JP2017075187A - アクチビン−ActRIIアンタゴニストおよび赤血球レベルを増加させるためのその使用 - Google Patents

アクチビン−ActRIIアンタゴニストおよび赤血球レベルを増加させるためのその使用 Download PDF

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Abstract

【課題】患者における赤血球を増加させるための代替的な組成物および方法を提供する。【解決手段】本発明は、患者における赤血球およびヘモグロビンのレベルを増加させるため、そして、処置を必要とする患者における低い赤血球もしくはヘモグロビンのレベルに伴う障害を処置するための、アクチビン−ActRIIアンタゴニスト(例えば、アクチビン結合ActRIIaポリペプチド、アクチビン結合ActRIIbポリペプチド、抗アクチビン抗体、抗ActRIIa抗体、抗ActRIIb抗体、アクチビン、ActRIIbもしくはActRIIaを標的とする低分子およびアプタマー、ならびに、アクチビン、ActRIIbもしくはActRIIaの発現を低下させる核酸を含む)の使用を提供する。【選択図】なし

Description

(関連出願)
本願は、2006年12月18日に出願された米国仮特許出願第60/875,682号の優先権を主張し、この仮出願は、その全体が本明細書により参考として援用される。
(発明の背景)
成熟赤血球(mature red blood cell,or erythrocyte)は、脊椎動物の循環系において酸素の輸送を担っている。赤血球は、肺において比較的高い酸素分圧(pO)で酸素を結合し、そして、比較的低いpOで身体の領域へと酸素を運搬するタンパク質であるヘモグロビンを高濃度で有する。
成熟赤血球は、赤血球生成と呼ばれるプロセスにおいて、多能性の造血幹細胞から生成される。出生後の個体において、赤血球生成は、主として、骨髄および赤脾臓において生じる。種々のシグナル伝達経路の連繋した作用により、細胞の増殖、分化、生存および死のバランスが制御される。正常な条件下では、赤血球は、身体において一定の赤血球質量を維持する速度で生成され、そして、この生成は、種々の刺激(酸素分圧の増減または組織の要求を含む)に応じて増減し得る。赤血球生成のプロセスは、系統が拘束された前駆体細胞の形成から始まり、そして、一連の別個の前駆体細胞型を通って進行する。赤血球生成の最終段階は、網状赤血球が血流へと放出されるときに生じ、成熟赤血球の形態を帯びながら、そのミトコンドリアおよびリボソームを失う。血中での網状赤血球レベルの上昇、または、網状赤血球:赤血球の比の上昇は、赤血球生成速度の増加を示す。
エリスロポエチン(Epo)は、出生後の脊椎動物における赤血球生成の最も重要な正の調節因子として広く認識されている。Epoは、組織酸素分圧の低下(低酸素)および低い赤血球レベルまたは低いヘモグロビンレベルに対し、これを補う赤血球生成性の応答を調節する。ヒトでは、Epoレベルの上昇は、骨髄および脾臓における赤血球先駆細胞の生成を刺激することによって、赤血球の形成を促進する。マウスでは、Epoは、主として脾臓における赤血球生成を増強する。
種々の臨床的状況において赤血球レベルを増加させるため、そして、特に、貧血の処置のために、組み換え型Epoの種々の形態が医師によって使用されている。貧血は、血中のヘモグロビンまたは赤血球が正常レベルよりも低いことによって特徴付けられる、広く定義される状態である。ある場合には、貧血は、赤血球の生成または生存における原発性の障害によって引き起こされる。より一般的には、貧血は、他の系の疾患に対して続発的である(非特許文献1)。貧血は、赤血球の生成速度の低下もしくは破壊速度の増加から、または、出血に起因する赤血球の喪失によって生じ得る。貧血は、例えば、慢性腎不全、骨髄異形成症候群、慢性関節リウマチおよび骨髄移植を含む種々の障害から生じ得る。
Epoを用いた処置は、代表的に、数週間の期間にわたり、健康なヒトにおいて約1〜3g/dLのヘモグロビンの上昇をもたらす。貧血の個体に投与された場合、この処置レジメンは、しばしば、ヘモグロビンおよび赤血球のレベルのかなりの増加を提供し、そして、クオリティオブライフの改善と生存の延長につながる。Epoは、一様に有効ではなく、多くの個体は、高用量に対してさえも不応性である(非特許文献2)。50%を超える癌を有する患者がEpoに対して不十分な応答を有し、末期の腎疾患を有する患者の約10%が低反応性であり(非特許文献3;非特許文献4)、そして、骨髄異形成症候群を有する患者の10%未満が有利に応答する(非特許文献5)。炎症、鉄およびビタミンの欠乏、不適切な透析、アルミニウムの毒性、および副甲状腺機能亢進を含むいくつかの要因で、治療応答が乏しいことが予測され得、そして、Epoに対する抵抗性の分子機構は未だにはっきりとしていない。
Weatherall & Provan(2000)Lancet 355,1169−1175 Horlら(2000)Nephrol Dial Transplant 15,43−50 Glaspyら(1997)J Clin Oncol 15,1218−1234 Demetriら(1998)J Clin Oncol 16,3412−3425 Estey(2003)Curr Opin Hematol 10,60−67
したがって、患者における赤血球を増加させるための代替的な組成物および方法を提供することが本開示の一つの目的である。
(発明の要旨)
本開示は、一部分で、アクチビンアンタゴニスト、ならびにActRIIaおよびActRIIbのアンタゴニストが、赤血球およびヘモグロビンのレベルを増加させるために使用され得ることを実証する。具体的には、本開示は、ActRIIaの可溶性形態がアクチビンのインヒビターとして作用し、そして、インビボで投与された場合に、血中の赤血球レベルを増加させることを実証する。可溶性のActRIIaよりも低い親和性でアクチビンAに結合するActRIIbの可溶性形態では、穏やかな作用が観察された。可溶性のActRIIaおよびActRIIbはアクチビンとの拮抗とは別の機構によって赤血球レベルに影響を及ぼし得るが、それにもかかわらず、本開示は、望ましい治療因子が、アクチビンとの拮抗もしくはActRIIとの拮抗、またはその両方に基づいて選択され得ることを実証する。このような因子は、まとめてアクチビン−ActRIIアンタゴニストと呼ばれる。したがって、特定の実施形態では、本開示は、患者における赤血球およびヘモグロビンのレベルを増加させるため、そして、処置を必要とする患者における低い赤血球もしくはヘモグロビンのレベルに伴う障害を処置するための、アクチビン−ActRIIアンタゴニスト(例えば、アクチビン結合ActRIIaポリペプチド、アクチビン結合ActRIIbポリペプチド、抗アクチビン抗体、抗ActRIIa抗体、抗ActRIIb抗体、アクチビン、ActRIIbもしくはActRIIaを標的とする低分子およびアプタマー、ならびに、アクチビン、ActRIIbもしくはActRIIaの発現を低下させる核酸を含む)を使用するための方法を提供する。米国特許出願第11/603,485号(本明細書中に参考として援用される)に記載されるように、アクチビン−ActRIIaアンタゴニストは、骨成長を促進し、そして、骨密度を増加させるために使用され得る。本明細書中に記載されるように、このようなアンタゴニストの赤血球レベルに対する作用は、より迅速であり、そして、このようなアンタゴニストの骨に対する作用よりも低い用量で生じる。したがって、特定の実施形態では、本開示は、骨密度の有意な増加を引き起こすことなく、赤血球またはヘモグロビンのレベルを増加させるための、アクチビン−ActRIIaアンタゴニストの使用方法を提供する。例えば、方法は、骨密度の3%未満、5%未満、10%未満または15%未満の増加を引き起こし得る。この選択的な作用は、例えば、より低用量のアクチビン−ActRIIaアンタゴニストを、より低い頻度で用いることによって、または、より短い半減期を有するアクチビン−ActRIIaアンタゴニストを、より低い血清濃度を提供すると計算される用量および頻度で使用することによって、達成され得る。
特定の局面では、本開示は、アクチビンに結合する可溶性のアクチビン結合ActRIIポリペプチドを含むポリペプチドを提供する。アクチビン結合ポリペプチドは、ActRIIaポリペプチドまたはActRIIbポリペプチドであり得る。ActRIIポリペプチドは、アクチビン結合ActRIIポリペプチドおよび薬学的に受容可能なキャリアを含む薬学的調製物として処方され得る。アクチビン結合ActRIIポリペプチドは、1マイクロモル濃度未満、または、100ナノモル濃度未満、10ナノモル濃度未満、もしくは1ナノモル濃度未満のKでアクチビンに結合し得る。必要に応じて、アクチビン結合ActRIIポリペプチドは、GDF11および/もしくはGDF8に対してアクチビンに選択的に結合し、そして、必要に応じて、アクチビンに対するKは、GDF11および/もしくはGDF8に対するKよりも少なくとも10倍、20倍もしくは50倍より低い。特定の作用機構に束縛されることは望まないが、GDF11/GDF8を上回るアクチビンの阻害のための選択性のこの度合いは、一貫して筋肉に対して測定可能な作用を伴うことなく、骨または赤血球生成に対して作用することの説明となることが予想される。多くの実施形態では、ActRIIポリペプチドは、赤血球レベルに対する所望の効果を達成する用量において、筋肉における15%未満、10%未満もしくは5%未満の増加を引き起こすものが選択される。組成物は、サイズ排除クロマトグラフィーによって評価したとき、他のポリペプチド成分に対して少なくとも95%純粋であり得、そして、必要に応じて、組成物は、少なくとも98%純粋である。このような調製物において使用するためのアクチビン結合ActRIIaポリペプチドは、配列番号2、3、7もしくは12から選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチド、または、配列番号2、3、7もしくは12から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、97%もしくは99%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドのような、本明細書中に開示される任意のものであり得る。アクチビン結合ActRIIaポリペプチドは、天然のActRIIaポリペプチドの機能的フラグメント(例えば、配列番号1〜3から選択される配列の少なくとも10、20もしくは30のアミノ酸を含むもの、または、C末端の10〜15アミノ酸(「テイル」)を欠く配列番号2の配列を含むもの)を含み得る。このような調製物において使用するためのアクチビン結合ActRIIbポリペプチドは、配列番号16、17、20もしくは21から選択されるアミノ酸配列を有するポリペプチド、または、配列番号16、17、20もしくは21から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、97%もしくは99%同一なアミノ酸配列を有するポリペプチドのような、本明細書中に開示される任意のものであり得る。アクチビン結合ActRIIbポリペプチドは、天然のActRIIbポリペプチドの機能的フラグメント(例えば、配列番号15〜17の少なくとも10、20もしくは30のアミノ酸を含むもの、または、配列番号17のようなC末端の10〜15アミノ酸(「テイル」)を欠く配列を含むもの)を含み得る。
可溶性のアクチビン結合ActRIIポリペプチドは、天然に存在するActRIIポリペプチドに対して、(例えば、リガンド結合ドメインにおいて)アミノ酸配列に1以上の変更を含み得る。変更されたActRIIaおよびActRIIbポリペプチドの例は、それぞれ、WO 2006/012627(本明細書中に参考として援用される)のpp.59〜60およびpp.55〜58に提供される。アミノ酸配列の変更は、例えば、哺乳動物、昆虫もしくは他の真核生物細胞において生成される場合にポリペプチドのグリコシル化を変更し得るか、または、天然に存在するActRIIポリペプチドに対して、ポリペプチドのタンパク質分解による切断を変更し得る。
アクチビン結合ActRIIポリペプチドは、1つのドメインとして、ActRIIポリペプチド(例えば、ActRIIaまたはActRIIbのリガンド結合部分)と、所望の特性(例えば、改善された薬物動態,より容易な精製,特定の組織への標的化など)を提供する1以上のさらなるドメインとを有する融合タンパク質であり得る。例えば、融合タンパク質のドメインは、インビボ安定性、インビボ半減期、取り込み/投与、組織局在化もしくは分布、タンパク質複合体の形成および/または精製のうちの1以上を増強し得る。アクチビン結合ActRII融合タンパク質は、免疫グロブリンFcドメイン(野生型または変異型)、または血清アルブミン、または所望の特性(例えば、改善された薬物動態、改善された溶解性または改善された安定性)を提供する他のポリペプチド部分を含み得る。好ましい実施形態では、ActRII−Fc融合物は、Fcドメインと細胞外ActRIIドメインとの間に位置する比較的構造の定まらない(unstructured)リンカーを含む。この構造の定まらないリンカーは、ActRIIの細胞外ドメインのC末端におよそ15アミノ酸の構造の定まらない領域(「テイル」)に対応し得るか、または、1、2、3、4もしくは5アミノ酸、または、比較的二次構造が自由な、5〜15、20、30、50もしくはそれ以上の長さのアミノ酸の人工配列であり得るか、あるいはこの両方の混合物であり得る。リンカーは、グリシン残基およびプロリン残基が豊富であり得、そして例えば、スレオニン/セリンおよびグリシンの単一の配列、または、スレオニン/セリンおよびグリシンの繰り返し配列(例えば、TGもしくはSGの単一体もしくは繰り返し)を含み得る。融合タンパク質は、エピトープタグ、FLAGタグ、ポリヒスチジン配列、または、GST融合物のような精製配列を含み得る。必要に応じて、可溶性のActRIIポリペプチドは、グリコシル化アミノ酸、PEG化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸、脂質部分に結合されたアミノ酸または有機誘導体化因子(organic derivatizing agent)に結合されたアミノ酸から選択される1以上の修飾されたアミノ酸残基を含む。薬学的調製物はまた、骨障害を処置するために使用される化合物のような1以上のさらなる化合物を含み得る。好ましくは、薬学的調製物は、発熱物質を実質的に含まない。一般に、ActRIIタンパク質は、患者における望ましくない免疫応答の可能性を無くすために、ActRIIタンパク質の天然のグリコシル化を適切に媒介する哺乳動物細胞株において発現されることが好ましい。ヒトおよびCHOの細胞株は、首尾よく使用されており、そして、他の一般的な哺乳動物発現系が有用であることが予想される。
本明細書中に記載されるように、ActRIIa−Fcと称されるActRIIaタンパク質(ActRIIa部分とFc部分との間に最小のリンカーを有する形態)は、所望の特性(GDF8および/もしくはGDF11に対するアクチビンへの選択的な結合、高親和性でのリガンド結合、および動物モデルにおける2週間より長い血清半減期を含む)を有する。特定の実施形態では、本発明は、ActRII−Fcのポリペプチド、および、このようなポリペプチドと薬学的に受容可能な賦形剤とを含む薬学的調製物を提供する。
特定の局面では、本開示は、可溶性のアクチビン結合ActRIIポリペプチド(例えば、ActRIIaポリペプチドまたはActRIIbポリペプチド)をコードする核酸を提供する。単離されたポリヌクレオチドは、上述のような可溶性のアクチビン結合ActRIIポリペプチドのコード配列を含み得る。例えば、単離された核酸は、ActRIIの細胞外ドメイン(例えば、リガンド結合ドメイン)をコードする配列、および、ActRIIの、膜貫通ドメインおよび/もしくは細胞外ドメインの一部もしくは全体をコードする配列を含み得るが、膜貫通ドメインもしくは細胞質ドメイン内、または、細胞外ドメインと膜貫通ドメインもしくは細胞質ドメインとの間に位置する終止コドンは除く。例えば、単離されたポリヌクレオチドは、全長ActRIIaポリヌクレオチド配列(例えば、配列番号4または5)、または、全長ActRIIaポリヌクレオチド配列(例えば、配列番号18)、または、ActRIlaもしくはActRIIbの部分的に短縮されたバージョンを含み得、前記単離されたポリヌクレオチドはさらに、3’末端の前の少なくとも600ヌクレオチド、または、ポリヌクレオチドの翻訳により必要に応じて全長ActRIIの短縮された部分に融合された細胞外ドメインが生じるように他の方法で位置決めされた、転写終止コドンを含む。ActRIIaに対する好ましい核酸配列は、配列番号14である。本明細書中に開示される核酸は、発現のためのプロモーターに作動可能に連結され得、そして、本開示は、このような組換えポリヌクレオチドで形質転換された細胞を提供する。好ましくは、細胞は、CHO細胞のような哺乳動物細胞である。
特定の局面では、本開示は、可溶性のアクチビン結合ActRIIポリペプチドを作製するための方法を提供する。このような方法は、適切な細胞(例えば、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞)において、本明細書中に開示される任意の核酸(例えば、配列番号4、5、14、18もしくは19)を発現させる工程を包含し得る。このような方法は、a)可溶性のActRIIポリペプチドの発現に適した条件下で細胞を培養する工程であって、前記細胞が、可溶性ActRII発現構築物で形質転換される、工程と;b)このようにして発現された可溶性ActRIIポリペプチドを回収する工程とを包含し得る。可溶性ActRIIポリペプチドは、粗製であるか、部分的に精製されたか、または、高度に精製された画分として回収され得る。精製は、例えば、以下のうちの1、2、もしくは3またはそれ以上を任意の順序で含む一連の精製工程によって達成され得る:プロテインAクロマトグラフィー、アニオン交換クロマトグラフィー(例えば、Qセファロース)、疎水性相互作用クロマトグラフィー(例えば、フェニルセファロース)、サイズ排除クロマトグラフィーおよびカチオン交換クロマトグラフィー。
特定の局面では、本明細書中に開示されるアクチビン−ActRIIアンタゴニスト(例えば、可溶性のアクチビン結合ActRIIaポリペプチドまたは可溶性のアクチビン結合ActRIIbポリペプチド)は、被験体における赤血球の生成を促進するか、または赤血球のレベルを上昇させるための方法において使用され得る。特定の実施形態では、本開示は、必要とする患者において、低い赤血球数もしくは低いヘモグロビンレベルに伴う障害(例えば、貧血)を処置するため、または、赤血球の生成を促進するための方法を提供する。方法は、それを必要とされる被験体に、有効量のアクチビン−ActRIIアンタゴニストを投与する工程を包含し得る。特定の局面では、本開示は、本明細書中に記載されるような障害もしくは状態の処置のための医薬を作製するためのアクチビン−ActRIIアンタゴニストの使用を提供する。
特定の局面では、本開示は、赤血球の生成を刺激する因子を同定するための方法を提供する。方法は、a)アクチビンまたはActRIIポリペプチドのリガンド結合ドメインに結合する試験因子を同定する工程;ならびに、b)赤血球、ヘモグロビン、および/または、赤血球前駆体のレベル(例えば、網状赤血球のレベル)に対する因子の作用を評価する工程、を包含する。
本発明はまた、以下の項目を提供する。
(項目1)
ヒト患者における赤血球レベルを増加させるための方法であって、該方法は、該赤血球レベルの増加を必要とするヒト患者に、以下:
a)配列番号2に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
b)配列番号3に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;および
c)配列番号2から選択される少なくとも50の連続するアミノ酸を含むポリペプチド;
d)配列番号16に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
e)配列番号17に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
および
f)配列番号16から選択される少なくとも50の連続するアミノ酸を含むポリペプチド
からなる群より選択される有効量のActRIIポリペプチドを投与する工程を包含する、方法。
(項目2)
上記ポリペプチドが、以下の特徴:
i)少なくとも10−7のKでActRIIリガンドに結合する、および
ii)細胞内のActRIIシグナル伝達を阻害する
のうち1つ以上を有する、項目1に記載の方法。
(項目3)
上記ポリペプチドが、ActRIIポリペプチドドメインに加えて、インビボ安定性、インビボ半減期、取り込み/投与、組織局在化もしくは分布、タンパク質複合体の形成および/または精製のうちの1以上を増強する1以上のポリペプチド部分を含む融合タンパク質である、項目1に記載の方法。
(項目4)
上記融合タンパク質が、免疫グロブリンFcドメインおよび血清アルブミンからなる群より選択されるポリペプチド部分を含む、項目1に記載の方法。
(項目5)
上記ポリペプチドが、グリコシル化アミノ酸、PEG化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸、脂質部分に結合されたアミノ酸または有機誘導体化因子に結合されたアミノ酸から選択される1以上の修飾されたアミノ酸残基を含む、項目1に記載の方法。
(項目6)
上記赤血球レベルの増加が、血中のヘモグロビンレベルの増加として測定される、項目1に記載の方法。
(項目7)
貧血を処置するための方法であって、該方法は、該貧血の処置を必要とする被験体に、有効量のアクチビン−ActRIIアンタゴニストを投与する工程を包含する、方法。
(項目8)
上記アクチビン−ActRIIアンタゴニストが、アクチビンまたはActRIIのアンタゴニストポリペプチドである、項目7に記載の方法。
(項目9)
上記アクチビン−ActRIIアンタゴニストポリペプチドが、以下:
a)配列番号2に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
b)配列番号3に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;および
c)配列番号2から選択される少なくとも50の連続するアミノ酸を含むポリペプチド;
d)配列番号16に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
e)配列番号17に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;および
f)配列番号16から選択される少なくとも50の連続するアミノ酸を含むポリペプチド
からなる群より選択される、項目8に記載の方法。
(項目10)
上記アクチビン−ActRIIアンタゴニストポリペプチドが、以下の特徴:
i)少なくとも10−7のKでActRIIリガンドに結合する、および
ii)細胞内のActRIIシグナル伝達を阻害する
のうち1つ以上を有する、項目9に記載の方法。
(項目11)
上記アクチビン−ActRIIアンタゴニストポリペプチドが、該アクチビン−ActRIIアンタゴニストポリペプチドに加えて、インビボ安定性、インビボ半減期、取り込み/投与、組織局在化もしくは分布、タンパク質複合体の形成および/または精製のうちの1以上を増強する1以上のポリペプチド部分を含む融合タンパク質である、項目9に記載の方法。
(項目12)
上記融合タンパク質が、免疫グロブリンFcドメインおよび血清アルブミンからなる群より選択されるポリペプチド部分を含む、項目11に記載の方法。
(項目13)
上記アクチビンまたはActRIIのアンタゴニストポリペプチドが、グリコシル化アミノ酸、PEG化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸、脂質部分に結合されたアミノ酸または有機誘導体化因子に結合されたアミノ酸から選択される1以上の修飾されたアミノ酸残基を含む、項目8に記載の方法。
(項目14)
赤血球レベルを増加させる因子を同定する方法であって、該方法は、以下:
a)ActRIIポリペプチドのリガンド結合ドメインに対して、ActRIIリガンドと競合的に結合する試験因子を同定する工程;および
b)動物における赤血球レベルに対する該因子の効果を評価する工程
を包含する、方法。
(項目15)
ヒト患者における赤血球レベルを増加させるための医薬を作製するための、アクチビンまたはActRIIのアンタゴニストポリペプチドの使用。
(項目16)
ヒト患者における赤血球レベルを増加させるための方法であって、該方法は、有効量のActRII−Fc融合タンパク質を該患者に投与する工程を包含し、該ActRII−Fc融合タンパク質は、以下:
a)配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列、
b)配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一なアミノ酸配列、
c)配列番号3のアミノ酸配列3、
d)配列番号2のアミノ酸配列、
e)配列番号7のアミノ酸配列、
f)配列番号17のアミノ酸配列に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列、
g)配列番号17のアミノ酸配列に対して少なくとも95%同一なアミノ酸配列、
h)配列番号17のアミノ酸配列、
i)配列番号16のアミノ酸配列、
j)配列番号20のアミノ酸配列、および
k)配列番号21のアミノ酸配列
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含む、方法。
(項目17)
上記患者の骨格筋量の15%未満の増加をもたらす、項目16に記載の方法。
(項目18)
上記ActRII−Fc融合タンパク質が、約20〜30日の期間にわたって、上記患者において少なくとも100ng/mlの血清濃度に達するように投与される、項目16に記載の方法。
(項目19)
上記ActRII−Fc融合タンパク質が、上記患者において、100ng/ml〜1000ng/mlの範囲の血清濃度に達するように投与される、項目16に記載の方法。
(項目20)
上記ActRII−Fc融合タンパク質が、15日と30日との間の血清半減期を有する、項目16に記載の方法。
(項目21)
上記ActRII−Fc融合タンパク質が、週に1回以下の頻度で上記患者に投与される、項目20に記載の方法。
(項目22)
上記ActRII−Fc融合タンパク質が、月に1回以下の頻度で上記患者に投与される、項目20に記載の方法。
図1は、CHO細胞において発現されたActRIIa−hFcの精製を示す。タンパク質は、サイジングカラム(左パネル)およびクーマシー染色されたSDS−PAGE(右パネル)(左レーン:分子量標準物質;右レーン:ActRIIa−hFc)によって視覚化されるように、単一の十分に画定されたピークとして精製される。 図2は、BiaCoreTMアッセイによって測定された、アクチビンおよびGDF−11に対するActRIIa−hFcの結合を示す。 図3は、雌性非ヒト霊長類における赤血球数に対するActRIIa−hFcの作用を示す。雌性カニクイザル(各群5匹のサルの4つの群)を、プラセボ、または、1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−hFcで、0日目、7日目、14日目および21日目に処置した。図3Aは、赤血球(RBC)数を示す。図3Bは、ヘモグロビンレベルを示す。統計的有意差は、各処置群についての基線に対するものである。57日目に、各群に2匹のサルが残っていた。 図3は、雌性非ヒト霊長類における赤血球数に対するActRIIa−hFcの作用を示す。雌性カニクイザル(各群5匹のサルの4つの群)を、プラセボ、または、1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−hFcで、0日目、7日目、14日目および21日目に処置した。図3Aは、赤血球(RBC)数を示す。図3Bは、ヘモグロビンレベルを示す。統計的有意差は、各処置群についての基線に対するものである。57日目に、各群に2匹のサルが残っていた。 図4は、雄性非ヒト霊長類における赤血球数に対するActRIIa−hFcの作用を示す。雄性カニクイザル(各群5匹のサルの4つの群)を、プラセボ、または、1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−hFcで、0日目、7日目、14日目および21日目に処置した。図4Aは、赤血球(RBC)数を示す。図4Bは、ヘモグロビンレベルを示す。統計的有意差は、各処置群についての基線に対するものである。57日目に、各群に2匹のサルが残っていた。 図4は、雄性非ヒト霊長類における赤血球数に対するActRIIa−hFcの作用を示す。雄性カニクイザル(各群5匹のサルの4つの群)を、プラセボ、または、1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−hFcで、0日目、7日目、14日目および21日目に処置した。図4Aは、赤血球(RBC)数を示す。図4Bは、ヘモグロビンレベルを示す。統計的有意差は、各処置群についての基線に対するものである。57日目に、各群に2匹のサルが残っていた。 図5は、雌性非ヒト霊長類における網状赤血球数に対するActRIIa−hFcの作用を示す。カニクイザル(各群5匹のサルの4つの群)を、プラセボ、または、1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−hFcで、0日目、7日目、14日目および21日目に処置した。図5Aは、絶対的な網状赤血球数を示す。図5Bは、RBCに対する網状赤血球の割合を示す。統計的有意差は、各処置群についての基線に対するものである。57日目に、各群に2匹のサルが残っていた。 図5は、雌性非ヒト霊長類における網状赤血球数に対するActRIIa−hFcの作用を示す。カニクイザル(各群5匹のサルの4つの群)を、プラセボ、または、1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−hFcで、0日目、7日目、14日目および21日目に処置した。図5Aは、絶対的な網状赤血球数を示す。図5Bは、RBCに対する網状赤血球の割合を示す。統計的有意差は、各処置群についての基線に対するものである。57日目に、各群に2匹のサルが残っていた。 図6は、雄性非ヒト霊長類における網状赤血球数に対するActRIIa−hFcの作用を示す。カニクイザル(各群5匹のサルの4つの群)を、プラセボ、または、1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−hFcで、0日目、7日目、14日目および21日目に処置した。図6Aは、絶対的な網状赤血球数を示す。図6Bは、RBCに対する網状赤血球の割合を示す。統計的有意差は、各処置群についての基線に対するものである。57日目に、各群に2匹のサルが残っていた。 図6は、雄性非ヒト霊長類における網状赤血球数に対するActRIIa−hFcの作用を示す。カニクイザル(各群5匹のサルの4つの群)を、プラセボ、または、1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−hFcで、0日目、7日目、14日目および21日目に処置した。図6Aは、絶対的な網状赤血球数を示す。図6Bは、RBCに対する網状赤血球の割合を示す。統計的有意差は、各処置群についての基線に対するものである。57日目に、各群に2匹のサルが残っていた。 図7は、実施例5に記載されるヒトの臨床治験からの結果を示し、この図において、曲線下面積(AUC)とActRIIa−hFcの投与された用量とは、ActRIIa−hFcが静脈内(IV)投与されたか皮下(SC)投与されたかに関わらず、線形の相関性を有する。 図8は、IVもしくはSCで投与された患者におけるActRIIa−hFcの血清レベルの比較を示す。 図9は、ActRIIa−hFcの異なる用量レベルに応答した、骨アルカリ性ホスファターゼ(BAP)レベルを示す。BAPは、同化作用性の骨成長についてのマーカーである。 図10は、実施例5に記載されるヒトの臨床治験からの、ヘマトクリットレベルの基線からのメジアン変化を示す。ActRIIa−hFcは、示される投薬量で静脈内(IV)投与された。 図11は、実施例5に記載されるヒトの臨床治験からの、ヘモグロビンレベルの基線からのメジアン変化を示す。ActRIIa−hFcは、示される投薬量で静脈内(IV)投与された。 図12は、実施例5に記載されるヒトの臨床治験からの、RBC(赤血球)数の基線からのメジアン変化を示す。ActRIIa−hFcは、示される投薬量で静脈内(IV)投与された。 図13は、実施例5に記載されるヒトの臨床治験からの、網状赤血球数の基線からのメジアン変化を示す。ActRIIa−hFcは、示される投薬量で静脈内(IV)投与された。
(発明の詳細な説明)
1.概要
トランスフォーミング増殖因子−β(TGF−β)スーパーファミリーは、共通の配列エレメントと構造モチーフを共有する、種々の増殖因子を含む。これらのタンパク質は、脊椎動物および無脊椎動物の両方における広範な種々の細胞型に対して生物学的作用を発揮することが知られる。このスーパーファミリーのメンバーは、胚発生の間に、パターン形成および組織の特殊化において重要な機能を果たし、そして、脂質生成、筋発生、軟骨形成、心臓発生、造血、神経発生および上皮細胞分化を含む種々の分化プロセスに影響を及ぼし得る。このファミリーは、一般に2つの枝:BMP/GDFの枝およびTGF−β/アクチビン/BMP10の枝、に分けられ、これらのメンバーは、多様な、しばしば相補的な作用を有する。TGF−βファミリーのメンバーの活性を操作することによって、しばしば、生物において有意な生理学的変化を引き起こすことが可能である。例えば、ウシのPiedmonteseおよびBelgian Blue品種は、GDF8(ミオスタチンとも呼ばれる)に機能喪失変異を有しており、筋肉質量の顕著な増加を引き起こしている。Grobetら、Nat Genet.1997,17(1):71−4。さらに、ヒトでは、GDF8の不活性な対立遺伝子は、筋肉質量の増加、および、報告によれば、非常に優れた強度と関連している。Schuelkeら、N Engl J Med
2004,350:2682−8。
アクチビンは、TGF−βスーパーファミリーに属する二量体ポリペプチド増殖因子である。3つの主なアクチビン形態(A、BおよびAB)が存在し、これらは、2つの密接に関連するβサブユニットのホモ二量体/ヘテロ二量体(それぞれ、βAβA、βBβBおよびβAβB)である。ヒトゲノムはまた、アクチビンCおよびアクチビンEもコードしているが、これらは、主として肝臓で発現されており、そして、βもしくはβを含むヘテロ二量体形態もまた知られる。TGF−βスーパーファミリーにおいて、アクチビンは、卵巣および胎盤の細胞におけるホルモン生成を刺激し得、神経細胞の生存を支援し得、細胞周期の進行に対して細胞型に依存して正もしくは負に影響を及ぼし得、そして、少なくとも両生類の胚において中胚葉分化を誘導し得る、独特かつ多機能の因子である(DePaoloら、1991,Proc Soc Ep Biol Med.198:500−512;Dysonら、1997,Curr Biol.7:81−84;Woodruff,1998,Biochem Pharmacol.55:953−963)。さらに、刺激されたヒト単球性白血病細胞から単離された赤血球分化因子(EDF)は、アクチビンAと同一であることが分かった(Murataら、1988,PNAS,85:2434)。アクチビンAは、骨髄における赤血球生成を促進することが示唆されている。いくつかの組織では、アクチビンのシグナル伝達は、その関連するヘテロ二量体であるインヒビンによって拮抗される。例えば、下垂体からの卵胞刺激ホルモン(FSH)の放出の間に、アクチビンは、FSHの分泌および合成を促進するが、インヒビンは、FSHの分泌および合成を抑制する。アクチビンの生活性を調節し得、そして/または、アクチビンに結合し得る他のタンパク質としては、フォリスタチン(FS)、フォリスタチン関連タンパク質(FSRP)およびα−マクログロブリンが挙げられる。
TGF−βシグナルは、I型およびII型のセリン/スレオニンキナーゼレセプターの異種複合体(heteromeric complex)によって媒介され、これらのレセプターは、リガンド刺激の際に、下流のSmadタンパク質をリン酸化および活性化する(Massague,2000,Nat.Rev.Mol.Cell Biol.1:169−178)。これらのI型およびII型レセプターは、システインリッチな領域を持つリガンド結合細胞外ドメイン、膜貫通ドメイン、および、推定のセリン/スレオニン特異性を持つ細胞質ドメインから構成される膜貫通タンパク質である。I型レセプターは、シグナル伝達に必須であり;そして、II型レセプターは、リガンド結合およびI型レセプターの発現に必要とされる。I型およびII型のアクチビンレセプターは、リガンド結合後に安定な複合体を形成し、II型レセプターによるI型レセプターのリン酸化をもたらす。
2つの関連するII型レセプター(ActRII)であるActRIIaおよびActRIIbが、アクチビンに対するII型レセプターとして同定されている(MathewsおよびVale,1991,Cell 65:973−982;Attisanoら、1992,Cell 68:97−108)。アクチビンに加えて、ActRIIaおよびActRIIbは、BMP7、Nodal、GDF8およびGDF11を含むいくつかの他のTGF−βファミリータンパク質と生化学的に相互作用し得る(Yamashitaら、1995,J.Cell Biol.130:217−226;LeeおよびMcPherron,2001,Proc.Natl.Acad.Sci.98:9306−9311;YeoおよびWhitman,2001,Mol.Cell 7:949−957;Ohら、2002,Genes Dev.16:2749−54)。ALK4は、アクチビン、特にアクチビンAに対する主たるI型レセプターであり、そして、ALK−7もまた、アクチビン、特にアクチビンBに対するレセプターとして機能し得る。
本明細書中に示されるように、GDF8もしくはGDF11のような他のTGF−βファミリーメンバーとは対照的にアクチビンAへの結合にかなりの選択性を示す可溶性ActRIIaポリペプチド(sActRIIa)は、インビボで赤血球レベルを増加させるのに有効である。任意の特定の機構に束縛されることは望まないが、これらの研究において使用される特定のsActRIIa構築物によって示される非常に強力なアクチビンの結合(ピコモル濃度の解離定数)を考慮すると、sActRIIaの作用は、主としてアクチビンアンタゴニスト作用によって引き起こされるものであることが予想される。機構によらず、ActRIIa−アクチビンアンタゴニストが、げっ歯類、サルおよびヒトにおいて赤血球レベルを増加させることは、本開示から明らかである。造血は、エリスロポエチン、G−CSFおよび鉄のホメオスタシスを含む種々の要因によって調節される複雑なプロセスであることに注意すべきである。用語「赤血球レベルを増加させる」および「赤血球の形成を促進する」とは、ヘマトクリット、赤血球数およびヘモグロビン測定値のような臨床的に観察可能な測定基準を指し、このような変化が生じる機構に関しては不特定であることが意図される。
また、本明細書中に示されるように、可溶性ActRIIbポリペプチド(sActRIIb)は、インビボで網状赤血球レベルを増加させるのに有効であり、この作用は、長時間にわたり、ヘマトクリットレベルの増加を引き起こすことが予測される。
本明細書中に報告される非ヒト霊長類に関するデータは、マウス、ラットおよびヒトでも再現可能であり、それゆえ、本開示は、ActRIIポリペプチドおよび他のアクチビン−ActRIIアンタゴニストを用いて、げっ歯類からヒトまでに及ぶ哺乳動物において赤血球の生成を促進し、そして、赤血球レベルを増加させるための方法を提供する。アクチビン−ActRIIアンタゴニストとしては、例えば、以下が挙げられる:アクチビン結合可溶性ActRIIaポリペプチド、アクチビン結合可溶性ActRIIbポリペプチド、アクチビン(特に、アクチビンAもしくはBサブユニット、または、βもしくはβとも呼ばれる)に結合し、ActRIIaおよび/もしくはActRIIbの結合を破壊する抗体、ActRIIaに結合しアクチビンの結合を破壊する抗体、ActRIIbに結合しアクチビンの結合を破壊する抗体、アクチビン、ActRIIbもしくはActRIIaの結合について選択された非抗体タンパク質(例えば、このようなタンパク質、ならびに、このようなタンパク質の設計および選択の方法については、例えば、WO/2002/088171、WO/2006/055689およびWO/2002/032925を参照のこと)、アクチビン、ActRIIbもしくはActRIIaの結合について選択されたランダム化ペプチド(しばしば、Fcドメインに付加される)。アクチビン、ActRIIbもしくはActRIIaの結合活性を持つ2つの異なるタンパク質(または他の部分)、特に、それぞれ、I型(例えば、可溶性I型アクチビンレセプター)およびII型(例えば、可溶性II型アクチビンレセプター)の結合部位をブロックするアクチビン結合因子は、二機能性の結合分子を生じるように互いに連結され得る。アクチビン−ActRIIシグナル伝達軸を阻害する核酸アプタマー、低分子および他の因子が、アクチビン−ActRIIアンタゴニストとして含まれる。種々のタンパク質がアクチビン−ActRIIアンタゴニスト活性を有し、インヒビン(すなわち、インヒビンαサブユニット)(インヒビンは、全ての組織において例外なくアクチビンと拮抗するわけではないが)、フォリスタチン(例えば、フォリスタチン−288およびフォリスタチン−315)、FSRP、アクチビンC、α(2)−マクログロブリンおよびM108A(108位におけるメチオニンからアラニンへの変化)変異型アクチビンAが挙げられる。一般に、アクチビンの代替的な形態、特に、I型レセプター結合ドメインに変化を有するものは、II型レセプターに結合し得るが、活性な3次元複合体を形成できず、したがって、アンタゴニストとして機能する。さらに、アクチビンA、B、CもしくはE、または、特に、ActRIIaもしくはActRIIbの発現を阻害する核酸(例えば、アンチセンス分子、siRNAまたはリボザイム)は、アクチビン−ActRIIアンタゴニストとして使用され得る。使用されるべきアクチビン−ActRIIアンタゴニストは、TGF−βファミリーの他のメンバー、特に、GDF8およびGDF11に関して、アクチビン媒介性のシグナル伝達の阻害についての選択性を示し得る。
本明細書中で使用される用語は、一般に、本開示の文脈の範囲内で、かつ、各々の用語が使用される特定の文脈において、当該分野におけるその通常の意味を有する。本開示の組成物および方法、ならびに、これらの作成方法および使用方法の記載において、専門家にさらなる案内を提供するために、特定の用語が以下または本明細書中の他の場所で論じられている。用語の任意の使用の範囲および意味は、その用語が使用される特定の文脈から明らかである。
「約」および「およそ」は、一般に、測定の性質または正確さを仮定して、測定された量についての誤差の容認可能な程度を意味する。代表的には、例示的な誤差の程度は、所与の値または値の範囲の、20パーセント(%)内、好ましくは10パーセント(%)内、そしてより好ましくは5%内である。
あるいは、そして、特に生物学的な系において、用語「約」および「およそ」は、所与の値のあるオーダーの大きさの範囲内、好ましくは、5倍以内、そしてより好ましくは2倍以内の値を意味し得る。本明細書中に与えられる数量は、特に明記しない限り近似値であり、明白に記述されない場合には、用語「約」または「およそ」は、推量され得ることを意味する。
本開示の方法は、配列を互いに比較する工程を包含し得、この比較には、野生型配列の1以上の変異体/配列改変体に対する比較を含む。このような比較は代表的には、例えば、当該分野で周知の配列アラインメントのプログラムおよび/またはアルゴリズム(例えば、少数の名を挙げれば、BLAST、FASTAおよびMEGALIGN)を用いた、ポリマー配列のアラインメントを含む。当業者は、変異が残基の挿入または欠失を含むようなこのようなアラインメントにおいて、配列のアラインメントは、挿入もしくは欠失された残基を含まないポリマー配列中に「ギャップ」(代表的には、―または「A」で表される)を導入することを容易に理解し得る。
「相同」は、そのあらゆる文法的な形態および語の綴りのバリエーションにおいて、同種の生物におけるスーパーファミリーに由来するタンパク質、ならびに、異なる種の生物に由来する相同なタンパク質を含む、「共通する進化の起源」を有する2タンパク質間の関係をいう。このようなタンパク質(およびこれをコードする核酸)は、%同一性の観点であれ、特定の残基もしくはモチーフおよび保存された位置の存在によるものであれ、その配列類似性によって反映されるように、配列の相同性を有する。
用語「配列類似性」は、そのあらゆる文法的な形態において、共通する進化の起源を共有していても共有していなくても、核酸もしくはアミノ酸間の同一性もしくは対応性の程度をいう。
しかし、一般的な用法および本願において、用語「相同」は、「高度に」のような副詞で修飾されるとき、配列の類似性を指す場合があり、そして、共通する進化の起源に関連していてもしていなくてもよい。
2.ActRIIポリペプチド
特定の局面では、本発明は、ActRIIポリペプチドに関する。本明細書中で使用される場合、用語「ActRII」は、II型アクチビンレセプターのファミリーを指す。このファミリーは、アクチビンレセプターIIa型およびアクチビンレセプターIIb型の両方を含む。
特定の局面では、本発明は、ActRIIaポリペプチドに関する。本明細書中で使用される場合、用語「ActRIIa」は、任意の種に由来するアクチビンレセプターIIa型(ActRIIa)タンパク質、および、突然変異誘発もしくは他の修飾法によってこのようなActRIIaタンパク質から誘導された改変体のファミリーを指す。本明細書におけるActRIIaに対する参照は、現在同定されている形態のうちの1つに対する参照であるものと理解される。ActRIIaファミリーのメンバーは、一般に、システインリッチな領域を持つリガンド結合細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよび推定のセリン/スレオニンキナーゼ活性を持つ細胞質ドメインから構成される、膜貫通タンパク質である。
用語「ActRIIaポリペプチド」は、ActRIIaファミリーメンバーの任意の天然に存在するポリペプチド、ならびに、有用な活性を保持するその任意の改変体(変異体、フラグメント、融合物およびペプチド模倣形態を含む)を含むポリペプチドを包含する。例えば、WO/2006/012627を参照のこと。例えば、ActRIIaポリペプチドは、ActRIIaポリペプチドの配列に対して少なくとも約80%同一な、そして、必要に応じて、少なくとも85%、90%、95%、97%、99%もしくはそれより高い同一性を持つ配列を有する任意の公知のActRIIaの配列から誘導されたポリペプチドを包含する。例えば、本発明のActRIIaポリペプチドは、ActRIIaタンパク質および/またはアクチビンに結合し、これらの機能を阻害し得る。ActRIIaポリペプチドは、インビボで赤血球の形成を促進する際の活性について選択され得る。ActRIIaポリペプチドの例としては、ヒトActRIIa前駆体ポリペプチド(配列番号1)および可溶性ActRIIaポリペプチド(例えば、配列番号2、3、7および12)が挙げられる。
ヒトActRIIa前駆体タンパク質配列は以下のとおりである:
Figure 2017075187
シグナルペプチドに一重下線を付す;細胞外ドメインは太字で示し、そして、潜在的なN連結グリコシル化部位に二重下線を付す。
ヒトActRIabの可溶性(細胞外)の、プロセシング後のポリペプチド配列は以下のとおりである:
Figure 2017075187
細胞外ドメインのC末端「テイル」に下線を付す。「テイル」が欠失された配列(Δ15配列)は以下のとおりである:
Figure 2017075187
ヒトActRIIa前駆体タンパク質をコードする核酸配列は以下のとおりである:
(GenbankエントリーNM_001616のヌクレオチド164〜1705)
Figure 2017075187
ヒトActRIIa可溶性(細胞外)ポリペプチドをコードする核酸配列は以下のとおりである:
Figure 2017075187
特定の局面では、本発明は、ActRIIbポリペプチドに関する。本明細書中で使用される場合、用語「ActRIIb」は、任意の種に由来するアクチビンレセプターIIb型(ActRIIb)タンパク質、および、突然変異誘発もしくは他の修飾法によってこのようなActRIIbタンパク質から誘導された改変体のファミリーを指す。本明細書におけるActRIIbに対する参照は、現在同定されている形態のうちの1つに対する参照であるものと理解される。ActRIIbファミリーのメンバーは、一般に、システインリッチな領域を持つリガンド結合細胞外ドメイン、膜貫通ドメインおよび推定のセリン/スレオニンキナーゼ活性を持つ細胞質ドメインから構成される、膜貫通タンパク質である。
用語「ActRIIbポリペプチド」は、ActRIIbファミリーメンバーの任意の天然に存在するポリペプチド、ならびに、有用な活性を保持するその任意の改変体(変異体、フラグメント、融合物およびペプチド模倣形態を含む)を含むポリペプチドを包含する。例えば、WO/2006/012627を参照のこと。例えば、ActRIIbポリペプチドは、ActRIIbポリペプチドの配列に対して少なくとも約80%同一な、そして、必要に応じて、少なくとも85%、90%、95%、97%、99%もしくはそれより高い同一性を持つ配列を有する任意の公知のActRIIbの配列から誘導されたポリペプチドを包含する。例えば、本発明のActRIIbポリペプチドは、ActRIIbタンパク質および/またはアクチビンに結合し、これらの機能を阻害し得る。ActRIIbポリペプチドは、インビボで赤血球の形成を促進する際の活性について選択され得る。ActRIIbポリペプチドの例としては、ヒトActRIIb前駆体ポリペプチド(配列番号15)および可溶性ActRIIbポリペプチド(例えば、配列番号16、17、20および21)が挙げられる。
ヒトActRIIb前駆体タンパク質の配列は以下のとおりである:
Figure 2017075187
シグナルペプチドに一重下線を付す;細胞外ドメインは太字で示し、そして、潜在的なN連結グリコシル化部位は四角で囲む。
ヒトActRIIbの可溶性(細胞外)の、プロセシング後のポリペプチド配列は以下のとおりである:
Figure 2017075187
細胞外ドメインのC末端「テイル」に下線を付す。「テイル」が欠失された配列(Δ15配列)は以下のとおりである:
Figure 2017075187
ヒトActRIIb前駆体タンパク質をコードする核酸配列は以下のとおりである:
(GenbankエントリーNM_001106のヌクレオチド5〜1543)
Figure 2017075187
ヒトActRIIb可溶性(細胞外)ポリペプチドをコードする核酸配列は以下のとおりである:
Figure 2017075187
特定の実施形態では、本発明は、可溶性ActRIIポリペプチドに関する。本明細書中で使用される場合、用語「可溶性ActRIIポリペプチド」は、一般に、ActRIIaもしくはActRIIbタンパク質の細胞外ドメインを含むポリペプチドを指す。用語「可溶性ActRIIポリペプチド」は、本明細書中で使用される場合、ActRIIaもしくはActRIIbタンパク質の任意の天然に存在する細胞外ドメインならびに任意のその改変体(変異体、フラグメントおよびペプチド模倣形態を含む)を包含する。アクチビン結合ActRIIポリペプチドは、アクチビン(例えば、アクチビンAA、AB、BB、または、CもしくはEサブユニットを含む形態を含む)に結合する能力を保持するものである。必要に応じて、アクチビン結合ActRIIポリペプチドは、1nM以下の解離定数でアクチビンAAに結合する。ActRIIタンパク質の細胞外ドメインは、アクチビンに結合し、そして、一般に可溶性であり、したがって、可溶性のアクチビン結合ActRIIポリペプチドと呼ばれ得る。可溶性のアクチビン結合ActRIIaポリペプチドの例としては、配列番号2、3、7、12および13に示される可溶性ポリペプチドが挙げられる。配列番号7は、ActRIIa−hFcと呼ばれ、そして、実施例においてさらに記載される。可溶性のアクチビン結合ActRIIaポリペプチドの他の例は、ActRIIaタンパク質の細胞外ドメインに加え、シグナル配列(例えば、ミツバチメリチンのリーダー配列(配列番号8)、組織プラスミノーゲンアクチベーター(TPA)リーダー(配列番号9)、またはネイティブなActRIIaリーダー(配列番号10))を含む。配列番号13に示されるActRIIa−hFcポリペプチドは、TPAリーダーを使用する。可溶性のアクチビン結合ActRIIbポリペプチドの例としては、配列番号16、17、20に示される可溶性ポリペプチドが挙げられる。アクチビン結合ActRIIbポリペプチドもまた、ActRIIbの細胞外ドメインに加え、シグナル配列(例えば、ミツバチメリチンのリーダー配列(配列番号8)、または組織プラスミノーゲンアクチベーター(TPA)リーダー(配列番号9))を含み得る。
ActRIIポリペプチドの機能的に活性なフラグメントは、ActRIIポリペプチドをコードする核酸の対応するフラグメントから組換えにより生成されるポリペプチドをスクリーニングすることによって得られ得る。さらに、フラグメントは、従来のMerrifield固相f−Mocもしくはt−Boc化学のような当該分野で公知の技術を用いて化学的に合成され得る。フラグメントは、(組換えにより、または、化学合成により)生成され得、そして、ActRIIタンパク質またはアクチビンにより媒介されるシグナル伝達のアンタゴニスト(インヒビター)として機能し得るペプチジルフラグメントを同定するために試験され得る。
ActRIIポリペプチドの機能的に活性な改変体は、ActRIIポリペプチドをコードする対応する変異誘発を起こした核酸から組換えにより生成される修飾ポリペプチドのライブラリーをスクリーニングすることによって得られ得る。改変体は、生成され得、そして、ActRIIタンパク質またはアクチビンにより媒介されるシグナル伝達のアンタゴニスト(インヒビター)として機能し得るものを同定するために試験され得る。特定の実施形態では、ActRIIaポリペプチドの機能的改変体は、配列番号2または3から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも75%同一なアミノ酸配列を含む。特定の場合、機能的改変体は、配列番号2または3から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%もしくは100%同一なアミノ酸配列を有する。特定の実施形態では、ActRIIbポリペプチドの機能的改変体は、配列番号16または17から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも75%同一なアミノ酸配列を含む。特定の場合、機能的改変体は、配列番号17または18から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%もしくは100%同一なアミノ酸配列を有する。
機能的改変体は、治療効率または安定性(例えば、エキソビボ貯蔵寿命およびインビボでのタンパク質分解に対する抵抗性)の増強のような目的のために、ActRIIポリペプチドの構造を修飾することによって作製され得る。このような改変されたActRIIポリペプチドは、アクチビン結合を保持するように選択される場合、天然に存在するActRIIポリペプチドの機能的な等価物とみなされる。改変されたActRIIポリペプチドはまた、例えば、アミノ酸の置換、欠失または付加によって生成され得る。例えば、ロイシンのイソロイシンもしくはバリンでの孤立した置換、アスパラギン酸のグルタミン酸での孤立した置換、スレオニンのセリンでの孤立した置換、または、あるアミノ酸の、構造的に関連したアミノ酸での同様の置換(例えば、保存的変異)は、結果として生じる分子の生物学的活性に対して大きな影響を及ぼさないもの予想するのは理にかなっている。保存的置換は、その側鎖が関連しているアミノ酸のファミリー内で行われる置換である。ActRIIポリペプチドのアミノ酸配列の変化が機能的なホモログを生じるかどうかは、改変型ActRIIポリペプチドが細胞において野生型ActRIIポリペプチドと同様の様式で応答を生じる能力を評価することによって容易に決定され得る。
特定の実施形態では、本発明は、ポリペプチドのグリコシル化を変更するようなActRIIポリペプチドの特定の変異を帰途する。このような変異は、1以上のグリコシル化部位(例えば、O−連結もしくはN−連結のグリコシル化部位)を導入もしくは排除するように選択され得る。アスパラギン連結グリコシル化認識部位は、一般に、トリペプチド配列、アスパラギン−X−スレオニンまたはアスパラギン−X−セリン(ここで、「X」は任意のアミノ酸である)を含み、この配列は、適切な細胞のグリコシル化酵素によって特異的に認識される。変化はまた、(O−連結グリコシル化部位については)野生型ActRIIポリペプチドの配列への、1以上のセリンもしくはスレオニン残基の付加、または、1以上のセリンもしくはスレオニン残基での置換によってなされ得る。グリコシル化認識部位の第1位もしくは第3位のアミノ酸の一方もしくは両方における種々のアミノ酸置換もしくは欠失(および/または、第2位におけるアミノ酸の欠失)は、改変されたトリペプチド配列において非グリコシル化をもたらす。ActRIIポリペプチドにおける糖質部分の数を増加させる別の手段は、ActRIIポリペプチドへのグリコシドの化学的もしくは酵素的なカップリングによるものである。使用されるカップリング様式に依存して、糖は、(a)アルギニンおよびヒスチジン;(b)遊離カルボキシル基;(c)遊離スルフヒドリル基(例えば、システインのもの);(d)遊離ヒドロキシル基(例えば、セリン、スレオニンまたはヒドロキシプロリンのもの);(e)芳香族残基(例えば、フェニルアラニン、チロシンまたはトリプトファンのもの);または(f)グルタミンのアミド基に付加され得る。ActRIIポリペプチド上に存在する1以上の糖質部分の除去は、化学的および/または酵素的に達成され得る。化学的な脱グリコシル化は、例えば、化合物トリフルオロメタンスルホン酸または等価な化合物へのActRIIポリペプチドの曝露を含み得る。この処理は、アミノ酸配列をインタクトなままにしつつ、連結糖(N−アセチルグルコサミンまたはN−アセチルガラクトサミン)を除くほとんどもしくは全ての糖の切断を生じる。ActRIIポリペプチド上の糖質部分の酵素的切断は、Thotakuraら(1987)Meth.Enzymol.138:350に記載されるように、種々のエンドグリコシダーゼもしくはエキソグリコシダーゼの使用により達成され得る。ActRIIポリペプチドの配列は、適切な場合、使用される発現系のタイプに応じて調節され得る。というのも、哺乳動物、酵母、昆虫および植物の細胞は全て、ペプチドのアミノ酸配列によって影響され得る異なるグリコシル化パターンを導入し得る。一般に、ヒトにおいて使用するためのActRIIタンパク質は、適切なグリコシル化を提供する哺乳動物細胞株(例えば、HEK293細胞株またはCHO細胞株)において発現され得るが、他の哺乳動物発現細胞株も同様に有用であることと期待される。
本開示はさらに、変異、特に、ActRIIポリペプチドのコンビナトリアル変異のセット、ならびに、短縮型変異(truncation mutant)を作製する方法を企図する;コンビナトリアル変異のプールは、機能的改変体の配列を同定するために特に有用である。このようなコンビナトリアルライブラリーをスクリーニングする目的は、例えば、アクチビンまたは他のリガンドに結合するActRIIポリペプチド改変体を作製するため、であり得る。種々のスクリーニングアッセイが以下に提供され、そして、このようなアッセイは、改変体を評価するために使用され得る。例えば、ActRIIポリペプチド改変体は、ActRIIリガンドに結合する能力、ActRIIリガンドのActRIIポリペプチドへの結合を妨害する能力、または、ActRIIリガンドにより引き起こされるシグナル伝達と干渉する能力についてスクリーニングされ得る。
ActRIIポリペプチドまたはその改変体の活性はまた、細胞ベースのアッセイまたはインビボアッセイにおいて試験され得る。例えば、造血に関与する遺伝子の発現に対するActRIIポリペプチド改変体の作用が評価され得る。これは、必要な場合、1以上の組換えActRIIリガンドタンパク質(例えば、アクチビン)の存在下で行われ得、そして、ActRIIポリペプチドおよび/またはその改変体、そして必要に応じてActRIIリガンドを生成するように細胞がトランスフェクトされ得る。同様に、ActRIIポリペプチドは、マウスもしくは他の動物に投与され得、そして、1以上の血液測定値(例えば、RBC数、ヘモグロビン、または網状赤血球数)が評価され得る。
天然に存在するActRIIポリペプチドに対して、選択性を有するか、または全体的に効力が増加された、コンビナトリアル由来の(combinatorially−derived)改変体が作製され得る。同様に、突然変異誘発は、対応する野生型ActRIIポリペプチドとは劇的に異なる細胞内半減期を有する改変体を生じ得る。例えば、変更されたタンパク質は、タンパク質分解、または、ネイティブなActRIIポリペプチドの崩壊もしくは他の方法で不活性化をもたらす他の細胞プロセスに対してより安定性であるかもしくは安定性が低いかのいずれかにされ得る。このような改変体およびこれをコードする遺伝子は、ActRIIポリペプチドの半減期を調節することによってActRIIポリペプチドレベルを変更するために利用され得る。例えば、短い半減期は、より一過性の生物学的作用を生じ得、そして、誘導性の発現系の一部である場合、細胞内での組換えActRIIポリペプチドレベルのより厳しい制御を可能にし得る。Fc融合タンパク質では、変異は、タンパク質の半減期を変更するために、リンカー(存在する場合)および/またはFc部分において作製され得る。
コンビナトリアルライブラリーは、各々が少なくとも潜在的なActRIIポリペプチド配列の一部を含むポリペプチドライブラリーをコードする遺伝子の縮重ライブラリー(degenerate library)によって生成され得る。例えば、合成オリゴヌクレオチドの混合物は、潜在的なActRIIポリペプチドのヌクレオチド配列の縮重セットが、個々のポリペプチドとして、あるいは、(例えば、ファージディスプレイのための)より大きな融合タンパク質のセットとして発現可能となるように、遺伝子配列中に酵素的にライゲーションされ得る。
縮重オリゴヌクレオチド配列から潜在的なホモログのライブラリーが作製され得る数多くの方法が存在する。縮重遺伝子配列の化学合成は、自動DNA合成装置において行われ得、そしてその後、合成遺伝子が、適切な発現ベクター中にライゲーションされ得る。縮重オリゴヌクレオチドの合成は当該分野で周知である(例えば、Narang,SA(1983)Tetrahedron 39:3;Itakuraら、(1981)Recombinant DNA,Proc.3rd Cleveland Sympos.Macromolecules,AG Walton編,Amsterdam:Elsevier pp273−289;Itakuraら、(1984)Annu.Rev.Biochem.53:323;Itakuraら、(1984)Science 198:1056;Ikeら、(1983)Nucleic Acid Res.11:477を参照のこと)。このような技術は、他のタンパク質の有向の進化(directed evolution)において用いられ得る(例えば、Scottら、(1990)Science 249:386−390;Robertsら、(1992)PNAS USA 89:2429−2433;Devlinら、(1990)Science 249:404−406;Cwirlaら、(1990)PNAS USA 87:6378−6382;ならびに、米国特許第5,223,409号、同第5,198,346号および同第5,096,815号を参照のこと)。
あるいは、コンビナトリアルライブラリーを作製するために、他の形態の突然変異誘発が利用され得る。例えば、ActRIIポリペプチド改変体は、例えば、アラニン走査突然変異誘発などを用いるスクリーニングによって(Rufら、(1994)Biochemistry 33:1565−1572;Wangら、(1994)J.Biol.Chem.269:3095−3099;Balintら、(1993)Gene 137:109−118;Grodbergら、(1993)Eur.J.Biochem.218:597−601;Nagashimaら、(1993)J.Biol.Chem.268:2888−2892;Lowmanら、(1991)Biochemistry
30:10832−10838;およびCunninghamら、(1989)Science 244:1081−1085)、リンカー走査突然変異誘発によって(Gustinら、(1993)Virology 193:653−660;Brownら、(1992)Mol.Cell Biol.12:2644−2652;McKnightら、(1982)Science 232:316);飽和突然変異誘発によって(Meyersら、(1986)Science 232:613);PCR突然変異誘発によって(Leungら、(1989)Method Cell Mol Biol 1:11−19);または、ランダム突然変誘発(化学突然変異誘発などを含む)によって(Millerら、(1992)A Short Course in Bacterial
Genetics,CSHL Press,Cold Spring Harbor,NY;およびGreenerら、(1994)Strategies in Mol Biol 7:32−34)、ライブラリーから作製および単離され得る。(特に、コンビナトリアルな設定における)リンカー走査突然変異誘発は、ActRIIポリペプチドの短縮型(生物活性)形態を同定するための魅力的な方法である。
点突然変異および短縮によって作製されたコンビナトリアルライブラリーの遺伝子産物をスクリーニングするため、また、その状況のために、特定の特性を持つ遺伝子産物についてのcDNAライブラリーをスクリーニングするための、広範囲の技術が当該分野で公知である。このような技術は、一般に、ActRIIポリペプチドのコンビナトリアル突然変異誘発によって作製された遺伝子ライブラリーの迅速なスクリーニングに適用可能である。大きな遺伝子ライブラリーをスクリーニングするための最も広く使用される技術は、代表的に、複製発現ベクター中への遺伝子ライブラリーのクローニング、得られたベクターライブラリーを用いた適切な細胞の形質転換、および、所望される活性の検出が、遺伝子(その産物が検出される)をコードするベクターの比較的簡単な単離を容易にする条件下でのコンビナトリアル遺伝子発現を含む。好ましいアッセイとしては、アクチビン結合アッセイおよびアクチビン媒介性細胞シグナル伝達アッセイが挙げられる。
特定の実施形態では、本発明のActRIIポリペプチドは、さらに、ActRIIポリペプチド中に天然に存在するものに加えて、翻訳後修飾を含み得る。このような修飾としては、アセチル化、カルボキシル化、グリコシル化、ホスホリル化、脂質化(lipidation)およびアシル化が挙げられるがこれらに限定されない。結果として、修飾されたActRIIポリペプチドは、ポリエチレングリコール、脂質、多糖類もしくは単糖類およびリン酸のような非アミノ酸成分を含み得る。このような非アミノ酸成分の、ActRIIポリペプチドの機能に対する影響は、他のActRIIポリペプチド改変体について本明細書中に記載されるようにして試験され得る。ActRIIポリペプチドの発生直後の形態を切断することによってActRIIポリペプチドが細胞内で生成される場合、翻訳後プロセシングもまた、このタンパク質の正確な折り畳みおよび/または機能にとって重要となり得る。異なる細胞(例えば、CHO、HeLa、MDCK、293、WI38、NIH−3T3またはHEK293)は、このような翻訳後の活性のための特定の細胞機構および特徴的なメカニズムを有し、そして、ActRIIポリペプチドの正確な修飾およびプロセシングを保証するように選択され得る。
特定の局面では、ActRIIポリペプチドの機能的改変体または改変された形態は、少なくともActRIIポリペプチドの一部分と1以上の融合ドメインとを有する融合タンパク質を含む。このような融合ドメインの周知の例としては、ポリヒスチジン、Glu−Glu、グルタチオンSトランスフェラーゼ(GST)、チオレドキシン、プロテインA、プロテインG、免疫グロブリン重鎖定常領域(Fc)、マルトース結合タンパク質(MBP)、またはヒト血清アルブミンが挙げられるがこれらに限定されない。融合ドメインは、所望される特性を与えるように選択され得る。例えば、いくつかの融合ドメインが、アフィニティクロマトグラフィーによる融合タンパク質の単離に特に有用である。アフィニティ精製の目的では、グルタチオン−、アミラーゼ−、およびニッケル−もしくはコバルト−結合化樹脂のような、アフィニティクロマトグラフィーのための適切なマトリクスが使用される。このようなマトリクスの多くは、Pharmacia GST精製システムおよび(HIS)融合パートナーと共に有用なQIAexpressTMシステム(Qiagen)のような「キット」の形態で利用可能である。別の例としては、融合ドメインは、ActRIIポリペプチドの検出を容易にするように選択され得る。このような検出ドメインの例としては、種々の蛍光タンパク質(例えば、GFP)、ならびに、「エピトープタグ」(特定の抗体に利用可能な通常は短いペプチド配列である)が挙げられる。特定のモノクローナル抗体に容易に利用可能な周知のエピトープタグとしては、FLAG、インフルエンザウイルスヘマグルチニン(HA)およびc−mycタグが挙げられる。いくつかの場合、融合ドメインは、関連のプロテアーゼが融合タンパク質を部分的に消化し、それによって、そこから組換えタンパク質を解放することを可能にする、第Xa因子またはトロンビンのようなプロテアーゼ切断部位を有する。解放されたタンパク質は、次いで、その後のクロマトグラフィーによる分離によって、融合ドメインから単離され得る。特定の好ましい実施形態では、ActRIIポリペプチドは、インビボでActRIIポリペプチドを安定化させるドメイン(「安定化」ドメイン)と融合される。「安定化」とは、それが、崩壊の減少によるものであるか、腎臓によるクリアランスの減少によるものであるか、他の薬物動態作用によるものであるかとは無関係に、血清半減期を増加させる何かを意味する。免疫グロブリンのFc部分との融合は、広範囲のタンパク質に対して所望の薬物動態特性を与えることが知られる。同様に、ヒト血清アルブミンへの融合は、所望の特性を与え得る。選択され得る融合ドメインの他のタイプとしては、多量体化(例えば、二量体化、四量体化)ドメインおよび機能的ドメイン(例えば、筋肉増殖のさらなる刺激のような付加的な生物学的機能を与えるもの)が挙げられる。
具体例として、本発明は、Fcドメインに融合されたActRIIaの可溶性細胞外ドメインを含む融合タンパク質(例えば、配列番号6)を提供する。
Figure 2017075187
別の具体例として、本発明は、Fcドメインに融合されたActRIIbの可溶性細胞外ドメインを含む融合タンパク質(例えば、配列番号21)を提供する。
Figure 2017075187
必要に応じて、Fcドメインは、Asp−265、リジン322およびAsn−434のような残基における1以上の変異を有する。特定の場合、これらの変異のうち1以上(例えば、Asp−265変異)を持つ変異型Fcドメインは、野生型Fcドメインに対する、Fcγレセプターへの結合能の低下を有する。他の場合では、これらの変異のうち1以上(例えば、Asn−434変異)を持つ変異型Fcドメインは、野生型Fcドメインに対する、MHCクラスI関連のFcレセプター(FcRN)への結合の増加を有する。
融合タンパク質の異なる成分は、所望の機能と両立するあらゆる様式で配列され得ることが理解される。例えば、ActRIIポリペプチドは、異種ドメインに対してC末端側に配置されても、あるいは、異種ドメインが、ActRIIポリペプチドに対してC末端側に配置されてもよい。ActRIIポリペプチドドメインと異種ドメインとは、融合タンパク質において隣接している必要はなく、そして、さらなるドメインもしくはアミノ酸配列が、いずれかのドメインに対してC末端もしくはN末端側に、または、これらのドメイン間に含められてもよい。
特定の実施形態では、本発明のActRIIポリペプチドは、ActRIIポリペプチドを安定化させ得る1以上の修飾を含む。例えば、このような修飾は、ActRIIポリペプチドのインビトロ半減期を増強させるか、ActRIIポリペプチドの循環半減期を増強させるか、または、ActRIIポリペプチドのタンパク質分解を減少させる。このような安定化修飾としては、融合タンパク質(例えば、ActRIIポリペプチドと安定化ドメインとを含む融合タンパク質が挙げられる)、グリコシル化部位の修飾(例えば、ActRIIポリペプチドのグリコシル化部位の付加が挙げられる)、および糖質部分の修飾(例えば、ActRIIポリペプチドからの糖質部分の除去が挙げられる)が挙げられるがこれらに限定されない。本明細書中で使用される場合、用語「安定化ドメイン」は、融合タンパク質の場合のように融合ドメイン(例えば、Fc)を指すだけでなく、糖質部分のような非タンパク質性修飾、または、ポリエチレングリコールのような非タンパク質性部分も含む。
特定の実施形態では、本発明は、ActRIIポリペプチドの単離および/または精製された形態(他のタンパク質から単離されたか、他の方法で他のタンパク質を実質的に含まないもの)を利用可能にする。ActRIIポリペプチドは一般に、組換え核酸からの発現によって生成される。
3.ActRIIポリペプチドをコードする核酸
特定の局面では、本発明は、本明細書中に開示されるフラグメント、機能的改変体および融合タンパク質を含むActRIIポリペプチドのいずれか(例えば、可溶性ActRIIaポリペプチドおよび可溶性ActRIIbポリペプチド)をコードする単離されたおよび/または組換えの核酸を提供する。例えば、配列番号4は、天然に存在するヒトActRIIa前駆体ポリペプチドをコードするが、配列番号5は、ActRIIaのプロセシングを受けた細胞外ドメインをコードする。例えば、配列番号18は、天然に存在するActRIIb前駆体ポリペプチドをコードするが、配列番号19は、ActRIIbのプロセシングを受けた細胞外ドメインをコードする。本発明の核酸は、一本鎖もしくは二本鎖であり得る。このような核酸は、DNA分子もしくはRNA分子であり得る。これらの核酸は、例えば、ActRIIポリペプチドを作製するための方法において、また、(例えば、遺伝子治療アプローチにおいて)直接的な治療剤として使用され得る。
特定の局面では、ActRIIaポリペプチドをコードする本発明の核酸はさらに、配列番号4または5の改変体である核酸を含むものと理解される。特定の局面では、ActRIIbポリペプチドをコードする本発明の核酸はさらに、配列番号18または19の改変体である核酸を含むものと理解される。改変体ヌクレオチド配列は、対立遺伝子改変体のような、1以上のヌクレオチドの置換、付加もしくは欠失によって異なる配列を含む。
特定の実施形態では、本発明は、配列番号4、5、18または19に対して少なくとも80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%または100%同一な単離されたまたは組換えの核酸配列を提供する。当業者は、配列番号4、5、18または19に対して相補的な核酸配列、および配列番号4、5、18または19の改変体もまた、本発明の範囲内であることを理解する。さらなる実施形態では、本発明の核酸配列は、異種ヌクレオチド配列と共に、または、DNAライブラリーにおいて、単離、組換えおよび/または融合され得る。
他の実施形態では、本発明の核酸はまた、配列番号4、5、18または19に指定されるヌクレオチド配列に対して高度にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列、配列番号の相補配列4、5、18または19、あるいは、これらのフラグメントを含む。上述のように、当業者は、DNAのハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件が変更され得ることを容易に理解する。当業者は、DNAのハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件が変更され得ることを容易に理解する。例えば、約45℃における6.0×塩化ナトリウム/クエン酸ナトリウム(SSC)でのハイブリダイゼーションの後に、50℃における2.0×SSCの洗浄を行い得る。例えば、洗浄工程における塩濃度は、50℃における約2.0×SSCの低ストリンジェンシーから、50℃における約0.2×SSCの高ストリンジェンシーまで選択され得る。さらに、洗浄工程における温度は、室温(約22℃)の低ストリンジェンシー条件から、約65℃の高ストリンジェンシー条件まで上昇され得る。温度と塩の両方が変更されても、温度または塩濃度が一定に保たれ、他方が変更されてもよい。一実施形態では、本発明は、室温における6×SSCとその後の室温で2×SSCでの洗浄の低ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズする核酸を提供する。
遺伝子コードにおける縮重に起因して配列番号4、5、18または19に示される核酸と異なる単離された核酸もまた、本発明の範囲内である。例えば、多数のアミノ酸が1以上のトリプレットによって示される。同じアミノ酸を特定するコドンまたは同義語(例えば、CAUおよびCACはヒスチジンに対する同義語である)は、タンパク質のアミノ酸配列に影響を及ぼさない「サイレント」変異を生じ得る。しかしながら、哺乳動物細胞の中には、本発明のタンパク質のアミノ酸配列に変化をもたらすDNA配列の多型が存在することが予想される。当業者は、天然の対立遺伝子改変に起因して、所与の種の個体間に、特定のタンパク質をコードする核酸の1以上のヌクレオチド(約3〜5%までのヌクレオチド)におけるこれらの改変がし得ることを理解する。任意およびあらゆるこのようなヌクレオチドの改変と、結果として生じるアミノ酸の多型とは、本発明の範囲内である。
特定の実施形態では、本発明の組換え核酸は、発現構築物において1以上の調節性ヌクレオチド配列に作動可能に連結され得る。調節性のヌクレオチド配列は、一般に、発現のために使用される宿主細胞に対して適切なものである。種々の宿主細胞について、多数のタイプの適切な発現ベクターおよび適切な調節性配列が当該分野で公知である。代表的には、上記1以上の調節性ヌクレオチド配列としては、プロモーター配列、リーダー配列もしくはシグナル配列、リボソーム結合部位、転写開始配列および転写終結配列、翻訳開始配列および翻訳終結配列、ならびに、エンハンサー配列もしくはアクチベーター配列が挙げられるがこれらに限定されない。当該分野で公知の構成的もしくは誘導性のプロモーターが、本発明によって企図される。プロモーターは、天然に存在するプロモーター、または、1以上のプロモーターの要素を組み合わせたハイブリッドプロモーターのいずれかであり得る。発現構築物は、プラスミドのようにエピソーム上で細胞中に存在し得るか、または、発現構築物は、染色体中に挿入され得る。好ましい実施形態では、発現ベクターは、形質転換された宿主細胞の選択を可能にするために、選択可能なマーカー遺伝子を含む。選択可能なマーカー遺伝子は、当該分野で周知であり、そして、使用される宿主細胞により変化する。
本発明の特定の局面では、本発明の核酸は、ActRIIポリペプチドをコードし、そして、少なくとも1つの調節性配列に作動可能に連結されたヌクレオチド配列を含む発現ベクターにおいて提供される。調節性配列は当該分野で認識され、そして、ActRIIポリペプチドの発現を誘導するように選択される。したがって、用語調節性配列は、プロモーター、エンハンサーおよび他の発現制御エレメントを含む。例示的な調節性配列は、Goeddel;Gene Expression Technology:Methods in Enzymology,Academic Press,San Diego,CA(1990)に記載される。例えば、作動可能に連結されたときにDNA配列の発現を制御する広範な種々の発現制御配列のいずれかが、ActRIIポリペプチドをコードするDNA配列を発現させるためにこれらのベクターにおいて使用され得る。このような有用な発現制御配列としては、例えば、SV40の初期および後期プロモーター、tetプロモーター、アデノウイルスもしくはサイトメガロウイルスの最初期プロモーター、RSVプロモーター、lacシステム、trpシステム、TACもしくはTRCシステム、T7 RNAポリメラーゼによってその発現が誘導されるT7プロモーター、ファージλの主要なオペレーターおよびプロモーター領域、fdコートタンパク質の制御領域、3−ホスホグリセリン酸キナーゼもしくは他の糖分解酵素のプロモーター、酸性ホスファターゼのプロモーター(例えば、Pho5)、酵母α−接合因子(mating factor)のプロモーター、バキュロウイルス系の多角体プロモーター、ならびに、原核生物もしくは真核生物の細胞、または、そのウイルスの遺伝子の発現を制御することが知られる他の配列、ならびにこれらの種々の組み合わせが挙げられる。発現ベクターの設計は、形質転換される宿主細胞の選択および/または発現されることが所望されるタンパク質のタイプのような要因に依存し得ることが理解されるべきである。さらに、ベクターのコピー数、コピー数を制御する能力およびベクターによってコードされる任意の他のタンパク質(例えば、抗生物質マーカー)の発現もまた考慮される。
本発明の組換え核酸は、クローニングされた遺伝子またはその一部を、原核生物細胞、真核生物細胞(酵母、鳥類、昆虫または哺乳動物)のいずれか、または両方において発現させるために適切なベクター中に連結することによって生成され得る。組換えActRIIポリペプチドの生成のための発現ビヒクルとしては、プラスミドおよび他のベクターが挙げられる。例えば、適切なベクターとしては、以下のタイプのプラスミドが挙げられる:原核生物細胞(例えば、E.coli)における発現のための、pBR322由来のプラスミド、pEMBL由来のプラスミド、pEX由来のプラスミド、pBTac由来のプラスミドおよびpUC由来のプラスミド。
いくつかの哺乳動物発現ベクターは、細菌中でのベクターの増殖を促進するための原核生物の配列と、真核生物細胞において発現される1以上の真核生物の転写単位の両方とを含む。pcDNAI/amp、pcDNAI/neo、pRc/CMV、pSV2gpt、pSV2neo、pSV2−dhfr、pTk2、pRSVneo、pMSG、pSVT7、pko−neoおよびpHyg由来のベクターは、真核生物細胞のトランスフェクションに適切な哺乳動物発現ベクターの例である。これらのベクターのいくつかは、原核生物細胞および真核生物細胞の両方における複製および薬物耐性選択を容易にするために、細菌プラスミド(例えば、pBR322)からの配列を用いて改変される。あるいは、ウシパピローマウイルス(BPV−1)またはエプスタイン−バーウイルスのようなウイルスの誘導体(pHEBo、pREP由来およびp205)が、真核生物細胞におけるタンパク質の一過的な発現のために使用され得る。他のウイルス(レトロウイルスを含む)発現系の例は、遺伝子治療送達系の説明において以下に見出され得る。プラスミドの調製および宿主生物の形質転換において用いられる種々の方法は、当該分野で周知である。原核生物細胞および真核生物細胞の両方についての他の適切な発現系、ならびに、一般的な組換え手順については、Molecular Cloning A Laboratory Manual,3rd Ed.,Sambrook,FritschおよびManiatis編(Cold Spring Harbor Laboratory Press,2001)を参照のこと。いくつかの場合において、バキュロウイルス発現系を用いて組換えポリペプチドを発現させることが望ましくあり得る。このようなバキュロウイルス発現系の例としては、pVL由来のベクター(例えば、pVL1392、pVL1393およびpVL941)、pAcUW由来のベクター(例えば、pAcUWl)およびpBlueBac由来のベクター(例えば、β−galを含むpBlueBac III)が挙げられる。
好ましい実施形態では、ベクターは、CHO細胞における本発明のActRIIポリペプチドの生成のために設計される(例えば、Pcmv−Scriptベクター(Stratagene,La Jolla,Calif.)、pcDNA4ベクター(Invitrogen,Carlsbad,Calif.)およびpCI−neoベクター(Promega,Madison,Wise))。明らかであるように、本発明の遺伝子構築物は、例えば、タンパク質(融合タンパク質または改変体タンパク質を含む)を生成するため、精製のために、培養物において増殖させた細胞において本発明のActRIIポリペプチドの発現を引き起こすために使用され得る。
本開示はまた、1以上の本発明のActRIIポリペプチドのコード配列(例えば、配列番号4、5、18または19)を含む組換え遺伝子をトランスフェクトされた宿主細胞に関する。宿主細胞は、任意の原核生物細胞または真核生物細胞であり得る。例えば、本発明のActRIIポリペプチドは、E.coliのような細菌細胞、昆虫細胞(例えば、バキュロウイルス発現系を用いる)、酵母細胞または哺乳動物細胞において発現され得る。他の適切な宿主細胞は、当業者に公知である。
したがって、本発明はさらに、本発明のActRIIポリペプチドを生成する方法に関する。例えば、ActRIIaもしくはActIIbポリペプチドをコードする発現ベクターでトランスフェクトされた宿主細胞は、ActRIIポリペプチドの発現を起こすことが可能な適切な条件下で培養され得る。ActRIIポリペプチドは、ActRIIポリペプチドを含む細胞および培地の混合物から分泌および単離され得る。あるいは、ActRIIポリペプチドは、細胞質または膜画分に保持され得、そして、細胞が回収、溶解され、そして、タンパク質が単離される。細胞培養物は、宿主細胞、培地および他の副産物を含む。細胞培養に適切な培地は、当該分野で周知である。本発明のActRIIポリペプチドは、タンパク質の精製についての当該分野で公知の技術(イオン交換クロマトグラフィー、ゲル濾過クロマトグラフィー、限外濾過、電気泳動、ActRIIポリペプチドの特定のエピトープに特異的な抗体を用いた免疫親和性精製、および、ActRIIポリペプチドに融合させたドメインに結合する因子を用いた親和性精製(例えば、ActRIIa−FcまたはActRIIb−Fc融合物を精製するために、プロテインAカラムが使用され得る)を含む)を用いて、細胞培養培地、宿主細胞またはこの両方から単離され得る。好ましい実施形態では、ActRIIポリペプチドは、その精製を促進するドメインを含む融合タンパク質である。好ましい実施形態では、精製は、例えば、以下のうちの3またはそれ以上を任意の順序で含む一連のカラムクロマトグラフィー工程によって達成され得る:プロテインAクロマトグラフィー、Qセファロースクロマトグラフィー、フェニルセファロースクロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィーおよびカチオン交換クロマトグラフィー。精製は、ウイルス濾過およびバッファの交換により完了され得る。本明細書中に示されるように、ActRIIa−hFcタンパク質は、サイズ排除クロマトグラフィーによって決定すると、98%を超える純度、そして、SDS PAGEによって決定すると、95%を超える純度まで精製された。このレベルの純度は、マウス、ラットおよび非ヒト霊長類において所望の結果を達成するのに十分であった。
別の実施形態では、精製用リーダー配列(例えば、組換えActRIIポリペプチドの所望の部分のN末端に位置するポリ−(His)/エンテロキナーゼ切断部位の配列)をコードする融合遺伝子は、Ni2+金属樹脂を用いる親和性クロマトグラフィーによる、発現された融合タンパク質の精製を可能にし得る。その後、精製用リーダー配列は、引き続いて、エンテロキナーゼでの処理によって除去され、精製ActRIIポリペプチドを提供し得る(例えば、Hochuliら、(1987)J.Chromatography 411:177;およびJanknechtら、PNAS USA 88:8972を参照のこと)。
融合遺伝子を作製するための技術は周知である。本質的には、異なるポリペプチド配列をコードする種々のDNAフラグメントの接合は、ライゲーションのための平滑末端もしくはジグザグの(staggered)末端、適切な末端を提供するための制限酵素消化、必要に応じた粘着末端の充填、所望されない接合を回避するためのアルカリ性ホスファターゼ処理、および酵素によるライゲーション、を用いる従来の技術に従って行われる。別の実施形態では、融合遺伝子は、自動DNA合成装置を含む従来の技術によって合成され得る。あるいは、遺伝子フラグメントのPCR増幅は、2つの連続した遺伝子フラグメント間の相補的なオーバーハングを生じるアンカープライマーを用いて行われ得、これらのフラグメントは、その後、キメラ遺伝子配列を生じるようにアニーリングされ得る(例えば、Current Protocols in Molecular Biology,Ausubelら編、John Wiley & Sons:1992を参照のこと)。
4.代替的なアクチビンおよびActRIIのアンタゴニスト
本明細書中に示されるデータは、アクチビン−ActRIIシグナル伝達のアンタゴニストが、赤血球またはヘモグロビンのレベルを増加させるために使用され得ることを示す。可溶性のActRIIaおよびActIIbポリペプチド、特に、ActRIIa−FcおよびActIIb−Fcが好ましいアンタゴニストであり、そして、このようなアンタゴニストは、アクチビン拮抗以外の機構によって赤血球レベルに影響を及ぼし得る(例えば、アクチビンの阻害は、ある因子があるスペクトルの分子(おそらくは、TGF−βスーパーファミリーの他のメンバーを含む)の活性を阻害する傾向の指標となり得、そして、このような集合的な阻害が造血に対して所望の作用をもたらし得る)が、抗アクチビン(例えば、アクチビンβ、β、βおよびβ)抗体、抗ActRIIa抗体、抗ActRIIb抗体、アンチセンス、RNAiもしくはリボザイム核酸、ならびに、アクチビン、ActRIIbもしくはActRIIaの他のインヒビター(特に、アクチビン−ActRIIaおよび/またはアクチビン−ActRIIb結合を破壊するもの)を含む他のタイプのアクチビン−ActRIIアンタゴニストが有用であることが期待される。
ActRIIポリペプチド(例えば、可溶性のActRIIaもしくはActRIIbポリペプチド)と特異的に反応性であり、そして、ActRIIポリペプチドと、リガンドに対して競合的に結合するか、または、他の方法で、ActRII媒介性のシグナル伝達を阻害するかのいずれかである抗体は、ActRIIポリペプチド活性のアンタゴニストとして使用され得る。同様に、アクチビンβ、β、βまたはβポリペプチドまたはその任意のヘテロ二量体と特異的に反応性であり、そして、ActRIIaおよび/またはActRIIbの結合を破壊する抗体は、アンタゴニストとして使用され得る。
ActRIIaポリペプチドに由来する免疫原を使用することによって、ActRIIbポリペプチドまたはアクチビンポリペプチド、抗タンパク質/抗ペプチドの抗血清またはモノクローナル抗体は、標準的なプロトコルによって作製され得る(例えば、Antibodies:A Laboratory Manual、HarlowおよびLane編(Cold Spring Harbor Press:1988)を参照のこと)。哺乳動物(例えば、マウス、ハムスターまたはウサギ)は、アクチビン、ActRIIaまたはActRIIbポリペプチド、抗体応答を誘発し得る抗原性フラグメント、または融合タンパク質の免疫原性形態を用いて免疫され得る。タンパク質またはペプチドに対して免疫原性を与えるための技術としては、キャリアに対する結合、または、当該分野で周知の他の技術が挙げられる。ActRIIもしくはアクチビンポリペプチドの免疫原性部分は、アジュバントの存在下で投与され得る。免疫の進行は、血漿もしくは血清中の抗体の力価の検出によって監視され得る。免疫原として抗原を用いた標準的なELISAまたは他のイムノアッセイが、抗体のレベルを評価するために使用され得る。
アクチビン、ActRIIaもしくはActRIIbポリペプチドの抗原性調製物を用いた動物の免疫の後、抗血清が得られ得、そして、必要に応じて、血清からポリクローナル抗体が単離され得る。モノクローナル抗体を生成するためには、抗体産生細胞(リンパ球)が免疫された動物から回収され、そして、標準的な体細胞融合手順によって骨髄腫細胞のような不死化細胞と融合されて、ハイブリドーマ細胞を生じ得る。このような技術は当該分野で周知であり、そして、例えば、ハイブリドーマ技術(最初に、KohlerおよびMilsteinによって開発された:KohlerおよびMilstein(1975)Nature,256:495−497)、ヒトB細胞ハイブリドーマ技術(Kozbarら、(1983)Immunology Today,4:72)およびヒトモノクローナル抗体を生成するためのEBV−ハイブリドーマ技術(Coleら、(1985)Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy,Alan R.Liss,Inc.pp.77−96)が挙げられる。ハイブリドーマ細胞は、アクチビン、ActRIIaまたはActRIIbポリペプチドと特異的に反応性の抗体の生成について免疫化学的にスクリーニングされ、そして、このようなハイブリドーマ細胞を含む培養物からモノクローナル抗体が単離され得る。
用語「抗体」は、本明細書中で使用される場合、例えば、任意のアイソタイプ(IgG、IgA、IgM、IgEなど)の抗体全体、および、選択された抗原と反応性の免疫グロブリンのフラグメントもしくはドメインを含むことが意図される。抗体は、従来の技術を用いてフラグメント化され得、そして、フラグメントは、関心のある特定のエピトープとの有用性および/または相互作用についてスクリーニングされ得る。したがって、この用語は、特定のタンパク質と選択的に反応し得る抗体分子の、タンパク質分解により切断されたか、または、組換えにより調製された部分のセグメントを含む。このようなタンパク質分解および/または組換えのフラグメントの非限定的な例としては、Fab、F(ab’)2、Fab’、Fv、ならびにペプチドリンカーによって結合されたV[L]および/またはV[H]ドメインを含む単鎖抗体(scFv)が挙げられる。scFvは、2以上の結合部位を有する抗体を形成するように共有結合もしくは非共有結合により連結され得る。用語抗体はまた、抗体のポリクローナル調製物、モノクローナル調製物、または他の精製された調製物、および組換え抗体を含む。用語「組換え抗体」は、分子生物学の技術を用いて構築された核酸から発現される、抗体、または、免疫グロブリンの抗原結合ドメイン(例えば、単鎖抗体から発生させたヒト化抗体または完全ヒト抗体)を意味する。単一ドメインの抗体および単鎖抗体もまた、用語「組換え抗体」に含まれる。
特定の実施形態では、本発明の抗体は、モノクローナル抗体であり、そして、特定の実施形態では、本発明は、新規抗体を作製するための方法を利用可能にする。例えば、ActRIIaポリペプチド、ActRIIbポリペプチドまたはアクチビンポリペプチドに特異的に結合するモノクローナル抗体を作製するための方法は、検出可能な免疫応答を刺激するのに有効な抗原ポリペプチドを含む免疫原性組成物の量をマウスに投与する工程と、このマウスから抗体産生細胞(例えば、脾臓からの細胞)を得る工程と、この抗体産生細胞を骨髄腫細胞と融合して抗体産生ハイブリドーマを得る工程と、この抗体産生ハイブリドーマを試験して、抗原に対して特異的に結合するモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマを同定する工程と、を包含し得る。一度得られると、ハイブリドーマは、必要に応じて、ハイブリドーマ由来の細胞が、抗原に対して特異的に結合するモノクローナル抗体を産生する培養条件下で、細胞培養において増殖させられ得る。モノクローナル抗体は、細胞培養物から精製され得る。
形容詞「〜と特異的に反応性の」は、抗体に関して使用される場合、当該分野で一般に理解されるように、抗体は、関心のある抗原(例えば、アクチビン、ActRIIaまたはActRIIbポリペプチド)と、関心のものではない他の抗原との間で十分に選択的であり、その抗体が、最小限でも、特定のタイプの生物学的サンプルにおいて関心のある抗原の存在を検出するために有用であることを意味することが意図される。治療用途のような抗体を用いる特定の方法において、より高い低度の結合の特異性が望ましくあり得る。モノクローナル抗体は、一般に、所望される抗原と、交差反応するポリペプチドとの間を効率的に区別する傾向が高い(ポリクローナル抗体と比較して)。抗体:抗原相互作用の特異性に影響する1つの特徴は、抗原に対する抗体の親和性である。所望される特異性はある範囲の多様な親和性で達され得るが、一般に好ましい抗体は、約10−6M、10−7M、10−8M、10−9Mまたはそれ以下の親和性(解離定数)を有する。
さらに、所望の抗体を同定するための抗体のスクリーニングに使用される技術は、得られる抗体の特性に影響し得る。たとえば、抗体が溶液中の抗原を結合するために使用される場合、溶液の結合を試験することが望ましくあり得る。抗体と抗原との間の相互作用を試験して、特定の所望される抗体を同定するためには、種々の多様な技術が利用可能である。このような技術としては、ELISA、表面プラズモン共鳴結合アッセイ(例えば、BiacoreTM結合アッセイ、Biacore AB,Uppsala,Sweden)、サンドイッチアッセイ(例えば、IGEN International,Inc.,Gaithersburg,Marylandの常磁性ビーズシステム)、ウェスタンブロット、免疫沈降アッセイおよび免疫組織化学が挙げられる。
アクチビンまたはActRIIアンタゴニストである核酸化合物のカテゴリーの例としては、アンチセンス核酸、RNAi構築物および触媒性の核酸構築物が挙げられる。核酸化合物は、一本鎖であっても二本鎖であってもよい。二本鎖の化合物はまた、鎖の一方もしくは他方が一本鎖であるオーバーハングまたは非相補的な領域を含み得る。一本鎖の化合物は、自己相補的な領域を含み得、これは、その化合物が二本鎖のらせん構造の領域と共にいわゆる「ヘアピン」または「ステム−ループ」構造を形成することを意味する。核酸化合物は、全長のActRII核酸配列またはアクチビンβ、β、βもしくはβの核酸配列のうち、1000以下、500以下、250以下、100以下、または、50以下、35以下、25以下、22以下、20以下、18以下もしくは15以下のヌクレオチドから構成される領域に対して相補的なヌクレオチド配列を含み得る。相補的な領域は、好ましくは、少なくとも8ヌクレオチドであり、任意に、約18〜35ヌクレオチドである。相補的な領域は、コード配列部分のような標的転写物のイントロン、コード配列または非コード配列内に入り得る。一般に、核酸化合物は、約8〜約500のヌクレオチドまたは塩基対の長さを有し、そして、任意に、その長さは、約14〜約50ヌクレオチドである。核酸は、DNA(特にアンチセンスとしての使用について)、RNA、またはRNA:DNAハイブリッドであり得る。任意の一本鎖は、DNAおよびRNAの混合物、ならびに、DNAもしくはRNAのいずれかとして容易に分類できない修飾された形態を含み得る。同様に、二本鎖の化合物は、DNA:DNA、DNA:RNAまたはRNA:RNAであり得、そして、任意の一本鎖もまた、DNAおよびRNAの混合物、ならびに、DNAもしくはRNAのいずれかとして容易に分類できない修飾された形態を含み得る。核酸化合物は、バックボーン(ヌクレオチド間結合を含む、天然の核酸中の糖−リン酸部分)または塩基部分(天然の核酸のプリンまたはピリミジン部分)に対する1以上の修飾を含む、種々の修飾のいずれかを含み得る。アンチセンス核酸化合物は、好ましくは、約15〜約30ヌクレオチドの長さを有し、そしてしばしば、血清中、細胞中、または、化合物が送達される可能性のある場所(例えば、経口送達される化合物の場合には胃、および吸入される化合物については肺)において、安定性のような特徴を改善するための1以上の修飾を含む。RNAi構築物の場合には、標的転写物に対して相補的な鎖は、一般に、RNAまたはその修飾物である。他方の鎖は、RNAであってもDNAであっても任意の他のバリエーションであってもよい。二本鎖もしくは一本鎖の「ヘアピン」RNAi構築物の二重鎖部分は、一般に、Dicer基質として機能する限りは、長さ18〜40ヌクレオチドの長さを有し、そして、任意に、約21〜23ヌクレオチドの長さを有する。触媒的または酵素的な核酸は、リボザイムまたはDNA酵素であり得、そしてまた、修飾された形態を含み得る。核酸化合物は、生理学的条件下で、かつ、ナンセンスもしくはセンスの制御がほとんどもしくは全く効果がない濃度で細胞と接触されたときに、標的の発現を約50%、75%、90%またはそれ以上阻害し得る。核酸化合物の作用を調べるための好ましい濃度は、1マイクロモル濃度、5マイクロモル濃度および10マイクロモル濃度である。核酸化合物はまた、例えば赤血球レベルに対する作用について試験され得る。
5.スクリーニングアッセイ
特定の局面では、本発明は、アクチビン−ActRIIaおよび/またはアクチビン−ActRIIbシグナル伝達経路のアゴニストまたはアンタゴニストである化合物(因子)を同定するための、ActRIIポリペプチド(例えば、可溶性のActRIIaポリペプチドまたはActRIIbポリペプチド)およびアクチビンポリペプチドの使用に関する。このスクリーニングによって同定された化合物は、インビボまたはインビトロでの、赤血球、ヘモグロビンおよび/または網状赤血球のレベルを調節する能力を評価するために試験され得る。これらの化合物は、例えば、動物モデルにおいて試験され得る。
アクチビンおよびActRIIのシグナル伝達を標的化することによって、赤血球またはヘモグロビンのレベルを増加させるための治療剤についてスクリーニングするための多数のアプローチが存在する。特定の実施形態では、選択された細胞株に対するアクチビンまたはActRII媒介性の作用を摂動する因子を同定するために、化合物のハイスループットスクリーニングが行われ得る。特定の実施形態では、アッセイは、アクチビンに多雨するActRIIaもしくはActRIIbポリペプチドの結合を特異的に阻害もしくは減少させる化合物をスクリーニングおよび同定するために行われる。あるいは、アッセイは、アクチビンに対するActRIIaもしくはActRIIbポリペプチドの結合を増強する化合物を同定するために使用され得る。さらなる実施形態では、化合物は、アクチビン、ActRIIbポリペプチドまたはActRIIaポリペプチドと相互作用する能力によって同定され得る。
種々のアッセイ形式が十分であり、そして、本開示を考慮すれば、本明細書中に明示的に記載されない形式は、本明細書中に記載されていないにもかかわらず、当業者によって理解される。本明細書中に記載されるように、本発明の試験化合物(因子)は、任意のコンビナトリアル化学の方法によって作製され得る。あるいは、本発明の化合物は、インビボまたはインビトロで合成された天然に存在する生体分子であり得る。組織増殖の調節因子として作用する能力について試験される化合物(因子)は、例えば、細菌、酵母、植物または他の生物によって生成されても(例えば、天然の生成物)、化学的に生成されても(例えば、ペプチド模倣物を含む低分子)、組換えにより生成されてもよい。本発明によって企図される試験化合物としては、非ペプチジル有機分子、ペプチド、ポリペプチド、ペプチド模倣物、糖、ホルモンおよび核酸分子が挙げられる。特定の実施形態では、試験因子は、約2000ダルトン未満の分子量を持つ小さな有機分子である。
本発明の試験化合物は、単一の別個の実体として提供され得るか、または、コンビナトリアル化学によって作製されたような、より複雑度の高いライブラリーにおいて提供され得る。これらのライブラリーは、例えば、アルコール、ハロゲン化アルキル、アミン、アミド、エステル、アルデヒド、エーテルおよび有機化合物の他の分類を含み得る。試験システムに対する試験化合物の提示は、特に、最初のスクリーニング段階において、単離された形態または化合物の混合物としてのいずれかであり得る。必要に応じて、化合物は、必要に応じて他の化合物で誘導体化され得、そして、化合物の単離を容易にする誘導体化基を有し得る。誘導体化基の非限定的な例としては、ビオチン、フルオレセイン、ジゴキシゲニン、緑色蛍光タンパク質、同位体、ポリヒスチジン、磁気ビーズ、グルタチオンSトランスフェラーゼ(GST)、光活性化クロスリンカー、またはこれらの任意の組み合わせが挙げられる。
化合物および天然抽出物のライブラリーを試験する多くの薬物スクリーニングプログラムにおいて、所与の期間に調査される化合物の数を最大にするためには、ハイスループットアッセイが望ましい。精製もしくは半精製されたタンパク質で誘導体化され得るような、無細胞のシステムにおいて行われるアッセイは、試験化合物によって媒介される分子標的における変更の迅速な発生と比較的容易な検出とを可能にするように生成され得るという点で、しばしば、「一次」スクリーニングとして好ましい。さらに、試験化合物の細胞障害性またはバイオアベイラビリティの作用は、一般に、インビトロのシステムでは無視され得るが、その代わりに、このアッセイは主として、ActRIIaポリペプチドとアクチビンとの間、および/または、ActRIIbポリペプチドとアクチビンとの間の結合親和性の変更において出現し得るような、分子標的に対する薬物の作用に焦点を当てている。
単なる例示として、本発明の例示的なスクリーニングアッセイでは、関心のある化合物は、通常アクチビンに結合し得る単離および精製されたActRIIaポリペプチドと接触される。その後、化合物とActRIIaポリペプチドとの混合物に、ActRIIaリガンドを含む組成物が加えられる。ActRIIa/アクチビン複合体の検出および定量は、ActRIIaポリペプチドとアクチビンとの間の複合体の形成の阻害(または助長)における化合物の効力を決定するための手段を提供する。化合物の効力は、種々の濃度の試験化合物を用いて得られたデータから用量応答曲線を生成することによって評価され得る。さらに、比較のための基線を提供するためのコントロールアッセイもまた行われ得る。例えば、コントロールアッセイでは、単離および精製されたアクチビンは、ActRIIaポリペプチドを含む組成物に加えられ、そして、ActRIIa/アクチビン複合体の形成は、試験化合物の非存在下で定量される。一般に、反応物が混合され得る順序は変化し得、そして、同時に混合され得ることが理解される。さらに、適切な無細胞アッセイ系を与えるように、精製したタンパク質の代わりに、細胞の抽出物および溶解物が使用され得る。ActRIIbシグナル伝達に影響を及ぼす化合物は、ActRIIbポリペプチドおよびActRIIbリガンドを用いて、同様の様式で同定され得る。
ActRIIポリペプチドとアクチビンとの間の複合体の形成は、種々の技術によって検出され得る。例えば、複合体の形成の調節は、例えば、検出可能に標識されたタンパク質(例えば、放射標識(例えば、32P、35S、14CまたはH)、蛍光標識もの(例えば、FITC)、または、酵素標識されたActRIIaまたはActRIIbポリペプチドまたはアクチビンを用いて、イムノアッセイによって、あるいは、クロマトグラフィーによる検出によって定量され得る。
特定の実施形態では、本発明は、直接的または間接的のいずれかで、ActRIIポリペプチドとその結合タンパク質との間の相互作用の程度を測定する、蛍光偏光アッセイおよび蛍光共鳴エネルギー遷移(FRET)アッセイの使用を企図する。さらに、光導波管(PCT公開WO96/26432および米国特許第5,677,196号)、表面プラズモン共鳴(SPR)、表面電荷センサ、および表面力センサに基づくもののような、他の検出様式が、本発明の多くの実施形態と適合性がある。
さらに、本発明は、ActRIIポリペプチドとその結合タンパク質との間の相互作用を妨害または助長する因子を同定するための、「ツーハイブリッドアッセイ」としても知られる相互作用トラップアッセイの使用を企図する。例えば、米国特許第5,283,317号;Zervosら(1993)Cell 72:223−232;Maduraら(1993)J Biol Chem 268:12046−12054;Bartelら(1993)Biotechniques 14:920−924;およびIwabuchiら(1993)Oncogene 8:1693−1696を参照のこと。特定の実施形態では、本発明は、ActRIIポリペプチドとその結合タンパク質との間の相互作用を解離させる化合物(例えば、低分子またはペプチド)を同定するための、逆ツーハイブリッドシステムの使用を企図する。例えば、VidalおよびLegrain(1999)Nucleic Acids Res 27:919−29;VidalおよびLegrain(1999)Trends Biotechnol 17:374−81;ならびに米国特許第5,525,490号;同第5,955,280号;および同第5,965,368号を参照のこと。
特定の実施形態では、本発明の化合物は、本発明のActRIIまたはアクチビンポリペプチドと相互作用する能力によって同定される。化合物と、ActRIIa、ActRIIbまたはアクチビンポリペプチドとの間の相互作用は、共有結合性であっても非共有結合性であってもよい。例えば、このような相互作用は、光架橋、放射標識リガンド結合、およびアフィニティクロマトグラフィーを含むインビトロの生化学的な方法を用いて、タンパク質レベルで同定され得る(Jakoby WBら、1974,Methods in Enzymology 46:1)。特定の場合には、化合物は、アクチビンまたはActRIIポリペプチドに結合する化合物を検出するためのアッセイのような、機構ベースのアッセイにおいてスクリーニングされ得る。これは、固相もしくは液相の結合事象を含み得る。あるいは、アクチビンまたはActRIIポリペプチドをコードする遺伝子は、レポーターシステム(例えば、β−ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼまたは緑色蛍光タンパク質)と共に細胞中にトランスフェクトされ、そして、必要に応じて、ハイスループットスクリーニングによって、ライブラリーに対して、または、ライブラリーの個々のメンバーを用いてスクリーニングされ得る。他の機構ベースの結合アッセイ(例えば、自由エネルギーの変化を検出する結合アッセイ)が使用され得る。結合アッセイは、ウェル、ビーズもしくはチップに固定されているか、または、固定された抗体によって捕捉されている標的を用いて行われ得るか、あるいは、キャピラリー電気泳動によって分解され得る。結合した化合物は通常、比色または蛍光または表面プラズモン共鳴を用いて検出され得る。
6.例示的な治療的用途
特定の実施形態では、本発明のアクチビン−ActRIIアンタゴニスト(例えば、ActRIIaポリペプチドまたはActRIIbポリペプチド)は、げっ歯類および霊長類、特に、ヒト患者のような哺乳動物における赤血球のレベルを増加させるために使用され得る。特定の実施形態では、本発明は、治療上有効量のアクチビン−ActRIIaアンタゴニスト(例えば、ActRIIaポリペプチド)、または、治療上有効量のアクチビン−ActRIIbアンタゴニスト(例えば、ActRIIbポリペプチド)を個体に投与することによって、処置または予防を必要とする個体における貧血を処置または予防する方法を提供する。特定の実施形態では、本発明は、治療上有効量のアクチビン−ActRIIアンタゴニスト、特に、ActRIIポリペプチドを個体に投与することによって、個体における赤血球の形成を促進する方法を提供する。これらの方法は、哺乳動物、特に、ヒトの治療的および予防的な処置に使用され得る。
本明細書中で使用される場合、障害または状態を「予防する」治療薬は、統計的標本において、未処置の対照標本に対して、処置標本における障害もしくは状態の出現を低下させるか、あるいは、未処置の対照標本に対して、障害もしくは状態の1以上の症状の発症を遅延させるか、または、重篤度を低下させるような化合物を指す。用語「処置する」は、本明細書中で使用される場合、指定された状態の予防、または、一度確立された状態の改善もしくは除去を含む。いずれの場合にも、予防または処置は、医師または他の医療提供者によって提供される診断、および、治療剤の投与の意図される結果において認識され得る。
本明細書中で示されるように、アクチビン−ActRIIaアンタゴニストおよびアクチビン−ActRIIbアンタゴニストは、健康な個体における赤血球、ヘモグロビンまたは網状赤血球のレベルを増加させるために使用され得、そして、このようなアンタゴニストは、選択された患者集団において使用され得る。適切な患者集団の例としては、貧血を有する患者のような望ましくない低い赤血球またはヘモグロビンレベルを有する患者、および、大きな外科手術またはかなりの血液喪失を生じ得る他の処置を受ける予定の患者のような、望ましくない低い赤血球またはヘモグロビンレベルを生じる危険性のある患者、が挙げられる。一実施形態では、適切な赤血球レベルを有する患者は、赤血球レベルを増加させるためにアクチビン−ActRIIaアンタゴニストで処置され、その後、血液が採血され、そして、後に輸血に使用するために保存される。一実施形態では、適切な赤血球レベルを有する患者は、赤血球レベルを増加させるためにアクチビン−ActRIIbアンタゴニストで処置され、その後、血液が採血され、そして、後に輸血に使用するために保存される。
本明細書中に開示されるアクチビン−ActRIIアンタゴニスト、そして特に、ActRIIa−FcおよびActRIIbタンパク質は、貧血を有する患者における赤血球レベルを増加させるために使用され得る。ヒトにおけるヘモグロビンレベルを観察するとき、適切な年齢および性別のカテゴリーにとっての正常値未満のレベルは貧血の指標となり得るが、個体の変動が考慮される。例えば、12g/dlのヘモグロビンレベルは、一般に、一般的な成人集団において正常の下限と考えられる。潜在的な原因としては、血液喪失、栄養不良、薬物療法反応、骨髄および多くの疾患に伴う種々の問題が挙げられる。より具体的には、貧血は、例えば、慢性腎不全、骨髄異形成症候群、慢性関節リウマチ、骨髄移植を含む種々の障害に関連している。貧血はまた、以下の状態とも関連し得る:固形腫瘍(例えば、乳癌、肺癌、結腸癌);リンパ系の腫瘍(例えば、慢性リンパ球性白血病、非ホジキンおよびホジキンリンパ腫);造血系の腫瘍(例えば、白血病、骨髄異形成症候群、多発性骨髄腫);放射線治療;化学療法(例えば、白金を含むレジメン);炎症および自己免疫疾患(慢性関節リウマチ、他の炎症性関節炎、全身性エリテマトーデス(SLE)、急性もしくは慢性の皮膚疾患(例えば、乾癬)、炎症性腸疾患(例えば、クローン病および潰瘍性大腸炎)が挙げられるがこれらに限定されない);急性もしくは慢性の陣疾患または腎不全(特発性もしくは先天性の状態を含む);急性もしくは慢性の肝臓病;急性もしくは慢性の出血;患者の同種もしくは自己抗体および/または宗教上の理由(例えば、いくつかのエホバの証人(Jehovah Witness))に起因する赤血球の輸血が可能ではない状況;感染(例えば、マラリア、骨髄炎);異常ヘモグロビン症(例えば、例えば、鎌状赤血球病、地中海貧血症を含む);薬物の使用または乱用(例えば、アルコールの誤用);輸血を回避するためのあらゆる要因から貧血を有する小児患者;ならびに、循環過負荷に関する問題に起因して輸血を受けることができない、老齢の患者または貧血と共に根底にある心肺疾患を有する患者。
患者は、患者を標的とするヘモグロビンレベル(通常は、約10g/dlと約12.5g/dlの間、代表的には約11.0g/dl(Jacobsら(2000)Nephrol Dial Transplant 15,15−19もまた参照のこと))まで回復させることを意図した投薬レジメンで処置され得るが、より低い標的レベルでは、より少ない心臓血管系の副作用が引き起こされ得る。あるいは、ヘマトクリットレベル(細胞によって占有される血液サンプルの容積の割合)が、赤血球の状態の指標として使用され得る。健康な個体についてのヘマトクリットレベルは、成人男性について41〜51%、そして、成人女性について35〜45%の範囲である。標的ヘマトクリットレベルは、通常、約30〜33%である。さらに、ヘモグロビン/ヘマトクリットレベルは、個々人で変動する。したがって、最適には、標的ヘモグロビン/ヘマトクリットレベルは、患者ごとに個別化され得る。
本明細書中に開示されるアクチビン−ActRIIaアンタゴニストの赤血球レベルに対する迅速な作用は、これらの因子がEpoとは異なる機構によって作用していることを示す。したがって、これらのアンタゴニストは、Apoに対して上手く応答しない患者において赤血球およびヘモグロビンレベルを増加させるために有用であり得る。例えば、アクチビン−ActRIIaアンタゴニストは、通常〜増量した(>300IU/kg/週)用量のEpoの投与が標的レベルまでのヘモグロビンレベルの増加をもたらさない患者に有益であり得る。不適切なEpo応答を有する患者は、全てのタイプの貧血について見られるが、より多い数の不応者が、癌を有する患者および末期の腎疾患を有する患者において特に頻繁に観察されている。Epoに対する不適切な応答は、構成的(すなわち、Epoでの最初の処置の際に観察される)、または後天的(例えば、Epoでの反復処置の際に観察される)のいずれかであり得る。
アクチビン−ActRIIアンタゴニストはまた、Epoの有害な作用に対して感受性である患者を処置するために使用され得る。Epoの主たる有害な作用は、ヘマトクリットまたはヘモグロビンレベルの過剰な増加と、赤血球増加症である。ヘマトクリットレベルの上昇は、高血圧(より具体的には、高血圧の深刻化)および脈管の血栓症につながり得る。報告されているEpoの他の有害な作用(このうちいくつかは、高血圧に関するものである)は、頭痛、インフルエンザ様症候群、バイパスの閉塞、血栓症に起因する心筋梗塞および大脳痙攣、高血圧性脳障害、ならびに赤血球血球無形成(red cell blood cell applasia)である(Singibarti,(1994)J.Clin Investig 72(補遺6),S36−S43;Horlら(2000)Nephrol Dial Transplant 15(補遺4),51−56;Delantyら(1997)Neurology 49,686−689;Bunn(2002)N Engl J Med 346(7),522−523)。
7.薬学的組成物
特定の実施形態では、本発明のアクチビン−ActRIIアンタゴニスト(例えば、ActRIIaおよびActRIlbポリペプチド)は、薬学的に受容可能なキャリアと共に処方される。例えば、ActRIIポリペプチドは、単独で、または、薬学的処方物(治療用組成物)の成分として投与され得る。本発明の化合物は、ヒトまたは獣医学における医薬での使用のために任意の簡便な方法で投与するために処方され得る。
特定の実施形態では、本発明の治療方法は、全身に、または、移植物もしくはデバイスとして局所的に組成物を投与する工程を包含する。投与される場合、本発明において使用するための治療用組成物は、当然のことながら、発熱物質を含まない生理学的に容認可能な形態である。また上記の組成物中に必要に応じて含められ得るアクチビン−ActRIIアンタゴニスト以外の治療上有用な因子は、本発明の方法において、本発明の化合物(例えば、ActRIIaおよびActRIIbポリペプチド)と同時に、または連続して投与され得る。
代表的に、アクチビン−ActRIIアンタゴニストは、非経口投与される。非経口投与に適した薬学的組成物は、1以上のActRIIポリペプチドを、1以上の薬学的に受容可能な無菌かつ等張の水性もしくは非水性の溶液、分散液、懸濁液もしくはエマルジョン、または、使用直前に無菌の注射可能な溶液もしくは分散液へと再構成され得る無菌粉末と組み合わせて含み得、この組成物は、抗酸化物質、緩衝液、静菌剤、処方物を意図されるレシピエントの血液と等張にする溶質、または、懸濁剤もしくは増粘剤を含み得る。本発明の薬学的組成物中で採用され得る適切な水性および非水性のキャリアの例としては、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコールなど)およびこれらの適切な混合物、植物油(例えば、オリーブ油)、ならびに、注射可能な有機エステル(例えば、オレイン酸エチル)が挙げられる。適切な流動性は、例えば、コーティング材料(例えば、レシチン)の使用によって、分散剤の場合には必要とされる粒子径の維持によって、そして、界面活性剤の使用によって維持され得る。
さらに、組成物は、カプセル化され得るか、または、標的組織部位(例えば、骨髄)へと送達するための形態で注射され得る。特定の実施形態では、本発明の組成物は、標的組織部位(例えば、骨髄)に1以上の治療用化合物(例えば、ActRIIaポリペプチドまたはActRIIbポリペプチド)を送達し、発生中の組織(developing tissue)のための構造を提供し得、そして、最適には身体内へと吸収され得るマトリクスを含み得る。例えば、マトリクスは、ActRIIポリペプチドの遅速放出を提供し得る。このようなマトリクスは、他の移植される医療用途に現在使用される材料から形成され得る。
マトリクス材料の選択は、生体適合性、生分解性、機械的特性、美容上の外観および界面の特性に基づく。本発明の組成物の特定の用途が、適切な処方物を画定する。組成物のための可能性のあるマトリクスは、生分解性でかつ化学的に画定された硫酸カルシウム、リン酸三カルシウム、ヒドロキシアパタイト、ポリ乳酸およびポリ無水物であり得る。他の可能性の有る材料は、生分解性でかつ生物学的に十分に画定されたもの(例えば、骨または皮膚のコラーゲンである。さらなるマトリクスは、純粋なタンパク質または細胞外マトリクスの成分から構成される。他の可能性のあるマトリクスは、非生分解性でかつ化学的に画定されたもの(例えば、焼結ヒドロキシアパタイト、バイオグラス、ミョウバン(aluminate)、または他のセラミクス)である。マトリクスは、上述のタイプの材料のいずれかの組み合わせ(例えば、ポリ乳酸およびヒドロキシアパタイト、または、コラーゲンおよびリン酸三カルシウム)から構成され得る。生体機能性セラミクスは、組成物中(例えば、カルシウム−ミョウバン−ホスフェート中)で変化され、孔径、粒子径、粒子の形状および生分解性を変更するように加工され得る。
特定の実施形態では、本発明の方法は、例えば、カプセル、カシェ、丸剤、錠剤、ロゼンジ(矯味矯臭薬を含む基材、通常はスクロースおよびアカシアまたはトラガントを用いて)、散剤、顆粒剤、または、水性もしくは非水性液体中の溶液もしくは懸濁液として、または、水中油もしくは油中水の液体エマルジョンとして、または、エリキシルもしくはシロップとして、または、香錠(ゼラチンおよびグリセリン、または、スクロースおよびアカシアのような不活性基材を用いて)および/またはマウスウォッシュなどの形態(この各々が、活性成分として所定量の因子を含む)で、経口投与され得る。因子はまた、ボーラス、舐剤またはペーストとしても投与され得る。
経口投与のための固体投薬形態(カプセル、錠剤、丸剤、糖衣錠、散剤、顆粒剤など)において、本発明の1以上の治療用化合物は、1以上の薬学的に受容可能なキャリア(例えば、クエン酸ナトリウムまたはリン酸二カルシウム)および/または、以下のうちのいずれかと共に混合され得る:(1)充填剤または増量剤(例えば、デンプン、ラクトース、スクロース、グルコース、マンニトールおよび/またはケイ酸);(2)結合剤(例えば、カルボキシメチルセルロース、アルギン酸、ゼラチン、ポリビニルピロリドン、スクロースおよび/またはアカシア);(3)湿潤剤(humectant)(例えば、グリセロール);(4)崩壊剤(例えば、アガー−アガー、炭酸カルシウム、ジャガイモもしくはタピオカデンプン、アルギン酸、特定のケイ酸塩、および炭酸ナトリウム);(5)溶液減速因子(solution retarding agent)(例えば、パラフィン);(6)吸収加速剤(例えば、四級アンモニウム化合物);(7)湿潤剤(wetting agent)(例えば、セチルアルコールおよびモノステアリン酸グリセロール);(8)吸着剤(例えば、カオリンおよびベントナイトクレイ);(9)滑沢剤(例えば、滑石、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、固体ポリエチレングリコール、ラウリル硫酸ナトリウムおよびこれらの混合物);および(10)着色剤。カプセル、錠剤および丸剤の場合には、薬学的組成物はまた、緩衝剤を含み得る。同様のタイプの固形組成物もまた、ラクトースすなわち乳糖ならびに高分子量ポリエチレングリコールなどのような賦形剤を用いて、軟充填ゼラチンカプセルおよび硬充填ゼラチンカプセル中の充填物(filler)として用いられ得る。
経口投与のための液体投薬形態としては、薬学的に受容可能なエマルジョン、マイクロエマルジョン、溶液、懸濁液、シロップおよびエリキシルが挙げられる。活性成分に加え、液体投薬形態は、当該分野で一般に用いられる不活性希釈剤(例えば、水または他の溶媒)、可溶化剤および乳化剤(例えば、エチルアルコール、イソプロピルアルコール、炭酸エチル、酢酸エチル、ベンジルアルコール、安息香酸ベンジル、プロピレングリコール、1,3−ブチレングリコール、油(特に、綿実油、ピーナッツ油、トウモロコシ油、胚芽油、オリーブ油、ヒマシ油およびゴマ油)、グリセロール、テトラヒドロフリルアルコール、ポリエチレングリコールおよびソルビタンの脂肪酸エステル、ならびにこれらの混合物)を含み得る。不活性な希釈剤に加え、経口用組成物はまた、湿潤剤、乳化剤および懸濁剤、甘味剤、矯味矯臭剤、着色剤、芳香剤および保存剤のようなアジュバントを含み得る。
懸濁液は、活性な化合物に加えて、エトキシル化イソステアリルアルコール、ポリオキシエチレンソルビトールおよびソルビタンエステル、微結晶性セルロース、アルミニウムメタヒドロキシド、ベントナイト、アガー−アガーおよびトラガント、ならびにこれらの混合物のような懸濁剤を含み得る。
本発明の組成物はまた、保存剤、湿潤剤、乳化剤および分散剤のようなアジュバントを含み得る。微生物の作用の阻止は、種々の抗細菌剤および抗真菌剤(例えば、パラベン、クロロブタノール、ソルビン酸フェノールなど)を含めることによって保証され得る。糖、塩化ナトリウムなどのような等張化剤を組成物中に含めることも望ましくあり得る。さらに、注射可能な薬学的形態の吸収の延長は、モノステアリン酸アルミニウムおよびゼラチンのような吸収を遅らせる因子を含めることによってもたらされ得る。
投薬レジメンは、本発明の化合物(例えば、ActRIIaおよびActRIIbポリペプチド)の作用を変える種々の要因を考慮して主治医によって決定されることが理解される。種々の要因としては、患者の赤血球数、ヘモグロビンレベルまたは他の診断指標、所望の標的赤血球数、患者の年齢、性別および食事、赤血球レベルの低下に寄与し得るあらゆる疾患の重篤度、投与時間、ならびに他の臨床的要因が挙げられるがこれらに限定されない。最終組成物への他の既知の増殖因子の添加もまた、投薬量に影響を及ぼし得る。進行は、赤血球およびヘモグロビンのレベルの周期的な評価、ならびに、網状赤血球レベルおよび造血プロセスの他の指標の評価によって監視され得る。
霊長類およびヒトを用いた実験は、化合物が、少なくとも約20〜30日の期間にわたって、約100ng/ml以上の血清濃度を達成するために十分な間隔および量で投薬された場合に、赤血球レベルに対するActRIIa−Fcの作用が検出可能であることを実証している。少なくとも20〜30日間の機関にわたって、200ng/ml、500ng/ml、1000ng/mlまたはそれ以上の血清レベルを得る投薬もまた使用され得る。骨への作用は、少なくとも約20〜30日の期間にわたって、約200ng/mlの血清レベルで観察され得、そして、実質的な作用は、約1000ng/ml以上で始まる。したがって、骨に対してほとんど作用を有さない一方で、赤血球に対する作用を達成することが望ましくあり得る場合、投薬スキームは、約20〜30日の期間にわたって、約100ng/mlと約1000ng/mlとの間の血清濃度を送達するように設計され得る。ヒトでは、200ng/mlの血清レベルは、0.1mg/kg以上の単回投薬で達成され得、そして、1000ng/mlの血清レベルは、0.3mg/kg以上の単回投薬で達成され得る。分子の実測血清半減期は、約20日と30日との間であって、実質的に多くのFc融合タンパク質よりも長く、したがって、例えば、毎週もしくは隔週ベースで約0.05〜0.5mg/kgの投薬によって持続的な有効血清レベルが達成され得るか、または、より長い投薬間隔でより高い用量が使用され得る。例えば、0.1〜1mg/kgの用量は、毎月または隔月ベースで使用され得る。
特定の実施形態では、本発明はまた、ActRIIポリペプチドのインビボ産生のための遺伝子治療を提供する。このような治療は、上に列挙したような障害を有する細胞または組織中にActRIIaもしくはActRIIbポリヌクレオチド配列を導入することによってその治療作用を達成する。ActRIIポリヌクレオチド配列の送達は、キメラウイルスのような組換え発現ベクターまたはコロイド分散系を用いて達成され得る。ActRIIポリヌクレオチド配列の治療的送達には、標的化されたリポソームの使用が好ましい。
本明細書中で教示されるような遺伝子治療に利用され得る種々のウイルスベクターとしては、アデノウイルス、ヘルペスウイルス、ワクシニア、または、レトロウイルスのようなRNAウイルスが挙げられる。レトロウイルスベクターは、マウスもしくはトリのレトロウイルスの誘導体であり得る。単一の外来遺伝子が挿入され得るレトロウイルスベクターの例としては、以下が挙げられるがこれらに限定されない:モロニーマウス白血病ウイルス(MoMuLV)、ハーベーマウス肉腫ウイルス(HaMuSV)、マウス乳癌ウイルス(MuMTV)およびラウス肉腫ウイルス(RSV)。多数のさらなるレトロウイルスベクターが多数の遺伝子を組み込み得る。これらのベクターは全て、形質導入された細胞が同定および生成され得るように、選択マーカーについての遺伝子を移送または組み込みし得る。レトロウイルスベクターは、例えば、糖、糖脂質またはタンパク質を付着させることによって、標的特異的とされ得る。好ましい標的化は、抗体を用いて達成される。当業者は、ActRIIポリヌクレオチドを含むレトロウイルスベクターの標的特異的な送達を可能にするために、特定のポリヌクレオチド配列がレトロウイルスゲノム中に挿入され得るか、または、ウイルスエンベロープに付着され得ることを認識する。
あるいは、組織培養細胞は、簡便なリン酸カルシウムトランスフェクション法によって、レトロウイルスの構造遺伝子gag、polおよびenvをコードするプラスミドを用いて直接トランスフェクトされ得る。これらの細胞は、次いで、関心のある遺伝子を含むベクタープラスミドでトランスフェクトされる。得られた細胞は、培養培地中にレトロウイルスベクターを放出する。
ActRIIポリヌクレオチドのための別の標的化送達システムは、コロイド分散系である。コロイド分散系としては、高分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフェア、ビーズおよび脂質ベースの系(水中油エマルジョン、ミセル、混合型ミセルおよびリポソームを含む)が挙げられる。本発明の好ましいコロイド系は、リポソームである。リポソームは、インビトロおよびインビボで送達ビヒクルとして有用な人工の膜ビヒクルである。RNA、DNAおよびインタクトなビリオンが、水性の内部に被包され得、そして、生物学的に活性な形態で細胞へと送達され得る(例えば、Fraleyら、Trends Biochem. Sci.,6:77,1981を参照のこと)。リポソームビヒクルを用いた効率的な遺伝子移入のための方法は当該分野で公知であり、例えば、Manninoら、Biotechniques,6:682,1988を参照のこと。リポソームの組成は、通常ステロイド(特に、コレステロール)との組み合わせでの、リン脂質の組み合わせである。他のリン脂質または他の脂質もまた使用され得る。リポソームの物理的特性は、pH、イオン強度および二価のカチオンの存在に依存する。
リポソームの生成において有用な脂質の例としては、ホスファチジル化合物(例えば、ホスファチジルグリセロール、ホスファチジルコリン、ホスファチジルセリン、ホスファチジルエタノールアミン、スフィンゴ脂質、セレブロシドおよびガングリオシド)が挙げられる。例示的なリン脂質としては、卵ホスファチジルコリン、ジパルミトイルホスファチジルコリンおよびジステアロイルホスファチジルコリンが挙げられる。例えば、臓器特異性、細胞特異性および細胞小器官特性に基づいたリポソームの標的化もまた可能であり、当該分野で公知である。
本発明は、ここで、一般的に記載されてきたが、単に特定の実施形態および本発明の実施形態を例示する目的のために含められ、本発明を限定することは意図されない以下の実施例を参照するとより容易に理解される。
実施例1:ActRIIa−Fc融合タンパク質
出願人は、間に最小限のリンカーを伴ってヒトもしくはマウスのFcドメインに融合させたヒトActRIIaの細胞外ドメインを有する可溶性ActRIIa融合タンパク質を構築した。この構築物は、それぞれ、ActRIIa−hFcおよびActRIIa−mFcと呼ばれる。
ActRIIa−hFcは、CHO細胞株から精製されたものとして以下に示される(配列番号7):
Figure 2017075187
ActRIIa−hFcおよびActRIIa−mFcのタンパク質を、CHO細胞株中で発現させた。3つの異なるリーダー配列を検討した:
(i)ミツバチメリチン(HBML):MKFLVNVALVFMVVYISYIYA(配列番号8)
(ii)組織プラスミノーゲンアクチベーター(TPA):MDAMKRGLCCVLLLCGAVFVSP(配列番号9)
(iii)ネイティブ:MHLLLFQLLVLLPLGKT(配列番号10)。
選択された形態では、TPAリーダーを採用し、そして、以下のプロセシングを受けていないアミノ酸配列を有する。
Figure 2017075187
このポリペプチドは、以下の核酸配列によってコードされる:
Figure 2017075187
ActRIIa−hFcおよびActRIIa−mFcは共に、組換え発現にとって際立って扱いやすかった。図1に示されるように、タンパク質は、単一の十分に画定されたタンパク質のピークとして精製された。N末端の配列決定は、−ILGRSTQE(配列番号11)の単一の配列を明らかにした。精製は、例えば、以下のうちの3またはそれ以上を任意の順序で含む一連のカラムクロマトグラフィー工程によって達成され得る:プロテインAクロマトグラフィー、Qセファロースクロマトグラフィー、フェニルセファロースクロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィーおよびカチオン交換クロマトグラフィー。精製は、ウイルス濾過およびバッファの交換により完了され得る。ActRIIa−hFcタンパク質は、サイズ排除クロマトグラフィーによって決定すると、98%を超える純度、そして、SDS PAGEによって決定すると、95%を超える純度まで精製された。
ActRIIa−hFcおよびActRIIa−mFcは、リガンド(特に、アクチビンA)に対する高い親和性を示した。標準的なアミンカップリングの手順を用いて、GDF−11またはアクチビンA(「ActA」)をBiacore CM5チップ上に固定した。ActRIIa−hFcおよびActRIIa−mFcのタンパク質を、このシステム上にローディングし、そして、結合を測定した。ActRIIa−hFcは、5×1012の解離定数(K)でアクチビンに結合し、そして、タンパク質は、9.96×10−9のKでGDF11に結合した。図2を参照のこと。ActRIIa−mFcも同様に挙動した。
ActRIIa−hFcは、薬物動態研究において非常に安定していた。ラットに、1mg/kg、3mg/kgまたは10mg/kgのActRIIa−hFcタンパク質を投薬し、そして、24時間、48時間、72時間、144時間および168時間に、タンパク質の血漿レベルを測定した。別の研究では、ラットに、1mg/kg、10mg/kgまたは30mg/kgを投薬した。ラットでは、ActRIIa−hFcは、11〜14日の血清半減期を有し、そして、薬物の循環レベルは、2週間後に極めて高かった(1mg/kg、10mg/kgまたは30mg/kgの初回投与について、それぞれ、11μg/ml、110μg/mlまたは304μg/ml)。カニクイザルでは、血漿半減期は14日よりもかなり長く、そして、薬物の循環レベルは、1mg/kg、10mg/kgまたは30mg/kgの初回投与について、それぞれ、25μg/ml、304μg/ml、または1440μg/mlであった。
実施例2:ActRHa−hFcは、非ヒト霊長類における赤血球レベルを増加させる
この研究では、各群雄性5匹および雌性5匹のカニクイザルの4つの群を用い、各群の各性別につき3匹は29日目に終結するように計画し、そして、各群の各性別につき2匹は57日目に終結するように計画した。各動物に、ビヒクル(第1群)または1mg/kg、10mg/kgもしくは30mg/kgのActRIIa−Fc(それぞれ、第2群、第3群および第4群)を、1日目、8日目、15日目および22日目に静脈内(IV)注射により投与した。投薬容量は、3mL/kgに維持した。最初の投与の2日前、ならびに、最初の投与の後に、15日目、29日目、および57日目(残存する2匹の動物について)に、赤血球レベルの種々の指標を評価した。
ActRIIa−hFcは、全ての用量レベルおよび研究全体にわたる時点で、雄性および雌性について、平均の赤血球パラメータ(赤血球数[RBC]、ヘモグロビン[HGB]およびヘマトクリット[HCT])における統計的に有意な増加を引き起こし、絶対的および相対的な網状赤血球数における上昇を伴った。図3〜6を参照のこと。
統計的有意差は、基線における処置群についての平均に対して、各処置群について計算した。
注目すべきことに、赤血球数およびヘモグロビンレベルの増加は、その強度がエリスロポエチンで報告されている作用とほぼ等しい。これらの作用の開始は、エリスロポエチンよりも、ActRIIa−Fcの方がより迅速である。
同様の結果がラットおよびマウスで観察された。
実施例3:ActRIIa−hFcはヒト患者における赤血球レベルを増加させる
主として健康な閉経後の女性におけるタンパク質の安定性を評価するために行われた、無作為化された二重盲検のプラセボ対照を含む研究において、実施例1に記載されるActRIIa−hFc融合タンパク質を、ヒト患者に投与した。48人の被験体を、6つのコホートに無作為化し、ActRIIa−hFcまたはプラセボ(5 有効(active):1 プラセボ)のいずれかの単回用量を与えた。用量レベルは、0.01〜3.0mg/kg静脈内(IV)および0.03〜0.1mg/kg皮下(SC)の範囲であった。全ての被験体を、120日間追跡した。薬物動態(PK)解析に加え、骨の形成および再吸収の生化学的マーカーおよびFSHレベルの測定によって、ActRIIa−hFcの生物学的活性もまた評価した。
潜在的な変化を調べるため、研究の経過にわたり、全被験体についてヘモグロビンおよびRBC数を詳しく検討し、基線レベルと比較した。対照と同じ時間にわたって、血小板数を比較した。血小板数については、経時的に、基線値からの臨床上有意な変化は存在しなかった。
ActRIIa−hFcのPK解析は、用量と共に線形のプロフィールと、約25〜32日の平均半減期を示した。ActRIIa−hFcの曲線下面積(AUC)は、用量に対して線形的に関連しており、そして、SC投薬後の吸収は、本質的に完全であった(図7および8を参照のこと)。これらのデータは、SCがIV投薬の最初の数日に伴う薬物の血清濃度におけるスパイクを回避しつつ、薬物についての等価なバイオアベイラビリティおよび血清半減期を提供するので、SCが望ましい投薬アプローチであることを示している(図8を参照のこと)。ActRIIa−hFcは、同化作用性の骨成長のマーカーである骨特異的アルカリ性ホスファターゼ(BAP)の血清レベルの、迅速かつ持続的な用量依存性の増加と、骨再吸収のマーカーであるC末端1型コラーゲンテロペプチド(telopeptide)および酒石酸抵抗性酸性ホスファターゼ5bレベルの用量依存性の減少とをもたらした。PINPのような他のマーカーは、決定的でない結果を示した。BAPレベルは、薬物の最高投薬量において飽和に近い作用を示し、この同化作用性の骨バイオマーカーに対する最大の半分の作用が、0.3mg/kgの投薬量において達成され得、その増加は3mg/kgまでの範囲であることを示している。薬物についてのAUCに対する薬力学的作用の関係性として計算すると、EC50は、51,465(日ng/ml)である。図9を参照のこと。これらの骨バイオマーカーの変化は、試験した最高用量レベルにおいて約120日間持続された。また、アクチビンの阻害と一致して、結成FSHレベルにおける用量依存性の減少もまた存在した。
全体として、IVまたはSCのいずれで与えたとしても、おそらく0.01mg/kgの群と0.03mg/kgの群における瀉血を研究するために関連付けられた研究の第1週にわたって、ヘモグロビンにおける非常に小さな薬物に関連しない減少が存在した。0.1mg/kgのSCおよびIVのヘモグロビンの結果は安定しており、8〜15日目までにあまり大きくない増加を示した。0.3mg/kgのIV用量レベルでは、早くも2日目に見られ、そして、しばしば15〜29日目にピークを迎えるHGBレベルのはっきりとした増加が存在した(これは、プラセボ被験体では見られなかった)。この研究のこの時点では、この変化は統計的有意差には到達していなかった。
全体として、ActRIIa−hFcは、赤血球数および網状赤血球数に対して用量依存性の作用を示した。血液学的変化のまとめについては、図10〜13を参照のこと。
実施例4:代替的なActRIIa−Fcタンパク質
本明細書中に記載される方法にしたがって使用され得る種々のActRIIa改変体は、WO2006/012627として公開される国際特許出願(pp.55〜58を参照のこと;その全体が本明細書中に参考として援用される)に記載されている。代替的な構築物は、C末端テイル(ActRIIaの細胞外ドメインの最後から15アミノ酸)の欠失を有し得る。このような構築物の配列は以下に示される(Fc部分に下線を付す)(配列番号12):
Figure 2017075187
実施例5:ActRIIb−Fc融合タンパク質
出願人は、ヒトFcドメインに融合させたヒトActRIIbの細胞外ドメインを有する可溶性ActRIIb融合タンパク質を構築した。アクチビンと細胞外ActRIIbとの共結晶構造は、リガンド結合における細胞外ドメインの最後(C末端)の15アミノ酸(本明細書において「テイル」と呼ばれる)に、何らかの役割を示さなかった。この配列は、結晶構造上で分解できず、これらの残基が、結晶中で均一にパッケージングされなかった可撓性ループ中に存在していることが示唆された。ThompsonらEMBO J.2003 Apr 1;22(7):1555−66。この配列はまた、ActRIIbとActRIIaとの間で、不完全に保存されている。したがって、これらの残基は、基本的、または、バックグラウンドのActRIIb−Fc融合構築物においては省略した。さらに、バックグラウンド融合物における64位は、アラニンによって占有されており、一般に「野生型」形態と考えられているが、A64R対立遺伝子が天然に生じる。したがって、バックグラウンドActRIIb−Fc融合物は、以下の配列を有する(Fc部分に下線を付す)(配列番号20):
Figure 2017075187
驚くべきことに、C末端テイルは、アクチビンおよびGDF−11の結合を増強することが見出され、したがって、ActRIIb−Fcの好ましいバージョンは、以下の配列を有する(Fc部分に下線を付す)(配列番号21):
Figure 2017075187
本明細書中に記載される方法にしたがって使用され得る種々のActRIIb改変体は、WO2006/012627として公開される国際特許出願(例えば、pp.59〜60を参照のこと;その全体が本明細書中に参考として援用される)に記載されている。
実施例6:ActRIIb−hFcは、非ヒト霊長類における赤血球生成を刺激する
雄性および雌性のカニクイザルに、ActRIIb−hFc(IgGl)を、1ヶ月間、週一回、皮下注射により投与した。48匹のカニクイザル(24匹/性別)を、4つの処置群(6匹の動物/性別/群)のうちの1つに割り当て、そして、4週間にわたり、週一回(合計5用量)、3mg/kg、10mg/kgまたh30mg/kgの、ビヒクルまたはActRIIb−hFcのいずれかの皮下注射を施した。評価したパラメータには、一般的な臨床病理学(血液学、臨床化学、凝固および尿検査)を含めた。ActRIIb−hFcは、処置した動物において、15日までに、平均の絶対的網状赤血球値の統計的に有意な上昇を引き起こした。36日までに、ActRIIb−hFcは、平均絶対的網状赤血球および赤血球分泌幅の値の上昇、ならびに、平均血球ヘモグロビン濃度の低下を含む、いくつかの血液学的変化を引き起こした。全ての処置群および両方の性別が影響を受けた。これらの作用は、骨髄からの未成熟な網状赤血球の放出に対するActRIIb−hFcの正の作用と一致している。この作用は、処置した動物から薬物を洗い出した後に逆転した(研究の56日目までに)。したがって、本発明者らは、ActRIIb−hFcが赤血球生成を刺激すると結論付ける。
(参考としての援用)
本明細書中で言及される全ての刊行物および特許は、各個々の刊行物または特許が、具体的かつ個別に参考として援用されると示されるかのように、その全体が本明細書により参考として援用される。
主題の特定の実施形態が考察されてきたが、上記明細書は、例示的であり、限定的なものではない。本明細書および以下の特許請求の範囲を精査すれば、多くのバリエーションが当業者に明らかとなる。本発明の完全な範囲は、その等価な範囲と共に特許請求の範囲を、そして、このようなバリエーションと共に明細書を参照することによって決定されるべきである。
アクチビン結合ActRIIポリペプチドは、1つのドメインとして、ActRIIポリペプチド(例えば、ActRIIaまたはActRIIbのリガンド結合部分)と、所望の特性(例えば、改善された薬物動態,より容易な精製,特定の組織への標的化など)を提供する1以上のさらなるドメインとを有する融合タンパク質であり得る。例えば、融合タンパク質のドメインは、インビボ安定性、インビボ半減期、取り込み/投与、組織局在化もしくは分布、タンパク質複合体の形成および/または精製のうちの1以上を増強し得る。アクチビン結合ActRII融合タンパク質は、免疫グロブリンFcドメイン(野生型または変異型)、または血清アルブミン、または所望の特性(例えば、改善された薬物動態、改善された溶解性または改善された安定性)を提供する他のポリペプチド部分を含み得る。好ましい実施形態では、ActRII−Fc融合物は、Fcドメインと細胞外ActRIIドメインとの間に位置する比較的構造の定まらない(unstructured)リンカーを含む。この構造の定まらないリンカーは、ActRIIの細胞外ドメインのC末端におよそ15アミノ酸の構造の定まらない領域(「テイル」)に対応し得るか、または、1、2、3、4もしくは5アミノ酸、または、比較的二次構造が自由な、5〜15、20、30、50もしくはそれ以上の長さのアミノ酸の人工配列であり得るか、あるいはこの両方の混合物であり得る。リンカーは、グリシン残基およびプロリン残基が豊富であり得、そして例えば、スレオニン/セリンおよびグリシンの単一の配列、または、スレオニン/セリンおよびグリシンの繰り返し配列(例えば、TG (配列番号22)もしくはSG (配列番号23)の単一体もしくは繰り返し)を含み得る。融合タンパク質は、エピトープタグ、FLAGタグ、ポリヒスチジン配列、または、GST融合物のような精製配列を含み得る。必要に応じて、可溶性のActRIIポリペプチドは、グリコシル化アミノ酸、PEG化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸、脂質部分に結合されたアミノ酸または有機誘導体化因子(organic derivatizing agent)に結合されたアミノ酸から選択される1以上の修飾されたアミノ酸残基を含む。薬学的調製物はまた、骨障害を処置するために使用される化合物のような1以上のさらなる化合物を含み得る。好ましくは、薬学的調製物は、発熱物質を実質的に含まない。一般に、ActRIIタンパク質は、患者における望ましくない免疫応答の可能性を無くすために、ActRIIタンパク質の天然のグリコシル化を適切に媒介する哺乳動物細胞株において発現されることが好ましい。ヒトおよびCHOの細胞株は、首尾よく使用されており、そして、他の一般的な哺乳動物発現系が有用であることが予想される。


Figure 2017075187
ActRIIa−hFcおよびActRIIa−mFcは共に、組換え発現にとって際立って扱いやすかった。図1に示されるように、タンパク質は、単一の十分に画定されたタンパク質のピークとして精製された。N末端の配列決定は、−ILGRSTQE(配列番号11)の単一の配列を明らかにした。精製は、例えば、以下のうちの3またはそれ以上を任意の順序で含む一連のカラムクロマトグラフィー工程によって達成され得る:プロテインAクロマトグラフィー、Qセファロースクロマトグラフィー、フェニルセファロースクロマトグラフィー、サイズ排除クロマトグラフィーおよびカチオン交換クロマトグラフィー。精製は、ウイルス濾過およびバッファの交換により完了され得る。ActRIIa−hFcタンパク質は、サイズ排除クロマトグラフィーによって決定すると、98%を超える純度、そして、SDS PAGEによって決定すると、95%を超える純度まで精製された。

Claims (46)

  1. 骨髄異形成症候群の処置を必要とする患者において骨髄異形成症候群を処置するための組成物であって、該組成物は、
    a)配列番号3に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    b)配列番号2に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    c)配列番号7に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    d)配列番号12に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    e)配列番号16に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    f)配列番号17に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    g)配列番号20に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;および
    h)配列番号21に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド
    からなる群から選択されるポリペプチドを含む、組成物。
  2. 異常ヘモグロビン症の処置を必要とする患者において異常ヘモグロビン症を処置するための組成物であって、該組成物は、
    a)配列番号3に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    b)配列番号2に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    c)配列番号7に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    d)配列番号12に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    e)配列番号16に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    f)配列番号17に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    g)配列番号20に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;および
    h)配列番号21に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド
    からなる群から選択されるポリペプチドを含む、組成物。
  3. 地中海貧血症の処置を必要とする患者において地中海貧血症を処置するための組成物であって、該組成物は、
    a)配列番号3に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    b)配列番号2に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    c)配列番号7に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    d)配列番号12に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    e)配列番号16に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    f)配列番号17に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    g)配列番号20に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;および
    h)配列番号21に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド
    からなる群から選択されるポリペプチドを含む、組成物。
  4. 鎌状赤血球病の処置を必要とする患者において鎌状赤血球病を処置するための組成物であって、該組成物は、
    a)配列番号3に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    b)配列番号2に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    c)配列番号7に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    d)配列番号12に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    e)配列番号16に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    f)配列番号17に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    g)配列番号20に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;および
    h)配列番号21に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド
    からなる群から選択されるポリペプチドを含む、組成物。
  5. 前記ポリペプチドがアクチビンおよび/またはGDF11に結合する、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  6. 前記ポリペプチドが、配列番号3に対して少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  7. 前記ポリペプチドが、配列番号3に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  8. 前記ポリペプチドが、配列番号3のアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  9. 前記ポリペプチドが、配列番号2に対して少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  10. 前記ポリペプチドが、配列番号2に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  11. 前記ポリペプチドが、配列番号2のアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  12. 前記ポリペプチドが、配列番号7に対して少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  13. 前記ポリペプチドが、配列番号7に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  14. 前記ポリペプチドが、配列番号7のアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  15. 前記ポリペプチドが、配列番号12に対して少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  16. 前記ポリペプチドが、配列番号12に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  17. 前記ポリペプチドが、配列番号12のアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  18. 前記ポリペプチドが、配列番号17に対して少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  19. 前記ポリペプチドが、配列番号17に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  20. 前記ポリペプチドが、配列番号17のアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  21. 前記ポリペプチドが、配列番号16に対して少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  22. 前記ポリペプチドが、配列番号16に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  23. 前記ポリペプチドが、配列番号16のアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  24. 前記ポリペプチドが、配列番号20に対して少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  25. 前記ポリペプチドが、配列番号20に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  26. 前記ポリペプチドが、配列番号20のアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  27. 前記ポリペプチドが、配列番号21に対して少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  28. 前記ポリペプチドが、配列番号21に対して少なくとも90%同一なアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  29. 前記ポリペプチドが、配列番号21のアミノ酸配列を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  30. 前記ポリペプチドがアクチビンに結合する、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  31. 前記ポリペプチドがアクチビンAに結合する、請求項30に記載の組成物。
  32. 前記ポリペプチドがアクチビンBに結合する、請求項30に記載の組成物。
  33. 前記ポリペプチドがGDF11に結合する、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  34. 前記ポリペプチドがアクチビンおよびGDF11に結合する、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  35. 前記ポリペプチドが、以下の特徴:
    i)少なくとも10 −7 MのK でActRIIリガンドに結合する、および
    ii)細胞内のActRIIシグナル伝達を阻害する
    のうち1つ以上を有する、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  36. 前記ポリペプチドが、免疫グロブリンFcドメインを含む融合タンパク質である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  37. 前記ポリペプチドが、グリコシル化アミノ酸、PEG化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸および脂質部分に結合されたアミノ酸から選択される1以上の修飾されたアミノ酸残基を含む、請求項1〜4のいずれか一項に記載の組成物。
  38. 前記免疫グロブリンFcドメインが、IgG1Fcドメインである、請求項36に記載の組成物。
  39. 骨髄異形成症候群の処置、異常ヘモグロビン症の処置、地中海貧血症の処置、鎌状赤血球病の処置またはヘモグロビンレベルの増加を必要とする患者において、骨髄異形成症候群の処置、異常ヘモグロビン症の処置、地中海貧血症の処置、鎌状赤血球病の処置またはヘモグロビンレベルを増加させるための医薬の製造のためのポリペプチドの使用であって、前記ポリペプチドは、
    a)配列番号3に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    b)配列番号2に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    c)配列番号7に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    d)配列番号12に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    e)配列番号16に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    f)配列番号17に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;
    g)配列番号20に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド;および
    h)配列番号21に対して、少なくとも85%同一なアミノ酸配列を含むポリペプチド
    からなる群から選択されるポリペプチドである、使用。
  40. 前記ポリペプチドがアクチビンおよび/またはGDF11に結合する、請求項39に記載の使用。
  41. 前記ポリペプチドがアクチビンAに結合する、請求項40に記載の使用。
  42. 前記ポリペプチドがアクチビンBに結合する、請求項40に記載の使用。
  43. 前記ポリペプチドが、以下の特徴:
    i)少なくとも10 −7 MのK でActRIIリガンドに結合する、および
    ii)細胞内のActRIIシグナル伝達を阻害する
    のうち1つ以上を有する、請求項39に記載の使用。
  44. 前記ポリペプチドが、グリコシル化アミノ酸、PEG化アミノ酸、ファルネシル化アミノ酸、アセチル化アミノ酸、ビオチン化アミノ酸および脂質部分に結合されたアミノ酸から選択される1以上の修飾されたアミノ酸残基を含む、請求項39に記載の使用。
  45. 前記ポリペプチドが、免疫グロブリンFcドメインを含む融合タンパク質である、請求項39に記載の使用。
  46. 前記免疫グロブリンFcドメインが、IgG1Fcドメインである、請求項45に記載の使用。
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