JP2015070806A - 酵母における外来遺伝子の発現システム - Google Patents

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Abstract

【課題】正のフィードバックループを用いて外来遺伝子を酵母で発現させるのに際して、形質転換酵母集団において外来遺伝子を発現する酵母比率を向上させることができる発現システムを提供する。【解決手段】発現システムを、人工転写因子タンパク質のコード領域を発現可能であって、かつ当該人工転写因子タンパク質による正のフィードバックによって当該人工転写因子タンパク質自身を増幅可能な2以上の自己増幅カセットと、前記人工転写因子タンパク質との結合に基づいて外来遺伝子を発現可能な発現カセットと、を備えるようにする。この、システムにおいて、前記2以上の自己増幅カセットは、同一の前記人工転写因子タンパク質を増幅可能に構築する。【選択図】図1

Description

本明細書は、酵母における外来遺伝子の発現システムに関する。
酵母は、外来遺伝子を発現させるのに好適な宿主として汎用されている。外来遺伝子を酵母で大量発現させるのにあたり、外来遺伝子を多数個導入することや高発現プロモータの制御下で外来遺伝子を発現させることが行われている。
一方、酵母にあっては、外来遺伝子の発現制御の観点から、各種の新たな発現システムの構築も試みられている。ここに、ポジティブフィードバックループは、例えば、遺伝子発現のスイッチオン/オフのそれぞれについての安定状態(双安定状態)を形成できることが知られている。
正のフィードバックループを利用した発現回路がいくつか検討されている。例えば、外部からインデューサーを供給することにより、人工転写因子を活性化させ、活性化した人工転写因子が正のフィードバックにより自己触媒的に自らの発現を促進するようにした自己触媒的発現回路を備えることで細胞群における転写因子量を段階的な分布から二値化分布へと切替えできることが開示されている(非特許文献1)。また、ガラクトース誘導可能な人工転写因子の発現回路と、その人工転写因子によって発現されるレポータータンパク質により正のフィードバックによりレポータータンパク質の発現を促進するようにした自己調節的レポーター発現回路とを備えることで、ガラクトース誘導を除去後においても、ガラクトース誘導時におけるレポータータンパク質の発現レベルが維持される(メモリされる)ことが開示されている(非特許文献2)。
Becskei et al. The EMBO Journal 20, 2528-2535 (2001) Ajo-Franklin et al., Gene & Development 21, 2271-2276 (2007)
しかしながら、多コピー同時導入による場合、原理的には300箇所への同時導入が可能であるものの導入効率に限界があるとともに、発現レベルの最適化が困難であるという問題があった。また、選抜マーカーにも限界がある。さらに、高発現プロモーターを用いる場合には、低い糖濃度下では発現量が低下してしまうとともに、コピー数の増加によりプロモーターによる発現増大効果が低下するという問題があった。
そこで、本発明者らは、酵母において人工転写因子タンパク質の正のフィードバックループを用いて所望の外来遺伝子を発現させるのにあたり、発現量の増大や安定化に関し種々検討した。しかしながら、人工転写因子タンパク質によって活性化される所望の外来遺伝子の発現レベルも、人工転写因子タンパク質と同様に二値化してしまうことがわかった。すなわち、外来遺伝子の発現する酵母と発現しない酵母が出現してしまうことがわかった。本発明者らは、こうした外来遺伝子の発現状態の二値化によって、形質転換酵母の集団全体として意図したあるいは十分な外来遺伝子の発現量が得られていないこともわかった。
本明細書は、人工転写因子タンパク質の正のフィードバックループを用いて外来遺伝子を酵母で発現させるのに際して、形質転換酵母集団において外来遺伝子を発現する酵母比率を向上させることができる発現システムを提供する。
本発明者らは、人工転写因子タンパク質の正のフィードバックループを用いて外来遺伝子を発現させるように構築した形質転換酵母集団における、外来遺伝子の発現状態の二値化の改善について種々検討した。その結果、人工転写因子の正のフィードバックループを単独で備える場合において、形質転換酵母集団における外来遺伝子の発現レベルの二値化が顕著であるが、複数個の正のフィードバックループを備える場合においては、意外にも二値化が抑制されるという知見を得た。さらに、強力なプロモーターの制御下に人工転写因子の正のフィードバックループを備える正のフィードバックループを実現する人工転写因子の発現カセットを用いても、当該発現カセットを単独で用いる場合には二値化を抑制できないという知見も得た。本明細書の開示は、これらの知見に基づき、以下の手段を提供する。
(1)人工転写因子タンパク質のコード領域を発現可能であって、かつ当該人工転写因子タンパク質による正のフィードバックによって当該人工転写因子タンパク質自身を増幅可能な2以上の自己増幅カセットと、
前記人工転写因子タンパク質との結合に基づいて外来遺伝子を発現可能な発現カセットと、
を備え、
前記2以上の自己増幅カセットは、同一の前記人工転写因子タンパク質を増幅可能に構築されている、酵母における発現システム。
(2)前記2以上の自己増幅カセットは、それぞれ、前記人工転写因子タンパク質が結合可能な1又は2以上の人工転写因子タンパク質結合領域を備えるプロモーター領域の制御下にある前記人工転写因子タンパク質のコード領域と、ターミネーター領域と、を備えている、(1)に記載の発現システム。
(3)前記プロモーター領域は、1又は2の前記人工転写因子タンパク質結合領域を備える、(2)に記載の発現システム。
(4)前記ターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下の酵母遺伝子のターミネーター領域から選択される、(2)又は(3)に記載の発現システム。
(5)前記人工転写因子タンパク質は、酵母とは異種生物由来のDNA結合ドメインと、核局在化シグナルと、転写活性化ドメインと、を備え、
前記プロモーター領域は、1又は2の人工転写因子タンパク質結合領域と、酵母由来のTATAボックス領域と、を備え、
前記ターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1プロモーターに対する相対発現強度が1.0以下のターミネーター領域から選択される、(1)〜(4)のいずれかに記載の発現システム。
(6)前記発現カセットは、前記人工転写因子タンパク質が結合可能な1又は2以上の人工転写因タンパク質子結合領域を含むプロモーター領域の制御下にある前記外来遺伝子と、ターミネーター領域を備えている、(1)〜(5)のいずれかに記載の発現システム。
(7)前記酵母の集団において前記外来遺伝子を発現する酵母の比率が70%以上である、(1)〜(6)のいずれかに記載の発現システム。
(8)(1)〜(7)のいずれかに記載の発現システムを保持する酵母。
(9)外来遺伝子を発現させるための酵母の作製方法であって、
人工転写因子タンパク質のコード領域を発現可能であって、かつ当該人工転写因子タンパク質による正のフィードバックによって当該人工転写因子タンパク質自身を増幅可能な2以上の自己増幅カセットと、
前記人工転写因子タンパク質との結合に基づいて外来遺伝子を発現可能な発現カセットと、
を酵母に導入する工程、
を備え、
前記2以上の増幅コンストラクトは、同一の前記人工転写因子タンパク質を増幅可能に構築されており、各自己増幅カセットにおけるプロモーター領域は、前記人工転写因子タンパク質が結合可能な1個又は2個の人工転写因子タンパク質結合領域を備え、
各自己増幅カセットにおけるターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下の範囲の酵母遺伝子のターミネーター領域からなる群から選択されるターミネーター領域を備える、作製方法。
(10)酵母における外来遺伝子の発現レベルの制御方法であって、
人工転写因子タンパク質のコード領域を発現可能であって、かつ当該人工転写因子タンパク質による正のフィードバックによって当該人工転写因子タンパク質自身を増幅可能な2以上の自己増幅カセットと、
前記人工転写因子タンパク質との結合に基づいて外来遺伝子を発現可能な発現カセットと、
を準備する工程、
を備え、
前記2以上の増幅コンストラクトは、同一の前記人工転写因子タンパク質を増幅可能に構築されており、各自己増幅カセットにおけるプロモーター領域は、前記人工転写因子タンパク質が結合可能な1個又は2個の人工転写因子結合領域から選択し、
各自己増幅カセットにおけるターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下の範囲の酵母遺伝子ターミネーター領域からなる群から選択されるターミネーター領域から選択する、
制御方法。
(11)酵母における外来タンパク質の生産方法であって、
(8)に記載の酵母を培養して、前記外来遺伝子がコードする外来タンパク質を生産する工程、
を備える、生産方法。
(12)酵母における有用物質の生産方法であって、(8)に記載の酵母を培養する工程、
を備える、有用物質の生産方法。
本発現システムの概要を示す図である。 比較例の発現システムの概要を示す図である。 比較例の発現システムによる評価結果を示す図である。 実施例の発現システムの概要を示す図である。 実施例の発現システムによる評価結果を示す図である。 他の実施例の発現システムの概要を示す図である。 他の実施例の発現システムによる評価結果を示す図である。 人工的転写因子タンパク質(LNV1)のアミノ酸配列を示す図である。 LNV1動作確認用出力器の構造を示す図である。 LNV1の動作結果を示す図である。 LNV1を酵母で恒常的に発現させるコンストラクトの概要を示す図である。 LNV1による出力器の概要を示す図である。 出力器におけるLexA DNA結合ドメインの結合領域を1〜8個備えるDNAについて示す図である。 出力器における酵母のTDH3由来のTATAボックス領域及びCYC1由来のTATAボックス領域のDNAを示す図である。 標準技術としてのコントロールコンストラクトを示す図である。 高出力システムの評価結果を示す図である。丸印は、RPL41Bターミネーター領域、ダイヤ印は、SAG1ターミネーター領域及び四角印は、CYC1ターミネーター領域を示す。標準技術を1として規格化して表す。 段階的出力器の概要を示す図である。 段階的出力システムの評価結果を示す図である。丸印は、RPL41Bターミネーター領域、ダイヤ印は、SAG1ターミネーター領域及び四角印は、CYC1ターミネーター領域を示す(以上、TATAボックス領域は、TDH3由来)。三角印は、CYC1ターミネーター領域、バツ印は、MFA2ターミネーター領域、*印は、STD1ターミネーター領域及び+印は、GIC1ターミネーター領域を示す(以上、TATAボックス領域は、CYC1由来)。標準技術を0として規格化して表す。 2遺伝子発現でのタンパク質発現量制御用出力器の概要を示す図である。 2遺伝子同時発現での段階的出力器の評価結果を示す図である。 実施例で用いるターミネーター領域の評価のためのベクターの概略を示す図である。 ターミネーター領域の評価結果の概略を示す図である。 実施例で作製した評価用コンストラクトの概略を示す図である。 実施例で選定した上位30種のターミネーター領域を示す図である。 実施例で選定した上位30種のターミネーター領域を示す図である。
本明細書の開示は、酵母において外来遺伝子の発現システムに関する。本明細書に開示される発現システムによれば、自己増幅カセットを2以上備えることで、正のポジティブフィードバックループを利用した場合の酵母集団における発現レベルの二値化を抑制して、酵母集団において外来遺伝子を発現する酵母の比率を増大させ、また、その発現強度を均質化して、酵母集団としての発現量を増大させるとともに、発現強度を安定化させることができる。また、高い確率で外来遺伝子を発現する酵母を得ることができ、外来遺伝子発現比率の高い酵母集団を得ることができる。
本発現システムの一例を図1に示す。正のフィードバックループによる人工転写因子タンパク質の自己増幅カセットを2つ備えることで、結果として自己増幅系統が4系列形成されることになる。
従来、単独の自己増幅カセットを導入した場合、偶然性により一定の確率で人工転写因子タンパク質の自己増幅が行われていたと考えられる。今回、2つの自己増幅カセットの導入により、自己増幅系統が4系統となった結果、格段に偶然性が低下し、安定量の人工転写因子タンパク質が生産されて、人工転写因子タンパク質が発現カセットにおける外来遺伝子の発現を促進したものと考えられる。
すなわち、自己増幅カセットが2つ存在するため、偶発的に生じうる自己増幅カセットの発現の抑制等が生じたり、人工転写因子タンパク質の不足が生じたとしても、それを補うことができる。また、自己増幅カセットが2つ存在するため、発現カセットに対して、確実に人工転写因子タンパク質を作用させることができ、その結果、高い比率で外来遺伝子すべての細胞での発現が可能となっていると考えられる。
以上のことから、自己増幅カセットを2つ以上を備えることで、人工転写因子タンパク質の十分量の供給と発現カセットへの人工転写因子タンパク質の確実な作用を確保することができて、酵母集団において高い比率で外来遺伝子を発現させることができる。
以上の本発現システムの作用に関する解釈は、本明細書の開示を拘束するものではない。
また、本発現システムによれば、人工転写因子タンパク質を自己増幅させる自己増幅カセットのプロモーター領域の人工転写因子タンパク質結合領域数及びTATAボックス領域の種類並びにターミネーター領域の種類によって、自己増幅カセットにおける人工転写因子タンパク質の自己増幅レベルの制御を介して、発現カセット上の外来遺伝子を発現する酵母比率や発現強度を制御できる。この結果、酵母集団としての発現レベルを安定化し均質化し、意図した発現量を確実に制御することができる。特に、概して人工転写因子タンパク質の自己増幅レベルを低く設定することで、意外にも、外来遺伝子を発現する酵母比率を向上させ、酵母集団としての発現レベルを安定化し均質化させて発現量を確実に制御できる。
さらに、本発現システムは、人工転写因子タンパク質に基づく発現カセットとして、人工転写因子タンパク質が結合可能な1又は2以上の人工転写因タンパク質子結合領域を含むプロモーター領域の制御下にある前記外来遺伝子と、ターミネーター領域を備えることができる。この発現システムによれば、人工転写因子タンパク質結合領域数、ターミネーター領域の種類により、外来遺伝子を広いダイナミックレンジで段階的に発現させることができる。こうした発現カセットと自己増幅カセットとの組合せにより、自在に発現強度を制御した酵母において外来遺伝子を確実に発現させることができ、一層意図した発現量で外来遺伝子を発現させることができるようになる。
以下、本明細書の開示に関する各種実施形態について詳細に説明する。
本明細書において、外来遺伝子の発現システムとは、外来遺伝子の発現のための1又は2以上のコンストラクトの組合せ、当該組合せに対するさらに宿主との組合せ、1又は2以上のコンストラクトを宿主染色体上あるいは染色体外に保持する宿主を包含している。
本明細書において、酵母としては、特に限定しないで公知の各種酵母を利用できる。エタノール発酵等を考慮すると、サッカロマイセス・セレビジエ(Saccharomyces cerevisiae)等のサッカロマイセス属の酵母、シゾサッカロマイセス・ポンベ(Schizosaccharomyces pombe)等のシゾサッカロマイセス属の酵母、キャンディダ・シェハーテ(Candida shehatae)等のキャンディダ属の酵母、ピヒア・スティピティス(Pichia stipitis)等のピヒア属の酵母、ハンセヌラ(Hansenula)属の酵母、トリコスポロン(Trichosporon)属の酵母、ブレタノマイセス(Brettanomyces)属の酵母、パチソレン(Pachysolen)属の酵母、ヤマダジマ(Yamadazyma)属の酵母、クルイベロマイセス・マーキシアヌス(Kluyveromyces marxianus)、クルイベロマイセス・ラクティス(Kluveromyces lactis)等のクルイベロマイセス属の酵母が挙げられる。なかでも、工業的利用性等の観点からサッカロマイセス属酵母が好ましい。なかでも、サッカロマイセス・セレビジエが好ましい。
本明細書において外来遺伝子とは、用いる酵母において外部から導入された遺伝子であれば、本来的に当該酵母に内在する遺伝子であっても外来遺伝子に相当する。また、外来遺伝子は、酵母内で発現させるものであってもよいし、酵母外に分泌発現させるものであってもよい。必要に応じて産生形態が選択される。分泌発現の場合にあっては、必要な遺伝子の修飾を公知の方法によって行えばよい。
発現対象となる外来遺伝子の種類も特定しないで所望の遺伝子とすることができる。例えば、セルロースを分解して、その分解物をそのまま酵母が利用して発酵する場合においては、セロビオヒドロラーゼ、エンドグルカナーゼ等の各種セルラーゼの遺伝子、ヘミセルロースを分解するヘミセルラーゼの遺伝子とすることができる。さらに、セルロースの分解産物を利用するのに適したβ−グルコシダーゼやキシロースイソメラーゼ等の酵素とすることもできる。さらに、酵母による発酵により工業原料等となりうる有用物質を生産するための酵素とすることもできる。さらに、こうしたセルラーゼ等を提示するために酵母表面に提示するスキャホールディンタンパク質とすることもできる。例えば、スキャホールディンタンパク質としては、各種セルロソーム生産微生物のスキャホールディンタンパク質が公知である。
(酵母における外来遺伝子の発現システム)
本明細書に開示される外来遺伝子の発現システムは、人工転写因子タンパク質(以下、単に、人工転写因子という。)を自己増幅可能な自己増幅カセットと、外来遺伝子を発現可能な発現カセットと、を備えることができる。
(自己増幅カセット)
自己増幅カセットは、人工転写因子のコード領域(人工転写因子遺伝子)を発現可能であって、かつ当該人工転写因子による正のフィードバックによって当該人工転写因子自身を増幅可能に構成されている。このため、自己増幅カセットは、人工転写因子のコード領域のほか、人工転写因子結合領域と、TATAボックス領域と、を含むプロモーター領域と、ターミネーター領域とを備えている。
自己増幅カセットは、酵母染色体上にあるか、あるいは酵母染色体に対して組換え可能に備えられていることが好ましい。また、核内に存在するように構築されていてもよい。自己増幅カセットが、酵母染色体に組換え可能な場合には、組換え部位を特定して相同組換え可能な領域をカセットの要素とともに備えている。
(人工転写因子のコード領域)
人工転写因子は、特定のDNA領域に結合して、当該DNA領域の下流側にある人工転写因子などの外来遺伝子の転写を制御することができる。人工転写因子は、自己増幅カセット及び発現カセットに作用して、発現カセットが保持する外来遺伝子の転写、翻訳を制御(促進)する。
人工転写因子は、例えば、転写の開始又は転写の伸長を促進するように作用して、結果として転写を促進する方向に制御しうるタンパク質であることが好ましい。人工転写因子は、DNA結合ドメインと、核局在化シグナルと、転写活性化ドメインと、を含むことができる。これらの配列順序は特に問わないで、適宜設定することができる。例えば、N末端側から、DNA結合ドメイン、核局在化シグナル及び転写活性化ドメインを備えることが好ましい。こうした配列順序でこれらの要素を備えることで、高い発現量調節能を発揮することができる。
人工転写因子は、DNA結合ドメイン、核局在化シグナル及び転写活性化ドメインを人工的に融合させた人工的な融合タンパク質であることが好ましい。こうした人工タンパク質を酵母内で発現させて、転写因子として機能させることで、酵母内におけるタンパク質合成の制御の影響を回避又は抑制し、所望の遺伝子の発現制御が可能となる。融合タンパク質の合成は、当業者において周知である。
(DNA結合ドメイン)
DNA結合ドメインは、人工転写因子のコード領域の上流側にある結合領域に結合するためのドメインである。DNA結合ドメインとしては、各種知られている。人工転写因子に用いるDNA結合ドメインとしては、どの生物種由来であってもよいが、好ましくは酵母以外の生物に由来することが好ましい。酵母における発現制御を受けにくく、また、酵母本来の発現制御に影響を及ぼしにくいと考えられるからである。酵母以外の生物としては、真核生物(動物、植物、微生物を包含している)、原核微生物、ウイルス、レトロウイルス等が挙げられる。
DNA結合ドメインとしては、例えば、ホメオドメイン、ジンクフィンガー、塩基性ループヘリックスループヘリックス、塩基性ロイシンジッパー等の各種形態のDNA結合ドメインが挙げられる。典型的には、制限酵素、核ホルモンレセプター、転写因子等に由来するDNA結合ドメインが挙げられる。より具体的には、Tetリプレッサー、LexA、LacR、各種ホルモンレセプター等が挙げられる。典型的には、大腸菌由来のLexA DNA結合ドメイン(1-87、Brent et al., Nature 612,312 (1984))又はZif268 DNA結合ドメイン(1-90、Pavletich, N. P. & Pabo, C. O. Science 252, 809-817 (1991))が挙げられる。DNA結合ドメインのアミノ酸配列は、天然に存在するものであってもよいし、天然由来のアミノ酸配列を人工的に改変されたものなど非天然であってもよい。
(核局在化シグナル)
核局在化シグナルは、細胞質から核内に輸送されるためのシグナルとして機能するアミノ酸配列を意味している。核移行シグナルとも称される。核局在化シグナルとしては、核タンパク質の一次構造上に存在している。核局在化シグナルは、典型的には、塩基性アミノ酸を多く含む数個のアミノ酸がクラスターをなすものや、2〜3個の塩基性アミノ酸が十数個の所望のアミノ酸を挟んで存在している。
人工転写因子に用いる各局在化シグナルとしては、公知のシグナル配列から適宜選択することができる。例えば、SV40ウイルス由来の核局在化シグナル(NLS、Dingwall et al., TIBS 16,478 (1991))が挙げられる。
(転写活性化ドメイン)
転写活性化ドメインは、公知の転写活性化ドメインを用いることができる。例えば、VP16などのヒトヘルペスウイルス由来転写活性化ドメイン(VP16、Trienzenberg et al., Genes Developm. 2, 718 (1988))遺伝子(403-479)が挙げられる。
人工転写因子におけるこれらの要素は、互いに適数個のアミノ酸で連結されていてもよい。例えば、1個〜十数個程度、好ましくは、1個から10個程度のアミノ酸、より好ましくは1個〜5個で連結されている。連結に用いるアミノ酸としては、アラニン、グリシンなど立体障害性の小さいアミノ酸残基等を適宜用いることができる。
人工転写因子として、例えば、LexA DNA結合ドメインとSV40ウイルス由来の核局在化シグナルとヒトヘルペスウイルス由来転写活性化ドメインとを組み合わせたタンパク質として、配列番号15890で表されるアミノ酸配列を有するタンパク質(塩基配列:配列番号15891)が挙げられる。また、例えば、Zif268DNA結合ドメインとSV40ウイルス由来の核局在化シグナルとヒトヘルペスウイルス由来転写活性化ドメインとを組み合わせたタンパク質として配列番号15892で表されるアミノ酸配列(塩基配列:配列番号15893)を有するタンパク質が挙げられる。
人工転写因子領域は、こうした人工転写因子のアミノ酸配列をコードする塩基配列を有するDNAを備えている。
(プロモーター領域)
自己増幅カセットは、人工転写因子結合領域とTATAボックス領域とを含むプロモーター領域を備えることができる。
(人工転写因子結合領域)
自己増幅カセットは、人工転写因子のコード領域の上流側に、1個又は2個以上の人工転写因子結合領域を備えることができる。人工転写因子結合領域は、人工転写因子のDNA結合ドメインが結合する領域である。
人工転写因子結合領域のDNA配列は、自己増幅カセットの起動剤でもある人工転写因子が備えるDNA結合ドメインに応じて決定される。公知のDNA結合ドメイン及び公知のDNA結合ドメインを改変して得た改変体が結合するDNA配列は、公知である。人工転写因子結合領域は、こうしたDNA配列に基づいて決定される。例えば、大腸菌由来のLexA DNA結合ドメインが結合する結合領域は、配列番号15894で表される塩基配列であり、マウス転写因子由来のジンクフィンガーDNA結合ドメインZif268が結合する結合領域は、配列番号15895で表される塩基配列である。転写因子結合領域は、天然の塩基配列のほか、これらを改変したものであってもよい。
人工転写因子結合領域は、人工転写因子の外来遺伝子を発現する酵母比率や外来遺伝子の発現強度に関連する要素である。人工転写因子の個数を調整することで外来遺伝子を発現する酵母比率や発現強度を制御できる。また、ターミネーター領域による発現強度との組合せでダイナミックレンジを大きく取れるため、外来遺伝子酵母比率や発現強度を最適化することができる。
人工転写因子結合領域は、1個でもよいが、2個以上備えられていてもよい。人工転写因子結合領域の個数は、人工転写因子やターミネーター領域の種類等にもよるが、人工転写因子結合領域の個数と外来遺伝子を発現する酵母比率等との関係を考慮して適宜決定できる。人工転写因子結合領域は、1個又は2個とすると概して良好な外来遺伝子発現酵母比率と発現強度を得ることができる。
自己増幅カセットは同一の人工転写因子について2以上備えられるが、人工転写因子結合領域の個数について、2以上の自己増幅カセットにおいて同一であってもよいし、異なっていてもよい。
(TATAボックス領域)
自己増幅カセットは、人工転写因子結合領域の下流側に、TATAボックス領域を備えることができる。TATAボックス領域は、真核生物においてRNAポリメラーゼIIによる転写開始位置の上流25塩基対の位置あるいはさらに上流に位置する配列である。TATAボックスの一般的な共通配列としては、5’−TATA A/T A A/T G−3’等が挙げられるが、これに限定されるものではない。本明細書においてTATAボックス領域とは、一般的に特定されるTATAボックスを少なくとも含み、当該TATAボックスよりも上流側領域及び/又は当該TATAボックスの下流側領域(例えば、TATAボックス以降の転写開始位置に至るまでの塩基配列の少なくとも一部)を含む領域を意味するものとする。TATAボックスは、通常TATAボックスを含んで開始コドン直前までの間の150bp〜350bp、200bp〜300bp程度の領域を適宜選択して用いることができる。TATAボックス領域は、典型的にはTATAボックスを含み開始コドンの直前までの150bp〜250bp程度の範囲から適宜選択される。
TATAボックス領域としては、各種真核生物由来のものを用いることができる。TATAボックス領域もまた、自己増幅カセットにおいて、自己増幅レベル及び外来遺伝子を発現する酵母比率に関連する要素である。TATAボックス領域としては、高発現プロモーターのTATAボックス領域やより低い発現プロモーターのTATAボックス領域など、意図した自己増幅レベル等に適合するTATAボックス領域を用いることが好ましい。TATAボックス領域による外来遺伝子発現酵母比率の影響は、TATAボックス領域以外は同一要素を備える自己増幅カセットを用いて、GFPなどのタンパク質を酵母において発現させることで評価することができる。
TATAボックス領域としては、好ましくは酵母由来のTATAボックス領域を用いる。酵母由来のTATAボックス領域としては、特に限定しないが、酵母遺伝子中TATAボックス領域を備える遺伝子のTATAボックス領域を適宜用いることができる。例えば、TDH3遺伝子、CYC1遺伝子のTATAボックス領域(それぞれ配列番号15896、配列番号15897で表される塩基配列)を用いることができる。なお、これらによるダイナミックレンジの差は概して約20倍である。
自己増幅カセットは同一の人工転写因子について2以上備えられるが、TATAボックス領域は、2以上の自己増幅カセットに関し、同一であっても異なっていてもよい。
(ターミネーター領域)
自己増幅カセットは、人工転写因子のコード領域の下流側にターミネーター領域を備えている。ターミネーター領域は、各種生物由来のものを用いることができうるが、好ましくは、酵母由来である。本発明者らは、酵母の約5000個の遺伝子につき、ターミネーター活性を網羅的に評価した。その結果によれば、ターミネーター領域の選択により、大きく発現量を変化させることがわかっている(ダイナミックレンジで約70倍)。
ターミネーター領域としては、以下に示す発現強度情報に基づいて、選択することができる。本明細書において、発現強度情報とは、ターミネーター領域が転写制御するように接続された遺伝子の発現強度、すなわち、発現量に関する情報である。発現強度情報は、例えば、公知の酵母用ターミネーター領域、例えば、酵母のPGK1ターミネーターなどを用いた場合の所定の遺伝子(例えば、蛍光性タンパク質遺伝子)の発現量に対する相対発現量として評価された情報とすることができる。
本発明者らによれば、一定の条件下(例えば、同一のプロモーターと外来遺伝子を備える発現カセットを用いるなど)において、種々の酵母遺伝子のターミネーターを連結したところ、酵母遺伝子のターミネーターは、それぞれ固有の発現強度を発揮していることがわかった。
酵母、特に出芽酵母であるSaccharomyces cerevisiaeから取得した5295個の遺伝子のターミネーター領域の発現強度情報を以下に示す。発現強度情報は、遺伝子名(PGK1ターミネーター領域に対する相対発現強度)で表されている。なお、これらの遺伝子は、モデル酵母であるSaccharomyces cerevisiaeに由来するものであるが他の出芽酵母を含む酵母においても広く適用されうる。以下、相対発現強度(以下、単に相対発現強度という場合もある。)が低いものから順に遺伝子名を記載する。
(発現強度情報)
ORC4(0.030)、ICY2(0.044)、GIC1(0.047)、HLR1(0.053)、ECM13(0.057)、YLR108C(0.060)、AQR1(0.064)、YHR213W-A(0.065)、SUT1(0.068)、PLB3(0.070)、AIM26(0.072)、TPO4(0.073)、YPR153W(0.073)、GIS3(0.073)、WSC3(0.079)、FUR4(0.079)、DLT1(0.080)、MOT1(0.080)、YNR063W(0.081)、MET13(0.081)、YDL156W(0.082)、YJL107C(0.082)、YJR154W(0.082)、YNL042W-B(0.082)、VHS1(0.083)、GPI19(0.084)、YIL057C(0.084)、STD1(0.085)、CTF19(0.088)、RAD34(0.088)、YIR021W-A(0.088)、FZF1(0.089)、YHK8(0.089)、YGL188C-A(0.089)、HCM1(0.090)、CDC6(0.090)、YPR157W(0.091)、CLB6(0.091)、YOX1(0.091)、YLR285C-A(0.091)、YDR114C(0.092)、YHR199C-A(0.092)、MPS3(0.092)、MUP3(0.093)、YIR014W(0.094)、AAR2(0.094)、YPT35(0.094)、AIM33(0.095)、SCW11(0.095)、BDF1(0.095)、YCL042W(0.096)、BSC4(0.096)、YGL193C(0.096)、NUT2(0.097)、YJL118W(0.098)、YKL069W(0.099)、SRB8(0.099)、YOR060C(0.099)、MDH2(0.099)、YPR116W(0.100)、YPK2(0.101)、GLN3(0.101)、YDL211C(0.101)、RAD55(0.102)、CYM1(0.102)、ENT4(0.102)、ULA1(0.103)、YMR182W-A(0.104)、YKR017C(0.104)、YOR302W(0.106)、YOR072W-B(0.107)、VTS1(0.107)、FYV12(0.107)、YGL235W(0.108)、YHR086W-A(0.108)、YEL067C(0.109)、YPL257W(0.109)、UBA3(0.109)、YMR105W-A(0.109)、YOR316C-A(0.110)、TMA10(0.110)、YDL159W-A(0.112)、ATG29(0.113)、YML037C(0.113)、NSL1(0.113)、YJL077W-B(0.113)、POP3(0.113)、WHI5(0.113)、MIH1(0.114)、YGR240C-A(0.115)、YRM1(0.115)、KAR9(0.115)、YJU2(0.116)、SPC24(0.116)、DPB2(0.117)、CHL4(0.117)、YMR087W(0.118)、CSI1(0.118)、YIL134C-A(0.118)、BUR2(0.118)、PTH1(0.119)、SSN8(0.119)、AUA1(0.119)、YLR154C-G(0.120)、YLR342W-A(0.120)、YCL001W-A(0.120)、FLC1(0.121)、YLL006W-A(0.121)、VAM7(0.121)、YPL077C(0.121)、CCZ1(0.123)、PRP28(0.123)、ACM1(0.123)、IME4(0.123)、YPR096C(0.123)、FRE5(0.124)、PDR8(0.125)、ILV5(0.125)、YIL161W(0.126)、PAC11(0.126)、UBR2(0.126)、YRB2(0.128)、YLR125W(0.128)、YMR253C(0.128)、DSE4(0.128)、EPL1(0.128)、SNP1(0.128)、YMR160W(0.128)、SPO77(0.129)、BUB1(0.129)、YFR016C(0.129)、SPC97(0.130)、GEM1(0.130)、INO2(0.130)、SPT10(0.130)、YLR132C(0.131)、AIM45(0.131)、YJR054W(0.132)、MBF1(0.132)、YAL064C-A(0.132)、YML054C-A(0.132)、NUP1(0.132)、ECM27(0.132)、YIL060W(0.133)、IRE1(0.133)、YHR177W(0.134)、YJR079W(0.134)、YNL187W(0.136)、YML003W(0.136)、PIH1(0.136)、YDR169C-A(0.136)、PET111(0.137)、YDL109C(0.137)、YOR012W(0.138)、YHR050W-A(0.138)、TAR1(0.139)、RIM9(0.139)、YCR095W-A(0.140)、RPR2(0.140)、COS7(0.140)、YDR049W(0.142)、CUS1(0.142)、JJJ3(0.142)、COS10(0.143)、MET1(0.144)、HXT8(0.145)、GLY1(0.146)、SUR1(0.146)、RTG1(0.147)、PHM7(0.147)、YJL052C-A(0.147)、HXT17(0.147)、YFL052W(0.148)、ATG1(0.148)、ECM2(0.148)、YNR075C-A(0.148)、YKR041W(0.149)、ALD5(0.149)、YHL018W(0.149)、LUC7(0.149)、YPS5(0.149)、YLR297W(0.150)、SNA4(0.150)、BIO4(0.150)、YBR298C-A(0.150)、ECM12(0.152)、SEF1(0.152)、YMR247W-A(0.152)、EXO1(0.153)、CTF13(0.154)、HUR1(0.154)、SNO3(0.154)、BSC5(0.154)、YER175W-A(0.155)、PGA1(0.155)、YLR173W(0.156)、YDR119W-A(0.157)、IRC15(0.157)、MGA1(0.157)、YPR174C(0.159)、IML3(0.159)、YLL054C(0.159)、RDS1(0.159)、MDM32(0.160)、PET494(0.160)、YPR036W-A(0.160)、GTB1(0.160)、ISF1(0.161)、KRE29(0.161)、SAP190(0.161)、YHR214C-E(0.162)、GTO3(0.163)、YOR365C(0.163)、MIP1(0.163)、SIP5(0.164)、YPL191C(0.164)、YPL162C(0.164)、YMR291W(0.165)、BRN1(0.166)、MDM1(0.166)、NAT4(0.166)、YLR406C-A(0.166)、YME1(0.166)、CSI2(0.166)、YOR008C-A(0.167)、CEF1(0.169)、BUD25(0.169)、DFG16(0.170)、GPB1(0.170)、KAR1(0.170)、PPM2(0.171)、DSS1(0.171)、RPC37(0.172)、VID24(0.172)、ERV41(0.172)、YGR169C-A(0.172)、ECM8(0.173)、YHR032W(0.173)、ELA1(0.173)、PEX29(0.173)、LTE1(0.173)、HAT2(0.174)、SLI1(0.174)、MUP1(0.175)、ALG13(0.176)、FRE7(0.176)、YMR147W(0.177)、ISU2(0.177)、YOR1(0.178)、JID1(0.179)、ECM3(0.179)、ATG5(0.179)、MED6(0.180)、YPL014W(0.180)、YLR030W(0.180)、AQY2(0.180)、CCT2(0.180)、YER067W(0.181)、NRG1(0.181)、SPT8(0.181)、PIR1(0.181)、YGR068C(0.182)、YER039C-A(0.182)、ELM1(0.182)、ASE1(0.182)、YBL095W(0.183)、YNR066C(0.183)、MTL1(0.183)、CNE1(0.183)、CAX4(0.183)、NDI1(0.184)、FLX1(0.184)、YNL130C-A(0.184)、CWC25(0.186)、YNL254C(0.186)、CDC13(0.186)、ATP10(0.187)、OCT1(0.187)、ALF1(0.187)、YEF1(0.187)、BAP2(0.187)、HTL1(0.188)、PDC5(0.189)、PKP1(0.190)、SSK2(0.191)、CAF120(0.192)、SKN1(0.192)、HHF1(0.193)、CDC39(0.194)、YFR012W(0.194)、YEL048C(0.194)、HAP4(0.195)、PEX7(0.195)、TPO1(0.196)、NFT1(0.196)、NGL3(0.198)、YMR206W(0.199)、DUS3(0.200)、YAP7(0.200)、CUS2(0.201)、YLR415C(0.201)、FUI1(0.202)、SLM5(0.203)、BTT1(0.203)、YFR035C(0.203)、RRN10(0.203)、HAP3(0.204)、SSY5(0.204)、SFL1(0.204)、KIP1(0.205)、CDC15(0.206)、GLT1(0.207)、DOC1(0.208)、MND1(0.209)、AAC1(0.209)、CEP3(0.209)、UBC5(0.209)、YNL213C(0.209)、CLN3(0.210)、CSF1(0.210)、ECM18(0.210)、MRS4(0.210)、YIL046W-A(0.211)、INP1(0.211)、RTT105(0.211)、MPT5(0.211)、ATG15(0.212)、RNH202(0.212)、TAX4(0.213)、IZH3(0.213)、BDF2(0.214)、COX14(0.214)、YIP4(0.214)、YJR120W(0.214)、SAE2(0.215)、YMC2(0.216)、YGR035C(0.216)、NDD1(0.216)、HPA2(0.216)、STL1(0.216)、GPM3(0.216)、ERF2(0.217)、MMS21(0.217)、YJL133C-A(0.218)、YNL024C(0.218)、IFH1(0.219)、LIN1(0.220)、ICS3(0.220)、YNR014W(0.220)、SPB1(0.220)、YNL211C(0.221)、SOL1(0.221)、COS111(0.221)、HSH155(0.221)、NKP2(0.221)、NAB3(0.221)、FMT1(0.222)、YPL152W-A(0.222)、BOR1(0.222)、SPC25(0.222)、MMS1(0.222)、YIL166C(0.223)、MAL13(0.223)、BFA1(0.223)、AEP3(0.224)、MTH1(0.225)、YGR031W(0.225)、BIT61(0.227)、YMR230W-A(0.227)、SKT5(0.227)、YGL258W-A(0.227)、PHR1(0.227)、HTB2(0.228)、SER1(0.229)、BAP3(0.230)、YER0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NMD2(1.482)、YIM1(1.483)、BCH1(1.483)、RRP1(1.483)、VCX1(1.483)、UGA1(1.484)、HOL1(1.484)、GRX1(1.484)、EMP24(1.484)、YGR237C(1.485)、FAP1(1.485)、KTR2(1.486)、PBP4(1.486)、YER163C(1.486)、RFS1(1.486)、PTA1(1.487)、MPD2(1.487)、SGT2(1.487)、IKI1(1.487)、ECM29(1.488)、REV3(1.489)、TPD3(1.489)、YDL124W(1.490)、MUM2(1.491)、YFR026C(1.491)、PHS1(1.491)、MLS1(1.493)、POR1(1.494)、PFD1(1.494)、EGD2(1.494)、GYP8(1.495)、RPT2(1.495)、TEX1(1.495)、RPS5(1.496)、TPK1(1.496)、DOT5(1.497)、LSB5(1.498)、DMA1(1.498)、BNA6(1.498)、VAB2(1.499)、AML1(1.500)、SEC31(1.500)、KIN1(1.501)、STB4(1.502)、GSP1(1.502)、AAD4(1.502)、MNN2(1.503)、RPP1B(1.503)、GUK1(1.506)、MCK1(1.506)、HSP31(1.506)、SBP1(1.506)、ZWF1(1.507)、IST2(1.508)、GPI16(1.508)、CDC42(1.508)、AHA1(1.509)、UBP2(1.510)、YNL115C(1.510)、CCW14(1.510)、YDL121C(1.510)、MCA1(1.510)、RPT4(1.511)、ERP1(1.512)、TMA7(1.513)、WHI4(1.513)、YDR131C(1.513)、PDR1(1.514)、TSR3(1.516)、ATG11(1.516)、DDP1(1.516)、COQ2(1.516)、RPP1A(1.517)、PMP3(1.517)、CRD1(1.517)、PHO85(1.517)、YGR017W(1.517)、YIL055C(1.518)、LAP3(1.518)、YOR291W(1.519)、GAS5(1.519)、YKR043C(1.520)、YIL083C(1.520)、CHO2(1.521)、ELP4(1.521)、BIM1(1.522)、CAM1(1.522)、DAL82(1.523)、UMP1(1.524)、YBR241C(1.524)、LTP1(1.524)、PHO91(1.525)、RPP0(1.526)、YOR164C(1.526)、TOM71(1.527)、FAS2(1.528)、FMP46(1.528)、TMA22(1.528)、YML131W(1.528)、YCF1(1.530)、OPI3(1.530)、ROM1(1.530)、IRC24(1.530)、FYV6(1.531)、ATG13(1.534)、TRX3(1.534)、ENP2(1.534)、CEX1(1.534)、VPS3(1.535)、TRX1(1.536)、DIT2(1.536)、SEC4(1.536)、GDH3(1.537)、PRE9(1.537)、UBP1(1.537)、AYR1(1.537)、NIT2(1.537)、PDR17(1.538)、TUB1(1.539)、KEG1(1.539)、CDC25(1.539)、PIG2(1.539)、NSE1(1.541)、VPS25(1.541)、YLR414C(1.541)、CWH43(1.541)、COG2(1.545)、RCY1(1.545)、VPS68(1.546)、RPL7A(1.548)、TAF14(1.549)、SRB5(1.553)、UPF3(1.553)、YML096W(1.555)、ARG81(1.555)、NPR2(1.555)、PSH1(1.556)、TAF6(1.557)、MCT1(1.557)、SBH1(1.557)、PBN1(1.558)、VPS45(1.560)、SRP68(1.560)、SAY1(1.561)、PEP1(1.562)、CCT4(1.563)、COQ10(1.565)、RET3(1.566)、SSE1(1.566)、YSP3(1.567)、ABZ1(1.567)、PNS1(1.567)、DPB3(1.568)、YDL073W(1.568)、ATM1(1.568)、RBD2(1.568)、YFR006W(1.569)、DDI1(1.569)、DCP1(1.570)、SAS10(1.570)、RMT2(1.571)、FIG1(1.572)、MUS81(1.573)、UBI4(1.573)、YBR285W(1.574)、DLD1(1.576)、RPS15(1.576)、YPR170W-B(1.576)、SRP1(1.577)、PSK1(1.577)、RAD4(1.578)、PGD1(1.580)、PMT4(1.581)、ABF2(1.582)、SEC24(1.584)、URA10(1.585)、CWC23(1.585)、RPS11B(1.586)、TPM1(1.586)、YLR290C(1.588)、TRM9(1.588)、YAP1(1.589)、UGP1(1.589)、SPS2(1.590)、PDR10(1.591)、POM34(1.591)、PNC1(1.591)、STE11(1.593)、GRH1(1.596)、YMR018W(1.596)、TRS33(1.596)、HEF3(1.597)、LAT1(1.597)、BDS1(1.597)、HMF1(1.598)、PRP6(1.600)、FSH3(1.600)、SRB2(1.601)、DUG1(1.601)、ERD2(1.602)、CDA2(1.602)、RPS6A(1.602)、HUT1(1.604)、SHS1(1.604)、IRA1(1.605)、SSA3(1.606)、ELP3(1.606)、PRP46(1.606)、CSM3(1.606)、PEP4(1.607)、YHC3(1.610)、MDY2(1.610)、RPL43A(1.613)、HRQ1(1.613)、YKL023W(1.613)、DFM1(1.614)、PCL8(1.614)、SKG3(1.614)、GPH1(1.615)、NEJ1(1.616)、URA4(1.617)、GPX1(1.620)、HOS2(1.622)、YDR531W(1.623)、PEP3(1.624)、MAL31(1.625)、YGR283C(1.626)、HFD1(1.627)、SPR28(1.627)、SWP82(1.628)、FUM1(1.629)、CDA1(1.629)、HOM6(1.630)、NHX1(1.631)、SNF6(1.632)、ECI1(1.632)、CDC10(1.632)、MIS1(1.632)、YIL165C(1.632)、GTT1(1.636)、PLP2(1.636)、PFA4(1.636)、RPL30(1.637)、PRE3(1.640)、MTD1(1.640)、MNT2(1.642)、ECM30(1.643)、YNL208W(1.645)、YCR024C-B(1.645)、PCA1(1.646)、HCS1(1.648)、DCC1(1.650)、FAR8(1.652)、PPH22(1.654)、DED81(1.656)、GPM1(1.657)、COF1(1.658)、YGR042W(1.658)、YPR148C(1.659)、VPS55(1.659)、JLP1(1.660)、CAT2(1.661)、GCN1(1.664)、YGL231C(1.664)、GUS1(1.665)、YGR111W(1.667)、VMA4(1.671)、YDR056C(1.671)、SCS2(1.672)、NQM1(1.675)、UFE1(1.677)、COG1(1.677)、PAA1(1.677)、IRC22(1.682)、KTR1(1.682)、TYW1(1.683)、SSB1(1.683)、SVP26(1.686)、ESC8(1.687)、YNL010W(1.687)、TIF1(1.689)、EAF6(1.690)、SHC1(1.690)、KIN2(1.692)、DCS2(1.692)、RPS1B(1.692)、URA5(1.692)、DSD1(1.693)、YJL218W(1.694)、NPT1(1.694)、SRO77(1.695)、FMN1(1.695)、CMD1(1.695)、YTA6(1.697)、RPL21A(1.699)、ALG3(1.699)、KRE2(1.703)、PCL5(1.704)、MDM34(1.705)、PFS2(1.708)、SNF12(1.708)、BNA1(1.709)、AIM29(1.710)、SNU13(1.712)、RNR4(1.712)、MAP2(1.713)、DCS1(1.716)、RPN5(1.716)、PDC2(1.722)、DOP1(1.723)、SPO74(1.725)、PAP1(1.728)、RPL24B(1.732)、RPN8(1.734)、FPR3(1.734)、ERS1(1.735)、CPR1(1.736)、FIT3(1.740)、HUG1(1.742)、VPS5(1.742)、PEX3(1.742)、RPS29A(1.743)、ERV29(1.743)、CAF20(1.743)、DOG2(1.743)、RPL4A(1.744)、YCP4(1.745)、PBY1(1.746)、FUS2(1.750)、SNF2(1.752)、SUI1(1.752)、YMR262W(1.759)、BUD8(1.761)、TED1(1.763)、TAH1(1.765)、YCL048W-A(1.769)、RPL41A(1.774)、YDR374C(1.776)、VMA8(1.777)、YKR051W(1.777)、YFL042C(1.778)、ORM2(1.778)、TAF12(1.778)、APE3(1.781)、YDR239C(1.782)、ERV2(1.784)、SHR5(1.785)、YHR192W(1.787)、YRB30(1.791)、PHO88(1.791)、WHI2(1.792)、LYS1(1.793)、RHO1(1.795)、VPS27(1.797)、VMA6(1.797)、PAB1(1.806)、YJR01


5W(1.807)、SIR2(1.809)、FAR1(1.809)、CPT1(1.814)、ECM15(1.815)、ROK1(1.815)、YFR018C(1.820)、HYR1(1.821)、POL1(1.821)、CTS2(1.830)、UBA4(1.832)、SRP72(1.833)、RTN2(1.834)、HAP1(1.835)、ARE2(1.836)、RCK2(1.837)、INM2(1.839)、AFR1(1.840)、YOS9(1.840)、RTT103(1.842)、RPS12(1.845)、RNY1(1.847)、PPA1(1.848)、LEU3(1.849)、ERG27(1.850)、TMA29(1.851)、UBX3(1.852)、VPS15(1.854)、RPT6(1.855)、LDB18(1.859)、YPL088W(1.862)、RPL5(1.863)、RVS167(1.870)、TIR2(1.871)、PHA2(1.873)、ERJ5(1.873)、VPS30(1.876)、IMD2(1.878)、PES4(1.879)、EMI1(1.897)、YPR085C(1.901)、YBR200W-A(1.903)、FMP40(1.909)、REH1(1.909)、SGT1(1.911)、CPS1(1.913)、YOP1(1.917)、TRR2(1.919)、STS1(1.920)、VPH1(1.931)、SWA2(1.933)、YGR026W(1.938)、CDC53(1.938)、FMP52(1.941)、YDR119W(1.945)、RNQ1(1.953)、SAG1(1.956)、RPS20(1.974)、TRM82(1.979)、VPS1(1.981)、YIP5(1.987)、YPR1(1.988)、ENT2(1.992)、YPT31(1.997)、PRX1(2.003)、YHL039W(2.003)、YHI9(2.022)、BUD32(2.035)、YLR361C-A(2.037)、APL2(2.043)、PTP3(2.046)、YMR114C(2.049)、LSC2(2.054)、ATG10(2.056)、SRP54(2.065)、ENT3(2.077)、RPL3(2.080)、TYR1(2.095)、NAT1(2.106)、YNR021W(2.114)、EBS1(2.126)、HBT1(2.132)、RPL15A(2.145)、RPL41B(2.149)、RPP2B(2.166)、CBR1(2.178)、BNA4(2.233)、PRC1(2.240)、DIT1(2.244)、RPS28A(2.260)、ASP3-1(2.300)、IDP1(2.304)、SCW4(2.321)、VMA2(2.369)、ALY2(2.382)、NAT5(2.449)
上記発現強度情報においては、遺伝子名は、公開されているゲノム情報(ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/Fungi/Saccharomyces_cerevisiae_uid128/)に基づくものである。また、このゲノム情報において、前記遺伝子名を参照することで、各遺伝子のコード領域の下流の遺伝子配列を取得することができる。酵母のmRNAに存在する3’−UTRの長さの中央値が100bp程度であり、ほとんどの3’−UTRは500bp程度の範囲内にあることが報告されている(Miura F, Kawaguchi N, Sese J, Toyoda A, Hattori M, Morishita S, Ito T, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 103, 17846-17851 (2006)、Nagalakshmi U, Wang Z, Waern K, Shou C, Raha D, Gerstein M, Snyder M, Science, 320, 1344-1349 (2008))。こうしたこと等から、酵母においては、コード領域の終始コドンの下流300bp程度が各遺伝子のターミネーターと想定されうる。当業者であれば、ターミネーター領域と想定されるDNAの塩基配列に基づいて、公知の手法を利用して適切なプライマーを設計し、特定遺伝子のターミネーター想定領域を増幅し、ターミネーター領域のクローニングすることができる。また、ターミネーターとしての活性を評価することができる。
上記各遺伝子のターミネーター領域の塩基配列の一例が、各遺伝子の記載の順にそれぞれ配列番号10591〜15885で表される。上記発現強度情報において記載される各遺伝子のターミネーター領域の塩基配列は、各遺伝子のターミネーター領域を取得するためにそれぞれ固有のプライマーセットを設計して得られた結果に基づくものであり、各遺伝子のコード領域の下流300bp〜700bp程度を含むものとなっている。発現強度情報とともに開示した各遺伝子のターミネーターを得るための5’プライマーの塩基配列は、配列番号1〜5295で表され、3’プライマーの塩基配列は、配列番号5296〜10590で表される。
ターミネーター領域は、特定された塩基配列と同一であってもよいほか、必要に応じて改変して用いることができる。例えば、配列番号10591〜15885のいずれかで特定される配列番号で表される塩基配列において1種又は2種以上の塩基の欠失、置換、挿入及び/又は付加を有し、元のターミネーター領域と同程度のターミネーター活性を有するDNAの塩基配列であってもよい。また、配列番号10591〜15885のいずれかで特定される配列番号で表される塩基配列又はその一部と相補的なDNAとストリンジェントな条件においてハイブリダイズし、元のターミネーターと同程度のターミネーター活性を有するDNAの塩基配列であってもよい。さらに、配列番号10591〜15885のいずれかで特定される配列番号で表される塩基配列に対して80%以上、好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上、より一層好ましくは98%以上、さらに一層好ましくは99%以上の同一性を有し、元のターミネーター領域と同程度のターミネーター活性を有するDNAの塩基配列であってもよい。なお、ここで同程度のターミネーター活性とは、例えば、元のターミネーターの発現強度情報における相対発現強度とプラスマイナス20%範囲内の相対発現強度を意味している。より好ましくはプラスマイナス10%範囲内である。さらに好ましくはプラスマイナス5%範囲内である。
本明細書において塩基配列又はアミノ酸配列の同一性又は類似性とは、当該技術分野で知られているとおり、配列を比較することにより決定される、2種以上のタンパク質あるいは2種以上のポリヌクレオチドの間の関係である。当該技術で“同一性 ”とは、タンパク質またはポリヌクレオチド配列の間のアラインメントによって、あるいは場合によっては、一続きのそのような配列間のアラインメントによって決定されるような、タンパク質またはポリヌクレオチド配列の間の配列不変性の程度を意味する。また、類似性とは、タンパク質またはポリヌクレオチド配列の間のアラインメントによって、あるいは場合によっては、一続きの部分的な配列間のアラインメントによって決定されるような、タンパク質またはポリヌクレオチド配列の間の相関性の程度を意味する。より具体的には、配列の同一性と保存性(配列中の特定アミノ酸又は配列における物理化学特性を維持する置換)によって決定される。なお、類似性は、後述するBLASTの配列相同性検索結果においてSimilarity と称される。同一性及び類似性を決定する方法は、対比する配列間で最も長くアラインメントするように設計される方法であることが好ましい。同一性及び類似性を決定するための方法は、公衆に利用可能なプログラムとして提供されている。例えば、AltschulらによるBLAST (Basic Local Alignment Search Tool) プログラム(たとえば、Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ., J. Mol. Biol., 215: p403-410 (1990), Altschyl SF, Madden TL, Schaffer AA, Zhang J, Miller W, Lipman DJ., Nucleic Acids Res. 25: p3389-3402 (1997))を利用し決定することができる。BLASTのようなソフトウェアを用いる場合の条件は、特に限定するものではないが、デフォルト値を用いるのが好ましい。
ストリンジェントな条件とは、たとえば、いわゆる特異的なハイブリッドが形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいう。例えば、塩基配列の同一性が高い核酸、すなわち、所定の塩基配列と80%以上、好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上、より一層好ましくは98%以上、さらに一層好ましくは99%以上の同一性を有する塩基配列からなるDNA又はその一部の相補鎖がハイブリダイズし、それより相同性が低い核酸の相補鎖がハイブリダイズしない条件が挙げられる。より具体的には、ナトリウム塩濃度が15〜750mM、好ましくは50〜750mM、より好ましくは300〜750mM、温度が25〜70℃、好ましくは50〜70℃、より好ましくは55〜65℃、ホルムアミド濃度が0〜50%、好ましくは20〜50%、より好ましくは35〜45%での条件をいう。さらに、ストリンジェントな条件では、ハイブリダイゼーション後のフィルターの洗浄条件が、通常はナトリウム塩濃度が15〜600mM、好ましくは50〜600mM、より好ましくは300〜600mM、温度が50〜70℃、好ましくは55〜70℃、より好ましくは60〜65℃である。なお、以上のことから、さらなる他の一態様として、所定の塩基配列と80%以上、好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは95%以上、より一層好ましくは98%以上、さらに一層好ましくは99%以上の同一性を有する塩基配列を有する。
例えば、所望の遺伝子(酵母において内在性であってもよいし外来性であってもよい。)の発現出力を増強するときには、各遺伝子のターミネーター領域の発現強度情報に基づいて、高い発現強度を呈したターミネーターを用いることができる。好ましくは、相対発現強度が1.2以上であり、より好ましくは、1.3以上であり、さらに好ましくは、1.4以上であり、一層好ましくは1.5以上であり、より一層好ましくは1.6以上であり、さらに一層好ましくは1.7以上であり、さらに好ましくは1.8以上であり、さらに好ましくは1.9以上であり、最も好ましくは、2.0以上である。
例えば、相対発現強度が1.2以上のターミネーター領域としてはYCT1、SOL3、YDL027C、KIP3、UTP11、SUB1、PRP19、DCW1、TAH18、YER010C、PIN3、GYP1、SCW10、CTK1、ARK1、FYV10、YCR016W、YDJ1、ARF1、BGL2、YHR100C、CBS2、REX3、TSA1、RNA14、RCE1、THR4、SIP18、PMS1、DSK2、CDC50、DPH5、HEM12、SER3、YML119W、ESC1、GAL11、PRE7、RPT5、ERG2、DSE1、SEC22、YFH7、HSF1、GOS1、WRS1、EXO70、TSA2、ALK2、COX6、KRI1、YGL015C、RPS17B、YDR367W、TOM20、RSP5、YBL086C、TRM44、YPR109W、PTP1、AVT7、CYR1、CIS1、FAL1、VPS28、AGA2、QRI1、ATS1、GIT1、THO1、FBP1、YJL016W、UGA3、YBR230W-A、CCE1、NDE1、SET5、HOT1、RPT1、CAR2、PRE4、ECM33、ECM11、RAD33、BUB2、SOP4、SPR1、MOG1、SPO11、YKR070W、YBR246W、YKL071W、AHP1、PRP42、GRC3、KEL3、YMR244W、YMR242W-A、HBN1、VAS1、RTT102、ZUO1、YGR250C、FRQ1、YCL049C、MCR1、UBP11、TIF35、ATG26、YKL107W、HEM14、THR1、LUG1、SPS100、VMA22、YEL020C、RPL2B、GAL10、FKS1、YPL247C、YEL057C、RPS22A、TRK1、VTC2、SNU114、SWD1、UBC8、YPT52、XDJ1、YJR142W、COQ9、ERV25、YKL075C、FPR4、SEN2、GDT1、NOP7、YOR251C、SRL1、YLL023C、IRA2、IES6、MLF3、DIA1、MTG1、FPR1、NCE102、ERG4、SIF2、NUP53、RPL14A、SEC18、SSB2、RAT1、YMR027W、GDI1、VAN1、KAP123、ICL2、LPX1、RPP2A、SCD5、EXO84、CWC21、TRE2、YGR153W、YCR061W、RAD14、CUL3、VPS53、GEA1、GET3、TAD2、POT1、MVP1、PUS4、SMC2、RFC5、TIF3、NTG2、HXT10、CDC60、ENT5、GAT4、PGU1、UFD4、RPL37A、PRE5、PDC6、GCV3、EGD1、MSC7、KEM1、APN1、APE2、YLR456W、MAK5、YPR172W、STE24、RPS9B、CRM1、STP22、DIA2、ECO1、MCX1、YKL065W-A、NTR2、HHO1、RRM3、PRE8、NYV1、RPC53、TMA23、REC104、ZTA1、TEC1、TUB3、YJL123C、AST2、SNX4、ARC1、SOD1、SMA2、RGD1、PHM8、SEM1、GGA2、YAK1、RGA2、SCS3、YTA7、MDM12、AUR1、SKN7、MDG1、RSM7、YOL038C-A、OSW2、TIR3、RSM28、NIF3、FRE6、MDM20、YNR071C、GDH2、VPS8、MVD1、GCD2、TFP3、FMP33、NUG1、CPR6、SCP160、SEC14、YNL181W、PRE6、YLR364W、HOG1、NUP49、RPL21B、RPL42A、GTT2、STR3、ARG5,6、RPS24A、PPM1、AIM46、ILM1、PEX10、PDS5、YDR042C、YDL218W、MGT1、NPC2、YLR194C、PDI1、XKS1、SIW14、KOG1、PDR15、NGR1、SMX3、FIP1、UGA4、EDC1、YDL086W、GGA1、SMM1、AIM39、UBC1、YGR203W、PRP4、YSF3、SNA3、SKI6、CDC12、VPS60、MSC1、SET1、NMA111、SKI7、KRE5、FOL2、DAL3、SAK1、RVS161、YBR141C、LHS1、YFL051C、YGR067C、NOT5、CKB2、ATG2、YJR112W-A、RKM2、RPL36B、CNB1、PRP43、LCB5、PAC1、ARP3、LRC1、RGR1、YDL157C、DPL1、GCY1、YER076C、TFB3、RPS8B、GAT2、GFD2、MRP8、VAC14、YHR138C、PHO90、PSK2、ALT1、ERP5、LAS21、AIM9、SLZ1、SGM1、FMP27、HXT3、YGR273C、RAM2、RET1、YIR007W、RPS2、MTQ2、RPS23B、COS12、RUB1、RGP1、GYP7、YOL138C、PMT2、YMR130W、SPS4、RAD28、YLR099W-A、YOR285W、MBR1、MPH1、NUP159、SEC63、RPS16A、YPL206C、BCD1、HOT13、IVY1、RNA15、YKR104W、STE4、PUP1、SFB2、YCK2、ODC1、FMP42、VPS24、YKL098W、YSY6、RTG2、LYS9、UTR1、HRR25、YBR261C、RPS26A、KTR5、CHL1、MNN10、GLE2、CPD1、SNZ1、PAM17、HIR2、CDC28、YDR061W、ENA5、APM3、YLR118C、AVT1、PEP12、PET18、MAM1、DOA1、FPR2、PIB2、PRP21、TOP2、YBL044W、OST6、AIM24、IRC18、OSW1、COT1、YOR387C、SKP1、STM1、YDL176W、YLR137W、ALE1、PBP1、YNL200C、YBL029C-A、SPE3、RRD2、CNN1、SPR6、PAN3、YRB1、YDL057W、YOR051C、POL4、ORC5、IMP2、ATG19、ARO8、YJL163C、SWI5、LSP1、TMA19、YET3、RAD26、MGA2、IME1、OXR1、GSF2、RPS18A、RUP1、YLR126C、KRE27、TVP23、INO1、ALG14、PUS5、VMA10、SPT16、YLL053C、CHC1、MSH6、SDS24、PTC4、PSP2、VBA2、TSR4、CPR4、DPP1、TFG1、ARN2、YGL230C、NBP1、YKL077W、MOB2、DYN3、UBC13、RFA3、SPG5、GYP5、YPI1、YDR179W-A、CHA1、TOS4、ADH1、SPO1、JJJ2、ADK1、SOK1、GOT1、TIR4、ERP2、SEN1、PHO81、ARF2、YOR227W、TVP38、YDL089W、ZDS2、GCD6、SUI2、VAC7、TAH11、CTR9、YKL100C、NUP188、GRE1、PHB2、BUD3、SMA1、RPL20B、NSP1、PPZ2、STO1、ETR1、SUL1、RPL6B、CPR5、YAL018C、ELP6、ACP1、SHR3、KAP120、YBR137W、IME2、SNF7、YCR023C、GIS2、YIP1、TFC3、CUE1、YLR283W、FUN12、BMH1、RIM1、YMC1、KIC1、NAR1、YBR184W、CAF4、CTK3、NUP157、PRY1、MFA1、POL2、YDL114W、STP3、IRC20、ZPS1、POP1、DUN1、SLY1、UTP6、TAL1、DIB1、PAC2、YNR029C、SPC72、RPC34、KTR7、KRR1、YBR062C、SSA4、VMA9、ATG22、NRD1、INH1、REF2、TSC13、UTP7、AIM15、ARC19、EHT1、YHL017W、NNF2、YPR027C、TGL3、PEX28、TEL1、PGM1、PAN1、HRD3、RPL26B、SDT1、YER128W、PSY3、VPS52、RPB4、AIM2、NUD1、RPS29B、PRO3、RPL32、PXA1、GID8、TRM3、SLX1、PEA2、UBR1、AIP1、RPS10A、CFD1、YOR114W、LEA1、MSN5、RPL6A、PTC2、YER071C、RAS2、ATG14、CDC11、RPS6B、URA6、RPN1、SFH5、YAP1801、FLR1、DDR48、YRA2、APN2、ELF1、YJL217W、YPR089W、GSP2、BUG1、PSE1、SUA5、GPM2、POS5、PRM5、TAF4、GIM5、BNR1、YPS7、HAL5、RPS27B、CAK1、PGA2、SSP2、PMR1、NUP85、LSB6、TMA17、TGL1、ASN2、SEI1、VMA7、MDR1、HBS1、PMT1、PHO2、YHR113W、SSO1、RET2、UBA1、ALD2、SEC28、SEH1、YMR144W、HOC1、PRT1、RPS19B、GCN2、SAP4、YLR179C、COQ6、LYS14、LSM12、YGL117W、RED1、VPS34、VTC3、BRF1、ARR2、VMA21、PSF1、SRL3、YDR379C-A、ALG12、RPS25A、SDS23、DGA1、YDR196C、LOC1、RPN2、ANB1、NAN1、STB2、CUE5、CDC8、SPH1、GID7、UBC4、RPS22B、ACT1、RPS8A、YNR068C、FRS2、TAF8、THI4、RBK1、SET3、YNL305C、TPP1、MSO1、NSA1、YMR210W、ERG24、YMR31、MAK11、URB2、FAD1、AGC1、OM45、APD1、GSH2、SPT14、YGR210C、RPS11A、SWH1、ANT1、SAP30、HRT3、NSG1、BAT2、SOM1、IPP1、HIS2、RSE1、RTT101、CRG1、YJR096W、IMH1、SPT7、MKT1、GTT3、PEX11、YDR374W-A、YPD1、DOS2、YEL023C、RPF1、BNA2、ATG27、RPL29、YPS6、RPL19B、YDR357C、ARO4、YBR096W、PEP8、RPL39、SCC4、HXT7、HSV2、APA2、TFC1、SEC53、PDR5、MUD2、RPL19A、TAF9、MXR1、RIX1、PKR1、CWC27、BFR1、YDR387C、UIP4、OST3、BUD6、GFA1、RPS0A、CRZ1、SLT2、SNC1、SEC5、PCL6、DAL5、MSB1、CSL4、COQ4、IAH1、YPL245W、PRI2、LOS1、SQS1、PBA1、YFR017C、HPA3、SCL1、YGR168C、SAP155、MON1、SGA1、MNI1、TFC8、FAB1、MED2、GCN3、PRE1、BBC1、GPA1、DIG2、IRS4、SXM1、SHU2、SRO7、GEF1、RPL24A、TMN2、RIB3、UBC9、MAL11、ARO10、LAC1、RCN1、MVB12、TBS1、CTL1、NTF2、BZZ1、HXT14、YGR125W、YNR062C、STE50、YLL056C、HIS3、CIN2、TCB3、NUM1、CPA1、PRP40、TRR1、TRP2、ADE16、EFT1、BET3、SUA7、RPS14A、FOL1、DPB4、VPS16、ANP1、YMR099C、VHS2、BMH2、ADH6、GSC2、DBR1、ADP1、CEG1、MBP1、FCP1、SRY1、YNL058C、AVO2、YMR196W、RPL35A、HIF1、YLR050C、YER187W、YOR186W、RAD57、ATH1、PEP7、YJL055W、YBR259W、UBX7、ILV6、SAM4、MRM1、PHO23、MYO4、BRE1、YFR032C、GAS4、MIP6、ERV46、YPR097W、PET10、HDA2、TRX2、MED4、SPO16、NSG2、GND2、PDB1、BDH1、NIT3、MUD1、ERG20、RPL18A、PAI3、TMA108、SAM50、SLY41、YDR461C-A、YMR265C、YJL132W、BLM10、SPO73、CWC15、ALO1、MAP1、YKR023W、PET130、YCS4、CWH41、ARP9、CHK1、PAM1、TAF10、ARA1、CGI121、YIL014C-A、CHS7、RPS21A、VMA13、NAT3、ARG2、DOG1、TMS1、PSF2、YHR126C、KAP104、DPS1、IRR1、YAL044W-A、RPL23B、YDR307W、RPL33A、NAB6、APA1、ALG6、MEX67、DAK1、ARC15、YOS1、GAD1、ECM22、CYS3、PBI2、YBR271W、GPI10、WBP1、ZRC1、FIG2、YOR262W、MSH3、IOC2、YGR201C、NAP1、KAE1、CHS1、GDE1、YTM1、YHR162W、TAD3、ALP1、TRM8、NMD2、YIM1、BCH1、RRP1、VCX1、UGA1、HOL1、GRX1、EMP24、YGR237C、FAP1、KTR2、PBP4、YER163C、RFS1、PTA1、MPD2、SGT2、IKI1、ECM29、REV3、TPD3、YDL124W、MUM2、YFR026C、PHS1、MLS1、POR1、PFD1、EGD2、GYP8、RPT2、TEX1、RPS5、TPK1、DOT5、LSB5、DMA1、BNA6、VAB2、AML1、SEC31、KIN1、STB4、GSP1、AAD4、MNN2、RPP1B、GUK1、MCK1、HSP31、SBP1、ZWF1、IST2、GPI16、CDC42、AHA1、UBP2、YNL115C、CCW14、YDL121C、MCA1、RPT4、ERP1、TMA7、WHI4、YDR131C、PDR1、TSR3、ATG11、DDP1、COQ2、RPP1A、PMP3、CRD1、PHO85、YGR017W、YIL055C、LAP3、YOR291W、GAS5、YKR043C、YIL083C、CHO2、ELP4、BIM1、CAM1、DAL82、UMP1、YBR241C、LTP1、PHO91、RPP0、YOR164C、TOM71、FAS2、FMP46、TMA22、YML131W、YCF1、OPI3、ROM1、IRC24、FYV6、ATG13、TRX3、ENP2、CEX1、VPS3、TRX1、DIT2、SEC4、GDH3、PRE9、UBP1、AYR1、NIT2、PDR17、TUB1、KEG1、CDC25、PIG2、NSE1、VPS25、YLR414C、CWH43、COG2、RCY1、VPS68、RPL7A、TAF14、SRB5、UPF3、YML096W、ARG81、NPR2、PSH1、TAF6、MCT1、SBH1、PBN1、VPS45、SRP68、SAY1、PEP1、CCT4、COQ10、RET3、SSE1、YSP3、ABZ1、PNS1、DPB3、YDL073W、ATM1、RBD2、YFR006W、DDI1、DCP1、SAS10、RMT2、FIG1、MUS81、UBI4、YBR285W、DLD1、RPS15、YPR170W-B、SRP1、PSK1、RAD4、PGD1、PMT4、ABF2、SEC24、URA10、CWC23、RPS11B、TPM1、YLR290C、TRM9、YAP1、UGP1、SPS2、PDR10、POM34、PNC1、STE11、GRH1、YMR018W、TRS33、HEF3、LAT1、BDS1、HMF1、PRP6、FSH3、SRB2、DUG1、ERD2、CDA2、RPS6A、HUT1、SHS1、IRA1、SSA3、ELP3、PRP46、CSM3、PEP4、YHC3、MDY2、RPL43A、HRQ1、YKL023W、DFM1、PCL8、SKG3、GPH1、NEJ1、URA4、GPX1、HOS2、YDR531W、PEP3、MAL31、YGR283C、HFD1、SPR28、SWP82、FUM1、CDA1、HOM6、NHX1、SNF6、ECI1、CDC10、MIS1、YIL165C、GTT1、PLP2、PFA4、RPL30、PRE3、MTD1、MNT2、ECM30、YNL208W、YCR024C-B、PCA1、HCS1、DCC1、FAR8、PPH22、DED81、GPM1、COF1、YGR042W、YPR148C、VPS55、JLP1、CAT2、GCN1、YGL231C、GUS1、YGR111W、VMA4、YDR056C、SCS2、NQM1、UFE1、COG1、PAA1、IRC22、KTR1、TYW1、SSB1、SVP26、ESC8、YNL010W、TIF1、EAF6、SHC1、KIN2、DCS2、RPS1B、URA5、DSD1、YJL218W、NPT1、SRO77、FMN1、CMD1、YTA6、RPL21A、ALG3、KRE2、PCL5、MDM34、PFS2、SNF12、BNA1、AIM29、SNU13、RNR4、MAP2、DCS1、RPN5、PDC2、DOP1、SPO74、PAP1、RPL24B、RPN8、FPR3、ERS1、CPR1、FIT3、HUG1、VPS5、PEX3、RPS29A、ERV29、CAF20、DOG2、RPL4A、YCP4、PBY1、FUS2、SNF2、SUI1、YMR262W、BUD8、TED1、TAH1、YCL048W-A、RPL41A、YDR374C、VMA8、YKR051W、YFL042C、ORM2、TAF12、APE3、YDR239C、ERV2、SHR5、YHR192W、YRB30、PHO88、WHI2、LYS1、RHO1、VPS27、VMA6、PAB1、YJR015W、SIR2、FAR1、CPT1、ECM15、ROK1、YFR018C、HYR1、POL1、CTS2、UBA4、SRP72、RTN2、HAP1、ARE2、RCK2、INM2、AFR1、YOS9、RTT103、RPS12、RNY1、PPA1、LEU3、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が1.3以上のターミネーター領域としてはPUP1、SFB2、YCK2、ODC1、FMP42、VPS24、YKL098W、YSY6、RTG2、LYS9、UTR1、HRR25、YBR261C、RPS26A、KTR5、CHL1、MNN10、GLE2、CPD1、SNZ1、PAM17、HIR2、CDC28、YDR061W、ENA5、APM3、YLR118C、AVT1、PEP12、PET18、MAM1、DOA1、FPR2、PIB2、PRP21、TOP2、YBL044W、OST6、AIM24、IRC18、OSW1、COT1、YOR387C、SKP1、STM1、YDL176W、YLR137W、ALE1、PBP1、YNL200C、YBL029C-A、SPE3、RRD2、CNN1、SPR6、PAN3、YRB1、YDL057W、YOR051C、POL4、ORC5、IMP2、ATG19、ARO8、YJL163C、SWI5、LSP1、TMA19、YET3、RAD26、MGA2、IME1、OXR1、GSF2、RPS18A、RUP1、YLR126C、KRE27、TVP23、INO1、ALG14、PUS5、VMA10、SPT16、YLL053C、CHC1、MSH6、SDS24、PTC4、PSP2、VBA2、TSR4、CPR4、DPP1、TFG1、ARN2、YGL230C、NBP1、YKL077W、MOB2、DYN3、UBC13、RFA3、SPG5、GYP5、YPI1、YDR179W-A、CHA1、TOS4、ADH1、SPO1、JJJ2、ADK1、SOK1、GOT1、TIR4、ERP2、SEN1、PHO81、ARF2、YOR227W、TVP38、YDL089W、ZDS2、GCD6、SUI2、VAC7、TAH11、CTR9、YKL100C、NUP188、GRE1、PHB2、BUD3、SMA1、RPL20B、NSP1、PPZ2、STO1、ETR1、SUL1、RPL6B、CPR5、YAL018C、ELP6、ACP1、SHR3、KAP120、YBR137W、IME2、SNF7、YCR023C、GIS2、YIP1、TFC3、CUE1、YLR283W、FUN12、BMH1、RIM1、YMC1、KIC1、NAR1、YBR184W、CAF4、CTK3、NUP157、PRY1、MFA1、POL2、YDL114W、STP3、IRC20、ZPS1、POP1、DUN1、SLY1、UTP6、TAL1、DIB1、PAC2、YNR029C、SPC72、RPC34、KTR7、KRR1、YBR062C、SSA4、VMA9、ATG22、NRD1、INH1、REF2、TSC13、UTP7、AIM15、ARC19、EHT1、YHL017W、NNF2、YPR027C、TGL3、PEX28、TEL1、PGM1、PAN1、HRD3、RPL26B、SDT1、YER128W、PSY3、VPS52、RPB4、AIM2、NUD1、RPS29B、PRO3、RPL32、PXA1、GID8、TRM3、SLX1、PEA2、UBR1、AIP1、RPS10A、CFD1、YOR114W、LEA1、MSN5、RPL6A、PTC2、YER071C、RAS2、ATG14、CDC11、RPS6B、URA6、RPN1、SFH5、YAP1801、FLR1、DDR48、YRA2、APN2、ELF1、YJL217W、YPR089W、GSP2、BUG1、PSE1、SUA5、GPM2、POS5、PRM5、TAF4、GIM5、BNR1、YPS7、HAL5、RPS27B、CAK1、PGA2、SSP2、PMR1、NUP85、LSB6、TMA17、TGL1、ASN2、SEI1、VMA7、MDR1、HBS1、PMT1、PHO2、YHR113W、SSO1、RET2、UBA1、ALD2、SEC28、SEH1、YMR144W、HOC1、PRT1、RPS19B、GCN2、SAP4、YLR179C、COQ6、LYS14、LSM12、YGL117W、RED1、VPS34、VTC3、BRF1、ARR2、VMA21、PSF1、SRL3、YDR379C-A、ALG12、RPS25A、SDS23、DGA1、YDR196C、LOC1、RPN2、ANB1、NAN1、STB2、CUE5、CDC8、SPH1、GID7、UBC4、RPS22B、ACT1、RPS8A、YNR068C、FRS2、TAF8、THI4、RBK1、SET3、YNL305C、TPP1、MSO1、NSA1、YMR210W、ERG24、YMR31、MAK11、URB2、FAD1、AGC1、OM45、APD1、GSH2、SPT14、YGR210C、RPS11A、SWH1、ANT1、SAP30、HRT3、NSG1、BAT2、SOM1、IPP1、HIS2、RSE1、RTT101、CRG1、YJR096W、IMH1、SPT7、MKT1、GTT3、PEX11、YDR374W-A、YPD1、DOS2、YEL023C、RPF1、BNA2、ATG27、RPL29、YPS6、RPL19B、YDR357C、ARO4、YBR096W、PEP8、RPL39、SCC4、HXT7、HSV2、APA2、TFC1、SEC53、PDR5、MUD2、RPL19A、TAF9、MXR1、RIX1、PKR1、CWC27、BFR1、YDR387C、UIP4、OST3、BUD6、GFA1、RPS0A、CRZ1、SLT2、SNC1、SEC5、PCL6、DAL5、MSB1、CSL4、COQ4、IAH1、YPL245W、PRI2、LOS1、SQS1、PBA1、YFR017C、HPA3、SCL1、YGR168C、SAP155、MON1、SGA1、MNI1、TFC8、FAB1、MED2、GCN3、PRE1、BBC1、GPA1、DIG2、IRS4、SXM1、SHU2、SRO7、GEF1、RPL24A、TMN2、RIB3、UBC9、MAL11、ARO10、LAC1、RCN1、MVB12、TBS1、CTL1、NTF2、BZZ1、HXT14、YGR125W、YNR062C、STE50、YLL056C、HIS3、CIN2、TCB3、NUM1、CPA1、PRP40、TRR1、TRP2、ADE16、EFT1、BET3、SUA7、RPS14A、FOL1、DPB4、VPS16、ANP1、YMR099C、VHS2、BMH2、ADH6、GSC2、DBR1、ADP1、CEG1、MBP1、FCP1、SRY1、YNL058C、AVO2、YMR196W、RPL35A、HIF1、YLR050C、YER187W、YOR186W、RAD57、ATH1、PEP7、YJL055W、YBR259W、UBX7、ILV6、SAM4、MRM1、PHO23、MYO4、BRE1、YFR032C、GAS4、MIP6、ERV46、YPR097W、PET10、HDA2、TRX2、MED4、SPO16、NSG2、GND2、PDB1、BDH1、NIT3、MUD1、ERG20、RPL18A、PAI3、TMA108、SAM50、SLY41、YDR461C-A、YMR265C、YJL132W、BLM10、SPO73、CWC15、ALO1、MAP1、YKR023W、PET130、YCS4、CWH41、ARP9、CHK1、PAM1、TAF10、ARA1、CGI121、YIL014C-A、CHS7、RPS21A、VMA13、NAT3、ARG2、DOG1、TMS1、PSF2、YHR126C、KAP104、DPS1、IRR1、YAL044W-A、RPL23B、YDR307W、RPL33A、NAB6、APA1、ALG6、MEX67、DAK1、ARC15、YOS1、GAD1、ECM22、CYS3、PBI2、YBR271W、GPI10、WBP1、ZRC1、FIG2、YOR262W、MSH3、IOC2、YGR201C、NAP1、KAE1、CHS1、GDE1、YTM1、YHR162W、TAD3、ALP1、TRM8、NMD2、YIM1、BCH1、RRP1、VCX1、UGA1、HOL1、GRX1、EMP24、YGR237C、FAP1、KTR2、PBP4、YER163C、RFS1、PTA1、MPD2、SGT2、IKI1、ECM29、REV3、TPD3、YDL124W、MUM2、YFR026C、PHS1、MLS1、POR1、PFD1、EGD2、GYP8、RPT2、TEX1、RPS5、TPK1、DOT5、LSB5、DMA1、BNA6、VAB2、AML1、SEC31、KIN1、STB4、GSP1、AAD4、MNN2、RPP1B、GUK1、MCK1、HSP31、SBP1、ZWF1、IST2、GPI16、CDC42、AHA1、UBP2、YNL115C、CCW14、YDL121C、MCA1、RPT4、ERP1、TMA7、WHI4、YDR131C、PDR1、TSR3、ATG11、DDP1、COQ2、RPP1A、PMP3、CRD1、PHO85、YGR017W、YIL055C、LAP3、YOR291W、GAS5、YKR043C、YIL083C、CHO2、ELP4、BIM1、CAM1、DAL82、UMP1、YBR241C、LTP1、PHO91、RPP0、YOR164C、TOM71、FAS2、FMP46、TMA22、YML131W、YCF1、OPI3、ROM1、IRC24、FYV6、ATG13、TRX3、ENP2、CEX1、VPS3、TRX1、DIT2、SEC4、GDH3、PRE9、UBP1、AYR1、NIT2、PDR17、TUB1、KEG1、CDC25、PIG2、NSE1、VPS25、YLR414C、CWH43、COG2、RCY1、VPS68、RPL7A、TAF14、SRB5、UPF3、YML096W、ARG81、NPR2、PSH1、TAF6、MCT1、SBH1、PBN1、VPS45、SRP68、SAY1、PEP1、CCT4、COQ10、RET3、SSE1、YSP3、ABZ1、PNS1、DPB3、YDL073W、ATM1、RBD2、YFR006W、DDI1、DCP1、SAS10、RMT2、FIG1、MUS81、UBI4、YBR285W、DLD1、RPS15、YPR170W-B、SRP1、PSK1、RAD4、PGD1、PMT4、ABF2、SEC24、URA10、CWC23、RPS11B、TPM1、YLR290C、TRM9、YAP1、UGP1、SPS2、PDR10、POM34、PNC1、STE11、GRH1、YMR018W、TRS33、HEF3、LAT1、BDS1、HMF1、PRP6、FSH3、SRB2、DUG1、ERD2、CDA2、RPS6A、HUT1、SHS1、IRA1、SSA3、ELP3、PRP46、CSM3、PEP4、YHC3、MDY2、RPL43A、HRQ1、YKL023W、DFM1、PCL8、SKG3、GPH1、NEJ1、URA4、GPX1、HOS2、YDR531W、PEP3、MAL31、YGR283C、HFD1、SPR28、SWP82、FUM1、CDA1、HOM6、NHX1、SNF6、ECI1、CDC10、MIS1、YIL165C、GTT1、PLP2、PFA4、RPL30、PRE3、MTD1、MNT2、ECM30、YNL208W、YCR024C-B、PCA1、HCS1、DCC1、FAR8、PPH22、DED81、GPM1、COF1、YGR042W、YPR148C、VPS55、JLP1、CAT2、GCN1、YGL231C、GUS1、YGR111W、VMA4、YDR056C、SCS2、NQM1、UFE1、COG1、PAA1、IRC22、KTR1、TYW1、SSB1、SVP26、ESC8、YNL010W、TIF1、EAF6、SHC1、KIN2、DCS2、RPS1B、URA5、DSD1、YJL218W、NPT1、SRO77、FMN1、CMD1、YTA6、RPL21A、ALG3、KRE2、PCL5、MDM34、PFS2、SNF12、BNA1、AIM29、SNU13、RNR4、MAP2、DCS1、RPN5、PDC2、DOP1、SPO74、PAP1、RPL24B、RPN8、FPR3、ERS1、CPR1、FIT3、HUG1、VPS5、PEX3、RPS29A、ERV29、CAF20、DOG2、RPL4A、YCP4、PBY1、FUS2、SNF2、SUI1、YMR262W、BUD8、TED1、TAH1、YCL048W-A、RPL41A、YDR374C、VMA8、YKR051W、YFL042C、ORM2、TAF12、APE3、YDR239C、ERV2、SHR5、YHR192W、YRB30、PHO88、WHI2、LYS1、RHO1、VPS27、VMA6、PAB1、YJR015W、SIR2、FAR1、CPT1、ECM15、ROK1、YFR018C、HYR1、POL1、CTS2、UBA4、SRP72、RTN2、HAP1、ARE2、RCK2、INM2、AFR1、YOS9、RTT103、RPS12、RNY1、PPA1、LEU3、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5、が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が1.4以上のターミネーター領域としては、ARR2、VMA21、PSF1、SRL3、YDR379C-A、ALG12、RPS25A、SDS23、DGA1、YDR196C、LOC1、RPN2、ANB1、NAN1、STB2、CUE5、CDC8、SPH1、GID7、UBC4、RPS22B、ACT1、RPS8A、YNR068C、FRS2、TAF8、THI4、RBK1、SET3、YNL305C、TPP1、MSO1、NSA1、YMR210W、ERG24、YMR31、MAK11、URB2、FAD1、AGC1、OM45、APD1、GSH2、SPT14、YGR210C、RPS11A、SWH1、ANT1、SAP30、HRT3、NSG1、BAT2、SOM1、IPP1、HIS2、RSE1、RTT101、CRG1、YJR096W、IMH1、SPT7、MKT1、GTT3、PEX11、YDR374W-A、YPD1、DOS2、YEL023C、RPF1、BNA2、ATG27、RPL29、YPS6、RPL19B、YDR357C、ARO4、YBR096W、PEP8、RPL39、SCC4、HXT7、HSV2、APA2、TFC1、SEC53、PDR5、MUD2、RPL19A、TAF9、MXR1、RIX1、PKR1、CWC27、BFR1、YDR387C、UIP4、OST3、BUD6、GFA1、RPS0A、CRZ1、SLT2、SNC1、SEC5、PCL6、DAL5、MSB1、CSL4、COQ4、IAH1、YPL245W、PRI2、LOS1、SQS1、PBA1、YFR017C、HPA3、SCL1、YGR168C、SAP155、MON1、SGA1、MNI1、TFC8、FAB1、MED2、GCN3、PRE1、BBC1、GPA1、DIG2、IRS4、SXM1、SHU2、SRO7、GEF1、RPL24A、TMN2、RIB3、UBC9、MAL11、ARO10、LAC1、RCN1、MVB12、TBS1、CTL1、NTF2、BZZ1、HXT14、YGR125W、YNR062C、STE50、YLL056C、HIS3、CIN2、TCB3、NUM1、CPA1、PRP40、TRR1、TRP2、ADE16、EFT1、BET3、SUA7、RPS14A、FOL1、DPB4、VPS16、ANP1、YMR099C、VHS2、BMH2、ADH6、GSC2、DBR1、ADP1、CEG1、MBP1、FCP1、SRY1、YNL058C、AVO2、YMR196W、RPL35A、HIF1、YLR050C、YER187W、YOR186W、RAD57、ATH1、PEP7、YJL055W、YBR259W、UBX7、ILV6、SAM4、MRM1、PHO23、MYO4、BRE1、YFR032C、GAS4、MIP6、ERV46、YPR097W、PET10、HDA2、TRX2、MED4、SPO16、NSG2、GND2、PDB1、BDH1、NIT3、MUD1、ERG20、RPL18A、PAI3、TMA108、SAM50、SLY41、YDR461C-A、YMR265C、YJL132W、BLM10、SPO73、CWC15、ALO1、MAP1、YKR023W、PET130、YCS4、CWH41、ARP9、CHK1、PAM1、TAF10、ARA1、CGI121、YIL014C-A、CHS7、RPS21A、VMA13、NAT3、ARG2、DOG1、TMS1、PSF2、YHR126C、KAP104、DPS1、IRR1、YAL044W-A、RPL23B、YDR307W、RPL33A、NAB6、APA1、ALG6、MEX67、DAK1、ARC15、YOS1、GAD1、ECM22、CYS3、PBI2、YBR271W、GPI10、WBP1、ZRC1、FIG2、YOR262W、MSH3、IOC2、YGR201C、NAP1、KAE1、CHS1、GDE1、YTM1、YHR162W、TAD3、ALP1、TRM8、NMD2、YIM1、BCH1、RRP1、VCX1、UGA1、HOL1、GRX1、EMP24、YGR237C、FAP1、KTR2、PBP4、YER163C、RFS1、PTA1、MPD2、SGT2、IKI1、ECM29、REV3、TPD3、YDL124W、MUM2、YFR026C、PHS1、MLS1、POR1、PFD1、EGD2、GYP8、RPT2、TEX1、RPS5、TPK1、DOT5、LSB5、DMA1、BNA6、VAB2、AML1、SEC31、KIN1、STB4、GSP1、AAD4、MNN2、RPP1B、GUK1、MCK1、HSP31、SBP1、ZWF1、IST2、GPI16、CDC42、AHA1、UBP2、YNL115C、CCW14、YDL121C、MCA1、RPT4、ERP1、TMA7、WHI4、YDR131C、PDR1、TSR3、ATG11、DDP1、COQ2、RPP1A、PMP3、CRD1、PHO85、YGR017W、YIL055C、LAP3、YOR291W、GAS5、YKR043C、YIL083C、CHO2、ELP4、BIM1、CAM1、DAL82、UMP1、YBR241C、LTP1、PHO91、RPP0、YOR164C、TOM71、FAS2、FMP46、TMA22、YML131W、YCF1、OPI3、ROM1、IRC24、FYV6、ATG13、TRX3、ENP2、CEX1、VPS3、TRX1、DIT2、SEC4、GDH3、PRE9、UBP1、AYR1、NIT2、PDR17、TUB1、KEG1、CDC25、PIG2、NSE1、VPS25、YLR414C、CWH43、COG2、RCY1、VPS68、RPL7A、TAF14、SRB5、UPF3、YML096W、ARG81、NPR2、PSH1、TAF6、MCT1、SBH1、PBN1、VPS45、SRP68、SAY1、PEP1、CCT4、COQ10、RET3、SSE1、YSP3、ABZ1、PNS1、DPB3、YDL073W、ATM1、RBD2、YFR006W、DDI1、DCP1、SAS10、RMT2、FIG1、MUS81、UBI4、YBR285W、DLD1、RPS15、YPR170W-B、SRP1、PSK1、RAD4、PGD1、PMT4、ABF2、SEC24、URA10、CWC23、RPS11B、TPM1、YLR290C、TRM9、YAP1、UGP1、SPS2、PDR10、POM34、PNC1、STE11、GRH1、YMR018W、TRS33、HEF3、LAT1、BDS1、HMF1、PRP6、FSH3、SRB2、DUG1、ERD2、CDA2、RPS6A、HUT1、SHS1、IRA1、SSA3、ELP3、PRP46、CSM3、PEP4、YHC3、MDY2、RPL43A、HRQ1、YKL023W、DFM1、PCL8、SKG3、GPH1、NEJ1、URA4、GPX1、HOS2、YDR531W、PEP3、MAL31、YGR283C、HFD1、SPR28、SWP82、FUM1、CDA1、HOM6、NHX1、SNF6、ECI1、CDC10、MIS1、YIL165C、GTT1、PLP2、PFA4、RPL30、PRE3、MTD1、MNT2、ECM30、YNL208W、YCR024C-B、PCA1、HCS1、DCC1、FAR8、PPH22、DED81、GPM1、COF1、YGR042W、YPR148C、VPS55、JLP1、CAT2、GCN1、YGL231C、GUS1、YGR111W、VMA4、YDR056C、SCS2、NQM1、UFE1、COG1、PAA1、IRC22、KTR1、TYW1、SSB1、SVP26、ESC8、YNL010W、TIF1、EAF6、SHC1、KIN2、DCS2、RPS1B、URA5、DSD1、YJL218W、NPT1、SRO77、FMN1、CMD1、YTA6、RPL21A、ALG3、KRE2、PCL5、MDM34、PFS2、SNF12、BNA1、AIM29、SNU13、RNR4、MAP2、DCS1、RPN5、PDC2、DOP1、SPO74、PAP1、RPL24B、RPN8、FPR3、ERS1、CPR1、FIT3、HUG1、VPS5、PEX3、RPS29A、ERV29、CAF20、DOG2、RPL4A、YCP4、PBY1、FUS2、SNF2、SUI1、YMR262W、BUD8、TED1、TAH1、YCL048W-A、RPL41A、YDR374C、VMA8、YKR051W、YFL042C、ORM2、TAF12、APE3、YDR239C、ERV2、SHR5、YHR192W、YRB30、PHO88、WHI2、LYS1、RHO1、VPS27、VMA6、PAB1、YJR015W、SIR2、FAR1、CPT1、ECM15、ROK1、YFR018C、HYR1、POL1、CTS2、UBA4、SRP72、RTN2、HAP1、ARE2、RCK2、INM2、AFR1、YOS9、RTT103、RPS12、RNY1、PPA1、LEU3、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が1.5以上のターミネーター領域としては、ERG20、RPL18A、PAI3、TMA108、SAM50、SLY41、YDR461C-A、YMR265C、YJL132W、BLM10、SPO73、CWC15、ALO1、MAP1、YKR023W、PET130、YCS4、CWH41、ARP9、CHK1、PAM1、TAF10、ARA1、CGI121、YIL014C-A、CHS7、RPS21A、VMA13、NAT3、ARG2、DOG1、TMS1、PSF2、YHR126C、KAP104、DPS1、IRR1、YAL044W-A、RPL23B、YDR307W、RPL33A、NAB6、APA1、ALG6、MEX67、DAK1、ARC15、YOS1、GAD1、ECM22、CYS3、PBI2、YBR271W、GPI10、WBP1、ZRC1、FIG2、YOR262W、MSH3、IOC2、YGR201C、NAP1、KAE1、CHS1、GDE1、YTM1、YHR162W、TAD3、ALP1、TRM8、NMD2、YIM1、BCH1、RRP1、VCX1、UGA1、HOL1、GRX1、EMP24、YGR237C、FAP1、KTR2、PBP4、YER163C、RFS1、PTA1、MPD2、SGT2、IKI1、ECM29、REV3、TPD3、YDL124W、MUM2、YFR026C、PHS1、MLS1、POR1、PFD1、EGD2、GYP8、RPT2、TEX1、RPS5、TPK1、DOT5、LSB5、DMA1、BNA6、VAB2、AML1、SEC31、KIN1、STB4、GSP1、AAD4、MNN2、RPP1B、GUK1、MCK1、HSP31、SBP1、ZWF1、IST2、GPI16、CDC42、AHA1、UBP2、YNL115C、CCW14、YDL121C、MCA1、RPT4、ERP1、TMA7、WHI4、YDR131C、PDR1、TSR3、ATG11、DDP1、COQ2、RPP1A、PMP3、CRD1、PHO85、YGR017W、YIL055C、LAP3、YOR291W、GAS5、YKR043C、YIL083C、CHO2、ELP4、BIM1、CAM1、DAL82、UMP1、YBR241C、LTP1、PHO91、RPP0、YOR164C、TOM71、FAS2、FMP46、TMA22、YML131W、YCF1、OPI3、ROM1、IRC24、FYV6、ATG13、TRX3、ENP2、CEX1、VPS3、TRX1、DIT2、SEC4、GDH3、PRE9、UBP1、AYR1、NIT2、PDR17、TUB1、KEG1、CDC25、PIG2、NSE1、VPS25、YLR414C、CWH43、COG2、RCY1、VPS68、RPL7A、TAF14、SRB5、UPF3、YML096W、ARG81、NPR2、PSH1、TAF6、MCT1、SBH1、PBN1、VPS45、SRP68、SAY1、PEP1、CCT4、COQ10、RET3、SSE1、YSP3、ABZ1、PNS1、DPB3、YDL073W、ATM1、RBD2、YFR006W、DDI1、DCP1、SAS10、RMT2、FIG1、MUS81、UBI4、YBR285W、DLD1、RPS15、YPR170W-B、SRP1、PSK1、RAD4、PGD1、PMT4、ABF2、SEC24、URA10、CWC23、RPS11B、TPM1、YLR290C、TRM9、YAP1、UGP1、SPS2、PDR10、POM34、PNC1、STE11、GRH1、YMR018W、TRS33、HEF3、LAT1、BDS1、HMF1、PRP6、FSH3、SRB2、DUG1、ERD2、CDA2、RPS6A、HUT1、SHS1、IRA1、SSA3、ELP3、PRP46、CSM3、PEP4、YHC3、MDY2、RPL43A、HRQ1、YKL023W、DFM1、PCL8、SKG3、GPH1、NEJ1、URA4、GPX1、HOS2、YDR531W、PEP3、MAL31、YGR283C、HFD1、SPR28、SWP82、FUM1、CDA1、HOM6、NHX1、SNF6、ECI1、CDC10、MIS1、YIL165C、GTT1、PLP2、PFA4、RPL30、PRE3、MTD1、MNT2、ECM30、YNL208W、YCR024C-B、PCA1、HCS1、DCC1、FAR8、PPH22、DED81、GPM1、COF1、YGR042W、YPR148C、VPS55、JLP1、CAT2、GCN1、YGL231C、GUS1、YGR111W、VMA4、YDR056C、SCS2、NQM1、UFE1、COG1、PAA1、IRC22、KTR1、TYW1、SSB1、SVP26、ESC8、YNL010W、TIF1、EAF6、SHC1、KIN2、DCS2、RPS1B、URA5、DSD1、YJL218W、NPT1、SRO77、FMN1、CMD1、YTA6、RPL21A、ALG3、KRE2、PCL5、MDM34、PFS2、SNF12、BNA1、AIM29、SNU13、RNR4、MAP2、DCS1、RPN5、PDC2、DOP1、SPO74、PAP1、RPL24B、RPN8、FPR3、ERS1、CPR1、FIT3、HUG1、VPS5、PEX3、RPS29A、ERV29、CAF20、DOG2、RPL4A、YCP4、PBY1、FUS2、SNF2、SUI1、YMR262W、BUD8、TED1、TAH1、YCL048W-A、RPL41A、YDR374C、VMA8、YKR051W、YFL042C、ORM2、TAF12、APE3、YDR239C、ERV2、SHR5、YHR192W、YRB30、PHO88、WHI2、LYS1、RHO1、VPS27、VMA6、PAB1、YJR015W、SIR2、FAR1、CPT1、ECM15、ROK1、YFR018C、HYR1、POL1、CTS2、UBA4、SRP72、RTN2、HAP1、ARE2、RCK2、INM2、AFR1、YOS9、RTT103、RPS12、RNY1、PPA1、LEU3、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が1.6以上のターミネーター領域としては、SRB5、UPF3、YML096W、ARG81、NPR2、PSH1、TAF6、MCT1、SBH1、PBN1、VPS45、SRP68、SAY1、PEP1、CCT4、COQ10、RET3、SSE1、YSP3、ABZ1、PNS1、DPB3、YDL073W、ATM1、RBD2、YFR006W、DDI1、DCP1、SAS10、RMT2、FIG1、MUS81、UBI4、YBR285W、DLD1、RPS15、YPR170W-B、SRP1、PSK1、RAD4、PGD1、PMT4、ABF2、SEC24、URA10、CWC23、RPS11B、TPM1、YLR290C、TRM9、YAP1、UGP1、SPS2、PDR10、POM34、PNC1、STE11、GRH1、YMR018W、TRS33、HEF3、LAT1、BDS1、HMF1、PRP6、FSH3、SRB2、DUG1、ERD2、CDA2、RPS6A、HUT1、SHS1、IRA1、SSA3、ELP3、PRP46、CSM3、PEP4、YHC3、MDY2、RPL43A、HRQ1、YKL023W、DFM1、PCL8、SKG3、GPH1、NEJ1、URA4、GPX1、HOS2、YDR531W、PEP3、MAL31、YGR283C、HFD1、SPR28、SWP82、FUM1、CDA1、HOM6、NHX1、SNF6、ECI1、CDC10、MIS1、YIL165C、GTT1、PLP2、PFA4、RPL30、PRE3、MTD1、MNT2、ECM30、YNL208W、YCR024C-B、PCA1、HCS1、DCC1、FAR8、PPH22、DED81、GPM1、COF1、YGR042W、YPR148C、VPS55、JLP1、CAT2、GCN1、YGL231C、GUS1、YGR111W、VMA4、YDR056C、SCS2、NQM1、UFE1、COG1、PAA1、IRC22、KTR1、TYW1、SSB1、SVP26、ESC8、YNL010W、TIF1、EAF6、SHC1、KIN2、DCS2、RPS1B、URA5、DSD1、YJL218W、NPT1、SRO77、FMN1、CMD1、YTA6、RPL21A、ALG3、KRE2、PCL5、MDM34、PFS2、SNF12、BNA1、AIM29、SNU13、RNR4、MAP2、DCS1、RPN5、PDC2、DOP1、SPO74、PAP1、RPL24B、RPN8、FPR3、ERS1、CPR1、FIT3、HUG1、VPS5、PEX3、RPS29A、ERV29、CAF20、DOG2、RPL4A、YCP4、PBY1、FUS2、SNF2、SUI1、YMR262W、BUD8、TED1、TAH1、YCL048W-A、RPL41A、YDR374C、VMA8、YKR051W、YFL042C、ORM2、TAF12、APE3、YDR239C、ERV2、SHR5、YHR192W、YRB30、PHO88、WHI2、LYS1、RHO1、VPS27、VMA6、PAB1、YJR015W、SIR2、FAR1、CPT1、ECM15、ROK1、YFR018C、HYR1、POL1、CTS2、UBA4、SRP72、RTN2、HAP1、ARE2、RCK2、INM2、AFR1、YOS9、RTT103、RPS12、RNY1、PPA1、LEU3、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5 SRB5、UPF3、YML096W、ARG81、NPR2、PSH1、TAF6、MCT1、SBH1、PBN1、VPS45、SRP68、SAY1、PEP1、CCT4、COQ10、RET3、SSE1、YSP3、ABZ1、PNS1、DPB3、YDL073W、ATM1、RBD2、YFR006W、DDI1、DCP1、SAS10、RMT2、FIG1、MUS81、UBI4、YBR285W、DLD1、RPS15、YPR170W-B、SRP1、PSK1、RAD4、PGD1、PMT4、ABF2、SEC24、URA10、CWC23、RPS11B、TPM1、YLR290C、TRM9、YAP1、UGP1、SPS2、PDR10、POM34、PNC1、STE11、GRH1、YMR018W、TRS33、HEF3、LAT1、BDS1、HMF1、PRP6、FSH3、SRB2、DUG1、ERD2、CDA2、RPS6A、HUT1、SHS1、IRA1、SSA3、ELP3、PRP46、CSM3、PEP4、YHC3、MDY2、RPL43A、HRQ1、YKL023W、DFM1、PCL8、SKG3、GPH1、NEJ1、URA4、GPX1、HOS2、YDR531W、PEP3、MAL31、YGR283C、HFD1、SPR28、SWP82、FUM1、CDA1、HOM6、NHX1、SNF6、ECI1、CDC10、MIS1、YIL165C、GTT1、PLP2、PFA4、RPL30、PRE3、MTD1、MNT2、ECM30、YNL208W、YCR024C-B、PCA1、HCS1、DCC1、FAR8、PPH22、DED81、GPM1、COF1、YGR042W、YPR148C、VPS55、JLP1、CAT2、GCN1、YGL231C、GUS1、YGR111W、VMA4、YDR056C、SCS2、NQM1、UFE1、COG1、PAA1、IRC22、KTR1、TYW1、SSB1、SVP26、ESC8、YNL010W、TIF1、EAF6、SHC1、KIN2、DCS2、RPS1B、URA5、DSD1、YJL218W、NPT1、SRO77、FMN1、CMD1、YTA6、RPL21A、ALG3、KRE2、PCL5、MDM34、PFS2、SNF12、BNA1、AIM29、SNU13、RNR4、MAP2、DCS1、RPN5、PDC2、DOP1、SPO74、PAP1、RPL24B、RPN8、FPR3、ERS1、CPR1、FIT3、HUG1、VPS5、PEX3、RPS29A、ERV29、CAF20、DOG2、RPL4A、YCP4、PBY1、FUS2、SNF2、SUI1、YMR262W、BUD8、TED1、TAH1、YCL048W-A、RPL41A、YDR374C、VMA8、YKR051W、YFL042C、ORM2、TAF12、APE3、YDR239C、ERV2、SHR5、YHR192W、YRB30、PHO88、WHI2、LYS1、RHO1、VPS27、VMA6、PAB1、YJR015W、SIR2、FAR1、CPT1、ECM15、ROK1、YFR018C、HYR1、POL1、CTS2、UBA4、SRP72、RTN2、HAP1、ARE2、RCK2、INM2、AFR1、YOS9、RTT103、RPS12、RNY1、PPA1、LEU3、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が1.7以上のターミネーター領域としては、DCC1、FAR8、PPH22、DED81、GPM1、COF1、YGR042W、YPR148C、VPS55、JLP1、CAT2、GCN1、YGL231C、GUS1、YGR111W、VMA4、YDR056C、SCS2、NQM1、UFE1、COG1、PAA1、IRC22、KTR1、TYW1、SSB1、SVP26、ESC8、YNL010W、TIF1、EAF6、SHC1、KIN2、DCS2、RPS1B、URA5、DSD1、YJL218W、NPT1、SRO77、FMN1、CMD1、YTA6、RPL21A、ALG3、KRE2、PCL5、MDM34、PFS2、SNF12、BNA1、AIM29、SNU13、RNR4、MAP2、DCS1、RPN5、PDC2、DOP1、SPO74、PAP1、RPL24B、RPN8、FPR3、ERS1、CPR1、FIT3、HUG1、VPS5、PEX3、RPS29A、ERV29、CAF20、DOG2、RPL4A、YCP4、PBY1、FUS2、SNF2、SUI1、YMR262W、BUD8、TED1、TAH1、YCL048W-A、RPL41A、YDR374C、VMA8、YKR051W、YFL042C、ORM2、TAF12、APE3、YDR239C、ERV2、SHR5、YHR192W、YRB30、PHO88、WHI2、LYS1、RHO1、VPS27、VMA6、PAB1、YJR015W、SIR2、FAR1、CPT1、ECM15、ROK1、YFR018C、HYR1、POL1、CTS2、UBA4、SRP72、RTN2、HAP1、ARE2、RCK2、INM2、AFR1、YOS9、RTT103、RPS12、RNY1、PPA1、LEU3、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が1.8以上のターミネーター領域としては、FUS2、SNF2、SUI1、YMR262W、BUD8、TED1、TAH1、YCL048W-A、RPL41A、YDR374C、VMA8、YKR051W、YFL042C、ORM2、TAF12、APE3、YDR239C、ERV2、SHR5、YHR192W、YRB30、PHO88、WHI2、LYS1、RHO1、VPS27、VMA6、PAB1、YJR015W、SIR2、FAR1、CPT1、ECM15、ROK1、YFR018C、HYR1、POL1、CTS2、UBA4、SRP72、RTN2、HAP1、ARE2、RCK2、INM2、AFR1、YOS9、RTT103、RPS12、RNY1、PPA1、LEU3、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が1.9以上のターミネーター領域としては、ERG27、TMA29、UBX3、VPS15、RPT6、LDB18、YPL088W、RPL5、RVS167、TIR2、PHA2、ERJ5、VPS30、IMD2、PES4、EMI1、YPR085C、YBR200W-A、FMP40、REH1、SGT1、CPS1、YOP1、TRR2、STS1、VPH1、SWA2、YGR026W、CDC53、FMP52、YDR119W、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が2.0以上のターミネーター領域としては、RNQ1、SAG1、RPS20、TRM82、VPS1、YIP5、YPR1、ENT2、YPT31、PRX1、YHL039W、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、例えば、ターミネーター領域としては、YHI9、BUD32、YLR361C-A、APL2、PTP3、YMR114C、LSC2、ATG10、SRP54、ENT3、RPL3、TYR1、NAT1、YNR021W、EBS1、HBT1、RPL15A、RPL41B、RPP2B、CBR1、BNA4、PRC1、DIT1、RPS28A、ASP3-1、IDP1、SCW4、VMA2、ALY2、NAT5が挙げられる。
また、ターミネーター領域としては、RPL41B、RPL15A、DIT1、RPL3、IDP1、YHI9、YHL039W、PPA1、PRC1、VMA2、NAT5、RPS28A、NAT1、CDC53、EBS1、YMR114C、LSC2、ALY2、BNA4、YIP5、ATG10、CBR1、ASP3-1、SRP54、YNR021W、YDR119W、YLR361C-A、YPT31、BUD32及びAPL2も好ましい。これら30種のターミネーター領域は、より高い確度で高いターミネーター活性を発揮できる。さらには、RPL41B、RPL15A、DIT1、RPL3、IDP1が好ましい。これらはさらに高い確度でかつ高いターミネーター活性を発揮できる。すなわち、異なる栄養条件、塩ストレス、浸透圧ストレス及び宿主において高い確度で高いターミネーター活性を発揮できる。なかでも、DIT1、RPL41B及びRPL3は、例えば、異なる栄養条件下であっても、高いターミネーター活性を発揮できる。また、RPL41B及びIDP1は、例えば、培地の塩ストレスに抵抗性があり塩ストレス下でも高いターミネーター活性を発揮できる。さらに、DIT1及びRPL41Bは、例えば、浸透圧ストレスに抵抗性があり、浸透圧ストレス下でも高いターミネーター活性を発揮できる。さらにまた、DIT1は、例えば、宿主を選ばず高いターミネーター活性を発揮できる。
また、所望の遺伝子(酵母において内在性であってもよいし外来性であってもよい。)の発現出力を抑制したいときには、前記発現強度情報に基づいて、低い発現強度を呈したターミネーター領域を用いることができる。好ましくは、相対強度が0.8以下であり、より好ましくは0.7以下であり、さらに好ましくは0.6以下であり、より一層好ましくは0.5以下であり、さらに一層好ましくは0.4以下であり、さらに好ましくは0.3以下であり、さらに好ましくは0.2以下であり、最も好ましくは0.1以下である。
例えば、相対発現強度が0.8以下のターミネーター領域としては、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34、YIR021W-A、FZF1、YHK8、YGL188C-A、HCM1、CDC6、YPR157W、CLB6、YOX1、YLR285C-A、YDR114C、YHR199C-A、MPS3、MUP3、YIR014W、AAR2、YPT35、AIM33、SCW11、BDF1、YCL042W、BSC4、YGL193C、NUT2、YJL118W、YKL069W、SRB8、YOR060C、MDH2、YPR116W、YPK2、GLN3、YDL211C、RAD55、CYM1、ENT4、ULA1、YMR182W-A、YKR017C、YOR302W、YOR072W-B、VTS1、FYV12、YGL235W、YHR086W-A、YEL067C、YPL257W、UBA3、YMR105W-A、YOR316C-A、TMA10、YDL159W-A、ATG29、YML037C、NSL1、YJL077W-B、POP3、WHI5、MIH1、YGR240C-A、YRM1、KAR9、YJU2、SPC24、DPB2、CHL4、YMR087W、CSI1、YIL134C-A、BUR2、PTH1、SSN8、AUA1、YLR154C-G、YLR342W-A、YCL001W-A、FLC1、YLL006W-A、VAM7、YPL077C、CCZ1、PRP28、ACM1、IME4、YPR096C、FRE5、PDR8、ILV5、YIL161W、PAC11、UBR2、YRB2、YLR125W、YMR253C、DSE4、EPL1、SNP1、YMR160W、SPO77、BUB1、YFR016C、SPC97、GEM1、INO2、SPT10、YLR132C、AIM45、YJR054W、MBF1、YAL064C-A、YML054C-A、NUP1、ECM27、YIL060W、IRE1、YHR177W、YJR079W、YNL187W、YML003W、PIH1、YDR169C-A、PET111、YDL109C、YOR012W、YHR050W-A、TAR1、RIM9、YCR095W-A、RPR2、COS7、YDR049W、CUS1、JJJ3、COS10、MET1、HXT8、GLY1、SUR1、RTG1、PHM7、YJL052C-A、HXT17、YFL052W、ATG1、ECM2、YNR075C-A、YKR041W、ALD5、YHL018W、LUC7、YPS5、YLR297W、SNA4、BIO4、YBR298C-A、ECM12、SEF1、YMR247W-A、EXO1、CTF13、HUR1、SNO3、BSC5、YER175W-A、PGA1、YLR173W、YDR119W-A、IRC15、MGA1、YPR174C、IML3、YLL054C、RDS1、MDM32、PET494、YPR036W-A、GTB1、ISF1、KRE29、SAP190、YHR214C-E、GTO3、YOR365C、MIP1、SIP5、YPL191C、YPL162C、YMR291W、BRN1、MDM1、NAT4、YLR406C-A、YME1、CSI2、YOR008C-A、CEF1、BUD25、DFG16、GPB1、KAR1、PPM2、DSS1、RPC37、VID24、ERV41、YGR169C-A、ECM8、YHR032W、ELA1、PEX29、LTE1、HAT2、SLI1、MUP1、ALG13、FRE7、YMR147W、ISU2、YOR1、JID1、ECM3、ATG5、MED6、YPL014W、YLR030W、AQY2、CCT2、YER067W、NRG1、SPT8、PIR1、YGR068C、YER039C-A、ELM1、ASE1、YBL095W、YNR066C、MTL1、CNE1、CAX4、NDI1、FLX1、YNL130C-A、CWC25、YNL254C、CDC13、ATP10、OCT1、ALF1、YEF1、BAP2、HTL1、PDC5、PKP1、SSK2、CAF120、SKN1、HHF1、CDC39、YFR012W、YEL048C、HAP4、PEX7、TPO1、NFT1、NGL3、YMR206W、DUS3、YAP7、CUS2、YLR415C、FUI1、SLM5、BTT1、YFR035C、RRN10、HAP3、SSY5、SFL1、KIP1、CDC15、GLT1、DOC1、MND1、AAC1、CEP3、UBC5、YNL213C、CLN3、CSF1、ECM18、MRS4、YIL046W-A、INP1、RTT105、MPT5、ATG15、RNH202、TAX4、IZH3、BDF2、COX14、YIP4、YJR120W、SAE2、YMC2、YGR035C、NDD1、HPA2、STL1、GPM3、ERF2、MMS21、YJL133C-A、YNL024C、IFH1、LIN1、ICS3、YNR014W、SPB1、YNL211C、SOL1、COS111、HSH155、NKP2、NAB3、FMT1、YPL152W-A、BOR1、SPC25、MMS1、YIL166C、MAL13、BFA1、AEP3、MTH1、YGR031W、BIT61、YMR230W-A、SKT5、YGL258W-A、PHR1、HTB2、SER1、BAP3、YER053C-A、ATG16、BIO2、MEP3、YNR073C、PCH2、APS2、MDM30、CLB5、ISR1、MRP20、GUD1、MED1、RER2、MCM10、YIR018C-A、SPO14、NUC1、MNN4、IFM1、YLR412C-A、ALT2、NNF1、YKL096C-B、RAD51、CIT2、SPT4、LRC4、USE1、YLR455W、YOL164W-A、PRP18、COA2、HSP82、YER184C、DAD2、LEU1、YDL129W、YPL119C-A、YOR034C-A、PRP38、MSA1、YBR147W、BBP1、MLH1、SWC3、SOH1、HHF2、NIP1、MSL1、RIF2、SPG1、WHI3、HTA1、ARR3、YIL077C、SGF29、RAD53、YEL073C、YNR065C、NCA3、YBR296C-A、ECM23、YLR225C、SLD3、YBR197C、YBL059W、YOL075C、DNA2、SIZ1、REC114、MSN1、RGT2、CBF1、YGL176C、PTP2、GAL3、VPS62、HMS2、SMF3、APL1、SKI3、MNS1、YOR214C、TID3、KSS1、YDR194W-A、UPC2、ARG80、MRS2、ATP23、YML100W-A、YGL101W、STE12、RPI1、YDR090C、YEH1、UTP13、AMN1、YIL089W、AVL9、ATO2、HEM3、RPA14、GIP3、YGR053C、ALR2、YAP5、CDD1、SLS1、MET6、ABM1、PET20、CBP1、RAD10、SPO22、PIB1、EAF3、YFR032C-B、ELP2、YIA6、PET112、PAU7、MEI4、YEA4、SGS1、JEN1、CLB2、GIC2、SWI6、ULP2、KIN28、YKL033W、CSM4、YNL095C、RRN3、RNR1、TPO3、SUP45、ABP140、RPS28B、MRF1、GLN1、OPT1、PHO4、UBP10、YOL163W、MDS3、OTU1、GAT1、HDA3、MSY1、GNP1、YFL041W-A、YPL141C、MPH2、PMA1、YNL260C、SKS1、YDL177C、SWR1、RMD5、RPL9B、MIC14、AOS1、LRG1、ROX1、PCL10、MRPL3、YER152C、EAF1、HTB1、SPA2、SSN2、YJR129C、ATG8、RHR2、TFG2、YBL100W-C、CSM2、EXG1、STE7、ADH2、SNT2、PML39、SEC2、ASI2、MNT3、BUR6、BIO5、YDR506C、RDR1、MRPL33、YGL159W、RIM8、YGR161W-C、YIG1、PDR16、YDR249C、YDR124W、HSP30、SDH2、YER130C、FAA3、BUD22、TIM22、CBP6、ICE2、SPC110、AFT2、NAM2、YPR071W、DIP5、SDS3、POP4、OCA6、PTC6、YBR201C-A、YPR127W、SEC10、ASF2、SLI15、RRN7、ORC2、GUF1、GPI2、RPS9A、RAD6、PSR2、RIP1、GZF3、CAR1、YHR151C、LEU5、YBR182C-A、IRC7、ASG7、YOR381W-A、OCA5、YHR035W、PET117、ISD11、HSP150、CCC2、YHR131C、MRK1、RXT2、PPH3、ODC2、SHE9、YCR075W-A、CYB5、YDR415C、LRO1、SOF1、YNL162W-A、PAU14、MTO1、YKL061W、MSS11、SAN1、SET2、YMR1、PHD1、YBL071C-B、MPA43、SAM37、AAT1、ASH1、UTR2、CAT8、SLX8、HXT2、COY1、TAF3、DSS4、TOR1、YMR030W-A、PAU5、SFP1、FHL1、COX10、DDR2、SWM1、HXT6、RCR2、YLR091W、RMD9、SHQ1、YLR346C、SPT21、ARE1、KAP95、YGR071C、TRL1、ECM17、YML020W、RPO41、CFT1、LRC5、THI74、TPN1、YOR059C、PRY3、YEL1、CNM67、STB6、YOR385W、RRN6、COP1、PDR12、ELG1、SRP40、SRM1、YDR109C、AIM30、RPC17、YJL028W、YBR071W、APS1、KIP2、ATP22、PRM6、BUD31、IXR1、NFI1、YHL015W-A、VHS3、YNL295W、SML1、SSK1、YAE1、RIM2、YDR246W-A、YLR445W、SPT23、MTG2、SGF11、BRL1、YMR315W、MRPS28、ERG5、UTP30、MDM35、ASR1、YIL102C-A、USA1、DOT6、COX23、ADH5、DAN4、RMA1、SCT1、PHO84、SFG1、SLX4、EST1、YNL190W、SNL1、RRP15、YML082W、DOT1、PEX1、YUR1、YAP1802、YDR185C、GET2、YPL264C、YDR065W、YJR115W、MAK21、YER064C、ATR1、IDP2、KCS1、ZPR1、ITC1、OAZ1、SWC7、RPL8A、CAC2、VTH1、OCH1、BUL1、YNR004W、LST7、MRPS8、TIS11、NDC1、TOS8、ISM1、MSL5、FMP43、YJR098C、COQ3、TPC1、RIM101、ADR1、ALD6、YHR087W、VPS21、POG1、YJR005C-A、SNT1、YHR022C、MEF1、PUP2、ERP6、HHT2、YGR146C、OAR1、YOR129C、YCR045C、DBP7、MUB1、YPL236C、RIB2、YPR084W、AIM5、UTR5、HKR1、YMR010W、ALR1、LRE1、RPN4、YLR363W-A、MGM1、HTD2、NAM8、SED5、YOR161C-C、YML018C、NAB2、YER140W、PRM4、RTR1、YIR042C、THI80、FUN19、DMR1、SIP1、CGR1、MTR3、YJL144W、RIM13、SAL1、MET28、INM1、VID27、CDC34、SRO9、RRP9、YOL087C、MCM22、YMR111C、NDJ1、ATG12、MSM1、SRS2、YBR225W、YLR063W、AI1、CDC36、ASN1、MET31、SSP1、NGG1、RBA50、PUT1、YPT53、NMA2、YBR219C、CDC40、SGO1、YJL047C-A、RPC31、INP52、UGO1、RAD30、CLB1、GLO4、TPK3、GIM3、CDC9、PEX27、AIM32、YGL081W、DJP1、HMS1、JSN1、UBP12、RSM25、UBP5、GIP1、PUT3、CKI1、FAR7、LAG2、DAM1、PSD2、HMT1、COR1、MMR1、MRPL39、CTF8、AGP2、PRM7、HIT1、HAL9、GPA2、TIM44、TFB1、ECM19、MRPL32、YBR284W、NAS2、SBE22、YOR011W-A、ORT1、MRPL25、QNQ1、APC4、TYE7、YPP1、MMT1、MRP10、MRPS5、LIP5、CDC27、ESC2、CAN1、MEC1、TOP1、SLM3、SIP4、URN1、YCK3、USO1、RSM19、ASG1、ISU1、YHL008C、YNL313C、KKQ8、FCY2、GPD1、HHT1、MDJ2、SDH1、SSF1、PIP2、STE13、AZF1、VPS35、YGL146C、TAM41、MIF2、YDL118W、HFM1、PRR1、MRE11、FMP37、MLH2、BUD5、YOR342C、PCL1、DHR2、CDC5、CBP3、RLP24、LSG1、NCL1、YDR262W、PGA3、MID2、YJL027C、YOR305W、QCR6、MSC6、RSC4、PAU18、POL12、SME1、DBF2、RPS27A、NHP6A、YGK3、SLO1、AIM36、UBP13、TRI1、CTH1、PGS1、NMD4、YIL064W、BAR1、BCS1、YBL029W、CTR1、MRPL20、AGP3、YOR338W、FCF2、YOR052C、YJL147C、RSA1、PEX8、YOL159C、RRP45、YDL199C、LIA1、THI2、TRZ1、CYT2、MGM101、YNL277W-A、ARP8、MRPL36、YAR028W、PAU2、SLD5、SMD1、YNL086W、QCR7、FMC1、HOS4、HEM1、NAM7、YPL108W、BUD14、BOI2、HRD1、YOL114C、RIS1、SIC1、BST1、KES1、MET4、TRS120、SYC1、NPA3、YLH47、SRL2、LRC3、MHR1、ZIP2、EAR1、RSF1、RIO2、MET2、NOP4、SRD1、PWP2、MST1、PCK1、CDC7、TOK1、PRO1、RAX2、LSM7、SHG1、TOM7、DAS2、SIP2、RRS1、EUG1、POX1、RAD61、SUN4、HAA1、YNR048W、ACO2、YOL047C、PMD1、FZO1、YEL025C、GPR1、BNI1、RSA4、YMR185W、PAU16、ECM7、YHP1、COG8、LST8、HST1、ESA1、YJL160C、MER1、CIN8、WSS1、PAT1、LRC6、FMP30、LYS21、MET18、MRPL50、GCR1、YOR022C、YJR012C、PDR3、YPL229W、SFK1、DUS4、IDS2、YOL036W、PHM6、YPR117W、RPB7、MCM2、MRS1、GLO2、YKL105C、RCK1、AME1、DIA3、HOM3、YDR541C、PMT6、DSE2、YJL216C、RIO1、ALB1、IBA57、YOR268C、CWC24、ARD1、UTP15、MSE1、UBS1、YNL234W、YDL025C、CAF40、YBR221W-A、ATP18、MAL33、YPT6、OAC1、YJR151W-A、YML108W、COX17、RAD52、HST3、TAZ1、YNR064C、YGL010W、MFA2、PGM3、NRM1、CRS5、CTM1、SKG6、SYF2、HYM1、IPI3、MDH1、TFB2、HST4、MRPL24、YMR166C、AVT5、YGR021W、SUV3、YNL146W、MID1、AKL1、MTR10、LAA1、HDA1、SMY2、MRPL8、PLB2、CWP1、ECM14、ECM1、GAL2、FAS1、KEL1、SET7、TSR2、FET5、DRE2、MMS4、TGS1、COQ1、SUR7、PCL2、SER2、YFL034W、MKK1、SSA2、AVO1、FMP25、YRR1、SLX5、SAF1、YPL260W、YKR096W、UTP14、PAM18、WTM1、STE18、AIM20、SYM1、SIT4、SSH4、MEI5、CYC8、DSN1、STB3、IMD4、YPL109C、ECM25、YMR102C、YDR306C、SUL2、YOL019W、PAU10、HNM1、MRPL1、CMK1、YBR196C-A、YGL226W、YPR147C、PGM2、SLM4、MSS1、YER121W、YDR381C-A、VPS72、YJL043W、PAN6、YMR086W、MDN1、HEH2、YKE4、YKL162C、ZRG8、HIP1、YPR145C-A、YCL056C、ERG1、INP54、MRPS16、MOD5、YJR008W、RMI1、YNL146C-A、RRF1、CAF130、BUD9、GWT1、BEM3、STF2、SSN3、MAS2、SLN1、TLG1、NOP6、YOR097C、HVG1、GCD11、TDP1、ATC1、CIT1、GRR1、RPA12、ADY3、CTA1、SWS2、SNF8、CIS3、MRPL4、CLB4、DBP2、APQ12、UTP5、MPD1、MRS3、AIM43、ATP11、SNU66、ARF3、YKU80、YLR422W、EGT2、MSP1、YLR218C、MRPL44、YHR127W、UBP3、SOD2、CYT1、POP6、HSP10、YHR033W、YKL161C、KIN82、YNL165W、CYC7、FYV7、TAT1、YNR040W、DBP3、SMY1、TRP3、SSL2、RPS24B、UTP4、SAW1、DAN2、YPR011C、YER156C、YGL059W、TRM5、SUT2、IML2、ATP1、CKA1、ECM31、MSK1、SCC2、SYG1、RPO26、YPR114W、HIR3、YIL029C、MAC1、YOR296W、IST3、HOR2、ITT1、PRP22、ROD1、DIA4、FMP32、TOM70、DIP2、YPR159C-A、PSP1、BTS1、ECM37、AST1、SMP1、BPL1、UPS1、BAG7、NOG2、RPC10、CYB2、SMD2、RAD1、ATP3、STP2、BUD21、RRN5、YLR352W、FRE4、PAN2、APL3、SEC7、DUS1、CSE1、MAK3、MRPL19、DBP1、FMP48、JAC1、VPS54、FUR1、PUP3、FUN26、SWI1、PWP1、BUD23、ATF1、FMP16、YOL024W、IPK1、RLM1、YNG2、MSS2、FLO8、SHY1、KSP1、KNH1、DON1、KTI11、SMC5、FPS1、SHU1、RAV2、YOR356W、PFA3、ERG8、SEN15、YNL152W、YJL193W、MSH2、CYC1、YLR446W、MRPL13、ISA1、HUA1、YHL010C、NNT1、RMD8、PPR1、ECM9、BSC2、ACO1、MPS2、LEE1、COG5、MCM1、RFC1、TAT2、DML1、KRE9、SPT2、SPC19、QCR8、HXT1、DOA4、MSR1、STU1、ERG10、TFB4、ATG21、GYP6、DAD4、OAF1、YPR013C、GAS1、FAP7、CPA2、RPO31、ATG20、TEP1、YBL081W、SMP3、MCD1、ADK2、SAD1、HUA2、BUD2、YJR136C、RPS14B、MNL1、MDJ1、FLO10、REB1、DSF2、KHA1、MRPL35、YOR283W、PPG1、CIT3、FAA4、SPL2、MET8、HOP2、HFA1、HAP5、ROG1、MAM3、DPH1、RTG3、YNL195C、DCN1、YLR211C、OXA1、YET2、RSC2、MRPL28、CTT1、YAP3、BIG1、UBP8、YOL019W-A、RIB5、NOG1、VID30、MRP17、ZRT1、UAF30、SPO23、YNL122C


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また、例えば、相対発現強度が0.7以下のターミネーター領域としては、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34、YIR021W-A、FZF1、YHK8、YGL188C-A、HCM1、CDC6、YPR157W、CLB6、YOX1、YLR285C-A、YDR114C、YHR199C-A、MPS3、MUP3、YIR014W、AAR2、YPT35、AIM33、SCW11、BDF1、YCL042W、BSC4、YGL193C、NUT2、YJL118W、YKL069W、SRB8、YOR060C、MDH2、YPR116W、YPK2、GLN3、YDL211C、RAD55、CYM1、ENT4、ULA1、YMR182W-A、YKR017C、YOR302W、YOR072W-B、VTS1、FYV12、YGL235W、YHR086W-A、YEL067C、YPL257W、UBA3、YMR105W-A、YOR316C-A、TMA10、YDL159W-A、ATG29、YML037C、NSL1、YJL077W-B、POP3、WHI5、MIH1、YGR240C-A、YRM1、KAR9、YJU2、SPC24、DPB2、CHL4、YMR087W、CSI1、YIL134C-A、BUR2、PTH1、SSN8、AUA1、YLR154C-G、YLR342W-A、YCL001W-A、FLC1、YLL006W-A、VAM7、YPL077C、CCZ1、PRP28、ACM1、IME4、YPR096C、FRE5、PDR8、ILV5、YIL161W、PAC11、UBR2、YRB2、YLR125W、YMR253C、DSE4、EPL1、SNP1、YMR160W、SPO77、BUB1、YFR016C、SPC97、GEM1、INO2、SPT10、YLR132C、AIM45、YJR054W、MBF1、YAL064C-A、YML054C-A、NUP1、ECM27、YIL060W、IRE1、YHR177W、YJR079W、YNL187W、YML003W、PIH1、YDR169C-A、PET111、YDL109C、YOR012W、YHR050W-A、TAR1、RIM9、YCR095W-A、RPR2、COS7、YDR049W、CUS1、JJJ3、COS10、MET1、HXT8、GLY1、SUR1、RTG1、PHM7、YJL052C-A、HXT17、YFL052W、ATG1、ECM2、YNR075C-A、YKR041W、ALD5、YHL018W、LUC7、YPS5、YLR297W、SNA4、BIO4、YBR298C-A、ECM12、SEF1、YMR247W-A、EXO1、CTF13、HUR1、SNO3、BSC5、YER175W-A、PGA1、YLR173W、YDR119W-A、IRC15、MGA1、YPR174C、IML3、YLL054C、RDS1、MDM32、PET494、YPR036W-A、GTB1、ISF1、KRE29、SAP190、YHR214C-E、GTO3、YOR365C、MIP1、SIP5、YPL191C、YPL162C、YMR291W、BRN1、MDM1、NAT4、YLR406C-A、YME1、CSI2、YOR008C-A、CEF1、BUD25、DFG16、GPB1、KAR1、PPM2、DSS1、RPC37、VID24、ERV41、YGR169C-A、ECM8、YHR032W、ELA1、PEX29、LTE1、HAT2、SLI1、MUP1、ALG13、FRE7、YMR147W、ISU2、YOR1、JID1、ECM3、ATG5、MED6、YPL014W、YLR030W、AQY2、CCT2、YER067W、NRG1、SPT8、PIR1、YGR068C、YER039C-A、ELM1、ASE1、YBL095W、YNR066C、MTL1、CNE1、CAX4、NDI1、FLX1、YNL130C-A、CWC25、YNL254C、CDC13、ATP10、OCT1、ALF1、YEF1、BAP2、HTL1、PDC5、PKP1、SSK2、CAF120、SKN1、HHF1、CDC39、YFR012W、YEL048C、HAP4、PEX7、TPO1、NFT1、NGL3、YMR206W、DUS3、YAP7、CUS2、YLR415C、FUI1、SLM5、BTT1、YFR035C、RRN10、HAP3、SSY5、SFL1、KIP1、CDC15、GLT1、DOC1、MND1、AAC1、CEP3、UBC5、YNL213C、CLN3、CSF1、ECM18、MRS4、YIL046W-A、INP1、RTT105、MPT5、ATG15、RNH202、TAX4、IZH3、BDF2、COX14、YIP4、YJR120W、SAE2、YMC2、YGR035C、NDD1、HPA2、STL1、GPM3、ERF2、MMS21、YJL133C-A、YNL024C、IFH1、LIN1、ICS3、YNR014W、SPB1、YNL211C、SOL1、COS111、HSH155、NKP2、NAB3、FMT1、YPL152W-A、BOR1、SPC25、MMS1、YIL166C、MAL13、BFA1、AEP3、MTH1、YGR031W、BIT61、YMR230W-A、SKT5、YGL258W-A、PHR1、HTB2、SER1、BAP3、YER053C-A、ATG16、BIO2、MEP3、YNR073C、PCH2、APS2、MDM30、CLB5、ISR1、MRP20、GUD1、MED1、RER2、MCM10、YIR018C-A、SPO14、NUC1、MNN4、IFM1、YLR412C-A、ALT2、NNF1、YKL096C-B、RAD51、CIT2、SPT4、LRC4、USE1、YLR455W、YOL164W-A、PRP18、COA2、HSP82、YER184C、DAD2、LEU1、YDL129W、YPL119C-A、YOR034C-A、PRP38、MSA1、YBR147W、BBP1、MLH1、SWC3、SOH1、HHF2、NIP1、MSL1、RIF2、SPG1、WHI3、HTA1、ARR3、YIL077C、SGF29、RAD53、YEL073C、YNR065C、NCA3、YBR296C-A、ECM23、YLR225C、SLD3、YBR197C、YBL059W、YOL075C、DNA2、SIZ1、REC114、MSN1、RGT2、CBF1、YGL176C、PTP2、GAL3、VPS62、HMS2、SMF3、APL1、SKI3、MNS1、YOR214C、TID3、KSS1、YDR194W-A、UPC2、ARG80、MRS2、ATP23、YML100W-A、YGL101W、STE12、RPI1、YDR090C、YEH1、UTP13、AMN1、YIL089W、AVL9、ATO2、HEM3、RPA14、GIP3、YGR053C、ALR2、YAP5、CDD1、SLS1、MET6、ABM1、PET20、CBP1、RAD10、SPO22、PIB1、EAF3、YFR032C-B、ELP2、YIA6、PET112、PAU7、MEI4、YEA4、SGS1、JEN1、CLB2、GIC2、SWI6、ULP2、KIN28、YKL033W、CSM4、YNL095C、RRN3、RNR1、TPO3、SUP45、ABP140、RPS28B、MRF1、GLN1、OPT1、PHO4、UBP10、YOL163W、MDS3、OTU1、GAT1、HDA3、MSY1、GNP1、YFL041W-A、YPL141C、MPH2、PMA1、YNL260C、SKS1、YDL177C、SWR1、RMD5、RPL9B、MIC14、AOS1、LRG1、ROX1、PCL10、MRPL3、YER152C、EAF1、HTB1、SPA2、SSN2、YJR129C、ATG8、RHR2、TFG2、YBL100W-C、CSM2、EXG1、STE7、ADH2、SNT2、PML39、SEC2、ASI2、MNT3、BUR6、BIO5、YDR506C、RDR1、MRPL33、YGL159W、RIM8、YGR161W-C、YIG1、PDR16、YDR249C、YDR124W、HSP30、SDH2、YER130C、FAA3、BUD22、TIM22、CBP6、ICE2、SPC110、AFT2、NAM2、YPR071W、DIP5、SDS3、POP4、OCA6、PTC6、YBR201C-A、YPR127W、SEC10、ASF2、SLI15、RRN7、ORC2、GUF1、GPI2、RPS9A、RAD6、PSR2、RIP1、GZF3、CAR1、YHR151C、LEU5、YBR182C-A、IRC7、ASG7、YOR381W-A、OCA5、YHR035W、PET117、ISD11、HSP150、CCC2、YHR131C、MRK1、RXT2、PPH3、ODC2、SHE9、YCR075W-A、CYB5、YDR415C、LRO1、SOF1、YNL162W-A、PAU14、MTO1、YKL061W、MSS11、SAN1、SET2、YMR1、PHD1、YBL071C-B、MPA43、SAM37、AAT1、ASH1、UTR2、CAT8、SLX8、HXT2、COY1、TAF3、DSS4、TOR1、YMR030W-A、PAU5、SFP1、FHL1、COX10、DDR2、SWM1、HXT6、RCR2、YLR091W、RMD9、SHQ1、YLR346C、SPT21、ARE1、KAP95、YGR071C、TRL1、ECM17、YML020W、RPO41、CFT1、LRC5、THI74、TPN1、YOR059C、PRY3、YEL1、CNM67、STB6、YOR385W、RRN6、COP1、PDR12、ELG1、SRP40、SRM1、YDR109C、AIM30、RPC17、YJL028W、YBR071W、APS1、KIP2、ATP22、PRM6、BUD31、IXR1、NFI1、YHL015W-A、VHS3、YNL295W、SML1、SSK1、YAE1、RIM2、YDR246W-A、YLR445W、SPT23、MTG2、SGF11、BRL1、YMR315W、MRPS28、ERG5、UTP30、MDM35、ASR1、YIL102C-A、USA1、DOT6、COX23、ADH5、DAN4、RMA1、SCT1、PHO84、SFG1、SLX4、EST1、YNL190W、SNL1、RRP15、YML082W、DOT1、PEX1、YUR1、YAP1802、YDR185C、GET2、YPL264C、YDR065W、YJR115W、MAK21、YER064C、ATR1、IDP2、KCS1、ZPR1、ITC1、OAZ1、SWC7、RPL8A、CAC2、VTH1、OCH1、BUL1、YNR004W、LST7、MRPS8、TIS11、NDC1、TOS8、ISM1、MSL5、FMP43、YJR098C、COQ3、TPC1、RIM101、ADR1、ALD6、YHR087W、VPS21、POG1、YJR005C-A、SNT1、YHR022C、MEF1、PUP2、ERP6、HHT2、YGR146C、OAR1、YOR129C、YCR045C、DBP7、MUB1、YPL236C、RIB2、YPR084W、AIM5、UTR5、HKR1、YMR010W、ALR1、LRE1、RPN4、YLR363W-A、MGM1、HTD2、NAM8、SED5、YOR161C-C、YML018C、NAB2、YER140W、PRM4、RTR1、YIR042C、THI80、FUN19、DMR1、SIP1、CGR1、MTR3、YJL144W、RIM13、SAL1、MET28、INM1、VID27、CDC34、SRO9、RRP9、YOL087C、MCM22、YMR111C、NDJ1、ATG12、MSM1、SRS2、YBR225W、YLR063W、AI1、CDC36、ASN1、MET31、SSP1、NGG1、RBA50、PUT1、YPT53、NMA2、YBR219C、CDC40、SGO1、YJL047C-A、RPC31、INP52、UGO1、RAD30、CLB1、GLO4、TPK3、GIM3、CDC9、PEX27、AIM32、YGL081W、DJP1、HMS1、JSN1、UBP12、RSM25、UBP5、GIP1、PUT3、CKI1、FAR7、LAG2、DAM1、PSD2、HMT1、COR1、MMR1、MRPL39、CTF8、AGP2、PRM7、HIT1、HAL9、GPA2、TIM44、TFB1、ECM19、MRPL32、YBR284W、NAS2、SBE22、YOR011W-A、ORT1、MRPL25、QNQ1、APC4、TYE7、YPP1、MMT1、MRP10、MRPS5、LIP5、CDC27、ESC2、CAN1、MEC1、TOP1、SLM3、SIP4、URN1、YCK3、USO1、RSM19、ASG1、ISU1、YHL008C、YNL313C、KKQ8、FCY2、GPD1、HHT1、MDJ2、SDH1、SSF1、PIP2、STE13、AZF1、VPS35、YGL146C、TAM41、MIF2、YDL118W、HFM1、PRR1、MRE11、FMP37、MLH2、BUD5、YOR342C、PCL1、DHR2、CDC5、CBP3、RLP24、LSG1、NCL1、YDR262W、PGA3、MID2、YJL027C、YOR305W、QCR6、MSC6、RSC4、PAU18、POL12、SME1、DBF2、RPS27A、NHP6A、YGK3、SLO1、AIM36、UBP13、TRI1、CTH1、PGS1、NMD4、YIL064W、BAR1、BCS1、YBL029W、CTR1、MRPL20、AGP3、YOR338W、FCF2、YOR052C、YJL147C、RSA1、PEX8、YOL159C、RRP45、YDL199C、LIA1、THI2、TRZ1、CYT2、MGM101、YNL277W-A、ARP8、MRPL36、YAR028W、PAU2、SLD5、SMD1、YNL086W、QCR7、FMC1、HOS4、HEM1、NAM7、YPL108W、BUD14、BOI2、HRD1、YOL114C、RIS1、SIC1、BST1、KES1、MET4、TRS120、SYC1、NPA3、YLH47、SRL2、LRC3、MHR1、ZIP2、EAR1、RSF1、RIO2、MET2、NOP4、SRD1、PWP2、MST1、PCK1、CDC7、TOK1、PRO1、RAX2、LSM7、SHG1、TOM7、DAS2、SIP2、RRS1、EUG1、POX1、RAD61、SUN4、HAA1、YNR048W、ACO2、YOL047C、PMD1、FZO1、YEL025C、GPR1、BNI1、RSA4、YMR185W、PAU16、ECM7、YHP1、COG8、LST8、HST1、ESA1、YJL160C、MER1、CIN8、WSS1、PAT1、LRC6、FMP30、LYS21、MET18、MRPL50、GCR1、YOR022C、YJR012C、PDR3、YPL229W、SFK1、DUS4、IDS2、YOL036W、PHM6、YPR117W、RPB7、MCM2、MRS1、GLO2、YKL105C、RCK1、AME1、DIA3、HOM3、YDR541C、PMT6、DSE2、YJL216C、RIO1、ALB1、IBA57、YOR268C、CWC24、ARD1、UTP15、MSE1、UBS1、YNL234W、YDL025C、CAF40、YBR221W-A、ATP18、MAL33、YPT6、OAC1、YJR151W-A、YML108W、COX17、RAD52、HST3、TAZ1、YNR064C、YGL010W、MFA2、PGM3、NRM1、CRS5、CTM1、SKG6、SYF2、HYM1、IPI3、MDH1、TFB2、HST4、MRPL24、YMR166C、AVT5、YGR021W、SUV3、YNL146W、MID1、AKL1、MTR10、LAA1、HDA1、SMY2、MRPL8、PLB2、CWP1、ECM14、ECM1、GAL2、FAS1、KEL1、SET7、TSR2、FET5、DRE2、MMS4、TGS1、COQ1、SUR7、PCL2、SER2、YFL034W、MKK1、SSA2、AVO1、FMP25、YRR1、SLX5、SAF1、YPL260W、YKR096W、UTP14、PAM18、WTM1、STE18、AIM20、SYM1、SIT4、SSH4、MEI5、CYC8、DSN1、STB3、IMD4、YPL109C、ECM25、YMR102C、YDR306C、SUL2、YOL019W、PAU10、HNM1、MRPL1、CMK1、YBR196C-A、YGL226W、YPR147C、PGM2、SLM4、MSS1、YER121W、YDR381C-A、VPS72、YJL043W、PAN6、YMR086W、MDN1、HEH2、YKE4、YKL162C、ZRG8、HIP1、YPR145C-A、YCL056C、ERG1、INP54、MRPS16、MOD5、YJR008W、RMI1、YNL146C-A、RRF1、CAF130、BUD9、GWT1、BEM3、STF2、SSN3、MAS2、SLN1、TLG1、NOP6、YOR097C、HVG1、GCD11、TDP1、ATC1、CIT1、GRR1、RPA12、ADY3、CTA1、SWS2、SNF8、CIS3、MRPL4、CLB4、DBP2、APQ12、UTP5、MPD1、MRS3、AIM43、ATP11、SNU66、ARF3、YKU80、YLR422W、EGT2、MSP1、YLR218C、MRPL44、YHR127W、UBP3、SOD2、CYT1、POP6、HSP10、YHR033W、YKL161C、KIN82、YNL165W、CYC7、FYV7、TAT1、YNR040W、DBP3、SMY1、TRP3、SSL2、RPS24B、UTP4、SAW1、DAN2、YPR011C、YER156C、YGL059W、TRM5、SUT2、IML2、ATP1、CKA1、ECM31、MSK1、SCC2、SYG1、RPO26、YPR114W、HIR3、YIL029C、MAC1、YOR296W、IST3、HOR2、ITT1、PRP22、ROD1、DIA4、FMP32、TOM70、DIP2、YPR159C-A、PSP1、BTS1、ECM37、AST1、SMP1、BPL1、UPS1、BAG7、NOG2、RPC10、CYB2、SMD2、RAD1、ATP3、STP2、BUD21、RRN5、YLR352W、FRE4、PAN2、APL3、SEC7、DUS1、CSE1、MAK3、MRPL19、DBP1、FMP48、JAC1、VPS54、FUR1、PUP3、FUN26、SWI1、PWP1、BUD23、ATF1、FMP16、YOL024W、IPK1、RLM1、YNG2、MSS2、FLO8、SHY1、KSP1、KNH1、DON1、KTI11、SMC5、FPS1、SHU1、RAV2、YOR356W、PFA3、ERG8、SEN15、YNL152W、YJL193W、MSH2、CYC1、YLR446W、MRPL13、ISA1、HUA1、YHL010C、NNT1、RMD8、PPR1、ECM9、BSC2、ACO1、MPS2、LEE1、COG5、MCM1、RFC1、TAT2、DML1、KRE9、SPT2、SPC19、QCR8、HXT1、DOA4、MSR1、STU1、ERG10、TFB4、ATG21、GYP6、DAD4、OAF1、YPR013C、GAS1、FAP7、CPA2、RPO31、ATG20、TEP1、YBL081W、SMP3、MCD1、ADK2、SAD1、HUA2、BUD2、YJR136C、RPS14B、MNL1、MDJ1、FLO10、REB1、DSF2、KHA1、MRPL35、YOR283W、PPG1、CIT3、FAA4、SPL2、MET8、HOP2、HFA1、HAP5、ROG1、MAM3、DPH1、RTG3、YNL195C、DCN1、YLR211C、OXA1、YET2、RSC2、MRPL28、CTT1、YAP3、BIG1、UBP8、YOL019W-A、RIB5、NOG1、VID30、MRP17、ZRT1、UAF30、SPO23、Y


NL122C、SNU71、CDC43、SPC29、DYS1、PRP11、SVF1、BUD20、MEK1、UBP16、PCF11、GRX4、UTP22、HRK1、RPB9、YPL272C、ERG29、DIS3、YFH1、MRM2、RRP5、PTI1、TIF6、FTH1、MPE1、FKS3、ESP1、YDL007C-A、DMC1、JHD2、LEU2、SNF3、SCJ1、YMR317W、CYK3、GPT2、FMP41、SIA1、HXK1、YGL057C、YLR287C、NSR1、YDL241W、RKR1、REX4、TIM17、TES1、RPO21、YNL300W、BSC6、YHR080C、OPI10、RPB8、UBP9、YKR011C、CRP1、RSM24、ARP1、SIK1、GCR2、YLR345W、FET4、MRPL40、THP2、AMD2、YDR524W-C、PSY4、BUD16、HPT1、YDR333C、RHO4、AHC1、YJL206C、SWT1、HEK2、ATP12、XBP1、RMD6、RPL15B、NUP42、PLC1、MAD3、YPS1、MCM16、HXT4、HXK2、ERG12、MMT2、YMR321C、MUM3、HST2、ROG3、DEF1、YLR281C、SSK22、MLH3、YGR131W、CSE4、YCL002C、MRPS18、CAD1、AIF1、SFC1、OYE3、EAF5、RSC9、GYL1、YDL063C、ISA2、GBP2、IMG1、NRP1、DHH1、RHB1、CIK1、PHO89、AGX1、RPB2、MRPL17、GPX2、LYP1、VPS9、BNA3、CKA2、OPI1、YER034W、RSM26、LSM6、THI3、SMC4、SWF1、YAH1、RPF2、HFI1、PLB1、MAM33、YLR413W、PRP8、ENO1、RPC19、YGL007C-A、YMR181C、URA7、YGL108C、SRB7、DAD1、LYS4、ATG18、FMP45、VAM3、SSC1、SNU56、YHR045W、HTA2、YJL213W、RPL20A、ALD4、QCR10、YGR287C、CBP4、PCI8、MCM4、DEM1、ATO3、TPS2、TAF1、KRE6、KGD2、ARB1、NMD5、EFR3、TRP4、HLJ1、ACE2、LDB17、ATG7、OSH6、AFT1、CTF4、YDR286C、AIM44、YLR149C、MRPS9、BET1、YLF2、BOI1、BUD4、CRF1、MLP2、ARX1、RRP12、NAT2、PCL7、ARP7、SFH1、STF1、YML081W、MRP49、FOL3、SAC7、PCS60、TPA1、SSS1、ERO1、NHP2、AIM1、AMD1、VPS38、COG3、YMR244C-A、PYC1、CCC1、TAO3、YDL233W、RPB10、YBR242W、EDC2、YVC1、YDR266C、PMT3、NIS1、YDR128W、ATP15、YML002W、ATG9、IKS1、SUR2、MSD1、SMC3、SPC1、MRPS35、ZIP1、YPR022C、YKL070W、RIM4、YJL127C-B、ARV1、YML6、CYC3、COX9、RMD11、SNU23、PRS2、YNL092W、TIF4632、CBP2、STP4、YIR024C、SHE1、EMG1、NUP192、THI7、NGL1、LDB19、AFG2、ROT1、PIK1、MRPL31、RHO2、MRPL49、FMO1、LRS4、CHS3、SEC8、HXT5、GRX3、YHL042W、AAC3、WSC4、PIN2、PUB1、ERG28、PSR1、ISY1、VPS70、IRC19、DNM1、RPA190、CCR4、SSU72、MRPL7、TBF1、YPR115W、SKP2、CDC73、RPL31B、MAK16、ERB1、DCG1、RNT1、RRP7、GCD7、RAD18、OMS1、YOL048C、PPT2、SCS7、YBL028C、RSC30、TIM23、PRI1、REC102、MCH5、PST1、CLB3、QCR9、MIR1、SSP120、MEF2、RPL14B、YPR003C、RLI1、SWC4、MTM1、SKY1、TOM1、YGL079W、ROM2、TFA2、AIM3、SSQ1、DUG2、MSF1、RPS0B、SCO2、OLE1、SBE2、SAR1、YJR116W、TEF1、AIM13、DFG5、YLR012C、MCM3、RPS7B、DFR1、YBL039W-B、RML2、RSM27、MEC3、YCG1、RFX1、RPL7B、CHS2、PEX5、TIF4631、RPL18B、SMB1、HUL4、NPL6、YOL107W、TRM1、STE6、ASK1、RAD9、YDL012C、RBG2、SEC6、YLR143W、XPT1、HGH1、YIL091C、PRS3、NTC20、YPR196W、MIC17、POA1、NPY1、SNQ2、ADE3、APT2、YGL082W、YHB1、MRPL16、CSH1、GUP1、YJL171C、IDP3、VHT1、PUG1、MPM1、RRP40、DPM1、AFG3、YBP2、YPL183W-A、AIM31、YCR015C、MSN4、YPL038W-A、TSC11、SEC59、ADA2、TPM2、YHR175W-A、POM152、YJR124C、RPL22B、COG7、NEW1、GSM1、UGX2、PRK1、GPD2、LDB16、PAM16、CMC1、TOM6、MBA1、SWC5、PRM10、SAM1、TRS31、YFT2、RGT1、RPL10、KRE33、CDC1、MRPL37、KEX2、VPS13、ACN9、RSC3、PBS2、EPS1、GPI18、ADH4、YTP1、YHM2、ZIM17、LYS5、AIM22、RGM1、ECM10、RDH54、DED1、CSE2、POC4、IPI1、SOL4、YKR075C、RSM10、MAE1、ATF2、SHE4、RSC1、GNT1、MSH4、HSK3、TRS20、NBP35、YBR090C、GLO1、FYV4、AEP2、ARP4、IES3、HYP2、DNF2、GAA1、RPA135、PCL9、SPT5、EDE1、ORC3、YOR304C-A、YCL047C、YER085C、YOL014W、YPL071C、GTS1、RFC2、NDE2、PET127、PLM2、YEA6、RPN7、MDL1、TMA64、NCE103、MCM6、MAS1、TSR1、BAS1、IRC4、TIM21、HCH1、APC5、PMP1、PUF6、YER077C、SNC2、MRP21、YLR036C、YME2、SEC12、YJL062W-A、YMR031C、YAL065C、YNR047W、NHP10、YOL083W、DLS1、IGO2、PAU17、NCS2、TAF7、YDL186W、CMK2、PUS7、TIM9、PMU1、MNP1、SEC16、RIF1、KAR3、MDL2、YLR356W、DCI1、ASP1、NET1、YPL068C、MOT3、NOC3、MRP13、GUT2、ICY1、NTO1、HOS3、TIM54、COX4、UBX2、RVB2、YBL059C-A、RBS1、DCR2、NEM1、MNN9、YNR036C、NOP15、SEC61、RTT106、CCT7、OSM1、SAS5、VPS29、KTI12、POL32、PUS9、SLF1、MUQ1、HSD1、KAR4、STN1、BAT1、THI71、RPL27B、COX5A、AEP1、LPP1、PRM1、YKL222C、TIP41、RPL43B、YCR043C、STP1、AIM8、HXT9、MRP7、YPL216W、SRB6、CTK2、RIT1、NST1、RIB7、MRPL38、SRT1、CBK1、ARL3、DRS2、YLR307C-A、GPI8、SHM2、IPL1、YPL041C、ARR1、GCN20、YPL039W、MNN1、SLX9、SEO1、RMP1、PSA1、CHS6、DAN1、RPB5、SIR3、BCP1、YLL058W、TNA1、TRM13、NOP1、SLP1、PEX31、YIF1、MSA2、ADH3、MNT4、GIS1、SLD2、PIN4、NVJ1、HTS1、RAD7、YKU70、NUF2、YIL001W、ASK10、YBL010C、ATP14、CDC123、MRPL51、YGR127W、YLR392C、APC2、DEP1、APS3、RCL1、DCD1、MIG3が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が0.6以下のターミネーター領域としては、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34、YIR021W-A、FZF1、YHK8、YGL188C-A、HCM1、CDC6、YPR157W、CLB6、YOX1、YLR285C-A、YDR114C、YHR199C-A、MPS3、MUP3、YIR014W、AAR2、YPT35、AIM33、SCW11、BDF1、YCL042W、BSC4、YGL193C、NUT2、YJL118W、YKL069W、SRB8、YOR060C、MDH2、YPR116W、YPK2、GLN3、YDL211C、RAD55、CYM1、ENT4、ULA1、YMR182W-A、YKR017C、YOR302W、YOR072W-B、VTS1、FYV12、YGL235W、YHR086W-A、YEL067C、YPL257W、UBA3、YMR105W-A、YOR316C-A、TMA10、YDL159W-A、ATG29、YML037C、NSL1、YJL077W-B、POP3、WHI5、MIH1、YGR240C-A、YRM1、KAR9、YJU2、SPC24、DPB2、CHL4、YMR087W、CSI1、YIL134C-A、BUR2、PTH1、SSN8、AUA1、YLR154C-G、YLR342W-A、YCL001W-A、FLC1、YLL006W-A、VAM7、YPL077C、CCZ1、PRP28、ACM1、IME4、YPR096C、FRE5、PDR8、ILV5、YIL161W、PAC11、UBR2、YRB2、YLR125W、YMR253C、DSE4、EPL1、SNP1、YMR160W、SPO77、BUB1、YFR016C、SPC97、GEM1、INO2、SPT10、YLR132C、AIM45、YJR054W、MBF1、YAL064C-A、YML054C-A、NUP1、ECM27、YIL060W、IRE1、YHR177W、YJR079W、YNL187W、YML003W、PIH1、YDR169C-A、PET111、YDL109C、YOR012W、YHR050W-A、TAR1、RIM9、YCR095W-A、RPR2、COS7、YDR049W、CUS1、JJJ3、COS10、MET1、HXT8、GLY1、SUR1、RTG1、PHM7、YJL052C-A、HXT17、YFL052W、ATG1、ECM2、YNR075C-A、YKR041W、ALD5、YHL018W、LUC7、YPS5、YLR297W、SNA4、BIO4、YBR298C-A、ECM12、SEF1、YMR247W-A、EXO1、CTF13、HUR1、SNO3、BSC5、YER175W-A、PGA1、YLR173W、YDR119W-A、IRC15、MGA1、YPR174C、IML3、YLL054C、RDS1、MDM32、PET494、YPR036W-A、GTB1、ISF1、KRE29、SAP190、YHR214C-E、GTO3、YOR365C、MIP1、SIP5、YPL191C、YPL162C、YMR291W、BRN1、MDM1、NAT4、YLR406C-A、YME1、CSI2、YOR008C-A、CEF1、BUD25、DFG16、GPB1、KAR1、PPM2、DSS1、RPC37、VID24、ERV41、YGR169C-A、ECM8、YHR032W、ELA1、PEX29、LTE1、HAT2、SLI1、MUP1、ALG13、FRE7、YMR147W、ISU2、YOR1、JID1、ECM3、ATG5、MED6、YPL014W、YLR030W、AQY2、CCT2、YER067W、NRG1、SPT8、PIR1、YGR068C、YER039C-A、ELM1、ASE1、YBL095W、YNR066C、MTL1、CNE1、CAX4、NDI1、FLX1、YNL130C-A、CWC25、YNL254C、CDC13、ATP10、OCT1、ALF1、YEF1、BAP2、HTL1、PDC5、PKP1、SSK2、CAF120、SKN1、HHF1、CDC39、YFR012W、YEL048C、HAP4、PEX7、TPO1、NFT1、NGL3、YMR206W、DUS3、YAP7、CUS2、YLR415C、FUI1、SLM5、BTT1、YFR035C、RRN10、HAP3、SSY5、SFL1、KIP1、CDC15、GLT1、DOC1、MND1、AAC1、CEP3、UBC5、YNL213C、CLN3、CSF1、ECM18、MRS4、YIL046W-A、INP1、RTT105、MPT5、ATG15、RNH202、TAX4、IZH3、BDF2、COX14、YIP4、YJR120W、SAE2、YMC2、YGR035C、NDD1、HPA2、STL1、GPM3、ERF2、MMS21、YJL133C-A、YNL024C、IFH1、LIN1、ICS3、YNR014W、SPB1、YNL211C、SOL1、COS111、HSH155、NKP2、NAB3、FMT1、YPL152W-A、BOR1、SPC25、MMS1、YIL166C、MAL13、BFA1、AEP3、MTH1、YGR031W、BIT61、YMR230W-A、SKT5、YGL258W-A、PHR1、HTB2、SER1、BAP3、YER053C-A、ATG16、BIO2、MEP3、YNR073C、PCH2、APS2、MDM30、CLB5、ISR1、MRP20、GUD1、MED1、RER2、MCM10、YIR018C-A、SPO14、NUC1、MNN4、IFM1、YLR412C-A、ALT2、NNF1、YKL096C-B、RAD51、CIT2、SPT4、LRC4、USE1、YLR455W、YOL164W-A、PRP18、COA2、HSP82、YER184C、DAD2、LEU1、YDL129W、YPL119C-A、YOR034C-A、PRP38、MSA1、YBR147W、BBP1、MLH1、SWC3、SOH1、HHF2、NIP1、MSL1、RIF2、SPG1、WHI3、HTA1、ARR3、YIL077C、SGF29、RAD53、YEL073C、YNR065C、NCA3、YBR296C-A、ECM23、YLR225C、SLD3、YBR197C、YBL059W、YOL075C、DNA2、SIZ1、REC114、MSN1、RGT2、CBF1、YGL176C、PTP2、GAL3、VPS62、HMS2、SMF3、APL1、SKI3、MNS1、YOR214C、TID3、KSS1、YDR194W-A、UPC2、ARG80、MRS2、ATP23、YML100W-A、YGL101W、STE12、RPI1、YDR090C、YEH1、UTP13、AMN1、YIL089W、AVL9、ATO2、HEM3、RPA14、GIP3、YGR053C、ALR2、YAP5、CDD1、SLS1、MET6、ABM1、PET20、CBP1、RAD10、SPO22、PIB1、EAF3、YFR032C-B、ELP2、YIA6、PET112、PAU7、MEI4、YEA4、SGS1、JEN1、CLB2、GIC2、SWI6、ULP2、KIN28、YKL033W、CSM4、YNL095C、RRN3、RNR1、TPO3、SUP45、ABP140、RPS28B、MRF1、GLN1、OPT1、PHO4、UBP10、YOL163W、MDS3、OTU1、GAT1、HDA3、MSY1、GNP1、YFL041W-A、YPL141C、MPH2、PMA1、YNL260C、SKS1、YDL177C、SWR1、RMD5、RPL9B、MIC14、AOS1、LRG1、ROX1、PCL10、MRPL3、YER152C、EAF1、HTB1、SPA2、SSN2、YJR129C、ATG8、RHR2、TFG2、YBL100W-C、CSM2、EXG1、STE7、ADH2、SNT2、PML39、SEC2、ASI2、MNT3、BUR6、BIO5、YDR506C、RDR1、MRPL33、YGL159W、RIM8、YGR161W-C、YIG1、PDR16、YDR249C、YDR124W、HSP30、SDH2、YER130C、FAA3、BUD22、TIM22、CBP6、ICE2、SPC110、AFT2、NAM2、YPR071W、DIP5、SDS3、POP4、OCA6、PTC6、YBR201C-A、YPR127W、SEC10、ASF2、SLI15、RRN7、ORC2、GUF1、GPI2、RPS9A、RAD6、PSR2、RIP1、GZF3、CAR1、YHR151C、LEU5、YBR182C-A、IRC7、ASG7、YOR381W-A、OCA5、YHR035W、PET117、ISD11、HSP150、CCC2、YHR131C、MRK1、RXT2、PPH3、ODC2、SHE9、YCR075W-A、CYB5、YDR415C、LRO1、SOF1、YNL162W-A、PAU14、MTO1、YKL061W、MSS11、SAN1、SET2、YMR1、PHD1、YBL071C-B、MPA43、SAM37、AAT1、ASH1、UTR2、CAT8、SLX8、HXT2、COY1、TAF3、DSS4、TOR1、YMR030W-A、PAU5、SFP1、FHL1、COX10、DDR2、SWM1、HXT6、RCR2、YLR091W、RMD9、SHQ1、YLR346C、SPT21、ARE1、KAP95、YGR071C、TRL1、ECM17、YML020W、RPO41、CFT1、LRC5、THI74、TPN1、YOR059C、PRY3、YEL1、CNM67、STB6、YOR385W、RRN6、COP1、PDR12、ELG1、SRP40、SRM1、YDR109C、AIM30、RPC17、YJL028W、YBR071W、APS1、KIP2、ATP22、PRM6、BUD31、IXR1、NFI1、YHL015W-A、VHS3、YNL295W、SML1、SSK1、YAE1、RIM2、YDR246W-A、YLR445W、SPT23、MTG2、SGF11、BRL1、YMR315W、MRPS28、ERG5、UTP30、MDM35、ASR1、YIL102C-A、USA1、DOT6、COX23、ADH5、DAN4、RMA1、SCT1、PHO84、SFG1、SLX4、EST1、YNL190W、SNL1、RRP15、YML082W、DOT1、PEX1、YUR1、YAP1802、YDR185C、GET2、YPL264C、YDR065W、YJR115W、MAK21、YER064C、ATR1、IDP2、KCS1、ZPR1、ITC1、OAZ1、SWC7、RPL8A、CAC2、VTH1、OCH1、BUL1、YNR004W、LST7、MRPS8、TIS11、NDC1、TOS8、ISM1、MSL5、FMP43、YJR098C、COQ3、TPC1、RIM101、ADR1、ALD6、YHR087W、VPS21、POG1、YJR005C-A、SNT1、YHR022C、MEF1、PUP2、ERP6、HHT2、YGR146C、OAR1、YOR129C、YCR045C、DBP7、MUB1、YPL236C、RIB2、YPR084W、AIM5、UTR5、HKR1、YMR010W、ALR1、LRE1、RPN4、YLR363W-A、MGM1、HTD2、NAM8、SED5、YOR161C-C、YML018C、NAB2、YER140W、PRM4、RTR1、YIR042C、THI80、FUN19、DMR1、SIP1、CGR1、MTR3、YJL144W、RIM13、SAL1、MET28、INM1、VID27、CDC34、SRO9、RRP9、YOL087C、MCM22、YMR111C、NDJ1、ATG12、MSM1、SRS2、YBR225W、YLR063W、AI1、CDC36、ASN1、MET31、SSP1、NGG1、RBA50、PUT1、YPT53、NMA2、YBR219C、CDC40、SGO1、YJL047C-A、RPC31、INP52、UGO1、RAD30、CLB1、GLO4、TPK3、GIM3、CDC9、PEX27、AIM32、YGL081W、DJP1、HMS1、JSN1、UBP12、RSM25、UBP5、GIP1、PUT3、CKI1、FAR7、LAG2、DAM1、PSD2、HMT1、COR1、MMR1、MRPL39、CTF8、AGP2、PRM7、HIT1、HAL9、GPA2、TIM44、TFB1、ECM19、MRPL32、YBR284W、NAS2、SBE22、YOR011W-A、ORT1、MRPL25、QNQ1、APC4、TYE7、YPP1、MMT1、MRP10、MRPS5、LIP5、CDC27、ESC2、CAN1、MEC1、TOP1、SLM3、SIP4、URN1、YCK3、USO1、RSM19、ASG1、ISU1、YHL008C、YNL313C、KKQ8、FCY2、GPD1、HHT1、MDJ2、SDH1、SSF1、PIP2、STE13、AZF1、VPS35、YGL146C、TAM41、MIF2、YDL118W、HFM1、PRR1、MRE11、FMP37、MLH2、BUD5、YOR342C、PCL1、DHR2、CDC5、CBP3、RLP24、LSG1、NCL1、YDR262W、PGA3、MID2、YJL027C、YOR305W、QCR6、MSC6、RSC4、PAU18、POL12、SME1、DBF2、RPS27A、NHP6A、YGK3、SLO1、AIM36、UBP13、TRI1、CTH1、PGS1、NMD4、YIL064W、BAR1、BCS1、YBL029W、CTR1、MRPL20、AGP3、YOR338W、FCF2、YOR052C、YJL147C、RSA1、PEX8、YOL159C、RRP45、YDL199C、LIA1、THI2、TRZ1、CYT2、MGM101、YNL277W-A、ARP8、MRPL36、YAR028W、PAU2、SLD5、SMD1、YNL086W、QCR7、FMC1、HOS4、HEM1、NAM7、YPL108W、BUD14、BOI2、HRD1、YOL114C、RIS1、SIC1、BST1、KES1、MET4、TRS120、SYC1、NPA3、YLH47、SRL2、LRC3、MHR1、ZIP2、EAR1、RSF1、RIO2、MET2、NOP4、SRD1、PWP2、MST1、PCK1、CDC7、TOK1、PRO1、RAX2、LSM7、SHG1、TOM7、DAS2、SIP2、RRS1、EUG1、POX1、RAD61、SUN4、HAA1、YNR048W、ACO2、YOL047C、PMD1、FZO1、YEL025C、GPR1、BNI1、RSA4、YMR185W、PAU16、ECM7、YHP1、COG8、LST8、HST1、ESA1、YJL160C、MER1、CIN8、WSS1、PAT1、LRC6、FMP30、LYS21、MET18、MRPL50、GCR1、YOR022C、YJR012C、PDR3、YPL229W、SFK1、DUS4、IDS2、YOL036W、PHM6、YPR117W、RPB7、MCM2、MRS1、GLO2、YKL105C、RCK1、AME1、DIA3、HOM3、YDR541C、PMT6、DSE2、YJL216C、RIO1、ALB1、IBA57、YOR268C、CWC24、ARD1、UTP15、MSE1、UBS1、YNL234W、YDL025C、CAF40、YBR221W-A、ATP18、MAL33、YPT6、OAC1、YJR151W-A、YML108W、COX17、RAD52、HST3、TAZ1、YNR064C、YGL010W、MFA2、PGM3、NRM1、CRS5、CTM1、SKG6、SYF2、HYM1、IPI3、MDH1、TFB2、HST4、MRPL24、YMR166C、AVT5、YGR021W、SUV3、YNL146W、MID1、AKL1、MTR10、LAA1、HDA1、SMY2、MRPL8、PLB2、CWP1、ECM14、ECM1、GAL2、FAS1、KEL1、SET7、TSR2、FET5、DRE2、MMS4、TGS1、COQ1、SUR7、PCL2、SER2、YFL034W、MKK1、SSA2、AVO1、FMP25、YRR1、SLX5、SAF1、YPL260W、YKR096W、UTP14、PAM18、WTM1、STE18、AIM20、SYM1、SIT4、SSH4、MEI5、CYC8、DSN1、STB3、IMD4、YPL109C、ECM25、YMR102C、YDR306C、SUL2、YOL019W、PAU10、HNM1、MRPL1、CMK1、YBR196C-A、YGL226W、YPR147C、PGM2、SLM4、MSS1、YER121W、YDR381C-A、VPS72、YJL043W、PAN6、YMR086W、MDN1、HEH2、YKE4、YKL162C、ZRG8、HIP1、YPR145C-A、YCL056C、ERG1、INP54、MRPS16、MOD5、YJR008W、RMI1、YNL146C-A、RRF1、CAF130、BUD9、GWT1、BEM3、STF2、SSN3、MAS2、SLN1、TLG1、NOP6、YOR097C、HVG1、GCD11、TDP1、ATC1、CIT1、GRR1、RPA12、ADY3、CTA1、SWS2、SNF8、CIS3、MRPL4、CLB4、DBP2、APQ12、UTP5、MPD1、MRS3、AIM43、ATP11、SNU66、ARF3、YKU80、YLR422W、EGT2、MSP1、YLR218C、MRPL44、YHR127W、UBP3、SOD2、CYT1、POP6、HSP10、YHR033W、YKL161C、KIN82、YNL165W、CYC7、FYV7、TAT1、YNR040W、DBP3、SMY1、TRP3、SSL2、RPS24B、UTP4、SAW1、DAN2、YPR011C、YER156C、YGL059W、TRM5、SUT2、IML2、ATP1、CKA1、ECM31、MSK1、SCC2、SYG1、RPO26、YPR114W、HIR3、YIL029C、MAC1、YOR296W、IST3、HOR2、ITT1、PRP22、ROD1、DIA4、FMP32、TOM70、DIP2、YPR159C-A、PSP1、BTS1、ECM37、AST1、SMP1、BPL1、UPS1、BAG7、NOG2、RPC10、CYB2、SMD2、RAD1、ATP3、STP2、BUD21、RRN5、YLR352W、FRE4、PAN2、APL3、SEC7、DUS1、CSE1、MAK3、MRPL19、DBP1、FMP48、JAC1、VPS54、FUR1、PUP3、FUN26、SWI1、PWP1、BUD23、ATF1、FMP16、YOL024W、IPK1、RLM1、YNG2、MSS2、FLO8、SHY1、KSP1、KNH1、DON1、KTI11、SMC5、FPS1、SHU1、RAV2、YOR356W、PFA3、ERG8、SEN15、YNL152W、YJL193W、MSH2、CYC1、YLR446W、MRPL13、ISA1、HUA1、YHL010C、NNT1、RMD8、PPR1、ECM9、BSC2、ACO1、MPS2、LEE1、COG5、MCM1、RFC1、TAT2、DML1、KRE9、SPT2、SPC19、QCR8、HXT1、DOA4、MSR1、STU1、ERG10、TFB4、ATG21、GYP6、DAD4、OAF1、YPR013C、GAS1、FAP7、CPA2、RPO31、ATG20、TEP1、YBL081W、SMP3、MCD1、ADK2、SAD1、HUA2、BUD2、YJR136C、RPS14B、MNL1、MDJ1、FLO10、REB1、DSF2、KHA1、MRPL35、YOR283W、PPG1、CIT3、FAA4、SPL2、MET8、HOP2、HFA1、HAP5、ROG1、MAM3、DPH1、RTG3、YNL195C、DCN1、YLR211C、OXA1、YET2、RSC2、MRPL28、CTT1、YAP3、BIG1、UBP8、YOL019W-A、RIB5、NOG1、VID30、MRP17、ZRT1、UAF30、SPO23、Y


NL122C、SNU71、CDC43、SPC29、DYS1、PRP11、SVF1、BUD20、MEK1、UBP16、PCF11、GRX4、UTP22、HRK1、RPB9、YPL272C、ERG29、DIS3、YFH1、MRM2、RRP5、PTI1、TIF6、FTH1、MPE1、FKS3、ESP1、YDL007C-A、DMC1、JHD2、LEU2、SNF3、SCJ1、YMR317W、CYK3、GPT2、FMP41、SIA1、HXK1、YGL057C、YLR287C、NSR1、YDL241W、RKR1、REX4、TIM17、TES1、RPO21、YNL300W、BSC6、YHR080C、OPI10、RPB8、UBP9、YKR011C、CRP1、RSM24、ARP1、SIK1、GCR2、YLR345W、FET4、MRPL40、THP2、AMD2、YDR524W-C、PSY4、BUD16、HPT1、YDR333C、RHO4、AHC1、YJL206C、SWT1、HEK2、ATP12、XBP1、RMD6、RPL15B、NUP42、PLC1、MAD3、YPS1、MCM16、HXT4、HXK2、ERG12、MMT2、YMR321C、MUM3、HST2、ROG3、DEF1、YLR281C、SSK22、MLH3、YGR131W、CSE4、YCL002C、MRPS18、CAD1、AIF1、SFC1、OYE3、EAF5、RSC9、GYL1、YDL063C、ISA2、GBP2、IMG1、NRP1、DHH1、RHB1、CIK1、PHO89、AGX1、RPB2、MRPL17、GPX2、LYP1、VPS9、BNA3、CKA2、OPI1、YER034W、RSM26、LSM6、THI3、SMC4、SWF1、YAH1、RPF2、HFI1、PLB1、MAM33、YLR413W、PRP8、ENO1、RPC19、YGL007C-A、YMR181C、URA7、YGL108C、SRB7、DAD1、LYS4、ATG18、FMP45、VAM3、SSC1、SNU56、YHR045W、HTA2、YJL213W、RPL20A、ALD4、QCR10、YGR287C、CBP4、PCI8、MCM4、DEM1、ATO3、TPS2、TAF1、KRE6、KGD2、ARB1、NMD5、EFR3、TRP4、HLJ1、ACE2、LDB17、ATG7、OSH6、AFT1、CTF4、YDR286C、AIM44、YLR149C、MRPS9、BET1、YLF2、BOI1、BUD4、CRF1、MLP2、ARX1、RRP12、NAT2、PCL7、ARP7、SFH1、STF1、YML081W、MRP49、FOL3、SAC7、PCS60、TPA1、SSS1、ERO1、NHP2、AIM1、AMD1、VPS38、COG3、YMR244C-A、PYC1、CCC1、TAO3、YDL233Wが挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が0.5以下のターミネーター領域としては、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34、YIR021W-A、FZF1、YHK8、YGL188C-A、HCM1、CDC6、YPR157W、CLB6、YOX1、YLR285C-A、YDR114C、YHR199C-A、MPS3、MUP3、YIR014W、AAR2、YPT35、AIM33、SCW11、BDF1、YCL042W、BSC4、YGL193C、NUT2、YJL118W、YKL069W、SRB8、YOR060C、MDH2、YPR116W、YPK2、GLN3、YDL211C、RAD55、CYM1、ENT4、ULA1、YMR182W-A、YKR017C、YOR302W、YOR072W-B、VTS1、FYV12、YGL235W、YHR086W-A、YEL067C、YPL257W、UBA3、YMR105W-A、YOR316C-A、TMA10、YDL159W-A、ATG29、YML037C、NSL1、YJL077W-B、POP3、WHI5、MIH1、YGR240C-A、YRM1、KAR9、YJU2、SPC24、DPB2、CHL4、YMR087W、CSI1、YIL134C-A、BUR2、PTH1、SSN8、AUA1、YLR154C-G、YLR342W-A、YCL001W-A、FLC1、YLL006W-A、VAM7、YPL077C、CCZ1、PRP28、ACM1、IME4、YPR096C、FRE5、PDR8、ILV5、YIL161W、PAC11、UBR2、YRB2、YLR125W、YMR253C、DSE4、EPL1、SNP1、YMR160W、SPO77、BUB1、YFR016C、SPC97、GEM1、INO2、SPT10、YLR132C、AIM45、YJR054W、MBF1、YAL064C-A、YML054C-A、NUP1、ECM27、YIL060W、IRE1、YHR177W、YJR079W、YNL187W、YML003W、PIH1、YDR169C-A、PET111、YDL109C、YOR012W、YHR050W-A、TAR1、RIM9、YCR095W-A、RPR2、COS7、YDR049W、CUS1、JJJ3、COS10、MET1、HXT8、GLY1、SUR1、RTG1、PHM7、YJL052C-A、HXT17、YFL052W、ATG1、ECM2、YNR075C-A、YKR041W、ALD5、YHL018W、LUC7、YPS5、YLR297W、SNA4、BIO4、YBR298C-A、ECM12、SEF1、YMR247W-A、EXO1、CTF13、HUR1、SNO3、BSC5、YER175W-A、PGA1、YLR173W、YDR119W-A、IRC15、MGA1、YPR174C、IML3、YLL054C、RDS1、MDM32、PET494、YPR036W-A、GTB1、ISF1、KRE29、SAP190、YHR214C-E、GTO3、YOR365C、MIP1、SIP5、YPL191C、YPL162C、YMR291W、BRN1、MDM1、NAT4、YLR406C-A、YME1、CSI2、YOR008C-A、CEF1、BUD25、DFG16、GPB1、KAR1、PPM2、DSS1、RPC37、VID24、ERV41、YGR169C-A、ECM8、YHR032W、ELA1、PEX29、LTE1、HAT2、SLI1、MUP1、ALG13、FRE7、YMR147W、ISU2、YOR1、JID1、ECM3、ATG5、MED6、YPL014W、YLR030W、AQY2、CCT2、YER067W、NRG1、SPT8、PIR1、YGR068C、YER039C-A、ELM1、ASE1、YBL095W、YNR066C、MTL1、CNE1、CAX4、NDI1、FLX1、YNL130C-A、CWC25、YNL254C、CDC13、ATP10、OCT1、ALF1、YEF1、BAP2、HTL1、PDC5、PKP1、SSK2、CAF120、SKN1、HHF1、CDC39、YFR012W、YEL048C、HAP4、PEX7、TPO1、NFT1、NGL3、YMR206W、DUS3、YAP7、CUS2、YLR415C、FUI1、SLM5、BTT1、YFR035C、RRN10、HAP3、SSY5、SFL1、KIP1、CDC15、GLT1、DOC1、MND1、AAC1、CEP3、UBC5、YNL213C、CLN3、CSF1、ECM18、MRS4、YIL046W-A、INP1、RTT105、MPT5、ATG15、RNH202、TAX4、IZH3、BDF2、COX14、YIP4、YJR120W、SAE2、YMC2、YGR035C、NDD1、HPA2、STL1、GPM3、ERF2、MMS21、YJL133C-A、YNL024C、IFH1、LIN1、ICS3、YNR014W、SPB1、YNL211C、SOL1、COS111、HSH155、NKP2、NAB3、FMT1、YPL152W-A、BOR1、SPC25、MMS1、YIL166C、MAL13、BFA1、AEP3、MTH1、YGR031W、BIT61、YMR230W-A、SKT5、YGL258W-A、PHR1、HTB2、SER1、BAP3、YER053C-A、ATG16、BIO2、MEP3、YNR073C、PCH2、APS2、MDM30、CLB5、ISR1、MRP20、GUD1、MED1、RER2、MCM10、YIR018C-A、SPO14、NUC1、MNN4、IFM1、YLR412C-A、ALT2、NNF1、YKL096C-B、RAD51、CIT2、SPT4、LRC4、USE1、YLR455W、YOL164W-A、PRP18、COA2、HSP82、YER184C、DAD2、LEU1、YDL129W、YPL119C-A、YOR034C-A、PRP38、MSA1、YBR147W、BBP1、MLH1、SWC3、SOH1、HHF2、NIP1、MSL1、RIF2、SPG1、WHI3、HTA1、ARR3、YIL077C、SGF29、RAD53、YEL073C、YNR065C、NCA3、YBR296C-A、ECM23、YLR225C、SLD3、YBR197C、YBL059W、YOL075C、DNA2、SIZ1、REC114、MSN1、RGT2、CBF1、YGL176C、PTP2、GAL3、VPS62、HMS2、SMF3、APL1、SKI3、MNS1、YOR214C、TID3、KSS1、YDR194W-A、UPC2、ARG80、MRS2、ATP23、YML100W-A、YGL101W、STE12、RPI1、YDR090C、YEH1、UTP13、AMN1、YIL089W、AVL9、ATO2、HEM3、RPA14、GIP3、YGR053C、ALR2、YAP5、CDD1、SLS1、MET6、ABM1、PET20、CBP1、RAD10、SPO22、PIB1、EAF3、YFR032C-B、ELP2、YIA6、PET112、PAU7、MEI4、YEA4、SGS1、JEN1、CLB2、GIC2、SWI6、ULP2、KIN28、YKL033W、CSM4、YNL095C、RRN3、RNR1、TPO3、SUP45、ABP140、RPS28B、MRF1、GLN1、OPT1、PHO4、UBP10、YOL163W、MDS3、OTU1、GAT1、HDA3、MSY1、GNP1、YFL041W-A、YPL141C、MPH2、PMA1、YNL260C、SKS1、YDL177C、SWR1、RMD5、RPL9B、MIC14、AOS1、LRG1、ROX1、PCL10、MRPL3、YER152C、EAF1、HTB1、SPA2、SSN2、YJR129C、ATG8、RHR2、TFG2、YBL100W-C、CSM2、EXG1、STE7、ADH2、SNT2、PML39、SEC2、ASI2、MNT3、BUR6、BIO5、YDR506C、RDR1、MRPL33、YGL159W、RIM8、YGR161W-C、YIG1、PDR16、YDR249C、YDR124W、HSP30、SDH2、YER130C、FAA3、BUD22、TIM22、CBP6、ICE2、SPC110、AFT2、NAM2、YPR071W、DIP5、SDS3、POP4、OCA6、PTC6、YBR201C-A、YPR127W、SEC10、ASF2、SLI15、RRN7、ORC2、GUF1、GPI2、RPS9A、RAD6、PSR2、RIP1、GZF3、CAR1、YHR151C、LEU5、YBR182C-A、IRC7、ASG7、YOR381W-A、OCA5、YHR035W、PET117、ISD11、HSP150、CCC2、YHR131C、MRK1、RXT2、PPH3、ODC2、SHE9、YCR075W-A、CYB5、YDR415C、LRO1、SOF1、YNL162W-A、PAU14、MTO1、YKL061W、MSS11、SAN1、SET2、YMR1、PHD1、YBL071C-B、MPA43、SAM37、AAT1、ASH1、UTR2、CAT8、SLX8、HXT2、COY1、TAF3、DSS4、TOR1、YMR030W-A、PAU5、SFP1、FHL1、COX10、DDR2、SWM1、HXT6、RCR2、YLR091W、RMD9、SHQ1、YLR346C、SPT21、ARE1、KAP95、YGR071C、TRL1、ECM17、YML020W、RPO41、CFT1、LRC5、THI74、TPN1、YOR059C、PRY3、YEL1、CNM67、STB6、YOR385W、RRN6、COP1、PDR12、ELG1、SRP40、SRM1、YDR109C、AIM30、RPC17、YJL028W、YBR071W、APS1、KIP2、ATP22、PRM6、BUD31、IXR1、NFI1、YHL015W-A、VHS3、YNL295W、SML1、SSK1、YAE1、RIM2、YDR246W-A、YLR445W、SPT23、MTG2、SGF11、BRL1、YMR315W、MRPS28、ERG5、UTP30、MDM35、ASR1、YIL102C-A、USA1、DOT6、COX23、ADH5、DAN4、RMA1、SCT1、PHO84、SFG1、SLX4、EST1、YNL190W、SNL1、RRP15、YML082W、DOT1、PEX1、YUR1、YAP1802、YDR185C、GET2、YPL264C、YDR065W、YJR115W、MAK21、YER064C、ATR1、IDP2、KCS1、ZPR1、ITC1、OAZ1、SWC7、RPL8A、CAC2、VTH1、OCH1、BUL1、YNR004W、LST7、MRPS8、TIS11、NDC1、TOS8、ISM1、MSL5、FMP43、YJR098C、COQ3、TPC1、RIM101、ADR1、ALD6、YHR087W、VPS21、POG1、YJR005C-A、SNT1、YHR022C、MEF1、PUP2、ERP6、HHT2、YGR146C、OAR1、YOR129C、YCR045C、DBP7、MUB1、YPL236C、RIB2、YPR084W、AIM5、UTR5、HKR1、YMR010W、ALR1、LRE1、RPN4、YLR363W-A、MGM1、HTD2、NAM8、SED5、YOR161C-C、YML018C、NAB2、YER140W、PRM4、RTR1、YIR042C、THI80、FUN19、DMR1、SIP1、CGR1、MTR3、YJL144W、RIM13、SAL1、MET28、INM1、VID27、CDC34、SRO9、RRP9、YOL087C、MCM22、YMR111C、NDJ1、ATG12、MSM1、SRS2、YBR225W、YLR063W、AI1、CDC36、ASN1、MET31、SSP1、NGG1、RBA50、PUT1、YPT53、NMA2、YBR219C、CDC40、SGO1、YJL047C-A、RPC31、INP52、UGO1、RAD30、CLB1、GLO4、TPK3、GIM3、CDC9、PEX27、AIM32、YGL081W、DJP1、HMS1、JSN1、UBP12、RSM25、UBP5、GIP1、PUT3、CKI1、FAR7、LAG2、DAM1、PSD2、HMT1、COR1、MMR1、MRPL39、CTF8、AGP2、PRM7、HIT1、HAL9、GPA2、TIM44、TFB1、ECM19、MRPL32、YBR284W、NAS2、SBE22、YOR011W-A、ORT1、MRPL25、QNQ1、APC4、TYE7、YPP1、MMT1、MRP10、MRPS5、LIP5、CDC27、ESC2、CAN1、MEC1、TOP1、SLM3、SIP4、URN1、YCK3、USO1、RSM19、ASG1、ISU1、YHL008C、YNL313C、KKQ8、FCY2、GPD1、HHT1、MDJ2、SDH1、SSF1、PIP2、STE13、AZF1、VPS35、YGL146C、TAM41、MIF2、YDL118W、HFM1、PRR1、MRE11、FMP37、MLH2、BUD5、YOR342C、PCL1、DHR2、CDC5、CBP3、RLP24、LSG1、NCL1、YDR262W、PGA3、MID2、YJL027C、YOR305W、QCR6、MSC6、RSC4、PAU18、POL12、SME1、DBF2、RPS27A、NHP6A、YGK3、SLO1、AIM36、UBP13、TRI1、CTH1、PGS1、NMD4、YIL064W、BAR1、BCS1、YBL029W、CTR1、MRPL20、AGP3、YOR338W、FCF2、YOR052C、YJL147C、RSA1、PEX8、YOL159C、RRP45、YDL199C、LIA1、THI2、TRZ1、CYT2、MGM101、YNL277W-A、ARP8、MRPL36、YAR028W、PAU2、SLD5、SMD1、YNL086W、QCR7、FMC1、HOS4、HEM1、NAM7、YPL108W、BUD14、BOI2、HRD1、YOL114C、RIS1、SIC1、BST1、KES1、MET4、TRS120、SYC1、NPA3、YLH47、SRL2、LRC3、MHR1、ZIP2、EAR1、RSF1、RIO2、MET2、NOP4、SRD1、PWP2、MST1、PCK1、CDC7、TOK1、PRO1、RAX2、LSM7、SHG1、TOM7、DAS2、SIP2、RRS1、EUG1、POX1、RAD61、SUN4、HAA1、YNR048W、ACO2、YOL047C、PMD1、FZO1、YEL025C、GPR1、BNI1、RSA4、YMR185W、PAU16、ECM7、YHP1、COG8、LST8、HST1、ESA1、YJL160C、MER1、CIN8、WSS1、PAT1、LRC6、FMP30、LYS21、MET18、MRPL50、GCR1、YOR022C、YJR012C、PDR3、YPL229W、SFK1、DUS4、IDS2、YOL036W、PHM6、YPR117W、RPB7、MCM2、MRS1、GLO2、YKL105C、RCK1、AME1、DIA3、HOM3、YDR541C、PMT6、DSE2、YJL216C、RIO1、ALB1、IBA57、YOR268C、CWC24、ARD1、UTP15、MSE1、UBS1、YNL234W、YDL025C、CAF40、YBR221W-A、ATP18、MAL33、YPT6、OAC1、YJR151W-A、YML108W、COX17、RAD52、HST3、TAZ1、YNR064C、YGL010W、MFA2、PGM3、NRM1、CRS5、CTM1、SKG6、SYF2、HYM1、IPI3、MDH1、TFB2、HST4、MRPL24、YMR166C、AVT5、YGR021W、SUV3、YNL146W、MID1、AKL1、MTR10、LAA1、HDA1、SMY2、MRPL8、PLB2、CWP1、ECM14、ECM1、GAL2、FAS1、KEL1、SET7、TSR2、FET5、DRE2、MMS4、TGS1、COQ1、SUR7、PCL2、SER2、YFL034W、MKK1、SSA2、AVO1、FMP25、YRR1、SLX5、SAF1、YPL260W、YKR096W、UTP14、PAM18、WTM1、STE18、AIM20、SYM1、SIT4、SSH4、MEI5、CYC8、DSN1、STB3、IMD4、YPL109C、ECM25、YMR102C、YDR306C、SUL2、YOL019W、PAU10、HNM1、MRPL1、CMK1、YBR196C-A、YGL226W、YPR147C、PGM2、SLM4、MSS1、YER121W、YDR381C-A、VPS72、YJL043W、PAN6、YMR086W、MDN1、HEH2、YKE4、YKL162C、ZRG8、HIP1、YPR145C-A、YCL056C、ERG1、INP54、MRPS16、MOD5、YJR008W、RMI1、YNL146C-A、RRF1、CAF130、BUD9、GWT1、BEM3、STF2、SSN3、MAS2、SLN1、TLG1、NOP6、YOR097C、HVG1、GCD11、TDP1、ATC1、CIT1、GRR1、RPA12、ADY3、CTA1、SWS2、SNF8、CIS3、MRPL4、CLB4、DBP2、APQ12、UTP5、MPD1、MRS3、AIM43、ATP11、SNU66、ARF3、YKU80、YLR422W、EGT2、MSP1、YLR218C、MRPL44、YHR127W、UBP3、SOD2、CYT1、POP6、HSP10、YHR033W、YKL161C、KIN82、YNL165W、CYC7、FYV7、TAT1、YNR040W、DBP3、SMY1、TRP3、SSL2、RPS24B、UTP4、SAW1、DAN2、YPR011C、YER156C、YGL059W、TRM5、SUT2、IML2、ATP1、CKA1、ECM31、MSK1、SCC2、SYG1、RPO26、YPR114W、HIR3、YIL029C、MAC1、YOR296W、IST3、HOR2、ITT1、PRP22、ROD1、DIA4、FMP32、TOM70、DIP2、YPR159C-A、PSP1、BTS1が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が0.4以下のターミネーター領域としては、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34、YIR021W-A、FZF1、YHK8、YGL188C-A、HCM1、CDC6、YPR157W、CLB6、YOX1、YLR285C-A、YDR114C、YHR199C-A、MPS3、MUP3、YIR014W、AAR2、YPT35、AIM33、SCW11、BDF1、YCL042W、BSC4、YGL193C、NUT2、YJL118W、YKL069W、SRB8、YOR060C、MDH2、YPR116W、YPK2、GLN3、YDL211C、RAD55、CYM1、ENT4、ULA1、YMR182W-A、YKR017C、YOR302W、YOR072W-B、VTS1、FYV12、YGL235W、YHR086W-A、YEL067C、YPL257W、UBA3、YMR105W-A、YOR316C-A、TMA10、YDL159W-A、ATG29、YML037C、NSL1、YJL077W-B、POP3、WHI5、MIH1、YGR240C-A、YRM1、KAR9、YJU2、SPC24、DPB2、CHL4、YMR087W、CSI1、YIL134C-A、BUR2、PTH1、SSN8、AUA1、YLR154C-G、YLR342W-A、YCL001W-A、FLC1、YLL006W-A、VAM7、YPL077C、CCZ1、PRP28、ACM1、IME4、YPR096C、FRE5、PDR8、ILV5、YIL161W、PAC11、UBR2、YRB2、YLR125W、YMR253C、DSE4、EPL1、SNP1、YMR160W、SPO77、BUB1、YFR016C、SPC97、GEM1、INO2、SPT10、YLR132C、AIM45、YJR054W、MBF1、YAL064C-A、YML054C-A、NUP1、ECM27、YIL060W、IRE1、YHR177W、YJR079W、YNL187W、YML003W、PIH1、YDR169C-A、PET111、YDL109C、YOR012W、YHR050W-A、TAR1、RIM9、YCR095W-A、RPR2、COS7、YDR049W、CUS1、JJJ3、COS10、MET1、HXT8、GLY1、SUR1、RTG1、PHM7、YJL052C-A、HXT17、YFL052W、ATG1、ECM2、YNR075C-A、YKR041W、ALD5、YHL018W、LUC7、YPS5、YLR297W、SNA4、BIO4、YBR298C-A、ECM12、SEF1、YMR247W-A、EXO1、CTF13、HUR1、SNO3、BSC5、YER175W-A、PGA1、YLR173W、YDR119W-A、IRC15、MGA1、YPR174C、IML3、YLL054C、RDS1、MDM32、PET494、YPR036W-A、GTB1、ISF1、KRE29、SAP190、YHR214C-E、GTO3、YOR365C、MIP1、SIP5、YPL191C、YPL162C、YMR291W、BRN1、MDM1、NAT4、YLR406C-A、YME1、CSI2、YOR008C-A、CEF1、BUD25、DFG16、GPB1、KAR1、PPM2、DSS1、RPC37、VID24、ERV41、YGR169C-A、ECM8、YHR032W、ELA1、PEX29、LTE1、HAT2、SLI1、MUP1、ALG13、FRE7、YMR147W、ISU2、YOR1、JID1、ECM3、ATG5、MED6、YPL014W、YLR030W、AQY2、CCT2、YER067W、NRG1、SPT8、PIR1、YGR068C、YER039C-A、ELM1、ASE1、YBL095W、YNR066C、MTL1、CNE1、CAX4、NDI1、FLX1、YNL130C-A、CWC25、YNL254C、CDC13、ATP10、OCT1、ALF1、YEF1、BAP2、HTL1、PDC5、PKP1、SSK2、CAF120、SKN1、HHF1、CDC39、YFR012W、YEL048C、HAP4、PEX7、TPO1、NFT1、NGL3、YMR206W、DUS3、YAP7、CUS2、YLR415C、FUI1、SLM5、BTT1、YFR035C、RRN10、HAP3、SSY5、SFL1、KIP1、CDC15、GLT1、DOC1、MND1、AAC1、CEP3、UBC5、YNL213C、CLN3、CSF1、ECM18、MRS4、YIL046W-A、INP1、RTT105、MPT5、ATG15、RNH202、TAX4、IZH3、BDF2、COX14、YIP4、YJR120W、SAE2、YMC2、YGR035C、NDD1、HPA2、STL1、GPM3、ERF2、MMS21、YJL133C-A、YNL024C、IFH1、LIN1、ICS3、YNR014W、SPB1、YNL211C、SOL1、COS111、HSH155、NKP2、NAB3、FMT1、YPL152W-A、BOR1、SPC25、MMS1、YIL166C、MAL13、BFA1、AEP3、MTH1、YGR031W、BIT61、YMR230W-A、SKT5、YGL258W-A、PHR1、HTB2、SER1、BAP3、YER053C-A、ATG16、BIO2、MEP3、YNR073C、PCH2、APS2、MDM30、CLB5、ISR1、MRP20、GUD1、MED1、RER2、MCM10、YIR018C-A、SPO14、NUC1、MNN4、IFM1、YLR412C-A、ALT2、NNF1、YKL096C-B、RAD51、CIT2、SPT4、LRC4、USE1、YLR455W、YOL164W-A、PRP18、COA2、HSP82、YER184C、DAD2、LEU1、YDL129W、YPL119C-A、YOR034C-A、PRP38、MSA1、YBR147W、BBP1、MLH1、SWC3、SOH1、HHF2、NIP1、MSL1、RIF2、SPG1、WHI3、HTA1、ARR3、YIL077C、SGF29、RAD53、YEL073C、YNR065C、NCA3、YBR296C-A、ECM23、YLR225C、SLD3、YBR197C、YBL059W、YOL075C、DNA2、SIZ1、REC114、MSN1、RGT2、CBF1、YGL176C、PTP2、GAL3、VPS62、HMS2、SMF3、APL1、SKI3、MNS1、YOR214C、TID3、KSS1、YDR194W-A、UPC2、ARG80、MRS2、ATP23、YML100W-A、YGL101W、STE12、RPI1、YDR090C、YEH1、UTP13、AMN1、YIL089W、AVL9、ATO2、HEM3、RPA14、GIP3、YGR053C、ALR2、YAP5、CDD1、SLS1、MET6、ABM1、PET20、CBP1、RAD10、SPO22、PIB1、EAF3、YFR032C-B、ELP2、YIA6、PET112、PAU7、MEI4、YEA4、SGS1、JEN1、CLB2、GIC2、SWI6、ULP2、KIN28、YKL033W、CSM4、YNL095C、RRN3、RNR1、TPO3、SUP45、ABP140、RPS28B、MRF1、GLN1、OPT1、PHO4、UBP10、YOL163W、MDS3、OTU1、GAT1、HDA3、MSY1、GNP1、YFL041W-A、YPL141C、MPH2、PMA1、YNL260C、SKS1、YDL177C、SWR1、RMD5、RPL9B、MIC14、AOS1、LRG1、ROX1、PCL10、MRPL3、YER152C、EAF1、HTB1、SPA2、SSN2、YJR129C、ATG8、RHR2、TFG2、YBL100W-C、CSM2、EXG1、STE7、ADH2、SNT2、PML39、SEC2、ASI2、MNT3、BUR6、BIO5、YDR506C、RDR1、MRPL33、YGL159W、RIM8、YGR161W-C、YIG1、PDR16、YDR249C、YDR124W、HSP30、SDH2、YER130C、FAA3、BUD22、TIM22、CBP6、ICE2、SPC110、AFT2、NAM2、YPR071W、DIP5、SDS3、POP4、OCA6、PTC6、YBR201C-A、YPR127W、SEC10、ASF2、SLI15、RRN7、ORC2、GUF1、GPI2、RPS9A、RAD6、PSR2、RIP1、GZF3、CAR1、YHR151C、LEU5、YBR182C-A、IRC7、ASG7、YOR381W-A、OCA5、YHR035W、PET117、ISD11、HSP150、CCC2、YHR131C、MRK1、RXT2、PPH3、ODC2、SHE9、YCR075W-A、CYB5、YDR415C、LRO1、SOF1、YNL162W-A、PAU14、MTO1、YKL061W、MSS11、SAN1、SET2、YMR1、PHD1、YBL071C-B、MPA43、SAM37、AAT1、ASH1、UTR2、CAT8、SLX8、HXT2、COY1、TAF3、DSS4、TOR1、YMR030W-A、PAU5、SFP1、FHL1、COX10、DDR2、SWM1、HXT6、RCR2、YLR091W、RMD9、SHQ1、YLR346C、SPT21、ARE1、KAP95、YGR071C、TRL1、ECM17、YML020W、RPO41、CFT1、LRC5、THI74、TPN1、YOR059C、PRY3、YEL1、CNM67、STB6、YOR385W、RRN6、COP1、PDR12、ELG1、SRP40、SRM1、YDR109C、AIM30、RPC17、YJL028W、YBR071W、APS1、KIP2、ATP22、PRM6、BUD31、IXR1、NFI1、YHL015W-A、VHS3、YNL295W、SML1、SSK1、YAE1、RIM2、YDR246W-A、YLR445W、SPT23、MTG2、SGF11、BRL1、YMR315W、MRPS28、ERG5、UTP30、MDM35、ASR1、YIL102C-A、USA1、DOT6、COX23、ADH5、DAN4、RMA1、SCT1、PHO84、SFG1、SLX4、EST1、YNL190W、SNL1、RRP15、YML082W、DOT1、PEX1、YUR1、YAP1802、YDR185C、GET2、YPL264C、YDR065W、YJR115W、MAK21、YER064C、ATR1、IDP2、KCS1、ZPR1、ITC1、OAZ1、SWC7、RPL8A、CAC2、VTH1、OCH1、BUL1、YNR004W、LST7、MRPS8、TIS11、NDC1、TOS8、ISM1、MSL5、FMP43、YJR098C、COQ3、TPC1、RIM101、ADR1、ALD6、YHR087W、VPS21、POG1、YJR005C-A、SNT1、YHR022C、MEF1、PUP2、ERP6、HHT2、YGR146C、OAR1、YOR129C、YCR045C、DBP7、MUB1、YPL236C、RIB2、YPR084W、AIM5、UTR5、HKR1、YMR010W、ALR1、LRE1、RPN4、YLR363W-A、MGM1、HTD2、NAM8、SED5、YOR161C-C、YML018C、NAB2、YER140W、PRM4、RTR1、YIR042C、THI80、FUN19、DMR1、SIP1、CGR1、MTR3、YJL144W、RIM13、SAL1、MET28、INM1、VID27、CDC34、SRO9、RRP9、YOL087C、MCM22、YMR111C、NDJ1、ATG12、MSM1、SRS2、YBR225W、YLR063W、AI1、CDC36、ASN1、MET31、SSP1、NGG1、RBA50、PUT1、YPT53、NMA2、YBR219C、CDC40、SGO1、YJL047C-A、RPC31、INP52、UGO1、RAD30、CLB1、GLO4、TPK3、GIM3、CDC9、PEX27、AIM32、YGL081W、DJP1、HMS1、JSN1、UBP12、RSM25、UBP5、GIP1、PUT3、CKI1、FAR7、LAG2、DAM1、PSD2、HMT1、COR1、MMR1、MRPL39、CTF8、AGP2、PRM7、HIT1、HAL9、GPA2、TIM44、TFB1、ECM19、MRPL32、YBR284W、NAS2、SBE22、YOR011W-A、ORT1、MRPL25、QNQ1、APC4、TYE7、YPP1、MMT1、MRP10、MRPS5、LIP5、CDC27、ESC2、CAN1、MEC1、TOP1、SLM3、SIP4、URN1、YCK3、USO1、RSM19、ASG1、ISU1、YHL008C、YNL313C、KKQ8、FCY2、GPD1、HHT1、MDJ2、SDH1、SSF1、PIP2、STE13、AZF1、VPS35、YGL146C、TAM41、MIF2、YDL118W、HFM1、PRR1、MRE11、FMP37、MLH2、BUD5、YOR342C、PCL1、DHR2、CDC5、CBP3、RLP24、LSG1、NCL1、YDR262W、PGA3、MID2、YJL027C、YOR305W、QCR6、MSC6、RSC4、PAU18、POL12、SME1、DBF2、RPS27A、NHP6A、YGK3が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が0.3以下のターミネーターとしては、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34、YIR021W-A、FZF1、YHK8、YGL188C-A、HCM1、CDC6、YPR157W、CLB6、YOX1、YLR285C-A、YDR114C、YHR199C-A、MPS3、MUP3、YIR014W、AAR2、YPT35、AIM33、SCW11、BDF1、YCL042W、BSC4、YGL193C、NUT2、YJL118W、YKL069W、SRB8、YOR060C、MDH2、YPR116W、YPK2、GLN3、YDL211C、RAD55、CYM1、ENT4、ULA1、YMR182W-A、YKR017C、YOR302W、YOR072W-B、VTS1、FYV12、YGL235W、YHR086W-A、YEL067C、YPL257W、UBA3、YMR105W-A、YOR316C-A、TMA10、YDL159W-A、ATG29、YML037C、NSL1、YJL077W-B、POP3、WHI5、MIH1、YGR240C-A、YRM1、KAR9、YJU2、SPC24、DPB2、CHL4、YMR087W、CSI1、YIL134C-A、BUR2、PTH1、SSN8、AUA1、YLR154C-G、YLR342W-A、YCL001W-A、FLC1、YLL006W-A、VAM7、YPL077C、CCZ1、PRP28、ACM1、IME4、YPR096C、FRE5、PDR8、ILV5、YIL161W、PAC11、UBR2、YRB2、YLR125W、YMR253C、DSE4、EPL1、SNP1、YMR160W、SPO77、BUB1、YFR016C、SPC97、GEM1、INO2、SPT10、YLR132C、AIM45、YJR054W、MBF1、YAL064C-A、YML054C-A、NUP1、ECM27、YIL060W、IRE1、YHR177W、YJR079W、YNL187W、YML003W、PIH1、YDR169C-A、PET111、YDL109C、YOR012W、YHR050W-A、TAR1、RIM9、YCR095W-A、RPR2、COS7、YDR049W、CUS1、JJJ3、COS10、MET1、HXT8、GLY1、SUR1、RTG1、PHM7、YJL052C-A、HXT17、YFL052W、ATG1、ECM2、YNR075C-A、YKR041W、ALD5、YHL018W、LUC7、YPS5、YLR297W、SNA4、BIO4、YBR298C-A、ECM12、SEF1、YMR247W-A、EXO1、CTF13、HUR1、SNO3、BSC5、YER175W-A、PGA1、YLR173W、YDR119W-A、IRC15、MGA1、YPR174C、IML3、YLL054C、RDS1、MDM32、PET494、YPR036W-A、GTB1、ISF1、KRE29、SAP190、YHR214C-E、GTO3、YOR365C、MIP1、SIP5、YPL191C、YPL162C、YMR291W、BRN1、MDM1、NAT4、YLR406C-A、YME1、CSI2、YOR008C-A、CEF1、BUD25、DFG16、GPB1、KAR1、PPM2、DSS1、RPC37、VID24、ERV41、YGR169C-A、ECM8、YHR032W、ELA1、PEX29、LTE1、HAT2、SLI1、MUP1、ALG13、FRE7、YMR147W、ISU2、YOR1、JID1、ECM3、ATG5、MED6、YPL014W、YLR030W、AQY2、CCT2、YER067W、NRG1、SPT8、PIR1、YGR068C、YER039C-A、ELM1、ASE1、YBL095W、YNR066C、MTL1、CNE1、CAX4、NDI1、FLX1、YNL130C-A、CWC25、YNL254C、CDC13、ATP10、OCT1、ALF1、YEF1、BAP2、HTL1、PDC5、PKP1、SSK2、CAF120、SKN1、HHF1、CDC39、YFR012W、YEL048C、HAP4、PEX7、TPO1、NFT1、NGL3、YMR206W、DUS3、YAP7、CUS2、YLR415C、FUI1、SLM5、BTT1、YFR035C、RRN10、HAP3、SSY5、SFL1、KIP1、CDC15、GLT1、DOC1、MND1、AAC1、CEP3、UBC5、YNL213C、CLN3、CSF1、ECM18、MRS4、YIL046W-A、INP1、RTT105、MPT5、ATG15、RNH202、TAX4、IZH3、BDF2、COX14、YIP4、YJR120W、SAE2、YMC2、YGR035C、NDD1、HPA2、STL1、GPM3、ERF2、MMS21、YJL133C-A、YNL024C、IFH1、LIN1、ICS3、YNR014W、SPB1、YNL211C、SOL1、COS111、HSH155、NKP2、NAB3、FMT1、YPL152W-A、BOR1、SPC25、MMS1、YIL166C、MAL13、BFA1、AEP3、MTH1、YGR031W、BIT61、YMR230W-A、SKT5、YGL258W-A、PHR1、HTB2、SER1、BAP3、YER053C-A、ATG16、BIO2、MEP3、YNR073C、PCH2、APS2、MDM30、CLB5、ISR1、MRP20、GUD1、MED1、RER2、MCM10、YIR018C-A、SPO14、NUC1、MNN4、IFM1、YLR412C-A、ALT2、NNF1、YKL096C-B、RAD51、CIT2、SPT4、LRC4、USE1、YLR455W、YOL164W-A、PRP18、COA2、HSP82、YER184C、DAD2、LEU1、YDL129W、YPL119C-A、YOR034C-A、PRP38、MSA1、YBR147W、BBP1、MLH1、SWC3、SOH1、HHF2、NIP1、MSL1、RIF2、SPG1、WHI3、HTA1、ARR3、YIL077C、SGF29、RAD53、YEL073C、YNR065C、NCA3、YBR296C-A、ECM23、YLR225C、SLD3、YBR197C、YBL059W、YOL075C、DNA2、SIZ1、REC114、MSN1、RGT2、CBF1、YGL176C、PTP2、GAL3、VPS62、HMS2、SMF3、APL1、SKI3、MNS1、YOR214C、TID3、KSS1、YDR194W-A、UPC2、ARG80、MRS2、ATP23、YML100W-A、YGL101W、STE12、RPI1、YDR090C、YEH1、UTP13、AMN1、YIL089W、AVL9、ATO2、HEM3、RPA14、GIP3、YGR053C、ALR2、YAP5、CDD1、SLS1、MET6、ABM1、PET20、CBP1、RAD10、SPO22、PIB1、EAF3、YFR032C-B、ELP2、YIA6、PET112、PAU7、MEI4、YEA4、SGS1、JEN1、CLB2、GIC2、SWI6、ULP2、KIN28、YKL033W、CSM4、YNL095C、RRN3、RNR1、TPO3、SUP45、ABP140、RPS28B、MRF1、GLN1、OPT1、PHO4、UBP10、YOL163W、MDS3、OTU1、GAT1、HDA3、MSY1、GNP1、YFL041W-A、YPL141C、MPH2、PMA1、YNL260C、SKS1、YDL177C、SWR1、RMD5、RPL9B、MIC14、AOS1、LRG1、ROX1、PCL10、MRPL3、YER152C、EAF1、HTB1、SPA2、SSN2、YJR129C、ATG8、RHR2、TFG2、YBL100W-C、CSM2、EXG1、STE7、ADH2、SNT2、PML39、SEC2、ASI2、MNT3、BUR6、BIO5、YDR506C、RDR1、MRPL33、YGL159W、RIM8、YGR161W-C、YIG1、PDR16、YDR249C、YDR124W、HSP30、SDH2、YER130C、FAA3、BUD22、TIM22、CBP6、ICE2、SPC110、AFT2、NAM2、YPR071W、DIP5、SDS3、POP4、OCA6、PTC6、YBR201C-A、YPR127W、SEC10、ASF2、SLI15、RRN7、ORC2、GUF1、GPI2、RPS9A、RAD6、PSR2、RIP1、GZF3、CAR1、YHR151C、LEU5、YBR182C-A、IRC7、ASG7、YOR381W-A、OCA5、YHR035W、PET117、ISD11、HSP150、CCC2、YHR131C、MRK1、RXT2、PPH3、ODC2、SHE9、YCR075W-A、CYB5、YDR415C、LRO1、SOF1、YNL162W-A、PAU14、MTO1、YKL061W、MSS11、SAN1、SET2、YMR1、PHD1、YBL071C-B、MPA43、SAM37、AAT1、ASH1、UTR2、CAT8、SLX8、HXT2、COY1、TAF3、DSS4、TOR1、YMR030W-A、PAU5、SFP1、FHL1、COX10、DDR2、SWM1、HXT6、RCR2、YLR091W、RMD9、SHQ1、YLR346C、SPT21、ARE1、KAP95、YGR071Cが挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が0.2以下のターミネーターとしては、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34、YIR021W-A、FZF1、YHK8、YGL188C-A、HCM1、CDC6、YPR157W、CLB6、YOX1、YLR285C-A、YDR114C、YHR199C-A、MPS3、MUP3、YIR014W、AAR2、YPT35、AIM33、SCW11、BDF1、YCL042W、BSC4、YGL193C、NUT2、YJL118W、YKL069W、SRB8、YOR060C、MDH2、YPR116W、YPK2、GLN3、YDL211C、RAD55、CYM1、ENT4、ULA1、YMR182W-A、YKR017C、YOR302W、YOR072W-B、VTS1、FYV12、YGL235W、YHR086W-A、YEL067C、YPL257W、UBA3、YMR105W-A、YOR316C-A、TMA10、YDL159W-A、ATG29、YML037C、NSL1、YJL077W-B、POP3、WHI5、MIH1、YGR240C-A、YRM1、KAR9、YJU2、SPC24、DPB2、CHL4、YMR087W、CSI1、YIL134C-A、BUR2、PTH1、SSN8、AUA1、YLR154C-G、YLR342W-A、YCL001W-A、FLC1、YLL006W-A、VAM7、YPL077C、CCZ1、PRP28、ACM1、IME4、YPR096C、FRE5、PDR8、ILV5、YIL161W、PAC11、UBR2、YRB2、YLR125W、YMR253C、DSE4、EPL1、SNP1、YMR160W、SPO77、BUB1、YFR016C、SPC97、GEM1、INO2、SPT10、YLR132C、AIM45、YJR054W、MBF1、YAL064C-A、YML054C-A、NUP1、ECM27、YIL060W、IRE1、YHR177W、YJR079W、YNL187W、YML003W、PIH1、YDR169C-A、PET111、YDL109C、YOR012W、YHR050W-A、TAR1、RIM9、YCR095W-A、RPR2、COS7、YDR049W、CUS1、JJJ3、COS10、MET1、HXT8、GLY1、SUR1、RTG1、PHM7、YJL052C-A、HXT17、YFL052W、ATG1、ECM2、YNR075C-A、YKR041W、ALD5、YHL018W、LUC7、YPS5、YLR297W、SNA4、BIO4、YBR298C-A、ECM12、SEF1、YMR247W-A、EXO1、CTF13、HUR1、SNO3、BSC5、YER175W-A、PGA1、YLR173W、YDR119W-A、IRC15、MGA1、YPR174C、IML3、YLL054C、RDS1、MDM32、PET494、YPR036W-A、GTB1、ISF1、KRE29、SAP190、YHR214C-E、GTO3、YOR365C、MIP1、SIP5、YPL191C、YPL162C、YMR291W、BRN1、MDM1、NAT4、YLR406C-A、YME1、CSI2、YOR008C-A、CEF1、BUD25、DFG16、GPB1、KAR1、PPM2、DSS1、RPC37、VID24、ERV41、YGR169C-A、ECM8、YHR032W、ELA1、PEX29、LTE1、HAT2、SLI1、MUP1、ALG13、FRE7、YMR147W、ISU2、YOR1、JID1、ECM3、ATG5、MED6、YPL014W、YLR030W、AQY2、CCT2、YER067W、NRG1、SPT8、PIR1、YGR068C、YER039C-A、ELM1、ASE1、YBL095W、YNR066C、MTL1、CNE1、CAX4、NDI1、FLX1、YNL130C-A、CWC25、YNL254C、CDC13、ATP10、OCT1、ALF1、YEF1、BAP2、HTL1、PDC5、PKP1、SSK2、CAF120、SKN1、HHF1、CDC39、YFR012W、YEL048C、HAP4、PEX7、TPO1、NFT1、NGL3、YMR206W、DUS3、YAP7、CUS2、YLR415C、FUI1、SLM5、BTT1、YFR035C、RRN10、HAP3、SSY5、SFL1、KIP1、CDC15、GLT1、DOC1、MND1、AAC1、CEP3、UBC5、YNL213C、CLN3、CSF1、ECM18、MRS4、YIL046W-A、INP1、RTT105、MPT5、ATG15、RNH202、TAX4、IZH3、BDF2、COX14、YIP4、YJR120W、SAE2、YMC2、YGR035C、NDD1、HPA2、STL1、GPM3、ERF2、MMS21、YJL133C-A、YNL024C、IFH1、LIN1、ICS3、YNR014W、SPB1、YNL211C、SOL1、COS111、HSH155、NKP2、NAB3、FMT1、YPL152W-A、BOR1、SPC25、MMS1、YIL166C、MAL13、BFA1、AEP3、MTH1、YGR031W、BIT61、YMR230W-A、SKT5、YGL258W-A、PHR1、HTB2、SER1、BAP3、YER053C-A、ATG16、BIO2、MEP3、YNR073C、PCH2、APS2、MDM30、CLB5、ISR1、MRP20、GUD1、MED1、RER2、MCM10、YIR018C-A、SPO14、NUC1、MNN4、IFM1、YLR412C-A、ALT2、NNF1、YKL096C-B、RAD51、CIT2、SPT4、LRC4、USE1、YLR455W、YOL164W-A、PRP18、COA2、HSP82、YER184C、DAD2、LEU1、YDL129W、YPL119C-A、YOR034C-A、PRP38が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が0.1以下のターミネーター領域としては、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34、YIR021W-A、FZF1、YHK8、YGL188C-A、HCM1、CDC6、YPR157W、CLB6、YOX1、YLR285C-A、YDR114C、YHR199C-A、MPS3、MUP3、YIR014W、AAR2、YPT35、AIM33、SCW11、BDF1、YCL042W、BSC4、YGL193C、NUT2、YJL118W、YKL069W、SRB8、YOR060C、MDH2、YPR116W、YPK2、GLN3、YDL211C、RAD55、CYM1、ENT4、ULA1、YMR182W-A、YKR017C、YOR302W、YOR072W-B、VTS1、FYV12、YGL235W、YHR086W-A、YEL067C、YPL257W、UBA3、YMR105W-A、YOR316C-A、TMA10、YDL159W-A、ATG29、YML037C、NSL1、YJL077W-B、POP3、WHI5、MIH1、YGR240C-A、YRM1、KAR9、YJU2、SPC24、DPB2、CHL4、YMR087W、CSI1、YIL134C-A、BUR2、PTH1、SSN8、AUA1、YLR154C-G、YLR342W-A、YCL001W-A、FLC1、YLL006W-A、VAM7、YPL077C、CCZ1、PRP28、ACM1、IME4、YPR096C、FRE5、PDR8、ILV5、YIL161W、PAC11、UBR2、YRB2、YLR125W、YMR253C、DSE4、EPL1、SNP1、YMR160W、SPO77、BUB1、YFR016C、SPC97、GEM1、INO2、SPT10、YLR132C、AIM45、YJR054W、MBF1、YAL064C-A、YML054C-A、NUP1、ECM27、YIL060W、IRE1、YHR177W、YJR079W、YNL187W、YML003W、PIH1、YDR169C-A、PET111、YDL109C、YOR012W、YHR050W-A、TAR1、RIM9、YCR095W-A、RPR2、COS7、YDR049W、CUS1、JJJ3、COS10、MET1、HXT8、GLY1、SUR1、RTG1、PHM7、YJL052C-A、HXT17、YFL052W、ATG1、ECM2、YNR075C-A、YKR041W、ALD5、YHL018W、LUC7、YPS5が挙げられる。
さらに、ターミネーター領域としては、例えば、ORC4、ICY2、GIC1、HLR1、ECM13、YLR108C、AQR1、YHR213W-A、SUT1、PLB3、AIM26、TPO4、YPR153W、GIS3、WSC3、FUR4、DLT1、MOT1、YNR063W、MET13、YDL156W、YJL107C、YJR154W、YNL042W-B、VHS1、GPI19、YIL057C、STD1、CTF19、RAD34が挙げられる。
また、所望の遺伝子の発現出力を公知のターミネーター領域を標準程度ないし、従来と同程度(例えば、公知の汎用ターミネーターと同程度)としたいときには、前記発現強度情報に基づいて、中程度の発現強度を呈したターミネーターを用いることができる。好ましくは、相対強度が、0.8超1.2未満である。より好ましくは、0.9以上1.1以下であり、さらに好ましくは0.95以上1.05以下である。
例えば、相対発現強度が0.8超1.2未満のターミネーター領域としては、LL014W、TOA1、NBA1、SLC1、IGO1、SDH3、ACS2、YOR093C、MPC54、PFY1、MIA40、YDR034C-A、RDS3、MSC3、TIM50、CSN12、GIN4、SMI1、ADE17、YGR016W、PCP1、SBA1、SRP102、SUM1、ICL1、OAF3、ZRT2、NOP10、BET2、YVH1、SPO75、DNL4、SGV1、IES4、SET4、YCL001W-B、SQT1、REI1、MRPL9、YPL066W、PET191、TEM1、UBX4、DBF20、MSB3、NUP100、RIC1、CUE4、IKI3、YEL043W、MRPL11、MPS1、EAP1、AVT2、GND1、TYW3、POP7、YDR186C、POR2、LSM5、MSH1、TOM22、YBR238C、MEP1、ILV3、YMD8、YJR061W、OSH3、TEF4、SCO1、TDH1、RIM21、YGL185C、NUS1、KTR4、RRP14、TUB4、LEU9、YLR437C、AIM7、ATX2、AI3、OST4、TRA1、MYO5、DAL4、IMG2、LTV1、YGR122W、CFT2、YMR001C-A、CDC16、YAL067W-A、YDR132C、YNL011C、TCP1、CCT3、MKK2、RRI2、ZEO1、RUD3、RTR2、YJL070C、NUP116、ENT1、SLU7、MSC2、STV1、NUP60、AIM28、YOL029C、SHE10、RSB1、SHO1、DLD2、RAX1、LCP5、ATG17、PEX17、GAL4、MET32、YOR223W、STE14、DUG3、SRX1、UFO1、YAT2、NMD3、PRP9、MSN2、PET123、SWD2、SOG2、RRP17、GPB2、YOR293C-A、TEN1、SOV1、PFK27、YIL127C、YNL024C-A、TMT1、SEC39、YER158C、ERP3、YLR257W、PKH3、YNL155W、PSO2、NOP9、GPG1、GIP4、RIB1、CYS4、ZRT3、FMP21、DAK2、ISW1、ACF4、RTT10、RTT109、FMP10、YAP6、APM4、ZAP1、ARO9、SCM4、MIM1、BRR6、SRN2、YOR287C、CLA4、RNR3、ALG8、RAD50、YBR239C、LDB7、ATP17、UGA2、ENA2、YLR408C、SAT4、BOP3、SDH4、YNL045W、RPC40、YNL134C、ARP5、MAD2、GRX6、RSM18、FES1、SGF73、ARH1、MHT1、CNS1、BDH2、YKL063C、GSH1、BOS1、THI72、BSC1、MED8、RAD5、EMP47、SIS2、TEA1、YJL185C、RTF1、CIN4、DIC1、EST2、YNK1、PUS2、PEX13、YNL217W、HOR7、MGS1、YHR009C、YML007C-A、JNM1、YHR078W、YMR155W、STB5、MRP4、STE3、CKS1、TAF13、YNL176C、PCD1、HSP26、DAS1、EDS1、CTR3、PXL1、MRS11、MET3、BDP1、CBF2、DBP6、FAR11、ERI1、MDM10、RPM2、COX13、TOA2、MYO2、PRP5、DRN1、ZDS1、IES2、FAT1、HIS1、MET16、LAS17、ACA1、HIS4、PHO12、EBP2、MRPL6、YLR271W、YBR085C-A、CRR1、SWI3、SWI4、PYK2、BUD7、PEX12、MDV1、IDH2、MRC1、TIM11、SPT15、FBP26、GUP2、NPL4、YCR007C、ABD1、YNL193W、YLR426W、YSP2、SSO2、MRPL23、YHR112C、VPS36、MET7、UTP18、MTW1、DYN1、RNH1、LST4、TAF11、RPL17A、SNA2、YGL041W-A、KAR5、YEH2、YMR118C、CUE2、URA8、YMR034C、YLR152C、YKL088W、HEM13、CAT5、KRE1、IBD2、YOL098C、AIM18、HMG1、TRM7、ADY2、LCD1、YGL194C-A、EFG1、BRX1、HIM1、TCM62、SET6、FIN1、CBF5、ASI1、DUT1、SEC65、YPL067C、RRP43、ASC1、ERG3、RTA1、NFU1、JIP4、YLR419W、YJR011C、YJL045W、ARC18、YBR287W、CAP2、NEO1、TOM5、PEP5、PCC1、PXR1、ALG11、YLR301W、ARG1、RFC4、AIM42、PPA2、DAP1、RTS1、EDC3、IRC23、YBR220C、GPI14、IML1、NIP7、YPT32、MSS18、CHO1、CST26、MOH1、PLP1、MKC7、XYL2、YMR295C、YLR003C、YIL096C、MOT2、RLP7、YSC84、NDL1、PFK1、MRD1、SAC6、REX2、RPA34、AHC2、APC1、YDR222W、VHR1、SUS1、UTH1、IRC8、SNO1、APT1、YOR352W、YMR258C、MRH1、HRP1、SRP21、MRPL22、SEC9、KAR2、YGR054W、HOF1、YDC1、YGR207C、WSC2、SRC1、YAR023C、HAM1、PER1、YKL047W、FLC3、TRM10、PAU15、RFA1、AI2、MPP10、ELC1、PHB1、OST1、LSB1、OKP1、THI22、MRP51、COX20、FCF1、PHO80、FIT1、YPL056C、KIN4、GCD1、FRT1、ACS1、LGE1、YJL136W-A、MLC2、SMF1、ISW2、HIS6、CTR2、GCV2、GAL83、IMP3、GRS1、MRS5、NCE101、BUD17、MKS1、SYF1、ACH1、ARN1、RCN2、UBC12、YER079W、YHL044W、THI20、PML1、IRC10、BMS1、SSA1、DDI2、RPC11、YDR115W、DDC1、IRC21、DUR3、PET100、SKI8、QRI5、QDR1、UBC11、MRT4、POL3、MFB1、TCO89、YDR370C、OYE2、MDM31、SLG1、YOR062C、DNF1、MEH1、AIR2、MSS116、ACB1、ADE12、ELO1、VTA1、MRPL27、YFL054C、SPC34、RGS2、DRS1、GTR1、COX8、KEL2、NUP82、GIR2、FKH2、CLG1、PEX6、HO、YHR003C、NUP84、RRB1、PSY2、BSD2、ESBP6、MED7、RSN1、YKE2、YHL012W、SHE2、RPL2A、DUO1、DST1、PET9、RSA3、GLN4、YKR015C、YJR141W、RIM20、BCK2、SPC42、TRF5、FAA2、TRS130、GUA1、HSL7、PDE2、RRP8、XRS2、SPE1、RFT1、VPS20、SEC20、PAD1、GGC1、ORC1、HMG2、STE2、LSM3、ICS2、TRM2、CDC3、HEM2、SIN4、VIK1、HIS7、RAD54、IQG1、DFG10、TIP1、BRR2、GRX2、HTZ1、BCH2、NRG2、RSC58、TMA16、RAD59、URM1、ADY4、AAP1、ABP1、YGR066C、BRE5、BFR2、LSM1、CHD1、VTI1、AIM11、RFA2、SUR4、YOR228C、DLD3、ISN1、CYC2、SNF5、YMR124W、GIP2、SVL3、SEC13、YEL047C、BEM1、RPL16A、SPR3、ATP4、WAR1、ITR1、FAR3、YOR021C、YBR028C、NOP58、RPN13、YNL035C、YJL049W、YER137C、NOC4、ALG7、MET22、SIL1、TYS1、GLK1、YDR341C、YKR045C、RAD23、BIK1、RPL27A、YOR152C、KNS1、YHR182W、EEB1、RKM1、SNG1、YIL067C、VPS66、TCB1、ADE4、YNL034W、HSP78、HEM15、PKC1、SPP2、MF(ALPHA)1、ARP6、NCS6、RTS3、SPE4、YPL199C、DAL81、SAC1、YOL131W、YHL026C、REC107、YGR174W-A、SGE1、NCB2、YNL320W、CDC20、CSG2、ECM5、NOC2、IES1、SMK1、PHO86、YHR202W、CIN1、PFS1、MCM21、ROT2、GLC7、HRT1、YDR018C、APM1、DPH2、CDH1、HNT3、ATG4、FRE3、ATP2、YMR148W、YAT1、ERG11、PGI1、FKH1、MET30、YGL140C、ARC35、SNX41、SAS2、YHR007C-A、YML083C、ABF1、YLR104W、TOS1、MF(ALPHA)2、FRM2、OPY1、MMF1、DIG1、PMI40、YIL092W、ASI3、FIR1、ERG26、YMR090W、YGL085W、CDC24、YPL113C、YPR010C-A、BIR1、AAH1、EPT1、MSW1、NOP14、CBT1、COX18、COX16、RRD1、BEM4、GEA2、FOB1、ERG7、YLR042C、SEC17、YPR063C、PUT4、MSI1、RPA43、SPE2、DAL1、RPC25、BRO1、AXL1、EAF7、RCR1、YDR338C、RGA1、LOT5、YIH1、RNA1、SKM1、PUT2、HEM4、AIM37、PHO13、YGR015C、AKR2、YKL050C、TCB2、HAC1、ADE1、RTN1、RPL8B、MDM36、JHD1、CCL1、YDR282C、PRE10、PEX14、OMA1、YNR034W-A、NBP2、SPT20、PRP2、YGL041C-B、YBR255W、YOR246C、YFL012W、YLR412W、DUR1,2、RPS4A、YAL037W、ICT1、CTR86、RPN10、RME1、MSB4、SAM35、MAG2、YOL092W、PPZ1、YGL138C、YHR097C、SSZ1、SIS1、CTP1、TAF5、PDC1、YPL150W、GCD10、ENP1、TOM40、ERG6、ECM4、RLF2、RKI1、SAM3、SEC62、CRC1、UME1、TUS1、YNL046W、VTC1、TEL2、YEN1、PEX30、GSG1、NTE1、RBG1、TIM8、YNG1、PMT5、PRP16、SPT6、NIP100、THS1、HMRA1、STE20、AIM10、YGL242C、GTR2、YOL157C、LOT6、KEX1、MET14、UBA2、NUT1、SPO21、PAC10、YND1、DSE3、YJR149W、YOR378W、GSY2、YBR063C、SRV2、YCK1、YKL091C、FMS1、UTP23、YCR090C、SFT2、BNI5、SNX3、FSH2、RGD2、SST2、UNG1、YLR164W、RPS26B、TRE1、MSH5、MYO3、YGL039W、SUP35、AMA1、ATP19、YGL036W、PTK2、PBP2、TRM112、SMC1、NPR1、PFK2、PDE1、RRI1、FRE2、YOR118W、FRE1、ECM38、ALD3、STT3、VMR1、RPC82、URK1、ATX1、REG1、PNT1、YMR279C、RSC8、YJR111C、YLR253W、FSH1、YDR336W、ERD1、VPS41、AYT1、VRG4、YPL009C、VID22、YDR514C、APC11、VPS74、KRE11、RRP6、FOX2、ASM4、MED11、TWF1、GRX5、MYO1、YPL107W、PET54、YLR064W、SPC2、APP1、DBP5、BPH1、YKL151C、NAF1、YKL027W、ARO3、UBX6、TIM18、BNI4、SPC98、PZF1、PIC2、UTP8、YBR235W、SMC6、RLR1、DBF4、RPB11、SHE3、SFB3、SYT1、STU2、NGL2、GDS1、NOP2、SVS1、PRY2、GDA1、BCY1、PUS1、COX7、MRPL15、RER1、SLH1、RPB3、TIF11、YDL173W、YML053C、PEX4、MIG1、CLU1、ECM32、FCY1、HSP32、MAL12、JLP2、DAT1、RMR1、KTR6、OST2、NOP12、IRC3、OPT2、YBL054W、PDX1、AMS1、YBR204C、SLM2、VPS64、PTH2、MRP1、TIF5、AAT2、CPR3、AVT6、CLF1、MDM38、COX12、ESS1、RPG1、SNF11、ERV15、YPR078C、RHO3、SUE1、CLN2、YFL040W、YLR040C、RLA1、YMR272W-B、MND2、EHD3、IMP4、PAH1、HMO1、RPL26A、PIR3、MNN5、FCY22、SMD3、YER186C、QDR2、MHP1、CRH1、LSB3、RMD1、SDA1、AXL2、NOP16、YCL058W-A、ORC6、PRR2、STH1、CCA1、FUS1、MRS6、YBP1、RPL12A、UTR4、MTF2、MAK31、BOP2、UIP5、SSL1、INO4、RPT3、YBR072C-A、YHR159W、ITR2、PUF3、ADD66、GCS1、LYS2、MTR2、TRP1、HXT11、ALG1、SPS18、YOR111W、STI1、SSD1、CRN1、CSN9、RSM22、YIL152W、TOF1、HOM2、MOB1、RAD24、IRC25、RSM23、YLR049C、YBL055C、SPP41、YMR310C、YHC1、YNL040W、AIM41、APL5、ILV2、YIR035C、REC8、MSS51、GAP1、EMP70、HAL1、CDC21、VPS75、YER066W、MCM7、CHZ1、YKL121W、MMS2、BUL2、SEC1、BEM2、YKR018C、NUP2、VPS73、YIL024C、YPL225W、FEN1、YSR3、CST9、YLR241W、MAK10、CUP2、CCP1、ERV14、YJU3、RAP1、IMP1、COA1、TFA1、FAF1、ATP5、ARG3、RVB1、RPA49、NSE4、YKT6、RRN9、APM2、GAT3、SPN1、CKB1、DTD1、TPO2、PRP45、DEG1、PTC5、TSC10、DPB11、YKR005C、RIM15、PNO1、COX15、VPS4、PKH2、MTR4、YLR053C、LEU4、YPK1、PDX3、TIF2、YDL180W、FYV8、BUD13、YBR139W、TPK2、SSH1、YGR102C、YDR348C、RPL28、QCR2、YAR1、SCP1、TIP20、UBC7、SEC11、RPN11、TGL5、HSP60、RPL42B、PRS1、YKL018C-A、TFC6、RNH201、URA1、ALG9、MSG5、AKR1、MNN11、OCA1、YGP1、PPX1、TSC3、PSF3、YAF9、YMR175W-A、LHP1、YMR252C、SLK19、YJR107W、PMC1、HCR1、SKG1、PCT1、LPE10、PGK1、HAS1、SEC23、GPI13、YDR476C、YLR073C、SUI3、RCO1、LYS20、NUP170、JJJ1、RAD27、YLL032C、GDB1、GON7、PRS4、GAL7、RAI1、MLC1、SWD3、REV1、FET3、DAL7、DAL80、COQ5、TRK2、PRP31、SYP1、RPL36A、OSH7、RPL12B、UME6、LCB4、IZH2、MDH3、OGG1、RPL1A、YGL157W、HUB1、TGL4、CAF16、NPP2、URE2、GMH1、AVT3、FAA1、BET5、YPR091C、PET8、STB1、ERG13、UTP10、MMP1、YTH1、EMI2、MES1、PDS1、NPL3、PRD1、YGR235C、PHO8、PEX22、LAP4、LCB2、YLR326W、EMP46、MRPS17、AIM17、NUP57、YER134C、YCR076C、YBL104C、SSM4、YMR187C、YEF3、PIG1、ECM16、SPO20、ILS1、MFT1、RRP46、RPS23A、ECM40、STT4、SOK2、RPL9A、SIR1、SES1、CDC26、SSU1、SAS3、YKL187C、ARG8、RPL16B、LCB3、TVP18、APJ1、GDH1、IPT1、ATP7、YAR029W、PIS1、TRS23、SEC72、CHA4、DMA2、RUP2、DCP2、KAP114、YTA12、PHO87、TPS3、RPS10B、LIP2、PAF1、MEU1、ALK1、RIM11、SLA2、RSC6、CBC2、YBR016W、FIS1、RAS1、SFA1、YOL057W、YOR292C、MCD4、CSM1、MAK32、DAP2、EXG2、DID2、HXT15、DIE2、VAC8、YBR138C、NTH2、YCR099C、RTT107、MAF1、ERG9、PPN1、SRB4、CDC55、YDR248C、YDR003W-A、GLC8、PDR11、SPB4、YSC83、YLR072W、MCH1、RPH1、DAD3、SPT3、YFR057W、IDI1、TDH3、OCA2、PEX18、FUN30、RRP3、ABC1、IWR1、YJR088C、PTR2、SEC26、AQY1、ECM21、BUD27、PFK26、YDR352W、CUP5、ATG3、AGE2、RIX7、HSE1、AGA1、GRX7、AGE1、TUB2、YHR122W、RIB4、VRP1、LAS1、OCA4、YGR277C、BUB3、LPD1、EMI5、CTF18、YOL073C、SIT1、LYS12、FTR1、TUL1、EKI1、LEO1、GAL1、VAC17、REV7、PMP2、TIM13、YMR158C-A、TLG2、YGR106C、YML079W、YFR045W、YBR056W、YLR065C、HSH49、MTF1、LAG1、ATE1、RFM1、RNH203、DBP8、TPS1、YGR205W、PIM1、RAD16、SPI1、SPP1、CHS5、MNR2、PIL1、SMT3、PEF1、SKO1、CDC45、SUC2、RXT3、RPN9、SPO12、RPE1、SEC15、HMI1、RRP4、ERG25、MUC1、TPT1、OPY2、OSH2、VNX1、PXA2、YSW1、SRP14、OST5、CDC4、RPL38、YDR520C、ARO2、DOM34、SWE1、GTO1、RPL37B、RAD3、MEP2、PKH1、ARL1、ROX3、SFT1、SIM1、CIA1、COX5B、CLN1、MNE1、BRE4、UBX5、DSL1、ACK1、YHR140W、ARG82、SCS22、ADH7、HSC82、ARO80、HED1、MAD1、TRP5、RPN3、SEN54、PTM1、ATG23、GIM4、YDR089W、MON2、PEX32、PUS6、YJL038C、SGN1、PRP39、YNR070W、SPO71、SAE3、MGR2、INP53、TUP1、SHP1、INO80、CDC23、GAB1、PTC1、SKI2、DNF3、YOR389W、AIM14、ATP16、VPS51、NSE3、UTP21、MDE1、ALY1、MNI2、BNS1、ILV1、TPO5、THI21、PEX2、YMR194C-B、SFI1、ESF1、YJL068C、GPI1、ISC10、RPL13A、YDR391C、TVP15、YNL108C、YDR051C、SRP101、SAS4、ARG4、PAN5、PTK1、THI6、YOR019W、GCN5、DID4、TRM11、ABZ2、YHR210C、RPL34B、POL31、RPS4B、COG4、RPS16B、LCB1、ARA2、VPH2、YBT1、HSM3、YBL036C、DAL2、VTC4、RPS21B、YOR131C、ADE13、YKL215C、LSM2、FAR10、MCH2、IMD3、USV1、YAR035C-A


、RAM1、SNM1、PNG1、RFC3、ARP2、TOR2、ISC1、CTS1、YSH1、AIM4、BIT2、GVP36、SED1、SPG4、KGD1、NMT1、SSY1、LSC1、NRK1、YLR177W、SCD6、YDR210W、LRP1、URA2、PEX21、MCM5、SSE2、PYC2、GFD1、YNL247W、RAD17、BRE2、CDC48、IES5、RPL23A、PTR3、ATP20、PAU3、CPR8、ARO7、YRO2、HRB1、HSP42、RPS18B、FMP23、ADE6、DER1、PPE1、CUE3、ACF2、QNS1、IOC3、NAM9、YDL144C、ENB1、KTR3、PSD1、HOS1、FCY21、CAJ1、ERP4、LRC2、TFB5、PRM3、CPR7、MET17、SAH1、YGR149W、GAC1、TFC7、RHO5、TIF34、YPT1、MSS4、FLC2、PRE2、YCL068C、GAL80、SPG3、URB1、MGE1、STR2、RPL34A、UIP3、NPP1、FMP24、AIM23、BIO3、PRO2、TMN3、EST3、PHO5、YSP1、TUF1、ORM1、OLA1、NMA1、YMR209C、SEC27、SLA1、YCL012C、SLM1、NOP53、YLR162W-A、PAU13、ALA1、YDL133W、CDC37、HCA4、PRB1、GSY1、YIP3、TMA46、RPP1、PRP3、YBL107C、UBP14、VAM10、CBS1、YOR238W、OM14、SEC66、CST6、SSF2、FRS1、NCA2、HMX1、NOP13、RNR2、QDR3、OTU2、SPO13、HUL5、SED4、RRP42、CDC33、MLP1、GOR1、YDL119C、YJR039W、HNT2、SCM3、MET12、VPS33、MGR1、PCM1、YUH1、CDS1、SAP185、CRT10、SNF1、CMP2、APL6、IDH1、YDR428C、SEC21、APL4、PAP2、GPI17、SCH9、HOP1、MUK1、RPS25B、NOB1、STE23、YLR243W、GRE3、CCS1、VEL1、ENO2、COG6、RPL11B、HNT1、LEM3、GPI15、FSF1、SEC3、SOL2、PRS5、VPS71、ACC1、ADE8、GNA1、YNR024W、RSF2、MAL32、PAU21、SPS19、YIL002W-A、SPF1、CCT8、PRM2、PDH1、RBL2、PIF1、VBA1、AFG1、DIN7、IZH1、YPL105C、YCR051W、WWM1、SIP3、SYS1、HPC2、RPL40A、NCR1、YER078C、CAP1、GCN4、AIM38、PTC7、FUN14、COS8、MCH4、PRP24、CWC2、CLC1、SIR4、FUS3、YLR057W、ZRG17、YSA1、PTC3、UBP6、KAP122、EFT2、URA3、ALG2、POL5、RPL1B、LIP1、TMA20、NAS6、IRC5、KIN3、YPL033C、AVT4、YGR266W、CTI6、YNL050C、SDP1、ESF2、NFS1、YER078W-A、IZH4、CWC22、YGR110W、DYN2、SNF4、YMR178W、NSE5、RPL40B、TKL2、HIR1、RPS30A、HSP12、YDR539W、GCV1、NTG1、AZR1、SPO7、YNL022C、DIM1、VAM6、YNR061C、PDA1、YOR032W-A、SPC3、CSR1、COS9、YJR085C、PEX15、TGL2、SGD1、YPL278C、YIL108W、THP1、SCY1、YGR130C、UBC6、END3、UBP15、RPL35B、MSB2、YCT1、SOL3、YDL027C、KIP3、UTP11、SUB1、PRP19、DCW1、TAH18、YER010C、PIN3、GYP1、SCW10、CTK1、ARK1、FYV10、YCR016W、YDJ1、ARF1、BGL2、YHR100C、CBS2、REX3、TSA1、RNA14、RCE1、THR4、SIP18、PMS1、DSK2、CDC50、DPH5、HEM12、SER3、YML119W、ESC1、GAL11、PRE7、RPT5、ERG2、DSE1、SEC22、YFH7、HSF1、GOS1、WRS1、EXO70、TSA2、ALK2、COX6、KRI1、YGL015C、RPS17B、YDR367W、TOM20、RSP5、YBL086C、TRM44、YPR109W、PTP1、AVT7、CYR1、CIS1、FAL1、VPS28、AGA2、QRI1、ATS1、GIT1、THO1、FBP1、YJL016W、UGA3、YBR230W-A、CCE1、NDE1、SET5、HOT1、RPT1、CAR2、PRE4、ECM33、ECM11、RAD33、BUB2、SOP4、SPR1、MOG1、SPO11、YKR070W、YBR246W、YKL071W、AHP1、PRP42、GRC3、KEL3、YMR244W、YMR242W-A、HBN1、VAS1、RTT102、ZUO1、YGR250C、FRQ1、YCL049C、MCR1、UBP11、TIF35、ATG26、YKL107W、HEM14、THR1、LUG1、SPS100、VMA22、YEL020C、RPL2B、GAL10、FKS1、YPL247C、YEL057C、RPS22A、TRK1、VTC2、SNU114、SWD1、UBC8、YPT52、XDJ1、YJR142W、COQ9、ERV25、YKL075C、FPR4、SEN2、GDT1、NOP7、YOR251C、SRL1、YLL023C、IRA2、IES6、MLF3、DIA1、MTG1、FPR1、NCE102、ERG4、SIF2、NUP53、RPL14A、SEC18、SSB2、RAT1、YMR027W、GDI1、VAN1、KAP123、ICL2、LPX1、RPP2A、SCD5、EXO84、CWC21、TRE2、YGR153W、YCR061W、RAD14、CUL3、VPS53、GEA1、GET3、TAD2、POT1、MVP1、PUS4、SMC2、RFC5、TIF3、NTG2、HXT10、CDC60、ENT5、GAT4、PGU1、UFD4、RPL37A、PRE5、PDC6、GCV3、EGD1、MSC7、KEM1、APN1、APE2、YLR456W、MAK5、YPR172W、STE24、RPS9B、CRM1、STP22、DIA2、ECO1、MCX1、YKL065W-A、NTR2、HHO1、RRM3、PRE8、NYV1、RPC53、TMA23、REC104、ZTA1、TEC1、TUB3、YJL123C、AST2、SNX4、ARC1、SOD1、SMA2、RGD1、PHM8、SEM1、GGA2、YAK1、RGA2、SCS3、YTA7、MDM12、AUR1、SKN7、MDG1、RSM7、YOL038C-A、OSW2、TIR3、RSM28、NIF3、FRE6、MDM20、YNR071C、GDH2、VPS8、MVD1、GCD2、TFP3、FMP33、NUG1、CPR6、SCP160、SEC14、YNL181W、PRE6、YLR364W、HOG1、NUP49、RPL21B、RPL42A、GTT2、STR3、ARG5,6、RPS24A、PPM1、AIM46、ILM1、PEX10、PDS5、YDR042C、YDL218W、MGT1、NPC2、YLR194C、PDI1、XKS1、SIW14、KOG1、PDR15、NGR1、SMX3、FIP1、UGA4、EDC1、YDL086W、GGA1、SMM1、AIM39、UBC1、YGR203W、PRP4、YSF3、SNA3、SKI6、CDC12、VPS60、MSC1、SET1、NMA111、SKI7、KRE5、FOL2、DAL3、SAK1、RVS161、YBR141C、LHS1、YFL051C、YGR067C、NOT5、CKB2、ATG2、YJR112W-A、RKM2、RPL36B、CNB1、PRP43、LCB5、PAC1、ARP3、LRC1、RGR1、YDL157C、DPL1、GCY1、YER076C、TFB3、RPS8B、GAT2、GFD2、MRP8、VAC14、YHR138C、PHO90、PSK2、ALT1、ERP5、LAS21、AIM9、SLZ1、SGM1、FMP27、HXT3、YGR273C、RAM2、RET1、YIR007W、RPS2、MTQ2、RPS23B、COS12、RUB1、RGP1、GYP7、YOL138C、PMT2、YMR130W、SPS4、RAD28、YLR099W-A、YOR285W、MBR1、MPH1、NUP159、SEC63、RPS16A、YPL206C、BCD1、HOT13、IVY1、RNA15、YKR104W、STE4が挙げられる。
また、例えば、相対発現強度が0.9以上1.1以下のターミネーター領域としては、DNF1、MEH1、AIR2、MSS116、ACB1、ADE12、ELO1、VTA1、MRPL27、YFL054C、SPC34、RGS2、DRS1、GTR1、COX8、KEL2、NUP82、GIR2、FKH2、CLG1、PEX6、HO、YHR003C、NUP84、RRB1、PSY2、BSD2、ESBP6、MED7、RSN1、YKE2、YHL012W、SHE2、RPL2A、DUO1、DST1、PET9、RSA3、GLN4、YKR015C、YJR141W、RIM20、BCK2、SPC42、TRF5、FAA2、TRS130、GUA1、HSL7、PDE2、RRP8、XRS2、SPE1、RFT1、VPS20、SEC20、PAD1、GGC1、ORC1、HMG2、STE2、LSM3、ICS2、TRM2、CDC3、HEM2、SIN4、VIK1、HIS7、RAD54、IQG1、DFG10、TIP1、BRR2、GRX2、HTZ1、BCH2、NRG2、RSC58、TMA16、RAD59、URM1、ADY4、AAP1、ABP1、YGR066C、BRE5、BFR2、LSM1、CHD1、VTI1、AIM11、RFA2、SUR4、YOR228C、DLD3、ISN1、CYC2、SNF5、YMR124W、GIP2、SVL3、SEC13、YEL047C、BEM1、RPL16A、SPR3、ATP4、WAR1、ITR1、FAR3、YOR021C、YBR028C、NOP58、RPN13、YNL035C、YJL049W、YER137C、NOC4、ALG7、MET22、SIL1、TYS1、GLK1、YDR341C、YKR045C、RAD23、BIK1、RPL27A、YOR152C、KNS1、YHR182W、EEB1、RKM1、SNG1、YIL067C、VPS66、TCB1、ADE4、YNL034W、HSP78、HEM15、PKC1、SPP2、MF(ALPHA)1、ARP6、NCS6、RTS3、SPE4、YPL199C、DAL81、SAC1、YOL131W、YHL026C、REC107、YGR174W-A、SGE1、NCB2、YNL320W、CDC20、CSG2、ECM5、NOC2、IES1、SMK1、PHO86、YHR202W、CIN1、PFS1、MCM21、ROT2、GLC7、HRT1、YDR018C、APM1、DPH2、CDH1、HNT3、ATG4、FRE3、ATP2、YMR148W、YAT1、ERG11、PGI1、FKH1、MET30、YGL140C、ARC35、SNX41、SAS2、YHR007C-A、YML083C、ABF1、YLR104W、TOS1、MF(ALPHA)2、FRM2、OPY1、MMF1、DIG1、PMI40、YIL092W、ASI3、FIR1、ERG26、YMR090W、YGL085W、CDC24、YPL113C、YPR010C-A、BIR1、AAH1、EPT1、MSW1、NOP14、CBT1、COX18、COX16、RRD1、BEM4、GEA2、FOB1、ERG7、YLR042C、SEC17、YPR063C、PUT4、MSI1、RPA43、SPE2、DAL1、RPC25、BRO1、AXL1、EAF7、RCR1、YDR338C、RGA1、LOT5、YIH1、RNA1、SKM1、PUT2、HEM4、AIM37、PHO13、YGR015C、AKR2、YKL050C、TCB2、HAC1、ADE1、RTN1、RPL8B、MDM36、JHD1、CCL1、YDR282C、PRE10、PEX14、OMA1、YNR034W-A、NBP2、SPT20、PRP2、YGL041C-B、YBR255W、YOR246C、YFL012W、YLR412W、DUR1,2、RPS4A、YAL037W、ICT1、CTR86、RPN10、RME1、MSB4、SAM35、MAG2、YOL092W、PPZ1、YGL138C、YHR097C、SSZ1、SIS1、CTP1、TAF5、PDC1、YPL150W、GCD10、ENP1、TOM40、ERG6、ECM4、RLF2、RKI1、SAM3、SEC62、CRC1、UME1、TUS1、YNL046W、VTC1、TEL2、YEN1、PEX30、GSG1、NTE1、RBG1、TIM8、YNG1、PMT5、PRP16、SPT6、NIP100、THS1、HMRA1、STE20、AIM10、YGL242C、GTR2、YOL157C、LOT6、KEX1、MET14、UBA2、NUT1、SPO21、PAC10、YND1、DSE3、YJR149W、YOR378W、GSY2、YBR063C、SRV2、YCK1、YKL091C、FMS1、UTP23、YCR090C、SFT2、BNI5、SNX3、FSH2、RGD2、SST2、UNG1、YLR164W、RPS26B、TRE1、MSH5、MYO3、YGL039W、SUP35、AMA1、ATP19、YGL036W、PTK2、PBP2、TRM112、SMC1、NPR1、PFK2、PDE1、RRI1、FRE2、YOR118W、FRE1、ECM38、ALD3、STT3、VMR1、RPC82、URK1、ATX1、REG1、PNT1、YMR279C、RSC8、YJR111C、YLR253W、FSH1、YDR336W、ERD1、VPS41、AYT1、VRG4、YPL009C、VID22、YDR514C、APC11、VPS74、KRE11、RRP6、FOX2、ASM4、MED11、TWF1、GRX5、MYO1、YPL107W、PET54、YLR064W、SPC2、APP1、DBP5、BPH1、YKL151C、NAF1、YKL027W、ARO3、UBX6、TIM18、BNI4、SPC98、PZF1、PIC2、UTP8、YBR235W、SMC6、RLR1、DBF4、RPB11、SHE3、SFB3、SYT1、STU2、NGL2、GDS1、NOP2、SVS1、PRY2、GDA1、BCY1、PUS1、COX7、MRPL15、RER1、SLH1、RPB3、TIF11、YDL173W、YML053C、PEX4、MIG1、CLU1、ECM32、FCY1、HSP32、MAL12、JLP2、DAT1、RMR1、KTR6、OST2、NOP12、IRC3、OPT2、YBL054W、PDX1、AMS1、YBR204C、SLM2、VPS64、PTH2、MRP1、TIF5、AAT2、CPR3、AVT6、CLF1、MDM38、COX12、ESS1、RPG1、SNF11、ERV15、YPR078C、RHO3、SUE1、CLN2、YFL040W、YLR040C、RLA1、YMR272W-B、MND2、EHD3、IMP4、PAH1、HMO1、RPL26A、PIR3、MNN5、FCY22、SMD3、YER186C、QDR2、MHP1、CRH1、LSB3、RMD1、SDA1、AXL2、NOP16、YCL058W-A、ORC6、PRR2、STH1、CCA1、FUS1、MRS6、YBP1、RPL12A、UTR4、MTF2、MAK31、BOP2、UIP5、SSL1、INO4、RPT3、YBR072C-A、YHR159W、ITR2、PUF3、ADD66、GCS1、LYS2、MTR2、TRP1、HXT11、ALG1、SPS18、YOR111W、STI1、SSD1、CRN1、CSN9、RSM22、YIL152W、TOF1、HOM2、MOB1、RAD24、IRC25、RSM23、YLR049C、YBL055C、SPP41、YMR310C、YHC1、YNL040W、AIM41、APL5、ILV2、YIR035C、REC8、MSS51、GAP1、EMP70、HAL1、CDC21、VPS75、YER066W、MCM7、CHZ1、YKL121W、MMS2、BUL2、SEC1、BEM2、YKR018C、NUP2、VPS73、YIL024C、YPL225W、FEN1、YSR3、CST9、YLR241W、MAK10、CUP2、CCP1、ERV14、YJU3、RAP1、IMP1、COA1、TFA1、FAF1、ATP5、ARG3、RVB1、RPA49、NSE4、YKT6、RRN9、APM2、GAT3、SPN1、CKB1、DTD1、TPO2、PRP45、DEG1、PTC5、TSC10、DPB11、YKR005C、RIM15、PNO1、COX15、VPS4、PKH2、MTR4、YLR053C、LEU4、YPK1、PDX3、TIF2、YDL180W、FYV8、BUD13、YBR139W、TPK2、SSH1、YGR102C、YDR348C、RPL28、QCR2、YAR1、SCP1、TIP20、UBC7、SEC11、RPN11、TGL5、HSP60、RPL42B、PRS1、YKL018C-A、TFC6、RNH201、URA1、ALG9、MSG5、AKR1、MNN11、OCA1、YGP1、PPX1、TSC3、PSF3、YAF9、YMR175W-A、LHP1、YMR252C、SLK19、YJR107W、PMC1、HCR1、SKG1、PCT1、LPE10、PGK1、HAS1、SEC23、GPI13、YDR476C、YLR073C、SUI3、RCO1、LYS20、NUP170、JJJ1、RAD27、YLL032C、GDB1、GON7、PRS4、GAL7、RAI1、MLC1、SWD3、REV1、FET3、DAL7、DAL80、COQ5、TRK2、PRP31、SYP1、RPL36A、OSH7、RPL12B、UME6、LCB4、IZH2、MDH3、OGG1、RPL1A、YGL157W、HUB1、TGL4、CAF16、NPP2、URE2、GMH1、AVT3、FAA1、BET5、YPR091C、PET8、STB1、ERG13、UTP10、MMP1、YTH1、EMI2、MES1、PDS1、NPL3、PRD1、YGR235C、PHO8、PEX22、LAP4、LCB2、YLR326W、EMP46、MRPS17、AIM17、NUP57、YER134C、YCR076C、YBL104C、SSM4、YMR187C、YEF3、PIG1、ECM16、SPO20、ILS1、MFT1、RRP46、RPS23A、ECM40、STT4、SOK2、RPL9A、SIR1、SES1、CDC26、SSU1、SAS3、YKL187C、ARG8、RPL16B、LCB3、TVP18、APJ1、GDH1、IPT1、ATP7、YAR029W、PIS1、TRS23、SEC72、CHA4、DMA2、RUP2、DCP2、KAP114、YTA12、PHO87、TPS3、RPS10B、LIP2、PAF1、MEU1、ALK1、RIM11、SLA2、RSC6、CBC2、YBR016W、FIS1、RAS1、SFA1、YOL057W、YOR292C、MCD4、CSM1、MAK32、DAP2、EXG2、DID2、HXT15、DIE2、VAC8、YBR138C、NTH2、YCR099C、RTT107、MAF1、ERG9、PPN1、SRB4、CDC55、YDR248C、YDR003W-A、GLC8、PDR11、SPB4、YSC83、YLR072W、MCH1、RPH1、DAD3、SPT3、YFR057W、IDI1、TDH3、OCA2、PEX18、FUN30、RRP3、ABC1、IWR1、YJR088C、PTR2、SEC26、AQY1、ECM21、BUD27、PFK26、YDR352W、CUP5、ATG3、AGE2、RIX7、HSE1、AGA1、GRX7、AGE1、TUB2、YHR122W、RIB4、VRP1、LAS1、OCA4、YGR277C、BUB3、LPD1、EMI5、CTF18、YOL073C、SIT1、LYS12、FTR1、TUL1、EKI1、LEO1、GAL1、VAC17、REV7、PMP2、TIM13、YMR158C-A、TLG2、YGR106C、YML079W、YFR045W、YBR056W、YLR065C、HSH49、MTF1、LAG1、ATE1、RFM1、RNH203、DBP8、TPS1、YGR205W、PIM1、RAD16、SPI1、SPP1、CHS5、MNR2、PIL1、SMT3、PEF1、SKO1、CDC45、SUC2、RXT3、RPN9、SPO12、RPE1、SEC15、HMI1、RRP4、ERG25、MUC1、TPT1、OPY2、OSH2、VNX1、PXA2、YSW1、SRP14、OST5、CDC4、RPL38、YDR520C、ARO2、DOM34、SWE1、GTO1、RPL37B、RAD3、MEP2、PKH1、ARL1、ROX3、SFT1、SIM1、CIA1、COX5B、CLN1、MNE1、BRE4、UBX5、DSL1、ACK1、YHR140W、ARG82、SCS22、ADH7、HSC82、ARO80、HED1、MAD1、TRP5、RPN3、SEN54、PTM1、ATG23、GIM4、YDR089W、MON2、PEX32、PUS6、YJL038C、SGN1、PRP39、YNR070W、SPO71、SAE3、MGR2、INP53、TUP1、SHP1、INO80、CDC23、GAB1、PTC1、SKI2、DNF3、YOR389W、AIM14、ATP16、VPS51、NSE3、UTP21、MDE1、ALY1、MNI2、BNS1、ILV1、TPO5、THI21、PEX2、YMR194C-B、SFI1、ESF1、YJL068C、GPI1、ISC10、RPL13A、YDR391C、TVP15、YNL108C、YDR051C、SRP101、SAS4、ARG4、PAN5、PTK1、THI6、YOR019W、GCN5、DID4、TRM11、ABZ2、YHR210C、RPL34B、POL31、RPS4B、COG4、RPS16B、LCB1、ARA2、VPH2、YBT1、HSM3、YBL036C、DAL2、VTC4、RPS21B、YOR131C、ADE13、YKL215C、LSM2、FAR10、MCH2、IMD3、USV1、YAR035C-A、RAM1、SNM1、PNG1、RFC3、ARP2、TOR2、ISC1、CTS1、YSH1、AIM4、BIT2、GVP36、SED1、SPG4、KGD1、NMT1、SSY1、LSC1、NRK1、YLR177W、SCD6、YDR210W、LRP1、URA2、PEX21、MCM5、SSE2、PYC2、GFD1、YNL247W、RAD17、BRE2、CDC48、IES5、RPL23A、PTR3、ATP20、PAU3、CPR8、ARO7、YRO2、HRB1、HSP42、RPS18B、FMP23、ADE6、DER1、PPE1、CUE3、ACF2、QNS1、IOC3、NAM9、YDL144C、ENB1、KTR3、PSD1、HOS1、FCY21、CAJ1、ERP4、LRC2、TFB5、PRM3、CPR7、MET17、SAH1、YGR149W、GAC1、TFC7、RHO5、TIF34、YPT1、MSS4、FLC2、PRE2、YCL068C、GAL80、SPG3、URB1、MGE1、STR2、RPL34A、UIP3、NPP1、FMP24、AIM23、BIO3、PRO2、TMN3、EST3、PHO5、YSP1、TUF1、ORM1、OLA1、NMA1、YMR209C、SEC27、SLA1、YCL012C、SLM1、NOP53、YLR162W-A、PAU13、ALA1、YDL133W、CDC37、HCA4、PRB1、GSY1、YIP3、TMA46、RPP1、PRP3、YBL107C、UBP14、VAM10、CBS1、YOR238W、OM14、SEC66、CST6、SSF2、FRS1、NCA2、HMX1、NOP13、RNR2、QDR3、OTU2、SPO13、HUL5、SED4、RRP42、CDC33、MLP1、GOR1、YDL119C、YJR039W、HNT2、SCM3、MET12、VPS33、MGR1、PCM1、YUH1、CDS1、SAP185、CRT10、SNF1、CMP2、APL6、IDH1、YDR428C、SEC21、APL4、PAP2、GPI17、SCH9、HOP1、MUK1、RPS25B、NOB1、STE23、YLR243W、GRE3、CCS1、VEL1、ENO2、COG6、RPL11B、HNT1、LEM3、GPI15、FSF1、SEC3、SOL2、PRS5、VPS71、ACC1、ADE8、GNA1、YNR024W、RSF2、MAL32、PAU21、SPS19、YIL002W-A、SPF1、CCT8、PRM2、PDH1、RBL2、PIF1、VBA1、AFG1、DIN7、IZH1、YPL105C、YCR051W、WWM1、SIP3、SYS1、HPC2、RPL40A、NCR1、YER078C、CAP1、GCN4、AIM38、PTC7、FUN14、COS8、MCH4、PRP24、CWC2、CLC1、SIR4、FUS3、YLR057W、ZRG17、YSA1、PTC3、UBP6、KAP122、EFT2、URA3、ALG2、POL5、RPL1B、LIP1、TMA20、NAS6、IRC5、KIN3、YPL033C、AVT4、YGR266W、CTI6、YNL050C、SDP1、ESF2、NFS1、YER078W-A、IZH4、CWC22、YGR110W、DYN2、SNF4、YMR178W、NSE5、RPL40B、TKL2、HIR1、RPS30A、HSP12、YDR539W、GCV1、NTG1、AZR1、SPO7、YNL022C、DIM1、VAM6、YNR061C、PDA1、YOR032W-A、SPC3、CSR1、COS9、YJR085C、PEX15、TGL2、SGD1、YPL278C、YIL108W、THP1、SCY1、YGR130C、UBC6、END3、UBP15、RPL35B、MSB2が挙げられる。
ターミネーター領域は、既に記載した発現強度情報に基づいて、意図した発現強度を備えるターミネーター領域を選択すればよい。同等の発現強度情報を有している限り、ターミネーター領域の種類によって結果として得られる発現強度は影響されない。
自己増幅カセットは、ターミネーター領域として、上記発現強度情報に基づく発現強度が最も弱いものから上限が2.0以下の範囲の酵母遺伝子由来のターミネーター領域から選択されるターミネーター領域を用いることが好ましい。こうしたターミネーター領域を用いた2以上の自己増幅カセットを用いることで、外来遺伝子を発現する酵母比率を効果的に向上させることができ、また、発現強度も向上させることができる。より好ましくは、発現強度が0.01以上である。所定以上の発現強度があると、2以上の自己増幅カセットをより有意義あらしめることができる。さらに好ましくは0.02以上であり、一層好ましくは0.03以上であり、より一層好ましくは0.04以上であり、さらに一層好ましくは0.05以上である。また、上限は、1.0以下であることがより好ましい。こうした範囲であると、より効果的に二値化を抑制して外来遺伝子を発現する酵母比率を向上させることができ、また、発現強度も向上させることができる。
自己増幅カセットは同一の人工転写因子について2以上備えられるが、2以上の自己増幅カセットに関し、ターミネーター領域は同一であってもよいし、異なっていてもよい。ターミネーター領域の発現強度も同一であってもよいし、異なっていてもよい。ターミネーター領域の発現強度が異なる場合、いずれもが記述の好ましい発現強度範囲内にあることが好ましい。
ターミネーター領域の好ましい発現強度の組合せとしては、例えば、2つの自己増幅カセットを用いる場合、発現強度が2.0以下の範囲から、より好ましくは既に説明した発現強度の範囲から2種のターミネーター領域を選択することが好ましい。例えば、発現強度が0.01以上1.0以下の範囲で選択することができる。例えば、発現強度の組合せとしては、最弱〜0.05/最弱〜0.05、最弱〜0.05/0.08、最弱〜0.05/0.5、0.08/0.08、0.08/0.5、0.5/0.5、0.8/0.8、1.0/1.0等が挙げられる。こうしたターミネーター領域の発現強度は、例えば、人工転写因子結合領域の個数が1個以上4個以下であることが好ましく、より好ましくは1個以上3個以下であり、さらに好ましくは1個以上2個以下である。さらにまた好ましくは1個である。
ターミネーター領域は、発現強度情報を元に選択すればよいが、例えば、ターミネーター領域としては、GIC1(0.047)、FUR4(0.079)、MFA2(0.496)及びPGK1(1.0)からなる群から選択される1種又は2種以上を組合せて2個以上用いることが好ましい。
自己増幅カセットにおいて用いられる、人工転写因子結合領域の種類及び個数、人工転写因子の種類、TATAボックスの種類及びターミネーター領域の種類の組合せは、同一酵母に形質転換された後述する発現カセットに導入したレポーター遺伝子などの外来遺伝子を発現する酵母比率や外来遺伝子の発現強度等に基づいて、選択されてもよい。好ましくは、フローサイトメトリーによってレポーター遺伝子などの外来遺伝子を発現する酵母を検出することにより、これら各種要素及びその組合せを評価できる。
この場合、フローサイトメトリーにより検出される外来遺伝子発現酵母が全酵母集団の70%以上、より好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、一層好ましくは95%以上、より一層好ましくは97%以上、さらに一層好ましくは98%以上、さらにまた好ましくは99%以上となるように各種要素等を選択することができる。
なお、自己増幅カセットにおける各種要素の選択は、好ましくは、選択した人工転写因子に関して人工転写因子結合領域の個数を1個又は2個、あるいは必要に応じて人工転写因子結合領域の個数をさらに増大させて、TATAボックス領域を適宜選択した上、ターミネーター領域を発現強度情報に基づいて選択し、さらに、こうした要素を備える自己増幅カセットを2個以上を用いることにより、行うことができる。
自己増幅カセットは、上流側から、人工転写因子結合領域、TATAボックス領域、人工転写因子コード領域及びターミネーター領域の全てを備えることができる。さらに、既述したように、自己増幅カセットを酵母染色体に組み込む場合など、適宜必要な染色体組換え領域を備えることができる。自己増幅カセットは、後述する発現カセットを同方向にあるいは逆方向に一体に備えることもできる。また、自己増幅カセットには、選択マーカー遺伝子などを発現可能に構成されていてもよい。
以上説明した自己増幅カセットは、公知の遺伝子工学的操作により当業者であれば、必要なアミノ酸配列情報及び塩基配列情報等を取得して構築することができる。自己増幅カセットは、酵母に適用される公知のベクターに組み込まれた形態を採ることもできる。
本発現システムが備える自己増幅カセット及びそれを含むベクターなどのコンストラクトは、人工転写因子を介した酵母における発現制御に有用である。また、自己増幅カセット及びそれを含むベクターは、それが酵母染色体上の異なる2箇所以上に組込み可能に備えられているときには、酵母における発現制御により有用である。
したがって、本明細書の開示は、自己増幅カセット、自己増幅カセットを含むベクターなどのコンストラクト、自己増幅カセットを染色体上あるいは核内に保持する酵母等も包含する。
(発現カセット)
発現カセットは、人工転写因子との結合に基づいて外来遺伝子を発現可能に構築されている。発現カセットは、上流側から、1個又は2個以上の人工転写因子結合領域と、TATAボックス領域と、を含むプロモーター領域と、外来遺伝子と、ターミネーター領域とを備えることができる。
発現カセットは、酵母染色体上にあるか、あるいは酵母染色体に対して組換え可能に備えられていることが好ましい。また、核内に存在するように構築されていてもよい。発現カセットが、酵母染色体に組換え可能な場合には、組換え部位を特定して相同組換え可能な領域をカセットの要素とともに備えている。
発現カセットが備える人工転写因子結合領域、TATAボックス領域は、自己増幅カセットの説明において既に説明した。発現カセットにおいては、人工転写因子結合領域に関し、外来遺伝子についての所望の発現レベルを考慮してその個数等を決定できる。
発現カセットにおける人工転写因子結合領域は、2個以上備えられていてもよい。人工転写因子結合領域を2個以上備えることで、発現カセットに保持される所望の遺伝子を1つの場合に比較して高く発現することができる。外来遺伝子の高発現を意図する場合には、結合領域を多数個備えていることが好ましい。人工転写因子結合領域の個数は、外来遺伝子がコードするタンパク質の種類等にもよるが、人工転写因子結合領域数が比較的少ない場合、人工転写因子結合領域数と発現量とが対応するが、ある時点で発現量の増大が得られにくくなる。通常、人工転写因子結合領域の数は、より好ましくは3個以上であり、さらに好ましくは、4個以上であり、さらに好ましくは、5個以上であり、一層好ましくは6個程度である。
また、TATAボックス領域についても、外来遺伝子についての発現レベル等を考慮してその種類を決定できる。さらに、ターミネーター領域に関しては、外来遺伝子についての発現レベル等を考慮して記述の発現強度情報に基づいてその種類を決定できる。
発現カセットは、人工転写因子結合領域の個数、TATAボックス領域の種類及びターミネーター領域の種類を適宜選択することで、大きなダイナミックレンジでかつ段階的に外来遺伝子の発現レベルを調節できる。
本発現システムによれば、自己増幅カセットと発現カセットとを備えることで、外来遺伝子発現酵母比率を向上させることができるとともに、外来遺伝子の発現レベルを広いダイナミックレンジで調節できる。このため、酵母集団全体として、広いダイナミックレンジで外来遺伝子の発現量を増大させることができるとともに広いダイナミックレンジで段階的に発現量を調節することができる。このため、本発現システムは、酵母における外来遺伝子の発現に好都合なシステムとなっている。
なお、本発現システムにおいては、他の発現カセットを備えていてもよい。例えば、酵母において公知のプロモーター領域の制御下に外来遺伝子を発現可能に構築した発現カセットを備えていてもよい。
本発現システムでは、同一の人工転写因子によって2以上の外来遺伝子の発現を制御してもよいし、異なる外来遺伝子の発現を制御してもよい。また、異なる人工転写因子によって、異なる外来遺伝子の発現を制御してもよい。本発現システムにおける種々の制御形態に応じて、自己増幅カセットと発現カセットとは様々な態様を取ることができる。
例えば、1種類の人工転写因子に関する自己増幅カセットに対して1種又は2種以上の発現カセットを備えることができる。1種又は2種以上の発現カセットは、1種の外来遺伝子を発現するための1種の発現カセットを複数個含んでいてもよいし、異なる外来遺伝子を発現するための複数種類の発現カセットをそれぞれ1個又は2個以上備えていてもよい。
以上説明した本発現システムは、外来遺伝子の安定かつ均質な発現を可能とし、さらに、広いダイナミックレンジ内で段階的に、1種又は2種以上の外来遺伝子につき同一又は異なる発現量制御が容易に実現できる。
本発現システムは、自己増幅カセットと発現カセットとを含む限りどのような形態であってもよい。自己増幅カセット及び発現カセットに対応するDNAコンストラクト又はそのセット、自己増幅カセット及び発現カセットに対応するDNAコンストラクトと制限酵素とのキット、自己増幅カセット及び発現カセットに対応するDNAコンストラクトを含む酵母等が挙げられる。
(酵母)
本明細書に開示される酵母は、既に説明した発現システムを保持する酵母とすることができる。本発現システムを保持する酵母は、公知の酵母の形質転換技術を用いて、自己増幅カセット等を保持するように形質転換することで取得できる。遺伝子組換え酵母の作製及は、当業者において周知事項であり、当業者であれば適宜公知技術を参照して本酵母を得ることができる。
(外来遺伝子を発現させるための酵母の作製方法)
本作製方法は、本明細書に開示される2以上の自己増幅カセットと、本明細書に開示される発現カセットと、を酵母に導入する工程、を備えている。そして、各自己増幅カセットにおけるターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下の範囲の酵母遺伝子のターミネーター領域からなる群から選択されるターミネーター領域を備えることができる。なお、相対発現強度については、既に説明した好ましい範囲を適用できる。
また、自己増幅カセットは、当該酵母集団の70%以上、より好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、一層好ましくは95%以上、より一層好ましくは97%以上、さらに一層好ましくは98%以上、さらにまた好ましくは99%以上が外来遺伝子を発現するように構成することができる。
本作製方法によれば、酵母集団における外来遺伝子発現酵母比率を向上させることができ、また、各酵母における外来遺伝子の発現レベルを大きなダイナミックレンジで段階的で調節することができる酵母を作製できる。
(酵母における外来遺伝子の発現レベルの制御方法)
本制御方法は、本明細書に開示される2以上の自己増幅カセットと、本明細書に開示される発現カセットと、を準備する工程を備え、各自己増幅カセットにおけるターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下の範囲の酵母遺伝子のターミネーター領域からなる群から選択するようにする。なお、相対発現強度については、既に説明した好ましい範囲を適用できる。
また、自己増幅カセットは、当該酵母集団の70%以上、より好ましくは80%以上、さらに好ましくは90%以上、一層好ましくは95%以上、より一層好ましくは97%以上、さらに一層好ましくは98%以上、さらにまた好ましくは99%以上が外来遺伝子を発現するように構成することができる。
本制御方法によれば、酵母集団における外来遺伝子の発現レベルを、発現酵母比率と、各酵母における外来遺伝子の発現レベルとから、大きなダイナミックレンジで段階的で調節することができる
(酵母における外来タンパク質の生産方法)
本生産方法は、本明細書に開示される酵母を培養して、外来遺伝子がコードする外来タンパク質を生産する工程を備えることができる。本生産方法によれば、酵母集団における外来遺伝子の発現酵母比率を向上させるとともに、各酵母における発現レベルを広いダイナミックレンジで段階的に調節できるため、外来遺伝子がコードする外来タンパク質を意図した発現量を容易に確保して生産することができる。
(酵母における有用物質の生産方法)
本明細書に開示される有用物質の生産方法は、本明細書に開示される発現システムを用いた酵母よる有用物質の生産方法である。本方法によれば、酵母において所望の遺伝子の発現強度を高い自由度で制御することができる。このため、従来困難であった長い代謝経路及び/又は複数の代謝経路に関わる酵素を所望の発現強度で発現させることができる。その結果、エタノールを始めとする有用物質なども酵母を用いて効率的に生産することができるようになる。有用物質とは、酵母内で生合成されるエタノール、有機酸、その他の有機化合物などの有用物質も包含する。酵母を用いた発酵技術においては、所望の有用物質を得るためのタンパク質(酵素)及び当該タンパク質を酵母で発現させるための遺伝子工学的な改変や酵母の培養技術は公知であり、当業者であれば、こうした酵母の改良に関連する遺伝子改変技術の全てに本明細書の開示を適用することができる。
以上説明した本明細書に開示される遺伝子組換え技術や遺伝子組換え酵母は、いずれも、公知の書籍であるモレキュラークローニング第3版、カレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジー等に記載されている方法に準じて作製することができる。また、形質転換にあたり、従来公知の各種方法、例えば、トランスフォーメーション法や、トランスフェクション法、接合法、プロトプラスト法、エレクトロポレーション法、リポフェクション法、酢酸リチウム法等を用いることも、同様に当業者において周知である。
以下、本開示を、実施例を挙げて具体的に説明する。なお、本開示は、以下の実施例に限定されるものではない。
本実施例では、自己増幅カセットを以下の要素から構築し、各種自己増幅カセットと発現カセットとを組み合わせて、各種の発現システムを構築し、これらの発現システムにおける外来遺伝子(ここでGFPタンパク質遺伝子)の発現量を評価した。
(単一の自己増幅カセットを備える発現システム(比較例)の構築)
(人工転写因子タンパク質LNV1の設計)
人工転写因子として、大腸菌由来のlexAのDNA結合ドメイン(lexA BD)遺伝子(1-87、Brent et al., Nature 612,312 (1984))とSV40ウィルス由来の核局在化シグナル配列(NLS、Dingwall et al., TIBS 16,478 (1991))、ヒトヘルペスウィルス由来の転写活性化ドメイン(VP16、Trienzenberg et al., Genes Developm. 2, 718 (1988))遺伝子(403-479)を順に連結した構築を設計した(LNV1、図2)。各遺伝子の間にはリンカー配列として2アミノ酸(Ala-Gly)を挿入した(アミノ酸配列:配列番号15890,塩基配列:配列番号15891)。
人工転写因子結合領域は、1個から4個のLNV1結合領域(配列番号15898〜15901)を備えることとした。
TATAボックス領域として、CYC1由来のTATAボックス領域(配列番号15897)を用いた。
ターミネーター領域として、4種類のターミネーター領域(高出力順にRPL41Bt(2.149、最高出力)、PGK1t(1.0)、MFA2t(0.496)及びGIC1t(0.047、最低出力))とした。
図2に示すように、上流側から、人工転写因子結合領域を1個から4個、CYC1ターミネーター、LNV1コード領域及び4種類のターミネーター領域の全ての組合せで、自己増幅カセットを構築した。この自己増幅カセットを、酵母W303−1a株の酵母ゲノムのPDC6遺伝子座に導入した。
また、図2に示すように、発現カセットとして、5個のLNV1結合領域(配列番号15902)とTDH3由来TATAボックス領域(配列番号15896)、GFP遺伝子及びRPL41Bターミネーター領域(配列番号15873)を酵母ゲノムのPDC5遺伝子座に組換え可能に構築した。
発現カセットを、自己増幅カセットを組み込んだ酵母W303−1a株に導入して比較例の発現システムを構築した。
(単一の自己増幅カセットを備える発現システムの評価)
作製した酵母株はSD−Ura培地で30℃にて終夜培養した後、フレッシュなSD−Ura培地に植え継いだ。OD660が約0.7まで培養後、フローサイトメトリ(Flow Cytometry(FCM)、Cell Lab Quanta SC MPL, Beckman-Coulter)にて、酵母細胞集団のGFP蛍光強度を測定した。なお、本実施例では、測定すべき酵母細胞のGFP蛍光強度はダイナミックレンジが広いことが予測された。そこで酵母細胞のGFP蛍光強度はFCMを用いて、高感度及び低感度の2種類の条件で測定した。結果を図3に示す。
図3に示すように、今回作製したすべての株では、低い蛍光強度だったか、あるいは酵母細胞のGFP蛍光強度に二値化が起っていた。すなわち、GFPをほとんど発現しない細胞が約40%〜90%も存在していた。換言すると、GFPを明らかに発現している細胞は、約10%〜60%であった。また、図3に示すように、高い発現レベルで人工転写因子を発現させるように構築した自己増幅カセットでも、二値化を抑制できなかった。
なお、以上の結果によれば、ターミネーター領域の有する発現強度が高いと、蛍光強度上位の集団の割合が増加することわかった。例えば、LNV1結合領域数を1に固定し、ターミネーター条件を、より高強度に変えていくと、GFP蛍光強度値が増加した。また、LNV1結合領域数の増加によって、蛍光強度上位集団の全体に対する割合が増加した。例えば、ターミネーター条件をMFA2tに固定し、LNV1結合領域数を増やしていくと、GFP蛍光強度値が増加することがわかった。
(2個の自己増幅カセットを備える発現システムの評価)
次に、2個の自己増幅カセットと発現カセットを組み合わせた発現システムによる外来遺伝子の発現をFCMで評価した。具体的には、図4に示すように、先に作製した自己増幅カセットにおける最低出力条件の一つである株(人工転写因子結合領域数2、GIC1t(0.047)、PDC6遺伝子座)に当該最低出力条件株及び低出力条件株(人工転写因子結合領域数2、GIC1t(0.047)またはMFA2t(0.496)、Leu2遺伝子座)の自己増幅カセットを導入して、その表現型を蛍光顕微鏡及びFCMで評価した。結果を図5に示す。
図5に示すように、最低出力の自己増幅カセット単独の場合では、酵母細胞の自家蛍光値(図5、「回路なし」参照)とほぼ同じで、ほとんどGFP蛍光強度は確認できなかった(図5、「最弱」参照)。一方、この最低出力の自己増幅カセット単独株と比較して、最低出力自己増幅カセットを2つ導入した株(図5、「最弱+最弱」参照)では、最低出力構築単独株の2倍ではなく、100〜1000倍のGFP蛍光強度を持つ細胞が確認できた。また、最低出力自己増幅カセットと低出力自己増幅カセットとを導入した株(図5、「最弱+弱」参照)では、すべての細胞で約1000倍以上のGFP蛍光強度が確認できた。
以上のことから、自己増幅カセットにおける出力が「最弱+弱」の組み合わせで、目的であるすべての細胞で一定の強い出力を得ることが分かった。また2つ目の自己増幅カセットの導入による効果は非線形であることが分かった。また、以上のことから、ターミネーター領域の発現強度は、酵母由来のターミネーター領域において最も低いものから選択できることがわかった。
本実施例では、大多数の酵母で高い外来遺伝子(GFP)の発現強度を得る構築条件を探るため、人工転写因子結合領域数を1個とし、ターミネーター領域の発現強度(GIC1:0.047、FUR4:0.079、MFA2:0.496、PGK1:1.0、RPL41B:2.149)を同一又は異ならせた2つの自己増幅カセットと、実施例1で作製した発現カセットとを組み合わせた発現システムを構築した(図6参照)。なお、2つの自己増幅カセットは、それぞれ酵母W303−1a株のPDC6遺伝子座及びLeu2遺伝子座に導入した。実施例1と同様にしてFCMで評価した。結果を図7に示す。
図7に示すように、最低出力条件(LNV1結合部位数1、GIC1t)の組合せでは、すべての細胞は低いGFP蛍光強度を示した。一方、95%以上の細胞で高いGFP蛍光強度を示したのは、低発現強度(LNV1結合部位数1、FUR4t)から中発現強度(LNV1結合部位数1、PGK1t)をそれぞれ組み合わせた出力条件であった。より高い出力条件(LNV1結合部位数1、RPL41Bt)では、目的とする株は得られなかった。
以上のことから、LNV1結合部位数1の条件では、FUR4t(0.079)、MFA2t(0.496)及びPGK1t(1.0)の自己増幅カセットを2つ組み合わせた酵母株が、目標である大多数の酵母(95%)でのGFPの高発現が可能である条件であった。
なお、以下に述べる遺伝子組換え操作は既出のMolecular Cloning等に従い行った。なお、以下の実施例においてSD培地として、2% glucose, 0.67% Yeast Nitrogen base w/o amino acids (Difco社), 0.082% Complete Supplement Mixture (CSM, FORMEDIUM社)の組成を用いた。
(人工転写因子タンパク質LNV1の設計)
人工転写因子として、大腸菌由来のlexAのDNA結合ドメイン(lexA BD)遺伝子(1-87、Brent et al., Nature 612,312 (1984))とSV40ウィルス由来の核局在化シグナル配列(NLS、Dingwall et al., TIBS 16,478 (1991))、ヒトヘルペスウィルス由来の転写活性化ドメイン(VP16、Trienzenberg et al., Genes Developm. 2, 718 (1988))遺伝子(403-479)を順に連結した構築を設計した(LNV1、図8)。各遺伝子の間にはリンカー配列として2アミノ酸(Ala-Gly)を挿入した(アミノ酸配列:配列番号15890,塩基配列:15891)。
(プラスミドpAUR112へのLNV1遺伝子の挿入)
LNV1遺伝子はインビトロジェン社に合成委託したものを使用した。LNV1遺伝子は、SmaIで切断したプラスミドpAUR112(タカラバイオ)断片にインフュージョン法(タカラバイオ)を用いて連結、大腸菌株DH5α株に形質転換し、目的配列を得た。なお、プラスミドに導入した塩基配列は、シーケンスにて確認した。
(評価用出力器(第1の発現カセット)の構築)
図9に示すように、クローニングベクターpSP73(プロメガ社製)に3つのLNV1結合配列(配列番号15894)を有する転写因子結合領域(配列番号15900)とCYC1由来のTATAボックス領域(配列番号15897)、GFP(図9中の#1)またはmKO2(RFP)遺伝子(Amalgaam社)(図9中の#2)、CYC1ターミネーター領域(配列番号11965)を順に、図9に示す制限酵素部位に導入し、その両端を酵母ゲノムへの組換え用としてPDC6遺伝子前後の数百ベースの配列を導入したコンストラクトを作製した。
(酵母への形質転換)
出力器及びプラスミドpAUR112_LNV1の酵母株への導入にはFrozen−EZ Yeast Transformation II Kit(Zymo research社)を用いた。まず、出芽酵母W303−1a株に出力器構築#1または#2を形質転換し(選択マーカーとしてTRPを使用)、それぞれの株に対しプラスミドpAUR112_LNV1を形質転換する(選択マーカーとしてURAを使用)ことで目的株を作製した。
(人工転写因子LNV1の動作確認)
実施例6で得られた酵母株をSD−ura培地にて終夜培養後、フローサイトメーター(Cell Lab Quanta SC MPL flow-cytometer、ベックマンコールター)にてGFP及びmKO2の蛍光強度を測定した。形質転換された酵母株の赤色蛍光をFCMで測定した。結果を図10に示す。図10に示すように、未導入株と比較して、緑色または赤色蛍光強度の向上が確認できた。以上の結果より、作製した人工転写因子LNV1は酵母内で機能したことが確認できた。
(高出力システムの構築)
本実施例では、人工転写因子LNV1を恒常発現させた酵母株に、TATAボックス領域を高発現型のTDH3由来のものを用い、LNV1結合部位数、及び、以前、我々が開発した高出力が期待できるターミネーター配列を組み合わせることで、最高の発現量が期待できる出力器の検討を行った。
(人工転写因子LNV1の恒常発現用コンストラクト(第2の発現カセットを含むコンストラクト))
図11に示すように、恒常的にLNV1を酵母で発現させる構築物を作製した。図11に示すTDH3p_UAS−TATA_CYC1−LNV1−CYC1tは合成委託で作製し、酵母ゲノムのPDC5遺伝子座に組換え導入が起こるように構築した。
(高出力用出力器の構築)
図12に示すように、酵母ゲノム上のPDC6遺伝子座に組み換え導入用の構築として、LNV1結合部位、TATAボックス領域、GFP遺伝子、ターミネーター配列及びTRP1マーカーを持つコンストラクトを作製した。それぞれのパーツ間に制限酵素部位を用いて、各パーツを順にライゲーションにより導入した。人工合成委託で作製した1〜8個のLNV1結合配列を持つ8種類の結合領域(配列番号15898〜15905)(図13参照)を、TATAボックス領域配列はTDH3由来のもの(配列番号15896)(図14参照)を、ターミネーター配列はRPL41B、SAG1、CYC1由来の3種類(配列番号15873、15840、11965)を、それぞれ組み合わせて(SAG1、CYC1ターミネーターには人工転写因子結合配列を1から8個、RPL41Bターミネーターには1〜5個)、21種類の出力器を作製した。
(標準技術としてのコントロールコンストラクトの作製)
図15に示すように、一般的に酵母での高発現系のコンストラクトとして、TDH3プロモーター−CYC1ターミネーターが使用されている。そこで、このコンストラクトを今回標準技術として、コントロール用に作製した。人工合成委託で作製したTDH3プロモーター−LNV1遺伝子配列を用いて、コントロールコンストラクトを作製した。
(酵母株の作製及びシステムの評価)
出芽酵母W303-1a株にLNV1の恒常発現用コンストラクト(図11)を形質転換により導入し、D株を作製した。次にD株に実施例8で作製したそれぞれの出力器を形質転換により導入した。またコントロール株として、W303-1a株にコントロールコンストラクトを導入した。なお、酵母への形質転換には、Frozen-EZ Yeast Transformation II Kitを用いた。
(高出力システムの評価)
上記で得られた酵母株をSD培地にて30℃で終夜培養後、一部を同培地に植え継ぎ、ODが0.7まで30℃でしんとう培養した。その培養液をフローサイトメーターにてGFPの蛍光強度を測定したところ、図16に示すように、LNV1結合領域数が増えるごとにGFP蛍光強度が増加していた。またその数は5個を超えるといずれのターミネーター領域を用いた場合であっても、GFP蛍光強度はほぼ同等の結果となっていた。また、ターミネーター領域による酵母のGFP蛍光強度はRPL41B由来>SAG1由来>CYC1由来となっており、本発明者らが確認しているように、ターミネーター領域の違いによって、異なることが示された。
なお、コントロールコンストラクトとの蛍光強度との比較から、最大GFP蛍光強度を示した株(LNV1結合領域数:5、TATAボックス領域:TDH3由来、ターミネーター領域:RPL41B由来)は、一般的に高発現系として使用されているコンストラクト(コントロールコンストラクト)よりも約7倍のGFP蛍光強度が確認された。
(段階的出力器の開発)
物質生産を行う際には、酵母内のエネルギーバランスを考慮すると、律速段階では過剰発現を、そうでないときには発現量を抑えるなど、それぞれの段階に必要な酵素の発現量には最適値が存在すると考えられる。そこで、段階的に酵素の発現量を選択できるようなコンストラクト条件を検討した。まず最低出力を出せるコンストラクトを検討し、上記の高出力コンストラクトと比較することで、発現量のダイナミックレンジを求めた。さらに、その間での段階的に発現できるコンストラクト条件を検討した。
(段階的出力器の構築)
実施例8で作製した高出力用出力器と同様に、図17に示すように、8種類のLNV1結合領域数(1〜8個)(図13参照)、TATAボックス領域をCYC1由来(図14参照)、4種類のターミネーター領域(CYC1、MFA2、STD1及びGIC1由来)(配列番号11965,11712,10618、10593)を組み合わせて、26種類の出力器を作製した。
(酵母株の作製)
上記で作製した酵母D株に作製したそれぞれの出力器を、Frozen-EZ Yeast Transformation II Kitを用いて、形質転換させた。
(評価)
上記で得られた酵母株をSD−Trp培地にて30℃で終夜培養後、一部を同培地に植え継ぎ、ODが0.7まで30℃でしんとう培養した。その培養液をフローサイトメーターにてGFPの蛍光強度を測定したところ、図18に示すように、実施例9と同様、人工転写因子結合領域数の増加と共に、GFP蛍光強度が増加していた。また、ターミネーター領域の違いによっても、酵母のGFP蛍光強度が異なっていた。ターミネーター領域による酵母のGFP蛍光強度はCYC1由来>MFA2由来>STD1由来>GIC1由来となっており、本発明者らが確認しているように、ターミネーター領域の違いによって、異なることが示された。さらに、実施例9の高出力での結果と比較すると、TATAボックス領域の違いに関しては、TDH3由来>CYC1由来であった。
今回得られた最低GFP蛍光強度を持つ株(LNV1結合部位数:1、TATAボックス領域:CYC1由来、ターミネーター:GIC1由来)はコントロール配列と比較して、約900倍低いものであった。上記の高出力株と今回得られた低出力株との比(ダイナミックレンジ)は約6000倍であった。得られたダイナミックレンジの間には、数多くの段階的なタンパク質発現量が担保された酵母株が存在していた。以上より、目的遺伝子の発現に必要な量が分かっていれば、出力器の構築条件を選ぶことにより、望みのタンパク質量での発現が達成できることが示された。
(2遺伝子同時発現での段階的出力器の評価)
本タンパク質発現量制御システムでは、複数個の酵素の同時発現そして発現量の制御が最終目標となる。そこで今回は、2種類のタンパク質(GFP及びRFP)を用いて、それぞれのタンパク質発現量の制御が可能かどうか検討した。
(段階的出力器の構築)
図19に示すように、実施例10で作製した段階的出力器の4種類のコンストラクト(LNV1結合領域数:1または5、TATAボックス領域:TDH3またはCYC1由来、ターミネーター領域:CYC1由来を組み合わせ)を、酵母ゲノム導入遺伝子座をPDC6からHXT3に変更したものを作製した。また実施例10で構築した段階的出力器の一つ(LNV1結合領域数:1、TATAボックス領域:TDH3由来、ターミネーター領域:CYC1由来)のGFP遺伝子をRFP遺伝子に置き換えたRFPコンストラクトを作製した。
(酵母株の作製)
上記で作製した酵母D株に、本実施例で作製したRFPコンストラクトを形質転換させてR1株を作製した。そのR1株に本実施例で作製した4種類のGFP遺伝子を持つ段階的出力器を形質転換させた。
(評価)
上記で得られた酵母株をSD培地にて30℃で終夜培養後、一部を同培地に植え継ぎ、ODが0.7まで30℃でしんとう培養した。その培養液をフローサイトメーターにてGFP及びRFPの蛍光強度を測定したところ、図20に示すように、RFPの蛍光強度はほぼ一定で、GFP蛍光強度のみが段階的となっていることが確認できた。このことより本発現量制御システムは、共通の転写因子タンパク質を用いても、結合領域の個数やTATAボックス領域の種類を異ならせることで、2種類のタンパク質の発現でも、容易にそれぞれの発現量の調整ができることを示している。
(形質転換用ベクターの作製)
本実施例では、図21に示す酵母で任意のターミネーターを用いて外来遺伝子を発現させるためのベクターを作製した。
本実施例で作製したベクターは、少なくとも一つの選択マーカーを持ち、酵母の細胞内で1ないし2コピー保持されるCEN型シャトルベクターを利用した。すなわち、タカラバイオ製pAUR112のSacI部位とKpnI部位の間に、両端にSacI部位を付与したTDH3プロモーターと、両端にKpnI部位を付与しかつ酵母コドン最適化したGFP遺伝子を、TDH3プロモーター-GFP遺伝子の順にクローニングした。
(ターミネーター配列増幅用プライマーの設計)
本実施例では、酵母から選択した約5295遺伝子のターミネーター領域を増幅できるPCRプライマーをそれぞれ設計し、これらのプライマーを用いてターミネーター配列をゲノムから増幅した。プライマーの設計には、公開されているPCRプライマー設計ソフトPrimer3(http://primer3.sourceforge.net/)を用いて、公開されている酵母のゲノム情報(ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/Fungi/Saccharomyces_cerevisiae_uid128/)を元に、各遺伝子ORFの下流300〜700bp程度のターミネーター領域を増幅する順方向プライマー及び逆方向プライマーをそれぞれデザインした。設計したプライマーの塩基配列を配列番号1〜10590に示す。
なお、各ターミネーター特異的プライマーの5’側に増幅に使用する2nd PCRプライマーとアニーリングする配列として、順方向プライマーには5’-GAATTGTATAACTGAGGTACC-3’(配列番号15886)、逆方向プライマーには5’-ATCAGTTATTACCCGGGTACC-3’(配列番号15887)を付加した1st PCRプライマーを最終的に合成した(オペロンバイオテクノロジ社)。
(酵母ゲノムからのターミネーター部位の増幅)
本実施例では、酵母ゲノムに対して実施例13で作製したプライマーを用いて遺伝子増幅反応を行い各ターミネーター部位を増幅した。すなわち、野生型酵母W303-1a株からゲノムDNAを抽出し、これを鋳型に用い、PrimeSTAR HS DNA Polymerase(タカラバイオ社)を用いてPCR反応を行った。
96穴プレートの各ウェル10μlの系で、各ターミネーター特異的な1st PCRプライマーを用い、以下の条件でPCR反応を行った。98℃ 10秒の反応後、1サイクルを98℃ 10秒、55℃ 15秒、72℃ 15秒として、35サイクル行った。96穴プレートの四隅のサンプルについて電気泳動を行い、増幅を確認した。
1st PCR反応液を1/200に希釈して1 μlを鋳型とし、96穴プレートの各ウェル10μlの系で、2nd PCRを行った。2nd PCR の順方向プライマー及び逆方向プライマーには以下の塩基配列のDNAを用いた。
順方向プライマー:5’-CCGCTGCTGGCATTACCCATGGTATGGATGAATTGTATAACTGAGGTAC-3’(配列番号15888)
逆方向プライマー:5’-CTCACAAATTAGAGCTTCAATTTAATTATATCAGTTATTACCCGGGTAC-3’(配列番号15889)
以下の条件でPCR反応を行った。すなわち、98℃ 15秒で反応後、1サイクルを98℃ 10秒、61℃ 15秒、72℃ 15秒として、30サイクル行った。96穴プレートの四隅のサンプルについて電気泳動を行い、増幅を確認した。96穴プレートを真空ポンプで乾燥した後、4℃で保存した。
本実施例では、ギャップ・リペアー・クローニング法を用いて各ターミネーター部位を酵母にクローニングした。
出芽酵母の細胞内では、数十bp程度の相同領域があれば相同組み換えが生じてDNA断片を連結することが可能なため(Ma H, Kunes S, Schatz PJ, Botstein D, Gene, 58, 201-216 (1987))、2nd PCRプライマーの上記ベクター相同部分を利用して、制限酵素で切断した上記ベクターPCR増幅断片を混合して、酵母へ形質転換を行い、ターミネーター部位をGFP遺伝子の下流へクローニングした。
酵母の野生株(W303-1A)をYPD液体培地で培養した後、Frozen-EZ Yeast Transformation IIキット(ZYMO RESEARCH社)で処理してコンピテントセルを調整した。上記の形質転換用ベクターをKpnIで切断し、96穴プレート内で乾燥させた2nd PCR産物に対し、1サンプルあたり、40ngの切断ベクターと10μlのコンピテントセルを加え、室温で良く混合した。
室温で45分間形質転換を行った後、この形質転換溶液を1mlのウラシル要求性培地(SD−Ura)(2% glucose, 0.67% Yeast Nitrogen base w/o amino acids (Difco社), 0.082% Complete Supplement Mixture (CSM) +40Ade (FORMEDIUM社))に加えて、96穴ディープウェルに入れ、Bioshaker(TAITEC社)を用いて、30℃、160rpm、60時間程度振とう培養した。
本実施例では、実施例15で作製した酵母が産生するGFPタンパク質をフロー・サイトメトリー(FCM)を用いて、ターミネーター活性を評価した。
Cell Lab Quanta SC MPL フロー・サイトメーター(Beckman-Coulter社)に、510/10のフィルターセットを用い、波長488nmのレーザーで酵母菌体内のGFPタンパク質の蛍光を励起し、その蛍光強度を測定した。それぞれ異なるターミネーターを持つ形質転換酵母について、約5,300個体の蛍光強度を測定した。
蛍光強度の測定値を元にIgorPro ver. 6.1(Wavemetrics社)を用いて、蛍光強度の平均値を求め、一般的に用いられているPGK1ターミネーターを1として、標準化を行った。活性を測定できた5295個のターミネーター活性を、標準偏差を含め、図22に示した。また、蛍光強度の平均値を、相対発現強度とした結果は、以下のとおりであった。
ORC4(0.030)、ICY2(0.044)、GIC1(0.047)、HLR1(0.053)、ECM13(0.057)、YLR108C(0.060)、AQR1(0.064)、YHR213W-A(0.065)、SUT1(0.068)、PLB3(0.070)、AIM26(0.072)、TPO4(0.073)、YPR153W(0.073)、GIS3(0.073)、WSC3(0.079)、FUR4(0.079)、DLT1(0.080)、MOT1(0.080)、YNR063W(0.081)、MET13(0.081)、YDL156W(0.082)、YJL107C(0.082)、YJR154W(0.082)、YNL042W-B(0.082)、VHS1(0.083)、GPI19(0.084)、YIL057C(0.084)、STD1(0.085)、CTF19(0.088)、RAD34(0.088)、YIR021W-A(0.088)、FZF1(0.089)、YHK8(0.089)、YGL188C-A(0.089)、HCM1(0.090)、CDC6(0.090)、YPR157W(0.091)、CLB6(0.091)、YOX1(0.091)、YLR285C-A(0.091)、YDR114C(0.092)、YHR199C-A(0.092)、MPS3(0.092)、MUP3(0.093)、YIR014W(0.094)、AAR2(0.094)、YPT35(0.094)、AIM33(0.095)、SCW11(0.095)、BDF1(0.095)、YCL042W(0.096)、BSC4(0.096)、YGL193C(0.096)、NUT2(0.097)、YJL118W(0.098)、YKL069W(0.099)、SRB8(0.099)、YOR060C(0.099)、MDH2(0.099)、YPR116W(0.100)、YPK2(0.101)、GLN3(0.101)、YDL211C(0.101)、RAD55(0.102)、CYM1(0.102)、ENT4(0.102)、ULA1(0.103)、YMR182W-A(0.104)、YKR017C(0.104)、YOR302W(0.106)、YOR072W-B(0.107)、VTS1(0.107)、FYV12(0.107)、YGL235W(0.108)、YHR086W-A(0.108)、YEL067C(0.109)、YPL257W(0.109)、UBA3(0.109)、YMR105W-A(0.109)、YOR316C-A(0.110)、TMA10(0.110)、YDL159W-A(0.112)、ATG29(0.113)、YML037C(0.113)、NSL1(0.113)、YJL077W-B(0.113)、POP3(0.113)、WHI5(0.113)、MIH1(0.114)、YGR240C-A(0.115)、YRM1(0.115)、KAR9(0.115)、YJU2(0.116)、SPC24(0.116)、DPB2(0.117)、CHL4(0.117)、YMR087W(0.118)、CSI1(0.118)、YIL134C-A(0.118)、BUR2(0.118)、PTH1(0.119)、SSN8(0.119)、AUA1(0.119)、YLR154C-G(0.120)、YLR342W-A(0.120)、YCL001W-A(0.120)、FLC1(0.121)、YLL006W-A(0.121)、VAM7(0.121)、YPL077C(0.121)、CCZ1(0.123)、PRP28(0.123)、ACM1(0.123)、IME4(0.123)、YPR096C(0.123)、FRE5(0.124)、PDR8(0.125)、ILV5(0.125)、YIL161W(0.126)、PAC11(0.126)、UBR2(0.126)、YRB2(0.128)、YLR125W(0.128)、YMR253C(0.128)、DSE4(0.128)、EPL1(0.128)、SNP1(0.128)、YMR160W(0.128)、SPO77(0.129)、BUB1(0.129)、YFR016C(0.129)、SPC97(0.130)、GEM1(0.130)、INO2(0.130)、SPT10(0.130)、YLR132C(0.131)、AIM45(0.131)、YJR054W(0.132)、MBF1(0.132)、YAL064C-A(0.132)、YML054C-A(0.132)、NUP1(0.132)、ECM27(0.132)、YIL060W(0.133)、IRE1(0.133)、YHR177W(0.134)、YJR079W(0.134)、YNL187W(0.136)、YML003W(0.136)、PIH1(0.136)、YDR169C-A(0.136)、PET111(0.137)、YDL109C(0.137)、YOR012W(0.138)、YHR050W-A(0.138)、TAR1(0.139)、RIM9(0.139)、YCR095W-A(0.140)、RPR2(0.140)、COS7(0.140)、YDR049W(0.142)、CUS1(0.142)、JJJ3(0.142)、COS10(0.143)、MET1(0.144)、HXT8(0.145)、GLY1(0.146)、SUR1(0.146)、RTG1(0.147)、PHM7(0.147)、YJL052C-A(0.147)、HXT17(0.147)、YFL052W(0.148)、ATG1(0.148)、ECM2(0.148)、YNR075C-A(0.148)、YKR041W(0.149)、ALD5(0.149)、YHL018W(0.149)、LUC7(0.149)、YPS5(0.149)、YLR297W(0.150)、SNA4(0.150)、BIO4(0.150)、YBR298C-A(0.150)、ECM12(0.152)、SEF1(0.152)、YMR247W-A(0.152)、EXO1(0.153)、CTF13(0.154)、HUR1(0.154)、SNO3(0.154)、BSC5(0.154)、YER175W-A(0.155)、PGA1(0.155)、YLR173W(0.156)、YDR119W-A(0.157)、IRC15(0.157)、MGA1(0.157)、YPR174C(0.159)、IML3(0.159)、YLL054C(0.159)、RDS1(0.159)、MDM32(0.160)、PET494(0.160)、YPR036W-A(0.160)、GTB1(0.160)、ISF1(0.161)、KRE29(0.161)、SAP190(0.161)、YHR214C-E(0.162)、GTO3(0.163)、YOR365C(0.163)、MIP1(0.163)、SIP5(0.164)、YPL191C(0.164)、YPL162C(0.164)、YMR291W(0.165)、BRN1(0.166)、MDM1(0.166)、NAT4(0.166)、YLR406C-A(0.166)、YME1(0.166)、CSI2(0.166)、YOR008C-A(0.167)、CEF1(0.169)、BUD25(0.169)、DFG16(0.170)、GPB1(0.170)、KAR1(0.170)、PPM2(0.171)、DSS1(0.171)、RPC37(0.172)、VID24(0.172)、ERV41(0.172)、YGR169C-A(0.172)、ECM8(0.173)、YHR032W(0.173)、ELA1(0.173)、PEX29(0.173)、LTE1(0.173)、HAT2(0.174)、SLI1(0.174)、MUP1(0.175)、ALG13(0.176)、FRE7(0.176)、YMR147W(0.177)、ISU2(0.177)、YOR1(0.178)、JID1(0.179)、ECM3(0.179)、ATG5(0.179)、MED6(0.180)、YPL014W(0.180)、YLR030W(0.180)、AQY2(0.180)、CCT2(0.180)、YER067W(0.181)、NRG1(0.181)、SPT8(0.181)、PIR1(0.181)、YGR068C(0.182)、YER039C-A(0.182)、ELM1(0.182)、ASE1(0.182)、YBL095W(0.183)、YNR066C(0.183)、MTL1(0.183)、CNE1(0.183)、CAX4(0.183)、NDI1(0.184)、FLX1(0.184)、YNL130C-A(0.184)、CWC25(0.186)、YNL254C(0.186)、CDC13(0.186)、ATP10(0.187)、OCT1(0.187)、ALF1(0.187)、YEF1(0.187)、BAP2(0.187)、HTL1(0.188)、PDC5(0.189)、PKP1(0.190)、SSK2(0.191)、CAF120(0.192)、SKN1(0.192)、HHF1(0.193)、CDC39(0.194)、YFR012W(0.194)、YEL048C(0.194)、HAP4(0.195)、PEX7(0.195)、TPO1(0.196)、NFT1(0.196)、NGL3(0.198)、YMR206W(0.199)、DUS3(0.200)、YAP7(0.200)、CUS2(0.201)、YLR415C(0.201)、FUI1(0.202)、SLM5(0.203)、BTT1(0.203)、YFR035C(0.203)、RRN10(0.203)、HAP3(0.204)、SSY5(0.204)、SFL1(0.204)、KIP1(0.205)、CDC15(0.206)、GLT1(0.207)、DOC1(0.208)、MND1(0.209)、AAC1(0.209)、CEP3(0.209)、UBC5(0.209)、YNL213C(0.209)、CLN3(0.210)、CSF1(0.210)、ECM18(0.210)、MRS4(0.210)、YIL046W-A(0.211)、INP1(0.211)、RTT105(0.211)、MPT5(0.211)、ATG15(0.212)、RNH202(0.212)、TAX4(0.213)、IZH3(0.213)、BDF2(0.214)、COX14(0.214)、YIP4(0.214)、YJR120W(0.214)、SAE2(0.215)、YMC2(0.216)、YGR035C(0.216)、NDD1(0.216)、HPA2(0.216)、STL1(0.216)、GPM3(0.216)、ERF2(0.217)、MMS21(0.217)、YJL133C-A(0.218)、YNL024C(0.218)、IFH1(0.219)、LIN1(0.220)、ICS3(0.220)、YNR014W(0.220)、SPB1(0.220)、YNL211C(0.221)、SOL1(0.221)、COS111(0.221)、HSH155(0.221)、NKP2(0.221)、NAB3(0.221)、FMT1(0.222)、YPL152W-A(0.222)、BOR1(0.222)、SPC25(0.222)、MMS1(0.222)、YIL166C(0.223)、MAL13(0.223)、BFA1(0.223)、AEP3(0.224)、MTH1(0.225)、YGR031W(0.225)、BIT61(0.227)、YMR230W-A(0.227)、SKT5(0.227)、YGL258W-A(0.227)、PHR1(0.227)、HTB2(0.228)、SER1(0.229)、BAP3(0.230)、YER0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NMD2(1.482)、YIM1(1.483)、BCH1(1.483)、RRP1(1.483)、VCX1(1.483)、UGA1(1.484)、HOL1(1.484)、GRX1(1.484)、EMP24(1.484)、YGR237C(1.485)、FAP1(1.485)、KTR2(1.486)、PBP4(1.486)、YER163C(1.486)、RFS1(1.486)、PTA1(1.487)、MPD2(1.487)、SGT2(1.487)、IKI1(1.487)、ECM29(1.488)、REV3(1.489)、TPD3(1.489)、YDL124W(1.490)、MUM2(1.491)、YFR026C(1.491)、PHS1(1.491)、MLS1(1.493)、POR1(1.494)、PFD1(1.494)、EGD2(1.494)、GYP8(1.495)、RPT2(1.495)、TEX1(1.495)、RPS5(1.496)、TPK1(1.496)、DOT5(1.497)、LSB5(1.498)、DMA1(1.498)、BNA6(1.498)、VAB2(1.499)、AML1(1.500)、SEC31(1.500)、KIN1(1.501)、STB4(1.502)、GSP1(1.502)、AAD4(1.502)、MNN2(1.503)、RPP1B(1.503)、GUK1(1.506)、MCK1(1.506)、HSP31(1.506)、SBP1(1.506)、ZWF1(1.507)、IST2(1.508)、GPI16(1.508)、CDC42(1.508)、AHA1(1.509)、UBP2(1.510)、YNL115C(1.510)、CCW14(1.510)、YDL121C(1.510)、MCA1(1.510)、RPT4(1.511)、ERP1(1.512)、TMA7(1.513)、WHI4(1.513)、YDR131C(1.513)、PDR1(1.514)、TSR3(1.516)、ATG11(1.516)、DDP1(1.516)、COQ2(1.516)、RPP1A(1.517)、PMP3(1.517)、CRD1(1.517)、PHO85(1.517)、YGR017W(1.517)、YIL055C(1.518)、LAP3(1.518)、YOR291W(1.519)、GAS5(1.519)、YKR043C(1.520)、YIL083C(1.520)、CHO2(1.521)、ELP4(1.521)、BIM1(1.522)、CAM1(1.522)、DAL82(1.523)、UMP1(1.524)、YBR241C(1.524)、LTP1(1.524)、PHO91(1.525)、RPP0(1.526)、YOR164C(1.526)、TOM71(1.527)、FAS2(1.528)、FMP46(1.528)、TMA22(1.528)、YML131W(1.528)、YCF1(1.530)、OPI3(1.530)、ROM1(1.530)、IRC24(1.530)、FYV6(1.531)、ATG13(1.534)、TRX3(1.534)、ENP2(1.534)、CEX1(1.534)、VPS3(1.535)、TRX1(1.536)、DIT2(1.536)、SEC4(1.536)、GDH3(1.537)、PRE9(1.537)、UBP1(1.537)、AYR1(1.537)、NIT2(1.537)、PDR17(1.538)、TUB1(1.539)、KEG1(1.539)、CDC25(1.539)、PIG2(1.539)、NSE1(1.541)、VPS25(1.541)、YLR414C(1.541)、CWH43(1.541)、COG2(1.545)、RCY1(1.545)、VPS68(1.546)、RPL7A(1.548)、TAF14(1.549)、SRB5(1.553)、UPF3(1.553)、YML096W(1.555)、ARG81(1.555)、NPR2(1.555)、PSH1(1.556)、TAF6(1.557)、MCT1(1.557)、SBH1(1.557)、PBN1(1.558)、VPS45(1.560)、SRP68(1.560)、SAY1(1.561)、PEP1(1.562)、CCT4(1.563)、COQ10(1.565)、RET3(1.566)、SSE1(1.566)、YSP3(1.567)、ABZ1(1.567)、PNS1(1.567)、DPB3(1.568)、YDL073W(1.568)、ATM1(1.568)、RBD2(1.568)、YFR006W(1.569)、DDI1(1.569)、DCP1(1.570)、SAS10(1.570)、RMT2(1.571)、FIG1(1.572)、MUS81(1.573)、UBI4(1.573)、YBR285W(1.574)、DLD1(1.576)、RPS15(1.576)、YPR170W-B(1.576)、SRP1(1.577)、PSK1(1.577)、RAD4(1.578)、PGD1(1.580)、PMT4(1.581)、ABF2(1.582)、SEC24(1.584)、URA10(1.585)、CWC23(1.585)、RPS11B(1.586)、TPM1(1.586)、YLR290C(1.588)、TRM9(1.588)、YAP1(1.589)、UGP1(1.589)、SPS2(1.590)、PDR10(1.591)、POM34(1.591)、PNC1(1.591)、STE11(1.593)、GRH1(1.596)、YMR018W(1.596)、TRS33(1.596)、HEF3(1.597)、LAT1(1.597)、BDS1(1.597)、HMF1(1.598)、PRP6(1.600)、FSH3(1.600)、SRB2(1.601)、DUG1(1.601)、ERD2(1.602)、CDA2(1.602)、RPS6A(1.602)、HUT1(1.604)、SHS1(1.604)、IRA1(1.605)、SSA3(1.606)、ELP3(1.606)、PRP46(1.606)、CSM3(1.606)、PEP4(1.607)、YHC3(1.610)、MDY2(1.610)、RPL43A(1.613)、HRQ1(1.613)、YKL023W(1.613)、DFM1(1.614)、PCL8(1.614)、SKG3(1.614)、GPH1(1.615)、NEJ1(1.616)、URA4(1.617)、GPX1(1.620)、HOS2(1.622)、YDR531W(1.623)、PEP3(1.624)、MAL31(1.625)、YGR283C(1.626)、HFD1(1.627)、SPR28(1.627)、SWP82(1.628)、FUM1(1.629)、CDA1(1.629)、HOM6(1.630)、NHX1(1.631)、SNF6(1.632)、ECI1(1.632)、CDC10(1.632)、MIS1(1.632)、YIL165C(1.632)、GTT1(1.636)、PLP2(1.636)、PFA4(1.636)、RPL30(1.637)、PRE3(1.640)、MTD1(1.640)、MNT2(1.642)、ECM30(1.643)、YNL208W(1.645)、YCR024C-B(1.645)、PCA1(1.646)、HCS1(1.648)、DCC1(1.650)、FAR8(1.652)、PPH22(1.654)、DED81(1.656)、GPM1(1.657)、COF1(1.658)、YGR042W(1.658)、YPR148C(1.659)、VPS55(1.659)、JLP1(1.660)、CAT2(1.661)、GCN1(1.664)、YGL231C(1.664)、GUS1(1.665)、YGR111W(1.667)、VMA4(1.671)、YDR056C(1.671)、SCS2(1.672)、NQM1(1.675)、UFE1(1.677)、COG1(1.677)、PAA1(1.677)、IRC22(1.682)、KTR1(1.682)、TYW1(1.683)、SSB1(1.683)、SVP26(1.686)、ESC8(1.687)、YNL010W(1.687)、TIF1(1.689)、EAF6(1.690)、SHC1(1.690)、KIN2(1.692)、DCS2(1.692)、RPS1B(1.692)、URA5(1.692)、DSD1(1.693)、YJL218W(1.694)、NPT1(1.694)、SRO77(1.695)、FMN1(1.695)、CMD1(1.695)、YTA6(1.697)、RPL21A(1.699)、ALG3(1.699)、KRE2(1.703)、PCL5(1.704)、MDM34(1.705)、PFS2(1.708)、SNF12(1.708)、BNA1(1.709)、AIM29(1.710)、SNU13(1.712)、RNR4(1.712)、MAP2(1.713)、DCS1(1.716)、RPN5(1.716)、PDC2(1.722)、DOP1(1.723)、SPO74(1.725)、PAP1(1.728)、RPL24B(1.732)、RPN8(1.734)、FPR3(1.734)、ERS1(1.735)、CPR1(1.736)、FIT3(1.740)、HUG1(1.742)、VPS5(1.742)、PEX3(1.742)、RPS29A(1.743)、ERV29(1.743)、CAF20(1.743)、DOG2(1.743)、RPL4A(1.744)、YCP4(1.745)、PBY1(1.746)、FUS2(1.750)、SNF2(1.752)、SUI1(1.752)、YMR262W(1.759)、BUD8(1.761)、TED1(1.763)、TAH1(1.765)、YCL048W-A(1.769)、RPL41A(1.774)、YDR374C(1.776)、VMA8(1.777)、YKR051W(1.777)、YFL042C(1.778)、ORM2(1.778)、TAF12(1.778)、APE3(1.781)、YDR239C(1.782)、ERV2(1.784)、SHR5(1.785)、YHR192W(1.787)、YRB30(1.791)、PHO88(1.791)、WHI2(1.792)、LYS1(1.793)、RHO1(1.795)、VPS27(1.797)、VMA6(1.797)、PAB1(1.806)、YJR01


5W(1.807)、SIR2(1.809)、FAR1(1.809)、CPT1(1.814)、ECM15(1.815)、ROK1(1.815)、YFR018C(1.820)、HYR1(1.821)、POL1(1.821)、CTS2(1.830)、UBA4(1.832)、SRP72(1.833)、RTN2(1.834)、HAP1(1.835)、ARE2(1.836)、RCK2(1.837)、INM2(1.839)、AFR1(1.840)、YOS9(1.840)、RTT103(1.842)、RPS12(1.845)、RNY1(1.847)、PPA1(1.848)、LEU3(1.849)、ERG27(1.850)、TMA29(1.851)、UBX3(1.852)、VPS15(1.854)、RPT6(1.855)、LDB18(1.859)、YPL088W(1.862)、RPL5(1.863)、RVS167(1.870)、TIR2(1.871)、PHA2(1.873)、ERJ5(1.873)、VPS30(1.876)、IMD2(1.878)、PES4(1.879)、EMI1(1.897)、YPR085C(1.901)、YBR200W-A(1.903)、FMP40(1.909)、REH1(1.909)、SGT1(1.911)、CPS1(1.913)、YOP1(1.917)、TRR2(1.919)、STS1(1.920)、VPH1(1.931)、SWA2(1.933)、YGR026W(1.938)、CDC53(1.938)、FMP52(1.941)、YDR119W(1.945)、RNQ1(1.953)、SAG1(1.956)、RPS20(1.974)、TRM82(1.979)、VPS1(1.981)、YIP5(1.987)、YPR1(1.988)、ENT2(1.992)、YPT31(1.997)、PRX1(2.003)、YHL039W(2.003)、YHI9(2.022)、BUD32(2.035)、YLR361C-A(2.037)、APL2(2.043)、PTP3(2.046)、YMR114C(2.049)、LSC2(2.054)、ATG10(2.056)、SRP54(2.065)、ENT3(2.077)、RPL3(2.080)、TYR1(2.095)、NAT1(2.106)、YNR021W(2.114)、EBS1(2.126)、HBT1(2.132)、RPL15A(2.145)、RPL41B(2.149)、RPP2B(2.166)、CBR1(2.178)、BNA4(2.233)、PRC1(2.240)、DIT1(2.244)、RPS28A(2.260)、ASP3-1(2.300)、IDP1(2.304)、SCW4(2.321)、VMA2(2.369)、ALY2(2.382)、NAT5(2.449)
これらの結果によれば、酵母遺伝子のターミネーターは、PGK1ターミネーターに対する相対強度において、極めて広い範囲で多様な発現強度を呈しており、これらを必要に応じて1種又は2種以上を組み合わせて用いて1種又は2種以上の任意の遺伝子を酵母において発現させることで、意図した発現強度で外来遺伝子を発現させることができることがわかった。
(セルラーゼの酵母での分泌発現量の調節)
本実施例では、異なるターミネーターを用いてセルラーゼの分泌発現量を調節した。
(プラスミドの作製)
タカラバイオ製のpAUR112を用い、そのSmaI部位にTDH3プロモーター配列、公知のリゾパス・オリゼ由来の分泌シグナル配列、トリコデルマ由来エンドグルカナーゼ2(TrEG2)遺伝子、ターミネーター配列を順に連結したプラスミドを作製した。本実施例では、ターミネーターとして、コントロール用としてPGK1及びMFA2由来配列を用いるほか、実施例16においてGFP発現量の向上が確認できたNAT5及びRPL41B、さらにGFP発現量の低下が確認されたICY2の各遺伝子のターミネーターを用いた。
(酵母でセルラーゼの分泌発現とセルロース分解反応)
酵母BJ5465株に上記作製したプラスミドをそれぞれFrozen-EZ Yeast Transformation IIキット(ZYMO RESEARCH社)を用いて導入した。上記で得られた酵母クローンを3個ずつ、SD-Ura培地で前培養(30℃、24時間)、さらに20%シードでSD-Ura培地に植え継ぎ培養した(30℃、24時間)。遠心上清10μlを50mリン酸緩衝液(pH5.0)を含むリン酸膨潤セルロース(PSC)90μlに加え攪拌後、40℃で3時間分解反応を行った。反応後、遠心上清5ulを取り出し、TZアッセイ(Journal of Biochemical and Biophysical Methods, 11 (1985) 109-115)にてその還元糖量を測定した。
その結果、GFP発現量の結果と同様に、NAT5及びRPL41Bの各遺伝子のターミネーターはコントロールのPGK1遺伝子のターミネーターよりも分泌量が高く、ICY2遺伝子のターミネーターはPGK1ターミネーターよりもセルラーゼ分泌量が低いことが確認できた。
本実施例では、これまでの結果に基づいて標準ターミネーターSAG1tを含む上位44種類のターミネーター評価用コンストラクトを作製した。評価用コンストラクトは、図23に示す構成とし、ゲノム上の1ヶ所に所定の遺伝子を挿入した遺伝子組換え酵母を作製するようにした。また、培養条件をOD660=0.7に合わせて、各遺伝子組換え酵母について細胞数10000個で活性測定を3回繰り返して行い、上位30位のターミネーターを決定した。さらに、様々な培養条件下で上位5種のターミネーターを決定した。
(1)評価対象となるターミネーターの選定
標準ターミネーターSAG1tよりも高い活性を示した44種類のターミネーター評価用コンストラクト(活性の高い順にNAT5t, ALY2t, SCW4t, IDP1t, ASP3-1t, RPS28At, DIT1t, PRC1t, BNA4t, CBR1t, VMA2t, RPP2Bt, RPL41Bt, RPL15At, HBT1t, EBS1t, YNR021Wt, NAT1t, TYR1t, RPL3t, ENT3t, SRP54t, ATG10t, LSC2t, YMR114Ct, APL2t, YLR361C-At, BUD32t, PRX1t, YHL039Wt, YPT31t, ENT2t, YIP5t, YPR1t, TRM82t, VPS1t, RPS20t, RNQ1t, YDR119Wt, YGR026Wt, CDC53t, FMP52t, SWA2t, SAG1t)の作製を試みて、結果として、YPR1t, VPS1t, RPS20t, SWA2tの4つを除く40種類とした。加えて、SAG1tよりも活性が低いと判定されたものの、スクリーニングの途中ではSAG1tよりも高い活性を示していたターミネーター(YHI9t, PPA1t, GUS1t, BUD6t)を含めて、計44種類とした。
(2)形質転換用ベクターの作製
評価用コンストラクトは、図23に示すように、pSP73(Promega)のBglII部位とXhoI部位の間に、以下の配置を持つコンストラクトとした。すなわち、PDC6の5’上流配列(開始コドンより-821〜-177)、TDH3プロモーター(-796〜-1)、酵母コドン最適化したGFP遺伝子、各ターミネーター領域、栄養要求性マーカー、PDC6の3’下流配列(終止コドンより+4〜+599)の順に並べたゲノム挿入用コンストラクトとした。栄養要求性マーカーはTRP1又はURA3とした。図23に示すコンストラクトは、レポーター遺伝子をコドン最適化GFP(Yamanishi M, Matsuyama T. A modified Cre-lox genetic switch to dynamically control metabolic flow in transgenic Saccharomyces cerevisiae. ACS Synthetic Biology, 1, 172-180 (2012))とし、栄養要求性マーカーをURA3に変更した以外は参考文献(Yamanishi M, Katahira S, Matsuyama T. TPS1terminator increases mRNA and protein yield in Saccharomyces cerevisiae expression system. Bioscience, Biotechnology and Biochemistry, 75, 2234-2236 (2011))で用いたベクターと同様であった。各ターミネーター領域は、KpnI部位とBamHI部位の部分をカセットとして、常法に従いクローニングした。
(3)遺伝子組換え酵母の作製
それぞれのターミネーターに対応する評価用コンストラクトを野生型酵母W303-1aに導入して遺伝子組換え酵母を作製し、培養条件をOD660=0.7に合わせて培養後、フロー・サイトメトリー(FCM)を用いて蛍光強度を測定した。具体的には、野生株酵母W303-1aをYPD液体培地を用いて培養した後、Frozen-EZ Yeast Transformation IIキット(ZYMO RESEARCH社)で処理してコンピテントセルを調整した。(2)で作製したコンストラクトを挿入部位末端の制限酵素BglIIまたはClaI、加えてApaIまたはXhoIで処理して断片化し、これにコンピテントセルを加え、PEGバッファーで希釈した。これを45分間加温し、形質転換した。これをトリプトファン選択培地で培養し、生育能を安定に保持している株を選択した。これらに対しコロニーPCRを行い、目的遺伝子が正しく導入されていることを確認した。
(4)ターミネーター活性の順位付け
それぞれの遺伝子組換え酵母の菌株は、SD培地(2% グルコース、0.67% Yeast Nitrogen base w/o amino acids (Difco社),0.082%Complete Supplement Mixture (CSM) +40Ade (FORMEDIUM社))で前培養を行った後、OD660=0.1程度でSD培地に植菌して、OD660=0.7まで培養し、蛍光強度の測定を行った。ターミネーター活性は、レポーター遺伝子であるGFP蛍光タンパク質の発する蛍光強度を指標として、フローサイトメーター(Cell Lab Quanta SC MPL flow-cytometer、ベックマン・コールター社)を用いて、各サンプルにつきGFP蛍光を発する10000細胞のGFP蛍光強度を測定した。励起光には488nmを用い、バンドパス・フィルターとして510nm/10nmを用いた。PGK1tコントロール株の蛍光強度を1として、それぞれの相対蛍光強度を決定した。実験は3回繰り返して、平均値と標準偏差を求めた。全てのデータは、IgorPro(ver. 6.1, Wavemetrics社)を用いて処理した。こうして選定した上位30位を図24及び図25に示す。図24及び図25に示すように,若干活性順位の変更があったが、相対発現強度は少なくとも1.9はあった。
配列番号1〜10590、15886〜15889:プライマー

Claims (12)

  1. 人工転写因子タンパク質のコード領域を発現可能であって、かつ当該人工転写因子タンパク質による正のフィードバックによって当該人工転写因子タンパク質自身を増幅可能な2以上の自己増幅カセットと、
    前記人工転写因子タンパク質との結合に基づいて外来遺伝子を発現可能な発現カセットと、
    を備え、
    前記2以上の自己増幅カセットは、同一の前記人工転写因子タンパク質を増幅可能に構築されている、酵母における発現システム。
  2. 前記2以上の自己増幅カセットは、それぞれ、前記人工転写因子タンパク質が結合可能な1又は2以上の人工転写因子タンパク質結合領域を備えるプロモーター領域の制御下にある前記人工転写因子タンパク質のコード領域と、ターミネーター領域と、を備えている、請求項1に記載の発現システム。
  3. 前記プロモーター領域は、1又は2の前記人工転写因子タンパク質結合領域を備える、請求項2に記載の発現システム。
  4. 前記ターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下の酵母遺伝子のターミネーター領域から選択される、請求項2又は3に記載の発現システム。
  5. 前記人工転写因子タンパク質は、酵母とは異種生物由来のDNA結合ドメインと、核局在化シグナルと、転写活性化ドメインと、を備え、
    前記プロモーター領域は、1又は2の人工転写因子タンパク質結合領域と、酵母由来のTATAボックス領域と、を備え、
    前記ターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下のターミネーター領域から選択される、請求項1〜4のいずれかに記載の発現システム。
  6. 前記発現カセットは、前記人工転写因子タンパク質が結合可能な1又は2以上の人工転写因タンパク質子結合領域を含むプロモーター領域の制御下にある前記外来遺伝子と、ターミネーター領域を備えている、請求項1〜5のいずれかに記載の発現システム。
  7. 前記酵母の集団において前記外来遺伝子を発現する酵母の比率が70%以上である、請求項1〜6のいずれかに記載の発現システム。
  8. 請求項1〜7のいずれかに記載の発現システムを保持する酵母。
  9. 外来遺伝子を発現させるための酵母の作製方法であって、
    人工転写因子タンパク質のコード領域を発現可能であって、かつ当該人工転写因子タンパク質による正のフィードバックによって当該人工転写因子タンパク質自身を増幅可能な2以上の自己増幅カセットと、
    前記人工転写因子タンパク質との結合に基づいて外来遺伝子を発現可能な発現カセットと、
    を酵母に導入する工程、
    を備え、
    前記2以上の増幅コンストラクトは、同一の前記人工転写因子タンパク質を増幅可能に構築されており、各自己増幅カセットにおけるプロモーター領域は、前記人工転写因子タンパク質が結合可能な1個又は2個の人工転写因子結合領域を備え、
    各自己増幅カセットにおけるターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下の範囲の酵母遺伝子のターミネーター領域からなる群から選択されるターミネーター領域を備える、作製方法。
  10. 酵母における外来遺伝子の発現レベルの制御方法であって、
    人工転写因子タンパク質のコード領域を発現可能であって、かつ当該人工転写因子タンパク質による正のフィードバックによって当該人工転写因子タンパク質自身を増幅可能な2以上の自己増幅カセットと、
    前記人工転写因子タンパク質との結合に基づいて外来遺伝子を発現可能な発現カセットと、
    を準備する工程、
    を備え、
    前記2以上の増幅コンストラクトは、同一の前記人工転写因子タンパク質を増幅可能に構築されており、各自己増幅カセットにおけるプロモーター領域は、前記人工転写因子タンパク質が結合可能な1個又は2個の人工転写因子結合領域から選択し、
    各自己増幅カセットにおけるターミネーター領域は、サッカロマイセス・セレビジエのPGK1遺伝子ターミネーターに対する相対発現強度が1.0以下の範囲の酵母遺伝子ターミネーター領域からなる群から選択されるターミネーター領域から選択する、
    制御方法。
  11. 酵母における外来タンパク質の生産方法であって、
    請求項8に記載の酵母を培養して、前記外来遺伝子がコードする外来タンパク質を生産する工程、
    を備える、生産方法。
  12. 酵母における有用物質の生産方法であって、請求項8に記載の酵母を培養する工程、
    を備える、有用物質の生産方法。
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