JP2018519828A - 新規トランスアミナーゼ、及びそれを利用したアミノ化合物の脱アミン方法 - Google Patents
新規トランスアミナーゼ、及びそれを利用したアミノ化合物の脱アミン方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2018519828A JP2018519828A JP2017567772A JP2017567772A JP2018519828A JP 2018519828 A JP2018519828 A JP 2018519828A JP 2017567772 A JP2017567772 A JP 2017567772A JP 2017567772 A JP2017567772 A JP 2017567772A JP 2018519828 A JP2018519828 A JP 2018519828A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- acid
- polypeptide
- transaminase
- reaction
- microorganism
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 108090000340 Transaminases Proteins 0.000 title claims abstract description 99
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 37
- 102000003929 Transaminases Human genes 0.000 title claims abstract description 6
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 title description 4
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 93
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 90
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 90
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 75
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims abstract description 51
- -1 amino compound Chemical class 0.000 claims abstract description 35
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 claims abstract description 26
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims abstract description 26
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 claims abstract description 26
- SLXKOJJOQWFEFD-UHFFFAOYSA-N 6-aminohexanoic acid Chemical compound NCCCCCC(O)=O SLXKOJJOQWFEFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 79
- 229960002684 aminocaproic acid Drugs 0.000 claims description 77
- JJMDCOVWQOJGCB-UHFFFAOYSA-N 5-aminopentanoic acid Chemical compound [NH3+]CCCCC([O-])=O JJMDCOVWQOJGCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 63
- JRLGPAXAGHMNOL-LURJTMIESA-N N(2)-acetyl-L-ornithine Chemical compound CC(=O)N[C@H](C([O-])=O)CCC[NH3+] JRLGPAXAGHMNOL-LURJTMIESA-N 0.000 claims description 51
- NGVDGCNFYWLIFO-UHFFFAOYSA-N pyridoxal 5'-phosphate Chemical compound CC1=NC=C(COP(O)(O)=O)C(C=O)=C1O NGVDGCNFYWLIFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 42
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 33
- 235000007682 pyridoxal 5'-phosphate Nutrition 0.000 claims description 21
- 239000011589 pyridoxal 5'-phosphate Substances 0.000 claims description 21
- 229960001327 pyridoxal phosphate Drugs 0.000 claims description 21
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 20
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 18
- 229960003692 gamma aminobutyric acid Drugs 0.000 claims description 16
- OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N (+/-)-DABA Natural products NCCC(N)C(O)=O OGNSCSPNOLGXSM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-L 2-oxoglutarate(2-) Chemical compound [O-]C(=O)CCC(=O)C([O-])=O KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-L 0.000 claims description 14
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 14
- PNPPVRALIYXJBW-UHFFFAOYSA-N 6-oxohexanoic acid Chemical compound OC(=O)CCCCC=O PNPPVRALIYXJBW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 7
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 7
- VBKPPDYGFUZOAJ-UHFFFAOYSA-N 5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCCC=O VBKPPDYGFUZOAJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 claims description 3
- RFMMMVDNIPUKGG-YFKPBYRVSA-N N-acetyl-L-glutamic acid Chemical compound CC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O RFMMMVDNIPUKGG-YFKPBYRVSA-N 0.000 claims description 3
- LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M Pyruvate Chemical compound CC(=O)C([O-])=O LCTONWCANYUPML-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 3
- KHPXUQMNIQBQEV-UHFFFAOYSA-N oxaloacetic acid Chemical compound OC(=O)CC(=O)C(O)=O KHPXUQMNIQBQEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- UIUJIQZEACWQSV-UHFFFAOYSA-N succinic semialdehyde Chemical compound OC(=O)CCC=O UIUJIQZEACWQSV-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 2
- 238000005576 amination reaction Methods 0.000 claims 1
- 102000014898 transaminase activity proteins Human genes 0.000 description 91
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 59
- WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-N adipic acid Chemical compound OC(=O)CCCCC(O)=O WNLRTRBMVRJNCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 32
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 30
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 28
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 28
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 27
- WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N L-glutamic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O WHUUTDBJXJRKMK-VKHMYHEASA-N 0.000 description 24
- 229930195712 glutamate Natural products 0.000 description 24
- 241000589614 Pseudomonas stutzeri Species 0.000 description 23
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 20
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 18
- 238000004809 thin layer chromatography Methods 0.000 description 17
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 16
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 16
- 239000001361 adipic acid Substances 0.000 description 16
- 235000011037 adipic acid Nutrition 0.000 description 16
- KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 2-oxoglutaric acid Chemical compound OC(=O)CCC(=O)C(O)=O KPGXRSRHYNQIFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 13
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 12
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 12
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 11
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 10
- 238000006481 deamination reaction Methods 0.000 description 10
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 10
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 10
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 9
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 8
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 8
- JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 2-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]ethanesulfonic acid Chemical compound OCC[NH+]1CCN(CCS([O-])(=O)=O)CC1 JKMHFZQWWAIEOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 239000007995 HEPES buffer Substances 0.000 description 7
- 241000212210 Pseudomonas stutzeri A1501 Species 0.000 description 7
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 7
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 7
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 7
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 7
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical compound C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- HWXBTNAVRSUOJR-UHFFFAOYSA-N alpha-hydroxyglutaric acid Natural products OC(=O)C(O)CCC(O)=O HWXBTNAVRSUOJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229940009533 alpha-ketoglutaric acid Drugs 0.000 description 6
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 6
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 6
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 5
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 5
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 5
- 230000009615 deamination Effects 0.000 description 5
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 5
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 4
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 4
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 4
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 4
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 4
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 4
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 4
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 4
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 4
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 4
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 description 4
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 238000005891 transamination reaction Methods 0.000 description 4
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 4
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 4
- 108010060511 4-Aminobutyrate Transaminase Proteins 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 3
- 102100035923 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial Human genes 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MWUXSHHQAYIFBG-UHFFFAOYSA-N Nitric oxide Chemical compound O=[N] MWUXSHHQAYIFBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 3
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 description 3
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 3
- 150000001412 amines Chemical class 0.000 description 3
- 101150050866 argD gene Proteins 0.000 description 3
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 3
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HMUNWXXNJPVALC-UHFFFAOYSA-N 1-[4-[2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)pyrimidin-5-yl]piperazin-1-yl]-2-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)ethanone Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)N1CCN(CC1)C(CN1CC2=C(CC1)NN=N2)=O HMUNWXXNJPVALC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010049445 Acetylornithine transaminase Proteins 0.000 description 2
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 2
- 102000005369 Aldehyde Dehydrogenase Human genes 0.000 description 2
- 108020002663 Aldehyde Dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 241000741267 Enterobacteriaceae bacterium Species 0.000 description 2
- 101100217185 Pseudomonas aeruginosa (strain ATCC 15692 / DSM 22644 / CIP 104116 / JCM 14847 / LMG 12228 / 1C / PRS 101 / PAO1) aruC gene Proteins 0.000 description 2
- 241000589755 Pseudomonas mendocina Species 0.000 description 2
- 241000589776 Pseudomonas putida Species 0.000 description 2
- 241000589615 Pseudomonas syringae Species 0.000 description 2
- 101100022072 Sulfolobus acidocaldarius (strain ATCC 33909 / DSM 639 / JCM 8929 / NBRC 15157 / NCIMB 11770) lysJ gene Proteins 0.000 description 2
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 2
- 230000000875 corresponding effect Effects 0.000 description 2
- JHIVVAPYMSGYDF-UHFFFAOYSA-N cyclohexanone Chemical compound O=C1CCCCC1 JHIVVAPYMSGYDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HGCIXCUEYOPUTN-UHFFFAOYSA-N cyclohexene Chemical compound C1CCC=CC1 HGCIXCUEYOPUTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 2
- 241001238031 gamma proteobacterium BP44-iso8 Species 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 2
- 125000000468 ketone group Chemical group 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 241001300301 uncultured bacterium Species 0.000 description 2
- OHVLMTFVQDZYHP-UHFFFAOYSA-N 1-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)-2-[4-[2-[[3-(trifluoromethoxy)phenyl]methylamino]pyrimidin-5-yl]piperazin-1-yl]ethanone Chemical compound N1N=NC=2CN(CCC=21)C(CN1CCN(CC1)C=1C=NC(=NC=1)NCC1=CC(=CC=C1)OC(F)(F)F)=O OHVLMTFVQDZYHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WZFUQSJFWNHZHM-UHFFFAOYSA-N 2-[4-[2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)pyrimidin-5-yl]piperazin-1-yl]-1-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)ethanone Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)N1CCN(CC1)CC(=O)N1CC2=C(CC1)NN=N2 WZFUQSJFWNHZHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IHCCLXNEEPMSIO-UHFFFAOYSA-N 2-[4-[2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)pyrimidin-5-yl]piperidin-1-yl]-1-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)ethanone Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)C1CCN(CC1)CC(=O)N1CC2=C(CC1)NN=N2 IHCCLXNEEPMSIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000186146 Brevibacterium Species 0.000 description 1
- 241000186216 Corynebacterium Species 0.000 description 1
- XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N Cyclohexane Chemical compound C1CCCCC1 XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- 241000588698 Erwinia Species 0.000 description 1
- 229920002444 Exopolysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 241000720950 Gluta Species 0.000 description 1
- SDVXSCSNVVZWDD-LURJTMIESA-N L-2-succinylamino-6-oxoheptanedioic acid Chemical compound OC(=O)CCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCC(=O)C(O)=O SDVXSCSNVVZWDD-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- 239000006137 Luria-Bertani broth Substances 0.000 description 1
- GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N Nitric acid Chemical compound O[N+]([O-])=O GRYLNZFGIOXLOG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004677 Nylon Substances 0.000 description 1
- 229920002292 Nylon 6 Polymers 0.000 description 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004952 Polyamide Substances 0.000 description 1
- 241000588768 Providencia Species 0.000 description 1
- 241000520900 Pseudomonas resinovorans Species 0.000 description 1
- 241000589774 Pseudomonas sp. Species 0.000 description 1
- 206010038997 Retroviral infections Diseases 0.000 description 1
- 241000293869 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium Species 0.000 description 1
- 241000607720 Serratia Species 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 1
- 150000004716 alpha keto acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000005571 anion exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 description 1
- 239000003782 beta lactam antibiotic agent Substances 0.000 description 1
- 238000006065 biodegradation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 230000001851 biosynthetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000036983 biotransformation Effects 0.000 description 1
- 239000006227 byproduct Substances 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 238000001311 chemical methods and process Methods 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 238000000975 co-precipitation Methods 0.000 description 1
- 239000005515 coenzyme Substances 0.000 description 1
- 238000010835 comparative analysis Methods 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 238000002425 crystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000008025 crystallization Effects 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 150000001923 cyclic compounds Chemical class 0.000 description 1
- HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N cyclohexanol Chemical compound OC1CCCCC1 HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000006240 deamidation Effects 0.000 description 1
- 238000007357 dehydrogenase reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 229940049906 glutamate Drugs 0.000 description 1
- 238000000227 grinding Methods 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 1
- 239000013067 intermediate product Substances 0.000 description 1
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 238000004811 liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- PWPJGUXAGUPAHP-UHFFFAOYSA-N lufenuron Chemical compound C1=C(Cl)C(OC(F)(F)C(C(F)(F)F)F)=CC(Cl)=C1NC(=O)NC(=O)C1=C(F)C=CC=C1F PWPJGUXAGUPAHP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 1
- 108010046778 molybdenum cofactor Proteins 0.000 description 1
- HPEUEJRPDGMIMY-IFQPEPLCSA-N molybdopterin Chemical compound O([C@H]1N2)[C@H](COP(O)(O)=O)C(S)=C(S)[C@@H]1NC1=C2N=C(N)NC1=O HPEUEJRPDGMIMY-IFQPEPLCSA-N 0.000 description 1
- 125000000896 monocarboxylic acid group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 1
- 238000002887 multiple sequence alignment Methods 0.000 description 1
- FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N ninhydrin Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(O)(O)C(=O)C2=C1 FEMOMIGRRWSMCU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910017604 nitric acid Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920001778 nylon Polymers 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 1
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 1
- 239000008031 plastic plasticizer Substances 0.000 description 1
- 229920002647 polyamide Polymers 0.000 description 1
- 239000000376 reactant Substances 0.000 description 1
- 230000036647 reaction Effects 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 1
- 239000002132 β-lactam antibiotic Substances 0.000 description 1
- 229940124586 β-lactam antibiotics Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1096—Transferases (2.) transferring nitrogenous groups (2.6)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
- C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
- C12P13/14—Glutamic acid; Glutamine
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y206/00—Transferases transferring nitrogenous groups (2.6)
- C12Y206/01—Transaminases (2.6.1)
- C12Y206/01011—Acetylornithine transaminase (2.6.1.11)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
本開示の他の目的は、前記ポリペプチドをコーディングするポリヌクレオチドを提供することである。
前記ポリペプチド及び前記ポリヌクレオチドは、それぞれ前述の通りである。
本開示において用語「作動可能に連結」とは、本開示のトランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドをコーディングするポリヌクレオチドの転写を開始して媒介させるプローモーター配列と、前記遺伝子配列とが機能的に連結されていることを意味する。発現ベクターとの作動可能な連結は、当業界公知の遺伝子組み換え技術を利用して製造することができ、部位特異的DNA切断及び連結は、当業界の切断酵素及び連結酵素などを使用して作製することができる。
本開示において用語「形質転換された微生物」は、前記トランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドを発現することができる微生物であるならば、原核微生物及び真核微生物のいずれも含まれる。前記微生物は、例えば、エシェリキア(Escherichia)属、エルウィニア(Erwinia)属、セラチア(Serratia)属、プロビデンシア(Providencia)属、コリネバクテリウム(Corynebacterium)属またはブレビバクテリウム(Brevibacterium)属に属する微生物菌株でもある。前記微生物は、具体的には、エシェリキア属微生物でもあり、さらに具体的には、大腸菌でもある。
前記方法において、前記トランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドは、前述の通りである。
前記方法において、前記トランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドを発現する微生物は、本開示のトランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドをコーディングするポリヌクレオチドを含む組み換えベクターに形質転換された微生物でもある。前記形質転換された微生物は、前述の通りである。前記微生物は、微生物の培養物、または微生物の粉砕液(lysate)の形態で、アミノ化合物が含有された溶液に加えられる。
前記アミノ化合物は、例えば、N−アセチルオルニチン、ガンマアミノ酪酸、5−アミノ吉草酸及び6−アミノカプロン酸からなる群から選択される1以上でもあるが、それらに限定されるものではない。また、前記アミノ化合物は、具体的には、ガンマアミノ酪酸、5−アミノ吉草酸または6−アミノカプロン酸でもある。
前記アミノ化合物が含有された溶液は、ピルベート(pyruvate)、オキサロ酢酸(oxaloacetate)及びα−ケトグルタレート(α−ketoglutarate)からなる群から選択される1以上、及びリン酸ピリドキサールを含んでもよい。前記リン酸ピリドキサールは、本開示のポリペプチドのトランスアミナーゼの反応において、助酵素としても要求される。また、前記ピルベート、オキサロ酢酸及びα−ケトグルタレートは、反応において、アミノ基から離脱されたアミノ基を受容するアミン受容体(amine acceptor)としても利用される。
1)6−アミノカプロン酸を窒素源として使用する微生物選別及び16Sr RNA分析
窒素源を6−アミノカプロン酸(6−ACA)に固定させ、継代培養方法を介して、6−アミノカプロン酸を脱アミンさせることができる新規菌株シュードモナス・スタッツェリCJ−MKBを選別した。選別のために、微生物が培養される最小培地を、下記表1の組成のように製造し、菌株培養に必要な窒素源として6−アミノカプロン酸を使用した。
選別された菌株が、シュードモナス属微生物であるか否かということを確認するために、シュードモナス種に存在する酸化還元酵素(oxidoreductase)の塩基配列を、新規菌株CJ−MKBが有している否かということを分析した。そのために、新たにデザインしたプライマーNCPPB 5P(ATGAGCAAGACTAACGAATCCC:配列番号20)及びプライマーNCPPB 3P(TCCAGAATGGCCAGCCCGCG:配列番号21)を利用して、配列分析を進めた。その結果、配列番号2の塩基配列を有するということを確認した。
相同性が確認された核酸配列は、714個の短い配列であるので、微生物の従属を正確に分類することができなかった。そのために、さらなるタンパク質核酸配列を分析して従属を確認した。該微生物が、6−ACAを窒素源として使用する場合、その酵素転換反応に関与すると予想されるトランスアミナーゼのうち、N−アセチルオルニチントランスアミナーゼまたは4−アミノブチレートトランスアミナーゼが特異的であると予想し、前記2つの酵素活性を有するタンパク質の塩基配列を確認した。
結論として、選別された菌株シュードモナス・スタッツェリCJ−MKB(Pseudomonas stutzeri CJ−MKB)は、現在まで知られた微生物遺伝体配列内に、シュードモナス・スタッツェリA1501と最も高い相同性を有し、新たな菌株であるということが確認された。それにより、選別された菌株を、2014年10月22日付けで、韓国微生物保存センターに寄託し、受託番号KCCM11587Pを受けた。
シュードモナス・スタッツェリCJ−MKBの5−アミノ吉草酸及び6−アミノカプロン酸の脱アミン化反応性評価を行った。トランスアミナーゼの反応は、アミン基とケトン基との置換反応であるので、反応結果物は、薄層クロマトグラフィ(TLC)を利用した物質分離後、ニンヒドリン(ninhydrin)のアミン基発色反応を介して、基質及び生成物を容易に確認することができる。シュードモナス・スタッツェリCJ−MKBのトランスアミナーゼ活性確認のために、前細胞反応を進めた。シュードモナス・スタッツェリCJ−MKBを培養し、光学密度が0.7に逹したとき、新たなM9培地で継代培養し、6−アミノカプロン酸と5−アミノ吉草酸とを窒素源として固定させて培養を進めた。前記培地に必要なアルファ−ケトグルタレートとリン酸ピリドキサールとを入れ、5−アミノ吉草酸及び6−アミノカプロン酸の脱アミン程度確認のために、TLCを行った。反応体積は、100μlであり、5−アミノ吉草酸、6−アミノカプロン酸、アルファ−ケトグルタレート、リン酸ピリドキサールの多様な濃度、それぞれの基質有無によるグルタメート(glutamate)の生成、及び基質の分解程度をTLC上で比較した。TLC展開が終わり、3%ニンヒドリン溶液で、アミン基が存在する物質を発色させた。TLC結果を介して、5−アミノ吉草酸、6−アミノカプロン酸が消滅し、グルタメートが生成されるということを確認することができた(図2Aないし図2F)。
1)大腸菌でのシュードモナス・スタッツェリCJ−MKB菌株由来トランスアミナーゼ活性を有するポリペプチド過発現誘導
実施例1で選別及び同定された新規シュードモナス・スタッツェリCJ−MKB菌株から、脱アミン反応に関与すると予想されたトランスアミナーゼと推定される酵素の活性を確認する実験を進めた。配列分析を介して、前記シュードモナス・スタッツェリCJ−MKBのトランスアミナーゼをコーディングする遺伝子(以下、「argD」とする)の塩基配列を確認した(配列番号4)。
実施例3−1のN−アセチルオルニチントランスアミナーゼが過発現された大腸菌粉砕液を利用して、アミノ化合物(ガンマアミノ酪酸、6−アミノカプロン酸及びN−アセチルオルニチン)それぞれに対する反応性を評価した。10mMの前記アミノ化合物それぞれ3種、10mMのアルファケトグルタレート及び0.1mMリン酸ピリドキサールを入れ、過発現されたN−アセチルオルニチントランスアミナーゼの活性を評価した。過発現が誘導された大腸菌粉砕液(cell lysate)50μlと基質とを添加し、50mM HEPES緩衝液(pH8.0)で充填し、100μl体積で反応を進めた。37℃で30分の反応後、6−アミノカプロン酸の脱アミン反応程度をTLCで確認した(図4)。
前記実施例3を介して、シュードモナス・スタッツェリCJ−MKB由来トランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドの6−アミノカプロン酸に対する脱アミン活性が評価された。それにより、同一生転換反応が可能であると判断されるシュードモナス・メンドシナ(Pseudomonas mendocina)、シュードモナス・プチダ(P.putida)、シュードモナス・レジノボランス(P.resinovorans)、シュードモナス・シリンガエ(P.syringae)、シュードモナス・サーモトレランス(P.thermotolerans)などの多様なシュードモナス属微生物由来のN−アセチルオルニチントランスアミナーゼ遺伝子を大腸菌に発現させ、その反応性を評価した。
シュードモナス属微生物のうち5個の菌株を選定し、NCBI(National Center for Biotechnology Information)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)で提供されるnucleotideとgenomeとのプログラムを利用して、シュードモナス・メンドシナ、シュードモナス・プチダ、シュードモナス・レジノボランス、シュードモナス・シリンガエ、シュードモナス・サーモトレランス由来のN−アセチルオルニチントランスアミナーゼの遺伝子とアミノ酸配列とを確認し、シュードモナス・スタッツェリCJ−MKB由来トランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドのアミノ酸配列と相同性とを比較した(表2)。各シュードモナス属微生物に由来したそれぞれの酵素は、互いに約75以上%のアミノ酸相同性を示した。
前記実施例4−1)の5種のシュードモナス菌株から得られたN−アセチルオルニチントランスアミナーゼ遺伝子、及び本開示のシュードモナス・スタッツェリCJ−MKB由来トランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドの遺伝子を、実施例3−1)のような方法で大腸菌で発現させ、His−tagカラムを利用して精製されたタンパク質を得ることができた。得られたタンパク質を、SDS−PAGEゲル上で比較した結果、正常な精製がなされているということを確認した(図6)。
実施例4−2)で精製されたタンパク質(図6のレーン3,5,7,9,11,13)をもって、6−アミノカプロン酸に対する反応性を検証した。具体的には、20mM 6−アミノカプロン酸、10mMアルファ−ケトグルタレート、及び0.1mMのリン酸ピリドキサールに、精製されたそれぞれのN−アセチルオルニチントランスアミナーゼを、全体反応液の0.5mg/ml濃度で添加した。前記混合液に、50mM HEPES緩衝液(pH8.0)を付加し、100μlの体積で反応を進めた。37℃で1時間の反応後、反応完了したサンプル10μlを、990μlのエチルアルコールに希釈し、酵素活性を除去した。その後、14,000rpm、4℃、10分の条件で遠心分離し、上澄み液のうち10μlを、990μlの滅菌蒸溜水(sterilized distilled water)で希釈し、液体クロマトグラフィ質量分析機(LC−MASS)で、6−アミノカプロン酸の減少程度を分析した。
P.サーモトレランス由来のN−アセチルオルニチントランスアミナーゼ反応サンプルのアルデヒド生成が、LC−Mass結果と比較して高く測定されたが、全体的な反応程度は、同一順であると確認された。また、LC−Massの結果と、シフ試薬結果とが相関関係を有すると確認された。
実施例4−3)で反応性確認された5種のシュードモナス種由来のN−アセチルオルニチントランスアミナーゼ、及び本開示のポリペプチドの多様な基質に係わる反応性を評価した。10mMアルファ−ケトグルタレート、0.1mMのリン酸ピリドキサールと共に、それぞれ全体反応液の10mM濃度で、N−アセチルオルニチン、ガンマアミノ酪酸または5−アミノ吉草酸、及び全体反応液の0.5mg/ml濃度で、N−アセチルオルニチントランスアミナーゼを添加し、37℃で1時間反応させた。総100μlの反応物のうち10μlを、180μlの50mM HEPES緩衝液(pH8.0)に希釈し、10μlのシフ試薬を使用して、30分間反応させた後、96ウェルプレートリーダを利用して、相対的な酵素活性を比較した。
前記実施例4を介して、多様なシュードモナス由来のN−アセチルオルニチントランスアミナーゼ、及び本開示のポリペプチドが6−アミノカプロン酸などのアミン化合物を脱アミンさせながら、アジペートセミアルデヒドなどに転換されるということを確認した。本実施例においては、その逆反応として、アジペートセミアルデヒドから6−アミノカプロン酸への転換反応性を確認するために、N−アセチルオルニチントランスアミナーゼによって生成されるアジペートセミアルデヒドが存在する状況において、過量のグルタメートを処理することにより、アジペートセミアルデヒドがさらに6−アミノカプロン酸に生成されるか否かということを確認した。
受託番号:KCCM11587P
受託日:20141022
受託番号:KCCM11588P
受託日:20141022
Claims (12)
- 配列番号7のアミノ酸配列、またはそれと75%以上の相同性を有するアミノ酸配列を含み、アミノ化合物に対するトランスアミナーゼ活性を有する分離されたポリペプチド。
- 前記アミノ化合物は、N−アセチルオルニチン、ガンマアミノ酪酸、5−アミノ吉草酸及び6−アミノカプロン酸からなる群から選択される1以上であることを特徴とする請求項1に記載のポリペプチド。
- 請求項1に記載のトランスアミナーゼ活性を有するポリペプチドをコーディングする ポリヌクレオチド。
- 前記ポリヌクレオチドは、配列番号4のヌクレオチド配列を含むことを特徴とする請求項3に記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1に記載のポリペプチドを発現するように形質転換された微生物。
- 前記微生物は、エシェリキア属であることを特徴とする請求項5に記載の微生物。
- 前記微生物は、大腸菌であることを特徴とする請求項6に記載の微生物。
- 請求項1に記載のポリペプチド、または請求項5に記載の微生物を、アミノ化合物が含有された溶液に加える段階を含むアミノ化合物を脱アミン化させる方法。
- 前記アミノ化合物は、N−アセチルオルニチン、ガンマアミノ酪酸、5−アミノ吉草酸及び6−アミノカプロン酸からなる群から選択される1以上であることを特徴とする請求項8に記載のアミノ化合物を脱アミン化させる方法。
- 前記溶液は、ピルベート、オキサロ酢酸及びアルファ−ケトグルタレートからなる群から選択される1以上、並びにリン酸ピリドキサールを追加して含むことを特徴とする請求項9に記載のアミノ化合物を脱アミン化させる方法。
- 請求項1に記載のポリペプチド、または請求項5に記載の微生物を、セミアルデヒド化合物が含有された溶液に加える段階を含むアミノ化合物を生産する方法。
- 前記セミアルデヒド化合物は、N−アセチルグルタメート5−セミアルデヒド、スクシネートセミアルデヒド、グルタレートセミアルデヒド及びアジペートセミアルデヒドからなる群から選択される1以上であることを特徴とする請求項11に記載のアミノ化合物を生産する方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR10-2015-0094943 | 2015-07-02 | ||
KR1020150094943A KR20170004510A (ko) | 2015-07-02 | 2015-07-02 | 신규 트랜스아미나제 및 이를 이용한 아미노 화합물의 탈아민 방법 |
PCT/KR2016/005870 WO2017003104A1 (ko) | 2015-07-02 | 2016-06-03 | 신규 트랜스아미나제 및 이를 이용한 아미노 화합물의 탈아민 방법 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2018519828A true JP2018519828A (ja) | 2018-07-26 |
JP6837014B2 JP6837014B2 (ja) | 2021-03-03 |
Family
ID=57608381
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2017567772A Active JP6837014B2 (ja) | 2015-07-02 | 2016-06-03 | 新規トランスアミナーゼ、及びそれを利用したアミノ化合物の脱アミン方法 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US10538747B2 (ja) |
EP (1) | EP3318629B1 (ja) |
JP (1) | JP6837014B2 (ja) |
KR (1) | KR20170004510A (ja) |
CN (1) | CN107922928B (ja) |
BR (1) | BR112017028617A2 (ja) |
MY (1) | MY190201A (ja) |
RU (1) | RU2718778C9 (ja) |
WO (1) | WO2017003104A1 (ja) |
Families Citing this family (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR102597723B1 (ko) * | 2021-10-20 | 2023-11-03 | 홍익대학교세종캠퍼스산학협력단 | 5-아미노발레르산으로부터 글루타르산으로의 전환 방법 |
Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR19980050070A (ko) * | 1996-12-20 | 1998-09-15 | 손경식 | D-아미노산 아미노트랜스퍼라아제 활성을 갖는 고온성 균주 바실러스 스티아로더모필러스 kl-01 |
KR19990039948A (ko) * | 1997-11-15 | 1999-06-05 | 박원훈 | 2고온성 미생물 바실러스 속 균주 유래의 내열성 d-아미노산 아미노트랜스퍼라아제를 암호하는 유전자 및이를 이용한 d-아미노산 아미노트랜스퍼라아제의 제조방법 |
JP2003159075A (ja) * | 2001-11-26 | 2003-06-03 | Tosoh Corp | 蛋白質、それをコードするdna、及び宿主細胞 |
WO2004053125A1 (ja) * | 2002-12-09 | 2004-06-24 | Ajinomoto Co., Inc. | 変異型d−アミノトランスフェラーゼおよびこれを用いた光学活性グルタミン酸誘導体の製造方法 |
WO2012050125A1 (ja) * | 2010-10-14 | 2012-04-19 | 味の素株式会社 | モナティンの製造方法 |
KR20140128174A (ko) * | 2013-04-26 | 2014-11-05 | 상지대학교산학협력단 | 아미노트랜스퍼라제 활성 강화를 통하여 l-오르니틴 생산능이 향상된 미생물 및 이를 이용한 l-오르니틴의 제조방법 |
WO2014197941A1 (en) * | 2013-06-12 | 2014-12-18 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation | Transaminase biocatalysts |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2252577A2 (en) | 2008-03-11 | 2010-11-24 | DSM IP Assets B.V. | Preparation of 6-aminocaproic acid from 5-formylvaleric acid |
EP3354727B1 (en) * | 2009-01-08 | 2020-10-07 | Codexis, Inc. | Transaminase polypeptides |
CN102597226B (zh) * | 2009-06-22 | 2015-08-19 | 科德克希思公司 | 转氨酶反应 |
US8771997B2 (en) | 2011-04-20 | 2014-07-08 | Ajinomoto Co., Inc. | Method for producing monatin using an L-amino acid aminotransferase |
-
2015
- 2015-07-02 KR KR1020150094943A patent/KR20170004510A/ko active Application Filing
-
2016
- 2016-06-03 RU RU2018101961A patent/RU2718778C9/ru active
- 2016-06-03 BR BR112017028617-3A patent/BR112017028617A2/pt active IP Right Grant
- 2016-06-03 EP EP16818137.8A patent/EP3318629B1/en active Active
- 2016-06-03 US US15/740,666 patent/US10538747B2/en active Active
- 2016-06-03 CN CN201680051231.2A patent/CN107922928B/zh active Active
- 2016-06-03 WO PCT/KR2016/005870 patent/WO2017003104A1/ko active Application Filing
- 2016-06-03 MY MYPI2017001964A patent/MY190201A/en unknown
- 2016-06-03 JP JP2017567772A patent/JP6837014B2/ja active Active
-
2019
- 2019-10-22 US US16/659,813 patent/US11091744B2/en active Active
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
KR19980050070A (ko) * | 1996-12-20 | 1998-09-15 | 손경식 | D-아미노산 아미노트랜스퍼라아제 활성을 갖는 고온성 균주 바실러스 스티아로더모필러스 kl-01 |
KR19990039948A (ko) * | 1997-11-15 | 1999-06-05 | 박원훈 | 2고온성 미생물 바실러스 속 균주 유래의 내열성 d-아미노산 아미노트랜스퍼라아제를 암호하는 유전자 및이를 이용한 d-아미노산 아미노트랜스퍼라아제의 제조방법 |
JP2003159075A (ja) * | 2001-11-26 | 2003-06-03 | Tosoh Corp | 蛋白質、それをコードするdna、及び宿主細胞 |
WO2004053125A1 (ja) * | 2002-12-09 | 2004-06-24 | Ajinomoto Co., Inc. | 変異型d−アミノトランスフェラーゼおよびこれを用いた光学活性グルタミン酸誘導体の製造方法 |
WO2012050125A1 (ja) * | 2010-10-14 | 2012-04-19 | 味の素株式会社 | モナティンの製造方法 |
KR20140128174A (ko) * | 2013-04-26 | 2014-11-05 | 상지대학교산학협력단 | 아미노트랜스퍼라제 활성 강화를 통하여 l-오르니틴 생산능이 향상된 미생물 및 이를 이용한 l-오르니틴의 제조방법 |
WO2014197941A1 (en) * | 2013-06-12 | 2014-12-18 | Commonwealth Scientific And Industrial Research Organisation | Transaminase biocatalysts |
Non-Patent Citations (9)
Title |
---|
DATABASE GENBANK,ACCESSION NO.WP_048329493.1,<HTTPS://WWW.NCBI.NLM.NIH.GOV/PROTEIN/852276940?SAT=46&, JPN6019004328 * |
DATABASE UNIPROTKB/TREMBL[ONLINE],ACCESSION NO.A4XWF0,<HTTPS://WWW.UNIPROT.ORG/UNIPROT/A4XWF0.TXT?VE, JPN6019004327 * |
DATABASE UNIPROTKB/TREMBL[ONLINE],ACCESSION NO.A5W0D2,<HTTPS://WWW.UNIPROT.ORG/UNIPROT/A5W0D2.TXT?VE, JPN6019004324 * |
DATABASE UNIPROTKB/TREMBL[ONLINE],ACCESSION NO.I7AZT5,<HTTPS://WWW.UNIPROT.ORG/UNIPROT/I7AZT5/.TXT?V, JPN6019004323 * |
DATABASE UNIPROTKB/TREMBL[ONLINE],ACCESSION NO.Q4ZQH5,<HTTPS://WWW.UNIPROT.ORG/UNIPROT/Q4ZQH5.TXT?VE, JPN6019004325 * |
DATABASE UNIPROTKB/TREMBL[ONLINE],ACCESSION NO.S6BL00,<HTTPS://WWW.UNIPROT.ORG/UNIPROT/S6BL00.TXT?VE, JPN6019004326 * |
DATABASE UNIPROTKB/TREMBL[ONLINE],ACCESSION NO.S6JJQ1,<HTTPS://WWW.UNIPROT.ORG/UNIPROT/S6JJQ1.TXT?VE, JPN6019004322 * |
PERDEEP K.MEHTA ET AL: "Aminotransferases:demonstration of homology and division into evolutionary subgroups", EUR.J.BIOCHEM., vol. vol.214, JPN6019004333, 1993, pages 49 - 561 * |
V.RAJARAM ET AL.: "Structure of biosynthetic N-acetylornithine aminotransferase from salmonella typhimurium:Studies on", PROTEINS, vol. vol.70, JPN6019004331, 2008, pages 29 - 441 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN107922928A (zh) | 2018-04-17 |
CN107922928B (zh) | 2021-09-14 |
RU2018101961A (ru) | 2019-08-05 |
RU2718778C2 (ru) | 2020-04-14 |
RU2718778C9 (ru) | 2020-09-01 |
JP6837014B2 (ja) | 2021-03-03 |
US10538747B2 (en) | 2020-01-21 |
US20190032030A1 (en) | 2019-01-31 |
US11091744B2 (en) | 2021-08-17 |
RU2018101961A3 (ja) | 2019-08-05 |
EP3318629A4 (en) | 2018-12-12 |
KR20170004510A (ko) | 2017-01-11 |
WO2017003104A1 (ko) | 2017-01-05 |
BR112017028617A2 (pt) | 2018-09-04 |
US20200040315A1 (en) | 2020-02-06 |
EP3318629B1 (en) | 2022-07-20 |
EP3318629A1 (en) | 2018-05-09 |
MY190201A (en) | 2022-04-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US11667936B2 (en) | Modified polypeptide with attenuated activity of citrate synthase and method for producing L-amino acid using the same | |
EP1784496B1 (en) | Biochemical synthesis of 1,4-butanediamine | |
JP4881739B2 (ja) | L−アルギニン、l−オルニチンまたはl−シトルリンの製造法 | |
JP5214633B2 (ja) | L−アルギニン生産コリネバクテリウムグルタミカム変異株およびその製造方法 | |
US10351839B2 (en) | Lysine decarboxylase having improved stability with a pH change, microorganism comprising a polynucleotide encoding the same, and method for producing cadaverine using the same | |
EP3498854B1 (en) | Method for the fermentative production of l-lysine | |
US11091744B2 (en) | Transaminases and method, for deaminating amino compound, using same | |
CN114540261A (zh) | 一种产氨基己二酸的基因工程菌 | |
KR101898171B1 (ko) | 신규 트랜스아미나제 및 이를 이용한 아미노 화합물의 탈아민 방법 | |
JP7214952B2 (ja) | オルニチン脱炭酸酵素変異型及びそれを用いたプトレシンの生産方法 | |
KR101716188B1 (ko) | 신규 트랜스아미나제 및 이를 이용한 아미노 화합물의 탈아민 방법 | |
JP2023506053A (ja) | クエン酸シンターゼの活性が弱化した新規な変異型ポリペプチド及びそれを用いたl-アミノ酸生産方法 | |
CN111471631A (zh) | 发酵产生l-赖氨酸的方法 | |
RU2805253C1 (ru) | Новый модифицированный полипептид с ослабленной активностью цитратсинтазы и способ получения L-аминокислоты с его использованием | |
TWI756604B (zh) | 鳥胺酸脫羧酶變異體、使用其製造丁二胺之方法、聚核苷酸、微生物、聚醯胺的製備方法以及聚醯胺製備用組成物 | |
WO2024005155A1 (ja) | 4-(アミノメチル)シクロヘキサン-1-カルボン酸の製造方法 | |
JP2022130759A (ja) | オルニチン脱炭酸酵素変異型及びそれを用いたプトレシンの生産方法 | |
TW201033370A (en) | Adipate (ester or thioester) synthesis |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180309 |
|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20180309 |
|
A977 | Report on retrieval |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971007 Effective date: 20190130 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20190212 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190509 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20190711 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190813 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20200204 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20200423 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20200626 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20200803 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20210112 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20210208 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6837014 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |