JP2016075624A - 検量線作成方法及び装置、目的成分検量方法及び装置、並びに、電子機器 - Google Patents

検量線作成方法及び装置、目的成分検量方法及び装置、並びに、電子機器 Download PDF

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Abstract

【課題】従来技術では除去しきれない変動を低減して検量精度を向上させる技術を提供する。
【解決手段】検量線作成方法は、各サンプルの独立成分を含む独立成分行列を求める工程を含み、この工程において、観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理と、独立成分分析処理とをこの順に実行することによって独立成分行列を求める。また、第1前処理において、複数のサンプルについての観測データに同一のノイズを加算する。
【選択図】図3

Description

本発明は、被検体の観測データから、被検体についての目的成分の含有量を導くことに用いる検量線を作成する技術と、被検体についての目的成分の含有量を求める技術とに関する。
本願の発明者は、従来から、目的成分の検量線の作成、及び、検量線を用いた目的成分の検量のために、独立成分分析を用いることを提案してきている。例えば、特許文献1では、検量線の作成時に、成分が既知である複数のサンプルの観測データについて独立成分分析を行い、求めた独立成分の混合比と目的成分の既知の成分量との関係から、単回帰の検量線を決定する。そして、目的成分の検量の際には、成分量が未知の対象サンプルについての観測データに対して、検量線作成時に求めた独立成分と検量線とを用いて、目的成分の検量を行う。また、観測データの第1前処理として、零空間射影法(PNS)や標準正規変量変換(SNV)を適用することによって観測データの変動を除去し、精度良く検量を行う技術が記載されている。
特開2013−160574号公報
しかしながら、本願の発明者は、この先行技術の前処理では、除去しきれない変動があり、十分な精度が得られない場合があることを見出した。
本発明は、上述の課題の少なくとも一部を解決するためになされたものであり、以下の形態または適用例として実現することが可能である。
(1)本発明の第1の形態によれば、被検体の観測データから、前記被検体についての目的成分の含有量を導くことに用いる検量線を作成する検量線作成方法が提供される。この検量線作成方法は、各サンプルの独立成分を含む独立成分行列を求める工程を含み、この工程において、観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理と、独立成分分析処理とをこの順に実行することによって独立成分行列を求める。また、第1前処理において、複数のサンプルについての観測データに同一のノイズを加算する。
この方法によれば、複数のサンプルについての観測データに同一のノイズを加算することによって、ノイズを加算しない場合に比べて観測データに含まれる変動の影響を低減することができ、検量精度を高めることが可能である。
一実施形態において、検量線作成方法は、(a)コンピューターが、前記被検体の複数のサンプルについての前記観測データを取得する工程と;(b)前記コンピューターが、前記各サンプルについての前記目的成分の含有量を取得する工程と;(c)前記コンピューターが、前記サンプル毎の観測データを複数の独立成分に分離したときの複数の独立成分を推定し、前記複数の独立成分に基づいて、前記サンプル毎に前記目的成分に対応する混合係数を求める工程と;(d)前記コンピューターが、前記複数のサンプルの前記目的成分の含有量と、前記サンプル毎の前記混合係数とに基づいて、前記検量線の回帰式を求める工程と;を含む。前記工程(c)は、(i)前記コンピューターが、前記各サンプルの前記独立成分を含む独立成分行列を求める工程と;(ii)前記コンピューターが、前記独立成分行列から、前記各サンプルにおける前記独立成分毎の独立成分要素の比率を規定するベクトルの集合を示す推定混合行列を求める工程と;(iii)前記コンピューターが、前記推定混合行列に含まれる前記ベクトル毎に、前記複数のサンプルの前記目的成分の含有量に対する相関を求め、前記相関が最も高いと判定される前記ベクトルを、前記目的成分に対応する混合係数として選択する工程と;を含む。前記工程(i)において、前記コンピューターが、前記観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理と、独立成分分析処理とをこの順に実行することによって前記独立成分行列を求め、前記コンピューターが、前記第1前処理において、前記複数のサンプルについての前記観測データに同一のノイズを加算する。
この検量線作成方法によれば、被検体の複数のサンプルについて、各サンプルから取得した観測データと目的成分の含有量から、被検体の観測データから被検体に含まれる目的成分量を導くための検量線が作成される。このため、この検量線を用いれば、被検体の観測データが一つであっても、目的成分の含有量を精度良く求めることができる。したがって、この検量線作成方法によって予め検量線を作成しておけば、検量に際して、被検体について一の観測データを取得するだけで済む。この結果、実測値である一の観測データから目的成分量を高精度に求めることができる。また、推定混合行列が求められ、推定混合行列のうちでサンプルの目的成分の含有量に対する相関の強いベクトルが抜き出されるので、推定精度の高い混合係数を得ることができる。更に、第1前処理において複数のサンプルについての観測データに同一のノイズを加算するによって、検量精度を高めることが可能である。尚、上記工程(a)から(d)に記載されているコンピューターは1台の同一のコンピューターであっても構わないし、複数台の異なるコンピューターであっても構わない。即ち、複数台のコンピューターがデータを通信して各工程を行っても良い。以下本明細書でコンピューターが各工程を実行する際には、これと同様で、コンピューターは1台の同一のコンピューターであっても構わないし、複数台の異なるコンピューターであっても構わない。
(2)本発明の第2の形態によれば、被検体の観測データから、前記被検体についての目的成分の含有量を導くことに用いる検量線を作成する検量線作成装置が提供される。この検量線作成装置は、各サンプルの独立成分を含む独立成分行列を求める独立成分行列算出部を含む。この独立成分行列算出部は、観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理と、独立成分分析処理とをこの順に実行することによって独立成分行列を求める。また、第1前処理において、複数のサンプルについての観測データに同一のノイズを加算する。
この検量線作成装置によれば、複数のサンプルについての観測データに同一のノイズを加算することによって、ノイズを加算しない場合に比べて観測データに含まれる変動の影響を低減することができ、検量精度を高めることが可能である。
一実施形態において、検量線作成装置は、前記被検体の複数のサンプルについての前記観測データを取得するサンプル観測データ取得部と;前記各サンプルについての前記目的成分の含有量を取得するサンプル目的成分量取得部と;前記サンプル毎の観測データを複数の独立成分に分離したときの複数の独立成分を推定し、前記複数の独立成分に基づいて、前記サンプル毎に前記目的成分に対応する混合係数を求める混合係数推定部と;前記複数のサンプルの前記目的成分の含有量と、前記サンプル毎の前記混合係数とに基づいて、前記検量線の回帰式を求める回帰式算出部と;を含む。前記混合係数推定部は、前記各サンプルの前記各独立成分を含む独立成分行列を求める独立成分行列算出部と;前記独立成分行列から、前記各サンプルにおける前記独立成分毎の独立成分要素の比率を規定するベクトルの集合を示す推定混合行列を求める推定混合行列算出部と;前記推定混合行列に含まれる前記ベクトル毎に、前記複数のサンプルの前記目的成分の含有量に対する相関を求め、前記相関が最も高いと判定される前記ベクトルを、前記目的成分に対応する混合係数として選択する混合係数選択部と;を含む。前記独立成分行列算出部は、前記観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理と、独立成分分析処理とをこの順に実行することによって前記独立成分行列を求める。前記独立成分行列算出部は、前記第1前処理において、前記複数のサンプルについての前記観測データに同一のノイズを加算する。
この検量線作成装置によれば、被検体の複数のサンプルについて、各サンプルから取得した観測データと目的成分の含有量から、被検体の観測データから被検体に含まれる目的成分量を導くための検量線が作成される。このため、この検量線を用いれば、被検体の観測データが一つであっても、目的成分の含有量を精度良く求めることができる。したがって、この検量線作成方法によって予め検量線を作成しておけば、検量に際して、被検体について一の観測データを取得するだけで済む。この結果、実測値である一の観測データから目的成分量を高精度に求めることができる。また、推定混合行列が求められ、推定混合行列のうちでサンプルの目的成分の含有量に対する相関の強いベクトルが抜き出されるので、推定精度の高い混合係数を得ることができる。更に、第1前処理において複数のサンプルについての観測データに同一のノイズを加算するによって、検量精度を高めることが可能である。
(3)本発明の第3の形態によれば、被検体についての目的成分の含有量を求める目的成分検量方法が提供される。この目的成分検量方法は、被検体についての観測データと検量用データとに基づいて被検体についての目的成分に対する混合係数を求める工程を含み、この工程において、観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理とをこの順に実行し、第1前処理において、被検体についての観測データにノイズを加算する。
この目的成分検量方法によれば、被検体についての観測データにノイズを加算することによって、ノイズを加算しない場合に比べて観測データに含まれる変動の影響を低減することができ、検量精度を高めることが可能である。
一実施形態において、目的成分検量方法は、(a)コンピューターが、前記被検体についての観測データを取得する工程と;(b)前記コンピューターが、前記目的成分に対応する独立成分を少なくとも含む検量用データを取得する工程と;(c)前記コンピューターが、前記被検体についての観測データと前記検量用データとに基づいて、前記被検体についての前記目的成分に対する混合係数を求める工程と;(d)前記コンピューターが、予め用意した、前記目的成分に対応する混合係数と含有量との関係を示す回帰式の定数と、前記工程(c)で求められた混合係数に基づいて、前記目的成分の含有量を算出する工程と;を含む。前記工程(c)において、前記コンピューターが、前記観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理とをこの順に実行し、前記コンピューターが、前記第1前処理において、前記被検体についての前記観測データにノイズを加算する。
この目的成分検量方法によれば、被検体について一の観測データを取得するだけでも、被検体についての目的成分の含有量を高精度に求めることができる。また、被検体についての観測データにノイズを加算することによって、検量精度を高めることが可能である。
(4)本発明の第4の形態によれば、被検体についての目的成分の含有量を求める目的成分検量装置が提供される。この目的成分検量装置は、被検体についての目的成分に対する混合係数を求める混合係数算出部を含む。この混合係数算出部は、観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理とをこの順に実行するとともに、第1前処理において、被検体についての観測データにノイズを加算する。
この目的成分検量装置によれば、被検体についての観測データにノイズを加算することによって、ノイズを加算しない場合に比べて観測データに含まれる変動の影響を低減することができ、検量精度を高めることが可能である。
一実施形態において、目的成分検量装置は、前記被検体についての観測データを取得する被検体観測データ取得部と;前記目的成分に対応する独立成分を少なくとも含む検量用データを取得する検量用データ取得部と;前記被検体についての観測データと前記検量用データとに基づいて、前記被検体についての前記目的成分に対する混合係数を求める混合係数算出部と;予め用意した、前記目的成分に対応する混合係数と含有量との関係を示す回帰式の定数と、前記混合係数算出部によって求められた混合係数に基づいて、前記目的成分の含有量を算出する目的成分量算出部と;を含む。前記混合係数算出部は、前記観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理とをこの順に実行するとともに、前記第1前処理において、前記被検体についての前記観測データにノイズを加算する。
この目的成分検量装置によれば、被検体について一の観測データを取得するだけでも、被検体についての目的成分の含有量を高精度に求めることができる。また、被検体についての観測データにノイズを加算することによって、検量精度を高めることが可能である。
上記方法又は装置において、前記第1前処理において、前記ノイズの加算の後に、零空間射影法による処理と、前記正規化とをこの順に実行するものとしてもよい。この構成によれば、ノイズの加算と零空間射影法による処理との両方の効果よって、観測データに含まれる各種の変動の影響を有効に低減することができ、検量精度を高めることが可能である。
或いは、上記方法又は装置において、前記第1前処理において、零空間射影法による処理の後に、前記ノイズの加算と、前記正規化とをこの順に実行するものとしてもよい。この構成によっても、ノイズの加算と零空間射影法による処理との両方の効果よって、観測データに含まれる各種の変動の影響を有効に低減することができ、検量精度を高めることが可能である。
本発明は、上述した形態以外の種々の形態でも実現可能であり、例えば、上述した装置を含む電子機器や、上述した装置の各部の機能を実現するコンピュータープログラム、及び、コンピュータープログラムを格納する一時的でない記録媒体(non-transitory storage medium)等の形態等で実現することが可能である。
独立成分分析を利用した検量線作成処理の概要を示す説明図。 目的成分の検量処理の概要を示す説明図。 ノイズ加算を利用した独立成分分析の概要を示す説明図。 ノイズ加算の有無による検量精度を比較して示す説明図。 検量線作成処理のフローチャート。 検量線作成処理で使用されるコンピューターを示す説明図。 検量線作成処理で使用される装置の機能ブロック図。 独立成分行列算出部の内部構成の一例を示す機能ブロック図。 測定データセットDS1を模式的に示す説明図。 混合係数推定処理のフローチャート。 推定混合行列Aを説明する説明図。 回帰式の算出処理のフローチャート。 目的成分の検量処理に使用される装置の機能ブロック図。 目的成分の検量処理のフローチャート。
以下、本発明の実施の形態を以下の順序で説明する。
A.検量線作成処理及び検量処理の概要:
B.ノイズ加算を利用した検量方法:
C.検量線作成方法:
D.目的成分の検量方法:
E.各種のアルゴリズムとその影響:
F.変形例:
本実施形態では、以下の略語を使用する。
・ICA:独立成分分析(Independent Component Analysis)
・SNV:標準正規変量変換(Standard Normal Variate transformation)
・PNS:零空間射影法(Project on Null Space)
・PCA:主成分分析(Principal Components Analysis)
・FA:因子分析(Factor Analysis)
A.検量線作成処理及び検量処理の概要:
図1は、独立成分分析を利用した検量線作成処理及の概要を示す説明図である。図1(A)は、複数のサンプルについての観測データ(「測定データ」とも呼ぶ)の一例が示されている。この観測データは分光吸光度であり、例えば、グルコースなどの複数の化学成分を含むサンプルの分光測定によって得ることができる。検量線作成処理で使用する複数のサンプルとしては、目的成分(例えばグルコース)の含有量が既知であるサンプルを使用する。この代わりに、複数のサンプルに含まれる目的成分の含有量を、分析装置で測定してもよい。
検量線の作成の際には、まず、観測データに前処理を行うことによって、観測データに含まれる変動や雑音を低減する(図1(B))。前処理としては、例えば、観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理とが行われる。第1前処理では、観測データのさまざまな変動要因(サンプルの状態や測定環境の変化など)による影響を減少するために、零空間射影法を実行することが好ましい。次に、前処理後の観測データに対して独立成分分析処理を実行することによって、複数の独立成分IC1,IC2…(図1(C))が得られる。これらの独立成分IC1,IC2…は、各サンプルに含まれる個々の物質成分に対応するデータであり、互いに統計的に独立な成分である。各サンプルの観測データは、これらの独立成分IC1,IC2…の線形結合として再現可能である。図1(C)では、2つの独立成分IC1,IC2のみが例示されているが、独立成分の数は2以上の任意の数に適宜設定される。なお、実施形態の説明において、「目的成分」という用語は、サンプルに含まれる物質又は化学成分を意味しており、一方、「独立成分」という用語は、サンプルの観測データと同じデータ長を有するデータを意味する。
次に、図1(D)〜(F)に示すように、前処理後の観測データと、独立成分(例えばIC1)との内積を計算する。図1(D)の観測データは、図1(B)と同じものである。1つの観測データと、1つの独立成分IC1との内積を取ると、その観測データに関して1つの内積値が得られる。従って、複数の観測データに対して同じ独立成分IC1との内積を計算すると、複数のサンプルに関して同じ独立成分IC1に対する複数の内積値が得られる。図1(F)は、複数のサンプルに関する内積値Pを横軸にとり、複数のサンプルに含まれている目的成分の既知の含有量Cを縦軸に取ってプロットした図である。仮に、内積で使用した独立成分IC1が目的成分に対応する独立成分である場合には、図1(F)に示すように、内積値Pと、各サンプルの目的成分の含有量Cとが強い相関を有する。そこで、図1(C)で得られた複数の独立成分IC1,IC2…のうちで最も強い相関を示す独立成分を、目的成分に対応する独立成分として選択することができる。図1の例では、独立成分IC1が、検量の目的成分(例えばグルコース)に対応する独立成分である。検量線は、図1(F)のプロットの単回帰式C=uP+vで与えられる直線として表される。なお、内積値Pは、各サンプルにおける独立成分IC1の含有量に比例する値なので、「混合係数」とも呼ぶ。
図2は、検量線を用いた目的成分の検量処理の概要を示す説明図である。検量処理では、図1に示した検量線作成処理で得られた目的成分の独立成分IC1(図1(E))と、検量線(図1(F))とを利用して行われる。検量処理では、まず、目的成分の含有量が未知であるサンプルの観測データを取得する(図2(A))。次に、この観測データに前処理を行う(図2(B))。この前処理は、検量線の作成時に使用した前処理と同じ処理とすることが好ましい。そして、この前処理後の観測データと、独立成分IC1(図2(B))との内積を取ることによって、観測データに関する内積値Pを算出する。この内積値Pを、検量線に適用することによって、目的成分の含有量Cを決定することが可能である。なお、図1の検量線作成処理や図2の検量処理の詳細については、後に詳述する。
検量線の単回帰式は、例えば以下の式で表される。
Figure 2016075624
ここで、Cは目的成分の含有量、Pは内積値(混合係数)、u,vは定数である。
本実施形態では、以下に詳述するように、図1の前処理と図2の前処理の少なくとも一方において測定データ(観測データ)にノイズを付加することによって、測定データにおける各種の変動による影響を低減し、検量精度を向上させている。良く知られているように、独立成分分析は、測定データの統計的特徴を利用して分析を行う手法である。本願の発明者は、測定データにノイズを加算することによって、測定条件等に起因する測定データの変動の影響を低減できることを見出した。しかしながら、検量線作成処理において、複数の測定データのそれぞれにランダムノイズを単純に付加すると、不要な情報を付加してしまい、本来の測定データが持つ情報を減少させる可能性がある。そこで、1つの同一のノイズをすべての測定データに加えることによって、測定データが持つ情報に影響を与えること無く測定データの統計的性質を調整することができ、その結果として検量精度が向上するように工夫した。なお、独立成分分析は、データの独立性に基づいて処理を行うものであるため、ノイズ加算により測定データの形状が変化しても、統計量の情報が保存されているならば、ノイズ加算の影響を受けることなく処理を行うことができる。従って、ノイズ加算によって測定データの変動の影響を低減しつつ、検量精度を向上させることが可能である。
B.ノイズ加算を利用した検量方法:
図3は、ノイズ加算を利用した独立成分分析の概要を示す説明図である。図3(A)は、複数のサンプルに関する測定データ(観測データ)の一例を示している。ここでは、サンプルとして濃度の異なるグルコース水溶液を使用し、その赤外吸光スペクトルを測定して測定データを得た。図3(A)では複数の測定データが重なり合っているので、図3(A)中にその一部を拡大して示している。
図3(B)は、これら複数の測定データに加算するノイズの一例を示している。このノイズは、測定データと同じデータ長(波長域の区分数)を有するノイズである。このノイズは、正規分布に従うノイズでも良く、或いは、非正規分布に従うノイズでもよい。図3(B)の例では、コンピューターで発生させた正規乱数をノイズとして使用している。
図1に示した検量線作成処理においては、複数の測定データに同一のノイズを加算し、ノイズ加算後の測定データに対して、他の前処理と独立成分分析とを実行して、検量線の回帰式を作成する。この同一のノイズを「固定ノイズ」とも呼ぶ。
ノイズの加算は、例えば以下のように実行される。まず、乱数の発生機能を有するコンピュータープログラムや関数を利用して、平均μ(=0),分散σ(所定の設定値),データ長Nの正規分布にしたがうノイズベクトルZを生成する。ここで、Nは測定データのデータ長(波長域の区分数)である。「ノイズベクトルZ」という語句は、N個の要素を有する一次元データであることを意味している。なお、ノイズベクトルZの分散σの値は、サンプルの種類や測定データの波形に合わせて実験的に調整してもよい。この調整によって、検量精度をさらに向上させることが期待できる。
次に、このノイズベクトルZを利用して、固定ノイズ行列Nzを作成する。
Figure 2016075624
ここで、1は、n個の要素が全て1.0である列ベクトルであり、nは測定データの個数(すなわちサンプル数)である。従って、固定ノイズ行列Nzは、行ベクトルがすべて同一のノイズベクトルZであるn行N列の行列である。
次に、この固定ノイズ行列Nzを測定データ行列Xに加算して、ノイズ付きの測定データ行列X’を生成する。
Figure 2016075624
ここで、測定データ行列Xは、n個の測定データの個々の測定データを行ベクトルとするn行N列の行列である。後述する検量線作成手順においては、この測定データ行列X、又は、ノイズ付きの測定データ行列X’を、「スペクトルデータX」と呼んでいる。このノイズ付きの測定データ行列X’に対して、図1(A)〜(C)で説明した他の前処理や独立成分分析が行われる。
図3(C)は、図3(A)の複数の測定データに図3(B)の固定ノイズを共通に加えた後に、図1(A)〜(C)の手順に従って得られた複数の独立成分の例を示している。ここでは、グルコースと水とノイズの3つの独立成分が得られている。測定データの波長帯は1100〜1250nmとした。また、付加した固定ノイズは、平均μ=0,分散σ=0.05の正規乱数である。第1前処理としては、ノイズ加算の後に、後述する零空間射影法(PNS)による処理と、標準正規変量変換(SNV)とを行った。また、第2前処理として、後述する白色化を行った。そして、第1前処理及び第2前処理を行った測定データに対して独立成分分析(ICA)を実行した。図3(C)に示す3つの独立成分は、このような処理手順で得られたものである。
図2に示した検量処理においては、被検体の測定データにノイズを加算し、ノイズ加算後の測定データに対して他の前処理と内積処理(「混合係数算出処理」とも呼ぶ)とを実行して、目的成分を検量する。検量処理で使用するノイズは、測定データと同じデータ長Nを有するノイズである。このノイズは、正規分布に従うノイズでも良く、或いは、非正規分布に従うノイズでもよい。また、検量処理で使用するノイズとして、検量線作成処理で使用されたノイズと異なるものを利用しても良いが、検量線作成処理で使用されたノイズと同じ固定ノイズを利用することが好ましい。但し、検量線作成処理と検量処理の両方において、同じノイズ発生方法(例えば、平均値と分散がそれぞれ所定値に設定された正規乱数)で発生したノイズを利用すれば、同一のノイズを利用した場合に近い検量結果を得ることが可能である。但し、検量処理において、ノイズ加算を省略してもよい。
図4は、ノイズ加算の有無による検量精度を比較して示す説明図である。ここでは、3つのサンプルグループSG1〜SG3を使用した。3つのサンプルグループSG1〜SG3の各々は、異なる濃度に調整した約30個のグルコース水溶液のサンプルを含んでいる。検量に当たっては、検量線作成処理及び検量処理の両方において、図3(B)に示した固定ノイズを測定データに加算した。図4では、各サンプルグループについて、ノイズ加算が無い場合とノイズ加算がある場合の検量精度を比較して示している。ここで、検量精度を示す指標値としては、以下の2つを使用している。
・SEP:グルコース濃度の実測値(調整値)と検量値との間の予測標準偏差
・R:グルコース濃度の実測値(調整値)と検量値との間の相関係数Rの2乗
第1のサンプルグループSG1では、検量精度SEPはノイズ加算無しの場合に32.75mg/dLであったのに対して、ノイズ加算有りの場合には21.13mg/dLに向上した。また、相関係数Rも、0.9576から0.9814に改善された。第2のサンプルグループSG2では、検量精度SEPはノイズ加算無しの場合に22.01mg/dLであったのに対して、ノイズ加算有りの場合には14.14mg/dLに向上した。また、相関係数Rも、0.9799から0.9916に改善された。第3のサンプルグループSG3では、検量精度SEPはノイズ加算無しの場合に22.13mg/dLであったのに対して、ノイズ加算有りの場合には11.33mg/dLに向上した。また、相関係数Rも、0.9798から0.9946に改善された。
このように、前処理において測定データにノイズを加算することによって、検量精度が向上することを確認することができた。
C.検量線作成方法:
図5は、本発明の一実施形態としての検量線作成方法を示すフローチャートである。この検量線作成方法は、工程1から工程5までの5つの工程によって構成される。各工程1〜5はこの順に実行される。各工程1〜5について、順に説明する。
[工程1]
工程1は、準備工程であり、作業者により行なわれるものである。作業者は、目的成分の含有量が相違する同一種類の複数のサンプル(例えば、グルコース水溶液や人体)を用意(準備)する。本実施例ではn個(nは2以上の整数)のサンプルを使用する。
[工程2]
工程2は、スペクトルの測定工程であり、作業者により分光計測器を用いて行なわれるものである。作業者は、工程1で用意した複数のサンプルのそれぞれを分光計測器で撮影することにより、各サンプルについての分光反射率のスペクトルを測定する。分光計測器は、被計測体からの光を分光器に通し、分光器から出力されるスペクトルを撮像素子の撮像面で受けることにより、前記スペクトルを測定する周知の機器である。分光反射率のスペクトルと吸光度のスペクトルとの間には、次式で表される関係が成り立つ。
Figure 2016075624
測定された分光反射率のスペクトルは、式(4)を用いて吸光度スペクトルに変換される。吸光度に変換するのは、後述する独立成分分析において分析される混合信号には線形結合が成立する必要があり、ランベルト・ベールの法則から、吸光度について線形結合が成立するためである。したがって、工程2においては、分光反射率スペクトルの代わりに吸光度スペクトルを測定してもよい。測定結果としては、被計測体の波長に対する特性を示す吸光度分布のデータが出力される。この吸光度分布のデータは、スペクトルデータとも呼ぶ。
なお、分光反射率スペクトルや吸光度スペクトルを分光器で測定する代わりに、これらのスペクトルを他の測定値から推定するようにしてもよい。例えば、サンプルをマルチバンドカメラで測定し、得られたマルチバンド画像から分光反射率や吸光度スペクトルを推定するようにしてもよい。このような推定方法としては、例えば、特開2001−99710号公報に記載された方法などを利用することができる。
[工程3]
工程3は、目的成分の含有量の測定工程であり、作業者により行なわれるものである。作業者は、工程1で用意した複数のサンプルのそれぞれを化学分析して、各サンプルについての目的成分の含有量(例えばグルコース量)を測定する。工程1で準備したサンプルにおける目的成分の含有量が既知の場合には、この工程3は省略可能である。
[工程4]
工程4は、混合係数の推定工程であり、典型的にはコンピューターを用いて行なわれるものである。図6は、工程4および後述する工程5で用いられるコンピューター100とその周辺装置を示す説明図である。コンピューター100は、分光計測器200に電気的に接続されている。
コンピューター100は、コンピュータープログラムを実行することにより種々の処理や制御を行うCPU10と、データの退避場所であるメモリー20(記憶部)と、コンピュータープログラムやデータを保存するハードディスクドライブ30と、入力インターフェイス50と、出力インターフェイス60とを備えた周知な装置である。
図7は、工程4及び工程5で使用する装置の機能ブロック図である。この装置400は、サンプル観測データ取得部410と、サンプル目的成分量取得部420と、混合係数推定部430と、回帰式算出部440とを有する。混合係数推定部432は、独立成分行列算出部432、推定混合行列算出部434、および混合係数選択部436を含んでいる。なお、サンプル観測データ取得部410およびサンプル目的成分量取得部420は、例えば図6のCPU10が入力I/F50とメモリー20と協働して実現される。混合係数推定部430、独立成分行列算出部432、推定混合行列算出部434、および混合係数選択部436は、例えば図6のCPU10がメモリー20と協働して実現される。また、回帰式算出部440は、例えば図6のCPU10がメモリー20と協働して実現される。なお、これらの各部は、図6に示したコンピューター以外の他の具体的な装置やハードウェア回路によっても実現可能である。
図8は、独立成分行列算出部432の内部構成の一例を示す機能ブロック図である。独立成分行列算出部432は、第1前処理部450と、第2前処理部460と、独立成分分析処理部470とを有している。これらの3つの処理部450,460,470は、この順番に処理対象データ(本実施形態では吸光度スペクトル)を処理することによって、独立成分行列(後述)を求める。これらの各部の処理内容については後述する。
図6に示した分光計測器200は、工程2で使用されたものである。コンピューター100は、工程2で分光計測器200により測定された分光分布から得られた吸光度スペクトルを、スペクトルデータとして入力I/F50を介して取得する(図7のサンプル観測データ取得部410に対応)。また、コンピューター100は、工程3で測定された目的成分の含有量を、作業者によるキーボードの操作等によって取得する(図7のサンプル目的成分量取得部420に対応)。
上記のスペクトルデータと目的成分含有量の取得の結果、コンピューター100のハードディスクドライブ30には、スペクトルデータと目的成分含有量とを含むデータセット(以下、「測定データセット」と呼ぶ)DS1が保存される。
図9は、ハードディスクドライブ30に保存された測定データセットDS1を模式的に示す説明図である。図示するように、測定データセットDS1は、工程1で用意した複数のサンプルを識別するためのサンプル番号B1,B2,…,Bnと、各サンプルについての目的成分含有量C1,C2,…,Cnと、各サンプルについてスペクトルデータX1,X2,…,Xnとを含むデータ構造である。測定データセットDS1において、目的成分含有量C1,C2,…,CnおよびスペクトルデータX1,X2,…,Xnは、いずれのサンプルについてのものであるかが判るように、サンプル番号B1,B2,…,Bnと対応づけがなされている。
CPU10は、ハードディスクドライブ30に格納された所定のプログラムをメモリー20にロードし、そのプログラムを実行することで、工程4の作業である、混合係数を推定する処理を行う。ここで、前記所定のプログラムは、外部からインターネット等のネットワークを用いてダウンロードする構成とすることもできる。工程4において、CPU10は図7の混合係数推定部430として機能する。
図10は、CPU10で実行される混合係数推定処理を示すフローチャートである。処理が開始されると、CPU10は、まず、独立成分分析を行う(ステップS110)。
独立成分分析(Independent Component Analysis, ICA) は、多次元信号解析法の1つであり、独立な信号が重なり合った混合信号をいくつかの異なる条件で観測し、それを基に独立な原信号を分離する技術である。独立成分分析を用いれば、工程2により得られたスペクトルデータを、目的成分を始めとするm個の独立成分(未知)が混合されたものと捕らえることで、工程2により得られたスペクトルデータ(観測データ)から独立成分のスペクトルを推定することが可能となる。
本実施形態において、独立成分分析は、図8に示した3つの処理部450,460,470がこの順に処理を行うことによって実行される。第1前処理部450は、図3で説明したノイズ加算処理を実行するノイズ加算処理部451と、標準正規変量変換(SNV)452と、零空間射影法(PNS)454とを備えており、これらの一部又は全部を用いた前処理を実行することが可能である。SNV452は、処理対象データの平均値を減算し、その標準偏差で除算することによって、平均値が0で標準偏差が1である正規化されたデータを得る処理である。PNS454は、処理対象データに含まれるベースライン変動を取り除くための処理である。スペクトルの測定では、さまざまな要因により、測定データごとにデータの平均値が上下するなどのベースライン変動と呼ばれるデータ間のばらつきが発生する。そのため、独立成分分析処理を行う前に、この変動要因を取り除くことが好ましい。PNSは、任意のベースライン変動を取り除くことの出来る前処理として使用することが可能である。なお、PNSについては、例えば、Zeng-Ping Chen, Julian Morris, and Elaine Martin, “Extracting Chemical Information from Spectral Data with Multiplicative Light Scattering Effects by Optical Path-Length Estimation and Correction”, 2006に説明されている。
なお、図5の工程2で得られたスペクトルデータに対してSNV452を行う場合にはPNS454による処理を行う必要は無い。一方、PNS454による処理を行う場合には、その後に何らかの正規化処理(例えばSNV452)を行うことが好ましい。第1前処理部450が有する3つの処理部451,452,454による処理の順序は任意である。例えば、第1前処理の前の測定データに対して、先ずノイズ加算処理を実行した後に、PNSによる処理を行い、更に、SNVを実行するようにしても良い。或いは、先ずPNSによる処理を行った後に、ノイズ加算処理を実行し、更に、SNVを実行するようにしても良い。或いは、先ずPNSによる処理を行った後に、SNVを実行し、更に、ノイズ加算処理を実行するようにしても良い。これらのいずれも場合にも、ノイズ加算とPNSの両方の効果よって、観測データに含まれる各種の変動の影響を有効に低減することができ、検量精度を高めることが可能である。3つの処理部451,452,454の処理順序に関しては、測定データの種類(すなわちサンプルの種類)に応じて適宜実験的に選択することが可能である。なお、グルコースを含むサンプルに関しては、図3及び図4で説明したように、先ずノイズ加算処理を実行した後に、PNSによる処理を行い、更に、SNVを実行することによって、検量精度が大幅に向上することが確認できた。
なお、第1前処理として、ノイズ加算やSNVやPNS以外の処理を行うようにしても良い。第1前処理では何らかの正規化処理を行うことが好ましいが、正規化処理を省略してもよい。以下では、第1前処理部450を「正規化処理部」とも呼ぶ。これらの2つの処理452,454の内容については、更に後述する。なお、独立成分行列算出部432に与えられる処理対象データが正規化済みのデータである場合には、第1前処理を省略することも可能である。
第2前処理部460は、主成分分析(PCA)462と、因子分析(FA)464のうちのいずれか一方を用いた前処理を実行することが可能である。また、第2前処理として、PCAやFA以外の処理を用いるようにしても良い。以下では、第2前処理部460を「白色化処理部」とも呼ぶ。一般的なICAの手法では、第2前処理として、処理対象データの次元圧縮と、無相関化を行う。この第2前処理によって、ICAで求めるべき変換行列が直交変換行列に限定されるため、ICAの計算量を削減できる。このような第2前処理を「白色化」とよび、多くの場合にPCAが用いられる。しかし、PCAは、処理対象データにランダムノイズが含まれる場合、その影響を受けて結果に誤差が生じる場合がある。そこで、ランダムノイズの影響を低減するために、PCAの代わりに、ノイズに対するロバスト性を持つFAを用いて白色化を行うことが好ましい。図8の第2前処理部460は、PCAとFAのいずれか一方を選択して白色化を実行することが可能である。これらの2つの処理462,464の内容については、更に後述する。なお、白色化処理は省略しても良い。
独立成分分析処理部(ICA処理部)470は、第1前処理と第2前処理が行われたスペクトルデータに対して、ICAを実行することによって、独立成分のスペクトルを推定する。ICA処理部470は、独立性指標として尖度を用いる第1処理472と、独立性指標としてβダイバージェンスを用いる第2処理474のうちのいずれか一方を用いた分析を実行することが可能である。ICAは、一般に、独立成分の分離のための指標として、分離したデータ同士の独立性を表す高次統計量を独立性指標として用いる。尖度は、典型的な独立性指標である。しかし、処理対象データにスパイクノイズのような外れ値が入っている場合には、その外れ値も含めた統計量が独立性指標として計算されてしまう。このため、処理対象データについての本来の統計量と、算出された統計量との間に誤差が生じ、分離精度の低下を引き起こす場合がある。そこで、処理対象データ中の外れ値からの影響を低減するために、その影響を受けにくい独立性指標を使用することが好ましい。この様な特性を持つ独立性指標として、βダイバージェンスを使用可能である。尖度とβダイバージェンスの内容については、更に後述する。なお、ICAの独立性指標としては、尖度やβダイバージェンス以外の指標を利用するようにしても良い。
独立成分分析の典型的な処理内容について、次に詳しく説明する。m個の未知成分(ソース)のスペクトルS(以下、このスペクトルを単に「未知成分」と呼ぶこともある)が下記の式(5)のベクトルで与えられたとし、工程2により得られたn個のスペクトルデータXが下記の式(6)のベクトルで与えられたとする。なお、式(5)に含まれる各要素(S1、S2、・・・Sm)は、それぞれがベクトル(スペクトル)となっている。すなわち、例えば要素S1は式(7)のように表される。式(6)に含まれる要素(X1、X2、・・・、Xn)もベクトルであり、例えば要素Xは式(8)のように表される。要素Xの添え字のjはスペクトルを測定した波長帯の数である。なお、未知成分のスペクトルSの要素数mは、1以上の整数であり、サンプルの種類に応じて予め経験的又は実験的に決められている。
Figure 2016075624
Figure 2016075624
Figure 2016075624
Figure 2016075624
各未知成分は統計的に独立であるとする。これら未知成分SとこれらスペクトルデータXとの間に、次式の関係が成立する。
Figure 2016075624
式(9)におけるAは混合行列であり、次式(10)で示すこともできる。なお、ここでも“A”の文字は、式(10)に示すように太字で示す必要があるが、明細書の使用文字の制限からここでは普通文字で表す。以下、行列を表す他の太字について、同様に普通文字で表すものとする。
Figure 2016075624
混合行列Aに含まれる混合係数ai jは、未知成分Sj(j=1〜m)が、観測データであるスペクトルデータXi(i=1〜n)へ寄与する度合いを示す。
混合行列Aが既知の場合、未知成分Sの最小二乗解は、Aの擬似逆行列A+を用いてA+・Xと簡単に求めることができるが、本実施形態の場合、混合行列Aも未知なので、観測データXのみから、未知成分Sと混合行列Aを推定しなければならない。すなわち、次式(11)に示すように、観測データXのみから、m×nの分離行列Wを用いて、独立成分のスペクトルを示す行列(以下、「独立成分行列」と呼ぶ)Yを算出する。次式(11)における分離行列Wを求めるアルゴリズムとしては、Infomax、FastICA (Fast Independent Component Analysis)、JADE (Joint Approximate Diagonalization of Eigenmatrices) など種々のものを採用することが可能である。
Figure 2016075624
独立成分行列Yは未知成分Sの推定値に該当する。よって、下記の式(12)を得ることができ、式(12)を変形して下記の式(13)を得ることができる。
Figure 2016075624
Figure 2016075624
式(13)で得られる推定混合行列A(明細書の使用文字の制限からこのように表記しただけであり、実際は式(13)の左辺の符号付き文字を意味する。他の文字も同じ)は、次式で示すこともできる。
Figure 2016075624
図10のステップS110では、CPU10は、上述した分離行列Wを求める処理までを行う。詳しくは、工程2で得られハードディスクドライブ30に予め保存したサンプル毎のスペクトルデータXを入力として、この入力に基づいて、前述したInfomax、FastICA、JADE などのいずれかのアルゴリズムを用いて、分離行列Wを求める。なお、前述した図8に示すように、独立成分分析の前処理として、第1前処理部450による正規化処理と、第2前処理部460による白色化処理とを行うことが好ましい。
ステップS110の実行後、CPU10は、その分離行列Wと、工程2で得られハードディスクドライブ30に予め保存したサンプル毎のスペクトルデータXとに基づいて、独立成分行列Yを算出する処理を行う(ステップS120)。この算出処理は、前述した式(11)に従う演算を行うものである。ステップS110、S120の処理において、CPU10は図7の独立成分行列算出部432として機能する。
続いて、CPU10は、前記ハードディスクドライブ30に予め保存したサンプル毎のスペクトルデータXと、ステップS120で算出した独立成分行列Yとに基づいて、推定混合行列Aを算出する処理を行う(ステップS130)。この算出処理は、前述した式(13)に従う演算を行うものである。
図11は、推定混合行列Aを説明するための説明図である。この表TBは、縦方向に各サンプル番号B1,B2,…,Bnをとり、横方向に独立成分行列Yの各要素(以下、「独立成分要素」と呼ぶ)Y1,Y2,…,Ymをとったものである。サンプル番号Bi(i=1〜n)と独立成分要素Yj(j=1〜m)から定まる表TB中の要素は、推定混合行列Aの要素i j(式(14)参照)と同一である。この表TBからも、推定混合行列Aの要素i jは、サンプルのそれぞれにおける独立成分要素Y1,Y2,…,Ymの比率を表したものであることがわかる。図11に例示した目的成分順位kについては後述する。ステップS130の処理において、CPU10は図7の推定混合行列算出部434として機能する。
ステップS130までの処理によって、推定混合行列Aが得られる。すなわち、推定混合行列Aの要素(推定混合係数)i jが得られる。なお、推定混合係数i jは、図1の例では、図1(D)〜(F)で算出される内積値Pに相当する。その後、ステップS140に進む。
ステップS140では、CPU10は、工程3で測定された目的成分含有量C1,C2,…,Cnと、ステップS130で算出された推定混合行列Aに含まれる各列の成分(以下、混合係数ベクトルαと呼ぶ)との間の相関(類似性の度合い)を求める。詳しくは、目的成分含有有量C(C1,C2,…,Cn)と第1列目の混合係数ベクトルα11121,…,n1)との相関を求め、次いで、目的成分含有量C(C1,C2,…,Cn)と第2列目の混合係数ベクトルα21222,…,n2)との相関を求め、こうして順次各列について目的成分含有量Cに対する相関を求める。
上記相関の高さを示す指標としては、次式に従う相関係数Rを使用できる。この相関係数Rは、ピアソンの積率相関係数と呼ばれるものである。
Figure 2016075624
図10のステップS140の結果、独立成分(独立成分スペクトル)Yj毎の相関係数Rj(j=1,2,……,m)が得られる。その後、CPU10は、ステップSS140で得られた相関係数Rjの中から最も相関が高いもの、すなわち値が1に近いものを特定する。そして、最も高い相関係数Rが得られた列ベクトルαを、推定混合行列Aの中から選択する(ステップS150)。
ステップS150における選択は、図11の表TBでいえば、複数の列の中から一の列を選択することである。この選択された列の要素が、目的成分に対応する独立成分の混合係数である。前記選択の結果、混合係数ベクトルαk1k2k,…,nk)が得られる。ここで、kは1〜mのいずれかの整数をとる。なお、このkの値を、何番目の独立成分が目的成分に当たるかを示す目的成分順位としてメモリー20に一時的に保存してもよい。この混合係数ベクトルαkに含まれる要素1k2k,…,nkが「目的成分に対応する混合係数」に相当する。なお、図11の例では、目的成分順位k=2が、独立成分Yに対応する混合係数ベクトルα2=(1222,…,n2)を示している。なお、本明細書において、「順位」という語句は、「行列内の位置を示す値」という意味で使用されている。ステップS140、S150の処理において、CPU10は図7の推定係数選択部436として機能する。ステップS150の実行後、CPUは、この混合係数の算出処理を終える。この結果、工程4が完了し、その後、工程5に進む。
[工程5]
工程5は、回帰式の算出工程であり、工程4を実行した時と同じくコンピューター100を用いて行なわれるものである。工程5では、コンピューター100は、検量線の回帰式を算出する処理を実行する。なお、工程5は、工程4までのデータを別のコンピューターや装置に移して実行してもよい。
図12は、コンピューター100のCPU10で実行される回帰式の算出処理を示すフローチャートである。処理が開始されると、CPU10は、まず、工程3で測定された目的成分含有量C(C1,C2,…,Cn)と、ステップS150で選択された混合係数ベクトルαk1k2k,…,nk)とに基づいて、回帰式を算出する(ステップS210)。この回帰式は、次式(16)にて表すことができる。ステップS210では、式(16)における定数u,vが求められることになる。
Figure 2016075624
ここで、Cは目的成分含有量、Pは測定データと独立成分との内積値、u,vは定数である。
ステップS210の実行後、CPU10は、ステップS210で求められた回帰式の定数u,vと、ステップS150で決定された目的成分順位k(図11)に対応する独立成分Yとを、検量用データセットDS2としてハードディスクドライブ30に保存する(ステップS220)。その後、CPU10は、「リターン」に抜けて、この回帰式の算出処理を一旦終了する。この結果、検量線の回帰線を求めることができ、図5に示した検量線作成方法も終了する。ステップS210、S220の処理において、CPU10は図7の回帰式算出部440として機能する。
D.目的成分の検量方法:
目的成分の検量方法について、次に説明する。被検体は、検量線を作成したときに用いたサンプルと同じ成分で構成されるものとする。具体的には、目的成分の検量方法は、コンピューターを用いて行なわれるものである。なお、ここでのコンピューターは、検量線を作成する際に用いたコンピューター100であってもよいし、他のコンピューターであってもよい。
図13は、目的成分の検量を行う際に使用する装置の機能ブロック図である。この装置500は、被検体観測データ取得部510と、検量用データ取得部520と、混合係数算出部530と、目的成分量算出部540と、不揮発性記憶装置550とを有する。混合係数算出部530は、前処理部532を含んでいる。この前処理部532は、図8の第1前処理部450と第2前処理部460の両者の機能を有している。混合計算算出部530は、図2(A)〜(C)で説明した内積演算を行う機能を有しているので、「内積演算部」と呼ぶことも可能である。被検体観測データ取得部510は、例えば図6のCPU10が入力I/F50とメモリー20と協働して実現される。検量用データ取得部520は、例えば図6のCPU10がメモリー20とハードディスクドライブ30と協働して実現される。混合係数算出部530、および目的成分量算出部540は、例えば図6のCPU10がメモリー20と協働して実現される。不揮発性記憶装置550には、検量用データセットDS2(独立成分及び回帰式の定数u,v)が格納されている。なお、図13の装置は、図6のコンピューターとは異なる別の装置又は電子機器として実装してもよい。この場合に、図13の装置又はこれを備える電子機器は、分光計測器を有することが好ましい。
図14は、コンピューター100のCPU10で実行する目的成分検量処理を示すフローチャートである。この目的成分検量処理は、CPU10がハードディスクドライブ30に格納された所定のプログラムをメモリー20にロードし、そのプログラムを実行することで、実現される。まず、CPU10は、被検体を分光計測器で撮影する処理を行う(ステップS310)。ステップS310による撮影は工程2と同様にして行うことができ、この結果、被検体の吸光度スペクトルXpが得られる。検量処理で使用する分光計測器は、誤差を抑制するため検量線の作成に使用した分光計測器と同一機種であることが好ましい。誤差をさらに抑制するためには、同一の機体であることがより好ましい。なお、図5の工程2と同様に、分光反射率スペクトルや吸光度スペクトルを分光器で測定する代わりに、これらのスペクトルを他の測定値から推定するようにしてもよい。一の被検体を一回撮像した場合に得られる被検体の吸光度のスペクトルXpは、次式のようにベクトルで表される。
Figure 2016075624
ステップS310の処理において、CPU10は図13の被検体観測データ取得部510として機能する。次いで、CPU10は、ハードディスクドライブ30(図13の不揮発性記憶装置550)から検量用データセットDS2を取得し、メモリー20に格納する(ステップS320)。ステップS320の処理において、CPU10は図13の検量用データ取得部520として機能する。
ステップS320の実行後、ステップS310で得られた被検体の観測データ(吸光度スペクトルXp)に対して前処理を実行する(ステップS330)。この前処理としては、検量線の作成時に図5の工程4(より具体的には図10のステップS110)において使用された前処理(すなわち第1前処理部450による正規化処理及び第2前処理部460による白色化処理)と同じ処理を実行することが好ましい。
その後、CPU10は、検量用データセットDS2に含まれる独立成分とステップS330で得られた前処理済みのスペクトル(前処理済みの観測データ)との内積値Pを求める(ステップS340)。ステップS340の処理は、前述した図2(B),(C)の処理に相当する。なお、この内積値Pは、検量線の作成時において、図10のステップS130で算出した混合係数に相当する。従って、内積値Pを「混合係数」とも呼ぶ。
ステップS330,S340の処理において、CPU10は図13の混合係数算出部530として機能することになる。
続いて、CPU10は、ハードディスクドライブ30(図13の不揮発性記憶装置550)から検量用データセットDS2に含まれる回帰式の定数u,vを読み出し、この定数u,vとステップS340で得られた内積値Pとを前述した式(16)の右辺に代入することで、目的成分の含有量Cを求める(ステップS350)。この際、必要に応じて定数u,vを調整してもよい。含有量Cは、例えば、被検体の単位容積又は単位質量当たり(例えば、1dL当たり、又は、100グラム当たり)の目的成分の質量として求められる。ステップS350の処理において、CPU10は図13の目的成分量算出部540として機能することになる。その後、「リターン」に抜けて、この目的成分検量処理を終了する。
なお、本実施形態では、ステップS350によって求められた含有量Cを被検体の目的成分の含有量としていたが、これに替えて、ステップS350によって求められた含有量Cを、ステップS330による正規化で用いた正規化係数で補正して、この補正後の値を求めるべき含有量としてもよい。具体的には、含有量Cに標準偏差を乗算することによって、含有量の絶対値(グラム)を求めるようにしてもよい。この構成によれば、目的成分の種類によっては、含有量Cをより精度の高いものとすることが可能となる。
以上の検量方法によれば、被検体の実測値である一のスペクトルから目的成分の含有量を高精度に求めることができる。
E.各種のアルゴリズムとその影響:
以下では、図8に示した第1前処理部450と、第2前処理部460と、独立成分分析処理部470とにおいて利用される各種のアルゴリズムについて順次説明する。
E−1.第1前処理(SNV/PNSを利用した正規化処理):
第1前処理部450が行う第1前処理としては、ノイズ加算処理と、SNV(標準正規変量変換)とPNS(零空間射影法)を利用可能である。ノイズ加算処理の内容と効果については、図3及び図4に即して説明した。
SNVは、以下の式で与えられる。
Figure 2016075624
ここで、zは処理後のデータ、xは処理対象データ(本実施例では吸光度スペクトル)、xaveは処理対象データxの平均値、σは処理対象データxの標準偏差である。標準正規変量変換の結果、平均値が0で標準偏差が1である正規化されたデータzが得られる。
PNSを行うと、処理対象データに含まれるベースライン変動を低減することが可能である。処理対象データ(本実施形態では吸光度スペクトル)の測定では、さまざまな要因により、測定データごとにデータの平均値が上下するなどのベースライン変動と呼ばれるデータ間のばらつきが発生する。そのため、ICA(独立成分分析)を行う前に、この変動要因を取り除くことが好ましい。PNSは、処理対象データのベースライン変動を低減することのできる前処理として使用することが可能である。特に、赤外領域を含む吸収光スペクトル又は反射光スペクトルの測定データについては、このようなベースライン変動が多いので、PNSを適用する利点が大きい。以下では、測定で得られるデータ(単に「測定データx」とも呼ぶ)に含まれるベースライン変動を、PNSによって取り除く原理について説明する。また、典型的な例として、測定データが赤外領域を含む吸収光スペクトル又は反射光スペクトルである場合について説明を行う。但し、他の種類の測定データ(例えば音声データなど)についても同様にPNSを適用可能である。
一般に、理想系において、測定データx(処理対象データx)は、m個(mは2以上の整数)の独立成分s(i=1〜m)とそれぞれの混合比cを用いて、以下の式で表わされる。
Figure 2016075624
ここで、Aは混合比cで形成される行列(混合行列)である。
ICA(独立成分分析)においても、このモデルを前提として処理が実行される。しかし、実際の測定データには、さまざまな変動要因(試料の状態や測定環境の変化など)が存在している。そこで、それらを考慮したモデルとして、以下の式によって測定データxを表現するモデルが考えられる。
Figure 2016075624
ここで、bはスペクトルの振幅方向の変動量を表すパラメーター、aは定数ベースライン変動E(「平均値変動」とも呼ぶ)の量を表すパラメーター、b…bは波長に依存するg個(gは1以上の整数)の変動f(λ)〜f(λ)の量を表すパラメーターであり、εはそれ以外の変動成分である。また、定数ベースライン変動Eは、E={1,1,1,…1}T(右肩のTは転置を示す)で与えられ、そのデータ長が測定データxのデータ長N(波長域の区分数)と等しい定数ベクトルである。波長を表す変数λとしては、1からNまでのN個の整数が使用される。すなわち、この変数λは、測定データxのデータ長N(Nは2以上の整数)の序数に相当する。このとき、波長に依存する変動f(λ)…f(λ)は、f(λ)={f(1), f(2), …f(N)}T,…,f(λ)={f(1), f(2), …f(N)}Tで与えられる。これらの変動は、ICAや検量における誤差要因となるため、事前に取り除くことが望ましい。
関数f(λ)としては、λの値が1からNまでの範囲においてλの増加に応じて関数f(λ)の値が単調に増加する1変数関数を使用することが好ましい。零空間射影法において、指数αが整数であるλのべき乗関数λα以外の他の関数を使用することによって、測定データに含まれる変動をより低減することが可能である。
好ましい関数f(λ)の関数形とその個数gと決定する方法としては、実験的なトライアンドエラーを採用してもよく、或いは、既存のパラメーター推定アルゴリズム(例えばEM(期待値最大化法)アルゴリズム)を用いてもよい。
PNSでは、上述したそれぞれのベースライン変動成分E,f(λ)〜f(λ)からなる空間を考え、測定データxを、それら変動成分を含まない空間(零空間)に射影することで、ベースライン変動成分E,f(λ)〜f(λ)を低減したデータを得ることができる。具体的な演算として、PNSによる処理後のデータzは、以下の式で算出される。
Figure 2016075624
ここで、PはPの擬似逆行列である。kは、式(20)の構成成分sを、変動成分を含まない零空間に射影したものである。また、ε*は、式(20)の変動成分εを零空間に射影したものである。
なお、PNSの処理後に、正規化(例えばSNV)を行えば、式(20)におけるスペクトルの振幅方向の変動量bの影響も取り除くことができる。
このようなPNSによる前処理を行ったデータに対してICAを行うと、得られる独立成分は、式(21)の成分kの推定値となり、真の構成成分sとは異なるものとなる。しかし、混合比cは、元の式(20)における値から変化しないため、混合比cを使用した検量処理(図2,図14)には影響しない。このように、ICAの前処理としてPNSを実行すると、ICAによって真の構成成分sを得ることはできないので、通常は、ICAの前処理にPNSを適用するという発想は生じ得ない。一方、本実施形態では、PNSをICAの前処理として行っても検量処理には影響しないので、PNSを前処理として実行すれば、より精度良く検量を行うことが可能である。
なお、PNSの詳細については、例えば、Zeng-Ping Chen, Julian Morris, and Elaine Martin, “Extracting Chemical Information from Spectral Data with Multiplicative Light Scattering Effects by Optical Path-Length Estimation and Correction”, 2006に説明されている。
E−2.第2前処理(PCA/FAを利用した白色化処理):
第2前処理部460が行う第2前処理としては、PCA(主成分分析)とFA(因子分析)を利用可能である。
一般的なICAの手法では、前処理として、処理対象データの次元圧縮と、無相関化を行う。この前処理によって、ICAで求めるべき変換行列が直交変換行列に限定されるため、ICAの計算量を削減できる。このような前処理を「白色化」とよび、多くの場合にPCAが用いられる。PCAを用いた白色化については、例えばAapo Hyvarinen, Juha Karhumen, Erkki Oja, "Independent Comonent Analysis", 2001, John Wiley &Sons, Inc.(「独立成分分析」、2005年2月、東京電気大学出版部発行)の第6章に詳述されている。
しかしながら、PCAでは、処理対象データにランダムノイズが含まれる場合、そのランダムノイズの影響を受けて、処理結果に誤差が生じる場合がある。そこで、ランダムノイズの影響を低減するために、PCAの代わりに、ノイズに対するロバスト性を持つFA(因子分析)を用いて白色化を行うことが好ましい。以下では、FAによる白色化の原理を説明する。
前述したように、一般にICAでは、処理対象データxを、構成成分sの線形和として表す線形混合モデル(上記式(19))を仮定し、混合比cと構成成分sとを求める。しかし、実際のデータには、構成成分s以外のランダムノイズが付加されていることが多い。そこで、ランダムノイズを考慮したモデルとして、以下の式によって測定データxを表現するモデルが考えられる。
Figure 2016075624
ここで、ρはランダムノイズである。
そして、このノイズ混合モデルを考慮した白色化を行い、その後、ICAを行って混合行列Aと独立成分sの推定を得ることができる。
本実施形態のFAでは、独立成分sとランダムノイズρとがそれぞれ正規分布N(0,Im),N(0,Σ)に従うと仮定する。なお、一般に知られているように、正規分布N(x1,x2)の第1のパラメーターx1は期待値を示し、第2のパラメーターx2は標準偏差を示す。このとき、処理対象データxは、正規分布に従う変数の線形和となるので、処理対象データxもやはり正規分布に従う。ここで、処理対象データxの共分散行列をV[x]とすると、処理対象データxが従う正規分布はN(0,V[x])と表現できる。このとき、処理対象データxの共分散行列V[x]に関する尤度関数を、下記の手順で計算できる。
まず、独立成分sが互いに直交すると仮定すると、処理対象データxの共分散行列V[x]は以下の式で計算される。
Figure 2016075624
ここで、Σはノイズρの共分散行列である。
このように、共分散行列V[x]は、混合行列Aとノイズの共分散行列Σとで表すことができる。このとき、対数尤度関数L(A,Σ)は以下の式で与えられる。
Figure 2016075624
ここで、nはデータxのデータ個数、mは独立成分の個数であり、演算子trは行列のトレース(対角成分の和)を示し、演算子detは行列式を示す。また、Cはデータxから標本計算で求められる標本共分散行列であり、以下の式で計算される。
Figure 2016075624
上記式(24)の対数尤度関数L(A,Σ)を用いた最尤法により、混合行列Aとノイズの共分散行列Σとを求めることができる。この混合行列Aとしては、上記式(22)のランダムノイズρの影響がほとんど無いものが得られる。これがFAの基本的な原理である。なお、FAのアルゴリズムとしては、最尤法以外のアルゴリズムを利用した種々のアルゴリズムが存在する。本実施形態においても、このような各種のFAを利用可能である。
ところで、FAで得られる推定値は、あくまでAAの値であり、この値に適合する混合行列Aを決めた場合に、ランダムノイズの影響を低減しつつデータを無相関化することが可能だが、回転の自由度が残るために複数の構成成分sを一意に決めることができない。一方、ICAは、複数の構成成分sが互いに直交するように複数の構成成分sの回転の自由度を減らす処理である。そこで、本実施形態では、FAで求める混合行列Aの値を白色化行列(白色化済の行列)として用い、残された回転に対する任意性をICAにより特定する。これにより、ランダムノイズにロバストな白色化処理を行った後に、ICAを実行することにより、互いに直交する独立な構成成分sを決定することが可能である。また、このような処理の結果、ランダムノイズの影響を低減して、構成成分sに関する検量精度を向上させることができる。
E−3.ICA(独立性指標としての尖度及びβダイバージェンス):
ICA(独立成分分析)では、一般に、独立成分の分離のための指標として、分離したデータ同士の独立性を表す高次統計量を独立性指標として用いられる。尖度は、典型的な独立性指標である。独立性指標として尖度を用いたICAについては、例えばAapo Hyvarinen, Juha Karhumen, Erkki Oja, "Independent Comonent Analysis", 2001, John Wiley &Sons, Inc.(「独立成分分析」、2005年2月、東京電気大学出版部発行)の第8章に詳述されている。
しかし、処理対象データにスパイクノイズのような外れ値が入っている場合には、その外れ値も含めた統計量が独立性指標として計算されてしまう。このため、処理対象データについての本来の統計量と、算出された統計量との間に誤差が生じ、分離精度の低下を引き起こす場合がある。そこで、処理対象データ中の外れ値からの影響を受けにくい独立性指標を使用することが好ましい。この様な特性を持つ独立性指標として、βダイバージェンスを使用可能である。以下では、ICAにおける独立性指標としてのβダイバージェンスの原理を説明する。
前述したように、一般にICAでは、処理対象データxを、構成成分sの線形和として表す線形混合モデル(上記式(19))を仮定し、混合比cと構成成分sとを求める。ICAにより求められる構成成分sの推定値yは、分離行列Wを用いてy=W・yと表わされる。このとき分離行列Wは混合行列Aの逆行列であることが望まれる。
ここで、分離行列Wの推定値^Wの対数尤度関数L(^W)は、以下の式で表すことができる。
Figure 2016075624
ここで、積算記号Σの要素は、各データ点x(t)における対数尤度である。この対数尤度関数L(^W)を、ICAにおける独立性指標として用いることができる。βダイバージェンスの手法は、この対数尤度関数L(^W)に適当な関数を作用させることにより、データ中のスパイクノイズのような外れ値に対して、その影響を抑えるように対数尤度関数L(^W)を変換しようとする方法である。
βダイバージェンスを独立性指標として利用する場合には、まず、予め選択された関数Φβを用いて対数尤度関数L(^W)を以下の式で変換する。
Figure 2016075624
そして、この関数LΦ(^W)を新たな尤度関数と考える。
スパイクノイズのような外れ値の影響を小さくするための関数Φβとしては、対数尤度の値(関数Φβの括弧内の値)が小さくなるほど、関数Φβの値が指数関数的に減衰するような関数が考えられる。このような関数Φβとしては、例えば以下を使用することができる。
Figure 2016075624
この関数では、βの値が大きいほど、各データ点z(上述の式(27)では対数尤度)に対する関数値が小さくなる。このβの値は経験的に決定することができ、例えば約0.1に設定することが可能である。なお、この関数Φβとしては、式(28)のものに限らず、βの値が大きいほど各データ点zに対する関数値が小さくなるような他の関数を利用することも可能である。
このようなβダイバージェンスを独立性指標として使用すると、スパイクノイズのような外れ値の影響を適切に抑えることができる。上記式(27)のような尤度関数LΦ(^W)を考える場合に、この尤度の最大化に対応して最小化される確率分布間の擬似距離がβダイバージェンスである。このようなβダイバージェンスを独立性指標として使用したICAを実行すれば、スパイクノイズのような外れ値の影響を低減して、構成成分sに関する検量精度を向上させることができる。
なお、βダイバージェンスを用いたICAについては、例えば、Minami Mihoko, Shinto Eguchi, “Robust Blind Source Separation by β-Divergence”, 2002に説明されている。
F.変形例:
この発明は前記実施例やその変形例に限られるものではなく、その要旨を逸脱しない範囲において種々の態様において実施することが可能であり、例えば次のような変形も可能である。
・変形例1:
前記実施形態では、未知成分のスペクトルSの要素数mは予め経験的又は実験的に決められるとしたが、未知成分のスペクトルSの要素数mはMDL(Minimum Description Length)やAIC(Akaike Information Criteria)として知られる情報量基準などによって決定してもよい。MDLなどを用いる場合、未知成分のスペクトルSの要素数mはサンプルの観測データから演算によって自動的に決めることができる。なお、MDLについては、例えば”Independent component analysis for noisy data ? MEG data analysis, 2000”に説明されている。
・変形例2:
前記実施形態では、検量処理の対象となる被検体は、検量線を作成したときに用いたサンプルと同じ成分で構成されるとしたが、被検体に検量線を作成したときに用いたサンプルと同じ成分以外の未知成分が含まれる、としてもよい。独立成分同士の内積は0と仮定するため、未知成分に対応する独立成分とも内積0と考えられるためであり、内積で混合係数を求める場合には未知成分の影響は無視できる。
・変形例3:
前記実施形態において用いたコンピューターは、専用の装置として構成してもよい。例えば、ハードウェア回路のみで図7や図13に示した装置を実現してもよい。或いは、図7や図13に示した装置の機能の一部をハードウェア回路で実現し、他の一部をソフトウェアで実現してもよい。
・変形例4:
前記実施形態では、サンプルや被検体についての分光反射率のスペクトルの入力を、分光計測器により測定されたスペクトルを入力することで行っていたが、本発明はこれに限られない。例えば、波長帯域の相違する複数のバンド画像から分光スペクトルを推定し、この分光スペクトルを入力する構成としてもよい。前記バンド画像は、例えば、透過波長帯域を変更可能なフィルターを備えるマルチバンドカメラによってサンプルや被検体を撮影することで得られる。
なお、前述した各実施例および各変形例における構成要素の中の、独立請求項で記載された要素以外の要素は、付加的な要素であり、適宜省略可能である。
10…CPU
20…メモリー
30…ハードディスクドライブ
50…入力インターフェイス
60…出力インターフェイス
100…パーソナルコンピューター
200…分光計測器
400…検量線作成装置
410…サンプル観測データ取得部
420…サンプル目的成分量取得部
430…混合係数推定部
432…独立成分行列算出部
434…推定混合行列算出部
436…混合係数選択部
440…回帰式算出部
450…第1前処理部(正規化処理部)
451…ノイズ加算処理部
452…標準正規変量変換(SNV)
454…零空間射影法(PNS)
460…第2前処理部(白色化処理部)
462…主成分分析(PCN)
464…因子分析(FA)
470…独立成分分析処理部
472…第1処理
474…第2処理
500…検量装置
510…被検体観測データ取得部
520…検量用データ取得部
530…混合係数算出部(内積演算部)
532…前処理部
540…目的成分量算出部
550…不揮発性記憶装置

Claims (13)

  1. 被検体の観測データから、前記被検体についての目的成分の含有量を導くことに用いる検量線を作成する検量線作成方法であって、
    前記被検体の前記サンプル毎の観測データを複数の独立成分に分離したときの複数の独立成分を推定し、前記複数の独立成分に基づいて、前記サンプル毎に前記目的成分に対応する混合係数を求める工程、
    を含み、
    前記工程は、
    (i)前記各サンプルの前記独立成分を含む独立成分行列を求める工程と、
    (ii)前記独立成分行列から、前記各サンプルにおける前記独立成分毎の独立成分要素の比率を規定するベクトルの集合を示す推定混合行列を求める工程と、
    (iii前記推定混合行列に含まれる前記ベクトル毎に、前記複数のサンプルの前記目的成分の含有量に対する相関を求め、前記相関が最も高いと判定される前記ベクトルを、前記目的成分に対応する混合係数として選択する工程と、
    を含み、
    前記工程(i)において、前記観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理と、独立成分分析処理とをこの順に実行することによって前記独立成分行列を求め、
    前記第1前処理において、前記複数のサンプルについての前記観測データに同一のノイズを加算する、検量線作成方法。
  2. 請求項1記載の検量線作成方法であって、
    前記第1前処理において、前記ノイズの加算の後に、零空間射影法による処理と、前記正規化とをこの順に実行する、検量線作成方法。
  3. 請求項1記載の検量線作成方法であって、
    前記第1前処理において、零空間射影法による処理の後に、前記ノイズの加算と、前記正規化とをこの順に実行する、検量線作成方法。
  4. 被検体の観測データから、前記被検体についての目的成分の含有量を導くことに用いる検量線を作成する検量線作成装置であって、
    前記被検体の複数のサンプルについての前記観測データを取得するサンプル観測データ取得部と、
    前記各サンプルについての前記目的成分の含有量を取得するサンプル目的成分量取得部と、
    前記サンプル毎の観測データを複数の独立成分に分離したときの複数の独立成分を推定し、前記複数の独立成分に基づいて、前記サンプル毎に前記目的成分に対応する混合係数を求める混合係数推定部と、
    前記複数のサンプルの前記目的成分の含有量と、前記サンプル毎の前記混合係数とに基づいて、前記検量線の回帰式を求める回帰式算出部と、
    を含み、
    前記混合係数推定部は、
    前記各サンプルの前記各独立成分を含む独立成分行列を求める独立成分行列算出部と、
    前記独立成分行列から、前記各サンプルにおける前記独立成分毎の独立成分要素の比率を規定するベクトルの集合を示す推定混合行列を求める推定混合行列算出部と、
    前記推定混合行列に含まれる前記ベクトル毎に、前記複数のサンプルの前記目的成分の含有量に対する相関を求め、前記相関が最も高いと判定される前記ベクトルを、前記目的成分に対応する混合係数として選択する混合係数選択部と、
    を含み、
    前記独立成分行列算出部は、前記観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理と、独立成分分析処理とをこの順に実行することによって前記独立成分行列を求め、
    前記独立成分行列算出部は、前記第1前処理において、前記複数のサンプルについての前記観測データに同一のノイズを加算する、検量線作成装置。
  5. 請求項4記載の検量線作成装置であって、
    前記第1前処理において、前記ノイズの加算の後に、零空間射影法による処理と、前記正規化とをこの順に実行する、検量線作成装置。
  6. 請求項4記載の検量線作成装置であって、
    前記第1前処理において、零空間射影法による処理の後に、前記ノイズの加算と、前記正規化とをこの順に実行する、検量線作成装置。
  7. 被検体についての目的成分の含有量を求める目的成分検量方法であって、
    (a)前記被検体についての観測データを取得する工程と、
    (b)前記目的成分に対応する独立成分を少なくとも含む検量用データを取得する工程と、
    (c)前記被検体についての観測データと前記検量用データとに基づいて、前記被検体についての前記目的成分に対する混合係数を求める工程と、
    (d)予め用意した、前記目的成分に対応する混合係数と含有量との関係を示す回帰式の定数と、前記工程(c)で求められた混合係数に基づいて、前記目的成分の含有量を算出する工程と、
    を含み、
    前記工程(c)において、前記観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理とをこの順に実行し、
    前記第1前処理において、前記被検体についての前記観測データにノイズを加算する、目的成分検量方法。
  8. 請求項7記載の目的成分検量方法であって、
    前記第1前処理において、前記ノイズの加算の後に、零空間射影法による処理と、前記正規化とをこの順に実行する、目的成分検量方法。
  9. 請求項7記載の目的成分検量方法であって、
    前記第1前処理において、零空間射影法による処理の後に、前記ノイズの加算と、前記正規化とをこの順に実行する、目的成分検量方法。
  10. 被検体についての目的成分の含有量を求める目的成分検量装置であって、
    前記被検体についての観測データを取得する被検体観測データ取得部と、
    前記目的成分に対応する独立成分を少なくとも含む検量用データを取得する検量用データ取得部と、
    前記被検体についての観測データと前記検量用データとに基づいて、前記被検体についての前記目的成分に対する混合係数を求める混合係数算出部と、
    予め用意した、前記目的成分に対応する混合係数と含有量との関係を示す回帰式の定数と、前記混合係数算出部によって求められた混合係数に基づいて、前記目的成分の含有量を算出する目的成分量算出部と、
    を含み、
    前記混合係数算出部は、前記観測データの正規化を含む第1前処理と、白色化を含む第2前処理とをこの順に実行するとともに、前記第1前処理において、前記被検体についての前記観測データにノイズを加算する、目的成分検量装置。
  11. 請求項10記載の目的成分検量装置であって、
    前記第1前処理において、前記ノイズの加算の後に、零空間射影法による処理と、前記正規化とをこの順に実行する、目的成分検量装置。
  12. 請求項10記載の目的成分検量装置であって、
    前記第1前処理において、零空間射影法による処理の後に、前記ノイズの加算と、前記正規化とをこの順に実行する、目的成分検量装置。
  13. 請求項10〜12のいずれか一項に記載の目的成分検量装置を備える電子機器。
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