JP2018522583A - 血管新生を阻害するための融合タンパク質 - Google Patents
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Abstract
Description
ディスインテグリンの発現方法
オーバーラップエクステンションポリメラーゼ連鎖反応(PCR)技術がロドストミン(Rho)変異コンストラクトの作製に用いられた。発現キット及び酵母導入ベクターであるpPICZaAをインビトロジェンより購入した。遺伝子変異に対応する相補的な配列に加え、EcoR1認識部位及び精製を容易にするための6つのヒスチジン残基を含むセンスプライマーと、Sac II認識部位及びTTA停止コドンを含むように設計されたアンチセンスプライマーと、を用いてPCR増幅した遺伝子配列によって、遺伝子変異コンストラクトが作製された。PCR産物が精製され、続いて酵母組み換えベクターであるpPICZaAのEcoR1部位及びSac II部位にクローン化された。組み換えプラスミドが大腸菌コンピテント細胞DH5aに形質転換され、低塩ルリアブロス(LB、1%トリプトン、0.5%酵母抽出物、0.5%NaCl及び1.5%寒天、pH7.0)と、25μg/mLの抗生物質ゼオシンと、を含む寒天プレートで、コロニーが選択された。単一のコロニーが選択され、配列解析のためのプラスミドが増幅された。DNA配列解析によってクローンが確認された後、10μgのプラスミドが調製され、Sac I酵素で消化することで直鎖化された。直鎖状のコンストラクトがキット(Pichia EasyComp;インビトロジェン)を用いてピキア株X33に形質転換され、YPSD(1%酵母抽出物、2%ペプトン、2%グルコース、2%寒天、及び1Mソルビトール)と、100μg/mLのゼオシンと、を用いた寒天プレートで、クローンが選択された。遺伝子がピキアゲノムに組み込まれたことを確かめるためにPCR解析でピキア組み込み体が解析された。遺伝子挿入された複数のコピーを有する多数のクローンから最もタンパク質の発現が高いクローンが選択された。
Rho変異体が次のように作製された。100μLの備蓄細胞が200mLの酵母抽出物ペプトンブドウ糖(YPD)培地(1%酵母抽出物、2%ペプトン及び2%ブドウ糖)及び100μg/mLのゼオシンで48時間、30℃で培養された。次に細胞が800mLのYPD培地に移された。さらに48時間後、細胞が遠心分離で収集され、1Lの最小メタノール培地(硫酸アンモニウムを含み、アミノ酸を含まない1.34%酵母ニトロゲンベース(YNB)、4×10−5%ビオチン及び1%メタノール)で培養された。タンパク質の発現を誘導するために、2日間で24時間毎に1回、1%メタノールが添加された。遠心分離後の上清が収集され、5LのH2Oで2回、さらにpH8の5Lの20mM Tris−HCl及び200mM NaClで1回、透析された。最終溶液がニッケル−キレートカラムに流され、200mMイミダゾールの勾配で溶出された。P.pastorisで産生された組み換えRhoタンパク質が、15%から18%のアセトニトリル勾配の逆相C18 HPLCによってさらに精製された。トリシン−SDS−PAGE分析によって、タンパク質の精製が95%より高いことを確認した。
合わせてVEGF trapとして知られる、配列番号8のFlt−1受容体(VEGFR1)の細胞外ドメインD2及び配列番号9のFlt−1受容体(VEGFR2)の細胞外ドメインD3がVEGFリガンドへの結合のためのタンパク質成分として供された。VEGFリガンド及びインテグリンの両方に結合するように、配列番号10のVEGFR1 D2/VEGFR2 D3及び配列番号13のRho変異体を含む融合タンパク質が産生された。
本発明に係る融合タンパク質のVEGF−AのスプライスバリアントであるヒトVEGF165への結合親和性の評価に、直接結合酵素結合免疫吸着検定法(ELISA)が用いられた。
本発明の融合タンパク質1のインテグリンαvβ3への結合親和性を評価するために競合的結合が用いられた。野生型Rho(配列番号1)及びRhoバリアントKG(配列番号13)が実施例1に従って合成され、それぞれ陽性対照3及び陽性対照4として競合的結合アッセイの対象とされた。
ヒト臍帯静脈内皮細胞(HUVEC)増殖アッセイが本発明の融合タンパク質の機能性を評価するために行われた。市販のVEGF Trapであるアフリベルセプト(Eylea(登録商標)、Regeneron)が陽性対照2として加えられた。
αvβ3過剰発現CHO細胞のフィブリノーゲンへの付着及びα5β1発現K562細胞のフィブロネクチンへの付着が融合タンパク質存在下で評価された。
HUVEC(1.5×104細胞/ウェル)がマトリゲルで被覆された96ウェルプレートに播かれた。6つの用量(0.1μΜ、0.3μΜ、1μΜ、3μΜ、10μΜ、及び30μΜ)の融合タンパク質1及び媒体が成長培地とともに、37℃、5%CO2雰囲気下で各ウェルに添加された。18時間のインキュベーション後、毛管のようなネットワークに似ている上皮細胞管の形態が光学顕微鏡で評価された。管の長さ全体の途絶(抗血管新生)が各写真から測定され、媒体対照群と比較して評価された。そして、管形成の最小阻害濃度(MIC≧30%)が決定され、抗血管新生の程度の評価に用いられた。すべての試験でスラミンが抗血管新生の陽性対照(陽性対照5)として使用された。
本発明の融合タンパク質が、血管漏出防止におけるその有効性を評価するために、血管透過性のin vivoモデルで試験された。このモデルでは、制御できない網膜漏出を誘導するために、ウサギの眼の硝子体にVEGFが注射された。ヒトIgG1のFc部分に融合したヒトVEGFR1及びVEGFR2の部分からなる組み換え融合タンパク質であるアフリベルセプト(Eylea(登録商標)、Regeneron)、及びVEGF−Aを阻害することで血管新生を阻害する組み換えヒト化モノクローナル抗体であるベバシズマブ(Avastin(登録商標)、Roche)がそれぞれ陽性対照2及び6として加えられた。
血管漏出の防止におけるその用量反応有効性を評価するために、本発明の融合タンパク質がいくつかの用量で網膜血管透過性のin vivoモデルにおいて試験された。このモデルでは、ヒトVEGFR165が網膜漏出を誘導するためにウサギの硝子体内に注射された。
ブラウンノルウェイラットの眼が1%サイクロジル溶液で膨張され、光から保護された。膨張に続いて、ケタミンとキシラジンとの混合物を用いてラットが麻酔された。1日目に532nmのレーザーを用いて各眼の網膜に3箇所の熱傷による病変がつくられた。
サルで確立された、レーザーで誘導されたCNVモデルで融合タンパク質が試験される。532nmのダイオードレーザー光凝固を用いて6から9箇所の熱傷が各眼の斑の周りに形成され、0.5−4mgの本発明の融合タンパク質が同日に硝子体内に注射される。
ヒト膠芽細胞腫細胞株U87−MG(2.5×105細胞/2μL、ルシフェラーゼ細胞)がBALB/cヌードマウスに移植され、同所性の異種移植モデルが確立される。
体重20±2gの雄のC57BL/6マウスが肺線維症の誘導及び線維症の阻害における融合タンパク質の影響に用いられる。動物がイソフルランで麻酔され、続いて、1日目に、1.5IU/kg(25μlの生理食塩水に溶解)のブレオマイシンの単回用量が気管内に投与される。ブレオマイシンのこの投与は肺の線維症を再現性よく引き起こすことが知られており、10−20%の死亡率をもたらし得る。
479685SEQLIST.TXTというファイル名でASCIIフォーマット化された配列表としてEFS−Webを介して電子的に提出された配列表の公式なコピーは、2016年6月17日に作成され、37kbのファイルサイズを有し、明細書とともに提出された。このASCIIフォーマット化された文書に含まれる当該配列表は、本明細書の一部であって、その全体が参照によって本明細書に取り込まれる。
(付記1)
ディスインテグリン、抗インテグリンαvβx抗体、抗インテグリンα5β1抗体、インテグリンαvβx又はα5β1を標的とするフィブロネクチン、及びそれらのインテグリン結合フラグメントからなる群から選択されるインテグリン結合ペプチドと、
血管新生因子を標的とする他のタンパク質結合ペプチドと、
Fcドメインと、
を含み、
xが1、3、5、6又は8である、
融合タンパク質。
配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、及び配列番号7からなる群から選択されるアミノ酸配列、又は配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、及び配列番号7に少なくとも85%の配列相同性を有するアミノ酸配列を有するインテグリン結合ペプチドと、
VEGF受容体の細胞外ドメインを含む他のタンパク質結合ペプチドと、
Fcドメインと、
を含み、
前記インテグリン結合ペプチドは、RGDモチーフに、又はRGDモチーフの近隣に少なくとも1つの変異を有する、
融合タンパク質。
ディスインテグリン及びそのインテグリン結合フラグメントを含むインテグリン結合ペプチドと、
VEGF受容体の細胞外ドメインを含む他のタンパク質結合ペプチドと、
Fcドメインと、
を含み、
前記インテグリン結合ペプチドは、RGDモチーフに、又はRGDモチーフの近隣に少なくとも1つの変異を有する、
融合タンパク質。
RGDモチーフに、又はRGDモチーフの近隣に少なくとも1つの変異を有する配列番号1のアミノ酸配列、配列番号1に少なくとも85%の配列相同性を有するアミノ酸配列、及び配列番号2のアミノ酸配列からなる群から選択されるインテグリン結合部分と、
イムノグロブリンCH2ドメイン及びCH3ドメインを含むヒト又はヒト化定常サブ領域と、
VEGFR1のIg様ドメインD2及びVEGFR2のIg様ドメインD3を有する他のタンパク質結合ペプチドと、
を含む、融合タンパク質。
C末端からN末端に、前記インテグリン結合ペプチド、前記Fcドメイン及び前記他のタンパク質結合ペプチドを含む、付記1から3のいずれか一つに記載の融合タンパク質。
N末端からC末端に、前記インテグリン結合ペプチド、前記Fcドメイン及び前記他のタンパク質結合ペプチドを含む、付記1から3のいずれか一つに記載の融合タンパク質。
前記インテグリン結合ペプチドが配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、又は配列番号7に少なくとも85%の配列相同性を有する、付記1から4のいずれか一つに記載の融合タンパク質。
前記インテグリン結合ペプチドが配列番号2に少なくとも85%の配列相同性を有する、付記7に記載の融合タンパク質。
付記1から4のいずれか一つに記載の融合タンパク質をコードする核酸。
付記1から4のいずれか一つに記載の融合タンパク質の二量体。
付記1から4のいずれか一つに記載の融合タンパク質をコードする核酸配列を含む、ベクター。
付記1から4のいずれか一つに記載の融合タンパク質をコードする核酸を含む宿主細胞を、前記融合タンパク質を産生する条件下で培養することと、前記宿主細胞によって産生された前記融合タンパク質を回収することと、を含む、融合タンパク質の製造方法。
付記1から4のいずれか一つに記載の有効量の融合タンパク質を、それを必要とする対象に投与することを含む、血管新生の疾患を治療/予防する方法。
前記インテグリン結合ペプチドと前記他のタンパク質結合ペプチドとの間にリンカー配列をさらに含む、付記1から4のいずれか一つに記載の融合タンパク質。
前記他のタンパク質結合ペプチドの上流にシグナルペプチド配列をさらに含む、付記1から4のいずれか一つに記載の融合タンパク質。
前記血管新生因子は、アンジオポエチン(ANG)、エフリン(Eph)、線維芽細胞増殖因子(FGF)、ニューロピリン(NRP)、プラスミノーゲン活性剤、ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化剤受容体(uPAR)、血小板由来増殖因子(PDGF)、腫瘍増殖因子ベータ(TGF−β)、血管内皮増殖因子(VEGF)、血管内皮カドヘリン(VE−カドヘリン)、インシュリン様成長因子(IGF)、結合組織成長因子(CTGF)、腫瘍壊死因子アルファ(TNF−α)、インターロイキン1(IL−1)、インターロイキン6(IL−6)、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、及びその受容体を含む、付記1に記載の融合タンパク質。
付記1から4のいずれか一つに記載の融合タンパク質と、薬学的に許容される補助剤、担体又は賦形剤と、を含む組成物。
前記血管新生の疾患が、関節リウマチ、炎症性関節炎、変形性関節炎、眼及び全身のがん、腫瘍関連転移及び浸潤、突発性肺線維症(IPF)、非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)又は肝線維症、糖尿病性腎症及び/又は腎線維症、皮膚線維症又はケロイド、創傷治癒、心臓線維症、虚血で誘導される脳卒中を含む全身の線維性疾患、血管形成又は虚血によって特徴づけられる眼疾患(脈絡膜の血管形成を含む)、ぶどう膜炎、網膜色素変性症、加齢黄斑変性症(AMD)、糖尿病性網膜症及び糖尿病黄斑浮腫(DME)を含む、付記13に記載の方法。
前記VEGF受容体の細胞外ドメインがVEGF受容体のIg様ドメインD1−D7を含む、付記2又は3に記載の融合タンパク質。
前記VEGF受容体の細胞外ドメインが、i)VEGFR1のIg様ドメインD2及びVEGFR2のIg様ドメインD3、ii)配列番号10のアミノ酸配列、又はiii)配列番号10に少なくとも90%の相同性を有するアミノ酸配列、を含む、付記2又は3に記載の融合タンパク質。
前記Fcドメインと前記インテグリン結合ペプチド又は前記他のタンパク質結合ペプチドとの間にGS又はG9リンカーをさらに含む、付記1から3のいずれか一つに記載の融合タンパク質。
Claims (21)
- ディスインテグリン、抗インテグリンαvβx抗体、抗インテグリンα5β1抗体、インテグリンαvβx又はα5β1を標的とするフィブロネクチン、及びそれらのインテグリン結合フラグメントからなる群から選択されるインテグリン結合ペプチドと、
血管新生因子を標的とする他のタンパク質結合ペプチドと、
Fcドメインと、
を含み、
xが1、3、5、6又は8である、
融合タンパク質。 - 配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、及び配列番号7からなる群から選択されるアミノ酸配列、又は配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、及び配列番号7に少なくとも85%の配列相同性を有するアミノ酸配列を有するインテグリン結合ペプチドと、
VEGF受容体の細胞外ドメインを含む他のタンパク質結合ペプチドと、
Fcドメインと、
を含み、
前記インテグリン結合ペプチドは、RGDモチーフに、又はRGDモチーフの近隣に少なくとも1つの変異を有する、
融合タンパク質。 - ディスインテグリン及びそのインテグリン結合フラグメントを含むインテグリン結合ペプチドと、
VEGF受容体の細胞外ドメインを含む他のタンパク質結合ペプチドと、
Fcドメインと、
を含み、
前記インテグリン結合ペプチドは、RGDモチーフに、又はRGDモチーフの近隣に少なくとも1つの変異を有する、
融合タンパク質。 - RGDモチーフに、又はRGDモチーフの近隣に少なくとも1つの変異を有する配列番号1のアミノ酸配列、配列番号1に少なくとも85%の配列相同性を有するアミノ酸配列、及び配列番号2のアミノ酸配列からなる群から選択されるインテグリン結合部分と、
イムノグロブリンCH2ドメイン及びCH3ドメインを含むヒト又はヒト化定常サブ領域と、
VEGFR1のIg様ドメインD2及びVEGFR2のIg様ドメインD3を有する他のタンパク質結合ペプチドと、
を含む、融合タンパク質。 - C末端からN末端に、前記インテグリン結合ペプチド、前記Fcドメイン及び前記他のタンパク質結合ペプチドを含む、請求項1から3のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- N末端からC末端に、前記インテグリン結合ペプチド、前記Fcドメイン及び前記他のタンパク質結合ペプチドを含む、請求項1から3のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記インテグリン結合ペプチドが配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、又は配列番号7に少なくとも85%の配列相同性を有する、請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記インテグリン結合ペプチドが配列番号2に少なくとも85%の配列相同性を有する、請求項7に記載の融合タンパク質。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質をコードする核酸。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質の二量体。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質をコードする核酸配列を含む、ベクター。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質をコードする核酸を含む宿主細胞を、前記融合タンパク質を産生する条件下で培養することと、前記宿主細胞によって産生された前記融合タンパク質を回収することと、を含む、融合タンパク質の製造方法。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載の有効量の融合タンパク質を、それを必要とする対象に投与することを含む、血管新生の疾患を治療/予防する方法。
- 前記インテグリン結合ペプチドと前記他のタンパク質結合ペプチドとの間にリンカー配列をさらに含む、請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記他のタンパク質結合ペプチドの上流にシグナルペプチド配列をさらに含む、請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
- 前記血管新生因子は、アンジオポエチン(ANG)、エフリン(Eph)、線維芽細胞増殖因子(FGF)、ニューロピリン(NRP)、プラスミノーゲン活性剤、ウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化剤受容体(uPAR)、血小板由来増殖因子(PDGF)、腫瘍増殖因子ベータ(TGF−β)、血管内皮増殖因子(VEGF)、血管内皮カドヘリン(VE−カドヘリン)、インシュリン様成長因子(IGF)、結合組織成長因子(CTGF)、腫瘍壊死因子アルファ(TNF−α)、インターロイキン1(IL−1)、インターロイキン6(IL−6)、顆粒球−マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)、及びその受容体を含む、請求項1に記載の融合タンパク質。
- 請求項1から4のいずれか一項に記載の融合タンパク質と、薬学的に許容される補助剤、担体又は賦形剤と、を含む組成物。
- 前記血管新生の疾患が、関節リウマチ、炎症性関節炎、変形性関節炎、眼及び全身のがん、腫瘍関連転移及び浸潤、突発性肺線維症(IPF)、非アルコール性脂肪性肝炎(NASH)又は肝線維症、糖尿病性腎症及び/又は腎線維症、皮膚線維症又はケロイド、創傷治癒、心臓線維症、虚血で誘導される脳卒中を含む全身の線維性疾患、血管形成又は虚血によって特徴づけられる眼疾患(脈絡膜の血管形成を含む)、ぶどう膜炎、網膜色素変性症、加齢黄斑変性症(AMD)、糖尿病性網膜症及び糖尿病黄斑浮腫(DME)を含む、請求項13に記載の方法。
- 前記VEGF受容体の細胞外ドメインがVEGF受容体のIg様ドメインD1−D7を含む、請求項2又は3に記載の融合タンパク質。
- 前記VEGF受容体の細胞外ドメインが、i)VEGFR1のIg様ドメインD2及びVEGFR2のIg様ドメインD3、ii)配列番号10のアミノ酸配列、又はiii)配列番号10に少なくとも90%の相同性を有するアミノ酸配列、を含む、請求項2又は3に記載の融合タンパク質。
- 前記Fcドメインと前記インテグリン結合ペプチド又は前記他のタンパク質結合ペプチドとの間にGS又はG9リンカーをさらに含む、請求項1から3のいずれか一項に記載の融合タンパク質。
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