JP2014527434A - 光干渉断層法におけるフィーチャの動き補正及び正規化 - Google Patents
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Abstract
Description
図3に示すCAD方法300の最初のステップは、データ取得305におけるOCTデータの取得である。幾つかの実施形態では、OCTデータは、図4に示すように、走査パターン410を用いて取得できる。また、臨床用途に応じて、当分野で周知の他の走査パターンを用いて、十分な3D情報が利用できるようにしてもよい。走査パターンは、眼の関心フィーチャ、例えば、中心窩又は視神経頭を実質的に覆う必要がある。図4に示すx−z座標の2D OCTイメージ420は、走査パターン410内の太い水平線412で示すように、水平走査(x−スキャン)によって取得される。同様に、図4に示すz−y座標の2D OCTイメージ430は、太い垂直線414で示すように、垂直走査(y−スキャン)によって取得される。
3Dボリュームスキャンの間に眼の動きから生じるアーチファクトは、通常、データ品質を劣化させ、後続する量的測定の正確度及び信頼性に直接的な影響を与える。動き補正ステップ310では、動き補正を実行して、グラウンドトゥルース(ground truth)又は疑似静止(pseudo-motionless)データセット、3Dデータ又は2D画像を得ることができ、後に実行される測定及びデータ評価に対する動きアーチファクトの影響を回避することができる。
スキャンされた3Dデータを保存するためには、通常、大きなメモリ空間が必要であるため、ベースライン基準として動き補正データのサブセットを抽出することは有益である。ステップ315では、ベースライン基準データは、フォローアップ通院の際に取得されたOCTデータセットのためのデータ位置合わせ及び進行解析を補助するベースラインとして使用できるため、重要である。また、ベースライン基準は、視覚化アプリケーション(visualization application)のために使用することもできる。幾つかの実施形態では、動き補正データのサブセットとして血管を抽出し、後のフォローアップ通院のためのベースライン基準として保存することができる。血管の網目状構造は、ストレージ及び処理のために必要なメモリを大幅に低減し、更に、フォローアップ通院の際のデータ位置合わせのための情報が豊かな基準を提供する。
病気の進行又はその治療に対する反応を追跡するために、複数回の通院に亘って、実質的に同じ位置でOCT測定を実行することが望ましい。データ取得のフォローアップモードでは、ステップ320において、ビデオベース又はSLOベースのリアルタイム追跡を用いて、ステップ320のデータ取得の間の患者の眼の動きを補償することができ、これによって、通院毎の患者の固定位置におけるあらゆる変化を考慮に入れることができ、動きアーチファクトを更に低減することができる。ステップ320では、同じ患者について、複数回の通院に亘って、実質的に同じ位置でOCTスキャンを取得することができ、後続する処理及び解析のためのOCTデータの質を更に向上させることができる。
フォローアップデータ取得モードのステップ325では、以前に保存したOCTのベースライン基準を用いて、今回の通院又は再来院において取得されたOCT又は他のイメージング方式からのデータを位置合わせすることができる。一般的な診療では、患者は、通常、構造的情報及び機能的情報の両方を提供する異なる眼科器具によって診察される。例えば、構造的情報を提供するOCTデータをカラー眼底撮影(構造的情報)又は視野検査データ(機能的情報)と位置合わせすることによって、医師にとってより有用な診断情報を提供することができる。データ位置合わせステップ325では、目印(例えば、血管及び中心窩位置)を用いることができる。スキャン領域、スキャン分解能及び雑音特性は、器具毎に異なることがあるので、データ位置合わせの前に追加的データ処理を実行してデータ品質を向上させることができる。このようなデータ処理としては、雑音低減、コントラスト強調及び当分野で周知のデータ強調のための他の如何なる手法を用いてもよい。データ位置合わせステップ325は、如何なるデータ位置合わせ方法によって達成してもよい。幾つかの実施形態では、データ位置合わせステップ325は、スケーリング、回転及び平行移動を含む複数の次元における変量を検出する能力を有する自己相関関数を使用する。
網膜の脈絡膜及び角膜のスキャンのための複数層セグメント化アルゴリズムは、RTVue FD−OCTシステム(オプトビュー社(Optovue)、カリフォルニア州フレモント)において利用可能である。3D表面は、最大の傾斜から開始され、最小の傾斜で終了するように階層的に検出される。幾つかの実施形態では、先験的な組織学的情報と共に幾つかの線形フィルタ及び非線形フィルタを用いて、全ての表面が平滑化される。網膜に関連するスキャンでは、セグメント化によって、以下の網膜表面、すなわち、内境界膜(inner limiting membrane:ILM)、神経線維層(nerve fiber layer:NFL)、神経節細胞層(ganglion cell layer:GCL)、内網状層(inner plexiform layer:IPL)、内顆粒層(inner nuclear layer:INL)、外網状層(outer plexiform layer:OPL)、外顆粒層(outer nuclear layer:ONL)、外境界膜(outer limiting membrane:OLM)、内節層(inner segment layer:ISL)、結合線毛(connecting cilia:CL)、外節層(outer segment layer:OSL)、ヴァーヘフ膜(Verhoeff's membrane:VM)及び網膜色素上皮(RPE)を生成することができる。脈絡膜に関連するスキャンでは、セグメント化によって、ブルッフ膜(Bruch's membrane:BM)、脈絡毛細管板(choriocapillaries:CC)、ザットラー層(Sattler's layer:SL)、ハラー層(Haller's layer:HL)及び脈絡膜−強膜界面(choroid sclera interface:CSI)等の表面を生成することができる。角膜に関連するスキャンでは、セグメント化によって、前眼部表面/涙液膜(anterior segment surface/tear film:TF)、上皮層(epithelium layer:EPL)、ボーマン膜(Bowman's membrane:BOM)、支質層(stroma layer:STL)、デスメ膜(Descemet's membrane:DM)及び内皮層(endothelium layer:ENL)等を生成することができる。
ステップ330について説明したように層がセグメント化されると、ステップ335では、これらの層のそれぞれにおける眼の組織の異なる特性が抽出及び解析される。当分野では、3Dデータをセグメント化して膜厚を解析することは知られているが、本発明の幾つかの実施形態は、網膜又はVOIの他の重要な特性又は特徴の解析を提供する。これらの重要且つこれまで気付かれていなかった特性としては、例えば、層反射率及び組織テクスチャがある。図2a及び図2bは、厚さが変化しない組織層の異なる構造的な特性を示す図である。図2aは、健康な場合の組織層の細胞構造を示しており、細胞構造210は、規則的に離間し、細胞は、良好に組織化されて、同様の形状及びサイズを有している。図2bは、細胞レベルの変化の具体例を示しており、ここでは、組織の厚さが変化することなく、異なる組織層220の形状、サイズ及び組織が病理のために変化している。これらの変化によって、媒質の不透明性によって生成されるシェーディングに加えて、反射率が低下し、取得データにおける組織構造が異なる領域が生じる。したがって、組織の厚さが変化することなく、病理によって細胞構造及び特性が変化するこれらの状況においては、反射率及びテクスチャを解析することによって空間の変化を定量化することがより適切である場合がある。
(フィーチャマップ(x,y)=VOI F(x,y,z|VOI)におけるΣz)
ここで、2Dフィーチャマップは、VOIのz軸に沿ったテクスチャ測定値の総和であってもよい。
(フィーチャスペクトル(r,B)=VOIにおけるサイズrの形状Bの数)
この具体例では、形状−サイズスペクトルを用いて、セグメント化されたVOI内の形状及びサイズを量的に評価している。フィーチャスペクトル内のあるサイズの大きなインパルスは、その所与のサイズにおける形状Bの主な(突出又は侵入している)部分的構造の存在を示す。パターンスペクトルの帯域幅mbwを用いて、形状Bのサイズ範囲を特徴付けることができ、mbwは、以下のように定義することができる。
ここで、サイズパラメータrmax及びrminは、それぞれ、フィーチャスペクトル内の最大サイズ及び最小サイズを表す。
p(r,B)=フィーチャスペクトル(r,B)/ボリューム(VOI)
この具体例では、p(r,B)は、確率的観点からフィーチャスペクトル(r,B)を処理する確率関数である。フィーチャスペクトルが平坦であれば、mirが最大値になり、これは、関心フィーチャが様々なサイズのB(例えば、球)パターンを含むことによって非常に不規則又は複雑であることを示している。フィーチャスペクトルが、例えば、r=kにおけるインパルスのみを含む場合、mirは、最小値(0)になり、この場合、VOIは、単にサイズkのパターンBであり、したがって、最も規則的である(又は不規則ではない)とみなすことができる。
一般的な診療において、眼疾患の診断は、主に視覚的印象に基づいて行われている。ある所定の基準に対してフィーチャを正規化した場合、異なる測定間での相対的なフィーチャ(反射率及びテクスチャ)の量的な比較がより有効で信頼できるものとなることがある。本発明の幾つかの実施形態では、ステップ340における正規化は、OCTデータに基づいて実行される。データ反射率は、特定の基準層における最大反射率に基づいて正規化してもよい。例えば、網膜、脈絡膜及び角膜のスキャンのための基準層として、それぞれ、RPE、CC及びTFを用いることができる。正規化されたフィーチャは、以下のように表すことができる。
ここで、Κ及びμは、それぞれターゲット平均反射率値(基準値)及び基準の測定された平均反射率値である。
ここで、C及びcは、それぞれ、眼底撮影(基準値)及び取得したOCTデータの平均コントラスト値である。
ステップ345では、疾患の検出及び評価のために、ステップ340で正規化されたフィーチャを標準データベースと比較することができる。眼のデータの標準データベース(正常な外観を有するデータ)は、N個の正常な眼のOCTボリュームの集合から導出することができる。幾つかの実施形態では、これらのN個のボリュームに亘る各2Dフィーチャマップ位置(x,y)における各正規化されたフィーチャの分布は、N個のフィーチャ値(1ボリュームあたり1つの正規化されたフィーチャ値)の平均μN(x,y)及び標準偏差σN(x,y)として定義される。したがって、正規化されたフィーチャマップNF−Map(x,y)と平均との間の偏差d(x,y|VOI)は、以下のように表すことができる。
幾つかの実施形態に基づいて眼球異常を分類する簡単な方法は、設定されたカットオフ点、例えば、以下の4個のカットオフにおける通常の外観から、局所的偏差を算出することを含む。
b.95%カットオフ:d(x,y|VOI)=1.64
c.5%カットオフ:d(x,y|VOI)=−1.64
d.1%カットオフ:d(x,y|VOI)=−2.32
例えば、フィーチャとしてRNFL反射率を用いる緑内障患者のCADでは、このような例示的なスキームを用いて、組織位置を、正常(5%以上のカットオフ)、疑い有り(1%以上5%未満のカットオフ)、進行した緑内障(1%未満のカットオフ)と分類することができる。
フォローアップ通院モードでデータを取得する場合、ステップ350において、進行解析を実行して、特定の医学的状態の傾向及び進行を監視することができる。ステップ350では、正常な場合及び病理がある場合の両方について、抽出された各フィーチャの再現性を評価できる。フィーチャの再現性は、異なる寄与因子のバリエーションを考慮し、共通の因子は、システム、オペレータ及び測定再現性を含む。再現性の共通の測定値は、評価されるフィーチャの標準偏差によって表すことができる。標準偏差が小さい程、測定の再現性が高く、したがって、進行解析の結果の信頼性が高い。本発明の幾つかの実施形態に基づく進行解析の具体例を図6に示す。この具体例では、一般的な臨床設定において、ある期間、通常は、2〜5年の期間に亘って傾向解析が行われている。この具体例では、3年の期間に亘って、6カ月毎の間隔で取得したOCTデータの抽出されたフィーチャをプロットしている。また、この傾向解析は、ステップ345について説明したようにフィーチャが調整(例えば、年齢調整)された標準データベースに重ねられている。また、図6の進行解析は、各フィーチャ値において、評価されているフィーチャの標準偏差を示す縦棒を含むことができ、これは、結果の信頼性及び再現性を図式的に示している。
Claims (20)
- 眼科のためのデータ解析の方法において、
少なくとも1つの3D OCTデータセットを取得するステップと、
ベースラインモードにおいて動きアーチファクトを補正するステップと、
ベースラインモードにおいて基準データを生成するステップと、
セグメント化を実行して関心ボリュームを特定するステップと、
反射率、テクスチャ又はこれらの組合せを含むフィーチャ情報を抽出するステップとを有する方法。 - さらに、前記フィーチャ情報を正規化するステップを有する請求項1記載の方法。
- さらに、標準データベースを構築し、前記3D OCTデータ内の異常を特定するステップを有する請求項2記載の方法。
- さらに、異なる時点における少なくとも1つのフォローアップ3D OCTデータを取得するステップと、
前記フォローアップ3D OCTデータの動きアーチファクトを補正するステップと、
前記フォローアップ3D OCTデータを前記ベースラインモードの3D OCTデータに位置合わせするステップと、を有する請求項3記載の方法。 - さらに、異なる時点で取得された3D OCTデータを用いて進行解析を実行するステップを有する請求項1記載の方法。
- 前記異なる時点で取得された少なくとも1つの3D OCTデータは、異なるイメージング方式によって取得される請求項4記載の方法。
- 前記異なるイメージング方式は、カラー眼底撮影、視野テスト、走査型レーザ検眼鏡、蛍光眼底血管造影、インドシアニングリーン血管造影及び超音波検査からなるグループから選択される請求項6記載の方法。
- 前記関心ボリュームは、実質的に、網膜領域、脈絡膜領域、角膜領域及びこれらの組合せからのデータを含む請求項1記載の方法。
- 前記関心ボリュームは、少なくとも1つの空間次元からの情報を含む請求項8記載の方法。
- さらに、強度レベル分布測定値、ランレングス測定値、共起マトリクス測定値、ウェーブレット解析測定値、パターンスペクトル測定値及びこれらの組合せを含む量的パラメータを算出するステップを有する請求項1記載の方法。
- 前記フィーチャ情報は、組織形状−サイズスペクトル、組織エントロピ測定値、組織コントラスト又はこれらの組合せを含む請求項1記載の方法。
- OCTイメージャと、
前記OCTイメージャに接続され、光源からの光を受光し、サンプルからの反射光を前記OCTイメージャに供給する2次元横断スキャナと、
前記OCTイメージャから3D OCTデータを受け取り、前記3D OCTデータを処理する命令を実行するコンピュータとを備え、
前記命令は、
ベースラインモードにおいて動きアーチファクトを補正することと、
ベースラインモードにおいて基準データを生成することと、
セグメント化を実行して関心ボリュームを特定することと、
反射率、テクスチャ又はこれらの組合せを含むフィーチャ情報を抽出することと、を含む、光干渉断層法(optical coherence tomography:OCT)システム。 - 前記命令は、さらに、前記フィーチャ情報を正規化することと、標準データベースを構築することと、前記3D OCTデータ内の異常を特定することと、を含む請求項12記載のシステム。
- 前記命令は、さらに、
異なる時点における少なくとも1つのフォローアップ3D OCTデータを取得することと、
前記フォローアップ3D OCTデータの動きアーチファクトを補正することと、
前記フォローアップ3D OCTデータを前記ベースラインモードの3D OCTデータに位置合わせすることと、を含む請求項13記載のシステム。 - 前記命令は、さらに、異なる時点で取得された3D OCTデータを用いて進行解析を実行することを含む請求項12記載のシステム。
- 前記異なる時点で取得された少なくとも1つの3D OCTデータは、異なるイメージング方式によって取得される請求項14記載のシステム。
- 前記異なるイメージング方式は、カラー眼底撮影、視野テスト、走査型レーザ検眼鏡、蛍光眼底血管造影、インドシアニングリーン血管造影及び超音波検査からなるグループから選択される請求項16記載のシステム。
- 前記関心ボリュームは、実質的に、網膜領域、脈絡膜領域、角膜領域及びこれらの組合せからのデータを含み、及び少なくとも1つの空間次元からの情報を含む請求項12記載のシステム。
- 前記命令は、さらに、強度レベル分布測定値、ランレングス測定値、共起マトリクス測定値、ウェーブレット解析測定値、パターンスペクトル測定値及びこれらの組合せを有する量的パラメータを算出することを含む請求項12記載のシステム。
- 前記フィーチャ情報は、組織形状−サイズスペクトル、組織エントロピ測定値、組織コントラスト又はこれらの組合せを含む請求項12記載のシステム。
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