JP2016534756A - 病原体および有益な微生物を検出するための核酸および方法 - Google Patents
病原体および有益な微生物を検出するための核酸および方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP2016534756A JP2016534756A JP2016551031A JP2016551031A JP2016534756A JP 2016534756 A JP2016534756 A JP 2016534756A JP 2016551031 A JP2016551031 A JP 2016551031A JP 2016551031 A JP2016551031 A JP 2016551031A JP 2016534756 A JP2016534756 A JP 2016534756A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- seq
- sequence number
- puccinia
- sequence
- phytophthora
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 91
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract description 77
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract description 77
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 66
- 244000052769 pathogen Species 0.000 title claims abstract description 44
- 244000005700 microbiome Species 0.000 title claims abstract description 38
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 title claims abstract description 31
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims abstract description 31
- 238000002493 microarray Methods 0.000 claims abstract description 30
- 244000053095 fungal pathogen Species 0.000 claims abstract description 8
- 230000008635 plant growth Effects 0.000 claims abstract description 5
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 claims abstract description 5
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 claims description 44
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 31
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 30
- 241000233866 Fungi Species 0.000 claims description 25
- 241000894007 species Species 0.000 claims description 25
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 20
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 claims description 19
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 18
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims description 14
- 239000002689 soil Substances 0.000 claims description 14
- 241000221300 Puccinia Species 0.000 claims description 12
- 241001361634 Rhizoctonia Species 0.000 claims description 12
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 12
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 claims description 12
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 11
- 239000003337 fertilizer Substances 0.000 claims description 11
- 229910052684 Cerium Inorganic materials 0.000 claims description 8
- 241000233614 Phytophthora Species 0.000 claims description 8
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 claims description 8
- 241001123561 Puccinia coronata Species 0.000 claims description 8
- 241000221301 Puccinia graminis Species 0.000 claims description 8
- 241000147799 Serratia entomophila Species 0.000 claims description 8
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 claims description 8
- 241001360088 Zymoseptoria tritici Species 0.000 claims description 8
- GWXLDORMOJMVQZ-UHFFFAOYSA-N cerium Chemical compound [Ce] GWXLDORMOJMVQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 claims description 7
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 7
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 7
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 7
- 241001459558 Monographella nivalis Species 0.000 claims description 6
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 claims description 6
- 241000221696 Sclerotinia sclerotiorum Species 0.000 claims description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 5
- UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 5,8-dihydroxy-2-methoxy-6-methyl-7-(2-oxopropyl)naphthalene-1,4-dione Chemical compound CC1=C(CC(C)=O)C(O)=C2C(=O)C(OC)=CC(=O)C2=C1O UHPMCKVQTMMPCG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 241000193744 Bacillus amyloliquefaciens Species 0.000 claims description 4
- 241000190150 Bipolaris sorokiniana Species 0.000 claims description 4
- 241000171926 Chalaropsis populi Species 0.000 claims description 4
- 241001429695 Colletotrichum graminicola Species 0.000 claims description 4
- 241001326569 Erysiphe trifolii Species 0.000 claims description 4
- 241000223218 Fusarium Species 0.000 claims description 4
- 241000223194 Fusarium culmorum Species 0.000 claims description 4
- 241001344133 Magnaporthe Species 0.000 claims description 4
- 241001480581 Marasmius Species 0.000 claims description 4
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 claims description 4
- 241000998584 Nuda Species 0.000 claims description 4
- 241001223281 Peronospora Species 0.000 claims description 4
- 241001149949 Phytophthora cactorum Species 0.000 claims description 4
- 241000522468 Phytophthora citricola Species 0.000 claims description 4
- 241000233633 Phytophthora drechsleri Species 0.000 claims description 4
- 241000233624 Phytophthora megasperma Species 0.000 claims description 4
- 241000233645 Phytophthora nicotianae Species 0.000 claims description 4
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 241001480435 Pseudopeziza medicaginis Species 0.000 claims description 4
- 241000540505 Puccinia dispersa f. sp. tritici Species 0.000 claims description 4
- 241000989993 Puccinia poae-nemoralis Species 0.000 claims description 4
- 241000221299 Puccinia poarum Species 0.000 claims description 4
- 241001123567 Puccinia sorghi Species 0.000 claims description 4
- 241000233639 Pythium Species 0.000 claims description 4
- 241001622911 Pythium graminicola Species 0.000 claims description 4
- 241001505297 Pythium irregulare Species 0.000 claims description 4
- 241001325469 Pythium mastophorum Species 0.000 claims description 4
- 241001622889 Pythium sulcatum Species 0.000 claims description 4
- 241000173767 Ramularia Species 0.000 claims description 4
- 241000813090 Rhizoctonia solani Species 0.000 claims description 4
- 241000221662 Sclerotinia Species 0.000 claims description 4
- 241001300361 Sclerotinia borealis Species 0.000 claims description 4
- 241001518640 Sclerotinia homoeocarpa Species 0.000 claims description 4
- 241001136641 Sclerotinia trifoliorum Species 0.000 claims description 4
- 241001533598 Septoria Species 0.000 claims description 4
- 241001367103 Septoria macropoda Species 0.000 claims description 4
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 claims description 4
- 241000266363 Stemphylium sarciniforme Species 0.000 claims description 4
- 239000005838 Streptomyces K61 (formerly S. griseoviridis) Substances 0.000 claims description 4
- 241000970977 Streptomyces graminofaciens Species 0.000 claims description 4
- 241000191251 Streptomyces griseoviridis Species 0.000 claims description 4
- 241000187181 Streptomyces scabiei Species 0.000 claims description 4
- 241000865903 Thielaviopsis Species 0.000 claims description 4
- 241000561282 Thielaviopsis basicola Species 0.000 claims description 4
- 241000722133 Tilletia Species 0.000 claims description 4
- 241000722093 Tilletia caries Species 0.000 claims description 4
- 241000722096 Tilletia controversa Species 0.000 claims description 4
- 241000227728 Trichoderma hamatum Species 0.000 claims description 4
- 241000959260 Typhula Species 0.000 claims description 4
- 241000983470 Typhula ishikariensis Species 0.000 claims description 4
- 241000221576 Uromyces Species 0.000 claims description 4
- 241000990716 Uromyces dactylidis Species 0.000 claims description 4
- 244000301083 Ustilago maydis Species 0.000 claims description 4
- 235000015919 Ustilago maydis Nutrition 0.000 claims description 4
- 241000007070 Ustilago nuda Species 0.000 claims description 4
- 241000233791 Ustilago tritici Species 0.000 claims description 4
- 241000082085 Verticillium <Phyllachorales> Species 0.000 claims description 4
- 241000589643 Xanthomonas translucens Species 0.000 claims description 4
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims description 4
- OSVMTWJCGUFAOD-KZQROQTASA-N formestane Chemical compound O=C1CC[C@]2(C)[C@H]3CC[C@](C)(C(CC4)=O)[C@@H]4[C@@H]3CCC2=C1O OSVMTWJCGUFAOD-KZQROQTASA-N 0.000 claims description 4
- 229960004421 formestane Drugs 0.000 claims description 4
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 239000011591 potassium Substances 0.000 claims description 4
- 241001426059 Aveneae Species 0.000 claims description 3
- 241000896542 Clonostachys rosea f. catenulata Species 0.000 claims description 3
- 241001330737 Leptosphaerulina australis Species 0.000 claims description 3
- 241001329985 Triticeae Species 0.000 claims description 3
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 claims description 3
- 235000008216 herbs Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000010871 livestock manure Substances 0.000 claims description 3
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 claims description 3
- 241000216654 Armillaria Species 0.000 claims description 2
- 108020000946 Bacterial DNA Proteins 0.000 claims description 2
- 108020000949 Fungal DNA Proteins 0.000 claims description 2
- 241000190478 Neotyphodium Species 0.000 claims description 2
- 241001099903 Paramyrothecium roridum Species 0.000 claims description 2
- 230000000843 anti-fungal effect Effects 0.000 claims description 2
- 239000003429 antifungal agent Substances 0.000 claims description 2
- 229940121375 antifungal agent Drugs 0.000 claims description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 claims description 2
- 229940096118 ella Drugs 0.000 claims description 2
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 claims description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims description 2
- OOLLAFOLCSJHRE-ZHAKMVSLSA-N ulipristal acetate Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1[C@@H]1C2=C3CCC(=O)C=C3CC[C@H]2[C@H](CC[C@]2(OC(C)=O)C(C)=O)[C@]2(C)C1 OOLLAFOLCSJHRE-ZHAKMVSLSA-N 0.000 claims description 2
- 241001480060 Blumeria Species 0.000 claims 4
- 241000228456 Leptosphaeria Species 0.000 claims 4
- 241000778032 Aureobasidium caulivorum Species 0.000 claims 3
- 241000221751 Claviceps purpurea Species 0.000 claims 3
- 241000329434 Limonomyces roseipellis Species 0.000 claims 3
- 241000947859 Microdochium Species 0.000 claims 3
- 241000873303 rhizosphere bacterium Species 0.000 claims 3
- 241000222199 Colletotrichum Species 0.000 claims 2
- 241001465183 Drechslera Species 0.000 claims 2
- 241000992414 Drechslera phlei Species 0.000 claims 2
- 241000223251 Myrothecium Species 0.000 claims 2
- 241001465315 Ophiosphaerella korrae Species 0.000 claims 2
- 241000222237 Colletotrichum trifolii Species 0.000 claims 1
- 241000371654 Curvularia affinis Species 0.000 claims 1
- 241000896533 Gliocladium Species 0.000 claims 1
- 241001495424 Macrophomina Species 0.000 claims 1
- 241001327151 Paniceae Species 0.000 claims 1
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 40
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 40
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 35
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 14
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 14
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 12
- 108020004465 16S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 11
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 11
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 11
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 10
- 108020004463 18S ribosomal RNA Proteins 0.000 description 9
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 9
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 9
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 6
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 6
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 6
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 6
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 5
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 5
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 5
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 5
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 5
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 4
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 3
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 108700022487 rRNA Genes Proteins 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 3
- 108020004565 5.8S Ribosomal RNA Proteins 0.000 description 2
- 241001480061 Blumeria graminis Species 0.000 description 2
- SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N Digoxigenin Natural products C1CC(C2C(C3(C)CCC(O)CC3CC2)CC2O)(O)C2(C)C1C1=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091029795 Intergenic region Proteins 0.000 description 2
- 241000222058 Kabatiella Species 0.000 description 2
- 241000209504 Poaceae Species 0.000 description 2
- 241001518705 Sclerotinia minor Species 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 2
- 239000003899 bactericide agent Substances 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N digitoxigenin Natural products CC12CCC(C3(CCC(O)CC3CC3)C)C3C11OC1CC2C1=CC(=O)OC1 QONQRTHLHBTMGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N digoxigenin Chemical compound C1([C@@H]2[C@@]3([C@@](CC2)(O)[C@H]2[C@@H]([C@@]4(C)CC[C@H](O)C[C@H]4CC2)C[C@H]3O)C)=CC(=O)OC1 SHIBSTMRCDJXLN-KCZCNTNESA-N 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 2
- 239000000417 fungicide Substances 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000007899 nucleic acid hybridization Methods 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000007923 virulence factor Effects 0.000 description 2
- 239000000304 virulence factor Substances 0.000 description 2
- UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 3,3',5,5'-tetramethylbenzidine Chemical compound CC1=C(N)C(C)=CC(C=2C=C(C)C(N)=C(C)C=2)=C1 UAIUNKRWKOVEES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HSTOKWSFWGCZMH-UHFFFAOYSA-N 3,3'-diaminobenzidine Chemical compound C1=C(N)C(N)=CC=C1C1=CC=C(N)C(N)=C1 HSTOKWSFWGCZMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- 241000239223 Arachnida Species 0.000 description 1
- 241001465178 Bipolaris Species 0.000 description 1
- 241001157813 Cercospora Species 0.000 description 1
- 241000221760 Claviceps Species 0.000 description 1
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 1
- 241000690372 Fusarium proliferatum Species 0.000 description 1
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 1
- 108091023242 Internal transcribed spacer Proteins 0.000 description 1
- 241001495426 Macrophomina phaseolina Species 0.000 description 1
- 241001486950 Microdochium bolleyi Species 0.000 description 1
- 241000244206 Nematoda Species 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 102100026456 POU domain, class 3, transcription factor 3 Human genes 0.000 description 1
- 101710133393 POU domain, class 3, transcription factor 3 Proteins 0.000 description 1
- 241000193985 Streptococcus agalactiae Species 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 208000005652 acute fatty liver of pregnancy Diseases 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 230000001775 anti-pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010170 biological method Methods 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 230000014670 detection of bacterium Effects 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 230000003090 exacerbative effect Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 238000004362 fungal culture Methods 0.000 description 1
- 230000000855 fungicidal effect Effects 0.000 description 1
- 238000000227 grinding Methods 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000011005 laboratory method Methods 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 238000012775 microarray technology Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 description 1
- 108020004418 ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/689—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for bacteria
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/16—Primer sets for multiplex assays
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Botany (AREA)
- Mycology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
Abstract
Description
本発明は、芝草の健全さだけでなく他の有機基質にも一般に関連した真菌および細菌のrRNAの遺伝子内の保存領域およびその遺伝子間領域に特異的なヌクレオチド配列の選択物の、本発明者らによる特定から得られたものである。
(i)
(ii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含むまたはそれらからなる核酸のセットの使用に関する。
(i)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100からなる群から選択される配列;
(ii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含むまたはそれらからなる核酸のセットの使用を含む方法に関する。
(i)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99もしくは配列番号100からなる群から選択される配列;
(ii)配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99もしくは配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含むまたはそれらからなる少なくとも1つの核酸の使用に関する。
(i)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99もしくは配列番号100からなる群から選択される配列;
(ii)配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99もしくは配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含むまたはそれらからなる少なくとも1つの核酸の使用を含む方法に関する。
(i)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100;
(ii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含むまたはそれらからなる核酸のセットを含むマイクロアレイ・チップに関する。
(i)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100からなる群から選択される配列;
(ii)配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99もしくは配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含むまたはそれらからなる少なくとも1つの核酸を含むマイクロアレイ・チップに関する。
a)病原体および/または有益な微生物のDNAを含む標準物からの、およびサンプルからのDNA単離;
b)PCRによる工程a)の単離DNAの増幅;
c)得られたPCR産物の,上記に定義されたマイクロアレイ・チップ上におけるハイブリダイゼーション;
d)結合DNAの検出;ならびに
e)サンプルが病原体および/または有益な微生物を含有するかどうかのそれからの推定
の工程を含む、有機サンプルにおける病原体および/または有益な微生物の検出方法に関する。
(i)以下の配列:配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100の核酸;
(ii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列の核酸;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列の核酸
を含む、有機サンプルにおける病原体および/または有益な微生物の検出のためのキットに関する。
a)罹患芝草が成長している土壌のサンプルまたは罹患芝草のサンプルにおける少なくとも1つの病原性真菌および/または細菌からの核酸の存在または非存在を、上記に定義された少なくとも1つの核酸、特に、上記に定義された核酸のセットを使用して、PCRとマイクロアレイ・チップとを組合せた方法により検出し、
b)1以上の病原性真菌および/または細菌からの核酸が工程a)において検出された場合には、核酸が検出された1以上の病原性真菌および/または細菌を標的とする1以上の抗真菌剤および/または抗細菌剤を選択し、
c)工程b)において選択された1以上の抗真菌剤および/または抗細菌剤を罹患芝草に適用する工程を含む、罹患芝草の治療方法に関する。
本発明において意図される核酸は任意のタイプのものでありうるが、それらはDNAであることが好ましい。
(i)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100;
(ii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列を含む若しくはそれらからなる配列;または
(iv)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含むまたはそれらからなる核酸のセットの使用に関する。
有機サンプル(例えば、芝草、土壌、作物、植物部分など)から、および標準物(単離された細菌、単離された真菌など)から、DNAを単離する。方法は当業者に公知である。具体例は科学文献(例えば、Michele K.Nishiguchi,Phaedra Doukakis,Mary Eganら,“DNA Isolation Methods”,Methods and Tools in Biosciences and Medicine,Techniques in molecular systematics and evolution,Rob DeSalleら編(C)2002 Birkhauser Verlag Basel/Switzerland)に記載されており、多数の商業的な方法も利用可能である(例えば、”DNeasy(R)Plant Mini Kit(QIAGEN 69104)または“PowerSoil(R)DNA Isolation Kit(MO BIO laboratories Inc,Cat no.12888−100)。
マイクロアレイチューブを本発明の核酸配列(配列番号1から100)(Alere Technologies GmbH,Jena,Germanyにより提供された)に共有結合させた。再現可能な結果を得るために、本発明のおよび上記の核酸配列を該マイクロアレイ上に二重重複してスポットした。各スポットは0.02μmolのヌクレオチドを含有し、該ヌクレオチドを3’C7−アミノ修飾により該アレイ上に固定化した。
本発明は真菌および細菌種の大きな選択物からの微生物の特定を可能にする。本発明の方法は従来の方法より迅速であり、特定可能な微生物の、より広いスペクトルを有し、より特異的である。
Claims (28)
- サンプルにおける少なくとも1つの病原体および/または1つの有益な微生物をハイブリダイゼーション技術により検出するための、
(i)
(ii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含む又はそれらからなる核酸のセットの使用。 - 少なくとも1つの病原体が細菌および/または真菌から選択される、請求項1記載の使用。
- 少なくとも1つの真菌および/または細菌が、アルミラリア・メレア(Armillaria mellea)、アスコキタ・フレイナ(Ascochyta phleina)、ビポラリス・ソロキニアナ(Bipolaris sorokiniana)、ブルメリア・グラミニス(Blumeria graminis)、セルコスポラ・ゼブリン(Cercospora zebrine)、クラビセプス・プルプレア(Claviceps purpurea)、コレトトリクム・トリフォリイ(Colletotrichum trifolii)、コルチシウム・フシフォルメ(Corticium fuciforme)、クルブラリア・アフィニス(Curvularia affinis)、ドレクスレラ・ジクチオイデス(Drechslera dictyoides)、ドレクスレラ・フレイ(Drechslera phlei)、ドレクスレラ・ポエ(Drechslera poae)、ドレクスレラ・シカンス(Drechslera siccans)、ドレクスレラ・トリチシ−レペンチス(Drechslera tritici−repentis)、エピクロエ・チフィナ(Epichloe typhina)、エクスセロヒルム・ツルシクム(Exserohilum turcicum)、フザリウム・クルモルム(Fusarium culmorum)、フザリウム・ポエ(Fusarium poae)、ゲウマンノマイセス・グラミニス(Gaeumannomyces graminis)、ギベレラ・インテルミディア(Gibberella intermedia)、グリオクラジウム・カテヌラツム(Gliocladium catenulatum)、グロメレラ・グラミニコラ(Glomerella graminicola)、カバチエラ・カウリボラ(Kabatiella caulivora)、レプトスフェリア・コルレ(Leptosphaeria korrae)、レプトスフェルリナ・アウストラリス(Leptosphaerulina australis)、マクロホミナ・ファセオリナ(Macrophomina phaseolina)、マグナポルテ・ポエ(Magnaporthe poae)、マラスミウス・オレアデス(Marasmius oreades)、ミクロドキウム・ボレイ(Microdochium bolleyi)、ミクロドキウム・ニバレ(Microdochium nivale)、ミクロスファエラ・トリフォリイ(Microsphaera trifolii)、ミロテシウム・ロリデゥム(Myrothecium roridum)、ネオチホジウム属種(Neotyphodium sp.)、オフィオスフェレラ・ヘルポトリチャ(Ophiosphaerella herpotricha)、オフィオスフェレラ・ナルマリ(Ophiosphaerella narmari)、ペロノスポラ・トリフォリオルム(Peronospora trifoliorum)、フィラコラ・ブルガタ(Phyllachora vulgata)、フィトフトラ・ブラッシケ(Phytophthora brassicae)、フィトフトラ・カクトルム(Phytophthora cactorum)、フィトフトラ・シトリコラ(Phytophthora citricola)、フィトフトラ・ドレクスレリ(Phytophthora drechsleri)、フィトフトラ・フラガリ(Phytophthora fragariae)、フィトフトラ・メガスペルマ(Phytophthora megasperma)、フィトフトラ・ニコチアネ(Phytophthora nicotianae)、シュードペジザ・メディカギニス(Pseudopeziza medicaginis)、プクキニア・コロナタ(Puccinia coronata)、プッシニア・コロナテ(Puccinia coronate)、プクキニア・グラミニス(Puccinia graminis)、プクキニア・ポエ−ネモラリス(Puccinia poae−nemoralis)、プクキニア・ポアルム(Puccinia poarum)、プクキニア・レコンディテ(Puccinia recondite)、プクキニア・ソルギ(Puccinia sorghi)、プクキニア・ストリイフォルミス(Puccinia striiformis)、プクキニア・トリチシナ(Puccinia triticina)、ピレノチェタ・リコペルシシ(Pyrenochaeta lycopersici)、ピチウム・アファニデルマツマ(Pythium aphanidermatuma)、ピチウム・デバリアヌム(Pythium debaryanum)、ピチウム・グラミニコラ(Pythium graminicola)、ピチウム・イレグラレ(Pythium irregulare)、ピチウム・マストホルム(Pythium mastophorum)、ピチウム・スルカツム(Pythium sulcatum)、ピチウム・ウルチムム(Pythium ultimum)、ラムラリア・コロ−シグニ(Ramularia collo−cygni)、リゾクトニア・セレアリス(Rhizoctonia cerealis)、リゾクトニア・フラガリエ(Rhizoctonia fragariae)、リンコスポリウム・オルトスポルム(Rhynchosporium orthosporum)、リンコスポリウム・セカリス(Rhynchosporium secalis)、スクレロチニア・ボレアリス(Sclerotinia borealis)、スクレロチニア・ホメオカルパ(Sclerotinia homoeocarpa)、スクレロチニア・スクレロチオルム(Sclerotinia sclerotiorum)、スクレロチニア・トリフォリオルム(Sclerotinia trifoliorum)、セプトリア・マクロポダ(Septoria macropoda)、セプトリア・トリチシ(Septoria tritici)、ステムフィリウム・サルシネフォルメ(Stemphylium sarcinaeforme)、タナテホルス・ククメリス(Thanatephorus cucumeris)、チエラビオプシス・バシコラ(Thielaviopsis basicola)、チエラビオプシス・ポプリ(Thielaviopsis populi)、チレチア・カリエス(Tilletia caries)、チレチア・コントロベルサ(Tilletia controversa)、トリコデルマ・ハマツム(Trichoderma hamatum)、チフラ・インカルナテ(Typhula incarnate)、チフラ・イシカリエンシス(Typhula ishikariensis)、チフラ・イシカリエンシス(Typhula ishikariensis)、ウロマイセス・ダクチリディス(Uromyces dactylidis)、ウロマイセス・トリフォリイ−レペンチス(Uromyces trifolii−repentis)、ウスチラゴ・メイディス(Ustilago maydis)、ウスチラゴ・ヌダ(Ustilago nuda)、ウスチラゴ・ストリイフォルミス(Ustilago striiformis)、ウスチラゴ・トリチシ(Ustilago tritici)、ベルチシリウム・ダーリエ(Verticillium dahliae);バチルス・アミロリクエファシエンス(Bacillus amyloliquefaciens)、シュードモナス・クロロラフィス(Pseudomonas chlororaphis)、セラチア・エントモフィラ(Serratia entomophila)、セラチア・プリムチカ(Serratia plymuthica)、ストレプトマイセス・アルビドフラブス(Streptomyces albidoflavus)、ストレプトマイセス・グラミノファシエンス(Streptomyces graminofaciens)、ストレプトマイセス・グリセオビリディス(Streptomyces griseoviridis)、ストレプトマイセス・リモスス(Streptomyces rimosus)、ストレプトマイセス・スカビエイ(Streptomyces scabiei)、キサントモナス・トランスルセンス(Xanthomonas translucens)からなる群から選択される、請求項2記載の使用。
- 請求項3記載の真菌および細菌の全ての検出のための、請求項1記載の使用。
- 少なくとも1つの有益な微生物が植物成長促進性根圏細菌である、請求項1記載の使用。
- サンプルが芝草;土壌;自然肥料、特に動物の糞もしくは動物の糞尿のような動物由来の自然肥料、または葉、茎、根、種子、果実体もしくは花のような植物もしくは薬草に由来する自然肥料;種子または作物サンプルである、前記請求項のいずれか1項記載の使用。
- サンプルが芝草の根もしくは種子または芝草サンプルの葉である、請求項6記載の使用。
- 芝草が、フェスタセエ連(Festaceae)、アベネエ連(Aveneae)、トリチセエ連(Triticeae)、クロリデエ連(Chlorideae)、ゾイシエエ連(Zoysieae)、パニセエ連(Paniceae)およびアンドロポゴネエ連(Andropogoneae)からなる群から選択される、請求項6または7記載の使用。
- ハイブリダイゼーション技術がマイクロアレイ・チップ、サザンブロット法、ノーザンブロット法、PCRから選択される、前記請求項のいずれか1項記載の使用。
- ハイブリダイゼーション技術が、マイクロアレイ・チップと組合されたPCRを含み、ここで、PCRが感度を増加させ、バックグラウンドを減少させ、および/または検出標識をPCR産物に付加する、前記請求項のいずれか1項記載の使用。
- (i)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100の配列;
(ii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列
を含む又はそれらからなる核酸のセットを含むマイクロアレイ・チップ。 - サンプルにおける少なくとも1つの病原体および/または有益な微生物を検出するための、請求項11記載のマイクロアレイ・チップの使用。
- 少なくとも1つの病原体が細菌および/または真菌から選択される、請求項12記載の使用。
- 少なくとも1つの真菌および/または細菌が、アルミラリア・メレア(Armillaria mellea)、アスコキタ・フレイナ(Ascochyta phleina)、ビポラリス・ソロキニアナ(Bipolaris sorokiniana)、ブルメリア・グラミニス(Blumeria graminis)、セルコスポラ・ゼブリン(Cercospora zebrine)、クラビセプス・プルプレア(Claviceps purpurea)、コレトトリクム・トリフォリイ(Colletotrichum trifolii)、コルチシウム・フシフォルメ(Corticium fuciforme)、クルブラリア・アフィニス(Curvularia affinis)、ドレクスレラ・ジクチオイデス(Drechslera dictyoides)、ドレクスレラ・フレイ(Drechslera phlei)、ドレクスレラ・ポエ(Drechslera poae)、ドレクスレラ・シカンス(Drechslera siccans)、ドレクスレラ・トリチシ−レペンチス(Drechslera tritici−repentis)、エピクロエ・チフィナ(Epichloe typhina)、エクスセロヒルム・ツルシクム(Exserohilum turcicum)、フザリウム・クルモルム(Fusarium culmorum)、フザリウム・ポエ(Fusarium poae)、ゲウマンノマイセス・グラミニス(Gaeumannomyces graminis)、ギベレラ・インテルミディア(Gibberella intermedia)、グリオクラジウム・カテヌラツム(Gliocladium catenulatum)、グロメレラ・グラミニコラ(Glomerella graminicola)、カバチエラ・カウリボラ(Kabatiella caulivora)、レプトスフェリア・コルレ(Leptosphaeria korrae)、レプトスフェルリナ・アウストラリス(Leptosphaerulina australis)、マクロホミナ・ファセオリナ(Macrophomina phaseolina)、マグナポルテ・ポエ(Magnaporthe poae)、マラスミウス・オレアデス(Marasmius oreades)、ミクロドキウム・ボレイ(Microdochium bolleyi)、ミクロドキウム・ニバレ(Microdochium nivale)、ミクロスファエラ・トリフォリイ(Microsphaera trifolii)、ミロテシウム・ロリデゥム(Myrothecium roridum)、ネオチホジウム属種(Neotyphodium sp.)、オフィオスフェレラ・ヘルポトリチャ(Ophiosphaerella herpotricha)、オフィオスフェレラ・ナルマリ(Ophiosphaerella narmari)、ペロノスポラ・トリフォリオルム(Peronospora trifoliorum)、フィラコラ・ブルガタ(Phyllachora vulgata)、フィトフトラ・ブラッシケ(Phytophthora brassicae)、フィトフトラ・カクトルム(Phytophthora cactorum)、フィトフトラ・シトリコラ(Phytophthora citricola)、フィトフトラ・ドレクスレリ(Phytophthora drechsleri)、フィトフトラ・フラガリ(Phytophthora fragariae)、フィトフトラ・メガスペルマ(Phytophthora megasperma)、フィトフトラ・ニコチアネ(Phytophthora nicotianae)、シュードペジザ・メディカギニス(Pseudopeziza medicaginis)、プクキニア・コロナタ(Puccinia coronata)、プクキニア・コロナテ(Puccinia coronate)、プクキニア・グラミニス(Puccinia graminis)、プクキニア・ポエ−ネモラリス(Puccinia poae−nemoralis)、プクキニア・ポアルム(Puccinia poarum)、プクキニア・レコンディテ(Puccinia recondite)、プクキニア・ソルギ(Puccinia sorghi)、プクキニア・ストリイフォルミス(Puccinia striiformis)、プクキニア・トリチシナ(Puccinia triticina)、ピレノチェタ・リコペルシシ(Pyrenochaeta lycopersici)、ピチウム・アファニデルマツマ(Pythium aphanidermatuma)、ピチウム・デバリアヌム(Pythium debaryanum)、ピチウム・グラミニコラ(Pythium graminicola)、ピチウム・イレグラレ(Pythium irregulare)、ピチウム・マストホルム(Pythium mastophorum)、ピチウム・スルカツム(Pythium sulcatum)、ピチウム・ウルチムム(Pythium ultimum)、ラムラリア・コロ−シグニ(Ramularia collo−cygni)、リゾクトニア・セレアリス(Rhizoctonia cerealis)、リゾクトニア・フラガリエ(Rhizoctonia fragariae)、リンコスポリウム・オルトスポルム(Rhynchosporium orthosporum)、リンコスポリウム・セカリス(Rhynchosporium secalis)、スクレロチニア・ボレアリス(Sclerotinia borealis)、スクレロチニア・ホメオカルパ(Sclerotinia homoeocarpa)、スクレロチニア・スクレロチオルム(Sclerotinia sclerotiorum)、スクレロチニア・トリフォリオルム(Sclerotinia trifoliorum)、セプトリア・マクロポダ(Septoria macropoda)、セプトリア・トリチシ(Septoria tritici)、ステムフィリウム・サルシネフォルメ(Stemphylium sarcinaeforme)、タナテホルス・ククメリス(Thanatephorus cucumeris)、チエラビオプシス・バシコラ(Thielaviopsis basicola)、チエラビオプシス・ポプリ(Thielaviopsis populi)、チレチア・カリエス(Tilletia caries)、チレチア・コントロベルサ(Tilletia controversa)、トリコデルマ・ハマツム(Trichoderma hamatum)、チフラ・インカルナテ(Typhula incarnate)、チフラ・イシカリエンシス(Typhula ishikariensis)、チフラ・イシカリエンシス(Typhula ishikariensis)、ウロマイセス・ダクチリディス(Uromyces dactylidis)、ウロマイセス・トリフォリイ−レペンチス(Uromyces trifolii−repentis)、ウスチラゴ・メイディス(Ustilago maydis)、ウスチラゴ・ヌダ(Ustilago nuda)、ウスチラゴ・ストリイフォルミス(Ustilago striiformis)、ウスチラゴ・トリチシ(Ustilago tritici)、ベルチシリウム・ダーリエ(Verticillium dahliae);バチルス・アミロリクエファシエンス(Bacillus amyloliquefaciens)、シュードモナス・クロロラフィス(Pseudomonas chlororaphis)、セラチア・エントモフィラ(Serratia entomophila)、セラチア・プリムチカ(Serratia plymuthica)、ストレプトマイセス・アルビドフラブス(Streptomyces albidoflavus)、ストレプトマイセス・グラミノファシエンス(Streptomyces graminofaciens)、ストレプトマイセス・グリセオビリディス(Streptomyces griseoviridis)、ストレプトマイセス・リモスス(Streptomyces rimosus)、ストレプトマイセス・スカビエイ(Streptomyces scabiei)、キサントモナス・トランスルセンス(Xanthomonas translucens)からなる群から選択される、請求項13記載の使用。
- 請求項14記載の真菌および細菌の全ての検出のための、請求項12記載の使用。
- 少なくとも1つの有益な微生物が植物成長促進性根圏細菌である、請求項12記載の使用。
- サンプルが芝草;土壌;自然肥料、特に動物の糞もしくは動物の糞尿のような動物由来の自然肥料、または葉、茎、根、種子、果実体もしくは花のような植物もしくは薬草に由来する自然肥料;種子または作物サンプルである、請求項12〜16のいずれか1項記載の使用。
- サンプルが芝草の根もしくは種子または芝草サンプルの葉である、請求項17記載の使用。
- 芝草が、フェスタセエ連(Festaceae)、アベネエ連(Aveneae)、トリチセエ連(Triticeae)、クロリデエ連(Chlorideae)、ゾイシエエ連(Zoysieae)、パニセエ(Paniceae)およびアンドロポゴネエ連(Andropogoneae)からなる群から選択される、請求項17または18記載の使用。
- a)病原体および/または有益な微生物のDNAを含む標準物からの、およびサンプルからのDNA単離;
b)PCRによる工程a)の単離DNAの増幅;
c)得られたPCR産物の、請求項11記載のマイクロアレイ・チップ上におけるハイブリダイゼーション;
d)結合DNAの検出;ならびに
e)サンプルが病原体および/または有益な微生物を含有するかどうかのそれからの推定
の工程を含む、有機サンプルにおける病原体および/または有益な微生物の検出方法。 - 検出されるべき病原体が細菌および/または真菌から選択される、請求項20記載の方法。
- 真菌および/または細菌が、アルミラリア・メレア(Armillaria mellea)、アスコキタ・フレイナ(Ascochyta phleina)、ビポラリス・ソロキニアナ(Bipolaris sorokiniana)、ブルメリア・グラミニス(Blumeria graminis)、セルコスポラ・ゼブリン(Cercospora zebrine)、クラビセプス・プルプレア(Claviceps purpurea)、コレトトリクム・トリフォリイ(Colletotrichum trifolii)、コルチシウム・フシフォルメ(Corticium fuciforme)、クルブラリア・アフィニス(Curvularia affinis)、ドレクスレラ・ジクチオイデス(Drechslera dictyoides)、ドレクスレラ・フレイ(Drechslera phlei)、ドレクスレラ・ポエ(Drechslera poae)、ドレクスレラ・シカンス(Drechslera siccans)、ドレクスレラ・トリチシ−レペンチス(Drechslera tritici−repentis)、エピクロエ・チフィナ(Epichloe typhina)、エクスセロヒルム・ツルシクム(Exserohilum turcicum)、フザリウム・クルモルム(Fusarium culmorum)、フザリウム・ポエ(Fusarium poae)、ゲウマンノマイセス・グラミニス(Gaeumannomyces graminis)、ギベレラ・インテルミディア(Gibberella intermedia)、グリオクラジウム・カテヌラツム(Gliocladium catenulatum)、グロメレラ・グラミニコラ(Glomerella graminicola)、カバチエラ・カウリボラ(Kabatiella caulivora)、レプトスフェリア・コルレ(Leptosphaeria korrae)、レプトスフェルリナ・アウストラリス(Leptosphaerulina australis)、マクロホミナ・ファセオリナ(Macrophomina phaseolina)、マグナポルテ・ポエ(Magnaporthe poae)、マラスミウス・オレアデス(Marasmius oreades)、ミクロドキウム・ボレイ(Microdochium bolleyi)、ミクロドキウム・ニバレ(Microdochium nivale)、ミクロスファエラ・トリフォリイ(Microsphaera trifolii)、ミロテシウム・ロリデゥム(Myrothecium roridum)、ネオチホジウム属種(Neotyphodium sp.)、オフィオスフェレラ・ヘルポトリチャ(Ophiosphaerella herpotricha)、オフィオスフェレラ・ナルマリ(Ophiosphaerella narmari)、ペロノスポラ・トリフォリオルム(Peronospora trifoliorum)、フィラコラ・ブルガタ(Phyllachora vulgata)、フィトフトラ・ブラッシケ(Phytophthora brassicae)、フィトフトラ・カクトルム(Phytophthora cactorum)、フィトフトラ・シトリコラ(Phytophthora citricola)、フィトフトラ・ドレクスレリ(Phytophthora drechsleri)、フィトフトラ・フラガリ(Phytophthora fragariae)、フィトフトラ・メガスペルマ(Phytophthora megasperma)、フィトフトラ・ニコチアネ(Phytophthora nicotianae)、シュードペジザ・メディカギニス(Pseudopeziza medicaginis)、プクキニア・コロナタ(Puccinia coronata)、プクキニア・コロナテ(Puccinia coronate)、プクキニア・グラミニス(Puccinia graminis)、プクキニア・ポエ−ネモラリス(Puccinia poae−nemoralis)、プクキニア・ポアルム(Puccinia poarum)、プクキニア・レコンディテ(Puccinia recondite)、プクキニア・ソルギ(Puccinia sorghi)、プクキニア・ストリイフォルミス(Puccinia striiformis)、プクキニア・トリチシナ(Puccinia triticina)、ピレノチェタ・リコペルシシ(Pyrenochaeta lycopersici)、ピチウム・アファニデルマツマ(Pythium aphanidermatuma)、ピチウム・デバリアヌム(Pythium debaryanum)、ピチウム・グラミニコラ(Pythium graminicola)、ピチウム・イレグラレ(Pythium irregulare)、ピチウム・マストホルム(Pythium mastophorum)、ピチウム・スルカツム(Pythium sulcatum)、ピチウム・ウルチムム(Pythium ultimum)、ラムラリア・コロ−シグニ(Ramularia collo−cygni)、リゾクトニア・セレアリス(Rhizoctonia cerealis)、リゾクトニア・フラガリエ(Rhizoctonia fragariae)、リンコスポリウム・オルトスポルム(Rhynchosporium orthosporum)、リンコスポリウム・セカリス(Rhynchosporium secalis)、スクレロチニア・ボレアリス(Sclerotinia borealis)、スクレロチニア・ホメオカルパ(Sclerotinia homoeocarpa)、スクレロチニア・スクレロチオルム(Sclerotinia sclerotiorum)、スクレロチニア・トリフォリオルム(Sclerotinia trifoliorum)、セプトリア・マクロポダ(Septoria macropoda)、セプトリア・トリチシ(Septoria tritici)、ステムフィリウム・サルシネフォルメ(Stemphylium sarcinaeforme)、タナテホルス・ククメリス(Thanatephorus cucumeris)、チエラビオプシス・バシコラ(Thielaviopsis basicola)、チエラビオプシス・ポプリ(Thielaviopsis populi)、チレチア・カリエス(Tilletia caries)、チレチア・コントロベルサ(Tilletia controversa)、トリコデルマ・ハマツム(Trichoderma hamatum)、チフラ・インカルナテ(Typhula incarnate)、チフラ・イシカリエンシス(Typhula ishikariensis)、チフラ・イシカリエンシス(Typhula ishikariensis)、ウロマイセス・ダクチリディス(Uromyces dactylidis)、ウロマイセス・トリフォリイ−レペンチス(Uromyces trifolii−repentis)、ウスチラゴ・メイディス(Ustilago maydis)、ウスチラゴ・ヌダ(Ustilago nuda)、ウスチラゴ・ストリイフォルミス(Ustilago striiformis)、ウスチラゴ・トリチシ(Ustilago tritici)、ベルチシリウム・ダーリエ(Verticillium dahliae);バチルス・アミロリクエファシエンス(Bacillus amyloliquefaciens)、シュードモナス・クロロラフィス(Pseudomonas chlororaphis)、セラチア・エントモフィラ(Serratia entomophila)、セラチア・プリムチカ(Serratia plymuthica)、ストレプトマイセス・アルビドフラブス(Streptomyces albidoflavus)、ストレプトマイセス・グラミノファシエンス(Streptomyces graminofaciens)、ストレプトマイセス・グリセオビリディス(Streptomyces griseoviridis)、ストレプトマイセス・リモスス(Streptomyces rimosus)、ストレプトマイセス・スカビエイ(Streptomyces scabiei)、キサントモナス・トランスルセンス(Xanthomonas translucens)からなる群から選択される、請求項21記載の方法。
- 工程b)において2つのPCRを行い、第1のPCRは真菌DNAに関するものであり、第2のPCRは細菌DNAに関するものである、請求項22記載の真菌および細菌の全ての検出のための請求項20記載の方法。
- 2つのPCRを単一の反応チューブ内に合体させる、請求項23記載の方法。
- 有益な微生物が植物成長促進性根圏細菌である、請求項20記載の方法。
- サンプルの使用の前に病原体の非存在に関してサンプルをスクリーニングするための、請求項20〜24のいずれか1項記載の方法。
- (i)以下の配列:配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100の核酸;
(ii)配列番号1、配列番号2、配列番号3、配列番号4、配列番号5、配列番号6、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号10、配列番号11、配列番号12、配列番号13、配列番号14、配列番号15、配列番号16、配列番号17、配列番号18、配列番号19、配列番号20、配列番号21、配列番号22、配列番号23、配列番号24、配列番号25、配列番号26、配列番号27、配列番号28、配列番号29、配列番号30、配列番号31、配列番号32、配列番号33、配列番号34、配列番号35、配列番号36、配列番号37、配列番号38、配列番号39、配列番号40、配列番号41、配列番号42、配列番号43、配列番号44、配列番号45、配列番号46、配列番号47、配列番号48、配列番号49、配列番号50、配列番号51、配列番号52、配列番号53、配列番号54、配列番号55、配列番号56、配列番号57、配列番号58、配列番号59、配列番号60、配列番号61、配列番号62、配列番号63、配列番号64、配列番号65、配列番号66、配列番号67、配列番号68、配列番号69、配列番号70、配列番号71、配列番号72、配列番号73、配列番号74、配列番号75、配列番号76、配列番号77、配列番号78、配列番号79、配列番号80、配列番号81、配列番号82、配列番号83、配列番号84、配列番号85、配列番号86、配列番号87、配列番号88、配列番号89、配列番号90、配列番号91、配列番号92、配列番号93、配列番号94、配列番号95、配列番号96、配列番号97、配列番号98、配列番号99および配列番号100に対して少なくとも80%の同一性を有する配列の核酸;または
(iii)(i)もしくは(ii)の相補的配列の核酸
を含む、有機サンプルにおける病原体および/または有益な微生物の検出のためのキット。 - a)罹患芝草が成長している土壌のサンプルまたは罹患芝草のサンプルにおける少なくとも1つの病原性真菌および/または細菌からの核酸の非存在または存在を、請求項1記載の核酸のセットを使用して、PCRとマイクロアレイ・チップとを組合せた方法により検出し、
b)1以上の病原性真菌および/または細菌からの核酸が工程a)において検出された場合には、核酸が検出された1以上の病原性真菌および/または細菌を標的とする1以上の抗真菌剤および/または抗細菌剤を選択し、
c)工程b)において選択された1以上の抗真菌剤および/または抗細菌剤を罹患芝草に適用する工程を含む、罹患芝草の治療方法。
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP13191823.7 | 2013-11-06 | ||
EP13191823.7A EP2871243B1 (en) | 2013-11-06 | 2013-11-06 | Nucleic acids and methods for detecting pathogens and beneficial microorganisms |
PCT/EP2014/073768 WO2015067635A2 (en) | 2013-11-06 | 2014-11-05 | Nucleic acids and methods for detecting pathogens and beneficial microorganisms |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2016534756A true JP2016534756A (ja) | 2016-11-10 |
JP6523312B2 JP6523312B2 (ja) | 2019-05-29 |
Family
ID=49517445
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2016551031A Expired - Fee Related JP6523312B2 (ja) | 2013-11-06 | 2014-11-05 | 病原体および有益な微生物を検出するための核酸および方法 |
Country Status (14)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US10415098B2 (ja) |
EP (2) | EP2871243B1 (ja) |
JP (1) | JP6523312B2 (ja) |
KR (1) | KR20160070166A (ja) |
CN (1) | CN105980577A (ja) |
AU (1) | AU2014345670A1 (ja) |
BR (1) | BR112016010159A2 (ja) |
CA (1) | CA2928659A1 (ja) |
CL (1) | CL2016001073A1 (ja) |
IL (1) | IL245495A0 (ja) |
MX (1) | MX2016005750A (ja) |
RU (1) | RU2016117429A (ja) |
SG (1) | SG11201603328XA (ja) |
WO (1) | WO2015067635A2 (ja) |
Families Citing this family (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN105886619B (zh) * | 2016-04-27 | 2017-10-27 | 四川仲测质量技术检测有限公司 | 一种用于对食品中的麦角菌进行鉴定的方法 |
CN107828906B (zh) * | 2017-10-16 | 2021-04-16 | 河南省农业科学院 | 一种检测玉蜀黍黑粉菌的方法及专用试剂盒 |
CN111684081A (zh) * | 2018-02-05 | 2020-09-18 | 先正达参股股份有限公司 | 用具有新颖引物组的lamp测定检测草坪草中真菌的方法 |
CN108893557A (zh) * | 2018-08-21 | 2018-11-27 | 山东农业大学 | 一种快速检测三种小麦根茎部病害的方法 |
CN109868329B (zh) * | 2019-04-09 | 2020-10-27 | 中国科学院微生物研究所 | 刺盘孢属特异性引物筛查检疫鉴定方法 |
CZ309500B6 (cs) * | 2021-01-05 | 2023-03-01 | Univerzita Palackého v Olomouci | Sada primerů, set a způsob detekce Microdochium bolleyi |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2008005760A (ja) * | 2006-06-29 | 2008-01-17 | National Institute Of Advanced Industrial & Technology | カビの検出方法、それに用いるマイクロアレイ及びカビ検出用キット |
WO2009147017A1 (en) * | 2008-06-02 | 2009-12-10 | Omya Development Ag | Nucleic acids and methods for detecting turfgrass pathogenic fungi |
US20110111970A1 (en) * | 2009-11-06 | 2011-05-12 | National Taiwan University | Microchip for identifying phellinus species and the method thereof |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6582908B2 (en) * | 1990-12-06 | 2003-06-24 | Affymetrix, Inc. | Oligonucleotides |
CN1251617A (zh) * | 1997-02-21 | 2000-04-26 | 伯斯坦恩实验室股份有限公司 | 基因测序仪和方法 |
PL2536850T3 (pl) * | 2010-02-15 | 2017-09-29 | Council Of Scientific & Industrial Research | Sposób wykrywania patogenów grzybiczych |
US9222125B2 (en) * | 2011-04-15 | 2015-12-29 | Rutgers, The State University Of New Jersey | Dimeric diagnostic arrays |
-
2013
- 2013-11-06 EP EP13191823.7A patent/EP2871243B1/en not_active Not-in-force
-
2014
- 2014-11-05 US US15/032,325 patent/US10415098B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2014-11-05 CN CN201480065471.9A patent/CN105980577A/zh active Pending
- 2014-11-05 BR BR112016010159A patent/BR112016010159A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2014-11-05 SG SG11201603328XA patent/SG11201603328XA/en unknown
- 2014-11-05 JP JP2016551031A patent/JP6523312B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2014-11-05 AU AU2014345670A patent/AU2014345670A1/en not_active Abandoned
- 2014-11-05 RU RU2016117429A patent/RU2016117429A/ru not_active Application Discontinuation
- 2014-11-05 MX MX2016005750A patent/MX2016005750A/es unknown
- 2014-11-05 EP EP14793170.3A patent/EP3066211A2/en not_active Withdrawn
- 2014-11-05 WO PCT/EP2014/073768 patent/WO2015067635A2/en active Application Filing
- 2014-11-05 CA CA2928659A patent/CA2928659A1/en not_active Abandoned
- 2014-11-05 KR KR1020167014988A patent/KR20160070166A/ko not_active Application Discontinuation
-
2016
- 2016-05-05 CL CL2016001073A patent/CL2016001073A1/es unknown
- 2016-05-05 IL IL245495A patent/IL245495A0/en unknown
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2008005760A (ja) * | 2006-06-29 | 2008-01-17 | National Institute Of Advanced Industrial & Technology | カビの検出方法、それに用いるマイクロアレイ及びカビ検出用キット |
WO2009147017A1 (en) * | 2008-06-02 | 2009-12-10 | Omya Development Ag | Nucleic acids and methods for detecting turfgrass pathogenic fungi |
US20110111970A1 (en) * | 2009-11-06 | 2011-05-12 | National Taiwan University | Microchip for identifying phellinus species and the method thereof |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
"Development of species-specific PCR primers on rDNA for the identification of European Armillaria sp", FOR. PATH., vol. vol. 33, JPN6018036894, 2003, pages p. 287-297 * |
PLANT DISEASE, vol. vol. 95, JPN6018036893, 2011, pages p. 1547-1557 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
IL245495A0 (en) | 2016-06-30 |
EP2871243B1 (en) | 2018-03-21 |
MX2016005750A (es) | 2016-08-19 |
CA2928659A1 (en) | 2015-05-14 |
CN105980577A (zh) | 2016-09-28 |
CL2016001073A1 (es) | 2016-12-09 |
RU2016117429A (ru) | 2017-12-11 |
RU2016117429A3 (ja) | 2018-06-26 |
JP6523312B2 (ja) | 2019-05-29 |
US20160258000A1 (en) | 2016-09-08 |
EP3066211A2 (en) | 2016-09-14 |
EP2871243A1 (en) | 2015-05-13 |
WO2015067635A3 (en) | 2015-06-25 |
SG11201603328XA (en) | 2016-05-30 |
WO2015067635A2 (en) | 2015-05-14 |
BR112016010159A2 (pt) | 2017-12-05 |
US10415098B2 (en) | 2019-09-17 |
KR20160070166A (ko) | 2016-06-17 |
AU2014345670A1 (en) | 2016-05-12 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Hariharan et al. | Recent advances in molecular diagnostics of fungal plant pathogens: a mini review | |
JP6523312B2 (ja) | 病原体および有益な微生物を検出するための核酸および方法 | |
JP2010537650A (ja) | 細菌及び真菌の検出方法 | |
Babu et al. | Quantitative real-time PCR assay for rapid detection of plant and human pathogenic Macrophomina phaseolina from field and environmental samples | |
Grudlewska-Buda et al. | Comparison of the intensity of biofilm formation by Listeria monocytogenes using classical culture-based method and digital droplet PCR | |
Achari et al. | Diagnosis of Fusarium oxysporum f. sp. ciceris causing Fusarium wilt of chickpea using loop-mediated isothermal amplification (LAMP) and conventional end-point PCR | |
Lievens et al. | From extensive clone libraries to comprehensive DNA arrays for the efficient and simultaneous detection and identification of orchid mycorrhizal fungi | |
Bonants et al. | A real-time TaqMan PCR assay to discriminate between pathotype 1 (D1) and non-pathotype 1 (D1) isolates of Synchytrium endobioticum | |
CA2726699A1 (en) | Nucleic acids and methods for detecting turfgrass pathogenic fungi | |
Lee et al. | Identification and characterization of simple sequence repeat markers for Pythium aphanidermatum, P. cryptoirregulare, and P. irregulare and the potential use in Pythium population genetics | |
Anthony et al. | Direct detection of Staphylococcus aureus mRNA using a flow through microarray | |
Lau et al. | Molecular inversion probe: a new tool for highly specific detection of plant pathogens | |
US10883145B2 (en) | Compositions and methods for metagenome biomarker detection | |
Mesapogu et al. | Rapid detection and quantification of Fusarium udum in soil and plant samples using real-time PCR | |
Kushida et al. | Development of a simple method for simultaneous detection and differentiation of Globodera pallida and G. rostochiensis | |
Zimmerman et al. | Development of a simple, low-density array to detect methicillin-resistant Staphylococcus aureus and mecA dropouts in nasal swabs | |
Yadav et al. | Real-time polymerase chain reaction (PCR) based identification and detection of fungi belongs to genus Fusarium | |
Jayalakshmi et al. | Detection and Diagnosis of Important Soil-Borne Pathogens | |
Yadav et al. | Real-time PCR assay based on topoisomerase-II gene for detection of Fusarium udum | |
Singh et al. | Molecular techniques | |
JP6873903B2 (ja) | 強毒型クロストリジウムディフィシル株の存在を検出するための方法 | |
JP7390736B2 (ja) | 腐蛆病菌の同時検出方法及びプライマーキット | |
JP7248329B2 (ja) | タマネギべと病発病リスクの判定方法 | |
KR102110906B1 (ko) | 배추과 작물의 검은썩음병균 race 1을 판별할 수 있는 특이적 분자마커 및 이를 이용한 검은썩음병균 race 1 판별방법 | |
KR102110907B1 (ko) | 배추과 작물의 검은썩음병균 race 4를 판별할 수 있는 특이적 분자마커 및 이를 이용한 검은썩음병균 race 4 판별방법 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20171005 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20180925 |
|
A601 | Written request for extension of time |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601 Effective date: 20181221 |
|
A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20190222 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20190409 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20190425 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6523312 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |