（登録商標）（ニボルマブ）は、例えば米国特許第８，００８，４４９号に記載されており（抗体５Ｃ４）、配列番号１６８のＶＨ及び配列番号１６９のＶＬを含む。ニボルマブ及びペムブロリズマブのアミノ酸配列もまた、ＣＡＳレジストリから入手可能である。使用され得る更なるＰＤ−１抗体は、米国特許第７，３３２，５８２号、米国特許出願公開第２０１４／００４４７３８号、国際公開第２０１４／１７９６６号及び米国特許出願公開第２０１４／０３５６３６３号に記載されている。
配列番号１６６
ＱＶＱＬＶＱＳＧＶＥＶＫＫＰＧＡＳＶＫＶＳＣＫＡＳＧＹＴＦＴＮＹＹＭＹＷＶＲＱＡＰＧＱＧＬＥＷＭＧＧＩＮＰＳＮＧＧＴＮＦＮＥＫＦＫＮＲＶＴＬＴＴＤＳＳＴＴＴＡＹＭＥＬＫＳＬＱＦＤＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＤＹＲＦＤＭＧＦＤＹＷＧＱＧＴＴＶＴＶＳＳ
配列番号１６７
ＥＩＶＬＴＱＳＰＡＴＬＳＬＳＰＧＥＲＡＴＬＳＣＲＡＳＫＧＶＳＴＳＧＹＳＹＬＨＷＹＱＱＫＰＧＱＡＰＲＬＬＩＹＬＡＳＹ
ＬＥＳＧＶＰＡＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣＱＨＳＲＤＬＰＬＴＦＧＧＧＴＫＶＥＩＫ
配列番号１６８
ＱＶＱＬＶＥＳＧＧＧＶＷＱＰＧＲＳＬＲＬＤＣＫＡＳＧＩＴＦＳＮＳＧＭＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＶＩＷＹＤＧＳＫＲＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＦＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＴＮＤＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ
配列番号１６９
ＥＩＶＬＴＱＳＰＡＴＬＳＬＳＰＧＥＲＡＴＬＳＣＲＡＳＱＳＶＳＳＹＬＡＷＹＱＱＫＰＧＱＡＰＲＬＬＩＹＤＡＳＮＲＡＴＧ
ＩＰＡＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣＱＱＳＳＮＷＰＲＴＦＧＱＧＴＫＶＥＩＫ
使用され得る例示の抗ＰＤ−Ｌ１抗体は、デュルバルマブ、アテゾリズマブ及びアベルマブ、並びに例えば米国特許出願公開第２００９／００５５９４４号、米国特許第８，５５２，１５４号、米国特許第８，２１７，１４９号及び米国特許第８，７７９，１０８号に記載されているものである。デュルバルマブは、配列番号１７０のＶＨ及び配列番号１７１のＶＬを含む。アテゾリズマブは、配列番号１７２のＶＨ及び配列番号１７３のＶＬを含む。アベルマブは、配列番号１７４のＶＨ及び配列番号１７５のＶＬを含む。
配列番号１７０
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧ ＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＲＹＷＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＮ ＩＫＱＤＧＳＥＫＹＹＶＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＡＫＮＳＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＥＧ ＧＷＦＧＥＬＡＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ
配列番号１７１
ＥＩＶＬＴＱＳＰＧＴＬＳＬＳＰＧＥＲＡＴＬＳＣＲＡＳＱＲＶＳＳＳＹＬＡＷＹＱＱＫ ＰＧＱＡＰＲＬＬＩＹ
ＤＡＳＳＲＡＴＧＩＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＲＬＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣＱＱＹＧＳＬＰＷＴＦＧ
ＱＧＴＫＶＥＩＫ
配列番号１７２
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＤＳＷＩＨＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＡＷ
ＩＳＰＹＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＡＤＴＳＫＮＴＡＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＲＨ
ＷＰＧＧＦＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ
配列番号１７３
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＤＶＳＴＡＶＡＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＳ
ＡＳＦＬＹＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＹＬＹＨＰＡＴＦＧＱ
ＧＴＫＶＥＩＫ
配列番号１７４
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＳＹＩＭＭＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＳ
ＩＹＰＳＧＧＩＴＦＹＡＤＴＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲＩＫ
ＬＧＴＶＴＴＶＤＹＷＧＱＧＴＬＶＴＶＳＳ
配列番号１７５
ＱＳＡＬＴＱＰＡＳＶＳＧＳＰＧＱＳＩＴＩＳＣＴＧＴＳＳＤＶＧＧＹＮＹＶＳＷＹＱＱＨＰＧＫＡＰＫＬＭＩ
ＹＤＶＳＮＲＰＳＧＶＳＮＲＦＳＧＳＫＳＧＮＴＡＳＬＴＩＳＧＬＱＡＥＤＥＡＤＹＹＣＳＳＹＴＳＳＳＴＲＶ
ＦＧＴＧＴＫＶＴＶＬ
第２の治療剤は、化学療法薬又は当業者に既知の他の抗がん治療薬のうちのいずれか１つ以上であり得る。化学療法剤は、アルキル化剤、代謝拮抗物質、抗微小管阻害剤（anti-microtubule inhibitor）、トポイソメラーゼ阻害剤、受容体チロシンキナーゼ阻害剤、及び血管新生阻害剤などを含む。化学療法剤の例としては、アルキル化剤、例えばチオテパ及びシクロホスファミド（ＣＹＴＯＸＡＮ（登録商標））など；アルキルスルホネート、例えばブスルファン、インプロスルファン及びピポスルファンなど；アジリジン、例えばベンゾドパ（benzodopa）、カルボコン、メツレドパ（meturedopa）、及びウレドパ（uredopa）など；アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホルアミド（trietylenephosphoramide）、トリエチレンチオホスホルアミド（triethylenethiophosphaoramide）及びトリメチロールメラミン（trimethylolomelamine）を含むエチレンイミン及びメチラメラミン（methylamelamine）；ナイトロジェンマスタード、例えばクロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド（cholophosphamide）、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノベムビチン（novembichin）、フェネステリン（phenesterine）、プレドニムスチン、トロホスファミド（trofosfamide）、ウラシルマスタードなど；ニトロソウレア（nitrosurea）、例えばカルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン（fotemustine）、ロムスチン、ニムスチン、ラニムスチンなど；抗生物質、例えばアクラシノマイシン（aclacinomysin）、アクチノマイシン、アウトラマイシン（authramycin）、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カリチェアミシン（calicheamicin）、カラビシン（carabicin）、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン（detorubicin）、６−ジアゾ−５−オキソ−Ｌ−ノルロイシン、ドキソルビシン、エピルビシン、エソルビシン（esorubicin）、イダルビシン、マルチェロマイシン、マイトマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン（potfiromycin）、ピューロマイシン、クエラマイシン（quelamycin）、ロドルビシン（rodorubicin）、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシンなど；代謝拮抗物質、例えばメトトレキサート及び５−ＦＵなど；葉酸類似体、例えばデノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサートなど；プリン類似体、例えばフルダラビン、６−メルカプトプリン、チアミプリン（thiamiprine）、チオグアニンなど；ピリミジン類似体、例えばアンシタビン、アザシチジン、６−アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジンなど；アンドロゲン、例えばカルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトンなど；抗副腎薬（anti-adrenal）、例えばアミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタンなど；葉酸補充物（folic acid replenisher）、例えばフォリン酸（frolinic acid）など；アセグラトン；アルドホスファミドグリコシド；アミノレブリン酸；アムサクリン、ベストラブシル（bestrabucil）；ビサントレン（bisantrene）；エダトラキサート（edatraxate）；デフォファミン（defofamine）；デメコルシン；ジアジクオン、エルフォルニチン（elfornithine）；エリプチニウムアセテート（elliptinium acetate）；エトグルシド；硝酸ガリウム；ヒドロキシウレア；レンチナン；ロニダミン（lonidamine）；ミトグアゾン（mitoguazone）；ミトキサントロン；モピダモール（mopidamol）；ニトラクリン（nitracrine）；ペントスタチン；フェナメット（phenamet）；ピラルビシン；ポドフィリン酸；２−エチルヒドラジド；プロカルバジン；ＰＳＫ（登録商標）；ラゾキサン；シゾフィラン；スピロゲルマニウム（spirogermanium）；テヌアゾン酸；トリアジクオン（triaziquone）；２，２’，２”−トリクロロトリエチルアミン；ウレタン；ビンデシン、ダカルバジン、マンノムスチン；ミトブロニトール；ミトラクトール；ピポブロマン；ガシトシン（gacytosine）；アラビノシド（「Ａｒａ−Ｃ」）；シクロホスファミド；チオテパ；タキソイド又はタキサンファミリーのメンバー、例えばパクリタキセル（ＴＡＸＯＬ（登録商標）ドセタキセル（ＴＡＸＯＴＥＲＥ（登録商標））及びその類似体；クロラムブシル、ゲムシタビン、６−チオグアニン；メルカプトプリン、メトトレキサート、白金類似体、例えばシスプラチン及びカルボプラチンなど；ビンブラスチン；白金；エトポシド（ＶＰ−１６）；イホスファミド、マイトマイシンＣ；ミトキサントロン；ビンクリスチン；ビノレルビン；ナベルビン；ノバントロン；テニポシド；ダウノマイシン；アミノプテリン；ゼローダ；イバンドロネート；ＣＰＴ−１１；トポイソメラーゼ阻害剤ＲＦＳ ２０００；ジフルオロメチルオルニチン（ＤＭＦＯ）；レチノイン酸；エスペラミシン；カペシタビン；ソラフェニブ（ＮＥＸＡＶＡＲ（登録商標））、スニチニブ（ＳＵＴＥＮＴ（登録商標））、パゾパニブ（ＶＯＴＲＩＥＮＴ（商標））、トセラニブ（ＰＡＬＬＡＤＩＡ（商標））、バンデタニブ（ＺＡＣＴＩＭＡ（商標））、セジラニブ（ＲＥＣＥＮＴＩＮ（登録商標））、レゴラフェニブ（ＢＡＹ ７３−４５０６）、アキシチニブ（ＡＧ０１３７３６）、レスタウルチニブ（ＣＥＰ−７０１）、エルロチニブ（ＴＡＲＣＥＶＡ（登録商標））、ゲフィチニブ（ＩＲＥＳＳＡ（商標））、ＢＩＢＷ ２９９２（ＴＯＶＯＫ（商標））、ラパチニブ（ＴＹＫＥＲＢ（登録商標））、及びネラチニブ（ＨＫＩ−２７２）などを含む受容体チロシンキナーゼ及び／又は血管新生阻害剤、並びに、上述のいずれかの薬学的に許容される塩、酸又は誘導体が挙げられる。腫瘍に対するホルモン作用を制御又は阻害するように作用する抗ホルモン剤、例えばタモキシフェン、ラロキシフェン、アロマターゼ阻害４（５）−イミダゾール、４−ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン（trioxifene）、ケオキシフェン（keoxifene）、ＬＹ １１７０１８、オナプリストン（onapristone）、及びトレミフェン（ＦＡＲＥＳＴＯＮ（登録商標））を含む抗エストロゲン薬など；並びに抗アンドロゲン薬、例えばフルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、ロイプロリド及びゴセレリン；並びに上述のいずれかの薬学的に許容される塩、酸又は誘導体もまた、この定義に含まれる。Ｗｉｅｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，１９８５，Ｍｅｄｉｃａｌ Ｏｎｃｏｌｏｇｙ（Ｃａｌａｂｒｅｓｉ ｅｔ ａＬ，ｅｄｓ．），Ｃｈａｐｔｅｒ １０，ＭｃＭｉｌｌａｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇに記載されているような他の一般的な細胞毒性化合物もまた、本発明の方法に適用可能である。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体と組み合わせて使用することができる薬剤の例としては、チロシンキナーゼ阻害剤及び標的抗がん治療薬、例えばＩｒｅｓｓａ（登録商標）（ゲフィチニブ）及びＴａｒｃｅｖａ（エルロチニブ）並びにＨＥＲ２、ＨＥＲ３、ＨＥＲ４又はＶＥＧＦの他のアンタゴニストが挙げられる。ＨＥＲ２アンタゴニストの例としては、ＣＰ−７２４−７１４、ＨＥＲＣＥＰＴＩＮ（商標）（トラスツズマブ）、ＯＭＮＩＴＡＲＧ（商標）（ペルツズマブ）、ＴＡＫ−１６５、ラパチニブ（ＥＧＦＲ及びＨＥＲ２阻害剤）、及びＧＷ−２８２９７４が挙げられる。ＨＥＲ３アンタゴニストの例としては、抗Ｈｅｒ３抗体が挙げられる（例えば、米国特許出願公開第２００４／０１９７３３２号を参照されたい）。ＨＥＲ４アンタゴニストの例としては、抗ＨＥＲ４ ｓｉＲＮＡが挙げられる（例えば、Ｍａａｔｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ Ｃｅｌｌ １７：６７〜７９，２００６を参照されたい）。ＶＥＧＦアンタゴニストの例としては、ベバシズマブ（Ａｖａｓｔｉｎ（商標））が挙げられる。
本発明のＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体と組み合わせて使用することができる治療剤の例としては、固形腫瘍のための標準治療薬（standard of care drugs）が挙げられる。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体と第２の治療剤との組み合わせは、任意の好都合な時間枠にわたって投与することができる。例えば、ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体及び第２の治療剤は、同じ日に、更には同じ静脈内注入において、対象に投与することができる。しかしながら、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体及び第２の治療剤はまた、隔日で又は隔週若しくは隔月などで投与することもできる。ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体及び第２の治療剤は、処置されている患者において検出可能なレベルでそれらが同時に存在する（例えば、血清中に）ように、時間的に十分に近接して投与することができる。ある期間にわたる数用量からなるヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体を用いた処置の完全な１クールの後又は前に、数用量からなる第２の治療剤を用いた処置のクールが行われる。ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体と第２の治療剤の投与の間に、１日、２日若しくは数日又は数週間の回復期を置いてもよい。
ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体又はヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアゴニスト抗体と第２の治療剤との組み合わせは、放射線外照射治療、強度変調放射線治療（ＩＭＲＴ）、集中照射を含む任意の形態の放射線療法、並びに、ガンマナイフ、サイバーナイフ（Cyberlaiife）、ライナック（Linac）を含む任意の形態の放射線手術、並びに組織内照射（例えば放射性シードの埋め込み、ＧｌｉａＳｉｔｅバルーン）と一緒に、並びに／又は外科手術と一緒に投与されてもよい。
用いられ得る集中照射方法としては、定位放射線手術、分割定位放射線手術、及び強度変調放射線治療（ＩＭＲＴ）が挙げられる。定位放射線手術では、周囲の腫瘍ではない正常な組織を避けながら、放射線が腫瘍組織、例えば脳腫瘍に正確に送達されることが明らかである。定位放射線手術により適用される放射線の線量は異なり得るが、典型的には、１Ｇｙ〜約３０Ｇｙであり、例えば１〜５、１０、１５、２０、２５、最大３０Ｇｙの線量を含む中間の範囲を含み得る。非侵襲的な固定デバイスのおかげで、定位放射線は、１回の処置で送達される必要はない。処置計画は、その日ごとに確実に再現され得、それにより、複数回の分割放射線量を送達することが可能となる。時間をかけて腫瘍を処置するために使用される場合、放射線手術は、「分割定位放射線手術」又はＦＳＲと呼ばれる。対照的に、定位放射線手術は、１回のセッションでの処置を指す。分割定位放射線手術は、高い治療可能比（therapeutic ratio）、すなわち、高い比率で腫瘍細胞を死滅させ、かつ正常組織への影響が少ないこと、をもたらし得る。腫瘍及び正常組織は、高い放射線量の単回照射与と低い放射線量の複数回照射に対して、異なる反応を示す。多量の放射線量の単回照射では、低い放射線量の複数回照射よりも多くの正常組織が死滅し得る。したがって、低い放射線量の複数回照射では、正常組織を温存しながらより多くの腫瘍細胞を死滅させることができる。分割定位照射により適用される放射線量は、１Ｇｙ〜約５０Ｇｙの範囲で様々であり得、例えば、１〜５、１０、１５、２０、２５、３０、４０、最大５０Ｇｙの寡分割（hypofractionated）線量を含む中間の範囲を含み得る。強度変調放射線治療（ＩＭＲＴ）もまた使用することができる。ＩＭＲＴは、高精度三次元原体照射法（３ＤＣＲＴ）の改良型であり、これは、コンピュータ制御の線形加速器を使用して正確な放射線量を悪性腫瘍又は腫瘍内部の特定の部位に送達し、多葉コリメーター（ＭＬＣ）を使用して、各放射線ビームの輪郭を、ビーム視点（beam's eye view）（ＢＥＶ）から標的の輪郭に合うように形成し、それにより多数のビームを生成する。ＩＭＲＴでは、放射線ビームの強度を複数の少量に変調することにより、放射線量を、腫瘍の三次元（３Ｄ）形状に対しより精密に一致させることができる。したがって、ＩＭＲＴでは、周囲の正常で重要な構造への線量を最小化しながら、より高い放射線量を腫瘍内部の領域に集中させることができる。ＩＭＲＴでは、例えば、腫瘍が脆弱な構造、例えば、脊髄、主要臓器、又は血管などを覆っている場合、処置体積を腫瘍の凹んだ形状に一致させる能力が向上する。
抗イディオタイプ抗体
本発明は、本発明の抗体に結合する抗イディオタイプ抗体を提供する。
本発明はまた、配列番号４８のＶＨ及び配列番号６３のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号４９のＶＨ及び配列番号６４のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５０のＶＨ及び配列番号６４のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５１のＶＨ及び配列番号６４のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５２のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５３のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５４のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５５のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５５のＶＨ及び配列番号６５のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５７のＶＨ及び配列番号６６のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５８のＶＨ及び配列番号６７のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５９のＶＨ及び配列番号６８のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５７のＶＨ及び配列番号７０のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５７のＶＨ及び配列番号７１のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号５７のＶＨ及び配列番号７２のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号６１のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
本発明はまた、配列番号６２のＶＨ及び配列番号６９のＶＬを含む抗体に特異的に結合する抗イディオタイプ抗体も提供する。
抗イディオタイプ（Ｉｄ）抗体は、抗体の抗原決定基（例えばパラトープ又はＣＤＲ）を認識する抗体である。Ｉｄ抗体は、抗原をブロッキングするものであっても、しないものであってもよい。抗原をブロッキングするＩｄを使用して、サンプル中の遊離抗体（例えば、本明細書に記載の本発明のＣＤ４０抗体）を検出することができる。ブロッキングしないＩｄを使用して、サンプル中の全抗体（遊離しているもの、抗原に一部結合しているもの、又は抗原に完全に結合しているもの）を検出することができる。Ｉｄ抗体は、抗Ｉｄが調製されている抗体で動物を免疫することによって調製することができる。
抗Ｉｄ抗体を、更に別の動物で免疫応答を誘導する免疫原として使用して、いわゆる抗−抗Ｉｄ抗体を製造することもできる。抗−抗Ｉｄは、抗Ｉｄを誘導した元のｍＡｂとエピトープが同一であり得る。したがって、ｍＡｂのイディオタイプ決定基に対する抗体を使用することによって、同じ特異性の抗体を発現する他のクローンを同定することが可能である。抗Ｉｄ抗体は多様であってよく（それにより抗Ｉｄ抗体変異体を産生する）、かつ／又は任意の好適な技術で誘導体化されていてもよい。
免疫複合体
「免疫複合体（immunoconjugate）」は、１つ以上の異種分子とコンジュゲートした本発明の抗体を指す。
いくつかの実施形態では、本発明の抗体は、１種以上の細胞毒性剤又は造影剤とコンジュゲートしている。
細胞毒性剤の例としては、化学療法剤若しくは薬、増殖阻害剤、毒素（例えば、タンパク質毒素、細菌、真菌、植物若しくは動物起源の酵素活性を有する毒素、又はこれらのフラグメント）、及び放射性核種が挙げられる。
細胞毒性剤は、１種以上の薬物、例えばメイタンシノイド（例えば、米国特許第５，２０８，０２０号、同第５，４１６，０６号を参照）、アウリスタチン、例えばモノメチルアウリスタチン薬物部分ＤＥ及びＤＦ（ＭＭＡＥ及びＭＭＡＦ）（例えば、米国特許第５，６３５，４８３号及び同第５，７８０，５８８号及び同第７，４９８，２９８号を参照）、ドラスタチン、カリチェアミシン又はこれらの誘導体（例えば、米国特許第５，７１２，３７４号、同第５，７１４，５８６号、同第５，７３９，１１６号、同第５，７６７，２８５号、同第５，７７０，７０１号、同第５，７７０，７１０号、同第５，７７３，００１号、及び同第５，８７７，２９６号；Ｈｉｎｍａｎ ｅｔ ａｌ．，（１９９３）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５３：３３３６〜３３４２；ａｎｄ Ｌｏｄｅ ｅｔ ａｌ．，（１９９８）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５８：２９２５〜２９２８を参照）；アントラサイクリン、例えばダウノマイシン又はドキソルビシンなど（例えば、Ｋｒａｔｚ ｅｔ ａｌ．，（２００６）Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ １３：４７７〜５２３；Ｊｅｆｆｒｅｙ ｅｔ ａｌ．，（２００６）Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ ＆ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ Ｌｅｔｔｅｒｓ １６：３５８〜３６２；Ｔｏｒｇｏｖ ｅｔ ａｌ．，（２００５）Ｂｉｏｃｏｎｊ Ｃｈｅｍ １６：７１７〜７２１；Ｎａｇｙ ｅｔ ａｌ．，（２０００）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ９７：８２９〜８３４；Ｄｕｂｏｗｃｈｉｋ ｅｔ ａｌ，Ｂｉｏｏｒｇ．＆ Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔｅｒｓ １２：１５２９〜１５３２（２００２）；Ｋｉｎｇ ｅｔ ａｌ．，（２００２）Ｊ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ ４５：４３３６〜４３４３；並びに米国特許第６，６３０，５７９号を参照）、メトトレキサート、ビンデシン、タキサン、例えば、ドセタキセル、パクリタキセル、ラロタキセル、テセタキセル、及びオルタタキセルなどであり得る。
細胞毒性剤はまた、酵素活性を有する毒素又はそのフラグメント、例えばジフテリアＡ鎖、ジフテリア毒素の非結合性活性フラグメント、外毒素Ａ鎖（緑膿菌（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ）由来）、リシンＡ鎖、モデシン（modeccin）Ａ鎖、α−サルシン、シナアブラギリ（Ａｌｅｕｒｉｔｅｓ ｆｏｒｄｉｉ）タンパク質、ジアンチン（dianthin）、ヨウシュヤマゴボウ（Ｐｈｙｔｏｌａｃｃａ ａｍｅｒｉｃａｎａ）タンパク質（ＰＡＰＩ、ＰＡＰＩＩ、及びＰＡＰ−Ｓ）、ツルレイシ（ｍｏｍｏｒｄｉｃａ ｃｈａｒａｎｔｉａ）阻害剤、クルシン、クロチン、サボンソウ（ｓａｐａｏｎａｒｉａ ｏｆｆｉｃｉｎａｌｉｓ）阻害剤、ゲロニン、ミトゲリン（mitogellin）、レストリクトシン、フェノマイシン（phenomycin）、エノマイシン（enomycin）、及びトリコテセンであってもよい。
細胞毒性剤又は造影剤はまた、放射性核種であってもよい。放射性核種の例としては、Ａｃ−２２５、Ａｔ−２１１、１−１３１、Ｉ−１２５、Ｙ−９０、Ｒｅ−１８６、Ｒｅ−１８８、Ｓｍ−１５３、Ｂｉ−２１２、Ｐ−３２、Ｐｂ−２１２及びＬｕの放射性同位体が挙げられる。検出のために放射性複合体を使用する場合、放射性複合体は、シンチグラフィー試験のための放射性原子、例えばＴｃ−９９ｍ若しくはＩ−１２３、又は核磁気共鳴（ＮＭＲ）映像法（磁気共鳴映像法、ＭＲＩとしても知られている）のためのスピンラベル、例えばＩ−１２３、Ｉ−１３１、Ｉｎ−１１１、Ｆ−１９、Ｃ−１３、Ｎ−１５又はＯ−１７を含み得る。
本発明の抗体と異種分子との複合体は、様々な二官能性タンパク質カップリング剤、例えば、Ｎ−スクシンイミジル−３−（２−ピリジルジチオ）プロピオネート（ＳＰＤＰ）、スクシンイミジル−４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボキシレート（ＳＭＣＣ）、イミノチオラン（ＩＴ）、イミドエステルの二官能性誘導体（ジメチルアジピミダートＨＱなど）、活性エステル（例えば、ジスクシンイミジルスベレート）、アルデヒド（グルタルアルデヒドなど）、ビス−アジド化合物（例えば、ビス（ｐ−アジドベンゾイル）ヘキサンジアミン）、ビス−ジアゾニウム誘導体（例えば、ビス−（ｐ−ジアゾニウムベンゾイル）エチレンジアミン）、ジイソシアネート（例えば、トルエン−２，６−ジイソシアネート）、及び二活性（bis-active）フッ素化合物（例えば、１，５−ジフルオロ−２，４−ジニトロベンゼン）などを使用して製造することができる。例えば、リシン免疫毒素は、Ｖｉｔｅｔｔａ ｅｔ ａｌ．，（１９８７）Ｓｃｉｅｎｃｅ ２３８：１０９８に記載されているように調製できる。炭素１４で標識した１−イソチオシアナトベンジル−３−メチルジエチレントリアミン五酢酸（ＭＸ−ＤＴＰＡ）は、放射性核種を抗体にコンジュゲートさせるためのキレート剤の例である。例えば、国際公開第９４／１１０２６号を参照されたい。リンカーは、細胞中での細胞毒性薬の放出を容易にする「切断可能なリンカー」であってもよい。例えば、酸不安定性リンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、光不安定性リンカー、ジメチルリンカー、又はジスルフィド含有リンカー（Ｃｈａｒｉ ｅｔ ａｌ．，（１９９２）Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ５２：１２７〜１３１；米国特許第５，２０８，０２０号）を使用することができる。
本発明の抗体と異種分子との複合体は、市販されている（例えば、Ｐｉｅｒｃｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．，（Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ．，Ｕ．Ｓ．Ａ）から）ＢＭＰＳ、ＥＭＣＳ、ＧＭＢＳ、ＨＢＶＳ、ＬＣ−ＳＭＣＣ、ＭＢＳ、ＭＰＢＨ、ＳＢＡＰ、ＳＩＡ、ＳＩＡＢ、ＳＭＣＣ、ＳＭＰＢ、ＳＭＰＨ、スルホ−ＥＭＣＳ、スルホ−ＧＭＢＳ、スルホ−ＫＭＵＳ、スルホ−ＭＢＳ、スルホ−ＳＩＡＢ、スルホ−ＳＭＣＣ、及びスルホ−ＳＭＰＢ、並びにＳＶＳＢ（スクシンイミジル−（４−ビニルスルホン）ベンゾエート）などの架橋剤試薬を用いて調製することができる。
本発明はまた、治療剤又は造影剤に連結させた、本発明の配列番号７５のＣＤ４０に特異的に結合する抗体を含む免疫複合体も提供する。
診断的使用及びキット
本発明はまた、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアンタゴニスト抗体を含むキットも提供する。
キットは、治療的使用のために、又は診断キットとして、使用することができる。
キットを使用して、生体サンプル中のＣＤ４０の存在を検出することができる。
いくつかの実施形態では、キットは、ヒトＣＤ４０に特異的に結合する本発明のアンタゴニスト抗体と、抗体を検出するための試薬と、を含む。キットは、使用説明書；他の試薬、例えば、標識、治療剤、又は抗体を標識若しくは治療剤にキレート化若しくは別の方法でカップリングするのに有用な試薬、又は放射線防護組成物など；投与用に抗体を調製するためのデバイス又は他の材料；薬学的に許容される担体；及び対象に投与するためのデバイス又は他の材料を含む１つ以上の要素を含むことができる。
いくつかの実施形態では、キットは、容器中の本発明の抗体と、キットの使用説明書と、を含む。
いくつかの実施形態では、キット中の抗体は標識されている。
いくつかの実施形態では、キットは、抗体Ｃ４０Ｍ６７、Ｃ４０Ｍ６６、４０Ｍ６３、Ｃ４０Ｍ６２、Ｃ４０Ｍ５９、Ｃ４０Ｍ５８、Ｃ４０Ｍ５６、Ｃ４０Ｍ５５、Ｃ４０Ｍ５１、Ｃ４０Ｍ１８、Ｃ４０Ｍ１７、Ｃ４０ＭＩ２、Ｃ４０ＭＩ０２、Ｃ４０ＭＩ０３、Ｃ４０Ｍ１０４、Ｃ４０ＭＩ０５、Ｃ４０Ｍ１２１又はＣ４０Ｍ１２６を含む。
ＣＤ４０を検出する方法
本発明はまた、サンプル中のＣＤ４０を検出する方法であって、サンプルを入手するステップと、サンプルを本発明の抗体と接触させるステップと、サンプル中のＣＤ４０に結合している抗体を検出するステップと、を含む方法も提供する。
いくつかの実施形態では、サンプルは、尿、血液、血清、血漿、唾液、腹水、循環細胞、循環腫瘍細胞、組織に存在しない細胞（すなわち、遊離細胞）、組織（例えば、外科的に切除された腫瘍組織、穿刺吸引を含む生検材料）、及び組織標本などから得ることができる。
本発明の抗体は、既知の方法を使用して検出することができる。方法の例としては、蛍光若しくは化学発光標識、又は放射線標識を使用して抗体を直接標識すること、又は本発明の抗体に、ビオチン、酵素、若しくはエピトープタグなどの容易に検出可能な部分を付加することが挙げられる。標識及び部分の例は、ルテニウム、111Ｉｎ−ＤＯＴＡ、111Ｉｎ−ジエチレントリアミン五酢酸（ＤＴＰＡ）、ホースラディッシュペルオキシダーゼ、アルカリホスファターゼ及びβ−ガラクトシダーゼ、ポリ−ヒスチジン（ＨＩＳタグ）、アクリジン染料、シアニン染料、フルオロン染料、オキサジン染料、フェナントリジン染料、ローダミン染料及びＡｌｅｘａｆｌｕｏｒ（登録商標）染料である。
本発明の抗体は、サンプル中のＣＤ４０を検出するための様々なアッセイにおいて使用することができる。アッセイの例は、ウェスタンブロット分析、ラジオイムノアッセイ、表面プラズモン共鳴、免疫沈降法、平衡透析法、免疫拡散法、電気化学発光（ＥＣＬ）イムノアッセイ、及び免疫組織化学検査、蛍光活性化細胞選別（ＦＡＣＳ）又はＥＬＩＳＡアッセイである。
次に、以下の具体的な非限定的な実施例を参照して本発明を説明する。
実施例１．材料及び方法
試験において使用される抗原の作製
抗原のクローニング、発現及び精製は、標準的な方法を使用して行った。使用したタンパク質のアミノ酸配列を以下に示す；
完全長ヒトＣＤ４０（ｈｕＣＤ４０）；配列番号７５
ＭＶＲＬＰＬＱＣＶＬＷＧＣＬＬＴＡＶＨＰＥＰＰＴＡＣＲＥＫＱＹＬＩＮＳＱＣＣＳＬＣＱＰＧＱＫＬＶＳＤＣＴＥＦＴＥＴＥＣＬＰＣＧＥＳＥＦＬＤＴＷＮＲＥＴＨＣＨＱＨＫＹＣＤＰＮＬＧＬＲＶＱＱＫＧＴＳＥＴＤＴＩＣＴＣＥＥＧＷＨＣＴＳＥＡＣＥＳＣＶＬＨＲＳＣＳＰＧＦＧＶＫＱＩＡＴＧＶＳＤＴＩＣＥＰＣＰＶＧＦＦＳＮＶＳＳＡＦＥＫＣＨＰＷＴＳＣＥＴＫＤＬＶＶＱＱＡＧＴＮＫＴＤＶＶＣＧＰＱＤＲＬＲＡＬＶＶＩＰＩＩＦＧＩＬＦＡＩＬＬＶＬＶＦＩＫＫＶＡＫＫＰＴＮＫＡＰＨＰＫＱＥＰＱＥＩＮＦＰＤＤＬＰＧＳＮＴＡＡＰＶＱＥＴＬＨＧＣＱＰＶＴＱＥＤＧＫＥＳＲＩＳＶＱＥＲＱ
ヒトＣＤ４０細胞外ドメイン（ｈｕＣＤ４０−ＥＣＤ）；配列番号７６
ＥＰＰＴＡＣＲＥＫＱＹＬＩＮＳＱＣＣＳＬＣＱＰＧＱＫＬＶＳＤＣＴＥＦＴＥＴＥＣＬＰＣＧＥＳＥＦＬＤＴＷＮＲＥＴＨＣＨＱＨＫＹＣＤＰＮＬＧＬＲＶＱＱＫＧＴＳＥＴＤＴＩＣＴＣＥＥＧＷＨＣＴＳＥＡＣＥＳＣＶＬＨＲＳＣＳＰＧＦＧＶＫＱＩＡＴＧＶＳＤＴＩＣＥＰＣＰＶＧＦＦＳＮＶＳＳＡＦＥＫＣＨＰＷＴＳＣＥＴＫＤＬＶＶＱＱＡＧＴＮＫＴＤＶＶＣＧＰＱＤＲＬＲ
カニクイザル（Macaca fascicularis）（カニクイザル（cynomolgous）、本明細書では以降カニクイザルと称する）ＣＤ４０（ｃＣＤ４０）；配列番号７７
ＭＶＲＬＰＬＱＣＶＬＷＧＣＬＬＴＡＶＹＰＥＰＰＴＡＣＲＥＫＱＹＬＩＮＳＱＣＣＳＬＣＱＰＧＱＫＬＶＳＤＣＴＥＦＴＥＴＥＣＬＰＣＳＥＳＥＦＬＤＴＷＮＲＥＴＲＣＨＱＨＫＹＣＤＰＮＬＧＬＲＶＱＱＫＧＴＳＥＴＤＴＩＣＴＣＥＥＧＬＨＣＭＳＥＳＣＥＳＣＶＰＨＲＳＣＬＰＧＦＧＶＫＱＩＡＴＧＶＳＤＴＩＣＥＰＣＰＶＧＦＦＳＮＶＳＳＡＦＥＫＣＲＰＷＴＳＣＥＴＫＤＬＶＶＱＱＡＧＴＮＫＴＤＶＶＣＧＰＱＤＲＱＲＡＬＶＶＩＰＩＣＬＧＩＬＦＶＩＬＬＬＶＬＶＦＩＫＫＶＡＫＫＰＮＤＫＡＰＨＰＫＱＥＰＱＥＩＮＦＬＤＤＬＰＧＳＮＰＡＡＰＶＱＥＴＬＨＧＣＱＰＶＴＱＥＤＧＫＥＳＲＩＳＶＱＥＲＱ
カニクイザルＣＤ４０細胞外ドメイン（ｃＣＤ４０−ＥＣＤ）；配列番号７８
ＥＰＰＴＡＣＲＥＫＱＹＬＩＮＳＱＣＣＳＬＣＱＰＧＱＫＬＶＳＤＣＴＥＦＴＥＴＥＣＬ
ＰＣＳＥＳＥＦＬＤＴＷＮＲＥＴＲＣＨＱＨＫＹＣＤＰＮＬＧＬＲＶＱＱＫＧＴＳＥＴＤＴＩＣＴＣＥＥＧＬＨＣＭＳＥＳＣＥＳＣＶＰＨＲＳＣＬＰＧＦＧＶＫＱＩＡＴＧＶＳＤＴＩＣＥＰＣＰＶＧＦＦＳＮＶＳＳＡＦＥＫＣＲＰＷＴＳＣＥＴＫＤＬＶＶＱＱＡＧＴＮＫＴＤＶＶＣＧＰＱＤＲＱＲ
完全長ヒトＣＤ１５４；配列番号８３
ＭＩＥＴＹＮＱＴＳＰＲＳＡＡＴＧＬＰＩＳＭＫＩＦＭＹＬＬＴＶＦＬＩＴＱＭＩＧＳＡＬＦＡＶＹＬＨＲＲＬＤＫＩＥＤＥＲＮＬＨＥＤＦＶＦＭＫＴＩＱＲＣＮＴＧＥＲＳＬＳＬＬＮＣＥＥＩＫＳＱＦＥＧＦＶＫＤＩＭＬＮＫＥＥＴＫＫＥＮＳＦＥＭＱＫＧＤＱＮＰＱＩＡＡＨＶＩＳＥＡＳＳＫＴＴＳＶＬＱＷＡＥＫＧＹＹＴＭＳＮＮＬＶＴＬＥＮＧＫＱＬＴＶＫＲＱＧＬＹＹＩＹＡＱＶＴＦＣＳＮＲＥＡＳＳＱＡＰＦＩＡＳＬＣＬＫＳＰＧＲＦＥＲＩＬＬＲＡＡＮＴＨＳＳＡＫＰＣＧＱＱＳＩＨＬＧＧＶＦＥＬＱＰＧＡＳＶＦＶＮＶＴＤＰＳＱＶＳＨＧＴＧＦＴＳＦＧＬＬ
可溶性ヒトＣＤ１５４；配列番号８８
ＭＱＫＧＤＱＮＰＱＩＡＡＨＶＩＳＥＡＳＳＫＴＴＳＶＬＱＷＡＥＫＧＹＹＴＭＳＮＮＬＶＴＬＥＮＧＫＱＬＴＶＫＲＱＧＬＹＹＩＹＡＱＶＴＦＣＳＮＲＥＡＳＳＱＡＰＦＩＡＳＬＣＬＫＳＰＧＲＦＥＲＩＬＬＲＡＡＮＴＨＳＳＡＫＰＣＧＱＱＳＩＨＬＧＧＶＦＥＬＱＰＧＡＳＶＦＶＮＶＴＤＰＳＱＶＳＨＧＴＧＦＴＳＦＧＬＬＫＬ
可溶性カニクイザルＣＤ１５４（配列番号４５）
ＭＱＫＧＤＱＮＰＱＩＡＡＨＶＩＳＥＡＳＳＫＴＴＳＶＬＱＷＡＥＫＧＹＹＴＭＳＮＮＬＶＴＬＥＮＧＫＱＬＴＶＫＲＱＧＬＹＹＩＹＡＱＶＴＦＣＳＮＲＥＡＳＳＱＡＰＦＩＡＳＬＣＬＫＳＰＧＲＦＥＲＩＬＬＲＡＡＮＴＨＳＳＡＫＰＣＧＱＱＳＩＨＬＧＧＶＦＥＬＱＰＧＡＳＶＦＶＮＶＴＤＰＳＱＶＳＨＧＴＧＦＴＳＦＧＬＬＫＬ
初代ヒト及びカニクイザル樹状細胞（ＤＣ）における結合アッセイ
製造者（ＭＡＣＳ Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）のプロトコールに従ってＣＤ１４ネガティブアイソレーションキットを使用して、凍結／新鮮ＰＢＭＣのいずれかからヒト単球を単離した。製造者（ＭＡＣＳ Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）のプロトコールに従ってＣＤ１４ポジティブアイソレーションキットを使用して、新鮮ＰＢＭＣからカニクイザル単球を単離した。ＤＣを作製するために、完全培地ＲＰＭＩ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）中で、１００ｎｇ／ｍｌのヒトＧＭ−ＣＳＦ及びヒトＩＬ−４（Ｐｅｐｒｏｔｅｃｈ）の存在下で５日間、単球を培養し、培地を２日ごとに補充した。５日目に、１００ｎｇ／ｍｌのＬＰＳ（Ｓｉｇｍａ）で２４時間、ＤＣを刺激した。次に、試験したＣＤ４０抗体のそれぞれを用いて１００μｌの体積のフローサイトメトリー緩衝液（ＰＢＳ＋１％ＦＢＳ；ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）中で異なる濃度で氷上で３０分間、細胞を染色し、その後、フローバッファーで２回洗浄した。次に、細胞を更に３０分間氷上で、ＡＰＣコンジュゲート抗ヒトＩｇＧ（Ｊａｃｋｓｏｎ ＩｍｍｕｎｏＲｅｓｅａｒｃｈ）を推奨される１：１００の希釈率で用いて染色し、フローバッファーで２回洗浄した。細胞の陽性パーセント及び平均蛍光強度（Ｍｅａｎ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ Ｉｎｔｅｎｓｉｔｙ、ＭＦＩ）を分析して、Ｆｏｒｔｅｓｓａ（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ）を使用して抗体の結合を測定した。
Ｒａｊｉ（Ｂ細胞リンパ腫細胞株）及びＨＥＫ ＣＤ４０細胞株における結合アッセイ
Ｒａｊｉ細胞はＡＴＣＣから入手し、ＨＥＫ ＣＤ４０細胞株はＩｎｖｉｖｏｇｅｎから入手した。会社の推奨に従って完全ＲＭＰＩ培地中で細胞を培養した。染色は、初代ヒト及びカニクイザルＤＣでの結合アッセイに関して上述したとおり行った。
ヒトＤＣ及びＢ細胞活性化アッセイ
ヒトＤＣは、上述したとおり作製した。ヒトＢ細胞は、製造者（ＭＡＣＳ Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）のプロトコールに従ってＢ細胞ネガティブアイソレーションキットを使用して、新鮮な又は凍結したＰＢＭＣから単離した。各ＣＤ４０抗体の力価測定（titration）は、９６ウェルＵ底プレートにプレーティングして、細胞を添加し、混合物を室温で１５分間インキュベートした。培地又は一定濃度２０μｇ／ｍｌの架橋剤抗ヒトＦ（ａｂ’）２のいずれかを添加し、複合体を、ＤＣアッセイでは２４時間、Ｂ細胞アッセイでは４８時間、３７℃のインキュベーターでインキュベートした。終了時点で細胞を回収し、フローバッファーで２回洗浄し、ヒトＦｃブロック（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ）と一緒に室温で１５分間インキュベートし、その後１回洗浄した。次に、細胞を、活性化マーカーＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６、ＨＬＡ−ＤＲ及びＣＤ２３（ＢＤ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅ及びＢｉｏＬｅｇｅｎｄ）に関して３０分間氷上で染色し、その後２回洗浄した。ＢＤ Ｆｏｒｔｅｓｓａを使用して細胞を分析した。
カニクイザルＢ細胞活性化アッセイ
製造者（ＭＡＣＳ Ｍｉｌｔｅｎｙ）のプロトコールに従ってＢ細胞ポジティブアイソレーションキットを使用して、新鮮ＰＢＭＣからカニクイザルＢ細胞を単離した。活性化アッセイは、ヒトＤＣ及びＢ細胞に関して上述したとおりに準備した。
ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ ＮＦ−κＢ活性化アッセイ
ＣＤ４０を過剰発現するＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞（Ｉｎｖｉｖｏｇｅｎ）を使用して、抗体がＣＤ４０〜ＣＤ１５４相互作用をブロックする能力又はＣＤ４０を活性化する能力のいずれかを評価した。ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞株は、ヒトＣＤ４０及びＮＦ−κＢ誘導性分泌型アルカリホスファターゼ（ＳＥＡＰ）を安定して発現する。ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞においてＣＤ４０を活性化することにより、下流のシグナル伝達イベントが誘導され、ＮＦ−κＢの活性化及びＳＥＡＰの分泌が引き起こされる。これを、製造者の指示に従ってＱＵＡＮＴＩ−Ｂｌｕｅ（商標）を使用して測定することができる。ＣＤ４０活性化をブロック又は受容体活性化する能力のいずれかに関して、抗ＣＤ４０抗体を評価した。
ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ ＣＤ４０Ｌ細胞株におけるＣＤ４０依存的ＮＦ−ｋＢ活性化の阻害
販売業者のプロトコールに従って取り扱い及び維持したＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞株（Ｉｎｖｉｖｏｇｅｎ）を、９６ウェル組織培養プレート中に、１ウェル当たり２．５×１０4個の細胞密度で１００μｌの体積で播種した。アッセイプレートに蓋をし、細胞を終夜回収した（３７℃、５％ ＣＯ2）。翌日、ｒｈＣＤ１５４−ＥＣＤ−Ｈｉｓの４×溶液（４０ｎｇ／ｍｌの最終濃度）及び適切な濃度（１〜２５μｇ／ｍｌの最終濃度）の４×抗ＣＤ４０ｍＡｂ又はＦａｂを調製し、１００μｌ／ウェルの得られる２×溶液を、ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ ＣＤ４０Ｌ（商標）細胞を含有する９６ウェルアッセイプレートに添加した（２００μｌ／ウェルの最終体積）。１６〜２４時間のインキュベーション（３７℃、５％ ＣＯ2）時間の後、販売業者のプロトコールに従って調製した１６０μｌ／ウェルの予め加温したＱＵＡＮＴＩ−Ｂｌｕｅ（商標）（Ｉｎｖｉｖｏｇｅｎ）に４０μｌ／ウェルの上清を添加することによって、９６ウェルアッセイプレート中でホスファターゼ活性について上清を分析した。プレートを密封し、３０〜６０分間インキュベートした後、６５０ｎｍでの吸光度を得た。
ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ ＣＤ４０Ｌ ＮＦｋＢ−ＳＥＡＰ細胞株におけるＣＤ４０依存的ＮＦ−ｋＢ活性化
ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞を前述のとおり播種し、終夜回収した。翌日、ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞を含有する９６ウェルプレートにＣＤ４０ ｍＡｂを２×溶液として添加し（２００μｌの最終体積／ウェル）添加し、プレートを終夜インキュベートした（３７℃、５％ ＣＯ2）。抗ＣＤ４０ ｍＡｂ単独のアゴニスト活性を測定するために、１〜２５μｇ／ｍｌの広範囲の最終アッセイ濃度を使用した。抗ＣＤ４０ ｍＡｂのアゴニスト活性に対する架橋の影響を測定するために、抗体の４×溶液及び抗ｈＩｇＧ Ｆｃフラグメントに対するＦ（ａｂ’）2フラグメントの４×溶液（ｍＡｂに対して５〜１０倍過剰）を、細胞添加の前にＲＴで１時間プレインキュベートし、１μｇ／ｍｌの抗ＣＤ４０ ｍＡｂで力価測定を開始して用量曲線を得た。１６〜２４ｈのインキュベーション（３７℃、５％ ＣＯ2）の後、販売業者のプロトコールに従って調製した１６０μｌ／ウェルの予め加温したＱＵＡＮＴＩ−Ｂｌｕｅ（商標）（Ｉｎｖｉｖｏｇｅｎ）に４０μｌ／ウェルの上清を添加することによって、９６ウェルアッセイプレート中でホスファターゼ活性について上清を分析した。プレートを密封し、３０〜６０分間インキュベートした後、６５０ｎｍでの吸光度を得た。
実施例２．ファージディスプレイライブラリーからの抗ＣＤ４０抗体の単離
ファージディスプレイライブラリーからの抗ＣＤ４０抗体の単離
Ｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ３９７：３８５〜９６，２０１０、国際公開第２００９／０８５４６２号及び米国特許出願公開第２０１０／００２１４７７号に記載されているように、デノボｐＩＸファージディスプレイライブラリーからＣＤ４０結合Ｆａｂを選択した。簡潔に述べると、ヒト足場を多様化することによってライブラリーが作製され、生殖系列ＶＨ遺伝子ＩＧＨＶ１−６９*０１、ＩＧＨＶ３−２３*０１、及びＩＧＨＶ５−５１*０１が、Ｈ３ループを介してヒトＩＧＨＪ−４ミニ遺伝子と組み換えられ、ヒト生殖系列ＶＬκ遺伝子Ｏ１２（ＩＧＫＶ１−３９*０１）、Ｌ６（ＩＧＫＶ３−１１*０１）、Ａ２７（ＩＧＫＶ３−２０*０１）、及びＢ３（ＩＧＫＶ４−１*０１）がＩＧＫＪ−１ミニ遺伝子と組み換えられて、完全なＶＨ及びＶＬドメインのアセンブリが行われた。多様化のために、タンパク質抗原及びペプチド抗原と高頻度に接していると特定された位置に相当する、Ｈ１、Ｈ２、Ｌ１、Ｌ２及びＬ３ループ周辺の重鎖及び軽鎖可変領域内の位置を選択した。選択した位置での配列多様性は、それぞれのＩＧＨＶ又はＩＧＬＶ遺伝子のＩＧＨＶ又はＩＧＬＶ生殖系列遺伝子ファミリーにおいてそれぞれの位置で見られる残基に制限した。Ｈ３ループにおける多様性は、７〜１４アミノ酸長の単鎖〜中鎖の合成ループを使用して作製した。Ｈ３におけるアミノ酸分布は、ヒト抗体において観察されたアミノ酸変異を模倣するように設計された。ライブラリー設計の詳細は、Ｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ ３９７：３８５〜９６，２０１０に記載されている。ライブラリーを作製するために利用した足場は、これらの由来するヒトＶＨ及びＶＬ生殖系列遺伝子に従って命名した。３つの重鎖ライブラリーを、４つの生殖系列軽鎖と組み合わせるか、又は多様化した軽鎖ライブラリーと組み合わせて、１２の特有のＶＨ：ＶＬ組み合わせを作製した。３つのライブラリーは、その後、ライブラリーのバージョンに基づいて更に組み合わせて、ＣＤ４０に対するパニング実験用の更なるライブラリーを作製した。
ライブラリーを、ビオチン化ｈｕＣＤ４０−ＥＣＤ又はＦｃに融合させたｃＣＤ４０−ＥＣＤのいずれかに対してパニングした。ビオチン化抗原を、ストレプトアビジン磁気ビーズ（Ｄｙｎａｌ）で捕捉し、デノボｐＩＸ Ｆａｂライブラリーに１００ｎＭ又は１０ｎＭの最終濃度で曝露した。非特異的ファージをＰＢＳ−Ｔｗｅｅｎ中で洗い流し、結合したファージを、ＴＧ１ Ｅ．ｃｏｌｉ細胞の感染によって回収した。これらの細胞からファージを終夜増幅し、パニングを合計４回繰り返した。４回のバイオパニングに続いて、モノクローナルＦａｂを、ｈｕＣＤ４０−ＥＣＤ及びＦｃ又はＨｉｓタグに融合させたｃＣＤ４０−ＥＣＤに対する結合について、ＥＬＩＳＡでスクリーニングした。ＥＬＩＳＡでは、Ｆａｂをヒツジ抗ヒトＦＤでＥＬＩＳＡプレート上に捕捉し、捕捉されたＦａｂにビオチン化ＣＤ４０を添加し、その後、ストレプトアビジンＨＲＰを有する抗原を検出した。ＣＤ４０のヒト及びカニクイザル型の両方に対する結合を示すクローンの重鎖及び軽鎖可変領域をシーケンシングした。
選択クローンを更に親和性成熟させた。デノボパニング結果は重鎖でプールしたため、軽鎖モノクローナルペア形成は不明であった。したがって、親和性成熟化は、各デノボ選択結果の重鎖を、４つの全ての可能なκ軽鎖ｖ５ライブラリー中にクローニングするように行った。
各デノボ結果のＶＨ領域をＰＣＲ増幅し、ＸｈｏＩ及びＮｃｏＩ制限酵素部位によって軽鎖ライブラリー中にクローニングした。Ｍ１３ファージにおいてこれらのライブラリーを調製し、３回のパニング全体にわたって、抗原濃度を低くした（１０ｎＭ、１ｎＭ、０．３ｎＭ）以外は記載のとおりに、パニング及びスクリーニングに使用した。また、Ｅ．ｃｏｌｉ細胞感染前の３回目には１時間の長時間の洗浄を行った。親和性成熟サイクルから得られたモノクローナルＦａｂを、デノボ選択と同じ方法で、ヒト及びカニクイザルＣＤ４０の両方に対する結合についてスクリーニングし、交差反応性を示すものをシーケンシングした。
ヒト免疫グロブリン遺伝子座を発現するラットを使用した抗ＣＤ４０抗体の単離
ヒト免疫グロブリンの遺伝子座を発現しているトランスジェニックラット、ＯｍｎｉＲａｔ（登録商標）（ＯＭＴ，Ｉｎｃ）を使用して、抗ＣＤ４０抗体を作製した。ＯｍｎｉＲａｔ（登録商標）の内因性イムノグロブリン遺伝子座は、ヒトＩｇκ及びＩｇλ遺伝子座と、ラットＣH遺伝子座に結合したヒト起源のＶ、Ｄ及びＪセグメントを有するヒト／ラットキメラＩｇＨ遺伝子座とで置き換えられている。ＩｇＨ遺伝子座は、２２個のヒトＶHセグメント、全てのヒトＤセグメント及びＪHセグメントを、ラットＣH遺伝子座に結合された天然の構成で含有する。ＯｍｎｉＲａｔ（登録商標）の作製及び特徴付けは、Ｏｓｂｏｒｎ，ｅｔ ａｌ．Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ １９０：１４８１〜１４９０，２０１３、及び国際公開第１４／０９３９０８号に記載されている。
５匹のＯｍｎｉＲａｔの別個のコホートを、組み換えヒト及びカニクイザルＣＤ４０ ＥＣＤ−Ｈｉｓ又はヒト及びカニクイザルＣＤ４０ ＥＣＤ−Ｆｃタンパク質で免疫した。３１〜３４日の免疫レジメンの後、２匹のラットからリンパ節を採取し、ハイブリドーマを作製するために使用した。作製したハイブリドーマを、ヒト及びカニクイザルＣＤ４０−ＥＣＤの両方に対する結合についてスクリーニングした。一元配置分散分析（one-way ANOVA）とともにＤｕｎｎｅｔｔの平均比較事後検定に従って、ヒト及びカニクイザルＣＤ４０−ＥＣＤの両方に対して統計学的に有意な結合を示すハイブリドーマをクローニングし、標準的な手順を使用してそれらのＶ領域をシーケンシングした。
デノボファージパニング及びＯＭＴラットの免疫、及びその後のハイブリドーマ上清のスクリーニングから特定された配列を、ｍＡｂ及びＦａｂの両方として発現させ、ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ ＮＦ−κＢ活性化アッセイにおいて潜在的なアンタゴニスト活性についてスクリーニングした。アンタゴニストは、ｒｈＣＤ１５４−ＥＣＤ−ｈｉｓ単独で処理されたＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞の平均シグナルの標準偏差の３倍よりも低いシグナルを有するはずであるという判断基準に基づいて、ｍＡｂとして発現された１８個のデノボファージ由来配列のうち、４個のｍＡｂがアンタゴニスト活性を示すと特定された。同じ判断基準に基づいて、対応する１８個のＦａｂのうち、１５個のＦａｂがアンタゴニストであると特定された。１３個のハイブリドーマ由来配列のうち、６個のｍＡｂ及び８個の対応するＦａｂがアンタゴニストであると特定された。したがって、合計３１個のｍＡｂ及び対応するＦａｂのうち、１０個のｍＡｂ及び２３個のＦａｂがアンタゴニスト活性を有すると特定された。
前述の３１個のｍＡｂを、ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ ＮＦ−κＢ活性化アッセイにおいてＣＤ４０リガンドを用いずにスクリーニングして、潜在的なアゴニストを特定した。アゴニストは、ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞単独の平均シグナルの標準偏差の３倍よりも高いシグナルを示すはずであるという判断基準に基づいて、１８個のデノボファージ由来配列のうち、１６個のｍＡｂがアゴニストであると特定された。ハイブリドーマライブラリーの１３個の配列から、８個のｍＡｂがアゴニストであると特定された。したがって、スクリーニングした合計３１個のｍＡｂのうち、２４個のｍＡｂがアゴニストであると特定された。
実施例３．抗ＣＤ４０抗体は細胞上のＣＤ４０に結合する
ＣＤ４０に対するＣＤ１５４の結合をブロックした選択抗体を、ＣＤ４０を発現する様々な細胞に対する結合について更に特徴付けた。
前述のアッセイを使用して実験を行った。ヒトＤＣ、カニクイザルＤＣ、Ｒａｊｉ細胞及びＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞に対するその結合に基づいて、２０個の抗体を更に特徴付けた。表４は、これらの細胞に対するその結合に関する選択抗体のＥＣ50値、及び抗体の供給源（ファージ又はＯＭＴラット）を示す。
Figure 2018533360
実施例４．アゴニスト抗ＣＤ４０抗体
前述のアッセイを使用して、架橋剤抗ヒト（Ｆ（ａｂ’）２の存在下又は非存在下で、初代ヒト樹状細胞及びＢ細胞を架橋依存的に活性化する能力について選択抗体を試験した。図１は、ＣＤ２３表面発現誘導（図１Ａ及び図１Ｂ）又はＨＬＡ−ＤＲ表面発現誘導（図１Ｃ及び図１Ｄ）によってＢ細胞活性化を評価した場合に、選択抗体が、架橋剤の存在下においてのみＢ細胞を活性化可能であったことを示す。図２は、ＣＤ８３表面発現誘導（図２Ａ及び図２Ｂ）又はＨＬＡ−ＤＲ表面発現誘導（図２Ｃ及び図２Ｄ）によってＤＣ活性化を評価した場合に、選択抗体が、架橋剤の存在下においてのみＤＣ細胞を活性化可能であったことを示す。アッセイにおいて使用した対照抗体は、架橋非依存的にＢ及びＤＣ細胞活性化を誘導する（ＣＰ−８７０，８９３）。
ＤＣ活性化マーカーＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６及びＨＬＡ−ＤＲ並びにＢ細胞活性化マーカーＣＤ２３、ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６及びＨＬＡ−ＤＲの表面発現の誘導に関して、各試験抗体のＥＣ50値を測定した。架橋された場合に、試験した全てのＤＣ及びＢ細胞マーカーの表面発現を誘導した抗体を、アゴニストと分類した。表５は、Ｂ細胞活性化マーカーの表面発現誘導に関する選択抗体のＥＣ50値を示す。表６は、ＤＣ活性化マーカーの表面発現誘導に関する選択抗体のＥＣ50値を示す。
Figure 2018533360
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作製した抗体を、４つのＤＣ表面マーカーを使用して、ＤＣ活性化を誘導する能力に関して参照抗体ＣＰ−８７０，８９３と比較した。いくつかの抗体が、参照抗体と同等又はそれより低いでＥＣ50値で、少なくとも１つのＤＣ活性化マーカー（ＣＤ８０、ＣＤ８３、ＣＤ８６、ＨＬＡ−ＤＲ）の表面発現を誘導した。このアッセイでは、作製したＣＤ４０抗体を架橋剤の存在下で評価したが、参照抗体は架橋剤の非存在下で評価した。
抗体Ｃ４０Ｍ９及びＣ４０Ｍ４８は、参照抗体と比較して、評価した全てのＤＣ活性化マーカーの表面発現誘導に関してより強力であった。
抗体Ｃ４０Ｍ１８、Ｃ４０Ｍ５５及びＣ４０Ｍ６３は、参照抗体と比較して、評価した３つのＤＣ活性化マーカーの表面発現誘導に関してより強力であった。
抗体Ｃ４０Ｍ１７、Ｃ４０Ｍ５１及びＣ４０Ｍ５６は、参照抗体と比較して、評価した２つのＤＣ活性化マーカーの表面発現誘導に関してより強力であった。
抗体Ｃ４０Ｍ１２、Ｃ４０Ｍ６２及びＣ４０Ｍ６６は、参照抗体と比較して、評価した１つのＤＣ活性化マーカーの表面発現誘導に関してより強力であった。
実験データは、作製したいくつかのＣＤ４０アゴニスト抗体が、樹状細胞を活性化する能力に関して参照抗体よりも強力であったことを示している。重要なことだが、作製した抗体は、架橋なしではＤＣもＢ細胞も活性化できなかったことから、参照抗体と比較した場合に有益な安全性プロファイルを有すると予想される。
実施例５．ＣＤ４０抗体の構造的特徴付け
抗体単離及びポリペプチド鎖のシーケンシングは、標準的な方法を使用して行った。選択抗ＣＤ４０抗体のＨＣＤＲ１アミノ酸配列を、表７に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＨＣＤＲ２アミノ酸配列を、表８に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＨＣＤＲ３アミノ酸配列を、表９に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＬＣＤＲ１アミノ酸配列を、表１０に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＬＣＤＲ２アミノ酸配列を、表１１に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＬＣＤＲ３アミノ酸配列を、表１２に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＶＨアミノ酸配列を、表１３に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＶＬアミノ酸配列を、表１４に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＶＨ ＤＮＡ配列を、表１５に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体のＶＬ ＤＮＡ配列を、表１６に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体の重鎖アミノ酸配列を、表１７に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体の重鎖ＤＮＡ配列を、表１８に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体の軽鎖アミノ酸配列を、表１９に示す。
選択抗ＣＤ４０抗体の軽鎖ＤＮＡ配列を、表２０に示す。
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潜在的な免疫原性リスクを特定するために、抗体フレームワークを最も近い生殖系列遺伝子配列と比較した。最も近い生殖系列配列と比較した場合、Ｃ４０Ｍ１８、Ｃ４０Ｍ１７、Ｃ４０Ｍ１２及びＣ４０Ｍ９ ｍＡｂ ＶＨ及び／又はＶＬは変異を有していた。表２０は、抗体フレームワーク及び変異の数を示す。
Figure 2018533360
フレームワーク配列：
ＩＧＨＶ３−２３*０３（配列番号７９）
＞ＩＧＨＶ３−２３*０３
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＳＹＡＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＶＩＹＳＧＧＳＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＫ
ＩＧＨＶ１−６９*０１（配列番号８０）
＞ＩＧＨＶ１−６９*０１
ＱＶＱＬＶＱＳＧＡＥＶＫＫＰＧＳＳＶＫＶＳＣＫＡＳＧＧＴＦＳＳＹＡＩＳＷＶＲＱＡＰＧＱＧＬＥＷＭＧＧＩＩＰＩＦＧＴＡＮＹＡＱＫＦＱＧＲＶＴＩＴＡＤＥＳＴＳＴＡＹＭＥＬＳＳＬＲＳＥＤＴＡＶＹＹＣＡＲ
ＩＧＨＶ３−２３*０１（配列番号８１）
＞ＩＧＨＶ３−２３*０１
ＥＶＱＬＬＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＳＹＡＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＡＩＳＧＳＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＫ
ＩＧＨＶ３−２３*０４（配列番号８２）
＞ＩＧＨＶ３−２３*０４
ＥＶＱＬＶＥＳＧＧＧＬＶＱＰＧＧＳＬＲＬＳＣＡＡＳＧＦＴＦＳＳＹＡＭＳＷＶＲＱＡＰＧＫＧＬＥＷＶＳＡＩＳＧＳＧＧＳＴＹＹＡＤＳＶＫＧＲＦＴＩＳＲＤＮＳＫＮＴＬＹＬＱＭＮＳＬＲＡＥＤＴＡＶＹＹＣＡＫ
ＩＧＨＶ４−３９*０１（配列番号７３）
＞ＩＧＨＶ４−３９*０１
ＱＬＱＬＱＥＳＧＰＧＬＶＫＰＳＥＴＬＳＬＴＣＴＶＳＧＧＳＩＳＳＳＳＹＹＷＧＷＩＲＱＰＰＧＫＧＬＥＷＩＧＳＩＹＹＳＧＳＴＹＹＮＰＳＬＫＳＲＶＴＩＳＶＤＴＳＫＮＱＦＳＬＫＬＳＳＶＴＡＡＤＴＡＶＹＹＣＡＲ
ＩＧＫＶ３−２０*０１（配列番号７４）
ＥＩＶＬＴＱＳＰＧＴＬＳＬＳＰＧＥＲＡＴＬＳＣＲＡＳＱＳＶＳＳＳＹＬＡＷＹＱＱＫＰＧＱＡＰＲＬＬＩＹＧＡＳＳＲＡＴＧＩＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＲＬＥＰＥＤＦＡＶＹＹＣＱＱＹＧＳＳＰ
ＩＧＫＶ４−１*０１（配列番号８４）
＞ＩＧＫＶ４−１*０１
ＤＩＶＭＴＱＳＰＤＳＬＡＶＳＬＧＥＲＡＴＩＮＣＫＳＳＱＳＶＬＹＳＳＮＮＫＮＹＬＡＷＹＱＱＫＰＧＱＰＰＫＬＬＩＹＷＡＳＴＲＥＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＡＥＤＶＡＶＹＹＣＱＱＹＹＳＴＰ
ＩＧＫＶ１−３９*０１（配列番号８５）
＞ＩＧＫＶ１−３９*０１
ＤＩＱＭＴＱＳＰＳＳＬＳＡＳＶＧＤＲＶＴＩＴＣＲＡＳＱＳＩＳＳＹＬＮＷＹＱＱＫＰＧＫＡＰＫＬＬＩＹＡＡＳＳＬＱＳＧＶＰＳＲＦＳＧＳＧＳＧＴＤＦＴＬＴＩＳＳＬＱＰＥＤＦＡＴＹＹＣＱＱＳＹＳＴＰ
ＩＧＬＶ３−１*０１（配列番号８６）
ＩＧＬＶ３−１*０１
ＳＹＥＬＴＱＰＰＳＶＳＶＳＰＧＱＴＡＳＩＴＣＳＧＤＫＬＧＤＫＹＡＣＷＹＱＱＫＰＧＱＳＰＶＬＶＩＹＱＤＳＫＲＰＳＧＩＰＥＲＦＳＧＳＮＳＧＮＴＡＴＬＴＩＳＧＴＱＡＭＤＥＡＤＹＹＣＱＡＷＤＳＳＴ
ＩＧＬＶ２−８*０１（配列番号８７）
＞ＩＧＬＶ２−８*０１
ＱＳＡＬＴＱＰＰＳＡＳＧＳＰＧＱＳＶＴＩＳＣＴＧＴＳＳＤＶＧＧＹＮＹＶＳＷＹＱＱＨＰＧＫＡＰＫＬＭＩＹＥＶＳＫＲＰＳＧＶＰＤＲＦＳＧＳＫＳＧＮＴＡＳＬＴＶＳＧＬＱＡＥＤＥＡＤＹＹＣＳＳＹＡＧＳＮＮＦ
実施例６．アゴニストＣＤ４０抗体の最適化
Ｃ４０Ｍ９のＶＨ（Ｃ４０Ｈ４３；配列番号６０）は、ＩＧＨＶ４−３９の最も近いヒト生殖系列配列の配列（配列番号７３）とは異なる、フレームワーク領域中の３つのアミノ酸を有していた。ＩＧＨＶ４−３９と比較したＣ４０Ｈ４３残基１〜９８のアライメントを図３に示す。
ＩＧＨＶ４−３９配列番号７３：
ＱＬＱＬＱＥＳＧＰＧＬＶＫＰＳＥＴＬＳＬＴＣＴＶＳＧＧＳＩＳＳＳＳＹＹＷＧＷＩＲＱＰＰＧＫＧＬＥＷＩＧＳＩＹＹＳＧＳＴＹＹＮＰＳＬＫＳＲＶＴＩＳＶＤＴＳＫＮＱＦＳＬＫＬＳＳＶＴＡＡＤＴＡＶＹＹＣＡＲ
生殖系列配列と異なる位置を個々に又は組み合わせて突然変異させるために、Ｃ４０Ｈ４３の変異体を作製した。得られたＶＨ鎖を親ＶＬ鎖ＢＣＭＬ１２と組み合わせ、得られた抗体を結合及び機能アッセイにおいて試験した。
Ｃ４０Ｍ１８のＶＬ（Ｃ４０Ｌ６４；配列番号６６）は、ＩＧＬＶ３−１の最も近いヒト生殖系列配列の配列（配列番号８６）とは異なる、フレームワーク領域中の２つのアミノ酸を有していた。ＩＧＶＬ３−１と比較したＣ４０Ｍ１８ ＶＬのアライメントを図４に示す。
ＩＧＬＶ３−１（配列番号８６）
ＳＹＥＬＴＱＰＰＳＶＳＶＳＰＧＱＴＡＳＩＴＣＳＧＤＫＬＧＤＫＹＡＣＷＹＱＱＫＰＧＱＳＰＶＬＶＩＹＱＤＳＫＲＰＳＧＩＰＥＲＦＳＧＳＮＳＧＮＴＡＴＬＴＩＳＧＴＱＡＭＤＥＡＤＹＹＣＱＡＷＤＳＳＴ
生殖系列配列と異なる位置を個々に又は組み合わせて突然変異させるために、Ｃ４０Ｌ６４の変異体を作製した。加えて、突然変異させたシステインがＣ４０Ｌ６４のＣＤＲ１中に存在していた。得られた変異体ＶＬ鎖を親ＶＨ鎖Ｃ４０Ｈ４８と組み合わせ、得られた抗体を結合及び機能アッセイにおいて試験した。
表２２は、作製した変異体抗体を示す。ＬＣＤＲ１に突然変異したシステインを有するＣ４０Ｌ６４鎖を有する抗体Ｃ４０Ｍ１０３及びＣ４０Ｍ１０４は、ＳＧＤＫＬＧＤＫＹＶＳのＬＣＤＲ１配列（配列番号３１）並びに親ＶＨ及びＶＬと同様の他のＣＤＲを有していた。作製した全ての抗体変異体を、ＩｇＧ１としてクローニングした。
Figure 2018533360
得られた抗体を、ＣＤ４０に対する結合に関して試験して、機能アッセイでは、行った置換の影響がもしあれば、その影響を評価した。表２３は、Ｂ細胞、ＤＣ細胞又はＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞における、ＣＤ４０に対するｍＡｂの結合に関するＥＣ50値を示す。ｍＡｂ Ｃ４０Ｍ１０２、Ｃ４０Ｍ１０３及びＣ４０Ｍ１０４は、親Ｃ４０Ｍ１８と同等の結合を保持していた。Ｃ４０Ｍ１０５は、親Ｃ４０Ｍ９と比較した場合、結合が減少していた。
Figure 2018533360
ＨＥＫ−Ｂｌｕｅ（商標）ＣＤ４０Ｌ細胞及び初代Ｂ細胞において、アゴニスト活性に関して抗体を試験した。表２４は、アッセイにおける抗体のＥＣ50値を示す。親Ｃ４０Ｍ１８ ｍＡｂと比較した場合、Ｃ４０Ｍ１０２、Ｃ４０Ｍ１０３及びＣ４０Ｍ１０４は、Ｂ細胞の活性化に関して同様の効力を有していた。親Ｃ４０Ｍ９と比較した場合、Ｃ４０Ｍ１０５は活性が減少していた。
Figure 2018533360
実施例７．アゴニスト抗ＣＤ４０抗体は高い親和性でヒトＣＤ４０に結合する
ＰｒｏｔｅＯｎ ＸＰＲ３６システム（ＢｉｏＲａｄ）を用いた表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）を使用して、親和性測定を実施した。アミンカップリング化学反応についての製造者の使用説明書を用いて、抗ヒトＩｇＧ Ｆｃ（Ｊａｃｋｓｏｎカタログ番号１０９−００５−０９８）を、ＧＬＣチップ（ＢｉｏＲａｄ，カタログ番号１７６−５０１１）の加工アルギン酸ポリマー層表面にカップリングさせて、バイオセンサー表面を調製した。約５０００ＲＵ（レスポンスユニット）のｍＡｂを固定化した。速度論的実験は、ランニングバッファー（ＤＰＢＳ＋０．０１％Ｐ２０＋１００μｇ／ｍｌ ＢＳＡ）中で２５℃で行った。速度論的実験を行うために、２００ＲＵのｍＡｂを捕捉した後、分析物（ヒト又はカニクイザルＣＤ４０）を５つの濃度（４倍の段階希釈）で注入した。５０μＬ／ｍｉｎで３分間、結合相をモニターした後、１５分間バッファーを流した（解離相）。１００μＬ／分で１００ｍＭ Ｈ3ＰＯ4（Ｓｉｇｍａ、カタログ番号７９６１）を１８秒間ずつ２回流してチップ表面を再生した。
回収したデータはＰｒｏｔｅＯｎ Ｍａｎａｇｅｒソフトウェアを用いて処理した。まず、インタースポットを用いてバックグラウンドについてデータを補正した。次に、分析物注入用のバッファー注入を使用して、データのダブルリファレンスサブトラクション（double reference subtraction）を行った。ラングミュア型の１：１結合モデルを用い、データの速度論的分析を実施した。各ｍＡｂの結果を、Ｋａ（結合速度（Ｏｎ−ｒａｔｅ））、Ｋｄ（解離速度（Ｏｆｆ−ｒａｔｅ））及びＫＤ（平衡解離定数）の形で報告した。
ヒトＣＤ４０に対する結合についての選択ＣＤ４０ ｍＡｂの速度論親和性の概要を、表２５に示す。この表で報告したパラメータは、全てのサンプルに関して、１：１ラングミュア結合モデルから得た。親和性、ＫＤ＝ｋｄ／ｋａ。
Figure 2018533360
Ｃ４０Ｍ９ ｎ＝５回の反復試験、値は平均及び（標準偏差）で記載
Ｃ４０Ｍ５５ ｎ＝２回の反復試験、値は平均及び（範囲）で記載
２つのサンプル（Ｃ４０Ｍ９、Ｃ４０Ｍ５５）は１：１結合モデルにうまく適合しなかった。
カニクイザルＣＤ４０に結合する選択ＣＤ４０ ｍＡｂの速度論親和性の概要を、表２６に示す。この表で報告したパラメータは、全てのサンプルに関して、１：１ラングミュア結合モデルから得た。親和性、ＫＤ＝ｋｄ／ｋａ。
Figure 2018533360
 Ｃ４０Ｍ９ ｎ＝３回の反復試験、値は平均及び（標準偏差）で記載
４つのサンプル（Ｃ４０Ｍ５５、Ｃ４０Ｍ５６、Ｃ４０Ｍ６２、Ｃ４０Ｍ６３）は１：１結合モデルにうまく適合しなかった。
実施例８．アゴニスト抗ＣＤ４０抗体のＦｃ改変
Ｓ２６７Ｅ変異をＣ４０Ｍ１２１に導入して、ｍＡｂ Ｃ４０Ｍ１２６を作製した。Ｃ４０Ｍ１２６は、樹状細胞におけるＨＬＡ−ＤＲ表面発現誘導によって評価した場合、架橋に非依存的に受容体活性化を強化することを示した（図６）。
実施例９．ヒトＣＤ４０と複合体形成したＣ４０Ｍ１２６の結晶構造
方法
ヒトＣＤ４０のＨｉｓタグ付き細胞外ドメイン（ＥＣＤ）を、バキュロウイルスに感染させたＨｉ５昆虫細胞において発現させ、Ｇｅｎｓｃｒｉｐｔ（Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ）でアフィニティ及びサイズ排除クロマトグラフィーによって精製した。ｍＡｂ Ｃ４０Ｍ１２６のＨｉｓタグ付きＦａｂフラグメントを、ＨＥＫ２９３ Ｅｘｐｉ細胞において発現させ、アフィニティ及びサイズ排除クロマトグラフィーによって精製した。１：１．２のモル比でＦａｂを過剰にして成分を混合して抗体−抗原複合体を調製し、４℃で終夜インキュベートした。タンパク質を、２０ｍＭ ＨＥＰＥＳ ｐＨ７．５、１００ｍＭ ＮａＣｌ中で１２ｍｇ／ｍＬまで濃縮し、１．６Ｍ硫酸アンモニウム、５％ ＰＥＧ ４００、０．１Ｍ ＨＥＰＥＳを含有するｐＨ７．５の溶液から蒸気拡散法によって結晶化した。１つの結晶を、２４％グリセロールを加えた母液に移し、液体窒素中で凍結させ、Ｘ線回折データ収集に使用した。構造を、３．０Åの解像度で決定した。
結果
Ｃ４０Ｍ１２６は、細胞表面から遠い位置でＣＤ４０に結合する（図５）。エピトープは立体構造であり、β−ヘアピンを形成するアミノ酸残基４６〜６４の連続的な区間及び隣接するループの更に２つの残基７５〜７６（残基番号付けは配列番号７５に従う）を含む。ＣＤ４０の結合に関与する抗体残基は、軽鎖の９残基及び重鎖の１１残基を含む（図６）。６つ全てのＣＤＲが結合に関与している。抗体−抗原境界面は、各分子上で９００Å2に及び広がっている。
Ｃ４０Ｍ１２６は、Ｃ４０Ｍ９と比較した場合に重鎖のフレームワーク領域中の２つの変異、Ｉ１７Ｔ及びＮ８５Ｓを有するＣ４０Ｍ９の変異体である。これらの２つの残基は、ｍＡｂ結合部位の方を向いておらず、抗体の結合特性に影響を与えない。したがって、Ｃ４０Ｍ９は、Ｃ４０Ｍ１２６と同じエピトープ残基に結合すると予想される。
したがって、全ての結論はエピトープに関連したものであり、この作用機序はＣ４０Ｂ８に当てはまる。
カニクイザルＣＤ４０は、ＥＣＤにおいてヒトＣＤ４０と９５％同一であり、エピトープ内のただ１つの位置がヒトＣＤ４０と異なる。マーモセットＣＤ４０は、ヒトＣＤ４０とのアミノ酸の違いがより多く、そのうちの４つはエピトープ内にある。全ての違いはエピトープの周辺部にあり、抗体が許容する可能性が高く、すなわち、Ｃ４０Ｍ９は、カニクイザル及びマーモセットＣＤ４０の両方に対して交差反応性であると予想される。
Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｄａｔａ Ｂａｎｋ（エントリー３ＱＤ６）から入手可能な受容体−リガンド複合体における抗体−抗原構造の重ね合わせは、Ｃ４０Ｍ１２６とＣＤ４０Ｌのエピトープがオーバーラップしていないことを示している。しかしながら、Ｃ４０Ｍ１２６及びＣＤ４０Ｌは、立体効果のために同じＣＤ４０分子について競合するであろう。例えばＣ４０Ｍ１２６は、ＣＤ４０Ｌ−ＣＤ４０相互作用をブロックするであろう。
実施例１０．カニクイザルにおける抗ＣＤ４０抗体の薬物動態試験
材料及び方法
終夜（又は少なくとも８時間）絶食したナイーブなカニクイザルに、０．１ｍｇ／ｋｇ、１０ｍｇ／ｋｇ又は１０ｍｇ／ｋｇで、抗ＣＤ４０抗体Ｃ４０Ｍ９、Ｃ４０Ｍ１２６又は対照抗体ＣＰ−８７０，８９３の単回ボーラス静脈内注射を行った。この試験の動物福祉は、米国農務省（ＵＳＤＡ）の動物福祉法（Animal Welfare Act）（米国連邦規則集（ＣＦＲ）第９巻１、２及び３条）を遵守した。
生体分析試験のために、投与前並びに投与後０．５時間、１時間、２時間、４時間、８時間、１２時間、２４時間、４８時間、７２時間、９６時間及び７日目、１４日目、２１日目及び２８日目に、約１ｍＬ／サンプルを大腿動脈から採取した。サンプルを周囲温度で少なくとも１５分間凝固させ、合間ごとに、サンプル採取を完了した後３０分以内に周囲条件下でサンプルを遠心分離した。得られた血清を、可能な場合は、３つのほぼ等しいアリコートに分け、９６ウェルプレートに入れた。サンプルを−６０〜−９０℃で凍結して保管した。
結果
雄のカニクイザルに、Ｃ４０Ｍ９、Ｃ４０Ｍ１２６又は対照抗体ＣＰ−８７０，８９３の単回静脈内ボーラスを、０．１、１．０、又は１０ｍｇ／ｋｇの用量で投与した。概して、ＣＰ−８７０，８９３の投与で影響が生じやすく、又は影響が最も顕著であった。以下の所見が観察された：
・１０ｍｇ／ｋｇのＣ４０Ｍ９並びに１．０及び１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３において、血液塗抹標本顕微鏡検査において網状赤血球数、赤血球分布幅（ＲＤＷ）、多染性、及び／又は有核赤血球が増加したこと；赤血球量の減少は２１日目及び／又は２８日目までに回復傾向であったが再生応答は概して持続したことによって示されるように、適切な再生応答のエビデンスで以て、赤血球量の中程度の減少。
・０．１、１．０、及び１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３において、血小板数の一時的な軽微〜中程度の減少。
・１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３において、軽い炎症性刺激を示唆するアルブミンの一時的な中程度の減少、グロブリンの中程度の増加、及び／又は好中球細胞質変化。
・１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３において、１４日目から２８日目のフィブリノゲンの軽微な減少。
・１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３において、ＡＰＴＴ及びプロトロンビン時間がわずかに長くなることによって示される、凝固の一時的な変化のエビデンス（変化幅は小さかったため生物学的に重要である可能性は低い）。
血液学的検査
１０ｍｇ／ｋｇのＣ４０Ｍ９並びに１．０及び１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３での雄における投与後７２時間、７日目、及び／又は１４日目の採取で、他の処置群における赤血球量の減少（最大−２０％）よりも大きい赤血球量の中程度の減少（最大−２９％；変化パーセントは試験前平均に対する群平均として表す）があった。他の処置群における赤血球量の減少幅は、概して、群間でほぼ同等であり、これらは主に手順に関連した（procedure-related）ものであり、薬物動態検査用血液採取の繰り返しに起因するものである可能性が最も高いと考えられるが、比較のための対照が存在しなかったため、決定的な比較は行うことができなかった。１０ｍｇ／ｋｇのＣ４０Ｍ９並びに１．０及び１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３での赤血球量のより大幅な減少は、同時に存在する手順に関連する寄与要因とともに、被験物質に関連する可能性が最も高かった。赤血球量の減少は、２１日目及び／又は２８日目までに回復傾向であった。
全ての群において７日目から２８日目の採取で、試験前と比較して、網状赤血球数の軽微〜顕著な増加（最大＋８８３％）があり、これは赤血球数の減少に対する適切な再生応答を示していた。また、同時に、１．０及び１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３で、血液塗抹標本顕微鏡検査における赤血球分布幅の増加（ＲＤＷ；最大＋４４％、赤血球粒度のばらつきが増加したことを示す）並びに多染性及び／又は有核赤血球の増加があり、これもまた再生応答を示していた。再生応答は、１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３で最も顕著であり、同時に、最も大幅な赤血球量の減少が観察された。
０．１ｍｇ／ｋｇ以上のＣＰ−８７０，８９３における投与後７２時間の採取で、並びに１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３における７日目及び１４日目の採取で、試験前と比較して軽微〜中程度の一時的な血小板数減少（最大−８１％）があり、これはＣＰ−８７０，８９３に関連するものと考えられた。これらの減少の後、その後の採取で血小板数は一時的に増加し、これは適切な再生応答を示すものであり、概して２８日目の採取で回復した。図８は、１０ｍｇ／ｋｇのＣ４０Ｍ９、Ｃ４０Ｍ１２６又は対照抗体ＣＰ−８７０，８９３を投与した動物における経時的な血小板数を示す。血小板数の一時的な減少は、Ｃ４０Ｍ９又はＣ４０Ｍ１２６を投与した動物では観察されなかった。
１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３での１匹の雄における１４日目の採取では、血液塗抹標本顕微鏡検査で好中球細胞質変化が観察された。この変化は、アルブミンの減少及びグロブリンの増加に関連していたことから、炎症性刺激を最も強く示していた。
０．１ｍｇ／ｋｇ以上のＣＰ−８７０，８９３及び１０ｍｇ／ｋｇのＣ４０Ｍ１２６での雄における投与後７２時間及び／又は７日目の採取では、試験前と比較して、リンパ球数の一時的な軽微〜中程度の減少（最大−４６％）があり、これは概してその後の採取で回復した。これらの変化は、処置群間で概して同等の変化幅であったことから被験物質との関連は不明であり、生物学的及び手順に関連するばらつきのための平均値及び個々の値と期待値との関連によるものであった。
血液学的評価項目における他の全ての変動は、その変化幅が小さいこと、散発性であること、投与に近いこと、並びに／又は生物学的及び手順に関連するばらつきについての期待値との関連から、重要であるとは考えられなかった。
凝固
１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３での雄における７日目及び１４日目の採取では、試験前と比較して、ＡＰＴＴ（最大＋３２％）及びプロトロンビン時間（最大＋２２％）がわずかに長くなった。これらの変化はＣＰ−８７０，８９３に関連する、凝固の変化を示すものであったが、これらの変化幅は小さかったため、生物学的に重要である可能性は低かった。これらの変化はその後の採取で回復した。
１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３での雄における１４日目、２１日目、及び２８日目の採取では、試験前と比較して、フィブリノゲンの軽微な減少（最大−６６％）があった。これらの変化は、ＣＰ−８７０，８９３に関連するものであり、凝固の変化に関連していた可能性もある。凝固時間（すなわち、ＡＰＴＴ及びプロトロンビン時間）及びフィブリノゲンにおける他の変動は、その変化幅が小さいこと、変化の方向及び／又は期待値との関連から、重要であるとは考えられなかった。
臨床化学検査
１０ｍｇ／ｋｇのＣＰ−８７０，８９３での雄における７日目、１４日目、及び２１日目の採取では、試験前と比較して、アルブミンの中程度の減少（最大−３０％）及びグロブリンの増加（最大＋３３％）があった。これらの変化は、被験物質に関連するものと考えられ、２匹のうちの１匹の動物において見られた好中球細胞質変化（血液学的検査の節を参照）に関連していたことから、軽い炎症性刺激を示唆していた。これらの変化は、２８日目の採取で回復傾向であった。アルブミンのわずか〜軽微な減少（最大−１６％）は、他の処置群全体でも全ての採取において広く観察されたが、これらの減少は典型的には、２１日目及び／又は２８日目の採取時には試験前の値に戻る傾向があった。これらの減少は、赤血球量の減少（血液学的検査を参照）と関連していたことから、手順に関連する可能性が最も高いと考えられた。アルブミンは血中の主なカルシウム運搬体であるため、概してアルブミンの減少と同時にカルシウムが減少し、加えて、同時に全タンパク質及び／又はアルブミン対グロブリン比が減少した。これらの変化に関して、他の試験評価項目の中で相関関係のある所見はなかった。
１．０ｍｇ／ｋｇのＣ４０Ｍ１２６を除く全ての処置群での雄における投与後７２時間及び／又は７日後の採取では、試験前と比較して、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ（ＡＳＴ；最大＋５２９％）及び／又はアラニンアミノトランスフェラーゼ（ＡＬＴ；最大＋３７４％）の軽微〜中程度の増加があり、概して、その後の採取時に回復し、軽い筋損傷を最も強く示唆していた。用量反応性のパターンが見られなかったこと、一過性及び他の試験評価項目の中で相関関係のある所見がなかったことから、これらの変化は、おそらく静脈穿刺の繰り返しに関連する手順に関連する可能性が最も高いと考えられた。
臨床化学検査評価項目における他の全ての変動は、その変化幅が小さいこと、散発性であること、投与に近いこと、及び／又は期待値との関連から、重要であるとは考えられなかった。
このカニクイザル忍容性試験において作成された毒性データによれば、おそらくＣＤ４０抗体のアゴニスト活性によって促進されるＡＰＣ活性化から、Ｃ４０Ｍ９及びＣ４０Ｍ１２６は、対照抗体と比較した場合、誘導する血小板減少がより少なく、誘導するサイトカインストームのレベルがより低いことが示唆される。まとめると、Ｃ４０Ｍ９及びＣ４０Ｍ１２６は、インビトロＤＣ活性化において示すように、強力なＡＰＣ活性化を維持しながらＣＤ４０活性に関連する、より少ない毒性を誘導することができる。

Claims (65)

  1. 配列番号７５のヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体又はその抗原結合フラグメントであって、配列番号５の重鎖可変領域（ＨＣＤＲ）１、配列番号１０のＨＣＤＲ２、配列番号１８のＨＣＤＲ３、配列番号３２の軽鎖可変領域（ＬＣＤＲ）１、配列番号３４のＬＣＤＲ２、及び配列番号４７のＬＣＤＲ３を含む、抗体又はその抗原結合フラグメント。
  2. 前記抗体が、配列番号７５のヒトＣＤ４０残基４６〜６４及び７５〜７６の範囲内で配列番号７５のヒトＣＤ４０に結合する、請求項１に記載の抗体。
  3. 前記抗体が、以下の特性：
    ａ）０．０１％のポリソルベート２０（ＰＳ−２０）及び１００μｇ／ｍｌのウシ血清アルブミンを含有するダルベッコリン酸緩衝生理食塩水中で２５℃でＰｒｏｔｅＯｎ ＸＰＲ３６システムを使用して解離定数（ＫＤ）が測定される場合に、約５×１０−９Ｍ以下のＫＤで配列番号７５のヒトＣＤ４０に結合すること、又は
    ｂ）Ｂ細胞及び樹状細胞（ＤＣ）に対するそのアゴニスト活性のために架橋を必要とし、ＣＤ２３及びＣＤ８３表面発現がフローサイトメトリーを使用して測定される場合に、２０μｇ／ｍｌの架橋剤抗ヒトＦ（ａｂ’）２の存在下で、Ｂ細胞に対するアゴニスト活性がＢ細胞ＣＤ２３表面発現によって測定され、ＤＣに対するアゴニスト活性がＤＣ ＣＤ８３表面発現によって測定されること、
    のうちの少なくとも１つを有する、請求項１又は２に記載の抗体。
  4. 配列番号６２又は６１の重鎖可変領域（ＶＨ）、及び配列番号６９の軽鎖可変領域（ＶＬ）を含む、請求項３に記載の抗体。
  5. それぞれ配列番号６２及び６９のＶＨ及びＶＬを含む、請求項３に記載の抗体。
  6. それぞれ配列番号６１及び６９のＶＨ及びＶＬを含む、請求項３に記載の抗体。
  7. 前記抗体が、ヒトＩＧＨＶ４−３９＊０１（配列番号７３）由来の重鎖フレームワーク、及びヒトＩＧＬＶ２−８＊０１（配列番号８７）由来の軽鎖フレームワークを含む、請求項３に記載の抗体。
  8. 前記抗体が、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３又はＩｇＧ４アイソタイプである、請求項１〜７のいずれかに記載の抗体。
  9. それぞれ配列番号１２９及び１３６の重鎖及び軽鎖を含む、請求項５に記載の抗体。
  10. それぞれ配列番号１２８及び１３６の重鎖及び軽鎖を含む、請求項５に記載の抗体。
  11. それぞれ配列番号１２７及び１３６の重鎖及び軽鎖を含む、請求項６に記載の抗体。
  12. Ｆｃ領域中に少なくとも１つの変異を更に含む、請求項１〜１１のいずれかに記載の抗体。
  13. 前記Ｆｃ領域中の前記少なくとも１つの変異が、ＦｃγＲＩＩｂに対する前記抗体の結合を強化する、請求項１２に記載の抗体。
  14. 前記Ｆｃ領域中の前記少なくとも１つの変異が、Ｓ２６７Ｅ変異、Ｓ２６７Ｅ／Ｉ３３２Ｅ変異、Ｓ２６７Ｅ／Ｌ３２８Ｆ変異、Ｇ２３６Ｄ／Ｓ２６７Ｅ変異又はＥ２３３Ｄ／Ｇ２３７Ｄ／Ｈ２６８Ｄ／Ｐ２７１Ｇ／Ａ３３０Ｒ／Ｐ２３８Ｄ変異であり、残基の番号付けはＥＵ Ｉｎｄｅｘに従う、請求項１３に記載の抗体。
  15. 前記Ｆｃ領域中の前記少なくとも１つの変異が、Ｓ２６７Ｅ変異である、請求項１３に記載の抗体。
  16. 前記抗体が多重特異性抗体である、請求項１〜１５のいずれかに記載の抗体。
  17. 前記抗体が二重特異性抗体である、請求項１６に記載の抗体。
  18. 細胞毒性剤又は造影剤に連結させた請求項１〜１７のいずれかに記載の抗体を含む、免疫複合体。
  19. 請求項１〜１７のいずれかに記載の抗体と、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物。
  20. 請求項１８に記載の免疫複合体と、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物。
  21. 配列番号６２若しくは６１の抗体ＶＨ、配列番号６９の抗体ＶＬ、又は配列番号６２若しくは６１の抗体ＶＨ及び配列番号６９の抗体ＶＬをコードするポリヌクレオチド。
  22. 配列番号１２９、１２８若しくは１２７の抗体重鎖、配列番号１３６の抗体軽鎖、又は配列番号１２９、１２８若しくは１２７の抗体重鎖及び配列番号１３６の抗体軽鎖をコードするポリヌクレオチド。
  23. 配列番号１０２、１０３、１１０、１５３、１５４、１５５又は１６２のポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド。
  24. 請求項２１に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
  25. 請求項２２に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
  26. 請求項２３に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
  27. 請求項２４に記載のベクターを含む宿主細胞。
  28. 請求項２５に記載のベクターを含む宿主細胞。
  29. 請求項２６に記載のベクターを含む宿主細胞。
  30. ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体の製造方法であって、前記抗体が発現する条件で請求項２７、２８又は２９に記載の宿主細胞を培養するステップと、前記宿主細胞によって産生された前記抗体を回収するステップと、を含む、方法。
  31. 対象においてがんを処置する方法であって、治療有効量の請求項１〜１７のいずれかに記載の単離された抗体を、前記がんを処置するのに十分な時間にわたって、それを必要とする前記対象に投与するステップを含む、方法。
  32. 前記がんが、固形腫瘍又は血液学的悪性疾患である、請求項３１に記載の方法。
  33. 前記固形腫瘍が、膀胱がん、腎がん、肺がん、非小細胞肺がん、膵がん、卵巣がん、乳がん又は頭頚部がんである、請求項３２に記載の方法。
  34. 前記抗体が、第２の治療剤と組み合わせて投与される、請求項３１〜３３のいずれかに記載の方法。
  35. 前記第２の治療剤が、化学療法剤、固形腫瘍若しくは血液学的悪性疾患の処置のための標準治療薬、又は免疫チェックポイントモジュレーターである、請求項３４に記載の方法。
  36. 前記第２の治療剤が、同時に、順次に、又は別々に投与される、請求項３４又は３５に記載の方法。
  37. 請求項４、５又は６に記載の抗体に結合する抗イディオタイプ抗体。
  38. 請求項４、５又は６に記載の抗体を含むキット。
  39. 前記抗体を検出するための試薬と、使用説明書と、を更に含む、請求項３８に記載のキット。
  40. 治療に使用するための、請求項１〜１７のいずれかに記載の抗体、又は請求項１９若しくは２０に記載の医薬組成物。
  41. 配列番号７５のヒトＣＤ４０に特異的に結合する単離されたアゴニスト抗体又はその抗原結合フラグメントであって、前記抗体が、以下の特性：
    ａ）０．０１％のポリソルベート２０（ＰＳ−２０）及び１００μｇ／ｍｌのウシ血清アルブミンを含有するダルベッコリン酸緩衝生理食塩水中で２５℃でＰｒｏｔｅＯｎ ＸＰＲ３６システムを使用して解離定数（ＫＤ）が測定される場合に、約５×１０−９Ｍ以下のＫＤで配列番号７５のヒトＣＤ４０に結合すること、又は
    ｂ）Ｂ細胞及び樹状細胞（ＤＣ）に対するそのアゴニスト活性のために架橋を必要とし、ＣＤ２３及びＣＤ８３表面発現がフローサイトメトリーを使用して測定される場合に、２０μｇ／ｍｌの架橋剤抗ヒトＦ（ａｂ’）２の存在下で、Ｂ細胞に対するアゴニスト活性がＢ細胞ＣＤ２３表面発現によって測定され、ＤＣに対するアゴニスト活性がＤＣ ＣＤ８３表面発現によって測定されること、
    のうちの少なくとも１つを有する、抗体又はその抗原結合フラグメント。
  42. ａ）それぞれ配列番号１、８、２２、２８、３８及び４２のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号４８及び６３のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１４及び１３０の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｂ）それぞれ配列番号２、７、２５、２６、３９及び４４のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号４９及び６４のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１５及び１３１の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｃ）それぞれ配列番号２、７、２４、２６、３９及び４４のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５０及び６４のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１１６及び１３１の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｄ）それぞれ配列番号２、７、２３、２６、３９及び４４のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５１及び６４のＶＨ及びＶＬ；又はそれぞれ配列番号１１７及び１３１の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｅ）それぞれ配列番号３、１３、１７、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３；それぞれ配列番号５２及び６５のＶＨ及びＶＬ；又はそれぞれ配列番号１１８及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｆ）それぞれ配列番号４、６、１９、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３；それぞれ配列番号５３及び６５のＶＨ及びＶＬ；又はそれぞれ配列番号１１９及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｇ）それぞれ配列番号４、６、２０、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３；それぞれ配列番号５４及び６５のＶＨ及びＶＬ；又はそれぞれ配列番号１２０及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｈ）それぞれ配列番号２、７、１４、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３；それぞれ配列番号５５及び６５のＶＨ及びＶＬ；又はそれぞれ配列番号１２１及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｉ）それぞれ配列番号４、６、２１、２７、３３及び４３のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３；それぞれ配列番号５６及び６５のＶＨ及びＶＬ；又はそれぞれ配列番号１２２及び１３２の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｊ）それぞれ配列番号４、９、１５、３０、３６及び４１のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３；それぞれ配列番号５７及び６６のＶＨ及びＶＬ；又はそれぞれ配列番号１２３及び１３３の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｋ）それぞれ配列番号４、１１、１６、２９、３７及び４０のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３；それぞれ配列番号５８及び６７のＶＨ及びＶＬ；又はそれぞれ配列番号１２４及び１３４の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｌ）それぞれ配列番号４、１２、１５、３０、３５及び４６のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５９及び６８のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２５及び１３５の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｍ）それぞれ配列番号４、９、１５、３０、３６及び４１のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５７及び７０のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２３及び１３７の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｎ）それぞれ配列番号４、９、１５、３１、３６及び４１のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５７及び７１のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２３及び１３８の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）；
    ｏ）それぞれ配列番号４、９、１５、３１、３６及び４１のＨＣＤＲ１、ＨＣＤＲ２、ＨＣＤＲ３、ＬＣＤＲ１、ＬＣＤＲ２及びＬＣＤＲ３、それぞれ配列番号５７及び７２のＶＨ及びＶＬ、並びに／又はそれぞれ配列番号１２３及び１３９の重鎖（ＨＣ）及び軽鎖（ＬＣ）
    を含む、請求項４１に記載の抗体。
  43. 前記抗体が、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３又はＩｇＧ４アイソタイプである、請求項４１〜４２のいずれかに記載の抗体。
  44. Ｆｃ領域中に少なくとも１つの変異を更に含む、請求項４３に記載の抗体。
  45. 前記Ｆｃ領域中の前記少なくとも１つの変異が、ＦｃγＲＩＩｂに対する前記抗体の結合を強化する、請求項４４に記載の抗体。
  46. 前記Ｆｃ領域中の前記少なくとも１つの変異が、Ｓ２６７Ｅ変異、Ｓ２６７Ｅ／Ｉ３３２Ｅ変異、Ｓ２６７Ｅ／Ｌ３２８Ｆ変異、Ｇ２３６Ｄ／Ｓ２６７Ｅ変異又はＥ２３３Ｄ／Ｇ２３７Ｄ／Ｈ２６８Ｄ／Ｐ２７１Ｇ／Ａ３３０Ｒ／Ｐ２３８Ｄ変異であり、残基の番号付けはＥＵ Ｉｎｄｅｘに従う、請求項４５に記載の抗体。
  47. 前記抗体が多重特異性抗体である、請求項４１〜４６のいずれかに記載の抗体。
  48. 前記抗体が二重特異性抗体である、請求項４７に記載の抗体。
  49. 細胞毒性剤又は造影剤に連結させた請求項４１〜４８のいずれかに記載の抗体を含む免疫複合体。
  50. 請求項４１〜４８のいずれかに記載の抗体と、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物。
  51. 請求項４９に記載の免疫複合体と、薬学的に許容される担体と、を含む医薬組成物。
  52. 配列番号４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８若しくは５９の抗体ＶＨ、配列番号６３、６４、６５、６６、６７、６８、７０、７１若しくは７２の抗体ＶＬ、又は配列番号４８、４９、５０、５１、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８若しくは５９の抗体ＶＨ及び配列番号６３、６４、６５、６６、６７、６８、７０、７１若しくは７２の抗体ＶＬ、をコードするポリヌクレオチド。
  53. 請求項５２に記載のポリヌクレオチドを含むベクター。
  54. 請求項５３に記載のベクターを含む宿主細胞。
  55. ヒトＣＤ４０に特異的に結合するアゴニスト抗体の製造方法であって、前記抗体が発現する条件で請求項５４に記載の宿主細胞を培養するステップと、前記宿主細胞によって産生された前記抗体を回収するステップと、を含む、方法。
  56. 対象においてがんを処置する方法であって、治療有効量の請求項４１〜４８のいずれかに記載の単離された抗体を、前記がんを処置するのに十分な時間にわたって、それを必要とする前記対象に投与するステップを含む、方法。
  57. 前記がんが、固形腫瘍又は血液学的悪性疾患である、請求項５６に記載の方法。
  58. 前記固形腫瘍が、膀胱がん、腎がん、肺がん、非小細胞肺がん、膵がん、卵巣がん、乳がん又は頭頚部がんである、請求項５７に記載の方法。
  59. 前記抗体が、第２の治療剤と組み合わせて投与される、請求項５６〜５８のいずれかに記載の方法。
  60. 前記第２の治療剤が、化学療法剤、固形腫瘍若しくは血液学的悪性疾患の処置のための標準治療薬、又は免疫チェックポイントモジュレーターである、請求項５９に記載の方法。
  61. 前記第２の治療剤が、同時に、順次に、又は別々に投与される、請求項５９又は６０に記載の方法。
  62. 請求項４２に記載の抗体に結合する抗イディオタイプ抗体。
  63. 請求項４２に記載の抗体を含むキット。
  64. 前記抗体を検出するための試薬と、使用説明書と、を更に含む、請求項６３に記載のキット。
  65. 治療に使用するための、請求項４１〜４８のいずれかに記載の抗体、又は請求項４９若しくは５０に記載の医薬組成物。
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