JP2016502531A - ジヒドロ−ピリド−オキサジン誘導体の固体形態 - Google Patents
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- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
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Landscapes
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Nitrogen And Oxygen Or Sulfur-Condensed Heterocyclic Ring Systems (AREA)
Abstract
Description
所与の状態、症状、もしくは障害、もしくは疾患の低減もしくは抑制、または生物学的活動もしくは過程の基本的活動における著しい減少を指す。
a)希釈剤、例えば、乳糖、デキストロース、ショ糖、マンニトール、ソルビトール、セルロースおよび/もしくはグリシン;
b)滑沢剤、例えば、シリカ、タルカム、ステアリン酸、そのマグネシウムもしくはカルシウム塩および/もしくはポリエチレングリコール;錠剤についてはさらに
c)結合剤、例えば、ケイ酸マグネシウムアルミニウム、デンプンペースト、ゼラチン、トラガカント、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウムおよび/もしくはポリビニルピロリドン;必要に応じて
d)崩壊剤、例えば、デンプン、寒天、アルギン酸もしくはそのナトリウム塩、または発泡混合物;ならびに/または
e)吸収剤、着色剤、香味剤および甘味剤
と一緒に活性成分を含む錠剤またはゼラチンカプセル剤である。
a)血小板由来増殖因子受容体(PDGFR)の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、例えば、PDGFRの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、特に、PDGF受容体を阻害する化合物、例えば、N−フェニル−2−ピリミジン−アミン誘導体、例えば、イマチニブ、SU101、SU6668およびGFB−111;
b)線維芽細胞増殖因子受容体(FGFR)の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物;
c)インスリン様増殖因子受容体I(IGF−IR)の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、例えば、IGF−IRの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、特に、IGF−IR受容体を阻害する化合物、例えば、WO02/092599において開示されているこれらの化合物;
d)Trk受容体チロシンキナーゼファミリーの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物;
e)Axl受容体チロシンキナーゼファミリーの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物;
f)c−Met受容体の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物;
g)Kit/SCFR受容体チロシンキナーゼの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物;
h)C−kit受容体チロシンキナーゼ(PDGFRファミリーの部分)の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、例えば、c−Kit受容体チロシンキナーゼファミリーの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、特に、c−Kit受容体を阻害する化合物、例えば、イマチニブ;
i)c−Ablファミリーのメンバーおよびこれらの遺伝子融合産物、例えば、BCR−Ablキナーゼの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、例えば、c−Ablファミリーメンバーおよびこれらの遺伝子融合産物の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、例えば、N−フェニル−2−ピリミジン−アミン誘導体、例えば、イマチニブ、PD180970、AG957、NSC680410またはParkeDaviからのPD173955;
j)タンパク質キナーゼC(PKC)およびセリン/トレオニンキナーゼのRafファミリーのメンバー、MEK、SRC、JAK、FAK、PDKのメンバーおよびRas/MAPKファミリーメンバー、またはPI(3)キナーゼファミリー、またはPI(3)−キナーゼ−関連キナーゼファミリー、および/またはサイクリン依存性キナーゼファミリー(CDK)のメンバーの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、ならびに特に、米国特許第5,093,330号に開示されているこれらのスタウロスポリン誘導体、例えば、ミドスタウリン;さらなる化合物の例は、例えば、UCN−01;サフィンゴール;BAY43−9006;ブリオスタチン1;ペリホシン;イルモホシン;RO318220およびRO320432;GO6976;Isis3521;LY333531/LY379196;イソキノリン化合物、例えば、WO00/09495において開示されているもの;FTI;PD184352;またはQAN697(P13K阻害剤)を含む;
k)タンパク質−チロシンキナーゼ阻害剤の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、例えば、メシル酸イマチニブ(GLEEVEC)またはチルホスチンを含む、タンパク質−チロシンキナーゼ阻害剤の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物。チルホスチンは、好ましくは低分子量(Mr<1500)化合物、または薬学的に許容されるその塩、特に、化合物のベンジリデンマロニトリルクラスまたはS−アリールベンゼンマロニトリルもしくは二基質キノリンクラスから選択される化合物、より特に、チルホスチンA23/RG−50810、AG99、チルホスチンAG213、チルホスチンAG1748、チルホスチンAG490、チルホスチンB44、チルホスチンB44(+)エナンチオマー、チルホスチンAG555、AG494、チルホスチンAG556、AG957およびアダフォスチン(4−{[(2,5−ジヒドロキシフェニル)メチル]アミノ}−安息香酸アダマンチルエステル、NSC680410、アダフォスチンからなる群から選択される任意の化合物である;ならびに
l)受容体チロシンキナーゼの上皮増殖因子ファミリー(ホモ二量体またはヘテロ二量体としてEGFR、ErbB2、ErbB3、ErbB4)の活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物、例えば、上皮増殖因子受容体ファミリーの活性を標的とし、減少させまたは阻害する化合物は、特に、EGF受容体チロシンキナーゼファミリーのメンバー、例えば、EGF受容体、ErbB2、ErbB3およびErbB4を阻害し、またはEGFもしくはEGF関連リガンドに結合する化合物、タンパク質または抗体であり、特に、WO97/02266において一般的におよび特に開示されているそれらの化合物、タンパク質またはモノクローナル抗体、例えば、実施例39の、またはEP0564409;WO99/03854;EP0520722;EP0566226;EP0787722;EP0837063;米国特許第5,747,498号;WO98/10767;WO97/30034;WO97/49688;WO97/38983、および特に、WO96/30347における化合物、例えば、CP358774として公知の化合物;WO96/33980、例えば、化合物ZD1839;およびWO95/03283、例えば、化合物ZM105180、例えば、トラスツズマブ(HERCEPTIN)、セツキシマブ、Iressa、Tarceva、OSI−774、CI−1033、EKB−569、GW−2016、E1.1、E2.4、E2.5、E6.2、E6.4、E2.11、E6.3またはE7.6.3;ならびにWO03/013541に開示されている7H−ピロロ−[2,3−d]ピリミジン誘導体
が含まれる。
下記の実施例は本発明を例示することを意図し、それに対する限定として解釈されない。温度は、摂氏温度で示す。他に記述しない限り、全ての蒸発は、減圧下、典型的には、約15mmHg〜100mmHg(=20〜133ミリバール)で行う。最終生成物、中間体および出発材料の構造は、標準的な分析方法、例えば、微量分析および分光学的特徴、例えば、MS、IR、NMRによって確認する。使用する略語は、当技術分野で通常のものである。
ACN アセトニトリル
AcOH 酢酸
aq. 水溶液
Boc tert−ブトキシカルボニル
Boc2O ジ−tert−ブチルジカーボネート
tBu tert−ブチル
tBuOH tert−ブタノール
BrettPhos 2−(ジシクロヘキシルホスフィノ)−3,6−ジメトキシ−2’−4’−6’−トリイソプロピル−1,1’−ビフェニル
br s ブロードな一重項
COMU (1−シアノ−2−エトキシ−2−オキソエチリデンアミノオキシ)ジメチルアミノ−モルホリノ−カルベニウムヘキサフルオロホスフェート
conc. 濃縮した
d 日
d 二重項
dd 二重項の二重項
dba ジベンジリデンアセトン
DCM ジクロロメタン
DEA ジエチルアミン
DEAD アゾジカルボン酸ジエチル
DEAP ジエチルアミノピリジン
DIPEA ジイソプロピルエチルアミン
DMF ジメチルホルムアミド
DMME ジメトキシメタン
DMSO ジメチルスルホキシド
DPPA ジフェニルホスホリルアジド
DPPF 1,1’−ビス(ジフェニルホスフィノ)フェロセン
EDC 1−(3−ジメチルアミノプロピル)−3−エチルカルボジイミド塩酸塩
eq. 当量
ESI エレクトロスプレーイオン化
Et3N トリエチルアミン
Et2O ジエチルエーテル
EtOAc 酢酸エチル
EtOH エタノール
h 時間
HATU O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−N,N,N’,N’−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート
HBTU O−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−N,N,N’,N’−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート
HMDS ヘキサメチルジシラザン
HOBT 1−ヒドロキシ−ベンゾトリアゾール
HPLC 高速液体クロマトグラフィー
IPA イソプロパノール
LCMS 液体クロマトグラフィー質量分析法
mCPBA メタ−クロロ過安息香酸
MeOH メタノール
m 多重項
min 分
MS 質量分析法
mw マイクロ波
NMR 核磁気共鳴分析法
NaOtBu ナトリウムtert−ブトキシド
NP 順相
OBD 最適床密度
Pd2(dba)3 トリス(ジベンジリデンアセトン)ジパラジウム
PL−HCO3 MP SPE 酸除去のためのポリマー担持バイカーボネートカートリッジ
prep. 分取
PPh3 トリフェニルホスフィン
q 四重項
Rac−BINAP ラセミの2,2’−ビス(ジ−p−トリルホスフィノ)−1,1’−ビナフチル
RP 逆相
Rt 保持時間
rt 室温
RuPhos 2−ジシクロヘキシルホスフィノ−2’,6’−ジ−イソプロポキシ−1,1’−ビフェニル
sat. 飽和
SCX−2 ポリマー担持スルホン酸マクロ多孔性ポリスチレン
soln. 溶液
t 三重項
TBME tert−ブチルメチルエーテル
TBAF フッ化テトラブチルアンモニウム
TBDMSCl tert−ブチルジメチルシリルクロリド
テトラメチル−t−ブチル−XPhos 2−ジ−t−ブチルホスフィノ−3,4,5,6−テトラメチル−2’,4’,6’−トリイソプロピルビフェニル
TFA トリフルオロ酢酸
THF テトラヒドロフラン
TLC 薄層クロマトグラフィー
UPLC 超高速液体クロマトグラフィー
XPhos 2−ジシクロヘキシルホスフィノ−2’,4’,6’−トリイソプロピルビフェニル
Pd[RuPhos] (2−ジシクロヘキシルホスフィノ−2’6’−ジイソプロピル−11’−ビフェニル)(2−(2−アミノエチル)フェニル)パラジウム(II)
使用するマイクロ波装置は、Biotage Initiator(登録商標)である。
全ての化合物は、AutoNomを使用して命名する。
LCMS方法M1(RtM1)
HPLC−カラムの寸法:2.1×50mm
HPLC−カラムタイプ:Acquity UPLC HSS T3、1.8μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05容量%ギ酸+3.75mMの酢酸アンモニウム、B)ACN+0.04容量%ギ酸
HPLC−勾配:1.4分で2〜98%B、98%B、0.45分、流量=1.2ml/分
HPLC−カラム温度:50℃
LCMS方法M2(RtM2)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05容量%ギ酸+3.75mMの酢酸アンモニウム、B)ACN+0.04容量%ギ酸
HPLC−勾配:1.4分で2〜98%B、98%B、0.75分、流量=1.2ml/分
HPLC−カラム温度:50℃
LCMS方法M3(RtM3)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05容量%ギ酸+3.75mMの酢酸アンモニウム、B)ACN+0.04容量%ギ酸
HPLC−勾配:8.5分で2〜98%B、98%B、1分、流量=1.2ml/分
HPLC−カラム温度:50℃
LCMS方法M4(RtM4)
HPLC−カラムの寸法:4.6×50mm
HPLC−カラムタイプ:SunFire C18、5μm
HPLC−溶離液:A)水+0.1容量%TFA、B)ACN+0.1容量%TFA
HPLC−勾配:8.0分で5〜100%B B、流量=2ml/分
HPLC−カラム温度:40℃
LCMS方法M5(RtM5)
HPLC−カラムの寸法:0.46×25cm
HPLC−カラムタイプ:Chiralcel OJ−H(1189)
HPLC−溶離液:EtOH/MeOH、60:40
HPLC−勾配:均一濃度、流量=0.5ml/分
検出器:UV220nm
LCMS方法M6(RtM6)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05%TFA、B)ACN+0.04%TFA
HPLC−勾配:1.4分で2〜98%B、98%B、0.75分、流量=1.2ml/分
HPLC−カラム温度:50℃
LCMS方法M7(RtM7)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05%TFA、B)ACN+0.04%TFA
HPLC−勾配:3.0分で10〜95%B、95%B、1分、流量=1.2ml/分
HPLC−カラム温度:50℃
LCMS方法M8(RtM8)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05%ギ酸+3.75mMの酢酸アンモニウム、B)アセトニトリル+0.04%ギ酸
HPLC−勾配:3.0分で10〜95%B、流量=1.2ml/分
LCMS方法M9(RtM9)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05%ギ酸+3.75mMの酢酸アンモニウム、B)アセトニトリル+0.04%ギ酸
HPLC−勾配:10%B、0.0〜0.5分、次いで、勾配10〜95%B、0.5分〜3.0分、流量=1.2ml/分
LCMS方法M10(RtM10)
HPLC−カラムの寸法:2.1×50mm
HPLC−カラムタイプ:Acquity UPLC BEH C18、1.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.1容量%ギ酸、B)アセトニトリル
HPLC−勾配:1.00分で20〜25%B、次いで、3.20分で25〜95%B、次いで、0.10分で95〜100%B、次いで、100%0.20分間、流量=0.7ml/分
LCMS方法M11(RtM11)
HPLC−カラムの寸法:2.1×50mm
HPLC−カラムタイプ:Acquity UPLC BEH C18、1.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.1容量%ギ酸、B)アセトニトリル
HPLC−勾配:1.00分で5〜10%B、次いで、3.00分で10〜90%B、次いで、0.10分で90〜100%B、次いで、100%0.40分間、流量=0.7ml/分
LCMS方法M12(RtM12)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.1容量%TFA、B)アセトニトリル
HPLC−勾配:1.7分にわたり10〜95%B、および溶媒流量として1.2mL/分、次いで、0.7分にわたり955B、流量=1.4mL/分。
LCMS方法M13(RtM13)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05%ギ酸+3.75mMの酢酸アンモニウム、B)アセトニトリル+0.04%ギ酸
HPLC−勾配:3.7分で10〜95%B、流量=1.2ml/分
LCMS方法M14(RtM14)
HPLC−カラムの寸法:2.1×30mm
HPLC−カラムタイプ:Ascentis Express C18、2.7μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05%ギ酸+3.75mMの酢酸アンモニウム、B)アセトニトリル+0.04%ギ酸
HPLC−勾配:1.5分で10〜95%B、95%B、1分、流量=1.2ml/分
LCMS方法M15(RtM15)
HPLC−カラムの寸法:0.46×25cm
HPLC−カラムタイプ:Chiralcel OD−H(1194)
HPLC−溶離液:Hexan/EtOH50:50+0.05%DEA
HPLC−勾配:均一濃度、流量=0.5ml/分
検出器:UV220nm
LCMS方法M16(RtM16)
HPLC−カラムの寸法:2.1×50mm
HPLC−カラムタイプ:Acquity UPLC HSS T3、1.8μm
HPLC−溶離液:A)水+0.05容量%ギ酸+3.75mMの酢酸アンモニウム、B)ACN+0.04容量%ギ酸
HPLC−勾配:1.4分で5〜98%B、0.4分、98%B、流量=1.0ml/分
HPLC−カラム温度:60℃
計器類:
方法X1
機器 Bruker D8 GADDS Discover
照射 CuKα(40kV、40mA)
検出器 HI−STAR Area検出器
走査範囲、6°〜39°(2シータ値)
融点は、示差走査熱量測定(DSC)によって決定した。DSCは、10℃/分の加熱速度を使用してTA Instruments DSC Q2000で記録した。0.6mgの試料を、標準的なアルミニウムパン(パン+蓋、TA900786.901、900779.901)中に秤量した。機器は、Thermal Advantage Q−シリーズソフトウェアV.2.6.0.367およびThermal AdvantageソフトウェアV4.6.9を使用して操作した。Universal Analysis V4.3A Build4.3.0.6を使用して、熱事象を特性決定した。ピンホールを有さない試料パンに対して試料を測定した。試料を下記のプロトコルによって処置した。
ステップ1:0℃で平衡化
ステップ2:300℃まで10℃/分の勾配
7−クロロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−2−オン(CAS登録928118−43−8)(3.70g、20mmol)のTHF(63ml)溶液を、BH3 *THF(THF中1M、47ml、47mmol)で処置した。反応混合物を75℃で1時間撹拌し、次いで、室温に冷却し、メタノール(24ml、600mmol)でクエンチした。反応混合物を減圧下で濃縮し、残渣をEtOAcで溶解し、飽和NaHCO3水溶液で洗浄した。有機層をMgSO4上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮し、表題生成物を淡黄色の固体として得た(3.3g、96%収率)。
UPLC RtM1=0.47分;ESIMS:171[(M+H)+]。
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 7.53 (s, 1H), 7.11 (br s, 1H), 6.47 (s, 1H), 4.09 (t, 2H), 3.17-3.38 (m, 2H).
b)2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−7−オール
ジオキサン(32.5ml)中の7−クロロ−2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン(1.08g、6.33mmol)、KOH水溶液(5.4mlの水中1.07g、19mmolのKOH)、2−ジ−t−ブチルホスフィノ−3,4,5,6−テトラメチル−2’,4’,6−トリ−i−プロピルビフェニル98%(0.30g、0.63mmol)およびPd2(dba)3(0.29g、0.32mmol)の混合物を窒素で3回脱気し、チューブを密封し、反応混合物を100℃で5時間撹拌した。室温に冷却した後、hyfloを通して反応混合物を濾過し、EtOAcおよびメタノールですすいだ。濾液を濃縮し、表題化合物をシリカゲル上のフラッシュクロマトグラフィー(DCM/MeOH、98:2から75:25)の後にオレンジ色の残渣として得た(660mg、69%収率)
UPLC RtM1=0.34分;ESIMS:153[(M+H)+]。
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 10.33 (br s, 1H), 7.03 (br s, 1H), 6.71 (s, 1H), 5.15 (s, 1H), 3.95 (t, 2H), 3.25 (m, 2H).
c)(S)−3−(2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−7−イルオキシ)−ピロリジン−1−カルボン酸tert−ブチルエステル
乾燥した2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−7−オール(0.66g、4.34mmol)および(R)−3−メタンスルホニルオキシ−ピロリジン−1−カルボン酸tert−ブチルエステル(CAS登録127423−61−4)(1.73g、6.51mmol)のDMF(40ml)溶液を、水素化ナトリウム(鉱油中60%、0.21g、8.68mmol)で処置し、反応混合物を80℃で18時間撹拌した。室温に冷却した後、反応混合物をTBMEで希釈し、飽和NaHCO3水溶液で洗浄した。有機層をMgSO4上で乾燥させ、濾過し、濃縮し、表題化合物をシリカゲル上のフラッシュクロマトグラフィー(シクロヘキサン/EtOAc、95:5〜30:70)後に黄色の油として得た(1.035g、75%純度、56%収率)
UPLC RtM1=0.65分;ESIMS:322[(M+H)+]。
1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.54 (s, 1H), 5.86 (s, 1H), 5.42 (br s, 1H), 4.25-4.41 (m, 1H), 4.19 (t, 2H), 3.38-3.66 (m, 6H), 2.00-2.18 (m, 2H), 1.46 (d, 9H).
d)(S)−3−[1−(6−メトキシ−5−メチル−ピリジン−3−イル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−7−イルオキシ]−ピロリジン−1−カルボン酸tert−ブチルエステル
ジオキサン(6ml)中の(S)−3−(2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−7−イルオキシ)−ピロリジン−1−カルボン酸tert−ブチルエステル(254mg、0.79mmol)、5−ブロモ−2−メトキシ−3−メチルピリジン(CAS登録760207−87−2)(208mg、1.03mmol)、XPhos(30mg、0.06mmol)、およびNaOtBu(167mg、1.74mmol)の混合物をアルゴンで5分間脱気し、次いで、Pd2(dba)3(29mg、0.03mmol)を加えた。チューブをアルゴンで充填し、密封し、反応混合物を100℃で2時間撹拌した。室温に冷却した後、hyfloを通して反応混合物を濾過し、EtOAcですすぎ、濾液を飽和NaHCO3水溶液で洗浄した。水層を、EtOAcで2回再抽出し、合わせた有機層をNa2SO4上で脱水させ、濾過し、濃縮し、表題化合物をシリカゲル上のフラッシュクロマトグラフィー(ヘプタン/EtOAc、100:0〜50:50)の後に透明なガムとして得た(274mg、78%収率)。UPLC RtM1=1.20分;ESIMS:443[(M+H)+]。
1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.93 (d, 1H), 7.61 (br s, 1H), 7.30-7.35 (m, 1H), 5.71 (s, 1H), 5.34-5.46 (m, 1H), 4.31 (br s, 2H), 3.99 (s, 3H), 3.68 (t, 2H), 3.34-3.62 (m, 4H), 2.23 (s, 3H), 2.01-2.09 (m, 2H), 1.44 (s, 9H).
e)1−(6−メトキシ−5−メチル−ピリジン−3−イル)−7−((S)−ピロリジン−3−イルオキシ)−2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン
(S)−3−[1−(6−メトキシ−5−メチル−ピリジン−3−イル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−7−イルオキシ]−ピロリジン−1−カルボン酸tert−ブチルエステル(364mg、0.82mmol)のDCM(6ml)溶液を、TFA(0.63ml、8.23mmol)で処置し、反応混合物を室温で18時間撹拌し、次いで、飽和NaHCO3水溶液でクエンチし、DCMで抽出した。有機層をMgSO4上で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮し、表題生成物を赤色の油として得て、これをそれ以上精製することなく次のステップで使用した(313mg、90%純度、定量的収率)。
UPLC RtM1=0.65分;ESIMS:343[(M+H)+]。
1H NMR (400 MHz, CDCl3): δ 7.93 (d, 1H), 7.62 (s, 1H), 7.32 (d, 1H), 5.70 (s, 1H), 5.26-5.36 (m, 1H), 4.31 (t, 2H), 3.99 (s, 3H), 3.67 (t, 2H), 2.95-3.15 (m, 3H), 2.81-2.92 (m, 1H), 2.22 (s, 3H), 1.98-2.10 (m, 1H), 1.79-1.90 (m, 1H).
f)(1,1−ジオキソ−ヘキサヒドロ−1λ6−チオピラン−4−イル)−{(S)−3−[1−(6−メトキシ−5−メチル−ピリジン−3−イル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−7−イルオキシ]−ピロリジン−1−イル}−メタノン
1,1−ジオキソ−ヘキサヒドロ−1λ6−チオピラン−4−カルボン酸(CAS登録64096−87−3)(106mg、0.59mmol)のDMF(4ml)溶液を、HBTU(225mg、0.59mmol)およびDIPEA(0.24ml、1.37mmol)で処置した。このように得られたオレンジ色の溶液を、室温で5分間撹拌し、次いで、1−(6−メトキシ−5−メチル−ピリジン−3−イル)−7−((S)−ピロリジン−3−イルオキシ)−2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン(156mg、0.46mmol)のDMF(2ml)溶液を加えた。反応混合物を室温で1時間撹拌し、次いで、減圧下で濃縮し、残渣をDCMで溶解し、飽和NaHCO3水溶液で洗浄した。相分離カートリッジを通過させることによって有機層を乾燥させ、濃縮し、SFCクロマトグラフィー(カラムDEAP(250mm×30mm、60A、5μm)Princeton、6分で超臨界CO2中メタノールの勾配11〜16%)後に僅かに着色した固体として表題化合物を得た(112mg、49%収率)。
UPLC RtM1=0.81分;ESIMS:503[(M+H)+]。
1H NMR (400 MHz, DMSO-d6): δ 8.01 (s, 1H), 7.61 (m, 1H), 7.52 (d, 1H), 5.52 (d, 1H), 5.24-5.43 (m, 1H), 4.26 (br s, 2H), 3.89 (s, 3H), 3.59-3.79 (m, 3H), 3.41-3.56 (m, 2H), 3.21-3.39 (m, 1H), 2.98-3.21 (m, 4H), 2.67-2.83 (m, 1H), 1.84-2.20 (m, 9H).
1H NMR (600 MHz, DMSO-d6): δ 8.01 (s, 1H), 7.63-7.59 (m, 1H), 7.55-7.51 (m, 1H), 5.55-5.51 (m, 1H), 5.43-5.24 (m, 1H), 4.29-4.22 (m, 2H), 3.90 (s, 3H), 3.80-3.60 (m, 2H), 3.56-3.37 (m, 3H), 3.28-2.99 (m, 5H), 2.89-2.66 (m, 1H), 2.19-2.09 (m, 4H), 2.08-1.98 (m, 2H), 1.98-1.86 (m, 3H).
474mgのアモルファスの実施例F1を、1.4mLのイソプロパノールに懸濁した。混合物を70℃に加熱し、70℃で撹拌し、実施例F1の完全な溶解を可能とした。溶液を室温に冷却し、接着剤残渣が形成された。2mLのジエチルエーテルを加え、スラリーを48時間撹拌した。白色の懸濁液が形成された。懸濁液を濾過し、固体を40℃、15ミリバールで乾燥させた。微細な白色の粉末が得られた。材料は、僅かのみの残留溶媒(<0.5%)を含有する。148.77℃の融解開始を伴う実施例F1の結晶性無水形態を得た。
化合物の活性は、次のインビトロおよびインビボ法によって評価することができる。
1 酵素的PI3KアルファおよびPI3Kデルタイソ型阻害の測定
1.1 脂質キナーゼ活性の試験
PI3キナーゼ阻害剤としての化合物の効能は、以下のとおり実証することができる。
キナーゼ反応を、ハーフエリアCOSTAR、96ウェルプレートのウェル当たり50μlの最終体積で実施する。アッセイにおけるATPおよびホスファチジルイノシトールの最終濃度は、それぞれ、5μMおよび6μg/mLである。PI3キナーゼ、例えばPI3キナーゼδの添加によって、反応を開始する。
p110δ。アッセイの成分を、次のとおりウェル当たり添加する。
− カラム2−1におけるウェル当たり5% DMSO中10μl試験化合物。
− カラム1の最初の4ウェルおよびカラム12の最後の4ウェルにおける10μlの5%体積/体積DMSOの添加によって、合計活性を測定する。
− カラム1の最後の4ウェルおよびカラム12の最初の4ウェルへの10μM対照化合物の添加によって、バックグラウンドを測定する。
− 2mL「アッセイミックス」をプレート当たり調製する。
1.912mLのHEPESアッセイ緩衝液
ウェル当たり5μMの最終濃度をもたらすATPの3mMストックの8.33μl
ウェル当たり0.05μCiをもたらす活性日における1μlの[33P]ATP
ウェル当たり6μg/mLの最終濃度をもたらす1mg/mL PIストックの30μl
ウェル当たり1mMの最終濃度をもたらす1MストックMgCl2の5μl
− 20μlのアッセイミックスをウェル当たり添加する。
− 2mL「酵素ミックス」をプレート当たり調製する(2mLのキナーゼ緩衝液中x*μlのPI3キナーゼp110β)。アッセイプレートへの添加の間、「酵素ミックス」を、氷上に維持する。
− 20μl「酵素ミックス」を、ウェル当たり添加して反応を開始する。
− 次いで、プレートを、室温で90分間インキュベートする。
− ウェル当たり50μlのWGA−SPAビーズ(コムギ胚芽凝集素をコーティングしたシンチレーション近接アッセイビーズ)懸濁液の添加によって、反応を停止する。
− TopSeal−S(ポリスチレンマイクロプレート用ヒートシール、PerkinElmer LAS[Deutschland]GmbH、Rodgau、ドイツ)を使用して、アッセイプレートを密閉し、室温で少なくとも60分間インキュベートする。
− 次いで、Jouan卓上遠心分離機(Jouan Inc.、Nantes、フランス)を使用して、1500rpmで2分間、アッセイプレートを遠心分離する。
− Packard TopCountを使用して、アッセイプレートをカウントし、各ウェルを20秒間カウントする。
*酵素の量は、使用するバッチの酵素活性によって決まる。
一つずつ8種の濃度(1/3および1/3.33連続希釈ステップ)でのカラム1〜20における、ウェル当たり90% DMSO中の50nl試験化合物。
− 低対照:カラム23〜24の半分のウェルに50nlの90% DMSO(最終0.45%)。
− 高対照:カラム23〜24の別の半分に参照化合物(例えば、WO2006/122806における実施例7の化合物)の50nl(最終2.5μM)。
− 標準:カラム21〜22における試験化合物として希釈した、ちょうど言及した50nlの参照化合物。
− 20mL「緩衝液」をアッセイ当たり調製する。
200μlの1M TRIS HCl pH7.5(最終10mM)
60μlの1M MgCl2(最終3mM)
500μlの2M NaCl(最終50mM)
100μlの10% CHAPS(最終0.05%)
200μlの100mM DTT(最終1mM)
18.94mLのナノ純水
− 10mL「PI」をアッセイ当たり調製する。
3%オクチルグルコシド中に調製された200μlの1mg/mLの1−アルファ−ホスファチジルイノシトール(Liver Bovine、Avanti Polar Lipids カタログ番号840042C MW=909.12)(最終10μg/mL)
9.8mLの「緩衝液」
− アッセイ当たり10mL「ATP」を調製する。
ウェル当たり1μMの最終濃度をもたらす6.7μlのATPの3mMストック
10mLの「緩衝液」
− 次の最終濃度で「PI」中にアッセイ当たり2.5mLの各PI3K構築物を調製する。
10nM PI3KアルファEMV B1075
25nM ベータEMV BV949
10nM デルタEMV BV1060
150nM ガンマEMV BV950
− ウェル当たり5μlの「PI/PI3K」を添加する。
− ウェル当たり5μlの「ATP」を添加して反応を開始する。
− 次いで、室温で60分間(アルファ、ベータ、デルタ)または120分間(ガンマ)、プレートをインキュベートする。
− 10μlキナーゼ−Glo(Promega カタログ番号6714)の添加によって、反応を停止する。
− 100ミリ秒の積分時間および191に設定された感度で、Synergy 2 reader(BioTek、Vermont 米国)で、10分後に、アッセイプレートを読む。
− アウトプット:高対照は、約60’000カウントであり、低対照は、30’000以下である。
− このルミネセンスアッセイは、0.4から0.7の間の有用なZ’比を与える
Z’値は、アッセイのロバストネスの万能尺度である。0.5から1.0の間のZ’は、優れたアッセイと認められる。
二つの異なる構築物、BV 1052およびBV 1075を使用して、化合物スクリーニングのためのPI3キナーゼαタンパク質を生成する。
p85サブユニットのインターSH2ドメイン(iSH2)およびp110−aサブユニット(最初の20個のアミノ酸の欠失を有する)のためのPCR生成物を生成し、オーバーラップPCRによって融合する。iSH2 PCR生成物を、最初にプライマー
gwG130−p01(5’−CGAGAATATGATAGATTATATGAAGAAT−3’)(配列番号1)およびgwG130−p02(5’−TGGTTT−AATGCTGTTCATACGTTTGTCAAT−3’)(配列番号2)
を使用して一本鎖cDNAから生成する。続いて、二次PCR反応において、Gateway(Invitrogen AG、Basel、スイス)組換えAttB1サイトおよびリンカー配列を、プライマー
gwG130−p03(5’−GGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTACGAAGGAGATATACATAT−GCGAGAATATGATAGATTATATGAAGAAT−3’)(配列番号3)および
gwG152−p04(5’−TACCATAATTCCACCACCACCACCGGAAATTCCCCCTGGTTT−AATGCTGTTCATACGTTTGTCAAT−3’)(配列番号4)
を使用して、それぞれp85 iSH2フラグメントの5’末端および3’末端に添加する。
gwG152−p01(5’−CTAGTGGAATGTTTACTACCAAATGG−3’)(配列番号5)および
gwG152−p02(5’−GTTCAATG−CATGCTGTTTAATTGTGT−3’)(配列番号6)
を使用して、一本鎖cDNAから生成する。
gw152−p03(5’−GGGGGAATTTCCGGTGGTGGTGGTGGAATTATGGTAC−TAGTGGAATGTTTACTACC−AAATGGA−3’)(配列番号7)および
gwG152−p06(5’−AGCTCCGTGATGGTGATGGTGATGTGCTCCGTTCAATG−CATGCTGTTTAATTGTGT−3’)(配列番号8)
を使用して、それぞれp110−aフラグメントの5’末端および3’末端に添加する。
(5’−GGGACCACTTTGTACAAGAAAGCTGGGTTTAAGCTCCGTGATGGTGATGGTGAT−GTGCTCC−3’)(配列番号9)
を含有するプライマーを使用して、第3のPCR反応において組み立てる。
バキュロウイルスBV−1075のための構築物を、p85フラグメントおよびベクターpBlueBac4.5にクローニングしたp110−aフラグメントから構成された3部のライゲーションによって生成する。p85フラグメントは、Nhe/Speで消化したプラスミドp1661−2由来である。p110−aフラグメントは、SpeI/HindIIIフラグメントとしてLR410(上記を参照されたい)由来である。クローニングベクターpBlueBac4.5(Invitrogen)を、Nhe/HindIIIで消化する。これは、構築物PED 153.8をもたらす。
KAC1028(5’−GCTAGCATGCGAGAATATGATAGATTATATGAAGAATATACC)(配列番号10)および二つのリバースプライマー
KAC1029(5’−GCCTCCACCACCTCCGCCTGGTTTAATGCTGTTCATACGTTTGTC)
(配列番号11)および
KAC1039(5’−TACTAGTCCGCCTCCACCACCTCCGCCTCCACCACCTCCGCC)
(配列番号12)
を使用して、PCRによって生成する。
p85サブユニットのインターSH2ドメイン(iSH2)および完全長p110−bサブユニットのためのPCR生成物を生成し、PCRをオーバーラップすることによって融合する。
gwG130−p01(5’−CGAGAATATGATAGATTATATGAAGAAT−3’)(配列番号1)およびgwG130−p02(5’−TGGTTT−AATGCTGTTCATACGTTTGTCAAT−3’)(配列番号2)
を使用して、一本鎖cDNAから生成する。続いて、二次PCR反応において、Gateway(Invitrogen)組換えAttB1部位およびリンカー配列を、プライマー
gwG130−p03(5’−GGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTACGAAGGAGATA−TACATATGCGAGAATATGATAGATTATATGAAGAAT−3’)(配列番号3)および
gwG130−p05(5’−ACTGAAGCATCCTCCTCCTCCTCCTCCTGGTTTAAT−GCTGTTCATACGTTTGTC−3’)(配列番号13)
を使用して、それぞれp85 iSH2フラグメントの5’末端および3’末端に添加する。
gwG130−p04(5’−ATTAAACCAGGAGGAGGAGGAGGAGGATGCTTCAGTTTCATAATGCC−TCCTGCT−3’)(配列番号4)
および、ヒスチジンタグに融合したp110−bの3’末端の配列を含有するプライマー
gwG130−p06(5’−AGCTCCGTGATGGTGATGGTGATGTGCTCCAGATCTGTAGTCTTT−CCGAACTGTGTG−3’)(配列番号14)
を最初に使用して、一本鎖cDNAから生成する。
p85サブユニットのインターSH2ドメイン(iSH2)および完全長p110−dサブユニットのためのPCR生成物を生成し、PCRをオーバーラップすることによって融合する。
gwG130−p01(5’−CGAGAATATGATAGATTATATGAAGAAT−3’)(配列番号1)およびgwG130−p02(5’−TGGTTT−AATGCTGTTCATACGTTTGTCAAT−3’)(配列番号2)
を使用して、一本鎖cDNAから生成する。続いて、二次PCR反応において、Gateway(Invitrogen)組換えAttB1部位およびリンカー配列を、プライマー
gwG130−p03(5’−GGGACAAGTTTGTACAAAAAAGCAGGCTACGAAGGAGATATACAT−ATGCGAGAATATGATAGATTATATGAAGAAT−3’)(配列番号3)および
gwG154−p04(5’−TCCTCCTCCTCCTCCTCCTGGTTTAATGCTGTTCATACGTTTGTC−3’)(配列番号16)
を使用して、それぞれp85 iSH2フラグメントの5’末端および3’末端に添加する。
gwG154−p01(5’−ATGCCCCCTGGGGTGGACTGCCCCAT−3’)(配列番号17)およびgwG154−p02(5’−CTACTG−CCTGTTGTCTTTGGACACGT−3’)(配列番号18)
を使用して、一本鎖cDNAから生成する。
gw154−p03(5’−ATTAAACCAGGAGGAGGAGGAGGAGGACCCCCTGGGGTGGAC−TGCCCCATGGA−3’)(配列番号19)およびgwG154−p06(5’−AGCTCCGTGATGGTGAT−GGTGATGTGCT−CCCTGCCTGTTGTCTTTGGACACGTTGT−3’)(配列番号20)
を使用して、それぞれp110−dフラグメントの5’末端および3’末端に添加する。
この構築物を、Roger Williams lab、MRC Laboratory of Molecular Biology、Cambridge、イギリス(2003年11月)より得る。構築物の説明:Pacold M. E.ら、(2000) Cell 103巻、931〜943ページ。
PI3Kイソ型のための組換えバキュロウイルスおよびタンパク質を生成する方法:
異なるPI3キナーゼ遺伝子を含有するpBlue−Bac4.5(a、b、およびdイソ型用)またはpVL1393(g用)プラスミドを、ベンダーに推奨される方法を使用して、BaculoGold WTゲノムDNA(BD Biosciences、Franklin Lakes、NJ、米国)と共に同時形質移入する。続いて、形質移入から得られる組換えバキュロウイルスを、Sf9昆虫細胞上でプラーク精製して、組換えタンパク質を発現しているいくつかの単離株を得る。陽性クローンは、抗HISまたは抗イソ型抗体ウェスタンによって選択される。PI3Kアルファおよびデルタイソ型について、二次プラーク精製を、PI3Kの第1のクローンウイルスストック上で実施する。全てのバキュロウイルス単離株の増幅を、低い感染多重度(moi)において実施して、タンパク質生成用の高力価低継代ストックを生成する。バキュロウイルスを、BV1052(α)およびBV1075(α)、BV949(β)、BV1060(δ)およびBV950(γ)と称する。
PI3Kアルファを三つのクロマトグラフィーステップ:Niセファロース樹脂(GE Healthcare、General Electric Company所属、Fairfield、CT、米国)上の固定化金属アフィニティークロマトグラフィー、Superdex 200 26/60カラム(GE Healthcare)を使用するゲル濾過、最後にSP−XLカラム(GE Healthcare)上の陽イオン交換ステップで精製する。全ての緩衝液を4℃に冷却し、氷上で冷却したまま溶解を行う。カラム分画を、室温で迅速に行う。
PI3Kベータを、二つのクロマトグラフィーステップ:Niセファロース樹脂(GE Healthcare)上の固定化金属アフィニティークロマトグラフィー(IMAC)およびSuperdex 200 26/60カラム(GE Healthcare)を使用するゲル濾過(GFC)で精製する。全ての緩衝液を4℃に冷却し、氷上で冷却したまま溶解を行う。カラム分画を、室温で迅速に行う。
PI3Kガンマを、二つのクロマトグラフィーステップ:Niセファロース樹脂(GE Healthcare)上の固定化金属アフィニティークロマトグラフィー(IMAC)およびSuperdex 200 26/60カラム(GE Healthcare)を使用するゲル濾過(GFC)で精製する。全ての緩衝液を4℃に冷却し、氷上で冷却したまま溶解を行う。カラム分画を、室温で迅速に行う。典型的に、凍結昆虫細胞を、高張溶解緩衝液に溶解し、分取IMACカラムに適用する。樹脂を3〜5カラム体積の溶解緩衝液で洗浄し、次いで、45mMイミダゾールを含有する3〜5カラム体積の洗浄緩衝液で洗浄し、次いで、目的のタンパク質を、250mMイミダゾールを含有する緩衝液で溶離する。画分を、クーマシィー染色SDS−PAGEゲルで分析し、目的のタンパク質を含有する画分をプールし、分取GFCカラムに適用する。GFCカラムからの画分を、クーマシィー染色SDS−PAGEゲルで分析し、目的のタンパク質を含有する画分をプールする。最終的なプールを、50%グリセロールを含有する保存用緩衝液中に透析し、−20℃で貯蔵する。最終的なプールを、ホスホイノシトールキナーゼアッセイで活性について評価する。
PI3Kデルタを、三つのクロマトグラフィーステップ:Niセファロース樹脂(GE Healthcare)上の固定化金属アフィニティークロマトグラフィー、Superdex 200 26/60カラム(GE Healthcare)を使用するゲル濾過、最後にQ−HPカラム(GE Healthcare)上の陰イオン交換ステップで精製する。全ての緩衝液を、4℃に冷却し、氷上で冷却したまま、溶解を行う。カラム分画を室温で迅速に行う。典型的に、凍結昆虫細胞を、高張溶解緩衝液に溶解し、分取IMACカラムに適用する。樹脂を3〜5カラム体積の溶解緩衝液で洗浄し、次いで、45mMイミダゾールを含有する3〜5カラム体積の洗浄緩衝液で洗浄し、次いで、目的のタンパク質を、250mMイミダゾールを含有する緩衝液で溶離する。画分を、クーマシィー染色SDS−PAGEゲルで分析し、目的のタンパク質を含有する画分をプールし、分取GFCカラムに適用する。GFCカラムからの画分を、クーマシィー染色SDS−PAGEゲルで分析し、目的のタンパク質を含有する画分をプールする。GFCカラムからのプールを、低塩濃度緩衝液に希釈し、分取Q−HPカラムに適用する。安定なA280ベースライン吸光度が達成されるまで、カラムを低塩濃度緩衝液で洗浄し、0mM NaClから500mM NaClまでの20カラム体積勾配を使用して溶離する。再び、Q−HPカラムからの画分を、クーマシィー染色SDS−PAGEゲルで分析し、目的のタンパク質を含有する画分をプールする。最終的なプールを、50%グリセロールを含有する保存用緩衝液中に透析し、−20℃で貯蔵する。最終的なプールを、ホスホイノシトールキナーゼアッセイで活性について評価する。
2.1 Rat−1細胞におけるホスホイノシチド−3キナーゼ(PI3K)が媒介するAkt1/2(S473)リン酸化
ヒトホスホイノシチド−3キナーゼ(PI3K)の触媒サブユニットであるアルファ、ベータまたはデルタのミリストイル化形態を安定的に過剰発現しているRat−1細胞を、30ulの完全増殖培地(10%(v/v)ウシ胎仔血清、1%(v/v)MEM非必須アミノ酸、10mMのHEPES、2mMのL−グルタミン、10μg/mLのピューロマイシンおよび1%(v/v)のペニシリン/ストレプトマイシンを補充したダルベッコ変法イーグル培地(DMEM高グルコース))中で、7500個(PI3Kアルファ)、6200個(PI3Kベータ)、または4000個(PI3Kデルタ)の細胞の密度で384ウェルプレートに蒔き、37%C/5%CO2/95%湿度にて24時間インキュベートした。90% DMSO中の40試験化合物用の8点連続希釈、ならびに4参照化合物プラス16高対照および16低(阻害された)対照を得るために、384ウェル化合物プレート中で化合物を希釈した。Hummingwellナノリットルディスペンサーを使用して384ウェルポリプロピレンプレートに250nlの化合物溶液をピペット分注することによって、予備希釈プレートを調製した。49.75ulの完全成長培地の添加によって、化合物を予備希釈した。10ulの予備希釈した化合物溶液を、384ウェルピペッターを使用して細胞プレートに移し、0.11%の最終DMSO濃度をもたらした。
細胞がB細胞受容体(BCR)を介して刺激されるとき、PI3KδはB細胞機能をモジュレートすると認識されてきた(Okkenhaug et al. Science 297:1031 (2002))。B細胞活性化に対する化合物の阻害特性を評価するために、マウス脾臓抗体に由来するマウスのB細胞上の活性化マーカーCD86およびCD69のアップレギュレーションを、抗IgMによる刺激の後に測定する。CD69は、B細胞およびT細胞のための周知の活性化マーカーである(Sancho et al. Trends Immunol. 26:136 (2005))。CD86(B7−2としてもまた公知である)は、B細胞を含む抗原提示細胞上に主に発現する。休止B細胞は、CD86を低レベルで発現するが、例えば、BCRまたはIL−4受容体の刺激に続いてCD86をアップレギュレートする。B細胞上のCD86は、T細胞上のCD28と相互作用する。この相互作用は、最適なT細胞活性化のために、および最適なIgG1反応を生じさせるために必要とされる(Carreno et al. Annu Rev Immunol. 20:29 (2002))。
細胞がB細胞受容体(BCR)を介して刺激されるとき、PI3KδはB細胞機能をモジュレートすることが認識されてきた(Okkenhaug et al. Science 297:1031 (2002))。B細胞活性化に対する化合物の阻害特性を評価するために、全血に由来するラットB細胞に対する活性化マーカーCD86のアップレギュレーションを、抗IgMおよび組換えIL−4による刺激の後で測定する。CD86分子(B7−2としてもまた公知である)は、B細胞を含む抗原提示細胞上に主に発現している。休止B細胞は、CD86を低レベルで発現するが、例えば、BCRまたはIL−4受容体の刺激に続いてCD86をアップレギュレートする。B細胞上のCD86は、T細胞上のCD28と相互作用する。この相互作用は、最適なT細胞活性化のために、および最適なIgG1反応を生じさせるために必要とされる(Carreno et al. Annu Rev Immunol. 20:29 (2002))。
ヘパリンナトリウムで事前コーティングした皮下針を有する10mlのシリンジを使用して、全血を、成体雄Lewisラット(LEW/HanHsd)obyの腹部大動脈から集めた。血液を50mlのFalconチューブ中に移し、抗凝血剤濃度を100U/mlに調節した。
免疫抑制薬のインビトロの効果のアセスメントのために、ヘパリン添加血液を、培地で50%に事前希釈した。培地として務めたのは100U/mlのペニシリン、100mg/mlのストレプトマイシン、2mMのL−グルタミン、50mg/mlのデキストラン40および5%ウシ胎仔血清(FCS、Fetaclone I、Gibco#10270−106)を補充したDMEM高グルコース(Animedカタログ#1−26F01−I)。次いで、190μlの事前希釈した血液を、96ウェルU底マイクロタイタープレート(Nunc)において10μlの事前希釈した試験化合物でスパイクし、20〜0.0003μMの濃度範囲を伴う3倍段階希釈をもたらした。対照ウェルをDMSOで事前処置し、0.5%DMSOの最終濃度を得た。培養物を2連で設け、プレート振盪機(Heidolph Titramax101;30秒、スピード900)上で撹拌によってよく混合し、ピペットに吸い上げて吐き出し、再びプレート振盪機上で撹拌した。培養物を37℃、5%CO2で1時間インキュベートした。次いで、20μlのポリクローナルヤギ抗ラットIgM Ab(Serotec、カタログ#302001)および10μlの希釈した組換えrIL−4(Immunotools#340085)を加え、それぞれ、30μg/mlおよび5ng/mlの最終濃度を得た。上記のようにプレート振盪機上での撹拌によってプレートを混合し、37℃、5%CO2で24時間インキュベートした。
インキュベーションの後、15μlの25mMのEDTA溶液を、ウェル毎に加え、15分間振盪し、接着細胞を剥離した。次いで、表面活性化マーカーの分析のために、試料をPE−Cy5−標識した抗ラットCD45RA(BDカタログ#557015)で染色し、FACS分析においてB細胞上のゲーティングを可能とした。さらに、試料をPE−標識した抗ラットCD86(BDカタログ#551396)で染色した。全ての染色手順は、暗中室温で30分間行った。インキュベーション後、試料を2ml/ウェルのBD Lysing Solution(BD#349202)を含有する96ディープウェルV底マイクロタイタープレート(Corning#396096)に移した。赤血球の溶解後、試料を2mlのCellWASH(BD#349524)で洗浄した。データは、それぞれ、Cellquest PlusまたはDIVA(バージョン6.1.1)ソフトウェアを使用して、LSRIIまたはFACScaliburフローサイトメーター(BD Biosciences)で取得した。リンパ球を、サイズおよび粒度によってFSC/SSCドットプロットにおいてゲーティングし、CD45RAおよび活性化マーカーの発現についてさらに分析した。データは、CD45RA+集団内で活性化マーカーについて陽染された細胞の百分率としてドットブロットまたはヒストグラムから計算した。
薬物への曝露の後のB細胞活性化の阻害百分率を、下記の式によって計算した。
マウス脾臓からの単一細胞懸濁液の調製
安楽死後即座に、脾臓をC57BL/6マウスから切り取った。5mlシリンジからのプランジャーを使用して0.4μMセルストレーナーを通して脾臓をすりつぶす前に、過剰な脂肪を脾臓から切り取った。単一細胞懸濁液を調製し、冷PBSを使用して50mlのFalcon管中で、体積を15mlに調節した。上清の除去および脾臓当たり5mlの赤血球溶解緩衝液中の再懸濁および5分間の室温インキュベーションの前に、4℃において5分間1500rpmで細胞を遠心分離した。4℃での5分間1500rpmの遠心分離の前に、氷冷したPBS(30ml)を細胞に添加した。上清を除去し、40mlのマウス脾細胞培養培地(MSCM)で2度、細胞を洗浄した。MSCMは、100単位/mlペニシリンおよび100μg/mlストレプトマイシン、1×非必須アミノ酸、1mMピルビン酸ナトリウム、0.05mM β−メルカプトエタノール、および10%加熱不活性化したウシ胎仔血清(FBS)を補充したRPMIからなった。細胞を10〜20mlのMSCMに再懸濁し、Countessセルカウンターを使用してカウントした。およそ60×106個の脾細胞が、単一のC57BL/6マウス脾臓から得られた。
脾細胞を、96ウェル平底プレートに100μlの量で2×105細胞/ウェルの最終密度でプレートし、加湿した37℃のインキュベーター中で2〜4時間インキュベートした。その後、試験すべき化合物を、先に調製した化合物ストックプレートを使用し、自動液体操作機械を使用して分注した。ストックプレートは、2倍または3倍希釈を使用して8〜10点に配列した化合物(90%/10% DMSO/ddH2O中)からなった。液体操作機械は、先に調製された化合物ソースプレートからの1μlの各希釈を、96ウェルプレート中の適切な目的ウェル中に分注した。細胞培養物中の化合物の最終出発濃度は、10μMであった。細胞培養物中のDMSOの最終濃度は、0.5%であった。細胞を、TLRリガンドの添加前に、1時間、化合物と共にインキュベートした。次いで、10×EC80濃度のCpG1826を、20μlの量で(200μlの最終培養物体積のために)添加し、その後、加湿した37℃のインキュベーター中で終夜、培養物をインキュベートした。
終夜の培養の後、プレートを室温で5分間、2000rpmで遠心分離した。続いて150μlの各培養物を、96ウェルV底プレートに移し、市販のマウスIL−6サンドイッチELISAキットを使用して、IL−6レベルを測定した。一時的に、PBS/0.1% BSAで1時間、遮断する前に、プレートを捕捉抗体で終夜コーティングした。試料および標準を50μlの量で添加し、プレートを室温で2時間インキュベートした。標準/試料の除去後、50μlのビオチン化検出抗体の添加の前に、PBS/0.05% Tweenを使用してプレートを洗浄し、その後、撹拌しながら、プレートを室温で2時間インキュベートした。ウェル当たり50μlストレプトアビジン−西洋ワサビペルオキシダーゼの添加の前に、プレートを、20分間、再び洗浄した。追加のプレート洗浄に続いて、50μl TMB基質を各ウェルに添加し、25μl/ウェルの停止液の添加の前に、プレートを20分間インキュベートした。SpectraMax 190 Plate Reader(450nm)を使用して、IL−6レベルを測定し、SoftMax ProおよびGraphPad Prismソフトウェアを使用して分析した。
ヒト新鮮血からのPBMCの調製
ヒト血液(約75ml)を、Heparin(S−Monovette 7.5mL NH Heparin 16 IU/mL血液;Starstedt)を入れた10S−Monovette管に集めた。Leucosep(商標)管(30mL #227290;Greiner Bio−one)を、管当たり15mlリンパ球分離培地LSM1077(商標)(#J15−004;PAA Laboratories)の添加および1000gにおける30秒間の遠心分離によって調製した。等量のPBS(Ca2+/Mg2+を含まない;#14190−094)による希釈に続いて、約25mlの血液をLeucosep(商標)管に移した。ブレーキをかけずにEppendorf 5810R遠心分離機を使用して、22℃で20分間、800gで、試料を遠心分離した。PBMC層を、血漿:分離媒体界面から注意深く取り出し、清潔な50ml管に移した。細胞を、PBS(最大で45mlまで)の添加によって一度洗浄し、Eppendorf 5810Rを使用してブレーキ(速度9に設定)をかけながら遠心分離(22℃で1400rpm、10分)した。ペレット細胞を、培地(RPMI 1640+GlutaMAX−I、0.05mM 2−メルカプトエタノール、10mM HEPESおよび5%v/v FCS)に注意深く再懸濁化し、試料をプールした。培地成分の2−メルカプトエタノール(#31350−010;50mM)、Hepes(#15630−056、1M)およびRPMI 1640(1×)+GlutaMAX−I(#61870−010)はGibcoから得た。FCS(#2−01F36−1)は、Amimedから得た。PBMCを、Countess(登録商標)自動セルカウンターを使用してカウントした(等量(10μl)のTrypan Blueの添加の前に、試料を培地に1:10で予備希釈した)。細胞を、4×106細胞/mlに希釈し、384ウェルプレート(#353962; Becton Dickinson AG)に播種して25μlの最終量を得た(即ち、1×105細胞/ウェル)。
化合物を、100%v/v DMSO(#41640−100mL;Sigma−Aldrich)中に予備希釈し、次いで培地に移した(0.25%の最終DMSO濃度を達成するため)。適切な化合物希釈(5μl)またはビヒクル対照(5μl)で、細胞を処理し、5%(v/v)CO2を含む空気中で、加湿したインキュベーター中で30分間、37℃でインキュベートした。細胞を、CpG2216(0.3μM;#tlrl−hodna;Invivogen)またはビヒクル対照(10μl/ウェル)で刺激し、20時間インキュベートした。プレートを、短時間遠心分離(22℃で200×g、2分間)し、IFNαレベルの定量のために、上清試料(30μl)を取り出した。
IFNアルファの定量化のために、PerkinElmer製のヒトインターフェロンAlphaLISAキット(#AL264F)を使用した。抗IFNαアクセプタービーズ(最終5μg/ml)およびビオチン化抗体抗IFNα(最終0.5nM)を含有する抗体ミックスを、新しく調製し、384ウェルOptiplate(商標)(#6007299;PerkinElmer)中に分注(5μl)する。既知のIFNα標準(ヒトIFNα B(2b))の希釈を調製し、細胞上清(5μl)と一緒に上記プレートに添加した。プレートを短時間遠心分離(200gにおけるパルス)し、接着性シーリングフィルムで覆い、ボルテックスし、暗所で、室温で1時間インキュベートした。ストレプトアビジン-コーティングしたドナービーズ(最終20μg/ml)を調製し、薄暗い場所(光に敏感なミックス)において各ウェル(5μl)に添加した。プレートを室温で30分インキュベートした(プレートを遠心分離または覆ってはならない)。インキュベーション後、装置自体の「AlphaScreen標準設定」(例えば、合計測定時間:550ms、レーザー 680nm励起時間:180ms、ミラー:D640 as、発光フィルター:M570w、中心波長570nm、帯域幅100nm、透過率75%)を使用するALPHAオプションを備えたEnVision(商標)マルチプレートリーダーで、プレートを読んだ。分析およびIFNαレベルの定量化のためにデータを集めた。
XLfitアドイン(IDBS;バージョン4.3.2)を備えたExcel XL fit 4.0(Microsoft)を使用してデータを分析した。特定のIFNα濃度を、ヒトIFNα B(2b)を使用する標準曲線への外挿に従って求めた。化合物の個別のIC50値は、実験データへの曲線の適合後の非線形回帰によって求めた。
簡潔に言えば、OFAラットに、d0にヒツジ赤血球をi.v.注射し、研究中の化合物で経口的に連続4日(d0からd3)処置した。d4に脾臓細胞懸濁液を調製し、指標細胞(SRBC)および補体の存在下でリンパ球を軟寒天上に蒔いた。SRBC特異抗体(主に、IgMサブクラス)の分泌による指標細胞の溶解、および補体の存在によって、プラークが生じた。プレート毎のプラークの数を計数し、脾臓毎のプラークの数として表した。
4日目に、CO2で動物を安楽死させた。脾臓を取り出し、秤量し、各ラットの脾臓について10mlの冷たい(4℃)ハンクス平衡塩類溶液(HBSS;Gibco、pH7.3、1mgのフェノールレッド/100mlを含有)を含有するプラスチックチューブ中に入れた。ガラス製ポッターで脾臓をホモジナイズし、氷上で5分間静置し、1mlの上清を、新しいチューブ中に移した。細胞を4mlのHBSS中で1回洗浄し、次いで、上清を廃棄し、ペレットを1mlのHBSSに再懸濁した。脾臓毎のリンパ球数を自動化細胞計数器によって決定し、脾臓細胞懸濁液を30×106個/mlの細胞濃度に調節した。
軟寒天ペトリ皿は、HBSS中の0.7%アガロース(SERVA)と共に調製した。
阻害%=C*100/V−100
式中、V=ビヒクル群についてのプラークの平均数/脾臓;C=化合物処置群についてのプラークの平均数/脾臓
酵素アッセイ
Claims (11)
- (1,1−ジオキソ−ヘキサヒドロ−1λ6−チオピラン−4−イル)−{(S)−3−[1−(6−メトキシ−5−メチル−ピリジン−3−イル)−2,3−ジヒドロ−1H−ピリド[3,4−b][1,4]オキサジン−7−イルオキシ]−ピロリジン−1−イル}−メタノンの無水結晶形態。
- 2シータ度+/−0.2度において得られる下記のピーク:9.1、10.2、11.9、13.0、17.1、17.7、18.7、20.3、20.8、26.0、26.7、23.2、24.1、24.8、29.3、27.4、および21.4を含むX線粉末回折パターンを特徴とする、請求項1に記載の無水結晶形態。
- 図1に示すX線粉末回折スペクトルと実質的に同じであるX線回折スペクトルを有する、請求項1に記載の無水結晶形態。
- 図2に示すものと実質的に同じである示差走査熱量測定グラフを有する、請求項1に記載の無水結晶形態。
- 医薬品として使用するための、請求項1から4のいずれか一項に記載の形態。
- 治療有効量の請求項1から4のいずれか一項に記載の形態、および1種または複数の治療活性剤を含む組合せ。
- PI3K酵素の活性、好ましくはPI3Kδイソ型の活性が媒介する疾患または障害の治療用の医薬の製造のための、請求項1から4のいずれか一項に記載の形態の使用。
- PI3K酵素の活性、好ましくはPI3Kδイソ型の活性が媒介する疾患または障害の治療における使用のための、請求項1から4のいずれか一項に記載の形態。
- 治療有効量の請求項1から4のいずれか一項に記載の形態、および1種または複数の薬学的に許容される担体を含む医薬組成物。
- 対象に治療有効量の請求項1から4のいずれか一項に記載の形態を投与するステップを含む、対象において、PI3K酵素、好ましくはPI3Kδイソ型の活性をモジュレートする方法。
- 対象において、PI3K酵素の活性、好ましくはPI3Kδイソ型の活性が媒介する障害または疾患の治療のための、請求項1から4のいずれか一項に記載の形態の使用。
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