JP2017000063A - バイオマーカーによるうつ病の検査方法及び検査キット - Google Patents
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Abstract
【解決手段】抑うつ症状の重症度に左右されずに、うつ病の発症の有無を客観的に示すマーカーとして、IGHA1、THEM4及び/又はTNFRSF25の発現量を測定する。さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2、IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、LZTS2からなる群より選ばれる1種又は2種以上の発現量を併せて測定する。
【選択図】図3
Description
[1]被検動物より採取された試料中のIGHA1、THEM4及びTNFRSF25からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定する工程を含み、当該マーカーの発現量を基準値と比較することにより被検動物のうつ病の発症の有無が判定される、該動物におけるうつ病の診断のための検査方法。
[2]前記マーカーが、IGHA1、THEM4及びTNFRSF25である、[1]に記載の検査方法。
[3]さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2、IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、LZTS2からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定する工程を含む、[1]又は[2]に記載の検査方法。
[4]さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2、IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、及びLZTS2の発現量を測定する工程を含む、[1]又は[2]に記載の検査方法。
[5]前記試料は、血液である、[1]〜[4]のいずれか一に記載の検査方法。
[6]前記測定が、マイクロアレイ、リアルタイムPCR、ELISA法、ウエスタンブロット法、FACS解析法、分光光度法、蛍光光度法、質量分析法、及びクロマトグラフィーからなる群より選ばれる1種又は2種以上により行われる、[1]〜[5]のいずれか一に記載の検査方法。
[7]IGHA1、THEM4及びTNFRSF25からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定し得る試薬を含んでなる、うつ病の診断のための検査用キット。
[8]前記マーカーが、IGHA1、THEM4及びTNFRSF25である、[7]に記載の検査用キット。
[9]さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2、IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、LZTS2からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定し得る試薬を含んでなる、[7]又は[8]に記載の検査用キット。
[10]さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、及びLZTS2の発現量を測定し得る試薬を含んでなる、[7]又は[8]に記載の検査用キット。
(1)うつ病の診断のための検査方法
本発明の第1は、被検動物より採取された試料中のIGHA1、THEM4及びTNFRSF25からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定する工程を含み、当該マーカーの発現量を基準値と比較することにより被検動物のうつ病の発症の有無が判定される、該動物におけるうつ病の診断のための検査方法である。
D27、CD3E、LZTS2からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーを使用することが好ましい。また、それらマーカーを全て測定してもよい。
Fを意味する。ヒトの遺伝子配列はGenBankよりNM_001010919のアクセッション番号にて入手可能である。
意味する。ヒトの遺伝子配列はGenBankよりNM_030755のアクセッション番号にて入手可能である。
は、標識イムノアッセイ法のうち、酵素を標識物質として用いる検出方法である。中でも、イムノソルベントを用いる、enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA) 法を選択するのが、特に好適である。また、ELISAのうちサンドイッチ法は、操作の簡便性、経済上の利便性、とりわけ臨床検査における汎用性を考慮すると、特に好適な測定態様の一つとして挙げられる。これらの測定方法は、例えば、新生化学実験講座(日本生化学会編;東京化学同人)、Molecular Cloning, A Laboratory Manual (T. Maniatis et al., Cold Spring Harbor Laboratory (2001))、Antibodies - A Laboratory Manual(E.Harlow, et al., Cold Spring Harbor Laboratory(1988))等の一般的実験書に記載の方法又はそれに準じて行うことができる。
本発明の第2は、IGHA1、THEM4及びTNFRSF25からなる群より選ばれる1種又は2種以上の発現量を測定し得る試薬を含んでなる、うつ病の診断のための検査用キットに関する。IGHA1、THEM4及びTNFRSF25を全て含んでもよい。キットの内容は、機器または試薬の組み合わせにより構成されるが、以下に述べる各構成要素と本質的に同一、またはその一部と本質的に同一な物質が含まれていれば、構成または形態が異なっていても、本発明のキットに包含される。
当該マーカーを特異的に増幅することが可能なプライマーを含む。プライマーは、上述したマーカーの遺伝子配列に基づいて、公知の方法により作製することが可能である。また、必要に応じて、逆転写酵素、Taqポリメラーゼ、反応用緩衝液等を含めてもよい。リアルタイムPCRの場合には、蛍光試薬、蛍光光度計、サーマルサイクラー等も含まれる。
群馬大学病院にて治療中の大うつ病(MDD)患者のうち、初発年齢が50歳以上であり、DSM-IV分類において大うつ病のメランコリー型を呈し、かつ、他の精神疾患の合併を認めない者を対象とした。MDDの重症度はハミルトンうつ病評価尺度構造化面接法(Structured Interview Guide for the Hamilton Depression Rating Scale;SIGH-D)により採点し
、8点未満を寛解とした。
対照として年齢と性別を一致させた健常者をリクルートした。リクルートした健常者に、精神疾患罹患歴や家族歴が無いことを確認した。リクルートした被験者に認知機能検査(Mini Mental State Examination; MMSE)を行い、認知機能が正常であることを確認した。
以下表1に、リクルートした被験者を示す。
被験者から10mLの血液を採取し、血液中の有核細胞(主に白血球)から、QIAmp RNA Blood Mini Kit (QIAGEN K.K.)によりRNAを抽出した。抽出操作はキットに添付の説明書の記載に多少の修正を加えて行われた。その操作は、要約すると次のとおりである。採取した10mlの血液を、50mlチューブに半分ずつ分け、各々のチューブに25mlのバッファーELを加えて、よく転倒混和した。各々のチューブを氷中に20分置いた後、4℃、480×gで15分遠心し、上清を捨てた。チューブ中のペレットに10mlのバッファーELを加えてボルテックスし、再懸濁した。再懸濁したサンプルを、4℃、480×gで15分遠心し、上清を捨てた。2-メルカプトエタノールを含むバッファーRLTをペレットに3ml加えて、ボルテックスにより溶解した。前記溶解物はQIAshredder spin columnsで室温にて2分遠心することによりホモジナイズした。ホモジナイズした溶解物に等量の70%エタノールを加えて、ボルテックスによりよく混和した。混和したサンプルをQIAamp spin columnに加えて15秒遠心した。カラムを洗浄後、DNaseI消化した。溶出工程はキットに添付の説明書どおりに行った。溶出したサンプルは標準的なエタノール沈殿法により処理された。RNAペレットはRNaseフリーの水に溶解した。
RNAの量はNanodrop ND-1000 spectrophotometer (Thermo Fisher Scientific Inc.)により測定した。
メスのC57BL/6Jマウス(8週齢)をCharles River Laboratories Japanより購入し、1週間の馴化後、ペントバルビタール麻酔下にて卵巣の摘除を行った(Ovariectomy; OVX)。同様にペントバルビタール麻酔を行い、卵巣を露出させたものの摘出せずに縫合したものを対照動物とした(Sham-operation; Sham)。
上記処置の2週間後より、慢性変動ストレス(chronic ultra-mild stress; CUMS)の負荷を開始した。CUMSの方法は既報(Uchida et al., Neuron, 69, 359-372, 2011)に準じ、6週に亘って負荷を行った。なお、同期間ストレス負荷を行わなかった群(Nonstress:
NS群)を設けた。すなわち、本試験は、Sham+NS、Sham+CUMS、OVX+NS、及び、OVX+CUMSの4つの群構成で行われた。
強制水泳試験は、以下のように行った。本試験のN数は、Sham+NS(n=24)、Sham+CUMS(n=24)、OVX+NS(n=24)、及び、OVX+CUMS(n=24)であった。アクリルシリンダー(高さ22cm、直径11.5cm)に室温の水を高さ15cmまで注ぎ、その中にマウスを置いた。マウスの行動は、パソコンに接続したCCDカメラにより5分間記録され、ImageJ PS1(小原医科産業社製)による解析を行った。記録された無動時間をうつ様行動の指標とした。
ペントバルビタール麻酔下にてマウスの大静脈から300μLの血液を採取後、すぐにヘパリン処置し、1000×gにて2分遠心した。得られたペレットは、2−メルカプトエタノールを含む冷却した溶解バッファーに溶解した。当該溶解物から、GeneJet Whole Blood RNA Purification Mini Kit (Thermo Fisher Scientific Inc.)を使用して、キット添付の説明書に従ってトータルRNAを抽出した。
RNAの量はNanodrop ND-1000 spectrophotometer (Thermo Fisher Scientific Inc.)により測定した。
被験者ならびにマウスから得たRNAを、Agilent Low Input Quick Amp Labeling Kit, one-color (Agilent Technologies)を使用して、キットに添付の説明書に従ってCyanine 3でラベルした。ラベル化したRNAを、 RNeasy mini spin column(QIAGEN)により精製した。得られたラベル化RNAをフラグメント化し、Agilent SurePrint G3 Human GE 8×60K v2 Microarray (Design ID: 039494)ならびにAgilent SurePrint G3 Mouse GE 8×60K Microarray (Design ID: 028005)と65℃で17時間ハイブリダイズさせた後、マイクロアレイを洗浄し、Agilent DNA microarray scannerにより測定した。発光強度をAgilent feature extraction software version 10.7.3.1により定量化し、Agilent GeneSpring GX version 11.0.2により標準化した。
被験者から得たRNAをPrimeScript RT reagent Kit (Takara Bio Inc.)により逆転写してcDNAサンプルを得た後、このcDNAサンプルと、被検者またはマウスのマイクロアレイの結果から得られたバイオマーカー候補に対する特異的なプライマーペアー(表3および表4)と、SYBR Premix Ex Taq II (Takara Bio Inc.)またはPremix Ex Taq (Takara Bio Inc.)とを混合してリアルタイム定量PCRを行った。リアルタイム定量PCRは、StepOnePlusリアルタイムPCRシステム(Applied Biosystems)により、95℃3秒及び60℃30秒を50サイクルで行った。なお、内標準物質として、表3のプライマーペアおよびSYBR Premix Ex Taq II を使用した場合にはRPS29を、表4のプライマーペアおよびPremix Ex Taqを使用した場合には、18S-rRNA、GAPDH、GUSB、HPRT1を選択した。ターゲット遺伝子の増幅量はΔΔCt法に従って定量解析を行い、健常者と比較した。
配列番号2:THEM4の配列。
配列番号3:TNFRSF25の配列。
配列番号4:ANKRD35の配列。
配列番号5:CLEC3Bの配列。
配列番号6:FAM26Fの配列。
配列番号7:NRG1の配列。
配列番号8:UTS2の配列。
配列番号9:CCDC64の配列。
配列番号10:GPR15の配列。
配列番号11:GSTM2の配列。
配列番号12:IGLV6−57の配列。
配列番号13:PDGFBの配列。
配列番号14:PRKAR1Bの配列。
配列番号15:SLC34A1の配列。
配列番号16:AIG1の配列。
配列番号17:TMX1の配列。
配列番号18:ATN1の配列。
配列番号19:CD27の配列。
配列番号20:CD3Eの配列。
配列番号21:LZTS2の配列。
配列番号22:AIGのforwardプライマー。
配列番号23:AIGのreverseプライマー。
配列番号24:ATN1forwardプライマー。
配列番号25:ATN1reverseプライマー。
配列番号26:CD27forwardプライマー。
配列番号27:CD27reverseプライマー。
配列番号28:CD3Eforwardプライマー。
配列番号29:CD3Ereverseプライマー。
配列番号30:LZTS2forwardプライマー。
配列番号31:LZTS2reverseプライマー。
配列番号32:TMX1forwardプライマー。
配列番号33:TMX1reverseプライマー。
配列番号34:TNFRSF25forwardプライマー。
配列番号35:TNFRSF25reverseプライマー。
Claims (10)
- 被検動物より採取された試料中のIGHA1、THEM4及びTNFRSF25からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定する工程を含み、当該マーカーの発現量を基準値と比較することにより被検動物のうつ病の発症の有無が判定される、該動物におけるうつ病の診断のための検査方法。
- 前記マーカーが、IGHA1、THEM4及びTNFRSF25である、請求項1に記載の検査方法。
- さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2、IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、LZTS2からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定する工程を含む、請求項1又は2に記載の検査方法。
- さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2、IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、及びLZTS2の発現量を測定する工程を含む、請求項1又は2に記載の検査方法。
- 前記試料は、血液である、請求項1〜4のいずれか一項に記載の検査方法。
- 前記測定が、マイクロアレイ、リアルタイムPCR、ELISA法、ウエスタンブロット法、FACS解析法、分光光度法、蛍光光度法、質量分析法、及びクロマトグラフィーからなる群より選ばれる1種又は2種以上により行われる、請求項1〜5のいずれか一項に記載の検査方法。
- IGHA1、THEM4及びTNFRSF25からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定し得る試薬を含んでなる、うつ病の診断のための検査用キット。
- 前記マーカーが、IGHA1、THEM4及びTNFRSF25である、請求項7に記載の検査用キット。
- さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2、IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、LZTS2からなる群より選ばれる1種又は2種以上のマーカーの発現量を測定し得る試薬を含んでなる、請求項7又は8に記載の検査用キット。
- さらに、ANKRD35、CLEC3B、FAM26F、NRG1、UTS2、CCDC64、GPR15、GSTM2、IGLV6−57、PDGFB、PRKAR1B、SLC34A1、AIG1、TMX1、ATN1、CD27、CD3E、及びLZTS2の発現量を測定し得る試薬を含んでなる、請求項7又は8に記載の検査用キット。
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