JP2016518816A - うつに罹っている対象のための治療レジメンを選択するためのアッセイ及び方法 - Google Patents

うつに罹っている対象のための治療レジメンを選択するためのアッセイ及び方法 Download PDF

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Abstract

本発明は、一塩基多型（ＳＮＰ）の特異的な組合せが、葉酸含有化合物に対する治療応答に関連するという認識に基づいて、うつである若しくはうつの危険性がある患者のための治療レジメンを選択するため及び／又は対象の少なくとも１種のうつ症状を治療するための、アッセイ、方法及び化合物を提供する。本明細書にまた提供するのは、治療応答を予測するＳＮＰの特異的な組合せを対象が保有する場合、葉酸含有化合物の補助療法を対象に施すことによって、うつに罹っている又はうつの危険性がある対象に投与した抗うつ薬の有効性を改善するための方法である。さらに、本明細書に提供するのは、葉酸含有化合物の組成物である。【選択図】図１Ａ

Description

関連出願の相互参照
[0001]本願は、２０１３年３月１２日に出願された米国特許出願第１３／７９６，３６２号、２０１３年３月１２日に出願された米国特許仮出願第６１／７７７，６５０号及び２０１３年１２月１０日に出願された米国特許仮出願第６１／９１４，３３８号の優先権を請求するものであり、これらの開示は、全ての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれている。
［「配列表」、表又はアスキーテキストファイルとして提出された添付物を列挙したコンピュータプログラムの参照］
[0001]２０１４年３月１１日に作成された３７，５０９バイトであり、マシンフォーマットがＩＢＭ−ＰＣのＭＳ−ＷｉｎｄｏｗｓオペレーティングシステムであるファイルＳＥＱ＿ＬＩＳＴＩＮＧ＿９５７６８−９０２１６５．ＴＸＴに書き込まれた配列表は、その全体が全ての目的のために参照により本明細書に組み込まれている。
発明の背景
[0002]近年の推計では、１８歳を超える１９００万人超のアメリカ人が毎年抑うつ病に罹患することが示されている。葉酸の欠乏状態とうつとの間には関係があると一般に考えられている。
[0003]中枢神経系機能における葉酸の役割は、神経活性化物質の合成に関与する広範な反応のための主要なメチル供給体であるＳＡＭｅを供給する一炭素循環、膜リン脂質の形成及び核酸の代謝における葉酸の役割を含めて研究されている。証拠は、葉酸がうつに作用し得ることを示唆している。非経口形態及びある特定の経口形態で投与した場合、欧州の研究では、ＳＡＭがプラセボよりも高く、三環系の抗うつ剤に匹敵する抗うつの効能を有することが報告されている。葉酸は、うつの発病に役割を果たすと仮定されている神経伝達物質であるドーパミン、ノルエピネフリン及びセロトニンの生合成の律速段階である、フェニルアラニン及びトリプトファンの水酸化の補因子であるテトラヒドロビオプテリンの合成速度に影響を及ぼすとも思われる。また、メチルテトラヒドロ葉酸（ＭＴＨＦ）は、シナプス前グルタミン酸受容体に結合することが示されており、この結合では、ＭＴＨＦは、モノアミンを含む他の神経伝達物質の放出を調節する可能性があり得る。葉酸の欠乏によって引き起こされるホモシステインレベルの上昇は、メチル化反応を広く阻害するＳ−アデノシル−ホモシステイン（ＳＡＨ）のレベルの上昇を生じることと、またおそらくはＮ−メチルアスパラギン酸グルタミン酸受容体での活性を介した直接的な興奮毒性効果を発揮することとの両方によって、その精神神経性の合併症の一部を媒介する上で役割を果たし得る。
[0004]感情鈍麻、疲労、不眠、易怒性及び集中力障害を含む精神神経性症状及びうつ症状は、吸収不良、抗けいれん剤で治療されているてんかん、巨赤芽球性貧血及び食事性葉酸の制限と関連する、葉酸の欠乏状態に関する臨床記述で議論されている。以前の研究では、精神科コホートのうち１／３もの主にイギリス出身の患者が、低値の血清葉酸値又はその欠乏を示すことが報告されており、このことは、組織の葉酸貯蔵をさらに正確に反映する赤血球（ＲＢＣ）葉酸を評価した数少ない研究での知見と、概ね類似する。うつ患者を精神科又は非精神科の対照対象と比較した一部の研究では、うつ患者では、血清葉酸、ＲＢＣの葉酸［２１］又は血清メチルテトラヒドロ葉酸（ＭＴＨＦ）レベルが、同様に葉酸の低い傾向があるアルコール中毒患者を除いて、他の全ての群のレベルよりも低いことが報告されている。さらに、血清又はＲＢＣの葉酸及び血清ＭＴＨＦが低いことは、多くの場合、うつ患者のうち症状のより高い重症度に関連する。
[0005]過去１０年に、うつ治療は大きく前進した一方で、抗うつ剤を摂取するうつに罹っている２９％〜４６％もの患者は、その治療に対し、依然として部分的又は全体的に抵抗性がある。また、治療抵抗性のうつに悩む者は、ほとんど選択肢がない。抗うつ薬を受けているおよそ５０％のＭＤＤ患者が、無応答であるか部分的に応答する。残りの症状の存在は、再発、うつのエピソードがより慢性化、及びエピソード間がより短期化する、高い危険性にも関連する。治療のためのガイドラインでは、無応答又は部分応答を管理するために、抗うつ薬の用量を増すこと、薬物を異なる抗うつ薬に置き換えること、抗うつ療法に非抗うつ剤を補うこと又は最初の抗うつ剤に第２の抗うつ剤を組み合わせることを含む、４通りの考えられる戦略を推奨している。あらゆる治療レジメンが各個体に効果があるわけではないことから、うつに罹っている対象のために適切で効果のある治療レジメンを選択することを容易にし得る予測マーカーを特定することが、強く必要とされている。
[0006]大うつ病性障害などのうつに罹っている患者のかなりの部分が、従来の抗うつ薬、例えば選択的セロトニン再取り込み阻害剤に対して、部分的にのみ応答を示すか全く応答を示さない。そのため、効果のある抗うつ療法を開発すること及び／又はうつに罹っている患者を、適切な抗うつ療法を受けることができるように階層化することが、強く必要とされている。本明細書に記載した様々な実施形態の態様は、うつ、例えば大うつ病性障害の治療のために、単独療法として又は抗うつ薬の補助剤として葉酸含有化合物を使用することに対する、効能応答に関連する一塩基多型（ＳＮＰ）、末梢のバイオマーカー（ｐｅｒｉｐｈｅｒａｌ ｂｉｏｍａｒｋｅｒｓ）及び／又は臨床的特徴を見出したことに端を発する。一部の実施形態では、発明者らは、本明細書に記載したこれらのマーカー又は状態を使用して、治療抵抗性うつ（ＴＲＤ）、例えば少なくとも１種の選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）に抵抗性のあるうつに罹った対象のために、さらに効果のある治療を選択することもできることも示している。
[0007]特に、葉酸含有化合物を含む治療レジメンに適した患者（例えば大うつ病性障害及び／又はＴＲＤに罹っている）を標示することのできる、１種の又は組合せのバイオマーカーとしては、以下のｒｓ番号：メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）に存在するｒｓ１８０１１３３、ＭＴＨＦＲに存在するｒｓ２２７４９７６、メチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）に存在するｒｓ１８０５０８７、メチオニンシンターゼレダクターゼ（ＭＴＲＲ）に存在するｒｓ１８０１３９４、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）に存在するｒｓ１００６７３７、ＤＮＡ（シトシン−５）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）に存在するｒｓ１８８３７２９、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１フィードバック調節タンパク質（ＧＣＨＦＲ）に存在するｒｓ７１６３８６２、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ２）に存在するｒｓ１２６５９、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原）１（ＦＯＬＨ１）に存在するｒｓ２０２６７６、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）に存在するｒｓ２２９７２９１、還元葉酸担体タンパク質１（ＲＦＣ１）に存在するｒｓ１０５１２６６、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）に存在するｒｓ８００７２６７、コリンリン酸シチジリルトランスフェラーゼＡ（ＰＣＹＴ１Ａ）に存在するｒｓ７６３９７５２、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）に存在するｒｓ６２７５、ＤＲＤ２に存在するｒｓ１０７９５９６、ＤＲＤ２に存在するｒｓ１１２４０５９４、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）に存在するｒｓ４６３３、ＣＯＭＴに存在するｒｓ４６８０、ドーパミン活性輸送体（ＤＡＴ若しくはＳＬＣ６Ａ３）に存在するｒｓ２５０６８２、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＦＴＣＤ）に存在するｒｓ２２７７８２０、メチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋依存性）１（ＭＴＨＦＤ１）に存在するｒｓ２２３６２２５及びそれらの任意の組合せ、並びに／又はｓ−アデノシルメチオニン（ＳＡＭ）、ｓ−アデノシルホモシステイン（ＳＡＨ）、４−ヒドロキシノネナール（４−ＨＮＥ）、高感度Ｃ−反応性タンパク質（ｈｓＣＲＰ）及びそれらの任意の組合せのうち少なくとも１種の発現、によって特定される、少なくとも１種又は複数のＳＮＰが挙げられるが、これらに限定されない。追加的に又は代替的に、ヒト対象が肥満であるか否かを（例えばＢＭＩ値の測定によって）決定することも、うつに罹っている又はうつの危険性がある患者のために適切な治療レジメン（例えば葉酸含有化合物を含むか否か）を選択するためのバイオマーカーとして使用することができる。本明細書に開示したそのようなバイオマーカーの任意の個々又は組合せを、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを受けるためのうつである又はうつの危険性があると診断されている患者を特定するために、使用することができる。一部の実施形態では、葉酸含有化合物は、本明細書に記載した少なくとも１種又は複数のバイオマーカーを保有することについて選択された対象において、うつ（例えば大うつ病性障害）の治療のために、抗うつ薬の非存在下で使用することができる。代わりの実施形態では、葉酸含有化合物は、本明細書に記載した少なくとも１種又は複数のバイオマーカーを保有することについて選択された対象において、うつ（例えば大うつ病性障害）の治療のために、単独で又は抗うつ薬と（例えば補助剤として）併用して使用することができる。一実施形態では、抗うつ薬としては、選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）を挙げることができる。ＳＳＲＩの例としては、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの任意の組合せが挙げられるが、これらに限定されない。
[0008]したがって、本明細書に提供するのは、うつに罹っている若しくはうつの危険性がある対象のための治療レジメンを選択するため、うつに罹っている若しくはうつの危険性がある対象に治療するため、及び／又はうつに罹っている若しくはうつの危険性がある対象に対し推奨された若しくは投与された治療レジメンの有効性を改善するための、アッセイ、方法、系及びキットに関する。本明細書に提供するのは、本明細書に記載したバイオマーカー又は状態のうち少なくとも１種（例えば少なくとも２種以上）又はその任意の組合せを保有することが選択された対象（例えばヒト対象）におけるうつの治療に使用するための、葉酸含有化合物にも関する。
[0009]一態様では、本明細書に提供するのは、ヒト対象における少なくとも１種のうつ症状を治療するための方法である。方法は、うつである又はうつの危険性があると診断されており、以下のバイオマーカー：
ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の１７９３位又は配列番号８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７４９７６によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号８が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｖ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号３の６６位又は配列番号１０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１３９４によって特定される）であり、配列番号３及び配列番号１０が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼレダクターゼ（ＭＴＲＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１００６７３７によって特定される）であり、配列番号１１が、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８８３７２９によって特定される）であり、配列番号１２が、ＤＮＡ（シトシン−５）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７１６３８６２によって特定される）であり、配列番号１３が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１フィードバック調節タンパク質（ＧＣＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉｉｉ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１２６５９によって特定される）であり、配列番号１４が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｘ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２０２６７６によって特定される）であり、配列番号１５が、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原）１（ＦＯＬＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２９７２９１によって特定される）であり、配列番号１６が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０５１２６６によって特定される）であり、配列番号１７が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）であり、配列番号１８が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７６３９７５２によって特定される）であり、配列番号１９が、コリンリン酸シチジリルトランスフェラーゼＡ（ＰＣＹＴ１Ａ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｖ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ６２７５によって特定される）であり、配列番号２０が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０７９５９６によって特定される）であり、配列番号２１が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１１２４０５９４によって特定される）であり、配列番号２２が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉｉ．２つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６３３によって特定される）であり、配列番号２３が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉｉｉ．２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｘ．少なくとも１つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２５０６８２によって特定される）であり、配列番号２５が、溶質担体ファミリー６（神経伝達性輸送ドーパミン）メンバー３（ＳＬＣ６Ａ３）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｘ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７７８２０によって特定される）であり、配列番号２６が、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＦＴＣＤ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｘｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２３６２２５によって特定される）であり、配列番号２７が、メチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋依存性）１（ＭＴＨＦＤ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｘｉｉ．肥満、
ｘｘｉｉｉ．所定の基準比よりも小さな、ＳＡＭとＳＡＨとの発現比、
ｘｘｉｖ．第１の所定の基準値よりも大きな、４−ＨＮＥの発現、及び
ｘｘｖ．第２の所定の基準値よりも大きな、ｈｓＣＲＰの発現
のうち少なくとも２種の組合せを保有することがさらに決定しているヒト対象に、上記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せが、葉酸含有化合物に対する陽性症状を低減する応答に関連するという認識に基づいて、有効量の葉酸含有化合物を含む組成物を投与するステップを含む。
[0010]一部の実施形態では、上記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せは、以下：
ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰと、
ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰと
を含む。
[0011]一部の実施形態では、上記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せは、本明細書に記載したバイオマーカー（ｉｉｉ）〜（ｘｘｖ）のうち少なくとも１種をさらに含む。他の実施形態では、肥満は以下の肥満指標：
ａ．３０ｋｇ／ｍ２を超えるＢＭＩ値、
ｂ．男性で４０インチを超える（若しくは１２０ｃｍを超える）、又は女性で３５インチを超える（若しくは８８ｃｍを超える）胴囲、
ｃ．男性で０．９５を上回る、又は女性で０．８０を上回る胴−臀部比、及び
ｄ．男性で少なくとも約２５％、又は女性で少なくとも約３２％の体脂肪率
のうち少なくとも１種によって特徴付けられる。
[0012]一部の実施形態では、方法は、上記少なくとも２種のバイオマーカーの存在を決定するために、対象から得た生体試料をアッセイするステップをさらに含む。
[0013]一部の実施形態では、生体試料は、血液試料、尿試料、口腔試料、唾液試料又は脳脊髄液試料から選択される試料を含む。
[0014]一部の実施形態では、アッセイするステップは、ＳＮＰのいずれか１つに隣接する少なくとも１組のプライマーを用いて生体試料を増幅するサブステップを含む。一部の例では、少なくとも２つのＳＮＰを増幅する少なくとも２組のプライマーは多重増幅アッセイに使用される。他の実施形態では、アッセイするステップは、ガスクロマトグラフィ、質量分析、高速液体クロマトグラフィ、核磁気共鳴（ＮＭＲ）スペクトル分析、酵素共役アッセイ又はそれらの任意の組合せを用いて、生体試料においてＳＡＭ、ＳＡＨ、４−ＨＮＥ、ｈｓＣＲＰ又はそれらの任意の組合せを分離及び／又はその存在を検出するサブステップを含む。
[0015]一部の実施形態では、ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比は、健常な対象の生体試料で測定した場合のＳＡＭ／ＳＡＨの対照比である。一部の実施形態では、健常な対象の血清試料で測定した場合のＳＡＭ／ＳＡＨの対照比は、約４〜約１２の範囲にある。ある特定の実施形態では、ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比は、血漿試料で測定した場合に約３．０である。一部の実施形態では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、健常な対象の生体試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値である。一部の実施形態では、健常な対象の血清試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値は、血清１リットル当たり約０．２４μｍｏｌ（又は血清１リットル当たり約０．０４ｍｇ）である。他の実施形態では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、血漿試料で測定した場合に血漿１リットル当たり約３ｍｇである。一部の実施形態では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、健常な対象の生体試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値である。他の実施形態では、健常な対象の血清試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値は、血清１リットル当たり約０．５ｍｇ〜血清１リットル当たり約４．５ｍｇの範囲にある。一部の実施形態では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、血漿試料で測定した場合に血漿１リットル当たり約２．３ｍｇである。
[0016]一部の実施形態では、方法は、対象の体測値を決定するステップをさらに含む。一部の例では、体側値は、体重、身長、胴囲、臀囲、体脂肪率又はそれらの任意の組合せを含む。
[0017]一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約７．５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である。
[0018]一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は毎日単回用量として投与される。他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は１日当たり１を超える分割用量で投与される。
[0019]一部の実施形態では、投与は経口である。
[0020]一部の実施形態では、組成物は、投与すると少なくとも約３〜６時間にわたって葉酸含有化合物の少なくとも一部分を放出するように製剤化されている。一部の例では、放出は定常放出である。
[0021]一部の実施形態では、方法は、対象に抗うつ薬を投与するステップをさらに含む。一部の例では、葉酸含有化合物と併用する抗うつ薬の投与は、抗うつ薬の有効性を増大させる。一部の実施形態では、抗うつ薬は選択的セロトニン再取り込み阻害剤を含む。一部の例では、選択的セロトニン再取り込み阻害剤は、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの任意の組合せからなる群から選択される。
[0022]一部の実施形態では、葉酸含有化合物を含み、任意選択で抗うつ薬と併用して投与する治療を、対象のためにさらに選択する方法。
[0023]一部の実施形態では、うつは大うつ病性障害である。
[0024]一部の実施形態では、うつであると診断されている対象は少なくとも１種の抗うつ単独療法に抵抗性である。一部の実施形態では、対象は成人対象である。
[0025]一部の実施形態では、少なくとも１種のうつ症状は、落ち込み若しくは抑うつ気分、快感消失、低いエネルギーレベル、罪悪感、作業量及び関心の減少、精神運動遅滞、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な身体症状、認知の低下又はそれらの任意の組合せから選択される。
[0026]別の態様では、本明細書に提供するのは、ヒト対象に投与した抗うつ薬の有効性を改善する方法である。方法は、うつであることが診断されており、以下のバイオマーカー：
ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の１７９３位又は配列番号８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７４９７６によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号８が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｖ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号３の６６位又は配列番号１０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１３９４によって特定される）であり、配列番号３及び配列番号１０が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼレダクターゼ（ＭＴＲＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１００６７３７によって特定される）であり、配列番号１１が、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８８３７２９によって特定される）であり、配列番号１２が、ＤＮＡ（シトシン−５）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７１６３８６２によって特定される）であり、配列番号１３が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１フィードバック調節タンパク質（ＧＣＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉｉｉ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１２６５９によって特定される）であり、配列番号１４が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｘ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２０２６７６によって特定される）であり、配列番号１５が、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原）１（ＦＯＬＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２９７２９１によって特定される）であり、配列番号１６が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０５１２６６によって特定される）であり、配列番号１７が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）であり、配列番号１８が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７６３９７５２によって特定される）であり、配列番号１９が、コリンリン酸シチジリルトランスフェラーゼＡ（ＰＣＹＴ１Ａ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｖ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ６２７５によって特定される）であり、配列番号２０が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０７９５９６によって特定される）であり、配列番号２１が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１１２４０５９４によって特定される）であり、配列番号２２が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉｉ．２つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６３３によって特定される）であり、配列番号２３が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉｉｉ．２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｘ．少なくとも１つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２５０６８２によって特定される）であり、配列番号２５が、溶質担体ファミリー６（神経伝達性輸送ドーパミン）メンバー３（ＳＬＣ６Ａ３）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｘ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７７８２０によって特定される）であり、配列番号２６が、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＦＴＣＤ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｘｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２３６２２５によって特定される）であり、配列番号２７が、メチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋依存性）１（ＭＴＨＦＤ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｘｉｉ．肥満、
ｘｘｉｉｉ．所定の基準比よりも小さな、ＳＡＭとＳＡＨとの発現比、
ｘｘｉｖ．第１の所定の基準値よりも大きな、４−ＨＮＥの発現、及び
ｘｘｖ．第２の所定の基準値よりも大きな、ｈｓＣＲＰの発現
のうち少なくとも２種の組合せを保有することがさらに決定しているヒト対象に、上記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せが、葉酸含有化合物と併用して投与した場合に抗うつ薬の有効性を増大させることに関連するという認識に基づいて、抗うつ薬と併用して有効量の葉酸含有化合物を含む組成物を投与するステップを含む。
[0027]一部の実施形態では、上記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せは、以下：
ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰと、
ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰと
を含む。
[0028]一部の実施形態では、上記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せは、本明細書に記載したバイオマーカー（ｉｉｉ）〜（ｘｘｖ）のうち少なくとも１種をさらに含む。
[0029]一部の実施形態では、肥満は以下の肥満指標：
ａ）３０ｋｇ／ｍ２を超えるＢＭＩ値、
ｂ）男性で４０インチを超える（若しくは１２０ｃｍを超える）、又は女性で３５インチを超える（若しくは８８ｃｍを超える）胴囲、
ｃ）男性で０．９５を上回る、又は女性で０．８０を上回る胴−臀部比、及び
ｄ）男性で少なくとも約２５％、又は女性で少なくとも約３２％の体脂肪率
のうち少なくとも１種によって特徴付けられる。
[0030]一部の実施形態では、方法は、上記少なくとも２種のバイオマーカーの存在を決定するために、対象から得た生体試料をアッセイするステップをさらに含む。
[0031]一部の実施形態では、生体試料は、血液試料、尿試料、口腔試料、唾液試料又は脳脊髄液試料から選択される試料を含む。
[0032]一部の実施形態では、アッセイするステップは、ＳＮＰのいずれか１つに隣接する少なくとも１組のプライマーを用いて生体試料を増幅するサブステップを含む。一部の実施形態では、少なくとも２つのＳＮＰを増幅する少なくとも２組のプライマーは多重増幅アッセイに使用される。他の実施形態では、アッセイするステップは、ガスクロマトグラフィ、質量分析、高速液体クロマトグラフィ、核磁気共鳴（ＮＭＲ）スペクトル分析、酵素共役アッセイ又はそれらの任意の組合せを用いて、生体試料においてＳＡＭ、ＳＡＨ、４−ＨＮＥ、ｈｓＣＲＰ又はそれらの任意の組合せを分離及び／又はその存在を検出するサブステップを含む。
[0033]一部の実施形態では、ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比は、健常な対象の生体試料で測定した場合のＳＡＭ／ＳＡＨの対照比である。一部の例では、健常な対象の血清試料で測定した場合のＳＡＭ／ＳＡＨの対照比は、約４〜約１２の範囲にある。一部の実施形態では、ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比は、血漿試料で測定した場合に約３．０である。
[0034]一部の実施形態では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、健常な対象の生体試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値である。一部の例では、健常な対象の血清試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値は、血清１リットル当たり約０．２４μｍｏｌ（又は血清１リットル当たり約０．０４ｍｇ）である。他の実施形態では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、血漿試料で測定した場合に血漿１リットル当たり約３ｍｇである。
[0035]一部の実施形態では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、健常な対象の生体試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値である。一部の例では、健常な対象の血清試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値は、血清１リットル当たり約０．５ｍｇ〜血清１リットル当たり約４．５ｍｇの範囲にある。一部の実施形態では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、血漿試料で測定した場合に血漿１リットル当たり約２．３ｍｇである。
[0036]一部の実施形態では、方法は対象の体測値を決定するステップを含む。一部の例では、体側値は、体重、身長、胴囲、臀囲、体脂肪率又はそれらの任意の組合せを含む。
[0037]一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約７．５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である。一部の例では、葉酸含有化合物の有効量は毎日単回用量として投与される。他の例では、葉酸含有化合物の有効量は１日当たり１を超える分割用量で投与される。一部の実施形態では、投与は経口である。
[0038]一部の実施形態では、組成物は、投与すると少なくとも約３〜６時間にわたって葉酸含有化合物の少なくとも一部分を放出するように製剤化されている。一部の例では、放出は定常放出である。
[0039]一部の実施形態では、抗うつ薬は、選択的セロトニン再取り込み阻害剤を含む。一部の例では、選択的セロトニン再取り込み阻害剤は、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの任意の組合せからなる群から選択される。
[0040]一部の実施形態では、方法は、葉酸含有化合物を含み、抗うつ薬と併用して投与する治療を、対象のために選択するステップをさらに含む。
[0041]一部の実施形態では、うつは大うつ病性障害である。
[0042]一部の実施形態では、うつであると診断されている対象は少なくとも１種の抗うつ単独療法に抵抗性である。一部の実施形態では、対象は成人対象である。
[0043]一部の実施形態では、ヒト対象に投与した抗うつ薬の有効性を改善する方法の結果、落ち込み若しくは抑うつ気分、快感消失、低いエネルギーレベル、罪悪感、作業量及び関心の減少、精神運動遅滞、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な身体症状、認知の低下又はそれらの任意の組合せから選択される少なくとも１種のうつ症状の改善を生じる。
[0044]別の態様では、本明細書に提供するのは、対象の少なくとも１種のうつ症状を治療する方法であって、うつである又はうつの危険性があることが診断されており、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰを保有することがさらに決定している対象に、（１つ又は複数の）ＳＮＰ対立遺伝子の存在が、葉酸含有化合物に対する陽性症状を低減する応答に関連するという認識に基づいて、有効量の葉酸含有化合物を含む組成物を投与するステップを含む、方法である。
[0045]さらに別の態様では、本明細書に提供するのは、うつであると診断されている対象のための治療レジメンを選択するための方法である。方法は、
以下のＳＮＰ：
（ｉ）少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
（ｉｉ）２つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６３３によって特定される）であり、配列番号２３が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、又は
（ｉｉｉ）２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰのうち１種の存在について対象由来の被験試料をアッセイするステップと、
対象が、ＭＴＲ、ＣＯＭＴ（ｒｓ４６３３）及びＣＯＭＴ（ｒｓ４６８０）のＳＮＰバイオマーカーのうち１種を保有することが決定している場合、葉酸含有化合物を任意選択で（任意選択で抗うつ薬と併用して）対象に投与するステップと
を含む。
[0046]別の態様では、本明細書で提供するのは、うつである又はうつの危険性があると診断されているヒト対象のために、治療レジメンを選択するためのアッセイである。アッセイは、
（ａ）メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）、メチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）及びそれらの組合せの群から選択される少なくとも２つの遺伝子バイオマーカーの遺伝子型を決定するために対象由来の試料を分析するステップと、
（ｂ）少なくとも２つの遺伝子バイオマーカーのそれぞれにおいて一塩基多型（ＳＮＰ）の存在又は非存在について遺伝子型判定するステップによって検出するステップであり、ＳＮＰの存在が以下：
（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｉ）ＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｖ）ＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ
のように示される、ステップと、
（ｃ）ＳＮＰの存在に基づいて葉酸含有化合物の有効量を含む治療レジメンを選択するステップと
を含む。
[0047]一部の実施形態では、アッセイは、治療レジメンを施すステップをさらに含む。
[0048]一部の実施形態では、少なくとも２つの遺伝子バイオマーカーはＭＴＨＦＲ及びＭＴＲの対である。他の実施形態では、少なくとも２つの遺伝子バイオマーカーはＧＣＨ１及びＣＯＭＴの対である。
[0049]一部の実施形態では、ステップ（ａ）は肥満、ＳＡＭ／ＳＡＨ比、４−ＨＮＥのレベル、ｈｓＣＲＰのレベル及びそれらの組合せからなる群から選択される少なくとも１つの追加的状態を決定するサブステップをさらに含む。
[0050]一部の実施形態では、ステップ（ｂ）は以下の状態：
（ｉ）所定の基準比よりも小さな、ＳＡＭとＳＡＨとの発現レベル比、
（ｉｉ）第１の所定の基準値よりも大きな、４−ＨＮＥの発現レベル、及び
（ｉｉｉ）第２の所定の基準値よりも大きな、ｈｓＣＲＰの発現レベル
の少なくとも１つを検出するサブステップをさらに含む。
[0051]一部の例では、以下の状態のいずれかが対象に存在する場合、肥満が決定する：３０ｋｇ／ｍ２以上のＢＭＩ値、男性で４０インチを超える若しくは女性で３５インチを超える胴囲、男性で約０．９５である若しくは女性で０．８０を上回る胴−臀部比、又は男性で少なくとも約２５％若しくは女性で少なくとも約３２％の体脂肪率。
[0052]一部の例では、ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比は、健常な対象由来の血清試料で測定した場合、約４〜約１２である。他の例では、ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比は、健常な対象由来の血漿試料で測定した場合、約３．０である。
[0053]一部の例では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、健常な対象の血清試料で測定した場合、１リットル当たり約０．２４μｍｏｌ又は１リットル当たり約０．０４ｍｇである。他の例では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、健常な対象の血漿試料で測定した場合、１リットル当たり約３．０ｍｇである。
[0054]一部の例では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、健常な対象の血清試料で測定した場合、１リットル当たり約０．５ｍｇ〜１リットル当たり約４．５ｍｇである。他の例では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、健常な対象の血漿試料で測定した場合、１リットル当たり約２．３ｍｇである。
[0055]一部の実施形態では、試料は、血液試料、血清試料、血漿試料、尿試料、口腔試料及び唾液試料の群から選択される。
[0056]一部の実施形態では、うつは大うつ病性障害である。
[0057]アッセイの一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約１５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である。他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約２０ｍｇ／日である。さらに他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約４０ｍｇ／日である。一部の例では、葉酸含有化合物は約２０ｍｇ用量で１日当たり２回投与される。
[0058]一部の実施形態では、治療レジメンは抗うつ薬をさらに含む。一部の例では、抗うつ薬は選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）である。一部の実施形態では、選択的セロトニン再取り込み阻害剤はフルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン又はそれらの組合せからなる群から選択される。
[0059]一部の実施形態では、対象は抗うつ単独療法への不十分な応答又は抵抗性を有する。
[0060]一部の実施形態では、ＳＮＰの存在又は非存在を検出するステップは、ハイブリダイゼーションアッセイ、増幅アッセイ、プライマー伸長アッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、シークエンシングアッセイ又はそれらの組合せを含む。
[0061]一部の実施形態では、状態を検出するステップは、免疫アッセイ、免疫組織化学（ＩＨＣ）、ガスクロマトグラフィ（ＧＣ）、質量分析（ＭＳ）、高速液体クロマトグラフィ（ＨＰＬＣ）、核磁気共鳴（ＮＭＲ）スペクトル分析又はフローサイトメトリーを含む。
[0062]別の態様では、本明細書に提供するのは、うつである又はうつの危険性があると診断されているヒト対象の少なくとも１種のうつ症状を治療するための方法である。方法は、
（ａ）対象由来の試料を、
（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ及びＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、及び
（ｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ及びＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰであって、少なくとも１つの組合せの存在が葉酸含有化合物への症状を低減する応答に関連するＳＮＰ
からなる群から選択される少なくとも２つの一塩基多型（ＳＮＰｓ）の少なくとも１つの組合せの存在又は非存在を決定するために分析するステップと、
（ｂ）少なくとも１種のうつ症状を治療するために葉酸含有化合物の有効量を含む治療レジメンを対象に施すステップと
を含む。
[0063]一部の実施形態では、治療レジメンは抗うつ薬をさらに含む。一部の例では、抗うつ薬は選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）である。一部の実施形態では、選択的セロトニン再取り込み阻害剤は、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン又はそれらの組合せからなる群から選択される。
[0064]一部の実施形態では、ｒｓ１８０１１３３での少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体の存在及びｒｓ１８０５０８７での少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体の存在は、葉酸含有化合物への症状を低減する応答と関連する。他の実施形態では、ｒｓ８００７２６７での少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体の存在及びｒｓ４８６０での２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体の存在は、葉酸含有化合物への症状を低減する応答と関連する。
[0065]一部の実施形態では、うつは大うつ病性障害である。一部の実施形態では、少なくとも１種のうつ症状は、抑うつ気分、罪悪感、作業量又は関心の減少、精神運動遅滞、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な症状、認知障害及びそれらの組合せからなる群から選択される。
[0066]一部の実施形態では、対象は肥満である。一部の例では、肥満は、対象に存在する以下の状態のうち少なくとも１種によって特徴付けられる：３０ｋｇ／ｍ２以上のＢＭＩ値、男性で４０インチを超える若しくは女性で３５インチを超える胴囲、男性で約０．９５である若しくは女性で０．８０を上回る胴−臀部比、又は男性で少なくとも約２５％若しくは女性で少なくとも約３２％の体脂肪率。
[0067]一部の実施形態では、試料は、血液試料、血清試料、血漿試料、尿試料、口腔試料及び唾液試料からなる群から選択される。
[0068]方法の一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約１５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である。他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約２０ｍｇ／日である。さらに他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約４０ｍｇ／日である。一部の例では、葉酸含有化合物は約２０ｍｇ用量で１日当たり２回投与される。
[0069]一部の実施形態では、葉酸含有化合物は経口で投与される。
[0070]一部の実施形態では、葉酸含有化合物はＬ−メチル葉酸である。
[0071]一部の実施形態では、対象は、ＳＳＲＩなどの抗うつ単独療法に対し、不十分な応答があるか、抵抗性である。
[0072]一部の実施形態では、方法は、少なくとも１つのバイオマーカーの発現レベルを測定するステップ及び（１つ又は複数の）バイオマーカーのレベルが葉酸含有化合物への症状を低減する応答と関連するかどうかを決定するステップをさらに含む。一部の例では、追加的バイオマーカーは、ＳＡＭ、ＳＡＨ、４−ＨＮＥ、ｈｓＣＲＰ及びそれらの組合せからなる群から選択される。
[0073]一部の実施形態では、対象は、以下の状態：
（ａ）所定の基準比よりも小さな、ＳＡＭとＳＡＨとの発現レベル比
（ｂ）第１の所定の基準値よりも高い、４−ＨＮＥの発現レベル、及び
（ｃ）第２の所定の基準値よりも高い、ｈｓＣＲＰの発現レベル
のうち１つ又は複数に合致する場合、葉酸含有化合物に対する症状を低減する応答がある可能性が高い。
[0074]一部の例では、ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比は、健常な対象由来の血清試料で測定した場合、約４〜約１２である。他の例では、ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比は、健常な対象由来の血漿試料で測定した場合、約３．０である。
[0075]一部の例では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、健常な対象の血清試料で測定した場合、１リットル当たり約０．２４μｍｏｌ又は１リットル当たり約０．０４ｍｇである。他の例では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、健常な対象の血漿試料で測定した場合、１リットル当たり約３．０ｍｇである。
[0076]一部の例では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、健常な対象の血清試料で測定した場合、１リットル当たり約０．５ｍｇ〜１リットル当たり約４．５ｍｇである。他の例では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、健常な対象の血漿試料で測定した場合、１リットル当たり約２．３ｍｇである。
[0077]さらに別の態様では、本明細書で提供するのは、うつである又はうつの危険性があると診断されているヒト対象に投与する抗うつ薬の有効性を改善するための方法である。方法は、
対象が以下の一塩基多型（ＳＮＰ）の組合せ：
（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位若しくは配列番号７の２７位にあるＳＮＰ、及びＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位若しくは配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、又は
（ｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７によって特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ、及びＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ
のうち少なくとも１種を保有する場合、有効量の葉酸含有化合物を含む治療組成物を、抗うつ薬と併用して投与するステップ
を含む。
[0078]一部の実施形態では、対象は抗うつ単独療法を受けている。一部の実施形態では、対象は抗うつ単独療法に対して不十分な応答がある。一部の例では、不十分な応答は臨床評価（例えば神経心理学的試験）に基づく。
[0079]一部の実施形態では、抗うつ薬は選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）である。一部の実施形態では、選択的セロトニン再取り込み阻害剤は、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの組合せからなる群から選択される。
[0080]方法の一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約１５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である。他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約２０ｍｇ／日である。さらに他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は約４０ｍｇ／日である。一部の例では、葉酸含有化合物は約２０ｍｇ用量で１日当たり２回投与される。
[0081]一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は毎日単回用量として投与される。他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は１日当たり少なくとも２回の分割用量で投与される。
[0082]一部の実施形態では、葉酸含有化合物は経口で投与される。
[0083]一部の実施形態では、葉酸含有化合物はＬ−メチル葉酸である。
[0084]一部の実施形態では、うつは大うつ病性障害である。
[0085]別の態様では、本明細書に提供するのは、うつである又はうつの危険性があることが診断されており、以下：
（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｉ）ＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ、並びに
（ｉｖ）ＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ
からなる群から選択される少なくとも２つのＳＮＰを保有しているヒト対象におけるうつの治療における使用のための葉酸を含む組成物である。
[0086]一部の実施形態では、少なくとも２つのＳＮＰは、ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ及びＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰである。他の実施形態では、少なくとも２つのＳＮＰはＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ及びＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰである。
[0087]一部の実施形態では、うつは大うつ病性障害である。
[0088]一部の実施形態では、対象は少なくとも１種の抗うつ薬を受けている。
[0089]一部の実施形態では、少なくとも２種のＳＮＰを保有している対象は葉酸を含む組成物及び抗うつ薬を含む補助療法を投与される。
[0090]一部の実施形態では、抗うつ薬は選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）である。
[0091]一部の実施形態では、葉酸含有化合物はＬ−メチル葉酸約１５ｍｇ〜約５０ｍｇを含む。一部の実施形態では、葉酸含有化合物はＬ−メチル葉酸約２０ｍｇを含む。
[0092]一部の実施形態では、葉酸含有化合物は所定の放出プロファイルを有する。一部の例では、所定の放出プロファイルは持続放出である。他の例では、所定の放出プロファイルはパルス放出である。さらに他の例では、所定の放出プロファイルは時間制御放出である。
[0093]一部の実施形態では、葉酸を含む組成物は、該組成物を投与すると、少なくとも３〜６時間の期間にわたって、葉酸含有化合物の少なくとも３０％を放出するように製剤化されている。
[0094]さらに別の態様では、本明細書で提供するのは、うつである又はうつの危険性があると診断されているヒト対象のための治療レジメンを選択する際に使用するためのキットである。キットは、対象から採取した試料において以下の一塩基多型（ＳＮＰ）：
（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｉ）ＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｖ）ＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ
のうち少なくとも２種（例えば２、３又は４種）の存在又は非存在を決定するための少なくとも１種の試薬と、
当該キットを使用するための説明書と
を含む。
[0095]一部の実施形態では、少なくとも１種の試薬は、制限酵素、オリゴヌクレオチド、核酸プローブ、ポリメラーゼ及びそれらの組合せからなる群から選択される。
[0096]本発明の他の目的、特徴及び利点は、以下の詳細な説明及び図面から、当業者に明らかとなろう。
１種のＳＮＰマーカー（例えば、提示した遺伝子の希少なバリアント）又は提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。図１Ａは、１種のＳＮＰマーカー（例えば、提示した遺伝子の希少なバリアント）を保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表の一式であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。 １種のＳＮＰマーカー（例えば、提示した遺伝子の希少なバリアント）又は提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。図１Ｂは、提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表の一式であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。 １種のＳＮＰマーカー（例えば、提示した遺伝子の希少なバリアント）又は提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。図１Ｂは、提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表の一式であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。 １種のＳＮＰマーカー（例えば、提示した遺伝子の希少なバリアント）又は提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。図１Ｂは、提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表の一式であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。 １種のＳＮＰマーカー（例えば、提示した遺伝子の希少なバリアント）又は提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。図１Ｂは、提示した２種のＳＮＰマーカーの組合せを保有したＭＤＤ患者のＨＡＭＤ−２８、ＨＡＭ７及びＣＰＦＱを、それぞれの（１つ又は複数の）遺伝子が完全に正常であるＭＤＤ患者と比較した場合の平均変化を要約した表の一式であり、両群とも、葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として用いて、治療された後のものである。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（Ｉｎｄｉｃａｔｅｄ ｃｏｎｄｉｔｉｏｎ）（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７の値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（２種のＳＮＰマーカーの組合せ又は１種のＳＮＰマーカーと脂肪指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 葉酸含有化合物を、例えばＳＳＲＩの補助剤として含む治療レジメンを用いて、患者が治療された場合、提示した状態（単一のＳＮＰマーカー）のＭＤＤ患者における存在又は非存在が、ＣＰＦＱの値に及ぼす効果を示す結果の表の一式である。 臨床試験のプラセボ群（葉酸含有化合物なしに抗うつ剤を投与）又は葉酸を含む治療群（葉酸含有化合物を抗うつ剤に対するアジュバントとして投与）内で、バイオマーカー陽性対象とバイオマーカー陰性対象とを比較した、遺伝的調整因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）の影響に関する統計解析を示す結果の表の一式である。図７Ａは、ある一連の患者を示す。結果は、提示した全ての遺伝的修飾因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）内で、ＭＴＲの２７５６のＡＧ又はＧＧの遺伝子型（ｒｓ１８０５０８７）について陽性であった対象が、このＳＮＰについて陰性であった対象と比較して統計的に有意な治療効果があることを示している。ＣＯＭＴのＣＣ（ｒｓ４６３３）又はＣＯＭＴのＧＧ（ｒｓ４６８０）のＳＮＰについて陽性であった対象も、少なくとも１種の遺伝的調整因子の範疇で、統計的に有意な治療効果を示している。 臨床試験のプラセボ群（葉酸含有化合物なしに抗うつ剤を投与）又は葉酸を含む治療群（葉酸含有化合物を抗うつ剤に対するアジュバントとして投与）内で、バイオマーカー陽性対象とバイオマーカー陰性対象とを比較した、遺伝的調整因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）の影響に関する統計解析を示す結果の表の一式である。図７Ａは、ある一連の患者を示す。結果は、提示した全ての遺伝的修飾因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）内で、ＭＴＲの２７５６のＡＧ又はＧＧの遺伝子型（ｒｓ１８０５０８７）について陽性であった対象が、このＳＮＰについて陰性であった対象と比較して統計的に有意な治療効果があることを示している。ＣＯＭＴのＣＣ（ｒｓ４６３３）又はＣＯＭＴのＧＧ（ｒｓ４６８０）のＳＮＰについて陽性であった対象も、少なくとも１種の遺伝的調整因子の範疇で、統計的に有意な治療効果を示している。 臨床試験のプラセボ群（葉酸含有化合物なしに抗うつ剤を投与）又は葉酸を含む治療群（葉酸含有化合物を抗うつ剤に対するアジュバントとして投与）内で、バイオマーカー陽性対象とバイオマーカー陰性対象とを比較した、遺伝的調整因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）の影響に関する統計解析を示す結果の表の一式である。図７Ａは、ある一連の患者を示す。結果は、提示した全ての遺伝的修飾因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）内で、ＭＴＲの２７５６のＡＧ又はＧＧの遺伝子型（ｒｓ１８０５０８７）について陽性であった対象が、このＳＮＰについて陰性であった対象と比較して統計的に有意な治療効果があることを示している。ＣＯＭＴのＣＣ（ｒｓ４６３３）又はＣＯＭＴのＧＧ（ｒｓ４６８０）のＳＮＰについて陽性であった対象も、少なくとも１種の遺伝的調整因子の範疇で、統計的に有意な治療効果を示している。 臨床試験のプラセボ群（葉酸含有化合物なしに抗うつ剤を投与）又は葉酸を含む治療群（葉酸含有化合物を抗うつ剤に対する補助剤として投与）内で、バイオマーカー陽性対象とバイオマーカー陰性対象とを比較した、遺伝的な調整因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）の影響に関する統計解析を示す結果の表の一式である。図７Ｂは第２の一連の患者を示す。結果は、提示した全ての遺伝的修飾因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）内で、ＭＴＲの２７５６のＡＧ又はＧＧの遺伝子型（ｒｓ１８０５０８７）について陽性であった対象が、このＳＮＰについて陰性であった対象と比較して統計的に有意な治療効果があることを示している。ＣＯＭＴのＣＣ（ｒｓ４６３３）又はＣＯＭＴのＧＧ（ｒｓ４６８０）のＳＮＰについて陽性であった対象も、少なくとも１種の遺伝的調整因子の範疇で、統計的に有意な治療効果を示している。 臨床試験のプラセボ群（葉酸含有化合物なしに抗うつ剤を投与）又は葉酸を含む治療群（葉酸含有化合物を抗うつ剤に対する補助剤として投与）内で、バイオマーカー陽性対象とバイオマーカー陰性対象とを比較した、遺伝的な調整因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）の影響に関する統計解析を示す結果の表の一式である。図７Ｂは第２の一連の患者を示す。結果は、提示した全ての遺伝的修飾因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）内で、ＭＴＲの２７５６のＡＧ又はＧＧの遺伝子型（ｒｓ１８０５０８７）について陽性であった対象が、このＳＮＰについて陰性であった対象と比較して統計的に有意な治療効果があることを示している。ＣＯＭＴのＣＣ（ｒｓ４６３３）又はＣＯＭＴのＧＧ（ｒｓ４６８０）のＳＮＰについて陽性であった対象も、少なくとも１種の遺伝的調整因子の範疇で、統計的に有意な治療効果を示している。 臨床試験のプラセボ群（葉酸含有化合物なしに抗うつ剤を投与）又は葉酸を含む治療群（葉酸含有化合物を抗うつ剤に対する補助剤として投与）内で、バイオマーカー陽性対象とバイオマーカー陰性対象とを比較した、遺伝的な調整因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）の影響に関する統計解析を示す結果の表の一式である。図７Ｂは第２の一連の患者を示す。結果は、提示した全ての遺伝的修飾因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）内で、ＭＴＲの２７５６のＡＧ又はＧＧの遺伝子型（ｒｓ１８０５０８７）について陽性であった対象が、このＳＮＰについて陰性であった対象と比較して統計的に有意な治療効果があることを示している。ＣＯＭＴのＣＣ（ｒｓ４６３３）又はＣＯＭＴのＧＧ（ｒｓ４６８０）のＳＮＰについて陽性であった対象も、少なくとも１種の遺伝的調整因子の範疇で、統計的に有意な治療効果を示している。 臨床試験のプラセボ群及び葉酸を含む治療群内で、バイオマーカー陽性対象の奏効率を示す結果の表の一式である。応答者は、鑑定期間中にわたって、少なくとも約５０％のＨＡＭＤ−２８の低下によって示される。図８Ａは、個々のバイオマーカーに関する奏効率を示している。 臨床試験のプラセボ群及び葉酸を含む治療群内で、バイオマーカー陽性対象の奏効率を示す結果の表の一式である。応答者は、鑑定期間中にわたって、少なくとも約５０％のＨＡＭＤ−２８の低下によって示される。図８Ｂは、二重マーカー組合せに関する奏効率を示している。 臨床試験のプラセボ群及び葉酸を含む治療群内で、バイオマーカー陽性対象の奏効率を示す結果の表の一式である。応答者は、鑑定期間中にわたって、少なくとも約５０％のＨＡＭＤ−２８の低下によって示される。図８Ｂは、二重マーカー組合せに関する奏効率を示している。 正常及び推測上は陽性であるメチル化に関与するマーカー（上部）及びＬ−メチル葉酸の代謝に関与するマーカー（下部）によって階層化した、Ｌ−メチル葉酸を用いたＨＤＲＳ−２８奏効率（治療マイナスプラセボ）を示す図である。図９Ａは、合計、ＭＴＨＦＲのＣＣ、ＭＴＨＦＲのＣＴ／ＴＴ、ＦＯＬＨ１のＡＡ、ＦＯＬＨ１のＡＧ／ＧＧ、ＧＣＨＦＲのＡＡ、ＧＣＨＦＲのＴＡ／ＴＴ、ＲＦＣ２のＡＡ（例えばＲＦＣ１の８１５のＡＡ）、ＲＦＣ２の８１５のＴＴ（例えばＲＦＣ１の８１５のＴＴ）、ＲＦＣ１のＧＧ、ＲＦＣ１のＡＡ、ＲＦＣ１の８０のＧＧ、ＲＦＣ１の８０のＡＡ、ＧＣＨ１のＣＣ及びＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴについての奏効率を示す。 正常及び推測上は陽性であるメチル化に関与するマーカー（上部）及びＬ−メチル葉酸の代謝に関与するマーカー（下部）によって階層化した、Ｌ−メチル葉酸を用いたＨＤＲＳ−２８奏効率（治療マイナスプラセボ）を示す図である。図９Ｂは、合計、ＣＡＣＮＡ１ＣのＧＧ、ＣＡＣＮＡ１ＣのＡＧ／ＡＡ、ＤＮＭＴ３ＢのＧＧ、ＤＮＭＴ３ＢのＡＧ／ＡＡ、ＤＲＤ２の１２９のＣＣ、ＤＲＤ２の１２９のＴＴとＣＣ、ＭＴＲの２７５６のＡＡ、ＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ、ＣＯＭＴのＴＴ、ＣＯＭＴのＣＣ、ＣＯＭＴのＡＡ及びＣＯＭＴのＧＧについての奏効率を示す。 Ｌ−メチル葉酸対プラセボについて、ＨＤＲＳ−２８に関するベースラインからの平均変化を、個々のマーカー、例えばＣＯＭＴのＡ／ＧＧ、ＣＯＭＴのＧＧ、ＧＣＨ１のＣＣ、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ、ＭＴＲの２７５６のＡＡ、ＭＴＲの２７５６のＡＡ／ＧＧ、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＣ、ＭＴＨＦＲの６７７のＴＣ／ＴＴ、ＢＭＩ＜３０ｋｇ／ｍ２及びＢＭＩ≧３０ｋｇ／ｍ２の存在に従って示す図である。Ｐ値は、Ｌ−メチル葉酸対プラセボの比較に関する。 Ｌ−メチル葉酸対プラセボについて、プールしたエフェクトサイズを個々のマーカーの存在に従って示す図である。 Ｌ−メチル葉酸対プラセボについて、ＣＧＩ、ＨＤＲＳ−７及びＣＰＦＱのスコアに関するプールした平均変化を、バイオマーカーの２種組合せの存在に従って示す図である。ＮＡは、試料サイズが小さいために利用することができないデータを示す。＊ｐ＜０．０５及び＊＊ｐ＜０．００１は、Ｌ−メチル葉酸対プラセボに関する。
発明の詳細な説明
Ｉ．序論
[0109]本発明は、一部では、うつに罹っている又はうつの危険性がある患者のために、治療レジメン、例えばＬ−メチル葉酸などの葉酸含有化合物の補助（追加）療法を選択するためのアッセイを提供する。また、提供するのは、うつに罹っている又はうつの危険性がある患者の少なくとも１種のうつ症状を治療するための方法である。また、うつに罹っている又はうつの危険性がある患者に投与する抗うつ薬の有効量を改善するための方法も提供する。アッセイ及び／又は方法は、患者が相乗的な二重マーカー組合せを保有しているか否かを特定するステップを含むが、そのような組合せには、メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ、ｒｓ１８０１１３３）とメチオニンシンターゼ（ＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ、ｒｓ１８０５０８７）とのＳＮＰ対及び／又はＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ、ｒｓ８００７２６７）とカテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ、ｒｓ４６８０）のマーカーの対などがある。また本明細書に提供しているのは、うつに罹っている又はうつの危険性があると診断されている、相乗的な二重マーカー組合せも保有する患者の治療に使用するための葉酸含有化合物である。
[0110]本明細書に提供するアッセイ、方法及び組成物は、例えば米国特許出願公開第２０１３／０１７２３６１号及び第２０１３／０２６７５２３号並びに国際公開第２０１３／０７４６７６号に見出される記載に関し、これらの開示は、全ての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれている。
ＩＩ．定義
[0111]本明細書で使用する場合、以下の用語は、別段に明記しない限り、それらが帰せられる意味を有する。
[0112]本発明は、本明細書に記載した特定の方法論、プロトコール及び試薬などに限定されず、またそれゆえ変化する場合があることを理解されたい。本明細書で使用する専門用語は、特定の実施形態のみを記載することを目的とし、特許請求の範囲によってのみ規定された本発明の範囲に限定することを意図するものではない。
[0113]「バイオマーカー」又は「マーカー」という用語は、任意の遺伝子マーカー、生化学的マーカー、血清学的マーカー、又は本明細書において提供したアッセイ及び／若しくは方法に従って、葉酸含有化合物の応答、効能、毒性及び／若しくは抵抗性を予測、特定、鑑定（ｅｖａｌｕａｔｉｎｇ）、評価（ａｓｓｅｓｓｉｎｇ）、決定、モニター及び／又はは最適化する際に使用することができる他の臨床的特徴を含む。
[0114]「核酸」という用語は、当技術分野で周知である。本明細書で使用する場合の「核酸」とは、一般に、核酸塩基を含むＤＮＡ、ＲＮＡ又はその誘導体若しくは類縁体の分子（すなわち鎖）を指す。核酸塩基としては、例えば、ＤＮＡ（例えばアデニン「Ａ」、グアニン「Ｇ」、チミン「Ｔ」若しくはシトシン「Ｃ」）又はＲＮＡ（例えばＡ、Ｇ、ウラシル「Ｕ」若しくは「Ｃ」）に見出される天然由来のプリン塩基又はピリミジン塩基が挙げられる。「核酸」という用語は、「オリゴヌクレオチド」及び「ポリヌクレオチド」という用語を、それぞれを「核酸」という用語の亜属として包含する。「オリゴヌクレオチド」という用語は、長さで約３〜約１００核酸塩基数の間の分子を指す。「ポリヌクレオチド」という用語は、長さで約１００核酸塩基数よりも長い少なくとも１つの分子を指す。
[0115]本明細書で使用する場合の「相補的」又は「相補体」という用語は、２本の核酸鎖の領域の間の、又は同じ核酸鎖の２つの領域の間の配列相補性に関する、広い概念を指す。第１の核酸領域のアデニン残基は、当該第１の領域と逆平行の第２の核酸領域の残基と、当該残基がチミン又はウラシルであれば、特異的な水素結合（「塩基対合」）を形成することができることが知られている。同様に、第１の核酸鎖のシトシン残基は、当該第１の鎖と逆平行の第２の核酸鎖の残基と、当該残基がグアニンであれば、塩基対合することができることが知られている。２つの領域を逆平行の様式で配列する場合、第１の領域の少なくとも１つのヌクレオチド残基が、第２の領域の残基と塩基対合することができるならば、核酸の第１の領域は、同じ又は異なる核酸の第２の領域と相補的である。第１の領域は第１の部分を含み、第２の領域は第２の部分を含み、その結果、該第１の部分及び第２の部分が逆平行の様式で配列される場合、少なくとも約５０％、及び好ましくは少なくとも約７５％、少なくとも約９０％、又は少なくとも約９５％又は少なくとも１００％の該第１の部分のヌクレオチド残基が、該第２の部分のヌクレオチド残基と塩基対合することができるようになることが好ましい。該第１の部分の全ヌクレオチド残基は、該第２の部分のヌクレオチド残基と塩基対合することができることがさらに好ましい。
[0116]「バリアント」、「変動（ｖａｒｉａｎｃｅ）」、「変異」又は「多型」という用語は、本明細書では互換的に使用され、個体の集団である場合、成員間の核酸配列の差異を指す。多型は、単一ヌクレオチドに変化がある場合、ときには「一塩基多型」又は「ＳＮＰ」と呼ばれることもある。一部の実施形態では、多型は、同義的又は非同義的であり得る。同義的な多型は、翻訳領域又は非翻訳領域に存在する場合、典型的にはアミノ酸変化を生じないが、ｍＲＮＡの安定性の変化又は代替的スプライシング部位の変化を生じ得る。非同義的な多型は、翻訳領域に存在する場合、１つ又は複数のコドンの変化を生じ、その結果、アミノ酸鎖のアミノ酸置換を生じ得る。そのような変異及び多型は、個体内でヘテロ接合性又はホモ接合性のいずれかである場合がある。ホモ接合性の個体は、相同染色体の対応する１つ又は複数の遺伝子座に、同一の対立遺伝子を有し、一方、ヘテロ接合性の個体は、相同染色体の対応する１つ又は複数の遺伝子座に、２つの異なる対立遺伝子を有する。ゆえに、多型が存在するために、１つの種の一部の成員が、１つの配列を伴う遺伝子（例えば、正常又は野生型の「対立遺伝子」）を保有し、一方で、他の成員が、変化した配列（例えば、バリアント又は変異の「対立遺伝子」）を有する場合がある点で、多型は、「対立遺伝子の（ａｌｌｅｌｉｃ）」と言われる。
[0117]ＳＮＰの位置、ＳＮＰの対立遺伝子又はヌクレオチド配列を規定する際に、核酸分子の一方の鎖の特定の部位にあるアデニン「Ａ」、チミン「Ｔ」（ウリジン「Ｕ」）、シトシン「Ｃ」、又はグアニン「Ｇ」に言及することはまた、核酸分子の相補鎖の対応する部位にあるチミン「Ｔ」（ウリジン「Ｕ」）、アデニン「Ａ」、グアニン「Ｇ」、又はシトシン「Ｃ」を（それぞれ）規定する。このように、特定のＳＮＰの位置、ＳＮＰの対立遺伝子又はヌクレオチド配列を指すために、どちらかの鎖に対して言及することができる。
[0118]「遺伝子型」という用語は、細胞全体の特異的な対立遺伝子の構成又はある特定の遺伝子を指し、一方、「表現型」という用語は、特異的な遺伝子型の検出可能な外見上の顕現を指す。
[0119]「対立遺伝子」という用語は、本明細書で使用する場合、遺伝子の異なる形態の対のうちの一成員を指す。本明細書で使用する場合、対立遺伝子は、翻訳配列及び非翻訳配列を指す。対立遺伝子は、相同染色体の同じ遺伝子座又は位置を占める。対象が、遺伝子の２つの同一の対立遺伝子を有する場合、その対象は、遺伝子又は対立遺伝子についてホモ接合性であると言われる。対象が、遺伝子の２つの異なる対立遺伝子を有する場合、その対象は、遺伝子についてヘテロ接合性であると言われる。特異的な遺伝子の対立遺伝子は、単一ヌクレオチド又はいくつかのヌクレオチドにおいて互いに異なる場合があり、ヌクレオチドの置換、欠失及び挿入を含み得る。遺伝子の対立遺伝子は、変異を含有する遺伝子の形態にもなり得る。
[0120]「ＳＡＭ」という用語は、通常ＳＡＭ、又はＳＡＭ−ｅ又はＡｄｏＭｅｔとして知られるＳ−アデノシルメチオニンを指し、あらゆる生細胞に見出される天然の化合物である。ＳＡＭは、生化学反応で最もよく使用される酵素基質の１つである。Ｓ−アデノシルメチオニンは、メチル基転移に関与するありふれた補助基質である。ＳＡＭは、アデノシン三リン酸（ＡＴＰ）及びメチオニンから、メチオニンアデノシルトランスフェラーゼによって作り出される。ＳＡＭは、メチル基転移、含硫基転移及びアミノプロピル化などの代謝経路に使用される。
[0121]「ＳＡＨ」という用語は、Ｓ−アデノシル−Ｌ−メチオニンの脱メチル化によって形成されるＳ−アデノシルホモシステインを指す。血液、血漿及び血清中のＳ−アデノシルメチオニン（ＳＡＭ）及びＳ−アデノシルホモシステイン（ＳＡＨ）の相対的なレベルは、心血管疾患、一部のがん及び神経精神疾患などの栄養疾患並びに慢性疾患の状態に関わる代謝変化を予測するために使用することができる。
[0122]「ＳＡＭ／ＳＡＨ比」という用語は、Ｓ−アデノシルメチオニンのＳ−アデノシルホモシステインに対する相対的なレベルを指す。一部の例では、ＳＡＭ／ＳＡＨ比の減少は、血清中のホモシステインの増加及びＳＡＨの増加に関係がある。
[0123]「４−ＨＮＥ」という用語は、細胞で脂質の過酸化によって生成するα，β−不飽和ヒドロキシアルケナールである４−ヒドロキシノネナール又は４−ヒドロキシ−２−ノネナールを指す。４−ＨＮＥは、この過程で形成される主なα，β−不飽和ヒドロキシアルケナールである。４−ＨＮＥは、ストレス事象における脂質の過酸化の連鎖反応の増加に起因する酸化ストレスの間に、体組織中に、大量に見出される。４−ＨＮＥは、細胞周期の事象から細胞接着まで様々な経路の細胞のシグナル伝達において、重要な役割を果たすようである。４−ＨＮＥは、慢性炎症、神経変性疾患、成人呼吸促迫症候群、アテローム発生、糖尿病及び様々な型のがんなどの多数の疾患の可能性のある病因とも考えられている。
[0124]「ｈｓＣＲＰ」という用語は、例えば血液、血清及び血漿に見出される高感度Ｃ−反応性タンパク質を指す。血清及び血漿のｈｓＣＲＰのレベルの上昇は、炎症性疾患のある患者だけではなく、うつ症状のある患者にも検出されている。例えば、大うつ病は、ｈｓＣＲＰ、並びにＩＬ−６及びＴＮＦ−αなどの炎症性マーカーのレベルの上昇に関連することが報告されている（例えば、Ｄｉｎａｎ ＴＧ．Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｐｓｙｃｈｉａ．、２００９年、２２巻、１号、３２〜６頁を参照されたい）。
[0125]「うつ」という用語は、悲しみ、絶望及び失意の感情によって特徴付けられる抑うつ気分の精神状態を指す。一部の例では、うつは、臨床症状であり、大うつ病性障害（単回のエピソード及び再発を含む）、単極性うつ、治療難治性うつ、抵抗性うつ、不安うつ及び気分変調（気分変調性障害とも呼ばれる）を含み得るが、これらに限定されない。さらに、「うつ」という用語は、あらゆる大うつ病性障害、気分変調性障害、うつの特性を伴う医学上の状態に起因する気分障害、大うつ病様のエピソードを伴う医学上の状態に起因する気分障害、うつの特性を伴う物質誘発性の気分障害、並びに、米国精神医学会の精神障害の診断と統計マニュアル第４版（ＤＳＭ−ＩＶ）若しくはそれ以降の任意の版、又は世界保健機関の疾病及び関連保健問題の国際統計分類（ＩＣＤ−１０）に列挙されているような診断基準によって規定されるように、別段に明記されない、あらゆるうつ障害を包含し得る。
[0126]本明細書で使用する場合の、疾患の治療に関する「治療」及び「治療すること」という用語は、疾患の進行を予防すること、又は障害の方向性を変えること（例えば、障害の進行を遅延させることであるがこれに限定されない）、又は障害の症状を部分的に反転させること、又は対象の１種若しくは複数の症状及び／若しくは１種若しくは複数の生化学的マーカーを低減すること、１種若しくは複数の症状が悪化若しくは進行するのを予防すること、回復を促進すること、又は予後を改善することを意味する。
[0127]「治療レジメン」という用語は、例えばうつの疾患又は障害に関連する少なくとも１種の症状の、臨床上意義のある軽減を指す。
[0128]「陰性応答」という用語は、治療を受けている患者が、障害の兆候又は症状をさらに多く又は追加で経験するほどに、患者において障害の状態が悪化することを含む。
[0129]「陽性応答」という用語は、治療によって障害の兆候又は症状が軽減されるほどに、障害の状態の患者が改善することを含む。
[0130]「抗うつ剤」又は「抗うつ薬」という用語は、うつを治療するあらゆる医薬の薬剤を指す。一部の実施形態では、本明細書に記載した方法に従って対象に投与される抗うつ薬は、うつを治療するために通常指示される任意の従来の医薬の薬剤であり得る。
[0131]「葉酸含有化合物」又は「葉酸を含む薬物」という用語は、本明細書に記載した方法に使用するために、少なくとも１種の有効量の葉酸含有化合物を指す。葉酸は、水溶性ビタミンＢ９の形態である。「葉酸」という用語は、葉酸（ｆｏｌａｔｅ）、葉酸（ｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ）(ビタミンＢ９又はフォラシンとしても知られる)並びにそれらの代謝物又は誘導体、例えばメチル葉酸、テトラヒドロ葉酸及びメチルテトラヒドロ葉酸の天然由来の形態を包含する。「葉酸」という用語は、プテロイン酸モノグルタメート（葉酸）、並びにジヒドロ葉酸及びテトラヒドロ葉酸などの還元形態の両方、例えば、５−ホルミルテトラヒドロ葉酸、５−メチルテトラヒドロ葉酸、５，１０−メチレンテトラヒドロ葉酸、５，１０−メテニルテトラヒドロ葉酸、１０−ホルミルテトラヒドロ葉酸及びテトラヒドロ葉酸、それらのポリグルタメート、それらの光学異性体（例えばそれらの光学的に純粋な天然の異性体、及びラセミ混合物などの光学異性体の混合物も含む）、それらの誘導体、それらの薬学的に許容される塩及びエステル、それらのグルコサミン塩、並びにそれらのガラクトサミン塩も指すことがある。
[0132]「薬学的に許容される塩及びエステル」という用語は、薬理学的に許容される及び薬学的に許容される塩及びエステルを指す。薬理学的及び薬学的に許容される塩としては、アルカリ金属又はアルカリ土類金属塩、例えばナトリウム塩、カリウム塩、マグネシウム塩又はカルシウム塩を挙げることができるが、これらに限定されない。薬理学的及び薬学的に許容されるエステルとしては、Ｃ１〜Ｃ４アルキルエステル、Ｃ５シクロアルキルエステル若しくはＣ６シクロアルキルエステル、フェニルエステル、Ｃ１〜Ｃ４アルキルフェニルエステル、ベンジルエステル又はＣ１〜Ｃ４アルキルベンジルエステルを挙げることができるが、これらに限定されない。エステルは、モノエステル又はジエステルであり得る。ジエステルは、均一でも不均一でもあり得る。一部の実施形態では、薬理学的及び薬学的に許容されるエステルは、Ｃ１〜Ｃ４ジアルキルエステル、例えばジメチルエステル又はジエチルエステルなどの均一なジエステルであり得る。
[0133]本明細書で使用する場合の「アジュバント」、「補助剤」、「補助薬」又は「補助療法」という用語は、一般に別の薬剤又は実体（ｅｎｔｉｔｙ）の効果を増大させる任意の薬剤又は実体を指す。ある特定の実施形態では、「アジュバント」という用語は、葉酸含有化合物について、抗うつ薬の効果（例えば効能及び／又は治療効果）を増大又は亢進させるための追加剤（薬）として、本明細書で使用される。
[0134]本明細書で使用する場合、「投与する」又は「投与」という用語は、所望の効果が生じるように、所望の部位に組成物を少なくとも部分的に局在させる結果をもたらす方法又は経路によって、対象内に組成物を配置することを指す。本明細書に記載した方法に適した投与の経路としては、局所投与と全身投与の両方が挙げられ得る。一般に、局所投与は、特異的な場所（例えば中枢神経系及び／又は末梢神経系のセロトニン受容体）に、対象の全身と比較してより高い量の抗うつ剤（例えばＳＳＲＩ）及び／又は葉酸含有化合物を送達する結果をもたらすが、一方、全身投与は、抗うつ剤（例えばＳＳＲＩ）及び／又は葉酸含有化合物を実質的に対象の全身に送達する結果をもたらす。一部の実施形態では、本明細書に記載した組成物は、うつに罹っている対象に経口的に投与される。他の実施形態では、本明細書に記載した組成物は、うつに罹っている対象に注射によって投与され得る。
[0135]療法に関する文脈における「不十分な応答」という用語は、（１つ又は複数の）疾患／障害の症状を低下又は最小にすることができず、そのために、患者に治療上の利益を提供しない薬物応答を指す。一部の例では、うつに罹っている患者についての不十分な応答は、神経心理学的な評価の尺度に従って、うつ症状の重症度が何も又は殆ど減少しないことを含む。
[0136]「症状が低下する応答」又は「陽性症状が低下する応答」という用語は、疾患／障害の症状を低下又は最小にして、その結果、対象に治療上の利益を与える薬物応答を指す。一部の例では、うつに罹っている対象の症状が低下する応答は、熟練の施療者によって決定された臨床上意義のある量の薬物によって、対象に重要な有害効果がなく、少なくとも１種のうつ症状が低下するものとして特徴付けられる。
[0137]「対象」又は「患者」又は「個体」という用語は、典型的にはヒトを含むが、例えば他の霊長類、齧歯類、イヌ、ネコ、ウマ、ヒツジ、ブタなどの他の動物も含むことができる。
[0138]「健常な対象」という用語は、疾患若しくは障害の症状を何も持たない、又は疾患若しくは障害を何も特定されていない、又は何の薬物治療中にない対象、又は健康診断に基づいて、医師によって健康であると特定されている対象を指す。
ＩＩＩ．実施形態の詳細な説明
[0139]本明細書に記載したアッセイ、方法及び組成物は、うつ、例えば大うつ病性障害を診断されている、又はうつの危険性がある個体に向けたものである。うつは、標準的な臨床基準、例えばＤＳＭ−ＩＶ−ＴＲ系を使用して、診断することができる。例えば、ＭＤＤを診断するためのＤＳＭ−ＩＶ系は、抑うつ気分若しくは過敏な、関心若しくは喜びの減少、大幅な体重変化（５％）若しくは食欲の変化、睡眠の変化（例えば不眠若しくは過眠）、活動の変化、疲労若しくはエネルギーの損失、罪悪感若しくは無気力、集中力の減退及び自殺傾向を含む１０種のうつ症状のうち少なくとも５種の存在が必要である。また、症状は、少なくとも２週間表れるべきであり、各症状は、ほぼ毎日、十分な重症度であるべきである。
[0140]一般に、うつは、臨床医学者によって、例えばＤＳＭ−ＩＶ、又はハミルトンうつ病評価尺度（ＨＡＭＤ−２８若しくはＨＡＭＤ−７）、臨床全般印象度（ＣＧＩ）尺度、モンゴメリ−アスベルグうつ病評価尺度（ＭＡＤＲＳ）、ベックうつ病特性尺度（ＢＤＩ）、ツングうつ病自己評価尺度、ウェクスラ−うつ病評価尺度、ラスキンうつ病評価尺度、抑うつ症状評価尺度（ＩＤＳ）及び簡易抑うつ症状評価尺度（ＱＩＤＳ）などの効能の測定（神経心理学的評価）の基準リストを使用して鑑定される。例えば、測定可能なうつの緩和（うつの改善）としては、血中のうつのマーカー、例えば赤血球の葉酸、血清の葉酸、血清のＭＴＨＦの測定又は、うつの程度の評価、例えば神経心理学的評価を使用してなどの、測定可能なマーカー又は症状における臨床上重要なあらゆる下落が挙げられる。
[0141]例えば、ＨＡＭＤのスコア０〜７は、典型的には正常であると考えられる。スコア２０以上は、中程度、重度又は非常に重度のうつを示す。質問１８〜２１は、うつに関するさらなる情報（例えば日内変動又は妄想症状が存在するか否か）を与えるために記録される場合があるが、尺度の必要な部分ではない。このように、症状の低下は、例えばＨＡＭＤスコアが例えば２０よりも減少する場合、臨床上関連すると考えられ得る。
[0142]一態様では、本明細書に提供した一部の実施形態は、葉酸応答性マーカーの相乗的な対が存在するか否かを決定するために、患者を遺伝子型判定することによって、うつに罹っている又はうつの危険性がある患者のための治療レジメンを選択するための、アッセイ又はアッセイ方法に関する。一部の実施形態では、葉酸応答性を示す遺伝子型としては、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＨＦＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）、及び少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）（例えば、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ）が挙げられる。他の実施形態では、葉酸応答性を示す遺伝子型としては、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＧＣＨ１のＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）、及び２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＣＯＭＴのＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）（例えば、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ）が挙げられる。さらに他の実施形態では、葉酸応答性を示す遺伝子型としては、表４に記載した任意の相乗的な２マーカーが挙げられる。有効量の葉酸含有化合物を含む治療レジメンは、患者が葉酸応答性のＳＮＰ対を保有することが決定している場合、患者のために選択される。
[0143]一部の例では、葉酸含有化合物の補助療法は、患者がＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、肥満である場合に処方される。一部の例では、該補助療法は、患者がＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対のＳＮＰ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する場合に処方される。他の例では、該補助療法は、患者がＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する場合に処方される。さらに一部の例では、該葉酸含有化合物の補助療法は、患者がＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する場合に処方される。
[0144]一部の例では、葉酸含有化合物の補助療法は、患者がＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、肥満である場合に処方される。一部の例では、該補助療法は、患者がＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する場合に処方される。他の例では、該補助療法は、患者がＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する場合に処方される。さらに一部の例では、該補助療法は、患者がＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する場合に処方される。
[0145]別の態様では、本明細書に提供した一部の実施形態は、葉酸含有化合物を（任意選択で抗うつ薬を併用して）対象に投与するステップを含む、うつに罹っているヒト対象を治療する方法に関する。一実施形態では、葉酸含有化合物を（任意選択で抗うつ薬を併用して）投与することによってうつ対象を治療する方法は、対象が両方の葉酸応答性マーカー：少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＨＦＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）と、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）とを保有することの決定に基づく。別の実施形態では、葉酸含有化合物を（任意選択で抗うつ薬を併用して）対象に投与することによってうつに罹っているヒト対象を治療する方法は、対象が両方の葉酸応答性マーカー：少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＧＣＨ１のＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）と、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＣＯＭＴのＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）とを保有することの決定に基づく。
[0146]一部の例では、葉酸含有化合物の投与は、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、肥満である患者のために選択される。一部の例では、葉酸含有化合物の投与は、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する患者のために選択される。他の例では、葉酸含有化合物の投与は、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する患者のために選択される。さらに一部の例では、葉酸含有化合物の投与は、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する患者のために選択される。
[0147]一部の例では、葉酸含有化合物の投与は、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、肥満である患者のために選択される。一部の例では、葉酸含有化合物の投与は、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する患者のために選択される。他の例では、葉酸含有化合物の投与は、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する患者のために選択される。さらに一部の例では、葉酸含有化合物の投与は、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する患者のために選択される。
[0148]本明細書に記載した方法を用いて治療されているうつに罹っている対象は、現在抗うつ剤を摂取している対象であり得る。それゆえ、対象が現在摂取している抗うつ薬の有効性を改善するために、本明細書に記載したうつに罹っているヒト対象を治療する方法を、葉酸含有化合物と抗うつ剤との組合せを用いて治療するヒト対象を選択するために使用することもできる。したがって、現在抗うつ剤を摂取しているヒト対象が１種又は複数の相乗的な二重バイオマーカー組合せを保有することが決定している場合、該対象は、葉酸含有化合物を抗うつ剤のアジュバントとして、さらに投与又は処方され得る。
[0149]別の態様では、本明細書に提供した一部の実施形態は、うつに罹っている又はうつの危険性のある対象の少なくとも１種のうつ症状を治療するための方法に関する。症状としては、抑うつ気分、罪悪感、作業量及び関心の減少、精神運動遅滞、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な身体症状、認知機能障害及びそれらの任意の組合せが挙げられる。一部の実施形態では、対象の少なくとも１種のうつ症状を治療するための方法は、（ｉ）少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＨＦＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）、及び少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子若しくはその相補体を含むＭＴＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）又は、（ｉｉ）少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子若しくはその相補体を含むＧＣＨ１のＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）、及び２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＣＯＭＴのＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）などの相乗的なＳＮＰの対を対象が保有するか否かを決定するために、対象を遺伝子型判定するステップを含む。有効量の葉酸含有化合物を含む治療レジメンは、相乗的なＳＮＰ対の存在が決定された場合、患者に施される。
[0150]一部の例では、有効量の葉酸含有化合物を含む治療レジメンは、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、肥満である患者のために選択される。一部の例では、該治療レジメンは、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する患者のために選択される。他の例では、該治療レジメンは、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰを保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する患者のために選択される。さらに一部の例では、該治療レジメンは、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する患者のために選択される。
[0151]一部の例では、有効量の葉酸含有化合物を含む治療レジメンは、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、肥満である患者のために選択される。一部の例では、該治療レジメンは、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する患者のために選択される。他の例では、該治療レジメンは、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する患者のために選択される。さらに一部の例では、該治療レジメンは、ＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧのＳＮＰ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する患者のために選択される。
[0152]一部の実施形態では、少なくとも１種のうつ症状は、対照（例えば、治療した対象と同じ又は同様の程度のうつである対象に、葉酸含有化合物なしで投与する、又は本明細書に記載した状態に見合うものがない対象に、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを施す）に比べて、医師又は心理学者によって鑑定されるような「臨床上意義のある量」又は「有効量」によって軽減される。
[0153]例えば、一部の実施形態では、治療レジメンを用いて患者が治療された後に、少なくとも１種の神経心理学的試験が、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、又は少なくとも約５０％改善される（例えばＨＡＭＤ−１７の評点が下がる）。別の実施形態では、少なくとも１種の神経心理学的試験が、５０％超、例えば、少なくとも約６０％、又は少なくとも約７０％改善される（例えばＨＡＭＤ−１７の評点が下がる）。一実施形態では、少なくとも１種の神経心理学的試験が、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％又はそれ以上、対照（例えば、治療した対象と同じ又は同様の程度のうつである対象に、葉酸含有化合物なしで投与する、又は本明細書に記載した状態に見合うものがない対象に、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを施す）に比べて改善される（例えばＨＡＭＤ−１７の評点が下がる）。一部の実施形態では、少なくとも１種のうつ症状は、少なくとも約１０日、例えば少なくとも約２０日、少なくとも約３０日、少なくとも約４０日又はそれ以上を含む治療期間内に、医師又は心理学者によって鑑定されるような臨床上意義のある量によって軽減され得る。一部の実施形態では、少なくとも１種の神経心理学的試験が、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、又は少なくとも約５０％又はそれ以上、少なくとも約１０日、例えば少なくとも約２０日、少なくとも約３０日、少なくとも約４０日又はそれ以上を含む治療期間内に、改善される（例えばＨＡＭＤ−１７の評点が下がる）。
[0154]別の一態様では、本明細書に提供した一部の実施形態は、うつに罹っているヒト対象に投与した抗うつ薬の有効性を増大させる方法に関するものであり、方法は、対象が少なくとも２種の葉酸応答性マーカーを保有するという決定に基づいて、抗うつ薬と併用して葉酸含有化合物を対象に投与するステップを含み、該マーカーの組合せは、相乗効果を生じるものである。一部の実施形態では、ヒト対象に投与した抗うつ薬の有効性を増大させる方法は、うつであることが診断されており、葉酸含有化合物を併用して投与する場合、抗うつ薬の有効性を増大させることに、示されたバイオマーカーの組合せが関連するという認識に基づいて、１種又は複数（例えば１、２、３以上）の相乗的な二重バイオマーカー組合せを保有することがさらに決定している対象に投与するステップを含む。一部の実施形態では、抗うつ薬の有効性を増大させる方法は、対象が、両方の葉酸応答性マーカー：少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＨＦＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）と、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）とを保有することの決定に基づいて、葉酸含有化合物を抗うつ薬と併用して対象に投与するステップを含む。他の実施形態では、抗うつ薬の有効性を増大させる方法は、対象が、両方の葉酸応答性マーカー：少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＧＣＨ１のＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）と、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＣＯＭＴのＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）とを保有することの決定に基づいて、葉酸含有化合物を抗うつ薬と併用して対象に投与するステップを含む。
[0155]一部の実施形態では、例えば本明細書に記載したアッセイを使用し、例えばヒト対象が葉酸又はその誘導体の影響をアジュバントとして受け易いか否かを決定することによって、ヒト対象に投与された抗うつ薬の有効性を決定及び／又は改善する方法。
[0156]一部の例では、対象は抗うつ薬に不十分な応答を有する。抗うつ薬に対し十分な応答とは、症状の重症度において５０パーセントの減少があることである場合がある。例えば、抗うつ剤に応答する患者は、神経心理学的試験のスコアについて、ベースラインよりも５０％以上の低下がある。うつからの緩和は、うつのエピソードについて、症状がないか、ほぼないとして規定され得る。
[0157]一部の例では、葉酸含有化合物の補助療法は、患者がＳＮＰ対、すなわちＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対を保有し、肥満である場合に処方される。一部の例では、該補助療法は、患者がＳＮＰ対、すなわちＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する場合に処方される。他の例では、該補助療法は、患者がＳＮＰ対、つまりＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する場合に処方される。さらに一部の例では、該補助療法は、患者がＳＮＰ対すなわち、ＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する場合に処方される。
[0158]一部の例では、葉酸含有化合物の補助療法は、患者がＳＮＰ対、すなわちＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ対を保有し、肥満である場合に処方される。一部の例では、該補助療法は、患者がＳＮＰ対、すなわちＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する場合に処方される。他の例では、該補助療法は、患者がＳＮＰ対、すなわちＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する場合に処方される。さらに一部の例では、該補助療法は、患者がＳＮＰ対、すなわちＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する場合に処方される。
[0159]さらに別の態様では、本明細書に提供した一部の実施形態は、うつに罹っている又はうつの危険性がある対象が葉酸応答性を標示する遺伝子型を有している場合、該対象を治療するのに使用するための葉酸含有化合物に関する。一部の実施形態では、対象は、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＨＦＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）と、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＭＴＲのＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）とを保有する場合、葉酸含有化合物に応答する可能性が高い。他の実施形態では、対象は、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含むＧＣＨ１のＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）と、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含むＣＯＭＴのＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）とを保有する場合、葉酸含有化合物に応答する可能性が高い。
[0160]一部の例では、葉酸含有化合物は、ＳＮＰ対、すなわちＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対を保有し、肥満である患者に投与される。一部の例では、葉酸含有化合物は、ＳＮＰ対、すなわちＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する患者に投与される。他の例では、葉酸含有化合物は、ＳＮＰ対、すなわちＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する患者に投与される。さらに一部の例では、葉酸含有化合物は、ＳＮＰ対、すなわちＭＴＨＦＲの６７７のＣＴ／ＴＴ及びＭＴＲの２７５６のＡＧ／ＧＧ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する患者に投与される。
[0161]一部の例では、葉酸含有化合物は、ＳＮＰ対、すなわちＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ対を保有し、肥満である患者に投与される。一部の例では、葉酸含有化合物は、ＳＮＰ対、すなわちＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ対を保有し、所定の基準比よりも小さなＳＡＭ／ＳＡＨ比を有する患者に投与される。他の例では、葉酸含有化合物は、ＳＮＰ対、すなわちＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ対を保有し、所定の基準値よりも大きな４−ＨＮＥの発現レベルを有する患者に投与される。さらに一部の例では、葉酸含有化合物は、ＳＮＰ対、すなわちＧＣＨ１のＴＣ／ＴＴ及びＣＯＭＴのＶａｌ１５８Ｍｅ ｔＧＧ対を保有し、所定の基準値よりも大きなｈｓＣＲＰレベルの発現レベルを有する患者に投与される。
[0162]一部の実施形態では、葉酸含有化合物は、うつ、例えば大うつ病性障害に関連する、少なくとも１種の症状（例えば、これらに限らないが、落ち込み、快感消失、低いエネルギー、不眠、激越、不安及び／又は体重減少）を低下させるのに有効な量で投与することができる。一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は、ヒト対象に、１日の投与当たり少なくとも約０．１〜約１ｍｇ／ｋｇ体重を提供することができる。一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は、約７．５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である。一部の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は、ヒト対象に、少なくとも約１５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日の投与を提供することができる。一実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は、ヒト対象に、少なくとも約１５ｍｇ／日の葉酸投与を提供することができる。他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は、ヒト対象に、少なくとも約２０ｍｇ／日の葉酸投与を提供することができる。他の実施形態では、葉酸含有化合物の有効量は、ヒト対象に、少なくとも約４０ｍｇ／日の葉酸投与を提供することができる。一部の例では、葉酸含有化合物は、単回日用量として１日１回、又は分割用量として１日２回、任意の適した投与経路、例えば経口投与を介して投与される。例えば、２０ｍｇの単回用量を１日当たり投与することができる。あるいは、２０ｍｇの２回用量を１日に投与することができる。他の例では、葉酸含有化合物は１日２回超投与される。
[0163]一部の実施形態では、葉酸含有化合物は抗うつ薬と併用して投与される。一部の例では、治療効果（例えば、うつに関連する少なくとも１種の中核症状の低下）は、少なくとも２種の葉酸応答性バイオマーカーを保有することが決定しているヒト対象が、葉酸含有化合物の補助療法を用いて投与された場合に相乗的であり得る。治療効果に関する文脈において本明細書で使用する場合の「相乗作用」又は「相乗的」という用語は、少なくとも２種以上の薬剤を組合せた、個々の効果の合計よりも大きな効果を指す。特に、本明細書で使用する場合の「相乗作用」又は「相乗的」という用語は、２種以上の葉酸応答性バイオマーカーを保有するヒト対象に関連する、組み合わせられた治療効果であって、ヒト対象が葉酸含有化合物を含む治療を施される場合、個々の葉酸応答性バイオマーカーに関連する治療効果の合計（相加効果）よりも高い治療効果を指す。一部の実施形態では、相乗効果は、相加効果よりも少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％又はそれ以上よりも高い場合がある（例えば、ＨＡＭＤ−２８又はうつ症状を鑑定するための任意の他の等価の手段によって決定される場合）。一部の実施形態では、例えば、ＨＡＭＤ−２８又は本願のどこかに記載されたうつ症状を鑑定するための任意の他の等価の手段によって決定される場合、相乗効果は、相加効果よりも、少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約３倍又はそれ以上よりも高い場合がある。
[0164]一部の実施形態では、治療効果は、ＨＡＭＤ−２８、ＣＧＩ−Ｓ及びＣＰＦＱなどの神経心理学的試験を使用して決定することができる。したがって、一部の実施形態では、相乗的な治療効果とは、少なくとも２種以上の葉酸応答性バイオマーカーを保有しているヒト対象が葉酸含有化合物を投与される場合、それぞれのバイオマーカーに関連するＨＡＭＤ−２８の個々の低下の合計よりも大きな、ＨＡＭＤ−２８スコアの総低下を指す。一部の実施形態では、ＨＡＭＤ−２８の平均変化への相乗効果は、相加効果よりも少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％又はそれ以上高よりも高い場合がある。一部の実施形態では、ＨＡＭＤ−２８の平均変化への相乗効果は、相加効果よりも少なくとも約１．５倍、少なくとも約２倍、少なくとも約３倍又はそれ以上よりも高い場合がある。
[0165]例えば、単一の葉酸応答性バイオマーカー（ｉ）（すなわち、ＭＴＨＦＲにおける少なくとも１つの「Ｔ」バリアント）を保有することが決定している患者が、葉酸含有化合物を用いた投与（例えば任意選択で抗うつ剤と併用して）の後に、ＨＡＭＤ−２８に約−３．０〜約−５．０の平均変化を示し、また、単一の葉酸応答性バイオマーカー（ｉｉｉ）（すなわち、ＭＴＲ遺伝子における少なくとも１つの「Ｇ」バリアント）を保有することが決定している患者が、葉酸含有化合物を用いた投与（例えば任意選択で抗うつ剤と併用して）の後に、ＨＡＭＤ−２８に約−８．２の平均変化を示したことを示す。患者が両方の遺伝子変異を保有する場合、葉酸含有化合物を含む（例えば任意選択で抗うつ薬と併用した）治療に対して応答する際の患者のＨＡＭＤ−２８の平均変化は、約−２３．３であったが、この値は、それぞれのバイオマーカーに個々に関連する効果よりも高いだけではなく、それぞれ個々のバイオマーカーに関連する効果の合計（すなわち、相加効果は、ＨＡＭＤ−２８に約−１１．２〜約−１３．２の平均変化を生じることになる）よりも、少なくとも約２倍という驚くほど高いものでもある。
Ａ．葉酸応答性遺伝子バイオマーカー
[0166]うつの治療のために対象に投与した葉酸含有化合物の（例えば、抗うつ剤の効能を増大させるための併用療法における）治療上の効能を予測することができるＳＮＰとしては、以下のＳＮＰ：メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）に存在するｒｓ１８０１１３３、ＭＴＨＦＲに存在するｒｓ２２７４９７６、メチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）に存在するｒｓ１８０５０８７、メチオニンシンターゼレダクターゼ（ＭＴＲＲ）に存在するｒｓ１８０１３９４、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）に存在するｒｓ１００６７３７、ＤＮＡ（シトシン−５）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）に存在するｒｓ１８８３７２９、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１フィードバック調節タンパク質（ＧＣＨＦＲ）に存在するｒｓ７１６３８６２、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）に存在するｒｓ１２６５９、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原）１（ＦＯＬＨ１）に存在するｒｓ２０２６７６、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）に存在するｒｓ２２９７２９１、還元葉酸担体タンパク質１（ＲＦＣ１）に存在するｒｓ１０５１２６６、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）に存在するｒｓ８００７２６７、コリンリン酸シチジリルトランスフェラーゼＡ（ＰＣＹＴ１Ａ）に存在するｒｓ７６３９７５２、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）に存在するｒｓ６２７５、ＤＲＤ２に存在するｒｓ１０７９５９６、ＤＲＤ２に存在するｒｓ１１２４０５９４、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）に存在するｒｓ４６３３、ＣＯＭＴに存在するｒｓ４６８０、ドーパミン活性輸送体（ＤＡＴ若しくはＳＬＣ６Ａ３）に存在するｒｓ２５０６８２、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＦＴＣＤ）に存在するｒｓ２２７７８２０、メチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋依存性）１（ＭＴＨＦＤ１）に存在するｒｓ２２３６２２５及びこれらの任意の組合せ（表１及び表２を参照）のうち少なくとも２種が挙げられる。
Figure 2016518816
Figure 2016518816
[0167]一部の実施形態では、本明細書に記載したＳＮＰの対は、うつに罹っている又はうつの危険性がある対象が、葉酸含有化合物に陽性応答を有する可能性が高いか否かを決定するために使用される。特に、以下のＳＮＰ：
ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の１７９３位又は配列番号８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７４９７６によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号８が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｖ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号３の６６位又は配列番号１０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１３９４によって特定される）であり、配列番号３及び配列番号１０が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼレダクターゼ（ＭＴＲＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１００６７３７によって特定される）であり、配列番号１１が、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８８３７２９によって特定される）であり、配列番号１２が、ＤＮＡ（シトシン−５）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７１６３８６２によって特定される）であり、配列番号１３が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１フィードバック調節タンパク質（ＧＣＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｖｉｉｉ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１２６５９によって特定される）であり、配列番号１４が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｉｘ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２０２６７６によって特定される）であり、配列番号１５が、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原）１（ＦＯＬＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２９７２９１によって特定される）であり、配列番号１６が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０５１２６６によって特定される）であり、配列番号１７が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）であり、配列番号１８が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７６３９７５２によって特定される）であり、配列番号１９が、コリンリン酸シチジリルトランスフェラーゼＡ（ＰＣＹＴ１Ａ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｖ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ６２７５によって特定される）であり、配列番号２０が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０７９５９６によって特定される）であり、配列番号２１が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１１２４０５９４によって特定される）であり、配列番号２２が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉｉ．２つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６３３によって特定される）であり、配列番号２３が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｖｉｉｉ．２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｉｘ．少なくとも１つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２５０６８２によって特定される）であり、配列番号２５が、溶質担体ファミリー６（神経伝達性輸送ドーパミン）メンバー３（ＳＬＣ６Ａ３）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
ｘｘ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７７８２０によって特定される）であり、配列番号２６が、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＦＴＣＤ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、及び
ｘｘｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２３６２２５によって特定される）であり、配列番号２７が、メチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋依存性）１（ＭＴＨＦＤ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ
のうち少なくとも２種の存在は、葉酸含有化合物に対する応答に関連する。
[0168]どちらかのマーカー単独によって生じる応答よりも大きな治療応答を示す２種のバイオマーカーの組合せを、表３に提示する。
Figure 2016518816
Figure 2016518816
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Figure 2016518816
Figure 2016518816
Figure 2016518816
Figure 2016518816
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[0169]一部の実施形態では、葉酸含有化合物を含む治療に対して、陽性に応答することになる患者を特定するために、表３に記載の二重バイオマーカー組合せを、本明細書に記載したアッセイ及び／又は方法に使用することができる。他の実施形態では、本明細書に記載した葉酸含有化合物を、表３に記載の二重バイオマーカー組合せを保有する患者を治療するために、使用することができる。
[0170]本明細書に記載した相乗的な二重バイオマーカー組合せは、２つの個々のバイオマーカー単独によって生ずる応答の合計よりも大きいか、又はどちらかのバイオマーカー単独によって生ずる応答よりも大きい、葉酸を含む治療に対する治療応答を標示する（表４）。
Figure 2016518816
[0171]一部の実施形態では、表２に記載の相乗的な二重バイオマーカー組合せは、葉酸含有化合物を含む治療に陽性に応答することになる患者を特定するために、本明細書に記載したアッセイ及び／又は方法において使用することができる。他の実施形態では、本明細書に記載した葉酸含有化合物は、表２に記載の相乗的な二重バイオマーカー組合せを保有する患者を治療するために使用することができる。
[0172]一部の実施形態では、葉酸含有化合物へ応答性があることを予測する相乗的な二重遺伝子対は、１）少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、及び２）少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰである。
[0173]他の実施形態では、葉酸含有化合物へ応答性があることを予測する相乗的な二重遺伝子対は、１）少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）であり、配列番号１８が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、及び２）２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰである。
[0174]さらに他の実施形態では、葉酸含有化合物へ応答性があることを予測する相乗的な二重遺伝子対は、１）少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）であり、配列番号１８が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、及び２）２つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６３３によって特定される）であり、配列番号２３が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰである。
[0175]他の相乗的な二重マーカー組み合わせは、
（ｉ）少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１００６７３７によって特定される）であり、配列番号１１が、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、及び（ｉｉ）２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
（ｉ）少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１００６７３７によって特定される）であり、配列番号１１が、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、及び（ｉｉ）少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
（ｉ）少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、及び（ｉｉ）少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子若しくはその相補体又は少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子若しくはその相補体を含む、配列番号１５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２０２６７６によって特定される）であり、配列番号１５が、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原）１（ＦＯＬＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
（ｉ）少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、並びに（ｉｉ）肥満、
（ｉ）少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）であり、配列番号１８が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、並びに（ｉｉ）肥満、
（ｉ）少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８８３７２９によって特定される）であり、配列番号１２が、ＤＮＡ（シトシン−５）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、並びに（ｉｉ）肥満、並びに
（ｉ）少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、並びに（ｉｉ）肥満
を含む。
[0176]さらに、うつの治療のために葉酸含有化合物をヒト対象に（例えば、抗うつ剤の効能を増大させるための併用療法で）投与することの効能を予測することができる、末梢のバイオマーカーの条件としては、ｓ−アデノシルメチオニン（ＳＡＭ）とｓ−アデノシルホモシステイン（ＳＡＨ）との間の相対発現レベル、４−ヒドロキシノネナール（４−ＨＮＥ）の発現、高感度ｃ−反応性タンパク質（ｈｓＣＲＰ）の発現及びそれらの任意の組合せが挙げられる。また、肥満も、葉酸含有化合物を含む治療レジメン（例えば、単独療法又は抗うつ剤との併用療法）の有効性を断定することが見出されている。
[0177]本明細書に提供したアッセイ及び／又は方法の一部の実施形態では、少なくとも１種の相乗的なバイオマーカーの組合せを測定し、任意選択で肥満、ＳＡＭ／ＳＡＨ比、４−ＨＮＥのレベル、ｈｓＣＲＰのレベル又はそれらの組合せなどの少なくとも１種の末梢のバイオマーカーを測定して、葉酸含有化合物、例えばＬ−メチル葉酸の補助療法に対して対象が治療応答を有することになるか否かを決定する。
Ｂ．他の葉酸応答性バイオマーカー
[0178]一部の実施形態では、ｓ−アデノシルメチオニン（ＳＡＭ）とｓ−アデノシルホモシステイン（ＳＡＨ）の発現比（ＳＡＭ／ＳＡＨ比）が所定の基準比よりも小さい場合、例えば健常な対象の生体試料で測定したときのＳＡＭ／ＳＡＨの対照比よりも小さい場合、対象は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを推奨及び／又は任意選択で施され得る。一実施形態では、ＳＡＭとＳＡＨとの所定の基準比は、健常な対象の血清試料で測定した場合のＳＡＭとＳＡＨとの対照比であり得るが、この場合、ＳＡＭとＳＡＨとの対照比は、４、５、６、７、８、９、１０、１１又は１２などの約４〜約１２の範囲であり得る。他の実施形態では、健常な対象の血清試料で測定した場合のＳＡＭとＳＡＨとの対照比は、約７であり得る。一部の実施形態では、ＳＡＭとＳＡＨとの所定の基準比は、血漿試料で測定した場合に約３であり得る。他の実施形態では、ＳＡＭとＳＡＨとの所定の基準比は、血漿試料で測定した場合に約２．８であり得る。別の実施形態では、血漿試料で測定した場合、ＳＡＭとＳＡＨとの所定の基準比は、約２．７１であり得る。一部の実施形態では、ＳＡＭとＳＡＨとの発現比が、少なくとも所定の基準比である又はそれよりも大きい（例えば、血漿試料で測定したときに少なくとも２．７１又はそれよりも大きい）場合、対象は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを推奨も施しもされない。血清試料対尿試料など、試験試料源に応じて、血漿試料についてのＳＡＭとＳＡＨとの所定の基準比は、例えば尿試料の所定の基準比とは異なり得る。例えば、Ｓｔａｂｌｅｒ ＳＰ及びＡｌｌｅｎ ＲＨ．２００４、Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、第５０巻、３６５〜３７２頁を参照されたい。ＳＡＭ及びＳＡＨを検出するための方法を以下に記載する。
[0179]一部の実施形態では、対象の４−ＨＮＥの発現が第１の所定の基準値よりも大きい場合、例えば健常な対象の生体試料で測定したときの４−ＨＮＥの対照値よりも大きい場合、対象は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを推奨及び／又は任意選択で施され得る。一実施形態では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、健常な対象の血清試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値であり得るが、この場合、４−ＨＮＥの対照値は、血清１リットル当たり約０．２４モル又は血清１リットル当たり約０．０４ｍｇであり得る。例えば、Ｇｏｃｍｅｎ ＡＹら、２００８、Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｂｉｏｈｅｍｉｓｔｒｙ、第４１巻、８３６〜８４０頁を参照されたい。一実施形態では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、血漿試料で測定した場合、血漿１リットル当たり約３ｍｇであり得る。一実施形態では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、血漿試料で測定した場合、血漿１リットル当たり約３．２ｍｇであり得る。一実施形態では、４−ＨＮＥの第１の所定の基準値は、血漿試料で測定した場合、血漿１リットル当たり約３．２８ｍｇであり得る。一部の実施形態では、４−ＨＮＥの発現が、第１の所定の基準値よりも低い（例えば、血漿試料で測定したときに血漿１リットル当たり３．２８ｍｇよりも低い）場合、対象は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを推奨も施しもされない。血液試料対脳脊髄液試料など、試験試料源に応じて、血漿試料についての所定の基準値は、例えば脳脊髄液試料の所定の基準値とは異なり得る。患者から採取した試料の４−ＨＮＥのレベルを測定するための方法を以下に記載する。
[0180]一部の実施形態では、本明細書に記載したアッセイ及び方法は、高感度ｃ−反応性タンパク質（ｈｓＣＲＰ）の発現を決定するステップをさらに含み得るが、この場合第２の所定の基準値よりも大きい、例えば健常な対象の生体試料で測定したときのｈｓＣＲＰの対照値よりも大きいｈｓＣＲＰの発現は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを推奨及び／又は任意選択で施される対象を標示する。一部の実施形態では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、健常な対象の血清試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値であり得るが、この場合、ｈｓＣＲＰの対照値は、血清１リットル当たり約０．５ｍｇ〜血清１リットル当たり約４．５ｍｇの範囲であり得る。例えば、Ｇｕｖｅｎ ＳＦら、２０１２、Ｓｌｅｅｐ Ｂｒｅａｔｈ、第１６巻、２１７〜２２１頁を参照されたい。他の実施形態では、ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値は、血漿試料で測定した場合、血漿１リットル当たり約２．３ｍｇであり得る。一部の実施形態では、ｈｓＣＲＰの発現が、第２の所定の基準値よりも低い（例えば、血漿試料で測定したときに血漿１リットル当たり２．３ｍｇよりも低い）場合、対象は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを推奨も施しもされない。血液試料対脳脊髄液試料など、試験試料源に応じて、ｈｓＣＲＰ発現血漿試料は、例えば脳脊髄液（ＣＳＦ）試料の発現とは異なり得る。患者から採取した試料のｈｓＣＲＰのレベルを測定するための方法を以下に記載する。
[0181]一部の実施形態では、物理的なバイオマーカー、例えば肥満指標を測定することもでき、この場合、肥満（例えば、少なくとも約３０ｋｇ／ｍ２又はそれ以上のＢＭＩ値によって規定される）、男性で４０インチを超える（若しくは１２０ｃｍを超える）、若しくは女性で３５インチを超える（若しくは８８ｃｍを超える）胴囲、男性で０．９５を上回る、若しくは女性で０．８０を上回る胴−臀部比、並びに／又は男性で少なくとも約２５％、若しくは女性で少なくとも約３２％の体脂肪率は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンがヒト対象に推奨及び／又は施されるべきであることを示す。
[0182]一部の実施形態では、本明細書に提供したアッセイ／方法は、ヒト対象が肥満か否かを決定するステップを含むことができる。ヒト対象が肥満であることが決定される場合、次いで、ヒト対象は、有効量の葉酸含有化合物を含む治療レジメンのために選択されて、任意選択で該レジメンを施される。ヒト対象の肥満を決定する方法は、当技術分野で公知であり、体格指数（ＢＭＩ）測定、腹部脂肪の測定（例えば胴囲又は胴−臀部比による）、体脂肪の測定、皮下脂肪厚、水中体重秤量（密度測定）、空気置換プレチスモグラフィ、コンピュータ断層撮影（ＣＴ）及び核磁気共鳴撮像（ＭＲＩ）、及び二重エネルギーＸ線吸収測定（ＤＥＸＡ）並びにこれらの任意の組合せを含むことができるが、これらに限定されない。
Ｃ．バイオマーカーを検出又は測定するための方法
[0183]一部の実施形態では、本明細書に記載したアッセイ及び／又は方法において実施される解析に付される試験試料は、対象の試料（例えば生体試料）に由来する。本明細書で使用する場合の「生体試料」という用語は、生物有機体から採取又は単離した試料、例えば細胞溶解物、対象由来の組織試料のホモジネート又は対象由来の液体試料を表す。生体試料は、未処理の又は前処理（若しくは前加工）した生体試料を含む。生体試料の非限定的な例としては、血液（全血、血漿、臍帯血及び血清を含む）、泌乳産物（例えば乳汁）、羊水、喀痰、唾液、尿、精液、脳脊髄液、気管支吸引液、汗、粘液、液性の糞便、滑液、リンパ液、涙液、気管吸引液やこれらの画分などの生体液が挙げられる。他の実施形態では、生体試料は、細胞溶解物及びその画分を含むことができる。例えば。細胞（赤血球、血小板、白血球及び本明細書に記載した生体液中に循環している任意の細胞など）を回収して溶解し、細胞溶解物を得ることができる。一部の実施形態では、生体試料は血液試料である。一部の実施形態では、生体試料は血漿試料である。他の実施形態では、生体試料は唾液試料である。別の実施形態では、生体試料は口腔試料である。さらに他の実施形態では、生体試料は尿試料である。他の実施形態では、生体試料は脳脊髄液試料である。
[0184]一実施形態では、試料は、血漿／血清バイオマーカーの発現レベルを測定する又はＳＮＰを決定するために使用することのできる、ヒト対象由来の細胞及び／又は血液、唾液若しくは尿の非細胞性画分などの非細胞性生体材料を含有する。一部の実施形態では、試料は、切除、生検又はコア針生検由来である。また、微細針吸引試料が使用され得る。試料は、パラフィン包埋又は凍結した組織のいずれかであり得る。
[0185]試料は、対象から細胞の試料を取り出すことによって得ることができるが、既に単離した（例えば、別の者によって単離された）細胞を使用することによって達成することもできる。また、生体試料は、新たに採集される又は既に採集された試料であり得る。一部の実施形態では、生体試料は、凍結生体試料、例えば凍結組織又は尿、血液、血清若しくは血漿などの液体試料であり得る。凍結試料は、本明細書に記載した方法、アッセイ及び系を用いる前に解凍することができる。解凍後、凍結試料は、本明細書に記載した方法、アッセイ及び系に付す前に遠心分離することができる。
[0186]一部の実施形態では、試料は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）後の増幅された核酸産物であり得る。核酸産物は、ＤＮＡ、ＲＮＡ及びｍＲＮＡを含むことができ、当技術分野で周知の任意の多くの手順を使用して、特定の生体試料から単離することができるが、選ばれる特定の単離手順は、特定の生体試料に対し適切である。先に記載したような核酸バリアントを単離及び解析する方法は、当業者に周知であり、例えばＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ： Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、第３版、Ｓａｍｂｒｏｏｋ及びＲｕｓｓｅｌｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、２００１に見出すことができる。
[0187]当業者は、本明細書に記載したＳＮＰ又は血清／血漿バイオマーカーの発現レベルを決定するために必要な試験試料又は生体試料、例えば血液の前処理に適切な方法又は工程を認識している。
[0188]ＳＮＰの特定方法は、陽性型（対立遺伝子の内包）又は陰性型（対立遺伝子の除外）のいずれかであり得る。陽性型の方法は、多型部位に含有されるヌクレオチドの同一性を決定し、一方、陰性型の方法は、多型部位に存在しないヌクレオチドの同一性を決定する。そのため、野生型の部位は、野生型又は変異でないとして、いずれかで特定される。例えば、野生型対立遺伝子がチミンを含有し、変異対立遺伝子がシトシンを含有する二対立遺伝子多型部位では、ある部位は、陽性には、チミン又はシトシンのいずれかであると決定され、陰性には、チミン（及びそれゆえシトシン）でもシトシン（及びそれゆえチミン）でもないことを決定される。
[0189]一部の態様では、本明細書に提供するのは、対象が、多型についてホモ接合性である、多型についてヘテロ接合性である、又は多型を全く欠損しているか（すなわちホモ接合性の野生型）を決定するための方法が包含されている。例示的な実施形態にすぎないものとして、配列番号１の６７７位のＣ＞Ｔの変動を検出する方法、すなわち、ＳＮＰ遺伝子座においてＣ及びＴ対立遺伝子についてヘテロ接合性である、又はＣ対立遺伝子若しくはＴ対立遺伝子についてホモ接合性である、対立遺伝子を決定するための方法を提供する。対立遺伝子識別、制限酵素消化、制限断片長多型解析、対立遺伝子特異的プローブハイブリダイゼーション、対立遺伝子特異的プライマー伸長、対立遺伝子特異的増幅、シークエンシング［例えばサンガーシークエンシング、ピロシークエンシング（ｐｙｒｏｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）（商標）、及び次世代シークエンシング］、５’ヌクレアーゼ消化、モレキュラービーコン（ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｂｅａｃｏｎ）アッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、一塩基伸長若しくはミニシークエンシング、サイズ解析、均一アッセイ［例えば、タックマン（ＴａｑＭａｎ）（登録商標）アッセイ］、融解曲線ＦＲＥＴハイブリダイゼーション、蛍光偏光、インベーダー（ＩＮＶＡＤEＲ）（登録商標）アッセイ、ＳＮＰマイクロアレイ及び一本鎖高次構造多型などの、本明細書に記載した任意のＳＮＰの対立遺伝子を検出するための実質的にあらゆる方法を使用することができる。
[0190]遺伝子の変異又は多型を検出する任意のアプローチは、本明細書に記載したＳＮＰバイオマーカーの存在又は非存在を検出するために使用することができ、そのようなアプローチとしては、一本鎖高次構造多型（ＳＳＣＰ）解析［Ｏｒｉｔａら（１９８９）、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、第８６巻、２７６６〜２７７０頁］、ヘテロ二本鎖解析［Ｐｒｉｏｒら（１９９５）、Ｈｕｍ．Ｍｕｔａｔ．、第５巻、２６３〜２６８頁］、オリゴヌクレオチドライゲーション［Ｎｉｃｋｅｒｓｏｎら（１９９０）、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、第８７号、８９２３〜８９２７頁］及びハイブリダイゼーションアッセイ［Ｃｏｎｎｅｒら（１９８３）、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、第８０巻、２７８〜２８２頁］が挙げられるが、これらに限定されない。ＰＣＲ−ＲＦＬＰ、対立遺伝子特異的増幅（ＡＳＡ）［Ｒｕａｎｏ及びＫｉｄｄ（１９８９）、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．、第１７巻、８３９２頁］、単一分子希釈（ＳＭＤ）［Ｒｕａｎｏら（１９９０）、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、第８７巻、６２９６〜６３００頁］や共役増幅及びシークエンシング（ＣＡＳ）［Ｒｕａｎｏ及びＫｉｄｄ（１９９１）、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．、第１９巻、６８７７〜６８８２頁］などの古典的なＴａｑポリメラーゼＰＣＲに基づく戦略は、ハプロタイプを決定するために、実施し易く、高感度の方法である［Ｍｉｃｈａｌａｔｏｓ−Ｂｅｌｏｉｎら（１９９６）、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．、第２４巻、４８４１〜４８４３頁；Ｂａｒｎｅｓ（１９９４）、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ、第９１巻、５６９５〜５６９９頁；Ｒｕａｎｏ及びＫｉｄｄ（１９９１）、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．、第１９巻、６８７７〜６８８２頁］。
[0191]ＳＮＰ遺伝子型判定方法は、例えばＳｅｑｕｅｎｏｍ（サンディエゴ、カリフォルニア州）、Ｉｌｌｕｍｉｎａ（サンディエゴ、カリフォルニア州），Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（カールスバッド、カリフォルニア州）及びＡｆｆｙｍｅｔｒｉｘ（サンタクララ、カリフォルニア州）から入手可能である。
[0192]一部の実施形態では、本明細書に提供するアッセイ及び／又は方法は、うつである又はうつの危険性がある対象由来の試料、例えば血清、血漿又はＣＳＦ試料中のＳＡＭ、ＳＡＨ及び／又は４−ＨＮＥなどの代謝物のレベルを測定するステップを含む。代謝物（例えばＳＡＭ、ＳＡＨ及び／又は４−ＨＮＥ）のレベルは、当技術分野で公知の任意の方法によって検出することができる。例えば、ＧＣ、ＨＰＬＣ（ＬＣ−ＭＳ）及び／又はＣＥによって分離した後に、質量分析計（ＭＳ）を、代謝物を特定及び定量するために使用することができる。一部の実施形態では、ＭＳを独立した技術として使用することができ、例えば、生体試料を、代謝物（例えばＳＡＭ、ＳＡＨ及び／又は４−ＨＮＥ）の分離と検出の両方を行う質量分析計の内部へ直接的に注入する。一部の例では、例えば、質量分析（ＧＣ−ＭＳ）及び／又は高速液体クロマトグラフィ（ＨＰＬＣ）及び／又はキャピラリー電気泳動（ＣＥ）とインターフェースで接続されている場合、ガスクロマトグラフィ（ＧＣ）によって、標的代謝物（例えばＳＡＭ、ＳＡＨ及び／又は４−ＨＮＥ）を、任意選択で生体試料から（例えば検出前に）分離することができる。ＳＡＭ、ＳＡＨ及び／又はそれらの比を決定するための免疫アッセイを含む、ＳＡＭ及びＳＡＨの検出に関するさらなる詳細は、参照により本明細書に組み込まれている米国特許出願公開第２００９／０２６３８７９号に記載されている。
[0193]代謝物を検出するための他の有用な方法としては、ナノ構造イニシエータ質量分析、レーザー脱離／イオン化質量分析、例えばマトリックス支援レーザー脱離／イオン化（ＭＡＬＤＩ）質量分析、表面増強レーザー脱離／イオン化（ＳＥＬＤＩ）質量分析、二次イオン質量分析（ＳＩＭＳ）、脱離エレクトロスプレーイオン化（ＤＥＳＩ）質量分析、核磁気共鳴（ＮＭＲ）スペクトル分析、イオン移動度スペクトル分析、電気化学的検出（ＨＰＬＣに共役）、放射標識（薄層クロマトグラフィに組み合わせる場合）、ＭＡＬＤＩ／ＴＯＦ（飛行時間型）、ＳＥＬＤＩ／ＴＯＦ、液体クロマトグラフィ−質量分析（ＬＣ−ＭＳ）、ガスクロマトグラフィ−質量分析（ＧＣ−ＭＳ）、高速液体クロマトグラフィ−質量分析（ＨＰＬＣ−ＭＳ）、キャピラリー電気泳動−質量分析又はタンデム質量分析（例えばＭＳ／ＭＳ、ＭＳ／ＭＳ／ＭＳ、ＥＳＩ−ＭＳ／ＭＳなど）などの質量分析が挙げられる。
[0194]他の実施形態では、酵素共役アッセイを、生体試料中の代謝物（例えばＳＡＭ、ＳＡＨ及び／又は４−ＨＮＥ）のレベルを決定するために使用することができる。ほんの一例としては、酵素共役反応、すなわちチオプリンメチルトランスフェラーゼによって触媒されるチオールメチル化（例えば、Ｃａｎｎｏｎ，Ｌ．Ｍら、Ａｎａｌｙｔｉｃａｌ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、第３０８巻、第２号、３５８〜３６３頁、２００２参照）に基づくＳＡＭの立体特異的比色アッセイによって、試料中のＳＡＭのレベルを検出することができる。例えば、米国特許第８，３４４，１１５号、米国特許出願公開第２０１２／０１３０２１２号及び第２００８／００８１３７５号に記載したような追加的な代謝物解析方法は、生体試料中の代謝物（例えばＳＡＭ、ＳＡＨ及び／又は４−ＨＮＥ）の測定のために使用することもできる。ＳＡＭ、ＳＡＨ及び／又はそれらの比を決定するための免疫アッセイを含む、ＳＡＭ及びＳＡＨの検出に関するさらなる詳細は、参照により本明細書に組み込まれている米国特許出願公開第２００９／０２６３８７９号に記載されている。４−ＨＮＥのレベルは、４−ＨＮＥの付加体、例えば４−ＨＮＥ−Ｈｉｓの発現レベルを測定することによって決定することができる。４−ＨＮＥの付加体を測定するための市販のＥＬＩＳＡキット、例えばＯｘｉＳｅｌｅｃｔ（商標）ＨＮＥ−Ｈｉｓ Ａｄｄｕｃｔ ＥＬＩＳＡキットは、例えばＣｅｌｌＢｉｏＬａｂｓから入手可能である。
[0195]一部の実施形態では、対象から採取した試料中のｈｓＣＲＰの発現レベルは、タンパク質レベル又はｍＲＮＡレベルを測定することによって、決定することができる。
[0196]限定なく、ｈｓＣＲＰタンパク質のレベルは、酵素結合免疫吸着アッセイ（ＥＬＩＳＡ）、放射免疫アッセイ（ＲＩＡ）、免疫放射アッセイ（ＩＲＭＡ）、ウェスタンブロッティング、免疫細胞化学又は免疫組織化学などの免疫アッセイによって検出することができる。血清、血漿、血液、ＣＳＦ試料中のｈｓＣＲＰの存在又はレベルを決定するのに適したＥＬＩＳＡキットは、例えばＭＰ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌｓ、Ａｂｃａｍ及びＣａｌｂｉｏｔｅｃｈから入手可能である。
[0197]当業者は、バイオマーカーに特異的に結合することができる（例えば認識する）抗体、抗体断片、免疫コンジュゲートなどが、本明細書に記載した分析物のタンパク質発現のレベルを検出するために有用であることを認識している。試料中のタンパク質発現のレベルを測定するための、当技術分野で公知の任意の方法は、本明細書に記載したアッセイ及び／又は方法において使用することができる。
[0198]他の実施形態では、ｈｓＣＲＰの発現は、例えばハイブリダイゼーションアッセイ（例えばマイクロアレイ）又は増幅ベースアッセイなどのアッセイを用いて、ｍＲＮＡ発現のレベルで検出される。好適な実施形態では、本明細書に提供する分析物のｍＲＮＡ発現のレベルは、ノーザンブロッティング、逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）、定量的ＲＴ−ＰＣＲ（ｑＲＴ−ＰＣＲ）、タックマン（登録商標）アッセイ又はマイクロアレイによって、実施される。試料中のＲＮＡ発現のレベルを測定するための、当技術分野で公知の任意の方法は、本明細書に記載したアッセイ及び／又は方法において使用することができる。
Ｄ．うつに罹っている又はうつの危険性がある対象
[0199]一部の実施形態では、本明細書に記載したアッセイ、方法及び組成物に適応可能な対象は、うつに罹っていると診断されているか、疑いがあるか、発症している対象である。したがって、うつであると診断されているか、疑いがあるか、発症している対象は、本明細書に記載したアッセイ、方法及び／又は組成物に付される前に選択され得る。他の実施形態では、本明細書に記載した対象は、大うつ病性障害（例えば、説明不能な不眠、疲労、易怒性など）を含む、うつを標示する１種又は複数の症状を提示する、又は、例えばＤＳＭ−ＩＶ又はＩＣＤ−１０に収載されている基準に従って、大うつ病性障害を含むうつについて（例えば、通常検診の間）スクリーニングされている個体である。
[0200]ＤＳＭ−ＩＶ及びＩＣＤ−１０は、精神障害を分類するための共通の言語と標準的な基準を提供し、大うつ病性障害を含むうつを診断するために、適切に訓練された総合診療医によって、又は精神科医若しくは心理学者によって、一般的に使用されている。うつ症状としては、集中、想起及び／又は意志決定の問題、食事及び／又は睡眠の習慣の変化、楽しい活動での関心の喪失、通勤すること又は日々の責務を果たすことの困難、罪悪及び／又は絶望の感情、思考及び／又は発話の遅延、並びに死又は自殺の思考への拘りを挙げることができるが、これらに限定されない。当業者は、ＤＳＭ−ＩＶ又はＩＣＤ−１０に基づいて、うつのスコア又は格付けを決定することができる。
[0201]当技術分野で公知の精神障害を分類するための他の尺度又は基準、例えばマイヤー若しくはＨＡＭＤ−７尺度、又は社会的機能質問表（ＳＦＱ）、視覚的アナログ尺度（ＶＡＳ）及び／又は認知・身体機能質問表（ＣＰＦＱ）もまた、うつの程度を決定するために使用することができる。
[0202]うつの診断の間に、診療医はまた、患者の病歴を評価し、アルコール及び薬物の使用などの患者の気分（健康か又はその反対か）を調節する現状の方法を話し合い、並びに／又は人間の現在の気分と思考の内容、特に、絶望若しくは悲観、自傷若しくは自殺、及び前向きな考え若しくは計画性の欠如のテーマの存在に関する評価である、精神現在症検査を実施することができる。また、診療医は、一般に、認知と関連しない他のうつ症状の原因を排除するために、健康診断を実施することができる。例えば、甲状腺機能低下を除外するためにＴＳＨ及びサイロキシンを、代謝障害を排除するために塩基性電解質及び血清カルシウムを、並びに全身性感染又は慢性疾患を排除するためにＥＳＲを含む全血球数を、測定する血液検査が使用され得る。テストステロンレベルも、男性のうつの原因である性腺機能低下症を診断するために鑑定することができる。
[0203]当技術分野で公知の任意の遺伝子法又はバイオマーカー法を、うつの診断のために使用することもできる。例えば、米国特許出願公開第２０１０／０２７３１５３号は、ＴＧ７ＡＴハプロタイプの存在が、大うつ病性障害の素因を標示し得ることを記載している。ＡＴＰ２Ａ２、ＳＣＹＡ５、ＳＴＩＰ１、ＥＥＦ１Ａ１、ＧＲＢ１０、ＣＡＳＰ６、ＴＳＳＣ１、ＲＡＢ９、ＮＦＡＴＣ３やＴＰＲなどのうつの追加的な遺伝子マーカー及び例えば、米国特許出願公開第２００５／０２３９１１０号に収載されている任意の他の遺伝子マーカーもまた、うつを診断するために使用することができる。
[0204]一部の実施形態では、本明細書に記載したアッセイ、方法及び組成物に適応可能な対象は、大うつ病性障害に罹っている、又は大うつ病性障害である若しくは発症する疑いがあることを診断されている対象である。大うつ病のエピソードは、少なくとも２週間続く重篤な抑うつ気分の存在によって特徴付けられる。エピソードは、孤立又は再発し得るものであり、熟練の診療医によって、軽度（最低限の基準を上回るごく僅かな症状あり）、中程度、又は重度（社会的若しくは職業上の機能に著しい影響あり）に分類することができる。
[0205]一部の実施形態では、本明細書に記載したアッセイ、方法及び組成物に適応可能な対象は、うつ［例えば大うつ病性障害（ＭＤＤ）］と診断されており、抗うつ単独療法、すなわち単一の抗うつ剤のみを用いたうつの治療に抵抗性がある対象である。一部の例では、うつに罹っている対象は、１種又は複数のクラスの少なくとも１種の抗うつ剤、例えば、１種又は複数のクラスの少なくとも２、３、４、５種又はそれ以上の抗うつ剤に抵抗性がある。一部の実施形態では、本明細書に記載した対象は、大うつ病性障害（ＭＤＤ）と診断されており、少なくとも１種のセロトニン再取り込み阻害剤（ＳＲＩ）に抵抗性があり、少なくとも１、２、３、４、５種又はそれ以上のＳＲＩが含まれる。他の実施形態では、本明細書に記載した対象は、大うつ病性障害（ＭＤＤ）と診断されており、少なくとも１種の選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）に抵抗性があり、少なくとも１、２、３、４、５種又はそれ以上のＳＳＲＩが含まれる。
[0206]一部の実施形態では、抗うつ単独療法に抵抗性のある対象は、抗うつ単独療法を少なくとも約３週間若しくはそれ以上又は約３週間まで施された後に、彼らが悩んでいるうつの少なくとも１種の症状において、臨床上意義のある低下を（例えば、医師又は心理学者によって鑑定される場合）示さない。うつ症状の非限定的な例としては、落ち込み若しくは抑うつ気分、快感消失、低いエネルギーレベル、罪悪感、作業量及び関心の減少、精神運動遅滞、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な身体症状、認知の低下又はそれらの任意の組合せが挙げられるが、これらに限定されない。
[0207]一部の実施形態では、抗うつ単独療法に抵抗性のある対象は、抗うつ単独療法を少なくとも約３週間、少なくとも約４週間、少なくとも約５週間、少なくとも約６週間、少なくとも約７週間、少なくとも約８週間、少なくとも約９週間、少なくとも約１０週間、少なくとも約１１週間、又は少なくとも約１２週間又はそれ以上施された後に、うつの少なくとも１種の症状（例えば１、２、３又はそれ以上の症状）において、臨床上意義のある低下を示さない。一部の実施形態では、対象は、抗うつ単独療法を少なくとも約３週間若しくはそれまで、少なくとも約４週間若しくはそれまで、少なくとも約５週間若しくはそれまで、少なくとも約６週間若しくはそれまで、少なくとも約７週間若しくはそれまで、少なくとも約８週間若しくはそれまで、少なくとも約９週間若しくはそれまで、少なくとも約１０週間若しくはそれまで、少なくとも約１１週間若しくはそれまで、又は少なくとも約１２週間若しくはそれまで施された後に、うつの少なくとも１種の症状（例えば１、２、３又はそれ以上の症状）において、臨床上意義のある低下を示さない場合、治療抵抗性であることを決定される。うつの症状の臨床上意義のある低下は、医師又は心理学者によって鑑定され得る。
[0208]一部の実施形態では、本明細書に記載した対象は、治療抵抗性うつ（ＴＲＤ）又は治療難治性うつと診断される。例えば、対象は、少なくとも２種若しくはそれ以上の抗うつ薬、例えば、少なくとも３種若しくはそれ以上、又は少なくとも４種若しくはそれ以上の抗うつ薬に応答しない又は抵抗性であるうつの一種を示す。治療抵抗性うつは、４〜１２週間以内の間に２種の治療又は２種の抗うつ剤を施された後に緩和を達成できないことを含み得る。
[0209]一部の実施形態では、対象は、少なくとも２種又はそれ以上の抗うつ薬を（個々に又は組み合わせて）少なくとも約３週間又はそれ以上、例えば、少なくとも約４週間、少なくとも約５週間、少なくとも約６週間、少なくとも約７週間、少なくとも約８週間、少なくとも約９週間、少なくとも約１０週間、少なくとも約１１週間、少なくとも約１２週間又はそれ以上投与された後に、本明細書に記載した少なくとも１種のうつの症状において、対象が臨床上意義のある低下を示さない場合、治療抵抗性うつと診断される。一部の実施形態では、対象は、少なくとも２種又はそれ以上の抗うつ薬を（個々に又は組み合わせて）、例えば、約１１週間まで、約１０週間まで、約９週間まで、約８週間まで、約７週間まで、約６週間まで、約５週間まで、約４週間まで、又は約３週間までを含む、約１２週間まで投与した後に、本明細書に記載した少なくとも１種のうつの症状において、対象が臨床上意義のある低下を示さない場合、治療抵抗性うつと診断される。一部の実施形態では、対象は、少なくとも２種又はそれ以上の抗うつ薬を（個々に又は組み合わせて）少なくとも約６週間若しくはそれまで、少なくとも約７週間若しくはそれまで、少なくとも約８週間若しくはそれまで、少なくとも約９週間若しくはそれまで、少なくとも約１０週間若しくはそれまで、少なくとも約１１週間若しくはそれまで、又は少なくとも約１２週間若しくはそれまで投与した後に、本明細書に記載した少なくとも１種のうつの症状において、対象が臨床上意義のある低下を示さない場合、治療抵抗性うつと診断される。一部の実施形態では、治療抵抗性うつは、対象が、少なくとも約１２週間又はそれまでの抗うつ剤の投薬後、うつ症状に臨床上意義のある改善を経験しない場合に診断される。
[0210]一部の実施形態では、本明細書に記載した対象は、治療抵抗性うつ（ＴＲＤ）又は治療難治性うつと診断され、ＴＲＤのための無投薬治療、例えば、以下に限定されないが、電気けいれん療法、迷走神経刺激、経頭蓋磁気刺激及び／又は「会話」療法を現在受けている。これらの対象は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを、単独で、又は本明細書に記載したＴＲＤのための無投薬治療との併用で、推奨又は施され得る。一部の実施形態では、これらの対象は、葉酸含有化合物を含む治療レジメンを、少なくとも１種の抗うつ薬と、任意選択でＴＲＤのための無投薬治療との併用で、推奨又は施され得る。これらの実施形態では、ＴＲＤに罹っている対象に、葉酸含有化合物との併用で推奨又は投与される抗うつ薬は、対象が既に抵抗性を示している抗うつ薬、又は対象が試したことのない抗うつ薬であり得る。
[0211]一部の実施形態では、本明細書に記載したアッセイ、方法及び組成物について選択される対象は、うつから緩和されており、今、再発又は再発の素因を診断されている。他の実施形態では、本明細書に記載したアッセイ、方法及び組成物について選択される対象は、うつと診断されており、少なくとも１種の抗うつ剤を現在摂取している。
Ｅ．葉酸含有化合物の補助的療法
[0212]本明細書に記載のアッセイ及び／又は方法は、うつである具体的な患者を特定する及び選択するためのスクリーニングとして使用でき、抗うつ剤及び葉酸含有化合物を含む治療レジメンは、抗うつ薬の治療効果を増強するために有益である。いくつかの実施形態では、選択された患者、例えば、うつである又はうつの危険性があり、相乗的二重ＳＮＰ組合せ（ＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧとＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴとの対及びＭＴＨＦＲ ６７７ ＣＴ／ＴＴとＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧとの対）を保有している患者は、現在少なくとも１種の抗うつ薬を受けている。いくつかの場合では選択された患者は、抗うつ単独療法への不十分な応答を経験している又はしたことがある。
[0213]治療レジメンに含まれる葉酸含有化合物は、単一投薬形態を介して一緒に又は別々の投与によって投与されてもよい。ある特定の実施形態では葉酸含有化合物は、単一投薬形態で投与されてもよい。例えば単一投薬形態は、経口投与のための単一の錠剤、丸剤、カプセル又は非経口投与のための溶液として投与されてもよい。代替的に葉酸含有化合物は、別々の組成物として、例えば別々の錠剤又は溶液として投与されてもよい。葉酸含有化合物の部分用量の投与間の時間の長さは、所望の治療効果を達成するために調整されてもよい。
[0214]いくつかの実施形態では葉酸含有化合物を含む治療レジメンは、少なくとも１つの抗うつ剤（例えば、１、２、３種以上の抗うつ剤）をさらに含む。抗うつ剤の非限定的例は、三環系抗うつ薬、モノアミンオキシダーゼ阻害剤、選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）、セロトニン−ノルエピネフリン再取り込み阻害剤、ノルエピネフリン及びドーパミン再取り込み阻害剤及び非定型的抗うつ剤を含む。
[0215]いくつかの実施形態では治療レジメンは、抗うつ剤と併用して葉酸含有化合物を含んでもよい。いくつかの実施形態では抗うつ薬は、これだけに限らないが、フルオキセチン、フルボキサミン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの任意の組合せなどの選択的セロトニン再取り込み阻害剤を含む。
[0216]葉酸含有化合物及び少なくとも１つの抗うつ剤を含む治療レジメンは、単一投薬形態を介して一緒に又は別々の投与によって投与されてもよい。ある特定の実施形態では抗うつ剤及び葉酸含有化合物は単一投薬形態で一緒に投与される。例えば単一投薬形態は、経口投与のための単一の錠剤、丸剤、カプセル又は非経口投与のための溶液として投与されてもよい。代替的に抗うつ剤及び葉酸含有化合物は別々の組成物として、例えば別々の錠剤又は溶液として投与されてもよい。抗うつ剤は葉酸含有化合物と同時に投与されてもよく、又は抗うつ剤は葉酸含有化合物と間欠的に投与されてもよい。抗うつ剤及び葉酸含有化合物の投与間の時間の長さは、所望の治療効果を達成するために調整されてもよい。特に葉酸含有化合物は、抗うつ薬単独（例えば葉酸含有化合物の非存在下）の有効性と比較して抗うつ薬の有効性を増強するために任意の頻度又は投与プロトコールで投与されてもよい。
[0217]いくつかの実施形態では葉酸含有化合物は、抗うつ剤の投与のわずか数分（例えば１、２、５、１０、３０若しくは６０分間）前又は後に投与されてもよい。代替的に葉酸含有化合物は、抗うつ剤の投与の数時間（例えば２、４、６、１０、１２、２４若しくは３６時間）前又は後に投与されてもよい。抗うつ剤及び葉酸含有化合物の半減期に応じて、ある特定の実施形態では抗うつ剤の投与の間に葉酸含有化合物の１回より多い量を投与することは有利である場合がある。例えば葉酸含有化合物は、抗うつ剤の投与後３時間で投与され、次いで６時間で再び投与されてもよい。代替的に、葉酸含有化合物の投与の間に１回より多い抗うつ剤の量を投与することが有利である場合がある。重要なことにいくつかの実施形態では抗うつ剤及び葉酸含有化合物それぞれの治療効果は、各治療薬の持続時間の少なくとも一部で重複していてもよく、それにより併用療法の全体的な治療効果は、併用療法の組合せにある程度帰因している。いくつかの実施形態では葉酸含有化合物及び抗うつ剤は、パルス投与で投与されてもよい。他の実施形態ではそれらは、パルスチェイス投与として投与されてもよく、例えば葉酸含有化合物が短期間（パルス）投与され、その後、長期間（例えばチェイス）の抗うつ剤の投与が続く。
[0218]いくつかの実施形態では、抗うつ剤及び葉酸含有化合物が別々の組成物中で投与される場合、抗うつ剤及び葉酸含有化合物は同じ又は異なる経路によって投与されてもよい。例えば抗うつ剤は、静脈内注射によって投与されてもよく、一方葉酸含有化合物は経口で投与されてもよく、逆も同様である。代替的に例えば抗うつ剤及び葉酸含有化合物の両方は、静脈内注射によって又は経口投与によって一緒に投与されてもよい。
[0219]抗うつ剤と併用して投与される葉酸含有化合物のアジュバント効果は、相加的である場合がある。１つの薬剤が第２の薬剤に相加的効果を有する内容で、本明細書において使用される用語「相加的」は、第１の薬剤だけでの使用と比較して第２の薬剤の存在下での第１の薬剤の有効性における増加を指す。別の言い方をすると、第２の薬剤は、第１の薬剤の存在への器官又は生物の生理的応答を増強する薬剤として機能できる。したがって第２の薬剤は、第１の薬剤の存在への個々の応答を増加させることによって第１の薬剤の有効性を増加させる。
[0220]いくつかの場合では、抗うつ剤と併用して投与される葉酸含有化合物のアジュバント効果は、相乗的であってもよく、２つ以上の薬剤の相互作用は、同じ投与量単独でのそれらの個々の効果よりも大きい併用効果をもたらす。
[0221]いくつかの実施形態では治療レジメンは、例えば運動レジメン、食事療法の指導を処方するステップ及び／又はうつの処置において有効な別の医薬品（例えば、抗精神病薬、リチウム、Ｌ−トリヨードチロニン及び刺激物質）を投与するステップを含む認知行動療法（ＣＢＴ）、対人関係療法（ＩＰＴ）、生活習慣の指導をさらに含んでよい。
[0222]本明細書に記載の方法で処置されているうつである対象は、現在抗うつ剤を摂取している対象であってもよい。したがって本明細書に記載のうつであるヒト対象を処置する方法は、葉酸含有化合物の補助的療法から利益を受けることができるヒト対象を特定するためにも使用できる。方法は、薬物への不十分な（不満足な）応答又は抵抗性を呈する対象によって現在摂取されている抗うつ薬の有効性を改善するための手段も提供する。
Ｆ．葉酸含有化合物
[0223]当技術分野において承認されている任意の葉酸含有化合物は、選択されてよく、及び／又は任意選択で少なくとも１つの二重マーカー組合せ（例えば、少なくとも１つの相乗的二重マーカー組合せ）を保有すると選択されたヒト対象に投与されてもよい。
[0224]いくつかの実施形態では葉酸含有化合物は、少なくとも１つの（少なくとも２つ、少なくとも３つ以上を含む）葉酸のアルカリ金属又はアルカリ土類金属塩、例えばこれだけに限らないが、葉酸のカルシウム塩を含んでもよい。
[0225]いくつかの実施形態では葉酸含有化合物は、少なくとも１つの（少なくとも２つ、少なくとも３つ以上を含む）葉酸のグルコサミン塩及び／又はガラクトサミン塩（例えば葉酸及び還元葉酸、例えば、これだけに限らないが、テトラヒドロ葉酸及びそれらの誘導体を含む）を含んでもよい。グルコサミン葉酸及び／又はガラクトサミン葉酸並びにそれらの誘導体の例は、例えば、米国特許第７，９４７，６６２号に開示されており、本明細書に記載の方法でヒト対象に投与されてよく、又は組成物に含まれてもよい。一実施形態では、クアトレフォリック（ＱＵＡＴＲＥＦＯＬＩＣ）（登録商標）（Ｇｎｏｓｉｓ Ｓ．ｐ．Ａ、Ｍｉｌａｎ、ＩＴ）又はＮ−［４−［［［（６Ｓ）−２−アミノ−１，４，５，６，７，８−ヘキサヒドロ−５−メチル−４−オキソ−６−プテリジニル］メチル］アミノ］ベンゾイル］−Ｌ−グルタミン酸、グルコサミン塩は、本明細書に記載の方法でヒト対象に投与されてよく、又は組成物に含まれてもよい。
[0226]いくつかの実施形態では、酵素ジヒドロ葉酸レダクターゼが欠損しているうつである対象について、Ｍｅ−ＴＨＦとしても周知のメチル葉酸、Ｎ５−メチル−ＴＨＦ、ＭＴＨＦ、５−ＭＴＨＦ、Ｌ−メチル葉酸及びレボメフォリック酸（Ｌｅｖｏｍｅｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ）又は薬学的に許容されるそれらの塩（例えば、ナトリウム塩、カリウム塩、マグネシウム塩、カルシウム塩、グルコサミン塩若しくはガラクトサミン塩）は、葉酸含有化合物としても使用のためにさらに望ましい。例えばメチル葉酸カルシウム塩は、デプリン（ＤＥＰＬＩＮ）（登録商標）（Ｌ−メチル葉酸カルシウム塩）として合衆国において処方箋により入手できる。メチル葉酸カルシウム塩は、合衆国外ではメタフォリン（ＭＥＴＡＦＯＬＩＮ）（登録商標）、ボディフォリン（ＢＯＤＹＦＯＬＩＮ）（登録商標）及びニュートリフォリン（ＮＵＴＲＩＦＯＬＩＮ）（登録商標）としても入手できる。
[0227]本明細書に記載の方法でヒト対象に投与されてよく、又は組成物に含まれてもよい葉酸又は葉酸含有化合物の追加的な例は、これだけに限らないが、それに組み込まれる開示がすべての目的について参照により本明細書に組み込まれる米国特許第４，３３６，１８５号、第６，９２１，７５４号及び第７，９４７，６６２号並びに米国特許出願公開第２００８／００６４７０２号に記載のものを含んでもよい。
[0228]本明細書に記載のアッセイ及び／又は方法により、本明細書に記載の少なくとも１つの状態の存在（例えば二重ＳＮＰ組合せ及び／又は本明細書に記載の血漿／血清バイオマーカー）を有すると判定されているうつである対象は、葉酸含有化合物の有効量と併用して投与される抗うつ剤の治療効果から利益を得られる。いくつかの実施形態では葉酸含有化合物は、Ｌ−メチル葉酸を含んでもよい。いくつかの実施形態では葉酸含有化合物は、６（Ｓ）−５−メチルテトラヒドロ葉酸（６（Ｓ）−５−ＭＴＨＦとしても周知）を含んでもよい。
[0229]本明細書に記載の治療方法における使用のための葉酸の有効量は、抗うつ剤（ある場合）の種類及び／又は投与量、葉酸の種類、うつの重症度、対象の身体の状態（例えば年齢、性別、体重）に応じて変更する場合がある。用語「有効量」は、選択された対象に投与される場合にうつに関連する少なくとも１種の症状を葉酸含有化合物の非存在下での処置と比較して例えば少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％以上低減できる葉酸又は葉酸含有化合物の量を指す。
[0230]いくつかの実施形態では用語「有効量」は、本明細書において、抗うつ剤と併用して選択された対象に投与される場合に抗うつ剤の効果（例えば有効性又は治療効果）を抗うつ剤単独での処置と比較して例えば少なくとも約５％まで、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％以上増加できる葉酸又は葉酸含有化合物の量を指して使用される。別の言い方をすると本明細書において使用される用語「有効量」は、抗うつ剤と併用して選択された対象に投与される場合に後に記載するうつに関連する少なくとも１種の症状を抗うつ剤単独での処置と比較して例えば少なくとも約５％まで、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％以上低減できる葉酸又は葉酸含有化合物の量を指して使用される。
[0231]いくつかの実施形態では、本明細書に記載の治療レジメンにおける葉酸の有効量は、約１ｍｇ／日〜約７０ｍｇ／日まで、約１ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日まで、約２．５ｍｇ／日〜約４０ｍｇ／日まで、約５ｍｇ／日〜約４０ｍｇ／日まで、約５ｍｇ／日〜約３０ｍｇ／日まで又は約７ｍｇ／日〜約１５ｍｇ／日までの範囲であってもよい。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の治療レジメンにおける葉酸の有効量は、約１５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日までの範囲であってもよい。他の実施形態では、本明細書に記載の治療レジメンにおける葉酸の有効量は、約２０ｍｇ／日〜約４０ｍｇ／日までの範囲であってもよい。いくつかの実施形態では、治療レジメンにおける葉酸の有効量は、約２０ｍｇ／日であってもよい。他の実施形態では、治療レジメンにおける葉酸の有効量は、約４０ｍｇ／日であってもよい。
Ｇ．抗うつ剤
[0232]うつである又はうつの危険性があるいくらかの患者について、抗うつ剤及び葉酸含有化合物を含む治療レジメンは、抗うつ薬の治療効果を増強するために有益である。いくつかの場合では抗うつ剤及び葉酸含有化合物は、相乗的治療効果を有する。
[0233]抗うつ剤又は抗うつ薬の例は、これだけに限らないが、フェネルジン、トラニルシプロミン及びモクロベミドなどのモノ−アミンオキシダーゼ阻害剤；イミプラミン、アミトリプチリン、デシプラミン、ノルトリプチリン、ドキセピン、プロトリプチリン、トリミプラミン、クロミプラミン及びアモキサピンなどの三環系；マプロチリンなどの四環系；ノミフェンシンなどの非環式；トラゾドンなどのトリアゾロピリジン（ｔｒｉａｚｏｌｏｐｙｒｉｄｉｎｅ）；フルオキセチン、セルトラリン、パロキセチン、シタロプラム及びフルボキサミンなどのセロトニン再取り込み阻害剤；ネファザドン（ｎｅｆａｚａｄｏｎｅ）などのセロトニン受容体アンタゴニスト；ベンラファキシン及びミルナシプランなどのセロトニンノルアドレナリン作動性の再取り込み阻害剤；ミルタザピンなどのノルアドレナリン作動性及び特異的セロトニン作用薬；レボキセチンなどのノルアドレナリン再取り込み阻害剤を含む。本明細書に記載の本発明において使用できる追加的抗うつ剤は、これだけに限らないが、ブプロピオン；カバカバ及びセントジョーンズワートなどの天然産生物；ｓ−アデノシルメチオニンなどの栄養補助食品；甲状腺刺激ホルモン放出ホルモンなどの神経ペプチド；ニューロキニン受容体アンタゴニストなどの化合物標的化神経ペプチド受容体；及びトリヨードチロニンなどのホルモンを含んでもよい。
[0234]いくつかの実施形態では抗うつ剤又は抗うつ薬は、セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＲＩ）又は選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）であってもよい。ＳＲＩ及び／又はＳＳＲＩの例は、非限定的に、シタロプラム、エスシタロプラム、フルオキセチン、Ｒ−フルオキセチン、セルトラリン、パロキセチン、フルボキサミン、ベンラファキシン、デュロキセチン、ダポキセチン、ネファゾドン、イミプラミン、イミプラミンＮ−オキシド、デシプラミン、ピランダミン、ダゼピニル、ネホパム、ベフラリン、フェゾラミン（ｆｅｚｏｌａｍｉｎｅ）、フェモキセチン、クロミプラミン、シアノミプラミン（ｃｉａｎｏｉｍｉｐｒａｍｉｎｅ）、リトキセチン、セリクラミン、セプロキセチン、ＷＹ２７５８７、ＷＹ２７８６６、イメルジン（ｉｍｅｌｄｉｎｅ）、イフォキセチン（ｉｆｏｘｅｔｉｎｅ）、チフルカルビン（ｔｉｆｌｕｃａｒｂｉｎｅ）、ビクアリン（ｖｉｑｕａｌｉｎｅ）、ミルナシプラン、バジナプリン（ｂａｚｉｎａｐｒｉｎｅ）、ＹＭ９２２、Ｓ３３００５、Ｆ９８２１４ＴＡ、ＯＰＣ１４５２３、アラプロクラート、シアノドセピン（ｃｙａｎｏｄｏｔｈｅｐｉｎｅ）、トリミプラミン、クヌプラミン、ドチエピン、アモキサピン、ニトロキサゼピン（ｎｉｔｒｏｘａｚｅｐｉｎｅ）、ＭｃＮ５６５２、ＭｃＮ５７０７、Ｏｌ７７、Ｏｒｇ６５８２、Ｏｒｇ６９９７、Ｏｒｇ６９０６、アミトリプチリン、アミトリプチリンＮ−オキシド、ノルトリプチリン、ＣＬ２５５．６６３、ピルリンドール（ｐｉｒｌｉｎｄｏｌｅ）、インダトラリン、ＬＹ１１３．８２１、ＬＹ２１４．２８１、ＣＧＰ６０８５Ａ、ＲＵ２５．５９１、ナパメゾール（ｎａｐａｍｅｚｏｌｅ）、ジクロフェンシン（ｄｉｃｌｏｆｅｎｓｉｎｅ）、トラゾドン、ＥＭＤ６８．８４３、ＢＭＹ４２．５６９、ＮＳ２３８９、セルクロレミン（ｓｅｒｃｌｏｒｅｍｉｎｅ）、ニトロキパジン（ｎｉｔｒｏｑｕｉｐａｚｉｎｅ）、アデメチオニン（ａｄｅｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅ）、シブトラミン及びクロボキサミン（ｃｌｏｖｏｘａｍｉｎｅ）を含む。ＳＲＩは、塩基又はそれらの薬学的に許容される酸付加塩の形態で使用されてよい。
[0235]他の実施形態では、シナプス間隙での５−ＨＴの細胞外レベルにおける上昇を生じる他の治療用化合物、例えばチアネプチンも抗うつ剤として使用されてもよい。
[0236]選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）は、モノアミントランスポーターの阻害物資であり、ドーパミン及びノルアドレナリントランスポーターよりもセロトニントランスポーターにさらに強い阻害効果を有する。選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）の例は、非限定的に、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの任意の組合せを含んでもよい。
[0237]葉酸含有化合物と併用してうつである対象に投与できる追加的ＳＲＩ及び／又はＳＳＲＩは、例えば米国特許出願公開第２００５／００５４６８８号及び第２００８／０１３８４１１号並びに米国特許第６，７２０，００３号、第６，７８７，５６０号、第７，８９３，２６１号及び第７，１４８，２３８号に記載のものを含む。
[0238]当業者は、薬物添付文書、ＦＤＡガイドライン及び医師用卓上参考書などの適切な参考文献を参考にすることによって、周知の及び／又は市販されている抗うつ薬についての推奨用量レベルを容易に決定できる。いくつかの実施形態では抗うつ薬用量は、０．１ｍｇ／日〜約１０００ｍｇ／日まで、約０．５ｍｇ／日〜約５００ｍｇ／日まで、約１ｍｇ／日〜約４００ｍｇ／日まで、約５ｍｇ／日〜約３００ｍｇ／日まで又は約１０ｍｇ／日〜約２００ｍｇ／日までの範囲であってもよい。当業者は、それぞれ異なる抗うつ薬についての用量を抗うつ剤の種類及び／又は強度、うつの重症度、対象の身体の状態（例えば年齢、性別及び体重）、投与経路、対象によって摂取されている他の薬物療法並びにそれらの任意の組合せなどの多数の要因に応じて容易に調整できる。
Ｈ．医薬組成物
[0239]本明細書で提供するのは、少なくとも１種の相乗的二重バイオマーカー組合せを保有する対象へのｉｎ ｖｉｖｏ投与のための葉酸含有化合物の治療有効量及び薬学的に許容される担体を含む医薬組成物である。
[0240]いくつかの実施形態では、抗うつ剤又はその薬学的塩と共に投与される治療有効量の葉酸含有化合物又は葉酸は、例えばＨＡＭＤ−１７、ＨＡＭＤ−２８又は実施例において記載される他の有効性測定によって測定される、少なくとも１つの神経生理学的検査における改善の程度を、葉酸含有化合物の非存在下（例えば抗うつ単独療法を伴って若しくは伴わずに）で得られる改善の程度と比較して、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％又は少なくとも約９０％増加させるために十分である。いくつかの実施形態では、抗うつ剤又はその薬学的塩と共に投与される治療有効量の葉酸含有化合物又は葉酸は、例えばＨＡＭＤ−１７、ＨＡＭＤ−２８又は実施例において記載される他の有効性測定によって測定される、少なくとも１つの神経生理学的検査における改善の程度を、葉酸含有化合物の非存在下（例えば抗うつ単独療法を伴って若しくは伴わずに）で得られる改善の程度と比較して、少なくとも約１倍、少なくとも約２倍、少なくとも約３倍、少なくとも約４倍、少なくとも約５倍以上増加させるために十分である。
[0241]いくつかの実施形態ではヒトへの投与のための葉酸含有化合物又は葉酸の用量は、１日当たりレシピエントの体重１キログラム当たり約０．０１〜約５０ｍｇの範囲、１日当たり体重１キログラム当たり約０．０５〜約５ｍｇの範囲、又は１日当たり体重１キログラム当たり約０．１〜約１ｍｇの範囲であってもよい。ある特定の実施形態では所望の用量は、例えば約０．５ｍｇ〜約５００ｍｇ、約５ｍｇ〜約２５０ｍｇ、約１０ｍｇ〜約１００ｍｇ又は約１０ｍｇ〜約５０ｍｇを含有する１種の単一単位投与形態として表されてもよい。いくつかの実施形態では１種の単一単位投与形態は、葉酸約１ｍｇ〜約７０ｍｇ、葉酸約５ｍｇ〜約６０ｍｇ又は葉酸約７ｍｇ〜約５０ｍｇまでを提供できる。他の実施形態では１種の単一単位投与形態は、葉酸約１５ｍｇ〜約５０ｍｇを提供できる。さらに他の実施形態では１種の単一単位投与形態は、葉酸約２０ｍｇを提供できる。他の実施形態では所望の用量は、１日を通して適切な間隔で投与される２つの、３つの、４つの、５つ以上の部分用量で表されてもよい。これらの部分用量は、例えば約０．１ｍｇ〜約２５０ｍｇ、約１ｍｇ〜約１００ｍｇ、約２ｍｇ〜約２０ｍｇ又は約２ｍｇ〜約１０ｍｇを含有する単位投与形態で投与されてもよい。
[0242]いくつかの実施形態では医薬組成物は、少なくとも１種の抗うつ薬をさらに含んでもよい。一般に抗うつ剤又はヒトへの投与のために好適な薬学的に許容されるその塩の用量は、１日当たりレシピエントの体重１キログラム当たり約０．０１〜５０ｍｇの範囲、又は１日当たり体重１キログラム当たり０．１〜５ｍｇの範囲である。ある特定の実施形態では、所望の用量は例えば約１ｍｇ〜約５００ｍｇ又は約５ｍｇ〜約３００ｍｇを含有する１種の単一単位投与形態として表されてもよい。他の実施形態では所望の用量は、１日を通して適切な間隔で投与される２つの、３つの、４つの、５つ以上の部分用量で表されてもよい。これらの部分用量は、例えば約０．１ｍｇ〜約１００ｍｇ又は約１ｍｇ〜約５０ｍｇを含有する単位投与形態で投与されてもよい。
[0243]薬学的に許容される担体は、液体若しくは固体フィラー、希釈剤、賦形剤、製造補助剤（ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ ａｉｄ）（例えば、滑沢剤、タルクマグネシウム、ステアリン酸カルシウム若しくは亜鉛又はステアリン酸）又は、１つの器官又は身体の一部から別の器官又は身体の部分に対象化合物を運ぶ又は輸送することに関与する溶媒封入材料などの薬学的に許容される材料、組成物又はビヒクルを含む。各担体は、製剤の他の成分と適合性であり、患者に有害でないという意味で「許容」されなければならない。薬学的に許容される担体として役立ち得る材料のいくつかの例は、（ｉ）乳糖、グルコース及びショ糖などの糖、（ｉｉ）コーンスターチ及びジャガイモデンプンなどのデンプン、（ｉｉｉ）カルボキシメチルセルロースナトリウム、メチルセルロース、エチルセルロース、結晶セルロース及びセルロースアセテートなどのセルロース及びその誘導体、（ｉｖ）粉末トラガント、（ｖ）麦芽、（ｖｉ）ゼラチン、（ｖｉｉ）ステアリン酸マグネシウム、ラウリル硫酸ナトリウム及びタルクなどの滑沢剤、（ｖｉｉｉ）ココアバター及び座薬ワックスなどの賦形剤、（ｉｘ）ピーナッツ油、綿実油、ベニバナ油、ゴマ油、オリーブ油、コーン油及びダイズ油などの油、（ｘ）プロピレングリコールなどのグリコール、（ｘｉ）グリセリン、ソルビトール、マンニトール及びポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などのポリオール、（ｘｉｉ）オレイン酸エチル及びエチルラウレートなどのエステル、（ｘｉｉｉ）アガー、（ｘｉｖ）水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなどの緩衝剤、（ｘｖ）アルギン酸、（ｘｖｉ）発熱物質不含有水、（ｘｖｉｉ）等張生理食塩水、（ｘｖｉｉｉ）リンゲル溶液、（ｘｉｘ）エチルアルコール、（ｘｘ）ｐＨ緩衝液、（ｘｘｉ）ポリエステル、ポリカーボネート及び／又はポリ酸無水物、（ｘｘｉｉ）ポリペプチド及びアミノ酸などのバルク剤（ｘｘｉｉｉ）血清アルブミン、ＨＤＬ及びＬＤＬなどの血清構成成分、（ｘｘｉｖ）エタノールなどのＣ２〜Ｃ１２アルコール、並びに（ｘｘｖ）製剤処方において用いられる他の無毒性適合性物質を含む。湿潤剤、着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味剤、香味剤、芳香剤、保存剤及び抗酸化物質も製剤中に存在してもよい。
[0244]薬学的に許容される担体は、投与経路及び製剤に応じて本明細書に記載の組成物において変更されてもよい。例えば本明細書に記載の薬学的に許容される組成物は、注射を介して送達されてもよい。投与（送達）のためのこれらの経路は、これだけに限らないが、静脈内、動脈内、筋肉内、腹腔内、心筋内及び注入技術を含む皮下又は非経口を含む。一実施形態では薬学的に許容される組成物は、注射のために好適な形態にある。別の実施形態では医薬組成物は、カテーテルによる送達のために製剤化されている。
[0245]医薬組成物を非経口で投与する場合、それは注射可能な形態（溶液、懸濁液、乳液）の単位投与に一般に製剤化されてもよい。注射のために好適な製剤処方は、滅菌水性溶液又は分散剤を含む。担体は、例えば、水、細胞培養培地、緩衝液（例えばリン酸緩衝生理食塩水）、ポリオール（例えば、グリセロール、プロピレングリコール、液体ポリエチレングリコールなど）、これらの好適な混合物を含有する溶媒又は分散媒体であってもよい。いくつかの実施形態では医薬用担体は、緩衝液（例えばＰＢＳ）であってもよい。いくつかの実施形態では医薬組成物は、乳液又はゲルに製剤化されてもよい。
[0246]いくつかの実施形態では本明細書に記載の医薬組成物は、経口投与のため又は吸入のために製剤化されてもよい。経口投与のために、好適な投薬形態は、錠剤、トローチ剤、カシェー剤、カプレット剤並びに硬ゼラチンカプセル及び軟ゼラチンカプセルを含むカプセル剤を含んでもよい。
[0247]いくつかの実施形態では、抗うつ剤及び葉酸含有化合物の両方は単一の医薬組成物中に製剤化されてもよい。例えば抗うつ剤及び葉酸含有化合物の両方は、経口投与のための単一錠剤中に製剤化されてもよい。
[0248]いくつかの実施形態では抗うつ剤及び葉酸含有化合物が単一の組成物に製剤化される場合、それらは組成物から同時に又は異なる時期に放出されてもよい。例示の方法によってのみ、抗うつ剤が組成物の内層に製剤化される一方で、葉酸含有化合物が組成物（例えば錠剤又は薬物送達粒子）の外側の相に製剤化される場合、葉酸含有化合物は最初に組成物からより速い速度で放出されてもよく、一方抗うつ剤は後に組成物から遅いゆっくりした速度で放出されてもよい。一方抗うつ剤及び葉酸含有化合物が組成物中で均一に混合されている場合、両者は組成物から同時に放出されてもよい。
[0249]他の実施形態では、抗うつ剤及び葉酸含有化合物は、治療過程の際に同じ又は異なる経路の投与のために別々の医薬組成物中に製剤化されてもよい。例えば抗うつ剤は吸入投与のために製剤化されてもよく、一方葉酸含有化合物は経口投与のために製剤化されてもよい。他の実施形態では抗うつ剤及び葉酸含有化合物の両方は、経口投与のために例えば別々の錠剤中に製剤化されてもよい。
[0250]本明細書に記載のうつの処置のために選択されたヒト対象に投与される葉酸の有効量は、栄養補助食品（５０〜６００μｇ／日の間）として摂取される典型的な量よりも顕著に多い。いくつかの実施形態では選択されたヒト対象に投与される葉酸の有効量は、栄養補助食品として摂取される典型的な量の少なくとも約２倍、少なくとも約５倍、少なくとも約１０倍、少なくとも約２５倍、少なくとも約５０倍、少なくとも約１００倍、少なくとも約２５０倍、少なくとも約５００倍、少なくとも約１０００倍以上である。したがっていくつかの実施形態では葉酸含有化合物は、持続放出又は徐放組成物で製剤化されることが望ましい。
[0251]したがって、いくつかの実施形態では葉酸含有化合物を含む医薬組成物（抗うつ剤を伴う又は伴わない）は、徐放又は持続送達のために製剤化されてもよい。いくつかの実施形態では医薬組成物は、例えば葉酸含有化合物（及び任意選択で抗うつ剤）の徐放を提供するために、制御放出薬物送達系に製剤化されてもよい。本明細書において使用される用語「徐放」又は「持続送達」は、投与後一定時間にわたってｉｎ ｖｉｖｏで治療薬の送達が継続されることを指す。例えば徐放は、投与後少なくとも約１時間、少なくとも約２時間、少なくとも約３時間、少なくとも約４時間、少なくとも約５時間、少なくとも約６時間、少なくとも約９時間、少なくとも約１２時間、少なくとも約１６時間、少なくとも約２４時間に渡って生じてもよい。いくつかの実施形態では徐放は、投与後少なくとも約１日間、少なくとも約２日間、少なくとも約３日間、少なくとも約４日間、少なくとも約５日間、少なくとも約６日間、少なくとも約７日間にわたって生じてもよい。いくつかの実施形態では葉酸含有化合物の薬物送達系からの放出は、葉酸含有化合物（及び任意選択で抗うつ剤）の少なくとも約３０％（例えば少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％以上を含む）が投与後約３〜６時間、又は投与後約４〜５時間放出される定常状態（ゼロ次速度過程）であってもよい。一実施形態では薬物送達系からの葉酸含有化合物（及び任意選択で抗うつ剤）の放出は、投与後約３〜６時間又は投与後約４〜５時間に葉酸含有化合物の実質的に完全な放出（例えば約１００％）が放出される定常状態（ゼロ次速度過程）であってもよい。いくつかの実施形態では葉酸含有化合物は、患者の十二指腸（葉酸含有化合物、例えばＬ−ＭＴＨＦについて約９０％の吸収が生じる小腸の最初の１／３）の腸管吸収能力に過負荷をかけないように十分に遅い速度で薬物送達系から放出されてもよい。いくつかの実施形態では葉酸含有化合物及び抗うつ剤（ある場合）は、薬物送達系から同時に又は別々に、同じ又は異なる放出速度で放出されてもよい。
[0252]所定の時間にわたって葉酸含有化合物（及び任意選択で抗うつ剤）の徐放を提供する任意の薬物送達系（例えば、これだけに限らないがポリマーベース）は、葉酸含有化合物（及び任意選択で抗うつ剤）の投与のために使用されてもよい。一実施形態では薬物送達システムは、胃と十二指腸との間の幽門弁によって阻まれるように十分大きいカプレット設計であってもよく、カプレットは、所望の時間にわたって、例えば約２〜３時間にわたって、ゆっくり及び部分的に溶解され、その際に葉酸含有化合物はカプレットから絶え間なく放出される。カプレットが幽門弁を通り抜けられる大きさに溶解されるとその定常状態放出が完了し（例えば、追加的な期間、例えば追加的な２時間）、カプレットは吸収が最少である空腸（小腸の第２の３分の１）に進み続けることができる。
[0253]いくつかの実施形態では薬物送達系は、ポリマーマトリクスを通じた拡散又は浸食を介する葉酸含有化合物（及び任意選択で抗うつ剤）の放出を制御するために親水性と疎水性ポリマーとのブレンドを使用できる。
[0254]いくつかの実施形態では薬物送達系は、ポリマーベース粒子に封入された葉酸含有化合物（及び任意選択で抗うつ剤）を含んでもよい。これらの葉酸を含有するポリマーベース粒子は、放出の追加的制御のためにカプセル又は単一用量サシェに充填されてもよい。
[0255]さまざまな投与方法（例えば、経口投与、注射、インプラント及び吸入）のための制御放出（例えば、徐放）薬物送達系は、当技術分野において周知であり、本明細書に記載の治療方法のために葉酸含有化合物（及び任意選択で抗うつ剤）を送達するために採用されてもよい。種々の投与経路を介して活性剤を送達するための薬物送達システムの種々の種類について、その開示がすべての目的についてそれら全体が参照により本明細書に組み込まれる例えば国際特許出願第２０１２／１１１９６１号（経口製剤）、第２０１２／１３１６７８号（注射可能な製剤）、米国特許出願公開第２０１２／０２５８１６１号（植え込み式製剤）、第２００１／００３８８５４号、第２００１／００３３８６６号及び米国特許第８，２６８，３４７号（吸入製剤）を参照されたい。
[0256]さらに、抗菌保存剤、抗酸化物質、キレート剤及び緩衝液を含む組成物の安定性、無菌性及び等張性を増強する種々の添加物が添加されてもよい。微生物の作用の予防は、種々の抗菌及び抗真菌剤、例えば、パラベン、クロロブタノール、フェノール、ソルビン酸などによって確実にできる。多くの場合、等張剤、例えば、糖、塩化ナトリウムなどを含むことは望ましい可能性がある。
[0257]組成物は、所望の投与の経路及び調製物に応じて湿潤又は乳化剤、ｐＨ緩衝剤、ゲル化又は粘度増強添加物、保存剤、着色料、結合剤などの補助物質も含有できる。参照により本明細書に組み込まれる「ＲＥＭＩＮＧＴＯＮ’Ｓ ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬ ＳＣＩＥＮＣＥ」、第１７版、１９８５などの標準的テキストは、過度の実験を伴うことなく、好適な調製物を調製するために参考にされてもよい。しかし本明細書に記載の組成物に関して、使用されるいかなるビヒクル、希釈剤又は添加物も抗うつ剤若しくは薬学的に許容されるそれらの塩及び／又は葉酸含有化合物と生体適合性を有するべきである。
[0258]医薬組成物は、等張であってもよく、すなわちそれらは、血液及び涙液と同じ浸透圧を有してもよい。本明細書に記載の組成物の望ましい等張性は、塩化ナトリウム又は、ブドウ糖、ホウ酸、酒石酸ナトリウム、プロピレングリコール又は他の無機若しくは有機溶質などの他の薬学的に許容される薬剤を使用して達成されてもよい。一実施形態では塩化ナトリウムは、ナトリウムイオンを含有する緩衝液において使用される。
[0259]組成物の粘度は、薬学的に許容される増粘剤を使用して選択されたレベルに維持されてもよい。一実施形態ではメチルセルロースが、それが容易に及び経済的に入手でき、共に作用することが容易であることから使用される。他の好適な増粘剤は、例えば、キサンタンガム、カルボキシメチルセルロース、ヒロドキシプロピルセルロース、カルボマーなどを含む。増粘剤の好ましい濃度は、選択された薬剤に依存する。重要な点は、選択された粘度を達成する量を使用することである。粘稠性組成物は、そのような増粘剤の付加によって溶液から通常調製される。
[0260]典型的には、任意の添加物（抗うつ剤及び／又は葉酸含有化合物に加えて）は、リン酸緩衝生理食塩水中で０．００１〜５０ｗｔ％溶液の量で存在してもよく、活性成分は約０．０００１〜約５ｗｔ％、約０．０００１〜約１ｗｔ％、約０．０００１〜約０．０５ｗｔ％又は約０．００１〜約２０ｗｔ％、約０．０１〜約１０ｗｔ％及び約０．０５〜約５ｗｔ％などのマイクログラムからミリグラムからグラムの桁で存在する。圧迫（ｃｏｍｐｒｅｓｓｉｏｎ）を有する対象に投与される任意の治療用組成物について及び投与の任意の具体的な方法について、好適な動物モデル例えばマウスなどのげっ歯類において致死量（ＬＤ）及びＬＤ５０を決定するステップなどによって毒性を、並びに好適な応答を誘発する組成物（複数可）の投薬量、その中の構成成分の濃度並びに組成物（複数可）を投与する時期を決定することは好ましい。そのような決定は、当業者の知識により過度の実験を必要としない。
[0261]本明細書に記載の組成物は、一般に許容される手順に従って成分を混合するステップによって調製されてもよい。例えば成分は適切な薬学的に許容される担体中に混合されてもよく、混合物は、水又は増粘剤及び場合によりｐＨを制御するための緩衝液又は浸透圧を制御するための追加的溶質の付加によって最終濃度及び粘度に調整されてもよい。一般にｐＨは、約３〜約７．５までで変化する場合がある。いくつかの実施形態では、組成物のｐＨは約６．５〜約７．５であってよい。組成物は、医学及び獣医学分野の当業者によって十分周知の投薬量で及び技術によって、年齢、性別、体重及び具体的な患者の状態、並びに投与のために使用される組成物形態（例えば液体）などの要因を考慮して投与されてよい。
Ｉ．キット
[0262]いくつかの実施形態では本明細書で提供されるのは、うつである又はうつの危険性があることが診断されているヒト対象のための治療レジメンの選択に使用するためのキットである。キットは、対象から採取された試料中で少なくとも２種の次の一塩基多型（ＳＮＰ）：
（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｉ）ＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ、
（ｉｖ）ＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ
の存在又は非存在を決定するための少なくとも１種の試薬、及び
キットの使用のための説明書を含む。
[0263]いくつかの実施形態では少なくとも１種の試薬は、制限酵素、オリゴヌクレオチド、核酸プローブ、ポリメラーゼ及びそれらの組合せからなる群から選択される。キットは、葉酸応答性遺伝子バイオマーカーを遺伝子型判定するために本明細書に記載の方法において使用されてもよい。いくつかの実施形態ではキットは、ＳＮＰのいずれか１種に隣接している少なくとも１組のプライマーを含む。いくつかの場合では、少なくとも２組のプライマーは、多重増幅アッセイにおいて少なくとも２種のＳＮＰを増幅できる。
[0264]本明細書に記載の種々の態様の実施形態は、以下の番号付けられた項のいずれか１つによっても記載されてもよい。
[0265]１．うつである又はうつの危険性があると診断されているヒト対象のための治療レジメンを選択するためのアッセイであって、
[0266]（ａ）対象由来の試料を分析して、メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）、メチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）及びそれらの組合せからなる群から選択される、少なくとも２種の遺伝子バイオマーカーの遺伝子型を決定するステップと、
[0267]（ｂ）少なくとも２種の遺伝子バイオマーカーのそれぞれでの一塩基多型（ＳＮＰ）の存在又は非存在について遺伝子型判定によって検出するステップであり、ＳＮＰの存在が以下：
[0268]（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ
[0269]（ｉｉ）ＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、
[0270]（ｉｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ
[0271]（ｉｖ）ＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ
のように示される、ステップと、及び
[0272]（ｃ）上記ＳＮＰの存在に基づいて、葉酸含有化合物の有効量を含む治療レジメンを選択するステップと
を含む、アッセイ。
[0273]２．上記治療レジメンを施すステップをさらに含む、項１に記載のアッセイ。
[0274]３．少なくとも２種の遺伝子バイオマーカーがＭＴＨＦＲ及びＭＴＲの対である、項１又は２に記載のアッセイ。
[0275]４．少なくとも２種の遺伝子バイオマーカーがＧＣＨ１及びＣＯＭＴの対である、項１〜３のいずれか１つに記載のアッセイ。
[0276]５．ステップ（ａ）が、肥満、ＳＡＭ／ＳＡＨ比、４−ＨＮＥのレベル、ｈｓＣＲＰのレベル及びそれらの組合せからなる群から選択される少なくとも１種の追加的状態を決定するサブステップをさらに含む、項１〜４のいずれか１つに記載のアッセイ。
[0277]６．ステップ（ｂ）が、以下の状態：
[0278]（ｉ）所定の基準比よりも小さな、ＳＡＭとＳＡＨとの発現レベル比、
[0279]（ｉｉ）第１の所定の基準値よりも大きな、４−ＨＮＥの発現レベル、及び
[0280]（ｉｉｉ）第２の所定の基準値よりも大きな、ｈｓＣＲＰの発現レベル
のうち少なくとも１種を検出することをさらに含む、項５に記載のアッセイ。
[0281]７．以下の状態：３０ｋｇ／ｍ２以上のＢＭＩ値、男性で４０インチを超える、若しくは女性で３５インチを超える胴囲、男性で約０．９５、若しくは女性で０．８を上回る胴−臀部比、又は男性で少なくとも約２５％、若しくは女性で少なくとも約３２％の体脂肪率のいずれかが対象において存在する場合、肥満が決定する、項５に記載のアッセイ。
[0282]８．ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比が、健常な対象の血漿試料で測定した場合、約３．０である、項６に記載のアッセイ。
[0283]９．４−ＨＮＥの第１の所定の基準値が、健常な対象の血清試料で測定した場合、１リットル当たり約０．２４μｍｏｌ又は１リットル当たり約０．０４ｍｇである、項６に記載のアッセイ。
[0284]１０．４−ＨＮＥの第１の所定の基準値が、健常な対象の血漿試料で測定した場合、１リットル当たり約３．０ｍｇである、項６に記載のアッセイ。
[0285]１１．ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値が、健常な対象の血清試料で測定した場合、１リットル当たり約０．５ｍｇ〜１リットル当たり約４．５ｍｇである、項６に記載のアッセイ。
[0286]１２．ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値が、健常な対象の血漿試料で測定した場合、１リットル当たり約２．３ｍｇである、項６に記載のアッセイ。
[0287]１３．試料が、血液試料、血清試料、血漿試料、尿試料、口腔試料及び唾液試料からなる群から選択される、上記項のいずれかに記載のアッセイ。
[0288]１４．うつが大うつ病性障害である、上記項のいずれかに記載のアッセイ。
[0289]１５．葉酸含有化合物の有効量が約１５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である、上記項のいずれかに記載のアッセイ。
[0290]１６．葉酸含有化合物の有効量が約２０ｍｇ／日である、項１５に記載のアッセイ。
[0291]１７．葉酸含有化合物の有効量が約４０ｍｇ／日である、項１５に記載のアッセイ。
[0292]１８．葉酸含有化合物が約２０ｍｇ用量で１日当たり２回投与される、項１７に記載のアッセイ。
[0293]１９．上記治療レジメンが抗うつ薬をさらに含む、上記項のいずれかに記載のアッセイ。
[0294]２０．抗うつ薬が選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）である、項１９に記載のアッセイ。
[0295]２１．選択的セロトニン再取り込み阻害剤が、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン又はそれらの組合せからなる群から選択される、項２０に記載のアッセイ。
[0296]２２．対象が抗うつ単独療法への不十分な応答又は抵抗性を有する、上記項のいずれかに記載のアッセイ。
[0297]２３．ＳＮＰの存在又は非存在を検出するステップが、ハイブリダイゼーションアッセイ、増幅アッセイ、プライマー伸長アッセイ、オリゴヌクレオチドライゲーションアッセイ、配列決定アッセイ又はそれらの組合せを含む、上記項のいずれかに記載のアッセイ。
[0298]２４．状態を検出するステップが、イムノアッセイ、免疫組織化学（ＩＨＣ）、ガスクロマトグラフィ（ＧＣ）、質量分析（ＭＳ）、高速液体クロマトグラフィ（ＨＰＬＣ）、核磁気共鳴（ＮＭＲ）スペクトル分析又はフローサイトメトリーを含む、項６〜２２のいずれか１つに記載のアッセイ。
[0299]２５．うつである又はうつの危険性があることが診断されたヒト対象における少なくとも１種のうつ症状を処置するための方法であって、
[0300]ａ）対象由来の試料を、
[0301]（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ及びＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、並びに
[0302]（ｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ及びＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰであって、少なくとも１種の組合せの存在が葉酸含有化合物への症状を低減する応答に関連するＳＮＰ
からなる群から選択される少なくとも２種の一塩基多型（ＳＮＰｓ）の少なくとも１種の組合せの存在又は非存在を決定するために分析するステップと、
[0303]ｂ）少なくとも１種のうつ症状を処置するために葉酸含有化合物の有効量を含む治療レジメンを対象に投与するステップと
を含む方法。
[0304]２６．治療レジメンがさらに抗うつ薬を含む、項２５に記載の方法。
[0305]２７．抗うつ薬が選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）である、項２６に記載の方法。
[0306]２８．選択的セロトニン再取り込み阻害剤が、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの組合せからなる群から選択される、項２７に記載の方法。
[0307]２９．ｒｓ１８０１１３３での少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体の存在及びｒｓ１８０５０８７での少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体の存在が、葉酸含有化合物への症状を低減する応答と関連する、項２５〜２８のいずれか１つに記載の方法。
[0308]３０．ｒｓ８００７２６７での少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体の存在及びｒｓ４８６０での２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体の存在が、葉酸含有化合物への症状を低減する応答と関連する、項２５〜２８のいずれか１つに記載の方法。
[0309]３１．うつが大うつ病性障害である、項２５〜３０のいずれか１つに記載の方法。
[0310]３２．少なくとも１種のうつ症状が、抑うつ気分、罪悪感、作業量又は関心の低減、精神運動遅延、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な症状、認知障害及びそれらの組合せからなる群から選択される、項２５〜３１のいずれか１つに記載の方法。
[0311]３３．対象が肥満である、項２５〜３２のいずれか１つに記載の方法。
[0312]３４．肥満が対象において存在する以下の状態の少なくとも１種によって特徴付けられる、項３３に記載の方法：
[0313]ａ）３０ｋｇ／ｍ２を超えるＢＭＩ値、
[0314]ｂ）男性で４０インチを超える、又は女性で３５インチを超える胴囲、
[0315]ｃ）男性で０．９５を上回る、又は女性で０．８０を上回る胴−臀部比、及び
[0316]ｄ）男性で少なくとも約２５％、又は女性で少なくとも約３２％の体脂肪率。
[0317]３５．試料が、血液試料、血清試料、血漿試料、尿試料、口腔試料及び唾液試料からなる群から選択される、項２５〜３４のいずれか１つに記載の方法。
[0318]３６．葉酸含有化合物の有効量が約１５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である、項２５〜３５のいずれか１つに記載の方法。
[0319]３７．葉酸含有化合物の有効量が約２０ｍｇ／日である、項３６に記載の方法。
[0320]３８．葉酸含有化合物の有効量が約４０ｍｇ／日である、項３６に記載の方法。
[0321]３９．葉酸含有化合物の有効量が毎日単回用量として投与される、項３５〜３８のいずれか１つに記載の方法。
[0322]４０．葉酸含有化合物の有効量が１日当たり少なくとも２回の分割用量で投与される、項２５〜３８のいずれか１つに記載の方法。
[0323]４１．葉酸含有化合物が１日当たり２回で１回投与当たり約２０ｍｇ投与される、項２５〜３６、３８又は４０のいずれか１つに記載の方法。
[0324]４２．葉酸含有化合物が経口で投与される、項２５〜４１のいずれか１つに記載の方法。
[0325]４３．葉酸含有化合物がＬ−メチル葉酸である、項２５〜４２のいずれか１つに記載の方法。
[0326]４４．対象が抗うつ単独療法への不十分な応答又は抵抗性を有する、項２５〜４３のいずれか１つに記載の方法。
[0327]４５．少なくとも１種のバイオマーカーの発現レベルを測定するステップ及びバイオマーカー（複数可）のレベルが、葉酸含有化合物への症状を低減する応答と関連するかどうかを決定するステップをさらに含む、項２５〜４４のいずれか１つに記載の方法。
[0328]４６．追加的バイオマーカーが、ＳＡＭ、ＳＡＨ、４−ＨＮＥ、ｈｓＣＲＰ及びそれらの組合せからなる群から選択される、項４５に記載の方法。
[0329]４７．以下の状態：
[0330]ａ）ＳＡＭ対ＳＡＨ（ＳＡＭ／ＳＡＨ）の発現比が所定の基準比より小さい、
[0331]ｂ）４−ＨＮＥの発現レベルが第１の所定の基準値より大きい、又は
[0332]ｃ）ｈｓＣＲＰの発現レベルが第２の所定の基準値より大きい
の１つ又は複数が合致する場合、対象が葉酸含有化合物に対する症状を低減する応答がある可能性が高い、項４５に記載の方法。
[0333]４８．ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比が健常な対象の血清試料で測定した場合、約４〜約１２である、項４７に記載の方法。
[0334]４９．ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比が健常な対象の血漿試料で測定した場合、約３．０である、項４７に記載の方法。
[0335]５０．４−ＨＮＥの第１の所定の基準値が健常な対象の血清試料で測定した場合、１リットル当たり約０．２４μｍｏｌ又は１リットル当たり約０．０４ｍｇである、項４７に記載の方法。
[0336]５１．４−ＨＮＥの第１の所定の基準値が健常な対象の血漿試料で測定した場合、１リットル当たり約３．０ｍｇである、項４７に記載の方法。
[0337]５２．ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値が健常な対象の血清試料で測定した場合、１リットル当たり約０．５ｍｇ〜１リットル当たり約４．５ｍｇである、項４７に記載の方法。
[0338]５３．ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値が健常な対象の血漿試料で測定した場合、１リットル当たり約２．３ｍｇである、項４７に記載の方法。
[0339]５４．うつである又はうつの危険性があることが診断されたヒト対象に投与される抗うつ薬の実効性を改善するための方法であって、
[0340]対象が一塩基多型（ＳＮＰ）の以下の組合せ：
[0341]（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ及びＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、又は
[0342]（ｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ及びＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ
の少なくとも１種を保有する場合に、抗うつ薬と併用して葉酸含有化合物の有効量を含む治療用組成物を投与するステップ、を含む方法。
[0343]５５．対象が抗うつ単独療法を受ける、項５４に記載の方法。
[0344]５６．対象が抗うつ単独療法への不十分な応答を有する、項５４又は５５に記載の方法。
[0345]５７．不十分な応答が臨床的評価に基づいている、項５６に記載の方法。
[0346]５８．抗うつ薬が選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）である、項５４〜５７のいずれか１つに記載の方法。
[0347]５９．選択的セロトニン再取り込み阻害剤が、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの組合せからなる群から選択されるメンバーである、項５８に記載の方法。
[0348]６０．葉酸含有化合物の有効量が約１５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である、項５４〜５９のいずれか１つに記載の方法。
[0349]６１．葉酸含有化合物の有効量が約２０ｍｇ／日である、項６０に記載の方法。
[0350]６２．葉酸含有化合物の有効量が約４０ｍｇ／日である、項６１に記載の方法。
[0351]６３．葉酸含有化合物の有効量が毎日単回用量として投与される、項５４〜６２のいずれか１つに記載の方法。
[0352]６４．葉酸含有化合物の有効量が１日当たり少なくとも２回の分割用量で投与される、項５４〜６２のいずれか１つに記載の方法。
[0353]６５．葉酸含有化合物が約２０ｍｇで１日当たり２回投与される、項５４〜６０、６２又は６４のいずれか１つに記載の方法。
[0354]６６．葉酸含有化合物が経口で投与される、項５４〜６５のいずれか１つに記載の方法。
[0355]６７．葉酸含有化合物がＬ−メチル葉酸である、項５４〜６６のいずれか１つに記載の方法。
[0356]６８．うつが大うつ病性障害である、項５４〜６７のいずれか１つに記載の方法。
[0357]６９．うつである又はうつの危険性があることが診断されており、以下：
[0358]（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ、
[0359]（ｉｉ）ＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ
[0360]（ｉｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ、及び
[0361]（ｉｖ）ＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ
からなる群から選択される少なくとも２種のＳＮＰを保有するヒト対象におけるうつの治療に使用するための、葉酸を含む組成物。
[0362]７０．少なくとも２種のＳＮＰが、ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ、及びＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰである、項６９の組成物。
[0363]７１．少なくとも２種のＳＮＰが、ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ、及びＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰである、項６９に記載の組成物。
[0364]７２．うつが大うつ病性障害である、項６９〜７１のいずれか１つに記載の組成物。
[0365]７３．対象が少なくとも１種の抗うつ薬を受けている、項６９〜７２のいずれか１つに記載の組成物。
[0366]７４．少なくとも２種のＳＮＰを保有している対象が、葉酸を含む組成物及び抗うつ薬を含む補助的療法を投与される、項６９〜７３のいずれか１つに記載の組成物。
[0367]７５．抗うつ薬が選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ）である、項７４に記載の組成物。
[0368]７６．葉酸含有化合物がＬ−メチル葉酸約１５ｍｇ〜約５０ｍｇを含む、項６９〜７４のいずれか１つに記載の組成物。
[0369]７７．葉酸含有化合物がＬ−メチル葉酸約２０ｍｇを含む、項７６に記載の組成物。
[0370]７８．葉酸含有化合物が所定の放出プロファイルを有する、項６９〜７７のいずれか１つに記載の組成物。
[0371]７９．所定の放出プロファイルが徐放である、項６９〜７８のいずれか１つに記載の組成物。
[0372]８０．所定の放出プロファイルが定常状態放出である、項７９に記載の組成物。
[0373]８１．所定の放出プロファイルが拍動性放出である、項６９〜７８のいずれか１つに記載の組成物。
[0374]８２．所定の放出プロファイルが時間制御放出である、項６９〜７８のいずれか１つに記載の組成物。
[0375]８３．葉酸を含む組成物が、投与されると少なくとも３〜６時間にわたって葉酸含有化合物の少なくとも３０％を放出するように製剤化されている、項６９〜８２のいずれか１つに記載の組成物。
[0376]８４．うつである又はうつの危険性があることが診断されているヒト対象のための治療レジメンの選択に使用するためのキットであって：
[0377]対象から採取された試料中で以下の一塩基多型（ＳＮＰ）：
[0378]（ｉ）ＭＴＨＦＲについての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０１１３３として特定される配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ
[0379]（ｉｉ）ＭＴＲについての、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ１８０５０８７として特定される配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ、
[0380]（ｉｉｉ）ＧＣＨ１についての、少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子を含む、ｒｓ８００７２６７として特定される配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ
[0381]（ｉｖ）ＣＯＭＴについての、２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子を含む、ｒｓ４６８０として特定される配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ、
のうち少なくとも２種の存在又は非存在を決定するための少なくとも１種の試薬と、
[0382]上記キットの使用のための説明書と
を含む、キット。
[0383]８５．少なくとも１種の試薬が、制限酵素、オリゴヌクレオチド、核酸プローブ、ポリメラーゼ及びそれらの組合せからなる群から選択される、項８４に記載のキット。
[0384]次の実施例は、例示のために提供されるが、特許請求される本発明を限定しない。
実施例１．ＳＳＲＩと併用して葉酸含有化合物を含む処置のためにうつである患者を選択するためのバイオマーカーの特定
[0385]大うつ病性障害（ＭＤＤ）であるＳＳＲＩ抵抗性外来患者において実施される６（Ｓ）−５−ＭＴＨＦの二重盲検、プラセボ対照研究を、患者が抗うつ薬、例えばＳＳＲＩに加えて葉酸含有化合物（例えば、６（Ｓ）−５−ＭＴＨＦ）を投与される場合に、より大きな有効性応答（例えば、両方のＳＮＰによってもたらされる相加的応答よりも大きな応答、又はいずれかのＳＮＰだけによってもたらされる応答よりも大きな応答）と関連するバイオマーカーの特異的な組合せを特定するために、実施した。例えば、Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜７４（２０１２）を参照されたい。
[0386]２つの遺伝子バイオマーカーの種々の組合せ、１つの遺伝子バイオマーカー及び臨床的特性を、うつである患者での葉酸含有化合物（例えば６（Ｓ）−５−ＭＴＨＦ）及びＳＳＲＩを含む処置の有効性へのそれらの効果について評価した。詳細には、評価した特異的な組合せを図１Ｂ、２、４及び５に示す。
[0387]患者を葉酸含有化合物（例えば６（Ｓ）−５−ＭＴＨＦ）及びＳＳＲＩで処置する場合に、種々の単一マーカー及び二重バイオマーカー組合せが、ＨＡＭＤ−１７スコア、ＨＡＭＤ−２８スコア又は認知及び身体機能質問票（ＣＰＦＱ）スコアによって測定される改善の程度に、どのように影響を与えるかの結果を図１〜６に示す。有効性効果を、ベースライン（例えば処置を受けない対象）と比較する第Ｉ相及び第ＩＩ相の最後までのＨＡＭＤ−１７スコア、ＨＡＭＤ−２８スコア又はＨＡＭＤ−２８における平均変化を測定するステップによって決定する。
[0388]図２は、患者が例えばＳＳＲＩへの補助剤として葉酸含有化合物を含む治療レジメンで処置された場合に、ＭＤＤ患者におけるＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７値への表示の状態（２つのＳＮＰマーカーの組合せ若しくは１つのＳＮＰマーカーと肥満指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）の存在又は非存在の効果を示す一連の結果の表である。
[0389]図３は、患者が例えばＳＳＲＩへの補助剤として葉酸含有化合物を含む治療レジメンで処置された場合に、ＭＤＤ患者におけるＨＡＭＤ−７値への表示の状態（単一のＳＮＰマーカー）の存在又は非存在の効果を示す一連の結果の表である。
[0390]図４は、患者が例えばＳＳＲＩへの補助剤として葉酸含有化合物を含む治療レジメンで処置された場合に、ＭＤＤ患者におけるＨＡＭＤ−２８又はＨＡＭＤ−７値への表示の状態（１つのＳＮＰマーカーと肥満指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）の存在又は非存在の効果を示す一連の結果の表である。
[0391]図５は、患者が例えばＳＳＲＩへの補助剤として葉酸含有化合物を含む治療レジメンで処置された場合に、ＭＤＤ患者におけるＣＰＦＱ値への表示の状態（２つのＳＮＰマーカーの組合せ、又は１つのＳＮＰマーカーと肥満指標、例えばＢＭＩ＞３０ｋｇ／ｍ２との組合せ）の存在又は非存在の効果を示す一連の結果の表である。
[0392]図６は、患者が例えばＳＳＲＩへの補助剤として葉酸含有化合物を含む治療レジメンで処置された場合に、ＭＤＤ患者におけるＣＰＦＱ値への表示の状態（単一のＳＮＰマーカー）の存在又は非存在の効果を示す一連の結果の表である。
[0393]図７Ａ〜Ｂは、臨床試験のプラセボ群（葉酸含有化合物を伴わずに投与される抗うつ剤）又は葉酸を含む処置群（抗うつ剤へのアジュバントとして投与される葉酸含有化合物）内でバイオマーカー陽性対象対バイオマーカー陰性対象を比較する、遺伝的調整因子（ｇｅｎｅｔｉｃ ｍｏｄｅｒａｔｏｒ）（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）の効果についての統計解析を示す一連の結果の表である。結果は、ＭＴＲ ２７５６ ＡＧ又はＧＧ遺伝子型［一塩基多型（ＳＮＰ）ｒｓ１８０５０８７に関連する］について陽性の対象について、このＳＮＰに陰性の対象と比較して、示されたすべての遺伝的調整因子（例えば人種、年齢、性別及びＢＭＩ）に統計的に有意な処置効果を示している。ＣＯＭＴ ＣＣ（ｒｓ４６３３）又はＧＧ（ｒｓ４６８０）ＳＮＰについて陽性の対象は少なくとも１つの遺伝的調整因子分類において統計的に有意な処置効果も示す。
[0394]図８Ａ〜Ｂは、臨床試験のプラセボ群及び葉酸を含む処置群内でのバイオマーカー陽性対象の奏功率を示す一連の結果の表である。応答者は、評価期間にわたってＨＡＭＤ−２８における少なくとも約５０％の低減によって示される。
[0395]図１Ｂの結果要約表は、２つのバイオマーカーの組合せをＭＤＤ患者でのそれらの減少効果の順に列挙している（すなわちＨＡＭＤ−２８においてより大きな低減を有するＳＮＰマーカーは、表でより早く列挙されている）。それぞれ個々のマーカーによってもたらされる応答（ＨＡＭＤ−２８における変化によって決定される）の合計よりも大きな治療応答を示す２つのバイオマーカーの組合せは、（Ａ＋Ｏ）、（Ｋ＋Ｐ）、（Ｋ＋Ｑ）、（Ｂ＋Ｑ）、（Ｃ＋Ｏ）、（Ｃ＋Ｋ）、（Ｂ＋Ｏ）、（Ｃ＋Ｈ）、（Ａ＋Ｇ）及び（Ａ＋Ｃ）であって、図１Ｂに示すとおり濃い色調で強調されており、それぞれ対応するＳＮＰに対するアルファベット識別子を図１Ａに列挙する。いずれかのマーカー単独によってもたらされる応答（ＨＡＭＤ−２８における変化によって決定される）よりも大きな治療応答を示す２つのバイオマーカーの組合せを薄い色調で強調する、例えば図１Ｂに示す（Ｏ＋Ｐ）。いずれかのマーカー単独によってもたらされる応答（ＨＡＭＤ−２８における変化によって決定される）に匹敵する又はより少ない治療応答を示す２つのバイオマーカーの組合せは強調しない、例えば図１Ｂに示す（Ｏ＋Ｑ）。
[0396]図１Ｂの結果表は、２つのバイオマーカーの組合せをＭＤＤ患者でのそれらの減少効果の順に列挙しているが、特異的バイオマーカー組合せを保有しているＭＤＤ患者を葉酸含有化合物で処置する場合に、遺伝子において正常な対立遺伝子を保有しているＭＤＤ患者と比較してこれらすべての強調された二重バイオマーカー組合せがＨＡＭＤ−２８における顕著な変化を示していることから、強調された組合せ（すなわち、濃い及び薄い色調での強調によって示されたもの）内で、１つの二重バイオマーカー組合せが、本明細書に記載のアッセイ、方法、型及びキットにおける使用のために別のものよりもさらに信頼できる予測因子であるとして解釈されるべきではない。
実施例２ 葉酸を含む増強療法（ＳＳＲＩを伴う）のために患者を選択する例示的方法及びそのような療法に供するＭＤＤ患者の個別の予後
[0397]患者３６名が葉酸含有化合物、例えばデプリン（登録商標）１５を受け、彼らのＨＡＭＤ−２８がベースライン測定から低減した、葉酸含有化合物、例えばデプリン（登録商標）１５でのＭＤＤ処置の増強についての二重盲検プラセボ対照多施設研究に基づいて、対応する「値」（下に詳細に示す）と共に検査のパネル（ＰＴ）において記載された少なくとも１種の状態であると診断された患者は、一般に下の表に示す予測されるＨＡＭＤ−２８低減に従って応答した。
[0398]したがって、ＭＭＤ患者を治療し、及び／又はＭＭＤ患者によって摂取された抗うつ薬の有効性を決定する若しくは改善する方法も本明細書で提供される。例えばいくつかの実施形態では方法は（１）治療抵抗性ＭＤＤ患者をスクリーニングするステップ（例えばステップ１について詳細は下を参照されたい）、及び（２）ＭＤＤ患者の検査試料について検査のパネル（ＰＴ）を実施するステップ（例えばステップ２について詳細は下を参照されたい）を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ＰＴ結果が下の表５に示すコード分類の少なくとも１つを示す場合、患者は抗うつ薬及び葉酸含有化合物（例えば、デプリン（登録商標）１５）を含む治療レジメンを推奨されてもよい。いくつかの実施形態ではＰＴ結果が下の表に示す少なくとも１つのコード分類を示す場合、ベースライン値（例えばベースライン来院時に測定された値）からのＨＡＭＤ−２８における対応する低減が抗うつ薬（例えばＳＳＲＩ）と併用する葉酸含有化合物（例えば、デプリン（登録商標）１５）での最低４週間の治療で達成できることが予測できる。
[0399]ステップ１：処置抵抗性ＭＤＤ患者を、（ａ）ＭＤＤについてのＤＳＭ−ＩＶ判定基準に合致するかどうか、並びに（ｂ）ＳＳＲＩの十分な投薬にあるかどうか及びＳＳＲＩの１つ又は複数の経過へ十分な応答を有さないかどうかを決定するために、スクリーニングする。患者がスクリーニング判定基準（ａ）及び（ｂ）の両方に合致すれば、医師は下に記載の検査のパネル（ＰＴ）を指示することが推奨される。
[0001]ステップ２：下に示す検査のパネル（ＰＴ）の例は実施できる。
Figure 2016518816
[0400]上に示す検査のパネル（ＰＴ）は、本明細書に記載のバイオマーカーの少なくとも１つの若しくは任意の組合せを削除若しくは追加するために、又は５２個の二重バイオマーカー組合せ（表３を参照されたい）の１つ若しくは複数又は１０個の相乗的二重バイオマーカー組合せの１つ若しくは複数（表４を参照されたい）を含むために変更されてもよい。
[0401]ステップ３：ステップ（２）のＰＴに列挙した状態の検査結果に基づいて、陽性（すなわちＹ判定を有する）と判定された任意のＰＴ（項目ＡからＦ）は特定され、次いで「コード」のアルファベット順に下の表に表したコードの最も大きな数を記録した。所与の患者のＰＴについてコード分類が選択されると、そのコード分類について対応する「９５％ＣＩ」（９５％信頼区間）を審査できる。いくつかの実施形態ではＣＩの上限がゼロ未満である場合、ベースライン値からのＨＡＭＤ−２８低減は、有意であると考えられる。他の実施形態ではＣＩの上限がゼロを超える場合、それによりベースライン値からのＨＡＭＤ−２８低減は慎重に解釈されるべきである。
[0402]ステップ４：ベースラインからのＨＡＭＤ−２８における予測される低減は、例えば次のとおり決定できる：
（ａ）患者がＰＴの１つのヒットだけを有する（すなわち、１種の状態が陽性である）場合、それによりベースラインからのＨＡＭＤ−２８低減はコード「Ａｌｌ」に基づいてもよい、又は
（ｂ）患者がＰＴの二重ヒットを有する（すなわち、２種の状態が陽性である）場合、それによりベースラインからのＨＡＭＤ−２８低減は、表５に示すＡ、Ｂ、Ｃ、Ｅ又は「ＡＬＬ」から得られた最も高い応答（すなわちＨＡＭ−Ｄ−２８での最も大きな変化）に基づいてもよい。いくつかの実施形態では、二重ヒットが「Ｄ＋Ｆ」である場合、それにより低減はコード「Ａｌｌ」に基づいてもよい、
（ｃ）患者がＰＴの三重ヒットを有する（すなわち、３種の状態が陽性である）場合、それによりベースラインからのＨＡＭＤ−２８低減は、表５に示す最良の組合せ（すなわち、最良の２つのコード組合せ）から得られた最も高い応答（すなわちＨＡＭ−Ｄ−２８での最も大きな変化）に基づいてもよい。例示の方法によってのみ、患者がＰＴのＡ、Ｃ及びＥでの三重ヒットを有する場合、可能性がある２つのコードの組合せは、Ａ＋Ｃ、Ａ＋Ｅ及びＣ＋Ｅである。これらの組合せの内、組合せ「Ａ＋Ｅ」が表５に示す最も大きなＨＡＭＤ−２８低減に対応することから、組合せ「Ａ＋Ｅ」は最も大きなＨＡＭＤ−２８低減に対応する最良の組合せとして考えられる。しかし、三重ヒットが「Ｄ＋Ｆ」を含有する場合、それによりＨＡＭ−Ｄ−２８低減はＡ、Ｂ、Ｃ、Ｅ又は「ＡＬＬ」単一のコードから得られる最高の応答に基づくはずである、
（ｄ）表５中の負のＨＡＭＤΔ数は、試験２ベースラインＨＡＭＤ−２８（約２４．４７）からの潜在的低減を反映している。ＨＡＭＤΔ数は、ＨＡＭＤ−２８尺度における予測される低減を表し、患者は、わずか４週間でデプリン（登録商標）１５増強療法（ＳＳＲＩを伴う）への応答で得ることができる。いくつかの実施形態では実際の低減は、下の表５に示す９５％の範囲に収まる可能性がある。
Figure 2016518816
実施例３．バイオマーカーレベル及び遺伝子型によって階層化した抑うつ患者での補助的Ｌ−メチル葉酸１５ｍｇの効果：無作為化臨床試験からの結果
[0403]本実施例は、うつである又はうつの危険性があることが診断されたヒト患者に投与される抗うつ薬（例えば、選択的セロトニン再取り込み阻害剤）の有効性を改善する方法を例示する。方法は、患者が少なくとも１つの一塩基多型（ＳＮＰ）を保有しているかどうかを決定するステップを含み、ここでＳＮＰは葉酸含有化合物、例えばＬ−メチル葉酸と併用して投与される場合、抗うつ薬の有効性の増加に関連する。本実施例は、ヒト対象において少なくとも１種のうつ症状（抑うつ気分、罪悪感、作業量又は関心の低減、精神運動遅延、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な症状、認知障害及びそれらの任意の組合せ）を治療するための方法も提供する。方法は、１）うつである又はうつの危険性があることが診断された対象、及び２）葉酸含有化合物への陽性症状を低減する応答に関連する具体的なＳＮＰの組合せ（例えば複数）を保有している対象に、葉酸含有化合物、例えばＬ−メチル葉酸を投与するステップを含む。
[0404]特異的遺伝子又は生物学的マーカーの存在は、大うつに対する療法への不十分な応答を予測できる。この分析の目的は、単独及び併用での特異的生物学的及び遺伝子マーカーの、ＳＳＲＩへの不十分な応答者の試験からの補助的Ｌ−メチル葉酸１５ｍｇ対プラセボの抗うつ有効性への効果を評価することであった。これは、逐次並行比較設計（ＳＰＣＤ）を使用する二重盲検、無作為化、プラセボ対照試験であった。ＳＳＲＩ抵抗性うつである外来患者は、Ｌ−メチル葉酸１５ｍｇ／日を６０日間、プラセボを３０日間に続いてＬ−メチル葉酸１５ｍｇ／日を３０日間又はプラセボを６０日間受けた。選択された生物学的及び遺伝子マーカーのベースラインレベルの個々で又は併用でのＬ−メチル葉酸対プラセボへの治療応答への影響を評価した。患者７５名を登録した。ベースラインで特異的生物学的（肥満度指数［ＢＭＩ］≧３０ｋｇ／ｍ２、高感受性Ｃ反応性タンパク質［ｈｓＣＲＰ］又は４−ヒドロキシ−２−ノネナール［４−ＨＮＥ］、低Ｓ−アデノシルメチオニン／Ｓ−アデノシルホモシステイン［ＳＡＭ／ＳＡＨ］比）及び遺伝子マーカーを有する患者は、Ｌ−メチル葉酸を伴うＨＤＲＳ−２８対プラセボにベースラインからの有意に（ｐ≦０．０５）大きなプールした平均変化（ｐｏｏｌｅｄ ｍｅａｎ ｃｈａｎｇｅ）を有した。ＣＧＩ−Ｉでのベースラインからのプールした平均変化は、大部分の遺伝子マーカーについてＬ−メチル葉酸対プラセボで有意に（ｐ＜０．０５）大きかった。ベースライン生物学的マーカーと遺伝子マーカーとの大部分の組合せは、ベースラインからのプールした平均変化においてＬ−メチル葉酸対プラセボでのＨＤＲＳ−２８スコアについて有意に（ｐ≦０．０５）大きな低減を予測した。要約すると、炎症若しくは代謝に関連するバイオマーカー又はＬ−メチル葉酸合成及び代謝に関連する遺伝子マーカーは、１５ｍｇ Ｌ−メチル葉酸での補助的療法に応答性であるＳＳＲＩ抵抗性ＭＤＤである患者を特定できる。
[0405]多数の抗うつ薬が利用できるにもかかわらず、大うつ病性障害（ＭＤＤ）である患者の６０％超は、最初の抗うつ剤治療後に症状の完全寛解を経験できず、寛解した者の大部分はぶり返し（ｒｅｌａｐｓｅ）又は再発（ｒｅｃｕｒｒｅｎｃｅ）を経験する（Ｒｕｓｈ ＡＪ，Ｔｒｉｖｅｄｉ ＭＨ，Ｗｉｓｎｉｅｗｓｋｉ ＳＲ，ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６３：１９０５〜１９１７（２００６）、Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｉｎｔ Ｊ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ，１５：８４１〜８５４（２０１２））。本実施例は、臨床的及び生物学的マーカーを使用することにより、さらに効果的な治療戦略への改善された成功率を有する特異的患者を特定する方法を記載する。
[0406]代謝系における妨害は、ＭＤＤの病態生理及び経過に関する（ＭｃＩｎｔｙｒｅ ＲＳ，Ｓｏｃｚｙｎｓｋａ ＪＫ，Ｋｏｎａｒｓｋｉ ＪＺ，ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１９：２５７〜２６４（２００７）、Ｖｏｇｅｌｚａｎｇｓ Ｎ，Ｂｅｅｋｍａｎ ＡＴ，Ｂｏｅｌｈｏｕｗｅｒ ＩＧ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，７２：５９８〜６０４（２０１１）、Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｓｈｅｌｔｏｎ ＲＣ，Ｋｉｎｒｙｓ Ｇ，ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１８：３３２〜３３９（２０１３））。例えば、前向きコホート研究は、うつであり、併存メタボリック症候群を有する参加者が慢性、再発性うつを発症する高い危険性を有したことを見出した（Ｖｏｇｅｌｚａｎｇｓ Ｎ，Ｂｅｅｋｍａｎ ＡＴ，Ｂｏｅｌｈｏｕｗｅｒ ＩＧ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，７２：５９８〜６０４（２０１１））。並行して近年、ＭＤＤとインターロイキン−６（ＩＬ−６）、腫瘍壊死因子アルファ（ＴＮＦα）及び高感受性Ｃ反応性タンパク質（ｈｓＣＲＰ）レベルの上昇によって特徴付けられる細胞性免疫の障害及び炎症との間の関連が認識されている（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｓｈｅｌｔｏｎ ＲＣ，Ｋｉｎｒｙｓ Ｇ，ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１８：３３２〜３３９（２０１３）、Ｂｌｕｍｅ Ｊ，Ｄｏｕｇｌａｓ ＳＤ，Ｅｖａｎｓ ＤＬ，Ｂｒａｉｎ Ｂｅｈａｖ Ｉｍｍｕｎ．，２５：２２１〜２２９（２０１１）、Ｍｉｌｌｅｒ ＡＨ，Ｍａｌｅｔｉｃ Ｖ，Ｒａｉｓｏｎ ＣＬ，Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６５：７３２〜７４１（２００９）、Ｓｉｍｏｎ ＮＭ，ＭｃＮａｍａｒａ Ｋ，Ｃｈｏｗ ＣＷ，ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，１８：２３０〜２３３（２００８））。さらに、脳内の炎症性経路の活性化もＭＤＤの神経病理学的特徴をもたらす酸化ストレスに寄与する可能性がある（Ｍｉｌｌｅｒ ＡＨ，Ｍａｌｅｔｉｃ Ｖ，Ｒａｉｓｏｎ ＣＬ，Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６５：７３２〜７４１（２００９）、Ｎｇ Ｆ，Ｂｅｒｋ Ｍ，Ｄｅａｎ Ｏ，ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｊ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，１１：８５１〜８７６（２００８）、Ｓｔａｆｆｏｒｄ Ｌ，Ｂｅｒｋ Ｍ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ７２：１２２９〜１２３５（２０１１））。心臓の介入治療で入院している患者の前向き研究において、抗炎症性及び抗酸化特性を有するスタチンの使用は、９カ月でのＭＤＤの危険性における顕著な低減と関連していた（Ｎｇ Ｆ，Ｂｅｒｋ Ｍ，Ｄｅａｎ Ｏ，ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｊ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，１１：８５１〜８７６（２００８）、Ｓｔａｆｆｏｒｄ Ｌ，Ｂｅｒｋ Ｍ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ７２：１２２９〜１２３５（２０１１））。
[0407]葉酸欠損、代謝調節不全及び炎症の間に関連が観察された（Ｖｏｇｅｌｚａｎｇｓ Ｎ，Ｂｅｅｋｍａｎ ＡＴ，Ｂｏｅｌｈｏｕｗｅｒ ＩＧ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，７２：５９８〜６０４（２０１１）、Ｂｌｕｍｅ Ｊ，Ｄｏｕｇｌａｓ ＳＤ，Ｅｖａｎｓ ＤＬ，Ｂｒａｉｎ Ｂｅｈａｖ Ｉｍｍｕｎ．，２５：２２１〜２２９（２０１１）、Ｍｉｌｌｅｒ ＡＨ，Ｍａｌｅｔｉｃ Ｖ，Ｒａｉｓｏｎ ＣＬ，Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６５：７３２〜７４１（２００９）、Ｓｉｍｏｎ ＮＭ，ＭｃＮａｍａｒａ Ｋ，Ｃｈｏｗ ＣＷ，ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，１８：２３０〜２３３（２００８））。ＭＤＤを治療するための葉酸及びその生物学的に活性な形態、Ｌ−メチル葉酸の利点は、認識されており、同様に認識されているのは、葉酸欠損とＭＤＤについての危険性の上昇、抗うつ剤の有効性の低減及び疾患のさらに慢性的な経過との間の関連である（Ｖｏｇｅｌｚａｎｇｓ Ｎ，Ｂｅｅｋｍａｎ ＡＴ，Ｂｏｅｌｈｏｕｗｅｒ ＩＧ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，７２：５９８〜６０４（２０１１）、Ｇｉｎｓｂｅｒｇ ＬＤ，Ｏｕｂｒｅ Ａ，Ｄａｏｕｄ Ｙ，Ｉｎｎｏｖ Ｃｌｉｎ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．，８：１９〜２８（２０１１）、Ｆａｖａ Ｍ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６８ Ｓｕｐｐｌ １０：４〜７（２００７）、Ｆａｖａ Ｍ，Ｂｏｒｕｓ ＪＳ，Ａｌｐｅｒｔ ＪＥ，ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１５４：４２６〜４２８（１９９７）、Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｐｅｔｅｒｓｅｎ Ｔ，Ｍｉｓｃｈｏｕｌｏｎ Ｄ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６５：１０９６〜１０９８（２００４））。さらに近年、選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩｓ）への十分な応答を達成しなかったＭＤＤ患者での無作為化、プラセボ対照試験からの結果が公開され、逐次並行比較設計（ｓｅｑｕｅｎｔｉａｌ ｐａｒａｌｌｅｌ ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｄｅｓｉｇｎ）（ＳＰＣＤ）を使用して１日１５ｍｇのＬ−メチル葉酸対プラセボでの補助的治療についてのより大きな有効性を実証した（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｓｈｅｌｔｏｎ ＲＣ，Ｚａｊｅｃｋａ ＪＭ，ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜１２７４（２０１２））。
[0408]本実施例は、ベースラインバイオマーカーレベル又は代謝若しくは炎症性状態のマーカーに焦点を合わせた遺伝子型の関数として１５ｍｇのＬ−メチル葉酸対プラセボの治療効果を記載する。具体的には、低葉酸血症（ｈｙｐｏｆｏｌａｔｅｍｉａ）と代謝障害及び炎症の間の関連、例えば、これらのドメインから特異的マーカーを使用して定義されるベースラインでの代謝性又は炎症性状態と、毎日１５ｍｇのＬ−メチル葉酸対プラセボ増強での治療結果との間の相互作用も例示する。さらに本実施例は、テトラヒドロビオプテリン（ＢＨ４）依存性モノアミン合成の増強についてのＬ−メチル葉酸の役割の観点における相互作用を示す（Ｈｙｎｄｍａｎ ＭＥ，Ｖｅｒｍａ Ｓ，Ｒｏｓｅｎｆｅｌｄ ＲＪ，ｅｔ ａｌ．．Ａｍ Ｊ Ｐｈｙｓｉｏｌ Ｈｅａｒｔ Ｃｉｒｃ Ｐｈｙｓｉｏｌ ２８２：Ｈ２１６７〜２１７２（２００２））。有意な相関関係がＭＤＤと赤血球葉酸、モノアミン神経伝達物質及び脳脊髄液ＢＨ４のレベルとの間に観察された。さらにＢＨ４は、神経末端からの神経伝達物質のシナプス前放出を制御する（Ｂｏｔｔｉｇｌｉｅｒｉ Ｔ．，Ｐｒｏｇ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，２９：１１０３〜１２（２００５））。最終的に本実施例は、一炭素循環代謝（ｏｎｅ−ｃａｒｂｏｎ ｃｙｃｌｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ）及び治療結果と関連するマーカーの影響も示す。
方法
[0409]本明細書は、ＳＳＲＩ抵抗性ＭＤＤである患者に対する補助的療法としての１５ｍｇ Ｌ−メチル葉酸の多施設、６０日間、無作為化、二重盲検試験からの探索解析の結果を表す（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｓｈｅｌｔｏｎ ＲＣ，Ｚａｊｅｃｋａ ＪＭ，ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜１２７４（２０１２））。本研究は、Ｆａｖａ Ｍ，Ｅｖｉｎｓ ＡＥ，Ｄｏｒｅｒ ＤＪ，ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ，７２：１１５〜１２７（２００３）の逐次並行比較設計（ＳＰＣＤ）により２つの３０日間相（第Ｉ及び第ＩＩ相）に分けられた。本研究設計及び結果は以前記載された（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｓｈｅｌｔｏｎ ＲＣ，Ｚａｊｅｃｋａ ＪＭ，ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜１２７４（２０１２））が、簡潔には下に要約されている。研究プロトコールは、再検討され、次のｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ ｒｅｖｉｅｗ ｂｏａｒｄｓ（ＩＲＢ）：Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ Ｇｅｎｅｒａｌ Ｈｏｓｐｉｔａｌ，Ｐａｒｔｎｅｒｓ Ｈｕｍａｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｏｆｆｉｃｅ、Ｒｕｓｈ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｃｅｎｔｅｒ，Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｔｒｉａｌｓ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ Ｏｆｆｉｃｅ、Ｇｏｏｄｗｙｎ ＩＲＢ、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，Ｈｕｍａｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎｓ Ｐｒｏｇｒａｍ、Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｉｎｃｉｎｎａｔｉ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｃｅｎｔｅｒ，Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ Ｒｅｖｉｅｗ Ｂｏａｒｄ Ｏｆｆｉｃｅ、Ｖａｎｄｅｒｂｉｌｔ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ Ｒｅｖｉｅｗ Ｂｏａｒｄ及びＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａ，Ｏｆｆｉｃｅ ｏｆ Ｒｅｇｕｌａｔｏｒｙ Ａｆｆａｉｒｓによって承認された。書面によるインフォームドコンセントは、いかなる研究手順が行われるより前にすべての研究患者から得た（臨床試験政府登録番号ＮＣＴ００９５５９５５）。
患者選択
[0410]年齢１８〜６５才及びＭＤＤの現在の発症についてＤＳＭ−ＩＶ判定基準に合致する成人は、スクリーニング及びベースライン来院時に彼らが簡易うつ症状自己評価項目（Ｑｕｉｃｋ Ｉｎｖｅｎｔｏｒｙ ｏｆ Ｄｅｐｒｅｓｓｉｖｅ Ｓｙｍｐｔｏｍｓ−Ｓｅｌｆ Ｒｅｐｏｒｔ）（ＱＩＤＳ−ＳＲ）尺度≧１２を有する場合に、適格であった。患者は、ＭＤＤの現在の発症の際に≧８週間、十分な用量（２０ｍｇ／日以上のフルオキセチン、シタロプラム又はパロキセチン、１０ｍｇ／日以上のエスシタロプラム、及び５０ｍｇ／日以上のセルトラリンとして定義される）のＳＳＲＩで治療されなければならず、Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ Ｇｅｎｅｒａｌ Ｈｏｓｐｉｔａｌ（ＭＧＨ）抗うつ剤治療応答質問票（ＡＴＲＱ）を使用して評価した（Ｃｈａｎｄｌｅｒ ＧＭ，Ｉｏｓｉｆｅｓｃｕ ＤＶ，Ｐｏｌｌａｃｋ ＭＨ，ｅｔ ａｌ．，ＣＮＳ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ Ｔｈｅｒ．，１６：３２２〜３２５（２０１０））。患者は、過去４週間について安定なＳＳＲＩ用量も受けていなければならない。現在の発症の際に２回より多く十分な抗うつ剤試験に失敗している場合患者を除外した。スクリーニングからベースラインでＱＩＤＳ−ＳＲ合計スコアでのうつ症状において≧２５％の減少を呈する患者は、除外した。
研究手順
[0411]適格性を、互いに１４日間以内にあるスクリーニング及びベースライン来院の際に評価した。ベースライン来院の際に適格性である患者を以前記載のＳＰＣＤを使用する研究に登録した（Ｆａｖａ Ｍ，Ｅｖｉｎｓ ＡＥ，Ｄｏｒｅｒ ＤＪ，ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ，７２：１１５〜１２７（２００３））。患者を第Ｉ及び第ＩＩ相の際にプラセボ−プラセボ、プラセボ−Ｌ−メチル葉酸１５ｍｇ／日、又はＬ−メチル葉酸−Ｌ−メチル葉酸１５ｍｇ／日を受ける３つの処置群の内の１つに、プライマリー研究センターによって作成された無作為化コードを使用して無作為化した。各相は、持続期間３０日間であった。研究来院は１０日間ごとであり、その際同時のＳＳＲＩ投与は一定のままであり、研究薬物療法に耐えることができない患者は研究から除いた。患者及び調査者は、研究割り当てに盲検であった。
[0412]患者をハミルトンうつ病評価尺度（ＨＤＲＳ）で各研究来院時に評価した。さらに、症状応答を、ＨＡＭＤ−７（ＭｃＩｎｔｙｒｅ Ｒ，Ｋｅｎｎｅｄｙ Ｓ，Ｂａｇｂｙ ＲＭ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ，２７：２３５〜２３９（２００２））、認知及び身体機能質問票（ＣＰＦＱ）（Ｆａｖａ Ｍ，Ｉｏｓｉｆｅｓｃｕ ＤＶ，Ｐｅｄｒｅｌｌｉ Ｐ，ｅｔ ａｌ．，Ｒｅｌｉａｂｉｌｉｔｙ ａｎｄ ｖａｌｉｄｉｔｙ ｏｆ ｔｈｅ ＭＧＨ Ｃｏｇｎｉｔｉｖｅ ａｎｄ Ｐｈｙｓｉｃａｌ Ｆｕｎｃｔｉｏｎｉｎｇ Ｑｕｅｓｔｉｏｎｎａｉｒｅ（ＣＰＦＱ）．Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ ７８：９１〜９７（２００９））及び臨床全般印象尺度（ＣＧＩ−Ｓ）（Ｇｕｙ Ｗ．Ｅｃｄｅｕ．Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ Ｍａｎｕａｌ ｆｏｒ Ｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ−Ｒｅｖｉｓｅｄ（ＤＨＥＷ Ｐｕｂｌ Ｎｏ ＡＤＭ ７６〜３３８）．Ｒｏｃｋｖｉｌｌｅ，ＭＤ，Ｕ．Ｓ．Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ，Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ，ａｎｄ Ｗｅｌｆａｒｅ，Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｅｒｖｉｃｅ，Ａｌｃｏｈｏｌ，Ｄｒｕｇ Ａｂｕｓｅ，ａｎｄ Ｍｅｎｔａｌ Ｈｅａｌｔｈ Ａｄｍｉｎｉｓｔｒａｔｉｏｎ，ＮＩＭＨ Ｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｂｒａｎｃｈ，Ｄｉｖｉｓｉｏｎ ｏｆ Ｅｘｔｒａｍｕｒａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐｒｏｇｒａｍｓ（１９７６））で評価した。身長及び体重を測定し、ＢＭＩをｋｇ／ｍ２で算出した。血漿ｈｓＣＲＰ、４−ヒドロキシ−２−ノネナール［４−ＨＮＥ］及び低Ｓ−アデノシルメチオニン／Ｓ−アデノシルホモシステイン（［ＳＡＭ／ＳＡＨ］比）のベースラインレベルを評価するためにベースライン血液試料を回収した。同様に評価したのはａ）メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）について遺伝子型Ｃ６７７Ｔ、１２９８Ｃ及びＧ１７９３Ａ、ｂ）メチオニンシンターゼレダクターゼ（ＭＴＲＲ）について遺伝子型Ａ６６Ｇ並びにｃ）メチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）について遺伝子型Ａ２７５６Ｇの遺伝子多型であった。追加的分析のためにベースライン試料をカルシウムチャネル、電圧依存性、Ｌ型、アルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）、ＤＮＡ（シトシン−５−）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）、葉酸ヒドロラーゼ１（ＦＯＬＨ１）、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１フィードバック制御タンパク質（ＧＣＨＦＲ）及び溶質担体ファミリー１９（葉酸トランスポーター）、メンバー１（ＳＬＣ１９Ａ１又は還元葉酸担体（ＲＦＣ１）としても周知）についての遺伝子多型について評価した（表６）。
Figure 2016518816
アッセイ方法
[0413]血清ｈｓＣＲＰを商業的に入手できるキット、ラテックスパーティクルエンハンストイムノチュービディメトリックアッセイ（ｌａｔｅｘ ｐａｒｔｉｃｌｅ ｅｎｈａｎｃｅｄ ｉｍｍｕｎｏｔｕｒｂｉｄｉｍｅｔｒｉｃ ａｓｓａｙ）（Ｐｏｉｎｔｅ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ、Ｉｎｃ．、Ｃａｎｔｏｎ、ＭＩ）によって測定した。濁度（吸光度）をＡＣＥアレラクリニカルケミカルアナライザー（Ａｌｅｒａ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎａｌｙｚｅｒ）（Ａｌｐｈａ Ｗａｓｓｅｒｍａｎｎ、Ｗｅｓｔ Ｃａｌｄｗｅｌｌ、ＮＪ）で読み取った。血漿４−ＨＮＥを酵素イムノアッセイを使用して試料中に存在するＨＮＥ−Ｈｉｓタンパク質付加物の量の分析によって測定した（オキシセレクトＨＮＥ−ＨｉｓアダクトＥＬＩＳＡキット（ＯｘｉＳｅｌｅｃｔ ＨＮＥ−Ｈｉｓ ａｄｄｕｃｔ ＥＬＩＳＡ ｋｉｔ），Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌａｂｓ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）。血漿ＳＡＭ及びＳＡＨを以前記載のとおり安定同位体希釈液体クロマトグラフィ−エレクトロスプレーイオン化タンデム質量分析によって決定した（Ｉｎｏｕｅ−Ｃｈｏｉ Ｍ，Ｎｅｌｓｏｎ ＭＨ， Ｒｏｂｉｅｎ Ｋ，ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｊ Ｍｏｌ Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌ Ｇｅｎｅｔ，３：１６０〜１７３（２０１２））。遺伝子多型の存在の決定を、ＤＮｅａｓｙブラッドアンドティシューキット（ＤＮｅａｓｙ ｂｌｏｏｄ ａｎｄ ｔｉｓｓｕｅ ｋｉｔ）（Ｑｉａｇｅｎ Ｉｎｃ，Ｖａｌｅｎｃｉａ，ＣＡ）を使用して全血から精製したＤＮＡについて実施した。遺伝子型判定をマスアレイプラットフォーム（ＭａｓｓＡｒｒａｙ ｐｌａｔｆｏｒｍ）（Ｓｅｑｕｅｎｏｍ，Ｉｎｃ．，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）を使用して実施した。
統計分析
[0414]探索分析のために、プールした治療効果を、研究の２つの相にわたってプールし、Ｆａｖａ Ｍ，Ｅｖｉｎｓ ＡＥ，Ｄｏｒｅｒ ＤＪ，ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ，７２：１１５〜１２７（２００３）のＳＰＣＤと一致するＬ−メチル葉酸及びプラセボ群について、ベースラインからエンドポイントまでの平均変化における平均差異によって評価した。Ｌ−メチル葉酸を伴うＨＤＲＳ−２８での応答へのバイオマーカーのプラセボと比較した効果を、ＢＭＩ（≧３０又は＜３０ｋｇ／ｍ２）、ｈｓＣＲＰレベル（ベースライン中央値≧又は＜２．２５ｍｇ／Ｌ）、ＳＡＭ／ＳＡＨ比（ベースライン中央値≧又は＜２．７１）、及び４−ＨＮＥレベル（ベースラインレベル中央値≧又は＜３．２８μｇ／ｍＬ）によって階層化した。さらに、遺伝子型の分子多型の存在を測定した。ＢＭＩの上昇、低いＳＡＭ／ＳＡＨ比、ｈｓＣＲＰ及び４−ＨＮＥの血漿レベルの上昇、並びに分子多型を、より大きなプールした（ＳＰＣＤによる第Ｉ及び第ＩＩ相）薬物／プラセボ差異の予測因子として評価した。
[0415]標準的ＳＰＣＤ分析アプローチを研究有効性データを分析するために用いた。具体的には、包括解析／ＬＯＣＦ（ｉｎｔｅｎｔ−ｔｏ−ｔｒｅａｔ／ｌａｓｔ ｏｂｓｅｒｖａｔｉｏｎ ｃａｒｒｉｅｄ ｆｏｒｗａｒｄ）（ＩＴＴ／ＬＯＣＦ）アプローチを第Ｉ相の際にＬ−メチル葉酸で治療された患者について用いた。目的の第ＩＩ相データセットは、第Ｉ相の際にプラセボで治療され、第Ｉ相を完了し、第Ｉ相の際及び第ＩＩ相に入ってＨＤＲＳへの臨床応答を経験しなかった患者に限定された。ＬＯＣＦアプローチを新規のベースライン来院として使用する第Ｉ相の最後の来院／第ＩＩ相の最初の来院と共に、第ＩＩ相についてのデータセットに適用した。第Ｉ相の際のＬ−メチル葉酸とプラセボとを比較するＩＴＴ／ＬＯＣＦデータを第ＩＩ相においてＬ−メチル葉酸とプラセボとを比較するデータと、ＳＰＣＤについてのモデルに従って組合せ、Ｆａｖａ Ｍ，Ｅｖｉｎｓ ＡＥ，Ｄｏｒｅｒ ＤＪ，ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ，７２：１１５〜１２７（２００３）に概説される一般的アプローチを使用して、ウエイト（ｗ＝０．５０）及び無作為化分率（ａ＝０．３３３）を使用して分析した。
[0416]二分法測定を二分法結果についての方法に従って分析し（Ｆａｖａ Ｍ，Ｅｖｉｎｓ ＡＥ，Ｄｏｒｅｒ ＤＪ，ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ，７２：１１５〜１２７（２００３））、一方表面上は無関係な回帰、ベースラインスコアについての制御を連続的な結果の比較のために用いた （Ｔａｍｕｒａ ＲＮ，Ｈｕａｎｇ Ｘ．，Ｃｌｉｎ Ｔｒｉａｌｓ，４：３０９〜３１７（２００７））。すべての検査は、両側としてアルファセット０．０５で実施した。ＨＤＲＳ−２８でのＬ−メチル葉酸対プラセボについてのベースラインからエンドポイントまでのプールした平均変化を各バイオマーカー及び遺伝子マーカーについて階層化した。治療効果、エフェクトサイズ（標準偏差で割った平均間の差異）、及び９５％信頼区間（ＣＩ）を各バイオマーカーについて算出した。さらに、群内分析、ＨＤＲＳ−２８奏功率（ベースラインから少なくとも５０％低減）、オッズ比、及び治療される必要がある数を決定した。群内分析は、曝露の際のバイオマーカー又は遺伝子マーカー状態と共に、Ｌ−メチル葉酸（第Ｉ相における若しくは第ＩＩ相におけるプラセボ非応答者として）又はプラセボ（第Ｉ相における若しくは第ＩＩ相におけるプラセボ非応答者として）を受けた個体について別々に実施した。個体は彼らのバイオマーカー状態に基づいて無作為化されてないことから、群内分析を年齢、性別、人種及びＢＭＩ並びにＨＤＲＳ−２８のベースラインレベルを含む潜在的交絡因子について補正した。補正は、連続的ＨＤＲＳ−２８について直線回帰を使用して及びバイナリー結果について傾向スコア階層化分析を通して行った（最終モデルにおける予測因子の数を減少させるために）。
結果
[0417]全体として、患者７４名がデータを提供し、６１名（８１．３％）が研究を完了した。研究のプライマリー分析からの詳細な結果（有効性、安全性、１５ｍｇ Ｌ−メチル葉酸対プラセボの認容性）は他所に公開されている（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｓｈｅｌｔｏｎ ＲＣ，Ｚａｊｅｃｋａ ＪＭ，ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜１２７４（２０１２））。すべての分析について、研究の第Ｉ相及び第ＩＩ相の両方からの結果をＳＰＣＤ方法（Ｆａｖａ Ｍ， Ｅｖｉｎｓ ＡＥ，Ｄｏｒｅｒ ＤＪ，ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ，７２：１１５〜１２７（２００３））に従ってプールした。ベースラインからのプールした（第Ｉ及び第ＩＩ相）平均変化は、ＨＤＲＳ−２８についてプラセボよりも補助的Ｌ−メチル葉酸１５ｍｇ／日で有意に大きかった（−６．８±７．２対−３．７±６．５、ｐ＝０．０１７）。
[0418]ＨＤＲＳ−２８でのＬ−メチル葉酸対プラセボのプールした平均変化を種々のバイオマーカー又はそれらの組合せの存在又は非存在によって特定される患者のサブグループ内で検討した。ＨＤＲＳ−２８でのＬ−メチル葉酸対プラセボについてのベースラインからのプールした平均変化は、研究中央値を下回る血漿ＳＡＭ／ＳＡＨ比、研究中央値を上回るｈｓＣＲＰ若しくは４−ＨＮＥ血液レベル又はＢＭＩ≧３０ｋｇ／ｍ２（肥満と一致する）（表７）を有する患者のサブグループ内で有意に（ｐ≦０．０５）大きかった。
Figure 2016518816
[0419]探索分析は、大部分の遺伝子マーカーのベースライン（表８を参照されたい）での存在に基づいて、ＨＤＲＳ−２８でのＬ−メチル葉酸対プラセボについてのベースラインからのプールした平均変化について有意な（ｐ≦０．０５）差異を実証した。ＨＤＲＳ−２８でのＬ−メチル葉酸対プラセボのベースラインからのプールした平均変化は、遺伝子型ＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ又はＭＴＲＲ ６６ ＡＧ／ＧＧを有する患者のサブグループにおいては有意に（ｐ＜０．０５）大きかったが、遺伝子型ＭＴＨＦＲ ６７７ ＣＴ／ＴＴ又はＭＴＨＦＲ １２９８ ＡＣ／ＣＣでは、それぞれのホモ接合性優性遺伝子型と比較して有意ではなかった（表８）。ＨＤＲＳ−２８について、すべての遺伝子型にわたるベースラインからの有意な平均変化に対してプールしたエフェクトサイズは−０．０５〜−１．５７の範囲であった。同様にＨＤＲＳ−２８奏功率（治療マイナスプラセボ）は、大部分の遺伝子マーカーのベースライン存在について階層化した場合にＬ−メチル葉酸対プラセボで、有意に（ｐ＜０．０５）改善された。ベースラインでの通常の及び推定の陽性マーカーの存在の比較は、ＭＴＨＦＲ６７７ＣＴ／ＴＴ、ＦＯＬＨ１ＡＧ／ＧＧ及びＧＣＨＦＲＴＡ／ＴＴを除く大部分のマーカーについて有意な（ｐ＜０．０５）差異が示されてＨＤＲＳ−２８奏功率における明らかな差異を実証した（図９Ａ〜Ｂ）。
Figure 2016518816
[0420]さらなる探索分析を、応答をＨＡＭＤ−７、ＣＧＩ−Ｓ及びＣＰＦＱを使用して評価した場合に、個々のマーカーのベースラインレベルによって階層化したＬ−メチル葉酸対プラセボの効果を決定するために実施した（表９）。有意な（ｐ＜０．０５）改善は、ＣＧＩ−ＳでのＭＴＨＦＲ１２９８ＡＣ／ＣＣ並びにＨＡＭＤ−７及びＣＰＦＱでの多数のマーカーを除いてすべての遺伝子マーカーについてＬ−メチル葉酸対プラセボでベースラインからのプールした平均変化について記された。
Figure 2016518816
[0421]ベースラインで存在する生物学的及び遺伝子マーカーの組合せを有する患者におけるＨＤＲＳ−２８についてＬ−メチル葉酸対プラセボでのベースラインからのプールした平均変化への影響も検討した。マーカーの組合せは、Ｌ−メチル葉酸対プラセボについて、−３．６〜−２３．３の範囲であるベースラインからのプールした平均変化及び−０．５６〜−４．５０の範囲であるプールしたエフェクトサイズを実証した（表１０）。ＭＴＨＦＲ ６７７ ＣＴ／ＴＴ＋ＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ、ＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴ＋ＣＯＭＴ ＧＧ及びＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴ＋ＣＯＭＴ ＣＣの組合せは、最も大きなエフェクトサイズ（それぞれ−２３．３、−２０．７及び−１８．２、）を実証し、Ｌ−メチル葉酸対プラセボについてのプールした平均変化が高度に有意（ｐ＜０．００１）であった。
Figure 2016518816
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考察
[0422]プライマリー分析からの結果は、ＳＳＲＩへの不十分な応答を有する患者における補助的療法としての１５ｍｇ Ｌ−メチル葉酸対プラセボの有意な差次的有効性を実証した（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ，Ｓｈｅｌｔｏｎ ＲＣ，Ｚａｊｅｃｋａ ＪＭ，ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜１２７４（２０１２））。Ｌ−メチル葉酸（０．４１）でのＨＤＲＳへの全体的なエフェクトサイズは、ＭＤＤでの補助的療法の他の研究において観察されたエフェクトサイズ（０．３５〜０．３７）と同様であった（Ｍａｒｃｕｓ ＲＮ，ＭｃＱｕａｄｅ ＲＤ，Ｃａｒｓｏｎ ＷＨ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，２８：１５６〜１６５（２００８）、Ｒｅｉｍｈｅｒｒ ＦＷ，Ｍａｒｔｉｎ ＭＬ，Ｅｕｄｉｃｏｎｅ ＪＭ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，３０：３００〜３０５（２０１０））。本明細書で提供する結果は、代謝機能障害、炎症又はＬ−メチル葉酸代謝のバリアントと関連する、ベースラインレベル生物学的及び遺伝子バイオマーカー（例えば、ＢＭＩ、ｈｓＣＲＰ、ＭＴＲＲ、ＭＴＲ）（結果の調節物質）の存在によって階層化した患者において、Ｌ−メチル葉酸対プラセボでの大きな差次的治療効果を明らかにした。
[0423]本明細書で提供するのは、ベースラインでの選択バイオマーカーの存在とＬ−メチル葉酸への応答との間の関連である。特異的生物学的血漿又は遺伝子マーカーの存在によって階層化された場合の１５ｍｇ Ｌ−メチル葉酸対プラセボでの治療効果及びエフェクトサイズは、従来の抗うつ剤プラセボ試験から報告されたものよりも大きいと考えられる（Ｆｏｕｒｎｉｅｒ ＪＣ，ＤｅＲｕｂｅｉｓ ＲＪ，Ｈｏｌｌｏｎ ＳＤ，ｅｔ ａｌ．，ＪＡＭＡ，３０３：４７〜５３（２０１０）、Ｎｅｌｓｏｎ ＪＣ，Ｍａｎｋｏｓｋｉ Ｒ，Ｂａｋｅｒ ＲＡ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ａｆｆｅｃｔ Ｄｉｓｏｒｄ．，１２０：１３３〜１４０（２０１０））。マーカーの組合せは、大部分の比較において１．０を超えるエフェクトサイズを伴って、１５ｍｇ Ｌ−メチル葉酸でのさらに大きな治療効果を実証した。
[0424]ＭＤＤの危険性及び重症度の増加と関連するいくつかのバイオマーカーが特定されている。体重の増加及び肥満は、ＭＤＤの危険性の増加及び抗うつ剤治療への乏しい応答と正に関連している（Ｋｌｏｉｂｅｒ Ｓ，Ｉｓｉｎｇ Ｍ，Ｒｅｐｐｅｒｍｕｎｄ Ｓ，ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６２：３２１〜３２６（２００７）、Ｌｕｐｐｉｎｏ ＦＳ，ｄｅ Ｗｉｔ ＬＭ，Ｂｏｕｖｙ ＰＦ，ｅｔ ａｌ．，Ａｒｃｈ Ｇｅｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６７：２２０〜２２９（２０１０）、Ｆａｉｔｈ ＭＳ，Ｂｕｔｒｙｎ Ｍ，Ｗａｄｄｅｎ ＴＡ，ｅｔ ａｌ．，Ｏｂｅｓ Ｒｅｖ．，１２：ｅ４３８〜４５３（２０１１）、Ｍａ Ｊ，Ｘｉａｏ Ｌ．，Ｏｂｅｓｉｔｙ，１８：３４７〜３５３（２０１０））。葉酸代謝に関連する遺伝子マーカーは、それらのＭＤＤとの関連について調査されている（Ｐｅｅｒｂｏｏｍｓ ＯＬ，ｖａｎ Ｏｓ Ｊ，Ｄｒｕｋｋｅｒ Ｍ，ｅｔ ａｌ．，Ｂｒａｉｎ Ｂｅｈａｖ Ｉｍｍｕｎ．，２５：１５３０〜１５４３（２０１１）、Ｓｌｏｐｉｅｎ Ｒ，Ｊａｓｎｉｅｗｉｃｚ Ｋ，Ｍｅｃｚｅｋａｌｓｋｉ Ｂ，ｅｔ ａｌ．，Ｍａｔｕｒｉｔａｓ，６１：２５２〜２５５（２００８）、Ｌｅｗｉｓ ＳＪ，Ｌａｗｌｏｒ ＤＡ，Ｄａｖｅｙ Ｓｍｉｔｈ Ｇ，ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１１：３５２〜３６０（２００６）、Ｌｏｐｅｚ−Ｌｅｏｎ Ｓ，Ｊａｎｓｓｅｎｓ ＡＣ，Ｇｏｎｚａｌｅｚ−Ｚｕｌｏｅｔａ Ｌａｄｄ ＡＭ，ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１３：７７２〜７８５（２００８））。本明細書に記載の結果は、ＳＳＲＩに十分に応答しない患者のための補助的治療としてのＬ−メチル葉酸の利点に対する支持を提供し、この治療に応答する可能性が最も高い個体を特定するための追加的手段を示唆する。本明細書に記載の方法は、初期抗うつ剤療法に非応答性である抑うつ患者に対する個別化治療アプローチを提供するために使用できる。
[0425]ハミルトンうつ病評価尺度（ＨＤＲＳ）は、ＭＤＤの臨床試験において薬物応答を評価するための標準として広く使用されている。しかしＨＤＲＳは、多次元的であり、臨床的変化を検出する感受性を欠いており、寛解を定義する識別力を欠いていることから批判されてきた（Ｂａｌｌｅｓｔｅｒｏｓ Ｊ，Ｂｏｂｅｓ Ｊ，Ｂｕｌｂｅｎａ Ａ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ａｆｆｅｃｔ Ｄｉｓｏｒｄ．，１０２：９３〜９９（２００７））。これらの分析については、ＨＤＲＳ−１７項目スコアよりもＨＤＲＳ−２８が、長いバージョンが非定型的又はメランコリーなうつの症状を有する患者における変化にさらに感受性であることからＬ−メチル葉酸対プラセボでの症状の改善を比較するために使用された（Ｎｅｍｅｒｏｆｆ ＣＢ，Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｒｅｓ．，４１：１８９〜２０６（２００７）、Ｃｕｓｉｎ Ｃ，Ｙａｎｇ Ｈ，Ｙｅｕｎｇ Ａ，Ｆａｖａ Ｍ．，Ｉｎ：Ｂａｅｒ Ｌ，Ｂｌａｉｓ ＭＡ（ｅｄｓ），Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｒａｔｉｎｇ Ｓｃａｌｅｓ ａｎｄ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ ｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ａｎｄ Ｍｅｎｔａｌ Ｈｅａｌｔｈ，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ（２０１０））。追加的に７項目ハミルトンうつ病評価尺度（ＨＡＭＤ−７）及び認知及び身体機能質問票（ＣＰＦＱ）を、ＨＡＭＤ−７がうつの臨床試験における変化にさらに感受性であると考えられることから探索分析において使用し（ＭｃＩｎｔｙｒｅ Ｒ，Ｋｅｎｎｅｄｙ Ｓ，Ｂａｇｂｙ ＲＭ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ，２７：２３５〜２３９（２００２）、ＭｃＩｎｔｙｒｅ ＲＳ，Ｋｏｎａｒｓｋｉ ＪＺ，Ｍａｎｃｉｎｉ ＤＡ，ｅｔ ａｌ．，ＣＭＡＪ，１７３：１３２７〜１３３４（２００５））、ＣＰＦＱが残る症状を予測するうつの認知及び身体症状機能を測定することが見出された（Ｆａｖａ Ｍ，Ｉｏｓｉｆｅｓｃｕ ＤＶ，Ｐｅｄｒｅｌｌｉ Ｐ，ｅｔ ａｌ．，Ｒｅｌｉａｂｉｌｉｔｙ ａｎｄ ｖａｌｉｄｉｔｙ ｏｆ ｔｈｅ ＭＧＨ Ｃｏｇｎｉｔｉｖｅ ａｎｄ Ｐｈｙｓｉｃａｌ Ｆｕｎｃｔｉｏｎｉｎｇ Ｑｕｅｓｔｉｏｎｎａｉｒｅ（ＣＰＦＱ）．Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ ７８：９１〜９７（２００９））。
[0426]結論として、不十分な応答者におけるＳＳＲＩ治療への補助として使用された場合にＬ−メチル葉酸でより大きな有効性が観察された。本分析は、有効性に関するＬ−メチル葉酸対プラセボの相対的優位性が炎症及び葉酸代謝の妨害に関連する代謝及び遺伝子マーカーの存在によって階層化した患者のサブセット内ではさらに増強される可能性があることを示している。これらの結果は、ある特定の代替マーカーの存在が、１５ｍｇ Ｌ−メチル葉酸での補助的療法に特に応答性である、ＳＳＲＩ抵抗性ＭＤＤである患者を特定するために使用できることを示している。
実施例４．大うつ病性障害である患者において補助的Ｌ−メチル葉酸に応答する抗うつ剤の予測的バイオマーカー
[0427]本実施例は、大うつ病性障害である患者がＬ−メチル葉酸と抗うつ薬（例えば選択的セロトニン再取り込み阻害剤（ＳＳＲＩ））との併用療法に応答するかどうかを予測するための遺伝子バイオマーカー（例えば、一塩基多型（ＳＮＰ））の使用を例示する。特に本実施例は、特異的相乗的二重マーカー組合せ（ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｓｙｎｅｒｇｉｓｔｉｃ ｄｕａｌ−ｍａｒｋｅｒ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ）が、ＭＤＤであると診断された患者でのＬ−メチル葉酸及び抗うつ薬の補助的療法への治療応答の指標であることを示している。さらに補助的療法への治療応答をＨＤＲＳ、ＣＧＩ−Ｓ及びＣＰＦＱなどの種々の神経心理学評価尺度を使用して検出した。
要約
[0428]生物学的又は遺伝子マーカーは、ＭＤＤの危険性の上昇又は療法への不十分な応答に関連している可能性がある。研究分析の目的は、ＳＳＲＩへの不十分な応答を有する患者における補助的Ｌ−メチル葉酸（１５ｍｇ）の抗うつ剤効果への特異的マーカー単独及び組合せの効果を評価することである。
[0429]プライマリー研究では、Ｌ−メチル葉酸をＳＳＲＩ抵抗性ＭＤＤである外来患者７５名において、二重盲検、無作為化、プラセボ対照試験で評価した。患者は、１５ｍｇ／日、６０日間のＬ−メチル葉酸、３０日間のプラセボに続く１５ｍｇ／日、３０日間のＬ−メチル葉酸、又は６０日間のプラセボのいずれかを受けた。臨床研究の詳細な記載は、例えば、Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜７４（２０１２）並びに米国特許出願公開第２０１３／０１７２３６１号及び第２０１３／０２６７５２３号並びに国際特許出願公開第２０１３／０７４６７６号において見出され、その開示はすべての目的について参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
[0430]下に記載の分析では、ベースライン肥満度指数（ＢＭＩ）並びにメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ ６７７ ＣＴ／ＴＴ、ｒｓ１８０１１３３）、メチオニンシンターゼ（ＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ、ｒｓ１８０５０８７）、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ、ｒｓ４６８０）及びＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴ、ｒｓ８００７２６７）多型の存在の、個々及び組合せでのＬ−メチル葉酸への治療応答への効果を評価した。
[0431]ＢＭＩ≧３０ｋｇ／ｍ２を有する患者は、ＢＭＩ＜０ｋｇ／ｍ２である者と比較して、Ｌ−メチル葉酸での有意に大きい症状の低減を経験した（２８項目ハミルトンうつ病評価尺度（ＨＤＲＳ−２８）、プールした平均変化は−４．６６であった、ｐ＝０．００１）。ＨＤＲＳ−２８についてＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ、ＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴ及びＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧでのベースラインからのプールした平均変化は、０．７５〜１．５７の範囲のプールしたエフェクトサイズを有してＬ−メチル葉酸対プラセボで有意に（ｐ≦０．０５）大きかった。ＨＤＲＳ−２８についてこれらの５つのマーカー（ＢＭＩ、ＭＴＨＦＲ、ＭＴＲ、ＣＯＭＴ及びＧＣＨ１）の大部分の組合せでのベースラインからのプールした平均変化も有意であった（プールした平均変化範囲：それぞれ−２３．２９、−９．８８、ｐ＜０．０５）。これらの結果は、結果測定ＨＤＲＳ−７、臨床全般印象重症度尺度（ＣＧＩ−Ｓ）及び認知及び身体機能質問票（ＣＰＦＱ）を使用する大部分の比較についての顕著な差異によって支持された。
[0432]１５ｍｇ／日でのＬ−メチル葉酸の補助的療法は、バイオマーカー、遺伝子型又はそれらの組合せによって階層化した患者において顕著な治療効果を実証した。これらの状態は、個々に及び組合せでＳＳＲＩ療法への不十分な応答に予測的であった。特異的バイオマーカー及び遺伝子型の組合せの存在はＬ−メチル葉酸増強からの利益を予測するとも考えられる一方で、それらの非存在は、そのような増強からの利益がないかそれに近いことを示している。
序論
[0433]大うつ病性障害（ＭＤＤ）の１２カ月有病率が米国成人において６．７％であり（Ｋｅｓｓｌｅｒ ＲＣ，Ａｒｃｈ Ｇｅｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ．，６２：６１７〜２７（２００５））、生涯有病率１６．９％であると報告されている（Ａｎｄｒａｄｅ Ｌ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｊ Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｒｅｓ．，１２：３〜２１（２００３））。ＭＤＤの発生は、患者及び介護者への大きな負担並びに著しく大きい経済的負担に関連する（Ｆｏｓｔｉｃｋ Ｌ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，２０：６７１〜５（２０１０）、Ｉｖａｎｏｖａ ＪＩ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ Ｍｅｄ Ｒｅｓ Ｏｐｉｎ．，２６：２４７５〜８４（２０１０）、Ｋｎｏｔｈ ＲＬ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｍａｎａｇ Ｃａｒｅ，１６：ｅ１８８〜９６（２０１０））。患者の大部分は、抗うつ剤への乏しい奏功率を経験する（Ｒｕｓｈ ＡＪ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６３：１９０５〜１７（２００６））。治療有効性の信頼できる予測はなく（Ｆａｂｂｒｉ Ｃ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｍｅｄ Ｇｅｎｅｔ Ｂ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｇｅｎｅｔ．，１６２Ｂ：４８７〜５２０（２０１３））、それにより抗うつ剤療法は、しばしば乏しい又は不十分な薬物応答を生じる。
[0434]初期の抗うつ剤療法への不十分な応答は、患者の３分の２に至るＭＤＤの有効な管理を妨げ続けている（Ｔｈａｓｅ，２００３、Ｒｕｓｈ ＡＪ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６３：１９０５〜１７（２００６））。抗うつ薬を切り替える間、増強戦略及び併用療法は応答しない患者のための治療の選択肢であり、別のアプローチは最適な応答を有する、すなわちＭＤＤ危険性及び／又は治療応答と関連するバイオマーカー又は分子マーカーのレベルを測定するステップにより、患者を特定することを試みることである。
[0435]遺伝子多型が抗うつ薬応答の個体間可変性に寄与すると仮定されている（Ｆａｂｂｒｉ Ｃ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｍｅｄ Ｇｅｎｅｔ Ｂ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｇｅｎｅｔ．，１６２Ｂ：４８７〜５２０（２０１３））。抗うつ剤有効性、認容性及び安全性に関連する多型は特定されている。しかし研究は、試料サイズが小さく、きちんと定義されていない患者集団及び交絡変数であり、結果の臨床適用性は限定的されている（Ｆａｂｂｒｉ Ｃ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｍｅｄ Ｇｅｎｅｔ Ｂ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｇｅｎｅｔ．，１６２Ｂ：４８７〜５２０（２０１３））。ＭＤＤの複雑な神経生物学及び薬理遺伝学は、臨床試験結果を診療に移行するための課題を提起する。抗うつ剤応答に関連する分子機構の理解の増大は、ＭＤＤにおける結果の改善を導くはずであり、必要である（Ｏ’Ｌｅａｒｙ ｅｔ ａｌ．，Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｅｈａｖ．，［Ｅｐｕｂ ａｈｅａｄ ｏｆ ｐｒｉｎｔ］ＰｕｂＭｅｄ ＰＭＩＤ：２４１６１６８３（２０１３ Ｏｃｔ ２４））。
[0436]ＭＤＤの危険性の増加、ＭＤＤのさらに大きな重症度又は抗うつ剤治療への乏しい応答と関連する種々の遺伝子バイオマーカーが特定されている（Ｖｏｇｅｌｚａｎｇｓ Ｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，７１：３９１〜９（２０１０）、Ｋｌｏｉｂｅｒ Ｓ，Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ．，６２：３２１〜６（２００７）、Ｌｕｐｐｉｎｏ ＦＳ ｅｔ ａｌ．，Ａｒｃｈ Ｇｅｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６７：２２０〜９（２０１０））。例えば遺伝子マーカー５，１０−メチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲＣ６７７Ｔ）及びカテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）は、抗うつ剤治療への応答又は自殺の危険性の増加の予測として認められている（Ｐｅｅｒｂｏｏｍｓ ＯＬ ｅｔ ａｌ．，Ｂｒａｉｎ Ｂｅｈａｖ Ｉｍｍｕｎ．，２５：１５３０〜４３（２０１１）、Ｌａｎｃｔｏｔ ｅｔ ａｌ．，２０１０、Ｓｌｏｐｉｅｎ ｅｔ ａｌ．，２００８、Ｓｃｈｏｓｓｅｒ Ａ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，２２：２５９〜６６（２０１２））。したがって、バイオマーカーのベースラインレベルの評価又は遺伝子マーカーの存在若しくは非存在は、抗うつ剤治療に応答する可能性がより高いＭＤＤ患者を特定するために有用である可能性がある。
[0437]ＭＤＤの従来の抗うつ剤治療への有用な補助剤としてのＬ−メチル葉酸の役割は、ますます認められている（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜７４（２０１２）、Ｆａｒａｈ Ａ．，ＣＮＳ Ｓｐｅｃｔｒ．，１４（１ Ｓｕｐｐｌ ２）：２〜７（２００９）、Ｇｉｎｓｂｅｒｇ ＬＤ，Ｏｕｂｒｅ Ａ，Ｄａｏｕｄ Ｙ．，Ｉｎｎｏｖ Ｃｌｉｎ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．，８：１９〜２８（２０１１））。Ｌ−メチル葉酸は、ドーパミン、ノルエピネフリン及びセロトニンの合成をチロシンヒドロキシラーゼ及びトリプトファンヒドロキシラーゼを活性化することによってそれらの合成に不可欠であるテトラヒドロビオプテリン（ＢＨ４）を介して調節している（Ｂｏｔｔｉｇｌｉｅｒｉ，２００５、Ｍｉｌｌｅｒ ＡＬ，Ａｌｔｅｒｎ Ｍｅｄ Ｒｅｖ．，１３：２１６〜２６（２００８））。機能障害性葉酸処分（ｄｉｓｐｏｓｉｔｉｏｎ）は、うつに関する危険性を増加させ、抗うつ剤治療効果を妨げ、治療応答の減少を生じる場合がある（Ｖｏｇｅｌｚａｎｇｓ Ｎ，Ｂｅｅｋｍａｎ ＡＴ，Ｂｏｅｌｈｏｕｗｅｒ ＩＧ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，７２：５９８〜６０４（２０１１））。ＳＳＲＩへの十分な応答を有するＭＤＤ患者における２つの無作為化、プラセボ対照試験からの結果は、ＳＳＲＩ単独療法の継続と比較して補助的Ｌ−メチル葉酸治療での応答及び寛解率の改善を実証した（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜７４（２０１２））。本明細書に示す１つの試験の分析は、補助的Ｌ−メチル葉酸への治療応答についての５つの遺伝子バイオマーカー単独及び組合せの予測値を評価した。
方法
[0438]事後分析をＭＤＤでありＳＳＲＩ治療への以前の不十分な応答を有する患者についての補助的療法としてのＬ−メチル葉酸の多施設、６０日間、無作為化、二重盲検試験からの結果に基づいて実施した。研究設計及び結果は完全に示され、Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜７４（２０１２）に要約されている。研究プロトコール、補正及びインフォームドコンセント形式は再検討され、Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ Ｒｅｖｉｅｗ Ｂｏａｒｄによって承認された。書面によるインフォームドコンセントは、いかなる研究手順が行われるより前にすべての研究患者から得た（臨床試験政府登録番号ＮＣＴ００９５５９５５）。
患者選択
[0439]ＭＤＤの現在の発症について分類と診断の手引きＩＶ（Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ ａｎｄ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｍａｎｕａｌ ＩＶ）（ＤＳＭ−ＩＶ）判定基準を満たし、年齢１８〜６５歳である患者は、スクリーニング及びベースライン来院時に簡易うつ症状自己評価項目（ＱＩＤＳ−ＳＲ）スコア≧１２を有する場合に適格である。患者はＭＤＤの現在の発症の際に、Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ Ｇｅｎｅｒａｌ Ｈｏｓｐｉｔａｌ（ＭＧＨ）抗うつ剤治療応答質問票（ＡＴＲＱ）（Ｃｈａｎｄｌｅｒ ＧＭ ｅｔ ａｌ．，ＣＮＳ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ Ｔｈｅｒ．，１６：３２２〜５（２０１０））を使用して決定し、その前４週間について安定のままであるのに十分な用量（≧２０ｍｇ／日のフルオキセチン、シタロプラム若しくはパロキセチン、≧１０ｍｇ／日のエスシタロプラム又は≧５０ｍｇ／日のセルトラリン）で≧８週間の、ＳＳＲＩでの以前行われた治療記録を有する必要があった。除外判定基準は、現在の発症の際に≧２の十分な抗うつ剤試験の失敗及びスクリーニングからベースラインでのＱＩＤＳ−ＳＲ合計スコアでうつ性症状における≧２５％減少を含んだ。
研究手順
[0440]スクリーニング及びベースライン来院は互いに１４日間以内であり、ベースライン来院の際に適格な患者は、書面でのインフォームドコンセントを提供した後に研究に登録した。患者を、第Ｉ相及び第ＩＩ相についての３０日間の治療の際に逐次並行比較設計（ＳＰＣＤ）（Ｆａｖａ Ｍ ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ．，７２：１１５〜２７（２００３））を使用して、プラセボ−プラセボ、プラセボ１５ｍｇ／日でのＬ−メチル葉酸又は１５ｍｇ／日でのＬ−メチル葉酸−Ｌ−メチル葉酸からなる処置群に２：３：３比で無作為化し、現在のＳＳＲＩ治療で安定用量で維持した。研究薬物療法を許容できなかった場合は患者を研究から外した。
[0441]各研究来院時に応答をハミルトンうつ病評価尺度（ＨＤＲＳ）（Ｈａｍｉｌｔｏｎ Ｍ．，Ｊ Ｎｅｕｒｏｌ Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ Ｐｓｙｃｈ．，２３：５６〜６２（１９６０））及び臨床全般印象重症度尺度（Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｇｌｏｂａｌ Ｉｍｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｓｅｖｅｒｉｔｙ ａｎｄ ｓｃａｌｅｓ）（ＣＧＩ−Ｓ）（Ｇｕｙ Ｗ．、Ｉｎ：ＥＣＤＥＵ ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ ｍａｎｕａｌ ｆｏｒ ｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ．Ｗａｓｈｉｎｇｔｏｎ（ＤＣ）：Ｓｕｐｅｒｉｎｔｅｎｄｅｎｔ ｏｆ Ｄｏｃｕｍｅｎｔｓ、ＵＳ Ｇｏｖｅｒｎｍｅｎｔ Ｐｒｉｎｔｉｎｇ Ｏｆｆｉｃｅ、ＵＳ Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ、Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ、ａｎｄ Ｗｅｌｆａｒｅ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ ＮＯ：７６〜３３８、１９７６：２１８〜２２）で評価した。さらに、症状応答をＨＤＲＳ−７（ＭｃＩｎｔｙｒｅ ＲＳ，ＣＭＡＪ，１７３：１３２７〜３４（２００５））並びに認知及び身体機能質問票（ＣＰＦＱ） （Ｆａｖａ Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ．，７８：９１〜７（２００９））で評価した。応答は、ＨＤＲＳ−２８でのベースラインからの≧５０低減として定義した。身長及び体重を測定し、ＢＭＩをｋｇ／ｍ２で算出した。ベースライン血液試料をメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）Ｔ６７７Ｃ対立遺伝子、ＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）ＴＣ／ＴＴ及びメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）Ａ２７５６Ｇに対する遺伝子多型の存在を評価するために回収した。
アッセイ方法
[0442]ＭＴＨＦＲ、ＭＴＲ、ＣＯＭＴ及びＧＣＨ１についての遺伝子多型の決定を全血から精製されたＤＮＡについてＤＮｅａｓｙブラッドアンドティシューキット（Ｑｉａｇｅｎ Ｉｎｃ、Ｖａｌｅｎｃｉａ、ＣＡ）を使用して実施した。遺伝子型判定をマスアレイプラットフォーム（Ｓｅｑｕｅｎｏｍ、Ｉｎｃ．、Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ、ＣＡ）を使用して実行した。
統計解析
[0443]分析のためにプールした治療効果を、研究の２つの相にわたってプールしたＬ−メチル葉酸及びプラセボ群についてベースラインからエンドポイントへの平均変化における差異によって評価した。これは、Ｆａｖａ Ｍ ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ．，７２：１１５〜２７（２００３）のＳＰＣＤと一致する。プラセボと比較するＬ−メチル葉酸でのＨＤＲＳ−２８への治療応答をベースラインＢＭＩ（≧３０ｋｇ／ｍ２又は＜３０ｋｇ／ｍ２）によって階層化した。さらにＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴ（ｒｓ１８０１１３３）、ＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ（ｒｓ１８０５０８７）、ＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴ（ｒｓ８００７２６７）及びＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ（ｒｓ４６８０）遺伝子型の多型の存在又は非存在を決定し、二分法変数として使用した。
[0444]有効性データを、ＳＰＣＤ及び包括解析／ＬＯＣＦ（ＩＴＴ／ＬＯＣＦ）アプローチを、第Ｉ相の際にＬ−メチル葉酸で治療された患者について使用して、分析した。第ＩＩ相データセットは、第Ｉ相の際にプラセボでの治療を完了し、ＨＤＲＳへの臨床応答を経験せず、第ＩＩ相に入った患者に限定された。第Ｉ相の最後の来院／第ＩＩ相の最初の来院を新規ベースライン来院とした。第Ｉ相及び第ＩＩ相からのＬ−メチル葉酸とプラセボとを比較するデータを、ＳＰＣＤについてのモデルに従って組合せ、Ｆａｖａ Ｍ ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ，７２：１１５〜２７（２００３）に概説されるアプロ−チを使用し、ウエイト（ｗ＝０．５０）及び無作為化分率（ａ＝０．３３３）を使用して分析した。二分法測定を二分法結果についての方法に従って分析し（Ｆａｖａ Ｍ ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ，７２：１１５〜２７（２００３））、一方表面上は無関係な回帰分析、ベースラインスコアについての制御を連続的な結果の比較のために用いた（Ｔａｍｕｒａ ＲＮ，Ｈｕａｎｇ Ｘ．，Ｃｌｉｎ Ｔｒｉａｌｓ，４：３０９〜１７（２００７））。すべての検査は、両側としてアルファセット０．０５で実施した。
[445]ＨＤＲＳ−２８でのＬ−メチル葉酸対プラセボについてのベースラインからエンドポイントまでのプールした平均変化を各バイオマーカー及び遺伝子マーカーについて階層化した。治療効果及びエフェクトサイズを各バイオマーカーについて算出した。群内分析、ＨＤＲＳ−２８奏功率（ベースラインから少なくとも５０％低減）、オッズ比、及び治療される必要がある数を算出した。曝露因子としてのバイオマーカー又は遺伝子マーカー状態と共に、Ｌ−メチル葉酸（第Ｉ相において若しくは第ＩＩ相におけるプラセボ非応答者として）又はプラセボ（第Ｉ相において若しくは第ＩＩ相におけるプラセボ非応答者として）を受けた個体について群内分析を別々に実施した。個々の患者がバイオマーカー状態に基づいて無作為化されていないことから、群内分析を年齢、性別、人種及びＢＭＩ並びにＨＤＲＳ−２８のベースラインレベルを含む潜在的交絡因子について補正した。最終モデルにおける予測因子の数を減少させるために、補正は、連続的ＨＤＲＳ−２８について直線回帰及びバイナリー結果について傾向スコア階層化分析を使用して行った。
結果
[0446]患者７４名からのデータが分析のために利用可能であり、患者６１名（８１．３％）は研究を完了した。結果は以前Ｌ−メチル葉酸対プラセボのプライマリー分析から公開された（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜７４（２０１２））。全体として、プールした平均（ＳＤ）ベースラインＨＤＲＳ−２８スコアは組み合わせたＬ−メチル葉酸及びプラセボ群について２６．０（５．０）であった。ベースライン対プラセボからのプールした平均変化は、ＨＤＲＳ−２８について補助的Ｌ−メチル葉酸１５ｍｇ／日で有意に大きかった（−２．７４、ｐ＝０．０１７）。
[0447]ＨＤＲＳ−２８でのＬ−メチル葉酸対プラセボについてのベースラインからのプールした平均変化は、ＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ、ＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴ及びＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ遺伝子型を有し、ＢＭＩが上昇している患者のサブグループ内で有意に（ｐ≦０．０１）大きく、ＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴ遺伝子型についてわずかに有意（ｐ＝０．０８７）であった（表１１及び図１０）。プールしたエフェクトサイズは、これらの各マーカーについて０．５０より大きかった（図１１）。プールした治療マイナスプラセボに対する奏功率は２３．１％〜６６．７％の範囲であり、ＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴを除く各マーカーによって階層化したＬ−メチル葉酸で有意に（ｐ＜０．０５）大きかった。
Figure 2016518816
[0448]ＨＤＲＳ−２８についてのＬ−メチル葉酸対プラセボのベースラインからのプールした平均変化への効果を種々のバイオマーカー及び遺伝子マーカーの組合せを使用して患者のサブグループ内で検討した（表１２）。Ｌ−メチル葉酸対プラセボについてのベースラインからのプールした平均変化の有意な（ｐ＜０．０５）差異は、ＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴプラスＢＭＩ≧３０ｋｇ／ｍ２を除くすべての組合せについてマイナス１０を超えた。プールしたエフェクトサイズは、すべての組合せにわたって−４０．３２〜−１．３６の範囲であった。これらのマーカーの組合せについて、患者の数は多数の組合せの統計解析のためには少なすぎた。
Figure 2016518816
[0449]ＢＭＩ≧３０ｋｇ／ｍ２を含むすべての組合せは、傾向だけであったＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴプラスＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴプラスＢＭＩ≧３０ｋｇ／ｍ２（ｐ＝０．０５６）、及びＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧプラスＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴプラスＢＭＩ≧３０ｋｇ／ｍ２（ｐ＝０．０７１）を除いて、Ｌ−メチル葉酸対プラセボでのプールした平均変化（範囲：−５．２９〜−２．８５）での治療群内の有意性（ｐ＜０．０５）を実証した（表１３）。
Figure 2016518816
[0450]Ｌ−メチル葉酸対プラセボについてのプールした平均変化をＨＤＲＳ−７、ＣＧＩ−Ｓ及びＣＰＦＱ尺度を使用してＨＤＲＳ−２８からの知見の一貫性を確認するために検討した（表１４）。Ｌ−メチル葉酸対プラセボについての有意な（ｐ＜０．０５）差異をＨＤＲＳ−７及びＣＧＩ−Ｓで集団全体において観察した。３つの尺度で、ＣＧＩ−Ｓ及びＣＰＦＱについてだけ有意（ｐ＜０．０５）であったＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴ遺伝子型を除いて、Ｌ−メチル葉酸対プラセボについて有意な（ｐ＜０．０５）差異が目的の比較（ＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ ＧＧ、ＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴ及びＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ遺伝子型並びにＢＭＩ≧３０ｋｇ／ｍ２）のそれぞれについて観察された。マーカーの組合せは、大部分の比較についてＬ−メチル葉酸対プラセボでのプールした平均変化について有意な（ｐ＜０．０５）差異を実証した（図１２）。
Figure 2016518816
考察
[0451]ＳＳＲＩへの不十分な応答が確認された患者のための補助的療法としてのＬ−メチル葉酸対プラセボのプライマリー分析は、Ｌ−メチル葉酸での奏功率の顕著な改善を実証した（Ｐａｐａｋｏｓｔａｓ ＧＩ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１６９：１２６７〜７４（２０１２））。ＳＳＲＩへの不十分な応答者での単独療法又は補助的療法としてのＬ−メチル葉酸での以前の研究からの結果は、応答の改善を示している（Ｆａｒａｈ Ａ．，ＣＮＳ Ｓｐｅｃｔｒ．，１４（１ Ｓｕｐｐｌ ２）：２〜７（２００９）、Ｇｉｎｓｂｅｒｇ ＬＤ，Ｏｕｂｒｅ Ａ，Ｄａｏｕｄ Ｙ．，Ｉｎｎｏｖ Ｃｌｉｎ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．，８：１９〜２８（２０１１））。
[0452]本探索分析からの結果は、５つのバイオマーカーのいずれかの存在又は非存在が標準的抗うつ剤療法への補助的治療としてのＬ−メチル葉酸の有用性に関する予後情報を提供することを実証した。予後的利益が個々のマーカーで観察されたが、２つ以上のマーカーの組合せは、顕著に改善された予測値を驚くべきことに提供した。これらの結果は、これらの５つのバイオマーカーについてのスクリーニングが、有効な補助的療法に対するまだ対処されていない高度な要求を有する患者を特定するため、治療応答又は応答の欠如を予測するため、及びＬ−メチル葉酸への有益な応答を示す可能性がある個々の患者を特定するための価値あるツールとなり得ることを示唆している。これらのバイオマーカーの存在は、Ｌ−メチル葉酸増強の中程度の独立した利益を示唆し、ある特定のバイオマーカー組合せ（例えばＣＯＭＴ（Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ）ＧＧとＧＣＨ１ＴＣ／ＴＴとの対及びＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ＋ＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴの対）が存在する場合さらに強固な、相乗的Ｌ−メチル葉酸効果を予測すると考えられる。これらのバイオマーカーが非存在である場合、Ｌ−メチル葉酸増強からの利益がわずかであるかないと考えられる。
[0453]この分析において個々のマーカー又はマーカーの組合せで報告されたエフェクトサイズを、抗うつ剤療法の他の研究と実質的に比較した。プラセボ制御抗うつ剤試験のメタ分析は、活性薬物療法での平均エフェクトサイズ０．３１を報告した（Ｔｕｒｎｅｒ ＥＨ，Ｒｏｓｅｎｔｈａｌ Ｒ．，ＢＭＪ，３３６：５１６〜７（２００８））。ＭＤＤのための補助的療法としての非定型的抗精神病薬（アリピプラゾール、クエチアピン、リスペリドン及びオランザピン／フルオキセチン）でのプラセボ対照試験の第２のメタ分析は、すべての研究にわたって０．３１のエフェクトサイズ及びＭＡＤＲＳでの対プラセボの平均変化におけるプールした差異２．６９点を報告した（Ｓｐｉｅｌｍａｎｓ ＧＩ ｅｔ ａｌ．，ＰＬｏＳ Ｍｅｄ．，１０：ｅ１００１４０３（２０１３））。本明細書で提供する分析においてエフェクトサイズ及びプールした平均変化は個々のマーカー又はこれらのマーカーの組合せに基づいて階層化された場合にＬ−メチル葉酸でより高いと考えられた。
[0454]ある特定のバイオマーカーの存在は、ＭＤＤの危険性又は重症度と関連する傾向があるが、一方他のバイオマーカーは、抗うつ剤療法への応答についての予測因子である。かなりの数の文献が、体重の増加及び肥満がＭＤＤのさらに大きな危険性及び標準的抗うつ剤治療への乏しい応答と関連することを実証している（Ｏｓｋｏｏｉｌａｒ Ｎ， Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，７０：１６０９〜１０（２００９）、Ｋｌｏｉｂｅｒ Ｓ，Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ．，６２：３２１〜６（２００７）、Ｍａ ｅｔ ａｌ．，２０１０、Ｆａｉｔｈ ＭＳ ｅｔ ａｌ．，Ｏｂｅｓ Ｒｅｖ．，１２：ｅ４３８〜５３（２０１１）、Ｌｕｐｐｉｎｏ ＦＳ ｅｔ ａｌ．，Ａｒｃｈ Ｇｅｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，６７：２２０〜９（２０１０）、Ｓｉｍｏｎ ｅｔ ａｌ．，２００８、ＭｃＩｎｔｙｒｅ ＲＳ ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，５１：２７４〜８０（２００６））。ＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴ多型の存在とＭＤＤの危険性の間に強い関連が報告されている（Ｗｕ ＹＬ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｇ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，４６：７８〜８５（２０１３）、Ｌｏｐｅｚ−Ｌｅｏｎ Ｓ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１３：７７２〜８５（２００８）、Ｐｅｅｒｂｏｏｍｓ ＯＬ ｅｔ ａｌ．， Ｂｒａｉｎ Ｂｅｈａｖ Ｉｍｍｕｎ．，２５：１５３０〜４３（２０１１）、Ｇｉｌｂｏｄｙ Ｓ，Ｌｅｗｉｓ Ｓ，Ｌｉｇｈｔｆｏｏｔ Ｔ．，Ａｍ Ｊ Ｅｐｉｄｅｍｉｏｌ．，１６５：１〜１３（２００７）、Ｌｅｗｉｓ ＳＪ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，１１：３５２〜６０（２００６））。さらにＣＯＭＴ Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ多型は、標準的抗うつ剤療法へのより悪い応答又は自殺の危険性の増加と関連していた（Ｂａｕｎｅ ＢＴ ｅｔ ａｌ．，Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ，３３：９２４〜３２（２００８）、Ｂｅｎｅｄｅｔｔｉ ｅｔ ａｌ．，２００９、Ｓｃｈｏｓｓｅｒ Ａ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，２２：２５９〜６６（２０１２））。公開されたデータは、本明細書に記載の分析に含まれる他の遺伝子マーカー及びそれらのＭＤＤとの関連についてはさらに限定的である。ＭＤＤである日本人患者の研究では、ＧＣＨ１とＭＤＤとの存在の間には関連は見出されなかったが、ＧＣＨ１はＳＳＲＩへの応答の予測因子であった（Ｋｉｓｈｉ Ｔ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ａｆｆｅｃｔ Ｄｉｓｏｒｄ．，１４２：３１５〜２２（２０１２））。閉経後の女性では、ＭＴＲ ２７５６ ＧＧ遺伝子型は、ＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴ多型の存在と同様に、ＭＤＤの危険性の５倍の増加と関連していた（Ｓｌｏｐｉｅｎ ｅｔ ａｌ．，２００８）。公開された文献は、ＭＤＤの危険性への２つ以上マーカーの影響及び治療への応答に関しては、わずかである。Ｐａｎ ＣＣ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｊ Ｇｅｒｉａｔｒ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，２４：８４７〜５５（２００９）は、老齢期集団における ＣＯＭＴ及びＭＴＨＦＲ遺伝子と被殻体積（ｐｕｔａｍｅｎ ｖｏｌｕｍｅ）及びＭＤＤとの関連を評価するためにＭＲＩを使用し、単独で役割を実証した遺伝子型はないことを見出したが、両方の多型の存在は抑うつと非抑うつ患者との間のＭＲＩ差異に関連していた。Ｓｅｃｈｅｒ Ａ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ．，２４：１９９〜２０３（２００９）は、抗うつ剤療法にある抑うつ患者内で体重増加とＣＯＭＴ多型の存在との間の関連を報告した。この研究では、マーカーの特異的な組合せの存在によって階層化された場合に、ＨＤＲＳ−２８でのＬ−メチル葉酸対プラセボについての平均変化は１０点を超え、顕著な差異がＣＧＩ−Ｓ、ＨＤＲＳ−７及びＣＰＦＱでの大部分のマーカー組合せについて記載された。知見は、バイオマーカーの具体的組合せ（例えば、（例えばＣＯＭＴ（Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ）ＧＧとＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴとの対及びＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ＋ＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴの対）が補助的Ｌ−メチル葉酸治療レジメンに応答する可能性が高い、ＭＤＤであると診断された対象を特定するために使用できることを示唆している。
[0455]ＨＤＲＳは、うつの臨床試験において薬物応答を評価するための標準として広く使用されている。しかしＨＤＲＳは、多次元的であり、臨床的変化を検出する感受性を欠いており、寛解を定義する識別力を欠いていることから批判されてきた（Ｂａｌｌｅｓｔｅｒｏｓ Ｊ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ａｆｆｅｃｔ Ｄｉｓｏｒｄ．，１０２：９３〜９（２００７））。ＨＤＲＳの潜在的限界は、ＭＤＤのコア症状に加えて、従来の抗うつ剤の有害作用、例えば眠り、不眠、不安及び、不穏状態を反映する場合がある症状応答も評価することである（Ｋｅｎｎｅｄｙ ＳＨ，Ｃｌｉｎ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．，１０：２７１〜７（２００８））。ＨＤＲＳの他のサブスケールは、ＨＤＲＳのさらに長いバージョンよりもＭＤＤのコア症状のさらに感受性の評価として広く評価されている（Ｓａｎｔｅｎ Ｇ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｒｅｓ．，４２：１０００〜９（２００８）、Ｋｅｎｎｅｄｙ ＳＨ，Ｃｌｉｎ Ｎｅｕｒｏｓｃｉ．，１０：２７１〜７（２００８）、ＭｃＩｎｔｙｒｅ ＲＳ，ＣＭＡＪ，１７３：１３２７〜３４（２００５））。これらの理由から本研究は、知見を検証するためにＨＤＲＳ−２８に加えてＨＤＲＳ−７、ＣＧＩ−Ｓ及びＣＰＦＱを使用した。ＨＤＲＳ−２８について個々のマーカー及びマーカーの組合せについて特定された有意差の大部分は、これらの追加的尺度で測定した場合も有意であり、知見をさらに強化する。結果は、種々のマーカーの存在によって階層化した場合でさえ、ＭＤＤの急性、短期治療の際の補助的療法としてのＬ−メチル葉酸での統計的に有意、強固な抗うつ剤応答を実証した。
[0456]本明細書で提供する分析は、バイオ及び遺伝子マーカーの存在によって階層化した患者のサブセット内で強固な応答を実証した。Ｌ−メチル葉酸の顕著な治療効果は、分析がＨＤＲＳ−２８若しくはＣＧＩ−Ｓに基づくかどうか、又は他の評価尺度を使用しているかに関わらず安定していた。それにより結果は、個々のマーカー又は、ＣＯＭＴ（Ｖａｌ１５８Ｍｅｔ）ＧＧとＧＣＨ１ ＴＣ／ＴＴとの対並びにＭＴＲ ２７５６ ＡＧ／ＧＧ＋ＭＴＨＦＲ ６７７ ＴＣ／ＴＴの対などのマーカーの組合せの、Ｌ−メチル葉酸での治療に応答性の対象を特定するための予測ツールとしての有用性を実証する。
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１０． Ｔ． Ｂｏｔｔｉｇｌｉｅｒｉ， Ｆｏｌａｔｅ， ｖｉｔａｍｉｎ Ｂ１２， ａｎｄ ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ． Ｎｕｔｒ Ｒｅｖ ５４ （１９９７）， ｐ． ３８２．
１１． Ｊ．Ｅ． Ａｌｐｅｒｔ ａｎｄ Ｍ． Ｆａｖａ， Ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ： ｔｈｅ ｒｏｌｅ ｏｆ ｆｏｌａｔｅ． Ｎｕｔｒ Ｒｅｖ ５５ （１９９７）， ｐ． １４５．
１２． Ｂ．Ｒ． Ｈｕｔｔｏ， Ｆｏｌａｔｅ ａｎｄ ｃｏｂａｌａｍｉｎ ｉｎ ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｉｌｌｎｅｓｓ． Ｃｏｍｐｒ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ３８ （１９９７）， ｐ． ３０５．
１３． Ｍ．Ｉ． Ｂｏｔｅｚ， Ｔ． Ｂｏｔｅｚ， Ｊ． Ｌｅｖｅｉｌｌｅ， Ｐ． Ｂｉｅｌｍａｎｎ ａｎｄ Ｍ． Ｃａｄｏｔｔｅ， Ｎｅｕｒｏｌｏｇｉｃａｌ ｃｏｒｒｅｌａｔｅｓ ｏｆ ｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ： ｆａｃｔｓ ａｎｄ ｈｙｐｏｔｈｅｓｅｓ． Ｉｎ： Ｍ．Ｉ． Ｂｏｔｅｚ ａｎｄ Ｅ．Ｈ． Ｒｅｙｎｏｌｄｓ， Ｅｄｉｔｏｒｓ， Ｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ ｉｎ ｎｅｕｒｏｌｏｇｙ， ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ａｎｄ ｉｎｔｅｒｎａｌ ｍｅｄｉｃｉｎｅ， Ｒａｖｅｎ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ （１９７９）， ｐ． ４３５．
１４． Ｅ．Ｈ． Ｒｅｙｎｏｌｄｓ， Ａｎｔｉｃｏｎｖｕｌｓａｎｔ ｄｒｕｇｓ， ｆｏｌａｔｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ａｎｄ ｍｅｎｔａｌ ｓｙｍｐｔｏｍｓ． Ｉｎ： Ｍ． Ｄａｍ， Ｌ． Ｇｒａｍ ａｎｄ Ｊ．Ｋ． Ｐｅｎｒｙ， Ｅｄｉｔｏｒｓ， Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ ｅｐｉｌｅｐｔｏｌｏｇｙ． ＸＩＩｔｈ Ｅｐｉｌｅｐｓｙ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ， Ｒａｖｅｎ Ｐｒｅｓｓ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ （１９８１）， ｐ． ６２１．
１５． Ｊ． Ｅｄｅｈ ａｎｄ Ｂ．Ｋ． Ｔｏｏｎｅ， Ａｎｔｉｅｐｉｌｅｐｔｉｃ ｔｈｅｒａｐｙ， ｆｏｌａｔｅ ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ， ａｎｄ ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｍｏｒｂｉｄｉｔｙ： ａ ｇｅｎｅｒａｌ ｐｒａｃｔｉｃｅ ｓｕｒｖｅｙ． Ｅｐｉｌｅｐｓｉａ ２６ （１９８５）， ｐ． ４３４．
１６． Ｓ．Ｄ． Ｓｈｏｒｖｏｎ， Ｍ．Ｗ．Ｐ． Ｃａｒｎｅｙ， Ｉ． Ｃｈａｎａｒｉｎ ａｎｄ Ｅ．Ｈ． Ｒｅｙｎｏｌｄｓ， Ｔｈｅ ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ｏｆ ｍｅｇａｌｏｂｌａｓｔｉｃ ａｎｅｍｉａ． Ｂｒ Ｍｅｄ Ｊ ２８１ （１９８０）， ｐ． １０３６．
１７． Ｓ．Ｎ． Ｙｏｕｎｇ ａｎｄ Ｍ． Ｇｈａｄｉｒｉａｎ， Ｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ ａｎｄ ｐｓｙｃｈｏｐａｔｈｏｌｏｇｙ． Ｐｒｏｇ Ｎｅｕｒｏｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ １３ （１９８９）， ｐ． ８４１．
１８． Ｒ． Ｃｒｅｌｌｉｎ， Ｔ． Ｂｏｔｔｉｇｌｉｅｒｉ ａｎｄ Ｅ．Ｈ． Ｒｅｙｎｏｌｄｓ， Ｆｏｌａｔｅｓ ａｎｄ ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ： ｃｌｉｎｉｃａｌ ｐｏｔｅｎｔｉａｌ． Ｄｒｕｇｓ ４５ （１９９３）， ｐ． ６２３．
１９． Ａ．Ｍ． Ｇｈａｄｉｒｉａｎ， Ｊ． Ａｎａｔｈ ａｎｄ Ｆ． Ｅｎｇｅｌｓｍａｎｎ， Ｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ ｉｎ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍａｔｉｃｓ ２１ （１９８０）， ｐ． ９２６．
２０． Ｍ．Ｗ．Ｐ． Ｃａｒｎｅｙ， Ｔ．Ｋ．Ｎ． Ｃｈａｒｙ， Ｍ． Ｌａｕｎｄｙ ｅｔ ａｌ．， Ｒｅｄ ｃｅｌｌ ｆｏｌａｔｅ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｐａｔｉｅｎｔｓ． Ｊ Ａｆｆｅｃｔ Ｄｉｓ １９ （１９９０）， ｐ． ２０７．
２１． Ｔ． Ｂｏｔｔｉｇｌｉｅｒｉ， Ｋ． Ｈｙｌａｎｄ， Ｍ． Ｌａｕｎｄｙ ｅｔ ａｌ．， Ｆｏｌａｔｅ ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ， ｂｉｏｐｔｅｒｉｎ ａｎｄ ｍｏｎｏａｍｉｎｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ｉｎ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ｐｓｙｃｈｏｌ Ｍｅｄ ２２ （１９９２）， ｐ． ８７１．
２２． Ａ． Ｗｉｌｋｉｎｓｏｎ， Ｄ． Ａｎｄｅｒｓｏｎ， Ｍ． Ａｂｏｕ−Ｓａｌｅｈ ｅｔ ａｌ．， ５−Ｍｅｔｈｙｌｔｅｔｒａｈｙｄｒｏｆｏｌａｔｅ ｌｅｖｅｌ ｉｎ ｔｈｅ ｓｅｒｕｍ ｏｆ ｄｅｐｒｅｓｓｅｄ ｓｕｂｊｅｃｔｓ ａｎｄ ｉｔｓ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｔｏ ｔｈｅ ｏｕｔｃｏｍｅ ｏｆ ＥＣＴ． Ｊ Ａｆｆｅｃｔ Ｄｉｓｏｒｄ ３２ （１９９４）， ｐ． １６３．
２３． Ｍ．Ｔ． Ａｂｏｕ−Ｓａｌｅｈ ａｎｄ Ａ． Ｃｏｐｐｅｎ， Ｓｅｒｕｍ ａｎｄ ｒｅｄ ｂｌｏｏｄ ｃｅｌｌ ｆｏｌａｔｅ ｉｎ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ａｃｔａ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｓｃａｎｄ ８０ （１９８９）， ｐ． ７８．
２４． Ｅ．Ｈ． Ｒｅｙｎｏｌｄｓ， Ｊ．Ｍ． Ｐｒｅｅｃｅ， Ｊ． Ｂａｉｌｅｙ ａｎｄ Ａ． Ｃｏｐｐｅｎ， Ｆｏｌａｔｅ ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ ｉｎ ｄｅｐｒｅｓｓｉｖｅ ｉｌｌｎｅｓｓ． Ｂｒ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ １１７ （１９７０）， ｐ． ２８７．
２５． Ｖ．Ａ． Ｗｅｓｓｏｎ， Ａ．Ｊ． Ｌｅｖｉｔｔ ａｎｄ Ｒ．Ｔ． Ｊｏｆｆｅ， Ｃｈａｎｇｅ ｉｎ ｆｏｌａｔｅ ｓｔａｔｕｓ ｗｉｔｈ ａｎｔｉｄｅｐｒｅｓｓａｎｔ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ． Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ Ｒｅｓ ５３ （１９９４）， ｐ． ３１３．
２６． Ａ． Ｌｅｖｉｔｔ ａｎｄ Ｒ． Ｊｏｆｆｅｅ， Ｆｏｌａｔｅ， Ｂ１２， ａｎｄ ｌｉｆｅ ｃｏｕｒｓｅ ｏｆ ｄｅｐｒｅｓｓｉｖｅ ｉｌｌｎｅｓｓ． Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ２５ （１９８９）， ｐ． ８６７．
２７． Ｉ．Ｒ． Ｂｅｌｌ， Ｊ．Ｓ． Ｅｄｍａｎ， Ｄ．Ｗ． Ｍａｒｂｙ ｅｔ ａｌ．， Ｖｉｔａｍｉｎ Ｂ１２ ａｎｄ ｆｏｌａｔｅ ｓｔａｔｕｓ ｉｎ ａｃｕｔｅ ｇｅｒｏｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｉｎｐａｔｉｅｎｔｓ： ａｆｆｅｃｔｉｖｅ ａｎｄ ｃｏｇｎｉｔｉｖｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ａ ｖｉｔａｍｉｎ ｎｏｎｄｅｆｉｃｉｅｎｔ ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ． Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ２７ （１９９０）， ｐ． １２５．
２８． Ｍ． Ｆａｖａ， Ｊ．Ｓ． Ｂｏｒｕｓ， Ｊ．Ｅ． Ａｌｐｅｒｔ ｅｔ ａｌ．， Ｆｏｌａｔｅ， Ｂ１２， ａｎｄ ｈｏｍｏｃｙｓｔｅｉｎｅ ｉｎ ｍａｊｏｒ ｄｅｐｒｅｓｓｉｖｅ ｄｉｓｏｒｄｅｒ． Ａｍ Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ １５４ （１９９７）， ｐ． ４２６．
２９． Ａｌｐｅｒｔ Ｍ， Ｓｉｌｖａ Ｒ， Ｐｏｕｇｅｔ Ｅ． Ｆｏｌａｔｅ ａｓ ａ ｐｒｅｄｉｃｔｏｒ ｏｆ ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ ｓｅｒｔｒａｌｉｎｅ ｏｒ ｎｏｒｔｒｉｐｔｙｌｉｎｅ ｉｎ ｇｅｒｉａｔｒｉｃ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ｐｒｅｓｅｎｔｅｄ ａｔ ｔｈｅ ３６ｔｈ Ａｎｎｕａｌ Ｍｅｅｔｉｎｇ ｏｆ ｔｈｅ ＮＣＤＥＵ． Ｂｏｃａ Ｒａｔｏｎ， ＦＬ， Ｍａｙ ２８−３１，１９９６．
３０． Ｍ． Ｆａｖａ ａｎｄ Ｋ．Ｇ． Ｄａｖｉｄｓｏｎ， Ｄｅｆｉｎｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ ｏｆ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ−ｒｅｓｉｓｔａｎｔ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｃｌｉｎ Ｎｏｒｔｈ Ａｍ １１９ （１９９６）， ｐ． １７６．
３１． Ｐ．Ｓ．Ａ． Ｇｏｄｆｒｅｙ， Ｂ．Ｋ． Ｔｏｏｎｅ， Ｍ．Ｗ．Ｐ． Ｃａｒｎｅｙ ｅｔ ａｌ．， Ｅｎｈａｎｃｅｍｅｎｔ ｏｆ ｒｅｃｏｖｅｒｙ ｆｒｏｍ ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｉｌｌｎｅｓｓ ｂｙ ｍｅｔｈｙｌｆｏｌａｔｅ． Ｌａｎｃｅｔ ３３６ （１９９０）， ｐ． ３９２．
３２． Ｍ．Ｗ．Ｐ． Ｃａｒｎｅｙ ａｎｄ Ｂ．Ｆ． Ｓｈｅｆｆｉｅｌｄ， Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｓｕｂｎｏｒｍａｌ ｓｅｒｕｍ ｆｏｌａｔｅ ａｎｄ ｖｉｔａｍｉｎ Ｂ１２ ｖａｌｕｅｓ ａｎｄ ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ｒｅｐｌａｃｅｍｅｎｔ ｔｈｅｒａｐｙ． Ｊ Ｎｅｒｖ Ｍｅｎｔ Ｄｉｓ １５０ （１９７０）， ｐ． ４０４．
３３． Ｓ． Ｌｅｅ， Ｙ．Ｋ． Ｗｉｎｇ ａｎｄ Ｓ． Ｆｏｎｇ， Ａ ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｓｔｕｄｙ ｏｆ ｆｏｌａｔｅ ｌｅｖｅｌｓ ｉｎ Ｃｈｉｎｅｓｅ ｉｎｐａｔｉｅｎｔｓ ｗｉｔｈ ｍａｊｏｒ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ ｉｎ Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ． Ｊ Ａｆｆｅｃｔ Ｄｉｓｏｒｄ ４９ （１９９８）， ｐ． ７３．
３４． Ｐ．Ｆ． Ｊａｃｑｕｅｓ， Ｊ． Ｓｅｌｈｕｂ， Ａ．Ｇ． Ｂｏｓｔｏｍ， Ｐ．Ｗ．Ｆ． Ｗｉｌｓｏｎ ａｎｄ Ｉ．Ｈ． Ｒｏｓｅｎｂｅｒｇ， Ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ ｆｏｒｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｎ ｐｌａｓｍａ ｆｏｌａｔｅ ａｎｄ ｔｏｔａｌ ｈｏｍｏｃｙｓｔｅｉｎｅ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎｓ． Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ ３４０ （１９９９）， ｐ． １４４９．
３５． Ｍ．Ｔ． Ａｂｏｕ−Ｓａｌｅｈ ａｎｄ Ａ． Ｃｏｐｐｅｎ， Ｔｈｅ ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ ｆｏｌａｔｅ ｉｎ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ： ｉｍｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ｆｏｒ ｎｕｔｒｉｔｉｏｎａｌ ｈｙｐｏｔｈｅｓｅｓ ｏｆ ｐｓｙｃｈｏｓｅｓ． Ｊ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｒｅｓ ２０ （１９８６）， ｐ． ９１．
３６． Ｗ．Ｅ． Ｔｈｏｒｔｏｎ ａｎｄ Ｂ．Ｐ． Ｔｈｏｒｎｔｏｎ， Ｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ， ｍｅｎｔａｌ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ａｎｄ ｄｉｅｔａｒｙ ｈａｂｉｔｓ． Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ３９ （１９７８）， ｐ． ３１５．
３７． Ａ． Ｃｏｐｐｅｎ， Ｓ． Ｃｈａｕｄｒｙ ａｎｄ Ｃ． Ｓｗａｄｅ， Ｆｏｌｉｃ ａｃｉｄ ｅｎｈａｎｃｅｓ ｌｉｔｈｉｕｍ ｐｒｏｐｈｙｌａｘｉｓ． Ｊ Ａｆｆｅｃｔ Ｄｉｓｏｒｄ １０ （１９８６）， ｐ． ９．
３８． Ｍ． Ｐａｓｓｅｒｉ， Ｓ． Ｖｅｎｔｕｒａ， Ｇ． Ａｂａｔｅ， Ｄ． Ｃｕｃｉｎｏｔｔａ ａｎｄ Ｐ． ＬａＧｒｅｃａ， Ｏｒａｌ ５−ｍｅｔｈｙｌｔｅｔｒａｈｙｄｒｏｆｏｌａｔｅ （ＭＴＨＦ） ｉｎ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ Ｓｅｎｉｌｅ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｍｅｎｔａｌ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ （ＯＭＤｓ）： ａ ｄｏｕｂｌｅ−ｂｌｉｎｄ， ｍｕｌｔｉｃｅｎｔｅｒ ｓｔｕｄｙ ｖｓ． ｔｒａｚｏｄｏｎｅ （ＴＲＺ）． Ｅｕｒ Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ ２１ （１９９３）， ｐ． ２４．
３９． Ｇ． Ｇｕａｒａｌｄｉ， Ｍ． Ｆａｖａ， Ｆ． Ｍａｚｚｉ ａｎｄ Ｐ． ＬａＧｒｅｃａ， Ａｎ ｏｐｅｎ ｔｒｉａｌ ｏｆ ｍｅｔｈｙｌｔｅｔｒａｈｙｄｒｏｆｏｌａｔｅ （ＭＴＨＦ） ｉｎ ｅｌｄｅｒｌｙ ｄｅｐｒｅｓｓｅｄ ｐａｔｉｅｎｔｓ． Ａｎｎ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ ５ （１９９３）， ｐ． １０１．
４０． Ａｌｐｅｒｔ ＪＥ， Ｍｉｓｃｈｏｕｌｏｎ Ｄ， Ｒｕｂｅｎｓｔｅｉｎ ＧＥ， Ｂｏｔｔｏｎａｒｉ Ｋ， Ｎｉｅｒｅｎｂｅｒｇ ＡＡ， Ｆａｖａ Ｍ． Ｆｏｌｉｎｉｃ ａｃｉｄ （Ｌｅｕｃｏｖｏｒｉｎ） ａｓ ａｎ ａｄｊｕｎｃｔｉｖｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ ｆｏｒ ＳＳＲＩ−ｒｅｆｒａｃｔｏｒｙ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ａｎｎ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ． ２００２ Ｍａｒ；１４（１）：３３−８．
４１． Ｍ． Ｓｐｉｌｌｍａｎ ａｎｄ Ｍ． Ｆａｖａ， Ｓ−ａｄｅｎｏｓｙｌ−ｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅ ｉｎ ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ： ｈｉｓｔｏｒｉｃａｌ ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅ ａｎｄ ｃｕｒｒｅｎｔ ｓｔａｔｕｓ． ＣＮＳ Ｄｒｕｇｓ ６ （１９９６）， ｐ． ４１６．
４２． Ａ． Ｒｕｃｋ， Ｓ． Ｋｒａｍｅｒ， Ｊ． Ｍｅｔｚ ａｎｄ Ｍ． Ｂｒｅｎｎａｎ， Ｍｅｔｈｙｌｔｅｔｒａｈｙｄｒｏｆｏｌａｔｅ ｉｓ ａ ｐｏｔｅｎｔ ａｎｄ ｓｅｌｅｃｔｉｖｅ ａｇｏｎｉｓｔ ｆｏｒ ｋａｉｎｉｃ ａｃｉｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒｓ． Ｎａｔｕｒｅ ２８７ （１９８０）， ｐ． ８５２．
４３． Ｒ．Ａ． Ｓｃｈａｔｚ， Ｔ．Ｅ． Ｗｉｌｅｎｓ ａｎｄ Ｏ．Ｚ． Ｓｅｌｌｉｎｇｅｒ， Ｄｅｃｒｅａｓｅｄ ｉｎ ｖｉｖｏ ｐｒｏｔｅｉｎ ａｎｄ ｐｈｏｓｐｈｏｌｉｐｉｄ ｍｅｔｈｙｌａｔｉｏｎ ａｆｔｅｒ ｉｎ ｖｉｖｏ ｅｌｅｖａｔｉｏｎ ｏｆ ｂｒａｉｎ Ｓ−ａｄｅｎｏｓｙｌｈｏｍｏｃｙｓｔｅｉｎｅ． Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ ９８ （１９８１）， ｐ． １０９７．
４４． Ｐ．Ｊ． Ｓｈａｗ， Ｅｘｃｉｔａｔｏｒｙ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｒｅｃｅｐｔｏｒｓ， ｅｘｃｉｔｏｔｏｘｉｃｉｔｙ ａｎｄ ｔｈｅ ｈｕｍａｎ ｎｅｒｖｏｕｓ ｓｙｓｔｅｍ． Ｃｕｒｒ Ｏｐｉｎ Ｎｅｕｒｏｌ Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ ６ （１９９３）， ｐ． ４１４．
４５． Ｍ．Ｂ． Ｂｏｗｅｒｓ， Ｊｒ ａｎｄ Ｅ．Ｈ． Ｒｅｙｎｏｌｄｓ， Ｃｅｒｅｂｒｏｓｐｉｎａｌ ｆｌｕｉｄ ｆｏｌａｔｅ ａｎｄ ａｃｉｄ ｍｏｎｏａｍｉｎｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ． Ｌａｎｃｅｔ ２ （１９７２）， ｐ． １３７．
４６． Ｍ．Ｉ． Ｂｏｔｅｚ ａｎｄ Ｓ．Ｎ． Ｙｏｕｎｇ， Ｅｆｆｅｃｔｓ ｏｆ ａｎｔｉｃｏｎｖｕｌｓａｎｔｓ ａｎｄ ｌｏｗ ｌｅｖｅｌｓ ｏｆ ｆｏｌａｔｅ ａｎｄ ｔｈｉａｍｉｎｅ ｏｎ ａｍｉｎｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ ｉｎ ｃｅｒｅｂｒｏｓｐｉｎａｌ ｆｌｕｉｄ． Ｂｒａｉｎ １１４ （１９９１）， ｐ． ３３３．
４７． Ｍ．Ｉ． Ｂｏｔｅｚ， Ｓ．Ｎ． Ｙｏｕｎｇ， Ｊ． Ｂａｃｈｅｖａｌｉｅｒ ａｎｄ Ｓ． Ｇａｕｔｈｉｅｒ， Ｆｏｌａｔｅ ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ ａｎｄ ｄｅｃｒｅａｓｅｄ ｂｒａｉｎ ５−ｈｙｄｒｏｘｙｔｒｙｐｔａｍｉｎｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｉｎ ｍａｎ ａｎｄ ｒａｔ． Ｎａｔｕｒｅ ２７８ （１９７９）， ｐ． １８２．
４８． Ｒ． Ｓｕｒｔｅｅｓ， Ｓ． Ｈｅａｌｅｓ ａｎｄ Ａ． Ｂｏｗｒｏｎ， Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｏｆ ｃｅｒｅｂｒｏｓｐｉｎａｌ ｆｌｕｉｄ ｄｅｆｉｃｉｅｎｃｙ ｏｆ ５−ｍｅｔｈｙｌｔｅｔｒａｈｙｄｒｏｆｏｌａｔｅ， ｂｕｔ ｎｏｔ Ｓ−ａｄｅｎｏｓｙｌｍｅｔｈｉｏｎｉｎｅ， ｗｉｔｈ ｒｅｄｕｃｅｄ ｃｏｎｃｅｎｔｒａｔｉｏｎｓ ｏｆ ｔｈｅ ａｃｉｄ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓ ｏｆ ５−ｈｙｄｒｏｘｙｔｒｙｐｔａｍｉｎｅ ａｎｄ ｄｏｐａｍｉｎｅ． Ｃｌｉｎ Ｓｃｉ ９８６ （１９９４）， ｐ． ６９７．
４９． Ａｌｐｅｒｔ ＪＥ， Ｍｉｓｃｈｏｕｌｏｎ Ｄ， Ｎｉｅｒｅｎｂｅｒｇ ＡＡ， Ｆａｖａ Ｍ． Ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ： ｆｏｃｕｓ ｏｎ ｆｏｌａｔｅ． Ｎｕｔｒｉｔｉｏｎ． ２０００ Ｊｕｌ−Ａｕｇ；１６（７−８）：５４４−６
５０． Ｆａｖａ Ｍ， Ｄａｖｉｄｓｏｎ ＫＧ． Ｄｅｆｉｎｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｅｐｉｄｅｍｉｏｌｏｇｙ ｏｆ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ−ｒｅｓｉｓｔａｎｔ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ｐｓｙｃｈｉａｔｒ Ｃｌｉｎ Ｎｏｒｔｈ Ａｍ． １９９６ Ｊｕｎ；１９（２）：１７９−２００．
５１． Ｆａｖａ Ｍ， Ｅｖｉｎｓ ＡＥ， Ｄｏｒｅｒ ＤＪ， Ｓｃｈｏｅｎｆｅｌｄ ＤＡ． Ｔｈｅ ｐｒｏｂｌｅｍ ｏｆ ｔｈｅ ｐｌａｃｅｂｏ ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｉｎ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｔｒｉａｌｓ ｆｏｒ ｐｓｙｃｈｉａｔｒｉｃ ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ： ｃｕｌｐｒｉｔｓ， ｐｏｓｓｉｂｌｅ ｒｅｍｅｄｉｅｓ， ａｎｄ ａ ｎｏｖｅｌ ｓｔｕｄｙ ｄｅｓｉｇｎ ａｐｐｒｏａｃｈ． Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ． ２００３ Ｍａｙ−Ｊｕｎ；７２（３）：１１５−２７．
５２． Ｔｒｉｖｅｄｉ ＭＨ， Ｒｕｓｈ ＡＪ， Ｉｂｒａｈｉｍ ＨＭ ｅｔ ａｌ． Ｔｈｅ Ｉｎｖｅｎｔｏｒｙ ｏｆ Ｄｅｐｒｅｓｓｉｖｅ Ｓｙｍｐｔｏｍａｔｏｌｏｇｙ， Ｃｌｉｎｉｃｉａｎ Ｒａｔｉｎｇ （ＩＤＳ−Ｃ） ａｎｄ Ｓｅｌｆ−Ｒｅｐｏｒｔ （ＩＤＳ−ＳＲ）， ａｎｄ ｔｈｅ Ｑｕｉｃｋ Ｉｎｖｅｎｔｏｒｙ ｏｆ Ｄｅｐｒｅｓｓｉｖｅ Ｓｙｍｐｔｏｍａｔｏｌｏｇｙ， Ｃｌｉｎｉｃｉａｎ Ｒａｔｉｎｇ （ＱＩＤＳ−Ｃ） ａｎｄ Ｓｅｌｆ−Ｒｅｐｏｒｔ （ＱＩＤＳ−ＳＲ） ｉｎ ｐｕｂｌｉｃ ｓｅｃｔｏｒ ｐａｔｉｅｎｔｓ ｗｉｔｈ ｍｏｏｄ ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ： ａ ｐｓｙｃｈｏｍｅｔｒｉｃ ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ． Ｐｓｙｃｈｏｌ Ｍｅｄ ２００４； ３４（１）：７３−８２．
５３． Ｆａｖａ Ｍ． Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ ａｎｄ ｄｅｆｉｎｉｔｉｏｎ ｏｆ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ−ｒｅｓｉｓｔａｎｔ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ｂｉｏｌ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ． ２００３ Ａｐｒ １５；５３（８）：６４９−５９．
５４． Ｌｅｖｉｎｅ Ｊ， Ｓｃｈｏｏｌｅｒ ＮＲ． Ｇｅｎｅｒａｌ ｖｅｒｓｕｓ ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｉｎｑｕｉｒｙ ｗｉｔｈ ＳＡＦＴＥＥ． Ｊ Ｃｌｉｎ Ｐｓｙｃｈｏｐｈａｒｍａｃｏｌ １９９２； １２（６）：４４８．
５５． Ｈａｍｉｌｔｏｎ Ｍ． Ａ ｒａｔｉｎｇ ｓｃａｌｅ ｆｏｒ ｄｅｐｒｅｓｓｉｏｎ． Ｊ Ｎｅｕｒｏｌ Ｎｅｕｒｏｓｕｒｇ Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ． １９６０ Ｆｅｂ；２３：５６−６２．
５６． Ｆａｖａ Ｍ， Ｒａｎｋｉｎ ＭＡ， Ａｌｐｅｒｔ ＪＥ， Ｎｉｅｒｅｎｂｅｒｇ ＡＡ， Ｗｏｒｔｈｉｎｇｔｏｎ ＪＪ． Ａｎ ｏｐｅｎ ｔｒｉａｌ ｏｆ ｏｒａｌ ｓｉｌｄｅｎａｆｉｌ ｉｎ ａｎｔｉｄｅｐｒｅｓｓａｎｔ−ｉｎｄｕｃｅｄ ｓｅｘｕａｌ ｄｙｓｆｕｎｃｔｉｏｎ． Ｐｓｙｃｈｏｔｈｅｒ Ｐｓｙｃｈｏｓｏｍ． １９９８；６７（６）：３２８−３１．
５７． ＤｅＬｏａｃｈ ＬＪ， Ｈｉｇｇｉｎｓ ＭＳ， Ｃａｐｌａｎ ＡＢ， Ｓｔｉｆｆ ＪＬ． Ｔｈｅ ｖｉｓｕａｌ ａｎａｌｏｇ ｓｃａｌｅ ｉｎ ｔｈｅ ｉｍｍｅｄｉａｔｅ ｐｏｓｔｏｐｅｒａｔｉｖｅ ｐｅｒｉｏｄ： ｉｎｔｒａｓｕｂｊｅｃｔ ｖａｒｉａｂｉｌｉｔｙ ａｎｄ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ａ ｎｕｍｅｒｉｃ ｓｃａｌｅ． Ａｎｅｓｔｈ Ａｎａｌｇ． １９９８；８６（１）：１０２−６．
[0457]前述の発明は、理解の明確さの目的のためにいくつかの詳細について例示及び例の方法によって記載されているが、当業者はある特定の変更及び修飾が添付の特許請求の範囲内で実施できることを理解する。さらに、本明細書で提供する各参考文献は、各参考文献が個々に参照により組み込まれたのと同様に、その全体が参照により組み込まれる。

Claims (70)

  1. ヒト対象の少なくとも１種のうつ症状を治療するための方法であって、
    うつである又はうつの危険性があることが診断されており、以下のバイオマーカー：
    ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の１７９３位又は配列番号８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７４９７６によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号８が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｖ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号３の６６位又は配列番号１０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１３９４によって特定される）であり、配列番号３及び配列番号１０が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼレダクターゼ（ＭＴＲＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｖ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１００６７３７によって特定される）であり、配列番号１１が、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８８３７２９によって特定される）であり、配列番号１２が、ＤＮＡ（シトシン−５）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｖｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７１６３８６２によって特定される）であり、配列番号１３が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１フィードバック調節タンパク質（ＧＣＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｖｉｉｉ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１２６５９によって特定される）であり、配列番号１４が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｘ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２０２６７６によって特定される）であり、配列番号１５が、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原）１（ＦＯＬＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２９７２９１によって特定される）であり、配列番号１６が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０５１２６６によって特定される）であり、配列番号１７が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）であり、配列番号１８が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７６３９７５２によって特定される）であり、配列番号１９が、コリンリン酸シチジリルトランスフェラーゼＡ（ＰＣＹＴ１Ａ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉｖ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ６２７５によって特定される）であり、配列番号２０が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｖ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０７９５９６によって特定される）であり、配列番号２１が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１１２４０５９４によって特定される）であり、配列番号２２が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｖｉｉ．２つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６３３によって特定される）であり、配列番号２３が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｖｉｉｉ．２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉｘ．少なくとも１つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２５０６８２によって特定される）であり、配列番号２５が、溶質担体ファミリー６（神経伝達性輸送ドーパミン）メンバー３（ＳＬＣ６Ａ３）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｘ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７７８２０によって特定される）であり、配列番号２６が、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＦＴＣＤ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｘｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２３６２２５によって特定される）であり、配列番号２７が、メチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋依存性）１（ＭＴＨＦＤ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｘｉｉ．肥満、
    ｘｘｉｉｉ．所定の基準比よりも小さな、ＳＡＭとＳＡＨとの発現比、
    ｘｘｉｖ．第１の所定の基準値よりも大きな、４−ＨＮＥの発現、及び
    ｘｘｖ．第２の所定の基準値よりも大きな、ｈｓＣＲＰの発現
    のうち少なくとも２種の組合せを保有することがさらに決定しているヒト対象に、前記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せが、葉酸含有化合物に対する陽性症状を低減する応答に関連するという認識に基づいて、有効量の葉酸含有化合物を含む組成物を投与するステップを含む、方法。
  2. 前記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せが以下：
    ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰと、
    ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰと
    を含む、請求項１に記載の方法。
  3. 前記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せがバイオマーカー（ｉｉｉ）〜（ｘｘｖ）のうち少なくとも１種をさらに含む、請求項２に記載の方法。
  4. 肥満が以下の肥満指標：
    ａ．３０ｋｇ／ｍ２を超えるＢＭＩ値、
    ｂ．男性で４０インチを超える（若しくは１２０ｃｍを超える）、又は女性で３５インチを超える（若しくは８８ｃｍを超える）胴囲、
    ｃ．男性で０．９５を上回る、又は女性で０．８０を上回る胴−臀部比、及び
    ｄ．男性で少なくとも約２５％、又は女性で少なくとも約３２％の体脂肪率
    のうち少なくとも１種によって特徴付けられる、請求項１に記載の方法。
  5. 前記少なくとも２種のバイオマーカーの存在を決定するために、対象から得た生体試料をアッセイするステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
  6. 生体試料が、血液試料、尿試料、口腔試料、唾液試料又は脳脊髄液試料から選択される試料を含む、請求項５に記載の方法。
  7. アッセイするステップが、ＳＮＰのいずれか１つに隣接する少なくとも１組のプライマーを用いて生体試料を増幅するサブステップを含む、請求項５に記載の方法。
  8. 少なくとも２つのＳＮＰを増幅する少なくとも２組のプライマーが多重増幅アッセイに使用される、請求項７に記載の方法。
  9. アッセイするステップが、ガスクロマトグラフィ、質量分析、高速液体クロマトグラフィ、核磁気共鳴（ＮＭＲ）スペクトル分析、酵素共役アッセイ又はそれらの任意の組合せを用いて、生体試料においてＳＡＭ、ＳＡＨ、４−ＨＮＥ、ｈｓＣＲＰ又はそれらの任意の組合せを分離及び／又はその存在を検出するサブステップを含む、請求項５に記載の方法。
  10. ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比が、健常な対象の生体試料で測定した場合のＳＡＭ／ＳＡＨの対照比である、請求項１に記載の方法。
  11. 健常な対象の血清試料で測定した場合のＳＡＭ／ＳＡＨの対照比が、約４〜約１２の範囲にある、請求項１０に記載の方法。
  12. ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比が、血漿試料で測定した場合に約３．０である、請求項１に記載の方法。
  13. ４−ＨＮＥの第１の所定の基準値が、健常な対象の生体試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値である、請求項１に記載の方法。
  14. 健常な対象の血清試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値が、血清１リットル当たり約０．２４μｍｏｌ（又は血清１リットル当たり約０．０４ｍｇ）である、請求項１３に記載の方法。
  15. ４−ＨＮＥの第１の所定の基準値が、血漿試料で測定した場合に血漿１リットル当たり約３ｍｇである、請求項１に記載の方法。
  16. ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値が、健常な対象の生体試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値である、請求項１に記載の方法。
  17. 健常な対象の血清試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値が、血清１リットル当たり約０．５ｍｇ〜血清１リットル当たり約４．５ｍｇの範囲にある、請求項１６に記載の方法。
  18. ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値が、血漿試料で測定した場合に血漿１リットル当たり約２．３ｍｇである、請求項１に記載の方法。
  19. 対象の体測値を決定するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
  20. 体側値が、体重、身長、胴囲、臀囲、体脂肪率又はそれらの任意の組合せを含む、請求項１９に記載の方法。
  21. 葉酸含有化合物の有効量が約７．５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である、請求項１に記載の方法。
  22. 葉酸含有化合物の有効量が毎日単回用量として投与される、請求項１に記載の方法。
  23. 葉酸含有化合物の有効量が１日当たり１を超える分割用量で投与される、請求項１に記載の方法。
  24. 投与が経口である、請求項１に記載の方法。
  25. 組成物が、投与すると少なくとも約３〜６時間にわたって葉酸含有化合物の少なくとも一部分を放出するように製剤化されている、請求項１に記載の方法。
  26. 放出が定常放出である、請求項２５に記載の方法。
  27. 対象に抗うつ薬を投与するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
  28. 葉酸含有化合物と併用する抗うつ薬の投与が、抗うつ薬の有効性を増大させる、請求項２７に記載の方法。
  29. 抗うつ薬が、選択的セロトニン再取り込み阻害剤を含む、請求項２７に記載の方法。
  30. 選択的セロトニン再取り込み阻害剤が、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの任意の組合せからなる群から選択される、請求項２９に記載の方法。
  31. 葉酸含有化合物を含み、任意選択で抗うつ薬と併用して投与する治療を、対象のために選択するステップをさらに含む、請求項１に記載の方法。
  32. うつが大うつ病性障害である、請求項１に記載の方法。
  33. うつであると診断されている対象が少なくとも１種の抗うつ単独療法に抵抗性である、請求項１に記載の方法。
  34. 対象が成人対象である、請求項１に記載の方法。
  35. 少なくとも１種のうつ症状が、落ち込み若しくは抑うつ気分、快感消失、低いエネルギーレベル、罪悪感、作業量及び関心の減少、精神運動遅滞、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な身体症状、認知の低下又はそれらの任意の組合せから選択される、請求項１の方法。
  36. ヒト対象に投与した抗うつ薬の有効性を改善する方法であって、
    うつであることが診断されており、以下のバイオマーカー：
    ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の１７９３位又は配列番号８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７４９７６によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号８が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｖ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号３の６６位又は配列番号１０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１３９４によって特定される）であり、配列番号３及び配列番号１０が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼレダクターゼ（ＭＴＲＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｖ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１００６７３７によって特定される）であり、配列番号１１が、Ｌ型電位依存性カルシウムチャネルのアルファ１Ｃサブユニット（ＣＡＣＮＡ１Ｃ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８８３７２９によって特定される）であり、配列番号１２が、ＤＮＡ（シトシン−５）−メチルトランスフェラーゼ３ベータ（ＤＮＭＴ３Ｂ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｖｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７１６３８６２によって特定される）であり、配列番号１３が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１フィードバック調節タンパク質（ＧＣＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｖｉｉｉ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１２６５９によって特定される）であり、配列番号１４が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｘ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２０２６７６によって特定される）であり、配列番号１５が、葉酸ヒドロラーゼ（前立腺特異的膜抗原）１（ＦＯＬＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２９７２９１によって特定される）であり、配列番号１６が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉ．２つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０５１２６６によって特定される）であり、配列番号１７が、還元葉酸担体タンパク質（ＲＦＣ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１８の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ８００７２６７によって特定される）であり、配列番号１８が、ＧＴＰシクロヒドロラーゼ１（ＧＣＨ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉｉｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ７６３９７５２によって特定される）であり、配列番号１９が、コリンリン酸シチジリルトランスフェラーゼＡ（ＰＣＹＴ１Ａ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉｖ．２つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２０の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ６２７５によって特定される）であり、配列番号２０が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｖ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２１の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１０７９５９６によって特定される）であり、配列番号２１が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｖｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２２の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１１２４０５９４によって特定される）であり、配列番号２２が、ドーパミン受容体Ｄ２（ＤＲＤ２）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｖｉｉ．２つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６３３によって特定される）であり、配列番号２３が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｖｉｉｉ．２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｉｘ．少なくとも１つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２５の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２５０６８２によって特定される）であり、配列番号２５が、溶質担体ファミリー６（神経伝達性輸送ドーパミン）メンバー３（ＳＬＣ６Ａ３）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｘ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２６の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２７７８２０によって特定される）であり、配列番号２６が、ホルムイミノトランスフェラーゼシクロデアミナーゼ（ＦＴＣＤ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｘｉ．少なくとも１つのアデニン「Ａ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ２２３６２２５によって特定される）であり、配列番号２７が、メチレンテトラヒドロ葉酸デヒドロゲナーゼ（ＮＡＤＰ＋依存性）１（ＭＴＨＦＤ１）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｘｘｉｉ．肥満、
    ｘｘｉｉｉ．所定の基準比よりも小さな、ＳＡＭとＳＡＨとの発現比、
    ｘｘｉｖ．第１の所定の基準値よりも大きな、４−ＨＮＥの発現、及び
    ｘｘｖ．第２の所定の基準値よりも大きな、ｈｓＣＲＰの発現
    のうち少なくとも２種の組合せを保有することがさらに決定しているヒト対象に、前記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せが、葉酸含有化合物と併用して投与した場合に抗うつ薬の有効性を増大させることに関連するという認識に基づいて、抗うつ薬と併用して有効量の葉酸含有化合物を含む組成物を投与するステップを含む、方法。
  37. 前記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せが以下：
    ｉ．少なくとも１つのチミン「Ｔ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号１の６７７位又は配列番号７の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０１１３３によって特定される）であり、配列番号１及び配列番号７が、それぞれ独立してメチレンテトラヒドロ葉酸レダクターゼ（ＭＴＨＦＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰと、
    ｉｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰと
    を含む、請求項３６に記載の方法。
  38. 前記少なくとも２種のバイオマーカーの組合せがバイオマーカー（ｉｉｉ）〜（ｘｘｖ）のうち少なくとも１種をさらに含む、請求項３７に記載の方法。
  39. 肥満が以下の肥満指標：
    ａ．３０ｋｇ／ｍ２を超えるＢＭＩ値、
    ｂ．男性で４０インチを超える（若しくは１２０ｃｍを超える）、又は女性で３５インチを超える（若しくは８８ｃｍを超える）胴囲、
    ｃ．男性で０．９５を上回る、又は女性で０．８０を上回る胴−臀部比、及び
    ｄ．男性で少なくとも約２５％、又は女性で少なくとも約３２％の体脂肪率
    のうち少なくとも１種によって特徴付けられる、請求項３６に記載の方法。
  40. 前記少なくとも２種のバイオマーカーの存在を決定するために、対象から得た生体試料をアッセイするステップをさらに含む、請求項３６に記載の方法。
  41. 生体試料が、血液試料、尿試料、口腔試料、唾液試料又は脳脊髄液試料から選択される試料を含む、請求項４０に記載の方法。
  42. アッセイするステップが、ＳＮＰのいずれか１つに隣接する少なくとも１組のプライマーを用いて生体試料を増幅するサブステップを含む、請求項４０に記載の方法。
  43. 少なくとも２つのＳＮＰを増幅する少なくとも２組のプライマーが多重増幅アッセイに使用される、請求項４２に記載の方法。
  44. アッセイするステップが、ガスクロマトグラフィ、質量分析、高速液体クロマトグラフィ、核磁気共鳴（ＮＭＲ）スペクトル分析、酵素共役アッセイ又はそれらの任意の組合せを用いて、生体試料においてＳＡＭ、ＳＡＨ、４−ＨＮＥ、ｈｓＣＲＰ又はそれらの任意の組合せを分離及び／又はその存在を検出するサブステップを含む、請求項４０に記載の方法。
  45. ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比が、健常な対象の生体試料で測定した場合のＳＡＭ／ＳＡＨの対照比である、請求項３６に記載の方法。
  46. 健常な対象の血清試料で測定した場合のＳＡＭ／ＳＡＨの対照比が、約４〜約１２の範囲にある、請求項４５に記載の方法。
  47. ＳＡＭ／ＳＡＨの所定の基準比が、血漿試料で測定した場合に約３．０である、請求項３６に記載の方法。
  48. ４−ＨＮＥの第１の所定の基準値が、健常な対象の生体試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値である、請求項３６に記載の方法。
  49. 健常な対象の血清試料で測定した場合の４−ＨＮＥの対照値が、血清１リットル当たり約０．２４μｍｏｌ（又は血清１リットル当たり約０．０４ｍｇ）である、請求項４８に記載の方法。
  50. ４−ＨＮＥの第１の所定の基準値が、血漿試料で測定した場合に血漿１リットル当たり約３ｍｇである、請求項３６に記載の方法。
  51. ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値が、健常な対象の生体試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値である、請求項３６に記載の方法。
  52. 健常な対象の血清試料で測定した場合のｈｓＣＲＰの対照値が、血清１リットル当たり約０．５ｍｇ〜血清１リットル当たり約４．５ｍｇの範囲にある、請求項５１に記載の方法。
  53. ｈｓＣＲＰの第２の所定の基準値が、血漿試料で測定した場合に血漿１リットル当たり約２．３ｍｇである、請求項３６に記載の方法。
  54. 対象の体測値を決定するステップをさらに含む、請求項３６に記載の方法。
  55. 体側値が、体重、身長、胴囲、臀囲、体脂肪率又はそれらの任意の組合せを含む、請求項５４に記載の方法。
  56. 葉酸含有化合物の有効量が約７．５ｍｇ／日〜約５０ｍｇ／日である、請求項３６に記載の方法。
  57. 葉酸含有化合物の有効量が毎日単回用量として投与される、請求項３６に記載の方法。
  58. 葉酸含有化合物の有効量が１日当たり１を超える分割用量で投与される、請求項３６に記載の方法。
  59. 投与が経口である、請求項３６に記載の方法。
  60. 組成物が、投与すると少なくとも約３〜６時間にわたって葉酸含有化合物の少なくとも一部分を放出するように製剤化されている、請求項３６に記載の方法。
  61. 放出が定常放出である、請求項６０に記載の方法。
  62. 抗うつ薬が、選択的セロトニン再取り込み阻害剤を含む、請求項３６に記載の方法。
  63. 選択的セロトニン再取り込み阻害剤が、フルオキセチン、シタロプラム、パロキセチン、エスシタロプラム、セルトラリン及びそれらの任意の組合せからなる群から選択される、請求項６２に記載の方法。
  64. 葉酸含有化合物を含み、抗うつ薬と併用して投与する治療を、対象のために選択するステップをさらに含む、請求項３６に記載の方法。
  65. うつが大うつ病性障害である、請求項３６に記載の方法。
  66. うつであると診断されている対象が少なくとも１種の抗うつ単独療法に抵抗性である、請求項３６に記載の方法。
  67. 対象が成人対象である、請求項３６に記載の方法。
  68. ヒト対象に投与した抗うつ薬の有効性を改善する方法の結果、落ち込み若しくは抑うつ気分、快感消失、低いエネルギーレベル、罪悪感、作業量及び関心の減少、精神運動遅滞、激越、心的な不安、身体的な不安、全身的な身体症状、認知の低下又はそれらの任意の組合せから選択される少なくとも１種のうつ症状の改善を生じる、請求項３６に記載の方法。
  69. 対象の少なくとも１種のうつ症状を治療する方法であって、
    うつである又はうつの危険性があることが診断されており、少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子又はその相補体を含む、配列番号２の２７５６位又は配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰを保有することがさらに決定している対象に、（１つ又は複数の）ＳＮＰ対立遺伝子の存在が、葉酸含有化合物に対する陽性症状を低減する応答に関連するという認識に基づいて、有効量の葉酸含有化合物を含む組成物を投与するステップを含む、方法。
  70. うつと診断されている対象のための治療レジメンを選択するための方法であって、
    以下のＳＮＰ：
    ｉ．少なくとも１つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子若しくはその相補体を含む、配列番号２の２７５６位若しくは配列番号９の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ１８０５０８７によって特定される）であり、配列番号２及び配列番号９が、それぞれ独立してメチオニンシンターゼ（ＭＴＲ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、
    ｉｉ．２つのシトシン「Ｃ」対立遺伝子若しくはその相補体を含む、配列番号２３の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６３３によって特定される）であり、配列番号２３が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ、又は
    ｉｉｉ．２つのグアニン「Ｇ」対立遺伝子若しくはその相補体を含む、配列番号２４の２７位にあるＳＮＰ（ｒｓ４６８０によって特定される）であり、配列番号２４が、カテコール−Ｏ−メチルトランスフェラーゼ（ＣＯＭＴ）のゲノム核酸配列の一部である、ＳＮＰ
    のうちの１種の存在について、対象由来の被験試料をアッセイするステップと、
    対象が、ＭＴＲ、ＣＯＭＴ（ｒｓ４６３３）及びＣＯＭＴ（ｒｓ４６８０）のＳＮＰバイオマーカーのうちの１種を保有することが決定している場合に、葉酸含有化合物を任意選択で（任意選択で抗うつ薬と併用して）対象に投与するステップと
    を含む、方法。
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