JP2018121646A - Mir−21活性を調節するためのマイクロrna化合物及び方法 - Google Patents

Mir−21活性を調節するためのマイクロrna化合物及び方法 Download PDF

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バルクリシェン バット
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Abstract

【課題】MIR−21活性を調節するためのマイクロRNA化合物及び方法の提供。【解決手段】miR−21の活性を阻害するための組成物及び方法であって、8〜22個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列はmiR−21と相補的であり、かつ前記修飾オリゴヌクレオチドは5’から3’方向に以下のヌクレオシドパターンIで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:(R)X−NB−NQ−NQ−NB−(NQ−NQ−NQ−NB)3−NQ−NZ。式中、Rは各々独立に非二環式ヌクレオシドであり;Xは1〜4であり;NBは各々独立に二環式ヌクレオシドであり;NQは各々独立に非二環式ヌクレオシドであり;かつNZは各々独立に修飾ヌクレオシドであるヌクレオシドを含む、化合物。【選択図】なし

Description

本出願は、いかなる目的においてもその全体を本明細書に援用する、2011年4月2
5日に出願された米国仮特許出願第61/478,767号明細書、及び2011年12
月1日に出願された同第61/565,779号明細書の優先権の利益を主張する。
本明細書で提供されるのは、miR−21活性を調節するための方法及び組成物である
「成熟型マイクロRNA」とも呼ばれるマイクロRNA(マイクロRNA)は、植物及
び動物のゲノムにコードされた小さな(約18〜24ヌクレオチド長)非コードRNA分
子である。高度に保存された、内因性に発現するマイクロRNAは、場合により、特異的
mRNAの3’−非翻訳領域(3’−UTR)に結合することによって遺伝子の発現を制
御する。植物及び動物では、1000種を超えるマイクロRNAが同定されている。ある
種の成熟型マイクロRNAは、数百ヌクレオチド長になることが多い長い内因性のRNA
一次転写物(プリ−マイクロRNA、pri−mirs、pri−miRまたはプリ−プ
レ−マイクロRNAとも呼ばれる)から生じると考えられる(Lee,et al.,E
MBO J.,2002,21(17),4663−4670)。
マイクロRNAの機能解析から、こうした小分子非コードRNA(small non
−coding RNA)が、発生タイミング、器官形成、分化、パターニング、胚形成
、増殖制御及びプログラムされた細胞死など動物の様々な生理的学プロセスに寄与してい
ることが明らかになった。マイクロRNAが関与する特定のプロセスの例として、幹細胞
分化、神経発生、血管新生、造血及びエキソサイトーシスが挙げられる(Alvarez
−Garcia and Miska,Development,2005,132,4
653−4662により概説される)。
本明細書で提供されるのは、修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、修飾オリ
ゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR−21と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオ
チドが本明細書に記載のヌクレオシドパターンを有する、化合物である。
本明細書で提供されるのは、miR−21の活性を阻害する方法であって、本明細書に
記載の化合物と細胞を接触させることを含む、方法である。ある種の実施形態では、細胞
はインビボにある。ある種の実施形態では、細胞はインビトロにある。
本明細書で提供されるのは、miR−21に関連する疾患を処置する方法であって、m
iR−21に関連する疾患を有する被検体に本明細書に記載の化合物を投与することを含
む、方法である。ある種の実施形態では、動物はヒトである。
本明細書に記載の化合物は、治療用に提供される。
本明細書で提供されるのは、8〜22個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌク
レオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR−21
(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが、5’から3’方向に以
下のヌクレオシドパターンIで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
(R)−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Rは各々独立に非二環式ヌクレオシドであり;Xは1〜4であり;Nは各々独立
に二環式ヌクレオシドであり;Nは各々独立に非二環式ヌクレオシドであり;かつN
は各々独立に修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
本明細書で提供されるのは、8〜19個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌク
レオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR−21
(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが5’から3’方向に以下
のヌクレオシドパターンIIで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Nは独立に、二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;Nは各々
独立に二環式ヌクレオシドであり;Nは各々独立に非二環式ヌクレオシドであり;かつ
は独立に修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
本明細書で提供されるのは、8〜19個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌク
レオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR−21
(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが5’から3’方向に以下
のヌクレオシドパターンIIIで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
(R)−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Rは各々、非二環式ヌクレオシドであり;Xは1〜4であり;Nは各々、二環式
ヌクレオシドであり;Nは各々、非二環式ヌクレオシドであり;Nは修飾ヌクレオシ
ドまたは非修飾ヌクレオシドであり;かつNは各々、修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
本明細書で提供されるのは、8〜19個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌク
レオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR−21
(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが5’から3’方向に以下
のヌクレオシドパターンIVで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Nは二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;Nは各々、二環式
ヌクレオシドであり;Nは各々、非二環式ヌクレオシドであり;Nは修飾ヌクレオシ
ドまたは非修飾ヌクレオシドであり;かつNは修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
本明細書で提供されるのは、8〜19個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌク
レオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がmiR−21
(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが5’から3’方向に以下
のヌクレオシドパターンVで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
−N−(N−N−N−N−N
式中、Nは二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;Nは各々、二環式
ヌクレオシドであり;Nは各々、非二環式ヌクレオシドであり;かつNは修飾ヌクレ
オシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
ヌクレオシドパターンIまたはIIIのある種の実施形態では、Xは1であるか、Xは
2であるか、Xは3であるかまたはXは4である。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド
は、ヌクレオシドパターンI、II、III、IVまたはVで少なくとも9個、少なくと
も10個、少なくとも11個、少なくとも12個、少なくとも13個、少なくとも14個
、少なくとも15個、少なくとも16個、少なくとも17個、少なくとも18個、少なく
とも19個、少なくとも20個、少なくとも21個または22個連続するヌクレオシドを
含む。本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオ
チドは、ヌクレオシドパターンI、II、III、IVまたはVで8個、9個、10個、
11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個、20個、
21個または22個連結したヌクレオシドからなる。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド
の核酸塩基配列は、miR−21(配列番号1)の核酸塩基配列と少なくとも90%相補
的、少なくとも95%相補的、または100%相補的である。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、miR−21の1番目の
核酸塩基は、修飾オリゴヌクレオチドの3’末端の1番目の核酸塩基と対を形成する。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、二環式ヌクレオシドは各
々、LNAヌクレオシド、cEtヌクレオシド及びENAヌクレオシドから独立に選択さ
れる。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、少なくとも2個の非二環
式ヌクレオシドは、互いに異なる糖部分を含む。本明細書に提供する化合物の何れかのあ
る種の実施形態では、非二環式ヌクレオシドは各々同じ種類の糖部分を有する。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、二環式ヌクレオシドは各
々cEtヌクレオシドである。ある種の実施形態では、cEtヌクレオシドはS−cEt
ヌクレオシドである。ある種の実施形態では、cEtヌクレオシドはR−cEtヌクレオ
シドである。本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、二環式ヌクレ
オシドは各々LNAヌクレオシドである。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、非二環式ヌクレオシドは
各々、β−D−デオキシリボヌクレオシド、β−D−リボヌクレオシド、2’−O−メチ
ルヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、及び2’−フルオロヌクレオ
シドから独立に選択される。本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では
、非二環式ヌクレオシドは各々、β−D−デオキシリボヌクレオシド及び2’−O−メト
キシエチルヌクレオシドから独立に選択される。本明細書に提供する化合物の何れかのあ
る種の実施形態では、非二環式ヌクレオシドは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドで
ある。本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、非二環式ヌクレオシ
ドは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、二環式ヌクレオシドは各
々、非メチル化核酸塩基を含む。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、2個以下の非二環式ヌク
レオシドは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。そうしたある種の実施形態で
は、非二環式ヌクレオシドは互いにβ−D−デオキシリボヌクレオシドである。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、最も5’側及び最も3’
側の非二環式ヌクレオシドは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり、非二環式ヌ
クレオシドは互いにβ−D−デオキシリボヌクレオシドである。本明細書に提供する化合
物の何れかのある種の実施形態では、2個の非二環式ヌクレオシドは2’−MOEヌクレ
オシドであり、非二環式ヌクレオシドは互いにβ−D−デオキシリボヌクレオシドである
ヌクレオシドパターンIまたはIIIのある種の実施形態では、Rのヌクレオシドは各
々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIまたはIII
のある種の実施形態では、Rの3個のヌクレオシドは2’−O−メトキシエチルヌクレオ
シドであり、Rの1個のヌクレオシドはβ−D−デオキシリボヌクレオシドである。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、少なくとも1つのヌクレ
オシド間結合は修飾ヌクレオシド間結合である。本明細書に提供する化合物の何れかのあ
る種の実施形態では、ヌクレオシド間結合は各々、修飾ヌクレオシド間結合である。ある
種の実施形態では、修飾ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合で
ある。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、少なくとも1個のヌクレ
オシドは、修飾核酸塩基を含む。本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態
では、少なくとも1つのシトシンは5−メチルシトシンである。本明細書に提供する化合
物の何れかのある種の実施形態では、シトシンは各々5−メチルシトシンである。本明細
書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの2番目
のシトシンは5−メチルシトシンである。
ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Rは4個連結したヌクレオシドN
−NR2−NR3−NR4からなり、NR1は2’−O−メトキシエチルヌクレオシド
であり、かつNR2−NR3−NR4は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
は各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシ
ドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。ヌクレオシドパタ
ーンIのある種の実施形態では、Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり
;Xは1であり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキ
シリボヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。
ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Rは各々2’−O−メトキシエチルヌ
クレオシドであり;Xは1であり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各
々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Rは各々2’−
O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;Nは各々S−cEtヌクレオ
シドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつNはS−cE
tヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Rは各々2’
−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;Nは各々LNAヌクレオシ
ドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつNは2’−O−
メトキシエチルヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、
Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;Nは各々LN
Aヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつN
はLNAヌクレオシドである。
ヌクレオシドパターンIIのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デ
オキシリボヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであ
る。ヌクレオシドパターンIIのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチ
ルヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々2’−O
−メトキシエチルヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシ
ドである。ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシ
エチルヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−
D−デオキシリボヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであ
り;かつNはS−cEtヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIIのある種の実
施形態では、Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Nは各々LNAヌ
クレオシドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつNは2
’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIIのある種の実施
形態では、Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Nは各々LNAヌク
レオシドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつNはLN
Aヌクレオシドである。
ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施形態では、Rは各々2’−O−メトキシエ
チルヌクレオシドであり;Xは1であり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;N
は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;Nはβ−D−デオキシリボヌクレ
オシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。ヌクレオシド
パターンIIIのある種の実施形態では、Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシ
ドであり;Xは1であり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D
−デオキシリボヌクレオシドであり;Nはβ−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
かつNはS−cEtヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施
形態では、Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;N
は各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドで
あり;NはS−cEtヌクレオシドであり;かつNはS−cEtヌクレオシドである
ヌクレオシドパターンIVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デ
オキシリボヌクレオシドであり;Nはβ−D−デオキシリボヌクレオシドであり;N
は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIVのある種の
実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Nは各々S−c
Etヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;N
β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつNはS−cEtヌクレオシドである。
ヌクレオシドパターンIVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチルヌ
クレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオ
キシリボヌクレオシドであり;NはS−cEtヌクレオシドであり;かつNはS−c
Etヌクレオシドである。
ヌクレオシドパターンVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチルヌ
クレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオ
キシリボヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド
は配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に選択される。
本明細書に提供する化合物の何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは
配列番号4の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に選択される。
本明細書で提供されるのは、本明細書に提供される化合物と細胞を接触させることを含
む、miR−21の活性を阻害する方法である。ある種の実施形態では、細胞はインビボ
にある。ある種の実施形態では、細胞はインビトロにある。ある種の実施形態では、細胞
は線維芽細胞、過剰増殖細胞、ケラチノサイトまたは低酸素細胞である。ある種の実施形
態では、線維芽細胞は過剰増殖線維芽細胞である。
本明細書で提供されるのは、細胞におけるコラーゲンの発現を低下させる方法であって
、本明細書に提供される化合物と細胞を接触させることを含む、方法である。
本明細書で提供されるのは、miR−21に関連する疾患の発症を処置、予防または遅
延させる方法であって、本明細書に提供する化合物の何れかをそうした疾患を有する被検
体に投与することを含む、方法である。
ある種の実施形態では、疾患は線維症である。ある種の実施形態では、線維症は腎線維
症、肺線維症、肝線維症、心線維症、皮膚線維症、加齢に伴う線維症、脾線維症、強皮症
または移植後の線維症である。
ある種の実施形態では、線維症は、腎線維症であり、糸球体硬化症、尿細管間質線維症
、IgA腎症、間質線維症/尿細管萎縮;慢性腎障害、糸球体疾患、糸球体腎炎、糖尿病
、特発性巣状分節性糸球体硬化症、膜性腎症、虚脱性糸球体症、慢性再発性腎感染症及び
末期腎臓病から選択される疾患を有する被検体に現れる。ある種の実施形態では、腎線維
症は腎臓の急性または反復性外傷に起因する。
ある種の実施形態では、線維症は、肝線維症であり、慢性肝傷害、肝炎感染症、非アル
コール性脂肪性肝炎及び硬変から選択される疾患を有する被検体に現れる。
ある種の実施形態では、肺線維症は特発性肺線維症であるか、或いは、被検体は慢性閉
塞性肺疾患を有する。
ある種の実施形態では、疾患は炎症性疾患である。
本明細書で提供されるのは、被検体の創傷治癒を促進する方法であって、本明細書に提
供する化合物の何れかを、急性または慢性創傷を有する被検体に投与することを含む、方
法である。ある種の実施形態では、慢性創傷は急性または慢性手術創、穿通創、引き抜き
損傷、圧挫損傷、剪断損傷、熱傷、裂傷、咬創、動脈性潰瘍、静脈性潰瘍、圧迫性潰瘍ま
たは糖尿病性潰瘍である。ある種の実施形態では、本化合物を創傷に局所投与する。
本明細書で提供されるのは、被検体の線維増殖性障害を処置する方法であって、本明細
書に提供する化合物の何れかを被検体に投与することを含む、方法である。
本明細書に提供する方法の何れかは、1つまたは複数の組織においてmiR−21の発
現が増加した被検体を選択することを含んでもよい。
ある種の実施形態では、本明細書に提供する化合物の何れかを被検体に投与することが
コラーゲンの発現を低下させる。
ある種の実施形態では、被検体は臓器機能の改善を必要としており、臓器機能は心機能
、肺機能、肝機能及び腎機能から選択される。ある種の実施形態では、本明細書に提供す
る化合物の何れかの投与が被検体の臓器機能を改善し、臓器機能は心機能、肺機能、肝機
能及び腎機能から選択される。
本明細書に提供する方法の何れかは、被検体の腎機能を評価することを含み、被検体の
血液中の血中尿素窒素の測定;被検体の血液中のクレアチニンの測定;被検体のクレアチ
ニンクリアランスの測定;被検体のタンパク尿の測定;被検体のアルブミン:Cr比の測
定;及び/または被検体の尿量の測定を含んでもよい。
本明細書に提供する方法の何れかは、被検体の肝機能を評価することを含んでもよく、
被検体の血液中のアラニンアミノトランスフェラーゼレベルの測定;被検体の血液中のア
スパラギン酸アミノトランスフェラーゼレベルの測定;被検体の血液中のビリルビンレベ
ルの測定;被検体の血液中のアルブミンレベルの測定;被検体のプロトロンビン時間の測
定;被検体の腹水の測定;及び/または被検体の脳症の測定を含んでもよい。
本明細書に提供する方法の何れかは、被検体の肺の機能を評価することを含んでもよく
、被検体の肺活量の測定;被検体の努力肺活量の測定;被検体の努力呼気肺活量1秒量の
測定;被検体の最大呼気流量の測定;被検体の努力呼気流量の測定;被検体の最大換気量
の測定;被検体の努力呼気肺活量1秒量と努力肺活量との比の判定;被検体の換気血流比
の測定;被検体の窒素洗い出しの測定;及び/または被検体の1つまたは複数の肺の絶対
空気量の測定を含んでもよい。
本明細書に提供する方法の何れかは、被検体の心機能を評価することを含んでもよく、
被検体の心拍出量の測定;被検体の一回拍出量の測定;被検体の収縮期平均駆出速度の測
定;被検体の収縮期血圧の測定;被検体の左心室駆出率の測定;被検体の一回拍出係数の
判定;被検体の心係数の判定;被検体の左室内径短縮率の測定;被検体の円周方向心筋線
維平均短縮速度の測定;被検体の左室流入血流速度波形の測定;被検体の肺静脈血流速波
形の測定;及び/または被検体の拡張早期僧帽弁輪運動最大速度の測定を含んでもよい。
本明細書に提供する方法の何れかは、抗炎症薬、免疫抑制薬、抗糖尿病薬、ジゴキシン
、血管拡張薬、アンジオテンシンII変換酵素(ACE)阻害剤、アンジオテンシンII
受容体遮断薬(ARB)、カルシウムチャネル遮断薬、二硝酸イソソルビド、ヒドララジ
ン、ニトレート、ヒドララジン、β遮断薬、ナトリウム利尿ペプチド、ヘパリノイド、及
び結合組織増殖因子阻害剤から選択される少なくとも1つの治療薬を被検体に投与するこ
とを含んでもよい。ある種の実施形態では、抗炎症薬は非ステロイド系抗炎症薬であり、
非ステロイド系抗炎症薬は、イブプロフェン、COX−1阻害剤及びCOX−2阻害剤か
ら任意に選択される。ある種の実施形態では、免疫抑制薬は、コルチコステロイド、シク
ロホスファミド及びミコフェノール酸モフェチルから選択される。ある種の実施形態では
、抗炎症薬はコルチコステロイドであり、コルチコステロイドは任意にプレドニゾンであ
る。ある種の実施形態では、アンジオテンシンII変換酵素(ACE)阻害剤は、カプト
プリル、エナラプリル、リシノプリル、ベナゼプリル、キナプリル、ホシノプリル及びラ
ミプリルから選択される。ある種の実施形態では、アンジオテンシンII受容体遮断薬(
ARB)は、カンデサルタン、イルベサルタン、オルメサルタン、ロサルタン、バルサル
タン、テルミサルタン及びエプロサルタンから選択される。
ある種の実施形態では、疾患は癌である。ある種の実施形態では、癌は肝癌、乳癌、膀
胱癌、前立腺癌、結腸癌、肺癌、脳癌、血液癌、膵癌、頭頸部癌、舌癌、胃癌、皮膚癌ま
たは甲状腺癌である。ある種の実施形態では、肝癌は肝細胞癌である。ある種の実施形態
では、脳癌は多形神経膠芽腫である。ある種の実施形態では、血液癌は、急性骨髄性白血
病、急性リンパ性白血病、急性単球性白血病、多発性骨髄腫、慢性リンパ性白血病、慢性
骨髄性白血病、ホジキンリンパ腫または非ホジキンリンパ腫である。
ある種の実施形態では、本明細書に提供する方法は、少なくとも1つの追加の抗癌治療
剤を被検体に投与することを含む。ある種の実施形態では、抗癌治療は、DNA傷害剤、
増殖阻害剤、葉酸代謝拮抗薬、増殖因子受容体阻害剤、血管新生阻害薬、受容体チロシン
キナーゼ阻害剤、キナーゼ阻害剤、増殖因子阻害剤、細胞傷害性薬物、放射線治療または
腫瘍の外科的切除である。ある種の実施形態では、DNA傷害剤は、1,3−ビス(2−
クロロエチル)−1−ニトロソウレア、ブスルファン、カルボプラチン、カルムスチン、
クロラムブシル、シスプラチン、シクロホスファミド、ダカルバジン、ダウノルビシン、
ドキソルビシン、エピルビシン、エトポシド、イダルビシン、イホスファミド、イリノテ
カン、ロムスチン、メクロレタミン、メルファラン、マイトマイシンC、ミトキサントロ
ン、オキサリプラチン、テモゾロミドまたはトポテカンである。ある種の実施形態では、
葉酸代謝拮抗薬は、メトトレキサート、アミノプテリン、チミジル酸シンターゼ、セリン
ヒドロキシメチルトランスフェラーゼ、ホリイルポリグルタミルシンテターゼ、g−グル
タミルヒドロラーゼ、グリシンアミドリボヌクレオチドホルミルトランスフェラーゼ、ロ
イコボリン、アミノ−イミダゾール−カルボキサミド−リボヌクレオチドホルミルトラン
スフェラーゼ、5−フルオロウラシル、または葉酸トランスポーターである。ある種の実
施形態では、増殖因子受容体阻害剤は、エルロチニブまたはゲフィチニブである。ある種
の実施形態では、血管新生阻害剤は、ベバシズマブ、サリドマイド、カルボキシアミドト
リアゾール、TNP−470、CM101、IFN−α、血小板因子−4、スラミン、S
U5416、トロンボスポンジン、VEGFRアンタゴニスト、軟骨由来血管新生抑制因
子、マトリックスメタロプロテアーゼ阻害物質、アンジオスタチン、エンドスタチン、2
−メトキシエストラジオール、テコガラン、テトラチオモリブデート、プロラクチンまた
はリノミドである。ある種の実施形態では、キナーゼ阻害剤は、ベバシズマブ、BIBW
2992、セツキシマブ、イマチニブ、トラスツズマブ、ゲフィチニブ、ラニビズマブ
、ペガプタニブ、ソラフェニブ、ダサチニブ、スニチニブ、エルロチニブ、ニロチニブ、
ラパチニブ、パニツムマブ、バンデタニブ、E7080、パゾパニブ、ムブリチニブまた
はホスタマチニブである。
ある種の実施形態では、癌を有する被検体への投与が腫瘍の大きさ及び/または腫瘍数
を減少させる。ある種の実施形態では、癌を有する被検体への投与が腫瘍の大きさ及び/
または腫瘍数の増加を予防または遅延させる。ある種の実施形態では、癌を有する被検体
への投与が転移性の進行を予防または遅らせる。ある種の実施形態では、癌を有する被検
体への投与が被検体の全生存期間及び/または無増悪生存期間を延長させる。ある種の実
施形態では、本明細書に提供する方法は、血清αフェトプロテインが上昇した、及び/ま
たは血清デス−γ−カルボキシプロトロンビンが上昇した被検体を選択することを含む。
ある種の実施形態では、本明細書に提供する方法は、血清αフェトプロテイン及び/また
は血清デス−γ−カルボキシプロトロンビンを低下させることを含む。ある種の実施形態
では、本明細書に提供する方法は、異常肝機能を有する動物を選択することを含む。
本明細書に提供する方法の何れかでは、被検体はヒトである。
本明細書に提供する方法の何れかでは、本化合物は医薬組成物として存在する。
本明細書に提供する化合物の何れかは、治療に使用されてもよい。本明細書に提供する
化合物の何れかは、線維症の処置に使用されてもよい。本明細書に提供する化合物の何れ
かは、創傷治癒の促進に使用されてもよい。本明細書に提供する化合物の何れかは、癌の
処置に使用されてもよい。本明細書に提供する化合物の何れかは、転移の発症を予防及び
/または遅延させるのに使用されてもよい。
本明細書に提供する化合物の何れかは、心臓病の処置に使用されてもよい。
本明細書に提供する化合物の何れかは、薬物の調製に使用されてもよい。本明細書に提
供する化合物の何れかは、線維症を処置する薬物の調製に使用されてもよい。本明細書に
提供する化合物の何れかは、創傷治癒を促進する薬物の調製に使用されてもよい。本明細
書に提供する化合物の何れかは、癌を処置する薬物の調製に使用されてもよい。本明細書
に提供する化合物の何れかは、転移の発症を予防及び/または遅延させる薬物の調製に使
用されてもよい。
実施例5に記載されているように、抗miR21化合物を投与した虚血再灌流/腎摘出(IR/Nx)モデルマウスの尿中アルブミン/クレアチニン比(ACR、μgAlb/mgCr)を示す。 実施例6に記載されているように、抗miR21化合物を投与したUUOモデルマウスの腎臓における(A)コラーゲン1A1及び(B)コラーゲン3A1の発現を示す。
他に記載がない限り、本明細書で使用する技術用語及び科学用語は全て、本発明が属す
る技術分野の当業者が一般に理解しているのと同じ意味を持つ。具体的な定義がなされて
いない場合、本明細書に記載の分析化学、有機合成化学並びに創薬化学及び薬化学に関連
して使用される用語と、本明細書に記載の分析化学、有機合成化学並びに創薬化学及び薬
化学の手順及び技法とは、当該技術分野において公知であり、一般に用いられるものであ
る。本明細書の用語に複数の定義が存在する場合、本セクションの定義が優先する。化学
合成、化学分析、医薬品の調製、製剤及び送達、並びに被検体の処置には、標準的な技法
を使用することができる。ある種のそうした技法及び手順は、例えば「Carbohyd
rate Modifications in Antisense Research
」Edited by Sangvi and Cook,American Chem
ical Society,Washington D.C.,1994;及び「Rem
ington’s Pharmaceutical Sciences,」Mack P
ublishing Co.,Easton,Pa.,18th edition,19
90で確認することができ、更に、これらをいかなる目的においても本明細書に援用する
。許容される場合、特許、特許出願、公開された出願及び公報、GENBANK配列、ウ
ェブサイト、及び本明細書の開示内容全体を通して参照した他の公開資料は、他に記載が
ない限り、その全体を援用する。URLまたは他のそうした識別子またはアドレスに言及
する場合、そうした識別子は変更されることがあり、インターネット上の特定の情報も変
更される場合があるが、インターネットの検索により、対応する情報を確認することがで
きることが理解されよう。それを参照することにより、そうした情報の利用可能性及び一
般への提供が明らかにされる。
本組成物及び方法を開示し、説明するのに先立ち、本明細書に使用される用語は、特定
の実施形態を説明するためのものにすぎず、限定的であることを意図するものではないこ
とを理解されたい。本明細書及び添付の特許請求の範囲に使用する場合、単数形表現「1
つの(a、an)」及び「前記(the)」は、文脈上明らかに他の意味に解すべき場合
を除き、複数の意味を含むことに留意しなければならない。
定義
「線維症」は、器官または組織に過剰な線維性結合組織が形成または発生することを意
味する。ある種の実施形態では、線維症は修復または反応プロセスとして起こる。ある種
の実施形態では、線維症は、損傷または傷害に反応して起こる。「線維症」という用語は
、器官または組織の正常成分としての線維組織の形成と異なり、器官または組織に過剰な
線維性結合組織が、修復または反応プロセスとして形成または発生するものと理解された
い。
「〜を有する疑いがある被検体」は、疾患の1つまたは複数の臨床徴候を示す被検体を
意味する。
「線維症を有する疑いがある被検体」は、線維症の1つまたは複数の臨床徴候を示す被
検体を意味する。
「線維芽細胞」は、結合組織を構成する細胞を意味する。
「線維増殖性障害」は、線維芽細胞の過剰増殖及び/または活性化を特徴とする障害を
意味する。
「肝癌」は、肝臓の悪性腫瘍、或いは原発癌または転移癌を意味する。ある種の実施形
態では、肝癌は、以下に限定されるものではないが、肝実質細胞から生じた癌、例えば、
ヘパトーマ及び肝細胞癌;線維層状肝癌;並びに胆管癌(cholangiocarci
noma)(即ち胆管癌(bile duct cancer))を含む。
「転移」は、癌が原発腫瘍として最初に生じた場所から体内の他の部位に広がるプロセ
スを意味する。原発腫瘍の転移性の進行は、隣接原発腫瘍細胞からの解離、循環血液中で
の生存、及び第2の場所における増殖を含む複数の段階を反映する。
「全生存期間」は、疾患の診断または処置後に被検体が生存する期間を意味する。ある
種の実施形態では、疾患は癌である。いくつかの実施形態では、全生存期間は診断後の生
存期間である。いくつかの実施形態では、全生存期間は処置の開始後の生存期間である。
「無増悪生存期間」は、疾患を有する被検体が、疾患が悪化せずに生存する期間を意味
する。ある種の実施形態では、無増悪生存期間は疾患の病期判定またはスコアリングによ
り評価される。ある種の実施形態では、肝癌を有する被検体の無増悪生存期間は、腫瘍の
大きさ、腫瘍数及び/または転移を評価することにより評価される。
「抗miR」は、マイクロRNAと相補的な核酸塩基配列を有するオリゴヌクレオチド
を意味する。ある種の実施形態では、抗miRは修飾オリゴヌクレオチドである。
「抗miR−X」は、「miR−X」が特定のマイクロRNAを示す場合、miR−X
と相補的な核酸塩基配列を有するオリゴヌクレオチドを意味する。ある種の実施形態では
、抗miR−Xは、miR−Xと完全に相補的である。ある種の実施形態では、抗miR
−Xは、miR−Xと少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%または少
なくとも95%相補的である。ある種の実施形態では、抗miR−Xは修飾オリゴヌクレ
オチドである。
「miR−21」は、核酸塩基配列UAGCUUAUCAGACUGAUGUUGA(
配列番号1)を有する成熟型miRNAを意味する。
「miR−21ステムループ配列」は、核酸塩基配列UGUCGGGUAGCUUAU
CAGACUGAUGUUGACUGUUGAAUCUCAUGGCAACACCAGU
CGAUGGGCUGUCUGACA(配列番号2)を有するステムループ配列を意味す
る。
「標的核酸」は、オリゴマー化合物がハイブリダイズするように設計される核酸を意味
する。
「標的化」は、標的核酸にハイブリダイズする核酸塩基配列の設計及び選択のプロセス
を意味する。
「〜を標的とする」は、標的核酸へのハイブリダイゼーションを可能にする核酸塩基配
列を有することを意味する。
「標的結合」は、マイクロRNAの活性、発現またはレベルを変化させる形でオリゴヌ
クレオチドと、相補的なマイクロRNAとが相互作用することを意味する。ある種の実施
形態では、標的結合は、マイクロRNAの活性が阻害されるように抗miRと、相補的な
マイクロRNAとが相互作用することを意味する。
「調節」は、機能、量または活性の変質を意味する。ある種の実施形態では、調節は機
能、量または活性の増加を意味する。ある種の実施形態では、調節は機能、量または活性
の低下を意味する。
「発現」は、遺伝子のコードされた情報が、細胞内に存在して働く構造体に変換される
任意の機能及び段階を意味する。
「5’標的部位」は、特定のオリゴヌクレオチドの最も3’側の核酸塩基と相補的な標
的核酸の核酸塩基を意味する。
「3’標的部位」は、特定のオリゴヌクレオチドの最も5’側の核酸塩基と相補的な標
的核酸の核酸塩基を意味する。
「領域」は、核酸においてヌクレオシドが連結した部分を意味する。ある種の実施形態
では、オリゴヌクレオチドは、標的核酸の領域と相補的な核酸塩基配列を有する。例えば
、そうしたある種の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、マイクロRNAステムループ
配列の領域と相補的である。そうしたある種の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、マ
イクロRNAステムループ配列の領域と完全に相補的である。
「セグメント」は、領域のより小さな部分または細部分を意味する。
「核酸塩基配列」は、典型的には任意の糖、結合及び/または核酸塩基の修飾と関係な
く5’から3’方向に記載された、オリゴマー化合物または核酸において連続する核酸塩
基の順序を意味する。
「連続する核酸塩基」は、核酸において互いに直接隣接する核酸塩基を意味する。
「核酸塩基相補性」は、2つの核酸塩基が水素結合を介して非共有結合により対を形成
できることを意味する。
「相補的」は、1つの核酸がもう1つの核酸またはオリゴヌクレオチドにハイブリダイ
ズできることを意味する。ある種の実施形態では、相補的とは、オリゴヌクレオチドが標
的核酸にハイブリダイズできることをいう。
「完全に相補的」は、オリゴヌクレオチドの各核酸塩基が、対応する各々の位置で標的
核酸の核酸塩基と対を形成できることを意味する。ある種の実施形態では、オリゴヌクレ
オチドは、マイクロRNAと完全に相補的である、即ちオリゴヌクレオチドの各核酸塩基
が、対応する各々の位置でマイクロRNAの核酸塩基と相補的である。ある種の実施形態
では、各核酸塩基がマイクロRNAステムループ配列の領域内の核酸塩基と相補性を有す
るオリゴヌクレオチドは、マイクロRNAステムループ配列と完全に相補的である。
「相補性パーセント」は、同じ長さの標的核酸の部分と相補的なオリゴヌクレオチドの
核酸塩基の割合を意味する。相補性パーセントは、オリゴヌクレオチドのうち、対応する
位置で標的核酸の核酸塩基と相補的な核酸塩基の数を、オリゴヌクレオチドの核酸塩基の
総数で割ることにより計算される。
「同一性パーセント」は、第1の核酸のうち、対応する位置で第2の核酸の核酸塩基と
同一である核酸塩基の数を、第1の核酸の核酸塩基の総数で割った商を意味する。ある種
の実施形態では、第1の核酸はマイクロRNAであり、第2の核酸はマイクロRNAであ
る。ある種の実施形態では、第1の核酸はオリゴヌクレオチドであり、第2の核酸はオリ
ゴヌクレオチドである。
「ハイブリダイズする」は、核酸塩基の相補性により相補的核酸のアニーリングが起こ
ることを意味する。
「ミスマッチ」は、第1の核酸の核酸塩基が、対応する位置で第2の核酸の核酸塩基と
対を形成できないことを意味する。
核酸塩基配列の文脈において「同一の」は、糖、結合及び/または核酸塩基の修飾に関
係なく、かつ、存在する任意のピリミジンのメチル状態にも関係なく、同じ核酸塩基配列
を有することを意味する。
「マイクロRNA」は、酵素ダイサーによるプレ−マイクロRNAの切断産物であり、
長さ18〜25核酸塩基の内在性非コードRNAを意味する。成熟型マイクロRNAの例
は、miRBaseと呼ばれるマイクロRNAデータベースで確認される(http:/
/microrna.sanger.ac.uk/)。ある種の実施形態では、マイクロ
RNAは、「マイクロRNA」または「miR」と略記される。
「プレ−マイクロRNA」または「pre−miR」は、Droshaと呼ばれる二本
鎖RNA特異的リボヌクレアーゼによるpri−miRの切断産物であり、ヘアピン構造
を有する非コードRNAを意味する。
「ステムループ配列」は、ヘアピン構造を有し、かつ成熟型マイクロRNA配列を含む
RNAを意味する。プレ−マイクロRNA配列及びステムループ配列は重複してもよい。
ステムループ配列の例は、miRBaseと呼ばれるマイクロRNAデータベースで確認
される(http://microrna.sanger.ac.uk/)。
「プリ−マイクロRNA」または「pri−miR」は、二本鎖RNA特異的リボヌク
レアーゼDroshaの基質であり、ヘアピン構造を有する非コードRNAを意味する。
「マイクロRNA前駆体」は、ゲノムDNAに由来し、かつ、1つまたは複数のマイク
ロRNA配列を含む非コードstructured RNAを含む転写物を意味する。例
えば、ある種の実施形態では、マイクロRNA前駆体はプレ−マイクロRNAである。あ
る種の実施形態では、マイクロRNA前駆体はプリ−マイクロRNAである。
「マイクロRNA制御転写物」は、マイクロRNAにより制御される転写物を意味する
「モノシストロニックな転写物」は、単一のマイクロRNA配列を含むマイクロRNA
前駆体を意味する。
「ポリシストロニックな転写物」は、2つ以上のマイクロRNA配列を含むマイクロR
NA前駆体を意味する。
「シード配列」は、成熟型マイクロRNA配列の5’末端の核酸塩基1〜9のうち連続
した6〜8核酸塩基を含む核酸塩基配列を意味する。
「シードマッチ配列」は、シード配列と相補的であり、シード配列と同じ長さの核酸塩
基配列を意味する。
「オリゴマー化合物」は、複数の連結したモノマーサブユニットを含む化合物を意味す
る。オリゴマー化合物はオリゴヌクレオチドを含んでいた。
「オリゴヌクレオチド」は、複数の連結したヌクレオシドを含む化合物を意味し、その
各々は、互いに独立に修飾されていても、または非修飾であってもよい。
「天然のヌクレオシド間結合」は、ヌクレオシド間の3’から5’のホスホジエステル
結合を意味する。
「天然糖」は、DNA(2’−H)またはRNA(2’−OH)に見られる糖を意味す
る。
「ヌクレオシド間結合」は、隣接するヌクレオシド間の共有結合を意味する。
「連結したヌクレオシド」は、共有結合により連結されたヌクレオシドを意味する。
「核酸塩基」は、別の核酸塩基と非共有結合的に対を形成することができる複素環部分
を意味する。
「ヌクレオシド」は、核酸塩基が糖部分に結合したものを意味する。
「ヌクレオチド」は、ヌクレオシドの糖部に共有結合したリン酸基を有するヌクレオシ
ドを意味する。
いくつかの連結したヌクレオシド「からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物」は
、所定の数の連結したヌクレオシドを有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を意味
する。従って、化合物は、追加の置換基またはコンジュゲートを含んでもよい。他に記載
がない限り、化合物は、オリゴヌクレオチドのヌクレオシド以外に任意の追加のヌクレオ
シドを含まない。
いくつかの連結したヌクレオシド「からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物」は
、所定の数の連結したヌクレオシドを有する修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を意味
する。従って、化合物は、追加の置換基またはコンジュゲートを含んでもよい。他に記載
がない限り、化合物は、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシド以外に任意の追加のヌク
レオシドを含まない。
「修飾オリゴヌクレオチド」は、天然の末端、糖、核酸塩基及び/またはヌクレオシド
間結合に関して1つまたは複数の修飾を有するオリゴヌクレオチドを意味する。修飾オリ
ゴヌクレオチドは、非修飾ヌクレオシドを含んでもよい。
「一本鎖修飾オリゴヌクレオチド」は、相補鎖にハイブリダイズしていない修飾オリゴ
ヌクレオチドを意味する。
「修飾ヌクレオシド」は、天然のヌクレオシドと異なるヌクレオシドを意味する。修飾
ヌクレオシドは、修飾糖及び非修飾核酸塩基を有してもよい。修飾ヌクレオシドは、修飾
糖及び修飾核酸塩基を有してもよい。修飾ヌクレオシドは、天然糖及び修飾核酸塩基を有
してもよい。ある種の実施形態では、修飾ヌクレオシドは二環式ヌクレオシドである。あ
る種の実施形態では、修飾ヌクレオシドは非二環式ヌクレオシドである。
「修飾ヌクレオシド間結合」は、天然のヌクレオシド間結合と何らか異なることを意味
する。
「ホスホロチオエートヌクレオシド間結合」は、非架橋原子の1つが硫黄原子である、
ヌクレオシド間の結合を意味する。
「修飾糖部分」は、天然糖の置換及び/または何らかの変化を意味する。
「非修飾核酸塩基」は、RNAまたはDNAの天然の複素環塩基:プリン塩基アデニン
(A)及びグアニン(G)と、ピリミジン塩基チミン(T)、シトシン(C)(5−メチ
ルシトシンを含む)及びウラシル(U)とを意味する。
「5−メチルシトシン」は、5位に結合したメチル基を含むシトシンを意味する。
「非メチル化シトシン」は、5位に結合したメチル基を有さないシトシンを意味する。
「修飾核酸塩基」は、非修飾核酸塩基でない任意の核酸塩基を意味する。
「フラノシル」は、4個の炭素原子及び1個の酸素原子からなる5員環を含む構造を意
味する。
「天然のフラノシル」は、天然のRNAに見られるようなリボフラノシル、または天然
のDNAに見られるようなデオキシリボフラノシルを意味する。
「糖部分」は、天然のフラノシルまたは修飾糖部分を意味する。
「修飾糖部分」は、置換糖部分または代用糖を意味する。
「置換糖部分」は、天然のフラノシルでないフラノシルを意味する。置換糖部分には、
以下に限定されるものではないが、天然のフラノシルの2’位、5’位及び/または4’
位に修飾を含む糖部分がある。ある種の置換糖部分は二環式糖部分である。
「代用糖」は、フラノシルを含まず、かつヌクレオシドの天然のフラノシルの代わりに
なることができ、その結果得られるヌクレオシドが(1)オリゴヌクレオチドへの取り込
み、及び(2)相補的ヌクレオシドへのハイブリダイゼーションが可能である構造を意味
する。こうした構造は、異なる数の原子を含む環(例えば、4員環、6員環または7員環
);フラノシルの酸素と非酸素原子(例えば、炭素、硫黄または窒素)との交換;または
原子数の変化と酸素の交換との両方などフラノシルの比較的単純な変化を含む。こうした
構造は、置換糖部分に記載した置換に対応する置換を更に含んでもよい(例えば、追加の
置換基を任意に含む6員の二環式炭素環式代用糖)。代用糖は、より複雑な糖の交換を更
に含んでもよい(例えば、ペプチド核酸の非環系)。代用糖は、以下に限定されるもので
はないが、モルホリノ、シクロヘキセニル及びシクロヘキシトールを含む。
「2’−O−メチル糖」または「2’−OMe糖」は、2’位にO−メチル修飾を有す
る糖を意味する。
「2’−O−メトキシエチル糖」または「2’−MOE糖」は、2’位にO−メトキシ
エチル修飾を有する糖を意味する。
「2’−O−フルオロ」または「2’−F」は、2’位にフルオロ修飾を有する糖を意
味する。
「二環式糖部分」は、4〜7員環の2個の原子を連結して第2の環を形成して、二環式
構造を生じさせる架橋を含む、4〜7員環(以下に限定されるものではないが、フラノシ
ル)を含む修飾糖部分を意味する。ある種の実施形態では、4〜7員環は糖環である。あ
る種の実施形態では 4〜7員環はフラノシルである。そうしたある種の実施形態では、
架橋はフラノシルの2’−炭素及び4’−炭素を連結する。
「ロックド核酸(LNA)糖部分」は、フラノース環の2’の原子と4’の原子との間
に(CH)−O架橋を含む置換糖部分を意味する。
「ENA糖部分」は、フラノース環の2’の原子と4’の原子との間に(CH
O架橋を含む置換糖部分を意味する。
「規制されたエチル(cEt)糖部分」は、フラノース環の4’の原子と2’の原子と
の間にCH(CH)−O架橋を含む置換糖部分を意味する。ある種の実施形態では、C
H(CH)−O架橋は、S方向に規制される。ある種の実施形態では、(CH
OはR方向に規制される。
「S−cEt糖部分」は、フラノース環の4’の原子と2’の原子との間にS−規制C
H(CH)−O架橋を含む置換糖部分を意味する。
「R−cEt糖部分」は、フラノース環の4’の原子と2’の原子との間にR−規制C
H(CH)−O架橋を含む置換糖部分を意味する。
「2’−O−メチル」ヌクレオシドは、2’−O−メチル糖修飾を含む2’−修飾ヌク
レオシドを意味する。
「2’−O−メトキシエチルヌクレオシド」は、2’−O−メトキシエチル糖修飾を有
する2’−修飾ヌクレオシドを意味する。2’−O−メトキシエチルヌクレオシドは、修
飾核酸塩基を含んでも、または非修飾核酸塩基を含んでもよい。
「2’−フルオロヌクレオシド」は、2’−フルオロ糖修飾を有する2’−修飾ヌクレ
オシドを意味する。2’−フルオロヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含んでも、または非
修飾核酸塩基を含んでもよい。
「二環式ヌクレオシド」は、二環式糖部分を有する2’−修飾ヌクレオシドを意味する
。二環式ヌクレオシドは、修飾核酸塩基を有しても、または非修飾核酸塩基を有してもよ
い。
「cEtヌクレオシド」は、cEt糖部分を含むヌクレオシドを意味する。cEtヌク
レオシドは、修飾核酸塩基を含んでも、または非修飾核酸塩基を含んでもよい。
「S−cEtヌクレオシド」は、S−cEt糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
「R−cEtヌクレオシド」は、R−cEt糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
「非二環式ヌクレオシド」は、二環式糖以外の糖を有するヌクレオシドを意味する。あ
る種の実施形態では、非二環式ヌクレオシドは天然の糖を含む。ある種の実施形態では、
非二環式ヌクレオシドは修飾糖を含む。ある種の実施形態では、非二環式ヌクレオシドは
β−D−デオキシリボヌクレオシドである。ある種の実施形態では、非二環式ヌクレオシ
ドは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。
「β−D−デオキシリボヌクレオシド」は、天然のDNAヌクレオシドを意味する。β
−D−デオキシリボヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含んでも、または非修飾核酸塩基を
含んでもよい。
「β−D−リボヌクレオシド」は、天然のRNAヌクレオシドを意味する。β−D−リ
ボヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含んでも、または非修飾核酸塩基を含んでもよい。
「LNAヌクレオシド」は、LNA糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
「ENAヌクレオシド」は、ENA糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
「モチーフ」は、オリゴヌクレオチドにおける修飾及び/若しくは非修飾の核酸塩基、
糖並びに/またはヌクレオシド間結合のパターンを意味する。ある種の実施形態では、モ
チーフはヌクレオシドパターンである。
「ヌクレオシドパターン」は、修飾オリゴヌクレオチドにおけるヌクレオシド修飾のパ
ターンまたはその領域を意味する。ヌクレオシドパターンは、オリゴヌクレオチドにおけ
るヌクレオシド修飾の構成を説明するモチーフである。
「完全修飾オリゴヌクレオチド」は、各核酸塩基、各糖及び/または各ヌクレオシド間
結合が修飾されていることを意味する。
「均一修飾オリゴヌクレオチド」は、修飾オリゴヌクレオチド全体で各核酸塩基、各糖
及び/または各ヌクレオシド間結合が同じ修飾を有することを意味する。
「安定化修飾」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合により結合された2’−デオ
キシヌクレオシドによって与えられる安定性に比べて、ヌクレアーゼの存在下で、修飾オ
リゴヌクレオチドに強い安定性を与えるヌクレオシドの修飾を意味する。例えば、ある種
の実施形態では、安定化修飾は安定化ヌクレオシド修飾である。ある種の実施形態では、
安定化修飾はヌクレオシド間結合修飾である。
「安定化ヌクレオシド」は、2’−デオキシヌクレオシドにより与えられる安定性に比
べて、オリゴヌクレオチドに強いヌクレアーゼ安定性を与えるヌクレオシド修飾を意味す
る。一実施形態では、安定化ヌクレオシドは2’−修飾ヌクレオシドである。
「安定化ヌクレオシド間結合」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合により与えら
れる安定性に比べて、オリゴヌクレオチドに改善されたヌクレアーゼ安定性を与えるヌク
レオシド間結合を意味する。一実施形態では、安定化ヌクレオシド間結合はホスホロチオ
エートヌクレオシド間結合である。
「被検体」は、処置または治療のために選択されたヒトまたは非ヒト動物を意味する。
「それを必要とする被検体」は、被検体が治療または処置を必要とすると判定される状
態にあることを意味する。
「〜を有する疑いがある被検体」は、疾患の1つまたは複数の臨床徴候を示す被検体を
意味する。
「投与すること」は、被検体に医薬品または組成物を与えることを意味し、以下に限定
されるものではないが、医療専門家による投与及び自己投与を含む。
「非経口投与」は、注射または注入による投与を意味する。非経口投与は、以下に限定
されるものではないが、皮下投与、静脈内投与または筋肉内投与を含む。
「皮下投与」は、皮膚直下の投与を意味する。
「静脈内投与」は、静脈への投与を意味する。
「心臓内投与」は、心臓への投与を意味する。ある種の実施形態では、心臓内投与はカ
テーテルによって行われる。ある種の実施形態では、心臓内投与は直視下心臓手術によっ
て行われる。
「経肺投与」は、肺への投与を意味する。
「併用投与される」は、2つの薬理効果が患者に同時に現れる任意の方法で2種の薬が
併用投与されることをいう。併用投与は、2種の薬を単一の医薬組成物で投与したり、同
じ剤形で投与したり、または同じ投与経路で投与したりする必要はない。2種の薬の作用
自体は、同時に現れる必要はない。効果は一定期間重複するだけでよく、同じ長さを持つ
必要はない。
「持続期間」は、活性またはイベントが継続する期間を意味する。ある種の実施形態で
は、処置の持続期間は、医薬品または医薬組成物の用量が投与される期間である。
「治療」は、疾患の処置方法を意味する。ある種の実施形態では、治療は、以下に限定
されるものではないが、化学療法、放射線治療、または医薬品の投与を含む。
「処置」は、疾患の治癒または軽減のために使用される1つまたは複数の特定の手順を
適用することを意味する。ある種の実施形態では、特定の手順は、1つまたは複数の医薬
品の投与である。
「軽減」は、状態または疾患の少なくとも1つの指標の重症度を低下させることを意味
する。ある種の実施形態では、軽減は、状態または疾患の1つまたは複数の指標の進行を
遅延させるまたは遅らせることを含む。指標の重症度は、当業者に公知の主観的基準また
は客観的基準により判定することができる。
「〜を発症するリスクがある」は、被検体がある状態または疾患を発症しやすい状態に
あることを意味する。ある種の実施形態では、状態または疾患を発症するリスクがある被
検体は、その状態または疾患の1つまたは複数の症状を示すものの、その状態または疾患
と診断されるのに十分な数の症状を示さない。ある種の実施形態では、状態または疾患を
発症するリスクがある被検体は、状態または疾患の1つまたは複数の症状を示すものの、
状態または疾患と診断するのに必要とされるより少ない程度で示す。
「〜の発症を予防する」は、疾患または状態を発症するリスクがある被検体の状態また
は疾患の発生を予防することを意味する。ある種の実施形態では、疾患または状態を発症
するリスクがある被検体は、疾患または状態を既に有する被検体が受けた処置と同様の処
置を受ける。
「〜の発症の遅延させる」は、疾患または状態を発症するリスクがある被検体の状態ま
たは疾患の発生を遅延させることを意味する。ある種の実施形態では、疾患または状態を
発症するリスクがある被検体は、疾患または状態を既に有する被検体が受けた処置と同様
の処置を受ける。
「治療薬」は、疾患の治癒、軽減または予防に使用される医薬品を意味する。
「用量」は、1回の投与で与えられる医薬品の所定量を意味する。ある種の実施形態で
は、用量を2以上のボーラス、錠剤または注射で投与してもよい。例えば、皮下投与が所
望であるある種の実施形態では、所望の用量は、1回の注射で容易に与えられない量を必
要とする。そうした実施形態では、所望の用量を達成するため2回以上の注射を使用して
もよい。ある種の実施形態では、用量は、2回以上の注射で投与して個体の注射部位反応
を最小限に抑えてもよい。ある種の実施形態では、用量を緩速注入として投与する。
「投薬単位」は、医薬品が与えられる形態を意味する。ある種の実施形態では、投薬単
位は、凍結乾燥オリゴヌクレオチドを含むバイアルである。ある種の実施形態では、投薬
単位は、再溶解したオリゴヌクレオチドを含むバイアルである。
「治療有効量」は、動物に治療上の利益を与える医薬品の量をいう。
「医薬組成物」は、医薬品など個体への投与に好適な物質の混合物を意味する。例えば
、医薬組成物は無菌水溶液を含んでもよい。
「医薬品」は、被検体に投与すると治療効果を与える物質を意味する。
「医薬活性成分」は、所望の作用を与える医薬組成物中の物質を意味する。
「臓器機能の改善」は、正常範囲に向けた臓器機能の変化を意味する。ある種の実施形
態では、臓器機能は、被検体の血液中に見られる分子の測定により評価される。例えば、
ある種の実施形態では、肝機能の改善は、肝トランスアミナーゼの血中レベルの低下によ
り測定される。
「許容可能な安全性プロファイル」は、臨床的に許容できる範囲内にある副作用のパタ
ーンを意味する。
「副作用」は、処置に起因する所望の作用以外の生理反応を意味する。ある種の実施形
態では、副作用は、以下に限定されるものではないが、注射部位反応、肝機能検査異常、
腎機能異常、肝毒性、腎毒性、中枢神経系異常及びミオパチーを含む。こうした副作用は
直接的に検出しても、または間接的に検出してもよい。例えば、血清中のアミノトランス
フェラーゼレベルの上昇から、肝毒性または肝機能異常が示唆されることがある。例えば
、ビリルビンの増加から、肝毒性または肝機能異常が示唆されることがある。
「注射部位反応」は、個体の注射部位における皮膚の炎症または異常な発赤を意味する
「被検体のコンプライアンス」は、推奨または処方された治療が被検体により遵守され
ることを意味する。
「遵守する」は、被検体が推奨された治療を遵守することを意味する。
「推奨された治療」は、疾患を処置、軽減、遅延または予防するために医療専門家によ
り推奨された処置を意味する。
概要
miR−21は、細胞分化、増殖、アポトーシス及びマトリックス代謝回転など種々の
細胞プロセスと関連する、広範に発現するマイクロRNAである。加えて、miR−21
は、複数の疾患と関連している。miR−21は、癌において上方制御されることが多く
、いくつかの癌動物モデルにおいてmiR−21の阻害から、腫瘍増殖が抑制されること
が立証された。心肥大動物モデルにおいてmiR−21の阻害から、心疾患におけるmi
R−21の役割が立証された。心線維症、腎線維症及び肺線維症の動物モデルでは、線維
症における役割も立証された。組織移植モデルにおけるmiR−21阻害の研究からは、
miR−21の阻害が創傷治癒を促進することが証明された。従って、miR−21の阻
害剤は、種々の研究及び臨床の場で有用である。
miR−21の強力な阻害剤を同定するため、多くの抗miR−21化合物を設計した
。これらの化合物は、二環式ヌクレオシド及び非二環式ヌクレオシドの長さ、並びに数、
配置及び種類が異なるものであった。最初に一連の化合物をインビトロルシフェラーゼア
ッセイで試験し、この試験によりインビトロ活性化合物として化合物のサブセットを同定
した。次いで、これらのインビトロ活性化合物をインビボアッセイで試験して、インビボ
でmiR−21の強力な阻害剤となる化合物を同定した。最初のインビトロ及びインビボ
スクリーニングから、新たな化合物の設計の根拠として一定の化合物を選択した。実験的
に観察された構造と活性との間の相関関係(インビトロ及びインビボの両方)が、これら
の新たな化合物の設計の特徴をなすように使用して、二環式及び非二環式ヌクレオシドの
長さ、並びに選択及び構成を変化させた。次いで、これらの新たな化合物についてインビ
トロ及びインビボスクリーニングアッセイを繰り返した。また、特定の化合物については
、他の特性、例えば、エキソヌクレアーゼ活性に対する感受性も試験した。インビトロで
最も活性な化合物が必ずしもインビボで最も活性な化合物であるとは限らないこと、更に
インビトロで中程度に活性な化合物の中には、インビボで高活性な化合物もあることも観
察された。本プロセスにおいてインビトロでスクリーニングした178種の化合物のうち
、60種をルシフェラーゼアッセイで活性であることを明らかにした。これらのインビト
ロで活性な化合物60種のうち、1つのサブセットをインビボで活性あることを明らかに
した。化合物を設計及びスクリーニングするこの反復プロセスを通して、二環式及び非二
環式修飾の特定のパターンを有する化合物がmiR−21の強力な阻害剤インビボである
ことが観察された。従って、これらの化合物は、miR−21の活性により促進される細
胞プロセスの調節に有用である。更に、こうした化合物は、miR−21に関連する疾患
の発症の処置、予防及び/または遅延にも有用である。こうした疾患は、非疾患サンプル
と比較してmiR−21の異常な高発現を特徴とすることがある。こうした疾患には、線
維症、急性腎傷害、心肥大、心筋梗塞、及び癌があるが、これに限定されるものではない
。加えて、本明細書に提供される組成物及び方法は、創傷治癒を促進するために使用して
もよい。
miR−21を標的とする特定の修飾オリゴヌクレオチド
本明細書で提供されるのは、二環式及び非二環式ヌクレオシドの特定のパターンを有す
る修飾オリゴヌクレオチドである。本明細書に同定されたパターンを有する修飾オリゴヌ
クレオチドは、miR−21活性の効果的な阻害剤である。
本明細書に図示したヌクレオシドパターンは各々、5’から3’方向に示す。
ある種の実施形態では、本明細書に提供されるのは、8〜22個連結したヌクレオシド
からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸
塩基配列がmiR−21(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが
5’から3’方向に以下のヌクレオシドパターンIで少なくとも8個連続するヌクレオシ
ドであり:
(R)−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Rは各々、非二環式ヌクレオシドであり;Xは1〜4であり;
は各々、二環式ヌクレオシドであり;
は各々、非二環式ヌクレオシドであり;かつ
は各々、修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Xは1である。ヌクレオシドパター
ンIのある種の実施形態では、Xは2である。ヌクレオシドパターンIのある種の実施形
態では、Xは3である。ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Xは4である
ある種の実施形態では、本明細書に提供されるのは、8〜19個連結したヌクレオシド
からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸
塩基配列がmiR−21(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが
5’から3’方向に以下のヌクレオシドパターンIIで少なくとも8個連続するヌクレオ
シドであり:
−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Nは二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;
は各々、二環式ヌクレオシドであり;
は各々、非二環式ヌクレオシドであり;かつ
は修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
ある種の実施形態では、本明細書に提供されるのは、8〜22個連結したヌクレオシド
からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸
塩基配列がmiR−21(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが
5’から3’方向に以下のヌクレオシドパターンIIIで少なくとも8個連続するヌクレ
オシドであり:
(R)−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N

式中、Rは各々、非二環式ヌクレオシドであり;Xは1〜4であり;
は各々、二環式ヌクレオシドであり;
は各々、非二環式ヌクレオシドであり;
は修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドであり;かつ
は各々、修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施形態では、Xは1である。ヌクレオシドパ
ターンIのある種の実施形態では、Xは2である。ヌクレオシドパターンIIIのある種
の実施形態では、Xは3である。ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施形態では、
Xは4である。
ある種の実施形態では、本明細書に提供されるのは、8〜19個連結したヌクレオシド
からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸
塩基配列がmiR−21(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが
5’から3’方向に以下のヌクレオシドパターンIVで少なくとも8個連続するヌクレオ
シドであり:
−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Nは二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;
は各々、二環式ヌクレオシドであり;
は各々、非二環式ヌクレオシドであり;
は修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドであり;かつ
は修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
ある種の実施形態では、本明細書に提供されるのは、8〜19個連結したヌクレオシド
からなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドの核酸
塩基配列がmiR−21(配列番号1)と相補的であり、かつ修飾オリゴヌクレオチドが
5’から3’方向に以下のヌクレオシドパターンVで少なくとも8個連続するヌクレオシ
ドであり:
−N−(N−N−N−N−N
式中、Nは二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;
は各々、二環式ヌクレオシドであり;
は各々、非二環式ヌクレオシドであり;かつ
は修飾ヌクレオシドである
ヌクレオシドを含む、化合物である。
以下の実施形態は、ヌクレオシドパターンI〜Vを含む本明細書に記載のヌクレオシド
パターンの何れかに当てはまる。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、本明細書に記載のヌクレオシドパ
ターンの少なくとも9個、少なくとも10個、少なくとも11個、少なくとも12個、少
なくとも13個、少なくとも14個、少なくとも15個、少なくとも16個、少なくとも
17個、少なくとも18個、少なくとも19個、少なくとも20個、少なくとも21個ま
たは22個の連続するヌクレオシドを含む。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴ
ヌクレオチドの核酸塩基配列は、少なくとも90%miR−21(配列番号1)と相補的
である。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、少なくとも
95%(配列番号1)と相補的である。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド
の核酸塩基配列は、(配列番号1)と100%相補的である。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴ
ヌクレオチドの核酸塩基配列はmiR−21と相補的であるため、マイクロRNAの1番
目は、オリゴヌクレオチドの3’−末端核酸塩基と対を形成する。例えば下記である:
Figure 2018121646
配列番号3及び配列番号4において、配列中の「T」は各々独立に核酸塩基「T」であっ
ても、或いは核酸塩基「U」であってもよく、かつ、配列番号3または配列番号4の配列
を有する化合物は、全てT、全てU、またはUとTとの任意の組み合わせを含んでもよい
ことが理解されよう。このため、本開示及び添付の配列表において配列番号3及び配列番
号4の様々な位置で「T」が存在しても、その特定の核酸塩基が「T」かそれとも「U」
であるかに関して限定するものではない。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、二環式ヌク
レオシドは各々、LNAヌクレオシド、cEtヌクレオシド及びENAヌクレオシドから
独立に選択される。ある種の実施形態では、少なくとも2個の二環式ヌクレオシドの糖部
分は、互いに異なる。ある種の実施形態では、全ての二環式ヌクレオシドが互いに同じ糖
部分を有する。ある種の実施形態では、二環式ヌクレオシドは各々cEtヌクレオシドで
ある。ある種の実施形態では、二環式ヌクレオシドは各々LNAヌクレオシドである。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、cEtヌク
レオシドはS−cEtヌクレオシドである。本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何
れかのある種の実施形態では、cEtヌクレオシドはR−cEtヌクレオシドである。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、非二環式ヌ
クレオシドは各々、β−D−デオキシリボヌクレオシド、β−D−リボヌクレオシド、2
’−O−メチルヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド及び2’−フルオ
ロヌクレオシドから独立に選択される。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、非二環式ヌ
クレオシドは各々、β−D−デオキシリボヌクレオシド及び2’−O−メトキシエチルヌ
クレオシドから独立に選択される。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、少なくとも
2個の非二環式ヌクレオシドは、互いに異なる糖部分を含み、β−D−デオキシリボヌク
レオシド、β−D−リボヌクレオシド、2’−O−メチルヌクレオシド、2’−O−メト
キシエチルヌクレオシド及び2’−フルオロヌクレオシドから独立に選択される。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、少なくとも
2個の非二環式ヌクレオシドは、互いに異なる糖部分を含み、β−D−デオキシリボヌク
レオシド及び2’−O−メトキシエチルヌクレオシドから独立に選択される。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、非二環式ヌ
クレオシドは各々、同じ種類の糖部分を有し、β−D−デオキシリボヌクレオシド、β−
D−リボヌクレオシド、2’−O−メチルヌクレオシド、2’−O−メトキシエチルヌク
レオシド及び2’−フルオロヌクレオシドから選択される。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、非二環式ヌ
クレオシドは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドである。ある種の実施形態では、非
二環式ヌクレオシドは各々2’−O−メチルヌクレオシドである。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、非二環式ヌ
クレオシドの3個以下が2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。ある種の実施形
態では、非二環式ヌクレオシドの2個以下が2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであ
る。ある種の実施形態では、非二環式ヌクレオシドの1以下が2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドである。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、非二環式ヌ
クレオシドの1個が2’−MOEヌクレオシドであり、非二環式ヌクレオシドは互いにβ
−D−デオキシリボヌクレオシドである。ある種の実施形態では、非二環式ヌクレオシド
の2個が2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり、非二環式ヌクレオシドは互いに
β−D−デオキシリボヌクレオシドである。ある種の実施形態では、非二環式ヌクレオシ
ドの3個が2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり、非二環式ヌクレオシドは互い
にβ−D−デオキシリボヌクレオシドである。
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、最も5’側
の非二環式ヌクレオシド及び最も3’側の非二環式ヌクレオシドは2’−O−メトキシエ
チルヌクレオシドであり、非二環式ヌクレオシドは互いにβ−D−デオキシリボヌクレオ
シドである。
Xが4である任意のヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Rのヌクレオシ
ドは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。Xが4であるヌクレオシドパタ
ーンIのある種の実施形態では、Rの2個のヌクレオシドがβ−D−デオキシリボヌクレ
オシドであり、Rの2個のヌクレオシドが2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである
。Xが4であるヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Rの3個のヌクレオシ
ドがβ−D−デオキシリボヌクレオシドであり、Rの1個のヌクレオシドが2’−O−メ
トキシエチルヌクレオシドである。
ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、RはNR1−NR2−NR3−N
であり、NR1は2’−MOEヌクレオシドであり、NR2はβ−D−デオキシリボヌ
クレオシドであり、NR3はβ−D−デオキシリボヌクレオシドであり、かつNR4はβ
−D−デオキシリボヌクレオシドである。
ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Rは4個連結したヌクレオシドN
−NR2−NR3−NR4からなり、式中、NR1は2’−O−メトキシエチルヌクレ
オシドであり、かつNR2−NR3−NR4は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドで
あり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキシリボヌク
レオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。ある種の実
施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは配列番号4の核酸塩基配列を有し、配列中のTは
各々T及びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Xは1であり、Rのヌクレオシドは
各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシド
であり;Nは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;かつNは2’−O
−メトキシエチルヌクレオシドである。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド
は配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIのある種の実施形態では、Xは4であり、Rのヌクレオシドは
各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシド
であり;Nは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;かつNは2’−O
−メトキシエチルヌクレオシドである。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド
は配列番号4の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIIのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デ
オキシリボヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであ
る。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基配列を有し
、配列中のTは各々T及びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIIのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デ
オキシリボヌクレオシドであり;かつNはS−cEtヌクレオシドである。ある種の実
施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは
各々T及びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIIのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々LNAヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキ
シリボヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基配列を有し、配
列中のTは各々T及びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIIのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々LNAヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオキ
シリボヌクレオシドであり;かつNはLNAヌクレオシドである。ある種の実施形態で
は、修飾オリゴヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及
びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施形態では、Rは二環式ヌクレオシドでない
修飾ヌクレオシドであり;かつxは1である。ヌクレオシドパターンIIIのある種の実
施形態では、Rは二環式ヌクレオシドでない修飾ヌクレオシドであり;xは1であり;か
つNは各々、非修飾ヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施
形態では、Rは二環式ヌクレオシドでない修飾ヌクレオシドであり;xは1であり;N
は各々、非修飾ヌクレオシドであり;Nは各々、S−cEtヌクレオシド及びLNAヌ
クレオシドから独立に選択され;かつNはβ−D−デオキシリボヌクレオシド、2’−
O−メトキシエチルヌクレオシド、S−cEtヌクレオシド及びLNAヌクレオシドから
選択される。ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施形態では、Rは二環式ヌクレオ
シドでない修飾ヌクレオシドであり;xは1であり;かつNは各々β−D−デオキシリ
ボヌクレオシドである。ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施形態では、Rは二環
式ヌクレオシドでない修飾ヌクレオシドであり;xは1であり;Nは各々β−D−デオ
キシリボヌクレオシドであり;Nは各々、S−cEtヌクレオシド及びLNAヌクレオ
シドから独立に選択され;かつNはβ−D−デオキシリボヌクレオシド、2’−O−メ
トキシエチルヌクレオシド、S−cEtヌクレオシド及びLNAヌクレオシドから選択さ
れる。ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施形態では、Rは二環式ヌクレオシドで
ない修飾ヌクレオシドであり;xは1であり;Nは各々、非修飾ヌクレオシドであり;
は各々S−cEtヌクレオシドであり;かつNはβ−D−デオキシリボヌクレオシ
ド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド及びS−cEtヌクレオシドから選択される
。ヌクレオシドパターンIIIのある種の実施形態では、Rは二環式ヌクレオシドでない
修飾ヌクレオシドであり;xは1であり;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシド
であり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;かつNはβ−D−デオキシリボヌ
クレオシド、2’−O−メトキシエチルヌクレオシド及びS−cEtヌクレオシドから選
択される。ある種の実施形態では、パターンIIIの修飾オリゴヌクレオチドは配列番号
3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシド及びLNAヌクレオシドから選
択され;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシド及び2’−O−メトキシエチルヌ
クレオシドから選択され;Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、S−cEtヌ
クレオシド、LNAヌクレオシド及びβ−D−デオキシリボヌクレオシドから選択され;
かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、LNAヌクレオシド及びS−cEt
ヌクレオシドから選択される。ある種の実施形態では、パターンIVの修飾オリゴヌクレ
オチドは配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に選択さ
れる。
ヌクレオシドパターンIVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デ
オキシリボヌクレオシド及び2’−O−メトキシエチルヌクレオシドから選択され;N
は2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、S−cEtヌクレオシド及びβ−D−デオキ
シリボヌクレオシドから選択され;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシド及
びS−cEtヌクレオシドから選択される。ある種の実施形態では、パターンIVの修飾
オリゴヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから
独立に選択される。
ヌクレオシドパターンIVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチル
ヌクレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デ
オキシリボヌクレオシドであり;NはS−cEtヌクレオシドであり;かつNはS−
cEtヌクレオシドである。ある種の実施形態では、パターンIVの修飾オリゴヌクレオ
チドは配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に選択され
る。
ヌクレオシドパターンVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチルヌ
クレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシド及びLNAヌクレオシドから選択
され;Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシド及び2’−O−メトキシエチルヌク
レオシドから選択され;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシド、LNAヌク
レオシド及びS−cEtヌクレオシドから選択される。ある種の実施形態では、パターン
Vの修飾オリゴヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及
びUから独立に選択される。
ヌクレオシドパターンVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチルヌ
クレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオ
キシリボヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシド及びS
−cEtヌクレオシドから選択される。ある種の実施形態では、パターンVの修飾オリゴ
ヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に
選択される。
ヌクレオシドパターンVのある種の実施形態では、Nは2’−O−メトキシエチルヌ
クレオシドであり;Nは各々S−cEtヌクレオシドであり;Nは各々β−D−デオ
キシリボヌクレオシドであり;かつNは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである
。ある種の実施形態では、パターンVの修飾オリゴヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基
配列を有し、配列中のTは各々T及びUから独立に選択される。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される化合物は、表1に示すような核酸塩基配
列及び修飾を有する。ヌクレオシド修飾は、以下の通り記載される:後に下付き文字がな
いヌクレオシドはβ−D−デオキシリボヌクレオシドを示し;後に下付き文字「E」があ
るヌクレオシドは2’−MOEヌクレオシドを示し;後に下付き文字「L」があるヌクレ
オシドはLNAヌクレオシドであり;後に下付き文字「S」があるヌクレオシドはS−c
Etヌクレオシドを示す。ヌクレオシド間結合は各々ホスホロチオエートヌクレオシド間
結合である。上付き文字「Me」はヌクレオシド塩基の5−メチル基を示す。
Figure 2018121646
本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかのある種の実施形態では、修飾オリゴ
ヌクレオチドは、ヌクレオシドパターンIに記載したヌクレオシドパターンの8個、9個
、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、18個、19個
、20個、21個または22個連結したヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、
修飾オリゴヌクレオチドは、ヌクレオシドパターンIに記載したヌクレオシドパターンの
少なくとも8個連結したヌクレオシドを含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレ
オチドは、ヌクレオシドパターンIIに記載したヌクレオシドパターンの少なくとも8個
連結したヌクレオシドを含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ヌク
レオシドパターンIIIに記載したヌクレオシドパターンの少なくとも8個連結したヌク
レオシドを含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ヌクレオシドパタ
ーンIVに記載したヌクレオシドパターンの少なくとも8個連結したヌクレオシドを含む
。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、ヌクレオシドパターンVに記載し
たヌクレオシドパターンの少なくとも8個連結したヌクレオシドを含む。
ある種の実施形態では、本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかを有する修飾
オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの修飾ヌクレオシド間結合を含む。ある種の実施
形態では、ヌクレオシド間結合は各々、修飾ヌクレオシド間結合である。ある種の実施形
態では、修飾ヌクレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの核酸塩基がシト
シンである核酸塩基配列を有する。ある種の実施形態では、少なくとも1つのシトシンは
5−メチルシトシンである。ある種の実施形態では、シトシンは各々、5−メチルシトシ
ンである。ある種の実施形態では、少なくとも1個のヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含
む。
修飾オリゴヌクレオチドは、修飾オリゴヌクレオチド全体の様々な位置でエキソヌクレ
アーゼ及び/またはエンドヌクレアーゼによる切断を受けてもよい。こうした酵素切断産
物は、miR−21阻害活性を保持し得、従って活性代謝物と見なされる。このため、本
明細書に記載の方法に修飾オリゴヌクレオチドの代謝産物を使用してもよい。
ある種の実施形態では、miR−21を標的とする修飾オリゴヌクレオチドは、表2A
から選択されるヌクレオシドパターンを有し、表中、Nは二環式ヌクレオシドではない
修飾ヌクレオシドであり;Nは各々、二環式ヌクレオシドであり;Nは各々、非二環
式ヌクレオシドであり;かつNは修飾ヌクレオシドである。
Figure 2018121646
ある種の実施形態では、miR−21を標的とする修飾オリゴヌクレオチドは、表2B
から選択されるヌクレオシドパターンを有し、表中、Nは二環式ヌクレオシドではない
修飾ヌクレオシドであり;Nは各々、二環式ヌクレオシドであり;Nは各々、非二環
式ヌクレオシドであり;Nは修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドであり;かつ
は修飾ヌクレオシドである。
Figure 2018121646
ある種の実施形態では、miR−21を標的とする修飾オリゴヌクレオチドは、表2C
から選択されるヌクレオシドパターンを有し、表中、Nは二環式ヌクレオシドではない
修飾ヌクレオシドであり;Nは各々、二環式ヌクレオシドであり;Nは各々、非二環
式ヌクレオシドであり;かつNは修飾ヌクレオシドである。
Figure 2018121646
ある種の実施形態では、miR−21を標的とする修飾オリゴヌクレオチドは、表3A
から選択されるヌクレオシドパターン及び核酸塩基配列を有する。後に下付き文字がない
ヌクレオシドはβ−D−デオキシリボヌクレオシドを示す。後に下付き文字「E」がある
ヌクレオシドは2’−MOEヌクレオシドを示す。後に下付き文字「S」があるヌクレオ
シドはS−cEtヌクレオシドを示す。ヌクレオシド間結合は各々ホスホロチオエートヌ
クレオシド間結合である。核酸塩基は、5’位にメチル基を含んでも含まなくてもよい。
Figure 2018121646
ある種の実施形態では、miR−21を標的とする修飾オリゴヌクレオチドは、表3B
から選択されるヌクレオシドパターン及び核酸塩基配列を有する。後に下付き文字がない
ヌクレオシドはβ−D−デオキシリボヌクレオシドを示す。後に下付き文字「E」がある
ヌクレオシドは2’−MOEヌクレオシドを示す。後に下付き文字「S」があるヌクレオ
シドはS−cEtヌクレオシドを示す。ヌクレオシド間結合は各々ホスホロチオエートヌ
クレオシド間結合である。核酸塩基は、5’位にメチル基を含んでも含まなくてもよい。
Figure 2018121646
ある種の実施形態では、miR−21を標的とする修飾オリゴヌクレオチドは、表3C
から選択されるヌクレオシドパターン及び核酸塩基配列を有する。後に下付き文字がない
ヌクレオシドはβ−D−デオキシリボヌクレオシドを示す。後に下付き文字「E」がある
ヌクレオシドは2’−MOEヌクレオシドを示す。後に下付き文字「S」があるヌクレオ
シドはS−cEtヌクレオシドを示す。ヌクレオシド間結合は各々ホスホロチオエートヌ
クレオシド間結合である。核酸塩基は、5’位にメチル基を含んでも含まなくてもよい。
Figure 2018121646
ある種の実施形態では、miR−21を標的とする修飾オリゴヌクレオチドは、表3D
から選択されるヌクレオシドパターン及び核酸塩基配列を有する。後に下付き文字がない
ヌクレオシドはβ−D−デオキシリボヌクレオシドを示す。後に下付き文字「E」がある
ヌクレオシドは2’−MOEヌクレオシドを示す。後に下付き文字「S」があるヌクレオ
シドはS−cEtヌクレオシドを示す。ヌクレオシド間結合は各々ホスホロチオエートヌ
クレオシド間結合である。核酸塩基は、5’位にメチル基を含んでも含まなくてもよい。
Figure 2018121646
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、19個を超える連結したヌクレオ
シドからなり、本明細書に記載のヌクレオシドパターンを含む。ヌクレオシドパターンに
記載されたヌクレオシドとは別に存在するヌクレオシドは、修飾されているか、或いは非
修飾である。例えば、21個連結したヌクレオシドからなり、かつmiR−21と相補的
な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドは、19個連結したヌクレオシド長さで
あるヌクレオシドパターンIIを有してもよい。他の2個のヌクレオシドは修飾糖部分か
らなっていても、または非修飾糖部分からなっていてもよい。ある種の実施形態では、修
飾オリゴヌクレオチドは、19個連結したヌクレオシドからなり、かつ本明細書に記載の
ヌクレオシドパターンの何れかを含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド
は、20個連結したヌクレオシドからなり、かつ本明細書に記載のヌクレオシドパターン
の何れかを含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、21個連結したヌ
クレオシドからなり、かつ本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかを含む。ある
種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、22個連結したヌクレオシドからなり、
かつ本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかを含む。ある種の実施形態では、修
飾オリゴヌクレオチドは、23個連結したヌクレオシドからなり、かつ本明細書に記載の
ヌクレオシドパターンの何れかを含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド
は、24個連結したヌクレオシドからなり、かつ本明細書に記載のヌクレオシドパターン
の何れかを含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、25個連結したヌ
クレオシドからなり、かつ本明細書に記載のヌクレオシドパターンの何れかを含む。
本発明の特定の使用
miR−21活性の調節
本明細書に提供する化合物は、miR−21活性の強力で特異的な阻害剤であり、従っ
てmiR−21活性の調節に有用である。
マイクロRNAは、メッセンジャーRNAに結合してその発現を抑制する。場合によっ
ては、マイクロRNA活性の阻害がメッセンジャーRNAの抑制解除を引き起こす、即ち
メッセンジャーRNAの発現がRNA及び/またはタンパク質のレベルで増加する。本明
細書で提供されるのは、miR−21制御転写物の発現を調節する方法であって、本発明
の化合物と細胞を接触させることを含み、化合物は、miR−21と相補的な配列を有す
る修飾オリゴヌクレオチドを含む、方法である。
ある種の実施形態では、miR−21制御転写物はYOD1であり、miR−21の阻
害の結果、YOD1のmRNAのレベルが上昇する。ある種の実施形態では、miR−2
1制御転写物PPAR−αであり、miR−21の阻害の結果、PPAR−αのmRNA
のレベルが上昇する。ある種の実施形態では、miR−21制御転写物はRNF167で
ある。
ある種の実施形態では、miR−21制御転写物はSPG20である。ある種の実施形
態では、肝臓におけるmiR−21の阻害の結果、SPG20のmRNAのレベルが上昇
する。
ある種の実施形態では、本発明の化合物と細胞を接触させた後、miR−21制御転写
物のmRNAレベルが少なくとも1.5倍上昇することが観察される。ある種の実施形態
では、本発明の化合物と細胞を接触させた後、miR−21制御転写物のmRNAレベル
が少なくとも2.0倍上昇することが観察される。ある種の実施形態では、マイクロRN
A制御転写物のmRNAレベルが少なくとも2.5倍上昇する。ある種の実施形態では、
マイクロRNA制御転写物のmRNAレベルが少なくとも3.0倍上昇する。ある種の実
施形態では、マイクロRNA制御転写物のmRNAレベルが少なくとも3.5倍上昇する
。ある種の実施形態では、マイクロRNA制御転写物のmRNAレベルが少なくとも4.
0倍上昇する。ある種の実施形態では、マイクロRNA制御転写物のmRNAレベルが少
なくとも4.5倍上昇する。ある種の実施形態では、マイクロRNA制御転写物のmRN
Aレベルが少なくとも5.0倍上昇する。
ある種のマイクロRNAは、いくつかのメッセンジャーRNA、場合によっては数百の
メッセンジャーRNAを標的とすることが知られている。単一のマイクロRNAの活性の
阻害が、多くのマイクロRNA標的の発現に検出可能な変化を引き起こす場合がある。本
明細書で提供されるのは、複数のmiR−21制御転写物を調節する方法であって、mi
R−21の活性を阻害することを含み、広範な遺伝子発現の変化が起こる、方法である。
ある種の実施形態では、本発明の化合物によるmiR−21の阻害後、表現型の変化が
観察されることがある。こうした表現型の変化は、miR−21制御転写物の発現におけ
る検出可能な変化を伴って或いは伴わずに起こることがある。
線維増殖性障害
器官若しくは組織の損傷または傷害に対する正常な生理反応では、生存に必要な基本的
な生物学的プロセスである損傷組織の修復が行われる。修復プロセスにおいて、異物、細
菌及び損傷組織が排除された後、線維芽細胞が傷害部位に遊走し、新しい細胞外マトリッ
クスに沈着し、その後細胞外マトリックスは組織リモデリング期の一環として構造的に組
織化される。
線維芽細胞は、結合組織に見られる最も一般的な細胞であり、細胞外マトリックスを支
持し、正常な創傷治癒において重要な役割を果たすレティキュリン及び他の弾性線維の合
成に関わっている(Sempowski,G.D.et al.,2002.Wound
Repair Regeneration.3:120−131)。線維芽細胞は、傷
害組織の修復並びにその構造及び機能の回復に必要なコラーゲンの沈着に関わっている。
創傷治癒プロセスにおいて、活性化線維芽細胞は、コラーゲンを分泌するα−SMA+線
維芽細胞である筋線維芽細胞に変換される。創傷治癒プロセスの初期段階において、筋線
維芽細胞はマトリックスメタロプロテアーゼを産生し、このマトリックスメタロプロテア
ーゼが基底膜を破壊するため、炎症細胞は傷害部位に効率的にリクルートすることができ
る。傷害修復の後期段階において、筋線維芽細胞は、創縁が創中央に向かって遊走するプ
ロセス、創収縮を促進する。このように、線維芽細胞活性は、正常な治癒プロセスに不可
欠である。
正常な傷害修復プロセスに関与する線維芽細胞は、局所の間葉系細胞に由来するか、骨
髄からリクルートされるか、または上皮間葉転換により誘導されることがある。上皮間葉
転換(EMT)とは、細胞表現型の一連の急速な変化をいい(Kalluri,R.an
d Neilson,E.G.2003.J.Clin.Invest.112:177
6−1784)、この過程で静止した上皮細胞が細胞間接触を失い、間葉系の特徴を獲得
し、遊走性の表現型を発現する。常在性線維芽細胞、浸潤性の線維細胞または周皮細胞様
細胞も傷害修復プロセスに関与することがある。
条件によっては、組織修復プロセスが過剰に起こり、細胞外マトリックス(ECM)成
分が蓄積しすぎてECMのリモデリングが著しくなり、これが永続的な線維性瘢痕の形成
を助長する。この過剰な線維性結合組織の形成(線維症と呼ばれるプロセス)は、組織構
造の異常な変化を助長し、正常な臓器機能を阻害する。
線維症は身体のどのような部位にも起こり得、種々の物理的傷害、代謝傷害、虚血傷害
、感染傷害、炎症性傷害または免疫学的傷害に起因する可能性がある。線維症の解剖学的
位置、起源及び臨床症状は多様であり得るが、あらゆる種類の線維症に共通の重要な病理
学的特徴がある。線維症が起こる位置に関係なく、線維化過程は線維化促進サイトカイン
の分泌及び活性化、間葉系細胞集団の増殖及び活性化、並びに細胞外マトリックスの合成
及び組織化を伴い、最終的には正常組織を破壊する。線維症は、未処置で放置すると、組
織のなかでも特に心臓、肺、腎臓、肝臓、眼及び皮膚の種々の状態に至る恐れがある。
本明細書に立証されるように、線維症のモデルでmiR−21を阻害すると、コラーゲ
ン沈着が減少した。従って、本明細書に提供されるのは、線維症の発症を処置、予防及び
/または遅延させるための組成物及び方法であって、miR−21と相補的な修飾オリゴ
ヌクレオチドを含む化合物を被検体に投与することを含む、組成物及び方法である。被検
体は、線維症の診断を受けていてもよいし、線維症を発症するリスクがあってもよいし、
または線維症を有する疑いがあってもよい。
ある種の実施形態では、線維症の被検体は、腎線維症、肺線維症、肝線維症、心線維症
、皮膚線維症、加齢に伴う線維症、脾線維症、強皮症または移植後の線維症を有する。
腎臓の多くの疾患または異常は、線維症の存在を特徴とする。従って、本明細書に提供
する化合物は、線維症の存在を特徴とする任意の腎疾患の発症の処置、軽減、予防及び/
または遅延に有用である。ある種の実施形態では、線維症の被検体は、腎臓の疾患または
状態を有する。ある種の実施形態では、線維症を発症するリスクがある被検体は、腎臓の
疾患または状態を有する。ある種の実施形態では、線維症を有する疑いがある被検体は、
腎臓の疾患または状態を有する。従って、本明細書に提供されるのは、線維症を有する、
それを発症するリスクがある、またはその疑いがある被検体を処置する方法であって、被
検体が腎臓の疾患または状態を有する、方法である。腎臓の疾患または状態は、以下に限
定されるものではないが、糸球体疾患、尿細管間質線維症、IgA腎症、間質線維症/尿
細管萎縮、糸球体硬化症、糸球体腎炎、糖尿病、特発性巣状分節性糸球体硬化症、膜性腎
症、虚脱性糸球体症、慢性再発性腎感染症、糖尿病、糖尿病性ニューロパチー、慢性再発
性腎感染症、高血圧、全身性高血圧、糸球体内高血圧または末期腎臓病の1つまたは複数
であってもよい。
慢性腎疾患は、線維症の存在を特徴とすることがある。従って、ある種の実施形態では
、腎臓の疾患または状態は慢性腎疾患である。ある種の実施形態では、被検体は慢性腎疾
患を発症するリスクがある。ある種の実施形態では、急性腎傷害を有する被検体は線維症
及び/または慢性腎疾患を発症するリスクがある。従って、本明細書に提供される組成物
及び方法は、線維症及び/または慢性腎疾患の発症を予防または遅延させるために、急性
腎傷害を有する被検体に投与してもよい。
ある種の実施形態では、線維症の被検体は、腎臓の急性または反復性外傷に起因する腎
線維症を有する。外傷は、手術、化学療法、放射線処置、同種移植片拒絶、慢性移植拒絶
反応及び急性移植拒絶反応に起因する場合がある。
ある種の実施形態では、腎線維症は、急性または慢性曝露後に腎毒性の恐れがある任意
の薬への曝露に起因することがある。こうした薬には、以下に限定されるものではないが
、鎮痛薬、非ステロイド系抗炎症剤、抗生物質、リチウム、シクロスポリン、メサラジン
、造影剤、化学療法剤などの医薬品;以下に限定されるものではないが、重金属などの職
業上の毒素;及び以下に限定されるものではないが、重金属(例えばカドミウム、塩化第
二水銀)または工場における腎毒素(例えばアリストロキア酸)などの環境毒素がある。
肝臓の多くの疾患または異常は、線維症の存在を特徴とする。従って、ある種の実施形
態では、線維症の被検体は肝臓の疾患または状態を有する。ある種の実施形態では、線維
症を発症するリスクがある被検体は肝臓の疾患または状態を有する。ある種の実施形態で
は、線維症を有する疑いがある被検体は肝臓の疾患または状態を有する。従って、本明細
書に提供されるのは、線維症を有する、それを発症するリスクがある、またはその疑いが
ある被検体を処置する方法であって、被検体が肝臓の疾患または状態を有する、方法であ
る。ある種の実施形態では、肝臓の疾患または状態は、以下に限定されるものではないが
、慢性肝傷害、肝炎ウイルス感染(C型肝炎ウイルス感染症及びB型肝炎ウイルス感染症
など)、非アルコール性脂肪性肝疾患(NAFLD)、非アルコール性脂肪性肝炎(NA
SH)、アルコール性肝疾患(ALD)、アルコール性脂肪性肝炎、架橋性線維化または
硬変の1つまたは複数であってもよい。ある種の実施形態では、肝臓の疾患または状態は
有毒な化学物質への曝露と関連する。ある種の実施形態では、肝臓の疾患または状態は、
医薬品、例えばアセトアミノフェンへの曝露に起因する。ある種の実施形態では、化学療
法を受けている被検体は、肝線維症及び/または慢性肝傷害のリスクがある。
線維症は、肺の多くの疾患または異常に存在することがある。従って、ある種の実施形
態では、線維症の被検体は肺の疾患または状態を有する。ある種の実施形態では、線維症
を発症するリスクがある被検体は肺の疾患または状態を有する。ある種の実施形態では、
線維症を有する疑いがある被検体は肺の疾患または状態を有する。従って、本明細書に提
供されるのは、線維症を有する、それを発症するリスクがある、またはその疑いがある被
検体を処置する方法であって、被検体が肺の疾患または状態を有する、方法である。ある
種の実施形態では、肺の疾患または状態は、以下に限定されるものではないが、肺線維症
、特発性肺線維症または慢性閉塞性肺疾患の1つまたは複数であってもよい。ある種の実
施形態では、肺線維症は、微粒子状物質、例えばシリカゲル、アスベスト、大気汚染物質
またはタバコの煙に見られるようなものの吸入に起因することがある。
ある種の実施形態では、線維症は心線維症である。
ある種の実施形態では、線維症は皮膚線維症である。ある種の実施形態では、線維症は
加齢に伴う線維症である。ある種の実施形態では、線維症は脾線維症である。
強皮症は、数ある症状の中でも特に線維症を特徴とする慢性自己免疫疾患である。ある
種の実施形態では、線維症の被検体は強皮症を有する。ある種の実施形態では、強皮症の
被検体は、皮膚の線維症に加えて内臓にも線維症を有する。
線維症は、多くの場合、移植臓器に起こり、臓器機能を喪失させ、最終的に移植臓器の
慢性拒絶反応を引き起こす。移植臓器の線維症の予防または処置は、移植臓器の慢性拒絶
反応を予防または遅延させることがある、即ち言い換えれば、移植臓器の機能を延長させ
得る。従って、ある種の実施形態では、被検体は移植後の線維症を有する。ある種の実施
形態では、移植後の線維症は移植後の腎線維症である。ある種の実施形態では、移植に関
連する線維症は、移植後の肝線維症である。ある種の実施形態では、本明細書に記載の化
合物を移植の前に投与する。ある種の実施形態では、本明細書に記載の化合物を移植と同
時に投与する。ある種の実施形態では、本明細書に記載の化合物を移植の後に投与する。
本明細書で提供されるのは、線維増殖性障害を有する被検体を処置する方法である。あ
る種の実施形態では、こうした方法は、miRNAまたはその前駆体と相補的な核酸塩基
配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを、線維増殖性障害を有するまたは有する疑いがあ
る被検体に投与する。ある種の実施形態では、miRNAはmiR−21である。
癌及び転移
多くの種類の癌においてmiR−21の異常な高発現が立証されてきた。更に、インビ
トロモデル及びインビボモデルにおけるmiR−21の阻害から、miR−21の阻害剤
が、癌細胞の増殖を支える細胞プロセスの阻害のほか、癌の処置に有用であることも立証
されてきた。
従って、ある種の実施形態では、本明細書に提供する化合物は、癌の発症の処置、予防
、軽減及び/または遅延に使用される。ある種の実施形態では、癌は肝癌、乳癌、肺癌、
結腸癌、卵巣癌、子宮頸癌、白血病、リンパ腫、脳癌、食道癌、ホジキンリンパ腫、非ホ
ジキンリンパ腫、腎臓癌、メラノーマ、骨髄腫、口腔癌、膵癌、前立腺癌、直腸癌、胃癌
、膀胱癌、甲状腺癌または精巣癌である。ある種の実施形態では、肝癌は肝細胞癌である
。ある種の実施形態では、肝癌は、身体の別の部分に由来した癌、例えば骨癌、結腸癌ま
たは乳癌の転移によるものである。
ある種の実施形態では、肝癌において、miR−21が増加し、1つまたは複数のmi
R−21制御転写物のレベルが低下する。ある種の実施形態では、減少したmiR−21
制御転写物はSPG20である。
ある種の実施形態では、肝癌は肝細胞癌(HCC)である。肝細胞癌の診断は典型的に
は、肝臓の画像検査、例えば腹部超音波、ヘリカルコンピューター断層撮影(CT)スキ
ャンまたはtriple phase CTスキャンにより行うことができる。こうした
画像検査は、αフェトプロテインの血中レベル及び/またはデス−γ−カルボキシプロト
ロンビンの血中レベルの測定と共に行ってもよい。一部の被検体では、CTスキャンの代
わりにMRIを使用してもよい。肝臓の画像検査により、腫瘍の大きさ、数、位置、肝臓
外の転移、腫瘍による肝臓の動脈及び静脈の開存性並びにまたは浸潤の評価が可能になる
。こうした評価は、適切な治療的または緩和的介入の方法に関する判断に役立つ。最終診
断は典型的には、針生検及び組織病理学的検査により確認される。
従って、ある種の実施形態では、肝癌は、腫瘍を検出するコンピューター断層撮影(C
T)スキャン後に検出される。ある種の実施形態では、肝癌は、磁気共鳴イメージング(
MRI)後に検出される。ある種の実施形態では、HCCは、単一の原発腫瘍を特徴する
。ある種の実施形態では、HCCは、複数の原発腫瘍を特徴する。ある種の実施形態では
、HCCは、浸潤性の増殖パターンを有する、境界が不明瞭な原発腫瘍を特徴する。ある
種の実施形態では、HCCは、血管侵入を伴う単一の原発腫瘍である。ある種の実施形態
では、HCCは、血管侵入を伴う複数の原発腫瘍を特徴する。ある種の実施形態では、H
CCは1つまたは複数のリンパ節に転移している。そうしたある種の実施形態では、リン
パ節は所属リンパ節である。ある種の実施形態では、HCCは1つまたは複数の遠位の組
織に転移している。ある種の実施形態では、HCCは肝臓、門脈、リンパ節、副腎、骨ま
たは肺の他の領域に転移している。ある種の実施形態では、線維症が存在する。
HCCの予後の予測には、TNM分類、Okuda分類、Barcelona Cli
nic Liver Cancer(BCLC)、及びCLIPスコアなど多くのシステ
ムが利用されてきた。これらの分類には各々、生存の重要な決定因子と認められてきた4
つの特徴、即ち、基礎疾患の肝臓病の重症度、腫瘍の大きさ、腫瘍の隣接する構造物への
拡張、及び転移の存在が組み込まれている。TNM分類は、HCCをステージI、II、
III、IVまたはVに分類する。BCLCは、HCCをステージA1、A2、A3、A
4、B、C及びDに分類し、更にChild−Pughスコアの考慮を含む。
ある種の実施形態では、肝癌をステージ1、ステージ2、ステージ3A、ステージ3B
、ステージ3Cまたはステージ4に分類する。ステージ1は、癌の大きさが2cm以下で
、広がり始めていないことを特徴とする。ステージ2では、癌が肝臓の血管に影響を与え
るまたは肝臓に2つ以上の腫瘍が存在する。ステージ3Aでは、癌の大きさが5cmを超
えるまたは癌が肝臓近傍の血管に広がっている。ステージ3Bでは、癌が近くの腸または
胃などの臓器に広がっているが、リンパ節までは広がっていない。ステージ3Cでは、癌
はどのような大きさでもよいが、近くのリンパ節まで広がっている。ステージ4では、癌
が肺など肝臓から更に離れた身体部位に広がっている。
肝癌の診断を強化する、肝癌のステージを判定する、または生命予後を明らかにするた
め、被検体の血液のバイオマーカーを使用してもよい。こうしたバイオマーカーには、血
液腫瘍バイオマーカー、例えばαフェトプロテイン及びデス−γカルボキシプロトロンビ
ンがある。そうしたある種の実施形態では、被検体は、血中αフェトプロテインが上昇し
ている。そうしたある種の実施形態では、被検体は、血中デス−γカルボキシプロトロン
ビンが上昇している。
また、肝癌を有する被検体は、異常肝機能に悩まされているかもしれない。肝機能は、
数ある中でも特に肝トランスアミナーゼの血中レベルを測定する肝機能検査により評価す
ることができる。ある種の実施形態では、異常肝機能を有する被検体は、血中肝トランス
アミナーゼが上昇している。血中肝トランスアミナーゼには、アラニンアミノトランスフ
ェラーゼ(ALT)及びアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)がある。あ
る種の実施形態では、異常肝機能を有する被検体は、血中ビリルビンが上昇している。あ
る種の実施形態では、被検体は、異常な血中アルブミンレベルを有する。
ある種の実施形態では、被検体の肝機能は、3分類の肝機能を定義するChild−P
ugh分類方式により評価される。この分類方式では、5つのカテゴリー:ビリルビンレ
ベル、アルブミンレベル、プロトロンビン時間、腹水及び脳症の各測定値にポイントが付
与される。以下の特徴が存在するごとに1ポイントが割り当てられる:血中ビリルビンが
2.0mg/dl未満;血中アルブミンが3.5mg/dl超;プロトロンビン時間の国
際標準比(INR)が1.7未満;腹水なし;または脳症なし。以下の特徴が存在するご
とに2ポイントが割り当てられる:血中ビリルビンが2〜3mg/dl;血中ビリルビン
が3.5〜2.8mg/dl;プロトロンビン時間のINRが1.7〜2.3;腹水が少
量から中等量;または脳症が軽度。以下の特徴が存在するごとに3ポイントが割り当てら
れる:ビリルビンが3.0mg/dl超;血中アルブミンが2.8mg/dl未満;プロ
トロンビン時間のINRが2.3超;腹水が大量から難治性;または脳症が重度。各スコ
アを加算し、5〜6ポイントのスコアにクラスAを割り当て、7〜9ポイントのスコアに
クラスBを割り当て、10〜15ポイントのスコアにクラスCを割り当てる、
肝癌を有する被検体は、C型慢性肝炎感染症、B型慢性肝炎感染症、非アルコール性脂
肪性肝疾患若しくは硬変に以前罹患したことがあっても、また現在罹患していてもよい。
C型肝炎感染症、B型肝炎感染症、非アルコール性脂肪性肝疾患若しくは硬変を伴う、及
び/または、C型肝炎感染症、B型肝炎感染症、非アルコール性脂肪性肝疾患若しくは硬
変に起因する肝癌を有する被検体は、本明細書に記載の方法により処置することができる
処置に対する被検体の反応は、肝癌を診断するのと同様の検査、以下に限定されるもの
ではないが、CTスキャン、MRI及び針生検により評価してもよい。また、処置に対す
る反応は、血液中のバイオマーカーを測定して処置前のバイオマーカーのレベルと比較す
ることにより評価してもよい。
miR−21は、転移のプロセスにも関連してきた。EMTは正常な生理的学プロセス
では起こらないが、転移のプロセスに関連付けられてきた。腫瘍進行におけるEMTの重
要性は、いくつかの研究で調査されてきた(Greenburg,G.and Hay,
E.1986.Dev.Biol.115:363−379; Boyer,B.et
al.,1989.J.Cell.Biol.109:1495−1509; Ueha
ra,Y.et al.,1992.J.Cell.Biol.117:889−894
)。上皮細胞は、基底膜と呼ばれる下にある細胞外マトリックス(ECM)によりインテ
グリンを介して支持されている。一方、間葉系細胞は、ECMの三次元構造に侵入し、そ
の中を移動する能力を有する。従って、EMTは、少なくとも表面上は、正常な接着細胞
の転移性表現型への変換に似ている。
本明細書で提供されるのは、転移の発症を処置、予防、軽減及び/または遅延させる方
法である。転移は、癌の任意の原発部位から癌の任意の第2の部位への癌細胞の遊走に起
因することがある。
急性腎傷害
急性腎傷害は、腎機能が急速に失われるものであり、低血液量、毒素への曝露及び尿路
閉塞など、いくつかの原因により引き起こされることがある。miR−21の増加は、急
性腎傷害モデルで観察されてきた。従って、ある種の実施形態では、急性腎傷害の発症の
処置、予防、軽減及び/または遅延のために本明細書に提供する化合物を使用する。ある
種の実施形態では、急性腎傷害は、有毒物質、例えば環境毒素または癌治療薬への曝露に
よることがある。急性腎傷害は、例えば糸球体腎炎、急性腎尿細管壊死及び急性間質性腎
炎などの状態では腎臓自体の損傷に起因することもある。ある種の実施形態では、急性腎
傷害は、良性前立腺肥大、腎結石、尿道カテーテルの閉塞、膀胱結石、膀胱、尿管または
腎臓の悪性腫瘍に関連するものなど尿路の閉塞による引き起こされる。ある種の実施形態
では、急性腎傷害は、線維症及び/または慢性腎疾患に進行することがある。このため、
いくつかの実施形態では、本明細書に提供する化合物を、急性腎傷害の被検体に投与して
線維症及び/または慢性腎疾患の発症を予防するまたは遅延させる。いくつかの実施形態
では、本明細書に提供する化合物を被検体に投与して急性腎傷害からの回復を促す。
心臓病
miR−21発現の増加はヒト心臓病で認められており、関連する動物モデルでmiR
−21を阻害すると、心線維症及び心機能が改善することが立証されてきた。従って、あ
る種の実施形態では、本明細書に提供する化合物を使用してもう1つの心臓病の発症を処
置、予防、軽減及び/または遅延させる。ある種の実施形態では、心臓病は、心線維症、
心拡大、心肥大、心拡張、肥大型心筋症、心不全、心筋梗塞後リモデリング、心筋梗塞、
心筋症(cardiomyopathy)(例えば、肥大型心筋症、拘束型心筋症(ca
rdiomyopathy)、拡張型心筋症(cardiomyopathy)(DCM
)、特発性拡張型心筋症(cardiomyopathy)、または不整脈を伴う拡張型
心筋症(cardiomyopathy))、拡張期心不全、慢性心房細動、原発性肺高
血圧症、急性呼吸窮迫症候群、ブルガダ症候群、進行性心臓伝導疾患、尿毒症性心膜炎、
アントラサイクリン心筋症(cardiomyopathy)、動脈線維化、放射線治療
後のリンパ管線維化、サルコイドーシス、強皮症、心内膜線維弾性症、セロトニンの過剰
、心弁膜症、心房線維化、心房細動、僧帽弁疾患、高血圧、慢性心室機能不全、圧過負荷
及び容量過負荷、または心筋線維症である。
細胞プロセス
本明細書で提供されるのは、線維芽細胞の増殖または活性化を低下または予防するため
の組成物及び方法である。また、本明細書に提供されるのは、以下に限定されるものでは
ないが、コラーゲン、フィブロネクチン、コラゲナーゼまたは組織メタロプロテアーゼ阻
害物質の合成を含む、細胞外マトリックスの合成を阻害するための組成物及び方法である
本明細書で提供されるのは、上皮間葉転換(EMT)に関連する細胞プロセスを調節す
る方法である。こうした方法は、miR−21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドからな
る化合物と上皮細胞を接触させることを含む。ある種の実施形態では、本接触により、上
皮細胞の線維芽細胞への転化が遅延する。ある種の実施形態では、本接触により、上皮細
胞の線維芽細胞への転化が予防される。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される化合物は、癌細胞の増殖を停止させる、
遅らせるまたは低下させることができる。ある種の実施形態では、本明細書に提供される
化合物は、癌細胞のアポトーシスを誘導することができる。ある種の実施形態では、本明
細書に提供される化合物は、癌細胞の生存を低下させることができる。
ある種の実施形態では、上皮細胞は癌細胞である。ある種の実施形態では、本接触によ
り、癌細胞の転移が遅延する。ある種の実施形態では、本接触により、癌細胞の転移が予
防される。
ある種の臨床転帰
ある種の実施形態では、本明細書に提供される化合物または方法を投与すると、被検体
において1つまたは複数の臨床的に望ましい転帰が得られる。こうした改善を使用すれば
、被検体が処置に反応するのがどの程度であるかを判定することができる。
ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は線維症の軽減である。ある種の実施形
態では、臨床的に望ましい転帰は、線維症が更に進行するのを遅らせることである。ある
種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、線維症が更に進行するのを食い止めること
である。ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は線維症の減少である。ある種の
実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、線維症を有する臓器におけるコラーゲン量の減
少である。
ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、任意の器官または組織における線維
症の軽減である。ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、線維症が更に進行す
るのを遅らせることである。ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、線維症が
更に進行するのを食い止めることである。ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰
は線維症の減少である。ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、患部臓器にお
けるコラーゲン量の減少である。
ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は腎機能の改善である。腎機能は、以下
に限定されるものではないが、被検体の血液中の血中尿素窒素の測定;被検体の血液中の
クレアチニンの測定;被検体のクレアチニンクリアランスの測定;被検体のタンパク尿の
測定;被検体の微量アルブミン:クレアチニン比の測定;被検体の尿量の測定;尿中の腎
臓傷害分子−1(kidney injury molecule−1:KIM−1)の
mRNAレベルの測定;及び/または尿中のクラステリンレベルの測定など臨床現場で一
般に行われる1つまたは複数の公知の方法により評価することができる。
ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は肝機能の改善である。肝機能は、以下
に限定されるものではないが、被検体の血液中のアラニンアミノトランスフェラーゼレベ
ルの測定;被検体の血液中のアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼレベルの測定;被
検体の血液中のビリルビンレベルの測定;被検体の血液中のアルブミンレベルの測定;被
検体のプロトロンビン時間の測定;被検体の腹水の測定;及び/または被検体の脳症の測
定など臨床現場で一般に行われる1つまたは複数の公知の方法により評価することができ
る。
ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、肺線維症を有する被検体における肺
の機能の改善である。ある種の実施形態では、被検体は特発性肺線維症を有する。肺の機
能は、以下に限定されるものではないが、被検体の肺活量の測定;被検体の努力肺活量の
測定;被検体の努力呼気肺活量1秒量の測定;被検体の最大呼気流量の測定;被検体の努
力呼気流量の測定;被検体の最大換気量の測定;被検体の努力呼気肺活量1秒量と努力肺
活量との比の判定;被検体の換気血流比の測定;被検体の窒素洗い出しの測定;被検体の
1つまたは複数の肺の絶対空気量の測定;及び6分間歩行テストの実施など臨床現場で一
般に行われる1つまたは複数の公知の方法により評価することができる。
ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、心線維症を有する被検体の心機能の
改善である。心機能は、以下に限定されるものではないが、被検体の心拍出量の測定;被
検体の一回拍出量の測定;被検体の収縮期平均駆出速度の測定;被検体の収縮期血圧の測
定;被検体の左心室駆出率の測定;被検体の一回拍出係数の判定;被検体の心係数の判定
;被検体の左室内径短縮率の測定;被検体の円周方向心筋線維平均短縮速度の測定;被検
体の左室流入血流速度波形の測定;被検体の肺静脈血流速波形の測定;被検体の拡張早期
僧帽弁輪運動最大速度の測定など臨床現場で一般に行われる1つまたは複数の公知の方法
により評価することができる。
ある種の実施形態では、臨床的に望ましい転帰は、癌を有する被検体における腫瘍数の
減少及び/または腫瘍の大きさの縮小である。ある種の実施形態では、臨床的に望ましい
転帰は、癌を有する被検体における癌細胞数の減少である。他の臨床的に望ましい転帰に
は、被検体の全生存期間の延長、及び/または被検体の無増悪生存期間の延長がある。あ
る種の実施形態では、本明細書に提供される化合物を投与すると、腫瘍の大きさ及び/ま
たは腫瘍数の増加が予防される。ある種の実施形態では、本明細書に提供される化合物を
投与すると、転移性の進行が予防される。ある種の実施形態では、本明細書に提供される
化合物を投与すると、転移性の進行が遅れるまたは停止する。ある種の実施形態では、本
明細書に提供される化合物を投与すると、腫瘍の再発が予防される。ある種の実施形態で
は、本明細書に提供される化合物を投与すると、腫瘍転移の再発が予防される。
ある種の望ましい臨床転帰は、血中バイオマーカーの測定により評価することができる
。ある種の実施形態では、本明細書に提供される化合物を投与すると、血中αフェトプロ
テイン及び/または血中デス−γカルボキシプロトロンビンを低下させることができる。
更に、本明細書に提供される化合物を投与すると、血中ALTレベル及び/またはAST
レベルの低下により証明されるような肝機能の改善をもたらすこともできる。
ある種の追加の治療剤
線維症または本明細書に記載した状態の何れかの処置は、2つ以上の治療剤を含んでも
よい。従って、ある種の実施形態では、本明細書に提供されるのは、線維症を有するまた
は有する疑いがある被検体を処置する方法であって、miR−21と相補的な核酸塩基配
列を有する修飾オリゴヌクレオチドの投与に加えて、少なくとも1つの治療剤を投与する
ことを含む。
ある種の実施形態では、少なくとも1つ追加の治療剤は医薬品を含む。
ある種の実施形態では、医薬品には抗炎症薬がある。ある種の実施形態では、抗炎症薬
はステロイド系抗炎症薬である。ある種の実施形態では、ステロイド抗炎症薬はコルチコ
ステロイドである。ある種の実施形態では、コルチコステロイドはプレドニゾンである。
ある種の実施形態では、抗炎症薬は非ステロイド系抗炎症剤である。ある種の実施形態で
は、非ステロイド系抗炎症薬はイブプロフェン、COX−I阻害剤またはCOX−2阻害
剤である。
ある種の実施形態では、医薬品は免疫抑制薬を含む。ある種の実施形態では、免疫抑制
薬はコルチコステロイド、シクロホスファミドまたはミコフェノール酸モフェチルである
ある種の実施形態では、医薬品は抗糖尿病薬を含む。抗糖尿病薬には、ビグアナイド、
グルコシダーゼ阻害剤、インスリン、スルホニル尿素及びチアゾリデンジオンがあるが、
これに限定されるものではない。
ある種の実施形態では、医薬品はアンジオテンシンII受容体遮断薬(ARB)を含む
。ある種の実施形態では、アンジオテンシンII受容体遮断薬はカンデサルタン、イルベ
サルタン、オルメサルタン、ロサルタン、バルサルタン、テルミサルタンまたはエプロサ
ルタンである。
ある種の実施形態では、医薬品には、利尿薬(例えばスプリオノラクトン、エプレレノ
ン、フロセミド)、変力作用薬(例えばドブタミン、ミルリノン)、ジゴキシン、血管拡
張薬、アンジオテンシンII変換酵素(ACE)阻害剤(例えばカプトプリル、エナラプ
リル、リシノプリル、ベナゼプリル、キナプリル、ホシノプリル及びラミプリル)、カル
シウムチャネル遮断薬、二硝酸イソソルビド、ヒドララジン、ニトレート(例えば一硝酸
イソソルビド、二硝酸イソソルビド)、ヒドララジン、β遮断薬(例えばカルベジロール
、メトプロロール)、及びナトリウム利尿ペプチド(例えばネシリチド)があるが、これ
に限定されるものではない。
ある種の実施形態では、医薬品はヘパリノイドを含む。ある種の実施形態では、ヘパリ
ノイドはペントサンポリ硫酸である。
ある種の実施形態では、医薬品は線維化シグナルに対する1つまたは複数の応答を遮断
する医薬品である。
ある種の実施形態では、医薬品は抗結合組織増殖因子治療剤である。ある種の実施形態
では、抗CTGF治療剤はCTGFに対するモノクローナル抗体である。
ある種の実施形態では、追加の治療剤は、身体の免疫系を強化する医薬品、例えば低用
量シクロホスファミド、チモスチムリン、ビタミン及び栄養補助剤(例えば、酸化防止剤
、例えばビタミンA、C、E、βカロテン、亜鉛、セレン、グルタチオン、コエンザイム
Q−10及びエキネシア)、並びにワクチン、例えば、多量体抗原の提示とアジュバント
とを組み合わせたワクチン製剤を含む免疫刺激複合体(ISCOM)であってもよい。
ある種の実施形態では、追加の治療剤は、本発明の1つまたは複数の医薬組成物の副作
用を処置または軽減させるように選択される。こうした副作用には、以下に限定されるも
のではないが、注射部位反応、肝機能検査異常、腎機能異常、肝毒性、腎毒性、中枢神経
系異常及びミオパチーがある。例えば、血清中のアミノトランスフェラーゼレベルの上昇
から、肝毒性または肝機能異常が示唆されることがある。例えば、ビリルビンの増加から
、肝毒性または肝機能異常が示唆されることがある。
追加の医薬品の別の例には、免疫グロブリン、以下に限定されるものではないが、静脈
内免疫グロブリン(IVIg);鎮痛薬(例えば、アセトアミノフェン);サリチレート
;抗生物質;抗ウイルス薬;抗真菌薬;アドレナリン作用修飾薬;ホルモン(例えば、ア
ナボリックステロイド、アンドロゲン、エストロゲン、カルシトニン、プロゲスチン、ソ
マトスタチン及び甲状腺ホルモン);免疫調節剤;筋弛緩薬;抗ヒスタミン剤;骨粗鬆症
薬(例えば、ビホスホネート、カルシトニン及びエストロゲン);プロスタグランジン、
抗腫瘍薬;精神治療薬;鎮静剤;毒オークまたは毒ウルシの生成物;抗体;並びにワクチ
ンがあるが、これに限定されるものではない。
癌の処置は、2つ以上の治療剤を含むことが多い。従って、ある種の実施形態では、本
発明は、miR−21と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物を被検体に投与す
ること、及び抗癌治療剤である少なくとも1つの追加の治療剤を投与することを含む、転
移を減少または予防する方法を提供する。
ある種の実施形態では、抗癌治療は化学療法である。好適な化学療法剤には、ドセタキ
セル、シクロホスファミド、イホスファミド、メトトレキサート、ビンブラスチン、シス
プラチン、5−フルオロウラシル、ゲムシタビン、ドキソルビシン、マイトマイシンC、
ソラフェニブ、エトポシド、カルボプラチン、エピルビシン、イリノテカン及びオキサリ
プラチンがある。追加の好適な化学療法剤には、本明細書に提供されるmiR−21を標
的とする組成物以外の、癌の処置に使用されるオリゴマー化合物がある。
ある種の実施形態では、抗癌治療は放射線治療である。ある種の実施形態では、抗癌治
療は腫瘍の外科的切除である。ある種の実施形態では、抗癌治療剤は、DNA傷害剤、増
殖阻害剤、葉酸代謝拮抗薬、増殖因子受容体阻害剤、血管新生阻害薬、受容体チロシンキ
ナーゼ阻害剤、キナーゼ阻害剤、増殖因子阻害剤または細胞傷害性薬物である。
ある種の実施形態では、DNA傷害剤は、1,3−ビス(2−クロロエチル)−1−ニ
トロソウレア、ブスルファン、カルボプラチン、カルムスチン、クロラムブシル、シスプ
ラチン、シクロホスファミド、ダカルバジン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、エピル
ビシン、エトポシド、イダルビシン、イホスファミド、イリノテカン、ロムスチン、メク
ロレタミン、メルファラン、マイトマイシンC、ミトキサントロン、オキサリプラチン、
テモゾロミドまたはトポテカンである。
ある種の実施形態では、葉酸代謝拮抗薬は、メトトレキサート、アミノプテリン、チミ
ジル酸シンターゼ、セリンヒドロキシメチルトランスフェラーゼ、ホリイルポリグルタミ
ルシンテターゼ、g−グルタミルヒドロラーゼ、グリシンアミドリボヌクレオチドホルミ
ルトランスフェラーゼ、ロイコボリン、アミノ−イミダゾール−カルボキサミド−リボヌ
クレオチドホルミルトランスフェラーゼ、5−フルオロウラシル、または葉酸トランスポ
ーターである。
ある種の実施形態では、増殖因子受容体は、エルロチニブまたはゲフィチニブである。
ある種の実施形態では、血管新生阻害剤は、ベバシズマブ、サリドマイド、カルボキシ
アミドトリアゾール、TNP−470、CM101、IFN−α、血小板因子−4、スラ
ミン、SU5416、トロンボスポンジン、VEGFRアンタゴニスト、軟骨由来血管新
生抑制因子、マトリックスメタロプロテアーゼ阻害物質、アンジオスタチン、エンドスタ
チン、2−メトキシエストラジオール、テコガラン、テトラチオモリブデート、プロラク
チンまたはリノミドである。
ある種の実施形態では、キナーゼ阻害剤は、ベバシズマブ、BIBW 2992、セツ
キシマブ、イマチニブ、トラスツズマブ、ゲフィチニブ、ラニビズマブ、ペガプタニブ、
ソラフェニブ、ダサチニブ、スニチニブ、エルロチニブ、ニロチニブ、ラパチニブ、パニ
ツムマブ、バンデタニブ、E7080、パゾパニブ、ムブリチニブまたはホスタマチニブ
である。
ある種のマイクロRNAの核酸塩基配列
本明細書に記載のヌクレオシドパターンを有する修飾オリゴヌクレオチドは、miR−
21(配列番号1)またはその前駆体(配列番号2)と相補的な核酸塩基配列を有する。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各核酸塩基はそれぞれ対応する位置で
、miR−21またはその前駆体の核酸塩基配列の核酸塩基と塩基対の形成を行うことが
できる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、miR−2
1配列または前駆体配列の核酸塩基配列に対して1つまたは複数のミスマッチ塩基対を有
していてもよく、依然としてその標的配列にハイブリダイズすることができる。
miR−21配列はmiR−21前駆体配列内に含まれており、miR−21と相補的
な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドは、miR−21前駆体の領域とも相補
的である。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、miR−21の長さと等しいいく
つかの連結したヌクレオシドからなる。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの連結したヌクレオシドの数は、mi
R−21の長さより短い。いくつかの連結したヌクレオシドを有する、miR−21の長
さより短い修飾オリゴヌクレオチドであって、その各核酸塩基が対応する位置でmiR−
21の各核酸塩基と相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、miR−21配列の領域と完全
に相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドと見なされる。例えば、19個
連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドであって、各核酸塩基が長さ22
核酸塩基のmiR−21の対応する位置と相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、miR−
21の19個の核酸塩基領域と完全に相補的である。こうした修飾オリゴヌクレオチドは
、全体としてmiR−21の全長対して約86%の相補性を有し、miR−21の19個
の核酸塩基部分に対して100%相補性を有する。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドはシード配列と相補的な核酸塩基配列
を含む、即ち修飾オリゴヌクレオチドはシード−マッチ配列を含む。ある種の実施形態で
は、シード配列は6量体シード配列である。そうしたある種の実施形態では、シード配列
はmiR−21の核酸塩基1〜6である。そうしたある種の実施形態では、シード配列は
miR−21の核酸塩基2〜7である。そうしたある種の実施形態では、シード配列はm
iR−21の核酸塩基3〜8である。ある種の実施形態では、シード配列は7量体シード
配列である。そうしたある種の実施形態では、7量体シード配列はmiR−21の核酸塩
基1〜7である。そうしたある種の実施形態では、7量体シード配列はmiR−21の核
酸塩基2〜8である。ある種の実施形態では、シード配列は8量体シード配列である。そ
うしたある種の実施形態では、8量体シード配列はmiR−21の核酸塩基1〜8である
。ある種の実施形態では、8量体シード配列はmiR−21の核酸塩基2〜9である。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、miR−21またはその前駆体の
核酸塩基配列に対して1つのミスマッチがある核酸塩基配列を有する。ある種の実施形態
では、修飾オリゴヌクレオチドは、miR−21またはその前駆体の核酸塩基配列に対し
て2つのミスマッチがある核酸塩基配列を有する。そうしたある種の実施形態では、修飾
オリゴヌクレオチドは、miR−21またはその前駆体の核酸塩基配列に対して2つ以下
のミスマッチがある核酸塩基配列を有する。そうしたある種の実施形態では、ミスマッチ
核酸塩基は隣接している。そうしたある種の実施形態では、ミスマッチ核酸塩基は隣接し
ていない。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの連結したヌクレオシドの数は、mi
R−21の長さを超える。そうしたある種の実施形態では、追加のヌクレオシドの核酸塩
基は、miR−21のステムループ配列の核酸塩基と相補的である。ある種の実施形態で
は、修飾オリゴヌクレオチドの連結したヌクレオシドの数は、miR−21の長さより1
個多い。そうしたある種の実施形態では、追加のヌクレオシドはオリゴヌクレオチドの5
’末端にある。そうしたある種の実施形態では、追加のヌクレオシドはオリゴヌクレオチ
ドの3’末端にある。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの連結したヌクレ
オシドの数は、miR−21の長さより2個多い。そうしたある種の実施形態では、2個
の追加のヌクレオシドはオリゴヌクレオチドの5’末端にある。そうしたある種の実施形
態では、2個の追加のヌクレオシドはオリゴヌクレオチドの3’末端にある。そうしたあ
る種の実施形態では、1個の追加のヌクレオシドが5’末端に位置し、1個の追加のヌク
レオシドがオリゴヌクレオチドの3’末端に位置する。ある種の実施形態では、オリゴヌ
クレオチドの領域はmiR−21の核酸塩基配列と完全に相補的である場合があるが、修
飾オリゴヌクレオチド全体がmiR−21と完全に相補的であるとは限らない。例えば、
24個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドであって、ヌクレオシド1
〜23の各核酸塩基が、長さ22核酸塩基のmiR−21の対応する位置と相補的な修飾
オリゴヌクレオチドは、miR−21の核酸塩基配列と完全に相補的である22個のヌク
レオシド部分を有し、miR−21の核酸塩基配列に対して全体として約96%相補性を
有する。
ある種の修飾オリゴヌクレオチド
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは8〜30個連結したヌクレオシドか
らなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは15〜30個連結したヌクレ
オシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは15〜25個連結し
たヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは15〜19
個連結したヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは1
5〜16個連結したヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオ
チドは、19〜24個連結したヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリ
ゴヌクレオチドは21〜24個連結したヌクレオシドからなる。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは8個連結したヌクレオシドからなる
。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは9個連結したヌクレオシドからなる
。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは10個連結したヌクレオシドからな
る。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは11個連結したヌクレオシドから
なる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは12個連結したヌクレオシドか
らなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは13個連結したヌクレオシド
からなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは14個連結したヌクレオシ
ドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは15個連結したヌクレオ
シドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは16個連結したヌクレ
オシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは17個連結したヌク
レオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは18個連結したヌ
クレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは19個連結した
ヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは20個連結し
たヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは21個連結
したヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは22個連
結したヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは23個
連結したヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは24
個連結したヌクレオシドからなる。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは2
5個連結したヌクレオシドからなる。
本明細書に記載した核酸塩基配列、以下に限定されるものではないが、実施例及び配列
表に見られる核酸塩基配列は、核酸に対するどのような修飾とも無関係である。従って、
配列番号で表される核酸は独立に、1つまたは複数の糖部分、1つまたは複数のヌクレオ
シド間結合、及び/または1つ若しくは複数の核酸塩基に対して1つまたは複数の修飾を
含んでもよい。
本出願に添付の配列表には、各核酸塩基配列が必要に応じて「RNA」或いは「DNA
」として示してあるが、実際には、それらの配列は任意の化学修飾の組み合わせで修飾さ
れていてもよい。当業者であれば、修飾オリゴヌクレオチドを記載するための「RNA」
または「DNA」のような表記は、やや恣意的なものであることを容易に理解するであろ
う。例えば、2’−OH糖部分及びチミン塩基を含むヌクレオシドを含む修飾オリゴヌク
レオチドは、修飾糖(DNAの天然2’−Hに対する2’−OH)を有するDNA、また
は修飾塩基(RNAの天然ウラシルに対するチミン(メチル化ウラシル))を有するRN
Aと記載することができる。
従って、本明細書に提供される核酸配列、以下に限定されるものではないが、配列表の
核酸配列は、天然または修飾RNA及び/またはDNAの任意の組み合わせを含む核酸、
以下に限定されるものではないが、修飾核酸塩基を有するそうした核酸を包含することを
意図するものである。以下に限定されるものではないが、更に例を挙げると、核酸塩基配
列「ATCGATCG」を有するオリゴヌクレオチドは、修飾または非修飾に関わらず、
こうした核酸塩基配列を有する任意のオリゴヌクレオチドを包含するものであり、以下に
限定されるものではないが、こうした化合物は、RNA塩基、例えば配列「AUCGAU
CG」を有する化合物、及び「AUCGATCG」などいくつかのDNA塩基といくつか
のRNA塩基とを有する化合物、並びに「ATmeCGAUCG」(meCは5−メチル
シトシンを示す)など他の修飾塩基を有するオリゴヌクレオチドを含む。同様に、核酸塩
基配列「AUCGAUCG」を有するオリゴヌクレオチドは、修飾または非修飾に関わら
ず、こうした核酸塩基配列を有する任意のオリゴヌクレオチドを包含するものであり、以
下に限定されるものではないが、こうした化合物は、DNA塩基、例えば配列「ATCG
ATCG」を有する化合物、及び「AUCGATCG」などいくつかのDNA塩基といく
つかのRNA塩基とを有する化合物、並びに「ATmeCGAUCG」(meCは5−メ
チルシトシンを示す)など他の修飾塩基を有するオリゴヌクレオチドを含む。
ある種の修飾
ある種の実施形態では、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドは、核酸塩基、糖及
び/またはヌクレオシド間結合に対して1つまたは複数の修飾を含んでもよく、従って修
飾オリゴヌクレオチドである。修飾された核酸塩基、糖及び/またはヌクレオシド間結合
は、望ましい特性、例えば、細胞取り込みの増大、他のオリゴヌクレオチドまたは核酸標
的に対する親和性の強化、及びヌクレアーゼの存在下での安定性の増強を理由に非修飾形
態と比較して選択すればよい。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは1つまたは複数の修飾ヌクレオシド
を含む。そうしたある種の実施形態では、修飾ヌクレオシドは安定化ヌクレオシドである
。安定化ヌクレオシドの例として糖修飾ヌクレオシドがある。
ある種の実施形態では、修飾ヌクレオシドは糖修飾ヌクレオシドである。そうしたある
種の実施形態では、糖修飾ヌクレオシドは、天然若しくは修飾複素環塩基部分及び/また
は天然若しくは修飾ヌクレオシド間結合を更に含んでもよく、糖修飾とは無関係な修飾を
更に含んでもよい。ある種の実施形態では、糖修飾ヌクレオシドは、天然リボースまたは
2’−デオキシ−リボースの2’炭素で糖環が修飾されている2’−修飾ヌクレオシドで
ある。
ある種の実施形態では、2’−修飾ヌクレオシドは二環式糖部分を有する。そうしたあ
る種の実施形態では、二環式糖部分はα配置のD糖である。そうしたある種の実施形態で
は、二環式糖部分はβ配置のD糖である。そうしたある種の実施形態では、二環式糖部分
はα配置のL糖である。そうしたある種の実施形態では、二環式糖部分はβ配置のL糖で
ある。
ある種の実施形態では、二環式糖部分は2’−炭素原子と4’−炭素原子との間に架橋
基を含む。そうしたある種の実施形態では、架橋基は1〜8個連結したビラジカル基を含
む。ある種の実施形態では、二環式糖部分は1〜4個連結したビラジカル基を含む。ある
種の実施形態では、二環式糖部分は2または3個連結したビラジカル基を含む。ある種の
実施形態では、二環式糖部分は、2個連結したビラジカル基を含む。こうした4’から2
’の糖置換基の例には、−[C(R)(R)]−、−[C(R)(R)]
O−、−C(R)−N(R)−O−または−C(R)−O−N(R)−;4
’−CH−2’、4’−(CH−2’、4’−(CH−2’; 4’−(
CH)−O−2’(LNA);4’−(CH)−S−2’;4’−(CH−O
−2’(ENA);4’−CH(CH)−O−2’(cEt)及び4’−CH(CH
OCH)−O−2’、並びにこれらのアナログ(例えば、2008年7月15日に発行
された米国特許第7,399,845号明細書を参照されたい);4’−C(CH)(
CH)−O−2’及びこれらのアナログ、(例えば、2009年1月8日に公開された
国際公開第2009/006478号パンフレットを参照されたい);4’−CH−N
(OCH)−2’及びこれらのアナログ(例えば、2008年12月11日に公開され
た国際公開第2008/150729号パンフレットを参照されたい);4’−CH
O−N(CH)−2’(例えば、2004年9月2日に公開された米国特許出願公開第
2004/0171570号明細書を参照されたい);Rが各々独立にH、保護基または
〜C12アルキルである4’−CH−O−N(R)−2’及び4’−CH−N(
R)−O−2’−;RがH、C〜C12アルキルまたは保護基である4’−CH−N
(R)−O−2’(2008年9月23日に発行された米国特許第7,427,672号
明細書を参照されたい);4’−CH−C(H)(CH)−2’(例えば、Chat
topadhyaya,et al.,J.Org.Chem.,2009,74,11
8−134を参照されたい);並びに4’−CH−C(=CH)−2’及びこれらの
アナログ(2008年12月8日に公開された国際公開第2008/154401号パン
フレットを参照されたい)があるが、これに限定されるものではない。
ある種の実施形態では、こうした4’から2’の架橋は独立に、−[C(R)(R
)]−、−C(R)=C(R)−、−C(R)=N−、−C(=NR)−、−
C(=O)−、−C(=S)−、−O−、−Si(R−、−S(=O)−及び−
N(R)−から独立に選択される1個または2〜4個連結した基を含み;
式中、
xは0、1または2であり;
nは1、2、3または4であり;
及びRは各々独立に、H、保護基、ヒドロキシル、C〜C12アルキル、
置換C〜C12アルキル、C〜C12アルケニル、置換C〜C12アルケニル、C
〜C12アルキニル、置換C〜C12アルキニル、C〜C20アリール、置換C
〜C20アリール、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロ
アリール、C〜C脂環式ラジカル、置換C〜C脂環式ラジカル、ハロゲン、OJ
、NJ、SJ、N、COOJ、アシル(C(=O)−H)、置換アシル、
CN、スルホニル(S(=O)−J)またはスルホキシル(S(=O)−J)であ
り;かつ
及びJは各々独立に、H、C〜C12アルキル、置換C〜C12アルキ
ル、C〜C12アルケニル、置換C〜C12アルケニル、C〜C12アルキニル、
置換C〜C12アルキニル、C〜C20アリール、置換C〜C20アリール、アシ
ル(C(=O)−H)、置換アシル、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、C〜C
アミノアルキル、置換C〜C12アミノアルキルまたは保護基である。
こうした二環式糖部分を含むヌクレオシドは、二環式ヌクレオシドまたはBNAという
。ある種の実施形態では、二環式ヌクレオシドには、下記に記載するように(A)α−L
−メチレンオキシ(4’−CH−O−2’)BNA;(B)β−D−メチレンオキシ(
4’−CH−O−2’)BNA;(C)エチレンオキシ(4’−(CH−O−2
’)BNA;(D)アミノオキシ(4’−CH−O−N(R)−2’)BNA;(E)
オキシアミノ(4’−CH−N(R)−O−2’)BNA;(F)メチル(メチレンオ
キシ)(4’−CH(CH)−O−2’)BNA(規制されたエチルまたはcEtとも
いう);(G)メチレン−チオ(4’−CH−S−2’)BNA;(H)メチレン−ア
ミノ(4’−CH2−N(R)−2’)BNA;(I)メチル炭素環式(4’−CH
CH(CH)−2’)BNA;(J)c−MOE(4’−CH−OMe−2’)BN
A及び(K)プロピレン炭素環式(4’−(CH−2’)BNAがあるが、これに
限定されるものではない。
Figure 2018121646
式中、Bxは核酸塩基部分であり、Rは独立に、H、保護基またはC〜C12アルキル
である。
ある種の実施形態では、2’−修飾ヌクレオシドはハロ、アリル、アミノ、アジド、S
H、CN、OCN、CF、OCF、O−、S−、またはN(R)−アルキル;O−
、S−、またはN(R)−アルケニル;O−、S−、またはN(R)−アルキニル;
O−アルキレニル−O−アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、O−アルカリ
ル、O−アラルキル、O(CHSCH、O−(CH−O−N(R)(R
)またはO−CH−C(=O)−N(R)(R)から選択される2’−置換基を
含み、式中、R及びRは各々独立に、H、アミノ保護基または置換若しくは非置換C
〜C10アルキルである。これらの2’−置換基は更に、ヒドロキシル、アミノ、アル
コキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ(NO)、チオール、チオアルコキ
シ(S−アルキル)、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル及びアルキニルから独
立に選択される1つまたは複数の置換基で置換されていてもよい。
ある種の実施形態では、2’−修飾ヌクレオシドは、F、NH、N、OCF3、
−CH、O(CHNH、CH−CH=CH、O−CH−CH=CH
OCHCHOCH、O(CHSCH、O−(CH−O−N(R
(R)、−O(CHO(CHN(CH及びN−置換アセトアミド(
O−CH−C(=O)−N(R)(R)から選択される2’−置換基を含み、R
及びRは各々独立に、H、アミノ保護基または置換若しくは非置換C〜C10アルキ
ルである。
ある種の実施形態では、2’−修飾ヌクレオシドは、F、OCF3、O−CH、OC
CHOCH、2’−O(CHSCH、O−(CH−O−N(CH
、−O(CHO(CHN(CH、及びO−CH−C(=O)
−N(H)CHから選択される2’−置換基を含む。
ある種の実施形態では、2’−修飾ヌクレオシドは、F、O−CH、及びOCH
OCHから選択される2’−置換基を含む。
ある種の実施形態では、糖修飾ヌクレオシドは4’−チオ修飾ヌクレオシドである。あ
る種の実施形態では、糖修飾ヌクレオシドは4’−チオ−2’−修飾ヌクレオシドである
。4’−チオ修飾ヌクレオシドは、4’−Oが4’−Sで置換されたβ−D−リボヌクレ
オシドを有する。4’−チオ−2’−修飾ヌクレオシドは、2’−OHが2’−置換基で
置換された4’−チオ修飾ヌクレオシドである。好適な2’−置換基は、2’−OCH
、2’−O−(CH−OCH、及び2’−Fを含む。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは1つまたは複数のヌクレオシド間修
飾を含む。そうしたある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間
結合は修飾ヌクレオシド間結合である。ある種の実施形態では、修飾ヌクレオシド間結合
はリン原子を含む。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つのホスホロチオエ
ートヌクレオシド間結合を含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌ
クレオシド間結合はホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。
ある種の実施形態では、修飾ヌクレオシド間結合はリン原子を含まない。そうしたある
種の実施形態では、ヌクレオシド間結合は、短鎖アルキルのヌクレオシド間結合により形
成される。そうしたある種の実施形態では、ヌクレオシド間結合は、シクロアルキルのヌ
クレオシド間結合により形成される。そうしたある種の実施形態では、ヌクレオシド間結
合は、ヘテロ原子とアルキルとが混合したヌクレオシド間結合により形成される。そうし
たある種の実施形態では、ヌクレオシド間結合は、ヘテロ原子とシクロアルキルとが混合
したヌクレオシド間結合により形成される。そうしたある種の実施形態では、ヌクレオシ
ド間結合は、1つまたは複数の短鎖ヘテロ原子のヌクレオシド間結合により形成される。
そうしたある種の実施形態では、ヌクレオシド間結合は、1つまたは複数の複素環のヌク
レオシド間結合により形成される。そうしたある種の実施形態では、ヌクレオシド間結合
はアミド骨格を有する。そうしたある種の実施形態では、ヌクレオシド間結合はN、O、
S及びCHの各構成部分が混合している。
ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは1つまたは複数の修飾核酸塩基を含
む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは1つまたは複数の5−メチルシト
シンを含む。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドのシトシンは各々5−メチ
ルシトシンを含む。
ある種の実施形態では、修飾核酸塩基は、5−ヒドロキシメチルシトシン、7−デアザ
グアニン及び7−デアザアデニンから選択される。ある種の実施形態では、修飾核酸塩基
は、7−デアザ−アデニン、7−デアザグアノシン、2−アミノピリジン及び2−ピリド
ンから選択される。ある種の実施形態では、修飾核酸塩基は、5−置換ピリミジン、6−
アザピリミジン、並びにN−2、N−6及びO−6置換プリン、例えば2アミノプロピル
アデニン、5−プロピニルウラシル及び5−プロピニルシトシンから選択される。
ある種の実施形態では、修飾核酸塩基は多環式複素環を含む。ある種の実施形態では、
修飾核酸塩基は三環式複素環を含む。ある種の実施形態では、修飾核酸塩基はフェノキサ
ジン誘導体を含む。ある種の実施形態では、フェノキサジンは更に修飾されて、当該技術
分野においてGクランプ(G−clamp)として知られる核酸塩基を形成していてもよ
い。
ある種の医薬組成物
本明細書で提供されるのは、オリゴヌクレオチドを含む医薬組成物である。ある種の実
施形態では、こうした医薬組成物は、代謝障害及び関連する状態の処置に使用される。あ
る種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、8〜30個連結したヌクレオ
シドからなり、miR−21またはその前駆体と相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリ
ゴヌクレオチドを含む化合物を含む。ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬
組成物は、8〜30個連結したヌクレオシドからなり、miR−21またはその前駆体と
相補的な核酸塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドからなる化合物を含む。
好適な投与経路には、経口、直腸、経粘膜、腸、経腸、局所、坐剤、吸入、髄膜内、心
臓内、脳室内、腹腔内、鼻腔内、眼内、腫瘍内及び非経口(例えば、静脈内、筋肉内、骨
髄内及び皮下)があるが、これに限定されるものではない。ある種の実施形態では、全身
曝露ではなく局所曝露を達成するため、医薬品のくも膜下腔内注射を投与する。例えば、
医薬組成物は、所望の作用部位に(例えば、肝臓に)直接注射してもよい。
ある種の実施形態では、医薬組成物は、投薬単位の形態(例えば、錠剤、カプセル剤、
ボーラス等)で投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、25mg〜800
mg、25mg〜700mg、25mg〜600mg、25mg〜500mg、25mg
〜400mg、25mg〜300mg、25mg〜200mg、25mg〜100mg、
100mg〜800mg、200mg〜800mg、300mg〜800mg、400m
g〜800mg、500mg〜800mg、600mg〜800mg、100mg〜70
0mg、150mg〜650mg、200mg〜600mg、250mg〜550mg、
300mg〜500mg、300mg〜400mg及び400mg〜600mgから選択
される範囲内の用量で修飾オリゴヌクレオチドを含む。ある種の実施形態では、こうした
医薬組成物は、25mg、30mg、35mg、40mg、45mg、50mg、55m
g、60mg、65mg、70mg、75mg、80mg、85mg、90mg、95m
g、100mg、105mg、110mg、115mg、120mg、125mg、13
0mg、135mg、140mg、145mg、150mg、155mg、160mg、
165mg、170mg、175mg、180mg、185mg、190mg、195m
g、200mg、205mg、210mg、215mg、220mg、225mg、23
0mg、235mg、240mg、245mg、250mg、255mg、260mg、
265mg、270mg、270mg、280mg、285mg、290mg、295m
g、300mg、305mg、310mg、315mg、320mg、325mg、33
0mg、335mg、340mg、345mg、350mg、355mg、360mg、
365mg、370mg、375mg、380mg、385mg、390mg、395m
g、400mg、405mg、410mg、415mg、420mg、425mg、43
0mg、435mg、440mg、445mg、450mg、455mg、460mg、
465mg、470mg、475mg、480mg、485mg、490mg、495m
g、500mg、505mg、510mg、515mg、520mg、525mg、53
0mg、535mg、540mg、545mg、550mg、555mg、560mg、
565mg、570mg、575mg、580mg、585mg、590mg、595m
g、600mg、605mg、610mg、615mg、620mg、625mg、63
0mg、635mg、640mg、645mg、650mg、655mg、660mg、
665mg、670mg、675mg、680mg、685mg、690mg、695m
g、700mg、705mg、710mg、715mg、720mg、725mg、73
0mg、735mg、740mg、745mg、750mg、755mg、760mg、
765mg、770mg、775mg、780mg、785mg、790mg、795m
g及び800mgから選択される用量で修飾オリゴヌクレオチドを含む。そうしたある種
の実施形態では、医薬組成物は、25mg、50mg、75mg、100mg、150m
g、200mg、250mg、300mg、350mg、400mg、500mg、60
0mg、700mg及び800mgから選択される用量の修飾オリゴヌクレオチドを含む
ある種の実施形態では、医薬品は、好適な希釈液、例えば、無菌注射用水または無菌注
射用生理食塩水で再溶解される無菌凍結乾燥修飾オリゴヌクレオチドである。再溶解され
る製品は、食塩水に希釈してから皮下注射または点滴静注として投与される。凍結乾燥製
剤は、注射用水または注射用食塩水で調製され、調製中に酸または塩基でpH7.0〜9
.0に調整し、その後凍結乾燥された修飾オリゴヌクレオチドからなる。凍結乾燥修飾オ
リゴヌクレオチドは、25〜800mgのオリゴヌクレオチドであってもよい。これは、
25mg、50mg、75mg、100mg、125mg、150mg、175mg、2
00mg、225mg、250mg、275mg、300mg、325mg、350mg
、375mg、425mg、450mg、475mg、500mg、525mg、550
mg、575mg、600mg、625mg、650mg、675mg、700mg、7
25mg、750mg、775mg及び800mgの凍結乾燥修飾オリゴヌクレオチドを
包含することが理解されよう。更に、いくつかの実施形態では、凍結乾燥修飾オリゴヌク
レオチドは、25mg〜800mg、25mg〜700mg、25mg〜600mg、2
5mg〜500mg、25mg〜400mg、25mg〜300mg、25mg〜200
mg、25mg〜100mg、100mg〜800mg、200mg〜800mg、30
0mg〜800mg、400mg〜800mg、500mg〜800mg、600mg〜
800mg、100mg〜700mg、150mg〜650mg、200mg〜600m
g、250mg〜550mg、300mg〜500mg、300mg〜400mg及び4
00mg〜600mgから選択される範囲内の量のオリゴヌクレオチドである。凍結乾燥
製剤は、2mLのType I透明ガラスバイアル(硫酸アンモニウム処理)に入れ、ブ
ロモブチルゴム栓で栓をしてアルミニウム製FLIP−OFF(登録商標)オーバーシー
ルで密封してもよい。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、医薬組成物に通常見られ
る他の補助成分を当該技術分野で確立された使用レベルで更に含んでもよい。このため、
例えば、組成物は、適合性がある追加の医薬活性物質、例えば、鎮痒薬、収斂薬、局所麻
酔薬または抗炎症薬を含んでもよいし、また、様々な剤形の本発明の組成物を物理的に配
合するのに有用な追加物質、例えば色素、着香剤、防腐剤、酸化防止剤、乳白剤、粘度付
与剤及び安定剤を含んでもよい。しかしながら、こうした物質は、加える際に、本発明の
組成物の成分の生物活性を必要以上に阻害するものであってはならない。こうした製剤は
滅菌し、必要に応じて、助剤、例えば、製剤のオリゴヌクレオチド(単数または複数)と
有害な相互作用を起こさない滑沢剤、防腐剤、安定剤、湿潤剤、乳化剤、浸透圧を調節す
るための塩、緩衝液、着色料、矯味矯臭剤及び/または芳香物質及び同種のものを含んで
もよい。
核酸治療剤には脂質部分が種々の方法で使用されてきた。1つの方法では、カチオン性
脂質と中性脂質との混合物で作られた、予め形成されたリポソームまたはリポプレックス
に核酸を導入する。別の方法では、中性脂質の存在なしにDNAとモノ−またはポリ−カ
チオン性脂質との複合体を形成する。ある種の実施形態では、脂質部分は、特定の細胞ま
たは組織への医薬品の分布が増加するように選択する。ある種の実施形態では、脂質部分
は、脂肪組織への医薬品の分布が増加するように選択する。ある種の実施形態では、脂質
部分は、筋肉組織への医薬品の分布が増加するように選択する。
ある種の実施形態では、イントラリピッドを使用してオリゴヌクレオチドを含む医薬組
成物を調製する。イントラリピッドは、静脈内投与用に調製された脂肪乳剤である。イン
トラリピッドは、10%大豆油、1.2%卵黄リン脂質、2.25%グリセリン及び注射
用水からなる。更に、pHを調整するため水酸化ナトリウムが加えられているため、最終
製品のpH範囲は6〜8.9になっている。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、ポリアミン化合物または
脂質部分と核酸との複合体を含む。ある種の実施形態では、こうした調製物は、各々独立
に式(Z)により定義される構造を有する1種または複数種の化合物またはその薬学的に
許容される塩を含み、
Figure 2018121646
式中、X及びXは、各々存在する場合、各々独立にC1〜6アルキレンであり;nは
0、1、2、3、4または5であり;Rは各々独立にHであり、調製物中の式(Z)の化
合物の分子の少なくとも約80%においてR部分の少なくともn+2はHではなく;mは
1、2、3または4であり;YはO、NR2またはSであり;Rはアルキル、アルケニ
ルまたはアルキニルであり;その各々は任意選択的に1つまたは複数の置換基で置換され
ており;RはH、アルキル、アルケニルまたはアルキニルであり;その各々は任意選択
的に1つまたは複数の置換基で置換されており;但し、n=0である場合、R部分の少な
くともn+3はHではない。こうした調製物は、脂質調製物の開示についてその全体を本
明細書に援用する国際公開第2008/042973号パンフレットに記載されている。
いくつかの他の調製物は、脂質調製物の開示についてその全体を本明細書に援用するAk
inc et al.,Nature Biotechnology 26,561−5
69(01 May 2008)に記載されている。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、1つまたは複数の修飾オ
リゴヌクレオチド、及び1種または複数種の賦形剤を含む。そうしたある種の実施形態で
は、賦形剤は、水、塩溶液、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトー
ス、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロ
キシメチルセルロース及びポリビニルピロリドンから選択される。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、以下に限定されるもので
はないが、混合工程、溶解工程、造粒工程、糖衣錠製造工程、水簸工程、乳化工程、カプ
セル充填工程、封入工程または錠剤化工程を含む既知の技術を用いて調製される。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は液体(例えば、懸濁剤、エ
リキシル剤及び/または溶液剤)である。こうした実施形態の一部では、液体医薬組成物
は、当該技術分野において公知の成分、以下に限定されるものではないが、水、グリコー
ル、油、アルコール、着香剤、防腐剤及び着色剤を用いて調製される。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は固体(例えば、散剤、錠剤
及び/またはカプセル剤)である。こうした実施形態の一部では、1つまたは複数のオリ
ゴヌクレオチドを含む固体医薬組成物は、当該技術分野において公知の成分、以下に限定
されるものではないが、デンプン、糖、希釈液、造粒剤、滑沢剤、バインダー及び崩壊剤
を用いて調製される。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物はデポ調製物として製剤化さ
れる。ある種のこうしたデポ調製物は典型的には非デポ調製物より長く作用する。ある種
の実施形態では、こうした調製物は、埋入(例えば皮下または筋肉内)または筋肉内注射
により投与される。ある種の実施形態では、デポ調製物は、好適なポリマー材料若しくは
疎水性材料(例えば許容可能な油に溶かしたエマルジョン)またはイオン交換樹脂を用い
て、或いは、やや溶けにくい誘導体、例えば、やや溶けにくい塩として調製される。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、送達系を含む。送達系の
例には、リポソーム及びエマルジョンがあるが、これに限定されるものではない。ある種
の送達系は、疎水性化合物を含む医薬組成物などある種の医薬組成物の調製に有用である
。ある種の実施形態では、ある種の有機溶媒、例えばジメチルスルホキシドが使用される
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、本発明の1つまたは複数
の医薬品を特異的な組織または細胞型に送達するように設計された1つまたは複数の組織
特異的送達分子を含む。例えば、ある種の実施形態では、医薬組成物は、組織特異的抗体
でコーティングされたリポソームを含む。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、共溶媒系を含む。こうし
た共溶媒系の一部は、例えば、ベンジルアルコール、非極性界面活性剤、水混和性有機ポ
リマー及び水相を含む。ある種の実施形態では、こうした共溶媒系は、疎水化合物に使用
される。こうした共溶媒系の非限定的な例として、3%w/vベンジルアルコール、8%
w/vの非界面活性剤Polysorbate 80(商標)及び65%w/vポリエチ
レングリコール300を含む無水エタノールの溶液であるVPD共溶媒系がある。こうし
た共溶媒系の比率は、溶解性及び毒性の特性を大きく変えなければ、かなり多岐にわたっ
てもよい。更に、共溶媒の成分の種類も多岐にわたってもよい。例えば、Polysor
bate 80(商標)の代わりに他の界面活性剤を使用してもよく、ポリエチレングリ
コールの分子量も多岐にわたってもよい。ポリエチレングリコールの代わりに他の生体適
合性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドンを使用してもよい。更にデキストロースの
代わりに他の糖または多糖類を使用してもよい。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は徐放系を含む。こうした徐
放系の非限定的な例として、固体疎水性ポリマーの半透性マトリックスがある。ある種の
実施形態では、徐放系は、その化学的性質に応じて数時間、数日、数週または数ヶ月の期
間にわたり医薬品を放出することができる。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は経口投与用に調製される。
こうした実施形態の一部では、医薬組成物は、修飾オリゴヌクレオチドを含む1種または
複数種の化合物を1種または複数種の薬学的に許容されるキャリアと組み合わせることに
より製剤化される。こうしたキャリアの一部を用いると、被検体の経口摂取を目的として
医薬組成物を錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液体剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー
剤、懸濁剤及び同種のものとして製剤化することができる。ある種の実施形態では、経口
使用のための医薬組成物は、オリゴヌクレオチドと1種または複数種の固体賦形剤とを混
合することによる得られる。好適な賦形剤には、充填剤、例えば糖、例えばラクトース、
スクロース、マンニトールまたはソルビトール;セルロース調製物、例えば、トウモロコ
シデンプン、コムギデンプン、コメデンプン、ポテトスターチ、ゼラチン、トラガントゴ
ム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチル−セルロース、カルボキシメチルセル
ロースナトリウム、及び/またはポリビニルピロリドン(PVP)があるが、これに限定
されるものではない。ある種の実施形態では、こうした混合物を任意に粉砕し、助剤を任
意に加える。ある種の実施形態では、医薬組成物は、錠剤または糖衣錠の素錠が得られる
ように形成する。ある種の実施形態では、崩壊剤(例えば、架橋ポリビニルピロリドン、
寒天またはアルギン酸またはその塩、例えばアルギン酸ナトリウム)を加える。
ある種の実施形態では、糖衣錠の素錠にコーティングを施す。そうしたある種の実施形
態では、任意にアラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カーボポールゲル、ポリ
エチレングリコール及び/または二酸化チタン、ラッカー溶液、並びに好適な有機溶媒ま
たは溶媒混合物を含んでもよい濃縮糖液を使用してもよい。錠剤または糖衣錠コーティン
グには色材または色素を加えてもよい。
ある種の実施形態では、経口投与用の医薬組成物は、ゼラチンで作られたプッシュフィ
ット(push−fit)カプセル剤である。こうしたプッシュフィット(push−f
it)カプセル剤の一部は、1種または複数種の充填剤、例えばラクトース、バインダー
、例えばデンプン、及び/または滑沢剤、例えばタルクまたはステアリン酸マグネシウム
、並びに任意に安定剤と混合された本発明の1つまたは複数の医薬品を含む。ある種の実
施形態では、経口投与用の医薬組成物は、ゼラチン及び可塑剤、例えばグリセロールまた
はソルビトールで作られた密封された軟カプセル剤である。ある種の軟カプセル剤では、
本発明の1つまたは複数の医薬品は、好適な液体、例えば脂肪油、流動パラフィンまたは
液体ポリエチレングリコールに溶解または懸濁される。更に、安定剤を加えてもよい。
ある種の実施形態では、医薬組成物は口腔内投与用に調製される。こうした医薬組成物
の一部は、従来の方法で製剤化された錠剤またはロゼンジである。
ある種の実施形態では、医薬組成物は、注射による投与(例えば、静脈内、皮下、筋肉
内等)用に調製される。こうした実施形態の一部では、医薬組成物は、キャリアを含み、
水溶液、例えば水または生理学的に適合性の緩衝液、例えばハンクス液、リンゲル液また
は生理食塩水緩衝液中で製剤化される。ある種の実施形態では、他の成分(例えば、溶解
を助けるまたは防腐剤として働く成分)も含まれる。ある種の実施形態では、適切な液体
キャリア、懸濁化剤及び同種のものを用いて注射用懸濁液を調製する。ある種の注射用医
薬組成物は、単位剤形、例えば、アンプルまたは複数用量容器で提供される。ある種の注
射用医薬組成物は、油性若しくは水性ビヒクル中の懸濁液、溶液またはエマルジョンであ
り、製剤添加剤、例えば懸濁剤、安定化剤及び/または分散剤を含んでもよい。注射用医
薬組成物に使用するのに好適なある種の溶媒には、親油性溶媒及び脂肪油、例えばゴマ油
、合成脂肪酸エステル、例えばオレイン酸エチルまたはトリグリセリド、並びにリポソー
ムがあるが、これに限定されるものではない。水性注射懸濁液は、懸濁液の粘度を高める
物質、例えばカルボキシメチルセルロースナトリウム、ソルビトールまたはデキストラン
を含んでもよい。任意に、こうした懸濁液は、好適な安定剤、または医薬品の溶解性を高
めて高濃縮溶液の調製を可能にする作用物質を更に含んでもよい。
ある種の実施形態では、医薬組成物は経粘膜投与用に調製される。こうした実施形態の
一部では、製剤中にバリアを透過するのに適切な浸透剤を使用する。こうした浸透剤は一
般に当該技術分野において公知である。
ある種の実施形態では、医薬組成物は、吸入による投与用に調製される。こうした吸入
用の医薬組成物は、加圧パックまたはネブライザーのエアロゾルスプレー形態で調製され
る。こうした医薬組成物の一部は、噴射剤、例えば、ジクロロジフルオロメタン、トリク
ロロフルオロメタン、ジクロロテトラフルオロエタン、二酸化炭素または他の好適なガス
を含む。加圧エアロゾルを用いるある種の実施形態では、投薬単位は、計量分が送達され
る弁により決定してもよい。ある種の実施形態では、吸入器またはインサフレーターに使
用するカプセル剤及びカートリッジ剤を製剤化してもよい。こうした製剤の一部は、本発
明の医薬品と好適な粉末基剤、例えばラクトースまたはデンプンとの粉末混合物を含む。
ある種の実施形態では、医薬組成物は、坐剤または停留浣腸剤など直腸投与用に調製さ
れる。こうした医薬組成物の一部は、既知の成分、例えばカカオバター及び/または他の
グリセリドを含む。
ある種の実施形態では、医薬組成物は、局所投与用に調製される。こうした医薬組成物
の一部は、刺激のない保湿基剤、例えば軟膏またはクリームを含む。好適な例示的軟膏基
剤には、ペトロラタム、ペトロラタムと揮発性シリコーンとを混合したもの、ラノリン、
及び油中水型エマルジョンがあるが、これに限定されるものではない。好適な例示的クリ
ーム基剤には、コールドクリーム及び親水軟膏があるが、これに限定されるものではない
ある種の実施形態では、本明細書に提供される医薬組成物は、治療有効量で修飾オリゴ
ヌクレオチドを含む。ある種の実施形態では、治療有効量は、疾患の症状を予防、緩和ま
たは軽減させる、或いは、処置された被検体の生存を延長させるのに十分な量である。治
療有効量の判定は、十分に当業者の能力の範囲内である。
ある種の実施形態では、本明細書に提供される1つまたは複数の修飾オリゴヌクレオチ
ドはプロドラッグとして製剤化される。ある種の実施形態では、プロドラッグは、インビ
ボ投与すると、生物学的に、薬学的にまたは治療的により活性な形態のオリゴヌクレオチ
ドに化学的に変換される。ある種の実施形態では、プロドラッグは、その活性形態より投
与しやすいため、有用である。例えば、場合によっては、プロドラッグは、その活性形態
より(例えば、経口投与により)体内吸収される可能性がある。場合によっては、プロド
ラッグは、その活性形態と比較して溶解性を改善できたかもしれない。ある種の実施形態
では、プロドラッグは、その活性形態より水溶性に乏しい。場合によっては、こうしたプ
ロドラッグは、細胞膜(通り抜けるには水溶性が妨げになる)を通過する優れた送達性を
有する。ある種の実施形態では、プロドラッグはエステルである。そうしたある種の実施
形態では、エステルは、投与すると代謝によりカルボン酸に加水分解される。場合によっ
ては、カルボン酸を含む化合物はその活性形態である。ある種の実施形態では、プロドラ
ッグは、酸性基に結合した短いペプチド(ポリアミノ酸)を含む。こうした実施形態の一
部では、ペプチドは、投与されると切断されてその活性形態となる。
ある種の実施形態では、プロドラッグは、インビボ投与すると医薬活性化合物が再生す
るように医薬活性化合物を修飾することにより製造する。プロドラッグは、薬剤の代謝安
定性または輸送性を変化させる、副作用または毒性をマスクする、薬剤の風味を改善する
、或いは、薬剤の他の特徴または特性を変化させるように設計してもよい。当業者は、医
薬活性化合物が分かれば、インビボでの薬力学的プロセス及び薬物代謝の知識に基づき、
その化合物のプロドラッグを設計することができる(例えば、Nogrady(1985
) Medicinal Chemistry A Biochemical Appr
oach,Oxford University Press,New York,pa
ges 388−392を参照されたい)。
ある種の投与経路
ある種の実施形態では、被検体への投与は非経口投与を含む。ある種の実施形態では、
被検体への投与は静脈内投与を含む。ある種の実施形態では、被検体への投与は皮下投与
を含む。
ある種の実施形態では、被検体への投与は動脈内投与を含む。ある種の実施形態では、
被検体への投与は心臓内投与を含む。心臓内投与の好適な手段は、カテーテルの使用また
は直視下心臓手術における投与を含む。ある種の実施形態では、投与はステントの使用を
含む。
ある種の実施形態では、投与は経肺投与を含む。ある種の実施形態では、経肺投与は、
エアロゾル化したオリゴヌクレオチドを被検体の肺に吸入により送達することを含む。エ
アロゾル化したオリゴヌクレオチドを被検体が吸入した後、オリゴヌクレオチドは、肺胞
マクロファージ、好酸球、上皮、血管内皮、及び細気管支上皮など正常肺組織及び炎症肺
組織の両方の細胞に供給される。修飾オリゴヌクレオチドを含む医薬組成物を送達するの
に好適な装置には、以下に限定されるものではないが、標準的なネブライザー装置がある
。気道及び肺の特定の部分を標的とするように、ネブライザー装置を用いて液滴の大きさ
を調節するための製剤及び方法は、当業者によく知られている。他の好適な装置として、
乾燥粉末吸入器または定量吸入器がある。
ある種の実施形態では、医薬組成物は、全身曝露ではなく局所曝露を達成するために投
与する。例えば、経肺投与により医薬組成物は全身曝露を最低限にして肺に送達される。
他の好適な投与経路には、経口、直腸、経粘膜、腸、経腸、局所、坐剤、髄膜内、脳室
内、腹腔内、鼻腔内、眼内、筋肉内、骨髄内及び腫瘍内があるが、これに限定されるもの
ではない。
ある種の化合物
本明細書で提供されるのは、ある種のヌクレオシドパターンを有する修飾オリゴヌクレ
オチドを含む化合物と、標的核酸の活性、レベルまたは発現を調節するための、それらの
化合物の使用とである。ある種の実施形態では、化合物はオリゴヌクレオチドを含む。そ
うしたある種の実施形態では、化合物はオリゴヌクレオチドからなる。ある種の実施形態
では、オリゴヌクレオチドは修飾オリゴヌクレオチドである。ある種の実施形態では、修
飾オリゴヌクレオチドは小分子非コードRNA(small non−coding R
NA)と相補的である。ある種の実施形態では、小分子非コードRNA(small n
on−coding RNA)はmiR−21である。
そうしたある種の実施形態では、本化合物は相補鎖にハイブリダイズする修飾オリゴヌ
クレオチドを含む、即ち本化合物は二本鎖オリゴマー化合物を含む。ある種の実施形態で
は、相補鎖への修飾オリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションにより、少なくとも1
つの平滑末端が形成される。そうしたある種の実施形態では、相補鎖への修飾オリゴヌク
レオチドのハイブリダイゼーションにより二本鎖オリゴマー化合物の各末端に平滑末端が
形成される。ある種の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの末端は、相補鎖に連結し
たヌクレオシドの数に対して1つまたは複数の追加の連結したヌクレオシドを含む。ある
種の実施形態では、1つまたは複数の追加のヌクレオシドはオリゴヌクレオチドの5’末
端にある。ある種の実施形態では、1つまたは複数の追加のヌクレオシドはオリゴヌクレ
オチドの3’末端にある。ある種の実施形態では、1つまたは複数の追加のヌクレオシド
のヌクレオシドの少なくとも1つの核酸塩基は、標的RNAと相補的である。ある種の実
施形態では、1つまたは複数の追加の各ヌクレオシドの核酸塩基は各々、標的RNAと相
補的である。ある種の実施形態では、相補鎖の末端は、オリゴヌクレオチドの連結したヌ
クレオシドの数に対して1つまたは複数の追加の連結したヌクレオシドを含む。ある種の
実施形態では、1つまたは複数の追加の連結したヌクレオシドは、相補鎖の3’末端にあ
る。ある種の実施形態では、1つまたは複数の追加の連結したヌクレオシドは、相補鎖の
5’末端にある。ある種の実施形態では、追加の2個連結したヌクレオシドが末端に連結
している。ある種の実施形態では、1個の追加のヌクレオシドが末端に連結している。
ある種の実施形態では、本化合物は、1つまたは複数の部分とコンジュゲートした修飾
オリゴヌクレオチドを含み、その1つまたは複数の部分は、その結果得られるアンチセン
スオリゴヌクレオチドの活性、細胞分布または細胞取り込みを増強するものである。そう
したある種の実施形態では、その部分はコレステロール部分である。ある種の実施形態で
は、その部分は脂質部分である。コンジュゲートする追加部分には、糖質、リン脂質、ビ
オチン、フェナジン、葉酸塩、フェナントリジン、アントラキノン、アクリジン、フルオ
レセイン、ローダミン、クマリン及び色素がある。ある種の実施形態では、コンジュゲー
ト基はオリゴヌクレオチドに直接結合している。ある種の実施形態では、コンジュゲート
基は、アミノ、ヒドロキシル、カルボン酸、チオール、不飽和部分(例えば、二重または
三重結合)、8−アミノ−3,6−ジオキサオクタン酸(ADO)、スクシニミジル4−
(N−マレイミドメチル)シクロヘキサン−1−カルボキシレート(SMCC)、6−ア
ミノヘキサン酸(AHEXまたはAHA)、置換C1〜C10アルキル、置換若しくは非
置換C2〜C10アルケニル、及び置換若しくは非置換C2〜C10アルキニルから選択
される連結部分により修飾オリゴヌクレオチドに結合している。そうしたある種の実施形
態では、置換基は、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ、チ
オール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル及びアルキニルか
ら選択される。
そうしたある種の実施形態では、本化合物は、例えば、ヌクレアーゼ安定性などの特性
を増強するため、修飾オリゴヌクレオチドの一方または両方の末端に結合した1つまたは
複数の安定化基を有する修飾オリゴヌクレオチドを含む。安定化基にはキャップ構造が含
まれる。これらの末端修飾は、エキソヌクレアーゼによる分解から修飾オリゴヌクレオチ
ドを保護し、細胞内の送達及び/または局在化に役立ち得る。キャップは5’末端(5’
−キャップ)にあっても、また3’末端(3’−キャップ)にあってもよいし、或いは両
末端にあってもよい。キャップ構造は、例えば、逆位デオキシ脱塩基キャップを含む。
好適なキャップ構造には、4’,5’−メチレンヌクレオチド、1−(β−D−エリト
ロフラノシル)ヌクレオチド、4’−チオヌクレオチド、炭素環式ヌクレオチド、1,5
−アンヒドロヘキシトールヌクレオチド、L−ヌクレオチド、α−ヌクレオチド、修飾塩
基ヌクレオチド、ホスホロジチオアート結合、スレオ−ペントフラノシルヌクレオチド、
非環式3’,4’−セコヌクレオチド、非環式3,4−ジヒドロキシブチルヌクレオチド
、非環式3,5−ジヒドロキシペンチルヌクレオチド、3’−3’−逆位ヌクレオチド部
分、3’−3’−逆位脱塩基部分、3’−2’−逆位ヌクレオチド部分、3’−2’−逆
位脱塩基部分、1,4−ブタンジオールホスフェート、3’−ホスホルアミデート、ヘキ
シルホスフェート、アミノヘキシルホスフェート、3’−ホスフェート、3’−ホスホロ
チオエート、ホスホロジチオアート、架橋メチルホスホネート部分及び非架橋メチルホス
ホネート部分 5’−アミノ−アルキルホスフェート、1,3−ジアミノ−2−プロピル
ホスフェート、3−アミノプロピルホスフェート、6−アミノヘキシルホスフェート、1
,2−アミノドデシルホスフェート、ヒドロキシプロピルホスフェート、5’−5’−逆
位ヌクレオチド部分、5’−5’−逆位脱塩基部分、5’−ホスホルアミデート、5’−
ホスホロチオエート、5’−アミノ、架橋及び/または非架橋5’−ホスホルアミデート
、ホスホロチオエート、並びに5’−メルカプト部分がある。
ある種の追加の治療剤
miR−21に関連する疾患の処置は、2種以上の治療剤を含んでもよい。従って、あ
る種の実施形態では、本明細書に提供されるのは、miR−21に関連する疾患を有する
または有する疑いがある被検体を処置する方法であって、マイクロRNAと相補的な核酸
塩基配列を有する修飾オリゴヌクレオチドを投与することに加えて、少なくとも1種の治
療剤を投与することを含む方法である。
ある種の実施形態では、少なくとも1種の追加の治療剤は医薬品を含む。
ある種の実施形態では、医薬品は抗炎症薬を含む。ある種の実施形態では、抗炎症薬は
ステロイド系抗炎症薬である。ある種の実施形態では、ステロイド抗炎症薬はコルチコス
テロイドである。ある種の実施形態では、コルチコステロイドはプレドニゾンである。あ
る種の実施形態では、抗炎症薬は非ステロイド系抗炎症剤である。ある種の実施形態では
、非ステロイド系抗炎症薬はイブプロフェン、COX−I阻害剤またはCOX−2阻害剤
である。
ある種の実施形態では、医薬品は抗糖尿病薬を含む。抗糖尿病薬には、ビグアナイド、
グルコシダーゼ阻害剤、インスリン、スルホニル尿素及びチアゾリデンジオンがあるが、
これに限定されるものではない。
ある種の実施形態では、医薬品には、利尿薬(例えばスプリオノラクトン、エプレレノ
ン、フロセミド)、変力作用薬(例えばドブタミン、ミルリノン)、ジゴキシン、血管拡
張薬、アンジオテンシンII変換酵素(ACE)阻害剤(例えばカプトプリル、エナラプ
リル、リシノプリル、ベナゼプリル、キナプリル、ホシノプリル及びラミプリルである)
、アンジオテンシンII受容体遮断薬(ARB)(例えばカンデサルタン、イルベサルタ
ン、オルメサルタン、ロサルタン、バルサルタン、テルミサルタン、エプロサルタン)、
カルシウムチャネル遮断薬、二硝酸イソソルビド、ヒドララジン、ニトレート(例えば一
硝酸イソソルビド、二硝酸イソソルビド)、ヒドララジン、β遮断薬(例えばカルベジロ
ール、メトプロロール)、及びナトリウム利尿ペプチド(例えばネシリチド)があるが、
これに限定されるものではない。
ある種の実施形態では、医薬品はヘパリノイドを含む。ある種の実施形態では、ヘパリ
ノイドはペントサンポリ硫酸である。
ある種の実施形態では、医薬品は、線維化シグナルに対する1つまたは複数の応答を遮
断する医薬品である。
ある種の実施形態では、医薬品は抗結合組織増殖因子治療剤である。ある種の実施形態
では、抗CTGF治療剤はCTGFに対するモノクローナル抗体である。
ある種の実施形態では、追加の治療剤は、身体の免疫系を強化する医薬品であってもよ
く、低用量シクロホスファミド、チモスチムリン、ビタミン及び栄養補助剤(例えば、酸
化防止剤、例えばビタミンA、C、E、βカロテン、亜鉛、セレン、グルタチオン、コエ
ンザイムQ−10及びエキネシア)、並びにワクチン、例えば、多量体抗原の提示とアジ
ュバントとを組み合わせたワクチン製剤を含む免疫刺激複合体(ISCOM)が挙げられ
る。
ある種の実施形態では、追加の治療剤は、本発明の1つまたは複数の医薬組成物の副作
用を処置または軽減させるように選択される。こうした副作用には、以下に限定されるも
のではないが、注射部位反応、肝機能検査異常、腎機能異常、肝毒性、腎毒性、中枢神経
系異常及びミオパチーがある。例えば、血清中のアミノトランスフェラーゼレベルの上昇
から、肝毒性または肝機能異常が示唆されることがある。例えば、ビリルビンの増加から
、肝毒性または肝機能異常が示唆されることがある。
追加の医薬品の別の例には、免疫グロブリン、以下に限定されるものではないが、静脈
内免疫グロブリン(IVIg);鎮痛薬(例えば、アセトアミノフェン);サリチレート
;抗生物質;抗ウイルス薬;抗真菌薬;アドレナリン作用修飾薬;ホルモン(例えば、ア
ナボリックステロイド、アンドロゲン、エストロゲン、カルシトニン、プロゲスチン、ソ
マトスタン及び甲状腺ホルモン);免疫調節剤;筋弛緩薬;抗ヒスタミン剤;骨粗鬆症薬
(例えば、ビホスホネート、カルシトニン及びエストロゲン);プロスタグランジン、抗
腫瘍薬;精神治療薬;鎮静剤;毒オークまたは毒ウルシの生成物;抗体;及びワクチンが
あるが、これに限定されるものではない。
ある種のキット
本発明はまたキットを提供する。いくつかの実施形態では、キットは、核酸塩基配列が
miR−21の核酸塩基配列と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを含む、本発明の1種ま
たは複数種の化合物を含む。miR−21と相補的な化合物は、本明細書に記載のヌクレ
オシドパターンのいずれを有してもよい。いくつかの実施形態では、miR−21と相補
的な化合物はバイアル内に存在してもよい。例えば、調剤容器には、10個などの複数の
バイアルが存在してもよい。いくつかの実施形態では、バイアルは、シリンジが利用しや
すいように製造する。キットは、miR−21と相補的な化合物の使用説明書を更に含ん
でもよい。
いくつかの実施形態では、キットを使用してmiR−21と相補的な化合物を被検体に
投与することができる。こうした例では、キットは、miR−21と相補的な化合物に加
えて、以下の1つまたは複数を更に含んでもよい:シリンジ、アルコール綿棒、コットン
ボール及び/またはガーゼ。いくつかの実施形態では、miR−21と相補的な化合物は
、バイアル中でなくプレフィルドシリンジ(例えば27ゲージ、1/2インチ針の針ガー
ド付き単回投与シリンジ)中に存在してもよい。10本など複数のプレフィルドシリンジ
が、例えば、調剤容器中に存在してもよい。キットは、miR−21と相補的な化合物の
投与説明書を更に含んでもよい。
ある種の実験モデル
ある種の実施形態では、本発明は、実験モデルを用いて本発明の修飾オリゴヌクレオチ
ドを使用及び/または試験する方法を提供する。当業者であれば、そうした実験モデルの
プロトコルを選択及び変更して本発明の医薬品を評価することができる。
一般に、修飾オリゴヌクレオチドは最初に培養細胞で試験する。好適な細胞型には、イ
ンビボでの修飾オリゴヌクレオチドの送達が望ましい細胞型に関連する細胞型がある。例
えば、本明細書に記載の方法の研究に好適な細胞型には、初代細胞または培養細胞がある
ある種の実施形態では、培養細胞を用いて、修飾オリゴヌクレオチドがmiR−21の
活性を阻害する程度を評価する。ある種の実施形態では、マイクロRNA活性の阻害は、
マイクロRNAのレベルを測定することにより評価することができる。或いは、予想され
るまたは検証されたマイクロRNA制御転写物のレベルを測定してもよい。マイクロRN
A活性が阻害されると、miR−21制御転写物、及び/またはmiR−21制御転写物
によりコードされたタンパク質が増加する場合がある。更に、ある種の実施形態では、あ
る種の表現型の結果を測定してもよい。
ヒト疾患モデルを用いたmiR−21の研究では、いくつかの動物モデルが、当業者に
入手可能である。例えば、miR−21の阻害剤は、癌のモデル、例えば同所性異種移植
モデル、毒素誘発癌モデル、または遺伝子誘発癌モデルで研究することができる。こうし
た癌モデルでは、miR−21の阻害剤が腫瘍の大きさ、腫瘍数、全生存率及び/または
無増悪生存期間に与える作用を評価する研究を行うことができる。
心機能及び線維症に対するmiR−21の阻害剤の作用は、各々が異常な心機能及び線
維症を誘導する動脈結紮モデルまたは心筋梗塞モデルで研究することができる。腎線維症
のモデルは、一側尿管結紮及び虚血/再灌流傷害を含む。腎臓虚血再灌流障害モデルは、
初期の時点では、急性腎傷害のモデルとして使用することができ、一方、後期の時点では
腎線維症のモデルとして役立つ。肝線維症モデルは、例えば、四塩化炭素中毒または胆管
切除により誘導する。肺線維症に対するmiR−21の作用は、例えば、ブレオマイシン
誘発肺線維症のモデルにより誘導される。創傷治癒モデルも当業者に入手可能であり、例
えばC57Bl/KsJ−db/dbマウス(創傷閉鎖の顕著な遅延など成人発症型糖尿
病のいくつかの特徴を示す)がある。
ある種の定量化アッセイ
修飾オリゴヌクレオチドの投与後のmiR−21のアンチセンス阻害の作用は、当該技
術分野において公知の種々の方法により評価することができる。ある種の実施形態では、
これらの方法を用いて、細胞または組織のマイクロRNAレベルをインビトロまたはイン
ビボで定量する。ある種の実施形態では、マイクロアレイ解析によりマイクロRNAレベ
ルの変化を測定する。ある種の実施形態では、市販されているいくつかのPCRアッセイ
の1つ、例えばTaqMan(登録商標)MicroRNA Assay(Applie
d Biosystems)によりマイクロRNAレベルの変化を測定する。ある種の実
施形態では、miR−21の標的のmRNA及び/またはタンパク質レベルを測定するこ
とにより、miR−21のアンチセンス阻害を評価する。miR−21のアンチセンス阻
害を行うと、一般にマイクロRNAの標的のmRNA及び/またはタンパク質のレベルが
上昇する。
標的結合アッセイ
抗miRまたはマイクロRNA模倣物によるマイクロRNA活性の調節は、標的結合を
測定することにより評価することができる。ある種の実施形態では、標的結合は、mRN
Aのマイクロアレイプロファイリングにより測定する。抗miRまたはマイクロRNA模
倣物により調節される(増加或いは減少する)mRNAの配列についてマイクロRNAシ
ード配列を検索し、マイクロRNAの標的であるmRNAの調節を、マイクロRNAの標
的でないmRNAの調節と比較する。この方法では、抗miRとmiR−21と、または
miR−21模倣物とその標的との相互作用を評価することができる。抗miRの場合に
は、発現レベルが上昇するmRNAについて、抗miRと相補的なマイクロRNAのシー
ドマッチを含むmRNA配列をスクリーニングする。
本発明のいくつかの実施形態をより詳細に説明するため、以下に実施例を示す。但し、
実施例は、本発明の広範な範囲を限定するものとして解釈してはならない。当業者であれ
ば、本発見の根底にある原理を採用し、本発明の精神を逸脱しない範囲で様々な化合物を
容易に設計するであろう。
実施例1:抗miR−21化合物のインビトロスクリーニング
miR−21を標的とし、cEtヌクレオシドを含む様々な抗miRについて、miR
−21活性に対するその阻害作用を評価した。表Aに示すように、これらの化合物は、長
さ並びに修飾ヌクレオシドの数、種類及び配置が多岐にわたる。25919は、2’−M
OE及び2’−フルオロヌクレオシドを含み、miR−21を阻害することが知られてお
り、従って陽性対照として含めた。残りの化合物は、2’−MOEヌクレオシド及び/ま
たはβ−D−デオキシリボヌクレオシドと共にcEtヌクレオシドを含む。
Figure 2018121646
上の表Aでは、後に下付き文字がないヌクレオシドはβ−D−デオキシリボヌクレオシ
ドを示す。後に下付き文字「E」があるヌクレオシドは2’−MOEヌクレオシドを示す
。後に下付き文字「S」があるヌクレオシドはS−cEtヌクレオシドを示す。後に下付
き文字「F」があるヌクレオシドは2’−フルオロヌクレオシドを示す。ヌクレオシド間
結合は各々ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。上付き文字「Me」は、ヌク
レオシドのピリミジン塩基の5−メチル基を示す。
化合物は、ルシフェラーゼアッセイでmiR−21阻害活性を評価した。pGL3−M
CS2(Promega)を用いてマイクロRNAルシフェラーゼセンサーコンストラク
トを設計した。コンストラクトをHela細胞に導入して、抗miR化合物がmiR−2
1の活性を阻害できるかどうかを試験した。このアッセイでは、Hela細胞に存在する
miR−21がルシフェラーゼセンサーコンストラクトのコグネイト部位(単数または複
数)に結合し、ルシフェラーゼ発現を抑制する。適切な抗miRを細胞に導入すると、抗
miRはmiR−21に結合し、ルシフェラーゼ発現の抑制を緩和する。このため、本ア
ッセイでは、抗miRがmiR−21発現の効果的な阻害剤であれば、ルシフェラーゼ発
現が増加する。
1日目:miR−21の相補的な配列を含むように設計されたルシフェラーゼコンスト
ラクトを安定にトランスフェクトしたHela細胞(ATCC)をT−170フラスコ(
BD Falcon)に3.5*10細胞/フラスコで播種した。Hela細胞を高グ
ルコースダルベッコ変法イーグル培地(Invitrogen)で増殖させた。
2日目:各フラスコのHela細胞に、ウミシイタケを発現する0.5ugのphR
Lセンサープラスミド(Promega)をトランスフェクトして補正に使用した。He
la細胞は、20ulのリポフェクタミン2000/フラスコ(Invitrogen)
を使用してトランスフェクトした。トランスフェクションの4時間後、細胞をPBSで洗
浄し、トリプシン処理した。Hela細胞を24ウェルプレート(BD Falcon)
に40k/ウェルで蒔き、一晩放置した。
3日目:2.5ul リポフェクチン/100nM ASO/ml Opti−ME
M I Reduced Serum Medium(Invitrogen)でリポフ
ェクチン(Invitrogen)を用いてHela細胞に抗miRを4時間トランスフ
ェクトした。ASOのトランスフェクション後、Hela細胞に高グルコースダルベッコ
変法イーグル培地(Invitrogen)を更に加えた。
4日目:Hela細胞を受動的に溶解し、Dual−Luciferase Rep
orter Assay System(Promega)を用いてルシフェラーゼ活性
を測定する。
ルシフェラーゼアッセイを実施して、本明細書に記載のヌクレオシドパターンを持つ抗
miRがmiR−21の活性を阻害できるかどうかを試験した。結果を、細胞に抗miR
処置を施していない「偽」処置と比較した。実験を繰り返し、2回の反復実験の結果を、
β−ガラクトシダーゼ活性に対して補正したルシフェラーゼ値として以下の表Bに示す。
Figure 2018121646
表Bに示すように、以下のいくつかのcEt含有化合物がmiR−21を用量依存性に
阻害することが立証された:25068、25070、25072及び25082。
実施例2:抗miR−21化合物25070の様々な修飾ヌクレオシド
前述の実施例に示すように、25070は、ルシフェラーゼアッセイにおいてmiR−
21活性の強力な阻害剤である。25070の様々な位置における修飾ヌクレオシドの種
類の変化を評価するため、表Cに示すような追加の抗miR−21化合物を設計した。
Figure 2018121646
前述の表Fでは、後に下付き文字がないヌクレオシドはβ−D−デオキシリボヌクレオ
シドを示す。後に下付き文字「E」があるヌクレオシドは2’−MOEヌクレオシドを示
す。後に下付き文字「S」があるヌクレオシドはS−cEtヌクレオシドを示す。後に下
付き文字「F」があるヌクレオシドは2’−フルオロヌクレオシドを示す。ヌクレオシド
間結合は各々ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。上付き文字「Me」は、ヌ
クレオシドのピリミジン塩基の5−メチル基を示す。
本明細書に記載するようにルシフェラーゼアッセイを実施して、表Fの抗miRがmi
R−21の活性を阻害できるかどうかを試験した。結果を、細胞に抗miR処置を施して
いない「偽」処置と比較した。実験を繰り返し、2回の反復実験の結果を、偽処置に対す
るルシフェラーゼ値の倍率変化として以下の表Dに示す。
Figure 2018121646
表Dに示したように、25070に加えて以下のいくつかのcEt含有化合物がmiR
−21を用量依存性に阻害することが立証された:25922、25923及び2592
4。抗miR−21化合物25116及び25117はそれぞれ各ヌクレオシドに糖修飾
を有し、シトシンは各々5−メチルシトシンであるが、miR−21の効果的な阻害剤で
はなかった。
実施例3:抗miR−21化合物に活性を与えるヌクレオシドパターンの比較
抗miR−21化合物に活性を与えるヌクレオシドパターン間の関係を判定するため、
表Eに示す活性抗miR−21化合物において修飾及び非修飾ヌクレオシドの配置を比較
した。
Figure 2018121646
Figure 2018121646
修飾及び非修飾ヌクレオシド(上記の表F)の配置の比較から、高活性な抗miR−2
1化合物それぞれに共通するいくつかのヌクレオシドパターンが明らかになった。
例えば、各化合物の5’末端の構造の比較から、長さ1〜4ヌクレオシドの範囲にあり
、その各々が非二環式ヌクレオシドである領域(以下の表Gの「R」欄)が明らかになっ
た。次の領域は1個の二環式ヌクレオシド、その後に2個の非二環式ヌクレオシド、その
後に1個の二環式ヌクレオシドを有する(以下の表Gの「1」欄)。
次に、3個の非二環式ヌクレオシド、その後に1個の二環式ヌクレオシドが続く4個の
ヌクレオシドの反復ブロックが続き、この4個のヌクレオシドのブロックは合計3回繰り
返される(下記の表Gの「2」欄)。
各活性抗miR−21では、2個の3’−末端ヌクレオシドが非二環式ヌクレオシドで
ある(下記の表Gの「T」欄)。
Figure 2018121646
このヌクレオシドパターンは5’から3’方向に以下の式Iで表され:
(R)−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Rは各々、非二環式ヌクレオシドであり;Xは0〜4であり;
は各々、二環式ヌクレオシドであり;
は各々、非二環式ヌクレオシドであり;かつ
は各々、修飾ヌクレオシドである。
この式は、活性抗miR−21化合物25068、25070、25072、2508
2、25922、25923及び25924の各ヌクレオシドパターンを包含し、ヌクレ
オシドパターンIにより活性抗miRの活性が得られ、二環式ヌクレオシド、非二環式ヌ
クレオシド、及び修飾ヌクレオシドの選択の際に柔軟性が許容されることを立証するもの
である。従って、本明細書に提供されるのは、miR−21に対して核酸塩基相補性を有
する修飾オリゴヌクレオチド、及び式Iに記載したヌクレオシドパターンを含む組成物で
ある。
19個連結したヌクレオシド長さの活性抗miR−21化合物に活性を与えるヌクレオ
シドパターン間の関係を判定するため、表Hに示す高活性化合物全てにおいて修飾及び非
修飾ヌクレオシドの配置を比較した。いくつかのヌクレオシドの類似配置を示すため、化
合物を表Iに再度示す。
Figure 2018121646
Figure 2018121646
修飾及び非修飾ヌクレオシドの配置の比較(上の表I)から、19個連結したヌクレオ
シド長さの高活性な抗miR−21化合物それぞれに共通するいくつかのヌクレオシドパ
ターンが明らかになった。
例えば、各化合物の5’末端の構造の比較から、二環式ヌクレオシドでない1個の修飾
ヌクレオシドが明らかになった(下記の表Jの「N」欄)。次の領域は、1個の二環式
ヌクレオシド、その後に2個の非二環式ヌクレオシド、その後に1個の二環式ヌクレオシ
ドを有する(下記の表Jの「1」欄)。
次に、3個の非二環式ヌクレオシド、その後に1個の二環式ヌクレオシドが続く4個の
ヌクレオシドの反復ブロックが続き、この4個のヌクレオシドのブロックは合計3回繰り
返される(下記の表Jの「2」欄)。
各活性抗miR−21では、3’末端から2番目のヌクレオシドが非修飾ヌクレオシド
である(下記の表Jの「N」欄)。miR−21の1番目の核酸塩基と相補的な3’末端
のヌクレオシドは、修飾ヌクレオシドである(下記の表Jの「N」欄)。
Figure 2018121646
このヌクレオシドパターンは5’から3’方向に以下の式IIで表され:
−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
式中、Nは二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;
は各々、二環式ヌクレオシドであり;
は各々、非二環式ヌクレオシドであり;かつ
は修飾ヌクレオシドである。
本明細書に提供されるデータから、このヌクレオシドパターンが抗miR−21化合物
に活性を与えること、更に化合物の活性が種々の修飾ヌクレオシドで維持されることが立
証される。従って、本明細書に提供されるのは、miR−21と相補的な核酸塩基配列を
有する修飾オリゴヌクレオチド、及び式IIのヌクレオシドパターンを含む組成物である
25211及び25220を含む抗miR−21化合物の群を用いて同様の解析を行っ
た。前述の解析の結果、式III〜Vが確立された。
実施例2:腎線維症モデルにおけるmiR−21の阻害
一側尿管結紮(UUO)は、間質線維症を引き起こす腎傷害の確立された実験モデルで
あり、従ってヒト腎疾患を反映する実験モデルとして使用される。UUOは、一側の尿管
を外科的に結紮することにより誘発される。線維症はコラーゲンの増加を特徴とするため
、腎線維症の存在及び程度はコラーゲン量を測定することにより判定することができる。
コラーゲン量を評価するにはコラーゲン1A1(Col 1A1)及びコラーゲン3A1
(Col 3A1)を測定する。腎線維症は、コラーゲン量の増加を検出するため、組織
サンプルをピクロシリウスレッドで染色することにより可視化してもよい。また、腎線維
症は、コラーゲンの主成分であるヒドロキシプロリンの、サンプル中の量を測定すること
によっても観察することができる。
腎線維症のUUOモデルを用いて、ルシフェラーゼアッセイで活性することが分かった
cEt含有抗miR−21化合物を試験した。2’−MOE修飾及び2’−フルオロ修飾
を含む25919は、インビボでmiR−21活性を阻害することが知られており、陽性
対照として含めた。動物8匹の各群を以下の通り処置した:UUOのみ、PBSを用いた
UUO、または抗miR−21化合物を用いたUUO。UUO処置日の3日前、1日前、
及び処置日から5日後にそれぞれPBSまたは抗miR−21化合物を投与した。抗mi
R−21化合物は、20mg/kgの用量で投与した。抗miR化合物をUUO処置の前
に投与したため、この投与レジメンは予防処置と考えられる。11日目に、動物を屠殺し
、コラーゲン発現を測定するため腎臓を単離した。コラーゲン発現はリアルタイムPCR
により測定し、最初にGAPDHに対し、次いでシャム対照動物に対して補正した。コラ
ーゲン1A1及びコラーゲン3A1の発現を下記の表Kに示す。
Figure 2018121646
Figure 2018121646
この研究は、上記の処置群それぞれについて2〜3回繰り返した。本研究のメタアナリ
シスから、25070処置がコラーゲン発現で判断して最も大きな効力を示し、コラーゲ
ン1A1を40%阻害し、コラーゲン3A1を30%阻害することが明らかになった。2
5068もコラーゲン発現の減少に有効でったが、程度は25070より低かった。25
072及び25082は、本明細書に記載のインビトロ試験においてmiR−21の活性
阻害剤ではあるものの、コラーゲン発現の減少が必ずしも立証されたわけではない。
25070の活性を確認するためUUO研究を繰り返した。抗miRを20mg/kg
の用量で皮下投与した。下記の表Lの結果から、25070がコラーゲン1A1及びコラ
ーゲン3A1発現の強力な阻害剤であることが確認される。
Figure 2018121646
UUO研究の比較から、UUOモデルにおいて25070がコラーゲン発現の非常に強
力な阻害剤であることが明らかになった。このため、25070は腎線維症を含む線維症
の処置の候補治療薬である。
実施例3:抗miR−21とアンジオテンシン受容体遮断薬との比較
アンジオテンシン受容体遮断薬イルベサルタンは、線維症を特徴とする慢性腎傷害モデ
ルにおいて尿細管間質線維症の形成を遮断することが明らかになっている。線維症のUU
Oモデルを用いて25070の作用をイルベサルタンと比較した。
対照処置群は、UUOのみ(シャム)、及びPBSを皮下投与したUUOとした。追加
の対照群にTween−MC/20キャリアを経口投与したUUOを設定した。2507
0は、UUO処置の5日前、2日前、及び処置の3日後に20mg/kgの用量で皮下投
与した。イルベサルタンは、UUO処置後、0日目から7日目まで毎日経口投与した。動
物はUUO処置から10日目に屠殺した。腎組織を採取してコラーゲン1A1及びコラー
ゲン3A1の発現を測定した。結果を下記の表Mに示し、更に25070処理動物では、
Col1A1発現が食塩水処置動物に対して統計学的に有意に減少したこと(1元配置分
散分析によるp<.05)も示す。イルベサルタンでは、Col1A1発現の統計学的に
有意な減少が認められなかった。イルベサルタン及び25070ではどちらもCol3a
1発現が統計学的に有意に減少したが、25070の方がイルベサルタンより大きな減少
をもたらした。
Figure 2018121646
線維症のもう1つの指標は、UUO処置後にコラーゲン発現を示す腎組織の割合である
。そこで、組織学的解析のため腎組織を更に採取し、コラーゲン発現の増加を示す腎組織
画分を評価した。結果を下記の表Nに示す。「コラーゲン領域画分」は、ピクロシリウス
レッド染色により赤色に染色される腎組織領域の定量的イメージ処理によって組織学的に
測定する。赤色として検出された割合は、腎切片の領域で正規化する。組織切片は盲検的
に解析したため、表M及びNのサンプルは同じ研究のサンプルであるが、下記の表Nのサ
ンプルの番号は、上記の表Mのサンプルの番号と必ずしも一致しない。
Figure 2018121646
これらの結果から、25070を用いてmiR−21を阻害すると、イルベサルタンよ
り大きな活性でコラーゲン発現が阻害されることが立証され、更に25070が線維症を
処置、予防及び/または軽減する候補薬であることも確認される。
実施例4:虚血/再灌流傷害モデルにおけるmiR−21の阻害
マウスを用いて、尿細管の損傷、炎症及び線維症を引き起こす一側または両側腎動脈ク
ランプにより、虚血再灌流障害(IRI)のモデルを作製する。このモデルでは遅かれ(
>7日)早かれ(<5日)腎機能障害が起こり得、初期の時点は急性腎傷害の処置の候補
薬の試験に有用であり、後期の時点は慢性線維症モデルの作製に有用である。
一側IRIモデルで抗miR−21化合物を試験した。一側IRIは、30分の期間誘
発した。処置群は以下の通りであった:シャムIRI処置;PBSを皮下投与したIRI
;抗miR−21化合物25070を20mg/kgの用量で腹腔内投与;2’−フルオ
ロ/2’−MOE修飾抗miR−21 25919を20mg/kgの用量で腹腔内投与
;及び2’−フルオロ/2’修飾ミスマッチ抗miR−21(miR−21の配列に3つ
のミスマッチ)25319を20mg/kgの用量で腹腔内投与したIRI。PBSまた
は抗miR化合物は、IRIから5日後、6日後及び7日後に投与し、動物はIRIから
14日後に屠殺した。線維症が既にある程度発症していた、腎臓の傷害から5日以降に抗
miR化合物を投与するため、この処置レジメンは予防レジメンではなく治療レジメンと
考えられる。
腎組織を採取し、コラーゲン1A1及びコラーゲン3A1の発現(表Oに示す)とコラ
ーゲン領域画分(表Pに示す)との解析を行った。「コラーゲン領域画分」は盲検的に解
析したため、表O及びPのサンプルは同じ研究のサンプルであるが、表Oのサンプルの番
号は表Pのサンプルの番号と一致しない。サンプル処理の誤りにより、抗miR−21ミ
スマッチ対照の処置におけるコラーゲン領域画分を解析できなかったため、この処置群の
結果はコラーゲン1A1及びコラーゲン3A1の発現のみを示す。この研究では、250
70がコリーン領域画分を統計学的に有意に減少させた。
Figure 2018121646
Figure 2018121646
同じ処置群を用い、処置の日数を増やして同様の研究を行った。この研究では、IRI
処置から5日後、6日後、7日後、14日後及び21日後に処置剤を腹腔内投与した。動
物は27日目に屠殺し、腎組織を採取してコラーゲン1A1及びコラーゲン3A1の発現
のほか、コラーゲン領域画分の解析を行った。「コラーゲン領域画分」は盲検的に解析し
たため、表Q及びRのサンプルは同じ研究のサンプルであるが、以下の表Qのサンプルの
番号は表Rのサンプルの番号と一致しない。この研究では、25070がコラーゲン領域
画分を統計学的に有意に減少させた。
Figure 2018121646
Figure 2018121646
これらの研究から、急性腎傷害のモデルにおいてmiR−21の阻害後にコラーゲン量
が減少することが立証される。このため、抗miR−21化合物25070は急性腎傷害
処置の治療薬である。例えば、急性腎傷害後の線維症の発症を予防または遅延させると、
慢性腎疾患の発症を予防または遅延させることができる。
抗miR−21化合物25070の投与の柔軟性を評価するため、抗miR−21をI
RI処置から3日後、5日後及び7日後に投与した上記の14日間の研究における化合物
の活性を、抗miR−21をIRI処置から3日後、5日後及び7日後に腹腔内投与した
別の14日間の研究と比較する。表Sのデータから、どちらも研究でも同様のコラーゲン
発現の阻害が観察されたことが立証され、投与スケジュールに柔軟性があってもよいこと
が示唆される。シャム動物と比較したコラーゲン1A1またはコラーゲン3A1の発現の
倍率変化を表Sに示し、どちらの投与スケジュールでもコラーゲン発現が統計学的に有意
に減少することを示す。
Figure 2018121646
実施例5:虚血再灌流障害/腎摘出モデルにおけるmiR−21の阻害
尿細管の損傷、炎症及び線維症を引き起こす、一方の腎臓の動脈の一側クランプを一時
的に行うことにより、マウスを用いて虚血再灌流障害/腎摘出(IR/Nx)モデルを作
製し、続いて、その後の時点にもう一方の腎臓を摘出する。このモデルでは、急性腎機能
障害期(即ち最初の約5日間)が急性腎傷害処置の候補薬の試験に有用であり、腎機能障
害の後期(即ち最初の約5日間より後)は慢性線維症モデルの作製に有用である。
IR/Nxモデルで抗miR−21化合物を試験した。miR−21に対して6塩基ミ
スマッチがある25109を対照化合物として使用した(AATCTGTC
CAUAATAAA;式中、後に下付き文字がないヌクレオシドはβ−デオキシヌ
クレオシドを示し;後に下付き文字「E」があるヌクレオシドは2’−MOEヌクレオシ
ドを示し;後に下付き文字「S」があるヌクレオシドはS−cEtヌクレオシドを示し;
ヌクレオシド間結合は全てホスホロチオエートヌクレオシド間結合である)。
一側IRは30分の期間誘発した。処置群は以下の通りであった:シャムIR処置;P
BSを皮下投与したIR;ミスマッチ対照25109を20mg/kgの用量で皮下投与
したIR;抗miR−21化合物25070を20mg/kgの用量で皮下投与したIR
;及び抗miR−21化合物25923を20mg/kgの用量で皮下投与したIR。P
BSまたは抗miRは、IRから2日後、3日後、4日後及び8日後に投与した。8日目
に、各動物から腎摘出により健康な腎臓を摘出し、動物は9日目に屠殺した。屠殺の直前
に、直接膀胱穿刺により尿を採取した。
各マウスの尿における尿中アルブミン/クレアチニン比を測定した。その実験の結果を
図1に示す。この研究では、25070及び25923がどちらも尿中アルブミン/クレ
アチニン比を統計学的に有意に低下させた。各マウス群のアルブミン/クレアチニン比の
幾何平均は、16μgAlb/mgCr(腎摘出のみの対照)、127μgAlb/mg
Cr(IR/Nx、PBSの対照)、140μgAlb/mgCr(IR/Nx、251
09の対照)、40μgAlb/mgCr(IR/Nx、25070)、及び31μgA
lb/mgCr(IR/Nx、25923)であった。全IR/Nxマウスにおいて血中
尿素窒素及び血清クレアチニンのレベルは類似しており、腎摘出のみの対照マウスに比較
して高かった(データ示さず)。
実施例6:抗miR−21化合物の投与後のIR/Nxモデルマウスの生存率
6つの異なる実験において腎摘出から2日後のIR/Nxモデルマウスの生存率を検討
し、抗miR−21化合物の投与により生存率が上昇するかどうかを判定した。最初の3
実験では、抗miR−21化合物を虚血再灌流障害から5日後、6日後及び7日後に投与
し、10日目または11日目に腎摘出を行った。第2の3実験では、抗miR−21化合
物を2日目、3日目及び4日目に投与し、7日目に腎摘出を行った。各実験におけるIR
/Nxマウスの生存率を表Tに示す。
Figure 2018121646
腎摘出を10日目または11日目に行った最初の3実験では、PBS処置マウスの生存
率は55%であったのに対し、25070処置マウスの生存率は80%であった(フィッ
シャーの正確確率検定(片側)によりP=0.02)。腎摘出を7日目に行った第2の3
実験では、PBS処置マウスの生存率は52%であったのに対し、25070処置マウス
の生存率は69%であった(フィッシャーの正確確率検定(片側)によりP=0.11)
実施例7:追加の抗miR−21化合物の設計
化合物25070のマウスへの投与後、腎組織に存在するその化合物の約50%が注射
から7日後までに3’−末端ヌクレオシドを欠損していることが認められた。エキソビボ
肝臓ホモジネートアッセイにおいて25070及び25923の安定性を評価した。この
アッセイでは、肝臓ホモジネート(1ml当たり組織50mg)中、5μMのオリゴヌク
レオチドを37℃で24時間インキュベートした。このインキュベーション後、オリゴヌ
クレオチドを液−液抽出(LLE)により抽出し、続いて固相抽出(SPE)を行った。
オリゴヌクレオチドの長さ及び量を高速液体クロマトグラフィー飛行時間型質量分析法(
HPLC−TOF MS)により測定した。肝組織ホモジネート中のヌクレアーゼ活性は
、ヌクレアーゼ活性に対して耐性がある化合物、3’−エキソヌクレアーゼ活性に対して
感受性を示す化合物、及びエンドヌクレアーゼ活性に対して感受性を示す化合物を含む標
準オリゴヌクレオチドを使用して確認した。内部標準化合物を抽出効率の対照として使用
した。このアッセイでは、化合物25070の約58%が全長化合物として存在し、化合
物25070の約27%が3’−末端ヌクレオシドを欠損する。化合物25923の約6
8%が全長化合物として存在し、化合物の約18%が3’−末端ヌクレオシドを欠損する
別の化合物を設計し、こうした化合物についてエキソビボ及びインビボでの安定性を試
験した。エキソビボでの試験は、上述のように行った。インビボ試験では、化合物をマウ
スに投与し、腎組織を単離し、エキソビボアッセイと同様に化合物の抽出及び検出を行っ
た。表Uは、化合物25923、25220及び25221の構造と、安定性測定の結果
とを示す。
Figure 2018121646
UUOモデルを用いて化合物25220及び25221並びに25923について、線
維症に対するその作用を試験した。動物8匹の群を各々、以下の通り試験した:シャム手
術、PBSを用いたUUO、25220を用いたUUO、25221を用いたUUO、ま
たは25923を用いたUUO。UUO処置日の5日前、3日前、及び処置日から3日後
に、PBSまたは抗miR−21化合物を投与した。抗miR−21化合物は、20mg
/kgの用量で投与した。抗miR化合物をUUO処置の前に投与したため、この投与レ
ジメンは予防処置と考えられる。10日目に動物を屠殺し、コラーゲン発現を測定するた
め腎臓を単離した。コラーゲン発現はリアルタイムPCRにより測定し、GAPDHに対
して補正した。
この実験の結果を図2に示す。コラーゲン1A1及びコラーゲン3A1の発現をそれぞ
れ図2A及び2Bに示す。化合物25220または25221の投与により、コラーゲン
1A1及びコラーゲン3A1の発現が統計学的に有意な量で減少し(*=p<0.05;
**=p<0.01;***=p<0.001)、化合物25923の投与も同様であっ
た。
明細書本文から、本明細書に記載の改変に加えて本発明の様々な改変が当業者に明らか
になるであろう。こうした改変も、添付の特許請求の範囲の範囲に包含されることを意図
している。本出願に引用した各参考文献(以下に限定されるものではないが、学術論文、
米国及び非米国特許、特許出願公開、国際特許出願公開、GENBANK(登録商標)受
託番号並びに同種のもの)は特に、その全体を本明細書に援用する。

Claims (51)

  1. 8〜22個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であっ
    て、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列はmiR−21(配列番号1)と相補的
    であり、かつ前記修飾オリゴヌクレオチドは5’から3’方向に以下のヌクレオシドパタ
    ーンIで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
    (R)−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N

    式中、Rは各々独立に非二環式ヌクレオシドであり;Xは1〜4であり;
    は各々独立に二環式ヌクレオシドであり;
    は各々独立に非二環式ヌクレオシドであり;かつ
    は各々独立に修飾ヌクレオシドである
    ヌクレオシドを含む、化合物。
  2. 8〜19個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であっ
    て、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列はmiR−21(配列番号1)と相補的
    であり、かつ前記修飾オリゴヌクレオチドは5’から3’方向に以下のヌクレオシドパタ
    ーンIIで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
    −N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
    式中、Nは独立に、二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;
    は各々独立に二環式ヌクレオシドであり;
    は各々独立に非二環式ヌクレオシドであり;かつ
    は独立に修飾ヌクレオシドである
    ヌクレオシドを含む、化合物。
  3. 8〜19個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であっ
    て、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列はmiR−21(配列番号1)と相補的
    であり、かつ前記修飾オリゴヌクレオチドは5’から3’方向に以下のヌクレオシドパタ
    ーンIIIで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
    (R)−N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
    式中、Rは各々、非二環式ヌクレオシドであり;Xは1〜4であり;
    は各々、二環式ヌクレオシドであり;
    は各々、非二環式ヌクレオシドであり;
    は修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドであり;かつ
    は各々、修飾ヌクレオシドである
    ヌクレオシドを含む、化合物。
  4. 8〜19個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であっ
    て、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列はmiR−21(配列番号1)と相補的
    であり、かつ前記修飾オリゴヌクレオチドは5’から3’方向に以下のヌクレオシドパタ
    ーンIVで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
    −N−N−N−N−(N−N−N−N−N−N
    式中、Nは二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;
    は各々、二環式ヌクレオシドであり;
    は各々、非二環式ヌクレオシドであり;
    は修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドであり;かつ
    は修飾ヌクレオシドである
    ヌクレオシドを含む、化合物。
  5. 8〜19個連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含む化合物であっ
    て、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列はmiR−21(配列番号1)と相補的
    であり、かつ前記修飾オリゴヌクレオチドは5’から3’方向に以下のヌクレオシドパタ
    ーンVで少なくとも8個連続するヌクレオシドであり:
    −N−(N−N−N−N−N
    式中、Nは二環式ヌクレオシドではない修飾ヌクレオシドであり;
    は各々、二環式ヌクレオシドであり;
    は各々、非二環式ヌクレオシドであり;かつ
    は修飾ヌクレオシドである
    ヌクレオシドを含む、化合物。
  6. 前記修飾オリゴヌクレオチドはヌクレオシドパターンI、II、III、IVまたはV
    の少なくとも9個、少なくとも10個、少なくとも11個、少なくとも12個、少なくと
    も13個、少なくとも14個、少なくとも15個、少なくとも16個、少なくとも17個
    、少なくとも18個、少なくとも19個、少なくとも20個、少なくとも21個または2
    2個の連続するヌクレオシドを含む、請求項1〜5の何れか1項に記載の化合物。
  7. 前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列は、miR−21(配列番号1)の核
    酸塩基配列と少なくとも90%相補的、少なくとも95%相補的、または100%相補的
    である、請求項1〜6の何れか1項に記載の化合物。
  8. 二環式ヌクレオシドは各々LNAヌクレオシド、cEtヌクレオシド及びENAヌクレ
    オシドから独立に選択される、請求項1〜7の何れか1項に記載の化合物。
  9. 二環式ヌクレオシドは各々S−cEtヌクレオシドである、請求項1〜7の何れか1項
    に記載の化合物。
  10. 二環式ヌクレオシドは各々LNAヌクレオシドである、請求項1〜7の何れか1項に記
    載の化合物。
  11. 非二環式ヌクレオシドは各々β−D−デオキシリボヌクレオシド及び2’−O−メトキ
    シエチルヌクレオシドから独立に選択される、請求項1〜10の何れか1項に記載の化合
    物。
  12. 非二環式ヌクレオシドは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドである、請求項1〜1
    0の何れか1項に記載の化合物。
  13. 非二環式ヌクレオシドは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである、請求項1
    〜10の何れか1項に記載の化合物。
  14. 前記修飾オリゴヌクレオチドはヌクレオシドパターンI、II、III、IVまたはV
    の8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、15個、16個、17個、1
    8個、19個、20個、21個または22個連結したヌクレオシドからなる、請求項1〜
    13の何れか1項に記載の化合物。
  15. 少なくとも1つのヌクレオシド間結合は修飾ヌクレオシド間結合であるか、または、ヌ
    クレオシド間結合は各々、修飾ヌクレオシド間結合であり、前記修飾ヌクレオシド間結合
    は任意選択的にホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項1〜14の何れか
    1項に記載の化合物。
  16. 少なくとも1つのシトシンは5−メチルシトシンであるか、または、シトシンは各々5
    −メチルシトシンである、請求項1〜15の何れか1項に記載の化合物。
  17. a.Rは4個連結したヌクレオシドNR1−NR2−NR3−NR4からなり、式中、
    R1は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり、かつNR2−NR3−NR4
    各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;
    b.Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;
    c.Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;
    d.Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    はS−cEtヌクレオシドである;
    e.Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;
    は各々LNAヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;或いは
    f.Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;
    は各々LNAヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    はLNAヌクレオシドである
    請求項1に記載の化合物。
  18. a.Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;
    b.Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;
    c.Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    Nは各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    はS−cEtヌクレオシドである;
    d.Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々LNAヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;或いは
    e.Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々LNAヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    はLNAヌクレオシドである
    請求項2に記載の化合物。
  19. a.Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    はβ−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;
    b.Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    はβ−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    はS−cEtヌクレオシドである;或いは
    c.Rは各々2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;Xは1であり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    はS−cEtヌクレオシドであり;かつ
    はS−cEtヌクレオシドである
    請求項3に記載の化合物。
  20. a.Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    はβ−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである;かつ
    b.Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    はβ−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    はS−cEtヌクレオシドである;
    c.Nは2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;
    はS−cEtヌクレオシドであり;かつ
    はS−cEtヌクレオシドである
    請求項4に記載の化合物。
  21. は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドであり;
    は各々S−cEtヌクレオシドであり;
    は各々β−D−デオキシリボヌクレオシドであり;かつ
    は2’−O−メトキシエチルヌクレオシドである
    請求項5に記載の化合物。
  22. 前記修飾オリゴヌクレオチドは配列番号3の核酸塩基配列を有するか、または前記修飾
    オリゴヌクレオチドは配列番号4の核酸塩基配列を有し、前記配列中のTは各々T及びU
    から独立に選択される、請求項1〜21の何れか1項に記載の化合物。
  23. miR−21の活性を阻害する方法であって、請求項1〜22の何れか1項に記載の化
    合物と細胞を接触させることを含む方法。
  24. 前記細胞はインビボにあるか、或いは、前記細胞はインビトロにある、請求項23に記
    載の方法。
  25. 前記細胞は線維芽細胞、過剰増殖細胞、ケラチノサイトまたは低酸素細胞である、請求
    項23または24に記載の方法。
  26. 細胞におけるコラーゲンの発現を低下させる方法であって、請求項1〜22の何れか1
    項に記載の化合物と細胞を接触させることを含む方法。
  27. miR−21に関連する疾患の発症を処置、予防または遅延させる方法であって、mi
    R−21に関連する疾患を有する被検体に請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物を
    投与することを含む方法。
  28. 前記疾患は線維症である、請求項27に記載の方法。
  29. 前記線維症は腎線維症、肺線維症、肝線維症、心線維症、皮膚線維症、加齢に伴う線維
    症、脾線維症、強皮症及び移植後の線維症から選択される、請求項28に記載の方法。
  30. a.前記腎線維症は糸球体硬化症、尿細管間質線維症、IgA腎症、間質線維症/尿細
    管萎縮;慢性腎障害、糸球体疾患、糸球体腎炎、糖尿病、特発性巣状分節性糸球体硬化症
    、膜性腎症、虚脱性糸球体症、慢性再発性腎感染症及び末期腎臓病から選択される疾患を
    有する被検体に現れ;
    b.前記腎線維症は腎臓の急性または反復性外傷に起因し;
    c.前記肝線維症は慢性肝傷害、肝炎感染症、非アルコール性脂肪性肝炎及び硬変から
    選択される疾患を有する被検体に現れ;前記肺線維症は特発性肺線維症であり;及び/ま
    たは
    d.前記被検体は慢性閉塞性肺疾患を有する
    請求項29に記載の方法。
  31. 被検体の線維増殖性障害を処置する方法であって、請求項1〜22の何れか1項に記載
    の化合物を前記被検体に投与することを含む方法。
  32. 1つまたは複数の組織においてmiR−21の発現が増加した被検体を選択することを
    含む、請求項23〜31の何れか1項に記載の方法。
  33. 前記被検体は臓器機能の改善を必要としており、前記臓器機能は心機能、肺機能、肝機
    能及び腎機能から選択される、請求項27〜31の何れか1項に記載の方法。
  34. 前記投与は前記被検体の臓器機能を改善し、前記臓器機能は心機能、肺機能、肝機能及
    び腎機能から選択される、請求項27〜33の何れか1項に記載の方法。
  35. 抗炎症薬、免疫抑制薬、抗糖尿病薬、ジゴキシン、血管拡張薬、アンジオテンシンII
    変換酵素(ACE)阻害剤、アンジオテンシンII受容体遮断薬(ARB)、カルシウム
    チャネル遮断薬、二硝酸イソソルビド、ヒドララジン、ニトレート、ヒドララジン、β遮
    断薬、ナトリウム利尿ペプチド、ヘパリノイド及び結合組織増殖因子阻害剤から選択され
    る少なくとも1つの治療薬を投与することを含む、請求項27〜34の何れか1項に記載
    の方法。
  36. 前記疾患は癌である、請求項27に記載の方法。
  37. 前記癌は肝癌、乳癌、膀胱癌、前立腺癌、結腸癌、肺癌、脳癌、血液癌、膵癌、頭頸部
    癌、舌癌、胃癌、皮膚癌または甲状腺癌である、請求項36に記載の方法。
  38. 少なくとも1つの追加の抗癌治療剤を前記被検体に投与することを更に含む、請求項3
    6または37に記載の方法。
  39. 前記被検体はヒトである、請求項23〜38の何れか1項に記載の方法。
  40. 前記化合物は医薬組成物として存在する、請求項23〜39の何れか1項に記載の方法
  41. 治療に使用される、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物。
  42. 線維症の処置に使用される、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物。
  43. 創傷治癒の促進に使用される、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物。
  44. 癌の処置に使用される、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物。
  45. 転移の発症の予防及び/または遅延に使用される、請求項1〜22の何れか1項に記載
    の化合物。
  46. 心臓病の処置に使用される、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物。
  47. 薬物を調製するための、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物の使用。
  48. 線維症を処置する薬物を調製するための、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物
    の使用。
  49. 創傷治癒を促進する薬物を調製するための、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合
    物の使用。
  50. 癌を処置する薬物を調製するための、請求項1〜22の何れか1項に記載の化合物の使
    用。
  51. 転移の発症を予防及び/または遅延させる薬物を調製するための、請求項1〜22の何
    れか1項に記載の化合物の使用。
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