JP2017533721A - タンパク質の調節のための化合物及び方法 - Google Patents

タンパク質の調節のための化合物及び方法 Download PDF

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    • C12Y301/26004—Ribonuclease H (3.1.26.4)

Abstract

ある特定の実施形態において、本開示は、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる化合物及び方法を提供する。ある特定の実施形態において、本化合物は、翻訳抑制要素阻害剤を含む。ある特定の実施形態において、この翻訳抑制要素阻害剤は、ｕＯＲＦ阻害剤である。ある特定の実施形態において、このｕＯＲＦ阻害剤は、アンチセンス化合物である。【選択図】なし

Description

配列表
本出願は、電子形式の配列表とともに出願されている。この配列表は、２０１５年１１月１１日に作成された７２ＫｂのサイズのＣＯＲＥ０１３２ＷＯＳＥＱ＿ＳＴ２５．ｔｘｔという名前のファイルとして提供される。配列表の電子形式の情報は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
ｍＲＮＡによってコードされるポリペプチドまたはタンパク質の翻訳は、典型的には、ｍＲＮＡの一次オープンリーディングフレーム（ｐＯＲＦ）の開始コドンにて始まる。いくつかのｍＲＮＡ転写物も、１つ以上の追加の開始コドンを含む。そのような追加の開始コドンは、ｐＯＲＦ開始コドンの上流にあっても良い。ｐＯＲＦの上流にあるそのような追加の開始コドンは、上流オープンリーディングフレーム（ｕＯＲＦ）開始部位と称される。ｐＯＲＦタンパク質産物の翻訳の調節における追加の開始部位の可能性のある役割は、既に考察されている（全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ｂａｒｂｏｓａ ｅｔ ａｌ．ＰＬＯＳ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ．９，ｅ１００３５２９（２０１３）を参照されたい）。転写物において追加の開始コドン（ｕＯＲＦ開始コドン）を導入または排除する突然変異は、その翻訳の調節を妨害し、疾患をもたらし得る（全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ｃａｌｖｏ ｅｔ ａｌ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．１０６，７５０７（２００９）を参照されたい）。
アンチセンス技術は、１つ以上の特異的な遺伝子産物の発現を調節するのに効果的な手段であり、それ故に、多くの治療的用途、診断的用途、及び研究用途に一意的に有用であることが判明し得る。化学修飾ヌクレオシドは、アンチセンス化合物に組み込まれ、標的核酸のヌクレアーゼ耐性、薬物動態、または親和性等の１つ以上の特性を強化し得る。１９９８年、アンチセンス化合物であるＶｉｔｒａｖｅｎｅ（登録商標）（ホミビルセン、Ｉｓｉｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ Ｉｎｃ．，Ｃａｒｌｓｂａｄ，ＣＡによって開発されたもの）が、アメリカ食品医薬品局（ＦＤＡ）の販売許可を得た最初のアンチセンス薬物であり、現在、ＡＩＤＳ患者におけるサイトメガロウイルス（ＣＭＶ）誘導性網膜炎の治療薬である。別の例では、ＡｐｏＢを標的とするアンチセンス化合物であるＫＹＮＡＭＲＯ（商標）が、ホモ接合性家族性高コレステロール血症（ＨｏＦＨ）を有する患者における低密度リポタンパク質コレステロール（ＬＤＬ−Ｃ）、ＡｐｏＢ、総コレステロール（ＴＣ）、及び非高密度リポタンパク質コレステロール（非ＨＤＬ−Ｃ）を低下させるための脂質低下薬及び食事療法の補助治療薬としてアメリカ食品医薬品局（ＦＤＡ）の承認を受けている。
本開示は、標的転写物の５’−ＵＴＲと相互作用して、標的タンパク質の翻訳を増加させる化合物を提供する。５’−ＵＴＲと相互作用するある特定の化合物が、所与の標的転写物の翻訳を増加させ得ることがわかった。例えば、ある特定の実施形態において、本開示は、５’−ＵＴＲの１つ以上の領域を標的とするアンチセンス化合物を提供する。５’−ＵＴＲのこれらの領域は、ステムループ構造またはｕＯＲＦ等の翻訳抑制要素を含んでも良い。アンチセンス化合物が５’−ＵＴＲにおいて翻訳抑制要素と相互作用するとき、アンチセンス化合物は標的転写物の翻訳を増加させる。本発明の一態様は、細胞を、５’−ＵＴＲにおいて翻訳抑制要素を標的とする薬剤と接触させることによる、発現の増加である。ある特定の実施形態において、５’−ＵＴＲを標的とするアンチセンス化合物は、５’−ＵＴＲ内で翻訳抑制要素を妨害することによって所与の標的タンパク質の発現を増加させる。
アンチセンスオリゴヌクレオチド技術は、ほとんどの場合、アンチセンス誘導性ＲＮａｓｅ Ｈ切断によってｍＲＮＡの量を低減するため、または細胞におけるプレｍＲＮＡ転写のスプライシングを変化させるために使用されてきた。ある特定の実施形態において、本開示は、細胞における標的タンパク質の発現を増加させるアンチセンス化合物を提供する。このように、アンチセンスオリゴヌクレオチドを使用して細胞における所望のタンパク質の発現を増加させ得る。ある特定の実施形態において、細胞における標的タンパク質の発現の増加は、アンチセンス化合物によって１つ以上の上流オープンリーディングフレームのリボソーム認識を減少させることで実現される。ある特定の実施形態において、上流オープンリーディングフレームの認識は、細胞における標的タンパク質の発現を低減する。したがって、ある特定の実施形態において、上流オープンリーディングフレーム、または上流オープンリーディングフレームの上流若しくは下流にある核酸塩基配列を標的とすることにより、上流オープンリーディングフレームのリボソーム認識が低減し、それにより１つ以上の標的タンパク質の発現が増加する。したがって、ある特定の実施形態において、上流オープンリーディングフレーム、または上流オープンリーディングフレームの上流若しくは下流にある核酸塩基配列を標的とすることにより、上流オープンリーディングフレームのリボソーム認識が低減し、それにより一次オープンリーディングフレームにおける開始コドンのリボソーム認識が増加する。
ある特定の実施形態において、本発明は、アンチセンス化合物を使用して標的タンパク質の発現を増加させる。ある特定の例において、目的とするタンパク質をコードする転写物は、ｐＯＲＦ、及びｕＯＲＦ開始部位等の１つ以上の追加の開始部位を含む。ある特定の実施形態において、本開示は、そのようなｕＯＲＦ開始部位にてまたはその付近で標的転写物に相補的である修飾オリゴヌクレオチドを提供する。標的タンパク質の量を低減するように設計したアンチセンス化合物は、典型的には、標的転写物の切断を誘導する（例えば、ＲＮａｓｅ Ｈのリクルートによって）。対照的に、本発明のある特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、切断を誘発するように設計されない。むしろ、ある特定のそのような実施形態において、本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、ｐＯＲＦ開始部位での増加した翻訳に有利になるようにｕＯＲＦ開始部位をマスクする。ある特定の実施形態において、本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、ｕＯＲＦ開始部位での翻訳の開始を妨害し、それにより、ある特定の実施形態において、標的タンパク質の翻訳が増加する。ある特定の実施形態において、本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、５’−ＵＴＲの調節機能を妨害する。ある特定のそのような実施形態において、所望のタンパク質の翻訳が増加する。ある特定の実施形態において、本発明の修飾オリゴヌクレオチドは、タンパク質を、ｕＯＲＦ開始部位での翻訳の開始に干渉する転写へとリクルートする。ある特定の実施形態において、本発明のアンチセンス化合物は、ｕＯＲＦポリペプチドの翻訳の減少をもたらす。
本開示は、細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法を提供し、本方法は、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質は、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドは、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる。
本開示は、細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法を提供し、本方法は、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質は、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドは、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる。
本開示は、細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法を提供し、本方法は、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質は、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドは、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる。
本開示は、細胞における標的タンパク質の量の増加方法を提供し、本方法は、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質は、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドは、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であることにより、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる。
本開示は、以下の非限定的な番号付けされた実施形態を提供する。
実施形態１：細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる、方法。
実施形態２：細胞における標的タンパク質の発現の増加方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、方法。
実施形態３：細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる、方法。
実施形態４：細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、方法。
実施形態５：細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳の減少方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、それにより、細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳を減少させる、方法。
実施形態６：ｕＯＲＦ阻害剤が小分子である、実施形態１〜５のいずれかに記載の方法。
実施形態７：ｕＯＲＦ阻害剤が抗体である、実施形態１〜５のいずれかに記載の方法。
実施形態８：ｕＯＲＦ阻害剤がペプチドである、実施形態１〜５のいずれかに記載の方法。
実施形態９：ｕＯＲＦ阻害剤が核酸である、実施形態１〜５のいずれかに記載の方法。
実施形態１０：ｕＯＲＦ阻害剤がｓｉＲＮＡである、実施形態１〜５のいずれかに記載の方法。
実施形態１１：ｕＯＲＦ阻害剤がアンチセンス化合物である、実施形態１〜５のいずれかに記載の方法。
実施形態１２：アンチセンス化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態１１に記載の方法。
実施形態１３：細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的であり、それにより、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる、方法。
実施形態１４：細胞における標的タンパク質の発現の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的であり、それにより、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、方法。
実施形態１５：細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的であり、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる、方法。
実施形態１６：細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的であり、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、方法。
実施形態１７：細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳の減少方法であって、細胞を、標的転写物のｕＯＲＦ領域内の標的部位に相補的である修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、それにより、細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳を減少させる、方法。
実施形態１８：ｕＯＲＦ開始部位領域が５’非翻訳領域である、実施形態１〜１７のいずれかに記載の方法。
実施形態１９：標的部位がｕＯＲＦ開始部位を含む、実施形態１３〜１８のいずれかに記載の方法。
実施形態２０：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある１００個のヌクレオシド及び下流にある１００個のヌクレオシドとからなる、実施形態１３〜１９のいずれかに記載の方法。
実施形態２１：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある７５個のヌクレオシド及び下流にある７５個のヌクレオシドとからなる、実施形態１３〜１９のいずれかに記載の方法。
実施形態２２：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある５０個のヌクレオシド及び下流にある５０個のヌクレオシドとからなる、実施形態１３〜１９のいずれかに記載の方法。
実施形態２３：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある３０個のヌクレオシド及び下流にある３０個のヌクレオシドとからなる、実施形態１３〜１９のいずれかに記載の方法。
実施形態２４：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある２０個のヌクレオシド及び下流にある２０個のヌクレオシドとからなる、実施形態１３〜１９のいずれかに記載の方法。
実施形態２５：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある１５個のヌクレオシド及び下流にある１５個のヌクレオシドとからなる、実施形態１３〜１９のいずれかに記載の方法。
実施形態２６：ｕＯＲＦ開始部位が野生型ｕＯＲＦ開始部位である、実施形態１３〜２５のいずれかに記載の方法。
実施形態２７：ｕＯＲＦ開始部位が変異ｕＯＲＦ開始部位である、実施形態１３〜２５のいずれかに記載の方法。
実施形態２８：標的転写物が、２つ以上のｕＯＲＦ領域を含む、実施形態１３〜２７のいずれかに記載の方法。
実施形態２９：標的転写物が、２つのｕＯＲＦ領域を含む、実施形態１３〜２７のいずれかに記載の方法。
実施形態３０：ｕＯＲＦ開始部位が、弱いコザック配列を含む、実施形態１３〜２９のいずれかに記載の方法。
実施形態３１：ｕＯＲＦ開始部位が、強いコザック配列を含む、実施形態１３〜２９のいずれかに記載の方法。
実施形態３２：ｕＯＲＦ開始部位が、非標準開始コドンを有する、実施形態１３〜３１のいずれかに記載の方法。
実施形態３３：非標準開始コドンがＡＵＵである、実施形態３２に記載の方法。
実施形態３４：標的転写物がＲＮａｓｅ Ｈ１をコードする、実施形態１３〜３３のいずれかに記載の方法。
実施形態３５：標的転写物が、表１または表２の遺伝子から選択される遺伝子によってコードされる、実施形態１３〜３４のいずれかに記載の方法。
実施形態３６：修飾オリゴヌクレオチドが、核酸塩基ＣＡＴを含む核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態３７：修飾オリゴヌクレオチドが、５’末端核酸塩基の最初の３個がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態３８：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から２番目、３番目、及び４番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態３９：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から３番目、４番目、及び５番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４０：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から４番目、５番目、及び６番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４１：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から５番目、６番目、及び７番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４２：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から６番目、７番目、及び８番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４３：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から７番目、８番目、及び９番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４４：修飾オリゴヌクレオチドが、３’末端核酸塩基の最初の３個がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４５：修飾オリゴヌクレオチドが、３’−最末端核酸塩基から２番目、３番目、及び４番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４６：修飾オリゴヌクレオチドが、３’−最末端核酸塩基から３番目、４番目、及び５番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４７：修飾オリゴヌクレオチドが、３’−最末端核酸塩基から４番目、５番目、及び６番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４８：修飾オリゴヌクレオチドが、３’−最末端核酸塩基から５番目、６番目、及び７番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態４９：修飾オリゴヌクレオチドが、コザック配列に相補的な核酸塩基配列を含む、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態５０：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１または２のｕＯＲＦ領域に相補的な少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態５１：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態５２：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態５３：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態５４：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態５５：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態１２〜３５のいずれかに記載の方法。
実施形態５６：修飾オリゴヌクレオチドが、１０〜４０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態１２〜５５のいずれかに記載の方法。
実施形態５７：修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態１２〜５５のいずれかに記載の方法。
実施形態５８：修飾オリゴヌクレオチドが、１５〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態１２〜５５のいずれかに記載の方法。
実施形態５９：修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態１２〜５５のいずれかに記載の方法。
実施形態６０：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１２〜５９のいずれかに記載の方法。
実施形態６１：少なくとも１つの修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態６０に記載の方法。
実施形態６２：少なくとも１つの修飾糖部分が、２’−置換糖部分である、実施形態６１に記載の方法。
実施形態６３：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、及び２’−ＭＯＥの中から選択される、実施形態６２に記載の方法。
実施形態６４：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＭＯＥである、実施形態６０〜６３のいずれかに記載の方法。
実施形態６５：少なくとも１つの修飾糖部分が、二環式糖部分である、実施形態６０〜６１のいずれかに記載の方法。
実施形態６６：少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡまたはｃＥｔである、実施形態６５に記載の方法。
実施形態６７：少なくとも１つの糖部分が、糖代理物である、実施形態６１〜６６のいずれかに記載の方法。
実施形態６８：少なくとも１つの糖代理物が、モルホリノである、実施形態６７に記載の方法。
実施形態６９：少なくとも１つの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態６７に記載の方法。
実施形態７０：少なくとも１つの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態６７に記載の方法。
実施形態７１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態６０〜７０のいずれかに記載の方法。
実施形態７２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態６０〜７０のいずれかに記載の方法。
実施形態７３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態６０〜７０のいずれかに記載の方法。
実施形態７４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態６０〜７０のいずれかに記載の方法。
実施形態７５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態６０〜７０のいずれかに記載の方法。
実施形態７６：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態６０〜７０に記載の方法。
実施形態７７：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドである、実施形態６０〜７６のいずれかに記載の方法。
実施形態７８：各非修飾ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドである、実施形態７７に記載の方法。
実施形態７９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態７７〜７８のいずれかに記載の方法。
実施形態８０：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態７７〜７８のいずれかに記載の方法。
実施形態８１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態７７〜７８のいずれかに記載の方法。
実施形態８２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態７７〜７８のいずれかに記載の方法。
実施形態８３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態７７〜７８のいずれかに記載の方法。
実施形態８４：修飾オリゴヌクレオチドが、４個以下の連続した２’−デオキシヌクレオシドを含有する、実施形態７９〜８３のいずれかに記載の方法。
実施形態８５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態７７〜７８のいずれかに記載の方法。
実施形態８６：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドであり、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態８５に記載の方法。
実施形態８７：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに同じである修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態６０〜８６のいずれかに記載の方法。
実施形態８８：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに異なる修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態６０〜８６のいずれかに記載の方法。
実施形態８９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態６０〜８６のいずれかに記載の方法。
実施形態９０：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態８９に記載の方法。
実施形態９１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態８９に記載の方法。
実施形態９２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１８個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態８９に記載の方法。
実施形態９３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも２０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態８９に記載の方法。
実施形態９４：修飾領域の各修飾ヌクレオシドが、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、２’−ＭＯＥ、ｃＥｔ、ＬＮＡ、モルホリノ、修飾モルホリノ、及びペプチド核酸の中から独立して選択される、修飾糖部分を有する、実施形態９０〜９３のいずれかに記載の方法。
実施形態９５：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、互いに同じ修飾を含む、実施形態９０〜９４のいずれかに記載の方法。
実施形態９６：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態９５に記載の方法。
実施形態９７：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態９５に記載の方法。
実施形態９８：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態９６に記載の方法。
実施形態９９：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態９５に記載の方法。
実施形態１００：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態９９に記載の方法。
実施形態１０１：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態９５に記載の方法。
実施形態１０２：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態１０１に記載の方法。
実施形態１０３：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態１０１に記載の方法。
実施形態１０４：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態１０１に記載の方法。
実施形態１０５：修飾ヌクレオチドが、４個以下の連続した天然ヌクレオシドを含む、実施形態６０〜１０４のいずれかに記載の方法。
実施形態１０６：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、実施形態６０〜１０７のいずれかに記載の方法。
実施形態１０７：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態１０６に記載の方法。
実施形態１０８：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、互いに同じ修飾を含む、実施形態１０７に記載の方法。
実施形態１０９：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態１０８に記載の方法。
実施形態１１０：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態１０９に記載の方法。
実施形態１１１：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態１１０に記載の方法。
実施形態１１２：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＯＭｅである、実施形態１１０に記載の方法。
実施形態１１３：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態１０８に記載の方法。
実施形態１１４：修飾オリゴヌクレオチドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態１１３に記載の方法。
実施形態１１５：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態９８に記載の方法。
実施形態１１６：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態１１５に記載の方法。
実施形態１１７：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態１１５に記載の方法。
実施形態１１８：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態１１５に記載の方法。
実施形態１１９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態６０〜１１８のいずれかに記載の方法。
実施形態１２０：修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１１９に記載の方法。
実施形態１２１：各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態１１９または１２０に記載の方法。
実施形態１２２：各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態１１９に記載の方法。
実施形態１２３：少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態１１９または１２０に記載の方法。
実施形態１２４：各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合であり、各ヌクレオシド間結合が同じ修飾を含む、実施形態１１９に記載の方法。
実施形態１２５：各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１２２に記載の方法。
実施形態１２６：アンチセンス化合物が、少なくとも１つの共役基を含む、実施形態６０〜１２５のいずれかに記載の方法。
実施形態１２７：共役基が、Ｇａｌ−ＮＡｃを含む、実施形態１２６に記載の方法。
実施形態１２８：アンチセンス化合物が、修飾オリゴヌクレオチドからなる、実施形態６０〜１２６のいずれかに記載の方法。
実施形態１２９：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１０％増加する、実施形態１３〜１２８のいずれかに記載の方法。
実施形態１３０：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２０％増加する、実施形態１３〜１２８のいずれかに記載の方法。
実施形態１３１：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも３０％増加する、実施形態１３〜１２８のいずれかに記載の方法。
実施形態１３２：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも５０％増加する、実施形態１３〜１２８のいずれかに記載の方法。
実施形態１３３：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１００％増加する、実施形態１３〜１２８のいずれかに記載の方法。
実施形態１３４：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１２０％増加する、実施形態１３〜１２８のいずれかに記載の方法。
実施形態１３５：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１５０％増加する、実施形態１３〜１２８のいずれかに記載の方法。
実施形態１３６：細胞がインビトロに存在する、実施形態１〜１３５のいずれかに記載の方法。
実施形態１３７：細胞が対象内に存在する、実施形態１〜１３５のいずれかに記載の方法。
実施形態１３８：対象が疾患または病態を有し、該疾患または病態の少なくとも１つの症状が緩和される、実施形態１３７に記載の方法。
実施形態１３９：細胞が動物内に存在する、実施形態１３７または１３８に記載の方法。
実施形態１４０：動物がヒトである、実施形態１３９に記載の方法。
実施形態１４１：標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的な核酸塩基配列を有する１０〜３０個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドが、４個を超えて連続した非修飾２’−デオキシヌクレオシドを有しない、アンチセンス化合物。
実施形態１４２：ｕＯＲＦ開始部位領域が、５’非翻訳領域である、実施形態１４１に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１４３：標的部位が、ｕＯＲＦ開始部位を含む、実施形態１４１〜１４２のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１４４：標的部位が、ｕＯＲＦ開始部位の上流または下流にある５０個のヌクレオシド内にある、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１４５：標的部位が、ｕＯＲＦ開始部位の上流または下流にある４０個のヌクレオシド内にある、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１４６：標的部位が、ｕＯＲＦ開始部位の上流または下流にある３０個のヌクレオシド内にある、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１４７：標的部位が、ｕＯＲＦ開始部位の上流または下流にある２０個のヌクレオシド内にある、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１４８：標的部位が、ｕＯＲＦ開始部位の上流または下流にある１０個のヌクレオシド内にある、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１４９：標的部位が、ｕＯＲＦ開始部位の上流または下流にある５個のヌクレオシド内にある、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５０：標的部位が、野生型ｕＯＲＦ領域を含む、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５１：標的部位が、突然変異から生じるｕＯＲＦ領域を含む、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５２：標的転写物が、１つ超のｕＯＲＦ領域を含む、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５３：標的転写物が、２つのｕＯＲＦ領域を含む、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５４：ｕＯＲＦ開始部位領域が、弱いコザック配列を含む、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５５：ｕＯＲＦ開始部位領域が、強いコザック配列を含む、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５６：ｕＯＲＦ開始部位が、非標準開始コドンを有する、実施形態１４１〜１４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５７：非標準開始コドンが、ＡＵＵである、実施形態１５６に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５８：標的転写物が、ＲＮａｓｅ Ｈ１をコードする、実施形態１４１〜１５７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１５９：標的転写物が、表１及び表２の遺伝子から選択される遺伝子から翻訳されるタンパク質をコードする、実施形態１４１〜１５７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６０：修飾オリゴヌクレオチドが、核酸塩基ＣＡＴを含む核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１５９のいずれかに記載の方法。
実施形態１６１：修飾オリゴヌクレオチドが、５’末端核酸塩基の最初の３個がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１５９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６２：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から２番目、３番目、及び４番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１５９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６３：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から３番目、４番目、及び５番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１５９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６４：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から４番目、５番目、及び６番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１５９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６５：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から５番目、６番目、及び７番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１５９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６６：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から６番目、７番目、及び８番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１５９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６７：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から７番目、８番目、及び９番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１５９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６８：修飾オリゴヌクレオチドが、コザック配列に相補的な核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１６７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１６９：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１または２のｕＯＲＦ領域に相補的な少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１６８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７０：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１６８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７１：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１６８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７２：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１６８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７３：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１６８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７４：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態１４１〜１６８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７５：修飾オリゴヌクレオチドが、１０〜４０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態１４１〜１７４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７６：修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態１４１〜１７４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７７：修飾オリゴヌクレオチドが、１５〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態１４１〜１７４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７８：修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態１４１〜１７４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１７９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１４１〜１７４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８０：少なくとも１つの修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態１７５〜１７９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８１：少なくとも１つの修飾糖部分が、２’−置換糖部分である、実施形態１８０に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８２：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、及び２’−ＭＯＥの中から選択される、実施形態１８１に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８３：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＭＯＥである、実施形態１７９〜１８２のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８４：少なくとも１つの修飾糖部分が、二環式糖部分である、実施形態１７９〜１８０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８５：少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡまたはｃＥｔである、実施形態１８４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８６：少なくとも１つの糖部分が、糖代理物である、実施形態１７９〜１８５のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８７：少なくとも１つの糖代理物が、モルホリノである、実施形態１８６に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８８：少なくとも１つの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態１８６に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１８９：少なくとも１つの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態１８６に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９０：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態１７９〜１８９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態１７９〜１８９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態１７９〜１８９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態１７９〜１８９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態１７９〜１８９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態１７９〜１８９に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９６：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドである、実施形態１７９〜１９５のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９７：非修飾ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドである、実施形態１９６に記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態１９６〜１９７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態１９９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態１９６〜１９７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２００：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態１９６〜１９７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態１９６〜１９７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態１９６〜１９７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０３：修飾オリゴヌクレオチドが、４個以下の連続した２’−デオキシヌクレオシドを含有する、実施形態１９８〜１２０２のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態１９６〜１９７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０５：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドであり、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態２０４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０６：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに同じである修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１４１〜２０５のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０７：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに異なる修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１４１〜２０５のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態１４１〜２０４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２０９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態２０８に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１０：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態２０８に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１８個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態２０８に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも２０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態２０８に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１３：修飾領域の各修飾ヌクレオシドが、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、２’−ＭＯＥ、ｃＥｔ、ＬＮＡ、モルホリノ、修飾モルホリノ、及びペプチド核酸の中から独立して選択される、修飾糖部分を有する、実施形態２０９〜２１２のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１４：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、互いに同じ修飾を含む、実施形態２０９〜２１３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１５：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態２１４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１６：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態２１４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１７：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態２１５に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１８：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態２１４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２１９：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態２１８に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２０：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態２１４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２１：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態２２０に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２２：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態２２０に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２３：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態２２０に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２４：修飾ヌクレオチドが、４個以下の連続した天然ヌクレオシドを含む、実施形態１４１〜２０４または２０６〜２２３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２５：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、実施形態１４１〜１９６のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２６：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態２２５に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２７：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、互いに同じ修飾を含む、実施形態２２６に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２８：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態２２７に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２２９：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態２２８に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３０：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態２２９に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３１：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＯＭｅである、実施形態２２９に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３２：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態２２７に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３３：修飾オリゴヌクレオチドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態２３２に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３４：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態２２７に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３５：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態２３４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３６：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態２３４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３７：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態２３４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態１４１〜２３７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２３９：各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態２３８に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４０：少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態２３８または２３９に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４１：各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエート結合またはホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態２３８または２３９に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４２：各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合であり、各ヌクレオシド間結合が同じ修飾を含む、実施形態２３８に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４３：各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態２４２に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４４：少なくとも１つの共役基を含む、実施形態１４１〜２４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４５：共役基が、Ｇａｌ−ＮＡｃを含む、実施形態２４４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４６：修飾オリゴヌクレオチドからなる、実施形態１４１〜２４３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４７：アンチセンス化合物が、標的タンパク質の翻訳を増加させる、実施形態１４１〜２４６のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４８：アンチセンス化合物が、転写物の抑制を軽減しない、実施形態１４１〜２４７のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２４９：アンチセンス化合物が、標的転写物のスプライシングを調節しない、実施形態１４１〜２４８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
実施形態２５０：実施形態１４１〜２４９のいずれかに記載のアンチセンス化合物と、少なくとも１つの薬学的に許容される担体または希釈剤と、を含む、薬学的組成物。
実施形態２５１：細胞を、実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物と接触させることを含む、細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法。
実施形態２５２：細胞を、実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物と接触させることを含む、細胞における標的タンパク質の発現の増加方法。
実施形態２５３：細胞を、実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物と接触させることを含む、細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法。
実施形態２５４：細胞を、実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物と接触させることを含む、細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法。
実施形態２５５：細胞を、実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物と接触させることを含む、細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳の減少方法。
実施形態２５６：細胞がインビトロに存在する、実施形態２５１〜２５５のいずれかに記載の方法。
実施形態２５７：細胞が動物内に存在する、実施形態２５１〜２５５のいずれかに記載の方法。
実施形態２５８：動物がヒトである、実施形態２５７に記載の方法。
実施形態２５９：実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物のそれを必要とする対象への投与方法。
実施形態２６０：実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物を、それを必要とする対象に投与することを含む、疾患または病態の治療方法。
実施形態２６１：請求項１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物を、それを必要とする対象に投与することが、疾患または病態の１つ以上の症状を緩和する、実施形態２６０に記載の方法。
実施形態２６２：対象がヒトである、実施形態２５９〜２６１のいずれかに記載の方法。
実施形態２６３：疾患または病態の治療のための実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物の使用。
実施形態２６４：疾患または病態の治療用の薬物の調製のための実施形態１４１〜２５０のいずれかに記載のアンチセンス化合物または組成物の使用。
実施形態２６５：細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞を翻訳抑制要素阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる、方法。
実施形態２６６：細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞を翻訳抑制要素阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、方法。
実施形態２６７：細胞における標的タンパク質の量または活性の減少方法であって、細胞を翻訳抑制要素阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる、方法。
実施形態２６８：細胞における標的タンパク質の発現の増加方法であって、細胞を翻訳抑制要素阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、方法。
実施形態２６９：翻訳抑制要素阻害剤が小分子である、実施形態２６５〜２６８のいずれかに記載の方法。
実施形態２７０：翻訳抑制要素阻害剤が抗体である、実施形態２６５〜２６８のいずれかに記載の方法。
実施形態２７１：翻訳抑制要素阻害剤がペプチドである、実施形態２６５〜２６８のいずれかに記載の方法。
実施形態２７２：翻訳抑制要素阻害剤が核酸である、実施形態２６５〜２６８のいずれかに記載の方法。
実施形態２７３：翻訳抑制要素阻害剤がｓｉＲＮＡである、実施形態２６５〜２６８のいずれかに記載の方法。
実施形態２７４：翻訳抑制要素阻害剤がアンチセンス化合物である、実施形態２６５〜２６８のいずれかに記載の方法。
実施形態２７５：アンチセンス化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態２７４に記載の方法。
実施形態２７６：細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって、細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる、方法。
実施形態２７７：細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、方法。
実施形態２７８：細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる、方法。
実施形態２７９：細胞における標的タンパク質の発現の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、方法。
実施形態２８０：翻訳抑制要素領域領域が、５’非翻訳領域である、実施形態２７６〜２７９のいずれかに記載の方法。
実施形態２８１：標的転写物がＲＮａｓｅ Ｈ１をコードする、実施形態２７６〜２８０のいずれかに記載の方法。
実施形態２８２：標的転写物がＲＮａｓｅ Ｈ１をコードしない、実施形態２７６〜２８０のいずれかに記載の方法。
実施形態２８３：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８１のいずれかに記載の方法。
実施形態２８４：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８１のいずれかに記載の方法。
実施形態２８５：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８１のいずれかに記載の方法。
実施形態２８６：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８１のいずれかに記載の方法。
実施形態２８７：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８１のいずれかに記載の方法。
実施形態２８８：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも３５％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２８９：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも４０％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２９０：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも４５％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２９１：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも５０％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２９２：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも５５％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２９３：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも６０％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２９４：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも６５％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２９５：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも７０％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２９６：修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列の少なくとも一部分が、Ｇ−カルテットに相補的である、実施形態２７６〜２８２のいずれかに記載の方法。
実施形態２９７：修飾オリゴヌクレオチドが、Ｇ−カルテットに相補的ではない核酸塩基配列を有する、実施形態２７６〜２９５のいずれかに記載の方法。
実施形態２９８：修飾オリゴヌクレオチドが、１０〜４０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態２７６〜２９７のいずれかに記載の方法。
実施形態２９９：修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態２７６〜２９７のいずれかに記載の方法。
実施形態３００：修飾オリゴヌクレオチドが、１５〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態２７６〜２９７のいずれかに記載の方法。
実施形態３０１：修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態２７６〜２９７のいずれかに記載の方法。
実施形態３０２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシドを含む、実施形態２７６〜２９７のいずれかに記載の方法。
実施形態３０３：少なくとも１つの修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態３０２に記載の方法。
実施形態３０４：少なくとも１つの修飾糖部分が、２’−置換糖部分である、実施形態３０３に記載の方法。
実施形態３０５：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、及び２’−ＭＯＥの中から選択される、実施形態３０４に記載の方法。
実施形態３０６：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＭＯＥである、実施形態３０２〜３０５のいずれかに記載の方法。
実施形態３０７：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’ＯＭｅではない、実施形態３０２〜３０５のいずれかに記載の方法。
実施形態３０８：少なくとも１つの修飾糖部分が、二環式糖部分である、実施形態３０２〜３０３のいずれかに記載の方法。
実施形態３０９：少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡまたはｃＥｔである、実施形態３０８に記載の方法。
実施形態３１０：少なくとも１つの糖部分が、糖代理物である、実施形態３０１〜３０８のいずれかに記載の方法。
実施形態３１１：少なくとも１つの糖代理物が、モルホリノである、実施形態３０３に記載の方法。
実施形態３１２：少なくとも１つの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態３１０に記載の方法。
実施形態３１３：少なくとも１つの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態３１０に記載の方法。
実施形態３１４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態３０２〜３１３のいずれかに記載の方法。
実施形態３１５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態３０２〜３１３のいずれかに記載の方法。
実施形態３１６：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態３０２〜３１３のいずれかに記載の方法。
実施形態３１７：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態３０２〜３１３のいずれかに記載の方法。
実施形態３１８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態３０２〜３１３のいずれかに記載の方法。
実施形態３１９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態３０２〜３１３に記載の方法。
実施形態３２０：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドである、実施形態３０２〜３１９のいずれかに記載の方法。
実施形態３２１：各非修飾ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドである、実施形態３２０に記載の方法。
実施形態３２２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態３２０〜３２１のいずれかに記載の方法。
実施形態３２３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態３２０〜３２１のいずれかに記載の方法。
実施形態３２４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態３２０〜３２１のいずれかに記載の方法。
実施形態３２５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態３２０〜３２１のいずれかに記載の方法。
実施形態３２６：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態３２０〜３２１のいずれかに記載の方法。
実施形態３２７：修飾オリゴヌクレオチドが、４個以下の連続した２’−デオキシヌクレオシドを含有する、実施形態３２２〜３２６のいずれかに記載の方法。
実施形態３２８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態３２２〜３２６のいずれかに記載の方法。
実施形態３２９：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドであり、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態３２０に記載の方法。
実施形態３３０：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに同じである修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態３０３〜３２９のいずれかに記載の方法。
実施形態３３１：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに異なる修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態３０３〜３２９のいずれかに記載の方法。
実施形態３３２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態３０３〜３２９のいずれかに記載の方法。
実施形態３３３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態３３２に記載の方法。
実施形態３３４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態３３２に記載の方法。
実施形態３３５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１８個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態３３２に記載の方法。
実施形態３３６：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも２０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態３３２に記載の方法。
実施形態３３７：修飾領域の各修飾ヌクレオシドが、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、２’−ＭＯＥ、ｃＥｔ、ＬＮＡ、モルホリノ、修飾モルホリノ、及びペプチド核酸の中から独立して選択される、修飾糖部分を有する、実施形態３３２〜３３６のいずれかに記載の方法。
実施形態３３８：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、互いに同じ修飾を含む、実施形態３３２〜３３７のいずれかに記載の方法。
実施形態３３９：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態３３８に記載の方法。
実施形態３４０：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態３３８に記載の方法。
実施形態３４１：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態３３９に記載の方法。
実施形態３４２：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態３３８に記載の方法。
実施形態３４３：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態３４２に記載の方法。
実施形態３４４：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態３３８に記載の方法。
実施形態３４５：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態３４４に記載の方法。
実施形態３４６：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態３４４に記載の方法。
実施形態３４７：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態３４４に記載の方法。
実施形態３４８：修飾ヌクレオチドが、４個以下の連続した天然ヌクレオシドを含む、実施形態３３８〜３４７のいずれかに記載の方法。
実施形態３４９：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、実施形態３３８〜３４７のいずれかに記載の方法。
実施形態３５０：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態３４９に記載の方法。
実施形態３５１：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、互いに同じ修飾を含む、実施形態３５０に記載の方法。
実施形態３５２：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態３５１に記載の方法。
実施形態３５３：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態３５２に記載の方法。
実施形態３５４：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態３５３に記載の方法。
実施形態３５５：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＯＭｅである、実施形態３５３に記載の方法。
実施形態３５６：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態３５１に記載の方法。
実施形態３５７：修飾オリゴヌクレオチドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態３５６に記載の方法。
実施形態３５８：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態３４９〜３５０に記載の方法。
実施形態３５９：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態３５８に記載の方法。
実施形態３６０：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態３５８に記載の方法。
実施形態３６１：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態３５８に記載の方法。
実施形態３６２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態２７６〜３６１のいずれかに記載の方法。
実施形態３６３：修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態３６１に記載の方法。
実施形態３６４：各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態３６２または３６３に記載の方法。
実施形態３６５：各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態３６２に記載の方法。
実施形態３６６：少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態３６２または３６３に記載の方法。
実施形態３６７：各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合であり、各ヌクレオシド間結合が同じ修飾を含む、実施形態３６２に記載の方法。
実施形態３６８：各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態３６３に記載の方法。
実施形態３６９：アンチセンス化合物が、少なくとも１つの共役基を含む、実施形態２７６〜３６８のいずれかに記載の方法。
実施形態３７０：共役基が、Ｇａｌ−ＮＡｃを含む、実施形態３６９に記載の方法。
実施形態３７１：アンチセンス化合物が、修飾オリゴヌクレオチドからなる、実施形態２７６〜３６８のいずれかに記載の方法。
実施形態３７２：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１０％増加する、実施形態２７６〜３７１のいずれかに記載の方法。
実施形態３７３：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２０％増加する、実施形態２７６〜３７１のいずれかに記載の方法。
実施形態３７４：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも３０％増加する、実施形態２７６〜３７１のいずれかに記載の方法。
実施形態３７５：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも５０％増加する、実施形態２７６〜３７１のいずれかに記載の方法。
実施形態３７６：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１００％増加する、実施形態２７６〜３７１のいずれかに記載の方法。
実施形態３７７：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１２０％増加する、実施形態２７６〜３７１のいずれかに記載の方法。
実施形態３７８：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１５０％増加する、実施形態２７６〜３７１のいずれかに記載の方法。
実施形態３７９：細胞がインビトロに存在する、実施形態２６５〜３７８のいずれかに記載の方法。
実施形態３８０：細胞が対象内に存在する、実施形態２６５〜３７８のいずれかに記載の方法。
実施形態３８１：対象が疾患または病態を有し、該疾患または病態の少なくとも１つの症状が緩和される、実施形態３８０に記載の方法。
実施形態３８２：細胞が動物内に存在する、実施形態３８０または３８１に記載の方法。
実施形態３８３：動物がヒトである、実施形態３８２に記載の方法。
実施形態３８４：標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的な核酸塩基配列を有する１０〜３０個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物であって、修飾オリゴヌクレオチドが、４個を超えて連続した非修飾２’−デオキシヌクレオシドを有しない、アンチセンス化合物。
実施形態３８５：翻訳抑制要素領域が、５’非翻訳領域である、実施形態３８４に記載のアンチセンス化合物。
実施形態３８６：細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる、方法。
実施形態３８７：細胞における標的タンパク質の発現の増加方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、方法。
実施形態３８８：細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる、方法。
実施形態３８９：細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、方法。
実施形態３９０：細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳の減少方法であって、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させることを含み、それにより、細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳を減少させる、方法。
実施形態３９１：ｕＯＲＦ阻害剤が小分子である、実施形態３８６〜３９０のいずれかに記載の方法。
実施形態３９２：ｕＯＲＦ阻害剤が抗体である、実施形態３８６〜３９０のいずれかに記載の方法。
実施形態３９３：ｕＯＲＦ阻害剤がペプチドである、実施形態３８６〜３９０のいずれかに記載の方法。
実施形態３９４：ｕＯＲＦ阻害剤が核酸である、実施形態３８６〜３９０のいずれかに記載の方法。
実施形態３９５：ｕＯＲＦ阻害剤がｓｉＲＮＡである、実施形態３８６〜３９０のいずれかに記載の方法。
実施形態３９６：ｕＯＲＦ阻害剤がアンチセンス化合物である、実施形態３８６〜３９０のいずれかに記載の方法。
実施形態３９７：アンチセンス化合物が修飾オリゴヌクレオチドである、実施形態３９６に記載の方法。
実施形態３９８：細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的であり、それにより、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる、方法。
実施形態３９９：細胞における標的タンパク質の発現の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的であり、それにより、細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、方法。
実施形態４００：細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的であり、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる、方法。
実施形態４０１：細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つのｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物のｕＯＲＦ開始部位領域内の標的部位に相補的であり、それにより、細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、方法。
実施形態４０２：細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳の減少方法であって、細胞を、標的転写物のｕＯＲＦ領域内の標的部位に相補的である修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、それにより、細胞におけるｕＯＲＦポリペプチドの翻訳を減少させる、方法。
実施形態４０３：ｕＯＲＦ開始部位領域が５’非翻訳領域である、実施形態３８６〜４０２のいずれかに記載の方法。
実施形態４０４：標的部位がｕＯＲＦ開始部位を含む、実施形態３９８〜４０３のいずれかに記載の方法。
実施形態４０５：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある１００個のヌクレオシド及び下流にある１００個のヌクレオシドとからなる、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４０６：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある７５個のヌクレオシド及び下流にある７５個のヌクレオシドとからなる、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４０７：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある５０個のヌクレオシド及び下流にある５０個のヌクレオシドとからなる、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４０８：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある３０個のヌクレオシド及び下流にある３０個のヌクレオシドとからなる、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４０９：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある２０個のヌクレオシド及び下流にある２０個のヌクレオシドとからなる、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４１０：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある１５個のヌクレオシド及び下流にある１５個のヌクレオシドとからなる、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４１１：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位の下流にある、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４１２：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位の下流にある６〜６５個の核酸塩基である、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４１３：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位の下流にある６〜２３個の核酸塩基である、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４１４：標的部位領域が、ｕＯＲＦ開始部位の下流にある４７〜６４個の核酸塩基である、実施形態３９８〜４０４のいずれかに記載の方法。
実施形態４１５：ｕＯＲＦ開始部位が野生型ｕＯＲＦ開始部位である、実施形態３９８〜４１４のいずれかに記載の方法。
実施形態４１６：ｕＯＲＦ開始部位が変異ｕＯＲＦ開始部位である、実施形態３９８〜４１４のいずれかに記載の方法。
実施形態４１７：標的転写物が、２つ以上のｕＯＲＦ領域を含む、実施形態３９８〜４１６のいずれかに記載の方法。
実施形態４１８：標的転写物が、２つのｕＯＲＦ領域を含む、実施形態３９８〜４１７のいずれかに記載の方法。
実施形態４１９：ｕＯＲＦ開始部位が、弱いコザック配列を含む、実施形態３９８〜４１８のいずれかに記載の方法。
実施形態４２０：ｕＯＲＦ開始部位が、強いコザック配列を含む、実施形態３９８〜４１８のいずれかに記載の方法。
実施形態４２１：ｕＯＲＦ開始部位が、非標準開始コドンを有する、実施形態３９８〜４２０のいずれかに記載の方法。
実施形態４２２：非標準開始コドンがＡＵＵである、実施形態４２１に記載の方法。
実施形態４２３：標的転写物がＲＮａｓｅ Ｈ１をコードする、実施形態３９８〜４２２のいずれかに記載の方法。
実施形態４２４：標的転写物がＬＲＰＰＲＣをコードする、実施形態３９８〜４２２のいずれかに記載の方法。
実施形態４２５：標的転写物がＳＦＸＮ３をコードする、実施形態３９８〜４２２のいずれかに記載の方法。
実施形態４２６：標的転写物がＭＲＰＬ１１をコードする、実施形態３９８〜４２２のいずれかに記載の方法。
実施形態４２７：標的転写物がＴＨＰＯをコードする、実施形態３９８〜４２２のいずれかに記載の方法。
実施形態４２８：標的転写物がＣＦＴＲをコードする、実施形態３９８〜４２２のいずれかに記載の方法。
実施形態４２９：標的転写物が、Ｌａ／ＳＳＢ、ＮＰＭ１、ＴＣＰ１−アルファ、ＴＣＰ１−イプシロン、ＴＣＰ１−ベータ、ＨＳＰ９０−ＡＡ１、ｈｓｐ９０−ＡＢ、ＨＳＰＡ１Ｌ、ＲＡＮ、ＩＭＰ９、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２、ＦＴＣＤ／５８Ｋ、ＰＣ４／ＳＵＢ１、ＶＡＲＳ、及びＤＨＸ３６からなる群から選択されるタンパク質をコードする、実施形態３９８〜４２２のいずれかに記載の方法。
実施形態４３０：標的転写物が、表１または表２の遺伝子から選択される遺伝子によってコードされる、実施形態３９８〜４２２のいずれかに記載の方法。
実施形態４３１：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に８０％相補的な核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４３２：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に８５％相補的な核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４３３：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に９０％相補的な核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４３４：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に９５％相補的な核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４３５：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に１００％相補的な核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４３６：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に対して少なくとも１つのミスマッチを有する核酸塩基を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４３７：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に対して少なくとも２つのミスマッチを有する核酸塩基を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４３８：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に対して少なくとも３つのミスマッチを有する核酸塩基を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４３９：修飾オリゴヌクレオチドが、核酸塩基ＣＡＴを含む核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４０：修飾オリゴヌクレオチドが、５’末端核酸塩基の最初の３個がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４１：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から２番目、３番目、及び４番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４２：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から３番目、４番目、及び５番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４３：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から４番目、５番目、及び６番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４４：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から５番目、６番目、及び７番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４５：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から６番目、７番目、及び８番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４６：修飾オリゴヌクレオチドが、５’−最末端核酸塩基から７番目、８番目、及び９番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４７：修飾オリゴヌクレオチドが、３’末端核酸塩基の最初の３個がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４８：修飾オリゴヌクレオチドが、３’−最末端核酸塩基から２番目、３番目、及び４番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４４９：修飾オリゴヌクレオチドが、３’−最末端核酸塩基から３番目、４番目、及び５番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５０：修飾オリゴヌクレオチドが、３’−最末端核酸塩基から４番目、５番目、及び６番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５１：修飾オリゴヌクレオチドが、３’−最末端核酸塩基から５番目、６番目、及び７番目の核酸塩基がＣＡＴである核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５２：修飾オリゴヌクレオチドが、コザック配列に相補的な核酸塩基配列を含む、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５３：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号１または２のｕＯＲＦ領域に相補的な少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５４：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、２１、２３、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４４、４５、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、８２、または８３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５５：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、２１、２３、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４４、４５、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、８２、または８３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５６：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、２１、２３、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４４、４５、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、８２、または８３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５７：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、２１、２３、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４４、４５、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、８２、または８３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５８：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、２１、２３、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４４、４５、５２、５３、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、７７、８２、または８３のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態３９７〜４３０のいずれかに記載の方法。
実施形態４５９：修飾オリゴヌクレオチドが、１０〜４０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態３９７〜４５８のいずれかに記載の方法。
実施形態４６０：修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態３９７〜４５８のいずれかに記載の方法。
実施形態４６１：修飾オリゴヌクレオチドが、１５〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態３９７〜４５８のいずれかに記載の方法。
実施形態４６２：修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態３９７〜４５８のいずれかに記載の方法。
実施形態４６３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシドを含む、実施形態３９７〜４６２のいずれかに記載の方法。
実施形態４６４：少なくとも１つの修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態４６３に記載の方法。
実施形態４６５：少なくとも１つの修飾糖部分が、２’−置換糖部分である、実施形態４６４に記載の方法。
実施形態４６６：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、及び２’−ＭＯＥの中から選択される、実施形態４６５に記載のアンチセンス化合物。
実施形態４６７：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＭＯＥである、実施形態４６３〜４６６のいずれかに記載の方法。
実施形態４６８：少なくとも１つの修飾糖部分が、二環式糖部分である、実施形態４６３〜４６４のいずれかに記載の方法。
実施形態４６９：少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡまたはｃＥｔである、実施形態４６８に記載の方法。
実施形態４７０：少なくとも１つの糖部分が、糖代理物である、実施形態４６４〜４６９のいずれかに記載の方法。
実施形態４７１：少なくとも１つの糖代理物が、モルホリノである、実施形態４７０に記載の方法。
実施形態４７２：少なくとも１つの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態４７０に記載の方法。
実施形態４７３：少なくとも１つの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態４７０に記載の方法。
実施形態４７４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態４６３〜４７３のいずれかに記載の方法。
実施形態４７５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態４６３〜４７３のいずれかに記載の方法。
実施形態４７６：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態４６３〜４７３のいずれかに記載の方法。
実施形態４７７：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態４６３〜４７３のいずれかに記載の方法。
実施形態４７８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態４６３〜４７３のいずれかに記載の方法。
実施形態４７９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態４６３〜４７３に記載の方法。
実施形態４８０：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドである、実施形態４６３〜４７９のいずれかに記載の方法。
実施形態４８１：各非修飾ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドである、実施形態４８０に記載の方法。
実施形態４８２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態４８０〜４８１のいずれかに記載の方法。
実施形態４８３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態４８０〜４８１のいずれかに記載の方法。
実施形態４８４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態４８０〜４８１のいずれかに記載の方法。
実施形態４８５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態４８０〜４８１のいずれかに記載の方法。
実施形態４８６：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態４８０〜４８１のいずれかに記載の方法。
実施形態４８７：修飾オリゴヌクレオチドが、４個以下の連続した２’−デオキシヌクレオシドを含有する、実施形態４８２〜４８６のいずれかに記載の方法。
実施形態４８８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態４８０〜４８１のいずれかに記載の方法。
実施形態４８９：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドであり、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態４８８に記載の方法。
実施形態４９０：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに同じである修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態４６３〜４８９のいずれかに記載の方法。
実施形態４９１：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに異なる修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態４６３〜４８９のいずれかに記載の方法。
実施形態４９２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態４６３〜４８９のいずれかに記載の方法。
実施形態４９３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態４９２に記載の方法。
実施形態４９４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態４９２に記載の方法。
実施形態４９５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１８個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態４９２に記載の方法。
実施形態４９６：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも２０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態４８８に記載の方法。
実施形態４９７：修飾領域の各修飾ヌクレオシドが、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、２’−ＭＯＥ、ｃＥｔ、ＬＮＡ、モルホリノ、修飾モルホリノ、及びペプチド核酸の中から独立して選択される、修飾糖部分を有する、実施形態４９３〜４９６のいずれかに記載の方法。
実施形態４９８：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、互いに同じ修飾を含む、実施形態４９３〜４９７のいずれかに記載の方法。
実施形態４９９：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態４９８に記載の方法。
実施形態５００：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態４９８に記載の方法。
実施形態５０１：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態５００に記載の方法。
実施形態５０２：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態４９９に記載の方法。
実施形態５０３：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態５０２に記載の方法。
実施形態５０４：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態４９８に記載の方法。
実施形態５０５：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態５０４に記載の方法。
実施形態５０６：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態５０４に記載の方法。
実施形態５０７：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態５０４に記載の方法。
実施形態５０８：修飾ヌクレオチドが、４個以下の連続した天然ヌクレオシドを含む、実施形態４６３〜５０７のいずれかに記載の方法。
実施形態５０９：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、実施形態４６３〜５０７のいずれかに記載の方法。
実施形態５１０：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態５０９に記載の方法。
実施形態５１１：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１及び第２のヌクレオシドが、二環式糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５１２：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１、第２、及び第３のヌクレオシドが、二環式糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５１３：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１、第２、第３、及び第４のヌクレオシドが、二環式糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５１４：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１、第２、第３、第４、及び第５のヌクレオシドが、二環式糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５１５：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１、第２、第３、第４、第５、及び第６のヌクレオシドが、二環式糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５１６：修飾オリゴヌクレオチドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態５１１〜５１５に記載の方法。
実施形態５１７：修飾オリゴヌクレオチドにおける各残りのヌクレオシドが、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される修飾糖部分を含む、実施形態５１５に記載の方法。
実施形態５１８：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１及び第２のヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５１９：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１、第２、及び第３のヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５２０：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１、第２、第３、及び第４のヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５２１：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１、第２、第３、第４、及び第５のヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５２２：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、３’−最末端ヌクレオシドから第１、第２、第３、第４、第５、及び第６のヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、実施形態５１０に記載の方法。
実施形態５２３：修飾オリゴヌクレオチドにおける各残りのヌクレオシドが、２’−ＯＭｅ及び２’−ＭＯＥから選択される修飾糖部分を含む、実施形態５１１〜５２２に記載の方法。
実施形態５２４：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、互いに同じ修飾を含む、実施形態５０９に記載の方法。
実施形態５２５：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態５２４に記載の方法。
実施形態５２６：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態５２５に記載の方法。
実施形態５２７：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態５２６に記載の方法。
実施形態５２８：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＯＭｅである、実施形態５２６に記載の方法。
実施形態５２９：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態５２４に記載の方法。
実施形態５３０：修飾オリゴヌクレオチドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態５２９に記載の方法。
実施形態５３１：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態５２４に記載の方法。
実施形態５３２：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態５３１に記載の方法。
実施形態５３３：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態５３１に記載の方法。
実施形態５３４：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態５３１に記載の方法。
実施形態５３５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態３９７〜５３４のいずれかに記載の方法。
実施形態５３６：修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態５３５に記載の方法。
実施形態５３７：各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態５３５または５３６に記載の方法。
実施形態５３８：各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態５３７に記載の方法。
実施形態５３９：少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態５３５または５３６に記載の方法。
実施形態５４０：各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合であり、各ヌクレオシド間結合が同じ修飾を含む、実施形態５３５に記載の方法。
実施形態５４１：各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態５４０に記載の方法。
実施形態５４２：アンチセンス化合物が、少なくとも１つの共役基を含む、実施形態３９７〜５４１のいずれかに記載の方法。
実施形態５４３：共役基が、Ｇａｌ−ＮＡｃを含む、実施形態５４２に記載の方法。
実施形態５４４：アンチセンス化合物が、修飾オリゴヌクレオチドからなる、実施形態３９７〜５４３のいずれかに記載の方法。
実施形態５４５：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１０％増加する、実施形態３９７〜５４４のいずれかに記載の方法。
実施形態５４６：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２０％増加する、実施形態３９７〜５４４のいずれかに記載の方法。
実施形態５４７：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも３０％増加する、実施形態３９７〜５４４のいずれかに記載の方法。
実施形態５４８：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも５０％増加する、実施形態３９７〜５４４のいずれかに記載の方法。
実施形態５４９：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１００％増加する、実施形態３９７〜５４４のいずれかに記載の方法。
実施形態５５０：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１２０％増加する、実施形態３９７〜５４４のいずれかに記載の方法。
実施形態５５１：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１５０％増加する、実施形態３９７〜５４４のいずれかに記載の方法。
実施形態５５２：細胞がインビトロに存在する、実施形態３８６〜５５１のいずれかに記載の方法。
実施形態５５３：細胞が対象内に存在する、実施形態３８６〜５５１のいずれかに記載の方法。
実施形態５５４：対象が疾患または病態を有し、該疾患または病態の少なくとも１つの症状が緩和される、実施形態５５３に記載の方法。
実施形態５５５：細胞が動物内に存在する、実施形態５５３または５５４に記載の方法。
実施形態５５６：動物がヒトである、実施形態５５５に記載の方法。
実施形態５５７：細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であることにより、細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる、方法。
実施形態５５８：細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であることにより、細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、方法。
実施形態５５９：細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であることにより、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる、方法。
実施形態５６０：細胞における標的タンパク質の発現の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それにより細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、方法。
実施形態５６１：翻訳抑制要素領域が、５’非翻訳領域である、実施形態５５７〜５６０のいずれかに記載の方法。
実施形態５６２：翻訳抑制要素領域が、１つ以上のｕＯＲＦを含有する、実施形態５５７〜５６１のいずれかに記載の方法。
実施形態５６３：翻訳抑制要素領域が、１つ以上のｕＯＲＦを含有するが、該１つ以上のｕＯＲＦが、標的転写物の翻訳を抑制しない、実施形態５５７〜５６１のいずれかに記載の方法。
実施形態５６４：翻訳抑制要素領域が、ｕＯＲＦを含有しない、請求項５５７〜５６１のいずれかに記載の方法。
実施形態５６５：標的転写物がＲＮａｓｅ Ｈ１をコードする、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５６６：標的転写物がＡＣＰ１をコードする、実施形態５５７〜５６１または５６４のいずれかに記載の方法。
実施形態５６７：標的転写物がＬＲＰＰＲＣをコードする、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５６８：標的転写物がＳＦＸＮ３をコードする、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５６９：標的転写物がＭＲＰＬ１１をコードする、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５７０：標的転写物がＴＨＰＯをコードする、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５７１：標的転写物がＣＦＴＲをコードする、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５７２：標的転写物が、Ｌａ／ＳＳＢ、ＮＰＭ１、ＴＣＰ１−アルファ、ＴＣＰ１−イプシロン、ＴＣＰ１−ベータ、ＨＳＰ９０−ＡＡ１、ｈｓｐ９０−ＡＢ、ＨＳＰＡ１Ｌ、ＲＡＮ、ＩＭＰ９、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２、ＦＴＣＤ／５８Ｋ、ＰＣ４／ＳＵＢ１、ＶＡＲＳ、及びＤＨＸ３６からなる群から選択されるタンパク質をコードする、実施形態５５７〜５６４のいずれかに記載の方法。
実施形態５７３：標的転写物がＲＮａｓｅ Ｈ１をコードしない、実施形態５５７〜５６４のいずれかに記載の方法。
実施形態５７４：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５７５：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５７６：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５７７：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５７８：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８、９、１１、または１２のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６３のいずれかに記載の方法。
実施形態５７９：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号７９または８０の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６１または５６４または５６６のいずれかに記載の方法。
実施形態５８０：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号７９または８０の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６１または５６４または５６６のいずれかに記載の方法。
実施形態５８１：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号７９または８０の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６１または５６４または５６６のいずれかに記載の方法。
実施形態５８２：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号７９または８０の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６１または５６４または５６６のいずれかに記載の方法。
実施形態５８３：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号７９または８０のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５６１または５６４または５６６のいずれかに記載の方法。
実施形態５８４：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも３５％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５８５：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも４０％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５８６：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも４５％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５８７：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも５０％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５８８：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも５５％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５８９：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも６０％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９０：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも６５％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９１：修飾オリゴヌクレオチドが、すべての核酸塩基の少なくとも７０％がＧまたはＣ核酸塩基である核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９２：修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列の少なくとも一部分が、Ｇ−カルテットに相補的である、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９３：修飾オリゴヌクレオチドが、Ｇ−カルテットに相補的ではない核酸塩基配列を有する、実施形態５５７〜５７３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９４：修飾オリゴヌクレオチドが、１０〜４０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態５５７〜５９３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９５：修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態５５７〜５９３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９６：修飾オリゴヌクレオチドが、１５〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態５５７〜５９３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９７：修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、実施形態５５７〜５９３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシドを含む、実施形態５５７〜５９３のいずれかに記載の方法。
実施形態５９９：少なくとも１つの修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態５９８に記載の方法。
実施形態６００：少なくとも１つの修飾糖部分が、２’−置換糖部分である、実施形態５９９に記載の方法。
実施形態６０１：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、及び２’−ＭＯＥの中から選択される、実施形態６００に記載のアンチセンス化合物。
実施形態６０２：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＭＯＥである、実施形態６００〜６０１のいずれかに記載の方法。
実施形態６０３：少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’ＯＭｅではない、実施形態６００〜６０２のいずれかに記載の方法。
実施形態６０４：少なくとも１つの修飾糖部分が、二環式糖部分である、実施形態５９８〜６０３のいずれかに記載の方法。
実施形態６０５：少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡまたはｃＥｔである、実施形態６０４に記載の方法。
実施形態６０６：少なくとも１つの糖部分が、糖代理物である、実施形態５９８〜６０５のいずれかに記載の方法。
実施形態６０７：少なくとも１つの糖代理物が、モルホリノである、実施形態６０６に記載の方法。
実施形態６０８：少なくとも１つの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態６０６に記載の方法。
実施形態６０９：少なくとも１つの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態６０６に記載の方法。
実施形態６１０：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態５９８〜６０９のいずれかに記載の方法。
実施形態６１１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態５９８〜６０９のいずれかに記載の方法。
実施形態６１２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態５９８〜６０９のいずれかに記載の方法。
実施形態６１３：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態５９８〜６０９のいずれかに記載の方法。
実施形態６１４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態５９８〜６０９のいずれかに記載の方法。
実施形態６１５：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態５９８〜６０９に記載の方法。
実施形態６１６：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドである、実施形態５９８〜６０９のいずれかに記載の方法。
実施形態６１７：各非修飾ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドである、実施形態６１６に記載の方法。
実施形態６１８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも６個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態６１６〜６１７のいずれかに記載の方法。
実施形態６１９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも７個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態６１６〜６１７のいずれかに記載の方法。
実施形態６２０：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも８個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態６１６〜６１７のいずれかに記載の方法。
実施形態６２１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも９個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態６１６〜６１７のいずれかに記載の方法。
実施形態６２２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の２’−デオキシヌクレオシドを含む、実施形態６１６〜６１７のいずれかに記載の方法。
実施形態６２３：修飾オリゴヌクレオチドが、４個以下の連続した２’−デオキシヌクレオシドを含有する、実施形態６１６〜６２２のいずれかに記載の方法。
実施形態６２４：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態５９８〜６２３のいずれかに記載の方法。
実施形態６２５：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドであり、各々独立して、修飾糖部分を含む、実施形態６２４に記載の方法。
実施形態６２６：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに同じである修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態５９８〜６２５のいずれかに記載の方法。
実施形態６２７：修飾オリゴヌクレオチドが、互いに異なる修飾糖部分を含む少なくとも２個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態５９８〜６２６のいずれかに記載の方法。
実施形態６２８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態５９８〜６２７のいずれかに記載の方法。
実施形態６２９：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態６２８に記載の方法。
実施形態６３０：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態６２８に記載の方法。
実施形態６３１：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１８個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態６２８に記載の方法。
実施形態６３２：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも２０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、実施形態６２８に記載の方法。
実施形態６３３：修飾領域の各修飾ヌクレオシドが、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、２’−ＭＯＥ、ｃＥｔ、ＬＮＡ、モルホリノ、修飾モルホリノ、及びペプチド核酸の中から独立して選択される、修飾糖部分を有する、実施形態６２６〜６３２のいずれかに記載の方法。
実施形態６３４：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、互いに同じ修飾を含む、実施形態６２８〜６３３のいずれかに記載の方法。
実施形態６３５：修飾領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態６３４に記載の方法。
実施形態６３６：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態６３５に記載の方法。
実施形態６３７：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態６３５に記載の方法。
実施形態６３８：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態６３４に記載の方法。
実施形態６３９：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態６３８に記載の方法。
実施形態６４０：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態６３４に記載の方法。
実施形態６４１：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態６４０に記載の方法。
実施形態６４２：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態６４０に記載の方法。
実施形態６４３：修飾ヌクレオシドの領域の修飾ヌクレオシドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態６４０に記載の方法。
実施形態６４４：修飾ヌクレオチドが、４個以下の連続した天然ヌクレオシドを含む、実施形態６２３〜６４３のいずれかに記載の方法。
実施形態６４５：修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、実施形態６２６〜６４４のいずれかに記載の方法。
実施形態６４６：各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態６４５に記載の方法。
実施形態６４７：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、互いに同じ修飾を含む、実施形態６４６に記載の方法。
実施形態６４８：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ２’−置換糖部分を含む、実施形態６４７に記載の方法。
実施形態６４９：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される、実施形態６４８に記載の方法。
実施形態６５０：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＭＯＥである、実施形態６４９に記載の方法。
実施形態６５１：修飾オリゴヌクレオチドの２’−置換糖部分が、２’−ＯＭｅである、実施形態６４９に記載の方法。
実施形態６５２：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、同じ二環式糖部分を含む、実施形態６４７に記載の方法。
実施形態６５３：修飾オリゴヌクレオチドの二環式糖部分が、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、実施形態６５２に記載の方法。
実施形態６５４：修飾オリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオシドが、各々、糖代理物を含む、実施形態６４６〜６４７に記載の方法。
実施形態６５５：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、モルホリノである、実施形態６５４に記載の方法。
実施形態６５６：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、修飾モルホリノである、実施形態６５４に記載の方法。
実施形態６５７：修飾オリゴヌクレオチドの糖代理物が、ペプチド核酸である、実施形態６５４に記載の方法。
実施形態６５８：修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態５５７〜６５７のいずれかに記載の方法。
実施形態６５９：修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態６５８に記載の方法。
実施形態６６０：各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、実施形態６５８または６５９に記載の方法。
実施形態６６１：各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態６５８に記載の方法。
実施形態６６２：少なくとも１つのホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含む、実施形態５５７〜６５７のいずれかに記載の方法。
実施形態６６３：各ヌクレオシド間結合が修飾ヌクレオシド間結合であり、各ヌクレオシド間結合が同じ修飾を含む、実施形態６５８に記載の方法。
実施形態６６４：各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態６６３に記載の方法。
実施形態６６５：アンチセンス化合物が、少なくとも１つの共役基を含む、実施形態５５７〜６６４のいずれかに記載の方法。
実施形態６６６：共役基が、Ｇａｌ−ＮＡｃを含む、実施形態６６５に記載の方法。
実施形態６６７：アンチセンス化合物が、修飾オリゴヌクレオチドからなる、実施形態５５７〜６６６のいずれかに記載の方法。
実施形態６６８：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１０％増加する、実施形態５５７〜６６７のいずれかに記載の方法。
実施形態６６９：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２０％増加する、実施形態５５７〜６６７のいずれかに記載の方法。
実施形態６７０：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも３０％増加する、実施形態５５７〜６６７のいずれかに記載の方法。
実施形態６７１：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも５０％増加する、実施形態５５７〜６６７のいずれかに記載の方法。
実施形態６７２：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１００％増加する、実施形態５５７〜６６７のいずれかに記載の方法。
実施形態６７３：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１２０％増加する、実施形態５５７〜６６７のいずれかに記載の方法。
実施形態６７４：標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１５０％増加する、実施形態５５７〜６６７のいずれかに記載の方法。
実施形態６７５：細胞がインビトロに存在する、実施形態５５７〜６７４のいずれかに記載の方法。
実施形態６７６：細胞が対象内に存在する、実施形態５５７〜６７４のいずれかに記載の方法。
実施形態６７７：対象が疾患または病態を有し、該疾患または病態の少なくとも１つの症状が緩和される、実施形態６７６に記載の方法。
実施形態６７８：細胞が動物内に存在する、実施形態６７６または６７７に記載の方法。
実施形態６７９：動物がヒトである、実施形態６７８に記載の方法。
実施形態６８０：修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物に結合されるとＲＮａｓｅ Ｈを活性化しない、先行実施形態のいずれかに記載の化合物または方法。
実施形態６８１：修飾オリゴヌクレオチドがギャップマーではない、先行実施形態のいずれかに記載の化合物または方法。
実施形態６８２：細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって細胞における標的タンパク質の翻訳を増加させる、方法。
実施形態６８３：細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それにより細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、方法。
実施形態６８４：細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それにより細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる、方法。
実施形態６８５：細胞における標的タンパク質の発現の増加方法であって、細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、修飾オリゴヌクレオチドが、標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それにより細胞における標的タンパク質の発現を増加させる、方法。
実施形態６８６：翻訳抑制要素領域が、５’非翻訳領域である、実施形態６８２〜６８５のいずれかに記載の方法。
実施形態６８７：翻訳抑制要素領域が、５’非翻訳領域におけるステムループ構造である、実施形態６８２〜６８５のいずれかに記載の方法。
実施形態６８８：翻訳抑制要素領域が、５’非翻訳領域におけるステムループ構造におけるステムである、実施形態６８２〜６８５のいずれかに記載の方法。
実施形態６８９：翻訳抑制要素領域が、５’非翻訳領域におけるステムループ構造におけるループである、実施形態６８２〜６８５のいずれかに記載の方法。
実施形態６９０：翻訳抑制要素領域が、１つ以上のｕＯＲＦを含有する、実施形態６８２〜６８９のいずれかに記載の方法。
実施形態６９１：翻訳抑制要素領域が、１つ以上のｕＯＲＦを含有するが、該１つ以上のｕＯＲＦが、標的転写物の翻訳を抑制しない、実施形態６８２〜６８９のいずれかに記載の方法。
実施形態６９２：翻訳抑制要素領域が、ｕＯＲＦを含有しない、請求項６８２〜６８９のいずれかに記載の方法。
実施形態６９３：標的転写物がＲＮａｓｅ Ｈ１をコードする、実施形態６８２〜６９１のいずれかに記載の方法。
実施形態６９４：標的転写物がＬＤＬｒをコードする、実施形態６８２〜６９２のいずれかに記載の方法。
実施形態６９５：標的転写物がＡＲＦ１をコードする、実施形態６８２〜６８９のいずれかに記載の方法。
実施形態６９６：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、９３、９５、９７、９９、または１００の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態６８２〜６９２または６９４〜６９５のいずれかに記載の方法。
実施形態６９７：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、９３、９５、９７、９９、または１００の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１０個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態６８２〜６９２または６９４〜６９５のいずれかに記載の方法。
実施形態６９８：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、９３、９５、９７、９９、または１００の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１２個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態６８２〜６９２または６９４〜６９５のいずれかに記載の方法。
実施形態６９９：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、９３、９５、９７、９９、または１００の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、実施形態６８２〜６９２または６９４〜６９５のいずれかに記載の方法。
実施形態７００：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、９３、９５、９７、９９、または１００のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態６８２〜６９２または６９４〜６９５のいずれかに記載の方法。
実施形態７０１：修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、９３、９５、９７、９９、または１００のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態６８２〜６９２または６９４〜６９５のいずれかに記載の方法。
実施形態７０２：修飾オリゴヌクレオチドがギャップマーではない、実施形態１〜７０１のいずれかに記載の化合物または方法。
実施形態７０３：標的転写物が、ＣＦＴＲ、ＦＸＮ（フラタキシン）、ＨＯＴＡＩＲ、ＬＡＭＡ１、ＵＴＲＮ、ＥＺＨ２、Ｓｕｖ３Ｈ１、ＮＥＳＴ、ＤＩＮＯ、Ａｐｏａ１、ＳＳＰＮ、ＭＥＲＴＫ、ＭＥＣＰ２、ＭＢＮＬ１、ＦＭＲ１、ＣＤ２４７、ＰＴＥＮ、ＫＬＦ４、ＡＴＰ２Ａ２、ＮＦＥ２Ｌ２、ＦｏｘＰ３、ＡＮＲＩＬ、ＳＭＮ、ＨＢＦ、ＡＣＴＢ、またはＥＰＯではない、先行実施形態のいずれかに記載の化合物または方法。
実施形態７０４：標的転写物がエピジェネティック調節遺伝子ではない、先行実施形態のいずれかに記載の化合物または方法。
実施形態７０５：標的タンパク質がフラタキシンではない、先行実施形態のいずれかに記載の化合物または方法。
実施形態７０６：標的転写物がフラタキシンではない、先行実施形態のいずれかに記載の化合物または方法。
実施形態７０７：標的転写物がｌｎｃＲＮＡではない、先行実施形態のいずれかに記載の化合物または方法。
実施形態７０８：先行実施形態のいずれかに記載のプロドラッグを含む薬学的組成物。
前述の一般的な説明及び以下の発明を実施するための形態のいずれも例示的かつ説明的であるにすぎず、特許請求される本発明を限定するものではないことを理解されたい。本明細書において、単数形の使用は、別途明確に記述されない限り、複数形を含む。本明細書で使用されるとき、「または（ｏｒ）」の使用は、別途記述されない限り、「及び／または（ａｎｄ／ｏｒ）」を意味する。さらに、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語、ならびに「含む（ｉｎｃｌｕｄｅ）」及び「含まれる（ｉｎｃｌｕｄｅｄ）」等の他の形態の使用は、限定的ではない。また、「要素」または「成分」等の用語は、別途明確に記述されない限り、１つのユニットを含む要素及び成分と２つ以上のサブユニットを含む要素及び成分の両方を包含する。
本明細書で使用される節の見出しは、単に構成目的のものであり、記載される主題を限定するものと解釈されるべきではない。特許、特許出願、記事、書籍、及び論文を含むが、これらに限定されない本出願において引用されるすべての文書または文書の一部は、参照によりそれらの全体があらゆる目的のために本明細書に明確に組み込まれる。
定義
別途示されない限り、以下の用語は、以下の意味を有する。
本明細書で使用されるとき、「標的転写」とは、標的タンパク質をコードする転写物を意味する。ある特定の実施形態において、標的転写物は、一次タンパク質をコードする一次オープンリーディングフレームと、標的タンパク質ではないポリペプチドの翻訳が開始され得る１つ以上の開始部位と、を含有する。ある特定のそのような実施形態において、標的転写物は、一次オープンリーディングフレーム及びｕＯＲＦを含有する。ある特定のそのような実施形態において、標的転写物は、一次オープンリーディングフレーム及び２つ以上のｕＯＲＦを含有する。ある特定の実施形態において、標的転写物は、一次オープンリーディングフレームを含有し、ｕＯＲＦを含有しない。ある特定の実施形態において、標的転写物は、一次オープンリーディングフレーム及び翻訳抑制要素を含有する。
本明細書で使用されるとき、「翻訳抑制要素」とは、標的転写物の翻訳を低減、阻害、かつ／または抑制する標的転写物の５’−ＵＴＲにおける任意の配列及び／または二次構造を意味する。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素はｕＯＲＦを含む。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素はｕＯＲＦを含まない。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素は１つ以上のステムループを含む。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素は、６０％超、７０％超、または８０％超のＧＣ含有量を含む。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素はｕＯＲＦである。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素はステムループである。
本明細書で使用されるとき、「翻訳抑制要素阻害剤」とは、任意の薬剤が翻訳抑制要素の活性を特異的に阻害することができる任意の手段を意味する。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素阻害剤の活性は、同じ転写物上のｐＯＲＦポリペプチドまたはタンパク質の翻訳の抑制である。例えば、翻訳抑制要素阻害剤としては、核酸（アンチセンス化合物及びｓｉＲＮＡを含む）、ペプチド、抗体、小分子、及び翻訳抑制要素の量または活性を阻害することができる他の薬剤が挙げられる。
本明細書で使用されるとき、「翻訳抑制要素領域」とは、１つ以上の翻訳抑制要素を含む標的転写物の一部分を意味する。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素領域はｕＯＲＦを含む。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素領域は２つ以上のｕＯＲＦを含む。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素領域は、ｕＯＲＦと、ｕＯＲＦではない少なくとも１つの翻訳抑制要素とを含む。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素領域は、ｕＯＲＦではない翻訳抑制要素を含み、ｕＯＲＦを含有しない。
本明細書で使用されるとき、「ＧＣ含有量」とは、Ｇ若しくはＣのいずれかであるか、またはＧ若しくはＣと塩基対合する、核酸またはオリゴヌクレオチドの特定の部分における総ヌクレオシドの割合を意味する。
本明細書で使用されるとき、「連続したＧＣヌクレオシド」または「連続したＧＣヌクレオチド」とは、すべてＧ若しくはＣのいずれかであるか、またはＧ若しくはＣと塩基対合する、核酸またはオリゴヌクレオチドにおける隣接するヌクレオシドの一部分を意味する。
本明細書で使用されるとき、「標的タンパク質」とは、量、濃度、または活性を増加させることを所望するタンパク質を意味する。ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、標的転写物の一次オープンリーディングフレームによってコードされる。
本明細書で使用されるとき、「標的転写」とは、標的タンパク質をコードする転写物を意味する。ある特定の実施形態において、標的転写物は、一次タンパク質をコードする一次オープンリーディングフレームと、標的タンパク質ではないポリペプチドの翻訳が開始され得る１つ以上の開始部位と、を含有する。ある特定のそのような実施形態において、標的転写物は、一次オープンリーディングフレーム及びｕＯＲＦを含有する。ある特定のそのような実施形態において、標的転写物は、一次オープンリーディングフレーム及び２つ以上のｕＯＲＦを含有する。
本明細書で使用されるとき、「一次オープンリーディングフレーム」または「ｐＯＲＦ」とは、標的転写物の一部分を意味し、これは、この転写物に関連する一次タンパク質をコードする。ある特定の実施形態において、ｐＯＲＦは、標的タンパク質をコードする。
本明細書で使用されるとき、「一次タンパク質」とは、一次オープンリーディングフレームによってコードされるタンパク質を意味する。
本明細書で使用されるとき、「標的部位」とは、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列の一部分に相補的である核酸塩基配列を有する標的転写物の一部分を意味する。ある特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾オリゴヌクレオチドの全長にわたる標的部位に相補的である。
本明細書で使用されるとき、「開始部位」とは、リボソームサブユニットがリクルートされる転写物上の核酸塩基群を意味する。ある特定の実施形態において、開始部位は、翻訳の開始をもたらし得る。ある特定の実施形態において、開始部位は、ＡＵＧコドンである。ある特定の実施形態において、開始部位は、非標準開始コドンである。
本明細書で使用されるとき、「上流オープンリーディングフレーム開始部位」または「ｕＯＲＦ開始部位」とは、ｐＯＲＦ開始コドンの上流にある開始部位を意味する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位は、標的タンパク質ではないポリペプチドの翻訳を開始する。
本明細書で使用されるとき、「ｕＯＲＦ開始部位領域」とは、ｕＯＲＦ開始部位を含む標的転写物の一部分を意味する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位領域は、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流及び下流にある１００個のヌクレオシドとを含む。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位領域は、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流及び下流にある７５個のヌクレオシドとを含む。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位領域は、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流及び下流にある５０個のヌクレオシドとを含む。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位領域は、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流及び下流にある３０個のヌクレオシドとを含む。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位領域は、ｕＯＲＦ開始部位と、ｕＯＲＦ開始部位の上流及び下流にある２０個のヌクレオシドとを含む。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位領域は、５’非翻訳領域を含む。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位領域は、５’−ＵＴＲからなる。
本明細書で使用されるとき、「ｕＯＲＦ」または「上流オープンリーディングフレーム」とは、ｐＯＲＦの上流（すなわち、５’）にある開始部位と、インフレーム終止コドンとを含む標的転写物の一部分を意味する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦは、翻訳がｕＯＲＦ開始部位にて開始されるときに翻訳される標的転写物の一部分である。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦは、ｐＯＲＦと重複しない。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦは、ｐＯＲＦと重複する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦは、別のｕＯＲＦと重複する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦは、ｐＯＲＦのフレーム外である。
本明細書で使用されるとき、「野生型ｕＯＲＦ開始部位」とは、突然変異から生じないｕＯＲＦ開始部位を意味する。
本明細書で使用されるとき、「野生型ｕＯＲＦ開始部位領域」とは、野生型ｕＯＲＦ開始部位のｕＯＲＦ開始部位領域を意味する。
本明細書で使用されるとき、「突然変異から生じるｕＯＲＦ開始部位」とは、野生型対立遺伝子上の標的転写物の同じ部分がｕＯＲＦ開始部位を含有しない、ｕＯＲＦ開始部位を意味する。
本明細書で使用されるとき、「ｕＯＲＦポリペプチド」とは、ｕＯＲＦによってコードされるポリペプチドを意味する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦポリペプチドは、タンパク質である。
本明細書で使用されるとき、「ｕＯＲＦ阻害剤」とは、ｕＯＲＦの活性を特異的に阻害することができる任意の薬剤を意味する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦの活性は、同じ転写物上のｐＯＲＦポリペプチドまたはタンパク質の翻訳の抑制である。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦの活性は、異なる転写物上のｐＯＲＦポリペプチドまたはタンパク質の翻訳の抑制である。例えば、ｕＯＲＦ特異的阻害剤としては、核酸（アンチセンス化合物及びｓｉＲＮＡを含む）、ペプチド、抗体、小分子、及びｕＯＲＦの量または活性を阻害することができる他の薬剤が挙げられる。
本明細書で使用されるとき、「細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制」とは、標的タンパク質の翻訳が、１つ以上のＴＳＥの非存在下での標的タンパク質の翻訳を下回ることを意味する。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオシド」とは、核酸塩基部分及び糖部分を含む化合物を意味する。ヌクレオシドには、天然ヌクレオシド（ＤＮＡ及びＲＮＡに見られるもの）ならびに修飾ヌクレオシドが含まれるが、これらに限定されない。ヌクレオシドは、ホスフェート部分に連結され得る。
本明細書で使用されるとき、「化学修飾」とは、天然の対応物と比較した場合の化合物の化学的相違を意味する。オリゴヌクレオチド化学修飾は、ヌクレオシド修飾（糖部分修飾及び核酸塩基修飾を含む）ならびにヌクレオシド間結合修飾を含む。オリゴヌクレオチドに関して、化学修飾は、核酸塩基配列のみの相違を含まない。
本明細書で使用されるとき、「フラノシル」とは、４個の炭素原子と１個の酸素原子と、を含む５員環を含む構造を意味する。
本明細書で使用されるとき、「天然の糖部分」とは、天然ＲＮＡに見られるリボフラノシルまたは天然ＤＮＡに見られるデオキシリボフラノシルを意味する。
本明細書で使用されるとき、「糖部分」とは、ヌクレオシドの天然の糖部分または修飾糖部分を意味する。
本明細書で使用されるとき、「修飾糖部分」とは、置換糖部分または糖代理物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「置換糖部分」とは、天然の糖部分ではないフラノシルを意味する。置換糖部分には、２’位、３’位、５’位、及び／または４’位に置換基を含むフラノシルが含まれるが、これらに限定されない。ある特定の置換糖部分は、二環式糖部分である。
本明細書で使用されるとき、「２’−置換糖部分」とは、ＨまたはＯＨ以外の２’位に置換基を含むフラノシルを意味する。別途示されない限り、２’−置換糖部分は、二環式糖部分ではない（すなわち、２’−置換糖部分の２’−置換基は、フラノシル環の別の原子への架橋を形成しない）。
本明細書で使用されるとき、「ＭＯＥ」とは、−ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３を意味する。
本明細書で使用されるとき、「２’−Ｆヌクレオシド」は、２’位にフルオロイン（ｆｌｕｏｒｏｉｎｅ）を含む糖を含むヌクレオシドを指す。別途示されない限り、２’−Ｆヌクレオシドにおけるフッ素は、（天然リボースのＯＨを置換する）リボ位に存在する。
本明細書で使用されるとき、「２’−（アラ）−Ｆ」は、フルオロ基がアラビノ位置にある２’−Ｆ置換ヌクレオシドを指す。
本明細書で使用されるとき、「糖代理物」という用語は、結果として生じるヌクレオシドサブユニットが一緒に結合し、かつ／または他のヌクレオシドに結合して、相補的なオリゴヌクレオチドにハイブリダイズすることができるオリゴヌクレオチドを形成することができるように、フラノシルを含まず、かつヌクレオシドの天然の糖部分を置換することができる構造を意味する。そのような構造は、フラノシル（例えば、４、６、若しくは７員環）とは異なる数の原子、フラノシルの酸素の非酸素原子（例えば、炭素、硫黄、若しくは窒素）との置換、または原子の数の変化及び酸素の置換の両方を含む環を含む。そのような構造はまた、置換糖部分（例えば、さらなる置換基を任意選択的に含む６員炭素環式二環式糖代理物）について記載された置換に対応する置換も含み得る。糖代理物はまた、より複雑な糖置換物（例えば、ペプチド核酸の非環系）も含む。糖代理物には、モルホリノ、シクロヘキセニル、及びシクロヘキシトールが含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用されるとき、「二環式糖部分」とは、４〜７員環の２個の原子をつないで第２の環を形成して、二環式構造をもたらす架橋を含む４〜７員環（フラノシルを含むが、これに限定されない）を含む修飾糖部分を意味する。ある特定の実施形態において、４〜７員環は、糖環である。ある特定の実施形態において、４〜７員環は、フラノシルである。ある特定のそのような実施形態において、架橋は、フラノシルの２’−炭素と４’−炭素をつなぐ。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオチド」とは、ホスフェート結合基をさらに含むヌクレオシドを意味する。本明細書で使用されるとき、「結合ヌクレオシド」は、ホスフェート結合によって連結されてもされなくても良く、それ故に、「結合ヌクレオチド」を含むが、これに限定されない。本明細書で使用されるとき、「結合ヌクレオシド」は、連続した配列において連結されるヌクレオシドである（すなわち、さらなるヌクレオシドは、連結される配列間に存在しない）。
本明細書で使用されるとき、「核酸塩基」とは、糖部分に連結されてオリゴヌクレオチドに組み込むことができるヌクレオシドを創出することができる原子群を意味し、この原子群は、別のオリゴヌクレオチドまたは核酸の相補的な天然核酸塩基と結合することができる。核酸塩基は、天然に存在しても良く、または修飾されても良い。
本明細書で使用されるとき、「非修飾核酸塩基」または「天然核酸塩基」は、ＲＮＡまたはＤＮＡの天然の複素環式核酸塩基：プリン塩基であるアデニン（Ａ）及びグアニン（Ｇ）、ならびにピリミジン塩基であるチミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）（５−メチルＣを含む）、及びウラシル（Ｕ）を意味する。
本明細書で使用されるとき、「修飾核酸塩基」とは、天然核酸塩基ではない任意の核酸塩基を意味する。
本明細書で使用されるとき、「修飾ヌクレオシド」とは、天然ＲＮＡまたはＤＮＡヌクレオシドと比較して、少なくとも１つの化学修飾を含むヌクレオシドを意味する。修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分及び／または修飾核酸塩基を含む。
本明細書で使用されるとき、「二環式ヌクレオシド」または「ＢＮＡ」とは、二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
本明細書で使用されるとき、「拘束エチルヌクレオシド」または「ｃＥｔ」とは、４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’架橋を含む二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
本明細書で使用されるとき、「ロックド核酸ヌクレオシド」または「ＬＮＡ」とは、４’−ＣＨ２−Ｏ−２’橋を含む二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。
本明細書で使用されるとき、「２’−置換ヌクレオシド」とは、ＨまたはＯＨ以外の２’位に置換基を含むヌクレオシドを意味する。別途示されない限り、２’−置換ヌクレオシドは、二環式ヌクレオシドではない。
本明細書で使用されるとき、「２’−デオキシヌクレオシド」とは、天然デオキシリボヌクレオシド（ＤＮＡ）に見られる２’−Ｈフラノシル糖部分を含むヌクレオシドを意味する。ある特定の実施形態において、２’−デオキシヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含んでも良く、またはＲＮＡ核酸塩基（例えば、ウラシル）を含んでも良い。
本明細書で使用されるとき、「オリゴヌクレオチド」とは、複数の結合ヌクレオシドを含む化合物を意味する。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１個以上の非修飾リボヌクレオシド（ＲＮＡ）、及び／または非修飾デオキシリボヌクレオシド（ＤＮＡ）、及び／または１個以上の修飾ヌクレオシドを含む。
本明細書で使用されるとき、「オリゴヌクレオシド」とは、ヌクレオシド間結合のうちのいずれもリン原子を含有しないオリゴヌクレオチドを意味する。本明細書で使用されるとき、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオシドを含む。
本明細書で使用されるとき、「修飾オリゴヌクレオチド」とは、少なくとも１個の修飾ヌクレオシド、及び／または少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドを意味する。修飾オリゴヌクレオチドの例としては、一本鎖及び二本鎖化合物、例えば、アンチセンス化合物、ｓｉＲＮＡｓ、ｓｈＲＮＡｓ、ｓｓＲＮＡｓ、及び占有に基づく（ｏｃｃｕｐａｎｃｙ−ｂａｓｅｄ）化合物が挙げられる。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオシド間結合」とは、オリゴヌクレオチド中の隣接したヌクレオシド間の共有結合を意味する。
本明細書で使用されるとき、「天然ヌクレオシド間結合」とは、３’から５’のホスホジエステル結合を意味する。
本明細書で使用されるとき、「修飾ヌクレオシド間結合」とは、天然ヌクレオシド間結合以外の任意のヌクレオシド間結合を意味する。
本明細書で使用されるとき、「オリゴマー化合物」とは、２つ以上の下部構造を含む重合体構造を意味する。ある特定の実施形態において、下部構造は、ヌクレオチドまたはヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、オリゴヌクレオチドからなる。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物は、アンチセンス化合物からなる。
本明細書で使用されるとき、「末端基」とは、オリゴヌクレオチドの３’末端若しくは５’末端のいずれか、またはこれら両方に結合される１個以上の原子を意味する。ある特定の実施形態において、末端基は、共役基である。ある特定の実施形態において、末端基は、１個以上の末端基ヌクレオシドを含む。
本明細書で使用されるとき、「共役基」とは、オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物に結合される原子または原子群を意味する。概して、共役基は、薬力学的特性、薬物動態学的特性、結合特性、吸収特性、細胞分布特性、細胞取り込み特性、電荷特性、及び／またはクリアランス特性を含むが、これらに限定されない、それらが結合するオリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物の１つ以上の特性を修飾する。
本明細書で使用されるとき、「共役基結合基」とは、共役体をオリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物に結合させるために使用される任意の原子または原子群を意味する。
本明細書で使用されるとき、「アンチセンス化合物」とは、オリゴヌクレオチドを含むか、またはそれからなる化合物を意味し、その少なくとも一部分は、それがハイブリダイズすることができる標的核酸に相補的であり、それによって少なくとも１つのアンチセンス活性をもたらす。
本明細書で使用されるとき、「アンチセンス活性」とは、アンチセンス化合物のその標的核酸へのハイブリダイゼーションに起因する任意の検出可能かつ／または測定可能な変化を意味する。
本明細書で使用されるとき、「検出」または「測定」とは、検出または測定のための試験またはアッセイが実行されることを意味する。そのような検出及び／または測定は、ゼロの値をもたらし得る。したがって、検出または測定のための試験により活性が見出されない（ゼロの活性）場合でもなお、活性を検出または測定するステップが実行されている。
本明細書で使用されるとき、「検出可能かつ／または測定可能な活性」とは、ゼロではない測定可能な活性を意味する。
本明細書で使用されるとき、「本質的に不変」とは、特にはるかに大きく変化する別のパラメータと比較して、特定のパラメータに変化がほとんどまたは全くないことを意味する。ある特定の実施形態において、あるパラメータは、その変化が５％未満のとき、本質的に不変である。ある特定の実施形態において、あるパラメータは、その変化が２倍未満である場合、本質的に不変であるが、別のパラメータは、少なくとも１０倍変化する。例えば、ある特定の実施形態において、アンチセンス活性は、標的核酸の量の変化である。ある特定のそのような実施形態において、非標的核酸の量の変化は、標的核酸の用量の変化よりもはるかに小さい場合、本質的に不変であるが、その変化はゼロである必要はない。
本明細書で使用されるとき、「発現」とは、遺伝子が最終的にタンパク質をもたらす工程を意味する。発現には、転写、転写後修飾（例えば、スプライシング、ポリアデニル化、５’−キャップの付加）、翻訳、及び翻訳後修飾が含まれるが、これらに限定されない。
本明細書で使用されるとき、「翻訳」とは、ポリペプチド（例えば、タンパク質）がｍＲＮＡから翻訳される工程を意味する。ある特定の実施形態において、翻訳の増加とは、ポリペプチド（例えば、タンパク質）分子の数の増加を意味し、これらの分子は、該ポリペプチドをコードするｍＲＮＡのコピー１つごとに作製される。
本明細書で使用されるとき、「標的核酸」とは、アンチセンス化合物がハイブリダイズするように意図される核酸分子を意味する。
本明細書で使用されるとき、「ｍＲＮＡ」とは、タンパク質をコードするＲＮＡ分子を意味する。
本明細書で使用されるとき、「プレｍＲＮＡ」とは、ｍＲＮＡへと完全に処理されていないＲＮＡ転写を意味する。プレＲＮＡは、１つ以上のイントロンを含む。
本明細書で使用されるとき、「標的とする」または「を標的とする」とは、アンチセンス化合物が特定の標的核酸分子または標的核酸分子の特定の領域に会合することを意味する。アンチセンス化合物は、生理学的条件下でハイブリダイゼーションを可能にするのに標的核酸に十分相補的である場合、標的核酸を標的とする。
本明細書で使用されるとき、核酸塩基に関して「核酸塩基相補性」または「相補性」とは、核酸塩基が別の核酸塩基と塩基対合することができることを意味する。例えば、ＤＮＡにおいて、アデニン（Ａ）は、チミン（Ｔ）に相補的である。例えば、ＲＮＡにおいて、アデニン（Ａ）は、ウラシル（Ｕ）に相補的である。ある特定の実施形態において、相補的核酸塩基とは、その標的核酸の核酸塩基と塩基対合することができるアンチセンス化合物の核酸塩基を意味する。例えば、アンチセンス化合物のある特定の位置の核酸塩基が、標的核酸のある特定の位置の核酸塩基と水素結合することができる場合、オリゴヌクレオチドと標的核酸との間の水素結合の位置は、その核酸塩基対において相補的であると見なされる。ある特定の修飾を含む核酸塩基は、対応する核酸塩基と対合する能力を維持し得、それ故に、依然として核酸塩基相補性を有することができる。
本明細書で使用されるとき、核酸塩基に関して「非相補的な」とは、核酸塩基の対が互いに水素結合を形成しないことを意味する。
本明細書で使用されるとき、オリゴマー化合物（例えば、結合ヌクレオシド、オリゴヌクレオチド、または核酸）に関して「相補的な」とは、そのようなオリゴマー化合物またはそれらの領域がストリンジェントな条件下で核酸塩基相補性により別のオリゴマー化合物またはそれらの領域にハイブリダイズする能力を意味する。相補的なオリゴマー化合物は、各ヌクレオシドで核酸塩基相補性を有する必要はない。むしろ、いくつかのミスマッチが許容される。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、核酸塩基の７０％で相補的である（７０％相補的である）。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、８０％相補的である。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、９０％相補的である。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、９５％相補的である。ある特定の実施形態において、相補的なオリゴマー化合物または領域は、１００％相補的である。
本明細書で使用されるとき、「ミスマッチ」とは、第１のオリゴマー化合物の核酸塩基が、第１及び第２のオリゴマー化合物が整列するときに、第２のオリゴマー化合物の対応する位置で核酸塩基と対合することができないことを意味する。第１及び第２のオリゴマー化合物のいずれかまたは両方がオリゴヌクレオチドであり得る。
本明細書で使用されるとき、「ハイブリダイゼーション」とは、相補的なオリゴマー化合物（例えば、アンチセンス化合物及びその標的核酸）の対合を意味する。特定の機構に限定されないが、最も一般的な対合機構には水素結合が含まれ、これは、相補的核酸塩基間のワトソン・クリック水素結合、フーグスティーン水素結合、または逆フーグスティーン水素結合であり得る。
本明細書で使用されるとき、「特異的にハイブリダイズする」とは、オリゴマー化合物が、ある核酸部位に、別の核酸部位にハイブリダイズするよりも高い親和性でハイブリダイズする能力を意味する。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、２つ以上の標的部位に特異的にハイブリダイズする。
本明細書で使用されるとき、オリゴヌクレオチドまたはその部分に関して「完全に相補的な」とは、オリゴヌクレオチドまたはその部分の各核酸塩基が、相補的な核酸またはその連続した部分の核酸塩基と対合することができることを意味する。したがって、完全に相補的な領域は、いずれの鎖でもミスマッチまたは非ハイブリダイズ核酸塩基を含まない。
本明細書で使用されるとき、「パーセント相補性」とは、標的核酸の等長部分に相補的なオリゴマー化合物の核酸塩基の割合を意味する。パーセント相補性は、標的核酸の対応する位置の核酸塩基に相補的なオリゴマー化合物の核酸塩基の数を、オリゴマー化合物の全長で割ることによって計算される。
本明細書で使用されるとき、「パーセント同一性」とは、第１の核酸の核酸塩基の総数で割った、第２の核酸の対応する位置の核酸塩基と同一の（化学修飾から独立した）種類の第１の核酸の核酸塩基の数を意味する。
本明細書で使用されるとき、「調節」とは、調節前の分子、機能、または活性の量または質と比較した場合の分子、機能、または活性の量または質の変化を意味する。例えば、調節は、遺伝子発現における増加（刺激若しくは誘導）または減少（阻害若しくは低減）のいずれかの変化を含む。さらなる例として、発現の調節は、調節の不在下における量と比較した、特定のスプライス変異体の絶対量または相対量の変化をもたらすプレｍＲＮＡ処理のスプライス部位選択の変化を含み得る。
本明細書で使用されるとき、「修飾モチーフ」とは、オリゴマー化合物またはその領域における化学修飾のパターンを意味する。モチーフは、オリゴマー化合物のある特定のヌクレオシド及び／またはある特定の結合基での修飾によって定義され得る。
本明細書で使用されるとき、「ヌクレオシドモチーフ」とは、オリゴマー化合物またはその領域におけるヌクレオシド修飾のパターンを意味する。そのようなオリゴマー化合物の結合は、修飾または非修飾であり得る。別途示されない限り、本明細書においてヌクレオシドのみを記載するモチーフは、ヌクレオシドモチーフであるよう意図される。したがって、そのような事例において、結合は限定されない。
本明細書で使用されるとき、「糖モチーフ」とは、オリゴマー化合物またはその領域における糖修飾のパターンを意味する。
本明細書で使用されるとき、「結合モチーフ」とは、オリゴマー化合物またはその領域における結合修飾のパターンを意味する。そのようなオリゴマー化合物のヌクレオシドは、修飾または非修飾であり得る。別途示されない限り、本明細書において結合のみを記載するモチーフは、結合モチーフであるよう意図される。したがって、そのような事例において、ヌクレオシドは限定されない。
本明細書で使用されるとき、「核酸塩基修飾モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドに沿った核酸塩基への修飾のパターンを意味する。別途示されない限り、核酸塩基修飾モチーフは、核酸塩基配列から独立している。
本明細書で使用されるとき、「配列モチーフ」とは、オリゴヌクレオチドまたはその部分に沿って整列した核酸塩基のパターンを意味する。別途示されない限り、配列モチーフは、化学修飾から独立しており、それ故に、化学修飾なしを含む化学修飾の任意の組み合わせを有し得る。
本明細書で使用されるとき、ヌクレオシドまたはある「種類」のヌクレオシドに関する「修飾の種類」とは、ヌクレオシドの化学修飾を意味し、修飾及び非修飾ヌクレオシドを含む。したがって、別途示されない限り、「第１の種類の修飾を有するヌクレオシド」は、非修飾ヌクレオシドであり得る。
本明細書で使用されるとき、「別々に修飾された」とは、修飾の不在も含む、互いに異なる化学修飾または化学置換基を意味する。したがって、例えば、ＭＯＥヌクレオシド及び非修飾ＤＮＡヌクレオシドは、ＤＮＡヌクレオシドが修飾されていなくても「別々に修飾される」。同様に、ＤＮＡ及びＲＮＡは、これら両方ともに天然の非修飾ヌクレオシドであっても「別々に修飾される」。同一であるが、異なる核酸塩基を含むヌクレオシドは、別々に修飾されない。例えば、２’−ＯＭｅ修飾糖及び非修飾アデニン核酸塩基を含むヌクレオシドと２’−ＯＭｅ修飾糖及び非修飾チミン核酸塩基とを含むヌクレオシドは、別々に修飾されない。
本明細書で使用されるとき、「同一の種類の修飾」とは、修飾の不在を含む、互いに同一の修飾を指す。したがって、例えば、２個の非修飾ＤＮＡヌクレオシドは、ＤＮＡヌクレオシドが修飾されていなくても「同一の種類の修飾」を有する。同一の種類の修飾を有するそのようなヌクレオシドは、異なる核酸塩基を含み得る。
本明細書で使用されるとき、「薬学的に許容される担体または希釈剤」とは、動物への投与における使用に好適な任意の物質を意味する。ある特定の実施形態において、薬学的に許容される担体または希釈剤は、滅菌生理食塩水である。ある特定の実施形態において、そのような滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの生理食塩水である。
本明細書で使用されるとき、「置換基（ｓｕｂｓｔｉｔｕｅｎｔ）」及び「置換基（ｓｕｂｓｔｉｔｕｅｎｔ ｇｒｏｕｐ）」とは、指名された親化合物の原子または基を置換する原子または基を意味する。例えば、修飾ヌクレオシドの置換基は、天然ヌクレオシドに見られる原子または基とは異なる任意の原子または基である（例えば、修飾された２’−置換基は、ＨまたはＯＨ以外のヌクレオシドの２’位の任意の原子または基である）。置換基は、保護されても保護されなくても良い。ある特定の実施形態において、本発明の化合物は、親化合物の１つの位置または２つ以上の位置に置換基を有する。置換基は、他の置換基でさらに置換され得、親化合物に直接結合され得るか、またはアルキル基若しくはヒドロカルビル基等の結合基を介して結合され得る。
同様に、本明細書で使用されるとき、化学官能基に関する「置換基」とは、指名された官能基に通常存在する原子または原子群とは異なる原子または原子群を意味する。ある特定の実施形態において、置換基は、官能基の水素原子を置換する（例えば、ある特定の実施形態において、置換メチル基の置換基は、非置換メチル基の水素原子のうちの１個を置換する水素以外の原子または基である）。別途示されない限り、置換基としての使用に適した基としては、ハロゲン、ヒドロキシル、アルキル、アルケニル、アルキニル、アシル（−Ｃ（Ｏ）Ｒａａ）、カルボキシル（−Ｃ（Ｏ）Ｏ−Ｒａａ）、脂肪族基、脂環式基、アルコキシ、置換オキシ（−Ｏ−Ｒａａ）、アリール、アラルキル、複素環式ラジカル、ヘテロアリール、ヘテロアリールアルキル、アミノ（−Ｎ（Ｒｂｂ）（Ｒｃｃ））、イミノ（＝ＮＲｂｂ）、アミド（−Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒｂｂ）（Ｒｃｃ）または−Ｎ（Ｒｂｂ）Ｃ（Ｏ）Ｒａａ）、アジド（−Ｎ３）、ニトロ（−ＮＯ２）、シアノ（−ＣＮ）、カルバミド（−ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒｂｂ）（Ｒｃｃ）または−Ｎ（Ｒｂｂ）Ｃ（Ｏ）ＯＲａａ）、ウレイド（−Ｎ（Ｒｂｂ）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒｂｂ）（Ｒｃｃ））、チオウレイド（−Ｎ（Ｒｂｂ）Ｃ（Ｓ）Ｎ（Ｒｂｂ）（Ｒｃｃ））、グアニジニジル（−Ｎ（Ｒｂｂ）Ｃ（＝ＮＲｂｂ）Ｎ（Ｒｂｂ）（Ｒｃｃ））、アミジニル（−Ｃ（＝ＮＲｂｂ）Ｎ（Ｒｂｂ）（Ｒｃｃ）または−Ｎ（Ｒｂｂ）Ｃ（＝ＮＲｂｂ）（Ｒａａ））、チオール（−ＳＲｂｂ）、スルフィニル（−Ｓ（Ｏ）Ｒｂｂ）、スルホニル（−Ｓ（Ｏ）２Ｒｂｂ）、及びスルホンアミジル（−Ｓ（Ｏ）２Ｎ（Ｒｂｂ）（Ｒｃｃ）または−Ｎ（Ｒｂｂ）Ｓ（Ｏ）２Ｒｂｂ）が挙げられるが、これらに限定されない。式中、各Ｒａａ、Ｒｂｂ、及びＲｃｃは、独立して、Ｈ、任意選択的に連結された化学官能基、またはさらなる置換基であり、好ましいものとしては、アルキル、アルケニル、アルキニル、脂肪族、アルコキシ、アシル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、脂環式、複素環式、及びヘテロアリールアルキルが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書に記載される化合物内の選択された置換基は、再帰的程度まで存在する。
本明細書で使用されるとき、本明細書で使用される「アルキル」とは、最大２４個の炭素原子を含有する飽和直鎖または分岐鎖炭化水素ラジカルを意味する。アルキル基の例としては、メチル、エチル、プロピル、ブチル、イソプロピル、ｎ−ヘキシル、オクチル、デシル、ドデシル等が挙げられるが、これらに限定されない。アルキル基は、典型的には、１〜約２４個の炭素原子、より典型的には、１〜約１２個の炭素原子（Ｃ１−Ｃ１２アルキル）を含むが、１〜約６個の炭素原子がより好ましい。
本明細書で使用されるとき、「アルケニル」とは、最大２４個の炭素原子を含有し、かつ少なくとも１個の炭素−炭素二重結合を有する直鎖または分岐鎖炭化水素鎖ラジカルを意味する。アルケニル基の例として、エテニル、プロペニル、ブテニル、１−メチル−２−ブテン−１−イル、１，３−ブタジエン等のジエン等が挙げられるが、これらに限定されない。アルケニル基は、典型的には、２〜約２４個の炭素原子、より典型的には、２〜約１２個の炭素原子を含むが、２〜約６個の炭素原子がより好ましい。本明細書で使用されるアルケニル基は、１個以上のさらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アルキニル」とは、最大２４個の炭素原子を含有し、かつ少なくとも１個の炭素−炭素三重結合を有する直鎖または分岐鎖炭化水素ラジカルを意味する。アルキニル基の例としては、エチニル、１−プロピニル、１−ブチニル等が挙げられるが、これらに限定されない。アルキニル基は、典型的には、２〜約２４個の炭素原子、より典型的には、２〜約１２個の炭素原子を含むが、２〜約６個の炭素原子がより好ましい。本明細書で使用されるアルキニル基は、１個以上のさらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アシル」とは、有機酸からのヒドロキシル基の除去によって形成されたラジカルを意味し、一般式−Ｃ（Ｏ）−Ｘを有し、式中、Ｘは、典型的には、脂肪族、脂環式、または芳香族である。例として、脂肪族カルボニル、芳香族カルボニル、脂肪族スルホニル、芳香族スルフィニル、脂肪族スルフィニル、芳香族ホスフェート、脂肪族ホスフェート等が挙げられる。本明細書で使用されるアシル基は、さらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「脂環式」とは、環式環系を意味し、この環は、脂肪族である。環系は、１個以上の環を含み得、少なくとも１個の環は、脂肪族である。好ましい脂環式基は、環内に約５〜約９個の炭素原子を有する環を含む。本明細書で使用される脂環式基は、さらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「脂肪族」とは、最大２４個の炭素原子を含有する直鎖または分岐鎖炭化水素ラジカルを意味し、任意の２個の炭素原子の間の飽和は、一重、二重、または三重結合である。脂肪族基は、好ましくは、１〜約２４個の炭素原子、より典型的には、１〜約１２個の炭素原子を含有するが、１〜約６個の炭素原子がより好ましい。脂肪族基の直鎖または分岐鎖は、窒素、酸素、硫黄、及びリンを含む１個以上のヘテロ原子で中断され得る。ヘテロ原子によって中断されるそのような脂肪族基としては、ポリアルコキシ、例えば、ポリアルキレングリコール、ポリアミン、及びポリイミンが挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で使用される脂肪族基は、さらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アルコキシ」とは、アルキル基と酸素原子との間に形成されたラジカルを意味し、この酸素原子を用いて、アルコキシ基を親分子に結合させる。アルコキシ基の例として、メトキシ、エトキシ、プロポキシ、イソプロポキシ、ｎ−ブトキシ、ｓｅｃ−ブトキシ、ｔｅｒｔ−ブトキシ、ｎ−ペントキシ、ネオペントキシ、ｎ−ヘキソキシ等が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で使用されるアルコキシ基は、さらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アミノアルキル」とは、アミノ置換されたＣ１−Ｃ１２アルキルラジカルを意味する。ラジカルのアルキル部分は、親分子と共有結合を形成する。アミノ基は、任意の位置に位置し得、アミノアルキル基は、アルキル及び／またはアミノ部分のさらなる置換基で置換され得る。
本明細書で使用されるとき、「アラルキル」及び「アリールアルキル」とは、Ｃ１−Ｃ１２アルキルラジカルに共有結合で連結されている芳香族基を意味する。結果として生じるアラルキル（またはアリールアルキル）基のアルキルラジカル部分は、親分子と共有結合を形成する。例として、ベンジル、フェネチル等が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書で使用されるアラルキル基は、ラジカル基を形成するアルキル、アリール、またはこれら両方の基に結合されるさらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「アリール」及び「芳香族」とは、１個以上の芳香環を有する単環式または多環式炭素環式環系ラジカルを意味する。アリール基の例として、フェニル、ナフチル、テトラヒドロナフチル、インダニル、イデニル等が挙げられるが、これらに限定されない。好ましいアリール環系は、１個以上の環内に約５〜約２０個の炭素原子を有する。本明細書で使用されるアリール基は、さらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「ハロ」及び「ハロゲン」とは、フッ素、塩素、臭素、及びヨウ素から選択される原子を意味する。
本明細書で使用されるとき、「ヘテロアリール」及び「ヘテロ芳香族」とは、単環式若しくは多環式芳香環、環系、または縮合環系を含むラジカルを意味し、これらの環のうちの少なくとも１つは、芳香族であり、１個以上のヘテロ原子を含む。ヘテロアリールは、縮合環のうちの１個以上がヘテロ原子を含有しない系を含む縮合環系もまた含むよう意図される。ヘテロアリール基は、典型的には、硫黄、窒素、または酸素から選択される１個の環原子を含む。ヘテロアリール基の例として、ピリジニル、ピラジニル、ピリミジニル、ピロリル、ピラゾリル、イミダゾリル、チアゾリル、オキサゾリル、イソオキサゾリル、チアジアゾリル、オキサジアゾリル、チオフェニル、フラニル、キノリニル、イソキノリニル、ベンズイミダゾリル、ベンゾオキサゾリル、キノキサリニル等が挙げられるが、これらに限定されない。ヘテロアリールラジカルは、親分子に直接結合され得るか、または脂肪族基若しくはヘテロ原子等の結合部分を介して結合され得る。本明細書で使用されるヘテロアリール基は、さらなる置換基を任意選択的に含み得る。
本明細書で使用されるとき、「脳室内」または「ＩＣＶ」とは、脳の脳室系への投与を意味する。
本明細書で使用されるとき、「翻訳抑制要素領域は１つのみのｕＯＲＦを含む」とは、まさに１つのｕＯＲＦが翻訳抑制要素領域に存在することを意味する。ある特定の実施形態においては、まさに１つのｕＯＲＦが５’−ＵＴＲに存在する。
本明細書に記載される化合物は、１個以上の原子が指示される元素の非放射性同位体または放射性同位体で置換される、変化形を含む。例えば、水素原子を含む本明細書に記載の化合物は、１Ｈ水素原子の各々についてすべての想定される重水素置換を包含する。本明細書の化合物によって包含される同位体置換としては、１Ｈの代わりに２Ｈまたは３Ｈ、１２Ｃの代わりに１３Ｃまたは１４Ｃ、１４Ｎの代わりに１５Ｎ、１６Ｏの代わりに１７Ｏまたは１８Ｏ、及び３２Ｓの代わりに３３Ｓ、３４Ｓ、３５Ｓ、または３６Ｓ、が挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、非放射性同位体置換は、治療用または研究用ツールとしての使用に有益な新たな特性をオリゴマー化合物に与え得る。ある特定の実施形態において、放射性同位体置換により、化合物を撮像等の研究目的に対して好適なものにし得る。
ある特定の修飾オリゴヌクレオチド
ある特定の実施形態において、本発明は、アンチセンス化合物を提供する。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、修飾オリゴヌクレオチドを含む。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、修飾オリゴヌクレオチド、ならびに任意選択的に１個以上の共役基及び／または末端基を含む。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、修飾オリゴヌクレオチドからなる。ある特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１個以上の化学修飾を含む。そのような化学修飾は、１個以上のヌクレオシドの修飾（糖部分及び／若しくは核酸塩基への修飾を含む）ならびに／または１個以上のヌクレオシド間結合への修飾を含む。
ａ．ある特定の修飾ヌクレオシド
ある特定の実施形態において、少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドを含むか、またはそれからなるアンチセンス化合物が本明細書で提供される。そのような修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分、修飾核酸塩基、または修飾糖部分及び修飾核酸塩基の両方を含む。
ｉ．ある特定の糖部分
ある特定の実施形態において、本発明のアンチセンス化合物は、修飾糖部分を含む１個以上の修飾ヌクレオシドを含む。１個以上の糖修飾ヌクレオシドを含むそのようなアンチセンス化合物は、天然の糖部分を含むヌクレオシドのみを含むアンチセンス化合物と比較して、強化されたヌクレアーゼ安定性または増大した標的核酸との結合親和性等の望ましい特性を有し得る。ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、置換糖部分である。ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、二環式または三環式糖部分である。ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、糖代理物である。そのような糖代理物は、置換糖部分のものに対応する１つ以上の置換を含み得る。
ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、２’位及び／または５’位の置換基を含むがこれらに限定されない、１個以上の置換基を含む置換糖部分である。２’−位に好適な糖置換基の例として、２’−Ｆ、２’−ＯＣＨ３（「ＯＭｅ」または「Ｏ−メチル」）、及び２’−Ｏ（ＣＨ２）２ＯＣＨ３（「ＭＯＥ」）が挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、２’位の糖置換は、アリル、アミノ、アジド、チオ、Ｏ−アリル、Ｏ−Ｃ１−Ｃ１０アルキル、Ｏ−Ｃ１−Ｃ１０置換アルキル；Ｏ−Ｃ１−Ｃ１０アルコキシ；Ｏ−Ｃ１−Ｃ１０置換アルコキシ、ＯＣＦ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２−Ｏ−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、及びＯ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）から選択され、式中、各Ｒｍ及びＲｎは、独立して、Ｈまたは置換若しくは非置換Ｃ１−Ｃ１０アルキルである。５’−位の糖置換基の例として、５’−メチル（ＲまたはＳ）、５’−ビニル、及び５’−メトキシが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態において、修飾糖は、２つ以上の非架橋糖置換基、例えば、２’−Ｆ−５’−メチル糖部分を含む（さらなる２’，５’−ビス置換糖部分及びヌクレオシドについては、例えば、ＰＣＴ国際出願第ＷＯ２００８／１０１１５７号を参照されたい）。
２’−置換糖部分を含むヌクレオシドは、２’−置換ヌクレオシドと称される。ある特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドは、ハロ、アリル、アミノ、アジド、Ｏ−Ｃ１−Ｃ１０アルコキシ；Ｏ−Ｃ１−Ｃ１０置換アルコキシ、ＳＨ、ＣＮ、ＯＣＮ、ＣＦ３、ＯＣＦ３、Ｏ−アルキル、Ｓ−アルキル、Ｎ（Ｒｍ）−アルキル；Ｏ−アルケニル、Ｓ−アルケニル、またはＮ（Ｒｍ）−アルケニル；Ｏ−アルキニル、Ｓ−アルキニル、Ｎ（Ｒｍ）−アルキニル；Ｏ−アルキレニル−Ｏ−アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、Ｏ−アルカリル、Ｏ−アラルキル、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、またはＯ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）から選択される、２’−置換基を含み、式中、各Ｒｍ及びＲｎは、独立して、Ｈ、アミノ保護基、または置換若しくは非置換Ｃ１−Ｃ１０アルキルである。これらの２’−置換基は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ（ＮＯ２）、チオール、チオアルコキシ（Ｓ−アルキル）、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、及びアルキニルから独立して選択される１個以上の置換基でさらに置換され得る。
ある特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドは、Ｆ、ＮＨ２、Ｎ３、ＯＣＦ３、Ｏ−ＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）３ＮＨ２、ＣＨ２−ＣＨ＝ＣＨ２、Ｏ−ＣＨ２−ＣＨ＝ＣＨ２、ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）、Ｏ（ＣＨ２）２Ｏ（ＣＨ２）２Ｎ（ＣＨ３）２、及びＮ−置換アセトアミド（Ｏ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｒｍ）（Ｒｎ）から選択される２’−置換基を含み、式中、Ｒｍ及びＲｎは、独立して、Ｈ、アミノ保護基、または置換若しくは非置換Ｃ１−Ｃ１０アルキルである。
ある特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＦ３、Ｏ−ＣＨ３、ＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２ＳＣＨ３、Ｏ−（ＣＨ２）２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）２、−Ｏ（ＣＨ２）２Ｏ（ＣＨ２）２Ｎ（ＣＨ３）２、及びＯ−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）ＣＨ３から選択される、２’−置換基を含む糖部分を含む。
ある特定の実施形態において、２’−置換ヌクレオシドは、Ｆ、Ｏ−ＣＨ３、及びＯＣＨ２ＣＨ２ＯＣＨ３から選択される２’−置換基を含む糖部分を含む。
ある特定の修飾糖部分は、第２の環を形成して二環式糖部分をもたらす架橋糖置換基を含む。そのようなある特定の実施形態において、二環式糖部分は、４’フラノース環原子と２’フラノース環原子との間に架橋を含む。そのような４’から２’への糖置換基の例として、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−Ｏ−、−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−、または−Ｃ（ＲａＲｂ）−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−；４’−ＣＨ２−２’、４’−（ＣＨ２）２−２’，４’−（ＣＨ２）３−２’、４’−（ＣＨ２）−Ｏ−２’（ＬＮＡ）；４’−（ＣＨ２）−Ｓ−２’；４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’（ＥＮＡ）；４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’（ｃＥｔ）、及び４’−ＣＨ（ＣＨ２ＯＣＨ３）−Ｏ−２’、及びその類似体（例えば、２００８年７月１５日に発行された米国特許第７，３９９，８４５号を参照）；４’−Ｃ（ＣＨ３）（ＣＨ３）−Ｏ−２’、及びその類似体（例えば、２００９年１月８日に公開されたＷＯ２００９／００６４７８を参照）；４’−ＣＨ２−Ｎ（ＯＣＨ３）−２’、及びその類似体（例えば、２００８年１２月１１日に公開されたＷＯ２００８／１５０７２９を参照）；４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（ＣＨ３）−２’（例えば、２００４年９月２日に公開されたＵＳ２００４／０１７１５７０を参照）；４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’及び４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’−（式中、各Ｒは、独立して、Ｈ、保護基、またはＣ１−Ｃ１２アルキルである）；４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’（式中、Ｒは、Ｈ、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、または保護基である）（２００８年９月２３日に発行された米国特許第７，４２７，６７２号を参照）；４’−ＣＨ２−Ｃ（Ｈ）（ＣＨ３）−２’（例えば、Ｃｈａｔｔｏｐａｄｈｙａｙａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００９，７４，１１８−１３４）；ならびに４’−ＣＨ２−Ｃ（＝ＣＨ２）−２’及びその類似体（２００８年１２月８日に公開されたＰＣＴ国際公開出願第ＷＯ２００８／１５４４０１号を参照）が挙げられるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態において、そのような４’から２’への架橋は、独立して、−［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｃ（Ｒｂ）−、−Ｃ（Ｒａ）＝Ｎ−、−Ｃ（＝ＮＲａ）−、−Ｃ（＝Ｏ）−、−Ｃ（＝Ｓ）−、−Ｏ−、−Ｓｉ（Ｒａ）２−、−Ｓ（＝Ｏ）ｘ−、及び−Ｎ（Ｒａ）−から独立して選択される１〜４個の連結した基を含み、
式中、
Ｘは、０、１、または２であり、
Ｎは、１、２、３、または４であり、
各Ｒａ及びＲｂは、独立して、Ｈ、保護基、ヒドロキシル、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アルキル、Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、Ｃ５−Ｃ２０アリール、置換Ｃ５−Ｃ２０アリール、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、Ｃ５−Ｃ７脂環式ラジカル、置換Ｃ５−Ｃ７脂環式ラジカル、ハロゲン、ＯＪ１、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＣＯＯＪ１、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換アシル、ＣＮ、スルホニル（Ｓ（＝Ｏ）２−Ｊ１）、またはスルホキシル（Ｓ（＝Ｏ）−Ｊ１）であり、
各Ｊ１及びＪ２は、独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アルキル、Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルケニル、Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２−Ｃ１２アルキニル、Ｃ５−Ｃ２０アリール、置換Ｃ５−Ｃ２０アリール、アシル（Ｃ（＝Ｏ）−Ｈ）、置換アシル、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、Ｃ１−Ｃ１２アミノアルキル、置換Ｃ１−Ｃ１２アミノアルキル、または保護基である。
二環式糖部分を含むヌクレオシドは、二環式ヌクレオシドまたはＢＮＡと称される。二環式ヌクレオシドとしては、以下に示される、（Ａ）α−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｂ）β−Ｄ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）ＢＮＡ（ロックド核酸またはＬＮＡとも称される）、（Ｃ）エチレンオキシ（４’−（ＣＨ２）２−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｄ）アミノオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−Ｎ（Ｒ）−２’）ＢＮＡ、（Ｅ）オキシアミノ（４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−Ｏ−２’）ＢＮＡ、（Ｆ）メチル（メチレンオキシ）（４’−ＣＨ（ＣＨ３）−Ｏ−２’）ＢＮＡ（拘束エチルまたはｃＥｔとも称される）、（Ｇ）メチレン−チオ（４’−ＣＨ２−Ｓ−２’）ＢＮＡ、（Ｈ）メチレン−アミノ（４’−ＣＨ２−Ｎ（Ｒ）−２’）ＢＮＡ、（Ｉ）メチル炭素環式（４’−ＣＨ２−ＣＨ（ＣＨ３）−２’）ＢＮＡ、（Ｊ）プロピレン炭素環式（４’−（ＣＨ２）３−２’）ＢＮＡ、及び（Ｍ）４’−ＣＨ２−Ｏ−ＣＨ２−２’が挙げられるが、これらに限定されず、
Figure 2017533721
 式中、Ｂｘは、核酸塩基部分であり、Ｒは、独立して、Ｈ、保護基、またはＣ１−Ｃ１２アルキルである。
さらなる二環式糖部分が当該技術分野で既知であり、例えば、Ｓｉｎｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．，１９９８，４，４５５−４５６、Ｋｏｓｈｋｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９８，５４，３６０７−３６３０、Ｗａｈｌｅｓｔｅｄｔ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．２０００，９７，５６３３−５６３８、Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．１９９８，８，２２１９−２２２２，Ｓｉｎｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９８，６３，１００３５−１００３９、Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，１２９（２６）８３６２−８３７９（Ｊｕｌ．４，２００７）、Ｅｌａｙａｄｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｉｎｖｅｎｓ．Ｄｒｕｇｓ，２００１，２，５５８−５６１、Ｂｒａａｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．，２００１，８，１−７、Ｏｒｕｍ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．２００１，３，２３９−２４３、米国特許第７，０５３，２０７号、同第６，２６８，４９０号、同第６，７７０，７４８号、同第６，７９４，４９９号、同第７，０３４，１３３号、同第６，５２５，１９１号、同第６，６７０，４６１号、及び同第７，３９９，８４５号；ＷＯ２００４／１０６３５６、ＷＯ１９９４／１４２２６、ＷＯ２００５／０２１５７０、及びＷＯ２００７／１３４１８１；米国特許公開第２００４／０１７１５７０号、同第２００７／０２８７８３１号、及び同第２００８／００３９６１８号、米国特許出願第１２／１２９，１５４号、同第６０／９８９，５７４号、同第６１／０２６，９９５号、同第６１／０２６，９９８号、同第６１／０５６，５６４号、同第６１／０８６，２３１号、同第６１／０９７，７８７号、及び同第６１／０９９，８４４号、ならびにＰＣＴ国際出願第ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０６４５９１号、同第ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０６６１５４号、及び同第ＰＣＴ／ＵＳ２００８／０６８９２２が知られている。
ある特定の実施形態において、二環式糖部分及びそのような二環式糖部分を組み込むヌクレオシドは、異性体構成によってさらに定義される。例えば、４’−２’メチレン−オキシ架橋を含むヌクレオシドは、α−Ｌ構成またはβ−Ｄ構成であり得る。これまでに、α−Ｌ−メチレンオキシ（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’）二環式ヌクレオシドが、アンチセンス活性を示すアンチセンスオリゴヌクレオチドに組み込まれている（Ｆｒｉｅｄｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００３，２１，６３６５−６３７２）。
ある特定の実施形態において、置換糖部分は、１つ以上の非架橋糖置換基及び１つ以上の架橋糖置換基（例えば、５’−置換及び４’−２’架橋糖）を含む。（２００７年１１月２２日に公開されたＰＣＴ国際出願第ＷＯ２００７／１３４１８１号（ＬＮＡが例えば５’−メチルまたは５’−ビニル基で置換されている）を参照されたい）。
ある特定の実施形態において、修飾糖部分は、糖代理物である。ある特定のそのような実施形態において、天然の糖の酸素原子は、例えば、硫黄、炭素、または窒素原子で置換される。ある特定のそのような実施形態において、そのような修飾糖部分は、上述の架橋及び／または非架橋置換基も含む。例えば、ある特定の糖代理物は、４’−硫黄原子及び置換を２’位（例えば、２００５年６月１６日に公開された米国特許出願第ＵＳ２００５／０１３０９２３号）及び／または５’位に含む。さらなる例として、４’−２’架橋を有する炭素環式二環式ヌクレオシドが記載されている（例えば、Ｆｒｅｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９７，２５（２２），４４２９−４４４３、及びＡｌｂａｅｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００６，７１，７７３１−７７４０を参照されたい）。
ある特定の実施形態において、糖代理物は、５個の原子以外を有する環を含む。例えば、ある特定の実施形態において、糖代理物は、６員テトラヒドロピランを含む。そのようなテトラヒドロピランは、さらに修飾または置換されても良い。そのような修飾テトラヒドロピランを含むヌクレオシドとしては、ヘキシトール核酸（ＨＮＡ）、アニトール核酸（ＡＮＡ）、マニトール核酸（ＭＮＡ）（Ｌｅｕｍａｎｎ，ＣＪ．Ｂｉｏｏｒｇ．＆Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．（２００２）１０：８４１−８５４を参照）、フルオロＨＮＡ（Ｆ−ＨＮＡ）、及び以下の式ＶＩＩを有する化合物が含まれるが、これらに限定されず、
Figure 2017533721
 式中、該少なくとも１つの式ＶＩＩのテトラヒドロピランヌクレオシド類似体の各々について、独立して、
Ｂｘは、核酸塩基部分であり、
Ｔ３及びＴ４は、各々独立して、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物に連結するヌクレオシド間連結基であるか、またはＴ３及びＴ４のうちの一方が、テトラヒドロピランヌクレオシド類似体をアンチセンス化合物に連結するヌクレオシド間連結基であり、かつＴ３及びＴ４のうちの他方が、Ｈ、ヒドロキシル保護基、連結された共役基、または５’末端基若しくは３’末端基であり、
ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７は、各々独立して、Ｈ、Ｃ１−Ｃ６アルキル、置換Ｃ１−Ｃ６アルキル、Ｃ２−Ｃ６アルケニル、置換Ｃ２−Ｃ６アルケニル、Ｃ２−Ｃ６アルキニル、または置換Ｃ２−Ｃ６アルキニルであり、かつ
Ｒ１及びＲ２の各々は、水素、ハロゲン、置換若しくは非置換アルコキシ、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊ１、ＯＣ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、ＮＪ３Ｃ（＝Ｘ）ＮＪ１Ｊ２、及びＣＮの中から独立して選択され、式中、Ｘは、Ｏ、Ｓ、またはＮＪ１であり、各Ｊ１、Ｊ２、及びＪ３は、独立して、ＨまたはＣ１−Ｃ６アルキルである。
ある特定の実施形態において、式ＶＩＩの修飾ＴＨＰヌクレオシドが提供され、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７は、各々、Ｈである。ある特定の実施形態において、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７のうちの少なくとも１つは、Ｈ以外のものである。ある特定の実施形態において、ｑ１、ｑ２、ｑ３、ｑ４、ｑ５、ｑ６、及びｑ７のうちの少なくとも１つは、メチルである。ある特定の実施形態において、Ｒ１及びＲ２の一方がＦである式ＶＩＩのＴＨＰヌクレオシドが提供される。ある特定の実施形態において、Ｒ１はフルオロであり、Ｒ２はＨであり、Ｒ１はメトキシであり、Ｒ２はＨであり、Ｒ１はメトキシエトキシであり、Ｒ２はＨである。
ヌクレオシドの修飾に使用することができる多くの他の二環式及び三環式糖ならびに糖代理物環系が、当該技術分野で既知である（例えば、総説論文：Ｌｅｕｍａｎｎ，Ｊ．Ｃ，Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ＆Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００２，１０，８４１−８５４を参照されたい）。
ある特定の実施形態において、糖代理物は、５つ超の原子及び１つ超のヘテロ原子を有する環を含む。例えば、モルホリノ糖部分を含むヌクレオシド、及びオリゴマー化合物におけるそれらの使用が報告されている（例えば、Ｂｒａａｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００２，４１，４５０３−４５１０、及びＵ．Ｓ．特許第５，６９８，６８５号、同第５，１６６，３１５号、同第５，１８５，４４４号、同第５，０３４，５０６号を参照）。本明細書で使用されるとき、「モルホリノ」という用語は、以下の構造を有する糖代理物を意味する。
Figure 2017533721
ある特定の実施形態において、モルホリノは、例えば、上記のモルホリノ構造に様々な置換基を付加するか、または上記のモルホリノ構造の様々な置換基を改変することによって修飾され得る。そのような糖代理物は、本明細書において「修飾」モルホリノと称される。
２’−Ｆ−５’−メチル置換ヌクレオシド（他の開示されている５’、２’−ビス置換ヌクレオシドについては、２００８年８月２１日に公開されたＰＣＴ国際出願第ＷＯ２００８／１０１１５７号を参照）、ならびにリボシル環酸素原子のＳとの置換及び２’−位でのさらなる置換（２００５年６月１６日に公開された米国特許出願第ＵＳ２００５−０１３０９２３号を参照）、または代替として二環式核酸の５’−置換（４’−ＣＨ２−Ｏ−２’二環式ヌクレオシドが５’位で５’−メチルまたは５’−ビニル基でさらに置換される、２００７年１１月２２日に公開されたＰＣＴ国際出願第ＷＯ２００７／１３４１８１号を参照）等であるが、これらに限定されない修飾の組み合わせも提供される。炭素環式二環式ヌクレオシドのオリゴマー化及び生化学的研究に加えて、それらの合成及び調製も記載されている（例えば、Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．２００７，１２９（２６），８３６２−８３７９を参照）。
ｉｉ．ある特定の修飾核酸塩基
ある特定の実施形態において、本発明のヌクレオシドは、１個以上の非修飾核酸塩基を含む。ある特定の実施形態において、本発明のヌクレオシドは、１個以上の修飾核酸塩基を含む。
ある特定の実施形態において、修飾核酸塩基は、本明細書で定義される普遍的塩基、疎水性塩基、非特異的（ｐｒｏｍｉｓｃｕｏｕｓ）塩基、サイズ拡大塩基、及びフッ素化塩基から選択される。５−置換ピリミジン、６−アザピリミジン、ならびにＮ−２、Ｎ−６、及びＯ−６置換プリンには、本明細書で定義される、２−アミノプロピルアデニン、５−プロピニルウラシル；５−プロピニルシトシン；５−ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２−アミノアデニン、６−メチルならびにアデニン及びグアニンの他のアルキル誘導体、２−プロピルならびにアデニン及びグアニンの他のアルキル誘導体、２−チオウラシル、２−チオチミン及び２−チオシトシン、５−ハロウラシル及びシトシン、５−プロピニル（−Ｃ≡Ｃ−ＣＨ３）ウラシルならびにシトシン及びピリミジン塩基の他のアルキニル誘導体、６−アゾウラシル、シトシン及びチミン、５−ウラシル（シュードウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、８−アミノ、８−チオール、８−チオアルキル、８−ヒドロキシルならびに他の８−置換アデニン及びグアニン、５−ハロ、特に、５−ブロモ、５−トリフルオロメチルならびに他の５−置換ウラシル及びシトシン、７−メチルグアニン及び７−メチルアデニン、２−Ｆ−アデニン、２−アミノ−アデニン、８−アザグアニン及び８−アザアデニン、７−デアザグアニン及び７−デアザアデニン、３−デアザグアニン及び３−デアザアデニン、普遍的塩基、疎水性塩基、非特異的（ｐｒｏｍｉｓｃｕｏｕｓ）塩基、サイズ拡大塩基、ならびにフッ素化塩基が含まれる。さらに、修飾核酸塩基としては、三環式ピリミジン、例えば、フェノキサジンシチジン（［５，４−ｂ］［１，４］ベンゾオキサジン−２（３Ｈ）−オン）、フェノチアジンシチジン（１Ｈ−ピリミド［５，４−ｂ］［１，４］ベンゾチアジン−２（３Ｈ）−オン）、Ｇ−クランプ、例えば、置換フェノキサジンシチジン（例えば、９−（２−アミノエトキシ）−Ｈ−ピリミド［５，４−ｂ］［１，４］ベンゾオキサジン−２（３Ｈ）−オン）、カルバゾールシチジン（２Ｈ−ピリミド［４，５−ｂ］インドール−２−オン）、ピリドインドールシチジン（Ｈ−ピリド［３’，２’：４，５］ピロロ［２，３−ｄ］ピリミジン−２−オン）が挙げられる。修飾核酸塩基としてはまた、プリンまたはピリミジン塩基が、他の複素環、例えば、７−デアザ−アデニン、７−デアザグアノシン、２−アミノピリジン、及び２−ピリドンに置換されるものが挙げられる。さらなる核酸塩基としては、米国特許第３，６８７，８０８号に開示されているもの、Ｔｈｅ Ｃｏｎｃｉｓｅ Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ Ｏｆ Ｐｏｌｙｍｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ａｎｄ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｋｒｏｓｃｈｗｉｔｚ，Ｊ．Ｉ．，Ｅｄ．Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，１９９０，８５８−８５９に開示されているもの、Ｅｎｇｌｉｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ Ｃｈｅｍｉｅ，Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９９１，３０，６１３によって開示されているもの、及びＳａｎｇｈｖｉ，Ｙ．Ｓ．，Ｃｈａｐｔｅｒ １５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｃｒｏｏｋｅ，Ｓ．Ｔ．ａｎｄ Ｌｅｂｌｅｕ，Ｂ．，Ｅｄｓ．ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，１９９３，２７３−２８８によって開示されているものが挙げられる。
上で述べた修飾核酸塩基及び他の修飾核酸塩基のいくつかの調製を教示する代表的な米国特許としては、Ｕ．Ｓ．３，６８７，８０８、４，８４５，２０５、５，１３０，３０２、５，１３４，０６６、５，１７５，２７３、５，３６７，０６６、５，４３２，２７２、５，４５７，１８７、５，４５９，２５５、５，４８４，９０８、５，５０２，１７７、５，５２５，７１１、５，５５２，５４０、５，５８７，４６９、５，５９４，１２１、５，５９６，０９１、５，６１４，６１７、５，６４５，９８５、５，６８１，９４１、５，７５０，６９２、５，７６３，５８８、５，８３０，６５３、及び６，００５，０９６が挙げられるがこれらに限定されず、これらのいくつかは、本出願と共同所有されており、これらの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
ｂ．ある特定のヌクレオシド間結合
ある特定の実施形態において、ヌクレオシドは、任意のヌクレオシド間結合を使用して一緒に連結されて、オリゴヌクレオチドを形成し得る。ヌクレオシド間結合基の２つの主なクラスは、リン原子の存在または不在によって定義される。代表的なリン含有ヌクレオシド間結合としては、ホスホジエステル（Ｐ＝Ｏ）、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホラミデート、及びホスホロチオエート（Ｐ＝Ｓ）が挙げられるが、これらに限定されない。代表的な非リン含有ヌクレオシド間結合基としては、メチレンメチルイミノ（−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−ＣＨ２−）、チオジエステル（−Ｏ−Ｃ（Ｏ）−Ｓ−）、チオノカルバメート（−Ｏ−Ｃ（Ｏ）（ＮＨ）−Ｓ−）、シロキサン（−Ｏ−Ｓｉ（Ｈ）２−Ｏ−）、及びＮ，Ｎ’−ジメチルヒドラジン（−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｎ（ＣＨ３）−）を含むが、これらに限定されない。修飾結合は、天然ホスホジエステル結合と比較して、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を変化させる、典型的には増加させるために使用することができる。ある特定の実施形態において、キラル原子を有するヌクレオシド間結合は、ラセミ混合物として、または別個のエナンチオマーとして調製され得る。代表的なキラル結合は、アルキルホスホネート及びホスホロチオエートを含むが、これらに限定されない。リン含有及び非リン含有ヌクレオシド間結合の調製方法は、当業者に周知である。
本明細書に記載されるオリゴヌクレオチドは、１つ以上の不斉中心を含有し、したがって、絶対立体化学の観点から、（Ｒ）若しくは（Ｓ）、糖アノマーの場合等にはα若しくはβ、またはアミノ酸の場合等には（Ｄ）若しくは（Ｌ）と定義され得る、エナンチオマー、ジアステレオマー、及び他の立体異性体構成を生じる。すべてのそのような可能な異性体、ならびにそれらのラセミ体及び光学的に純粋な形態が、本明細書において提供されるアンチセンス化合物に含まれる。
中性ヌクレオシド間結合は、限定されることなく、ホスホトリエステル、メチルホスホン酸、ＭＭＩ（３’−ＣＨ２−Ｎ（ＣＨ３）−Ｏ−５’）、アミド−３（３’−ＣＨ２−Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）−５’）、アミド−４（３’−ＣＨ２−Ｎ（Ｈ）−Ｃ（＝Ｏ）−５’）、ホルムアセタール（３’−Ｏ−ＣＨ２−Ｏ−５’）、及びチオホルムアセタール（３’−Ｓ−ＣＨ２−Ｏ−５’）を含む。さらなる中性ヌクレオシド間結合は、シロキサン（ジアルキルシロキサン）、カルボキシレートエステル、カルボキサミド、スルフィド、スルホン酸エステル、及びアミドを含む非イオン性結合を含む（例えば、Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ ｉｎ Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ；Ｙ．Ｓ．Ｓａｎｇｈｖｉ ａｎｄ Ｐ．Ｄ．Ｃｏｏｋ，Ｅｄｓ．，ＡＣＳ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ Ｓｅｒｉｅｓ ５８０；Ｃｈａｐｔｅｒｓ ３ ａｎｄ ４，４０−６５を参照）。さらなる中性ヌクレオシド間結合は、混合されたＮ、Ｏ、Ｓ、及びＣＨ２構成成分を含む非イオン性結合を含む。
ｃ．ある特定のモチーフ
ある特定の実施形態において、本発明は、修飾オリゴククレオチド（ｏｌｉｇｏｃｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ）を提供する。ある特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１個以上の修飾糖を含む。ある特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１個以上の修飾核酸塩基を含む。ある特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１個以上の修飾ヌクレオシド間結合を含む。ある特定の実施形態において、修飾（糖修飾、核酸塩基修飾、及び／または結合修飾）は、パターンまたはモチーフを定義する。ある特定の実施形態において、糖部分、ヌクレオシド間結合、及び核酸塩基の化学修飾のパターンは、互いに独立している。したがって、修飾オリゴヌクレオチドは、その糖修飾モチーフ、ヌクレオシド間結合モチーフ、及び／または核酸塩基修飾モチーフ（本明細書で使用されるとき、核酸塩基修飾モチーフは、核酸塩基の配列から独立している核酸塩基への化学修飾を説明する）によって説明され得る。
ある特定の実施形態においては、本発明の修飾オリゴヌクレオチドのいずれの糖部分も修飾される。ある特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、１つ以上の非修飾糖部分を含む。
ｄ．ある特定の全長
ある特定の実施形態において、本発明は、様々な範囲の長さのうちのいずれかの修飾オリゴヌクレオチドを提供する。ある特定の実施形態において、本発明は、Ｘ〜Ｙ個の結合ヌクレオシドからなるオリゴマー化合物またはオリゴヌクレオチドを提供し、ここで、Ｘは、その範囲の最小数のヌクレオシドを表し、Ｙは、その範囲の最大数のヌクレオシドを表す。ある特定のそのような実施形態において、Ｘ及びＹは、各々独立して、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、及び５０から選択されるが、但し、ＸがＹ以下であることを条件とする。例えば、ある特定の実施形態において、本発明は、８〜９、８〜１０、８〜１１、８〜１２、８〜１３、８〜１４、８〜１５、８〜１６、８〜１７、８〜１８、８〜１９、８〜２０、８〜２１、８〜２２、８〜２３、８〜２４、８〜２５、８〜２６、８〜２７、８〜２８、８〜２９、８〜３０、９〜１０、９〜１１、９〜１２、９〜１３、９〜１４、９〜１５、９〜１６、９〜１７、９〜１８、９〜１９、９〜２０、９〜２１、９〜２２、９〜２３、９〜２４、９〜２５、９〜２６、９〜２７、９〜２８、９〜２９、９〜３０、１０〜１１、１０〜１２、１０〜１３、１０〜１４、１０〜１５、１０〜１６、１０〜１７、１０〜１８、１０〜１９、１０〜２０、１０〜２１、１０〜２２、１０〜２３、１０〜２４、１０〜２５、１０〜２６、１０〜２７、１０〜２８、１０〜２９、１０〜３０、１１〜１２、１１〜１３、１１〜１４、１１〜１５、１１〜１６、１１〜１７、１１〜１８、１１〜１９、１１〜２０、１１〜２１、１１〜２２、１１〜２３、１１〜２４、１１〜２５、１１〜２６、１１〜２７、１１〜２８、１１〜２９、１１〜３０、１２〜１３、１２〜１４、１２〜１５、１２〜１６、１２〜１７、１２〜１８、１２〜１９、１２〜２０、１２〜２１、１２〜２２、１２〜２３、１２〜２４、１２〜２５、１２〜２６、１２〜２７、１２〜２８、１２〜２９、１２〜３０、１３〜１４、１３〜１５、１３〜１６、１３〜１７、１３〜１８、１３〜１９、１３〜２０、１３〜２１、１３〜２２、１３〜２３、１３〜２４、１３〜２５、１３〜２６、１３〜２７、１３〜２８、１３〜２９、１３〜３０、１４〜１５、１４〜１６、１４〜１７、１４〜１８、１４〜１９、１４〜２０、１４〜２１、１４〜２２、１４〜２３、１４〜２４、１４〜２５、１４〜２６、１４〜２７、１４〜２８、１４〜２９、１４〜３０、１５〜１６、１５〜１７、１５〜１８、１５〜１９、１５〜２０、１５〜２１、１５〜２２、１５〜２３、１５〜２４、１５〜２５、１５〜２６、１５〜２７、１５〜２８、１５〜２９、１５〜３０、１６〜１７、１６〜１８、１６〜１９、１６〜２０、１６〜２１、１６〜２２、１６〜２３、１６〜２４、１６〜２５、１６〜２６、１６〜２７、１６〜２８、１６〜２９、１６〜３０、１７〜１８、１７〜１９、１７〜２０、１７〜２１、１７〜２２、１７〜２３、１７〜２４、１７〜２５、１７〜２６、１７〜２７、１７〜２８、１７〜２９、１７〜３０、１８〜１９、１８〜２０、１８〜２１、１８〜２２、１８〜２３、１８〜２４、１８〜２５、１８〜２６、１８〜２７、１８〜２８、１８〜２９、１８〜３０、１９〜２０、１９〜２１、１９〜２２、１９〜２３、１９〜２４、１９〜２５、１９〜２６、１９〜２９、１９〜２８、１９〜２９、１９〜３０、２０〜２１、２０〜２２、２０〜２３、２０〜２４、２０〜２５、２０〜２６、２０〜２７、２０〜２８、２０〜２９、２０〜３０、２１〜２２、２１〜２３、２１〜２４、２１〜２５、２１〜２６、２１〜２７、２１〜２８、２１〜２９、２１〜３０、２２〜２３、２２〜２４、２２〜２５、２２〜２６、２２〜２７、２２〜２８、２２〜２９、２２〜３０、２３〜２４、２３〜２５、２３〜２６、２３〜２７、２３〜２８、２３〜２９、２３〜３０、２４〜２５、２４〜２６、２４〜２７、２４〜２８、２４〜２９、２４〜３０、２５〜２６、２５〜２７、２５〜２８、２５〜２９、２５〜３０、２６〜２７、２６〜２８、２６〜２９、２６〜３０、２７〜２８、２７〜２９、２７〜３０、２８〜２９、２８〜３０、または２９〜３０個の結合ヌクレオシドからなるオリゴヌクレオチドを含む、修飾オリゴヌクレオチドを提供する。ある範囲またはある特定の数にかかわらず、オリゴマー化合物またはオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの数が限定される実施形態において、オリゴマー化合物またはオリゴヌクレオチドは、それでもやはり、さらなる他の置換基をさらに含み得る。例えば、８〜３０個のヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、３１個のヌクレオシドを有するオリゴヌクレオチドを除外するが、別途示されない限り、そのようなオリゴヌクレオチドは、例えば、１個以上の共役体、末端基、または他の置換基をさらに含んでも良い。ある特定の実施形態において、修飾オリゴヌクレオチドは、上記の長さのいずれかを有する。
さらに、オリゴヌクレオチドが全長範囲及び特定の長さを有する領域によって説明され、かつそれらの領域の特定の長さの合計が全長範囲の上限未満である場合、オリゴヌクレオチドは、特定の領域の長さを超えてさらなるヌクレオシドを有し得るが、但し、ヌクレオシドの総数が全長範囲の上限を超えないことを条件とする。
ｅ．ある特定のオリゴヌクレオチド
ある特定の実施形態において、本発明のオリゴヌクレオチドは、その修飾モチーフ及び全長によって特徴付けられる。ある特定の実施形態において、そのようなパラメータは各々、互いに独立している。
Ｉ．ある特定のオリゴマー化合物
ある特定の実施形態において、本発明は、オリゴヌクレオチド（修飾または非修飾）、ならびに任意選択的に１個以上の共役基及び／または末端基からなるオリゴマー化合物を提供する。共役基は、１個以上の共役部分、及び共役部分をオリゴヌクレオチドに結合させる共役リンカーからなる。共役基は、オリゴヌクレオチドのいずれか若しくは両方の末端及び／または任意の内部位置に結合しても良い。ある特定の実施形態において、共役基は、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドの２’位に結合する。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドのいずれかまたは両方の末端に結合する共役基は、末端基である。そのようなある特定の実施形態において、共役基または末端基は、オリゴヌクレオチドの３’及び／または５’末端に結合する。そのようなある特定の実施形態において、共役基（または末端基）は、オリゴヌクレオチドの３’末端に結合する。ある特定の実施形態において、共役基は、オリゴヌクレオチドの３’末端付近に結合する。ある特定の実施形態において、共役基（または末端基）は、オリゴヌクレオチドの５’末端に結合する。ある特定の実施形態において、共役基は、オリゴヌクレオチドの５’末端付近に結合する。
末端基の例は、限定されないが、共役基、キャッピング基、リン酸部分、保護基、脱塩基ヌクレオシド、修飾または非修飾ヌクレオシド、及び独立して修飾されているかまたは非修飾の２つ以上のヌクレオシドを含む。
ある特定の実施形態において、５’−末端基が５’−末端安定化ホスフェートを含むアンチセンス化合物が提供される。「５’−末端安定化ホスフェート」は、５’−ホスフェートと比較してヌクレアーゼ安定性を増加させる１つ以上の修飾を有する５’−末端ホスフェート基である。
ある特定の実施形態において、５’−末端基が式ＩＩｅ：
Figure 2017533721
 を有するアンチセンス化合物が提供され、式中、
Ｂｘは、ウラシル、チミン、シトシン、５−メチルシトシン、アデニン、またはグアニンであり、
Ｔ２は、式ＩＩｅの化合物をオリゴマー化合物に結合させるホスホロチオエートヌクレオシド間結合基であり、
Ｇは、ハロゲン、ＯＣＨ３、ＯＣＦ３、ＯＣＨ２ＣＨ３、ＯＣＨ２ＣＦ３、ＯＣＨ２−ＣＨ＝ＣＨ２、Ｏ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３、Ｏ（ＣＨ２）２−Ｏ（ＣＨ２）２−Ｎ（ＣＨ３）２、ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）ＣＨ３、ＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）−Ｎ（Ｈ）−（ＣＨ２）２−Ｎ（ＣＨ３）２、またはＯＣＨ２−Ｎ（Ｈ）−Ｃ（＝ＮＨ）ＮＨ２である。
ある特定の実施形態において、該５’−末端化合物が式ＩＩｅを有するアンチセンス化合物が提供され、式中、Ｇは、Ｆ、ＯＣＨ３、またはＯ（ＣＨ２）２−ＯＣＨ３である。
ある特定の実施形態において、５’−末端基は、上の式ＩＩｅによって表されるビニルホスホネートを含む５’−末端安定化ホスフェートである。
ｆ．ある特定の共役基
ある特定の実施形態において、本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物は、１つ以上の共役基の共有結合によって修飾される。概して、共役基は、限定されないが、薬物動力学、薬物動態、安定性、結合、吸収、細胞分布、細胞取り込み、電荷、及びクリアランスを含む、結合したオリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物の１つ以上の特性を改変する。本明細書で使用されるとき、「共役基」とは、オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物に結合される原子群を含むラジカル基を意味する。概して、共役基は、薬力学的特性、薬物動態学的特性、結合特性、吸収特性、細胞分布特性、細胞取り込み特性、電荷特性、及び／またはクリアランス特性を含むが、これらに限定されない、それらが結合する化合物の１つ以上の特性を修飾する。共役基は、化学分野で常用され、共役基をオリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物に共有結合させる共役リンカーを含むことができる。ある特定の実施形態において、共役基は、共役基をオリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物に共有結合させる切断可能な部分を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、共役基をオリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物に共有結合させる共役リンカー及び切断可能な部分を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、一般式：
Figure 2017533721
 を有し、式中、ｎは、１〜約３であり、ｎが１である場合ｍは０であり、またはｎが２または３である場合ｍは１であり、ｊは１または０であり、ｋは１または０であり、ｊとｋとの合計は少なくとも１である。
ある特定の実施形態において、ｎは１であり、ｊは１であり、ｋは０である。ある特定の実施形態において、ｎは１であり、ｊは０であり、ｋは１である。ある特定の実施形態において、ｎは１であり、ｊは１であり、ｋは１である。ある特定の実施形態において、ｎは２であり、ｊは１であり、ｋは０である。ある特定の実施形態において、ｎは２であり、ｊは０であり、ｋは１である。ある特定の実施形態において、ｎは２であり、ｊは１であり、ｋは１である。ある特定の実施形態において、ｎは３であり、ｊは１であり、ｋは０である。ある特定の実施形態において、ｎは３であり、ｊは０であり、ｋは１である。ある特定の実施形態において、ｎは３であり、ｊは１であり、ｋは１である。
共役基は、本明細書においてラジカルとして示され、オリゴヌクレオチドなどのオリゴマー化合物への共有結合を形成するための結合を提供する。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物上の結合点は、３’−末端ヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドにある。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物の結合点は、３’末端ヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドの３’−ヒドロキシル基の３’−酸素原子である。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物上の結合点は、５’−末端ヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドにある。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物の結合点は、５’末端ヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドの５’−ヒドロキシル基の５’−酸素原子である。ある特定の実施形態において、オリゴマー化合物の結合点は、ヌクレオシド、修飾ヌクレオシド、またはヌクレオシド間結合上のいずれかの反応部位にある。
本明細書で使用されるとき、「切断可能な部分」及び「切断可能な結合」とは、ある特定の生理学的条件下で分割または切断され得る切断可能な原子結合または原子群を意味する。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、切断可能な結合である。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、切断可能な結合を含む。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、原子群である。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、リソソーム等の細胞または細胞内コンパートメント内で選択的に切断される。ある特定の実施形態において、開裂可能な部分は、ヌクレアーゼ等の内在性酵素によって選択的に切断される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、１つ、２つ、３つ、４つ、または４つ以上の切断可能な結合を有する原子群を含む。
ある特定の実施形態において、共役基は、切断可能な部分を含む。ある特定のそのような実施形態において、切断可能な部分は、オリゴマー化合物を共役リンカーに共有結合させる。ある特定のそのような実施形態において、切断可能な部分は、オリゴマー化合物を細胞標的部分に共有結合させる。
ある特定の実施形態において、切断可能な結合は、アミド、ポリアミド、エステル、エーテル、ホスホジエステルの一方若しくは両方のエステル、リン酸エステル、カルバメート、ジスルフィド、またはペプチドの中から選択される。ある特定の実施形態において、切断可能な結合は、ホスホジエステルのエステルの１つである。ある特定の実施形態において、切断可能な結合は、ホスホジエステルのエステルの１つまたは両方である。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、オリゴマー化合物と共役基の残りとの間のホスホジエステル結合である。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、オリゴマー化合物と共役基の残りとの間に位置するホスホジエステル結合を含む。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスフェートまたはホスホジエステルを含む。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合またはホスホロチオエート結合のいずれかによって共役リンカーに結合される。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によって共役リンカーに結合される。ある特定の実施形態において、共役基は、切断可能な部分を含まない。
ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、切断可能なヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、ヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドは、プリン、置換プリン、ピリミジン、または置換ピリミジンから選択される任意選択的に保護された複素環塩基を含む。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ウラシル、チミン、シトシン、４−Ｎ−ベンゾイルシトシン、５−メチルシトシン、４−Ｎ−ベンゾイル−５−メチルシトシン、アデニン、６−Ｎ−ベンゾイルアデニン、グアニン及び２−Ｎ−イソブチリルグアニンから選択されるヌクレオシドである。
ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によってオリゴマー化合物の３’または５’−末端ヌクレオシドに結合され、かつホスホジエステルまたはホスホロチオエート結合によって共役基の残りに共有結合される、２’−デオキシヌクレオシドである。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によってオリゴマー化合物の３’または５’−末端ヌクレオシドに結合され、かつホスホジエステルまたはホスホロチオエート結合によって共役基の残りに共有結合される、２’−デオキシアデノシンである。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によって３’−末端ヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドの３’−ヒドロキシル基の３’−酸素原子に結合される２’−デオキシアデノシンである。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、ホスホジエステル結合によって５’−末端ヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドの５’−ヒドロキシル基の５’−酸素原子に結合される２’−デオキシアデノシンである。ある特定の実施形態において、切断可能な部分は、オリゴマー化合物のヌクレオシドまたは修飾ヌクレオシドの２’位に結合される。
本明細書で使用されるとき、共役基の文脈において「共役リンカー」とは、細胞標的部分を、直接的にまたは切断可能な部分を介してオリゴマー化合物に共有結合させる任意の原子または原子群を含む共役基の一部分を意味する。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテル（−Ｓ−）、及びヒドロキシルアミノ（−Ｏ−Ｎ（Ｈ）−）から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、及びエーテル基から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、アルキル基及びアミド基から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、アルキル基及びエーテル基から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、少なくとも１つのリン結合基を含む。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、少なくとも１つのホスホジエステル基を含む。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、少なくとも１つの中性結合基を含む。
ある特定の実施形態において、共役リンカーは、オリゴマー化合物に共有結合する。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、オリゴマー化合物及び分岐基に共有結合する。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、オリゴマー化合物及びテザーリガンドに共有結合する。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、切断可能な部分に共有結合する。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、切断可能な部分及び分岐基に共有結合する。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、切断可能な部分及びテザーリガンドに共有結合する。ある特定の実施形態において、共役リンカーは、１つ以上の切断可能な結合を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、共役リンカーを含まない。
本明細書で使用されるとき、「分岐基」とは、２つ以上のテザーリガンド及び共役基の残りとの共有結合を形成することができる少なくとも３つの位置を有する原子群を意味する。概して、分岐基は、共役リンカー及び／または切断可能な部分を介してテザーリガンドをオリゴマー化合物に接続するための複数の反応部位を提供する。ある特定の実施形態において、分岐基は、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテル、及びヒドロキシルアミノ基から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、分岐基は、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテル、及びヒドロキシルアミノ基から選択される基を含む分岐脂肪族基を含む。そのようなある特定の実施形態において、分岐脂肪族基は、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、及びエーテル基から選択される基を含む。そのようなある特定の実施形態において、分岐脂肪族基は、アルキル、アミノ、及びエーテル基から選択される基を含む。そのようなある特定の実施形態において、分岐脂肪族基は、アルキル及びエーテル基から選択される基を含む。ある特定の実施形態において、分岐基は、単環式または多環式環系を含む。
ある特定の実施形態において、分岐基は、共役リンカーに共有結合する。ある特定の実施形態において、分岐基は、切断可能な部分に共有結合する。ある特定の実施形態において、分岐基は、共役リンカー、及びテザーリガンドの各々に共有結合する。ある特定の実施形態において、分岐基は、１個以上の切断可能な結合を含む。ある特定の実施形態において、共役基は、分岐基を含まない。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される共役基は、少なくとも１つのテザーリガンドを有する細胞標的部分を含む。ある特定の実施形態において、細胞標的部分は、分岐基に共有結合した２つのテザーリガンドを含む。ある特定の実施形態において、細胞標的部分は、分岐基に共有結合した３つのテザーリガンドを含む。
本明細書で使用されるとき、「テザー」とは、リガンドを共役基の残りに接続する原子群を意味する。ある特定の実施形態において、各テザーは、アルキル、置換アルキル、エーテル、チオエーテル、ジスルフィド、アミノ、オキソ、アミド、ホスホジエステル、及びポリエチレングリコール基から選択される１つ以上の基を任意の組み合わせで含む直鎖状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、アルキル、エーテル、チオエーテル、ジスルフィド、アミノ、オキソ、アミド、及びポリエチレングリコール基から選択される１つ以上の基を任意の組み合わせで含む直鎖状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、アルキル、置換アルキル、ホスホジエステル、エーテル、及びアミノ、オキソ、アミド基から選択される１つ以上の基を任意の組み合わせで含む直鎖状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、アルキル、エーテル、及びアミノ、オキソ、アミド基から選択される１つ以上の基を任意の組み合わせで含む直鎖状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、アルキル、アミノ、及びオキソ基から選択される１つ以上の基を任意の組み合わせで含む直鎖状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、アルキル及びオキソ基から選択される１つ以上の基を任意の組み合わせで含む直鎖状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、アルキル及びホスホジエステルから選択される１つ以上の基を任意の組み合わせで含む直鎖状脂肪族基である。ある特定の実施形態において、各テザーは、少なくとも１つのリン結合基または中性結合基を含む。
ある特定の実施形態において、テザーは、１つ以上の切断可能な結合を含む。ある特定の実施形態において、各テザーリガンドは、分岐基に結合する。ある特定の実施形態において、各テザーリガンドは、アミド基を介して分岐基に結合する。ある特定の実施形態において、各テザーリガンドは、エーテル基を介して分岐基に結合する。ある特定の実施形態において、各テザーリガンドは、リン結合基または中性結合基を介して分岐基に結合する。ある特定の実施形態において、各テザーリガンドは、ホスホジエステル基を介して分岐基に結合する。ある特定の実施形態において、各テザーは、アミド基またはエーテル基のいずれかを介してリガンドに結合する。ある特定の実施形態において、各テザーは、エーテル基を介してリガンドに結合する。
ある特定の実施形態において、各テザーは、リガンドと分岐基との間に約８〜約２０原子長の鎖を含む。ある特定の実施形態において、各テザーは、リガンドと分岐基との間に約１０〜約１８原子長の鎖を含む。ある特定の実施形態において、各テザーは、約１３原子長の鎖を含む。
ある特定の実施形態において、本開示は、各リガンドがテザーを介して共役基の残りに共有結合されるリガンドを提供する。ある特定の実施形態において、各リガンドは、標的細胞において少なくとも１種類の受容体に対する親和性を有するように選択される。ある特定の実施形態において、哺乳動物肝臓細胞の表面において少なくとも１種類の受容体に対する親和性を有するリガンドが選択される。ある特定の実施形態において、肝臓のアシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰ−Ｒ）に対する親和性を有するリガンドが選択される。ある特定の実施形態において、各リガンドは、炭水化物である。ある特定の実施形態において、各リガンドは、ガラクトース、Ｎ−アセチルガラクトースアミン、マンノース、グルコース、グルコサミン、及びフコースから独立して選択される。ある特定の実施形態において、各リガンドは、Ｎ−アセチルガラクトースアミン（ＧａｌＮＡｃ）である。ある特定の実施形態において、標的部分は、１〜３個のリガンドを含む。ある特定の実施形態において、標的部分は、３個のリガンドを含む。ある特定の実施形態において、標的部分は、２個のリガンドを含む。ある特定の実施形態において、標的部分は、１個のリガンドを含む。ある特定の実施形態において、標的部分は、３個のＮ−アセチルガラクトースアミンリガンドを含む。ある特定の実施形態において、標的部分は、２個のＮ−アセチルガラクトースアミンリガンドを含む。ある特定の実施形態において、標的部分は、１個のＮ−アセチルガラクトースアミンリガンドを含む。
ある特定の実施形態において、各リガンドは、炭水化物、炭水化物誘導体、修飾炭水化物、多価炭水化物クラスター、多糖、修飾多糖、または多糖誘導体である。ある特定の実施形態において、各リガンドは、アミノ糖またはチオ糖である。例えば、アミノ糖は、当該技術分野で既知の任意の数の化合物、例えば、グルコサミン、シアル酸、α−Ｄ−ガラクトサミン、Ｎ−アセチルガラクトサミン、２−アセトアミド−２−デオキシ−Ｄ−ガラクトピラノース（ＧａｌＮＡｃ）、２−アミノ−３−Ｏ−［（Ｒ）−１−カルボキシエチル］−２−デオキシ−β−Ｄ−グルコピラノース（β−ムラミン酸）、２−デオキシ−２−メチルアミノ−Ｌ−グルコピラノース、４，６−ジデオキシ−４−ホルムアミド−２，３−ジ−Ｏ−メチル−Ｄ−マンノピラノース、２−デオキシ−２−スルホアミノ−Ｄ−グルコピラノース、及びＮ−スルホ−Ｄ−グルコサミン、及びＮ−グリコロイル−α−ノイラミン酸から選択され得る。例えば、チオ糖は、５−チオ−β−Ｄ−グルコピラノース、メチル２，３，４−トリ−Ｏ−アセチル−１−チオ−６−Ｏ−トリチル−α−Ｄ−グルコピラノシド、４−チオ−β−Ｄ−ガラクトピラノース、及びエチル３，４，６，７−テトラ−Ｏ−アセチル−２−デオキシ−１，５−ジチオ−α−Ｄ−グルコ−ヘプトピラノシドからなる群から選択され得る。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される共役基は、炭水化物クラスターを含む。本明細書で使用されるとき、「炭水化物クラスター」とは、２つ以上の炭水化物残基がテザー基を介して分岐基に結合する共役基の一部分を意味する。（例えば、炭水化物共役クラスターの例については、全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ｍａｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，“Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｄ ｔｏ ａ Ｍｕｌｔｉｖａｌｅｎｔ Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ Ｃｌｕｓｔｅｒ ｆｏｒ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ，” Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００３，（１４）：１８−２９、またはＲｅｎｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，“Ｄｅｓｉｇｎ ａｎｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ Ｎｏｖｅｌ Ｎ−Ａｃｅｔｙｌｇａｌａｃｔｏｓａｍｉｎｅ−Ｔｅｒｍｉｎａｔｅｄ Ｇｌｙｃｏｌｉｐｉｄｓ ｆｏｒ Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｏｆ Ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｓ ｔｏ ｔｈｅ Ｈｅｐａｔｉｃ Ａｓｉａｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ，”Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２００４，（４７）：５７９８−５８０８を参照されたい）。
本明細書で使用されるとき、「修飾炭水化物」とは、天然炭水化物と比較して、１つ以上の化学修飾を有する任意の炭水化物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「炭水化物誘導体」とは、炭水化物を出発物質または中間体として使用して合成され得る任意の化合物を意味する。
本明細書で使用されるとき、「炭水化物」とは、天然炭水化物、修飾炭水化物、または炭水化物誘導体を意味する。
ある特定の実施形態において、細胞標的部分が以下の式を有する共役基が提供される。
Figure 2017533721
ある特定の実施形態において、細胞標的部分が以下の式を有する共役基が提供される。
Figure 2017533721
ある特定の実施形態において、細胞標的部分が以下の式を有する共役基が提供される。
Figure 2017533721
ある特定の実施形態において、共役基は、式：
Figure 2017533721
 を有する。
上述の共役基、共役基を含むアンチセンス化合物等の共役オリゴマー化合物、テザー、共役リンカー、分岐基、リガンド、切断可能な部分、ならびに他の修飾のいくつかの調製を教示する代表的な米国特許、米国特許出願公開、及び国際特許出願公開としては、ＵＳ５，９９４，５１７、ＵＳ６，３００，３１９、ＵＳ６，６６０，７２０、ＵＳ６，９０６，１８２、ＵＳ７，２６２，１７７、ＵＳ７，４９１，８０５、ＵＳ８，１０６，０２２、ＵＳ７，７２３，５０９、ＵＳ２００６／０１４８７４０、ＵＳ２０１１／０１２３５２０、ＷＯ２０１３／０３３２３０、及びＷＯ２０１２／０３７２５４が挙げられるが、これらに限定されず、これらの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
上述の共役基、共役基を含むアンチセンス化合物等の共役オリゴマー化合物、テザー、共役リンカー、分岐基、リガンド、切断可能な部分、ならびに他の修飾のいくつかの調製を教示する代表的な出版物としては、ＢＩＥＳＳＥＮ ｅｔ ａｌ．，“Ｔｈｅ Ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ Ｄｅｒｉｖａｔｉｖｅ ｏｆ ａ Ｔｒｉａｎｔｅｎｎａｒｙ Ｇａｌａｃｔｏｓｉｄｅ ｗｉｔｈ Ｈｉｇｈ Ａｆｆｉｎｉｔｙ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｈｅｐａｔｉｃ Ａｓｉａｌｏｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ：ａ Ｐｏｔｅｎｔ Ｃｈｏｌｅｓｔｅｒｏｌ Ｌｏｗｅｒｉｎｇ Ａｇｅｎｔ”Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．（１９９５）３８：１８４６−１８５２、ＢＩＥＳＳＥＮ ｅｔ ａｌ．，“Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ Ｃｌｕｓｔｅｒ Ｇａｌａｃｔｏｓｉｄｅｓ ｗｉｔｈ Ｈｉｇｈ Ａｆｆｉｎｉｔｙ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｈｅｐａｔｉｃ Ａｓｉａｌｏｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ”Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．（１９９５）３８：１５３８−１５４６、ＬＥＥ ｅｔ ａｌ．，“Ｎｅｗ ａｎｄ ｍｏｒｅ ｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｍｕｌｔｉｖａｌｅｎｔ ｇｌｙｃｏ−ｌｉｇａｎｄｓ ｆｏｒ ａｓｉａｌｏｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｏｆ ｍａｍｍａｌｉａｎ ｈｅｐａｔｏｃｙｔｅｓ”Ｂｉｏｏｒｇａｎｉｃ ＆ Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ（２０１１）１９：２４９４−２５００、ＲＥＮＳＥＮ ｅｔ ａｌ．，“Ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ Ｕｐｐｅｒ Ｓｉｚｅ Ｌｉｍｉｔ ｆｏｒ Ｕｐｔａｋｅ ａｎｄ Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ ｏｆ Ｌｉｇａｎｄｓ ｂｙ ｔｈｅ Ａｓｉａｌｏｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ ｏｎ Ｈｅｐａｔｏｃｙｔｅｓ ｉｎ Ｖｉｔｒｏ ａｎｄ ｉｎ Ｖｉｖｏ”Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．（２００１）２７６（４０）：３７５７７−３７５８４、ＲＥＮＳＥＮ ｅｔ ａｌ．，“Ｄｅｓｉｇｎ ａｎｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ Ｎｏｖｅｌ Ｎ−Ａｃｅｔｙｌｇａｌａｃｔｏｓａｍｉｎｅ−Ｔｅｒｍｉｎａｔｅｄ Ｇｌｙｃｏｌｉｐｉｄｓ ｆｏｒ Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｏｆ Ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎｓ ｔｏ ｔｈｅ Ｈｅｐａｔｉｃ Ａｓｉａｌｏｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ”Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．（２００４）４７：５７９８−５８０８、ＳＬＩＥＤＲＥＧＴ ｅｔ ａｌ．，“Ｄｅｓｉｇｎ ａｎｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ Ｎｏｖｅｌ Ａｍｐｈｉｐｈｉｌｉｃ Ｄｅｎｄｒｉｔｉｃ Ｇａｌａｃｔｏｓｉｄｅｓ ｆｏｒ Ｓｅｌｅｃｔｉｖｅ Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｏｆ Ｌｉｐｏｓｏｍｅｓ ｔｏ ｔｈｅ Ｈｅｐａｔｉｃ Ａｓｉａｌｏｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ”Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．（１９９９）４２：６０９−６１８、及びＶａｌｅｎｔｉｊｎ ｅｔ ａｌ．，“Ｓｏｌｉｄ−ｐｈａｓｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ ｌｙｓｉｎｅ−ｂａｓｅｄ ｃｌｕｓｔｅｒ ｇａｌａｃｔｏｓｉｄｅｓ ｗｉｔｈ ｈｉｇｈ ａｆｆｉｎｉｔｙ ｆｏｒ ｔｈｅ Ａｓｉａｌｏｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ”Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９７，５３（２），７５９−７７０が挙げられるが、これらに限定されず、これらの各々は、参照によりその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
ある特定の実施形態において、共役基は、限定されることなく、インターカレーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ポリエチレングリコール、チオエーテル、ポリエーテル、コレステロール、チオコレステロール、コール酸部分、葉酸、脂質、リン脂質、ビオチン、フェナジン、フェナントリジン、アントラキノン、アダマンタン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、及び色素を含む。ある特定の共役基が以前に、例えば、コレステロール部分（Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１９８９，８６，６５５３−６５５６）、コール酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔ．，１９９４，４，１０５３−１０６０）、チオエーテル、例えば、ヘキシル−Ｓ−トリチルチオール（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．１９９２，６６０，３０６−３０９、Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔ．，１９９３，３，２７６５−２７７０）、チオコレステロール（Ｏｂｅｒｈａｕｓｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１９９２， ２０，５３３−５３８）、脂肪族鎖、例えば、ドデカンジオール若しくはウンデシル残基（Ｓａｉｓｏｎ−Ｂｅｈｍｏａｒａｓ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．，１９９１，１０，１１１１−１１１８、Ｋａｂａｎｏｖ ｅｔ ａｌ．，ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ，１９９０，２５９，３２７−３３０、Ｓｖｉｎａｒｃｈｕｋ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍｉｅ，１９９３，７５，４９−５４）、リン脂質、例えば、ジ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロール若しくはトリエチル−アンモニウム１，２−ジ−Ｏ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロ−３−Ｈ−ホスホネート（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９５，３６，３６５１−３６５４、Ｓｈｅａ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．１９９０，１８，３７７７−３７８３）、ポリアミン若しくはポリエチレングリコール鎖（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ＆Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ，１９９５，１４，９６９−９７３）、またはアダマンタン酢酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９５，３６，３６５１−３６５４）、パルミチル部分（Ｍｉｓｈｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ，１９９５，１２６４，２２９−２３７）、またはオクタデシルアミン若しくはヘキシルアミノ−カルボニル−オキシコレステロール部分（Ｃｒｏｏｋｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．１９９６，２７７，９２３−９３７）で説明されている。
ある特定の実施形態において、共役基は、活性薬剤物質、例えば、アスピリン、ワルファリン、フェニルブタゾン、イブプロフェン、スプロフェン、フェンブフェン、ケトプロフェン、（Ｓ）−（＋）−プラノプロフェン、カルプロフェン、ダンシルサルコシン、２，３，５−トリヨード安息香酸、フィンゴリモド、フルフェナム酸、フォリン酸、ベンゾチアジアジド、クロロチアジド、ジアゼピン、インドメタシン、バルビツレート、セファロスポリン、サルファ剤、抗糖尿病薬、抗菌剤、または抗生物質を含む。
共役リンカーのいくつかの非限定的な例は、限定されないが、ピロリジン、８−アミノ−３，６−ジオキサオクタン酸（ＡＤＯ）、スクシンイミジル４−（Ｎ−マレイミドメチル）シクロヘキサン−１−カルボキシレート（ＳＭＣＣ）、及び６−アミノヘキサン酸（ＡＨＥＸまたはＡＨＡ）を含む。他の共役リンカーは、限定されないが、置換Ｃ１−Ｃ１０アルキル、置換若しくは非置換Ｃ２−Ｃ１０アルケニル、または置換若しくは非置換Ｃ２−Ｃ１０アルキニルを含み、好ましい置換基の非限定的なリストは、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、及びアルキニルを含む。
共役基は、オリゴヌクレオチドのいずれか若しくは両方の末端（末端共役基）及び／または任意の内部位置に結合しても良い。
ある特定の実施形態において、共役基は、オリゴマー化合物のオリゴヌクレオチドの３’−末端にある。ある特定の実施形態において、共役基は、３’−末端付近にある。ある特定の実施形態において、共役体は、オリゴマー化合物の３’末端であるが、１個以上の末端基ヌクレオシドの前で結合される。ある特定の実施形態において、共役基は、末端基内に配置される。
Ｂ．アンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される修飾オリゴヌクレオチドは、アンチセンス化合物である。そのようなアンチセンス化合物は、標的核酸にハイブリダイズすることができ、少なくとも１つのアンチセンス活性をもたらす。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、１つ以上の標的核酸に特異的にハイブリダイズする。ある特定の実施形態において、特異的にハイブリダイズするアンチセンス化合物は、標的核酸に対して、ハイブリダイゼーションを可能にし、かつアンチセンス活性をもたらすのに十分な相補性と、任意の非標的に対して、特異的ハイブリダイゼーションが所望される条件下（例えば、インビボまたは治療的使用のために生理学的条件下、かつインビトロアッセイの場合、アッセイが実行される条件下）で任意の非標的核酸配列への非特異的ハイブリダイゼーションを回避するように不十分な相補性と、を有する領域を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本発明は、オリゴヌクレオチドの全長にわたって標的核酸に完全に相補的なオリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物を提供する。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、標的核酸に９９％相補的である。ある特定の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、標的核酸に９５％相補的である。ある特定の実施形態において、そのようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に９０％相補的である。
ある特定の実施形態において、そのようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に８５％相補的である。ある特定の実施形態において、そのようなオリゴヌクレオチドは、標的核酸に８０％相補的である。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、標的核酸に完全に相補的であり、かつオリゴヌクレオチドの全長にわたって標的核酸に少なくとも８０％相補的な領域を含む。ある特定のそのような実施形態において、完全な相補性の領域は、６〜１４核酸塩基長である。
ａ．ある特定のアンチセンス化合物
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４５、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、または７７の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号１７、１８、１９、４１、または３２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２１の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２５または４４の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号７９、８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、または９３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号８２または８３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号９５の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号９７の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号９９、１０１、１０２、１０３、または１０４の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４５、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、または７７のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号１７、１８、１９、４１、または３２のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２１の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２５または４４のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２３の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号７９、８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、または９３のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号８２または８３のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号９５の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号９７の核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号９９、１０１、１０２、１０３、または１０４のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４５、５４、５５、５６、５７、５８、５９、６０、６１、６２、６３、６４、６５、６６、６７、６８、６９、７０、７１、７２、７３、７４、７５、７６、または７７の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＲＮＡｓｅ Ｈ１の発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号１７、１８、１９、４１、または３２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＬＲＰＰＲＣの発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号２１の核酸塩基配列の少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＳＦＸＮ３の発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号２５または４４の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＴＨＰＯの発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号２３の核酸塩基配列の少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＭＲＰＬ１１の発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号７９、８０、８４、８５、８６、８７、８８、８９、９０、９２、または９３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＡＣＰ１の発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号８２または８３の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＣＦＴＲの発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号９５の核酸塩基配列の少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＡＲＦ１の発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号９７の核酸塩基配列の少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＵＳＰ１６の発現の増加方法を提供する。
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞を、配列番号９９、１０１、１０２、１０３、または１０４の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも１４個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する本明細書に記載される修飾オリゴヌクレオチドと接触させることによる、ＬＤＬｒの発現の増加方法を提供する。
ｂ．ある特定のアンチセンス活性及び機序
５’−ＵＴＲは、多くの転写物の翻訳の調節において重要な役割を担うことが明らかになっている。ある特定の実施形態において、５’−ＵＴＲは、標的タンパク質の翻訳を抑制するように働く翻訳抑制要素（ＴＳＥ）を含有する。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素はｕＯＲＦである。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素はＧ−カルテットである。ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素はステムループである。ＴＳＥの妨害は、所与の転写物の翻訳のＴＳＥによる抑制を減少させるため、標的タンパク質の翻訳の増加をもたらすことになる。ある特定の実施形態においては、アンチセンス化合物を使用して、ＴＳＥを妨害し、標的タンパク質の翻訳を増加させる。
上流オープンリーディングフレームは、翻訳を調節する重要な機序であることが明らかになっている。ヒト転写物の約５０％がｕＯＲＦを有し、ほとんどが機能性であると考えられる。ｕＯＲＦは、機能性である場合、典型的には、下流ｐＯＲＦからのポリペプチドまたはタンパク質の翻訳を減少させる。コザック配列の強度及び／または５’キャップからの距離等のｕＯＲＦの特徴は、各ｕＯＲＦが下流タンパク質の翻訳を減少させる効率に影響する。ｕＯＲＦの２次構造または転写物１つあたりのｕＯＲＦの数等の他の因子も、各ｕＯＲＦが下流タンパク質の翻訳を減少させる効率に影響する。本開示のある特定の実施形態は、ｕＯＲＦからの翻訳の開始を遮断するように機能するｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）を提供する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤はＲＮａｓｅ Ｈを活性化しない。ある特定のそのような実施形態において、下流ＯＲＦ（例えば、ｐＯＲＦ）によってコードされるタンパク質の翻訳が強化される。本発明のある特定の実施形態は、ｕＯＲＦ阻害剤によってｕＯＲＦからの翻訳の開始を遮断する。ある特定のそのような実施形態において、下流ＯＲＦ（例えば、ｐＯＲＦ）によってコードされるタンパク質の翻訳が強化される。本開示のある特定の実施形態は、相補的標的転写物に結合するときにＲＮａｓｅ Ｈを活性化しないＴＳＥ阻害剤及び／またはｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）を提供する。本開示のある特定の実施形態は、アンチセンス化合物が、ギャップマーではない修飾オリゴヌクレオチドである、ＴＳＥ阻害剤及び／またはｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）を提供する。
上流オープンリーディングフレームは、様々な機序により、ｐＯＲＦによってコードされるポリペプチドまたはタンパク質の翻訳を調節することができる。ｕＯＲＦによってコードされるポリペプチドまたはタンパク質が翻訳され得、結果として生じるｕＯＲＦポリペプチドは、同じｍＲＮＡ分子（シス調節）または別個のｍＲＮＡ分子（トランス調節）上でｐＯＲＦによってコードされるポリペプチドまたはタンパク質の翻訳を遮断し得る。シス調節の別の例においては、リボソームサブユニットがｕＯＲＦポリペプチドの翻訳の後にｍＲＮＡから解離し、それによってｐＯＲＦポリペプチドまたはタンパク質の認識及び翻訳が行われない。代替的に、ｕＯＲＦ終了コドンは、早期終了コドンとして認識され、ナンセンス変異による崩壊を開始し得る。ｕＯＲＦがｐＯＲＦポリペプチドまたはタンパク質の翻訳を抑制する程度は、翻訳機構によって認識される頻度に依存し、これは、同様に、関連するコザック配列の強度、５’−ＵＴＲにおけるｕＯＲＦの数、終了コドンの位置、及びｕＯＲＦの二次構造を含む多くの因子によって影響される。ｕＯＲＦ阻害剤は、これらの機序のいずれかを妨害、改変、または利用するために用いられ得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤はアンチセンス化合物であり、アンチセンス化合物は、これらの機序のいずれかを妨害、改変、または利用するために用いられ得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤はアンチセンス化合物であり、アンチセンス化合物は、これらの機序のいずれかを妨害、改変、または利用して、細胞における標的タンパク質の発現を増加させるために用いられ得る。
ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、リボソームサブユニットによるｕＯＲＦ開始部位の認識に寄与する因子のうちの１つ以上を妨害する。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、上で考察したｐＯＲＦポリペプチドまたはタンパク質翻訳のｕＯＲＦ媒介性翻訳サプレッサーのうちの１つ以上を防止または減少させ得る。例えば、ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、コザック配列の１つ以上の要素を妨害することで、リボソームサブユニットによるｕＯＲＦ開始部位の認識を阻害することになる。例えば、ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止しても良い。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止しても良く、それにより、リボソームにｕＯＲＦ開始部位を通過させ、下流開始部位（例えば、ｐＯＲＦ開始部位）での翻訳を開始し得る。ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、こうして、ｐＯＲＦによってコードされる標的タンパク質の量または活性を増加させ得る。
ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがｕＯＲＦ開始部位を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位から１０核酸塩基上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位から２０核酸塩基上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位から３０核酸塩基上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位から４０核酸塩基上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位から５０核酸塩基上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位から６０核酸塩基上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位から少なくとも６０核酸塩基上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。したがって、ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位の上流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、ｐＯＲＦによってコードされる標的タンパク質の量または活性を増加させ得る。
ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位の下流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがコザック共通配列を認識することを防止し得る。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位の下流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、１つ以上のリボソームサブユニットがｕＯＲＦ開始部位を認識することを防止し得る。したがって、ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ開始部位の下流にある標的転写物の一部分に相補的なアンチセンス化合物は、ｐＯＲＦによってコードされる標的タンパク質の量または活性を増加させ得る。
ある特定の実施形態において、リボソームサブユニットによるｕＯＲＦ開始部位の認識に寄与する因子のうちの１つ以上のｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）による妨害は、下流ｐＯＲＦの発現を増加させる。例えば、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ｕＯＲＦポリペプチド翻訳後のリボソームサブミットの解離を防止することで、下流ｐＯＲＦの発現を増加させても良い。例えば、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、早期のｕＯＲＦ終止コドンの認識を防止し、ｐＯＲＦを含む転写物のナンセンス変異による崩壊を防止しても良い。
ある特定の実施形態において、リボソームサブユニットはｕＯＲＦ開始部位を認識し、ｕＯＲＦポリペプチドのすべてまたは一部の翻訳の後、リボソームサブユニットは、ｐＯＲＦ開始部位の認識の前に転写物から解離する。ある特定の実施形態において、リボソームサブユニットは、６０Ｓリボソームサブユニット及び／または４０Ｓリボソームサブユニットである。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ｕＯＲＦポリペプチド翻訳後にｐＯＲＦでの翻訳再開の量を増加させ得る。例えば、ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ｕＯＲＦポリペプチドのすべてまたは一部の翻訳後に転写物から解離する６０Ｓリボソームサブユニット及び／または４０Ｓリボソームサブユニットの量を抑制し、それによりｐＯＲＦポリペプチドまたはタンパク質の翻訳を増加させる。
ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤は小分子である。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤は抗体である。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤はポリペプチドである。ある特定の実施形態では、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、小分子、抗体、ポリペプチド、及び／またはｓｉＲＮＡ）は、本明細書に記載される機序のいずれかによって、ｐＯＲＦによってコードされる標的タンパク質の量または活性を増加させる。
上流オープンリーディングフレームは、翻訳抑制要素の一種である。ｕＯＲＦに加えて、翻訳は、５’−ＵＴＲにおける他の種類の翻訳抑制要素（ＴＳＥ）によって調節されても良い。翻訳は、ステムループ及びヘアピン等の５’−ＵＴＲにおける構造要素によって抑制され得る。ある特定の実施形態において、構造要素が翻訳を抑制する程度は、その構造要素の配列及び／または安定性と相関し得る。例えば、構造要素が翻訳を抑制する程度は、標的転写物の５’−キャップと構造要素との間の距離が減少するにつれて増加し得る。別の例としては、ある特定の実施形態において、構造要素におけるＧＣ含有量及び／または連続したＧＣヌクレオシドの数は、構造要素の安定性の増加に起因して、翻訳が抑制される程度と正に相関し得る。したがって、ある特定の実施形態において、少なくとも３個の連続したＧＣヌクレオシドの複数のストレッチを含有する５’−ＵＴＲを持つ転写物は、少なくとも１つのＴＳＥを含み得る。ある特定の実施形態において、少なくとも７個のＧＣヌクレオシドの少なくとも１つのストレッチを含有する５’−ＵＴＲを持つ転写物は、少なくとも１つのＴＳＥを含み得る。
構造要素であるＴＳＥは、１つ以上のリボソームサブユニットがコード領域にアクセスするのを立体的に阻止し得る。機序に束縛されることを意図するものではないが、ＴＳＥ阻害剤は、そのような立体的遮断を軽減することによって標的タンパク質の翻訳を増加させ得る。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ構造要素の少なくとも一部分に相補的なアンチセンス化合物は、構造要素の構造を変化させることで、標的タンパク質の翻訳の増加をもたらす。ある特定の実施形態において、そのようなアンチセンス化合物は、構造要素をアンフォールドする。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ阻害剤であるアンチセンス化合物は、少なくとも６０％のＧＣ含有量を有する。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ阻害剤であるアンチセンス化合物は、少なくとも７０％のＧＣ含有量を有する。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ阻害剤であるアンチセンス化合物は、少なくとも８０％のＧＣ含有量を有する。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ阻害剤であるアンチセンス化合物は、少なくとも９０％のＧＣ含有量を有する。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ阻害剤であるアンチセンス化合物は、１００％のＧＣ含有量を有する。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ阻害剤であるアンチセンス化合物は、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または少なくとも２０個の連続したＧＣヌクレオシドを有する。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ阻害剤であるアンチセンス化合物は、標的転写物の５’−ＵＴＲにおけるステムループのステム部分に相補的である。ある特定の実施形態において、ＴＳＥ阻害剤であるアンチセンス化合物は、標的転写物の５’−ＵＴＲにおけるヘアピンに相補的である。
ＴＳＥの第３の種類はＧカルテットである。ある特定の実施形態において、Ｇカルテットが翻訳を抑制する程度は、標的転写物の５’−キャップとＧカルテットとの間の距離が減少するにつれて増加し得る。
ＴＳＥの第４の種類はステムループ構造である。ある特定の実施形態において、５’−ＵＴＲ内にステムループ構造を有する転写物は、標的タンパク質の翻訳を抑制する。ある特定の実施形態において、ステムループが翻訳を抑制する程度は、標的転写物の５’−キャップとステムループとの間の距離が減少するにつれて増加し得る。
ｃ．アンチセンス活性を増加させるためのある特定の組成物及び方法
ある特定の実施形態において、本開示は、細胞におけるアンチセンス化合物の活性の増加方法を提供し、本方法は、細胞を翻訳抑制要素阻害剤と接触させることにより、アンチセンス化合物の活性を増加させることを含む。
ある特定の実施形態において、本明細書に記載の翻訳抑制要素阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる。ある特定の実施形態において、本明細書に記載されるｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、細胞における標的タンパク質の量または活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、アンチセンス活性における役割を担う。したがって、ある特定の実施形態において、標的タンパク質の量または活性を増加させることは、アンチセンス化合物の量または活性も増加させ得る。例えば、ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、アンチセンス化合物の細胞内局在化の役割を担っても良いる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、ＲＮＡ結合における役割を担っても良い。ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、核輸送における役割を担っても良い。ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、膜結合における役割を担っても良い。ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、ＤＮＡ結合における役割を担っても良い。ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、核内移行における役割を担っても良い。ある特定の実施形態において、標的タンパク質は、熱ショックタンパク質である。
ある特定の実施形態において、翻訳抑制要素阻害剤は、アンチセンス活性における役割を担う標的タンパク質の量または活性を増加させ、それによりアンチセンス化合物の量または活性を増加させるために使用される。このように、翻訳抑制要素阻害剤は、細胞を翻訳抑制要素阻害剤と接触させた後、細胞をアンチセンス化合物と接触させることによってアンチセンス化合物の活性を増加させるために使用されても良い。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤は、アンチセンス活性における役割を担う標的タンパク質の量または活性を増加させ、それによりアンチセンス化合物の量または活性を増加させるために使用される。このように、ｕＯＲＦ阻害剤は、細胞をｕＯＲＦ阻害剤と接触させた後、細胞をアンチセンス化合物と接触させることによってアンチセンス化合物の活性を増加させるために使用されても良い。
例えば、ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＲＮａｓｅ Ｈである。ある特定の実施形態において、ＲＮａｓｅ Ｈの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＲＮａｓｅ Ｈタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＬａ／ＳＳＢである。ある特定の実施形態において、Ｌａ／ＳＳＢの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＬａ／ＳＳＢタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＮＰＭ１である。ある特定の実施形態において、ＮＰＭ１の５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＮＰＭ１タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＴＣＰ１−アルファである。ある特定の実施形態において、ＴＣＰ１−アルファの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＴＣＰ１−アルファタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。
ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＴＣＰ１−イプシロンである。ある特定の実施形態において、ＴＣＰ１−イプシロンの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＴＣＰ１−イプシロンタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＴＣＰ１−ベータである。ある特定の実施形態において、ＴＣＰ１−ベータの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＴＣＰ１−ベータタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＨＳＰ９０−ＡＡ１である。ある特定の実施形態において、ＨＳＰ９０−ＡＡ１の５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＨＳＰ９０−ＡＡ１タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＨＳＰ９０−ＡＢである。ある特定の実施形態において、ＨＳＰ９０−ＡＢの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＨＳＰ９０−ＡＢタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＨＳＰＡ１Ｌである。ある特定の実施形態において、ＨＳＰＡ１Ｌの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＨＳＰＡ１Ｌタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＲＡＮである。ある特定の実施形態において、ＲＡＮの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＲＡＮタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。
ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＩＭＰ９である。ある特定の実施形態において、ＩＭＰ９の５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＩＭＰ９タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＡｎｎｅｘｉｎ Ａ２である。ある特定の実施形態において、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２の５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＡｎｎｅｘｉｎ Ａ２タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＦＴＣＤ／５８ｋである。ある特定の実施形態において、ＦＴＣＤ／５８ｋの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＦＴＣＤ／５８ｋタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。
ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＰＣ４／ＳＵＢ１である。ある特定の実施形態において、ＰＣ４／ＳＵＢ１の５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＰＣ４／ＳＵＢ１タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＶＡＲＳである。ある特定の実施形態において、ＶＡＲＳの５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＶＡＲＳタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＤＨＸ３６である。ある特定の実施形態において、ＤＨＸ３６の５’−ＵＴＲを標的とする翻訳抑制要素阻害剤は、細胞におけるＤＨＸ３６タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。
例えば、ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＲＮａｓｅ Ｈである。ある特定の実施形態において、ＲＮａｓｅ Ｈの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＲＮａｓｅ Ｈタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＬａ／ＳＳＢである。ある特定の実施形態において、Ｌａ／ＳＳＢの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＬａ／ＳＳＢタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＮＰＭ１である。ある特定の実施形態において、ＮＰＭ１の５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＮＰＭ１タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＴＣＰ１−アルファである。ある特定の実施形態において、ＴＣＰ１−アルファの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＴＣＰ１−アルファタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。
ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＴＣＰ１−イプシロンである。ある特定の実施形態において、ＴＣＰ１−イプシロンの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＴＣＰ１−イプシロンタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＴＣＰ１−ベータである。ある特定の実施形態において、ＴＣＰ１−ベータの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＴＣＰ１−ベータタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＨＳＰ９０−ＡＡ１である。ある特定の実施形態において、ＨＳＰ９０−ＡＡ１の５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＨＳＰ９０−ＡＡ１タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＨＳＰ９０−ＡＢである。ある特定の実施形態において、ＨＳＰ９０−ＡＢの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＨＳＰ９０−ＡＢタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＨＳＰＡ１Ｌである。ある特定の実施形態において、ＨＳＰＡ１Ｌの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＨＳＰＡ１Ｌタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＲＡＮである。ある特定の実施形態において、ＲＡＮの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＲＡＮタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。
ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＩＭＰ９である。ある特定の実施形態において、ＩＭＰ９の５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＩＭＰ９タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＡｎｎｅｘｉｎ Ａ２である。ある特定の実施形態において、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２の５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＡｎｎｅｘｉｎ Ａ２タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＦＴＣＤ／５８ｋである。ある特定の実施形態において、ＦＴＣＤ／５８ｋの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＦＴＣＤ／５８ｋタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。
ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＰＣ４／ＳＵＢ１である。ある特定の実施形態において、ＰＣ４／ＳＵＢ１の５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＰＣ４／ＳＵＢ１タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＶＡＲＳである。ある特定の実施形態において、ＶＡＲＳの５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＶＡＲＳタンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＤＨＸ３６である。ある特定の実施形態において、ＤＨＸ３６の５’−ＵＴＲを標的とするｕＯＲＦ阻害剤は、細胞におけるＤＨＸ３６タンパク質の量または活性を増加させることで、細胞におけるアンチセンス活性を増加させる。
ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＬＤＬｒである。ＬＤＬｒタンパク質の発現を増加させることで、コレステロール値が減少する。
ある特定の実施形態において、標的タンパク質はＣＦＴＲである。ＣＦＴＲ遺伝子における突然変異は嚢胞性線維症をもたらす。ある特定の実施形態において、ＣＦＴＲタンパク質の発現を増加させることで、嚢胞性線維症の１つ以上の症状が緩和され得る。
ｄ．アンチセンス活性を減少させるためのある特定の組成物及び方法
ある特定の実施形態において、本明細書に記載されるアンチセンス化合物は、ｕＯＲＦ領域または翻訳抑制要素に相補的であるマイクロＲＮＡまたは他の天然の非コード転写物を標的とし得る。ある特定のそのようなアンチセンス化合物は、したがって、翻訳抑制要素またはｕＯＲＦの効果を増加させることによって標的転写物の発現を阻害する。例えば、ある特定の実施形態において、マイクロＲＮＡ等の非コード転写物は、ｕＯＲＦまたはｕＯＲＦ領域に相補的であり、標的タンパク質の発現を増加させるように機能し得る。マイクロＲＮＡに相補的なアンチセンス化合物がマイクロＲＮＡを隔離し、その後ｕＯＲＦが標的タンパク質の翻訳を抑制する。そのようにして、アンチセンス化合物は標的タンパク質の発現を阻害する。
Ｃ．ある特定の標的遺伝子
本開示は、少なくとも１つのｕＯＲＦが標的タンパク質をコードする転写物上に存在することを条件に、任意の標的タンパク質の発現を増加させるために使用され得る化合物及び方法を提供する。本開示はまた、少なくとも１つのＴＳＥが標的タンパク質をコードする転写物上に存在することを条件に、任意の標的タンパク質の発現を増加させるために使用され得る化合物及び方法を提供する。ある特定の実施形態において、少なくとも１つのＴＳＥは、ｕＯＲＦを含む。ある特定の実施形態において、少なくとも２つのＴＳＥが標的タンパク質をコードする転写物上に存在する。ある特定の実施形態において、少なくとも２つのＴＳＥのいずれもｕＯＲＦを含まない。ある特定の実施形態において、少なくとも２つのＴＳＥの一方がｕＯＲＦを含む。ある特定の実施形態において、少なくとも２つのＴＳＥの両方がｕＯＲＦを含む。ある特定の実施形態において、標的タンパク質の欠乏が疾患と関連するため、タンパク質の量または活性を増加させることが、疾患の１つ以上の症状を緩和するか、または疾患の１つ以上の症状の発症を遅延させると考えられる。以下の表１及び表２は、ある特定の遺伝子及び関連する疾患を列挙する。ある特定の実施形態において、標的転写物は、表１または表２に列挙される遺伝子によってコードされる。ある特定の実施形態において、表１または表２中の関連する疾患または障害は、そのような転写物を標的とする本発明のアンチセンス化合物の使用によって治療される。表１中の各遺伝子と関連する疾患には、対応するｕＯＲＦ含有遺伝子の不足に起因して生じるかまたはそれと相関する疾患、及び対応するｕＯＲＦ含有遺伝子の上方調節によって緩和され得る疾患が含まれる。表２中の各遺伝子と関連する疾患には、対応する遺伝子においてｕＯＲＦを導入する突然変異またはＳＮＰと相関する疾患が含まれる。
ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、表１または表２中の遺伝子の５’ＵＴＲにおける１つ以上のＴＳＥを標的とする。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、表１または表２中の遺伝子の５’ＵＴＲにおける１つ以上のＴＳＥを標的としない。
Figure 2017533721
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ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＣＤＫＮ２Ａ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＣＤＫＮ２Ａの発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＣＦＴＲ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＣＦＴＲの発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＦＸＩＩ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＦＸＩＩの発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＧＣＨ１転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＧＣＨ１の発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＨＡＭＰ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＨＡＭＰの発現を増加させる。
ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＨＢＢ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＨＢＢの発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＩＲＦ６転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＩＲＦ６の発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＫＣＮＪ１１転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＫＣＮＪ１１の発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＬＤＬＲ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＬＤＬＲの発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＰＥＸ７転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＰＥＸ７の発現を増加させる。
ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＰＯＭＣ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＰＯＭＣの発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＰＲＫＡＲ１Ａ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＰＲＫＡＲ１Ａの発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＳＰＩＮＫ１転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＳＰＩＮＫ１の発現を増加させる。ある特定の実施形態において、ｕＯＲＦ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）は、ＳＲＹ転写物におけるｕＯＲＦ開始部位のリボソーム認識またはｕＯＲＦ活性を阻害し、それによりＳＲＹの発現を増加させる。
ある特定の実施形態においては、ＴＳＥ阻害剤（例えば、アンチセンス化合物）を使用して、ＡＴＭ、リポタンパク質リパーゼ（ＬＰＬ）、ＤＭＤ、スフィンゴミエリナーゼ、第ＶＩＩＩ因子、インスリン、成長ホルモン、甲状腺刺激ホルモン、卵胞刺激ホルモン、またはヘプシジンの発現を上方調節しても良い。
Ｄ．ある特定の薬学的組成物
ある特定の実施形態において、本発明は、１個以上のアンチセンス化合物を含む薬学的組成物を提供する。ある特定の実施形態において、そのような薬学的組成物は、好適な薬学的に許容される希釈剤または担体を含む。ある特定の実施形態において、薬学的組成物は、滅菌生理食塩水溶液及び１つ以上のアンチセンス化合物を含む。ある特定の実施形態において、そのような薬学的組成物は、滅菌生理食塩水溶液及び１つ以上のアンチセンス化合物からなる。ある特定の実施形態において、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの生理食塩水である。ある特定の実施形態において、薬学的組成物は、１つ以上のアンチセンス化合物及び滅菌水を含む。ある特定の実施形態において、薬学的組成物は、１つ以上のアンチセンス化合物及び滅菌水からなる。ある特定の実施形態において、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの水である。ある特定の実施形態において、薬学的組成物は、１つ以上のアンチセンス化合物及びリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）を含む。ある特定の実施形態において、薬学的組成物は、１個以上のアンチセンス化合物及び滅菌リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）からなる。ある特定の実施形態において、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードのＰＢＳである。
ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、薬学的組成物または製剤を調製するために薬学的に許容される活性及び／または不活性物質と混合され得る。組成物及び薬学的組成物を製剤化するための方法は、投与経路、疾患の程度、または投与される用量を含むがこれらに限定されない、ある数の基準に依存する。
アンチセンス化合物を含む薬学的組成物は、任意の薬学的に許容される塩、エステル、またはそのようなエステルの塩を包含する。ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物を含む薬学的組成物は、ヒトを含む動物への投与時に、生物学的に活性な代謝物またはその残渣を（直接的または間接的に）提供することができる１個以上のオリゴヌクレオチドを含む。したがって、例えば、本開示は、アンチセンス化合物の薬学的に許容される塩、プロドラッグ、そのようなプロドラッグの薬学的に許容される塩、及び他の生物学的等価物を対象とする。好適な薬学的に許容される塩には、ナトリウム塩及びカリウム塩が含まれるが、これらに限定されない。
プロドラッグは、体内で内因性ヌクレアーゼによって切断されて活性化合物を形成するオリゴマー化合物の一方または両方の末端におけるさらなるヌクレオシドの組み込みを含み得る。
脂質部分は、様々な方法で核酸療法において使用されている。ある特定のそのような方法において、核酸は、カチオン性脂質と中性脂質との混合物で作製される事前形成されたリポソームまたはリポプレックスに導入される。ある特定の方法において、モノまたはポリカチオン性脂質とのＤＮＡ複合体は、中性脂質の存在なしで形成される。ある特定の実施形態において、脂質部分は、特定の細胞または組織への医薬品の分布を増加させるように選択される。ある特定の実施形態において、脂質部分は、脂肪組織への医薬品の分布を増加させるように選択される。ある特定の実施形態において、脂質部分は、筋肉組織への医薬品の分布を増加させるように選択される。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される薬学的組成物は、１個以上の修飾オリゴヌクレオチド及び１個以上の賦形剤を含む。ある特定のそのような実施形態において、賦形剤は、水、食塩水、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、滑石、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース、及びポリビニルピロリドンから選択される。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される薬学的組成物は、送達系を含む。送達系の例としては、リポソーム及びエマルジョンが挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の送達系は、疎水性化合物を含む薬学的組成物を含むある特定の薬学的組成物の調製に有用である。ある特定の実施形態において、ジメチルスルホキシド等のある特定の有機溶媒が使用される。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される薬学的組成物は、特定の組織または細胞型に本発明の１個以上の医薬品を送達するように設計された１個以上の組織特異的送達分子を含む。例えば、ある特定の実施形態において、薬学的組成物は、組織特異的抗体でコーティングされたリポソームを含む。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される薬学的組成物は、共溶媒系を含む。ある特定のそのような共溶媒系は、例えば、ベンジルアルコール、非極性界面活性剤、水混和性有機ポリマー、及び水相を含む。ある特定の実施形態において、そのような共溶媒系は、疎水性化合物に使用される。そのような共溶媒系の非限定的な例にはＶＰＤ共溶媒系があり、これは、３ｗ／ｖ％のベンジルアルコール、８ｗ／ｖ％の非極性界面活性剤ポリソルベート８０（商標）、及び６５ｗ／ｖ％のポリエチレングリコール３００を含む無水エタノールの溶液である。そのような共溶媒系の割合は、それらの溶解度及び毒性特性を著しく変化させることなく大幅に変化し得る。さらに、共溶媒成分の同一性が変化しても良く、例えば、他の界面活性剤をポリソルベート８０（商標）の代わりに使用しても良く、ポリエチレングリコールの画分サイズが変化されても良く、他の生体適合性ポリマーが、ポリエチレングリコール、例えば、ポリビニルピロリドンを代置しても良く、他の糖または多糖が、デキストロースと置き換わっても良い。
ある特定の実施形態において、本明細書に提供される薬学的組成物は、経口投与のために調製される。ある特定の実施形態において、薬学的組成物は、口腔投与のために調製される。
ある特定の実施形態において、薬学的組成物は、注入による投与（例えば、静脈内、皮下、筋肉内等）のために調製される。そのような実施形態のいくつかにおいて、薬学的組成物は、担体を含み、水または生理学的に相溶性の緩衝液、例えば、ハンクス溶液、リンガー溶液、または生理学的生理食塩水緩衝液等の水溶液中で製剤化される。ある特定の実施形態において、他の成分（例えば、溶解に役立つか、または防腐剤として働く成分）が含まれる。ある特定の実施形態において、注入可能な懸濁液は、適切な液体担体、懸濁化剤等を使用して調製される。注入用のある特定の薬学的組成物は、単位剤形で、例えば、アンプル単位で提供されるか、または多回投与容器内に提供される。注入用のある特定の薬学的組成物は、油性または水性ビヒクル中の懸濁液、溶液、またはエマルジョンであり、懸濁化剤、安定化剤、及び／または分散剤等の製剤化剤を含有し得る。注入用の薬学的組成物における使用に好適なある特定の溶媒には、親油性溶媒及び脂肪油、例えば、ゴマ油、合成脂肪酸エステル、例えば、オレイン酸エチルまたはトリグリセリド、及びリポソームが含まれるが、これらに限定されない。水性注入懸濁液が含まれても良い。
Ｅ．投与
ある特定の実施形態において、本明細書に記載される化合物及び組成物は、非経口投与される。
ある特定の実施形態において、非経口投与は、注入によるものである。注入は、長期投与、または連続投与、または短期投与、または間欠投与であっても良い。ある特定の実施形態において、注入される医薬品は、ポンプによって送達される。ある特定の実施形態において、非経口投与は、注射によるものである。
ある特定の実施形態において、化合物及び組成物は、ＣＮＳに送達される。ある特定の実施形態において、化合物及び組成物は、脳脊髄液に送達される。ある特定の実施形態において、化合物及び組成物は、脳実質に投与される。ある特定の実施形態において、化合物及び組成物は、髄腔内投与または脳室内投与によって動物に送達される。中枢神経系内の本明細書に記載される化合物及び組成物の広域な分布は、実質内投与、髄腔内投与、または脳室内投与を用いて達成され得る。
ある特定の実施形態において、非経口投与は、注射によるものである。注射は、シリンジまたはポンプによって送達されても良い。ある特定の実施形態において、注射は、ボーラス注射である。ある特定の実施形態において、注射は、線条体、尾状核、皮質、海馬、及び小脳等の組織に直接投与される。
したがって、ある特定の実施形態において、本明細書に記載の化合物または組成物の送達は、該化合物または組成物の薬物動態プロファイルに影響し得る。ある特定の実施形態において、本明細書に記載の化合物または組成物の標的組織への注射は、該化合物または組成物の注入と比較して、該化合物または組成物の薬物動態プロファイルを改善する。ある特定の実施形態において、化合物または組成物の注射は、広域な拡散と比較して効力を改善し、同様の薬理を達成するためにより少ない化合物または組成物しか必要としない。ある特定の実施形態において、同様の薬理は、標的のｍＲＮＡ及び／または標的タンパク質が下方調節される時間（例えば、作用期間）を指す。ある特定の実施形態において、ボーラス注射等による医薬品の特異的な局在化方法は、半有効濃度（ＥＣ５０）を約５０分の１に減少させる（例えば、同じまたは同様の薬力学効果を達成するために、組織中で５０分の１の濃度しか必要としない）。ある特定の実施形態において、ボーラス注射等による医薬品の特異的な局在化方法は、半有効濃度（ＥＣ５０）を２０、２５、３０、３５、４０、４５、または５０分の１に減少させる。ある特定の実施形態において、本明細書にさらに記載されるアンチセンス化合物における医薬品。ある特定の実施形態において、標的組織は脳組織である。ある特定の実施形態において、標的組織は線条体組織である。ある特定の実施形態において、ＥＣ５０を減少させることは、それが、薬理学的結果を、それを必要とする患者において達成するために必要とされる用量を低減するため望ましい。
ある特定の実施形態において、アンチセンス化合物は、１か月に１回、２か月に１回、９０日に１回、３か月に１回、６か月に１回、１年に２回、または１年に１回の注射または注入によって送達される。
Ｆ．ある特定の併用療法
ある特定の実施形態において、１つ以上の薬学的組成物は、１つ以上の他の医薬品と共投与される。ある特定の実施形態において、そのような１つ以上の他の医薬品は、１つ以上の本明細書に記載される薬学的組成物と同じ疾患、障害、または病態を治療するように設計される。ある特定の実施形態において、そのような１つ以上の他の医薬品は、１つ以上の本明細書に記載される薬学的組成物とは異なる疾患、障害、または病態を治療するように設計される。ある特定の実施形態において、そのような１つ以上の他の医薬品は、１つ以上の本明細書に記載される薬学的組成物の望ましくない副作用を治療するように設計される。ある特定の実施形態において、１つ以上の薬学的組成物は、別の医薬品と共投与されて、その他の医薬品の望ましくない影響を治療する。ある特定の実施形態において、１つ以上の薬学的組成物は、別の医薬品と共投与されて、併用効果をもたらす。ある特定の実施形態において、１つ以上の薬学的組成物は、別の医薬品と共投与されて、相乗効果をもたらす。
ある特定の実施形態において、１つ以上の薬学的組成物及び１つ以上の他の医薬品は、同時に投与される。ある特定の実施形態において、１つ以上の薬学的組成物及び１つ以上の他の医薬品は、異なる時間に投与される。ある特定の実施形態において、１つ以上の薬学的組成物及び１つ以上の他の医薬品は、単一製剤で共に調製される。ある特定の実施形態において、１つ以上の薬学的組成物及び１つ以上の他の医薬品は、別個に調製される。
ある特定の実施形態において、薬学的組成物と共投与され得る医薬品としては、抗精神病薬、例えば、ハロペリドール、クロルプロマジン、クロザピン、クエタピン（ｑｕｅｔａｐｉｎｅ）、及びオランザピン等；抗鬱剤、例えば、フルオキセチン、塩酸セルトラリン、ベンラファキシン、及びノルトリプチリン等；鎮静剤、例えば、ベンゾジアゼピン、クロナゼパム、パロキセチン、ベンラファキシン、及びベータ遮断薬等；精神安定剤、例えば、リチウム、バルプロエート、ラモトリジン、及びカルバマゼピン等；麻痺薬、例えば、ボツリヌス毒素等；ならびに／または他の実験的薬剤が挙げられ、これらの実験的薬剤としては、限定されないが、テトラベナジン（Ｘｅｎａｚｉｎｅ）、クレアチン、コネザイム（ｃｏｎｅｚｙｍｅ）Ｑ１０、トレハロース、ドコサヘキサン酸（ｄｏｃｏｓａｈｅｘａｎｏｉｃ ａｃｉｄ）、ＡＣＲ１６、エチル−ＥＰＡ、アトモキセチン、シタロプラム、ジメボン（ｄｉｍｅｂｏｎ）、メマンチン、フェニル酪酸ナトリウム、ラメルテオン、ウルソジオール、ジプレキサ、キセナシン（ｘｅｎａｓｉｎｅ）、チアプリド、リルゾール、アマンタジン、［１２３Ｉ］ＭＮＩ−４２０、アトモキセチン、テトラベナジン、ジゴキシン、デトロメトルファン（ｄｅｔｒｏｍｅｔｈｏｒｐｈａｎ）、ワルファリン、アルプロザム（ａｌｐｒｏｚａｍ）、ケトコナゾール、オメプラゾール、及びミノサイクリンが挙げられる。
ある特定の実施形態において、本発明は、タンパク質の発現を増加させるために使用されても良く、これは細胞の他の治療への感受性を高める。例えば、ある特定の実施形態において、本発明は、ＲＮａｓｅ Ｈの発現を増加させるために使用されても良い。ＲＮａｓｅ Ｈが増加した細胞は、ＲＮａｓｅ Ｈ依存性アンチセンス化合物による後続の治療により感受性であり得る。
非限定的な開示及び参照による組み込み
本明細書に記載されるある特定の化合物、組成物、及び方法がある特定の実施形態に従って具体的に説明されているが、以下の実施例は、本明細書に記載される化合物を例証することのみに役立ち、それを限定するようには意図されていない。本出願に列挙される参考文献、ＧｅｎＢａｎｋ受入番号等は各々、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本出願に添付される配列表が必要に応じて各配列を「ＲＮＡ」または「ＤＮＡ」のいずれかと特定するが、実際には、それらの配列は、化学修飾の任意の組み合わせで修飾され得る。当業者であれば、修飾オリゴヌクレオチドを説明するための「ＲＮＡ」または「ＤＮＡ」のそのような指定が、ある特定の事例において、任意であることを容易に認識する。例えば、２’−ＯＨ糖部分及びチミン塩基を含むヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、修飾糖を有するＤＮＡ（ＤＮＡの天然２’−Ｈの場合、２’−ＯＨ）または修飾塩基を有するＲＮＡ（ＲＮＡの天然ウラシルの場合、チミン（メチル化ウラシル））と記載され得る。
したがって、配列表中のものを含むが、これらに限定されない本明細書に提供される核酸配列は、修飾核酸塩基を有する核酸を含むが、これらに限定されない天然または修飾ＲＮＡ及び／またはＤＮＡの任意の組み合わせを含有する核酸を包含するよう意図されている。さらなる例として、かつ限定されることなく、核酸塩基配列「ＡＴＣＧＡＴＣＧ」を有するオリゴマー化合物は、修飾であろうと非修飾であろうと、そのような核酸塩基配列を有する任意のオリゴマー化合物を包含し、それには、限定されないが、配列「ＡＵＣＧＡＵＣＧ」を有するもの、ならびに「ＡＵＣＧＡＴＣＧ」等のいくつかのＤＮＡ塩基及びＲＮＡ塩基を有するもの等のＲＮＡ塩基を含むそのような化合物、ならびに「ＡＴｍＣＧＡＵＣＧ」（この場合、ｍＣは、５位にメチル基を含むシトシン塩基を示す）等の他の修飾塩基または天然塩基を有するオリゴマー化合物が含まれる。
実施例
以下の実施例は、本発明のある特定の実施形態を示しており、限定的なものではない。さらに、特定の実施形態が提供される場合、本発明者らは、それらのある特定の実施形態の一般的適用を企図した。例えば、ある特定のモチーフを有するオリゴヌクレオチドの開示は、同じモチーフまたは同様のモチーフを有するさらなるオリゴヌクレオチドへの合理的な支持を提供する。同様に、例えば、ある特定の高親和性修飾がある特定の位置に出現する場合、同一の位置での他の高親和性修飾は、別途示されない限り、好適なものと見なされる。
実施例１：ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現に与える影響
ヒトＲＮａｓｅ Ｈ１ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号１と表される、ＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿００１２８６８３４．１）は、上流オープンリーディングフレーム（ｕＯＲＦ）を含む。ヒトＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦの開始コドンを標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＲＮａｓｅ Ｈ１発現に与える影響について試験した。表３に記載するこれらのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。表３に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号１上の位置を示す。標的のｕＯＲＦは８６位で始まる。ＨｅＬａ細胞を、２５ｎＭの最終濃度のＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）及びアンチセンスオリゴヌクレオチドのうちの１つでトランスフェクトするか、または対照として模擬トランスフェクトした。トランスフェクションから３０時間後、細胞を溶解し、ＲＮａｓｅ Ｈ１の発現をウエスタンブロット及びＲＴ−ＰＣＲによって分析した。ウエスタンブロットに使用した一次抗体は、Ｗｕ ｅｔ ａｌ．Ｄｅｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ Ｒｏｌｅ ｏｆ ｔｈｅ Ｈｕｍａｎ ＲＮａｓｅ Ｈ１ ｉｎ ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ ｏｆ ＤＮＡ−ｌｉｋｅ Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｄｒｕｇｓ．Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７９，１７１８１（２００４）に記載されている通りに作製し、二次抗体は、Ｂｉｏｒａｄ（カタログ番号１７０−６５１５）から購入した。ウエスタンブロットを、Ｉｍａｇｅ Ｊを使用して定量化し、結果を、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２ローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクト細胞に対するタンパク質レベルのパーセントとして表３に示す。ＲＴ−ＰＣＲ結果を、Ｒｉｂｏｇｒｅｅｎに対して正規化した後の模擬トランスフェクト細胞に対するｍＲＮＡレベルのパーセントとして表３に示す。結果は、ｕＯＲＦ開始コドンを含むＲＮａｓｅ Ｈ１ ｕＯＲＦの一部分を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＲＮａｓｅ Ｈ１発現を増加させたことを示す。さらに、ある特定のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＲＮａｓｅ Ｈ１ ｍＲＮＡレベルに著しく影響せず、これは、これらのオリゴヌクレオチドが呈したＲＮａｓｅ Ｈ１発現の増加が、主に翻訳の増加によって生じたことを示す。
Figure 2017533721
実施例２：インビトロのｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドによる処理後のＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現の経時変化
ＨｅＬａ細胞を２５ｎＭのＩｓｉｓ番号７６１９０９（表３参照）でトランスフェクトした。トランスフェクション後の様々な時点で、細胞を採取し、ＲＮａｓｅ Ｈ１発現を実施例１に記載のようにウエスタンブロットによって分析した。結果を、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２ローディング対照に対して正規化した後のアンチセンスオリゴヌクレオチド処理を受けなかった細胞（０時間の時点で採取）に対するＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現のパーセントとして表４に示す。結果は、ＲＮａｓｅ Ｈ１発現の導入がトランスフェクション後４時間以内に観察され、最大の発現はトランスフェクション後約１２時間で観察されたことを示す。
Figure 2017533721
実施例３：ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがインビトロのＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現に与える用量応答効果
Ｉｓｉｓ番号７６１９０９（表３参照）を、インビトロのＲＮａｓｅ Ｈ１発現に与えるその影響について５つの異なる用量で試験した。ＨｅＬａ細胞を、表５に列挙する濃度の７６１９０９でトランスフェクトするか、または対照として処理しなかった。トランスフェクションの１５時間後、ＲＮａｓｅ Ｈ１発現を実施例１に記載のように分析した。結果を、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２ローディング対照に対して正規化した後の未処理対照に対するタンパク質レベルのパーセント、及びＲｉｂｏｇｒｅｅｎに対して正規化した後の未処理対照細胞に対するｍＲＮＡレベルとして、表５に示す。結果は、ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦの一部分を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが、用量依存的にＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質レベルを増加させ、かつｍＲＮＡレベルは増加しなかったことを示し、これは、アンチセンスオリゴヌクレオチドが翻訳の増加によってＲＮａｓｅ Ｈ１発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
実施例４：ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦの上流にある５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現に与える影響
ヒトＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦの上流にある５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＲＮａｓｅ Ｈ１発現に与える影響について試験した。表６に記載するこれらのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。表６に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号１上の位置を示す。Ｉｓｉｓ７６１９０９を参照のため含めた。ＨｅＬａ細胞を、２０ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として模擬トランスフェクトした。トランスフェクションの１５時間後、ＲＮａｓｅ Ｈ１発現を実施例１に記載のように分析した。結果を、γ−チューブリンローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクトした細胞に対するタンパク質発現のパーセント、及びＲｉｂｏｇｒｅｅｎに対して正規化した後の模擬トランスフェクトした細胞に対するｍＲＮＡレベルのパーセントとして以下の表６に示す。結果は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的の翻訳の増加を誘導するために必ずしもｕＯＲＦの開始コドンを標的とする必要がないことを示す。ｕＯＲＦの上流にある５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド、及びｕＯＲＦ自体の少なくとも一部分を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的の翻訳を誘導することができる。さらに、ｕＯＲＦの上流にある５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドはｍＲＮＡレベルを増加させず、このことは、それらが翻訳の増加によってＲＮａｓｅ Ｈ１発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
実施例５：様々な長さのアンチセンスオリゴヌクレオチドがＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現に与える影響
ヒトＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦの少なくとも一部分を標的とするように設計される様々な長さのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＲＮａｓｅ Ｈ１発現に与える影響について試験した。表７に記載するこれらのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。表７に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号１上の位置を示す。ＨｅＬａ細胞を、２０ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として模擬トランスフェクトした。トランスフェクションの１５時間後、ＲＮａｓｅ Ｈ１発現を実施例１に記載のように分析した。結果を、γ−チューブリンローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクトした細胞に対するタンパク質発現のパーセント、及びＲｉｂｏｇｒｅｅｎに対して正規化した後の模擬トランスフェクトした細胞に対するｍＲＮＡレベルのパーセントとして以下の表７に示す。結果は、様々な長さのアンチセンスオリゴヌクレオチドが、主に標的の翻訳の増加によってＲＮａｓｅ Ｈ１発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
実施例６：マウスＬＲＰＰＲＣのｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＬＲＰＰＲＣタンパク質発現に与える影響
マウスのロイシンリッチＰＰＲモチーフ含有（ＬＲＰＰＲＣ）ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号２と表される、ＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０２８２３３．２）は、上流オープンリーディングフレームを含む。マウスＬＲＰＰＲＣのｕＯＲＦの開始コドンを標的とするように設計される様々な長さ及びヌクレオシド間結合を持つアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＬＲＰＰＲＣタンパク質発現に与える影響について試験した。表８に記載するこれらのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。表８に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号２上の位置を示す。標的のｕＯＲＦは７０位で始まる。ＭＨＴ細胞を、表８に列挙する濃度のＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）及びアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として未処理とした。トランスフェクションの１５時間後、細胞を溶解し、ウエスタンブロットを、Ａｂｃａｍ（カタログ番号ａｂ９７５０５）から購入したＬＲＰＰＲＣ抗体を用いて行い、ＬＲＰＰＲＣの発現を分析した。ウエスタンブロットを、Ｉｍａｇｅ Ｊを使用して定量化し、結果を、ローディング対照（７６１９３２及び７６１９３３についてはＡｎｎｅｘｉｎ Ａ２、７５９７０４及び７６１９３０についてはｈｎＲＮＰ Ｋ）に対して正規化した後の未処理対照細胞に対する発現のパーセントとして以下の表８に示す。結果は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチド及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含むオリゴヌクレオチドを含む、マウスＬＲＰＰＲＣのｕＯＲＦの開始コドンを標的とする様々な長さのアンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＬＲＰＰＲＣ発現を増加させたことを示す。したがって、表８中の結果は、上記の実施例における結果とともに、ｕＯＲＦの少なくとも一部分を標的とする様々なアンチセンスオリゴヌクレオチドが、複数の種における複数の標的の発現を増加させ得ることを示す。
Figure 2017533721
実施例７：ヒトＳＦＸＮ３のｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＳＦＸＮ３タンパク質発現に与える影響
ヒトＳｉｄｅｒｏｆｌｅｘｉｎ ３（ＳＦＸＮ３）ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号２０と表される、ＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０３０９７１．３）は、上流オープンリーディングフレームを含む。ヒトＳＦＸＮ３のｕＯＲＦの開始コドンを標的とするように設計されたアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それがインビトロのＳＦＸＮ３タンパク質発現に与える影響について試験した。表９に記載するアンチセンスオリゴヌクレオチドを、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。表９に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号２０上の位置を示す。標的のｕＯＲＦは３８８位で始まる。ＨｅＬａ細胞を、表９に列挙する濃度のＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）及びアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として未処理とした。トランスフェクションから１０時間後、細胞を溶解し、ＳＦＸＮ３ ｍＲＮＡ及びタンパク質発現を、それぞれＲＴ−ＰＣＲ及びウエスタンブロットによって分析した。ウエスタンブロットは、Ａｂｃａｍから購入したＳＦＸＮ３抗体（カタログ番号ａｂ１８１１６３）を用いて行い、Ｉｍａｇｅ Ｊを使用して定量化した。結果を、ローディング対照（Ｋｕ７０、Ａｂｃａｍ抗体で検出、カタログ番号ａｂ３１１４）に対して正規化した後の未処理対照細胞（「ＵＴＣ」）に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表９に示す。Ｒｉｂｏｇｒｅｅｎに対して正規化したＳＦＸＮ３ ｍＲＮＡレベルも示す。結果は、ヒトＳＦＸＮ３のｕＯＲＦの開始コドンを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＳＦＸＮ３タンパク質発現を増加させたことを示す。ＳＦＸＮ３ ｍＲＮＡレベルは増加せず、これは、アンチセンスオリゴヌクレオチドが翻訳の増加によってＳＦＸＮ３発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
実施例８：マウスＭＲＰＬ１１のｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＭＲＰＬ１１タンパク質発現に与える影響
マウスミトコンドリアリボソームタンパク質Ｌ１１（ＭＲＰＬ１１）ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号２２と表される、ＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０２５５５３．４）は、上流オープンリーディングフレームを含む。マウスＭＲＰＬ１１のｕＯＲＦの開始コドンを標的とするように設計されたアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それがインビトロのＭＲＰＬ１１タンパク質発現に与える影響について試験した。表１０に記載するアンチセンスオリゴヌクレオチドを、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。表１０に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号２２上の位置を示す。標的のｕＯＲＦは２４位で始まる。ｂＥＮＤ細胞を、表１０に列挙する濃度のＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）及びアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として未処理とした。トランスフェクションから１０時間後、細胞を溶解し、ＭＲＰＬ１１ ｍＲＮＡ及びタンパク質発現を、それぞれＲＴ−ＰＣＲ及びウエスタンブロットによって分析した。ウエスタンブロットは、Ａｂｃａｍから購入したＭＲＰＬ１１抗体（カタログ番号ａｂ２０６６ｓ）を用いて行い、Ｉｍａｇｅ Ｊを使用して定量化した。結果を、ローディング対照（ＧＡＰＤＨ、Ｓａｎｔａ Ｃｒｕｚ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ抗体で検出、カタログ番号ｓｃ−３２２３３）に対して正規化した後の未処理対照細胞（「ＵＴＣ」）に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表１０に示す。Ｒｉｂｏｇｒｅｅｎに対して正規化したＭＲＰＬ１１ ｍＲＮＡレベルも示す。結果は、マウスＭＲＰＬ１１のｕＯＲＦの開始コドンを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＭＲＰＬ１１タンパク質発現を増加させたことを示す。ＭＲＰＬ１１ ｍＲＮＡレベルは増加せず、これは、アンチセンスオリゴヌクレオチドが翻訳の増加によってＭＲＰＬ１１発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
実施例９：ヒトＴＨＰＯのｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＴＨＰＯタンパク質発現に与える影響
ヒトトロンボポエチン（ＴＨＰＯ）ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号２４と表される、ＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０００４６０．３）は、７個の上流オープンリーディングフレームを含む。ヒトＴＨＰＯの最後のｕＯＲＦの開始コドンを標的とするように設計されたアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それがインビトロのＴＨＰＯタンパク質発現に与える影響について試験した。表１１に記載するアンチセンスオリゴヌクレオチドを、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。表１１に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号２４上の位置を示す。標的のｕＯＲＦは２１０位で始まる。Ｈｅｐ３Ｂ細胞を、表１１に列挙する濃度のＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）及びアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または細胞を対照として未処理とした。トランスフェクションの１０時間後、培地を無血清培地に変え、細胞をさらに１２時間インキュベートした。培地からのタンパク質を、トリクロロ酢酸を使用して沈殿させ、ＴＨＰＯタンパク質発現を、Ａｂｃａｍ（カタログ番号ａｂ１９６０２６）から購入したＴＨＰＯ抗体を使用するウエスタンブロットによって分析し、Ｉｍａｇｅ Ｊを使用して定量化した。結果を、ローディング対照（トランスフェリン）に対して正規化した後の未処理対照細胞（「ＵＴＣ」）に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表１１に示す。結果は、ヒトＴＨＰＯのｕＯＲＦの開始コドンを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＴＨＰＯタンパク質発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
実施例１０：ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦを標的とするミスマッチのアンチセンスオリゴヌクレオチドがＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現に与える影響
アンチセンスオリゴヌクレオチドと標的配列との間に２つのミスマッチを持つヒトＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦの開始コドンを標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＲＮａｓｅ Ｈ１発現に与える影響について試験した。表１２に記載するこれらのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。表１２に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号１上の位置を示し、ミスマッチのヌクレオチドは太字にする。標的のｕＯＲＦは８６位で始まる。ＨｅＬａ細胞を、２５ｎＭの最終濃度のＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）及びアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として模擬トランスフェクトした。トランスフェクションの２４時間後、細胞を溶解し、ＲＮａｓｅ Ｈ１の発現を実施例１に記載のようにウエスタンブロットによって分析した。結果を、Ｋｕ７０ローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクト細胞に対するタンパク質レベルのパーセントとして表１２に示す。結果は、ｕＯＲＦ開始コドンに対するまたはｕＯＲＦ開始コドンに対して近くのミスマッチを持つアンチセンスオリゴヌクレオチドが、ＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現にほとんどまたは全く影響しなかった一方で、ｕＯＲＦ開始コドンからさらに離れたミスマッチを持つアンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
Figure 2017533721
実施例１１：様々な修飾を含むアンチセンスヌクレオチドの影響
ヒトＲＮａｓｅ Ｈ１（配列番号１）またはマウスＬＲＰＰＲＣ（配列番号２）におけるｕＯＲＦの開始コドンを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを、様々な長さならびにヌクレオシド間結合及び糖への様々な修飾を持つように設計した。これらのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロの標的タンパク質発現に与える影響について試験した。ＨＥＫ２９３細胞（ＲＮａｓｅ Ｈ１標的化オリゴヌクレオチド）またはＭＨＴ細胞（ＬＲＰＰＲＣ標的化オリゴヌクレオチド）を、以下の表に列挙する濃度のＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭＡＸ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）及びアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。トランスフェクションの１０時間後、細胞を溶解し、標的タンパク質発現を、実施例１（ＲＮａｓｅ Ｈ１について）または実施例６（ＬＲＰＰＲＣについて）で記載したようにウエスタンブロットによって分析した。結果を、ローディング対照（Ｋｕ７０、γ−チューブリン、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２、または一次抗体によって検出された非特異的帯）に対して正規化した後の未処理対照細胞（「ＵＴＣ」）に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、様々な長さであり、修飾ヌクレオシド間結合ならびに様々な２’−修飾及び二環式ヌクレオシドを持つアンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的タンパク質発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
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実施例１２：インビボのマウスＬＲＰＰＲＣのｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
Ｉｓｉｓ番号７６１９３３（実施例６参照）を、それがインビボのＬＲＰＰＲＣタンパク質発現に与える影響について試験した。生後７週の３匹または４匹の雄のＢＡＬＢ／ｃマウスの群に、以下の表に列挙する用量のＩｓｉｓ番号７６１９３３、または生理食塩水を、皮下注射により全身投与した。４８時間後、動物を屠殺するか（表２３）、または動物に第２の投薬を行った（表２４）。第２の投薬を受けた動物を、第２の投薬の４８時間後に屠殺した。肝臓ホモジネートを調製し、ＬＲＰＰＲＣタンパク質発現を実施例６に記載のようにウエスタンブロットによって分析した。結果を、ローディング対照（ＧＡＰＤＨまたはｈｎＲＮＰ Ｋ）に対して正規化した後の生理食塩水処理動物に対する発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、ＬＲＰＰＲＣタンパク質発現が、ＬＲＰＰＲＣのｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理した後、インビボで増加したことを示す。
Figure 2017533721
Figure 2017533721
実施例１３：インビボのマウスＴＨＰＯのｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
マウストロンボポエチン（ＴＨＰＯ）ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号４３と表される、ＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿００９３７９．２）は、上流オープンリーディングフレームを含む。Ｉｓｉｓ番号８０９７９３（以下の表参照）を、マウスＴＨＰＯのｕＯＲＦの開始コドンを標的とするように設計し、それがインビボのＴＨＰＯタンパク質発現に与える影響について試験した。表２５に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号４３上の位置を示す。３匹のマウスの群に、以下の表に列挙する用量のＩｓｉｓ番号８０９７９３、または生理食塩水を、皮下注射により全身投与した。４８時間後に動物を屠殺し、血清及び骨髄を採取した。血清のＴＨＰＯタンパク質発現を実施例９に記載のようにウエスタンブロットによって分析し、骨髄のＴＨＰＯ ｍＲＮＡ発現をＲＴ−ＰＣＲによって分析した。骨髄のＴＨＰＯ ｍＲＮＡレベルは、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理による影響を受けなかった（データは示さず）。以下の表に示す結果は、２つの独立した実験の平均であり、ローディング対照（トランスフェリン）に対して正規化した後の生理食塩水処理動物に対する発現のパーセントとして示す。結果は、ＴＨＰＯタンパク質発現が、ＴＨＰＯのｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理した後、インビボで増加したことを示す。
Figure 2017533721
実施例１４：相補的オリゴヌクレオチドによるｕＯＲＦ標的化オリゴヌクレオチドの阻害
ｕＯＲＦを標的とするオリゴヌクレオチドによって媒介される翻訳の増加が可逆的であるかどうかを試験するために、ｕＯＲＦ標的化オリゴヌクレオチドに相補的なオリゴヌクレオチドの影響を、インビトロで試験した。ＨｅＬａ細胞を、実施例１に記載のように２０ｎＭのＩｓｉｓ番号７６１９０９でトランスフェクトした。５時間後、細胞を、以下の表に列挙する濃度のＩｓｉｓ番号７６１９０９に相補的なＩｓｉｓ番号７６１９２９でトランスフェクトした。第２のトランスフェクションの５時間後、細胞を溶解し、ＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現を、γ−チューブリンをローディング対照として使用して実施例１に記載のように分析した。結果を、γ−チューブリンローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクト細胞に対する発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、ｕＯＲＦ標的化オリゴヌクレオチドを標的とするオリゴヌクレオチドが、ｕＯＲＦ標的化オリゴヌクレオチドの用量依存的に翻訳を増加させる能力を遮断したことを示す。
Figure 2017533721
実施例１５：翻訳を全体的に遮断することによるｕＯＲＦ標的化オリゴヌクレオチドの阻害
ｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドによって媒介されるタンパク質発現の増加が、タンパク質安定性の増加に起因するかどうかを試験するために、翻訳をオリゴヌクレオチドのトランスフェクション後に遮断した。ＨｅＬａ細胞を、Ｉｓｉｓ番号７６１９０９（実施例１参照）でトランスフェクトするか、または模擬トランスフェクトした。１２時間後、細胞を、３７℃にて、ＤＭＳＯまたは１５μｇ／ｍｌのシクロヘキシミドで処理した。その後、細胞を様々な時点で収集し、細胞溶解物を調製し、実施例１に記載のように、ウェスタン分析を行った。複製ＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルを銀染色し、ローディング対照とした。ＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質レベルを、ローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクト細胞に対して計算した。結果（データは示さず）は、シクロヘキシミド処理後のＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質レベルの低減率が、模擬トランクフェクト細胞及びＩｓｉｓ番号７６１９０９トランスフェクト細胞と同様であったことを示した。したがって、これらの結果は、いくつかの上記の実施例で示したｍＲＮＡの増加の欠如とともに、ｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドによって媒介されるタンパク質発現の増加が、タンパク質翻訳の増加に起因することを示す。
実施例１６：ｕＯＲＦ標的化アンチセンスオリゴヌクレオチドが新生タンパク質翻訳に与える影響
ｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが新たなタンパク質の翻訳の増加を媒介することをさらに確認するために、ＬＲＰＰＲＣのパルスチェイス標識及び免疫沈降を行った。ＭＨＴ細胞をＩｓｉｓ番号７６１９３０で７時間トランスフェクトし、メチオニンを欠く予熱した培地（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ、ＲＰＭＩ １６４０）で３７℃で３０分間インキュベートした。その後、細胞を、２０分間ＲＰＭＩ１６４０培地において３５μＣｉ／ｍｌ Ｓ３５−メチオニンでパルス標識し、１ｍＭのメチオニンで４０分間追跡した。細胞を、１０μｇ／ｍｌのシクロヘキシミドを含有する冷ＰＢＳで洗浄し、細胞溶解物を、ＩＰ緩衝液（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を使用して調製した。免疫沈降を、抗ＬＲＰＰＲＣ抗体（Ｐｒｏｔｅｉｎｔｅｃｈ）を使用して４℃で３時間実施した。４回洗浄した後、沈降したタンパク質を４〜１２％のＳＤＳ−ＰＡＧＥゲルで分析し、膜に移し、オートラジオグラフィーによって可視化した。模擬トランスフェクト細胞からの免疫沈降物中のＬＲＰＰＲＣ帯は、Ｉｓｉｓ番号７６１９３０処理細胞からの免疫沈降物（データ割愛）中のものよりも著しく軽く、ｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが、標的タンパク質翻訳の増加によってタンパク質発現を増加させることがさらに裏付られた。さらに、模擬トランスフェクト細胞とＩｓｉｓ番号７６１９３０トランスフェクト細胞との両方への溶解物の流入もオートラジオグラフィーによって分析すると、非常に類似しており、翻訳増加が標的特異的であったことを示した。
実施例１７：ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＲＮａｓｅ Ｈ１活性に与える影響
ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドによって媒介されるＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質レベルの増加がＲＮａｓｅ Ｈ１活性の増加をもたらすかどうかを試験するために、細胞を、まずＩｓｉｓ番号７６１９０９（実施例１参照）、またはＲＮａｓｅ Ｈ１を標的としない対照オリゴヌクレオチドＩｓｉｓ番号７５９７０４でトランスフェクトし、次に、Ｕ１６ ｓｎｏＲＮＡまたはＮＣＬ１ ｍＲＮＡを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトした。第１のトランスフェクションの１０時間後、細胞を約５０％の密集度で再度播種した。１４時間後、細胞に対してＩｓｉｓ番号４６２０２６（Ｕ１６）またはＩｓｉｓ番号１１００７４（ＮＣＬ１）でさらに４時間、２度目のトランスフェクトを行った。次に細胞を収集し、溶解し、Ｕ１６ ｓｎｏＲＮＡまたはＮＣＬ１ ｍＲＮＡレベルを、ＴａｑＭａｎプライマープローブセットを使用してＲＴ−ｑＰＣＲによって分析した。使用したプライマープローブセット配列は、Ｕ１６について、順方向：５´−ＣＴＴＧＣＡＡＴＧＡＴＧＴＣＧＴＡＡＴＴＴＧＣ−３´（配列番号４６）、逆方向：５´−ＴＣＧＴＣＡＡＣＣＴＴＣＴＧＴＡＣＣＡＧＣＴＴ−３´（配列番号４７）、及びプローブ：５´−ＴＴＡＣＴＣＴＧＴＴＣＴＣＡＧＣＧＡＣＡＧＴＴＧＣＣＴＧＣ−３´（配列番号４８）；ＮＣＬ１について、順方向：５’−ＧＣＴＴＧＧＣＴＴＣＴＴＣＴＧＧＡＣＴＣＡ−３’（配列番号４９）、逆方向：５’−ＴＣＧＣＧＡＧＣＴＴＣＡＣＣＡＴＧＡ−３’（配列番号５０）、及びプローブ：５’−ＣＧＣＣＡＣＴＴＧＴＣＣＧＣＴＴＣＡＣＡＣＴＣＣ−３’（配列番号５１）であった。結果を、Ｒｉｂｏｇｒｅｅｎを使用して測定した総ＲＮＡに対して正規化した、いずれのオリゴヌクレオチドでもトランスフェクトしなかった未処理対照細胞に対するＲＮＡレベルのパーセントとして以下の表に示す。結果は、ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦを標的とするＩｓｉｓ番号７６１９０９が、Ｕ１６及びＮＣｌ１アンチセンスオリゴヌクレオチドのアンチセンス活性を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
Figure 2017533721
実施例１８：ＲＮａｓｅ Ｈ１の５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
ヒトＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦの上流にある５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＲＮａｓｅ Ｈ１発現に与える影響について試験した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号１上の位置を示す。ＨＥＫ ２９３細胞を、２０ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として模擬トランスフェクトした。トランスフェクションの１０時間後、ＲＮａｓｅ Ｈ１タンパク質発現を実施例１に記載のように分析した。結果を、ＧＡＰＤＨローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクト細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、ＲＮａｓｅ Ｈ１のｕＯＲＦの上流にある５’−非翻訳領域を標的とする多くのアンチセンスオリゴヌクレオチドが標的の翻訳を誘導したことを示す。
Figure 2017533721
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Figure 2017533721
Figure 2017533721
実施例１９：ＡＣＰ１の５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
ｕＯＲＦを含まない細胞質ホスホチロシンタンパク質ホスファターゼ（ＡＣＰ１）の５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それがインビトロのＡＣＰ１タンパク質発現に与える影響について試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒトＡＣＰ１ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号７８と表されるＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿００４３００．３）を標的とし、５’−非翻訳領域における少なくとも１つのステムループ構造を標的とするように設計した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号７８上の位置を示す。ＨＥＫ ２９３細胞を、以下の表に示す濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションの１０時間後、ＡＣＰ１タンパク質発現を、ＡＣＰ１に対するＡｂｃａｍ抗体（カタログ番号ａｂ１６６８９６）を使用してウエスタンブロットによって分析した。結果を、ｐ３２ローディング対照に対して正規化した後の未処理対照細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、ヒトＡＣＰ１の５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが標的の翻訳を誘導したことを示す。
Figure 2017533721
実施例２０：ＣＦＴＲのｕＯＲＦ開始コドンの下流にある５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＣＦＴＲタンパク質発現に与える影響
ヒト嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子（ＣＦＴＲ）のｕＯＲＦ開始コドンの下流にある５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＣＦＴＲタンパク質発現に与える影響について試験した。以下の表に記載するこれらのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、ＣＦＴＲ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号８１と表されるＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０００４９２．３）を標的とするように設計し、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号８１上の位置を示す。１つのｕＯＲＦは配列番号８１の１３位で始まる。Ｉｓｉｓ番号７８６４５５は、ｕＯＲＦ開始コドンのすぐ下流にあるｕＯＲＦの部分を標的とする。Ｉｓｉｓ番号７８６４５６は、さらに下流のステムループ構造を標的とする。
ＨＴ−２９細胞を、以下の表に列挙する濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として模擬トランスフェクトした。トランスフェクションの１２時間または２２時間後、ＣＦＴＲ発現を、ＥＭＤ Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅから購入した抗ＣＦＴＲ（カタログ番号０５−５８３、クローンＭ３Ａ７）を使用してウエスタンブロットによって分析した。結果を、ＨＳＰ９０ローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクト細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、アンチセンスオリゴヌクレオチドがＣＦＴＲタンパク質発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
実施例２１：ｕＯＲＦを含まない翻訳抑制要素の特定
ＲＮａｓｅ Ｈ１ ５’−ＵＴＲ配列の一部がＲＮａｓｅ Ｈ１発現に与える影響を試験するために、野生型及び変異型５’−ＵＴＲ配列をプラスミドにクローニングし、蛍ルシフェラーゼに縮合した。レニラルシフェラーゼを正規化のための同じプラスミドにクローニングした。プラスミドをＨｅＬａ細胞にトランスフェクトし、蛍ルシフェラーゼ及びレニラルシフェラーゼ活性を、標準的な方法を使用して検出した。レニラルシフェラーゼ活性に対して正規化した野生型５’−ＵＴＲレポーターと比較した変異体及びそれらの蛍ルシフェラーゼ活性を以下の表に示す。以下の表で報告するヌクレオチド位置は、突然変異または欠失した配列番号１の５’−ＵＴＲの位置を指す。結果は、複数の実験の平均であり、ｕＯＲＦを含まない部分を含むＲＮａｓｅ Ｈ１の５’−ＵＴＲ配列の一部分の突然変異及び／または欠失が、レポーター系における発現の増加をもたらしたことを示し、このことは、突然変異した部分が翻訳抑制要素の一部であることを示す。
Figure 2017533721
実施例２２：インビボのマウスＬＲＰＰＲＣのｕＯＲＦを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
Ｉｓｉｓ番号８０６７４０（実施例１１参照）を、それがインビボのＬＲＰＰＲＣタンパク質発現に与える影響について試験した。生後７週の３匹の雄のＢＡＬＢ／ｃマウスの群に、以下の表に列挙する用量のＩｓｉｓ番号８０６７４０、または生理食塩水を、皮下注射により全身投与した。４８時間後、マウスに以下の表に列挙する第２の投薬を行った。第２の投薬の４８時間後に動物を屠殺した。肝臓ホモジネートを調製し、ＬＲＰＰＲＣタンパク質発現を実施例６に記載のようにウエスタンブロットによって分析した。結果を、ローディング対照（ＰＳＦ）に対して正規化した後の生理食塩水処理動物に対する発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、ＬＲＰＰＲＣタンパク質発現が、ＬＲＰＰＲＣのｕＯＲＦを標的とし、かつ二環式核酸を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理した後、インビボで増加したことを示す。
Figure 2017533721
実施例２３：ＡＣＰ１の５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
ｕＯＲＦを含まないＡＣＰ１の５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響を上に示す（実施例１９参照）。ＡＣＰ１の５’−非翻訳領域を標的とするように設計した追加のアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＡＣＰ１タンパク質発現に与える影響について試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒトＡＣＰ１ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号７８と表されるＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿００４３００．３）を標的とする。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号７８上の位置を示す。ＨｅＬａ細胞を、以下の表に示す２５ｎＭのアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションの１０時間後、ＡＣＰ１タンパク質発現を、ＡＣＰ１に対するＡｂｃａｍ抗体（カタログ番号ａｂ１６６８９６）を使用してウエスタンブロットによって分析した。結果を、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２ローディング対照に対して正規化した後の未処理対照細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。
Figure 2017533721
実施例２４：様々な修飾を含むＡＣＰ１を標的とするアンチセンスヌクレオチドの影響
ＡＣＰ１の５’−非翻訳領域のＩｓｉｓ番号８１２６５８（実施例１９及び２３参照）と同じまたは同様の部位を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、様々な修飾を考慮して設計し、それらがインビトロのＡＣＰ１タンパク質発現に与える影響について試験した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号７８上の位置を示す。ＨｅＬａ細胞を、以下の表に示す濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションの１０時間後、ＡＣＰ１タンパク質発現を、ＡＣＰ１に対するＡｂｃａｍ抗体（カタログ番号ａｂ１６６８９６）を使用してウエスタンブロットによって分析した。結果を、Ａｎｎｅｘｉｎ Ａ２またはＴＭＥＤ９ローディング対照に対して正規化した後の未処理対照細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。
Figure 2017533721
Figure 2017533721
Figure 2017533721
Figure 2017533721
実施例２５：マウスＡＣＰ１の５’−ＵＴＲを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
マウスＡＣＰ１の５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＡＣＰ１タンパク質発現に与える影響について試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、マウスＡＣＰ１ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号９１と表されるＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０２１３３０．４）を標的とし、５’−ＵＴＲにおける少なくとも１つのステムループ構造を標的とするように設計した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号９１上の位置を示す。ＭＨＴ細胞を、以下の表に示す濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションの１０時間後、ＡＣＰ１タンパク質発現をウエスタンブロットによって分析した。結果を、ＴＣＰ−１βローディング対照に対して正規化した後の未処理対照細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、マウスＡＣＰ１の５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが標的の翻訳を誘導したことを示す。
Figure 2017533721
実施例２６：インビボの５’−ＵＴＲマウスＡＣＰ１を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
Ｉｓｉｓ番号８２７８１５（以下の表を参照）を、それがインビボのマウスＡＣＰ１タンパク質発現に与える影響について試験した。生後７週の３匹の雄のＢＡＬＢ／ｃマウスの群に、以下の表に列挙する用量のＩｓｉｓ番号８２７８１５、または生理食塩水を、皮下注射により全身投与した。７２時間後に動物を屠殺した。肝臓ホモジネートを調製し、ＡＣＰ１タンパク質発現をウエスタンブロットによって分析した。結果を、ＴＭＥＤ９ローディング対照に対して正規化した後の生理食塩水処理動物に対する発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、ＡＣＰ１タンパク質発現が、ＡＣＰ１ ５’−ＵＴＲを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドで処理した後、インビボで増加したことを示す。
Figure 2017533721
実施例２７：マウスＡＲＦ１の５’−ＵＴＲを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
マウスＡＤＰ−リボシル化因子１（ＡＲＦ１）の５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それがインビトロのＡＲＦ１タンパク質発現に与える影響について試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ｕＯＲＦを含まないマウスＡＲＦ１ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号９４と表されるＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿００７４７６．３）を標的とし、５’−ＵＴＲにおける少なくとも１つのステムループ構造を標的とするように設計した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号９４上の位置を示す。ＭＨＴ細胞を、以下の表に示す濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションの１０時間後、ＡＲＦ１タンパク質発現をウエスタンブロットによって分析した。結果を、ＴＣＰ−１βローディング対照に対して正規化した後の未処理対照細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、マウスＡＲＦ１の５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが標的の翻訳を誘導したことを示す。
Figure 2017533721
実施例２８：マウスＵＳＰ１６の５’−ＵＴＲを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
マウスユビキチン処理プロテアーゼ（ＵＳＰ１６）の５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それがインビトロのＵＳＰ１６タンパク質発現に与える影響について試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、マウスＵＳＰ１６ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号９６と表されるＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０２４２５８．２）を標的とし、５’−ＵＴＲにおける少なくとも１つのステムループ構造を標的とするように設計した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号９６上の位置を示す。ＭＨＴ細胞を、以下の表に示す濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションの１０時間後、ＵＳＰ１６タンパク質発現をウエスタンブロットによって分析した。結果を、β−アクチン（ＡＣＴＢ）ローディング対照に対して正規化した後の未処理対照細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、マウスＵＳＰ１６の５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが標的の翻訳を誘導したことを示す。
Figure 2017533721
実施例２９：ヒトＬＤＬｒの５’−ＵＴＲを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
ヒトの低濃度リポタンパク質受容体（ＬＤＬｒ）の５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＬＤＬｒタンパク質発現及びＬＤＬ取り込みに与える影響について試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒトＬＤＬｒ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号９８と表されるＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０００５２７．４）を標的とし、５’−ＵＴＲにおける少なくとも１つのステムループ構造を標的とするように設計した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号９８上の位置を示す。ＨＥＫ２９３細胞またはＨｅＬａ細胞を、以下の表に示す濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションから１０時間後、ＬＤＬｒタンパク質発現をＥＬＩＳＡ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ、カタログ番号ＤＬＤＬＲ０）によって分析した。結果を、未処理対照細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、ヒトＬＤＬｒの５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが標的の翻訳を誘導したことを示す。
以下の表中のアンチセンスオリゴヌクレオチドがＬＤＬ取り込みに与える影響を試験するために、ＨＥＫ ２９３またはＨｅＬａ細胞を、以下の表に示す濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションの約１４時間後、培地を無脂質培地に変え、３７℃で１時間インキュベートした後、５〜１０μｇ／ｍＬのボディパイで標識したＬＤＬを、４℃で３０〜６０分間、トランスフェクトしていない対照細胞を含むすべての細胞に添加した。その後、細胞を、冷ＰＢＳで洗浄し、採取し、ＲＩＰＡ緩衝液で溶解した。ボディパイ蛍光を測定した。以下の表中の結果は、トランスフェクトしていない対照細胞に対するボディパイ蛍光のパーセントを示す。
Figure 2017533721
Figure 2017533721
実施例３０：ＣＦＴＲのｕＯＲＦ開始コドンの下流にある５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドがＣＦＴＲタンパク質発現に与える影響
ヒトＣＦＴＲのｕＯＲＦ開始コドンを標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＣＦＴＲタンパク質発現に与える影響について試験した。以下の表に記載するこれらのアンチセンスオリゴヌクレオチドを、ＣＦＴＲ ｍＲＮＡ（本明細書では配列番号８１と表されるＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＭ＿０００４９２．３）を標的とするように設計し、標的ＲＮＡの切断を含まないように均一に修飾した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号８１上の位置を示す。
ＨＴ−２９細胞を、以下の表に列挙する濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照として模擬トランスフェクトした。トランスフェクションの２４時間後、ＣＦＴＲ発現を実施例２０に記載のようにウエスタンブロットによって分析した。結果を、ローディング対照に対して正規化した後の模擬トランスフェクト細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、アンチセンスオリゴヌクレオチドがＣＦＴＲタンパク質発現を増加させたことを示す。
Figure 2017533721
実施例３１：ヒトＬＤＬｒの５’−ＵＴＲを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの影響
ヒトの低濃度リポタンパク質受容体（ＬＤＬｒ）の５’−非翻訳領域を標的とするように設計したアンチセンスオリゴヌクレオチドを、それらがインビトロのＬＤＬｒタンパク質発現に与える影響について試験した。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ヒトＬＤＬｒ ｍＲＮＡ（配列番号９８）を標的とし、５’−ＵＴＲにおける少なくとも１つのステムループ構造を標的とするように設計した。以下の表に列挙する開始部位及び終了部位は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的とする配列番号９８上の位置を示す。ＨＥＫ２９３細胞を、以下の表に示す濃度のアンチセンスオリゴヌクレオチドでトランスフェクトするか、または対照としてトランスフェクトしなかった。トランスフェクションから１６時間後、ＬＤＬｒタンパク質発現をＥＬＩＳＡ（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ、カタログ番号ＤＬＤＬＲ０）によって分析した。結果を、未処理対照細胞に対するタンパク質発現のパーセントとして以下の表に示す。結果は、ヒトＬＤＬｒの５’−非翻訳領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが標的の翻訳を誘導したことを示す。
Figure 2017533721
Figure 2017533721
実施例３２：５’−ＵＴＲを標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドによる処理後のＬＤＬｒタンパク質発現の経時変化
Ｈｅｐ３Ｂ細胞を、３０ｎＭのＩｓｉｓ番号８４２１９６（表４５参照）及びＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ２０００（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）でトランスフェクトした。トランスフェクション後の様々な時点で、細胞を採取し、ＬＤＬｒタンパク質発現を、実施例３０及び３１に記載のようにＥＬＩＳＡによって分析した。結果を、アンチセンスオリゴヌクレオチド処理を受けなかった細胞（０時間の時点で採取）に対するＬＤＬｒタンパク質発現のパーセントとして表４９に示す。結果は、ＬＤＬｒ発現が、４８時間の時点で、Ｉｓｉｓ番号８４２１９６による基準発現と比較して４倍超増加したことを示す。
Figure 2017533721

Claims (197)

  1. 細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、前記細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、前記標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって前記細胞における前記標的タンパク質の翻訳を増加させる、前記方法。
  2. 細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、前記細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、前記標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって前記細胞における前記標的タンパク質の翻訳の抑制を減少させる、前記方法。
  3. 細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、前記細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、前記標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって前記細胞における前記標的タンパク質の量または活性を増加させる、前記方法。
  4. 細胞における標的タンパク質の量の増加方法であって、前記細胞を、修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物と接触させることを含み、前記標的タンパク質が、少なくとも１つの翻訳抑制要素を含む標的転写物によってコードされ、前記修飾オリゴヌクレオチドが、前記標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的であり、それによって前記細胞における前記標的タンパク質の発現を増加させる、前記方法。
  5. 前記翻訳抑制要素領域が、５’非翻訳領域である、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
  6. 前記翻訳抑制要素領域が、前記５’非翻訳領域内にある、請求項１〜４のいずれかに記載の方法。
  7. 前記翻訳抑制要素領域が、１つのみのｕＯＲＦを含む、請求項１〜６のいずれかに記載の方法。
  8. 前記翻訳抑制要素領域が、少なくとも１つのｕＯＲＦを含有する、請求項１〜７のいずれかに記載の方法。
  9. 前記翻訳抑制要素が、ｕＯＲＦからなる、請求項１〜８のいずれかに記載の方法。
  10. 前記翻訳抑制要素領域が、１つ以上のｕＯＲＦを含有し、前記１つ以上のｕＯＲＦが、前記標的転写物の翻訳を抑制しない、請求項１〜８のいずれかに記載の方法。
  11. 前記翻訳抑制要素領域が、ｕＯＲＦを含有しない、請求項１〜６のいずれかに記載の方法。
  12. 前記翻訳抑制要素領域が、少なくとも１つのステムループ構造を含む、請求項１〜１１のいずれかに記載の方法。
  13. 前記少なくとも１つのステムループが、翻訳抑制要素である、請求項１２に記載の方法。
  14. 前記翻訳抑制要素が、突然変異から生じる、請求項１〜１３のいずれかに記載の方法。
  15. 前記突然変異が、ｕＯＲＦを創出する、請求項１４に記載の方法。
  16. 前記突然変異が、疾患を創出する、請求項１４または１５に記載の方法。
  17. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０〜４０個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  18. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  19. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１５〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  20. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  21. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  22. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜１８個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  23. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  24. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１７個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  25. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の結合ヌクレオシドからなる、請求項１〜１６のいずれかに記載の方法。
  26. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、請求項１〜２５のいずれかに記載の方法。
  27. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドである、請求項１〜２６のいずれかに記載の方法。
  28. 各非修飾ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドである、請求項２７に記載の方法。
  29. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、請求項１〜２６のいずれかに記載の方法。
  30. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドであり、各々独立して、修飾糖部分を含む、請求項２９に記載の方法。
  31. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、請求項１〜３０のいずれかに記載の方法。
  32. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、互いに同じである修飾糖部分を含む少なくとも２つの修飾ヌクレオシドを含む、請求項１〜３０のいずれかに記載の方法。
  33. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、互いに異なる修飾糖部分を含む少なくとも２つの修飾ヌクレオシドを含む、請求項１〜３０のいずれかに記載の方法。
  34. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項１〜３０のいずれかに記載の方法。
  35. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項１〜３０のいずれかに記載の方法。
  36. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項１〜３０のいずれかに記載の方法。
  37. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１８個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項１〜３０のいずれかに記載の方法。
  38. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも２０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項１〜２１及び２６〜３０のいずれかに記載の方法。
  39. 少なくとも１つの修飾糖部分が、２’−置換糖部分である、請求項２６〜３８のいずれかに記載の方法。
  40. 前記少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、及び２’−ＭＯＥの中から選択される、請求項３９に記載の方法。
  41. 前記少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＭＯＥである、請求項４０に記載の方法。
  42. 前記少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅである、請求項４０に記載の方法。
  43. 前記少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’Ｆである、請求項４０に記載の方法。
  44. 少なくとも１つの修飾糖部分が、二環式糖部分である、請求項２６〜４３のいずれかに記載の方法。
  45. 少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡまたはｃＥｔである、請求項４４に記載の方法。
  46. 少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡである、請求項４４に記載の方法。
  47. 少なくとも１つの二環式糖部分が、ｃＥｔである、請求項４４に記載の方法。
  48. 少なくとも１つの糖部分が、糖代理物である、請求項２６〜４７のいずれかに記載の方法。
  49. 少なくとも１つの糖代理物が、モルホリノである、請求項４８に記載の方法。
  50. 少なくとも１つの糖代理物が、修飾モルホリノである、請求項４８に記載の方法。
  51. 少なくとも１つの糖代理物が、ペプチド核酸である、請求項４８に記載の方法。
  52. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの、第１、第２、及び第３の３’−最末端ヌクレオシドが、二環式糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  53. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの、第１、第２、第３、及び第４の３’−最末端ヌクレオシドが、二環式糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  54. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、第１、第２、第３、第４、及び第５の３’−最末端ヌクレオシドが、二環式糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  55. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、第１、第２、第３、第４、第５、及び第６の３’−最末端ヌクレオシドが、二環式糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  56. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各二環式糖部分が、独立して、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、請求項５２〜５５に記載の方法。
  57. 前記修飾オリゴヌクレオチドの前記二環式糖部分が、ｃＥｔである、請求項５２〜５５に記載の方法。
  58. 二環式糖部分を含まない前記修飾オリゴヌクレオチドにおける各ヌクレオシドが、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される修飾糖部分を含む、請求項５２〜５７のいずれかに記載の方法。
  59. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１及び第２の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  60. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、及び第３の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  61. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、第３、及び第４の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  62. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、第３、第４、及び第５の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  63. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、第３、第４、第５、及び第６の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項２９に記載の方法。
  64. 前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第３、及び第５の３’−最末端ヌクレオシドが、ｃＥｔヌンクレオシドであり、前記修飾オリゴヌクレオチドの前記第２及び第４の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドであり、各残りのヌクレオシドが、２’−修飾ヌクレオシドである、請求項２８に記載の方法。
  65. 各残りのヌクレオシドが、２’−ＯＭｅヌクレオシドである、請求項６４に記載の方法。
  66. 各残りのヌクレオシドが、２’−ＭＯＥヌクレオシドである、請求項６４に記載の方法。
  67. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、請求項１〜６６のいずれかに記載の方法。
  68. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項１〜６６のいずれかに記載の方法。
  69. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項１〜６６のいずれかに記載の方法。
  70. 前記修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項６９に記載の方法。
  71. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、請求項６９または７０に記載の方法。
  72. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、ちょうど２個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項７１に記載の方法。
  73. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、ちょうど３個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項７１に記載の方法。
  74. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、ちょうど４個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項７１に記載の方法。
  75. 前記アンチセンス化合物が、少なくとも１つの共役基を含む、請求項１〜７４のいずれかに記載の方法。
  76. 前記共役基が、ＧａｌＮＡｃを含む、請求項７５に記載の方法。
  77. 前記アンチセンス化合物が、前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、請求項１〜７５のいずれかに記載の方法。
  78. 前記アンチセンス化合物が、ギャップマーではない、請求項１〜７７のいずれかに記載の方法。
  79. 前記アンチセンス化合物が、ＲＮａｓｅ Ｈをリクルートしない、請求項１〜７７のいずれかに記載の方法。
  80. 前記アンチセンス化合物が、前記標的核酸転写物の量を変化させない、請求項１〜７９のいずれかに記載の方法。
  81. 前記アンチセンス化合物が、一本鎖である、請求項１〜８０のいずれかに記載の方法。
  82. 前記アンチセンス化合物が、安定化ホスフェートを含む５’−末端基を有する、請求項８１に記載の方法。
  83. 前記５’−末端安定化ホスフェートが、ビニルホスホネートである、請求項８２に記載の方法。
  84. 前記細胞が、前記アンチセンス化合物のプロドラッグに接触する、請求項１〜８３のいずれかに記載の方法。
  85. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１０％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  86. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２０％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  87. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも３０％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  88. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも５０％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  89. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１００％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  90. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１２０％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  91. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１５０％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  92. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２００％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  93. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２５０％増加する、請求項１〜８４のいずれかに記載の方法。
  94. 前記細胞がインビトロに存在する、請求項１〜９３のいずれかに記載の方法。
  95. 前記細胞が対象内に存在する、請求項１〜９３のいずれかに記載の方法。
  96. 前記対象が、疾患または病態を有し、前記疾患または病態の少なくとも１つの症状が、緩和される、請求項９５に記載の方法。
  97. 前記細胞が動物内に存在する、請求項９４または９５に記載の方法。
  98. 前記動物がヒトである、請求項９７に記載の方法。
  99. 標的転写物の翻訳抑制要素領域内の標的部位に相補的な核酸塩基配列を有する１０〜３０個の結合ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むアンチセンス化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドが、４個超の連続した非修飾２’−デオキシヌクレオシドを有しない、前記アンチセンス化合物。
  100. 前記翻訳抑制要素領域が、５’非翻訳領域である、請求項９９に記載のアンチセンス化合物。
  101. 前記翻訳抑制要素領域が、前記５’非翻訳領域内にある、請求項９９に記載のアンチセンス化合物。
  102. 前記翻訳抑制要素領域が、１つのみのｕＯＲＦを含む、請求項９９〜１０１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  103. 前記翻訳抑制要素領域が、少なくとも１つのｕＯＲＦを含有する、請求項９９〜１０１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  104. 前記翻訳抑制要素が、ｕＯＲＦからなる、請求項９９〜１０３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  105. 前記翻訳抑制要素領域が、１つ以上のｕＯＲＦを含有し、前記１つ以上のｕＯＲＦが、前記標的転写物の翻訳を抑制しない、請求項９９〜１０４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  106. 前記翻訳抑制要素領域が、ｕＯＲＦを含有しない、請求項９９〜１０１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  107. 前記翻訳抑制要素領域が、少なくとも１つのステムループ構造を含む、請求項９９〜１０６のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  108. 少なくとも１つのステムループが、翻訳抑制要素である、請求項１０７に記載のアンチセンス化合物。
  109. 前記翻訳抑制要素が、突然変異から生じる、請求項９９〜１０８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  110. 前記突然変異が、ｕＯＲＦを創出する、請求項１０９に記載のアンチセンス化合物。
  111. 前記突然変異が、疾患を創出する、請求項１０９または１１０に記載のアンチセンス化合物。
  112. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１２〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、請求項９９〜１１１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  113. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１５〜２２個の結合ヌクレオシドからなる、請求項９９〜１１１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  114. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、請求項９９〜１１１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  115. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８〜２０個の結合ヌクレオシドからなる、請求項９９〜１１１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  116. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６〜１８個の結合ヌクレオシドからなる、請求項９９〜１１１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  117. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１６個の結合ヌクレオシドからなる、請求項９９〜１１１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  118. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１７個の結合ヌクレオシドからなる、請求項９９〜１１１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  119. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の結合ヌクレオシドからなる、請求項９９〜１１１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  120. 前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、請求項９９〜１１９のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  121. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシドである、請求項９９〜１２０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  122. 各非修飾ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドである、請求項１２１に記載のアンチセンス化合物。
  123. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、請求項９９〜１２０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  124. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドであり、各々独立して、修飾糖部分を含む、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  125. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の修飾ヌクレオシドを含み、各々独立して、修飾糖部分を含む、請求項９９〜１２４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  126. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、互いに同じである修飾糖部分を含む少なくとも２つの修飾ヌクレオシドを含む、請求項９９〜１２４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  127. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、互いに異なる修飾糖部分を含む少なくとも２つの修飾ヌクレオシドを含む、請求項９９〜１２４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  128. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項９９〜１２４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  129. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項９９〜１２４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  130. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１５個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項９９〜１２４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  131. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１８個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、請求項９９〜１２４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  132. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも２０個の連続した修飾ヌクレオシドの修飾領域を含む、先行請求項のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  133. 少なくとも１つの修飾糖部分が、２’−置換糖部分である、請求項１２４〜１３２のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  134. 前記少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅ、２’−Ｆ、及び２’−ＭＯＥの中から選択される、請求項１３３に記載のアンチセンス化合物。
  135. 前記少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＭＯＥである、請求項１３４に記載のアンチセンス化合物。
  136. 前記少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’−ＯＭｅである、請求項１３４に記載のアンチセンス化合物。
  137. 前記少なくとも１つの２’−置換糖部分の２’−置換基が、２’Ｆである、請求項１３４に記載のアンチセンス化合物。
  138. 少なくとも１つの修飾糖部分が、二環式糖部分である、請求項１２４〜１３８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  139. 少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡまたはｃＥｔである、請求項１３８に記載のアンチセンス化合物。
  140. 少なくとも１つの二環式糖部分が、ＬＮＡである、請求項１３８に記載のアンチセンス化合物。
  141. 少なくとも１つの二環式糖部分が、ｃＥｔである、請求項１３８に記載のアンチセンス化合物。
  142. 少なくとも１つの糖部分が、糖代理物である、請求項１２４〜１４１のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  143. 少なくとも１つの糖代理物が、モルホリノである、請求項１４２に記載のアンチセンス化合物。
  144. 少なくとも１つの糖代理物が、修飾モルホリノである、請求項１４２に記載のアンチセンス化合物。
  145. 少なくとも１つの糖代理物が、ペプチド核酸である、請求項１４２に記載のアンチセンス化合物。
  146. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、及び第３の３’−最末端ヌクレオシドが、二環式糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  147. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、第３、及び第４の３’−最末端ヌクレオシドが、二環式糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  148. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、第１、第２、第３、第４、及び第５の３’−最末端ヌクレオシドが、二環式糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  149. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、第１、第２、第３、第４、第５、及び第６の３’−最末端ヌクレオシドが、二環式糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  150. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各二環式糖部分が、独立して、ＬＮＡ及びｃＥｔから選択される、請求項１４６〜１４９に記載のアンチセンス化合物。
  151. 前記修飾オリゴヌクレオチドの前記二環式糖部分が、ｃＥｔである、請求項１４６〜１４９に記載のアンチセンス化合物。
  152. 二環式糖部分を含まない前記修飾オリゴヌクレオチドにおける各ヌクレオシドが、２’−Ｆ、２’−ＯＭｅ、及び２’−ＭＯＥから選択される修飾糖部分を含む、請求項１４６〜１５１に記載のアンチセンス化合物。
  153. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１及び第２の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  154. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、及び第３の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  155. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、第３、及び第４の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  156. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、第３、第４、及び第５の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  157. 各修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第２、第３、第４、第５、及び第６の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−Ｆ修飾糖部分である、請求項１２３に記載のアンチセンス化合物。
  158. 前記修飾オリゴヌクレオチドの第１、第３、及び第５の３’−最末端ヌクレオシドが、ｃＥｔヌンクレオシドであり、前記修飾オリゴヌクレオチドの前記第２及び第４の３’−最末端ヌクレオシドが、２’−デオキシヌクレオシドであり、各残りのヌクレオシドが、２’−修飾ヌクレオシドである、請求項１２２に記載のアンチセンス化合物。
  159. 各残りのヌクレオシドが、２’−ＯＭｅヌクレオシドである、請求項１５８に記載のアンチセンス化合物。
  160. 各残りのヌクレオシドが、２’−ＭＯＥヌクレオシドである、請求項１５８に記載のアンチセンス化合物。
  161. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である、請求項９９〜１６０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  162. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項９９〜１６０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  163. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項９９〜１６０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  164. 前記修飾ヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、請求項１６３に記載のアンチセンス化合物。
  165. 前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合のいずれかである、請求項１６３または１６４に記載のアンチセンス化合物。
  166. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、ちょうど２個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項１６５に記載のアンチセンス化合物。
  167. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、ちょうど３個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項１６５に記載のアンチセンス化合物。
  168. 前記修飾オリゴヌクレオチドが、ちょうど４個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を有する、請求項１６５に記載のアンチセンス化合物。
  169. 少なくとも１つの共役基を含む、請求項９９〜１６８のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  170. 前記共役基が、ＧａｌＮＡｃを含む、請求項１６９に記載のアンチセンス化合物。
  171. 前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、請求項９９〜１７０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  172. ギャップマーではない、請求項９９〜１７０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  173. ＲＮａｓｅ Ｈをリクルートしない、請求項９９〜１７０のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  174. 前記標的核酸転写物の量を変化させない、請求項９９〜１７３のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  175. 一本鎖である、請求項９９〜１７４のいずれかに記載のアンチセンス化合物。
  176. 安定化ホスフェートを含む５’−末端基を有する、請求項１７５に記載のアンチセンス化合物。
  177. 前記５’−末端安定化ホスフェートが、ビニルホスホネートである、請求項１７６に記載のアンチセンス化合物。
  178. 請求項９９〜１７７のいずれかに記載のアンチセンス化合物のプロドラッグを含む薬学的組成物。
  179. 細胞を、請求項９９〜１７８のいずれかに記載のアンチセンス化合物と接触させることを含む、方法。
  180. 細胞における標的タンパク質の翻訳の増加方法であって、細胞を請求項９９〜１７８のいずれかに記載のアンチセンス化合物と接触させることを含む、前記方法。
  181. 細胞における標的タンパク質の翻訳の抑制の減少方法であって、細胞を請求項９９〜１７８のいずれかに記載のアンチセンス化合物と接触させることを含む、前記方法。
  182. 細胞における標的タンパク質の量または活性の増加方法であって、細胞を請求項９９〜１７８のいずれかに記載のアンチセンス化合物と接触させることを含む、前記方法。
  183. 細胞における標的タンパク質の量の増加方法であって、細胞を請求項９９〜１７８のいずれかに記載のアンチセンス化合物と接触させることを含む、前記方法。
  184. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１０％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  185. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２０％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  186. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも３０％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  187. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも５０％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  188. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１００％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  189. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１２０％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  190. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも１５０％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  191. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２００％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  192. 前記標的タンパク質の発現、翻訳、または量若しくは活性が、少なくとも２５０％増加する、請求項１７９〜１８３のいずれかに記載の方法。
  193. 前記細胞がインビトロに存在する、請求項１７９〜１９２のいずれかに記載の方法。
  194. 前記細胞が対象内に存在する、請求項１７９〜１９２のいずれかに記載の方法。
  195. 前記対象が、疾患または病態を有し、前記疾患または病態の少なくとも１つの症状が、緩和される、請求項１９４に記載の方法。
  196. 前記細胞が動物内に存在する、請求項１９４または１９５に記載の方法。
  197. 前記動物がヒトである、請求項１９６に記載の方法。
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