JP2015177745A - 肺癌の検査方法 - Google Patents
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Abstract
【解決手段】被験者の生物学的サンプルからDNAを回収すること、該DNAについてGFRA1、KCNJ3及びOSAPの3つの遺伝子のうち1つ以上の遺伝子のメチル化を測定し、メチル化陽性であるとき肺癌であると評価することを含む、肺癌のインビトロ検査方法、並びに、ICONプローブを用いたDNAメチル化測定方法。
【選択図】図1
Description
本発明はまた、上記7種の遺伝子のDNAメチル化の測定をICONプローブを用いて行う方法に関する。
本発明の別の目的は、上記のDNAメチル化マーカーについてメチル化の有無を測定する肺癌の検査方法を提供することである。
本発明のさらに別の目的は、血液中の癌由来の微量DNAのメチル化異常を検出可能とする新規のDNAメチル化測定方法を提供することである。
(2)p16、PENK、HOXA11及びSFRP2の4つの遺伝子のうち1つ以上の遺伝子のメチル化を測定することをさらに含む、上記(1)に記載の方法。
(3)生物学的サンプルが、喀痰、血液、胸水、尿、便又は肺組織である、上記(1)又は(2)に記載の方法。
(4)測定を、メチル化特異的PCR(MSP)法、パイロシークエンス法、定量的MSP法、デジタルPCRによるMSP法、バオサルファイトシークエンス法、次世代シークエンサーを用いたバイサルファイトシークエンス法又はICONプローブを用いたDNAメチル化測定法によって行う、上記(1)〜(3)のいずれかに記載の方法。
(5)肺癌が肺腺癌である、上記(1)〜(4)のいずれかに記載の方法。
(7)生物学的サンプルが血液であり、該血液からDNAを回収することを含む、上記(6)に記載の方法。
(8)DNAのメチル化を、デジタルPCRによるMSP法、次世代シークエンサーを用いたバイサルファイトシークエンス法又はICONプローブを用いたDNAメチル化測定法により行う、上記(6)又は(7)に記載の方法。
(10)蛍光IがFAM蛍光であり、蛍光IIがAlexa647蛍光である、上記(9)に記載の方法。
(11)癌が肺癌である、上記(10)に記載の方法。
(12)肺癌が肺腺癌である、上記(11)に記載の方法。
(13)上記(1)〜(8)のいずれかに記載の方法におけるDNAのメチル化の測定のために使用する、上記(9)〜(12)のいずれかに記載の方法。
本発明は、第1の態様において、肺癌のインビトロ検査方法を提供する。該方法は、被験者の生物学的サンプルからDNAを回収すること、該DNAについてGFRA1、KCNJ3及びOSAPの3つの遺伝子のうち1つ以上の遺伝子のメチル化を測定し、メチル化陽性であるとき肺癌であると評価することを含む。
CDKN2A/p16遺伝子:配列番号1〜3
GFRA1遺伝子:配列番号4〜6
HOXA11遺伝子:配列番号7〜9
OSAP遺伝子:配列番号10〜12
PENK遺伝子:配列番号13〜15
SFRP2遺伝子:配列番号16〜18
KCNJ3遺伝子:配列番号19〜21
CDKN2A/p16遺伝子:配列番号22及び23(メチル化特異的プラーマー)、配列番号25及び26(非メチル化特異的プライマー)
GFRA1遺伝子:配列番号28及び29(メチル化特異的プラーマー)、配列番号30及び31(非メチル化特異的プライマー)
HOXA11遺伝子:配列番号32及び33(メチル化特異的プラーマー)、配列番号34及び35(非メチル化特異的プライマー)
OSAP遺伝子:配列番号36及び37(メチル化特異的プラーマー)、配列番号39及び40(非メチル化特異的プライマー)
PENK遺伝子:配列番号42及び43(メチル化特異的プラーマー)、配列番号44及び45(非メチル化特異的プライマー)
SFRP2遺伝子:配列番号46及び47(メチル化特異的プラーマー)、配列番号49及び50(非メチル化特異的プライマー)
KCNJ3遺伝子:配列番号52及び53(メチル化特異的プラーマー)、配列番号54及び55(非メチル化特異的プライマー)
(次世代シークエンサーを用いたバイサルファイトシークエンス法の場合)
CDKN2A/p16遺伝子:配列番号56及び57
GFRA1遺伝子:配列番号58及び59
HOXA11遺伝子:配列番号60及び61
OSAP遺伝子:配列番号62及び63
PENK遺伝子:配列番号64及び65
SFRP2遺伝子:配列番号66及び67
KCNJ3遺伝子:配列番号68及び69
本発明はさらに、被験者の生物学的サンプルからのDNAを、該DNAの塩基配列中のメチル化シトシンに結合する蛍光I標識ICONプローブと、該DNAのメチル化部位と非メチル化部位との両方に結合する蛍光II標識コントロールプローブとを反応させる工程、並びに、各プローブ由来の蛍光の数を測定してメチル化レベルを決定する工程を含む、ICONプローブを用いたDNAメチル化測定方法を提供する。
上記の方法で使用可能なプローブを以下に例示する。これらのプローブのセットは、肺癌検査用キットとしても使用も可能である。
GFRA1遺伝子:配列番号72(ICONプローブ)、配列番号73(コントロールプローブ)
HOXA11遺伝子:配列番号74(ICONプローブ)、配列番号75(コントロールプローブ)
OSAP遺伝子:配列番号76(ICONプローブ)、配列番号77(コントロールプローブ)
PENK遺伝子:配列番号78(ICONプローブ)、配列番号79(コントロールプローブ)
SFRP2遺伝子:配列番号80(ICONプローブ)、配列番号81(コントロールプローブ)
KCNJ3遺伝子:配列番号82(ICONプローブ)、配列番号83(コントロールプローブ)
LINE1遺伝子:配列番号84(ICONプローブ)、配列番号85(コントロールプローブ)
本発明の方法は、被験者における肺癌、より好ましくは肺腺癌、の検査や、上記1節に記載の方法でのDNAメチル化検出などに使用できる。
<種々のDNAメチル化検出法による肺腺癌の検出>
[I]実験手順
(1)DNA抽出
腫瘍組織及び正常肺組織DNAについて、肺腺癌患者の手術検体から得られた腫瘍組織もしくは正常肺組織からDNAを抽出した。方法はフェノール/クロロホルムを用いた一般的手法である。
組織由来DNA及び血液由来DNAはキアゲン社のEpiTect Plus DNA Bisulfiteキットを用いてバイサルファイト変換を行った。DNAは500ngから2μgを使用し、最終25μlで溶出した。バイサルファイト変換を行ったうえでメチル化アッセイ(パイロシークエンス法、定量的メチル化PCR(qMSP)法、デジタルPCR法、次世代シークエンサーを用いたバイサルファイトシークエンス)を行った。
バイサルファイト変換後のサンプルをPCRで目的遺伝子領域を増幅する。PCRはPCRバッファー(Tris−HCl pH8.8 670mM,(NH4)2SO4 166mM, MgCl2 67mM, βメルカプトエタノール 100mM)、プライマー 05.pmol、MgCl2 3mM、dNTP 1.25mM、ポリメラーゼ(Takara rTaq)1Uを用いてPCRを行った。PCRは95℃ 30秒、アニーリング温度 30秒、72℃ 30秒で50サイクル行った。各遺伝子のアニーリング温度は、HOXA11 55℃, OSAP 57.5℃, SFRP2 56℃, GFRA1 52.5℃である。
Fwd: GGTTGTTTTYGGTTGGTGTTTT(配列番号1)
Rev: Biotin-ACCCTATCCCTCAAATCCTCTAAAA(配列番号2)
Sequence primer: TTTTTGTTTGGAAAGAT(配列番号3)
(GFRA1)
Fwd: GYGGGYGAGTTTAGGAGGGAGTT(配列番号4)
Rev: GGGACACCGCTGATCGTTTAAAAAAACCCTCRACCTACTCCTATT(配列番号5)
Sequence primer: TAGGAGGGAGTTGGAG(配列番号6)
(HOXA11)
Fwd: TTTTTTGTTAAGGATGGGGATAGA(配列番号7)
Rev: GGGACACCGCTGATCGTTTAAACCACCCTCATCAAAATCCATTAT(配列番号8)
Sequence primer: AGTGGAGAATTATGTTAAGT(配列番号9)
(OSAP)
Fwd: GGGACACCGCTGATCGTTTAGGAGGATGGTGAGGATTATAAAGG(配列番号10)
Rev: AACTACCCTTCCACAAAAAAACT(配列番号11)
Sequence primer: AAAAAAACTAAAAACCTAAC(配列番号12)
(PENK)
Fwd: GGAAAAGAGTYGGGTGTTTTAGG(配列番号13)
Rev: GGGACACCHCTGATCGTTTACCCRACCRACAACTTTTAAAT(配列番号14)
Sequence primer: GGGTGTTTTAGGTAGT(配列番号15)
(SFRP2)
Fwd: GGGACACCGCTGATCGTTTAGGTTTATTTT(配列番号16)
Rev: CCRAAATTCRAACTTATCCC(配列番号17)
Sequence primer: CCCRCTCTCTTCRCTAAATA(配列番号18)
(KCNJ3)
Fwd: GGGATTTTGGTTAAAAGATAGGA(配列番号19)
Rev: GGGACACCGCTGATCGTTTAAATCCCAACCCACCTACCAA(配列番号20)
Sequence primer: TTAAAAGATAGGAGATAGGT(配列番号21)
バイサルファイト変換後のサンプルをメチル化配列特異的プライマー、メチル化に関係ない領域のコントロールプライマーを用いてSYBR Green法でリアルタイムPCRを行った。SYBR Green PCR master mix、プライマー 05.pmolを用いてリアルタイムPCRを行い、サンプルと同時に0%メチル化および100%メチル化サンプルをコントロールとしてPCRを行い、サイクル数を比較することでメチル化率を計算した。
M-Fwd: TTGGTAGTTAGGAAGGTTGTATCGC(配列番号22)
M-Rev: TCCCTACTCCCAACCGCG(配列番号23)
M-probe(FAM): ACGTTTTTGTTGGTAGGCGG(配列番号24)
UM-Fwd: GGTAGTTAGGAAGGTTGTATTGT(配列番号25)
UM-Rev: TCCCTACTCCCAACCACA(配列番号26)
UM-probe(VIC): TATGTTTTTGTTGGTAGGTGG(配列番号27)
(GFRA1)
M-Fwd: TCGAGTCGAGGGTTTTGTTC(配列番号28)
M-Rev: CTCCTTCCCTTTCCGAACTC(配列番号29)
UM-Fwd: GGTGGGAATAGGAGTAGGTT(配列番号30)
UM-Rev: AATTTCCAAACAAAACCCTCAA(配列番号31)
(HOXA11)
M-Fwd: TTAAGGACGGGGATAGATTTTTAC(配列番号32)
M-Rev: CTCCGCGATAACCGAACTTA(配列番号33)
UM-Fwd: TTAAGGATGGGGATAGATTTTTAT(配列番号34)
UM-Rev: CCTTAAACTCTCCACAATAACCAAA(配列番号35)
(OSAP)
M-Fwd: GGATGAAGGTCGACGTGTTTTTTTC(配列番号36)
M-Rev: CAACGACAACGCCAAAATCT(配列番号37)
M-probe(FAM): TTCGGGCGGGGCGT(配列番号38)
UM-Fwd: GGGTTGGATGAAGGTTGATG(配列番号39)
UM-Rev: CCCTCAACAACAACACCAAAA(配列番号40)
UM-probe(VIC): TTTGGGTGGGGTGTTGT(配列番号41)
(PENK)
M-Fwd: AATTTTGTTTTGGGTCGCGGAC(配列番号42)
M-Rev: CTCGCGATTCCCGAAATAAC(配列番号43)
UM-Fwd: TTGTGGATGTTTAGGAAAAGAGTT(配列番号44)
UM-Rev: ACCCTCCCAACCAACAACTT(配列番号45)
(SFRP2)
M-Fwd: GTTTCGTTCGCGTTGTTTTTTC(配列番号46)
M-Rev: ACCCGCTCTCTTCGCTAAAT(配列番号47)
M-probe(FAM): TTTTTCGGGGTTTCGAGTCG(配列番号48)
UM-Fwd: TGTTTTGTTTGTGTTGTTTTTTT(配列番号49)
UM-Rev: CCCAAACCCACTCTCTTCAC(配列番号50)
UM-probe(VIC): TTTTGGGGTTTTGAGTTGTA(配列番号51)
(KCNJ3)
M-Fwd: GGTTTTTGGAGTTCGGAATTC(配列番号52)
M-Rev: CCCGCCCAAAAACATATCTA(配列番号53)
UM-Fwd: GGGGGTGTTGTATTAGTGTTTG(配列番号54)
UM-Rev:CCAACCCACCTACCAACTCA(配列番号55)
バイサルファイト変換後のサンプルをメチル化配列特異的プライマー(M)、非メチル化配列特異的プライマー(UM)を用いてTaq Man法を用いたドロップレットPCRを行う。反応後のドロップレットをQX100 Droplet Reader(BioRad)により蛍光をカウントしサンプル中のコピー数を算出する。Mプライマーでのカウント数とUMプライマーでのカウント数とを合わせて計算することにより、サンプルのメチル化率を算出した。
測定に使用したプライマーは、上記のqMSPと同じプライマーである。
バイサルファイト変換後のサンプルを用いてPCRを行い、目的遺伝子領域を増幅する。PCRバッファー(Tris−HCl pH8.8 670mM,(NH4)2SO4 166mM, MgCl2 67mM, βメルカプトエタノール 100mM)、プライマー 05.pmol、MgCl2 3mM、dNTP 1.25mM、ポリメラーゼ(Takara rTaq)1Uを用いてPCRを行った。PCRは95℃ 30秒、アニーリング温度 30秒、72℃ 30秒で50サイクル行った。アニーリング温度はHOXA11 57.5℃, OSAP 60℃, SFRP2 50℃, GFRA1 52.5℃, KCNJ3 57.5℃, PENK 57.5℃, p16 64℃から60℃に段階的に下げる、の各温度である。得られた産物はキアゲン社 QIA qick PCR purification キットにて精製した。精製産物はNew England BioLabs社のNEBnext DNA library Prep Master Mix Set for Illuminaを用いて次世代シークエンス用にライブラリーを作成した。次世代シークエンスはイルミナ社 MiSEQを用いて行った。
測定に使用したプライマーは、7種の遺伝子について以下のものを使用した。
Fwd: GTATYGYGGAGGAAGGAAA(配列番号56)
Rev: AACTCCTCCCCACCTACCC(配列番号57)
(GFRA1)
Fwd: GGYGAGTTTAGGAGGGAGTT(配列番号58)
Rev: CRTATTCCRAAACCAAATTTCT(配列番号59)
(HOXA11)
Fwd: TTTTGTTAAGGATGGGGATAGATT(配列番号60)
Rev: AACCACRCTCATCAAAATCC(配列番号61)
(OSAP)
Fwd: AGATGGGTTAGGGGAGGATG(配列番号62)
Rev: AAACRCAAACTACCCTTCCA(配列番号63)
(PENK)
Fwd: GGAAAAGAGTYGGGTGTTTTAGG(配列番号64)
Rev: CCCRACCRACAACTTTTAAAT(配列番号65)
(SFRP2)
Fwd: AAYGGTTTATTTTGTTTTTT(配列番号66)
Rev: RCCCGCTCTCTTCRCTAAAT(配列番号67)
(KCNJ3)
Fwd: GGYGGATAGGTTTTTGGAGT(配列番号68)
Rev: AATCTCCCRCCCCCTAAA(配列番号69)
肺腺癌と診断された41人の患者の臨床検体(肺癌組織及び正常肺組織)からDNAを抽出した後、制限酵素のイソシゾマー性質を利用したMCA(methylated CpG island amplification)法を用いて、メチル化しているDNA断片を増幅したうえで回収し、マイクロアレイ(アジレント社、G4497A)で解析した。高頻度でメチル化している遺伝子を選択し、別のメチル化検出法(パイロシークエンス法及び定量的MSP法)によってメチル化レベルの検証を行い、正常組織ではメチル化が検出されず、肺腺癌組織でのみDNAメチル化を示す7種の遺伝子、すなわちGFRA1、KCNJ3、OSAP、p16、PENK、HOXA11及びSFRP2遺伝子を最終的に選択した。7遺伝子のうち、p16、PENK、HOXA11及びSFRP2の4種の遺伝子はメチル化マーカーとして肺癌の検出において知られている(上記「背景技術」参照)が、GFRA1、KCNJ3、OSAPの3種の遺伝子については肺癌のメチル化マーカーとなりうることが今回初めて見出された。
上記の7遺伝子の配列情報については、以下のとおりGenBank等から入手可能である。
RefSeq: NM_000077
HGNC ID: 1787
GFRA1(GDNF family receptor alpha 1)
RefSeq: NM_145793
HGNC ID: 4243
HOXA11 (homeobox A11)
RefSeq: NM_005523
HGNC ID: 5101
OSAP (ovary-specific acidic protein) = MGARP(mitochondrial-localized glutamic acid-rich protein)
RefSeq: NM_032623
HGNC ID: 29969
PENK (proenkephalin)
RefSeq: NM_006211
HGNC ID: 8831
SFRP2 (secreted frizzled-related protein 2)
RefSeq: NM_003013
HGNC ID: 10777
KCNJ3 (potassium inwardly-rectifying channel, subfamily J, member3)
RefSeq: NM_002239
HGNC ID: 6264
上で選択された7種の遺伝子のメチル化マーカーについて、肺腺癌患者からの肺組織臨床サンプル(腫瘍組織95検体、正常組織45検体)を用いてDNAメチル化検出法にてメチル化の有無を測定した。メチル化されている場合陽性とし、メチル化されていない場合陰性とした。上記の7遺伝子、4遺伝子又は3遺伝子について、それぞれの遺伝子群のなかで何個の遺伝子がメチル化されているかを調べ、例えば1遺伝子以上の場合又は2遺伝子以上の場合を肺腺癌と判定すると仮定し、測定結果から感度、特異度、偽陽性、及び偽陰性を決定した。
特異度は、(真陰性の数)÷(真陰性の数+偽陽性の数)で表される。
偽陽性は、(真陽性の数)÷(真陽性の数+偽陽性の数)で表される。
偽陰性は、(真陰性の数)÷(真陰性の数+偽陰性の数)で表される。
結果を表1に示した。
感度74.7%、特異度91.1%、偽陽性8.9%、偽陰性25.3%であった。
結果を表2に示した。
感度47.4%、特異度100%、偽陽性0%、偽陰性52.6%であった。
結果を表3に示した。
感度89.5%、特異度88.9%、偽陽性11.1%、偽陰性10.5%であった。
結果を表4に示した。
感度69.5%、特異度100%、偽陽性0%、偽陰性30.5%であった。
結果を表5に示した。
感度90.5%、特異度82.2%、偽陽性17.8%、偽陰性9.5%であった。
結果を表6に示した。
感度80.0%、特異度97.8%、偽陽性2.2%、偽陰性20.0%であった。
結果を表7に示した。
感度80.0%、特異度97.8%、偽陽性2.2%、偽陰性20.0%であった。
<ICONプローブ反応を利用する高感度DNAメチル化測定>
ICONプローブはジーンデザイン社製のものを使用した。メチル化DNAに結合するメチル化プローブにはFAM(カルボキシフルオレセイン)蛍光(緑)を、コントロールプローブにはAlex647蛍光(赤)を付加している。ゲノムDNA500ngを95℃5分加熱し1本鎖にしたのち、バッファー(Potassium osmate 5mM, Potassium hexacyanoferrate 100mM, Tris−HCl pH7.7 50mM, EDTA 0.5mM, NaCl 1M)とプローブ0.002pmolとを加え0℃で15分反応させる。反応後はキアゲン社のQIA qick PCR purification キットを用いて精製し、最終30μlで溶出した。
Methyprobe: FAM-GTCCCTCAAATCCTCTGGAGGGACCGCBGTATCTTTCCAGGCAAGGGGAC(配列番号70)
UnMethyprobe: BGCGAGTGCTCGGAGGAGGTGCTATTAACTCCGAGCACTTAGCGAATGTG-Alexa647(配列番号71)
(GFRA1)
Methyprobe: FAM-CGGCCTGCTCCTGTTCCCGCCBCTCCGCAGCTCCAGCTCCCTCCTAAGCT(配列番号72)
UnMethyprobe: BTAGATGCGGTAATCTTCGAGAGCTCGAAGGGCCGAGTTGGGCCAGGACG-Alexa647(配列番号73)
(HOXA11)
Methyprobe: FAM-TGGGCTACCTTGGGCTCTCCBCAGTAGCCGAGCTTAACATGATTCTCCAC(配列番号74)
UnMethyprobe: BGCTGCCTCTTTGAAGCGGATCCGTGAAGTAGAAATTTGGAGACGTAAGC(配列番号75)
(OSAP)
Methyprobe: FAM-CTGAGAGCCTGGCAGCGCCCCBCCCGGAGGAGGCACGTCGACCTTCATCC(配列番号76)
UnMethyprobe: BGTCTTGGAGACCGCCCTGCGGAGATACATCGCGCCCGCTGTCCGCCGCG-Alexa647(配列番号77)
(PENK)
Methyprobe: FAM-CGGTTCCCGGGATGGCGCGGTCGCCCCCAACGCBAGGCTGCCTGGGGCAC(配列番号78)
UnMethyprobe: BGGGCAAGATTCCGGAGAGAACGCCGCAGACCAGGGGCGAGAGAGCGGGA-Alexa647(配列番号79)
(SFRP2)
Methyprobe: FAM-TCTCTTCGCTGGGTGCGACTCBGGGCCCCGAAAAGCTGGCAGCCGGCGGC(配列番号80)
UnMethyprobe: BTTGCTGCGCTTGTAGGAGAAGTCGGGCTGGCCAAAGAGGAAGAGCCCGC-Alexa647(配列番号81)
(KCNJ3)
Methyprobe: FAM- GGGACCGCTCCCCGCACCCCCBGCGCACCTGTCTCCTATCTTTTAGCCAA(配列番号82)
UnMethyprobe: BTTAATGAGTTGACAAGCGAGTCCCAACCCACCTGCCAACTCGCTGGCTG-Alexa647(配列番号83)
(LINE1)
Methyprobe: FAM- TTTTCAGACCGGCTTAAGAAACGGCGCACCACBAGACTATATCCCACACC(配列番号84)
UnMethyprobe: BGAGGGTCCTACGCCCACGGAATCTCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTG-Alexa647(配列番号85)
配列番号70〜85: プローブ
Claims (13)
- 被験者の生物学的サンプルからDNAを回収すること、該DNAについてGFRA1、KCNJ3及びOSAPの3つの遺伝子のうち1つ以上の遺伝子のメチル化を測定し、メチル化陽性であるとき肺癌であると評価することを含む、肺癌のインビトロ検査方法。
- p16、PENK、HOXA11及びSFRP2の4つの遺伝子のうち1つ以上の遺伝子のメチル化を測定することをさらに含む、請求項1に記載の方法。
- 生物学的サンプルが、喀痰、血液、胸水、尿、便又は肺組織である、請求項1又は2に記載の方法。
- 測定を、メチル化特異的PCR(MSP)法、パイロシークエンス法、定量的MSP法、デジタルPCRによるMSP法、バオサルファイトシークエンス法、次世代シークエンサーを用いたバイサルファイトシークエンス法又はICONプローブを用いたDNAメチル化測定法によって行う、請求項1〜3のいずれか1項に記載の方法。
- 肺癌が肺腺癌である、請求項1〜4のいずれか1項に記載の方法。
- GFRA1、KCNJ3及びOSAPの3つの遺伝子のうち1つ以上の遺伝子と、p16、PENK、HOXA11及びSFRP2の4つの遺伝子のうち1つ以上の遺伝子がともにメチル化陽性であるとき肺癌であると評価する、請求項2〜5のいずれか1項に記載の方法。
- 生物学的サンプルが血液であり、該血液からDNAを回収することを含む、請求項6に記載の方法。
- DNAのメチル化を、デジタルPCRによるMSP法、次世代シークエンサーを用いたバイサルファイトシークエンス法又はICONプローブを用いたDNAメチル化測定法により行う、請求項6又は7に記載の方法。
- 被験者の生物学的サンプルからのDNAを、該DNAの塩基配列中のメチル化シトシンに結合する蛍光I標識ICONプローブと、該DNAのメチル化部位と非メチル化部位との両方に結合する蛍光II標識コントロールプローブとを反応させる工程、並びに、各プローブ由来の蛍光の数を測定してメチル化レベルを決定する工程を含む、ICONプローブを用いたDNAメチル化測定方法。
- 蛍光IがFAM蛍光であり、蛍光IIがAlexa647蛍光である、請求項9に記載の方法。
- 癌が肺癌である、請求項10に記載の方法。
- 肺癌が肺腺癌である、請求項11に記載の方法。
- 請求項1〜8のいずれか1項に記載の方法におけるDNAのメチル化の測定のために使用する、請求項9〜12のいずれか1項に記載の方法。
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